product sequences frame codon ref_codon_maj alt_codon1_maj alt_codon2_maj num_defined_seqs nonamers nonamer_counts multiple_variants NN_sites SN_sites NS_sites SS_sites NN_diffs SN_diffs NS_diffs SS_diffs pair which_gene ratio_name sw_num_replicates sw_N_diffs sw_S_diffs sw_N_sites sw_S_sites sw_dN sw_dS sw_dNdS sw_dN_m_dS sw_boot_dN_SE sw_boot_dS_SE sw_boot_dN_over_dS_SE sw_boot_dN_over_dS_P sw_boot_dN_m_dS_SE sw_boot_dN_m_dS_P sw_boot_dN_gt_dS_count sw_boot_dN_eq_dS_count sw_boot_dN_lt_dS_count sw_ASL_dN_gt_dS_P sw_ASL_dN_lt_dS_P sw_ASL_dNdS_P ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666669 1 31.166666666666647 0 0.0327921082603738 0 -0.0327921082603738 0 0.0358984696653665 NA NA 0.0358909690227038 0.360896033607885 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333334 1 31.49999999999998 0 0.0324374878453625 0 -0.0324374878453625 0 0.0353170977981971 NA NA 0.0348932196946253 0.352567082456026 0 395 605 0.605 0 0.001 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666667 1 31.83333333333331 0 0.0320904564039067 0 -0.0320904564039067 0 0.034343425909388 NA NA 0.0349001860739969 0.357838070773274 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.58333333333334 1 31.666666666666647 0 0.0322630388127681 0 -0.0322630388127681 0 0.0346476237169708 NA NA 0.0340797538320111 0.343795621056605 0 358 642 0.642 0 0.001 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAT 2 ATGAGATTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666667 1 32.333333333333314 0 0.0315836140125952 0 -0.0315836140125952 0 0.0307625500847606 NA NA 0.0333219458545385 0.343214873506174 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 7 TTT GAT TTT 2 AGATTTTTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333333 1 32.66666666666664 0 0.0312545223004261 0 -0.0312545223004261 0 0.0331550341150075 NA NA 0.033619131814798 0.352544682843513 0 373 627 0.627 0 0.001 ORF3a all ss13 8 TTT TTT TTA 2 TTTTTTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666667 1 32.833333333333314 0 0.0310925352587596 0 -0.0310925352587596 0 0.0336365467514909 NA NA 0.0330392306426326 0.346664234793555 0 364 636 0.636 0 0.001 ORF3a all ss13 9 ACT TTA CTC 2 TTTACTCTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666667 1 32.49999999999998 0 0.0314182062818702 0 -0.0314182062818702 0 0.0336930446950641 NA NA 0.0341974189693278 0.358236637385096 0 392 608 0.608 0 0.001 ORF3a all ss13 10 CTT CTC TTA 2 ACTCTTAGA:ACTCTTGGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666667 1 33.49999999999998 0 0.0304610393656427 0 -0.0304610393656427 0 0.0317550121670634 NA NA 0.0319865635541138 0.340941134636181 0 375 625 0.625 0 0.001 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAT 2 CTTAGATCA:CTTGGATCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.75 1 33.16666666666664 0 0.0307735475083969 0 -0.0307735475083969 0 0.0315425347613745 NA NA 0.0311942086025057 0.323880571252744 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGATCAATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 0 33.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 13 ATT CAA TTA 2 TCAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 0 33.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 14 ACT TTA CTG 2 ATTACTGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666669 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 15 GCA CTG CAC 2 ACTGCACAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 0 32.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 16 CAG CAC AGC 2 GCACAGCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 0 32.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 17 CCA AGC CAG 2 CAGCCAGTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000001 0 33.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 18 GTA CAG TAA 2 CCAGTAAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.50000000000001 0 34.16666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 19 AAA TAA AAA 2 GTAAAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000003 0 34.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 0 34.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 21 GAC TTG ACA 2 ATTGACAAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 34.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 22 AAT ACA ATG 2 GACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.6666666666667 0 34.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000003 0 33.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000003 0 34.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.6666666666667 0 33.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333336 0 33.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000003 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333337 0 33.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333337 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000004 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000004 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666671 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 31.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 30.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666671 0 30.999999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 0 31.666666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 0 31.666666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.6666666666667 0 31.666666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 0 32.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 0 31.999999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.1666666666667 0 31.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000003 0 30.999999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666669 0 30.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666669 0 30.166666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 30.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 31.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAT 2 GTTGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.1666666666667 0 30.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 52 TTT CAT TTC 2 GCATTTCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000003 0 30.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 TTTCTTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000003 0 30.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 30.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666671 0 30.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 30.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 57 CAG TTC AGA 2 TTTCAGAGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 58 AGC AGA GCG 2 CAGAGCGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333337 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000004 0 30.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 30.166666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333337 0 29.166666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.1666666666667 0 28.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.6666666666667 0 29.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 0 29.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.6666666666667 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.6666666666667 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.6666666666667 0 27.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 0 27.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 0 28.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TTT 2 GCCCTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 0 29.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 74 TAT TTT ATA 2 CTTTATAAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 75 AAG ATA AGG 2 TATAAGGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000001 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 76 GGC AGG GCT 2 AAGGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 0 28.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 77 TTC GCT TCC 2 GGCTTCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGT 2 TTCCAGTTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 0 27.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 79 TTC AGT TCA 2 CAGTTCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666669 0 27.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 TTCATTTGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 0 27.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATT 2 TGCAATTTA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666669 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 83 TTA ATT TAC 2 AATTTACTG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666669 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000003 0 29.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 86 CTA TGC TAT 2 CTGCTATTT 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 29.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333337 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 88 GTT TTG TTA 2 TTTGTTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000003 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 89 ACC TTA CCA 2 GTTACCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.6666666666667 0 30.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 90 ATC CCA TCT 2 ACCATCTAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333336 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 91 TAT TCT ATT 2 ATCTATTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000003 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 92 TCA ATT CAC 2 TATTCACAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.6666666666667 0 29.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 93 CAT CAC ATC 2 TCACATCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000003 0 28.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 94 CTT ATC TTT 2 CATCTTTTG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.6666666666667 0 28.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 95 TTG TTT TGC 2 CTTTTGCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 28.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 96 CTT TGC TTG 2 TTGCTTGTC 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666671 0 29.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TCG 2 CTTGTCGCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666671 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 98 GCT TCG CTG 2 GTCGCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666671 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 29.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 100 GGT CAG GTA 2 GCAGGTATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666671 0 29.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 101 ATG GTA TGG 2 GGTATGGAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666671 0 30.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 102 GAG TGG AGG 2 ATGGAGGCG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 30.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 103 GCG AGG CGC 2 GAGGCGCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 30.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 104 CAA CGC AAT 2 GCGCAATTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTT 2 CAATTTTTG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333337 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 106 TTG TTT TGT 2 TTTTTGTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 30.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACC 2 TTGTACCTC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333339 0 31.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 108 CTC ACC TCT 2 TACCTCTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333339 0 31.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 CTCTATGCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666671 0 31.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 TATGCCTTG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666671 0 31.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 111 TTG CCT TGA 2 GCCTTGATA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333339 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 TTGATATAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATT 2 ATATATTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666673 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 114 TTT ATT TTC 2 TATTTTCTA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666673 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 TTTCTACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666673 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAT 2 CTACAATGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 117 TGC AAT GCA 2 CAATGCATC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TCA 2 TGCATCAAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333337 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333337 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 121 TGT CAT GTA 2 GCATGTAGA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.1666666666667 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 TGTAGAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.6666666666667 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.6666666666667 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 124 ATT TTA TTA 2 ATTATTATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 34.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 125 ATG TTA TGA 2 ATTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666671 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 127 TGT GAT GTT 2 AGATGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 TGTTGGCTT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333337 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000004 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 130 TGT TTT GTT 2 CTTTGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 131 TGG GTT GGA 2 TGTTGGAAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000004 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333337 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 136 AAG CCA AGA 2 TCCAAGAAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333337 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 137 AAC AGA ACC 2 AAGAACCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000003 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333337 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333337 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 140 CTT TAC TTT 2 TTACTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 141 TAT TTT ATG 2 CTTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333337 0 36.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333337 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333337 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 147 GTT TTG TTT 2 TTTGTTTGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333337 0 35.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 0 37.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666669 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 152 CAT CAC ATA 2 ACACATAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 CATAACTAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 0 36.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.6666666666667 0 36.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 0 36.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 0 36.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 160 TAT CAT ATA 2 CCATATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 161 AAC ATA ACA 2 TATAACAGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.1666666666667 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCG 2 ATTGTCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666671 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 169 GTT TCG TTA 2 GTCGTTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTG 2 GTTACTGAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333336 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TTT 2 GGCATTTCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 176 TCA TTT CAA 2 ATTTCAACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.6666666666667 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 TCAACACCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.1666666666667 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 180 CTC AAC TCA 2 AAACTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666669 0 35.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 181 AAA TCA AAG 2 CTCAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 0 35.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666669 0 35.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 36.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666667 0 37.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000001 0 36.83333333333331 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000001 0 36.83333333333331 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000001 0 36.83333333333331 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666667 0 37.16666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 36.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666667 0 35.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGG 2 TCTGAGGAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666667 0 36.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 192 GAT AGG ATA 2 GAGGATAGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333334 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 GATAGGCAC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000001 0 36.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666667 0 37.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000001 0 36.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000001 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 202 GTT TCG TTG 2 GTCGTTGTA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 36.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 203 GTA TTG TAC 2 GTTGTACAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 GTACATGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666667 0 37.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 0 37.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666667 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666667 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666667 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.5 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333333 0 34.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 215 GAG TTG AGT 2 CTTGAGTCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666667 0 34.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 216 TCT AGT CTA 2 GAGTCTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666667 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000001 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666669 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000001 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CTA 2 ATTACTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666669 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 0 36.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666669 0 36.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000003 0 37.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333336 0 36.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTT TCT TTA 2 ATCTTTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TTA ACA 2 TTTAACAAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA--- 2 FALSE 0 0 2 1 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG 2 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C CGA 0 ---CCGAAT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT CGA ATG 2 CCGAATGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.66666666666669 11 33.25000000000001 0.117311764843583 0.436342234072308 0.268852647493533 -0.319030469228726 0.0471462776257194 0.169806461448092 0.188638970824551 0.154092676976318 0.180943885080767 0.0778758853580654 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.00000000000001 12 33.583333333333336 0.118472334721436 0.485308821352962 0.244117414538549 -0.366836486631527 0.046150426746107 0.191678067784685 0.157334347368319 0.120761857123023 0.202796588212987 0.0704682734455273 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.33333333333334 12 33.91666666666667 0.119656146346601 0.478631367986199 0.249996457294565 -0.358975221639598 0.0458080026013135 0.18447770717444 0.189190663428885 0.186368176417544 0.191889725837416 0.0613815352798064 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.5 12 33.75000000000001 0.119357976360937 0.481946176047835 0.247658311846612 -0.362588199686898 0.0475457400815602 0.196911116810291 0.174704881054834 0.15631314415339 0.185295823642384 0.0503701416163835 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAA 2 ATGAGAATT:ATGAGATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.83333333333334 12 34.41666666666667 0.118766081588831 0.46896366858246 0.253252201706427 -0.350197586993629 0.0476878320626852 0.184463446320324 0.159930116969843 0.11330347188198 0.196915278984791 0.0753353032442646 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 7 ATT GAA TTT 2 AGAATTTTT:AGATTTTTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.5 12 34.75000000000001 0.117599765999126 0.462739364695786 0.254138236275703 -0.345139598696659 0.0461532714853188 0.190993272687658 0.172887187959495 0.14157104388752 0.189649073536974 0.0687764437767601 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 8 TTT TTT TTA 2 ATTTTTAAT:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.5 12 34.91666666666667 0.101851155869296 0.459690676830551 0.221564545471172 -0.357839520961255 0.0424885941027108 0.189076340255097 0.160061871987528 0.166284023347465 0.191455070103535 0.0616155516179414 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 9 AAT TTA ATC 2 TTTAATCTT:TTTACTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.5 12 34.583333333333336 0.100388275971152 0.465830061577935 0.215504073805587 -0.365441785606782 0.0433039817665071 0.181528284179092 0.137041996382746 0.115825280835903 0.198264131662077 0.0652988298588894 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 10 CTT ATC TTA 2 AATCTTGGA:ACTCTTAGA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.33333333333333 12 35.41666666666668 0.0866346653413833 0.450788036519037 0.192184925781021 -0.364153371177654 0.0410917617880417 NA 0.145636858839812 0.186962807042583 0.176094813720976 0.0386457391140923 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAT 2 CTTAGATCA:CTTGGATCT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.5 13 35.25000000000001 0.0864264476831886 0.507550613188961 0.170281436840688 -0.421124165505773 0.0395733478048933 0.197443417763849 0.11982903681156 0.155306144324342 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGATCTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.58333333333334 12 35.75000000000001 0.0863227141399175 0.445047583344664 0.193962887049463 -0.358724869204747 0.0414174027319075 0.165830454409831 0.141197836486801 0.169536114727009 0.173471923235797 0.0386481917374732 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 13 ATT CAA TAA 2 TCAATTACT:TCTGTAACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.91666666666667 12 35.41666666666667 0.0871596303651496 0.450788036519037 0.193349475372488 -0.363628406153888 0.0416880120166497 0.159710644454643 0.132389078816765 0.144162611651401 0.189568072516412 0.0550863720429636 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 14 ACA TAA CAT 2 ATTACTGCA:GTAACATTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.83333333333334 11 34.75000000000001 0.0872653886078579 0.41121696623111 0.212212519847281 -0.323951577623252 0.0412984446629166 0.164487797318962 0.150902127254144 0.159637305865897 0.168626614180223 0.0547168673248078 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 15 GCA CAT CAC 2 ACATTCAAA:ACTGCACAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.00000000000001 12 34.583333333333336 0.0870541284395655 0.465830061577935 0.186879584680906 -0.378775933138369 0.0411252011369114 0.189835707932845 0.132619802839969 0.15879440887245 0.182942356483578 0.0384087247150623 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 16 AAA CAC AAC 2 GCACAGCCA:TTCAAACCA 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000001 12 34.583333333333336 0.0568993130810351 0.465830061577935 0.122146073802744 -0.408930748496899 0.0269500746785867 0.181190126831368 0.0840393950976822 0.146102104735631 0.176273550728828 0.020348209791837 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 17 CCA AAC CAG 2 AAACCAGGA:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.50000000000001 12 35.083333333333336 0.0573071018565008 0.456683122596106 0.125485482210788 -0.399376020739605 0.0260646309284868 0.186783930168751 0.0886786720026597 0.157051431802386 0.18558028041577 0.0313942744922577 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 18 GGA CAG GAA 2 CCAGGAAAA:CCAGTAAAA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000001 12 35.50000000000001 0.0571024790858329 0.449338673183752 0.127081158363775 -0.392236194097919 0.028172207331686 0.179624816335848 0.094164967891316 0.177157556495534 0.167977865530512 0.0195409708323607 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 19 AAA GAA AAA 2 GGAAAAATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000001 12 35.50000000000001 0.0568993130810351 0.449338673183752 0.126629013874724 -0.392439360102716 0.026277419253255 0.173384598166195 0.100138794499785 0.206038054445947 0.182729071417459 0.0317410177066212 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAA:AAAATTGAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.16666666666667 12 35.66666666666667 0.0567646707244322 0.44646854291714 0.127141478666207 -0.389703872192708 0.0278030115812001 0.21109200308525 0.089783468482159 0.156749133442995 0.173658281418672 0.0248269596556409 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 21 GAA TTG AAG 2 ATTGAAGAT:ATTGACAAT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000001 12 36.00000000000001 0.0568993130810351 0.440839998676589 0.12907021425426 -0.383940685595554 0.0273762663022003 0.164039863906999 0.0924852215615801 0.162842022627056 0.16454748133018 0.0196317528699969 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 22 AAT AAG ATG 2 GAAGATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.58333333333334 13 36.083333333333336 0.0425143321315748 0.490977994348552 0.0865911153268373 -0.448463662216977 0.0239837754877096 0.20237554391085 0.0683223648113449 0.20501569902387 0.213326537660488 0.0355322239817507 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTA 2 AATGCTTCT:GATGCTACT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.25000000000001 12 35.75000000000001 0.0427161696956043 0.445047583344664 0.0959811294212175 -0.40233141364906 0.0239507056652361 0.200261621635049 0.0717318677182983 0.180878757636448 0.181702499103006 0.0268128517636556 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 24 ACT CTA CTC 2 GCTACTCCT:GCTTCTCCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.41666666666669 12 36.583333333333336 0.0432292511544661 0.431333307335396 0.10022238120566 -0.38810405618093 0.0243184546652676 0.166759536421932 0.0746027335879023 0.179137849985686 0.166489088540598 0.0197476624079809 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 ACTCCTTCA:TCTCCTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.75000000000001 11 36.25000000000001 0.0579298692281368 0.38888847704186 0.148962678629075 -0.330958607813723 0.0281001770768679 0.150561945519464 0.121044287408904 0.218455260312504 0.155975912527557 0.0338497343292809 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT:CCTTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.5 11 36.166666666666664 0.0573071018565008 0.390063711884091 0.146917285844652 -0.33275661002759 0.0281546490796181 0.159353360412443 0.10718264320037 0.170462568577779 0.160371457675052 0.0379947213792506 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 27 AGT CAA ATT 2 GCAAGTACT:TCAGATTCT 1:1 TRUE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.16666666666667 10 35.5 0.0567646707244322 0.353207278115753 0.160712064109362 -0.296442607391321 0.0292812679113203 0.142057485100627 0.129415527302344 0.214299348963457 0.152590005731131 0.0520476601271876 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 28 ACT ATT CTA 2 AGTACTGTT:GATTCTATT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.16666666666667 10 36.166666666666664 0.0427669289697661 0.344937320784251 0.123984638346848 -0.302170391814485 0.0247434160598808 0.134573906030745 NaN NaN 0.144652653547308 0.0367133251399519 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 29 ATT CTA TTC 2 ACTGTTCAT:TCTATTCGC 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.33333333333334 9 35.66666666666666 0.0566306643811089 0.307611718065443 0.184097877471173 -0.250981053684334 0.0296267721632603 0.121886223310456 0.219919034232126 0.402527022069221 0.132049937275586 0.0573475338566083 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 ATTCGCGCT:GTTCATGCT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.75 8 35.33333333333333 0.056298401666626 0.269530500680923 0.208875810063787 -0.213232099014297 0.0283165917763298 0.111959566849508 0.220247016084729 0.342940785735197 0.12239294451383 0.0814747244247456 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CGCGCTACT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.25 9 35.666666666666664 0.0566975883332357 0.307611718065443 0.184315437298047 -0.250914129732207 0.0285326514553224 0.125404768704469 NaN NaN 0.12835321274356 0.0505981544090414 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.91666666666666 9 35.49999999999999 0.0561665862243823 0.309399206498443 0.181534357699347 -0.25323262027406 0.0289778617580435 0.128905914198564 0.162818206767965 0.264871327306098 0.138552566516236 0.0675944857813262 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75 9 35.33333333333333 0.0555166649189651 0.311207889047031 0.17839093054153 -0.255691224128066 0.0274222997683728 0.132068484010429 0.14350613129904 0.213834943075864 0.134766521446399 0.0577896244950347 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.25 9 35.16666666666666 0.0551338852123344 0.313038150259031 0.176125130967943 -0.257904265046697 0.0285182199737466 0.137280034100644 0.148948103208571 0.237023342925674 0.126883867739897 0.0420928594914302 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333333 9 34.58333333333333 0.0550706014161129 0.319619774513248 0.172300357510672 -0.264549173097135 0.0277874328730878 0.144785602766467 0.145725312265091 0.237061316367588 0.135709363920325 0.0512500143315132 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGA 2 ATACCGATA:ATACCGCTA 1:1 FALSE 0.75 1 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.58333333333333 9 33.58333333333333 0.0548816190849609 0.331581375185359 0.165514782168574 -0.276699756100398 0.0271065365941502 0.141425131217301 0.13388423959933 0.216364565223526 0.147440186217681 0.0605603772599416 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 37 ATA CGA TAC 2 CCGATACAA:CCGCTACAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.08333333333333 9 32.33333333333333 0.0545075207127158 0.347877835747554 0.156685810682893 -0.293370315034838 0.0277777768350706 0.146814961226897 0.150182844926676 0.296809221362455 0.156350032963739 0.0606046633549683 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 ATACAAGCC:CTACAAGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.08333333333333 8 32.83333333333332 0.0545075207127158 0.294640950387176 0.184996419001125 -0.24013342967446 0.0260343245965375 0.125895558699666 0.158714537778256 0.243779384009088 0.141585087134033 0.0898790293759083 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.74999999999999 8 33.499999999999986 0.0547563501152288 0.287492986673213 0.190461516118545 -0.232736636557984 0.0273479264498406 0.126773803420173 0.162676419985019 0.241679267791119 0.131577095905145 0.0769233626045988 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.74999999999999 8 33.499999999999986 0.0547563501152288 0.287492986673213 0.190461516118545 -0.232736636557984 0.027741266418304 0.116682356416754 0.18462294589711 0.302248155320038 0.127395508924839 0.0677174253482405 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.24999999999999 9 33.16666666666666 0.0543839525266103 0.336838303699426 0.16145418121788 -0.282454351172816 0.0274543801795743 0.148212682094296 NaN NaN 0.152374598419687 0.0637843857751352 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.58333333333331 9 33.83333333333332 0.0548816190849609 0.328506491880477 0.167064032040283 -0.273624872795516 0.0256748105455016 0.148292237774428 0.1498421594121 0.264878951796437 0.162634962499354 0.0924819938389821 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.74999999999999 9 33.66666666666666 0.0547563501152288 0.330549935209217 0.165652279074178 -0.275793585093988 0.0282528732555391 0.13886980563533 0.141633219389655 0.242167476018977 0.136048931864921 0.0426455772048442 3 1 996 0.996 0.003 0.006 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.24999999999999 9 33.33333333333332 0.0543839525266103 0.334715326971315 0.162478225956086 -0.280331374444704 0.0255593627732184 0.144250861536792 0.132991197432868 0.221812903947653 0.148118497537108 0.0584090118321318 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666666 9 33.16666666666666 0.0542609435735893 0.336838303699426 0.161088994267138 -0.282577360125837 0.0279236555339179 0.149525288015995 0.140040780238744 0.250020081630552 0.14595079474151 0.0528537543983898 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTA 2 TGGCTTATT:TGGCTTGTT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.08333333333331 9 32.83333333333332 0.0545075207127159 0.341167493576766 0.159767626573284 -0.28665997286405 0.0279517889405654 0.1533049096737 0.15514052721324 0.303092062516425 0.160572624381908 0.0742231022783937 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 47 ATT TTA TTA 2 CTTATTGTT:CTTGTTATT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.58333333333333 9 32.33333333333333 0.0541384900641951 0.347877835747554 0.155625005392646 -0.293739345683359 0.028282390012781 0.156753374973083 0.121029118994539 0.198496244933225 0.155110125379056 0.0582585900945456 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 ATTGTTGGC:GTTATTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.5 8 32.16666666666666 0.0541996476239405 0.30215833840741 0.179374985676752 -0.24795869078347 0.026321888016102 0.134080881322471 0.195330925655494 0.358454869613291 0.140480761318928 0.0775516269887364 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666666 7 32.49999999999999 0.0546316519559279 0.253894219074791 0.215174855713571 -0.199262567118863 0.0271084900778309 0.111774754754098 NaN NaN 0.117886891454745 0.0909732442140649 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.08333333333333 7 33.33333333333333 0.055260890339147 0.246378050229027 0.224293074353733 -0.19111715988988 0.026905994148228 0.108821246667188 NaN NaN 0.113386098820873 0.0918838308816194 18 0 982 0.982 0.018 0.036 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAC 2 GTTGCACTT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.74999999999999 7 32.666666666666664 0.0547563501152288 0.25235417746591 0.216982142578661 -0.197597827350681 0.0281446733262973 0.1176740165415 NaN NaN 0.117286590954791 0.0920380607090082 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 52 CTT CAC TTC 2 GCACTTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.41666666666664 8 33.5 0.0550074627952336 0.287492986673213 0.191334972834518 -0.23248552387798 0.0286454364504335 0.128372681007679 0.162167514342571 0.238055878217793 0.127247954297328 0.0676956204882342 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 CTTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.66666666666664 7 33.583333333333336 0.0548189130040021 0.244209971081393 0.224474507577463 -0.189391058077391 0.0280274990236382 0.100995122776069 0.206670754747719 0.277414630539707 0.110187306537555 0.0856489513728771 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.99999999999999 7 33.25000000000001 0.0545695157118212 0.247109400847682 0.22083140311387 -0.192539885135861 0.0272522998374203 0.10350887705182 0.216074624283953 0.306774028870551 0.11241284092477 0.0867506970042116 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.33333333333333 7 33.583333333333336 0.0543223783836108 0.244209971081393 0.222441279293652 -0.189887592697782 0.0269491576930264 0.104705483354781 0.210075094335338 0.289661017695689 0.105059788292723 0.0706961799967316 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.66666666666666 7 32.91666666666667 0.0533558250189308 0.250079150443413 0.213355751266453 -0.196723325424482 0.0273295426143004 0.10289159782253 NaN NaN 0.105050905324119 0.0611170640738916 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 57 CAG TTC AGA 2 TTTCAGAGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.33333333333333 8 32.75000000000001 0.0535942229866087 0.295559839412279 0.181331208912486 -0.24196561642567 0.0264690873329097 0.1341919039626 0.146200246913503 0.214866873504487 0.127737212934086 0.05819245658513 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 58 AGC AGA GCG 2 CAGAGCGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666666 8 33.00000000000001 0.0542609435735893 0.292820423057718 0.185304505085337 -0.238559479484128 0.0266777844321306 0.12754083895103 0.203622297885777 0.36280123611865 0.130712582179214 0.0679906200352153 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.25 8 33.50000000000001 0.0551338852123344 0.287492986673213 0.191774713708074 -0.232359101460879 0.0276202624537243 0.123185654712591 0.20222998326412 0.342976699098126 0.134474106804247 0.0840044311132375 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.75 8 33 0.0547563501152288 0.292820423057718 0.186996349310088 -0.238064072942489 0.0277929466827451 0.126229234711533 0.162029993582052 0.248465413079414 0.136119046325408 0.0803013557216165 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCCAAAATA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.25 7 32.5 0.0543839525266103 0.253894219074791 0.214199254810879 -0.199510266548181 0.025883447616423 0.111338889866288 0.22096917513268 0.332364304210569 0.117980879364891 0.0908293570411189 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.58333333333333 7 32.166666666666664 0.0556454425645554 0.257031947307571 0.216492319913714 -0.201386504743015 0.0268092143225882 0.117360466702125 NaN NaN 0.118463465113775 0.089133126172836 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTA 2 ATAATTACA:ATAATTGCG 1:1 FALSE 0.916666666666667 0.75 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.08333333333333 7 31.833333333333336 0.055260890339147 0.26024898720615 0.212338541380656 -0.204988096867003 0.0286265221172732 0.117843873977626 0.202533419263035 0.294448658375998 0.119417138476561 0.0860574317581581 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 64 ACA TTA CAC 2 ATTACACTC:ATTGCGCTC 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.5 7 32.16666666666667 0.0549444688504895 0.25703194730757 0.213765134747011 -0.202087478457081 0.0288158671222254 0.117165830841019 0.189565666580346 0.259464617253449 0.117808266500742 0.0862731936415545 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 65 CTC CAC TCA 2 ACACTCAAA:GCGCTCAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.83333333333333 6 32.5 0.054693929928504303 0.211925228838758 0.258081259263935 -0.157231298910254 0.0279911356234317 0.0983344759013461 NaN NaN 0.102355494163422 0.124506610836322 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 66 AAA TCA AAA 2 CTCAAAAAG:CTCAATAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.16666666666666 6 31.833333333333336 0.0544456664773409 0.217071598340042 0.250818932065226 -0.162625931862701 0.0268375473694106 0.101978752059433 NaN NaN 0.105134887529248 0.121903937161063 22 0 978 0.978 0.022 0.044 ORF3a all ss13 67 AAA AAA AAA 2 AAAAAGAGG:AATAAAAGA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.16666666666666 6 30.833333333333336 0.039920730758297 0.22528117443765 0.177204024517129 -0.185360443679353 0.0238668491147457 0.110450313579168 0.217415661769778 0.415045297816891 0.101481255660154 