product	sequences	frame	codon	ref_codon_maj	alt_codon1_maj	alt_codon2_maj	num_defined_seqs	nonamers	nonamer_counts	multiple_variants	NN_sites	SN_sites	NS_sites	SS_sites	NN_diffs	SN_diffs	NS_diffs	SS_diffs	pair	which_gene	ratio_name	sw_num_replicates	sw_N_diffs	sw_S_diffs	sw_N_sites	sw_S_sites	sw_dN	sw_dS	sw_dNdS	sw_dN_m_dS	sw_boot_dN_SE	sw_boot_dS_SE	sw_boot_dN_over_dS_SE	sw_boot_dN_over_dS_P	sw_boot_dN_m_dS_SE	sw_boot_dN_m_dS_P	sw_boot_dN_gt_dS_count	sw_boot_dN_eq_dS_count	sw_boot_dN_lt_dS_count	sw_ASL_dN_gt_dS_P	sw_ASL_dN_lt_dS_P	sw_ASL_dNdS_P
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80	5	32.333333333333336	0.249858334896404	0.173179167487274	1.44277362295765	0.0766791674091295	0.0643354342521805	0.0837598123761801	NaN	NaN	0.0955737137118726	0.422377161813867	811	0	189	0.189	0.811	0.378
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.83333333333333	5	32.16666666666667	0.268177549189387	0.174189200634338	1.53957620916093	0.0939883485550491	0.0666396398780314	0.0853168534052014	NaN	NaN	0.0997718239975501	0.346175755777273	850	0	150	0.15	0.85	0.3
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79	5	32.66666666666667	0.271586000425913	0.171193988985735	1.58642252590155	0.100392011440178	0.0674619366695037	0.0844926434889971	NaN	NaN	0.100263052071651	0.31668845769603	835	0	165	0.165	0.835	0.33
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.83333333333333	5	32.16666666666667	0.272278228294921	0.174189200634338	1.56311773234722	0.0980890276605833	0.066117270234118	0.0863856749330612	NaN	NaN	0.108697133231698	0.366840832205534	820	0	180	0.18	0.82	0.36
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGATTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.33333333333333	5	31.66666666666667	0.274376485003047	0.177291583548173	1.54760017092687	0.0970849014548747	0.0656708692866586	0.086793091916495	NaN	NaN	0.0999160985594652	0.331217605075663	829	0	171	0.171	0.829	0.342
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGATTTTTT	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.83333333333333	5	31.66666666666667	0.272278228294921	0.177291583548173	1.53576510991532	0.094986644746748	0.0669938176903623	0.0856643040560583	NaN	NaN	0.100504352751525	0.344607922036326	821	0	179	0.179	0.821	0.358
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:TTTTTTACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.33333333333333	5	32.16666666666667	0.260153207881584	0.174189200634338	1.49350939630123	0.0859640072472462	0.0652569818416105	0.0847621134523283	NaN	NaN	0.0977034057258513	0.378942427813514	809	0	191	0.191	0.809	0.382
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.66666666666666	5	31.833333333333336	0.25881973474884	0.176245193423779	1.46852081308403	0.0825745413250609	0.0650880378557556	0.0884277339709262	NaN	NaN	0.100737204453077	0.412385707555549	814	0	186	0.186	0.814	0.372
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACTCTTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.33333333333333	5	32.16666666666667	0.260153207881584	0.174189200634338	1.49350939630123	0.0859640072472462	0.0658092101560015	0.0876490846433563	NaN	NaN	0.10493542114667	0.412667366694785	796	0	204	0.204	0.796	0.408
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGATCA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.16666666666666	5	32.16666666666667	0.260825162391735	0.174189200634338	1.49736700921699	0.086635961757398	0.0632425212090536	0.0887535908070111	NaN	NaN	0.102900645305065	0.399822668085865	815	0	185	0.185	0.815	0.37
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGATCAATT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.49999999999999	5	32.5	0.259484741116488	0.172180831233375	1.50704778956945	0.0873039098831133	0.0650586582305864	0.0845672865471821	NaN	NaN	0.0981183492538816	0.373583124093904	822	0	178	0.178	0.822	0.356
ORF3a	all	ss12	13	ATT	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATTACT	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.16666666666666	5	32.16666666666667	0.239040218372072	0.174189200634338	1.37230217201508	0.0648510177377344	0.0620384721887949	0.0860819143380084	NaN	NaN	0.0968444792157091	0.503086777432035	743	0	257	0.257	0.743	0.514
ORF3a	all	ss12	14	ACT	AAC	TGC	2	ATTACTGCA:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.41666666666666	5	32.083333333333336	0.220826439413092	0.174698668260279	1.26404191635902	0.0461277711528129	0.0631115739454135	0.0869493043587009	NaN	NaN	0.0963742931504971	0.632200814819266	704	0	296	0.296	0.704	0.592
ORF3a	all	ss12	15	GCA	TGC	ACA	2	ACTGCACAG:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.66666666666666	5	31.833333333333336	0.237252996159118	0.176245193423779	1.34615300168014	0.0610078027353386	0.0631520374711928	0.089213427137527	NaN	NaN	0.0993992008096508	0.539370281278282	754	0	246	0.246	0.754	0.492
ORF3a	all	ss12	16	AAG	ACA	GCA	2	GCACAGCCA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.08333333333333	4	32.333333333333336	0.221923403608424	0.135196367873208	1.64148939131672	0.0867270357352156	0.0608776965676228	0.0730939375379726	NaN	NaN	0.0874729169340813	0.321454667981053	845	0	155	0.155	0.845	0.31
ORF3a	all	ss12	17	CAA	GCA	AGG	2	AAGCAAGGT:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.25	4	32	0.204399702385691	0.136741167595466	1.49479272394679	0.0676585347902254	0.0590675642478224	0.0746887222254316	NaN	NaN	0.0827642247043743	0.413651162255331	819	0	181	0.181	0.819	0.362
ORF3a	all	ss12	18	GGT	AGG	AAA	2	CAAGGTGAA:CCAGTAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.25	3	31.166666666666664	0.201440688758903	0.103018812035868	1.95537770993483	0.0984218767230349	0.0566527871100029	0.0631697682141168	NaN	NaN	0.0803145055602888	0.220403533565229	890	0	110	0.11	0.89	0.22
ORF3a	all	ss12	19	AAA	AAA	AAT	2	GGTGAAATC:GTAAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.41666666666666	3	31.166666666666664	0.184673013955982	0.103018812035868	1.79261447794296	0.0816542019201137	0.0541885713686198	0.0665234642816991	NaN	NaN	0.0795925946766248	0.304937780695015	843	1	156	0.156	0.843	0.312
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAAATTGAC:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.08333333333333	3	30.833333333333332	0.182931885877799	0.104213595070396	1.75535529461611	0.0787182908074028	0.0548045732260232	0.0689741946822432	NaN	NaN	0.078846785529753	0.318099818314994	846	1	153	0.153	0.846	0.306
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	CAA	2	ATCAAGGAT:ATTGACAAT	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.25	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.58333333333333	3	31.499999999999996	0.184234616510935	0.101851155869296	1.80886132256918	0.0823834606416383	0.0564637922606925	0.0668742222689423	NaN	NaN	0.0764184086282639	0.281007967515271	869	0	131	0.131	0.869	0.262
ORF3a	all	ss12	22	AAT	CAA	TGC	2	AAGGATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.83333333333333	3	32.166666666666664	0.156594789439853	0.0995936054863591	1.57233778890856	0.0570011839534941	0.0486273744018705	0.0620408875168678	NaN	NaN	0.069058236077622	0.409140295123829	794	0	206	0.206	0.794	0.412
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.5	3	31.833333333333332	0.141595553474679	0.100709711722406	1.40597715009819	0.0408858417522729	0.0453800291869066	0.0605723972557674	NaN	NaN	0.0667145011611889	0.539976917071928	736	0	264	0.264	0.736	0.528
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77	3	32.33333333333333	0.142608211856373	0.0990447915097998	1.43983554998208	0.0435634203465729	0.0483515368090788	0.0638924604921225	NaN	NaN	0.068158372761419	0.522725389898309	748	0	252	0.252	0.748	0.504
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77	4	32.33333333333333	0.127063613968535	0.135196367873208	0.939844878730025	-0.00813275390467302	0.0438972146761778	0.0805216568934145	NaN	NaN	0.0743303550309111	0.912874424099007	462	0	538	0.538	0.462	0.924
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.33333333333333	4	31.666666666666664	0.12471051706475	0.138321779350139	0.901597113995079	-0.0136112622853896	0.0427454301744848	0.0748747718685129	NaN	NaN	0.0792532220482046	0.863638823294643	442	0	558	0.558	0.442	0.884
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.08333333333333	4	31.916666666666664	0.110163273884948	0.137132914796851	0.803332110661718	-0.0269696409119032	0.0400352898601658	0.0744637381404399	NaN	NaN	0.0756932381164647	0.721614522650132	354	0	646	0.646	0.354	0.708
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.33333333333333	3	32.33333333333333	0.111315003838705	0.0990447915097998	1.12388548798844	0.0122702123289052	0.0402896168187971	0.0587286818651373	NaN	NaN	0.0683872210406176	0.857605894858762	594	1	405	0.405	0.594	0.81
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.33333333333333	2	32.666666666666664	0.111315003838705	0.0638683562552301	1.74288192722338	0.0474466475834749	0.0396096525491208	0.0485704792076381	NaN	NaN	0.064185251428628	0.459776955645382	791	0	209	0.209	0.791	0.418
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.5	2	33.166666666666664	0.11105698371059	0.0628640039123036	1.76662281749532	0.0481929797982868	0.0400760709188797	0.0470216205862333	NaN	NaN	0.0636864253191575	0.449215860859408	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACA:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.91666666666667	1	32.58333333333333	0.125436421140775	0.0313361505112163	4.00293013322989	0.0941002706295586	0.0430131276324326	0.0320308290276098	NaN	NaN	0.0559881773163931	0.0928179343854102	963	0	37	0.037	0.963	0.074
ORF3a	all	ss12	32	ACA	TAC	AGC	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.33333333333334	1	32.166666666666664	0.123002232202702	0.0317507728699206	3.87399175152772	0.0912514593327818	0.042146156802248	0.033119910421108	NaN	NaN	0.0525787609263314	0.0826488492744441	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	33	GCA	AGC	AAC	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.66666666666667	1	31.499999999999996	0.120796168025329	0.0324374878453625	3.72396803973212	0.0883586801799665	0.0409973237617873	0.0337442191999273	NaN	NaN	0.0554306756565197	0.110927213638517	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.41666666666667	1	32.08333333333333	0.121203743914918	0.0318350176854428	3.80724600540559	0.0893687262294755	0.0430301132555686	0.03393623725076	NaN	NaN	0.0567533379789203	0.115328780344407	933	0	67	0.067	0.933	0.134
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.41666666666666	1	32.75	0.122861989946783	0.0311733183159379	3.94125478403008	0.0916886716308449	0.0419673069335329	0.0330975258237515	NaN	NaN	0.0540638609540259	0.0898986192347732	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.41666666666666	1	33.416666666666664	0.124566345596373	0.0305385697640887	4.07898426673718	0.0940277758322847	0.0411095574079782	0.0326021287229791	NaN	NaN	0.0540300011001418	0.0818084169608327	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.41666666666666	1	33.416666666666664	0.124566345596373	0.0305385697640887	4.07898426673718	0.0940277758322847	0.0413675112069787	0.0327334291683006	NaN	NaN	0.0543925477316899	0.083864847214191	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.91666666666666	1	33.58333333333333	0.108911256999757	0.0303839016876759	3.5845053120328	0.0785273553120807	0.0385575928447066	0.0306265789203998	NaN	NaN	0.05255276807398	0.135108391133234	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.75	1	33.08333333333333	0.109159374475305	0.0308526791703671	3.53808412788179	0.0783066953049378	0.0393360303094113	0.0321809139285564	NaN	NaN	0.0526649079311745	0.137045017699575	932	0	68	0.068	0.932	0.136
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.41666666666666	1	33.416666666666664	0.109659022528177	0.0305385697640887	3.59083687858651	0.079120452764088	0.0405360678489043	0.0320341573685084	NaN	NaN	0.0506435962423043	0.118217507058237	935	0	65	0.065	0.935	0.13
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	1	32.75	0.123142795706581	0.0311733183159379	3.95026267202431	0.0919694773906432	0.041480081375523	0.0321851665901577	NaN	NaN	0.0568104974289984	0.105472708658124	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.58333333333331	1	32.416666666666664	0.122582464773988	0.031500692980973	3.89142120930577	0.091081771793015	0.0414245145143352	0.0335632541781122	NaN	NaN	0.054234282475933	0.0930715356263624	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.58333333333331	1	32.416666666666664	0.122582464773988	0.031500692980973	3.89142120930577	0.091081771793015	0.0411855284521442	0.0303349158484323	NaN	NaN	0.0552729447729399	0.0993825283738801	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	1	32.75	0.123142795706581	0.0311733183159379	3.95026267202431	0.0919694773906432	0.0435520362887773	0.0326083708015413	NaN	NaN	0.0535899571788672	0.0861309303229242	960	0	40	0.04	0.96	0.08
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	1	32.75	0.123142795706581	0.0311733183159379	3.95026267202431	0.0919694773906432	0.0400924923229015	0.032067902022623	NaN	NaN	0.0544222757671411	0.0910426098946728	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333331	1	33.25	0.125145045452681	0.0306948207819131	4.07707366470184	0.0944502246707676	0.0427352870247273	0.0333010485871906	NaN	NaN	0.0557993677394059	0.0905172444364949	961	1	38	0.038	0.961	0.076
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TAT	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333331	1	33.25	0.125145045452681	0.0306948207819131	4.07707366470184	0.0944502246707676	0.0421363058237985	0.0324099826812757	NaN	NaN	0.0526286894605988	0.0727090358057871	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	48	ATT	TAT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.91666666666664	1	33.25	0.110417145764054	0.0306948207819131	3.59725657134695	0.0797223249821406	0.0401178721534382	0.0320989651341648	NaN	NaN	0.0522426808237735	0.127009892882329	931	0	69	0.069	0.931	0.138
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.74999999999997	1	33.25	0.0959115685461867	0.0306948207819131	3.12468247420759	0.0652167477642736	0.0357722025005014	0.0311867705301231	NaN	NaN	0.05024845677077	0.194326653814113	910	0	90	0.09	0.91	0.18
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.24999999999997	1	33.75	0.0965740892437444	0.0302307926160697	3.19456027733818	0.0663432966276747	0.0357889465211963	0.0300814635210979	NaN	NaN	0.0471658109950395	0.159546870465527	928	1	71	0.071	0.928	0.142
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.0833333333333	1	32.916666666666664	0.095474921927806	0.0310121698640216	3.07862759511613	0.0644627520637843	0.035902182485683	0.032173057044623	NaN	NaN	0.0521169634316106	0.216129339642248	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.5833333333333	1	33.416666666666664	0.109408627044446	0.0305385697640887	3.58263755931043	0.0788700572803574	0.039199625879529	0.0314215307092219	NaN	NaN	0.0515378582101922	0.125934457777877	948	0	52	0.052	0.948	0.104
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.74999999999997	1	33.58333333333333	0.0946134639951751	0.0303839016876759	3.11393398279562	0.0642295623074992	0.0360250500343626	0.0320547919180625	NaN	NaN	0.0501892910124869	0.200634355513053	911	0	89	0.089	0.911	0.178
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.0833333333333	1	33.25	0.0941885460903395	0.0306948207819131	3.06854849420851	0.0634937253084264	0.036206347972867	0.0309453282744589	NaN	NaN	0.0496494658172666	0.200953387551009	888	0	112	0.112	0.888	0.224
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.91666666666663	2	33.75	0.0944005262514171	0.0617314855970427	1.52921196271906	0.0326690406543744	0.0361808563529431	0.0433770061311766	NaN	NaN	0.0597379503197127	0.584466348071863	735	1	264	0.264	0.735	0.528
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.5833333333333	2	33.75	0.0935582868591561	0.0617314855970427	1.51556836765383	0.0318268012621134	0.0341448310682023	0.0461833447983194	NaN	NaN	0.0598784926765905	0.595056347227184	698	0	302	0.302	0.698	0.604
ORF3a	all	ss12	57	CAG	TCA	GAG	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.66666666666664	2	34.166666666666664	0.109283858386045	0.0609472230590743	1.79309003594995	0.048336635326971	0.039827483499003	0.0450987250491034	NaN	NaN	0.0624810705867974	0.439155262031565	774	0	226	0.226	0.774	0.452
ORF3a	all	ss12	58	AGC	GAG	CGC	2	CAGAGCGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.16666666666664	2	34.166666666666664	0.108541192153805	0.0609472230590743	1.78090463692824	0.0475939690947306	0.0373372770457058	0.0453779073707767	NaN	NaN	0.0597857171633337	0.425987916136755	781	0	219	0.219	0.781	0.438
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TAC	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.83333333333331	2	34.83333333333333	0.110544521791661	0.0597330472949441	1.85064259731844	0.0508114744967167	0.0400401155238534	0.0431801191537201	NaN	NaN	0.0619729480239521	0.412274456118224	810	0	190	0.19	0.81	0.38
ORF3a	all	ss12	60	ACC	TAC	CAA	2	GCTACCAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.16666666666664	2	34.5	0.110036776004805	0.0603340239140544	1.82379309163188	0.0497027520907508	0.0390483521571389	0.0441783745562683	NaN	NaN	0.0600679859597411	0.407986794239469	802	1	197	0.197	0.802	0.394
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	ACCAAAATA:TCCAAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.33333333333331	2	34.33333333333333	0.0951500406590925	0.0606390724718212	1.56912097729246	0.0345109681872713	0.0344500023188632	0.0453094240911895	NA	NA	0.0588544750907342	0.557621538837002	758	0	242	0.242	0.758	0.484
ORF3a	all	ss12	62	ATA	AAT	AAT	2	AAAATAATT:AAAATCATA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.33333333333331	2	35	0.0964630333665702	0.0594370287406054	1.62294508003678	0.0370260046259648	0.0371394275039887	0.0450960664788133	NaN	NaN	0.0582118492420513	0.524739825890669	719	0	281	0.281	0.719	0.562
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATAATTGCG:ATCATAACC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.16666666666664	2	35	0.111574227897278	0.0594370287406054	1.87718380715512	0.0521371991566726	0.0385165254898021	0.0446294892293755	NaN	NaN	0.0596221241200346	0.381867461271556	819	2	179	0.179	0.819	0.358
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTC	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.33333333333331	2	35.5	0.112888706112188	0.0585663277285774	1.92753601754519	0.0543223783836109	0.0406629496296462	0.0446916061894237	NaN	NaN	0.0578155227122373	0.347432421763711	845	0	155	0.155	0.845	0.31
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.74999999999999	2	35.75	0.0972458393976114	0.0581404786806199	1.67260128578932	0.0391053607169915	0.0381860366010881	0.0439859030844415	NaN	NaN	0.0605893518354686	0.518657385025499	735	1	264	0.264	0.735	0.528
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTCAATAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.74999999999999	2	35.75	0.0972458393976114	0.0581404786806199	1.67260128578932	0.0391053607169915	0.0371212838141059	0.0441593101764236	NaN	NaN	0.0597709566981028	0.512948465266022	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	67	AAA	AAA	AAG	2	AAAAAGAGA:AATAAAAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.16666666666664	2	36.416666666666664	0.0980414726907267	0.0570345959917882	1.71898250501928	0.0410068766989384	0.0367085411937571	0.0409983778037785	NaN	NaN	0.0578767781516147	0.478622162375445	763	0	237	0.237	0.763	0.474
ORF3a	all	ss12	68	AGA	AAG	ATG	2	AAAAGATGG:AAGAGATGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.41666666666664	2	36.25	0.112755863557943	0.0573071018565008	1.96757225378956	0.0554487617014421	0.0389648695426	0.0425113093211296	NaN	NaN	0.0576372328227909	0.336034407167582	832	1	167	0.167	0.832	0.334
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGATGGCAG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.41666666666664	2	36.583333333333336	0.112755863557943	0.0567646707244322	1.98637395617643	0.0559911928335107	0.039287902817121	0.0400384526965734	NaN	NaN	0.0580683355454803	0.334930957865697	853	0	147	0.147	0.853	0.294
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.74999999999997	2	36.916666666666664	0.113827458253345	0.0562324166616758	2.02423201795134	0.0575950415916689	0.0401759608209606	0.0429513362188391	NaN	NaN	0.0593033934681452	0.331452170807614	846	0	154	0.154	0.846	0.308
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTAGCC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.41666666666663	3	36.916666666666664	0.12997618937868	0.0860130038580103	1.511122545996	0.0439631855206701	0.0426700998375011	0.0528106213222806	NaN	NaN	0.0618384632226652	0.477123938014215	767	0	233	0.233	0.767	0.466
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTAGCCCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.49999999999997	3	36.166666666666664	0.159636110589833	0.0879053734766805	1.81599945801016	0.071730737113152	0.0493426405595612	0.0536452924856186	NaN	NaN	0.0672952655894826	0.286464055538055	865	0	135	0.135	0.865	0.27
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCCCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666663	3	36.166666666666664	0.159249476407496	0.0879053734766805	1.81160115825845	0.0713441029308151	0.0509470934005738	0.0552808391306139	NaN	NaN	0.070547382051484	0.311876016717686	858	0	142	0.142	0.858	0.284
ORF3a	all	ss12	74	TAT	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTTTATAAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.66666666666663	3	35.5	0.156968578879544	0.089658862987337	1.75073131254981	0.0673097158922067	0.0523409947483878	0.056518454506145	NaN	NaN	0.0701402101587923	0.337233812984379	833	0	167	0.167	0.833	0.334
ORF3a	all	ss12	75	AAG	CAA	GGG	2	TATAAGGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.99999999999997	2	35.5	0.156222782397911	0.0585663277285774	2.66745053782299	0.097656454669334	0.0508683443277045	0.0421827912378792	NaN	NaN	0.0609251163452415	0.108958235350934	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	76	GGC	GGG	CTT	2	AAGGGCTTC:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.99999999999997	2	35.833333333333336	0.156222782397911	0.0579999025523778	2.69350077367512	0.0982228798455337	0.0500252744459315	0.0427434912310528	NaN	NaN	0.0611782512457547	0.108379509149799	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	77	GTT	CTT	CCA	2	GGCTTCCAG:GGTGTTCAC	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.91666666666664	2	35.166666666666664	0.154208039717062	0.0591439311842398	2.60733496454077	0.0950641085328218	0.0506489616668439	0.0419047882353998	NaN	NaN	0.0616915898822907	0.12332716777723	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	78	CAC	CCA	CTT	2	GTTCACTTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.0833333333333	2	34.916666666666664	0.169534158879359	0.059584670169267	2.84526470311491	0.109949488710092	0.0612623191039242	0.0431398029422274	NaN	NaN	0.0666068216360792	0.0987949152187415	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	79	TTC	CTT	CAT	2	CACTTTGTT:CAGTTCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.41666666666664	2	33.916666666666664	0.151021335369834	0.0614153696041381	2.45901533025469	0.0896059657656957	0.0534041519882356	0.0450543774613518	NaN	NaN	0.064407271298594	0.164152691296723	925	0	75	0.075	0.925	0.15
ORF3a	all	ss12	80	ATT	CAT	TTG	2	TTCATTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.75	0.5	0.416666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.74999999999997	2	33.916666666666664	0.152421181209951	0.0614153696041381	2.48180841688985	0.0910058116058131	0.0527068470508094	0.0452956698897929	NaN	NaN	0.0641562363067518	0.156043972828783	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	ATTTGCAAT:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.16666666666664	2	33.833333333333336	0.136429382099394	0.0615730216404005	2.21573309973596	0.0748563604589935	0.0515556006687509	0.0440434159379478	NaN	NaN	0.0633448450447353	0.237313748448999	880	0	120	0.12	0.88	0.24
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAATTTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.99999999999997	2	34	0.136741167595466	0.0612585232607003	2.23219823653814	0.0754826443347657	0.0513277907897452	0.0453937081759725	NA	NA	0.0643988299450969	0.241152074189757	887	1	112	0.112	0.887	0.224
ORF3a	all	ss12	83	TTA	CTT	ACT	2	AACTTGCTG:AATTTACTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.99999999999997	2	34	0.136741167595466	0.0612585232607003	2.23219823653814	0.0754826443347657	0.0529079072557852	0.0451300574755706	NaN	NaN	0.06577651270851	0.251149312366491	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	84	CTG	ACT	GCT	2	TTACTGCTG:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.91666666666664	2	33.5	0.135043810631934	0.0622118122355632	2.17071012367546	0.0728319983963708	0.0514966259201059	0.0446737261477541	NaN	NaN	0.0603000934762244	0.227114340675806	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	85	CTG	GCT	GCT	2	CTGCTGCTA:CTGTTGTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.91666666666664	3	33.166666666666664	0.162983364284634	0.0963891381007337	1.69088932110073	0.0665942261839007	0.0564521248849769	0.0564473778830623	NaN	NaN	0.0638442657178798	0.296914510537276	860	0	140	0.14	0.86	0.28
ORF3a	all	ss12	86	CTA	GCT	ATT	2	CTGCTATTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.41666666666664	3	32.666666666666664	0.161879739624373	0.0979651368127982	1.65242192162411	0.0639146028115747	0.0594633173177281	0.0576680940638585	NaN	NaN	0.0667345596989886	0.338192024879669	858	0	142	0.142	0.858	0.284
ORF3a	all	ss12	87	TTT	ATT	TGT	2	CTATTTGTT:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.58333333333331	3	32	0.159362050384892	0.100148544468392	1.59125677992443	0.0592135059165	0.0556558795056726	0.0614551091026559	NaN	NaN	0.0637446253827793	0.352931779014677	846	1	153	0.153	0.846	0.306
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.08333333333331	3	31.5	0.158306944120205	0.101851155869296	1.55429698140448	0.0564557882509082	0.0571743768800101	0.0607604195922359	NaN	NaN	0.0654828973152035	0.388607430699574	815	2	183	0.183	0.815	0.366
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	GTAACAGTT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.58333333333331	3	32	0.159362050384892	0.100148544468392	1.59125677992443	0.0592135059165	0.0575420652272622	0.0614014593886974	NaN	NaN	0.0666170687110414	0.37407624159607	849	0	151	0.151	0.849	0.302
ORF3a	all	ss12	90	ATC	AGT	CTA	2	ACAGTTTAC:ACCATCTAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.58333333333331	3	32.333333333333336	0.159362050384892	0.0990447915097998	1.60898971016688	0.0603172588750922	0.0586835270688184	0.0586653636723946	NaN	NaN	0.0655859036539495	0.357746263621143	837	0	163	0.163	0.837	0.326
ORF3a	all	ss12	91	TAC	CTA	CTC	2	ATCTATTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.74999999999999	3	33	0.146318676888877	0.0969087986100047	1.50985956886862	0.0494098782788726	0.0560548612042598	0.0590908111967049	NaN	NaN	0.0636950319443409	0.437910915369322	788	0	212	0.212	0.788	0.424
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.08333333333331	3	32.666666666666664	0.145670745382058	0.0979651368127982	1.48696516047765	0.0477056085692595	0.0572034983686019	0.0572408296303774	NaN	NaN	0.0628348239492656	0.447719502609165	786	1	213	0.213	0.786	0.426
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCACATCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.74999999999999	3	31.666666666666664	0.146318676888877	0.101277212852957	1.44473443499393	0.0450414640359202	0.0572908348518762	0.0616568299971578	NaN	NaN	0.0623287379998524	0.469898870150221	779	1	220	0.22	0.779	0.44
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TTT	2	CACCTTTTG:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.58333333333331	3	31.166666666666664	0.146644815816844	0.103018812035868	1.42347609061718	0.0436260037809757	0.0573606009086836	0.061059791754828	NaN	NaN	0.0641476988557265	0.496449496682142	768	0	232	0.232	0.768	0.464
ORF3a	all	ss12	95	TTG	TTT	GCT	2	CTTTTGCTC:CTTTTGCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.91666666666664	3	30.5	0.144075823397336	0.105436462965892	1.36647056762463	0.0386393604314436	0.0571655538455463	0.064285987403076	NA	NA	0.0642091915955556	0.547325223231437	723	0	277	0.277	0.723	0.554
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	TTGCTCGTT:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.08333333333331	3	31	0.145670745382058	0.103612753860613	1.40591519821994	0.0420579915214448	0.0591339425586972	0.0610601650978102	NaN	NaN	0.0682029410020326	0.537459339691767	738	0	262	0.262	0.738	0.524
ORF3a	all	ss12	97	GTC	CGT	CGC	2	CTCGTTGCT:CTTGTCGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.08333333333331	3	30.666666666666664	0.143761033640075	0.104821456781369	1.37148478998841	0.0389395768587056	0.054708585949368	0.0641930749486628	NaN	NaN	0.0669218768317818	0.560656822140598	739	0	261	0.261	0.739	0.522
ORF3a	all	ss12	98	GCT	CGC	TGC	2	GTCGCTGCA:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.08333333333331	3	30.666666666666664	0.158306944120205	0.104821456781369	1.51025323422467	0.0534854873388355	0.056693174618094	0.0609451315006291	NaN	NaN	0.0657486715455167	0.415940659513083	807	0	193	0.193	0.807	0.386
ORF3a	all	ss12	99	GCA	TGC	AGG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.5	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.99999999999999	3	30.25	0.156408563919793	0.106372646579413	1.47038330763938	0.0500359173403795	0.0564308396575296	0.0626798473541336	NaN	NaN	0.0678952683544938	0.461148283623905	770	0	230	0.23	0.77	0.46
ORF3a	all	ss12	100	GGC	AGG	CCT	2	GCAGGTATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.49999999999999	3	30.75	0.155392217528976	0.104516640682884	1.48677011156965	0.0508755768460925	0.0570480116626457	0.063309284309027	NaN	NaN	0.0685422033131659	0.457934762211729	790	0	210	0.21	0.79	0.42
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CCT	GGA	2	GGCCTTGAA:GGTATGGAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.33333333333333	3	31.583333333333332	0.155729523583683	0.101563372279023	1.53332367849948	0.0541661513046608	0.0571527382986994	0.0646522602979164	NaN	NaN	0.0652467343994989	0.406440336651428	812	0	188	0.188	0.812	0.376
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAGGCG:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.66666666666666	3	31.25	0.142670052225801	0.102724391304868	1.3888624737856201	0.0399456609209329	0.0581436043324557	0.0604265869124038	NaN	NaN	0.0671343880980479	0.551836501225393	719	1	280	0.28	0.719	0.56
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CCC	2	GAAGCCCCT:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.66666666666666	3	31.25	0.157093573671717	0.102724391304868	1.52927237315518	0.0543691823668485	0.0576453885389007	0.0630694443120393	NaN	NaN	0.0659357932503395	0.409611406641043	795	0	205	0.205	0.795	0.41
ORF3a	all	ss12	104	CAA	CCC	ATT	2	GCCCCTTTT:GCGCAATTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.58333333333333	4	30.916666666666664	0.155224113808277	0.142015736265178	1.09300643640248	0.0132083775430985	0.0575376102714544	0.0776278992453757	NaN	NaN	0.0826221098091051	0.872987477425475	565	2	433	0.433	0.565	0.866
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.58333333333333	3	30.583333333333332	0.155224113808277	0.105128058952294	1.47652411121484	0.0500960548559828	0.0595550223669986	0.0630707154508414	NaN	NaN	0.0704200663500204	0.476843263934033	770	0	230	0.23	0.77	0.46
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.08333333333333	3	31.083333333333332	0.156238247272028	0.103314927985559	1.51225239487044	0.0529233192864695	0.0598376766776613	0.0615640107534821	NaN	NaN	0.0717749660597223	0.460909126177423	787	1	212	0.212	0.787	0.424
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CCT	2	CTCTATCTT:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.66666666666666	3	31.333333333333332	0.142670052225801	0.102431651254313	1.39283171245171	0.0402384009714879	0.0554862106629168	0.0638587971639159	NaN	NaN	0.0679487766795709	0.553725188869662	720	0	280	0.28	0.72	0.56
ORF3a	all	ss12	108	CTC	CCT	CTA	2	TACCTCTAT:TATCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.49999999999999	3	31	0.141140007184765	0.103612753860613	1.36218758720221	0.0375272533241516	0.055017051846661	0.0644378646505924	NaN	NaN	0.0685313361921964	0.583971664103861	715	0	285	0.285	0.715	0.57
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	CTCTATGCC:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.83333333333331	3	31	0.140537165576334	0.103612753860613	1.3563693690199	0.0369244117157208	0.0567453815873007	0.0632150572195624	NaN	NaN	0.0655820131946025	0.573416835293255	737	0	263	0.263	0.737	0.526
ORF3a	all	ss12	110	GCC	TGC	CTT	2	TATGCCTTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.49999999999999	3	31.333333333333332	0.141140007184765	0.102431651254313	1.37789448335991	0.0387083559304515	0.0540856766185444	0.063831245881866	NaN	NaN	0.0676390724061701	0.56713362315462	720	2	278	0.278	0.72	0.556
ORF3a	all	ss12	111	TTA	CTT	AGT	2	GCCTTGATA:GCTTTAGTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.49999999999999	3	31.333333333333332	0.141140007184765	0.102431651254313	1.37789448335991	0.0387083559304515	0.0547863447334148	0.060857953072166	NaN	NaN	0.0714170261106278	0.587815344128559	692	0	308	0.308	0.692	0.616
ORF3a	all	ss12	112	ATA	AGT	ATA	2	TTAGTCTAC:TTGATATAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	86.83333333333333	3	30.666666666666664	0.138759235313158	0.104821456781369	1.32376747637246	0.0339377785317888	0.054371595946887	0.067254960141257	NaN	NaN	0.0669284559375316	0.612101862863303	709	1	290	0.29	0.709	0.58
ORF3a	all	ss12	113	TAC	ATA	CTT	2	ATATATTTT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.33333333333333	3	30.666666666666664	0.124250341416613	0.104821456781369	1.18535217150977	0.019428884635244	0.0532144113983388	0.0664078264884551	NA	NA	0.0679974178381795	0.775085123345511	633	0	367	0.367	0.633	0.734
ORF3a	all	ss12	114	TTC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATTTTCTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.66666666666666	3	30.333333333333332	0.123736695538234	0.106058740537371	1.16668079322169	0.0176779550008629	0.0505909675470348	0.0672084413772641	NaN	NaN	0.0688436425109923	0.797345420102077	607	1	392	0.392	0.607	0.784
ORF3a	all	ss12	115	CTA	CTT	ACA	2	TTCTTGCAG:TTTCTACAA	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.33333333333333	3	29.999999999999996	0.124250341416613	0.107325632730505	1.15769493508234	0.0169247086861081	0.0518268828417965	0.0661001081723437	NaN	NaN	0.0684836347364741	0.804803684107903	627	0	373	0.373	0.627	0.746
ORF3a	all	ss12	116	CAA	ACA	ATG	2	CTACAATGC:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	88.33333333333333	3	29.333333333333332	0.149874354334322	0.109952605643907	1.3630814245522	0.0399217486904154	0.0591985076737492	0.070169477617856	NaN	NaN	0.0763390750599403	0.601006957356865	720	1	279	0.279	0.72	0.558
ORF3a	all	ss12	117	AGT	ATG	CAT	2	CAATGCATC:CAGAGTATA	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.416666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	87.75	3	29.333333333333332	0.165046413582601	0.109952605643907	1.50106868878689	0.0550938079386947	0.0612964437513816	0.0706021114508201	NaN	NaN	0.0768641932572365	0.47351714845072	785	0	215	0.215	0.785	0.43
ORF3a	all	ss12	118	ATA	CAT	AAA	2	AGTATAAAC:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	87.33333333333333	3	29.499999999999996	0.151776366554434	0.109283858386045	1.38882693927482	0.0424925081683888	0.0609493775667957	0.0704340536138789	NaN	NaN	0.0741635363735157	0.566673892529094	726	0	274	0.274	0.726	0.548
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CGC	2	ATAAACTTT:ATCAACGCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	87	3	29.33333333333333	0.152421181209951	0.109952605643907	1.38624437608676	0.0424685755660447	0.0604186200611906	0.0686758492550399	NaN	NaN	0.0776991314764769	0.584669220322343	744	0	256	0.256	0.744	0.512
ORF3a	all	ss12	120	GCA	CGC	ATG	2	AACGCATGT:AACTTTGTA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	86.16666666666667	3	29.666666666666664	0.168446461160547	0.108623210908842	1.5507409489295	0.0598232502517052	0.0636752654493454	0.0686077774198094	NaN	NaN	0.0779999288572774	0.443102059968325	800	0	200	0.2	0.8	0.4
ORF3a	all	ss12	121	GTA	ATG	AAG	2	GCATGTAGA:TTTGTAAGA	1:1	TRUE	1.75	1	0.25	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.83333333333334	2	29.666666666666664	0.154721985556199	0.0706404112947758	2.19027583107576	0.084081574261423	0.0606006776945697	0.0534824486433465	NaN	NaN	0.0698331175818689	0.22857573811775	899	0	101	0.101	0.899	0.202
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.25	2	30.583333333333332	0.127560056151149	0.0684234871721278	1.86427294812168	0.059136568979021	0.0553731001948884	0.0517154850501597	NaN	NaN	0.0643259960343568	0.357925014493448	839	0	161	0.161	0.839	0.322
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGAATTATT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.08333333333334	2	30.583333333333332	0.127832485302701	0.0684234871721278	1.8682544632828	0.0594089981305732	0.053896566000088	0.0514547245067048	NaN	NaN	0.0650846190940768	0.361349695689999	826	0	174	0.174	0.826	0.348
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:ATTATTATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	83.58333333333334	2	30.416666666666668	0.13033787247006	0.0688161477015357	1.89400128928099	0.0615217247685243	0.0570045982108208	0.0530085983564196	NA	NA	0.066036356294346	0.351525627376445	851	1	148	0.148	0.851	0.296
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATTATGAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	83.41666666666667	2	30.25	0.130622339506704	0.0692133441658409	1.88724213633895	0.0614089953408634	0.054670971112476	0.0552218742944735	NaN	NaN	0.0653612547457132	0.347457631769697	825	1	174	0.174	0.825	0.348
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGT:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	82.91666666666667	3	29.916666666666668	0.131483259230803	0.107647107231784	1.22142863484196	0.0238361519990195	0.0544791565629733	0.0713084371807306	NaN	NaN	0.0800520390390671	0.765887710702822	639	0	361	0.361	0.639	0.722
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	TTG	2	AGATGTTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.33333333333334	3	30.25	0.147136768189642	0.106372646579413	1.38321996228416	0.040764121610229	0.0595741957574619	0.0700878896334572	NaN	NaN	0.0828864394633601	0.622855868773872	717	0	283	0.283	0.717	0.566
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.58333333333334	3	30.083333333333332	0.146644815816844	0.107006075844546	1.37043447915877	0.039638739972298	0.0566103584855549	0.0673242031395431	NaN	NaN	0.0835972548376441	0.63538354945493	688	1	311	0.311	0.688	0.622
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.58333333333334	3	31.083333333333332	0.15067539576423	0.103314927985559	1.45840875759302	0.0473604677786719	0.0601967515009218	0.0690096119010071	NaN	NaN	0.0863511384439908	0.583373524795964	729	0	271	0.271	0.729	0.542
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.41666666666667	3	30.75	0.179546761902854	0.104516640682884	1.71787727513766	0.0750301212199705	0.0650123863193678	0.0691488588462898	NaN	NaN	0.0907115587821546	0.408164196631196	802	0	198	0.198	0.802	0.396
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.58333333333333	4	31.083333333333336	0.197626838051651	0.141177857059553	1.39984302190029	0.0564489809920988	0.071406444189124	0.081837894408478	NaN	NaN	0.0957334774688066	0.55542717214125	721	0	279	0.279	0.721	0.558
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.08333333333333	4	31.166666666666668	0.215501453764008	0.140762624951505	1.53095648676807	0.0747388288125025	0.0734111110771972	0.0784247037871584	NaN	NaN	0.102919545464074	0.467724182922902	761	0	239	0.239	0.761	0.478
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCCGT:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.08333333333333	4	32.00000000000001	0.235784099565019	0.136741167595466	1.72430953831373	0.0990429319695526	0.0760516311498743	0.078681362212598	NaN	NaN	0.101109122121162	0.327301011960861	848	0	152	0.152	0.848	0.304
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CAA	ATC	2	TGCAAATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.16666666666666	4	31.83333333333334	0.235492518065836	0.137526919369799	1.71233762193579	0.0979655986960378	0.0776987358520223	0.0821658630041149	NaN	NaN	0.101163612772489	0.332850778056412	821	0	179	0.179	0.821	0.358
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AAATCCAAG:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.49999999999999	3	32.16666666666667	0.203651779146104	0.0995936054863591	2.04482785969625	0.104058173659745	0.0704321701771968	0.0637603579647648	NaN	NaN	0.0936074007856966	0.266290932880603	858	1	141	0.141	0.858	0.282
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.66666666666666	3	32.66666666666667	0.20315621560155	0.0979651368127982	2.07376034180161	0.105191078788752	0.0724487933877448	0.064042722385759	NaN	NaN	0.0912937168303217	0.249227835467506	848	0	152	0.152	0.848	0.304
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.49999999999999	3	32.66666666666667	0.203651779146104	0.0979651368127982	2.0788189122347	0.105686642333306	0.0676929131021479	0.0622278775784107	NaN	NaN	0.0907568521010687	0.244220157824782	880	0	120	0.12	0.88	0.24
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.16666666666666	3	32.333333333333336	0.20465023999998	0.0990447915097998	2.06623929315588	0.10560544849018	0.0708955066544901	0.0617609773363985	NaN	NaN	0.0969727593970622	0.276144274667978	869	0	131	0.131	0.869	0.262
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.16666666666666	3	31.33333333333334	0.201683977327343	0.102431651254313	1.96896149635048	0.0992523260730298	0.0686585002112143	0.0669284339437343	NaN	NaN	0.0934656419679111	0.288275446048307	858	0	142	0.142	0.858	0.284
ORF3a	all	ss12	140	CTT	ACT	TTA	2	TTACTTTAT	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.5	3	30.66666666666667	0.200714352979387	0.104821456781369	1.91482125074856	0.0958928961980183	0.0659197674864553	0.0695258996310555	NaN	NaN	0.0949904521694794	0.312734726356599	860	0	140	0.14	0.86	0.28
ORF3a	all	ss12	141	TAT	TTA	TGA	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.83333333333333	3	30.33333333333334	0.216283656691977	0.106058740537371	2.03928177532682	0.110224916154606	0.0684956994385652	0.0667734499840812	NaN	NaN	0.0970522118768242	0.256070411155633	883	0	117	0.117	0.883	0.234
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.66666666666666	3	30.000000000000004	0.220010857490594	0.107325632730505	2.04993766999764	0.112685224760089	0.0702874429880301	0.0700868278600309	NaN	NaN	0.0997551139708388	0.258637001435167	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.99999999999999	3	30.66666666666667	0.249858334896404	0.104821456781369	2.38365638647386	0.145036878115035	0.0767319374168191	0.069755723048463	NaN	NaN	0.101989582208274	0.155004357078947	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAC:GCCAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.33333333333331	3	30.16666666666667	0.262255311359812	0.106688419438138	2.45814224956137	0.155566891921673	0.0755600056428336	0.0696187711788376	NaN	NaN	0.107256598302652	0.146942013647912	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.66666666666666	3	30.83333333333334	0.301006043193227	0.104213595070396	2.88835677331635	0.19679244812283	0.0891705528873995	0.0660137002082205	NaN	NaN	0.118743438907744	0.0974606296135162	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.83333333333333	3	30.66666666666667	0.300242781455809	0.104821456781369	2.86432559396727	0.19542132467444	0.0843274544097281	0.0653273915310794	NaN	NaN	0.120120614669326	0.10376347229523	948	0	52	0.052	0.948	0.104
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.66666666666666	3	30.16666666666667	0.301006043193227	0.106688419438138	2.82135628944959	0.194317623755089	0.0934128027733984	0.0710335266676149	NaN	NaN	0.109286119448074	0.0753934808430515	963	0	37	0.037	0.963	0.074
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.99999999999999	3	29.83333333333334	0.281300723192845	0.107970516691131	2.60534756907347	0.173330206501714	0.0833147194364108	0.0707362941317831	NaN	NaN	0.115062180547022	0.131963321740066	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAC:TGCTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.49999999999999	3	30.33333333333334	0.283423708706632	0.106058740537371	2.6723276862482	0.177364968169261	0.0862808761796247	0.0666701836233868	NaN	NaN	0.113298807621423	0.117474641032882	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	150	CAC	GCA	CAC	2	TGGCACACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.83333333333331	3	29.66666666666667	0.28200480071778	0.108623210908842	2.59617441206412	0.173381589808938	0.0844831356577981	0.072835128824713	NaN	NaN	0.115615989378948	0.133709412108176	936	0	64	0.064	0.936	0.128
ORF3a	all	ss12	151	ACA	CAC	ACA	2	CACACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.41666666666664	4	29.66666666666667	0.283780696115475	0.148632696437812	1.90927503111141	0.135147999677663	0.0841853105869263	0.0812716573135784	NaN	NaN	0.120460821759875	0.261894357488197	857	0	143	0.143	0.857	0.286
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ACA	TAA	2	ACACATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.58333333333331	4	29.500000000000004	0.283067628950574	0.149561992614941	1.89264414040908	0.133505636335633	0.0821155922601145	0.0835913384910615	NaN	NaN	0.125225429681354	0.286368312439687	883	0	117	0.117	0.883	0.234
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATTGTTAC:CATAACTAT	1:1	TRUE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666664	4	29.250000000000004	0.26683825481505	0.150978005779684	1.76739819443924	0.115860249035366	0.0800113342103141	0.0881000284685634	NaN	NaN	0.121449623040881	0.34009485969196	853	0	147	0.147	0.853	0.294
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.33333333333331	3	29.66666666666667	0.288505753829318	0.108623210908842	2.65602306740348	0.179882542920476	0.0894461355458396	0.0704114459046151	NaN	NaN	0.111592038050367	0.106969393739987	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.83333333333331	3	30.000000000000004	0.286305319885247	0.107325632730505	2.66763225709705	0.178979687154742	0.0850283559848975	0.0688825439223314	NaN	NaN	0.105852800731734	0.0908681998582323	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.33333333333331	3	29.16666666666667	0.302544426379644	0.110629602831442	2.73475108502927	0.191914823548202	0.0886192212682813	0.0689280386899622	NaN	NaN	0.112996436701203	0.08942949552553	961	1	38	0.038	0.961	0.076
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.66666666666664	3	28.83333333333334	0.301006043193227	0.11200896641424	2.68733881607321	0.188997076778987	0.0867814612451235	0.0753064875186852	NaN	NaN	0.112512921315267	0.0929999171139714	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.83333333333331	3	28.83333333333334	0.300242781455809	0.11200896641424	2.68052452466555	0.18823381504157	0.0839746115855998	0.071199644773515	NaN	NaN	0.111357013487452	0.0909584610271051	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAT:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.16666666666666	3	28.16666666666667	0.298727964139002	0.114873729376874	2.60048982268996	0.183854234762128	0.088892325976301	0.0718884742533195	NaN	NaN	0.118696591809704	0.121395463927285	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATATAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.49999999999999	4	28.16666666666667	0.297228554032125	0.157438341821211	1.88790450022435	0.139790212210914	0.0839496582312547	0.0864683915099561	NaN	NaN	0.130177378361434	0.282892552204804	855	0	145	0.145	0.855	0.29
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAATAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	81.99999999999999	4	28.000000000000004	0.313301400524984	0.158481820250405	1.97689173452173	0.154819580274579	0.0898343717668278	0.0853487717957538	NaN	NaN	0.132477619586465	0.242545860656277	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.66666666666664	4	28.33333333333334	0.31975701984729	0.156408563919793	2.04437028148448	0.163348455927497	0.0892281016784501	0.0818109825475053	NaN	NaN	0.130553105049391	0.210860370261557	902	0	98	0.098	0.902	0.196
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.66666666666664	4	28.66666666666667	0.324778826259198	0.154389040653111	2.1036391241586	0.170389785606087	0.0917635445395249	0.0859922901771227	NaN	NaN	0.122989796992374	0.165930884639368	928	0	72	0.072	0.928	0.144
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.83333333333331	4	29.16666666666667	0.323930763923761	0.151456007747705	2.13877791142735	0.172474756176056	0.0889401658560854	0.0808500213145221	NaN	NaN	0.130296059281997	0.185597949265793	906	0	94	0.094	0.906	0.188
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	78.99999999999999	4	29.83333333333334	0.328216664807022	0.147714914296514	2.22196022906786	0.180501750510508	0.0947762017931722	0.0813313275892177	NaN	NaN	0.130984928290034	0.168192635809454	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.33333333333331	4	30.500000000000007	0.312120297918684	0.144154737019872	2.16517545223406	0.167965560898812	0.0884403996769768	0.0781522819030589	NaN	NaN	0.12125091084327	0.165969137795898	925	0	75	0.075	0.925	0.15
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.33333333333331	4	30.500000000000007	0.293010983942946	0.144154737019872	2.03261432818925	0.148856246923073	0.0819828001481273	0.080650500486933	NaN	NaN	0.115519764614241	0.197544776593487	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.66666666666664	4	30.83333333333334	0.296094486163045	0.142438427764417	2.07875424357227	0.153656058398628	0.0878853691363572	0.075403422633648	NaN	NaN	0.119565469311254	0.198750112628968	905	0	95	0.095	0.905	0.19
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT:GTCGTTACT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.83333333333331	4	31.33333333333334	0.295317464132448	0.139939466685309	2.11032292124242	0.155377997447139	0.0807472128655887	0.0752766951495851	NaN	NaN	0.118200157977133	0.188666931158156	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TGA	2	ATTACTTCA:GTTACTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.16666666666664	4	31.08333333333334	0.3129461186614	0.141177857059552	2.21667990419625	0.171768261601848	0.092365863378626	0.078795870287236	NaN	NaN	0.116709661185135	0.1410865073357	920	0	80	0.08	0.92	0.16
ORF3a	all	ss12	171	GAA	TGA	AGG	2	ACTGAAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.16666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.83333333333331	4	30.750000000000007	0.309669148463835	0.142863650574837	2.16758529701451	0.166805497888998	0.0875245774383352	0.0791732177940962	NaN	NaN	0.120623170512796	0.16670642355287	919	0	81	0.081	0.919	0.162
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	GAAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.66666666666664	4	30.58333333333334	0.310481848332055	0.143721781908901	2.16029779347473	0.166760066423154	0.0858116800191883	0.0764665239652698	NaN	NaN	0.123410543077406	0.176611288746476	917	0	83	0.083	0.917	0.166
ORF3a	all	ss12	173	GAC	TGA	CGG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.3333333333333	4	30.58333333333334	0.307256730483381	0.143721781908901	2.13785778608101	0.16353494857448	0.0862337729610339	0.0806872334935728	NaN	NaN	0.124569006740784	0.189248303080491	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	174	GGC	CGG	CAC	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.49999999999997	4	30.750000000000004	0.301773247822437	0.142863650574837	2.11231651024036	0.158909597247601	0.0881120473789575	0.0797228469516895	NaN	NaN	0.118352892022557	0.179376883005246	909	0	91	0.091	0.909	0.182
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.99999999999997	4	30.250000000000004	0.29948343190034	0.145469445655623	2.05873769952572	0.154013986244716	0.0848991599816775	0.0822686172797066	NaN	NaN	0.120931000090171	0.20281616520118	898	0	102	0.102	0.898	0.204
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAC	2	ACAACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.41666666666664	3	30.66666666666667	0.320997633478909	0.104821456781369	3.06232753613059	0.21617617669754	0.0864158288075093	0.0642801556002547	NaN	NaN	0.114290811910595	0.0585633419524688	974	1	25	0.025	0.974	0.05
ORF3a	all	ss12	177	ACA	AAC	ACC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.66666666666664	3	30.000000000000004	0.305669512283459	0.107325632730505	2.84805693203782	0.198343879552954	0.0925056788339971	0.0628958287284255	NaN	NaN	0.107804186239391	0.0657897890270901	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	178	CCA	ACC	AAA	2	ACACCAAAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.66666666666664	3	30.33333333333334	0.287035013343561	0.106058740537371	2.70637772888148	0.18097627280619	0.0798415190718365	0.0620885978145287	NaN	NaN	0.106696884118605	0.0898533017236434	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTC:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.16666666666664	4	29.83333333333334	0.284857139505292	0.147714914296514	1.92842503996236	0.137142225208778	0.0818040077339897	0.0810532201484837	NaN	NaN	0.116413246012327	0.238771192066579	882	0	118	0.118	0.882	0.236
ORF3a	all	ss12	180	CTC	ACT	CAA	2	AAACTCAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.33333333333331	4	30.16666666666667	0.25235417746591	0.145913043990275	1.7294833317488	0.106441133475635	0.0754032024618427	0.0796671962077745	NaN	NaN	0.108877234894504	0.328259706621094	846	0	154	0.154	0.846	0.308
ORF3a	all	ss12	181	AAA	CAA	ACA	2	CTCAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.83333333333331	3	30.333333333333336	0.233185780458787	0.106058740537371	2.19864745967468	0.127127039921416	0.0700811937476594	0.0636107050133922	NaN	NaN	0.102286199171728	0.213920817240996	905	0	95	0.095	0.905	0.19
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.49999999999999	3	30.750000000000004	0.217335531831527	0.104516640682884	2.07943472361449	0.112818891148643	0.0672030346249625	0.0653152454211087	NaN	NaN	0.102135560337006	0.269333158214477	869	1	130	0.13	0.869	0.26
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.16666666666666	3	29.916666666666668	0.198802969548926	0.107647107231784	1.84680271176138	0.091155862317142	0.0643303011451474	0.0627545711631828	NaN	NaN	0.101073866197812	0.367123960338597	831	0	169	0.169	0.831	0.338
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.83333333333333	4	30.583333333333332	0.202663072619289	0.143721781908901	1.41010687404188	0.0589412907103882	0.0639673923326006	0.0765070559391923	NaN	NaN	0.109252725629452	0.589545399777037	721	0	279	0.279	0.721	0.558
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.5	4	29.916666666666668	0.197860943283853	0.147260274111344	1.34361384615004	0.0506006691725088	0.0617171248182844	0.0801347890427481	NaN	NaN	0.111913920142238	0.651168712781637	694	0	306	0.306	0.694	0.612
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.16666666666666	4	29.25	0.196003572834134	0.150978005779684	1.29822600200558	0.0450255670544508	0.0676034187467381	0.078162905193671	NaN	NaN	0.106680445626005	0.672981099032597	681	0	319	0.319	0.681	0.638
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.66666666666666	4	29.583333333333332	0.213698279309918	0.149095891727942	1.43329421644868	0.0646023875819759	0.0706565608175992	0.0754904514882278	NaN	NaN	0.110245299507478	0.55788379219097906	736	0	264	0.264	0.736	0.528
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.16666666666666	4	30.083333333333332	0.21524198382966	0.146359364647636	1.4706403266225	0.0688826191820243	0.066897573434021	0.0785468186956481	NaN	NaN	0.109101734796567	0.527804277712761	749	0	251	0.251	0.749	0.502
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.16666666666666	4	30.583333333333332	0.221648134682889	0.143721781908901	1.54220280140544	0.0779263527739883	0.0686937823533008	0.0754577941556558	NaN	NaN	0.11062128811528	0.481157156529434	753	1	246	0.246	0.753	0.492
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.83333333333331	4	30.583333333333332	0.23666322859543	0.143721781908901	1.6466761367142	0.0929414466865291	0.070675966440879	0.0773598645828087	NaN	NaN	0.112845209940619	0.410156138523208	782	0	218	0.218	0.782	0.436
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.49999999999999	4	30.916666666666668	0.220553902912914	0.142015736265178	1.55302439513524	0.0785381666477355	0.0681261186115162	0.0775500900211547	NaN	NaN	0.113959700363033	0.490713201604706	752	0	248	0.248	0.752	0.496
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGGATAGG	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.99999999999999	4	30.916666666666668	0.222199362107379	0.142015736265178	1.56461085194445	0.0801836258422008	0.0711444613193964	0.0786009535983258	NaN	NaN	0.107927086925908	0.457516459399665	791	0	209	0.209	0.791	0.418
ORF3a	all	ss12	193	AGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:GATAGGCAC	1:1	FALSE	2.83333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.16666666666666	6	31.41666666666667	0.190803499198466	0.220417888585699	0.865644346848381	-0.0296143893872323	0.0629772393068161	0.111866419802234	NaN	NaN	0.131253410267043	0.821491087821345	442	0	558	0.558	0.442	0.884
ORF3a	all	ss12	194	CAC	GCA	ATC	2	AGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333333	6	32.083333333333336	0.193179203235308	0.215112484631514	0.898038082569788	-0.0219332813962062	0.0629779330977063	0.109609239345877	NaN	NaN	0.139416217700751	0.874990838488998	441	0	559	0.559	0.441	0.882
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.16666666666666	6	31.583333333333336	0.160415060140258	0.219066980579392	0.732264897776881	-0.0586519204391334	0.0495371500671065	0.11423937453109	NaN	NaN	0.139957735097046	0.675165850062081	364	0	636	0.636	0.364	0.728
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666666	6	31.750000000000004	0.159249476407496	0.217732646143538	0.731399168788461	-0.0584831697360422	0.0520780445261554	0.110928466195473	NaN	NaN	0.127134253732395	0.645508242830803	338	0	662	0.662	0.338	0.676
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333333	6	31.91666666666667	0.158864717514625	0.216414580065769	0.734075853236624	-0.0575498625511439	0.0506535812643544	0.11646964742509	NaN	NaN	0.130522104209925	0.659270601446005	322	0	678	0.678	0.322	0.644
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32.5	0.158673037027526	0.211925228838758	0.748721791628931	-0.0532521918112318	0.0519048989170158	0.111361651778649	NaN	NaN	0.133826755494746	0.690689987236147	337	0	663	0.663	0.337	0.674
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32	0.158673037027526	0.215761554338836	0.735409222990409	-0.0570885173113096	0.0509578621796026	0.113818003842547	NaN	NaN	0.12931653501475	0.658877551994117	358	0	642	0.642	0.358	0.716
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.75	6	32	0.15905686340681	0.215761554338836	0.737188160764845	-0.0567046909320252	0.0501537653154176	0.109206046740086	NaN	NaN	0.123946659147196	0.647316952848028	346	0	654	0.654	0.346	0.692
ORF3a	all	ss12	201	GTC	TGT	CGT	2	TATGTCGTT:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333334	5	32.333333333333336	0.158864717514625	0.173179167487274	0.91734311822638	-0.0143144499726495	0.0508508747258037	0.0962539773163305	NaN	NaN	0.121829143138866	0.906466929265991	468	0	532	0.532	0.468	0.936
ORF3a	all	ss12	202	GTA	CGT	ATT	2	GTCGTTGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.33333333333334	5	32.833333333333336	0.160024633856936	0.17021844254226	0.940113371188945	-0.0101938086853242	0.0529675642440595	0.0972805990828819	NaN	NaN	0.117106076558493	0.930633637141245	468	0	532	0.532	0.468	0.936
ORF3a	all	ss12	203	GTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.08333333333334	5	33.083333333333336	0.160610991304224	0.168775880107432	0.951622893046025	-0.00816488880320848	0.0499144569864666	0.102454787383342	NaN	NaN	0.118395959549781	0.945019419030589	498	0	502	0.502	0.498	0.996
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	GTACATGGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.83333333333334	5	33.166666666666664	0.145028544735405	0.168300466878196	0.861723959686733	-0.023271922142791	0.0502402701545233	0.096117809224023	NaN	NaN	0.11526169892172	0.839990933306295	418	0	582	0.582	0.418	0.836
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:CATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	32.833333333333336	0.146091244169313	0.17021844254226	0.858257436664322	-0.0241271983729469	0.0494233895128313	0.0981771434638818	NaN	NaN	0.108011521515045	0.8232427610401	437	0	563	0.563	0.437	0.874
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.83333333333334	5	33	0.131083275220683	0.169253998250676	0.774476683419554	-0.0381707230299936	0.0480059916558439	0.0969786917051626	NaN	NaN	0.118563622610387	0.747495910678528	371	1	628	0.628	0.371	0.742
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	6	32.83333333333333	0.130765040358583	0.209443067094397	0.624346473591541	-0.0786780267358138	0.0475134894778817	0.115692078262	NaN	NaN	0.126575190846372	0.534210698699294	263	0	737	0.737	0.263	0.526
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CGA	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.66666666666667	6	32.166666666666664	0.133355157329571	0.214467334863233	0.621797055549798	-0.0811121775336623	0.0476981604921917	0.119417734224866	NaN	NaN	0.134457054096644	0.546337642533274	270	0	730	0.73	0.27	0.54
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73	6	32.83333333333333	0.13468918273131	0.209443067094397	0.643082555082164	-0.0747538843630872	0.0508363198740332	0.118874609241261	NaN	NaN	0.129919708878348	0.565030776471982	300	0	700	0.7	0.3	0.6
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.33333333333334	6	32.166666666666664	0.134018841557532	0.214467334863233	0.624891625771338	-0.0804484933057014	0.0498383241533978	0.119413745394851	NaN	NaN	0.140762094100685	0.567646526871588	279	0	721	0.721	0.279	0.558
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.00000000000001	6	32.166666666666664	0.116739982283845	0.214467334863233	0.544325234228749	-0.0977273525793884	0.0473301943036882	0.116165107312384	NaN	NaN	0.136365634576351	0.473585918227388	212	0	788	0.788	0.212	0.424
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.33333333333336	6	32.5	0.132047365954149	0.211925228838758	0.623084692076074	-0.0798778628846088	0.0496153882633785	0.117718168126751	NaN	NaN	0.127804328521895	0.53197024897762	265	0	735	0.735	0.265	0.53
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.00000000000003	6	32.83333333333333	0.132698031119309	0.209443067094397	0.633575667890219	-0.0767450359750885	0.0491889675328012	0.11259948838116	NaN	NaN	0.128912683433518	0.55162576732128	260	1	739	0.739	0.26	0.52
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.33333333333336	6	32.166666666666664	0.132047365954149	0.214467334863233	0.615699197448209	-0.0824199689090843	0.0486641055354141	0.122088814591717	NaN	NaN	0.127273502440311	0.517255649240393	278	0	722	0.722	0.278	0.556
ORF3a	all	ss12	215	GAG	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.16666666666669	6	31.499999999999996	0.130448350815189	0.219740343511106	0.593647705882449	-0.0892919926959165	0.0477689685185012	0.12189404016242	NaN	NaN	0.130242170891244	0.492975259802496	254	0	746	0.746	0.254	0.508
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.83333333333336	6	30.499999999999996	0.117025173722032	0.228158530802244	0.512911672908095	-0.111133357080212	0.0452896204102321	0.129397466761004	NaN	NaN	0.141058736820743	0.43078349139927	193	0	807	0.807	0.193	0.386
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.50000000000003	6	29.499999999999996	0.117599765999126	0.237252996159118	0.495672416799559	-0.119653230159991	0.0483786931904182	0.134420257849685	NaN	NaN	0.15077004439662	0.427420132763756	182	0	818	0.818	0.182	0.364
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AAT	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.1666666666667	6	29.83333333333333	0.11818004032857	0.234141361979703	0.504737989603115	-0.115961321651132	0.0467033716458553	0.135184760206271	NaN	NaN	0.143136277165893	0.417856111403297	166	0	834	0.834	0.166	0.332
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTACT:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.1666666666667	6	29.166666666666664	0.11818004032857	0.240449165598692	0.491496986626321	-0.122269125270122	0.0460530334636519	0.128425680444722	NaN	NaN	0.151755107296148	0.420415715279877	186	0	814	0.814	0.186	0.372
ORF3a	all	ss12	220	ACT	GAG	TAC	2	ATTACTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	6	29.08333333333333	0.0870541284395655	0.24126182510618	0.360828441885709	-0.154207696666615	0.0340426618703068	0.132591641794957	NaN	NaN	0.133845235193582	0.249265858659537	108	0	892	0.892	0.108	0.216
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	ACTACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	6	28.749999999999993	0.0870541284395655	0.244568640424989	0.355949676492827	-0.157514511985424	0.0344671594323085	0.143074289707982	NaN	NaN	0.167743778546149	0.347721244011434	96	0	904	0.904	0.096	0.192
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	6	28.749999999999993	0.0870541284395655	0.244568640424989	0.355949676492827	-0.157514511985424	0.0354943041986491	0.133589159751929	NaN	NaN	0.15191615559919	0.299805014202467	101	0	899	0.899	0.101	0.202
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333337	6	28.41666666666666	0.0892139571460239	0.247968200054092	0.359779831149972	-0.158754242908068	0.0364834439497965	0.140545656350362	NaN	NaN	0.151356776036641	0.294235943681163	96	0	904	0.904	0.096	0.192
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	70.6666666666667	6	29.08333333333333	0.0901082338815474	0.24126182510618	0.373487325820778	-0.151153591224633	0.0375149785347303	0.137084258036542	NaN	NaN	0.14431765346237	0.294930206761614	105	0	895	0.895	0.105	0.21
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TGA	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	69.6666666666667	6	30.08333333333333	0.0914838201648646	0.231861099259994	0.39456303992711	-0.140377279095129	0.0366856045742	0.126461582889256	NaN	NaN	0.145160023205048	0.333518079393452	99	0	901	0.901	0.099	0.198
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.25000000000003	6	29.83333333333333	0.0747816950380488	0.234141361979703	0.319386948148578	-0.159359666941654	0.03172046704842	0.121138544040074	NaN	NaN	0.137737169679551	0.24727899995569	81	0	919	0.919	0.081	0.162
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAC	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AACAAGCTT:AATAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAC:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAC	AGA	CCC	2	AAAGACCCA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCA	CCC	A--	1	GACCCA---:GAGCCTGAA	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCA---CCG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	CCG	-CC	ACA	1	---CCGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	2	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AAT	ACA	TGT	2	CCGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGC	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GCT	TGC	TAA	2	GTTGCTAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	TAA	TCC	2	GCTAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.16666666666669	1	30.999999999999993	0.025698445480572	0.032972342565837	0.77939398540637606	-0.00727389708526503	0.0186015860910733	0.033325388058745	NA	NA	0.041301636546645	0.860202467626305	429	41	530	0.53	0.429	0.858
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000001	1	30.999999999999993	0.0259205062991005	0.032972342565837	0.786128745549216	-0.00705183626673655	0.0190745772059965	0.034781055579742	NA	NA	0.0409120668405926	0.863150050848885	422	48	530	0.53	0.422	0.844
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666669	1	31.499999999999993	0.0262035385209603	0.0324374878453625	0.807816519142268	-0.00623394932440213	0.0185851317445278	0.0353964726532547	NA	NA	0.0395179731085408	0.874654017441677	434	55	511	0.511	0.434	0.868
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.50000000000001	1	30.999999999999993	0.0262608883838265	0.032972342565837	0.796452006143952	-0.00671145418201052	0.0199406214430349	0.0322946033834832	NA	NA	0.0403076244094525	0.867758900919517	452	39	509	0.509	0.452	0.904
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000001	1	30.499999999999993	0.026434454296256	0.0335251341884302	0.788496599228491	-0.00709067989217416	0.0188223637023235	0.0353718796388686	NA	NA	0.0405225283550866	0.861094420371209	441	41	518	0.518	0.441	0.882
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGAATTTTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.50000000000001	1	30.499999999999993	0.0262608883838265	0.0335251341884302	0.783319411526453	-0.00726424580460368	0.0193300024492214	0.0341560883418629	NA	NA	0.0412022121494964	0.860052622125388	440	50	510	0.51	0.44	0.88
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.00000000000001	1	31.16666666666666	0.0267885619515594	0.0327921082603737	0.816921002420909	-0.00600354630881426	0.0187111719696856	0.0354346676620079	NA	NA	0.041477736527719	0.884915038381732	443	46	511	0.511	0.443	0.886
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACTCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.33333333333334	1	30.833333333333325	0.0266694765273651	0.0331545693783718	0.804398218025501	-0.00648509285100666	0.0196604873752548	0.0374264753677536	NA	NA	0.0401015365666903	0.87152886079996	456	46	498	0.498	0.456	0.912
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACTCTTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666667	1	31.499999999999993	0.0269087157486764	0.0324374878453625	0.829556095002083	-0.00552877209668605	0.0192468110738389	0.0351506309181048	NA	NA	0.0416656620182837	0.89443560192901	433	50	517	0.517	0.433	0.866
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGAACT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333334	1	31.166666666666657	0.0133041182530362	0.0327921082603738	0.405710976171453	-0.0194879900073375	0.0134945523447418	0.0356005567837639	NA	NA	0.0402666400083323	0.628404617844979	287	123	590	0.59	0.287	0.574
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	TGT	2	GGAACTGTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666667	1	31.499999999999993	0.0132453773639628	0.0324374878453625	0.408335486000234	-0.0191921104813997	0.0135407887287032	0.0359497888663789	NA	NA	0.0375037254035151	0.608833845113623	275	114	611	0.611	0.275	0.55
ORF3a	all	ss12	13	GTA	TGT	AAC	2	ACTGTAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.5	1	31.499999999999993	0.0131871529184001	0.0324374878453625	0.406540512054032	-0.0192503349269624	0.0133851585295754	0.0344822114247166	NA	NA	0.0365268535777566	0.598180601846554	269	134	597	0.597	0.269	0.538
ORF3a	all	ss12	14	ACT	AAC	TTT	2	GTAACTTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77	1	31.333333333333325	0.0131007697802931	0.0326138339548042	0.401693643208217	-0.019513064174511	0.0135501186095355	0.0348399345422284	NA	NA	0.0391030497448995	0.617767811456017	263	127	610	0.61	0.263	0.526
ORF3a	all	ss12	15	TTG	TTT	GAA	2	ACTTTGAAA:ACTTTGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77	1	31.333333333333325	0.0131007697802931	0.0326138339548042	0.401693643208217	-0.019513064174511	0.0137779873918891	0.0350732695587873	NA	NA	0.0402263207254771	0.627618178697952	277	130	593	0.593	0.277	0.554
ORF3a	all	ss12	16	AAA	GAA	ACA	2	TTGAAACAA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.33333333333334	1	31.833333333333325	0.0132162010123647	0.0320904564039067	0.411842101776892	-0.0188742553915421	0.0135001257366893	0.0347840934611102	NA	NA	0.0384319155421245	0.623349433970655	273	134	593	0.593	0.273	0.546
ORF3a	all	ss12	17	CAA	ACA	AGG	2	AAACAAGGT:AAGCAAGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666667	1	31.833333333333325	0.0132453773639628	0.0320904564039067	0.412751292697422	-0.018845079039944	0.0136551766914335	0.0340402722853745	NA	NA	0.0372247083497429	0.612679830373331	282	136	582	0.582	0.282	0.564
ORF3a	all	ss12	18	GGT	AGG	TGA	2	CAAGGTGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.00000000000001	1	30.83333333333333	0.0131007697802931	0.0331545693783718	0.395142208930011	-0.0200537995980786	0.0129156184915019	0.036360470619508	NA	NA	0.038452563682758	0.602004240209522	276	137	587	0.587	0.276	0.552
ORF3a	all	ss12	19	GAA	TGA	AAT	2	GGTGAAATC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.25000000000001	1	30.83333333333333	0.0130580012294226	0.0331545693783718	0.393852234375299	-0.0200965681489492	0.0138695262845086	0.034739983539182	NA	NA	0.0382188850447369	0.59900756796279	246	151	603	0.603	0.246	0.492
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	GAAATCAAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.08333333333336	1	31.33333333333333	0.012752698321938	0.0326138339548042	0.391021133535253	-0.0198611356328661	0.0130087633613529	0.0346779836268771	NA	NA	0.0401348890001207	0.620699221036705	255	134	611	0.611	0.255	0.51
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	GGA	2	ATCAAGGAT	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333336	1	31.999999999999993	0.0258925390301244	0.0319197108140969	0.811177118142602	-0.00602717178397254	0.0183646734701979	0.0336692078738386	NA	NA	0.0400861416706108	0.880484149710086	452	49	499	0.499	0.452	0.904
ORF3a	all	ss12	22	GAT	GGA	TGC	2	AAGGATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666669	1	32.666666666666664	0.0262896575662818	0.0312545223004261	0.841147316653226	-0.00496486473414428	0.0178286789507247	0.0328179698917021	NA	NA	0.0383505395820938	0.896993593874062	466	44	490	0.49	0.466	0.932
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	GATGCTACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666669	1	31.999999999999993	0.0262896575662818	0.0319197108140969	0.823618287753136	-0.00563005324781515	0.0194028247451148	0.0341290041751214	NA	NA	0.0402294547264657	0.888700653308593	440	47	513	0.513	0.44	0.88
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666669	1	32.49999999999999	0.0264636052740321	0.0314182062818701	0.84230159534292	-0.00495460100783797	0.0187511129219442	0.0324788108950972	NA	NA	0.0386468633742411	0.897989202757865	476	42	482	0.482	0.476	0.952
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TTC	2	ACTCCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666669	1	32.49999999999999	0.0264636052740321	0.0314182062818701	0.84230159534292	-0.00495460100783797	0.018994713756487	0.031603197443103	NA	NA	0.0402036223654977	0.901918891405405	470	36	494	0.494	0.47	0.94
ORF3a	all	ss12	26	TCA	TTC	AGA	2	CCTTCAGAT	2	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	31.83333333333333	0.0260047718198447	0.0320904564039067	0.810358428454101	-0.00608568458406204	0.0190597442467132	0.0346054359980731	NA	NA	0.0401572921306802	0.879544877970924	428	57	515	0.515	0.428	0.856
ORF3a	all	ss12	27	GAT	AGA	TTC	2	TCAGATTCT:TCAGATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	31.83333333333333	0.0260047718198447	0.0320904564039067	0.810358428454101	-0.00608568458406204	0.0192507796030168	0.0336841164458878	NA	NA	0.0424668508702991	0.886049818192096	443	27	530	0.53	0.443	0.886
ORF3a	all	ss12	28	TCT	TTC	TGT	2	GATTCTGTT:GATTTTGTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666669	1	31.999999999999993	0.0262896575662818	0.0319197108140969	0.823618287753136	-0.00563005324781515	0.0188222095997398	0.0351671200322338	NA	NA	0.0413188869428548	0.891616859414385	408	44	548	0.548	0.408	0.816
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCG	2	TCTGTTCGC:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333336	0	32.666666666666664	0.0264053674769446	0	-Inf	0.0264053674769446	0.0192286863940737	0	NA	NA	0.0203882523398391	0.195276567836279	865	135	0	0	0.865	0.001
ORF3a	all	ss12	30	CGC	TCG	CGC	2	GTTCGCGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25000000000001	0	33.166666666666664	0.0263473854682498	0	-Inf	0.0263473854682498	0.0190983881086517	0	NA	NA	0.0192942208737971	0.172077609822676	869	131	0	0	0.869	0.001
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CGCGCTACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75000000000001	0	32.666666666666664	0.0261749574292545	0	-Inf	0.0261749574292545	0.0187550899316036	0	NA	NA	0.0187711728582008	0.163189870344046	887	113	0	0	0.887	0.001
ORF3a	all	ss12	32	ACT	TAC	TGC	2	GCTACTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.41666666666669	0	31.999999999999993	0.0256161505491714	0	-Inf	0.0256161505491714	0.0184665092071187	0	NA	NA	0.0184616178024979	0.165278526306793	862	138	0	0	0.862	0.001
ORF3a	all	ss12	33	GCA	TGC	AAC	2	ACTGCAACG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.75000000000001	0	31.33333333333333	0.025185997239258	0	-Inf	0.025185997239258	0.017351060107471	0	NA	NA	0.017707480672467	0.15492856873409	863	137	0	0	0.863	0.001
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.58333333333336	0	31.83333333333333	0.0252389746234555	0	-Inf	0.0252389746234555	0.0185092867379469	0	NA	NA	0.0174931072693865	0.149078116604282	874	126	0	0	0.874	0.001
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.58333333333334	0	32.49999999999999	0.0255615794834085	0	-Inf	0.0255615794834085	0.0175493138308567	0	NA	NA	0.0181892631244357	0.159928689155055	861	139	0	0	0.861	0.001
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333334	0	33.166666666666664	0.0258925390301244	0	-Inf	0.0258925390301244	0.0176667040971924	0	NA	NA	0.0177412597941898	0.144440402553492	884	116	0	0	0.884	0.001
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333334	0	33.166666666666664	0.0258925390301244	0	-Inf	0.0258925390301244	0.0192552217342923	0	NA	NA	0.0186389129561225	0.164782361551491	873	127	0	0	0.873	0.001
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	0	33.83333333333333	0.0260047718198447	0	-Inf	0.0260047718198447	0.018883619926687	0	NA	NA	0.0181016994820244	0.150833720018296	860	140	0	0	0.86	0.001
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CAC	2	CAAGCCACA:CAAGCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333334	0	33.33333333333333	0.0260612539038721	0	-Inf	0.0260612539038721	0.0187562768763146	0	NA	NA	0.018525764711292102	0.159499381728212	871	129	0	0	0.871	0.001
ORF3a	all	ss12	40	ACA	CAC	ACT	2	GCCACACTC:GCCTCACTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333334	0	33.33333333333333	0.0260612539038721	0	-Inf	0.0260612539038721	0.017565741566783	0	NA	NA	0.0181473590124222	0.150976527863034	886	114	0	0	0.886	0.001
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	ACACTCCCT:TCACTCCCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.41666666666669	0	32.99999999999999	0.0128620515547158	0	-Inf	0.0128620515547158	0.0132687737085558	0	NA	NA	0.0125301936405003	0.30466319081441	622	378	0	0	0.622	0.001
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.08333333333336	0	32.33333333333333	0.012752698321938	0	-Inf	0.012752698321938	0.013188186548973	0	NA	NA	0.0127732916740811	0.318091356730967	653	347	0	0	0.653	0.001
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.08333333333336	0	32.33333333333333	0.012752698321938	0	-Inf	0.012752698321938	0.0129029911111087	0	NA	NA	0.0121408301994698	0.29353537064646	600	400	0	0	0.6	0.001
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.75000000000003	0	32.66666666666666	0.0128071415099282	0	-Inf	0.0128071415099282	0.0127999195490057	0	NA	NA	0.0130421456949716	0.326109124128408	632	368	0	0	0.632	0.001
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.75000000000003	0	32.66666666666666	0.0128071415099282	0	-Inf	0.0128071415099282	0.0132637981383872	0	NA	NA	0.0130377593705235	0.325946390130138	651	349	0	0	0.651	0.001
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.58333333333336	0	33.16666666666666	0.0130014090011593	0	-Inf	0.0130014090011593	0.0138573752679135	0	NA	NA	0.0136755140374746	0.341753056630895	644	356	0	0	0.644	0.001
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.58333333333336	0	33.16666666666666	0.0130014090011593	0	-Inf	0.0130014090011593	0.0132212988215978	0	NA	NA	0.0133348993783951	0.329564645406827	642	358	0	0	0.642	0.001
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000003	0	32.91666666666666	0.0130155110198637	0	-Inf	0.0130155110198637	0.0127932592788055	0	NA	NA	0.0134909310319437	0.334665020324052	638	362	0	0	0.638	0.001
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000003	0	32.91666666666666	0.0130155110198637	0	-Inf	0.0130155110198637	0.0142676260184762	0	NA	NA	0.0130318445326551	0.317917437862133	656	344	0	0	0.656	0.001
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.00000000000003	0	33.41666666666666	0.0131007697802931	0	-Inf	0.0131007697802931	0.0134770113401228	0	NA	NA	0.0132830972915114	0.323998812094879	618	382	0	0	0.618	0.001
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.00000000000003	0	32.41666666666666	0.0129313548258795	0	-Inf	0.0129313548258795	0.0130227418856862	0	NA	NA	0.0130344208999524	0.321152269731749	652	348	0	0	0.652	0.001
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000003	0	32.91666666666666	0.0130155110198637	0	-Inf	0.0130155110198637	0.0130732842537852	0	NA	NA	0.0132630459198942	0.326426830516481	620	380	0	0	0.62	0.001
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.1666666666667	0	31.91666666666666	0.0130722263514627	0	-Inf	0.0130722263514627	0.0135801722467879	0	NA	NA	0.0124716135500884	0.294565638963297	633	367	0	0	0.633	0.001
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333337	0	31.249999999999993	0.0129592857062641	0	-Inf	0.0129592857062641	0.0129343732973614	0	NA	NA	0.0125692914631527	0.302527903418487	640	360	0	0	0.64	0.001
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333337	0	31.749999999999993	0.0130438070339019	0	-Inf	0.0130438070339019	0.0131536373835946	0	NA	NA	0.0135214316745439	0.334706882231009	642	358	0	0	0.642	0.001
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.00000000000003	0	31.749999999999993	0.0129313548258795	0	-Inf	0.0129313548258795	0.0130756208183263	0	NA	NA	0.0126499557242574	0.306664926006706	651	349	0	0	0.651	0.001
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAG	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.6666666666667	0	32.41666666666666	0.0131582322381821	0	-Inf	0.0131582322381821	0.0135371717963663	0	NA	NA	0.0128059498191393	0.30418071943138	627	373	0	0	0.627	0.001
ORF3a	all	ss12	58	AGC	AAG	CGC	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000003	0	32.08333333333333	0.0130155110198637	0	-Inf	0.0130155110198637	0.0132893603597341	0	NA	NA	0.0131728269989085	0.323124469597505	634	366	0	0	0.634	0.001
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.1666666666667	0	32.74999999999999	0.0132453773639628	0	-Inf	0.0132453773639628	0.0138617604638965	0	NA	NA	0.0131913822776566	0.315333688361437	635	365	0	0	0.635	0.001
ORF3a	all	ss12	60	TCC	TTC	CAA	2	GCTTCCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.83333333333337	0	32.08333333333333	0.0131294381352109	0	-Inf	0.0131294381352109	0.0125710758054123	0	NA	NA	0.0132653881320602	0.322295583678375	640	360	0	0	0.64	0.001
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	TCCAAAATA:TCCAAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.6666666666667	0	32.24999999999999	0.0131582322381821	0	-Inf	0.0131582322381821	0.0129037230644526	0	NA	NA	0.0131045594593887	0.315332471874924	648	352	0	0	0.648	0.001
ORF3a	all	ss12	62	ATA	AAT	AAT	2	AAAATAATA:AAAATCATA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.6666666666667	0	32.916666666666664	0.013333684515963	0	-Inf	0.013333684515963	0.0137222030569811	0	NA	NA	0.0131959427264434	0.312285397542267	656	344	0	0	0.656	0.001
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATAATAACA:ATCATAACC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333337	0	32.916666666666664	0.0133932130500048	0	-Inf	0.0133932130500048	0.0142716675271411	0	NA	NA	0.0132567244614917	0.312353592609296	627	373	0	0	0.627	0.001
ORF3a	all	ss12	64	ACA	AAC	ACT	2	ATAACACTC:ATAACCCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.6666666666667	0	33.24999999999999	0.0135138791270087	0	-Inf	0.0135138791270087	0.0136129627543123	0	NA	NA	0.0131369372540778	0.303623826796766	649	351	0	0	0.649	0.001
ORF3a	all	ss12	65	CTC	ACT	CAA	2	ACACTCAAA:ACCCTCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000003	0	33.58333333333333	0.0134532755150005	0	-Inf	0.0134532755150005	0.014022755988565	0	NA	NA	0.0138749884611849	0.33224279694607	607	393	0	0	0.607	0.001
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333337	0	33.58333333333333	0.0133932130500048	0	-Inf	0.0133932130500048	0.0131359638904676	0	NA	NA	0.0137090255656883	0.328587387004242	639	361	0	0	0.639	0.001
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	GAG	2	AAAAAGAGA:AAAAAGAGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.6666666666667	0	34.25	0.0135138791270087	0	-Inf	0.0135138791270087	0.0139959296567533	0	NA	NA	0.013577852956941	0.319596032891066	619	381	0	0	0.619	0.001
ORF3a	all	ss12	68	AGA	GAG	ATG	2	AAGAGATGG:AAGAGGTGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333336	0	34.25	0.0134835092215562	0	-Inf	0.0134835092215562	0.0136586966669616	0	NA	NA	0.0136455800099939	0.323092492989864	634	366	0	0	0.634	0.001
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGGTGGCAT	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.41666666666669	0	34.916666666666664	0.013559691378237	0	-Inf	0.013559691378237	0.0132838888723499	0	NA	NA	0.0137019096082882	0.322359619709587	638	362	0	0	0.638	0.001
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCATTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.25000000000001	0	34.75	0.0135904058348962	0	-Inf	0.0135904058348962	0.0141668813794062	0	NA	NA	0.0138005752355673	0.324736584134534	613	387	0	0	0.613	0.001
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CATTTAGCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.25000000000001	0	34.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:TTAGCCCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.75000000000001	0	34.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCCCTCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.91666666666667	0	34.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	74	TCC	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTCTCTAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.91666666666667	0	33.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	75	AAG	CAA	GGG	2	TCCAAGGGT:TCTAAGGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.91666666666667	0	32.916666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	76	GGT	GGG	TGT	2	AAGGGTGTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.25000000000001	0	32.916666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	77	GTT	TGT	TCA	2	GGTGTTCAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.25000000000001	0	32.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	78	CAC	TCA	CTT	2	GTTCACTTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.75000000000001	0	32.74999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	79	TTT	CTT	TGT	2	CACTTTGTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.08333333333334	0	31.749999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	80	GTT	TGT	TTG	2	TTTGTTTGC	2	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.58333333333334	0	31.749999999999996	0.0128345378007018	0	-Inf	0.0128345378007018	0.0135727435645208	0	NA	NA	0.0134682863987996	0.340617877383161	611	389	0	0	0.611	0.001
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	GTTTGCAAC	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.91666666666667	0	31.916666666666664	0.0127798619317583	0	-Inf	0.0127798619317583	0.0124908445322112	0	NA	NA	0.0124133656188405	0.303233352491881	631	369	0	0	0.631	0.001
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.25	0	32.58333333333333	0.0128896835290581	0	-Inf	0.0128896835290581	0.0128421906731944	0	NA	NA	0.0135318224218189	0.340820140726062	614	386	0	0	0.614	0.001
ORF3a	all	ss12	83	TTG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.25	0	32.58333333333333	0.0128896835290581	0	-Inf	0.0128896835290581	0.0135902130469728	0	NA	NA	0.0132886779037322	0.33205902195328	640	360	0	0	0.64	0.001
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GCT	2	TTGCTGCTG:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.41666666666667	0	31.58333333333333	0.012698716061835	0	-Inf	0.012698716061835	0.0127399450092683	0	NA	NA	0.0131541430927723	0.334355679782662	651	349	0	0	0.651	0.001
ORF3a	all	ss12	85	CTG	GCT	GCT	2	CTGCTGCTG:CTGTTGTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.75	0	31.58333333333333	0.012645188900681	0	-Inf	0.012645188900681	0.0135942968727818	0	NA	NA	0.012640542081945	0.317132637733859	660	340	0	0	0.66	0.001
ORF3a	all	ss12	86	CTG	GCT	GTT	2	CTGCTGTTT:TTGTTGTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.41666666666667	0	30.916666666666664	0.0125394770467935	0	-Inf	0.0125394770467935	0.0127369084965456	0	NA	NA	0.0132353275555698	0.343422378667057	639	361	0	0	0.639	0.001
ORF3a	all	ss12	87	TTT	GTT	TGT	2	CTGTTTGTA:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.58333333333334	0	30.249999999999996	0.0123586730492886	0	-Inf	0.0123586730492886	0.0125285289401745	0	NA	NA	0.0122968645497299	0.31488415588324	650	350	0	0	0.65	0.001
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.25	0	29.58333333333333	0.0122576783566175	0	-Inf	0.0122576783566175	0.0125818736677926	0	NA	NA	0.01300814062097	0.346034840356103	628	372	0	0	0.628	0.001
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	GTAACAGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75	0	30.08333333333333	0.0123332686697829	0	-Inf	0.0123332686697829	0.0130505907325092	0	NA	NA	0.0123392116048923	0.317543644736836	609	391	0	0	0.609	0.001
ORF3a	all	ss12	90	GTT	AGT	TTA	2	ACAGTTTAC:ACAGTTTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.41666666666667	0	30.749999999999996	0.0123841823043677	0	-Inf	0.0123841823043677	0.0122620955065976	0	NA	NA	0.0125795682608017	0.324885461837424	635	365	0	0	0.635	0.001
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	GTTTACTCA:GTTTATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.75	0	31.416666666666664	0.0124872811774231	0	-Inf	0.0124872811774231	0.0125521211548919	0	NA	NA	0.0125979294832021	0.32157965803703	623	377	0	0	0.623	0.001
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.75	0	31.416666666666664	0.0124872811774231	0	-Inf	0.0124872811774231	0.0131733654389103	0	NA	NA	0.0127083583867057	0.32580247597713	622	378	0	0	0.622	0.001
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCACATCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.41666666666666	0	30.416666666666664	0.0125394770467935	0	-Inf	0.0125394770467935	0.0128999838622666	0	NA	NA	0.0132067579813603	0.342379446356276	668	332	0	0	0.668	0.001
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TTT	2	CACCTTTTG:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.25	0	29.916666666666664	0.0125657389590355	0	-Inf	0.0125657389590355	0.0125153525787239	0	NA	NA	0.0134076268913037	0.348651430652009	650	350	0	0	0.65	0.001
ORF3a	all	ss12	95	TTG	TTT	GCT	2	CTTTTGCTC:CTTTTGCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.58333333333333	0	29.249999999999996	0.0123586730492886	0	-Inf	0.0123586730492886	0.0130265065098899	0	NA	NA	0.0126965171712628	0.33035910792856	669	331	0	0	0.669	0.001
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	TTGCTCGTT:TTGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.75	0	29.749999999999996	0.0124872811774231	0	-Inf	0.0124872811774231	0.012588782788681	0	NA	NA	0.0126918137747705	0.325172215433624	639	361	0	0	0.639	0.001
ORF3a	all	ss12	97	GTT	CGT	TGC	2	CTCGTTGCT:CTTGTTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75	0	29.416666666666664	0.0123332686697829	0	-Inf	0.0123332686697829	0.0129600926102112	0	NA	NA	0.0125800581258636	0.326897351285979	647	353	0	0	0.647	0.001
ORF3a	all	ss12	98	GCT	TGC	TGC	2	GTTGCTGCT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333333	0	29.666666666666664	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.0116734997255239	0	NA	NA	0.0127929764749727	0.332522480992998	642	358	0	0	0.642	0.001
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.66666666666666	0	29.83333333333333	0.012345957790554	0	-Inf	0.012345957790554	0.012607946306468	0	NA	NA	0.0122848768970159	0.31491031362519	595	405	0	0	0.595	0.001
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CCT	2	GCTGGCCTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.66666666666666	0	29.83333333333333	0.0121953906538352	0	-Inf	0.0121953906538352	0.0122382638472198	0	NA	NA	0.0122740429616024	0.320421550056415	624	376	0	0	0.624	0.001
ORF3a	all	ss12	101	CTT	CCT	TGA	2	GGCCTTGAA	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333333	0	30.83333333333333	0.0122451699655716	0	-Inf	0.0122451699655716	0.012881153287533	0	NA	NA	0.0125128242594355	0.327772913194272	639	361	0	0	0.639	0.001
ORF3a	all	ss12	102	GAA	TGA	AGC	2	CTTGAAGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333333	0	30.83333333333333	0.0122451699655716	0	-Inf	0.0122451699655716	0.0121195773115021	0	NA	NA	0.0126840948911136	0.334346682064253	638	362	0	0	0.638	0.001
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CCC	2	GAAGCCCCA:GAAGCCCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333333	0	30.83333333333333	0.0122451699655716	0	-Inf	0.0122451699655716	0.012583069242003	0	NA	NA	0.0119466913749355	0.305370640356942	629	371	0	0	0.629	0.001
ORF3a	all	ss12	104	CCA	CCC	ATT	2	GCCCCATTT:GCCCCTTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.83333333333333	0	30.83333333333333	0.0121706524663175	0	-Inf	0.0121706524663175	0.0123961102411323	0	NA	NA	0.0128403486960648	0.343208678949069	621	379	0	0	0.621	0.001
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CCATTTCTT:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.5	0	30.16666666666666	0.012072695281631	0	-Inf	0.012072695281631	0.0125321232770464	0	NA	NA	0.0121652952390101	0.321008199448462	620	380	0	0	0.62	0.001
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	83	0	30.66666666666666	0.0121460144399855	0	-Inf	0.0121460144399855	0.0122789904229396	0	NA	NA	0.0127226878998382	0.339742777261238	625	375	0	0	0.625	0.001
ORF3a	all	ss12	107	TAT	CTA	TCT	2	CTCTATCTT:CTTTATCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	83	0	30.66666666666666	0.0121460144399855	0	-Inf	0.0121460144399855	0.0118235619322361	0	NA	NA	0.012956552680536	0.348531333164034	626	374	0	0	0.626	0.001
ORF3a	all	ss12	108	CTT	TCT	TTA	2	TATCTTTAT	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.83333333333334	0	30.33333333333333	0.0120243056482867	0	-Inf	0.0120243056482867	0.0125575569007817	0	NA	NA	0.0120117679650792	0.316805641467131	637	363	0	0	0.637	0.001
ORF3a	all	ss12	109	TAT	TTA	TGC	2	CTTTATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.16666666666667	0	30.33333333333333	0.0119763023840483	0	-Inf	0.0119763023840483	0.0121258717007253	0	NA	NA	0.0121446619545563	0.324065813402345	641	359	0	0	0.641	0.001
ORF3a	all	ss12	110	GCT	TGC	TTT	2	TATGCTTTA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.5	0	30.999999999999996	0.012072695281631	0	-Inf	0.012072695281631	0.0121542423412792	0	NA	NA	0.0120977478521809	0.318313713656026	631	369	0	0	0.631	0.001
ORF3a	all	ss12	111	TTA	TTT	AGT	2	GCTTTAGTC:GCTTTAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.5	0	30.999999999999996	0.012072695281631	0	-Inf	0.012072695281631	0.0116053441244054	0	NA	NA	0.0119620694471156	0.31285568701454203	627	373	0	0	0.627	0.001
ORF3a	all	ss12	112	GTC	AGT	CTA	2	TTAGTCTAC:TTAGTTTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.83333333333334	0	30.33333333333333	0.0120243056482867	0	-Inf	0.0120243056482867	0.0121099547881351	0	NA	NA	0.0124851057127883	0.33550134739469	637	363	0	0	0.637	0.001
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	GTCTACTTC:GTTTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.83333333333333	0	29.999999999999996	0.0121706524663175	0	-Inf	0.0121706524663175	0.0126912652551289	0	NA	NA	0.012403461094019	0.326479160852397	598	402	0	0	0.598	0.001
ORF3a	all	ss12	114	TTC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATTTCTTG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	83	0	29.83333333333333	0.0121460144399855	0	-Inf	0.0121460144399855	0.0119887811667606	0	NA	NA	0.0125032346711465	0.331334307542785	628	372	0	0	0.628	0.001
ORF3a	all	ss12	115	TTG	CTT	GCA	2	TTCTTGCAA:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.66666666666667	0	29.499999999999993	0.0121953906538352	0	-Inf	0.0121953906538352	0.0121502565895756	0	NA	NA	0.012114549951471	0.314091928868514	643	357	0	0	0.643	0.001
ORF3a	all	ss12	116	CAA	GCA	AAG	2	TTGCAAAGT:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.00000000000001	0	28.83333333333333	0.0121460144399855	0	-Inf	0.0121460144399855	0.0119091168145778	0	NA	NA	0.0126691458946799	0.337705751108652	619	381	0	0	0.619	0.001
ORF3a	all	ss12	117	AGT	AAG	TAT	2	CAAAGTATA:CAGAGTATA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.50000000000001	0	28.83333333333333	0.0122202296145754	0	-Inf	0.0122202296145754	0.0124206634981196	0	NA	NA	0.0119538235744273	0.306645433597167	611	389	0	0	0.611	0.001
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	AGTATAAAC	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.16666666666669	0	28.83333333333333	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.0120437611499437	0	NA	NA	0.0122509836038539	0.316551526012124	639	361	0	0	0.639	0.001
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.16666666666669	0	28.33333333333333	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.0124544672240113	0	NA	NA	0.0126406962017992	0.331702084622139	636	364	0	0	0.636	0.001
ORF3a	all	ss12	120	TTT	CTT	TGT	2	AACTTTGTA:AACTTTGTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333336	0	28.33333333333333	0.0123206056064609	0	-Inf	0.0123206056064609	0.0122094449288477	0	NA	NA	0.0124508290689101	0.322398529810902	623	377	0	0	0.623	0.001
ORF3a	all	ss12	121	GTA	TGT	AAG	2	TTTGTAAGA:TTTGTGAGA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666669	0	28.33333333333333	0.0124226442537559	0	-Inf	0.0124226442537559	0.012891153842072	0	NA	NA	0.012487599378255	0.319834310082065	630	370	0	0	0.63	0.001
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:GTGAGAATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.66666666666669	0	28.83333333333333	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0133385128663317	0	NA	NA	0.0130708358079424	0.338895609098904	637	363	0	0	0.637	0.001
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.16666666666669	0	29.16666666666666	0.0125789112103712	0	-Inf	0.0125789112103712	0.0130933825986898	0	NA	NA	0.0128839130964297	0.328902482985932	665	335	0	0	0.665	0.001
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333336	0	28.83333333333333	0.0127934871784325	0	-Inf	0.0127934871784325	0.0134482500825026	0	NA	NA	0.0127767291655671	0.316676184442757	636	364	0	0	0.636	0.001
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333336	0	28.499999999999996	0.0127934871784325	0	-Inf	0.0127934871784325	0.0128920379165476	0	NA	NA	0.0132769205694156	0.33525230481517	623	377	0	0	0.623	0.001
ORF3a	all	ss12	126	AGG	GAG	GCT	2	ATGAGGCTT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333336	0	28.499999999999996	0.0129592857062641	0	-Inf	0.0129592857062641	0.0136823074528264	0	NA	NA	0.0128602270373784	0.313597201032134	622	378	0	0	0.622	0.001
ORF3a	all	ss12	127	CTT	GCT	TTG	2	AGGCTTTGG	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000003	0	28.499999999999996	0.0130155110198637	0	-Inf	0.0130155110198637	0.0134628721024902	0	NA	NA	0.0130411444863232	0.318262670346672	600	400	0	0	0.6	0.001
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTT:CTTTGGTTG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333336	1	27.83333333333333	0.0127934871784325	0.0368172076473927	0.347486623672245	-0.0240237204689603	0.0128147891591296	0.0395615012892656	NA	NA	0.0426151192028095	0.572933116473844	256	134	610	0.61	0.256	0.512
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	GTG	2	TGGCTTTGC:TGGTTGTGC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.83333333333336	1	28.83333333333333	0.0131294381352109	0.0355095904478987	0.369743440281999	-0.0223801523126878	0.0136345140417249	0.0388132516948351	NA	NA	0.0400887804444968	0.576663623355336	248	122	630	0.63	0.248	0.496
ORF3a	all	ss12	130	TGC	GTG	CTG	2	CTTTGCTGG:TTGTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.33333333333336	1	28.499999999999996	0	0.0359350167719231	0	-0.0359350167719231	0	0.0412878391725574	NA	NA	0.0389901128983621	0.356714123511928	0	345	655	0.655	0	0.001
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.83333333333336	1	28.499999999999996	0.0131294381352109	0.0359350167719231	0.36536613349988	-0.0228055786367122	0.0134460251161903	0.037496096258141	NA	NA	0.0421998896450692	0.588908818778595	240	156	604	0.604	0.24	0.48
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666669	1	27.83333333333333	0.0130722263514627	0.0368172076473927	0.355057517578699	-0.02374498129593	0.0137426987208782	0.0424906880776988	NA	NA	0.0428936925608969	0.579868056670112	264	122	614	0.614	0.264	0.528
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CCG	2	AAATGCCGT	2	FALSE	2.5	0.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333336	1	28.499999999999996	0.0133041182530361	0.0359350167719231	0.370227133535971	-0.022630898518887	0.0133162743131747	0.0407071848993671	NA	NA	0.0422102590760729	0.591857045579912	246	126	628	0.628	0.246	0.492
ORF3a	all	ss12	134	CGT	CCG	TTC	2	TGCCGTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.00000000000001	1	28.499999999999996	0.0136367393123929	0.0359350167719231	0.37948331564569	-0.0222982774595303	0.0142686337185797	0.0398657696563315	NA	NA	0.0420024848138882	0.595501965633868	270	118	612	0.612	0.27	0.54
ORF3a	all	ss12	135	TCC	TTC	CAA	2	CGTTCCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.00000000000001	1	28.499999999999996	0.0136367393123929	0.0359350167719231	0.37948331564569	-0.0222982774595303	0.013311172483746	0.0391363803143612	NA	NA	0.0423828719913328	0.598808098042131	237	133	630	0.63	0.237	0.474
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAAAAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.00000000000001	1	29.166666666666664	0.0136367393123929	0.0350941211300692	0.388576173822706	-0.0214573818176763	0.0138383226266457	0.0387958235078249	NA	NA	0.0434127930383483	0.621119728442614	249	130	621	0.621	0.249	0.498
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAAAATCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.83333333333334	1	29.166666666666664	0.0136678042173386	0.0350941211300692	0.389461362109103	-0.0214263169127306	0.0142994835363661	0.0376823832689698	NA	NA	0.0405121393647864	0.596884301948103	261	152	587	0.587	0.261	0.522
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA:AATCCTTTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.50000000000001	1	28.83333333333333	0.0137303605832671	0.0355095904478987	0.386666261426273	-0.0217792298646316	0.0144379153741717	0.0393230295604631	NA	NA	0.0417518338454408	0.601924288949111	271	137	592	0.592	0.271	0.542
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTT:CCTTTACTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.50000000000001	1	27.83333333333333	0.0135443861537981	0.0368172076473927	0.367881950296611	-0.0232728214935946	0.0138787042122975	0.040779890697699	NA	NA	0.0427195860174782	0.585904104240615	261	136	603	0.603	0.261	0.522
ORF3a	all	ss12	140	CTT	ACT	TTA	2	TTACTTTAT	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333336	1	27.166666666666664	0.0134835092215562	0.0377438129156368	0.357237602138765	-0.0242603036940806	0.0134447249389454	0.0420421421769373	NA	NA	0.0436368393123973	0.578238724372225	266	143	591	0.591	0.266	0.532
ORF3a	all	ss12	141	TAT	TTA	TGA	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666669	2	26.83333333333333	0.0270909813104956	0.0785029669229164	0.34509499923865	-0.0514119856124208	0.018867272782536	0.0602596501207958	NA	NA	0.0568168623260976	0.365533223089998	135	53	812	0.812	0.135	0.27
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC:TATGATGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.00000000000001	2	26.499999999999996	0.0275260251378209	0.0795446789702432	0.346044832843164	-0.0520186538324222	0.0199823252205578	0.0579136615708771	NA	NA	0.0553330967246509	0.347166179830121	119	45	836	0.836	0.119	0.238
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC:GATGCTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666669	2	26.83333333333333	0.0269087157486763	0.0785029669229164	0.342773232699581	-0.0515942511742401	0.019195757642448	0.0617458906067581	NA	NA	0.0557741013436126	0.354935994671962	124	37	839	0.839	0.124	0.248
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAT:GCTAACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666669	2	26.33333333333333	0.0263763446044989	0.0800759815692795	0.329391461554284	-0.0536996369647806	0.0187225853140924	0.0609257571291634	NA	NA	0.0537693236226576	0.317938116948171	112	43	845	0.845	0.112	0.224
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTC:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.50000000000003	2	26.999999999999996	0.0266103300115572	0.0779922851430357	0.34119182381635	-0.0513819551314786	0.0188828930554291	0.0608231481490713	NA	NA	0.0546722223367861	0.347310769575812	135	45	820	0.82	0.135	0.27
ORF3a	all	ss12	146	TTC	CTT	CCT	2	TACTTCCTG:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333336	2	26.666666666666664	0.0264928206228062	0.0790203867433697	0.33526564111671	-0.0525275661205635	0.0193954594543255	0.058968285170367	NA	NA	0.0563108718895784	0.350916043877657	127	44	829	0.829	0.127	0.254
ORF3a	all	ss12	147	CTG	CCT	GTG	2	TTCCTGTGT:TTTCTTTGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333336	2	25.999999999999996	0.0264928206228062	0.0811601884801745	0.326426307268591	-0.0546673678573684	0.0193735358632449	0.0621103204441703	NA	NA	0.0573045069818854	0.340093640013036	154	47	799	0.799	0.154	0.308
ORF3a	all	ss12	148	TGC	GTG	CTG	2	CTGTGTTGG:CTTTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0	0.666666666666667	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666669	2	25.33333333333333	0.0262035385209603	0.0834192263326683	0.314118695089104	-0.057215687811707903	0.018022012165999	0.066107280999357	NA	NA	0.0606886966675048	0.34579682942491	115	56	829	0.829	0.115	0.23
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT:TGTTGGCAT	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.50000000000003	2	25.499999999999996	0.0262608883838265	0.082842746673233	0.316996833620337	-0.0565818582894064	0.0186289526922073	0.0613949057845496	NA	NA	0.0608853604016885	0.35272433564486	130	42	828	0.828	0.13	0.26
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.33333333333336	2	25.33333333333333	0.0263184898584525	0.0834192263326683	0.315496690816777	-0.0571007364742157	0.0186259112304105	0.0657238910629427	NA	NA	0.0594264539377229	0.336620585689941	106	52	842	0.842	0.106	0.212
ORF3a	all	ss12	151	ACT	TAC	TAA	2	CATACTAAT	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666669	2	25.33333333333333	0.0263763446044989	0.0834192263326683	0.316190232924392	-0.0570428817281694	0.0201511827491301	0.0688726178606287	NA	NA	0.0599846673876535	0.341625845942691	142	58	800	0.8	0.142	0.284
ORF3a	all	ss12	152	AAT	TAA	TTG	2	ACTAATTGT	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666669	2	24.83333333333333	0.0262035385209603	0.0851978832927791	0.307560910062905	-0.0589943447718187	0.018597581202784	0.0725957282525728	NA	NA	0.0641892562490863	0.358059570500416	125	44	831	0.831	0.125	0.25
ORF3a	all	ss12	153	TGT	TTG	TTA	2	AATTGTTAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000003	2	25.33333333333333	0.0259205062991005	0.0834192263326683	0.310725805532311	-0.0574987200335678	0.0191289608383919	0.0660047690518901	NA	NA	0.0573502121442741	0.316058968098449	110	44	846	0.846	0.11	0.22
ORF3a	all	ss12	154	TAC	TTA	CGA	2	TGTTACGAC	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666669	2	25.999999999999996	0.0262035385209603	0.0811601884801745	0.322861972250856	-0.0549566499592142	0.0194980873380477	0.064009547268032	NA	NA	0.0575165968966496	0.339328933625414	123	46	831	0.831	0.123	0.246
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.00000000000001	2	26.666666666666664	0.0260895870640617	0.0790203867433697	0.330162735710108	-0.0529307996793081	0.0185687704939977	0.0597715633770483	NA	NA	0.0561373430128396	0.345742088158881	140	49	811	0.811	0.14	0.28
ORF3a	all	ss12	156	TAT	CTA	TTG	2	GACTATTGT	2	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666667	2	25.999999999999996	0.025864632053377	0.0811601884801745	0.318686199942661	-0.0552955564267975	0.0181904046148668	0.0630254611753788	NA	NA	0.0601025095406848	0.35756191140964	98	46	856	0.856	0.098	0.196
ORF3a	all	ss12	157	TGT	TTG	TAT	2	TATTGTATA:TATTGTATT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	79	2	25.666666666666664	0.0257536031856687	0.0822741879423184	0.313021663656216	-0.0565205847566497	0.018236037883812	0.066830534684843207	NA	NA	0.0570707369227166	0.32199810595538	109	51	840	0.84	0.109	0.218
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCT:TGTATTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.5	2	26.33333333333333	0.0259205062991005	0.0800759815692795	0.323698889368903	-0.0541554752701791	0.0190402581573005	0.0642249065488335	NA	NA	0.0602699601007717	0.368893262318597	109	44	847	0.847	0.109	0.218
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCTTAC:ATTCCATAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333334	2	25.666666666666664	0.0258089981982962	0.0822741879423184	0.313694961248242	-0.0564651897440222	0.0187709732520943	0.0657969607329816	NA	NA	0.0596772220463945	0.344058530364791	127	40	833	0.833	0.127	0.254
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATACAAT:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333334	2	25.666666666666664	0.0258089981982962	0.0822741879423184	0.313694961248242	-0.0564651897440222	0.0183270746796244	0.0655562366007502	NA	NA	0.0582707394244823	0.332537969035357	145	40	815	0.815	0.145	0.29
ORF3a	all	ss12	161	AAT	CAA	TAG	2	TACAATAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.66666666666667	2	25.499999999999996	0.0255343810572878	0.082842746673233	0.30822711803613	-0.0573083656159451	0.0188824047595574	0.0666039636405038	NA	NA	0.0564532312429995	0.310035445616645	108	40	852	0.852	0.108	0.216
ORF3a	all	ss12	162	AGT	TAG	TGT	2	AATAGTGTA	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.33333333333333	2	25.83333333333333	0.0256435235612095	0.0817133878414162	0.313822792551163	-0.0560698642802067	0.0178463442493992	0.0623783339674966	NA	NA	0.0548849924642389	0.306975813655308	118	46	836	0.836	0.118	0.236
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	80	2	26.499999999999996	0.025426163756761	0.0795446789702432	0.319646318093416	-0.0541185152134822	0.0190247911946492	0.0646799963614933	NA	NA	0.0554860598346526	0.32938500749690103	116	55	829	0.829	0.116	0.232
ORF3a	all	ss12	164	ACT	AAC	TTC	2	GTAACTTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.16666666666666	2	26.999999999999996	0.0253723983888037	0.0779922851430357	0.325319335653153	-0.0526198867542321	0.0179944567785355	0.0618743295345345	NA	NA	0.0551607476460278	0.340115453940886	120	52	828	0.828	0.12	0.24
ORF3a	all	ss12	165	TCT	TTC	TTC	2	ACTTCTTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.16666666666666	2	27.666666666666664	0.025698445480572	0.0760143706952156	0.338073514856968	-0.0503159252146436	0.0173145968289148	0.0590858226536988	NA	NA	0.0527149066514941	0.339834958879503	117	50	833	0.833	0.117	0.234
ORF3a	all	ss12	166	TCA	TTC	AAT	2	TCTTCAATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.49999999999999	2	28.333333333333332	0.0259205062991005	0.0741343759774745	0.34964219982072	-0.048213869678374	0.0188196807851228	0.0606820821974094	NA	NA	0.0527064526372436	0.360316491730626	124	54	822	0.822	0.124	0.248
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	TCAATTGTC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.49999999999999	2	28.333333333333332	0.0259205062991005	0.0741343759774745	0.34964219982072	-0.048213869678374	0.0178306437761355	0.0583920787606237	NA	NA	0.0533866730591436	0.366469193403715	142	41	817	0.817	0.142	0.284
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666666	2	28.333333333333332	0.026032982222434	0.0741343759774745	0.351159389678333	-0.0481013937550405	0.0187295026417505	0.0558400671097604	NA	NA	0.0539754938484787	0.372837450347361	122	48	830	0.83	0.122	0.244
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACC:GTCATTACT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.33333333333333	2	28.833333333333332	0.0263184898584525	0.0727843418621031	0.361595491353284	-0.0464658520036506	0.0190809221746083	0.0565672007205457	NA	NA	0.0502939428240216	0.355545855698395	123	39	838	0.838	0.123	0.246
ORF3a	all	ss12	170	ACC	TAC	CTC	2	ATTACCTCC:ATTACTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77	2	28.999999999999996	0.0264344542962561	0.0723451996406717	0.365393342302631	-0.0459107453444155	0.0186985333113956	0.0540291879725249	NA	NA	0.0496007889039992	0.354651219254851	132	48	820	0.82	0.132	0.264
ORF3a	all	ss12	171	TCA	CTC	AGG	2	ACCTCCGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333333	2	28.333333333333332	0.0259766224970673	0.0741343759774745	0.350399152276674	-0.0481577534804072	0.0182218656255886	0.0552171301629698	NA	NA	0.0502330641862203	0.337716771701694	118	61	821	0.821	0.118	0.236
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	TCAGGTGAT:TCCGGTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666666	2	27.999999999999996	0.025864632053377	0.0750625939177369	0.344574184069934	-0.0491979618643599	0.0187380611387543	0.0568910515685898	NA	NA	0.0526093657141826	0.349707931230738	117	39	844	0.844	0.117	0.234
ORF3a	all	ss12	173	GAT	TGA	TGG	2	GGTGATGGC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.66666666666666	2	27.666666666666664	0.0255343810572878	0.0760143706952156	0.335915180560654	-0.0504799896379278	0.0193011441302441	0.0603539192345817	NA	NA	0.0535480564002196	0.345832110142697	130	46	824	0.824	0.13	0.26
ORF3a	all	ss12	174	GGC	TGG	CAC	2	GATGGCACA	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.66666666666666	2	27.999999999999996	0.0252124580992387	0.0750625939177369	0.335885782562613	-0.0498501358184982	0.0178354716069615	0.0563373933362326	NA	NA	0.054199296543347	0.357700207701619	124	55	821	0.821	0.124	0.248
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.66666666666666	2	27.999999999999996	0.0252124580992387	0.0750625939177369	0.335885782562613	-0.0498501358184982	0.017893626763104	0.0574607734052746	NA	NA	0.0539044172645657	0.355076410170502	124	48	828	0.828	0.124	0.248
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAA	2	ACAACAAAT:ACAACAAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.49999999999999	2	28.166666666666664	0.0252655469877565	0.0745955951479785	0.338700253515454	-0.049330048160222	0.0185170127377043	0.0598683872150055	NA	NA	0.0530593647121056	0.352519047632531	113	51	836	0.836	0.113	0.226
ORF3a	all	ss12	177	AAT	AAA	TCC	2	ACAAATCCC:ACAAGTCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.49999999999999	2	27.833333333333332	0.0255888359187695	0.0755354817013731	0.338765773943617	-0.0499466457826035	0.0188571753938268	0.0592565982425102	NA	NA	0.0528075994708428	0.344238837329292	117	48	835	0.835	0.117	0.234
ORF3a	all	ss12	178	CCC	TCC	CAT	2	AATCCCATT:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333333	1	28.499999999999996	0.0258089981982962	0.0359350167719231	0.718213055585977	-0.0101260185736269	0.0184924231514434	0.0378760664158253	NA	NA	0.0293154635967682	0.72978194773294	336	121	543	0.543	0.336	0.672
ORF3a	all	ss12	179	ATT	CAT	TAC	2	CCCATTACA:CCTATTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.33333333333333	1	27.999999999999996	0.0256435235612095	0.036592623127074	0.70078396599659	-0.0109490995658646	0.018092967232003	0.0393846993721706	NA	NA	0.0311807539876999	0.725476352743082	325	116	559	0.559	0.325	0.65
ORF3a	all	ss12	180	ACA	TAC	AGA	2	ATTACAGAA:ATTTCTGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	0.666666666666667	0.5	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.99999999999999	1	27.999999999999996	0.0257536031856687	0.036592623127074	0.703792212332933	-0.0108390199414054	0.0194973569392618	0.0391964088079464	NA	NA	0.0285156529197822	0.703865452123106	309	123	568	0.568	0.309	0.618
ORF3a	all	ss12	181	GAA	AGA	ACA	2	ACAGAACAT:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.66666666666666	1	27.999999999999996	0.0126585283405138	0.036592623127074	0.34593115384363	-0.0239340947865602	0.0125452580854725	0.0388434066744957	NA	NA	0.0254803825439873	0.347569255869813	0	379	621	0.621	0	0.001
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	TGA	2	GAACATGAC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79	1	28.666666666666664	0.012766265677073	0.0357210367419409	0.357387882364674	-0.022954771064868	0.0124084240000606	0.0362896965046282	NA	NA	0.0243039409470954	0.344920531064209	0	376	624	0.624	0	0.001
ORF3a	all	ss12	183	GAC	TGA	CTA	2	CATGACTAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80	1	27.999999999999996	0.012605338737286	0.036592623127074	0.344477593025015	-0.0239872843897881	0.0130333951672742	0.0393201077390522	NA	NA	0.0282089982190663	0.395135200262756	0	370	630	0.63	0	0.001
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.33333333333333	1	28.999999999999996	0.0125525942666429	0.0353006331434894	0.355591193382264	-0.0227480388768465	0.0124161136841494	0.0383364988262887	NA	NA	0.0249580651607459	0.362058099841705	0	376	624	0.624	0	0.001
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81	1	28.333333333333332	0.0124484185567784	0.0361515763634083	0.344339578214861	-0.0237031578066299	0.0130071675284155	0.0363361289543059	NA	NA	0.0254160725279954	0.351023920630195	0	353	647	0.647	0	0.001
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80	1	27.333333333333332	0.012605338737286	0.0375078154309961	0.336072324992541	-0.0249024766937101	0.0130504807643799	0.0388819525151129	NA	NA	0.0269348417737465	0.355202567789177	0	374	626	0.626	0	0.001
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80	1	27.333333333333332	0.012605338737286	0.0375078154309961	0.336072324992541	-0.0249024766937101	0.0125107389842571	0.0414062439362392	NA	NA	0.0270053503277332	0.356460133065165	0	365	635	0.635	0	0.001
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.25	1	28.083333333333332	0.0127256499425275	0.0364813554167594	0.348826127679494	-0.0237557054742319	0.013225490575369	0.0385737483079838	NA	NA	0.0257250496113659	0.355774600077993	0	368	632	0.632	0	0.001
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.91666666666667	1	28.416666666666664	0.0127798619317583	0.0360429712153345	0.354572930611258	-0.0232631092835761	0.0125279086375822	0.0374237520973309	NA	NA	0.0252303174071749	0.356512933245447	0	356	644	0.644	0	0.001
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTTTGAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.91666666666667	1	28.083333333333332	0.0129453051997499	0.0364813554167594	0.354847155536412	-0.0235360502170094	0.0124818383449489	0.0397228795384653	NA	NA	0.0246831858739356	0.34032381953345	0	377	623	0.623	0	0.001
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TTTGAGAAA	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.58333333333333	0	28.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGAAATGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.08333333333333	0	29.916666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GGA	2	AAATGGGAA	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.08333333333333	0	29.916666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	194	GAA	GGA	ATC	2	TGGGAATCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.75	0	30.916666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	195	TCT	ATC	TGG	2	GAATCTGGA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.58333333333333	0	30.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	196	GGA	TGG	AGT	2	TCTGGAGTA	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.91666666666667	0	30.749999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.91666666666667	0	31.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.91666666666667	0	31.749999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTG	2	AAAGACTGT	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.91666666666667	0	31.249999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	200	TGT	CTG	TGT	2	GACTGTGTT	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.75000000000001	0	31.249999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	201	GTT	TGT	TGT	2	TGTGTTGTA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.58333333333334	0	31.583333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	202	GTA	TGT	ATT	2	GTTGTATTA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.08333333333334	0	32.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	203	TTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.58333333333334	0	32.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	TTACACAGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.58333333333334	0	32.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	205	AGC	CAG	CTA	2	CACAGCTAC:CACAGTTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.58333333333334	0	32.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGCTACTTC:AGTTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.91666666666669	0	32.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.08333333333336	0	32.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	208	ACT	CAC	TTC	2	TTCACTTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.08333333333336	0	31.083333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	209	TCA	TTC	AGA	2	ACTTCAGAC:ACTTCAGAT	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.41666666666669	0	31.749999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	TCAGACTAT:TCAGATTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.08333333333336	1	31.083333333333325	0	0.0328819783981324	0	-0.0328819783981324	0	0.0362896964286082	NA	NA	0.0351100847248616	0.348995526038335	0	350	650	0.65	0	0.001
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GATTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.41666666666669	1	31.083333333333325	0	0.0328819783981324	0	-0.0328819783981324	0	0.0347453857855783	NA	NA	0.0355213650354052	0.354604091549175	0	384	616	0.616	0	0.001
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.75000000000003	1	31.41666666666666	0	0.0325254218363474	0	-0.0325254218363474	0	0.0320852651627097	NA	NA	0.0348321825196337	0.350419958998361	0	378	622	0.622	0	0.001
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.4166666666667	1	31.749999999999993	0	0.0321765161581571	0	-0.0321765161581571	0	0.0362841606045363	NA	NA	0.0339675018369443	0.34349940357765	0	325	675	0.675	0	0.001
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC	2	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.75000000000003	1	31.083333333333325	0	0.0328819783981324	0	-0.0328819783981324	0	0.035891054017234	NA	NA	0.0339951546763409	0.333416646035049	0	358	642	0.642	0	0.001
ORF3a	all	ss12	215	TAC	GTA	CTC	2	CTGTACTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.75000000000003	1	30.416666666666657	0	0.0336190735350483	0	-0.0336190735350483	0	0.0357563191596369	NA	NA	0.0377742560289874	0.373466089783628	0	351	649	0.649	0	0.001
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	TACTCAACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.75000000000003	1	29.416666666666657	0	0.0347888449357013	0	-0.0347888449357013	0	0.0378549739138101	NA	NA	0.0374558944554233	0.352995371533835	0	345	655	0.655	0	0.001
ORF3a	all	ss12	217	ACT	AAC	TCA	2	TCAACTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.4166666666667	1	28.416666666666657	0	0.0360429712153345	0	-0.0360429712153345	0	0.0402348803090855	NA	NA	0.0379837650576588	0.342669110327417	0	355	645	0.645	0	0.001
ORF3a	all	ss12	218	CAA	TCA	ATT	2	ACTCAATTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.75000000000003	1	29.083333333333325	0	0.0351970741664875	0	-0.0351970741664875	0	0.0383052581832873	NA	NA	0.0384551800676206	0.360047154078383	0	365	635	0.635	0	0.001
ORF3a	all	ss12	219	TTG	ATT	GAG	2	CAATTGAGC:CAATTGAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.75000000000003	1	28.416666666666657	0	0.0360429712153345	0	-0.0360429712153345	0	0.0406336514587094	NA	NA	0.036150416025589	0.318750996644723	0	373	627	0.627	0	0.001
ORF3a	all	ss12	220	AGC	GAG	CAC	2	TTGAGCACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.75000000000003	1	28.249999999999993	0	0.0362608381183453	0	-0.0362608381183453	0	0.0391687528249045	NA	NA	0.0379176344308631	0.338917968426033	0	352	648	0.648	0	0.001
ORF3a	all	ss12	221	ACA	CAC	AGA	2	AGCACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.08333333333337	1	28.249999999999993	0	0.0362608381183453	0	-0.0362608381183453	0	0.0382084400608553	NA	NA	0.0388019197797531	0.350040135096348	0	364	636	0.636	0	0.001
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.75000000000004	1	28.583333333333325	0	0.0358277072015149	0	-0.0358277072015149	0	0.0398875816047112	NA	NA	0.0388501291479767	0.356422677739963	0	377	623	0.623	0	0.001
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.08333333333339	1	28.249999999999993	0	0.0362608381183453	0	-0.0362608381183453	0	0.0408372705026584	NA	NA	0.040334714011014	0.368653582117534	0	369	631	0.631	0	0.001
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TGT	2	ACTGGTGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.41666666666671	1	28.916666666666657	0	0.0354048034273472	0	-0.0354048034273472	0	0.0414900981863996	NA	NA	0.0397080053258055	0.372591897189666	0	378	622	0.622	0	0.001
ORF3a	all	ss12	225	GTT	TGT	TGA	2	GGTGTTGAA	2	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.41666666666671	1	29.916666666666657	0	0.0341939559917542	0	-0.0341939559917542	0	0.0374073950625452	NA	NA	0.0346888673703203	0.3242642264307	0	349	651	0.651	0	0.001
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	ACA	2	GTTGAACAT	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.75000000000004	1	29.916666666666657	0	0.0341939559917542	0	-0.0341939559917542	0	0.0345465617907109	NA	NA	0.0375306285954898	0.362245490120074	0	364	636	0.636	0	0.001
ORF3a	all	ss12	227	CAT	ACA	TGT	2	GAACATGTA:GAACATGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GTA	TGT	AAC	2	CATGTAACT:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACC	AAC	CTT	2	GTAACTTTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	CTT	CTT	2	ACCTTCTTC:ACTTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAT	CAA	TAA	2	TACAATAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	TAA	AAT	2	AATAAAATC:AATAAAATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATC	AAT	CGT	2	AAAATCGTA:AAAATTGTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTA	CGT	AGA	2	ATCGTAGAT:ATTGTTGAT	1:1	FALSE	1.25	0.5	0.75	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	GAT	AGA	TGA	2	GTAGATGAG:GTTGATGAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	TGA	GCC	2	GATGAGCCC:GATGAGCCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCC	GCC	CGA	2	GAGCCCGAA:GAGCCTGAA	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	GAA	CGA	AGA	2	CCCGAAGAA:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	1	0.5	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	GAA	AGA	ACA	2	GAAGAACAT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	CAT	ACA	TGT	2	GAACATGTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	CATGTCCAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATT	AAT	TCA	2	CAAATTCAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	TCA	CAC	2	ATTCACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGT	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGT	CGG	TTC	2	GACGGTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	TTC	ATC	2	GGTTCATCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCC	ATC	CGG	2	TCATCCGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	CGG	AGT	2	TCCGGAGTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTT	TGT	TAA	2	GTTGTTAAT	2	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	TAA	TCC	2	GTTAATCCA	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAA:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA	2	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.58333333333336	6	32.41666666666667	0.206421458535371	0.212555050951034	0.971143511348142	-0.00613359241566364	0.0560283964541002	0.0953214210201524	0.797263850139391	0.223187682226649	0.0924902198673031	0.947126150465843	472	0	528	0.528	0.472	0.944
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.91666666666669	6	32.41666666666667	0.208483869201781	0.212555050951034	0.98084645962993	-0.00407118174925289	0.0548815976402442	0.0977815521411543	NaN	NaN	0.0934989420938864	0.965269051892718	480	0	520	0.52	0.48	0.96
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.08333333333336	6	32.91666666666667	0.211120957185982	0.208831643632827	1.01096248400545	0.00228931355315581	0.0541977184344938	0.0933209840764803	NaN	NaN	0.0921293887890354	0.980175490125604	517	0	483	0.483	0.517	0.966
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA:TTTATGAGT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.91666666666669	6	32.41666666666667	0.211656453778207	0.212555050951034	0.995772402637307	-8.98597172827614e-4	0.0535127296916642	0.0962878355731566	NaN	NaN	0.0916979377098475	0.992181227262778	494	0	506	0.506	0.494	0.988
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGTATT	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.41666666666669	6	31.916666666666668	0.21327947816281	0.216414580065769	0.985513444140383	-0.00313510190295835	0.0557479158541826	0.0992918917329252	0.758407426136363	0.193789128560644	0.095789103731272	0.97389052839429	511	0	489	0.489	0.511	0.978
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGTATTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.66666666666669	6	31.916666666666668	0.195123032668416	0.216414580065769	0.901616853213486	-0.0212915473973522	0.0541832340909009	0.0992389801776198	NaN	NaN	0.093952445967009	0.820718874157891	424	0	576	0.576	0.424	0.848
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	74.50000000000001	6	32.25	0.198621110585722	0.213826069393717	0.928890996074017	-0.0152049588079953	0.0561808294250608	0.0991325395884975	0.74108789684475	0.21005456325088	0.0934009909035962	0.870681999121525	439	1	560	0.56	0.439	0.878
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	74.83333333333334	6	31.916666666666668	0.197608853033171	0.216414580065769	0.913103234417558	-0.0188057270325978	0.0537130923047545	0.0957420197914282	NaN	NaN	0.0937908088526753	0.841083972874308	437	0	563	0.563	0.437	0.874
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	CGG	2	ACAATTGGA:ACGCTCGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	74.16666666666667	6	32.583333333333336	0.199643853662043	0.211299152734159	0.944839821072162	-0.0116552990721168	0.0527493627475834	0.0932107818712796	NaN	NaN	0.0910179972256028	0.898105539408307	444	0	556	0.556	0.444	0.888
ORF3a	all	ss12	11	GGA	CGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTCGGATCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	74.33333333333334	6	32.25	0.181789348152453	0.213826069393717	0.850173922515152	-0.0320367212412635	0.0524331062743981	0.0963182801921238	0.646972571572755	0.188819176855401	0.0905102263974506	0.723371166406066	351	0	649	0.649	0.351	0.702
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGATCAATC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.16666666666667	6	32.083333333333336	0.179512162520447	0.215112484631514	0.834503691535849	-0.0356003221110671	0.052526304300086	0.0990483294698894	NaN	NaN	0.0930402000746348	0.701991330754485	339	0	661	0.661	0.339	0.678
ORF3a	all	ss12	13	ATC	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATCACA	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.66666666666667	6	31.75	0.195123032668416	0.217732646143538	0.896158826544476	-0.0226096134751214	0.0580530540735984	0.0990958955886266	0.677045893815797	0.185625676908638	0.0944265455075992	0.810763419394864	400	1	599	0.599	0.4	0.8
ORF3a	all	ss12	14	ACA	AAC	ACG	2	ATCACACGT:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.91666666666667	6	31.666666666666668	0.177511154654184	0.218397760919419	0.812788345021902	-0.0408866062652354	0.0560983093735961	0.108479583960792	0.629714723878439	0.196799158278247	0.0952872736665407	0.66785933309952	352	0	648	0.648	0.352	0.704
ORF3a	all	ss12	15	CGT	ACG	GAA	2	ACACGTCAA:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.75	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.83333333333334	6	31.75	0.194633396613813	0.217732646143538	0.893910031688604	-0.0230992495297244	0.0573030386663328	0.0942933514266095	NaN	NaN	0.0947715308699223	0.807435161897491	394	0	606	0.606	0.394	0.788
ORF3a	all	ss12	16	AAG	GAA	ACC	2	CGTCAACCG:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.5	5	32	0.178617257777546	0.175211138386129	1.01944008481876	0.00340611939141738	0.0554947898466216	0.081545835746522	NaN	NaN	0.0908301963219541	0.970086454006923	537	0	463	0.463	0.537	0.926
ORF3a	all	ss12	17	CAA	ACC	AGG	2	AAGCAAGGT:CAACCGAGT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.33333333333334	5	32	0.196109775043318	0.175211138386129	1.11927687274728	0.0208986366571887	0.0583891016888026	0.083826714565337	NaN	NaN	0.0858477758289671	0.807665876446606	619	0	381	0.381	0.619	0.762
ORF3a	all	ss12	18	AGT	AGG	TAA	2	CAAGGTGAA:CCGAGTAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333334	4	31.166666666666664	0.193179203235308	0.140762624951505	1.37237568070261	0.0524165782838028	0.0574693985294092	0.0765341245971511	NaN	NaN	0.0847765370308738	0.536383467963566	745	0	255	0.255	0.745	0.51
ORF3a	all	ss12	19	AAG	TAA	AAT	2	AGTAAGATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.58333333333334	4	31.166666666666664	0.175769733616626	0.140762624951505	1.24869604894894	0.0350071086651207	0.0558791564494914	0.0777115182285655	NaN	NaN	0.0762040866616918	0.645956829365156	667	0	333	0.333	0.667	0.666
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAGATTGAA:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.41666666666667	4	31.666666666666664	0.17115311705112	0.138321779350139	1.23735479586243	0.0328313377009807	0.0557962325767275	0.0737705003515137	NaN	NaN	0.0779100276610328	0.673462531462105	691	1	308	0.308	0.691	0.616
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	AAA	2	ATCAAGGAT:ATTGAAAAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.91666666666667	4	32.33333333333333	0.172387863428196	0.135196367873208	1.27509241660891	0.0371914955549877	0.0548533166568928	0.0756839879648357	NaN	NaN	0.0791339766552981	0.638368320679599	667	0	333	0.333	0.667	0.666
ORF3a	all	ss12	22	AAT	AAA	TGC	2	AAGGATGCT:GAAAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.58333333333333	4	33	0.159442558228446	0.132209431753494	1.20598474793938	0.027233126474952	0.0543028752650603	0.0705813475917835	NaN	NaN	0.0728778601427194	0.708641103052364	655	0	345	0.345	0.655	0.69
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTCTT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.91666666666666	4	33	0.144852934121868	0.132209431753494	1.09563237811919	0.0126435023683738	0.0506571176349803	0.0722815016391365	NaN	NaN	0.0709029957146465	0.858470784833841	587	0	413	0.413	0.587	0.826
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTCTTCCT	1:1	TRUE	1	1	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.25	4	33.5	0.14626988152442	0.130054644852002	1.12468018109519	0.0162152366724181	0.0523192979967364	0.0718301616259988	NaN	NaN	0.0744684186853491	0.827626640044894	579	0	421	0.421	0.579	0.842
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:CTTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.25	4	33.5	0.130290582016017	0.130054644852002	1.00181413869749	2.35937164014932e-4	0.0490846598332718	0.0699674651483902	NaN	NaN	0.0761128427749338	0.997526694416581	482	0	518	0.518	0.482	0.964
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.41666666666667	4	33	0.128121317751782	0.132209431753494	0.969078499563222	-0.00408811400171177	0.0477008078368041	0.0719190186137938	NaN	NaN	0.0741060286330513	0.956006421866182	465	0	535	0.535	0.465	0.93
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.5	4	32.916666666666664	0.112623333869567	0.132575542143044	0.849503098754452	-0.0199522082734768	0.0465312639663403	0.0727028977863321	NaN	NaN	0.0767861613991651	0.794986269643765	398	1	601	0.601	0.398	0.796
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.91666666666667	3	33	0.113557650951866	0.0969087986100047	1.17179918212445	0.0166488523418617	0.0447490125795107	0.0575006532199917	NaN	NaN	0.0685256409923356	0.80803793770227	610	0	390	0.39	0.61	0.78
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.91666666666667	2	33.33333333333333	0.113557650951866	0.0625362067042884	1.81587046826873	0.051021444247578	0.045362938331351	0.045048744936167	NaN	NaN	0.0674930911846847	0.44967880145346	794	0	206	0.206	0.794	0.412
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.75	2	33.83333333333333	0.129351945263207	0.0615730216404005	2.10078930377414	0.0677789236228066	0.0484305605151302	0.0457628573356716	NaN	NaN	0.0718008259873556	0.345177164760529	836	0	164	0.164	0.836	0.328
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACT:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.91666666666667	1	33.33333333333333	0.129042071919527	0.0306164958901914	4.21478905954316	0.0984255760293352	0.0479905986656449	0.0309238823027297	NaN	NaN	0.0608425384838373	0.105725134349445	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	32	ACT	TAC	TGC	2	GCTACTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.33333333333334	1	32.916666666666664	0.126467034326845	0.0310121698640216	4.07798083401973	0.0954548644628229	0.0467635636824874	0.0310677748831011	NaN	NaN	0.0593397539006283	0.10770038175635	949	1	50	0.05	0.949	0.1
ORF3a	all	ss12	33	GCA	TGC	AAC	2	ACTGCAACG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.66666666666667	1	32.25	0.12413582885818	0.03166697281676	3.92004090749338	0.09246885604142	0.0470307808872782	0.0328332969461861	NA	NA	0.0575850019330471	0.108322212086784	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.75	1	32.5	0.123992985319038	0.0314182062818701	3.9465329180994	0.0925747790371675	0.0480897145738302	0.031563223901005	NA	NA	0.0602003606597978	0.124102949908624	937	0	63	0.063	0.937	0.126
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.75	1	33.166666666666664	0.12572916000110201	0.0307735475083969	4.08562451133708	0.0949556124927053	0.0478457434720942	0.0310715997748664	NaN	NaN	0.0579888317179187	0.10152999730848	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.75	1	33.83333333333333	0.127514764415745	0.0301548153585304	4.22867004488795	0.0973599490572142	0.0493974772358234	0.0305467481091591	NaN	NaN	0.0569809774674561	0.087517746470014	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.91666666666666	1	33.83333333333333	0.142778402413796	0.0301548153585304	4.73484585185518	0.112623587055266	0.0523140219895464	0.0317175195495772	NaN	NaN	0.0600623794774182	0.0607775493479473	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.58333333333333	1	33.83333333333333	0.126023271644748	0.0301548153585304	4.17920886420211	0.0958684562862176	0.0465110501118175	0.0320709315926671	NaN	NaN	0.0583935400618937	0.100638764847374	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.41666666666666	1	33.33333333333333	0.126318765773573	0.0306164958901914	4.12584007740877	0.0957022698833812	0.0481304254871557	0.0312593757850273	NaN	NaN	0.0557993660036691	0.0863243409676987	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.41666666666666	1	33.33333333333333	0.126318765773573	0.0306164958901914	4.12584007740877	0.0957022698833812	0.0467401873277163	0.0309141398868949	NaN	NaN	0.0596188767632064	0.108442236999116	956	1	43	0.043	0.956	0.086
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.25	1	32.666666666666664	0.140103325003136	0.0312545223004261	4.48265769850612	0.10884880270271	0.0528620668955681	0.0323259583867059	NaN	NaN	0.060679110973353	0.0728382202990107	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.91666666666666	1	31.999999999999996	0.138803133576506	0.0319197108140969	4.34850849322876	0.106883422762409	0.0505772445656648	0.0345095936755461	NaN	NaN	0.0589384222904202	0.0697584148626985	966	0	34	0.034	0.966	0.068
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.91666666666666	1	31.999999999999996	0.138803133576506	0.0319197108140969	4.34850849322876	0.106883422762409	0.0500009693563906	0.0317114363412403	NaN	NaN	0.062412656117663	0.0867994043878193	960	0	40	0.04	0.96	0.08
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.58333333333333	1	32.33333333333333	0.139450189981991	0.0315836140125951	4.41527020708839	0.107866575969396	0.0506741534972216	0.0333790176619963	NA	NA	0.0591231731537721	0.0680858503926256	976	0	24	0.024	0.976	0.048
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.41666666666667	1	32.33333333333333	0.13977599230927	0.0315836140125951	4.42558575638397	0.108192378296675	0.0500431914124171	0.032012615314048	NaN	NaN	0.0599208530006164	0.0709827049882699	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.66666666666667	1	33.08333333333333	0.143291427572032	0.0308526791703671	4.64437551049564	0.112438748401665	0.0518614082988526	0.0318656440888425	NaN	NaN	0.0582200839823495	0.0534495719560958	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT:CTTGTTGTT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.66666666666667	1	33.08333333333333	0.143291427572032	0.0308526791703671	4.64437551049564	0.112438748401665	0.0501665273530587	0.0305100595808568	NaN	NaN	0.0638547098973715	0.0782633107174762	970	0	30	0.03	0.97	0.06
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTGTTGGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.41666666666667	1	33.33333333333333	0.143808164114262	0.0306164958901914	4.6970810973941	0.113191668224071	0.0502799460840742	0.0314606858271005	NaN	NaN	0.0592062598570123	0.0558993798375326	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.5	1	33.25	0.143635503733589	0.0306948207819131	4.67947034954595	0.112940682951676	0.0506929909083055	0.0315859837798992	NaN	NaN	0.0615844408158787	0.0666664844128612	976	0	24	0.024	0.976	0.048
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76	1	33.75	0.144677749593369	0.0302307926160697	4.78577427428955	0.114446956977299	0.0526086274921896	0.0298333179877372	NaN	NaN	0.0647970824953836	0.0773562192568266	959	1	40	0.04	0.959	0.08
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77	1	32.75	0.142608211856373	0.0311733183159379	4.57468821288306	0.111434893540435	0.0491958895544199	0.0324614616594564	NaN	NaN	0.0629937366671271	0.0768965943306912	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.83333333333333	1	32.916666666666664	0.156594789439853	0.0310121698640216	5.04946252153496	0.125582619575832	0.0538416774050822	0.0313248715939431	NaN	NaN	0.0635482742427547	0.0481347666239811	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.5	1	32.916666666666664	0.155117328626829	0.0310121698640216	5.00182119816086	0.124105158762807	0.0521459694787334	0.0301942500931234	NaN	NaN	0.0606306900202965	0.0406675811965395	985	0	15	0.015	0.985	0.03
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.83333333333333	1	32.58333333333333	0.154389040653112	0.0313361505112163	4.92686683381389	0.123052890141895	0.0518651831927903	0.0311307231874444	NaN	NaN	0.0626766010095209	0.0496114748361293	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.66666666666666	2	33.08333333333333	0.170542381646746	0.0630291953285242	2.7057680295272	0.107513186318222	0.0565956438537467	0.0447101112331144	NaN	NaN	0.0665431900871197	0.1061612906563	956	1	43	0.043	0.956	0.086
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.33333333333333	2	33.08333333333333	0.168934951133241	0.0630291953285242	2.68026507799615	0.105905755804717	0.0528234554477974	0.0459834814244302	NaN	NaN	0.0641095975772744	0.0985450426986248	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAG	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.41666666666667	2	33.5	0.187348078274046	0.0622118122355632	3.0114550845209	0.125136266038483	0.0576759577520709	0.047857488228554	NaN	NaN	0.066486840838377	0.0598196158958621	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	58	AGC	AAG	CGC	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.91666666666667	2	33.5	0.186000879178407	0.0622118122355632	2.98980004752346	0.123789066942844	0.0564728349075531	0.0454566907793924	NaN	NaN	0.0645263236902991	0.0550568404062275	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.08333333333334	2	33.833333333333336	0.204901396368095	0.0615730216404005	3.32777880489222	0.143328374727694	0.0570866417276367	0.0441004100818769	NaN	NaN	0.0709350596959884	0.0433255807393203	985	0	15	0.015	0.985	0.03
ORF3a	all	ss12	60	TCC	TTC	CAA	2	GCTTCCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.41666666666667	2	33.5	0.203900474239319	0.0622118122355632	3.27752024755775	0.141688662003756	0.0590939043358208	0.0443046461562829	NaN	NaN	0.070381819733994	0.0440995962255811	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	TCCAAAATC:TCCAAAGTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.25	2	33.666666666666664	0.204399702385691	0.0618907677660026	3.30258792649799	0.142508934619689	0.0601942990889203	0.0446735826293867	NaN	NaN	0.0702989095042297	0.0426434387786561	980	0	20	0.02	0.98	0.04
ORF3a	all	ss12	62	ATC	AAT	CAT	2	AAAATCATA:AAAGTGATT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.91666666666667	2	34.333333333333336	0.208483869201781	0.0606390724718212	3.43811111719533	0.14784479672996	0.0593307402813585	0.0433265286231809	NaN	NaN	0.0715332920013019	0.0387532817852923	982	0	18	0.018	0.982	0.036
ORF3a	all	ss12	63	ATA	CAT	AAC	2	ATCATAACC:GTGATTGCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.91666666666667	2	34.333333333333336	0.191510018856633	0.0606390724718212	3.1581950555993	0.130870946384812	0.0526160624681798	0.046360956736953	NaN	NaN	0.0635274905930364	0.0393920467102078	982	0	18	0.018	0.982	0.036
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTT	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.25	2	34.666666666666664	0.193420049534211	0.0600320307551523	3.22194746872878	0.133388018779059	0.0543589082863615	0.0421408237000768	NaN	NaN	0.0629264834003137	0.0340276627952007	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.16666666666667	2	35.25	0.193661500470681	0.0589984642956841	3.28248375246011	0.134663036174997	0.0535050934184786	0.0425714897673563	NaN	NaN	0.0644287446503343	0.0366080970448406	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTTCATAAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.16666666666667	2	35.25	0.193661500470681	0.0589984642956841	3.28248375246011	0.134663036174997	0.0518171481305107	0.0444688367257146	NaN	NaN	0.0638047442247099	0.0348110992006092	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	GAG	2	AAAAAGAGA:CATAAGAGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.91666666666667	2	35.583333333333336	0.177511154654184	0.058423686245627	3.03834225570576	0.119087468408557	0.0504780756324323	0.0428892669618248	NaN	NaN	0.0609537908604121	0.05073273213029	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	68	AGA	GAG	ATG	2	AAGAGATGG:AAGAGGTGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.75	2	35.583333333333336	0.21219469193644	0.058423686245627	3.63199766348743	0.153771005690813	0.0612076576884004	0.0423775365890523	NaN	NaN	0.0681177961236563	0.023981357115933	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGGTGGCAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	75.33333333333333	2	36	0.249703998029926	0.0577207808520962	4.3260675677581	0.19198321717783	0.0719381309096521	0.0419725585634311	NaN	NaN	0.0799412137854276	0.0163255571965723	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	75.16666666666666	3	35.833333333333336	0.250361262210016	0.0887734500607747	2.82022679121537	0.161587812149242	0.0756687132541416	0.0548898216747137	NaN	NaN	0.0922525729385384	0.0798459599977336	963	0	37	0.037	0.963	0.074
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTCGCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	75.16666666666666	3	35.833333333333336	0.250361262210016	0.0887734500607747	2.82022679121537	0.161587812149242	0.0715335657632669	0.0533874918171254	NaN	NaN	0.0958810072108813	0.0919316093877596	959	1	40	0.04	0.959	0.08
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTCGCCCTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.08333333333333	4	35.583333333333336	0.265279817755724	0.12178588422283	2.17824766350051	0.143493933532893	0.0761150094339565	0.063392036658472	NaN	NaN	0.0966455472981783	0.137611549727261	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCCCTGTAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.58333333333333	4	35.25	0.26320487089109	0.12303734291849899	2.13922752757623	0.140167527972591	0.0723927666355794	0.0671974375831176	NaN	NaN	0.101026395230348	0.165309245222822	911	0	89	0.089	0.911	0.178
ORF3a	all	ss12	74	TAT	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTGTATAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.74999999999999	4	34.75	0.276866163038679	0.124963623649128	2.21557406030462	0.15190253938955	0.073150231937021	0.0701847197679127	NaN	NaN	0.101421336432119	0.134201463445505	937	0	63	0.063	0.937	0.126
ORF3a	all	ss12	75	AAA	CAA	AGG	2	TATAAAGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.41666666666666	3	34.416666666666664	0.274024507731711	0.0926626795339059	2.95722624372678	0.181361828197805	0.0748661079510351	0.0566166556156313	NaN	NaN	0.089336407626844	0.042346390240434	982	0	18	0.018	0.982	0.036
ORF3a	all	ss12	76	GGC	AGG	CAT	2	AAAGGCATT:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.58333333333331	3	34.583333333333336	0.273323285248654	0.092187504132096	2.96486262234638	0.181135781116558	0.0747157768204308	0.0582050057656088	NaN	NaN	0.0863406568021563	0.0359122227708452	980	0	20	0.02	0.98	0.04
ORF3a	all	ss12	77	ATT	CAT	TCA	2	GGCATTCAG:GGTGTTCAC	1:1	FALSE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.24999999999999	3	34.25	0.270554304269646	0.0931427851735378	2.90472637000886	0.177411519096108	0.0750085595824942	0.0575160404579706	NaN	NaN	0.0920715732666847	0.0539937119262893	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	78	CAC	TCA	CTT	2	ATTCAGCTT:GTTCACTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.74999999999999	4	34.833333333333336	0.272625681756849	0.124638389543236	2.1873331543832	0.147987292213613	0.0718805805871119	0.0693845045032612	NaN	NaN	0.0901084724821501	0.100522909786965	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	79	CTT	CTT	TGT	2	CACTTTGTT:CAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.58333333333331	4	34.333333333333336	0.251412360682455	0.126615652181289	1.98563413252006	0.124796708501166	0.0722414379319877	0.065506199051754	NaN	NaN	0.0857877128682554	0.145748062682342	930	0	70	0.07	0.93	0.14
ORF3a	all	ss12	80	GTT	TGT	TTG	2	CTTGTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.24999999999999	4	34.333333333333336	0.235201662735449	0.126615652181289	1.85760337433389	0.10858601055416	0.0694114392669616	0.0669842048903381	NaN	NaN	0.0852206263119135	0.202601324010807	906	0	94	0.094	0.906	0.188
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	GTTTGCAAC:GTTTGCAAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.91666666666666	4	34.166666666666664	0.23290063730458	0.127288788480472	1.82970267911938	0.105611848824108	0.0678475750269757	0.0672508689199891	NaN	NaN	0.0861838041847661	0.220414867585749	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAATTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.24999999999999	4	34.833333333333336	0.235201662735449	0.124638389543236	1.88707238273372	0.110563273192212	0.070116558210923	0.0700442099103938	NaN	NaN	0.0853675428532213	0.195270509155717	904	0	96	0.096	0.904	0.192
ORF3a	all	ss12	83	TTG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG:AATTTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.24999999999999	4	34.833333333333336	0.235201662735449	0.124638389543236	1.88707238273372	0.110563273192212	0.0701167397577664	0.0647855269373698	NaN	NaN	0.0855944630856814	0.196457393608197	891	0	109	0.109	0.891	0.218
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GCT	2	TTGCTGCTA:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.91666666666666	4	34.583333333333336	0.23290063730458	0.125619222573624	1.85402068674704	0.107281414730956	0.0674667800601435	0.0663182836045994	NaN	NaN	0.0887570943927395	0.22677502684076	873	1	126	0.126	0.873	0.252
ORF3a	all	ss12	85	CTA	GCT	ACT	2	CTGCTACTT:CTGTTGTTG	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.91666666666666	5	34.25	0.263873706540401	0.162356129339379	1.62527714607446	0.101517577201022	0.075696583327382	0.0804570392733717	NaN	NaN	0.0923387589368494	0.271591998854644	869	0	131	0.131	0.869	0.262
ORF3a	all	ss12	86	CTT	ACT	GTT	2	CTACTTTTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.41666666666666	5	33.75	0.261934035771843	0.165046413582601	1.58703258123662	0.0968876221892419	0.0788450449678305	0.0832544693773266	NaN	NaN	0.0939178064019917	0.302249495035309	855	0	145	0.145	0.855	0.29
ORF3a	all	ss12	87	TTT	GTT	TGT	2	CTTTTTGTG:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.41666666666666	5	33.083333333333336	0.241213868267319	0.168775880107432	1.42919632896464	0.0724379881598864	0.0709694743077829	0.0877093210083915	NaN	NaN	0.090666869778183	0.424321371223414	791	1	208	0.208	0.791	0.416
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTGACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.75	5	32.75	0.240068645070168	0.170704815996831	1.40633785677508	0.0693638290733365	0.0723548565940529	0.0812391715552062	NaN	NaN	0.0855865875730536	0.417680388105795	798	1	201	0.201	0.798	0.402
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AAT	2	GTAACAGTT:GTGACAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.25	5	33.25	0.241790622554605	0.167827735578764	1.44070717346436	0.0739628869758413	0.0733264327265748	0.0798848099459855	NaN	NaN	0.0918957959586504	0.420902755147461	804	1	195	0.195	0.804	0.39
ORF3a	all	ss12	90	ATT	AAT	TTA	2	ACAATTTAC:ACAGTTTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.91666666666666	5	33.916666666666664	0.242952517757944	0.164139760909006	1.48015640093828	0.0788127568489381	0.0740039660256731	0.0824292965533684	NaN	NaN	0.0890809664861847	0.3763013425235	844	0	156	0.156	0.844	0.312
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	ATTTACTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.08333333333333	5	34.583333333333336	0.228981181189788	0.160610991304224	1.42568811343714	0.0683701898855646	0.0704799772796236	0.0769898723628498	NaN	NaN	0.0844026089283732	0.417912416399228	789	0	211	0.211	0.789	0.422
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.74999999999999	5	34.916666666666664	0.247109400847682	0.158903109406266	1.55509481073715	0.0882062914414162	0.0744663878162073	0.0775434981638202	NaN	NaN	0.084766842277923	0.298072649796042	886	0	114	0.114	0.886	0.228
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTA:TCACACCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.41666666666664	5	33.916666666666664	0.248323576611812	0.164139760909006	1.5128788736903	0.0841838157028059	0.0735175537257266	0.0827454771699103	NaN	NaN	0.088710801725894	0.342636293507795	839	1	160	0.16	0.839	0.32
ORF3a	all	ss12	94	CTA	CCT	ACT	2	CACCTACTA:CACCTTTTG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.24999999999999	5	33.416666666666664	0.248935191022842	0.166890228132415	1.49161034656463	0.0820449628904268	0.0775205052216766	0.0821871799533914	NaN	NaN	0.0909291232756739	0.366899774404889	815	1	184	0.184	0.815	0.368
ORF3a	all	ss12	95	CTA	ACT	ACT	2	CTACTACTT:CTTTTGCTC	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.74999999999997	5	32.75	0.243537699774927	0.170704815996831	1.42665980659531	0.0728328837780957	0.070073704763623	0.0869683494064561	NaN	NaN	0.0904795194880911	0.420839638908618	799	0	201	0.201	0.799	0.402
ORF3a	all	ss12	96	CTC	ACT	CGT	2	CTACTTTTA:TTGCTCGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.49999999999997	5	33	0.244420824406181	0.169253998250676	1.44410664996036	0.0751668261555052	0.0753606835256537	0.080213233127203007	NaN	NaN	0.0909684894959993	0.408636656116705	816	0	184	0.184	0.816	0.368
ORF3a	all	ss12	97	GTT	CGT	AGC	2	CTCGTTGCT:CTTTTAGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.49999999999997	5	32.666666666666664	0.240926530560309	0.171193988985735	1.40733054932428	0.0697325415745735	0.0721204841692806	0.082336189309419	NaN	NaN	0.0897545650082317	0.437203177343774	789	0	211	0.211	0.789	0.422
ORF3a	all	ss12	98	GCT	AGC	TGC	2	GTTGCTGCT:TTAGCTGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.5833333333333	5	32.416666666666664	0.240639882456706	0.172678550040526	1.393571363671	0.0679613324161804	0.0730231717902951	0.0852920761618089	NaN	NaN	0.0907332766668108	0.453843201166635	777	0	223	0.223	0.777	0.446
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.16666666666664	5	32.333333333333336	0.238652446115001	0.173179167487274	1.37806671309087	0.0654732786277268	0.0728405353592768	0.0818279333921663	NaN	NaN	0.0915518131691979	0.474516364732885	771	0	229	0.229	0.771	0.458
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CAT	2	GCTGGCATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.66666666666664	5	32.833333333333336	0.236975089717772	0.17021844254226	1.39218222290419	0.066756647175512	0.0708555420567589	0.0822581638287709	NaN	NaN	0.091485471498408	0.465575595201562	793	0	207	0.207	0.793	0.414
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CAT	GGA	2	GGCATGGAG:GGCCTTGAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.33333333333331	5	33.833333333333336	0.238090673089088	0.164591833676269	1.44655216344076	0.0734988394128196	0.072878502950585	0.0789692668996459	NaN	NaN	0.0868945848591013	0.397642497275994	811	0	189	0.189	0.811	0.378
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAGGCA:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.99999999999999	5	34.166666666666664	0.225993636641676	0.162798378928371	1.38818112397243	0.063195257713305	0.0722288644375661	0.0788492504228841	NaN	NaN	0.0830126319805836	0.446494151038605	803	0	197	0.197	0.803	0.394
ORF3a	all	ss12	103	GCA	AGC	ACA	2	GAAGCCCCT:GAGGCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.99999999999999	5	34.166666666666664	0.242660989230208	0.162798378928371	1.4905614590731	0.0798626103018377	0.0741095185611338	0.0779711088298652	NaN	NaN	0.0850707382288604	0.347844296995774	830	0	170	0.17	0.83	0.34
ORF3a	all	ss12	104	CAA	ACA	ATT	2	GCACAATTT:GCCCCTTTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.91666666666666	6	33.83333333333333	0.239500136249871	0.202335646591906	1.18367742058286	0.037164489657965503	0.0726145904805764	0.0909753219989735	0.924253682318087	0.200304485099144	0.105460774419297	0.724537500289642	652	0	348	0.348	0.652	0.696
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.91666666666666	5	33.5	0.223083612157793	0.16642540730596	1.34044203808179	0.0566582048518337	0.0672019109862311	0.0814717646777647	NaN	NaN	0.0976457285548728	0.561751074923397	736	0	264	0.264	0.736	0.528
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.41666666666666	5	34	0.224661472302045	0.163690174515013	1.37247988749282	0.060971297787032	0.0703654036845736	0.0876584909591817	NaN	NaN	0.096899993812694707	0.529205822805689	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CAT	2	CTCTATCTT:TTGTACATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.99999999999999	5	34.25	0.209688646664371	0.162356129339379	1.29153514263728	0.0473325173249924	0.0675520059897828	0.0820221830556925	NaN	NaN	0.0944496980209633	0.616272629755137	698	0	302	0.302	0.698	0.604
ORF3a	all	ss12	108	ATC	CAT	CTA	2	TACATCTAT:TATCTTTAT	1:1	TRUE	1.5	0.5	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82.83333333333331	5	33.916666666666664	0.207258628986463	0.164139760909006	1.26269605754672	0.0431188680774573	0.0686851966859369	0.084607311877889	NaN	NaN	0.0908664481058815	0.635121912359485	693	0	307	0.307	0.693	0.614
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	ATCTATGCC:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	82.66666666666664	5	34.25	0.1919500306029	0.162356129339379	1.18227769646849	0.0295939012635217	0.0664866344420679	0.0820824523926084	NaN	NaN	0.0876012635850739	0.735495031274319	636	0	364	0.364	0.636	0.728
ORF3a	all	ss12	110	GCC	TGC	CCT	2	TATGCCCTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	82.33333333333331	5	34.58333333333333	0.192836181436011	0.160610991304224	1.20064125045307	0.0322251901317867	0.0655703176768029	0.0846044586521579	NaN	NaN	0.0873930850514364	0.712322691265651	681	0	319	0.319	0.681	0.638
ORF3a	all	ss12	111	CTG	CCT	AGT	2	GCCCTGATT:GCTTTAGTC	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	82.33333333333331	5	34.58333333333333	0.192836181436011	0.160610991304224	1.20064125045307	0.0322251901317867	0.0636957559641648	0.0828733371408966	NaN	NaN	0.0885270869040528	0.715846786456948	668	0	332	0.332	0.668	0.664
ORF3a	all	ss12	112	ATT	AGT	CTA	2	CTGATTTAT:TTAGTCTAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	83.99999999999999	5	33.916666666666664	0.18848582121068	0.164139760909006	1.14832518438461	0.0243460603016734	0.0640853783954585	0.0868634044165072	NaN	NaN	0.0938934157234724	0.795407907512765	608	0	392	0.392	0.608	0.784
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	ATTTATATT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	84.49999999999999	5	33.916666666666664	0.172180831233375	0.164139760909006	1.04898916801047	0.00804107032436904	0.0641579533506592	0.0829711962669012	NaN	NaN	0.089319160271118	0.928266343721267	585	0	415	0.415	0.585	0.83
ORF3a	all	ss12	114	ATT	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATATTCTG	1:1	TRUE	1.5	0.5	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	84.66666666666666	5	33.75	0.171799927212999	0.165046413582601	1.04091887538664	0.00675351363039764	0.0633510183648635	0.0800185060236918	NaN	NaN	0.0880617242062385	0.938869617912398	542	0	458	0.458	0.542	0.916
ORF3a	all	ss12	115	CTG	CTT	GCA	2	ATTCTGCAA:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.83333333333333	5	33.08333333333333	0.156750317692118	0.168775880107432	0.928748335321018	-0.0120255624153148	0.0570545713758095	0.0888495235138278	NaN	NaN	0.0893161123235667	0.892896150692993	463	0	537	0.537	0.463	0.926
ORF3a	all	ss12	116	CAA	GCA	AGT	2	CTGCAAGTT:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	85.83333333333333	5	32.416666666666664	0.18392275403779	0.172678550040526	1.06511639108983	0.0112442039972642	0.0690641567547775	0.0873224220478152	NaN	NaN	0.097447584343019	0.908138223357551	555	1	444	0.444	0.555	0.888
ORF3a	all	ss12	117	AGT	AGT	TAT	2	CAAGTTGTG:CAGAGTATA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	85.25	5	32.416666666666664	0.200521552470618	0.172678550040526	1.16124181274141	0.0278430024300919	0.0723700910052884	0.0892392175648386	NaN	NaN	0.102585080605041	0.786072820282398	611	0	389	0.389	0.611	0.778
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	AGTATAAAC:GTTGTGAGC	1:1	TRUE	1.5	0.75	0.75	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	85.25	5	32.416666666666664	0.170479989533073	0.172678550040526	0.987267900344676	-0.00219856050745279	0.0587027706167032	0.0877163609780509	NaN	NaN	0.091850924569661	0.980903512959321	494	0	506	0.506	0.494	0.988
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT:GTGAGCTTC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.25	5	32.166666666666664	0.141595553474679	0.174189200634338	0.81288365156414	-0.0325936471596586	0.0511519558170256	0.0887118832001777	NaN	NaN	0.0861043799560661	0.705032114181539	365	0	635	0.635	0.365	0.73
ORF3a	all	ss12	120	TTC	CTT	CTG	2	AACTTTGTA:AGCTTCTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.166666666666667	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.41666666666667	4	32.5	0.157611296097191	0.134437018317738	1.17238018270147	0.0231742777794531	0.0541513661994056	0.0704751838347408	NaN	NaN	0.0703119952662501	0.741708196897798	647	0	353	0.353	0.647	0.706
ORF3a	all	ss12	121	GTA	CTG	AAG	2	TTCTGCAGA:TTTGTAAGA	1:1	TRUE	1.75	0.5	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.75	4	32.5	0.159008783209024	0.134437018317738	1.18277528911874	0.0245717648912858	0.0540042783803102	0.0776485858041406	NaN	NaN	0.0740060525104223	0.739871347724618	649	0	351	0.351	0.649	0.702
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGCAGATTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.25	3	32.5	0.160073332783954	0.0985020015458152	1.62507695551242	0.0615713312381383	0.0568521564896727	0.0615324797469168	NaN	NaN	0.0680660163142859	0.36568657840437	822	0	178	0.178	0.822	0.356
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGATTTATT	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.08333333333334	3	32.5	0.160431369407456	0.0985020015458152	1.62871177123072	0.061929367861641	0.0579545066960789	0.0639038086266914	NaN	NaN	0.0684255997929851	0.365432869873517	828	1	171	0.171	0.828	0.342
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:TTTATTATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.58333333333334	3	32.166666666666664	0.148632696437812	0.0995936054863591	1.49239196343955	0.0490390909514525	0.0537902054117566	0.0629252872332108	NaN	NaN	0.0671410670103466	0.465152493403628	767	0	233	0.233	0.767	0.466
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATTATGAGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.41666666666667	3	31.999999999999996	0.148969278730818	0.100148544468392	1.48748321327659	0.0488207342624256	0.0533949207321754	0.0610283806619678	NaN	NaN	0.0629988542736302	0.438371342583767	795	0	205	0.205	0.795	0.41
ORF3a	all	ss12	126	AGG	GAG	GCT	2	ATGAGGCTT:ATGAGGTGC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.91666666666667	4	31.666666666666664	0.149988265227745	0.138321779350139	1.08434308705698	0.0116664858776053	0.0544041130423629	0.0791624806939919	NaN	NaN	0.0849308365417869	0.890742652853825	587	0	413	0.413	0.587	0.826
ORF3a	all	ss12	127	CTT	GCT	CTG	2	AGGCTTTGG:AGGTGCTGG	1:1	TRUE	1.25	0.333333333333333	1	0.416666666666667	1	0	1	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.25	4	31.999999999999996	0.166773778676097	0.136741167595466	1.21963108556656	0.030032611080631	0.0571455430947082	0.0772221985825414	NaN	NaN	0.0887020413884788	0.734927222328896	666	0	334	0.334	0.666	0.668
ORF3a	all	ss12	128	TGG	CTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGCTGGCTT	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81	3	31.333333333333332	0.180591011470439	0.102431651254313	1.76303915107328	0.0781593602161258	0.0653571614298518	0.0659276947327403	NaN	NaN	0.0834334418378839	0.34886815502326	842	0	158	0.158	0.842	0.316
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.5	3	31.833333333333332	0.184453553433394	0.100709711722406	1.83153690223856	0.0837438417109882	0.067301768120239	0.0668174835138745	NaN	NaN	0.086429094543749	0.332579543753398	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.33333333333333	3	31.499999999999996	0.214724926668622	0.101851155869296	2.10822277701172	0.112873770799326	0.0708539328726646	0.063921032951793	NaN	NaN	0.0923021932208307	0.221378032663153	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGCTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.49999999999999	4	31.833333333333332	0.234333426514436	0.137526919369799	1.70390951522976	0.0968065071446368	0.0765127387711283	0.0754922415693732	NaN	NaN	0.0970789337679635	0.318670468408997	842	1	157	0.157	0.842	0.314
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.49999999999999	4	31.416666666666664	0.251725510203618	0.139531497680893	1.80407660196776	0.112194012522725	0.0783601860293177	0.0843011570313879	NaN	NaN	0.102388779151394	0.273181748909931	876	0	124	0.124	0.876	0.248
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCCGT:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.49999999999999	4	32.25	0.273673442339373	0.135579277355344	2.01854920366697	0.138094164984029	0.0823575127254089	0.0756696519189983	NaN	NaN	0.105987235496998	0.192597964166479	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CAA	ATC	2	TGCAAATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.58333333333331	4	32.083333333333336	0.273323285248654	0.136351658368326	2.00454683514246	0.136971626880328	0.0829492282507198	0.0800779465739327	NaN	NaN	0.108282230228623	0.20588918665574	907	0	93	0.093	0.907	0.186