0.0677676702805626 13 1 986 0.986 0.013 0.026 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AAGAGGTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.75 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.5 6 30.416666666666668 0.0534747581886499 0.228889480485489 0.233626980476457 -0.175414722296839 0.0271418251508684 0.109042807549674 NaN NaN 0.107416558848985 0.102462179813287 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG:AGGTGGCAA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.5 7 31.16666666666667 0.0541996476239405 0.266933470240076 0.203045528817327 -0.212733822616136 0.0271900128198794 0.114232688836663 0.185162139293853 0.272824018384801 0.116001886482314 0.066671446740916 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 70 CAA GGC AAT 2 TGGCAATTT:TGGCAGCTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.16666666666667 7 31.16666666666667 0.0544456664773409 0.266933470240076 0.203967177395826 -0.212487803762735 0.0277444823615445 0.124005896576671 NaN NaN 0.119873915727665 0.0762959790193628 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 71 CTA AAT TAG 2 CAATTTGCT:CAGCTAGCC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76 7 30.66666666666667 0.0545695157118212 0.272179120267026 0.200491189986524 -0.217609604555205 0.0267718166976297 0.117766610422928 NaN NaN 0.121304976565262 0.0728283325154577 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT:TTTGCTCTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76 6 30.83333333333334 0.0545695157118212 0.22528117443765 0.242228476693796 -0.170711658725829 0.0280866280596666 0.100205730370232 0.237120312031988 0.306997483476591 0.104701634412113 0.103004651685045 24 0 976 0.976 0.024 0.048 ORF3a all ss13 73 CTC CCC TCT 2 GCCCTTTAT:GCTCTCTCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76 6 31.000000000000007 0.0545695157118212 0.223869741416997 0.243755656152636 -0.169300225705176 0.0283778589055458 0.0982219159187968 NaN NaN 0.105043768159791 0.107024782606225 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 74 TAT TCT ATA 2 CTCTCCAAG:CTTTATAAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.33333333333333 6 30.66666666666667 0.0543223783836108 0.2267106539047 0.239611052449462 -0.172388275521089 0.0267294699895985 0.105224064315766 0.225010218504052 0.286925870005682 0.103389296826329 0.0954407329837547 24 0 976 0.976 0.024 0.048 ORF3a all ss13 75 AAG ATA AGG 2 TATAAGGGC:TCCAAGGGT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.333333333333333 1.08333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.33333333333333 6 30.66666666666667 0.0403684875103351 0.2267106539047 0.178061713532459 -0.186342166394365 0.0214818161753822 0.109189415772864 NaN NaN 0.106896365396109 0.0812979957525323 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 76 GGC AGG GCT 2 AAGGGCTTC:AAGGGTGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.41666666666666 6 29.916666666666675 0.0408727688266098 0.233376267232886 0.175136783663709 -0.192503498406276 0.0234556433383531 0.113898070872993 0.175786839198978 0.319103420738374 0.102944152381955 0.0614866055833367 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 77 GTT GCT TCC 2 GGCTTCCAG:GGTGTTCAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.41666666666666 6 29.583333333333343 0.0408727688266098 0.236467295831908 0.172847448873708 -0.195594527005299 0.0243811728713387 0.112363040339614 NaN NaN 0.10899072593532 0.0727177892653747 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGT 2 GTTCATTTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.66666666666666 6 29.25000000000001 0.0548189130040021 0.23964200873058 0.228753352946699 -0.184823095726578 0.0273242243883407 0.110906069378227 NaN NaN 0.109609016054453 0.0917566289360461 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 79 TTC AGT TCA 2 CAGTTCATT:CATTTTGCT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 76 6 29.25000000000001 0.0405504159527068 0.23964200873058 0.169212468913562 -0.199091592777873 0.0237323121008991 0.10725317025352 NaN NaN 0.106480207392932 0.0615182490528355 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 80 ATT TCA CTT 2 TTCATTTGC:TTTGCTTGC 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.41666666666666 6 29.416666666666675 0.0408727688266098 0.238043979028558 0.171702594593692 -0.197171210201948 0.0239163183529283 0.115409486539163 NA NA 0.10318690430269 0.0560282028210506 2 1 997 0.997 0.002 0.004 ORF3a all ss13 81 TGC CTT GCA 2 ATTTGCAAT:GCTTGCAAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 76 5 29.166666666666675 0.0267885619515594 0.194633396613813 0.137635998845114 -0.167844834662254 0.0185551618595264 0.0973435452041797 NA NA 0.0980617197695139 0.0869659042384535 9 1 990 0.99 0.009 0.018 ORF3a all ss13 82 AAC GCA ACT 2 TGCAACTTG:TGCAATTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.16666666666666 5 29.500000000000007 0.0267288865855191 0.192126605059278 0.139121214249699 -0.165397718473759 0.0190273197583015 0.0949057678349467 NA NA 0.0970943752956697 0.0884794485192222 7 3 990 0.99 0.007 0.014 ORF3a all ss13 83 TTA ACT TAC 2 AACTTGCTT:AATTTACTG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.16666666666666 5 29.500000000000007 0.0267288865855191 0.192126605059278 0.139121214249699 -0.165397718473759 0.0189508716927542 0.096264903236162 NaN NaN 0.0926225345945862 0.0741449447278626 7 2 991 0.991 0.007 0.014 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG:TTGCTTCTA 1:1 FALSE 1.25 1 0.25 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.5 5 29.333333333333343 0.0266103300115572 0.193371831976575 0.137612235140746 -0.166761501965018 0.0181550356754451 0.10019032582415 NA NA 0.0936470356942745 0.0749540982532768 7 2 991 0.991 0.007 0.014 ORF3a all ss13 85 CTA TGC TAC 2 CTGCTGCTA:CTTCTACTA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.91666666666667 5 29.833333333333343 0.0400540111089283 0.189683904532547 0.211161886442798 -0.149629893423619 0.0232758328032414 0.0950384087946211 NaN NaN 0.0949124657380357 0.114909669662938 22 1 977 0.977 0.022 0.044 ORF3a all ss13 86 CTA TAC TAT 2 CTACTATTT:CTGCTATTT 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.00000000000001 5 30.166666666666675 0.0400094855289696 0.187302855665743 0.213608518603527 -0.147293370136773 0.0233354217301021 0.0912298760330442 NaN NaN 0.0880270605090153 0.0942734164846651 24 0 976 0.976 0.024 0.048 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.16666666666669 5 31.416666666666675 0.039920730758297 0.178884786483983 0.223164482251102 -0.138964055725686 0.0224985156626491 0.0873531859451968 NaN NaN 0.0882069635704168 0.115156808166786 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 88 GTT TTG TTA 2 TTTGTTACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.33333333333334 5 30.41666666666668 0.0393103070130301 0.185556129985381 0.211851298128104 -0.146245822972351 0.0206795545623224 0.0923305519761569 NaN NaN 0.0907003103833524 0.10687338437506 25 0 975 0.975 0.025 0.05 ORF3a all ss13 89 ACA TTA CAG 2 GTTACAGTC:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.16666666666669 5 30.583333333333343 0.0393963647100293 0.184409724221212 0.213634963537881 -0.145013359511182 0.0220955544963065 0.0981504415775989 NA NA 0.08592879050035 0.0914881897741786 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 90 ATC CAG TCT 2 ACAGTCTAC:ACCATCTAT 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.83333333333334 5 30.25000000000001 0.039054375562259 0.18671695246621 0.209163522896116 -0.147662576903951 0.0215700590635913 0.0957825617715311 NaN NaN 0.0902628586115291 0.101856885276825 23 0 977 0.977 0.023 0.046 ORF3a all ss13 91 TAC TCT ACT 2 ATCTATTCA:GTCTACTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.33333333333334 4 30.583333333333343 0.0393103070130301 0.143721781908901 0.273516696571069 -0.104411474895871 0.0226884846330014 0.0794388509050494 NA NA 0.0750713848270292 0.164277223029623 46 1 953 0.953 0.046 0.092 ORF3a all ss13 92 TCA ACT CAC 2 TACTCTCAC:TATTCACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.00000000000001 4 29.91666666666668 0.0389698041980333 0.147260274111344 0.26463215849081 -0.108290469913311 0.0223807898244705 0.081282537805113 NA NA 0.077952090524847 0.164774181189574 46 0 954 0.954 0.046 0.092 ORF3a all ss13 93 CAC CAC ACC 2 TCACATCTT:TCTCACCTT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.50000000000001 4 29.083333333333343 0.0382248326940206 0.151937056450332 0.251583343702043 -0.113712223756312 0.0217988518131335 0.0808296221312236 NA NA 0.0789413260794007 0.149735862113996 50 2 948 0.948 0.05 0.1 ORF3a all ss13 94 CTT ACC TTT 2 CACCTTTTG:CATCTTTTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.50000000000001 4 28.41666666666668 0.0382248326940206 0.155898728322134 0.245190150717822 -0.117673895628113 0.0223081804853684 0.0863479306070147 NaN NaN 0.0833692610096331 0.158103655033778 46 2 952 0.952 0.046 0.092 ORF3a all ss13 95 TTG TTT TGC 2 CTTTTGCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.00000000000001 4 28.583333333333343 0.0379827996140662 0.154888999008431 0.245225935071081 -0.116906199394364 0.0221231011750157 0.0851503259395093 NA NA 0.0772870169755757 0.130375185694152 36 1 963 0.963 0.036 0.072 ORF3a all ss13 96 CTT TGC TTG 2 TTGCTTGTC:TTGCTTGTT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.83333333333336 4 29.41666666666668 0.0385523838449736 0.150031026615648 0.256962741071803 -0.111478642770675 0.0217118101769854 0.0798489662952372 NA NA 0.0822276214876549 0.175184357056834 47 1 952 0.952 0.047 0.094 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TCG 2 CTTGTCGCT:CTTGTTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.08333333333336 4 29.750000000000014 0.038428896281493 0.148172379571929 0.259352629636606 -0.109743483290436 0.0213292098446185 0.0825920054069631 NA NA 0.0767049021308047 0.152509560437046 42 2 956 0.956 0.042 0.084 ORF3a all ss13 98 GCT TCG CTG 2 GTCGCTGCA:GTTGCTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.25000000000003 4 29.583333333333346 0.0515777829948789 0.149095891727942 0.345936983220126 -0.0975181087330634 0.0264604558485818 0.0815691178947629 NA NA 0.0766412560519979 0.203232078804701 74 0 926 0.926 0.074 0.148 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.4166666666667 4 28.91666666666668 0.0508130785858607 0.152908411727716 0.332310551209854 -0.102095333141855 0.0258612256914691 0.082653047322282 NA NA 0.0817596361445445 0.211765532768438 76 0 924 0.924 0.076 0.152 ORF3a all ss13 100 GGC CAG GCC 2 GCAGGTATG:GCTGGCCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.58333333333336 4 28.75000000000001 0.0500707265730996 0.15389231077321 0.325362107577216 -0.103821584200111 0.0251547131204685 0.0807623073158841 NaN NaN 0.0826578357538874 0.209101309275805 75 0 925 0.925 0.075 0.15 ORF3a all ss13 101 ATG GCC TGG 2 GGCCTTGAA:GGTATGGAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.9166666666667 4 29.083333333333343 0.0498625949111442 0.151937056450332 0.328179287371176 -0.102074461539188 0.0258271546541717 0.0865760245995936 NA NA 0.0831925237521822 0.219835083573163 76 0 924 0.924 0.076 0.152 ORF3a all ss13 102 GAA TGG AAG 2 ATGGAGGCG:CTTGAAGCC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.58333333333337 3 28.91666666666667 0.0500707265730995 0.11166090491713 0.448417703673995 -0.06159017834403 0.0253206459260828 0.0739318253153205 NA NA 0.0684651562978946 0.368341525916388 181 2 817 0.817 0.181 0.362 ORF3a all ss13 103 GCC AAG CCC 2 GAAGCCCAA:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.33333333333337 3 29.16666666666667 0.0633287393599309 0.110629602831442 0.572439362874871 -0.0473008634715114 0.0277184772533944 0.0652171444387859 NA NA 0.071312538343801593 0.507145110033389 226 1 773 0.773 0.226 0.452 ORF3a all ss13 104 CAA CCC AAT 2 GCCCAATTT:GCGCAATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.58333333333337 4 29.500000000000007 0.0764181120413494 0.149561992614941 0.510946067949856 -0.0731438805735915 0.0304271071980761 0.0874807166691387 NaN NaN 0.08027180635936 0.362188621817173 152 0 848 0.848 0.152 0.304 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTC 2 CAATTTCTC:CAATTTTTG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.9166666666667 4 29.500000000000007 0.0770731033781903 0.149561992614941 0.515325464916886 -0.0724888892367506 0.0301142426972666 0.082434415973292 NaN NaN 0.0810561751789252 0.371159078580664 158 0 842 0.842 0.158 0.316 ORF3a all ss13 106 CTC TTC TCT 2 TTTCTCTAT:TTTTTGTAC 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.25000000000004 4 29.166666666666675 0.0767442089720042 0.151456007747705 0.506709572721899 -0.0747117987757009 0.0313616205501475 0.0876219973306408 NA NA 0.0801061939583145 0.350995827925635 158 0 842 0.842 0.158 0.316 ORF3a all ss13 107 TAC TCT ACC 2 CTCTATCTT:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.25000000000004 3 30.000000000000007 0.0777394299845026 0.107325632730505 0.724332370624886 -0.0295862027460024 0.0312081486889804 0.0673022065428437 NaN NaN 0.0575459860831094 0.607160072474915 310 0 690 0.69 0.31 0.62 ORF3a all ss13 108 CTC ACC TCT 2 TACCTCTAT:TATCTTTAC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.66666666666671 3 30.08333333333334 0.0773216317702306 0.107006075844546 0.722591041302743 -0.0296844440743151 0.0308026142043148 0.0622506781525646 NA NA 0.0604015526390456 0.623107024982968 309 0 691 0.691 0.309 0.618 ORF3a all ss13 109 TAC TCT ACG 2 CTCTATGCC:CTTTACGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.83333333333337 3 30.250000000000007 0.0771557683120387 0.106372646579413 0.725334668198159 -0.0292168782673746 0.0313349138189543 0.0653140973984015 NaN NaN 0.0604209593075913 0.628701467480302 287 0 713 0.713 0.287 0.574 ORF3a all ss13 110 GCC ACG CCT 2 TACGCTTTA:TATGCCTTG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.50000000000004 3 30.58333333333334 0.0774882105210195 0.105128058952294 0.737084003008014 -0.0276398484312747 0.0320032398979079 0.0660666715075847 NaN NaN 0.0557943689864058 0.620326420939671 302 0 698 0.698 0.302 0.604 ORF3a all ss13 111 TTA CCT TAG 2 GCCTTGATA:GCTTTAGTT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.66666666666671 3 30.41666666666667 0.0773216317702306 0.105746684778908 0.731196745618005 -0.0284250530086775 0.0320016981484558 0.0668171090019069 NA NA 0.0583141914466736 0.625941893015171 324 1 675 0.675 0.324 0.648 ORF3a all ss13 112 ATA TAG TAT 2 TTAGTTTAT:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.66666666666671 3 30.41666666666667 0.0753771912377858 0.105746684778908 0.712809024655309 -0.0303694935411222 0.0294482369846406 0.0632907217721561 NaN NaN 0.0568795878618961 0.59339269984474 292 0 708 0.708 0.292 0.584 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATT 2 ATATATTTT:GTTTATTTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.33333333333337 3 31.250000000000007 0.0747506138799603 0.102724391304868 0.727681253988779 -0.0279737774249076 0.030405142198121 0.0634353900240429 NaN NaN 0.0569691403954602 0.623402492924706 338 1 661 0.661 0.338 0.676 ORF3a all ss13 114 TTT ATT TTC 2 TATTTTCTA:TATTTTCTG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.00000000000004 4 31.58333333333334 0.0750625939177369 0.138722674692595 0.541098231302657 -0.063660080774858 0.029941853057232 0.0700420077291081 NaN NaN 0.0655980865482807 0.331819063765038 156 0 844 0.844 0.156 0.312 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 TTTCTACAA:TTTCTGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.00000000000004 4 31.91666666666667 0.0760143706952156 0.137132914796851 0.554311638513798 -0.0611185441016354 0.0300882528446177 0.0753524102465565 NaN NaN 0.0702222286595465 0.384104281227651 172 0 828 0.828 0.172 0.344 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAA 2 CTACAATGC:CTGCAAAGT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 83.00000000000004 4 32.583333333333336 0.103166657193186 0.134060541816084 0.769552739349054 -0.0308938846228982 0.0413847660519157 0.0735543394798662 NaN NaN 0.0725062972176541 0.670045518217377 336 0 664 0.664 0.336 0.672 ORF3a all ss13 117 AGT AAA GCA 2 CAAAGTGTT:CAATGCATC 1:1 TRUE 2.25 0.416666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.50000000000004 5 33.41666666666667 0.105204990412841 0.166890228132415 0.630384364561891 -0.0616852377195736 0.0414861865856975 0.0768052309227232 NaN NaN 0.0794069862059904 0.437262725995838 206 0 794 0.794 0.206 0.412 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TCA 2 AGTGTTAAT:TGCATCAAC 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.08333333333337 5 33.75000000000001 0.0917171833187057 0.165046413582601 0.555705400243694 -0.0733292302638956 0.0403559056556557 0.0818560085299437 NaN NaN 0.0795144932531966 0.356417936670251 185 0 815 0.815 0.185 0.37 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA:GTTAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.91666666666671 4 32.91666666666667 0.0907253574709977 0.132575542143044 0.684329522658926 -0.0418501846720465 0.0398010702507995 0.068640982476451 NaN NaN 0.0728154719121229 0.565465103844808 268 1 731 0.731 0.268 0.536 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AATGCTTGC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.58333333333337 5 33.58333333333333 0.0923227698874005 0.16596317904302 0.55628465554681406 -0.0736404091556193 0.040979063096745 0.0812141512370045 NaN NaN 0.082492121917216 0.372019850902397 168 0 832 0.832 0.168 0.336 ORF3a all ss13 121 TGC CAT GCA 2 GCATGTAGA:GCTTGCAGA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.58333333333337 5 33.58333333333333 0.0923227698874005 0.16596317904302 0.55628465554681406 -0.0736404091556193 0.0399271573600233 0.0805151081467677 NA NA 0.0800369604961871 0.357530938361273 153 1 846 0.846 0.153 0.306 ORF3a all ss13 122 AGA GCA GAA 2 TGCAGAATT:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.41666666666671 5 33.58333333333333 0.106728023137133 0.16596317904302 0.643082542480508 -0.0592351559058869 0.0426773562630092 0.0783361853602944 NaN NaN 0.0830241015380484 0.475555341839975 235 0 765 0.765 0.235 0.47 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.41666666666671 5 33.416666666666664 0.106728023137133 0.166890228132415 0.639510319636283 -0.0601622049952821 0.0425349359479941 0.0793065049902654 NaN NaN 0.0832101236556741 0.469670392250187 228 0 772 0.772 0.228 0.456 ORF3a all ss13 124 ATT TTA TTA 2 ATTATTATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.75000000000006 5 33.75 0.106254713938364 0.165046413582601 0.643786869595842 -0.0587916996442377 0.0422557487356691 0.0810401936337557 NaN NaN 0.0800792046741535 0.46284551592587603 223 0 777 0.777 0.223 0.446 ORF3a all ss13 125 ATG TTA TGA 2 ATTATGAGA:ATTATGAGG 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.91666666666673 5 33.58333333333333 0.106019632717102 0.16596317904302 0.63881418353417 -0.0599435463259179 0.0446431562668482 0.0850229504353044 NaN NaN 0.0849624400066866 0.480480498264326 224 0 776 0.776 0.224 0.448 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT:ATGAGGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.25000000000006 6 34.41666666666667 0.105552582259344 0.198409364312814 0.53199395414084 -0.0928567820534696 0.0435951807685438 0.0857571588857094 NaN NaN 0.0901004100878119 0.30273208392148 147 0 853 0.853 0.147 0.294 ORF3a all ss13 127 CTT GAT GTT 2 AGATGTTGG:AGGCTTTGG 1:1 TRUE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.91666666666671 7 35.083333333333336 0.106019632717102 0.231968667588477 0.457042900747207 -0.125949034871375 0.0411562903162085 0.0942648101492903 0.379680657704052 0.228683869149405 0.0953421013529803 0.186493953747825 65 0 935 0.935 0.065 0.13 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 CTTTGGCTG:TGTTGGCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.33333333333339 6 34.75 0.119722609193913 0.196233824001589 0.61010179974347 -0.0765112148076763 0.0489898320031091 0.0845519240158604 0.659736261311061 0.355087532380218 0.10065030425162 0.447153728809096 214 0 786 0.786 0.214 0.428 ORF3a all ss13 129 CTG GGC TGT 2 TGGCTGTGC:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.16666666666673 6 34.916666666666664 0.121614085547219 0.195163947524611 0.623138069759957 -0.0735498619773914 0.0507455201642528 0.0834593342011293 0.642848441858496 0.332376073622322 0.0967465069139115 0.447115478417855 239 0 761 0.761 0.239 0.478 ORF3a all ss13 130 TGC TGT GCT 2 CTGTGCTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.08333333333333 0.5 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 11 80.5833333333334 6 35 0.15067539576423 0.194633396613813 0.774149752229811 -0.0439580008495832 0.0564102572281349 0.0845903738615901 NaN NaN 0.0985662153051884 0.655615795880435 313 0 687 0.687 0.313 0.626 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAG:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 13 80.16666666666674 6 34.916666666666664 0.182716561993313 0.195163947524611 0.936220876400706 -0.0124473855312983 0.0658615596606946 0.0882217693373277 NaN NaN 0.10887722799176 0.90898019119968 449 0 551 0.551 0.449 0.898 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 14 80.16666666666674 7 34.583333333333336 0.198802969548925 0.235909286040997 0.842709385820348 -0.0371063164920715 0.0663544840251952 0.0975358521921493 0.780419528298036 0.280224186185585 0.120894892524658 0.758896357036813 384 0 616 0.616 0.384 0.768 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA:AAGTGCAGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 16 80.41666666666674 7 34.333333333333336 0.231204431105144 0.237930656019994 0.971730314086617 -0.00672622491485039 0.0772869376992221 0.102392166314567 0.930359482606658 0.296269112727557 0.118236038361601 0.954634324751974 446 0 554 0.554 0.446 0.892 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC:TGCAGATCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 16 80.75000000000007 7 34.166666666666664 0.230087393607352 0.239297754894712 0.961510874636447 -0.00921036128735936 0.0747413938007062 0.0980478110537425 NaN NaN 0.118801757951379 0.93820419651292 473 0 527 0.527 0.473 0.946 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG:AGATCCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 80.0833333333334 7 34.416666666666664 0.215501453764007 0.237252996159118 0.908319208830887 -0.0217515423951104 0.0769332120550306 0.098486108929139 0.682802393711712 0.183425628801685 0.121326799086105 0.857717372163361 402 0 598 0.598 0.402 0.804 ORF3a all ss13 136 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAT:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 80.0833333333334 7 35.083333333333336 0.215501453764007 0.231968667588477 0.929011042759951 -0.0164672138244696 0.0734845151234546 0.0994311875192649 NaN NaN 0.123794831788123 0.89417740171738 475 0 525 0.525 0.475 0.95 ORF3a all ss13 137 AAC AAA ACC 2 AAAAATCCA:AAGAACCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 80.50000000000006 7 34.5 0.214210364540791 0.236579217337834 0.905448783503668 -0.0223688527970423 0.0740469061836854 0.0964030047318008 0.810425127033115 0.263886756343564 0.120871791914557 0.8531799051207 429 0 571 0.571 0.429 0.858 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA:AATCCATTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.8333333333334 7 34.5 0.216283656691977 0.236579217337834 0.914212411072125 -0.0202955606458565 0.0778695849752855 0.10200706646818 NaN NaN 0.122849383065748 0.868781167136295 438 0 562 0.562 0.438 0.876 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.66666666666673 7 34.66666666666667 0.216808309568067 0.235243169141281 0.921634878323956 -0.0184348595732146 0.0744328197519162 0.0980259077112235 0.75716182957745 0.223519339015234 0.121757678417372 0.879655349722624 443 0 557 0.557 0.443 0.886 ORF3a all ss13 140 CTT TAC TTT 2 TTACTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.3333333333334 7 35.66666666666667 0.221099655165483 0.227535736496163 0.971713975880055 -0.00643608133068002 0.075943271351438 0.101750100962865 NaN NaN 0.117887294936316 0.956460956913394 464 0 536 0.536 0.464 0.928 ORF3a all ss13 141 TAT TTT ATG 2 CTTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.3333333333334 8 35.66666666666667 0.221099655165483 0.266505540694197 0.829624984867333 -0.0454058855287133 0.0771087683498882 0.10437508315954 0.652176153013234 0.203342112130104 0.132877906795463 0.732568148869923 364 0 636 0.636 0.364 0.728 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.16666666666673 8 36.50000000000001 0.221648134682889 0.259234959672941 0.855008656866834 -0.0375868249900517 0.0773789871546203 0.105260955166722 0.649519058764064 0.188049239082442 0.12152902167928 0.757106483200053 364 0 636 0.636 0.364 0.728 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC:GATGCCAAT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.75000000000006 9 36.91666666666667 0.240550445951301 0.294844647490837 0.815854884931487 -0.0542942015395355 0.0778687158675707 0.113028655867282 0.708784923590841 0.249707023849202 0.133491355929648 0.684210363066955 338 0 662 0.662 0.338 0.676 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC:GCCAATTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 78.08333333333339 9 37.25000000000001 0.257172181186926 0.29161934182815 0.881876282878645 -0.034447160641224 0.0853605049498739 0.106722577082802 0.615965823464885 0.152230619815025 0.14068175800781 0.806565795497522 377 0 623 0.623 0.377 0.754 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT:AATTACTTT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 18 78.08333333333339 10 37.25000000000001 0.275437924150749 0.332307284140461 0.828865141681113 -0.0568693599897117 0.0845622825197722 0.115246486160132 0.457575510796732 0.0700746082954128 0.142295948042075 0.689410263444071 353 0 647 0.647 0.353 0.706 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTC 2 TACTTTCTT:TACTTTGTT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.416666666666667 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 18 77.91666666666671 10 37.41666666666667 0.27615017609084 0.330447149722366 0.835686361110557 -0.0542969736315267 0.0817272843716647 0.119446465869576 0.516726776782776 0.105820159522102 0.141100951785399 0.70037862880265 340 1 659 0.659 0.34 0.68 ORF3a all ss13 147 CTT TTC TTT 2 TTTCTTTGC:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 18 77.83333333333337 10 36.91666666666667 0.27650770083468 0.336092154301423 0.822713941089786 -0.059584453466743 0.086278013704398 0.116803380305412 0.487737328894885 0.0916423617970841 0.139414353645866 0.669094491330754 324 0 676 0.676 0.324 0.648 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 CTTTGCTGG:GTTTGCTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.83333333333337 10 37.916666666666664 0.262179645500183 0.324991546958348 0.806727584006316 -0.0628119014581648 0.0828623126459787 0.115191051972857 0.47989684818826 0.0927544223473423 0.140976616035128 0.655923512569886 323 0 677 0.677 0.323 0.646 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGCTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.83333333333337 10 38.083333333333336 0.262179645500183 0.323213439068629 0.811165668901886 -0.0610337935684456 0.0876041628780873 0.119500163237758 0.435710665821533 0.062644377941657 0.138414746121086 0.65925018208765 332 0 668 0.668 0.332 0.664 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.1666666666667 10 37.416666666666664 0.260825162391735 0.330447149722367 0.78930976590621 -0.0696219873306312 0.0834890519009047 0.112696897165982 0.460058864693339 0.0862222302762038 0.144907659381554 0.630902040095057 316 0 684 0.684 0.316 0.632 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACTAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 18 76.75000000000003 10 37.416666666666664 0.281242210583348 0.330447149722367 0.851095888766602 -0.0492049391390187 0.0870205605713278 0.125202302541067 0.490655414386739 0.0828098707650386 0.14193104329953 0.728830228173848 372 1 627 0.627 0.372 0.744 ORF3a all ss13 152 AAT CAC ATA 2 ACACATAAC:ACTAATTGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 18 77.08333333333337 10 37.083333333333336 0.279768061455196 0.334188826423192 0.837155641765588 -0.0544207649679961 0.0877643081097418 0.122788535195646 0.66896744827277 0.210783247826185 0.148201046501762 0.71346309189602 348 0 652 0.652 0.348 0.696 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 AATTGCTAT:CATAACTAT 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.416666666666667 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.25000000000003 12 37.25 0.264584505778426 0.420971287091357 0.628509624983064 -0.156386781312931 0.0874360804809352 0.161278169699683 0.360650690347528 0.0813842547240734 0.182219968932533 0.390765057351554 174 0 826 0.826 0.174 0.348 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC:TGCTATGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.33333333333337 11 36.75 0.264238228927332 0.381986287095468 0.691747944504858 -0.117748058168135 0.0842326805647763 0.158676171144649 0.492735879128512 0.1603510209295 0.187818951906341 0.53070957946071 225 0 775 0.775 0.225 0.45 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC:TATGACTAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.00000000000003 11 36.75 0.261500632286273 0.381986287095468 0.684581203882111 -0.120485654809195 0.0827225247266347 0.150257594754425 0.488817720224848 0.161368549049451 0.171674613942211 0.482787874013162 238 0 762 0.762 0.238 0.476 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT:GACTATTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.33333333333337 11 36.75 0.264238228927332 0.381986287095468 0.691747944504858 -0.117748058168135 0.0838115621967272 0.157781618295934 0.471623482822945 0.142447421871416 0.171446195963075 0.492213141475064 226 0 774 0.774 0.226 0.452 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA:TATTGTATA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.33333333333337 11 36.75 0.264238228927332 0.381986287095468 0.691747944504858 -0.117748058168135 0.0855631389450472 0.153045874793982 0.447109816715533 0.121826005660628 0.17932008616209 0.511414873007 234 0 766 0.766 0.234 0.468 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.6666666666667 11 36.916666666666664 0.267034361445878 0.379740833733665 0.703201598891432 -0.112706472287786 0.0856597698541122 0.162688096153892 0.470392117257279 0.134933649003912 0.175832807568967 0.521531393539329 256 0 744 0.744 0.256 0.512 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.6666666666667 11 36.583333333333336 0.267034361445878 0.384259035673055 0.694933200407767 -0.117224674227177 0.0863157997203217 0.163699855017304 0.421763017697637 0.0994170343579972 0.18246904892318 0.520590173061101 245 1 754 0.754 0.245 0.49 ORF3a all ss13 160 TAT CAT ATA 2 CCATATAAC:CCATATAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 18 76.33333333333337 11 36.25 0.283107148654449 0.38888847704186 0.727990581793389 -0.105781328387411 0.0889307356735059 0.164360626664879 0.539052647754596 0.176855664969296 0.182757574085655 0.562719535837636 250 0 750 0.75 0.25 0.5 ORF3a all ss13 161 AAC ATA ACA 2 TATAACAGT:TATAATAGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 19 76.58333333333337 11 36.333333333333336 0.301247890911877 0.38772045925013 0.776971871679159 -0.0864725683382532 0.0892532864615757 0.148859595090429 0.478280600557903 0.104266894985766 0.191835403456074 0.65215937005877 306 0 694 0.694 0.306 0.612 ORF3a all ss13 162 AGC ACA GCA 2 AACAGTGTC:AATAGCATA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 76.50000000000003 11 36 0.321454977502394 0.392436107823411 0.819126912875822 -0.070981130321017 0.0903018268425701 0.165789881160818 0.514585249260969 0.111425232970693 0.19051422313587 0.709463635060874 358 0 642 0.642 0.358 0.716 ORF3a all ss13 163 ATA GCA TAA 2 AGCATAACT:AGTGTCACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 75.6666666666667 11 36.166666666666664 0.325888073027 0.390063711884091 0.835473957454004 -0.064175638857091 0.0924100821119058 0.150897298515978 0.57607396682179 0.146977838695325 0.195631282854147 0.742878509289696 340 0 660 0.66 0.34 0.68 ORF3a all ss13 164 ACA TAA CAG 2 ATAACTTCT:GTCACAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 76.33333333333337 10 36.166666666666664 0.322331773206585 0.344937320784251 0.934464767319843 -0.0226055475776658 0.0914378857810362 0.162052642247701 0.681394207293547 0.170249953889013 0.173234016344428 0.896177665731428 438 0 562 0.562 0.438 0.876 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA:ACTTCTTCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 76.83333333333337 10 35.5 0.319715833685829 0.353207278115753 0.905179064801297 -0.0334914444299241 0.0926693332333018 0.14684679915627 NaN NaN 0.181369698488942 0.853496950568295 417 0 583 0.583 0.417 0.834 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT:TCTTCAATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 19 77.00000000000003 10 35.333333333333336 0.29924444520191 0.355338264064231 0.842139660894551 -0.0560938188623211 0.0812777845604473 0.156974945692246 NaN NaN 0.179326716518734 0.754430827686388 379 0 621 0.621 0.379 0.758 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC:TCAATTGTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 19 76.83333333333337 9 35.5 0.300042574574177 0.309399206498443 0.969758707431227 -0.0093566319242655 0.0851060897679339 0.137407059670552 0.729617072348867 0.183803832832561 0.165695371997479 0.954968286854134 495 0 505 0.505 0.495 0.99 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCA 2 ATTGTCATT:ATTGTCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 19 76.00000000000003 9 35.833333333333336 0.304098831081123 0.305845048400816 0.994290516296328 -0.00174621731969327 0.0835829031714359 0.138644391873763 0.738803633190747 0.178363276196399 0.165564289073996 0.991584815687789 490 0 510 0.51 0.49 0.98 ORF3a all ss13 169 ATT TCA TTA 2 GTCATTACA:GTCGTTACT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 19 77.00000000000003 9 35.5 0.29924444520191 0.309399206498443 0.967179097155882 -0.0101547612965326 0.0861055318609733 0.13705316786611 0.827760713295699 0.242634018775708 0.154832034634656 0.947707705596875 446 0 554 0.554 0.446 0.892 ORF3a all ss13 170 ACA TTA CAT 2 ATTACATCA:GTTACTGAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 77.6666666666667 8 34.833333333333336 0.315450399129949 0.274200382158177 1.15043748898926 0.0412500169717713 0.0857103504763502 0.126125687588437 1.23848475426063 0.352937146302215 0.149828755434534 0.783074686479914 626 0 374 0.374 0.626 0.748 ORF3a all ss13 171 GAA CAT AAG 2 ACATCAGGT:ACTGAAGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 21 78.00000000000003 8 34.833333333333336 0.333514365946084 0.274200382158177 1.21631619664808 0.0593139837879067 0.0897173235289334 0.136189982081841 1.16214365783523 0.295277493661507 0.15359479244141 0.699369406802802 676 0 324 0.324 0.676 0.648 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:TCAGGTGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 77.33333333333336 8 35.16666666666667 0.317142638115025 0.271069160022998 1.16996945756617 0.0460734780920274 0.0875235621790061 0.127716971211057 NaN NaN 0.154501309767403 0.765544655837485 635 0 365 0.365 0.635 0.73 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGATGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 78.00000000000001 8 35.16666666666667 0.313776384708054 0.271069160022998 1.15755102749953 0.0427072246850566 0.0857858134570749 0.138409704087319 1.11411549972935 0.29881098820315 0.149499757934575 0.77513278580768 631 1 368 0.368 0.631 0.736 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT:GATGGCACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 77.16666666666669 8 35.33333333333334 0.317995686432648 0.269530500680923 1.17981336297483 0.0484651857517255 0.0870213468638305 0.125059462453457 1.01969402264626 0.247261390680168 0.152074868432577 0.749959374621693 649 0 351 0.351 0.649 0.702 ORF3a all ss13 175 ACT GCA CTA 2 GGCACTACA:GGCATTTCA 1:1 FALSE 1 0.833333333333333 1.16666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 76.66666666666669 8 35.83333333333334 0.320583011120205 0.265018643484554 1.20966210869195 0.0555643676356509 0.0853473704868684 0.121970229780606 NaN NaN 0.150291605445164 0.71159829151344 660 0 340 0.34 0.66 0.68 ORF3a all ss13 176 ACA CTA CAA 2 ACTACAAGT:ATTTCAACA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 76.58333333333334 8 36 0.321018393180178 0.263548415128416 1.21806231702725 0.0574699780517618 0.0889648842391842 0.127139034749023 1.05361789712263 0.24765009008854 0.146020381040245 0.693894808348143 645 0 355 0.355 0.645 0.71 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 ACAAGTCCT:TCAACACCA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 77.41666666666669 7 35.833333333333336 0.316717853327956 0.226300369430573 1.3995463380148 0.0904174838973826 0.0875207427490029 0.110789234544932 1.60963638110279 0.38458474548401 0.136612681025885 0.508065571089688 750 0 250 0.25 0.75 0.5 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA:AGTCCTATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 19 77.75000000000001 7 35.833333333333336 0.295705458110177 0.226300369430573 1.3066945443096 0.069405088679604 0.0763022137800035 0.111316379932546 NaN NaN 0.135861091222328 0.609453774079963 697 0 303 0.303 0.697 0.606 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC:CCTATTACA 1:1 TRUE 1.41666666666667 0.666666666666667 0.916666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 20 77.91666666666667 7 35.666666666666664 0.314193196111627 0.227535736496164 1.38085208481932 0.0866574596154632 0.0799743893431485 0.114854818981413 NaN NaN 0.138616310934897 0.531865641506782 746 0 254 0.254 0.746 0.508 ORF3a all ss13 180 ACA AAC CAG 2 AAACTCAAA:ATTACAGAC 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 18 77.5 7 35.75 0.277947211843005 0.226916358788052 1.22488838322414 0.051030853054953 0.0697002456667836 0.110441235523236 1.09067608903857 0.261414468017307 0.128119724943219 0.690404650362027 681 0 319 0.319 0.681 0.638 ORF3a all ss13 181 AAA CAG AAG 2 ACAGACCAT:CTCAAAGAA 1:1 TRUE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.83333333333334 7 36.083333333333336 0.240246862716335 0.224472453654355 1.07027325092757 0.0157744090619799 0.0598798054304997 0.112539244980902 NaN NaN 0.122950856997542 0.897912761549176 555 0 445 0.445 0.555 0.89 ORF3a all ss13 182 CAT AAG AAG 2 AAAGAAGAC:GACCATGAC 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.83333333333334 6 36.416666666666664 0.226136674284849 0.186038038359055 1.21553998461542 0.0400986359257938 0.0626753227913117 0.101262421708668 NaN NaN 0.113219427719013 0.723213396308438 669 0 331 0.331 0.669 0.662 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 CATGACTAC:GAAGACTAC 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.25 6 36.666666666666664 0.193420049534211 0.184599802154181 1.04778037287745 0.00882024738003009 0.0511693483189394 0.0968491105596311 NaN NaN 0.103323330023856 0.931970822711339 585 1 414 0.414 0.585 0.828 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 14 74.91666666666667 6 37.333333333333336 0.214927757699318 0.180871542612666 1.18828951528092 0.0340562150866518 0.0539082531203651 0.0920253511012859 NaN NaN 0.109674715562217 0.756165397473956 628 0 372 0.372 0.628 0.744 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.91666666666667 6 37 0.229330320216207 0.182716561993313 1.25511512319611 0.0466137582228946 0.0549244719694535 0.0964954385574584 NaN NaN 0.110633472736773 0.673510449696664 668 1 331 0.331 0.668 0.662 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.91666666666667 6 36.75 0.24743074621853 0.184125343811615 1.34381688634719 0.0633054024069151 0.0554579206073908 0.0918512916467922 NaN NaN 0.110405861186448 0.566381973833099 720 0 280 0.28 0.72 0.56 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.66666666666667 6 36.75 0.267034361445878 0.184125343811615 1.45028574512312 0.0829090176342636 0.0584851217690507 0.093370795960835 NaN NaN 0.114827808475621 0.470276595014412 787 0 213 0.213 0.787 0.426 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.5 6 36.916666666666664 0.267742763704315 0.183183742573707 1.46160767294392 0.0845590211306077 0.0585507301447078 0.0992104695843447 NaN NaN 0.112221873007716 0.451150368707783 775 1 224 0.224 0.775 0.448 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATA 2 GGTTATACG:GGTTATTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 18 