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AAATCCAAA:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.91666666666664	3	32.416666666666664	0.239944051297493	0.0987726497511971	2.42925599244223	0.141171401546296	0.074765364071341	0.0671544652448313	NaN	NaN	0.0990358315097471	0.154024901456281	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.08333333333331	3	32.916666666666664	0.239340732066682	0.097170738715697	2.46309470556715	0.142169993350985	0.0736868919276951	0.064705852531505	NaN	NaN	0.101716369301884	0.162200149970105	911	0	89	0.089	0.911	0.178
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.91666666666664	3	32.916666666666664	0.239944051297493	0.097170738715697	2.46930356266534	0.142773312581796	0.0749211625967109	0.0586216645815339	NaN	NaN	0.10096665016833	0.157343090583588	936	0	64	0.064	0.936	0.128
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.58333333333331	3	32.583333333333336	0.241159939803403	0.0982328346145694	2.45498300796906	0.142927105188834	0.0747683509552966	0.0639938948971508	NaN	NaN	0.0963873218478145	0.138116570474961	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.58333333333331	3	31.583333333333336	0.237548992808331	0.101563372279023	2.33892384112373	0.135985620529309	0.0735978802790432	0.0656482480790421	NaN	NaN	0.100269861655909	0.17503670262412	918	0	82	0.082	0.918	0.164
ORF3a	all	ss12	140	CTT	ACT	TCA	2	TTACTTCAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.91666666666666	3	30.916666666666668	0.236369452063806	0.103912304538584	2.27470127925071	0.132457147525222	0.0751496670738301	0.0706380510687479	NaN	NaN	0.102650140683295	0.196920581751506	905	0	95	0.095	0.905	0.19
ORF3a	all	ss12	141	CAT	TCA	TGA	2	CTTCATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.24999999999999	3	30.583333333333336	0.252669701240021	0.105128058952294	2.40344684148196	0.147541642287726	0.0769237806587782	0.0704742844497921	NaN	NaN	0.102554472332845	0.150245149803387	931	0	69	0.069	0.931	0.138
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	CATGATGCC:TATGATGCC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.41666666666666	3	29.916666666666668	0.238143225992366	0.107647107231784	2.21225848159208	0.130496118760582	0.0734047148977658	0.0718359966474042	NaN	NaN	0.110847938342328	0.239094357285772	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.74999999999999	3	30.583333333333336	0.268514498493544	0.105128058952294	2.55416585419305	0.16338643954125	0.0784308305453939	0.0695416048516921	NaN	NaN	0.108842147392312	0.133321401853152	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAC:GCCAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.24999999999999	3	30.083333333333336	0.262577384081623	0.107006075844546	2.45385490505311	0.155571308237078	0.0800167090284563	0.0702297394861781	NaN	NaN	0.113317361564409	0.169789191671278	922	0	78	0.078	0.922	0.156
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333333	3	30.75	0.301389150714295	0.104516640682884	2.88364751053134	0.196872510031412	0.0917439281383184	0.0693262254152052	NaN	NaN	0.11848506381820301	0.0965968507747908	951	1	48	0.048	0.951	0.096
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.75	3	30.583333333333336	0.300623921390007	0.105128058952294	2.85959737472587	0.195495862437713	0.0894777596390773	0.0672415490275517	NaN	NaN	0.113442432722656	0.084833462263431	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333333	3	30.083333333333336	0.301389150714295	0.107006075844546	2.81656110025137	0.19438307486975	0.0934651234588625	0.0718069262069994	NaN	NaN	0.117258249729158	0.0973710173010884	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.91666666666666	3	29.75	0.281652316781776	0.10829587866142	2.60076671673114	0.173356438120356	0.0928067103799715	0.0700951905278928	NaN	NaN	0.117974241026438	0.14171263594306	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.41666666666666	3	30.25	0.283780696115475	0.106372646579413	2.66779764573796	0.177408049536061	0.0854092675901859	0.0668188674112118	NaN	NaN	0.115749303827048	0.125351723848584	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.74999999999999	3	29.583333333333336	0.282358178426184	0.108952531416164	2.59157061112849	0.17340564701002	0.0882690871906502	0.0685842606757932	NaN	NaN	0.113550322412948	0.126729688633936	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	151	ACA	TAC	ACA	2	CATACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.66666666666664	4	29.25	0.282712453350107	0.150978005779684	1.8725406517997	0.131734447570424	0.0847368187772183	0.0830074749543805	NaN	NaN	0.128640820754072	0.305812338004001	871	0	129	0.129	0.871	0.258
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ACA	TAA	2	ACACATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.16666666666664	4	28.75	0.280600193443143	0.153892310773211	1.8233542146018	0.126707882669932	0.0848553201692326	0.0866221130814006	NaN	NaN	0.138553963957789	0.360453106510344	830	0	170	0.17	0.83	0.34
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATTGTTAC:CATAACTAT	1:1	TRUE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.74999999999999	4	28.5	0.264526729305941	0.155392217528976	1.70231645775062	0.109134511776964	0.0869581083788558	0.0909071034585664	NaN	NaN	0.12700832662541	0.390191280660481	822	0	178	0.178	0.822	0.356
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.91666666666664	3	28.916666666666668	0.28594187943614	0.11166090491713	2.56080567901859	0.17428097451901	0.0886741868028963	0.0702256993970255	NaN	NaN	0.119529935638997	0.144825950377529	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.41666666666664	3	29.25	0.283780696115475	0.110290063467372	2.57303955763365	0.173490632648102	0.0885081304095143	0.069108927942108	NaN	NaN	0.112380258528217	0.122641126676059	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.91666666666664	3	28.416666666666668	0.299862619562067	0.113782401199837	2.63540421365704	0.18608021836223	0.0912102850172319	0.0753465204872236	NaN	NaN	0.121501801977045	0.125645442367825	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.24999999999999	3	28.083333333333336	0.298351676521946	0.115242181679947	2.58891034665184	0.183109494841999	0.0887775555898837	0.0745452129667089	NaN	NaN	0.120384330912765	0.128249565959208	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.41666666666664	3	28.083333333333336	0.297601975168629	0.115242181679947	2.58240490443972	0.182359793488682	0.0859613258650776	0.0749143349136842	NaN	NaN	0.120342850255081	0.129687461831333	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAT:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.74999999999999	3	27.416666666666668	0.296113964785258	0.11827731107372	2.50355678614216	0.177836653711538	0.0920373955092158	0.0704703028152471	NaN	NaN	0.12329560662399	0.149200836095779	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATATAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.08333333333331	4	27.416666666666668	0.294640950387176	0.162245943584362	1.81601427978982	0.132395006802814	0.0872204525096586	0.0898231317366703	NaN	NaN	0.130409148746984	0.309997201925423	868	0	132	0.132	0.868	0.264
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAATAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.58333333333331	4	27.25	0.310559474021052	0.163354604039617	1.9011369520123	0.147204869981435	0.0899327915812443	0.0909446098278736	NaN	NaN	0.134323927944085	0.273124893728858	871	0	129	0.129	0.871	0.258
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	81.24999999999999	4	27.583333333333336	0.316899762465234	0.16115228773261	1.96646145657607	0.15574747473262401	0.0930354317985146	0.0894457881151188	NaN	NaN	0.135239973114374	0.249469912344317	881	0	119	0.119	0.881	0.238
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.24999999999999	4	27.916666666666668	0.321830153373904	0.159008783209024	2.02397720980509	0.16282137016488	0.0910128240635606	0.0863030080048678	NaN	NaN	0.136669042296446	0.23351418395658	897	0	103	0.103	0.897	0.206
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.41666666666664	4	28.416666666666668	0.320997633478909	0.155898728322134	2.05901380295823	0.165098905156775	0.0915724577380351	0.08208423288423	NaN	NaN	0.134113595884505	0.218308729449711	909	0	91	0.091	0.909	0.182
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.58333333333331	4	29.083333333333336	0.325204550847101	0.151937056450332	2.14038996440219	0.173267494396768	0.094144370464959	0.0812853862107183	NaN	NaN	0.136112440647621	0.203027538311739	904	0	96	0.096	0.904	0.192
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.91666666666664	4	29.750000000000004	0.309264414414868	0.148172379571929	2.08719341154091	0.161092034842939	0.0913982349001059	0.0851070886497413	NaN	NaN	0.127963208820634	0.208068849864699	893	0	107	0.107	0.893	0.214
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.91666666666664	4	29.750000000000004	0.290365776711344	0.148172379571929	1.95964846856218	0.142193397139415	0.0834175736097387	0.0769841602280219	NaN	NaN	0.117225453443836	0.22513333604018201	880	0	120	0.12	0.88	0.24
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.24999999999997	4	30.08333333333334	0.293392860236679	0.146359364647636	2.0046059980038198	0.147033495589043	0.0823151043610228	0.0834797472680462	NaN	NaN	0.126046377708038	0.243411079130661	873	0	127	0.127	0.873	0.254
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT:GTCGTTACT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.41666666666664	4	30.58333333333334	0.292630113009912	0.143721781908901	2.03608742615923	0.148908331101011	0.0869023109364908	0.0764475450679423	NaN	NaN	0.123016736932922	0.226097780258978	889	0	111	0.111	0.889	0.222
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TGC	2	ATTACTTCA:GTTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.74999999999997	4	30.33333333333334	0.310074958318006	0.145028544735405	2.13802709586391	0.165046413582601	0.0899000649501124	0.0781126990666935	NaN	NaN	0.128122173820136	0.197677902253689	901	0	99	0.099	0.901	0.198
ORF3a	all	ss12	171	GCA	TGC	AGG	2	ACTGCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.41666666666664	4	30.000000000000004	0.306858361132519	0.146808432844571	2.09019574139447	0.160049928287948	0.0935536403756069	0.0793675828349059	NaN	NaN	0.123230616172753	0.194018134783827	903	0	97	0.097	0.903	0.194
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	GCAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.16666666666664	4	30.250000000000004	0.289246860608989	0.145469445655623	1.98836848044184	0.143777414953365	0.0821196269829737	0.0817808250247817	NaN	NaN	0.120704658899678	0.233594507388325	881	0	119	0.119	0.881	0.238
ORF3a	all	ss12	173	GAC	TGA	CGG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.8333333333333	4	30.250000000000004	0.286305319885247	0.145469445655623	1.96814745938491	0.140835874229623	0.0854503268178106	0.0810112628930843	NaN	NaN	0.116066935635248	0.224976088306981	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	174	GGC	CGG	CAC	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.99999999999997	4	30.41666666666667	0.281300723192845	0.144590316625212	1.94550181338904	0.136710406567633	0.0865121789912157	0.079503357085263	NaN	NaN	0.121545896226971	0.260689199291176	876	0	124	0.124	0.876	0.248
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.49999999999997	4	29.91666666666667	0.279209669341883	0.147260274111344	1.89602845048877	0.131949395230539	0.0832205222140634	0.0816105927593389	NaN	NaN	0.125288730873346	0.292266514007415	861	0	139	0.139	0.861	0.278
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAC	2	ACAACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.91666666666664	3	30.33333333333334	0.299862619562067	0.106058740537371	2.82732585775338	0.193803879024695	0.0907358298903166	0.066967120044327	NaN	NaN	0.114656201475671	0.0909697384610846	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	177	ACA	AAC	ACC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.16666666666664	3	29.66666666666667	0.284857139505292	0.108623210908842	2.62243342948449	0.17623392859645	0.0898290367342496	0.067923341190974	NaN	NaN	0.108242875653629	0.103496431554217	956	0	44	0.044	0.956	0.088
ORF3a	all	ss12	178	CCA	ACC	AAA	2	ACACCAAAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666664	3	30.000000000000004	0.26683825481505	0.107325632730505	2.48624907234492	0.159512622084545	0.0782944991337588	0.0688763156109066	NaN	NaN	0.102445626104618	0.119459402772526	933	0	67	0.067	0.933	0.134
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTC:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.66666666666664	4	29.500000000000004	0.264854466829819	0.149561992614941	1.77086746571843	0.115292474214878	0.082895876631344	0.0830970696746317	NaN	NaN	0.112101962485983	0.303733120377924	853	1	146	0.146	0.853	0.292
ORF3a	all	ss12	180	CTC	ACT	CAA	2	AAACTCAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.83333333333331	4	29.83333333333334	0.233185780458787	0.147714914296514	1.57862042278753	0.0854708661622732	0.0696306145486925	0.0824230206893894	NaN	NaN	0.107317264604193	0.425781188009797	810	0	190	0.19	0.81	0.38
ORF3a	all	ss12	181	AAA	CAA	ACA	2	CTCAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.33333333333331	3	30.000000000000004	0.214724926668622	0.107325632730505	2.00068633378381	0.107399293938117	0.068134752651494	0.0647078604210421	NaN	NaN	0.100410897942014	0.284800303346301	861	0	139	0.139	0.861	0.278
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.99999999999999	3	30.41666666666667	0.199277374299754	0.105746684778908	1.88447869279682	0.0935306895208463	0.07008361640328	0.064780080343703	NaN	NaN	0.10163340173081	0.357429014718457	832	0	168	0.168	0.832	0.336
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.66666666666666	3	29.583333333333332	0.18143524049715	0.108952531416164	1.66526870132209	0.0724827090809861	0.0603780464341901	0.0665777905575563	NaN	NaN	0.100905210349526	0.472557078636881	770	1	229	0.229	0.77	0.458
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.33333333333333	4	30.25	0.184892999968705	0.145469445655623	1.27100917402553	0.0394235543130818	0.0652463306307354	0.0800127747856504	NaN	NaN	0.107573147740503	0.714005913416263	655	0	345	0.345	0.655	0.69
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81	4	29.583333333333332	0.180591011470439	0.149095891727942	1.21124069467968	0.0314951197424964	0.0640988668676389	0.08106684048723	NaN	NaN	0.112592371792827	0.779687007189164	606	1	393	0.393	0.606	0.786
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.66666666666666	4	28.916666666666668	0.178926016229881	0.152908411727716	1.17015155810064	0.026017604502165	0.0618964105612157	0.0846932873999835	NaN	NaN	0.112068313500661	0.81641495830474	614	0	386	0.386	0.614	0.772
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.16666666666666	4	29.25	0.196003572834134	0.150978005779684	1.29822600200558	0.0450255670544508	0.0663749902683411	0.0838665959617514	NaN	NaN	0.113960927924495	0.692771650452913	676	0	324	0.324	0.676	0.648
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.66666666666666	4	29.75	0.197393289332614	0.148172379571929	1.33218680770927	0.049220909760685	0.067734588771733	0.0793746653478823	NaN	NaN	0.108453619243763	0.649941872665712	680	0	320	0.32	0.68	0.64
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.66666666666666	4	30.25	0.20315621560155	0.145469445655623	1.39655592063292	0.0576867699459266	0.0660464851991548	0.0808030039583819	NaN	NaN	0.110785922637034	0.602572378171225	712	0	288	0.288	0.712	0.576
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.33333333333331	4	30.25	0.217865342534542	0.145469445655623	1.49767081020096	0.0723958968789189	0.0658595815920079	0.0760687402091366	NaN	NaN	0.116390373540099	0.533935740905941	721	0	279	0.279	0.721	0.558
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.99999999999999	4	30.583333333333332	0.202172332401979	0.143721781908901	1.40669235878336	0.0584505504930782	0.0682926394182949	0.0794115584090507	NaN	NaN	0.105789380845239	0.58059341895391	718	0	282	0.282	0.718	0.564
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGGATTGG	1:1	TRUE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.49999999999999	4	30.583333333333332	0.203651779146104	0.143721781908901	1.416986182896	0.0599299972372034	0.0691889544923737	0.0758730310606803	NaN	NaN	0.111880604652811	0.592193352132794	714	0	286	0.286	0.714	0.572
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:GATTGGCAC	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.66666666666666	6	31.083333333333336	0.173011971365532	0.223170685092358	0.775245060944863	-0.050158713726826	0.0600033132401473	0.126305526794792	NaN	NaN	0.145162047789563	0.729691448846899	347	0	653	0.653	0.347	0.694
ORF3a	all	ss12	194	CAC	GCA	ATC	2	TGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.66666666666666	6	31.750000000000004	0.192221818973333	0.217732646143538	0.882834165560146	-0.0255108271702051	0.059805604593268	0.120843518563788	NaN	NaN	0.141433035512435	0.856859048778663	472	0	528	0.528	0.472	0.944
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.49999999999999	6	31.250000000000004	0.159636110589833	0.221785683111784	0.719776445215236	-0.0621495725219514	0.0523728828453437	0.116323538176688	NaN	NaN	0.137463132487878	0.651183893273267	301	0	699	0.699	0.301	0.602
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.99999999999999	6	31.41666666666667	0.158481820250405	0.220417888585699	0.719006162645403	-0.0619360683352935	0.0492872718544182	0.117889239910586	NaN	NaN	0.132301519074268	0.639682123849165	330	0	670	0.67	0.33	0.66
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.16666666666666	6	31.583333333333336	0.158100771086867	0.219066980579392	0.721700598916004	-0.0609662094925241	0.0515763559590278	0.110590058498943	NaN	NaN	0.136922649384154	0.656131709400759	303	0	697	0.697	0.303	0.606
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.25	6	32.16666666666667	0.15791093535129	0.214467334863233	0.736293643281345	-0.056556399511943	0.0524482239752253	0.108883824089713	NaN	NaN	0.129788278064529	0.663011653943215	348	0	652	0.652	0.348	0.696
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTG	2	AAAGACTGT:AAAGATTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.25	6	31.666666666666668	0.15791093535129	0.218397760919419	0.723042831055186	-0.0604868255681287	0.0510127387244711	0.114567489904139	NaN	NaN	0.137393641917208	0.659759872764407	341	0	659	0.659	0.341	0.682
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTG	TGT	2	GACTGTGTT:GATTATGTC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.08333333333334	6	31.666666666666668	0.158291065496404	0.218397760919419	0.724783371542018	-0.0601066954230148	0.050405831678744	0.114409150341887	NaN	NaN	0.134627003144674	0.655258972830973	335	0	665	0.665	0.335	0.67
ORF3a	all	ss12	201	GTC	TGT	CGT	2	TATGTCGTT:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333334	5	32.333333333333336	0.158864717514625	0.173179167487274	0.91734311822638	-0.0143144499726495	0.0520377203035657	0.10272897784596	NaN	NaN	0.123087859012859	0.907419086759732	482	0	518	0.518	0.482	0.964
ORF3a	all	ss12	202	GTA	CGT	ATT	2	GTCGTTGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.33333333333334	5	32.833333333333336	0.160024633856936	0.17021844254226	0.940113371188945	-0.0101938086853242	0.0523195334242154	0.0985251313056232	NaN	NaN	0.115727277952795	0.92980931467357	460	0	540	0.54	0.46	0.92
ORF3a	all	ss12	203	GTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.08333333333334	5	33.083333333333336	0.160610991304224	0.168775880107432	0.951622893046025	-0.00816488880320848	0.051522282648607	0.105324815530413	NaN	NaN	0.117054043283136	0.944390133347411	482	1	517	0.517	0.482	0.964
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	GTACATGGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.83333333333334	5	33.166666666666664	0.145028544735405	0.168300466878196	0.861723959686733	-0.023271922142791	0.051085745593039	0.0964750959473165	NaN	NaN	0.114271811938075	0.838623819252297	425	0	575	0.575	0.425	0.85
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:CATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	32.833333333333336	0.146091244169313	0.17021844254226	0.858257436664322	-0.0241271983729469	0.0506503294402359	0.101495583059722	NaN	NaN	0.117322931355822	0.837066065423034	427	0	573	0.573	0.427	0.854
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.83333333333334	5	33	0.131083275220683	0.169253998250676	0.774476683419554	-0.0381707230299936	0.0484568348968265	0.102282686810073	NaN	NaN	0.113806079134459	0.737322280469295	364	0	636	0.636	0.364	0.728
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	5	32.83333333333333	0.130765040358583	0.17021844254226	0.768218992052627	-0.039453402183677	0.0465727428406195	0.0994163377361019	NaN	NaN	0.117233360454594	0.736465705739275	369	0	631	0.631	0.369	0.738
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CGA	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.33333333333334	5	32.5	0.13013319533385	0.172180831233375	0.755793745457451	-0.0420476358995253	0.0485590398562349	0.0988327921434911	NaN	NaN	0.11380421548097	0.711774860668595	395	0	605	0.605	0.395	0.79
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.66666666666667	5	33.166666666666664	0.131403066768818	0.168300466878196	0.780764719232291	-0.0368974001093777	0.048047613926655	0.102215618017251	NaN	NaN	0.116074220466532	0.750577748755819	417	0	583	0.583	0.417	0.834
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	5	32.5	0.130765040358583	0.172180831233375	0.759463404967208	-0.0414157908747918	0.0474022610834236	0.104855996374704	NaN	NaN	0.117438225176062	0.724343181886179	399	0	601	0.601	0.399	0.798
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.66666666666667	5	32.5	0.113962844188242	0.172180831233375	0.661878812942748	-0.0582179870451332	0.0446250537894207	0.101097065954828	NaN	NaN	0.114984699384538	0.612638531864132	350	0	650	0.65	0.35	0.7
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.83333333333333	0.128887692694994	0.17021844254226	0.757189942347142	-0.0413307498472659	0.0472189623252868	0.103608370505821	NaN	NaN	0.112337862220515	0.712936845691949	371	0	629	0.629	0.371	0.742
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.66666666666669	5	33.166666666666664	0.12950744207608	0.168300466878196	0.769501383319442	-0.0387930248021161	0.0483699728444491	0.102830834483845	NaN	NaN	0.119356779566118	0.745167936738678	379	0	621	0.621	0.379	0.758
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.5	0.128887692694994	0.172180831233375	0.748560056144108	-0.0432931385383807	0.0473986423461941	0.100389526181303	NaN	NaN	0.125253763047812	0.729610713373379	356	0	644	0.644	0.356	0.712
ORF3a	all	ss12	215	GAG	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.83333333333336	5	31.83333333333333	0.127364024533652	0.176245193423779	0.722652471023176	-0.0488811688901276	0.0483356038544451	0.107953745712639	NaN	NaN	0.117812394580427	0.678210099030281	346	0	654	0.654	0.346	0.692
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.50000000000003	5	30.83333333333333	0.114234586398441	0.182716561993313	0.625201049933402	-0.0684819755948721	0.0468704271953412	0.122226357731789	NaN	NaN	0.122967080716965	0.57758681781278	288	0	712	0.712	0.288	0.576
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.16666666666669	5	29.83333333333333	0.114781984854672	0.189683904532547	0.605122427954751	-0.074901919677875	0.0455875191280692	0.111850913818555	NaN	NaN	0.126605933704722	0.55410869043284	286	0	714	0.714	0.286	0.572
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AAT	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	30.166666666666664	0.115334665090852	0.187302855665743	0.615765652268946	-0.0719681905748906	0.0456733926816168	0.118458836406137	NaN	NaN	0.127991457692014	0.573919121995217	277	0	723	0.723	0.277	0.554
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTACT:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	29.499999999999996	0.115334665090852	0.192126605059278	0.600305538398846	-0.0767919399684257	0.0454845196266228	0.115964321531254	NaN	NaN	0.134608215362276	0.568348932885091	285	0	715	0.715	0.285	0.57
ORF3a	all	ss12	220	ACT	GAG	TAC	2	ATTACTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.1666666666667	6	29.41666666666666	0.0843980831669965	0.238043979028558	0.354548279319728	-0.153645895861561	0.0343700112497582	0.137006699202566	NaN	NaN	0.149861133575871	0.30524282187783	95	0	905	0.905	0.095	0.19
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	ACTACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.1666666666667	6	29.08333333333333	0.0843980831669965	0.24126182510618	0.34981946741824	-0.156863741939184	0.0336083023961596	0.141645812729166	NaN	NaN	0.140248749477792	0.26336715512146	94	0	906	0.906	0.094	0.188
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.1666666666667	6	29.08333333333333	0.0843980831669965	0.24126182510618	0.34981946741824	-0.156863741939184	0.0343830657561449	0.144741150323224	NaN	NaN	0.144497191510201	0.277663379465068	88	0	912	0.912	0.088	0.176
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.50000000000004	6	28.749999999999993	0.0864264476831885	0.244568640424989	0.353383195543813	-0.158142192741801	0.0353466661661981	0.146786616892385	NaN	NaN	0.147896756712799	0.284946112701034	114	0	886	0.886	0.114	0.228
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.83333333333337	6	29.41666666666666	0.0872653886078579	0.238043979028558	0.366593555375701	-0.1507785904207	0.0363416606103598	0.131473106139538	NaN	NaN	0.142191222619891	0.28896580292305	99	0	901	0.901	0.099	0.198
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TGA	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.83333333333337	6	30.41666666666666	0.0885548256923263	0.228889480485489	0.386889015189758	-0.140334654793163	0.0357452822820413	0.127629111009384	NaN	NaN	0.14672437797015	0.338844508936318	125	0	875	0.875	0.125	0.25
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.4166666666667	6	30.16666666666666	0.0724326033146383	0.231110927283054	0.313410552093568	-0.158678323968416	0.032304236234294	0.132186013758094	NaN	NaN	0.14033427274072	0.258174295494289	79	0	921	0.921	0.079	0.158
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAC	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AACAAGCTT:AATAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAC:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAC	AGA	CCC	2	AAAGACCCA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCA	CCC	A--	1	GACCCA---:GAGCCTGAA	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCA---CCG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	CCG	-CC	ACA	1	---CCGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	2	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AAT	ACA	TGT	2	CCGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG:CCGACGATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT:ACGATGACT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT:ATGACTACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.75000000000001	5	30.916666666666668	0.260656845281595	0.182159096576957	1.43092961142061	0.0784977487046378	0.0631296784349476	0.0884775660048704	NaN	NaN	0.101494786534469	0.439275892297431	774	0	226	0.226	0.774	0.452
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.08333333333334	5	30.916666666666668	0.263223932942835	0.182159096576957	1.44502216957159	0.0810648363658779	0.0658587822025013	0.0896168236502353	NaN	NaN	0.102317071611304	0.428191352205488	812	1	187	0.187	0.812	0.374
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.25000000000001	5	31.416666666666668	0.266505540694197	0.178884786483983	1.48981669113633	0.0876207542102134	0.0655148326822048	0.08807091439289	NaN	NaN	0.0971330394943801	0.367019939568534	796	1	203	0.203	0.796	0.406
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA:TTTATGAGC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.08333333333334	5	30.916666666666668	0.267171809494173	0.182159096576957	1.4666948536457	0.0850127129172165	0.0628421573810467	0.0891392430622366	NaN	NaN	0.0996707877260164	0.393695297691616	810	0	190	0.19	0.81	0.38
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGCATT	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.58333333333334	5	30.416666666666668	0.26919097092383	0.185556129985381	1.45072529236861	0.0836348409384491	0.0661782155240559	0.093119199208798	NaN	NaN	0.107579307044859	0.436908077621978	778	0	222	0.222	0.778	0.444
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGCATTTTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.83333333333334	5	30.416666666666668	0.250477612683731	0.185556129985381	1.34987517094405	0.0649214826983507	0.0629685816541968	0.0888041020552078	NaN	NaN	0.102767939708487	0.527564007184376	745	0	255	0.255	0.745	0.51
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.33333333333334	5	31.083333333333336	0.256193776295553	0.181054357970061	1.41501027187601	0.0751394183254918	0.0642953778327649	0.085584952268182	NaN	NaN	0.10618604337404	0.479180975098193	783	0	217	0.217	0.783	0.434
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.66666666666667	5	30.75	0.254900869216763	0.183277466946071	1.39079218773668	0.071623402270692	0.0631122654125665	0.0899336799977696	NaN	NaN	0.0941245345311711	0.446691135173841	801	0	199	0.199	0.801	0.398
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	GGG	2	ACAATTGGA:ACATTGGGA	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78	5	31.416666666666668	0.257499995250869	0.178884786483983	1.43947397826323	0.0786152087668853	0.066591227552314	0.0910010931054831	NaN	NaN	0.0991285165786806	0.427740824486562	798	1	201	0.201	0.798	0.402
ORF3a	all	ss12	11	GGA	GGG	AAC	2	ATTGGAACT:TTGGGAGCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.75	5	31.333333333333332	0.22303140124308	0.179422266799376	1.24305307931745	0.0436091344437048	0.0537029628302638	0.0900422300877704	NaN	NaN	0.090675451039233	0.630561627334348	718	1	281	0.281	0.718	0.562
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGAGCAATC	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.58333333333333	5	31.166666666666668	0.220282043117094	0.180507022556888	1.22035165167976	0.0397750205602068	0.052647622139764	0.0874458271536772	NaN	NaN	0.0875178312706494	0.649484069459832	684	0	316	0.316	0.684	0.632
ORF3a	all	ss12	13	ATC	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:GCAATCACG	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.74999999999999	5	31.166666666666668	0.219740343511106	0.180507022556888	1.21735066258629	0.0392333209542178	0.0522344698889065	0.086270238065672	NaN	NaN	0.0914926247532532	0.668058569283122	641	1	358	0.358	0.641	0.716
ORF3a	all	ss12	14	ACG	AAC	GCG	2	ATCACGCGC:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.99999999999999	5	31.083333333333332	0.202172332401979	0.181054357970061	1.11663886287349	0.021117974431918	0.0519465099561646	0.0893875756845932	NaN	NaN	0.0909164416976652	0.816321370946322	613	0	387	0.387	0.613	0.774
ORF3a	all	ss12	15	CGC	GCG	CAA	2	ACGCGCAAT:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.75	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.91666666666664	5	31.166666666666668	0.219201320467129	0.180507022556888	1.21436450151432	0.0386942979102414	0.0539959600082457	0.0868874739753553	NaN	NaN	0.0907669958332626	0.66988662838149	687	1	312	0.312	0.687	0.624
ORF3a	all	ss12	16	AAG	CAA	GCA	2	CGCAATCCA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.58333333333331	4	31.416666666666668	0.203403693684308	0.139531497680893	1.45776184635737	0.0638721960034151	0.0510860599405066	0.0738935835137988	NaN	NaN	0.0837076182328972	0.44544000416723	800	0	200	0.2	0.8	0.4
ORF3a	all	ss12	17	CAA	GCA	AGC	2	AAGCAAGGT:AATCCAGCG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.08333333333331	4	31.75	0.204901396368095	0.137923200937065	1.48561949676322	0.0669781954310294	0.051167373539247	0.0754503099696323	NaN	NaN	0.0850107179172514	0.430767237979961	775	0	225	0.225	0.775	0.45
ORF3a	all	ss12	18	GCG	AGC	GAA	2	CAAGGTGAA:CCAGCGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.08333333333331	4	30.916666666666664	0.20192785781644	0.142015736265178	1.42186959788309	0.0599121215512613	0.0529134574828185	0.0783324751724394	NaN	NaN	0.0934521109597874	0.521457900424207	752	0	248	0.248	0.752	0.496
ORF3a	all	ss12	19	AAA	GAA	AAT	2	GCGAAAATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.33333333333331	4	30.916666666666664	0.184892999968705	0.142015736265178	1.30191910298915	0.0428772637035266	0.0508947730296889	0.0815149207773312	NaN	NaN	0.0908206289109951	0.636848773392043	688	0	312	0.312	0.688	0.624
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAAATTGAA:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.49999999999999	4	31.083333333333332	0.16853783682123	0.141177857059553	1.19379795338681	0.0273599797616776	0.0468345570146206	0.0745346075205876	NaN	NaN	0.0888555264376882	0.758146751810059	643	0	357	0.357	0.643	0.714
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	AAA	2	ATCAAGGAT:ATTGAAAAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.99999999999999	4	31.749999999999996	0.169734844556617	0.137923200937065	1.23064751545367	0.0318116436195513	0.0479457512156062	0.0759792687390453	NaN	NaN	0.0824244089057465	0.699534211504937	666	0	334	0.334	0.666	0.668
ORF3a	all	ss12	22	AAT	AAA	TGC	2	AAGGATGCT:GAAAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.66666666666666	4	32.416666666666664	0.156968578879544	0.134815620966532	1.16432040852678	0.022152957913012	0.0475856134276184	0.0735356196948212	NaN	NaN	0.0858839910159127	0.796452842700147	605	0	395	0.395	0.605	0.79
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.99999999999999	4	32.416666666666664	0.142608211856373	0.134815620966532	1.05780183953442	0.00779259088984111	0.0441119339658038	0.0749734055794762	NaN	NaN	0.0797450086443827	0.922155543554247	558	0	442	0.442	0.558	0.884
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666666	4	32.916666666666664	0.159249476407496	0.132575542143044	1.20119800253708	0.0266739342644514	0.0471323150912618	0.0733310045198692	NaN	NaN	0.0832340702789902	0.748612872176092	647	0	353	0.353	0.647	0.706
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.5	5	33.08333333333333	0.143635503733589	0.168775880107432	0.851042836465493	-0.0251403763738432	0.0472346364047372	0.0860441355096092	NaN	NaN	0.0968146737351369	0.795114271428527	411	0	589	0.589	0.411	0.822
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.66666666666666	5	32.58333333333333	0.141261198495611	0.171685985854599	0.822788172211364	-0.0304247873589874	0.0469420152538732	0.0885535061818065	NaN	NaN	0.0925473474427589	0.742345908996564	377	1	622	0.622	0.377	0.754
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.75	5	32.5	0.12572916000110201	0.172180831233375	0.730215780121819	-0.0464516712322729	0.0431052409105515	0.0857490178751892	NaN	NaN	0.0931285030837809	0.617926537392177	285	0	715	0.715	0.285	0.57
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.66666666666666	4	32.916666666666664	0.112359208671495	0.132575542143044	0.847510836880181	-0.0202163334715491	0.0410765928180105	0.0701499444370147	NaN	NaN	0.0848637483673741	0.811709631109446	439	0	561	0.561	0.439	0.878
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.66666666666666	3	33.25	0.112359208671495	0.0961313950679982	1.16880867683256	0.0162278136034969	0.0386652997898228	0.0615864404130458	NaN	NaN	0.0737474968886483	0.825835626451859	611	0	389	0.389	0.611	0.778
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.5	3	33.75	0.127969137773073	0.094613463995175	1.35254679798637	0.0333556737778975	0.0435946086903916	0.0565967182858681	NaN	NaN	0.0774276747136217	0.666615381969677	686	0	314	0.314	0.686	0.628
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACT:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.66666666666666	2	33.25	0.1276658623949	0.0626996766264699	2.03614865759936	0.0649661857684305	0.0428532782007155	0.0467987789949891	NaN	NaN	0.0676751525361695	0.337069796280596	846	0	154	0.154	0.846	0.308
ORF3a	all	ss12	32	ACT	TAC	TGC	2	GCTACTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.25	2	32.666666666666664	0.124855023415448	0.0638683562552301	1.95488080069736	0.0609866671602181	0.0411892275317739	0.0489322639667132	NaN	NaN	0.0710549460724578	0.390725221636862	812	0	188	0.188	0.812	0.376
ORF3a	all	ss12	33	GCA	TGC	AAC	2	ACTGCAACG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.58333333333333	2	31.999999999999996	0.122582464773988	0.0652585327422224	1.87841282393217	0.0573239320317657	0.0424972321844683	0.0489786243957432	NaN	NaN	0.0695021235036842	0.40949674344357	810	0	190	0.19	0.81	0.38
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.75	2	32.5	0.137211534497054	0.0642103145422439	2.13690799484845	0.0730012199548105	0.0439842968924559	0.0491503314556242	NaN	NaN	0.069717654391238	0.295054358660873	848	0	152	0.152	0.848	0.304
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCA:ACGATACCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.74999999999999	2	33.166666666666664	0.139125907283501	0.0628640039123036	2.21312513720227	0.0762619033711971	0.0458156033425208	0.0476809327681499	NaN	NaN	0.0692344711026235	0.270678266046497	868	0	132	0.132	0.868	0.264
ORF3a	all	ss12	36	CCA	ACC	ACT	2	ATACCACTA:ATACCGATA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.74999999999999	2	33.83333333333333	0.141094614194941	0.0615730216404005	2.29150057015171	0.0795215925545409	0.0449929622651686	0.0477114465628195	NaN	NaN	0.0674623259668082	0.238495520486615	888	0	112	0.112	0.888	0.224
ORF3a	all	ss12	37	ATA	ACT	ACA	2	CCACTACAA:CCGATACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.91666666666666	2	33.83333333333333	0.156408563919793	0.0615730216404005	2.54021257610601	0.0948355422793923	0.0480914675195202	0.0497596632332327	NaN	NaN	0.0689758802923848	0.169159732051318	924	0	76	0.076	0.924	0.152
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.58333333333333	2	33.83333333333333	0.139450189981991	0.0615730216404005	2.26479367532764	0.0778771683415902	0.0446636864543213	0.0455544664979719	NaN	NaN	0.0687231854744099	0.257129940859384	879	0	121	0.121	0.879	0.242
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CAC	2	CAAGCCACA:CAAGCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.41666666666666	2	33.33333333333333	0.13977599230927	0.0625362067042884	2.23512105507489	0.0772397856049819	0.0445723856878184	0.0496214680475213	NaN	NaN	0.0682367293562062	0.257660263158401	879	1	120	0.12	0.879	0.24
ORF3a	all	ss12	40	ACA	CAC	ACT	2	GCCACATTC:GCCTCACTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.41666666666666	2	33.33333333333333	0.13977599230927	0.0625362067042884	2.23512105507489	0.0772397856049819	0.0441550110566061	0.0476141420655804	NaN	NaN	0.0703612723359833	0.272309331487344	869	0	131	0.131	0.869	0.262
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	ACATTCCCT:TCACTCCCT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.91666666666666	2	33	0.138803133576506	0.0631952577133049	2.19641692429214	0.0756078758632013	0.0458512495123188	0.0473348695978833	NaN	NaN	0.0727287652268912	0.29853183832176	855	1	144	0.144	0.855	0.288
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC:TTCCCTTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.08333333333333	2	32.5	0.123424890893523	0.0642103145422439	1.9221972633746	0.0592145763512795	0.0420617977750757	0.0483585351465239	NaN	NaN	0.0669470839613273	0.376427324885411	813	0	187	0.187	0.813	0.374
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.08333333333333	2	32.5	0.123424890893523	0.0642103145422439	1.9221972633746	0.0592145763512795	0.0416278568652949	0.0493893945238725	NaN	NaN	0.0677304500126328	0.38197223109365	833	0	167	0.167	0.833	0.334
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.75	2	32.83333333333333	0.123992985319038	0.0635300231041221	1.95172265427671	0.0604629622149156	0.0417527221225199	0.0485472123386117	NaN	NaN	0.0700606341031039	0.38813248381495	832	0	168	0.168	0.832	0.336
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.75	2	32.83333333333333	0.123992985319038	0.0635300231041221	1.95172265427671	0.0604629622149156	0.0411820942335264	0.0484523556867824	NaN	NaN	0.0686612140653866	0.378535169970194	815	0	185	0.185	0.815	0.37
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77	2	33.58333333333333	0.127063613968535	0.0620508745044359	2.04773284797866	0.0650127394640992	0.0430566402495245	0.0467245697623764	NaN	NaN	0.0666930797039994	0.329657056690349	852	0	148	0.148	0.852	0.296
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77	2	33.58333333333333	0.127063613968535	0.0620508745044359	2.04773284797866	0.0650127394640992	0.0428380131969509	0.0494631831495249	NaN	NaN	0.0637359176893259	0.307712809290294	867	0	133	0.133	0.867	0.266
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.5	2	33.58333333333333	0.143635503733589	0.0620508745044359	2.31480224703877	0.0815846292291533	0.0473833565639539	0.0490988887515156	NaN	NaN	0.0708983612882459	0.249844735526191	890	1	109	0.109	0.89	0.218
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.58333333333333	2	33.5	0.143463258720043	0.0622118122355632	2.30604532426774	0.0812514464844796	0.0450798436276348	0.0473358823295456	NaN	NaN	0.0688077791705273	0.237663584910475	893	0	107	0.107	0.893	0.214
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.08333333333333	2	34	0.144502989596306	0.0612585232607003	2.35890422923418	0.0832444663356058	0.0481987770580564	0.0480838889155692	NaN	NaN	0.0663331433971238	0.209498618833399	891	0	109	0.109	0.891	0.218
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.16666666666666	2	33.166666666666664	0.158100771086867	0.0628640039123036	2.51496502366316	0.0952367671745638	0.0481382303700708	0.0451380675565274	NaN	NaN	0.068703057150452	0.165683222861558	910	1	89	0.089	0.91	0.178
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78	2	33.33333333333333	0.172180831233375	0.0625362067042884	2.75329829401961	0.109644624529087	0.0493213980325158	0.0485604859102661	NaN	NaN	0.0708889145192194	0.121933083280198	933	0	67	0.067	0.933	0.134
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.66666666666666	2	33.33333333333333	0.170542381646746	0.0625362067042884	2.72709827849298	0.108006174942457	0.0479358512619985	0.0483472846273295	NaN	NaN	0.0727186121663714	0.13747449359692	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.33333333333333	2	32.666666666666664	0.168934951133241	0.0638683562552301	2.64504930200716	0.105066594878011	0.0482190730227063	0.0495382745598897	NaN	NaN	0.070341271762409	0.135262088639787	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.16666666666666	3	33.166666666666664	0.185334556070405	0.0963891381007337	1.92277428476138	0.0889454179696709	0.0504632645740064	0.0619196058018996	NaN	NaN	0.076173320095843	0.242939280978581	883	0	117	0.117	0.883	0.234
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.83333333333333	3	33.166666666666664	0.183580928580378	0.0963891381007337	1.90458107830078	0.087191790479644593	0.0507529948236988	0.0572356289618445	NaN	NaN	0.0801368429403671	0.276579102649158	866	0	134	0.134	0.866	0.268
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAG	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.66666666666667	3	33.83333333333333	0.20315621560155	0.0943651299007743	2.15287379792907	0.108791085700776	0.0558326831816658	0.0559656002562467	NaN	NaN	0.0816597832577494	0.182778697138154	917	0	83	0.083	0.917	0.166
ORF3a	all	ss12	58	AGC	AAG	CGC	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.16666666666667	3	33.83333333333333	0.201683977327343	0.0943651299007743	2.13727229051044	0.107318847426569	0.053198253693273	0.0581427492846843	NaN	NaN	0.0805568378112348	0.182790283965404	918	0	82	0.082	0.918	0.164
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCC:AGCGCTTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.33333333333334	3	34.166666666666664	0.221099655165484	0.0933847109044368	2.36762156271749	0.127714944261047	0.0567717855664201	0.0552613937666459	NaN	NaN	0.080005189903163	0.110414411866463	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	60	TCC	TTC	CAA	2	GCTTCCAAA:GCTTCTAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.66666666666667	3	33.833333333333336	0.220010857490594	0.0943651299007742	2.3314847096797	0.12564572758982	0.0603491614239009	0.058464486827413	NaN	NaN	0.0829665924702077	0.129920997712943	928	0	72	0.072	0.928	0.144
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	TCCAAAATC:TCTAAAGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.5	3	34	0.220553902912914	0.0938723572155045	2.34950851832328	0.126681545697409	0.0583890414996778	0.0593300547273049	NaN	NaN	0.081689166825886	0.120955531543002	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	62	ATC	AAT	AAT	2	AAAATCATA:AAAGTAATT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.16666666666667	3	34.666666666666664	0.224997455190221	0.0919517415692493	2.44690803404494	0.133045713620971	0.0577295191687837	0.0577483591900622	NaN	NaN	0.0816637590749717	0.103272974355586	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATCATAACC:GTAATTGCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.16666666666667	3	34.666666666666664	0.224997455190221	0.0919517415692493	2.44690803404494	0.133045713620971	0.058705812325631	0.0568768994909153	NaN	NaN	0.0820141500978306	0.104754374268704	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTT	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.5	3	35	0.227287577010071	0.0910206427532006	2.4970992308454	0.136266934256871	0.0603093085309233	0.0584230189399407	NaN	NaN	0.0838356606034372	0.104076209100892	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.41666666666667	3	35.583333333333336	0.227577149508142	0.0894358561096487	2.54458512958306	0.13814129339849399	0.0591370809363645	0.0546427056439805	NaN	NaN	0.0814817107958802	0.0900060783833069	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTTCATAGA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.75	3	35.583333333333336	0.226423297579346	0.0894358561096487	2.53168368290398	0.136987441469697	0.0581628151906287	0.0535730976756754	NaN	NaN	0.0777281848563882	0.0780032841959442	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	AAG	2	AAAAAGAGA:CATAGAAGG	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.5	3	35.916666666666664	0.209794072585264	0.0885548256923263	2.36908684473244	0.121239246892938	0.0544635934899598	0.0557241773377955	NaN	NaN	0.081350925365146	0.136139031357736	933	0	67	0.067	0.933	0.134
ORF3a	all	ss12	68	AGA	AAG	ATG	2	AAGAGATGG:AGAAGGTGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.5	2	35.916666666666664	0.227287577010071	0.0578600049104132	3.92823293675811	0.169427572099658	0.0570953897324319	0.0413382528294744	NaN	NaN	0.068504959261395	0.0133903125232422	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGGTGGCAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.08333333333333	2	36.333333333333336	0.246788896582768	0.0571705240409132	4.31671566288526	0.189618372541855	0.0615452674786275	0.0418815116583637	NaN	NaN	0.070300854058684	0.00699165700451994	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	75.91666666666666	3	36.166666666666664	0.24743074621853	0.0879053734766805	2.81473971877462	0.159525372741849	0.0624096435619575	0.0568603223115177	NaN	NaN	0.0868757115534328	0.0663209505569489	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTCGCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.25	3	35.833333333333336	0.246150398079761	0.0887734500607747	2.77279296806922	0.157376948018986	0.0593254442869578	0.0543947974950489	NaN	NaN	0.0840242457877855	0.0610691481156806	966	0	34	0.034	0.966	0.068
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTCGCCTTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.99999999999999	3	35.25	0.280135131226172	0.0903346148069003	3.10108292181231	0.189800516419271	0.0731229861658043	0.0564563079400652	NaN	NaN	0.0955807617233143	0.0470599059635767	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	ATA	2	GCACTCTCC:GCCTTATAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.49999999999999	3	34.916666666666664	0.277947211843005	0.091251642986027	3.04594199893547	0.186695568856978	0.0690784606118157	0.0544504332254497	NaN	NaN	0.0909164050830736	0.0400254620583737	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	74	TAT	ATA	CAA	2	CTCTCCAAG:TTATATAAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.33333333333331	3	34.416666666666664	0.274376485003047	0.0926626795339059	2.96102472304021	0.181713805469142	0.0699489796529073	0.0578835962227493	NaN	NaN	0.0909951315248523	0.0458293282943151	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	75	AAA	CAA	AGG	2	TATAAAGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.83333333333331	2	34.25	0.272278228294921	0.0607927570603562	4.47879388040582	0.211485471234565	0.0686491608942754	0.0447847743008699	NaN	NaN	0.0838911064233707	0.0117037741859636	995	0	5	0.005	0.995	0.01
ORF3a	all	ss12	76	GGC	AGG	CGT	2	AAAGGCGTT:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.33333333333331	2	34.083333333333336	0.270212163986199	0.0611024764460933	4.42227843620363	0.209109687540105	0.0701119689504863	0.0450863226060693	NaN	NaN	0.0812449214800471	0.0100583002183867	994	0	6	0.006	0.994	0.012
ORF3a	all	ss12	77	GTT	CGT	TCA	2	GGCGTTCAA:GGTGTTCAC	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.91666666666666	2	33.75	0.267841453433817	0.0617314855970427	4.33881431563423	0.206109967836775	0.0677098237434828	0.045623812713033	NaN	NaN	0.0797931318708244	0.00979299959135379	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	78	CAA	TCA	ACT	2	GTTCAACTT:GTTCACTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.41666666666666	2	33.5	0.30215833840741	0.0622118122355632	4.85692873345815	0.239946526171847	0.0755238219731582	0.0440119112478214	NaN	NaN	0.0899823512294532	0.00766238501416335	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	79	CTT	ACT	TGT	2	CAACTTGTA:CACTTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.24999999999999	2	33	0.280251250519624	0.0631952577133049	4.43468799179564	0.217055992806319	0.0752731479757956	0.0481417673946642	NaN	NaN	0.0869476324091064	0.0125461349856165	995	0	5	0.005	0.995	0.01
ORF3a	all	ss12	80	GTA	TGT	ATG	2	CTTGTATGT:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.5	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.75	2	33	0.26452672930594	0.0631952577133049	4.18586360555735	0.201331471592635	0.0731201471163198	0.0476808025079876	NaN	NaN	0.0839700967264689	0.0165003181117016	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	81	TGC	ATG	CAA	2	GTATGTAAT:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.83333333333333	0	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.08333333333333	2	33.166666666666664	0.263223932942835	0.0628640039123036	4.18719643295449	0.200359929030531	0.0732852101783441	0.0466526189314453	NaN	NaN	0.0890201479059798	0.0244029200158199	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGTAATATG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.25	2	34	0.266505540694197	0.0612585232607003	4.35050547268367	0.205247017433496	0.0742287937222731	0.0451095720070195	NaN	NaN	0.0892587969260752	0.0214788422556314	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	83	ATG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG:AATATGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.25	2	34	0.266505540694197	0.0612585232607003	4.35050547268367	0.205247017433496	0.0740841322666429	0.045422675527516	NaN	NaN	0.083439012075597	0.0138997120904993	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GCT	2	ATGCTGCTG:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.83333333333333	2	33.5	0.246807726551292	0.0622118122355632	3.96721647678036	0.184595914315729	0.070973198203354	0.0457628698249556	NaN	NaN	0.0814634637497494	0.0234516046210421	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	85	CTG	GCT	GCT	2	CTGCTGCTT:CTGTTGTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.58333333333333	2	33.166666666666664	0.26129386407213	0.0628640039123036	4.15649414308131	0.198429860159827	0.0689155876132742	0.0474456655338691	NaN	NaN	0.0836216206508134	0.0176466894550197	995	0	5	0.005	0.995	0.01
ORF3a	all	ss12	86	CTT	GCT	GTT	2	CTGCTTTTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	82.08333333333333	2	32.666666666666664	0.259392172808674	0.0638683562552301	4.06135664071411	0.195523816553444	0.0725102272303411	0.0486218011035715	NaN	NaN	0.0809832653175225	0.015762312991185	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	87	TTT	GTT	TGT	2	CTTTTTGTG:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.08333333333333	2	32	0.238934336330373	0.0652585327422224	3.66135011453884	0.17367580358815	0.0663640332595859	0.0479691267834599	NaN	NaN	0.0787851091028133	0.0274945230982069	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTGACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.41666666666666	2	31.666666666666664	0.237810785479922	0.0659765797094679	3.60447277696323	0.171834205770454	0.0643833498060982	0.0493611321768239	NaN	NaN	0.0805438655112258	0.0328899701474737	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AAT	2	GTAACAGTT:GTGACAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.91666666666666	2	32.166666666666664	0.239500136249871	0.0649053422482923	3.6899911155799	0.174594794001579	0.0675296189003783	0.0510115379234311	NaN	NaN	0.079172191206866	0.0274362734477132	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	90	ATT	AAT	TTA	2	ACAATTTAC:ACAGTTTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.58333333333331	2	32.833333333333336	0.240639882456706	0.0635300231041221	3.78781355174877	0.177109859352584	0.0654971462865601	0.046355168650948	NaN	NaN	0.0821290721337055	0.0310460538736081	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	ATTTACTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.74999999999999	2	33.5	0.226800603533016	0.0622118122355632	3.64561962403928	0.164588791297453	0.0704879447252444	0.0465386090395603	NaN	NaN	0.0750065757023138	0.0282120658108756	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.41666666666664	2	33.833333333333336	0.227885636068375	0.0615730216404005	3.70106306296409	0.166312614427975	0.0685320616374398	0.0444353486462385	NaN	NaN	0.081441771506372	0.0411411588888677	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.08333333333331	2	32.833333333333336	0.228981181189789	0.0635300231041221	3.60429872368378	0.165451158085667	0.0677750516063118	0.0456606880700832	NaN	NaN	0.0791290930083485	0.0365368732960082	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TCT	2	CACCTTCTA:CACCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.91666666666664	2	32.333333333333336	0.229532944197988	0.0645559565784322	3.555565688491	0.164976987619556	0.0658567792188083	0.0485949731800217	NaN	NaN	0.0819541943409509	0.0441105289625344	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	95	CTA	TCT	ACT	2	CTTCTACTT:CTTTTGCTC	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.24999999999997	2	31.666666666666668	0.225192434762777	0.0659765797094679	3.4132177774966	0.15921585505331	0.0657030003201484	0.047826548062052	NaN	NaN	0.0791834493278597	0.0443548937153934	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	96	CTC	ACT	CGT	2	CTACTTCTA:TTGCTCGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.99999999999997	2	31.916666666666668	0.225993636641676	0.0654365742860851	3.45362878645884	0.160557062355591	0.0664501161377797	0.0483953660756042	NaN	NaN	0.0793256291725134	0.0429675720387395	980	0	20	0.02	0.98	0.04
ORF3a	all	ss12	97	CTA	CGT	AGC	2	CTCGTTGCT:CTTCTAGCT	1:1	TRUE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.3333333333333	2	31.25	0.221785683111784	0.0668966841033532	3.31534643434841	0.154888999008431	0.0658581403332106	0.0524521020877918	NaN	NaN	0.0792055671842837	0.0505203432109952	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	98	GCT	AGC	TGC	2	CTAGCTGCT:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.74999999999997	2	31	0.220502877731968	0.0674611774972046	3.26858922290682	0.153041700234763	0.0665573743004175	0.0467984997076646	NaN	NaN	0.0808076472773756	0.058238125057377	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC:GCTGCTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.5	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	84.49999999999997	2	30.75	0.218231098881568	0.0680352852661241	3.20761643062043	0.150195813615444	0.0641183639792439	0.0508401878388051	NaN	NaN	0.0806355731904481	0.0625115890266461	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CAT	2	GCTGGCCTT:GCTTGCATG	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.75	0.166666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	85.49999999999997	2	30.75	0.215274383162239	0.0680352852661241	3.1641578677914	0.147239097896115	0.0620952974642111	0.04993644260916	NaN	NaN	0.0816984592258247	0.0715098353885161	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CAT	GGA	2	GGCCTTGAA:TGCATGGAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	85.08333333333331	2	31.583333333333332	0.200972001243735	0.0661585688516753	3.03773199348228	0.134813432392059	0.0614444322371149	0.0508311373033674	NaN	NaN	0.0731860336799472	0.0654656401102338	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAAGCA:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	83.74999999999999	2	31.916666666666664	0.189125752990118	0.0654365742860851	2.89021476221035	0.123689178704033	0.0613205440101839	0.0492412148459785	NaN	NaN	0.0731290188878236	0.0907636786888515	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	103	GCA	AGC	ACA	2	GAAGCACAA:GAAGCCCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	82.74999999999997	2	30.916666666666664	0.191729770904647	0.0676514664202386	2.83408152180554	0.124078304484408	0.0591149105245062	0.05094594598727	NaN	NaN	0.0755681305113962	0.100602526169483	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	104	CAA	ACA	ATT	2	GCACAATTC:GCCCCTTTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	83.3333333333333	2	30.916666666666664	0.190202069099189	0.0676514664202386	2.81149957515611	0.12255060267895	0.0616597372957645	0.05130459923774	NaN	NaN	0.0770796576827201	0.111852507382119	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss12	105	TTC	ATT	CTT	2	CAATTCTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	83.3333333333333	1	30.583333333333332	0.174895415375783	0.0334317184415283	5.2314216417464	0.141463696934255	0.0550581863485657	0.0358447842749556	NaN	NaN	0.0690796955215722	0.0405763417906886	986	0	14	0.014	0.986	0.028
ORF3a	all	ss12	106	CTC	CTT	CTA	2	TTCTTGTAC:TTTCTCTAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	82.8333333333333	1	31.083333333333332	0.176085310670526	0.0328819783981324	5.35507044431752	0.143203332272393	0.0582690157248637	0.0339925982078666	NaN	NaN	0.0707713209723926	0.0430251684783102	986	0	14	0.014	0.986	0.028
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CAT	2	CTCTATCTT:TTGTACATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.66666666666664	1	31.083333333333332	0.161333534712709	0.0328819783981324	4.90644245182865	0.128451556314577	0.0546313757730754	0.0339877720588162	NaN	NaN	0.0691682529541124	0.0632985862963052	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	108	ATC	CAT	CTA	2	TACATCTAT:TATCTTTAT	1:1	TRUE	1.5	0.5	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.49999999999997	1	30.75	0.159539275483744	0.0332464403304228	4.79868743535093	0.126292835153321	0.0569473406973762	0.0353385771615137	NaN	NaN	0.0687033450538933	0.0660279095339315	978	1	21	0.021	0.978	0.042
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	ATCTATGCC:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.3333333333333	1	31.083333333333332	0.145188561804499	0.0328819783981324	4.41544483870671	0.112306583406367	0.0506429271359196	0.0364053742678981	NaN	NaN	0.0631194326319222	0.0751953238433149	966	0	34	0.034	0.966	0.068
ORF3a	all	ss12	110	GCC	TGC	CCT	2	TATGCCCTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.99999999999997	1	31.416666666666664	0.145832187994725	0.0325254218363474	4.48363709865113	0.113306766158377	0.0547124584669597	0.0360189483816392	NaN	NaN	0.0642312931598342	0.0777247318361288	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	111	CTG	CCT	AGT	2	GCCCTGATT:GCTTTAGTC	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.99999999999997	1	31.416666666666664	0.145832187994725	0.0325254218363474	4.48363709865113	0.113306766158377	0.0538208220631438	0.0371605138438912	NaN	NaN	0.0678686122437723	0.0950179860535801	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	112	ATT	AGT	CTA	2	CTGATTTAT:TTAGTCTAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.66666666666664	1	30.75	0.142670052225801	0.0332464403304228	4.29128805393484	0.109423611895378	0.0517909975314833	0.0359787412028898	NaN	NaN	0.0676007967701707	0.105517551958227	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	ATTTATATC:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.16666666666664	1	30.75	0.127696125074967	0.0332464403304228	3.84089616229129	0.0944496847445446	0.0500180687347248	0.0367192791730798	NaN	NaN	0.0644436450150898	0.142752728902572	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	114	ATC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATATCTTG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.3333333333333	1	30.583333333333332	0.127424277596548	0.0334317184415283	3.81147854602244	0.0939925591550198	0.0494156215368675	0.0365789745209337	NaN	NaN	0.0671080137637754	0.161328927744087	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss12	115	TTG	CTT	GCA	2	ATCTTGCAA:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	85.49999999999997	1	29.916666666666664	0.113423227292943	0.0341939559917542	3.31705484209825	0.0792292713011884	0.0485784707365065	0.037148152859329	NaN	NaN	0.064531134544389	0.219534017286934	896	0	104	0.104	0.896	0.208
ORF3a	all	ss12	116	CAA	GCA	AAT	2	TTGCAAATT:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	86.16666666666664	1	29.249999999999996	0.139939466685309	0.0349917687305995	3.9992110076715	0.10494769795471	0.0544000379690565	0.0375403898839462	NA	NA	0.0684145921624102	0.12503068273724	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	117	AGT	AAT	TAT	2	CAAATTGTA:CAGAGTATA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.58333333333331	1	29.249999999999996	0.155224113808277	0.0349917687305995	4.43601793905711	0.120232345077678	0.0571766995190931	0.0372393276141996	NaN	NaN	0.0737058534595281	0.102838518631807	966	0	34	0.034	0.966	0.068
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	AGTATAAAC:ATTGTAAGT	1:1	FALSE	1.5	0.75	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.24999999999997	1	29.249999999999996	0.155898728322134	0.0349917687305995	4.45529717352652	0.120906959591534	0.0602002919017844	0.0371533185527014	NaN	NaN	0.0766327738400964	0.114624252247102	948	0	52	0.052	0.948	0.104
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT:GTAAGTTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.24999999999997	1	28.999999999999996	0.141595553474679	0.0353006331434894	4.01113353687238	0.10629492033119	0.0525638717668779	0.0366851302768096	NaN	NaN	0.0708350556387503	0.133459651125995	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	120	TTT	CTT	TGT	2	AACTTTGTA:AGTTTTTGT	1:1	FALSE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.91666666666664	0	28.999999999999996	0.142207556415652	0	-Inf	0.142207556415652	0.0560491413647749	0	NaN	NaN	0.0560854252448637	0.0112270005795394	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	121	GTA	TGT	AAG	2	TTTGTAAGA:TTTTGTAGA	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.24999999999997	0	28.999999999999996	0.143447620627212	0	-Inf	0.143447620627212	0.0549691524606636	0	NaN	NaN	0.0554112901439381	0.00963167035461823	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGTAGATTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	83.66666666666664	0	29.583333333333332	0.116111183253091	0	-Inf	0.116111183253091	0.0492532448529038	0	NaN	NaN	0.0484884718760179	0.0166378613953459	999	1	0	0	0.999	0.001
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGATTTATC	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	83.49999999999999	0	29.583333333333332	0.116361886617636	0	-Inf	0.116361886617636	0.0492722309321755	0	NA	NA	0.0490730016088296	0.0177304483814593	999	1	0	0	0.999	0.001
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:TTTATCATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	82.16666666666666	0	29.083333333333332	0.104289191336005	0	-Inf	0.104289191336005	0.048509361801533	0	NA	NA	0.0472263845458475	0.0272245970772343	998	2	0	0	0.998	0.001
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATCATGAGA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	82.49999999999999	0	28.416666666666664	0.103837254348707	0	-Inf	0.103837254348707	0.0463266485523945	0	NA	NA	0.0450976536839281	0.0213071079079059	999	1	0	0	0.999	0.001
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGC:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.49999999999999	0	28.416666666666664	0.105204990412841	0	-Inf	0.105204990412841	0.0461063632539713	0	NaN	NaN	0.0461309845316942	0.0225738387012178	999	1	0	0	0.999	0.001
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	CTG	2	AGATGCTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.58333333333331	0	28.416666666666664	0.133835669008081	0	-Inf	0.133835669008081	0.0557192086724295	0	NA	NA	0.0552604905559753	0.0154393779869231	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	128	TGG	CTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGCTGGCTG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.83333333333331	1	28.583333333333332	0.118929905904287	0.0358277072015149	3.31949530667311	0.0831021987027722	0.0494788367871798	0.0386650846221472	NaN	NaN	0.0559631894626252	0.137558676674683	938	0	62	0.062	0.938	0.124
ORF3a	all	ss12	129	CTG	GCT	GTG	2	TGGCTGTGC:TGGCTTTGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.33333333333331	1	29.083333333333332	0.121340215764185	0.0351970741664875	3.44745177369651	0.0861431415976976	0.0516563190190596	0.0371500625930819	NA	NA	0.0543716532468187	0.113116549824988	958	1	41	0.041	0.958	0.082
ORF3a	all	ss12	130	TGC	GTG	CTG	2	CTGTGCTGG:CTTTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.33333333333331	1	28.749999999999996	0.149138144058874	0.0356149996994909	4.18750934486195	0.113523144359383	0.0574767864528504	0.0366605059138978	NaN	NaN	0.0627193995908173	0.0702932377772434	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGCTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.66666666666666	2	28.749999999999996	0.150503021596613	0.073005919868405	2.06151805042521	0.0774971017282085	0.0592405630793877	0.0515260263385225	NaN	NaN	0.075343253749338	0.303673724576161	859	0	141	0.141	0.859	0.282
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.66666666666666	2	28.333333333333332	0.165809675320019	0.0741343759774745	2.2366098471025	0.0916752993425442	0.0594145123959535	0.0587902323436291	NaN	NaN	0.0787243137303739	0.24421714232571	886	0	114	0.114	0.886	0.228
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAG	2	AAATGCCGT:AAGTGCAGA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.66666666666666	2	29.166666666666668	0.184016201307693	0.0719113287774619	2.55893201302333	0.112104872530231	0.0652433766729085	0.0534380434798665	NaN	NaN	0.079514852066775	0.158580791047109	924	0	76	0.076	0.924	0.152
ORF3a	all	ss12	134	AGA	CAG	ATC	2	TGCAGATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.916666666666667	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.74999999999999	2	29	0.183798305951801	0.0723451996406717	2.54057362291764	0.111453106311129	0.0653063112086679	0.0526782573959584	NaN	NaN	0.0806163424536533	0.166814375410383	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AGATCCAAA:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.33333333333331	2	29.333333333333332	0.168934951133241	0.0714826348532437	2.3633005621585	0.0974523162799978	0.0629464044906174	0.0567983350813756	NaN	NaN	0.0762866132624248	0.20144350451374	896	0	104	0.104	0.896	0.208
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAAAAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.49999999999999	2	29.833333333333332	0.16853783682123	0.0702267037754945	2.39991097061914	0.0983111330457356	0.0635169135022172	0.0562130651668031	NaN	NaN	0.0764836610624652	0.19865694745413	908	0	92	0.092	0.908	0.184
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAAAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.33333333333331	2	29.833333333333332	0.168934951133241	0.0702267037754945	2.40556571860904	0.098708247357747	0.0620886926626827	0.052536810026734	NaN	NaN	0.0774540203163134	0.202517833115304	907	0	93	0.093	0.907	0.186
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA:AATCCATTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.99999999999999	2	29.5	0.169734844556617	0.0710590256920247	2.38864581808735	0.0986758188645919	0.0616999136454497	0.0528688036134761	NaN	NaN	0.080901471419423	0.222577242666219	902	0	98	0.098	0.902	0.196
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTC:CCATTACTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.99999999999999	2	28.5	0.167357663485657	0.0736788296875599	2.27144844991905	0.0936788337980974	0.0650767481874809	0.0563039366118033	NaN	NaN	0.0827276133812853	0.257476035582449	864	0	136	0.136	0.864	0.272
ORF3a	all	ss12	140	CTC	ACT	CTA	2	TTACTCTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.33333333333331	2	27.833333333333332	0.166580058439327	0.0755354817013731	2.20532198494339	0.091044576737954	0.0632064783721831	0.0586579091452494	NaN	NaN	0.0794028204806557	0.251540192453995	876	0	124	0.124	0.876	0.248
ORF3a	all	ss12	141	TAT	CTA	TGA	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.66666666666666	2	27.5	0.18143524049715	0.0764993759663411	2.37172183701184	0.104935864530809	0.0641061369931587	0.0591823621736307	NaN	NaN	0.0835918542969233	0.209356809475159	897	0	103	0.103	0.897	0.206
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC:TATGATGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.83333333333331	2	26.833333333333332	0.183580928580378	0.0785029669229164	2.33852217025937	0.105077961657462	0.0656501087725779	0.0626080295562765	NaN	NaN	0.0846845615802418	0.214673717422122	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC:GATGCTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.16666666666666	2	27.5	0.212176706271015	0.0764993759663411	2.77357434084652	0.135677330304674	0.0709702660123298	0.0576215662864247	NaN	NaN	0.0884206789600288	0.124918374743345	944	1	55	0.055	0.944	0.11
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAT:GCTAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82.66666666666666	2	27	0.207740087501275	0.0779922851430357	2.66359790741206	0.129747802358239	0.070319716036141	0.0581199187149723	NaN	NaN	0.0833440954944742	0.119524490104066	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	145	TAT	CTA	TTT	2	AACTATTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82	2	27.666666666666668	0.242660989230208	0.0760143706952156	3.19230412632333	0.166646618534993	0.0802540148718652	0.0569279711619873	NaN	NaN	0.0927693960507304	0.072438332648104	972	0	28	0.028	0.972	0.056
ORF3a	all	ss12	146	TTT	TTT	TCT	2	TATTTTCTT:TATTTTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.16666666666666	2	27.5	0.242080044197288	0.0764993759663411	3.16447083573337	0.165580668230947	0.0829433619848828	0.0570158824636113	NaN	NaN	0.0930116022239784	0.0750407484584004	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	ATG	2	TTTCTTTGC:TTTGTATGT	1:1	TRUE	1.25	0.833333333333333	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.66666666666666	2	27.333333333333336	0.243831358478173	0.0769906155450625	3.167027003901	0.166840742933111	0.0791037023713178	0.0600540599275289	NaN	NaN	0.0982805734496385	0.0895839718764327	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	148	TGC	ATG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTATGTTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.166666666666667	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82	2	27	0.225993636641676	0.0779922851430357	2.89764091701133	0.14800135149864	0.075720081321349	0.0601191822838932	NaN	NaN	0.0940141199148059	0.115430590273729	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT:TGTTGGCAT	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.33333333333333	2	27.666666666666668	0.228158530802244	0.0760143706952156	3.00151838021602	0.152144160107028	0.0748254864807851	0.0572781482366795	NaN	NaN	0.090284876165262	0.0919583509066954	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.16666666666666	2	27.5	0.228706300945733	0.0764993759663411	2.98964923643771	0.152206924979392	0.0777278866230709	0.0592436835098409	NaN	NaN	0.0948787723306	0.108664404606224	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	151	ACT	TAC	TAA	2	CATACTAAT	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.75	3	27.5	0.230087393607353	0.117889187641809	1.95172600821072	0.112198205965543	0.0786417863093862	0.0770492373724732	NaN	NaN	0.104563787581958	0.283265701491151	873	0	127	0.127	0.873	0.254
ORF3a	all	ss12	152	AAT	TAA	TAA	2	ACTAATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.25	3	27	0.2284320849576	0.120256987556385	1.89953273900609	0.108175097401216	0.074681879144063	0.0744486394289785	NaN	NaN	0.110501414815297	0.327605859655528	862	0	138	0.138	0.862	0.276
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATAACTAT:AATTGTTAC	1:1	FALSE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.16666666666666	3	27.416666666666668	0.225458865345149	0.11827731107372	1.90618862821987	0.107181554271429	0.0767589790423234	0.07453893033298	NaN	NaN	0.108631020071402	0.323810826227086	850	0	150	0.15	0.85	0.3
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.58333333333333	3	27.75	0.244125732475453	0.116739982283845	2.09119213228831	0.127385750191608	0.0773741801052102	0.0742452373621923	NaN	NaN	0.115734521185731	0.271039424405451	880	0	120	0.12	0.88	0.24
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.91666666666667	3	27.916666666666668	0.260022955936781	0.115986237049084	2.24184319236723	0.144036718887697	0.0829650201017945	0.0721060813298437	NaN	NaN	0.107634562116059	0.180830801427456	908	0	92	0.092	0.908	0.184
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.41666666666667	3	27.083333333333336	0.275456620020365	0.119855757106799	2.29823436662217	0.155600862913566	0.0828419278429028	0.0776773984933641	NaN	NaN	0.113051042165428	0.168704921268639	919	0	81	0.081	0.919	0.162
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.75	3	26.75	0.274117044773636	0.121476995958792	2.25653460237544	0.152640048814843	0.0810100817626071	0.0764116859818535	NaN	NaN	0.112081225231111	0.173238941813968	922	0	78	0.078	0.922	0.156
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.91666666666667	3	26.75	0.273452185043192	0.121476995958792	2.25106146958025	0.1519751890844	0.0810927179766639	0.0781275149863028	NaN	NaN	0.111545556721952	0.173056067997847	918	0	82	0.082	0.918	0.164
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAC:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	83.25	3	26.083333333333336	0.272132199812821	0.124855023415448	2.17958550940571	0.147277176397373	0.0852408742628317	0.0757089694032288	NaN	NaN	0.113723007100878	0.19530238698094	890	0	110	0.11	0.89	0.22
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATACAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	83.58333333333334	4	26.083333333333336	0.270825034296094	0.171562720556584	1.57857740549627	0.0992623137395097	0.0805738807928641	0.0931130200224859	NaN	NaN	0.130584410225563	0.447171453601029	779	0	221	0.221	0.779	0.442
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAACAGT:TACAATAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	84.08333333333334	4	25.916666666666668	0.286105312004963	0.172803431663443	1.65566915686137	0.11330188034152	0.0808399242495616	0.0944442379734819	NaN	NaN	0.127850845803667	0.375507821871376	824	0	176	0.176	0.824	0.352
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.75	4	26.25	0.291739000800334	0.170339774770387	1.71268866119842	0.121399226029947	0.0841501021444689	0.0916695689890198	NaN	NaN	0.131197153987188	0.354799971849417	837	0	163	0.163	0.837	0.326
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.08333333333334	4	26.25	0.294640950387176	0.170339774770387	1.72972490297315	0.124301175616789	0.0806508954500582	0.0919279255587293	NaN	NaN	0.131509526199292	0.344563100465706	828	0	172	0.172	0.828	0.344
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.25	4	26.75	0.293909995138393	0.166773778676097	1.76232737227365	0.127136216462296	0.0847642983622273	0.0913440132391575	NaN	NaN	0.13445116543506	0.344355701403723	825	0	175	0.175	0.825	0.35
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.41666666666667	4	27.416666666666668	0.297601975168629	0.162245943584362	1.83426450359227	0.135356031584267	0.0872920415307729	0.0942097912641621	NaN	NaN	0.128760849624283	0.293157376843198	856	0	144	0.144	0.856	0.288
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAGTT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.75	4	28.083333333333336	0.282358178426184	0.157958351375551	1.78754827438574	0.124399827050633	0.0793749026429238	0.0851194070900141	NaN	NaN	0.122858783862707	0.311278398726818	861	0	139	0.139	0.861	0.278
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAGTTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81	4	27.833333333333336	0.263548415128416	0.159539275483744	1.65193438624629	0.104009139644672	0.0753854984841294	0.0810902256697617	NaN	NaN	0.123373628528779	0.399205004102562	802	0	198	0.198	0.802	0.396
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:GTTGTCATC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.83333333333334	4	27.833333333333336	0.246807726551292	0.159539275483744	1.54700292954784	0.0872684510675477	0.0739052228302397	0.0859903538858	NaN	NaN	0.118346425268634	0.460880177901752	787	0	213	0.213	0.787	0.426
ORF3a	all	ss12	169	ATC	CAT	CAC	2	GTCATCACC:GTCATTACT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80	4	28.333333333333336	0.249858334896404	0.156408563919793	1.59747221401849	0.0934497709766109	0.0790097638315602	0.0846329535213128	NaN	NaN	0.122072878932425	0.443959325232736	760	0	240	0.24	0.76	0.48
ORF3a	all	ss12	170	ACC	CAC	CTC	2	ATCACCTCA:ATTACTTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.75	4	28.500000000000004	0.250788414893047	0.155392217528976	1.613905888474	0.0953961973640707	0.075829350484594	0.0830579243152198	NaN	NaN	0.12052539087525	0.42865057987721	792	0	208	0.208	0.792	0.416
ORF3a	all	ss12	171	TCA	CTC	AGG	2	ACCTCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.08333333333334	4	28.500000000000004	0.303708714037217	0.155392217528976	1.95446540931552	0.148316496508241	0.0992910931246159	0.0858120722493455	NaN	NaN	0.132900191781847	0.264422513118749	875	1	124	0.124	0.875	0.248
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	TCAGGTGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.41666666666667	4	28.16666666666667	0.30215833840741	0.157438341821211	1.91921697670409	0.144719996586199	0.0952234655558355	0.0808442128169123	NaN	NaN	0.132826459735617	0.27591497733011	869	0	131	0.131	0.869	0.262
ORF3a	all	ss12	173	GAT	TGA	TGG	2	GGTGATGGA:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.08333333333334	4	28.16666666666667	0.29910521468218	0.157438341821211	1.89982447237565	0.141666872860969	0.0930761251659799	0.0851032357099776	NaN	NaN	0.128315651944269	0.269571525516813	879	0	121	0.121	0.879	0.242
ORF3a	all	ss12	174	GGA	TGG	AAC	2	GATGGAACA:GATGGCACA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.75	4	28.833333333333336	0.296113964785258	0.153398778089708	1.93035412975773	0.14271518669555	0.0909971529167863	0.0850348089501002	NaN	NaN	0.127742596016231	0.263904944106444	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	175	ACA	AAC	AAA	2	GGAACAAAT:GGCACAACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.75	4	28.833333333333336	0.296113964785258	0.153398778089708	1.93035412975773	0.14271518669555	0.0923547655735334	0.0814447682646688	NaN	NaN	0.132801101000145	0.282529826553112	873	0	127	0.127	0.873	0.254
ORF3a	all	ss12	176	AAT	AAA	AAG	2	ACAAATCAG:ACAACAAGT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.58333333333333	5	29.000000000000004	0.296856081021002	0.195911624447713	1.51525506389862	0.100944456573289	0.0964743839878165	0.0967624379514524	NaN	NaN	0.144401460314076	0.484518119416766	780	1	219	0.219	0.78	0.438
ORF3a	all	ss12	177	AGT	AAG	GCC	2	AATCAGCCA:ACAAGTCCT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666666	5	28.66666666666667	0.26683825481505	0.198519415670312	1.34414185088172	0.068318839144738	0.0885479125425306	0.0999346405353603	NaN	NaN	0.142178418037202	0.630861356794245	681	1	318	0.318	0.681	0.636
ORF3a	all	ss12	178	CCA	GCC	AAA	2	AGTCCTATT:CAGCCAAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666666	4	28.66666666666667	0.26683825481505	0.154389040653111	1.72834971761107	0.112449214161938	0.0914080868742999	0.0836633816827152	NaN	NaN	0.125653352381864	0.370831913640849	819	0	181	0.181	0.819	0.362
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTA:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.66666666666666	5	28.16666666666667	0.264854466829819	0.202564732921051	1.30750532439941	0.0622897339087676	0.0846087318044842	0.101726521680372	NaN	NaN	0.144539417097091	0.666502351552288	680	0	320	0.32	0.68	0.64
ORF3a	all	ss12	180	CTA	ACT	AAA	2	AAACTAAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.16666666666667	1.16666666666667	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.83333333333333	5	28.500000000000004	0.233185780458787	0.199849674976131	1.16680590291997	0.0333361054826558	0.079141069341105	0.102889567772149	NaN	NaN	0.136289546496274	0.806767968543764	599	0	401	0.401	0.599	0.802
ORF3a	all	ss12	181	AAA	AAA	ACA	2	CTAAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.5	4	28.66666666666667	0.230924148132868	0.154389040653111	1.49572888824226	0.0765351074797562	0.0803838137228113	0.0769901592306684	NaN	NaN	0.122518905973468	0.532181116604014	740	0	260	0.26	0.74	0.52
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.16666666666666	4	29.083333333333336	0.21524198382966	0.151937056450332	1.41665232207537	0.0633049273793277	0.0774702068962271	0.0818257619659873	NaN	NaN	0.124885412417707	0.612222109912931	721	0	279	0.279	0.721	0.558
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.83333333333333	4	28.25	0.196927853470251	0.156921757285409	1.25494295295252	0.0400060961848415	0.0755582354000517	0.0850714269342832	NaN	NaN	0.122621387527465	0.744229856136209	641	0	359	0.359	0.641	0.718
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAG:GACTATCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.5	4	28.916666666666668	0.200714352979387	0.152908411727716	1.31264428628557	0.0478059412516712	0.0751819388435341	0.0765340748552155	NaN	NaN	0.12716381172214	0.706961631744405	649	0	351	0.351	0.649	0.702
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAGATT:TATCAAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.16666666666667	5	28.25	0.196003572834134	0.201879034260684	0.970896128723485	-0.00587546142655018	0.0730435288830082	0.0999914781305758	NaN	NaN	0.132455804372911	0.964619118915724	465	0	535	0.535	0.465	0.93
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.83333333333333	5	27.583333333333332	0.194180942034071	0.207499077183959	0.935815930698904	-0.0133181351498886	0.0729734459662265	0.101636672279176	NaN	NaN	0.137029694657343	0.922574239396688	497	0	503	0.503	0.497	0.994
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.33333333333333	5	27.916666666666668	0.211674350763162	0.20465023999998	1.03432251417434	0.00702411076318202	0.0750402767084298	0.102297439030063	NaN	NaN	0.142668614883335	0.960733016123951	532	0	468	0.468	0.532	0.936
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.83333333333333	5	28.416666666666668	0.213188653016244	0.200521552470618	1.06317076837654	0.0126671005456263	0.0784280781350166	0.0988604528662192	NaN	NaN	0.147730994344081	0.931669632483559	549	0	451	0.451	0.549	0.902
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.83333333333333	5	28.916666666666668	0.219470498668977	0.196557091159957	1.11657380241944	0.02291340750902	0.0798240528405021	0.104190813439855	NaN	NaN	0.143528282724601	0.873161635346971	578	0	422	0.422	0.578	0.844
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.5	5	28.916666666666668	0.234333426514436	0.196557091159957	1.19219014247487	0.0377763353544784	0.0765658475463157	0.102342892108204	NaN	NaN	0.147174185972495	0.797427567813408	617	0	383	0.383	0.617	0.766
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.41666666666666	6	29	0.234622119670259	0.242080044197288	0.969192320037121	-0.0074579245270295904	0.0798866500139249	0.117999298879144	NaN	NaN	0.148434624051376	0.959928081612085	462	0	538	0.538	0.462	0.924
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGGATTGG	1:1	TRUE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.91666666666666	6	29	0.236369452063806	0.242080044197288	0.976410314396555	-0.00571059213348202	0.0783459439961376	0.11994497692241	NaN	NaN	0.155898830614091	0.970779931136468	508	0	492	0.492	0.508	0.984
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:GATTGGCAT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.41666666666666	6	29.500000000000004	0.220826439413092	0.237252996159118	0.930763543508598	-0.0164265567460254	0.0762415606884667	0.109010030911549	NaN	NaN	0.147978473820473	0.911611276513052	472	0	528	0.528	0.472	0.944
ORF3a	all	ss12	194	CAT	GCA	ATC	2	TGGCATTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.08333333333333	6	30.500000000000004	0.22528117443765	0.228158530802244	0.987388784655667	-0.00287735636459363	0.0758680485893808	0.110446123095674	NaN	NaN	0.139158467882614	0.983503449865362	516	0	484	0.484	0.516	0.968
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CATTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.91666666666666	6	30.000000000000004	0.191510018856633	0.23261619622788	0.823287552466996	-0.0411061773712462	0.06540345997974	0.111344402563971	NaN	NaN	0.137210992423321	0.764494715710997	386	0	614	0.614	0.386	0.772
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.41666666666666	6	30.16666666666667	0.190102201146667	0.231110927283054	0.822558255386335	-0.0410087261363869	0.067689177742409	0.114430250327029	NaN	NaN	0.13103570352664	0.754312255939971	384	0	616	0.616	0.384	0.768
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.58333333333333	6	30.333333333333336	0.189637541338727	0.229625165344413	0.825856961515045	-0.0399876240056862	0.0637454014602886	0.108065338323574	NaN	NaN	0.137631109367328	0.771401589800705	390	0	610	0.61	0.39	0.78
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.66666666666667	6	30.916666666666668	0.189406066724906	0.224573223705648	0.843404496758545	-0.0351671569807418	0.0671368630473585	0.108107951977051	NaN	NaN	0.125156449063914	0.778721462715871	381	0	619	0.619	0.381	0.762
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.66666666666667	6	30.416666666666668	0.189406066724906	0.228889480485489	0.827500094469888	-0.0394834137605833	0.0657355529902042	0.110555014729399	NaN	NaN	0.129582071783516	0.760596080991366	374	0	626	0.626	0.374	0.748
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTA:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.50000000000001	6	30.416666666666668	0.189869585440857	0.228889480485489	0.829525171004499	-0.0390198950446328	0.069320765819151	0.111026470963406	0.912717737670781	0.363428352255623	0.130974740610879	0.765764803774289	382	1	617	0.617	0.382	0.764
ORF3a	all	ss12	201	GTA	TGT	AGT	2	TATGTAGTA:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.58333333333334	5	30.75	0.189637541338727	0.183277466946071	1.03470188942827	0.00636007439265551	0.0654888768076272	0.0962612582445108	NaN	NaN	0.122352717235074	0.958543456344468	516	0	484	0.484	0.516	0.968
ORF3a	all	ss12	202	GTA	AGT	AAT	2	GTAGTAATA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.08333333333334	5	31.25	0.191038422684604	0.179963002222943	1.06154276337277	0.0110754204616603	0.0658321516557686	0.0922533381538712	NaN	NaN	0.116780199781478	0.924442007727371	523	0	477	0.477	0.523	0.954
ORF3a	all	ss12	203	ATA	AAT	ACA	2	GTAATATAT:GTATTACAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.50000000000001	5	31.833333333333332	0.192699315438847	0.176245193423779	1.09335926668652	0.0164541220150678	0.0651930743116045	0.088991480144871	NaN	NaN	0.119478156669136	0.890464422632181	560	0	440	0.44	0.56	0.88
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	ATATATGGC:TTACACAGT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.00000000000001	5	31.999999999999996	0.177291583548173	0.175211138386129	1.01187393210961	0.00208044516204389	0.0662629974363404	0.0883873589243619	NaN	NaN	0.11741413445248	0.985863131156961	489	0	511	0.511	0.489	0.978
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:TATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.66666666666667	5	31.833333333333332	0.161597898479986	0.176245193423779	0.916892514007042	-0.0146472949437929	0.0644696373459346	0.0943892660253257	NaN	NaN	0.116510110674965	0.899955989695207	461	0	539	0.539	0.461	0.922
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.16666666666667	5	31.999999999999996	0.146448957671432	0.175211138386129	0.835842738197896	-0.0287621807146965	0.0647525202146703	0.0914158905819045	NaN	NaN	0.111914686214003	0.797178039438154	403	0	597	0.597	0.403	0.806
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	31.833333333333332	0.146091244169313	0.176245193423779	0.828909097214578	-0.0301539492544657	0.0630426619981374	0.0902675711537373	NaN	NaN	0.115191265675418	0.793496549535377	384	0	616	0.616	0.384	0.768
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CGA	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.66666666666667	5	31.499999999999996	0.145381050470112	0.178350531835637	0.815142231277959	-0.0329694813655254	0.0618017580812114	0.0890702640318863	NaN	NaN	0.108330428498932	0.760867476285274	378	0	622	0.622	0.378	0.756
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75	5	32.166666666666664	0.146808432844572	0.174189200634338	0.842810187485477	-0.0273807677897661	0.0623594032217284	0.0874197616295694	NaN	NaN	0.115576399448986	0.812729545313188	390	0	610	0.61	0.39	0.78
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAT:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	31.499999999999996	0.146091244169313	0.178350531835637	0.819124241827026	-0.032259287666324	0.0627025273925757	0.0975353621190843	NaN	NaN	0.113639054744672	0.776506169051293	355	0	645	0.645	0.355	0.71
ORF3a	all	ss12	211	TAT	CTA	TTA	2	GACTATTAC:GTTTATTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	31.499999999999996	0.128887692694994	0.178350531835637	0.722665031432446	-0.0494628391406431	0.0584271975685035	0.0965271888559589	NaN	NaN	0.108636703949632	0.648889798844792	315	0	685	0.685	0.315	0.63
ORF3a	all	ss12	212	TAC	TTA	CCA	2	TATTACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.33333333333336	5	31.83333333333333	0.143981241370948	0.176245193423779	0.816937123639718	-0.0322639520528312	0.0609428116189583	0.0940444032669488	NaN	NaN	0.109656207343333	0.768583508644371	397	0	603	0.603	0.397	0.794
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.66666666666669	5	32.5	0.145381050470112	0.172180831233375	0.844350961885307	-0.0267997807632631	0.0585706449624946	0.0952258748495125	NaN	NaN	0.111493780983654	0.810043289632495	395	0	605	0.605	0.395	0.79
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.00000000000001	5	31.83333333333333	0.144677749593369	0.176245193423779	0.820889051115811	-0.0315674438304106	0.0613643352604104	0.0963911153289967	NaN	NaN	0.114507811484015	0.782794325418021	407	0	593	0.593	0.407	0.814
ORF3a	all	ss12	215	GAA	GTA	ATC	2	CTGTACTCA:CTTGAATCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.83333333333336	5	31.166666666666664	0.142949000902461	0.180507022556888	0.791930412886897	-0.0375580216544271	0.0615076351074448	0.0942516682604549	NaN	NaN	0.114549844283679	0.743006233270617	367	0	633	0.633	0.367	0.734
ORF3a	all	ss12	216	TCA	ATC	AAC	2	GAATCGACT:TACTCAACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.50000000000001	5	30.166666666666664	0.12981956276725	0.187302855665743	0.693099751767389	-0.0574832928984934	0.0583589241241188	0.0991714440998099	NaN	NaN	0.113368228950204	0.612120154668076	297	1	702	0.702	0.297	0.594
ORF3a	all	ss12	217	ACT	AAC	TCA	2	TCAACTCAA:TCGACTCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.91666666666669	5	29.416666666666664	0.130923963916947	0.192747196311253	0.679252235168845	-0.0618232323943062	0.0583343308499762	0.109639694084254	NaN	NaN	0.117787167142777	0.599671901366441	293	0	707	0.707	0.293	0.586
ORF3a	all	ss12	218	CAA	TCA	ATT	2	ACTCAATTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.25000000000001	5	30.08333333333333	0.132209431753494	0.187892466749351	0.703644132416769	-0.0556830349958575	0.0584492749009651	0.100938478060883	NaN	NaN	0.119186625873	0.640362535492616	304	0	696	0.696	0.304	0.608
ORF3a	all	ss12	219	TTG	ATT	GAG	2	CAATTGAGT:CAATTGTCG	1:1	FALSE	1.75	0.75	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.25000000000001	5	29.416666666666664	0.130290582016017	0.192747196311253	0.675966159350096	-0.0624566142952362	0.0567958579616664	0.10797689089191	NaN	NaN	0.127828970370596	0.625128351004643	313	0	687	0.687	0.313	0.626
ORF3a	all	ss12	220	AGT	GAG	GAC	2	TTGAGTACA:TTGTCGACT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	3	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.16666666666669	5	29.249999999999996	0.130448350815189	0.194000551939624	0.672412266413483	-0.0635522011244347	0.0571838857887927	0.101688356909629	NaN	NaN	0.120283245446061	0.597253270313352	298	0	702	0.702	0.298	0.596
ORF3a	all	ss12	221	ACA	GAC	AGA	2	AGTACAGAC:TCGACTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.16666666666669	5	28.91666666666666	0.0843980831669965	0.196557091159957	0.429382031800184	-0.112159007992961	0.0339182659990488	0.106268296818496	NaN	NaN	0.108018361372225	0.299115141705053	111	0	889	0.889	0.111	0.222
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT:ACTGATACT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	5	29.249999999999993	0.0847960953267638	0.194000551939624	0.437092031331714	-0.10920445661286	0.0331850758136071	0.108948405386167	NaN	NaN	0.109205276265456	0.317314140154021	124	0	876	0.876	0.124	0.248
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT:GATACTGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.1666666666667	5	28.91666666666666	0.0868438898173541	0.196557091159957	0.441825269721157	-0.109713201342603	0.0352529110087202	0.106884279954681	NaN	NaN	0.108836154948896	0.313426422017541	122	1	877	0.877	0.122	0.244
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TGC	2	ACTGGTGCT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.83333333333337	5	29.249999999999993	0.0872653886078579	0.194000551939624	0.449820311001055	-0.106735163331766	0.0333241644427965	0.109637975267311	NaN	NaN	0.103784746380434	0.303748433539262	117	0	883	0.883	0.117	0.234
ORF3a	all	ss12	225	GCT	TGC	TGA	2	GGTGCTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.83333333333337	5	30.249999999999993	0.0885548256923263	0.18671695246621	0.474273088343985	-0.0981621267738835	0.0367566102315803	0.0975355896562493	NaN	NaN	0.103731849113765	0.343992260819147	142	0	858	0.858	0.142	0.284
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	GCTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	4	30.249999999999993	0.0881207952860292	0.145469445655623	0.605768413352188	-0.057348650369594	0.0354326049725807	0.0837314253682603	NaN	NaN	0.0923838790406827	0.534754456553708	261	0	739	0.739	0.261	0.522
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTATAGC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAT	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TATAGCAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AATAAAATT:AGCAAGCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAT:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	AGA	GCC	2	AAAGATGTA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCT	GCC	A--	1	GAGCCTGAA:GATGTA---	1:1	TRUE	1.25	0	0.75	1	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCTGAAGAA:GTA---GAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	GAA	-GA	ACA	1	---GATCAT:GAAGAACAT	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	CAT	ACA	TGT	2	GAACATGTC:GATCATGTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	CATGTCCAA:CATGTGCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.75000000000001	5	30.916666666666668	0.260656845281595	0.182159096576957	1.43092961142061	0.0784977487046378	0.0626164815490019	0.0855439397816278	NaN	NaN	0.102119159962282	0.442078690647233	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.08333333333334	5	30.916666666666668	0.263223932942835	0.182159096576957	1.44502216957159	0.0810648363658779	0.0643232736888806	0.0911501601227291	NaN	NaN	0.100854476187378	0.421523896254591	797	0	203	0.203	0.797	0.406
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.25000000000001	5	31.416666666666668	0.266505540694197	0.178884786483983	1.48981669113633	0.0876207542102134	0.0629728874323506	0.0897517719392577	NaN	NaN	0.0962490194812147	0.362635441579891	837	0	163	0.163	0.837	0.326
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA:TTTATGAGC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.08333333333334	5	30.916666666666668	0.267171809494173	0.182159096576957	1.4666948536457	0.0850127129172165	0.0643729192345945	0.086743739278365	NaN	NaN	0.10176099261426	0.403483792441061	806	0	194	0.194	0.806	0.388
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGCATT	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.58333333333334	5	30.416666666666668	0.26919097092383	0.185556129985381	1.45072529236861	0.0836348409384491	0.0611781297922058	0.090779251294234	NaN	NaN	0.0968848883508794	0.388005922959517	817	0	183	0.183	0.817	0.366
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGCATTTTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.83333333333334	5	30.416666666666668	0.250477612683731	0.185556129985381	1.34987517094405	0.0649214826983507	0.0620950449716962	0.0930482380119238	NaN	NaN	0.0979435749561447	0.507429347413639	746	0	254	0.254	0.746	0.508
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.33333333333334	5	31.083333333333336	0.256193776295553	0.181054357970061	1.41501027187601	0.0751394183254918	0.0639070347039135	0.0920162800748821	NaN	NaN	0.102817024894656	0.464896947388439	767	0	233	0.233	0.767	0.466
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.66666666666667	5	30.75	0.254900869216763	0.183277466946071	1.39079218773668	0.071623402270692	0.0609348709262465	0.0932930253575428	NaN	NaN	0.106832029269721	0.502583686587283	748	0	252	0.252	0.748	0.504
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	GGG	2	ACAATTGGA:ACATTGGGA	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78	5	31.416666666666668	0.257499995250869	0.178884786483983	1.43947397826323	0.0786152087668853	0.0654050472104695	0.0864288491183691	NaN	NaN	0.0934923224713822	0.400418851441207	823	0	177	0.177	0.823	0.354
ORF3a	all	ss12	11	GGA	GGG	AAC	2	ATTGGAACT:TTGGGAGCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.75	5	31.333333333333332	0.22303140124308	0.179422266799376	1.24305307931745	0.0436091344437048	0.0542968948344493	0.0886994831835242	NaN	NaN	0.0907276758742849	0.630758401401043	692	0	308	0.308	0.692	0.616
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGAGCAATC	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.58333333333333	5	31.166666666666668	0.220282043117094	0.180507022556888	1.22035165167976	0.0397750205602068	0.054509258204217	0.0903370246649608	NaN	NaN	0.0886397869844362	0.653628972293659	689	0	311	0.311	0.689	0.622
ORF3a	all	ss12	13	ATC	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:GCAATCACG	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.74999999999999	5	31.166666666666668	0.219740343511106	0.180507022556888	1.21735066258629	0.0392333209542178	0.0528339035407287	0.0885447895546535	NaN	NaN	0.0947990402713895	0.67897826083918	678	0	322	0.322	0.678	0.644
ORF3a	all	ss12	14	ACG	AAC	GCG	2	ATCACGCGC:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.99999999999999	5	31.083333333333332	0.202172332401979	0.181054357970061	1.11663886287349	0.021117974431918	0.0508604020357278	0.0912480525377418	NaN	NaN	0.0911251318420095	0.816734536985949	593	0	407	0.407	0.593	0.814
ORF3a	all	ss12	15	CGC	GCG	CAA	2	ACGCGCAAT:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.75	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.91666666666664	5	31.166666666666668	0.219201320467129	0.180507022556888	1.21436450151432	0.0386942979102414	0.0552104316745077	0.0891723593624435	NaN	NaN	0.0963959707270485	0.688118354567668	663	0	337	0.337	0.663	0.674
ORF3a	all	ss12	16	AAG	CAA	GCA	2	CGCAATCCA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.58333333333331	4	31.416666666666668	0.203403693684308	0.139531497680893	1.45776184635737	0.0638721960034151	0.0514940534790098	0.0766087697127067	NaN	NaN	0.0863524732335812	0.459501224744377	785	1	214	0.214	0.785	0.428
ORF3a	all	ss12	17	CAA	GCA	AGC	2	AAGCAAGGT:AATCCAGCG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.08333333333331	4	31.75	0.204901396368095	0.137923200937065	1.48561949676322	0.0669781954310294	0.0524692577386281	0.079842837158957	NaN	NaN	0.082918315317773	0.419228082062085	788	1	211	0.211	0.788	0.422
ORF3a	all	ss12	18	GCG	AGC	GAA	2	CAAGGTGAA:CCAGCGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.08333333333331	4	30.916666666666664	0.20192785781644	0.142015736265178	1.42186959788309	0.0599121215512613	0.0538480658328934	0.0783247023679206	NaN	NaN	0.0915900892441479	0.513025969801696	766	0	234	0.234	0.766	0.468
ORF3a	all	ss12	19	AAA	GAA	AAT	2	GCGAAAATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.33333333333331	4	30.916666666666664	0.184892999968705	0.142015736265178	1.30191910298915	0.0428772637035266	0.0500435966974714	0.0833069243271597	NaN	NaN	0.0868647417773282	0.621581974429784	705	0	295	0.295	0.705	0.59
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAAATTGAA:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.49999999999999	4	31.083333333333332	0.16853783682123	0.141177857059553	1.19379795338681	0.0273599797616776	0.0485526296500469	0.0803634085533618	NaN	NaN	0.0870799371708749	0.753373821682791	630	1	369	0.369	0.63	0.738
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	AAA	2	ATCAAGGAT:ATTGAAAAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.99999999999999	4	31.749999999999996	0.169734844556617	0.137923200937065	1.23064751545367	0.0318116436195513	0.0475744512785906	0.0734508495332154	NaN	NaN	0.0846106044775997	0.706933974094401	640	0	360	0.36	0.64	0.72
ORF3a	all	ss12	22	AAT	AAA	TGC	2	AAGGATGCT:GAAAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.66666666666666	4	32.416666666666664	0.156968578879544	0.134815620966532	1.16432040852678	0.022152957913012	0.0461314716132726	0.0743464697981824	NaN	NaN	0.0813705339703347	0.785431404694343	590	1	409	0.409	0.59	0.818
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.99999999999999	4	32.416666666666664	0.142608211856373	0.134815620966532	1.05780183953442	0.00779259088984111	0.0444487165118676	0.0756617884176027	NaN	NaN	0.0804017432100717	0.922789393118356	556	0	444	0.444	0.556	0.888
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666666	4	32.916666666666664	0.159249476407496	0.132575542143044	1.20119800253708	0.0266739342644514	0.048643855192071	0.0761577318461222	NaN	NaN	0.0844783572593824	0.752193233923857	649	0	351	0.351	0.649	0.702
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.5	5	33.08333333333333	0.143635503733589	0.168775880107432	0.851042836465493	-0.0251403763738432	0.0466789144292498	0.0842119693602929	NaN	NaN	0.0929391896344268	0.786772922243766	407	0	593	0.593	0.407	0.814
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.66666666666666	5	32.58333333333333	0.141261198495611	0.171685985854599	0.822788172211364	-0.0304247873589874	0.0447270815493923	0.088395408749661	NaN	NaN	0.0926630229854484	0.742656150368553	367	0	633	0.633	0.367	0.734
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.75	5	32.5	0.12572916000110201	0.172180831233375	0.730215780121819	-0.0464516712322729	0.0403574468909518	0.0886038008019907	NaN	NaN	0.0900559340086001	0.605987738742423	320	0	680	0.68	0.32	0.64
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.66666666666666	4	32.916666666666664	0.112359208671495	0.132575542143044	0.847510836880181	-0.0202163334715491	0.0407268967145235	0.0711048823280148	NaN	NaN	0.0836718077899017	0.809078779339779	406	0	594	0.594	0.406	0.812
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.66666666666666	3	33.25	0.112359208671495	0.0961313950679982	1.16880867683256	0.0162278136034969	0.0400046526039358	0.0558565791854954	NaN	NaN	0.0754065008380947	0.829607931288319	581	0	419	0.419	0.581	0.838
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.5	3	33.75	0.127969137773073	0.094613463995175	1.35254679798637	0.0333556737778975	0.0419155986476185	0.0606453331526899	NaN	NaN	0.075888539055591	0.660273881727997	699	0	301	0.301	0.699	0.602
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACT:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.66666666666666	2	33.25	0.1276658623949	0.0626996766264699	2.03614865759936	0.0649661857684305	0.0443200397669803	0.0471330989839694	NaN	NaN	0.0673842271632611	0.334987963699665	840	0	160	0.16	0.84	0.32
ORF3a	all	ss12	32	ACT	TAC	TGC	2	GCTACTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.25	2	32.666666666666664	0.124855023415448	0.0638683562552301	1.95488080069736	0.0609866671602181	0.043094141191868	0.0485870848945843	NaN	NaN	0.0672271975938284	0.364315566004051	811	0	189	0.189	0.811	0.378
ORF3a	all	ss12	33	GCA	TGC	AAC	2	ACTGCAACG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.58333333333333	2	31.999999999999996	0.122582464773988	0.0652585327422224	1.87841282393217	0.0573239320317657	0.0412442055956661	0.0515013819104376	NaN	NaN	0.0680603105960967	0.399646918252845	813	1	186	0.186	0.813	0.372
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.75	2	32.5	0.137211534497054	0.0642103145422439	2.13690799484845	0.0730012199548105	0.0445583813974614	0.0495871727839189	NaN	NaN	0.0712098777268513	0.305289674813824	812	0	188	0.188	0.812	0.376
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCA:ACGATACCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.74999999999999	2	33.166666666666664	0.139125907283501	0.0628640039123036	2.21312513720227	0.0762619033711971	0.044684054297509	0.046274657915417	NaN	NaN	0.0694757565891775	0.272345787169605	870	0	130	0.13	0.87	0.26
ORF3a	all	ss12	36	CCA	ACC	ACT	2	ATACCACTA:ATACCGATA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.74999999999999	2	33.83333333333333	0.141094614194941	0.0615730216404005	2.29150057015171	0.0795215925545409	0.0464674074764384	0.0449746077042444	NaN	NaN	0.0690896321342293	0.24973565367038	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	37	ATA	ACT	ACA	2	CCACTACAA:CCGATACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.91666666666666	2	33.83333333333333	0.156408563919793	0.0615730216404005	2.54021257610601	0.0948355422793923	0.0500086855364857	0.0458121191012938	NaN	NaN	0.0714643876391706	0.184498037171081	903	0	97	0.097	0.903	0.194
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.58333333333333	2	33.83333333333333	0.139450189981991	0.0615730216404005	2.26479367532764	0.0778771683415902	0.0462593904595608	0.043740757059645	NaN	NaN	0.0690748301275875	0.259559909700573	878	0	122	0.122	0.878	0.244
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CAC	2	CAAGCCACA:CAAGCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.41666666666666	2	33.33333333333333	0.13977599230927	0.0625362067042884	2.23512105507489	0.0772397856049819	0.0453432591548325	0.0492569423859923	NaN	NaN	0.0713090741435347	0.278733372773771	858	0	142	0.142	0.858	0.284
ORF3a	all	ss12	40	ACA	CAC	ACT	2	GCCACATTC:GCCTCACTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.41666666666666	2	33.33333333333333	0.13977599230927	0.0625362067042884	2.23512105507489	0.0772397856049819	0.0457375142500582	0.0456477685952816	NaN	NaN	0.0690884144444924	0.263573556946858	868	0	132	0.132	0.868	0.264
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	ACATTCCCT:TCACTCCCT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.91666666666666	2	33	0.138803133576506	0.0631952577133049	2.19641692429214	0.0756078758632013	0.0446839515688394	0.0457459326889382	NaN	NaN	0.0692533566716908	0.274939676679089	866	0	134	0.134	0.866	0.268
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC:TTCCCTTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.08333333333333	2	32.5	0.123424890893523	0.0642103145422439	1.9221972633746	0.0592145763512795	0.0427543864563659	0.0489629615748333	NaN	NaN	0.0680717226599047	0.384363206317898	826	0	174	0.174	0.826	0.348
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.08333333333333	2	32.5	0.123424890893523	0.0642103145422439	1.9221972633746	0.0592145763512795	0.0435178137275948	0.045778880202886	NaN	NaN	0.0707206326380061	0.40242244438382	816	0	184	0.184	0.816	0.368
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.75	2	32.83333333333333	0.123992985319038	0.0635300231041221	1.95172265427671	0.0604629622149156	0.043393144317674	0.0466525709551844	NaN	NaN	0.0672997044279357	0.368965148131646	830	0	170	0.17	0.83	0.34
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.75	2	32.83333333333333	0.123992985319038	0.0635300231041221	1.95172265427671	0.0604629622149156	0.0429134830052946	0.0462907129465714	NaN	NaN	0.0641472306328816	0.345903227692337	830	0	170	0.17	0.83	0.34
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77	2	33.58333333333333	0.127063613968535	0.0620508745044359	2.04773284797866	0.0650127394640992	0.0440513120604966	0.0471839144783853	NaN	NaN	0.0664011416454016	0.327535172259917	830	0	170	0.17	0.83	0.34
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77	2	33.58333333333333	0.127063613968535	0.0620508745044359	2.04773284797866	0.0650127394640992	0.0428745698324954	0.0448964615206314	NaN	NaN	0.0654867646211809	0.320826190330411	845	0	155	0.155	0.845	0.31
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.5	2	33.58333333333333	0.143635503733589	0.0620508745044359	2.31480224703877	0.0815846292291533	0.0479691847191511	0.0466848478832877	NaN	NaN	0.0703418809789475	0.24611799586045	871	0	129	0.129	0.871	0.258
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.58333333333333	2	33.5	0.143463258720043	0.0622118122355632	2.30604532426774	0.0812514464844796	0.0466110874202374	0.047834269678786	NaN	NaN	0.0688233416110644	0.237769694369259	877	0	123	0.123	0.877	0.246
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.08333333333333	2	34	0.144502989596306	0.0612585232607003	2.35890422923418	0.0832444663356058	0.0466498187149137	0.0467904144706985	NaN	NaN	0.0699879990534146	0.234278140712048	886	0	114	0.114	0.886	0.228
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.08333333333333	2	33	0.142438427764417	0.0631952577133049	2.25394171838987	0.0792431700511121	0.0452903780587601	0.047613388767885	NaN	NaN	0.0698490606500616	0.256588410436812	878	0	122	0.122	0.878	0.244
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.91666666666666	2	33.166666666666664	0.156408563919793	0.0628640039123036	2.48804648424853	0.0935445600074892	0.0466436338280031	0.0479931177894165	NaN	NaN	0.0713095735657617	0.189584494647539	913	0	87	0.087	0.913	0.174
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.58333333333333	2	33.166666666666664	0.154934610949651	0.0628640039123036	2.46459979173117	0.0920706070373473	0.0472075883682032	0.0507169052739311	NaN	NaN	0.0693329323184766	0.184194913259559	910	0	90	0.09	0.91	0.18
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.25	2	32.5	0.153488274894032	0.0642103145422439	2.39039905018769	0.0892779603517886	0.0481651512729572	0.0514006918608502	NaN	NaN	0.0716890486878876	0.213003105632108	893	0	107	0.107	0.893	0.214
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.08333333333333	3	33	0.169534158879359	0.0969087986100047	1.74941967407547	0.0726253602693546	0.0493285331405753	0.0608509285938684	NaN	NaN	0.0760702157235414	0.339721946834453	829	0	171	0.171	0.829	0.342
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.75	3	33	0.167945668219814	0.0969087986100047	1.73302806998657	0.0710368696098091	0.0513703545018251	0.0590656853927203	NaN	NaN	0.0757374316521502	0.348277260986396	842	0	158	0.158	0.842	0.316
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAG	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.58333333333334	3	33.666666666666664	0.186896837565466	0.0948631103318397	1.970174042488	0.0920337272336259	0.051686888372478	0.0568790285633791	NaN	NaN	0.0778494443916566	0.237125771373859	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	58	AGC	AAG	CGC	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.08333333333334	3	33.666666666666664	0.185556129985381	0.0948631103318397	1.95604096614889	0.090693019653541	0.0547908895601081	0.0591418069544191	NaN	NaN	0.0806432320536258	0.260749947638804	882	0	118	0.118	0.882	0.236
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCC:AGCGCTTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.25000000000001	3	34	0.204399702385691	0.0938723572155045	2.17742164412093	0.110527345170187	0.0555364357573316	0.0587852800818652	NaN	NaN	0.0831934088786564	0.183993533774377	898	0	102	0.102	0.898	0.204
ORF3a	all	ss12	60	TCC	TTC	CAA	2	GCTTCCAAA:GCTTCTAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.58333333333334	3	33.666666666666664	0.203403693684308	0.0948631103318397	2.14418115717252	0.108540583352468	0.0551254636798431	0.0595658873587136	NaN	NaN	0.0825833098344207	0.18873981217032	912	0	88	0.088	0.912	0.176
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	TCCAAAATC:TCTAAAGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.41666666666667	3	33.833333333333336	0.203900474239319	0.0943651299007742	2.16076080702398	0.109535344338545	0.0557366601014562	0.0589859357059091	NaN	NaN	0.0827526379047407	0.185620053377894	906	0	94	0.094	0.906	0.188
ORF3a	all	ss12	62	ATC	AAT	AAT	2	AAAATCATA:AAAGTAATT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.08333333333334	3	34.5	0.207964387858376	0.0924244803179611	2.25010069997615	0.115539907540415	0.056120668013384	0.0589627077634254	NaN	NaN	0.0827671343613727	0.162725454180987	907	0	93	0.093	0.907	0.186
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATCATAACC:GTAATTGCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.08333333333334	3	34.5	0.207964387858376	0.0924244803179611	2.25010069997615	0.115539907540415	0.0587745349855653	0.0569251651474899	NaN	NaN	0.0822083477995837	0.159886838304397	926	0	74	0.074	0.926	0.148
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTT	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.41666666666667	3	34.833333333333336	0.210058104799921	0.0914838201648646	2.29612301302429	0.118574284635057	0.0569408615394717	0.0568752690835113	NaN	NaN	0.08461322385629	0.161103984415046	911	1	88	0.088	0.911	0.176
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.33333333333334	3	35.416666666666664	0.210322806792345	0.0898829861073045	2.33996238777889	0.120439820685041	0.0576315127841431	0.0563820434554184	NaN	NaN	0.0812833051655555	0.13841244955492	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTTCATAGA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.66666666666667	3	35.416666666666664	0.2092680072815	0.0898829861073045	2.32822713557458	0.119385021174195	0.0559443232194609	0.0560723315281673	NaN	NaN	0.0821788953066053	0.146294426081144	925	0	75	0.075	0.925	0.15
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	AAG	2	AAAAAGAGA:CATAGAAGG	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.41666666666667	3	35.75	0.192938959293253	0.088993157850987	2.1680201484289	0.103945801442266	0.054119572885709	0.055253122614895	NaN	NaN	0.0766894263618378	0.175286192807536	902	0	98	0.098	0.902	0.196
ORF3a	all	ss12	68	AGA	AAG	ATG	2	AAGAGATGG:AGAAGGTGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.41666666666667	2	35.75	0.210058104799921	0.0581404786806199	3.61294075258345	0.151917626119301	0.0585845929638238	0.0437377968292977	NaN	NaN	0.0680319325144592	0.0255466948371152	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGGTGGCAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76	2	36.166666666666664	0.229036237163386	0.0574443341110379	3.98709882719969	0.171591903052348	0.0620059677281286	0.0443615562149255	NaN	NaN	0.0697750035436001	0.0139240270599478	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	75.83333333333333	3	36	0.229625165344413	0.0883372767422876	2.59941412971462	0.141287888602125	0.0601017299810674	0.0527179235809637	NaN	NaN	0.0792959451706479	0.0747851984639322	960	0	40	0.04	0.96	0.08
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTCGCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.16666666666666	3	35.666666666666664	0.228450345406382	0.089213957146024	2.56070185332614	0.139236388260358	0.0606539594569307	0.0572585315857976	NaN	NaN	0.0807410313475471	0.0846210152692243	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTCGCCTTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.91666666666666	3	35.083333333333336	0.261839694220712	0.0907908105289243	2.88398894882974	0.171048883691788	0.0691680880447367	0.0567028494739232	NaN	NaN	0.088349935524133	0.0528629760487595	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	ATA	2	GCACTCTCC:GCCTTATAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.41666666666666	3	34.75	0.259818540246921	0.0917171833187057	2.83282293290761	0.168101356928215	0.0688336783638327	0.0543916284375424	NaN	NaN	0.0935043409007593	0.0722099740731371	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	74	TAT	ATA	CAA	2	CTCTCCAAG:TTATATAAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.24999999999999	3	34.25	0.256519074969479	0.0931427851735378	2.75404127642897	0.163376289795942	0.0697551482832626	0.0574934529352039	NaN	NaN	0.0897427830362056	0.068683653621474	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	75	AAA	CAA	AGG	2	TATAAAGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.74999999999999	2	34.083333333333336	0.254579698386761	0.0611024764460933	4.16643830485922	0.193477221940668	0.0655246289643579	0.043927114875669	NaN	NaN	0.0810059787287825	0.0169204675958341	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	76	GGC	AGG	CGT	2	AAAGGCGTT:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.24999999999999	2	33.916666666666664	0.252669701240021	0.0614153696041381	4.11411187246191	0.191254331635883	0.0682902686281622	0.0467765208370124	NaN	NaN	0.0832310177650394	0.0215690025730308	985	0	15	0.015	0.985	0.03
ORF3a	all	ss12	77	GTT	CGT	TCA	2	GGCGTTCAA:GGTGTTCAC	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.83333333333333	2	33.583333333333336	0.250477612683731	0.0620508745044359	4.03664919606935	0.188426738179296	0.0666993315837459	0.0471292063796146	NaN	NaN	0.0794894115201423	0.0177658043150682	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	78	CAA	TCA	ACT	2	GTTCAACTT:GTTCACTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.33333333333333	2	33.333333333333336	0.284138594692556	0.0625362067042883	4.54358538304294	0.221602387988267	0.0763491827696824	0.0453427066016979	NaN	NaN	0.0893564077946718	0.0131388581958359	994	0	6	0.006	0.994	0.012
ORF3a	all	ss12	79	CTT	ACT	TGT	2	CAACTTGTA:CACTTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.16666666666666	2	32.833333333333336	0.262900256937487	0.0635300231041221	4.13820496344868	0.199370233833365	0.072262411264969	0.0484080977020243	NaN	NaN	0.0849373505027622	0.018911939968632	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	80	GTA	TGT	ATG	2	CTTGTATGT:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.5	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.66666666666666	2	32.833333333333336	0.247411820206618	0.0635300231041221	3.89440784243261	0.183881797102496	0.0700157017566519	0.0482128915298577	NaN	NaN	0.0864711492404756	0.0334607852473966	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	81	TGC	ATG	CAA	2	GTATGTAAT:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.83333333333333	0	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81	2	33	0.246206602062776	0.0631952577133049	3.8959664217168	0.183011344349471	0.0694626994748396	0.045264044080189	NaN	NaN	0.0822314590927105	0.0260434248143449	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGTAATATG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.16666666666666	2	33.833333333333336	0.249242139805801	0.0615730216404005	4.04791145806402	0.187669118165401	0.0730331847578279	0.044763537147844	NaN	NaN	0.0850129070384488	0.0272765811018123	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	83	ATG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG:AATATGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.16666666666666	2	33.833333333333336	0.249242139805801	0.0615730216404005	4.04791145806402	0.187669118165401	0.0710053538033727	0.0457195346205315	NaN	NaN	0.0799328105655522	0.0188828410820706	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GCT	2	ATGCTGCTG:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.75	2	33.333333333333336	0.230087393607353	0.0625362067042883	3.67926687167572	0.167551186903064	0.0670200319314451	0.0471298533987593	NaN	NaN	0.0814253791584713	0.0396163638669263	985	0	15	0.015	0.985	0.03
ORF3a	all	ss12	85	CTG	GCT	GCT	2	CTGCTGCTT:CTGTTGTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.5	2	33	0.244420824406181	0.0631952577133049	3.86770832575815	0.181225566692877	0.0708589150314729	0.05001213352372	NaN	NaN	0.0811460583667944	0.0255274827879169	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	86	CTT	GCT	GTT	2	CTGCTTTTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82	2	32.5	0.242660989230208	0.0642103145422439	3.77915901767717	0.178450674687964	0.0671104233243588	0.0490535484865322	NaN	NaN	0.0802245881862756	0.0261222973842634	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	87	TTT	GTT	TGT	2	CTTTTTGTG:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83	2	31.833333333333332	0.222822803539787	0.0656155905923368	3.39588200804536	0.15720721294745	0.0650716262041808	0.0495150542152184	NaN	NaN	0.0786571634319152	0.0456475121422768	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTGACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.33333333333333	2	31.5	0.221785683111784	0.0663415654213976	3.34308787715537	0.155444117690386	0.0629691234401752	0.0512342424527401	NaN	NaN	0.08053675065898	0.0535942404347753	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AAT	2	GTAACAGTT:GTGACAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.83333333333333	2	32	0.223345036542076	0.0652585327422224	3.42246488170844	0.158086503799854	0.0640833262479675	0.0483291970134448	NaN	NaN	0.0797582497925166	0.0474713089533295	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	90	ATT	AAT	TTA	2	ACAATTTAC:ACAGTTTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.49999999999999	2	32.666666666666664	0.22439693588559	0.0638683562552301	3.51342901309151	0.16052857963036	0.0666103887706497	0.0471039297179472	NaN	NaN	0.0790286277680836	0.0422274859903808	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	ATTTACTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.66666666666666	2	33.333333333333336	0.210676789099802	0.0625362067042883	3.36887701065749	0.148140582395513	0.0656753493363095	0.0472640546689692	NaN	NaN	0.079417855235679	0.0621350311622857	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.33333333333331	2	33.666666666666664	0.211674350763162	0.0618907677660026	3.42012804823271	0.14978358299716	0.0653104243489966	0.0477770314301341	NaN	NaN	0.0765012986125915	0.0502391545944857	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.99999999999999	2	32.666666666666664	0.212681467874346	0.0638683562552301	3.32999751902851	0.148813111619115	0.0666850988926888	0.0474239139112178	NaN	NaN	0.0772153565048152	0.0539487786543061	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TCT	2	CACCTTCTA:CACCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.83333333333331	2	32.166666666666664	0.213188653016244	0.0649053422482923	3.28460871835019	0.148283310767952	0.0648358670049868	0.046577185568594	NaN	NaN	0.0798490523961493	0.0633047035501703	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	95	CTA	TCT	ACT	2	CTTCTACTT:CTTTTGCTC	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82.16666666666664	2	31.5	0.209198065799156	0.0663415654213976	3.1533483491133	0.142856500377758	0.0636651968247954	0.0485651331057482	NaN	NaN	0.080728840603389	0.0767963924366367	970	0	30	0.03	0.97	0.06
ORF3a	all	ss12	96	CTC	ACT	CGT	2	CTACTTCTA:TTGCTCGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.91666666666664	2	31.75	0.209934806572056	0.0657955896932053	3.19071244062025	0.14413921687885	0.0646081529717654	0.0490918339998463	NaN	NaN	0.0789564409061789	0.0679175267430037	970	0	30	0.03	0.97	0.06
ORF3a	all	ss12	97	CTA	CGT	AGC	2	CTCGTTGCT:CTTCTAGCT	1:1	TRUE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	83.24999999999997	2	31.083333333333332	0.206064750939693	0.0672719567702241	3.06315975977231	0.138792794169469	0.0637401256790455	0.0500312301453786	NaN	NaN	0.0763582210004124	0.0691170960204341	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	98	GCT	AGC	TGC	2	CTAGCTGCT:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	83.66666666666664	2	30.833333333333332	0.204884633313866	0.0678428326164385	3.01998936972778	0.137041800697427	0.0648878407667126	0.0509076379477034	NaN	NaN	0.0758940608021152	0.0709654286730832	968	1	31	0.031	0.968	0.062
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	84.41666666666664	2	30.583333333333332	0.202794341745946	0.0684234871721278	2.96381184483906	0.134370854573818	0.0614407280459052	0.0495462261242418	NaN	NaN	0.0809428258805217	0.0969001286808561	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CAT	2	GCTGGCATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	85.41666666666664	2	30.583333333333332	0.200073130342575	0.0684234871721278	2.92404170864993	0.131649643170447	0.0605623252083357	0.0539948346170942	NaN	NaN	0.0767950099378194	0.0864737444160762	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CAT	GGA	2	GGCATGGAA:GGCCTTGAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	85.08333333333331	2	31.583333333333332	0.200972001243735	0.0661585688516753	3.03773199348228	0.134813432392059	0.0601273162879229	0.0506741188824971	NaN	NaN	0.074291320686183	0.0695762908008231	962	1	37	0.037	0.962	0.074
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAAGCA:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	83.74999999999999	2	31.916666666666664	0.189125752990118	0.0654365742860851	2.89021476221035	0.123689178704033	0.0617058199473206	0.0480125269344582	NaN	NaN	0.0805806810074347	0.124790432806233	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	103	GCA	AGC	ACA	2	GAAGCACAA:GAAGCCCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	82.74999999999997	2	30.916666666666664	0.191729770904647	0.0676514664202386	2.83408152180554	0.124078304484408	0.0623467731403169	0.0515204578686284	NaN	NaN	0.0769434273979128	0.106833321747903	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	104	CAA	ACA	ATT	2	GCACAATTC:GCCCCTTTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	83.3333333333333	2	30.916666666666664	0.190202069099189	0.0676514664202386	2.81149957515611	0.12255060267895	0.0630235923308682	0.0516445263464377	NaN	NaN	0.0795387706292586	0.12337384138404	926	0	74	0.074	0.926	0.148
ORF3a	all	ss12	105	TTC	ATT	CTT	2	CAATTCTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	83.3333333333333	1	30.583333333333332	0.174895415375783	0.0334317184415283	5.2314216417464	0.141463696934255	0.0575506970899499	0.0348366230294417	NaN	NaN	0.0713394097985529	0.0473711134143728	976	0	24	0.024	0.976	0.048
ORF3a	all	ss12	106	CTC	CTT	CTA	2	TTCTTGTAC:TTTCTCTAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	82.8333333333333	1	31.083333333333332	0.176085310670526	0.0328819783981324	5.35507044431752	0.143203332272393	0.0582932773102241	0.0323713081555582	NaN	NaN	0.0734650061561641	0.051262864774309	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CAT	2	CTCTATCTT:TTGTACATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.66666666666664	1	31.083333333333332	0.161333534712709	0.0328819783981324	4.90644245182865	0.128451556314577	0.0569569064974713	0.0341240078928393	NaN	NaN	0.070294873956325	0.0676509703242388	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	108	ATC	CAT	CTA	2	TACATCTAT:TATCTTTAT	1:1	TRUE	1.5	0.5	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.49999999999997	1	30.75	0.159539275483744	0.0332464403304228	4.79868743535093	0.126292835153321	0.0555601851234399	0.0355261409098069	NaN	NaN	0.0678321455976265	0.0626251617003446	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	ATCTATGCC:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.3333333333333	1	31.083333333333332	0.145188561804499	0.0328819783981324	4.41544483870671	0.112306583406367	0.0533080162744104	0.0339462564490514	NaN	NaN	0.0657191007479458	0.0874716955827868	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	110	GCC	TGC	CCT	2	TATGCCCTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.99999999999997	1	31.416666666666664	0.145832187994725	0.0325254218363474	4.48363709865113	0.113306766158377	0.0545612931016499	0.0343524877097585	NaN	NaN	0.0665788110737898	0.0887845707290473	968	1	31	0.031	0.968	0.062
ORF3a	all	ss12	111	CTG	CCT	AGT	2	GCCCTGATT:GCTTTAGTC	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.99999999999997	1	31.416666666666664	0.145832187994725	0.0325254218363474	4.48363709865113	0.113306766158377	0.0542063401028311	0.0338710271482035	NaN	NaN	0.0654860574344694	0.0835869404625694	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	112	ATT	AGT	CTA	2	CTGATTTAT:TTAGTCTAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.66666666666664	1	30.75	0.142670052225801	0.0332464403304228	4.29128805393484	0.109423611895378	0.0505419378882717	0.0351769595467021	NaN	NaN	0.0641768332684882	0.0881882893326414	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	ATTTATATC:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.16666666666664	1	30.75	0.127696125074967	0.0332464403304228	3.84089616229129	0.0944496847445446	0.0495143505712656	0.0340694311002189	NaN	NaN	0.0620335352465052	0.127869205688486	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	114	ATC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATATCTTG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.3333333333333	1	30.583333333333332	0.127424277596548	0.0334317184415283	3.81147854602244	0.0939925591550198	0.0504622734495518	0.0373907365627947	NaN	NaN	0.0641206351859539	0.142683520770093	932	0	68	0.068	0.932	0.136
ORF3a	all	ss12	115	TTG	CTT	GCA	2	ATCTTGCAA:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	85.49999999999997	1	29.916666666666664	0.113423227292943	0.0341939559917542	3.31705484209825	0.0792292713011884	0.0462640906563837	0.0366320767580349	NaN	NaN	0.0610859230585696	0.194626516851339	916	0	84	0.084	0.916	0.168
ORF3a	all	ss12	116	CAA	GCA	AAT	2	TTGCAAATT:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	86.16666666666664	1	29.249999999999996	0.139939466685309	0.0349917687305995	3.9992110076715	0.10494769795471	0.0517910589510352	0.0385972674537928	NaN	NaN	0.0652429318480313	0.10771081745099	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	117	AGT	AAT	TAT	2	CAAATTGTA:CAGAGTATA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.58333333333331	1	29.249999999999996	0.155224113808277	0.0349917687305995	4.43601793905711	0.120232345077678	0.0577417632467626	0.0353492247586625	NaN	NaN	0.0732714981823281	0.100814934364087	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	AGTATAAAC:ATTGTAAGT	1:1	FALSE	1.5	0.75	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.24999999999997	1	29.249999999999996	0.155898728322134	0.0349917687305995	4.45529717352652	0.120906959591534	0.0577769258091645	0.0389877078131042	NaN	NaN	0.0711717420470407	0.0893558032055866	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT:GTAAGTTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.24999999999997	1	28.999999999999996	0.141595553474679	0.0353006331434894	4.01113353687238	0.10629492033119	0.0588088275687466	0.037167910109043	NaN	NaN	0.0698291799952538	0.127955594109168	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	120	TTT	CTT	TGT	2	AACTTTGTA:AGTTTTTGT	1:1	FALSE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.91666666666664	0	28.999999999999996	0.142207556415652	0	-Inf	0.142207556415652	0.0581060844641743	0	NA	NA	0.058943167856694297	0.0158382558453107	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	121	GTA	TGT	AAG	2	TTTGTAAGA:TTTTGTAGA	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.24999999999997	0	28.999999999999996	0.143447620627212	0	-Inf	0.143447620627212	0.0565990069103031	0	NaN	NaN	0.0563752676645696	0.0109430131740279	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGTAGATTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	83.66666666666664	0	29.583333333333332	0.116111183253091	0	-Inf	0.116111183253091	0.0494100867591734	0	NaN	NaN	0.0467076216305356	0.0129218778492858	998	2	0	0	0.998	0.001
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGATTTATC	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	83.49999999999999	0	29.583333333333332	0.116361886617636	0	-Inf	0.116361886617636	0.0498762086769954	0	NA	NA	0.0499474044332323	0.0198226283081273	999	1	0	0	0.999	0.001
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:TTTATCATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	82.16666666666666	0	29.083333333333332	0.104289191336005	0	-Inf	0.104289191336005	0.0462992328492458	0	NA	NA	0.0481075697933058	0.0301713729121637	997	3	0	0	0.997	0.001
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATCATGAGA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	82.49999999999999	0	28.416666666666664	0.103837254348707	0	-Inf	0.103837254348707	0.0469262626172253	0	NaN	NaN	0.0455133234170696	0.0225206858511902	995	5	0	0	0.995	0.001
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGC:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.49999999999999	0	28.416666666666664	0.105204990412841	0	-Inf	0.105204990412841	0.0493985713057483	0	NaN	NaN	0.0477533132201323	0.0275881939856165	998	2	0	0	0.998	0.001
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	CTG	2	AGATGCTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.58333333333331	0	28.416666666666664	0.133835669008081	0	-Inf	0.133835669008081	0.0565889759616235	0	NaN	NaN	0.0565835963126581	0.018016770368361	999	1	0	0	0.999	0.001
ORF3a	all	ss12	128	TGG	CTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGCTGGCTG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.83333333333331	1	28.583333333333332	0.118929905904287	0.0358277072015149	3.31949530667311	0.0831021987027722	0.0482965149491352	0.0367504804382759	NA	NA	0.0569868415181361	0.144766148833314	947	1	52	0.052	0.947	0.104
ORF3a	all	ss12	129	CTG	GCT	GTG	2	TGGCTGTGC:TGGCTTTGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.33333333333331	1	29.083333333333332	0.121340215764185	0.0351970741664875	3.44745177369651	0.0861431415976976	0.0508555978874781	0.0384104653628457	NaN	NaN	0.0528210911713385	0.102922513359009	966	1	33	0.033	0.966	0.066
ORF3a	all	ss12	130	TGC	GTG	CTG	2	CTGTGCTGG:CTTTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.33333333333331	1	28.749999999999996	0.149138144058874	0.0356149996994909	4.18750934486195	0.113523144359383	0.0556025162329211	0.0396236126260499	NaN	NaN	0.0629098887479556	0.0711473573025548	976	1	23	0.023	0.976	0.046
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGCTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.66666666666666	2	28.749999999999996	0.150503021596613	0.073005919868405	2.06151805042521	0.0774971017282085	0.0581471844472296	0.0535369627814611	NA	NA	0.0742022755273562	0.296298835615916	853	0	147	0.147	0.853	0.294
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.66666666666666	2	28.333333333333332	0.165809675320019	0.0741343759774745	2.2366098471025	0.0916752993425442	0.0611830867782472	0.0578642919535766	NaN	NaN	0.081064876534113	0.258102217789577	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAG	2	AAATGCCGT:AAGTGCAGA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.66666666666666	2	29.166666666666668	0.184016201307693	0.0719113287774619	2.55893201302333	0.112104872530231	0.0647028506053278	0.0541821438279026	NaN	NaN	0.0782463450296222	0.151938715280362	924	1	75	0.075	0.924	0.15
ORF3a	all	ss12	134	AGA	CAG	ATC	2	TGCAGATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.916666666666667	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.74999999999999	2	29	0.183798305951801	0.0723451996406717	2.54057362291764	0.111453106311129	0.0654195817730015	0.0524534660371976	NaN	NaN	0.0805564898477994	0.166499425968394	935	0	65	0.065	0.935	0.13
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AGATCCAAA:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.33333333333331	2	29.333333333333332	0.168934951133241	0.0714826348532437	2.3633005621585	0.0974523162799978	0.0630048279202407	0.0516263627309862	NaN	NaN	0.0770949201783178	0.206209835363155	906	0	94	0.094	0.906	0.188
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAAAAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.49999999999999	2	29.833333333333332	0.16853783682123	0.0702267037754945	2.39991097061914	0.0983111330457356	0.0631158438078608	0.0511586298630362	NaN	NaN	0.0774736547092404	0.204454575028267	911	1	88	0.088	0.911	0.176
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAAAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.33333333333331	2	29.833333333333332	0.168934951133241	0.0702267037754945	2.40556571860904	0.098708247357747	0.0613042568710048	0.0532421944343822	NaN	NaN	0.0772629578079572	0.201403776460842	904	0	96	0.096	0.904	0.192
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA:AATCCATTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.99999999999999	2	29.5	0.169734844556617	0.0710590256920247	2.38864581808735	0.0986758188645919	0.0611426324341671	0.0536790538009613	NaN	NaN	0.0795485980527407	0.214810110425163	891	0	109	0.109	0.891	0.218
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTC:CCATTACTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.99999999999999	2	28.5	0.167357663485657	0.0736788296875599	2.27144844991905	0.0936788337980974	0.0619078875395639	0.0575007993699984	NaN	NaN	0.0790877614065896	0.236218295628835	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	140	CTC	ACT	CTA	2	TTACTCTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.33333333333331	2	27.833333333333332	0.166580058439327	0.0755354817013731	2.20532198494339	0.091044576737954	0.0632507108417722	0.0542335178267171	NaN	NaN	0.0792725998224103	0.250762234656323	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	141	TAT	CTA	TGA	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.66666666666666	2	27.5	0.18143524049715	0.0764993759663411	2.37172183701184	0.104935864530809	0.0648908181649844	0.0585191367209719	NaN	NaN	0.0866478016295954	0.225871623396677	880	0	120	0.12	0.88	0.24
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC:TATGATGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.83333333333331	2	26.833333333333332	0.183580928580378	0.0785029669229164	2.33852217025937	0.105077961657462	0.0632704229875879	0.0597980619488655	NaN	NaN	0.0856293646217859	0.219775491725966	902	0	98	0.098	0.902	0.196
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC:GATGCTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.16666666666666	2	27.5	0.212176706271015	0.0764993759663411	2.77357434084652	0.135677330304674	0.0710631631850749	0.057995990459609	NaN	NaN	0.0867030962881168	0.117618111613191	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAT:GCTAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82.66666666666666	2	27	0.207740087501275	0.0779922851430357	2.66359790741206	0.129747802358239	0.0736481797168956	0.0569690125068842	NaN	NaN	0.086697372470656	0.134507836995954	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	145	TAT	CTA	TTT	2	AACTATTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82	2	27.666666666666668	0.242660989230208	0.0760143706952156	3.19230412632333	0.166646618534993	0.0814453014248035	0.0542738186440651	NaN	NaN	0.0949909628556957	0.0793719542057175	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	146	TTT	TTT	TCT	2	TATTTTCTT:TATTTTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.16666666666666	2	27.5	0.242080044197288	0.0764993759663411	3.16447083573337	0.165580668230947	0.0788775092589788	0.0596433178934	NaN	NaN	0.095730725774156	0.0836927926447753	966	0	34	0.034	0.966	0.068
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	ATG	2	TTTCTTTGC:TTTGTATGT	1:1	TRUE	1.25	0.833333333333333	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.66666666666666	2	27.333333333333336	0.243831358478173	0.0769906155450625	3.167027003901	0.166840742933111	0.0790916604665747	0.0603309666598384	NaN	NaN	0.0973304742763757	0.0864979543337876	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	148	TGC	ATG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTATGTTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.166666666666667	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82	2	27	0.225993636641676	0.0779922851430357	2.89764091701133	0.14800135149864	0.0773232429912962	0.0590161059948016	NaN	NaN	0.0928924141218024	0.111102880853917	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT:TGTTGGCAT	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.33333333333333	2	27.666666666666668	0.228158530802244	0.0760143706952156	3.00151838021602	0.152144160107028	0.0777839104679607	0.0551764702760147	NaN	NaN	0.0956673955481889	0.111757070038343	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.16666666666666	2	27.5	0.228706300945733	0.0764993759663411	2.98964923643771	0.152206924979392	0.0743705324137953	0.0564402892918862	NaN	NaN	0.0968306650927827	0.115976613077445	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	151	ACT	TAC	TAA	2	CATACTAAT	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.75	3	27.5	0.230087393607353	0.117889187641809	1.95172600821072	0.112198205965543	0.0767717660413407	0.0716011491979019	NaN	NaN	0.106524531067071	0.292221078934953	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	152	AAT	TAA	TAA	2	ACTAATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.25	3	27	0.2284320849576	0.120256987556385	1.89953273900609	0.108175097401216	0.0764481567180414	0.0770725800484895	NaN	NaN	0.106882953220679	0.311495339635961	846	0	154	0.154	0.846	0.308
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATAACTAT:AATTGTTAC	1:1	FALSE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.16666666666666	3	27.416666666666668	0.225458865345149	0.11827731107372	1.90618862821987	0.107181554271429	0.0772864402909074	0.0764828328707858	NaN	NaN	0.104973889137414	0.307239935574561	864	0	136	0.136	0.864	0.272
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.58333333333333	3	27.75	0.244125732475453	0.116739982283845	2.09119213228831	0.127385750191608	0.0799325188525158	0.0703372023273834	NaN	NaN	0.103903712925757	0.220199406104617	888	0	112	0.112	0.888	0.224
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.91666666666667	3	27.916666666666668	0.260022955936781	0.115986237049084	2.24184319236723	0.144036718887697	0.0835737684726972	0.0737856131618346	NaN	NaN	0.111779378802377	0.197543994054478	899	0	101	0.101	0.899	0.202
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.41666666666667	3	27.083333333333336	0.275456620020365	0.119855757106799	2.29823436662217	0.155600862913566	0.0798557519180416	0.0764886521943998	NaN	NaN	0.116734449300672	0.182549115900049	919	0	81	0.081	0.919	0.162
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.75	3	26.75	0.274117044773636	0.121476995958792	2.25653460237544	0.152640048814843	0.0853576434699147	0.0748037353875968	NaN	NaN	0.114150391372899	0.181162663670843	910	0	90	0.09	0.91	0.18
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.91666666666667	3	26.75	0.273452185043192	0.121476995958792	2.25106146958025	0.1519751890844	0.0794433953414517	0.0763402273497164	NaN	NaN	0.120112610317847	0.205773642066696	907	0	93	0.093	0.907	0.186
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAC:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	83.25	3	26.083333333333336	0.272132199812821	0.124855023415448	2.17958550940571	0.147277176397373	0.085759128124415	0.0786893209820199	NaN	NaN	0.115181986659603	0.201021162703959	901	0	99	0.099	0.901	0.198
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATACAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	83.58333333333334	4	26.083333333333336	0.270825034296094	0.171562720556584	1.57857740549627	0.0992623137395097	0.0804717803781009	0.092007688257426	NaN	NaN	0.129045257337086	0.441771362470641	783	1	216	0.216	0.783	0.432
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAACAGT:TACAATAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	84.08333333333334	4	25.916666666666668	0.286105312004963	0.172803431663443	1.65566915686137	0.11330188034152	0.0814421753176665	0.0881943800196921	NaN	NaN	0.129675811522813	0.38226432830203	806	0	194	0.194	0.806	0.388
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.75	4	26.25	0.291739000800334	0.170339774770387	1.71268866119842	0.121399226029947	0.083288148322904	0.0934691130225078	NaN	NaN	0.130097440852056	0.350747291692764	837	1	162	0.162	0.837	0.324
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.08333333333334	4	26.25	0.294640950387176	0.170339774770387	1.72972490297315	0.124301175616789	0.0847211732107272	0.0917703013251035	NaN	NaN	0.133956112598877	0.353446669547606	836	0	164	0.164	0.836	0.328
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.25	4	26.75	0.293909995138393	0.166773778676097	1.76232737227365	0.127136216462296	0.0879054050538436	0.0886400960072602	NaN	NaN	0.130966141234594	0.331669611495719	838	0	162	0.162	0.838	0.324
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.41666666666667	4	27.416666666666668	0.297601975168629	0.162245943584362	1.83426450359227	0.135356031584267	0.0901544460469964	0.084625687561561	NaN	NaN	0.130024698013141	0.2978744026266	856	0	144	0.144	0.856	0.288
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAGTT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.75	4	28.083333333333336	0.282358178426184	0.157958351375551	1.78754827438574	0.124399827050633	0.0812640904821384	0.08515561170718	NaN	NaN	0.124598751304845	0.318083746257221	846	1	153	0.153	0.846	0.306
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAGTTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81	4	27.833333333333336	0.263548415128416	0.159539275483744	1.65193438624629	0.104009139644672	0.0749516735037658	0.0824089733913167	NaN	NaN	0.119709961861737	0.384933113970167	818	0	182	0.182	0.818	0.364
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:GTTGTCATC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.83333333333334	4	27.833333333333336	0.246807726551292	0.159539275483744	1.54700292954784	0.0872684510675477	0.0773043778976634	0.0859739619489673	NaN	NaN	0.113947697566325	0.443757167707605	774	1	225	0.225	0.774	0.45
ORF3a	all	ss12	169	ATC	CAT	CAC	2	GTCATCACC:GTCATTACT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80	4	28.333333333333336	0.249858334896404	0.156408563919793	1.59747221401849	0.0934497709766109	0.0771496025807933	0.0829659486036932	NaN	NaN	0.112907060591229	0.407857492976169	806	0	194	0.194	0.806	0.388
ORF3a	all	ss12	170	ACC	CAC	CTC	2	ATCACCTCA:ATTACTTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.75	4	28.500000000000004	0.250788414893047	0.155392217528976	1.613905888474	0.0953961973640707	0.0766061030719588	0.0867981899143795	NaN	NaN	0.118457336740917	0.420634386228335	799	0	201	0.201	0.799	0.402
ORF3a	all	ss12	171	TCA	CTC	AGG	2	ACCTCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.08333333333334	4	28.500000000000004	0.303708714037217	0.155392217528976	1.95446540931552	0.148316496508241	0.0939060686795548	0.0851176347803906	NaN	NaN	0.132254612803788	0.26209777551606	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	TCAGGTGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.41666666666667	4	28.16666666666667	0.30215833840741	0.157438341821211	1.91921697670409	0.144719996586199	0.0992296238712334	0.0845949790243224	NaN	NaN	0.142085914674885	0.308422039939524	860	0	140	0.14	0.86	0.28
ORF3a	all	ss12	173	GAT	TGA	TGG	2	GGTGATGGA:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.08333333333334	4	28.16666666666667	0.29910521468218	0.157438341821211	1.89982447237565	0.141666872860969	0.0973310459181602	0.0841931174765601	NaN	NaN	0.141049175964404	0.315195822819104	852	0	148	0.148	0.852	0.296
ORF3a	all	ss12	174	GGA	TGG	AAC	2	GATGGAACA:GATGGCACA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.75	4	28.833333333333336	0.296113964785258	0.153398778089708	1.93035412975773	0.14271518669555	0.0974530496944998	0.0814113877958718	NaN	NaN	0.130632796000582	0.27461723403507	873	1	126	0.126	0.873	0.252
ORF3a	all	ss12	175	ACA	AAC	AAA	2	GGAACAAAT:GGCACAACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.75	4	28.833333333333336	0.296113964785258	0.153398778089708	1.93035412975773	0.14271518669555	0.0916827285326738	0.0822094639013993	NaN	NaN	0.130385969573081	0.273709717207513	882	1	117	0.117	0.882	0.234
ORF3a	all	ss12	176	AAT	AAA	AAG	2	ACAAATCAG:ACAACAAGT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.58333333333333	5	29.000000000000004	0.296856081021002	0.195911624447713	1.51525506389862	0.100944456573289	0.0947984664823365	0.0996008519203554	NaN	NaN	0.144554872876608	0.484981861905222	766	0	234	0.234	0.766	0.468
ORF3a	all	ss12	177	AGT	AAG	GCC	2	AATCAGCCA:ACAAGTCCT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666666	5	28.66666666666667	0.26683825481505	0.198519415670312	1.34414185088172	0.068318839144738	0.0905525262989402	0.10132978420139	NaN	NaN	0.14123033370241	0.628570011953519	676	0	324	0.324	0.676	0.648
ORF3a	all	ss12	178	CCA	GCC	AAA	2	AGTCCTATT:CAGCCAAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666666	4	28.66666666666667	0.26683825481505	0.154389040653111	1.72834971761107	0.112449214161938	0.0859719042778667	0.0830340093230384	NaN	NaN	0.134576571381376	0.403392383845283	816	0	184	0.184	0.816	0.368
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTA:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.66666666666666	5	28.16666666666667	0.264854466829819	0.202564732921051	1.30750532439941	0.0622897339087676	0.0921219172836145	0.104803759824983	NaN	NaN	0.15230169743401	0.682547661501537	653	0	347	0.347	0.653	0.694
ORF3a	all	ss12	180	CTA	ACT	AAA	2	AAACTAAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.16666666666667	1.16666666666667	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.83333333333333	5	28.500000000000004	0.233185780458787	0.199849674976131	1.16680590291997	0.0333361054826558	0.0816161224240499	0.101221198196802	NaN	NaN	0.136412649144659	0.806938901325721	618	0	382	0.382	0.618	0.764
ORF3a	all	ss12	181	AAA	AAA	ACA	2	CTAAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.5	4	28.66666666666667	0.230924148132868	0.154389040653111	1.49572888824226	0.0765351074797562	0.0822227520213841	0.0838126337539878	NaN	NaN	0.132400346573365	0.563224819227203	743	0	257	0.257	0.743	0.514
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.16666666666666	4	29.083333333333336	0.21524198382966	0.151937056450332	1.41665232207537	0.0633049273793277	0.0780164404083092	0.0801415564774013	NaN	NaN	0.122864723838088	0.606384711698186	693	0	307	0.307	0.693	0.614
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.83333333333333	4	28.25	0.196927853470251	0.156921757285409	1.25494295295252	0.0400060961848415	0.0737851470739899	0.0826223146991518	NaN	NaN	0.125065181671906	0.749057809260725	647	0	353	0.353	0.647	0.706
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAG:GACTATCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.5	4	28.916666666666668	0.200714352979387	0.152908411727716	1.31264428628557	0.0478059412516712	0.0742172878413733	0.0861787060834067	NaN	NaN	0.121613956564057	0.694248691400396	669	0	331	0.331	0.669	0.662
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAGATT:TATCAAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.16666666666667	5	28.25	0.196003572834134	0.201879034260684	0.970896128723485	-0.00587546142655018	0.072842200057113	0.107862194525311	NaN	NaN	0.134656429743458	0.965196961770105	494	0	506	0.506	0.494	0.988
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.83333333333333	5	27.583333333333332	0.194180942034071	0.207499077183959	0.935815930698904	-0.0133181351498886	0.0718897353853186	0.110500565027675	NaN	NaN	0.142956523515511	0.925774754262761	474	0	526	0.526	0.474	0.948
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.33333333333333	5	27.916666666666668	0.211674350763162	0.20465023999998	1.03432251417434	0.00702411076318202	0.0759141261985425	0.104153951444488	NaN	NaN	0.141973505224002	0.960540919360055	525	0	475	0.475	0.525	0.95
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.83333333333333	5	28.416666666666668	0.213188653016244	0.200521552470618	1.06317076837654	0.0126671005456263	0.0788976105076854	0.109848408441325	NaN	NaN	0.139842050327966	0.927825144491402	563	0	437	0.437	0.563	0.874
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.83333333333333	5	28.916666666666668	0.219470498668977	0.196557091159957	1.11657380241944	0.02291340750902	0.0783729728118281	0.102205514068788	NaN	NaN	0.135043715455677	0.865266521773932	583	0	417	0.417	0.583	0.834
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.5	5	28.916666666666668	0.234333426514436	0.196557091159957	1.19219014247487	0.0377763353544784	0.0751684765190172	0.0960879576273225	NaN	NaN	0.137646608142328	0.783743156366908	617	1	382	0.382	0.617	0.764
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.41666666666666	6	29	0.234622119670259	0.242080044197288	0.969192320037121	-0.0074579245270295904	0.0810732672216011	0.114528645231763	NaN	NaN	0.143863931944269	0.958656081663247	507	0	493	0.493	0.507	0.986
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGGATTGG	1:1	TRUE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.91666666666666	6	29	0.236369452063806	0.242080044197288	0.976410314396555	-0.00571059213348202	0.0789425170558448	0.117809802826525	1.02988566764965	0.343090552638796	0.151857967187849	0.970002761625291	497	0	503	0.503	0.497	0.994
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:GATTGGCAT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.41666666666666	6	29.500000000000004	0.220826439413092	0.237252996159118	0.930763543508598	-0.0164265567460254	0.0774773729255842	0.109267677935796	NaN	NaN	0.146232062570954	0.910560079524404	465	0	535	0.535	0.465	0.93
ORF3a	all	ss12	194	CAT	GCA	ATC	2	TGGCATTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.08333333333333	6	30.500000000000004	0.22528117443765	0.228158530802244	0.987388784655667	-0.00287735636459363	0.0770699104961537	0.10846819524775	1.09136989613237	0.365611503405716	0.140947962555197	0.983712863049321	476	0	524	0.524	0.476	0.952
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CATTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.91666666666666	6	30.000000000000004	0.191510018856633	0.23261619622788	0.823287552466996	-0.0411061773712462	0.0627854095355306	0.109761775009758	NaN	NaN	0.132231511338102	0.755903088602681	380	0	620	0.62	0.38	0.76
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.41666666666666	6	30.16666666666667	0.190102201146667	0.231110927283054	0.822558255386335	-0.0410087261363869	0.0666493101042156	0.104291884295409	NaN	NaN	0.126389239420086	0.745586964980468	373	0	627	0.627	0.373	0.746
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.58333333333333	6	30.333333333333336	0.189637541338727	0.229625165344413	0.825856961515045	-0.0399876240056862	0.0682943177695555	0.110814635799378	NaN	NaN	0.133979433773065	0.765351404977529	368	0	632	0.632	0.368	0.736
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.66666666666667	6	30.916666666666668	0.189406066724906	0.224573223705648	0.843404496758545	-0.0351671569807418	0.0663475955726119	0.107106968078087	0.920658029736178	0.359620328998427	0.125604699998622	0.779490692535323	399	1	600	0.6	0.399	0.798
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.66666666666667	6	30.416666666666668	0.189406066724906	0.228889480485489	0.827500094469888	-0.0394834137605833	0.0670756320707575	0.109642981024396	NaN	NaN	0.134412072520013	0.768949697978713	412	0	588	0.588	0.412	0.824
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTA:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.50000000000001	6	30.416666666666668	0.189869585440857	0.228889480485489	0.829525171004499	-0.0390198950446328	0.0636607912941019	0.105997450703064	NaN	NaN	0.13572524372934	0.773735777347978	397	0	603	0.603	0.397	0.794
ORF3a	all	ss12	201	GTA	TGT	AGT	2	TATGTAGTA:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.58333333333334	5	30.75	0.189637541338727	0.183277466946071	1.03470188942827	0.00636007439265551	0.0645007491002042	0.0958439984359057	NaN	NaN	0.115981397030754	0.956268305664136	540	0	460	0.46	0.54	0.92
ORF3a	all	ss12	202	GTA	AGT	AAT	2	GTAGTAATA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.08333333333334	5	31.25	0.191038422684604	0.179963002222943	1.06154276337277	0.0110754204616603	0.0661238835701841	0.092250330503727	NaN	NaN	0.121860676090659	0.927583232860158	543	0	457	0.457	0.543	0.914
ORF3a	all	ss12	203	ATA	AAT	ACA	2	GTAATATAT:GTATTACAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.50000000000001	5	31.833333333333332	0.192699315438847	0.176245193423779	1.09335926668652	0.0164541220150678	0.0693751671201819	0.0932918650865779	NaN	NaN	0.114318142474641	0.885553592183437	594	0	406	0.406	0.594	0.812
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	ATATATGGC:TTACACAGT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.00000000000001	5	31.999999999999996	0.177291583548173	0.175211138386129	1.01187393210961	0.00208044516204389	0.0675279275915832	0.0898222929801893	NaN	NaN	0.112189447020711	0.985204847822444	529	0	471	0.471	0.529	0.942
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:TATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.66666666666667	5	31.833333333333332	0.161597898479986	0.176245193423779	0.916892514007042	-0.0146472949437929	0.0664002670296861	0.0924002023879986	NaN	NaN	0.112936659707162	0.896807914680004	447	0	553	0.553	0.447	0.894
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.16666666666667	5	31.999999999999996	0.146448957671432	0.175211138386129	0.835842738197896	-0.0287621807146965	0.061812451095404	0.0902770274527236	NaN	NaN	0.109137259660553	0.79213335713852	382	0	618	0.618	0.382	0.764
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	31.833333333333332	0.146091244169313	0.176245193423779	0.828909097214578	-0.0301539492544657	0.0600137147901802	0.0893164783204177	NaN	NaN	0.111252814038193	0.786360360804007	363	0	637	0.637	0.363	0.726
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CGA	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.66666666666667	5	31.499999999999996	0.145381050470112	0.178350531835637	0.815142231277959	-0.0329694813655254	0.0615389244438566	0.0958587102160092	NaN	NaN	0.109889956814866	0.764159841930275	394	0	606	0.606	0.394	0.788
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75	5	32.166666666666664	0.146808432844572	0.174189200634338	0.842810187485477	-0.0273807677897661	0.0636521367881821	0.0937589268670922	NaN	NaN	0.112374078451585	0.807496224030332	416	0	584	0.584	0.416	0.832
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAT:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	31.499999999999996	0.146091244169313	0.178350531835637	0.819124241827026	-0.032259287666324	0.0645708523834936	0.0947723305560901	NaN	NaN	0.114652933071399	0.778430693234258	378	0	622	0.622	0.378	0.756
ORF3a	all	ss12	211	TAT	CTA	TTA	2	GACTATTAC:GTTTATTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	31.499999999999996	0.128887692694994	0.178350531835637	0.722665031432446	-0.0494628391406431	0.0596359628862926	0.0940028944125445	NaN	NaN	0.114728253500683	0.66637354912037	322	0	678	0.678	0.322	0.644
ORF3a	all	ss12	212	TAC	TTA	CCA	2	TATTACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.33333333333336	5	31.83333333333333	0.143981241370948	0.176245193423779	0.816937123639718	-0.0322639520528312	0.064377231030305	0.0926733104344034	NaN	NaN	0.112237973460027	0.773759960292184	385	0	615	0.615	0.385	0.77
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.66666666666669	5	32.5	0.145381050470112	0.172180831233375	0.844350961885307	-0.0267997807632631	0.0607407514119509	0.0927697018232128	NaN	NaN	0.111240552353372	0.809619163090913	399	2	599	0.599	0.399	0.798
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.00000000000001	5	31.83333333333333	0.144677749593369	0.176245193423779	0.820889051115811	-0.0315674438304106	0.0614799356079435	0.0918714501735353	NaN	NaN	0.113588930914818	0.781081825481233	391	0	609	0.609	0.391	0.782
ORF3a	all	ss12	215	GAA	GTA	ATC	2	CTGTACTCA:CTTGAATCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.83333333333336	5	31.166666666666664	0.142949000902461	0.180507022556888	0.791930412886897	-0.0375580216544271	0.0623475147517474	0.0963583890460574	NaN	NaN	0.11747017065226	0.749177636840612	379	0	621	0.621	0.379	0.758
ORF3a	all	ss12	216	TCA	ATC	AAC	2	GAATCGACT:TACTCAACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.50000000000001	5	30.166666666666664	0.12981956276725	0.187302855665743	0.693099751767389	-0.0574832928984934	0.0618883697674928	0.100906463925898	NaN	NaN	0.118053166345207	0.626309951555472	300	0	700	0.7	0.3	0.6
ORF3a	all	ss12	217	ACT	AAC	TCA	2	TCAACTCAA:TCGACTCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.91666666666669	5	29.416666666666664	0.130923963916947	0.192747196311253	0.679252235168845	-0.0618232323943062	0.0603527411161206	0.104784057586736	NaN	NaN	0.121698140703737	0.611450018678087	290	0	710	0.71	0.29	0.58
ORF3a	all	ss12	218	CAA	TCA	ATT	2	ACTCAATTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.25000000000001	5	30.08333333333333	0.132209431753494	0.187892466749351	0.703644132416769	-0.0556830349958575	0.0585865393625565	0.0979918711794907	NaN	NaN	0.119138618923478	0.640227865289458	308	0	692	0.692	0.308	0.616
ORF3a	all	ss12	219	TTG	ATT	GAG	2	CAATTGAGT:CAATTGTCG	1:1	FALSE	1.75	0.75	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.25000000000001	5	29.416666666666664	0.130290582016017	0.192747196311253	0.675966159350096	-0.0624566142952362	0.056731821762131	0.106247779170128	NaN	NaN	0.124714650722335	0.616514610327417	264	0	736	0.736	0.264	0.528
ORF3a	all	ss12	220	AGT	GAG	GAC	2	TTGAGTACA:TTGTCGACT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	3	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.16666666666669	5	29.249999999999996	0.130448350815189	0.194000551939624	0.672412266413483	-0.0635522011244347	0.0625052480319597	0.104819076801416	NaN	NaN	0.127267447228825	0.617526187888227	280	0	720	0.72	0.28	0.56
ORF3a	all	ss12	221	ACA	GAC	AGA	2	AGTACAGAC:TCGACTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.16666666666669	5	28.91666666666666	0.0843980831669965	0.196557091159957	0.429382031800184	-0.112159007992961	0.033868311790191	0.107551790781407	NaN	NaN	0.1152314175997	0.330385814491171	112	0	888	0.888	0.112	0.224
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT:ACTGATACT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	5	29.249999999999993	0.0847960953267638	0.194000551939624	0.437092031331714	-0.10920445661286	0.0341478323531707	0.111643491972079	NaN	NaN	0.111368447037787	0.326805284044772	111	0	889	0.889	0.111	0.222
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT:GATACTGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.1666666666667	5	28.91666666666666	0.0868438898173541	0.196557091159957	0.441825269721157	-0.109713201342603	0.0352679537962623	0.107988867935825	NaN	NaN	0.109771303545524	0.317566726973402	129	1	870	0.87	0.129	0.258
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TGC	2	ACTGGTGCT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.83333333333337	5	29.249999999999993	0.0872653886078579	0.194000551939624	0.449820311001055	-0.106735163331766	0.0347932987828135	0.10718015415649	NaN	NaN	0.109269497694384	0.328664922453239	138	0	862	0.862	0.138	0.276
ORF3a	all	ss12	225	GCT	TGC	TGA	2	GGTGCTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.83333333333337	5	30.249999999999993	0.0885548256923263	0.18671695246621	0.474273088343985	-0.0981621267738835	0.0365324704475161	0.0997631219530005	NaN	NaN	0.110115056788906	0.372687514771447	166	0	834	0.834	0.166	0.332
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	GCTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	4	30.249999999999993	0.0881207952860292	0.145469445655623	0.605768413352188	-0.057348650369594	0.0344364583571248	0.0856322149391551	NaN	NaN	0.0841814437833165	0.49571300104831	231	0	769	0.769	0.231	0.462
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTATAGC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAT	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TATAGCAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AATAAAATT:AGCAAGCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAT:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	AGA	GCC	2	AAAGATGTA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCT	GCC	A--	1	GAGCCTGAA:GATGTA---	1:1	TRUE	1.25	0	0.75	1	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCTGAAGAA:GTA---GAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	GAA	-GA	ACA	1	---GATCAT:GAAGAACAT	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	CAT	ACA	TGT	2	GAACATGTC:GATCATGTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	CATGTCCAA:CATGTGCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.91666666666666	6	31.500000000000004	0.290365776711344	0.219740343511106	1.32140403565297	0.0706254332002387	0.0649999727854536	0.103519016359993	1.23957508168506	0.286417442929223	0.12443177492939	0.570317754238562	746	0	254	0.254	0.746	0.508
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.74999999999999	6	31.33333333333334	0.310074958318006	0.221099655165484	1.40242171832393	0.0889753031525223	0.0671833915622974	0.110672658503787	NaN	NaN	0.115198219899963	0.439897095012865	790	0	210	0.21	0.79	0.42
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG:TTGTTTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.91666666666666	6	31.83333333333334	0.314193196111627	0.217071598340042	1.447417343007	0.097121597771585	0.0664465983537784	0.107157401404655	NaN	NaN	0.125448218725838	0.438814475655825	807	0	193	0.193	0.807	0.386
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAA	2	TTTATGAGA:TTTTTGAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.416666666666667	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.74999999999999	6	31.33333333333334	0.315030198683349	0.221099655165484	1.42483351431536	0.0939305435178658	0.0712978260611184	0.11092028937086	1.49241405846346	0.339720680821551	0.126182215617598	0.456632111854268	766	0	234	0.234	0.766	0.468
ORF3a	all	ss12	6	AAC	GAA	AAT	2	ATGAGAATC:TTGAACATC	1:1	TRUE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.41666666666666	6	31.08333333333334	0.297267816808078	0.223170685092358	1.33202000381482	0.0740971317157201	0.063722950784174	0.110486470100667	NaN	NaN	0.126705703484129	0.55868413456973	725	0	275	0.275	0.725	0.55
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AACATCTTC:AGAATCTTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.66666666666666	5	31.08333333333334	0.277225566435928	0.181054357970061	1.5311731213991	0.0961712084658671	0.0657676412208977	0.0901442049666225	NaN	NaN	0.120137322627735	0.42341498482356	790	0	210	0.21	0.79	0.42
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATCTTCACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.16666666666666	5	31.750000000000004	0.283860150265539	0.176766832783369	1.60584508867348	0.10709331748217	0.0628692313998001	0.0948554364831864	NaN	NaN	0.110995323642736	0.33462229736962	850	0	150	0.15	0.85	0.3
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACTTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.83333333333331	5	31.08333333333334	0.280872201839526	0.181054357970061	1.55131422954188	0.0998178438694649	0.0651234788834914	0.0889721750363466	NaN	NaN	0.107842079594465	0.354657677697294	821	0	179	0.179	0.821	0.358
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	AGG	2	ACAATTGGA:ACTTTAGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.16666666666664	5	31.750000000000004	0.283860150265539	0.176766832783369	1.60584508867348	0.10709331748217	0.0656191781374857	0.0889777456471199	NaN	NaN	0.114435298162027	0.349354726996688	824	0	176	0.176	0.824	0.352
ORF3a	all	ss12	11	GGA	AGG	AAC	2	ATTGGAACT:TTAGGATCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.24999999999999	5	31.33333333333334	0.28348314348195103	0.179422266799376	1.57997749409182	0.104060876682575	0.0628157688992218	0.0929265011832897	NaN	NaN	0.112991129847353	0.357068696913614	826	0	174	0.174	0.826	0.348
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	TAT	2	GGAACTGTA:GGATCTATT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.74999999999999	5	31.500000000000004	0.281242210583348	0.178350531835637	1.57690704753565	0.102891678747711	0.062063925909846	0.0938924922051437	NaN	NaN	0.114687458294155	0.369639692981024	819	0	181	0.181	0.819	0.362
ORF3a	all	ss12	13	ATT	TAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCTATTACT	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.91666666666664	5	31.66666666666667	0.28050317670762	0.177291583548173	1.58215732012684	0.103211593159448	0.0634256183359077	0.0877368925345357	NaN	NaN	0.110371183493383	0.349720428354448	834	0	166	0.166	0.834	0.332
ORF3a	all	ss12	14	ACT	AAC	TAG	2	ATTACTAGA:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.49999999999999	5	31.250000000000004	0.259484741116488	0.179963002222943	1.44187826337233	0.0795217388935452	0.0596817689877883	0.0906449922388425	NaN	NaN	0.113782405563538	0.484618835853749	751	0	249	0.249	0.751	0.498
ORF3a	all	ss12	15	AGA	TAG	ACA	2	ACTAGACAA:ACTTTGAAG	1:1	FALSE	1.75	0.75	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.49999999999999	5	31.250000000000004	0.277947211843005	0.179963002222943	1.54446863193956	0.0979842096200621	0.0649601706062959	0.0919903659112657	NaN	NaN	0.112916739448696	0.385527769452472	809	0	191	0.191	0.809	0.382
ORF3a	all	ss12	16	AAG	ACA	ACC	2	AGACAACCT:TTGAAGCAA	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.08333333333331	5	31.41666666666667	0.29884699168421	0.178884786483983	1.67061155707038	0.119962205200227	0.0663953087983167	0.0940966715910129	NaN	NaN	0.112212141060238	0.285039848820399	852	0	148	0.148	0.852	0.296
ORF3a	all	ss12	17	CAA	ACC	AGG	2	AAGCAAGGT:CAACCTGGT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.49999999999999	5	31.08333333333334	0.296875661285402	0.181054357970061	1.63970458714114	0.115821303315341	0.0661422372272907	0.0937698849058342	NaN	NaN	0.115407354703794	0.315577796623214	858	0	142	0.142	0.858	0.284
ORF3a	all	ss12	18	GGT	AGG	TAA	2	CAAGGTGAA:CCTGGTAAA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.58333333333331	5	30.25	0.273323285248654	0.18671695246621	1.46383754468206	0.0866063327824444	0.0623250037014499	0.0991364784684385	NaN	NaN	0.131138798307613	0.508986065080562	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	19	AAA	TAA	AAT	2	GGTAAAGTT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.16666666666664	5	30.75	0.3129461186614	0.183277466946071	1.70749914801847	0.129668651715329	0.0732597502160797	0.0962726669335781	NaN	NaN	0.132017945504034	0.325998993355454	836	0	164	0.164	0.836	0.328
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAAGTTGAA:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.49999999999999	5	30.75	0.301773247822437	0.183277466946071	1.6465376396283	0.118495780876366	0.0714282568266462	0.0940780111485437	NaN	NaN	0.132455091986033	0.37099507529734	819	1	180	0.18	0.819	0.36
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	AAA	2	ATCAAGGAT:GTTGAAAAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.99999999999999	5	31.416666666666668	0.285579371638345	0.178884786483983	1.5964430360539	0.106694585154361	0.0741195330976852	0.0976019872990186	NaN	NaN	0.124449483982535	0.391261161207356	820	0	180	0.18	0.82	0.36
ORF3a	all	ss12	22	AAT	AAA	TGC	2	AAGGATGCT:GAAAATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.66666666666664	6	32.083333333333336	0.272974032901059	0.215112484631514	1.26898275276147	0.0578615482695448	0.0704034334314872	0.103594682504733	NaN	NaN	0.137700471679155	0.674340362292718	701	0	299	0.299	0.701	0.598
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGTTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.58333333333331	6	31.75	0.291871371191942	0.217732646143538	1.34050348609427	0.0741387250484044	0.0764749703833752	0.105333695628363	NaN	NaN	0.139922805101728	0.596212829294485	698	1	301	0.301	0.698	0.602
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GTTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.24999999999999	5	32.25	0.31253265489275	0.173682709081938	1.79944599289562	0.138849945810812	0.0801213829655424	0.0863336819864255	NaN	NaN	0.131474704282592	0.290924230814258	847	1	152	0.152	0.847	0.304
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.08333333333333	6	32.416666666666664	0.294159645070685	0.212555050951034	1.38392215924546	0.0816045941196503	0.0767580839541925	0.10233335159462	1.42419831119152	0.331189802624415	0.135322367847036	0.546483095186349	729	0	271	0.271	0.729	0.542
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79	6	32.083333333333336	0.308860751840117	0.215112484631514	1.4358104429373	0.0937482672086033	0.0808677315297591	0.104678453285128	1.58017710927699	0.363540748311748	0.143007470719185	0.51211496658082	768	0	232	0.232	0.768	0.464
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TTC	2	GCAAGTTCT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.41666666666667	6	32	0.306858361132519	0.215761554338836	1.42221056050896	0.0910968067936837	0.0785618129422492	0.102847898389389	NaN	NaN	0.143871938299585	0.526616227696795	747	0	253	0.253	0.747	0.506
ORF3a	all	ss12	28	TCT	TTC	TGT	2	AGTTCTTTT:GATTTTGTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.66666666666667	5	32.416666666666664	0.310481848332055	0.172678550040526	1.79803367736866	0.13780329829152899	0.0783859982094662	0.0889879086124322	NaN	NaN	0.136735654351934	0.313546602626231	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	TCTTTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	78.33333333333334	4	33.083333333333336	0.331729257996926	0.13184534303006	2.51604835160005	0.199883914966866	0.085705077362074	0.0702249485321115	NaN	NaN	0.120150352770078	0.0961894159151676	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCGCGCT:TTTCATTCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	78.16666666666667	4	33.416666666666664	0.332619377773053	0.130408872715656	2.55058855158037	0.202210505057397	0.0824092205054422	0.068636977918302	NaN	NaN	0.120143116265254	0.0923595590095084	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATTCTACA:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	78.08333333333334	3	33.166666666666664	0.353303576254924	0.0963891381007337	3.66538785610569	0.25691443815419	0.087415053141467	0.0613647169698177	NaN	NaN	0.115281133120587	0.0258411636920057	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	32	ACA	TAC	AGC	2	GCTACTGCA:TCTACAGCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.41666666666667	3	32.833333333333336	0.326059409811611	0.0974341006801572	3.34646091599852	0.228625309131454	0.0836729432144807	0.0602421656730904	NaN	NaN	0.108003443393101	0.0342739795165272	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	33	GCA	AGC	AAC	2	ACAGCGTCC:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.75	3	32.166666666666664	0.319345642309943	0.0995936054863591	3.20648741202247	0.219752036823584	0.0802266197242782	0.0629344902136031	NaN	NaN	0.110816996985323	0.0473654823730252	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	CAT	2	GCAACGATA:GCGTCCATC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	80.58333333333334	3	32.5	0.339432170735082	0.0985020015458152	3.44594186319357	0.240930169189267	0.08435614290231	0.060206499121794	NaN	NaN	0.113580422424972	0.0339024742396795	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	35	ATA	CAT	ACC	2	ACGATACCG:TCCATCCCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.08333333333334	3	32.833333333333336	0.322667069425418	0.0974341006801572	3.31164414894764	0.225232968745261	0.0830030216263163	0.0620528329999379	NaN	NaN	0.111000460222084	0.0424463308308168	981	0	19	0.019	0.981	0.038
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATCCCTTTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	79.25000000000001	3	33.5	0.346689348322456	0.095366381613935	3.63534132736559	0.251322966708521	0.0864019430769631	0.0584126478845839	NaN	NaN	0.113080171046742	0.0262481690544109	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCTTTACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	79.58333333333334	3	33.5	0.38574159811854	0.095366381613935	4.04483835488391	0.290375216504605	0.0958425243581481	0.0574266231084658	NaN	NaN	0.127014530905886	0.0222450488394343	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:TTACAGGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	79.50000000000001	4	33.583333333333336	0.386270482964768	0.129702340924675	2.97813038848001	0.256568142040093	0.102403260069034	0.0710487402094225	NaN	NaN	0.12654498186155	0.042612764689423	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CAC	2	CAAGCCTCA:CAGGCCACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	79.50000000000001	4	33.083333333333336	0.407624238525752	0.13184534303006	3.09168476608852	0.275778895495692	0.0983348821835094	0.0698073835437121	NaN	NaN	0.138067515748025	0.0457795155137646	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	40	ACT	CAC	ACT	2	GCCACTCTA:GCCTCACTC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	79.83333333333334	4	32.75	0.405366611692162	0.133313895827917	3.04069286382129	0.272052715864245	0.101836726219027	0.0717069313456941	NaN	NaN	0.135551312039971	0.0447486947609576	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	41	CTA	ACT	ACC	2	ACTCTACCT:TCACTCCCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	80.16666666666669	4	32.416666666666664	0.382080436494996	0.134815620966532	2.83409618081164	0.247264815528465	0.0950635833278868	0.0719752680888401	NaN	NaN	0.127141363557555	0.0517987779083965	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	42	CCT	ACC	TTT	2	CTACCTTTC:CTCCCTTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	81.00000000000003	4	31.749999999999996	0.376971642421359	0.137923200937065	2.7331996347255	0.239048441484294	0.097862120303069	0.0775803109272007	NaN	NaN	0.133464698520421	0.0732774656033717	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	81.00000000000003	4	31.749999999999996	0.376971642421359	0.137923200937065	2.7331996347255	0.239048441484294	0.102053173812112	0.0769711242767781	NaN	NaN	0.131408669571002	0.0688927732955739	972	0	28	0.028	0.972	0.056
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	80.6666666666667	4	32.08333333333333	0.378998328336262	0.136351658368326	2.77956522767384	0.242646669967936	0.0913692573762887	0.0705382170211578	NaN	NaN	0.130885051985649	0.0637547010344891	972	0	28	0.028	0.972	0.056
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	80.83333333333337	4	32.08333333333333	0.398744783001624	0.136351658368326	2.92438528268205	0.262393124633298	0.10622361142137	0.0716589815489657	NaN	NaN	0.13724687665614899	0.0558976019812246	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	79.08333333333337	4	32.83333333333333	0.410482767825298	0.132943691128056	3.08764383132635	0.277539076697242	0.104518981503905	0.0691059528731506	NaN	NaN	0.136472604598864	0.0419857402077124	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT:CTTGTTGTT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	79.08333333333337	4	32.83333333333333	0.410482767825298	0.132943691128056	3.08764383132635	0.277539076697242	0.10666298058018	0.0702541207663836	NaN	NaN	0.133209424425715	0.0372075577370787	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTGTTGGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	78.9166666666667	4	32.83333333333333	0.390014598784791	0.132943691128056	2.93368264018723	0.257070907656735	0.105362038393288	0.074028315189429	NaN	NaN	0.129705458252615	0.0474838233154717	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	78.9166666666667	4	32.83333333333333	0.390014598784791	0.132943691128056	2.93368264018723	0.257070907656735	0.103652680875677	0.0714641756637202	NaN	NaN	0.134293063695959	0.0555878294379376	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	78.4166666666667	4	33.33333333333333	0.393283424743571	0.130765040358583	3.00755785846975	0.262518384384988	0.098436743256054	0.0703876786657536	NaN	NaN	0.134318011617889	0.0506475416800053	982	0	18	0.018	0.982	0.036
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	79.25000000000003	4	32.5	0.387866069113228	0.134437018317738	2.88511359420749	0.25342905079549	0.0995757668687459	0.073869292835301	NaN	NaN	0.137388610157368	0.0650936061544368	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	78.75000000000003	4	33	0.391098016478285	0.132209431753494	2.95817031577211	0.258888584724791	0.100194822923724	0.0714132586714949	NaN	NaN	0.13321318866643	0.0519659677635219	976	0	24	0.024	0.976	0.048
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	77.9166666666667	4	32.166666666666664	0.375140419170701	0.135964367940317	2.75910832267005	0.239176051230384	0.096197951235813	0.0745823020239223	NaN	NaN	0.128876506118164	0.0634742916784049	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	78.58333333333336	4	31.499999999999996	0.37102218137708	0.139125907283501	2.6668087103363	0.231896274093579	0.101081499123672	0.0743292947028766	NaN	NaN	0.129082698937095	0.0724160107836525	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	78.08333333333336	4	31.999999999999996	0.374102136084068	0.136741167595466	2.73584131730401	0.237360968488602	0.095962719594209	0.0729654194141844	NaN	NaN	0.127643400664579	0.0629473522189767	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	78.9166666666667	4	31.833333333333332	0.368997461709812	0.137526919369799	2.68309261489096	0.231470542340013	0.0928143355305435	0.0738598982327349	NaN	NaN	0.129316515562683	0.0734613961335044	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAG	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	77.58333333333336	4	32.5	0.377234736853032	0.134437018317738	2.80603320107448	0.242797718535294	0.0978128229692509	0.0720483178290422	NaN	NaN	0.132704860554116	0.0673087524950946	976	0	24	0.024	0.976	0.048
ORF3a	all	ss12	58	AGC	AAG	CGC	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	78.4166666666667	4	32.166666666666664	0.37204306715298	0.135964367940317	2.7363277069496	0.236078699212663	0.100203927588265	0.0782484982377777	NaN	NaN	0.132078447912197	0.0738708055721575	963	0	37	0.037	0.963	0.074
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TGC	2	AGCGCTGCG:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	76.9166666666667	4	32.83333333333333	0.381495840567313	0.132943691128056	2.86960469752448	0.248552149439257	0.0988037757107548	0.0682440770147654	NaN	NaN	0.129707843304019	0.0553337774509107	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	60	GCG	TGC	CAA	2	GCTGCGAAA:GCTTCCAAA	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	77.25000000000003	5	32.5	0.401133184223939	0.172180831233375	2.32972033733674	0.228952352990564	0.10201218410069	0.0867863149350978	NaN	NaN	0.137310098920312	0.0954327317522362	963	0	37	0.037	0.963	0.074
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	GCGAAATTA:TCCAAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	77.1666666666667	5	32.58333333333333	0.379886454198651	0.171685985854599	2.21268178825252	0.208200468344052	0.100521231320147	0.0862249210307684	NaN	NaN	0.135210462619893	0.123602984319276	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	62	ATC	AAT	AAT	2	AAAATCATA:AAATTAATA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	76.4166666666667	5	33	0.3847567730602	0.169253998250676	2.27325071807373	0.215502774809524	0.0970455050289017	0.0810211647230312	NaN	NaN	0.135697374370965	0.112260771686308	946	0	54	0.054	0.946	0.108
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATCATAACC:TTAATACCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	76.58333333333336	5	32.666666666666664	0.383663484902079	0.171193988985735	2.24110371617106	0.212469495916344	0.102173768132632	0.088538484741176	NaN	NaN	0.135802166956983	0.117688087955809	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATACCTTTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	75.91666666666669	5	33	0.388075182994517	0.169253998250676	2.2928568128698	0.218821184743841	0.101659264794011	0.0857142841519482	NaN	NaN	0.132753960011731	0.0992867486983523	956	0	44	0.044	0.956	0.088
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:CCTTTTAAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	76.25000000000003	5	33.33333333333333	0.364233327851873	0.167357663485657	2.17637675064153	0.196875664366216	0.0970236349327267	0.0860850723989649	NaN	NaN	0.129184815436774	0.12751256771684	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:TTTAACAGT	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.25	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	76.25000000000003	5	33.666666666666664	0.343216190776894	0.165503521626615	2.07376971440649	0.177712669150279	0.0941722927106219	0.0802519523346547	NaN	NaN	0.125812456821328	0.157796771231082	926	0	74	0.074	0.926	0.148
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	GAG	2	AAAAAGAGA:AACAGTCTT	1:1	FALSE	2.25	0.416666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	75.41666666666669	5	34.33333333333333	0.327242322351052	0.161916285324778	2.0210587322619	0.165326037026274	0.0902453976689759	0.083462943769672	NaN	NaN	0.122188506628499	0.176042590487959	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	68	AGA	GAG	ATG	2	AAGAGATGG:AGTCTTTGG	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.75	0.666666666666667	0.166666666666667	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	75.08333333333336	4	34.666666666666664	0.350009644846423	0.125290563497375	2.7935834517478	0.224719081349048	0.0924467878939873	0.0678324421329949	NaN	NaN	0.111017913947431	0.0429527090701598	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:CTTTGGCAG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	74.91666666666669	4	35	0.329985417673969	0.123992985319038	2.66132327425544	0.205992432354931	0.0844470338043915	0.067988876541741	NaN	NaN	0.105309527771029	0.0504573287372825	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	73.83333333333336	4	35.416666666666664	0.402556281259198	0.122408407943652	3.28863260311748	0.280147873315546	0.116648355423947	0.0666257080341494	NaN	NaN	0.127724494510685	0.0282802817377879	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	71	CGT	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCGTTGC	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	74.00000000000001	4	35.25	0.401357198562523	0.12303734291849899	3.26207628547687	0.278319855644023	0.111324144251666	0.0682692182028764	NaN	NaN	0.128500374438835	0.0303182971866954	994	0	6	0.006	0.994	0.012
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CGTTGCTTA:CTAGCACTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	74.91666666666669	3	34.5	0.417837100355913	0.0924244803179611	4.52084879372282	0.325412620037952	0.113971577650015	0.0563044692196542	NaN	NaN	0.121513876826556	0.00740660245678254	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	ATA	2	GCACTCTCC:TGCTTATAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	74.91666666666669	3	34.5	0.372625674037229	0.0924244803179611	4.03167724346745	0.280201193719268	0.103420171823254	0.0555984859031952	NaN	NaN	0.1110911047115	0.0116601864759965	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	74	TAC	ATA	CAA	2	CTCTCCAAG:TTATACCAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	75.25000000000001	3	34.166666666666664	0.370490808198053	0.0933847109044368	3.96736044487182	0.277106097293616	0.100332156714995	0.0572360765097283	NaN	NaN	0.105785582918706	0.008805691093206	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	75	AAG	CAA	GAG	2	TACCAGAGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.416666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	75.58333333333334	2	34	0.390320159404604	0.0612585232607003	6.37168737717531	0.329061636143904	0.102816252156467	0.0462012100512919	NaN	NaN	0.100949672093663	0.00111545735224236	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	76	AGC	GAG	CTT	2	AAGGGTGTT:CAGAGCTTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	75.75	2	33.75	0.41171012368939103	0.0617314855970427	6.66937009060275	0.349978638092349	0.109255994784965	0.043056538681679	NaN	NaN	0.116925069581271	0.0027608022373662	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	77	GTT	CTT	TCA	2	AGCTTTCAA:GGTGTTCAC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	76	2	33.416666666666664	0.387518057413791	0.062373587449531503	6.21285504425002	0.32514446996426	0.102329042368387	0.0465352877652654	NaN	NaN	0.11205441666188	0.00371184282919251	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	78	CAA	TCA	ATT	2	GTTCACTTT:TTTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	76.16666666666667	2	33.166666666666664	0.408715173680987	0.0628640039123036	6.50157718638399	0.345851169768683	0.116129399833516	0.0476839252921564	NaN	NaN	0.119127540844327	0.00369369745187328	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	79	TTG	ATT	GCT	2	CAATTGCTT:CACTTTGTT	1:1	FALSE	1.75	0.5	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	77	2	32.666666666666664	0.380957833043326	0.0638683562552301	5.96473520503559	0.317089476788096	0.108165353790655	0.0470740999729671	NaN	NaN	0.114270939950172	0.00552201018144218	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	80	CTT	GCT	TTG	2	TTGCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	76.08333333333334	2	32.916666666666664	0.365261231304204	0.0633621979772033	5.76465531444504	0.301899033327001	0.108910969737747	0.0453723353691797	NaN	NaN	0.115382027595985	0.00888319483672203	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	CTTTGCAAT:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	76.66666666666667	2	32.833333333333336	0.340854515411144	0.0635300231041221	5.36525092793533	0.277324492307022	0.103498947734351	0.0464080567880973	NaN	NaN	0.1062423712202	0.00904627750792847	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAATGTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	76	2	33.5	0.34464924703383	0.0622118122355632	5.53993260522336	0.282437434798267	0.107436409072325	0.0451314194960167	NaN	NaN	0.106804841798164	0.00818297460398655	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	83	GTG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG:AATGTGCTT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	76	2	33.5	0.34464924703383	0.0622118122355632	5.53993260522336	0.282437434798267	0.110603886618948	0.0469209324474918	NaN	NaN	0.104115092393075	0.00667289394201406	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GTT	2	GTGCTTCTT:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.33333333333333	2	32.75	0.317142638115025	0.0636987401522852	4.97878980583963	0.25344389796274	0.103718468687363	0.0464189035620236	NaN	NaN	0.10482113702122	0.0156116468864951	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	85	CTT	GTT	GTT	2	CTGTTGTTG:CTTCTTATT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	78.16666666666666	3	32.416666666666664	0.352822619571909	0.0987726497511971	3.57206798097095	0.254049969820712	0.103417874175675	0.0618170207039591	NaN	NaN	0.107301565282868	0.0179026256317571	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	86	ATT	GTT	GTT	2	CTTATTGCT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	78.33333333333333	3	32.083333333333336	0.331729257996926	0.0998703029515669	3.32160059790548	0.231858955045359	0.0994193400897508	0.0642123374235656	NaN	NaN	0.109237815397811	0.0337944734957332	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	87	GCT	GTT	TGT	2	ATTGCTTTG:TTGTTTGTA	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.16666666666666	3	31.416666666666668	0.289246860608989	0.102140577511979	2.8318506479471	0.187106283097009	0.0911243742656806	0.0605992435516817	NaN	NaN	0.0912192509376638	0.0402502959822078	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	GCTTTGACA:TTTGTAACA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.91666666666666	2	31	0.267841453433817	0.0674611774972046	3.97030504611213	0.200380275936613	0.0890524106913843	0.0520807349967173	NaN	NaN	0.0871922831132681	0.0215536901955662	995	0	5	0.005	0.995	0.01
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	GTAACAGTT:TTGACAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.25	2	31.5	0.252669701240021	0.0663415654213976	3.80861831696431	0.186328135818623	0.0864410332218393	0.04724673036003	NaN	NaN	0.0830597587983915	0.0248773365762794	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	90	GTT	AGT	TTA	2	ACAGTTTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.91666666666666	2	32.166666666666664	0.253939801735161	0.0649053422482923	3.91246379633477	0.189034459486869	0.0878019429098878	0.0469713299127928	NaN	NaN	0.0824354750923979	0.0218410812930122	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	GTTTACTCA:GTTTACTCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.74999999999999	2	32.5	0.272625681756849	0.0642103145422439	4.24582380105753	0.208415367214605	0.0910520696016878	0.0505609802753036	NaN	NaN	0.084813504735304	0.0139971295934422	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TACTCGCAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.74999999999999	2	32.5	0.272625681756849	0.0642103145422439	4.24582380105753	0.208415367214605	0.0916432510085438	0.0490120773498348	NaN	NaN	0.0885417266610679	0.0185793032487828	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCGCACTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.41666666666664	2	31.5	0.274024507731712	0.0663415654213976	4.13051012575788	0.207682942310314	0.0896590377688131	0.0503005779405592	NaN	NaN	0.0877754232331212	0.0179779637254297	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	ACT	2	CACCTTTTG:CACTTACTG	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.99999999999999	2	31.25	0.294544561748051	0.0668966841033532	4.40297700395717	0.227647877644698	0.0926949348056162	0.0502315469890368	NaN	NaN	0.0936357223017764	0.0150485902610891	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	95	CTG	ACT	GCT	2	CTTTTGCTC:TTACTGCTT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.16666666666664	2	30.583333333333332	0.270897321493184	0.0684234871721278	3.95912767222325	0.202473834321056	0.0925545609426226	0.0542292552100635	NaN	NaN	0.0869985213361935	0.0199479737627733	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	CTGCTTGTT:TTGCTCGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.91666666666664	2	30.833333333333332	0.271931669012678	0.0678428326164385	4.00825936248995	0.20408883639624	0.0884841376922948	0.0499878737915757	NaN	NaN	0.0880779550892869	0.0204961786785546	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	97	GTT	CGT	TGC	2	CTCGTTGCT:CTTGTTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.24999999999997	2	30.166666666666668	0.266505540694197	0.0694136680239339	3.83938132476021	0.197091872670263	0.0855312927015618	0.0540419524813443	NaN	NaN	0.0874585354255725	0.0242247149562856	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	98	GCT	TGC	TGC	2	GTTGCTGCA:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.24999999999997	2	30.166666666666668	0.284497407971714	0.0694136680239339	4.09857908493784	0.21508373994778	0.0916652678025785	0.0533029447641827	NaN	NaN	0.093063495348342	0.020824545706222	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	99	GCA	TGC	AGG	2	GCTGCAGGG:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.5	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.91666666666664	2	30	0.281652316781776	0.069817817299509	4.03410372417582	0.211834499482267	0.0881500273888748	0.0508402820850218	NaN	NaN	0.0901267189945566	0.0187528774474505	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	100	GGC	AGG	CCT	2	GCAGGGCTT:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.41666666666664	2	30.5	0.279555991798541	0.0686192553184994	4.07401669547373	0.210936736480042	0.0926780959636775	0.050151504986815	NaN	NaN	0.0884830289426184	0.0171291814434348	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	101	CTT	CCT	TGA	2	GGCCTTGAA:GGGCTTGAA	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.24999999999999	2	31.333333333333332	0.280251250519624	0.0667106145123721	4.20099938470285	0.213540636007252	0.0865147704731284	0.0498203755726387	NaN	NaN	0.0898919150823245	0.0175239289572698	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	102	GAA	TGA	AGC	2	CTTGAAGCA:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.24999999999999	2	31.333333333333332	0.280251250519624	0.0667106145123721	4.20099938470285	0.213540636007252	0.0952388844384717	0.049718345899146	NaN	NaN	0.0894099566109708	0.0169250571132483	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	103	GCA	AGC	ACC	2	GAAGCACCT:GAAGCCCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.24999999999999	2	32.333333333333336	0.276131384897019	0.0645559565784322	4.27739591406307	0.211575428318586	0.0930868606514406	0.0508449545354843	NaN	NaN	0.0872842310175707	0.015351355005941	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	104	CCT	ACC	TTT	2	GCACCTTTC:GCCCCTTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.49999999999999	2	32.333333333333336	0.292820423057718	0.0645559565784322	4.53591641387819	0.228264466479286	0.0925320731328494	0.0473303444237392	NaN	NaN	0.0855262362312927	0.00760908468372301	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	105	TTC	TTT	CCT	2	CCTTTCCTT:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.83333333333331	2	32	0.309399206498443	0.0652585327422224	4.74113029357555	0.24414067375622	0.0950375606853182	0.0498050990525574	NaN	NaN	0.0938253256796588	0.00926611839335487	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	106	CTC	CCT	CTA	2	TTCCTTTAT:TTTCTCTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.16666666666666	2	32.666666666666664	0.312512993784714	0.0638683562552301	4.89308026866784	0.24864463752948401	0.0880330195344764	0.0485185132817433	NaN	NaN	0.0927028451702984	0.00731466388016194	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	107	TAT	CTA	TCT	2	CTCTATCTT:CTTTATCTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.16666666666666	2	32.666666666666664	0.312512993784714	0.0638683562552301	4.89308026866784	0.24864463752948401	0.099337836368278	0.0460699643985258	NaN	NaN	0.0893470834058866	0.00538742209550444	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	108	CTA	TCT	ACT	2	TATCTACTT:TATCTTTAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	83	2	32.333333333333336	0.308630566923095	0.0645559565784322	4.78082245668725	0.244074610344663	0.0960423595233587	0.0495854316235827	NaN	NaN	0.090923411867531	0.00726605859141091	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	109	CTT	ACT	TGC	2	CTACTTGCT:CTTTATGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	83.49999999999999	2	32.333333333333336	0.306347708328316	0.0645559565784322	4.74545997867941	0.241791751749884	0.0895148290502641	0.0487358146536573	NaN	NaN	0.0921459247155162	0.00869014445513509	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	110	GCT	TGC	TTT	2	CTTGCTTTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	83.16666666666666	1	32.666666666666664	0.289954491278301	0.0312545223004261	9.27720118359796	0.258699968977875	0.0887464903680952	0.0339408929186168	NaN	NaN	0.0883342416937199	0.00340438863848689	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	111	TTA	TTT	AGT	2	GCTTTAGTC:GCTTTGATT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	83.33333333333333	1	32.5	0.289246860608989	0.0314182062818701	9.20634545505224	0.257828654327118	0.0873154390869291	0.0324651106984995	NaN	NaN	0.085273198053101	0.00249819256353514	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	112	ATT	AGT	CTA	2	TTAGTCTAC:TTGATTTAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	83.41666666666667	1	32.08333333333333	0.288894354874281	0.0318350176854428	9.07473517774686	0.257059337188838	0.093075991133838007	0.0321554448953033	NaN	NaN	0.086960644167937	0.00311614413755907	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	ATTTACTTC:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.25	1	31.75	0.276131384897019	0.0321765161581571	8.58176763263466	0.243954868738862	0.0929348380959863	0.0361306184382601	NaN	NaN	0.0868892145385822	0.00499037806583035	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	114	TTC	CTT	CTT	2	TACTTCTTA:TACTTCTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.66666666666667	1	31.5	0.292098575071292	0.0324374878453625	9.00496907972031	0.25966108722593	0.09440050838188	0.0339619591396185	NaN	NaN	0.080451185618158	0.00124850536716154	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	115	TTA	CTT	ACA	2	TTCTTACAG:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.33333333333334	1	31.166666666666664	0.293545893158417	0.0327921082603737	8.95172371436515	0.260753784898043	0.0926837505517684	0.0344286064074031	NaN	NaN	0.0827315120652356	0.00162263311750197	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	116	CAG	ACA	GAG	2	TTACAGTGC:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	83	1	30.5	0.327036398610183	0.0335251341884302	9.75496165867835	0.293511264421753	0.100759884085663	0.0356364460035114	NaN	NaN	0.0919555331212059	0.00141348780707935	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	117	AGT	GAG	CGT	2	CAGAGTATA:CAGTGCGTT	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.416666666666667	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	82.75	1	30.166666666666664	0.347234260731578	0.0339040775760351	10.2416666536009	0.313330183155543	0.104687772711746	0.0360917875646475	NaN	NaN	0.101806929514183	0.00208611706159489	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	118	ATA	CGT	AAA	2	AGTATAAAC:TGCGTTGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	82.5	1	30.166666666666664	0.329524994837884	0.0339040775760351	9.71933225727418	0.295620917261849	0.106704719383631	0.0356647377322063	NaN	NaN	0.0983597209495683	0.00265137718229618	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	ATT	2	ATAAACTTT:GTTGTATTT	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	3	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.5	1	29.916666666666664	0.310948193753578	0.0341939559917542	9.09365952943737	0.276754237761823	0.0935801454350485	0.0374484547140762	NaN	NaN	0.0930105449342217	0.00292497392295224	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	120	TTT	ATT	TGG	2	AACTTTGTA:GTATTTGGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.08333333333334	1	30.166666666666664	0.276809501266932	0.0339040775760351	8.16448996868133	0.242905423690897	0.0798184807191669	0.0368683400709337	NaN	NaN	0.0780678960632421	0.00186162368712891	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	121	GGC	TGG	AAG	2	TTTGGCAGG:TTTGTAAGA	1:1	TRUE	1.75	1	0.25	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.58333333333334	1	30	0.278864213743485	0.034096780557568	8.17860833730796	0.244767433185917	0.0832247421680658	0.034304377402629	NaN	NaN	0.0741081636123214	9.57108610960858e-4	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GGCAGGCTT:GTAAGAATA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.08333333333334	1	30.5	0.280950016543332	0.0335251341884302	8.38028014934212	0.247424882354902	0.0786953840505437	0.0344127629322206	NaN	NaN	0.0783994892231797	0.00159976181278237	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGGCTTCTT	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.83333333333334	1	30.5	0.28200480071778	0.0335251341884302	8.41174263860521	0.248479666529349	0.0834605859654521	0.0342641796039538	NaN	NaN	0.0753416657293227	9.73630031891372e-4	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:CTTCTTGTC	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80	1	29.833333333333332	0.267506207954049	0.0342916870035713	7.80090544761445	0.233214520950478	0.0812967519502508	0.0350134362454297	NaN	NaN	0.0761827450807784	0.00220414078191794	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	CAG	2	ATAATGAGG:CTTGTCAGA	1:1	TRUE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.5	1	29.166666666666664	0.248018905279285	0.0350941211300692	7.06724936521572	0.212924784149216	0.0794041054094718	0.0383470404132139	NaN	NaN	0.0729648009090659	0.00352075450791044	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	126	AGA	CAG	ATG	2	ATGAGGCTT:GTCAGATGC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80	2	29.166666666666664	0.23261619622788	0.0719113287774619	3.23476426013122	0.160704867450418	0.0730757825059525	0.055900848153869	NaN	NaN	0.0717689135941793	0.0251429818569716	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	CTG	2	AGATGCTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.75	2	29.166666666666664	0.233471628313773	0.0719113287774619	3.24665991135108	0.161560299536311	0.0724493241485102	0.0548838980541703	NaN	NaN	0.072309829341151	0.0254647518078952	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	128	TGG	CTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGCTGGCTG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.83333333333333	2	29.333333333333332	0.216283656691977	0.0714826348532437	3.02568109214238	0.144801021838734	0.0673850953581179	0.0542216122045835	NaN	NaN	0.0655956299796805	0.027280563421856	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	129	CTG	GCT	GTG	2	TGGCTGTGC:TGGCTTTGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.33333333333333	2	29.833333333333332	0.221099655165484	0.0702267037754945	3.14837011106644	0.150872951389989	0.0650126085699174	0.0532989208003334	NaN	NaN	0.0628370818466442	0.0163495416267544	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	130	TGC	GTG	CTG	2	CTGTGCTGG:CTTTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.16666666666667	2	29.5	0.218397760919419	0.0710590256920247	3.07346967950239	0.147338735227394	0.066858332858606	0.0552799620627274	NaN	NaN	0.0646220481451923	0.0226072612915845	986	0	14	0.014	0.986	0.028
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.66666666666667	3	29.5	0.237252996159118	0.109283858386045	2.17097931627763	0.127969137773072	0.0705282411962858	0.070513977076589	NaN	NaN	0.0774370486752553	0.0984210530725955	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.66666666666667	3	28.833333333333332	0.272974032901059	0.11200896641424	2.4370730454875	0.160965066486819	0.0780360087793521	0.0694965017390178	NaN	NaN	0.0835839346023084	0.0541306587906046	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCAAA:AAATGCCGT	1:1	FALSE	2.75	0.25	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.33333333333334	3	30	0.278672667324362	0.107325632730505	2.59651548502034	0.171347034593857	0.0817332888152378	0.0693418272095975	NaN	NaN	0.0826145340070643	0.0380742624496331	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CAA	ATC	2	TGCAAATCA:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.91666666666667	3	30.333333333333332	0.28050317670762	0.106058740537371	2.64479075733302	0.174444436170249	0.0778953776593193	0.0688146352464398	NaN	NaN	0.0799491589357538	0.0291138058075777	986	0	14	0.014	0.986	0.028
ORF3a	all	ss12	135	TCA	ATC	AAA	2	AAATCAAAG:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.25	2	30.666666666666664	0.246150398079761	0.068228833654295	3.60771809946169	0.177921564425466	0.0708943367330796	0.0518081048026373	NaN	NaN	0.0742976059511975	0.0166333049953737	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	136	AAA	AAA	AAA	2	TCAAAGAAT:TCCAAAAAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.58333333333334	2	31	0.244883349127368	0.0674611774972046	3.62998925029904	0.177422171630164	0.0719008076422385	0.0504584346479214	NaN	NaN	0.0737349408268576	0.0161187448518958	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAGAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.41666666666667	2	31	0.245515224303584	0.0674611774972046	3.63935575114676	0.178054046806379	0.0712569062803026	0.0511076582944	NaN	NaN	0.0786254815217161	0.0235381889377497	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA:AATCCATTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.08333333333334	2	30.666666666666664	0.246788896582768	0.068228833654295	3.6170762911353602	0.178560062928474	0.0726200659078544	0.0524803651399015	NaN	NaN	0.0769709817021295	0.0203497447411057	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	AAT	2	CCATTAATT:CCATTACTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.08333333333334	2	29.666666666666664	0.243007258038147	0.0706404112947758	3.44006006737561	0.172366846743372	0.0718188270580036	0.0520630472755827	NaN	NaN	0.0779350819125384	0.0269893292056241	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	140	ATT	AAT	TTA	2	TTAATTTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1.5	0.5	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.41666666666669	2	29	0.241772556876833	0.0723451996406717	3.34192950019743	0.169427357236161	0.0678252285050335	0.0551939550825736	NaN	NaN	0.0773040176675714	0.0284010432903275	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	141	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAC:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.41666666666669	3	29.833333333333332	0.241772556876833	0.107970516691131	2.23924608574826	0.133802040185702	0.0703195156170304	0.0640329134310214	NaN	NaN	0.0822743101448923	0.103887584362224	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	142	GAC	TGA	CTC	2	TATGACTCA:TATGATGCC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.25000000000001	3	30.5	0.24238832144563	0.105436462965892	2.29890414214711	0.136951858479738	0.0692393392122273	0.0684210111994272	NaN	NaN	0.0795772104480188	0.0852520112630478	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	143	GCC	CTC	AAA	2	GACTCAAAC:GATGCCAAC	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.91666666666667	3	30.833333333333332	0.236369452063806	0.104213595070396	2.26812492078542	0.13215585699341	0.0698513962117772	0.0671168806871018	NaN	NaN	0.078223391281345	0.0911299247124202	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	144	AAC	AAA	CTA	2	GCCAACTAT:TCAAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.66666666666667	3	30.083333333333332	0.213698279309918	0.107006075844546	1.99706677983754	0.106692203465372	0.064883589780673	0.0657733643128162	NaN	NaN	0.0746516193488951	0.15294633781584	928	0	72	0.072	0.928	0.144
ORF3a	all	ss12	145	TAT	CTA	TTT	2	AACTATTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.00000000000001	3	30.75	0.215761554338836	0.104516640682884	2.06437513614203	0.111244913655952	0.0676094173285313	0.0655904019622037	NaN	NaN	0.0733610146090626	0.129417305209612	933	0	67	0.067	0.933	0.134
ORF3a	all	ss12	146	TTT	TTT	TCT	2	TATTTTCTT:TATTTTGTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.33333333333334	3	30.416666666666664	0.214724926668622	0.105746684778908	2.03055941770243	0.108978241889714	0.0644371013474099	0.0630501340887479	NaN	NaN	0.075775609593239	0.150385699843887	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.00000000000001	3	30.083333333333332	0.215761554338836	0.107006075844546	2.01634862914033	0.10875547849429	0.0654092615376418	0.0663361700410929	NaN	NaN	0.0772148545438333	0.158989367678742	930	0	70	0.07	0.93	0.14
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.33333333333334	3	29.75	0.198330831309248	0.10829587866142	1.83137930788036	0.0900349526478274	0.061856490160113	0.0678744943040529	NaN	NaN	0.0714543628410244	0.207656965909107	910	0	90	0.09	0.91	0.18
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.08333333333334	3	30	0.199039887585717	0.107325632730505	1.85454194419246	0.0917142548552119	0.0626683694372518	0.0657037742521073	NaN	NaN	0.0746477677921243	0.219211728459857	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.08333333333334	3	29.666666666666668	0.199039887585717	0.108623210908842	1.83238817855195	0.0904166766768749	0.0601006824556803	0.0652870887721355	NaN	NaN	0.0724467015058437	0.212014916299867	906	0	94	0.094	0.906	0.188
ORF3a	all	ss12	151	ACT	TAC	TAA	2	CATACTAAT:CATACTCAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.66666666666667	4	29.666666666666668	0.200233049317567	0.148632696437812	1.34716690281768	0.0516003528797557	0.0601586627234146	0.0807677317510343	NaN	NaN	0.0878653749767939	0.55702502948205	752	1	247	0.247	0.752	0.494
ORF3a	all	ss12	152	AAT	TAA	CAC	2	ACTAATTGT:ACTCACACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.166666666666667	1	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.91666666666667	4	29.416666666666668	0.216022287871794	0.150031026615648	1.4398507611709	0.0659912612561451	0.0647342957361377	0.08033609134356	NaN	NaN	0.090789216597852	0.467310297279045	765	0	235	0.235	0.765	0.47
ORF3a	all	ss12	153	ACT	CAC	TCA	2	AATTGTTAC:CACACTCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.5	0.333333333333333	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.5	5	29.166666666666668	0.234333426514436	0.194633396613813	1.20397337040464	0.0397000299006222	0.0702523776765828	0.10025267558552001	NaN	NaN	0.102206979345502	0.697699490824051	671	0	329	0.329	0.671	0.658
ORF3a	all	ss12	154	CAT	TCA	CGA	2	ACTCATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.75	5	29.833333333333332	0.236957742360063	0.189683904532547	1.24922429735942	0.0472738378275157	0.0696356333585647	0.0939483366783431	NaN	NaN	0.0968778256064079	0.625568420078621	700	1	299	0.299	0.7	0.598
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	CATGACTAT:TACGACTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.08333333333334	5	30.166666666666668	0.235784099565018	0.187302855665743	1.25883878666428	0.0484812438992753	0.0701457450040574	0.0912359397305494	NaN	NaN	0.0912697193062885	0.59528953839058	712	0	288	0.288	0.712	0.576
ORF3a	all	ss12	156	TAT	CTA	TTG	2	GACTATTGT	2	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.58333333333334	5	29.333333333333332	0.23404544868519	0.193371831976575	1.21033889110355	0.0406736167086151	0.0683552560307796	0.0920165320894971	NaN	NaN	0.101362644475409	0.688222594996305	663	2	335	0.335	0.663	0.67
ORF3a	all	ss12	157	TGT	TTG	TAT	2	TATTGTATA:TATTGTATT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.91666666666667	5	29	0.267841453433817	0.195911624447713	1.36715447176184	0.0719298289861041	0.0790814931699518	0.0989331848220723	NaN	NaN	0.113650375524566	0.526796038371949	752	2	246	0.246	0.752	0.492
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCT:TGTATTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.75	5	29.333333333333336	0.268514498493544	0.193371831976575	1.38859158414589	0.0751426665169695	0.0788562981041162	0.0985183028526428	NaN	NaN	0.107471883236492	0.48443678494665	741	0	259	0.259	0.741	0.518
ORF3a	all	ss12	159	CCT	ACC	TTA	2	ATACCTTAC:ATTCCTTAC	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.08333333333334	5	28.666666666666668	0.267171809494173	0.198519415670312	1.34582206275418	0.0686523938238618	0.0756143057989606	0.098967308782257	NaN	NaN	0.10738585809517	0.522624065094808	756	1	243	0.243	0.756	0.486
ORF3a	all	ss12	160	TAC	TTA	CAA	2	CCTTACAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.41666666666667	5	28.666666666666668	0.265842621320033	0.198519415670312	1.33912655556839	0.067323205649721607	0.0771134210723485	0.0977979255216199	NaN	NaN	0.108668576231508	0.535568703541813	756	1	243	0.243	0.756	0.486
ORF3a	all	ss12	161	AAT	CAA	TAG	2	TACAATAGC:TACAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.75	5	28.666666666666668	0.282358178426184	0.198519415670312	1.42232021725828	0.0838387627558724	0.0760484232469284	0.0926625457000096	NaN	NaN	0.114337064359428	0.46340004293525	783	0	217	0.217	0.783	0.434
ORF3a	all	ss12	162	AGC	TAG	CAT	2	AATAGCATT:AATAGTGTA	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.41666666666666	5	29	0.283780696115475	0.195911624447713	1.44851382308462	0.0878690716677615	0.0833677260031642	0.0916306702524003	NaN	NaN	0.106706967386799	0.410245643616265	824	1	175	0.175	0.824	0.35
ORF3a	all	ss12	163	ATT	CAT	AAC	2	AGCATTACA:AGTGTAACT	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.41666666666667	5	29.333333333333336	0.279555991798541	0.193371831976575	1.4456913860774	0.0861841598219663	0.076445161952964	0.0963547668543468	NaN	NaN	0.105616407404548	0.414493792406876	780	0	220	0.22	0.78	0.44
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AAA	2	ATTACAAAC:GTAACTTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.33333333333334	5	29.916666666666668	0.262255311359812	0.189082955000185	1.38698547079273	0.0731723563596266	0.078301386140074	0.0914332091418703	NaN	NaN	0.103455650959767	0.47939102913578	757	0	243	0.243	0.757	0.486
ORF3a	all	ss12	165	AAC	AAA	CAC	2	ACAAACACT:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.83333333333334	5	30.25	0.264199810240475	0.18671695246621	1.41497494871703	0.0774828577742649	0.0762933203959625	0.0906440780238799	NaN	NaN	0.104671191170979	0.459148264397161	772	0	228	0.228	0.772	0.456
ORF3a	all	ss12	166	ACT	CAC	AAT	2	AACACTATC:TCTTCAATT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.16666666666667	5	30.916666666666668	0.249242139805801	0.182159096576957	1.36826622710277	0.0670830432288441	0.0698157519392891	0.0878371016570659	NaN	NaN	0.0979676994669015	0.493503875486508	768	0	232	0.232	0.768	0.464
ORF3a	all	ss12	167	ATC	AAT	CGT	2	ACTATCGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.00000000000001	5	31.083333333333332	0.23261619622788	0.181054357970061	1.28478650741091	0.0515618382578185	0.0713114600610189	0.0874335359416466	NaN	NaN	0.0978358388273309	0.598176899870183	705	0	295	0.295	0.705	0.59
ORF3a	all	ss12	168	GTC	CGT	CAT	2	ATCGTCCTC:ATTGTCATT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.66666666666667	5	31.083333333333332	0.233758183505998	0.181054357970061	1.29109393514102	0.0527038255359364	0.0699448455331157	0.0862926072713009	NaN	NaN	0.0939815683706337	0.574941416909159	736	0	264	0.264	0.736	0.528
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	CAC	2	GTCATTACT:GTCCTCACT	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.08333333333334	5	31.333333333333332	0.232332454618518	0.179422266799376	1.29489198170874	0.0529101878191422	0.069360423937328	0.0864217617074194	NaN	NaN	0.0994224988457172	0.594604660431807	726	0	274	0.274	0.726	0.548
ORF3a	all	ss12	170	ACT	CAC	TGC	2	ATTACTTCA:CTCACTGCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.41666666666667	5	31.083333333333332	0.231204431105144	0.181054357970061	1.27698904184	0.0501500731350827	0.0696818511071809	0.0882019798152964	NaN	NaN	0.0967000631468982	0.604029463949968	708	0	292	0.292	0.708	0.584
ORF3a	all	ss12	171	GCA	TGC	AGG	2	ACTGCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.08333333333334	5	30.75	0.263223932942835	0.183277466946071	1.43620455546937	0.0799464659967636	0.076815556545365	0.0936319517408875	NaN	NaN	0.105272719415483	0.447599890989473	804	0	196	0.196	0.804	0.392
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	GCAGGTGAT:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.16666666666667	5	30.666666666666668	0.245608424712543	0.183841843524739	1.33597672871189	0.0617665811878042	0.0734217421232428	0.0874922406299203	NaN	NaN	0.101029867692483	0.540954979896997	720	0	280	0.28	0.72	0.56
ORF3a	all	ss12	173	GAT	TGA	TGG	2	GGTGATGGC:GGTGATGGT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.83333333333333	5	30.666666666666668	0.243244753739329	0.183841843524739	1.32311963955364	0.0594029102145898	0.0735092680787252	0.087415740344705	NaN	NaN	0.103480547316701	0.565934607492542	735	0	265	0.265	0.735	0.53
ORF3a	all	ss12	174	GGC	TGG	CAC	2	GATGGCACA:GATGGTGTC	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.83333333333333	5	31	0.239784050822811	0.181605039003649	1.32036011852068	0.0581790118191622	0.0765226425972386	0.0911945358464101	NaN	NaN	0.099156394619544	0.557378414521331	726	1	273	0.273	0.726	0.546
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGTGTCACT	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.83333333333333	5	31	0.239784050822811	0.181605039003649	1.32036011852068	0.0581790118191622	0.0718061965913358	0.0865286781299998	NaN	NaN	0.0999561187493985	0.560536015321178	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAG	2	ACAACAAGT:GTCACTATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.5	4	31.333333333333332	0.240926530560309	0.139939466685309	1.72164819737448	0.100987063874999	0.0686806192014494	0.0752358886989866	NaN	NaN	0.0945239086448553	0.285350993629107	860	0	140	0.14	0.86	0.28
ORF3a	all	ss12	177	AGT	AAG	TCC	2	ACAAGTCCT:ACTATTCCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.5	4	31	0.244420824406181	0.141595553474679	1.72618997142372	0.102825270931502	0.074872639309144	0.0762221662768586	NaN	NaN	0.0935739538958334	0.271826357928665	857	0	143	0.143	0.857	0.286
ORF3a	all	ss12	178	CCC	TCC	CAT	2	AGTCCTATT:ATTCCCATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.33333333333334	4	31.333333333333332	0.228158530802244	0.139939466685309	1.63040874891512	0.0882190641169344	0.0672289759736542	0.0784211174355591	NaN	NaN	0.0940502811387016	0.34824495429015	854	0	146	0.146	0.854	0.292
ORF3a	all	ss12	179	ATT	CAT	TCG	2	CCCATTCGG:CCTATTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.83333333333334	5	30.833333333333332	0.226530970147252	0.182716561993313	1.23979439890919	0.0438144081539394	0.0700122036574199	0.0891645812066028	NaN	NaN	0.103277605398334	0.671391378989178	694	0	306	0.306	0.694	0.612
ORF3a	all	ss12	180	CGG	TCG	GAC	2	ATTCGGACA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.5	5	30.833333333333332	0.227613398356493	0.182716561993313	1.24571848262351	0.0448968363631805	0.0687796040098026	0.0841188964748403	NaN	NaN	0.107665401188598	0.676675934362165	644	0	356	0.356	0.644	0.712
ORF3a	all	ss12	181	ACA	GAC	ACA	2	CGGACACAA:TCTGAACAT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82	4	31	0.209688646664371	0.141595553474679	1.48089852766365	0.0680930931896921	0.0659875524845005	0.0747461631216925	NaN	NaN	0.0955067389003649	0.475866565984019	764	1	235	0.235	0.764	0.47
ORF3a	all	ss12	182	CAA	ACA	AGA	2	ACACAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.66666666666667	4	31.666666666666664	0.178926016229881	0.138321779350139	1.29354912198576	0.0406042368797416	0.0613728759638931	0.0738097210160745	NaN	NaN	0.0901593315399012	0.652450239874709	688	0	312	0.312	0.688	0.624
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CAAGACTAC:CATGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	82.16666666666667	4	30.833333333333332	0.193282349186992	0.142438427764417	1.35695368322	0.0508439214225749	0.0627092775200386	0.0773022132595065	NaN	NaN	0.0914425735389848	0.578197020432952	772	0	228	0.228	0.772	0.456
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.50000000000001	5	31.5	0.195087976520146	0.178350531835637	1.09384577950086	0.0167374446845085	0.0629627102814975	0.0852159536766294	NaN	NaN	0.103330114978071	0.871321354650789	589	0	411	0.411	0.589	0.822
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.83333333333334	5	31.166666666666668	0.226530970147252	0.180507022556888	1.2549703991481	0.0460239475903645	0.0722553641803139	0.0870145575485099	NaN	NaN	0.113347578941988	0.684711287314605	681	0	319	0.319	0.681	0.638
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.41666666666667	5	30.5	0.224661472302045	0.184981141936135	1.21451013844216	0.0396803303659101	0.0718152739174653	0.0874852473296061	NaN	NaN	0.113228830223761	0.726005734198889	658	0	342	0.342	0.658	0.684
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.41666666666667	5	30.5	0.241213868267319	0.184981141936135	1.30399167040821	0.0562327263311835	0.0740063285029718	0.088603102603319	NaN	NaN	0.11443511994022	0.623147837960272	698	0	302	0.302	0.698	0.604
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAC:GGTGGTTAT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.91666666666667	5	31	0.242952517757944	0.181605039003649	1.33780713955334	0.0613474787542956	0.0743527313932641	0.0849545360290875	NaN	NaN	0.114977209330252	0.593644550772018	721	0	279	0.279	0.721	0.558
ORF3a	all	ss12	189	TAC	TTA	CTT	2	GGTTACTTC:GGTTATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.41666666666667	5	31	0.248323576611812	0.181605039003649	1.36738263417252	0.0667185376081633	0.0800409683724587	0.0881360945006864	NaN	NaN	0.112441998506038	0.55294052982144	726	0	274	0.274	0.726	0.548
ORF3a	all	ss12	190	ACT	CTT	CGA	2	TACTTCGAA:TATACTGAA	1:1	TRUE	1.5	0	1.5	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.25	6	31.25	0.266505540694197	0.221785683111784	1.20163545705461	0.044719857582413	0.081243978629008	0.0960017380679073	NaN	NaN	0.12494852636126	0.720413478893645	664	0	336	0.336	0.664	0.672
ORF3a	all	ss12	191	GAA	CGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TTCGAAAAA	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.75	5	30.416666666666668	0.300623921390007	0.185556129985381	1.62012390220518	0.115067791404626	0.0944541485262994	0.0899906783167508	NaN	NaN	0.137326904287104	0.402080413443851	817	0	183	0.183	0.817	0.366
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.5	5	30.666666666666668	0.301773247822437	0.183841843524739	1.64148292922133	0.117931404297698	0.0970888541985546	0.0907332884153315	NaN	NaN	0.137380498936787	0.390655620043944	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GGA	2	AAATGGGAA	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.08333333333334	5	31	0.303708714037217	0.181605039003649	1.67235840868444	0.122103675033568	0.100222687012977	0.0881398030755108	NaN	NaN	0.134246679940501	0.363061420956658	851	0	149	0.149	0.851	0.298
ORF3a	all	ss12	194	GAA	GGA	ATC	2	TGGGAATCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.08333333333334	6	31.666666666666668	0.327782897005287	0.218397760919419	1.50085282754445	0.109385136085868	0.0983385455206359	0.103374496044778	NaN	NaN	0.142066602477606	0.441325562928322	798	0	202	0.202	0.798	0.404
ORF3a	all	ss12	195	TCT	ATC	TGG	2	GAATCTGGA:GAATCTGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	78.91666666666667	6	31.166666666666668	0.328651600510862	0.222476012792921	1.4772451033486	0.106175587717941	0.103088569817274	0.106622742534545	NaN	NaN	0.141161658090337	0.451957252064881	782	0	218	0.218	0.782	0.436
ORF3a	all	ss12	196	GGA	TGG	AGT	2	TCTGGAGTA:TCTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.25000000000001	6	31.5	0.326918846054154	0.219740343511106	1.48775068260341	0.107178502543049	0.0977281451599911	0.102036812312321	NaN	NaN	0.139033509465397	0.440776567263194	775	0	225	0.225	0.775	0.45
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	79.08333333333334	6	31.833333333333332	0.347618763912994	0.217071598340042	1.60140141119913	0.130547165572952	0.103633132197042	0.0991066771162081	NaN	NaN	0.136297574227727	0.338158627510306	849	0	151	0.151	0.849	0.302
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAGGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.5	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	79.16666666666669	6	32.416666666666664	0.347153422982966	0.212555050951034	1.63324005442213	0.134598372031932	0.101722203936787	0.100917670666997	NaN	NaN	0.133184154575352	0.312199052456125	829	0	171	0.171	0.829	0.342
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTGT:AAGGACTAT	1:1	FALSE	2	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	78.91666666666669	6	32.166666666666664	0.348553265730336	0.214467334863233	1.62520444408287	0.134085930867103	0.101463812451609	0.0959415885439397	NaN	NaN	0.139017510479577	0.334782540746303	853	0	147	0.147	0.853	0.294
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TCT	2	GACTATCTT:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	79.08333333333336	6	31.833333333333332	0.347618763912994	0.217071598340042	1.60140141119913	0.130547165572952	0.0972073121277874	0.0995329386646154	NaN	NaN	0.13839223084774	0.345520920303298	810	1	189	0.189	0.81	0.378
ORF3a	all	ss12	201	CTT	TCT	TAC	2	TATCTTACA:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	79.16666666666669	5	32.166666666666664	0.347153422982966	0.174189200634338	1.99296754172332	0.172964222348628	0.108750653328804	0.085250548381885	NaN	NaN	0.126124086059386	0.170256100896862	927	0	73	0.073	0.927	0.146
ORF3a	all	ss12	202	ACA	TAC	ACT	2	CTTACACTT:GTTGTATTA	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	78.91666666666669	5	32.416666666666664	0.328651600510862	0.172678550040526	1.90325666062016	0.155973050470336	0.0958808773903711	0.0871059892941134	NaN	NaN	0.120535360955115	0.195664580037132	912	0	88	0.088	0.912	0.176
ORF3a	all	ss12	203	CTT	ACT	ACA	2	ACACTTATT:GTATTACAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.66666666666669	4	32.666666666666664	0.310481848332055	0.133686173554739	2.32246791179886	0.176795674777316	0.0958468694344328	0.0767641484579366	NaN	NaN	0.114671760580406	0.123133322223619	946	0	54	0.054	0.946	0.108
ORF3a	all	ss12	204	ATT	ACA	CAG	2	CTTATTGGT:TTACACAGT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.66666666666669	4	32.49999999999999	0.291493492343837	0.134437018317738	2.16825317900833	0.157056474026099	0.0884378154800559	0.0728409776736395	NaN	NaN	0.113320630015155	0.165762853795158	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	TCC	2	ATTGGTCCT:CACAGTTAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.166666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.33333333333334	4	32.166666666666664	0.274376485003047	0.135964367940317	2.01800287207225	0.138412117062731	0.0871461277213199	0.0726101492299219	NaN	NaN	0.114319045926187	0.225990119162611	881	0	119	0.119	0.881	0.238
ORF3a	all	ss12	206	CCT	TCC	CTT	2	AGTTACTTC:GGTCCTTTC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.83333333333334	4	32.33333333333333	0.27650770083468	0.135196367873208	2.04523024682142	0.141311332961472	0.092704451935567	0.0709916818350528	NaN	NaN	0.110116838549318	0.199392100227316	909	0	91	0.091	0.909	0.182
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	CCTTTCACT:TACTTCACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.00000000000001	4	32.166666666666664	0.23964200873058	0.135964367940317	1.76253537864989	0.103677640790263	0.0848866163382317	0.0758932275151114	NaN	NaN	0.103504395527242	0.316501166412018	845	0	155	0.155	0.845	0.31
ORF3a	all	ss12	208	ACT	CAC	TGA	2	TTCACTGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.00000000000001	4	32.166666666666664	0.23964200873058	0.135964367940317	1.76253537864989	0.103677640790263	0.0803195715959275	0.0749480920001212	NaN	NaN	0.105459109877313	0.325554538437724	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	209	GAA	TGA	AGA	2	ACTGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.33333333333334	4	31.83333333333333	0.245832397240244	0.137526919369799	1.78752202380991	0.108305477870446	0.088051392818477	0.0734962070103418	NaN	NaN	0.106450582086679	0.30895131918642	854	0	146	0.146	0.854	0.292
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAT:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	75.00000000000001	4	30.83333333333333	0.251022027914968	0.142438427764417	1.76231956400235	0.108583600150551	0.0858562943814242	0.0756259921707301	NaN	NaN	0.105958294481996	0.305468523637611	856	0	144	0.144	0.856	0.288
ORF3a	all	ss12	211	TAT	CTA	TTA	2	GACTATTAC:GTTTATTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	73.00000000000001	4	30.499999999999996	0.240125645697202	0.144154737019872	1.6657492543176	0.0959709086773295	0.0861236863869129	0.0810737499904882	NaN	NaN	0.113489451763472	0.397755134754827	802	0	198	0.198	0.802	0.396
ORF3a	all	ss12	212	TAC	TTA	CCA	2	TATTACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	71.66666666666669	4	29.83333333333333	0.245409683406312	0.147714914296514	1.66137376564218	0.097694769109798	0.0962419976165668	0.0833521554166914	NaN	NaN	0.117289960525772	0.404882082219655	803	0	197	0.197	0.803	0.394
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	70.50000000000001	4	30.999999999999996	0.250229530152682	0.141595553474679	1.76721319287352	0.108633976678002	0.0861421554139015	0.0809409118020102	NaN	NaN	0.118390970515904	0.358835297952373	848	0	152	0.152	0.848	0.304
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	70.83333333333334	4	30.33333333333333	0.248833044237754	0.145028544735405	1.71575219686396	0.103804499502349	0.0898772157923248	0.0837997469695477	NaN	NaN	0.112359070462675	0.355557132074003	825	0	175	0.175	0.825	0.35
ORF3a	all	ss12	215	GAA	GTA	ATC	2	CTGTACTCA:CTTGAATCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	71.66666666666667	4	29.66666666666666	0.245409683406312	0.148632696437812	1.65111505939067	0.0967769869685006	0.0869697796765635	0.0814637401836989	NaN	NaN	0.113089761400657	0.392134004590753	800	0	200	0.2	0.8	0.4
ORF3a	all	ss12	216	TCA	ATC	AAC	2	GAATCTACC:TACTCAACT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	71.33333333333334	4	29.66666666666666	0.227535736496163	0.148632696437812	1.53085923857518	0.0789030400583519	0.0864926374315376	0.0836050386680661	NaN	NaN	0.11223187385102	0.482033356975361	776	0	224	0.224	0.776	0.448
ORF3a	all	ss12	217	ACC	AAC	CCA	2	TCAACTCAA:TCTACCCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	70.83333333333334	4	28.83333333333333	0.229414483788198	0.153398778089708	1.49554309783377	0.0760157056984896	0.084065790357768	0.0886873176010623	NaN	NaN	0.115247997018125	0.509520987122779	754	0	246	0.246	0.754	0.492
ORF3a	all	ss12	218	CAA	CCA	ATT	2	ACCCAGATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	70.50000000000001	4	29.16666666666666	0.230684450150283	0.151456007747705	1.52311191599977	0.0792284424025777	0.0894129545010337	0.0885582950435483	NA	NA	0.115059942822274	0.491085055815721	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	219	ATT	ATT	GAG	2	CAATTGAGT:CAGATTTCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	70.50000000000001	4	28.499999999999993	0.230684450150283	0.155392217528976	1.48453026682155	0.0752922326213067	0.0850453252133777	0.0867495729251702	NaN	NaN	0.115449651370684	0.514294675944075	782	0	218	0.218	0.782	0.436
ORF3a	all	ss12	220	AGT	GAG	CAC	2	ATTTCCACA:TTGAGTACA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	70.00000000000001	4	28.749999999999993	0.23261619622788	0.153892310773211	1.51155177967718	0.0787238854546691	0.086180601046775	0.0868670656590787	NaN	NaN	0.11661293846175699	0.499620456153372	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	221	ACA	CAC	AGA	2	AGTACAGAC:TCCACAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	69.66666666666669	4	28.749999999999993	0.195697415235261	0.153892310773211	1.27165167805985	0.0418051044620504	0.0790756873384586	0.0853665591226204	NaN	NaN	0.106715185524868	0.695246885469709	675	0	325	0.325	0.675	0.65
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	69.33333333333336	4	29.08333333333333	0.196773198350618	0.151937056450333	1.29509681803624	0.0448361419002856	0.0742609951681659	0.0852416418635639	NaN	NaN	0.109401882363602	0.681930869211594	711	0	289	0.289	0.711	0.578
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	67.66666666666669	4	28.749999999999993	0.202335646591905	0.153892310773211	1.31478724034553	0.0484433358186949	0.0818100403069197	0.0858410712875296	NaN	NaN	0.112551471499969	0.666897054197492	678	0	322	0.322	0.678	0.644
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	67.00000000000003	4	29.41666666666666	0.20465023999998	0.150031026615649	1.36405278705621	0.0546192133843316	0.0789731016541699	0.081219454206219	NaN	NaN	0.112390140418777	0.626982273865107	694	0	306	0.306	0.694	0.612
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TAA	2	GGTATTAAT:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	66.00000000000003	4	30.41666666666666	0.208223802448709	0.144590316625212	1.44009507212326	0.0636334858234977	0.082775755486553	0.0805070041836326	NaN	NaN	0.110691063101161	0.565376077543759	720	0	280	0.28	0.72	0.56
ORF3a	all	ss12	226	AAT	TAA	ACA	2	ATTAATAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	66.16666666666669	4	30.41666666666666	0.207619511953736	0.144590316625212	1.43591574318148	0.0630291953285242	0.0806711644006152	0.0828148170294161	NaN	NaN	0.10917420108714	0.563718693098885	728	0	272	0.272	0.728	0.544
ORF3a	all	ss12	227	AAT	ACA	TGC	2	AATAATGCG:GAACATGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCG	TGC	GAC	2	AATGCGACA:CATGTTACC	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	GAC	ATT	2	GCGACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC:TTCTTCCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCCTCTTC	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:CTCTTCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAT	CAA	AAA	2	TACAATAAA:TTCTCAAAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	AAA	AAT	2	AATAAAATT:TCAAAGAAT	1:1	FALSE	2.25	0.416666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	AAT	AAT	TGA	2	AAAATTGTT:AAGAATGAT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GAT	TGA	TGA	2	AATGATGAA:ATTGTTGAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	GAA	TGA	AAG	2	GATGAAAGA:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	AGA	AAG	AGA	2	GAAAGAGAA:GATGAGCCT	1:1	TRUE	1.5	0.916666666666667	0.583333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCT	AGA	ACA	2	AGAGAACAG:GAGCCTGAA	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	3	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	CAG	ACA	AGA	2	CCTGAAGAA:GAACAGGAA	1:1	FALSE	1.25	0.5	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	GAA	AGA	AAG	2	CAGGAAAGT:GAAGAACAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.416666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AGT	AAG	TGT	2	GAAAGTGTC:GAACATGTC	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AGTGTCCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTCCAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATT	AAT	TCA	2	CAAATTCAC:CAAGTTCAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	TCA	CAC	2	ATTCACACA:GTTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCA:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCATCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCAGGA:TCATCCGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAC:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAC	AAA	C--	1	GTAAAC---:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	---	TCC	AGT	1	AAC------:AATCCAGTA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	---	AGT	AAT	1	---------:CCAGTAATG	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	---	AAT	GGA	1	---------:GTAATGGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	---	GGA	ACC	1	------CCA:ATGGAACCA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	-CC	AAT	1	---CCAATT:GAACCAATT	1:1	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAC:CCAATTTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAC	TTA	CGA	2	ATTTACGAT:ATTTATGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	CGA	TGA	2	TACGATGAG:TATGATGAA	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG:CCGACGCCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT:ACGCCGACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT:CCGACTACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TCT	2	GTGCCTCTT:GTGCCTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	CTT	TCT	GTA	2	CCTCTTTAA:CCTTTGTAA	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80	5	32.16666666666667	0.23261619622788	0.174189200634338	1.33542260588355	0.0584269955935421	0.0602631993193769	0.0845563266312327	NaN	NaN	0.0927254622340738	0.528624348985299	729	0	271	0.271	0.729	0.542
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.83333333333333	5	32	0.250477612683731	0.175211138386129	1.42957585340112	0.0752664742976026	0.0627758282324687	0.0892951235168798	NaN	NaN	0.0967482711782725	0.436591441468931	787	0	213	0.213	0.787	0.426
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79	5	32.5	0.253621069659043	0.172180831233375	1.47299248030278	0.0814402384256683	0.0625281831309281	0.0865407287862297	NaN	NaN	0.0983046158660044	0.40741697048033	809	0	191	0.191	0.809	0.382
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.83333333333333	5	32	0.254259343604678	0.175211138386129	1.4511597033537	0.0790482052185496	0.063029584021318	0.084159886612149	NaN	NaN	0.0971392920734144	0.41578165844597	781	0	219	0.219	0.781	0.438
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.33333333333333	5	31.500000000000004	0.256193776295553	0.178350531835637	1.43646208205117	0.0778432444599154	0.064069185986052	0.0891494353958733	NaN	NaN	0.0962850403795583	0.418821994592825	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGAATTTTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.83333333333333	5	31.500000000000004	0.254259343604678	0.178350531835637	1.42561584194768	0.075908811769041	0.0617152606331964	0.0876698825729226	NaN	NaN	0.0970439166019066	0.434090625022837	764	0	236	0.236	0.764	0.472
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTTACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.33333333333333	5	32.16666666666667	0.260153207881584	0.174189200634338	1.49350939630123	0.0859640072472462	0.0642171095168731	0.0847338327332122	NaN	NaN	0.0974807981030103	0.377854791591092	813	0	187	0.187	0.813	0.374
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.66666666666666	5	31.833333333333336	0.25881973474884	0.176245193423779	1.46852081308403	0.0825745413250609	0.065188941459672	0.0883633024629568	NaN	NaN	0.0990292630100127	0.404371261623047	792	0	208	0.208	0.792	0.416
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACTCTTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.33333333333333	5	32.16666666666667	0.260153207881584	0.174189200634338	1.49350939630123	0.0859640072472462	0.0645907839675261	0.0819558262441469	NaN	NaN	0.101234744764814	0.395794952914902	799	0	201	0.201	0.799	0.402
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGATCA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.16666666666666	5	32.16666666666667	0.260825162391735	0.174189200634338	1.49736700921699	0.086635961757398	0.0667176229977142	0.0834507751603646	NaN	NaN	0.102596391229747	0.398426490260811	812	1	187	0.187	0.812	0.374
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGATCAATT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.49999999999999	5	32.5	0.259484741116488	0.172180831233375	1.50704778956945	0.0873039098831133	0.0630065818687876	0.0856538790170757	NaN	NaN	0.0999225159492118	0.382272886630106	795	0	205	0.205	0.795	0.41
ORF3a	all	ss12	13	ATT	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATTACT	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.16666666666666	5	32.16666666666667	0.239040218372072	0.174189200634338	1.37230217201508	0.0648510177377344	0.0633374999163	0.0862072222473397	NaN	NaN	0.0951065075974594	0.495316213626013	750	1	249	0.249	0.75	0.498
ORF3a	all	ss12	14	ACT	AAC	TGC	2	ATTACTGCA:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.41666666666666	5	32.083333333333336	0.220826439413092	0.174698668260279	1.26404191635902	0.0461277711528129	0.0613605846012924	0.0866290233556354	NaN	NaN	0.0974177882675075	0.635853217841173	697	0	303	0.303	0.697	0.606
ORF3a	all	ss12	15	GCA	TGC	ACA	2	ACTGCACAG:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.66666666666666	5	31.833333333333336	0.237252996159118	0.176245193423779	1.34615300168014	0.0610078027353386	0.0607415623192089	0.0907493362445575	NaN	NaN	0.09888607943999	0.537267465462725	731	0	269	0.269	0.731	0.538
ORF3a	all	ss12	16	AAG	ACA	GCA	2	GCACAGCCA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.08333333333333	4	32.333333333333336	0.221923403608424	0.135196367873208	1.64148939131672	0.0867270357352156	0.0611898009771437	0.0701884537606082	NaN	NaN	0.0888840600836729	0.329197211926276	844	0	156	0.156	0.844	0.312
ORF3a	all	ss12	17	CAA	GCA	AGG	2	AAGCAAGGT:CAGCCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.16666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.25	4	32	0.204399702385691	0.136741167595466	1.49479272394679	0.0676585347902254	0.0573847398527682	0.0735418007542367	NaN	NaN	0.0889096375111319	0.44666848351676	785	0	215	0.215	0.785	0.43
ORF3a	all	ss12	18	GGA	AGG	AAA	2	CAAGGTGAA:CCAGGAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.25	3	31.166666666666664	0.201440688758903	0.103018812035868	1.95537770993483	0.0984218767230349	0.0596736094211007	0.0634726909227326	NaN	NaN	0.0783016041367946	0.208768617904283	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	19	AAA	AAA	AAT	2	GGAAAAATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.41666666666666	3	31.166666666666664	0.200955878734158	0.103018812035868	1.95067167600604	0.0979370666982898	0.0574618905818628	0.0671338217990239	NaN	NaN	0.0754623489175513	0.194346822264221	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAAATTGAC:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.08333333333333	3	30.833333333333332	0.182931885877799	0.104213595070396	1.75535529461611	0.0787182908074028	0.0537899389289893	0.0690626043589805	NaN	NaN	0.07509663966291	0.294534245230718	865	0	135	0.135	0.865	0.27
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	CAA	2	ATCAAGGAT:ATTGACAAT	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.25	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.58333333333333	3	31.499999999999996	0.184234616510935	0.101851155869296	1.80886132256918	0.0823834606416383	0.0557636877578314	0.0648834590101572	NaN	NaN	0.0790594884607639	0.297391308833294	860	0	140	0.14	0.86	0.28
ORF3a	all	ss12	22	AAT	CAA	TGC	2	AAGGATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.83333333333333	3	32.166666666666664	0.156594789439853	0.0995936054863591	1.57233778890856	0.0570011839534941	0.0500018789211625	0.062899765555803	NaN	NaN	0.0722557567961057	0.430181640247067	790	0	210	0.21	0.79	0.42
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.5	3	31.833333333333332	0.141595553474679	0.100709711722406	1.40597715009819	0.0408858417522729	0.0443312852538888	0.0645886479179499	NaN	NaN	0.0708736388342285	0.564018072495062	737	0	263	0.263	0.737	0.526
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77	3	32.33333333333333	0.142608211856373	0.0990447915097998	1.43983554998208	0.0435634203465729	0.0448345240577631	0.0617868451653873	NaN	NaN	0.0671725955462915	0.516642435591768	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77	4	32.33333333333333	0.127063613968535	0.135196367873208	0.939844878730025	-0.00813275390467302	0.0428058234828168	0.0744549337578381	NaN	NaN	0.0759997977777075	0.914780884196626	470	0	530	0.53	0.47	0.94
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.33333333333333	4	31.666666666666664	0.12471051706475	0.138321779350139	0.901597113995079	-0.0136112622853896	0.0425932845625901	0.0769302525871547	NaN	NaN	0.081589751916793	0.867507246440147	447	0	553	0.553	0.447	0.894
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.08333333333333	4	31.916666666666664	0.110163273884948	0.137132914796851	0.803332110661718	-0.0269696409119032	0.0388308854810481	0.0800009743786817	NaN	NaN	0.0768995661373605	0.725804029080493	388	0	612	0.612	0.388	0.776
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.33333333333333	3	32.33333333333333	0.111315003838705	0.0990447915097998	1.12388548798844	0.0122702123289052	0.0387802677756522	0.0592224402499006	NaN	NaN	0.067362000710235	0.855462402288627	579	0	421	0.421	0.579	0.842
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.33333333333333	2	32.666666666666664	0.111315003838705	0.0638683562552301	1.74288192722338	0.0474466475834749	0.0419402743462547	0.0472690222282791	NaN	NaN	0.0640514355601152	0.458839860619149	779	0	221	0.221	0.779	0.442
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.5	2	33.166666666666664	0.11105698371059	0.0628640039123036	1.76662281749532	0.0481929797982868	0.0426184094186313	0.0467255140279358	NaN	NaN	0.0643147665202644	0.453658369620137	786	1	213	0.213	0.786	0.426
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACA:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.91666666666667	1	32.58333333333333	0.125436421140775	0.0313361505112163	4.00293013322989	0.0941002706295586	0.0435243998301806	0.032951506860794	NaN	NaN	0.0569623691302589	0.0985401452240756	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	32	ACA	TAC	AGC	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.33333333333334	1	32.166666666666664	0.123002232202702	0.0317507728699206	3.87399175152772	0.0912514593327818	0.0447061441098009	0.0335359186085503	NaN	NaN	0.055567281717245	0.100552778405965	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	33	GCA	AGC	AAC	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.66666666666667	1	31.499999999999996	0.120796168025329	0.0324374878453625	3.72396803973212	0.0883586801799665	0.0435404939120123	0.035845035067683	NaN	NaN	0.0562984377901763	0.116538584314339	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.41666666666667	1	32.08333333333333	0.121203743914918	0.0318350176854428	3.80724600540559	0.0893687262294755	0.0421289384042865	0.0344111943435504	NaN	NaN	0.0535914973815625	0.0953968440761292	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.41666666666666	1	32.75	0.122861989946783	0.0311733183159379	3.94125478403008	0.0916886716308449	0.0434328053313851	0.0319401091564676	NaN	NaN	0.0555634955885524	0.0989101650087167	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.41666666666666	1	33.416666666666664	0.124566345596373	0.0305385697640887	4.07898426673718	0.0940277758322847	0.0409889774813057	0.0309944997994358	NaN	NaN	0.0527263087286326	0.0745345516887735	960	0	40	0.04	0.96	0.08
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.41666666666666	1	33.416666666666664	0.124566345596373	0.0305385697640887	4.07898426673718	0.0940277758322847	0.0425842140723742	0.0314376406363322	NaN	NaN	0.0541262413248252	0.0823529526717029	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.91666666666666	1	33.58333333333333	0.108911256999757	0.0303839016876759	3.5845053120328	0.0785273553120807	0.0389261587303298	0.0316306838382614	NaN	NaN	0.0530932305549105	0.139127895002462	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.75	1	33.08333333333333	0.109159374475305	0.0308526791703671	3.53808412788179	0.0783066953049378	0.0385971516644893	0.0322565199902158	NaN	NaN	0.0525607305209127	0.136268229557227	926	0	74	0.074	0.926	0.148
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.41666666666666	1	33.416666666666664	0.109659022528177	0.0305385697640887	3.59083687858651	0.079120452764088	0.0390910709584978	0.0307379894423432	NA	NA	0.0506623175987149	0.118353508644237	937	0	63	0.063	0.937	0.126
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	1	32.75	0.123142795706581	0.0311733183159379	3.95026267202431	0.0919694773906432	0.041165758234275	0.0338850711653732	NaN	NaN	0.0549081812163018	0.0939403998608578	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.58333333333331	1	32.416666666666664	0.122582464773988	0.031500692980973	3.89142120930577	0.091081771793015	0.0406022732309336	0.0328543405700705	NaN	NaN	0.0525943156181286	0.0833127814200541	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.58333333333331	1	32.416666666666664	0.122582464773988	0.031500692980973	3.89142120930577	0.091081771793015	0.0407974779806471	0.033524780946692	NaN	NaN	0.05515608325288	0.0986679654012542	960	0	40	0.04	0.96	0.08
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	1	32.75	0.123142795706581	0.0311733183159379	3.95026267202431	0.0919694773906432	0.0417140269694521	0.0326565525024527	NaN	NaN	0.055448083810538	0.0971844741444041	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	1	32.75	0.123142795706581	0.0311733183159379	3.95026267202431	0.0919694773906432	0.0434565910700833	0.0331693947320524	NaN	NaN	0.0542939940323841	0.0902812034377282	951	1	48	0.048	0.951	0.096
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333331	1	33.25	0.125145045452681	0.0306948207819131	4.07707366470184	0.0944502246707676	0.0425744355454939	0.032718716524124	NaN	NaN	0.053584060352664	0.0779586545284438	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TAT	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333331	1	33.25	0.125145045452681	0.0306948207819131	4.07707366470184	0.0944502246707676	0.0431372644023355	0.0325290621483156	NaN	NaN	0.0552480065116544	0.0873457849905427	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	48	ATT	TAT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.91666666666664	1	33.25	0.110417145764054	0.0306948207819131	3.59725657134695	0.0797223249821406	0.0393065283369715	0.0314098534478385	NaN	NaN	0.0529787330104701	0.13237585547594	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.74999999999997	1	33.25	0.0959115685461867	0.0306948207819131	3.12468247420759	0.0652167477642736	0.0355959016538241	0.0324442587739387	NaN	NaN	0.0482178594074871	0.176201543140031	918	0	82	0.082	0.918	0.164
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.24999999999997	1	33.75	0.0965740892437444	0.0302307926160697	3.19456027733818	0.0663432966276747	0.0355326743578699	0.0301589177698781	NA	NA	0.0492894375265562	0.178304389740239	896	1	103	0.103	0.896	0.206
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.0833333333333	1	32.916666666666664	0.095474921927806	0.0310121698640216	3.07862759511613	0.0644627520637843	0.0361857906185575	0.031345460092579	NaN	NaN	0.0493735753807508	0.191684402615179	904	0	96	0.096	0.904	0.192
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.5833333333333	1	33.416666666666664	0.109408627044446	0.0305385697640887	3.58263755931043	0.0788700572803574	0.0395783205067519	0.0338923195308016	NaN	NaN	0.0524513586136536	0.132663789364346	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.74999999999997	1	33.58333333333333	0.0946134639951751	0.0303839016876759	3.11393398279562	0.0642295623074992	0.034766651267298	0.0323200399693365	NaN	NaN	0.049534387404219	0.19474608872926	903	0	97	0.097	0.903	0.194
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.0833333333333	1	33.25	0.0941885460903395	0.0306948207819131	3.06854849420851	0.0634937253084264	0.0350374446395535	0.0322317264721037	NaN	NaN	0.0499416835883611	0.203601556796768	913	1	86	0.086	0.913	0.172
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.91666666666663	2	33.75	0.0944005262514171	0.0617314855970427	1.52921196271906	0.0326690406543744	0.0352958862905884	0.0450514280714538	NA	NA	0.0571411626993524	0.567508183209299	759	1	240	0.24	0.759	0.48
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.5833333333333	2	33.75	0.0935582868591561	0.0617314855970427	1.51556836765383	0.0318268012621134	0.0352179045792606	0.0441644826470304	NaN	NaN	0.0616653504711157	0.605769687563337	721	1	278	0.278	0.721	0.556
ORF3a	all	ss12	57	CAG	TCA	GAG	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.66666666666664	2	34.166666666666664	0.109283858386045	0.0609472230590743	1.79309003594995	0.048336635326971	0.0382461071629797	0.0461863488642117	NaN	NaN	0.0629501319721393	0.442572751798174	794	0	206	0.206	0.794	0.412
ORF3a	all	ss12	58	AGC	GAG	CGC	2	CAGAGCGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.16666666666664	2	34.166666666666664	0.108541192153805	0.0609472230590743	1.78090463692824	0.0475939690947306	0.0398031870418638	0.0451872775372835	NaN	NaN	0.0644883479068213	0.460499670742612	792	0	208	0.208	0.792	0.416
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TAC	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.83333333333331	2	34.83333333333333	0.110544521791661	0.0597330472949441	1.85064259731844	0.0508114744967167	0.0388378934509402	0.0419279874581103	NaN	NaN	0.0606840229341205	0.402417087212976	811	0	189	0.189	0.811	0.378
ORF3a	all	ss12	60	ACC	TAC	CAA	2	GCTACCAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.16666666666664	2	34.5	0.110036776004805	0.0603340239140544	1.82379309163188	0.0497027520907508	0.0382300018106904	0.0458021461971486	NaN	NaN	0.0605377727376976	0.411634594712735	800	0	200	0.2	0.8	0.4
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	ACCAAAATA:TCCAAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.33333333333331	2	34.33333333333333	0.0951500406590925	0.0606390724718212	1.56912097729246	0.0345109681872713	0.0354796684499979	0.0445414844371328	NaN	NaN	0.0585655365500181	0.555679542396994	712	0	288	0.288	0.712	0.576
ORF3a	all	ss12	62	ATA	AAT	AAT	2	AAAATAATT:AAAATCATA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.33333333333331	2	35	0.0964630333665702	0.0594370287406054	1.62294508003678	0.0370260046259648	0.0357021468737865	0.0449413423891365	NA	NA	0.0562017619467809	0.510020963614507	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATAATTTCG:ATCATAACC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.16666666666664	2	35	0.111574227897278	0.0594370287406054	1.87718380715512	0.0521371991566726	0.0385042692097453	0.0451448583932881	NaN	NaN	0.0589348722543861	0.376341179173527	817	0	183	0.183	0.817	0.366
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTTCGCTC	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.33333333333331	2	35.5	0.112888706112188	0.0585663277285774	1.92753601754519	0.0543223783836109	0.0392787463158589	0.0425533073418599	NaN	NaN	0.0590263348806608	0.3574120935793	831	0	169	0.169	0.831	0.338
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:TCGCTCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.74999999999999	2	35.75	0.0972458393976114	0.0581404786806199	1.67260128578932	0.0391053607169915	0.0356251297472479	0.0446668004894947	NA	NA	0.0577938376379114	0.498637265973922	738	0	262	0.262	0.738	0.524
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTCAATAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.74999999999999	2	35.75	0.0972458393976114	0.0581404786806199	1.67260128578932	0.0391053607169915	0.0368636847282457	0.0423963797044175	NaN	NaN	0.056626968333375	0.489830530635216	748	0	252	0.252	0.748	0.504
ORF3a	all	ss12	67	AAA	AAA	AAG	2	AAAAAGAGA:AATAAAAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.16666666666664	2	36.416666666666664	0.0980414726907267	0.0570345959917882	1.71898250501928	0.0410068766989384	0.0367877296438401	0.0412770109409269	NaN	NaN	0.0597053318126631	0.492195524104994	760	1	239	0.239	0.76	0.478
ORF3a	all	ss12	68	AGA	AAG	ATG	2	AAAAGATGG:AAGAGATGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.41666666666664	2	36.25	0.112755863557943	0.0573071018565008	1.96757225378956	0.0554487617014421	0.0388000636486673	0.0429808308892834	NaN	NaN	0.0625175779752147	0.375116190337099	825	0	175	0.175	0.825	0.35
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGATGGCAG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.41666666666664	2	36.583333333333336	0.112755863557943	0.0567646707244322	1.98637395617643	0.0559911928335107	0.0391807917186874	0.0403182518856128	NaN	NaN	0.0610750560346438	0.359268207513276	833	0	167	0.167	0.833	0.334
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.74999999999997	2	36.916666666666664	0.113827458253345	0.0562324166616758	2.02423201795134	0.0575950415916689	0.0379750893406496	0.0396380515676112	NA	NA	0.060510667270239	0.341190135851725	828	0	172	0.172	0.828	0.344
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTAGCC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.41666666666663	3	36.916666666666664	0.12997618937868	0.0860130038580103	1.511122545996	0.0439631855206701	0.0429437343063522	0.0484690167556242	NaN	NaN	0.0610658530431847	0.471567632610382	771	0	229	0.229	0.771	0.458
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTAGCCCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.49999999999997	3	36.166666666666664	0.159636110589833	0.0879053734766805	1.81599945801016	0.071730737113152	0.0522994818620183	0.0527633289348045	NaN	NaN	0.0744162752074691	0.335090070999604	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCCCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666663	3	36.166666666666664	0.159249476407496	0.0879053734766805	1.81160115825845	0.0713441029308151	0.0506944923191124	0.0562884158476701	NaN	NaN	0.0717480599194217	0.320042872436652	848	0	152	0.152	0.848	0.304
ORF3a	all	ss12	74	TAT	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTTTATAAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.66666666666663	3	35.5	0.156968578879544	0.089658862987337	1.75073131254981	0.0673097158922067	0.0537231707215279	0.0541025545098874	NaN	NaN	0.0692735555742439	0.331224227662733	808	0	192	0.192	0.808	0.384
ORF3a	all	ss12	75	AAG	CAA	GGG	2	TATAAGGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.99999999999997	2	35.5	0.156222782397911	0.0585663277285774	2.66745053782299	0.097656454669334	0.0495422589750333	0.03980987673656	NaN	NaN	0.0590268146163729	0.0980376925075854	956	0	44	0.044	0.956	0.088
ORF3a	all	ss12	76	GGC	GGG	CTT	2	AAGGGCTTC:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.3333333333333	2	35.5	0.155484064573147	0.0585663277285774	2.654837183812	0.0969177368445694	0.0517591656391146	0.0420747792618195	NaN	NaN	0.0619025236571874	0.117430385915732	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	77	GTT	CTT	CCA	2	GGCTTCCAG:GGTGTTCAC	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.24999999999997	2	34.833333333333336	0.153488274894033	0.0597330472949441	2.5695704780664	0.0937552275990885	0.0504727097603669	0.0426241661601969	NaN	NaN	0.0611547834210117	0.125255934428824	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	78	CAC	CCA	CTT	2	GTTCACTTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.41666666666664	2	34.583333333333336	0.168736159344387	0.0601826482875392	2.80373436772346	0.108553511056848	0.0570334300572759	0.0434769878116615	NaN	NaN	0.0662095876881232	0.101100081486691	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	79	TTC	CTT	CAT	2	CACTTTGTT:CAGTTCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.74999999999997	2	33.583333333333336	0.150331042691939	0.0620508745044359	2.42270626953359	0.0882801681875029	0.0551668492603377	0.0455522115043536	NaN	NaN	0.0639099131476209	0.167179980887968	930	0	70	0.07	0.93	0.14
ORF3a	all	ss12	80	ATT	CAT	TTG	2	TTCATTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.75	0.5	0.416666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.0833333333333	2	33.583333333333336	0.151718018390913	0.0620508745044359	2.44505850405166	0.0896671438864772	0.0561555682535385	0.0441545844058606	NaN	NaN	0.0648298227329047	0.166629400773848	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	ATTTGCAAT:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.49999999999997	2	33.5	0.135810068779417	0.0622118122355632	2.18302704742271	0.0735982565438541	0.0554684910636959	0.0438904811695744	NaN	NaN	0.0616227862021983	0.232346912582041	908	0	92	0.092	0.908	0.184
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAATTTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.3333333333333	2	33.666666666666664	0.136119019073685	0.0618907677660026	2.19934287434153	0.0742282513076819	0.0521764662459644	0.0448467465179309	NaN	NaN	0.0636721621806544	0.243700114855643	888	0	112	0.112	0.888	0.224
ORF3a	all	ss12	83	TTA	CTT	ACT	2	AACTTGCTG:AATTTACTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.3333333333333	2	33.666666666666664	0.136119019073685	0.0618907677660026	2.19934287434153	0.0742282513076819	0.0528495894931987	0.0441745497757527	NaN	NaN	0.0624983308998167	0.234958032694469	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	84	CTG	ACT	GCT	2	TTACTGCTG:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.24999999999997	2	33.166666666666664	0.134437018317738	0.0628640039123036	2.13853731787877	0.0715730144054348	0.0530893052435771	0.0436218951370352	NaN	NaN	0.0641279181734534	0.26438036712054	873	0	127	0.127	0.873	0.254
ORF3a	all	ss12	85	CTG	GCT	GCT	2	CTGCTGCTA:CTGTTGTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.24999999999999	3	32.833333333333336	0.162245943584362	0.0974341006801572	1.66518644347075	0.0648118429042051	0.0600858343062051	0.0590486041728239	NaN	NaN	0.0665332268808096	0.329993259582004	863	0	137	0.137	0.863	0.274
ORF3a	all	ss12	86	CTA	GCT	ATT	2	CTGCTATTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.74999999999999	3	32.333333333333336	0.16115228773261	0.0990447915097998	1.62706473784303	0.0621074962228102	0.0598051169765351	0.0588967038235594	NaN	NaN	0.0656349812776626	0.344018018894961	839	0	161	0.161	0.839	0.322
ORF3a	all	ss12	87	TTT	ATT	TGT	2	CTATTTGTT:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.91666666666664	3	31.666666666666664	0.158657084608275	0.101277212852957	1.56656250837616	0.0573798717553175	0.0571451439842993	0.0622660139251179	NaN	NaN	0.0670285882132656	0.391969720642408	822	1	177	0.177	0.822	0.354
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.41666666666664	3	31.166666666666664	0.157611296097191	0.103018812035868	1.52992733057643	0.0545924840613231	0.0578096398258274	0.0641921820467433	NaN	NaN	0.0680460601998874	0.422386836814037	818	0	182	0.182	0.818	0.364
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	GTAACAGTT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.91666666666664	3	31.666666666666664	0.158657084608275	0.101277212852957	1.56656250837616	0.0573798717553175	0.05815658056641	0.0558158423313704	NaN	NaN	0.0663240726879175	0.386959772014871	818	0	182	0.182	0.818	0.364
ORF3a	all	ss12	90	ATC	AGT	CTA	2	ACAGTTTAC:ACCATCTAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.91666666666664	3	32	0.158657084608275	0.100148544468392	1.58421757850259	0.0585085401398827	0.0595060065041138	0.0604680884599304	NaN	NaN	0.0677763402874509	0.387995045441549	818	0	182	0.182	0.818	0.364
ORF3a	all	ss12	91	TAC	CTA	CTC	2	ATCTATTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.08333333333331	3	32.666666666666664	0.145670745382058	0.0979651368127982	1.48696516047765	0.0477056085692595	0.0566224241271933	0.0565306255292822	NA	NA	0.068517635582939	0.486270408384199	771	0	229	0.229	0.771	0.458
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.41666666666666	3	32.33333333333333	0.145028544735405	0.0990447915097998	1.46427230068989	0.045983753225605	0.0581453443920821	0.0609893677505813	NaN	NaN	0.0636387677442175	0.469941315801788	769	0	231	0.231	0.769	0.462
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCACATCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.08333333333333	3	31.333333333333332	0.145670745382058	0.102431651254313	1.42212630176577	0.0432390941277445	0.0550517747087569	0.0632527332425328	NaN	NaN	0.0657469048110672	0.51075678021034	742	1	257	0.257	0.742	0.514
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TTT	2	CACCTTTTG:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.91666666666666	3	30.833333333333332	0.145993989979143	0.104213595070396	1.4009111755575	0.0417803949087462	0.0583207726513444	0.0629726348988437	NaN	NaN	0.0648239255294012	0.519237508478634	753	0	247	0.247	0.753	0.494
ORF3a	all	ss12	95	TTG	TTT	GCT	2	CTTTTGCTC:CTTTTGCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.24999999999999	3	30.166666666666664	0.143447620627212	0.106688419438138	1.3445472468583	0.0367592011890736	0.054587452969078	0.0664907613944567	NaN	NaN	0.0685690840984401	0.591896341978343	728	0	272	0.272	0.728	0.544
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	TTGCTCGTT:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.41666666666666	3	30.666666666666664	0.145028544735405	0.104821456781369	1.38357688576965	0.0402070879540357	0.0570321136778917	0.0662454061050226	NaN	NaN	0.0695200259294648	0.56302608669275	744	1	255	0.255	0.744	0.51
ORF3a	all	ss12	97	GTC	CGT	CGC	2	CTCGTTGCT:CTTGTCGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.41666666666666	3	30.333333333333332	0.143135575319406	0.106058740537371	1.34958773406299	0.0370768347820347	0.0573124489303894	0.063243946725763	NaN	NaN	0.0701181608733949	0.596960510606692	704	1	295	0.295	0.704	0.59
ORF3a	all	ss12	98	GCT	CGC	TGC	2	GTCGCTGCA:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.41666666666666	3	30.333333333333332	0.157611296097191	0.106058740537371	1.48607550210965	0.05155255555982	0.0585331278953054	0.0646698393841173	NaN	NaN	0.0690650932095383	0.455405096554767	784	0	216	0.216	0.784	0.432
ORF3a	all	ss12	99	GCA	TGC	AGG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.5	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.33333333333333	3	29.916666666666664	0.155729523583683	0.107647107231784	1.44666705486446	0.0480824163518998	0.0557478658531547	0.0657850743436425	NaN	NaN	0.0672735849121348	0.474776199616149	775	0	225	0.225	0.775	0.45
ORF3a	all	ss12	100	GGC	AGG	CCT	2	GCAGGTATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.83333333333333	3	30.416666666666664	0.154721985556199	0.105746684778908	1.46313793079837	0.0489753007772906	0.0567600852794843	0.0617755202194177	NaN	NaN	0.0673893947336449	0.467378588965841	779	0	221	0.221	0.779	0.442
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CCT	GGA	2	GGCCTTGAA:GGTATGGAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.66666666666667	3	31.249999999999996	0.155056374697807	0.102724391304868	1.50944067643707	0.0523319833929385	0.0570139810188579	0.0621420209747206	NaN	NaN	0.0665386213116378	0.431580271843708	779	1	220	0.22	0.779	0.44
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAGGCG:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85	3	30.916666666666664	0.14205405876177	0.103912304538584	1.36705714874241	0.0381417542231858	0.054973210674811	0.061884563508443	NaN	NaN	0.0669557710124853	0.568911063503843	720	0	280	0.28	0.72	0.56
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CCC	2	GAAGCCCCT:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85	3	30.916666666666664	0.156408563919793	0.103912304538584	1.50519772046549	0.0524962593812088	0.0609520476359686	0.062917273872714	NaN	NaN	0.070338806363317	0.455465534446256	789	0	211	0.211	0.789	0.422
ORF3a	all	ss12	104	CAA	CCC	ATT	2	GCCCCTTTT:GCGCAATTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.91666666666667	4	30.583333333333332	0.154555333162315	0.143721781908901	1.07537863161397	0.010833551253414401	0.057580684923724	0.0800093335979596	NaN	NaN	0.0837846742350012	0.89711844997038	564	1	435	0.435	0.564	0.87
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.91666666666667	3	30.249999999999996	0.154555333162315	0.106372646579413	1.45296124645099	0.048182686582902	0.0575425404234671	0.0681521928780586	NaN	NaN	0.0735615694473237	0.512468991694877	755	0	245	0.245	0.755	0.49
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.41666666666667	3	30.749999999999996	0.155560687054249	0.104516640682884	1.48838200345761	0.0510440463713658	0.0572198696819331	0.0643163982371362	NaN	NaN	0.0727663800115923	0.483004488088344	757	0	243	0.243	0.757	0.486
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CCT	2	CTCTATCTT:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85	3	30.999999999999996	0.14205405876177	0.103612753860613	1.37100939284821	0.0384413049011569	0.0560897723882994	0.0660879027898378	NaN	NaN	0.070962173071199	0.588014550701026	705	0	295	0.295	0.705	0.59
ORF3a	all	ss12	108	CTC	CCT	CTA	2	TACCTCTAT:TATCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.83333333333333	3	30.666666666666664	0.140537165576334	0.104821456781369	1.34072898709525	0.0357157087949646	0.0541019749764484	0.0678107833460221	NA	NA	0.0676066695564861	0.597300315772924	732	1	267	0.267	0.732	0.534
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	CTCTATGCC:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	86.16666666666666	3	30.666666666666664	0.139939466685309	0.104821456781369	1.33502692084491	0.0351180099039401	0.0554928637746533	0.0661056744380457	NaN	NaN	0.069642874039483	0.614079749233178	721	1	278	0.278	0.721	0.556
ORF3a	all	ss12	110	GCC	TGC	CTT	2	TATGCCTTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.83333333333333	3	30.999999999999996	0.140537165576334	0.103612753860613	1.3563693690199	0.0369244117157208	0.0520892363697288	0.0613051791900435	NaN	NaN	0.0699737167826456	0.597714702492765	746	1	253	0.253	0.746	0.506
ORF3a	all	ss12	111	TTA	CTT	AGT	2	GCCTTGATA:GCTTTAGTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.66666666666666	3	31.166666666666664	0.140837939389346	0.103018812035868	1.36710894453248	0.0378191273534778	0.0558214680067672	0.0637434290710443	NaN	NaN	0.0650348334099981	0.560889306998043	738	1	261	0.261	0.738	0.522
ORF3a	all	ss12	112	ATA	AGT	ATA	2	TTAGTCTAC:TTGATATAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	87	3	30.499999999999996	0.138467290336675	0.105436462965892	1.31327708120737	0.0330308273707833	0.0558197557728395	0.0664331198384384	NaN	NaN	0.072049055921635	0.646629797942237	713	0	287	0.287	0.713	0.574
ORF3a	all	ss12	113	TAC	ATA	CTT	2	ATATATTTT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.5	3	30.499999999999996	0.123992985319038	0.105436462965892	1.17599720088437	0.0185565223531456	0.0527413214038898	0.0665017922023441	NA	NA	0.0667605912867117	0.781045957600634	625	0	375	0.375	0.625	0.75
ORF3a	all	ss12	114	TTC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATTTTCTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.83333333333333	3	30.166666666666664	0.123481465445845	0.106688419438138	1.15740270683684	0.0167930460077069	0.0527086733326733	0.0701511842300781	NaN	NaN	0.0685856698757009	0.806574330445857	601	0	399	0.399	0.601	0.798
ORF3a	all	ss12	115	CTA	CTT	ACA	2	TTCTTGCAG:TTTCTACAA	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.5	3	29.833333333333332	0.123992985319038	0.107970516691131	1.14839670234923	0.0160224686279064	0.0512180930363687	0.067702770391561	NaN	NaN	0.0673756661832815	0.812030057246911	622	0	378	0.378	0.622	0.756
ORF3a	all	ss12	116	CAA	ACA	ATG	2	CTACAATGC:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	88.5	3	29.166666666666664	0.149561992614941	0.110629602831442	1.35191656470843	0.0389323897834988	0.0604482761918181	0.0688279519227096	NaN	NaN	0.0759486350788757	0.608220840738467	710	1	289	0.289	0.71	0.578
ORF3a	all	ss12	117	AGT	ATG	CAT	2	CAATGCATC:CAGAGTATA	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.416666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	87.91666666666667	3	29.166666666666664	0.164696513443584	0.110629602831442	1.48872010048269	0.0540669106121421	0.0623122474608427	0.0693049066808144	NaN	NaN	0.0777738075591671	0.486941577354933	751	1	248	0.248	0.751	0.496
ORF3a	all	ss12	118	ATA	CAT	AAA	2	AGTATAAAC:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	87.5	3	29.33333333333333	0.151456007747705	0.109952605643907	1.37746628977772	0.0415034021037985	0.0627766664216765	0.0676261897859068	NaN	NaN	0.080748357492646	0.607262845273104	714	0	286	0.286	0.714	0.572
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CGC	2	ATAAACTTT:ATCAACGCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	87.16666666666667	3	29.16666666666666	0.152098088127224	0.110629602831442	1.37484076806245	0.0414684852957813	0.0612143365400936	0.0719127028893266	NaN	NaN	0.0781518089837663	0.595685925624426	729	2	269	0.269	0.729	0.538
ORF3a	all	ss12	120	GCA	CGC	ATG	2	AACGCATGT:AACTTTGTA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	86.33333333333334	3	29.499999999999996	0.168081951325626	0.109283858386045	1.53803090234861	0.0587980929395812	0.0656833931164503	0.0676920668478836	NaN	NaN	0.0788569596223898	0.45589112285434	751	1	248	0.248	0.751	0.496
ORF3a	all	ss12	121	GTA	ATG	AAG	2	GCATGTAGA:TTTGTAAGA	1:1	TRUE	1.75	1	0.25	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	86	2	29.499999999999996	0.154389040653112	0.0710590256920247	2.17268727159651	0.0833300149610869	0.0593862888796282	0.0544170536964945	NaN	NaN	0.0735012686517878	0.256911123178207	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.5	2	29.999999999999996	0.141140007184765	0.069817817299509	2.02154711567812	0.0713221898852555	0.058205834301359	0.0523361214456388	NaN	NaN	0.0681592095857581	0.295373731957424	865	0	135	0.135	0.865	0.27
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGAATTATC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.33333333333334	2	29.999999999999996	0.141443377355663	0.069817817299509	2.02589228404104	0.0716255600561536	0.0585484047249585	0.0549128869792225	NaN	NaN	0.0680527909219129	0.29257022662449	871	0	129	0.129	0.871	0.258
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:ATTATCATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.83333333333334	2	29.833333333333332	0.144233737401781	0.0702267037754945	2.05383037573395	0.0740070336262862	0.0576790693409436	0.0569159950917566	NaN	NaN	0.0657131687489154	0.260075316124267	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATCATGAGA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.66666666666667	2	29.666666666666664	0.144550609399811	0.0706404112947758	2.04628776574665	0.0739101981050353	0.0573559265820348	0.0515582734305888	NaN	NaN	0.068424959499409	0.280069025170218	868	1	131	0.131	0.868	0.262
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGT:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.83333333333334	3	29.666666666666664	0.14615615254037	0.108623210908842	1.34553334703967	0.0375329416315282	0.0581838437322954	0.0689991467316012	NaN	NaN	0.0863791423066547	0.663915272751428	676	0	324	0.324	0.676	0.648
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	TTG	2	AGATGTTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.25	3	29.999999999999996	0.162245943584362	0.107325632730505	1.51171662776741	0.0549203108538573	0.063655120779106	0.0688245552889313	NaN	NaN	0.0880310677536327	0.532710213515683	737	0	263	0.263	0.737	0.526
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.5	3	29.833333333333332	0.16169725925912	0.107970516691131	1.49760568175925	0.0537267425679888	0.0621393474924687	0.0722607103665421	NaN	NaN	0.0885823687218526	0.544171272006354	743	0	257	0.257	0.743	0.514
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.5	3	30.833333333333332	0.166193970467093	0.104213595070396	1.59474366424869	0.0619803753966967	0.0607087769793932	0.0657768489075312	NaN	NaN	0.0851616943578796	0.466738222660729	788	0	212	0.212	0.788	0.424
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.33333333333333	3	30.499999999999996	0.19554469684744	0.105436462965892	1.85462117513082	0.0901082338815474	0.0690910731330462	0.0676097327448086	NaN	NaN	0.0924789074377411	0.329875216536963	844	0	156	0.156	0.844	0.312
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.49999999999999	4	30.833333333333332	0.214210364540791	0.142438427764417	1.50388043383265	0.0717719367763744	0.0747453674376632	0.0788983207768661	NaN	NaN	0.0938818953561484	0.444574236601059	802	0	198	0.198	0.802	0.396
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.99999999999999	4	30.916666666666664	0.23261619622788	0.142015736265178	1.63796071016755	0.0906004599627012	0.0758060198586588	0.0809535447108165	NaN	NaN	0.10345732099269	0.381177987260076	805	0	195	0.195	0.805	0.39
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCCGT:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.99999999999999	4	31.75	0.253621069659043	0.137923200937065	1.83885718962375	0.115697868721978	0.0805877124593495	0.0803792600641008	NaN	NaN	0.105829910873754	0.274286875324755	875	0	125	0.125	0.875	0.25
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CAA	ATC	2	TGCAAATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.08333333333331	4	31.583333333333336	0.25330314427324	0.138722674692595	1.82596785157547	0.114580469580645	0.0838765851047759	0.0770382311155196	NaN	NaN	0.101939027481204	0.26100885316008	870	0	130	0.13	0.87	0.26
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AAATCCAAG:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.41666666666664	3	31.916666666666668	0.220826439413092	0.100428343016685	2.19884579173436	0.120398096396408	0.0722841393117646	0.0638227344507073	NaN	NaN	0.0937703133480552	0.199153097439854	902	0	98	0.098	0.902	0.196
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.58333333333331	3	32.416666666666664	0.220282043117094	0.0987726497511971	2.23019270690796	0.121509393365897	0.0695193130425995	0.0649116849370977	NaN	NaN	0.0982930354183797	0.216385958575181	893	0	107	0.107	0.893	0.214
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.41666666666664	3	32.416666666666664	0.220826439413092	0.0987726497511971	2.2357043166235	0.122053789661895	0.0729481067809034	0.0619177658591014	NaN	NaN	0.099299850311646	0.219017917107872	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.08333333333331	3	32.083333333333336	0.221923403608424	0.0998703029515669	2.22211605502036	0.122053100656857	0.0729005969065451	0.0656271796219433	NaN	NaN	0.097925281940017	0.21262121886312	906	0	94	0.094	0.906	0.188
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.08333333333331	3	31.083333333333336	0.21866495405835	0.103314927985559	2.11648943983115	0.115350026072792	0.0699312813128062	0.0659792773048216	NaN	NaN	0.10018746275426	0.249591596273136	891	0	109	0.109	0.891	0.218
ORF3a	all	ss12	140	CTT	ACT	TTA	2	TTACTTTAT	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.41666666666666	3	30.416666666666668	0.21760011242993	0.105746684778908	2.05774878791596	0.111853427651022	0.0665900947023812	0.0701196925800249	NaN	NaN	0.100146140911333	0.264036218406071	872	1	127	0.127	0.872	0.254
ORF3a	all	ss12	141	TAT	TTA	TGA	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.74999999999999	3	30.083333333333336	0.233471628313773	0.107006075844546	2.18185394120005	0.126465552469227	0.075136750098602	0.073182335098837	NaN	NaN	0.103382845449068	0.221226203519012	888	0	112	0.112	0.888	0.224
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.58333333333331	3	29.75	0.237548992808331	0.10829587866142	2.19351831061838	0.129253114146911	0.0751111078676967	0.0716523930608897	NaN	NaN	0.101389463503216	0.202373664382209	902	0	98	0.098	0.902	0.196
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.24999999999999	3	30.083333333333336	0.248935191022842	0.107006075844546	2.32636501299688	0.141929115178296	0.0754731987729933	0.0691832992291707	NaN	NaN	0.102550636237199	0.166361337204521	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAC:GCCAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.74999999999999	3	29.583333333333336	0.243537699774927	0.108952531416164	2.23526426242168	0.134585168358763	0.0732568925030147	0.0692700866105814	NaN	NaN	0.104462243065511	0.197620033519523	899	0	101	0.101	0.899	0.202
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.08333333333331	3	30.25	0.280950016543333	0.106372646579413	2.64118667324487	0.174577369963919	0.081918497106677	0.0735021636256902	NaN	NaN	0.112250508729172	0.11988703610933	936	0	64	0.064	0.936	0.128
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.24999999999999	3	30.083333333333336	0.280251250519624	0.107006075844546	2.61902184813096	0.173245174675078	0.0826060391781427	0.0692956279558217	NaN	NaN	0.114911239502498	0.131645812389533	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.08333333333331	3	29.583333333333336	0.280950016543333	0.108952531416164	2.57864606624139	0.171997485127169	0.0823592955583537	0.0753039922983043	NaN	NaN	0.113755252503625	0.130534883789353	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.41666666666664	3	29.25	0.261934035771843	0.110290063467372	2.37495588937921	0.151643972304471	0.0806687465588174	0.0698265170052781	NaN	NaN	0.107037744274967	0.156560819864889	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAC:TGCTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.91666666666664	3	29.75	0.263873706540401	0.10829587866142	2.43659970999806	0.155577827878981	0.0793356976973578	0.077370057270456	NaN	NaN	0.109020689654064	0.153565872456845	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	150	CAC	GCA	CAC	2	TGGCACACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.24999999999999	3	29.083333333333336	0.262577384081623	0.110971243090164	2.36617502669841	0.15160614099146	0.0783050838902834	0.0755110290601055	NaN	NaN	0.112126115273877	0.176342127708725	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	151	ACA	CAC	ACA	2	CACACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.83333333333331	4	29.083333333333336	0.264199810240475	0.151937056450332	1.73887671916851	0.112262753790142	0.0802998365119567	0.0912889040940467	NaN	NaN	0.11868847407376901	0.344219680983397	842	0	158	0.158	0.842	0.316
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ACA	TAA	2	ACACATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.99999999999999	4	28.916666666666668	0.263548415128416	0.152908411727716	1.72357041807299	0.1106400034007	0.0800912422841267	0.0916379338232543	NaN	NaN	0.125785725292534	0.379080866587461	804	0	196	0.196	0.804	0.392
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATTGTTAC:CATAACTAT	1:1	TRUE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.58333333333331	4	28.666666666666668	0.247714987416377	0.154389040653112	1.60448556690597	0.0933259467632652	0.076049482516524	0.0835139023470426	NaN	NaN	0.123408370259807	0.449507253293402	779	0	221	0.221	0.779	0.442
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.74999999999999	3	29.083333333333336	0.268514498493544	0.110971243090164	2.41967640459229	0.157543255403381	0.082818265151264	0.0729486209215265	NaN	NaN	0.108349330458277	0.145937788291482	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.24999999999999	3	29.416666666666668	0.266505540694197	0.109617210244414	2.43123812492554	0.156888330449783	0.0818122519489791	0.0729730059026715	NaN	NaN	0.10767420954454	0.145098417255897	919	0	81	0.081	0.919	0.162
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.74999999999999	3	28.583333333333336	0.282358178426184	0.11306631811959	2.49727932351644	0.169291860306594	0.0842756325356224	0.0675715250330738	NaN	NaN	0.111204179259394	0.127921005104958	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.08333333333331	3	28.25	0.280950016543333	0.114507630156718	2.45354843305041	0.166442386386614	0.0842434800631176	0.0737671345278847	NaN	NaN	0.111957475031695	0.137105372089838	927	0	73	0.073	0.927	0.146
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCG:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.24999999999999	3	28.25	0.280251250519624	0.114507630156718	2.44744607967229	0.165743620362906	0.0836475676389277	0.0749640398855991	NaN	NaN	0.10936058848718	0.129628133217105	936	0	64	0.064	0.936	0.128
ORF3a	all	ss12	159	CCG	ACC	GTA	2	ATACCGTAT:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.58333333333331	3	27.583333333333336	0.278864213743486	0.117503608300369	2.3732395777212	0.161360605443117	0.0802739033707071	0.0742579599268738	NaN	NaN	0.113905118358255	0.15659319327589	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	160	TAC	GTA	CAA	2	CCGTATAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.91666666666664	4	27.583333333333336	0.277490994441353	0.16115228773261	1.72191781044881	0.116338706708743	0.0877244686965542	0.0885442099744745	NaN	NaN	0.125177646659718	0.352687613896607	815	1	184	0.184	0.815	0.368
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAATAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.58333333333331	4	27.25	0.29245904801873	0.163354604039617	1.79033244724344	0.129104443979113	0.0810065024785846	0.0890374968052321	NaN	NaN	0.128969874524244	0.316805818208831	846	0	154	0.154	0.846	0.308
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.24999999999999	4	27.583333333333336	0.298351676521946	0.16115228773261	1.85136482217977	0.137199388789337	0.0817392803029411	0.0876672796801131	NaN	NaN	0.128308513762587	0.284937687769167	857	0	143	0.143	0.857	0.286
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.24999999999999	4	27.916666666666668	0.30293151567038	0.159008783209024	1.90512441864399	0.143922732461356	0.0838303091838316	0.0853035850632977	NaN	NaN	0.127760483153966	0.259952125437817	879	0	121	0.121	0.879	0.242
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.41666666666664	4	28.416666666666668	0.30215833840741	0.155898728322134	1.93817064230992	0.146259610085276	0.0836321716095945	0.0895617844592324	NaN	NaN	0.129594920058494	0.259070572997758	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.58333333333331	4	29.083333333333336	0.306064756191029	0.151937056450332	2.01441809747762	0.154127699740697	0.0822316876792042	0.0829983983158237	NaN	NaN	0.124234812005159	0.214747625904131	897	0	103	0.103	0.897	0.206
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.91666666666664	4	29.750000000000004	0.290365776711344	0.148172379571929	1.95964846856218	0.142193397139415	0.0842069015409839	0.0870563487164144	NaN	NaN	0.118282817726167	0.22930637418319	883	0	117	0.117	0.883	0.234
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.91666666666664	4	29.750000000000004	0.271931669012678	0.148172379571929	1.83523859033844	0.12375928944075	0.0772307460357331	0.0864728701196433	NaN	NaN	0.113474587974671	0.275433785462077	862	0	138	0.138	0.862	0.276
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.24999999999997	4	30.083333333333336	0.27472937774977	0.146359364647636	1.87708779968531	0.128370013102134	0.0774180529295034	0.0806631346080623	NaN	NaN	0.114736405193617	0.263214601167336	858	0	142	0.142	0.858	0.284
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT:GTCGTTACT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.41666666666664	4	30.583333333333336	0.274024507731712	0.143721781908901	1.90663171644646	0.130302725822811	0.0753386227582439	0.0819402191029766	NaN	NaN	0.11255946975224	0.247013222790119	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TGC	2	ATTACTTCA:GTTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.74999999999997	4	30.333333333333336	0.291116602929805	0.145028544735405	2.00730555119979	0.1460880581944	0.0814506877513968	0.0806717557800778	NaN	NaN	0.117322933698568	0.21306594460251	896	0	104	0.104	0.896	0.208
ORF3a	all	ss12	171	GCA	TGC	AGG	2	ACTGCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.41666666666664	4	30.000000000000004	0.288136640212584	0.146808432844571	1.96267090813264	0.141328207368013	0.086947115007467	0.079573622471002	NaN	NaN	0.121114844700347	0.243253106639944	891	0	109	0.109	0.891	0.218
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	GCAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.16666666666664	4	30.250000000000004	0.270897321493184	0.145469445655623	1.86222832067768	0.125427875837561	0.0807073437365443	0.0759060703859132	NaN	NaN	0.120024239435102	0.296013167155046	881	0	119	0.119	0.881	0.238
ORF3a	all	ss12	173	GAC	TGA	CGG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.8333333333333	4	30.250000000000004	0.268177549189387	0.145469445655623	1.84353180133962	0.122708103533763	0.0818420211764495	0.0777704655996523	NaN	NaN	0.116718598849425	0.293113586917949	845	0	155	0.155	0.845	0.31
ORF3a	all	ss12	174	GGC	CGG	CAC	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.99999999999997	4	30.41666666666667	0.263548415128417	0.144590316625212	1.82272520926524	0.118958098503205	0.0802660462932146	0.0813319872122395	NaN	NaN	0.116894862370983	0.308844146669608	863	0	137	0.137	0.863	0.274
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.49999999999997	4	29.91666666666667	0.261613554332634	0.147260274111344	1.77653855332924	0.11435328022129	0.0760111785987372	0.0819657992954871	NaN	NaN	0.11226076089304	0.308373996953033	873	0	127	0.127	0.873	0.254
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAC	2	ACAACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.91666666666664	3	30.333333333333336	0.281652316781776	0.106058740537371	2.65562569718176	0.175593576244405	0.0827412719078237	0.0616109116268727	NaN	NaN	0.107304075163741	0.101753584312822	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	177	ACA	AAC	ACC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666664	3	29.66666666666667	0.26683825481505	0.108623210908842	2.4565491351474	0.158215043906208	0.077388296258724	0.0642841765759151	NaN	NaN	0.101941645277745	0.120658443685517	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	178	CCA	ACC	AAA	2	ACACCAAAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.16666666666664	3	30.000000000000004	0.249242139805801	0.107325632730505	2.32229835002836	0.141916507075296	0.0714361669194254	0.0656376969521009	NaN	NaN	0.0963588813559824	0.140807361120617	931	0	69	0.069	0.931	0.138
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTC:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.66666666666664	4	29.500000000000004	0.247411820206618	0.149561992614941	1.65424260456063	0.0978498275916772	0.0743673220813303	0.0827622109951519	NaN	NaN	0.105795559668477	0.35502031415198	833	0	167	0.167	0.833	0.334
ORF3a	all	ss12	180	CTC	ACT	CAA	2	AAACTCAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.83333333333331	4	29.833333333333336	0.216283656691977	0.147714914296514	1.46419647414764	0.0685687423954632	0.0655326498875648	0.083197713517819	NaN	NaN	0.104664941378905	0.512386522694989	762	0	238	0.238	0.762	0.476
ORF3a	all	ss12	181	AAA	CAA	ACA	2	CTCAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.33333333333331	3	30.000000000000004	0.198330831309248	0.107325632730505	1.84793535582741	0.0910051985787427	0.0619087620750926	0.0696178806133988	NaN	NaN	0.0960529988900051	0.343410664349802	824	0	176	0.176	0.824	0.352
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.99999999999999	3	30.41666666666667	0.183147720384032	0.105746684778908	1.73194763284496	0.0774010356051235	0.0579429644519975	0.0637542263452531	NaN	NaN	0.0957860365790665	0.41905501590046	805	0	195	0.195	0.805	0.39
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.66666666666666	3	29.583333333333332	0.165809675320019	0.108952531416164	1.52185243577938	0.0568571439038547	0.0568923793994264	0.0665432301657697	NaN	NaN	0.0928914745035839	0.540483901997886	754	0	246	0.246	0.754	0.492
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.33333333333333	4	30.25	0.168934951133241	0.145469445655623	1.16130882586278	0.0234655054776181	0.0571621494346343	0.07777715115521	NaN	NaN	0.102195415857357	0.81839167187679	615	0	385	0.385	0.615	0.77
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81	4	29.583333333333332	0.165046413582601	0.149095891727942	1.10698163222206	0.0159505218546588	0.0555651775733154	0.0817380581337337	NaN	NaN	0.10126250535773	0.874837755059716	571	0	429	0.429	0.571	0.858
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.66666666666666	4	28.916666666666664	0.163540861355054	0.152908411727716	1.0695347594498	0.0106324496273377	0.0557862353942083	0.0773338041921069	NaN	NaN	0.10535704921047	0.919615351174718	557	1	442	0.442	0.557	0.884
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.16666666666666	4	29.25	0.180171850426458	0.150978005779684	1.19336488448109	0.0291938446467744	0.0621700699261063	0.0815073847951901	NaN	NaN	0.105526448092837	0.782049211629917	616	2	382	0.382	0.616	0.764
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.66666666666666	4	29.75	0.18143524049715	0.148172379571929	1.22448759358065	0.0332628609252213	0.0589883136005511	0.0793191924762322	NaN	NaN	0.108195017861585	0.758512814390204	632	1	367	0.367	0.632	0.734
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.66666666666666	4	30.25	0.186672035562468	0.145469445655623	1.28323879094436	0.0412025899068452	0.0596662518309445	0.0798715655036562	NaN	NaN	0.104823159840617	0.69426953914119	635	2	363	0.363	0.635	0.726
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.33333333333331	4	30.25	0.20119798994601	0.145469445655623	1.38309449822415	0.0557285442903863	0.0641136954649968	0.0774355540640431	NaN	NaN	0.102712967818745	0.587428786645048	713	0	287	0.287	0.713	0.574
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGAAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.99999999999999	4	30.583333333333332	0.185778237042605	0.143721781908901	1.29262408644753	0.0420564551337039	0.0586216491884104	0.0761064063753548	NaN	NaN	0.10179536069329	0.679498864064118	665	0	335	0.335	0.665	0.67
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGAATTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.49999999999999	4	30.583333333333332	0.187122184471386	0.143721781908901	1.30197512155808	0.0434004025624847	0.0605614132317102	0.0769227931691348	NaN	NaN	0.102047769448654	0.670621663342759	662	0	338	0.338	0.662	0.676
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:AATTGGCAC	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.33333333333333	6	31.41666666666667	0.173851210542993	0.220417888585699	0.788734578933233	-0.0465666780427055	0.0604590043057109	0.110862782481166	NaN	NaN	0.141184390988125	0.741529325878043	344	0	656	0.656	0.344	0.688
ORF3a	all	ss12	194	CAC	GCA	ATC	2	TGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333333	6	32.083333333333336	0.193179203235308	0.215112484631514	0.898038082569788	-0.0219332813962062	0.0596386808657652	0.113588103662646	NaN	NaN	0.13330843830376	0.869313671893084	465	0	535	0.535	0.465	0.93
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.16666666666666	6	31.583333333333336	0.160415060140258	0.219066980579392	0.732264897776881	-0.0586519204391334	0.0524720530723248	0.117503151539509	NaN	NaN	0.134958738673793	0.663858967173171	326	0	674	0.674	0.326	0.652
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666666	6	31.750000000000004	0.159249476407496	0.217732646143538	0.731399168788461	-0.0584831697360422	0.0514853692982422	0.108362843192218	NaN	NaN	0.135556568190636	0.666155742964439	346	0	654	0.654	0.346	0.692
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333333	6	31.91666666666667	0.158864717514625	0.216414580065769	0.734075853236624	-0.0575498625511439	0.0525521466598203	0.113584216135186	NaN	NaN	0.132832323703618	0.664831745542561	345	0	655	0.655	0.345	0.69
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32.5	0.158673037027526	0.211925228838758	0.748721791628931	-0.0532521918112318	0.0515305911542834	0.109241508627725	NaN	NaN	0.128269118435987	0.678024866583868	322	1	677	0.677	0.322	0.644
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32	0.158673037027526	0.215761554338836	0.735409222990409	-0.0570885173113096	0.0509461274294196	0.120107563112053	NaN	NaN	0.131207880957855	0.663490018756872	331	1	668	0.668	0.331	0.662
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.75	6	32	0.15905686340681	0.215761554338836	0.737188160764845	-0.0567046909320252	0.0520668778194804	0.112897730461386	NaN	NaN	0.128679050950815	0.659453642483383	345	0	655	0.655	0.345	0.69
ORF3a	all	ss12	201	GTC	TGT	CGT	2	TATGTCGTT:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333334	5	32.333333333333336	0.158864717514625	0.173179167487274	0.91734311822638	-0.0143144499726495	0.0518702624055406	0.105443655089988	NaN	NaN	0.11946373358043	0.904623713132919	464	0	536	0.536	0.464	0.928
ORF3a	all	ss12	202	GTA	CGT	ATT	2	GTCGTTGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.33333333333334	5	32.833333333333336	0.160024633856936	0.17021844254226	0.940113371188945	-0.0101938086853242	0.0512965522258494	0.0957216461077189	NaN	NaN	0.1137919086099	0.92861867697033	481	0	519	0.519	0.481	0.962
ORF3a	all	ss12	203	GTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.08333333333334	5	33.083333333333336	0.160610991304224	0.168775880107432	0.951622893046025	-0.00816488880320848	0.0518307313449313	0.0978997603717138	NaN	NaN	0.114229933268191	0.943017600527629	479	0	521	0.521	0.479	0.958
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	GTACATGGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.83333333333334	5	33.166666666666664	0.145028544735405	0.168300466878196	0.861723959686733	-0.023271922142791	0.0502131581356639	0.103612684778052	NaN	NaN	0.109876758121831	0.832262892621934	455	0	545	0.545	0.455	0.91
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:CATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	32.833333333333336	0.146091244169313	0.17021844254226	0.858257436664322	-0.0241271983729469	0.04838196361672	0.100924064944896	NaN	NaN	0.117761010887327	0.837663741997586	437	0	563	0.563	0.437	0.874
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.83333333333334	5	33	0.131083275220683	0.169253998250676	0.774476683419554	-0.0381707230299936	0.04896782284146	0.0943983031696449	NaN	NaN	0.118465151133524	0.747293182837631	385	0	615	0.615	0.385	0.77
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	5	32.83333333333333	0.130765040358583	0.17021844254226	0.768218992052627	-0.039453402183677	0.0473720357247622	0.0995468933598501	NaN	NaN	0.113510457842578	0.728159352335748	360	0	640	0.64	0.36	0.72
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CGA	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.33333333333334	5	32.5	0.13013319533385	0.172180831233375	0.755793745457451	-0.0420476358995253	0.0497347156362991	0.0993760644148159	NaN	NaN	0.112127666239169	0.707662051475771	375	0	625	0.625	0.375	0.75
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.66666666666667	5	33.166666666666664	0.131403066768818	0.168300466878196	0.780764719232291	-0.0368974001093777	0.0484691670982784	0.0963839468315531	NaN	NaN	0.119510462230819	0.757520968712078	410	0	590	0.59	0.41	0.82
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	5	32.5	0.130765040358583	0.172180831233375	0.759463404967208	-0.0414157908747918	0.0485267682388989	0.104732284974464	NaN	NaN	0.114739278015802	0.718132599961017	357	0	643	0.643	0.357	0.714
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.66666666666667	5	32.5	0.113962844188242	0.172180831233375	0.661878812942748	-0.0582179870451332	0.0437896639237308	0.102651271034934	NaN	NaN	0.118903654531665	0.624400561079923	305	0	695	0.695	0.305	0.61
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.83333333333333	0.128887692694994	0.17021844254226	0.757189942347142	-0.0413307498472659	0.0484215105824562	0.0979965131677437	NaN	NaN	0.117301443880104	0.724578440659443	371	0	629	0.629	0.371	0.742
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.66666666666669	5	33.166666666666664	0.12950744207608	0.168300466878196	0.769501383319442	-0.0387930248021161	0.0460988849367252	0.100315418097898	NaN	NaN	0.114985218472847	0.735834970741642	405	0	595	0.595	0.405	0.81
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.5	0.128887692694994	0.172180831233375	0.748560056144108	-0.0432931385383807	0.0485488790441493	0.104473598104297	NaN	NaN	0.121332099649135	0.721230149361299	367	1	632	0.632	0.367	0.734
ORF3a	all	ss12	215	GAG	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.83333333333336	5	31.83333333333333	0.127364024533652	0.176245193423779	0.722652471023176	-0.0488811688901276	0.0467530788746046	0.0993541071760912	NaN	NaN	0.119074540807037	0.681432613762383	365	0	635	0.635	0.365	0.73
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.50000000000003	5	30.83333333333333	0.114234586398441	0.182716561993313	0.625201049933402	-0.0684819755948721	0.0468903454231284	0.112040759000494	NaN	NaN	0.123446161007532	0.579064464367895	283	0	717	0.717	0.283	0.566
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.16666666666669	5	29.83333333333333	0.114781984854672	0.189683904532547	0.605122427954751	-0.074901919677875	0.0466101368368203	0.117479143400889	NaN	NaN	0.133081669503965	0.5735528828854	277	0	723	0.723	0.277	0.554
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AAT	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	30.166666666666664	0.115334665090852	0.187302855665743	0.615765652268946	-0.0719681905748906	0.0466820948344747	0.113750498781858	NaN	NaN	0.126165024507258	0.568386755283967	290	0	710	0.71	0.29	0.58
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTACT:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	29.499999999999996	0.115334665090852	0.192126605059278	0.600305538398846	-0.0767919399684257	0.0475552675634952	0.114814828158136	NaN	NaN	0.128254575154423	0.54934214127145	266	1	733	0.733	0.266	0.532
ORF3a	all	ss12	220	ACT	GAG	TAC	2	ATTACTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.41666666666666	0.0849965139802523	0.192747196311253	0.440974061396971	-0.107750682331	0.0354339895286694	0.114891672138202	NaN	NaN	0.124321242686962	0.386099963521106	192	0	808	0.808	0.192	0.384
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	ACTACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.195270406950441	0.435275960692929	-0.110273892970189	0.034455772054548	0.121498052730102	NaN	NaN	0.124785425963539	0.376853801094235	157	0	843	0.843	0.157	0.314
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.195270406950441	0.435275960692929	-0.110273892970189	0.0338299650199784	0.118323667067124	NaN	NaN	0.126537991909131	0.383498316216552	174	0	826	0.826	0.174	0.348
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	5	28.749999999999993	0.0870541284395655	0.197860943283853	0.439976313641024	-0.110806814844288	0.0342999153829814	0.120878022331675	NaN	NaN	0.131429978798309	0.399180178888293	176	0	824	0.824	0.176	0.352
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.33333333333337	5	29.41666666666666	0.0879053734766805	0.192747196311253	0.456065640170085	-0.104841822834572	0.0356369167061685	0.108428254781393	NaN	NaN	0.123316868535709	0.395223723164872	167	0	833	0.833	0.167	0.334
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TGA	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333337	5	30.41666666666666	0.0892139571460239	0.185556129985381	0.480792292623546	-0.0963421728393568	0.035380494916816	0.121432661967094	NaN	NaN	0.127062932207079	0.448316857577686	196	0	804	0.804	0.196	0.392
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.9166666666667	5	30.16666666666666	0.0729614963194685	0.187302855665743	0.389537554353545	-0.114341359346275	0.031662806281335	0.113984072883743	NaN	NaN	0.130898054000216	0.382382659908527	143	0	857	0.857	0.143	0.286
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAC	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AACAAGCTT:AATAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAC:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAC	AGA	CCC	2	AAAGACCCA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCA	CCC	A--	1	GACCCA---:GAGCCTGAA	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCA---CCG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	CCG	-CC	ACA	1	---CCGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	2	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AAT	ACA	TGT	2	CCGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.75000000000001	5	31.416666666666668	0.247109400847682	0.178884786483983	1.38138857811593	0.0682246143636984	0.0644501578483348	0.0857942859149396	NaN	NaN	0.0939914579041288	0.467924764987109	770	0	230	0.23	0.77	0.46
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.08333333333336	5	31.416666666666668	0.249549853467475	0.178884786483983	1.39503117270299	0.070665066983492	0.0614420933251283	0.0898190201765898	NaN	NaN	0.0976431454890093	0.469245388907524	766	0	234	0.234	0.766	0.468
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.25000000000001	5	31.916666666666668	0.252669701240021	0.175726637753458	1.43785657354074	0.0769430634865631	0.063089539769872	0.0881464368242893	NaN	NaN	0.0930838241036197	0.408463972802626	817	1	182	0.182	0.817	0.364
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA:TTTATGAGC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.08333333333336	5	31.416666666666668	0.253303144273239	0.178884786483983	1.41601278259579	0.0744183577892562	0.0637472734922324	0.0876402307929858	NaN	NaN	0.0994072570648602	0.454085685735077	764	0	236	0.236	0.764	0.472
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGCATT	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.58333333333336	5	30.916666666666668	0.255222859246332	0.182159096576957	1.40109862226127	0.0730637626693748	0.064843857936539	0.0924717971112861	NaN	NaN	0.096545744362596	0.449182457325701	783	0	217	0.217	0.783	0.434
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGCATTTTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.83333333333336	5	30.916666666666668	0.23666322859543	0.182159096576957	1.29921169484636	0.0545041320184729	0.0594426292932191	0.0890997001838964	NaN	NaN	0.0981094971633478	0.578522696041739	725	0	275	0.275	0.725	0.55
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.33333333333336	5	31.583333333333336	0.242080044197288	0.177819473768805	1.36138095039035	0.0642605704284832	0.0642225055175513	0.0854134511252545	NaN	NaN	0.0985495892537872	0.514360337840525	759	1	240	0.24	0.759	0.48
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.66666666666669	5	31.25	0.24085480398197	0.179963002222943	1.33835733460143	0.060891801759027	0.0628516419987558	0.0866209928555988	NaN	NaN	0.0984611492055085	0.536288759850241	741	1	258	0.258	0.741	0.516
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	GGG	2	ACAATTGGA:ACATTGGGA	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.00000000000001	5	31.916666666666668	0.243317923578779	0.175726637753458	1.38463881565953	0.0675912858253212	0.0619099140780939	0.0871613930005819	NaN	NaN	0.0988098192938863	0.493940852194873	767	0	233	0.233	0.767	0.466
ORF3a	all	ss12	11	GGA	GGG	AAC	2	ATTGGAACT:TTGGGAGCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.75000000000001	5	31.833333333333336	0.209005969121087	0.176245193423779	1.18588181079376	0.032760775697308	0.0517683197568605	0.0861696643705043	NaN	NaN	0.0912185386869496	0.719485851283728	651	0	349	0.349	0.651	0.698
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGAGCAATC	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.58333333333334	5	31.666666666666668	0.206421458535371	0.177291583548173	1.16430489481912	0.029129874987198	0.0543671179697606	0.0897353662549418	NaN	NaN	0.088762140408284	0.742776286513147	650	0	350	0.35	0.65	0.7
ORF3a	all	ss12	13	ATC	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:GCAATCACA	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.75	5	31.666666666666668	0.22303140124308	0.177291583548173	1.25799204214609	0.0457398176949076	0.0605386276353335	0.0949879018363694	NaN	NaN	0.0904807121466498	0.6131935920098	713	1	286	0.286	0.713	0.572
ORF3a	all	ss12	14	ACA	AAC	ACG	2	ATCACACGC:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78	5	31.583333333333332	0.205153173799212	0.177819473768805	1.15371601012578	0.0273337000304073	0.0581184791794572	0.0871618530406566	NaN	NaN	0.0930773162923222	0.769012670475989	619	0	381	0.381	0.619	0.762
ORF3a	all	ss12	15	CGC	ACG	CCA	2	ACACGCCAA:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.75	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.91666666666666	5	31.666666666666668	0.222476012792921	0.177291583548173	1.25485941487161	0.0451844292447484	0.0574142893906441	0.0862919230250092	NaN	NaN	0.0944959090400157	0.632534331256657	683	0	317	0.317	0.683	0.634
ORF3a	all	ss12	16	AAG	CCA	ACC	2	CGCCAACCA:TTGAAGCAA	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.58333333333333	4	31.916666666666668	0.206421458535371	0.137132914796851	1.50526559463251	0.0692885437385197	0.0583520271337104	0.0753609135024806	NaN	NaN	0.0902152832516892	0.442466071107276	803	0	197	0.197	0.803	0.394
ORF3a	all	ss12	17	CAA	ACC	AGC	2	AAGCAAGGT:CAACCAGCG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.41666666666666	4	31.916666666666668	0.206933202001177	0.137132914796851	1.50899732794077	0.0698002872043264	0.058688935317975	0.0729143097997468	NaN	NaN	0.090443548592233	0.440259376065951	783	0	217	0.217	0.783	0.434
ORF3a	all	ss12	18	GCG	AGC	GAA	2	CAAGGTGAA:CCAGCGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.41666666666666	3	31.083333333333332	0.20390047423932	0.103314927985559	1.97358192291264	0.100585546253761	0.0573136411748156	0.063829031447238	NaN	NaN	0.0789037898247125	0.202384550222997	900	0	100	0.1	0.9	0.2
ORF3a	all	ss12	19	AAA	GAA	AAT	2	GCGAAAATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.66666666666666	3	31.083333333333332	0.186672035562468	0.103314927985559	1.80682539495707	0.0833571075769099	0.0552263348446661	0.0645471475867529	NaN	NaN	0.0763771928330316	0.275102444685619	866	1	133	0.133	0.866	0.266
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAAATTGAA:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.83333333333333	3	31.249999999999996	0.170137650782942	0.102724391304868	1.65625367667551	0.0674132594780736	0.0522184156760663	0.0655326184996363	NaN	NaN	0.0755792048521598	0.37241698322134	833	0	167	0.167	0.833	0.334
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	AAA	2	ATCAAGGAT:ATTGAAAAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.33333333333333	3	31.916666666666664	0.171357672967179	0.100428343016685	1.70626804963526	0.0709293299504946	0.0547737140884588	0.0599332073561676	NaN	NaN	0.0721151285657657	0.32533344150416	836	0	164	0.164	0.836	0.328
ORF3a	all	ss12	22	AAT	AAA	TGC	2	AAGGATGCT:GAAAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77	3	32.58333333333333	0.158481820250405	0.0982328346145694	1.6133283832461	0.0602489856358358	0.0543199384110521	0.0610219810840873	NaN	NaN	0.0696344479139981	0.386919085524573	806	0	194	0.194	0.806	0.388
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.58333333333333	3	32.33333333333333	0.143463258720043	0.0990447915097998	1.44846848110986	0.044418467210243	0.0516226202090245	0.0649481175997881	NaN	NaN	0.0700125061361312	0.525796201808155	740	0	260	0.26	0.74	0.52
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.25	3	32.83333333333333	0.16021960824549	0.0974341006801572	1.64438946043579	0.0627855075653325	0.0533983282247994	0.0611354760248238	NaN	NaN	0.071501011201528	0.379885888899479	814	0	186	0.186	0.814	0.372
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.91666666666666	4	33.166666666666664	0.144852934121868	0.131483259230803	1.10168347643099	0.0133696748910647	0.0507858125897186	0.0708950727845854	NaN	NaN	0.0796297909694893	0.866663600161529	549	2	449	0.449	0.549	0.898
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.08333333333333	4	32.666666666666664	0.142438427764417	0.133686173554739	1.06546865675749	0.00875225420967796	0.0497740124932539	0.0708407506369704	NaN	NaN	0.0809748606802301	0.913927420394014	542	1	457	0.457	0.542	0.914
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.16666666666666	4	32.58333333333333	0.126764620575651	0.134060541816084	0.945577414938079	-0.0072959212404331	0.0480006176450899	0.0723186755215037	NaN	NaN	0.0757060591655863	0.923225371617638	486	1	513	0.513	0.486	0.972
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.58333333333333	3	32.666666666666664	0.127817319751755	0.0979651368127982	1.30472251568434	0.0298521829389568	0.0485874894602517	0.059408626452466	NaN	NaN	0.0707039237870124	0.672868860185602	666	1	333	0.333	0.666	0.666
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.58333333333333	2	33	0.127817319751755	0.0631952577133049	2.02257771194823	0.0646220620384501	0.0488125344234267	0.0473251878952308	NaN	NaN	0.0669151171409412	0.334178361517777	853	1	146	0.146	0.853	0.292
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.75	2	33.5	0.127514764415745	0.0622118122355632	2.04968734768429	0.0653029521801813	0.0485550553762018	0.0468795750500383	NaN	NaN	0.0697448954139289	0.349112795361859	831	0	169	0.169	0.831	0.338
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACA:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.91666666666667	1	33	0.127213641474078	0.0309322189005369	4.1126581278613	0.096281422573541	0.0496048735911112	0.0315823509159149	NaN	NaN	0.0581374511590482	0.0977016052038425	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	32	ACA	TAC	AGC	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.33333333333334	1	32.58333333333333	0.12471051706475	0.0313361505112163	3.97976506463715	0.0933743665535337	0.046543392400952	0.0325686520636932	NaN	NaN	0.0565878293351802	0.0989268598091869	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	33	GCA	AGC	AAC	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.66666666666667	1	31.916666666666664	0.122443179667292	0.0320048558445568	3.82576882276809	0.0904383238227357	0.0465730275021458	0.0319424907313809	NaN	NaN	0.0567450503228184	0.110988487218917	946	1	53	0.053	0.946	0.106
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.08333333333334	1	32.5	0.123424890893523	0.0314182062818701	3.92845122303324	0.0920066846116532	0.0467299880927774	0.0322065376496095	NaN	NaN	0.0597719301020146	0.123732083950075	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333334	1	33.166666666666664	0.125145045452681	0.0307735475083969	4.06664345144263	0.0943714979442838	0.04537369645499	0.0320464105399291	NaN	NaN	0.0573114420931629	0.0996313999090222	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.08333333333334	1	33.83333333333333	0.126913940754554	0.0301548153585304	4.20874541082714	0.096759125396024	0.0485483058916172	0.0313103974696332	NaN	NaN	0.0590992052747008	0.101581948890726	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.25000000000001	1	33.83333333333333	0.142100073148949	0.0301548153585304	4.71235096151073	0.111945257790419	0.0495568290838076	0.0302663011020095	NaN	NaN	0.0613599632655628	0.0680912753331007	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.91666666666669	1	33.83333333333333	0.125436421140775	0.0301548153585304	4.15974761076727	0.0952816057822444	0.047710758113793	0.0303382102800578	NaN	NaN	0.0592677829513519	0.107912762605079	955	1	44	0.044	0.955	0.088
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.75000000000001	1	33.33333333333333	0.12572916000110201	0.0306164958901914	4.10658229642087	0.0951126641109108	0.0484510790305025	0.0318066913997799	NaN	NaN	0.0583826524311737	0.103286467520987	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.75000000000001	1	33.33333333333333	0.12572916000110201	0.0306164958901914	4.10658229642087	0.0951126641109108	0.045523487791951	0.0312085152271409	NaN	NaN	0.0577963941054183	0.0998357383324944	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.58333333333334	1	32.666666666666664	0.139450189981991	0.0312545223004261	4.46176040195277	0.108195667681565	0.0505244482212262	0.0306519790357045	NaN	NaN	0.0619214777129544	0.080584558054883	962	1	37	0.037	0.962	0.074
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.25000000000001	1	31.999999999999996	0.138162071083302	0.0319197108140969	4.32842489983602	0.106242360269205	0.0476293000857759	0.0319425066912678	NaN	NaN	0.0575216331499693	0.0647473825705864	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.25000000000001	1	31.999999999999996	0.138162071083302	0.0319197108140969	4.32842489983602	0.106242360269205	0.0491714108989505	0.031461679908034	NaN	NaN	0.0615596279389448	0.0843753478808411	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.91666666666669	1	32.33333333333333	0.138803133576506	0.0315836140125951	4.39478311510372	0.107219519563911	0.0497598803396207	0.0313312195953537	NaN	NaN	0.0602366796063425	0.07508077006005	972	0	28	0.028	0.972	0.056
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.91666666666669	1	32.33333333333333	0.138803133576506	0.0315836140125951	4.39478311510372	0.107219519563911	0.0506511870828085	0.0311049487687014	NaN	NaN	0.0606627009709094	0.0771495061868966	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.16666666666669	1	33.08333333333333	0.142269048679191	0.0308526791703671	4.61123806764358	0.111416369508824	0.0512768562481393	0.029622330646119	NaN	NaN	0.060449124121021	0.0653081598343514	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT:CTTGTTGTT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.00000000000001	1	33.08333333333333	0.142608211856373	0.0308526791703671	4.62223105711165	0.111755532686006	0.0510810251929156	0.0327754015910294	NaN	NaN	0.0598583350348669	0.0619015384489971	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTGTTGGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.75000000000001	1	33.33333333333333	0.143120008795216	0.0306164958901914	4.67460447820442	0.112503512905024	0.0508430173159137	0.0301881591837043	NaN	NaN	0.0591716235220288	0.0572616116307409	972	0	28	0.028	0.972	0.056
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.83333333333334	1	33.25	0.142949000902461	0.0306948207819131	4.6571049206677	0.112254180120548	0.0487433816794165	0.031665790706465	NaN	NaN	0.0624657662407811	0.0723274920559542	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.33333333333334	1	33.75	0.143981241370948	0.0302307926160697	4.76273457992009	0.113750448754878	0.0501455560340755	0.0304819288835147	NaN	NaN	0.0624434301315554	0.0685071991221654	976	0	24	0.024	0.976	0.048
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.33333333333334	1	32.75	0.141931499728896	0.0311733183159379	4.55298015727544	0.110758181412958	0.0511111860799872	0.0317760436305971	NaN	NaN	0.0626860802424215	0.0772499305774374	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.16666666666667	1	32.916666666666664	0.155852544989684	0.0310121698640216	5.02552854808441	0.124840375125662	0.0541894687031697	0.032212944042273	NaN	NaN	0.063008758535544	0.0475556449487812	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.83333333333334	1	32.916666666666664	0.154389040653111	0.0310121698640216	4.97833725695614	0.12337687078909	0.0495370206146631	0.0319986933936446	NaN	NaN	0.0609481667432188	0.0429401425380765	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.16666666666667	1	32.58333333333333	0.153667583253645	0.0313361505112163	4.903843667672	0.122331432742428	0.0515107023456907	0.0311057865936247	NaN	NaN	0.0614133221770875	0.0463780349961575	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79	2	33.08333333333333	0.169734844556617	0.0630291953285242	2.69295591783959	0.106705649228092	0.0550369574028514	0.043990497286131	NaN	NaN	0.0660686221395878	0.106294882384527	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.66666666666667	2	33.08333333333333	0.168142592913661	0.0630291953285242	2.66769378916007	0.105113397585136	0.054479667161925	0.0457503977034923	NaN	NaN	0.0662262118475767	0.112470246622922	946	0	54	0.054	0.946	0.108
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAG	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.75000000000001	2	33.5	0.186447776478305	0.0622118122355632	2.99698352737782	0.124235964242741	0.0600768601120545	0.0455249239585295	NaN	NaN	0.0707712175494142	0.0791808435837334	970	1	29	0.029	0.97	0.058
ORF3a	all	ss12	58	AGC	AAG	CGC	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.25000000000001	2	33.5	0.185113513370723	0.0622118122355632	2.9755364249766	0.12290170113516	0.0575055320577432	0.0445355112509066	NaN	NaN	0.0672001162201697	0.0674159089282647	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.41666666666669	2	33.833333333333336	0.203900474239319	0.0615730216404005	3.31152294961487	0.142327452598919	0.0584003334029111	0.044770273470356003	NaN	NaN	0.0675960871290555	0.0352428020440974	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	60	TCC	TTC	CAA	2	GCTTCCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.75000000000001	2	33.5	0.202909342656595	0.0622118122355632	3.26158868171666	0.140697530421032	0.0590763513731309	0.0457448260040508	NaN	NaN	0.0709479726467174	0.0473553069406658	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	TCCAAAATC:TCCAAAGTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.58333333333334	2	33.666666666666664	0.203403693684308	0.0618907677660026	3.28649491719572	0.141512925918305	0.0585723616208727	0.0458694829084499	NaN	NaN	0.0695940807352782	0.0420116600660668	981	0	19	0.019	0.981	0.038
ORF3a	all	ss12	62	ATC	AAT	CAT	2	AAAATCATA:AAAGTGATT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.25000000000001	2	34.333333333333336	0.207447505316393	0.0606390724718212	3.42102042231587	0.146808432844571	0.061697606743554	0.0460604978995538	NaN	NaN	0.0696590844674212	0.03507188462767	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	63	ATA	CAT	AAC	2	ATCATAACC:GTGATTGCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.25000000000001	2	34.333333333333336	0.190569155883606	0.0606390724718212	3.1426792679285	0.129930083411785	0.0527027020487645	0.0435858688042759	NaN	NaN	0.0610540676400744	0.0333275414482899	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTT	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.58333333333334	2	34.666666666666664	0.192460269414335	0.0600320307551523	3.20595966841946	0.132428238659182	0.0530264068240901	0.0453765063469473	NaN	NaN	0.0647278428078533	0.0407638614317415	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.83333333333334	2	34.916666666666664	0.191746695912757	0.059584670169267	3.2180541633955	0.13216202574349	0.0513426391790019	0.0439363372725662	NaN	NaN	0.0646292522498724	0.0408621733190787	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTTCATAAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.83333333333334	2	34.916666666666664	0.191746695912757	0.059584670169267	3.2180541633955	0.13216202574349	0.055024830324403	0.0426194924691897	NaN	NaN	0.0660463701288304	0.045387104970415	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	GAG	2	AAAAAGAGA:CATAAGAGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.58333333333334	2	35.25	0.175769733616626	0.0589984642956841	2.97922557332537	0.116771269320942	0.0516026590062166	0.0414536083949112	NaN	NaN	0.0602731775160655	0.0527004889941604	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	68	AGA	GAG	ATG	2	AAGAGATGG:AAGAGGTGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.58333333333334	2	35.25	0.192460269414335	0.0589984642956841	3.26212337408947	0.13346180511865	0.0540128744429065	0.042795300047753	NaN	NaN	0.063502136398242	0.0355804400360953	978	1	21	0.021	0.978	0.042
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGGTGGCAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.75	2	35.916666666666664	0.21219469193644	0.0578600049104132	3.66738116018118	0.154334687026027	0.0549674764687783	0.0416029695071814	NaN	NaN	0.0681497963008946	0.0235348411672238	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.58333333333333	3	35.75	0.21273569290826	0.088993157850987	2.39047245929256	0.123742535057273	0.0565909249765607	0.0510983499782422	NaN	NaN	0.0754386725874145	0.100941482192388	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTTGCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.58333333333333	3	35.75	0.21273569290826	0.088993157850987	2.39047245929256	0.123742535057273	0.0553825512017135	0.0531757846518319	NaN	NaN	0.0788030449225664	0.116350900726679	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTTGCCTTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.83333333333333	3	35.166666666666664	0.243941664762153	0.09056213746611	2.69363855124821	0.153379527296043	0.0652159371446674	0.0570738186745359	NaN	NaN	0.0837048536223646	0.0668940650793487	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCCTTGTAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.08333333333333	3	35.083333333333336	0.243007258038148	0.0907908105289243	2.67656227125244	0.152216447509223	0.0634715244426722	0.0555054911361192	NaN	NaN	0.0840333174152308	0.0700817238627156	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	74	TAT	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:TTGTATAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.91666666666666	3	34.583333333333336	0.239944051297493	0.092187504132096	2.60278281266489	0.147756547165397	0.0662591153136561	0.0568306314226474	NaN	NaN	0.0839775194625104	0.0784964564691617	963	1	36	0.036	0.963	0.072
ORF3a	all	ss12	75	AAA	CAA	AGG	2	TATAAAGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.91666666666666	2	33.916666666666664	0.236369452063806	0.0614153696041381	3.8487019387388	0.174954082459668	0.0636614014019282	0.0448591718646593	NaN	NaN	0.0761762341273701	0.0216357953797122	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	76	GGC	AGG	CAT	2	AAAGGCATT:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.41666666666666	2	33.75	0.234622119670259	0.0617314855970427	3.80068805085582	0.172890634073216	0.060655422717163	0.0457789469920291	NaN	NaN	0.0744043976424001	0.0201436435662057	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	77	ATT	CAT	TCA	2	GGCATTCAG:GGTGTTCAC	1:1	FALSE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80	2	33.416666666666664	0.23261619622788	0.062373587449531503	3.72940223161121	0.170242608778348	0.0630546791516685	0.0462641803627608	NaN	NaN	0.0773185664274966	0.0276770726494898	986	0	14	0.014	0.986	0.028
ORF3a	all	ss12	78	CAC	TCA	CTT	2	ATTCAGTTT:GTTCACTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80	2	33.5	0.249858334896404	0.0622118122355632	4.01625231475853	0.187646522660841	0.0691811647142761	0.0452394615140411	NaN	NaN	0.0816207536160518	0.0215046540035941	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	79	TTT	CTT	TGT	2	CACTTTGTT:CAGTTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.83333333333333	2	33	0.229809831868383	0.0631952577133049	3.63650438630935	0.166614574155078	0.0667311757272855	0.0491550520367346	NaN	NaN	0.0752001722372014	0.026717931225624	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	80	GTT	TGT	TTG	2	TTTGTTTGC	2	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80	2	33	0.23261619622788	0.0631952577133049	3.6809122178626	0.169420938514575	0.0682406607747443	0.0470231234975396	NaN	NaN	0.0814707652516766	0.0375686204782114	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	GTTTGCAAC	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.33333333333333	2	33.166666666666664	0.231485400687619	0.0628640039123036	3.68232034680046	0.168621396775316	0.063698982840438	0.0486797891953916	NaN	NaN	0.079924960285295	0.0348802060072172	985	0	15	0.015	0.985	0.03
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CCT	2	TGCAACCTG:TGCAACTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.66666666666666	2	33.833333333333336	0.233758183505998	0.0615730216404005	3.7964383958805	0.172185161865597	0.0677719485533133	0.0467297906335739	NaN	NaN	0.0770866456864067	0.0255056194886597	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	83	CTG	CCT	GCT	2	AACCTGCTG:AACTTGCTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.66666666666666	2	33.833333333333336	0.233758183505998	0.0615730216404005	3.7964383958805	0.172185161865597	0.0665238507873748	0.0450293392273098	NaN	NaN	0.0834593833556375	0.0391030051902335	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GCT	2	CTGCTGCTA:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.91666666666666	2	33.333333333333336	0.229532944197988	0.0625362067042883	3.67040081729563	0.1669967374937	0.066168450770255	0.0476093937896134	NaN	NaN	0.082432066063693	0.0427779990434459	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	85	CTA	GCT	ACT	2	CTGCTACTT:CTGTTGTTG	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.66666666666666	2	33	0.243831358478173	0.0631952577133049	3.85838063331195	0.180636100764868	0.0662866875789078	0.0469619110314168	NaN	NaN	0.0825227948985956	0.028602386858024	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	86	CTT	ACT	GTT	2	CTACTTTTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.16666666666666	2	32.5	0.242080044197288	0.0642103145422439	3.77011148322633	0.177869729655044	0.067652368431832	0.047023222859684403	NaN	NaN	0.0779891382146442	0.0225662794845813	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	87	TTT	GTT	TGT	2	CTTTTTGTG:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.16666666666666	2	31.833333333333332	0.222303024858063	0.0656155905923368	3.38796043518391	0.156687434265726	0.0608716953772546	0.0511959589515874	NaN	NaN	0.0761720429492817	0.0396842787473557	982	0	18	0.018	0.982	0.036
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTGACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.49999999999999	2	31.5	0.221270761080787	0.0663415654213976	3.33532619671075	0.154929195659389	0.0619142138100804	0.0519381512053418	NaN	NaN	0.080249931516456	0.0535345768922573	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AAT	2	GTAACAGTT:GTGACAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.99999999999999	2	32	0.222822803539787	0.0652585327422224	3.41446235728221	0.157564270797565	0.0659882148791065	0.047893252874631	NaN	NaN	0.0816193880311821	0.0535478845102217	980	0	20	0.02	0.98	0.04
ORF3a	all	ss12	90	ATT	AAT	TTA	2	ACAATTTAC:ACAGTTTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.66666666666664	2	32.666666666666664	0.223869741416997	0.0638683562552301	3.50517462078359	0.160001385161767	0.0611823822423377	0.0454617625878043	NaN	NaN	0.0753038291746129	0.0336079510867821	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	ATTTACTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.83333333333331	2	33.333333333333336	0.210181548890314	0.0625362067042883	3.36095775498806	0.147645342186026	0.0624251406542485	0.0471564235951082	NaN	NaN	0.0753445638997858	0.0500423521535739	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TACTCACAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.49999999999997	2	33.666666666666664	0.211174384075759	0.0618907677660026	3.41204983712869	0.149283616309756	0.0633028928720642	0.0466498355673381	NaN	NaN	0.0788666548643359	0.0583763549875828	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCACATCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.16666666666664	2	32.666666666666664	0.212176706271015	0.0638683562552301	3.32209436270939	0.148308350015785	0.0624996347893367	0.0492560073548477	NaN	NaN	0.0776816458422101	0.0562387004170457	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TCT	2	CACCTTTTG:CATCTTCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.99999999999997	2	32.166666666666664	0.212681467874346	0.0649053422482923	3.27679449036326	0.147776125626053	0.0645559110655638	0.0463195847705099	NaN	NaN	0.0797052090128997	0.0637343710368663	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	95	CTA	TCT	ACT	2	CTTCTACTG:CTTTTGCTC	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82.3333333333333	2	31.5	0.208709789830043	0.0663415654213976	3.14598831824862	0.142368224408645	0.0636737042805995	0.0509966750106579	NaN	NaN	0.0761058610063411	0.0613921596323315	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	96	CTC	ACT	CGT	2	CTACTGTTA:TTGCTCGTT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82.0833333333333	2	31.75	0.209443067094397	0.0657955896932053	3.18323869534414	0.143647477401192	0.0632572997742269	0.0494621172927734	NaN	NaN	0.0784735624300314	0.0671721201094263	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	97	GTT	CGT	AGC	2	CTCGTTGCT:CTGTTAGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	83.24999999999997	2	31.416666666666668	0.206064750939693	0.0665255778124882	3.09752666140707	0.139539173127205	0.0620038133954455	0.047957033557178	NaN	NaN	0.0760182356600991	0.0664166429603345	966	0	34	0.034	0.966	0.068
ORF3a	all	ss12	98	GCT	AGC	TGC	2	GTTGCTGCT:TTAGCTGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	83.3333333333333	2	31.166666666666668	0.20582763427632	0.0670837952639451	3.06821689897656	0.138743839012375	0.0617487319393079	0.0489603843806758	NaN	NaN	0.0787211131629614	0.0779894088700202	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	84.0833333333333	2	30.916666666666668	0.203718038135974	0.0676514664202386	3.01128783920979	0.136066571715735	0.0608143365370119	0.0524491549863518	NaN	NaN	0.0776029938669367	0.0795389362495969	966	0	34	0.034	0.966	0.068
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CAT	2	GCTGGCATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	85.0833333333333	2	30.916666666666668	0.200972001243735	0.0676514664202386	2.97069689510251	0.133320534823496	0.0587020781401704	0.0515407914195949	NaN	NaN	0.0735940535694945	0.0700531782697793	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CAT	GGA	2	GGCATGGAG:GGCCTTGAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	84.74999999999997	2	31.916666666666668	0.201879034260684	0.0654365742860851	3.0851100697613	0.136442459974599	0.0609778979771779	0.04711262786684	NaN	NaN	0.0750294216313671	0.0689847819624232	963	1	36	0.036	0.963	0.072
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAGGCA:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	83.74999999999997	2	31.916666666666668	0.189125752990118	0.0654365742860851	2.89021476221035	0.123689178704033	0.0609090869143705	0.049778099835288	NaN	NaN	0.0749620520115896	0.0989380443756376	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	103	GCA	AGC	ACA	2	GAAGCCCCT:GAGGCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	84.41666666666663	2	31.25	0.187428887552107	0.0668966841033532	2.80176648610169	0.120532203448754	0.0613385933650011	0.0511256388982338	NaN	NaN	0.0736345068584412	0.101651708871623	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	104	CAA	ACA	ATT	2	GCACAATTT:GCCCCTTTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	85.24999999999997	2	30.916666666666664	0.185350365139014	0.0676514664202386	2.73978340672841	0.117698898718775	0.0561991834903541	0.0529964081983959	NaN	NaN	0.074787691593162	0.115539786819889	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	85.24999999999997	2	30.583333333333332	0.170479989533073	0.0684234871721278	2.49154196283813	0.102056502360945	0.0549351728755185	0.0503472803078425	NaN	NaN	0.0815524491580547	0.210780674148779	908	0	92	0.092	0.908	0.184