76.91666666666667 6 36.166666666666664 0.28050317670762 0.187498978963039 1.49602508909083 0.0930041977445808 0.0585573338348585 0.10404578716104 NaN NaN 0.112846039438994 0.409843587616316 799 0 201 0.201 0.799 0.402 ORF3a all ss13 190 ACG ATA CGG 2 TATACGGAA:TATTCTGAG 1:1 TRUE 1 1 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 19 78.41666666666667 6 35.333333333333336 0.292630113009912 0.19253988513586 1.51984152687858 0.100090227874052 0.0598488658276534 0.103962678417801 NaN NaN 0.12105998436602 0.408360578512709 808 0 192 0.192 0.808 0.384 ORF3a all ss13 191 GAA CGG AAA 2 ACGGAAAAG:TCTGAGGAT 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 19 78.25 5 35.50000000000001 0.293392860236678 0.156000428408735 1.88071829820854 0.137392431827944 0.0592312280356921 0.0925870875413162 NaN NaN 0.108332721265495 0.204710472332959 895 0 105 0.105 0.895 0.21 ORF3a all ss13 192 AAG AAA AGT 2 GAAAAGTGG:GAGGATAGG 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 19 76.75 5 34.333333333333336 0.300443259262439 0.161916285324778 1.85554688745359 0.138526973937661 0.0639803082081222 0.0927395719299392 NaN NaN 0.110698053489192 0.210790455632959 900 0 100 0.1 0.9 0.2 ORF3a all ss13 193 AGG AGT GGC 2 AAGTGGGAA:GATAGGCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.166666666666667 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 18 75.91666666666667 6 34.833333333333336 0.284997283854379 0.195697415235261 1.45631603520039 0.0892998686191179 0.0601850735607335 0.120398622546649 NaN NaN 0.135958443502997 0.511298347693154 760 0 240 0.24 0.76 0.48 ORF3a all ss13 194 CAC GGC AAT 2 AGGCACTCA:TGGGAATCT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.25000000000001 7 35.5 0.268812518156829 0.228784770270838 1.17495809637419 0.0400277478859912 0.0597627921187634 0.130336961804411 NaN NaN 0.143390862067687 0.780128703024424 610 1 389 0.389 0.61 0.778 ORF3a all ss13 195 TCA AAT CAG 2 CACTCAGGT:GAATCTGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.58333333333334 6 34.5 0.248724605929925 0.197860943283853 1.25706772545354 0.0508636626460724 0.0560255130300642 0.120064640626265 NaN NaN 0.136877885363547 0.710191557118557 662 0 338 0.338 0.662 0.676 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT:TCTGGTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.25000000000001 6 33.5 0.24238832144563 0.20465023999998 1.18440282037125 0.0377380814456497 0.0565411880107104 0.129558009997238 NaN NaN 0.147172921689959 0.797626541672074 630 0 370 0.37 0.63 0.74 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.91666666666669 6 33.166666666666664 0.239944051297493 0.207018740932176 1.15904507107453 0.0329253103653171 0.0577072333393974 0.127590886336335 NaN NaN 0.149321488480164 0.825482178342096 597 1 402 0.402 0.597 0.804 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 16 79.25000000000001 6 32.50000000000001 0.235201662735449 0.211925228838758 1.10983323705362 0.0232764338966907 0.0543183862240852 0.1358255714312 NaN NaN 0.149521741695551 0.87629111899954 581 0 419 0.419 0.581 0.838 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT:AAAGACTGT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 16 78.08333333333334 6 33.00000000000001 0.239340732066682 0.208223802448709 1.14943982989475 0.0311169296179728 0.0559118359696712 0.132084439388594 NaN NaN 0.140608569680685 0.824857448241926 649 0 351 0.351 0.649 0.702 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC:GACTGTGTT 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.91666666666669 6 33.00000000000001 0.239944051297493 0.208223802448709 1.15233728553486 0.0317202488487835 0.0556249685897719 0.124208447324753 NaN NaN 0.148075597973032 0.830378163680471 607 0 393 0.393 0.607 0.786 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT:TGTGTTACA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.33333333333336 6 33.00000000000001 0.221099655165484 0.208223802448709 1.06183660352637 0.0128758527167741 0.0517278524569559 0.12957383519719 NaN NaN 0.15040092001934 0.931776290471512 549 0 451 0.451 0.549 0.902 ORF3a all ss13 202 ACA TCG CAT 2 GTCGTTGTA:GTTACATTA 1:1 TRUE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 2 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.00000000000003 6 33.333333333333336 0.222199362107379 0.20582763427632 1.07954096100177 0.0163717278310589 0.0522912760139654 0.131530307722745 NaN NaN 0.151800528282151 0.914114466401414 582 0 418 0.418 0.582 0.836 ORF3a all ss13 203 GTA CAT TAC 2 ACATTACAT:GTTGTACAT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.83333333333336 4 33.50000000000001 0.222753358291529 0.130054644852002 1.71276741822651 0.0926987134395269 0.0536222047046377 0.0871244682527856 NaN NaN 0.102364274592166 0.365159886713386 813 0 187 0.187 0.813 0.374 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 GTACATGGC:TTACATGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.16666666666669 4 34.00000000000001 0.210854230397134 0.127969137773072 1.64769595284014 0.0828850926240612 0.0537802077992996 0.090057799679998 NaN NaN 0.107897982970546 0.442380143359752 802 0 198 0.198 0.802 0.396 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT:CATGGTTAC 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.00000000000001 4 33.50000000000001 0.211388364105741 0.130054644852002 1.62538111842368 0.081333719253739 0.0522962967324416 0.0849705116870918 NaN NaN 0.111455445569656 0.465547905977415 788 0 212 0.212 0.788 0.424 ORF3a all ss13 206 TAC GCT ACT 2 GGCTATTTC:GGTTACTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 14 75.33333333333334 4 34.16666666666667 0.213552421666518 0.127288788480472 1.67770016680833 0.0862636331860462 0.0543020054916195 0.082143460104862 NaN NaN 0.107222196394291 0.421090091840457 787 0 213 0.213 0.787 0.426 ORF3a all ss13 207 TTC ACT TCA 2 TACTTTACA:TATTTCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 14 75.66666666666667 5 33.833333333333336 0.212464845734057 0.164591833676269 1.29085897512964 0.0478730120577883 0.0522902738606466 0.0955212873255666 NaN NaN 0.119585684593629 0.688917939638414 667 0 333 0.333 0.667 0.666 ORF3a all ss13 208 ACA TCA CAT 2 TTCACCGAA:TTTACATCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.33333333333334 5 33.833333333333336 0.210322806792345 0.164591833676269 1.27784472713284 0.0457309731160767 0.0513355310913076 0.0996863273391574 NaN NaN 0.118481975812311 0.699515855944441 650 0 350 0.35 0.65 0.7 ORF3a all ss13 209 GAA CAT AAG 2 ACATCAGAA:ACCGAAGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.33333333333334 5 33.833333333333336 0.210322806792345 0.164591833676269 1.27784472713284 0.0457309731160767 0.0530887224377419 0.100429462727341 NaN NaN 0.118391981035715 0.699298576366868 664 0 336 0.336 0.664 0.672 ORF3a all ss13 210 GAA AAG AAT 2 GAAGTTTAC:TCAGAATGC 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.666666666666667 0.416666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.33333333333334 5 33.50000000000001 0.193179203235308 0.16642540730596 1.16075547815944 0.0267537959293483 0.0518533876194151 0.0983489052394072 NaN NaN 0.113288508421788 0.813311381557551 634 0 366 0.366 0.634 0.732 ORF3a all ss13 211 TAC AAT ACT 2 GAATGCTAC:GTTTACTAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.75 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.08333333333334 5 33.41666666666667 0.17448602671933 0.166890228132415 1.04551374080985 0.00759579858691528 0.0486559186313768 0.0971658633993663 NaN NaN 0.111583296925917 0.945727603157604 588 0 412 0.412 0.588 0.824 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG:TGCTACCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.83333333333334 5 33.083333333333336 0.156594789439853 0.168775880107432 0.92782682774443 -0.0121810906675791 0.0457438893633057 0.0965944701198332 NaN NaN 0.11276155559091 0.913975694922659 484 0 516 0.516 0.484 0.968 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTG:TACCAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.00000000000001 5 32.91666666666667 0.156222782397911 0.169734844556617 0.920393115544416 -0.0135120621587051 0.0455413052686312 0.102492884633083 NaN NaN 0.116656088377649 0.907788718072814 469 0 531 0.531 0.469 0.938 ORF3a all ss13 214 CTG AGC TGT 2 CAGCTGTAC:CAGCTTGAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.00000000000001 5 32.583333333333336 0.156222782397911 0.171685985854599 0.909933222681419 -0.0154632034566873 0.0452850424081722 0.101390127084958 NaN NaN 0.112109951872652 0.890296601933602 458 0 542 0.542 0.458 0.916 ORF3a all ss13 215 GAG TGT ACT 2 CTGTACTCT:CTTGAGTCT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.83333333333334 5 32.91666666666667 0.156594789439853 0.169734844556617 0.922584810731774 -0.0131400551167634 0.0453789919578066 0.0994143990213665 NaN NaN 0.110525469219631 0.905364783308685 478 0 522 0.522 0.478 0.956 ORF3a all ss13 216 TCT ACT CTA 2 GAGTCTACA:TACTCTACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 10 78.66666666666669 5 32.41666666666667 0.13928785934632 0.172678550040526 0.806630929629826 -0.0333906906942059 0.0427023004020627 0.102784078034568 NaN NaN 0.117680291125102 0.776609085530949 400 0 600 0.6 0.4 0.8 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.33333333333336 5 31.41666666666667 0.136119019073684 0.178884786483983 0.760931221425428 -0.0427657674102989 0.0406497649873137 0.111299904873368 NaN NaN 0.128790990057053 0.739847287884022 367 0 633 0.633 0.367 0.734 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT:ACACAACTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.50000000000003 5 31.250000000000004 0.135810068779417 0.179963002222943 0.754655496417936 -0.044152933443526 0.0436411722398194 0.106269464188908 NaN NaN 0.122078759522852 0.717594310676205 343 1 656 0.656 0.343 0.686 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT:CAACTTAGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 10 78.33333333333336 5 32.75000000000001 0.139939466685309 0.170704815996831 0.819774567390688 -0.0307653493115219 0.0434958201878995 0.102937371309522 NaN NaN 0.112400587228647 0.784306230155925 385 0 615 0.615 0.385 0.77 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CTA 2 ATTACTACA:CTTAGTACA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.50000000000003 5 33.583333333333336 0.126170845288571 0.16596317904302 0.76023396283501 -0.0397923337544486 0.0395659724348199 0.0967610641857291 NaN NaN 0.115526094737309 0.730511989882343 381 0 619 0.619 0.381 0.762 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC:AGTACAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.33333333333336 5 34.416666666666664 0.112888706112188 0.161478827235442 0.69909292781519 -0.0485901211232535 0.0368164128051825 0.0960772913037013 NaN NaN 0.0998872008721821 0.626648202454814 353 0 647 0.647 0.353 0.706 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT:ACAGATACT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.00000000000003 5 34.75 0.113423227292943 0.15975246858483 0.709993581305531 -0.0463292412918871 0.0396492726405765 0.0977514692769704 NaN NaN 0.106850877167358 0.664587764815288 332 0 668 0.668 0.332 0.664 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT:GATACTGGT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.33333333333337 5 35.416666666666664 0.114507630156718 0.156408563919793 0.732105885298188 -0.0419009337630746 0.0399900071554159 0.094754506479768 NaN NaN 0.105306713298178 0.690708152315533 369 0 631 0.631 0.369 0.738 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT:ACTGGTGTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.50000000000004 5 35.24999999999999 0.114234586398441 0.157231298910254 0.726538463971127 -0.0429967125118128 0.0398789541073991 0.0902679428325855 NaN NaN 0.107052043310818 0.687946719522856 322 0 678 0.678 0.322 0.644 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA:GGTGTTGAA 1:1 FALSE 0.916666666666667 0.75 1.33333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.00000000000004 5 34.74999999999999 0.113423227292943 0.15975246858483 0.70999358130553 -0.0463292412918873 0.0400174421998434 0.0922321009727665 NaN NaN 0.107158599497174 0.66549233636978 347 0 653 0.653 0.347 0.694 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:GTTGAACAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.75000000000004 4 34.08333333333333 0.112227610965344 0.127628054258582 0.879333400617114 -0.0154004432932375 0.0383388653620684 0.0886033959187478 NaN NaN 0.0955384641581002 0.871938825162687 477 0 523 0.523 0.477 0.954 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATA 2 GAAAATGCT:GAACATACT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 ACT ATA CTA 2 AATGCTACA:CATACTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 ACTACCTTC:GCTACATTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC:ACCTTCTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC:TTCTTCATT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT:TTCATTTAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TAC TCT ACA 2 ATCTTTAAC:ATTTACAGT 1:1 TRUE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC ACA ACA 2 TACAGTAGA:TTTAACAAG 1:1 TRUE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT:AGTAGAATT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 ATT AGC TTG 2 AAGCTTGTT:AGAATTGTG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTG TTG TGG 2 ATTGTGGAT:CTTGTTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TGG AAG 2 GTGGATGAA:GTTAAAGAC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAA AAG AAC 2 AAAGACCCA:GATGAACCA 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA AAC CA- 1 GAACCAGAA:GACCCA--- 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.5 1.16666666666667 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- CAG AAG 1 CCA---CCG:CCAGAAGAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C ACC 1 ---CCGAAT:GAAGACCAT 1:1 TRUE 1.41666666666667 0.666666666666667 0.916666666666667 0 0 1 2 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT ACC ATG 2 CCGAATGTG:GACCATGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA:CATGTTCAA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA:GTTCAAATT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC:CAAATTCAC 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA:ATTCACACA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCA:GACGGCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCA GCT CAT 2 GGCTCATCA:GGCTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CAT CAG 2 TCATCAGGA:TCTTCAGGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA:ATGGATCCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT:GATCCTATC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATC CAA TCT 2 CCAATTTAT:CCTATCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TCT ATG 2 ATCTATGAT:ATTTATGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.58333333333336 14 33.75 0.135536624489237 0.604042526880535 0.224382586420183 -0.468505902391297 0.0420357202716414 0.24712085340517 0.113503998765321 0.0480563900346761 0.245002397484519 0.0558441001961008 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 71.91666666666669 15 34.08333333333333 0.136915000021786 0.662862330839796 0.206551185143263 -0.52594733081801 0.0423640619618802 NA 0.0989605459166314 0.0368693895827088 0.280768681859228 0.061035150163598 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 71.25000000000001 15 34.416666666666664 0.138321779350139 0.652616998847441 0.211949396957823 -0.514295219497301 0.0429872167334273 0.290878907711428 NA NA 0.261668533995746 0.0493627078992832 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 71.41666666666667 15 34.25 0.137967373637613 0.657697243495181 0.20977337977641 -0.519729869857568 0.0415366953051124 0.265732100488519 0.106551183046137 0.0489810106103721 0.273431043037411 0.0573319792625361 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAA 2 ATGAGAATT:ATGAGATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 71.75000000000001 15 34.916666666666664 0.137263997871083 0.637863835561037 0.21519325946791 -0.500599837689954 0.0435414394083309 0.247490394782679 NA NA 0.251741091902915 0.0467508557047627 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 7 ATT GAA TTT 2 AGAATTTTC:AGATTTTTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.41666666666667 15 35.25 0.135878602808038 0.628414519653643 0.216224480113745 -0.492535916845605 0.04430781014363 0.267731473136498 0.110269904860406 0.0498946851774857 0.236682323490406 0.0374339054147644 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACT:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.66666666666667 15 35.166666666666664 0.119061291806916 0.630748970219412 0.188761769623657 -0.511687678412497 0.0409939417067286 NA 0.0996411110044083 0.058169741559064 0.277477249123677 0.0651728302944172 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 9 ACT TCA CTC 2 TTCACTCTT:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.5 15 35 0.117599765999126 0.635473395290403 0.185058519948557 -0.517873629291276 0.0409427195720789 0.270452252717316 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 10 CTT CTC TTA 2 ACTCTTAGA:ACTCTTGGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 73 15 35.5 0.118472334721436 0.621519504417127 0.190617243512802 -0.503047169695691 0.0391994494775065 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAA 2 CTTAGATCA:CTTGGAACT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.33333333333334 16 35.16666666666667 0.117889187641809 0.699763144259601 0.168470129655863 -0.581873956617792 0.0411467111535669 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 12 ACT GAA CAA 2 AGATCAATT:GGAACTGTA 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.41666666666667 15 35.66666666666667 0.117744298602214 0.617010924563885 0.190830168340112 -0.499266625961671 0.040562190380888 NA 0.101052190595617 0.0589680080493358 0.264966790038986 0.0595296610001215 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 13 ATT CAA TAA 2 ACTGTAACT:TCAATTACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 72.75000000000001 15 35.333333333333336 0.102976648483437 0.626098273217229 0.164473618421415 -0.523121624733792 0.0372088218719389 0.244114702388149 0.0782544390221139 0.0355725478910494 0.25380520460044 0.0392921037633411 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 14 ACT TAA CTG 2 ATTACTGCA:GTAACTTTG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 72.91666666666669 14 34.66666666666667 0.102724391304868 0.579892416175111 0.177143877794477 -0.477168024870243 0.0363443796441459 0.237398281497236 0.0981478238353813 0.0710953223378805 0.225512875279752 0.0343513021370719 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 15 GCA CTG CAC 2 ACTGCACAG:ACTTTGAAA 1:1 TRUE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.08333333333336 14 34.5 0.102473368909235 0.584131426248621 0.175428618123381 -0.481658057339386 0.0352926120939245 NA 0.0883489825972018 0.0470741362793229 0.22374815539025 0.0313438791923688 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 16 AAA CAC AAC 2 GCACAGCCA:TTGAAACAA 1:1 TRUE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.41666666666669 13 34.333333333333336 0.0865304311153283 0.527177516628982 0.164139077228946 -0.440647085513654 0.0346604094132905 0.208937548319344 0.0917106210726697 0.0734941224334297 0.184251587386422 0.0167773485408843 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 17 CAA AAC AAG 2 AAACAAGGT:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.41666666666669 13 35.333333333333336 0.0877980575084776 0.505841285660844 0.173568389922495 -0.418043228152367 0.0341628898506855 0.20270254729248 0.105233694866783 0.0990736261596107 0.181073927424948 0.0209608931132486 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 18 GGT AAG GTG 2 CAAGGTGAA:CCAGTAAAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.16666666666669 13 35.91666666666667 0.0726960870999215 0.494202238982722 0.147097850567332 -0.4215061518828 0.0330476820585178 0.186694026444114 0.0917072739986456 0.108715535434621 0.167270065669382 0.0117383566563215 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 19 AAA GTG AAA 2 GGTGAAATC:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.33333333333334 13 36.00000000000001 0.0574443341110379 0.492584652291803 0.116618197184529 -0.435140318180765 0.0288820640298948 0.182737339079597 0.0711380278908004 0.101146032167429 0.185179148650257 0.0187817691874212 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 20 ATC AAA TCA 2 AAAATTGAC:GAAATCAAG 1:1 FALSE 1.75 0.75 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 73 12 35.66666666666667 0.0568993130810351 0.44646854291714 0.127443050543418 -0.389569229836105 0.027363540195967 0.173165916431023 0.0819900665969882 0.12009574668694 0.171031571329753 0.0227407559828372 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 21 AAG TCA ACA 2 ATCAAGGAT:ATTGACAAT 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.91666666666667 12 36.16666666666667 0.0719113287774619 0.438080105957789 0.164151094285005 -0.366168777180327 0.0318444820719474 0.154781164053039 0.0990780391966679 0.0975627769681003 0.157168034088869 0.0198171644588048 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 22 AAT ACA ATG 2 AAGGATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.58333333333334 11 35.50000000000001 0.0580701054974426 0.399733821305343 0.145271934478331 -0.3416637158079 0.0281202528087019 0.153771757084483 0.103243313156542 0.159402710461902 0.152824859304885 0.0253743552799617 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTA 2 AATGCTTCT:GATGCTACT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.58333333333334 10 34.833333333333336 0.0589259989959384 0.361891385702354 0.162827857539564 -0.302965386706416 0.0288135854620882 0.13533545075614 0.111414677712356 0.143889829373177 0.14553276236511 0.0373637042633595 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 24 ACT CTA CTC 2 GCTACTCCT:GCTTCTCCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 69.75000000000001 10 35.66666666666667 0.05965876642654 0.351102161303205 0.169918539393495 -0.291443394876665 0.0291638063156355 0.140283794809204 0.121734456372998 0.162770808058071 0.144740855442529 0.0440564770724575 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 ACTCCTTCA:TCTCCTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.91666666666669 9 35.50000000000001 0.0751566968036821 0.309399206498442 0.242911730945439 -0.23424250969476 0.033265345337996 0.122255613270131 0.17983066177659 0.176765792521698 0.129768036189208 0.0710611720465784 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT:CCTTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.66666666666669 9 35.416666666666664 0.0743181769831732 0.310300874693003 0.239503601324682 -0.23598269770983 0.0327060599109242 0.121133050609951 0.181055611751196 0.185895948173909 0.123416379116267 0.0558651985002273 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 27 AGT CAA ATT 2 GCAAGTACT:TCAGATTCT 1:1 TRUE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.33333333333336 8 34.75 0.0735883919688925 0.274994650264777 0.267599358380384 -0.201406258295884 0.0316163474374825 0.124340003322128 0.211229711569668 0.205203853509432 0.120366998350959 0.0942745299105392 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 28 ACT ATT CTG 2 AGTACTGTT:GATTCTGTT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.33333333333336 8 35.416666666666664 0.0591439311842398 0.268767772591288 0.2200558891939 -0.209623841407048 0.0298075195486334 0.105644493807272 0.267372734672875 0.410490705180998 0.115590182346362 0.0697533445503192 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT:TCTGTTCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.50000000000001 7 34.91666666666666 0.073408181482178 0.233267379251205 0.314695443991441 -0.159859197769027 0.0322722154094134 0.100475256672838 NaN NaN 0.11421330175538601 0.161616710717731 39 0 961 0.961 0.039 0.078 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT:GTTCGCGCT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.91666666666669 7 34.74999999999999 0.0729614963194686 0.234580833893542 0.311029230770746 -0.161619337574074 0.0310116864296209 0.101152382618574 0.351221298555309 0.375852068613966 0.109373818216652 0.139493856821344 38 0 962 0.962 0.038 0.076 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CGCGCTACT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.41666666666669 8 35.08333333333333 0.0582110227221988 0.271845168498986 0.214133004620297 -0.213634145776787 0.0287465971854821 0.10976758197253 0.213552245780544 0.315996210701585 0.118914948588182 0.0724104353619329 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.41666666666669 8 34.58333333333333 0.0573756358851215 0.276597228353308 0.207433878591992 -0.219221592468186 0.0280426830483206 0.115283284104638 0.220618087051463 0.347094634723887 0.116644941566542 0.0601909616117781 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.25000000000003 8 34.41666666666666 0.0566975883332357 0.278218809519287 0.203787761263155 -0.221521221186051 0.0290497639109721 0.11762387464915 0.22464499870652 0.364325007335164 0.127837974818431 0.0831262460067228 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.75000000000003 8 34.24999999999999 0.0562984016666259 0.279859737639748 0.201166491977122 -0.223561335973122 0.0281974536560467 0.117044536143116 0.258795846661257 0.436971583443384 0.126392307141634 0.076929075414323 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.83333333333336 8 33.41666666666666 0.0562324166616758 0.288367224091207 0.195002801857572 -0.232134807429531 0.0284155432713868 0.128729156707589 0.195410719844614 0.31832178537026 0.123214131641771 0.0595656523605319 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGA 2 ATACCGATA:ATACCGCTA 1:1 FALSE 0.75 1 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000003 8 32.41666666666666 0.0561009098120237 0.299294202221815 0.187444024627132 -0.243193292409791 0.0276976106845611 0.127222734797718 0.205533259612969 0.361774629246202 0.134686873054822 0.0709777388699601 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 37 ATA CGA TAC 2 CCGATACAA:CCGCTACAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000003 8 31.166666666666657 0.0555166649189651 0.314193196111627 0.176695948881213 -0.258676531192662 0.027958049284068 0.140105986444057 0.180985459408128 0.328916244617942 0.133756768648363 0.0531214558904273 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 ATACAAGCC:CTACAAGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.00000000000003 7 31.416666666666654 0.0553246126797069 0.264386521096341 0.209256555327746 -0.209061908416635 0.0272252635979294 0.114790507844419 NaN NaN 0.128812282456341 0.104590111852251 18 0 982 0.982 0.018 0.036 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCA 2 CAAGCCACA:CAAGCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.66666666666669 7 32.08333333333332 0.0555809791152914 0.257828654327118 0.215573320429984 -0.202247675211827 0.0273392278513857 0.114974094299719 0.240460894694324 0.369985495384297 0.121489359292506 0.0959654945639051 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 40 ACA CCA CAC 2 GCCACACTC:GCCTCACTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.66666666666669 7 32.08333333333332 0.0555809791152914 0.257828654327118 0.215573320429984 -0.202247675211827 0.027527643004819 0.116838969147361 0.259441889196359 0.406023471720878 0.118400433582795 0.0876054196913918 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 ACACTCCCT:TCACTCCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.16666666666669 7 31.74999999999999 0.0551973146854054 0.261065996643646 0.211430501846433 -0.205868681958241 0.0271895463861404 0.111171075353427 0.283772948561587 0.456229848966504 0.13071723894653 0.115275815782549 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.83333333333334 7 32.08333333333332 0.0554524994575896 0.257828654327118 0.215075006314987 -0.202376154869529 0.0276159697333196 0.111333204138587 0.274811005814931 0.433845127100087 0.121752974014271 0.096475377549712 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.16666666666667 7 31.74999999999999 0.0551973146854054 0.261065996643646 0.211430501846433 -0.205868681958241 0.0280469962537409 0.122724948910776 NaN NaN 0.121961423605448 0.091414693391634 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 76 7 31.08333333333332 0.0545695157118212 0.267793509240842 0.203774601806139 -0.21322399352902 0.0276193065962097 0.122565381591231 0.294013920230838 0.488260556185594 0.127683367236541 0.0949305669575442 18 0 982 0.982 0.018 0.036 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.33333333333333 7 30.74999999999999 0.0543223783836108 0.271290419358981 0.20023699514331 -0.21696804097537 0.0271862910929968 0.125474208632642 0.249981386761826 0.423127235679718 0.129742625873838 0.0944660186211873 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTA 2 TGGCTTATT:TGGCTTGTT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 76 7 30.416666666666657 0.0545695157118212 0.274880898641229 0.198520581028239 -0.220311382929407 0.0278540392487797 0.124795420569955 0.261422613468077 0.447621895634589 0.132554360296086 0.0965036444225607 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 47 ATT TTA TTA 2 CTTATTGTT:CTTGTTATT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.5 7 29.91666666666666 0.0541996476239405 0.280450538895226 0.193259202986196 -0.226250891271286 0.0266864849288696 0.123546821365706 NaN NaN 0.139462263620824 0.104737193643816 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 ATTGTTGGC:GTTATTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666667 6 29.749999999999993 0.0542609435735893 0.234911530842709 0.230984589725913 -0.18065058726912 0.0273517451242965 0.110707154112307 NaN NaN 0.118803267134378 0.128363756958781 28 0 972 0.972 0.028 0.056 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.83333333333334 5 30.083333333333325 0.054693929928504303 0.187892466749351 0.291091659366344 -0.133198536820847 0.0270372854380824 0.0947391149605005 NaN NaN 0.100333518055311 0.184324258675573 52 0 948 0.948 0.052 0.104 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75 5 30.91666666666666 0.0553246126797069 0.182159096576957 0.303715892971251 -0.12683448389725 0.0284174602645166 0.0880060052315201 NaN NaN 0.0993948329720855 0.201931773300363 67 0 933 0.933 0.067 0.134 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAC 2 GTTGCACTT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.66666666666666 5 30.25 0.0548189130040021 0.18671695246621 0.293593657565307 -0.131898039462208 0.0267951053376694 0.0950285010198766 NaN NaN 0.0992748766822682 0.183975189693346 49 0 951 0.951 0.049 0.098 ORF3a all ss13 52 CTT CAC TTC 2 GCACTTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333333 6 31.083333333333336 0.0550706014161129 0.223170685092358 0.246764495047019 -0.168100083676245 0.0280914396580002 0.109414344574292 0.278031774341066 0.37478790374126 0.106790213508552 0.115460850778858 42 0 958 0.958 0.042 0.084 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 CTTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.58333333333333 5 31.16666666666667 0.0548816190849609 0.180507022556888 0.304041462252055 -0.125625403471927 0.0281264264455522 0.0888383780281686 NaN NaN 0.095155776603308 0.186765630980458 61 0 939 0.939 0.061 0.122 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666666 5 30.833333333333336 0.0546316519559279 0.182716561993313 0.298996715787195 -0.128084910037385 0.0278091730177009 0.0890142044347788 NaN NaN 0.0979374994926969 0.190933366263614 70 0 930 0.93 0.07 0.14 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.91666666666666 5 31.16666666666667 0.0689348268033826 0.180507022556888 0.381895539724265 -0.111572195753505 0.0299825924785393 0.0907492166535546 NaN NaN 0.0964662938611566 0.247438871926528 86 0 914 0.914 0.086 0.172 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.25 5 30.500000000000004 0.0676896531853505 0.184981141936135 0.365927318195064 -0.117291488750785 0.0299141330112439 0.0879346181623097 NaN NaN 0.0966304670002949 0.224818462213133 93 0 907 0.907 0.093 0.186 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAGC:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.91666666666666 6 30.333333333333336 0.0679967073757475 0.229625165344413 0.296120450359872 -0.161628457968665 0.0298360178595262 0.10524613666214 0.317852742845395 0.35152891290045 0.115538569633045 0.161838941573974 50 0 950 0.95 0.05 0.1 ORF3a all ss13 58 AGC AAA GCG 2 CAAAGCGCT:CAGAGCGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.08333333333333 6 30.500000000000004 0.0687766788210944 0.228158530802244 0.301442503943482 -0.159381851981149 0.0301072984033842 0.0994577864953241 NaN NaN 0.114103224967634 0.162467218009236 49 0 951 0.951 0.049 0.098 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.91666666666666 6 31.000000000000004 0.0698992129639131 0.223869741416997 0.312231624164488 -0.153970528453084 0.0312796260382627 0.106363660888647 0.420491280122881 0.457760184151483 0.111757395609995 0.168289396409061 62 0 938 0.938 0.062 0.124 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.41666666666666 6 30.5 0.0694136680239339 0.228158530802244 0.304234375019263 -0.15874486277831 0.0311629014218296 0.106814575873615 0.417312557233083 0.465981843798652 0.117223865022165 0.175671749805734 46 0 954 0.954 0.046 0.092 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCCAAAATA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.41666666666666 5 29.5 0.0684625513252421 0.192126605059278 0.356340816536673 -0.123664053734036 0.0298503001418386 0.103927596624153 NaN NaN 0.105694094279689 0.241993493234782 101 1 898 0.898 0.101 0.202 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATA:AAAATAATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.74999999999999 5 29.166666666666668 0.0700625753990949 0.194633396613813 0.359972012090563 -0.124570821214718 0.030324469376568 0.100186276124695 NaN NaN 0.105977618822619 0.239816883552482 71 0 929 0.929 0.071 0.142 ORF3a all ss13 63 ATA TAA TAA 2 ATAATAACA:ATAATTGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.25 5 28.833333333333336 0.0695747645549368 0.197206849707019 0.352800953203709 -0.127632085152082 0.0306309289082594 0.10235858646917 NaN NaN 0.108381180331319 0.23894725128822 97 0 903 0.903 0.097 0.194 ORF3a all ss13 64 ACA TAA CAC 2 ATAACACTC:ATTGCGCTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.41666666666666 5 29.166666666666668 0.0694136680239339 0.194633396613813 0.356638013987202 -0.12521972858988 0.0317043530944488 0.0953100936981234 NaN NaN 0.106249693796091 0.238580591310862 86 0 914 0.914 0.086 0.172 ORF3a all ss13 65 CTC CAC TCA 2 ACACTCAAA:GCGCTCAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.74999999999999 5 29.500000000000004 0.0690937042816379 0.192126605059278 0.359625905325917 -0.12303290077764 0.0305074486192017 0.0934543904908548 NaN NaN 0.102367642167163 0.229412753488595 96 1 903 0.903 0.096 0.192 ORF3a all ss13 66 AAA TCA AAA 2 CTCAAAAAG:CTCAATAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.08333333333333 5 29.166666666666668 0.0687766788210944 0.194633396613813 0.353365249837156 -0.125856717792719 0.0307853797725554 0.0990948670844655 NaN NaN 0.109095956117159 0.248650577928775 89 0 911 0.911 0.089 0.178 ORF3a all ss13 67 AAA AAA AAA 2 AAAAAGAGG:AATAAAAGA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.08333333333333 5 28.166666666666668 0.0537744248135208 0.202564732921051 0.265467853352731 -0.14879030810753 0.026193129216203 0.102427868136167 NA NA 0.109131113835805 0.172753746314767 52 0 948 0.948 0.052 0.104 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AAGAGGTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.75 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.41666666666666 5 27.75 0.0675371643768684 0.206064750939693 0.327747293357485 -0.138527586562824 0.0287898330690517 0.0984061080111822 NaN NaN 0.109433374893186 0.205562376194314 76 0 924 0.924 0.076 0.152 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG:AGGTGGCAT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.58333333333333 5 28.333333333333336 0.0683065619163606 0.201197989946009 0.339499226282978 -0.132891428029649 0.0308815279898653 0.107203118921334 NaN NaN 0.10978906963663 0.226115876690535 104 0 896 0.896 0.104 0.208 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA:TGGCATTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.91666666666666 5 28.666666666666668 0.0689348268033826 0.198519415670312 0.347244759766295 -0.129584588866929 0.0303428512328224 0.103892347913021 NaN NaN 0.107485222291939 0.227970306122536 84 1 915 0.915 0.084 0.168 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC:CATTTAGCC 1:1 FALSE 0.5 0 0.166666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.33333333333333 6 28.83333333333334 0.0694941228620286 0.243733392896608 0.285123519744822 -0.17423927003458 0.0299412139921999 0.116837296368091 NaN NaN 0.111854648533477 0.119297417638807 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT:TTAGCCCTC 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 77 6 29.000000000000004 0.111834664347976 0.242080044197288 0.461973909162186 -0.130245379849312 0.0542216407942929 0.112938932002553 0.523942370331821 0.377924688910001 0.127783956465915 0.308078417936533 103 0 897 0.897 0.103 0.206 ORF3a all ss13 73 CTC CCC TCT 2 GCCCTCTCT:GCCCTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.66666666666666 6 29.500000000000004 0.110800159129969 0.237252996159118 0.467012686557006 -0.126452837029149 0.0528559454195406 0.110883283630062 NaN NaN 0.119496911322286 0.289959673184928 125 0 875 0.875 0.125 0.25 ORF3a all ss13 74 TAT TCT ATA 2 CTCTCTAAG:CTTTATAAG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 78 6 29.16666666666667 0.110290063467372 0.240449165598692 0.45868349425444 -0.13015910213132 0.0557421835409438 0.110297593572203 NaN NaN 0.127712871454397 0.308129792969883 102 0 898 0.898 0.102 0.204 ORF3a all ss13 75 AAG ATA AGG 2 TATAAGGGC:TCTAAGGGT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.333333333333333 1.08333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.16666666666666 6 29.000000000000004 0.095366381613935 0.242080044197288 0.393945655166083 -0.146713662583353 0.0488510651710594 0.109459583737148 NaN NaN 0.121569635809533 0.227498320312092 106 0 894 0.894 0.106 0.212 ORF3a all ss13 76 GGC AGG GCT 2 AAGGGCTTC:AAGGGTGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.24999999999999 6 28.250000000000007 0.0965740892437444 0.249703998029926 0.386754277086786 -0.153129908786182 0.0499197119409277 0.11745116418171 NaN NaN 0.130046633483921 0.238996004095675 92 0 908 0.908 0.092 0.184 ORF3a all ss13 77 GTT GCT TCC 2 GGCTTCCAG:GGTGTTCAC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.24999999999999 6 27.916666666666675 0.0965740892437444 0.253250234920167 0.381338596879043 -0.156676145676422 0.0505820700038983 0.116704517408171 0.542587219355896 0.482170863894907 0.134986214926001 0.245771016221208 91 0 909 0.909 0.091 0.182 ORF3a all ss13 78 CAC TCC ACT 2 GTTCACTTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.49999999999999 6 27.583333333333343 0.11105698371059 0.256899645924678 0.432297145879103 -0.145842662214087 0.0537155271742404 0.122293684762414 NaN NaN 0.130153553607671 0.262482410576451 81 1 918 0.918 0.081 0.162 ORF3a all ss13 79 TTC ACT TCA 2 CACTTTGTT:CAGTTCATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.75 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.83333333333331 6 27.583333333333343 0.095802032379497 0.256899645924678 0.37291617135037203 -0.161097613545181 0.0535799335544364 0.120500678213906 NaN NaN 0.123465311043111 0.191960750326506 61 1 938 0.938 0.061 0.122 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 TTCATTTGC:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.74999999999999 7 27.583333333333343 0.0959115685461867 0.309784984170421 0.309606899776082 -0.213873415624235 0.050977404344192 0.145372815082533 0.283683476127455 0.27510504613227 0.146840989002815 0.145255361746462 41 0 959 0.959 0.041 0.082 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT:GTTTGCAAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.33333333333331 6 27.333333333333343 0.0951500406590925 0.259707177538375 0.366374320344045 -0.164557136879283 0.0546762672771873 0.12158148200228 0.418966018692698 0.38186091387313 0.126884846405548 0.194665109501121 66 0 934 0.934 0.066 0.132 ORF3a all ss13 82 AAC GCA ACT 2 