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	84.74999999999997	2	31.083333333333332	0.171610109242551	0.0672719567702241	2.5509903008873	0.104338152472327	0.0539195285786125	0.0484165367471424	NaN	NaN	0.0848219902724975	0.218665741905557	889	0	111	0.111	0.889	0.222
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CAT	2	CTCTATCTT:TTGTACATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.66666666666663	2	31	0.157093573671717	0.0674611774972046	2.32865152225109	0.0896323961745121	0.0549140683410456	0.0528723554385308	NaN	NaN	0.0788871340340965	0.25586844442107	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	108	ATC	CAT	CTA	2	TACATCTAT:TATCTTTAT	1:1	TRUE	1.5	0.5	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.49999999999996	2	30.666666666666668	0.155392217528976	0.068228833654295	2.27751537299208	0.0871633838746812	0.0544508568967166	0.0526721840367834	NaN	NaN	0.0751805919410515	0.246298565896236	890	0	110	0.11	0.89	0.22
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	ATCTATGCC:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.33333333333329	2	31	0.141443377355663	0.0674611774972046	2.09666333442703	0.073982199858458	0.0510655229542115	0.0524735588936568	NaN	NaN	0.0763957397951506	0.332840944462095	827	0	173	0.173	0.827	0.346
ORF3a	all	ss12	110	GCC	TGC	CCT	2	TATGCCCTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.99999999999996	2	31.333333333333332	0.14205405876177	0.0667106145123721	2.12940713858099	0.0753434442493977	0.0507752890116572	0.0506591020574108	NaN	NaN	0.0766658129336278	0.325729747046405	844	0	156	0.156	0.844	0.312
ORF3a	all	ss12	111	CTG	CCT	AGT	2	GCCCTGATT:GCTTTAGTC	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.99999999999996	2	31.333333333333332	0.14205405876177	0.0667106145123721	2.12940713858099	0.0753434442493977	0.0520264023198256	0.0518152411269532	NaN	NaN	0.0749728104612827	0.314924020004185	854	0	146	0.146	0.854	0.292
ORF3a	all	ss12	112	ATT	AGT	CTA	2	CTGATTTAC:TTAGTCTAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	86.66666666666663	2	30.666666666666664	0.139052417498522	0.068228833654295	2.03803011206493	0.0708235838442271	0.0522799942783711	0.0495449154798568	NaN	NaN	0.0769286970736772	0.357238763096796	830	1	169	0.169	0.83	0.338
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CAT	2	ATTTACATT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.16666666666663	2	30.666666666666664	0.124508770514841	0.068228833654295	1.82487027619008	0.0562799368605456	0.0492169723549482	0.0544546518854149	NA	NA	0.0789052132133962	0.475684849325014	787	0	213	0.213	0.787	0.426
ORF3a	all	ss12	114	ATT	CAT	CTT	2	TACATTCTG:TACTTCTTG	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	87.24999999999997	2	30.75	0.138031675513526	0.0680352852661241	2.02882482190831	0.0699963902474015	0.0502675519396104	0.0518174264767465	NaN	NaN	0.0752229951671388	0.352102678953333	833	0	167	0.167	0.833	0.334
ORF3a	all	ss12	115	CTG	CTT	GCA	2	ATTCTGCAA:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.08333333333331	2	30.416666666666664	0.124638389543236	0.0688161477015357	1.81117940637725	0.0558222418417007	0.0485820328608585	0.0546822790937014	NaN	NaN	0.0769117807549286	0.467964006714533	782	0	218	0.218	0.782	0.436
ORF3a	all	ss12	116	CAA	GCA	AAT	2	CTGCAAATC:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	88.08333333333331	2	29.749999999999996	0.123100592858581	0.0704329495874262	1.74776995113317	0.0526676432711549	0.0478830795679765	0.0538274580114341	NaN	NaN	0.076890191956774	0.493361469253303	778	0	222	0.222	0.778	0.444
ORF3a	all	ss12	117	AGT	AAT	CCT	2	CAAATCCTA:CAGAGTATA	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	87.83333333333331	2	29.416666666666664	0.137025851599643	0.0712702003524607	1.92262475651806	0.0657556512471826	0.0503467216692699	0.0555330241595956	NaN	NaN	0.0779545787716759	0.398941952245195	817	0	183	0.183	0.817	0.366
ORF3a	all	ss12	118	ATA	CCT	AAA	2	AGTATAAAC:ATCCTAAGC	1:1	FALSE	1.08333333333333	0.916666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.66666666666664	2	29.416666666666664	0.123736695538234	0.0712702003524607	1.73616314990424	0.0524664951857736	0.046948046866508	0.0575922436998317	NaN	NaN	0.0785000604942021	0.503902238850588	768	0	232	0.232	0.768	0.464
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT:CTAAGCTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	88.08333333333331	2	28.916666666666664	0.109840578956452	0.0725641058409196	1.51370402327085	0.0372764731155322	0.0454553179027822	0.0549042590142182	NaN	NaN	0.0744048983528148	0.616374726326883	697	0	303	0.303	0.697	0.606
ORF3a	all	ss12	120	TTT	CTT	TGT	2	AACTTTGTA:AGCTTTTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.166666666666667	1	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.24999999999999	1	29.25	0.124379421420718	0.0349917687305995	3.55453370700724	0.0893876526901185	0.0489265774965827	0.037065715165242	NaN	NaN	0.0634122563626749	0.158649738426793	932	0	68	0.068	0.932	0.136
ORF3a	all	ss12	121	GTA	TGT	AAG	2	TTTGTAAGA:TTTTGCAGA	1:1	TRUE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	86.91666666666664	1	28.916666666666664	0.124898440797609	0.0354048034273472	3.52772586504847	0.0894936373702622	0.0493191873769073	0.0386172307829437	NaN	NaN	0.0626043465576515	0.152857253570562	935	0	65	0.065	0.935	0.13
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGCAGATTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	85.83333333333331	1	29.5	0.0995246708707934	0.0346882632380668	2.86911657086295	0.0648364076327266	0.0397664456861272	0.036627814639691	NaN	NaN	0.0562438541591507	0.249003488006417	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGATTCATC	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	85.66666666666664	1	29.5	0.0997317620180998	0.0346882632380668	2.87508663473974	0.065043498780033	0.0421672244525696	0.0378104391208332	NaN	NaN	0.054516180326834	0.23282845863981	896	1	103	0.103	0.896	0.206
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:TTCATCATG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	84.33333333333331	1	29	0.0879668148923251	0.0353006331434893	2.49193306348811	0.0526661817488358	0.0387312810880017	0.0370026649434238	NA	NA	0.0535756474508392	0.325595309948363	840	0	160	0.16	0.84	0.32
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATCATGAGA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	84.33333333333331	1	28.666666666666664	0.0879668148923251	0.0357210367419409	2.46260531372095	0.0522457781503842	0.0377198517785839	0.0381484896687596	NaN	NaN	0.0560272824749595	0.351075077400592	837	2	161	0.161	0.837	0.322
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGC:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	83.33333333333331	1	28.666666666666664	0.0890876519924752	0.0357210367419409	2.49398282127336	0.0533666152505343	0.039781740664805	0.0366145399590106	NaN	NaN	0.058369082454189	0.36056136209543	832	0	168	0.168	0.832	0.336
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	CTG	2	AGATGCTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.74999999999997	1	29	0.0897547785817449	0.0353006331434893	2.54258268447797	0.0544541454382556	0.0396826571411802	0.0367453215215228	NaN	NaN	0.0560880730496947	0.331613747502816	840	1	159	0.159	0.84	0.318
ORF3a	all	ss12	128	TGG	CTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGCTGGCTG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.99999999999997	2	29.166666666666668	0.0894676462102162	0.0719113287774619	1.2441384094999	0.0175563174327543	0.0400398274701233	0.0547405872729377	NA	NA	0.052763183478521	0.739332044118913	647	0	353	0.353	0.647	0.706
ORF3a	all	ss12	129	CTG	GCT	GTG	2	TGGCTGTGC:TGGCTTTGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.49999999999997	2	29.666666666666668	0.0912185711042867	0.0706404112947758	1.2913086069621	0.0205781598095109	0.0398707415561286	0.0511839431624149	NA	NA	0.0507629987643539	0.685200303788202	700	0	300	0.3	0.7	0.6
ORF3a	all	ss12	130	TGC	GTG	CTG	2	CTGTGCTGG:CTTTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	82.49999999999997	2	29.333333333333332	0.117889187641809	0.0714826348532437	1.6492003671079	0.0464065527885656	0.0492469704769155	0.0534418615190555	NaN	NaN	0.0595833382713538	0.436067390353776	785	0	215	0.215	0.785	0.43
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGCTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.83333333333331	3	29.333333333333332	0.118929905904287	0.109952605643907	1.08164699879378	0.0089773002603806	0.0492051496815242	0.0683077975838096	NaN	NaN	0.0744855055536635	0.904067971246032	565	0	435	0.435	0.565	0.87
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.83333333333331	3	28.916666666666668	0.133388184973715	0.11166090491713	1.19458269725389	0.021727280056585	0.050909828738849	0.0720900084497461	NA	NA	0.0750878372235506	0.772307292869667	644	0	356	0.356	0.644	0.712
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAG	2	AAATGCCGT:AAGTGCAGA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.83333333333331	3	29.750000000000004	0.15015945768772	0.10829587866142	1.38656668696676	0.0418635790262994	0.0572800596077855	0.0663684015554406	NaN	NaN	0.0816464812555443	0.608131815225546	711	0	289	0.289	0.711	0.578
ORF3a	all	ss12	134	AGA	CAG	ATC	2	TGCAGATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.916666666666667	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.91666666666664	3	29.583333333333336	0.149988265227745	0.108952531416164	1.37663864508882	0.0410357338115808	0.0530008468261939	0.0712132950342867	NaN	NaN	0.0751564313702868	0.585062989556454	717	1	282	0.282	0.717	0.564
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AGATCCAAA:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.49999999999997	3	29.916666666666668	0.135810068779417	0.107647107231784	1.26162302240964	0.0281629615476338	0.0529787359855122	0.066322489675388	NaN	NaN	0.0754581475585453	0.708980059717664	662	0	338	0.338	0.662	0.676
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAAAAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.66666666666664	3	30.416666666666668	0.135502521566611	0.105746684778908	1.28138789267877	0.029755836787703	0.0540949309164963	0.0649335825609535	NaN	NaN	0.0747949959334182	0.690754086912727	686	0	314	0.314	0.686	0.628
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAAAATCCG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.49999999999997	3	30.416666666666668	0.135810068779417	0.105746684778908	1.28429623172929	0.030063384000509102	0.0535923210887716	0.0641269480255816	NaN	NaN	0.0707315688311442	0.670811246634608	699	0	301	0.301	0.699	0.602
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA:AATCCGTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.16666666666664	3	30.083333333333336	0.136429382099394	0.107006075844546	1.27496855690319	0.0294233062548483	0.0531062926180794	0.0685212666085414	NaN	NaN	0.0751339577592539	0.695345443371222	668	0	332	0.332	0.668	0.664
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTT:CCGTTGCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.16666666666664	3	29.083333333333336	0.134588203229996	0.110971243090164	1.21282054235117	0.0236169601398326	0.0547788885496347	0.068480478622475	NaN	NaN	0.0760897942889614	0.756269904944422	620	0	380	0.38	0.62	0.76
ORF3a	all	ss12	140	CTC	ACT	CTA	2	TTACTTTAT:TTGCTCTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.49999999999999	3	28.416666666666668	0.133985500074053	0.113782401199837	1.17755908348896	0.0202030988742157	0.0521376085023896	0.0691471490314584	NaN	NaN	0.081447197428036	0.804094566278651	635	0	365	0.365	0.635	0.73
ORF3a	all	ss12	141	TAT	CTA	TGA	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.83333333333331	3	28.083333333333336	0.148130674385878	0.115242181679947	1.28538589105567	0.0328884927059309	0.0550711857785847	0.0735973900834604	NaN	NaN	0.0820963286331646	0.688708336027756	663	0	337	0.337	0.663	0.674
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC:TATGATGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.08333333333331	3	28.416666666666668	0.147632043085198	0.113782401199837	1.29749452928059	0.0338496418853608	0.0529900718648797	0.0688173524895533	NaN	NaN	0.0860385782089942	0.694006343926278	688	0	312	0.312	0.688	0.624
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC:GATGCTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.08333333333331	3	29.083333333333336	0.160431369407456	0.110971243090164	1.44570219220764	0.0494601263172927	0.0564567426272898	0.0714882439798204	NaN	NaN	0.0814195917868891	0.543537686022438	738	0	262	0.262	0.738	0.524
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAT:GCTAACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.58333333333331	3	28.583333333333336	0.157265768099113	0.11306631811959	1.39091615181785	0.0441994499795234	0.05275799612088	0.0702166897105245	NaN	NaN	0.0803842329314329	0.582420729228506	732	0	268	0.268	0.732	0.536
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	83.91666666666666	3	29.250000000000004	0.188698647545819	0.110290063467372	1.71093062795855	0.078408584078447	0.0644595516639345	0.0703012567382605	NaN	NaN	0.085855381767889	0.361103988596308	823	1	176	0.176	0.823	0.352
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTA:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	84.08333333333333	3	29.083333333333336	0.1882734769284	0.110971243090164	1.69659698932479	0.0773022338382369	0.0639061608958725	0.0670037011901247	NaN	NaN	0.0900137336581994	0.390460434663795	809	0	191	0.191	0.809	0.382
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	ATG	2	TTTCTTTGC:TTTGTATGT	1:1	TRUE	1.25	0.833333333333333	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	83.91666666666666	3	28.583333333333336	0.188698647545819	0.11306631811959	1.66892006995605	0.0756323294262294	0.0653597854070489	0.070376555190111	NaN	NaN	0.0928654653908368	0.415399222801009	812	0	188	0.188	0.812	0.376
ORF3a	all	ss12	148	TGC	ATG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTATGTTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.166666666666667	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	84.24999999999999	3	28.250000000000004	0.172755378805282	0.114507630156718	1.50868006410441	0.0582477486485641	0.0640425546609986	0.0757768585795257	NaN	NaN	0.0854836169333781	0.495624253611374	751	0	249	0.249	0.751	0.498
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT:TGTTGGCAC	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	83.83333333333333	3	28.666666666666668	0.173721564907407	0.112711652287003	1.54129197276827	0.0610099126204033	0.0605374883466274	0.0700921183277166	NaN	NaN	0.0904779763158406	0.500116296215519	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	150	CAC	GCA	CAC	2	TGGCACACC:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	83.33333333333333	3	28.833333333333336	0.174895415375783	0.11200896641424	1.5614412039923	0.0628864489615436	0.0632132200999012	0.0703492936330938	NaN	NaN	0.0876901334141135	0.473285277443113	763	0	237	0.237	0.763	0.474
ORF3a	all	ss12	151	ACC	CAC	CAA	2	CACACCAAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	82.91666666666666	4	28.833333333333336	0.175885866555892	0.153398778089708	1.14659235716359	0.0224870884661842	0.0616758956609027	0.0853752401230399	NaN	NaN	0.0988781900840564	0.820095514874853	581	0	419	0.419	0.581	0.838
ORF3a	all	ss12	152	AAT	CAA	TTG	2	ACCAATTGC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	83.08333333333333	4	28.666666666666668	0.175488336836973	0.154389040653112	1.13666317307631	0.0210992961838615	0.0598872995243228	0.082658950713639	NaN	NaN	0.0992031595994263	0.831570527156397	626	0	374	0.374	0.626	0.748
ORF3a	all	ss12	153	TGC	TTG	CTT	2	AATTGCTTT:AATTGTTAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.25	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	82.33333333333333	4	28.750000000000004	0.177291583548173	0.15389231077321	1.1520496550958	0.0233992727749624	0.0632379111184832	0.0806526713621892	NaN	NaN	0.101218360279101	0.817177942879492	604	0	396	0.396	0.604	0.792
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTT	CGA	2	TGCTTTGAT:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.83333333333333	4	29.08333333333334	0.194180942034071	0.151937056450332	1.27803543500626	0.0422438855837382	0.0650514633802032	0.0818857464977722	NaN	NaN	0.100521030376173	0.67430339461819	678	0	322	0.322	0.678	0.644
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TTTGATTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	82.33333333333333	3	29.41666666666667	0.192836181436011	0.109617210244414	1.75917797037567	0.0832189711915967	0.0652881273658226	0.0703779555900306	NaN	NaN	0.0890329036676445	0.349943412489464	828	0	172	0.172	0.828	0.344
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTATTGT:GATTACTGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82.83333333333333	3	28.58333333333334	0.207258628986463	0.11306631811959	1.83307135523106	0.0941923108668734	0.065297937376356	0.0709507253977478	NaN	NaN	0.0904562787838491	0.297735373620903	853	0	147	0.147	0.853	0.294
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	83.16666666666667	3	28.250000000000004	0.206302418001819	0.114507630156718	1.80164778294222	0.091794787845101	0.0666398504776699	0.0697883526377868	NaN	NaN	0.0933075767631865	0.325220216570131	840	1	159	0.159	0.84	0.318
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	83.33333333333334	3	28.250000000000004	0.20582763427632	0.114507630156718	1.79750147649217	0.0913200041196019	0.0673376635183756	0.0721664826561596	NaN	NaN	0.0899869565285706	0.310194600524157	837	0	163	0.163	0.837	0.326
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAC:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	83.66666666666667	3	27.583333333333336	0.204884633313866	0.117503608300369	1.74364546142386	0.0873810250134966	0.0686640809134571	0.0719017943964599	NaN	NaN	0.0864743385235631	0.312262965496639	848	0	152	0.152	0.848	0.304
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATACAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	84	3	27.583333333333336	0.203950286612731	0.117503608300369	1.73569381879221	0.0864466783123624	0.0665887696116261	0.0707358407708382	NaN	NaN	0.0926174826249916	0.350627300540401	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAACAGT:TACAATAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	84.66666666666667	3	27.416666666666668	0.233690694979001	0.11827731107372	1.97578633516066	0.115413383905282	0.071428333291489	0.0709473067653462	NaN	NaN	0.101292906630713	0.254535343112709	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TAT	2	AACAGTATC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83	3	28.083333333333336	0.239216898899161	0.115242181679947	2.07577551389576	0.123974717219214	0.0728487351735236	0.0713751350923631	NaN	NaN	0.0950942407484194	0.192334614109262	908	0	92	0.092	0.908	0.184
ORF3a	all	ss12	163	ATC	TAT	AAC	2	AGTATCACT:AGTGTAACT	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82	3	28.41666666666667	0.242660989230208	0.113782401199837	2.13267593820612	0.128878588030371	0.0719888644905782	0.0692137702793663	NaN	NaN	0.0969088668860303	0.183552969357111	902	0	98	0.098	0.902	0.196
ORF3a	all	ss12	164	ACT	AAC	TGA	2	ATCACTGAC:GTAACTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.25	3	28.66666666666667	0.225192434762777	0.112711652287003	1.99795167751918	0.112480782475774	0.0720761852867327	0.0694160639384293	NaN	NaN	0.0908659966322919	0.215762262866817	903	0	97	0.097	0.903	0.194
ORF3a	all	ss12	165	GAC	TGA	CAC	2	ACTGACACA:ACTTCTTCA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.25	3	29.58333333333334	0.2284320849576	0.108952531416164	2.0966202619475	0.119479553541436	0.073537329920149	0.0683869359552719	NaN	NaN	0.0925280475338844	0.196606841734079	898	0	102	0.102	0.898	0.204
ORF3a	all	ss12	166	ACA	CAC	AAT	2	GACACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.91666666666667	3	29.91666666666667	0.246506794543136	0.107647107231784	2.28995279931083	0.138859687311352	0.0758354552063353	0.0668491467395854	NaN	NaN	0.09784480301444	0.155845652266215	910	0	90	0.09	0.91	0.18
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.83333333333334	3	30.000000000000004	0.229809831868383	0.107325632730505	2.14123901272901	0.122484199137878	0.0710944500014426	0.0660660927299097	NaN	NaN	0.0899622376104582	0.173353582962806	925	0	75	0.075	0.925	0.15
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:ATTGTCCTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.50000000000001	3	30.000000000000004	0.230924148132868	0.107325632730505	2.15162158617521	0.123598515402363	0.0723622874126936	0.0659006925443064	NaN	NaN	0.0920552533367128	0.179383468581246	913	0	87	0.087	0.913	0.174
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	CAC	2	GTCATTACT:GTCCTCACG	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.66666666666669	3	30.500000000000004	0.230365631898451	0.105436462965892	2.18487632663638	0.124929168932559	0.0717644977495504	0.0649575306022319	NaN	NaN	0.0883495327308457	0.157352166535193	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	170	ACG	CAC	GTC	2	ATTACTTCA:CTCACGTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.33333333333336	3	30.58333333333334	0.214724926668622	0.105128058952294	2.04250824003191	0.109596867716328	0.073379710343090307	0.0639281848073998	NaN	NaN	0.0874668217420035	0.210201795294079	900	0	100	0.1	0.9	0.2
ORF3a	all	ss12	171	TCA	GTC	AGG	2	ACGTCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.9166666666667	3	30.33333333333334	0.246506794543136	0.106058740537371	2.32424780168189	0.140448054005764	0.0793500654282217	0.0652554100514514	NaN	NaN	0.0964116558132665	0.145184330010258	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	TCAGGTGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.25000000000003	3	30.000000000000004	0.245310434390387	0.107325632730505	2.28566492597683	0.137984801659882	0.0755388182530355	0.0656735528121352	NaN	NaN	0.0964106969082653	0.15236751794798	930	0	70	0.07	0.93	0.14
ORF3a	all	ss12	173	GAT	TGA	TGG	2	GGTGATGGA:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.91666666666669	3	30.000000000000004	0.242952517757944	0.107325632730505	2.26369518238014	0.135626885027439	0.075785147759302507	0.0629968124767332	NaN	NaN	0.097749891636671	0.165292747839741	920	0	80	0.08	0.92	0.16
ORF3a	all	ss12	174	GGA	TGG	AAC	2	GATGGAACT:GATGGCACA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.91666666666669	3	30.33333333333334	0.239500136249871	0.106058740537371	2.25818386147514	0.1334413957125	0.0785610594687257	0.0662418790348175	NaN	NaN	0.0946594632147274	0.158628439473311	922	0	78	0.078	0.922	0.156
ORF3a	all	ss12	175	ACA	AAC	AAC	2	GGAACTACT:GGCACAACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.91666666666669	3	30.33333333333334	0.239500136249871	0.106058740537371	2.25818386147514	0.1334413957125	0.0767904777234333	0.0657221076659214	NaN	NaN	0.0958258437686781	0.163758700134768	909	0	91	0.091	0.909	0.182
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAG	2	ACAACAAGT:ACTACTCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.75000000000001	4	30.500000000000004	0.240068645070168	0.144154737019872	1.66535384152567	0.0959139080502951	0.0808622276109016	0.0785474568475754	NaN	NaN	0.106638638652489	0.368424078664475	807	0	193	0.193	0.807	0.386
ORF3a	all	ss12	177	AGT	AAG	GCC	2	ACAAGTCCT:ACTCAGCCA	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.00000000000001	4	29.83333333333334	0.242660989230208	0.147714914296514	1.64276566375082	0.0949460749336942	0.0806273438537079	0.081981324856498	NaN	NaN	0.111337084310053	0.393781136730685	795	0	205	0.205	0.795	0.41
ORF3a	all	ss12	178	CCA	GCC	AAA	2	AGTCCTATT:CAGCCAAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.00000000000001	3	29.83333333333334	0.225993636641676	0.107970516691131	2.09310507689956	0.118023119950544	0.0688433773509984	0.0662980107321609	NaN	NaN	0.105061886239723	0.261281400541646	864	0	136	0.136	0.864	0.272
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTA:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.50000000000001	4	29.33333333333334	0.22439693588559	0.150503021596613	1.49097960629011	0.0738939142889766	0.0737187078539466	0.082311226897995	NaN	NaN	0.11506482061403	0.520747358722098	752	0	248	0.248	0.752	0.496
ORF3a	all	ss12	180	CTA	ACT	AAA	2	AAACTAAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.16666666666667	1.16666666666667	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.66666666666669	4	29.66666666666667	0.194633396613813	0.148632696437812	1.30949246887443	0.0460007001760019	0.0597418953827379	0.0840691281226141	NaN	NaN	0.107988396838779	0.670123749591488	672	0	328	0.328	0.672	0.656
ORF3a	all	ss12	181	AAA	AAA	ACA	2	CTAAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	82.33333333333336	3	29.833333333333336	0.19283618143601	0.107970516691131	1.7860077671727	0.0848656647448792	0.0636384167037038	0.0692103100950109	NaN	NaN	0.0998709198675546	0.395462141364855	805	0	195	0.195	0.805	0.39
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	82.00000000000001	3	30.250000000000004	0.178105032651776	0.106372646579413	1.67434992339699	0.0717323860723627	0.0628172814074508	0.0681191343897058	NaN	NaN	0.0972739289859106	0.460862943346202	779	0	221	0.221	0.779	0.442
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.66666666666669	3	29.416666666666668	0.161333534712709	0.109617210244414	1.47179019018075	0.0517163244682952	0.0584468855428144	0.0672920158383111	NaN	NaN	0.093051730024763	0.57836100993914	732	0	268	0.268	0.732	0.536
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.33333333333336	3	30.083333333333332	0.164290174547013	0.107006075844546	1.53533501018847	0.0572840987024676	0.0582276970493055	0.0698168810672181	NaN	NaN	0.0921641350871353	0.534241514416732	741	0	259	0.259	0.741	0.518
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.00000000000003	4	29.416666666666668	0.160610991304224	0.150031026615648	1.07051851158547	0.0105799646885754	0.0576473110818785	0.0901772305353569	NaN	NaN	0.109254625123888	0.922855298318767	546	0	454	0.454	0.546	0.908
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.66666666666669	4	28.75	0.159185220067497	0.153892310773211	1.03439359164661	0.00529290929428686	0.0573596346706522	0.087729314772632	NaN	NaN	0.11389488021113	0.9629341457535	544	0	456	0.456	0.544	0.912
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	83.16666666666669	4	29.083333333333332	0.175290248137798	0.151937056450332	1.15370306779044	0.0233531916874651	0.0603270139123842	0.0890175926865276	NaN	NaN	0.115588588968933	0.839887663912782	611	0	389	0.389	0.611	0.778
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	82.66666666666669	4	29.583333333333332	0.176485565200849	0.149095891727942	1.18370508506622	0.0273896734729062	0.0586172466631327	0.0870503393322032	NaN	NaN	0.11098324256283	0.805069919868165	582	0	418	0.418	0.582	0.836
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.66666666666669	4	30.083333333333332	0.18143524049715	0.146359364647636	1.23965583571615	0.0350758758495142	0.0615749156428134	0.0820077074750225	NaN	NaN	0.108663484455682	0.746851570598746	642	0	358	0.358	0.642	0.716
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	CGA	2	TATACTGAA:TATTCCGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	0.666666666666667	0.5	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.33333333333336	4	30.083333333333332	0.195544696847439	0.146359364647636	1.33605866162523	0.0491853321998035	0.0629713118842334	0.0867411755027685	NaN	NaN	0.11419358901989	0.666672805526461	644	0	356	0.356	0.644	0.712
ORF3a	all	ss12	191	GAA	CGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCCGAGTAT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.25000000000001	5	30.166666666666668	0.195773864425284	0.187302855665743	1.04522626592869	0.00847100875954115	0.0619943268490515	0.095930467017948	NaN	NaN	0.119106826951403	0.943301373922008	549	0	451	0.451	0.549	0.902
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGTATTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.166666666666667	0.666666666666667	0.5	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.66666666666669	5	29.166666666666668	0.200233049317567	0.194633396613813	1.02877025629299	0.00559965270375384	0.0700018642539768	0.101086904895692	NaN	NaN	0.12674230258636	0.964759806109494	540	0	460	0.46	0.54	0.92
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:TATTGGCAT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.50000000000001	5	29.66666666666667	0.200714352979387	0.19089739885116	1.05142529016795	0.00981695412822695	0.0632974571928415	0.0956012528555291	NaN	NaN	0.123272151372515	0.936526419785599	542	1	457	0.457	0.542	0.914
ORF3a	all	ss12	194	CAT	GCA	ATC	2	TGGCATTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.16666666666669	5	30.66666666666667	0.20465023999998	0.183841843524739	1.11318640020296	0.0208083964752414	0.0670598476111806	0.0908033885234732	NaN	NaN	0.121932851848985	0.864495399006645	555	0	445	0.445	0.555	0.89
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CATTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.00000000000001	5	30.16666666666667	0.172180831233375	0.187302855665743	0.919264314584961	-0.0151220244323679	0.0581259782452512	0.0969725793014602	NaN	NaN	0.11704511853255	0.897200781262068	458	0	542	0.542	0.458	0.916
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTA:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.50000000000001	5	30.333333333333336	0.170949051034505	0.186134722106651	0.918415699659493	-0.0151856710721458	0.0574132330831415	0.0949918779090405	NaN	NaN	0.113222834758595	0.893306117099558	478	0	522	0.522	0.478	0.956
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTAAAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.66666666666669	5	30.500000000000004	0.170542381646746	0.184981141936135	0.92194469047891	-0.0144387602893897	0.0567275619385906	0.0936137800934926	NaN	NaN	0.111269139378862	0.896752920556886	451	1	548	0.548	0.451	0.902
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTAAAGGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.5	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.75000000000003	5	31.083333333333336	0.170339774770387	0.181054357970061	0.940821180336095	-0.0107145831996743	0.059315045509843	0.0978705450883571	NaN	NaN	0.111374934263972	0.923359487987922	479	0	521	0.521	0.479	0.958
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTGT:AAGGACTAT	1:1	FALSE	2	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.50000000000003	5	30.833333333333336	0.170949051034505	0.182716561993313	0.935596911246402	-0.0117675109588077	0.055044633469419	0.0966692817040928	NaN	NaN	0.108717239672534	0.913805630117343	473	0	527	0.527	0.473	0.946
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTA:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.6666666666667	5	30.5	0.170542381646746	0.184981141936135	0.92194469047891	-0.0144387602893897	0.0572310940615686	0.0933818123976171	NaN	NaN	0.108976821780545	0.894593675439776	425	0	575	0.575	0.425	0.85
ORF3a	all	ss12	201	GTA	TGT	AGT	2	TATGTAGTA:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.75000000000003	4	30.833333333333332	0.170339774770387	0.142438427764417	1.195883564877	0.0279013470059698	0.0560769461047326	0.0842952798671556	NaN	NaN	0.100262118142087	0.780794328885826	615	0	385	0.385	0.615	0.77
ORF3a	all	ss12	202	GTA	AGT	AAT	2	GTAGTAATA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.25000000000003	4	31.333333333333332	0.171562720556584	0.139939466685309	1.22597809338797	0.0316232538712749	0.0582699574304356	0.0806067787947859	NaN	NaN	0.1029741523866	0.758768058402156	651	0	349	0.349	0.651	0.698
ORF3a	all	ss12	203	ATA	AAT	ACA	2	GTAATACAT:GTATTACAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.6666666666667	4	31.916666666666664	0.173011971365532	0.137132914796851	1.26163708852708	0.0358790565686807	0.058760249255911	0.0783830157096849	NaN	NaN	0.0990623090224655	0.717212474185235	657	0	343	0.343	0.657	0.686
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	ATACATGGT:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.1666666666667	4	32.08333333333333	0.158100771086867	0.136351658368326	1.15950750419031	0.021749112718541	0.0559022092875651	0.07636604986034	NaN	NaN	0.092811958704557	0.814724729020775	621	0	379	0.379	0.621	0.758
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	TTA	2	CACAGTTAC:CATGGTTAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.6666666666667	4	31.749999999999996	0.159249476407495	0.137923200937065	1.15462427876918	0.0213262754704302	0.0560225008121429	0.0818386907536491	NaN	NaN	0.0972225451532587	0.826373328251281	605	0	395	0.395	0.605	0.79
ORF3a	all	ss12	206	TAC	TTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGTTATTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.1666666666667	4	31.916666666666664	0.144328652584645	0.137132914796851	1.05247272544636	0.00719573778779437	0.0536458435558282	0.0842872364995781	NaN	NaN	0.0989977451979048	0.942056088489865	527	0	473	0.473	0.527	0.946
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.00000000000003	4	32.08333333333333	0.144677749593369	0.136351658368326	1.06106336603953	0.00832609122504224	0.0537079266929119	0.0813150943680119	NaN	NaN	0.0936897390894988	0.929186208760403	544	0	456	0.456	0.544	0.912
ORF3a	all	ss12	208	ACT	CAC	TGA	2	TTCACTGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.33333333333336	4	31.749999999999996	0.143981241370948	0.137923200937065	1.04392328768999	0.00605804043388267	0.0537072845092931	0.0816467115783686	NaN	NaN	0.0924710109930979	0.947765667218068	518	0	482	0.482	0.518	0.964
ORF3a	all	ss12	209	GAA	TGA	AAT	2	ACTGAAATC:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.66666666666669	4	32.416666666666664	0.145381050470112	0.134815620966532	1.07836947549426	0.0105654295035803	0.0548204653685605	0.0745983010910801	NaN	NaN	0.0938329105240595	0.910349005045868	532	0	468	0.468	0.532	0.936
ORF3a	all	ss12	210	ATC	AAT	CTA	2	GAAATCTAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.166666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.00000000000003	4	31.749999999999996	0.144677749593369	0.137923200937065	1.04897325910661	0.00675454865630332	0.0542608329665905	0.0786536877508269	NaN	NaN	0.0984992187434518	0.945328204142432	529	0	471	0.471	0.529	0.942
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	ATCTACTAC:GACTATTAC	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.50000000000003	4	31.749999999999996	0.112623333869567	0.137923200937065	0.816565545929852	-0.0252998670674979	0.044084332023065	0.0784811002224452	NaN	NaN	0.0893623855850507	0.777088380904739	400	0	600	0.6	0.4	0.8
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.1666666666667	4	31.749999999999996	0.126764620575651	0.137923200937065	0.919095697565011	-0.0111585803614141	0.0476105768807656	0.0797896380526378	NaN	NaN	0.0862627490146682	0.897076180310971	477	0	523	0.523	0.477	0.954
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.83333333333337	4	32.08333333333333	0.127364024533652	0.136351658368326	0.934084895319744	-0.00898763383467474	0.0466123720571987	0.0765478621204753	NaN	NaN	0.0909480060158253	0.92127986256349	471	0	529	0.529	0.471	0.942
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	AGA	2	CAGCTGTAC:CAGTTAGAA	1:1	TRUE	0.666666666666667	1.08333333333333	1.25	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.1666666666667	4	31.416666666666664	0.126764620575651	0.139531497680893	0.908501827061015	-0.012766877105242	0.0491609968034651	0.0788616723940515	NaN	NaN	0.093276496749858	0.891132509877369	479	0	521	0.521	0.479	0.958
ORF3a	all	ss12	215	GAA	AGA	ATC	2	CTGTACTCA:TTAGAATCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.1666666666667	4	30.499999999999996	0.124999865819317	0.144154737019872	0.867122845932456	-0.0191548712005558	0.0474366440633128	0.081589966050342	NaN	NaN	0.0969303574857645	0.84334647064151	429	0	571	0.571	0.429	0.858
ORF3a	all	ss12	216	TCA	ATC	AAC	2	GAATCGACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.50000000000003	4	29.83333333333333	0.112623333869567	0.147714914296514	0.762437120218572	-0.0350915804269467	0.0458345935707681	0.086283587497149	NaN	NaN	0.0948275241001324	0.711340088373871	351	0	649	0.649	0.351	0.702
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCGACACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.9166666666667	4	29.08333333333333	0.113557650951866	0.151937056450333	0.747399308666926	-0.0383794054984662	0.0458417946946852	0.0862217767440831	NaN	NaN	0.0963025054123777	0.690239793741983	346	0	654	0.654	0.346	0.692
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	ACT	2	ACACAACTA:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.25000000000003	4	29.749999999999996	0.114644643047729	0.148172379571929	0.773724788512799	-0.0335277365242001	0.045207788258946	0.0858714981151959	NaN	NaN	0.0950279209185351	0.72422350364344	364	0	636	0.636	0.364	0.728
ORF3a	all	ss12	219	CTA	ACT	ATC	2	CAACTATCG:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.16666666666667	1.08333333333333	0.75	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.25000000000003	4	29.08333333333333	0.114644643047729	0.151937056450333	0.754553535037093	-0.0372924134026038	0.0470670439010599	0.0900331324978152	NaN	NaN	0.0954839373559564	0.696120895767236	329	0	671	0.671	0.329	0.658
ORF3a	all	ss12	220	AGT	ATC	GAC	2	CTATCGACT:TTGAGTACA	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.75000000000003	4	28.66666666666666	0.113827458253345	0.154389040653112	0.737276802626797	-0.0405615823997669	0.0456514151447565	0.0871397790318053	NaN	NaN	0.0997840502240808	0.684379924623854	339	0	661	0.661	0.339	0.678
ORF3a	all	ss12	221	ACA	GAC	AGA	2	AGTACAGAC:TCGACTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.50000000000003	4	28.58333333333333	0.0840037937823711	0.154888999008431	0.542348354758227	-0.0708852052260596	0.0350409238002227	0.0874426350936422	NaN	NaN	0.095679543765409	0.458777960509759	189	0	811	0.811	0.189	0.378
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT:ACTGACACT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.1666666666667	4	28.91666666666666	0.0843980831669965	0.152908411727716	0.551951865913591	-0.0685103285607196	0.0350745387199295	0.0919126224602963	NA	NA	0.091118875572646	0.452124095206257	199	0	801	0.801	0.199	0.398
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.50000000000004	4	28.58333333333333	0.0864264476831885	0.154888999008431	0.557989581161178	-0.0684625513252423	0.0355357225055196	0.0911279932825644	NA	NA	0.0930223471222855	0.461743102951865	225	0	775	0.775	0.225	0.45
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TGC	2	ACTGGTGCT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.83333333333337	4	29.249999999999993	0.0872653886078579	0.150978005779684	0.578000670741412	-0.0637126171718257	0.0349425671554612	0.0858732211338344	NaN	NaN	0.0932302913341211	0.494360651528924	214	0	786	0.786	0.214	0.428
ORF3a	all	ss12	225	GCT	TGC	TGA	2	GGTGCTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.83333333333337	4	30.249999999999993	0.0885548256923263	0.145469445655623	0.608752066753361	-0.0569146199632969	0.034409760945289	0.0860447770037637	NaN	NaN	0.0941322415353822	0.545428802905427	235	1	764	0.764	0.235	0.47
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	GCTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	3	30.249999999999993	0.0881207952860292	0.106372646579413	0.828415933228116	-0.0182518512933841	0.034344326807052	0.0683808938582745	NaN	NaN	0.0712602136810478	0.797850752892273	416	2	582	0.582	0.416	0.832
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTATAGC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAT	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TATAGCAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AATAAAATT:AGCAAGCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAT:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	AGA	GCC	2	AAAGATGTG:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCT	GCC	G--	1	GAGCCTGAA:GATGTG---	1:1	TRUE	1.25	0	0.75	1	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCTGAAGAA:GTG---GAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	GAA	-GA	ACA	1	---GACCAT:GAAGAACAT	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	CAT	ACA	TGT	2	GAACATGTC:GACCATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTA	TGT	ACA	2	CATGTACAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	ACA	AAT	2	GTACAAATA:GTCCAAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGT	2	AATCCAGTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GTA	AGT	AAT	2	CCAGTAATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GTAATGGAA:GTAATGGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.08333333333337	7	31.500000000000004	0.271241219068681	0.263548415128416	1.02918933865156	0.00769280394026461	0.0643263291736692	0.114178670550501	0.766789381348436	0.179529198791418	0.121443685249993	0.94949208646573	518	0	482	0.482	0.518	0.964
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.4166666666667	7	31.500000000000004	0.274024507731711	0.263548415128416	1.03975016354468	0.0104760926032949	0.0641920444695095	0.114599137538255	0.965138861154952	0.281343454231361	0.122824221445994	0.932028156872776	537	0	463	0.463	0.537	0.926
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.58333333333337	7	32	0.277585914779586	0.258630364718797	1.0732920516947	0.0189555500607885	0.0667011152079675	0.108788845288589	NaN	NaN	0.120089853602483	0.874579153995826	562	0	438	0.438	0.562	0.876
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA:TTTATGAGT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.4166666666667	7	31.500000000000004	0.278309461419876	0.263548415128416	1.05600886002015	0.0147610462914597	0.065502493253974	0.111521211282678	0.76819544275648	0.169236347671984	0.12301040041663	0.904484447240376	559	0	441	0.441	0.559	0.882
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGTATT	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.9166666666667	7	31.000000000000004	0.28050317670762	0.268659167443214	1.04408563227946	0.0118440092644062	0.0671856333977572	0.110662084815341	0.680407335785357	0.124906485329161	0.122893034098863	0.923221498878532	562	0	438	0.438	0.562	0.876
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGTATTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.1666666666667	7	31.000000000000004	0.260825162391735	0.268659167443214	0.970840358339402	-0.00783400505147869	0.0619120024801267	0.111893758512611	0.70815586845311	0.170393153544973	0.123393121497052	0.949377769035535	474	1	525	0.525	0.474	0.948
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.00000000000003	7	31.333333333333336	0.26562886029046	0.265230030182684	1.0015037139931	3.98830107776416e-4	0.0636559849609236	0.115593547891052	0.68411575163544	0.143210622281675	0.121760386057133	0.997386507823713	534	0	466	0.466	0.534	0.932
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACACTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.33333333333336	7	31	0.264238228927332	0.268659167443214	0.983544434541523	-0.00442093851588166	0.0675075438274628	0.118323302747456	NaN	NaN	0.128225799704036	0.972496175707684	522	0	478	0.478	0.522	0.956
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACACTTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.66666666666669	7	31.666666666666668	0.267034361445878	0.261888204157181	1.01965020648891	0.00514615728869711	0.0672789893252394	0.115220416711695	0.835564007630369	0.222345977932949	0.12026204863423	0.965867979523848	541	0	459	0.459	0.541	0.918
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGATCA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	75.83333333333336	7	31.333333333333336	0.247752936040273	0.265230030182684	0.934105899960222	-0.0174770941424111	0.0617779273084338	0.114858494801192	0.691914030685409	0.177005803264923	0.114852156738978	0.879052570260266	459	0	541	0.541	0.459	0.918
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGATCAATC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.16666666666669	7	31.666666666666668	0.246469230096624	0.261888204157181	0.941123831406693	-0.0154189740605566	0.0639082485631516	0.10935094917586	NaN	NaN	0.120117825996403	0.897859802960013	466	1	533	0.533	0.466	0.932
ORF3a	all	ss12	13	ATC	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATCACA	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.66666666666669	7	31.333333333333332	0.244568640424989	0.265230030182684	0.922100111576869	-0.0206613897576947	0.0600335593809573	0.115866429828999	0.699236714073441	0.187261459946548	0.120385332658363	0.86373067322361	457	0	543	0.543	0.457	0.914
ORF3a	all	ss12	14	ACA	AAC	ACG	2	ATCACACGT:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.91666666666669	7	31.25	0.225850781199047	0.266078995344485	0.848811011581896	-0.0402282141454381	0.0577201119351147	0.112671714949517	0.583765645786811	0.145938820248851	0.11808181145881	0.733343842321306	359	0	641	0.641	0.359	0.718
ORF3a	all	ss12	15	CGT	ACG	GAA	2	ACACGTCAA:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.75	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.83333333333334	7	31.333333333333332	0.243941664762153	0.265230030182684	0.919736217630155	-0.0212883654205303	0.0607045282285442	0.119287907549243	NaN	NaN	0.122322595472162	0.861838260977331	448	0	552	0.552	0.448	0.896
ORF3a	all	ss12	16	AAG	GAA	ACC	2	CGTCAACCA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.50000000000001	6	31.583333333333332	0.227287577010071	0.219066980579392	1.03752549292886	0.00822059643067957	0.0594810274703996	0.0970149041010381	NaN	NaN	0.10857877800513	0.939649108138732	552	0	448	0.448	0.552	0.896
ORF3a	all	ss12	17	CAA	ACC	AAG	2	AAGCAAGGT:CAACCAAGT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.33333333333334	6	31.583333333333332	0.245832397240244	0.219066980579392	1.12217914625957	0.0267654166608527	0.0646640444577319	0.105994176178311	NaN	NaN	0.107901484618856	0.804092469840631	616	0	384	0.384	0.616	0.768
ORF3a	all	ss12	18	AGT	AAG	TAA	2	CAAGGTGAA:CCAAGTAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.33333333333334	5	30.749999999999996	0.242080044197288	0.183277466946071	1.32083909839565	0.0588025772512168	0.0599101301904021	0.091093347005624	NaN	NaN	0.0992015989111611	0.553342877302691	725	0	275	0.275	0.725	0.55
ORF3a	all	ss12	19	AAG	TAA	AAT	2	AGTAAGATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.75	6	30.749999999999996	0.22303140124308	0.225993636641676	0.986892394659359	-0.00296223539859522	0.0567997528904861	0.109457638344657	NaN	NaN	0.120723103029315	0.980423923190283	484	0	516	0.516	0.484	0.968
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAGATTGAA:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.58333333333334	6	31.249999999999996	0.217071598340042	0.221785683111784	0.978744864386192	-0.00471408477174201	0.0579030983612923	0.103038795910839	NaN	NaN	0.120966786878906	0.968914247077112	519	0	481	0.481	0.519	0.962
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	AAA	2	ATCAAGGAT:ATTGAAAAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.08333333333334	6	31.916666666666664	0.21866495405835	0.216414580065769	1.01039843984586	0.0022503739925816	0.0571805382761318	0.102865053864089	0.994031505398008	0.309407907799228	0.112379803341118	0.984023653540072	506	0	494	0.494	0.506	0.988
ORF3a	all	ss12	22	AAT	AAA	TGC	2	AAGGATGCT:GAAAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.75	6	32.58333333333333	0.205912255736412	0.211299152734159	0.974505827742127	-0.00538689699774728	0.0571016112409992	0.0979170117680085	NaN	NaN	0.109214563999078	0.960661109296889	492	0	508	0.508	0.492	0.984
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTTT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.33333333333333	6	32.33333333333333	0.190335390582075	0.213188653016244	0.892802632265668	-0.0228532624341691	0.0539172033013992	0.0993644960530972	NaN	NaN	0.108045510974075	0.832485311828878	413	0	587	0.587	0.413	0.826
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTTTCTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77	6	32.83333333333333	0.20822380244871	0.209443067094397	0.994178539005362	-0.00121926464568745	0.060546720577569	0.10052932965226	0.939600025882865	0.290015796886307	0.107765681190674	0.99097289906191	497	0	503	0.503	0.497	0.994
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TTTCTTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.5	6	33	0.192699315438847	0.20822380244871	0.925443264279612	-0.0155244870098627	0.0568078410279312	0.0968652252126599	NaN	NaN	0.114118437813401	0.891790942888551	433	0	567	0.567	0.433	0.866
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTTCAGAT:CTTGCAAGT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.66666666666667	5	32.5	0.189406066724906	0.172180831233375	1.10004153986331	0.017225235491531	0.0542279503369195	0.0878066158889892	NaN	NaN	0.10269681634729701	0.866796471625516	601	0	399	0.399	0.601	0.798
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.75	5	32.416666666666664	0.172803431663443	0.172678550040526	1.00072320286965	1.24881622916989e-4	0.0515471232519518	0.0890270668278754	NaN	NaN	0.0966232034116825	0.998968766428826	532	1	467	0.467	0.532	0.934
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77	4	32.83333333333333	0.174698668260279	0.132943691128056	1.31408017016771	0.0417549771322235	0.0513363338138235	0.0693556689852678	NaN	NaN	0.0898500912899364	0.642133237794384	698	0	302	0.302	0.698	0.604
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77	3	33.166666666666664	0.174698668260279	0.0963891381007337	1.81243106539356	0.0783095301595457	0.0536528756079052	0.0598402794181771	NaN	NaN	0.0928278482537016	0.398893220986839	805	0	195	0.195	0.805	0.39
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77	3	33.666666666666664	0.191273928510779	0.0948631103318397	2.01631517079385	0.0964108181789391	0.054494415682908	0.0585119481732106	NaN	NaN	0.0852967875856521	0.258350530044083	881	1	118	0.118	0.881	0.236
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACT:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.25	2	33.08333333333333	0.190569155883606	0.0630291953285242	3.02350608936559	0.127539960555082	0.0574725345804037	0.0471728563721103	NaN	NaN	0.074650152752463	0.0875431728241208	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	32	ACT	TAC	TGC	2	GCTACTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.66666666666667	2	32.666666666666664	0.186672035562468	0.0638683562552301	2.92276248376412	0.122803679307238	0.0536738568624019	0.0491214393352331	NaN	NaN	0.0786692355125608	0.118520743666987	927	1	72	0.072	0.927	0.144
ORF3a	all	ss12	33	GCA	TGC	AAC	2	ACTGCAACG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80	2	31.999999999999996	0.183147720384032	0.0652585327422224	2.80649460979276	0.117889187641809	0.0549226407389782	0.0501330608528739	NaN	NaN	0.0749113723061301	0.115553237058571	942	1	57	0.057	0.942	0.114
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.83333333333333	2	32.5	0.183580928580378	0.0642103145422439	2.85905667787378	0.119370614038134	0.0530485175202519	0.0496133732087063	NaN	NaN	0.0729918422613422	0.101965925014932	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.83333333333333	2	33.166666666666664	0.186224058338554	0.0628640039123036	2.9623321256842	0.123360054426251	0.0534210376820404	0.0466891388975675	NaN	NaN	0.0807176261281826	0.126440202398757	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.83333333333333	2	33.83333333333333	0.188944817553035	0.0615730216404005	3.06862993758066	0.127371795912634	0.0538965794362213	0.0476448340165808	NaN	NaN	0.0808671279675789	0.11523912149024	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78	2	33.83333333333333	0.205153173799212	0.0615730216404005	3.33186789170995	0.143580152158812	0.0575600731597477	0.0471883116108184	NaN	NaN	0.0791668238754999	0.0697331023846832	966	1	33	0.033	0.966	0.066
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.33333333333334	2	34.166666666666664	0.187574520977054	0.0609472230590743	3.07765492113141	0.126627297917979	0.0551794424930995	0.0459980738406328	NaN	NaN	0.0769717001958848	0.0999460995753274	939	2	59	0.059	0.939	0.118
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.16666666666667	2	33.666666666666664	0.188029061147841	0.0618907677660026	3.03807931190551	0.126138293381838	0.0541048723083199	0.0481838902807962	NaN	NaN	0.077822589214915	0.105051053637686	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC:GCCTCATTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.16666666666667	2	33.666666666666664	0.188029061147841	0.0618907677660026	3.03807931190551	0.126138293381838	0.0541815933363574	0.0468942856027397	NaN	NaN	0.0796213109390849	0.113141891656872	937	0	63	0.063	0.937	0.126
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT:TCATTCTCT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79	2	33	0.202172332401979	0.0631952577133049	3.19916936361214	0.138977074688674	0.0582395176742253	0.0472599461626645	NaN	NaN	0.0804373121661776	0.0840296912411169	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC:TTCTCTTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.16666666666667	2	32.5	0.185334556070404	0.0642103145422439	2.88636736000527	0.121124241528161	0.052679720518325	0.0486641920733905	NaN	NaN	0.0779567366092236	0.120247238640382	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CCG	2	CCTTTCGGA:TCTTTCCGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.16666666666667	2	32.5	0.169333949214161	0.0642103145422439	2.6371767592379	0.105123634671917	0.0502476930040548	0.050109259590995	NaN	NaN	0.0722619948501405	0.145736577611465	932	0	68	0.068	0.932	0.136
ORF3a	all	ss12	44	CGA	CCG	ATG	2	TTCCGATGG:TTCGGATGG	1:1	FALSE	0.75	1.25	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.66666666666667	2	33	0.170542381646746	0.0631952577133049	2.69865790278817	0.107347123933441	0.049374976159748	0.0479660243573371	NaN	NaN	0.0748142970579443	0.15133049472694	924	0	76	0.076	0.924	0.152
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	CGATGGCTT:GGATGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.58333333333334	2	32.666666666666664	0.168339981897205	0.0638683562552301	2.6357337462152	0.104471625641975	0.0490666522820671	0.0488112148993694	NaN	NaN	0.0755976049351412	0.166989021986209	916	0	84	0.084	0.916	0.168
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.83333333333334	2	33.416666666666664	0.172595396296097	0.062373587449531503	2.76712312620705	0.110221808846565	0.0506714507220466	0.0452885936545739	NaN	NaN	0.0746960393722368	0.140050107121831	917	0	83	0.083	0.917	0.166
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TAT	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.83333333333334	2	33.416666666666664	0.172595396296097	0.062373587449531503	2.76712312620705	0.110221808846565	0.0528447232882692	0.0464129090434188	NaN	NaN	0.0710381552721096	0.120761309532079	936	0	64	0.064	0.936	0.128
ORF3a	all	ss12	48	ATT	TAT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.58333333333334	2	33.666666666666664	0.173221017246649	0.0618907677660026	2.79881836175575	0.111330249480646	0.0495439984927828	0.0494302269033759	NaN	NaN	0.07391583893802	0.132022044395304	938	0	62	0.062	0.938	0.124
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.75	2	33.33333333333333	0.156781460557421	0.0625362067042884	2.50705101604236	0.094245253853133	0.0492950865478116	0.0492372474907613	NaN	NaN	0.07075551800505	0.182865279225355	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.25	2	33.83333333333333	0.15791093535129	0.0615730216404005	2.56461240888134	0.0963379137108898	0.0485851483083119	0.0454315904678825	NaN	NaN	0.0717044273514459	0.179096517812156	897	0	103	0.103	0.897	0.206
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.25	2	32.83333333333333	0.155668085942854	0.0635300231041221	2.45030740328432	0.0921380628387323	0.0472640480364584	0.0500619880370056	NaN	NaN	0.0694480170640758	0.184601371894917	913	0	87	0.087	0.913	0.174
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.08333333333333	2	33	0.171974297894147	0.0631952577133049	2.72131650565198	0.108779040180842	0.0517310737767182	0.0468775114798992	NaN	NaN	0.0738542397904414	0.140781177524217	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.75	2	31.999999999999996	0.172803431663443	0.0652585327422224	2.647982177994	0.10754489892122	0.0522858527333684	0.0473606228320319	NaN	NaN	0.0768960582409276	0.161940489910453	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.08333333333333	3	31.666666666666664	0.171974297894147	0.101277212852957	1.69805519968084	0.0706970850411898	0.0499558394541382	0.0622719161698085	NaN	NaN	0.0868667271492142	0.415726935533712	816	0	184	0.184	0.816	0.368
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.91666666666666	4	32.166666666666664	0.172387863428196	0.135964367940317	1.26789000706323	0.0364234954878789	0.050710866072045	0.0737090276299371	NaN	NaN	0.0957315626912562	0.703592624631859	688	0	312	0.312	0.688	0.624
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.58333333333333	4	32.166666666666664	0.170745473151992	0.135964367940317	1.25581044312244	0.0347811052116751	0.0523468476163686	0.0737515739533293	NaN	NaN	0.0961088485331531	0.717432102381756	668	0	332	0.332	0.668	0.664
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAG	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.41666666666667	4	32.83333333333333	0.190102201146667	0.132943691128056	1.42994526128776	0.057158510018611	0.0569656316159201	0.0725020419709614	NaN	NaN	0.0936636601942136	0.54169436451121	737	1	262	0.262	0.737	0.524
ORF3a	all	ss12	58	AGC	AAG	CGC	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.91666666666667	4	32.83333333333333	0.188715038816376	0.132943691128056	1.41951105174746	0.0557713476883197	0.0527358672255842	0.0771383834265655	NaN	NaN	0.0957586620712261	0.560286712510498	741	0	259	0.259	0.741	0.518
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.08333333333334	4	33.166666666666664	0.207964387858376	0.131483259230803	1.58167959232985	0.0764811286275733	0.0566750469398046	0.0729691141761439	NaN	NaN	0.102413938641254	0.455193731910755	772	0	228	0.228	0.772	0.456
ORF3a	all	ss12	60	TCC	TTC	CAA	2	GCTTCCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.41666666666667	4	32.833333333333336	0.206933202001177	0.132943691128056	1.55654774021471	0.0739895108731214	0.0582481899616711	0.0715348149518356	NaN	NaN	0.0989652242040674	0.454682508838479	787	1	212	0.212	0.787	0.424
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	TCCAAAATC:TCCAAAGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.25	4	33	0.207447505316393	0.132209431753494	1.56908249710339	0.0752380735628987	0.0550535774760759	0.0723947604223055	NaN	NaN	0.101847706299958	0.460070264509878	777	0	223	0.223	0.777	0.446
ORF3a	all	ss12	62	ATC	AAT	AAT	2	AAAATCATA:AAAGTAATT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.5	4	33.416666666666664	0.209794072585264	0.130408872715656	1.60874078746698	0.0793851998696088	0.0563887174011003	0.0694682347504997	NaN	NaN	0.102503785711016	0.43865813337841	821	0	179	0.179	0.821	0.358
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATCATAACC:GTAATTGCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.5	4	33.416666666666664	0.209794072585264	0.130408872715656	1.60874078746698	0.0793851998696088	0.0561997956411301	0.0717448298837762	NaN	NaN	0.0982245034292994	0.418974542462783	793	0	207	0.207	0.793	0.414
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTT	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.83333333333333	4	33.75	0.211925228838758	0.129003442367267	1.64278739349774	0.0829217864714911	0.0585208548674126	0.0691041797774547	NaN	NaN	0.0967682080571178	0.391493818685699	798	0	202	0.202	0.798	0.404
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.75	4	34.333333333333336	0.21219469193644	0.126615652181289	1.67589621252054	0.0855790397551512	0.0592043274184485	0.0667427527828589	NaN	NaN	0.0998900237052528	0.391592682135235	806	0	194	0.194	0.806	0.388
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTTCATAAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.75	4	34.333333333333336	0.21219469193644	0.126615652181289	1.67589621252054	0.0855790397551512	0.0581593313162313	0.0681019908180237	NaN	NaN	0.0991955820330062	0.388285738406681	809	0	191	0.191	0.809	0.382
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	GAA	2	AAAAAGAGA:CATAAGAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.5	4	34.666666666666664	0.195615152460455	0.125290563497375	1.56129198400927	0.0703245889630804	0.0562786986396836	0.0720330071196815	NaN	NaN	0.101282120559246	0.487466774521939	772	0	228	0.228	0.772	0.456
ORF3a	all	ss12	68	AAG	GAA	ATG	2	AAGAAGTGG:AAGAGATGG	1:1	TRUE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.5	4	34.666666666666664	0.213007236149638	0.125290563497375	1.70010597928312	0.0877166726522632	0.0556879833915296	0.0688797769128005	NaN	NaN	0.0991789844771864	0.376465203919574	823	0	177	0.177	0.823	0.354
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AAGTGGCAG:AGATGGCAA	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	74.75	3	35.333333333333336	0.233528882680639	0.0901082338815474	2.59164864986286	0.143420648799092	0.0644727384980917	0.0539951347844706	NaN	NaN	0.0876610038287576	0.101822287601703	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	74.58333333333333	4	35.166666666666664	0.234141361979703	0.123354245726484	1.89812163011292	0.110787116253219	0.0621643663773106	0.0659192799720711	NaN	NaN	0.103082706084432	0.282491111998122	860	0	140	0.14	0.86	0.28
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTTGCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	74.58333333333333	4	35.166666666666664	0.234141361979703	0.123354245726484	1.89812163011292	0.110787116253219	0.0590289621505681	0.0677447018496983	NaN	NaN	0.103956650804959	0.286557044081524	864	0	136	0.136	0.864	0.272
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTTGCCTTA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.83333333333333	4	34.583333333333336	0.266329737124579	0.125619222573624	2.12013521233572	0.140710514550955	0.0678089274613109	0.0698796197321456	NaN	NaN	0.112959927518654	0.212886476834016	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	ATA	2	GCACTCTCC:GCCTTATAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.08333333333333	4	34.5	0.265279817755724	0.125949614506391	2.10623763157498	0.139330203249332	0.068509216659324	0.0701948231467766	NaN	NaN	0.108942582490398	0.200920846536092	901	0	99	0.099	0.901	0.198
ORF3a	all	ss12	74	TAC	ATA	CAA	2	CTCTCCAAG:TTATACAAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.91666666666666	4	34	0.261839694220712	0.127969137773073	2.04611595246529	0.13387055644764	0.0690471516940915	0.069688619118341	NaN	NaN	0.117740992220061	0.255541664725156	870	0	130	0.13	0.87	0.26
ORF3a	all	ss12	75	AAA	CAA	AGG	2	TACAAAGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.41666666666666	3	33.833333333333336	0.259818540246921	0.0943651299007742	2.75333208908972	0.165453410346147	0.0672157755392012	0.0588591261564876	NaN	NaN	0.0964644844855069	0.0863132644343492	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	76	GGC	AGG	CTT	2	AAAGGCTTT:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.91666666666666	3	33.666666666666664	0.257828654327118	0.0948631103318397	2.71790217952174	0.162965543995279	0.0664731085908933	0.0565307258167317	NaN	NaN	0.0953193734950275	0.0873252231863958	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	77	GTT	CTT	TCA	2	GGCTTTCAA:GGTGTTCAC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.5	3	33.333333333333336	0.255545671643513	0.0958750286324137	2.66540386259784	0.1596706430111	0.0661404551963398	0.0611929985834041	NaN	NaN	0.0965511620456269	0.0981800899182649	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	78	CAA	TCA	ATT	2	GTTCACTTT:TTTCAATTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.66666666666666	3	33.083333333333336	0.272974032901059	0.0966482688635724	2.82440685291928	0.176325764037486	0.0769471432577516	0.0613632700323752	NaN	NaN	0.102899470569767	0.0866071587316047	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	79	TTA	ATT	AGT	2	CAATTAGTT:CACTTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.5	3	32.583333333333336	0.251725510203618	0.0982328346145694	2.5625394115043	0.153492675589049	0.0717847604212283	0.0599124157741349	NaN	NaN	0.0987656899654137	0.120158351353481	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	80	GTT	AGT	TTG	2	TTAGTTTGT:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.416666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79	3	32.583333333333336	0.236076409978014	0.0982328346145694	2.40323320511206	0.137843575363445	0.0699790539586357	0.0615362733633915	NaN	NaN	0.0966260005712788	0.153704408720512	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	GTTTGCAAC:GTTTGTAAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.25	3	32.833333333333336	0.235201662735449	0.0974341006801572	2.4139563160493	0.137767562055291	0.0671503665617783	0.0631687885399124	NaN	NaN	0.101784570762637	0.175889220568764	916	0	84	0.084	0.916	0.168
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGTAACTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.08333333333333	3	33	0.235784099565019	0.0969087986100047	2.43305151799371	0.138875300955014	0.067742374637077	0.0608848869580948	NaN	NaN	0.0979950929833565	0.156434438535047	926	0	74	0.074	0.926	0.148
ORF3a	all	ss12	83	TTG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.08333333333333	3	33	0.235784099565019	0.0969087986100047	2.43305151799371	0.138875300955014	0.069307017816238	0.0610201052588363	NaN	NaN	0.0965762466105216	0.150437995933506	922	0	78	0.078	0.922	0.156
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GCT	2	TTGCTGCTA:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80	3	32.5	0.23261619622788	0.0985020015458152	2.36153776144016	0.134114194682064	0.0658499663374644	0.0610231951621702	NaN	NaN	0.100176901236501	0.180644374739734	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	85	CTA	GCT	ACT	2	CTGCTACTC:CTGTTGTTG	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81	4	32.166666666666664	0.263548415128416	0.135964367940317	1.93836384576953	0.127584047188099	0.0770498543727893	0.0765193087279763	NaN	NaN	0.102842671632335	0.214762792708247	879	0	121	0.121	0.879	0.242
ORF3a	all	ss12	86	CTC	ACT	CTT	2	CTACTCTTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.5	4	31.666666666666668	0.261613554332634	0.138321779350139	1.89134029045709	0.123291774982495	0.0719602178638453	0.0749355172524	NaN	NaN	0.104966384703374	0.240161420294287	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	87	TTT	CTT	TGT	2	CTCTTTGTG:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.5	4	31	0.240926530560309	0.141595553474679	1.70151198005941	0.0993309770856295	0.0723137608879201	0.0783043047117092	NaN	NaN	0.0994167051891868	0.317727995749761	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTGACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.16666666666666	4	30.333333333333332	0.238652446115001	0.145028544735405	1.64555499436616	0.0936239013795962	0.0689802099737254	0.0824370761626426	NaN	NaN	0.101189008879904	0.354842197298866	843	0	157	0.157	0.843	0.314
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AAT	2	GTAACAGTT:GTGACAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.66666666666666	4	30.833333333333332	0.240353921456079	0.142438427764417	1.68742329740965	0.0979154936916618	0.0736350037831583	0.0752000262781252	NaN	NaN	0.103380783845086	0.34357031234036	835	0	165	0.165	0.835	0.33
ORF3a	all	ss12	90	ATT	AAT	TTA	2	ACAATTTAT:ACAGTTTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.33333333333331	4	31.5	0.241501898090417	0.139125907283501	1.73585137955867	0.102375990806916	0.0739388273219071	0.0740626492380105	NaN	NaN	0.103793062808748	0.323962794068437	849	0	151	0.151	0.849	0.302
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	ATTTATTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.66666666666666	4	32.166666666666664	0.243831358478173	0.135964367940317	1.79334749369927	0.107866990537856	0.0718497712220896	0.0776444913641788	NaN	NaN	0.101596642239623	0.288363695195357	869	0	131	0.131	0.869	0.262
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.49999999999999	4	32.333333333333336	0.244420824406181	0.135196367873208	1.80789490317823	0.109224456532973	0.0742611816336063	0.0771765503951848	NaN	NaN	0.103753398943267	0.292464132633655	845	0	155	0.155	0.845	0.31
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCACATTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.16666666666666	4	31.333333333333332	0.245608424712543	0.139939466685309	1.75510476443974	0.105668958027234	0.0717942588687159	0.0747514359367967	NaN	NaN	0.104079814795108	0.309977852939329	864	0	136	0.136	0.864	0.272
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TCT	2	CACCTTTTG:CATTTTCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.99999999999999	4	30.833333333333332	0.246206602062776	0.142438427764417	1.7285124943248	0.103768174298359	0.0731142839092438	0.0785928589033954	NaN	NaN	0.105439046524398	0.325040196080589	834	0	166	0.166	0.834	0.332
ORF3a	all	ss12	95	CTA	TCT	ACT	2	CTTTTGCTC:TTTCTACTT	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.66666666666664	4	30.5	0.227070884459176	0.144154737019872	1.57518850336408	0.0829161474393035	0.0715355678923161	0.0763131613239322	NaN	NaN	0.103530990096925	0.423199732135171	789	0	211	0.211	0.789	0.422
ORF3a	all	ss12	96	CTC	ACT	CGT	2	CTACTTTTA:TTGCTCGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.41666666666664	4	30.75	0.227885636068375	0.142863650574837	1.59512678803487	0.0850219854935386	0.072991670093741	0.0782915470485103	NaN	NaN	0.104000067304242	0.413632145869669	813	0	187	0.187	0.813	0.374
ORF3a	all	ss12	97	GTT	CGT	AGC	2	CTCGTTGCT:CTTTTAGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.41666666666664	4	30.416666666666668	0.224661472302046	0.144590316625212	1.55377951681497	0.0800711556768338	0.0692251980521055	0.0784659055404173	NaN	NaN	0.105234694353535	0.446727715476268	792	0	208	0.208	0.792	0.416
ORF3a	all	ss12	98	GCT	AGC	TGC	2	GTTGCTGCT:TTAGCTGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.49999999999997	4	30.166666666666668	0.22439693588559	0.145913043990275	1.53788125961203	0.0784838918953152	0.0714291737141249	0.0820860314946063	NaN	NaN	0.101101477181269	0.437578791115484	804	0	196	0.196	0.804	0.392
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.08333333333331	4	30.083333333333332	0.222562608499314	0.146359364647636	1.52065847672364	0.0762032438516777	0.0680403388799287	0.0791274539552459	NaN	NaN	0.103103965456061	0.459851559436856	788	0	212	0.212	0.788	0.424
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CAT	2	GCTGGCATT:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.58333333333331	4	30.583333333333332	0.221014202121839	0.143721781908901	1.53779196991817	0.0772924202129379	0.0721127890905236	0.0771881829430802	NaN	NaN	0.101529108478982	0.446487840982366	779	0	221	0.221	0.779	0.442
ORF3a	all	ss12	101	ATT	CAT	TGA	2	GGCATTGAG:GGCCTTGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.24999999999999	4	31.583333333333332	0.222044050448096	0.138722674692595	1.60063270795592	0.0833213757555009	0.069991628943934	0.0718192527913297	NaN	NaN	0.0999815983850516	0.404637717791668	803	2	195	0.195	0.803	0.39
ORF3a	all	ss12	102	GAA	TGA	AGC	2	ATTGAGGTG:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82.91666666666666	4	31.916666666666664	0.207018740932176	0.137132914796851	1.50962109453339	0.0698858261353251	0.0664154014614015	0.0735181680386839	NaN	NaN	0.0937093156556687	0.455804883649943	800	0	200	0.2	0.8	0.4
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CCC	2	GAAGCCCCT:GAGGTGCAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	84.24999999999999	4	32.583333333333336	0.218983102328585	0.134060541816084	1.63346424952545	0.0849225605125009	0.0629531747984736	0.0731499977944562	NaN	NaN	0.0966886786209091	0.379775918990621	809	0	191	0.191	0.809	0.382
ORF3a	all	ss12	104	CAA	CCC	ATT	2	GCCCCTTTT:GTGCAATTC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	85.16666666666666	4	32.25	0.216250950767294	0.135579277355344	1.59501477648767	0.0806716734119499	0.0671664716086884	0.0776566519051689	NaN	NaN	0.0999868878290858	0.419768739152987	787	0	213	0.213	0.787	0.426
ORF3a	all	ss12	105	TTC	ATT	CTT	2	CAATTCTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	85.5	3	31.583333333333332	0.215274383162239	0.101563372279023	2.11960649131284	0.113711010883216	0.0673756691155328	0.0637360007345119	NaN	NaN	0.092504785785321	0.218980101491973	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	106	CTC	CTT	CTA	2	TTCTTGTAC:TTTCTCTAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	85	3	32.08333333333333	0.216742587833847	0.0998703029515669	2.17024061636179	0.11687228488228	0.0654917294851131	0.0667522806394261	NaN	NaN	0.0879647281804536	0.183971164872466	911	0	89	0.089	0.911	0.178
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CAT	2	CTCTATCTT:TTGTACATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	84.83333333333333	3	32.08333333333333	0.201651504699057	0.0998703029515669	2.0191338039382	0.10178120174749	0.0646206479696817	0.0618882471537575	NaN	NaN	0.0844314554294327	0.228014531836964	881	2	117	0.117	0.881	0.234
ORF3a	all	ss12	108	ATC	CAT	CTA	2	TACATCTAT:TATCTTTAT	1:1	TRUE	1.5	0.5	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	85.66666666666666	3	31.75	0.199404267117924	0.100992663859693	1.97444308821235	0.0984116032582307	0.0649931269707521	0.0634906316666658	NaN	NaN	0.0864028035488179	0.254708898628554	872	0	128	0.128	0.872	0.256
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	ATCTATGCT:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	85.49999999999999	3	32.08333333333333	0.18473581339815	0.0998703029515669	1.84975721449188	0.0848655104465833	0.0602128192523526	0.0610568451633353	NaN	NaN	0.086249721516058	0.325139544927141	823	1	176	0.176	0.823	0.352
ORF3a	all	ss12	110	GCT	TGC	TTT	2	TATGCTTTA:TATGCTTTG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	85.16666666666666	3	32.416666666666664	0.185556129985381	0.0987726497511971	1.87861852904409	0.0867834802341836	0.0612728187223656	0.0648108220105769	NaN	NaN	0.0850031365313515	0.307280759285551	836	0	164	0.164	0.836	0.328
ORF3a	all	ss12	111	TTA	TTT	AGT	2	GCTTTAGTC:GCTTTGATT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	85.16666666666666	3	32.416666666666664	0.185556129985381	0.0987726497511971	1.87861852904409	0.0867834802341836	0.0617671685119153	0.0618216077209192	NaN	NaN	0.0834145758925362	0.298159917015431	835	0	165	0.165	0.835	0.33
ORF3a	all	ss12	112	ATT	AGT	CTA	2	TTAGTCTAC:TTGATTTAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	86.25	3	31.999999999999996	0.182916488688042	0.100148544468392	1.82645179377293	0.0827679442196504	0.0607865027206728	0.0658643171933745	NaN	NaN	0.0827263482099553	0.31706723624746	856	1	143	0.143	0.856	0.286
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	ATTTATATT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	86.75	3	31.999999999999996	0.167177569836095	0.100148544468392	1.66929605141548	0.0670290253677027	0.0585087522294078	0.0658493918022169	NaN	NaN	0.081583388904838	0.411303800433567	798	1	201	0.201	0.798	0.402
ORF3a	all	ss12	114	ATT	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATATTCTG	1:1	TRUE	1.5	0.5	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	86.91666666666667	3	31.833333333333332	0.166818547612438	0.100709711722406	1.65642960107216	0.0661088358900316	0.0593398989800785	0.0630739258112089	NaN	NaN	0.0851797434606923	0.437684142356213	805	0	195	0.195	0.805	0.39
ORF3a	all	ss12	115	CTG	CTT	GCA	2	ATTCTGCAA:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	87.08333333333334	3	31.166666666666664	0.152259462680424	0.103018812035868	1.47797727105814	0.049240650644556	0.0555991141307183	0.065704922730813	NaN	NaN	0.0839086713289527	0.557313683357475	747	0	253	0.253	0.747	0.506
ORF3a	all	ss12	116	CAA	GCA	AAT	2	CTGCAAATT:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	88.08333333333334	3	30.499999999999996	0.178617257777546	0.105436462965892	1.69407482718125	0.0731807948116541	0.0606717187616483	0.0690037812908535	NaN	NaN	0.0896140768612888	0.414144681922471	767	1	232	0.232	0.767	0.464
ORF3a	all	ss12	117	AGT	AAT	TAT	2	CAAATTTTA:CAGAGTATA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	87.5	3	30.499999999999996	0.194633396613813	0.105436462965892	1.84597805293199	0.0891969336479213	0.0674602005854805	0.0701568885546761	NaN	NaN	0.091397710962894	0.329103678754448	850	0	150	0.15	0.85	0.3
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	AGTATAAAC:ATTTTAAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	87.33333333333334	3	30.499999999999996	0.180351251228637	0.105436462965892	1.71052068853049	0.0749147882627447	0.0675538455959161	0.0659058997367634	NaN	NaN	0.0883401849947498	0.396423399435681	791	0	209	0.209	0.791	0.418
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT:TTAAGCTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	87.25	3	30.249999999999996	0.166105128302498	0.106372646579413	1.56153986615808	0.0597324817230847	0.0638529354762928	0.0720269546474717	NaN	NaN	0.0863847269202298	0.489269975653289	767	0	233	0.233	0.767	0.466
ORF3a	all	ss12	120	TTT	CTT	TGT	2	AACTTTGTA:AGCTTTTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.166666666666667	1	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	86.41666666666667	2	30.583333333333332	0.182517074011287	0.0684234871721278	2.66746232258147	0.11409358683916	0.0653020305694646	0.0532298011249717	NaN	NaN	0.0758089404356986	0.132320239497067	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss12	121	GTA	TGT	AAG	2	TTTGTAAGA:TTTTGCAGA	1:1	TRUE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	85.75	2	30.583333333333332	0.184125343811615	0.0684234871721278	2.69096696794223	0.115701856639487	0.0661911687384071	0.0542170127333321	NaN	NaN	0.0750532695957492	0.123171680119512	949	1	50	0.05	0.949	0.1
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGCAGATTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	84.66666666666667	2	31.166666666666664	0.171799927212999	0.0670837952639451	2.56097506912127	0.104716131949054	0.0636782911486336	0.0526506211601379	NaN	NaN	0.0713252846505146	0.142063804979723	928	0	72	0.072	0.928	0.144
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGATTTATC	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	84.50000000000001	2	31.166666666666664	0.172180831233375	0.0670837952639451	2.56665310237621	0.10509703596943	0.061253169333003	0.0508374774103393	NaN	NaN	0.0718428779653009	0.143502020701955	946	0	54	0.054	0.946	0.108
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:TTTATCATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.00000000000001	2	30.833333333333332	0.160610991304224	0.0678428326164385	2.36739807449177	0.0927681586877853	0.0608086256438344	0.0485032377957964	NaN	NaN	0.0732939950954995	0.205620757085519	916	0	84	0.084	0.916	0.168
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATCATGAGA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.83333333333334	2	30.666666666666664	0.160971449092545	0.068228833654295	2.35928771563299	0.0927426154382496	0.0595638458208046	0.056298153090354	NaN	NaN	0.0695452325533137	0.18234868831613	920	0	80	0.08	0.92	0.16
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGC:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82	3	30.666666666666664	0.162798378928371	0.104821456781369	1.55310166379319	0.0579769221470016	0.0586544437086779	0.0699708312264338	NaN	NaN	0.0847604667693172	0.493969482422746	781	0	219	0.219	0.781	0.438
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	CTG	2	AGATGCTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.41666666666667	3	30.999999999999996	0.179546761902854	0.103612753860613	1.73286352512542	0.0759340080422411	0.0649380439876423	0.0683890153820754	NaN	NaN	0.0862708525428451	0.378760996013983	819	0	181	0.181	0.819	0.362
ORF3a	all	ss12	128	TGG	CTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGCTGGCTC	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.66666666666667	3	30.833333333333332	0.178926016229881	0.104213595070396	1.71691626326696	0.0747124211594847	0.0634437960689503	0.0658520448074196	NaN	NaN	0.0870779860874812	0.390895576382653	834	0	166	0.166	0.834	0.332
ORF3a	all	ss12	129	CTC	GCT	CTG	2	TGGCTCTGT:TGGCTTTGC	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.16666666666667	3	31.333333333333332	0.182716561993313	0.102431651254313	1.78379006640898	0.0802849107389998	0.067413686362802	0.0623411669267931	NaN	NaN	0.0862764753785318	0.352084369905579	823	0	177	0.177	0.823	0.354
ORF3a	all	ss12	130	TGC	CTG	CTG	2	CTCTGTTGG:CTTTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0	0.666666666666667	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81	3	30.999999999999996	0.229256728124845	0.103612753860613	2.21263039136338	0.125643974264232	0.0844297260833707	0.0622681223015691	NaN	NaN	0.104640302293702	0.229858830243677	878	0	122	0.122	0.878	0.244
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.5	4	30.999999999999996	0.248018905279285	0.141595553474679	1.751600945037	0.106423351804606	0.0875643978690878	0.0807320067668452	NaN	NaN	0.107997090166263	0.324413903326436	849	1	150	0.15	0.849	0.3
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80	4	31.083333333333332	0.267506207954049	0.141177857059553	1.89481703098247	0.126328350894497	0.0888306207534991	0.0776348780877431	NaN	NaN	0.110987638891742	0.255028627289829	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCCGT:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.66666666666667	4	31.416666666666664	0.305669512283459	0.139531497680893	2.19068466521102	0.166138014602566	0.100538227934771	0.0781181788214487	NaN	NaN	0.129661639407459	0.200081391533528	916	0	84	0.084	0.916	0.168
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CAA	ATC	2	TGCAAATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.08333333333334	4	31.583333333333332	0.308458156432115	0.138722674692595	2.22355975413283	0.16973548173952	0.101804140669687	0.0772832268173483	NaN	NaN	0.119125355123095	0.154201246297416	934	1	65	0.065	0.934	0.13
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AAATCCAAG:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.41666666666667	3	31.916666666666664	0.274024507731711	0.100428343016685	2.72855749184457	0.173596164715027	0.0923833951976118	0.0657741797350138	NaN	NaN	0.116291057174006	0.135496584687785	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAGAAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.58333333333334	3	32.416666666666664	0.273323285248654	0.0987726497511971	2.76719603996795	0.174550635497457	0.0915670273437295	0.0637218084114137	NaN	NaN	0.109582611545571	0.111189805918511	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAGAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.41666666666667	3	32.416666666666664	0.274024507731711	0.0987726497511971	2.77429539879677	0.175251857980514	0.094786760011723	0.063692926662604	NaN	NaN	0.113103000206682	0.121264206788233	938	0	62	0.062	0.938	0.124
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA:AATCCATTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.08333333333334	3	32.08333333333333	0.275437924150749	0.0998703029515669	2.75795622933401	0.175567621199182	0.0911096293584899	0.0651659347121103	NaN	NaN	0.116264510612033	0.131025406254705	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTT:CCATTATTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.08333333333334	3	31.083333333333332	0.271241219068681	0.103314927985559	2.62538264660646	0.167926291083123	0.091385190015268	0.0689846203139929	NaN	NaN	0.11462519641994	0.142920017261168	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	140	CTT	ACT	ATA	2	TTACTTTAT:TTATTATAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.41666666666667	3	30.416666666666664	0.269870897248761	0.105746684778908	2.55205066535181	0.164124212469853	0.0844108036474736	0.0703220589985431	NaN	NaN	0.116631262052851	0.159366311161227	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	141	TAT	ATA	TGA	2	CTTTATGAT:TTATATGAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.58333333333334	3	30.083333333333332	0.26919097092383	0.107006075844546	2.51566061832694	0.162184895079284	0.0875729823715208	0.0671022930884783	NaN	NaN	0.119393534345139	0.174334887039829	936	1	63	0.063	0.936	0.126
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.58333333333334	3	29.583333333333332	0.273323285248654	0.108952531416164	2.50864556973574	0.16437075383249	0.0911742582459433	0.0687469592996453	NaN	NaN	0.114406686034881	0.150796625897652	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.91666666666667	3	30.25	0.304489965379427	0.106372646579413	2.86248368514652	0.198117318800014	0.0984846049703173	0.0690714336718551	NaN	NaN	0.121875917840198	0.104042064419323	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAC:GCCAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.41666666666667	3	29.75	0.297601975168629	0.10829587866142	2.74804525201796	0.189306096507209	0.0937102070736065	0.0703923647149206	NaN	NaN	0.123342513492069	0.124832949266695	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	80.75000000000001	3	30.416666666666664	0.338546690989034	0.105746684778908	3.20148751421244	0.232800006210126	0.10685751986981	0.0672473870341247	NaN	NaN	0.13169411646314	0.0771055876990399	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	80.91666666666669	3	30.25	0.337665896705046	0.106372646579413	3.17436773045747	0.231293250125633	0.110398931946785	0.0677113175885051	NaN	NaN	0.129395453073128	0.0738581126460243	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	80.75000000000001	3	29.75	0.338546690989034	0.10829587866142	3.12612719129855	0.230250812327613	0.109793850432757	0.0710461911836161	NaN	NaN	0.13043361058709	0.0775180479093724	972	0	28	0.028	0.972	0.056
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	81.08333333333334	3	29.416666666666664	0.317710819960381	0.109617210244414	2.89836622599663	0.208093609715967	0.10236492048125	0.0706519611657657	NaN	NaN	0.127235818512723	0.101945215451983	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.58333333333334	3	29.916666666666664	0.320169474684061	0.107647107231784	2.97425061311381	0.212522367452277	0.103042910470244	0.0704058376790605	NaN	NaN	0.130358601131329	0.103040149385584	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.91666666666667	3	29.25	0.318526102048975	0.110290063467372	2.88807615151301	0.208236038581602	0.0994757981530788	0.0729389572416424	NaN	NaN	0.136784128938842	0.127916426324162	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	151	ACA	TAC	ATA	2	CATACATAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.5	4	29.25	0.320583011120205	0.150978005779684	2.12337558351393	0.169605005340521	0.104861717479805	0.0838894138273107	NaN	NaN	0.146058432010631	0.245555135308316	890	0	110	0.11	0.89	0.22
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ATA	TAA	2	ACATATAAT:ACTAATTGT	1:1	FALSE	2	0	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	81	4	28.75	0.318117930840238	0.153892310773211	2.0671463651556	0.164225620067027	0.103055560969932	0.0871105761105551	NaN	NaN	0.140189149405902	0.241414961261718	901	0	99	0.099	0.901	0.198
ORF3a	all	ss12	153	AAT	TAA	TTA	2	AATTGTTAC:TATAATTAT	1:1	FALSE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.25	4	28.833333333333332	0.30293151567038	0.153398778089708	1.97479744912456	0.149532737580672	0.104975368932803	0.0904522380644529	NaN	NaN	0.145929692849084	0.305509351618996	876	0	124	0.124	0.876	0.248
ORF3a	all	ss12	154	TAC	TTA	CGA	2	AATTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.41666666666667	3	29.25	0.326059409811611	0.110290063467372	2.95638065262398	0.215769346344238	0.108334784175937	0.0664579832882005	NaN	NaN	0.134502480320251	0.108669208984193	956	0	44	0.044	0.956	0.088
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.58333333333333	3	29.916666666666664	0.325204550847101	0.107647107231784	3.02102452364908	0.217557443615317	0.105690310735184	0.066579241426974	NaN	NaN	0.133915251337042	0.104249845114678	960	0	40	0.04	0.96	0.08
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	80.08333333333333	3	29.083333333333332	0.342117105945297	0.110971243090164	3.082934789397	0.231145862855133	0.107719956395597	0.0718109850401003	NaN	NaN	0.135998488209988	0.0892022704522866	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	80.41666666666666	3	28.75	0.340322374052081	0.112359208671495	3.02887834540632	0.227963165380586	0.104269369597485	0.0708061723336408	NaN	NaN	0.139492222259036	0.102209375325157	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	80.58333333333333	3	28.75	0.339432170735082	0.112359208671495	3.02095551177724	0.22707296206358701	0.106751857368221	0.072922843961632	NaN	NaN	0.129658973173729	0.0798926512625086	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAC:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	80.58333333333333	3	28.416666666666668	0.359202673003384	0.113782401199837	3.15692645976518	0.245420271803547	0.113267914289379	0.0715643607248092	NaN	NaN	0.132405840283744	0.0638041866896756	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATACAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	80.91666666666666	3	28.416666666666668	0.377476236347421	0.113782401199837	3.31752742398586	0.263693835147584	0.107557002043257	0.0719035847268204	NaN	NaN	0.138651975733277	0.0571921113611009	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAACAGT:TACAATAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	81.41666666666666	3	28.25	0.394983289151012	0.114507630156718	3.4494058484175	0.280475658994294	0.119901059056185	0.0702986876160765	NaN	NaN	0.139848659046289	0.0449026157955698	981	0	19	0.019	0.981	0.038
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	26	80.08333333333331	3	28.916666666666668	0.425391460730286	0.11166090491713	3.80967233828165	0.313730555813157	0.124193746179605	0.0659440758814006	NaN	NaN	0.143295934249617	0.0285685715786867	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	26	79.08333333333331	3	29.25	0.432665530833063	0.110290063467372	3.92297834664915	0.32237546736569	0.119164017454516	0.068249882424074	NaN	NaN	0.146376592327187	0.027639158279356	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	26	79.24999999999999	3	29.75	0.431435486737038	0.10829587866142	3.98385877717371	0.323139608075618	0.127108640087165	0.0641583399278043	NaN	NaN	0.145631809283606	0.026494843200029	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	26	78.41666666666666	3	30.416666666666668	0.437658657745317	0.105746684778908	4.13874589695516	0.331911972966409	0.127227542770231	0.0664070472829324	NaN	NaN	0.146487202215731	0.0234631002617265	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAATC:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	77.74999999999999	3	31.083333333333336	0.419912832511125	0.103314927985559	4.06439650782915	0.316597904525566	0.125558255989638	0.0629388568741819	NaN	NaN	0.142658006150178	0.0264677554362619	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	167	ATC	AAT	CGT	2	ACAATCGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	77.74999999999999	3	31.083333333333336	0.39773006950336	0.103314927985559	3.84968636438439	0.294415141517801	0.118869624075344	0.0610117520012121	NaN	NaN	0.141355068987103	0.0372689390385646	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	168	GTC	CGT	CAT	2	ATCGTCGTT:ATTGTCATT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	77.08333333333331	3	31.416666666666668	0.402280843999458	0.102140577511979	3.93850175707376	0.300140266487479	0.115709825380212	0.0647973598911156	NaN	NaN	0.138565520320781	0.030307134115273	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT:GTCGTTACT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	77.49999999999999	3	31.666666666666668	0.399424207801798	0.101277212852957	3.94387045762916	0.29814699494884	0.114611177588355	0.059107319053666	NaN	NaN	0.143841542444519	0.0381959157760596	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TAC	2	ATTACTTCA:GTTACTACA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	77.83333333333331	3	31.416666666666668	0.419310449451486	0.102140577511979	4.10522888812048	0.317169871939507	0.121788198158863	0.0637770279455623	NaN	NaN	0.143165527160903	0.0267321600270573	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	171	ACA	TAC	AGG	2	ACTACAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	78.49999999999999	3	31.083333333333336	0.414554454852538	0.103314927985559	4.01253200225319	0.311239526866979	0.122476011777157	0.0646761941697463	NaN	NaN	0.137056262949195	0.0231537129256862	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	ACAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	78.49999999999999	3	31.083333333333336	0.392734734146289	0.103314927985559	3.80133579729336	0.289419806160731	0.117684743958653	0.0641733341228881	NaN	NaN	0.132181940309152	0.0285564279409032	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	173	GAC	TGA	CGG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	79.16666666666664	3	31.083333333333336	0.388400929793553	0.103314927985559	3.75938828363549	0.285086001807994	0.113878964396017	0.0668614315287908	NaN	NaN	0.137210310416799	0.0377342184774698	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	174	GGC	CGG	CAC	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	80.33333333333331	3	31.25	0.381047393302561	0.102724391304868	3.70941495454257	0.278323001997692	0.113794919534242	0.0614410531407186	NaN	NaN	0.130164360992692	0.0324970458776073	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	80.83333333333331	3	30.75	0.377982211440312	0.104516640682884	3.61647876329241	0.273465570757428	0.109917386624818	0.0646713337309158	NaN	NaN	0.131117333793885	0.0370098522787165	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAC	2	ACAACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	80.58333333333331	2	31.166666666666668	0.400379393794157	0.0670837952639451	5.9683473813436	0.333295598530212	0.11438842306389	0.0498137532631506	NaN	NaN	0.123052067429222	0.00675730940044044	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	177	ACA	AAC	ACC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	79.83333333333331	2	31.5	0.384163786238471	0.0663415654213976	5.79069522701621	0.317822220817073	0.120437547477468	0.0512462443647252	NaN	NaN	0.125228788582927	0.0111509468220887	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	178	CCA	ACC	AGA	2	ACACCAGAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	0.75	1	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	79.83333333333331	2	31.833333333333336	0.363543930803322	0.0656155905923368	5.54051144737817	0.297928340210985	0.109732141429457	0.0489858733067321	NaN	NaN	0.116079834191569	0.0102706523844534	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	179	ATT	AGA	ACT	2	CCAGAACTC:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	3	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	80.08333333333331	3	31.583333333333336	0.362085007479425	0.101563372279023	3.56511406971283	0.260521635200403	0.102115568378134	0.0640131227457045	NaN	NaN	0.126373997389091	0.0392541270070065	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	180	CTC	ACT	CAA	2	ATTTCTGAA:GAACTCAAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.24999999999999	3	31.916666666666668	0.307656150003133	0.100428343016685	3.063439470987	0.207227806986448	0.0862766727024824	0.0600926231318987	NaN	NaN	0.108595853223774	0.0563591855423467	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	181	AAA	CAA	ACA	2	CTCAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.74999999999999	2	32.083333333333336	0.286669696632392	0.0650814580158656	4.40478295004558	0.221588238616527	0.080344644900168	0.0497304305427781	NaN	NaN	0.10642093155575	0.0373254279316177	985	0	15	0.015	0.985	0.03
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	ATA	2	AAAGAATAC:GAACATGAC	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.41666666666666	2	32.5	0.269870897248761	0.0642103145422439	4.20292127787683	0.205660582706517	0.0813678520959349	0.0485736017758392	NaN	NaN	0.0976837272882904	0.0352589405580239	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	183	GAC	ATA	CTA	2	CATGACTAC:GAATACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.41666666666666	2	32.166666666666664	0.234622119670259	0.0649053422482923	3.61483525921061	0.169716777421966	0.073284012681737	0.0482972967165829	NaN	NaN	0.0913376469549122	0.0631512464721895	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAG:TACTACCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.74999999999999	3	32.5	0.236957742360063	0.0985020015458152	2.4056134762891	0.138455740814248	0.0747012166043318	0.0604887099018055	NaN	NaN	0.0984341937688182	0.159551446978201	933	0	67	0.067	0.933	0.134
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.41666666666666	3	31.833333333333332	0.231204431105144	0.100709711722406	2.295751096403	0.130494719382738	0.0675936431507286	0.0606457386890006	NaN	NaN	0.0968698069430249	0.177943366048698	910	0	90	0.09	0.91	0.18
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.08333333333331	3	31.166666666666668	0.228981181189789	0.103018812035868	2.22271230530269	0.12596236915392	0.0722647745728585	0.064449190035791	NaN	NaN	0.0969969902566456	0.194073883533494	905	1	94	0.094	0.905	0.188
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.58333333333331	3	31.5	0.247714987416377	0.101851155869296	2.43212740495812	0.14586383154708	0.07496687381607	0.0600849785252492	NaN	NaN	0.097977143319733	0.136552246806959	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.08333333333331	3	32	0.249549853467475	0.100148544468392	2.49179710790741	0.149401308999083	0.0732833297608718	0.0597523155576181	NaN	NaN	0.103656480746243	0.149496614707541	931	0	69	0.069	0.931	0.138
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.08333333333331	3	32.5	0.257172181186926	0.0985020015458152	2.61083203540093	0.158670179641111	0.0772333237687729	0.0587319981927615	NaN	NaN	0.102527360338629	0.121721364700089	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.74999999999997	3	32.5	0.272625681756849	0.0985020015458152	2.76771717811283	0.174123680211034	0.0788686945509867	0.0591759686570603	NaN	NaN	0.105038990625545	0.097376985186003	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.41666666666664	3	32.833333333333336	0.255869309592864	0.0974341006801572	2.62607555062057	0.158435208912706	0.0734637292873499	0.0564169826725102	NaN	NaN	0.101320751688412	0.117888154869252	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGGATTGG	1:1	TRUE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.91666666666664	3	32.833333333333336	0.257828654327118	0.0974341006801572	2.64618498582423	0.160394553646961	0.0789905900089101	0.0595178015904471	NaN	NaN	0.104728635163885	0.125639620259952	930	0	70	0.07	0.93	0.14
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:GATTGGCAT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.08333333333331	5	33.333333333333336	0.22528117443765	0.167357663485657	1.34610611635933	0.0579235109519927	0.0693036455761651	0.0976394344871063	NaN	NaN	0.127566355972388	0.649781515959205	689	0	311	0.311	0.689	0.622
ORF3a	all	ss12	194	CAT	GCA	ATC	2	TGGCATTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.08333333333331	5	34.00000000000001	0.246788896582768	0.163690174515013	1.50765858313709	0.083098722067755	0.0717169136400581	0.0937803158588934	NaN	NaN	0.123767721403074	0.501960218848283	763	0	237	0.237	0.763	0.474
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CATTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.91666666666664	5	33.50000000000001	0.211656453778207	0.16642540730596	1.2717796952066	0.0452310464722472	0.0622120041808848	0.09008582197835	NaN	NaN	0.119661789784748	0.705437485374954	652	0	348	0.348	0.652	0.696
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.41666666666664	5	33.66666666666667	0.210058104799921	0.165503521626615	1.26920625455828	0.0445545831733058	0.0599896945750251	0.0967002852269905	NaN	NaN	0.119542055316937	0.709363896108467	682	1	317	0.317	0.682	0.634
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.58333333333331	5	33.833333333333336	0.209530707593171	0.164591833676269	1.27303222105959	0.0449388739169025	0.0596711544112684	0.095126507600616	NaN	NaN	0.118519584607756	0.704562861792339	658	0	342	0.342	0.658	0.684
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.66666666666666	5	34.41666666666667	0.2092680072815	0.161478827235442	1.29594703444545	0.0477891800460581	0.0598326121913449	0.0938818006583645	NaN	NaN	0.119778214705619	0.689907523051202	672	0	328	0.328	0.672	0.656
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.66666666666666	5	33.91666666666667	0.2092680072815	0.164139760909006	1.27493793169049	0.0451282463724937	0.0601435233218878	0.0950574518231262	NaN	NaN	0.117540551815258	0.7010246405441	678	0	322	0.322	0.678	0.644
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.5	5	33.91666666666667	0.209794072585264	0.164139760909006	1.27814291566787	0.0456543116762583	0.0612053069474993	0.100040432596805	NaN	NaN	0.116324227474602	0.694707530615932	660	0	340	0.34	0.66	0.68
ORF3a	all	ss12	201	GTC	TGT	CGT	2	TATGTCGTT:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.58333333333333	4	34.25	0.209530707593171	0.126951325912032	1.65048065538411	0.0825793816811396	0.061338848499866	0.0862477733707503	NaN	NaN	0.107836024957312	0.443803295455528	766	0	234	0.234	0.766	0.468
ORF3a	all	ss12	202	GTA	CGT	ATT	2	GTCGTTGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.08333333333333	4	34.75	0.211120957185982	0.124963623649128	1.68945930840455	0.086157333536854	0.0583291214444654	0.083808753866101	NaN	NaN	0.110515489007142	0.435629241907575	783	0	217	0.217	0.783	0.434
ORF3a	all	ss12	203	GTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.83333333333333	4	35	0.211925228838758	0.123992985319038	1.7091711139422	0.0879322435197202	0.0614363174133217	0.0804693246945523	NaN	NaN	0.109745433833736	0.422993709451699	784	0	216	0.216	0.784	0.432
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	GTACATGGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.58333333333333	4	35.083333333333336	0.195368780910995	0.123672788927057	1.57972325687767	0.0716959919839381	0.0568838445226037	0.0819258021897842	NaN	NaN	0.105641239479271	0.497344267189078	771	0	229	0.229	0.771	0.458
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:CATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.08333333333333	4	34.75	0.196856443813826	0.124963623649128	1.57530998273992	0.0718928201646976	0.0586281600692033	0.0825228522829495	NaN	NaN	0.101856795221231	0.480298513768484	771	0	229	0.229	0.771	0.458
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	74.58333333333333	4	34.916666666666664	0.181100119848143	0.124314847835042	1.45678591899539	0.0567852720131013	0.0576222854463216	0.08164249868698	NaN	NaN	0.103259330857973	0.582368262177649	728	0	272	0.272	0.728	0.544
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	74.75	4	34.75	0.180643544434896	0.124963623649128	1.44556903168961	0.0556799207857671	0.0562001667968463	0.088723795088468893	NaN	NaN	0.103708986199118	0.59134624204154	722	0	278	0.278	0.722	0.556
ORF3a	all	ss12	208	ACT	CAC	CGA	2	TTCACTTCA:TTCGCCGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.75	0.666666666666667	0.25	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.08333333333333	4	34.416666666666664	0.179737298307158	0.126281753068954	1.423303794405	0.0534555452382036	0.0585079686722598	0.0929771233331119	NaN	NaN	0.104547461430091	0.609138137449781	712	1	287	0.287	0.712	0.574
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACTTCAGAC:GCCGAAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	74.75	4	34.75	0.163812543580385	0.124963623649128	1.31088182942211	0.0388489199312569	0.0550702438288819	0.0816151322654452	NaN	NaN	0.101066096095973	0.700688507394428	664	0	336	0.336	0.664	0.672
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTCAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.08333333333334	5	34.08333333333333	0.146628474234188	0.163243053958072	0.898221827385369	-0.0166145797238842	0.0505017473247398	0.100135932640816	NaN	NaN	0.111041122306227	0.881060115015362	469	0	531	0.531	0.469	0.938
ORF3a	all	ss12	211	CAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GTTCACTAC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0	1	0.666666666666667	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.75	5	34.08333333333333	0.129351945263207	0.163243053958072	0.792388662959161	-0.0338911086948653	0.0477494391346363	0.0950275848265605	NaN	NaN	0.113562554606674	0.76537072426002	391	0	609	0.609	0.391	0.782
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	CACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.08333333333334	5	34.08333333333333	0.128733683316993	0.163243053958072	0.788601292340791	-0.0345093706410791	0.0487496783582524	0.0971030171813795	NaN	NaN	0.111211647851327	0.756330121465824	392	0	608	0.608	0.392	0.784
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.75000000000001	5	34.416666666666664	0.129351945263207	0.161478827235442	0.801045855222911	-0.0321268819722345	0.0480791387572811	0.0958891339685091	NaN	NaN	0.113070401087858	0.776309476967249	403	1	596	0.596	0.403	0.806
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.08333333333334	5	33.75	0.128733683316993	0.165046413582601	0.779984735945599	-0.0363127302656079	0.046776339073482	0.100021973066956	NaN	NaN	0.105032484875443	0.729546714861379	397	0	603	0.603	0.397	0.794
ORF3a	all	ss12	215	GAG	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.91666666666669	5	33.08333333333333	0.127213641474078	0.168775880107432	0.753743019400056	-0.0415622386333545	0.0471522768606773	0.100407080745395	NaN	NaN	0.121722307395203	0.732763870215414	372	0	628	0.628	0.372	0.744
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.58333333333336	5	32.08333333333333	0.114098553183291	0.17469866826028	0.653116330648259	-0.0606001150769883	0.0458979011244196	0.101505985961158	NaN	NaN	0.117706075051855	0.606662934805091	304	0	696	0.696	0.304	0.608
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.25000000000001	5	31.08333333333333	0.114644643047729	0.181054357970061	0.633205653446277	-0.0664097149223324	0.0454009333959335	0.108236374401577	NaN	NaN	0.117283691440798	0.57123645162717	290	0	710	0.71	0.29	0.58
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AAT	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.91666666666669	5	31.416666666666664	0.115195995681218	0.178884786483983	0.643967538802034	-0.0636887908027653	0.0486879496244249	0.10720684256095	NaN	NaN	0.125831927316592	0.612757149597929	283	0	717	0.717	0.283	0.566
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTACT:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.91666666666669	5	30.749999999999996	0.115195995681218	0.183277466946071	0.628533324912844	-0.0680814712648532	0.0459110293009027	0.112975705029758	NaN	NaN	0.124691347881409	0.585065962999771	310	0	690	0.69	0.31	0.62
ORF3a	all	ss12	220	ACT	GAG	TAC	2	ATTACTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.75000000000003	5	30.66666666666666	0.0848961862428276	0.183841843524739	0.461789245664323	-0.0989456572819112	0.0341951999144907	0.108912224963634	NaN	NaN	0.113953498003369	0.385230914811003	168	0	832	0.832	0.168	0.336
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	ACTACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.75000000000003	5	30.33333333333333	0.0848961862428276	0.186134722106651	0.456100749403349	-0.101238535863823	0.0340491973840994	0.110949919171587	NaN	NaN	0.123993709699323	0.414224957994497	184	0	816	0.816	0.184	0.368
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.75000000000003	5	30.33333333333333	0.0848961862428276	0.186134722106651	0.456100749403349	-0.101238535863823	0.0345943174264618	0.114259701831397	NaN	NaN	0.116556177355298	0.385076093345889	180	1	819	0.819	0.18	0.36
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.08333333333337	5	29.999999999999993	0.086948881899372693	0.18848582121068	0.461301976673279	-0.101536939311307	0.0345776457313836	0.110438792502311	NaN	NaN	0.119484767955533	0.395441951072576	204	0	796	0.796	0.204	0.408
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.4166666666667	5	30.66666666666666	0.0877980575084776	0.183841843524739	0.477573852748398	-0.0960437860162613	0.0336415863994757	0.109943788910623	NaN	NaN	0.121182653710517	0.428037770839089	182	0	818	0.818	0.182	0.364
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TCA	2	GGTATTCAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.4166666666667	5	31.66666666666666	0.0891034205520704	0.177291583548173	0.502581221109459	-0.0881881629961024	0.0336999955470843	0.107195451754769	NaN	NaN	0.113954213498529	0.438995134168472	207	1	792	0.792	0.207	0.414
ORF3a	all	ss12	226	CAA	TCA	AAA	2	ATTCAAAAC:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.6666666666667	5	31.41666666666666	0.073228852172937	0.178884786483983	0.409363219825815	-0.105655934311046	0.0321592666806394	0.112517649136187	NaN	NaN	0.115152695939393	0.358865520231999	156	0	844	0.844	0.156	0.312
ORF3a	all	ss12	227	AAC	AAA	CGC	2	CAAAACGCT:GAACATGTT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	CGC	TAC	2	AACGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAC	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AACAAGCTT:AATAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAT:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	AGA	GCC	2	AAAGATCCG:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCG	GCC	G--	1	GAGCCTGAA:GATCCG---	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCG---CCG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	CCG	-CC	ACA	1	---CCGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	2	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AAT	ACA	TGT	2	CCGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAC:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGACCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GACCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	73.49999999999999	4	31.500000000000004	0.238202814237623	0.139125907283501	1.71213844271456	0.099076906954122	0.0618081994678923	0.0801430562004119	NaN	NaN	0.0946477470950271	0.295193559219424	856	1	143	0.143	0.856	0.286
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	73.24999999999999	4	31.250000000000004	0.258178784173293	0.140349835343382	1.83953749244969	0.11782894882991	0.0658132701164938	0.0759807787938179	NaN	NaN	0.0950828294987668	0.215262459414093	908	0	92	0.092	0.908	0.184
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG:TTGTTTATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	72.41666666666666	4	31.750000000000004	0.261733641996886	0.137923200937065	1.89767667962053	0.12381044105982	0.0663574077405013	0.076156596432456	NaN	NaN	0.0942871913290116	0.189142356956662	896	0	104	0.104	0.896	0.208
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA:TTTATTAGC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	72.24999999999999	4	31.250000000000004	0.26245651320671	0.140349835343382	1.87001653806418	0.122106677863327	0.0640591844942002	0.0736217985213618	NaN	NaN	0.100671339354129	0.225158900640998	889	0	111	0.111	0.889	0.222
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATTAGCATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	71.74999999999999	4	30.750000000000004	0.264649534797667	0.142863650574837	1.85246235646929	0.12178588422283	0.0673723472242608	0.0782047473474419	NaN	NaN	0.10060249558679	0.226062072954911	888	0	112	0.112	0.888	0.224
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGCATTTTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	72.24999999999999	4	30.750000000000004	0.243069327110716	0.142863650574837	1.70140778380424	0.100205676535879	0.0627963747784089	0.0796629396117792	NaN	NaN	0.0924705898850801	0.278520387702553	863	0	137	0.137	0.863	0.274
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	70.74999999999999	4	31.41666666666667	0.249180688951088	0.139531497680893	1.78583827374204	0.109649191270195	0.0649791453321337	0.0754399008586225	NaN	NaN	0.0953510756416346	0.250163507210108	872	0	128	0.128	0.872	0.256
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACATTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	71.08333333333331	5	31.083333333333336	0.247795958666601	0.181054357970061	1.36862741910679	0.0667416006965398	0.0644101723449469	0.0959873600782898	NaN	NaN	0.116163407503602	0.565596171319469	726	0	274	0.274	0.726	0.548
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	AGG	2	ACAATTGGA:ACATTAGGT	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	70.66666666666664	5	31.500000000000004	0.249529315369302	0.178350531835637	1.39909487681966	0.0711787835336647	0.067304278744391	0.0924402837422304	NaN	NaN	0.10897923061402	0.513665501399112	774	0	226	0.226	0.774	0.452
ORF3a	all	ss12	11	GGA	AGG	AAC	2	ATTGGAACT:TTAGGTTCA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	70.49999999999997	5	31.33333333333334	0.230684450150283	0.179422266799376	1.28570692069244	0.0512621833509075	0.0600838061788923	0.0930255152649108	NaN	NaN	0.10609948582436	0.628987783685726	691	0	309	0.309	0.691	0.618
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGTTCAATC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	70.99999999999997	5	31.500000000000004	0.228784770270838	0.178350531835637	1.28278154214689	0.0504342384352004	0.061371854239188	0.0917290112324364	NaN	NaN	0.115674978396813	0.662837056641081	683	0	317	0.317	0.683	0.634
ORF3a	all	ss12	13	ATC	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATCACT	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	71.49999999999997	5	31.16666666666667	0.226916358788052	0.180507022556888	1.25710543320573	0.0464093362311646	0.063024578143167	0.0894216128758013	NaN	NaN	0.104812294986164	0.657921087007564	683	0	317	0.317	0.683	0.634
ORF3a	all	ss12	14	ACT	AAC	TCG	2	ATCACTCGT:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	71.74999999999997	5	31.083333333333336	0.207388031363475	0.181054357970061	1.14544622779954	0.0263336733934137	0.0593405209574175	0.0934020485802478	NaN	NaN	0.106613958446918	0.804908037828928	609	0	391	0.391	0.609	0.782
ORF3a	all	ss12	15	CGT	TCG	GAA	1	ACTCGT---:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.416666666666667	0.75	0.5	1	0	1	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	71.41666666666663	5	31.41666666666667	0.227225622340203	0.178884786483983	1.27023447217826	0.0483408358562195	0.0616290007550863	0.0920860588022158	NaN	NaN	0.107529430913295	0.653028373571314	686	0	314	0.314	0.686	0.628
ORF3a	all	ss12	16	---	GAA	GCA	1	CGT------:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	71.41666666666663	4	31.333333333333336	0.227225622340203	0.139939466685309	1.62374223457046	0.0872861556548937	0.0606453441504168	0.0775921564140689	NaN	NaN	0.101310891144597	0.388925646292161	793	0	207	0.207	0.793	0.414
ORF3a	all	ss12	17	---	GCA	AGG	1	------GGT:AAGCAAGGT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	73.8333333333333	4	31.666666666666668	0.236938085116859	0.138321779350139	1.71294850478382	0.0986163057667199	0.0619787458979421	0.0799571135463981	NaN	NaN	0.0998704194949917	0.323425713687014	852	0	148	0.148	0.852	0.296
ORF3a	all	ss12	18	GGT	-GG	TAG	1	---GGTAGT:CAAGGTGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.0833333333333	5	32	0.246788896582769	0.175211138386129	1.40852287620492	0.0715777581966398	0.0602773222537248	0.0891061156099777	NaN	NaN	0.107164168748612	0.504180689207991	769	0	231	0.231	0.769	0.462
ORF3a	all	ss12	19	AGT	TAG	AAT	2	GGTAGTGTG:GGTGAAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.8333333333333	5	31.5	0.262179645500183	0.178350531835637	1.47002446699627	0.0838291136645459	0.0636479838059615	0.0896477614919086	NaN	NaN	0.107715338953509	0.436423554625781	791	0	209	0.209	0.791	0.418
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AGTGTGCAA:GAAATCAAG	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.66666666666663	5	32	0.237252996159118	0.175211138386129	1.35409768091491	0.0620418577729891	0.0585762962802249	0.0907694999537679	NaN	NaN	0.10740912572014	0.563519452624891	731	0	269	0.269	0.731	0.538
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	AAA	2	ATCAAGGAT:GTGCAAAAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.49999999999997	5	32.583333333333336	0.220553902912914	0.171685985854599	1.28463544543293	0.0488679170583153	0.0564205737790462	0.089058119734487	NaN	NaN	0.107532100712252	0.649505280311849	689	0	311	0.311	0.689	0.622
ORF3a	all	ss12	22	AAT	AAA	TGC	2	AAGGATGCT:CAAAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.49999999999997	6	32.916666666666664	0.206677011490545	0.208831643632827	0.989682444169859	-0.00215463214228176	0.0533963339004343	0.102924773586179	NaN	NaN	0.110878713005776	0.984496216776872	508	0	492	0.492	0.508	0.984
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTGTT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.0833333333333	7	32.916666666666664	0.207964387858376	0.250079150443413	0.831594267213547	-0.0421147625850367	0.0556653735102708	0.116859707322099	0.677420020364423	0.219600793195116	0.120258783147488	0.726187753574093	372	0	628	0.628	0.372	0.744
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTGTTCCT	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.5833333333333	7	33.416666666666664	0.209530707593171	0.245651054395603	0.852960749990259	-0.0361203468024315	0.0542483068203177	0.113110312518137	0.670884570662863	0.20358738602411	0.121881861421448	0.766958688099999	392	0	608	0.608	0.392	0.784
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:GTTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.66666666666663	7	33.333333333333336	0.192221818973333	0.246378050229027	0.780190519385343	-0.0541562312556944	0.0516785236520687	0.110870244195944	0.76662074221212	0.308820181401678	0.129097224792797	0.674851063428329	314	1	685	0.685	0.314	0.628
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAA	2	CCTGCAAAT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.5833333333333	7	33	0.189637541338727	0.249329979819956	0.760588604209034	-0.059692438481229	0.0528614994745787	0.11168373413404	NaN	NaN	0.124037938749501	0.630343523864817	292	0	708	0.708	0.292	0.584
ORF3a	all	ss12	27	AAT	AAA	TTC	2	GCAAATTCT:TCAGATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.99999999999997	7	32.916666666666664	0.18848582121068	0.250079150443413	0.753704660610359	-0.0615933292327334	0.0516833036371987	0.110886363078183	NaN	NaN	0.128673097712058	0.632165793847307	317	0	683	0.683	0.317	0.634
ORF3a	all	ss12	28	TCT	TTC	TCT	2	AATTCTCTT:GATTTTGTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.24999999999997	7	33.333333333333336	0.190569155883606	0.246378050229027	0.773482685273538	-0.0558088943454207	0.0503622121503265	0.112789145224751	NaN	NaN	0.122937384075195	0.649856215079225	337	0	663	0.663	0.337	0.674
ORF3a	all	ss12	29	CTT	TCT	TCA	2	TCTCTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.91666666666664	6	34	0.208483869201781	0.20119798994601	1.03621248531224	0.00728587925577187	0.0569005388659281	0.0950081579600423	NaN	NaN	0.10664376436842	0.945531073260907	550	0	450	0.45	0.55	0.9
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	CTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.99999999999997	6	34.25	0.20822380244871	0.199515431752951	1.04364760469527	0.00870837069575855	0.0538379922303944	0.0968517659458028	NaN	NaN	0.109752618596344	0.936757857919719	555	0	445	0.445	0.555	0.89
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACG:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.16666666666664	5	33.75	0.207705622965276	0.165046413582601	1.25846795732599	0.0426592093826751	0.0559587232535735	0.0856599853472569	NaN	NaN	0.0916831384470776	0.641724092630633	698	0	302	0.302	0.698	0.604
ORF3a	all	ss12	32	ACG	TAC	GGC	2	GCTACGGCT:GCTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.58333333333331	5	33.333333333333336	0.203403693684308	0.167357663485657	1.21538320652845	0.0360460301986509	0.0521227222270111	0.0826997564786931	NaN	NaN	0.0942965018598898	0.702266559623745	679	1	320	0.32	0.679	0.64
ORF3a	all	ss12	33	GCA	GGC	AAC	2	ACGGCTACC:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.91666666666664	6	32.666666666666664	0.199515431752951	0.210676789099802	0.94702141894918	-0.0111613573468504	0.0524497411314101	0.0993544115896006	NaN	NaN	0.116283930206995	0.923533549205995	449	0	551	0.551	0.449	0.898
ORF3a	all	ss12	34	ACC	AAC	CAT	2	GCAACGATA:GCTACCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.66666666666664	6	32.916666666666664	0.200233049317567	0.208831643632827	0.958825232777569	-0.00859859431525919	0.0545668300169145	0.102966341141526	NaN	NaN	0.112257786407076	0.938944254380094	505	0	495	0.495	0.505	0.99
ORF3a	all	ss12	35	ATA	CAT	ACC	2	ACCATCCCT:ACGATACCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.33333333333331	6	33.25	0.20119798994601	0.206421458535371	0.974695127985126	-0.00522346858936118	0.0531148187560838	0.0988136897993048	NaN	NaN	0.111629382445879	0.962678244552236	509	0	491	0.491	0.509	0.982
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATCCCTTTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.83333333333331	6	33.583333333333336	0.23666322859543	0.204066610769614	1.15973518501082	0.0325966178258156	0.0656723266299066	0.103645249996151	NaN	NaN	0.116006950112755	0.778719227429937	600	1	399	0.399	0.6	0.798
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCTTTACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.49999999999999	6	33.083333333333336	0.269530500680923	0.207619511953736	1.29819446228629	0.061910988727187	0.0742731463361261	0.0986333757120179	NaN	NaN	0.128016694557749	0.628658046145633	685	0	315	0.315	0.685	0.63
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:TTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.83333333333331	6	33.083333333333336	0.250477612683732	0.207619511953736	1.20642617028955	0.0428581007299955	0.0699434063383243	0.109621652088145	NaN	NaN	0.124836278831439	0.731361897179421	661	0	339	0.339	0.661	0.678
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CAC	2	CAAGCCACT:CAAGCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.41666666666664	6	32.833333333333336	0.269870897248761	0.209443067094397	1.28851673627912	0.0604278301543641	0.0727459403655312	0.0980909321753365	NaN	NaN	0.129298835817646	0.640249382692946	687	0	313	0.313	0.687	0.626
ORF3a	all	ss12	40	ACT	CAC	ACT	2	GCCACTCTG:GCCTCACTC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.41666666666664	6	32.833333333333336	0.269870897248761	0.209443067094397	1.28851673627912	0.0604278301543641	0.0712835377825291	0.0990244475528053	NaN	NaN	0.137472740286912	0.660254170494257	673	0	327	0.327	0.673	0.654
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	ACTCTGCCT:TCACTCCCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.74999999999999	6	32.5	0.250788414893047	0.211925228838758	1.18338159296672	0.038863186054289	0.0699079629160635	0.100276360123388	1.28622652919838	0.357551151003756	0.130231399097521	0.765385369079519	613	0	387	0.387	0.613	0.774
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC:CTGCCTTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.24999999999999	6	32.166666666666664	0.248935191022842	0.214467334863233	1.16071378040665	0.0344678561596085	0.0691658227672642	0.104563280746795	1.33516607873667	0.384660985010713	0.132700073508634	0.795062364647188	625	0	375	0.375	0.625	0.75
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.49999999999999	7	31.916666666666668	0.265512409704092	0.259437126225709	1.02341717072944	0.00607528347838315	0.0733503577909937	0.116438109039257	0.905353490174939	0.258305115730741	0.143944634913336	0.966334721987511	483	0	517	0.517	0.483	0.966
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666666	7	32.25	0.26683825481505	0.256240196522408	1.04135985858766	0.0105980582926418	0.0755304058121986	0.117859895809053	0.92458814918575	0.260040284868908	0.143628847619583	0.941179225829726	515	0	485	0.485	0.515	0.97
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.99999999999999	7	32.25	0.267506207954049	0.256240196522408	1.0439666047112801	0.0112660114316415	0.0745419632936599	0.118202956934516	0.789556376267066	0.186095167483826	0.142278097797547	0.936887039255532	530	0	470	0.47	0.53	0.94
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.83333333333331	7	32.75	0.272278228294921	0.251591206901637	1.08222473928261	0.0206870213932843	0.0782322902400655	0.119984263306805	NaN	NaN	0.131493932086346	0.874990285500701	606	0	394	0.394	0.606	0.788
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.66666666666664	7	32.75	0.272974032901059	0.251591206901637	1.08499035503964	0.0213828259994222	0.0736817234471932	0.117248401230654	1.06728321235737	0.30934810567435	0.137398840666765	0.876327863901403	560	0	440	0.44	0.56	0.88
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.33333333333331	8	32.75	0.274376485003047	0.295559839412279	0.928328035191266	-0.0211833544092318	0.075129760147237	0.127212106289955	0.652107460794645	0.154567690731023	0.144167085349204	0.883182429340729	459	0	541	0.541	0.459	0.918
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.41666666666664	8	32.666666666666664	0.274024507731712	0.29648455248311	0.924245480706191	-0.0224600447513982	0.0758654846642622	0.129600326956794	NaN	NaN	0.148239490187119	0.879571935331674	441	0	559	0.559	0.441	0.882
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.91666666666664	8	33.166666666666664	0.27615017609084	0.291022534714547	0.948896195827945	-0.0148723586237073	0.0722564648378324	0.130909533879363	0.83361224459566	0.254997548530819	0.142448729661364	0.916847960495084	462	0	538	0.538	0.462	0.924
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT:GTTGCATTG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.91666666666664	8	32.166666666666664	0.271931669012678	0.30215833840741	0.899964139483796	-0.0302266693947317	0.0731571262921439	0.130548413088702	0.616569630509724	0.14439151772058	0.154448461480017	0.844839381781304	432	0	568	0.568	0.432	0.864
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	GCT	2	GCACTTCTT:GCATTGCTT	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.24999999999999	8	32.666666666666664	0.27472937774977	0.29648455248311	0.926622906484887	-0.0217551747333395	0.074614935288652	0.12567000072407	0.755635547189501	0.220092255784691	0.148779840911651	0.883744606215465	454	1	545	0.545	0.454	0.908
ORF3a	all	ss12	53	CTT	GCT	TGC	2	CTTCTTGCT:TTGCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.16666666666664	8	32.25	0.252986022490643	0.301197473497683	0.839934078970916	-0.0482114510070397	0.070776843209263	0.127538074276301	0.761083534389513	0.269765385177445	0.14670769012804	0.742441023244879	361	0	639	0.639	0.361	0.722
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.83333333333331	8	31.583333333333332	0.250477612683732	0.309062449462982	0.810443368707374	-0.0585848367792503	0.0709540690903303	0.134092727400775	0.524784844456843	0.12250730576561	0.15272262881129	0.701272821965011	347	0	653	0.653	0.347	0.694
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.33333333333331	8	32.083333333333336	0.25235417746591	0.303125437044423	0.832507426385755	-0.0507712595785134	0.0725625883619047	0.138743292541394	0.678659588306163	0.219937744807623	0.149150608360271	0.733553337230266	345	1	654	0.654	0.345	0.69
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.99999999999999	8	32.083333333333336	0.249858334896404	0.303125437044423	0.824273730811271	-0.0532671021480194	0.074238910499043	0.133083803095809	0.60362545312369	0.172083894901709	0.147075092356505	0.717220342896761	389	2	609	0.609	0.389	0.778
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAA	2	TTTCAAAAT:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.66666666666666	8	32.75	0.254900869216763	0.295559839412279	0.862434049645019	-0.0406589701955159	0.0713920258224597	0.1377658449641	0.640398131431669	0.178071898472745	0.143852251988502	0.777449778325817	382	0	618	0.618	0.382	0.764
ORF3a	all	ss12	58	AAT	AAA	CGC	2	CAAAATGCT:CAGAGCGCT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.49999999999999	8	32.416666666666664	0.251725510203618	0.299294202221815	0.841063770480452	-0.0475686920181963	0.0718410072514743	0.139155137361802	NaN	NaN	0.149080479553405	0.749665378279929	367	0	633	0.633	0.367	0.734
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AATGCTTCA:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.16666666666666	7	33.083333333333336	0.256845208849377	0.248585325313905	1.03322755888764	0.00825988353547175	0.0740506971628043	0.109623838064113	NaN	NaN	0.126080069059912	0.947765556251283	551	0	449	0.449	0.551	0.898
ORF3a	all	ss12	60	TCA	TTC	AAA	2	GCTTCAAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.41666666666666	7	33	0.274024507731711	0.249329979819956	1.09904355637291	0.0246945279117555	0.0756912018322884	0.113600586942714	0.926201698783215	0.235380058632168	0.141136085073242	0.861103500927593	577	0	423	0.423	0.577	0.846
ORF3a	all	ss12	61	AAA	AAA	AAT	2	TCAAAAGTA:TCCAAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.66666666666666	7	32.75	0.272974032901059	0.251591206901637	1.08499035503964	0.0213828259994222	0.076169749313481	0.11350062838249	NaN	NaN	0.13520066299963	0.874333699711495	593	0	407	0.407	0.593	0.814
ORF3a	all	ss12	62	ATC	AAT	AAT	2	AAAATCATA:AAAGTAATT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.33333333333333	7	33.416666666666664	0.278672667324362	0.245651054395603	1.13442487763794	0.0330216129287594	0.0752537494238723	0.106893285379283	NaN	NaN	0.130488962156599	0.800221397327713	632	0	368	0.368	0.632	0.736
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATCATAACC:GTAATTCCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.33333333333333	7	33.416666666666664	0.278672667324362	0.245651054395603	1.13442487763794	0.0330216129287594	0.0788892407755623	0.100585656457636	NaN	NaN	0.130112913946284	0.799656276354261	624	0	376	0.376	0.624	0.752
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTCCTTTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.33333333333333	7	34.083333333333336	0.283107148654449	0.239987262930077	1.17967572611108	0.0431198857243722	0.0753104514170245	0.108982051813426	1.04062611473203	0.256953516257076	0.126139063142823	0.73246827207879	644	0	356	0.356	0.644	0.712
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:CCTTTTAAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.66666666666666	7	34.416666666666664	0.262862230268109	0.237252996159118	1.10794061412744	0.0256092341089908	0.0767790399541667	0.108366005723794	0.844228825354494	0.189395311788394	0.120559573693929	0.831779581624144	628	0	372	0.372	0.628	0.744
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:TTTAACAGC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.25	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.66666666666666	7	34.75	0.244568640424989	0.234580833893542	1.042577248813	0.00998780653144671	0.0682844856461751	0.097129559321741707	NaN	NaN	0.116668266733425	0.931777564802659	570	0	430	0.43	0.57	0.86
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	CTT	2	AAAAAGAGA:AACAGCTTG	1:1	TRUE	2.25	0.416666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	75.83333333333333	7	35.416666666666664	0.229625165344413	0.229414483788198	1.00091834461685	2.10681556215203e-4	0.0677997677486384	0.104020637539361	NaN	NaN	0.120877581987703	0.998609341177441	504	0	496	0.496	0.504	0.992
ORF3a	all	ss12	68	AGA	CTT	ATG	2	AAGAGATGG:AGCTTGTGG	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	75.49999999999999	6	35.75	0.230812226626943	0.18998582171068	1.21489185113211	0.0408264049162628	0.0678009026612165	0.0840552165856651	NaN	NaN	0.113272193705952	0.718527521906266	634	0	366	0.366	0.634	0.732
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:TTGTGGCAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	75.41666666666666	6	35.833333333333336	0.231110927283054	0.189483161783181	1.21969110662987	0.0416277654998732	0.0704859949392931	0.0821217194614401	NaN	NaN	0.109567619206841	0.70399913934593	671	0	329	0.329	0.671	0.658
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	74.83333333333333	6	35.75	0.270614772901576	0.18998582171068	1.42439457042053	0.0806289511908959	0.0803762862809363	0.0891564667610263	NaN	NaN	0.119207595266702	0.498803043964096	751	1	248	0.248	0.751	0.496
ORF3a	all	ss12	71	CGC	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCGCTGC	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.16666666666666	6	35.41666666666667	0.269171025507784	0.192023563619284	1.40176039041467	0.0771474618885002	0.0795566974279317	0.0885437348386436	NaN	NaN	0.116598226573393	0.508194207138029	745	0	255	0.255	0.745	0.51
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CGCTGCCTT:CTAGCACTC	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.08333333333333	5	34.66666666666667	0.284238173143925	0.160180575223544	1.77448590596737	0.124057597920381	0.0822996727168577	0.0795140915807118	NaN	NaN	0.11116790300516	0.264444398006264	886	0	114	0.114	0.886	0.228
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:TGCCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.33333333333333	4	34.333333333333336	0.264238228927333	0.126615652181289	2.08693178430258	0.137622576746044	0.0799323720145789	0.0692080554725484	NaN	NaN	0.10387405013946199	0.185204807185805	911	0	89	0.089	0.911	0.178
ORF3a	all	ss12	74	TAT	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTTTATCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.16666666666666	4	34	0.279401963476042	0.127969137773073	2.183354270711	0.15143282570297	0.0804299215918196	0.0703722091735334	NaN	NaN	0.10589830623848	0.152721768049142	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	75	AAG	CAA	AAG	2	TATCAAAGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.416666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.5	3	34	0.296875661285402	0.0938723572155045	3.16254614341748	0.203003304069898	0.082275353163148	0.0595932085405228	NaN	NaN	0.103267555993751	0.0493217821661998	972	0	28	0.028	0.972	0.056
ORF3a	all	ss12	76	AGC	AAG	CTT	2	AAGGGTGTT:CAAAGCTTC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	77.5	3	34	0.336228950088493	0.0938723572155045	3.58176741334625	0.242356592872988	0.0882216787078684	0.0623420208308733	NaN	NaN	0.110147065332252	0.0277856140610604	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	77	GTT	CTT	CCA	2	AGCTTCCAA:GGTGTTCAC	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.83333333333333	3	33.666666666666664	0.314611132561275	0.0948631103318397	3.31647498654363	0.21974802222943501	0.0888731989511121	0.0593398685447464	NaN	NaN	0.104955898627427	0.0362851356257773	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	78	CAA	CCA	ACT	2	GTTCACTTT:TTCCAACTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.5	4	33.916666666666664	0.316294221734958	0.128312053707491	2.46503904033836	0.187982168027467	0.0896061101266348	0.0698506878591272	NaN	NaN	0.111821663007194	0.0927456280210196	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	79	CTT	ACT	TGT	2	CAACTTGTT:CACTTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.83333333333333	4	32.916666666666664	0.290740699021438	0.132575542143044	2.19301912194135	0.158165156878394	0.0818418683811021	0.069937311764545	NaN	NaN	0.111013385397579	0.154232512142816	931	1	68	0.068	0.931	0.136
ORF3a	all	ss12	80	GTT	TGT	TTG	2	CTTGTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.5	4	32.916666666666664	0.273673442339373	0.132575542143044	2.06428303377473	0.141097900196329	0.0877906535212759	0.0710129559395682	NaN	NaN	0.103705888192144	0.173653337716718	918	0	82	0.082	0.918	0.164
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	GTTTGCAAC:GTTTGCAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.16666666666667	4	32.75	0.270897321493184	0.133313895827917	2.03202614259252	0.137583425665267	0.0773537942858708	0.0747419034096639	NaN	NaN	0.107372592183909	0.200065674551351	907	0	93	0.093	0.907	0.186
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAGTCTG	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.5	4	33.416666666666664	0.273673442339373	0.130408872715656	2.0985799251259	0.143264569623718	0.0829591624998599	0.0706754279009801	NaN	NaN	0.108527023516998	0.186807643745986	926	0	74	0.074	0.926	0.148
ORF3a	all	ss12	83	CTG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG:AGTCTGTTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.5	3	33.416666666666664	0.273673442339373	0.0956200277799543	2.86209331552554	0.178053414559419	0.0787442469794582	0.0577816623534573	NaN	NaN	0.0933930630281614	0.0565860042544234	981	0	19	0.019	0.981	0.038
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	AGT	2	CTGTTAGTT:TTGCTGTTG	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.25	3	32.416666666666664	0.266505540694197	0.0987726497511971	2.69817142058565	0.167732890943	0.0779947832354399	0.0579065624619993	NaN	NaN	0.0958912575091357	0.0802566283381105	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	85	GTT	AGT	GTT	2	CTGTTGTTG:TTAGTTGGT	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.91666666666667	4	32.083333333333336	0.299862619562067	0.136351658368326	2.19918571692065	0.163510961193741	0.0935153455981736	0.0704790864579383	NaN	NaN	0.096580700868102	0.0904557931381271	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	86	GGT	GTT	GTT	2	GTTGGTTTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.75	4	32.083333333333336	0.26452672930594	0.136351658368326	1.94003309143021	0.128175070937614	0.0807512819054654	0.0711344619039	NaN	NaN	0.086451992419057	0.138176575165481	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	87	TTT	GTT	TCT	2	GGTTTTCTC:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.25	4	31.916666666666668	0.2284320849576	0.137132914796851	1.66577138169928	0.0912991701607493	0.0699504389317269	0.0717949274678782	NaN	NaN	0.0797774066902682	0.252447884985778	879	0	121	0.121	0.879	0.242
ORF3a	all	ss12	88	CTC	TCT	AAC	2	TTTCTCACA:TTTGTAACA	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	81.58333333333333	4	31.583333333333332	0.227341815278809	0.138722674692595	1.63882231785533	0.0886191405862143	0.0710550292659863	0.0744007964272059	NaN	NaN	0.0840776633419697	0.291875928477725	871	0	129	0.129	0.871	0.258
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	CTCACAGTC:GTAACAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	81.33333333333333	4	31.833333333333332	0.211674350763162	0.137526919369799	1.53914849349593	0.0741474313933635	0.0689959396045131	0.0782271616087747	NaN	NaN	0.0796408380028412	0.351841800185828	830	0	170	0.17	0.83	0.34
ORF3a	all	ss12	90	GTC	AGT	CTA	2	ACAGTCTAT:ACAGTTTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.83333333333333	4	32.5	0.229809831868383	0.134437018317738	1.709423749084	0.0953728135506447	0.0717632806628576	0.0723153117113734	NaN	NaN	0.0806444327325966	0.236954401238462	882	0	118	0.118	0.882	0.236
ORF3a	all	ss12	91	TAC	CTA	CTC	2	GTCTATGTA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.33333333333333	4	33.166666666666664	0.248629004244657	0.131483259230803	1.89095559160287	0.117145745013854	0.0741345339955506	0.069565769983634	NaN	NaN	0.0838596643647355	0.1624358268529	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	92	GTA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TATGTACAC	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.66666666666667	4	32.833333333333336	0.247411820206618	0.132943691128056	1.86102716200577	0.114468129078562	0.0745665645108477	0.0690862272453308	NaN	NaN	0.0889374508574912	0.19807222554247	888	0	112	0.112	0.888	0.224
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	GTACACCTA:TCACACCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.08333333333334	3	32.083333333333336	0.232332454618518	0.0998703029515669	2.32634174276201	0.132462151666951	0.0744152453425179	0.0603271400612106	NaN	NaN	0.0785613939371173	0.0917770661847261	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	94	CTA	CCT	ATT	2	CACCTATTG:CACCTTTTG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.91666666666667	3	31.583333333333332	0.23290063730458	0.101563372279023	2.29315581078519	0.131337265025557	0.0698061334963204	0.0627843971615539	NaN	NaN	0.0818980269650151	0.108787199435712	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	95	TTG	ATT	GCT	2	CTATTGCTG:CTTTTGCTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.75	3	31.25	0.26452672930594	0.102724391304868	2.57511118776914	0.161802338001072	0.0820324934355416	0.0622710577676507	NaN	NaN	0.0901442558354321	0.0726653680633992	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	TTGCTCGTT:TTGCTGGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.91666666666667	3	31.75	0.267841453433817	0.100992663859693	2.65208821311936	0.166848789574124	0.0809731181224225	0.0614767779823993	NaN	NaN	0.0915643750500931	0.0684243375462788	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	97	GCA	CGT	AGC	2	CTCGTTGCT:CTGGCAGCT	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.08333333333334	3	31.416666666666668	0.263223932942835	0.102140577511979	2.57707504064155	0.161083355430856	0.0810561304246255	0.0622258196564984	NaN	NaN	0.0827038710277144	0.0514493851101831	981	0	19	0.019	0.981	0.038
ORF3a	all	ss12	98	GCT	AGC	TGC	2	GCAGCTGCT:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.33333333333334	2	31.166666666666668	0.279903184417457	0.0670837952639451	4.17244109872081	0.212819389153512	0.0833043751580244	0.0490038030485568	NaN	NaN	0.0822415333615171	0.00966089486903375	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC:GCTGCTGGG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.91666666666669	2	31.083333333333332	0.277490994441353	0.0672719567702241	4.12491337793486	0.210219037671129	0.0839092340766907	0.049860553532543	NaN	NaN	0.0807102504213748	0.00919778518546684	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CCT	2	GCTGGCCTT:GCTGGGCTA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.91666666666669	2	31.083333333333332	0.273452185043192	0.0672719567702241	4.06487633438704	0.206180228272968	0.0805541615596978	0.0491513001136675	NaN	NaN	0.0804568643535332	0.0103886206779183	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	101	CTA	CCT	AGA	2	GGCCTTGAA:GGGCTAGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.666666666666667	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.58333333333336	2	32.083333333333336	0.274785181580729	0.0650814580158656	4.22217310364715	0.209703723564863	0.0842997620518919	0.0468247111366307	NaN	NaN	0.0784951312643018	0.00755016638751378	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	102	GAA	AGA	AGC	2	CTAGAAGCC:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.75000000000001	2	32.083333333333336	0.274117044773635	0.0650814580158656	4.21190694140274	0.20903558675777	0.0802276135067664	0.048047841264667	NaN	NaN	0.0732514347400496	0.00432170918136354	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CCC	2	GAAGCCCCA:GAAGCCCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.08333333333336	2	32.75	0.294640950387176	0.0636987401522852	4.62553811398428	0.230942210234891	0.0858260771226584	0.0472191785411298	NaN	NaN	0.085697355722033	0.00704186203345037	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	104	CCA	CCC	ATT	2	GCCCCATTT:GCCCCTTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.33333333333336	2	32.75	0.311728601865911	0.0636987401522852	4.89379540506858	0.248029861713626	0.0891741586304059	0.0473395848034697	NaN	NaN	0.0856631695319081	0.00378665510946638	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CCATTTCTT:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	82.66666666666669	2	32.416666666666664	0.328691198198366	0.0643826713791054	5.10527430996035	0.264308526819261	0.0880284578910019	0.0471147285522693	NaN	NaN	0.0890892523594446	0.00300932749265201	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	82.16666666666669	2	32.916666666666664	0.331205550124057	0.0633621979772033	5.22717899153719	0.267843352146854	0.0909263856271593	0.0486657788161857	NaN	NaN	0.0827182892427387	0.00120362997685056	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	107	TAT	CTA	TCT	2	CTCTATCTT:CTTTATCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	82.16666666666669	2	32.916666666666664	0.331205550124057	0.0633621979772033	5.22717899153719	0.267843352146854	0.0917166580274419	0.045921815312574	NaN	NaN	0.0909991202473477	0.0032466853915461	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	108	CTT	TCT	TTA	2	TATCTTTAT:TATCTTTTA	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	83.00000000000003	2	32.583333333333336	0.327036398610183	0.0640388786228151	5.10684143200581	0.262997519987368	0.0891299625472245	0.0455916722904403	NaN	NaN	0.0840576921860356	0.00175537277014725	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	109	TAT	TTA	AGC	2	CTTTATGCT:CTTTTAGCC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	83.33333333333336	2	32.583333333333336	0.325398436972397	0.0640388786228151	5.08126381926474	0.261359558349581	0.0879035923890376	0.048972961134771	NaN	NaN	0.0865470995467909	0.00252897009440871	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	110	GCC	AGC	CCT	2	TATGCTTTA:TTAGCCCTA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.83333333333336	2	32.916666666666664	0.309399206498442	0.0633621979772033	4.88302515341654	0.246037008521239	0.0862606951428639	0.0490130315495811	NaN	NaN	0.0884506341726793	0.00540865302388831	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	111	CTA	CCT	AAT	2	GCCCTAATC:GCTTTAGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.58333333333336	2	33.166666666666664	0.310559474021052	0.0628640039123036	4.94017966870656	0.247695470108748	0.0904316376038134	0.0470255339574636	NaN	NaN	0.0854373358912195	0.00374178384354494	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	112	ATC	AAT	CTA	2	CTAATCTAC:TTAGTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	83.25000000000003	2	32.5	0.307484841347018	0.0642103145422439	4.78871414256543	0.243274526804774	0.0888201004216519	0.0480067851995557	NaN	NaN	0.0819692756189381	0.00299866691939731	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	ATCTACTTC:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.08333333333337	2	32.166666666666664	0.294640950387176	0.0649053422482923	4.53954852067556	0.229735608138884	0.0856934780376602	0.0511676362021647	NaN	NaN	0.0799648032523461	0.00406646774590438	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	114	TTC	CTT	CTT	2	TACTTCTTA:TACTTCTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.50000000000003	2	31.916666666666668	0.310948193753578	0.0654365742860851	4.75190208451514	0.245511619467492	0.0904246212012955	0.0470854452297763	NaN	NaN	0.0817280713787628	0.00266450041621717	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	115	TTA	CTT	ACA	2	TTCTTACAG:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.1666666666667	2	31.583333333333332	0.312512993784714	0.0661585688516753	4.72369640409476	0.246354424933039	0.0836471909610486	0.0484131727075475	NaN	NaN	0.0850588349612821	0.00377612161696312	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	116	CAG	ACA	GAG	2	TTACAGTGT:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	82.83333333333337	2	30.916666666666668	0.327861677224959	0.0676514664202386	4.8463351139847	0.260210210804721	0.0881588285484736	0.0511849598962377	NaN	NaN	0.0840479202694028	0.00196167286748532	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	117	AGT	GAG	TAT	2	CAGAGTATA:CAGTGTGTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.416666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	82.58333333333337	2	30.583333333333332	0.348126011656901	0.0684234871721278	5.08781452165901	0.279702524484773	0.0918078984564784	0.0508715711723201	NaN	NaN	0.0925179967337535	0.0025009797213243	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	AGTATAAAC:TGTGTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.75	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	82.6666666666667	2	30.25	0.328691198198366	0.0692133441658409	4.74895704231246	0.259477854032525	0.0878730984596915	0.0524889657243949	NaN	NaN	0.0880532316415211	0.0032105024711933	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT:GTTGTTTTT	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.75000000000003	2	29.916666666666668	0.309784984170421	0.070021663193269107	4.42413061962515	0.239763320977152	0.0879193662448177	0.0569470918233737	NaN	NaN	0.0867115652146997	0.00569110378780855	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	120	TTT	CTT	TGG	2	AACTTTGTA:GTTTTTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.33333333333336	2	30.166666666666668	0.293545893158417	0.0694136680239339	4.22893504283914	0.224132225134483	0.0806766639152965	0.0489470623779997	NaN	NaN	0.0792189357797974	0.00466534618416621	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	121	GGT	TGG	AAG	2	TTTGGTAGG:TTTGTAAGA	1:1	FALSE	1.75	1	0.25	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.66666666666669	2	30.166666666666668	0.29648455248311	0.0694136680239339	4.27127049936162	0.227070884459176	0.0830503570699156	0.0517370215338166	NaN	NaN	0.0787656669490221	0.00394074701267499	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GGTAGGTTT:GTAAGAATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.16666666666669	2	30.666666666666668	0.298727964139002	0.068228833654295	4.37832435554462	0.230499130484707	0.0860520522298937	0.0501543790058433	NaN	NaN	0.0798264913148855	0.00388314490419096	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGGTTTTTA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.00000000000003	2	30.666666666666668	0.299483431900339	0.068228833654295	4.38939691418112	0.231254598246044	0.0813925207132424	0.0496173689980532	NaN	NaN	0.0815192855583517	0.00455669402557715	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:TTTTTATTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.50000000000003	2	30.333333333333332	0.279209669341883	0.0690141740401891	4.04568587866154	0.210195495301694	0.08129672278819	0.0484544970902331	NaN	NaN	0.0772760037942708	0.00652697438667518	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	AAG	2	ATAATGAGG:TTATTAAGG	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.416666666666667	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.83333333333336	2	29.666666666666664	0.260339510885746	0.0706404112947758	3.6854189565711	0.18969909959097	0.0765086842051156	0.050265748676008	NaN	NaN	0.0756313825489893	0.0121345846168985	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	126	AGG	AAG	GCT	2	ATGAGGCTT:TTAAGGTGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.50000000000001	3	29.416666666666664	0.244420824406181	0.109617210244414	2.22976687566848	0.134803614161768	0.073502805942813	0.0677767314145403	NaN	NaN	0.0777996459679468	0.0831486214501699	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	127	CTT	GCT	TTG	2	AGGCTTTGG:AGGTGTTGG	1:1	TRUE	1.25	0.333333333333333	1	0.416666666666667	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.16666666666669	3	29.416666666666664	0.245608424712543	0.109617210244414	2.24060094363749	0.135991214468129	0.0717646458006203	0.0668488463019401	NaN	NaN	0.0769634280689235	0.0772351110915556	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.75000000000001	2	29.083333333333332	0.243537699774927	0.0721276112438599	3.37648364579187	0.171410088531067	0.070741756593847	0.0566419754564864	NaN	NaN	0.0733050079789032	0.019370992089375	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.75000000000001	2	30.083333333333332	0.250788414893047	0.0696151556756318	3.602497365108	0.181173259217415	0.0690408669328716	0.0522146346310401	NaN	NaN	0.0728555785333795	0.0128917700357992	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.16666666666669	2	30.083333333333332	0.249242139805801	0.0696151556756318	3.58028560572545	0.179626984130169	0.0727258338300068	0.0499036757418119	NaN	NaN	0.0728358804274563	0.0136559587323678	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.33333333333334	2	30.083333333333332	0.284138594692556	0.0696151556756318	4.08156229681486	0.214523439016924	0.0797927325310081	0.0516094790309957	NaN	NaN	0.0774961036135808	0.00563696990532811	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.33333333333334	2	29.416666666666664	0.32141334610676	0.0712702003524607	4.50978592058445	0.250143145754299	0.0863995225752265	0.0567402371593882	NaN	NaN	0.0880416032942939	0.00449451688125541	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCAAG:AAATGCCGT	1:1	FALSE	2.75	0.25	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.00000000000001	2	30.583333333333332	0.328216664807022	0.0684234871721278	4.79684211331339	0.259793177634894	0.0865656342957376	0.0510700214480316	NaN	NaN	0.0893254226715122	0.00363294808691048	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	134	AAG	CAA	GTC	2	TGCAAGTCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	78.58333333333334	2	30.916666666666664	0.330403118680469	0.0676514664202386	4.88390180085773	0.262751652260231	0.0909802321625236	0.0524843011913431	NaN	NaN	0.0895869985192647	0.00335788561788947	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	135	TCC	GTC	CAA	2	AAGTCCAAG:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.91666666666667	1	31.25	0.294930500060605	0.0327027281115989	9.01852894517385	0.262227771949006	0.0829754238595065	0.0339669993954022	NaN	NaN	0.0866479022220578	0.00247517162328942	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.25000000000001	1	31.583333333333332	0.293392860236678	0.0323500281131817	9.06932319224567	0.261042832123497	0.0817572906824219	0.0355197530223486	NaN	NaN	0.084935110988957	0.00211607365461867	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAGAACCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.08333333333334	1	31.583333333333332	0.294159645070684	0.0323500281131817	9.09302594858713	0.261809616957503	0.0843705429830272	0.034142367097377	NaN	NaN	0.0846298311305866	0.00197753573923812	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA:AACCCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.75000000000001	1	31.25	0.295705458110177	0.0327027281115989	9.0422259910878	0.263002729998578	0.0828917475364944	0.0360830443313339	NaN	NaN	0.0854570368394334	0.00208673553759753	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	139	CTT	ATT	ACT	2	CCATTACTT:CCTCTTATT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.75000000000001	1	30.25	0.291116602929804	0.0338085407384937	8.61074144493747	0.257308062191311	0.0813963896726554	0.0374669742028123	NaN	NaN	0.0869893410355341	0.00309716135067876	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	140	ATT	ACT	TTA	2	CTTATTTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.58333333333334	1	29.583333333333332	0.287401273704121	0.0345882615712242	8.30921418563647	0.252813012132897	0.0791044402768562	0.0377638898213157	NaN	NaN	0.0841782137647284	0.00267062947378007	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	141	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.66666666666667	2	29.333333333333332	0.287035013343561	0.0714826348532437	4.01545094039768	0.215552378490317	0.0792575957017882	0.0529771907586853	NaN	NaN	0.0824906295788915	0.00897374123251964	994	1	5	0.005	0.994	0.01
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.16666666666667	2	29.333333333333332	0.284857139505292	0.0714826348532437	3.98498376689826	0.213374504652048	0.0773667583981016	0.0552933435423148	NaN	NaN	0.087373604584525	0.0146023674885347	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC:GATGCCTCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.83333333333334	2	29.666666666666664	0.277833015310553	0.0706404112947758	3.93306055582238	0.207192604015777	0.0763775903460968	0.0545279540494355	NaN	NaN	0.0841682618286657	0.0138300459226447	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAT:GCCTCCTAC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	83.33333333333334	2	29.166666666666664	0.271804213985788	0.0719113287774619	3.77971341381993	0.199892885208326	0.0718897670902723	0.05564205388705	NaN	NaN	0.0865773164327293	0.0209526448851366	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTATTTT:TCCTACTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.33333333333334	2	29.499999999999996	0.238090673089088	0.0710590256920247	3.35060424443465	0.167031647397064	0.0676011575006684	0.056390264685463	NaN	NaN	0.075563207658679	0.0270712357098549	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.5	2	29.333333333333332	0.23753156062678	0.0714826348532437	3.32292676556258	0.166048925773536	0.0638409200232726	0.0537137794351825	NaN	NaN	0.0759529572738816	0.028800426911622	986	0	14	0.014	0.986	0.028
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGT	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.5	2	28.666666666666664	0.23753156062678	0.073228852172937	3.24368815812962	0.164302708453843	0.0653888024944018	0.0550171892032506	NaN	NaN	0.0778831569488458	0.0348923809876555	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.83333333333334	2	28.333333333333332	0.220248108096996	0.0741343759774745	2.97093089667225	0.146113732119522	0.0656476399740456	0.055147386422798	NaN	NaN	0.0725131249356466	0.0439049592026308	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT:TGTTGGCAT	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.58333333333334	2	28.583333333333332	0.221014202121839	0.0734531512400294	3.00891382317432	0.14756105088180901	0.061503162037553	0.056465543156998	NaN	NaN	0.0703352068558237	0.0359079250009065	982	0	18	0.018	0.982	0.036
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.08333333333334	2	28.749999999999996	0.222562608499314	0.073005919868405	3.04855563631673	0.149556688630909	0.0650613084308787	0.0549150642008214	NaN	NaN	0.0736839975619164	0.0423866581013523	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	151	ACA	TAC	ACA	2	CATACACAC:CATACTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.66666666666667	3	28.749999999999996	0.223869741416997	0.112359208671495	1.99244676127549	0.111510532745502	0.0600551553770899	0.0696274605254463	NaN	NaN	0.0861613437483789	0.19559425601861	900	0	100	0.1	0.9	0.2
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ACA	CAC	2	ACACACACT:ACTAATTGT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.166666666666667	1	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.16666666666667	3	28.249999999999996	0.222303024858063	0.114507630156718	1.94138176254117	0.107795394701344	0.0636883421843014	0.074191107182905	NaN	NaN	0.0856213781120209	0.208038433019231	889	0	111	0.111	0.889	0.222
ORF3a	all	ss12	153	ACT	CAC	TCA	2	AATTGTTAC:CACACTCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.5	0.333333333333333	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.75	4	27.999999999999996	0.223607078891877	0.158481820250405	1.41093204595058	0.0651252586414718	0.0639481227206559	0.0884921881563868	NaN	NaN	0.0900032818641755	0.469318956845427	778	0	222	0.222	0.778	0.444
ORF3a	all	ss12	154	CAT	TCA	CGA	2	ACTCATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82	4	28.666666666666664	0.225993636641676	0.154389040653112	1.46379325686367	0.071604595988564	0.0666065096978934	0.0876226257337169	NaN	NaN	0.0965263345096005	0.458199976273773	774	0	226	0.226	0.774	0.452
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	CATGACTAT:TACGACTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.66666666666667	4	28.666666666666664	0.240353921456079	0.154389040653112	1.55680688499203	0.0859648808029673	0.0693768452867283	0.0848770159827957	NaN	NaN	0.0947511579260495	0.364264047099236	820	0	180	0.18	0.82	0.36
ORF3a	all	ss12	156	TAT	CTA	TTG	2	GACTATTGT	2	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	83	4	27.999999999999996	0.255977372918159	0.158481820250405	1.61518445783692	0.0974955526677537	0.0715701074686663	0.0913953449777452	NaN	NaN	0.0972646126133954	0.316162826487763	838	0	162	0.162	0.838	0.324
ORF3a	all	ss12	157	TGT	TTG	TAT	2	TATTGTATA:TATTGTATT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	83.33333333333333	4	27.666666666666664	0.289246860608989	0.160610991304224	1.80091572974048	0.128635869304765	0.081326895971757407	0.0901871446321835	NaN	NaN	0.11425659724071	0.260228722349968	869	0	131	0.131	0.869	0.262
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCT:TGTATTCCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	83.16666666666666	4	28	0.289954491278301	0.158481820250405	1.82957572559531	0.131472671027896	0.0831200789052995	0.0906401223928666	NaN	NaN	0.105534737646486	0.212846546557631	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	159	CCG	ACC	GTA	2	ATACCTTAC:ATTCCGTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	83.5	4	27.333333333333332	0.288542717851011	0.162798378928371	1.77239306527718	0.12574433892264	0.0812963723125447	0.0877578293354709	NaN	NaN	0.108179204614288	0.245084915342945	870	0	130	0.13	0.87	0.26
ORF3a	all	ss12	160	TAC	GTA	CAA	2	CCGTACAAT:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	83.83333333333333	4	27.333333333333332	0.28714479220035	0.162798378928371	1.76380621287814	0.124346413271979	0.0810605646191469	0.0911861580944248	NaN	NaN	0.111926568959783	0.266583751105484	872	0	128	0.128	0.872	0.256
ORF3a	all	ss12	161	AAT	CAA	TAG	2	TACAATAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	84.66666666666667	4	26.999999999999996	0.319009858996495	0.165046413582601	1.93284938504186	0.153963445413894	0.0864905983087094	0.0934416837817235	NaN	NaN	0.118297546505837	0.193089710663595	917	0	83	0.083	0.917	0.166
ORF3a	all	ss12	162	AGT	TAG	TAT	2	AATAGTATT:AATAGTGTA	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	84.33333333333333	4	27.666666666666664	0.338988842807293	0.160610991304224	2.11062045040985	0.178377851503069	0.0902804585508629	0.092355049511395	NaN	NaN	0.1161455318124	0.124584178910291	946	0	54	0.054	0.946	0.108
ORF3a	all	ss12	163	ATT	TAT	AAC	2	AGTATTACT:AGTGTAACT	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	85.33333333333333	4	27.999999999999996	0.333983262491523	0.158481820250405	2.10739163623828	0.175501442241118	0.0914322245428582	0.0864155139716422	NaN	NaN	0.118734249082305	0.139380228212347	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	164	ACT	AAC	TGA	2	ATTACTGAA:GTAACTTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	85.58333333333333	4	28.249999999999996	0.314763389292021	0.156921757285409	2.00586199604896	0.157841632006612	0.0907971939451892	0.085493893460693	NaN	NaN	0.113966005489266	0.166055916699971	920	0	80	0.08	0.92	0.16
ORF3a	all	ss12	165	GAA	TGA	AAC	2	ACTGAAACC:ACTTCTTCA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	85.16666666666667	4	28.583333333333332	0.316679293783978	0.154888999008431	2.04455639723478	0.161790294775548	0.0882648941431039	0.0871841091225945	NaN	NaN	0.113393723454787	0.153637220268658	936	0	64	0.064	0.936	0.128
ORF3a	all	ss12	166	ACC	AAC	AAT	2	GAAACCATA:TCTTCAATT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	84.5	4	29.249999999999996	0.31979447116059	0.150978005779684	2.11815270382664	0.168816465380907	0.0916638388838099	0.080542253044091	NaN	NaN	0.111392547053032	0.129643421595782	927	1	72	0.072	0.927	0.144
ORF3a	all	ss12	167	ATA	AAT	AGT	2	ACCATAGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	84.33333333333334	4	29.416666666666664	0.302618080353335	0.150031026615648	2.01703665688155	0.152587053737687	0.0863887219662748	0.0847838802512233	NaN	NaN	0.104545306738259	0.144419178805416	927	0	73	0.073	0.927	0.146
ORF3a	all	ss12	168	GTC	AGT	CAT	2	ATAGTCCTC:ATTGTCATT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	83.66666666666667	4	29.749999999999996	0.305594345036271	0.148172379571929	2.06242449449173	0.157421965464343	0.0906488843485346	0.0811474643400953	NaN	NaN	0.109295154212685	0.149771791169236	931	0	69	0.069	0.931	0.138
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	CAC	2	GTCATTACT:GTCCTCACT	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.75	4	30.333333333333332	0.309784984170422	0.145028544735405	2.13602766776433	0.164756439435017	0.0895527706808978	0.0834866879421456	NaN	NaN	0.112529684244904	0.14316243046244	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	170	ACT	CAC	TGC	2	ATTACTTCA:CTCACTGCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	83.08333333333333	4	30.083333333333332	0.326625339874549	0.146359364647636	2.23166683362495	0.180265975226913	0.0982127376937777	0.0769247947435656	NaN	NaN	0.111018481904038	0.104429722779731	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	171	GCA	TGC	AGG	2	ACTGCAGGA:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	83.41666666666667	4	30.083333333333332	0.343713267878283	0.146359364647636	2.34842005980131	0.197353903230647	0.0951383978864286	0.0787498531796101	NaN	NaN	0.111668239922879	0.0771740684973475	963	0	37	0.037	0.963	0.074
ORF3a	all	ss12	172	GGA	AGG	AGA	2	GCAGGAGAT:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	83.5	4	29.999999999999996	0.343278245405688	0.146808432844572	2.33827334543597	0.196469812561117	0.093601193403332	0.0823849820736435	NaN	NaN	0.112416605177298	0.080517049614092	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	173	GAT	AGA	TGG	2	GGAGATGGT:GGTGATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	84.16666666666666	4	29.999999999999996	0.339837979609008	0.146808432844572	2.31483963846137	0.193029546764436	0.099136383286891	0.0760718816426227	NaN	NaN	0.11448288286309	0.091776610714216	956	0	44	0.044	0.956	0.088
ORF3a	all	ss12	174	GGC	TGG	CAC	2	GATGGCACA:GATGGTGTA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	83.5	4	29.999999999999996	0.343278245405688	0.146808432844572	2.33827334543597	0.196469812561117	0.0936972829515488	0.0831062979536564	NaN	NaN	0.11821216681745	0.0965107538580258	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGTGTAACT	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	83.5	4	29.999999999999996	0.343278245405688	0.146808432844572	2.33827334543597	0.196469812561117	0.0961255976861352	0.0803541765395217	NaN	NaN	0.115482980394829	0.0888889140107997	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAG	2	ACAACAAGT:GTAACTATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	83.16666666666667	3	30.333333333333332	0.345025092694414	0.106058740537371	3.25315095150351	0.238966352157043	0.097935021532303	0.0653409035024245	NaN	NaN	0.111316160281043	0.0318143454578868	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	177	AGT	AAG	TCC	2	ACAAGTCCT:ACTATTCCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	82.33333333333334	3	29.999999999999996	0.36908137485979	0.107325632730505	3.43889307213827	0.261755742129285	0.101920372743015	0.0674843943668834	NaN	NaN	0.121838964053177	0.0316840046990046	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	178	CCT	TCC	TAT	2	AGTCCTATT:ATTCCTATA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	82.5	3	29.999999999999996	0.368118717794491	0.107325632730505	3.42992357397825	0.260793085063986	0.102281085153034	0.0626899101926657	NaN	NaN	0.118009839993624	0.0271102564507493	994	0	6	0.006	0.994	0.012
ORF3a	all	ss12	179	ATA	TAT	AAA	2	CCTATAAAA:CCTATTTCT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.583333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	82.75	4	29.749999999999996	0.366684297251457	0.148172379571929	2.4747142369638	0.218511917679528	0.0997422872383611	0.0789828871962121	NaN	NaN	0.12512840318739	0.0807585760621615	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	180	AAA	AAA	AAC	2	ATAAAAACA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	82.66666666666667	4	29.416666666666664	0.367161168989029	0.150031026615648	2.44723493047627	0.217130142373381	0.10189371464682	0.0809556936346275	NaN	NaN	0.127913170997041	0.0896058119874861	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	181	ACA	AAC	ACA	2	AAAACACAA:TCTGAACAT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	82	4	30.083333333333332	0.332052377179047	0.146359364647636	2.2687470526978	0.185693012531411	0.0887869933591322	0.0767263769844792	NaN	NaN	0.116561905401411	0.111141144154841	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	182	CAA	ACA	AGA	2	ACACAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82	4	30.416666666666664	0.295007810681865	0.144590316625212	2.04030129795307	0.150417494056653	0.0866962065384992	0.0805742929317246	NaN	NaN	0.116621983135166	0.197124693411672	917	0	83	0.083	0.917	0.166
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CAAGACTAC:CATGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.5	4	29.583333333333332	0.310948193753578	0.149095891727942	2.08555842920856	0.161852302025635	0.0880985536347097	0.0790388806518815	NaN	NaN	0.116126250206573	0.163389623864998	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.16666666666667	5	29.916666666666668	0.312512993784714	0.189082955000185	1.65278247203408	0.123430038784529	0.0848063968868496	0.0910076537451943	NaN	NaN	0.124084998796487	0.319871645875181	846	0	154	0.154	0.846	0.308
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	82.5	5	29.583333333333332	0.348573637792092	0.191510018856633	1.82013264827173	0.157063618935459	0.0999441243648465	0.0965864741651284	NaN	NaN	0.138118631146561	0.255469479547565	881	0	119	0.119	0.881	0.238
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	81.5	5	28.583333333333332	0.354038034650595	0.199182311241132	1.77745720714122	0.154855723409464	0.101166039859662	0.100327821305734	NaN	NaN	0.138073431407591	0.262055464948981	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	81.33333333333333	5	28.75	0.395516194287901	0.197860943283853	1.99896041999805	0.197655251004048	0.107815493462567	0.0963306937175196	NaN	NaN	0.15700203073637	0.208054042004128	896	0	104	0.104	0.896	0.208
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT:GGTGGTTTT	1:1	FALSE	2	0.833333333333333	0	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	80.83333333333333	5	29.25	0.398744783001625	0.194000551939624	2.0553796317328	0.204744231062001	0.113970444073061	0.096891225970865	NaN	NaN	0.150994393921552	0.175107949059249	922	0	78	0.078	0.922	0.156
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTTTGTA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	78.83333333333333	5	29.75	0.41221769498023	0.190288706694225	2.16627514129161	0.221928988286005	0.119097926419474	0.0955508863691497	NaN	NaN	0.149371242951443	0.13734408354455	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	AGA	2	TATACTGAA:TTTGTAGAA	1:1	TRUE	1.25	0.5	0.75	0.5	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	24	79.08333333333333	5	29.75	0.388937300597615	0.190288706694225	2.04393265031013	0.19864859390339001	0.110033633714849	0.0982011714708884	NaN	NaN	0.155285890034684	0.200811030737845	907	0	93	0.093	0.907	0.186
ORF3a	all	ss12	191	GAA	AGA	AAA	2	ACTGAAAAA:GTAGAAAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	79.16666666666666	4	30.333333333333332	0.409907779776052	0.145028544735405	2.82639380077834	0.264879235040648	0.121069382201427	0.0837314350989421	NaN	NaN	0.152090253911796	0.0815797867375929	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	77	4	29.999999999999996	0.425415290490481	0.146808432844572	2.89775786204922	0.27860685764591	0.125775379162849	0.0786620940230743	NaN	NaN	0.158036598913506	0.0779129408634722	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GGA	2	AAATGGGAA:AAATGGGAG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	76.08333333333333	4	30.833333333333336	0.432345026568149	0.142438427764417	3.03531170172151	0.289906598803732	0.12062543781323	0.073750207523439	NaN	NaN	0.148428259360052	0.0507986761376475	985	0	15	0.015	0.985	0.03
ORF3a	all	ss12	194	GAA	GGA	ATC	2	TGGGAATCT:TGGGAGTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	26	75.08333333333333	5	31.5	0.464517275003141	0.178350531835637	2.60451858607983	0.286166743167504	0.136510518054464	0.0890939729583709	NaN	NaN	0.165376183778132	0.0835590554334384	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	195	TCT	ATC	TGG	2	GAATCTGGA:GAGTCTGGT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	26	74.66666666666666	5	31.25	0.46811573180474497	0.179963002222943	2.60117760885557	0.288152729581802	0.126952052818157	0.0897094329897444	NaN	NaN	0.16662212259027	0.083741361272066	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	196	GGA	TGG	AGT	2	TCTGGAGTA:TCTGGTGTC	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	26	75.16666666666666	5	31.416666666666668	0.463804422121597	0.178884786483983	2.5927549862555	0.284919635637614	0.131682364211956	0.0924150288961494	NaN	NaN	0.16553070552999	0.0852055682734077	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTCAAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	27	75	5	31.75	0.490444850554998	0.176766832783369	2.7745298302428	0.313678017771629	0.131731918267302	0.0876823918905621	NaN	NaN	0.172139498266972	0.0684198654439745	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTCAAGGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.5	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	27	75.08333333333333	5	32.333333333333336	0.489676866871544	0.173179167487274	2.8275737432883	0.31649769938427	0.137179925452617	0.0861502702318006	NaN	NaN	0.162848970737549	0.0519552381810955	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTGT:AAGGACTAT	1:1	FALSE	2	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	27	74.83333333333333	5	32.083333333333336	0.491988325632415	0.174698668260279	2.81621108238452	0.317289657372136	0.143183350358505	0.0843507026671619	NaN	NaN	0.166634085403261	0.0568958369394364	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTT:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	27	75	5	31.75	0.490444850554998	0.176766832783369	2.7745298302428	0.313678017771629	0.141506584703139	0.0883011502824573	NaN	NaN	0.163718409532267	0.0553701143555948	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	201	GTT	TGT	TAC	2	TATGTTACA:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	27	75.08333333333333	4	32.08333333333333	0.489676866871544	0.136351658368326	3.59127914343939	0.353325208503218	0.133617992707159	0.0726828131089816	NaN	NaN	0.162383219440735	0.0295647832478761	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	202	ACA	TAC	ACT	2	GTTACACTC:GTTGTATTA	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	27	74.58333333333333	4	32.58333333333333	0.494322498141466	0.134060541816084	3.68730792405434	0.360261956325381	0.138042839133479	0.0746283998182943	NaN	NaN	0.16898641197831	0.0330151535608885	995	0	5	0.005	0.995	0.01
ORF3a	all	ss12	203	CTC	ACT	ACA	2	ACACTCATA:GTATTACAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	26	74.33333333333333	3	32.83333333333333	0.471036208761442	0.0974341006801572	4.83440813301795	0.373602108081285	0.132206103255899	0.0592058584986221	NaN	NaN	0.147055991593986	0.0110680400940837	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	204	ATA	ACA	AGG	2	CTCATAGGC:TTACACAGT	1:1	TRUE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	2	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	25	74.33333333333333	3	32.666666666666664	0.446240562065776	0.0979651368127982	4.55509558383508	0.348275425252978	0.134080750764258	0.0620253533004635	NaN	NaN	0.157302385321529	0.0268253050407028	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	205	AGT	AGG	CCT	2	ATAGGCCTT:CACAGTTAC	1:1	TRUE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	23	73.66666666666666	3	32.666666666666664	0.403762722867061	0.0979651368127982	4.1214939926906	0.305797586054262	0.113794192605284	0.0587646817028031	NaN	NaN	0.139110915085096	0.027932822660094	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	206	CTT	CCT	CTT	2	AGTTACTTC:GGCCTTTTC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	22	73.33333333333333	3	32.666666666666664	0.383119217824493	0.0979651368127982	3.91077101802651	0.285154081011695	0.116191250767165	0.059746152631400803	NaN	NaN	0.135591597684138	0.0354625777075596	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	CTTTTCACT:TACTTCACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	73.5	3	32.49999999999999	0.338017654584825	0.0985020015458152	3.43158158494481	0.23951565303901	0.103470551004108	0.060879627016935	NaN	NaN	0.126613472117827	0.0585299653682725	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	208	ACT	CAC	TGA	2	TTCACTGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	73.5	3	32.49999999999999	0.338017654584825	0.0985020015458152	3.43158158494481	0.23951565303901	0.104365719242543	0.061873685114948	NaN	NaN	0.124002225128707	0.0534159140184096	981	0	19	0.019	0.981	0.038
ORF3a	all	ss12	209	GAA	TGA	AAT	2	ACTGAAATA:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	71.83333333333333	3	32.166666666666664	0.347991951918035	0.0995936054863591	3.49411942883922	0.248398346431676	0.105727444153438	0.0608932574336329	NaN	NaN	0.126794047256109	0.0501046521124886	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	210	ATA	AAT	ACA	2	GAAATACAT:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0.166666666666667	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	70.5	3	31.166666666666664	0.356413610151385	0.103018812035868	3.45969442966681	0.253394798115517	0.111339586091432	0.063824228507204	NaN	NaN	0.131099802358012	0.0532560463172621	985	0	15	0.015	0.985	0.03
ORF3a	all	ss12	211	CAT	ACA	TTA	2	ATACATTAC:GACTATTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	1	0.666666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	68.33333333333333	3	30.833333333333332	0.324495638187491	0.104213595070396	3.11375534034973	0.220282043117094	0.1026447300773	0.0656028921233285	NaN	NaN	0.126681065889319	0.0820574404682563	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	212	TAC	TTA	CCA	2	CATTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	67	3	29.833333333333332	0.309716834877992	0.107970516691131	2.86853156185212	0.20174631818686	0.0984179231949425	0.0649841377108645	NaN	NaN	0.12515084599309	0.106956455013089	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	65.83333333333333	3	30.999999999999996	0.316543277401188	0.103612753860613	3.05506094188969	0.212930523540575	0.103476221808053	0.0642428268526432	NaN	NaN	0.126018470804844	0.091089747806847	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GGA	2	CAGCTGTAC:CAGTTGGAA	1:1	FALSE	0.916666666666667	1.08333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	66.16666666666666	3	30.333333333333332	0.314561905023373	0.106058740537371	2.96592155846441	0.208503164486001	0.105254229001688	0.0701876276904368	NaN	NaN	0.123132997178598	0.0903951947867404	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	215	GAA	GGA	ATC	2	CTGTACTCA:TTGGAATCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	66.91666666666667	3	29.666666666666664	0.310194519528617	0.108623210908842	2.85569278364397	0.201571308619775	0.0981227250840949	0.068879950205776	NaN	NaN	0.128965242926427	0.118055086324761	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	216	TCA	ATC	AAC	2	GAATCTACT:TACTCAACT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	65.58333333333334	3	28.666666666666664	0.295099670381598	0.112711652287003	2.61818245402144	0.182388018094595	0.0974051714564466	0.070484871720573	NaN	NaN	0.121514912667427	0.133368047528787	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	217	ACT	AAC	TCA	2	TCAACTCAA:TCTACTCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	65.08333333333333	3	27.83333333333333	0.297882665436047	0.116361886617636	2.55996765001659	0.181520778818411	0.103491830104524	0.0761568932348791	NaN	NaN	0.125634349406694	0.148504520150967	937	0	63	0.063	0.937	0.126
ORF3a	all	ss12	218	CAA	TCA	AAT	2	ACTCAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	64.75	3	28.166666666666664	0.29976773146071	0.114873729376874	2.60954121614039	0.184894002083836	0.101289896465514	0.0720474196674776	NaN	NaN	0.130419390777359	0.156281882228667	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTTCA:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	65.75	3	27.499999999999996	0.294183672510022	0.117889187641809	2.49542539392044	0.176294484868213	0.100414219641299	0.0722568101706272	NaN	NaN	0.135014847663968	0.191640492220099	919	0	81	0.081	0.919	0.162
ORF3a	all	ss12	220	AGT	GAG	AGC	2	ATTTCAGCT:TTGAGTACA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	65.25	3	27.749999999999996	0.274517532042651	0.116739982283845	2.35152967023055	0.157777549758806	0.0907512373879325	0.0765844387377635	NaN	NaN	0.122228817073209	0.196760005569086	908	0	92	0.092	0.908	0.184
ORF3a	all	ss12	221	ACA	AGC	AGA	2	AGTACAGAC:TCAGCTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	0.666666666666667	0.5	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	65.25	3	27.41666666666666	0.252737417126778	0.11827731107372	2.13682078864012	0.134460106053058	0.0890528492731602	0.0727929519805561	NaN	NaN	0.121690565560031	0.269187965347916	876	0	124	0.124	0.876	0.248
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT:GCTGACACT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	64.91666666666667	3	27.749999999999996	0.232966377161054	0.116739982283845	1.99560058690614	0.116226394877208	0.083597563946731	0.0714970479402625	NaN	NaN	0.107951660313281	0.281635664934432	879	0	121	0.121	0.879	0.242
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	63.250000000000014	3	27.41666666666666	0.240200226182037	0.11827731107372	2.03082251364613	0.121922915108317	0.0845770254361568	0.0740309003868954	NaN	NaN	0.112840151221739	0.279923011523204	859	1	140	0.14	0.859	0.28
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	62.58333333333334	3	28.08333333333333	0.243222248872649	0.115242181679947	2.11053145061182	0.127980067192702	0.0828815715538161	0.0719708305579319	NaN	NaN	0.11883344104845	0.281493607557204	863	0	137	0.137	0.863	0.274
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TAA	2	GGTATTAAC:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	61.58333333333334	3	29.08333333333333	0.247901924779697	0.110971243090164	2.23392942060024	0.136930681689534	0.0923183356118573	0.0733844535008218	NaN	NaN	0.115397756750185	0.235386449777706	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	226	AAC	TAA	ACA	2	ATTAACAAC:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	61.750000000000014	3	29.08333333333333	0.247109400847682	0.110971243090164	2.22678771514623	0.136138157757518	0.0949138217903237	0.0670595591321356	NaN	NaN	0.118267466634373	0.24968943923851	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	227	AAC	ACA	CGC	2	AACAACGCG:GAACATGTT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCG	CGC	GAC	2	AACGCGACG:CATGTTACC	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACC	GAC	CTT	2	GCGACGTTT:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	CTT	CTT	2	ACCTTCTTC:ACGTTTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC:TTTTTCCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCCTTTTC	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:CTTTTCTCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAT	CAA	TAA	2	TACAATAAA:TTCTCTAAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	TAA	AAT	2	AATAAAATT:TCTAAATAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGA	2	AAAATTGTT:AAATATGAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GAT	TGA	TAG	2	ATTGTTGAT:TATGATAGA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AGA	TAG	AGA	2	GATAGAGAA:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAA	AGA	AAG	2	AGAGAAAGT:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.25	0.416666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	AGT	AAG	T--	1	GAAAGT---:GAGCCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0	1.33333333333333	0.333333333333333	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	AGT---GAG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	GAA	-GA	ACA	1	---GAGAGC:GAAGAACAT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.416666666666667	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AGC	ACA	CGT	2	GAACATGTC:GAGAGCGTC	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	CGT	CCA	2	AGCGTCCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTCCAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATT	AAT	TCA	2	CAAATTCAC:CAAGTTCAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	TCA	CAC	2	ATTCACACA:GTTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCA:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCATCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCAGGA:TCATCCGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	T--	1	GTAAAT---:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	---	TCC	AGT	1	AAT------:AATCCAGTA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	---	AGT	AAT	1	---------:CCAGTAATG	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	---	AAT	GGA	1	---------:GTAATGGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	---	GGA	ACC	1	------CCA:ATGGAACCA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	-CC	AAT	1	---CCAATT:GAACCAATT	1:1	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCA	ACC	AAC	2	GAACCGACG:GAGCCAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	AAC	GAC	2	CCAACGCCG:CCGACGACG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT:ACGCCGACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT:CCGACTACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TCT	2	GTGCCTCTC:GTGCCTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	CTC	TCT	CTA	2	CCTCTCTAA:CCTTTGTAA	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.08333333333336	5	30.916666666666668	0.20192785781644	0.182159096576957	1.10852469962229	0.0197687612394827	0.0528514724493343	0.0900316835715851	NaN	NaN	0.0911822404328185	0.828360352788029	584	0	416	0.416	0.584	0.832
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.41666666666669	5	30.916666666666668	0.203900474239319	0.182159096576957	1.11935378507533	0.0217413776623624	0.0540583615477534	0.0927851750184574	NaN	NaN	0.0956475893451177	0.820184940353361	618	0	382	0.382	0.618	0.764
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.58333333333336	5	31.416666666666668	0.206421458535371	0.178884786483983	1.1539352372699	0.0275366720513873	0.0539369184658346	0.090814406203374	NaN	NaN	0.092599315954663	0.766180636282141	647	0	353	0.353	0.647	0.706
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA:TTTATGAGT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.41666666666669	5	30.916666666666668	0.206933202001177	0.182159096576957	1.13600257077337	0.0247741054242204	0.0536840387192461	0.0910688123478653	NaN	NaN	0.0974487741376129	0.799320225025653	635	0	365	0.365	0.635	0.73
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGTATT	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.91666666666669	5	30.416666666666668	0.208483869201781	0.185556129985381	1.12356228392027	0.0229277392164006	0.0528361867256481	0.0923083665764777	NaN	NaN	0.0968335304675133	0.812831507154251	615	0	385	0.385	0.615	0.77
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGTATTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.16666666666669	5	30.416666666666668	0.190803499198466	0.185556129985381	1.02827914773551	0.00524736921308566	0.0524721352192549	0.0893482828814946	NaN	NaN	0.0968280291420024	0.956781662382253	565	0	435	0.435	0.565	0.87
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.00000000000001	5	30.750000000000004	0.194146225437217	0.183277466946071	1.0593022081342	0.0108687584911455	0.0534612529158383	0.0957122665351816	NaN	NaN	0.0924027336104818	0.906365764757414	553	0	447	0.447	0.553	0.894
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333334	5	30.416666666666668	0.193179203235308	0.185556129985381	1.04108230350853	0.0076230732499271104	0.0527318501419776	0.0930444313592703	NaN	NaN	0.0944416056495112	0.9356667628529	534	0	466	0.466	0.534	0.932
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACGCTTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.66666666666667	5	31.083333333333336	0.195123032668416	0.181054357970061	1.07770414838996	0.0140686746983554	0.0537649071368031	0.0903732411377611	NaN	NaN	0.0934045691276736	0.880274820693687	565	0	435	0.435	0.565	0.87
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGATCA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.83333333333334	5	30.75	0.177731272847004	0.183277466946071	0.969738810823375	-0.00554619409906765	0.0497647720063034	0.090184889743534	NaN	NaN	0.0930812925843341	0.952486633625831	490	0	510	0.51	0.49	0.98
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGATCAATC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.16666666666667	5	31.083333333333336	0.176854074420993	0.181054357970061	0.976800980676959	-0.00420028354906832	0.0478442384982789	0.0849573679716248	NaN	NaN	0.0907886164420621	0.963099490045474	504	0	496	0.496	0.504	0.992
ORF3a	all	ss12	13	ATC	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATCACA	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.66666666666667	5	30.75	0.192221818973333	0.183277466946071	1.0488022459951	0.00894435202726146	0.0595420233471516	0.085035674422667	NaN	NaN	0.094813889895927	0.924842346461235	571	0	429	0.429	0.571	0.858
ORF3a	all	ss12	14	ACA	AAC	ACG	2	ATCACACGT:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.91666666666667	5	30.666666666666668	0.174911831064805	0.183841843524739	0.951425571628737	-0.00893001245993344	0.0529809831942685	0.0865155207498055	NaN	NaN	0.0933758287758476	0.923810338384179	429	0	571	0.571	0.429	0.858
ORF3a	all	ss12	15	CGT	ACG	GAA	2	ACACGTCAA:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.75	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.83333333333334	5	30.75	0.191746695912757	0.183277466946071	1.04620987570271	0.00846922896668584	0.0557093733355361	0.0930061517734408	NaN	NaN	0.0962431840269314	0.929878090186251	549	1	450	0.45	0.549	0.9
ORF3a	all	ss12	16	AAG	GAA	ACC	2	CGTCAACCG:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.5	4	31	0.175985531846771	0.141595553474679	1.2428747056541	0.0343899783720917	0.0568275025754281	0.0746277842566031	NaN	NaN	0.0852136815331541	0.686526421917759	665	0	335	0.335	0.665	0.67
ORF3a	all	ss12	17	CAA	ACC	AGG	2	AAGCAAGGT:CAACCGAGT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333334	4	31	0.193179203235308	0.141595553474679	1.36430275170931	0.0515836497606288	0.0557748175623665	0.0767789970819023	NaN	NaN	0.0905177218161361	0.568763508500027	737	0	263	0.263	0.737	0.526
ORF3a	all	ss12	18	AGT	AGG	TAA	2	CAAGGTGAA:CCGAGTAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.33333333333334	3	30.166666666666664	0.190335390582075	0.106688419438138	1.78403046539121	0.0836469711439363	0.0566687653504049	0.0694895880422986	NaN	NaN	0.0786143071990799	0.28732093019877	858	0	142	0.142	0.858	0.284
ORF3a	all	ss12	19	AAG	TAA	AAT	2	AGTAAGATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.5	3	30.166666666666664	0.173430571160122	0.106688419438138	1.62558009644789	0.0667421517219836	0.0527217769782833	0.0635193230362676	NaN	NaN	0.0732742692331576	0.362372373985973	832	1	167	0.167	0.832	0.334
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAGATTGAA:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.83333333333333	3	30.166666666666664	0.167749206172702	0.106688419438138	1.57232815947722	0.0610607867345636	0.0529589645313703	0.0680558862484515	NaN	NaN	0.0797137877889698	0.443676113424044	782	0	218	0.218	0.782	0.436
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	AAA	2	ATCAAGGAT:ATTGAAAAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.33333333333333	3	30.833333333333332	0.168934951133241	0.104213595070396	1.62104522945519	0.064721356062845	0.0517741995667419	0.065889549691773	NaN	NaN	0.0753430444052801	0.390328207349971	819	0	181	0.181	0.819	0.362
ORF3a	all	ss12	22	AAT	AAA	TGC	2	AAGGATGCT:GAAAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78	3	31.499999999999996	0.156222782397911	0.101851155869296	1.53383416284828	0.0543716265286151	0.0510608878739491	0.067259245756779	NaN	NaN	0.0714460183332444	0.446646980301198	780	1	219	0.219	0.78	0.438
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.33333333333333	3	31.499999999999996	0.141931499728896	0.101851155869296	1.39351879237418	0.0400803438596	0.0490229656356968	0.064701811772672	NaN	NaN	0.0723958513760725	0.579833710439773	719	1	280	0.28	0.719	0.56
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.25	3	31.749999999999996	0.15791093535129	0.100992663859693	1.56358817874804	0.0569182714915975	0.0535745162506737	0.065080010564612	NaN	NaN	0.0724615492185767	0.432162697965031	777	0	223	0.223	0.777	0.446
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.91666666666666	4	32.08333333333333	0.142778402413796	0.136351658368326	1.0471335964841	0.00642674404547006	0.0502453699801811	0.0742002536960173	NaN	NaN	0.0833321098879619	0.938526443283318	561	1	438	0.438	0.561	0.876
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.08333333333333	4	31.583333333333332	0.140432198903081	0.138722674692595	1.01232332215533	0.00170952421048617	0.0521470739841137	0.0752148789940647	NaN	NaN	0.0790658948621789	0.982749873286691	526	1	473	0.473	0.526	0.946
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.16666666666666	4	31.499999999999996	0.124999865819317	0.139125907283501	0.898465772910296	-0.014126041464184	0.0464723450712267	0.0792873781139124	NaN	NaN	0.0792405743597784	0.85851267946514	434	0	566	0.566	0.434	0.868
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.91666666666666	3	31.583333333333332	0.140762624951505	0.101563372279023	1.38595855762638	0.0391992526724824	0.0543001356612287	0.0591849048745974	NaN	NaN	0.0813320507421818	0.629830365795902	697	0	303	0.303	0.697	0.606
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.91666666666666	2	31.916666666666664	0.140762624951505	0.0654365742860851	2.15113071683885	0.0753260506654199	0.0555632473944782	0.047809382205131	NaN	NaN	0.0757080737436284	0.319758638362451	829	1	170	0.17	0.829	0.34
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.75	2	32.416666666666664	0.156781460557421	0.0643826713791054	2.43514997435013	0.0923987891783159	0.0585529855857252	0.0457560034852619	NaN	NaN	0.0738279660983797	0.210736855453465	905	0	95	0.095	0.905	0.19
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACT:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.91666666666666	1	31.916666666666664	0.156408563919793	0.0320048558445568	4.88702604003117	0.124403708075236	0.0553888993303705	0.0323669424958833	NaN	NaN	0.0679775443715806	0.0672393766730765	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	32	ACT	TAC	TGC	2	GCTACTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.33333333333333	1	31.499999999999996	0.15330938595611	0.0324374878453625	4.72630268678554	0.120871898110747	0.054939953109956	0.0337660435146288	NaN	NaN	0.0653425086193902	0.0643394557476037	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	33	GCA	TGC	AAC	2	ACTGCAACG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.66666666666666	1	30.833333333333332	0.150503021596613	0.0331545693783718	4.53943526996292	0.117348452218242	0.0550843074544726	0.0354415120099188	NaN	NaN	0.0650195284001102	0.0711030776303855	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.16666666666666	1	31.333333333333332	0.151543243677375	0.0326138339548042	4.64659395419078	0.118929409722571	0.0528100057616694	0.0337996674944289	NaN	NaN	0.0668959929319789	0.075432500254295	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.16666666666666	1	31.999999999999996	0.153667583253645	0.0319197108140969	4.81419096020692	0.121747872439548	0.0562272513906938	0.0323597843483065	NaN	NaN	0.063667455303623	0.0558445765908499	974	1	25	0.025	0.974	0.05
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.16666666666666	1	32.666666666666664	0.155852544989684	0.0312545223004261	4.98655981657923	0.124598022689258	0.0578408169720501	0.0327333233011398	NaN	NaN	0.0668166258804369	0.0622128457545306	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.33333333333333	1	32.666666666666664	0.171357672967179	0.0312545223004261	5.48265212054907	0.140103150666753	0.0592658212517614	0.0308727074129373	NaN	NaN	0.0677985175825368	0.0387847511045703	984	1	15	0.015	0.984	0.03
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.66666666666667	1	33	0.154752324748371	0.0309322189005369	5.00294935988849	0.123820105847834	0.0566212132647288	0.0309731450496851	NaN	NaN	0.0659094758338062	0.0602938144342751	972	1	27	0.027	0.972	0.054
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.5	1	32.5	0.155117328626829	0.0314182062818701	4.93717964785085	0.123699122344959	0.0585313160034456	0.0307892945721304	NaN	NaN	0.0639482826478547	0.0530686458730139	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.5	1	32.5	0.155117328626829	0.0314182062818701	4.93717964785085	0.123699122344959	0.0565582731208053	0.0318717759476996	NaN	NaN	0.0641836810858629	0.0539463021357229	980	0	20	0.02	0.98	0.04
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.33333333333333	1	31.833333333333332	0.168934951133241	0.0320904564039067	5.26433619413013	0.136844494729335	0.0595166943822763	0.0332851368156289	NaN	NaN	0.0690952821510879	0.0476452801478294	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC:CTCCCTTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80	1	31.166666666666664	0.167357663485657	0.0327921082603737	5.10359572360567	0.134565555225284	0.0578256874391191	0.0326129651678104	NaN	NaN	0.0719844885632704	0.0615715256517429	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA:CCTTTTGGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80	1	31.166666666666664	0.167357663485657	0.0327921082603737	5.10359572360567	0.134565555225284	0.058639629877492	0.0338322211504395	NaN	NaN	0.0687565015326591	0.0503319410037039	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG:TTTGGATGG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.5	1	31.666666666666664	0.16853783682123	0.0322630388127681	5.22386740440988	0.136274798008462	0.0570972251136036	0.0331318553658806	NaN	NaN	0.0683181434283712	0.0460746552639705	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79	1	32.166666666666664	0.169734844556617	0.0317507728699206	5.34584922552914	0.137984071686696	0.0593534040918742	0.0311509308721482	NaN	NaN	0.0681401688668836	0.0428670180370799	980	0	20	0.02	0.98	0.04
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.58333333333333	1	32.916666666666664	0.173221017246649	0.0310121698640216	5.585581983014	0.142208847382627	0.0607148172445543	0.0305493745158898	NaN	NaN	0.0712983674679654	0.0460909272961618	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT:CTTGTTGTT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.58333333333333	1	32.916666666666664	0.173221017246649	0.0310121698640216	5.585581983014	0.142208847382627	0.0578169602159644	0.0296256786132294	NaN	NaN	0.0651224968356471	0.0289833388844037	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTGTTGGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.33333333333333	1	33.166666666666664	0.173851210542993	0.0307735475083969	5.64937176955488	0.143077663034596	0.0590522420129929	0.0318547187491106	NaN	NaN	0.0650732730179126	0.027898104529028	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.41666666666666	1	33.08333333333333	0.173640634968376	0.0308526791703671	5.62805693500848	0.142787955798009	0.0619005454542596	0.0319013172469395	NaN	NaN	0.0680605219707753	0.0359090643660938	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.91666666666666	1	33.58333333333333	0.174911831064805	0.0303839016876759	5.75672712684401	0.144527929377129	0.0581951894324913	0.0321145826366356	NaN	NaN	0.0694880814117749	0.037535143241717	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.91666666666666	1	32.58333333333333	0.172387863428196	0.0313361505112163	5.50124570554678	0.14105171291698	0.0609399705203437	0.0315230125256223	NaN	NaN	0.0681134428797276	0.0383742025124466	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.74999999999999	1	32.75	0.186447776478305	0.0311733183159379	5.98100512074713	0.155274458162367	0.0629767671458598	0.0310713682429675	NaN	NaN	0.069930455176126	0.0263907779851921	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.41666666666666	1	32.75	0.184673013955982	0.0311733183159379	5.92407301925136	0.153499695640044	0.0593080753719414	0.0304577719755414	NaN	NaN	0.0665416067288575	0.0210647005771844	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.74999999999999	1	32.416666666666664	0.183798305951801	0.031500692980973	5.83473849489021	0.152297612970828	0.0578483595924314	0.0329914805174688	NaN	NaN	0.067897211228173	0.0248928560383552	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.58333333333331	2	32.916666666666664	0.200473410548214	0.0633621979772033	3.16392765636604	0.13711121257101	0.0646442067958734	0.0475656499378654	NaN	NaN	0.0794202717411153	0.0842753503032689	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.24999999999999	2	32.916666666666664	0.198566618137443	0.0633621979772033	3.13383412312944	0.13520442016024	0.0635728106750888	0.0466283519105906	NaN	NaN	0.070215670292358	0.0541594546709079	980	0	20	0.02	0.98	0.04
ORF3a	all	ss12	57	CAG	TCA	GAG	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.33333333333333	2	33.33333333333333	0.217865342534542	0.0625362067042884	3.4838272740902	0.155329135830254	0.0669084578277268	0.0451099554704423	NaN	NaN	0.0764586085526515	0.0421996972095701	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	58	AGC	GAG	CGC	2	CAGAGCGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.83333333333333	2	33.33333333333333	0.216283656691977	0.0625362067042884	3.45853495263482	0.153747449987689	0.0630963388222173	0.0465828135465463	NaN	NaN	0.0757251829744165	0.0423225516816893	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79	2	33.666666666666664	0.236076409978014	0.0618907677660026	3.81440428838393	0.174185642212012	0.0665568226916186	0.0440796558670771	NaN	NaN	0.0804725833582509	0.0304233906206971	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	60	TCC	TTC	CAA	2	GCTTCCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.33333333333333	2	33.333333333333336	0.234911530842709	0.0625362067042883	3.75640837880563	0.172375324138421	0.0661163995625624	0.0474264641803363	NaN	NaN	0.0772973198247292	0.0257454667587832	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	TCCAAAATC:TCCAAAGTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.16666666666666	2	33.5	0.235492518065836	0.0622118122355632	3.78533448236729	0.173280705830273	0.0703670949892367	0.0449761111648756	NaN	NaN	0.0810023517096229	0.0324189994335871	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	62	ATC	AAT	CAT	2	AAAATCATA:AAAGTGATT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.83333333333333	2	34.166666666666664	0.240246862716335	0.0609472230590743	3.94188366028541	0.179299639657261	0.0706643521274364	0.0464177446093121	NaN	NaN	0.078332174465352	0.0220813608733039	994	0	6	0.006	0.994	0.012
ORF3a	all	ss12	63	ATA	CAT	AAC	2	ATCATAACC:GTGATTGCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.83333333333333	2	34.166666666666664	0.222753358291529	0.0609472230590743	3.65485656459886	0.161806135232454	0.0627348100798036	0.0457545810444624	NaN	NaN	0.073486164788747907	0.0276753065286257	985	0	15	0.015	0.985	0.03
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTT	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.16666666666666	2	34.5	0.224997455190221	0.0603340239140544	3.72919690406741	0.164663431276166	0.061906845297927	0.0442706862225599	NaN	NaN	0.0749196505303843	0.0279585816142574	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.08333333333333	2	35.083333333333336	0.22528117443765	0.0592901175479514	3.79964121770297	0.165991056889699	0.0612773642459548	0.0429484469374322	NaN	NaN	0.072626368223932	0.0222807102219276	994	0	6	0.006	0.994	0.012
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTTCATAAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.08333333333333	2	35.083333333333336	0.22528117443765	0.0592901175479514	3.79964121770297	0.165991056889699	0.0656145626374245	0.0421066894206594	NaN	NaN	0.0713417995008235	0.0199811691874187	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	GAG	2	AAAAAGAGA:CATAAGAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.83333333333333	2	35.416666666666664	0.208744590595666	0.0587096677913667	3.55554031301063	0.150034922804299	0.0612003491374018	0.041689729367007	NaN	NaN	0.0691078555126484	0.0299292380278349	985	0	15	0.015	0.985	0.03
ORF3a	all	ss12	68	AGA	GAG	ATG	2	AAGAGATGG	2	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.66666666666666	2	35.416666666666664	0.244568640424989	0.0587096677913667	4.16573027280786	0.185858972633622	0.0698028783067161	0.0420641382413696	NaN	NaN	0.0789461101258246	0.0185600649790174	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGATGGCAG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.33333333333333	2	35.833333333333336	0.283107148654449	0.0579999025523778	4.88116593642177	0.225107246102071	0.0785814131881759	0.0414324926302989	NaN	NaN	0.0919137346296064	0.0143207976689061	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	75.25	3	36.5	0.307845716476152	0.0870541284395655	3.53625637283663	0.220791588036586	0.0847564514018345	0.0513470924912106	NaN	NaN	0.0949918851925354	0.0201083217940096	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTCGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	75.25	3	36.5	0.307845716476152	0.0870541284395655	3.53625637283663	0.220791588036586	0.0817638929430142	0.0507503537689305	NaN	NaN	0.0934934482389783	0.0181975966493153	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTCGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	76.16666666666667	4	36.25	0.323213439068629	0.119357976360937	2.70793330218029	0.203855462707692	0.0870317877322556	0.0623614444987459	NaN	NaN	0.0966359498852353	0.0348997271548589	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCTTTGTAT	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	76.66666666666667	4	35.916666666666664	0.320583011120205	0.120559681536883	2.65912290936276	0.200023329583322	0.0866989869028062	0.0630897985984016	NaN	NaN	0.0973763070246793	0.0399633734616068	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	74	TAT	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:TTGTATAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.25	4	35.666666666666664	0.317568580879768	0.121476995958792	2.61422813737915	0.196091584920976	0.0850510429548304	0.0645712853230733	NaN	NaN	0.0987874955275637	0.0471462664094781	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	75	AAA	CAA	AGG	2	TATAAAGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.91666666666667	3	35.333333333333336	0.314193196111627	0.0901082338815474	3.4868422404622	0.224084962230079	0.0807776347896919	0.0563241093321238	NaN	NaN	0.0903733390950429	0.0131549308439274	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	76	GGC	AGG	CAT	2	AAAGGCATG:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.08333333333333	3	35.5	0.313360693749776	0.089658862987337	3.49503309889211	0.223701830762439	0.0815967824428824	0.0527790223029873	NaN	NaN	0.0883329451040718	0.0113257316845125	994	0	6	0.006	0.994	0.012
ORF3a	all	ss12	77	ATG	CAT	GCA	2	GGCATGCAG:GGTGTTCAC	1:1	TRUE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.66666666666667	3	35.166666666666664	0.310481848332055	0.09056213746611	3.42838472036112	0.219919710865945	0.0800884641244644	0.0538946146656869	NaN	NaN	0.0915017847151426	0.0162413109690255	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	78	CAC	GCA	CTT	2	ATGCAGCTT:GTTCACTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.33333333333334	3	35.25	0.312120297918684	0.0903346148069003	3.45515723497437	0.221785683111784	0.0835109636834643	0.0546828763336144	NaN	NaN	0.0871156084771815	0.0109003377080948	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	79	CTT	CTT	TGT	2	CACTTTGTT:CAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.16666666666667	3	34.75	0.289246860608988	0.0917171833187057	3.15368233239231	0.197529677290283	0.0803549113682317	0.0542008398078476	NaN	NaN	0.0855239558564535	0.0209080102867905	994	0	6	0.006	0.994	0.012
ORF3a	all	ss12	80	GTT	TGT	TTG	2	CTTGTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.83333333333334	3	34.75	0.272278228294921	0.0917171833187057	2.96867193739245	0.180561044976215	0.0758561331547156	0.0564000224746819	NaN	NaN	0.0852138071283018	0.0340974220627775	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	GTTTGCAAC:GTTTGCAAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.5	3	34.583333333333336	0.269530500680923	0.092187504132096	2.92372055430323	0.177342996548827	0.0767964494256293	0.0549024031804835	NaN	NaN	0.0795737950715801	0.0258364833688571	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAATCTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.83333333333334	3	35.25	0.272278228294921	0.0903346148069003	3.0141073704354	0.18194361348802	0.0761556114429282	0.0561480694439993	NaN	NaN	0.082508388883503	0.0274433666231001	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	83	CTG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG:AATCTGCTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.83333333333334	3	35.25	0.272278228294921	0.0903346148069003	3.0141073704354	0.18194361348802	0.0799555309376171	0.0560554560698961	NaN	NaN	0.0803902259939121	0.0236199495964529	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GCT	2	CTGCTGCTA:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.08333333333334	3	34.75	0.267171809494173	0.0917171833187057	2.91299623284096	0.175454626175468	0.0777926034649845	0.055545204809335	NaN	NaN	0.0804238874364617	0.0291373463071979	994	0	6	0.006	0.994	0.012
ORF3a	all	ss12	85	CTA	GCT	ACT	2	CTGCTACTC:CTGTTGTTG	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.08333333333334	4	34.416666666666664	0.29910521468218	0.126281753068954	2.36855450144772	0.172823461613226	0.0858125082457547	0.0708018984002144	NaN	NaN	0.0836459189644572	0.0388160718625424	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	86	CTC	ACT	CTT	2	CTACTCTTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.58333333333334	4	33.916666666666664	0.296856081021002	0.128312053707491	2.31354788925548	0.168544027313511	0.0795754460094265	0.0689399648959677	NaN	NaN	0.0847178352480761	0.0466487829030166	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	87	TTT	CTT	TGT	2	CTCTTTGTG:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.58333333333334	4	33.25	0.274785181580729	0.131123163798598	2.09562653630592	0.143662017782131	0.0822329964998568	0.070700772435618	NaN	NaN	0.080937278551001	0.0759012566973488	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTGACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	83.25	4	32.583333333333336	0.272132199812821	0.134060541816084	2.02992018476365	0.138071657996737	0.083070462487781	0.0739710322975396	NaN	NaN	0.085276917288945	0.105426250296181	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AAT	2	GTAACAGTT:GTGACAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.75	4	33.083333333333336	0.274117044773636	0.13184534303006	2.07908021985379	0.142271701743576	0.0810202653353896	0.0693477457933212	NaN	NaN	0.0849280609258432	0.0938945031628688	966	0	34	0.034	0.966	0.068
ORF3a	all	ss12	90	ATT	AAT	TTA	2	ACAATTTAT:ACAGTTTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.41666666666666	4	33.75	0.275456620020365	0.129003442367267	2.13526565621523	0.146453177653098	0.078605940773535	0.0685537255136476	NaN	NaN	0.0787060039368035	0.0627777287159105	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	ATTTATTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.58333333333333	4	34.416666666666664	0.26129386407213	0.126281753068954	2.06913396212876	0.135012111003176	0.0779296795707435	0.0677461123571035	NaN	NaN	0.0798075724943412	0.0906992669414173	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TATTCACAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.24999999999999	4	34.75	0.262577384081623	0.124963623649128	2.10123055345198	0.137613760432495	0.0800984131411084	0.0666453687891232	NaN	NaN	0.0792134610665623	0.0823426626529504	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTC:TCACACCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.91666666666666	4	33.75	0.263873706540401	0.129003442367267	2.04547802522327	0.134870264173134	0.0795738237204626	0.0709682061342624	NaN	NaN	0.0837569886725191	0.10734179657657	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	94	CTC	CCT	CTT	2	CACCTCTTA:CACCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.74999999999999	5	33.25	0.264526729305941	0.167827735578764	1.57618005387312	0.0966989937271764	0.0778053661371894	0.0789749579996775	NaN	NaN	0.094771374458191407	0.307567391494201	855	0	145	0.145	0.855	0.29
ORF3a	all	ss12	95	TTA	CTT	ACT	2	CTCTTACTT:CTTTTGCTC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	82.08333333333331	5	32.583333333333336	0.259392172808674	0.171685985854599	1.51085233612692	0.0877061869540751	0.0782715545658366	0.0853509654017063	NaN	NaN	0.0920343698723595	0.340604205740075	856	0	144	0.144	0.856	0.288
ORF3a	all	ss12	96	CTC	ACT	CGT	2	TTACTTTTA:TTGCTCGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.49999999999999	5	32.833333333333336	0.261613554332634	0.17021844254226	1.53692837524161	0.091395111790374	0.0802646078186634	0.0855542499975749	NaN	NaN	0.0983887381499899	0.352931362989939	836	0	164	0.164	0.836	0.328
ORF3a	all	ss12	97	GTT	CGT	AGC	2	CTCGTTGCT:CTTTTAGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	82.49999999999999	5	32.5	0.257828654327118	0.172180831233375	1.49742949014839	0.0856478230937434	0.0758072545724885	0.0848411790471752	NaN	NaN	0.0964361545833235	0.374470932279282	824	1	175	0.175	0.824	0.35
ORF3a	all	ss12	98	GCT	AGC	TGC	2	GTTGCTGCT:TTAGCTGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	82.58333333333331	5	32.25	0.257518231889492	0.173682709081938	1.48269354647159	0.083835522807554	0.0740040399361112	0.0851744829040374	NaN	NaN	0.0953372361884986	0.379207416206629	817	0	183	0.183	0.817	0.366
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	83.16666666666666	5	32.166666666666664	0.255366229707077	0.174189200634338	1.46602790975055	0.0811770290727396	0.0747853378421003	0.0847082802586393	NaN	NaN	0.0937749981036669	0.386678020955893	802	0	198	0.198	0.802	0.396
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CAT	2	GCTGGCATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	83.66666666666666	5	32.666666666666664	0.253550349968272	0.171193988985735	1.48107040130596	0.0823563609825365	0.0733403208190457	0.0849479304154744	NaN	NaN	0.0933180134376537	0.377487862537735	801	0	199	0.199	0.801	0.398
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CAT	GGA	2	GGCATGGAG:GGCCTTGAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	83.33333333333333	5	33.666666666666664	0.254758025677621	0.165503521626615	1.539290663871	0.0892545040510055	0.0749239861691181	0.080214644907837307	NaN	NaN	0.0896504205585126	0.319452421767049	851	0	149	0.149	0.851	0.298
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAGGCA:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82	5	34	0.242660989230208	0.163690174515013	1.48244077538051	0.0789708147151947	0.0749827243913483	0.0814442179872251	NaN	NaN	0.0915021436169647	0.38811063979612	793	0	207	0.207	0.793	0.414
ORF3a	all	ss12	103	GCA	AGC	ACA	2	GAAGCCCCT:GAGGCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	82	5	34	0.259707177538375	0.163690174515013	1.58657768132904	0.0960170030233619	0.0797129937794462	0.0783191974601173	NaN	NaN	0.0891964644821653	0.28171868994128	883	0	117	0.117	0.883	0.234
ORF3a	all	ss12	104	CAA	ACA	ATT	2	GCACAATTT:GCCCCTTTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	82.91666666666667	6	33.666666666666664	0.256284053446515	0.203486321240682	1.25946575614478	0.0527977322058333	0.0745936872520001	0.0953946542020559	NaN	NaN	0.113920419018688	0.643033580319878	696	0	304	0.304	0.696	0.608
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.91666666666667	5	33.333333333333336	0.239500136249871	0.167357663485657	1.43106763838392	0.0721424727642136	0.0728714339994227	0.0869877842966537	NaN	NaN	0.103687953158247	0.486575866265686	772	2	226	0.226	0.772	0.452
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.41666666666667	5	33.833333333333336	0.241213868267319	0.164591833676269	1.46552755917256	0.07662203459105	0.0764921952476461	0.0837124042006325	NaN	NaN	0.100255860380106	0.444709400937829	792	0	208	0.208	0.792	0.416
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CAT	2	CTCTATCTT:TTGTACATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82	5	34.083333333333336	0.225993636641676	0.163243053958072	1.38439971050603	0.0627505826836031	0.0745291623982752	0.0786350771574702	NaN	NaN	0.0959770518707903	0.51323538851974	753	0	247	0.247	0.753	0.494
ORF3a	all	ss12	108	ATC	CAT	CTA	2	TACATCTAT:TATCTTTAT	1:1	TRUE	1.5	0.5	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	82.83333333333333	5	33.75	0.223345036542076	0.165046413582601	1.35322562722817	0.0582986229594749	0.0743455077781158	0.0816703226957617	NaN	NaN	0.096740718637715	0.546756483704733	731	0	269	0.269	0.731	0.538
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	ATCTATGCT:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82.66666666666666	5	34.083333333333336	0.207740087501275	0.163243053958072	1.27258148181074	0.0444970335432023	0.0711263259363118	0.0845074410136388	NaN	NaN	0.0956759423859419	0.641873671932267	687	0	313	0.313	0.687	0.626
ORF3a	all	ss12	110	GCT	TGC	TCT	2	TATGCTCTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82.33333333333333	5	34.416666666666664	0.208709789830043	0.161478827235442	1.29249012643457	0.0472309625946012	0.0699012610222213	0.0833545392034289	NaN	NaN	0.09982935170587	0.63612971460924606	688	1	311	0.311	0.688	0.622
ORF3a	all	ss12	111	CTG	TCT	AGT	2	GCTCTGATT:GCTTTAGTC	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	82.33333333333333	5	34.416666666666664	0.208709789830043	0.161478827235442	1.29249012643457	0.0472309625946012	0.0666811075431425	0.0827837924473171	NaN	NaN	0.0954563469782929	0.620747501058975	692	0	308	0.308	0.692	0.616
ORF3a	all	ss12	112	ATT	AGT	CTA	2	CTGATTTAT:TTAGTCTAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	84	5	33.75	0.203950286612731	0.165046413582601	1.2357147434207	0.0389038730301301	0.0652226195645717	0.0818892049981728	NaN	NaN	0.0920493358575209	0.672556814337905	672	0	328	0.328	0.672	0.656
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	ATTTATATT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	84.5	5	33.75	0.187218929017546	0.165046413582601	1.13434109202166	0.0221725154349448	0.0691070607276202	0.0832772006311489	NaN	NaN	0.0919769103947284	0.809503883337775	608	1	391	0.391	0.608	0.782
ORF3a	all	ss12	114	ATT	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATATTCTG	1:1	TRUE	1.5	0.5	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	84.66666666666667	5	33.58333333333333	0.186800427243001	0.16596317904302	1.12555344095078	0.0208372481999811	0.0672485783448275	0.0879842815584156	NaN	NaN	0.0934106699415828	0.823479943016574	616	0	384	0.384	0.616	0.768
ORF3a	all	ss12	115	CTG	CTT	GCA	2	ATTCTGCAA:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	84.83333333333334	5	32.916666666666664	0.171420712082988	0.169734844556617	1.00993235968003	0.00168586752637107	0.0625946217716959	0.0862553614224079	NaN	NaN	0.0937947542750334	0.985659589840628	499	0	501	0.501	0.499	0.998
ORF3a	all	ss12	116	CAA	GCA	AGT	2	CTGCAAGTT:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	85.83333333333334	5	32.25	0.198960851821961	0.173682709081938	1.14554208000116	0.0252781427400222	0.0718540576628869	0.0875396615088422	NaN	NaN	0.101994334930588	0.804259215397074	589	1	410	0.41	0.589	0.82
ORF3a	all	ss12	117	AGT	AGT	TAT	2	CAAGTTGTG:CAGAGTATA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	85.25	5	32.25	0.216005973438278	0.173682709081938	1.24368150738812	0.0423232643563393	0.0737803285282303	0.094720794272652	NaN	NaN	0.103250421434926	0.681872792884991	655	0	345	0.345	0.655	0.69
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	AGTATAAAC:GTTGTGTGC	1:1	TRUE	1.5	0.75	0.75	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	85.25	5	32.25	0.185350365139014	0.173682709081938	1.0671779943942	0.0116676560570754	0.0650348542321388	0.0906027273525366	NaN	NaN	0.0970056102045638	0.904262806320904	559	0	441	0.441	0.559	0.882
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT:GTGTGCTTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.416666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.25	5	31.999999999999996	0.155898728322134	0.175211138386129	0.889776356446959	-0.0193124100639951	0.0586021130024056	0.0884812728916762	NaN	NaN	0.0877618016681773	0.825828437704646	419	0	581	0.581	0.419	0.838
ORF3a	all	ss12	120	TTC	CTT	CTG	2	AACTTTGTA:TGCTTCTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.166666666666667	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.83333333333334	4	31.999999999999996	0.156750317692117	0.136741167595466	1.1463286473891	0.0200091500966514	0.0586664173747249	0.0755491117286825	NaN	NaN	0.0868892692866595	0.81787161485761	604	0	396	0.396	0.604	0.792
ORF3a	all	ss12	121	GTA	CTG	AAG	2	TTCTGCAGA:TTTGTAAGA	1:1	TRUE	1.75	0.5	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.16666666666667	4	31.999999999999996	0.158132454924419	0.136741167595466	1.15643633665785	0.0213912873289525	0.059791729322579	0.0813308867200271	NaN	NaN	0.0837384580678445	0.798372806683278	604	0	396	0.396	0.604	0.792
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGCAGATTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.66666666666667	3	31.999999999999996	0.159185220067497	0.100148544468392	1.58949109957098	0.0590366755991054	0.06078725238251	0.065160340197976	NaN	NaN	0.0785612347278513	0.452367823095939	795	0	205	0.205	0.795	0.41
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGATTTATT	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.5	3	31.999999999999996	0.159539275483744	0.100148544468392	1.5930264022369	0.0593907310153522	0.0614113807499273	0.0634394245833642	NaN	NaN	0.079298303407737	0.453885315286722	804	0	196	0.196	0.804	0.392
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:TTTATTATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82	3	31.666666666666664	0.147797878898369	0.101277212852957	1.45933991205854	0.0465206660454114	0.0575776488749558	0.0632384028573337	NaN	NaN	0.0763393278302116	0.542263854729335	770	0	230	0.23	0.77	0.46
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATTATGAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.83333333333334	3	31.499999999999996	0.148130674385878	0.101851155869296	1.45438383218715	0.0462795185165818	0.0601192601597037	0.0614821593062786	NaN	NaN	0.0794890895762132	0.560423749953824	729	1	270	0.27	0.729	0.54
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGC:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.33333333333334	4	31.166666666666664	0.149138144058874	0.140762624951505	1.0595010153459	0.00837551910736886	0.0601798556766241	0.0791752103108074	NaN	NaN	0.0963753694420926	0.930746879760103	555	0	445	0.445	0.555	0.89
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	CTG	2	AGATGCTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.75	4	31.499999999999996	0.165618196142339	0.139125907283501	1.19041952269073	0.0264922888588383	0.0612110214960261	0.0779079332693143	NaN	NaN	0.0971132119639289	0.785008506057046	630	0	370	0.37	0.63	0.74
ORF3a	all	ss12	128	TGG	CTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGCTGGCTT	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81	4	31.333333333333332	0.165046413582601	0.139939466685309	1.17941290968152	0.0251069468972921	0.0600476624089765	0.0773485899595848	NaN	NaN	0.0965835708729771	0.79490196163051	620	1	379	0.379	0.62	0.758
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.5	4	31.833333333333332	0.16853783682123	0.137526919369799	1.22548979933191	0.0310109174514314	0.0610645706804437	0.0804219577552396	NaN	NaN	0.0941004129696992	0.741738993198185	652	0	348	0.348	0.652	0.696
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.33333333333333	4	31.499999999999996	0.198330831309248	0.139125907283501	1.42554923940301	0.059204924025747	0.0709496882120325	0.077691236817867	NaN	NaN	0.0981846292165454	0.546511449488828	753	1	246	0.246	0.753	0.492
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGCTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.49999999999999	5	31.833333333333332	0.217335531831527	0.176245193423779	1.23314302994321	0.0410903384077475	0.0769540891228829	0.0945883532902301	NaN	NaN	0.108914619707317	0.705972146771768	663	0	337	0.337	0.663	0.674
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.49999999999999	5	31.416666666666664	0.234333426514436	0.178884786483983	1.30996845019807	0.0554486400304521	0.0755311046411	0.0952281592882692	NaN	NaN	0.114377086815817	0.627826730421595	699	0	301	0.301	0.699	0.602
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCCGT:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.49999999999999	5	32.25	0.255545671643513	0.173682709081938	1.47133628323908	0.081862962561575	0.0792059288459737	0.0877925272857641	NaN	NaN	0.116369787087481	0.481761244996379	772	0	228	0.228	0.772	0.456
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CAA	ATC	2	TGCAAATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.58333333333331	5	32.083333333333336	0.255222859246332	0.174698668260279	1.46093191086083	0.0805241909860524	0.0796056025091292	0.0815810438834112	NaN	NaN	0.113807454700798	0.479226245558836	765	0	235	0.235	0.765	0.47
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AAATCCAAA:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.91666666666664	4	32.416666666666664	0.222476012792921	0.134815620966532	1.65022429298569	0.0876603918263895	0.0727282573129162	0.0757903651717752	NaN	NaN	0.109970096808908	0.425375912047356	800	0	200	0.2	0.8	0.4
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.08333333333331	4	32.916666666666664	0.221923403608424	0.132575542143044	1.67393925018973	0.0893478614653796	0.0752519401969669	0.0736404526281816	NaN	NaN	0.107996272259108	0.408053688087915	793	0	207	0.207	0.793	0.414
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.91666666666664	4	32.916666666666664	0.222476012792921	0.132575542143044	1.67810750909755	0.089900470649877	0.0716131647527882	0.0765939581325344	NaN	NaN	0.105879455230626	0.39583497695807	812	0	188	0.188	0.812	0.376
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.58333333333331	4	32.583333333333336	0.223589590132048	0.134060541816084	1.66782549960739	0.0895290483159636	0.0680494638021403	0.0743391747675208	NaN	NaN	0.108978543492292	0.411344936979079	810	0	190	0.19	0.81	0.38
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTC:CCATTACTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.58333333333331	4	31.583333333333336	0.220282043117094	0.138722674692595	1.58793105456792	0.0815593684244996	0.0693439802479936	0.0817935121113845	NaN	NaN	0.107501114152097	0.448041648539479	799	0	201	0.201	0.799	0.402
ORF3a	all	ss12	140	CTC	ACT	CTA	2	TTACTCTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.91666666666666	4	30.916666666666668	0.219201320467129	0.142015736265178	1.54350022210092	0.0771855842019507	0.0691723833729587	0.0785805665800667	NaN	NaN	0.115102769976133	0.50248830017966	761	0	239	0.239	0.761	0.478
ORF3a	all	ss12	141	TAT	CTA	TGA	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.24999999999999	4	30.583333333333336	0.235201662735449	0.143721781908901	1.63650672578311	0.091479880826548	0.0704646449306167	0.088025292589402	NaN	NaN	0.118351444873336	0.439551314468473	798	0	202	0.202	0.798	0.404
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC:TATGATGTC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.41666666666666	4	29.916666666666668	0.238143225992366	0.147260274111344	1.61715864940129	0.0908829518810215	0.0711872828718324	0.0826248909013934	NaN	NaN	0.119271253295521	0.446068726866891	794	0	206	0.206	0.794	0.412
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC:GATGTCAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.74999999999999	4	30.583333333333336	0.268514498493544	0.143721781908901	1.86829369165312	0.124792716584644	0.0857866863252007	0.0812814509489526	NaN	NaN	0.122821104814766	0.309604286023886	840	0	160	0.16	0.84	0.32
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAT:GTCAACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.24999999999999	3	30.083333333333336	0.262577384081623	0.107006075844546	2.45385490505311	0.155571308237078	0.0836419803733567	0.0708217206838782	NaN	NaN	0.108319339025475	0.150937367447231	931	0	69	0.069	0.931	0.138
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333333	3	30.75	0.301389150714295	0.104516640682884	2.88364751053134	0.196872510031412	0.0956691043309123	0.0677502446964292	NaN	NaN	0.114592645661432	0.0857928830884939	963	0	37	0.037	0.963	0.074
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.75	3	30.583333333333336	0.300623921390007	0.105128058952294	2.85959737472587	0.195495862437713	0.0920022919574735	0.0680413957159221	NaN	NaN	0.119875315148606	0.102926895737193	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333333	3	30.083333333333336	0.301389150714295	0.107006075844546	2.81656110025137	0.19438307486975	0.0914978450497026	0.0710984241359665	NaN	NaN	0.115171870168245	0.09145630966817	946	0	54	0.054	0.946	0.108
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.91666666666666	3	29.75	0.281652316781776	0.10829587866142	2.60076671673114	0.173356438120356	0.0863146135459162	0.0714380712753922	NaN	NaN	0.121928036565989	0.155086330335526	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.41666666666666	3	30.25	0.283780696115475	0.106372646579413	2.66779764573796	0.177408049536061	0.08423282710849	0.0708156116220869	NaN	NaN	0.111114526298371	0.11034968613624	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.74999999999999	3	29.583333333333336	0.282358178426184	0.108952531416164	2.59157061112849	0.17340564701002	0.0883594875062658	0.0725600198230404	NaN	NaN	0.118875621823842	0.144643578983449	925	0	75	0.075	0.925	0.15
ORF3a	all	ss12	151	ACA	TAC	ACA	2	CATACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.33333333333331	4	29.583333333333336	0.284138594692556	0.149095891727942	1.9057439571241	0.135042702964613	0.0878736452026693	0.0848516529219982	NaN	NaN	0.12297282996541	0.272138676605329	866	0	134	0.134	0.866	0.268
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ACA	TAA	2	ACACATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.83333333333331	4	29.083333333333336	0.28200480071778	0.151937056450332	1.85606334166389	0.130067744267447	0.0885246185004912	0.0840245757806051	NaN	NaN	0.125064237256992	0.298336417935254	852	0	148	0.148	0.852	0.296
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATTGTTAC:CATAACTAT	1:1	TRUE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.41666666666664	4	28.833333333333336	0.265842621320033	0.153398778089708	1.73301655091782	0.112443843230325	0.0823226018479947	0.0857220736081936	NaN	NaN	0.1354438864728	0.406432690783579	802	0	198	0.198	0.802	0.396
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.58333333333331	3	29.25	0.287401273704121	0.110290063467372	2.6058673344507	0.177111210236748	0.0862685896112908	0.0715795700053604	NaN	NaN	0.115735704767221	0.125940647222849	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.08333333333331	3	29.583333333333336	0.285217792864262	0.108952531416164	2.61781703607069	0.176265261448098	0.0851842207860735	0.067333961711051	NaN	NaN	0.11201486804148	0.115582710119058	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333331	3	28.75	0.301389150714295	0.112359208671495	2.6823716033411	0.1890299420428	0.0917527648988038	0.0711862184983945	NaN	NaN	0.111545158510782	0.0901419394892993	956	0	44	0.044	0.956	0.088
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.91666666666664	3	28.416666666666668	0.299862619562067	0.113782401199837	2.63540421365704	0.18608021836223	0.0921155357148422	0.0697944416235595	NaN	NaN	0.120955051434507	0.123944847897782	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.08333333333331	3	28.416666666666668	0.299105214682181	0.113782401199837	2.62874760532483	0.185322813482343	0.0902301583167132	0.0706511284558627	NaN	NaN	0.118451784457436	0.117690294583021	946	0	54	0.054	0.946	0.108
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAC:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.41666666666666	3	27.75	0.297601975168629	0.116739982283845	2.54927206040713	0.180861992884784	0.0895735962510126	0.07498756284443	NaN	NaN	0.116078050030094	0.119207945669833	946	0	54	0.054	0.946	0.108
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATACAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.74999999999999	4	27.75	0.296113964785258	0.160073332783954	1.84986443172839	0.136040632001304	0.0869978663850496	0.0915806287441771	NaN	NaN	0.134005042709316	0.310015079088595	861	0	139	0.139	0.861	0.278
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAACAGT:TACAATAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.24999999999999	4	27.583333333333336	0.312120297918684	0.16115228773261	1.93680339454173	0.150968010186074	0.0921390371976507	0.0867442667090496	NaN	NaN	0.134429958816916	0.261427490810051	861	0	139	0.139	0.861	0.278
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.91666666666664	4	27.916666666666668	0.318526102048975	0.159008783209024	2.00319816063405	0.159517318839951	0.0940210285763169	0.0882527840763588	NaN	NaN	0.131684335025296	0.225756930892507	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.91666666666664	4	28.250000000000004	0.323508417071989	0.156921757285409	2.06159058290172	0.16658665978658	0.0950729642319938	0.0856971534218395	NaN	NaN	0.128989913200031	0.196540599272773	890	0	110	0.11	0.89	0.22
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.08333333333331	4	28.750000000000004	0.322667069425418	0.15389231077321	2.09670689720768	0.168774758652208	0.0921900641662821	0.0875878731632667	NaN	NaN	0.132236671676227	0.201846565247319	909	0	91	0.091	0.909	0.182
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.24999999999999	4	29.416666666666668	0.326918846054154	0.150031026615648	2.17900825868278	0.176887819438506	0.0936038601285491	0.0834405168765293	NaN	NaN	0.130757256749037	0.176120992975195	926	0	74	0.074	0.926	0.148
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.58333333333331	4	30.083333333333336	0.310889822884503	0.146359364647636	2.12415395238275	0.164530458236867	0.0880715766102935	0.0798475488587477	NaN	NaN	0.119397384597502	0.168201058451672	920	0	80	0.08	0.92	0.16
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.58333333333331	4	30.083333333333336	0.291871371191942	0.146359364647636	1.9942104278372	0.145512006544306	0.0846333432786144	0.0800976976429485	NaN	NaN	0.121647599365585	0.231627667258168	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.91666666666664	4	30.41666666666667	0.294930500060605	0.144590316625212	2.03976661054755	0.150340183435394	0.0844647477835185	0.0806303491437391	NaN	NaN	0.115194387255313	0.19185883238331	903	0	97	0.097	0.903	0.194
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT:GTCGTTACT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.08333333333331	4	30.91666666666667	0.294159645070685	0.142015736265178	2.07131725544426	0.152143908805506	0.0863448835150704	0.0762468017085346	NaN	NaN	0.119675793205979	0.203621725719964	897	0	103	0.103	0.897	0.206
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TGC	2	ATTACTTCA:GTTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.41666666666664	4	30.66666666666667	0.311709043238926	0.143291427572032	2.17535025312126	0.168417615666894	0.0906078683824093	0.0773276471021024	NaN	NaN	0.121171458374819	0.164555722482544	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	171	GCA	TGC	AGG	2	ACTGCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.08333333333331	4	30.33333333333334	0.308458156432116	0.145028544735405	2.12687893266031	0.163429611696711	0.0919225034525112	0.0793585246492305	NaN	NaN	0.124864682674793	0.190583886142747	916	0	84	0.084	0.916	0.168
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	GCAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.83333333333331	4	30.58333333333334	0.290740699021438	0.143721781908901	2.02294109605269	0.147018917112537	0.0890004306142331	0.0795875564133875	NaN	NaN	0.128494064974289	0.252553584754255	886	0	114	0.114	0.886	0.228
ORF3a	all	ss12	173	GAC	TGA	CGG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.49999999999997	4	30.58333333333334	0.287768481418953	0.143721781908901	2.00226074013859	0.144046699510052	0.0866343096752895	0.0729884711608264	NaN	NaN	0.122104893269951	0.238120997640276	897	0	103	0.103	0.897	0.206
ORF3a	all	ss12	174	GGC	CGG	CAC	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.66666666666664	4	30.750000000000004	0.282712453350107	0.142863650574837	1.97889702672839	0.139848802775271	0.0863485975011178	0.0783196104647127	NaN	NaN	0.122628678416251	0.25410930890807	871	0	129	0.129	0.871	0.258
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.16666666666664	4	30.250000000000004	0.280600193443143	0.145469445655623	1.92892873261799	0.135130747787519	0.0837384451847957	0.0800630889670053	NaN	NaN	0.124581004252448	0.278062611957872	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAC	2	ACAACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333331	3	30.66666666666667	0.301389150714295	0.104821456781369	2.87526199280856	0.196567693932926	0.0885182068794578	0.0638312716606189	NaN	NaN	0.104575828937473	0.0601535288446301	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	177	ACA	AAC	ACC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.83333333333331	3	30.000000000000004	0.286305319885247	0.107325632730505	2.66763225709705	0.178979687154742	0.0914608695531023	0.0638103984883787	NaN	NaN	0.110554215708697	0.105462031831773	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	178	CCA	ACC	AAA	2	ACACCAAAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.83333333333331	3	30.33333333333334	0.268177549189387	0.106058740537371	2.52857565374247	0.162118808652015	0.0806305259286038	0.0640330954909278	NaN	NaN	0.101964682282077	0.111845938708955	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTC:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.33333333333331	4	29.83333333333334	0.266173663925686	0.147714914296514	1.80194170096721	0.118458749629172	0.0809984994020445	0.0837468684223927	NaN	NaN	0.117835932001332	0.314759412240279	871	1	128	0.128	0.871	0.256
ORF3a	all	ss12	180	CTC	ACT	CAA	2	AAACTCAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.49999999999999	4	30.16666666666667	0.234333426514436	0.145913043990275	1.60597997345634	0.0884203825241606	0.0694764151172669	0.0788439798023245	NaN	NaN	0.106223117724113	0.405181824476802	808	0	192	0.192	0.808	0.384
ORF3a	all	ss12	181	AAA	CAA	ACA	2	CTCAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.99999999999999	3	30.333333333333336	0.215761554338836	0.106058740537371	2.03435900940959	0.109702813801464	0.0706607677264178	0.0647829998898114	NaN	NaN	0.102682425929705	0.2853536860748	862	0	138	0.138	0.862	0.276
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.66666666666666	3	30.750000000000004	0.200233049317567	0.104516640682884	1.9158006611129	0.0957164086346837	0.0650197754249009	0.0632454664204557	NaN	NaN	0.0970035818493081	0.323774693837993	861	0	139	0.139	0.861	0.278
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.33333333333333	3	29.916666666666668	0.182287438823259	0.107647107231784	1.69337981772944	0.0746403315914759	0.0659460507833775	0.0642636791934807	NaN	NaN	0.101964805005423	0.464156031213277	793	0	207	0.207	0.793	0.414
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79	4	30.583333333333332	0.185778237042605	0.143721781908901	1.29262408644753	0.0420564551337039	0.0632284954974163	0.0815412719833701	NaN	NaN	0.110890843987655	0.704494842649222	655	0	345	0.345	0.655	0.69
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.66666666666667	4	29.916666666666668	0.18143524049715	0.147260274111344	1.23207186454078	0.0341749663858059	0.0660692259698513	0.0746878058424915	NaN	NaN	0.107267401202824	0.750032876919291	621	0	379	0.379	0.621	0.758
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.33333333333333	4	29.25	0.179754639949065	0.150978005779684	1.19060149868037	0.0287766341693818	0.0627533567518341	0.0830451613344128	NaN	NaN	0.110350865567502	0.794266812979704	624	0	376	0.376	0.624	0.752
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.83333333333333	4	29.583333333333332	0.196927853470251	0.149095891727942	1.32081341201264	0.0478319617423084	0.064054409162104	0.079273458926021	NaN	NaN	0.109241133830672	0.661490169833104	660	0	340	0.34	0.66	0.68
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.33333333333333	4	30.083333333333332	0.198330831309248	0.146359364647636	1.35509491850238	0.0519714666616118	0.0640293699893985	0.0803271132888881	NaN	NaN	0.109441534808293	0.634873350210607	677	0	323	0.323	0.677	0.646
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.33333333333333	4	30.583333333333332	0.204149781227553	0.143721781908901	1.42045122538875	0.0604279993186521	0.0661516895365344	0.0765389299820636	NaN	NaN	0.11194738543574	0.589342356259986	715	1	284	0.284	0.715	0.568
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.99999999999999	4	30.583333333333332	0.218932806420977	0.143721781908901	1.52330985264119	0.0752110245120757	0.0685731332046272	0.0773352957157661	NaN	NaN	0.107760656841757	0.48521151600168	756	1	243	0.243	0.756	0.486
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.66666666666666	4	30.916666666666668	0.20315621560155	0.142015736265178	1.43051904629926	0.0611404793363713	0.0671839439718568	0.0771932577685049	NaN	NaN	0.108675495739658	0.573709514191418	724	0	276	0.276	0.724	0.552
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGGATTGG	1:1	TRUE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.16666666666666	4	30.916666666666668	0.20465023999998	0.142015736265178	1.44103917905159	0.0626345037348018	0.0659100149434002	0.0754710386503906	NaN	NaN	0.105157979879507	0.551427157095098	726	0	274	0.274	0.726	0.548
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:GATTGGCAC	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.33333333333333	6	31.41666666666667	0.173851210542993	0.220417888585699	0.788734578933233	-0.0465666780427055	0.0583441814672854	0.115779178418096	NaN	NaN	0.138352586433882	0.736433728525649	371	0	629	0.629	0.371	0.742
ORF3a	all	ss12	194	CAC	GCA	ATC	2	TGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333333	6	32.083333333333336	0.193179203235308	0.215112484631514	0.898038082569788	-0.0219332813962062	0.0621428829617271	0.116479919550291	NaN	NaN	0.1384836055134	0.874155961744774	458	0	542	0.542	0.458	0.916
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.16666666666666	6	31.583333333333336	0.160415060140258	0.219066980579392	0.732264897776881	-0.0586519204391334	0.0541502838869564	0.118100812911991	NaN	NaN	0.13538615710652	0.664855328982323	338	0	662	0.662	0.338	0.676
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666666	6	31.750000000000004	0.159249476407496	0.217732646143538	0.731399168788461	-0.0584831697360422	0.049973738603452	0.124121478805687	NaN	NaN	0.130170984798039	0.6532299622636	315	0	685	0.685	0.315	0.63
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333333	6	31.91666666666667	0.158864717514625	0.216414580065769	0.734075853236624	-0.0575498625511439	0.0514901848064378	0.118530592685642	NaN	NaN	0.133740755389464	0.666970816730125	361	0	639	0.639	0.361	0.722
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32.5	0.158673037027526	0.211925228838758	0.748721791628931	-0.0532521918112318	0.0522382700889045	0.111874405958682	NaN	NaN	0.139193588085448	0.702033818279478	347	0	653	0.653	0.347	0.694
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32	0.158673037027526	0.215761554338836	0.735409222990409	-0.0570885173113096	0.0522491581005583	0.107214882388409	NaN	NaN	0.131117802912612	0.663273073874047	330	0	670	0.67	0.33	0.66
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.75	6	32	0.15905686340681	0.215761554338836	0.737188160764845	-0.0567046909320252	0.0490623108584327	0.112790177482722	NaN	NaN	0.133385426711843	0.670749863854144	316	0	684	0.684	0.316	0.632
ORF3a	all	ss12	201	GTC	TGT	CGT	2	TATGTCGTT:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333334	5	32.333333333333336	0.158864717514625	0.173179167487274	0.91734311822638	-0.0143144499726495	0.050099466080678	0.100869188575344	NaN	NaN	0.117001398908182	0.902626378105657	476	1	523	0.523	0.476	0.952
ORF3a	all	ss12	202	GTA	CGT	ATT	2	GTCGTTGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.33333333333334	5	32.833333333333336	0.160024633856936	0.17021844254226	0.940113371188945	-0.0101938086853242	0.0517216089109715	0.10109552484722201	NaN	NaN	0.121703366043381	0.933247677900359	496	0	504	0.504	0.496	0.992
ORF3a	all	ss12	203	GTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.08333333333334	5	33.083333333333336	0.160610991304224	0.168775880107432	0.951622893046025	-0.00816488880320848	0.0533701537066467	0.0944219034777076	NaN	NaN	0.117428021893607	0.944566951059	494	0	506	0.506	0.494	0.988
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	GTACATGGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.83333333333334	5	33.166666666666664	0.145028544735405	0.168300466878196	0.861723959686733	-0.023271922142791	0.0498443247541613	0.105209665146913	NaN	NaN	0.118576089802606	0.844405487974152	418	0	582	0.582	0.418	0.836
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:CATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	32.833333333333336	0.146091244169313	0.17021844254226	0.858257436664322	-0.0241271983729469	0.0500153235020434	0.0989753711750231	NaN	NaN	0.118321674114554	0.838422339042544	428	0	572	0.572	0.428	0.856
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.83333333333334	5	33	0.131083275220683	0.169253998250676	0.774476683419554	-0.0381707230299936	0.0483366287786745	0.0981628707501044	NaN	NaN	0.108512183915418	0.72501496061531	385	1	614	0.614	0.385	0.77
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	5	32.83333333333333	0.130765040358583	0.17021844254226	0.768218992052627	-0.039453402183677	0.0475314036797725	0.10086508334261	NaN	NaN	0.114286210615634	0.729932164045548	361	0	639	0.639	0.361	0.722
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CGA	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.33333333333334	5	32.5	0.13013319533385	0.172180831233375	0.755793745457451	-0.0420476358995253	0.0486803426730975	0.100168257156154	NaN	NaN	0.11607903752307	0.717178063459296	387	0	613	0.613	0.387	0.774
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.66666666666667	5	33.166666666666664	0.131403066768818	0.168300466878196	0.780764719232291	-0.0368974001093777	0.0476766591353995	0.0972279519808245	NaN	NaN	0.10947232191465	0.736080902349724	408	0	592	0.592	0.408	0.816
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	5	32.5	0.130765040358583	0.172180831233375	0.759463404967208	-0.0414157908747918	0.049003145301071	0.0975944978225301	NaN	NaN	0.110555709203395	0.707947058811807	366	0	634	0.634	0.366	0.732
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.66666666666667	5	32.5	0.113962844188242	0.172180831233375	0.661878812942748	-0.0582179870451332	0.0447402105974017	0.0984062997213238	NaN	NaN	0.117347470346538	0.619812394243296	297	0	703	0.703	0.297	0.594
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.83333333333333	0.128887692694994	0.17021844254226	0.757189942347142	-0.0413307498472659	0.0483139834286994	0.101874367974316	NaN	NaN	0.116468602866048	0.722689964074248	396	0	604	0.604	0.396	0.792
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.66666666666669	5	33.166666666666664	0.12950744207608	0.168300466878196	0.769501383319442	-0.0387930248021161	0.0471741642317933	0.0990437173511367	NaN	NaN	0.114720569959712	0.735248418325255	358	0	642	0.642	0.358	0.716
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.5	0.128887692694994	0.172180831233375	0.748560056144108	-0.0432931385383807	0.0478158120262788	0.0986149248874293	NaN	NaN	0.121153781169104	0.720837001847024	352	0	648	0.648	0.352	0.704
ORF3a	all	ss12	215	GAG	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.83333333333336	5	31.83333333333333	0.127364024533652	0.176245193423779	0.722652471023176	-0.0488811688901276	0.0477406155272779	0.103850636028771	NaN	NaN	0.123262971271065	0.691691924391842	338	0	662	0.662	0.338	0.676
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.50000000000003	5	30.83333333333333	0.114234586398441	0.182716561993313	0.625201049933402	-0.0684819755948721	0.0460804765745101	0.104644347493387	NaN	NaN	0.123396825084527	0.578912743840208	304	0	696	0.696	0.304	0.608
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.16666666666669	5	29.83333333333333	0.114781984854672	0.189683904532547	0.605122427954751	-0.074901919677875	0.0457197200522566	0.123971508249864	NaN	NaN	0.129714094135088	0.563643232291889	298	1	701	0.701	0.298	0.596
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AAT	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	30.166666666666664	0.115334665090852	0.187302855665743	0.615765652268946	-0.0719681905748906	0.047235298885242	0.110218748693796	NaN	NaN	0.130956382513843	0.582622243196574	300	0	700	0.7	0.3	0.6
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTACT:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	29.499999999999996	0.115334665090852	0.192126605059278	0.600305538398846	-0.0767919399684257	0.0460170624991177	0.114806465273854	NaN	NaN	0.134316746997141	0.567509819331642	272	0	728	0.728	0.272	0.544
ORF3a	all	ss12	220	ACT	GAG	TAC	2	ATTACTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.41666666666666	0.0849965139802523	0.192747196311253	0.440974061396971	-0.107750682331	0.0336762773292597	0.120778234087298	NaN	NaN	0.126114853911344	0.39289151603457	181	1	818	0.818	0.181	0.362
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	ACTACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.195270406950441	0.435275960692929	-0.110273892970189	0.036094989676443	0.119643372158586	NaN	NaN	0.127736609104561	0.387977370946942	182	0	818	0.818	0.182	0.364
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.195270406950441	0.435275960692929	-0.110273892970189	0.0341600189861302	0.115067524063585	NaN	NaN	0.126927092209974	0.384958105173185	169	0	831	0.831	0.169	0.338
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	5	28.749999999999993	0.0870541284395655	0.197860943283853	0.439976313641024	-0.110806814844288	0.03475559204118	0.115411638887742	NaN	NaN	0.128331887959	0.387895896777048	163	0	837	0.837	0.163	0.326
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.33333333333337	5	29.41666666666666	0.0879053734766805	0.192747196311253	0.456065640170085	-0.104841822834572	0.0343250387191465	0.12033721401941	NaN	NaN	0.124972723137519	0.401515524283778	168	0	832	0.832	0.168	0.336
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TGA	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333337	5	30.41666666666666	0.0892139571460239	0.185556129985381	0.480792292623546	-0.0963421728393568	0.0372830024067078	0.114509561505199	NaN	NaN	0.121302276689153	0.427060272129198	206	0	794	0.794	0.206	0.412
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.9166666666667	5	30.16666666666666	0.0729614963194685	0.187302855665743	0.389537554353545	-0.114341359346275	0.0331161863134012	0.111971208402815	NaN	NaN	0.122068783590863	0.348914878382821	130	0	870	0.87	0.13	0.26
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAC	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AACAAGCTT:AATAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAT:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	AGA	GCC	2	AAAGATCCA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCA	GCC	A--	1	GAGCCTGAA:GATCCA---	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCA---CCG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	CCG	-CC	ACA	1	---CCGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	2	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AAT	ACA	TGT	2	CCGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.66666666666666	5	32.50000000000001	0.233758183505998	0.172180831233375	1.35763186779578	0.0615773522726224	0.0623547233248229	0.0801863513827808	NaN	NaN	0.097099564414832	0.525971755271798	738	0	262	0.262	0.738	0.524
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.49999999999999	5	32.333333333333336	0.251725510203618	0.173179167487274	1.453555377682	0.0785463427163442	0.0627976613764465	0.0832970450469826	NaN	NaN	0.102478563444747	0.44339902782309	797	0	203	0.203	0.797	0.406
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.66666666666666	5	32.833333333333336	0.254900869216763	0.17021844254226	1.49749266536427	0.0846824266745031	0.0634482663714119	0.083039541071416	NaN	NaN	0.0956404882221335	0.375927750334005	817	0	183	0.183	0.817	0.366
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.49999999999999	5	32.333333333333336	0.255545671643513	0.173179167487274	1.47561439029491	0.0823665041562393	0.0666923244909117	0.0841627669320626	NaN	NaN	0.099240049176668	0.406554375096346	795	0	205	0.205	0.795	0.41
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.99999999999999	5	31.83333333333334	0.257499995250869	0.176245193423779	1.4610327251973	0.0812548018270896	0.0655442519150369	0.086973669079359	NaN	NaN	0.102362800568722	0.427316362114391	776	0	224	0.224	0.776	0.448
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGAATTTTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.49999999999999	5	31.83333333333334	0.255545671643513	0.176245193423779	1.44994406190163	0.0793004782197343	0.0657359963245068	0.0871918991093468	NaN	NaN	0.103215541142943	0.442309101500414	780	0	220	0.22	0.78	0.44
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTTACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.99999999999999	5	32.50000000000001	0.261500632286273	0.172180831233375	1.51875577794042	0.0893198010528983	0.0661072361548874	0.0850757838844317	NaN	NaN	0.0991049105110284	0.367447363808083	805	0	195	0.195	0.805	0.39
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.33333333333331	5	32.16666666666667	0.260153207881584	0.174189200634338	1.49350939630123	0.0859640072472462	0.0643492404966746	0.0860418578434666	NaN	NaN	0.0994543305364234	0.38739202502979603	811	0	189	0.189	0.811	0.378
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACTCTTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.99999999999999	6	32.50000000000001	0.261500632286273	0.211925228838758	1.23392874797948	0.0495754034475156	0.0657983786214997	0.0952970368739691	NaN	NaN	0.110911000985184	0.65488686893491	680	0	320	0.32	0.68	0.64
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGATCA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.83333333333331	6	32.50000000000001	0.262179645500183	0.211925228838758	1.23713277053796	0.0502544166614255	0.0682527826661833	0.0987796250243947	NaN	NaN	0.106084161510971	0.635698058709973	677	0	323	0.323	0.677	0.646
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGATCAATT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.16666666666664	6	32.833333333333336	0.260825162391736	0.209443067094397	1.24532726726247	0.0513820952973386	0.0688146273240338	0.0944876893230665	1.13313887512754	0.271765123668391	0.109762070723222	0.639696987632017	679	0	321	0.321	0.679	0.642
ORF3a	all	ss12	13	ATT	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATTACT	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.83333333333331	6	32.5	0.240246862716335	0.211925228838758	1.13363974658782	0.0283216338775775	0.0626518029171327	0.102073433591695	NaN	NaN	0.108962738159372	0.794925207659166	627	0	373	0.373	0.627	0.746
ORF3a	all	ss12	14	ACT	AAC	TGC	2	ATTACTGCA:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.08333333333331	6	32.41666666666667	0.221923403608424	0.212555050951034	1.0440749472453	0.00936835265738953	0.0582732288296137	0.10312289814044	0.851054992343681	0.219897469292199	0.108091695099333	0.930933489008098	560	0	440	0.44	0.56	0.88
ORF3a	all	ss12	15	GCA	TGC	ACA	2	ACTGCACAG:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.33333333333331	6	32.16666666666667	0.238441468231124	0.214467334863233	1.11178454464023	0.0239741333678911	0.0629736884104918	0.0977593477793702	NaN	NaN	0.113395538577379	0.832559217285428	580	0	420	0.42	0.58	0.84
ORF3a	all	ss12	16	AAG	ACA	GCA	2	GCACAGTCA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.74999999999999	5	32.66666666666667	0.223031401243081	0.171193988985735	1.30279925460271	0.0518374122573454	0.0600279989225411	0.0826719384886977	NaN	NaN	0.102739034159133	0.613871977667671	699	1	300	0.3	0.699	0.6
ORF3a	all	ss12	17	CAA	GCA	AGG	2	AAGCAAGGT:CAGTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.16666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.91666666666666	5	32.333333333333336	0.205405574614085	0.173179167487274	1.1860870888479	0.0322264071268105	0.0574094555739081	0.0905349344831411	NaN	NaN	0.0975348674179362	0.741090871400198	615	0	385	0.385	0.615	0.77
ORF3a	all	ss12	18	GGA	AGG	AAA	2	CAAGGTGAA:TCAGGAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.91666666666666	4	31.499999999999996	0.202417403270485	0.139125907283501	1.45492243121918	0.0632914959869844	0.0570263933217916	0.0744802132079831	NaN	NaN	0.085557987330277	0.459451881332939	787	0	213	0.213	0.787	0.426
ORF3a	all	ss12	19	AAA	AAA	AAT	2	GGAAAAATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.08333333333331	4	31.499999999999996	0.20192785781644	0.139125907283501	1.45140370876408	0.0628019505329391	0.059095045216678	0.076949260664663	NaN	NaN	0.0900490555429819	0.485540418025942	779	0	221	0.221	0.779	0.442
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAAATTGAC:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.74999999999999	4	31.166666666666664	0.183798305951801	0.140762624951505	1.3057322994305	0.0430356810002961	0.0559830759223282	0.0790757296137994	NaN	NaN	0.091557377126994	0.638326038291901	699	1	300	0.3	0.699	0.6
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	CAA	2	ATCAAGGAT:ATTGACAAT	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.25	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.24999999999999	4	31.833333333333332	0.185113513370723	0.137526919369799	1.34601657783789	0.0475865940009246	0.0571909365500976	0.0765124188936548	NaN	NaN	0.0841046442126533	0.571528240465904	743	0	257	0.257	0.743	0.514
ORF3a	all	ss12	22	AAT	CAA	TGC	2	AAGGATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.49999999999999	4	32.5	0.157344163604509	0.134437018317738	1.17039313704973	0.0229071452867708	0.0461437649427189	0.0693108069498314	NaN	NaN	0.0801569282867044	0.775047598884587	612	0	388	0.388	0.612	0.776
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.16666666666666	4	32.166666666666664	0.142269048679191	0.135964367940317	1.04637009559476	0.00630468073887414	0.0466195006820797	0.0728296096295796	NaN	NaN	0.0812304871415397	0.938134540438012	551	1	448	0.448	0.551	0.896
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.66666666666666	4	32.666666666666664	0.143291427572032	0.133686173554739	1.07184927028643	0.00960525401729284	0.0480074382201025	0.0744371563622156	NaN	NaN	0.0767651565094567	0.9004244492816	591	0	409	0.409	0.591	0.818
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.66666666666666	5	32.666666666666664	0.1276658623949	0.171193988985735	0.745737996709325	-0.0435281265908347	0.0415363040658766	0.0826783663397129	NaN	NaN	0.0897100187238228	0.62752795529683	306	0	694	0.694	0.306	0.612
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.99999999999999	5	31.999999999999996	0.125290563497375	0.175211138386129	0.715083325474778	-0.0499205748887542	0.0435880346541368	0.0869779515302709	NaN	NaN	0.0912364528844394	0.584271544877636	259	0	741	0.741	0.259	0.518
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.74999999999999	5	32.25	0.110672192571585	0.173682709081938	0.637209041456012	-0.0630105165103531	0.0388606358641362	0.0904226180209863	NaN	NaN	0.0888078295878622	0.478004741767029	238	1	761	0.761	0.238	0.476
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.99999999999999	4	32.666666666666664	0.111834664347976	0.133686173554739	0.836546228935067	-0.0218515092067632	0.03855057106015	0.0701749396552883	NaN	NaN	0.0785160957530292	0.780777385978943	415	0	585	0.585	0.415	0.83
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.99999999999999	3	33	0.111834664347976	0.0969087986100047	1.15401971701288	0.0149258657379712	0.0399780366774998	0.0578917680281973	NaN	NaN	0.0721038167073849	0.836005789434232	612	1	387	0.387	0.612	0.774
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.16666666666666	3	33.5	0.111574227897278	0.095366381613935	1.16995345748732	0.016207846283343	0.0401175947826883	0.0588520116974183	NaN	NaN	0.0750881235257457	0.82910389576687	593	0	407	0.407	0.593	0.814
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACA:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.58333333333333	2	32.916666666666664	0.126023271644748	0.0633621979772033	1.98893465927569	0.0626610736675446	0.0415907468547194	0.0482449672038735	NaN	NaN	0.0640887961715162	0.328211469615467	844	0	156	0.156	0.844	0.312
ORF3a	all	ss12	32	ACA	TAC	AGC	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79	2	32.5	0.123566424807041	0.0642103145422439	1.92440148733032	0.0593561102647976	0.0431494082124198	0.0461461342080403	NaN	NaN	0.0649427181374252	0.360729258440147	821	0	179	0.179	0.821	0.358
ORF3a	all	ss12	33	GCA	AGC	AAC	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.33333333333333	2	31.833333333333332	0.121340215764185	0.0656155905923368	1.84925891345031	0.0557246251718483	0.0405670707914527	0.0483144509390671	NaN	NaN	0.0671183197618602	0.406400481416753	802	0	198	0.198	0.802	0.396
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.08333333333333	2	32.416666666666664	0.121751485582717	0.0643826713791054	1.89105986090273	0.0573688142036118	0.0423130734727907	0.0457540706688466	NaN	NaN	0.063787247200223	0.368451625594539	823	0	177	0.177	0.823	0.354
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.08333333333333	2	33.08333333333333	0.123424890893523	0.0630291953285242	1.95821777908161	0.0603956955649992	0.0414148455884167	0.0444882732120489	NaN	NaN	0.0665914831477062	0.364428871367432	836	1	163	0.163	0.836	0.326
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333333	2	33.75	0.125145045452681	0.0617314855970427	2.02724823876061	0.063413559855638	0.0435342191774726	0.0434293344356173	NaN	NaN	0.0643364173745232	0.324302069536398	843	0	157	0.157	0.843	0.314
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCGCTACAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333333	2	33.75	0.125145045452681	0.0617314855970427	2.02724823876061	0.063413559855638	0.0434673874564556	0.0455567310464929	NaN	NaN	0.0634944304087485	0.31792727906379	849	0	151	0.151	0.849	0.302
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAGGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.58333333333333	2	33.916666666666664	0.109408627044446	0.0614153696041381	1.7814535310893	0.047993257440308	0.0392617326221335	0.04483018799238	NaN	NaN	0.0629481890929841	0.445806538184338	798	0	202	0.202	0.798	0.404
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA:CAGGCCTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.41666666666666	2	33.416666666666664	0.109659022528177	0.062373587449531503	1.75810029552822	0.0472854350786452	0.0400950611405787	0.0483532398680428	NaN	NaN	0.0641954329130846	0.461374360387275	767	0	233	0.233	0.767	0.466
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.41666666666666	2	33.416666666666664	0.109659022528177	0.062373587449531503	1.75810029552822	0.0472854350786452	0.0405948720510878	0.0467936665699678	NaN	NaN	0.0657332873570343	0.471923470179187	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	2	32.75	0.123142795706581	0.0636987401522852	1.93320614210238	0.0594440555542959	0.0406766042652176	0.0482763462808898	NaN	NaN	0.0670202668385787	0.375102367003613	814	0	186	0.186	0.814	0.372
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.58333333333331	2	32.416666666666664	0.122582464773988	0.0643826713791054	1.90396673744996	0.0581997933948826	0.0415730872695374	0.0455669589126022	NaN	NaN	0.0663601271791141	0.380470580469893	823	0	177	0.177	0.823	0.354
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.58333333333331	2	32.416666666666664	0.122582464773988	0.0643826713791054	1.90396673744996	0.0581997933948826	0.0414766279101012	0.0480237552489681	NaN	NaN	0.0657111577666258	0.375783958026325	821	0	179	0.179	0.821	0.358
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	2	32.75	0.123142795706581	0.0636987401522852	1.93320614210238	0.0594440555542959	0.0415282989178026	0.046272083170918	NaN	NaN	0.0667729519104229	0.373336203829442	829	0	171	0.171	0.829	0.342
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	2	32.75	0.123142795706581	0.0636987401522852	1.93320614210238	0.0594440555542959	0.0417821787654719	0.0470303920373573	NaN	NaN	0.0645196886215139	0.356877104508755	827	0	173	0.173	0.827	0.346
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333331	2	33.25	0.125145045452681	0.0626996766264699	1.99594403330381	0.0624453688262108	0.0412981363223558	0.0474632323253907	NaN	NaN	0.0677405523324053	0.356616521224538	824	0	176	0.176	0.824	0.352
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TAT	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333331	2	33.25	0.125145045452681	0.0626996766264699	1.99594403330381	0.0624453688262108	0.0419503065277338	0.0464876978567009	NaN	NaN	0.0641783005238506	0.330554212680674	832	0	168	0.168	0.832	0.336
ORF3a	all	ss12	48	ATT	TAT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.91666666666664	2	33.25	0.110417145764054	0.0626996766264699	1.76104808995839	0.0477174691375838	0.0392146298593807	0.0483219385752253	NaN	NaN	0.062274690590861	0.443532458895494	775	1	224	0.224	0.775	0.448
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.74999999999997	2	33.25	0.0959115685461867	0.0626996766264699	1.52969797783129	0.0332118919197168	0.0371259284479303	0.0469317553975308	NaN	NaN	0.0624136025929362	0.594638828244783	719	2	279	0.279	0.719	0.558
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.24999999999997	2	33.75	0.0965740892437444	0.0617314855970427	1.56442192034936	0.0348426036467017	0.0375883833348603	0.0454613438775811	NaN	NaN	0.0620739101252461	0.574587354935822	741	0	259	0.259	0.741	0.518
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.74999999999997	2	33.25	0.0959115685461867	0.0626996766264699	1.52969797783129	0.0332118919197168	0.0359405890857738	0.0459961602677585	NaN	NaN	0.0626447191896793	0.595999147093432	715	0	285	0.285	0.715	0.57
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.24999999999997	2	33.75	0.109910568819638	0.0617314855970427	1.78046207306734	0.0481790832225948	0.0389934818131838	0.0456780375240028	NaN	NaN	0.0628008045569742	0.442978648664076	777	0	223	0.223	0.777	0.446
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.41666666666664	2	33.916666666666664	0.0950422383375635	0.0614153696041381	1.54753181410732	0.0336268687334254	0.0363209416323416	0.0461459040649097	NA	NA	0.0585771776786607	0.565926574927841	707	1	292	0.292	0.707	0.584
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.74999999999997	2	33.58333333333333	0.0946134639951751	0.0620508745044359	1.52477245084453	0.0325625894907392	0.0361053196557408	0.0446083171922986	NaN	NaN	0.0630483723046887	0.605526223754987	707	0	293	0.293	0.707	0.586
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.5833333333333	3	34.08333333333333	0.094827365833507	0.0936278982824406	1.01281100583341	0.00119946755106641	0.0359749098339441	0.0586555051999405	NaN	NaN	0.0698908858605973	0.986307375411717	526	1	473	0.473	0.526	0.946
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.24999999999997	3	34.08333333333333	0.0939775170586381	0.0936278982824406	1.00373413034588	3.49618776197519e-4	0.0339255448084119	0.0574797872055509	NaN	NaN	0.0682135769123642	0.995910576530351	505	0	495	0.495	0.505	0.99
ORF3a	all	ss12	57	CAG	TCA	GAG	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.33333333333331	3	34.5	0.109784651326779	0.0924244803179611	1.18783087499215	0.0173601710088176	0.0384578096690493	0.0547608821283618	NaN	NaN	0.0741014384300716	0.81477090091622	618	0	382	0.382	0.618	0.764
ORF3a	all	ss12	58	AGC	GAG	CGC	2	CAGAGCGCT:CAGAGCGTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.83333333333331	3	34.5	0.109035174336848	0.0924244803179611	1.17972180056347	0.0166106940188873	0.0370947667356575	0.0546880915066423	NaN	NaN	0.0703675390258563	0.813389059171447	629	0	371	0.371	0.629	0.742
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TAC	2	AGCGCTTCC:AGCGTTACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.49999999999999	3	35.166666666666664	0.11105698371059	0.09056213746611	1.22630700663564	0.0204948462444804	0.0377080266691759	0.0547477229444393	NaN	NaN	0.0677420132354543	0.762238447783196	634	0	366	0.366	0.634	0.732
ORF3a	all	ss12	60	ACC	TAC	CAA	2	GCTTCCAAA:GTTACCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.83333333333331	2	34.83333333333333	0.110544521791661	0.0597330472949441	1.85064259731844	0.0508114744967167	0.0394035490072059	0.045782299481973	NaN	NaN	0.0608151648330847	0.403432505611894	799	1	200	0.2	0.799	0.4
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	ACCAAAATA:TCCAAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.99999999999999	2	34.666666666666664	0.0955837099260903	0.0600320307551523	1.59221183631018	0.035551679170938	0.0375602443279245	0.042127960686607	NaN	NaN	0.059740521378289	0.551775566884943	728	0	272	0.272	0.728	0.544
ORF3a	all	ss12	62	ATA	AAT	AAT	2	AAAATAATT:AAAATCATA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.99999999999999	2	35.33333333333333	0.0969087986100047	0.0588537115811214	1.64660470863303	0.0380550870288833	0.0383634744736842	0.0428116651434066	NA	NA	0.0578261259988648	0.510477059205617	758	0	242	0.242	0.758	0.484
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATAATTGCG:ATCATAACC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.83333333333331	2	35.33333333333333	0.112096321732094	0.0588537115811214	1.90466019424425	0.0532426101509721	0.0390539101392794	0.0441035031249532	NaN	NaN	0.0617132461893852	0.388279328364237	820	0	180	0.18	0.82	0.36
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTC	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.99999999999999	2	35.83333333333333	0.113423227292943	0.0579999025523778	1.95557616998604	0.0554233247405648	0.0401873689218136	0.0418165197974938	NaN	NaN	0.0585470250988178	0.343819042144147	832	0	168	0.168	0.832	0.336
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.41666666666666	2	36.08333333333333	0.0976988961284261	0.0575822255219405	1.69668496211908	0.0401166706064856	0.0370932571679737	0.0417598149382232	NaN	NaN	0.058731186267527	0.494571656917087	764	2	234	0.234	0.764	0.468
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTCAATAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.41666666666666	2	36.08333333333333	0.0976988961284261	0.0575822255219405	1.69668496211908	0.0401166706064856	0.0360836037380555	0.0424832531149765	NA	NA	0.0566063776152502	0.478513616753487	771	0	229	0.229	0.771	0.458
ORF3a	all	ss12	67	AAA	AAA	AAG	2	AAAAAGAGA:AATAAAAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.83333333333331	2	36.75	0.0985020015458152	0.0564972895530331	1.74348189665547	0.0420047119927821	0.0367206133633293	0.0423451951341084	NaN	NaN	0.0559087499487584	0.452467090957438	780	0	220	0.22	0.78	0.44
ORF3a	all	ss12	68	AGA	AAG	ATG	2	AAAAGATGG:AAGAGATGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.08333333333331	2	36.583333333333336	0.11328912210942	0.0567646707244322	1.9957681540934	0.0565244513849878	0.038271364585492	0.0415390848683952	NaN	NaN	0.0584274134098233	0.333328957873648	848	0	152	0.152	0.848	0.304
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGATGGCAG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.08333333333331	2	36.916666666666664	0.11328912210942	0.0562324166616758	2.01465860503609	0.0570567054477442	0.0403609822823758	0.0419160791152585	NaN	NaN	0.0593347647726321	0.336247220762306	845	0	155	0.155	0.845	0.31
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.41666666666664	2	37.25	0.114370944999209	0.0557100557871529	2.05296769825859	0.0586608892120562	0.0394383056739795	0.0425888536535934	NaN	NaN	0.0567472159711634	0.301265785683423	857	0	143	0.143	0.857	0.286
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTAGCC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.0833333333333	3	37.25	0.130606503128167	0.085197883292779	1.5329782628442	0.0454086198353879	0.0433723967307036	0.0513669747975139	NaN	NaN	0.0620939993147298	0.464603029817781	763	0	237	0.237	0.763	0.474
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTAGCCCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.16666666666664	3	36.5	0.160415060140258	0.0870541284395655	1.84270479775834	0.0733609317006926	0.0534820362145414	0.050777704680791	NaN	NaN	0.0687741989603987	0.28611065273259	854	0	146	0.146	0.854	0.292
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCCCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.3333333333333	3	36.5	0.160024633856936	0.0870541284395655	1.83821992966167	0.0729705054173706	0.0525303611521118	0.0536306755770721	NaN	NaN	0.0743841607745961	0.326595103689811	842	0	158	0.158	0.842	0.316
ORF3a	all	ss12	74	TAT	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTTTATAAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.3333333333333	3	35.833333333333336	0.157721556627271	0.0887734500607747	1.77667485626946	0.0689481065664959	0.0517611315845115	0.0572662222190831	NaN	NaN	0.0700443233640258	0.324943615544434	849	0	151	0.151	0.849	0.302
ORF3a	all	ss12	75	AAG	CAA	GGG	2	TATAAGGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.66666666666664	2	35.833333333333336	0.156968578879544	0.0579999025523778	2.70635935530737	0.0989686763271659	0.0507241866696622	0.0403192515505336	NaN	NaN	0.0629759482073592	0.116059280456969	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	76	GGC	GGG	CTT	2	AAGGGCTTC:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.99999999999997	2	35.833333333333336	0.156222782397911	0.0579999025523778	2.69350077367512	0.0982228798455337	0.0500249316880629	0.0416683201708409	NaN	NaN	0.0617399037934292	0.111628922141299	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	77	GTT	CTT	CCA	2	GGCTTCCAG:GGTGTTCAC	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.91666666666664	2	35.166666666666664	0.154208039717062	0.0591439311842398	2.60733496454077	0.0950641085328218	0.0490836838541406	0.0412087947064578	NaN	NaN	0.0607628992868196	0.117698058919321	944	1	55	0.055	0.944	0.11
ORF3a	all	ss12	78	CAC	CCA	CTT	2	GTTCACTTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.08333333333331	2	34.916666666666664	0.169534158879359	0.059584670169267	2.84526470311491	0.109949488710092	0.0585803805790803	0.0429114745551624	NaN	NaN	0.065819883417247	0.0948283683310625	954	1	45	0.045	0.954	0.09
ORF3a	all	ss12	79	TTC	CTT	CAT	2	CACTTTGTT:CAGTTCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.41666666666664	2	33.916666666666664	0.151021335369834	0.0614153696041381	2.45901533025469	0.0896059657656957	0.0558991397659922	0.0431945704786801	NaN	NaN	0.0644069297018132	0.164150454523159	937	0	63	0.063	0.937	0.126
ORF3a	all	ss12	80	ATT	CAT	TTG	2	TTCATTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.75	0.5	0.416666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.74999999999997	2	33.916666666666664	0.152421181209951	0.0614153696041381	2.48180841688985	0.0910058116058131	0.0557396563106794	0.0417739008466976	NaN	NaN	0.0650435809403266	0.161767613304235	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	ATTTGCAAT:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.16666666666664	2	33.83333333333333	0.136429382099394	0.0615730216404005	2.21573309973596	0.0748563604589935	0.0516795871063679	0.0449200883422252	NaN	NaN	0.0630094937973468	0.234826645467812	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAATTTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.99999999999997	2	34	0.136741167595466	0.0612585232607003	2.23219823653814	0.0754826443347657	0.0528898214000265	0.045743364978912	NaN	NaN	0.0631467935008388	0.231949540778711	890	0	110	0.11	0.89	0.22
ORF3a	all	ss12	83	TTA	CTT	ACT	2	AACTTGCTG:AATTTACTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.99999999999997	2	34	0.136741167595466	0.0612585232607003	2.23219823653814	0.0754826443347657	0.0516214308453358	0.0445167535142165	NaN	NaN	0.0654347550306914	0.248682308543323	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	84	CTG	ACT	GCT	2	TTACTGCTG:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.91666666666664	2	33.5	0.135043810631934	0.0622118122355632	2.17071012367546	0.0728319983963708	0.0506743131703515	0.043287954940453	NaN	NaN	0.063796717633226	0.253609467415987	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	85	CTG	GCT	GCT	2	CTGCTGCTA:CTGTTGTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.91666666666664	3	33.166666666666664	0.162983364284634	0.0963891381007337	1.69088932110073	0.0665942261839007	0.0598367179833458	0.0583259180303047	NaN	NaN	0.0680824241048834	0.328004477532196	859	0	141	0.141	0.859	0.282
ORF3a	all	ss12	86	CTA	GCT	ATT	2	CTGCTATTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.41666666666664	3	32.666666666666664	0.161879739624373	0.0979651368127982	1.65242192162411	0.0639146028115747	0.0599783981409203	0.0609444031178298	NaN	NaN	0.0690385877623015	0.354559878486129	828	1	171	0.171	0.828	0.342
ORF3a	all	ss12	87	TTT	ATT	TGT	2	CTATTTGTT:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.58333333333331	3	32	0.159362050384892	0.100148544468392	1.59125677992443	0.0592135059165	0.0589827426390878	0.0603873079024006	NaN	NaN	0.0654024065717418	0.365268358233723	828	0	172	0.172	0.828	0.344
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.08333333333331	3	31.5	0.158306944120205	0.101851155869296	1.55429698140448	0.0564557882509082	0.0556762069071596	0.0599734509025553	NaN	NaN	0.0685608373267106	0.410257389993276	786	1	213	0.213	0.786	0.426
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	GTAACAGTT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.58333333333331	3	32	0.159362050384892	0.100148544468392	1.59125677992443	0.0592135059165	0.056046154586859	0.0626818037391701	NaN	NaN	0.0643346620402621	0.357364718865413	829	0	171	0.171	0.829	0.342
ORF3a	all	ss12	90	ATC	AGT	CTA	2	ACAGTTTAC:ACCATCTAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.58333333333331	3	32.33333333333333	0.159362050384892	0.0990447915097998	1.60898971016688	0.0603172588750922	0.0590364416701109	0.0589043157250049	NaN	NaN	0.0655309930158149	0.357343577970979	840	0	160	0.16	0.84	0.32
ORF3a	all	ss12	91	TAC	CTA	CTC	2	ATCTATTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.74999999999999	3	33	0.146318676888877	0.0969087986100047	1.50985956886862	0.0494098782788726	0.0591484854188005	0.0568388840595253	NaN	NaN	0.0653243270469117	0.449422645493144	781	0	219	0.219	0.781	0.438
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.74999999999999	3	33	0.146318676888877	0.0969087986100047	1.50985956886862	0.0494098782788726	0.0550931423163935	0.0563629585443518	NaN	NaN	0.0644428300366109	0.443245503173406	785	0	215	0.215	0.785	0.43
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCACATCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.41666666666666	3	32	0.146972416556176	0.100148544468392	1.46754420981687	0.0468238720877841	0.0574169865910443	0.0608528653701994	NaN	NaN	0.0640371422000503	0.464657823108828	782	0	218	0.218	0.782	0.436
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TTT	2	CACCTTTTG:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.24999999999999	3	31.5	0.147301488988551	0.101851155869296	1.44624268356444	0.0454503331192552	0.0599971611386926	0.059563536970591	NaN	NaN	0.0645199777202443	0.481159960865915	761	0	239	0.239	0.761	0.478
ORF3a	all	ss12	95	TTG	TTT	GCT	2	CTTTTGCTC:CTTTTGCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.58333333333331	3	30.833333333333332	0.144709569703683	0.104213595070396	1.38858629342872	0.0404959746332868	0.0564286386779877	0.064009310357011	NaN	NaN	0.0697992110521231	0.561794511003108	718	1	281	0.281	0.718	0.562
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	TTGCTCGTT:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.74999999999999	3	31.333333333333332	0.146318676888877	0.102431651254313	1.4284518027109	0.0438870256345643	0.0558084085924758	0.0600038924343567	NaN	NaN	0.0670655894325015	0.512860819638097	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	97	GTC	CGT	CGC	2	CTCGTTGCT:CTTGTCGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.74999999999999	3	31	0.144391999018411	0.103612753860613	1.3935736059352	0.0407792451577979	0.0561993574078663	0.0663509730917602	NaN	NaN	0.0641119025599273	0.524734993563428	726	0	274	0.274	0.726	0.548
ORF3a	all	ss12	98	GCT	CGC	TGC	2	GTCGCTGCG:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.74999999999999	3	31	0.159008783209024	0.103612753860613	1.53464488959471	0.0553960293484112	0.0599324932126442	0.064634448443072	NaN	NaN	0.0624791994653298	0.375277302945695	812	0	188	0.188	0.812	0.376
ORF3a	all	ss12	99	GCG	TGC	GGG	2	GCTGCGGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.66666666666666	3	30.583333333333332	0.157093573671717	0.105128058952294	1.49430680293454	0.0519655147194224	0.0561756243906227	0.0638308787042424	NaN	NaN	0.0669289784542759	0.437496477705472	776	0	224	0.224	0.776	0.448
ORF3a	all	ss12	100	GGC	GGG	CCT	2	GCGGGTATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.16666666666666	3	31.083333333333332	0.156068302479755	0.103314927985559	1.51060747486143	0.0527533744941961	0.0573133794252038	0.0603164501857125	NaN	NaN	0.0709763906899427	0.457328869055536	777	0	223	0.223	0.777	0.446
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CCT	GGA	2	GGCCTTGAA:GGTATGGAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.33333333333333	3	31.583333333333332	0.155729523583683	0.101563372279023	1.53332367849948	0.0541661513046608	0.0555957426145913	0.0614860593890542	NaN	NaN	0.066561891010216	0.415776024853061	782	1	217	0.217	0.782	0.434
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAGGCG:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.33333333333333	3	31.583333333333332	0.143291427572032	0.101563372279023	1.41085732342927	0.0417280552930093	0.056311820607452	0.0620547812786406	NaN	NaN	0.0667825974733762	0.532079838402367	754	0	246	0.246	0.754	0.492
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CCC	2	GAAGCCCCT:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.33333333333333	3	31.583333333333332	0.157784632191834	0.101563372279023	1.55355842023792	0.0562212599128115	0.0581394738099202	0.059143159175595	NaN	NaN	0.0673847584578759	0.404093927454663	811	0	189	0.189	0.811	0.378
ORF3a	all	ss12	104	CAA	CCC	ATT	2	GCCCCTTTT:GCGCAATTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.25	4	31.249999999999996	0.155898728322134	0.140349835343382	1.11078668486293	0.0155488929787513	0.0567578881628208	0.080153249062848	NaN	NaN	0.0817040678483172	0.849068214430485	575	2	423	0.423	0.575	0.846
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.25	3	30.916666666666664	0.155898728322134	0.103912304538584	1.50029131789919	0.0519864237835498	0.0586699976444213	0.0651462225306455	NaN	NaN	0.0715306682172259	0.46736617811632297	788	0	212	0.212	0.788	0.424
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.75	3	31.416666666666664	0.156921757285409	0.102140577511979	1.53633121241169	0.0547811797734301	0.0565453591546928	0.0658274813031085	NaN	NaN	0.0724800681018721	0.449762958932043	781	0	219	0.219	0.781	0.438
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CCT	2	CTCTATCTT:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.33333333333333	3	31.666666666666664	0.143291427572032	0.101277212852957	1.41484371000686	0.0420142147190748	0.0576215203688906	0.0628091475644398	NaN	NaN	0.0709962028722914	0.553997146081592	739	0	261	0.261	0.739	0.522
ORF3a	all	ss12	108	CTC	CCT	CTA	2	TACCTCTAT:TATCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.16666666666666	3	31.333333333333332	0.14174805836807	0.102431651254313	1.38383064836223	0.0393164071137568	0.0562192033068574	0.0648137674405932	NaN	NaN	0.0695326754403658	0.571775980064431	741	1	258	0.258	0.741	0.516
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	CTCTATGCC:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.49999999999999	3	31.333333333333332	0.141140007184765	0.102431651254313	1.37789448335991	0.0387083559304515	0.0545428897416075	0.0668799744146589	NaN	NaN	0.0693346034677781	0.576650900455686	720	1	279	0.279	0.72	0.558
ORF3a	all	ss12	110	GCC	TGC	CTT	2	TATGCCTTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.16666666666666	3	31.666666666666664	0.14174805836807	0.101277212852957	1.39960465315995	0.0404708455151127	0.0556044117834624	0.0638465949967875	NaN	NaN	0.0679597800198225	0.551501467070767	719	0	281	0.281	0.719	0.562
ORF3a	all	ss12	111	TTA	CTT	AGT	2	GCCTTGATA:GCTTTAGTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.16666666666666	3	31.666666666666664	0.14174805836807	0.101277212852957	1.39960465315995	0.0404708455151127	0.0577485125281519	0.0632383736877308	NaN	NaN	0.0669769020075364	0.545676922305133	743	1	256	0.256	0.743	0.512
ORF3a	all	ss12	112	ATA	AGT	ATA	2	TTAGTCTAC:TTGATATAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	86.5	3	30.999999999999996	0.139346844796606	0.103612753860613	1.34488120047523	0.0357340909359928	0.0549827838950824	0.0666766886054945	NaN	NaN	0.0667269795761923	0.592285577969828	735	0	265	0.265	0.735	0.53
ORF3a	all	ss12	113	TAC	ATA	CTT	2	ATATATTTT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87	3	30.999999999999996	0.124768279353705	0.103612753860613	1.20417877823759	0.0211555254930925	0.0532376692446699	0.06717017405098	NaN	NaN	0.0624036819038604	0.734601553556735	673	0	327	0.327	0.673	0.654
ORF3a	all	ss12	114	TTC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATTTTCTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.33333333333333	3	30.666666666666664	0.124250341416613	0.104821456781369	1.18535217150977	0.019428884635244	0.0504532551897762	0.0643675244191364	NaN	NaN	0.0680398090995238	0.775221484786687	594	1	405	0.405	0.594	0.81
ORF3a	all	ss12	115	CTA	CTT	ACA	2	TTCTTGCAG:TTTCTACAA	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87	3	30.333333333333332	0.124768279353705	0.106058740537371	1.17640732599254	0.018709538816334	0.0522647745715991	0.0694140858674379	NaN	NaN	0.0671931787981823	0.780671531983156	640	0	360	0.36	0.64	0.72
ORF3a	all	ss12	116	CAA	ACA	ATG	2	CTACAATGC:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	88	3	29.666666666666664	0.150503021596613	0.108623210908842	1.38555121264936	0.0418798106877713	0.0599311365026321	0.0655542630865149	NaN	NaN	0.0761199474435107	0.582194676529432	724	0	276	0.276	0.724	0.552
ORF3a	all	ss12	117	AGT	ATG	CAT	2	CAATGCATC:CAGAGTATA	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.416666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	87.41666666666667	3	29.666666666666664	0.165750711317512	0.108623210908842	1.52592351055256	0.0571275004086698	0.0608041585261187	0.0667671985724043	NaN	NaN	0.075894803822015	0.451618476623538	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	118	ATA	CAT	AAA	2	AGTATAAAC:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	87	3	29.83333333333333	0.152421181209951	0.107970516691131	1.41169261647584	0.0444506645188199	0.0612284920113252	0.0679454692221957	NaN	NaN	0.073764983213565	0.546775852024749	751	0	249	0.249	0.751	0.498
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CGC	2	ATAAACTTT:ATCAACGCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	86.41666666666667	3	29.91666666666666	0.153562935654265	0.107647107231784	1.42654029080054	0.0459158284224815	0.062875190506677	0.064479011774737	NaN	NaN	0.0786709466539953	0.559459829999418	734	0	266	0.266	0.734	0.532
ORF3a	all	ss12	120	GCA	CGC	ATG	2	AACGCATGT:AACTTTGTA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	85.58333333333334	3	30.249999999999996	0.169734844556617	0.106372646579413	1.59566251301174	0.0633621979772033	0.0636810602800027	0.0688161539925352	NaN	NaN	0.0769381201529506	0.410196706159054	825	0	175	0.175	0.825	0.35
ORF3a	all	ss12	121	GTA	ATG	AAG	2	GCATGTAGA:TTTGTAAGA	1:1	TRUE	1.75	1	0.25	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.25	2	30.249999999999996	0.155898728322134	0.0692133441658409	2.25243744831325	0.0866853841562928	0.0646712590938692	0.0522275449445186	NaN	NaN	0.0742979035781629	0.243320559333563	890	0	110	0.11	0.89	0.22
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.75	2	30.749999999999996	0.142515552056709	0.0680352852661241	2.09472998458448	0.0744802667905847	0.0561754485063213	0.0488750712903643	NaN	NaN	0.0661451698146578	0.260160364291377	878	0	122	0.122	0.878	0.244
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGAATTATC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.58333333333334	2	30.749999999999996	0.142824888756511	0.0680352852661241	2.09927669440707	0.074789603490387	0.0575693200341215	0.053849012583246	NaN	NaN	0.0660927500660598	0.257808701695849	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:ATTATCATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.08333333333334	2	30.583333333333332	0.145670745382058	0.0684234871721278	2.12895821891691	0.0772472582099297	0.0567150817305408	0.0512810051955189	NaN	NaN	0.0662481400298354	0.24360268561355	889	0	111	0.111	0.889	0.222
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATCATGAGA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.91666666666667	2	30.416666666666664	0.145993989979143	0.0688161477015357	2.12150773990338	0.0771778422776068	0.0574209155620257	0.0561604728098153	NaN	NaN	0.0695071094131007	0.266844372125115	868	1	131	0.131	0.868	0.262
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGT:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.08333333333334	3	30.416666666666664	0.147632043085198	0.105746684778908	1.39609145566939	0.0418853583062897	0.0598813894596771	0.0693342755629892	NaN	NaN	0.0835388993825611	0.616098448838624	714	1	285	0.285	0.714	0.57
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	TTG	2	AGATGTTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.5	3	30.749999999999996	0.163914658204208	0.104516640682884	1.56831158304777	0.0593980175213246	0.0611123213597403	0.0671616481652462	NaN	NaN	0.084817462616627	0.483737406670885	766	0	234	0.234	0.766	0.468
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.75	3	30.583333333333332	0.163354604039617	0.105128058952294	1.55386302826865	0.0582265450873224	0.0605345792945052	0.0681635334575681	NaN	NaN	0.0843824817783055	0.490174567569483	770	0	230	0.23	0.77	0.46
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.75	3	31.583333333333332	0.167945668219814	0.101563372279023	1.65360468494903	0.0663822959407911	0.0648058369181769	0.065053502925742	NaN	NaN	0.0854468285678959	0.437227060083712	782	0	218	0.218	0.782	0.436
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.58333333333333	3	31.249999999999996	0.197626838051651	0.102724391304868	1.92385504105962	0.0949024467467833	0.0747094612814686	0.0700042889413633	NaN	NaN	0.0883682074560597	0.282848082661573	851	0	149	0.149	0.851	0.298
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.74999999999999	4	31.583333333333332	0.21654566314	0.138722674692595	1.56099688547571	0.0778229884474055	0.0734278288996528	0.0778221044919844	NaN	NaN	0.0978729055400465	0.426530129633317	805	0	195	0.195	0.805	0.39
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.24999999999999	4	31.666666666666664	0.235201662735449	0.138321779350139	1.70039500533082	0.0968798833853093	0.0743251213286158	0.0754049785751766	NaN	NaN	0.102386070411076	0.344035710655086	818	0	182	0.182	0.818	0.364
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCCGT:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.24999999999999	4	32.5	0.256519074969479	0.134437018317738	1.9080985146755	0.122082056651741	0.081932588753391	0.0777971179212873	NaN	NaN	0.103789404170944	0.239495874848086	886	0	114	0.114	0.886	0.228
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CAA	ATC	2	TGCAAATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.33333333333331	4	32.333333333333336	0.256193776295553	0.135196367873208	1.89497528909816	0.12099740842234501	0.0845002995479635	0.0795675767152151	NaN	NaN	0.105821722808052	0.252869216850856	886	0	114	0.114	0.886	0.228
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AAATCCAAG:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.66666666666664	3	32.666666666666664	0.223310144300941	0.0979651368127982	2.27948586166592	0.125345007488143	0.0720849315254656	0.0633313466861015	NaN	NaN	0.0960456234090181	0.191873459374413	911	1	88	0.088	0.911	0.176
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.83333333333331	3	33.166666666666664	0.222753358291529	0.0963891381007337	2.31097987471093	0.126364220190795	0.0732899144608394	0.0598773767772631	NaN	NaN	0.0959527377036179	0.187857962312976	905	0	95	0.095	0.905	0.19
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.66666666666664	3	33.166666666666664	0.223310144300941	0.0963891381007337	2.31675631405238	0.126921006200208	0.073663416654283	0.0630387114538117	NaN	NaN	0.0995039157944493	0.202118952476801	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.33333333333331	3	32.833333333333336	0.224432171139643	0.0974341006801572	2.30342528512042	0.126998070459486	0.0725297649929642	0.064174337743213	NaN	NaN	0.0979641806418765	0.194847179253933	900	0	100	0.1	0.9	0.2
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTC:CCATTACTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.33333333333331	3	31.833333333333336	0.221099655165484	0.100709711722406	2.19541543098562	0.120389943443078	0.071086678001339	0.0622237816915895	NaN	NaN	0.0999900669521323	0.228582223273593	889	0	111	0.111	0.889	0.222
ORF3a	all	ss12	140	CTC	ACT	CTA	2	TTACTCTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.66666666666666	3	31.166666666666668	0.220010857490594	0.103018812035868	2.13563768735745	0.116992045454726	0.0709620484422473	0.0650826074823849	NaN	NaN	0.0996425969149866	0.24034825153211	881	0	119	0.119	0.881	0.238
ORF3a	all	ss12	141	TAT	CTA	TGA	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.99999999999999	3	30.833333333333336	0.236076409978014	0.104213595070396	2.26531298357517	0.131862814907618	0.0742783917612763	0.0683625221687806	NaN	NaN	0.103086975937785	0.200847280101345	900	0	100	0.1	0.9	0.2
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.16666666666666	3	30.166666666666668	0.239040218372072	0.106688419438138	2.24054512786813	0.132351798933934	0.0765825577878098	0.0694626077778553	NaN	NaN	0.103054473499324	0.199040609134148	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.49999999999999	3	30.833333333333336	0.269530500680923	0.104213595070396	2.58632763315434	0.165316905610527	0.0811644142642363	0.0688059149853957	NaN	NaN	0.108307699865768	0.126919395147933	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAC:GCCAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.99999999999999	3	30.333333333333336	0.263548415128416	0.106058740537371	2.48492876488149	0.157489674591045	0.0815023253454051	0.0696449226200458	NaN	NaN	0.105985397412102	0.137290666335927	930	0	70	0.07	0.93	0.14
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.33333333333333	3	31	0.302544426379644	0.103612753860613	2.91995352991629	0.198931672519031	0.0942580735132928	0.0660654642848313	NaN	NaN	0.116974923981298	0.0890115112215676	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.5	3	30.833333333333336	0.301773247822437	0.104213595070396	2.895718621151	0.197559652752041	0.0860320672375845	0.0671682948469341	NaN	NaN	0.117871661996233	0.0937269808198039	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.33333333333333	3	30.333333333333336	0.302544426379644	0.106058740537371	2.85261190965244	0.196485685842272	0.0903787617945103	0.0703474190789196	NaN	NaN	0.124002420902578	0.113072922169068	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.66666666666666	3	30	0.282712453350107	0.107325632730505	2.63415594352935	0.175386820619602	0.086503642273728	0.0689411180275852	NaN	NaN	0.116808074402566	0.133227399857589	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.16666666666666	3	30.5	0.284857139505292	0.105436462965892	2.70169475997541	0.1794206765394	0.0887108099740295	0.0692239917715615	NaN	NaN	0.11293603711603	0.112129750230603	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.49999999999999	3	29.833333333333336	0.283423708706632	0.107970516691131	2.62501021012445	0.175453192015501	0.0868401913602979	0.0690674956091599	NaN	NaN	0.117453335767357	0.135224787311114	932	0	68	0.068	0.932	0.136
ORF3a	all	ss12	151	ACA	TAC	ACA	2	CATACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.08333333333331	4	29.833333333333336	0.285217792864262	0.147714914296514	1.93086659002985	0.137502878567748	0.089928931939194	0.0823771799319881	NaN	NaN	0.128230750546802	0.283581648483989	861	0	139	0.139	0.861	0.278
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ACA	TAA	2	ACACATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.58333333333331	4	29.333333333333336	0.283067628950574	0.150503021596613	1.88081027176496	0.132564607353961	0.0887005791994096	0.0875636784362665	NaN	NaN	0.132579653525809	0.317365432424803	861	0	139	0.139	0.861	0.278
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATTGTTAC:CATAACTAT	1:1	TRUE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666664	4	29.083333333333336	0.26683825481505	0.151937056450332	1.75624209820254	0.114901198364717	0.0852448599248998	0.088838802555627	NaN	NaN	0.130204918598228	0.377525752212074	808	0	192	0.192	0.808	0.384
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.33333333333331	3	29.5	0.288505753829318	0.109283858386045	2.63996676261348	0.179221895443273	0.0880059576681547	0.0710608923447446	NaN	NaN	0.112735461944905	0.111889778550169	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.83333333333331	3	29.833333333333336	0.286305319885247	0.107970516691131	2.65169908100258	0.178334803194115	0.0905830536755353	0.0698649391112864	NaN	NaN	0.117530426353359	0.129178317486394	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.33333333333331	3	29	0.302544426379644	0.111315003838705	2.71791237431056	0.191229422540939	0.0943119288627557	0.0692750542909259	NaN	NaN	0.114140276106826	0.0938578312323047	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.66666666666664	3	28.666666666666668	0.301006043193227	0.112711652287003	2.67058495803752	0.188294390906223	0.0874848602883884	0.0689382407216835	NaN	NaN	0.116739132005704	0.106755356286536	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.83333333333331	3	28.666666666666668	0.300242781455809	0.112711652287003	2.6638131494274	0.187531129168806	0.0898699127344406	0.0744287370922262	NaN	NaN	0.116426226676148	0.107238746768106	936	0	64	0.064	0.936	0.128
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAT:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.16666666666666	3	28	0.298727964139002	0.115613009870444	2.58386114567693	0.183114954268559	0.0855697541186894	0.0709917483033308	NaN	NaN	0.117172658268421	0.118104616266671	938	0	62	0.062	0.938	0.124
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATATAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.49999999999999	4	28	0.297228554032125	0.158481820250405	1.875474130487	0.13874673378172	0.0908107932991019	0.0861007577958673	NaN	NaN	0.130003807337939	0.285858368013757	855	0	145	0.145	0.855	0.29
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAATAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	81.99999999999999	4	27.833333333333336	0.313301400524984	0.159539275483744	1.96378853780684	0.15376212504124	0.0899947935159738	0.0859065023058287	NaN	NaN	0.131208499686517	0.241240621556318	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.66666666666664	4	28.166666666666668	0.31975701984729	0.157438341821211	2.03099839688612	0.162318678026078	0.0903732695305633	0.0875491450271995	NaN	NaN	0.130661071249001	0.21413032929813	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.66666666666664	4	28.500000000000004	0.324778826259198	0.155392217528976	2.09005850758669	0.169386608730222	0.0920742265216897	0.0869403904385589	NaN	NaN	0.130971923345564	0.195905683346777	889	0	111	0.111	0.889	0.222
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.83333333333331	4	29.000000000000004	0.323930763923761	0.152421181209951	2.12523457273019	0.17150958271381	0.0904504415513274	0.0812599056311825	NaN	NaN	0.127545984437869	0.178725940563973	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	78.99999999999999	4	29.666666666666668	0.328216664807022	0.148632696437812	2.20823999478707	0.17958396836921	0.0938497959402521	0.0777703901954932	NaN	NaN	0.133706700676254	0.179233545268036	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAATC:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.33333333333331	4	30.333333333333336	0.312120297918684	0.145028544735405	2.15213010989063	0.16709175318328	0.0854746696476199	0.0789775627272441	NaN	NaN	0.125800279258151	0.184102009852296	913	0	87	0.087	0.913	0.174
ORF3a	all	ss12	167	ATC	AAT	CGT	2	ACAATCGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.33333333333331	4	30.333333333333336	0.293010983942946	0.145028544735405	2.02036767642898	0.147982439207541	0.0849863049128321	0.0783676608013396	NaN	NaN	0.121485656033638	0.223183591901759	881	0	119	0.119	0.881	0.238
ORF3a	all	ss12	168	GTC	CGT	CAT	2	ATCGTCGTT:ATTGTCATT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.66666666666664	4	30.66666666666667	0.296094486163045	0.143291427572032	2.06637962354168	0.152803058591013	0.0879299454400521	0.0768573045875225	NaN	NaN	0.123118641533179	0.214567271758898	911	0	89	0.089	0.911	0.178
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT:GTCGTTACT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.08333333333331	4	30.91666666666667	0.294159645070685	0.142015736265178	2.07131725544426	0.152143908805506	0.0872133495606097	0.0750387313012846	NaN	NaN	0.117827394708484	0.196619104699537	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TGC	2	ATTACTTCA:GTTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.41666666666664	4	30.66666666666667	0.311709043238926	0.143291427572032	2.17535025312126	0.168417615666894	0.0877168026511969	0.0787558638447381	NaN	NaN	0.116878540032438	0.149595223093146	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss12	171	GCA	TGC	AGG	2	ACTGCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.08333333333331	4	30.33333333333334	0.308458156432116	0.145028544735405	2.12687893266031	0.163429611696711	0.0941672565224335	0.0824076931192857	NaN	NaN	0.129430894297712	0.206704731988256	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	GCAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.83333333333331	4	30.58333333333334	0.290740699021438	0.143721781908901	2.02294109605269	0.147018917112537	0.0869072333052181	0.079724488795492	NaN	NaN	0.121834780731678	0.227544893682113	890	0	110	0.11	0.89	0.22
ORF3a	all	ss12	173	GAC	TGA	CGG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.49999999999997	4	30.58333333333334	0.287768481418953	0.143721781908901	2.00226074013859	0.144046699510052	0.0864178341155767	0.0782620384767546	NaN	NaN	0.121302824426675	0.235031771125112	893	0	107	0.107	0.893	0.214
ORF3a	all	ss12	174	GGC	CGG	CAC	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.66666666666664	4	30.750000000000004	0.282712453350107	0.142863650574837	1.97889702672839	0.139848802775271	0.0855787117577844	0.0794133553070521	NaN	NaN	0.119118733513064	0.240383560700422	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.16666666666664	4	30.250000000000004	0.280600193443143	0.145469445655623	1.92892873261799	0.135130747787519	0.0865464012918859	0.079248746530117	NaN	NaN	0.123697375502893	0.274644057979756	866	0	134	0.134	0.866	0.268
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAC	2	ACAACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333331	3	30.66666666666667	0.301389150714295	0.104821456781369	2.87526199280856	0.196567693932926	0.0873896605033076	0.0626896296454987	NaN	NaN	0.107594787852694	0.0677109264121185	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	177	ACA	AAC	ACC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.83333333333331	3	30.000000000000004	0.286305319885247	0.107325632730505	2.66763225709705	0.178979687154742	0.0820374204642087	0.0643363605085431	NaN	NaN	0.106954757627681	0.0942456427380313	960	0	40	0.04	0.96	0.08
ORF3a	all	ss12	178	CCA	ACC	AAA	2	ACACCAAAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.83333333333331	3	30.33333333333334	0.268177549189387	0.106058740537371	2.52857565374247	0.162118808652015	0.0783218816630199	0.0652737631774696	NaN	NaN	0.101783871095346	0.111210667988756	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTC:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.33333333333331	4	29.83333333333334	0.266173663925686	0.147714914296514	1.80194170096721	0.118458749629172	0.0790022044906511	0.0822221655682265	NaN	NaN	0.116956115630694	0.311132843643262	846	1	153	0.153	0.846	0.306
ORF3a	all	ss12	180	CTC	ACT	CAA	2	AAACTCAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.49999999999999	4	30.16666666666667	0.234333426514436	0.145913043990275	1.60597997345634	0.0884203825241606	0.0696446400646567	0.081053889913522	NaN	NaN	0.113159403424658	0.434579613155639	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	181	AAA	CAA	ACA	2	CTCAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.99999999999999	3	30.333333333333336	0.215761554338836	0.106058740537371	2.03435900940959	0.109702813801464	0.0666179314282639	0.0634063780769841	NaN	NaN	0.0984242741995015	0.265025713158911	870	0	130	0.13	0.87	0.26
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.66666666666666	3	30.750000000000004	0.200233049317567	0.104516640682884	1.9158006611129	0.0957164086346837	0.067497589589575	0.0652016774924424	NaN	NaN	0.101143951726897	0.343975997353402	830	0	170	0.17	0.83	0.34
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.33333333333333	3	29.916666666666668	0.182287438823259	0.107647107231784	1.69337981772944	0.0746403315914759	0.0626803106640807	0.065698007124066607	NaN	NaN	0.099454501994552	0.452955271288105	784	0	216	0.216	0.784	0.432
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79	4	30.583333333333332	0.185778237042605	0.143721781908901	1.29262408644753	0.0420564551337039	0.0631334839840782	0.0780422192348251	NaN	NaN	0.106381507184691	0.692594826273775	693	0	307	0.307	0.693	0.614
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.66666666666667	4	29.916666666666668	0.18143524049715	0.147260274111344	1.23207186454078	0.0341749663858059	0.0656279676282633	0.0803146022837589	NaN	NaN	0.106453821575768	0.748186972753638	637	0	363	0.363	0.637	0.726
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.33333333333333	4	29.25	0.179754639949065	0.150978005779684	1.19060149868037	0.0287766341693818	0.064360683345366	0.0841519402502296	NaN	NaN	0.113366099054046	0.799620644609619	599	1	400	0.4	0.599	0.8
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.83333333333333	4	29.583333333333332	0.196927853470251	0.149095891727942	1.32081341201264	0.0478319617423084	0.0644536534558156	0.0793275951303041	NaN	NaN	0.108434514636644	0.659130607186026	696	0	304	0.304	0.696	0.608
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.33333333333333	4	30.083333333333332	0.198330831309248	0.146359364647636	1.35509491850238	0.0519714666616118	0.0670916997599407	0.0804388825090506	NaN	NaN	0.109741180681234	0.635797891421613	698	0	302	0.302	0.698	0.604
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.33333333333333	4	30.583333333333332	0.204149781227553	0.143721781908901	1.42045122538875	0.0604279993186521	0.0674703919829017	0.0733830471204804	NaN	NaN	0.115281500518176	0.600154904323344	702	0	298	0.298	0.702	0.596
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.99999999999999	4	30.583333333333332	0.218932806420977	0.143721781908901	1.52330985264119	0.0752110245120757	0.0662385934795222	0.0738689911703252	NaN	NaN	0.11494334535464901	0.512898407507956	755	0	245	0.245	0.755	0.49
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.66666666666666	4	30.916666666666668	0.20315621560155	0.142015736265178	1.43051904629926	0.0611404793363713	0.0684753386168891	0.0739573439119286	NaN	NaN	0.108212399677081	0.572070787851108	724	0	276	0.276	0.724	0.552
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGGATTGG	1:1	TRUE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.16666666666666	4	30.916666666666668	0.20465023999998	0.142015736265178	1.44103917905159	0.0626345037348018	0.0660929762248438	0.0780415711169002	NaN	NaN	0.107691763888569	0.560830050367099	761	0	239	0.239	0.761	0.478
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:GATTGGCAC	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.58333333333333	5	31.41666666666667	0.173221017246649	0.178884786483983	0.968338452091668	-0.00566376923733442	0.0597426628335536	0.0865441487242829	NaN	NaN	0.113767315172941	0.960294676596117	495	1	504	0.504	0.495	0.99
ORF3a	all	ss12	194	CAC	GCA	ATC	2	TGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.58333333333333	5	32.083333333333336	0.192460269414335	0.174698668260279	1.10166992874607	0.0177616011540552	0.0610226709213715	0.0841414072689636	NaN	NaN	0.108374201017504	0.869816625555843	575	0	425	0.425	0.575	0.85
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.41666666666666	5	31.583333333333336	0.159830135220283	0.177819473768805	0.898833698203884	-0.0179893385485215	0.0525296217809144	0.0810817962865692	NaN	NaN	0.103392788413171	0.861873113755865	440	1	559	0.559	0.44	0.88
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666666	5	31.750000000000004	0.158673037027526	0.176766832783369	0.897640323860885	-0.0180937957558427	0.0529676316285088	0.0846070189473249	NaN	NaN	0.103094677402442	0.860681589436495	448	0	552	0.552	0.448	0.896
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.08333333333333	5	31.91666666666667	0.158291065496404	0.175726637753458	0.900780140791659	-0.0174355722570532	0.0515368264444585	0.0853652861400624	NaN	NaN	0.107693930752244	0.871385152208477	445	0	555	0.555	0.445	0.89
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.16666666666667	5	32.5	0.158100771086867	0.172180831233375	0.918225158714541	-0.0140800601465076	0.0537273630780875	0.0810805925506879	NaN	NaN	0.107166920327052	0.895471238872871	487	0	513	0.513	0.487	0.974
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.16666666666667	5	32	0.158100771086867	0.175211138386129	0.902344294678608	-0.0171103672992614	0.0496441279314031	0.0833789108986184	NaN	NaN	0.102783263488455	0.867786803733674	456	0	544	0.544	0.456	0.912
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77	5	32	0.158481820250405	0.175211138386129	0.90451909456318	-0.0167293181357236	0.0523447299210883	0.082696275615876	NaN	NaN	0.103851674166099	0.872023639064463	417	0	583	0.583	0.417	0.834
ORF3a	all	ss12	201	GTC	TGT	CGT	2	TATGTCGTT:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.08333333333334	4	32.333333333333336	0.158291065496404	0.135196367873208	1.17082335854507	0.0230946976231962	0.0494703174528284	0.0750474434116768	NaN	NaN	0.0913062255257548	0.800317109815483	633	1	366	0.366	0.633	0.732
ORF3a	all	ss12	202	GTA	CGT	ATT	2	GTCGTTGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.58333333333334	4	32.833333333333336	0.159442558228446	0.132943691128056	1.1993239910487	0.02649886710039	0.0533539951830123	0.071729481579975	NaN	NaN	0.0910008156094359	0.77090315620818	636	1	363	0.363	0.636	0.726
ORF3a	all	ss12	203	GTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.33333333333334	4	33.083333333333336	0.160024633856936	0.13184534303006	1.21372989124426	0.0281792908268762	0.0531449250317872	0.0714145069085203	NaN	NaN	0.0929346960500285	0.761725223367363	642	0	358	0.358	0.642	0.716
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	GTACATGGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.08333333333334	4	33.166666666666664	0.144502989596306	0.131483259230803	1.09902196250436	0.0130197303655031	0.049615367443539	0.0692651593415249	NaN	NaN	0.0884354208447524	0.882955985585484	564	0	436	0.436	0.564	0.872
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:CATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.58333333333334	4	32.833333333333336	0.145557948736739	0.132943691128056	1.09488421377238	0.0126142576086834	0.0525768770942185	0.0680018747166223	NaN	NaN	0.0918807911568715	0.890802057972755	570	0	430	0.43	0.57	0.86
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.08333333333334	4	33	0.130606503128167	0.132209431753494	0.987875837570229	-0.0016029286253271	0.0478630685364856	0.0702867589478868	NaN	NaN	0.0910121140153961	0.985948179546078	499	0	501	0.501	0.499	0.998
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.25	4	32.83333333333333	0.130290582016017	0.132943691128056	0.980043362046539	-0.00265310911203939	0.0478224294142699	0.0676316820133367	NaN	NaN	0.088311686106152	0.976033110653254	485	0	515	0.515	0.485	0.97
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CGA	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.58333333333334	4	32.5	0.12966331412301	0.134437018317738	0.964491147940769	-0.00477370419472864	0.0475573629371336	0.0728168455503043	NaN	NaN	0.091790863669625	0.958523664841592	480	0	520	0.52	0.48	0.96
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.91666666666667	4	33.166666666666664	0.130923963916947	0.131483259230803	0.995746262169585	-5.59295313856401e-4	0.0467588808639975	0.0674988689118409	NaN	NaN	0.0904968765403906	0.995068887766055	501	0	499	0.499	0.501	0.998
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.25	4	32.5	0.130290582016017	0.134437018317738	0.969157034620317	-0.00414643630172176	0.0501808088478745	0.0730571279087069	NaN	NaN	0.0947555577307301	0.965096274724485	491	0	509	0.509	0.491	0.982
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.91666666666667	4	32.5	0.113557650951866	0.134437018317738	0.844690341788717	-0.020879367365872	0.0460316351238743	0.0737338028225252	NaN	NaN	0.0925085195900443	0.821433122761801	417	0	583	0.583	0.417	0.834
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.25000000000001	4	32.83333333333333	0.128426768784144	0.132943691128056	0.966023793189544	-0.00451692234391216	0.047429375437064	0.0703593589595094	NaN	NaN	0.0909988618671814	0.960411557560193	504	0	496	0.496	0.504	0.992
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.91666666666669	4	33.166666666666664	0.129042071919526	0.131483259230803	0.981433474302677	-0.00244118731127652	0.0467684992454886	0.0701242500399302	NaN	NaN	0.0908430324258723	0.978561357856449	479	0	521	0.521	0.479	0.958
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.25000000000001	4	32.5	0.128426768784144	0.134437018317738	0.955293195216592	-0.00601024953359452	0.0487821711177225	0.07425307306938	NaN	NaN	0.0913637211752828	0.947549982147658	458	0	542	0.542	0.458	0.916
ORF3a	all	ss12	215	GAG	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.08333333333336	4	31.83333333333333	0.126913940754554	0.137526919369799	0.922829809146623	-0.0106129786152444	0.045057123106538	0.0725040848884731	NaN	NaN	0.0966121940464743	0.912527276916592	460	0	540	0.54	0.46	0.92
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.75000000000003	4	30.83333333333333	0.113827458253345	0.142438427764417	0.799134475435288	-0.0286109695110724	0.0467690102580246	0.0780984388342154	NaN	NaN	0.0962978434085549	0.766383185999617	387	0	613	0.613	0.387	0.774
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.41666666666669	4	29.83333333333333	0.114370944999209	0.147714914296514	0.774268092994507	-0.0333439692973051	0.0456815244837863	0.0821664393441034	NaN	NaN	0.0982628113425124	0.734357699278214	380	0	620	0.62	0.38	0.76
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AAT	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.08333333333336	4	30.166666666666664	0.114919656765687	0.145913043990275	0.787590016786616	-0.030993387224588	0.045335317021559	0.0796158647168765	NaN	NaN	0.095161763343273	0.744657698157718	391	0	609	0.609	0.391	0.782
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTACT:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.08333333333336	4	29.499999999999996	0.114919656765687	0.149561992614941	0.768374737167059	-0.0346423358492541	0.0458407767610866	0.081479975755529	NaN	NaN	0.0911847732085685	0.704009548383982	373	0	627	0.627	0.373	0.746
ORF3a	all	ss12	220	ACT	GAG	TAC	2	ATTACTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.9166666666667	4	29.41666666666666	0.0846962403936439	0.150031026615649	0.564524833990637	-0.0653347862220047	0.0355220623038581	0.0866494458973215	NaN	NaN	0.096644786040567	0.499021522443882	244	0	756	0.756	0.244	0.488
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	ACTACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.9166666666667	4	29.08333333333333	0.0846962403936439	0.151937056450333	0.557442946259332	-0.0672408160566887	0.0340933284759854	0.0869751319289777	NaN	NaN	0.0917532877447006	0.463653783309424	238	0	762	0.762	0.238	0.476
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.9166666666667	4	29.08333333333333	0.0846962403936439	0.151937056450333	0.557442946259332	-0.0672408160566887	0.0331580540493413	0.0791228208568991	NaN	NaN	0.0948129359289204	0.478203764072711	228	1	771	0.771	0.228	0.456
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.25000000000004	4	28.749999999999993	0.0867391512707804	0.153892310773211	0.563635381358377	-0.0671531595024301	0.0341197075114015	0.0844948034839975	NaN	NaN	0.0929790673603314	0.470147213017814	236	0	764	0.764	0.236	0.472
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.58333333333337	4	29.41666666666666	0.0875842106243668	0.150031026615649	0.583773987288251	-0.0624468159912817	0.0347890497913923	0.0831932823420107	NaN	NaN	0.0961968570362137	0.51623721881571	251	0	749	0.749	0.251	0.502
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TGA	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.58333333333337	4	30.41666666666666	0.0888831680248487	0.144590316625212	0.61472420905779	-0.055707148600363	0.0354949880417346	0.0803406864663945	NaN	NaN	0.0905552259273867	0.53844034101202	275	0	725	0.725	0.275	0.55
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.1666666666667	4	30.16666666666666	0.0726960870999214	0.145913043990275	0.498215136302458	-0.0732169568903535	0.0315163361775331	0.0785232603718652	NaN	NaN	0.089372901943641	0.412655237272238	183	1	816	0.816	0.183	0.366
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAC	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AACAAGCTT:AATAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAT:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	AGA	GCC	2	AAAGATCCA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCA	GCC	A--	1	GAGCCTGAA:GATCCA---	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCA---CAG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	CAG	-CA	ACA	1	---CAGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.416666666666667	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AAT	ACA	TGT	2	CAGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.75000000000003	5	31.583333333333336	0.202909342656595	0.177819473768805	1.14109741951217	0.0250898688877902	0.0518572486698028	0.0898347220266122	NaN	NaN	0.0865573307472293	0.771920153085476	608	0	392	0.392	0.608	0.784
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.08333333333336	5	31.583333333333336	0.204901396368095	0.177819473768805	1.15230009416461	0.0270819225992897	0.0508899887481728	0.0883426247830399	NaN	NaN	0.095397582449866	0.776498673490429	640	0	360	0.36	0.64	0.72
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.25000000000003	5	32.083333333333336	0.207447505316393	0.174698668260279	1.18745899658102	0.0327488370561131	0.0541579344884678	0.0832948179777494	NaN	NaN	0.0907300586486504	0.718138288424052	675	1	324	0.324	0.675	0.648
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA:TTTATGAGT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.08333333333336	5	31.583333333333336	0.207964387858376	0.177819473768805	1.16952538127947	0.0301449140895714	0.0533437110862602	0.0895019012401866	NaN	NaN	0.0879034912861149	0.731649668584335	637	0	363	0.363	0.637	0.726
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGTATT	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.58333333333336	5	31.083333333333336	0.209530707593171	0.181054357970061	1.15728066389774	0.02847634962311	0.0545677527015415	0.0918273527112527	NaN	NaN	0.0916062632038459	0.755910152800525	645	0	355	0.355	0.645	0.71
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGTATTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.83333333333336	5	31.083333333333336	0.191746695912757	0.181054357970061	1.05905595459052	0.0106923379426959	0.0525019717611341	0.0951424914652901	NaN	NaN	0.0951746210965119	0.9105503198352	551	1	448	0.448	0.551	0.896
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.66666666666669	5	31.416666666666668	0.195123032668416	0.178884786483983	1.09077488647078	0.016238246184433	0.0541150306739323	0.0890183758825211	NaN	NaN	0.0922181161791311	0.860227001524824	587	0	413	0.413	0.587	0.826
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.00000000000001	5	31.083333333333336	0.194146225437217	0.181054357970061	1.07230904361507	0.0130918674671556	0.052645368669656	0.0890177144994878	NaN	NaN	0.0930978409297437	0.88816633663482	586	0	414	0.414	0.586	0.828
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACGCTTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.33333333333334	5	31.750000000000004	0.196109775043318	0.176766832783369	1.10942631010227	0.0193429422599486	0.051653131561433	0.0857860330686967	NaN	NaN	0.0926022902438782	0.834540434793198	607	1	392	0.392	0.607	0.784
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGATCA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.50000000000001	5	31.416666666666668	0.178617257777546	0.178884786483983	0.998504463617642	-2.6752870643712e-4	0.0499087314838916	0.0900318609689585	NaN	NaN	0.0862756877301435	0.997525876779685	506	0	494	0.494	0.506	0.988
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGATCAATC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.83333333333334	5	31.75	0.177731272847004	0.176766832783369	1.00545600126703	9.64440063634664e-4	0.0501913718254618	0.0889320696816501	NaN	NaN	0.0884091604404387	0.991296189549454	536	0	464	0.464	0.536	0.928
ORF3a	all	ss12	13	ATC	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATCACA	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333334	5	31.416666666666668	0.193179203235308	0.178884786483983	1.07990851000962	0.0142944167513245	0.0582759344016726	0.0924133235661833	NaN	NaN	0.0877586457255353	0.870610329473438	557	0	443	0.443	0.557	0.886
ORF3a	all	ss12	14	ACA	AAC	ACG	2	ATCACACGT:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.58333333333334	5	31.333333333333332	0.175769733616626	0.179422266799376	0.979642809959401	-0.00365253318274988	0.0552909123169969	0.0858559332569181	NaN	NaN	0.0931665042624672	0.968727457450266	494	0	506	0.506	0.494	0.988
ORF3a	all	ss12	15	CGT	ACG	GAA	2	ACACGTCAA:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.75	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.5	5	31.416666666666668	0.192699315438847	0.178884786483983	1.07722584589998	0.0138145289548636	0.0567170756001191	0.084409320376537	NaN	NaN	0.0933679505698312	0.882375967529593	565	0	435	0.435	0.565	0.87
ORF3a	all	ss12	16	AAG	GAA	ACC	2	CGTCAACCA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.16666666666667	4	31.666666666666668	0.176854074420993	0.138321779350139	1.27856997829181	0.0385322950708533	0.0560814364367187	0.0760161364266607	NaN	NaN	0.08633856011856	0.655385611523632	695	0	305	0.305	0.695	0.61
ORF3a	all	ss12	17	CAA	ACC	AAG	2	AAGCAAGGT:CAACCAAGT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76	4	31.666666666666668	0.194146225437217	0.138321779350139	1.40358392112472	0.0558244460870773	0.0574484022285324	0.0722290140158263	NaN	NaN	0.0891174813153951	0.531043369201536	725	0	275	0.275	0.725	0.55
ORF3a	all	ss12	18	AGT	AAG	TAA	2	CAAGGTGAA:CCAAGTAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77	3	30.833333333333332	0.191273928510779	0.104213595070396	1.83540284145819	0.0870603334403824	0.0588732825780165	0.0640041012894496	NaN	NaN	0.0795488633468375	0.273768245917028	866	0	134	0.134	0.866	0.268
ORF3a	all	ss12	19	AAG	TAA	AAT	2	AGTAAGATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.25	3	30.833333333333332	0.174062299764764	0.104213595070396	1.6702456109223	0.0698487046943675	0.0544004710815728	0.0675348713367038	NaN	NaN	0.0750389177883949	0.351939930831429	840	0	160	0.16	0.84	0.32
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAGATTGAA:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.08333333333334	3	31.333333333333332	0.169534158879359	0.102431651254313	1.65509543977229	0.0671025076250462	0.0525637157662507	0.062578246383234	NaN	NaN	0.0765563282786274	0.380751988395479	819	0	181	0.181	0.819	0.362
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	AAA	2	ATCAAGGAT:ATTGAAAAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.58333333333334	3	31.999999999999996	0.170745473151992	0.100148544468392	1.70492216395498	0.0705969286836001	0.0509008443798611	0.0623187350387906	NaN	NaN	0.0730507596516744	0.333839445255252	816	0	184	0.184	0.816	0.368
ORF3a	all	ss12	22	AAT	AAA	TGC	2	AAGGATGCT:GAAAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.25	3	32.666666666666664	0.15791093535129	0.0979651368127982	1.61190950667524	0.0599457985384922	0.0529019403640069	0.0587169755003424	NaN	NaN	0.071574492582917107	0.402294613166287	808	0	192	0.192	0.808	0.384
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.58333333333333	3	32.666666666666664	0.143463258720043	0.0979651368127982	1.46443177019379	0.0454981219072446	0.0494398862431919	0.0603294175944443	NaN	NaN	0.0730591511074165	0.533444002147081	742	0	258	0.258	0.742	0.516
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.58333333333333	3	33.166666666666664	0.159442558228446	0.0963891381007337	1.65415482875069	0.0630534201277122	0.0527517253543663	0.0587753095483808	NaN	NaN	0.069391650669903	0.36352960303098	821	0	179	0.179	0.821	0.358
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.25	4	33.5	0.144154737019872	0.130054644852002	1.10841667503622	0.0141000921678708	0.0494605066248885	0.0719134339862006	NaN	NaN	0.077451795278756	0.855543559712767	614	0	386	0.386	0.614	0.772
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.41666666666667	4	33	0.141763326981146	0.132209431753494	1.07226334082931	0.00955389522765196	0.0507244619714664	0.0762221642497039	NaN	NaN	0.0798467571420756	0.904758120698209	570	0	430	0.43	0.57	0.86
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.5	4	32.916666666666664	0.126170845288571	0.132575542143044	0.951690208081046	-0.00640469685447295	0.0479183280293931	0.0722034373758182	NaN	NaN	0.075027350019065	0.931971353990737	489	0	511	0.511	0.489	0.978
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.91666666666667	3	33	0.127213641474078	0.0969087986100047	1.31271508158955	0.0303048428640732	0.0458826995137578	0.0587642540397066	NaN	NaN	0.0706462734781842	0.667948034821556	673	0	327	0.327	0.673	0.654
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.91666666666667	2	33.33333333333333	0.127213641474078	0.0625362067042884	2.03423981367508	0.0646774347697895	0.048127968109817	0.0456379568854064	NaN	NaN	0.0680678620783922	0.342015473327142	840	0	160	0.16	0.84	0.32
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.75	2	33.83333333333333	0.143120008795216	0.0615730216404005	2.32439475897523	0.0815469871548152	0.0523831511788433	0.0450328566573477	NaN	NaN	0.0687012914714008	0.235235921721264	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACT:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.91666666666667	1	33.33333333333333	0.142778402413796	0.0306164958901914	4.66344688581878	0.112161906523605	0.0511460477836934	0.0297839635246842	NaN	NaN	0.0608660213031811	0.0653630103993234	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	32	ACT	TAC	TGC	2	GCTACTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.33333333333334	1	32.916666666666664	0.139939466685309	0.0310121698640216	4.51240488166093	0.108927296821288	0.0515053197051797	0.0311453107769982	NaN	NaN	0.0589270393769748	0.0645284145005169	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	33	GCA	TGC	AAC	2	ACTGCAACG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.66666666666667	1	32.25	0.137369045405264	0.03166697281676	4.3379279162598	0.105702072588504	0.0506118075295125	0.030541606401666	NaN	NaN	0.061773202085522	0.0870568384396471	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.75	1	32.5	0.137211534497054	0.0314182062818701	4.36726187567978	0.105793328215184	0.0474416273165143	0.0326950256991299	NaN	NaN	0.0604899529348064	0.0803013058257947	972	0	28	0.028	0.972	0.056
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.75	1	33.166666666666664	0.139125907283501	0.0307735475083969	4.52095772336741	0.108352359775104	0.0480204380529613	0.0311154328873704	NaN	NaN	0.0596840590420064	0.0694575237352044	972	1	27	0.027	0.972	0.054
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATACCGTTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.75	1	33.83333333333333	0.141094614194941	0.0301548153585304	4.6790077311824	0.110939798836411	0.050214247578346	0.0319571088642167	NaN	NaN	0.0608181610714631	0.0681334979638065	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCGTTACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.91666666666667	1	33.83333333333333	0.156408563919793	0.0301548153585304	5.18685198566627	0.126253748561262	0.0529974738892077	0.0318533264856155	NaN	NaN	0.0623543047208468	0.0428899605389832	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:TTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.91666666666667	1	34.166666666666664	0.140762624951505	0.0298546878003148	4.71492537095032	0.11090793715119	0.0501107206621807	0.0298647492533267	NaN	NaN	0.0607884795096643	0.0680781158127536	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.75	1	33.666666666666664	0.141094614194941	0.0303071537534075	4.65548877809345	0.110787460441534	0.0481420098157894	0.0311325954206152	NaN	NaN	0.0594113410108422	0.0622160716469832	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.75	1	33.666666666666664	0.141094614194941	0.0303071537534075	4.65548877809345	0.110787460441534	0.0474239887661506	0.030103782335988	NaN	NaN	0.0613356319873688	0.070879361262126	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.58333333333333	1	33	0.154934610949651	0.0309322189005369	5.0088424450844	0.124002392049114	0.053940925337245	0.0315612333378473	NaN	NaN	0.0648315978720173	0.0557884552809229	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.25	1	32.33333333333333	0.153488274894032	0.0315836140125951	4.85974387962135	0.121904660881437	0.050858282039017	0.0300827816216678	NaN	NaN	0.0599603430924793	0.0420436215766202	982	0	18	0.018	0.982	0.036
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.25	1	32.33333333333333	0.153488274894032	0.0315836140125951	4.85974387962135	0.121904660881437	0.0523709225241485	0.0327500523052382	NaN	NaN	0.0629752209423277	0.0528975939646426	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.91666666666667	1	32.666666666666664	0.154208039717062	0.0312545223004261	4.93394326218704	0.122953517416636	0.0518582739258374	0.0323287414468111	NaN	NaN	0.0643133053436688	0.0559031680682157	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.91666666666667	1	32.666666666666664	0.154208039717062	0.0312545223004261	4.93394326218704	0.122953517416636	0.0521724860642142	0.0302993834927853	NaN	NaN	0.0611617595856105	0.0443993913418739	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.5	1	33.416666666666664	0.157344163604509	0.0305385697640887	5.15230951612984	0.12680559384042	0.0522462510802613	0.0297643249983194	NaN	NaN	0.0619927151112903	0.0408063913770035	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT:CTTGTTGTT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.5	1	33.416666666666664	0.157344163604509	0.0305385697640887	5.15230951612984	0.12680559384042	0.053336596634906	0.0304634604461134	NaN	NaN	0.0635613424766414	0.0460416519707517	980	0	20	0.02	0.98	0.04
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTGTTGGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.25	1	33.666666666666664	0.15791093535129	0.0303071537534075	5.21035187388839	0.127603781597883	0.0554433388280792	0.0320641559786971	NaN	NaN	0.0605896487694522	0.0352015119762477	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.33333333333333	1	33.58333333333333	0.157721556627271	0.0303839016876759	5.19095797006362	0.127337654939595	0.054730554063271	0.0313687725092703	NaN	NaN	0.0596616805944924	0.0328158591863689	986	0	14	0.014	0.986	0.028
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333333	1	34.08333333333333	0.158864717514625	0.0299291581301553	5.30802493086364	0.128935559384469	0.0517576173735367	0.0303701763284395	NaN	NaN	0.0596879531777486	0.0307602460374024	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.83333333333333	1	33.08333333333333	0.156594789439853	0.0308526791703671	5.07556535285457	0.125742110269486	0.0518354216620985	0.0311029466343471	NaN	NaN	0.0643962750796379	0.0508634322156284	979	0	21	0.021	0.979	0.042
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.66666666666666	1	33.25	0.170542381646746	0.0306948207819131	5.55606376914367	0.139847560864833	0.0534666317384542	0.0322241203792346	NaN	NaN	0.0628887528377699	0.0261666642220216	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.33333333333333	1	33.25	0.168934951133241	0.0306948207819131	5.50369563430669	0.138240130351328	0.0522012735289809	0.0303539314092158	NaN	NaN	0.0654075307636643	0.0345562772836076	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.66666666666666	1	32.916666666666664	0.168142592913661	0.0310121698640216	5.42182612990035	0.137130423049639	0.0561760883134483	0.0319541743922381	NaN	NaN	0.0640556847789101	0.03229015350793	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.49999999999999	2	33.416666666666664	0.184453553433394	0.062373587449531503	2.95723816723932	0.122079965983863	0.0558555173614014	0.0433765632651415	NaN	NaN	0.0680122302557312	0.0726583555779028	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.16666666666666	2	33.416666666666664	0.182716561993313	0.062373587449531503	2.92938997842885	0.120342974543781	0.0556293258375466	0.0444685848174874	NaN	NaN	0.067428028163182	0.074299948412111	966	0	34	0.034	0.966	0.068
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAG	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.25	2	33.83333333333333	0.201440688758903	0.0615730216404005	3.27157387102682	0.139867667118503	0.0602414769894212	0.0434930181180861	NaN	NaN	0.069641632411392193	0.0446016985217561	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	58	AGC	AAG	CGC	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.75	2	33.83333333333333	0.199993267174727	0.0615730216404005	3.24806647207815	0.138420245534327	0.0596947235709508	0.0432725886586973	NaN	NaN	0.0695408968980099	0.0465373236741262	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.91666666666667	2	34.166666666666664	0.219201320467129	0.0609472230590743	3.59657601224364	0.158254097408055	0.0622818348043344	0.0450545810345955	NaN	NaN	0.0734299776737121	0.0311485203522266	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	60	TCC	TTC	CAA	2	GCTTCCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.25	2	33.833333333333336	0.218131224556612	0.0615730216404005	3.5426428449548	0.156558202916212	0.0620497904876132	0.0447023823743359	NaN	NaN	0.0723473703565641	0.0304659475940333	982	0	18	0.018	0.982	0.036
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	TCCAAAATC:TCCAAAGTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.08333333333333	2	34	0.21866495405835	0.0612585232607003	3.56954334546671	0.15740643079765	0.0607673667772766	0.0445109653677251	NaN	NaN	0.0752124477279757	0.0363648506391356	980	1	19	0.019	0.98	0.038
ORF3a	all	ss12	62	ATC	AAT	CAT	2	AAAATCATA:AAAGTGATT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.75	2	34.666666666666664	0.22303140124308	0.0600320307551523	3.71520667279673	0.162999370487928	0.0639240130165323	0.0423519759057238	NaN	NaN	0.0708710985511034	0.0214515427009461	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	63	ATA	CAT	AAC	2	ATCATAACC:GTGATTGCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.75	2	34.666666666666664	0.205912255736412	0.0600320307551523	3.43003981618163	0.14588022498126	0.0556694038275088	0.0421236098957061	NaN	NaN	0.0638271271109442	0.022280474625641	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTT	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.08333333333333	2	35	0.207964387858376	0.0594370287406054	3.49890282648503	0.148527359117771	0.0569685598019424	0.0429774254242262	NaN	NaN	0.0667422125578963	0.0260551620191798	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77	2	35.583333333333336	0.20822380244871	0.058423686245627	3.56403054701628	0.149800116203083	0.053107190815869	0.0434236498455618	NaN	NaN	0.065786070227447	0.0227814747252505	990	0	10	0.01	0.99	0.02
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTTCATAAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77	2	35.583333333333336	0.20822380244871	0.058423686245627	3.56403054701628	0.149800116203083	0.0567251297115212	0.0422978833788469	NaN	NaN	0.0643897345609644	0.0199940452252273	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	GAG	2	AAAAAGAGA:CATAAGAGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.75	2	35.916666666666664	0.191983961880758	0.0578600049104132	3.31807717918472	0.134123956970345	0.052832394050242	0.0409413278148183	NaN	NaN	0.0631743045011524	0.0337473415244257	981	0	19	0.019	0.981	0.038