TGCAACTTG:TGCAATTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.16666666666664 6 28.000000000000007 0.095366381613935 0.25235417746591 0.3779068869459 -0.156987795851975 0.0555854959901826 0.117032532811008 NA NA 0.121032366353718 0.19460612359318 75 0 925 0.925 0.075 0.15 ORF3a all ss13 83 TTA ACT TAC 2 AACTTGCTG:AATTTACTG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.16666666666664 6 28.000000000000007 0.095366381613935 0.25235417746591 0.3779068869459 -0.156987795851975 0.0525065177181238 0.116428653462655 NaN NaN 0.1242567024659 0.206440035457214 78 0 922 0.922 0.078 0.156 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG:TTGCTGCTG 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.49999999999999 6 27.833333333333343 0.0949346803392896 0.254152739478919 0.373533964394525 -0.15921805913963 0.0496008353058055 0.114589269738129 NaN NaN 0.117220780376487 0.174376430021799 51 0 949 0.949 0.051 0.102 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA:CTGCTGCTG 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.58333333333331 7 28.833333333333343 0.124279002650387 0.293338244775017 0.423671324363811 -0.16905924212463 0.0583960193699124 0.13759895419507 0.338698806703309 0.210978519173164 0.131339049442474 0.198025601608846 63 0 937 0.937 0.063 0.126 ORF3a all ss13 86 CTA TGC TAT 2 CTGCTATTT:CTGCTGTTT 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.41666666666664 7 29.500000000000007 0.124566345596374 0.285269390232816 0.436662151150222 -0.160703044636443 0.063893175625655 0.123193578040583 0.321656971279156 0.174609745695366 0.127228722597899 0.20655198685198 64 0 936 0.936 0.064 0.128 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:CTGTTTGTA 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.5 1.08333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.33333333333331 7 30.750000000000007 0.12471051706475 0.27129041935898 0.459693775251712 -0.14657990229423 0.0599650505124523 0.116248795105244 0.329970386815548 0.163578530790659 0.122369557461275 0.230976920151254 85 0 915 0.915 0.085 0.17 ORF3a all ss13 88 GTA TTG TAA 2 TTTGTAACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.24999999999997 7 30.00000000000001 0.123142795706581 0.27950646396388 0.44057226426969 -0.156363668257299 0.0600134637809296 0.120880885032949 0.319202145057428 0.167515948243514 0.12123453259284 0.197133376984876 64 0 936 0.936 0.064 0.128 ORF3a all ss13 89 ACA TAA CAG 2 GTAACAGTT:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.08333333333331 7 30.16666666666668 0.123424890893523 0.277637470472643 0.444554154320049 -0.15421257957912 0.0629858564645644 0.125105816306082 NaN NaN 0.115141907358658 0.180464485122529 72 0 928 0.928 0.072 0.144 ORF3a all ss13 90 ATC CAG TCT 2 ACAGTTTAT:ACCATCTAT 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.41666666666664 7 30.16666666666668 0.122861989946783 0.277637470472643 0.442526686825181 -0.15477548052586 0.0598972350751701 0.120566399797285 0.331217060906008 0.181528853245284 0.121546441049046 0.202881265813876 59 0 941 0.941 0.059 0.118 ORF3a all ss13 91 TAT TCT ATT 2 ATCTATTCA:GTTTATTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.91666666666664 6 30.50000000000001 0.123708284429488 0.228158530802243 0.542203195271764 -0.104450246372756 0.0600246049781543 0.104481173224902 0.433480045760468 0.21100210569007 0.10747246703681 0.331110689930108 144 0 856 0.856 0.144 0.288 ORF3a all ss13 92 TCA ATT CAC 2 TATTCACAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.24999999999999 6 30.16666666666668 0.123142795706581 0.231110927283054 0.53282982831773 -0.107968131576473 0.0575395590506946 0.103708024173168 NaN NaN 0.100167067094508 0.281087074398216 119 1 880 0.88 0.119 0.238 ORF3a all ss13 93 CAT CAC ATC 2 TCACATCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.58333333333331 6 29.50000000000001 0.120931721082168 0.237252996159118 0.509716307232906 -0.116321275076949 0.0583066806085173 0.106231920924915 0.382081598877663 0.182187170240422 0.108116891795098 0.281978968582074 111 0 889 0.889 0.111 0.222 ORF3a all ss13 94 CTT ATC TTT 2 CATCTTTTG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.08333333333331 6 29.333333333333343 0.121751485582717 0.238840298338901 0.509761068083908 -0.117088812756184 0.0591768567330402 0.109443313635717 NaN NaN 0.10391543780244 0.259839676951491 116 0 884 0.884 0.116 0.232 ORF3a all ss13 95 TTG TTT TGC 2 CTTTTGCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.41666666666666 6 29.66666666666668 0.121203743914918 0.235686824877377 0.51425761273664 -0.114483080962459 0.0586869463129924 0.103516694344339 NaN NaN 0.106993193247659 0.284617776579687 99 0 901 0.901 0.099 0.198 ORF3a all ss13 96 CTT TGC TTG 2 TTGCTTGTC:TTGCTTGTT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.08333333333333 6 30.66666666666668 0.123424890893523 0.2267106539047 0.544415927384719 -0.103285763011177 0.0604245146247566 0.102486550275465 NaN NaN 0.105056111874027 0.325534337390323 150 0 850 0.85 0.15 0.3 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TCG 2 CTTGTCGCT:CTTGTTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.33333333333333 6 31.000000000000014 0.123002232202702 0.223869741416997 0.549436611773223 -0.100867509214295 0.0605725994000095 0.102378809756619 0.527470140623406 0.297576317330956 0.102674214253798 0.32590109423755 135 0 865 0.865 0.135 0.27 ORF3a all ss13 98 GCT TCG CTG 2 GTCGCTGCA:GTTGCTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.16666666666666 7 31.000000000000014 0.123283681565969 0.268659167443214 0.458885072633998 -0.145375485877245 0.0592023748219006 0.11446516124183 0.367549878419807 0.211848954929074 0.123245756144597 0.238176158265151 81 0 919 0.919 0.081 0.162 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.24999999999999 7 30.416666666666682 0.121476995958792 0.274880898641228 0.441925927044289 -0.153403902682436 0.0581177007675556 0.122805303196016 NaN NaN 0.120779490134341 0.204043490647327 71 0 929 0.929 0.071 0.142 ORF3a all ss13 100 GGC CAG GCC 2 GCAGGTATG:GCTGGCCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.41666666666666 7 30.25000000000001 0.119589757406955 0.2767124213498 0.432180661871258 -0.157122663942845 0.0601557184007115 0.121383509450291 NaN NaN 0.117165168909112 0.179908890702891 75 0 925 0.925 0.075 0.15 ORF3a all ss13 101 ATG GCC TGG 2 GGCCTTGAA:GGTATGGAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.75 7 30.583333333333343 0.119061291806916 0.273073727172108 0.436004199451513 -0.154012435365192 0.0573484029521655 0.112217882372871 0.333639726305675 0.191276770833155 0.127636793128652 0.227568474832445 71 0 929 0.929 0.071 0.142 ORF3a all ss13 102 GAA TGG AAG 2 ATGGAGGCG:CTTGAAGCC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.41666666666667 6 30.416666666666675 0.119589757406955 0.228889480485489 0.522478172230971 -0.109299723078534 0.05892840119647 0.108143245399653 NaN NaN 0.105484283491893 0.300122516873664 126 0 874 0.874 0.126 0.252 ORF3a all ss13 103 GCC AAG CCC 2 GAAGCCCCA:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 81.16666666666667 6 30.666666666666675 0.134588203229996 0.2267106539047 0.593656279102664 -0.092122450674704 0.058008119804455 0.104053815327259 NaN NaN 0.110005594559224 0.402348530268659 163 0 837 0.837 0.163 0.326 ORF3a all ss13 104 CAA CCC AAT 2 GCCCCATTT:GCGCAATTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 81.41666666666667 7 31.000000000000007 0.148969278730818 0.268659167443214 0.554491700947837 -0.119689888712396 0.0637806689309476 0.123933364443545 0.419720811635217 0.186469185394697 0.125682365506359 0.340934482215203 110 0 890 0.89 0.11 0.22 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTC 2 CAATTTTTG:CCATTTCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 81.08333333333334 7 31.000000000000007 0.134739729478646 0.268659167443214 0.501526639723268 -0.133919437964568 0.058009795980149 0.121576687452896 0.340588059057238 0.140877411755768 0.110924872593893 0.227317188471915 85 0 915 0.915 0.085 0.17 ORF3a all ss13 106 CTT TTC TGT 2 TTTCTTTAT:TTTTTGTAC 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.91666666666667 7 31.166666666666675 0.135043810631934 0.266933470240076 0.505908122014364 -0.131889659608142 0.0599480917029951 0.121170504560021 NaN NaN 0.108690191118313 0.224959411689823 81 0 919 0.919 0.081 0.162 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACC 2 CTTTATCTT:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.91666666666667 6 32.00000000000001 0.136897596837873 0.215761554338836 0.634485588766599 -0.078863957500963 0.0596649292869394 0.0977800562259987 NaN NaN 0.0931852379315978 0.39737768338153 176 0 824 0.824 0.176 0.352 ORF3a all ss13 108 CTC ACC TCT 2 TACCTCTAT:TATCTTTAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.00000000000001 6 32.41666666666667 0.136741167595466 0.212555050951034 0.643321186599168 -0.0758138833555683 0.0604966362291112 0.0996990642902505 0.447441878095441 0.150497625615462 0.09460877928957 0.422934325185019 190 0 810 0.81 0.19 0.38 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 CTCTATGCC:CTTTATGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.16666666666667 6 32.58333333333334 0.136429382099394 0.211299152734159 0.645669328693614 -0.0748697706347653 0.0604966103588547 0.0985880668287402 NaN NaN 0.0907001156517008 0.409107647515727 193 1 806 0.806 0.193 0.386 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 TATGCCTTG:TATGCTTTA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.16666666666667 6 32.58333333333334 0.136429382099394 0.211299152734159 0.645669328693614 -0.0748697706347653 0.0601211048388358 0.0959633242334466 NaN NaN 0.0911559156042003 0.411454060590327 173 0 827 0.827 0.173 0.346 ORF3a all ss13 111 TTA CCT TAG 2 GCCTTGATA:GCTTTAGTT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.83333333333334 6 32.91666666666667 0.137054385390789 0.208831643632827 0.656291273710231 -0.0717772582420377 0.0595196903385858 0.0951135299099192 NaN NaN 0.0894728037447227 0.422423216562438 181 0 819 0.819 0.181 0.362 ORF3a all ss13 112 ATA TAG TAT 2 TTAGTTTAT:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 81.66666666666667 6 33.08333333333334 0.133686173554739 0.207619511953736 0.643899854578834 -0.0739333383989969 0.0584749209091571 0.0924469341410567 NaN NaN 0.0909905205954933 0.416482469354407 183 0 817 0.817 0.183 0.366 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATT 2 ATATATTTT:GTTTATTTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 82.33333333333334 6 33.91666666666667 0.132502157521956 0.201765204947521 0.65671460823198 -0.0692630474255645 0.0587414410381207 0.0911158779679913 NaN NaN 0.0830154221156139 0.404089687960059 162 0 838 0.838 0.162 0.324 ORF3a all ss13 114 TTC ATT TCT 2 TATTTCTTG:TATTTTCTA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 82 6 34.25000000000001 0.133091525357086 0.199515431752951 0.66707384079386 -0.0664239063958648 0.0600317761830686 0.0909686841729733 NaN NaN 0.0851624234973212 0.43541011688901 195 0 805 0.805 0.195 0.39 ORF3a all ss13 115 CTA TCT TAC 2 TTCTTGCAA:TTTCTACAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 81 6 34.583333333333336 0.134891598224071 0.19731556308439 0.683633850850268 -0.0624239648603196 0.0567525038464882 0.085627115413526 NaN NaN 0.0864774471621577 0.470385143203333 222 1 777 0.777 0.222 0.444 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAA 2 CTACAATGC:TTGCAAAGT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 12 81 6 34.91666666666667 0.165046413582601 0.195163947524611 0.845680852821386 -0.0301175339420096 0.0657190591244398 0.0886105437508896 NaN NaN 0.0881316816764674 0.732551579272702 347 1 652 0.652 0.347 0.694 ORF3a all ss13 117 AGT AAA GCA 2 CAAAGTATA:CAATGCATC 1:1 TRUE 2.25 0.416666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 12 79.5 7 35.75000000000001 0.16853783682123 0.226916358788052 0.742731100222926 -0.0583785219668221 0.0684146628007441 0.0994151644008368 0.614386059058056 0.226701395358636 0.101807543184531 0.566360082115965 269 0 731 0.731 0.269 0.538 ORF3a all ss13 118 ATA GCA TAA 2 AGTATAAAC:TGCATCAAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 79.08333333333334 7 36.08333333333334 0.153847312516879 0.224472453654355 0.685372793018848 -0.070625141137476 0.0663675727410131 0.0981893953138769 0.44625310932313 0.124577946819072 0.0973632549655147 0.46822030461854 212 0 788 0.788 0.212 0.424 ORF3a all ss13 119 AAC TAA ACG 2 ATAAACTTT:ATCAACGCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 79.75 7 35.41666666666667 0.152421181209951 0.229414483788198 0.664392146010585 -0.0769933025782464 0.0679026483313498 0.0980259504140077 NaN NaN 0.0951398375302456 0.418362963695937 203 0 797 0.797 0.203 0.406 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AACTTTGTG 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.75 1.16666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.75 8 35.75 0.154570468491074 0.265759990634356 0.581616774301211 -0.111189522143282 0.0687228303472908 0.10346447646205 0.353827852627991 0.100220704026733 0.108544722733608 0.305662440537306 146 0 854 0.854 0.146 0.292 ORF3a all ss13 121 GTG CAT GTA 2 GCATGTAGA:TTTGTGAGA 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 3 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.16666666666667 7 35.083333333333336 0.138321779350139 0.231968667588477 0.596295097903173 -0.0936468882383375 0.0639077522770373 0.101941254884264 0.433002048514705 0.16847563790451 0.102638524813597 0.36156076226061 158 0 842 0.842 0.158 0.316 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 GTGAGAATA:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.33333333333333 8 35.75 0.109784651326779 0.265759990634356 0.413096986738779 -0.155975339307577 0.0493298876411897 0.104444079893347 0.241001428981228 0.0865130763385042 0.0925641658852505 0.0919787343033025 24 0 976 0.976 0.024 0.048 ORF3a all ss13 123 ATA GAA TAA 2 AGAATAATA:AGAATTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 78 8 35.916666666666664 0.110290063467372 0.264281463445784 0.41732046595087 -0.153991399978411 0.0489367858040469 0.106470481865509 0.232162052999007 0.0722500095675037 0.093189277889480407 0.0984411498759461 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 124 ATA TAA TAA 2 ATAATAATG:ATTATTATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.33333333333333 8 36.25 0.109784651326779 0.261373712626115 0.420029429217395 -0.151589061299336 0.0481572068501942 0.105089378185598 0.232689695213096 0.0710581876289889 0.0949824407407901 0.110495643398747 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 125 ATG TAA TGA 2 ATAATGAGG:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.5 8 36.083333333333336 0.109533681430367 0.262819463546309 0.416763963948459 -0.153285782115942 0.0507343228085158 0.102105908110423 0.249194813537768 0.0944371234933064 0.0901033597328495 0.0889013826611578 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT:ATGAGGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 79 8 36.75 0.108787621497542 0.25713126368002 0.423082047435975 -0.148343642182477 0.0491583372847404 0.102103979987527 0.266555037140737 0.112462349759465 0.0948981184268115 0.11800827715696 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 127 CTT GAT GTT 2 AGATGTTGG:AGGCTTTGG 1:1 TRUE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 79 8 37.083333333333336 0.123566424807041 0.25437938121672 0.485756448561248 -0.130812956409678 0.0500569071738803 0.0996558524145339 0.253269048880288 0.0551178139092057 0.0898380821393261 0.14536582362398 46 0 954 0.954 0.046 0.092 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 CTTTGGTTG:TGTTGGCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.41666666666667 7 36.75 0.137843761514516 0.219740343511106 0.627302930868263 -0.08189658199659 0.0571630477067897 0.0887629389890247 0.458083654139532 0.170872108981864 0.0933315494105159 0.380225895770399 174 0 826 0.826 0.174 0.348 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TGT 2 TGGCTTTGT:TGGTTGTGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 78.58333333333334 7 36.58333333333333 0.139450189981991 0.220904431633438 0.631269318369266 -0.0814542416514477 0.0594117270441096 0.0941226235655819 0.472747561856278 0.181771605019261 0.0934650747563903 0.383484540137252 190 1 809 0.809 0.19 0.38 ORF3a all ss13 130 TGC TGT GCT 2 CTTTGTTGG:TTGTGCTGG 1:1 FALSE 2.08333333333333 0.5 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 12 78.66666666666669 6 36.666666666666664 0.170542381646746 0.184599802154181 0.923849211410884 -0.0140574205074358 0.0668432744397186 0.0834904679657523 NaN NaN 0.0864339196685737 0.870803641640006 435 1 564 0.564 0.435 0.87 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAA:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.25000000000003 6 36.58333333333333 0.204399702385691 0.185076724431924 1.10440522984766 0.0193229779537677 0.0748208324000315 0.0815207268610068 NaN NaN 0.0968948462322962 0.841932540143976 592 0 408 0.408 0.592 0.816 ORF3a all ss13 132 AAA GGA AAT 2 TGGAAATGC:TGGAAGTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.1666666666667 7 36.33333333333333 0.20465023999998 0.222674045667529 0.919057447339599 -0.0180238056675486 0.0749303806047747 0.0957980303624045 0.648373418630183 0.156342144757383 0.110511876462033 0.870444554318417 422 0 578 0.578 0.422 0.844 ORF3a all ss13 133 TGC AAT GCA 2 AAATGCCGT:AAGTGCAAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 16 78.75000000000003 7 35.75 0.236957742360063 0.226916358788052 1.0442514749736 0.0100413835720107 0.0818237586276154 0.095254891904491 0.873372389644532 0.231831482376025 0.12054347192391 0.93361225914922 524 1 475 0.475 0.524 0.95 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC:TGCCGTTCC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 2 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 16 79.08333333333336 7 35.583333333333336 0.235784099565018 0.228158530802244 1.03342223819536 0.00762556876277484 0.0836274371880455 0.0949829190507183 0.864526242466336 0.231945435985925 0.115908323961573 0.947545291698546 544 1 455 0.455 0.544 0.91 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG:CGTTCCAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.75000000000003 6 35.583333333333336 0.202909342656595 0.190999228388671 1.06235687111619 0.0119101142679239 0.0733898190238041 0.0820915513637599 NaN NaN 0.108246972595543 0.912387781669828 538 0 462 0.462 0.538 0.924 ORF3a all ss13 136 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAT:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 79.08333333333337 6 35.916666666666664 0.20192785781644 0.188983168709011 1.06849651847758 0.0129446891074287 0.0749360580655045 0.0790925361460101 NaN NaN 0.106724363486835 0.903460664598302 557 1 442 0.442 0.557 0.884 ORF3a all ss13 137 AAC AAA ACC 2 AAAAATCCT:AAGAACCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 79.50000000000003 6 35.333333333333336 0.200714352979387 0.19253988513586 1.04245597133165 0.00817446784352671 0.0721121727341265 0.0821034936127603 NaN NaN 0.109367423512905 0.940419059637259 539 0 461 0.461 0.539 0.922 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA:AATCCTTTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.83333333333337 6 35.333333333333336 0.202663072619289 0.19253988513586 1.05257709318921 0.0101231874834284 0.0755512441209908 0.0874125253358889 1.14730104676929 0.358913389074638 0.110810235425818 0.927209667797172 554 0 446 0.446 0.554 0.892 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTT:CCTTTACTT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.6666666666667 6 35.5 0.20315621560155 0.191510018856633 1.06081246722468 0.0116461967449163 0.0744089413214836 0.0859116933565492 NaN NaN 0.105153651224535 0.911811353720394 542 0 458 0.458 0.542 0.916 ORF3a all ss13 140 CTT TAC TTT 2 TTACTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.6666666666667 6 36.166666666666664 0.206166540743903 0.187498978963039 1.0995608716597 0.0186675617808639 0.0762092016377628 0.0834736963320646 NaN NaN 0.106149805584484 0.860403509244536 571 0 429 0.429 0.571 0.858 ORF3a all ss13 141 TAT TTT ATG 2 CTTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.9166666666667 7 36.166666666666664 0.205405574614085 0.223869741416997 0.917522722427592 -0.0184641668029129 0.0746146982313711 0.0947714303772656 NaN NaN 0.116826057253263 0.874418691468093 432 0 568 0.568 0.432 0.864 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC:TATGATGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.75000000000003 7 37.00000000000001 0.205912255736412 0.218017195136802 0.944477134508614 -0.0121049394003899 0.0734105798162079 0.0863947196787794 0.698557049483963 0.176362491503091 0.115684555146571 0.916663479546595 461 0 539 0.539 0.461 0.922 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC:GATGCTAAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.33333333333336 8 37.41666666666667 0.224432171139643 0.251686323459179 0.891713812872488 -0.0272541523195361 0.0764168282332147 0.102587315682929 0.629752434345747 0.156782773217595 0.122269866054064 0.823612068535168 401 1 598 0.598 0.401 0.802 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC:GCTAACTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.83333333333336 8 37.583333333333336 0.240246862716335 0.250361262210016 0.959600780870018 -0.0101143994936813 0.0774189826625143 0.0951525879162233 0.615846030617358 0.119189887022494 0.117945804485918 0.931661469056505 467 0 533 0.533 0.467 0.934 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTC:AACTACTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.83333333333336 9 37.583333333333336 0.258158161718876 0.288464693936611 0.894938504244145 -0.0303065322177352 0.0813282874700835 0.113447812612308 0.542747873131221 0.0991675431833667 0.131312529013626 0.817472544759986 384 0 616 0.616 0.384 0.768 ORF3a all ss13 146 TTC ACT TCC 2 TACTTCCTG:TACTTTGTT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.416666666666667 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.83333333333336 9 37.583333333333336 0.258158161718876 0.288464693936611 0.894938504244145 -0.0303065322177352 0.0805538976543818 0.112415677156347 0.555269118661732 0.107022820658624 0.12765221654067 0.812334968108797 401 0 599 0.599 0.401 0.802 ORF3a all ss13 147 CTG TCC TGT 2 TTCCTGTGT:TTTGTTTGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.75000000000001 9 37.083333333333336 0.258488520746743 0.293223013063023 0.881542407079711 -0.0347344923162802 0.084228569828728 0.109033424082011 0.510251333213722 0.0840486403414173 0.128165981387724 0.786381962681239 375 0 625 0.625 0.375 0.75 ORF3a all ss13 148 TGC TGT GCT 2 CTGTGTTGG:GTTTGCTGG 1:1 FALSE 2.08333333333333 0.5 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.41666666666669 8 37.583333333333336 0.259818540246921 0.250361262210016 1.03777452611248 0.00945727803690449 0.0823960627420628 0.0968129853437758 0.790120945592232 0.189035548394299 0.114984833915598 0.934449466771339 520 0 480 0.48 0.52 0.96 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGTTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.50000000000003 8 37.666666666666664 0.259484741116488 0.249703998029926 1.03916934916432 0.00978074308656188 0.0848832714728175 0.0980960937849336 0.647598113168589 0.108570498698195 0.125824331298646 0.938040188266882 526 0 474 0.474 0.526 0.948 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.83333333333336 8 37 0.258158161718876 0.255061761633984 1.01213980513996 0.00309640008489126 0.084143753118046 0.100565490447827 0.742977436779706 0.173111021959895 0.119343160207261 0.97930092798328 511 0 489 0.489 0.511 0.978 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACTAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 77.41666666666669 8 37 0.278309461419876 0.255061761633984 1.09114537450444 0.0232476997858919 0.0880238437082741 0.0997702863639483 0.660038947422438 0.0982997264901313 0.121666984261142 0.848465669854767 566 0 434 0.434 0.566 0.868 ORF3a all ss13 152 AAT CAC ATA 2 ACACATAAC:ACTAATTGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 77.75000000000001 8 36.666666666666664 0.276866163038678 0.257828654327118 1.07383783141266 0.01903750871156 0.088702924031259 0.101666816134309 0.871350475546609 0.217805911819282 0.12558342452889 0.879508327637966 553 0 447 0.447 0.553 0.894 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 AATTGTTAC:CATAACTAT 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.416666666666667 0.666666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.91666666666669 8 36.833333333333336 0.261839694220712 0.256437672127084 1.02106563380029 0.00540202209362856 0.0866326314951162 0.105303541150046 0.580836247173341 0.0787605427330003 0.119790924956907 0.964031251884686 479 0 521 0.521 0.479 0.958 ORF3a all ss13 154 TAC ACT ACG 2 AACTATGAC:TGTTACGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.66666666666669 7 36.333333333333336 0.244568640424989 0.222674045667529 1.0983257599323 0.0218945947574604 0.0801302184566628 0.0929914633226434 0.84152022467684 0.191835449213725 0.115849404363636 0.850099194258184 553 0 447 0.447 0.553 0.894 ORF3a all ss13 155 GAC ACG ACT 2 TACGACTAT:TATGACTAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.33333333333336 7 36.333333333333336 0.242080044197288 0.222674045667529 1.08714979993104 0.0194059985297594 0.0801094850859739 0.0914685759176514 0.847097233450948 0.199358087501254 0.117472845447971 0.868790019385363 577 0 423 0.423 0.577 0.846 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT:GACTATTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.00000000000001 8 36.333333333333336 0.243317923578779 0.260656845281595 0.933479891218339 -0.0173389217028162 0.0821817280402273 0.104548246096281 NaN NaN 0.129235210613304 0.893271614125312 461 0 539 0.539 0.461 0.922 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA:TATTGTATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.00000000000001 8 36.333333333333336 0.243317923578779 0.260656845281595 0.933479891218339 -0.0173389217028162 0.0854807238011228 0.103707486653548 NaN NaN 0.12345278692154 0.888304597234972 442 0 558 0.558 0.442 0.884 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA:TGTATTCCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.50000000000001 8 36.333333333333336 0.245198876012612 0.260656845281595 0.940696093163087 -0.0154579692689833 0.0866087643074369 0.099228899070689 0.767329120644061 0.220222907103301 0.13192931635011 0.906726473250714 458 0 542 0.542 0.458 0.916 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT:ATTCCATAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.16666666666669 8 36.333333333333336 0.246469230096624 0.260656845281595 0.945569757933489 -0.0141876151849704 0.0841411807582486 0.101778787823213 0.719996540556502 0.189082673278263 0.130823256194893 0.913639752964059 487 0 513 0.513 0.487 0.974 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATACAAT:CCATATAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.16666666666669 8 36.666666666666664 0.264931700823142 0.257828654327118 1.02754948442236 0.00710304649602317 0.0853356890271093 0.102733675727639 NaN NaN 0.130011947701828 0.956430212001995 515 0 485 0.485 0.515 0.97 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAATAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 76.50000000000001 8 36.666666666666664 0.282358178426184 0.257828654327118 1.09513885942229 0.0245295240990657 0.0879020838883488 0.106974483290654 NaN NaN 0.13971738630711 0.860635469619264 567 0 433 0.433 0.567 0.866 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC:AATAGTGTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 76.16666666666669 8 36.333333333333336 0.283860150265539 0.260656845281595 1.0890185905491 0.0232033049839436 0.0891290317624703 0.104637588189459 0.68905847444772 0.114005135868214 0.134601534234575 0.863134750003407 596 0 404 0.404 0.596 0.808 ORF3a all ss13 163 GTA GTG TAA 2 AGTGTAACT:AGTGTCACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 75.33333333333336 8 36.5 0.287686797643992 0.259234959672941 1.10975309042788 0.0284518379710517 0.0919936618729216 0.0993049589973304 0.765926854898768 0.147364902043214 0.138182209670877 0.836868341431763 589 0 411 0.411 0.589 0.822 ORF3a all ss13 164 ACA TAA CAG 2 GTAACTTCT:GTCACAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 76.00000000000003 8 36.5 0.284617216278678 0.259234959672941 1.09791216677627 0.025382256605737 0.0882818960933317 0.101226526297034 0.780650166727797 0.159603185863779 0.131016147635536 0.84638432187372 593 0 407 0.407 0.593 0.814 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA:ACTTCTTCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 76.50000000000003 8 35.833333333333336 0.282358178426184 0.265018643484554 1.06542760431358 0.0173395349416301 0.0875125524503207 0.10530865695502 0.749320986331939 0.155067646429457 0.136830897029495 0.899160143455671 522 0 478 0.478 0.522 0.956 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT:TCTTCAATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.66666666666669 8 35.666666666666664 0.262862230268108 0.266505540694197 0.986329325774622 -0.00364331042608851 0.0812344294888848 0.109733051784442 0.704960226185548 0.161774715536337 0.129342591159449 0.977528231425723 493 0 507 0.507 0.493 0.986 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC:TCAATTGTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.50000000000001 7 35.833333333333336 0.263548415128416 0.226300369430573 1.16459560270082 0.037248045697843 0.0818458600307832 0.0953101994641584 NaN NaN 0.123885697184318 0.763670252530872 631 0 369 0.369 0.631 0.738 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCA 2 ATTGTCATT:ATTGTCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.00000000000001 7 35.833333333333336 0.26562886029046 0.226300369430573 1.17378889375588 0.0393284908598868 0.0824444901915977 0.0942300314768296 0.91419513388023 0.199156368954498 0.117582906534502 0.738021485186489 655 0 345 0.345 0.655 0.69 ORF3a all ss13 169 ATT TCA TTA 2 GTCATTACC:GTCGTTACT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.50000000000001 7 36 0.263548415128416 0.225078444337754 1.1709180588299 0.0384699707906628 0.0759908401174407 0.0906522208541596 NaN NaN 0.120125561433665 0.748780338920276 627 0 373 0.373 0.627 0.746 ORF3a all ss13 170 ACC TTA CCT 2 ATTACCTCC:GTTACTGAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 77.16666666666669 6 35.16666666666667 0.279401963476042 0.193580949501978 1.44333398609137 0.0858210139740639 0.0849960012425689 0.0854771765626795 NaN NaN 0.111309551233875 0.440699742909743 771 1 228 0.228 0.771 0.456 ORF3a all ss13 171 GAA CCT AAG 2 ACCTCCGGT:ACTGAAGGT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 19 77.50000000000001 6 35.16666666666667 0.296875661285402 0.193580949501978 1.53359957190606 0.103294711783424 0.0839720089990166 0.0902151752408862 NaN NaN 0.119308461827171 0.386611592695777 800 0 200 0.2 0.8 0.4 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:TCCGGTGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 77.16666666666669 5 35.16666666666667 0.279401963476042 0.157645932730055 1.77233854776625 0.121756030745987 0.0809108476216147 0.079788847466062 NaN NaN 0.110757888341077 0.271637688681105 871 0 129 0.129 0.871 0.258 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGATGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 78.16666666666669 5 34.833333333333336 0.275083189587406 0.159326652781303 1.72653592343394 0.115756536806103 0.0815974279720513 0.0800733631254451 NaN NaN 0.110119782303488 0.293172490763885 843 0 157 0.157 0.843 0.314 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT:GATGGCACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 77.16666666666667 5 35.166666666666664 0.279401963476042 0.157645932730055 1.77233854776625 0.121756030745987 0.0791448070017342 0.0780885520170125 NaN NaN 0.111664168934236 0.275547151630792 859 0 141 0.141 0.859 0.282 ORF3a all ss13 175 ACA GCA CAA 2 GGCACAACA:GGCATTTCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 76.66666666666667 5 35.666666666666664 0.281613206922171 0.155190536855492 1.81462873077371 0.12642267006668 0.0839252559439675 0.0723523311779304 NaN NaN 0.113315386018156 0.264563063790211 864 0 136 0.136 0.864 0.272 ORF3a all ss13 176 ACA CAA CAA 2 ACAACAAAT:ATTTCAACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 18 76.41666666666667 6 35.99999999999999 0.282732161667018 0.18848582121068 1.50001819686477 0.0942463404563385 0.0837063855074362 0.0871455984501543 1.39881968121711 0.283564810971845 0.121218560995961 0.436869141076497 802 0 198 0.198 0.802 0.396 ORF3a all ss13 177 AAT CAA ATC 2 ACAAATCCC:TCAACACCA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.91666666666667 6 36.166666666666664 0.261839694220712 0.187498978963039 1.39648597378403 0.0743407152576726 0.0797874817563765 0.0864780517010597 NaN NaN 0.112237967431309 0.507747524719221 741 0 259 0.259 0.741 0.518 ORF3a all ss13 178 CCA ATC CAA 2 AATCCCATT:ACACCAAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.25 6 36.166666666666664 0.24238832144563 0.187498978963039 1.29274475405762 0.0548893424825905 0.0733044374580896 0.079833477086433 NaN NaN 0.109565812447836 0.616391225246822 681 0 319 0.319 0.681 0.638 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC:CCCATTACA 1:1 TRUE 1.41666666666667 0.666666666666667 0.916666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.41666666666667 7 35.99999999999999 0.241772556876833 0.225078444337754 1.07417019692045 0.0166941125390794 0.0735766392679783 0.0956295351938332 NaN NaN 0.118842962463827 0.888287047847896 565 0 435 0.435 0.565 0.87 ORF3a all ss13 180 ACA AAC CAG 2 AAACTCAAA:ATTACAGAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 77 7 36.08333333333333 0.20822380244871 0.224472453654356 0.927614052677191 -0.0162486512056459 0.0616891078434736 0.0936538340471067 NaN NaN 0.111099186286963 0.883721227457689 468 0 532 0.532 0.468 0.936 ORF3a all ss13 181 AAA CAG AAC 2 ACAGAACAT:CTCAAAGAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.33333333333333 7 36.416666666666664 0.173851210542993 0.22208100957439 0.782827900846511 -0.0482297990313963 0.0517757454939289 0.0954844279872073 NaN NaN 0.105783645211228 0.648441256161328 348 1 651 0.651 0.348 0.696 ORF3a all ss13 182 CAT AAC AAG 2 AAAGAAGAC:GAACATGAC 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 12 76.41666666666666 6 36.666666666666664 0.176201863051343 0.184599802154181 0.954507323383669 -0.00839793910283881 0.0511479184270537 0.081550916526284 0.786453811522624 0.224867971753764 0.0914716880738661 0.926849663942585 430 1 569 0.569 0.43 0.86 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 CATGACTAC:GAAGACTAC 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.5 6 37.24999999999999 0.145735279379414 0.181329278360777 0.80370517489986 -0.0355939989813634 0.0429175888799482 0.0855450534858203 NaN NaN 0.0883457469412205 0.687025975499155 375 1 624 0.624 0.375 0.75 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 73.83333333333333 6 38.25 0.16608898542729 0.175985531846771 0.943764999794996 -0.00989654641948087 0.0485826451140259 0.0799327391751588 NaN NaN 0.0865133864783915 0.908926074013515 493 0 507 0.507 0.493 0.986 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.83333333333333 6 37.916666666666664 0.16360869705703 0.177731272847004 0.920539725149379 -0.0141225757899737 0.0460501799228654 0.0803217784928 NaN NaN 0.0903280903054384 0.875759076149721 449 0 551 0.551 0.449 0.898 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.08333333333333 6 37.666666666666664 0.163000202065247 0.179063586735151 0.910292287992297 -0.0160633846699032 0.0489163688169371 0.0828674160469421 NaN NaN 0.0910035094212706 0.859890226848265 435 0 565 0.565 0.435 0.87 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 12 75 6 37.5 0.179963002222943 0.179963002222943 1 0 0.0511430903454686 0.0836898732891767 NaN NaN 0.0919516734725898 1 513 0 487 0.487 0.513 0.974 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.33333333333333 6 38.166666666666664 0.181789348152453 0.17641872921631 1.03044245336082 0.00537061893614302 0.0507398346570784 0.0779931263313202 NaN NaN 0.0887418133945597 0.951741806938712 519 1 480 0.48 0.519 0.96 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT:GGTTATTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 13 75.5 6 37.666666666666664 0.195615152460455 0.179063586735151 1.09243401200148 0.0165515657253045 0.0532790580652569 0.080121192827766 NaN NaN 0.0905650770529349 0.854987268921495 553 0 447 0.447 0.553 0.894 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG:TATTTTGAG 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 77 6 36.833333333333336 0.20822380244871 0.18365333026498 1.13378724005864 0.0245704721837293 0.0524664172942207 0.0828398976430169 NaN NaN 0.100606814955575 0.807058314897925 589 0 411 0.411 0.589 0.822 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGA 2 TCTGAGGAT:TTTGAGAAA 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.58333333333333 5 37 0.209530707593171 0.149003021096613 1.40621784747111 0.0605276864965582 0.052255489788893 0.0759173136608142 NaN NaN 0.083361248799255 0.467784206714474 772 0 228 0.228 0.772 0.456 ORF3a all ss13 192 AAA AGA AAT 2 GAGAAATGG:GAGGATAGG 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 14 75.08333333333333 5 35.833333333333336 0.214375488522047 0.154389040653112 1.38854084211661 0.0599864478689356 0.0502283982338501 0.0760230860828791 NaN NaN 0.087553341052179 0.49325448735246 765 1 234 0.234 0.765 0.468 ORF3a all ss13 193 AGG AAT GGC 2 AAATGGGAA:GATAGGCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.166666666666667 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 13 74.16666666666666 6 36.416666666666664 0.199643853662043 0.186038038359055 1.07313458808208 0.0136058153029877 0.0520050273603898 0.101166599674196 NaN NaN 0.113024010991907 0.904182239977899 597 0 403 0.403 0.597 0.806 ORF3a all ss13 194 CAC GGC AAT 2 AGGCACTCA:TGGGAATCT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 12 73.83333333333333 7 36.75 0.183183742573707 0.219740343511106 0.833637281378189 -0.0365566009373982 0.049536157777591 0.111553467742478 NaN NaN 0.126879193150993 0.773253871324762 384 0 616 0.616 0.384 0.768 ORF3a all ss13 195 TCA AAT CAG 2 CACTCAGGT:GAATCTGGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.16666666666666 6 35.75 0.165253875289951 0.18998582171068 0.869822146736865 -0.024731946420729 0.0497811467340232 0.100639444476472 NaN NaN 0.117523650965816 0.833322487706361 423 0 577 0.577 0.423 0.846 ORF3a all ss13 196 GGA CAG GAG 2 TCAGGTGTT:TCTGGAGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.33333333333333 6 35.25 0.162396234146618 0.193059006111768 0.841174091886711 -0.0306627719651506 0.0477535021210177 0.106994822488662 NaN NaN 0.126426281982517 0.808365801554917 393 0 607 0.607 0.393 0.786 ORF3a all ss13 197 GTA GAG TAA 2 GGAGTAAAA:GGTGTTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 76 6 34.916666666666664 0.160807403509091 0.195163947524611 0.823960601067535 -0.0343565440155196 0.0483092817411393 0.105164195007121 NaN NaN 0.122073084112661 0.778371087159047 384 0 616 0.616 0.384 0.768 ORF3a all ss13 198 AAA TAA AAG 2 GTAAAAGAC:GTTAAAGAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 77 6 34.583333333333336 0.158481820250405 0.19731556308439 0.803189661134959 -0.0388337428339852 0.046718491941793 0.102244200545925 NaN NaN 0.122625662697545 0.751482416066096 386 1 613 0.613 0.386 0.772 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT:AAAGACTGT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.83333333333333 6 35.083333333333336 0.161201678172285 0.194105738514483 0.830483835284742 -0.0329040603421978 0.0470973010862012 0.104225929714768 NaN NaN 0.122950102130409 0.788990870276051 393 0 607 0.607 0.393 0.786 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC:GACTGTGTT 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.66666666666667 6 35.083333333333336 0.161597898479986 0.194105738514483 0.832525095428484 -0.0325078400344967 0.0485979417583488 0.102386289221475 NaN NaN 0.124655604286847 0.794261231016985 401 0 599 0.599 0.401 0.802 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT:TGTGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.08333333333334 6 35.083333333333336 0.144502989596306 0.194105738514483 0.744455010460828 -0.0496027489181768 0.044311752698661 0.107964564886238 NaN NaN 0.118836641015805 0.676383793551379 331 1 668 0.668 0.331 0.662 ORF3a all ss13 202 GTA TCG TAT 2 GTCGTTGTA:GTTGTATTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.75000000000001 6 35.416666666666664 0.145204582995195 0.192023563619284 0.756181065794014 -0.0468189806240892 0.0439411368137772 0.100957846733713 NaN NaN 0.119127084241798 0.694306855031958 330 1 669 0.669 0.33 0.66 ORF3a all ss13 203 GTA TAT TAC 2 GTATTACAC:GTTGTACAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.58333333333334 6 35.583333333333336 0.145557948736739 0.190999228388671 0.762086579954858 -0.0454412796519319 0.0447085519590836 0.10604199955185 NaN NaN 0.114319544355662 0.691003554022473 348 0 652 0.652 0.348 0.696 ORF3a all ss13 204 CAC TAC ACA 2 GTACATGGC:TTACACAGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.25 6 36.083333333333336 0.14626988152442 0.187991098237596 0.778068126074532 -0.0417212167131764 0.0436523437820091 0.107973774040431 NaN NaN 0.112518652893432 0.710791133924206 319 0 681 0.681 0.319 0.638 ORF3a all ss13 205 AGC ACA GCT 2 CACAGCTAC:CATGGCTAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.83333333333333 6 35.833333333333336 0.147169682776295 0.189483161783181 0.776690030878293 -0.0423134790068855 0.0461833994714806 0.109017419738704 NaN NaN 0.113574521584947 0.709474930661768 351 0 649 0.649 0.351 0.702 ORF3a all ss13 206 TAC GCT ACT 2 AGCTACTTC:GGCTATTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.33333333333333 5 36 0.148264213964023 0.15359580948451 0.965288144654596 -0.00533159552048651 0.0455204849596136 0.0851075949822006 NaN NaN 0.107150505717365 0.960315231456283 530 0 470 0.47 0.53 0.94 ORF3a all ss13 207 TTC ACT TCA 2 TACTTCACT:TATTTCACC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.66666666666666 6 35.666666666666664 0.147532720684541 0.190491169998981 0.774485876092471 -0.0429584493144405 0.0456018111928633 0.100372853773283 NaN NaN 0.117545625525961 0.714766631585868 389 0 611 0.611 0.389 0.778 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA:TTCACTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.49999999999999 6 35.5 0.145735279379414 0.191510018856633 0.760979922875539 -0.0457747394772194 0.0449548294539642 0.104015073236916 NaN NaN 0.122836502125367 0.70941066946439 341 0 659 0.659 0.341 0.682 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT:ACTTCAGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.83333333333331 6 35.166666666666664 0.145028544735405 0.193580949501978 0.749188105071893 -0.0485524047665734 0.0461065433180308 0.101974113596669 NaN NaN 0.122798375906789 0.692560166047681 342 0 658 0.658 0.342 0.684 ORF3a all ss13 210 GAT AAG ATT 2 GAAGTTTAC:TCAGATTAC 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.16666666666666 6 34.5 0.128580042454815 0.197860943283853 0.649850548171871 -0.0692809008290377 0.0422615475928843 0.0998400791909828 NaN NaN 0.119076316133996 0.560688391676366 286 0 714 0.714 0.286 0.572 ORF3a all ss13 211 TAC ATT ACT 2 GATTACTAC:GTTTACTAC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.83333333333333 6 34.5 0.112096321732094 0.197860943283853 0.566540924508174 -0.0857646215517595 0.0393194071164007 0.105684112762827 NaN NaN 0.11835111644824 0.46865907685051 225 0 775 0.775 0.225 0.45 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 78 6 34 0.125290563497375 0.20119798994601 0.622722739581025 -0.0759074264486349 0.0392619581501498 0.112239405131791 NaN NaN 0.126452914044686 0.548318216294189 244 0 756 0.756 0.244 0.488 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTG:TACCAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.5 6 33.5 0.124422507844916 0.20465023999998 0.607976359299299 -0.0802277321550646 0.0408089176845403 0.111918869309732 NaN NaN 0.125797647386414 0.523634969803824 245 0 755 0.755 0.245 0.49 ORF3a all ss13 214 CTG AGC TGT 2 CAGCTGTAC:CAGCTTGAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.83333333333333 6 32.833333333333336 0.123850470889023 0.209443067094397 0.591332396947772 -0.0855925962053742 0.0401002189522031 0.115487261727778 NaN NaN 0.123872382266208 0.489581876592974 231 0 769 0.769 0.231 0.462 ORF3a all ss13 215 GAG TGT ACT 2 CTGTACTCA:CTTGAGTCT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 9 79 6 32.833333333333336 0.123566424807041 0.209443067094397 0.589976199839308 -0.0858766422873555 0.0398565281901699 0.112889808979713 NaN NaN 0.125879408124092 0.495103905810267 248 1 751 0.751 0.248 0.496 ORF3a all ss13 216 TCA ACT CAA 2 GAGTCTACA:TACTCAACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.83333333333334 6 32.333333333333336 0.107566557885163 0.213188653016244 0.504560427411523 -0.105622095131081 0.0377397856266313 0.116587619071221 NaN NaN 0.120422915188496 0.380436130180893 180 0 820 0.82 0.18 0.36 ORF3a all ss13 217 ACA CAA CAC 2 TCAACTCAA:TCTACACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.50000000000001 6 31.333333333333332 0.105204990412841 0.221099655165484 0.475826117114927 -0.115894664752642 0.0362826272262972 0.118597770242792 NaN NaN 0.133554585351883 0.385520247184306 150 0 850 0.85 0.15 0.3 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT:ACTCAATTG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.33333333333336 6 31.5 0.105436462965892 0.219740343511106 0.479822964145695 -0.114303880545214 0.0351187305025093 0.125085820055237 NaN NaN 0.130170324927738 0.379883957798033 148 0 852 0.852 0.148 0.296 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TGA 2 CAAATTACT:CAATTGAGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.66666666666669 6 32.5 0.107808568999606 0.211925228838758 0.508710405034559 -0.104116659839152 0.0369207960796013 0.12188473723355 NaN NaN 0.126938785272042 0.412095509696473 179 0 821 0.821 0.179 0.358 ORF3a all ss13 220 ACT TGA CTA 2 ATTACTACA:TTGAGCACA 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.83333333333336 6 33.5 0.0945068750198486 0.20465023999998 0.46179703976823 -0.110143364980132 0.0348853560807999 0.109932677601566 NaN NaN 0.115402890734748 0.339868727605688 139 0 861 0.861 0.139 0.278 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC:AGCACAGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.66666666666669 6 34.33333333333333 0.0815281512006671 0.198960851821961 0.409769813780363 -0.117432700621294 0.0311486192777066 0.116682164167525 NaN NaN 0.116248577465033 0.312406122993316 123 0 877 0.877 0.123 0.246 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.33333333333336 6 34.66666666666666 0.081899468973744 0.196773198350618 0.416212521116886 -0.114873729376874 0.0325560078141007 0.110136160466539 NaN NaN 0.116840541243328 0.325525400960609 123 0 877 0.877 0.123 0.246 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.6666666666667 6 35.33333333333333 0.0826523551002107 0.19253988513586 0.429273940004116 -0.10988753003565 0.0313471825220255 0.105993273136467 NaN NaN 0.111562585650789 0.32463118977325 136 0 864 0.864 0.136 0.272 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT:ACTGGTGTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.00000000000003 6 35 0.0822741879423183 0.194633396613813 0.422713621473527 -0.112359208671495 0.0341611272119175 0.101984613196507 NaN NaN 0.115106601274406 0.328999177024 135 0 865 0.865 0.135 0.27 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA:GGTGTTGAA 1:1 FALSE 0.916666666666667 0.75 1.33333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.50000000000003 6 34.5 0.0817133878414161 0.197860943283853 0.412983919338691 -0.116147555442437 0.0322133295451101 0.106209661442122 NaN NaN 0.121642084724018 0.339663491968061 127 0 873 0.873 0.127 0.254 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:GTTGAACAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.25000000000003 5 33.833333333333336 0.0808863909048056 0.164591833676269 0.491436234095908 -0.0837054427714631 0.0319085987369561 0.103971772873935 NaN NaN 0.106470569590978 0.43175978364342 202 0 798 0.798 0.202 0.404 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GAACATGTA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA:CATGTAACT 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC:GTAACTTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC:ACTTTCTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTAC:TTCATCTTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TAC TCT ACA 2 ATCTACAAT:ATCTTTAAC 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC ACA ACA 2 TACAATAAA:TTTAACAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAA ACA AAA 2 AACAAGCTT:AATAAAATC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 ATC AAA TCG 2 AAAATCGTA:AAGCTTGTT 1:1 TRUE 1.75 0.75 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTA TCG TAG 2 ATCGTAGAT:CTTGTTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TAG AAG 2 GTAGATGAG:GTTAAAGAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:GATGAGCCC 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 1 GACCCA---:GAGCCCGAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.5 1.16666666666667 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- CCG AAG 1 CCA---CCG:CCCGAAGAA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C AAC 1 ---CCGAAT:GAAGAACAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 2 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT AAC ATG 2 CCGAATGTG:GAACATGTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTC ATG TCC 2 AATGTGCAA:CATGTCCAA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TCC AAA 2 GTCCAAATT:GTGCAAATA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC:CAAATTCAC 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA:ATTCACACA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC:ATCGACGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT:GACGGTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCA GCT CAT 2 GGCTCTTCA:GGTTCATCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CAT CAG 2 TCATCCGGA:TCTTCAGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT:TCCGGAGTT 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTTAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTTAATCCA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAA:GCAATGGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAA TGG AAC 2 ATGGAACCA:ATGGATCCA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA AAC CAA 2 GAACCAATT:GATCCAATT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAA:TATGATGAG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAA ATG AAC 2 GATGAACCG:GATGAGCCG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AAC CGA 2 GAACCGACG:GAGCCGACG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.16666666666669 4 33.666666666666664 0.0881207952860292 0.129351945263207 0.681248319124383 -0.0412311499771781 0.0447140276794322 0.0710809280091804 NaN NaN 0.0763081273205536 0.588973272054884 294 0 706 0.706 0.294 0.588 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.50000000000001 5 33.99999999999999 0.088993157850987 0.163690174515013 0.543668293559212 -0.0746970166640264 0.0429014142930561 0.084222586372437 NaN NaN 0.0923713130412969 0.418710551292437 182 0 818 0.818 0.182 0.364 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 70.83333333333334 5 34.33333333333333 0.0898829861073045 0.161916285324778 0.555120109919848 -0.0720332992174739 0.0425367399736914 0.0777896491970491 NaN NaN 0.0878269005452143 0.412117188398879 183 0 817 0.817 0.183 0.366 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA:TTTATGAGT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 71 5 34.166666666666664 0.089658862987337 0.162798378928371 0.550735600547877 -0.0731395159410336 0.043565430784196 0.0831555169487258 NaN NaN 0.0906428156610437 0.419725192263869 203 0 797 0.797 0.203 0.406 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAT 2 ATGAGATTT:ATGAGTATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.33333333333333 5 34.83333333333333 0.089213957146024 0.159326652781303 0.559943710538387 -0.0701126956352791 0.0426572082671878 0.0836850828356558 NaN NaN 0.0893573236277025 0.432668836826957 193 0 807 0.807 0.193 0.386 ORF3a all ss13 7 ATT GAT TTT 2 AGATTTTTT:AGTATTTTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 72 5 35.166666666666664 0.0728728113402358 0.157645932730055 0.462256209711541 -0.0847731213898191 0.0397946042658403 0.0782328145768353 NA NA 0.0890926598588822 0.341342329139741 133 0 867 0.867 0.133 0.266 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACG:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.58333333333333 5 34.74999999999999 0.0572387314369155 0.15975246858483 0.358296381545562 -0.102513737147914 0.0369179928001006 0.082291755533642 NaN NaN 0.0811213575443289 0.206334725850391 68 0 932 0.932 0.068 0.136 ORF3a all ss13 9 ACG TCA CGC 2 TTCACGCTC:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.41666666666666 5 34.58333333333333 0.0565638983071325 0.160610991304224 0.352179498101665 -0.104047092997091 0.0375381011168494 0.0806145568029952 NA NA 0.0892204785855986 0.243541879631586 95 0 905 0.905 0.095 0.19 ORF3a all ss13 10 CTC CGC TCG 2 ACGCTCGGA:ACTCTTAGA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.91666666666667 5 35.08333333333333 0.0569668741816512 0.158062767299148 0.360406660942713 -0.101095893117497 0.0352279204635009 0.0806838472499074 NA NA 0.0828556431939793 0.222409938075467 69 0 931 0.931 0.069 0.138 ORF3a all ss13 11 AGA TCG GAT 2 CTCGGATCA:CTTAGATCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.916666666666667 0.75 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.08333333333333 6 34.916666666666664 0.0568319121182793 0.195163947524611 0.291200874132312 -0.138332035406332 0.0361697120786439 0.0943844151045694 0.372560121483039 0.434437247866924 0.0911738808100254 0.129207826628064 37 1 962 0.962 0.037 0.074 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGATCAATC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.41666666666667 5 35.166666666666664 0.0565638983071325 0.157645932730055 0.358803410450111 -0.101082034422922 0.0364072055965063 0.0766520080570167 NaN NaN 0.0835663675926744 0.226431700650649 95 1 904 0.904 0.095 0.19 ORF3a all ss13 13 ATC CAA TCA 2 TCAATCACA:TCAATTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.41666666666667 6 35.166666666666664 0.0565638983071325 0.193580949501978 0.292197648852603 -0.137017051194846 0.0364114081374859 0.0917453600102764 NaN NaN 0.0933645956070327 0.142226967117244 41 0 959 0.959 0.041 0.082 ORF3a all ss13 14 ACA TCA CAC 2 ATCACACGT:ATTACTGCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.08333333333334 6 34.99999999999999 0.0568319121182793 0.194633396613814 0.291994658198581 -0.137801484495534 0.0357312808808038 0.0900958768267017 NaN NaN 0.0956543041752542 0.149692123697608 47 0 953 0.953 0.047 0.094 ORF3a all ss13 15 CGT CAC CAC 2 ACACGTCAA:ACTGCACAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 2 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.58333333333334 6 34.49999999999999 0.0564308375631679 0.197860943283853 0.285204531155053 -0.141430105720685 0.0368330842765522 0.0942197616850218 NaN NaN 0.0991866032110298 0.153897418410028 45 0 955 0.955 0.045 0.09 ORF3a all ss13 16 CAA CAC AAC 2 CGTCAACCG:GCACAGCCA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.25000000000001 6 34.83333333333333 0.0278131522748419 0.195697415235261 0.142123247981614 -0.167884262960419 0.020070133044967 0.0906229202355151 0.154933971902465 0.358977627968267 0.0911299802896508 0.0654384986981293 5 1 994 0.994 0.005 0.01 ORF3a all ss13 17 CCA AAC CAG 2 CAACCGAGT:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.08333333333334 7 34.99999999999999 0.0278777737612569 0.23261619622788 0.119844508737245 -0.204738422466623 0.0195897723467287 0.0998595935525439 0.118456959151539 0.311675042668676 0.10504093345198 0.0512799156405489 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 18 AGT CAG GTA 2 CCAGTAAAA:CCGAGTAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.58333333333334 7 35.166666666666664 0.0276848040229394 0.231324762417615 0.11967937947326 -0.203639958394675 0.0198130398478815 0.104477680347428 0.112464196392516 0.287258317252499 0.106976702914235 0.0569633871644318 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 19 AAA GTA AAA 2 AGTAAGATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.41666666666667 6 34.916666666666664 0.0277488297186241 0.195163947524611 0.142182150292512 -0.167415117805987 0.0193357232432113 0.0916921775387167 NA NA 0.0887806999582567 0.0593333397957667 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAC:AAGATTGAA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.33333333333333 6 34.33333333333333 0.027400307499342 0.198960851821961 0.137717079759294 -0.171560544322619 0.0196785462929002 0.0991586031218646 NA NA 0.091648985313146 0.06121619905807 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 21 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:ATTGACAAT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.16666666666667 6 34.666666666666664 0.0274630224286674 0.196773198350618 0.139566885423759 -0.169310175921951 0.0197445642507812 0.0942360468887927 NA NA 0.0889798526865719 0.0570676562064132 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 22 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333334 6 34.416666666666664 0.0137146678675636 0.198409364312814 0.0691230875874434 -0.18469469644525 0.0140345364695322 0.0951066066309999 NA NA 0.0890211635183054 0.0380117550839894 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTC 2 AATGCTCTT:AATGCTTCT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.58333333333334 6 34.74999999999999 0.0139053809368069 0.196233824001589 0.0708612850386807 -0.182328443064782 0.0139475757327547 0.0918967841862252 NA NA 0.0882982829369492 0.0389310498253892 0 2 998 0.998 0 0.001 ORF3a all ss13 24 CTT CTC CTC 2 GCTCTTCCT:GCTTCTCCT 1:1 TRUE 1 1 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.58333333333334 6 35.58333333333333 0.0141014729867999 0.190999228388671 0.0738299997636865 -0.176897755401871 0.0137050386540972 0.0903417988370405 NA NA 0.0854324003776765 0.0383946297640233 0 4 996 0.996 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 CTTCCTGCA:TCTCCTGCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666667 5 34.99999999999999 0 0.158481820250405 0 -0.158481820250405 0 0.0778703321205519 NA NA 0.0822958940454737 0.054134834916185 0 4 996 0.996 0 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666667 5 34.666666666666664 0 0.160180575223544 0 -0.160180575223544 0 0.0849666034326733 NA NA 0.0830077753763795 0.0536433163922988 0 4 996 0.996 0 0.001 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333334 5 33.99999999999999 0 0.163690174515013 0 -0.163690174515013 0 0.0816503412770472 NA NA 0.0859785297834048 0.0569297973942703 0 2 998 0.998 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 6 34.666666666666664 0 0.196773198350618 0 -0.196773198350618 0 0.091430253962933 NA NA 0.0961241980172775 0.0406509706961044 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000001 6 33.83333333333333 0 0.202335646591906 0 -0.202335646591906 0 0.0968190242491941 NA NA 0.0973143218518877 0.0375992467834792 0 3 997 0.997 0 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 7 33.33333333333333 0 0.246378050229027 0 -0.246378050229027 0 0.112483641235352 0 NaN 0.110697196349978 0.0260347064306143 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CATGCTACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666669 8 33.666666666666664 0 0.285760509183 0 -0.285760509183 0 0.131593517241982 0 NaN 0.129571400252757 0.0274240127656301 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 8 33.666666666666664 0 0.285760509183 0 -0.285760509183 0 0.123057241878802 0 NaN 0.120493891365866 0.0177123684357662 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000003 8 33.49999999999999 0 0.287492986673213 0 -0.287492986673213 0 0.131114770347352 0 NaN 0.124259808741522 0.0206872466589411 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.1666666666667 8 33.166666666666664 0 0.291022534714547 0 -0.291022534714547 0 0.126617581759004 0 NaN 0.135886058723508 0.0322203787101175 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.25000000000003 8 32.33333333333333 0 0.300242781455809 0 -0.300242781455809 0 0.122831715553328 0 NaN 0.133514201023286 0.0245271083651542 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.4166666666667 8 31.33333333333333 0 0.312120297918684 0 -0.312120297918684 0 0.137098823617467 0 NaN 0.144087756945408 0.0302972860807828 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.6666666666667 8 30.83333333333333 0 0.318423959611188 0 -0.318423959611188 0 0.146192647448099 0 NaN 0.149523401536516 0.0332052458513118 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 8 31.16666666666666 0 0.314193196111627 0 -0.314193196111627 0 0.138601607298609 0 NaN 0.144250729073844 0.029398240120871 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 8 31.83333333333333 0 0.306064756191029 0 -0.306064756191029 0 0.140692756779681 0 NaN 0.131034783766078 0.0195041714354093 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 8 31.83333333333333 0 0.306064756191029 0 -0.306064756191029 0 0.138497269897919 NA NA 0.135348197147055 0.0237398276358064 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 8 31.499999999999996 0 0.310074958318006 0 -0.310074958318006 0 0.134216047503363 0 NaN 0.135972766035183 0.0225828153028739 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666669 8 31.83333333333333 0 0.306064756191029 0 -0.306064756191029 0 0.141225368548625 0 NaN 0.135483440033892 0.0238798658131644 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 8 31.66666666666666 0 0.308056623906756 0 -0.308056623906756 0 0.138407115530124 0 NaN 0.137950970482561 0.0255431574971001 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666669 8 30.999999999999996 0 0.316294221734959 0 -0.316294221734959 0 0.143000270809891 0 NaN 0.137971956597764 0.0218795183965944 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333336 8 30.66666666666666 0 0.320583011120205 0 -0.320583011120205 0 0.133083609931557 NA NA 0.142414979076806 0.0243824719047863 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 8 30.33333333333333 0 0.324991546958348 0 -0.324991546958348 0 0.145158684440326 0 NaN 0.151533705531233 0.031978314660117003 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT:CTTGTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.75000000000001 8 29.916666666666668 0 0.330678508474864 0 -0.330678508474864 0 0.150049899104615 0 NaN 0.150792878312693 0.0283122881918693 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC:GTTGTTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.08333333333336 8 29.416666666666668 0.0129174344873365 0.337775741046657 0.0382426353275389 -0.324858306559321 0.0135667286465581 0.151999737327147 NA NA 0.148243229734207 0.0284237892532036 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.1666666666667 7 30.08333333333333 0.0130722263514627 0.27856879640113 0.0469263841476314 -0.265496570049667 0.0135043302411631 0.132175412094477 0.0720304439086525 0.514736768126209 0.124790796851728 0.0333758013731421 2 1 997 0.997 0.002 0.004 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.33333333333336 7 30.916666666666668 0.0132162010123647 0.269530500680923 0.0490341574663208 -0.256314299668558 0.0132624605248434 0.120920758411954 NA NA 0.131128946846574 0.050621599870614 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAC 2 GTTGCACTT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.00000000000001 7 30.250000000000004 0.0131007697802931 0.2767124213498 0.0473443501971748 -0.263611651569507 0.0128751687649768 0.127858909151219 0.0846149489312525 0.575802096297301 0.132990587889306 0.0474587886414538 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 52 CTT CAC TTC 2 GCACTTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.33333333333336 7 30.91666666666667 0.0130438070339019 0.269530500680923 0.0483945490434253 -0.256486693647021 0.0135787777862336 0.128645067774683 NA NA 0.12843980385387 0.0458316067413657 1 1 998 0.998 0.001 0.002 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 CTTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.66666666666669 6 30.91666666666667 0.0129873375085957 0.224573223705648 0.0578311932931881 -0.211585886197052 0.0126210188990919 0.108405928842289 NA NA 0.104648907890417 0.0431903774207269 3 1 996 0.996 0.003 0.006 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.00000000000001 6 30.583333333333336 0.0129313548258795 0.227432270381152 0.0568580474714865 -0.214500915555273 0.0126565924549731 0.102220478228419 0.0864270827412369 0.510619717163721 0.113695582605972 0.0592107971318499 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333336 6 30.416666666666668 0.0127934871784325 0.228889480485489 0.0558937315568049 -0.216095993307057 0.012342469338167 0.106466724495478 NaN NaN 0.112269540599619 0.0542548504696336 3 1 996 0.996 0.003 0.006 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.16666666666669 6 29.750000000000004 0.0125789112103712 0.234911530842709 0.0535474404566104 -0.222332619632338 0.0131774953001885 0.110382853610292 NaN NaN 0.118584951829984 0.0608091585007958 2 2 996 0.996 0.002 0.004 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAGC:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.16666666666669 6 29.416666666666668 0.0125789112103712 0.238043979028558 0.0528428035092713 -0.225465067818186 0.0130548843631057 0.115574858878815 NA NA 0.110476215313139 0.0412660235323197 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 58 AGC AAA GCG 2 CAAAGCGCT:CAGAGCGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.25000000000001 6 29.666666666666668 0.0127256499425275 0.235686824877377 0.0539938961337715 -0.22296117493485 0.0125440717403154 0.113099941176762 NA NA 0.11937944312288 0.0618083509599907 4 1 995 0.995 0.004 0.008 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.08333333333336 7 30.333333333333336 0.0129174344873365 0.275793585093988 0.0468373275721202 -0.262876150606652 0.0134458153788063 0.123084127621915 NaN NaN 0.136710037530024 0.0544958997292035 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.25000000000003 7 30.166666666666668 0.0128896835290581 0.277637470472643 0.0464263109266735 -0.264747786943585 0.0134025029307583 0.128466591391842 0.0900915421479408 0.606326808571074 0.133130470899932 0.0467416106809312 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCCAAAGTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.25000000000003 6 29.166666666666668 0.0127256499425275 0.240449165598692 0.0529244920057926 -0.227723515656165 0.012929248793201 0.122721229628623 NaN NaN 0.119048418010556 0.0557653764805962 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAAGTGATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333336 6 28.833333333333332 0.0130014090011593 0.243733392896608 0.0533427481833584 -0.230731983895449 0.0125078120391474 0.116949031957693 NA NA 0.119432782479827 0.0533720653910586 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG:GTGATTGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.25000000000001 5 28.5 0.0128896835290581 0.199849674976131 0.0644968951317912 -0.186959991447073 0.0129694621881766 0.0977374070686959 NA NA 0.0946892193503384 0.0483295629058471 4 1 995 0.995 0.004 0.008 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC:ATTGCGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.41666666666669 5 28.833333333333336 0.0128620515547158 0.197206849707019 0.0652211197218778 -0.184344798152303 0.013579406097319901 0.0952406853876893 NA NA 0.0988638894689027 0.0622329670603678 6 1 993 0.993 0.006 0.012 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT:GCGCTTCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.58333333333334 6 29.166666666666668 0.0128345378007018 0.240449165598692 0.0533773438919832 -0.22761462779799 0.0119559252846966 0.106396212242772 NA NA 0.110068829995376 0.0386466126016519 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA:CTTCATAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.25000000000001 6 28.166666666666668 0.0127256499425275 0.250581126994749 0.0507845506768518 -0.237855477052222 0.0133972309782975 0.122525594734711 NaN NaN 0.1197267054102 0.0469608093265836 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA:CATAAGAGG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.91666666666669 5 27.5 0.0126185941874855 0.20822380244871 0.0606011130288228 -0.195605208261224 0.0126327786428911 0.104012104233876 NA NA 0.105144544504961 0.0628366223451989 8 2 990 0.99 0.008 0.016 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AAGAGGTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.75 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.75000000000001 5 27.25 0.0385937229566066 0.210428875701957 0.183405071323335 -0.17183515274535 0.0290093218390421 0.103753061612185 NaN NaN 0.114927979473005 0.134873972832791 30 0 970 0.97 0.03 0.06 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG:AGGTGGCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.25000000000001 6 27.5 0.0388436318463037 0.257828654327118 0.150656768339725 -0.218985022480815 0.0295696973357497 0.119100538622148 0.229564095262398 0.511648344106078 0.130001758546955 0.0920894461425702 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA:TGGCAGCTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.58333333333336 6 27.833333333333336 0.0527110387112104 0.254152739478919 0.207399057823583 -0.201441700767709 0.0326123854488644 0.127062227628991 NaN NaN 0.122586553940433 0.100328947859003 21 0 979 0.979 0.021 0.042 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC:CAGCTCGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.25000000000001 7 27.833333333333336 0.0667849179180056 0.306347708328316 0.218003647823706 -0.23956279041031 0.0351561227650623 0.146464380754306 NaN NaN 0.141824811025624 0.0911914838848879 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT:CTCGCCCTG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.41666666666667 7 28.333333333333336 0.0666364763682366 0.299699991491825 0.222343938138064 -0.233063515123588 0.0364653660974935 0.137593522640838 0.211612807998924 0.293391270650162 0.136891965763299 0.0886549149541241 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 73 CTG CCC TGT 2 GCCCTGTAT:GCCCTTTAT 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.08333333333334 7 27.833333333333336 0.0660492550084018 0.306347708328316 0.215602249381335 -0.240298453319914 0.0353757865110606 0.139000875058312 0.222948427512106 0.333519100517896 0.145452163567044 0.0985184635806998 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 74 TAT TGT ATA 2 CTGTATAAA:CTTTATAAG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.41666666666667 7 27.666666666666668 0.0796327387923167 0.308630566923095 0.258019610909634 -0.228997828130778 0.0373484595587984 0.136563362442233 0.261804497308524 0.324357380890251 0.139666955589545 0.101088530329653 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 75 AAA ATA AAG 2 TATAAAGGC:TATAAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.16666666666667 7 27.916666666666668 0.0798980931045125 0.305219070273711 0.261772939131433 -0.225320977169198 0.0379547527816269 0.132009369874831 0.226943350292107 0.24871645255795 0.14141246081702 0.111079424192306 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 76 GGC AAG GCA 2 AAAGGCATT:AAGGGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.83333333333334 7 27.583333333333336 0.0813437533100697 0.309784984170422 0.262581330492508 -0.228441230860352 0.0384765224615722 0.137437621582427 NaN NaN 0.148090251198601 0.122932433104394 25 0 975 0.975 0.025 0.05 ORF3a all ss13 77 ATT GCA TCC 2 GGCATTCAG:GGCTTCCAG 1:1 TRUE 1.5 0.5 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.83333333333334 7 27.25 0.0813437533100697 0.314491607077193 0.258651587131556 -0.233147853767123 0.038707260755238 0.1388277894319 NaN NaN 0.153313939611562 0.128329659840094 27 0 973 0.973 0.027 0.054 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGC 2 ATTCAGCTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.16666666666667 6 26.916666666666668 0.0809774510729235 0.26452672930594 0.306121998655449 -0.183549278233017 0.0373905119042145 0.12269964157215 NaN NaN 0.128343825843229 0.152677648631668 43 0 957 0.957 0.043 0.086 ORF3a all ss13 79 CTT AGC TCA 2 CAGCTTGTT:CAGTTCATT 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 0 1 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78 6 27.416666666666668 0.0811601884801745 0.258764472899754 0.313645020781567 -0.177604284419579 0.0401329745466895 0.121996849807493 NaN NaN 0.130653120133334 0.174033366335144 48 0 952 0.952 0.048 0.096 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 CTTGTTTGC:TTCATTTGC 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.5 5 27.916666666666668 0.0817133878414162 0.20465023999998 0.399283127356333 -0.122936852158564 0.039430884549191 0.0944231538981121 NaN NaN 0.112138047501837 0.272947857855089 100 0 900 0.9 0.1 0.2 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT:GTTTGCAAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.16666666666667 4 27.583333333333336 0.0809774510729235 0.16115228773261 0.502490235864876 -0.0801748366596865 0.0404117746049378 0.0833595866140033 NaN NaN 0.09234697953493 0.385289660937146 169 0 831 0.831 0.169 0.338 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATT 2 TGCAATTTA:TGCAATTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78 4 28.25 0.0811601884801745 0.156921757285409 0.517201628914723 -0.0757615688052347 0.0405031657978174 0.0810396856681512 NaN NaN 0.0896731145309722 0.398186884916375 191 0 809 0.809 0.191 0.382 ORF3a all ss13 83 TTA ATT TAC 2 AATTTACTG:AATTTGCTG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78 4 28.25 0.0811601884801745 0.156921757285409 0.517201628914723 -0.0757615688052347 0.0389710460870892 0.0833823803277335 NA NA 0.0911321747731096 0.40578315400609 197 1 802 0.802 0.197 0.394 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG:TTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.16666666666667 4 28.25 0.0809774510729235 0.156921757285409 0.516037116036381 -0.0759443062124858 0.0394778993405615 0.0822152571364449 NaN NaN 0.0874783355082245 0.385312289387628 188 0 812 0.812 0.188 0.376 ORF3a all ss13 85 CTA TGC TAC 2 CTGCTACTT:CTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.58333333333334 4 29.25 0.0805241909860523 0.150978005779684 0.533350474264167 -0.0704538147936312 0.0420616308335128 0.0776108841645514 NaN NaN 0.087004854077098 0.418073077384806 198 0 802 0.802 0.198 0.396 ORF3a all ss13 86 CTA TAC TAT 2 CTACTTTTT:CTGCTATTT 1:1 FALSE 1.25 1 0.5 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.75 4 29.583333333333336 0.0803443058867966 0.149095891727942 0.538876725278266 -0.0687515858411459 0.0400934444496037 0.0836772230898943 NaN NaN 0.0890797179918896 0.440233826084178 216 0 784 0.784 0.216 0.432 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:CTTTTTGTG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.91666666666667 4 30.333333333333336 0.0801652234595281 0.145028544735405 0.552754794621875 -0.0648633212758766 0.0391363313518926 0.0762456799107105 NaN NaN 0.0844799882987217 0.442608924590459 210 0 790 0.79 0.21 0.42 ORF3a all ss13 88 GTG TTG TGA 2 TTTGTGACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.75 4 29.666666666666668 0.0792816652689176 0.148632696437812 0.533406627000737 -0.0693510311688939 0.0377056290259604 0.0812414514452758 NaN NaN 0.0852585446477259 0.415977123041798 210 1 789 0.789 0.21 0.42 ORF3a all ss13 89 ACA TGA CAA 2 GTGACAATT:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.41666666666667 4 30 0.0796327387923167 0.146808432844572 0.542426189349935 -0.0671756940522548 0.0387950322711397 0.0778720461036121 NaN NaN 0.089372477123105 0.452269160986838 218 0 782 0.782 0.218 0.436 ORF3a all ss13 90 ATC CAA TCT 2 ACAATTTAC:ACCATCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.08333333333334 4 29.666666666666668 0.0789336765288098 0.148632696437812 0.531065360587305 -0.0696990199090017 0.0399510757392084 0.0812238331849445 NaN NaN 0.0837256257519142 0.405144053665053 185 1 814 0.814 0.185 0.37 ORF3a all ss13 91 TAC TCT ACT 2 ATCTATTCA:ATTTACTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.41666666666667 4 30 0.0796327387923167 0.146808432844572 0.542426189349935 -0.0671756940522548 0.0394510422443442 0.0829267777058042 NaN NaN 0.0885317338679782 0.447986975941368 200 0 800 0.8 0.2 0.4 ORF3a all ss13 92 TCA ACT CAC 2 TACTCACAC:TATTCACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.08333333333334 5 29.666666666666668 0.0789336765288098 0.19089739885116 0.413487438822323 -0.111963722322351 0.0379149572062007 0.0959947576654264 NaN NaN 0.106648815500771 0.293793708353108 97 1 902 0.902 0.097 0.194 ORF3a all ss13 93 CAC CAC ACC 2 TCACACCTA:TCACATCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.58333333333334 5 28.833333333333332 0.0774048314449128 0.197206849707019 0.392505795614653 -0.119802018262106 0.0377944945780847 0.107048652654519 NaN NaN 0.104779302388036 0.252882993453301 107 0 893 0.893 0.107 0.214 ORF3a all ss13 94 CTA ACC TAC 2 CACCTACTA:CATCTTTTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.666666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.25 5 28.5 0.0777394299845027 0.199849674976131 0.388989524220079 -0.122110244991629 0.0392299484579426 0.106089339406552 NaN NaN 0.111170781384124 0.272028846628033 104 0 896 0.896 0.104 0.208 ORF3a all ss13 95 CTA TAC TAC 2 CTACTACTT:CTTTTGCTT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0 1 0 1 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.75 5 28.833333333333332 0.0772386109180752 0.197206849707019 0.391662921611623 -0.119968238788944 0.0367241732916151 0.103708198003441 NaN NaN 0.10634438750285 0.25927318130805 101 0 899 0.899 0.101 0.202 ORF3a all ss13 96 CTT TAC TTG 2 CTACTTTTA:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.08333333333333 1 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.08333333333334 5 29.833333333333332 0.0779078173603665 0.189683904532547 0.410724449986206 -0.111776087172181 0.0387535755548347 0.094660192357269 NaN NaN 0.105989782423074 0.291611486944727 94 1 905 0.905 0.094 0.188 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TAG 2 CTTGTCGCT:CTTTTAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.16666666666667 5 30.249999999999996 0.0778235325055638 0.18671695246621 0.416799500407696 -0.108893419960646 0.0359214770819838 0.0928762928982074 NaN NaN 0.102721857546849 0.289108058649757 97 0 903 0.903 0.097 0.194 ORF3a all ss13 98 GCT TAG CTG 2 GTCGCTGCA:TTAGCTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.16666666666667 5 30.41666666666666 0.0642791463517657 0.185556129985381 0.346413488774691 -0.121276983633615 0.0341127638237126 0.0921781283203887 NA NA 0.0943766722211466 0.198781324942988 59 0 941 0.941 0.059 0.118 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.66666666666669 5 29.416666666666664 0.063062337907906 0.192747196311253 0.327176421316507 -0.129684858403347 0.0357081703858296 0.0981330546052052 NaN NaN 0.107966710698522 0.229690707835438 67 1 932 0.932 0.067 0.134 ORF3a all ss13 100 GGC CAG GCA 2 GCAGGTATG:GCTGGCATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.83333333333334 5 29.249999999999996 0.0621473370101289 0.194000551939624 0.320346186589563 -0.131853214929495 0.0331951800636459 0.094886696236679 NaN NaN 0.107756009690288 0.221092787038224 65 0 935 0.935 0.065 0.13 ORF3a all ss13 101 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAG:GGTATGGAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 84.16666666666669 5 29.58333333333333 0.0618907677660026 0.191510018856633 0.32317248014233 -0.129619251090631 0.0333091260805997 0.104011973546741 NaN NaN 0.0994937837996808 0.192647342685713 50 0 950 0.95 0.05 0.1 ORF3a all ss13 102 GAG TGG AGG 2 ATGGAGGCA:ATGGAGGCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.33333333333336 5 29.41666666666666 0.0625362067042883 0.192747196311253 0.324446777442632 -0.130210989606965 0.0339681529335443 0.0943978171851989 NaN NaN 0.111160359837702 0.24144618592224 67 1 932 0.932 0.067 0.134 ORF3a all ss13 103 GCA AGG CAC 2 GAGGCACAA:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.33333333333336 5 29.41666666666666 0.0625362067042883 0.192747196311253 0.324446777442632 -0.130210989606965 0.0345116153041028 0.0987849128810735 NA NA 0.099484322950501 0.190581987096006 54 0 946 0.946 0.054 0.108 ORF3a all ss13 104 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT:GCGCAATTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.66666666666669 5 29.749999999999996 0.0622764214574927 