ORF3a	all	ss12	68	AGA	GAG	ATG	2	AAGAGATGG:AAGAGGTGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.58333333333333	2	35.916666666666664	0.226998746097743	0.0578600049104132	3.92324104446955	0.16913874118733	0.0637039618799984	0.0409638873974413	NaN	NaN	0.070231467405155	0.0160268185732736	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGGTGGCAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.16666666666666	2	36.333333333333336	0.264931700823142	0.0571705240409132	4.63406108773023	0.207761176782228	0.0754277351014317	0.0417701758515334	NaN	NaN	0.0829212991478691	0.0122270635148298	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.99999999999999	3	36.166666666666664	0.26562886029046	0.0879053734766805	3.02175907779888	0.17772348681378	0.0729487566283341	0.0540860029370566	NaN	NaN	0.0919339193952207	0.0532158058426957	974	1	25	0.025	0.974	0.05
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTCGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.99999999999999	3	36.166666666666664	0.26562886029046	0.0879053734766805	3.02175907779888	0.17772348681378	0.0735623644790999	0.0544035418769387	NaN	NaN	0.0916848341749677	0.0525723073944633	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTCGCTATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.91666666666666	4	35.916666666666664	0.28050317670762	0.120559681536883	2.32667483135152	0.159943495170737	0.0739135136139461	0.0666540051730751	NaN	NaN	0.0936471663727668	0.0876479639283905	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	73	ATG	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCTATGTAC	1:1	TRUE	1.5	0.5	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.41666666666666	4	35.583333333333336	0.278309461419876	0.12178588422283	2.28523579063282	0.156523577197046	0.0766842982107304	0.0645504463021492	NaN	NaN	0.0956147567032688	0.101625617261482	948	0	52	0.052	0.948	0.104
ORF3a	all	ss12	74	TAC	CTC	CAA	2	ATGTACAAA:CTCTCCAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.91666666666666	4	35.083333333333336	0.27615017609084	0.123672788927057	2.23290974907759	0.152477387163783	0.0716452472100946	0.0674032946210789	NaN	NaN	0.0979678759698766	0.119612556433505	937	0	63	0.063	0.937	0.126
ORF3a	all	ss12	75	AAA	CAA	AGG	2	TACAAAGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.58333333333333	3	34.75	0.273323285248654	0.0917171833187057	2.98006627938944	0.181606101929949	0.0731577873400422	0.0553419543398543	NaN	NaN	0.0913610151012804	0.0468354170383918	983	0	17	0.017	0.983	0.034
ORF3a	all	ss12	76	GGC	AGG	CAT	2	AAAGGCATT:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.08333333333333	3	34.583333333333336	0.271241219068681	0.092187504132096	2.9422774986946	0.179053714936585	0.0746662197411105	0.0575057185443639	NaN	NaN	0.084183012697303	0.0334235902016093	982	0	18	0.018	0.982	0.036
ORF3a	all	ss12	77	ATT	CAT	TCA	2	GGCATTCAG:GGTGTTCAC	1:1	FALSE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.66666666666667	3	34.25	0.268852304636067	0.0931427851735378	2.88645335368872	0.175709519462529	0.0732780245936065	0.0536448996670903	NaN	NaN	0.0858860382186627	0.040771625782245	981	0	19	0.019	0.981	0.038
ORF3a	all	ss12	78	CAC	TCA	CTT	2	ATTCAGCTT:GTTCACTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.66666666666667	3	34.33333333333333	0.287035013343561	0.0929021112845893	3.08965005611422	0.194132902058972	0.0842446442123515	0.0571382408428521	NaN	NaN	0.0936008530353084	0.0380746150788777	987	1	12	0.012	0.987	0.024
ORF3a	all	ss12	79	CTT	CTT	TGT	2	CACTTTGTT:CAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81	3	33.33333333333333	0.263548415128416	0.0958750286324137	2.74887443464414	0.167673386496003	0.0758208510538002	0.057908706797534	NaN	NaN	0.0962015555111223	0.081344373227856	969	0	31	0.031	0.969	0.062
ORF3a	all	ss12	80	GTT	TGT	TTG	2	CTTGTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.66666666666667	3	33.33333333333333	0.247411820206618	0.0958750286324137	2.58056580254279	0.151536791574204	0.0729550516927711	0.0615292443908139	NaN	NaN	0.094500986895043	0.108813900306291	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	GTTTGCAAC:GTTTGCAAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.33333333333334	3	33.166666666666664	0.245013172691288	0.0963891381007337	2.5419168333597	0.148624034590554	0.0722218295054035	0.058761427455993	NaN	NaN	0.0920228103668819	0.106293762013825	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAATTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.16666666666667	3	33.33333333333333	0.245608424712543	0.0958750286324137	2.56175594642281	0.149733396080129	0.0749433022919677	0.0589327243995665	NaN	NaN	0.0899332017570183	0.0959247021361022	963	0	37	0.037	0.963	0.074
ORF3a	all	ss12	83	TTG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG:AATTTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.16666666666667	3	33.33333333333333	0.245608424712543	0.0958750286324137	2.56175594642281	0.149733396080129	0.0727083436888506	0.0604017336617043	NaN	NaN	0.0888245978025818	0.0918497535002469	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GCT	2	TTGCTGCTA:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.83333333333334	3	33.08333333333333	0.243244753739329	0.0966482688635724	2.51680404211575	0.146596484875756	0.07604802820937	0.0627665293503498	NaN	NaN	0.0894101305270052	0.101089212787746	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	85	CTA	GCT	ACT	2	CTGCTACTC:CTGTTGTTG	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.83333333333334	4	32.75	0.273784206798952	0.133313895827917	2.05368093924999	0.140470310971035	0.0789494206570838	0.073032335082896	NaN	NaN	0.0936540423993738	0.133644145502728	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	86	CTC	ACT	CTT	2	CTACTCTTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	83.33333333333334	4	32.25	0.271804213985788	0.135579277355344	2.00476222685129	0.136224936630444	0.0808803704655496	0.0718085950305646	NaN	NaN	0.0954783396392817	0.153648296984919	930	0	70	0.07	0.93	0.14
ORF3a	all	ss12	87	TTT	CTT	TGT	2	CTCTTTGTA:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	84.33333333333334	4	31.583333333333332	0.251169343096271	0.138722674692595	1.81058607508004	0.112446668403676	0.0737657505743116	0.0785292025547347	NaN	NaN	0.0900010191406332	0.211521265512586	903	0	97	0.097	0.903	0.194
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	85	4	30.916666666666664	0.248833044237754	0.142015736265178	1.75215121071598	0.106817307972575	0.0746274518425184	0.0762558347542338	NaN	NaN	0.0931643993015412	0.251569133921766	866	1	133	0.133	0.866	0.266
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AAT	2	GTAACAATT:GTAACAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	84.5	4	31.416666666666664	0.250581126994749	0.139531497680893	1.79587498994546	0.111049629313856	0.0760550294606433	0.0785334605713598	NaN	NaN	0.0894089502547888	0.214221239864034	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	90	ATT	AAT	TTA	2	ACAATTTAC:ACAGTTTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	84.16666666666666	4	32.08333333333333	0.251760353206859	0.136351658368326	1.84640477585377	0.115408694838533	0.0755303505646828	0.0774321538108305	NaN	NaN	0.0909486191592855	0.204461075980736	911	0	89	0.089	0.911	0.178
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	ATTTACTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.33333333333333	4	32.75	0.238090673089088	0.133313895827917	1.78594040486536	0.104776777261171	0.074441950685341	0.0739644064016076	NaN	NaN	0.0881497494770057	0.234588242412296	893	0	107	0.107	0.893	0.214
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.99999999999999	4	33.083333333333336	0.239216898899161	0.13184534303006	1.81437503518514	0.107371555869102	0.0747602629041505	0.0717249804758243	NaN	NaN	0.0924386419233301	0.245420714249332	878	0	122	0.122	0.878	0.244
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.66666666666666	4	32.083333333333336	0.240353921456079	0.136351658368326	1.76275026158326	0.104002263087753	0.0758259398177316	0.0741758543651187	NaN	NaN	0.0921892880026197	0.259261532633456	866	0	134	0.134	0.866	0.268
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TTT	2	CACCTTTTA:CACCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	82.49999999999999	4	31.583333333333332	0.240926530560309	0.138722674692595	1.73674946142867	0.102203855867714	0.0780171758027428	0.0791285877041808	NaN	NaN	0.0927183800893005	0.270329462431669	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	95	TTA	TTT	ACT	2	CTTTTACTT:CTTTTGCTC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.83333333333331	4	30.916666666666664	0.236421241533877	0.142015736265178	1.66475383469068	0.0944055052686982	0.0762415437985068	0.0806437608313203	NaN	NaN	0.0931936346255113	0.311058349667282	862	0	138	0.138	0.862	0.276
ORF3a	all	ss12	96	CTC	ACT	CGT	2	TTACTTTTA:TTGCTCGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.24999999999999	4	31.166666666666664	0.238371225836276	0.140762624951505	1.69342697266692	0.0976086008847707	0.0756540867030933	0.0778354480599969	NaN	NaN	0.0912790785463631	0.284915352648812	865	0	135	0.135	0.865	0.27
ORF3a	all	ss12	97	GTT	CGT	AGC	2	CTCGTTGCT:CTTTTAGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	84.24999999999999	4	30.833333333333332	0.235047973554202	0.142438427764417	1.65017247973949	0.0926095457897852	0.0743146397312588	0.0789479908035461	NaN	NaN	0.0884381696690408	0.295022494757915	872	0	128	0.128	0.872	0.256
ORF3a	all	ss12	98	GCT	AGC	TGC	2	GTTGCTGCT:TTAGCTGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	84.33333333333331	4	30.583333333333332	0.234775247736897	0.143721781908901	1.63353977816467	0.0910534658279957	0.0724656703663247	0.07508883259973	NaN	NaN	0.0897744593142581	0.310464961119933	860	0	140	0.14	0.86	0.28
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	84.91666666666666	4	30.5	0.232883886067431	0.144154737019872	1.61551323863417	0.0887291490475582	0.0730920499221277	0.0817079860324563	NaN	NaN	0.0938152561471343	0.344257784658733	840	0	160	0.16	0.84	0.32
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CAT	2	GCTGGCATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	85.41666666666666	4	31	0.231286997829461	0.141595553474679	1.6334340461533	0.0896914443547822	0.0751294950239158	0.0759280836102492	NaN	NaN	0.0875716306360557	0.305737689724995	860	0	140	0.14	0.86	0.28
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CAT	GGA	2	GGCATGGAG:GGCCTTGAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	85.08333333333333	4	32	0.232349125985585	0.136741167595466	1.69918927906894	0.0956079583901187	0.071440621386264	0.0755232470982402	NaN	NaN	0.0898585087115555	0.287336235861589	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAGGCA:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	83.75	4	32.33333333333333	0.220502877731968	0.135196367873208	1.63098226084567	0.0853065098587594	0.0734289318570479	0.0724321950185765	NaN	NaN	0.0844238516768648	0.312277309988865	846	0	154	0.154	0.846	0.308
ORF3a	all	ss12	103	GCA	AGC	ACA	2	GAAGCCCCT:GAGGCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	83.75	4	32.33333333333333	0.236697838954893	0.135196367873208	1.75077069508906	0.101501471081685	0.0731291588367112	0.0727654346716163	NaN	NaN	0.0921896082409989	0.270893293910892	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	104	CAA	ACA	ATT	2	GCACAATTT:GCCCCTTTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	84.66666666666667	5	31.999999999999996	0.233690694979001	0.175211138386129	1.33376620420099	0.0584795565928726	0.076689620762193	0.0864629108295544	NaN	NaN	0.106463656658754	0.582805581239428	723	0	277	0.277	0.723	0.554
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	84.66666666666667	4	31.666666666666664	0.217732646143538	0.138321779350139	1.574102409371	0.0794108667933983	0.0719738944545184	0.0794163244098901	NaN	NaN	0.0961764010235713	0.408986018085375	814	0	186	0.186	0.814	0.372
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	84.16666666666667	4	32.166666666666664	0.219234931370512	0.135964367940317	1.61244401523455	0.0832705634301949	0.0735115088746395	0.0779274930425391	NaN	NaN	0.0998135893834806	0.404134044763046	809	0	191	0.191	0.809	0.382
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CAT	2	CTCTATCTT:TTGTACATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	83.75	4	32.416666666666664	0.20465023999998	0.134815620966532	1.51800094479248	0.0698346190334486	0.0656196952631562	0.0748778468119747	NaN	NaN	0.0959684513769968	0.466807605394805	790	0	210	0.21	0.79	0.42
ORF3a	all	ss12	108	ATC	CAT	CTA	2	TACATCTAT:TATCTTTAT	1:1	TRUE	1.5	0.5	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	84.58333333333333	4	32.08333333333333	0.202335646591905	0.136351658368326	1.48392508762407	0.0659839882235791	0.0704611677565761	0.0783713689846565	NaN	NaN	0.0956058358439862	0.490089204028178	741	0	259	0.259	0.741	0.518
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	ATCTATGCT:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	84.41666666666666	4	32.416666666666664	0.187428887552107	0.134815620966532	1.39026090751484	0.0526132665855752	0.0659281664470897	0.078338733953051	NaN	NaN	0.0919819868983672	0.56732514114728	736	0	264	0.264	0.736	0.528
ORF3a	all	ss12	110	GCT	TGC	TCT	2	TATGCTCTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	84.08333333333333	4	32.75	0.1882734769284	0.133313895827917	1.41225695760497	0.0549595811004834	0.0641116656250627	0.0753187048321141	NaN	NaN	0.0909762853437215	0.545771261528422	715	0	285	0.285	0.715	0.57
ORF3a	all	ss12	111	CTG	TCT	AGT	2	GCTCTGATT:GCTTTAGTC	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	84.08333333333333	4	32.75	0.1882734769284	0.133313895827917	1.41225695760497	0.0549595811004834	0.0671648747943182	0.0707964423795385	NaN	NaN	0.0916618177264537	0.548778991039433	738	0	262	0.262	0.738	0.524
ORF3a	all	ss12	112	ATT	AGT	CTA	2	CTGATTTAT:TTAGTCTAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	85.75	4	32.08333333333333	0.184125343811615	0.136351658368326	1.35037113603883	0.0477736854432884	0.0632949527815788	0.0794195697936534	NaN	NaN	0.0863773715527509	0.580207927264012	712	0	288	0.288	0.712	0.576
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	ATTTATATT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	86.25	4	32.08333333333333	0.168264008006834	0.136351658368326	1.23404445549392	0.0319123496385073	0.0626105696196579	0.0773760141759747	NaN	NaN	0.0878210141157255	0.716321469118995	627	0	373	0.373	0.627	0.746
ORF3a	all	ss12	114	ATT	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATATTCTG	1:1	TRUE	1.5	0.5	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	86.41666666666667	4	31.916666666666664	0.167900289820674	0.137132914796851	1.22436170826969	0.0307673750238232	0.0633198145948076	0.0782069941405928	NaN	NaN	0.091496232844365	0.736667791345833	663	0	337	0.337	0.663	0.674
ORF3a	all	ss12	115	CTG	CTT	GCA	2	ATTCTGCAA:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	86.58333333333334	4	31.249999999999996	0.15323497233538	0.140349835343382	1.09180728256982	0.0128851369919973	0.0625710387205847	0.0796543220777615	NaN	NaN	0.0955382549468252	0.892715548588141	558	0	442	0.442	0.558	0.884
ORF3a	all	ss12	116	CAA	GCA	AGC	2	CTGCAAGCT:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	87.58333333333334	4	30.58333333333333	0.179769506889945	0.143721781908901	1.25081601760193	0.036047724981044	0.0672543379127874	0.0853713318325962	NaN	NaN	0.0962211057941147	0.707932472740236	665	0	335	0.335	0.665	0.67
ORF3a	all	ss12	117	AGT	AGC	TAT	2	CAAGCTGTG:CAGAGTATA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	87	4	30.58333333333333	0.195911624447713	0.143721781908901	1.36313105672384	0.0521898425388123	0.0676558136852315	0.0804346480035547	NaN	NaN	0.102591514483088	0.61095200503064	709	0	291	0.291	0.709	0.582
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	AGTATAAAC:GCTGTGAGC	1:1	TRUE	1.5	0.75	0.75	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	87	4	30.58333333333333	0.166639616518412	0.143721781908901	1.15945971657962	0.0229178346095109	0.0628725154998907	0.0860567517148784	NaN	NaN	0.0894894441416195	0.797877177156063	614	0	386	0.386	0.614	0.772
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT:GTGAGCTTC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	87	4	30.33333333333333	0.138467290336675	0.145028544735405	0.954758875842683	-0.00656125439872937	0.0551352591831857	0.0847179647678061	NaN	NaN	0.085064104935422	0.938517696166008	486	1	513	0.513	0.486	0.972
ORF3a	all	ss12	120	TTC	CTT	CTG	2	AACTTTGTA:AGCTTCTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.166666666666667	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	86.16666666666667	3	30.666666666666664	0.154057530619536	0.104821456781369	1.46971369555434	0.0492360738381666	0.0569909524624527	0.0628290140107699	NaN	NaN	0.0718273160015209	0.493042084627238	765	0	235	0.235	0.765	0.47
ORF3a	all	ss12	121	GTA	CTG	AAG	2	TTCTGCAGA:TTTGTAAGA	1:1	TRUE	1.75	0.5	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.5	3	30.666666666666664	0.155392217528976	0.104821456781369	1.48244665071851	0.050570760747607	0.0583438354779274	0.0660642817115589	NaN	NaN	0.0728548655879393	0.487600575338603	765	0	235	0.235	0.765	0.47
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGCAGATTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85	2	30.666666666666664	0.156408563919793	0.068228833654295	2.2924115149365	0.0881797302654978	0.059015278991841	0.0553160959860416	NaN	NaN	0.066703516121693	0.18617972319474901	928	0	72	0.072	0.928	0.144
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGATTTATC	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.83333333333334	2	30.666666666666664	0.156750317692117	0.068228833654295	2.29742044963493	0.0885214840378225	0.0542117957258094	0.0504801898015384	NaN	NaN	0.0652671115880498	0.175005194512989	922	0	78	0.078	0.922	0.156
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:TTTATCATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.33333333333334	2	30.333333333333332	0.145188561804499	0.0690141740401891	2.10374990099789	0.0761743877643099	0.0573647453234287	0.0506094123231158	NaN	NaN	0.0679157008652346	0.262031689364954	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATCATGAGA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.16666666666667	2	30.166666666666664	0.145509660941463	0.0694136680239339	2.09626814262706	0.0760959929175292	0.0567905523008629	0.0524917464756185	NaN	NaN	0.0708259324135539	0.282639576872662	864	0	136	0.136	0.864	0.272
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGT:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.33333333333334	3	30.166666666666664	0.147136768189642	0.106688419438138	1.37912595354323	0.040448348751504	0.0588703061595849	0.066305838392989	NaN	NaN	0.0882957729465574	0.646880150092303	687	1	312	0.312	0.687	0.624
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	TTG	2	AGATGTTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.75	3	30.499999999999996	0.163354604039617	0.105436462965892	1.54931794413912	0.0579181410737245	0.0598625092373119	0.0677615867959985	NaN	NaN	0.0827644631595688	0.48405546168354	761	0	239	0.239	0.761	0.478
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82	3	30.333333333333332	0.162798378928371	0.106058740537371	1.53498314333656	0.0567396383909992	0.0596965254573675	0.0679725994834782	NaN	NaN	0.0851329625623813	0.505102680591673	758	0	242	0.242	0.758	0.484
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80	3	31.333333333333332	0.167357663485657	0.102431651254313	1.63384716966193	0.0649260122313442	0.0617981860253688	0.0695597271247574	NaN	NaN	0.0859849785512738	0.450197670830735	809	0	191	0.191	0.809	0.382
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.83333333333333	3	30.999999999999996	0.196927853470251	0.103612753860613	1.90061402802952	0.0933150996096379	0.0728359485794133	0.0682636591844474	NaN	NaN	0.0916219234001922	0.308449884827612	849	0	151	0.151	0.849	0.302
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.99999999999999	4	31.333333333333332	0.215761554338836	0.139939466685309	1.54182061322295	0.0758220876535265	0.0726225779458601	0.0777653986924516	NaN	NaN	0.098525825361554	0.441557606799306	791	1	208	0.208	0.791	0.416
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.49999999999999	4	31.416666666666664	0.234333426514436	0.139531497680893	1.6794303107844	0.0948019288335424	0.0743316100455214	0.0792889047416502	NaN	NaN	0.0994522323486009	0.340468061776181	842	0	158	0.158	0.842	0.316
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCCGT:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.49999999999999	4	32.25	0.255545671643513	0.135579277355344	1.88484314585736	0.11996639428817	0.0779233219196078	0.0766675958009714	NaN	NaN	0.0999376790815951	0.229979351007111	880	0	120	0.12	0.88	0.24
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CAA	ATC	2	TGCAAATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.58333333333331	4	32.083333333333336	0.255222859246332	0.136351658368326	1.87179871737899	0.118871200878006	0.0773268128307638	0.0796354296569748	NaN	NaN	0.102546176368011	0.246375970051786	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AAATCCAAA:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.91666666666664	3	32.416666666666664	0.222476012792921	0.0987726497511971	2.25240502662757	0.123703363041724	0.0707156083850486	0.0655285435743077	NaN	NaN	0.0925294489898243	0.181252660509373	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.08333333333331	3	32.916666666666664	0.221923403608424	0.097170738715697	2.2838501234176	0.124752664892727	0.0705478833177122	0.0609336986837969	NaN	NaN	0.0952740909750789	0.190396154673323	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.91666666666664	3	32.916666666666664	0.222476012792921	0.097170738715697	2.28953711511696	0.125305274077224	0.073389430912208	0.0639149035603014	NaN	NaN	0.0985857501546018	0.203718596612475	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.58333333333331	3	32.583333333333336	0.223589590132048	0.0982328346145694	2.2761186828145	0.125356755517478	0.073173660261843	0.0642770142262156	NaN	NaN	0.0964493400397537	0.193698306447999	906	0	94	0.094	0.906	0.188
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTC:CCATTACTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.58333333333331	3	31.583333333333336	0.220282043117094	0.101563372279023	2.16891225817039	0.118718670838072	0.071000334195545	0.0673260133653259	NaN	NaN	0.0976312991690346	0.223988780724165	897	0	103	0.103	0.897	0.206
ORF3a	all	ss12	140	CTC	ACT	CTA	2	TTACTCTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.91666666666666	3	30.916666666666668	0.219201320467129	0.103912304538584	2.1094837751937	0.115289015928545	0.0718265243400911	0.06977385372462	NaN	NaN	0.0964998425213662	0.232201613363421	898	0	102	0.102	0.898	0.204
ORF3a	all	ss12	141	TAT	CTA	TGA	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.24999999999999	3	30.583333333333336	0.235201662735449	0.105128058952294	2.23728721979144	0.130073603783155	0.0754171099275231	0.067874971536641	NaN	NaN	0.106881494777327	0.223608399912883	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.41666666666666	3	29.916666666666668	0.238143225992366	0.107647107231784	2.21225848159208	0.130496118760582	0.0742367975937457	0.0704236951171231	NaN	NaN	0.101957591148854	0.200578245154935	909	0	91	0.091	0.909	0.182
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.74999999999999	3	30.583333333333336	0.268514498493544	0.105128058952294	2.55416585419305	0.16338643954125	0.0808499526951934	0.0679568723322203	NaN	NaN	0.11101482495006	0.141087497537149	936	0	64	0.064	0.936	0.128
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAC:GCCAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.24999999999999	3	30.083333333333336	0.262577384081623	0.107006075844546	2.45385490505311	0.155571308237078	0.0799808192773187	0.0704588533651876	NaN	NaN	0.106384051679913	0.143643803838055	923	1	76	0.076	0.923	0.152
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333333	3	30.75	0.301389150714295	0.104516640682884	2.88364751053134	0.196872510031412	0.0895628942047221	0.0691802995601948	NaN	NaN	0.117402628249302	0.0935619669934297	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.75	3	30.583333333333336	0.300623921390007	0.105128058952294	2.85959737472587	0.195495862437713	0.0909258292074694	0.0683375574418523	NaN	NaN	0.122212280529684	0.109678087968548	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333333	3	30.083333333333336	0.301389150714295	0.107006075844546	2.81656110025137	0.19438307486975	0.0866360952273059	0.0792072342184156	NaN	NaN	0.113017234921552	0.0854430078323777	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.91666666666666	3	29.75	0.281652316781776	0.10829587866142	2.60076671673114	0.173356438120356	0.0871344818096917	0.0750754839616311	NaN	NaN	0.110918377519308	0.118071651346954	936	0	64	0.064	0.936	0.128
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.41666666666666	3	30.25	0.283780696115475	0.106372646579413	2.66779764573796	0.177408049536061	0.0909454517285657	0.0684599115566627	NaN	NaN	0.112748245050849	0.115605784885748	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.74999999999999	3	29.583333333333336	0.282358178426184	0.108952531416164	2.59157061112849	0.17340564701002	0.0857533813455958	0.0696052443872475	NaN	NaN	0.115503197705345	0.133276426490257	928	0	72	0.072	0.928	0.144
ORF3a	all	ss12	151	ACA	TAC	ACA	2	CATACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.33333333333331	4	29.583333333333336	0.284138594692556	0.149095891727942	1.9057439571241	0.135042702964613	0.0937303718187249	0.0883811174333985	NaN	NaN	0.12619658777479	0.284575246425733	855	0	145	0.145	0.855	0.29
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ACA	TAA	2	ACACATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.83333333333331	4	29.083333333333336	0.28200480071778	0.151937056450332	1.85606334166389	0.130067744267447	0.0860849874157281	0.0856930352834908	NaN	NaN	0.12923186758799	0.314190478897651	847	1	152	0.152	0.847	0.304
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATTGTTAC:CATAACTAT	1:1	TRUE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.41666666666664	4	28.833333333333336	0.265842621320033	0.153398778089708	1.73301655091782	0.112443843230325	0.0853162540471855	0.0917417462829523	NaN	NaN	0.130720895183986	0.389688378868655	803	2	195	0.195	0.803	0.39
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.58333333333331	3	29.25	0.287401273704121	0.110290063467372	2.6058673344507	0.177111210236748	0.0906723780311242	0.0678166301488253	NaN	NaN	0.113178846086586	0.117611261262552	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.08333333333331	3	29.583333333333336	0.285217792864262	0.108952531416164	2.61781703607069	0.176265261448098	0.0915119774463132	0.0699478977571557	NaN	NaN	0.115035185284614	0.125455181765014	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333331	3	28.75	0.301389150714295	0.112359208671495	2.6823716033411	0.1890299420428	0.0921108285000473	0.0716916597314845	NaN	NaN	0.113613828648212	0.0961537167197825	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.91666666666664	3	28.416666666666668	0.299862619562067	0.113782401199837	2.63540421365704	0.18608021836223	0.087379493504182	0.0696584474691531	NaN	NaN	0.112687884063043	0.0986796588723484	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.08333333333331	3	28.416666666666668	0.299105214682181	0.113782401199837	2.62874760532483	0.185322813482343	0.0915362038602148	0.0703469738470963	NaN	NaN	0.118976016963741	0.119316596667715	945	1	54	0.054	0.945	0.108
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAC:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.41666666666666	3	27.75	0.297601975168629	0.116739982283845	2.54927206040713	0.180861992884784	0.0870820649349054	0.0733684332365042	NaN	NaN	0.110089719277287	0.100411908957935	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATACAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.74999999999999	4	27.75	0.296113964785258	0.160073332783954	1.84986443172839	0.136040632001304	0.0855685039551583	0.0920139686267067	NaN	NaN	0.129507217937596	0.293512066388482	875	0	125	0.125	0.875	0.25
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAACAGT:TACAATAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.24999999999999	4	27.583333333333336	0.312120297918684	0.16115228773261	1.93680339454173	0.150968010186074	0.0888289055316157	0.0862462329466843	NaN	NaN	0.129003887276892	0.241896599887515	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.91666666666664	4	27.916666666666668	0.318526102048975	0.159008783209024	2.00319816063405	0.159517318839951	0.0949691193236652	0.082018730292672	NaN	NaN	0.134781990657818	0.236602721576096	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.91666666666664	4	28.250000000000004	0.323508417071989	0.156921757285409	2.06159058290172	0.16658665978658	0.0961613000221893	0.0869163384519881	NaN	NaN	0.132754781396565	0.209535071121335	910	0	90	0.09	0.91	0.18
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.08333333333331	4	28.750000000000004	0.322667069425418	0.15389231077321	2.09670689720768	0.168774758652208	0.0918124356152025	0.0850267318648919	NaN	NaN	0.131628914208439	0.199772056998315	899	0	101	0.101	0.899	0.202
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.24999999999999	4	29.416666666666668	0.326918846054154	0.150031026615648	2.17900825868278	0.176887819438506	0.0952605672279917	0.0808687872567039	NaN	NaN	0.128798187954854	0.169636743132925	913	0	87	0.087	0.913	0.174
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.58333333333331	4	30.083333333333336	0.310889822884503	0.146359364647636	2.12415395238275	0.164530458236867	0.0860815691596361	0.0805031696733672	NaN	NaN	0.126243811856589	0.19248074605412	906	0	94	0.094	0.906	0.188
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.58333333333331	4	30.083333333333336	0.291871371191942	0.146359364647636	1.9942104278372	0.145512006544306	0.084527563209468	0.080044089888208	NaN	NaN	0.125382576481444	0.245827358819896	889	0	111	0.111	0.889	0.222
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.91666666666664	4	30.41666666666667	0.294930500060605	0.144590316625212	2.03976661054755	0.150340183435394	0.0878869411759135	0.0774721581015083	NaN	NaN	0.127174678857483	0.237144201399268	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT:GTCGTTACT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.08333333333331	4	30.91666666666667	0.294159645070685	0.142015736265178	2.07131725544426	0.152143908805506	0.0832912365020049	0.0776992087805011	NaN	NaN	0.123769881526193	0.218978747896231	899	0	101	0.101	0.899	0.202
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TGC	2	ATTACTTCA:GTTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.41666666666664	4	30.66666666666667	0.311709043238926	0.143291427572032	2.17535025312126	0.168417615666894	0.0939269198546469	0.0778410084403124	NaN	NaN	0.12406679875739	0.174630234431458	922	0	78	0.078	0.922	0.156
ORF3a	all	ss12	171	GCA	TGC	AGG	2	ACTGCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.08333333333331	4	30.33333333333334	0.308458156432116	0.145028544735405	2.12687893266031	0.163429611696711	0.0931636949863089	0.081659541728659	NaN	NaN	0.124263632546956	0.188447880774539	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	GCAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.83333333333331	4	30.58333333333334	0.290740699021438	0.143721781908901	2.02294109605269	0.147018917112537	0.0885294118356768	0.0744506700685391	NaN	NaN	0.121712634973076	0.227078696104145	897	0	103	0.103	0.897	0.206
ORF3a	all	ss12	173	GAC	TGA	CGG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.49999999999997	4	30.58333333333334	0.287768481418953	0.143721781908901	2.00226074013859	0.144046699510052	0.0913675301815436	0.0836073318151217	NaN	NaN	0.122498782296137	0.239633594542536	891	0	109	0.109	0.891	0.218
ORF3a	all	ss12	174	GGC	CGG	CAC	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.66666666666664	4	30.750000000000004	0.282712453350107	0.142863650574837	1.97889702672839	0.139848802775271	0.0835192772661105	0.0828440904647459	NaN	NaN	0.115800717211132	0.227175050587887	897	0	103	0.103	0.897	0.206
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.16666666666664	4	30.250000000000004	0.280600193443143	0.145469445655623	1.92892873261799	0.135130747787519	0.0840513858469261	0.0761782276728966	NaN	NaN	0.11449294590678499	0.237899240890961	880	0	120	0.12	0.88	0.24
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAC	2	ACAACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333331	3	30.66666666666667	0.301389150714295	0.104821456781369	2.87526199280856	0.196567693932926	0.0944609931033786	0.0620148482385748	NaN	NaN	0.112706999268072	0.0811487443617791	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	177	ACA	AAC	ACC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.83333333333331	3	30.000000000000004	0.286305319885247	0.107325632730505	2.66763225709705	0.178979687154742	0.0865855111962417	0.0667164401302303	NaN	NaN	0.108567077969069	0.0992371574432168	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	178	CCA	ACC	AAA	2	ACACCAAAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.83333333333331	3	30.33333333333334	0.268177549189387	0.106058740537371	2.52857565374247	0.162118808652015	0.0815438756567433	0.0655563934607198	NaN	NaN	0.101701699518525	0.110922161943307	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTC:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.33333333333331	4	29.83333333333334	0.266173663925686	0.147714914296514	1.80194170096721	0.118458749629172	0.0775042634455225	0.0775893258324689	NaN	NaN	0.117643918421609	0.313970216283771	849	0	151	0.151	0.849	0.302
ORF3a	all	ss12	180	CTC	ACT	CAA	2	AAACTCAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.49999999999999	4	30.16666666666667	0.234333426514436	0.145913043990275	1.60597997345634	0.0884203825241606	0.072307967667309	0.0789726487800586	NaN	NaN	0.110691976531653	0.424408320317336	793	0	207	0.207	0.793	0.414
ORF3a	all	ss12	181	AAA	CAA	ACA	2	CTCAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.99999999999999	3	30.333333333333336	0.215761554338836	0.106058740537371	2.03435900940959	0.109702813801464	0.0701526793138551	0.0660554080239952	NaN	NaN	0.102274286626642	0.283435641598602	858	0	142	0.142	0.858	0.284
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.66666666666666	3	30.750000000000004	0.200233049317567	0.104516640682884	1.9158006611129	0.0957164086346837	0.0640487745777183	0.0650844238523153	NaN	NaN	0.0985701243129993	0.331523939208321	830	0	170	0.17	0.83	0.34
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.33333333333333	3	29.916666666666668	0.182287438823259	0.107647107231784	1.69337981772944	0.0746403315914759	0.0629115864237701	0.0657679492367215	NaN	NaN	0.097678431345233	0.444781773504359	790	2	208	0.208	0.79	0.416
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79	4	30.583333333333332	0.185778237042605	0.143721781908901	1.29262408644753	0.0420564551337039	0.0631151384814104	0.0754797253892213	NaN	NaN	0.101406576252779	0.678338804614629	682	0	318	0.318	0.682	0.636
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.66666666666667	4	29.916666666666668	0.18143524049715	0.147260274111344	1.23207186454078	0.0341749663858059	0.062654771751788	0.0766115031989873	NaN	NaN	0.106885448464349	0.749169597474386	639	0	361	0.361	0.639	0.722
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.33333333333333	4	29.25	0.179754639949065	0.150978005779684	1.19060149868037	0.0287766341693818	0.0654075925844092	0.0790490730696354	NaN	NaN	0.108022405779742	0.789934977206469	599	0	401	0.401	0.599	0.802
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.83333333333333	4	29.583333333333332	0.196927853470251	0.149095891727942	1.32081341201264	0.0478319617423084	0.0652122148244616	0.0786927733482277	NaN	NaN	0.11137585202236	0.667585307292287	662	0	338	0.338	0.662	0.676
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.33333333333333	4	30.083333333333332	0.198330831309248	0.146359364647636	1.35509491850238	0.0519714666616118	0.069247012445955	0.0808918661535229	NaN	NaN	0.108817439157652	0.632933244883239	696	0	304	0.304	0.696	0.608
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.33333333333333	4	30.583333333333332	0.204149781227553	0.143721781908901	1.42045122538875	0.0604279993186521	0.0677800305898671	0.0763681518061137	NaN	NaN	0.105415819687678	0.566485833857454	755	0	245	0.245	0.755	0.49
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.99999999999999	4	30.583333333333332	0.218932806420977	0.143721781908901	1.52330985264119	0.0752110245120757	0.0680653585483792	0.0774241221010937	NaN	NaN	0.108086394431339	0.486527947656057	764	0	236	0.236	0.764	0.472
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.66666666666666	4	30.916666666666668	0.20315621560155	0.142015736265178	1.43051904629926	0.0611404793363713	0.0687302062730068	0.0735324819417596	NaN	NaN	0.107075261706112	0.567996446461375	722	0	278	0.278	0.722	0.556
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGGATTGG	1:1	TRUE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.16666666666666	4	30.916666666666668	0.20465023999998	0.142015736265178	1.44103917905159	0.0626345037348018	0.0704258175920869	0.0774758431420035	NaN	NaN	0.106679482114041	0.557117789302642	743	0	257	0.257	0.743	0.514
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:GATTGGCAC	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.33333333333333	6	31.41666666666667	0.173851210542993	0.220417888585699	0.788734578933233	-0.0465666780427055	0.0634471740078181	0.119382264784509	NaN	NaN	0.137529107898105	0.734914796328998	387	0	613	0.613	0.387	0.774
ORF3a	all	ss12	194	CAC	GCA	ATC	2	TGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333333	6	32.083333333333336	0.193179203235308	0.215112484631514	0.898038082569788	-0.0219332813962062	0.0624605114860898	0.110834415947823	NaN	NaN	0.13553845539896	0.87144499676724	441	0	559	0.559	0.441	0.882
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.16666666666666	6	31.583333333333336	0.160415060140258	0.219066980579392	0.732264897776881	-0.0586519204391334	0.0532084176791218	0.111718933719431	NaN	NaN	0.131551707420751	0.655707843828044	332	0	668	0.668	0.332	0.664
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666666	6	31.750000000000004	0.159249476407496	0.217732646143538	0.731399168788461	-0.0584831697360422	0.0527736511417596	0.112251528382612	NaN	NaN	0.133037322316238	0.660227043022187	348	0	652	0.652	0.348	0.696
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333333	6	31.91666666666667	0.158864717514625	0.216414580065769	0.734075853236624	-0.0575498625511439	0.0510736105937271	0.120835143108331	NaN	NaN	0.136637520294746	0.673618989097241	337	0	663	0.663	0.337	0.674
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32.5	0.158673037027526	0.211925228838758	0.748721791628931	-0.0532521918112318	0.0500597321761022	0.110301830223681	NaN	NaN	0.130336162536811	0.682851049849465	351	0	649	0.649	0.351	0.702
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32	0.158673037027526	0.215761554338836	0.735409222990409	-0.0570885173113096	0.0548234371485083	0.108383647269078	NaN	NaN	0.128780389173048	0.657547796655958	328	1	671	0.671	0.328	0.656
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.75	6	32	0.15905686340681	0.215761554338836	0.737188160764845	-0.0567046909320252	0.0521445915040018	0.110643547301471	NaN	NaN	0.126297422443389	0.653447945152518	338	1	661	0.661	0.338	0.676
ORF3a	all	ss12	201	GTC	TGT	CGT	2	TATGTCGTT:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333334	5	32.333333333333336	0.158864717514625	0.173179167487274	0.91734311822638	-0.0143144499726495	0.052860835843309	0.101061332900945	NaN	NaN	0.124310631445637	0.908325714235619	462	0	538	0.538	0.462	0.924
ORF3a	all	ss12	202	GTA	CGT	ATT	2	GTCGTTGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.33333333333334	5	32.833333333333336	0.160024633856936	0.17021844254226	0.940113371188945	-0.0101938086853242	0.0509863775528854	0.0995209616015499	NaN	NaN	0.110056368732713	0.926202654815815	490	0	510	0.51	0.49	0.98
ORF3a	all	ss12	203	GTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.08333333333334	5	33.083333333333336	0.160610991304224	0.168775880107432	0.951622893046025	-0.00816488880320848	0.0512267886790106	0.0979015875206074	NaN	NaN	0.116542416734553	0.944146401773377	485	0	515	0.515	0.485	0.97
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	GTACATGGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.83333333333334	5	33.166666666666664	0.145028544735405	0.168300466878196	0.861723959686733	-0.023271922142791	0.0484879990153952	0.0948138436794479	NaN	NaN	0.112949220637516	0.836760601641035	453	0	547	0.547	0.453	0.906
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:CATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	32.833333333333336	0.146091244169313	0.17021844254226	0.858257436664322	-0.0241271983729469	0.0473931127129762	0.0964945896258179	NaN	NaN	0.116172084163495	0.835474936805624	459	1	540	0.54	0.459	0.918
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.83333333333334	5	33	0.131083275220683	0.169253998250676	0.774476683419554	-0.0381707230299936	0.0489346091766255	0.100366744169665	NaN	NaN	0.115320615035395	0.740647109140278	377	0	623	0.623	0.377	0.754
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	5	32.83333333333333	0.130765040358583	0.17021844254226	0.768218992052627	-0.039453402183677	0.0467535635625624	0.0981799496524007	NaN	NaN	0.115661424235743	0.733019902714799	364	0	636	0.636	0.364	0.728
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CGA	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.33333333333334	5	32.5	0.13013319533385	0.172180831233375	0.755793745457451	-0.0420476358995253	0.0472212260192643	0.106814229101415	NaN	NaN	0.114092817781533	0.712471482038683	393	0	607	0.607	0.393	0.786
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.66666666666667	5	33.166666666666664	0.131403066768818	0.168300466878196	0.780764719232291	-0.0368974001093777	0.047913898353874	0.0976609590462871	NaN	NaN	0.119810609827844	0.758109436962436	376	0	624	0.624	0.376	0.752
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	5	32.5	0.130765040358583	0.172180831233375	0.759463404967208	-0.0414157908747918	0.0472124877550876	0.100894950008172	NaN	NaN	0.113376588435493	0.714891934478603	374	0	626	0.626	0.374	0.748
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.66666666666667	5	32.5	0.113962844188242	0.172180831233375	0.661878812942748	-0.0582179870451332	0.0439528161430737	0.103765331146367	NaN	NaN	0.111373213487599	0.601162988433906	309	1	690	0.69	0.309	0.618
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.83333333333333	0.128887692694994	0.17021844254226	0.757189942347142	-0.0413307498472659	0.0501204140053467	0.105588730074204	NaN	NaN	0.117207415666543	0.724366490841992	374	0	626	0.626	0.374	0.748
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.66666666666669	5	33.166666666666664	0.12950744207608	0.168300466878196	0.769501383319442	-0.0387930248021161	0.0458160947106621	0.0985489695737278	NaN	NaN	0.114630880855145	0.735049057003392	381	0	619	0.619	0.381	0.762
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.5	0.128887692694994	0.172180831233375	0.748560056144108	-0.0432931385383807	0.0467879531656845	0.105131616084636	NaN	NaN	0.116043675080888	0.709091698260807	363	0	637	0.637	0.363	0.726
ORF3a	all	ss12	215	GAG	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.83333333333336	5	31.83333333333333	0.127364024533652	0.176245193423779	0.722652471023176	-0.0488811688901276	0.047834497084285	0.10330803420897	NaN	NaN	0.117225433209364	0.676689868439939	351	0	649	0.649	0.351	0.702
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.50000000000003	5	30.83333333333333	0.114234586398441	0.182716561993313	0.625201049933402	-0.0684819755948721	0.0448803941313846	0.1091746240341	NaN	NaN	0.122932167064001	0.577478751728944	284	0	716	0.716	0.284	0.568
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.16666666666669	5	29.83333333333333	0.114781984854672	0.189683904532547	0.605122427954751	-0.074901919677875	0.0459603579230573	0.112539662759925	NaN	NaN	0.126369855570114	0.553368666233738	259	0	741	0.741	0.259	0.518
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AAT	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	30.166666666666664	0.115334665090852	0.187302855665743	0.615765652268946	-0.0719681905748906	0.0466477700564759	0.114691571045013	NaN	NaN	0.131298031715529	0.583603686151736	253	0	747	0.747	0.253	0.506
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTACT:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	29.499999999999996	0.115334665090852	0.192126605059278	0.600305538398846	-0.0767919399684257	0.047026978669103	0.121788769544537	NaN	NaN	0.128668460198675	0.5506274101423	258	0	742	0.742	0.258	0.516
ORF3a	all	ss12	220	ACT	GAG	TAC	2	ATTACTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.41666666666666	0.0849965139802523	0.192747196311253	0.440974061396971	-0.107750682331	0.0338317611054433	0.124529230831163	NaN	NaN	0.130282400240062	0.408206011087868	173	0	827	0.827	0.173	0.346
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	ACTACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.195270406950441	0.435275960692929	-0.110273892970189	0.0331495862883723	0.117066980533819	NaN	NaN	0.12694027098299	0.385007450546442	171	0	829	0.829	0.171	0.342
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.195270406950441	0.435275960692929	-0.110273892970189	0.0328494052690525	0.114835411937471	NaN	NaN	0.123761660844763	0.372919403420738	180	0	820	0.82	0.18	0.36
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	5	28.749999999999993	0.0870541284395655	0.197860943283853	0.439976313641024	-0.110806814844288	0.0355568953575849	0.122295526317931	NaN	NaN	0.131415536867026	0.399128367333443	166	0	834	0.834	0.166	0.332
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.33333333333337	5	29.41666666666666	0.0879053734766805	0.192747196311253	0.456065640170085	-0.104841822834572	0.0353390925839965	0.114995778046873	NaN	NaN	0.129960217058075	0.41982641522044	189	0	811	0.811	0.189	0.378
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TGA	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333337	5	30.41666666666666	0.0892139571460239	0.185556129985381	0.480792292623546	-0.0963421728393568	0.037467066573809	0.113262005289015	NaN	NaN	0.125653313736147	0.443242027031839	195	0	805	0.805	0.195	0.39
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.9166666666667	5	30.16666666666666	0.0729614963194685	0.187302855665743	0.389537554353545	-0.114341359346275	0.0324837665541646	0.111167112520916	NaN	NaN	0.116684820517536	0.327127428818609	138	0	862	0.862	0.138	0.276
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAC	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AACAAGCTT:AATAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAT:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	AGA	GCC	2	AAAGATCCA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCA	GCC	A--	1	GAGCCTGAA:GATCCA---	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCA---CCG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	CCG	-CC	ACA	1	---CCGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	2	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AAT	ACA	TGT	2	CCGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80	5	32.16666666666667	0.23261619622788	0.174189200634338	1.33542260588355	0.0584269955935421	0.0586749471862956	0.0856818466152449	NaN	NaN	0.0978813257204891	0.55056301298692	738	0	262	0.262	0.738	0.524
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.83333333333333	5	32	0.250477612683731	0.175211138386129	1.42957585340112	0.0752664742976026	0.064951732420848	0.0932851820115999	NaN	NaN	0.0974867862554712	0.440073873107703	804	0	196	0.196	0.804	0.392
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79	5	32.5	0.253621069659043	0.172180831233375	1.47299248030278	0.0814402384256683	0.0627709270317318	0.0875849901107619	NaN	NaN	0.0979077846210966	0.4055187119143	795	0	205	0.205	0.795	0.41
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.83333333333333	5	32	0.254259343604678	0.175211138386129	1.4511597033537	0.0790482052185496	0.0642108342667258	0.0879533509078145	NaN	NaN	0.0999866612854359	0.429184739781631	788	0	212	0.212	0.788	0.424
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.33333333333333	5	31.500000000000004	0.256193776295553	0.178350531835637	1.43646208205117	0.0778432444599154	0.0645291326747542	0.0892604643463709	NaN	NaN	0.100816541341038	0.440038796043602	789	0	211	0.211	0.789	0.422
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGAATTTTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.83333333333333	5	31.500000000000004	0.254259343604678	0.178350531835637	1.42561584194768	0.075908811769041	0.0626819195919105	0.0907438073030709	NaN	NaN	0.10358504953185	0.46367048398157	776	0	224	0.224	0.776	0.448
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTTACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.33333333333333	5	32.16666666666667	0.260153207881584	0.174189200634338	1.49350939630123	0.0859640072472462	0.0663779523576048	0.0879062489692315	NaN	NaN	0.0985150200219785	0.38288224320719	823	0	177	0.177	0.823	0.354
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.66666666666666	5	31.833333333333336	0.25881973474884	0.176245193423779	1.46852081308403	0.0825745413250609	0.0638591480594712	0.0842530558311959	NaN	NaN	0.0978301888064006	0.398635923082055	811	0	189	0.189	0.811	0.378
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACTCTTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.33333333333333	5	32.16666666666667	0.260153207881584	0.174189200634338	1.49350939630123	0.0859640072472462	0.0636413807199793	0.0861924670110345	NaN	NaN	0.100672490603584	0.393161679198465	806	0	194	0.194	0.806	0.388
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGATCA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.16666666666666	5	32.16666666666667	0.260825162391735	0.174189200634338	1.49736700921699	0.086635961757398	0.0656718651740685	0.0842497875012454	NaN	NaN	0.0958424682648836	0.366026548043094	817	0	183	0.183	0.817	0.366
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGATCAATT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.49999999999999	5	32.5	0.259484741116488	0.172180831233375	1.50704778956945	0.0873039098831133	0.0642261884135126	0.0832941160791045	NaN	NaN	0.0983718712071348	0.374815925055948	797	0	203	0.203	0.797	0.406
ORF3a	all	ss12	13	ATT	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATTACT	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.16666666666666	5	32.16666666666667	0.239040218372072	0.174189200634338	1.37230217201508	0.0648510177377344	0.0622478958931238	0.0851328192620243	NaN	NaN	0.0959960416740665	0.499320495989329	778	0	222	0.222	0.778	0.444
ORF3a	all	ss12	14	ACT	AAC	TGC	2	ATTACTGCA:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.41666666666666	5	32.083333333333336	0.220826439413092	0.174698668260279	1.26404191635902	0.0461277711528129	0.0582348029860904	0.0874656276116521	NaN	NaN	0.0951286792840491	0.627748217764006	706	0	294	0.294	0.706	0.588
ORF3a	all	ss12	15	GCA	TGC	ACA	2	ACTGCACAG:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.66666666666666	5	31.833333333333336	0.237252996159118	0.176245193423779	1.34615300168014	0.0610078027353386	0.061693278227506	0.0913934659273052	NaN	NaN	0.0958772197941363	0.524573239651565	731	0	269	0.269	0.731	0.538
ORF3a	all	ss12	16	AAG	ACA	GCA	2	GCACAGCCA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.08333333333333	4	32.333333333333336	0.221923403608424	0.135196367873208	1.64148939131672	0.0867270357352156	0.060276725567868	0.0739993858401837	NaN	NaN	0.0896064469511905	0.333111283520473	836	0	164	0.164	0.836	0.328
ORF3a	all	ss12	17	CAA	GCA	AGG	2	AAGCAAGGT:CAGCCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.16666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.25	4	32	0.204399702385691	0.136741167595466	1.49479272394679	0.0676585347902254	0.0602160346419867	0.074683250301813	NaN	NaN	0.0917194350229137	0.460715940010581	778	2	220	0.22	0.778	0.44
ORF3a	all	ss12	18	GGA	AGG	AAA	2	CAAGGTGAA:CCAGGAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.25	3	31.166666666666664	0.201440688758903	0.103018812035868	1.95537770993483	0.0984218767230349	0.0573770776699892	0.0645176073851615	NaN	NaN	0.0784276946981524	0.209501349434581	906	0	94	0.094	0.906	0.188
ORF3a	all	ss12	19	AAA	AAA	AAT	2	GGAAAAATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.41666666666666	3	31.166666666666664	0.200955878734158	0.103018812035868	1.95067167600604	0.0979370666982898	0.0589742853458411	0.0644685421379389	NaN	NaN	0.0775529010675681	0.206645939522795	907	0	93	0.093	0.907	0.186
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAAATTGAC:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.08333333333333	3	30.833333333333332	0.182931885877799	0.104213595070396	1.75535529461611	0.0787182908074028	0.0542409933150809	0.0659604825530734	NaN	NaN	0.0738851736793384	0.286688670796047	852	0	148	0.148	0.852	0.296
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	CAA	2	ATCAAGGAT:ATTGACAAT	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.25	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.58333333333333	3	31.499999999999996	0.184234616510935	0.101851155869296	1.80886132256918	0.0823834606416383	0.0550576248835396	0.0617668151302736	NaN	NaN	0.0761443838689496	0.279280321945191	863	0	137	0.137	0.863	0.274
ORF3a	all	ss12	22	AAT	CAA	TGC	2	AAGGATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.83333333333333	3	32.166666666666664	0.156594789439853	0.0995936054863591	1.57233778890856	0.0570011839534941	0.0475006060464771	0.0616395571970369	NaN	NaN	0.07001333015517	0.415560406051829	802	1	197	0.197	0.802	0.394
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.5	3	31.833333333333332	0.141595553474679	0.100709711722406	1.40597715009819	0.0408858417522729	0.0462715063849972	0.0656325258536376	NaN	NaN	0.06547016459484	0.532302038404517	748	1	251	0.251	0.748	0.502
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77	3	32.33333333333333	0.142608211856373	0.0990447915097998	1.43983554998208	0.0435634203465729	0.0449238759065916	0.0611326534680077	NaN	NaN	0.0668866781903419	0.514851624491068	767	1	232	0.232	0.767	0.464
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77	4	32.33333333333333	0.127063613968535	0.135196367873208	0.939844878730025	-0.00813275390467302	0.0440673074667784	0.0750224014545123	NaN	NaN	0.0779432470466052	0.916897952471694	489	0	511	0.511	0.489	0.978
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.33333333333333	4	31.666666666666664	0.12471051706475	0.138321779350139	0.901597113995079	-0.0136112622853896	0.0426205150091265	0.0738972892362427	NaN	NaN	0.0809352207723416	0.866445787429281	449	1	550	0.55	0.449	0.898
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.08333333333333	4	31.916666666666664	0.110163273884948	0.137132914796851	0.803332110661718	-0.0269696409119032	0.0399751818643427	0.0744671938358009	NaN	NaN	0.0798600793983828	0.735580855793055	381	0	619	0.619	0.381	0.762
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.33333333333333	3	32.33333333333333	0.111315003838705	0.0990447915097998	1.12388548798844	0.0122702123289052	0.041353627701045	0.0591664353133627	NaN	NaN	0.0676513019933072	0.856073734416601	588	0	412	0.412	0.588	0.824
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.33333333333333	2	32.666666666666664	0.111315003838705	0.0638683562552301	1.74288192722338	0.0474466475834749	0.0401372781042401	0.0494747628178392	NaN	NaN	0.0642047207446909	0.459913060195156	769	0	231	0.231	0.769	0.462
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.5	2	33.166666666666664	0.11105698371059	0.0628640039123036	1.76662281749532	0.0481929797982868	0.0403691562268622	0.0448028132683114	NaN	NaN	0.0640246484339403	0.45161493678394	767	0	233	0.233	0.767	0.466
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACA:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.91666666666667	1	32.58333333333333	0.125436421140775	0.0313361505112163	4.00293013322989	0.0941002706295586	0.0438849788957951	0.0331793736800033	NaN	NaN	0.0591999747252347	0.111940272922944	936	0	64	0.064	0.936	0.128
ORF3a	all	ss12	32	ACA	TAC	AGC	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.33333333333334	1	32.166666666666664	0.123002232202702	0.0317507728699206	3.87399175152772	0.0912514593327818	0.0414819981295283	0.0340567321521568	NaN	NaN	0.0557080212552876	0.101415251279872	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	33	GCA	AGC	AAC	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.66666666666667	1	31.499999999999996	0.120796168025329	0.0324374878453625	3.72396803973212	0.0883586801799665	0.0404860356760404	0.0342676559461322	NaN	NaN	0.0549334125007978	0.107732543714566	950	1	49	0.049	0.95	0.098
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.41666666666667	1	32.08333333333333	0.121203743914918	0.0318350176854428	3.80724600540559	0.0893687262294755	0.0415613449491316	0.0327267671338684	NaN	NaN	0.0545184049135448	0.101163377355592	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCA:ACGATACCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80	1	32.5	0.121889197123331	0.0314182062818701	3.87957211910177	0.0904709908414611	0.0415883148050484	0.0343830681672523	NaN	NaN	0.0527720208668725	0.0864600244724103	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	36	CCA	ACC	ACT	2	ATACCACTA:ATACCGATA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79	1	33.166666666666664	0.123566424807041	0.0307735475083969	4.01534547725852	0.0927928772986446	0.0428530627743426	0.033106094416092	NaN	NaN	0.0541308840327979	0.0864861813593515	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	37	ATA	ACT	ACA	2	CCACTACAA:CCGATACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79	1	33.166666666666664	0.123566424807041	0.0307735475083969	4.01534547725852	0.0927928772986446	0.042250873958624	0.0319006477239774	NaN	NaN	0.0553523344820962	0.0936590776010468	958	1	41	0.041	0.958	0.082
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.5	1	33.33333333333333	0.108051673445481	0.0306164958901914	3.52919791451699	0.07743517755529	0.0380285472436886	0.0339747122863516	NaN	NaN	0.0520144511358959	0.136559982383108	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.33333333333333	1	32.83333333333333	0.10829587866142	0.0310925352587596	3.48301860109366	0.077203343402660607	0.0427793419802248	0.0311580753409502	NaN	NaN	0.0524692697973707	0.141182665275383	930	0	70	0.07	0.93	0.14
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.99999999999999	1	33.166666666666664	0.108787621497542	0.0307735475083969	3.53510174502496	0.0780140739891454	0.0402320894496896	0.0319296573661973	NaN	NaN	0.0532678057069912	0.143040097553595	927	1	72	0.072	0.927	0.144
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.83333333333331	1	32.5	0.12216555897624	0.0314182062818701	3.88836835178385	0.0907473526943701	0.041701673911716	0.0332512678103512	NaN	NaN	0.0545122851932015	0.0959698711488224	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.16666666666664	1	32.166666666666664	0.12161408554722	0.0317507728699206	3.83027166127449	0.089863312677299	0.0428234098791177	0.0331385318927213	NaN	NaN	0.0534094281637599	0.0924648520578791	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.16666666666664	1	32.166666666666664	0.12161408554722	0.0317507728699206	3.83027166127449	0.089863312677299	0.0397872564121053	0.032856456380976	NaN	NaN	0.0520947836195936	0.0845281265690045	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.83333333333331	1	32.5	0.12216555897624	0.0314182062818701	3.88836835178385	0.0907473526943701	0.0396478638488539	0.0326154662586895	NaN	NaN	0.0536672040373338	0.090850644828462307	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.83333333333331	1	32.5	0.12216555897624	0.0314182062818701	3.88836835178385	0.0907473526943701	0.0413694966459928	0.032036986721144	NaN	NaN	0.05364005582184	0.0906872916147774	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.66666666666664	1	33	0.12413582885818	0.0309322189005369	4.01315629044723	0.0932036099576432	0.0431559422451643	0.0321733146483258	NaN	NaN	0.0566017169457502	0.0996285798760232	950	1	49	0.049	0.95	0.098
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TAT	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.66666666666664	1	33	0.12413582885818	0.0309322189005369	4.01315629044723	0.0932036099576432	0.040704541329312303	0.0332332080971365	NaN	NaN	0.0532215247046951	0.0799047493734852	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	48	ATT	TAT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.49999999999997	1	33	0.109533681430367	0.0309322189005369	3.54108710346887	0.0786014625298302	0.0404080154906501	0.0320816792047053	NaN	NaN	0.0534311768342222	0.141269852977109	928	0	72	0.072	0.928	0.144
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.3333333333333	1	33	0.0951500406590925	0.0309322189005369	3.07608196376242	0.0642178217585556	0.0366830869574189	0.033280190908553	NA	NA	0.0479473607905495	0.180459988356117	908	1	91	0.091	0.908	0.182
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.8333333333333	1	33.5	0.095802032379497	0.0304610393656427	3.14506774471895	0.0653409930138543	0.0348968460605969	0.0324694724084121	NA	NA	0.0507074506861359	0.197541490872969	903	0	97	0.097	0.903	0.194
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.66666666666664	1	32.666666666666664	0.0947202939932191	0.0312545223004261	3.03061083713725	0.063465771692793	0.0363189558849247	0.0344699894363114	NaN	NaN	0.0487600672509994	0.193055487519778	910	0	90	0.09	0.91	0.18
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.16666666666664	1	33.166666666666664	0.108541192153805	0.0307735475083969	3.52709391480421	0.0777676446454081	0.0387559759497361	0.0320136194771666	NaN	NaN	0.0500447785593845	0.120193669581415	939	1	60	0.06	0.939	0.12
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.3333333333333	1	33.33333333333333	0.0938723572155045	0.0306164958901914	3.06607123010372	0.0632558613253132	0.0348171341369061	0.0321656572952915	NaN	NaN	0.048364736214129	0.190909874972001	911	0	89	0.089	0.911	0.178
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.66666666666664	1	33	0.0934540638415832	0.0309322189005369	3.02125315167614	0.0625218449410463	0.0338937477353872	0.0312227185160835	NaN	NaN	0.0479911662700433	0.192650497285488	907	0	93	0.093	0.907	0.186
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.49999999999997	2	33.5	0.0936627429044699	0.0622118122355632	1.50554596528741	0.0314509306689067	0.0361193416028784	0.0447163129776047	NaN	NaN	0.059364509787965	0.596255121123326	740	0	260	0.26	0.74	0.52
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.16666666666664	2	33.5	0.0928335758860083	0.0622118122355632	1.4922178369358	0.0306217636504451	0.0357869709257036	0.0460431607905888	NaN	NaN	0.0590998413274885	0.604363286707614	735	0	265	0.265	0.735	0.53
ORF3a	all	ss12	57	CAG	TCA	GAG	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.24999999999997	2	33.916666666666664	0.10841839640124	0.0614153696041381	1.76533003220639	0.0470030267971023	0.0369552113090307	0.0444431158633422	NaN	NaN	0.0618601596472377	0.447357931240206	766	0	234	0.234	0.766	0.468
ORF3a	all	ss12	58	AGC	GAG	CGC	2	CAGAGCGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.74999999999997	2	33.916666666666664	0.107687427238245	0.0614153696041381	1.75342797629258	0.0462720576341064	0.0376313347356029	0.0454298113818157	NaN	NaN	0.0618448434917238	0.454342010530383	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TAC	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.41666666666664	2	34.58333333333333	0.109659022528177	0.0601826482875393	1.82210364030925	0.0494763742406376	0.037643712627052	0.0446049922872084	NaN	NaN	0.0595551180491828	0.406105766610875	789	0	211	0.211	0.789	0.422
ORF3a	all	ss12	60	ACC	TAC	CAA	2	GCTACCAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.74999999999997	2	34.25	0.109159374475305	0.0607927570603562	1.79559835338492	0.0483666174149487	0.0401028830813971	0.0437750906603066	NaN	NaN	0.0602828427737971	0.422363204288761	798	0	202	0.202	0.798	0.404
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	ACCAAAATA:TCCAAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.91666666666664	2	34.08333333333333	0.0944005262514171	0.0611024764460933	1.5449541776707	0.0332980498053238	0.0346269763518003	0.0448965075546512	NaN	NaN	0.058978417507061	0.572359300652497	716	1	283	0.283	0.716	0.566
ORF3a	all	ss12	62	ATA	AAT	AAT	2	AAAATAATT:AAAATCATA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.91666666666664	2	34.75	0.095692746458713	0.0598821656332629	1.59801746391013	0.0358105808254501	0.0352170996930437	0.0452732339917546	NaN	NaN	0.0585484361178415	0.540775793536369	740	0	260	0.26	0.74	0.52
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATAATTGCG:ATCATAACC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.74999999999997	2	34.75	0.110672192571585	0.0598821656332629	1.84816616769301	0.0507900269383225	0.0390784765459469	0.0431943942819378	NaN	NaN	0.0611204669135435	0.405983621433453	797	0	203	0.203	0.797	0.406
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTC	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.91666666666664	2	35.25	0.11196533988639	0.0589984642956841	1.89776702195587	0.0529668755907061	0.0392006481425964	0.0435404617415763	NaN	NaN	0.0625239332961264	0.396913965549766	799	0	201	0.201	0.799	0.402
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.33333333333331	2	35.5	0.0964630333665702	0.0585663277285774	1.64707327756015	0.0378967056379928	0.0361726633664643	0.0420993051016012	NaN	NaN	0.0560812597427858	0.499201713209204	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTCAATAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.33333333333331	2	35.5	0.0964630333665702	0.0585663277285774	1.64707327756015	0.0378967056379928	0.035286246610934	0.0421759522816476	NaN	NaN	0.0558220482233673	0.497211247948893	756	0	244	0.244	0.756	0.488
ORF3a	all	ss12	67	AAA	AAA	AAG	2	AAAAAGAGA:AATAAAAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.74999999999997	2	36.166666666666664	0.0972458393976114	0.0574443341110379	1.6928708618963	0.0398015052865736	0.0353439723215752	0.0404824347419434	NaN	NaN	0.0568746386738684	0.484045261639382	757	0	243	0.243	0.757	0.486
ORF3a	all	ss12	68	AGA	AAG	ATG	2	AAAAGATGG:AAGAGATGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.99999999999997	2	36	0.111834664347976	0.0577207808520962	1.93751128617856	0.0541138834958796	0.0375953459411377	0.0407896044981089	NaN	NaN	0.0605090006484431	0.371155351543438	827	0	173	0.173	0.827	0.346
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGATGGCAG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.99999999999997	2	36.333333333333336	0.111834664347976	0.0571705240409132	1.95615951093859	0.0546641403070627	0.0374517828392282	0.040879205365177	NaN	NaN	0.0581627082057404	0.347295221938894	844	0	156	0.156	0.844	0.312
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.3333333333333	2	36.666666666666664	0.112888706112188	0.0566306643811089	1.99342012575516	0.0562580417310796	0.0387216400057045	0.040407526241083	NaN	NaN	0.0579815894330799	0.331909821575733	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTAGCC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.99999999999997	3	36.666666666666664	0.128887692694994	0.0866346653413833	1.48771501785242	0.0422530273536112	0.0412002897302051	0.0514877871880757	NaN	NaN	0.0611182173610869	0.48935643398002	757	0	243	0.243	0.757	0.486
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTAGCCCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.0833333333333	3	35.916666666666664	0.158291065496404	0.0885548256923263	1.78749225983877	0.069736239804078	0.0515725901648751	0.0540751643461063	NaN	NaN	0.0727219476891752	0.337587203800238	849	0	151	0.151	0.849	0.302
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCCCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.24999999999996	3	35.916666666666664	0.15791093535129	0.0885548256923263	1.78319966322258	0.069356109658964	0.0509164229680778	0.0522096963169454	NaN	NaN	0.0722127586309918	0.336833203300898	837	0	163	0.163	0.837	0.326
ORF3a	all	ss12	74	TAT	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTTTATAAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.24999999999996	3	35.25	0.155668085942854	0.0903346148069003	1.7232384980620301	0.0653334711359542	0.0499817008847562	0.0543396691002577	NaN	NaN	0.0711610658463748	0.358562861841575	821	0	179	0.179	0.821	0.358
ORF3a	all	ss12	75	AAG	CAA	GGG	2	TATAAGGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.5833333333333	2	35.25	0.154934610949651	0.0589984642956841	2.62607870898404	0.0959361466539669	0.0519198777956704	0.0434137708570585	NaN	NaN	0.0611813964956155	0.116866954734177	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	76	GGC	GGG	CTT	2	AAGGGCTTC:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.91666666666664	2	35.25	0.154208039717062	0.0589984642956841	2.61376362178197	0.0952095754213774	0.0504092031633436	0.0430415561673529	NaN	NaN	0.0599694633559138	0.112369063246431	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	77	GTT	CTT	CCA	2	GGCTTCCAG:GGTGTTCAC	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.83333333333331	2	34.583333333333336	0.152244778069162	0.0601826482875392	2.52971217454192	0.092062129781623	0.0492793101791346	0.040950205146812003	NaN	NaN	0.0603219390984999	0.126965072743793	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	78	CAC	CCA	CTT	2	GTTCACTTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.99999999999999	2	34.333333333333336	0.167357663485657	0.0606390724718212	2.75989814262789	0.106718591013836	0.0563401241425592	0.0425497765100373	NaN	NaN	0.0664596978032472	0.108325770537673	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	79	TTC	CTT	CAT	2	CACTTTGTT:CAGTTCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.33333333333331	2	33.333333333333336	0.149138144058874	0.0625362067042883	2.38482875630906	0.0866019373545856	0.0539468395641389	0.0443981857459864	NaN	NaN	0.0668591579806313	0.195220524180531	917	0	83	0.083	0.917	0.166
ORF3a	all	ss12	80	ATT	CAT	TTG	2	TTCATTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.75	0.5	0.416666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.66666666666664	2	33.333333333333336	0.150503021596613	0.0625362067042883	2.40665415330177	0.0879668148923252	0.0550416023211573	0.0456744432389211	NaN	NaN	0.0681991863497674	0.19710226323273	925	0	75	0.075	0.925	0.15
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	ATTTGCAAT:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.08333333333331	2	33.25	0.134739729478646	0.0626996766264699	2.14897008610349	0.072040052852176	0.0512298145308077	0.0441737729534605	NaN	NaN	0.0647111113675933	0.265598366062941	869	0	131	0.131	0.869	0.262
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAATTTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.91666666666664	2	33.416666666666664	0.135043810631934	0.062373587449531503	2.16508006279424	0.0726702231824025	0.0517186204881385	0.0451495985323061	NaN	NaN	0.0640892579649418	0.256840335761171	864	0	136	0.136	0.864	0.272
ORF3a	all	ss12	83	TTA	CTT	ATT	2	AACTTGCTG:AATTTATTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.91666666666664	2	33.416666666666664	0.135043810631934	0.062373587449531503	2.16508006279424	0.0726702231824025	0.0523227056520307	0.0431454783911893	NaN	NaN	0.0637525341767827	0.254336399556229	893	0	107	0.107	0.893	0.214
ORF3a	all	ss12	84	CTG	ATT	GCT	2	TTATTGCTG:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.83333333333331	2	32.916666666666664	0.133388184973715	0.0633621979772033	2.10516978943353	0.0700259869965112	0.0500022563552207	0.0449948633982734	NaN	NaN	0.065074305263784	0.281885785389006	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	85	CTG	GCT	GCT	2	CTGTTGTTG:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.24999999999999	3	32.833333333333336	0.162245943584362	0.0974341006801572	1.66518644347075	0.0648118429042051	0.0586800268258578	0.0560191446186578	NaN	NaN	0.0627734634801783	0.301851061564249	875	0	125	0.125	0.875	0.25
ORF3a	all	ss12	86	CTA	GCT	ATT	2	CTGCTATTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.74999999999999	3	32.333333333333336	0.16115228773261	0.0990447915097998	1.62706473784303	0.0621074962228102	0.0609273292541859	0.0611015946553745	NaN	NaN	0.0681005856971919	0.361770556779978	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	87	TTT	ATT	TGT	2	CTATTTGTT:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.91666666666664	3	31.666666666666664	0.158657084608275	0.101277212852957	1.56656250837616	0.0573798717553175	0.0568303087752099	0.0624585058615058	NaN	NaN	0.0655569599804887	0.381428412434611	830	0	170	0.17	0.83	0.34
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.41666666666664	3	31.166666666666664	0.157611296097191	0.103018812035868	1.52992733057643	0.0545924840613231	0.0588015603190686	0.0634648338389034	NaN	NaN	0.0676884883875255	0.419939977933887	794	0	206	0.206	0.794	0.412
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	GTAACAGTT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.91666666666664	3	31.666666666666664	0.158657084608275	0.101277212852957	1.56656250837616	0.0573798717553175	0.0578988645229533	0.0598269743322528	NaN	NaN	0.0674052692041327	0.394621130543256	810	0	190	0.19	0.81	0.38
ORF3a	all	ss12	90	ATC	AGT	CTA	2	ACAGTTTAC:ACCATCTAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.91666666666664	3	32	0.158657084608275	0.100148544468392	1.58421757850259	0.0585085401398827	0.0582497427447518	0.0589859929257831	NaN	NaN	0.0664513817377972	0.378603999881229	813	0	187	0.187	0.813	0.374
ORF3a	all	ss12	91	TAC	CTA	CTC	2	ATCTATTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.08333333333331	3	32.666666666666664	0.145670745382058	0.0979651368127982	1.48696516047765	0.0477056085692595	0.057506414055374	0.060154402496588	NaN	NaN	0.06352516497021	0.452669617084006	781	0	219	0.219	0.781	0.438
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.41666666666666	3	32.33333333333333	0.145028544735405	0.0990447915097998	1.46427230068989	0.045983753225605	0.0579272220008279	0.0580028975033526	NaN	NaN	0.0678815742228874	0.498144957986209	761	0	239	0.239	0.761	0.478
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCACATCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.08333333333333	3	31.333333333333332	0.145670745382058	0.102431651254313	1.42212630176577	0.0432390941277445	0.0579621110219466	0.0621711330630605	NA	NA	0.0618197660230968	0.48427834062772	775	0	225	0.225	0.775	0.45
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TTT	2	CACCTTTTG:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.91666666666666	3	30.833333333333332	0.145993989979143	0.104213595070396	1.4009111755575	0.0417803949087462	0.0591138198366953	0.0623914731735566	NaN	NaN	0.0643122849435173	0.5159191417653	745	1	254	0.254	0.745	0.508
ORF3a	all	ss12	95	TTG	TTT	GCT	2	CTTTTGCTC:CTTTTGCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.24999999999999	3	30.166666666666664	0.143447620627212	0.106688419438138	1.3445472468583	0.0367592011890736	0.0561064116411765	0.0678037195112271	NaN	NaN	0.0677692087667041	0.587530963422418	724	0	276	0.276	0.724	0.552
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	TTGCTCGTT:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.41666666666666	3	30.666666666666664	0.145028544735405	0.104821456781369	1.38357688576965	0.0402070879540357	0.0573028543832079	0.063727540782596	NaN	NaN	0.0641873216411149	0.531051080433277	751	0	249	0.249	0.751	0.498
ORF3a	all	ss12	97	GTC	CGT	CGC	2	CTCGTTGCT:CTTGTCGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.41666666666666	3	30.333333333333332	0.143135575319406	0.106058740537371	1.34958773406299	0.0370768347820347	0.0578561325669514	0.0630869033316323	NaN	NaN	0.0644448330568946	0.565070350015767	716	1	283	0.283	0.716	0.566
ORF3a	all	ss12	98	GCT	CGC	TGC	2	GTCGCTGCA:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.41666666666666	3	30.333333333333332	0.157611296097191	0.106058740537371	1.48607550210965	0.05155255555982	0.059525031454569	0.0625645931179137	NaN	NaN	0.0675547494113962	0.445390286993225	783	1	216	0.216	0.783	0.432
ORF3a	all	ss12	99	GCA	TGC	AGG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.5	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.33333333333333	3	29.916666666666664	0.155729523583683	0.107647107231784	1.44666705486446	0.0480824163518998	0.0560621118324525	0.0602368380360506	NaN	NaN	0.0712153458168362	0.499568198566713	766	0	234	0.234	0.766	0.468
ORF3a	all	ss12	100	GGC	AGG	CCT	2	GCAGGTATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.83333333333333	3	30.416666666666664	0.154721985556199	0.105746684778908	1.46313793079837	0.0489753007772906	0.0579068023993994	0.061148166323833	NaN	NaN	0.0707579847478537	0.48884170026305	780	0	220	0.22	0.78	0.44
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CCT	GGA	2	GGCCTTGAA:GGTATGGAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.66666666666667	3	31.249999999999996	0.155056374697807	0.102724391304868	1.50944067643707	0.0523319833929385	0.0553954761331863	0.0597645799548445	NaN	NaN	0.065276208367478	0.422726097943632	790	1	209	0.209	0.79	0.418
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAGGCG:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85	3	30.916666666666664	0.14205405876177	0.103912304538584	1.36705714874241	0.0381417542231858	0.0581576288766535	0.06434020298476	NaN	NaN	0.0671838978129068	0.57022397921611	704	2	294	0.294	0.704	0.588
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CCC	2	GAAGCCCCT:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85	3	30.916666666666664	0.156408563919793	0.103912304538584	1.50519772046549	0.0524962593812088	0.0587676330217656	0.0627836834176594	NaN	NaN	0.0681025595530497	0.440801057619962	789	0	211	0.211	0.789	0.422
ORF3a	all	ss12	104	CAA	CCC	ATT	2	GCCCCTTTT:GCGCAATTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.91666666666667	4	30.583333333333332	0.154555333162315	0.143721781908901	1.07537863161397	0.010833551253414401	0.0568269264367826	0.0784180750055288	NaN	NaN	0.0842301442771788	0.897659560444662	578	0	422	0.422	0.578	0.844
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.91666666666667	3	30.249999999999996	0.154555333162315	0.106372646579413	1.45296124645099	0.048182686582902	0.0565398138557916	0.0660723891748755	NaN	NaN	0.0754227799643999	0.522930492850816	749	0	251	0.251	0.749	0.502
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.41666666666667	3	30.749999999999996	0.155560687054249	0.104516640682884	1.48838200345761	0.0510440463713658	0.0548095434660006	0.066637596231014	NaN	NaN	0.0736047137174798	0.488002836914274	777	1	222	0.222	0.777	0.444
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CCT	2	CTCTATCTT:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85	3	30.999999999999996	0.14205405876177	0.103612753860613	1.37100939284821	0.0384413049011569	0.0557941993081028	0.0655844508576474	NaN	NaN	0.0671123120821553	0.566786450183847	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	108	CTC	CCT	CTA	2	TACCTCTAT:TATCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.83333333333333	3	30.666666666666664	0.140537165576334	0.104821456781369	1.34072898709525	0.0357157087949646	0.0553141143273431	0.0670722733602896	NaN	NaN	0.0677285537904286	0.597960236198725	694	0	306	0.306	0.694	0.612
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	CTCTATGCC:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	86.16666666666666	3	30.666666666666664	0.139939466685309	0.104821456781369	1.33502692084491	0.0351180099039401	0.0531593193408246	0.0658375093185565	NaN	NaN	0.0682103793057932	0.60665890698678	728	1	271	0.271	0.728	0.542
ORF3a	all	ss12	110	GCC	TGC	CTT	2	TATGCCTTA:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.83333333333333	3	30.999999999999996	0.140537165576334	0.103612753860613	1.3563693690199	0.0369244117157208	0.0547676974690873	0.0636016267599517	NaN	NaN	0.0678591699477042	0.586349973542581	710	0	290	0.29	0.71	0.58
ORF3a	all	ss12	111	TTA	CTT	AAT	2	GCCTTAATA:GCTTTAGTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.83333333333333	3	30.999999999999996	0.140537165576334	0.103612753860613	1.3563693690199	0.0369244117157208	0.0543606617561028	0.063490208731063	NaN	NaN	0.0672279170050739	0.582839220227293	718	1	281	0.281	0.718	0.562
ORF3a	all	ss12	112	ATA	AAT	ATA	2	TTAATATAT:TTAGTCTAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	87.16666666666667	3	30.333333333333332	0.138176574732179	0.106058740537371	1.30283062039088	0.0321178341948076	0.0566045738790351	0.0702564623505932	NaN	NaN	0.0663112118672785	0.628137510381729	720	2	278	0.278	0.72	0.556
ORF3a	all	ss12	113	TAC	ATA	CTT	2	ATATATTTT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.66666666666667	3	30.333333333333332	0.123736695538234	0.106058740537371	1.16668079322169	0.0176779550008629	0.0523209060429842	0.0665379875723643	NaN	NaN	0.0704572419099588	0.801888867527787	637	0	363	0.363	0.637	0.726
ORF3a	all	ss12	114	TTC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATTTTCTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	88	3	29.999999999999996	0.123227288468457	0.107325632730505	1.14816270198827	0.0159016557379522	0.0526106255115314	0.0677786261346635	NaN	NaN	0.0689477048836187	0.817599480803497	591	1	408	0.408	0.591	0.816
ORF3a	all	ss12	115	CTA	CTT	ACA	2	TTCTTGCAG:TTTCTACAA	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.66666666666667	3	29.666666666666664	0.123736695538234	0.108623210908842	1.13913678764363	0.0151134846293923	0.0533324661725006	0.0667691323832983	NaN	NaN	0.0731303056358365	0.836271386257759	616	0	384	0.384	0.616	0.768
ORF3a	all	ss12	116	CAA	ACA	ATG	2	CTACAATGC:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	88.66666666666667	3	28.999999999999996	0.149250934494458	0.111315003838705	1.34079799979814	0.0379359306557525	0.0588989462125729	0.0731518903627578	NaN	NaN	0.0771355230798764	0.622854500172167	709	0	291	0.291	0.709	0.582
ORF3a	all	ss12	117	AGT	ATG	CAT	2	CAATGCATC:CAGAGTATA	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.416666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	88.08333333333334	3	28.999999999999996	0.164348099669168	0.111315003838705	1.47642360869257	0.0530330958304627	0.0592662772528233	0.0727564711775515	NaN	NaN	0.0802365701339666	0.508638506101125	761	0	239	0.239	0.761	0.478
ORF3a	all	ss12	118	ATA	CAT	AAA	2	AGTATAAAC:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	87.66666666666667	3	29.16666666666666	0.151137003037576	0.110629602831442	1.36615335470246	0.0405074002061339	0.0613197382113023	0.0673796352503725	NaN	NaN	0.0770020200707813	0.598849068266821	724	1	275	0.275	0.724	0.55
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CGC	2	ATAAACTTT:ATCAACGCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	87.33333333333334	3	28.999999999999996	0.151776366554434	0.111315003838705	1.36348525643818	0.040461362715729	0.0607311556492381	0.0731536767920835	NaN	NaN	0.0770134267412221	0.599318615638888	743	0	257	0.257	0.743	0.514
ORF3a	all	ss12	120	GCA	CGC	ATG	2	AACGCATGT:AACTTTGTA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	86.5	3	29.33333333333333	0.167719022201393	0.109952605643907	1.52537560359933	0.0577664165574862	0.0610229140111088	0.0707130079354775	NaN	NaN	0.0777644902253551	0.457579780309361	785	0	215	0.215	0.785	0.43
ORF3a	all	ss12	121	GTA	ATG	AAG	2	GCATGTAGA:TTTGTAAGA	1:1	TRUE	1.75	1	0.25	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	86.16666666666667	2	29.33333333333333	0.154057530619536	0.0714826348532437	2.15517420329876	0.082574895766292	0.0598230344512541	0.0545249062206379	NaN	NaN	0.0712847789336751	0.24670880528061	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.66666666666667	2	29.83333333333333	0.140837939389346	0.0702267037754945	2.0054755786287	0.0706112356138515	0.0565004694595032	0.0516242891540848	NaN	NaN	0.0670209289311347	0.292079860838401	865	0	135	0.135	0.865	0.27
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGAATTATC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.50000000000001	2	29.83333333333333	0.141140007184765	0.0702267037754945	2.00977690247246	0.07091330340927	0.0546705515972352	0.0547709533990607	NaN	NaN	0.0653032184865805	0.277519588568646	872	0	128	0.128	0.872	0.256
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:ATTATCATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.00000000000001	2	29.666666666666664	0.143918255857579	0.0706404112947758	2.03733604065556	0.0732778445628031	0.0577731200676713	0.0545131382858294	NaN	NaN	0.0683420968171826	0.283620693712916	856	0	144	0.144	0.856	0.288
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATCATGAGA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.83333333333334	2	29.499999999999996	0.144233737401781	0.0710590256920247	2.0297736423646	0.073174711709756	0.0580599455334476	0.0577613275226336	NaN	NaN	0.0678138576653932	0.280564330618388	871	0	129	0.129	0.871	0.258
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGT:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83	3	29.499999999999996	0.145832187994725	0.109283858386045	1.33443483922001	0.0365483296086793	0.0585555517231315	0.071422857647122	NaN	NaN	0.0824969488211873	0.657746609932659	682	0	318	0.318	0.682	0.636
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	TTG	2	AGATGTTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.41666666666667	3	29.833333333333332	0.161879739624373	0.107970516691131	1.4992957761558	0.0539092229332416	0.061790594022914	0.0700945703501964	NaN	NaN	0.0809897261560256	0.505647377337635	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.66666666666667	3	29.666666666666664	0.161333534712709	0.108623210908842	1.48525838412291	0.0527103238038671	0.0618501044674447	0.0724804644879034	NaN	NaN	0.0855262840282469	0.537692874353459	745	0	255	0.255	0.745	0.51
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.66666666666667	3	30.666666666666664	0.165809675320019	0.104821456781369	1.5818295262377	0.0609882185386496	0.0624150195456659	0.0671817072524017	NaN	NaN	0.0829355239461141	0.462114757752538	771	1	228	0.228	0.771	0.456
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.5	3	30.333333333333332	0.195087976520146	0.106058740537371	1.83943327567051	0.0890292359827745	0.0728016875361897	0.0665613126674762	NaN	NaN	0.0917102439903275	0.33166454965129	856	0	144	0.144	0.856	0.288
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.66666666666666	4	30.666666666666664	0.213698279309918	0.143291427572032	1.4913542486866	0.0704068517378864	0.0778972652793333	0.0797904708221535	NaN	NaN	0.100326193937724	0.482816775175014	761	0	239	0.239	0.761	0.478
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.16666666666666	4	30.749999999999996	0.232049409879348	0.142863650574837	1.6242718770356	0.0891857593045116	0.0770383643466927	0.0785671555552479	NaN	NaN	0.10153107727389	0.379722083846262	811	0	189	0.189	0.811	0.378
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCCGT:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.16666666666666	4	31.583333333333336	0.252986022490643	0.138722674692595	1.82368183897299	0.114263347798048	0.0820747754282757	0.080164269042007	NaN	NaN	0.104269778477149	0.273147315201927	890	0	110	0.11	0.89	0.22
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CAA	ATC	2	TGCAAATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.24999999999999	4	31.416666666666668	0.252669701240021	0.139531497680893	1.81084346860429	0.113138203559128	0.0796189150696322	0.0826330146499756	NaN	NaN	0.0982630633938964	0.24957561326071	883	0	117	0.117	0.883	0.234
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AAATCCAAG:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.58333333333331	3	31.75	0.220282043117094	0.100992663859693	2.18116875719932	0.119289379257402	0.0734007545761836	0.0648677403575666	NaN	NaN	0.0967361528323657	0.217522920065418	904	0	96	0.096	0.904	0.192
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.74999999999999	3	32.25	0.219740343511106	0.0993184392369987	2.21248285010551	0.120421904274107	0.0722067440909387	0.062062303141196	NaN	NaN	0.0987103652357733	0.222483083923071	896	0	104	0.104	0.896	0.208
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.58333333333331	3	32.25	0.220282043117094	0.0993184392369987	2.21793701964493	0.120963603880096	0.0750393777300983	0.0668641473091269	NaN	NaN	0.0988364117765904	0.220998658979199	886	1	113	0.113	0.886	0.226
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.24999999999999	3	31.916666666666668	0.221373552730839	0.100428343016685	2.2042935896499	0.120945209714155	0.0718912738861737	0.0649050148326575	NaN	NaN	0.0930835382957207	0.193834477188267	906	0	94	0.094	0.906	0.188
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.24999999999999	3	30.916666666666668	0.218131224556612	0.103912304538584	2.0991857078448	0.114218920018028	0.0724567287956879	0.0639210744332789	NaN	NaN	0.100314791531695	0.254867955326147	870	0	130	0.13	0.87	0.26
ORF3a	all	ss12	140	CTT	ACT	TTA	2	TTACTTTAT	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.58333333333333	3	30.25	0.217071598340042	0.106372646579413	2.04067121877978	0.110698951760629	0.0719301526052668	0.0672670142502605	NaN	NaN	0.100428178604472	0.270344379797747	858	0	142	0.142	0.858	0.284
ORF3a	all	ss12	141	TAT	TTA	TGA	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.91666666666666	3	29.916666666666668	0.23290063730458	0.107647107231784	2.16355685994518	0.125253530072796	0.0728181389372417	0.0686603747793092	NaN	NaN	0.104103008739957	0.228910864729776	882	0	118	0.118	0.882	0.236
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.74999999999999	3	29.583333333333336	0.236957742360063	0.108952531416164	2.1748713800412798	0.128005210943899	0.0725687527578306	0.0752015634422522	NaN	NaN	0.102313118786086	0.210893474446358	909	0	91	0.091	0.909	0.182
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.41666666666664	3	29.916666666666668	0.248323576611812	0.107647107231784	2.30683000219529	0.140676469380029	0.073218280770813493	0.0740139149836686	NaN	NaN	0.104359337452238	0.177658128359692	920	0	80	0.08	0.92	0.16
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAC:GCCAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.91666666666664	3	29.416666666666668	0.242952517757944	0.109617210244414	2.21637202056349	0.13333530751353	0.0720014349149856	0.0698291047490729	NaN	NaN	0.100241349109268	0.183471230267509	911	0	89	0.089	0.911	0.178
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.24999999999999	3	30.083333333333336	0.280251250519624	0.107006075844546	2.61902184813096	0.173245174675078	0.0806497061601539	0.0688888719707625	NaN	NaN	0.111993577357777	0.121882386976754	947	1	52	0.052	0.947	0.104
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.41666666666666	3	29.916666666666668	0.279555991798541	0.107647107231784	2.59696706198158	0.171908884566758	0.0826236264115841	0.0692214437200344	NaN	NaN	0.115258031935023	0.135826788816417	938	0	62	0.062	0.938	0.124
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.24999999999999	3	29.416666666666668	0.280251250519624	0.109617210244414	2.55663549450626	0.17063404027521	0.0884101437803783	0.0752526159308997	NaN	NaN	0.108509359212209	0.115828076784202	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.58333333333331	3	29.083333333333336	0.261293864072131	0.110971243090164	2.35460878688933	0.150322620981967	0.0768120730597449	0.0717366484526935	NaN	NaN	0.112829375413385	0.182761498715032	920	0	80	0.08	0.92	0.16
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAC:TGCTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.08333333333331	3	29.583333333333336	0.263223932942835	0.108952531416164	2.41595059354246	0.154271401526671	0.0795086171827989	0.0724495133485309	NaN	NaN	0.111013575174666	0.164631389607305	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	150	CAC	GCA	CAC	2	TGGCACACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.41666666666664	3	28.916666666666668	0.261934035771843	0.11166090491713	2.34579897025051	0.150273130854714	0.0787337245882635	0.071877015838118	NaN	NaN	0.11298995430295	0.183528501935985	913	0	87	0.087	0.913	0.174
ORF3a	all	ss12	151	ACA	CAC	ACA	2	CACACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.99999999999999	4	28.916666666666668	0.263548415128416	0.152908411727716	1.72357041807299	0.1106400034007	0.0824875939036544	0.0835871809742168	NaN	NaN	0.122867247013432	0.367862678513916	826	0	174	0.174	0.826	0.348
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ACA	TAA	2	ACACATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.16666666666664	4	28.75	0.262900256937487	0.153892310773211	1.70833913414245	0.109007946164277	0.0801428884878557	0.0875547853867044	NaN	NaN	0.125797881654557	0.386198240960968	811	1	188	0.188	0.811	0.376
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATTGTTAC:CATAACTAT	1:1	TRUE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.74999999999999	4	28.5	0.247109400847682	0.155392217528976	1.59023022373436	0.0917171833187057	0.0763623876974483	0.089206261682168	NaN	NaN	0.121742404807242	0.451227073131241	801	0	199	0.199	0.801	0.398
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.66666666666664	3	29.166666666666668	0.268852304636067	0.110629602831442	2.43020220406735	0.158222701804625	0.0819993151535733	0.0685537970218868	NaN	NaN	0.11146954918438	0.155775051560997	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666664	3	29.5	0.26683825481505	0.109283858386045	2.44169869874509	0.157554396429004	0.0822044674988095	0.0676911392180825	NaN	NaN	0.110030033580705	0.152166221554149	932	0	68	0.068	0.932	0.136
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.66666666666664	3	28.666666666666668	0.282712453350107	0.112711652287003	2.50828062239938	0.170000801063104	0.0837323843253063	0.0700768516152094	NaN	NaN	0.11062168188934	0.124348050184286	946	0	54	0.054	0.946	0.108
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.99999999999999	3	28.333333333333336	0.281300723192845	0.114143861506444	2.46444022026506	0.167156861686401	0.0806487388496746	0.0729558230305577	NaN	NaN	0.111143926811871	0.132589716765598	933	0	67	0.067	0.933	0.134
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.16666666666664	3	28.333333333333336	0.280600193443143	0.114143861506444	2.45830296732428	0.166456331936699	0.082944370570337	0.0771414143292625	NaN	NaN	0.110937664932946	0.133498080003571	931	0	69	0.069	0.931	0.138
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAT:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.49999999999999	3	27.666666666666668	0.279209669341883	0.117120548066462	2.38395118492308	0.162089121275421	0.0830746741413486	0.0743628494915248	NaN	NaN	0.109115312171131	0.13741548672369	935	0	65	0.065	0.935	0.13
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATATAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.83333333333331	4	27.666666666666668	0.277833015310553	0.160610991304224	1.72985057283092	0.117222024006329	0.0816692245466664	0.0863476583413375	NaN	NaN	0.122485843925833	0.338554598702122	852	0	148	0.148	0.852	0.296
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAATAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.33333333333331	4	27.5	0.293545893158417	0.16169725925912	1.81540425919037	0.131848633899297	0.0813031667420697	0.086245335180493	NaN	NaN	0.125436287370043	0.293203320204799	865	0	135	0.135	0.865	0.27
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.99999999999999	4	27.833333333333336	0.29948343190034	0.159539275483744	1.87717683305422	0.139944156416595	0.0864381091903728	0.0893111438204551	NaN	NaN	0.127860161462611	0.273731600209166	866	0	134	0.134	0.866	0.268
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.99999999999999	4	28.166666666666668	0.304098831081123	0.157438341821211	1.93154239026768	0.146660489259912	0.087300322572222	0.0867596211101877	NaN	NaN	0.128775591178777	0.254751446363156	886	0	114	0.114	0.886	0.228
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.16666666666664	4	28.666666666666668	0.303319610231809	0.154389040653112	1.96464469853998	0.148930569578697	0.0835413434627012	0.0821933211310799	NaN	NaN	0.127500490348707	0.242775139631629	903	0	97	0.097	0.903	0.194
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.33333333333331	4	29.333333333333336	0.307256730483381	0.150503021596613	2.041531972075	0.156753708886768	0.0866949885923861	0.0814865248563602	NaN	NaN	0.125687695289645	0.212335794764121	917	0	83	0.083	0.917	0.166
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.66666666666664	4	30.000000000000004	0.291493492343837	0.146808432844571	1.9855364347663	0.144685059499266	0.0816079758928314	0.0805211230223415	NaN	NaN	0.119319415267449	0.225288121639481	882	0	118	0.118	0.882	0.236
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.66666666666664	4	30.000000000000004	0.272974032901059	0.146808432844571	1.85938932533979	0.126165600056487	0.0778484298106758	0.0805247401330878	NaN	NaN	0.112029279282085	0.260087575752658	872	0	128	0.128	0.872	0.256
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.99999999999997	4	30.333333333333336	0.275793585093988	0.145028544735405	1.90165036543086	0.130765040358583	0.0776869018994224	0.0800957535900043	NaN	NaN	0.115106322400386	0.25594108251305703	878	0	122	0.122	0.878	0.244
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT:GTCGTTACT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.16666666666664	4	30.833333333333336	0.275083189587407	0.142438427764417	1.93124281069975	0.132644761822989	0.0799594560479178	0.0803081450196864	NaN	NaN	0.110677492853297	0.230730203865874	886	0	114	0.114	0.886	0.228
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TGC	2	ATTACTTCA:GTTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.49999999999997	4	30.583333333333336	0.29225024342368	0.143721781908901	2.03344433628665	0.148528461514779	0.0827231433333071	0.0792516634060314	NaN	NaN	0.116729664412343	0.203226055410705	901	0	99	0.099	0.901	0.198
ORF3a	all	ss12	171	GCA	TGC	AGG	2	ACTGCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.16666666666664	4	30.250000000000004	0.289246860608989	0.145469445655623	1.98836848044184	0.143777414953365	0.0788127274507415	0.0776436124987974	NaN	NaN	0.122710124570609	0.241324193440978	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	GCAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.91666666666664	4	30.500000000000004	0.271931669012678	0.144154737019872	1.88638732680142	0.127776931992806	0.080751886129648	0.0802655304707531	NaN	NaN	0.118347257487752	0.280285587478397	868	0	132	0.132	0.868	0.264
ORF3a	all	ss12	173	GAC	TGA	CGG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.5833333333333	4	30.500000000000004	0.26919097092383	0.144154737019872	1.86737513097971	0.125036233903958	0.0797812854648104	0.079979607649732	NaN	NaN	0.109957297268939	0.255482072375137	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	174	GGC	CGG	CAC	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.74999999999997	4	30.66666666666667	0.264526729305941	0.143291427572032	1.8460750499046	0.121235301733909	0.0805951008033534	0.0765922348146954	NaN	NaN	0.112415933951344	0.280831643584526	851	0	149	0.149	0.851	0.298
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.24999999999997	4	30.16666666666667	0.262577384081623	0.145913043990275	1.7995470240421	0.116664340091349	0.080681040819573	0.0761874592493976	NaN	NaN	0.113694320403589	0.304833680877904	859	0	141	0.141	0.859	0.282
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAC	2	ACAACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.66666666666664	3	30.583333333333336	0.282712453350107	0.105128058952294	2.68921975890755	0.177584394397813	0.0804949674322312	0.0639677522701118	NaN	NaN	0.101338563900265	0.0797072642197372	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	177	ACA	AAC	ACC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.91666666666664	3	29.91666666666667	0.267841453433817	0.107647107231784	2.48814353048156	0.160194346202034	0.0846080738288645	0.064165136273401	NaN	NaN	0.102780666634259	0.119090163232246	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	178	CCA	ACC	AAA	2	ACACCAAAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.91666666666664	3	30.250000000000004	0.250167586995817	0.106372646579413	2.35180373000358	0.143794940416403	0.0754568188665511	0.0632657631321979	NaN	NaN	0.0935057731256166	0.124092913516615	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTC:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.41666666666664	4	29.750000000000004	0.248323576611812	0.148172379571929	1.67591002674872	0.100151197039883	0.0715301061813536	0.083083673048176	NaN	NaN	0.115577241022825	0.3861993431053	828	0	172	0.172	0.828	0.344
ORF3a	all	ss12	180	CTC	ACT	CAA	2	AAACTCAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.58333333333331	4	30.083333333333336	0.217071598340042	0.146359364647636	1.48314116327744	0.070712233692406	0.0654050762327891	0.0764270488927365	NaN	NaN	0.11058848142104	0.522551230042037	739	0	261	0.261	0.739	0.522
ORF3a	all	ss12	181	AAA	CAA	ACA	2	CTCAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.08333333333331	3	30.250000000000004	0.199039887585717	0.106372646579413	1.87115667407149	0.0926672410063036	0.0635502142347548	0.067309750261439	NaN	NaN	0.094650361871088	0.327556296974173	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.74999999999999	3	30.66666666666667	0.183798305951801	0.104821456781369	1.75344162918054	0.0789768491704321	0.0596986340162026	0.0629043128436635	NaN	NaN	0.0950581085934515	0.40607133191821	788	0	212	0.212	0.788	0.424
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.41666666666666	3	29.833333333333332	0.166386789563673	0.107970516691131	1.54103911570278	0.0584162728725418	0.0573541380032074	0.0633720126209661	NaN	NaN	0.086893712657405	0.501410091102525	761	0	239	0.239	0.761	0.478
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.08333333333333	4	30.5	0.169534158879359	0.144154737019872	1.17605680107472	0.0253794218594869	0.0568021646661595	0.0779293174337881	NaN	NaN	0.105165370325922	0.809300370547539	598	1	401	0.401	0.598	0.802
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.75	4	29.833333333333332	0.165618196142339	0.147714914296514	1.12120158571048	0.017903281845825	0.0550887907455998	0.0771915545307343	NaN	NaN	0.103442716208978	0.862592978992796	574	0	426	0.426	0.574	0.852
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.41666666666666	4	29.166666666666664	0.164102200695281	0.151456007747705	1.08349746659533	0.0126461929475757	0.0548895756442162	0.0804969395784735	NaN	NaN	0.106630691954181	0.905593804293003	562	0	438	0.438	0.562	0.876
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.91666666666666	4	29.5	0.180801327755151	0.149561992614941	1.20887215123322	0.0312393351402099	0.0590469743308833	0.0805537597122438	NaN	NaN	0.103312779986787	0.762365227016093	598	0	402	0.402	0.598	0.804
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.41666666666666	4	30	0.182073635926153	0.146808432844572	1.24021238016291	0.0352652030815813	0.0615633943718241	0.0810342442939178	NaN	NaN	0.102094498237496	0.729780694056003	655	0	345	0.345	0.655	0.69
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.41666666666666	4	30.5	0.187348078274046	0.144154737019872	1.29963178558759	0.0431933412541737	0.0601188706350143	0.0768673096311766	NaN	NaN	0.10711126995909	0.686759364514897	657	0	343	0.343	0.657	0.686
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.08333333333331	4	30.5	0.20192785781644	0.144154737019872	1.40077157359458	0.0577731207965674	0.0639057374788918	0.0794946709376424	NaN	NaN	0.104055928100868	0.578749524920039	707	0	293	0.293	0.707	0.586
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGAAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.74999999999999	4	30.833333333333332	0.186447776478305	0.142438427764417	1.30897103685163	0.0440093487138876	0.0613766989039199	0.0782185730335534	NaN	NaN	0.102594932289287	0.667950727442251	658	0	342	0.342	0.658	0.684
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGAATTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.24999999999999	4	30.833333333333332	0.187801514593863	0.142438427764417	1.31847506000609	0.0453630868294463	0.0621526757118359	0.0748722302244524	NaN	NaN	0.103586316342791	0.661440307636085	677	0	323	0.323	0.677	0.646
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:AATTGGCAC	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.08333333333333	6	31.66666666666667	0.17448602671933	0.218397760919419	0.798936884630926	-0.0439117342000886	0.0583651560056749	0.113023519747648	NaN	NaN	0.13686948864763	0.74833979848852	402	0	598	0.598	0.402	0.804
ORF3a	all	ss12	194	CAC	GCA	ATC	2	TGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.08333333333333	6	32.333333333333336	0.193903558337025	0.213188653016244	0.909539769559173	-0.019285094679219	0.0618632417432774	0.110159202185354	NaN	NaN	0.13718038966451	0.888200162359233	470	0	530	0.53	0.47	0.94
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.91666666666666	6	31.833333333333336	0.161004298535341	0.217071598340042	0.741710568156082	-0.0560672998047006	0.051258629690157	0.114454001759048	NaN	NaN	0.132353135947114	0.671843714601508	322	0	678	0.678	0.322	0.644
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.41666666666666	6	32.00000000000001	0.159830135220283	0.215761554338836	0.740772079205934	-0.0559314191185522	0.0517392053382561	0.112303835530022	NaN	NaN	0.132492464966009	0.672917049056128	351	0	649	0.649	0.351	0.702
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.58333333333333	6	32.16666666666667	0.159442558228446	0.214467334863233	0.743435163821675	-0.0550247766347874	0.0498825618572027	0.116558227309751	NaN	NaN	0.130195055564326	0.672562767187076	367	0	633	0.633	0.367	0.734
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666667	6	32.75	0.159249476407496	0.210058104799921	0.758121075876504	-0.0508086283924256	0.0530041698642223	0.105924779813139	NaN	NaN	0.123988651850809	0.68196403335262	369	0	631	0.631	0.369	0.738
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666667	6	32.25	0.159249476407496	0.213826069393717	0.74476174424864094	-0.0545765929862214	0.0514782711648993	0.107693965757848	NaN	NaN	0.130303928790086	0.675332533975884	354	0	646	0.646	0.354	0.708
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.5	6	32.25	0.159636110589832	0.213826069393717	0.74656991564436	-0.0541899588038845	0.0504132718689115	0.111635064351277	NaN	NaN	0.134642909363199	0.687336921621474	316	0	684	0.684	0.316	0.632
ORF3a	all	ss12	201	GTC	TGT	CGT	2	TATGTCGTC:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.58333333333334	5	32.583333333333336	0.159442558228446	0.171685985854599	0.92868708785281	-0.0122434276261528	0.0522272451045363	0.104365292508817	NaN	NaN	0.120529657778036	0.91908989043597	463	0	537	0.537	0.463	0.926
ORF3a	all	ss12	202	GTA	CGT	ATT	2	GTCGTCGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.08333333333334	5	33.083333333333336	0.160610991304224	0.168775880107432	0.951622893046025	-0.00816488880320848	0.053268388874018	0.0961097590524663	NaN	NaN	0.11375788569892	0.942781552356795	499	0	501	0.501	0.499	0.998
ORF3a	all	ss12	203	GTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTCGTACAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.83333333333334	5	33.333333333333336	0.161201678172285	0.167357663485657	0.963216591429649	-0.00615598531337219	0.0511952223671466	0.0937410363062632	NaN	NaN	0.115540379757357	0.957508857455635	485	0	515	0.515	0.485	0.97
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	GTACATGGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.83333333333334	5	33.166666666666664	0.145028544735405	0.168300466878196	0.861723959686733	-0.023271922142791	0.0503924999352149	0.097893823104563	NaN	NaN	0.111865029274221	0.835201075281948	471	1	528	0.528	0.471	0.942
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:CATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	32.833333333333336	0.146091244169313	0.17021844254226	0.858257436664322	-0.0241271983729469	0.0499225042163479	0.0987800103448475	NaN	NaN	0.117117282458756	0.836783986952668	413	1	586	0.586	0.413	0.826
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.83333333333334	5	33	0.131083275220683	0.169253998250676	0.774476683419554	-0.0381707230299936	0.0491164240388861	0.0972289743443848	NaN	NaN	0.109296589165706	0.726909260837532	397	0	603	0.603	0.397	0.794
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	6	32.83333333333333	0.130765040358583	0.209443067094397	0.624346473591541	-0.0786780267358138	0.0488732267169789	0.112890087254077	NaN	NaN	0.13261277418723	0.552986111436501	266	0	734	0.734	0.266	0.532
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CGA	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.33333333333334	6	32.5	0.13013319533385	0.211925228838758	0.61405239973982	-0.081792033504908	0.0459548859712499	0.112768609795425	NaN	NaN	0.125414548663911	0.514289313050728	261	0	739	0.739	0.261	0.522
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.66666666666667	6	33.166666666666664	0.131403066768818	0.207018740932176	0.63473995724797	-0.075615674163358	0.0463518163722515	0.111890703861876	NaN	NaN	0.124479438758552	0.543548908800608	274	0	726	0.726	0.274	0.548
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	6	32.5	0.130765040358583	0.211925228838758	0.617033852340795	-0.0811601884801746	0.0477810138040531	0.117051575897738	NaN	NaN	0.134224895274561	0.545406103022179	280	0	720	0.72	0.28	0.56
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.66666666666667	6	32.5	0.113962844188242	0.211925228838758	0.537750247163588	-0.097962384650516	0.0466397291164929	0.116464480390443	NaN	NaN	0.136923745110342	0.474329712356256	206	1	793	0.793	0.206	0.412
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	6	32.83333333333333	0.128887692694994	0.209443067094397	0.615382950999777	-0.0805553743994027	0.0468524764659223	0.11138053906934	NaN	NaN	0.131450473246378	0.539995891321327	279	0	721	0.721	0.279	0.558
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.66666666666669	6	33.166666666666664	0.12950744207608	0.207018740932176	0.625583179053867	-0.0775112988560965	0.0482076707837046	0.116837231368082	NaN	NaN	0.132513504029965	0.558593897900385	297	0	703	0.703	0.297	0.594
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	6	32.5	0.128887692694994	0.211925228838758	0.608175314478758	-0.0830375361437635	0.0509076204799447	0.118788274857382	NaN	NaN	0.133309013517142	0.533353434389055	263	0	737	0.737	0.263	0.526
ORF3a	all	ss12	215	GAG	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.83333333333336	6	31.83333333333333	0.127364024533652	0.217071598340042	0.586737396820271	-0.0897075738063904	0.0472344336474201	0.11170866475589	NaN	NaN	0.135845057288843	0.509018434232905	245	0	755	0.755	0.245	0.49
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.50000000000003	6	30.83333333333333	0.114234586398441	0.22528117443765	0.507075598676164	-0.111046588039209	0.0454777503229225	0.122442097026509	NaN	NaN	0.137077928017211	0.417883716546988	186	0	814	0.814	0.186	0.372
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.16666666666669	6	29.83333333333333	0.114781984854672	0.234141361979703	0.49022515237877	-0.11935937712503	0.0455108303782669	0.129306505180972	NaN	NaN	0.148015358309364	0.420013056232325	184	0	816	0.816	0.184	0.368
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AAT	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	6	30.166666666666664	0.115334665090852	0.231110927283054	0.499044620895817	-0.115776262192202	0.0457504103970958	0.131372743023909	NaN	NaN	0.147642445793609	0.432942410352073	167	0	833	0.833	0.167	0.334
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTACT:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	6	29.499999999999996	0.115334665090852	0.237252996159118	0.486125220578885	-0.121918331068265	0.045386497113237	0.133260511389314	NaN	NaN	0.148724370231644	0.412352779644508	167	1	832	0.832	0.167	0.334
ORF3a	all	ss12	220	ACT	GAG	TAC	2	ATTACTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	6	29.41666666666666	0.0849965139802523	0.238043979028558	0.357062229959009	-0.153047465048305	0.0354547208329325	0.129986775061124	NaN	NaN	0.143944522456784	0.287673470285845	81	0	919	0.919	0.081	0.162
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	ACTACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	6	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.24126182510618	0.352299888069093	-0.156265311125928	0.034427734570732	0.133901118470136	NaN	NaN	0.151779257904694	0.303218276463674	99	0	901	0.901	0.099	0.198
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	6	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.24126182510618	0.352299888069093	-0.156265311125928	0.0333818865742917	0.131778427537792	NaN	NaN	0.140088891085408	0.264647979510144	89	0	911	0.911	0.089	0.178
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	6	28.749999999999993	0.0870541284395655	0.244568640424989	0.355949676492827	-0.157514511985424	0.0349704917554683	0.131876962872425	NaN	NaN	0.147525099861205	0.28564985478015	89	0	911	0.911	0.089	0.178
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.33333333333337	6	29.41666666666666	0.0879053734766805	0.238043979028558	0.369282070630044	-0.150138605551877	0.0353136090962842	0.139505173894794	NaN	NaN	0.141787957317588	0.28964745230321	110	0	890	0.89	0.11	0.22
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TGA	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333337	6	30.41666666666666	0.0892139571460239	0.228889480485489	0.389768708272636	-0.139675523339465	0.0343349320342908	0.130466242089288	NaN	NaN	0.138679629512704	0.313847679185727	115	0	885	0.885	0.115	0.23
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.9166666666667	6	30.16666666666666	0.0729614963194685	0.231110927283054	0.315699033261671	-0.158149430963585	0.0320689148055571	0.134845272688337	NaN	NaN	0.134909104985244	0.241090057153504	77	0	923	0.923	0.077	0.154
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAC	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AACAAGCTT:AATAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAC:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAC	AGA	CCC	2	AAAGACCCA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCA	CCC	A--	1	GACCCA---:GAGCCTGAA	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCA---CCG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	CCG	-CC	ACA	1	---CCGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	2	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AAT	ACA	TGT	2	CCGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGC	2	GGAGTTGCA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GCA	TGC	AAA	2	GTTGCAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GCAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.08333333333334	2	30.83333333333333	0.0941885460903394	0.0678428326164385	1.38833451461042	0.0263457134739009	0.0362655043226879	0.0540680516480507	NaN	NaN	0.0638375334663167	0.679826844806827	685	0	315	0.315	0.685	0.63
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.91666666666667	2	30.499999999999993	0.108911256999757	0.0686192553184994	1.5871821472594	0.0402920016812573	0.0398484092825621	0.0529623253756068	NaN	NaN	0.0662226860504205	0.542900989651466	721	0	279	0.279	0.721	0.558
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.08333333333334	2	30.999999999999993	0.110163273884948	0.0674611774972046	1.63298771192532	0.0427020963877432	0.0385921590167391	0.0520683834610632	NaN	NaN	0.067432683067832	0.526567011688703	756	1	243	0.243	0.756	0.486
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.91666666666667	2	30.499999999999993	0.110417145764054	0.0686192553184994	1.6091277186199	0.0417978904455542	0.0390002864967794	0.0511122696604026	NaN	NaN	0.0680579717616788	0.539115364807455	751	0	249	0.249	0.751	0.498
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.41666666666667	2	29.999999999999993	0.111185843809109	0.069817817299509	1.59251388985905	0.0413680265096005	0.0387642858148083	0.0542192369294396	NaN	NaN	0.0679312658760726	0.542545070248991	753	0	247	0.247	0.753	0.494
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGAATTTTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.91666666666667	2	29.999999999999993	0.110417145764054	0.069817817299509	1.58150383433471	0.0405993284645446	0.0397218482475771	0.0576717207461888	NaN	NaN	0.0710499687367892	0.567715401121168	726	0	274	0.274	0.726	0.548
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.41666666666667	2	30.66666666666666	0.112755863557943	0.0682288336542951	1.65261308920008	0.0445270299036479	0.0413565511371322	0.0544162605810436	NA	NA	0.0706047286333836	0.528267936867373	744	0	256	0.256	0.744	0.512
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACTCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.75	2	30.33333333333333	0.112227610965344	0.0690141740401891	1.6261530696577	0.0432134369251551	0.0416456524803182	0.0495588363498473	NaN	NaN	0.0713173319747012	0.544560064274612	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACTCTTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.08333333333333	2	30.999999999999993	0.11328912210942	0.0674611774972046	1.67932322429614	0.0458279446122154	0.040572420300757	0.0532237823714416	NaN	NaN	0.0686984119816584	0.504715382120426	757	0	243	0.243	0.757	0.486
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGAACT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.91666666666666	2	30.999999999999993	0.0983864636202627	0.0674611774972046	1.45841604416614	0.0309252861230581	0.0373318904690548	0.0496873381196664	NaN	NaN	0.0664884395720196	0.641843552184014	706	0	294	0.294	0.706	0.588
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	TGT	2	GGAACTGTA:GGAACTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.24999999999999	2	31.33333333333333	0.0979270134965697	0.0667106145123721	1.46793751207925	0.0312163989841976	0.037151823603441	0.0520587868238339	NaN	NaN	0.0654825710966587	0.6335664384514	707	1	292	0.292	0.707	0.584
ORF3a	all	ss12	13	GTA	TGT	AAC	2	ACTGTAACT:ACTGTTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.58333333333331	2	31.33333333333333	0.0974718405643037	0.0667106145123721	1.46111441600087	0.0307612260519316	0.0388471758683931	0.0510740496055283	NaN	NaN	0.0669925779775226	0.646109476532579	683	0	317	0.317	0.683	0.634
ORF3a	all	ss12	14	ACT	AAC	TCT	2	GTAACTTTG:GTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.08333333333331	2	31.16666666666666	0.0967969709734609	0.0670837952639451	1.44292627739095	0.0297131757095159	0.0383531481342972	0.0503242711524785	NaN	NaN	0.0657389391728948	0.651278021046121	706	0	294	0.294	0.706	0.588
ORF3a	all	ss12	15	CTT	TCT	GAA	2	ACTCTTAAA:ACTTTGAAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.08333333333331	2	31.16666666666666	0.0967969709734609	0.0670837952639451	1.44292627739095	0.0297131757095159	0.037866075605776	0.0497080204430883	NaN	NaN	0.0665139985104448	0.655076780296647	670	0	330	0.33	0.67	0.66
ORF3a	all	ss12	16	AAA	GAA	ACA	2	CTTAAACAA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.49999999999999	2	31.41666666666666	0.082842746673233	0.0665255778124882	1.24527661986998	0.0163171688607447	0.0341646962949415	0.0509348331750678	NaN	NaN	0.0656423272238828	0.803688047612725	625	0	375	0.375	0.625	0.75
ORF3a	all	ss12	17	CAA	ACA	AGG	2	AAACAAGGT:AAGCAAGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.33333333333333	2	31.41666666666666	0.0830340183118736	0.0665255778124882	1.24815177924372	0.0165084404993854	0.0344514769230058	0.0516226206574136	NaN	NaN	0.0645261889061357	0.79807366398258	604	0	396	0.396	0.604	0.792
ORF3a	all	ss12	18	GGT	AGG	TGA	2	CAAGGTGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.16666666666667	2	30.416666666666664	0.0820864003916518	0.0688161477015357	1.19283632015658	0.013270252690116	0.034162757465107	0.0525441334593628	NA	NA	0.0663240656724728	0.841416439063703	605	0	395	0.395	0.605	0.79
ORF3a	all	ss12	19	GAA	TGA	AAT	2	GGTGAAATC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333333	2	30.416666666666664	0.081899468973744	0.0688161477015357	1.19011993128346	0.0130833212722082	0.0347717455791787	0.0515582094594033	NaN	NaN	0.0644596930164216	0.839159239968038	621	0	379	0.379	0.621	0.758
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	GAAATCAAA:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.66666666666666	2	30.416666666666664	0.0793691428528859	0.0688161477015357	1.15335056529348	0.0105529951513502	0.0330914910892976	0.0526895136370138	NaN	NaN	0.064145577442394	0.86932469039054	555	1	444	0.444	0.555	0.888
ORF3a	all	ss12	21	AAA	CAA	AGG	2	ATCAAAGGT:ATCAAGGAT	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.416666666666667	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.16666666666666	2	31.083333333333332	0.0798980931045125	0.0672719567702241	1.18768796004276	0.0126261363342884	0.0321870999107817	0.0523843528570886	NaN	NaN	0.0637645750817864	0.843035855434319	626	0	374	0.374	0.626	0.748
ORF3a	all	ss12	22	GAT	AGG	TGC	2	AAAGGTGCT:AAGGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.08333333333333	2	31.583333333333332	0.0810687166991056	0.0661585688516753	1.22536986676447	0.0149101478474303	0.0339223110221273	0.0496996403246797	NaN	NaN	0.0617745518423354	0.809273075638663	591	0	409	0.409	0.591	0.818
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	GATGCTACT:GGTGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.08333333333333	1	31.249999999999996	0.0810687166991056	0.0327027281115989	2.47895883250035	0.0483659885875067	0.0342492278932331	0.0363281254489762	NA	NA	0.0502351555805055	0.335652089341822	828	0	172	0.172	0.828	0.344
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.58333333333333	1	31.749999999999996	0.0816206643196587	0.0321765161581571	2.53665325103777	0.0494441481615016	0.0346158332645345	0.0348956318015413	NaN	NaN	0.0520029976262532	0.341708861007468	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TAC	2	ACTCCTACA:ACTCCTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.58333333333333	1	31.749999999999996	0.0816206643196587	0.0321765161581571	2.53665325103777	0.0494441481615016	0.0343252155043737	0.0346057085387594	NaN	NaN	0.0505823109922139	0.328322272875012	839	0	161	0.161	0.839	0.322
ORF3a	all	ss12	26	ACA	TAC	AAA	2	CCTACAAAT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1	0.75	1	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.75	1	31.249999999999996	0.0803443058867966	0.0327027281115989	2.45680744470674	0.0476415777751976	0.0326439716627061	0.0341120742924872	NA	NA	0.0510086780768851	0.350309227950807	842	0	158	0.158	0.842	0.316
ORF3a	all	ss12	27	AAT	AAA	TTC	2	ACAAATTCT:TCAGATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.08333333333333	1	30.916666666666664	0.0660492550084018	0.0330632048490145	1.9976664485497	0.0329860501593874	0.03016548288093	0.035595661538229	NA	NA	0.0492584295664069	0.503079083875235	788	2	210	0.21	0.788	0.42
ORF3a	all	ss12	28	TCT	TTC	TGT	2	AATTCTGTT:GATTTTGTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.25	1	31.083333333333332	0.0529436946379864	0.0328819783981324	1.61011281003072	0.020061716239854	0.027569234492113	0.036273928536046	NA	NA	0.0451473186115667	0.656781467696308	692	7	301	0.301	0.692	0.602
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCG	2	TCTGTTCGC:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666667	0	31.749999999999996	0.0531784143271382	0	-Inf	0.0531784143271382	0.0265026710709809	0	NA	NA	0.0272927296531761	0.0513616009385642	981	19	0	0	0.981	0.001
ORF3a	all	ss12	30	CGC	TCG	CAC	2	GTTCGCACT:GTTCGCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.41666666666667	0	31.916666666666664	0.0528271104098974	0	-Inf	0.0528271104098974	0.0277032020206607	0	NA	NA	0.0270868831846059	0.0511422983018385	987	13	0	0	0.987	0.001
ORF3a	all	ss12	31	ACT	CAC	TAC	2	CGCACTACT:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.91666666666667	0	31.416666666666664	0.0524804194365887	0	-Inf	0.0524804194365887	0.0266070715929226	0	NA	NA	0.0264905677301189	0.0475802477750802	984	16	0	0	0.984	0.001
ORF3a	all	ss12	32	ACT	TAC	TGC	2	ACTACTGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.25000000000001	0	31.083333333333332	0.0383470098919532	0	-Inf	0.0383470098919532	0.0218526665945704	0	NA	NA	0.0235806806853815	0.103906151562983	946	54	0	0	0.946	0.001
ORF3a	all	ss12	33	GCA	TGC	AAC	2	ACTGCAACA:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.58333333333334	0	30.416666666666664	0.0377042739400825	0	-Inf	0.0377042739400825	0.0223101452492648	0	NA	NA	0.0225008654298983	0.0938006824563879	948	52	0	0	0.948	0.001
ORF3a	all	ss12	34	ACA	AAC	AAT	2	GCAACAATA:GCAACGATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.41666666666667	0	30.916666666666664	0.0377834349217082	0	-Inf	0.0377834349217082	0.0232540874002452	0	NA	NA	0.0221098426288237	0.0874701042105814	950	50	0	0	0.95	0.001
ORF3a	all	ss12	35	ATA	AAT	ACC	2	ACAATACCG:ACGATACCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.58333333333333	0	31.583333333333332	0.0381842798232054	0	-Inf	0.0381842798232054	0.0231304950793066	0	NA	NA	0.0232037693918332	0.0998447459954857	953	47	0	0	0.953	0.001
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333333	0	32.25	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.0231471028552784	0	NA	NA	0.0229193781679613	0.0915054299527151	970	30	0	0	0.97	0.001
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333333	0	32.25	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.0231022431956692	0	NA	NA	0.0237614959140939	0.103587791064964	950	50	0	0	0.95	0.001
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25	0	32.916666666666664	0.0388436318463037	0	-Inf	0.0388436318463037	0.0221992529934134	0	NA	NA	0.0234426172399941	0.0975262446699603	951	49	0	0	0.951	0.001
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CAC	2	CAAGCCACA:CAAGCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79	0	32.666666666666664	0.0524230797130337	0	-Inf	0.0524230797130337	0.0272147348099938	0	NA	NA	0.02647438762428	0.0476874355098596	985	15	0	0	0.985	0.001
ORF3a	all	ss12	40	ACA	CAC	ACT	2	GCCACACTC:GCCTCACTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79	0	32.666666666666664	0.0524230797130337	0	-Inf	0.0524230797130337	0.0280731999932617	0	NA	NA	0.026458830566018	0.0475567986708193	988	12	0	0	0.988	0.001
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	ACACTCCCT:TCACTCCCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.33333333333334	0	32.33333333333333	0.0388017557993917	0	-Inf	0.0388017557993917	0.0226339666712444	0	NA	NA	0.0230408218379682	0.0921731821553667	960	40	0	0	0.96	0.001
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.00000000000001	0	31.666666666666664	0.0384699707906629	0	-Inf	0.0384699707906629	0.0236577416137821	0	NA	NA	0.0241173202842818	0.110685859426768	965	35	0	0	0.965	0.001
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.33333333333334	0	31.333333333333332	0.0383061974523115	0	-Inf	0.0383061974523115	0.0216312859462468	0	NA	NA	0.0219269552286364	0.0806388675545388	954	46	0	0	0.954	0.001
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.00000000000001	0	31.666666666666664	0.0384699707906629	0	-Inf	0.0384699707906629	0.0232254951456622	0	NA	NA	0.0220528878455342	0.0810821493510773	967	33	0	0	0.967	0.001
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.16666666666669	0	31.666666666666664	0.0516332867726302	0	-Inf	0.0516332867726302	0.0261984544964528	0	NA	NA	0.0264158042730722	0.0506260276857798	986	14	0	0	0.986	0.001
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.75000000000001	0	32.416666666666664	0.0525954761681725	0	-Inf	0.0525954761681725	0.0273755006195222	0	NA	NA	0.026665489494362	0.0485619740879037	986	14	0	0	0.986	0.001
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT:CTTGTTGTT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.75000000000001	0	32.416666666666664	0.0525954761681725	0	-Inf	0.0525954761681725	0.0265208226908575	0	NA	NA	0.0270022474614755	0.0514366886983168	985	15	0	0	0.985	0.001
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTGTTGGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.33333333333334	0	32.666666666666664	0.0528853382457436	0	-Inf	0.0528853382457436	0.0280695373189492	0	NA	NA	0.0277734681849235	0.0568883599971565	988	12	0	0	0.988	0.001
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.33333333333334	0	32.666666666666664	0.0528853382457436	0	-Inf	0.0528853382457436	0.0267792096327596	0	NA	NA	0.0276886863524043	0.0561334583217502	982	18	0	0	0.982	0.001
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.08333333333334	0	32.916666666666664	0.0669340227304818	0	-Inf	0.0669340227304818	0.0322225086728002	0	NA	NA	0.0307791491754498	0.0296559987430431	996	4	0	0	0.996	0.001
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	AAT	2	GTTGCAATT:GTTGCACTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.08333333333334	0	31.916666666666664	0.0660492550084018	0	-Inf	0.0660492550084018	0.0299035735008035	0	NA	NA	0.0296712230167018	0.0260116699130636	995	5	0	0	0.995	0.001
ORF3a	all	ss12	52	ATT	AAT	TCT	2	GCAATTCTT:GCACTTCTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.91666666666667	0	32.416666666666664	0.0801652234595281	0	-Inf	0.0801652234595281	0.0348792707319063	0	NA	NA	0.0332678494713961	0.015966054911523	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	ATTCTTGCT:CTTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.08333333333334	0	32.75	0.0660492550084018	0	-Inf	0.0660492550084018	0.0310870135031604	0	NA	NA	0.030761467905908	0.0317819389472047	992	8	0	0	0.992	0.001
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.75000000000001	0	32.08333333333333	0.0654722993105784	0	-Inf	0.0654722993105784	0.0311153633236711	0	NA	NA	0.0296668835039563	0.0273199768339824	994	6	0	0	0.994	0.001
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.58333333333334	0	32.25	0.0794568138723562	0	-Inf	0.0794568138723562	0.0346603259697241	0	NA	NA	0.0334596038063432	0.017562802196393	999	1	0	0	0.999	0.001
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.41666666666667	0	32.08333333333333	0.0785887320551954	0	-Inf	0.0785887320551954	0.0326126169023568	0	NA	NA	0.0325352383505174	0.0157138030939048	998	2	0	0	0.998	0.001
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAG	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.08333333333334	0	32.75	0.0799869383386865	0	-Inf	0.0799869383386865	0.0340827383137214	0	NaN	NaN	0.03474096223048	0.021313684185028	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	58	AGC	AAG	CGC	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.91666666666667	1	32.75	0.0791072878500077	0.0311733183159379	2.53766015694142	0.0479339695340698	0.0341572566732354	0.0334839079203749	NA	NA	0.0478253119904101	0.316212257740637	849	3	148	0.148	0.849	0.296
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCA:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.58333333333334	1	33.416666666666664	0.0805241909860523	0.0305385697640887	2.63680295469316	0.0499856212219636	0.0331873051347224	0.0314282900496099	NaN	NaN	0.0480666688791498	0.298375804191636	874	1	125	0.125	0.874	0.25
ORF3a	all	ss12	60	TCA	TTC	AAA	2	GCTTCAAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.25000000000001	1	32.75	0.0798094452064726	0.0311733183159379	2.56018446280288	0.0486361268905347	0.0349160636310509	0.0311084107656219	NA	NA	0.0494800850594273	0.325635257824131	852	1	147	0.147	0.852	0.294
ORF3a	all	ss12	61	AAA	AAA	AAT	2	TCAAAAATA:TCCAAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.41666666666669	1	32.58333333333333	0.0796327387923167	0.0313361505112163	2.54124190410094	0.0482965882811005	0.0340969857898703	0.0302655003135763	NaN	NaN	0.0490247882838468	0.324552218637368	841	1	158	0.158	0.841	0.316
ORF3a	all	ss12	62	ATA	AAT	AAT	2	AAAATAATT:AAAATCATA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.41666666666669	1	33.25	0.0807048841711543	0.0306948207819131	2.62926715697619	0.0500100633892412	0.0334609704753782	0.0318232600421424	NaN	NaN	0.0474436916684616	0.291840339654543	859	1	140	0.14	0.859	0.28
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATAATTACA:ATCATAACC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.08333333333336	2	33.25	0.0810687166991055	0.0626996766264699	1.29296865727184	0.0183690400726357	0.0334382731216591	0.0476870922825694	NaN	NaN	0.0610010801098027	0.763318055197014	648	0	352	0.352	0.648	0.704
ORF3a	all	ss12	64	ACA	AAC	ACT	2	ATAACCCTC:ATTACACTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.41666666666669	2	33.58333333333333	0.0818063224852469	0.0620508745044359	1.31837501306124	0.019755447980811	0.033733495432811	0.0480655261750867	NaN	NaN	0.0628364387228147	0.75322122446491	647	2	351	0.351	0.647	0.702
ORF3a	all	ss12	65	CTC	ACT	CAA	2	ACACTCAAA:ACCCTCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.00000000000003	3	33.58333333333333	0.0811601884801745	0.0951140793534504	0.853293108989446	-0.0139538908732759	0.0336630841587993	0.0572000447540182	NaN	NaN	0.0721313865260627	0.846605755548735	446	1	553	0.553	0.446	0.892
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.33333333333336	3	33.58333333333333	0.0807955355010693	0.0951140793534504	0.849459260398532	-0.0143185438523811	0.0358275158457501	0.0591574437055175	NaN	NaN	0.0728687624023544	0.844220636594504	462	1	537	0.537	0.462	0.924
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	GAG	2	AAAAAGAGA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75000000000001	3	34.25	0.0814358477684013	0.0931427851735378	0.874311924607742	-0.0117069374051365	0.0352170473244128	0.0592107743532626	NaN	NaN	0.0732245509714776	0.872977796062963	455	1	544	0.544	0.455	0.91
ORF3a	all	ss12	68	AGA	GAG	ATG	2	AAGAGATGG	2	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333334	3	34.25	0.0961313950679982	0.0931427851735378	1.03208632734025	0.00298860989446038	0.0396535515526508	0.0545547216179365	NaN	NaN	0.0730611320328324	0.96737114809964	523	0	477	0.477	0.523	0.954
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGATGGCAG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.25000000000001	3	34.666666666666664	0.111444464849685	0.0919517415692493	1.21198862520462	0.0194927232804361	0.0403466350523089	0.0595164431273548	NaN	NaN	0.0745879065842512	0.793831151901649	626	0	374	0.374	0.626	0.748
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.58333333333334	3	35	0.112491115941025	0.0910206427532006	1.23588575666336	0.0214704731878243	0.0405831934170722	0.0546038983329948	NaN	NaN	0.0764976446962278	0.77896473150176	641	1	358	0.358	0.641	0.716
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGTTAGCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.91666666666667	3	34.666666666666664	0.11196533988639	0.0919517415692493	1.21765328177138	0.0200135983171409	0.0407397201522693	0.0561251713203023	NaN	NaN	0.0765355971886903	0.793711587338123	607	0	393	0.393	0.607	0.786
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:TTAGCCCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.41666666666667	3	34.166666666666664	0.111185843809109	0.0933847109044368	1.19062149180811	0.0178011329046726	0.040140032617732	0.060079448611027	NaN	NaN	0.0736116144687776	0.808915721951543	589	0	411	0.411	0.589	0.822
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCCCTCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.58333333333333	3	34.166666666666664	0.110928422497729	0.0933847109044368	1.18786492374801	0.0175437115932923	0.0406718945474242	0.05872882166368	NaN	NaN	0.0745554645170703	0.813967455031191	576	0	424	0.424	0.576	0.848
ORF3a	all	ss12	74	TCC	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTCTCTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.58333333333333	3	33.5	0.109408627044446	0.095366381613935	1.14724523666377	0.0140422454305111	0.0400057683301541	0.0623535450885434	NaN	NaN	0.0762471116923269	0.853881998134161	597	0	403	0.403	0.597	0.806
ORF3a	all	ss12	75	AAA	CAA	AGG	2	TCCAAGGGT:TCTAAAGGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.58333333333333	3	32.83333333333333	0.107929984092779	0.0974341006801572	1.10772289516046	0.010495883412622	0.0394319955773153	0.060671993386016	NaN	NaN	0.0779086910019883	0.89283301037254	550	0	450	0.45	0.55	0.9
ORF3a	all	ss12	76	GGT	AGG	TGT	2	AAAGGTGTT:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.08333333333333	3	32.666666666666664	0.107205575102587	0.0979651368127982	1.09432374200065	0.00924043828978924	0.0402673211926629	0.0622506550128864	NaN	NaN	0.0710956638953494	0.8965886611744	538	0	462	0.462	0.538	0.924
ORF3a	all	ss12	77	GTT	TGT	TCA	2	GGTGTTCAC:GGTGTTCAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80	3	32.666666666666664	0.107325632730505	0.0979651368127982	1.09554925580917	0.0093604959177068	0.0387622308979493	0.0606165110941018	NaN	NaN	0.0742285367336772	0.899649808925788	587	0	413	0.413	0.587	0.826
ORF3a	all	ss12	78	CAC	TCA	CTT	2	GTTCACTTT:GTTCATTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80	3	33	0.121889197123331	0.0969087986100047	1.25777224433311	0.0249803985133265	0.0431099110039723	0.0583491998585829	NaN	NaN	0.0790993194412093	0.752146320108259	636	0	364	0.364	0.636	0.728
ORF3a	all	ss12	79	TTT	CTT	TGT	2	CACTTTGTT:CATTTTGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.83333333333333	3	32.5	0.120525973482338	0.0985020015458152	1.22358908033233	0.0220239719365226	0.0407939046448911	0.058191754620557	NaN	NaN	0.0770593652725692	0.775027279114813	635	0	365	0.365	0.635	0.73
ORF3a	all	ss12	80	GTT	TGT	TTG	2	TTTGTTTGC	2	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80	3	32.83333333333333	0.136741167595466	0.0974341006801572	1.40342207339031	0.0393070669153088	0.04664660269618	0.0617965497032484	NaN	NaN	0.0792242325442345	0.619788905803999	685	1	314	0.314	0.685	0.628
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	GTTTGCAAC	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.33333333333333	3	33	0.136119019073684	0.0969087986100047	1.40460949909693	0.0392102204636797	0.044310047701781	0.063479492891422	NaN	NaN	0.0794097114654268	0.621467846516516	714	0	286	0.286	0.714	0.572
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.66666666666666	3	33.666666666666664	0.137369045405264	0.0948631103318397	1.44807654866823	0.042505935073424	0.0441843505310369	0.056984239691689	NaN	NaN	0.0814777904938684	0.60188801268401	720	0	280	0.28	0.72	0.56
ORF3a	all	ss12	83	TTG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG:AACTTGCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.66666666666666	3	33.666666666666664	0.137369045405264	0.0948631103318397	1.44807654866823	0.042505935073424	0.0453948395099832	0.0592506916712721	NaN	NaN	0.0796467034843658	0.593562233157453	707	0	293	0.293	0.707	0.586
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GTT	2	TTGCTGTTG:TTGCTTCTG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.33333333333333	3	33.166666666666664	0.136119019073684	0.0963891381007337	1.41218213748763	0.0397298809729507	0.044447256679902	0.0602952451713427	NaN	NaN	0.0814152017385053	0.62555625716614	731	0	269	0.269	0.731	0.538
ORF3a	all	ss12	85	CTG	GTT	GCT	2	CTGTTGTTG:CTTCTGCTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.5	3	33.166666666666664	0.135810068779417	0.0963891381007337	1.40897689776503	0.0394209306786835	0.0445953881691205	0.060483771550795	NaN	NaN	0.0832546007405729	0.635857552816939	704	0	296	0.296	0.704	0.592
ORF3a	all	ss12	86	CTG	GCT	GTT	2	CTGCTGTTT:TTGTTGTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.16666666666667	3	32.5	0.134588203229996	0.0985020015458152	1.36634993317772	0.0360862016841809	0.0431662078521226	0.06161785960471	NaN	NaN	0.0796119324739529	0.650349800997327	708	0	292	0.292	0.708	0.584
ORF3a	all	ss12	87	TTT	GTT	TGT	2	CTGTTTTTA:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	82.33333333333334	3	31.83333333333333	0.132502157521956	0.100709711722406	1.3156840115597	0.03179244579955	0.0435378289111946	0.0621878258805027	NaN	NaN	0.0796387821596069	0.689739885648133	690	0	310	0.31	0.69	0.62
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTTTAACA	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	83	3	31.16666666666666	0.131338983374922	0.103018812035868	1.27490291121969	0.0283201713390542	0.0416988008421524	0.0647742268813568	NaN	NaN	0.0846137782592449	0.737851938591482	664	0	336	0.336	0.664	0.672
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	GTAACAGTT:TTAACAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	82.58333333333333	3	31.41666666666666	0.11776037975845	0.102140577511979	1.1529245538546	0.015619802246471	0.0399836983603397	0.0624361141595395	NaN	NaN	0.0829838888110543	0.850698766314108	578	1	421	0.421	0.578	0.842
ORF3a	all	ss12	90	GTT	AGT	TTA	2	ACAGTTTAC:ACAGTTTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	82.24999999999999	3	32.08333333333333	0.11827731107372	0.0998703029515669	1.18430912471628	0.0184070081221527	0.042206301970217	0.0624528842587842	NaN	NaN	0.0791968554671524	0.81621108122099	631	0	369	0.369	0.631	0.738
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	GTTTACTCA:GTTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.58333333333331	3	32.75	0.119324938259741	0.0976988961284261	1.22135400693665	0.0216260421313151	0.0417194908058874	0.0613704181108235	NaN	NaN	0.079756383171421	0.786274713963275	636	0	364	0.364	0.636	0.728
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TATTCTCAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.24999999999999	3	33.08333333333333	0.119855757106799	0.0966482688635724	1.24012316533042	0.0232074882432268	0.0401127836298554	0.061439329038171	NaN	NaN	0.0792197334010885	0.769559720213422	617	0	383	0.383	0.617	0.766
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCTCACTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.58333333333331	3	32.416666666666664	0.120931721082168	0.0987726497511971	1.22434420243649	0.0221590713309712	0.0419800906436352	0.061481738885395	NaN	NaN	0.0804873038535693	0.783077016145684	622	0	378	0.378	0.622	0.756
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	GTT	2	CACCTTTTG:CACTTGTTG	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.41666666666664	3	31.916666666666664	0.121203743914918	0.100428343016685	1.20686790475854	0.0207754008982337	0.0416013260625612	0.062958135896087	NaN	NaN	0.0778820716279595	0.7896581115107	611	0	389	0.389	0.611	0.778
ORF3a	all	ss12	95	TTG	GTT	GCT	2	CTTTTGCTC:TTGTTGCTT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.5833333333333	3	31.249999999999996	0.105089635467852	0.102724391304868	1.02302514653958	0.0023652441629841	0.0383968094747786	0.0623355607521155	NaN	NaN	0.0824313309601575	0.977109033052024	544	1	455	0.455	0.544	0.91
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	TTGCTCGTT:TTGCTTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.99999999999997	3	31.499999999999996	0.105902482398362	0.101851155869296	1.03977693227423	0.0040513265290652	0.0381977081144127	0.0667950864576111	NaN	NaN	0.081401020418581	0.960305695673154	569	0	431	0.431	0.569	0.862
ORF3a	all	ss12	97	CTT	CGT	TGC	2	CTCGTTGCT:CTTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.99999999999997	3	31.166666666666664	0.104516640682884	0.103018812035868	1.01453937021225	0.00149782864701525	0.0373140360715402	0.0667061103332146	NaN	NaN	0.0773361681259357	0.984547726245283	512	1	487	0.487	0.512	0.974
ORF3a	all	ss12	98	GCT	TGC	TGC	2	CTTGCTGGT:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.99999999999997	3	31.166666666666664	0.0906273548574554	0.103018812035868	0.879716559203784	-0.0123914571784129	0.0349459619255812	0.0662232031824476	NaN	NaN	0.0754208288637083	0.869496912629912	458	0	542	0.542	0.458	0.916
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC:GCTGGTGGC	1:1	FALSE	1.75	1	0.25	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.66666666666664	3	30.999999999999996	0.0898508998594655	0.103612753860613	0.867179922467259	-0.0137618540011474	0.0354598408159114	0.065136907977686	NaN	NaN	0.0806891503122856	0.864574503081961	453	0	547	0.547	0.453	0.906
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CCT	2	GCTGGCCTT:GGTGGCTTG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.41666666666664	3	31.249999999999996	0.0756148767114709	0.102724391304868	0.736094667984541	-0.0271095145933972	0.0315026948001214	0.0622220127202372	NaN	NaN	0.0761386484407869	0.721799690011982	381	0	619	0.619	0.381	0.762
ORF3a	all	ss12	101	CTT	CCT	GGA	2	GGCCTTGAA:GGCTTGGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.08333333333331	3	32.25	0.0759341342651253	0.0993184392369987	0.764552230668139	-0.0233843049718733	0.0326268700916035	0.0624619253758879	NaN	NaN	0.0712809337977203	0.742867550586771	381	0	619	0.619	0.381	0.762
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	CTTGAAGCC:TTGGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.74999999999999	3	32.25	0.0629960875876532	0.0993184392369987	0.634283906106586	-0.0363223516493455	0.0282176103949061	0.0617501260026742	NaN	NaN	0.0731695646344187	0.619602779636897	313	0	687	0.687	0.313	0.626
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CAC	2	GAAGCCACT:GAAGCCCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.74999999999999	3	31.249999999999996	0.0638004014677689	0.102724391304868	0.621083275912733	-0.0389239898370992	0.028271986173992	0.0626129870679053	NaN	NaN	0.0746272282144057	0.601963536672119	310	0	690	0.69	0.31	0.62
ORF3a	all	ss12	104	ACT	CAC	TTT	2	GCCACTTTT:GCCCCTTTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.24999999999999	3	31.249999999999996	0.0633956919887587	0.102724391304868	0.617143515609758	-0.0393286993161094	0.0286732617798178	0.0656720375673002	NaN	NaN	0.0737337033573405	0.593764771452172	303	1	696	0.696	0.303	0.606
ORF3a	all	ss12	105	TTT	TTT	TCT	2	ACTTTTCTC:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333333	3	30.91666666666666	0.0500707265730996	0.103912304538584	0.481855606950838	-0.0538415779654843	0.0254860221759246	0.0629497949230683	NaN	NaN	0.0707653469102364	0.446748660046286	224	1	775	0.775	0.224	0.448
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTCTCTTT	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.91666666666666	3	31.58333333333333	0.0504922483436096	0.101563372279023	0.497150175408645	-0.051071123935413	0.0258381111623308	0.062023342238996	NA	NA	0.0685028183848764	0.455949461389497	221	0	779	0.779	0.221	0.442
ORF3a	all	ss12	107	TAT	CTA	TCT	2	CTCTATCTT:CTCTTTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.91666666666666	3	31.58333333333333	0.0504922483436096	0.101563372279023	0.497150175408645	-0.051071123935413	0.0251018249304549	0.0629183135395272	NA	NA	0.0724590714607437	0.480917783725776	238	0	762	0.762	0.238	0.476
ORF3a	all	ss12	108	CTT	TCT	TTA	2	TATCTTTAT:TTTCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75	2	30.91666666666666	0.0499664439235006	0.0676514664202387	0.738586265272035	-0.0176850224967381	0.0248606343651544	0.0517346427137566	NaN	NaN	0.0597113108755824	0.767096120212354	388	2	610	0.61	0.388	0.776
ORF3a	all	ss12	109	TAT	TTA	TGC	2	CTTTATGCA:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333333	2	30.91666666666666	0.0497591768358709	0.0676514664202387	0.735522516641042	-0.0178922895843678	0.0255753728416396	0.0503510483576055	NA	NA	0.0593569812600025	0.763082578123684	373	3	624	0.624	0.373	0.746
ORF3a	all	ss12	110	GCA	TGC	ATT	2	TATGCATTA:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.41666666666666	2	31.58333333333333	0.0501754455827152	0.0661585688516753	0.758411895142508	-0.0159831232689602	0.0257033964152152	0.0500000521022376	NA	NA	0.060985165727951	0.79325810921329	419	4	577	0.577	0.419	0.838
ORF3a	all	ss12	111	TTA	ATT	AGC	2	GCATTAGCT:GCTTTAGTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.41666666666666	2	31.58333333333333	0.0501754455827152	0.0661585688516753	0.758411895142508	-0.0159831232689602	0.0256498853206128	0.0498149809258139	NA	NA	0.0590731085966444	0.78672551847018	429	3	568	0.568	0.429	0.858
ORF3a	all	ss12	112	GCT	AGC	CTA	2	TTAGCTTAT:TTAGTCTAC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75	2	30.91666666666666	0.0499664439235006	0.0676514664202387	0.738586265272035	-0.0176850224967381	0.0257781708477047	0.0526568264235143	NA	NA	0.0589790900408583	0.764289733474309	383	1	616	0.616	0.383	0.766
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	GCTTATTGC:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	0.666666666666667	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.75	1	30.58333333333333	0.0505987404816737	0.0334317184415283	1.51349505321332	0.0171670220401453	0.0245246657729191	0.0347614843278662	NA	NA	0.0444000342514127	0.699019525778894	706	4	290	0.29	0.706	0.58
ORF3a	all	ss12	114	TGC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATTGCTTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.416666666666667	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.91666666666667	1	30.416666666666664	0.0504922483436096	0.0336190735350483	1.50189291477562	0.0168731748085614	0.0256913943996902	0.035282727374753	NA	NA	0.0434327209079681	0.697653502982671	685	7	308	0.308	0.685	0.616
ORF3a	all	ss12	115	TTG	CTT	GCA	2	TGCTTGCAA:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.66666666666667	0	30.08333333333333	0.0506521552428655	0	-Inf	0.0506521552428655	0.0265234093887027	0	NA	NA	0.0258222040807591	0.0498121419503886	992	8	0	0	0.992	0.001
ORF3a	all	ss12	116	CAA	GCA	AAC	2	TTGCAAACT:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.66666666666667	0	29.749999999999996	0.0506521552428655	0	-Inf	0.0506521552428655	0.0263995274026303	0	NA	NA	0.0261555030821673	0.0527970270457359	982	18	0	0	0.982	0.001
ORF3a	all	ss12	117	ACT	AAC	TAT	2	CAAACTGTA:CAGAGTATA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.08333333333334	0	29.749999999999996	0.0510292410063947	0	-Inf	0.0510292410063947	0.0257585515868068	0	NA	NA	0.0262283118329243	0.0517053852276441	985	15	0	0	0.985	0.001
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	ACTGTAAAT:AGTATAAAC	1:1	FALSE	1.5	0.75	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.08333333333334	0	29.749999999999996	0.0379427585051849	0	-Inf	0.0379427585051849	0.0228155193600531	0	NA	NA	0.0219348016528659	0.0836665147043929	963	37	0	0	0.963	0.001
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT:GTAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.08333333333334	0	29.499999999999996	0.0250807069504691	0	-Inf	0.0250807069504691	0.0177804941978663	0	NA	NA	0.0174342554541351	0.150267349013945	874	126	0	0	0.874	0.001
ORF3a	all	ss12	120	TTT	CTT	TGT	2	AACTTTGTA:AATTTTGTG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.75000000000001	0	29.499999999999996	0.025185997239258	0	-Inf	0.025185997239258	0.018449233141877	0	NA	NA	0.0181974870201676	0.166347093751116	877	123	0	0	0.877	0.001
ORF3a	all	ss12	121	GTA	TGT	AAG	2	TTTGTAAGA:TTTGTGAGA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.08333333333334	0	29.499999999999996	0.0253992526173405	0	-Inf	0.0253992526173405	0.0189662368612621	0	NA	NA	0.0179902384226718	0.157998478976401	882	118	0	0	0.882	0.001
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:GTGAGAATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.33333333333334	0	29.499999999999996	0.0383061974523115	0	-Inf	0.0383061974523115	0.0225889620639778	0	NA	NA	0.0236253580093573	0.104931499976195	956	44	0	0	0.956	0.001
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.33333333333334	0	29.33333333333333	0.0383061974523115	0	-Inf	0.0383061974523115	0.0231851922717666	0	NA	NA	0.0215110364402626	0.0749501151378822	969	31	0	0	0.969	0.001
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.00000000000001	0	28.999999999999996	0.0389698041980333	0	-Inf	0.0389698041980333	0.0233252704582892	0	NA	NA	0.0234103695288202	0.0959848842751556	961	39	0	0	0.961	0.001
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATAATGCGA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.00000000000001	0	28.666666666666664	0.0389698041980333	0	-Inf	0.0389698041980333	0.0229527418791432	0	NA	NA	0.021833750410222	0.0742868784291711	961	39	0	0	0.961	0.001
ORF3a	all	ss12	126	AGG	GAG	ATT	2	ATGAGGCTT:ATGCGATTC	1:1	TRUE	1.25	1.08333333333333	0.666666666666667	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.66666666666667	0	28.999999999999996	0.0396568140359608	0	-Inf	0.0396568140359608	0.022583496047424	0	NA	NA	0.023199334786861	0.0873779090305792	954	46	0	0	0.954	0.001
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATT	CTG	2	AGGCTTTGG:CGATTCTGG	1:1	TRUE	1.5	0.333333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75	0	28.999999999999996	0.0396131668795608	0	-Inf	0.0396131668795608	0.0223810830375136	0	NA	NA	0.0232168873400346	0.0879667306610315	955	45	0	0	0.955	0.001
ORF3a	all	ss12	128	TGG	CTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TTCTGGTTG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333333	1	28.499999999999996	0.0258925390301244	0.0359350167719231	0.720537830675366	-0.0100424777417987	0.0180548491676615	0.0364650900667174	NA	NA	0.0449083762890306	0.823051845299875	435	44	521	0.521	0.435	0.87
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	GTG	2	TGGCTTTGC:TGGTTGTGC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333333	1	28.999999999999996	0.0264053674769446	0.0353006331434894	0.748013990842955	-0.0088952656665448	0.0194139523796272	0.0400966888207216	NA	NA	0.0435897328066046	0.838300430841129	440	58	502	0.502	0.44	0.88
ORF3a	all	ss12	130	TGC	GTG	CTG	2	CTTTGCTGG:TTGTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.58333333333333	1	28.666666666666664	0.0130014090011593	0.0357210367419409	0.363970651106385	-0.0227196277407816	0.0134504866518167	0.0367984057665133	NA	NA	0.0397033804544637	0.567163396006106	255	144	601	0.601	0.255	0.51
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGCTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.41666666666667	1	28.333333333333332	0.0130296436641525	0.0361515763634083	0.360417026720328	-0.0231219326992558	0.013918102183704	0.0390096935547974	NA	NA	0.0384961194537336	0.548086305263776	269	132	599	0.599	0.269	0.538
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76	1	27.333333333333332	0.0132746828245507	0.0375078154309961	0.353917781454706	-0.0242331326064453	0.0133339381796615	0.039207920264324	NA	NA	0.0441832546438184	0.583370109678263	258	128	614	0.614	0.258	0.516
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CCG	2	AAATGCCGT:AAGTGCCGT	1:1	FALSE	2	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666667	1	28.499999999999996	0.0270909813104957	0.0359350167719231	0.753888094235218	-0.00884403546142741	0.0187148331734952	0.0389767217532951	NA	NA	0.0442579356927638	0.841614029665848	422	42	536	0.536	0.422	0.844
ORF3a	all	ss12	134	CGT	CCG	TTC	2	TGCCGTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.83333333333334	1	28.999999999999996	0.0272138698048234	0.0353006331434894	0.770917328712063	-0.00808676333866603	0.019429117932529	0.0398602822025758	NA	NA	0.0433326669203055	0.851958203814681	413	48	539	0.539	0.413	0.826
ORF3a	all	ss12	135	TCC	TTC	CAA	2	CGTTCCAAA:CGTTCCAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.83333333333334	1	28.999999999999996	0.0272138698048234	0.0353006331434894	0.770917328712063	-0.00808676333866603	0.0193135453768433	0.0391861677320945	NA	NA	0.0455466915163781	0.85907728691916	421	48	531	0.531	0.421	0.842
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAGAAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.83333333333334	1	29.666666666666664	0.0272138698048234	0.0344888349313675	0.789063181141918	-0.00727496512654417	0.0205141257563409	0.0361306643098848	NA	NA	0.0444980982583774	0.87013315840676	426	54	520	0.52	0.426	0.852
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAGAATCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666667	1	29.666666666666664	0.0272757331281561	0.0344888349313675	0.790856901441715	-0.00721310180321141	0.019205755368887	0.0373727811865421	NA	NA	0.0421662725567093	0.864173991501099	461	37	502	0.502	0.461	0.922
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA:AATCCTTTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.33333333333334	1	29.333333333333332	0.027400307499342	0.0348900117261696	0.785333857563312	-0.00748970422682765	0.0189911394328714	0.0381424678366848	NA	NA	0.0409740297385041	0.854961620754988	427	43	530	0.53	0.427	0.854
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTT:CCTTTACTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333334	1	28.333333333333332	0.0270299523623976	0.0361515763634083	0.747683920907986	-0.0091216240010107	0.0193999222051952	0.0380051648153494	NA	NA	0.049269867907281	0.853122401772541	451	51	498	0.498	0.451	0.902
ORF3a	all	ss12	140	CTC	ACT	CTA	2	TTACTCTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666669	1	27.666666666666664	0.0269087157486763	0.0370445664971824	0.726387653928223	-0.010135850748506	0.0197400754629542	0.0398293040884488	NA	NA	0.046774866376734	0.828446526736604	452	40	508	0.508	0.452	0.904
ORF3a	all	ss12	141	TAT	CTA	TGA	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.00000000000001	1	27.333333333333332	0.0267885619515594	0.0375078154309961	0.714212801885061	-0.0107192534794366	0.0190202758673919	0.0405423170273315	NA	NA	0.046431918220312	0.817423887321133	423	47	530	0.53	0.423	0.846
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666669	1	27.666666666666664	0.0267288865855191	0.0370445664971824	0.721533253400389	-0.0103156799116633	0.0196210180748357	0.0402569602057883	NA	NA	0.0477062555101914	0.828805916602564	431	49	520	0.52	0.431	0.862
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333334	1	27.999999999999996	0.0261464386246643	0.036592623127074	0.714527584804903	-0.0104461845024098	0.0188920021301177	0.0398815733892019	NA	NA	0.0459642402075834	0.820215632504445	421	42	537	0.537	0.421	0.842
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAC:GCCAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333334	1	27.999999999999996	0.0258089981982962	0.036592623127074	0.705306042386469	-0.0107836249287779	0.0178649289152578	0.0389205124785384	NA	NA	0.0469560735610019	0.818361059062455	447	48	505	0.505	0.447	0.894
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666669	1	28.666666666666664	0.026032982222434	0.0357210367419409	0.728785740752816	-0.00968805451950695	0.0183500087563943	0.0393436151547634	NA	NA	0.0443734067003075	0.827171850000656	431	31	538	0.538	0.431	0.862
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTCTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333336	1	28.499999999999996	0.0259766224970672	0.0359350167719231	0.72287770622006	-0.00995839427485597	0.0185869859081706	0.0389715559893616	NA	NA	0.0433448624633454	0.818287615065556	451	53	496	0.496	0.451	0.902
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTCTTTGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333336	1	27.833333333333332	0.0259766224970672	0.0368172076473927	0.705556563274748	-0.0108405851503256	0.0183304016935275	0.0403932163593272	NA	NA	0.0445541399104051	0.807763217690065	418	44	538	0.538	0.418	0.836
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.91666666666669	1	27.249999999999996	0.0257812709329177	0.0376254440385144	0.685208416584461	-0.0118441731055967	0.0188370080523955	0.0416599380418515	NA	NA	0.0462320389348017	0.797804346140064	402	49	549	0.549	0.402	0.804
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT:TGTTGGCAT	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666669	1	27.499999999999996	0.025864632053377	0.0372747514142044	0.693891470018514	-0.0114101193608274	0.0187405669943327	0.0412533384976629	NA	NA	0.0476438083783498	0.810727216988997	428	41	531	0.531	0.428	0.856
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666669	1	27.666666666666664	0.026032982222434	0.0370445664971824	0.70274765462336	-0.0110115842747484	0.018963247041679	0.0384326438741845	NA	NA	0.0450490901568368	0.806893767064367	428	35	537	0.537	0.428	0.856
ORF3a	all	ss12	151	ACT	TAC	TAA	2	CATACTAAT	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.00000000000001	1	27.666666666666664	0.0260895870640617	0.0370445664971824	0.704275674707816	-0.010954979433120699	0.0179305258975108	0.041237732427308	NA	NA	0.0447144272923612	0.806457388152076	397	44	559	0.559	0.397	0.794
ORF3a	all	ss12	152	AAT	TAA	TTG	2	ACTAATTGT	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000001	1	27.166666666666664	0.0259205062991005	0.0377438129156368	0.686748483971049	-0.0118233066165363	0.0180506864976688	0.0382755155535249	NA	NA	0.0451697550173368	0.793512085918246	432	45	523	0.523	0.432	0.864
ORF3a	all	ss12	153	TGT	TTG	TTA	2	AATTGTTAC:AATTGTTAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.33333333333334	1	27.666666666666664	0.0256435235612095	0.0370445664971824	0.692234408065214	-0.0114010429359729	0.0184349331937536	0.040012617486198	NA	NA	0.0472498387771246	0.809328239412521	444	44	512	0.512	0.444	0.888
ORF3a	all	ss12	154	TAC	TTA	CGA	2	TGTTACGAC:TGTTATGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.5	1	28.333333333333332	0.0259205062991005	0.0361515763634083	0.716995188219138	-0.0102310700643078	0.0179119048584077	0.0378252941702227	NA	NA	0.0428790685601847	0.811413516984346	441	35	524	0.524	0.441	0.882
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333334	1	29	0.0258089981982962	0.0353006331434893	0.73111998001249	-0.00949163494519314	0.0193762794805559	0.0383362928777337	NA	NA	0.0464173485252895	0.837974791521482	437	34	529	0.529	0.437	0.874
ORF3a	all	ss12	156	TAT	CTA	TTG	2	GACTATTGT	2	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.5	1	28.333333333333332	0.0255888359187695	0.0361515763634083	0.707820750651136	-0.0105627404446388	0.0177987581053696	0.039747395265165	NA	NA	0.043742460691804	0.809186463328419	451	48	501	0.501	0.451	0.902
ORF3a	all	ss12	157	TGT	TTG	TAT	2	TATTGTATA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.16666666666667	1	27.666666666666664	0.0253723983888037	0.0370445664971824	0.684915516307459	-0.0116721681083787	0.0179284580100921	0.0397450859774632	NA	NA	0.0451918166150701	0.796190381353365	435	42	523	0.523	0.435	0.87
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80	1	28	0.025426163756761	0.036592623127074	0.6948439762972	-0.011166459370313	0.0185582662632241	0.0393925542657632	NA	NA	0.0457037917741563	0.80698114865569	434	37	529	0.529	0.434	0.868
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAC:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.33333333333334	1	27.333333333333332	0.0253188599437158	0.0375078154309961	0.675028914715	-0.0121889554872803	0.0185969185124656	0.0390214079168419	NA	NA	0.0473872620236316	0.797008881201363	408	38	554	0.554	0.408	0.816
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATACAAT:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.33333333333334	1	27.333333333333332	0.0253188599437158	0.0375078154309961	0.675028914715	-0.0121889554872803	0.0184499905755159	0.0391241403351198	NA	NA	0.0466797216992754	0.794000851673535	417	41	542	0.542	0.417	0.834
ORF3a	all	ss12	161	AAT	CAA	TAG	2	TACAATAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.16666666666667	1	27.166666666666664	0.0250545217996291	0.0377438129156368	0.663804736835405	-0.0126892911160078	0.018109517484973	0.0430615457859492	NA	NA	0.0462956136921525	0.784013361064197	392	56	552	0.552	0.392	0.784
ORF3a	all	ss12	162	AGT	TAG	TGT	2	AATAGTGTA	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.83333333333333	1	27.5	0.0251595918684029	0.0372747514142044	0.67497678492405	-0.0121151595458015	0.0169901532938389	0.041364598352329	NA	NA	0.0457909454171309	0.791336541879857	421	48	531	0.531	0.421	0.842
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACC:AGTGTAACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.49999999999999	1	28.166666666666664	0.0249503257372043	0.0363707624539579	0.68599952417245	-0.0114204367167536	0.018275275564386	0.039136660042282403	NA	NA	0.0422138523331554	0.786746650252669	429	58	513	0.513	0.429	0.858
ORF3a	all	ss12	164	ACC	AAC	CTC	2	GTAACCTCT:GTAACTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.66666666666666	1	28.666666666666664	0.0248985520571968	0.0357210367419409	0.697027699309825	-0.0108224846847441	0.0177827864824257	0.0378625153659963	NA	NA	0.0415827323531238	0.794660205958756	428	39	533	0.533	0.428	0.856
ORF3a	all	ss12	165	TCT	CTC	TTC	2	ACCTCTTCA:ACTTCTTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.66666666666666	1	29.333333333333332	0.0252124580992387	0.0348900117261696	0.722626816440072	-0.00967755362693088	0.0178043628888591	0.0362376067372815	NA	NA	0.0437364985754763	0.824882588772351	396	41	563	0.563	0.396	0.792
ORF3a	all	ss12	166	TCA	TTC	AAT	2	TCTTCAATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.33333333333333	1	29.666666666666664	0.0253188599437158	0.0344888349313675	0.734117577300019	-0.00916997498765172	0.0185382475810512	0.0351645770546379	NA	NA	0.0420523661556673	0.827381695367581	412	55	533	0.533	0.412	0.824
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	TCAATTGTC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.33333333333333	1	29.666666666666664	0.0253188599437158	0.0344888349313675	0.734117577300019	-0.00916997498765172	0.0179498732191336	0.0376687423750692	NA	NA	0.0430746626165268	0.831416201869175	421	43	536	0.536	0.421	0.842
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATC:ATTGTCATT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80	1	29.666666666666664	0.025426163756761	0.0344888349313675	0.73722883963343	-0.00906267117460653	0.0181392362556159	0.038158219010005	NA	NA	0.0425305272860707	0.831259678185958	437	37	526	0.526	0.437	0.874
ORF3a	all	ss12	169	ATC	CAT	CAC	2	GTCATCACA:GTCATTACT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.16666666666667	1	30.166666666666664	0.0253723983888037	0.0339040775760351	0.748358315659884	-0.00853167918723145	0.0180085902354327	0.0354727983692276	NA	NA	0.0408387250108413	0.834517328697745	424	51	525	0.525	0.424	0.848
ORF3a	all	ss12	170	ACA	CAC	ATG	2	ATCACATGT:ATTACTTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.83333333333334	1	30.25	0.0385523838449736	0.0338085407384937	1.14031493234722	0.00474384310647995	0.021393087352384	0.0388930044786122	NA	NA	0.0429658537774764	0.912084533015958	539	14	447	0.447	0.539	0.894
ORF3a	all	ss12	171	TCA	ATG	AGG	2	ACATGTGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.75	0.583333333333333	0.5	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.83333333333334	1	29.916666666666664	0.038063135955626	0.0341939559917542	1.11315391424159	0.00386917996387183	0.0219885944127547	0.0380243033890902	NA	NA	0.0459415061410834	0.932881753781596	563	10	427	0.427	0.563	0.854
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	TCAGGTGAT:TGTGGTGAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.08333333333334	1	30.416666666666664	0.0253992526173405	0.0336190735350483	0.755501265995967	-0.00821982091770779	0.0174864077877906	0.0359792076172315	NA	NA	0.041954475644936	0.844670916336054	417	53	530	0.53	0.417	0.834
ORF3a	all	ss12	173	GAT	TGA	TGG	2	GGTGATGGC:GGTGATGGT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.58333333333334	1	30.583333333333332	0.0252389746234555	0.0334317184415283	0.754940990173694	-0.0081927438180728	0.0179146701828551	0.0358506681545609	NA	NA	0.0402574391926701	0.838737355052706	461	46	493	0.493	0.461	0.922
ORF3a	all	ss12	174	GGC	TGG	CAC	2	GATGGCACA:GATGGTACT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.58333333333334	1	30.916666666666664	0.0249244120083241	0.0330632048490145	0.753841381140854	-0.00813879284069043	0.0178204362457184	0.0361744337804769	NA	NA	0.0383963027368876	0.832131890804598	448	47	505	0.505	0.448	0.896
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGTACTACG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.58333333333334	1	30.916666666666664	0.0249244120083241	0.0330632048490145	0.753841381140854	-0.00813879284069043	0.0188304799743189	0.0371144561392092	NA	NA	0.0391362709662266	0.835259921954428	456	49	495	0.495	0.456	0.912
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAG	2	ACAACAAGT:ACTACGAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.75000000000001	1	30.749999999999996	0.0248727457165765	0.0332464403304228	0.74813259613289	-0.00837369461384638	0.0176830567215444	0.0372012126456655	NA	NA	0.0392659521286409	0.831127395767001	430	47	523	0.523	0.43	0.86
ORF3a	all	ss12	177	AAT	AAG	TCC	2	ACAAGTCCT:ACGAATCCC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.08333333333334	1	30.083333333333332	0.0250807069504691	0.0340001559761409	0.737664467423888	-0.00891944902567178	0.0173625689446076	0.0371217601262925	NA	NA	0.0419641505291564	0.831678553805559	426	40	534	0.534	0.426	0.852
ORF3a	all	ss12	178	CCC	TCC	CAT	2	AATCCCATT:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.41666666666669	0	30.749999999999996	0.0252921753687316	0	-Inf	0.0252921753687316	0.0175920167676873	0	NA	NA	0.0178411221861145	0.156297747171149	856	144	0	0	0.856	0.001
ORF3a	all	ss12	179	ATT	CAT	TTC	2	CCCATTTCT:CCTATTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.91666666666669	0	30.249999999999996	0.0251332418122965	0	-Inf	0.0251332418122965	0.0177543494375023	0	NA	NA	0.0177373235548987	0.156491922034197	862	138	0	0	0.862	0.001