0.190288706694225 0.327273344484729 -0.128012285236733 0.0337317859378132 0.0970731517135198 NaN NaN 0.099272102926835 0.197221136781412 52 0 948 0.948 0.052 0.104 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTT 2 CAATTTTTG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.50000000000001 5 30.249999999999996 0.0631952577133049 0.18671695246621 0.338454847717919 -0.123521694752905 0.0339710269675854 0.0908822788116926 NaN NaN 0.0993223317494069 0.21363034483959 72 0 928 0.928 0.072 0.144 ORF3a all ss13 106 TTG TTT TGT 2 TTTTTGTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.83333333333336 5 29.91666666666666 0.062929976401818 0.189082955000185 0.332816759721977 -0.126152978598367 0.035124536748464 0.0942836414151145 NaN NaN 0.108227929780021 0.243766850627194 68 1 931 0.931 0.068 0.136 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACA 2 TTGTACATC:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.50000000000003 5 30.91666666666666 0.0640047012994632 0.182159096576957 0.351367033006903 -0.118154395277494 0.0351062550539317 0.093619079572222 NaN NaN 0.0945612486482369 0.211481808615277 75 0 925 0.925 0.075 0.15 ORF3a all ss13 108 ATC ACA TCT 2 TACATCTAT:TACCTCTAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.50000000000003 5 31.41666666666666 0.0640047012994632 0.178884786483983 0.357798460995418 -0.11488008518452 0.0342635581766926 0.0911631323920138 NaN NaN 0.0959132280142339 0.231014291390764 88 0 912 0.912 0.088 0.176 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 ATCTATGCC:CTCTATGCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.66666666666669 4 31.41666666666666 0.0638683562552301 0.139531497680893 0.457734327494257 -0.075663141425663 0.0356728800655153 0.0791177234749987 NA NA 0.0848188924233443 0.37236329934756 159 1 840 0.84 0.159 0.318 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCC 2 TATGCCCTG:TATGCCTTG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.66666666666669 4 31.41666666666666 0.0638683562552301 0.139531497680893 0.457734327494257 -0.075663141425663 0.0347281560161287 0.0787541495115948 NA NA 0.0820784131690223 0.356612185562082 152 0 848 0.848 0.152 0.304 ORF3a all ss13 111 CTG CCC TGA 2 GCCCTGATT:GCCTTGATA 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.33333333333336 4 31.749999999999996 0.0641416300786215 0.137923200937065 0.465053229934023 -0.0737815708584438 0.0350890314802798 0.0792570196847768 NaN NaN 0.0826936103825401 0.372270631762068 169 0 831 0.831 0.169 0.338 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 CTGATTTAT:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.33333333333336 4 31.749999999999996 0.0625362067042883 0.137923200937065 0.453413249398292 -0.075386994232777 0.0329155032048751 0.0753076745896607 NaN NaN 0.0823006474175589 0.359669436440814 157 0 843 0.843 0.157 0.314 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATA 2 ATATATTTT:ATTTATATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.6666666666667 4 32.74999999999999 0.0622764214574927 0.133313895827917 0.467141261387183 -0.0710374743704243 0.0339652475117212 0.0735668012643162 NaN NaN 0.0824883494342325 0.389137861383775 172 0 828 0.828 0.172 0.344 ORF3a all ss13 114 ATT ATA TTC 2 TATATTCTG:TATTTTCTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.33333333333337 4 33.08333333333333 0.0625362067042883 0.13184534303006 0.474314869733627 -0.0693091363257716 0.0341087397365219 0.07507876953691 NaN NaN 0.0777134807265186 0.372470795397635 165 1 834 0.834 0.165 0.33 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 ATTCTGCAA:TTTCTACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.50000000000004 3 33.416666666666664 0.0631952577133049 0.0956200277799543 0.660899804994128 -0.0324247700666494 0.034021558259125 0.0619690186703555 NaN NaN 0.0670765465005624 0.628812092283299 343 1 656 0.656 0.343 0.686 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAG 2 CTACAATGC:CTGCAAGTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.1666666666667 3 33.74999999999999 0.0626669142682301 0.0946134639951751 0.662346685366322 -0.031946549726945 0.0346456132704751 0.0609008872263947 NA NA 0.0631443195582635 0.612906412278438 314 2 684 0.684 0.314 0.628 ORF3a all ss13 117 GTT AAG GCA 2 CAAGTTGTG:CAATGCATC 1:1 TRUE 1.75 0.75 0.5 0 2 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.83333333333336 3 34.416666666666664 0.0637325912188816 0.0926626795339059 0.687791369076063 -0.0289300883150243 0.0325464649754781 0.0597363401050731 NA NA 0.0623135979003434 0.642457140354133 329 2 669 0.669 0.329 0.658 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TCA 2 GTTGTGAGC:TGCATCAAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.91666666666669 3 34.58333333333333 0.0375469431438597 0.092187504132096 0.407288856525049 -0.0546405609882364 0.0218385935735985 0.059710848671938 NA NA 0.0539818117757717 0.311440920959062 133 8 859 0.859 0.133 0.266 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA:GTGAGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.25000000000003 2 34.24999999999999 0.037390920168914 0.0607927570603562 0.615055509520511 -0.0234018368914422 0.023320744153861 0.047414741579361 NA NA 0.0430305966309564 0.586550345439039 291 12 697 0.697 0.291 0.582 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AGCTTCTGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.25000000000003 2 34.58333333333332 0.0250283912732922 0.0601826482875393 0.415873877030339 -0.035154257014247 0.0183841740728173 0.0427538215565313 NA NA 0.0417495983786257 0.399773270321217 146 43 811 0.811 0.146 0.292 ORF3a all ss13 121 TGC CAT GCA 2 GCATGTAGA:TTCTGCAGA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.25000000000003 1 34.24999999999999 0.0124097970858067 0.0297805871963345 0.416707602304569 -0.0173707901105278 0.0128405726829992 0.0308298419493826 NA NA 0.0335153905017173 0.604253901496942 280 126 594 0.594 0.28 0.56 ORF3a all ss13 122 AGA GCA GAA 2 TGCAGATTT:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.75000000000003 1 34.58333333333332 0.025185997239258 0.0294878275056261 0.854115049148761 -0.00430183026636807 0.0189732013998445 0.0306401568857659 NA NA 0.0371338648986407 0.907774154515439 468 43 489 0.489 0.468 0.936 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATT:AGATTTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.75000000000003 1 34.41666666666666 0.025185997239258 0.0296334842053817 0.84991683950158 -0.00444748696612369 0.0185479742321811 0.0303879130746459 NA NA 0.035757011243518 0.901013745841324 437 44 519 0.519 0.437 0.874 ORF3a all ss13 124 ATT TTA TTA 2 ATTATTATG:TTTATTATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.08333333333337 1 34.74999999999999 0.0124355180497881 0.0293435958691742 0.423789848566303 -0.0169080778193861 0.0128617371570511 0.0310828143850334 NA NA 0.0349350518501603 0.628395768027166 267 141 592 0.592 0.267 0.534 ORF3a all ss13 125 ATG TTA TGA 2 ATTATGAGA:ATTATGAGG 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.75000000000003 1 35.08333333333332 0.0124872811774231 0.0290593249318817 0.429716836392265 -0.0165720437544586 0.013096412399419 0.0319568029656855 NA NA 0.0332041400373115 0.61771196160495 265 138 597 0.597 0.265 0.53 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT:ATGAGGTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.4166666666667 1 35.74999999999999 0.0123841823043677 0.0285069944752381 0.434426095501752 -0.0161228121708704 0.0123859922480088 0.0303317541203993 NA NA 0.0333858978749995 0.629150533329861 280 130 590 0.59 0.28 0.56 ORF3a all ss13 127 TGC GAT GCT 2 AGATGTTGG:AGGTGCTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.4166666666667 1 36.08333333333332 0.0125394770467935 0.0282386296527663 0.444054021069154 -0.0156991526059728 0.0129433892560528 0.0301927267167983 NA NA 0.0325888342441763 0.629994851576989 270 129 601 0.601 0.27 0.54 ORF3a all ss13 128 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCTT:TGTTGGCTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000003 1 35.74999999999999 0.0125657389590355 0.0285069944752381 0.440794941394133 -0.0159412555162027 0.0131644471633255 0.0311860797506295 NA NA 0.0316905983668341 0.614944648376671 288 134 578 0.578 0.288 0.576 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGC:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.9166666666667 1 35.08333333333332 0.0126185941874855 0.0290593249318817 0.434235627189032 -0.0164407307443962 0.0127224044437658 0.0315724928323149 NA NA 0.0322898753838677 0.61063969191932 265 130 605 0.605 0.265 0.53 ORF3a all ss13 130 TGC TTT GCT 2 CTTTGCTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.08333333333337 1 34.58333333333332 0.0124355180497881 0.0294878275056261 0.421716996527313 -0.017052309455838 0.0127908223622237 0.0312444651276891 NA NA 0.033294912510531 0.608539307140054 271 122 607 0.607 0.271 0.542 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAG:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.58333333333337 1 34.58333333333332 0.012513324680928 0.0294878275056261 0.424355598205414 -0.0169745028246981 0.0128989959446714 0.0320951400966726 NA NA 0.0353480242982585 0.631077512165448 268 124 608 0.608 0.268 0.536 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000004 1 34.58333333333332 0.0125657389590355 0.0294878275056261 0.426133086835169 -0.0169220885465907 0.0128631465505103 0.0311780857679223 NA NA 0.0349244288910448 0.62800662954142 273 109 618 0.618 0.273 0.546 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.75000000000004 1 34.08333333333332 0.0124872811774231 0.0299291581301553 0.417227946176055 -0.0174418769527323 0.0125930954210508 0.0306573916814048 NA NA 0.0373271059273499 0.64030594748952 296 119 585 0.585 0.296 0.592 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.9166666666667 1 34.08333333333332 0.012461345857946 0.0299291581301553 0.416361389243036 -0.0174678122722094 0.0126140488229631 0.0304956252909433 NA NA 0.0347928034669111 0.615630625802732 288 113 599 0.599 0.288 0.576 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAA:AAATCCAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000003 1 34.08333333333332 0.0125657389590355 0.0299291581301553 0.419849395843004 -0.0173634191711199 0.0123269218141478 0.0332644915677825 NA NA 0.0319760301459737 0.58712044019572 263 139 598 0.598 0.263 0.526 ORF3a all ss13 136 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAC:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000003 1 34.74999999999999 0.0125657389590355 0.0293435958691742 0.428227645141335 -0.0167778569101387 0.0122502086091403 0.0300572758928164 NA NA 0.0338745836627103 0.620393045867602 268 124 608 0.608 0.268 0.536 ORF3a all ss13 137 AAC AAA ACC 2 AAAAACCCA:AAGAACCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.6666666666667 1 34.16666666666666 0.0125002893639087 0.0298546878003148 0.418704407412257 -0.017354398436406 0.0128709978563522 0.0300249200459851 NA NA 0.0342710656470344 0.612585483905096 285 116 599 0.599 0.285 0.57 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000003 1 34.16666666666666 0.0126053387372859 0.0298546878003148 0.422223096808032 -0.0172493490630289 0.0132828777405543 0.0323371641786659 NA NA 0.0355033760961339 0.627072846149463 251 127 622 0.622 0.251 0.502 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000003 1 34.16666666666666 0.0126053387372859 0.0298546878003148 0.422223096808032 -0.0172493490630289 0.0133703734611526 0.0310736920474154 NA NA 0.0356126118692971 0.628129915298535 262 114 624 0.624 0.262 0.524 ORF3a all ss13 140 CTT TAC TTC 2 TTACTTCAT:TTACTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.6666666666667 1 35.16666666666666 0.0128208250194751 0.0289891158257094 0.442263403153011 -0.0161682908062344 0.0128413445973339 0.031336528842819 NA NA 0.0326454762354942 0.620410284061514 287 120 593 0.593 0.287 0.574 ORF3a all ss13 141 CAT TTC ATG 2 CTTCATGAT:CTTTATGAT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.6666666666667 1 35.16666666666666 0.0128208250194751 0.0289891158257094 0.442263403153011 -0.0161682908062344 0.0135031411042708 0.0308245017390172 NA NA 0.0352842515546842 0.646787448724318 280 137 583 0.583 0.28 0.56 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 CATGATGCC:TATGATGCC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.00000000000003 0 36.16666666666665 0.0129313548258795 0 -Inf 0.0129313548258795 0.0131924296219873 0 NA NA 0.0128318165821907 0.313571064581368 635 365 0 0 0.635 0.001 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.6666666666667 0 36.499999999999986 0.0129873375085957 0 -Inf 0.0129873375085957 0.0127590718889092 0 NA NA 0.0131390280851687 0.32292988126127 643 357 0 0 0.643 0.001 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 1 36.999999999999986 0.0129592857062641 0.0275260251378209 0.470801201458542 -0.0145667394315568 0.0128620540771704 0.0288359543900891 NA NA 0.0329856637285803 0.65877275255695 301 113 586 0.586 0.301 0.602 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 1 36.999999999999986 0.0129592857062641 0.0275260251378209 0.470801201458542 -0.0145667394315568 0.013560796987351501 0.0287717533558677 NA NA 0.0334046590946768 0.662786599775567 321 115 564 0.564 0.321 0.642 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.83333333333337 1 36.999999999999986 0.0131294381352109 0.0275260251378209 0.476982712522883 -0.0143965870026101 0.0131607320500721 0.0288447316944887 NA NA 0.0330318130986173 0.662952785242513 289 132 579 0.579 0.289 0.578 ORF3a all ss13 147 GTT TTG TTT 2 TTTGTTTGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.33333333333337 1 35.99999999999999 0.0130438070339019 0.0283052459871353 0.460826485656769 -0.0152614389532334 0.0137429152187017 0.0302853608167593 NA NA 0.0321989256078557 0.635518771649713 297 123 580 0.58 0.297 0.594 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.33333333333336 1 36.999999999999986 0.0132162010123647 0.0275260251378209 0.480134743254504 -0.0143098241254563 0.0131093632221095 0.0307597418070031 NA NA 0.0330210176717006 0.664756864797754 311 123 566 0.566 0.311 0.622 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGCTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.33333333333336 1 37.16666666666665 0.0132162010123647 0.027400307499342 0.482337689556297 -0.0141841064869773 0.0130227163390457 0.0292219484117638 NA NA 0.0319310610390726 0.656890539714412 292 143 565 0.565 0.292 0.584 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0131582322381821 0.0279101972553257 0.471448915885799 -0.0147519650171436 0.0130287631978183 0.0293021157784878 NA NA 0.0330573898609897 0.655414379614219 292 125 583 0.583 0.292 0.584 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666669 1 36.33333333333332 0.0132453773639628 0.0280406490537152 0.472363437044187 -0.0147952716897525 0.014058707889325 0.0303779024166726 NA NA 0.0330500736960516 0.654396940616412 299 116 585 0.585 0.299 0.598 ORF3a all ss13 152 CAT CAC ATA 2 ACACATAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.00000000000003 1 35.499999999999986 0.0131007697802931 0.0287116399282627 0.456287756917612 -0.0156108701479696 0.0132648136389639 0.029812010145018 NA NA 0.0312983469406392 0.617937065151285 275 121 604 0.604 0.275 0.55 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 CATAACTAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333336 1 36.499999999999986 0.0133932130500048 0.0279101972553257 0.479868090056196 -0.0145169842053209 0.0138313518479918 0.0288712541084394 NA NA 0.0322612735898751 0.652723603035109 272 124 604 0.604 0.272 0.544 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000003 1 36.16666666666665 0.0134532755150005 0.0281723261817365 0.477535132463501 -0.014719050666736 0.0131575462226399 0.0297934519284047 NA NA 0.0338521094948748 0.663704314187745 288 121 591 0.591 0.288 0.576 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.6666666666667 1 36.16666666666665 0.013333684515963 0.0281723261817365 0.473290151120248 -0.0148386416657735 0.0136251843992532 0.0293357290304515 NA NA 0.0343862337023412 0.666084096077119 291 130 579 0.579 0.291 0.582 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000003 1 36.16666666666665 0.0134532755150005 0.0281723261817365 0.477535132463501 -0.014719050666736 0.0131159959289731 0.0304581441982171 NA NA 0.0340063768453809 0.665136769159111 283 127 590 0.59 0.283 0.566 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000003 1 36.16666666666665 0.0134532755150005 0.0281723261817365 0.477535132463501 -0.014719050666736 0.0135844345717422 0.0299775524457656 NA NA 0.0329387842039313 0.654975586264964 280 145 575 0.575 0.28 0.56 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 35.833333333333314 0.0134835092215562 0.0284394261467203 0.474113266280206 -0.0149559169251641 0.0136776680243112 0.0302010264323231 NA NA 0.0335951396220958 0.656188976226249 279 123 598 0.598 0.279 0.558 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000003 1 35.833333333333314 0.0135443861537981 0.0284394261467203 0.47625384858056 -0.0148950399929221 0.0142902702369419 0.0314295834469948 NA NA 0.0333480648926355 0.655125042339943 307 119 574 0.574 0.307 0.614 ORF3a all ss13 160 TAT CAT ATA 2 CCATATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.1666666666667 1 35.833333333333314 0.013423177093157 0.0284394261467203 0.471991840619646 -0.0150162490535633 0.01377384178834 0.0291433109149771 NA NA 0.0322451204869573 0.641436991802196 315 130 555 0.555 0.315 0.63 ORF3a all ss13 161 AAC ATA ACA 2 TATAACAGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.1666666666667 1 35.833333333333314 0.013423177093157 0.0284394261467203 0.471991840619646 -0.0150162490535633 0.0131614027547271 0.02975118668593 NA NA 0.0338286596770933 0.657121146389017 286 118 596 0.596 0.286 0.572 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 35.499999999999986 0.0134835092215562 0.0287116399282627 0.469618219483296 -0.0152281307067065 0.0133826864741764 0.0308313571421296 NA NA 0.0349694360630798 0.663221509628756 282 119 599 0.599 0.282 0.564 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.1666666666667 1 35.499999999999986 0.0136058153029875 0.0287116399282627 0.473878027760945 -0.0151058246252752 0.0141484701081066 0.0304991296251496 NA NA 0.0327912966151131 0.645038488684419 305 137 558 0.558 0.305 0.61 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 35.499999999999986 0.0134835092215562 0.0287116399282627 0.469618219483296 -0.0152281307067065 0.0141521308385432 0.0306611144573738 NA NA 0.034292546938716 0.656995361462936 288 134 578 0.578 0.288 0.576 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.1666666666667 1 35.16666666666665 0.013423177093157 0.0289891158257094 0.463041962847741 -0.0155659387325524 0.0136167961071835 0.0306605635494373 NA NA 0.0332069341571203 0.63924428836889 291 124 585 0.585 0.291 0.582 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 35.333333333333314 0.0134532755150005 0.028849710620847 0.466322719551961 -0.0153964351058466 0.0139820783210397 0.0306628473489147 NA NA 0.0328705661723581 0.639501571704115 263 142 595 0.595 0.263 0.526 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 35.333333333333314 0.0134532755150005 0.028849710620847 0.466322719551961 -0.0153964351058466 0.0138662250056099 0.0319473698819861 NA NA 0.0349525120304373 0.659578046156315 271 127 602 0.602 0.271 0.542 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCG 2 ATTGTCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666671 1 35.66666666666665 0.0136058153029875 0.0285748846742028 0.476145939279005 -0.0149690693712153 0.0141436747383563 0.0296966532712721 NA NA 0.0328041146498034 0.648162168438286 280 139 581 0.581 0.28 0.56 ORF3a all ss13 169 GTT TCG TTA 2 GTCGTTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666671 1 35.333333333333314 0.013423177093157 0.028849710620847 0.465279436233142 -0.01542653352769 0.0137243280692021 0.0303016408872314 NA NA 0.0348972511900099 0.658448802191559 284 135 581 0.581 0.284 0.568 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTG 2 GTTACTGAA:GTTACTGCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333337 1 34.66666666666665 0.0133041182530361 0.029415534864961 0.452282044644501 -0.0161114166119248 0.0133823651049762 0.0306906122091251 NA NA 0.033558051443582 0.631152132961614 285 120 595 0.595 0.285 0.57 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTGCAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333337 1 34.66666666666665 0.0133041182530361 0.029415534864961 0.452282044644501 -0.0161114166119248 0.0138042586700073 0.0317980756184105 NA NA 0.0348034619450941 0.643417632981175 276 129 595 0.595 0.276 0.552 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:GCAGGTGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 1 34.66666666666665 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0309718044327457 NA NA 0.0311389541305973 0.344835593092574 0 363 637 0.637 0 0.001 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.1666666666667 1 34.66666666666665 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0325232693358205 NA NA 0.0308066335403663 0.339656499585203 0 373 627 0.627 0 0.001 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 1 34.999999999999986 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0297141553917401 NA NA 0.0310643433313913 0.348384699671061 0 352 648 0.648 0 0.001 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TTT 2 GGCATTTCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 1 34.999999999999986 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0298249867038309 NA NA 0.0310937147006343 0.348840215937683 0 368 632 0.632 0 0.001 ORF3a all ss13 176 TCA TTT CAA 2 ATTTCAACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 1 35.333333333333314 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0316776732063256 NA NA 0.0296070600140382 0.32984805640584 0 382 618 0.618 0 0.001 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 TCAACACCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000004 1 35.49999999999998 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.029392725931784 NA NA 0.0301013385286828 0.340168352269452 0 354 646 0.646 0 0.001 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 1 35.49999999999998 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0302296548376214 NA NA 0.0301020397141756 0.340179600753522 0 367 633 0.633 0 0.001 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 1 35.49999999999998 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0301417802352431 NA NA 0.0298109773267729 0.335485766850159 0 360 640 0.64 0 0.001 ORF3a all ss13 180 CTC AAC TCA 2 AAACTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 1 35.99999999999998 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.029950363892892 NA NA 0.0312884033929319 0.365647588078714 0 367 633 0.633 0 0.001 ORF3a all ss13 181 AAA TCA AAG 2 CTCAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666669 1 35.99999999999998 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0304344526764827 NA NA 0.0287589799610938 0.325005940063881 0 367 633 0.633 0 0.001 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 1 35.99999999999998 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0292834576625325 NA NA 0.0315319256552382 0.369361807458767 0 349 651 0.651 0 0.001 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666669 1 36.49999999999998 0 0.0279101972553257 0 -0.0279101972553257 0 0.0282164828139494 NA NA 0.0299224140592069 0.350947931268902 0 342 658 0.658 0 0.001 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000001 1 37.49999999999998 0 0.0271522864979704 0 -0.0271522864979704 0 0.0284843698225056 NA NA 0.0301628026418846 0.368018561503343 0 362 638 0.638 0 0.001 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 1 36.83333333333331 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0309735297647702 NA NA 0.0279372833553805 0.322261756617132 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 1 36.83333333333331 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0283761888592709 NA NA 0.0300251697651074 0.357055287076579 0 353 647 0.647 0 0.001 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333334 1 36.83333333333331 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0285345055019678 NA NA 0.0296617732876044 0.351194909070683 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000001 1 37.16666666666664 0 0.027400307499342 0 -0.027400307499342 0 0.028527907695141 NA NA 0.0297493164111823 0.35702959441775 0 378 622 0.622 0 0.001 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666667 1 36.66666666666664 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0289143090450712 NA NA 0.0293485526738417 0.34384935196379 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 1 35.99999999999998 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.030395402289339 NA NA 0.0302736011551596 0.349798021324223 0 354 646 0.646 0 0.001 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGG 2 TCTGAGGAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000001 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0302670054224922 NA NA 0.0288171963043071 0.339479386635945 0 349 651 0.651 0 0.001 ORF3a all ss13 192 GAT AGG ATA 2 GAGGATAGG:GAGGATTGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0297616828708315 NA NA 0.0311817957206286 0.359459034089393 0 362 638 0.638 0 0.001 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 GATAGGCAC:GATTGGCAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333334 1 36.833333333333314 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0310136189576531 NA NA 0.0277997378156664 0.31987339795804 0 331 669 0.669 0 0.001 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCACTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333334 0 37.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666667 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666667 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAAGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666669 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT:AAAGATTAT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC:GATTATGTC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 202 GTT TCG TTG 2 GTCGTTGTA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 36.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 203 GTA TTG TAC 2 GTTGTACAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 GTACATGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666667 0 37.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5 1 36.83333333333332 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0280009604275602 NA NA 0.0291732925118571 0.343188429852213 0 378 622 0.622 0 0.001 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 1 37.16666666666666 0 0.027400307499342 0 -0.027400307499342 0 0.0296076858516363 NA NA 0.028489196100612 0.33616068252418 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666667 1 36.83333333333332 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0300077628169933 NA NA 0.0302000305944813 0.359846261345193 0 356 644 0.644 0 0.001 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666667 1 36.16666666666666 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0295088724786112 NA NA 0.0305499350697236 0.356438328660713 0 363 637 0.637 0 0.001 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 1 36.16666666666666 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0288022936998262 NA NA 0.0300868063133271 0.349083687555236 0 374 626 0.626 0 0.001 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666667 1 35.83333333333332 0 0.0284394261467203 0 -0.0284394261467203 0 0.0285068938119361 NA NA 0.0294152351904433 0.333630821132289 0 377 623 0.623 0 0.001 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.5 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0289627191100565 NA NA 0.0298420131126169 0.33598861726386 0 366 634 0.634 0 0.001 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333333 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.029706817209953 NA NA 0.0323597817673567 0.365687991460049 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 215 GAG TTG AGT 2 CTTGAGTCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666667 1 34.499999999999986 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.0296024205630486 NA NA 0.0330543362861624 0.371161667551263 0 378 622 0.622 0 0.001 ORF3a all ss13 216 TCT AGT CTA 2 GAGTCTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666667 1 33.999999999999986 0 0.0300040009602743 0 -0.0300040009602743 0 0.0317907920700334 NA NA 0.0308391755227841 0.330593864877406 0 342 658 0.658 0 0.001 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000001 1 33.33333333333332 0 0.0306164958901914 0 -0.0306164958901914 0 0.0328611898263599 NA NA 0.0329925905660473 0.353417445836529 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666669 1 33.16666666666666 0 0.0307735475083969 0 -0.0307735475083969 0 0.0315943580165929 NA NA 0.031450223889615 0.327834896597753 0 353 647 0.647 0 0.001 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000001 1 34.66666666666666 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0308283998516665 NA NA 0.0310788166968807 0.343902892703317 0 383 617 0.617 0 0.001 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CTA 2 ATTACTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666669 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.028963465380525 NA NA 0.0309936808085517 0.354253329590108 0 368 632 0.632 0 0.001 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0284117412451803 NA NA 0.0279189108180849 0.31293778632889 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666669 1 36.49999999999998 0 0.0279101972553257 0 -0.0279101972553257 0 0.029125185530417 NA NA 0.0282187822656438 0.3226315593952 0 381 619 0.619 0 0.001 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000003 1 37.16666666666665 0 0.027400307499342 0 -0.027400307499342 0 0.0293947502874684 NA NA 0.0276204366556596 0.321182790159725 0 385 615 0.615 0 0.001 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333336 1 36.833333333333314 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0282809728590902 NA NA 0.0298156775249015 0.353686818137957 0 366 634 0.634 0 0.001 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 1 36.333333333333314 0 0.0280406490537152 0 -0.0280406490537152 0 0.0291582872758503 NA NA 0.0310983252174861 0.367228398012671 0 368 632 0.632 0 0.001 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 1 35.66666666666666 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0306987010036613 NA NA 0.0294275814952013 0.331536381874615 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTT TCT TTA 2 ATCTTTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TTA ACA 2 TTTAACAAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA--- 2 FALSE 0 0 2 1 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG 2 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C CGA 0 ---CCGAAT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT CGA ATG 2 CCGAATGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG:CCGACGATG 1:1 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT:ACGATGACT 1:1 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT:ATGACTACT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.25000000000001 7 32.83333333333332 0.100750036200046 0.250832878769865 0.401662001784392 -0.150082842569819 0.0375959826008535 0.113774293788784 NaN NaN 0.112914333815674 0.18379043693269 39 0 961 0.961 0.039 0.078 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.58333333333334 8 33.16666666666665 0.101727620280473 0.291022534714547 0.349552382190106 -0.189294914434074 0.0376931940948706 0.129995365331707 NaN NaN 0.133683649293233 0.156777985815336 38 0 962 0.962 0.038 0.076 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 72.91666666666667 8 33.499999999999986 0.102724391304868 0.287492986673213 0.357310946933229 -0.184768595368345 0.0382088349865849 0.137784332710328 0.25270299237455 0.157374781640565 0.139421305061415 0.185087031802922 37 0 963 0.963 0.037 0.074 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA:TTTATGAGC 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.08333333333334 8 33.33333333333332 0.102473368909235 0.289246860608989 0.354276512088964 -0.186773491699753 0.0385448748552949 0.138458583585106 0.319640454354786 0.267706618240926 0.131508179217173 0.155537124529072 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAT 2 ATGAGATTT:ATGAGCATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.41666666666667 8 33.999999999999986 0.101974992322902 0.282358178426184 0.361154732231567 -0.180383186103283 0.0364461813939493 0.123668504947076 0.290059656832857 0.213093152386546 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 7 ATT GAT TTT 2 AGATTTTTT:AGCATTTTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.08333333333333 8 34.33333333333332 0.0857055104092924 0.27903683339124 0.307147659926042 -0.193331322981948 0.0338914954281983 0.121784292899488 NaN NaN 0.122012547332994 0.113075431260769 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACA:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.66666666666667 8 33.91666666666666 0.0701445435081176 0.283201052715922 0.247684614288773 -0.213056509207804 0.0310122219762007 0.131552208418491 0.16465953889789 0.132524037707463 0.12202389700467 0.0808069859487857 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 9 ACA TCA CAT 2 TTCACATTG:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.5 8 33.749999999999986 0.069333399391501 0.284902170689401 0.243358621044302 -0.2155687712979 0.029689241052564 0.126318759399268 0.168882678439121 0.149586888578536 0.136290123894316 0.113720280886776 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 10 CTT CAT TGG 2 ACATTGGGA:ACTCTTAGA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.5 0.666666666666667 0.166666666666667 1 0 0 1 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75 8 34.24999999999999 0.069817817299509 0.279859737639748 0.249474318415115 -0.210041920340239 0.0305272867022466 0.12086371899174 0.211906413616914 0.239081628296954 0.121594046263635 0.0840953121682145 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 11 AGA TGG GAG 2 CTTAGATCA:TTGGGAGCA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.916666666666667 0.25 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.16666666666667 9 34.74999999999999 0.0559700169039056 0.317710819960381 0.176166543244845 -0.261740803056476 0.0275613853549237 0.136960435525625 0.139457056729258 0.206506005048305 0.132544419125475 0.048297629566357 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 12 GCA GAG CAA 2 AGATCAATT:GGAGCAATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74 8 35.49999999999999 0.0561009098120238 0.268009394822974 0.20932441509776 -0.211908485010951 0.028765362519075 0.115667256940981 0.15365329199113 0.173098022321172 0.11445088131688 0.0640942914002501 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 13 ATC CAA TCA 2 GCAATCACG:TCAATTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73 9 35.49999999999999 0.0422647024133488 0.309399206498443 0.13660249129812 -0.267134504085094 0.0239162841017245 0.130505834350209 0.0976097546894799 0.161670344926916 0.127323834351651 0.0358988325336282 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 14 ACG TCA CGC 2 ATCACGCGC:ATTACTGCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.66666666666667 9 35.33333333333333 0.042464170499631 0.311207889047031 0.136449530986066 -0.2687437185474 0.0255298482636277 0.131151277177832 NA NA 0.121816531386712 0.0273745458291932 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 15 CGC CGC CAC 2 ACGCGCAAT:ACTGCACAG 1:1 TRUE 1 1 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.16666666666667 9 34.83333333333333 0.0421656696333547 0.316764994602515 0.133113413261669 -0.27459932496916 0.0246507393995783 0.133463654995004 NaN NaN 0.125961305557832 0.0292552966861795 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 16 AAT CAC AGC 2 CGCAATCCA:GCACAGCCA 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.16666666666667 8 34.83333333333333 0.02784542552167 0.274200382158177 0.101551373862079 -0.246354956636507 0.0195779632058 0.130031093813207 NaN NaN 0.121765541730105 0.0430534520287364 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 17 CCA AGC CAG 2 AATCCAGCG:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73 8 34.99999999999999 0.0138252762666285 0.272625681756849 0.0507115697154279 -0.258800405490221 0.0137231856838516 0.118840098605752 0.0690299726843627 0.462564148449215 0.126962045047938 0.041509180615373 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 18 GCG CAG CGA 2 CCAGCGAAA:CCAGTAAAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.66666666666667 8 34.74999999999999 0.0276529018562458 0.274994650264777 0.100557962962626 -0.247341748408531 0.0192648858405986 0.120129743021474 0.110449165009666 0.362587526879413 0.127789627408972 0.0529242444768514 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 19 AAA CGA AAA 2 GCGAAAATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.33333333333333 8 34.33333333333333 0.027400307499342 0.27903683339124 0.0981960236802276 -0.251636525891898 0.0184804311252301 0.119810390990532 0.108925770470185 0.367325258272396 0.124557004469126 0.0433572645174354 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAA:AAAATTGAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75 8 33.99999999999999 0.0271522864979704 0.282358178426184 0.0961625643334031 -0.255205891928214 0.0190649727393229 0.119739233667142 NaN NaN 0.129972493098439 0.0495837267698471 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 21 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:ATTGACAAT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.83333333333333 8 34.33333333333333 0.0272138698048234 0.27903683339124 0.0975278764243519 -0.251822963586417 0.0191518177137365 0.119249466140928 0.121771744058201 0.423185324735806 0.120781612165398 0.0370743344638073 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 22 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25 8 34.08333333333333 0.0135904058348962 0.281520365031792 0.0482750362779667 -0.267929959196896 0.0136875098934912 0.128595781972835 NaN NaN 0.128455867448449 0.036999063846339 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.25 8 34.41666666666666 0.0137776549513118 0.278218809519287 0.0495209327331863 -0.264441154567975 0.0130353167925671 0.127900952902742 0.0812471121056719 0.542186402139172 0.122080722388175 0.030302230914729 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.58333333333333 9 35.24999999999999 0.0139053809368069 0.312120297918684 0.0445513509679836 -0.298214916981877 0.0143234070371161 0.126092997179683 0.0577711979344072 0.440606827568428 0.132351520880226 0.0242463175435303 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.91666666666666 9 34.91666666666666 0.0138412232800193 0.315824866691675 0.0438256285042045 -0.301983643411656 0.0138613425247253 0.136184061586702 NA NA 0.138932661863194 0.0297353996501115 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25 9 34.25 0.0135904058348962 0.323508417071989 0.0420094350493266 -0.309918011237093 0.0136251211587275 0.142925406574062 0.0687895131342102 0.541401292246811 0.135101780226938 0.0217928255977413 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666667 9 33.58333333333333 0.0134683754007452 0.331581375185359 0.0406186125297785 -0.318112999784614 0.0136697071000707 0.142820188663436 0.0569498323417863 0.475700364101606 0.140258441462924 0.0233262281701009 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666667 10 34.25 0.0136522540928075 0.369855206523338 0.0369124291128399 -0.356202952430531 0.0134814305269801 0.15616682757097 0.053794364759992 0.492601812756177 0.144046074441128 0.0134043990104684 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.41666666666667 10 33.416666666666664 0.0133782811395161 0.381873370361936 0.0350332916035395 -0.36849508922242 0.0138534385157613 0.158219268273193 0.0408192577653109 0.390752219163925 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666667 11 32.916666666666664 0.0132893842388272 0.442360526313466 0.0300419758281282 -0.429071142074638 0.0131719269498567 0.206208318548197 0.0435943921291162 0.490744748077329 0.186863564708424 0.0216659702344408 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CATGCTACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333334 12 33.25 0.0134382094503063 0.492181967718371 0.0273033356191459 -0.478743758268064 0.0140527313914649 0.234116377720867 0.0353465393818578 0.439849603525726 0.185913832962253 0.0100215711252385 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25 12 33.583333333333336 0.0134081783305544 0.485308821352962 0.0276281364372784 -0.471900643022408 0.0135507224477712 0.201034039412365 NA NA 0.207021881461626 0.0226390051222513 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333334 12 33.416666666666664 0.0132600139021293 0.488720381506319 0.0271321074461017 -0.475460367604189 0.0134858996669149 0.224468989736847 0.0344476513401684 0.430911398057492 0.215583722606374 0.0274221273747252 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.91666666666667 13 33.25 0.0264636052740321 0.552515991632425 0.047896541774012 -0.526052386358393 0.0190291451641463 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCA:ACGATACCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77 13 32.416666666666664 0.0264344542962561 0.573811734264465 0.046068166120968 -0.547377279968209 0.0192883315464101 NA NA NA 0.247874131986283 0.0272242570435297 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 36 CCA TAC CAC 2 ATACCACTA:ATACCGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.16666666666667 13 31.416666666666664 0.0263763446044989 0.601759854393703 0.0438320110786954 -0.575383509789204 0.0186658873654122 NA 0.038075919791859 0.249660635653682 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 37 CTA CAC TAC 2 CCACTACAA:CCGCTACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.66666666666667 13 30.666666666666664 0.0262035385209603 0.624681842201328 0.0419470148653932 -0.598478303680368 0.018476143635415 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.83333333333334 13 31.333333333333332 0.0261464386246643 0.604218872989977 0.0432731246796026 -0.578072434365312 0.0184711990900236 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCA 2 CAAGCCACA:CAAGCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.5 13 32 0.0262608883838265 0.585118918162181 0.0448812840752273 -0.558858029778355 0.018869644039161 0.258566033213502 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 40 ACA CCA CAC 2 GCCACATTC:GCCTCACTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.5 13 32 0.0262608883838265 0.585118918162181 0.0448812840752273 -0.558858029778355 0.0180917633076508 NA 0.0367863324096028 0.222444692674414 NaN NaN 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 ACATTCCCT:TCACTCCCT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.16666666666667 12 31.666666666666668 0.026032982222434 0.527796967417862 0.0493238571449075 -0.501763985195428 0.0178386596951683 0.237910177203225 0.0410321177718779 0.22933282690584 0.259527073357035 0.053189625116423 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC:TTCCCTTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.5 11 32 0.0262608883838265 0.459828354664807 0.057110198006318 -0.43356746628098 0.0188108355859807 0.20157566895244 0.0504749803025644 0.257863390376242 0.212109093005887 0.0409458721045747 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.66666666666667 11 31.833333333333332 0.0262035385209603 0.463158329862746 0.0565757686550205 -0.436954791341785 0.0176954788741572 0.194294551598012 0.0456577471848142 0.215298296218638 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.5 11 31.166666666666668 0.0259205062991005 0.476991575039997 0.0543416438685043 -0.451071068740897 0.0188948750039823 0.203980910645168 0.0516459431284368 0.292709731199464 0.228991161794107 0.0488591545757766 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.66666666666667 11 31 0.025864632053377 0.480584396281972 0.0538191257424877 -0.454719764228595 0.0174500792273146 0.205634979500091 0.0404950546243293 0.183838208632872 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTA 2 TGGCTTATT:TGGCTTGTT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78 11 30.666666666666668 0.0260895870640617 0.487940674605862 0.053468768688193 -0.4618510875418 0.0181962691165387 0.21710873470263 0.0463923031147513 0.249101157680016 0.200441700323852 0.0212132887307581 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 47 ATT TTA TTA 2 CTTATTGTT:CTTGTTATT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.41666666666667 11 30.250000000000004 0.0259485340559256 0.497470663057698 0.0521609332627441 -0.471522129001772 0.0174876507096332 0.21892285405526 0.0498108843947258 0.295016833019315 0.222044553744529 0.0337080101050398 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 ATTGTTGGC:GTTATTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.50000000000001 10 29.750000000000004 0.0392246245521367 0.445899039781238 0.0879675017272534 -0.406674415229101 0.0221386798669262 0.18392077768099999 0.0634993043794653 0.165951534466853 0.190294256875316 0.0325913294845969 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.58333333333334 9 30.416666666666668 0.0397005575048303 0.376300989048554 0.105502134355825 -0.336600431543724 0.0226148726720172 0.16555340687078 0.0886680995774933 0.234103597465329 0.170938646808626 0.0489381552634039 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.91666666666667 9 31.083333333333332 0.0400540111089283 0.365892312067182 0.10946939792923 -0.325838300958254 0.0223636393363068 0.161359301987302 0.103008388482795 0.287907524386578 0.154525394300213 0.0349757381578985 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAC 2 GTTGCACTT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.83333333333334 9 30.41666666666667 0.0532374199351599 0.376300989048554 0.141475631168991 -0.323063569113394 0.0261357871281039 0.163655981644427 0.11315114126366 0.211181073927424 0.160435315910881 0.0440443315274208 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 52 CTT CAC TTC 2 GCACTTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.16666666666667 9 31.08333333333334 0.0530021800130169 0.365892312067182 0.144857320760774 -0.312890132054165 0.0261572486118093 0.159514563690553 0.139237201093972 0.298170989619455 0.1659314592581 0.05934093544616 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 CTTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.66666666666667 8 30.91666666666667 0.0526531940049364 0.317355464450165 0.165912359808144 -0.264702270445229 0.0262204305686099 0.136621790196176 0.128604160391984 0.197015582250046 0.135477138185957 0.0507187286273845 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.00000000000001 8 30.58333333333334 0.0524230797130337 0.321673722092295 0.162969730234888 -0.269250642379261 0.0252307040805565 0.138330954676391 0.140733929974939 0.246864502328607 0.147989273212863 0.0688514994407452 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.83333333333336 8 30.41666666666667 0.0518565020980098 0.32387790933552 0.160111266015026 -0.27202140723751 0.0252191536574666 0.13491608143909 0.130432173977344 0.219618098548164 0.140131357358336 0.0522353934034399 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.16666666666669 8 29.750000000000004 0.0509750280987295 0.33301033366905 0.153073412278519 -0.28203530557032 0.0250921488289679 0.146802643531092 0.154831458460051 0.322836655524725 0.151073108505502 0.0619184021645362 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAGC:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.83333333333336 8 29.750000000000004 0.0511925740908369 0.33301033366905 0.153726683273777 -0.281817759578213 0.0259759554244518 0.142113343393186 0.125235991066268 0.219636208760742 0.151700764894696 0.0632085858245588 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 58 AGC AAA GCG 2 CAAAGCGCT:CAGAGCGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.91666666666669 8 30.000000000000004 0.0518005174564371 0.329524994837884 0.157197536660068 -0.277724477381447 0.026072542308859 0.149223291349447 0.128876535019924 0.222558533799163 0.142426538117988 0.0511822048643749 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.75000000000001 9 30.66666666666667 0.0525954761681725 0.372327664735418 0.141261262994109 -0.319732188567246 0.0255286363684064 0.159199491176551 0.0987755798638922 0.152681620143223 0.166728556739582 0.055151469958295 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCTAAA 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.91666666666669 9 30.5 0.0524804194365887 0.374966963646815 0.139960115222365 -0.322486544210226 0.0259625437247505 0.156821702561482 0.103407726096895 0.175902872058984 0.157315723794508 0.040371062086917 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCTAAAGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.08333333333336 8 29.333333333333332 0.0516889101836223 0.338988842807293 0.152479679730953 -0.287299932623671 0.0250624162512207 0.154129663618281 0.121952528296084 0.211182691610125 0.14715173639325 0.0508900216006543 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAAGTAATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.41666666666669 8 28.999999999999996 0.0528271104098974 0.343931200066585 0.153597900974585 -0.291104089656687 0.0262902857671972 0.14706425868726 0.144323319424651 0.287209787529146 0.1534759048215 0.0578620879182527 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG:GTAATTGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.08333333333334 7 28.666666666666664 0.0523658652014987 0.295428214280316 0.177254110035041 -0.243062349078818 0.0263945658438836 0.129547753428221 NaN NaN 0.136108623786699 0.074132159972237 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC:ATTGCGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.25 7 29 0.0522518101768581 0.291278006061648 0.17938810720161 -0.23902619588479 0.0266043872780222 0.14139337729251 0.152765301296698 0.240285855447538 0.133598822221646 0.0735932368593959 7 1 992 0.992 0.007 0.014 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT:GCGCTTCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.41666666666667 8 29.333333333333332 0.0521382511052232 0.338988842807293 0.153805212801244 -0.28685059170207 0.0267162497342289 0.149865329518722 0.14511654863574 0.289202063672988 0.144699603395621 0.0474359596656825 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA:CTTCATAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.08333333333334 8 28.666666666666664 0.0516889101836223 0.349022437266925 0.148096238707117 -0.297333527083303 0.0250299824558652 0.152282259100758 0.160342863165763 0.35568301660951 0.151639562006219 0.0499033786126784 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA:CATAGAAGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.25 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.75 7 28 0.0512472511431301 0.304098831081123 0.168521697242102 -0.252851579937993 0.0259468965380173 0.140849944652441 NaN NaN 0.130002662419972 0.0517783098402923 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AGAAGGTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.75 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.58333333333334 7 28.25 0.0647651348577861 0.300787567424286 0.215318523343186 -0.2360224325665 0.0357565983463346 0.141109056494466 NaN NaN 0.134586317125817 0.0794839532235841 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG:AGGTGGCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.08333333333334 8 28.5 0.0651875872755847 0.351626041530565 0.185388963206009 -0.286438454254981 0.0341983235644641 0.147077224873007 NaN NaN 0.153148228003305 0.0614373454273544 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA:TGGCAGCTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.41666666666667 8 28.833333333333332 0.0796327387923167 0.346457784201476 0.22984831752548401 -0.26682504540916 0.0361552561944754 0.155231382468026 0.203436528120486 0.258548641407438 0.163671006465881 0.103048170645378 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC:CAGCTCGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.08333333333334 9 28.833333333333332 0.0941885460903394 0.40362830824239 0.233354658647422 -0.30943976215205 0.0413647943857969 0.179776278223517 0.215096610756218 0.277973473545117 0.179552839777774 0.0848178272013179 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT:CTCGCCTTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.58333333333334 9 28.999999999999996 0.093558286859156 0.400561864447693 0.233567633774016 -0.307003577588537 0.0393516850645258 0.166978671495586 0.171691682610779 0.173706567688046 0.175837533263958 0.0808196045265244 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TAT 2 GCCCTTTAT:GCCTTATAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.25 9 28.499999999999996 0.0927309624185635 0.409907779776052 0.226223963031943 -0.317176817357489 0.039129050661475 0.172298115044297 0.183012596220957 0.216417144743188 0.184978802219765 0.0864065257374866 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 74 TAT TAT ATA 2 CTTTATAAG:TTATATAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.25 8 28.333333333333332 0.106966265210453 0.354269507203646 0.301934722112464 -0.247303241993193 0.0425842642496723 0.157533451392679 0.232125191883119 0.193347170580273 0.162498244499793 0.128038513392096 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 75 AAA ATA AAG 2 TATAAAGGC:TATAAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.41666666666667 8 28.166666666666664 0.106728023137133 0.356953773574163 0.298996763834347 -0.25022575043703 0.0435501570208774 0.160576192862757 NaN NaN 0.150689707359787 0.0968065831599684 24 0 976 0.976 0.024 0.048 ORF3a all ss13 76 GGC AAG GCG 2 AAAGGCGTT:AAGGGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.75000000000001 8 28.166666666666664 0.109159374475305 0.356953773574163 0.305808153762592 -0.247794399098858 0.0418661711486098 0.161117028963423 0.261814757221177 0.242793642782141 0.160611439114477 0.122874669123048 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 77 GTT GCG TCC 2 GGCGTTCAA:GGCTTCCAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.75000000000001 8 27.833333333333332 0.109159374475305 0.362448618140339 0.301171997938308 -0.253289243665034 0.0431547713924339 0.163762996441946 0.229119589201756 0.188686367725837 0.166017820653694 0.127090815858137 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 78 CAA TCC AAC 2 GTTCAACTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.58333333333336 7 27.166666666666664 0.107929984092779 0.315691024758642 0.341884867253657 -0.207761040665863 0.0438063221307299 0.150969252246762 0.261491447429362 0.191062684804607 0.146381860891221 0.155809052781659 41 0 959 0.959 0.041 0.082 ORF3a all ss13 79 CTT AAC TCA 2 CAACTTGTA:CAGTTCATT 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.41666666666669 7 27.666666666666664 0.108173637989641 0.308630566923095 0.350495542512468 -0.200456928933454 0.0434844791834305 0.14730307286271 0.337226208961513 0.2986427026541 0.144060463755582 0.164080604322039 46 0 954 0.954 0.046 0.092 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TAT 2 CTTGTATGT:TTCATTTGC 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.91666666666669 6 27.999999999999996 0.108911256999757 0.25235417746591 0.431580955359732 -0.143442920466153 0.0426067678033878 0.118034573631241 0.41855484935566 0.302483789244272 0.126999181509415 0.258695783831473 98 0 902 0.902 0.098 0.196 ORF3a all ss13 81 TGC TAT GCA 2 ATTTGCAAT:GTATGTAAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.50000000000001 5 27.749999999999996 0.108051673445481 0.206064750939693 0.524357867867969 -0.0980130774942115 0.0430003848953617 0.101161774483111 NaN NaN 0.106016462153305 0.355221838644458 147 0 853 0.853 0.147 0.294 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATA 2 TGCAATTTA:TGTAATATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.66666666666669 5 28.083333333333332 0.107808568999606 0.203255134092856 0.530410065560037 -0.0954465650932503 0.0416345018931933 0.107633682096401 NaN NaN 0.104373610914685 0.36046978802001 170 0 830 0.83 0.17 0.34 ORF3a all ss13 83 ATG ATA TAC 2 AATATGCTG:AATTTACTG 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 1 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.66666666666669 5 28.083333333333332 0.107808568999606 0.203255134092856 0.530410065560037 -0.0954465650932503 0.0424798216725947 0.101612686561656 NaN NaN 0.108019368556534 0.376908924391581 154 0 846 0.846 0.154 0.308 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 ATGCTGCTG:TTACTGCTG 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.66666666666669 4 27.916666666666664 0.0934540638415831 0.159008783209024 0.587728941480758 -0.065554719367441 0.0395103183235246 0.0887698436747279 NaN NaN 0.0951771104869596 0.490970788317601 233 1 766 0.766 0.233 0.466 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA:CTGCTGCTT 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.08333333333336 4 28.666666666666664 0.107205575102587 0.154389040653112 0.694385913981173 -0.0471834655505242 0.0427542474240161 0.0843638307055041 NaN NaN 0.0897116188096273 0.598925738518636 314 0 686 0.686 0.314 0.628 ORF3a all ss13 86 CTA TGC TAT 2 CTGCTATTT:CTGCTTTTT 1:1 FALSE 1.5 1 0.25 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.25000000000001 4 28.999999999999996 0.106966265210453 0.152421181209951 0.701780844114525 -0.0454549159994987 0.0430408973304647 0.0800617538290194 NaN NaN 0.0894635076413097 0.611394912214335 293 0 707 0.707 0.293 0.586 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:CTTTTTGTG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.16666666666669 4 29.999999999999996 0.10708578623022 0.146808432844572 0.729425307220555 -0.0397226466143517 0.0439664467259272 0.080945030790787 NaN NaN 0.0854638890563791 0.642082808201693 321 0 679 0.679 0.321 0.642 ORF3a all ss13 88 GTG TTG TGA 2 TTTGTGACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.00000000000001 4 29.33333333333333 0.105902482398361 0.150503021596613 0.703656852034553 -0.044600539198252 0.0440254495206743 0.0817098369047426 NaN NaN 0.0870950033864381 0.608587549493293 296 0 704 0.704 0.296 0.592 ORF3a all ss13 89 ACA TGA CAA 2 GTGACAATT:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.83333333333336 4 29.499999999999996 0.106137042941326 0.149561992614941 0.709652506533424 -0.0434249496736147 0.041683668175829 0.0812780961247416 NaN NaN 0.0888070059221541 0.624855059793331 305 0 695 0.695 0.305 0.61 ORF3a all ss13 90 ATC CAA TCT 2 ACAATTTAC:ACCATCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.50000000000001 4 29.166666666666664 0.105204990412841 0.151456007747705 0.69462408244704 -0.0462510173348637 0.0440689708768497 0.0817822888797737 NaN NaN 0.0917757052013665 0.614291530878211 328 0 672 0.672 0.328 0.656 ORF3a all ss13 91 TAC TCT ACT 2 ATCTATTCA:ATTTACTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.83333333333336 4 29.499999999999996 0.106137042941326 0.149561992614941 0.709652506533424 -0.0434249496736147 0.043246239055889 0.0810297721577261 NaN NaN 0.0892492553674917 0.626571510251644 324 0 676 0.676 0.324 0.648 ORF3a all ss13 92 TCA ACT CAC 2 TACTCACAC:TATTCACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.83333333333336 4 29.499999999999996 0.106137042941326 0.149561992614941 0.709652506533424 -0.0434249496736147 0.0424290969676353 0.0822731207943284 NaN NaN 0.0905176627714862 0.631412233277352 302 0 698 0.698 0.302 0.604 ORF3a all ss13 93 CAC CAC ACC 2 TCACACCTT:TCACATCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 82.33333333333336 4 28.666666666666664 0.104062731375236 0.154389040653112 0.674029263573499 -0.0503263092778758 0.0410369718716779 0.0853638614379307 NaN NaN 0.0929924191620795 0.588378541875109 323 0 677 0.677 0.323 0.646 ORF3a all ss13 94 CTT ACC TTC 2 CACCTTCTA:CATCTTTTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.83333333333336 4 28.499999999999996 0.104745085924422 0.155392217528976 0.674069059506729 -0.0506471316045541 0.0421496816207931 0.0875340071116891 NaN NaN 0.0914245404326183 0.579594294742993 273 0 727 0.727 0.273 0.546 ORF3a all ss13 95 CTA TTC TAC 2 CTTCTACTT:CTTTTGCTT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 82.33333333333336 4 28.666666666666664 0.104062731375236 0.154389040653112 0.674029263573499 -0.0503263092778758 0.0422307237256891 0.0809678792368645 NaN NaN 0.0892428601122437 0.572804951090084 295 0 705 0.705 0.295 0.59 ORF3a all ss13 96 CTT TAC TTC 2 CTACTTCTA:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.08333333333333 1 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.33333333333336 4 29.666666666666664 0.105436462965892 0.148632696437812 0.709375968362432 -0.0431962334719195 0.0433143249493172 0.0778483411611279 NaN NaN 0.0897534129968912 0.630319798799083 349 0 651 0.651 0.349 0.698 ORF3a all ss13 97 CTA TTC TAG 2 CTTCTAGCT:CTTGTCGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.58333333333336 4 29.916666666666668 0.105089635467852 0.147260274111344 0.713631942504693 -0.0421706386434921 0.0438351800576925 0.080557676181714 NaN NaN 0.0886281620854426 0.634205943732597 320 0 680 0.68 0.32 0.64 ORF3a all ss13 98 GCT TAG CTG 2 CTAGCTGCT:GTCGCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.58333333333336 4 30.083333333333332 0.0911194993124764 0.146359364647636 0.62257375557655 -0.0552398653351595 0.039594777601187 0.0772725248639407 NaN NaN 0.0868314572745593 0.524663394096516 263 1 736 0.736 0.263 0.526 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTTGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.75000000000001 4 29.41666666666667 0.0897547785817448 0.150031026615648 0.59824144782852 -0.0602762480339036 0.0385235569864748 0.081795315444834 NaN NaN 0.0896797471573918 0.501502362059458 245 0 755 0.755 0.245 0.49 ORF3a all ss13 100 GGT CAG GCA 2 GCAGGTATG:GCTTGCATG 1:1 TRUE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 83.75000000000001 4 29.41666666666667 0.0886171797125078 0.150031026615648 0.590659023746658 -0.0614138469031406 0.0396091925499144 0.0813194762826665 NaN NaN 0.0865997142080439 0.478219506781159 221 1 778 0.778 0.221 0.442 ORF3a all ss13 101 ATG GCA TGG 2 GGTATGGAG:TGCATGGAA 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.83333333333336 4 29.750000000000004 0.0752195633615916 0.148172379571929 0.50764902054554 -0.0729528162103373 0.0346734385435084 0.0788609864377555 NaN NaN 0.084093722583989 0.385658265512306 188 2 810 0.81 0.188 0.376 ORF3a all ss13 102 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGCA:ATGGAGGCG 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.83333333333336 4 29.750000000000004 0.0761753537657808 0.148172379571929 0.514099550711489 -0.0719970258061481 0.037591306699302 0.0801664223323963 NaN NaN 0.084848444926306 0.396139101032845 177 1 822 0.822 0.177 0.354 ORF3a all ss13 103 GCA AAG CAC 2 GAAGCACAA:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.33333333333336 4 30.250000000000004 0.0902374551086072 0.145469445655623 0.620318959090768 -0.055231990547016 0.0389755250877005 0.0795498131700332 NaN NaN 0.086656444121035 0.523885572432942 257 0 743 0.743 0.257 0.514 ORF3a all ss13 104 CAA CAC AAT 2 GCACAATTC:GCGCAATTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.66666666666669 4 30.583333333333336 0.0898508998594655 0.143721781908901 0.62517245935914 -0.0538708820494353 0.0400125131557799 0.0782998416633621 NaN NaN 0.0840179299484053 0.521403687616631 278 0 722 0.722 0.278 0.556 ORF3a all ss13 105 TTC AAT TCT 2 CAATTCTTG:CAATTTTTG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.50000000000001 4 31.083333333333336 0.0912185711042866 0.141177857059553 0.646125199830793 -0.049959285955266 0.0392371095000606 0.0751918435589677 NaN NaN 0.0848524126373283 0.556009793450212 266 0 734 0.734 0.266 0.532 ORF3a all ss13 106 TTG TCT TGT 2 TTCTTGTAC:TTTTTGTAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.83333333333336 4 30.750000000000004 0.0908235725293773 0.142863650574837 0.635736047370573 -0.0520400780454593 0.0396740224397862 0.0746224463177429 NaN NaN 0.0826212548941439 0.528784170471453 266 2 732 0.732 0.266 0.532 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACA 2 TTGTACATC:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.83333333333336 4 31.41666666666667 0.0920189790070996 0.139531497680893 0.659485353031513 -0.0475125186737935 0.0401901867230579 0.0736456764935231 NaN NaN 0.0817328928089807 0.561028485432942 286 0 714 0.714 0.286 0.572 ORF3a all ss13 108 ATC ACA TCT 2 TACATCTAT:TACCTCTAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.83333333333336 4 31.91666666666667 0.0920189790070996 0.137132914796851 0.671020368402558 -0.0451139357897514 0.0404915172549633 0.0726403532510362 NaN NaN 0.0852442046708165 0.596644725274911 266 0 734 0.734 0.266 0.532 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 ATCTATGCC:CTCTATGCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.00000000000001 3 31.91666666666667 0.0918175614096642 0.100428343016685 0.914259447598474 -0.00861078160702046 0.0400730443353795 0.0610175614960165 NaN NaN 0.0736197365824397 0.906889413114545 477 0 523 0.523 0.477 0.954 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCC 2 TATGCCCTG:TATGCCTTG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.00000000000001 3 31.91666666666667 0.0918175614096642 0.100428343016685 0.914259447598474 -0.00861078160702046 0.0411666924602572 0.0613999437735315 NaN NaN 0.0711414242507372 0.903661316467543 489 0 511 0.511 0.489 0.978 ORF3a all ss13 111 CTG CCC TGA 2 GCCCTGATT:GCCTTGATA 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.66666666666669 3 32.25000000000001 0.0922212833511261 0.0993184392369987 0.928541407412405 -0.00709715588587251 0.0402554376997811 0.0630343076565773 NaN NaN 0.0691715034122025 0.918278611128938 473 1 526 0.526 0.473 0.946 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 CTGATTTAT:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.50000000000001 3 32.41666666666667 0.0900437621201392 0.0987726497511971 0.911626470960883 -0.00872888763105795 0.0393043468694558 0.0630551377252939 NaN NaN 0.0724708148141841 0.904129112046176 465 0 535 0.535 0.465 0.93 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATA 2 ATATATTTT:ATTTATATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.83333333333336 3 33.41666666666667 0.089658862987337 0.0956200277799543 0.937657780163635 -0.00596116479261728 0.040425952985262 0.0609178338152923 NaN NaN 0.0683847757498108 0.930535642473534 496 0 504 0.504 0.496 0.992 ORF3a all ss13 114 ATC ATA TCT 2 TATATCTTG:TATTTTCTA 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.50000000000003 3 33.75 0.0900437621201392 0.094613463995175 0.951701357480486 -0.00456970187503583 0.0388931363732818 0.0588918926683706 NaN NaN 0.064739087485404 0.943726900829803 484 1 515 0.515 0.484 0.968 ORF3a all ss13 115 CTA TCT TAC 2 ATCTTGCAA:TTTCTACAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.6666666666667 2 34.083333333333336 0.0910206427532005 0.0611024764460933 1.4896391774481 0.0299181663071073 0.0402547374982026 0.0441043707533014 NaN NaN 0.0573807083489658 0.602089790397971 696 0 304 0.304 0.696 0.608 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAA 2 CTACAATGC:TTGCAAATT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.33333333333336 2 34.083333333333336 0.0902374551086072 0.0611024764460933 1.47682156856961 0.029134978662514 0.041172762283164 0.0472323030266896 NA NA 0.0551735477205864 0.597457251495931 729 0 271 0.271 0.729 0.542 ORF3a all ss13 117 ATT AAA GCA 2 CAAATTGTA:CAATGCATC 1:1 TRUE 2 0.5 0.5 0 2 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.00000000000001 2 34.75 0.0918175614096642 0.0598821656332629 1.53330395517062 0.0319353957764013 0.0401299994531534 0.0434588904482408 NaN NaN 0.0548386638166347 0.560329726188737 743 3 254 0.254 0.743 0.508 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TAA 2 ATTGTAAGT:TGCATCAAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.58333333333334 3 34.91666666666667 0.0647651348577861 0.0912516429860269 0.709742123412544 -0.0264865081282408 0.0293922937894272 0.0562068396843616 NaN NaN 0.0596541305932506 0.657041685298569 320 1 679 0.679 0.32 0.64 ORF3a all ss13 119 AAC TAA ACG 2 ATCAACGCA:GTAAGTTTT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.91666666666669 2 34.583333333333336 0.0644865306153867 0.0601826482875392 1.07151367462735 0.00430388232784751 0.0285840078999295 0.043649617076954 NA NA 0.0453718851608561 0.924427686410693 549 3 448 0.448 0.549 0.896 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AGTTTTTGT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.08333333333334 3 34.75000000000001 0.0516889101836223 0.0917171833187057 0.563568442829408 -0.0400282731350834 0.0253169225422537 0.054280285177047 NA NA 0.0561578910429077 0.475981335250155 244 2 754 0.754 0.244 0.488 ORF3a all ss13 121 TGT CAT GTA 2 GCATGTAGA:TTTTGTAGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.91666666666669 2 34.583333333333336 0.0385111332176099 0.0601826482875392 0.639904263328731 -0.0216715150699293 0.0222451158550891 0.0454178658128339 NA NA 0.0512587417828942 0.672450881042863 322 4 674 0.674 0.322 0.644 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 TGTAGAATT:TGTAGATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.08333333333334 3 35.25000000000001 0.0389276557511925 0.0903346148069003 0.430927345341588 -0.0514069590557078 0.0224828796792255 0.0513802664010731 NA NA 0.0610276670156378 0.399589286331615 186 3 811 0.811 0.186 0.372 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATT:AGATTTATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.08333333333334 3 35.083333333333336 0.0389276557511925 0.0907908105289243 0.428762068808614 -0.0518631547777318 0.0221913633325626 0.056628855791271 NA NA 0.0586065021231393 0.376189758605492 181 1 818 0.818 0.181 0.362 ORF3a all ss13 124 ATC TTA TCA 2 ATTATTATG:TTTATCATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.41666666666669 3 35.41666666666667 0.0256161505491714 0.0898829861073045 0.284994431744738 -0.0642668355581331 0.0175797500932098 0.0529734018024589 NA NA 0.0577757883321629 0.265988159289964 103 9 888 0.888 0.103 0.206 ORF3a all ss13 125 ATG TCA TGA 2 ATCATGAGA:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.41666666666669 3 35.41666666666667 0.0256161505491714 0.0898829861073045 0.284994431744738 -0.0642668355581331 0.0173931519004988 0.05206938570512 NA NA 0.0586329750482296 0.273040749158895 109 1 890 0.89 0.109 0.218 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGC:ATGAGATGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333336 3 35.41666666666667 0.0252389746234555 0.0898829861073045 0.280798132288625 -0.064644011483849 0.0181539966970486 0.0515077668744212 NA NA 0.0575022110435675 0.26092799895613 101 2 897 0.897 0.101 0.202 ORF3a all ss13 127 TGC GAT GCT 2 AGATGCTGG:AGATGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.91666666666669 3 35.75000000000001 0.0644865306153867 0.088993157850987 0.72462346738347 -0.0245066272356003 0.0438332550396193 0.0541882119557169 NA NA 0.0717074407781847 0.732532644937352 364 1 635 0.635 0.364 0.728 ORF3a all ss13 128 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCTG:TGTTGGCTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.66666666666669 4 35.833333333333336 0.078331997525698 0.120863906464681 0.648100825274815 -0.0425319089389834 0.0457531394140857 0.0639205379310662 NA NA 0.0774087873781685 0.582699764681372 267 2 731 0.731 0.267 0.534 ORF3a all ss13 129 CTG GGC TGT 2 TGGCTGTGC:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.33333333333336 4 35.16666666666667 0.0786746849626466 0.123354245726484 0.637794706613454 -0.0446795607638371 0.0462515199116288 0.0636593408803987 NaN NaN 0.0795053498373828 0.57413697913003 264 0 736 0.736 0.264 0.528 ORF3a all ss13 130 TGC TGT GCT 2 CTGTGCTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.08333333333333 0.5 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.50000000000003 4 34.833333333333336 0.0774882105210195 0.124638389543236 0.621704202092079 -0.0471501790222168 0.0428446663306459 0.0646889144269677 NaN NaN 0.0749756492972016 0.5294320506232 257 1 742 0.742 0.257 0.514 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAG:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.08333333333336 4 34.583333333333336 0.0779078173603665 0.125619222573624 0.620190252448867 -0.0477114052132579 0.0450321552155597 0.0691805540218066 NaN NaN 0.0809871558979594 0.555778691237829 282 0 718 0.718 0.282 0.564 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.75000000000003 4 34.583333333333336 0.078246792038373 0.125619222573624 0.622888682442794 -0.0473724305352514 0.0456537449231839 0.0682783537299132 NaN NaN 0.07701252293944 0.538471295411321 259 1 740 0.74 0.259 0.518 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA:AAGTGCAGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.25000000000003 4 34.083333333333336 0.0777394299845026 0.127628054258581 0.609109262349156 -0.0498886242740789 0.0468204080197105 0.0672336943262243 NA NA 0.0781307458317178 0.523130404732566 245 0 755 0.755 0.245 0.49 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC:TGCAGATCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.4166666666667 4 34.083333333333336 0.0775717695799524 0.127628054258581 0.60779559815891 -0.050056284678629 0.0456221886041624 0.0653313557684076 NaN NaN 0.0786582828992639 0.524531038241099 258 1 741 0.741 0.258 0.516 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG:AGATCCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.75000000000003 4 34.333333333333336 0.0646255322826462 0.126615652181289 0.510407135052426 -0.0619901198986428 0.0445399797496899 0.0691274680278895 NA NA 0.077041075544831 0.421029034439652 196 0 804 0.804 0.196 0.392 ORF3a all ss13 136 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAT:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.00000000000003 4 34.75000000000001 0.0644172539103222 0.124963623649128 0.51548804387421 -0.0605463697388062 0.0455604571625501 0.0659672049137774 NA NA 0.0741124343939483 0.413955333168195 186 1 813 0.813 0.186 0.372 ORF3a all ss13 137 AAC AAA ACC 2 AAAAATCCA:AAGAACCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.41666666666669 4 34.16666666666667 0.06407309248799 0.127288788480472 0.503367918360067 -0.0632156959924819 0.043095624787637 0.0680881423120873 NA NA 0.0741566007072956 0.3939576327055 184 4 812 0.812 0.184 0.368 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA:AATCCATTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.75000000000003 4 34.16666666666667 0.0646255322826462 0.127288788480472 0.50770796905307 -0.0626632561978257 0.0444649024460049 0.0675726194810641 NA NA 0.0800550906633539 0.433772951346591 195 2 803 0.803 0.195 0.39 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTC:CCATTACTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.58333333333336 4 34.33333333333334 0.0647651348577861 0.126615652181289 0.511509704701083 -0.0618505173235029 0.0445055013522512 0.0680492043664174 NA NA 0.0782002729011069 0.428988008896036 203 2 795 0.795 0.203 0.406 ORF3a all ss13 140 CTC TAC TCT 2 TTACTCTAT:TTACTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.25000000000003 4 35.33333333333334 0.0659040642696656 0.122722067836352 0.537018854323314 -0.056818003566686 0.0433426422836185 0.0655752928610544 NA NA 0.0718734696782308 0.429219368393523 196 2 802 0.802 0.196 0.392 ORF3a all ss13 141 TAT TCT ATG 2 CTCTATGAT:CTTTATGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.25000000000003 4 35.33333333333334 0.0659040642696656 0.122722067836352 0.537018854323314 -0.056818003566686 0.0436765851288844 0.0680278260437488 NA NA 0.0730991984110712 0.436997960633152 192 1 807 0.807 0.192 0.384 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC:TATGATGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.25000000000003 4 36 0.0659040642696656 0.120256987556385 0.548026901461882 -0.054352923286719 0.0456643199326785 0.0625916333965522 NaN NaN 0.0728702776784271 0.455736255261514 203 1 796 0.796 0.203 0.406 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC:GATGCTAAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.91666666666669 4 36.333333333333336 0.0661950873041523 0.119061291806916 0.555974878985038 -0.0528662045027636 0.0471537390269344 0.0648268543352489 NaN NaN 0.0718674957185533 0.461970142070339 214 2 784 0.784 0.214 0.428 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC:GCTAACTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.25000000000003 5 36.66666666666667 0.0659040642696656 0.150503021596613 0.437891967686239 -0.0845989573269477 0.0443786669941505 0.0746920891810674 NaN NaN 0.0840204602846419 0.313989948575117 129 0 871 0.871 0.129 0.258 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT:AACTATTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.25000000000003 5 36.66666666666667 0.0659040642696656 0.150503021596613 0.437891967686239 -0.0845989573269477 0.0447335098877408 0.0748177488047326 NaN NaN 0.0780275366045273 0.278267597851558 123 1 876 0.876 0.123 0.246 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT:TATTTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.41666666666669 5 36.5 0.0666364763682366 0.151264442981809 0.440529678056925 -0.0846279666135727 0.0486564166411372 0.078395077883016 NA NA 0.085537676294825 0.322484686634456 151 2 847 0.847 0.151 0.302 ORF3a all ss13 147 GTA TTG TAT 2 TTTGTATGT:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.75000000000003 5 35.666666666666664 0.0663415654213976 0.155190536855492 0.427484605476767 -0.0888489714340943 0.0452946222239404 0.0759366706535852 NaN NaN 0.0829571421217638 0.284159282087205 131 0 869 0.869 0.131 0.262 ORF3a all ss13 148 TGC TAT GCT 2 GTATGTTGG:GTTTGCTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.75000000000003 5 36.666666666666664 0.0672342400167485 0.150503021596613 0.446730167298258 -0.0832687815798649 0.0453867472901412 0.075143968329092 NA NA 0.08062428562498 0.301697391202518 131 0 869 0.869 0.131 0.262 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGTTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.08333333333337 5 36.49999999999999 0.0669340227304817 0.151264442981809 0.442496738896735 -0.0843304202513276 0.0469131046567976 0.0726439023877235 NaN NaN 0.0801302175357057 0.292608174581366 128 0 872 0.872 0.128 0.256 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.4166666666667 5 35.83333333333333 0.0666364763682366 0.154389040653112 0.431614032228871 -0.0877525642848749 0.0451998726222547 0.0769421996317792 NaN NaN 0.0846355824719228 0.299815899457063 130 0 870 0.87 0.13 0.26 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACTAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.75000000000003 5 35.83333333333333 0.0672342400167485 0.154389040653112 0.435485833271116 -0.0871548006363631 0.0483482616251408 0.0766775617427125 NaN NaN 0.0888496962126985 0.32663021440537 133 1 866 0.866 0.133 0.266 ORF3a all ss13 152 AAT CAC ATA 2 ACACATAAC:ACTAATAAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.75000000000003 5 34.83333333333333 0.0663415654213976 0.159326652781303 0.41638711579826 -0.0929850873599056 0.0442042220858277 0.0804232789131866 NA NA 0.089323878334113 0.297881107724523 128 0 872 0.872 0.128 0.256 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 AATAACTAT:CATAACTAT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.4166666666667 5 35.49999999999999 0.0535344239114693 0.156000428408735 0.34316844163533 -0.102466004497265 0.0421665452532776 0.0745573090470369 NA NA 0.0846751385205395 0.226237716730108 93 2 905 0.905 0.093 0.186 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.25000000000003 5 35.16666666666666 0.0536541558618204 0.157645932730055 0.340345957124661 -0.103991776868235 0.0430159965512458 0.0782572537945622 NaN NaN 0.0914164588609973 0.255303937684316 102 3 895 0.895 0.102 0.204 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.58333333333336 6 35.16666666666666 0.0534152253723939 0.193580949501978 0.275932241833787 -0.140165724129584 0.0433407108001537 0.0894697179645167 NaN NaN 0.0921528172190185 0.128256326816261 54 2 944 0.944 0.054 0.108 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.91666666666669 6 35.16666666666666 0.0538952343889476 0.193580949501978 0.278411871248709 -0.139685715113031 0.0437902932113979 0.0870769053852838 0.359207500533056 0.438296794365718 0.0966307305747926 0.148300082791438 50 1 949 0.949 0.05 0.1 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.91666666666669 6 35.16666666666666 0.0538952343889476 0.193580949501978 0.278411871248709 -0.139685715113031 0.0444847597401774 0.0904730967505182 NaN NaN 0.101342197319292 