ORF3a	all	ss12	180	TCT	TTC	TGA	2	ATTTCTGAA:ATTTCTGAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.25000000000001	0	30.583333333333332	0.0253456008907939	0	-Inf	0.0253456008907939	0.017863264144564	0	NA	NA	0.0170232652224922	0.136518943685511	880	120	0	0	0.88	0.001
ORF3a	all	ss12	181	GAA	TGA	ACA	2	TCTGAACAT:TCTGAGGAC	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.58333333333334	0	30.916666666666664	0.0252389746234555	0	-Inf	0.0252389746234555	0.018551475744082	0	NA	NA	0.0185459632234753	0.173549157484332	881	119	0	0	0.881	0.001
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	CGA	2	GAACATGAC:GAGGACGAC	1:1	FALSE	1.5	0	1.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.66666666666669	0	31.916666666666664	0.0248985520571968	0	-Inf	0.0248985520571968	0.0171278868530175	0	NA	NA	0.0169595048660216	0.14207220994276	879	121	0	0	0.879	0.001
ORF3a	all	ss12	183	GAC	CGA	CTA	2	CATGACTAC:GACGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.16666666666669	0	30.749999999999996	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.0125496129180184	0	NA	NA	0.0125179691228389	0.326983501672985	627	373	0	0	0.627	0.001
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000001	0	30.749999999999996	0.0123714145268332	0	-Inf	0.0123714145268332	0.0121801904947425	0	NA	NA	0.01229603207871	0.314352735241904	652	348	0	0	0.652	0.001
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.16666666666669	0	30.083333333333332	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.0126767916762374	0	NA	NA	0.0123069797210753	0.318758454012819	645	355	0	0	0.645	0.001
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666669	0	29.083333333333332	0.0124226442537559	0	-Inf	0.0124226442537559	0.0125141528568932	0	NA	NA	0.0127151414920298	0.32857105958464	635	365	0	0	0.635	0.001
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666669	0	29.083333333333332	0.0124226442537559	0	-Inf	0.0124226442537559	0.012854940536498	0	NA	NA	0.0126351156335662	0.325516859774044	644	356	0	0	0.644	0.001
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAC:GGTGGTTAT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.66666666666669	0	29.583333333333332	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0125135863479594	0	NA	NA	0.0125313827245777	0.318512772161145	639	361	0	0	0.639	0.001
ORF3a	all	ss12	189	TAC	TTA	CAC	2	GGTTACACG:GGTTATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.66666666666669	0	29.583333333333332	0.0128208250194751	0	-Inf	0.0128208250194751	0.0130425344447178	0	NA	NA	0.0124908892790504	0.304696429260771	629	371	0	0	0.629	0.001
ORF3a	all	ss12	190	ACG	CAC	GGA	2	TACACGGAA:TATACTGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.66666666666667	0	29.249999999999996	0.0129873375085957	0	-Inf	0.0129873375085957	0.013169546487512	0	NA	NA	0.0134054347300187	0.332639315493609	638	362	0	0	0.638	0.001
ORF3a	all	ss12	191	GAA	GGA	AAA	2	ACGGAAAAG:ACTGAAAAA	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333334	0	29.583333333333332	0.0130438070339019	0	-Inf	0.0130438070339019	0.0127593308043399	0	NA	NA	0.012907316371607	0.312220042390437	644	356	0	0	0.644	0.001
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAAAAGTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333334	0	29.083333333333332	0.0133041182530362	0	-Inf	0.0133041182530362	0.0132159350618489	0	NA	NA	0.0136960060827984	0.331355745366153	622	378	0	0	0.622	0.001
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GGA	2	AAATGGGAA:AAGTGGGAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333334	0	29.083333333333332	0.0133041182530362	0	-Inf	0.0133041182530362	0.0132449300474468	0	NA	NA	0.0135644840556013	0.326688749620461	614	386	0	0	0.614	0.001
ORF3a	all	ss12	194	GAA	GGA	ATC	2	TGGGAATCT:TGGGAGTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000001	0	29.583333333333332	0.0134532755150005	0	-Inf	0.0134532755150005	0.0139031074205128	0	NA	NA	0.0138980404472991	0.333045362864663	645	355	0	0	0.645	0.001
ORF3a	all	ss12	195	TCT	ATC	TGG	2	GAATCTGGA:GAGTCTGGT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333334	0	29.083333333333332	0.0134835092215562	0	-Inf	0.0134835092215562	0.0135004857254595	0	NA	NA	0.0131799397752016	0.306292390567782	610	390	0	0	0.61	0.001
ORF3a	all	ss12	196	GGA	TGG	AGT	2	TCTGGAGTA:TCTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333334	0	29.249999999999996	0.0133932130500048	0	-Inf	0.0133932130500048	0.0136094830287472	0	NA	NA	0.013122805471245	0.307441179984351	650	350	0	0	0.65	0.001
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333334	0	29.583333333333332	0.0133932130500048	0	-Inf	0.0133932130500048	0.0136561450802247	0	NA	NA	0.0136499208715926	0.326497350061631	652	348	0	0	0.652	0.001
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAGGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.5	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666669	0	30.166666666666664	0.0133782811395161	0	-Inf	0.0133782811395161	0.0126318657163283	0	NA	NA	0.0136885900408427	0.328405392133255	616	384	0	0	0.616	0.001
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTG	2	AAAGACTGT:AAGGACTGT	1:1	FALSE	2	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666669	0	29.916666666666664	0.013423177093157	0	-Inf	0.013423177093157	0.0137909334964331	0	NA	NA	0.0133542432295013	0.314818876359825	617	383	0	0	0.617	0.001
ORF3a	all	ss12	200	TGT	CTG	TGT	2	GACTGTGTT	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333336	0	29.58333333333333	0.0133932130500048	0	-Inf	0.0133932130500048	0.0134003780039075	0	NA	NA	0.0139861287613538	0.338261031336166	668	332	0	0	0.668	0.001
ORF3a	all	ss12	201	GTT	TGT	TGT	2	TGTGTTGTA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666669	0	29.91666666666666	0.013423177093157	0	-Inf	0.013423177093157	0.0134493437223338	0	NA	NA	0.0135515756862156	0.321917482595613	654	346	0	0	0.654	0.001
ORF3a	all	ss12	202	GTA	TGT	ATT	2	GTTGTATTA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.66666666666669	0	30.41666666666666	0.0135138791270087	0	-Inf	0.0135138791270087	0.0132718132868437	0	NA	NA	0.013500297214288	0.316823885670394	633	367	0	0	0.633	0.001
ORF3a	all	ss12	203	TTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTATTACAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666669	0	30.91666666666666	0.0274630224286674	0	-Inf	0.0274630224286674	0.0199836614371604	0	NA	NA	0.020078610152746	0.17138249312634601	869	131	0	0	0.869	0.001
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	TTACACAGT:TTACATAGT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666669	0	30.583333333333325	0.0274630224286674	0	-Inf	0.0274630224286674	0.0198340425184017	0	NA	NA	0.0191527618368235	0.151602631368091	856	144	0	0	0.856	0.001
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	TTA	2	CACAGTTAC:CATAGTTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.66666666666669	0	30.083333333333325	0.0276529018562458	0	-Inf	0.0276529018562458	0.0199371055921911	0	NA	NA	0.0208482978226268	0.18471169104241	846	154	0	0	0.846	0.001
ORF3a	all	ss12	206	TAC	TTA	CTT	2	AGTTACTTC:AGTTATTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.00000000000003	0	30.083333333333325	0.0279101972553257	0	-Inf	0.0279101972553257	0.020201314609322	0	NA	NA	0.0208541347827474	0.180781339121422	860	140	0	0	0.86	0.001
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.83333333333336	0	30.249999999999993	0.0279752710599065	0	-Inf	0.0279752710599065	0.0203139186256909	0	NA	NA	0.0213551523475372	0.190195495246041	832	168	0	0	0.832	0.001
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CTC	2	TTCACCTCA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.50000000000003	0	29.583333333333325	0.0285069944752381	0	-Inf	0.0285069944752381	0.0207877480440156	0	NA	NA	0.0199419457189913	0.152860818768883	874	126	0	0	0.874	0.001
ORF3a	all	ss12	209	TCA	CTC	AGA	2	ACCTCAGAT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.83333333333336	0	30.249999999999993	0.0287805096612113	0	-Inf	0.0287805096612113	0.0210108364819995	0	NA	NA	0.0202590009478775	0.155424852711921	889	111	0	0	0.889	0.001
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	TCAGACTAT:TCAGATTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.50000000000003	1	29.583333333333325	0.0285069944752381	0.0345882615712242	0.82418118691905	-0.00608126709598607	0.0209249686767383	0.0385953643974484	NA	NA	0.0450492864799764	0.892618659066924	446	36	518	0.518	0.446	0.892
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GATTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.83333333333337	1	29.583333333333325	0.0283721774047871	0.0345882615712242	0.820283417435221	-0.00621608416643708	0.0193120696779738	0.0375969926660805	NA	NA	0.0436750156988793	0.886822621181558	442	45	513	0.513	0.442	0.884
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.1666666666667	1	29.91666666666666	0.0282386296527662	0.0341939559917542	0.82583687186051	-0.00595532633898797	0.0199797950558564	0.0360243107922861	NA	NA	0.0418415615117514	0.886819032351826	437	38	525	0.525	0.437	0.874
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.83333333333337	1	30.249999999999993	0.0283721774047871	0.0338085407384937	0.839201479420351	-0.00543636333370658	0.0200805135619068	0.0393212213518006	NA	NA	0.0422610462022259	0.897644342254044	436	43	521	0.521	0.436	0.872
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC	2	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.1666666666667	1	29.583333333333325	0.0282386296527662	0.0345882615712242	0.816422345905336	-0.00634963191845796	0.0197128722450646	0.0370478765528368	NA	NA	0.0428831419731256	0.882288903607873	471	50	479	0.479	0.471	0.942
ORF3a	all	ss12	215	TAC	GTA	CTC	2	CTGTACTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.16666666666671	1	28.916666666666657	0.02784542552167	0.0354048034273472	0.786487222808918	-0.00755937790567723	0.020350558997598	0.039117912967085	NA	NA	0.0444570632055953	0.864980468051703	439	45	516	0.516	0.439	0.878
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	TACTCAACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.16666666666671	1	27.916666666666657	0.0282386296527662	0.0367045717801664	0.769349110565708	-0.0084659421274002	0.0215954824623348	0.0430473646215413	NA	NA	0.0463200869719401	0.85497815265642	443	43	514	0.514	0.443	0.886
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACACAA:TCAACTCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.83333333333337	1	26.916666666666657	0.0283721774047871	0.0381034317265946	0.744609504161394	-0.00973125432180744	0.0195536274882967	0.0419807686029008	NA	NA	0.0474271926424098	0.837429140148085	455	48	497	0.497	0.455	0.91
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AGT	2	ACACAAGTG:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.1666666666667	1	27.583333333333325	0.0286430990492924	0.0371593024135724	0.770819073256621	-0.00851620336428	0.0219062277703866	0.0409668781327775	NA	NA	0.0473045706173539	0.857129655046239	455	48	497	0.497	0.455	0.91
ORF3a	all	ss12	219	GTG	AGT	GAG	2	CAAGTGAGT:CAATTGAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.916666666666667	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.1666666666667	1	26.916666666666657	0.0286430990492924	0.0381034317265946	0.751719668055535	-0.00946033267730215	0.0214849677275024	0.041654275640494	NA	NA	0.0476582318853853	0.84265103428489	446	52	502	0.502	0.446	0.892
ORF3a	all	ss12	220	AGT	GAG	TAC	2	GTGAGTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.1666666666667	1	26.833333333333325	0.0141848199798651	0.0382248326940206	0.371089131858621	-0.0240400127141555	0.0150561382606309	0.0399981936899934	NA	NA	0.0461900876691768	0.602744211946092	282	125	593	0.593	0.282	0.564
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	AGTACAGAC	2	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.50000000000004	1	26.833333333333325	0.0143202441116848	0.0382248326940206	0.374631963109281	-0.0239045885823359	0.0150700551368863	0.0419464123093881	NA	NA	0.0428637022359904	0.577057195063275	257	141	602	0.602	0.257	0.514
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.50000000000004	1	26.833333333333325	0.0143202441116848	0.0382248326940206	0.374631963109281	-0.0239045885823359	0.0141619811844803	0.0460702614779849	NA	NA	0.0450216561926143	0.595448191152165	271	109	620	0.62	0.271	0.542
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	68.83333333333339	1	26.499999999999993	0.0146703943908702	0.0387182740539804	0.378901042190491	-0.0240478796631102	0.0152180541181137	0.0433587777155272	NA	NA	0.0449464991848478	0.592626740336703	267	139	594	0.594	0.267	0.534
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TGT	2	ACTGGTGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	68.16666666666671	1	27.166666666666657	0.0148152965521744	0.0377438129156368	0.392522519791226	-0.0229285163634624	0.0159943369461837	0.0394707089638853	NA	NA	0.0455906855297176	0.615019766511182	274	132	594	0.594	0.274	0.548
ORF3a	all	ss12	225	GTT	TGT	TGA	2	GGTGTTGAA	2	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	67.16666666666671	1	28.166666666666657	0.0150380977841708	0.0363707624539579	0.413466663043088	-0.0213326646697871	0.0151946917148438	0.040389730703344603	NA	NA	0.0424114126945549	0.61496884613622	267	131	602	0.602	0.267	0.534
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	ACA	2	GTTGAACAT	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	67.50000000000004	1	28.166666666666657	0.0149630898145115	0.0363707624539579	0.411404348024143	-0.0214076726394464	0.0156862905753304	0.0385922210160387	NA	NA	0.044663628470781	0.631718923309893	286	121	593	0.593	0.286	0.572
ORF3a	all	ss12	227	CAT	ACA	TGT	2	GAACATGTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GTT	TGT	TAC	2	CATGTTACC:CATGTTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACC	TAC	CTT	2	GTTACCTTC:GTTACTTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	CTT	CTT	2	ACCTTCTTC:ACTTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAT	CAA	TAA	2	TACAATAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	TAA	AAT	2	AATAAAATT	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TGA	2	ATTGTTGAT	2	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	GAT	TGA	TGA	2	GTTGATGAG	2	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	TGA	GCC	2	GATGAGCCT	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCT	GCC	TGA	2	GAGCCTGAA	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	GAA	TGA	AGA	2	CCTGAAGAA	2	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	GAA	AGA	ACA	2	GAAGAACAT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	CAT	ACA	TGT	2	GAACATGTC:GAACATGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	CATGTCCAA:CATGTTCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTTCAAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATT	AAT	TCA	2	CAAATTCAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	TCA	CAC	2	ATTCACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGT	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGT	CGG	TAC	2	GACGGTACA:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	ACA	TAC	ATC	2	GGTACATCT:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCC	ATC	CGG	2	ACATCTGGA:TCATCCGGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.833333333333333	0.666666666666667	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	CGG	AGT	2	TCCGGAGTT:TCTGGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTT	TGT	TAA	2	GTTGTTAAT	2	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	TAA	TCC	2	GTTAATCCA	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAA:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA	2	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.33333333333333	5	32.50000000000001	0.217865342534542	0.172180831233375	1.26532867203577	0.0456845113011671	0.0596239294764389	0.084234581129242	NaN	NaN	0.0981625710411698	0.641647581671915	720	0	280	0.28	0.72	0.56
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.16666666666666	5	32.333333333333336	0.235492518065836	0.173179167487274	1.35982013011548	0.0623133505785623	0.0630159570560829	0.0884867061743192	NaN	NaN	0.103791869079723	0.548260792784456	707	0	293	0.293	0.707	0.586
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.33333333333333	5	32.833333333333336	0.238441468231124	0.17021844254226	1.40079690937089	0.068223025688864	0.062605912205220507	0.0841672128892556	NaN	NaN	0.103765562915916	0.510877013777775	746	0	254	0.254	0.746	0.508
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.16666666666666	5	32.333333333333336	0.239040218372072	0.173179167487274	1.38030585225926	0.0658610508847978	0.0637853070169209	0.0834269181976317	NaN	NaN	0.101352259139294	0.515806421487988	734	0	266	0.266	0.734	0.532
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.66666666666666	5	31.83333333333334	0.24085480398197	0.176245193423779	1.36658934807282	0.0646096105581911	0.0635014420050022	0.0870942717767641	NaN	NaN	0.107839408412121	0.549087522067002	734	0	266	0.266	0.734	0.532
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGAATTTTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.16666666666666	5	31.83333333333334	0.239040218372072	0.176245193423779	1.35629354610144	0.0627950249482928	0.0593634458979235	0.0820521533278311	NaN	NaN	0.106758261210457	0.556399215972092	722	0	278	0.278	0.722	0.556
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTTACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.66666666666666	5	32.50000000000001	0.244568640424989	0.172180831233375	1.42041735234452	0.072387809191614	0.0633284094768272	0.0857980590576916	NaN	NaN	0.103616638025821	0.48479464809777	779	0	221	0.221	0.779	0.442
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.99999999999999	5	32.16666666666667	0.243317923578779	0.174189200634338	1.39685998151836	0.0691287229444414	0.0629327980209825	0.0825035803135928	NaN	NaN	0.0975731405367382	0.478646564060844	779	0	221	0.221	0.779	0.442
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACTCTTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.66666666666666	5	32.50000000000001	0.244568640424989	0.172180831233375	1.42041735234452	0.072387809191614	0.0651802353977275	0.0827761713750575	NaN	NaN	0.108591015278189	0.505021559379699	753	0	247	0.247	0.753	0.494
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGATCA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.49999999999999	5	32.50000000000001	0.245198876012612	0.172180831233375	1.42407766448907	0.0730180447792366	0.0643506016780247	0.0867391560495941	NaN	NaN	0.103143683717349	0.478991517749005	761	0	239	0.239	0.761	0.478
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGATCAATT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.83333333333331	5	32.833333333333336	0.243941664762154	0.17021844254226	1.43310948636832	0.0737232222198933	0.0642144038180813	0.0830469299451219	NaN	NaN	0.106768115012204	0.48988075905409	761	0	239	0.239	0.761	0.478
ORF3a	all	ss12	13	ATT	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATTACT	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.49999999999999	5	32.5	0.223869741416997	0.172180831233375	1.30020130471761	0.0516889101836223	0.0624088065669991	0.0850052995168314	NaN	NaN	0.104533171531755	0.620971634734792	693	0	307	0.307	0.693	0.614
ORF3a	all	ss12	14	ACT	AAC	TGC	2	ATTACTGCA:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.74999999999999	5	32.41666666666667	0.205912255736412	0.172678550040526	1.19245995341105	0.0332337056958866	0.0595819382103348	0.0888049885543377	NaN	NaN	0.0977938492498806	0.733981305139982	665	0	335	0.335	0.665	0.67
ORF3a	all	ss12	15	GCA	TGC	ACA	2	ACTGCACAG:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.99999999999999	5	32.16666666666667	0.222199362107379	0.174189200634338	1.2756207692452	0.0480101614730418	0.0607149049098271	0.0827995621259962	NaN	NaN	0.099709180214344	0.630159817192618	679	0	321	0.321	0.679	0.642
ORF3a	all	ss12	16	AAG	ACA	GCA	2	GCACAGTCA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.41666666666666	4	32.66666666666667	0.206933202001177	0.133686173554739	1.54790279726607	0.0732470284464383	0.0603784811446632	0.0721088738515363	NaN	NaN	0.0904317031520359	0.417957025025703	787	0	213	0.213	0.787	0.426
ORF3a	all	ss12	17	CAA	GCA	AGG	2	AAGCAAGGT:CAGTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.16666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.58333333333333	4	32.333333333333336	0.189637541338727	0.135196367873208	1.40268221936684	0.0544411734655187	0.0577433637196243	0.0718765113160324	NaN	NaN	0.0891914466767039	0.541606413976066	722	0	278	0.278	0.722	0.556
ORF3a	all	ss12	18	GGA	AGG	AAA	2	CAAGGTGAA:TCAGGAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.58333333333333	3	31.499999999999996	0.186896837565466	0.101851155869296	1.8349996715335	0.0850456816961693	0.0571164005641031	0.064705343092159	NaN	NaN	0.0915510633045794	0.352918840377631	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	19	AAA	AAA	AAT	2	GGAAAAATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.74999999999999	3	31.499999999999996	0.186447776478305	0.101851155869296	1.83059067800438	0.0845966206090083	0.055719812868196	0.0623569999242173	NaN	NaN	0.0840133294421335	0.31396224308212	822	2	176	0.176	0.822	0.352
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAAATTGAC:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.41666666666666	3	31.166666666666664	0.168736159344387	0.103018812035868	1.63791598844722	0.0657173473085189	0.0549088803409739	0.0671650797527323	NaN	NaN	0.0796407644909111	0.409273816436375	820	0	180	0.18	0.82	0.36
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	CAA	2	ATCAAGGAT:ATTGACAAT	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.25	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.91666666666666	3	31.833333333333332	0.16993600795279	0.100709711722406	1.68738451383118	0.0692262962303841	0.0537610087353892	0.0627084860831845	NaN	NaN	0.0845016158602869	0.412654948790381	811	0	189	0.189	0.811	0.378
ORF3a	all	ss12	22	AAT	CAA	TGC	2	AAGGATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.16666666666666	3	32.5	0.142269048679191	0.0985020015458152	1.44432647506172	0.0437670471333758	0.0447938622219366	0.0600988068858706	NaN	NaN	0.0730335388708964	0.548990674494041	741	0	259	0.259	0.741	0.518
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.83333333333333	3	32.166666666666664	0.127364024533652	0.0995936054863591	1.27883737024759	0.0277704190472926	0.0449658714926839	0.0629310767931923	NaN	NaN	0.0733920636843739	0.705144983749116	667	0	333	0.333	0.667	0.666
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.33333333333333	3	32.666666666666664	0.128273860987016	0.0979651368127982	1.3093827575838	0.0303087241742174	0.0445426885476599	0.0600375574183075	NaN	NaN	0.07476196137725	0.685181298821131	684	0	316	0.316	0.684	0.632
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.33333333333333	4	32.666666666666664	0.112888706112188	0.133686173554739	0.844430677537232	-0.0207974674425507	0.0385696672836029	0.0721226605414338	NaN	NaN	0.0830619219672541	0.80228955301259	412	1	587	0.587	0.412	0.824
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AGA	2	CCTGCAGGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.583333333333333	0.75	0.416666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.66666666666666	4	31.999999999999996	0.110800159129969	0.136741167595466	0.810291158678409	-0.0259410084654974	0.0407136404949261	0.0770752545085913	NaN	NaN	0.086033854393665	0.763017286358113	377	0	623	0.623	0.377	0.754
ORF3a	all	ss12	27	GAT	AGA	TAC	2	GCAGGTACT:TCAGATTTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.41666666666666	4	32.25	0.0963522329653767	0.135579277355344	0.710670796045359	-0.0392270443899672	0.0373391377009058	0.0773136027009946	NaN	NaN	0.0822424063423283	0.633384490186831	308	0	692	0.692	0.308	0.616
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	GATTTTGTT:GGTACTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.99999999999999	3	32.666666666666664	0.111834664347976	0.0979651368127982	1.14157615644105	0.0138695275351777	0.042434203577252	0.061933816036182	NaN	NaN	0.0695888998711477	0.842022911024621	542	1	457	0.457	0.542	0.914
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.99999999999999	2	33	0.111834664347976	0.0631952577133049	1.76966861746701	0.048639406634671	0.0415668520287728	0.0457555144772464	NaN	NaN	0.0643705646311667	0.449879664448401	772	0	228	0.228	0.772	0.456
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.16666666666666	2	33.5	0.111574227897278	0.0622118122355632	1.79345728548793	0.0493624156617148	0.042157494149199	0.0450938421961393	NaN	NaN	0.0624174390792237	0.429035418603705	787	1	212	0.212	0.787	0.424
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACA:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.58333333333333	1	32.916666666666664	0.126023271644748	0.0310121698640216	4.0636715262853	0.0950111017807263	0.0434514223198957	0.0325271932667944	NaN	NaN	0.0540234700709735	0.0786283988653552	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	32	ACA	TAC	AGC	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79	1	32.5	0.123566424807041	0.0314182062818701	3.93295606052296	0.0921482185251714	0.0436464902373523	0.0320102698023861	NaN	NaN	0.0551151890971651	0.0945399854289413	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	33	GCA	AGC	AAC	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.33333333333333	1	31.833333333333332	0.121340215764185	0.0320904564039067	3.78119320700634	0.0892497593602784	0.0397231931164352	0.0322355622299611	NaN	NaN	0.0546284436606934	0.10230928032353	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.08333333333333	1	32.416666666666664	0.121751485582717	0.031500692980973	3.86504149785712	0.0902507926017442	0.0415638044292107	0.0326234294616462	NaN	NaN	0.0557886735310207	0.105721641144056	956	0	44	0.044	0.956	0.088
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.08333333333333	1	33.08333333333333	0.123424890893523	0.0308526791703671	4.00045941592225	0.0925722117231563	0.0409583302510061	0.0304792464686122	NaN	NaN	0.0542319052042611	0.0878277091502637	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333333	1	33.75	0.125145045452681	0.0302307926160697	4.13965478980389	0.094914252836611	0.0432451825209198	0.0314844576794601	NaN	NaN	0.0554502176767918	0.0869515854379204	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCGCTACAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333333	1	33.75	0.125145045452681	0.0302307926160697	4.13965478980389	0.094914252836611	0.0441796720851066	0.0318978115519319	NaN	NaN	0.0550639398038252	0.0847602444149743	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAGGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.58333333333333	1	33.916666666666664	0.109408627044446	0.0300792190929219	3.63734931769527	0.0793294079515242	0.0398176600605513	0.032075318722106	NaN	NaN	0.0533455494939625	0.136992157354514	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA:CAGGCCTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.33333333333333	1	33.666666666666664	0.12471051706475	0.0303071537534075	4.11488713455081	0.0944033633113424	0.0435436985735703	0.032129677028871	NaN	NaN	0.0542323341353742	0.0817324941123502	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.33333333333333	1	33.666666666666664	0.12471051706475	0.0303071537534075	4.11488713455081	0.0944033633113424	0.0435089535825556	0.0301848529066852	NaN	NaN	0.0552547293626363	0.0875413980030073	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.16666666666666	1	33	0.138321779350139	0.0309322189005369	4.47177035035591	0.107389560449603	0.0444338155574575	0.0320158368497405	NaN	NaN	0.0583474598924249	0.065692198294607193	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.49999999999999	1	32.666666666666664	0.137685157650863	0.0312545223004261	4.40528753974865	0.106430635350437	0.0445837645522457	0.0322633532404915	NaN	NaN	0.0573315622446128	0.0633957618113874	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.49999999999999	1	32.666666666666664	0.137685157650863	0.0312545223004261	4.40528753974865	0.106430635350437	0.044009666417832	0.0332806227401186	NaN	NaN	0.0573566016198077	0.0635112766524335	972	0	28	0.028	0.972	0.056
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.16666666666666	1	33	0.138321779350139	0.0309322189005369	4.47177035035591	0.107389560449603	0.0441801676258086	0.030237125080075	NaN	NaN	0.0568162925498955	0.0587420315091121	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.16666666666666	1	33	0.138321779350139	0.0309322189005369	4.47177035035591	0.107389560449603	0.0448244910258077	0.0309609640392469	NaN	NaN	0.0585420145169031	0.0665944140687815	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.99999999999999	1	33.5	0.14059721722078	0.0304610393656427	4.6156408365816	0.110136177855137	0.0462649666800225	0.0319946684235851	NaN	NaN	0.0589353627970625	0.0616559069144954	966	0	34	0.034	0.966	0.068
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TAT	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.99999999999999	1	33.5	0.14059721722078	0.0304610393656427	4.6156408365816	0.110136177855137	0.0459572649477737	0.0316807931956902	NaN	NaN	0.0555342005818581	0.04734358345676	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	48	ATT	TAT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.83333333333331	1	33.5	0.125582619575832	0.0304610393656427	4.12272930245045	0.095121580210189	0.0427771621299942	0.0313820767569376	NaN	NaN	0.0555763584730131	0.0869800811199955	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.66666666666664	1	33.5	0.110800159129969	0.0304610393656427	3.63743855880838	0.0803391197643259	0.0405382433469391	0.0328918744139145	NaN	NaN	0.0522460342632444	0.124120144190683	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.16666666666664	1	34	0.111574227897278	0.0300040009602743	3.71864499154641	0.0815702269370036	0.0401208574821243	0.0310178410162775	NaN	NaN	0.0498579673075205	0.101828705640162	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.66666666666664	1	33.5	0.110800159129969	0.0304610393656427	3.63743855880838	0.0803391197643259	0.0397884648855074	0.031782500681696003	NaN	NaN	0.0523080533636625	0.124566750739506	928	0	72	0.072	0.928	0.144
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.16666666666664	1	34	0.124999865819317	0.0300040009602743	4.16610657974642	0.0949958648590424	0.0411356631108659	0.0316966542319093	NaN	NaN	0.0522691335433796	0.0691502043894957	974	0	26	0.026	0.974	0.052
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.33333333333331	1	34.166666666666664	0.109784651326779	0.0298546878003148	3.67730026390097	0.0799299635264639	0.0394216925406528	0.0301869440508593	NaN	NaN	0.0507028822813103	0.114924836801588	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.66666666666664	1	33.83333333333333	0.109283858386045	0.0301548153585304	3.6240931037613	0.079129043027515	0.0383847398326488	0.0307403180764088	NA	NA	0.0518457418919088	0.126950115074248	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.49999999999997	2	34.33333333333333	0.109533681430367	0.0606390724718212	1.80632184770417	0.0488946089585459	0.0367290773796091	0.0450497398629638	NaN	NaN	0.0601391080265122	0.41620362322363	806	0	194	0.194	0.806	0.388
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.16666666666664	2	34.33333333333333	0.108541192153805	0.0606390724718212	1.78995468976284	0.0479021196819838	0.0388350221694659	0.0457411549630122	NaN	NaN	0.0603909316188535	0.427660991891188	777	0	223	0.223	0.777	0.446
ORF3a	all	ss12	57	CAG	TCA	GAG	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.24999999999999	2	34.75	0.124855023415448	0.0598821656332629	2.08501182439024	0.0649728577821854	0.0404633536766491	0.0435865794557138	NaN	NaN	0.0646892343985536	0.315193367065769	867	0	133	0.133	0.867	0.266
ORF3a	all	ss12	58	AGC	GAG	CGC	2	CAGAGCGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.74999999999999	2	34.75	0.123992985319038	0.0598821656332629	2.07061625122928	0.0641108196857748	0.040931291386101	0.0422559268294881	NaN	NaN	0.0648828212767801	0.323102890970018	839	0	161	0.161	0.839	0.322
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TAC	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.41666666666666	2	35.416666666666664	0.126318765773573	0.0587096677913667	2.15158372591145	0.0676090979822058	0.0434428194284317	0.0407749256225653	NaN	NaN	0.0641359111618114	0.291812625686893	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	60	ACC	TAC	CAA	2	GCTACCAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.74999999999999	2	35.08333333333333	0.12572916000110201	0.0592901175479514	2.12057532015209	0.0664390424531508	0.0418610542795968	0.0424230606071954	NaN	NaN	0.0626069673496033	0.288595182447266	872	0	128	0.128	0.872	0.256
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	ACCAAAATA:TCCAAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.91666666666666	2	34.916666666666664	0.110417145764054	0.059584670169267	1.85311331673705	0.0508324755947867	0.0375642195316153	0.0436933973720708	NaN	NaN	0.0608865537469684	0.40378981197416	815	1	184	0.184	0.815	0.368
ORF3a	all	ss12	62	ATA	AAT	AAT	2	AAAATAATT:AAAATCATA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.91666666666666	2	35.58333333333333	0.11196533988639	0.058423686245627	1.91643744312301	0.0535416536407632	0.0385524582028378	0.0419911584491901	NaN	NaN	0.0585061159199813	0.3601148481492	826	0	174	0.174	0.826	0.348
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATAATTGCG:ATCATAACC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.74999999999999	2	35.58333333333333	0.127514764415745	0.058423686245627	2.18258676591618	0.0690910781701176	0.04200740030619	0.0424742355444337	NaN	NaN	0.0611250630800333	0.258340053460812	877	0	123	0.123	0.877	0.246
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTC	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.91666666666666	2	36.08333333333333	0.129042071919527	0.0575822255219405	2.24100528852185	0.0714598463975861	0.041771899547775	0.0450168963231557	NaN	NaN	0.0616888519564293	0.24670427559808	868	0	132	0.132	0.868	0.264
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.33333333333333	2	36.33333333333333	0.112888706112188	0.0571705240409132	1.97459631525157	0.0557181820712752	0.0388589266918195	0.0428004766224236	NaN	NaN	0.0609771632883624	0.360845646492437	823	0	177	0.177	0.823	0.354
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTCAATAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.33333333333333	2	36.33333333333333	0.112888706112188	0.0571705240409132	1.97459631525157	0.0557181820712752	0.037912353836727	0.0445607837311601	NaN	NaN	0.060302768589839	0.355499923923585	838	0	162	0.162	0.838	0.324
ORF3a	all	ss12	67	AAA	AAA	AAG	2	AAAAAGAGA:AATAAAAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.74999999999999	2	37	0.113827458253345	0.0561009098120238	2.0289770457332	0.0577265484413209	0.0401119034501203	0.0414380983234337	NaN	NaN	0.0594050666359884	0.331177658636137	837	0	163	0.163	0.837	0.326
ORF3a	all	ss12	68	AGA	AAG	ATG	2	AAAAGATGG:AAGAGATGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.99999999999999	2	36.833333333333336	0.128887692694994	0.0563645417845084	2.28668039541162	0.072523150910486	0.0434281011959111	0.0408341298436476	NaN	NaN	0.0630694889240924	0.250188028710938	876	0	124	0.124	0.876	0.248
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGATGGCAG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.99999999999999	2	37.166666666666664	0.128887692694994	0.0558397336460622	2.30817169565929	0.0730479590489322	0.0407901791167182	0.0396938525381429	NaN	NaN	0.0612638300628271	0.233123836759545	890	1	109	0.109	0.89	0.218
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.33333333333331	2	37.5	0.13013319533385	0.0553246126797069	2.35217544291246	0.074808582654143	0.0402594635081739	0.0400398999688664	NaN	NaN	0.0590502101744457	0.205203940039026	887	0	113	0.113	0.887	0.226
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTAGCC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	74.99999999999997	3	37.5	0.146808432844572	0.0845966206090083	1.73539358650148	0.0622118122355632	0.0445793050806871	0.0482716022839587	NaN	NaN	0.0634660149650946	0.32696855260994	869	0	131	0.131	0.869	0.262
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTAGCCCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.0833333333333	3	36.75	0.177072557482515	0.0864264476831886	2.04882373659051	0.090646109799326	0.0555985439023368	0.0523295402405284	NaN	NaN	0.0709000421075618	0.201071167145103	904	0	96	0.096	0.904	0.192
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCCCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.24999999999997	3	36.75	0.176636132337568	0.0864264476831886	2.04377406537705	0.090209684654379	0.054581020263832	0.0523320563767828	NaN	NaN	0.072695526838185	0.214633517288352	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	74	TAT	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTTTATAAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.24999999999997	3	36.083333333333336	0.174062299764764	0.0881207952860292	1.97526927894578	0.0859415044787347	0.0563702455775927	0.0533047046298165	NaN	NaN	0.0729769328418021	0.238934968116148	878	0	122	0.122	0.878	0.244
ORF3a	all	ss12	75	AAG	CAA	GGG	2	TATAAGGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.5833333333333	2	36.083333333333336	0.173221017246649	0.0575822255219405	3.00823762326878	0.115638791724709	0.0549647199557549	0.0415301405017793	NaN	NaN	0.0648990696592971	0.0747777566559774	966	0	34	0.034	0.966	0.068
ORF3a	all	ss12	76	GGC	GGG	CTT	2	AAGGGCTTC:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.91666666666664	2	36.083333333333336	0.172387863428196	0.0575822255219405	2.99376868236034	0.114805637906255	0.0545147744907498	0.0410462436883748	NaN	NaN	0.0659131739581937	0.0815485682653724	961	1	38	0.038	0.961	0.076
ORF3a	all	ss12	77	GTT	CTT	CCA	2	GGCTTCCAG:GGTGTTCAC	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.83333333333331	2	35.416666666666664	0.170137650782942	0.0587096677913667	2.89794947209632	0.111427982991575	0.051161138093016	0.040793685414051	NaN	NaN	0.0638207863058231	0.0808194195451061	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	78	CAC	CCA	CTT	2	GTTCACTTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.99999999999999	2	35.166666666666664	0.185778237042605	0.0591439311842398	3.14112087787816	0.126634305858365	0.0605619993806191	0.0439104995501764	NaN	NaN	0.0674808858027472	0.0605735968370148	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	79	TTC	CTT	CAT	2	CACTTTGTT:CAGTTCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.33333333333331	2	34.166666666666664	0.166580058439327	0.0609472230590743	2.73318537052732	0.105632835380253	0.0586020105764679	0.0454305829041132	NaN	NaN	0.0665402578482173	0.112398848229217	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	80	ATT	CAT	TTG	2	TTCATTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.75	0.5	0.416666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.66666666666664	2	34.166666666666664	0.168142592913661	0.0609472230590743	2.75882287123541	0.107195369854586	0.0579665539705606	0.0440600686891188	NaN	NaN	0.0669868313479443	0.109544150401257	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	ATTTGCAAT:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.08333333333331	2	34.08333333333333	0.151718018390913	0.0611024764460933	2.4830093183664	0.0906155419448198	0.0543107936923924	0.0446630788028378	NaN	NaN	0.0657941637758228	0.168432478911198	928	0	72	0.072	0.928	0.144
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAATTTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.91666666666664	2	34.25	0.152068784169476	0.0607927570603562	2.50142930708834	0.0912760271091201	0.0523545653012966	0.0430878021019882	NaN	NaN	0.0645795119737993	0.157541126674558	936	0	64	0.064	0.936	0.128
ORF3a	all	ss12	83	TTA	CTT	ACT	2	AACTTGCTG:AATTTACTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.91666666666664	2	34.25	0.152068784169476	0.0607927570603562	2.50142930708834	0.0912760271091201	0.0542437625425765	0.0434275211837613	NaN	NaN	0.0657996935716975	0.165386844539406	937	0	63	0.063	0.937	0.126
ORF3a	all	ss12	84	CTG	ACT	GCT	2	TTACTGCTG:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.58333333333331	2	33.75	0.15067539576423	0.0617314855970427	2.44081920768562	0.0889439101671876	0.0552444646853416	0.0446419778324184	NaN	NaN	0.064049976899706	0.164934884094705	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss12	85	CTG	GCT	GCT	2	CTGCTGCTA:CTGTTGTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.24999999999999	3	33.75	0.164478581255283	0.094613463995175	1.73842679794147	0.0698651172601081	0.055096489855783	0.0538054806607047	NaN	NaN	0.0693620574479978	0.313813370163543	855	0	145	0.145	0.855	0.29
ORF3a	all	ss12	86	CTA	GCT	ATT	2	CTGCTATTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.74999999999999	3	33.25	0.163354604039617	0.0961313950679982	1.69928465018185	0.0672232089716185	0.0538892187153986	0.0555254933274254	NaN	NaN	0.0689949354590782	0.329897220730159	834	0	166	0.166	0.834	0.332
ORF3a	all	ss12	87	TTT	ATT	TAT	2	CTATTTATT:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.91666666666664	3	32.58333333333333	0.160791017408873	0.0982328346145694	1.63683576921871	0.0625581827943039	0.0546655225007417	0.057337494789434	NaN	NaN	0.0706677422531786	0.376025137704307	836	0	164	0.164	0.836	0.328
ORF3a	all	ss12	88	ATT	TAT	AAC	2	TTTATTACC:TTTGTAACA	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.41666666666664	3	32.08333333333333	0.159716896692547	0.0998703029515669	1.59924313807282	0.0598465937409798	0.0548624254667431	0.0605583484310105	NaN	NaN	0.0695076185819408	0.389233810661273	818	0	182	0.182	0.818	0.364
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	ATTACCATC:GTAACAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.99999999999999	3	32.33333333333333	0.145832187994725	0.0990447915097998	1.47238623830407	0.0467873964849248	0.0541171580187409	0.0590689680397979	NaN	NaN	0.066393617918947	0.480998695709023	765	1	234	0.234	0.765	0.468
ORF3a	all	ss12	90	ATC	AGT	CTA	2	ACAGTTTAC:ACCATCTAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.99999999999999	3	32.666666666666664	0.145832187994725	0.0979651368127982	1.48861312033275	0.0478670511819264	0.053335489510552	0.0578882035274658	NaN	NaN	0.0683301626861683	0.483598913661227	769	1	230	0.23	0.769	0.46
ORF3a	all	ss12	91	TAC	CTA	CTC	2	ATCTATTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	82.16666666666664	3	33.33333333333333	0.132796185811243	0.0958750286324137	1.38509670041806	0.0369211571788293	0.0510079512994557	0.0563252743232545	NaN	NaN	0.0676119525884423	0.585014788736407	720	0	280	0.28	0.72	0.56
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	82.49999999999999	3	33	0.132209431753494	0.0969087986100047	1.36426654390332	0.0353006331434894	0.0497900476744934	0.055704299789788	NaN	NaN	0.0653243100583384	0.588927794185838	718	0	282	0.282	0.718	0.564
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCACATCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	82.16666666666666	3	31.999999999999996	0.132796185811243	0.100148544468392	1.32599217009245	0.032647641342851	0.049940335909718	0.0605231481931048	NaN	NaN	0.0666850106065519	0.624431197074325	707	1	292	0.292	0.707	0.584
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TTT	2	CACCTTTTG:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.99999999999999	3	31.499999999999996	0.133091525357086	0.101851155869296	1.30672572364206	0.03124036948779	0.0505295493719546	0.058144580121701	NaN	NaN	0.0659157470005969	0.635539877320765	677	0	323	0.323	0.677	0.646
ORF3a	all	ss12	95	TTG	TTT	GCT	2	CTTTTGCTC:CTTTTGCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	83.33333333333331	3	30.833333333333332	0.130765040358583	0.104213595070396	1.25477909355542	0.026551445288187	0.0506035236939386	0.0622836433272892	NaN	NaN	0.0662593235486159	0.688626182433686	649	2	349	0.349	0.649	0.698
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	TTGCTCGTT:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	82.49999999999999	3	31.333333333333332	0.132209431753494	0.102431651254313	1.29070878126576	0.029777780499181	0.0489978203003568	0.0598186470212036	NaN	NaN	0.0670921525328581	0.657162582409718	678	1	321	0.321	0.678	0.642
ORF3a	all	ss12	97	GTC	CGT	CGC	2	CTCGTTGCT:CTTGTCGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	83.49999999999999	3	30.999999999999996	0.130479950551863	0.103612753860613	1.25930395332792	0.0268671966912497	0.0490448149593257	0.0599067804902447	NaN	NaN	0.0696779145563058	0.699799387730764	660	0	340	0.34	0.66	0.68
ORF3a	all	ss12	98	GCT	CGC	TGC	2	GTCGCTGCG:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.49999999999999	3	30.999999999999996	0.144868881092874	0.103612753860613	1.39817614815799	0.0412561272322611	0.0545654860533259	0.0611024395482237	NaN	NaN	0.0730095032204061	0.57202012313344	739	0	261	0.261	0.739	0.522
ORF3a	all	ss12	99	GCG	TGC	GGG	2	GCTGCGGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.41666666666666	3	30.583333333333332	0.143135575319406	0.105128058952294	1.36153541448301	0.0380075163671119	0.0516497880307774	0.0635247127612349	NaN	NaN	0.072373219028078	0.599472001021347	709	1	290	0.29	0.709	0.58
ORF3a	all	ss12	100	GGC	GGG	CCT	2	GCGGGTATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.91666666666666	3	31.083333333333332	0.142207556415652	0.103314927985559	1.37644732652313	0.0388926284300935	0.0483400944770529	0.0609926548806795	NaN	NaN	0.0734328581802458	0.596364866051932	697	0	303	0.303	0.697	0.606
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CCT	GGA	2	GGCCTTGAA:GGTATGGAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.08333333333333	3	31.583333333333332	0.141900893105619	0.101563372279023	1.39716602473358	0.0403375208265962	0.0530326795858238	0.0611526106790782	NaN	NaN	0.0729247086515802	0.580168041430007	737	0	263	0.263	0.737	0.526
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAGGCG:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	84.41666666666666	3	31.249999999999996	0.128933967567753	0.102724391304868	1.25514462465978	0.0262095762628851	0.0520194120631357	0.0604682724014245	NaN	NaN	0.0659966482549955	0.691267940911267	678	0	322	0.322	0.678	0.644
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CCC	2	GAAGCCCCT:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.41666666666666	3	31.249999999999996	0.143135575319406	0.102724391304868	1.39339424163249	0.040411184014538	0.0539299091559209	0.0590323336764248	NaN	NaN	0.070214986969711	0.564929512517422	710	0	290	0.29	0.71	0.58
ORF3a	all	ss12	104	CAA	CCC	ATT	2	GCCCCTTTT:GCGCAATTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.33333333333333	4	30.916666666666664	0.141443377355663	0.142015736265178	0.995969750081447	-5.72358909515958e-4	0.0530814934930576	0.07795129130351	NaN	NaN	0.0859967311485719	0.994689647391143	514	0	486	0.486	0.514	0.972
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.33333333333333	3	30.583333333333332	0.141443377355663	0.105128058952294	1.34543887488542	0.0363153184033683	0.0520413046823122	0.0656263342558827	NaN	NaN	0.0742125468718789	0.624599569089535	692	1	307	0.307	0.692	0.614
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.83333333333333	3	31.083333333333332	0.142361387151106	0.103314927985559	1.37793627626596	0.0390464591655475	0.053568523401862	0.061570441998997	NaN	NaN	0.0750636138936414	0.60293934464849	703	0	297	0.297	0.703	0.594
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CCT	2	CTCTATCTT:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	84.41666666666666	3	31.333333333333332	0.128933967567753	0.102431651254313	1.25873171025664	0.0265023163134402	0.0507398628092279	0.0656817813054547	NaN	NaN	0.0697709803381017	0.704058792096967	636	0	364	0.364	0.636	0.728
ORF3a	all	ss12	108	CTC	CCT	CTA	2	TACCTCTAT:TATCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.24999999999999	3	30.999999999999996	0.127560056151149	0.103612753860613	1.23112311369266	0.0239473022905361	0.0496365044109026	0.0628213041509642	NaN	NaN	0.0732199616877414	0.743622694724792	657	0	343	0.343	0.657	0.686
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	CTCTATGCC:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.58333333333331	3	30.999999999999996	0.127018674861012	0.103612753860613	1.22589806880229	0.0234059210003995	0.049648146205529	0.0650059728490988	NaN	NaN	0.0748533372145562	0.754515879177762	631	2	367	0.367	0.631	0.734
ORF3a	all	ss12	110	GCC	TGC	CTT	2	TATGCCTTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.24999999999999	3	31.333333333333332	0.127560056151149	0.102431651254313	1.24531875244741	0.0251284048968359	0.047320834579329	0.0633007663504534	NaN	NaN	0.071986507442384	0.727035978715831	652	1	347	0.347	0.652	0.694
ORF3a	all	ss12	111	TTA	CTT	AGT	2	GCCTTGATA:GCTTTAGTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.24999999999999	3	31.333333333333332	0.127560056151149	0.102431651254313	1.24531875244741	0.0251284048968359	0.0495657595730801	0.0647195470213135	NaN	NaN	0.0717548419395937	0.726190078763934	649	1	350	0.35	0.649	0.7
ORF3a	all	ss12	112	ATA	AGT	ATA	2	TTAGTCTAC:TTGATATAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	86.58333333333333	3	30.666666666666664	0.125421820060538	0.104821456781369	1.19652811467919	0.0206003632791687	0.0493690778699225	0.0640609663909025	NaN	NaN	0.0705048571947166	0.770146247000066	647	0	353	0.353	0.647	0.706
ORF3a	all	ss12	113	TAC	ATA	CTT	2	ATATATTTT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	87.08333333333333	3	30.666666666666664	0.11120018009293	0.104821456781369	1.06085322134823	0.006378723311561	0.0480973733710648	0.0668483711494838	NaN	NaN	0.0691199568158122	0.926471742596059	510	0	490	0.49	0.51	0.98
ORF3a	all	ss12	114	TTC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATTTTCTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	87.41666666666666	3	30.333333333333332	0.110743248522278	0.106058740537371	1.04416899504154	0.00468450798490684	0.0471268573410401	0.0647395121118409	NaN	NaN	0.0674969032100686	0.944668600320887	557	0	443	0.443	0.557	0.886
ORF3a	all	ss12	115	CTA	CTT	ACA	2	TTCTTGCAG:TTTCTACAA	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	87.08333333333333	3	29.999999999999996	0.11120018009293	0.107325632730505	1.03610085739866	0.0038745473624251	0.0475613440730957	0.0673899437729379	NaN	NaN	0.0672511040487617	0.954056781790497	523	0	477	0.477	0.523	0.954
ORF3a	all	ss12	116	CAA	ACA	ATG	2	CTACAATGC:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	88.08333333333333	3	29.33333333333333	0.136599269950544	0.109952605643907	1.24234681980103	0.026646664306637	0.0531802522269514	0.0673928744929076	NaN	NaN	0.0769072886815946	0.728983703170618	639	0	361	0.361	0.639	0.722
ORF3a	all	ss12	117	AGT	ATG	CAT	2	CAATGCATC:CAGAGTATA	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.416666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	87.5	3	29.33333333333333	0.151456007747705	0.109952605643907	1.37746628977772	0.0415034021037985	0.0582216063732265	0.0674961158884806	NaN	NaN	0.0775338978091518	0.592446826034424	717	0	283	0.283	0.717	0.566
ORF3a	all	ss12	118	ATA	CAT	AAA	2	AGTATAAAC:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	87.08333333333333	3	29.499999999999996	0.138321779350139	0.109283858386045	1.26571097866547	0.0290379209640942	0.0569556626498988	0.0652607964098387	NaN	NaN	0.0794476083268254	0.714739896598	630	1	369	0.369	0.63	0.738
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CGC	2	ATAAACTTT:ATCAACGCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	86.75	3	29.33333333333333	0.138905671262317	0.109952605643907	1.2633231422653	0.0289530656184105	0.0540897728149351	0.0646125729062561	NaN	NaN	0.0829077308004204	0.726923900109037	645	0	355	0.355	0.645	0.71
ORF3a	all	ss12	120	GCA	CGC	ATG	2	AACGCATGT:AACTTTGTA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.91666666666667	3	29.66666666666666	0.154555333162315	0.108623210908842	1.42285734208336	0.0459321222534732	0.0588614852974635	0.0672577048426781	NaN	NaN	0.0829312130883758	0.57967597769251	720	0	280	0.28	0.72	0.56
ORF3a	all	ss12	121	GTA	ATG	AAG	2	GCATGTAGA:TTTGTAAGA	1:1	TRUE	1.75	1	0.25	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.58333333333334	2	29.66666666666666	0.140988811016388	0.0706404112947758	1.99586622490142	0.0703483997216122	0.0538589546804766	0.0553390071239599	NaN	NaN	0.0731780573170735	0.336385321252791	824	0	176	0.176	0.824	0.352
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.08333333333334	2	30.16666666666666	0.127832485302701	0.0694136680239339	1.84160395123658	0.0584188172787671	0.0513166604341811	0.0499070476636559	NaN	NaN	0.0672598865655989	0.385091337539801	791	1	208	0.208	0.791	0.416
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGAATTATC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	84.91666666666667	2	30.16666666666666	0.128106083428852	0.0694136680239339	1.84554551107544	0.0586924154049182	0.048708025019254	0.0515853840491181	NaN	NaN	0.0725206243589619	0.418330917145382	804	0	196	0.196	0.804	0.392
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:ATTATCATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	83.41666666666667	2	29.999999999999996	0.130622339506704	0.069817817299509	1.87090265148726	0.0608045222071953	0.051036298408816	0.0543777936321524	NaN	NaN	0.0702586071422021	0.386798011908709	826	1	173	0.173	0.826	0.346
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATCATGAGA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	83.25	2	29.83333333333333	0.13090805413601	0.0702267037754945	1.86407800876581	0.0606813503605159	0.0519117802468354	0.0521307793543109	NaN	NaN	0.070704606371984	0.390761288118469	802	1	197	0.197	0.802	0.394
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGT:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	82.41666666666667	3	29.83333333333333	0.132355632365563	0.107970516691131	1.22584976363677	0.0243851156744315	0.052948016771732	0.0682633467192974	NaN	NaN	0.0844077084794774	0.772660363485874	595	0	405	0.405	0.595	0.81
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	TTG	2	AGATGTTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.83333333333333	3	30.166666666666664	0.148130674385878	0.106688419438138	1.38844192430622	0.0414422549477399	0.0581200972513553	0.0657230636171552	NaN	NaN	0.0882690455411831	0.638712786263797	692	0	308	0.308	0.692	0.616
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.08333333333333	3	29.999999999999996	0.147632043085198	0.107325632730505	1.37555250623029	0.040306410354693	0.0515756838641962	0.0705954251286596	NaN	NaN	0.084382455296595	0.632889799411555	685	0	315	0.315	0.685	0.63
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.08333333333333	3	30.999999999999996	0.151718018390913	0.103612753860613	1.46427937428451	0.0481052645303002	0.0556266668859902	0.0679447604544548	NaN	NaN	0.0798115177351156	0.54668441547186	744	0	256	0.256	0.744	0.512
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.91666666666666	3	30.666666666666664	0.180801327755151	0.104821456781369	1.72485036276739	0.0759798709737819	0.0620349595452958	0.0639346993411192	NaN	NaN	0.0924077480496015	0.410949404977747	808	0	192	0.192	0.808	0.384
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.08333333333331	4	30.999999999999996	0.199039887585717	0.141595553474679	1.40569306522263	0.0574443341110377	0.0726193112838756	0.0778606992373384	NaN	NaN	0.102721985871141	0.576010620898334	729	0	271	0.271	0.729	0.542
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.58333333333331	4	31.083333333333332	0.217071598340042	0.141177857059553	1.5375753879624	0.0758937412804894	0.0706716801209147	0.0792649284943634	NaN	NaN	0.100530475147476	0.450289374599342	798	0	202	0.202	0.798	0.404
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CCG	2	AAATGCCGT:AAGTGTAAA	1:1	FALSE	2	0.5	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.58333333333331	4	31.916666666666668	0.237548992808331	0.137132914796851	1.73225365449452	0.10041607801148	0.0724570784398886	0.0762951332320888	NaN	NaN	0.104970535745787	0.338763111079541	832	0	168	0.168	0.832	0.336
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CCG	ATC	2	TGCCGTTCC:TGTAAATCC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.91666666666664	4	31.75	0.236369452063806	0.137923200937065	1.71377585828843	0.0984462511267411	0.0760684534951993	0.0780371463265193	NaN	NaN	0.104061948831811	0.344130708534817	834	0	166	0.166	0.834	0.332
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AAATCCAAG:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.58333333333331	3	31.75	0.220282043117094	0.100992663859693	2.18116875719932	0.119289379257402	0.0702223295253694	0.0660308398855597	NaN	NaN	0.0949430786975274	0.208959931493244	893	0	107	0.107	0.893	0.214
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.74999999999999	3	32.25	0.219740343511106	0.0993184392369987	2.21248285010551	0.120421904274107	0.0730722911714247	0.0643585899921675	NaN	NaN	0.0998405142044338	0.227762485012517	904	0	96	0.096	0.904	0.192
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.58333333333331	3	32.25	0.220282043117094	0.0993184392369987	2.21793701964493	0.120963603880096	0.075801954418661	0.0630032746123166	NaN	NaN	0.0983677737692782	0.218806601227188	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.24999999999999	3	31.916666666666668	0.221373552730839	0.100428343016685	2.2042935896499	0.120945209714155	0.0698260777653395	0.0614772534312998	NaN	NaN	0.0937240195107092	0.196897983395177	904	0	96	0.096	0.904	0.192
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.24999999999999	3	30.916666666666668	0.218131224556612	0.103912304538584	2.0991857078448	0.114218920018028	0.0707130729681168	0.066647600118814	NaN	NaN	0.098259888892361	0.24506630816288	868	0	132	0.132	0.868	0.264
ORF3a	all	ss12	140	CTT	ACT	TTA	2	TTACTTTAT	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.58333333333333	3	30.25	0.217071598340042	0.106372646579413	2.04067121877978	0.110698951760629	0.0684984801283489	0.0674288370211553	NaN	NaN	0.100220432533334	0.269352580641592	878	0	122	0.122	0.878	0.244
ORF3a	all	ss12	141	TAT	TTA	TGA	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.91666666666666	3	29.916666666666668	0.23290063730458	0.107647107231784	2.16355685994518	0.125253530072796	0.0693668712732053	0.0676740626504515	NaN	NaN	0.104395328100852	0.230216966816926	886	0	114	0.114	0.886	0.228
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.74999999999999	3	29.583333333333336	0.236957742360063	0.108952531416164	2.1748713800412798	0.128005210943899	0.0737291414293837	0.0701701952879332	NaN	NaN	0.103624866570993	0.216728160730628	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.41666666666664	3	29.916666666666668	0.248323576611812	0.107647107231784	2.30683000219529	0.140676469380029	0.0753140640622688	0.0689199415729711	NaN	NaN	0.102016875278946	0.167909266146886	924	0	76	0.076	0.924	0.152
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAC:GCCAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.91666666666664	3	29.416666666666668	0.242952517757944	0.109617210244414	2.21637202056349	0.13333530751353	0.0730476098849939	0.0674747437465034	NaN	NaN	0.108178032898291	0.217742068778937	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.24999999999999	3	30.083333333333336	0.280251250519624	0.107006075844546	2.61902184813096	0.173245174675078	0.0809690122918214	0.0671477215603191	NaN	NaN	0.107144925210981	0.105894740249373	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.41666666666666	3	29.916666666666668	0.279555991798541	0.107647107231784	2.59696706198158	0.171908884566758	0.079355775188254	0.0730949250746941	NaN	NaN	0.114397773236973	0.13290886642322	932	0	68	0.068	0.932	0.136
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.24999999999999	3	29.416666666666668	0.280251250519624	0.109617210244414	2.55663549450626	0.17063404027521	0.0826185144761684	0.070296143872168	NaN	NaN	0.115375276788118	0.139154200608124	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.58333333333331	3	29.083333333333336	0.261293864072131	0.110971243090164	2.35460878688933	0.150322620981967	0.0805036450192435	0.070782454180552	NaN	NaN	0.111891139732729	0.179119164358837	908	0	92	0.092	0.908	0.184
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAC:TGCTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.08333333333331	3	29.583333333333336	0.263223932942835	0.108952531416164	2.41595059354246	0.154271401526671	0.0819826561901531	0.0733820691184952	NaN	NaN	0.111139765197189	0.165111271667194	930	1	69	0.069	0.93	0.138
ORF3a	all	ss12	150	CAC	GCA	CAC	2	TGGCACACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.41666666666664	3	28.916666666666668	0.261934035771843	0.11166090491713	2.34579897025051	0.150273130854714	0.0825094244326597	0.0746600864916645	NaN	NaN	0.109822411242872	0.171209286199043	911	0	89	0.089	0.911	0.178
ORF3a	all	ss12	151	ACA	CAC	ACA	2	CACACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.99999999999999	4	28.916666666666668	0.263548415128416	0.152908411727716	1.72357041807299	0.1106400034007	0.0794306684506297	0.0872256953833234	NaN	NaN	0.126013191967681	0.379941906299231	809	0	191	0.191	0.809	0.382
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ACA	TAA	2	ACACATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.16666666666664	4	28.75	0.262900256937487	0.153892310773211	1.70833913414245	0.109007946164277	0.077996851701844	0.0847159487924627	NaN	NaN	0.126761832982096	0.389820484523164	812	0	188	0.188	0.812	0.376
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATTGTTAC:CATAACTAT	1:1	TRUE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.74999999999999	4	28.5	0.247109400847682	0.155392217528976	1.59023022373436	0.0917171833187057	0.0773290980992293	0.0835739900023147	NaN	NaN	0.121294854800592	0.449558877049258	790	0	210	0.21	0.79	0.42
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.66666666666664	3	29.166666666666668	0.268852304636067	0.110629602831442	2.43020220406735	0.158222701804625	0.0834050557826729	0.0693017099580139	NaN	NaN	0.1066257578426	0.13783361108747	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666664	3	29.5	0.26683825481505	0.109283858386045	2.44169869874509	0.157554396429004	0.0809319287140946	0.0696270358561811	NaN	NaN	0.109286703900409	0.149397985384172	935	0	65	0.065	0.935	0.13
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.66666666666664	3	28.666666666666668	0.282712453350107	0.112711652287003	2.50828062239938	0.170000801063104	0.0828807084515931	0.0718365930036383	NaN	NaN	0.11350007006813	0.134184313814669	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.99999999999999	3	28.333333333333336	0.281300723192845	0.114143861506444	2.46444022026506	0.167156861686401	0.0834417583811983	0.0725547063204901	NaN	NaN	0.108726689866267	0.124194376447833	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.16666666666664	3	28.333333333333336	0.280600193443143	0.114143861506444	2.45830296732428	0.166456331936699	0.0809654943763148	0.0721422489058129	NaN	NaN	0.110218264960832	0.13098150242614	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAT:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.49999999999999	3	27.666666666666668	0.279209669341883	0.117120548066462	2.38395118492308	0.162089121275421	0.0812815988208649	0.0778563270793327	NaN	NaN	0.1180309199523	0.169666319430378	923	1	76	0.076	0.923	0.152
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATATAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.83333333333331	3	27.666666666666668	0.277833015310553	0.117120548066462	2.37219702176336	0.160712467244091	0.0848754899134443	0.072588531860254	NaN	NaN	0.109580380525623	0.142480227394981	930	0	70	0.07	0.93	0.14
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAATAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	82.33333333333331	3	27.5	0.293545893158417	0.117889187641809	2.49001540370536	0.175656705516607	0.0850940245694103	0.0747907065195954	NaN	NaN	0.111218484556803	0.114247983404584	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.99999999999999	3	27.833333333333336	0.29948343190034	0.116361886617636	2.57372444367836	0.183121545282704	0.0834838349678078	0.0692919248757348	NaN	NaN	0.11498241542145	0.111248878854061	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.99999999999999	3	28.166666666666668	0.304098831081123	0.114873729376874	2.64724435021558	0.189225101704249	0.0849272021961779	0.0695490189400005	NaN	NaN	0.118391936199904	0.109977598873003	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.16666666666664	3	28.666666666666668	0.303319610231809	0.112711652287003	2.69111138091961	0.190607957944806	0.0876130708765773	0.0711059488097574	NaN	NaN	0.115633085615962	0.09927348974828	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.33333333333331	3	29.333333333333336	0.307256730483381	0.109952605643907	2.79444701363845	0.197304124839474	0.0839309083836348	0.0677277340465577	NaN	NaN	0.114981549595321	0.0861687508931532	960	0	40	0.04	0.96	0.08
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.66666666666664	3	30.000000000000004	0.291493492343837	0.107325632730505	2.71597273575622	0.184167859613332	0.0820611162360928	0.065359992326517	NaN	NaN	0.107470919705453	0.0865924809906255	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.66666666666664	3	30.000000000000004	0.272974032901059	0.107325632730505	2.54341880831486	0.165648400170554	0.0720255139339262	0.070086263197408	NaN	NaN	0.105800019067963	0.117424820800219	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.99999999999997	3	30.333333333333336	0.275793585093988	0.106058740537371	2.60038525534638	0.169734844556617	0.0792040235362091	0.0682353600880148	NaN	NaN	0.105405788614243	0.107332579742008	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT:GTCGTTACT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.16666666666664	3	30.833333333333336	0.275083189587407	0.104213595070396	2.63960944252607	0.17086959451701	0.0775861630945349	0.0690545932790339	NaN	NaN	0.102604702412436	0.0958490635859914	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TGC	2	ATTACTTCA:GTTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.49999999999997	3	30.583333333333336	0.29225024342368	0.105128058952294	2.77994520526912	0.187122184471386	0.0867612226027459	0.0686754846062949	NaN	NaN	0.107972841404577	0.0830870263432623	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	171	GCA	TGC	AGG	2	ACTGCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.16666666666664	3	30.250000000000004	0.289246860608989	0.106372646579413	2.71918458278698	0.182874214029575	0.0858362774833468	0.0665125944155356	NaN	NaN	0.110536512541345	0.098041476431683	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	GCAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.91666666666664	3	30.500000000000004	0.271931669012678	0.105436462965892	2.57910462247436	0.166495206046786	0.0808129470160338	0.0648312444684428	NaN	NaN	0.103878453652641	0.108981324461059	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	173	GAC	TGA	CGG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.5833333333333	3	30.500000000000004	0.26919097092383	0.105436462965892	2.55311078683388	0.163754507957938	0.0833561312574718	0.0659311324243252	NaN	NaN	0.108582526697731	0.131526108498554	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	174	GGC	CGG	CAC	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.74999999999997	3	30.66666666666667	0.264526729305941	0.104821456781369	2.52359333125542	0.159705272524572	0.0799612307071713	0.0680638466539064	NaN	NaN	0.097620431473054	0.101843346500744	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.24999999999997	3	30.16666666666667	0.262577384081623	0.106688419438138	2.46116106569444	0.155888964643485	0.0774655065608359	0.0715752784835854	NaN	NaN	0.105799202442772	0.14063195292239	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAC	2	ACAACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.66666666666664	2	30.583333333333336	0.282712453350107	0.0684234871721278	4.13180422446036	0.21428896617798	0.0834415345926535	0.0518462887222216	NaN	NaN	0.0949934446518692	0.0240813431194399	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	177	ACA	AAC	ACC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.91666666666664	2	29.91666666666667	0.267841453433817	0.070021663193269107	3.82512270087815	0.197819790240548	0.081048885370977	0.0513194072002028	NaN	NaN	0.092580780124596	0.0326202574130358	986	0	14	0.014	0.986	0.028
ORF3a	all	ss12	178	CCA	ACC	AAA	2	ACACCAAAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.91666666666664	2	30.250000000000004	0.250167586995817	0.0692133441658409	3.61444155040962	0.180954242829976	0.0723789506408932	0.0532982384658682	NaN	NaN	0.0896711166297457	0.0435936661591502	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTC:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.41666666666664	3	29.750000000000004	0.248323576611812	0.10829587866142	2.2930104052083	0.140027697950392	0.0755638873862648	0.0700534950969365	NaN	NaN	0.0978149965091561	0.152270774964782	930	0	70	0.07	0.93	0.14
ORF3a	all	ss12	180	CTC	ACT	CAA	2	AAACTCAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.58333333333331	3	30.083333333333336	0.217071598340042	0.107006075844546	2.02859133583587	0.110065522495496	0.0640815025786964	0.0664096642764542	NaN	NaN	0.0938351557998284	0.240809119361833	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	181	AAA	CAA	ACA	2	CTCAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.08333333333331	2	30.250000000000004	0.199039887585717	0.0692133441658409	2.87574441004903	0.129826543419876	0.0589255210575314	0.0514809544608213	NaN	NaN	0.0895440031079374	0.147096706924	927	0	73	0.073	0.927	0.146
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.74999999999999	2	30.66666666666667	0.183798305951801	0.068228833654295	2.69385091474785	0.115569472297506	0.0595834756698812	0.0539479213798218	NaN	NaN	0.0849557428555339	0.173719462809531	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.41666666666666	2	29.833333333333332	0.166386789563673	0.0702267037754945	2.36928092333067	0.0961600857881785	0.0567847060508809	0.0511400435817054	NaN	NaN	0.0827611502035529	0.245276551663845	889	0	111	0.111	0.889	0.222
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.08333333333333	3	30.5	0.169534158879359	0.105436462965892	1.60792722091031	0.0640976959134673	0.0593444121552516	0.0618039912131343	NaN	NaN	0.0912939384286974	0.482615287718222	746	0	254	0.254	0.746	0.508
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.75	3	29.833333333333332	0.165618196142339	0.107970516691131	1.53392056663134	0.0576476794512078	0.0602659864840111	0.0643425176336109	NaN	NaN	0.0897535739467294	0.520685944301016	732	0	268	0.268	0.732	0.536
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.41666666666666	3	29.166666666666664	0.164102200695281	0.110629602831442	1.48334800537348	0.0534725978638385	0.0585697720296686	0.0643484659456977	NaN	NaN	0.0937879561449815	0.568580342377597	729	0	271	0.271	0.729	0.542
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.91666666666666	3	29.5	0.180801327755151	0.109283858386045	1.65441932985629	0.0715174693691057	0.0596577423975145	0.0674261660928077	NaN	NaN	0.0974410188974177	0.462975249208035	785	0	215	0.215	0.785	0.43
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.41666666666666	3	30	0.182073635926153	0.107325632730505	1.69645993500304	0.0747480031956479	0.0621112856412457	0.0635584423784919	NaN	NaN	0.0956817484205976	0.4346761383053	788	0	212	0.212	0.788	0.424
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.41666666666666	3	30.5	0.187348078274046	0.105436462965892	1.7768812894895	0.0819116153081541	0.0603877510122051	0.0605103869702127	NaN	NaN	0.0930218595848798	0.378554348234645	811	1	188	0.188	0.811	0.376
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.08333333333331	3	30.5	0.20192785781644	0.105436462965892	1.91516153080517	0.0964913948505478	0.0647552564326169	0.0650320873549056	NaN	NaN	0.0948726867925159	0.309123984752905	867	0	133	0.133	0.867	0.266
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGAAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.74999999999999	3	30.833333333333332	0.186447776478305	0.104213595070396	1.78909264527684	0.0822341814079083	0.0600366889756771	0.0631884980828587	NaN	NaN	0.0904787353084966	0.363414239466327	839	0	161	0.161	0.839	0.322
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGAATTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.24999999999999	3	30.833333333333332	0.187801514593863	0.104213595070396	1.80208267901134	0.083587919523467	0.0608626922753462	0.0628681781472717	NaN	NaN	0.0927528747177032	0.367487557086205	819	0	181	0.181	0.819	0.362
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:AATTGGCAC	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.08333333333333	5	31.66666666666667	0.17448602671933	0.177291583548173	0.98417546522686306	-0.00280555682884251	0.0582104031599127	0.0998457574567025	NaN	NaN	0.131244735184142	0.982945296790174	550	0	450	0.45	0.55	0.9
ORF3a	all	ss12	194	CAC	GCA	ATC	2	TGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.08333333333333	5	32.333333333333336	0.193903558337025	0.173179167487274	1.11967023026181	0.0207243908497506	0.0613773558192245	0.103816549909039	NaN	NaN	0.123590038455063	0.866829854432381	595	1	404	0.404	0.595	0.808
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.91666666666666	5	31.833333333333336	0.161004298535341	0.176245193423779	0.913524479207831	-0.0152408948884379	0.0547242606301064	0.099087268717648	NaN	NaN	0.120108370442421	0.899025196186455	468	0	532	0.532	0.468	0.936
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.41666666666666	5	32.00000000000001	0.159830135220283	0.175211138386129	0.912214467028067	-0.0153810031658454	0.0514561155927663	0.111999357071779	NaN	NaN	0.120811422355029	0.898691763860526	448	0	552	0.552	0.448	0.896
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.58333333333333	5	32.16666666666667	0.159442558228446	0.174189200634338	0.915341236126067	-0.0147466424058916	0.0528902725291618	0.102333613097583	NaN	NaN	0.120073160484683	0.902254537672125	482	0	518	0.518	0.482	0.964
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666667	5	32.75	0.159249476407496	0.170704815996831	0.932893869909633	-0.0114553395893355	0.0523196941826512	0.100589673899929	NaN	NaN	0.121815958551724	0.925078902500492	499	0	501	0.501	0.499	0.998
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666667	5	32.25	0.159249476407496	0.173682709081938	0.916898851067358	-0.0144332326744429	0.051748691576275	0.102674416856741	NaN	NaN	0.119346611469162	0.903742186347924	472	0	528	0.528	0.472	0.944
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.5	5	32.25	0.159636110589832	0.173682709081938	0.919124945906508	-0.014046598492106	0.0526733361125924	0.103643054937268	NaN	NaN	0.121214977942201	0.90774629414255	467	0	533	0.533	0.467	0.934
ORF3a	all	ss12	201	GTC	TGT	CGT	2	TATGTCGTC:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.58333333333334	4	32.583333333333336	0.159442558228446	0.134060541816084	1.18933249163787	0.0253820164123617	0.0504839402114588	0.0861828778532794	NaN	NaN	0.106715507344733	0.811999377545113	632	1	367	0.367	0.632	0.734
ORF3a	all	ss12	202	GTA	CGT	ATT	2	GTCGTCGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.08333333333334	4	33.083333333333336	0.160610991304224	0.13184534303006	1.21817720378342	0.0287656482741639	0.0560004651121722	0.0894194977349368	NaN	NaN	0.110857385342195	0.795262309203232	603	0	397	0.397	0.603	0.794
ORF3a	all	ss12	203	GTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTCGTACAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.83333333333334	4	33.333333333333336	0.161201678172285	0.130765040358583	1.2327582183299	0.0304366378137018	0.052472450300059	0.0860239620082898	NaN	NaN	0.105208422858029	0.77235296814064	642	0	358	0.358	0.642	0.716
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	GTACATGGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.83333333333334	4	33.166666666666664	0.145028544735405	0.131483259230803	1.10301908839075	0.0135452855046016	0.0508528679950511	0.0828748913011587	NaN	NaN	0.103430189714976	0.895806431177492	609	0	391	0.391	0.609	0.782
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:CATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	4	32.833333333333336	0.146091244169313	0.132943691128056	1.09889565220958	0.0131475530412575	0.0503354457087286	0.088402144952389	NaN	NaN	0.106982908010308	0.90219106989926	547	0	453	0.453	0.547	0.906
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.83333333333334	4	33	0.131083275220683	0.132209431753494	0.991482025768699	-0.00112615653281123	0.0477360250842648	0.0860375018476176	NaN	NaN	0.102929864431478	0.991270512313583	530	0	470	0.47	0.53	0.94
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	4	32.83333333333333	0.130765040358583	0.132943691128056	0.98361222897464	-0.00217865076947271	0.0486868769133718	0.0898603215684189	NaN	NaN	0.108250617385159	0.983942867862105	533	0	467	0.467	0.533	0.934
ORF3a	all	ss12	208	ACT	CAC	TGA	2	TTCACTGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.33333333333334	4	32.5	0.13013319533385	0.134437018317738	0.967986325212029	-0.00430382298388851	0.0471167693892217	0.0908512956991515	NaN	NaN	0.105256531722142	0.967384472745728	487	0	513	0.513	0.487	0.974
ORF3a	all	ss12	209	GAA	TGA	AGA	2	ACTGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.66666666666667	4	33.166666666666664	0.131403066768818	0.131483259230803	0.999390093746883	-8.01924619850403e-5	0.0475318788198561	0.0864563227869562	NaN	NaN	0.105493338971638	0.999393475249034	548	0	452	0.452	0.548	0.904
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	5	32.5	0.130765040358583	0.172180831233375	0.759463404967208	-0.0414157908747918	0.049975303024861	0.105833699411342	NaN	NaN	0.120030012425977	0.730060319935092	370	0	630	0.63	0.37	0.74
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.66666666666667	5	32.5	0.113962844188242	0.172180831233375	0.661878812942748	-0.0582179870451332	0.0466506781266031	0.100758254725272	NaN	NaN	0.114787109404807	0.612026932110882	322	0	678	0.678	0.322	0.644
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.83333333333333	0.128887692694994	0.17021844254226	0.757189942347142	-0.0413307498472659	0.0489505320385129	0.100230950534309	NaN	NaN	0.112744821953686	0.713927346157791	347	0	653	0.653	0.347	0.694
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.66666666666669	5	33.166666666666664	0.12950744207608	0.168300466878196	0.769501383319442	-0.0387930248021161	0.0462512740232697	0.100162565636663	NaN	NaN	0.119150172314666	0.744741436701278	401	0	599	0.599	0.401	0.802
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.5	0.128887692694994	0.172180831233375	0.748560056144108	-0.0432931385383807	0.0487902607499497	0.101186258151097	NaN	NaN	0.112910985653045	0.701403068659954	363	0	637	0.637	0.363	0.726
ORF3a	all	ss12	215	GAG	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.83333333333336	5	31.83333333333333	0.127364024533652	0.176245193423779	0.722652471023176	-0.0488811688901276	0.0472198967123616	0.101808216743034	NaN	NaN	0.123462539642738	0.692164762143472	353	0	647	0.647	0.353	0.706
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.50000000000003	5	30.83333333333333	0.114234586398441	0.182716561993313	0.625201049933402	-0.0684819755948721	0.0441025078407658	0.107826795352097	NaN	NaN	0.125111715870319	0.584126891036409	291	0	709	0.709	0.291	0.582
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.16666666666669	5	29.83333333333333	0.114781984854672	0.189683904532547	0.605122427954751	-0.074901919677875	0.0470841570670622	0.116024865479972	NaN	NaN	0.124018212980557	0.545870880920532	272	0	728	0.728	0.272	0.544
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AAT	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	30.166666666666664	0.115334665090852	0.187302855665743	0.615765652268946	-0.0719681905748906	0.0463000156488223	0.114190487959959	NaN	NaN	0.129744623788523	0.579105951671357	257	0	743	0.743	0.257	0.514
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTACT:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	29.499999999999996	0.115334665090852	0.192126605059278	0.600305538398846	-0.0767919399684257	0.0468880557929819	0.120627082685435	NaN	NaN	0.131044111952592	0.5578750514473	281	0	719	0.719	0.281	0.562
ORF3a	all	ss12	220	ACT	GAG	TAC	2	ATTACTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.41666666666666	0.0849965139802523	0.192747196311253	0.440974061396971	-0.107750682331	0.0342367107224231	0.118241570657769	NaN	NaN	0.130120081261523	0.407621515832219	181	0	819	0.819	0.181	0.362
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	ACTACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.195270406950441	0.435275960692929	-0.110273892970189	0.0344709712263846	0.119539337556074	NaN	NaN	0.131811331854651	0.402815173007759	170	0	830	0.83	0.17	0.34
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.195270406950441	0.435275960692929	-0.110273892970189	0.0339368113243008	0.122145507281621	NaN	NaN	0.131534693360723	0.40182655217238	151	0	849	0.849	0.151	0.302
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	5	28.749999999999993	0.0870541284395655	0.197860943283853	0.439976313641024	-0.110806814844288	0.033804698442343	0.11847842832545	NaN	NaN	0.139369225058739	0.426578940128296	169	0	831	0.831	0.169	0.338
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.33333333333337	5	29.41666666666666	0.0879053734766805	0.192747196311253	0.456065640170085	-0.104841822834572	0.0355554744546779	0.116654509334268	NaN	NaN	0.131809476985403	0.426378368005461	156	0	844	0.844	0.156	0.312
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TGA	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333337	5	30.41666666666666	0.0892139571460239	0.185556129985381	0.480792292623546	-0.0963421728393568	0.0371072951763395	0.120955563542604	NaN	NaN	0.115551424644912	0.404416156841907	177	0	823	0.823	0.177	0.354
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.9166666666667	5	30.16666666666666	0.0729614963194685	0.187302855665743	0.389537554353545	-0.114341359346275	0.0313792398298645	0.115720957541881	NaN	NaN	0.117228122911845	0.329374368914094	150	0	850	0.85	0.15	0.3
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAC	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AACAAGCTT:AATAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAT:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	AGA	GCC	2	AAAGATCCG:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCG	GCC	G--	1	GAGCCTGAA:GATCCG---	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCG---CCG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	CCG	-CC	ACA	1	---CCGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	2	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AAT	ACA	TGT	2	CCGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.16666666666669	5	31.083333333333336	0.218397760919419	0.181054357970061	1.20625520074768	0.0373434029493578	0.0543125705354593	0.0957587782894181	NaN	NaN	0.0978454807269751	0.702715872374367	662	0	338	0.338	0.662	0.676
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.50000000000001	5	31.083333333333336	0.220553902912914	0.181054357970061	1.21816401099489	0.0394995449428528	0.0566132835048188	0.0937635756119564	NaN	NaN	0.0943354432242738	0.675425362930153	673	0	327	0.327	0.673	0.654
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.66666666666669	5	31.583333333333336	0.223310144300941	0.177819473768805	1.25582502055586	0.0454906705321362	0.0581161825071145	0.0892176709672022	NaN	NaN	0.0877140691016858	0.604022578481891	709	0	291	0.291	0.709	0.582
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA:TTTATGAGT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.50000000000001	5	31.083333333333336	0.223869741416997	0.181054357970061	1.23647806066074	0.0428153834469363	0.0558847939140877	0.0905536625775407	NaN	NaN	0.093389273817747	0.646620940277786	691	0	309	0.309	0.691	0.618
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGTATT	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.00000000000001	5	30.583333333333336	0.22556561551435	0.184409724221212	1.22317636158801	0.0411558912931383	0.056408014023943	0.0898256528958956	NaN	NaN	0.0931354550233005	0.658566747672184	669	0	331	0.331	0.669	0.662
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGTATTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.25000000000001	5	30.583333333333336	0.207447505316393	0.184409724221212	1.12492714900189	0.0230377810951807	0.0542005485965496	0.0880539831317678	NaN	NaN	0.0923047232518316	0.802909081211781	614	0	386	0.386	0.614	0.772
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.08333333333334	5	30.916666666666668	0.211120957185982	0.182159096576957	1.15899211817177	0.0289618606090255	0.0576921450525683	0.0930454136450197	NaN	NaN	0.0924581053555328	0.754095999897477	652	0	348	0.348	0.652	0.696
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACACTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.41666666666667	5	30.583333333333336	0.210058104799921	0.184409724221212	1.13908366647706	0.0256483805787093	0.0588662489821255	0.0934899324546221	NaN	NaN	0.0982965125635174	0.794147497060729	610	0	390	0.39	0.61	0.78
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACACTTGGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.75	5	31.250000000000004	0.21219469193644	0.179963002222943	1.17910175600187	0.032231689713497	0.0546399783666571	0.0884903092118106	NaN	NaN	0.0940002239730001	0.731681591909655	641	0	359	0.359	0.641	0.718
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGCTCA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.91666666666667	5	30.916666666666668	0.19438950408697	0.182159096576957	1.06714134918234	0.0122304075100131	0.0525599904995571	0.087732757329501	NaN	NaN	0.09468881141268	0.897227698603432	570	1	429	0.429	0.57	0.858
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	GGAACTGTA:GGCTCAATC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.25	5	31.25	0.193420049534211	0.179963002222943	1.07477674380314	0.0134570473112682	0.050300189131782	0.0902205926199335	NaN	NaN	0.0960735423952775	0.888604467720337	574	0	426	0.426	0.574	0.852
ORF3a	all	ss12	13	ATC	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATCACA	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.75	5	30.916666666666668	0.209005969121087	0.182159096576957	1.14738145417178	0.0268468725441303	0.0588006935264206	0.0911911507747775	NaN	NaN	0.0952376988398462	0.778025300279674	623	0	377	0.377	0.623	0.754
ORF3a	all	ss12	14	ACA	AAC	ACG	2	ATCACACGT:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77	5	30.833333333333332	0.191273928510779	0.182716561993313	1.04683410427665	0.008557366517466	0.0594137087580596	0.0851462356014873	NaN	NaN	0.0943631494798062	0.927742516683783	554	0	446	0.446	0.554	0.892
ORF3a	all	ss12	15	CGT	ACG	GAA	2	ACACGTCAA:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.75	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.91666666666667	5	30.916666666666668	0.208483869201781	0.182159096576957	1.1445152787838	0.0263247726248245	0.0612582901080968	0.088037439716254	NaN	NaN	0.0999292507156155	0.79221600743402	621	0	379	0.379	0.621	0.758
ORF3a	all	ss12	16	AAG	GAA	ACC	2	CGTCAACCG:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.91666666666667	4	31.166666666666668	0.208483869201781	0.140762624951505	1.48110245367765	0.0677212442502764	0.0613727163516888	0.077038302725704	NaN	NaN	0.0908927309921896	0.456230752841149	783	0	217	0.217	0.783	0.434
ORF3a	all	ss12	17	CAA	ACC	AGG	2	AAGCAAGGT:CAACCGAGT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.75	4	31.166666666666668	0.226423297579346	0.140762624951505	1.60854699645842	0.0856606726278408	0.0637857283411429	0.075871124808468	NaN	NaN	0.0907879359238391	0.345412516385918	814	0	186	0.186	0.814	0.372
ORF3a	all	ss12	18	AGT	AGG	TAA	2	CAAGGTGAA:CCGAGTAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.75	3	30.333333333333332	0.22303140124308	0.106058740537371	2.10290448588244	0.116972660705709	0.0624590174848647	0.0672722847038337	NaN	NaN	0.0854189818861776	0.170874614736809	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss12	19	AAG	TAA	AAT	2	AGTAAGATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78	3	30.333333333333332	0.205153173799212	0.106058740537371	1.93433537641269	0.0990944332618409	0.0577066332022047	0.0632881275882944	NaN	NaN	0.0847576968090219	0.242343334867573	882	0	118	0.118	0.882	0.236
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAGATTGAA:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.83333333333333	3	30.833333333333332	0.199754062017259	0.104213595070396	1.9167754637226	0.0955404669468624	0.0567073605384224	0.063158234757635	NaN	NaN	0.0788917716935693	0.225883107275435	882	0	118	0.118	0.882	0.236
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	AAA	2	ATCAAGGAT:ATTGAAAAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.33333333333333	3	31.499999999999996	0.20119798994601	0.101851155869296	1.97541194529204	0.0993468340767132	0.0569124630623935	0.0652578641033493	NaN	NaN	0.0791980089715803	0.209692746090412	903	0	97	0.097	0.903	0.194
ORF3a	all	ss12	22	AAT	AAA	TGC	2	AAGGATGCT:GAAAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78	3	32.166666666666664	0.18848582121068	0.0995936054863591	1.89254942915482	0.0888922157243205	0.05663603803349	0.06212381884531	NaN	NaN	0.0761912840410573	0.243332366616657	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.33333333333333	3	32.166666666666664	0.173851210542993	0.0995936054863591	1.74560615306577	0.0742576050566342	0.0557951539517477	0.0621959783882797	NaN	NaN	0.0778430979043869	0.340114273011708	838	0	162	0.162	0.838	0.324
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.66666666666666	3	32.666666666666664	0.1755544663848	0.0979651368127982	1.79200960766551	0.0775893295720019	0.0562514083789652	0.0587561316729846	NaN	NaN	0.0743609395510519	0.296756068126481	865	0	135	0.135	0.865	0.27
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.83333333333333	4	33	0.175125517060618	0.132209431753494	1.32460683582047	0.0429160853071238	0.0544690554420249	0.0785779440427051	NaN	NaN	0.0780866556795057	0.582596751692896	730	0	270	0.27	0.73	0.54
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78	4	32.5	0.172180831233375	0.134437018317738	1.28075461199556	0.0377438129156367	0.055806064091382	0.0735319401016134	NaN	NaN	0.0767727279752271	0.622980593875599	684	1	315	0.315	0.684	0.63
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.08333333333333	4	32.416666666666664	0.156037443282552	0.134815620966532	1.15741367479433	0.0212218223160207	0.0503592350173774	0.0718007388542775	NaN	NaN	0.0724088489354657	0.769458503194382	615	0	385	0.385	0.615	0.77
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.5	3	32.5	0.157344163604509	0.0985020015458152	1.59737021720645	0.0588421620586939	0.0536218391741783	0.0561549687814108	NaN	NaN	0.0677390809746257	0.385033675484411	819	0	181	0.181	0.819	0.362
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.5	2	32.83333333333333	0.157344163604509	0.0635300231041221	2.47668985334117	0.0938141405003871	0.0533142896667283	0.0448035760181735	NaN	NaN	0.0651660635521127	0.149975928082218	917	0	83	0.083	0.917	0.166
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.33333333333333	2	33.33333333333333	0.173851210542993	0.0625362067042884	2.78000888933149	0.111315003838705	0.0554261330667493	0.0441080672051416	NaN	NaN	0.0657507835329612	0.0904585726132662	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACT:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.5	1	32.83333333333333	0.173430571160122	0.0310925352587596	5.57788452169598	0.142338035901362	0.0568000045791581	0.032972022692107	NaN	NaN	0.0590821864147546	0.0159895863287774	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	32	ACT	TAC	TGC	2	GCTACTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.91666666666667	1	32.416666666666664	0.16993600795279	0.031500692980973	5.39467522366681	0.138435314971817	0.0542283309479749	0.031073693493706	NaN	NaN	0.0575396691145618	0.0161322003529523	994	0	6	0.006	0.994	0.012
ORF3a	all	ss12	33	GCA	TGC	AAC	2	ACTGCAACG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.25	1	31.749999999999996	0.166773778676097	0.0321765161581571	5.18308998576336	0.13459726251794	0.0555855282908418	0.0326405650924019	NaN	NaN	0.0558642559817273	0.0159804015158551	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.33333333333333	1	31.999999999999996	0.166580058439327	0.0319197108140969	5.21872079009435	0.13466034762523	0.0545764831316167	0.0331188237207253	NaN	NaN	0.0606977872041465	0.0265181713772474	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.33333333333333	1	32.666666666666664	0.168934951133241	0.0312545223004261	5.40513623946633	0.137680428832815	0.0554495823045272	0.0314917939173646	NaN	NaN	0.0564436122312333	0.0147175314533147	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.33333333333333	1	33.33333333333333	0.171357672967179	0.0306164958901914	5.5969067649599	0.140741177076988	0.0551711530992501	0.0303861703901337	NaN	NaN	0.0549006585471611	0.0103604548204372	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.5	1	33.33333333333333	0.187122184471386	0.0306164958901914	6.11180930510516	0.156505688581194	0.0608748069947978	0.0303613708027875	NaN	NaN	0.0612342339348627	0.0105927917169578	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.83333333333333	1	33.666666666666664	0.170137650782942	0.0303071537534075	5.61377858730177	0.139830497029534	0.0554446491137773	0.0311083472116117	NaN	NaN	0.0567379098409494	0.0137205115342293	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.66666666666666	1	33.166666666666664	0.170542381646746	0.0307735475083969	5.54184991510035	0.139768834138349	0.0562628411920309	0.0300680268871836	NaN	NaN	0.0590817194571603	0.0179966698516312	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.66666666666666	1	33.166666666666664	0.170542381646746	0.0307735475083969	5.54184991510035	0.139768834138349	0.0533635329422045	0.0317004582581968	NaN	NaN	0.0585529225541904	0.016984117783151	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.5	1	32.5	0.184453553433394	0.0314182062818701	5.87091292795519	0.153035347151524	0.0537819527972513	0.0330471675542551	NaN	NaN	0.059037632359666	0.00953737217257242	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.16666666666666	1	31.833333333333332	0.182716561993313	0.0320904564039067	5.69379754820404	0.150626105589406	0.0558937987820533	0.0323317616142024	NaN	NaN	0.0582087249671893	0.00966220367678724	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CAG	2	CCTTTCAGA:CCTTTCGGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.166666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.16666666666666	1	31.833333333333332	0.182716561993313	0.0320904564039067	5.69379754820404	0.150626105589406	0.0576661143370167	0.0334303224657342	NaN	NaN	0.058223375179063	0.00968048118519353	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	44	AGA	CAG	ATG	2	TTCAGATGG:TTCGGATGG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.916666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.5	1	32.33333333333333	0.184453553433394	0.0315836140125951	5.84016614944182	0.152869939420799	0.0568136166268142	0.0328356533025447	NaN	NaN	0.0586166194966694	0.00910829597794361	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	AGATGGCTT:GGATGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.08333333333333	1	32.666666666666664	0.169534158879359	0.0312545223004261	5.42430811291102	0.138279636578933	0.0559294637751203	0.03141981548429	NaN	NaN	0.0575931807758693	0.0163515704471838	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.33333333333333	1	33.416666666666664	0.173851210542993	0.0305385697640887	5.69284062370958	0.143312640778905	0.0549114057834563	0.029351129474765	NaN	NaN	0.0574000372113692	0.0125342839861982	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT:CTTGTTGTT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.33333333333333	1	33.416666666666664	0.173851210542993	0.0305385697640887	5.69284062370958	0.143312640778905	0.0557856740458475	0.032512880345954	NaN	NaN	0.0574457888596773	0.0126047390640952	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTGTTGGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.08333333333333	1	33.666666666666664	0.17448602671933	0.0303071537534075	5.75725546974903	0.144178872965923	0.0555043018311839	0.0290090369012436	NaN	NaN	0.0563625800384641	0.0105257867774586	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.16666666666666	1	33.58333333333333	0.174273904523748	0.0303839016876759	5.73573158296637	0.143890002836072	0.0561378291039499	0.0315847218898058	NaN	NaN	0.0562690994684325	0.0105525745829522	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.66666666666666	1	34.08333333333333	0.1755544663848	0.0299291581301553	5.86566670607146	0.145625308254645	0.0548217654721084	0.0293190777648853	NaN	NaN	0.0564244596214537	0.00985460539593403	997	1	2	0.002	0.997	0.004
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.66666666666666	1	33.08333333333333	0.173011971365532	0.0308526791703671	5.60768062994359	0.142159292195165	0.0550938735723611	0.0321939646549625	NaN	NaN	0.0575240057278331	0.0134621411160138	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.5	1	33.25	0.187122184471386	0.0306948207819131	6.09621361860654	0.156427363689472	0.0556457543221736	0.0313185429854982	NaN	NaN	0.0602658958265204	0.00944204294532715	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.16666666666666	1	33.25	0.185334556070405	0.0306948207819131	6.03797485534149	0.154639735288492	0.0573223728659446	0.0316526048085156	NaN	NaN	0.0580448836691309	0.00771852785095368	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.5	1	32.916666666666664	0.184453553433394	0.0310121698640216	5.94777966979298	0.153441383569373	0.0577001797555782	0.0316014809525422	NaN	NaN	0.059629785053033	0.0100753094846844	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.33333333333333	2	33.416666666666664	0.20119798994601	0.062373587449531503	3.22569212663622	0.138824402496478	0.0588492182874181	0.0442671503561354	NaN	NaN	0.0627094236028489	0.0268444271944341	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80	2	33.416666666666664	0.199277374299754	0.062373587449531503	3.19489999610806	0.136903786850223	0.0616834019047579	0.0437656789632844	NaN	NaN	0.0626739652357486	0.0289343006846181	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAG	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.08333333333333	2	33.83333333333333	0.21866495405835	0.0615730216404005	3.55131108126218	0.15709193241795	0.0635740018839495	0.0439267146771382	NaN	NaN	0.0652381148229404	0.0160411562836972	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	58	AGC	AAG	CGC	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.58333333333333	2	33.83333333333333	0.217071598340042	0.0615730216404005	3.52543358368517	0.155498576699641	0.0605435285216263	0.0456602379685701	NaN	NaN	0.0661137474211162	0.0186735017734367	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.75	2	34.166666666666664	0.236957742360063	0.0609472230590743	3.88791696268733	0.176010519300989	0.0629331215170754	0.043272034601415	NaN	NaN	0.067835950198087	0.00946874037250779	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	60	TCC	TTC	CAA	2	GCTTCCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.08333333333333	2	33.833333333333336	0.235784099565019	0.0615730216404005	3.82934105365248	0.174211077924618	0.0635598538391356	0.0441384091045021	NaN	NaN	0.0642402528847123	0.00669052555807477	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	TCCAAAATC:TCCAAAGTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.91666666666666	2	34	0.236369452063806	0.0612585232607003	3.85855615646951	0.175110928803106	0.0614486594750147	0.0449497732885304	NaN	NaN	0.064956343515645	0.00702145637441931	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	62	ATC	AAT	CAT	2	AAAATCATA:AAAGTGATT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.16666666666666	2	34.416666666666664	0.239040218372072	0.0604861633757489	3.95198182577922	0.178554054996323	0.0640638179078176	0.0426573503173397	NaN	NaN	0.0684310005569578	0.0090739113622311	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	63	ATA	CAT	AAC	2	ATCATAACC:GTGATTGCG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.16666666666666	2	34.416666666666664	0.221648134682889	0.0604861633757489	3.66444360681266	0.16116197130714	0.0586570553706828	0.0443021983886904	NaN	NaN	0.0603796438424786	0.00760448126663156	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGTTT	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.5	2	34.75	0.223869741416997	0.0598821656332629	3.73850442864818	0.163987575783735	0.0570429761456563	0.0435751232739111	NaN	NaN	0.0612764146071546	0.00744635190083098	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGTTTCAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.5	2	35.083333333333336	0.223869741416997	0.0592901175479514	3.77583568182237	0.164579623869046	0.0561015653370742	0.0435224639572232	NaN	NaN	0.05954714684051	0.00571230808648867	998	0	2	0.002	0.998	0.004
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:TTTCATAAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.16666666666666	2	35.083333333333336	0.207705622965276	0.0592901175479514	3.50320814927197	0.148415505417325	0.0533017420872706	0.0443175978950502	NaN	NaN	0.0579092026110424	0.0103801889147081	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	GAG	2	AAAAAGAGA:CATAAGAGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.91666666666666	2	35.416666666666664	0.191510018856633	0.0587096677913667	3.2619843726112	0.132800351065267	0.0538411459734171	0.0427586425565118	NaN	NaN	0.0556809975070274	0.0170781441803179	994	0	6	0.006	0.994	0.012
ORF3a	all	ss12	68	AGA	GAG	ATG	2	AAGAGATGG:AAGAGGTGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.75	2	35.416666666666664	0.226423297579346	0.0587096677913667	3.85666119563091	0.167713629787979	0.0625148108000625	0.0415077300617488	NaN	NaN	0.0651823608469351	0.0100823820723546	999	0	1	0.001	0.999	0.002
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGGTGGCAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.33333333333333	2	35.833333333333336	0.245832397240244	0.0579999025523778	4.23849672882193	0.187832494687866	0.0659541004067645	0.0418114427486088	NaN	NaN	0.0654668130757961	0.00411608605180538	1000	0	0	0	1	0.001
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.16666666666666	3	35.666666666666664	0.246469230096625	0.089213957146024	2.76267568417807	0.157255272950601	0.0642978601438563	0.0557256384293497	NaN	NaN	0.0783751451709989	0.0448089887430387	976	0	24	0.024	0.976	0.048
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTCGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.16666666666666	3	35.666666666666664	0.246469230096625	0.089213957146024	2.76267568417807	0.157255272950601	0.0644281337543536	0.0545754436885172	NaN	NaN	0.0801896440598495	0.0498741047871442	977	0	23	0.023	0.977	0.046
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTCGCTCTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.41666666666664	3	35.083333333333336	0.278309461419876	0.0907908105289243	3.06539240919335	0.187518650890952	0.0743511540867408	0.0572942578493633	NaN	NaN	0.0866705091650011	0.0304965352110625	986	0	14	0.014	0.986	0.028
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCTCTGCAC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.91666666666664	3	34.75	0.27615017609084	0.0917171833187057	3.01088810295507	0.184432992772134	0.0720506388399366	0.0530007582079657	NaN	NaN	0.0871428474919825	0.0343070280783957	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	74	CAC	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTGCACAAA	1:1	TRUE	1.5	0.5	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.08333333333331	3	34.25	0.289618861360617	0.0931427851735378	3.1094073558249	0.196476076187079	0.0768632252514083	0.0560384147805068	NaN	NaN	0.089892041570825	0.0288383419932251	985	0	15	0.015	0.985	0.03
ORF3a	all	ss12	75	AAA	CAA	AGG	2	CACAAAGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.24999999999999	2	33.916666666666664	0.270554304269646	0.0614153696041381	4.40531915729798	0.209138934665508	0.071900979054326	0.0448325451102924	NaN	NaN	0.0835323451866117	0.012290634557982	997	0	3	0.003	0.997	0.006
ORF3a	all	ss12	76	GGC	AGG	CAT	2	AAAGGCATT:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.41666666666664	2	34.083333333333336	0.269870897248761	0.0611024764460933	4.41669328225756	0.208768420802668	0.0689084150869894	0.0463880268568348	NaN	NaN	0.0888688440609812	0.0188150876153797	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	77	ATT	CAT	TCA	2	GGCATTCAG:GGTGTTCAC	1:1	FALSE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.99999999999999	2	33.75	0.267506207954049	0.0617314855970427	4.33338361075931	0.205774722357007	0.0706416803425042	0.0461185326908429	NaN	NaN	0.0811818411440396	0.0112531357866631	992	0	8	0.008	0.992	0.016
ORF3a	all	ss12	78	CAC	TCA	CTT	2	ATTCAGCTT:GTTCACTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.99999999999999	2	33.833333333333336	0.285579371638345	0.0615730216404005	4.63806004691776	0.224006349997944	0.0766365096886017	0.0462471157632325	NaN	NaN	0.0887383638345842	0.0115913719031596	996	0	4	0.004	0.996	0.008
ORF3a	all	ss12	79	CTT	CTT	TGT	2	CACTTTGTT:CAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.33333333333331	2	32.833333333333336	0.262255311359812	0.0635300231041221	4.12805314000894	0.19872528825569	0.0754074412571878	0.0475997228820706	NaN	NaN	0.0836332428367717	0.0174942596912749	993	0	7	0.007	0.993	0.014
ORF3a	all	ss12	80	GTT	TGT	TTG	2	CTTGTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.99999999999999	2	32.833333333333336	0.246206602062776	0.0635300231041221	3.87543699864956	0.182676578958654	0.0699301551310186	0.0494581628770378	NaN	NaN	0.085984513964545	0.0336259478328694	984	0	16	0.016	0.984	0.032
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	GTTTGCAAC:GTTTGCAAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.66666666666666	2	32.666666666666664	0.243831358478173	0.0638683562552301	3.81771776783759	0.179963002222943	0.0751247523609922	0.0474755527978308	NaN	NaN	0.0821566010092944	0.0284889050673454	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAATTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.99999999999999	2	33.333333333333336	0.246206602062776	0.0625362067042883	3.93702488587132	0.183670395358488	0.0720226030917903	0.0466043860319393	NaN	NaN	0.0823214888675196	0.0256721555578681	988	0	12	0.012	0.988	0.024
ORF3a	all	ss12	83	TTG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG:AATTTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.99999999999999	2	33.333333333333336	0.246206602062776	0.0625362067042883	3.93702488587132	0.183670395358488	0.0719532322841028	0.0483961949943185	NaN	NaN	0.0829129097718003	0.0267449186355652	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GCT	2	TTGCTGCTA:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	81.66666666666666	2	33.083333333333336	0.243831358478173	0.0630291953285242	3.86854626982405	0.180802163149649	0.0736531028907377	0.0473934275159904	NaN	NaN	0.0831474881445567	0.0296694548771801	989	0	11	0.011	0.989	0.022
ORF3a	all	ss12	85	CTA	GCT	ACT	2	CTGCTACTC:CTGTTGTTG	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	82.66666666666666	3	32.75	0.274450702013647	0.0976988961284261	2.80914844373348	0.176751805885221	0.0816990429244207	0.0583765638646966	NaN	NaN	0.0901595685277249	0.0499451857477028	987	0	13	0.013	0.987	0.026
ORF3a	all	ss12	86	CTC	ACT	CTT	2	CTACTCTTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	83.16666666666666	3	32.25	0.272460986853495	0.0993184392369987	2.74330717384044	0.173142547616496	0.0792871942572791	0.061989323939634	NaN	NaN	0.0874110613597517	0.047615353170339	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	87	TTT	CTT	TGT	2	CTCTTTGTA:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	84.16666666666666	3	31.583333333333332	0.251760353206859	0.101563372279023	2.47884988020291	0.150196980927837	0.0747047757743924	0.0634400061276913	NaN	NaN	0.0834398825105813	0.0718508127437235	972	0	28	0.028	0.972	0.056
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	84.83333333333331	3	30.916666666666664	0.249412997226024	0.103912304538584	2.40022582824552	0.14550069268744	0.0782174040656754	0.0631875366352422	NaN	NaN	0.0866761747638939	0.093216379409059	953	1	46	0.046	0.953	0.092
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AAT	2	GTAACAATT:GTAACAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	84.33333333333331	3	31.416666666666664	0.251169343096271	0.102140577511979	2.45905544313976	0.149028765584292	0.0770595304624094	0.0632485816408918	NaN	NaN	0.0875596616491467	0.0887506123793463	961	0	39	0.039	0.961	0.078
ORF3a	all	ss12	90	ATT	AAT	TTA	2	ACAATTTAC:ACAGTTTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	84.33333333333331	3	31.75	0.267929817115268	0.100992663859693	2.65296316460667	0.166937153255576	0.0778049548277209	0.0655691568395207	NaN	NaN	0.0879407294416633	0.0576576720256708	973	0	27	0.027	0.973	0.054
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	ATTTACTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	83.49999999999999	3	32.416666666666664	0.254152739478919	0.0987726497511971	2.57310844772431	0.155380089727722	0.0780475350728025	0.0625014511128105	NaN	NaN	0.0837247159275161	0.0634756640552366	967	0	33	0.033	0.967	0.066
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	83.49999999999999	3	32.416666666666664	0.254152739478919	0.0987726497511971	2.57310844772431	0.155380089727722	0.0774317550813517	0.061810459457305	NaN	NaN	0.0847601291800251	0.0667766558346964	980	0	20	0.02	0.98	0.04
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	83.16666666666666	3	31.416666666666668	0.255366229707077	0.102140577511979	2.50014476055932	0.153225652195098	0.0746344985411606	0.0625615345241008	NaN	NaN	0.0897219683324901	0.0876766146951787	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TCT	2	CACCTTCTA:CACCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	82.99999999999999	3	30.916666666666668	0.255977372918159	0.103912304538584	2.46339809375618	0.152065068379575	0.0784227412927158	0.0652726049911625	NaN	NaN	0.0877482655176636	0.0831010888597975	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	95	CTA	TCT	ACT	2	CTTCTACTT:CTTTTGCTC	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	84.33333333333331	3	30.25	0.251169343096271	0.106372646579413	2.36122115198815	0.144796696516858	0.072505268252766	0.0673400762654476	NaN	NaN	0.088681062547992	0.102515200838897	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	96	CTC	ACT	CGT	2	CTACTTTTA:TTGCTCGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	84.08333333333331	3	30.5	0.252056912301495	0.105436462965892	2.39060477951573	0.146620449335603	0.0746075852269128	0.0665889437491995	NaN	NaN	0.0864932864078515	0.0900439983853406	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	97	GTT	CGT	AGC	2	CTCGTTGCT:CTTTTAGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	85.08333333333331	3	30.166666666666668	0.248544087208511	0.106688419438138	2.3296257318033	0.141855667770372	0.0742018410468091	0.0640668362610267	NaN	NaN	0.0853004052301559	0.0963098685554551	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	98	GCT	AGC	TGC	2	GTTGCTGCT:TTAGCTGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	84.91666666666664	3	30.166666666666668	0.24912268010471	0.106688419438138	2.33504893423939	0.142434260666571	0.0733254243334848	0.0641270311753404	NaN	NaN	0.0837595579062037	0.0890343754662912	956	0	44	0.044	0.956	0.088
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	85.49999999999999	3	30.083333333333332	0.247109400847682	0.107006075844546	2.30930252228549	0.140103325003136	0.0737255181185981	0.0690649279554453	NaN	NaN	0.0877962556109342	0.11053838759551	942	0	58	0.058	0.942	0.116
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CAT	2	GCTGGCATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	85.99999999999999	3	30.583333333333332	0.245409683406312	0.105128058952294	2.3343880392358	0.140281624454018	0.0724203894658605	0.0667963929273383	NaN	NaN	0.0872997464963848	0.10807715636413	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CAT	GGA	2	GGCATGGAG:GGCCTTGAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	85.66666666666666	3	31.583333333333332	0.246540194862671	0.101563372279023	2.42745183948163	0.144976822583649	0.0734881982649478	0.063870782083529	NaN	NaN	0.0837755920828043	0.0835342470277229	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAGGCA:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	84.33333333333333	3	31.916666666666664	0.234775247736897	0.100428343016685	2.33773893588877	0.134346904720212	0.0727481306276037	0.0624429229192094	NaN	NaN	0.0828638637689235	0.104954033187147	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	103	GCA	AGC	ACA	2	GAAGCCCCT:GAGGCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	84.33333333333333	3	31.916666666666664	0.251169343096271	0.100428343016685	2.50098065497847	0.150741000079586	0.0785958560107152	0.065218320258035	NaN	NaN	0.0828134634951077	0.0687213221169591	971	0	29	0.029	0.971	0.058
ORF3a	all	ss12	104	CAA	ACA	ATT	2	GCACAATTT:GCCCCTTTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	85.25	4	31.583333333333332	0.247968200054092	0.138722674692595	1.78751022933765	0.109245525361497	0.0757203674918834	0.0753826479030817	NaN	NaN	0.099817124044355	0.273754705289117	862	0	138	0.138	0.862	0.276
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	85.25	3	31.25	0.231816835640619	0.102724391304868	2.25668736213415	0.129092444335751	0.0735526304948433	0.0651260615086117	NaN	NaN	0.0921533302908914	0.161260713132327	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	84.75	3	31.75	0.23342113325175	0.100992663859693	2.31126820831301	0.132428469392057	0.0727425843259695	0.0653678159819145	NaN	NaN	0.0918096742632653	0.149182822518179	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CAT	2	CTCTATCTT:TTGTACATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	84.33333333333333	3	32	0.218731855250908	0.100148544468392	2.18407423105328	0.118583310782516	0.0700405306486163	0.0673783069109505	NaN	NaN	0.089610027384957	0.185726871381694	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	108	ATC	CAT	CTA	2	TACATCTAT:TATCTTTAT	1:1	TRUE	1.5	0.5	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	85.16666666666666	3	31.666666666666664	0.216250950767294	0.101277212852957	2.13523797382996	0.114973737914337	0.0717322216605235	0.0667724423477868	NaN	NaN	0.0912191539203512	0.207520689273103	910	0	90	0.09	0.91	0.18
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	ATCTATGCT:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	84.99999999999999	3	32	0.20119798994601	0.100148544468392	2.00899564755542	0.101049445477618	0.0702163651844079	0.0629461298453561	NaN	NaN	0.0883553108355445	0.252759922423549	894	0	106	0.106	0.894	0.212
ORF3a	all	ss12	110	GCT	TGC	TTT	2	TATGCTTTA:TATGCTTTG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	84.66666666666666	3	32.33333333333333	0.202107080966406	0.0990447915097998	2.04056243529383	0.103062289456607	0.0666848759746063	0.0666118742772193	NaN	NaN	0.0885387144038587	0.24440924670804	873	0	127	0.127	0.873	0.254
ORF3a	all	ss12	111	TTA	TTT	AGT	2	GCTTTAGTC:GCTTTGATT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	84.66666666666666	3	32.33333333333333	0.202107080966406	0.0990447915097998	2.04056243529383	0.103062289456607	0.0685910594836743	0.0647289255659311	NaN	NaN	0.0910275001641517	0.25754595606976	887	0	113	0.113	0.887	0.226
ORF3a	all	ss12	112	ATT	AGT	CTA	2	TTAGTCTAC:TTGATTTAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	85.75	3	31.916666666666664	0.199182311241132	0.100428343016685	1.98332766685238	0.0987539682244469	0.0649804969626608	0.0633115218851689	NaN	NaN	0.0876710317566485	0.25998988614488	866	0	134	0.134	0.866	0.268
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	ATTTATGTT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	86.25	3	31.916666666666664	0.182916488688042	0.100428343016685	1.82136320478427	0.0824881456713578	0.0644062248203731	0.0658974256109823	NaN	NaN	0.0858435295848525	0.336596018437015	838	0	162	0.162	0.838	0.324
ORF3a	all	ss12	114	GTT	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATGTTCTG	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	86.41666666666667	3	31.749999999999996	0.182517074011287	0.100992663859693	1.80723101100546	0.0815244101515946	0.0630745350154413	0.067191364138801	NaN	NaN	0.0907736372904175	0.369128677289971	826	0	174	0.174	0.826	0.348
ORF3a	all	ss12	115	CTG	CTT	GCA	2	GTTCTGCAA:TTCTTGCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	86.5	3	31.333333333333332	0.167719022201393	0.102431651254313	1.63737497294647	0.0652873709470797	0.0617491023560063	0.0654345408323409	NaN	NaN	0.0847847502053486	0.441278111123867	807	1	192	0.192	0.807	0.384
ORF3a	all	ss12	116	CAA	GCA	AGC	2	CTGCAAGCT:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	87.5	3	30.666666666666664	0.194633396613813	0.104821456781369	1.85680873544592	0.0898119398324443	0.0700322696971431	0.0694775555538163	NaN	NaN	0.0936859634573062	0.33773568142449	837	0	163	0.163	0.837	0.326
ORF3a	all	ss12	117	AGT	AGC	TAT	2	CAAGCTGTC:CAGAGTATA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	86.91666666666667	3	30.666666666666664	0.211221154937527	0.104821456781369	2.01505647243656	0.106399698156158	0.0685304479627835	0.0668604724343356	NaN	NaN	0.0946608269483548	0.261008864076155	875	0	125	0.125	0.875	0.25
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	AGTATAAAC:GCTGTCAGC	1:1	TRUE	1.5	0.75	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	86.91666666666667	3	30.666666666666664	0.181329278360777	0.104821456781369	1.72988702817768	0.0765078215794081	0.0646286636933296	0.0661998347811766	NaN	NaN	0.0885014682720491	0.387323813951765	832	0	168	0.168	0.832	0.336
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT:GTCAGCTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	86.91666666666667	3	30.416666666666664	0.166818547612438	0.105746684778908	1.57752981061502	0.0610718628335295	0.061792758440504	0.0682358716078038	NaN	NaN	0.0850008913650334	0.472458312294374	787	0	213	0.213	0.787	0.426
ORF3a	all	ss12	120	TTT	CTT	TGT	2	AACTTTGTA:AGCTTTTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.166666666666667	1	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	86.08333333333334	2	30.749999999999996	0.18331766404586	0.0680352852661241	2.69444984802815	0.115282378779736	0.0640038166605042	0.0528821651289853	NaN	NaN	0.0719573635530246	0.109135075407909	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	121	GTA	TGT	AAG	2	TTTGTAAGA:TTTTGCAGA	1:1	TRUE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	85.41666666666667	2	30.749999999999996	0.184940208378112	0.0680352852661241	2.71829841904399	0.116904923111988	0.0669527844579267	0.0514903539272863	NaN	NaN	0.0747224523597013	0.117695022708194	948	0	52	0.052	0.948	0.104
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGCAGATTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	84.58333333333334	2	31.083333333333332	0.171990167404454	0.0672719567702241	2.55663987881174	0.10471821063423	0.0599163190134812	0.0527600287516765	NaN	NaN	0.0714667454080415	0.142846762061537	935	0	65	0.065	0.935	0.13
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGATTTATT	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	84.41666666666669	2	31.083333333333332	0.17237192012259	0.0672719567702241	2.56231464637409	0.105099963352366	0.0596147694462222	0.0529706654197013	NaN	NaN	0.0737305864976218	0.154024425550762	936	1	63	0.063	0.936	0.126
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:TTTATTATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.91666666666669	2	30.749999999999996	0.160791017408873	0.0680352852661241	2.36334744213873	0.0927557321427492	0.0632933598030361	0.0525981404813239	NaN	NaN	0.0709732684729663	0.191243002627638	907	0	93	0.093	0.907	0.186
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATTATGAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.75000000000001	2	30.583333333333332	0.16115228773261	0.0684234871721278	2.35521886406069	0.0927288005604821	0.0608303045964674	0.0512382040892878	NaN	NaN	0.0703870901900871	0.187700545022243	916	0	84	0.084	0.916	0.168
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGT:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.25000000000001	3	30.249999999999996	0.162245943584362	0.106372646579413	1.52526000622948	0.0558732970049489	0.061817499008444	0.066935094081338	NaN	NaN	0.0872577434162417	0.521961461607229	745	0	255	0.255	0.745	0.51
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	TTG	2	AGATGTTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.66666666666667	3	30.583333333333332	0.178926016229881	0.105128058952294	1.70198154529872	0.0737979572775869	0.0652106605308359	0.0715176546318764	NaN	NaN	0.0857733579391037	0.389577836424777	833	0	167	0.167	0.833	0.334
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.91666666666667	3	30.416666666666664	0.178309568095365	0.105746684778908	1.68619534946338	0.0725628833164565	0.0631235921592386	0.0683143240859049	NaN	NaN	0.0891458948312781	0.415657000782043	790	0	210	0.21	0.79	0.42
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.91666666666667	3	31.416666666666664	0.183364067339478	0.102140577511979	1.79521275291372	0.0812234898274984	0.06787621604023	0.0667228407831249	NaN	NaN	0.084898618777604	0.338712862820978	851	0	149	0.149	0.851	0.298
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.75	3	31.083333333333332	0.213443159911581	0.103314927985559	2.06594694564774	0.110128231926023	0.0735929292755733	0.0643052796352117	NaN	NaN	0.0933057867027626	0.237883424202607	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGCTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.91666666666667	4	31.416666666666664	0.23290063730458	0.139531497680893	1.66916173893024	0.0933691396236868	0.0771800803391945	0.0742713483060698	NaN	NaN	0.101693027161718	0.358541953694238	835	0	165	0.165	0.835	0.33
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.91666666666667	4	30.999999999999996	0.250167586995817	0.141595553474679	1.76677572746345	0.108572033521138	0.0819095061562025	0.0814660904686486	NaN	NaN	0.105123362825107	0.30169472356909	848	0	152	0.152	0.848	0.304
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCCGT:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.91666666666667	4	31.833333333333336	0.271931669012678	0.137526919369799	1.9772977556595701	0.13440474964288	0.0834198784517682	0.0764150051688867	NaN	NaN	0.107125012721126	0.209604649226023	889	1	110	0.11	0.889	0.22
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CAA	ATC	2	TGCAAATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79	4	31.666666666666668	0.271586000425913	0.138321779350139	1.96343628387281	0.133264221075773	0.0870789694814059	0.0781106055340034	NaN	NaN	0.1055388556144	0.206695964540589	891	0	109	0.109	0.891	0.218
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AAATCCAAA:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.33333333333333	3	32	0.238441468231124	0.100148544468392	2.3808780197138	0.138292923762732	0.0746555981723338	0.0621921359783251	NaN	NaN	0.102987227979217	0.179331478693607	908	0	92	0.092	0.908	0.184
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.5	3	32.5	0.237845735137858	0.0985020015458152	2.41462844820703	0.139343733592043	0.0781305659141439	0.0640566480645702	NaN	NaN	0.100416713225819	0.165242187453703	910	0	90	0.09	0.91	0.18
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.33333333333333	3	32.5	0.238441468231124	0.0985020015458152	2.42067637701982	0.139939466685309	0.0733895423750245	0.0605388992707816	NaN	NaN	0.0992433865225024	0.158520964199037	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	AAT	2	AACCCAATA:AACCCATTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78	3	32.166666666666664	0.23964200873058	0.0995936054863591	2.40619874700091	0.140048403244221	0.0768034694182445	0.0632181740522475	NaN	NaN	0.0984162061663088	0.154729846373526	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	139	ATA	AAT	ACT	2	CCAATACTT:CCATTACTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79	3	31.166666666666668	0.236076409978014	0.103018812035868	2.29158544262595	0.133057597942146	0.070265125965453007	0.067296767740547	NaN	NaN	0.103592699675755	0.198991451553912	898	0	102	0.102	0.898	0.204
ORF3a	all	ss12	140	CTT	ACT	TTA	2	ATACTTTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79	3	30.833333333333332	0.218932806420977	0.104213595070396	2.10080850078233	0.11471921135058	0.069372172896321	0.0694834638155822	NaN	NaN	0.0993042608398373	0.247996458327217	874	0	126	0.126	0.874	0.252
ORF3a	all	ss12	141	TAT	TTA	TGA	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.33333333333333	3	30.5	0.234911530842709	0.105436462965892	2.22799138205823	0.129475067876817	0.073394190641053	0.0678369094886363	NaN	NaN	0.104314809969791	0.214533553945383	900	0	100	0.1	0.9	0.2
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.16666666666666	3	30.166666666666668	0.239040218372072	0.106688419438138	2.24054512786813	0.132351798933934	0.0761556862122947	0.0699715673205367	NaN	NaN	0.10610725517067	0.212272941975125	904	0	96	0.096	0.904	0.192
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.49999999999999	3	30.833333333333336	0.269530500680923	0.104213595070396	2.58632763315434	0.165316905610527	0.0849975114132868	0.068819970173248	NaN	NaN	0.112714751793253	0.14246207939625	937	0	63	0.063	0.937	0.126
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAC:GCCAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.99999999999999	3	30.333333333333336	0.263548415128416	0.106058740537371	2.48492876488149	0.157489674591045	0.0836673042113822	0.0703386609605837	NaN	NaN	0.104786960349696	0.132851661072237	941	1	58	0.058	0.941	0.116
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTC:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.33333333333333	3	31	0.302544426379644	0.103612753860613	2.91995352991629	0.198931672519031	0.092368826506958	0.0691747141317329	NaN	NaN	0.114193979927612	0.0814996192708572	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	146	TTC	CTT	CGT	2	TACTTCGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.5	3	30.833333333333336	0.301773247822437	0.104213595070396	2.895718621151	0.197559652752041	0.0895925396441624	0.0700541319200479	NaN	NaN	0.117093812681863	0.0915665889920358	956	0	44	0.044	0.956	0.088
ORF3a	all	ss12	147	CTT	CGT	TTG	2	TTCGTTTGC:TTTCTTTGC	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.33333333333333	3	30.333333333333336	0.302544426379644	0.106058740537371	2.85261190965244	0.196485685842272	0.0889800418100591	0.0679861894375393	NaN	NaN	0.123756727332994	0.112359439921389	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.91666666666666	3	29.75	0.281652316781776	0.10829587866142	2.60076671673114	0.173356438120356	0.0850293070372333	0.072453691468424	NaN	NaN	0.113736136495867	0.127459155735398	937	0	63	0.063	0.937	0.126
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.41666666666666	3	30.25	0.283780696115475	0.106372646579413	2.66779764573796	0.177408049536061	0.088622093399109	0.0731618053589499	NaN	NaN	0.117205799259309	0.130115733554698	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.74999999999999	3	29.583333333333336	0.282358178426184	0.108952531416164	2.59157061112849	0.17340564701002	0.0935200588175899	0.0677356020276657	NaN	NaN	0.122024732286569	0.155296504027591	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	151	ACA	TAC	ACA	2	CATACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.33333333333331	4	29.583333333333336	0.284138594692556	0.149095891727942	1.9057439571241	0.135042702964613	0.0860952844646186	0.0879071997097699	NaN	NaN	0.125966083858135	0.283694855272665	852	0	148	0.148	0.852	0.296
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ACA	TAA	2	ACACATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.83333333333331	4	29.083333333333336	0.28200480071778	0.151937056450332	1.85606334166389	0.130067744267447	0.0882892270869434	0.0862598525788989	NaN	NaN	0.124855139024412	0.297527960562484	847	0	153	0.153	0.847	0.306
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATTGTTAC:CATAACTAT	1:1	TRUE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.41666666666664	4	28.833333333333336	0.265842621320033	0.153398778089708	1.73301655091782	0.112443843230325	0.086637383961012	0.0899555330908931	NaN	NaN	0.127395061985098	0.37743137911008	827	0	173	0.173	0.827	0.346
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.58333333333331	3	29.25	0.287401273704121	0.110290063467372	2.6058673344507	0.177111210236748	0.0881970012660338	0.0661638214803459	NaN	NaN	0.108934816848992	0.103982470735654	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.08333333333331	3	29.583333333333336	0.285217792864262	0.108952531416164	2.61781703607069	0.176265261448098	0.0840808542123126	0.0674723167855405	NaN	NaN	0.112273632502137	0.116424107849316	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333331	3	28.75	0.301389150714295	0.112359208671495	2.6823716033411	0.1890299420428	0.0911375446891834	0.0698437836487651	NaN	NaN	0.119957480789055	0.115070088615235	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.91666666666664	3	28.416666666666668	0.299862619562067	0.113782401199837	2.63540421365704	0.18608021836223	0.0873764646420221	0.0734355942632605	NaN	NaN	0.115408413242958	0.106883041193545	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.08333333333331	3	28.416666666666668	0.299105214682181	0.113782401199837	2.62874760532483	0.185322813482343	0.0909435381729788	0.0699362830240546	NaN	NaN	0.119622542433295	0.121326476200475	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAC:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.41666666666666	3	27.75	0.297601975168629	0.116739982283845	2.54927206040713	0.180861992884784	0.0900106618076599	0.0779829308080773	NaN	NaN	0.11784179572186	0.124836288970871	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATACAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.74999999999999	4	27.75	0.296113964785258	0.160073332783954	1.84986443172839	0.136040632001304	0.091497830685035	0.0859872483895116	NaN	NaN	0.129941820200462	0.295129584769337	866	0	134	0.134	0.866	0.268
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAACAGT:TACAATAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	82.24999999999999	4	27.583333333333336	0.312120297918684	0.16115228773261	1.93680339454173	0.150968010186074	0.0888101859008021	0.0897226302712118	NaN	NaN	0.135955140040984	0.266815854825862	877	0	123	0.123	0.877	0.246
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.91666666666664	4	27.916666666666668	0.318526102048975	0.159008783209024	2.00319816063405	0.159517318839951	0.0906494898433688	0.0864302635168013	NaN	NaN	0.13245494791449	0.228468323040167	902	0	98	0.098	0.902	0.196
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.91666666666664	4	28.250000000000004	0.323508417071989	0.156921757285409	2.06159058290172	0.16658665978658	0.0932209299342252	0.0873821336976233	NaN	NaN	0.132912504464171	0.210076245641578	893	0	107	0.107	0.893	0.214
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.08333333333331	4	28.750000000000004	0.322667069425418	0.15389231077321	2.09670689720768	0.168774758652208	0.0946364595549459	0.0847311702180923	NaN	NaN	0.132252236708842	0.201899648741768	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.24999999999999	4	29.416666666666668	0.326918846054154	0.150031026615648	2.17900825868278	0.176887819438506	0.0935771555581803	0.0810191385268259	NaN	NaN	0.130854063238134	0.17644102386674	930	0	70	0.07	0.93	0.14
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.58333333333331	4	30.083333333333336	0.310889822884503	0.146359364647636	2.12415395238275	0.164530458236867	0.0859337088389392	0.0790292450625558	NaN	NaN	0.122774417139483	0.180211613328818	909	0	91	0.091	0.909	0.182
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.58333333333331	4	30.083333333333336	0.291871371191942	0.146359364647636	1.9942104278372	0.145512006544306	0.0851896717030567	0.0792567139627146	NaN	NaN	0.117410657911317	0.215218722891971	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.91666666666664	4	30.41666666666667	0.294930500060605	0.144590316625212	2.03976661054755	0.150340183435394	0.0848143387879638	0.0801325264829551	NaN	NaN	0.125771415328596	0.231952417078778	888	0	112	0.112	0.888	0.224
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT:GTCGTTACT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.08333333333331	4	30.91666666666667	0.294159645070685	0.142015736265178	2.07131725544426	0.152143908805506	0.0854826142324459	0.0753729185611424	NaN	NaN	0.116497170534153	0.191556632425263	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TGC	2	ATTACTTCA:GTTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.41666666666664	4	30.66666666666667	0.311709043238926	0.143291427572032	2.17535025312126	0.168417615666894	0.0906210576037127	0.0801616341131524	NaN	NaN	0.121393165003765	0.165328013120823	917	0	83	0.083	0.917	0.166
ORF3a	all	ss12	171	GCA	TGC	AGG	2	ACTGCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.08333333333331	4	30.33333333333334	0.308458156432116	0.145028544735405	2.12687893266031	0.163429611696711	0.0894648744373666	0.0811821817341705	NaN	NaN	0.12607616564719001	0.194880129933511	903	0	97	0.097	0.903	0.194
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	GCAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.83333333333331	4	30.58333333333334	0.290740699021438	0.143721781908901	2.02294109605269	0.147018917112537	0.0887195886093381	0.0754505884963102	NaN	NaN	0.122643364665015	0.230624587079639	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	173	GAC	TGA	CGG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.49999999999997	4	30.58333333333334	0.287768481418953	0.143721781908901	2.00226074013859	0.144046699510052	0.0858638135280055	0.0789629534443745	NaN	NaN	0.123069371678717	0.241819422888656	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	174	GGC	CGG	CAC	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.66666666666664	4	30.750000000000004	0.282712453350107	0.142863650574837	1.97889702672839	0.139848802775271	0.0868776343118689	0.0754263242559737	NaN	NaN	0.116744035169541	0.23095220433984	888	0	112	0.112	0.888	0.224
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	81.16666666666664	4	30.250000000000004	0.280600193443143	0.145469445655623	1.92892873261799	0.135130747787519	0.0861652975901302	0.0815294512740154	NaN	NaN	0.121161757387842	0.264725280444359	851	0	149	0.149	0.851	0.298
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAC	2	ACAACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.58333333333331	3	30.66666666666667	0.301389150714295	0.104821456781369	2.87526199280856	0.196567693932926	0.0881655460177931	0.0660209070066885	NaN	NaN	0.109513713872627	0.0726674092573365	968	0	32	0.032	0.968	0.064
ORF3a	all	ss12	177	ACA	AAC	ACC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.83333333333331	3	30.000000000000004	0.286305319885247	0.107325632730505	2.66763225709705	0.178979687154742	0.0877485042049932	0.0650039485680073	NaN	NaN	0.105931489754462	0.0911084059081037	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	178	CCA	ACC	AAA	2	ACACCAAAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.83333333333331	3	30.33333333333334	0.268177549189387	0.106058740537371	2.52857565374247	0.162118808652015	0.0791149658589421	0.0618479770294058	NaN	NaN	0.0985530309129929	0.0999717512533615	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTC:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.33333333333331	4	29.83333333333334	0.266173663925686	0.147714914296514	1.80194170096721	0.118458749629172	0.080732672683212	0.0812414342053173	NaN	NaN	0.123241603038889	0.336456018578697	828	0	172	0.172	0.828	0.344
ORF3a	all	ss12	180	CTC	ACT	CAA	2	AAACTCAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.49999999999999	4	30.16666666666667	0.234333426514436	0.145913043990275	1.60597997345634	0.0884203825241606	0.0681598294821363	0.0767289888233333	NaN	NaN	0.109834718498754	0.420801637350766	787	0	213	0.213	0.787	0.426
ORF3a	all	ss12	181	AAA	CAA	ACA	2	CTCAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.99999999999999	3	30.333333333333336	0.215761554338836	0.106058740537371	2.03435900940959	0.109702813801464	0.0656290674635471	0.0650722329217139	NaN	NaN	0.100030028321826	0.272773073432235	877	0	123	0.123	0.877	0.246
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.66666666666666	3	30.750000000000004	0.200233049317567	0.104516640682884	1.9158006611129	0.0957164086346837	0.0682788686786914	0.0670973352272248	NaN	NaN	0.0972548699735605	0.32502645806805	840	0	160	0.16	0.84	0.32
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.33333333333333	3	29.916666666666668	0.182287438823259	0.107647107231784	1.69337981772944	0.0746403315914759	0.0650663951329163	0.0677863649245666	NaN	NaN	0.0945603093569385	0.429912714381321	792	0	208	0.208	0.792	0.416
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79	4	30.583333333333332	0.185778237042605	0.143721781908901	1.29262408644753	0.0420564551337039	0.0633859666734955	0.0752752651907712	NaN	NaN	0.104998519567821	0.688756386645477	662	0	338	0.338	0.662	0.676
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.66666666666667	4	29.916666666666668	0.18143524049715	0.147260274111344	1.23207186454078	0.0341749663858059	0.0642701141639902	0.0772199144110142	NaN	NaN	0.111147249232712	0.758482082395471	646	1	353	0.353	0.646	0.706
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.33333333333333	4	29.25	0.179754639949065	0.150978005779684	1.19060149868037	0.0287766341693818	0.063632693678769	0.08225442290471	NaN	NaN	0.106817028959087	0.787620974437853	631	0	369	0.369	0.631	0.738
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.83333333333333	4	29.583333333333332	0.196927853470251	0.149095891727942	1.32081341201264	0.0478319617423084	0.0659742575917918	0.0814592497083905	NaN	NaN	0.111342179555516	0.667490809915145	681	0	319	0.319	0.681	0.638
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.33333333333333	4	30.083333333333332	0.198330831309248	0.146359364647636	1.35509491850238	0.0519714666616118	0.0656233830776106	0.0770513718591044	NaN	NaN	0.114687525056912	0.650435618789262	694	0	306	0.306	0.694	0.612
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.33333333333333	4	30.583333333333332	0.204149781227553	0.143721781908901	1.42045122538875	0.0604279993186521	0.0654884291722886	0.0757678382413994	NaN	NaN	0.107606335733454	0.574412132298835	743	0	257	0.257	0.743	0.514
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.99999999999999	4	30.583333333333332	0.218932806420977	0.143721781908901	1.52330985264119	0.0752110245120757	0.0663440393284686	0.0782678803325206	NaN	NaN	0.108463711687895	0.488045334676351	758	0	242	0.242	0.758	0.484
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.66666666666666	4	30.916666666666668	0.20315621560155	0.142015736265178	1.43051904629926	0.0611404793363713	0.0680717014661455	0.0779484738670364	NaN	NaN	0.105869621462767	0.563596808086099	734	0	266	0.266	0.734	0.532
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGGATTGG	1:1	TRUE	2	0.166666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.16666666666666	4	30.916666666666668	0.20465023999998	0.142015736265178	1.44103917905159	0.0626345037348018	0.0661275897910137	0.07672162812636	NaN	NaN	0.109587713335702	0.56762906531535	712	0	288	0.288	0.712	0.576
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:GATTGGCAC	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.33333333333333	6	31.41666666666667	0.173851210542993	0.220417888585699	0.788734578933233	-0.0465666780427055	0.0581895018230043	0.115424173225921	NaN	NaN	0.133897395108497	0.728006297271894	372	0	628	0.628	0.372	0.744
ORF3a	all	ss12	194	CAC	GCA	ATC	2	TGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333333	6	32.083333333333336	0.193179203235308	0.215112484631514	0.898038082569788	-0.0219332813962062	0.0618650841731379	0.113154220449104	NaN	NaN	0.128706296939626	0.864685011791598	452	0	548	0.548	0.452	0.904
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.16666666666666	6	31.583333333333336	0.160415060140258	0.219066980579392	0.732264897776881	-0.0586519204391334	0.0552550589810217	0.115898843251907	NaN	NaN	0.134159435101935	0.661980280037877	320	0	680	0.68	0.32	0.64
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666666	6	31.750000000000004	0.159249476407496	0.217732646143538	0.731399168788461	-0.0584831697360422	0.0520710422433913	0.112811323423956	NaN	NaN	0.133242646581074	0.660717833216133	332	0	668	0.668	0.332	0.664
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333333	6	31.91666666666667	0.158864717514625	0.216414580065769	0.734075853236624	-0.0575498625511439	0.0524002188275829	0.11708090447774	NaN	NaN	0.135592191172635	0.671249724489133	326	0	674	0.674	0.326	0.652
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32.5	0.158673037027526	0.211925228838758	0.748721791628931	-0.0532521918112318	0.0494548836480402	0.108901805958222	NaN	NaN	0.128939991971612	0.679606755070354	326	0	674	0.674	0.326	0.652
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32	0.158673037027526	0.215761554338836	0.735409222990409	-0.0570885173113096	0.0517418959537337	0.115980154787704	NaN	NaN	0.132042919850826	0.665488368049549	332	0	668	0.668	0.332	0.664
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.75	6	32	0.15905686340681	0.215761554338836	0.737188160764845	-0.0567046909320252	0.0514933732526418	0.114553930315073	NaN	NaN	0.134137073792785	0.672487229082613	332	0	668	0.668	0.332	0.664
ORF3a	all	ss12	201	GTC	TGT	CGT	2	TATGTCGTT:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333334	5	32.333333333333336	0.158864717514625	0.173179167487274	0.91734311822638	-0.0143144499726495	0.0525433304645756	0.103581963335955	NaN	NaN	0.114863110089401	0.900822952220394	456	0	544	0.544	0.456	0.912
ORF3a	all	ss12	202	GTA	CGT	ATT	2	GTCGTTGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.33333333333334	5	32.833333333333336	0.160024633856936	0.17021844254226	0.940113371188945	-0.0101938086853242	0.0511629929071393	0.103779301759378	NaN	NaN	0.121402040301978	0.933082383939967	456	0	544	0.544	0.456	0.912
ORF3a	all	ss12	203	GTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.08333333333334	5	33.083333333333336	0.160610991304224	0.168775880107432	0.951622893046025	-0.00816488880320848	0.0533444070019715	0.0983704742413987	NaN	NaN	0.114929685860746	0.943363954388338	502	0	498	0.498	0.502	0.996
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	GTACATGGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.83333333333334	5	33.166666666666664	0.145028544735405	0.168300466878196	0.861723959686733	-0.023271922142791	0.0509242760094455	0.10518056216354	NaN	NaN	0.111262823537469	0.834322004296989	424	0	576	0.576	0.424	0.848
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:CATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	32.833333333333336	0.146091244169313	0.17021844254226	0.858257436664322	-0.0241271983729469	0.0513009551099667	0.0960919628423659	NaN	NaN	0.113536783075232	0.831712635742453	447	1	552	0.552	0.447	0.894
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.83333333333334	5	33	0.131083275220683	0.169253998250676	0.774476683419554	-0.0381707230299936	0.0481980208364693	0.102175047505207	NaN	NaN	0.117046732055164	0.744337167500749	398	1	601	0.601	0.398	0.796
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	5	32.83333333333333	0.130765040358583	0.17021844254226	0.768218992052627	-0.039453402183677	0.0483977241263759	0.0993588003829665	NaN	NaN	0.113978360666256	0.729231355931259	399	0	601	0.601	0.399	0.798
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CGA	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.33333333333334	5	32.5	0.13013319533385	0.172180831233375	0.755793745457451	-0.0420476358995253	0.0475218896298867	0.101453970391513	NaN	NaN	0.114249874800282	0.712849204099274	368	0	632	0.632	0.368	0.736
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.66666666666667	5	33.166666666666664	0.131403066768818	0.168300466878196	0.780764719232291	-0.0368974001093777	0.0514181917280079	0.0967282561703043	NaN	NaN	0.11329176110041	0.74466287529883	370	0	630	0.63	0.37	0.74
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	5	32.5	0.130765040358583	0.172180831233375	0.759463404967208	-0.0414157908747918	0.046938892230915	0.105351464034616	NaN	NaN	0.12400652053944	0.73839408388495	381	1	618	0.618	0.381	0.762
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.66666666666667	5	32.5	0.113962844188242	0.172180831233375	0.661878812942748	-0.0582179870451332	0.0454879231532562	0.101560253056158	NaN	NaN	0.118275052802254	0.62255999913889	303	0	697	0.697	0.303	0.606
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.83333333333333	0.128887692694994	0.17021844254226	0.757189942347142	-0.0413307498472659	0.0485408881280509	0.104229080051532	NaN	NaN	0.124035397046575	0.738970200859879	384	1	615	0.615	0.384	0.768
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.66666666666669	5	33.166666666666664	0.12950744207608	0.168300466878196	0.769501383319442	-0.0387930248021161	0.0479349369548552	0.102464132688485	NaN	NaN	0.109839042955697	0.723953011932787	405	0	595	0.595	0.405	0.81
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000001	5	32.5	0.128887692694994	0.172180831233375	0.748560056144108	-0.0432931385383807	0.0459242231980813	0.102578516768429	NaN	NaN	0.113210341714248	0.702154838727261	368	0	632	0.632	0.368	0.736
ORF3a	all	ss12	215	GAG	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.83333333333336	5	31.83333333333333	0.127364024533652	0.176245193423779	0.722652471023176	-0.0488811688901276	0.0470622889261946	0.100546292762245	NaN	NaN	0.117776645476072	0.67811790476611	320	1	679	0.679	0.32	0.64
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.50000000000003	5	30.83333333333333	0.114234586398441	0.182716561993313	0.625201049933402	-0.0684819755948721	0.0450962587396155	0.112240305665164	NaN	NaN	0.126213438986168	0.587413076512741	279	0	721	0.721	0.279	0.558
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.16666666666669	5	29.83333333333333	0.114781984854672	0.189683904532547	0.605122427954751	-0.074901919677875	0.045176091155343	0.121225775235051	NaN	NaN	0.128162727397428	0.558932218739888	280	0	720	0.72	0.28	0.56
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AAT	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	30.166666666666664	0.115334665090852	0.187302855665743	0.615765652268946	-0.0719681905748906	0.0485711216546989	0.111815063470691	NaN	NaN	0.126511790080231	0.569447431350523	292	0	708	0.708	0.292	0.584
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTACT:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.83333333333336	5	29.499999999999996	0.115334665090852	0.192126605059278	0.600305538398846	-0.0767919399684257	0.0454062228948923	0.110238058182305	NaN	NaN	0.126754674671369	0.544626831971329	268	1	731	0.731	0.268	0.536
ORF3a	all	ss12	220	ACT	GAG	TAC	2	ATTACTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.41666666666666	0.0849965139802523	0.192747196311253	0.440974061396971	-0.107750682331	0.0349926145364271	0.10764688796831	NaN	NaN	0.127678280354866	0.398712238092171	184	0	816	0.816	0.184	0.368
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	ACTACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.195270406950441	0.435275960692929	-0.110273892970189	0.034688224414866	0.117819042452718	NaN	NaN	0.118931934105146	0.353821813883197	155	0	845	0.845	0.155	0.31
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	5	29.08333333333333	0.0849965139802523	0.195270406950441	0.435275960692929	-0.110273892970189	0.0345726828544751	0.122846441209593	NaN	NaN	0.127669288837632	0.387727199507189	164	0	836	0.836	0.164	0.328
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	5	28.749999999999993	0.0870541284395655	0.197860943283853	0.439976313641024	-0.110806814844288	0.0345977316999872	0.12204353875478	NaN	NaN	0.130301418823978	0.395109184201285	164	0	836	0.836	0.164	0.328
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.33333333333337	5	29.41666666666666	0.0879053734766805	0.192747196311253	0.456065640170085	-0.104841822834572	0.0358301636950117	0.119512309380519	NaN	NaN	0.12415451937433	0.398420066620578	173	0	827	0.827	0.173	0.346
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TGA	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333337	5	30.41666666666666	0.0892139571460239	0.185556129985381	0.480792292623546	-0.0963421728393568	0.0367151616385944	0.110748199951615	NaN	NaN	0.123421925302993	0.435042473100658	173	0	827	0.827	0.173	0.346
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.9166666666667	5	30.16666666666666	0.0729614963194685	0.187302855665743	0.389537554353545	-0.114341359346275	0.0326238313812799	0.113678239161088	NaN	NaN	0.121801807457435	0.347859484103719	142	0	858	0.858	0.142	0.284
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAC	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AACAAGCTT:AATAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAT:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	AGA	GCC	2	AAAGATCCA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCA	GCC	A--	1	GAGCCTGAA:GATCCA---	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCA---CCG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	CCG	-CC	ACA	1	---CCGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	2	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AAT	ACA	TGT	2	CCGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333336	1	31.333333333333325	0.0127934871784325	0.0326138339548042	0.392271794728627	-0.0198203467763717	0.0134642188822287	0.0358236125859615	NA	NA	0.0390451509600928	0.611715420227662	282	126	592	0.592	0.282	0.564
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666669	1	31.166666666666657	0.025864632053377	0.0327921082603738	0.788745628918041	-0.00692747620699678	0.0181611226245726	0.0333748793257088	NA	NA	0.0385127448981182	0.857250779259504	436	44	520	0.52	0.436	0.872
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333336	1	31.666666666666657	0.0261464386246643	0.0322630388127681	0.810414628838892	-0.00611660018810386	0.018811998624878	0.0331460039937125	NA	NA	0.0376402801022208	0.870910984570835	456	51	493	0.493	0.456	0.912
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666669	1	31.166666666666657	0.0262035385209603	0.0327921082603738	0.799080629793629	-0.00658856973941343	0.018919024381538	0.0358301254045767	NA	NA	0.0381352432049365	0.862833377950919	440	51	509	0.509	0.44	0.88
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666669	1	30.666666666666657	0.0263763446044989	0.0333388219281254	0.791160067424196	-0.00696247732362644	0.0187937194565624	0.0360562988934421	NA	NA	0.042375279383396	0.869490914893626	436	45	519	0.519	0.436	0.872
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGAATTTTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666669	1	30.666666666666657	0.0262035385209603	0.0333388219281254	0.78597673839382	-0.00713528340716501	0.0187284713446934	0.0354698989799773	NA	NA	0.0409887121678101	0.861803196905172	448	40	512	0.512	0.448	0.896
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTCACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666669	1	31.333333333333325	0.0267288865855191	0.0326138339548042	0.819556713956403	-0.00588494736928512	0.0194100503716905	0.0347029142491966	NA	NA	0.0401233941491855	0.883391532088892	439	43	518	0.518	0.439	0.878
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTCACACTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.50000000000001	1	30.999999999999993	0.0266103300115572	0.032972342565837	0.80705002862394	-0.00636201255427989	0.0191315185218988	0.034821320407974	NA	NA	0.0401763552782988	0.874179310512976	447	50	503	0.503	0.447	0.894
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	ACAATTGGA:ACACTTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.83333333333334	1	31.666666666666657	0.0268485044068343	0.0322630388127681	0.832175312519197	-0.00541453440593382	0.0190506473367681	0.0348158636203668	NA	NA	0.0410389988370225	0.895034662007508	445	42	513	0.513	0.445	0.89
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGAACT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.00000000000001	1	31.333333333333325	0.0132746828245506	0.0326138339548042	0.407026136299907	-0.0193391511302535	0.013246867352087	0.0363955136550933	NA	NA	0.0369050815841772	0.600261797121593	250	141	609	0.609	0.25	0.5
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	TGT	2	GGAACTGTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.33333333333334	1	31.666666666666657	0.0132162010123647	0.0322630388127681	0.409639063730548	-0.0190468378004034	0.0134825969292631	0.0336245704639649	NA	NA	0.0384587704909722	0.620421243107188	278	117	605	0.605	0.278	0.556
ORF3a	all	ss12	13	GTA	TGT	AAC	2	ACTGTAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.66666666666667	1	31.666666666666657	0.0131582322381821	0.0322630388127681	0.407842308796243	-0.019104806574586	0.0127483826788757	0.0340313400286357	NA	NA	0.0367171262282184	0.602837683913291	281	139	580	0.58	0.281	0.562
ORF3a	all	ss12	14	ACT	AAC	TTT	2	GTAACTTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666667	1	31.49999999999999	0.0130722263514627	0.0324374878453625	0.402997495175375	-0.0193652614938997	0.0134272339097186	0.0345883829867606	NA	NA	0.038419498563994	0.614227828326301	240	126	634	0.634	0.24	0.48
ORF3a	all	ss12	15	TTG	TTT	GAA	2	ACTTTGAAA:ACTTTGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666667	1	31.49999999999999	0.0130722263514627	0.0324374878453625	0.402997495175375	-0.0193652614938997	0.0133397772581121	0.0343198956770398	NA	NA	0.0370624077666577	0.601319364744155	271	134	595	0.595	0.271	0.542
ORF3a	all	ss12	16	AAA	GAA	ACA	2	TTGAAACAA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.5	1	31.99999999999999	0.0131871529184001	0.031919710814097	0.413135099976412	-0.0187325578956969	0.0129784197456294	0.0335165941903934	NA	NA	0.0366668136909787	0.609430959054936	285	128	587	0.587	0.285	0.57
ORF3a	all	ss12	17	CAA	ACA	AGG	2	AAACAAGGT:AAGCAAGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.33333333333334	1	31.99999999999999	0.0132162010123647	0.031919710814097	0.414045136227483	-0.0187035098017323	0.0139663650875531	0.0338034402056601	NA	NA	0.0379017136015618	0.621677714314243	276	127	597	0.597	0.276	0.552
ORF3a	all	ss12	18	GGT	AGG	TGA	2	CAAGGTGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666669	1	30.999999999999993	0.0130722263514627	0.032972342565837	0.396460346284495	-0.0199001162143743	0.0131909023540472	0.0338904448130226	NA	NA	0.0368686719965029	0.589364766711443	254	149	597	0.597	0.254	0.508
ORF3a	all	ss12	19	GAA	TGA	AAT	2	GGTGAAATC:GGTGAAATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333334	1	30.999999999999993	0.0130438070339019	0.032972342565837	0.395598432469785	-0.0199285355319351	0.0130198770016186	0.0348414906626089	NA	NA	0.0378547695861069	0.598577563670852	274	126	600	0.6	0.274	0.548
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	GAAATCAAG:GAAATTAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.66666666666669	1	30.999999999999993	0.0126585283405138	0.032972342565837	0.383913527382475	-0.0203138142253232	0.0133308481125193	0.0352757603945704	NA	NA	0.0365622731507897	0.578487786317305	280	125	595	0.595	0.28	0.56
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	GGA	2	ATCAAGGAT:ATTAAGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.16666666666669	1	31.66666666666666	0.0127391597743079	0.0322630388127681	0.394853065398985	-0.0195238790384602	0.0128217167178706	0.0330353161508992	NA	NA	0.0358392104783458	0.585916467316476	255	121	624	0.624	0.255	0.51
ORF3a	all	ss12	22	GAT	GGA	TGC	2	AAGGATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.66666666666667	1	32.33333333333333	0.0129873375085957	0.0315836140125951	0.41120492111563	-0.0185962765039994	0.0131242656494146	0.0347791430085086	NA	NA	0.0349001800088911	0.59414306077096	272	137	591	0.591	0.272	0.544
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	GATGCTACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.66666666666667	1	31.66666666666666	0.0129873375085957	0.0322630388127681	0.402545388981027	-0.0192757013041724	0.0129125791067682	0.0350551824228819	NA	NA	0.0347672154057307	0.579290226689935	263	117	620	0.62	0.263	0.526
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666667	1	32.16666666666666	0.0130722263514627	0.0317507728699206	0.411713642531418	-0.018678546518457802	0.0135487660529346	0.0330806709174205	NA	NA	0.0403457190508585	0.643391396775018	267	143	590	0.59	0.267	0.534
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TTC	2	ACTCCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666667	1	32.16666666666666	0.0130722263514627	0.0317507728699206	0.411713642531418	-0.018678546518457802	0.0130720240728344	0.0347707249113982	NA	NA	0.0364811675965031	0.608647389307669	235	138	627	0.627	0.235	0.47
ORF3a	all	ss12	26	TCA	TTC	AGA	2	CCTTCAGAT	2	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.5	1	31.499999999999993	0.0128482799476378	0.0324374878453625	0.39609355721037	-0.0195892078977247	0.0124061663851606	0.0356550180065503	NA	NA	0.0366145024162156	0.592641375632311	262	145	593	0.593	0.262	0.524
ORF3a	all	ss12	27	GAT	AGA	TTC	2	TCAGATTCT:TCAGATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.5	1	31.499999999999993	0.0128482799476378	0.0324374878453625	0.39609355721037	-0.0195892078977247	0.0133922996418841	0.0370902804502686	NA	NA	0.0386901291214681	0.612638887590854	253	119	628	0.628	0.253	0.506
ORF3a	all	ss12	28	TCT	TTC	TGT	2	GATTCTGTT:GATTTTGTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333334	1	31.91666666666666	0.0262321821040851	0.0320048558445568	0.819631315681945	-0.00577267374047172	0.0188315188707145	0.0340878886971201	NA	NA	0.0391787255468053	0.882862043511345	451	58	491	0.491	0.451	0.902
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCG	2	TCTGTTCGC:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25000000000001	0	32.58333333333333	0.0263473854682498	0	-Inf	0.0263473854682498	0.0184494055133251	0	NA	NA	0.0183826264178108	0.151778850334012	887	113	0	0	0.887	0.001
ORF3a	all	ss12	30	CGC	TCG	CGC	2	GTTCGCGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666669	0	33.08333333333333	0.0262896575662818	0	-Inf	0.0262896575662818	0.0190439475465213	0	NA	NA	0.0191582004864487	0.169988598431922	871	129	0	0	0.871	0.001
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CGCGCTACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.83333333333336	0	32.83333333333333	0.0395696157178212	0	-Inf	0.0395696157178212	0.0238126126168643	0	NA	NA	0.0233274441496897	0.0898349861170034	959	41	0	0	0.959	0.001
ORF3a	all	ss12	32	ACT	TAC	TGC	2	GCTACTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.50000000000003	0	32.16666666666666	0.0387182740539804	0	-Inf	0.0387182740539804	0.0230486348273591	0	NA	NA	0.0229823825786195	0.0920476917616941	960	40	0	0	0.96	0.001
ORF3a	all	ss12	33	GCA	TGC	AAC	2	ACTGCAACG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.83333333333336	0	31.499999999999993	0.038063135955626	0	-Inf	0.038063135955626	0.0224145116256893	0	NA	NA	0.0217264497360903	0.0797865032652784	953	47	0	0	0.953	0.001
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.66666666666669	0	31.999999999999993	0.0381438129251182	0	-Inf	0.0381438129251182	0.0224312484041601	0	NA	NA	0.0233345161846127	0.102122025774365	958	42	0	0	0.958	0.001
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.66666666666669	0	32.66666666666666	0.038635150837581	0	-Inf	0.038635150837581	0.0234233129610391	0	NA	NA	0.0226280129526828	0.0877470612034044	967	33	0	0	0.967	0.001
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.66666666666669	0	33.33333333333333	0.0391393148779276	0	-Inf	0.0391393148779276	0.0228772581663492	0	NA	NA	0.0223125348498364	0.0794064827860503	961	39	0	0	0.961	0.001
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.66666666666669	0	33.33333333333333	0.0391393148779276	0	-Inf	0.0391393148779276	0.023488081931221	0	NA	NA	0.0227233428114356	0.0849920711655979	950	50	0	0	0.95	0.001
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.33333333333336	0	33.99999999999999	0.0393103070130301	0	-Inf	0.0393103070130301	0.0233619740463938	0	NA	NA	0.0224117120511326	0.0794292527096939	948	52	0	0	0.948	0.001
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.16666666666669	0	33.49999999999999	0.0393963647100293	0	-Inf	0.0393963647100293	0.0232151854463014	0	NA	NA	0.0233596775002716	0.0916973222157696	957	43	0	0	0.957	0.001
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.16666666666669	0	33.49999999999999	0.0393963647100293	0	-Inf	0.0393963647100293	0.0245501175672585	0	NA	NA	0.0251921798747626	0.117856769147983	952	48	0	0	0.952	0.001
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.83333333333336	0	32.83333333333333	0.039054375562259	0	-Inf	0.039054375562259	0.0233407543276263	0	NA	NA	0.0232300544254734	0.0927240061352626	949	51	0	0	0.949	0.001
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.50000000000003	0	32.16666666666666	0.0387182740539804	0	-Inf	0.0387182740539804	0.02275300718728	0	NA	NA	0.0233382500546039	0.0971147802641734	955	45	0	0	0.955	0.001
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.50000000000003	0	32.16666666666666	0.0387182740539804	0	-Inf	0.0387182740539804	0.0224260000122041	0	NA	NA	0.0227417205417716	0.0886576031390329	951	49	0	0	0.951	0.001
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.1666666666667	0	32.49999999999999	0.0388855983989721	0	-Inf	0.0388855983989721	0.0222684743527787	0	NA	NA	0.0230553268247669	0.0916762512096311	962	38	0	0	0.962	0.001
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.1666666666667	0	32.49999999999999	0.0388855983989721	0	-Inf	0.0388855983989721	0.0238158332991446	0	NA	NA	0.0233841773631766	0.0963320275116212	942	58	0	0	0.942	0.001
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000003	0	32.99999999999999	0.0394828001140665	0	-Inf	0.0394828001140665	0.0227072301700759	0	NA	NA	0.0229514043831819	0.0853818881683617	961	39	0	0	0.961	0.001
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000003	0	32.99999999999999	0.0394828001140665	0	-Inf	0.0394828001140665	0.0232710350612429	0	NA	NA	0.0242244204547563	0.103127719195548	947	53	0	0	0.947	0.001
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.6666666666667	0	32.99999999999999	0.0396568140359608	0	-Inf	0.0396568140359608	0.0235149773839897	0	NA	NA	0.0249755103065987	0.112325243008893	950	50	0	0	0.95	0.001
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.6666666666667	0	32.99999999999999	0.0396568140359608	0	-Inf	0.0396568140359608	0.0235249741320384	0	NA	NA	0.0231468302387301	0.0866625277620568	951	49	0	0	0.951	0.001
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.1666666666667	0	33.49999999999999	0.039920730758297	0	-Inf	0.039920730758297	0.0239383903752322	0	NA	NA	0.0235531582198226	0.090090502644994	953	47	0	0	0.953	0.001
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.1666666666667	0	32.49999999999999	0.0393963647100293	0	-Inf	0.0393963647100293	0.0226822221616063	0	NA	NA	0.0226727085024312	0.0822792479372893	957	43	0	0	0.957	0.001
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.6666666666667	0	32.99999999999999	0.0396568140359608	0	-Inf	0.0396568140359608	0.0230911354302062	0	NA	NA	0.022931579263586	0.0837457909475186	958	42	0	0	0.958	0.001
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333336	0	32.16666666666666	0.0264928206228062	0	-Inf	0.0264928206228062	0.0189558458525649	0	NA	NA	0.0188876790030456	0.16072095495497	870	130	0	0	0.87	0.001
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.50000000000003	0	31.499999999999993	0.0262608883838265	0	-Inf	0.0262608883838265	0.0188668771673479	0	NA	NA	0.019411439468736	0.176101539101178	855	145	0	0	0.855	0.001
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000003	0	31.999999999999993	0.026434454296256	0	-Inf	0.026434454296256	0.0199015283234521	0	NA	NA	0.0187758878820026	0.159162548314035	882	118	0	0	0.882	0.001
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.6666666666667	0	31.999999999999993	0.0262035385209603	0	-Inf	0.0262035385209603	0.0187878911423865	0	NA	NA	0.0197154341275454	0.183819079239477	847	153	0	0	0.847	0.001
ORF3a	all	ss12	57	CAA	TCA	AAG	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.33333333333337	0	32.66666666666666	0.0266694765273651	0	-Inf	0.0266694765273651	0.0189282702175789	0	NA	NA	0.0194441004984366	0.170188822279795	875	125	0	0	0.875	0.001
ORF3a	all	ss12	58	AGC	AAG	CGC	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333337	0	32.66666666666666	0.0264928206228062	0	-Inf	0.0264928206228062	0.0183727090542809	0	NA	NA	0.0190941573058422	0.165294500080382	838	162	0	0	0.838	0.001
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000004	0	33.33333333333333	0.0269691977905829	0	-Inf	0.0269691977905829	0.0191281167172905	0	NA	NA	0.0193267287462749	0.162884639715907	877	123	0	0	0.877	0.001
ORF3a	all	ss12	60	TCC	TTC	CAA	2	GCTTCCAAA:GCTTCCAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.83333333333337	0	32.99999999999999	0.0268485044068343	0	-Inf	0.0268485044068343	0.0202419824797754	0	NA	NA	0.0191758782004812	0.161477795646707	881	119	0	0	0.881	0.001
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	TCCAAAATC:TCCAAGATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.4166666666667	0	33.416666666666664	0.0269995408952429	0	-Inf	0.0269995408952429	0.0192326913506347	0	NA	NA	0.0192438032544653	0.160609324701361	891	109	0	0	0.891	0.001
ORF3a	all	ss12	62	ATC	AAT	CAT	2	AAAATCATA:AAGATCATA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.4166666666667	0	34.08333333333333	0.0273690573365762	0	-Inf	0.0273690573365762	0.0199685031443558	0	NA	NA	0.0194898814801571	0.160238441669186	880	120	0	0	0.88	0.001
ORF3a	all	ss12	63	ATA	CAT	AAC	2	ATCATAACC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.08333333333337	0	34.08333333333333	0.0274944876870936	0	-Inf	0.0274944876870936	0.0205676172275	0	NA	NA	0.0202271768200698	0.174056457556128	860	140	0	0	0.86	0.001
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATAACCCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.08333333333337	0	34.74999999999999	0.0278777737612569	0	-Inf	0.0278777737612569	0.0199196676845761	0	NA	NA	0.0197534230780138	0.158159639554372	865	135	0	0	0.865	0.001
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:ACCCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.08333333333337	0	35.416666666666664	0.0278777737612569	0	-Inf	0.0278777737612569	0.0208418987117509	0	NA	NA	0.0195570028367778	0.154023558446619	878	122	0	0	0.878	0.001
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTTAAAAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.4166666666667	0	35.416666666666664	0.0277488297186241	0	-Inf	0.0277488297186241	0.0201875766167585	0	NA	NA	0.0203456129041865	0.17260757684902	876	124	0	0	0.876	0.001
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	GAG	2	AAAAAGAGA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.75000000000003	0	36.08333333333333	0.0280079218999906	0	-Inf	0.0280079218999906	0.019968154097187	0	NA	NA	0.0200989657993064	0.163468448690307	866	134	0	0	0.866	0.001
ORF3a	all	ss12	68	AGA	GAG	ATG	2	AAGAGATGG	2	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.91666666666669	0	36.08333333333333	0.0279426962668192	0	-Inf	0.0279426962668192	0.0196313191287867	0	NA	NA	0.0200857170147445	0.164173137573618	864	136	0	0	0.864	0.001
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.58333333333336	0	36.75	0.0280734527889724	0	-Inf	0.0280734527889724	0.0200215810590736	0	NA	NA	0.0195068141434419	0.150104815897494	866	134	0	0	0.866	0.001
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.91666666666669	0	37.08333333333333	0.0283386721709848	0	-Inf	0.0283386721709848	0.0204619312453975	0	NA	NA	0.0198482091422773	0.153358148696583	863	137	0	0	0.863	0.001
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.91666666666669	0	37.08333333333333	0.0283386721709848	0	-Inf	0.0283386721709848	0.0197251887331919	0	NA	NA	0.0211050323562347	0.179354627158262	869	131	0	0	0.869	0.001
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.75000000000003	0	36.58333333333333	0.0280079218999906	0	-Inf	0.0280079218999906	0.0201009242076021	0	NA	NA	0.0198563132860891	0.158383299235146	860	140	0	0	0.86	0.001
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCACTCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.91666666666669	0	36.58333333333333	0.0279426962668192	0	-Inf	0.0279426962668192	0.0203239897326249	0	NA	NA	0.0208211402788983	0.179584690018009	854	146	0	0	0.854	0.001