0.168093129011513 53 0 947 0.947 0.053 0.106 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.75000000000001 6 34.83333333333332 0.0540165882431453 0.195697415235261 0.276020959082205 -0.141680826992116 0.0466128605860365 0.085971491209977 0.398232676402667 0.488237514847921 0.0918982413254757 0.12314305076621 36 1 963 0.963 0.036 0.072 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAC:ATACCATAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666669 6 34.83333333333332 0.0542609435735893 0.195697415235261 0.277269597599736 -0.141436471661672 0.0428018988858912 0.0904386486489387 NA NA 0.101555680131437 0.163710898173521 58 0 942 0.942 0.058 0.116 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATACAAC:CCATATAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.08333333333336 6 34.83333333333332 0.0537744248135208 0.195697415235261 0.274783521023386 -0.14192299042174 0.0435855856976576 0.0918168397279138 NA NA 0.0957161742935783 0.138141308629073 45 0 955 0.955 0.045 0.09 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAACAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.08333333333336 6 34.83333333333332 0.0537744248135208 0.195697415235261 0.274783521023386 -0.14192299042174 0.043400328802802 0.087862863743004 0.383051214260014 0.473155372855265 0.0889814282440057 0.110718236300193 47 0 953 0.953 0.047 0.094 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.9166666666667 6 34.33333333333332 0.0538952343889476 0.198960851821961 0.270883613009335 -0.145065617433013 0.0446696204125677 0.0902901871079168 NaN NaN 0.0910792732535289 0.111218491352797 44 1 955 0.955 0.044 0.088 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.4166666666667 6 34.16666666666666 0.0542609435735893 0.200073130342575 0.271205551093648 -0.145812186768986 0.0436543847240427 0.0952251697959836 NA NA 0.095332992827821 0.126139566637606 42 1 957 0.957 0.042 0.084 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.08333333333337 6 34.16666666666666 0.0537744248135208 0.200073130342575 0.268773846450273 -0.146298705529054 0.0437351064643694 0.0879679396100234 NA NA 0.0921746037773681 0.11246938272636 44 0 956 0.956 0.044 0.088 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.4166666666667 6 33.83333333333332 0.0535344239114693 0.202335646591906 0.264582266215522 -0.148801222680436 0.0429537297215039 0.0927526971228679 NaN NaN 0.0999169690118107 0.136421873938556 42 0 958 0.958 0.042 0.084 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT:GATACAGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.25000000000003 6 33.99999999999999 0.0536541558618204 0.20119798994601 0.266673418935339 -0.147543834084189 0.0455634312102479 0.0898631781551461 NA NA 0.0960464112063955 0.124496133700853 40 1 959 0.959 0.04 0.08 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC:ACAGTTGTC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.4166666666667 6 33.83333333333332 0.0535344239114693 0.202335646591906 0.264582266215522 -0.148801222680436 0.0436749536796809 0.0907549859429557 NA NA 0.100334631637864 0.138061266631853 57 1 942 0.942 0.057 0.114 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCA 2 ATTGTCGTT:GTTGTCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.83333333333337 5 34.16666666666666 0.0539558430514737 0.162798378928371 0.331427397537008 -0.108842535876897 0.0440974777712318 0.0772505094816191 NA NA 0.0846018677096775 0.198259413092354 100 1 899 0.899 0.1 0.2 ORF3a all ss13 169 ATC TCA TCA 2 GTCATCACC:GTCGTTACT 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.33333333333337 5 34.33333333333332 0.0535942229866087 0.161916285324778 0.330999583390313 -0.10832206233817 0.0430368030078459 0.0772038207596678 NA NA 0.085455881521095 0.20494841258881 70 2 928 0.928 0.07 0.14 ORF3a all ss13 170 ACC TCA CCT 2 ATCACCTCA:GTTACTGAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.33333333333337 4 33.499999999999986 0.066710614512372 0.130054644852002 0.512942960155608 -0.0633440303396297 0.046405317034077 0.069866689555295 NA NA 0.0825912539853775 0.443106434368912 195 0 805 0.805 0.195 0.39 ORF3a all ss13 171 GAA CCT AAG 2 ACCTCAGGT:ACTGAAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.58333333333337 4 33.249999999999986 0.0805241909860523 0.131123163798598 0.614111104806285 -0.0505989728125454 0.0475148078946846 0.075479647621134 NA NA 0.0809946011433672 0.532154636949316 238 0 762 0.762 0.238 0.476 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:TCAGGTGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.08333333333337 3 33.41666666666666 0.0810687166991055 0.0956200277799544 0.84782151376974 -0.0145513110808489 0.048039356800838 0.0616941055226749 NaN NaN 0.0741106788974329 0.84433961562848 402 3 595 0.595 0.402 0.804 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGATGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.4166666666667 3 33.74999999999999 0.0807048841711543 0.0946134639951751 0.852995765753486 -0.0139085798240208 0.0496578933595663 0.0573517985202425 NA NA 0.0746290256800436 0.85215494978242 455 1 544 0.544 0.455 0.91 ORF3a all ss13 174 GGA ACG GAA 2 GACGGCATT:GATGGAACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.58333333333337 3 33.91666666666666 0.0816206643196587 0.0941180977157372 0.867215405969804 -0.0124974333960785 0.050067363470874 0.0581155244292511 NaN NaN 0.072313923064608 0.862791380870998 408 0 592 0.592 0.408 0.816 ORF3a all ss13 175 ACA GAA CAA 2 GGAACAAAT:GGCATTTCA 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.08333333333337 3 34.41666666666666 0.0821801867828476 0.0926626795339059 0.886874707230728 -0.0104824927510583 0.0505553215638439 0.0593636094224726 NA NA 0.0741453923431702 0.887571701010158 435 0 565 0.565 0.435 0.87 ORF3a all ss13 176 AAT CAA ATC 2 ACAAATCAG:ATTTCAACA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 3 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.50000000000003 5 35.08333333333332 0.0828427466732329 0.158062767299149 0.524112971630095 -0.0752200206259157 0.0493409226753614 0.0881920898924465 NaN NaN 0.0983342024189233 0.444305724406511 208 0 792 0.792 0.208 0.416 ORF3a all ss13 177 ACA ATC AGC 2 AATCAGCCA:TCAACACCA 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.666666666666667 0.416666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.4166666666667 5 35.49999999999999 0.0403232602433046 0.156000428408735 0.258481727612018 -0.11567716816543 0.0231907548087241 0.0931743509789263 NA NA 0.0881486379867293 0.189420039722086 48 2 950 0.95 0.048 0.096 ORF3a all ss13 178 CCA AGC CAA 2 ACACCAAAA:CAGCCAAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.83333333333337 4 35.41666666666666 0.0264928206228062 0.122408407943652 0.216429745863549 -0.0959155873208458 0.018707896107486702 0.0830621379553455 NA NA 0.0852665513233559 0.260635170863674 91 4 905 0.905 0.091 0.182 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTA:CCAAAACTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.83333333333337 4 35.41666666666666 0.0264928206228062 0.122408407943652 0.216429745863549 -0.0959155873208458 0.0185448436648178 0.0826114819343049 NA NA 0.0820064398377528 0.242157778290744 78 3 919 0.919 0.078 0.156 ORF3a all ss13 180 CTA AAC TAA 2 AAACTAAAA:AAACTCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.6666666666667 4 35.91666666666666 0.0269087157486763 0.120559681536883 0.223198298184324 -0.0936509657882068 0.018670983972967 0.0804729239805226 NA NA 0.0816783634625971 0.251554295478231 95 5 900 0.9 0.095 0.19 ORF3a all ss13 181 AAA TAA AAG 2 CTAAAAGAA:CTCAAAGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.33333333333336 4 36.08333333333332 0.0266694765273651 0.119955812971472 0.222327504326178 -0.0932863364441069 0.0192931316260826 0.0828558350601862 NA NA 0.0798344209027474 0.242606070302287 85 4 911 0.911 0.085 0.17 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.66666666666669 4 36.08333333333332 0.0269087157486763 0.119955812971472 0.224321898890184 -0.0930470972227957 0.0187994736029742 0.078599550850199 NA NA 0.0828505542338217 0.261407123978455 112 5 883 0.883 0.112 0.224 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC:GAAGACTAT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.83333333333334 4 36.58333333333332 0.0272138698048234 0.11818004032857 0.230274670148715 -0.0909661705237471 0.0185610180061026 0.0731697387772279 NA NA 0.0788638874068793 0.248722505905596 91 5 904 0.904 0.091 0.182 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA:GACTATCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.33333333333334 4 37.41666666666666 0.0420670999882827 0.115334665090853 0.364739429859576 -0.0732675651025699 0.0248460596397175 0.0760281965456467 NA NA 0.0805021801215938 0.362753195712582 160 0 840 0.84 0.16 0.32 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT:TATCAAATT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.50000000000001 4 36.91666666666666 0.0557100557871529 0.117025173722032 0.476051895632986 -0.0613151179348791 0.027603202904312 0.0766375956591861 NaN NaN 0.0795435185414648 0.440803324042899 217 0 783 0.783 0.217 0.434 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.25000000000001 4 37.16666666666666 0.0559047993353385 0.116173757560117 0.481217105389824 -0.0602689582247781 0.0277655460840028 0.0778807644737107 NA NA 0.0812587869750287 0.458274221550792 230 0 770 0.77 0.23 0.46 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.75000000000001 4 37.16666666666666 0.056298401666626 0.116173757560117 0.484605153943593 -0.0598753558934906 0.0286915168286126 0.0769793754537039 NaN NaN 0.0815724110581193 0.462939726190847 228 1 771 0.771 0.228 0.456 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.41666666666667 4 37.49999999999999 0.0565638983071325 0.115057659974651 0.491613494656457 -0.0584937616675185 0.0278875622015881 0.0746090697546349 NaN NaN 0.0837166255017652 0.484732400201889 259 0 741 0.741 0.259 0.518 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.58333333333334 4 36.99999999999999 0.0556454425645553 0.116739982283845 0.476661392917273 -0.0610945397192897 0.02701525586665 0.0743258567756067 NaN NaN 0.0871056370843572 0.483063121033572 223 0 777 0.777 0.223 0.446 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666667 4 36.33333333333333 0.0546316519559279 0.119061291806916 0.45885317660189 -0.0644296398509879 0.0271091576161786 0.0841039234478988 NaN NaN 0.0821891648679474 0.43308769804028 211 1 788 0.788 0.211 0.422 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGG 2 TCTGAGGAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.41666666666667 6 36.83333333333333 0.0550074627952336 0.18365333026498 0.299517916260311 -0.128645867469747 0.0281409355268416 0.103226652258675 NA NA 0.111786137813419 0.249805763667644 91 0 909 0.909 0.091 0.182 ORF3a all ss13 192 GAT AGG ATA 2 GAGGATAGG:GAGGATTGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.08333333333334 6 35.5 0.0560353868844177 0.191510018856633 0.292597678277952 -0.135474631972216 0.0283093020859279 0.110472108973349 NaN NaN 0.116678731838134 0.245604871574858 82 0 918 0.918 0.082 0.164 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 GATAGGCAC:GATTGGCAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.83333333333334 8 36.416666666666664 0.0570345959917882 0.259943938648383 0.219411140295665 -0.202909342656595 0.0296167719950823 0.132433011558562 NaN NaN 0.138698766358946 0.143481095686014 28 0 972 0.972 0.028 0.056 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.50000000000001 8 36.75 0.0573071018565008 0.25713126368002 0.222870999956719 -0.199824161823519 0.0288432246263095 0.139371366475171 NaN NaN 0.140065874351838 0.153682488266758 43 0 957 0.957 0.043 0.086 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT:CATTCAGGT 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.83333333333334 8 35.75 0.0570345959917882 0.265759990634356 0.214609414515893 -0.208725394642568 0.0293847178625587 0.145429046056504 NaN NaN 0.139115280978521 0.133516724166445 27 0 973 0.973 0.027 0.054 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333334 8 34.916666666666664 0.0550706014161129 0.273410739562984 0.201420769001748 -0.218340138146871 0.0284919114409425 0.150602871544251 NaN NaN 0.144716588275055 0.131364474688394 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.66666666666667 8 34.916666666666664 0.0548189130040021 0.273410739562984 0.200500218431887 -0.218591826558982 0.0277858278910617 0.147108044550282 NaN NaN 0.153672300517094 0.1548944057345 30 0 970 0.97 0.03 0.06 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.66666666666667 8 34.583333333333336 0.054077470426008 0.276597228353308 0.195509805893401 -0.2225197579273 0.0273987032639104 0.146688676927419 NaN NaN 0.151990529495896 0.143183840715997 43 1 956 0.956 0.043 0.086 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.5 8 35.083333333333336 0.0549444688504895 0.271845168498985 0.202116775346311 -0.216900699648496 0.0270647220875859 0.138291352136548 NaN NaN 0.145670618781854 0.136492523860166 35 0 965 0.965 0.035 0.07 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTA:GACTATGTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333334 8 35.083333333333336 0.0550706014161129 0.271845168498985 0.202580762130847 -0.216774567082873 0.0277012690347462 0.145716840532728 NaN NaN 0.147405461767787 0.141399149553545 35 1 964 0.964 0.035 0.07 ORF3a all ss13 201 GTA ATG TAG 2 TATGTAGTA:TATGTCGTT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.00000000000001 8 35.083333333333336 0.0545695157118212 0.271845168498985 0.200737486022397 -0.217275652787164 0.0265024618379158 0.148009008289887 NaN NaN 0.147938549467973 0.141917286194196 42 0 958 0.958 0.042 0.084 ORF3a all ss13 202 GTA TAG TAA 2 GTAGTAATA:GTCGTTGTA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.00000000000001 8 36.083333333333336 0.0553246126797069 0.262819463546309 0.210504244751107 -0.207494850866602 0.0279634831632087 0.146565845542217 NaN NaN 0.147942929275068 0.160756122217531 40 0 960 0.96 0.04 0.08 ORF3a all ss13 203 ATA TAA TAC 2 GTAATATAT:GTTGTACAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.833333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333334 8 35.75000000000001 0.0550706014161129 0.265759990634356 0.20721930823621 -0.210689389218243 0.0279549338335804 0.134258442506826 NaN NaN 0.143049828710578 0.140794410958442 33 0 967 0.967 0.033 0.066 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 ATATATGGC:GTACATGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.50000000000001 8 36.41666666666667 0.0564972895530331 0.259943938648383 0.217344131380016 -0.20344664909535 0.0284207391318397 0.130091350751857 NaN NaN 0.140638725271356 0.148011638161399 47 0 953 0.953 0.047 0.094 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT:TATGGCTAT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.66666666666669 7 35.91666666666667 0.0563645417845084 0.225687740489177 0.249745695811117 -0.169323198704669 0.0282753545845118 0.129746846563931 NaN NaN 0.131745197835435 0.198711079668192 55 0 945 0.945 0.055 0.11 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000001 7 36.583333333333336 0.0568993130810351 0.220904431633438 0.257574339547212 -0.164005118552403 0.0292695751474676 0.124929184077513 NaN NaN 0.132493838145771 0.215778343907712 79 0 921 0.921 0.079 0.158 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.33333333333334 8 36.25000000000001 0.0566306643811089 0.261373712626115 0.216665493297395 -0.204743048245006 0.028968565646069 0.137524264835028 NaN NaN 0.147647598937462 0.165533006894462 37 1 962 0.962 0.037 0.074 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.66666666666669 8 36.583333333333336 0.0563645417845084 0.258529875671953 0.218019451864159 -0.202165333887444 0.0289626455167787 0.136365803897504 NaN NaN 0.140270317586902 0.149512580167698 50 0 950 0.95 0.05 0.1 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000001 8 36.25000000000001 0.0561009098120237 0.261373712626115 0.214638684389328 -0.205272802814091 0.028049261567926 0.143392990217015 NaN NaN 0.144402666899825 0.155162578099467 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC:GAAGTTTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000001 8 35.583333333333336 0.0561009098120237 0.267255329878453 0.209915027092399 -0.21115442006643 0.0285230470251197 0.141229892546928 NaN NaN 0.152030709165493 0.16486522477887 37 0 963 0.963 0.037 0.074 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC:GTTTATTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.00000000000001 8 35.583333333333336 0.0553246126797069 0.267255329878453 0.207010324938583 -0.211930717198747 0.0278236954765622 0.144262578455051 NaN NaN 0.163342287939273 0.194471628448486 48 0 952 0.952 0.048 0.096 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG:TATTACCAG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.00000000000001 8 35.25000000000001 0.0545695157118212 0.270297617029844 0.201886780621511 -0.215728101318022 0.0275587507447044 0.145308989468933 NaN NaN 0.152029415149741 0.155902158721049 40 0 960 0.96 0.04 0.08 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.16666666666667 8 35.083333333333336 0.0544456664773409 0.271845168498985 0.200281898618861 -0.217399502021645 0.0269060864605267 0.146741701578825 NaN NaN 0.153416971128376 0.156468341735667 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAA:CAGCTTGAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.5 8 34.41666666666667 0.0541996476239405 0.278218809519287 0.194809429734776 -0.224019161895346 0.0267612030178035 0.144714758429477 NaN NaN 0.156513393383054 0.152341431643443 32 0 968 0.968 0.032 0.064 ORF3a all ss13 215 GAA TTG AAT 2 CTTGAATCG:CTTGAGTCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.83333333333334 8 34.083333333333336 0.0539558430514737 0.281520365031792 0.191658756358107 -0.227564521980318 0.0277892494612373 0.1616904799443 NaN NaN 0.162015546806174 0.160144875415865 37 0 963 0.963 0.037 0.074 ORF3a all ss13 216 TCG AAT CGA 2 GAATCGACT:GAGTCTACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.33333333333334 8 33.583333333333336 0.0535942229866087 0.286624098210084 0.186984357984186 -0.233029875223475 0.026244476539278 0.155216729822288 NaN NaN 0.153404456530521 0.12874854002289501 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 217 ACA CGA CAC 2 TCGACTCAA:TCTACACAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.50000000000001 8 33.083333333333336 0.0527690107059348 0.291918675814013 0.180766134810624 -0.239149665108079 0.0280360967386292 0.164686518305537 NaN NaN 0.170647448640753 0.161086907929193 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT:ACTCAATTG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.66666666666669 8 32.91666666666667 0.0526531940049364 0.293727829875654 0.179258444891744 -0.241074635870718 0.0262428873154809 0.163434054860219 NaN NaN 0.168843324505895 0.153349198997432 32 0 968 0.968 0.032 0.064 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TGT 2 CAAATTACT:CAATTGTCG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.00000000000001 8 33.91666666666667 0.053834761795598 0.283201052715922 0.190093791245895 -0.229366290920324 0.0267125364253777 0.156274451354991 NaN NaN 0.165490132407604 0.165752499122007 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 220 ACT TGT CGA 2 ATTACTACA:TTGTCGACT 1:1 TRUE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.66666666666669 8 35.083333333333336 0.0407339920153049 0.271845168498985 0.149842619018101 -0.231111176483681 0.0246557280231435 0.139898166503392 NaN NaN 0.157270511443332 0.141693499518566 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 221 ACA CGA CAG 2 ACTACAGAC:TCGACTGAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.91666666666669 8 35.833333333333336 0.0271830432683088 0.265018643484554 0.102570305661885 -0.237835600216245 0.0195028969719712 0.146190956990835 NA NA 0.143772852439385 0.0980776329207833 10 1 989 0.989 0.01 0.02 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT:ACTGATACT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.75000000000001 8 35.99999999999999 0.0272447663451876 0.263548415128416 0.103376703411069 -0.236303648783229 0.0208582226119521 0.145538045402498 NaN NaN 0.142810440724164 0.0979921707520816 11 1 988 0.988 0.011 0.022 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT:GATACTGGT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.41666666666669 8 36.33333333333333 0.0273690573365762 0.260656845281595 0.105000339841482 -0.233287787945019 0.0197891445576909 0.151023045079856 NA NA 0.148544516908263 0.116300987544524 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT:ACTGGTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.58333333333336 8 36.16666666666666 0.0273067703935705 0.262094574111018 0.104186706215459 -0.234787803717448 0.0199072063494363 0.144251556451897 NaN NaN 0.141064013935635 0.0960313040941855 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 225 ATT GTA CTG 2 GGTATTGAA:GGTGCTGAA 1:1 TRUE 0.916666666666667 0.75 1.33333333333333 0 0 0 2 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.08333333333336 8 35.66666666666666 0.0271215992572094 0.266505540694197 0.10176748740969 -0.239383941436987 0.0196077124310249 0.143241989696673 NaN NaN 0.146075355144658 0.101261124101972 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 226 GAA CTG AAA 2 ATTGAAAAT:GCTGAAAAT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.83333333333336 6 34.99999999999999 0.0268485044068343 0.194633396613814 0.137943975052269 -0.167784892206979 0.0191792420788722 0.114436944240924 NaN NaN 0.117242296390917 0.152402921528615 29 6 965 0.965 0.029 0.058 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTAT:TTCATCTTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TAT TCT ATA 2 ATCTATAGC:ATCTTTAAC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC ATA ACA 2 TATAGCAAG:TTTAACAAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT:AGCAAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAAGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:AAAGATGTA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA---:GATGTA--- 1:1 TRUE 0.5 0 1.5 1 0 0 2 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG:GTA---GAT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C ATC 0 ---CCGAAT:---GATCAT 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.666666666666667 1.25 0 0 1 2 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT ATC ATG 2 CCGAATGTG:GATCATGTG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA:CATGTGCAA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.25000000000001 7 32.83333333333332 0.100750036200046 0.250832878769865 0.401662001784392 -0.150082842569819 0.0366719007765245 0.119340713173646 0.310513456486184 0.195823885531329 0.113507602781561 0.186092498124094 66 0 934 0.934 0.066 0.132 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.58333333333334 8 33.16666666666665 0.101727620280473 0.291022534714547 0.349552382190106 -0.189294914434074 0.0377985520208935 0.135428724118294 0.324155437408323 0.280878463595393 0.126968612360039 0.135993107311565 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 72.91666666666667 8 33.499999999999986 0.102724391304868 0.287492986673213 0.357310946933229 -0.184768595368345 0.0384334317998179 0.125170154889199 0.268281219815747 0.182908743620418 0.13389868026438 0.16761328214248 44 0 956 0.956 0.044 0.088 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA:TTTATGAGC 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.08333333333334 8 33.33333333333332 0.102473368909235 0.289246860608989 0.354276512088964 -0.186773491699753 0.0395554658553403 0.134161644091018 0.250835206536362 0.157835892858891 0.129420257954549 0.148976814210037 25 0 975 0.975 0.025 0.05 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAT 2 ATGAGATTT:ATGAGCATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.41666666666667 8 33.999999999999986 0.101974992322902 0.282358178426184 0.361154732231567 -0.180383186103283 0.0391635358341617 0.132458446179729 0.26560805539159 0.173915987534771 0.133382287500759 0.176254627562825 30 0 970 0.97 0.03 0.06 ORF3a all ss13 7 ATT GAT TTT 2 AGATTTTTT:AGCATTTTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.08333333333333 8 34.33333333333332 0.0857055104092924 0.27903683339124 0.307147659926042 -0.193331322981948 0.0338523929785073 0.12519111988583 0.239216182813783 0.199150612860053 0.124465049806602 0.120351938582586 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACA:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.66666666666667 8 33.91666666666666 0.0701445435081176 0.283201052715922 0.247684614288773 -0.213056509207804 0.0301001832875947 0.122998497855774 0.209526510405177 0.237159726007114 0.133581097221769 0.110721176909953 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 9 ACA TCA CAT 2 TTCACATTG:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.5 8 33.749999999999986 0.069333399391501 0.284902170689401 0.243358621044302 -0.2155687712979 0.0317557652735277 0.127096371898125 0.173076109410894 0.159700773460966 0.121900140236181 0.0769932846020861 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 10 CTT CAT TGG 2 ACATTGGGA:ACTCTTAGA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.5 0.666666666666667 0.166666666666667 1 0 0 1 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75 8 34.24999999999999 0.069817817299509 0.279859737639748 0.249474318415115 -0.210041920340239 0.0317272723424337 0.122039288589993 0.230480586949182 0.27907072152664403 0.127041242269761 0.0982624024834421 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 11 AGA TGG GAG 2 CTTAGATCA:TTGGGAGCA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.916666666666667 0.25 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.16666666666667 9 34.74999999999999 0.0559700169039056 0.317710819960381 0.176166543244845 -0.261740803056476 0.0276084642165405 0.134284871908525 0.112618181746212 0.117751464379672 0.12727531401995 0.0397350122231833 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 12 GCA GAG CAA 2 AGATCAATT:GGAGCAATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74 8 35.49999999999999 0.0561009098120238 0.268009394822974 0.20932441509776 -0.211908485010951 0.0267019355487892 0.115771723496269 0.170398526859591 0.219281732567747 0.110457057633352 0.055051518641329 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 13 ATC CAA TCA 2 GCAATCACG:TCAATTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73 9 35.49999999999999 0.0422647024133488 0.309399206498443 0.13660249129812 -0.267134504085094 0.0240487028032026 0.135802595150925 0.0905383129330555 0.131354743740292 0.130456190780377 0.0405898831818328 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 14 ACG TCA CGC 2 ATCACGCGC:ATTACTGCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.66666666666667 9 35.33333333333333 0.042464170499631 0.311207889047031 0.136449530986066 -0.2687437185474 0.0237794935715071 0.1328117410354 0.0988553638222319 0.167495937879068 0.124287991423343 0.030597666149832 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 15 CGC CGC CAC 2 ACGCGCAAT:ACTGCACAG 1:1 TRUE 1 1 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.16666666666667 9 34.83333333333333 0.0421656696333547 0.316764994602515 0.133113413261669 -0.27459932496916 0.0242769415225015 0.135027431953699 0.0936342080442982 0.155133026882109 0.123921310724526 0.026697194850817 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 16 AAT CAC AGC 2 CGCAATCCA:GCACAGCCA 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.16666666666667 8 34.83333333333333 0.02784542552167 0.274200382158177 0.101551373862079 -0.246354956636507 0.019671368105621 0.122975584967422 0.0903575790224012 0.261062537919564 0.122285526353377 0.0439478335713273 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 17 CCA AGC CAG 2 AATCCAGCG:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73 8 34.99999999999999 0.0138252762666285 0.272625681756849 0.0507115697154279 -0.258800405490221 0.0140632627343597 0.120837983394361 NA NA 0.123833746822549 0.0366265963993175 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 18 GCG CAG CGA 2 CCAGCGAAA:CCAGTAAAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.66666666666667 8 34.74999999999999 0.0276529018562458 0.274994650264777 0.100557962962626 -0.247341748408531 0.019311888137828 0.116761480779516 0.112129668788689 0.36982528627495 0.133852368080355 0.0646211805615587 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 19 AAA CGA AAA 2 GCGAAAATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.33333333333333 8 34.33333333333333 0.027400307499342 0.27903683339124 0.0981960236802276 -0.251636525891898 0.019046726757821 0.127429894070873 0.131430058490114 0.454981951385027 0.126675739501546 0.0469820630651765 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAA:AAAATTGAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75 8 33.99999999999999 0.0271522864979704 0.282358178426184 0.0961625643334031 -0.255205891928214 0.0180965374825677 0.127538067702205 0.132028147333433 0.4663999962552 0.12675720733415 0.0440784283760287 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 21 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:ATTGACAAT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.83333333333333 8 34.33333333333333 0.0272138698048234 0.27903683339124 0.0975278764243519 -0.251822963586417 0.0190042566799595 0.129757483646873 0.139265968248296 0.483740335537536 0.126151312434954 0.045912404395207 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 22 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25 8 34.08333333333333 0.0135904058348962 0.281520365031792 0.0482750362779667 -0.267929959196896 0.0135187667662597 0.12084094925269 0.0641652055123796 0.451837384309974 0.120672221227762 0.0263976080885759 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.25 8 34.41666666666666 0.0137776549513118 0.278218809519287 0.0495209327331863 -0.264441154567975 0.0141372274841886 0.130710946694351 0.0704863972491592 0.482329913809103 0.125923953292034 0.0357282454875141 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.58333333333333 9 35.24999999999999 0.0139053809368069 0.312120297918684 0.0445513509679836 -0.298214916981877 0.014205410224402 0.135108127446967 0.0717175571880914 0.534464329426071 0.123482391684811 0.0157334811356446 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.91666666666666 9 34.91666666666666 0.0138412232800193 0.315824866691675 0.0438256285042045 -0.301983643411656 0.0133874720005589 0.132132404700118 0.0741651256722523 0.55457427365365 0.129025315536487 0.0192579814226128 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25 9 34.25 0.0135904058348962 0.323508417071989 0.0420094350493266 -0.309918011237093 0.0137610783805825 0.141894936455162 0.0640254736151559 0.511736453404932 0.14387154374022 0.0312299769879569 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666667 9 33.58333333333333 0.0134683754007452 0.331581375185359 0.0406186125297785 -0.318112999784614 0.0132331132618429 0.142153662723558 0.0580140493709545 0.483832816625915 0.143872299370735 0.0270303765366392 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666667 10 34.25 0.0136522540928075 0.369855206523338 0.0369124291128399 -0.356202952430531 0.0132852707646939 0.15642806503011 0.0502171063115562 0.462304858326488 0.152458927507235 0.0194711163349659 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.41666666666667 10 33.416666666666664 0.0133782811395161 0.381873370361936 0.0350332916035395 -0.36849508922242 0.0133061226489011 0.162602889238046 0.0472623136690618 0.458540568863699 0.168566455328981 0.0288117784115701 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666667 11 32.916666666666664 0.0132893842388272 0.442360526313466 0.0300419758281282 -0.429071142074638 0.0134756206487517 0.192697856188901 0.0404836478204305 0.458040805316693 0.205891228263017 0.0371628965863761 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CATGCTACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333334 12 33.25 0.0134382094503063 0.492181967718371 0.0273033356191459 -0.478743758268064 0.0126508229210528 0.204095737528996 0.034606414728186 0.43013101709356 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25 12 33.583333333333336 0.0134081783305544 0.485308821352962 0.0276281364372784 -0.471900643022408 0.0133573592383878 0.204338542044026 0.0359268897799343 0.441887391814056 0.219099914193594 0.0312546967444218 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333334 12 33.416666666666664 0.0132600139021293 0.488720381506319 0.0271321074461017 -0.475460367604189 0.0124141519576333 0.222348791022108 0.0327902125232038 0.407984710114591 0.197045544826793 0.0158241399558603 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.91666666666667 13 33.25 0.0264636052740321 0.552515991632425 0.047896541774012 -0.526052386358393 0.0191058012542198 0.253438994475317 0.0404476552554596 0.236349279480201 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCA:ACGATACCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77 13 32.416666666666664 0.0264344542962561 0.573811734264465 0.046068166120968 -0.547377279968209 0.0180006786865173 NA 0.041128761261125 0.262672801681395 0.258964801955821 0.034539783688111 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 36 CCA TAC CAC 2 ATACCACTA:ATACCGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.16666666666667 13 31.416666666666664 0.0263763446044989 0.601759854393703 0.0438320110786954 -0.575383509789204 0.0181281671263406 NA NA NA 0.31875808411723 0.071062327545408 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 37 CTA CAC TAC 2 CCACTACAA:CCGCTACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.66666666666667 13 30.666666666666664 0.0262035385209603 0.624681842201328 0.0419470148653932 -0.598478303680368 0.0183251620491216 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.83333333333334 13 31.333333333333332 0.0261464386246643 0.604218872989977 0.0432731246796026 -0.578072434365312 0.0178956055109925 NA 0.0380982073484163 0.256027303332612 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCA 2 CAAGCCACA:CAAGCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.5 13 32 0.0262608883838265 0.585118918162181 0.0448812840752273 -0.558858029778355 0.018297631653245 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 40 ACA CCA CAC 2 GCCACATTC:GCCTCACTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.5 13 32 0.0262608883838265 0.585118918162181 0.0448812840752273 -0.558858029778355 0.0181201386581607 0.279018829893821 0.0355117520314694 0.20628633485217 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 ACATTCCCT:TCACTCCCT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.16666666666667 12 31.666666666666668 0.026032982222434 0.527796967417862 0.0493238571449075 -0.501763985195428 0.0182501322211503 0.227762252635404 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC:TTCCCTTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.5 11 32 0.0262608883838265 0.459828354664807 0.057110198006318 -0.43356746628098 0.0181348861253211 0.203261106385323 0.0519352101985307 0.271487634618497 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.66666666666667 11 31.833333333333332 0.0262035385209603 0.463158329862746 0.0565757686550205 -0.436954791341785 0.0177350271603045 NA 0.0471101559600206 0.229780257647835 0.207031046768139 0.0348087587289882 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.5 11 31.166666666666668 0.0259205062991005 0.476991575039997 0.0543416438685043 -0.451071068740897 0.0176388359220026 0.215694727535846 NA NA 0.238141980588447 0.0582082029143946 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.66666666666667 11 31 0.025864632053377 0.480584396281972 0.0538191257424877 -0.454719764228595 0.0178890766928103 0.223538759922004 0.0485930776767987 0.268057429372663 0.210795014467625 0.030992759923209202 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTA 2 TGGCTTATT:TGGCTTGTT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78 11 30.666666666666668 0.0260895870640617 0.487940674605862 0.053468768688193 -0.4618510875418 0.0181277300721408 0.219416719575246 0.0469111764515173 0.25437487678464 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 47 ATT TTA TTA 2 CTTATTGTT:CTTGTTATT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.41666666666667 11 30.250000000000004 0.0259485340559256 0.497470663057698 0.0521609332627441 -0.471522129001772 0.0176006008964266 0.221952668311739 0.048299386802736 0.280164349453375 0.224155342674894 0.0354176578836735 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 ATTGTTGGC:GTTATTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.50000000000001 10 29.750000000000004 0.0392246245521367 0.445899039781238 0.0879675017272534 -0.406674415229101 0.021415793458117 0.197294632344885 0.0798714211435546 0.270738300452855 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.58333333333334 9 30.416666666666668 0.0397005575048303 0.376300989048554 0.105502134355825 -0.336600431543724 0.0221467471411414 0.166059129713909 0.0860174381848524 0.220002939731951 0.165773828742202 0.042307779603378 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.75000000000001 9 31.250000000000004 0.0401433603117785 0.363381236586463 0.110471747767931 -0.323237876274684 0.0238545244697258 0.153266110691209 0.0964299339165332 0.251953762382845 0.154500736077621 0.0364255850607952 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAC 2 GTTGCACTT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.41666666666667 9 30.58333333333334 0.0397883346582442 0.373642557445839 0.106487694898116 -0.333854222787594 0.0227534543954037 0.158961723738927 0.0937185338969565 0.255851902048858 0.161636581422625 0.0388793039261436 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 52 CTT CAC TTC 2 GCACTTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.75 9 31.250000000000007 0.0396131668795608 0.363381236586463 0.109012692156809 -0.323768069706902 0.0230286734596511 0.160769846840414 0.0828124216023812 0.188046221433402 0.159709383913382 0.0426386306119616 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 CTTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.25 8 31.083333333333343 0.0393532888030902 0.315240156824316 0.12483590034826 -0.275886868021226 0.0221773357796772 0.134578897634194 0.125073201843286 0.318229561430317 0.136721596214649 0.0436044511908812 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.58333333333334 8 30.750000000000007 0.0391819232689515 0.319499782912404 0.122635210928121 -0.280317859643452 0.0219275182759213 0.146246361864727 0.105141992936456 0.243462020312931 0.134493514861386 0.0371376009413689 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.41666666666669 8 30.58333333333334 0.038759969965707 0.321673722092295 0.120494673029543 -0.282913752126588 0.0215383129211292 0.142585315853206 0.110715992317804 0.276452890640797 0.133373286386119 0.0339035013432556 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.75000000000001 8 29.916666666666675 0.0381034317265946 0.330678508474864 0.115228025862137 -0.292575076748269 0.0209731206399248 0.149988034009007 0.0898278344428302 0.199574326746618 0.139401489109179 0.0358350210846373 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAGC:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.41666666666669 8 29.916666666666675 0.0382654718118908 0.330678508474864 0.115718048894005 -0.292413036662973 0.0218983325202185 0.148721678069166 0.111539875784195 0.299521990234101 0.144149843641407 0.0425056511565099 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 58 AGC AAA GCG 2 CAAAGCGCT:CAGAGCGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.50000000000001 8 30.166666666666675 0.0387182740539804 0.327242322351052 0.118316829485292 -0.288524048297072 0.0221588138160947 0.142172064494435 0.100802832044645 0.240497142559241 0.139006050461951 0.0379289038820846 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.33333333333336 9 30.83333333333334 0.0393103070130301 0.369726004774488 0.106322807985895 -0.330415697761458 0.0218143180831123 0.149632018986607 0.0840970861224482 0.20612722477196 0.150035208875224 0.0276473438437954 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCTAAA 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.50000000000001 9 30.66666666666667 0.0392246245521367 0.372327664735418 0.105349745042476 -0.333103040183282 0.0220073215365395 0.163547466748293 0.0945822662476727 0.265346773620186 0.162649857317096 0.04056232940398