ORF3a	all	ss12	74	TCC	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTCTCTAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.91666666666669	0	35.916666666666664	0.0275576350296145	0	-Inf	0.0275576350296145	0.0197610256885436	0	NA	NA	0.0196044776008263	0.159818972128273	860	140	0	0	0.86	0.001
ORF3a	all	ss12	75	AAG	CAA	GGG	2	TCCAAGGGT:TCTAAGGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666669	0	35.24999999999999	0.0271830432683088	0	-Inf	0.0271830432683088	0.0194946749668393	0	NA	NA	0.0199810000123556	0.173689277708014	860	140	0	0	0.86	0.001
ORF3a	all	ss12	76	GGT	GGG	TAT	2	AAGGGTATT:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000003	0	35.24999999999999	0.0270604324233619	0	-Inf	0.0270604324233619	0.0200543270954906	0	NA	NA	0.0199192146201675	0.174302227327041	872	128	0	0	0.872	0.001
ORF3a	all	ss12	77	ATT	TAT	TCA	2	GGTATTCAC:GGTGTTCAC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.25000000000003	0	34.58333333333333	0.026699148503671	0	-Inf	0.026699148503671	0.018615486829391	0	NA	NA	0.0183393238739562	0.145436444630009	872	128	0	0	0.872	0.001
ORF3a	all	ss12	78	CAC	TCA	CTT	2	ATTCACTTT:GTTCACTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333336	0	34.83333333333333	0.0133041182530361	0	-Inf	0.0133041182530361	0.0139894031800066	0	NA	NA	0.0140865699112895	0.344937663287401	653	347	0	0	0.653	0.001
ORF3a	all	ss12	79	TTT	CTT	TAT	2	CACTTTATT:CACTTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666669	0	33.83333333333333	0.0130722263514627	0	-Inf	0.0130722263514627	0.0129681394291081	0	NA	NA	0.0133360319796275	0.326978234176791	638	362	0	0	0.638	0.001
ORF3a	all	ss12	80	ATT	TAT	TTG	2	TTTATTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.5	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.50000000000001	0	33.83333333333333	0.0131871529184001	0	-Inf	0.0131871529184001	0.0134695483879729	0	NA	NA	0.0136196124926214	0.332920881197128	631	369	0	0	0.631	0.001
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	ATTTGCAAC:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.25000000000001	0	33.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.58333333333334	0	34.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	83	TTG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.58333333333334	0	34.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GCT	2	TTGCTGCTG:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.75000000000001	0	33.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	85	CTG	GCT	GCT	2	CTGCTGCTG:CTGTTGTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.08333333333334	0	33.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	86	CTG	GCT	GTT	2	CTGCTGTTT:TTGTTGTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.75000000000001	0	32.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	87	TTT	GTT	TGT	2	CTGTTTGTA:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.91666666666669	0	31.749999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.58333333333334	0	31.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	GTAACAGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.08333333333334	0	31.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	90	GTT	AGT	TTA	2	ACAGTTTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.75	0	32.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	91	TAC	TTA	CTC	2	GTTTACTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.08333333333334	0	32.916666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TACTCACAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.75	0	33.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCACATCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.41666666666666	0	32.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TTT	2	CACCTTTTG:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.25	0	31.749999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	95	TTG	TTT	GCT	2	CTTTTGCTC	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.58333333333333	0	31.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	TTGCTCGTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.75	0	31.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	97	GTT	CGT	TGC	2	CTCGTTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.75	0	31.249999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	98	GCT	TGC	TGC	2	GTTGCTGCT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.75	0	31.249999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC:GCTGCTGGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.41666666666666	0	31.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CCT	2	GCTGGCCTT:GCTGGTCTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.41666666666666	0	31.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	101	CTT	CCT	TGA	2	GGCCTTGAA:GGTCTTGAA	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.08333333333333	0	32.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	102	GAA	TGA	AGC	2	CTTGAAGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.08333333333333	0	32.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CCC	2	GAAGCCCCA:GAAGCCCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.08333333333333	0	32.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	104	CCA	CCC	ATT	2	GCCCCATTC:GCCCCTTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.58333333333333	0	32.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	105	TTC	ATT	CCT	2	CCATTCCTC:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.25	0	31.41666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	106	CTC	CCT	CTA	2	TTCCTCTAC:TTTCTCTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.75	0	31.91666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CCT	2	CTCTACCTC:CTCTATCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.75	0	31.91666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	108	CTC	CCT	CTA	2	TACCTCTAC:TATCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.91666666666667	0	31.249999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	109	TAC	CTA	CGC	2	CTCTACGCT:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.25	0	31.249999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	110	GCT	CGC	TTT	2	TACGCTTTA:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.91666666666667	0	31.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	111	TTA	TTT	AGT	2	GCTTTAGTC	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.33333333333334	0	31.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	112	GTC	AGT	CTA	2	TTAGTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.66666666666669	0	30.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	GTCTACTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.66666666666669	0	30.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	114	TTC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.16666666666669	0	29.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	115	TTG	CTT	GCA	2	TTCTTGCAG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.16666666666669	0	28.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	116	CAG	GCA	GAG	2	TTGCAGAGT	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.50000000000003	0	28.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	117	AGT	GAG	TAT	2	CAGAGTATA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.00000000000003	0	28.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	AGTATAAAC	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.66666666666669	0	28.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.66666666666669	0	27.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	120	TTT	CTT	TGT	2	AACTTTGTA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.33333333333336	0	27.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	121	GTA	TGT	AAG	2	TTTGTAAGA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.66666666666669	0	27.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA	2	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.16666666666669	0	28.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.00000000000003	0	28.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.6666666666667	0	27.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.6666666666667	0	27.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	126	AGG	GAG	GCT	2	ATGAGGCTT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.6666666666667	0	27.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	127	CTT	GCT	TTG	2	AGGCTTTGG	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.33333333333337	0	27.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.6666666666667	0	26.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.6666666666667	0	27.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.00000000000003	0	27.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000003	0	27.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.1666666666667	0	26.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CCG	2	AAATGCCGT	2	FALSE	2.5	0.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333337	0	27.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	134	CGT	CCG	TTC	2	TGCCGTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000003	0	27.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	135	TCC	TTC	CAA	2	CGTTCCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000003	0	27.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000003	0	28.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333336	0	28.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.50000000000003	0	27.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTC:CCATTACTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000003	0	26.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	140	CTC	ACT	CTA	2	TTACTCTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333337	0	26.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	141	TAT	CTA	TGA	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333337	0	26.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC:TATGATGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000004	0	25.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC:GATGCTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.6666666666667	0	25.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAT:GCTAACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.1666666666667	0	25.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTC:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000004	0	26.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	146	TTC	CTT	CCT	2	TACTTCCTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.66666666666671	0	25.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	147	CTT	CCT	TTG	2	TTCCTTTGT:TTTCTTTGC	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.66666666666671	0	25.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.33333333333339	0	24.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT:TGTTGGCAT	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333339	0	25.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.66666666666671	0	24.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	151	ACT	TAC	TAA	2	CATACTAAT	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000004	0	24.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	152	AAT	TAA	TTG	2	ACTAATTGT	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000004	0	24.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	153	TGT	TTG	TTA	2	AATTGTTAC:AATTGTTAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333339	0	24.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	154	TAC	TTA	CGA	2	TGTTACGAC:TGTTATGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000004	0	25.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.33333333333337	0	26.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	156	TAT	CTA	TTG	2	GACTATTGT	2	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000003	0	25.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	157	TGT	TTG	TAT	2	TATTGTATA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.6666666666667	0	24.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.1666666666667	0	25.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	159	CCT	ACC	TTA	2	ATACCTTAC	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000004	0	24.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	160	TAC	TTA	CAA	2	CCTTACAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000004	0	24.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	161	AAT	CAA	TAG	2	TACAATAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.1666666666667	0	24.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	162	AGT	TAG	TGT	2	AATAGTGTA	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333336	0	25.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.83333333333336	0	25.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	164	ACT	AAC	TTC	2	GTAACTTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.00000000000003	0	26.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	165	TCT	TTC	TTC	2	ACTTCTTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.00000000000003	0	26.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	166	TCA	TTC	AAT	2	TCTTCAATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.33333333333336	0	27.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	TCAATTGTC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.33333333333336	0	27.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000003	0	27.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.1666666666667	0	27.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TTC	2	ATTACTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333337	0	28.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	171	TCA	TTC	AGG	2	ACTTCAGGT	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.1666666666667	0	27.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	TCAGGTGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000003	0	27.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	173	GAT	TGA	TGG	2	GGTGATGGC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.16666666666669	0	27.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	174	GGC	TGG	CAC	2	GATGGCACA	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.16666666666669	0	27.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.16666666666669	0	27.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAG	2	ACAACAAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.00000000000001	0	27.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	177	AGT	AAG	TCC	2	ACAAGTCCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.00000000000001	0	27.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	178	CCT	TCC	TAT	2	AGTCCTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.33333333333336	0	27.999999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	179	ATT	TAT	TTC	2	CCTATTTCT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333336	0	27.499999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	180	TCT	TTC	TGA	2	ATTTCTGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000003	0	27.499999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	181	GAA	TGA	ACA	2	TCTGAACAT	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000003	0	28.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	TGA	2	GAACATGAC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.50000000000003	0	29.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	183	GAC	TGA	CTA	2	CATGACTAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.50000000000003	0	28.499999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333336	0	29.499999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	185	CAG	CCA	GAT	2	TACCAGATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.50000000000003	0	28.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	186	ATT	GAT	TGG	2	CAGATTGGT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.50000000000003	0	27.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.50000000000003	0	27.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.00000000000003	0	28.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000003	0	28.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000003	0	27.999999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA	2	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000003	0	27.999999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000003	0	28.499999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GGA	2	AAATGGGAA:AAATGGGAG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000003	0	28.499999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	194	GAA	GGA	ATC	2	TGGGAATCT:TGGGAGTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.1666666666667	0	29.499999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	195	TCT	ATC	TGG	2	GAATCTGGA:GAGTCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.00000000000003	0	28.999999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	196	GGA	TGG	AGT	2	TCTGGAGTA	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000003	0	29.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000003	0	29.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000003	0	30.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTG	2	AAAGACTGT	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000003	0	29.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	200	TGT	CTG	TGT	2	GACTGTGTT	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333337	0	29.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	201	GTT	TGT	TGT	2	TGTGTTGTA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.1666666666667	0	29.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	202	GTA	TGT	ATT	2	GTTGTATTA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.6666666666667	0	30.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	203	TTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.1666666666667	0	30.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	TTACACAGT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.1666666666667	0	30.666666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	TTA	2	CACAGTTAC	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.1666666666667	0	30.666666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	206	TAC	TTA	CTT	2	AGTTACTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.50000000000003	0	30.666666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.33333333333337	0	30.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	208	ACT	CAC	TTC	2	TTCACTTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333336	0	29.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	209	TCA	TTC	AGA	2	ACTTCAGAC:ACTTCAGAT	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666669	0	30.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	TCAGACTAT:TCAGATTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333336	1	29.833333333333325	0	0.0342916870035713	0	-0.0342916870035713	0	0.036098863839684	NA	NA	0.0363583928291797	0.345600402906422	0	359	641	0.641	0	0.001
ORF3a	all	ss12	211	TAT	CTA	TTA	2	GACTATTAC:GATTATTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.6666666666667	1	29.833333333333325	0	0.0342916870035713	0	-0.0342916870035713	0	0.0377875186167959	NA	NA	0.0381006219279912	0.368104505780198	0	330	670	0.67	0	0.001
ORF3a	all	ss12	212	TAC	TTA	CCA	2	TATTACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.00000000000004	1	30.166666666666657	0	0.0339040775760351	0	-0.0339040775760351	0	0.0380013555787878	NA	NA	0.0354754098376449	0.339220568932138	0	325	675	0.675	0	0.001
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333337	1	30.833333333333325	0	0.0331545693783718	0	-0.0331545693783718	0	0.0363993142918714	NA	NA	0.0343835071031705	0.334916627363773	0	376	624	0.624	0	0.001
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC	2	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.6666666666667	1	30.166666666666657	0	0.0339040775760351	0	-0.0339040775760351	0	0.0346202746691046	NA	NA	0.03849754633965	0.378490222554974	0	336	664	0.664	0	0.001
ORF3a	all	ss12	215	TAC	GTA	CTC	2	CTGTACTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.6666666666667	1	29.499999999999993	0	0.0346882632380668	0	-0.0346882632380668	0	0.0361585062006493	NA	NA	0.0384289317066595	0.366706320200841	0	377	623	0.623	0	0.001
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	TACTCAACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.6666666666667	1	28.499999999999993	0	0.0359350167719231	0	-0.0359350167719231	0	0.0402033439824418	NA	NA	0.0385783435026339	0.351604503006309	0	374	626	0.626	0	0.001
ORF3a	all	ss12	217	ACT	AAC	TCA	2	TCAACTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333337	1	27.499999999999993	0	0.0372747514142044	0	-0.0372747514142044	0	0.0375446907014294	NA	NA	0.0390541515936906	0.339862172208208	0	391	609	0.609	0	0.001
ORF3a	all	ss12	218	CAA	TCA	ATT	2	ACTCAATTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.6666666666667	1	28.166666666666657	0	0.0363707624539579	0	-0.0363707624539579	0	0.0383809398363256	NA	NA	0.0388404108334818	0.349059304179551	0	354	646	0.646	0	0.001
ORF3a	all	ss12	219	TTG	ATT	GAG	2	CAATTGAGC:CAATTGAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.6666666666667	1	27.499999999999993	0	0.0372747514142044	0	-0.0372747514142044	0	0.0404349743657394	NA	NA	0.0389264552315077	0.338280336810461	0	381	619	0.619	0	0.001
ORF3a	all	ss12	220	AGC	GAG	CAC	2	TTGAGCACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.6666666666667	1	27.333333333333325	0	0.0375078154309961	0	-0.0375078154309961	0	0.0405161136433653	NA	NA	0.0423717972633915	0.376044948103968	0	365	635	0.635	0	0.001
ORF3a	all	ss12	221	ACA	CAC	AGA	2	AGCACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.00000000000004	1	27.333333333333325	0	0.0375078154309961	0	-0.0375078154309961	0	0.0402606272009302	NA	NA	0.0406385851969352	0.356027706646477	0	358	642	0.642	0	0.001
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666671	1	27.666666666666657	0	0.0370445664971824	0	-0.0370445664971824	0	0.0409751187083208	NA	NA	0.0403682617899713	0.358793945357698	0	385	615	0.615	0	0.001
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	68.00000000000006	1	27.333333333333325	0	0.0375078154309961	0	-0.0375078154309961	0	0.0413327886403941	NA	NA	0.040555810461777	0.355046835498414	0	370	630	0.63	0	0.001
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TGT	2	ACTGGTGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	67.33333333333339	1	27.999999999999993	0	0.036592623127074	0	-0.036592623127074	0	0.0403963207548922	NA	NA	0.0410386962180539	0.372574425439068	0	370	630	0.63	0	0.001
ORF3a	all	ss12	225	GTT	TGT	TGA	2	GGTGTTGAA	2	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	66.33333333333339	1	28.999999999999993	0	0.0353006331434894	0	-0.0353006331434894	0	0.0368137464735367	NA	NA	0.0379005345777836	0.351645664391726	0	346	654	0.654	0	0.001
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	ACA	2	GTTGAACAT	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	66.66666666666671	1	28.999999999999993	0	0.0353006331434894	0	-0.0353006331434894	0	0.0383207251083033	NA	NA	0.0381292836781733	0.354542534350929	0	378	622	0.622	0	0.001
ORF3a	all	ss12	227	CAT	ACA	TGT	2	GAACATGTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GTT	TGT	TAC	2	CATGTTACC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACC	TAC	CTT	2	GTTACCTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	CTT	CTT	2	ACCTTCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAT	CAA	TAA	2	TACAATAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	TAA	AAT	2	AATAAAATT	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TGA	2	ATTGTTGAT	2	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	GAT	TGA	TGA	2	GTTGATGAG	2	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAG	TGA	GCC	2	GATGAGCCT	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCT	GCC	TGA	2	GAGCCTGAA	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	GAA	TGA	AGA	2	CCTGAAGAA	2	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	GAA	AGA	ACA	2	GAAGAACAT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	CAT	ACA	TGT	2	GAACATGTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	CATGTCCAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATT	AAT	TCA	2	CAAATTCAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	TCA	CAC	2	ATTCACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGT	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGT	CGG	TTC	2	GACGGTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	TTC	ATC	2	GGTTCATCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCC	ATC	CGG	2	TCATCCGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	CGG	AGT	2	TCCGGAGTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTT	TGT	TAA	2	GTTGTTAAT	2	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	TAA	TCC	2	GTTAATCCA	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAA:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA	2	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	17	80.5	5	32.333333333333336	0.248018905279285	0.173179167487274	1.43215208201939	0.074839737792011	0.0634541461313385	0.0895257891293933	NaN	NaN	0.0976570136019542	0.443466336440327	785	0	215	0.215	0.785	0.43
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.33333333333333	5	32.16666666666667	0.266173663925686	0.174189200634338	1.52807213625399	0.0919844632913487	0.0649756689484008	0.0854726336382381	NaN	NaN	0.101483697343313	0.364726049631457	813	0	187	0.187	0.813	0.374
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.5	5	32.66666666666667	0.269530500680923	0.171193988985735	1.57441568058433	0.0983365116951878	0.0654524439387312	0.0882128274100313	NaN	NaN	0.096280136286048	0.307084737084036	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.33333333333333	5	32.16666666666667	0.270212163986199	0.174189200634338	1.55125669675375	0.0960229633518611	0.0672832576889061	0.0856066000341389	NaN	NaN	0.10351218522842	0.353589730358185	829	0	171	0.171	0.829	0.342
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGATTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.83333333333333	5	31.66666666666667	0.272278228294921	0.177291583548173	1.53576510991532	0.094986644746748	0.0642378238701027	0.0856256921869321	NaN	NaN	0.0980276705334732	0.3325562239294	833	1	166	0.166	0.833	0.332
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGATTTTTT	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	18	79.33333333333333	5	31.66666666666667	0.270212163986199	0.177291583548173	1.52411162773995	0.0929205804380258	0.0648537065729318	0.0889976098848519	NaN	NaN	0.101303815259495	0.359013431071378	818	0	182	0.182	0.818	0.364
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:TTTTTTACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.83333333333333	5	32.16666666666667	0.258158161718876	0.174189200634338	1.48205606764801	0.0839689610845383	0.0672069083832681	0.0871635637639878	NaN	NaN	0.0994899653499374	0.398672605265424	801	0	199	0.199	0.801	0.398
ORF3a	all	ss12	9	ACA	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.16666666666666	5	31.833333333333336	0.256845208849377	0.176245193423779	1.45731752372841	0.0806000154255975	0.0623640499178448	0.0873917108516941	NaN	NaN	0.0978324125471253	0.410020249084165	790	0	210	0.21	0.79	0.42
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TAG	2	ACAATTGGA:ACTCTTAGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.83333333333333	5	32.16666666666667	0.258158161718876	0.174189200634338	1.48205606764801	0.0839689610845383	0.0647281065567428	0.0887911435081446	NaN	NaN	0.101259168124525	0.406964097572841	787	0	213	0.213	0.787	0.426
ORF3a	all	ss12	11	AGA	TAG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTAGATCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.49999999999999	5	32.16666666666667	0.259484741116488	0.174189200634338	1.48967180612537	0.0852955404821508	0.0659433452281201	0.0861893833496752	NaN	NaN	0.0993646369601713	0.390666427268073	800	0	200	0.2	0.8	0.4
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	AAT	2	AGATCAATT:GGAACTGTA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.49999999999999	5	32.5	0.259484741116488	0.172180831233375	1.50704778956945	0.0873039098831133	0.068048617955318	0.0840221762365961	NaN	NaN	0.102576633203035	0.394708729655089	818	0	182	0.182	0.818	0.364
ORF3a	all	ss12	13	ATT	AAT	AAC	2	ACTGTAACT:TCAATTACT	1:1	TRUE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.16666666666666	5	32.16666666666667	0.239040218372072	0.174189200634338	1.37230217201508	0.0648510177377344	0.0609780090885761	0.0872066650297301	NaN	NaN	0.101213455136755	0.521694776787578	732	0	268	0.268	0.732	0.536
ORF3a	all	ss12	14	ACT	AAC	TGC	2	ATTACTGCA:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.41666666666666	5	32.083333333333336	0.220826439413092	0.174698668260279	1.26404191635902	0.0461277711528129	0.0580656076146894	0.085154801657211	NaN	NaN	0.0938389949708525	0.623028355965706	694	0	306	0.306	0.694	0.612
ORF3a	all	ss12	15	GCA	TGC	ACA	2	ACTGCACAG:ACTTTGAAG	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.66666666666666	5	31.833333333333336	0.237252996159118	0.176245193423779	1.34615300168014	0.0610078027353386	0.0631501925543529	0.0852114747351075	NaN	NaN	0.0964857951543295	0.527191984468881	744	0	256	0.256	0.744	0.512
ORF3a	all	ss12	16	AAG	ACA	GCA	2	GCACAGCCA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.08333333333333	4	32.333333333333336	0.221923403608424	0.135196367873208	1.64148939131672	0.0867270357352156	0.0585460200035655	0.0726102938790881	NaN	NaN	0.0881640309353817	0.325262601887881	837	1	162	0.162	0.837	0.324
ORF3a	all	ss12	17	CAA	GCA	AGG	2	AAGCAAGGT:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.25	4	32	0.204399702385691	0.136741167595466	1.49479272394679	0.0676585347902254	0.0575764486445267	0.0742810370809758	NaN	NaN	0.0883373486234833	0.443729342680968	752	0	248	0.248	0.752	0.496
ORF3a	all	ss12	18	GGT	AGG	AAA	2	CAAGGTGAA:CCAGTAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.25	3	31.166666666666664	0.201440688758903	0.103018812035868	1.95537770993483	0.0984218767230349	0.0582362262109722	0.0675514642481418	NaN	NaN	0.0815161319005459	0.227281445454823	896	0	104	0.104	0.896	0.208
ORF3a	all	ss12	19	AAA	AAA	AAT	2	GGTGAAATC:GTAAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.41666666666666	3	31.166666666666664	0.184673013955982	0.103018812035868	1.79261447794296	0.0816542019201137	0.055298595381217	0.0648067158854897	NaN	NaN	0.0768183828209554	0.287804024984979	852	2	146	0.146	0.852	0.292
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAAATTGAC:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.08333333333333	3	30.833333333333332	0.182931885877799	0.104213595070396	1.75535529461611	0.0787182908074028	0.0547086539801413	0.0670513590021023	NaN	NaN	0.0788518117363758	0.318130666820179	848	0	152	0.152	0.848	0.304
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	CAA	2	ATCAAGGAT:ATTGACAAT	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.25	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.58333333333333	3	31.499999999999996	0.184234616510935	0.101851155869296	1.80886132256918	0.0823834606416383	0.0548440701114552	0.0667174482827071	NaN	NaN	0.0739647869055782	0.265356405283384	882	0	118	0.118	0.882	0.236
ORF3a	all	ss12	22	AAT	CAA	TGC	2	AAGGATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.83333333333333	3	32.166666666666664	0.156594789439853	0.0995936054863591	1.57233778890856	0.0570011839534941	0.0476102159727237	0.062724374186388	NaN	NaN	0.0693849427544533	0.411349596964863	797	0	203	0.203	0.797	0.406
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.5	3	31.833333333333332	0.141595553474679	0.100709711722406	1.40597715009819	0.0408858417522729	0.0454694705920098	0.0643294665242281	NaN	NaN	0.0692036501508321	0.55465128562527	738	0	262	0.262	0.738	0.524
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	77	3	32.33333333333333	0.142608211856373	0.0990447915097998	1.43983554998208	0.0435634203465729	0.0459833437553866	0.0617330987057921	NaN	NaN	0.0678315920937367	0.520724460330852	732	2	266	0.266	0.732	0.532
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TGC	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	77	4	32.33333333333333	0.127063613968535	0.135196367873208	0.939844878730025	-0.00813275390467302	0.0420790310737437	0.0766276515077465	NaN	NaN	0.0804171880046837	0.919445647827796	453	0	547	0.547	0.453	0.906
ORF3a	all	ss12	26	GCA	TGC	AAG	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1.25	0.75	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.33333333333333	4	31.666666666666664	0.12471051706475	0.138321779350139	0.901597113995079	-0.0136112622853896	0.0414566926065644	0.0782870172083027	NaN	NaN	0.0772898470779414	0.860210093232573	446	0	554	0.554	0.446	0.892
ORF3a	all	ss12	27	AGT	AAG	TAC	2	GCAAGTACT:TCAGATTTT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.08333333333333	4	31.916666666666664	0.110163273884948	0.137132914796851	0.803332110661718	-0.0269696409119032	0.0396246230982248	0.0764026409029795	NaN	NaN	0.0786783378824939	0.731761293193955	360	0	640	0.64	0.36	0.72
ORF3a	all	ss12	28	ACT	TAC	TGT	2	AGTACTGTT:GATTTTGTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.33333333333333	3	32.33333333333333	0.111315003838705	0.0990447915097998	1.12388548798844	0.0122702123289052	0.0399326043476095	0.0637044839340565	NaN	NaN	0.0712481158949993	0.863266099837691	584	0	416	0.416	0.584	0.832
ORF3a	all	ss12	29	GTT	TGT	TCA	2	ACTGTTCAT:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.33333333333333	2	32.666666666666664	0.111315003838705	0.0638683562552301	1.74288192722338	0.0474466475834749	0.041010555618099	0.046644869082691	NaN	NaN	0.0636518251008545	0.456024464052606	771	0	229	0.229	0.771	0.458
ORF3a	all	ss12	30	CAT	TCA	CGC	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.5	2	33.166666666666664	0.11105698371059	0.0628640039123036	1.76662281749532	0.0481929797982868	0.0399231146151086	0.0468489506897583	NaN	NaN	0.0637287527301857	0.449517092705566	790	0	210	0.21	0.79	0.42
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CATGCTACA:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.91666666666667	1	32.58333333333333	0.125436421140775	0.0313361505112163	4.00293013322989	0.0941002706295586	0.0438805781892262	0.0310278584617071	NaN	NaN	0.0553328492426107	0.0890139567397958	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	32	ACA	TAC	AGC	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.33333333333334	1	32.166666666666664	0.123002232202702	0.0317507728699206	3.87399175152772	0.0912514593327818	0.0412523557236927	0.0328058882285113	NaN	NaN	0.0550350512869869	0.0973052017555431	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	33	GCA	AGC	AAC	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.66666666666667	1	31.499999999999996	0.120796168025329	0.0324374878453625	3.72396803973212	0.0883586801799665	0.0412335122470202	0.0361101196111939	NaN	NaN	0.0552733647176238	0.109914822232548	957	1	42	0.042	0.957	0.084
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.41666666666667	1	32.08333333333333	0.121203743914918	0.0318350176854428	3.80724600540559	0.0893687262294755	0.0411939381642149	0.0330859783285828	NaN	NaN	0.0545911495314596	0.101618932342434	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.41666666666666	1	32.75	0.122861989946783	0.0311733183159379	3.94125478403008	0.0916886716308449	0.0444645134214618	0.0333074687097722	NaN	NaN	0.0546897406606616	0.0936355675488294	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.41666666666666	1	33.416666666666664	0.124566345596373	0.0305385697640887	4.07898426673718	0.0940277758322847	0.044747878445544	0.0332203809790213	NaN	NaN	0.0530776910627655	0.0764755702282552	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.41666666666666	1	33.416666666666664	0.124566345596373	0.0305385697640887	4.07898426673718	0.0940277758322847	0.0434287825794089	0.0300800992514879	NaN	NaN	0.0547038150357097	0.0856412777509444	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.91666666666666	1	33.58333333333333	0.108911256999757	0.0303839016876759	3.5845053120328	0.0785273553120807	0.0387609897941225	0.0309522692769129	NaN	NaN	0.0519706446926041	0.130789866781286	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.75	1	33.08333333333333	0.109159374475305	0.0308526791703671	3.53808412788179	0.0783066953049378	0.0391231848481241	0.0331902740999891	NaN	NaN	0.0506459008327289	0.122065791633702	931	1	68	0.068	0.931	0.136
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.41666666666666	1	33.416666666666664	0.109659022528177	0.0305385697640887	3.59083687858651	0.079120452764088	0.0372488565883249	0.0318926256594856	NaN	NaN	0.0501547624877257	0.114674494392107	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	1	32.75	0.123142795706581	0.0311733183159379	3.95026267202431	0.0919694773906432	0.0411278015486844	0.0333906921635826	NaN	NaN	0.0555383236021048	0.0977290624604516	949	0	51	0.051	0.949	0.102
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.58333333333331	1	32.416666666666664	0.122582464773988	0.031500692980973	3.89142120930577	0.091081771793015	0.0396757049923577	0.0330360766244267	NaN	NaN	0.0549486190129466	0.0974021226264461	948	0	52	0.052	0.948	0.104
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.58333333333331	1	32.416666666666664	0.122582464773988	0.031500692980973	3.89142120930577	0.091081771793015	0.0412533300043206	0.0349063381705484	NaN	NaN	0.0563794144804744	0.106199283701068	960	0	40	0.04	0.96	0.08
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	1	32.75	0.123142795706581	0.0311733183159379	3.95026267202431	0.0919694773906432	0.0418066356386571	0.033186464001509	NA	NA	0.0537944697909579	0.0873314320416504	951	0	49	0.049	0.951	0.098
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	1	32.75	0.123142795706581	0.0311733183159379	3.95026267202431	0.0919694773906432	0.0438701867329529	0.0331393382788347	NaN	NaN	0.0565293754038829	0.103751437022239	957	0	43	0.043	0.957	0.086
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333331	1	33.25	0.125145045452681	0.0306948207819131	4.07707366470184	0.0944502246707676	0.0407792010757031	0.0321822300735173	NaN	NaN	0.0547206080829996	0.0843393413779118	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TAT	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.08333333333331	1	33.25	0.125145045452681	0.0306948207819131	4.07707366470184	0.0944502246707676	0.0407710283921055	0.0312246538766166	NaN	NaN	0.0522743716443817	0.0707908132387797	966	1	33	0.033	0.966	0.066
ORF3a	all	ss12	48	ATT	TAT	TGG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.91666666666664	1	33.25	0.110417145764054	0.0306948207819131	3.59725657134695	0.0797223249821406	0.039065970102938	0.0327139207603723	NaN	NaN	0.0536411384308105	0.137221963296013	939	0	61	0.061	0.939	0.122
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.74999999999997	1	33.25	0.0959115685461867	0.0306948207819131	3.12468247420759	0.0652167477642736	0.0364915138681076	0.0337557774181078	NA	NA	0.048871169592592	0.182052297885117	919	0	81	0.081	0.919	0.162
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.24999999999997	1	33.75	0.0965740892437444	0.0302307926160697	3.19456027733818	0.0663432966276747	0.0355719365022673	0.0315807443983894	NaN	NaN	0.0510838779345976	0.194042439244088	897	0	103	0.103	0.897	0.206
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.0833333333333	1	32.916666666666664	0.095474921927806	0.0310121698640216	3.07862759511613	0.0644627520637843	0.0375298958707479	0.0333718905964633	NaN	NaN	0.0506461070187272	0.203086308652562	900	0	100	0.1	0.9	0.2
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.5833333333333	1	33.416666666666664	0.109408627044446	0.0305385697640887	3.58263755931043	0.0788700572803574	0.0389572592996317	0.0332721541467108	NaN	NaN	0.053686522402254	0.141809773538598	933	0	67	0.067	0.933	0.134
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.74999999999997	1	33.58333333333333	0.0946134639951751	0.0303839016876759	3.11393398279562	0.0642295623074992	0.0345050242478163	0.0327426889283248	NaN	NaN	0.050261234039249	0.201279557016165	902	0	98	0.098	0.902	0.196
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.0833333333333	1	33.25	0.0941885460903395	0.0306948207819131	3.06854849420851	0.0634937253084264	0.0366830450767759	0.0308756465944639	NaN	NaN	0.0494593816588409	0.199227716016922	895	1	104	0.104	0.895	0.208
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.91666666666663	2	33.75	0.0944005262514171	0.0617314855970427	1.52921196271906	0.0326690406543744	0.0373182582277647	0.04423721837016	NaN	NaN	0.0575662311505082	0.570372114016069	725	1	274	0.274	0.725	0.548
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.5833333333333	2	33.75	0.0935582868591561	0.0617314855970427	1.51556836765383	0.0318268012621134	0.0358464283311368	0.0482077857979661	NaN	NaN	0.0611509240064753	0.602740819851226	702	0	298	0.298	0.702	0.596
ORF3a	all	ss12	57	CAG	TCA	GAG	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.66666666666664	2	34.166666666666664	0.109283858386045	0.0609472230590743	1.79309003594995	0.048336635326971	0.0387917862476881	0.0470392596881698	NaN	NaN	0.0641985316611994	0.451495397223865	773	1	226	0.226	0.773	0.452
ORF3a	all	ss12	58	AGC	GAG	CGC	2	CAGAGCGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.16666666666664	2	34.166666666666664	0.108541192153805	0.0609472230590743	1.78090463692824	0.0475939690947306	0.0380755053889698	0.0442135988369067	NaN	NaN	0.0607620669797938	0.433460219372041	795	0	205	0.205	0.795	0.41
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TAC	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.83333333333331	2	34.83333333333333	0.110544521791661	0.0597330472949441	1.85064259731844	0.0508114744967167	0.0395539736123778	0.0443973437683594	NaN	NaN	0.0620808038863093	0.413087036350217	817	0	183	0.183	0.817	0.366
ORF3a	all	ss12	60	ACC	TAC	CAA	2	GCTACCAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.16666666666664	2	34.5	0.110036776004805	0.0603340239140544	1.82379309163188	0.0497027520907508	0.0385211364204035	0.0440868509283664	NaN	NaN	0.0586932882177431	0.39709449217817	807	0	193	0.193	0.807	0.386
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	ACCAAAATA:TCCAAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.33333333333331	2	34.33333333333333	0.0951500406590925	0.0606390724718212	1.56912097729246	0.0345109681872713	0.0362957097517906	0.044686131738059	NA	NA	0.0618782265039593	0.57703290861327	726	0	274	0.274	0.726	0.548
ORF3a	all	ss12	62	ATA	AAT	AAT	2	AAAATAATT:AAAATCATA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.33333333333331	2	35	0.0964630333665702	0.0594370287406054	1.62294508003678	0.0370260046259648	0.0361992319172508	0.044803320523704	NaN	NaN	0.0602360214822388	0.538764678419411	752	0	248	0.248	0.752	0.496
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATAATTGCG:ATCATAACC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.16666666666664	2	35	0.111574227897278	0.0594370287406054	1.87718380715512	0.0521371991566726	0.0393111422375831	0.0446147978763222	NaN	NaN	0.0597209654589421	0.382655809982867	817	0	183	0.183	0.817	0.366
ORF3a	all	ss12	64	ACC	AAC	CCT	2	ATAACCCTC:ATTGCGCTC	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.33333333333331	2	35.5	0.112888706112188	0.0585663277285774	1.92753601754519	0.0543223783836109	0.038983856717443	0.0443488855992238	NaN	NaN	0.0607744846498251	0.371410030883282	820	1	179	0.179	0.82	0.358
ORF3a	all	ss12	65	CTC	CCT	CAA	2	ACCCTCAAA:GCGCTCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.74999999999999	2	35.75	0.0972458393976114	0.0581404786806199	1.67260128578932	0.0391053607169915	0.0369836381926848	0.0431465534142394	NaN	NaN	0.0592406898690375	0.509183361802581	742	1	257	0.257	0.742	0.514
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTCAATAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.74999999999999	2	35.75	0.0972458393976114	0.0581404786806199	1.67260128578932	0.0391053607169915	0.0365926984702162	0.0418071437249515	NaN	NaN	0.0593239716575979	0.50977818519015	770	0	230	0.23	0.77	0.46
ORF3a	all	ss12	67	AAA	AAA	AAG	2	AAAAAGAGA:AATAAAAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.16666666666664	2	36.416666666666664	0.0980414726907267	0.0570345959917882	1.71898250501928	0.0410068766989384	0.0375186524257175	0.0439071038402775	NaN	NaN	0.056095424219371	0.464766940275348	755	0	245	0.245	0.755	0.49
ORF3a	all	ss12	68	AGA	AAG	ATG	2	AAAAGATGG:AAGAGATGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.41666666666664	2	36.25	0.112755863557943	0.0573071018565008	1.96757225378956	0.0554487617014421	0.038804496852712	0.0412006470528462	NaN	NaN	0.0599042147690321	0.354641565605318	830	0	170	0.17	0.83	0.34
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGATGGCAG	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.41666666666664	2	36.583333333333336	0.112755863557943	0.0567646707244322	1.98637395617643	0.0559911928335107	0.0369714597921429	0.0403427430412712	NaN	NaN	0.0573421857635339	0.328846562790596	824	1	175	0.175	0.824	0.35
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAGCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.74999999999997	2	36.916666666666664	0.113827458253345	0.0562324166616758	2.02423201795134	0.0575950415916689	0.0391791548405918	0.0402297672186521	NaN	NaN	0.0595188606292717	0.333205631968847	830	0	170	0.17	0.83	0.34
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAGCTAGCC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.41666666666663	3	36.916666666666664	0.12997618937868	0.0860130038580103	1.511122545996	0.0439631855206701	0.0435269812256974	0.0520028282707606	NaN	NaN	0.0604983780411904	0.467419737669704	779	0	221	0.221	0.779	0.442
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:CTAGCCCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.49999999999997	3	36.166666666666664	0.159636110589833	0.0879053734766805	1.81599945801016	0.071730737113152	0.0523190586285805	0.0535227988559607	NaN	NaN	0.068650316606608	0.296082512772749	859	1	140	0.14	0.859	0.28
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCCCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666663	3	36.166666666666664	0.159249476407496	0.0879053734766805	1.81160115825845	0.0713441029308151	0.0515404334749948	0.0563093288345237	NaN	NaN	0.073664739592543	0.332796056426776	844	1	155	0.155	0.844	0.31
ORF3a	all	ss12	74	TAT	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG:CTTTATAAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.66666666666663	3	35.5	0.156968578879544	0.089658862987337	1.75073131254981	0.0673097158922067	0.0516152071812656	0.0518538850816051	NaN	NaN	0.070725803681724	0.341249375122456	846	0	154	0.154	0.846	0.308
ORF3a	all	ss12	75	AAG	CAA	GGG	2	TATAAGGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.99999999999997	2	35.5	0.156222782397911	0.0585663277285774	2.66745053782299	0.097656454669334	0.0522454709248652	0.0444547421382505	NaN	NaN	0.0619190541786046	0.114757974272147	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss12	76	GGC	GGG	CTT	2	AAGGGCTTC:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.99999999999997	2	35.833333333333336	0.156222782397911	0.0579999025523778	2.69350077367512	0.0982228798455337	0.0500915215139734	0.0418765160734037	NaN	NaN	0.0600563850024122	0.101941965226843	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss12	77	GTT	CTT	CCA	2	GGCTTCCAG:GGTGTTCAC	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.91666666666664	2	35.166666666666664	0.154208039717062	0.0591439311842398	2.60733496454077	0.0950641085328218	0.0505580438538817	0.0428219669736664	NaN	NaN	0.0607076316580554	0.117364207744963	946	0	54	0.054	0.946	0.108
ORF3a	all	ss12	78	CAC	CCA	CTT	2	GTTCACTTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.0833333333333	2	34.916666666666664	0.169534158879359	0.059584670169267	2.84526470311491	0.109949488710092	0.0550113501408945	0.0421123140205816	NaN	NaN	0.0662475008075988	0.0969793414600224	965	0	35	0.035	0.965	0.07
ORF3a	all	ss12	79	TTC	CTT	CAT	2	CACTTTGTT:CAGTTCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.41666666666664	2	33.916666666666664	0.151021335369834	0.0614153696041381	2.45901533025469	0.0896059657656957	0.0549618637134909	0.0447924179431246	NaN	NaN	0.0641204560221871	0.162274381225461	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	80	ATT	CAT	TTG	2	TTCATTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.75	0.5	0.416666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.74999999999997	2	33.916666666666664	0.152421181209951	0.0614153696041381	2.48180841688985	0.0910058116058131	0.0525402319709388	0.0427744641369018	NaN	NaN	0.0659374942618208	0.167530293038947	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	ATTTGCAAT:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.16666666666664	2	33.833333333333336	0.136429382099394	0.0615730216404005	2.21573309973596	0.0748563604589935	0.0502979525218269	0.0460490314380942	NaN	NaN	0.0615009598569656	0.223544260285267	889	0	111	0.111	0.889	0.222
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG:TGCAATTTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.99999999999997	2	34	0.136741167595466	0.0612585232607003	2.23219823653814	0.0754826443347657	0.0516095886510403	0.0431564272124526	NaN	NaN	0.0633026173589421	0.23310070458219	886	0	114	0.114	0.886	0.228
ORF3a	all	ss12	83	TTA	CTT	ACT	2	AACTTGCTG:AATTTACTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.99999999999997	2	34	0.136741167595466	0.0612585232607003	2.23219823653814	0.0754826443347657	0.0495023641297328	0.044076370688496	NaN	NaN	0.0630476231779174	0.231216064148799	893	2	105	0.105	0.893	0.21
ORF3a	all	ss12	84	CTG	ACT	GCT	2	TTACTGCTG:TTGCTGTTG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.91666666666664	2	33.5	0.135043810631934	0.0622118122355632	2.17071012367546	0.0728319983963708	0.0515685168760343	0.0452696790375635	NaN	NaN	0.0629504050352984	0.247282876106422	898	0	102	0.102	0.898	0.204
ORF3a	all	ss12	85	CTG	GCT	GCT	2	CTGCTGCTA:CTGTTGTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.91666666666664	3	33.166666666666664	0.162983364284634	0.0963891381007337	1.69088932110073	0.0665942261839007	0.0599043983447583	0.0610725195414886	NaN	NaN	0.0660178234392185	0.313103652154825	852	0	148	0.148	0.852	0.296
ORF3a	all	ss12	86	CTA	GCT	ATT	2	CTGCTATTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	82.41666666666664	3	32.666666666666664	0.161879739624373	0.0979651368127982	1.65242192162411	0.0639146028115747	0.0615622952837475	0.059199163999572	NaN	NaN	0.0640308354503349	0.318189784936409	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	87	TTT	ATT	TGT	2	CTATTTGTT:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.58333333333331	3	32	0.159362050384892	0.100148544468392	1.59125677992443	0.0592135059165	0.0580642748649599	0.0601682348424802	NaN	NaN	0.0650976055073273	0.363027631582621	831	0	169	0.169	0.831	0.338
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.08333333333331	3	31.5	0.158306944120205	0.101851155869296	1.55429698140448	0.0564557882509082	0.0563030883184781	0.0616304503797602	NaN	NaN	0.0661203684197515	0.393197227664227	808	0	192	0.192	0.808	0.384
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	GTAACAGTT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.58333333333331	3	32	0.159362050384892	0.100148544468392	1.59125677992443	0.0592135059165	0.0585489548020936	0.0627236978556986	NaN	NaN	0.0657759360314225	0.367997580847299	825	0	175	0.175	0.825	0.35
ORF3a	all	ss12	90	ATC	AGT	CTA	2	ACAGTTTAC:ACCATCTAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	83.58333333333331	3	32.333333333333336	0.159362050384892	0.0990447915097998	1.60898971016688	0.0603172588750922	0.0596271052949812	0.0602217618780488	NaN	NaN	0.0668889414577108	0.367188447292272	824	1	175	0.175	0.824	0.35
ORF3a	all	ss12	91	TAC	CTA	CTC	2	ATCTATTCA:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.74999999999999	3	33	0.146318676888877	0.0969087986100047	1.50985956886862	0.0494098782788726	0.0590829053739855	0.0594403321546109	NaN	NaN	0.061112072770951	0.418795579782957	786	0	214	0.214	0.786	0.428
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.08333333333331	3	32.666666666666664	0.145670745382058	0.0979651368127982	1.48696516047765	0.0477056085692595	0.0565858795976875	0.0594910458139367	NaN	NaN	0.0654007689068229	0.46573562692739	782	1	217	0.217	0.782	0.434
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCACATCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.74999999999999	3	31.666666666666664	0.146318676888877	0.101277212852957	1.44473443499393	0.0450414640359202	0.0588635635521389	0.0618494613177919	NaN	NaN	0.0686465993396133	0.511737008054568	756	0	244	0.244	0.756	0.488
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TTT	2	CACCTTTTG:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.58333333333331	3	31.166666666666664	0.146644815816844	0.103018812035868	1.42347609061718	0.0436260037809757	0.0575532409979461	0.0665438830506214	NaN	NaN	0.0655933020599283	0.505987523541776	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	95	TTG	TTT	GCT	2	CTTTTGCTC:CTTTTGCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.91666666666664	3	30.5	0.144075823397336	0.105436462965892	1.36647056762463	0.0386393604314436	0.0554949359419513	0.0619632779402122	NaN	NaN	0.0665484789027827	0.561496766006087	736	0	264	0.264	0.736	0.528
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	TTGCTCGTT:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	83.08333333333331	3	31	0.145670745382058	0.103612753860613	1.40591519821994	0.0420579915214448	0.0554765353707097	0.0646637549942109	NaN	NaN	0.0676840278032779	0.534344862723863	740	0	260	0.26	0.74	0.52
ORF3a	all	ss12	97	GTC	CGT	CGC	2	CTCGTTGCT:CTTGTCGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.08333333333331	3	30.666666666666664	0.143761033640075	0.104821456781369	1.37148478998841	0.0389395768587056	0.0564777948649347	0.0655339552267999	NaN	NaN	0.0674513678484515	0.56373779299597	740	0	260	0.26	0.74	0.52
ORF3a	all	ss12	98	GCT	CGC	TGC	2	GTCGCTGCA:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.08333333333331	3	30.666666666666664	0.158306944120205	0.104821456781369	1.51025323422467	0.0534854873388355	0.058927662723371	0.0641431041442307	NaN	NaN	0.0725701514117876	0.461111575104002	764	0	236	0.236	0.764	0.472
ORF3a	all	ss12	99	GCA	TGC	AGG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.5	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.99999999999999	3	30.25	0.156408563919793	0.106372646579413	1.47038330763938	0.0500359173403795	0.0601035103398388	0.0618866123738863	NaN	NaN	0.0661161868752504	0.44917705989114	793	0	207	0.207	0.793	0.414
ORF3a	all	ss12	100	GGC	AGG	CCT	2	GCAGGTATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.49999999999999	3	30.75	0.155392217528976	0.104516640682884	1.48677011156965	0.0508755768460925	0.0583686011564947	0.0635422006103919	NaN	NaN	0.0681221923018779	0.455167247969497	777	0	223	0.223	0.777	0.446
ORF3a	all	ss12	101	ATG	CCT	GGA	2	GGCCTTGAA:GGTATGGAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.33333333333333	3	31.583333333333332	0.155729523583683	0.101563372279023	1.53332367849948	0.0541661513046608	0.0594090462503253	0.058256276482095	NaN	NaN	0.0650526417807498	0.405041551710335	797	0	203	0.203	0.797	0.406
ORF3a	all	ss12	102	GAA	GGA	AGC	2	ATGGAGGCG:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.66666666666666	3	31.25	0.142670052225801	0.102724391304868	1.3888624737856201	0.0399456609209329	0.0555482406716135	0.0612236676073011	NaN	NaN	0.0636885053623353	0.530525772622845	739	1	260	0.26	0.739	0.52
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CCC	2	GAAGCCCCT:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	84.66666666666666	3	31.25	0.157093573671717	0.102724391304868	1.52927237315518	0.0543691823668485	0.0595382739025413	0.0651225258010868	NaN	NaN	0.0690842229555264	0.431282722831941	786	0	214	0.214	0.786	0.428
ORF3a	all	ss12	104	CAA	CCC	ATT	2	GCCCCTTTT:GCGCAATTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.58333333333333	4	30.916666666666664	0.155224113808277	0.142015736265178	1.09300643640248	0.0132083775430985	0.0598523561460651	0.0743716771746259	NaN	NaN	0.0838752793619972	0.874869401195256	548	0	452	0.452	0.548	0.904
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTTTG:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.58333333333333	3	30.583333333333332	0.155224113808277	0.105128058952294	1.47652411121484	0.0500960548559828	0.0637154281928032	0.0620119624917115	NA	NA	0.0734123697211491	0.49499075944534	760	1	239	0.239	0.76	0.478
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.75	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.08333333333333	3	31.083333333333332	0.156238247272028	0.103314927985559	1.51225239487044	0.0529233192864695	0.0564394170957232	0.0646478874163343	NaN	NaN	0.0685526834834465	0.44010883211881	792	0	208	0.208	0.792	0.416
ORF3a	all	ss12	107	TAC	CTA	CCT	2	CTCTATCTT:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	84.66666666666666	3	31.333333333333332	0.142670052225801	0.102431651254313	1.39283171245171	0.0402384009714879	0.0560674720688733	0.0638051676775743	NaN	NaN	0.0694466416521023	0.562309427129607	743	0	257	0.257	0.743	0.514
ORF3a	all	ss12	108	CTC	CCT	CTA	2	TACCTCTAT:TATCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.49999999999999	3	31	0.141140007184765	0.103612753860613	1.36218758720221	0.0375272533241516	0.055304090536928	0.0657099402536346	NaN	NaN	0.0695353570220532	0.589413649716876	720	0	280	0.28	0.72	0.56
ORF3a	all	ss12	109	TAT	CTA	TGC	2	CTCTATGCC:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.83333333333331	3	31	0.140537165576334	0.103612753860613	1.3563693690199	0.0369244117157208	0.0553397979262943	0.0679694796695943	NaN	NaN	0.0639130922982608	0.563447468567779	720	0	280	0.28	0.72	0.56
ORF3a	all	ss12	110	GCC	TGC	CTT	2	TATGCCTTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.49999999999999	3	31.333333333333332	0.141140007184765	0.102431651254313	1.37789448335991	0.0387083559304515	0.0522147643704249	0.065123771216537	NaN	NaN	0.0668324269848894	0.562464182303361	718	0	282	0.282	0.718	0.564
ORF3a	all	ss12	111	TTA	CTT	AGT	2	GCCTTGATA:GCTTTAGTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	85.49999999999999	3	31.333333333333332	0.141140007184765	0.102431651254313	1.37789448335991	0.0387083559304515	0.0538943825866136	0.0646104333970396	NaN	NaN	0.0688748756220326	0.574109333647922	706	0	294	0.294	0.706	0.588
ORF3a	all	ss12	112	ATA	AGT	ATA	2	TTAGTCTAC:TTGATATAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	86.83333333333333	3	30.666666666666664	0.138759235313158	0.104821456781369	1.32376747637246	0.0339377785317888	0.0562344940361017	0.0641858100247767	NaN	NaN	0.0679421329318678	0.617420105258334	683	0	317	0.317	0.683	0.634
ORF3a	all	ss12	113	TAC	ATA	CTT	2	ATATATTTT:GTCTACTTC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.33333333333333	3	30.666666666666664	0.124250341416613	0.104821456781369	1.18535217150977	0.019428884635244	0.0536955231566003	0.066793307212826	NaN	NaN	0.0638110647483068	0.76076590860514	630	2	368	0.368	0.63	0.736
ORF3a	all	ss12	114	TTC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATTTTCTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.66666666666666	3	30.333333333333332	0.123736695538234	0.106058740537371	1.16668079322169	0.0176779550008629	0.0531602198236564	0.0668489008900389	NaN	NaN	0.0716591817609079	0.80514435033394	620	1	379	0.379	0.62	0.758
ORF3a	all	ss12	115	CTA	CTT	ACA	2	TTCTTGCAG:TTTCTACAA	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	87.33333333333333	3	29.999999999999996	0.124250341416613	0.107325632730505	1.15769493508234	0.0169247086861081	0.0531617265325194	0.0650044875695596	NaN	NaN	0.0715084203906605	0.812904013021822	627	0	373	0.373	0.627	0.746
ORF3a	all	ss12	116	CAA	ACA	ATG	2	CTACAATGC:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	88.33333333333333	3	29.333333333333332	0.149874354334322	0.109952605643907	1.3630814245522	0.0399217486904154	0.0594766658207972	0.0682557099825313	NaN	NaN	0.0785119499417857	0.611116829564805	699	0	301	0.301	0.699	0.602
ORF3a	all	ss12	117	AGT	ATG	CAT	2	CAATGCATC:CAGAGTATA	1:1	TRUE	2.41666666666667	0.416666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	13	87.75	3	29.333333333333332	0.165046413582601	0.109952605643907	1.50106868878689	0.0550938079386947	0.0606963082596969	0.0716703161402975	NaN	NaN	0.076671765585771	0.472407693146659	773	0	227	0.227	0.773	0.454
ORF3a	all	ss12	118	ATA	CAT	AAA	2	AGTATAAAC:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	87.33333333333333	3	29.499999999999996	0.151776366554434	0.109283858386045	1.38882693927482	0.0424925081683888	0.0588396675014606	0.0675767663671761	NaN	NaN	0.074660693885123	0.569260036433792	706	2	292	0.292	0.706	0.584
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CGC	2	ATAAACTTT:ATCAACGCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	87	3	29.33333333333333	0.152421181209951	0.109952605643907	1.38624437608676	0.0424685755660447	0.060724829192005	0.0696605061275743	NaN	NaN	0.0754259914606478	0.573401098376171	736	0	264	0.264	0.736	0.528
ORF3a	all	ss12	120	GCA	CGC	ATG	2	AACGCATGT:AACTTTGTA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	13	86.16666666666667	3	29.666666666666664	0.168446461160547	0.108623210908842	1.5507409489295	0.0598232502517052	0.0626889374776672	0.0703897546228398	NaN	NaN	0.0760979305486589	0.431788373549846	791	0	209	0.209	0.791	0.418
ORF3a	all	ss12	121	GTA	ATG	AAG	2	GCATGTAGA:TTTGTAAGA	1:1	TRUE	1.75	1	0.25	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	12	85.83333333333334	2	29.666666666666664	0.154721985556199	0.0706404112947758	2.19027583107576	0.084081574261423	0.0628232732104287	0.0554358544736388	NaN	NaN	0.0743356200081888	0.258009865218684	880	1	119	0.119	0.88	0.238
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.25	2	30.583333333333332	0.127560056151149	0.0684234871721278	1.86427294812168	0.059136568979021	0.0537329740328519	0.0540721281865139	NaN	NaN	0.0663528086366348	0.372798070719268	809	0	191	0.191	0.809	0.382
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGAATTATT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	85.08333333333334	2	30.583333333333332	0.127832485302701	0.0684234871721278	1.8682544632828	0.0594089981305732	0.0544475311403959	0.0509350659953895	NaN	NaN	0.0630463446180078	0.346035596792862	834	0	166	0.166	0.834	0.332
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:ATTATTATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	83.58333333333334	2	30.416666666666668	0.13033787247006	0.0688161477015357	1.89400128928099	0.0615217247685243	0.0576974220479106	0.0536796397124941	NaN	NaN	0.0641761736761506	0.337741095220126	849	0	151	0.151	0.849	0.302
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATTATGAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	83.41666666666667	2	30.25	0.130622339506704	0.0692133441658409	1.88724213633895	0.0614089953408634	0.0547841547107699	0.0529614424782309	NaN	NaN	0.0651188656286423	0.345665939314056	845	0	155	0.155	0.845	0.31
ORF3a	all	ss12	126	AGA	GAG	ATG	2	ATGAGATGT:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	82.91666666666667	3	29.916666666666668	0.131483259230803	0.107647107231784	1.22142863484196	0.0238361519990195	0.0588611527126205	0.0701971564381587	NaN	NaN	0.0794679448929193	0.764217771836712	619	0	381	0.381	0.619	0.762
ORF3a	all	ss12	127	CTT	ATG	TTG	2	AGATGTTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.75	0.333333333333333	0.5	0.416666666666667	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.33333333333334	3	30.25	0.147136768189642	0.106372646579413	1.38321996228416	0.040764121610229	0.0567501437251737	0.0654569822966513	NaN	NaN	0.0842433899745481	0.628467411788823	720	1	279	0.279	0.72	0.558
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTT:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	82.58333333333334	3	30.083333333333332	0.146644815816844	0.107006075844546	1.37043447915877	0.039638739972298	0.0593909771006067	0.0679742090242676	NaN	NaN	0.0845191954877993	0.639076086349415	703	0	297	0.297	0.703	0.594
ORF3a	all	ss12	129	CTT	GCT	TTG	2	TGGCTTTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.58333333333334	3	31.083333333333332	0.15067539576423	0.103314927985559	1.45840875759302	0.0473604677786719	0.057869850155421	0.0643262045393639	NaN	NaN	0.0785688515422221	0.546648825529611	737	0	263	0.263	0.737	0.526
ORF3a	all	ss12	130	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.41666666666667	3	30.75	0.179546761902854	0.104516640682884	1.71787727513766	0.0750301212199705	0.0662708466015765	0.0711123584863663	NaN	NaN	0.086537226622618	0.385927157716099	822	0	178	0.178	0.822	0.356
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.58333333333333	4	31.083333333333336	0.197626838051651	0.141177857059553	1.39984302190029	0.0564489809920988	0.0710457859431345	0.0833323258024796	NaN	NaN	0.100776101661757	0.575382220062409	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.08333333333333	4	31.166666666666668	0.215501453764008	0.140762624951505	1.53095648676807	0.0747388288125025	0.073569617144845	0.0814045745312206	NaN	NaN	0.101955389412496	0.463525358361296	784	0	216	0.216	0.784	0.432
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAA	2	AAATGCCGT:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.08333333333333	4	32.00000000000001	0.235784099565019	0.136741167595466	1.72430953831373	0.0990429319695526	0.0762506855326635	0.0738864067958739	NaN	NaN	0.097795371698407	0.311176318977842	841	0	159	0.159	0.841	0.318
ORF3a	all	ss12	134	AAA	CAA	ATC	2	TGCAAATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.16666666666666	4	31.83333333333334	0.235492518065836	0.137526919369799	1.71233762193579	0.0979655986960378	0.0747869017925718	0.0779333031232529	NaN	NaN	0.103889938984607	0.345693771796639	819	0	181	0.181	0.819	0.362
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AAATCCAAG:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.49999999999999	3	32.16666666666667	0.203651779146104	0.0995936054863591	2.04482785969625	0.104058173659745	0.0687958705122227	0.0644689158252279	NaN	NaN	0.0913196448023602	0.254497231835076	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.66666666666666	3	32.66666666666667	0.20315621560155	0.0979651368127982	2.07376034180161	0.105191078788752	0.0702370616252623	0.0643931343581955	NaN	NaN	0.092052659508232	0.253151868685243	892	0	108	0.108	0.892	0.216
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.49999999999999	3	32.66666666666667	0.203651779146104	0.0979651368127982	2.0788189122347	0.105686642333306	0.0677119660073242	0.0632018350702453	NaN	NaN	0.0912496469762173	0.246776610470746	900	0	100	0.1	0.9	0.2
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.16666666666666	3	32.333333333333336	0.20465023999998	0.0990447915097998	2.06623929315588	0.10560544849018	0.06762545314113	0.0604025146684699	NaN	NaN	0.0948835490090003	0.265708164951372	880	0	120	0.12	0.88	0.24
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.16666666666666	3	31.33333333333334	0.201683977327343	0.102431651254313	1.96896149635048	0.0992523260730298	0.0681444189181725	0.0659271257176813	NaN	NaN	0.0978604352389693	0.310476249564892	855	0	145	0.145	0.855	0.29
ORF3a	all	ss12	140	CTT	ACT	TTA	2	TTACTTTAT	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.5	3	30.66666666666667	0.200714352979387	0.104821456781369	1.91482125074856	0.0958928961980183	0.0658814886478781	0.0679494130466141	NaN	NaN	0.0947054036436275	0.311280502612869	863	0	137	0.137	0.863	0.274
ORF3a	all	ss12	141	TAT	TTA	TGA	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.83333333333333	3	30.33333333333334	0.216283656691977	0.106058740537371	2.03928177532682	0.110224916154606	0.0709206141083333	0.0720882241938449	NaN	NaN	0.097546323908828	0.258486720910419	878	0	122	0.122	0.878	0.244
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.66666666666666	3	30.000000000000004	0.220010857490594	0.107325632730505	2.04993766999764	0.112685224760089	0.0688978803378499	0.0681375132934603	NaN	NaN	0.0979924708466605	0.250169581379781	873	0	127	0.127	0.873	0.254
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.99999999999999	3	30.66666666666667	0.249858334896404	0.104821456781369	2.38365638647386	0.145036878115035	0.0795110226202945	0.0706959162715985	NaN	NaN	0.103645426100385	0.161706169867379	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAC:GCCAACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	18	81.33333333333331	3	30.16666666666667	0.262255311359812	0.106688419438138	2.45814224956137	0.155566891921673	0.0789037566089595	0.0705306416939953	NaN	NaN	0.103973238511639	0.13459620159042401	925	0	75	0.075	0.925	0.15
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.66666666666666	3	30.83333333333334	0.301006043193227	0.104213595070396	2.88835677331635	0.19679244812283	0.0911307695851507	0.0713025873836577	NaN	NaN	0.118003974239579	0.0953799740432833	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTGTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.83333333333333	3	30.66666666666667	0.300242781455809	0.104821456781369	2.86432559396727	0.19542132467444	0.0882624811348842	0.0684908288048003	NaN	NaN	0.114896649665599	0.0889722069265779	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.25	0.666666666666667	0.75	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.66666666666666	3	30.16666666666667	0.301006043193227	0.106688419438138	2.82135628944959	0.194317623755089	0.0946154359512677	0.0695338867140843	NaN	NaN	0.115971014411076	0.0938223289114721	963	0	37	0.037	0.963	0.074
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.99999999999999	3	29.83333333333334	0.281300723192845	0.107970516691131	2.60534756907347	0.173330206501714	0.0862704023958949	0.0669986601997798	NaN	NaN	0.113857032236238	0.127921508315596	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAC:TGCTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.49999999999999	3	30.33333333333334	0.283423708706632	0.106058740537371	2.6723276862482	0.177364968169261	0.0874065751478043	0.0694430373935058	NaN	NaN	0.110353865016083	0.108002083911789	944	0	56	0.056	0.944	0.112
ORF3a	all	ss12	150	CAC	GCA	CAC	2	TGGCACACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.83333333333331	3	29.66666666666667	0.28200480071778	0.108623210908842	2.59617441206412	0.173381589808938	0.0831392685266363	0.071256058188948	NaN	NaN	0.113883697057654	0.127897782315141	952	0	48	0.048	0.952	0.096
ORF3a	all	ss12	151	ACA	CAC	ACA	2	CACACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.41666666666664	4	29.66666666666667	0.283780696115475	0.148632696437812	1.90927503111141	0.135147999677663	0.0867197610174256	0.0832515757080295	NaN	NaN	0.125772098299293	0.282577702741676	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	152	AAT	ACA	TAA	2	ACACATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.58333333333331	4	29.500000000000004	0.283067628950574	0.149561992614941	1.89264414040908	0.133505636335633	0.0851712759766233	0.0838075222994938	NaN	NaN	0.128909202407218	0.300362484776653	838	1	161	0.161	0.838	0.322
ORF3a	all	ss12	153	AAC	TAA	CTA	2	AATTGTTAC:CATAACTAT	1:1	TRUE	2.25	0	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	18	80.16666666666664	4	29.250000000000004	0.26683825481505	0.150978005779684	1.76739819443924	0.115860249035366	0.08393372941494	0.0850087431950736	NaN	NaN	0.124661246547144	0.3526814683757	833	0	167	0.167	0.833	0.334
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.33333333333331	3	29.66666666666667	0.288505753829318	0.108623210908842	2.65602306740348	0.179882542920476	0.0840214443255271	0.069803577284268	NaN	NaN	0.112925480496454	0.111175582885889	954	0	46	0.046	0.954	0.092
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.83333333333331	3	30.000000000000004	0.286305319885247	0.107325632730505	2.66763225709705	0.178979687154742	0.0840987893960684	0.0665861222790601	NaN	NaN	0.113731859632405	0.115557107273991	940	0	60	0.06	0.94	0.12
ORF3a	all	ss12	156	TAC	CTA	CTG	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.33333333333331	3	29.16666666666667	0.302544426379644	0.110629602831442	2.73475108502927	0.191914823548202	0.0865032046269274	0.0681838640143824	NaN	NaN	0.118270540952955	0.104658584583105	962	0	38	0.038	0.962	0.076
ORF3a	all	ss12	157	TGT	CTG	TAT	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.66666666666664	3	28.83333333333334	0.301006043193227	0.11200896641424	2.68733881607321	0.188997076778987	0.0896788071986801	0.0678324349711179	NaN	NaN	0.115976262549447	0.103182126844069	959	0	41	0.041	0.959	0.082
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.83333333333331	3	28.83333333333334	0.300242781455809	0.11200896641424	2.68052452466555	0.18823381504157	0.0866546351935228	0.0716624696100457	NaN	NaN	0.110967518928543	0.0898297411656682	963	0	37	0.037	0.963	0.074
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAT:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.16666666666666	3	28.16666666666667	0.298727964139002	0.114873729376874	2.60048982268996	0.183854234762128	0.0885985260984146	0.07168673534778	NaN	NaN	0.115532338584332	0.111527232861386	933	0	67	0.067	0.933	0.134
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATATAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	81.49999999999999	4	28.16666666666667	0.297228554032125	0.157438341821211	1.88790450022435	0.139790212210914	0.0870209155589742	0.0866383893037385	NaN	NaN	0.129176026120134	0.27917771146745	862	0	138	0.138	0.862	0.276
ORF3a	all	ss12	161	AAC	CAA	CAG	2	TACAATAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	21	81.99999999999999	4	28.000000000000004	0.313301400524984	0.158481820250405	1.97689173452173	0.154819580274579	0.0884460314842279	0.0830056740787219	NaN	NaN	0.127826495698401	0.225830367344559	898	0	102	0.102	0.898	0.204
ORF3a	all	ss12	162	AGT	CAG	TGT	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.66666666666664	4	28.33333333333334	0.31975701984729	0.156408563919793	2.04437028148448	0.163348455927497	0.0897838009514935	0.0841046721368962	NaN	NaN	0.12530240727754	0.192358463562943	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	163	GTA	TGT	AAC	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.66666666666664	4	28.66666666666667	0.324778826259198	0.154389040653111	2.1036391241586	0.170389785606087	0.0932397079052638	0.0872374297580636	NaN	NaN	0.123046835467683	0.166127233614744	919	0	81	0.081	0.919	0.162
ORF3a	all	ss12	164	ACA	AAC	AGA	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	21	79.83333333333331	4	29.16666666666667	0.323930763923761	0.151456007747705	2.13877791142735	0.172474756176056	0.0923245904510494	0.0806651129772036	NaN	NaN	0.130111554265527	0.184975079430171	913	0	87	0.087	0.913	0.174
ORF3a	all	ss12	165	GAT	AGA	TAC	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	21	78.99999999999999	4	29.83333333333334	0.328216664807022	0.147714914296514	2.22196022906786	0.180501750510508	0.0900340516759552	0.0820762089720098	NaN	NaN	0.125406420421329	0.150055855895058	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss12	166	ACA	TAC	AAT	2	GATACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.33333333333331	4	30.500000000000007	0.312120297918684	0.144154737019872	2.16517545223406	0.167965560898812	0.0868252121370417	0.0793884417289643	NaN	NaN	0.122502215897358	0.170336730408394	909	0	91	0.091	0.909	0.182
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.33333333333331	4	30.500000000000007	0.293010983942946	0.144154737019872	2.03261432818925	0.148856246923073	0.0821892401150724	0.0795454319161803	NaN	NaN	0.12185672064711	0.221871109262362	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.66666666666664	4	30.83333333333334	0.296094486163045	0.142438427764417	2.07875424357227	0.153656058398628	0.0889706110022293	0.074643246303123	NaN	NaN	0.116761859298252	0.188181368410785	916	0	84	0.084	0.916	0.168
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACT:GTCGTTACT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.83333333333331	4	31.33333333333334	0.295317464132448	0.139939466685309	2.11032292124242	0.155377997447139	0.0817826245159599	0.0776457838912275	NaN	NaN	0.122274633531632	0.203824857666513	902	0	98	0.098	0.902	0.196
ORF3a	all	ss12	170	ACT	TAC	TGA	2	ATTACTTCA:GTTACTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.16666666666664	4	31.08333333333334	0.3129461186614	0.141177857059552	2.21667990419625	0.171768261601848	0.0930604688010953	0.0791671949623115	NaN	NaN	0.124412086594393	0.167389780974736	915	0	85	0.085	0.915	0.17
ORF3a	all	ss12	171	GAA	TGA	AGG	2	ACTGAAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.16666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.83333333333331	4	30.750000000000007	0.309669148463835	0.142863650574837	2.16758529701451	0.166805497888998	0.0861170728783513	0.0807841729711526	NaN	NaN	0.123685303077794	0.177456391548538	914	0	86	0.086	0.914	0.172
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	GAAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.66666666666664	4	30.58333333333334	0.310481848332055	0.143721781908901	2.16029779347473	0.166760066423154	0.0873819395967199	0.0788024118513709	NaN	NaN	0.121877715426103	0.171231570495486	921	0	79	0.079	0.921	0.158
ORF3a	all	ss12	173	GAC	TGA	CGG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.3333333333333	4	30.58333333333334	0.307256730483381	0.143721781908901	2.13785778608101	0.16353494857448	0.087903169231383	0.0769058461738545	NaN	NaN	0.123077846471296	0.183943173227643	902	1	97	0.097	0.902	0.194
ORF3a	all	ss12	174	GGC	CGG	CAC	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.49999999999997	4	30.750000000000004	0.301773247822437	0.142863650574837	2.11231651024036	0.158909597247601	0.0880085101889263	0.0791804864861253	NaN	NaN	0.123192661697234	0.197075845340148	897	0	103	0.103	0.897	0.206
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	80.99999999999997	4	30.250000000000004	0.29948343190034	0.145469445655623	2.05873769952572	0.154013986244716	0.086233734488987	0.0795911287917255	NaN	NaN	0.114748977455024	0.179537064228323	909	0	91	0.091	0.909	0.182
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAC	2	ACAACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	21	80.41666666666664	3	30.66666666666667	0.320997633478909	0.104821456781369	3.06232753613059	0.21617617669754	0.095884744774314	0.0615665760003978	NaN	NaN	0.110127551728931	0.0496506133928735	978	0	22	0.022	0.978	0.044
ORF3a	all	ss12	177	ACA	AAC	ACC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	20	79.66666666666664	3	30.000000000000004	0.305669512283459	0.107325632730505	2.84805693203782	0.198343879552954	0.0863127923057903	0.0674737483517879	NaN	NaN	0.110631452801353	0.0729993996119704	975	0	25	0.025	0.975	0.05
ORF3a	all	ss12	178	CCA	ACC	AAA	2	ACACCAAAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	79.66666666666664	3	30.33333333333334	0.287035013343561	0.106058740537371	2.70637772888148	0.18097627280619	0.0842081582592403	0.0656691264839251	NaN	NaN	0.107425309567856	0.0920521200973311	964	0	36	0.036	0.964	0.072
ORF3a	all	ss12	179	AAA	AAA	ACT	2	CCAAAACTC:CCTATTTCT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	19	80.16666666666664	4	29.83333333333334	0.284857139505292	0.147714914296514	1.92842503996236	0.137142225208778	0.0821919886529887	0.0786188828160485	NaN	NaN	0.119051319238895	0.249337968100184	885	0	115	0.115	0.885	0.23
ORF3a	all	ss12	180	CTC	ACT	CAA	2	AAACTCAAA:ATTTCTGAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	17	79.33333333333331	4	30.16666666666667	0.25235417746591	0.145913043990275	1.7294833317488	0.106441133475635	0.0722482102190734	0.0774042421284777	NaN	NaN	0.108328508487911	0.325815520726008	852	0	148	0.148	0.852	0.296
ORF3a	all	ss12	181	AAA	CAA	ACA	2	CTCAAAGAA:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.83333333333331	3	30.333333333333336	0.233185780458787	0.106058740537371	2.19864745967468	0.127127039921416	0.073401241589713	0.0642928001249223	NaN	NaN	0.100547480201398	0.20610502538362	905	1	94	0.094	0.905	0.188
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	AGA	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.49999999999999	3	30.750000000000004	0.217335531831527	0.104516640682884	2.07943472361449	0.112818891148643	0.0642436480144775	0.065826511852615	NaN	NaN	0.0951390615129162	0.235688869277566	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss12	183	GAC	AGA	CTA	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.16666666666666	3	29.916666666666668	0.198802969548926	0.107647107231784	1.84680271176138	0.091155862317142	0.0655876745794763	0.0629165666969483	NaN	NaN	0.0993388813499987	0.358815112501445	834	1	165	0.165	0.834	0.33
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.83333333333333	4	30.583333333333332	0.202663072619289	0.143721781908901	1.41010687404188	0.0589412907103882	0.0662445205428307	0.0738905147162127	NaN	NaN	0.105575509652693	0.576649350843275	723	0	277	0.277	0.723	0.554
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.5	4	29.916666666666668	0.197860943283853	0.147260274111344	1.34361384615004	0.0506006691725088	0.066002914320466	0.0750514257851301	NaN	NaN	0.104981584304931	0.629809021494909	703	0	297	0.297	0.703	0.594
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	14	81.16666666666666	4	29.25	0.196003572834134	0.150978005779684	1.29822600200558	0.0450255670544508	0.0631762555525565	0.0798002960164483	NaN	NaN	0.113756834230585	0.692248607259706	664	0	336	0.336	0.664	0.672
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.66666666666666	4	29.583333333333332	0.213698279309918	0.149095891727942	1.43329421644868	0.0646023875819759	0.0677142749127195	0.0825743487110527	NaN	NaN	0.109160602977591	0.553977512379223	730	0	270	0.27	0.73	0.54
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.16666666666666	4	30.083333333333332	0.21524198382966	0.146359364647636	1.4706403266225	0.0688826191820243	0.0692038680449681	0.0776919111944384	NaN	NaN	0.106609095665593	0.518199516129343	768	1	231	0.231	0.768	0.462
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACT:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.16666666666666	4	30.583333333333332	0.221648134682889	0.143721781908901	1.54220280140544	0.0779263527739883	0.0701942075382678	0.0766823662231441	NaN	NaN	0.116804895317418	0.504676506306466	777	0	223	0.223	0.777	0.446
ORF3a	all	ss12	190	ACT	TAC	TGA	2	TATACTGAA:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.83333333333331	4	30.583333333333332	0.23666322859543	0.143721781908901	1.6466761367142	0.0929414466865291	0.0739968692640466	0.0763382742775062	NaN	NaN	0.114800423338353	0.418174996197443	785	0	215	0.215	0.785	0.43
ORF3a	all	ss12	191	GAA	TGA	AAA	2	ACTGAAAAA:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.49999999999999	4	30.916666666666668	0.220553902912914	0.142015736265178	1.55302439513524	0.0785381666477355	0.0681568120437909	0.0744847079564703	NaN	NaN	0.110996569230525	0.479210514212081	771	0	229	0.229	0.771	0.458
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAGGATAGG	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.99999999999999	4	30.916666666666668	0.222199362107379	0.142015736265178	1.56461085194445	0.0801836258422008	0.0699447748421242	0.0741903277328982	NaN	NaN	0.104379267374156	0.442371374637423	794	0	206	0.206	0.794	0.412
ORF3a	all	ss12	193	AGG	ATG	GCA	2	AAATGGGAA:GATAGGCAC	1:1	FALSE	2.83333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.16666666666666	6	31.41666666666667	0.190803499198466	0.220417888585699	0.865644346848381	-0.0296143893872323	0.0609823979462978	0.111780013206359	NaN	NaN	0.143177942442518	0.836137741084894	437	0	563	0.563	0.437	0.874
ORF3a	all	ss12	194	CAC	GCA	ATC	2	AGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333333	6	32.083333333333336	0.193179203235308	0.215112484631514	0.898038082569788	-0.0219332813962062	0.0596892604479359	0.110034915143128	NaN	NaN	0.135849912602963	0.871737174285813	448	0	552	0.552	0.448	0.896
ORF3a	all	ss12	195	TCA	ATC	AGG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.16666666666666	6	31.583333333333336	0.160415060140258	0.219066980579392	0.732264897776881	-0.0586519204391334	0.0518486155534457	0.115811879633019	NaN	NaN	0.134332500201123	0.662388768903104	353	1	646	0.646	0.353	0.706
ORF3a	all	ss12	196	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666666	6	31.750000000000004	0.159249476407496	0.217732646143538	0.731399168788461	-0.0584831697360422	0.0533007566627087	0.116870338977053	NaN	NaN	0.128974617088642	0.650226806955612	323	0	677	0.677	0.323	0.646
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333333	6	31.91666666666667	0.158864717514625	0.216414580065769	0.734075853236624	-0.0575498625511439	0.0527000956016934	0.107661138837001	NaN	NaN	0.131587338754232	0.661856768167371	299	0	701	0.701	0.299	0.598
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32.5	0.158673037027526	0.211925228838758	0.748721791628931	-0.0532521918112318	0.0512739873039341	0.109398155747153	NaN	NaN	0.122838936653921	0.664642621305244	369	0	631	0.631	0.369	0.738
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTA	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.91666666666667	6	32	0.158673037027526	0.215761554338836	0.735409222990409	-0.0570885173113096	0.0514854351021934	0.119124782780793	NaN	NaN	0.127654909093338	0.654723637405633	332	0	668	0.668	0.332	0.664
ORF3a	all	ss12	200	TAT	CTA	TGT	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.75	6	32	0.15905686340681	0.215761554338836	0.737188160764845	-0.0567046909320252	0.0500955215052388	0.114397365785404	NaN	NaN	0.123621482883928	0.646452421711126	318	0	682	0.682	0.318	0.636
ORF3a	all	ss12	201	GTC	TGT	CGT	2	TATGTCGTT:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333334	5	32.333333333333336	0.158864717514625	0.173179167487274	0.91734311822638	-0.0143144499726495	0.0524001594813399	0.0995329186967762	NaN	NaN	0.118401670965951	0.903772329681131	485	1	514	0.514	0.485	0.97
ORF3a	all	ss12	202	GTA	CGT	ATT	2	GTCGTTGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.33333333333334	5	32.833333333333336	0.160024633856936	0.17021844254226	0.940113371188945	-0.0101938086853242	0.0519009582674582	0.102389867720576	NaN	NaN	0.115968239968352	0.929954783184323	493	0	507	0.507	0.493	0.986
ORF3a	all	ss12	203	GTA	ATT	ACA	2	GTATTACAC:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.08333333333334	5	33.083333333333336	0.160610991304224	0.168775880107432	0.951622893046025	-0.00816488880320848	0.0532837507258957	0.101481926908427	NaN	NaN	0.118235121351528	0.944944746300395	493	1	506	0.506	0.493	0.986
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	GTACATGGC:TTACACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.83333333333334	5	33.166666666666664	0.145028544735405	0.168300466878196	0.861723959686733	-0.023271922142791	0.051271183504930803	0.100846267235338	NaN	NaN	0.115771699178899	0.840686345139148	452	0	548	0.548	0.452	0.904
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	CTA	2	CACAGTTAC:CATGGCTAT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.33333333333334	5	32.833333333333336	0.146091244169313	0.17021844254226	0.858257436664322	-0.0241271983729469	0.0479875534690276	0.101929524028924	NaN	NaN	0.110627031909353	0.827355122302104	417	0	583	0.583	0.417	0.834
ORF3a	all	ss12	206	TAC	CTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.83333333333334	5	33	0.131083275220683	0.169253998250676	0.774476683419554	-0.0381707230299936	0.0466700556687649	0.0989728295430183	NaN	NaN	0.109554766044941	0.727527173595081	383	0	617	0.617	0.383	0.766
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	6	32.83333333333333	0.130765040358583	0.209443067094397	0.624346473591541	-0.0786780267358138	0.047103778564023	0.11628840490865	NaN	NaN	0.135576297391386	0.561696903980608	275	0	725	0.725	0.275	0.55
ORF3a	all	ss12	208	ACC	CAC	CGA	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.66666666666667	6	32.166666666666664	0.133355157329571	0.214467334863233	0.621797055549798	-0.0811121775336623	0.0476735459793822	0.122196898335264	NaN	NaN	0.133395640289854	0.543149547325993	291	0	709	0.709	0.291	0.582
ORF3a	all	ss12	209	GAA	CGA	AGA	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.416666666666667	1	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	73	6	32.83333333333333	0.13468918273131	0.209443067094397	0.643082555082164	-0.0747538843630872	0.05164792424393	0.115002642405851	NaN	NaN	0.130450912310583	0.566616087107147	287	0	713	0.713	0.287	0.574
ORF3a	all	ss12	210	GAC	AGA	CTA	2	GAAGTTTAC:TCAGACTAT	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.33333333333334	6	32.166666666666664	0.134018841557532	0.214467334863233	0.624891625771338	-0.0804484933057014	0.0480336465205888	0.12353387051817	NaN	NaN	0.132038905888225	0.542339721063508	258	0	742	0.742	0.258	0.516
ORF3a	all	ss12	211	TAC	CTA	CTA	2	GACTATTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.00000000000001	6	32.166666666666664	0.116739982283845	0.214467334863233	0.544325234228749	-0.0977273525793884	0.0466306784694471	0.119189771996076	NaN	NaN	0.137222730491595	0.476353011548241	238	1	761	0.761	0.238	0.476
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.33333333333336	6	32.5	0.132047365954149	0.211925228838758	0.623084692076074	-0.0798778628846088	0.0475987271898683	0.121430651479788	NaN	NaN	0.13390743140238	0.550830879916952	256	0	744	0.744	0.256	0.512
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.00000000000003	6	32.83333333333333	0.132698031119309	0.209443067094397	0.633575667890219	-0.0767450359750885	0.0486363380112973	0.117064576864457	NaN	NaN	0.127630152002134	0.547634838497264	291	0	709	0.709	0.291	0.582
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.33333333333336	6	32.166666666666664	0.132047365954149	0.214467334863233	0.615699197448209	-0.0824199689090843	0.048867446700734	0.112810604471476	NaN	NaN	0.134793518727464	0.540899393027892	276	0	724	0.724	0.276	0.552
ORF3a	all	ss12	215	GAG	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.16666666666669	6	31.499999999999996	0.130448350815189	0.219740343511106	0.593647705882449	-0.0892919926959165	0.0477850155234097	0.120751889301286	NaN	NaN	0.138059000276657	0.517782812767556	286	0	714	0.714	0.286	0.572
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.83333333333336	6	30.499999999999996	0.117025173722032	0.228158530802244	0.512911672908095	-0.111133357080212	0.046285568280099	0.129500651771652	NaN	NaN	0.142296927191787	0.434804739307953	196	0	804	0.804	0.196	0.392
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.50000000000003	6	29.499999999999996	0.117599765999126	0.237252996159118	0.495672416799559	-0.119653230159991	0.0482277312851108	0.132784652893766	NaN	NaN	0.14513996845312	0.409712940376093	176	0	824	0.824	0.176	0.352
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	AAT	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.1666666666667	6	29.83333333333333	0.11818004032857	0.234141361979703	0.504737989603115	-0.115961321651132	0.0450611362822255	0.134376768774746	NaN	NaN	0.145154029157012	0.42435731685943	188	0	812	0.812	0.188	0.376
ORF3a	all	ss12	219	ATT	AAT	GAG	2	CAAATTACT:CAATTGAGT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.1666666666667	6	29.166666666666664	0.11818004032857	0.240449165598692	0.491496986626321	-0.122269125270122	0.0477990632334231	0.130368923465204	NaN	NaN	0.14601226512161	0.402373713627753	168	0	832	0.832	0.168	0.336
ORF3a	all	ss12	220	ACT	GAG	TAC	2	ATTACTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	6	29.08333333333333	0.0870541284395655	0.24126182510618	0.360828441885709	-0.154207696666615	0.0347792149718639	0.132760803524722	NaN	NaN	0.142386817235985	0.278799776947207	107	0	893	0.893	0.107	0.214
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	ACTACAGAC:AGTACAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	6	28.749999999999993	0.0870541284395655	0.244568640424989	0.355949676492827	-0.157514511985424	0.0341546169507697	0.135412434707489	NaN	NaN	0.145570637737773	0.279230911295336	86	0	914	0.914	0.086	0.172
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000004	6	28.749999999999993	0.0870541284395655	0.244568640424989	0.355949676492827	-0.157514511985424	0.0368831219019499	0.147739840424745	NaN	NaN	0.141818969087544	0.266709091280856	93	0	907	0.907	0.093	0.186
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333337	6	28.41666666666666	0.0892139571460239	0.247968200054092	0.359779831149972	-0.158754242908068	0.0357880943591015	0.146555578895304	NaN	NaN	0.14531025147729	0.274604946261647	106	0	894	0.894	0.106	0.212
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TAT	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	70.6666666666667	6	29.08333333333333	0.0901082338815474	0.24126182510618	0.373487325820778	-0.151153591224633	0.037003464172287	0.137002108912246	NaN	NaN	0.146132287358805	0.300967262117534	116	0	884	0.884	0.116	0.232
ORF3a	all	ss12	225	ATT	TAT	TGA	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	1.25	0	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	69.6666666666667	6	30.08333333333333	0.0914838201648646	0.231861099259994	0.39456303992711	-0.140377279095129	0.0363292560202141	0.135042889872042	NaN	NaN	0.13298541544346	0.291158305993669	107	0	893	0.893	0.107	0.214
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	0.583333333333333	0.416666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.25000000000003	6	29.83333333333333	0.0747816950380488	0.234141361979703	0.319386948148578	-0.159359666941654	0.0324681405394274	0.138328034754337	NaN	NaN	0.142188191165186	0.262387549989933	82	0	918	0.918	0.082	0.164
ORF3a	all	ss12	227	AAT	AAA	TGC	2	GAAAATGCT:GAACATGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	GCT	TGC	TAC	2	AATGCTACA:CATGTTACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACA	TAC	ATT	2	GCTACATTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	ATT	CTT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAC	CAA	CAA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	CAA	AAT	2	AACAAGCTT:AATAAAATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AAGCTTGTT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTT	TGT	TAA	2	ATTGTTGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	AAA	TAA	AGA	2	GTTAAAGAC:GTTGATGAG	1:1	FALSE	0	0.5	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAC	AGA	CCC	2	AAAGACCCA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCA	CCC	A--	1	GACCCA---:GAGCCTGAA	1:1	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	---	TGA	AGA	1	CCA---CCG:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	CCG	-CC	ACA	1	---CCGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	2	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	AAT	ACA	TGT	2	CCGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATA	AAT	ACA	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	ACA	CAC	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGC	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GCT	TGC	TAA	2	GTTGCTAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	TAA	TCC	2	GCTAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATT	AAT	TTA	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	TTA	TGA	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	2	GAT	GGA	TTT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.83333333333336	2	31.916666666666664	0.0920189790070996	0.0654365742860851	1.40623160688085	0.0265824047210145	0.0339731659099525	0.0490722465597808	NaN	NaN	0.0633419194871507	0.674729988359516	681	0	319	0.319	0.681	0.638
ORF3a	all	ss12	3	TTG	TTT	GTT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.16666666666669	2	31.916666666666664	0.0928335758860083	0.0654365742860851	1.41868025487008	0.0273970015999232	0.0352711814780753	0.048212361942487	NaN	NaN	0.0608829907181935	0.652714517311367	703	0	297	0.297	0.703	0.594
ORF3a	all	ss12	4	TTT	GTT	TAT	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.33333333333336	2	32.416666666666664	0.0938723572155045	0.0643826713791054	1.45803762417304	0.0294896858363991	0.0346174763129907	0.0464757846449832	NaN	NaN	0.0626221652674694	0.637701790756215	702	0	298	0.298	0.702	0.596
ORF3a	all	ss12	5	ATG	TAT	GAG	2	TTTATGAGA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.16666666666669	2	31.916666666666664	0.0940829130843776	0.0654365742860851	1.43777259293942	0.0286463387982925	0.0353833855519105	0.0451412035998178	NaN	NaN	0.0605751712334155	0.636280516522673	693	2	305	0.305	0.693	0.61
ORF3a	all	ss12	6	AGA	GAG	AAT	2	ATGAGAATC:ATGAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.66666666666669	2	31.416666666666664	0.0947202939932191	0.0665255778124882	1.42381768197792	0.0281947161807308	0.0347391835726724	0.0510990677601125	NaN	NaN	0.0613408415673921	0.645774505237351	702	0	298	0.298	0.702	0.596
ORF3a	all	ss12	7	ATC	AAT	CTT	2	AGAATCTTC:AGAATTTTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.16666666666669	2	31.416666666666664	0.0940829130843776	0.0665255778124882	1.41423669178137	0.0275573352718894	0.0351389282744952	0.0498380380002424	NaN	NaN	0.0632886705580348	0.663255505001973	687	0	313	0.313	0.687	0.626
ORF3a	all	ss12	8	TTC	CTT	CAC	2	ATCTTCACA:ATTTTTAAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.66666666666669	2	32.083333333333336	0.0960213558204693	0.0650814580158656	1.4754026530423	0.0309398978046037	0.0357702081890762	0.0491192715688124	NaN	NaN	0.0601022453638211	0.606701368042698	696	0	304	0.304	0.696	0.608
ORF3a	all	ss12	9	AAT	CAC	AAT	2	TTCACAATT:TTTAATCTT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.00000000000001	2	31.75	0.0955837099260903	0.0657955896932053	1.45273733956611	0.0297881202328849	0.0370570921237382	0.0488414448314541	NaN	NaN	0.0633027618290862	0.637950773426543	673	0	327	0.327	0.673	0.654
ORF3a	all	ss12	10	ATT	AAT	TGG	2	AATCTTGGA:ACAATTGGA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.00000000000001	2	32.416666666666664	0.0822741879423184	0.0643826713791054	1.27789335515238	0.0178915165632129	0.0334855057769965	0.0469126326106535	NaN	NaN	0.0582312102698083	0.758653388216423	621	0	379	0.379	0.621	0.758
ORF3a	all	ss12	11	GGA	TGG	AAC	2	ATTGGAACT:CTTGGATCT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.16666666666669	2	32.08333333333333	0.067766156279967	0.0650814580158656	1.04125135401003	0.00268469826410142	0.0290113341642779	0.0481221077072025	NaN	NaN	0.058842704909905	0.96360914479573	560	1	439	0.439	0.56	0.878
ORF3a	all	ss12	12	ACT	AAC	TGT	2	GGAACTGTA:GGATCTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.50000000000001	2	32.416666666666664	0.0674611774972046	0.0643826713791054	1.04781575619893	0.00307850611809911	0.0297537785985569	0.0509826753226151	NaN	NaN	0.0579929564008022	0.957664869434427	520	0	480	0.48	0.52	0.96
ORF3a	all	ss12	13	GTA	TGT	AAC	2	ACTGTAACT:TCTGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.00000000000001	2	32.25	0.0531195394264593	0.0647301776657745	0.820630212089558	-0.0116106382393152	0.0260815704735635	0.0499271133319491	NA	NA	0.0575362717314856	0.840075546358943	434	5	561	0.561	0.434	0.868
ORF3a	all	ss12	14	ACA	AAC	ATT	2	GTAACATTC:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.50000000000001	2	32.08333333333333	0.0527690107059348	0.0650814580158656	0.810814820606365	-0.0123124473099308	0.0268907935536527	0.0492095696316851	NA	NA	0.0522856120885655	0.813832765886443	455	5	540	0.54	0.455	0.91
ORF3a	all	ss12	15	TTC	ATT	CAA	2	ACATTCAAA:ACTTTGAAG	1:1	FALSE	2	0.416666666666667	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.16666666666667	2	32.416666666666664	0.0530021800130169	0.0643826713791054	0.823236732457455	-0.0113804913660886	0.0268432296848632	0.0492626777179054	NaN	NaN	0.0555094973262894	0.837557424965889	433	4	563	0.563	0.433	0.866
ORF3a	all	ss12	16	AAA	CAA	ACC	2	TTCAAACCA:TTGAAGCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666667	2	32.83333333333333	0.039920730758297	0.0635300231041221	0.628375826227376	-0.0236092923458251	0.0225163505396481	0.0457123683075863	NA	NA	0.0520807393052711	0.650317619908021	294	9	697	0.697	0.294	0.588
ORF3a	all	ss12	17	CAA	ACC	AGG	2	AAACCAGGA:AAGCAAGGT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.16666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	2	32.83333333333333	0.0400094855289696	0.0635300231041221	0.629772878618292	-0.0235205375751525	0.0220966625364181	0.0487569183948547	NA	NA	0.0534400330936253	0.659843282776469	330	2	668	0.668	0.33	0.66
ORF3a	all	ss12	18	GGA	AGG	AAA	2	CAAGGTGAA:CCAGGAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000001	1	31.999999999999993	0.0394828001140665	0.0319197108140969	1.23694103446042	0.0075630892999696	0.0226152955860571	0.0331210032361903	NA	NA	0.0426971377546872	0.859403605126244	603	15	382	0.382	0.603	0.764
ORF3a	all	ss12	19	AAA	AAA	AAT	2	GGAAAAATT:GGTGAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.25000000000001	1	31.999999999999993	0.0393532888030902	0.0319197108140969	1.23288362580373	0.00743357798899328	0.0216382753308685	0.035245057615632	NA	NA	0.0418672013529763	0.859075336889758	590	13	397	0.397	0.59	0.794
ORF3a	all	ss12	20	ATC	AAT	CAA	2	AAAATTGAA:GAAATCAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	1	32.166666666666664	0.0259485340559256	0.0317507728699206	0.817256769220514	-0.00580223881399495	0.0181343301340661	0.0340769379642853	NA	NA	0.0396148967163836	0.883553461718966	439	44	517	0.517	0.439	0.878
ORF3a	all	ss12	21	AAG	CAA	AGA	2	ATCAAGGAT:ATTGAAGAT	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.5	0.583333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.91666666666669	1	32.83333333333333	0.0261179819037762	0.0310925352587596	0.840008114051041	-0.00497455335498345	0.0195461999513587	0.0323827159975869	NA	NA	0.0405153959851604	0.90227988458168	461	40	499	0.499	0.461	0.922
ORF3a	all	ss12	22	GAT	AGA	TGC	2	AAGGATGCT:GAAGATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	77.33333333333334	1.5	33.08333333333333	0.0196517792955181	0.0467683957825312	0.420193572319587	-0.0271166164870131	0.0142787734945902	0.0360545229662516	NA	NA	0.037111186671049	0.464971101442443	217	45	738	0.738	0.217	0.434
ORF3a	all	ss12	23	GCT	TGC	TAC	2	GATGCTACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	76.91666666666667	1.5	32.83333333333333	0.0197596500234239	0.0471359277447477	0.41920570929307	-0.0273762777213239	0.0140239789728872	0.0397044675612785	NA	NA	0.039460934601534	0.487834961013342	222	48	730	0.73	0.222	0.444
ORF3a	all	ss12	24	ACT	TAC	TCC	2	GCTACTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	76.41666666666667	1.5	33.33333333333333	0.0198906685349743	0.0464065527885656	0.42861767012945	-0.0265158842535913	0.0160613859909397	0.0355691781129015	NA	NA	0.036916025767144	0.472587310107562	198	50	752	0.752	0.198	0.396
ORF3a	all	ss12	25	CCT	TCC	TTC	2	ACTCCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	76.41666666666667	1.5	33.33333333333333	0.0198906685349743	0.0464065527885656	0.42861767012945	-0.0265158842535913	0.0158279578546335	0.0381589628035683	NA	NA	0.0374835029199701	0.479317037136229	222	44	734	0.734	0.222	0.444
ORF3a	all	ss12	26	TCA	TTC	AGA	2	CCTTCAGAT	2	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	77.75	1.5	32.666666666666664	0.0195450800023987	0.0473841762161487	0.412481160656702	-0.02783909621375	0.0150770356403944	0.0367732203937096	NA	NA	0.0387575946584366	0.472580028901957	236	46	718	0.718	0.236	0.472
ORF3a	all	ss12	27	GAT	AGA	TTC	2	TCAGATTCT:TCAGATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	77.75	1.5	32.666666666666664	0.0195450800023987	0.0473841762161487	0.412481160656702	-0.02783909621375	0.0149316714800414	0.0381252763867595	NA	NA	0.0404271316553348	0.491059865566979	203	55	742	0.742	0.203	0.406
ORF3a	all	ss12	28	TCT	TTC	TAT	2	GATTCTATT:GATTTTGTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	76.91666666666667	1.5	32.83333333333333	0.0197596500234239	0.0471359277447477	0.41920570929307	-0.0273762777213239	0.0149728928534927	0.0375399993889639	NA	NA	0.038856502725823	0.481091465614807	202	52	746	0.746	0.202	0.404
ORF3a	all	ss12	29	ATT	TAT	TCG	2	TCTATTCGC:TTTGTTCGC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	76.58333333333334	0.5	33.49999999999999	0.0198468030606237	0.0150758844908154	1.31646027619241	0.00477091856980827	0.0150034971414848	0.0159889940355943	NA	NA	0.0171426608711403	0.780776879915559	525	127	348	0.348	0.525	0.696
ORF3a	all	ss12	30	CGC	TCG	CGC	2	ATTCGCGCT:GTTCGCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	77.16666666666667	0.5	33.416666666666664	0.00650763301926673	0.0151138615779809	0.430573813693488	-0.00860622855871422	0.00644189818523591	0.0144911889968906	NA	NA	0.00891917808821344	0.334588520252301	0	360	640	0.64	0	0.001
ORF3a	all	ss12	31	GCT	CGC	TAC	2	CGCGCTACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	77.66666666666667	1.5	32.916666666666664	0.00646555728293023	0.047012776720265	0.137527662350206	-0.0405472194373348	0.00664041886630561	0.0363866045909949	NA	NA	0.0352722805774377	0.250329620548899	0	124	876	0.876	0	0.001
ORF3a	all	ss12	32	ACT	TAC	TGC	2	GCTACTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	79.33333333333334	1.5	32.24999999999999	0.00632915148439845	0.0480163940736983	0.1318123029956	-0.0416872425892998	0.00635337442297408	0.0400217422478511	NA	NA	0.0346534535005073	0.228985946325438	0	131	869	0.869	0	0.001
ORF3a	all	ss12	33	GCA	TGC	AAC	2	ACTGCAACG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	80.66666666666667	1.5	31.58333333333333	0.0062241021110213	0.0490638117052579	0.1268572883903	-0.0428397095942366	0.0063771895249921	0.0387821243494192	NA	NA	0.0343731212824841	0.212649061964634	0	137	863	0.863	0	0.001
ORF3a	all	ss12	34	ACG	AAC	GAT	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	80.5	1.5	32.08333333333333	0.00623704218124313	0.0482740319661775	0.129200771661522	-0.0420369897849344	0.00590966214655012	0.0357165826968633	NA	NA	0.0357393936666803	0.239511443827883	0	112	888	0.888	0	0.001
ORF3a	all	ss12	35	ATA	GAT	ACC	2	ACGATACCG	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	79.66666666666666	1.5	32.74999999999999	0.00630255809728463	0.0472597258715505	0.133360022324604	-0.0409571677742659	0.00623118108886549	0.0370300144295477	NA	NA	0.0351544906775363	0.243993821702081	0	121	879	0.879	0	0.001
ORF3a	all	ss12	36	CCG	ACC	GAT	2	ATACCGATA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	78.66666666666666	1.5	33.416666666666664	0.00638301725093146	0.0462871798939189	0.137900327165321	-0.0399041626429874	0.00655321656723625	0.0367312975825594	NA	NA	0.0332955454917879	0.230728834011853	0	130	870	0.87	0	0.001
ORF3a	all	ss12	37	ATA	GAT	ACA	2	CCGATACAA	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	78.66666666666666	1.5	33.416666666666664	0.00638301725093146	0.0462871798939189	0.137900327165321	-0.0399041626429874	0.00642343141494157	0.0377116985154928	NA	NA	0.0354298692370189	0.260044518253178	0	119	881	0.881	0	0.001
ORF3a	all	ss12	38	CAA	ACA	AGC	2	ATACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	78.5	1.5	33.916666666666664	0.00639662726064033	0.0455836471964618	0.140327236938093	-0.0391870199358215	0.00653895426693482	0.0341382746282558	NA	NA	0.0333904260933215	0.24055509072066	0	124	876	0.876	0	0.001
ORF3a	all	ss12	39	GCC	AGC	CTC	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	78.33333333333333	1.5	33.416666666666664	0.00641029543384381	0.0462871798939189	0.138489651962702	-0.039876884460075	0.0064857981263563	0.0370781832306407	NA	NA	0.0324830030319871	0.21958849097264	0	149	851	0.851	0	0.001
ORF3a	all	ss12	40	TCA	CTC	ACT	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	77.99999999999999	1.5	33.75	0.00643780776854358	0.0458157689848786	0.140515108906463	-0.039377961216335	0.00627777817664008	0.0359856523174055	NA	NA	0.0365363995050485	0.281134872296919	0	124	876	0.876	0	0.001
ORF3a	all	ss12	41	CTC	ACT	CCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	78.66666666666666	1.5	33.08333333333333	0.00638301725093146	0.0467683957825312	0.136481423921657	-0.0403853785315997	0.00669457130017239	0.0356104701351547	NA	NA	0.0368889004065523	0.273611270677582	0	136	864	0.864	0	0.001
ORF3a	all	ss12	42	CCT	CCC	TTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	78.99999999999999	1.5	32.75	0.00635597024322917	0.0472597258715505	0.13449020547652701	-0.0409037556283214	0.00599993186614452	0.0388758462867386	NA	NA	0.03595827645617	0.255315194169041	0	120	880	0.88	0	0.001
ORF3a	all	ss12	43	TTC	TTT	CGG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	78.99999999999999	1.5	32.75	0.00635597024322917	0.0472597258715505	0.13449020547652701	-0.0409037556283214	0.00631361897058485	0.0389024612456437	NA	NA	0.0363167305677317	0.260035971343156	0	124	876	0.876	0	0.001
ORF3a	all	ss12	44	GGA	CGG	ATG	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	78.66666666666666	1.5	33.08333333333333	0.00638301725093146	0.0467683957825312	0.136481423921657	-0.0403853785315997	0.0063271919864583	0.0366635204932684	NA	NA	0.0335983181239731	0.22936122009808	0	117	883	0.883	0	0.001
ORF3a	all	ss12	45	TGG	ATG	GCT	2	GGATGGCTT	2	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	78.66666666666666	1.5	33.08333333333333	0.00638301725093146	0.0467683957825312	0.136481423921657	-0.0403853785315997	0.0064639717531404	0.0335570354900285	NA	NA	0.0350688097963854	0.249483873346088	0	131	869	0.869	0	0.001
ORF3a	all	ss12	46	CTT	GCT	TAT	2	TGGCTTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	77.49999999999999	1.5	33.58333333333333	0.00647952194303081	0.0460502676481925	0.140705413322069	-0.0395707457051617	0.00631235292529624	0.0359033375376638	NA	NA	0.0350473114937566	0.258869777280915	0	127	873	0.873	0	0.001
ORF3a	all	ss12	47	ATT	TAT	TGT	2	CTTATTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	77.49999999999999	1.5	33.58333333333333	0.00647952194303081	0.0460502676481925	0.140705413322069	-0.0395707457051617	0.00626244236750154	0.0354033453678164	NA	NA	0.0345800915045661	0.252490287806515	0	151	849	0.849	0	0.001
ORF3a	all	ss12	48	GTT	TGT	TGG	2	ATTGTTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	77.41666666666666	1.5	33.33333333333333	0.00648652691889879	0.0464065527885656	0.139776099044725	-0.0399200258696669	0.006569612696095	0.0371581334246268	NA	NA	0.0343874925019432	0.245687467557801	0	113	887	0.887	0	0.001
ORF3a	all	ss12	49	GGC	TGG	CGT	2	GTTGGCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	77.41666666666666	1.5	33.33333333333333	0.00648652691889879	0.0464065527885656	0.139776099044725	-0.0399200258696669	0.00679936248168919	0.0362129547225543	NA	NA	0.0345694852414224	0.248182002011105	0	139	861	0.861	0	0.001
ORF3a	all	ss12	50	GTT	CGT	TGC	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	76.91666666666666	1.5	33.83333333333333	0.00652887692049817	0.0456994132463681	0.142865661869675	-0.03917053632587	0.00690568419050257	0.0362296614570283	NA	NA	0.0341349813410075	0.251167225395587	0	110	890	0.89	0	0.001
ORF3a	all	ss12	51	GCA	TGC	ACT	2	GTTGCACTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	77.91666666666666	1.5	32.83333333333333	0.00644472279212388	0.0471359277447477	0.136726338071112	-0.0406912049526239	0.00667614894928252	0.0365365287205771	NA	NA	0.0344841684403346	0.238001527515828	0	135	865	0.865	0	0.001
ORF3a	all	ss12	52	CTT	ACT	TCT	2	GCACTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	77.41666666666666	1.5	33.33333333333333	0.00648652691889879	0.0464065527885656	0.139776099044725	-0.0399200258696669	0.00663069788489973	0.0371600104867076	NA	NA	0.0350861929877319	0.255216438902885	0	127	873	0.873	0	0.001
ORF3a	all	ss12	53	CTT	TCT	TGC	2	CTTCTTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	77.08333333333331	1.5	32.33333333333333	0.00651469894197028	0.0478886039898996	0.136038606248458	-0.0413739050479293	0.00649599638030695	0.0384437834040171	NA	NA	0.0358206709517853	0.248078650458987	0	123	877	0.877	0	0.001
ORF3a	all	ss12	54	GCT	TGC	TGT	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0.5	77.74999999999999	1.5	31.666666666666664	0.00645859750118894	0.0489303914013007	0.131995623092793	-0.0424717939001118	0.0063446059826653	0.0384254567815603	NA	NA	0.036186764251005	0.240521979100924	0	112	888	0.888	0	0.001
ORF3a	all	ss12	55	GTT	TGT	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	77.58333333333331	2.5	32.166666666666664	0.0195876203714479	0.08204894580533	0.238730920661938	-0.0624613254338821	0.0148609059476524	0.0515424984383127	NA	NA	0.0433523144928471	0.149645686671798	0	45	955	0.955	0	0.001
ORF3a	all	ss12	56	TTT	TTT	TCA	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	78.24999999999999	2.5	32.166666666666664	0.0194185604495562	0.08204894580533	0.236670444195942	-0.0626303853557738	0.0144174020803437	0.0506844924009285	NA	NA	0.0420751245359706	0.136609296273487	0	46	954	0.954	0	0.001
ORF3a	all	ss12	57	CAG	TCA	GAG	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	0.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	76.91666666666666	2.5	32.83333333333333	0.0197596500234239	0.0802904971231195	0.246101976341284	-0.0605308470996956	0.0148256708367518	0.0485839096602497	NA	NA	0.0405627753335871	0.135626864041484	0	45	955	0.955	0	0.001
ORF3a	all	ss12	58	AGC	GAG	CGC	2	CAGAGCGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	77.41666666666666	2.5	32.83333333333333	0.0196303463354343	0.0802904971231195	0.244491528123592	-0.0606601507876852	0.0145094329725429	0.0520998214882474	NA	NA	0.0431548001823337	0.159830794034754	0	40	960	0.96	0	0.001
ORF3a	all	ss12	59	GCT	CGC	TTC	2	AGCGCTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	76.08333333333333	2.5	33.5	0.0199789838107979	0.0786059075949375	0.254166441455663	-0.0586269237841395	0.0147822995604141	0.0508114634414938	NA	NA	0.0427575392547216	0.170328756245338	0	38	962	0.962	0	0.001
ORF3a	all	ss12	60	TCC	TTC	CAA	2	GCTTCCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	76.75	2.5	32.83333333333333	0.0198031306473831	0.0802904971231195	0.246643517688232	-0.0604873664757365	0.0150072145071586	0.0503132481965684	NA	NA	0.0422315451601885	0.152063914672177	0	32	968	0.968	0	0.001
ORF3a	all	ss12	61	AAA	CAA	AAT	2	TCCAAAATA:TCCAAAATC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	76.33333333333333	2.5	33.25	0.0199126740705906	0.0792292713011884	0.251329764158666	-0.0593165972305978	0.0145114442697422	0.0484460066274735	NA	NA	0.0396058308675845	0.134218140200332	0	44	956	0.956	0	0.001
ORF3a	all	ss12	62	ATA	AAT	AAT	2	AAAATAATT:AAAATCATA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	75.33333333333333	2.5	33.916666666666664	0.0201805896899433	0.0775885030410186	0.260097680699864	-0.0574079133510753	0.0158042563613443	0.0481188301551066	NA	NA	0.0415677571069352	0.167257948687063	0	45	955	0.955	0	0.001
ORF3a	all	ss12	63	ATA	AAT	AAC	2	ATAATTACA:ATCATAACC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	75	2.5	33.916666666666664	0.0202715042909394	0.0775885030410186	0.261269434212728	-0.0573169987500791	0.0159661085934791	0.0468955639759819	NA	NA	0.0388440270566539	0.14005993248893	0	48	952	0.952	0	0.001
ORF3a	all	ss12	64	ACA	AAC	ACT	2	ATAACCCTC:ATTACACTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	74.33333333333333	2.5	34.25	0.0204558134397444	0.0767933639165996	0.266374754229547	-0.0563375504768552	0.0149828433411648	0.0502513959166801	NA	NA	0.0406334495905103	0.165599742675099	0	54	946	0.946	0	0.001
ORF3a	all	ss12	65	CTC	ACT	CAA	2	ACACTCAAA:ACCCTCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	75	2.5	34.25	0.0202715042909394	0.0767933639165996	0.263974688137832	-0.0565218596256602	0.0157699414364018	0.0502030846217572	NA	NA	0.0396638115248208	0.154150436589708	0	46	954	0.954	0	0.001
ORF3a	all	ss12	66	AAA	CAA	AAA	2	CTCAAAAAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	75	2.5	34.25	0.0202715042909394	0.0767933639165996	0.263974688137832	-0.0565218596256602	0.0156975764855121	0.0471709378679232	NA	NA	0.0384513659919942	0.141573364900191	0	45	955	0.955	0	0.001
ORF3a	all	ss12	67	AAG	AAA	GAG	2	AAAAAGAGA:AAAAAGAGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	74.33333333333333	2.5	34.916666666666664	0.0204558134397444	0.0752510361297835	0.271834309423524	-0.0547952226900391	0.0160514572622004	0.0472877942008937	NA	NA	0.0375230972121371	0.144205856944158	0	40	960	0.96	0	0.001
ORF3a	all	ss12	68	AGA	GAG	ATG	2	AAGAGATGG:AAGAGGTGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1.5	74.49999999999999	2.5	34.916666666666664	0.0204094226436635	0.0752510361297835	0.271217828927484	-0.05484161348612	0.0159970091055123	0.0464469081009621	NA	NA	0.0382789708021389	0.151948578666015	0	47	953	0.953	0	0.001
ORF3a	all	ss12	69	TGG	ATG	GCA	2	AGATGGCAA:AGGTGGCAA	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2.5	74.33333333333331	2.5	35.33333333333333	0.0344097043130202	0.0743181769831732	0.463005225771498	-0.0399084726701529	0.0206905690343053	0.047745439377176	NA	NA	0.0402995441626922	0.322029518314305	121	12	867	0.867	0.121	0.242
ORF3a	all	ss12	70	CAA	GCA	ACT	2	TGGCAACTA:TGGCAATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2.5	74.16666666666664	2.5	35.166666666666664	0.0344888349313675	0.0746885290720775	0.46176883331153	-0.0401996941407099	0.0218017442033882	0.0453983741780229	NA	NA	0.0406691349821936	0.322928847763067	126	16	858	0.858	0.126	0.252
ORF3a	all	ss12	71	CTA	ACT	AGC	2	CAACTAGCA:CAATTTGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.833333333333333	0.833333333333333	0	0.5	1	0.5	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3.5	74.08333333333331	3.5	34.916666666666664	0.0487976950102964	0.107601064242965	0.453505691171514	-0.0588033692326688	0.0246179851792714	0.0583118235885968	NA	NA	0.050335170817949	0.242711497853777	77	8	915	0.915	0.077	0.154
ORF3a	all	ss12	72	GCA	AGC	ACT	2	CTAGCACTC:TTTGCTCTC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.83333333333331	3	34.5	0.0699807987745894	0.0924244803179611	0.75716734931957	-0.0224436815433717	0.0358095762536092	0.0573234288072163	NA	NA	0.0536124362983878	0.675487824470001	314	2	684	0.684	0.314	0.628
ORF3a	all	ss12	73	CTC	ACT	CTC	2	GCACTCTCC:GCTCTCTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.08333333333331	3	34.416666666666664	0.0697366111169323	0.0926626795339059	0.752585738591934	-0.0229260684169736	0.0375986177009665	0.0584878851858188	NA	NA	0.0532898694568258	0.667039698874008	348	9	643	0.643	0.348	0.696
ORF3a	all	ss12	74	TCC	CTC	CAA	2	CTCTCCAAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.08333333333331	3	33.75	0.0687766788210944	0.094613463995175	0.726922743517791	-0.0258367851740806	0.0370644709413094	0.0570787213618689	NA	NA	0.053646756472183	0.630083407900544	332	4	664	0.664	0.332	0.664
ORF3a	all	ss12	75	AAG	CAA	GGG	2	TCCAAGGGT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.74999999999999	3	33.416666666666664	0.0681512822117691	0.0956200277799543	0.712730207196784	-0.0274687455681852	0.0382804737624822	0.0590049077159814	NA	NA	0.0560863731073188	0.624305209089708	292	11	697	0.697	0.292	0.584
ORF3a	all	ss12	76	GGT	GGG	TGT	2	AAGGGTGTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.74999999999999	3	33.75	0.0681512822117691	0.094613463995175	0.720312726476695	-0.0264621817834059	0.0365497791823502	0.0563014616227398	NA	NA	0.0552025595352587	0.631678900105739	316	6	678	0.678	0.316	0.632
ORF3a	all	ss12	77	GTT	TGT	TCA	2	GGTGTTCAC:GGTGTTCAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.74999999999999	3	33.08333333333333	0.0672342400167485	0.0966482688635724	0.695659020149192	-0.029414028846824	0.035520325630401	0.0578349174234075	NA	NA	0.0559085427038067	0.598811961912688	262	7	731	0.731	0.262	0.524
ORF3a	all	ss12	78	CAC	TCA	CTT	2	GTTCACTTT:GTTCATTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.24999999999999	3	33.58333333333333	0.0676896531853506	0.0951140793534504	0.71166806897022294	-0.0274244261680998	0.0346936748116503	0.0614849755425097	NA	NA	0.0574914189878894	0.633349496545984	278	4	718	0.718	0.278	0.556
ORF3a	all	ss12	79	TTT	CTT	TGC	2	CACTTTGTT:CATTTTGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.58333333333331	3	32.58333333333333	0.0664886936625222	0.0982328346145694	0.676847959477094	-0.0317441409520472	0.0356682100047991	0.0617688701478692	NA	NA	0.0582307814144564	0.585654720910958	291	5	704	0.704	0.291	0.582
ORF3a	all	ss12	80	GCT	TGC	TTG	2	TTTGCTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.41666666666664	3	32.916666666666664	0.0675371643768684	0.097170738715697	0.695036029050569	-0.0296335743388286	0.0353439737766938	0.0594766934226338	NA	NA	0.0573473290643816	0.605338697737167	289	1	710	0.71	0.289	0.578
ORF3a	all	ss12	81	TGC	TTG	CAA	2	GCTTGCAAC:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.74999999999997	2	33.08333333333333	0.0672342400167486	0.0630291953285242	1.0667158237751	0.00420504468822443	0.0349786882958852	0.0469258782181491	NA	NA	0.0403554777468073	0.917010557144633	493	14	493	0.493	0.493	0.986
ORF3a	all	ss12	82	AAC	CAA	CTT	2	TGCAACTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.0833333333333	2	33.75	0.0678428326164385	0.0617314855970427	1.09899886517049	0.00611134701939578	0.0364403102425687	0.0451634651894413	NA	NA	0.0415893314517546	0.883175381140315	549	7	444	0.444	0.549	0.888
ORF3a	all	ss12	83	TTG	CTT	GCT	2	AACTTGCTG:AACTTGCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.0833333333333	2	33.75	0.0678428326164385	0.0617314855970427	1.09899886517049	0.00611134701939578	0.0343712250128598	0.0462492671074172	NA	NA	0.0397301291747186	0.877750501790352	545	27	428	0.428	0.545	0.856
ORF3a	all	ss12	84	CTG	GCT	GTT	2	TTGCTGTTG:TTGCTTCTA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1.16666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.99999999999997	2	33.25	0.0670088252518875	0.0626996766264699	1.06872680781257	0.00430914862541761	0.0382910160055987	0.0460812644167486	NA	NA	0.0414307677666874	0.917162667949086	506	4	490	0.49	0.506	0.98
ORF3a	all	ss12	85	CTA	GTT	ACT	2	CTGTTGTTG:CTTCTACTA	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.58333333333331	2	32.916666666666664	0.0805241909860523	0.0633621979772033	1.27085539259581	0.017161993008849	0.0389034936239136	0.0453385867996566	NA	NA	0.045917028033618	0.708582158603702	649	5	346	0.346	0.649	0.692
ORF3a	all	ss12	86	CTA	ACT	ATT	2	CTACTATTT:TTGTTGTTT	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.08333333333331	2	32.416666666666664	0.0799869383386865	0.0643826713791054	1.24236749773395	0.0156042669595811	0.0380397210969986	0.0475594185852779	NA	NA	0.0441634664236483	0.72384123779711	610	6	384	0.384	0.61	0.768
ORF3a	all	ss12	87	TTT	ATT	TGT	2	CTATTTGTT:TTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.24999999999999	2	31.75	0.0787608262631878	0.0657955896932053	1.19705327713358	0.0129652365699824	0.0381422221854112	0.0508278655854314	NA	NA	0.0432521540458951	0.764360742066795	594	4	402	0.402	0.594	0.804
ORF3a	all	ss12	88	GTA	TGT	AAC	2	TTTGTAACA:TTTGTTACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.74999999999999	2	31.25	0.0782467920383731	0.0668966841033532	1.16966622616876	0.0113501079350198	0.0388097050757616	0.0473404698285795	NA	NA	0.0455939881246939	0.803408202450811	605	2	393	0.393	0.605	0.786
ORF3a	all	ss12	89	ACA	AAC	AGT	2	GTAACAGTT:GTTACAGTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.24999999999999	2	31.75	0.0787608262631878	0.0657955896932053	1.19705327713358	0.0129652365699824	0.0387345778974686	0.0472332529545853	NA	NA	0.0447489370739315	0.772020631650619	599	5	396	0.396	0.599	0.792
ORF3a	all	ss12	90	GTC	AGT	CTA	2	ACAGTCTAC:ACAGTTTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.24999999999999	2	32.08333333333333	0.0787608262631878	0.0650814580158656	1.21018841102158	0.0136793682473222	0.0377142981876252	0.0463358973853785	NA	NA	0.045090942968381	0.761605727634807	628	10	362	0.362	0.628	0.724
ORF3a	all	ss12	91	TAC	CTA	CTC	2	GTCTACTCT:GTTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.58333333333331	2	32.75	0.0794568138723562	0.0636987401522852	1.24738438597683	0.015758073720071	0.0375370414275992	0.0478290415497058	NA	NA	0.0448577828999675	0.725371077865936	658	6	336	0.336	0.658	0.672
ORF3a	all	ss12	92	TCA	CTC	ACA	2	TACTCACAC:TACTCTCAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.91666666666664	2	32.416666666666664	0.0791072878500077	0.0643826713791054	1.22870465228445	0.0147246164709023	0.0379070650081432	0.0489656431295139	NA	NA	0.0432230505712077	0.733355163969633	643	5	352	0.352	0.643	0.704
ORF3a	all	ss12	93	CAC	ACA	CCT	2	TCACACCTT:TCTCACCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.58333333333331	2	31.416666666666664	0.0794568138723562	0.0665255778124882	1.19437991348706	0.0129312360598679	0.0401990136545047	0.0458622167927986	NA	NA	0.0441222025200357	0.769462719531375	610	11	379	0.379	0.61	0.758
ORF3a	all	ss12	94	CTT	CCT	TTT	2	CACCTTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.41666666666664	2	30.916666666666664	0.0796327387923167	0.0676514664202386	1.1771029218739	0.0119812723720781	0.0364074270716918	0.0509406188520034	NA	NA	0.0467350678561533	0.797668404595915	602	3	395	0.395	0.602	0.79
ORF3a	all	ss12	95	TTG	TTT	GCT	2	CTTTTGCTC:CTTTTGCTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.74999999999997	2	30.249999999999996	0.0782467920383731	0.0692133441658409	1.13051598620762	0.00903344787253214	0.038468913727841	0.0476949803436351	NA	NA	0.04600888508958	0.844342977103716	574	5	421	0.421	0.574	0.842
ORF3a	all	ss12	96	CTC	GCT	CGT	2	TTGCTCGTT:TTGCTTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.24999999999997	2	30.416666666666664	0.0787608262631878	0.0688161477015357	1.14451082912667	0.00994467856165204	0.0389356378697195	0.0486953101045124	NA	NA	0.045731338995153	0.827850871859517	615	2	383	0.383	0.615	0.766
ORF3a	all	ss12	97	GTT	CGT	TGC	2	CTCGTTGCT:CTTGTTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.24999999999997	2	30.083333333333332	0.0777394299845027	0.0696151556756318	1.1167026666826	0.00812427430887086	0.0369166279845865	0.0500726274728685	NA	NA	0.0473805493618288	0.863855354139221	577	4	419	0.419	0.577	0.838
ORF3a	all	ss12	98	GCT	TGC	TGC	2	GTTGCTGCT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.99999999999997	2	30.333333333333332	0.0779922851430357	0.0690141740401891	1.13009082884363	0.00897811110284663	0.0379455996460764	0.0489571763623184	NA	NA	0.0466573421252448	0.847408101709481	577	5	418	0.418	0.577	0.836
ORF3a	all	ss12	99	GCT	TGC	TGG	2	GCTGCTGGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.66666666666664	2	30.166666666666664	0.0773216317702307	0.0694136680239339	1.11392516735422	0.00790796374629683	0.0378789393303517	0.0497425913454756	NA	NA	0.0475234323983623	0.867841104357598	564	4	432	0.432	0.564	0.864
ORF3a	all	ss12	100	GGC	TGG	CCT	2	GCTGGCCTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.16666666666664	2	30.666666666666664	0.0768261689073374	0.068228833654295	1.12600736070917	0.00859733525304246	0.037512806965655	0.0501676068909867	NA	NA	0.0452629642917937	0.8493546271988	561	8	431	0.431	0.561	0.862
ORF3a	all	ss12	101	CTT	CCT	TGA	2	GGCCTTGAA	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.83333333333331	2	31.666666666666664	0.0771557683120387	0.0659765797094679	1.16944177239559	0.0111791886025708	0.0363992750883802	0.049518256536271	NA	NA	0.0455045301415333	0.805936154327812	597	2	401	0.401	0.597	0.802
ORF3a	all	ss12	102	GAA	TGA	AGC	2	CTTGAAGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.83333333333331	2	31.666666666666664	0.0771557683120387	0.0659765797094679	1.16944177239559	0.0111791886025708	0.0373786428516525	0.0481663912736869	NA	NA	0.0447457572069138	0.802712664245743	626	6	368	0.368	0.626	0.736
ORF3a	all	ss12	103	GCC	AGC	CCA	2	GAAGCCCAA:GAAGCCCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.83333333333331	2	31.666666666666664	0.0771557683120387	0.0659765797094679	1.16944177239559	0.0111791886025708	0.0382586214908989	0.0480140447765098	NA	NA	0.046086004108991	0.808336731892893	609	6	385	0.385	0.609	0.77
ORF3a	all	ss12	104	CAA	CCA	ATT	2	GCCCAATTT:GCCCCTTTT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.33333333333331	2	31.666666666666664	0.0766624238758939	0.0659765797094679	1.16196420325943	0.010685844166426	0.0368584711858074	0.0464983485965659	NA	NA	0.0443849331244243	0.809745888868558	594	10	396	0.396	0.594	0.792
ORF3a	all	ss12	105	TTT	ATT	TCT	2	CAATTTCTC:CCTTTTCTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.33333333333331	1	31.333333333333332	0.0633287393599309	0.0326138339548042	1.94177536586747	0.0307149054051267	0.0354576002840881	0.0336669021119075	NA	NA	0.0385367753340423	0.425434522198996	776	16	208	0.208	0.776	0.416
ORF3a	all	ss12	106	CTC	TCT	CTA	2	TTTCTCTAT	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.83333333333331	1	31.833333333333332	0.0637325912188816	0.0320904564039067	1.98602944179762	0.0316421348149749	0.0347590803663367	0.0335141273679991	NA	NA	0.0388726765467047	0.415648250541903	797	16	187	0.187	0.797	0.374
ORF3a	all	ss12	107	TAT	CTA	TCT	2	CTCTATCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.83333333333331	1	31.833333333333332	0.0637325912188816	0.0320904564039067	1.98602944179762	0.0316421348149749	0.0338715304895578	0.0333954491069485	NA	NA	0.0387613919578875	0.414310716670029	791	16	193	0.193	0.791	0.386
ORF3a	all	ss12	108	CTT	TCT	TTA	2	TATCTTTAC:TATCTTTAT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.99999999999999	1	31.166666666666664	0.062798169682851	0.0327921082603737	1.91503910587954	0.0300060614224773	0.0323362036093437	0.0337636934492868	NA	NA	0.0391865175239527	0.44384047556227	771	21	208	0.208	0.771	0.416
ORF3a	all	ss12	109	TAC	TTA	CGC	2	CTTTACGCT:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.33333333333331	1	31.166666666666664	0.0625362067042884	0.0327921082603737	1.90705050763259	0.0297440984439147	0.0332169757406271	0.0338321073469271	NA	NA	0.0378982517447067	0.432546849850497	799	13	188	0.188	0.799	0.376
ORF3a	all	ss12	110	GCT	CGC	TTT	2	TACGCTTTA:TATGCTTTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.66666666666664	1	31.833333333333332	0.0630623379079061	0.0320904564039067	1.9651430666542	0.0309718815039993	0.0345499755821746	0.0331428237545504	NA	NA	0.0377141049771321	0.411516372614733	804	15	181	0.181	0.804	0.362
ORF3a	all	ss12	111	TTA	TTT	AGT	2	GCTTTAGTC:GCTTTAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.91666666666664	1	31.583333333333332	0.0628640039123036	0.0323500281131817	1.94324418180918	0.0305139757991219	0.0346493524648953	0.0323900706002583	NA	NA	0.0380359286594312	0.422413649727454	800	13	187	0.187	0.8	0.374
ORF3a	all	ss12	112	GTC	AGT	CTA	2	TTAGTCTAC:TTAGTTTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.24999999999999	1	30.916666666666664	0.062601492219649807	0.0330632048490145	1.8933885116559	0.0295382873706353	0.0346182498599019	0.0333652808513631	NA	NA	0.0377794910588729	0.434296629436349	775	17	208	0.208	0.775	0.416
ORF3a	all	ss12	113	TAC	CTA	CTT	2	GTCTACTTC:GTTTATTTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.24999999999999	1	30.583333333333332	0.0633956919887587	0.0334317184415283	1.89627380655401	0.0299639735472304	0.0344596921234762	0.0344471811824346	NA	NA	0.0392813040854394	0.445579723304853	776	9	215	0.215	0.776	0.43
ORF3a	all	ss12	114	TTC	CTT	CTT	2	TACTTCTTG:TATTTTCTG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.66666666666666	1	30.333333333333332	0.0763370207324568	0.0337135408966997	2.26428368845497	0.0426234798357571	0.0360599977848519	0.0355482304759702	NA	NA	0.041093636585229	0.299629505765948	856	3	141	0.141	0.856	0.282
ORF3a	all	ss12	115	CTG	CTT	GCA	2	TTCTTGCAG:TTTCTGCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.33333333333333	1	29.999999999999996	0.0766624238758939	0.034096780557568	2.24837719638836	0.0425656433183258	0.0342612158955453	0.0345372232216712	NA	NA	0.0419125400826224	0.309828229542281	851	4	145	0.145	0.851	0.29
ORF3a	all	ss12	116	CAA	GCA	AAG	2	CTGCAAAGT:TTGCAGAGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	83	1	29.333333333333332	0.0760143706952156	0.0348900117261696	2.178685730799	0.041124358969046	0.0369181581985925	0.0352849638484329	NA	NA	0.0428234425160989	0.336892417280962	837	4	159	0.159	0.837	0.318
ORF3a	all	ss12	117	AGT	AAG	TAT	2	CAAAGTGTT:CAGAGTATA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.5	1	29.333333333333332	0.0764993759663411	0.0348900117261696	2.19258670838915	0.0416093642401715	0.0372366234915879	0.0361115336529109	NA	NA	0.0417172357575921	0.318563490970717	854	3	143	0.143	0.854	0.286
ORF3a	all	ss12	118	ATA	TAT	AAA	2	AGTATAAAC:AGTGTTAAT	1:1	FALSE	1.75	0.5	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.16666666666666	1	29.333333333333332	0.0768261689073374	0.0348900117261696	2.20195308360167	0.0419361571811678	0.0367853521839391	0.0364545847515698	NA	NA	0.0427344497760113	0.326435113856881	850	8	142	0.142	0.85	0.284
ORF3a	all	ss12	119	AAC	AAA	CTT	2	ATAAACTTT:GTTAATGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.91666666666666	1	29.083333333333332	0.0636649250476359	0.0351970741664875	1.80881299242349	0.0284678508811484	0.0335087597703305	0.0386789934508575	NA	NA	0.0385603217881545	0.460351620104459	772	20	208	0.208	0.772	0.416
ORF3a	all	ss12	120	GCT	CTT	TGT	2	AACTTTGTA:AATGCTTGC	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.5	0.75	0.166666666666667	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.58333333333333	1	29.083333333333332	0.0639364560441675	0.0351970741664875	1.8165275824274	0.02873938187768	0.033814689396014	0.0343856048335053	NA	NA	0.0389659110026218	0.460786790941632	762	13	225	0.225	0.762	0.45
ORF3a	all	ss12	121	GTA	TGT	AAG	2	GCTTGCAGA:TTTGTAAGA	1:1	TRUE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	81	0	29.333333333333332	0.0510835693943594	0	-Inf	0.0510835693943594	0.0306130510259883	0	NA	NA	0.0301608960392634	0.0903219277011691	962	38	0	0	0.962	0.001
ORF3a	all	ss12	122	AGA	AAG	AAT	2	GTAAGAATA:TGCAGAATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.91666666666667	0	29.916666666666664	0.0254531319881873	0	-Inf	0.0254531319881873	0.0176938078923742	0	NA	NA	0.0179639075671585	0.156511005010828	864	136	0	0	0.864	0.001
ORF3a	all	ss12	123	ATA	AAT	AAT	2	AGAATAATA:AGAATTATT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.75000000000001	0	29.916666666666664	0.0255072404553968	0	-Inf	0.0255072404553968	0.0178890260702027	0	NA	NA	0.018037640647524	0.157329079496099	887	113	0	0	0.887	0.001
ORF3a	all	ss12	124	ATA	AAT	AAT	2	ATAATAATG:ATTATTATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	0	29.583333333333332	0.0259485340559256	0	-Inf	0.0259485340559256	0.019468871309476	0	NA	NA	0.0192577018334771	0.177839629953305	842	158	0	0	0.842	0.001
ORF3a	all	ss12	125	ATG	AAT	GAG	2	ATAATGAGG:ATTATGAGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.75000000000001	0	28.916666666666664	0.0258367851740807	0	-Inf	0.0258367851740807	0.0185868744476423	0	NA	NA	0.01846865412025	0.161826978787077	861	139	0	0	0.861	0.001
ORF3a	all	ss12	126	AGG	GAG	GCT	2	ATGAGGCTT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	0	28.58333333333333	0.026061253903872	0	-Inf	0.026061253903872	0.0189235066682437	0	NA	NA	0.0189047220755304	0.168031105426968	881	119	0	0	0.881	0.001
ORF3a	all	ss12	127	CTT	GCT	TTG	2	AGGCTTTGG	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666669	0	28.916666666666664	0.0262896575662818	0	-Inf	0.0262896575662818	0.0196724756998995	0	NA	NA	0.0188587908870785	0.163309549414663	865	135	0	0	0.865	0.001
ORF3a	all	ss12	128	TGG	TTG	GCT	2	CTTTGGCTG:CTTTGGCTT	1:1	FALSE	3	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.75000000000001	0	28.249999999999996	0.0258367851740807	0	-Inf	0.0258367851740807	0.0179036571959688	0	NA	NA	0.0181535079318748	0.154666808461082	873	127	0	0	0.873	0.001
ORF3a	all	ss12	129	CTG	GCT	GTG	2	TGGCTGTGC:TGGCTTTGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.75000000000001	0	29.249999999999996	0.0265221005560517	0	-Inf	0.0265221005560517	0.019067774592758	0	NA	NA	0.0187272716284537	0.156708539872027	880	120	0	0	0.88	0.001
ORF3a	all	ss12	130	TGC	GTG	CTG	2	CTGTGCTGG:CTTTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25000000000001	0	29.249999999999996	0.0263473854682498	0	-Inf	0.0263473854682498	0.0194484172106882	0	NA	NA	0.018695910703152	0.158758517703751	872	128	0	0	0.872	0.001
ORF3a	all	ss12	131	TGG	CTG	GAA	2	TGCTGGAAA:TGCTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000001	0	29.249999999999996	0.0401433603117785	0	-Inf	0.0401433603117785	0.0235863401052267	0	NA	NA	0.0239664268675695	0.0939375447509364	953	47	0	0	0.953	0.001
ORF3a	all	ss12	132	AAA	GAA	ATG	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333334	0	28.58333333333333	0.0537744248135208	0	-Inf	0.0537744248135208	0.0263430754215637	0	NA	NA	0.0266754964949224	0.0438132118549768	985	15	0	0	0.985	0.001
ORF3a	all	ss12	133	TGC	ATG	CAG	2	AAATGCCGT:AAGTGCAGA	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.75000000000001	0	29.249999999999996	0.0547563501152288	0	-Inf	0.0547563501152288	0.0265547572619406	0	NA	NA	0.0273619225921343	0.0453721377363665	987	13	0	0	0.987	0.001
ORF3a	all	ss12	134	AGA	CAG	ATC	2	TGCAGATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.916666666666667	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.16666666666667	0	28.749999999999996	0.0559700169039056	0	-Inf	0.0559700169039056	0.0274967342323938	0	NA	NA	0.028311985509793	0.0480527241912415	988	12	0	0	0.988	0.001
ORF3a	all	ss12	135	TCC	ATC	CAA	2	AGATCCAAA:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.75	0	29.08333333333333	0.0418226808888407	0	-Inf	0.0418226808888407	0.024541167230008	0	NA	NA	0.0242502947141074	0.084594953345923	959	41	0	0	0.959	0.001
ORF3a	all	ss12	136	AAA	CAA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAAAAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666667	0	29.58333333333333	0.04172570688178	0	-Inf	0.04172570688178	0.0247594922069399	0	NA	NA	0.0237948765535759	0.0795061956171934	954	46	0	0	0.954	0.001
ORF3a	all	ss12	137	AAC	AAA	CCC	2	AAAAACCCA:AAAAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.75	0	29.58333333333333	0.0418226808888407	0	-Inf	0.0418226808888407	0.0229562686436643	0	NA	NA	0.0236510503817423	0.0770070302944746	965	35	0	0	0.965	0.001
ORF3a	all	ss12	138	CCA	CCC	ATT	2	AACCCATTA:AATCCATTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.41666666666667	0	29.249999999999996	0.0420179878270026	0	-Inf	0.0420179878270026	0.0234691470244885	0	NA	NA	0.0246529315540797	0.0883099335199743	957	43	0	0	0.957	0.001
ORF3a	all	ss12	139	TTA	ATT	ACT	2	CCATTACTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.41666666666667	0	28.249999999999996	0.0414374651394939	0	-Inf	0.0414374651394939	0.0237960236502438	0	NA	NA	0.0233041591239841	0.0753850381276842	958	42	0	0	0.958	0.001
ORF3a	all	ss12	140	CTT	ACT	TTA	2	TTACTTTAT	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000001	0	27.58333333333333	0.0412475068105866	0	-Inf	0.0412475068105866	0.0239287080944781	0	NA	NA	0.0238378497236037	0.0835701317764389	955	45	0	0	0.955	0.001
ORF3a	all	ss12	141	TAT	TTA	TGA	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000001	0	27.58333333333333	0.0412475068105866	0	-Inf	0.0412475068105866	0.0238273710051953	0	NA	NA	0.0237864437169802	0.0829045572125899	955	45	0	0	0.955	0.001
ORF3a	all	ss12	142	GAT	TGA	TGC	2	TATGATGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.58333333333334	0	28.249999999999996	0.0413422677171007	0	-Inf	0.0413422677171007	0.0225461995465181	0	NA	NA	0.0235611372296601	0.0793139757640998	957	43	0	0	0.957	0.001
ORF3a	all	ss12	143	GCC	TGC	CAA	2	GATGCCAAC:GATGCCAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000001	0	28.58333333333333	0.0404138163712346	0	-Inf	0.0404138163712346	0.0232398445248597	0	NA	NA	0.0227295750271908	0.0753992885046885	957	43	0	0	0.957	0.001
ORF3a	all	ss12	144	AAC	CAA	CTA	2	GCCAACTAT:GCCAATTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000001	0	28.58333333333333	0.0398765009105086	0	-Inf	0.0398765009105086	0.0226544262161053	0	NA	NA	0.0229969333141925	0.0829194831952335	960	40	0	0	0.96	0.001
ORF3a	all	ss12	145	TAC	CTA	CTT	2	AACTATTTT:AATTACTTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333334	0	29.249999999999996	0.0402331091273882	0	-Inf	0.0402331091273882	0.0230762241837877	0	NA	NA	0.022386220664247	0.072299668353567	945	55	0	0	0.945	0.001
ORF3a	all	ss12	146	TTT	CTT	TCT	2	TACTTTCTT:TATTTTCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333334	0	29.249999999999996	0.0402331091273882	0	-Inf	0.0402331091273882	0.0234040920900211	0	NA	NA	0.0222448599283945	0.07050579221193	945	55	0	0	0.945	0.001
ORF3a	all	ss12	147	CTT	TCT	TTG	2	TTTCTTTGC	2	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333334	0	28.58333333333333	0.0402331091273882	0	-Inf	0.0402331091273882	0.0231253365034933	0	NA	NA	0.0213831830203295	0.0598998025027781	968	32	0	0	0.968	0.001
ORF3a	all	ss12	148	TGC	TTG	CTG	2	CTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666667	0	27.999999999999996	0.039920730758297	0	-Inf	0.039920730758297	0.0227979965170456	0	NA	NA	0.0229786835173059	0.0823352766005448	954	46	0	0	0.954	0.001
ORF3a	all	ss12	149	TGG	CTG	GCA	2	TGCTGGCAT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.66666666666667	0	28.499999999999996	0.0401881846005798	0	-Inf	0.0401881846005798	0.023419506787858	0	NA	NA	0.0226854041377756	0.0764703337801466	950	50	0	0	0.95	0.001
ORF3a	all	ss12	150	CAT	GCA	TAC	2	TGGCATACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	0	27.83333333333333	0.0400094855289696	0	-Inf	0.0400094855289696	0.0225533550036812	0	NA	NA	0.0232371864774015	0.0851081108886051	963	37	0	0	0.963	0.001
ORF3a	all	ss12	151	ACT	TAC	TAA	2	CATACTAAT	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	0	27.83333333333333	0.0400986359257937	0	-Inf	0.0400986359257937	0.0234491193121763	0	NA	NA	0.0231793537837494	0.0836429642142434	954	46	0	0	0.954	0.001
ORF3a	all	ss12	152	AAT	TAA	TTG	2	ACTAATTGC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.33333333333334	0	27.33333333333333	0.0398323689854613	0	-Inf	0.0398323689854613	0.0240815261465289	0	NA	NA	0.0232916395771479	0.0872367771438799	947	53	0	0	0.947	0.001
ORF3a	all	ss12	153	TGC	TTG	CTA	2	AATTGCTAT:AATTGTTAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666667	1	28.08333333333333	0.0531784143271382	0.0364813554167594	1.45768746033784	0.0166970589103788	0.0272284541261396	0.037932344604085	NA	NA	0.0349770901778222	0.633097749325696	690	23	287	0.287	0.69	0.574
ORF3a	all	ss12	154	TAC	CTA	CGA	2	TGCTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333333	1	28.749999999999996	0.0537744248135208	0.0356149996994909	1.50988137771315	0.0181594251140298	0.0284568458414016	0.0383101949416845	NA	NA	0.0329746138775652	0.581832997712009	732	12	256	0.256	0.732	0.512
ORF3a	all	ss12	155	GAC	CGA	CTA	2	TACGACTAT:TATGACTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333333	1	29.08333333333333	0.0534152253723939	0.0351970741664875	1.51760413719992	0.0182181512059064	0.0269069020361179	0.0379619615199669	NA	NA	0.0342256745695184	0.594521780452675	722	15	263	0.263	0.722	0.526
ORF3a	all	ss12	156	TAT	CTA	TTG	2	GACTATTGT	2	FALSE	1	0	1	1	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.08333333333333	1	28.249999999999996	0.0669340227304818	0.0362608381183453	1.84590390635836	0.0306731846121365	0.0283529301966828	0.0376773793588743	NA	NA	0.0368177658039941	0.404783678489055	802	9	189	0.189	0.802	0.378
ORF3a	all	ss12	157	TGT	TTG	TAT	2	TATTGTATA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.75	1	27.58333333333333	0.0663415654213976	0.0371593024135724	1.78532860178684	0.0291822630078252	0.0289613295860682	0.0393123941029319	NA	NA	0.036555138444513	0.424691720404634	796	7	197	0.197	0.796	0.394
ORF3a	all	ss12	158	ATA	TAT	ACC	2	TGTATACCA:TGTATACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.25	1	28.249999999999996	0.0667849179180056	0.0362608381183453	1.8417918995705	0.0305240797996603	0.0297832805357594	0.0380301346861995	NA	NA	0.0359061828575731	0.39526587253616	813	2	185	0.185	0.813	0.37
ORF3a	all	ss12	159	CCA	ACC	ATA	2	ATACCATAT:ATACCTTAC	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.25	1	27.916666666666664	0.0667849179180056	0.0367045717801664	1.81952587045555	0.0300803461378392	0.030467720947092	0.0362597281635862	NA	NA	0.0364987575987613	0.409855966448773	800	6	194	0.194	0.8	0.388
ORF3a	all	ss12	160	TAC	ATA	CAA	2	CCATATAAT:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.25	1	27.916666666666664	0.0667849179180056	0.0367045717801664	1.81952587045555	0.0300803461378392	0.0296524350530202	0.0386004716993651	NA	NA	0.0375569375202972	0.423174203558067	809	2	189	0.189	0.809	0.378
ORF3a	all	ss12	161	AAT	CAA	TAG	2	TACAATAGT:TATAATAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.08333333333333	1	27.749999999999996	0.0799869383386865	0.0369305370773724	2.16587530723172	0.0430564012613141	0.0327757402701432	0.0389967951177916	NaN	NaN	0.0376114334133665	0.252304879380185	865	1	134	0.134	0.865	0.268
ORF3a	all	ss12	162	AGC	TAG	CAT	2	AATAGCATA:AATAGTGTA	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.16666666666666	1	27.916666666666664	0.0940829130843776	0.0367045717801664	2.56324780596449	0.0573783413042112	0.0338712766005143	0.0394293723758173	NA	NA	0.040157165014376	0.153048954083183	937	1	62	0.062	0.937	0.124
ORF3a	all	ss12	163	ATA	CAT	AAC	2	AGCATAACT:AGTGTAACT	1:1	FALSE	1.75	0.833333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.83333333333333	1	28.583333333333332	0.0932463137734779	0.0358277072015149	2.60263134475809	0.057418606571963	0.0346237474788467	0.0375999741926566	NA	NA	0.0406236759794313	0.157530167311866	911	0	89	0.089	0.911	0.178
ORF3a	all	ss12	164	ACT	AAC	TTC	2	ATAACTTCT:GTAACTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.75	1	29.166666666666664	0.0792816652689176	0.0350941211300692	2.25911527959558	0.0441875441388484	0.0332272546318959	0.0378720282982435	NA	NA	0.0367788995993877	0.229581590190736	884	1	115	0.115	0.884	0.23
ORF3a	all	ss12	165	TCT	TTC	TTC	2	ACTTCTTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.74999999999999	1	29.833333333333332	0.0803443058867966	0.0342916870035713	2.34296743343158	0.0460526188832252	0.0313425715932344	0.0354203061264365	NA	NA	0.0353141969084362	0.192205525483282	901	1	98	0.098	0.901	0.196
ORF3a	all	ss12	166	TCA	TTC	AAT	2	TCTTCAATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.08333333333331	1	30.499999999999996	0.0810687166991056	0.0335251341884302	2.4181474186935	0.0475435825106754	0.0318529084633837	0.0340153617506354	NaN	NaN	0.035586867443405	0.181553612138348	898	1	101	0.101	0.898	0.202
ORF3a	all	ss12	167	ATT	AAT	TGT	2	TCAATTGTC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.08333333333331	1	30.499999999999996	0.0810687166991056	0.0335251341884302	2.4181474186935	0.0475435825106754	0.0320081551103753	0.0361128113592974	NA	NA	0.0364366451901349	0.191951164119738	915	1	84	0.084	0.915	0.168
ORF3a	all	ss12	168	GTC	TGT	CAT	2	ATTGTCATT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.41666666666666	1	30.833333333333332	0.0818063224852469	0.0331545693783718	2.46742225940696	0.0486517531068751	0.0331619488571053	0.0353650235961165	NA	NA	0.0378143634027073	0.198235651287817	901	2	97	0.097	0.901	0.194
ORF3a	all	ss12	169	ATT	CAT	TAC	2	GTCATTACA:GTCATTACT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.58333333333331	1	31.333333333333332	0.0816206643196587	0.0326138339548042	2.50263935337279	0.0490068303648545	0.0318932508321578	0.0329079525063076	NA	NA	0.0368506127901054	0.183558371534403	914	1	85	0.085	0.914	0.17
ORF3a	all	ss12	170	ACA	TAC	ATC	2	ATTACATCA:ATTACTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.16666666666666	1	31.75	0.0966854014827293	0.0321765161581571	3.00484368809513	0.0645088853245722	0.0359729446181649	0.0322595802498781	NA	NA	0.0384106695688943	0.093063938040439	956	0	44	0.044	0.956	0.088
ORF3a	all	ss12	171	TCA	ATC	AGG	2	ACATCAGGT:ACTTCAGGT	1:1	FALSE	1	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.49999999999999	1	31.083333333333332	0.0949346803392896	0.0328819783981324	2.8871340766005	0.0620527019411572	0.0346322951513059	0.0342448758628971	NA	NA	0.0394236990122055	0.115488624057756	949	2	49	0.049	0.949	0.098
ORF3a	all	ss12	172	GGT	AGG	TGA	2	TCAGGTGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.49999999999999	1	31.083333333333332	0.0949346803392896	0.0328819783981324	2.8871340766005	0.0620527019411572	0.0366909519997714	0.034784005332183	NaN	NaN	0.0381034406719857	0.103411965668806	944	1	55	0.055	0.944	0.11
ORF3a	all	ss12	173	GAT	TGA	TGG	2	GGTGATGGC	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.16666666666664	1	31.083333333333332	0.0940829130843776	0.0328819783981324	2.86123030509993	0.0612009346862452	0.0350404169915295	0.0351984699886001	NaN	NaN	0.03935280888098	0.119901794201839	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss12	174	GGC	TGG	CAC	2	GATGGCACA:GATGGCACT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.8333333333333	1	31.75	0.093246313773478	0.0321765161581571	2.89796177172024	0.0610697976153209	0.0339772025783903	0.0337535725160317	NaN	NaN	0.038919442810382	0.116616858717928	943	0	57	0.057	0.943	0.114
ORF3a	all	ss12	175	ACA	CAC	AAC	2	GGCACAACA:GGCACTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.8333333333333	1	31.75	0.093246313773478	0.0321765161581571	2.89796177172024	0.0610697976153209	0.0354586742373432	0.0337712820678422	NaN	NaN	0.0373947339687565	0.102445393559579	955	0	45	0.045	0.955	0.09
ORF3a	all	ss12	176	ACA	AAC	AAG	2	ACAACAAGT:ACTACAAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.66666666666663	1	31.916666666666664	0.0934540638415832	0.0320048558445568	2.91999639977998	0.0614492079970264	0.0353399240164329	0.0343064965878553	NaN	NaN	0.0375217250924229	0.101484964704179	958	0	42	0.042	0.958	0.084
ORF3a	all	ss12	177	AGT	AAG	TCC	2	ACAAGTCCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.99999999999997	1	31.25	0.0942944168777401	0.0327027281115989	2.8833807551455	0.0615916887661412	0.0344699532146205	0.033557384422714	NaN	NaN	0.0395924606252059	0.119793280830796	943	1	56	0.056	0.943	0.112
ORF3a	all	ss12	178	CCT	TCC	TAT	2	AGTCCTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.33333333333331	1	31.916666666666664	0.0951500406590925	0.0320048558445568	2.97298763416474	0.0631451848145357	0.0337831410489444	0.0337552546688053	NA	NA	0.0387716174794297	0.103388280322216	941	0	59	0.059	0.941	0.118
ORF3a	all	ss12	179	ATT	TAT	TAC	2	CCTATTACA:CCTATTTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.58333333333331	2	31.666666666666664	0.109408627044446	0.0659765797094679	1.6582949211104001	0.0434320473349782	0.0391048293267739	0.047826352780709	NaN	NaN	0.0447418004529187	0.331684536727103	839	1	160	0.16	0.839	0.32
ORF3a	all	ss12	180	ACA	TAC	AGA	2	ATTACAGAC:ATTTCTGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	0.666666666666667	0.5	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.24999999999999	2	31.666666666666664	0.109910568819638	0.0659765797094679	1.6659027991999	0.0439339891101697	0.0391343581449973	0.0468174135503285	NaN	NaN	0.0443398381398127	0.321760366838009	832	0	168	0.168	0.832	0.336
ORF3a	all	ss12	181	GAA	AGA	ACA	2	ACAGACCAT:TCTGAACAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.58333333333331	2	32	0.094827365833507	0.0652585327422224	1.45310294070025	0.0295688330912847	0.0347523314039193	0.0476761403917254	NA	NA	0.040620983076362	0.466662452597315	762	0	238	0.238	0.762	0.476
ORF3a	all	ss12	182	CAT	ACA	TGA	2	GAACATGAC:GACCATGAC	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666666	2	32.666666666666664	0.0812518671161106	0.0638683562552301	1.27217720762082	0.0173835108608805	0.0327324572267746	0.0467509756048926	NA	NA	0.0415456613599273	0.675640502074006	668	3	329	0.329	0.668	0.658
ORF3a	all	ss12	183	GAC	TGA	CTA	2	CATGACTAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.91666666666666	2	32	0.0801652234595281	0.0652585327422224	1.22842515899321	0.0149066907173058	0.0329978628288847	0.0488791928867372	NA	NA	0.0417236591282554	0.720888268791385	653	5	342	0.342	0.653	0.684
ORF3a	all	ss12	184	TAC	CTA	CCA	2	GACTACCAA:GACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.58333333333333	2	32.666666666666664	0.0794568138723562	0.0638683562552301	1.24407168950508	0.0155884576171261	0.0322862824085584	0.0493392392594044	NaN	NaN	0.0373165428448789	0.676140260424249	694	4	302	0.302	0.694	0.604
ORF3a	all	ss12	185	CAA	CCA	AAT	2	TACCAAATT:TACCAGATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.25	3	32	0.0787608262631878	0.100148544468392	0.786440049441214	-0.0213877182052042	0.03169750675911	0.0620859401682979	NaN	NaN	0.0544903523264517	0.69468535541106	337	0	663	0.663	0.337	0.674
ORF3a	all	ss12	186	ATT	AAT	TGG	2	CAAATTGGT:CAGATTGGT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.24999999999999	3	31	0.0798094452064726	0.103612753860613	0.770266615187526	-0.0238033086541403	0.0326791105597451	0.0652504910867877	NA	NA	0.0613444070274259	0.697995782309387	329	0	671	0.671	0.329	0.658
ORF3a	all	ss12	187	GGT	TGG	TGG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.24999999999999	3	31	0.0798094452064726	0.103612753860613	0.770266615187526	-0.0238033086541403	0.0319666236741878	0.0676097838623246	NA	NA	0.0581777494914089	0.682431067666432	360	0	640	0.64	0.36	0.72
ORF3a	all	ss12	188	GGT	TGG	TTA	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.74999999999999	3	31.5	0.0803443058867966	0.101851155869296	0.788840393622051	-0.0215068499824998	0.0326256068170312	0.0644593626387516	NaN	NaN	0.0570848597777711	0.706357721126127	387	0	613	0.613	0.387	0.774
ORF3a	all	ss12	189	TAT	TTA	TAC	2	GGTTATACG:GGTTATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.74999999999999	3	32.5	0.0814358477684014	0.0985020015458152	0.826743076185351	-0.0170661537774138	0.0319183668434312	0.0640148246402909	NA	NA	0.0559326086396394	0.760274810598956	381	0	619	0.619	0.381	0.762
ORF3a	all	ss12	190	ACG	TAC	GGA	2	TATACGGAA:TATACTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.74999999999999	3	32.166666666666664	0.0825574874404694	0.0995936054863591	0.828943655943624	-0.0170361180458896	0.0318075660195147	0.062857546015339	NA	NA	0.0570701333734186	0.765312440210985	412	0	588	0.588	0.412	0.824
ORF3a	all	ss12	191	GAA	GGA	AAA	2	ACGGAAAAG:ACTGAAAAA	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.74999999999999	3	32.166666666666664	0.0825574874404694	0.0995936054863591	0.828943655943624	-0.0170361180458896	0.0329484773962765	0.0629924988607168	NaN	NaN	0.0559634294455208	0.760811596132191	405	2	593	0.593	0.405	0.81
ORF3a	all	ss12	192	AAA	AAA	ATG	2	GAAAAATGG:GAAAAGTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.91666666666666	3	32	0.0823684046093706	0.100148544468392	0.822462323807083	-0.0177801398590213	0.0336484836104097	0.0637512869913086	NA	NA	0.0570568965772099	0.755328403665568	374	0	626	0.626	0.374	0.748
ORF3a	all	ss12	193	TGG	ATG	GGA	2	AAATGGGAA:AAGTGGGAA	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.91666666666666	3	32	0.0970208852905795	0.100148544468392	0.96876979895799	-0.00312765917781252	0.0363031003065284	0.0637637870355475	NaN	NaN	0.0563440176135809	0.955732124362129	509	0	491	0.491	0.509	0.982
ORF3a	all	ss12	194	GAA	GGA	ATC	2	TGGGAATCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.08333333333333	3	32.5	0.0981562001449569	0.0985020015458152	0.99648939721598	-3.45801400858298e-4	0.0357198084323553	0.06172799215659	NaN	NaN	0.0596144914598581	0.995371795601493	500	0	500	0.5	0.5	1
ORF3a	all	ss12	195	TCT	ATC	TGG	2	GAATCTGGA:GAATCTGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.91666666666666	3	32	0.0983864636202627	0.100148544468392	0.98240532743154	-0.00176208084812926	0.0358807898611788	0.065323596644561	NaN	NaN	0.0593475535606994	0.976313588687083	500	0	500	0.5	0.5	1
ORF3a	all	ss12	196	GGA	TGG	AGT	2	TCTGGAGTA:TCTGGTGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.25	3	32.33333333333333	0.0979270134965697	0.0990447915097998	0.988714419040203	-0.00111777801323007	0.0366125315073976	0.0621516416579197	NA	NA	0.0561504145796091	0.984117678832984	511	1	488	0.488	0.511	0.976
ORF3a	all	ss12	197	GTA	AGT	AAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.25	3	32.666666666666664	0.0979270134965697	0.0979651368127982	0.999610848129562	-3.81233162284611e-5	0.0354939314820473	0.0644876593125183	NaN	NaN	0.0555993154641945	0.999452906878659	504	0	496	0.496	0.504	0.992
ORF3a	all	ss12	198	AAA	AAA	AGA	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.33333333333334	3	33.25	0.0978128216213729	0.0961313950679982	1.01749092013265	0.00168142655337465	0.0363535950076305	0.0619067959632803	NaN	NaN	0.0560525020120653	0.976069166157345	544	2	454	0.454	0.544	0.908
ORF3a	all	ss12	199	GAC	AGA	CTG	2	AAAGACTGT	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.33333333333334	3	32.75	0.0978128216213729	0.0976988961284261	1.00116608782147	1.13925492946768e-4	0.0366365760536514	0.0617565722573378	NaN	NaN	0.0582758718356425	0.998440189204529	511	2	487	0.487	0.511	0.974
ORF3a	all	ss12	200	TGT	CTG	TGT	2	GACTGTGTT	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.16666666666667	3	32.75	0.0980414726907267	0.0976988961284261	1.00350645274283	3.42576562300551e-4	0.0343058983642169	0.0636727348510322	NaN	NaN	0.0593632488165455	0.995395551317245	509	2	489	0.489	0.509	0.978
ORF3a	all	ss12	201	GTT	TGT	TAC	2	TGTGTTACA:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.00000000000001	3	33.08333333333333	0.098271196804803	0.0966482688635724	1.01679210564569	0.00162292794123058	0.0365168378650222	0.0598733319381478	NaN	NaN	0.0566665170792662	0.977151725364954	536	0	464	0.464	0.536	0.928
ORF3a	all	ss12	202	ACA	TAC	ATT	2	GTTACATTA:GTTGTATTA	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.50000000000001	3	33.58333333333333	0.0989668835968827	0.0951140793534504	1.04050719167575	0.00385280424343229	0.0364107148713462	0.0597191925143518	NA	NA	0.0529069549964713	0.94194755389339	569	0	431	0.431	0.569	0.862
ORF3a	all	ss12	203	TTA	ATT	ACA	2	ACATTACAT:GTATTACAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.25000000000001	2	33.83333333333333	0.0842991638602775	0.0615730216404005	1.36909252809782	0.0227261422198769	0.0332678136720706	0.0470395471441264	NA	NA	0.0497529494931631	0.647829327735119	691	3	306	0.306	0.691	0.612
ORF3a	all	ss12	204	CAC	ACA	CAG	2	TTACACAGT:TTACATGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.08333333333334	2	33.66666666666666	0.0844972351423309	0.0618907677660027	1.36526396734645	0.0226064673763282	0.0331264537677883	0.0440461441296344	NaN	NaN	0.050557387347498	0.654770592316639	660	0	340	0.34	0.66	0.68
ORF3a	all	ss12	205	AGT	CAG	TTA	2	CACAGTTAC:CATGGTTAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.58333333333334	2	33.33333333333333	0.0850970793814355	0.0625362067042884	1.36076496906551	0.0225608726771472	0.0339636664975009	0.0505391891209075	NaN	NaN	0.0511760648041902	0.65932294414661	689	1	310	0.31	0.689	0.62
ORF3a	all	ss12	206	TAC	TTA	CTT	2	AGTTACTTC:GGTTACTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.08333333333334	2	33.49999999999999	0.0707237388415596	0.0622118122355632	1.13682171118511	0.0085119266059964609	0.0311351365883882	0.0487026620660179	NaN	NaN	0.0480200991882719	0.859306068825758	594	3	403	0.403	0.594	0.806
ORF3a	all	ss12	207	TTC	CTT	CAC	2	TACTTCACT:TACTTTACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.91666666666667	2	33.66666666666666	0.070890985529723	0.0618907677660027	1.14542100685757	0.00900021776372029	0.0323440597166132	0.0441932935123737	NA	NA	0.0485380700827797	0.852894956054069	591	1	408	0.408	0.591	0.816
ORF3a	all	ss12	208	ACA	CAC	ATC	2	TTCACTTCA:TTTACATCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.58333333333334	2	32.99999999999999	0.0702267037754945	0.063195257713305	1.11126540687734	0.00703144606218953	0.0317157206794043	0.0491427972057159	NA	NA	0.0476612610973797	0.882714029890628	563	2	435	0.435	0.563	0.87
ORF3a	all	ss12	209	TCA	ATC	AGA	2	ACATCAGAA:ACTTCAGAC	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.25000000000001	2	33.33333333333333	0.0705572800165473	0.0625362067042884	1.12826286938362	0.00802107331225896	0.0299262704916156	0.0486409298930404	NA	NA	0.0509828418541889	0.874985662208896	576	3	421	0.421	0.576	0.842
ORF3a	all	ss12	210	GAA	AGA	ATG	2	TCAGAATGC:TCAGACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.91666666666667	3	32.66666666666666	0.0698992129639131	0.0979651368127982	0.713511104439978	-0.028065923848885	0.0305770867889055	0.0636306723598106	NA	NA	0.0676642807459238	0.67830151764724	321	1	678	0.678	0.321	0.642
ORF3a	all	ss12	211	TAT	ATG	CTA	2	GAATGCTAC:GACTATTAC	1:1	TRUE	1.75	0	0.5	0.75	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.25000000000001	3	32.66666666666666	0.0551338852123344	0.0979651368127982	0.562790876489969	-0.0428312516004638	0.0288264873263549	0.0633023458825257	NA	NA	0.0624262199580948	0.492643767394274	249	3	748	0.748	0.249	0.498
ORF3a	all	ss12	212	TAC	CTA	CCA	2	TATTACCAG:TGCTACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.16666666666669	3	33.16666666666666	0.0551973146854054	0.0963891381007338	0.572650775523277	-0.0411918234153284	0.0278066638940476	0.0619786609117826	NaN	NaN	0.0659187695828251	0.532044814389126	230	0	770	0.77	0.23	0.46
ORF3a	all	ss12	213	CAG	CCA	GCT	2	TACCAGCTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	3	33.49999999999999	0.0554524994575896	0.095366381613935	0.581468002865769	-0.0399138821563454	0.0277910998347866	0.0589906506863654	NA	NA	0.0613445149923954	0.51527167289239	223	1	776	0.776	0.223	0.446
ORF3a	all	ss12	214	CTG	GCT	GTA	2	CAGCTGTAC	2	FALSE	0.666666666666667	1.33333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	3	33.16666666666666	0.0554524994575896	0.0963891381007338	0.575298218764417	-0.0409366386431442	0.0276161937911019	0.063661001883211	NA	NA	0.0609575791036002	0.501864196864541	244	1	755	0.755	0.244	0.488
ORF3a	all	ss12	215	TAC	GTA	CTC	2	CTGTACTCA:CTGTACTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	3	32.83333333333333	0.0549444688504894	0.0974341006801572	0.563914158050817	-0.0424896318296678	0.0274996683814465	0.0605462455347339	NA	NA	0.0627060465137002	0.498025197310293	238	2	760	0.76	0.238	0.476
ORF3a	all	ss12	216	TCA	CTC	AAC	2	TACTCAACT:TACTCTACA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000003	3	31.833333333333325	0.0557100557871529	0.100709711722406	0.553174612799119	-0.0449996559352532	0.0277750689254895	0.0641370145578033	NA	NA	0.0659730203348595	0.495180907792998	215	0	785	0.785	0.215	0.43
ORF3a	all	ss12	217	ACA	AAC	ACA	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.16666666666669	3	30.833333333333325	0.0559700169039056	0.104213595070396	0.53707020534219	-0.0482435781664908	0.0286064872639369	0.0691273902945232	NA	NA	0.0650673135679278	0.458426054288905	213	4	783	0.783	0.213	0.426
ORF3a	all	ss12	218	CAA	ACA	ACT	2	ACACAACTT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.83333333333336	3	31.16666666666666	0.0562324166616758	0.103018812035868	0.545846098886262	-0.0467863953741925	0.0288064746893576	0.0688521725545913	NA	NA	0.0662789104268762	0.480249271899936	213	0	787	0.787	0.213	0.426
ORF3a	all	ss12	219	CTT	ACT	GAG	2	CAACTTAGT:CAATTGAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.83333333333336	3	30.499999999999993	0.0562324166616758	0.105436462965892	0.533329884936168	-0.0492040463042163	0.0277617959158418	0.0693713125337182	NA	NA	0.0663646734153671	0.458439276982808	209	2	789	0.789	0.209	0.418
ORF3a	all	ss12	220	AGT	GAG	TAC	2	CTTAGTACA:TTGAGTACA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.9166666666667	3	30.083333333333325	0.0417257068817799	0.107006075844546	0.389937735333808	-0.0652803689627659	0.0244103720061236	0.0686520684849847	NA	NA	0.0673127804455965	0.332142974843589	107	3	890	0.89	0.107	0.214
ORF3a	all	ss12	221	ACA	TAC	AGA	2	AGTACAGAC:AGTACAGAT	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.25000000000004	3	30.083333333333325	0.0421163271222965	0.107006075844546	0.393588184501612	-0.0648897487222493	0.024607186426446	0.068695852805125	NA	NA	0.06954734566599	0.350804562260771	117	5	878	0.878	0.117	0.234
ORF3a	all	ss12	222	GAC	AGA	CAC	2	ACAGACACT:ACAGATACT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.25000000000004	3	30.083333333333325	0.0421163271222965	0.107006075844546	0.393588184501612	-0.0648897487222493	0.0247491570538306	0.0674723592713194	NA	NA	0.0666871876685842	0.330530086329453	105	10	885	0.885	0.105	0.21
ORF3a	all	ss12	223	ACT	CAC	TGG	2	GACACTGGT:GATACTGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.58333333333337	3	29.749999999999993	0.0431256509016318	0.10829587866142	0.398220610374853	-0.0651702277597884	0.0252206804258946	0.0667012596349243	NA	NA	0.073466107042646	0.375036464656033	128	9	863	0.863	0.128	0.256
ORF3a	all	ss12	224	GGT	TGG	TGT	2	ACTGGTGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.25000000000004	3	30.083333333333325	0.0433333505001085	0.107006075844546	0.404961588938758	-0.0636727253444373	0.0253489316899413	0.0717956123091189	NA	NA	0.0670162341924992	0.34205688507493	128	1	871	0.871	0.128	0.256
ORF3a	all	ss12	225	GTT	TGT	TGA	2	GGTGTTGAA	2	FALSE	1.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000004	3	31.083333333333325	0.0439686325106426	0.103314927985559	0.425578697754003	-0.059346295474916	0.0251474912702952	0.0640008995393075	NA	NA	0.0670294357027928	0.375953535889914	145	4	851	0.851	0.145	0.29
ORF3a	all	ss12	226	GAA	TGA	ACA	2	GTTGAACAT	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.58333333333337	3	31.083333333333325	0.0437548116643347	0.103314927985559	0.423509095127577	-0.0595601163212239	0.0246849163472356	0.0654282192624392	NA	NA	0.0658117256545228	0.365461325220632	128	7	865	0.865	0.128	0.256
ORF3a	all	ss12	227	CAT	ACA	TAC	2	GAACATACT:GAACATGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	228	ACT	TAC	TAC	2	CATACTACC:CATGTTACC	1:1	TRUE	1.25	1	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	229	ACC	TAC	CTT	2	ACTACCTTC:GTTACCTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	230	TTC	CTT	CTT	2	ACCTTCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	231	TTC	CTT	CAT	2	TTCTTCATC:TTCTTCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	232	ATC	CAT	CTA	2	TTCATCTAC:TTCATTTAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	233	TAC	CTA	CAA	2	ATCTACAAT:ATTTACAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	234	AAT	CAA	TAA	2	TACAATAAA:TACAGTAGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	235	AAA	TAA	AAT	2	AATAAAATT:AGTAGAATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	236	ATT	AAT	TGT	2	AAAATTGTT:AGAATTGTG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	237	GTG	TGT	GGA	2	ATTGTGGAT:ATTGTTGAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	238	GAT	GGA	TGA	2	GTGGATGAA:GTTGATGAG	1:1	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	239	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCA:GATGAGCCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	240	CCA	ACC	AGA	2	GAACCAGAA:GAGCCTGAA	1:1	FALSE	1	0.5	1	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	241	GAA	AGA	AGA	2	CCAGAAGAC:CCTGAAGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	242	GAA	AGA	ACA	2	GAAGAACAT:GAAGACCAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	243	CAT	ACA	TGT	2	GAACATGTC:GACCATGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	244	GTC	TGT	CCA	2	CATGTCCAA:CATGTTCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	245	CAA	CCA	AAT	2	GTCCAAATT:GTTCAAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	246	ATT	AAT	TCA	2	CAAATTCAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	247	CAC	TCA	CAC	2	ATTCACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	248	ACA	CAC	AAT	2	CACACAATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	249	ATC	AAT	CGA	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	250	GAC	CGA	CGG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	251	GGC	CGG	CTC	2	GACGGCTCA:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	252	TCA	CTC	ATC	2	GGCTCATCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	253	TCA	ATC	AGG	2	TCATCAGGA:TCATCCGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	254	GGA	AGG	AGT	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	255	GTT	AGT	TGT	2	GGAGTTGTA:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	256	GTA	TGT	AAA	2	GTTGTAAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	257	AAT	AAA	TCC	2	GTAAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	258	CCA	TCC	AGC	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	259	GCA	AGC	AAT	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	260	ATG	AAT	GGA	2	GCAATGGAT:GTAATGGAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	261	GAA	GGA	ACC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	262	CCA	ACC	AAT	2	GAACCAATT:GATCCTATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	263	ATC	AAT	CTA	2	CCAATTTAT:CCTATCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	264	TAT	CTA	TGA	2	ATCTATGAT:ATTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	265	GAT	TGA	TGA	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	0	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	266	GAA	TGA	ACC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	267	CCG	ACC	GAC	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	268	ACG	GAC	GAC	2	CCGACGACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	269	ACG	GAC	GAC	2	ACGACGACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	270	ACT	GAC	TAC	2	ACGACTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	271	ACT	TAC	TAG	2	ACTACTAGC	2	FALSE	1	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	272	AGC	TAG	CGT	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	273	GTG	CGT	GCC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	274	CCT	GCC	TTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss12	275	TTG	TTT	GTA	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA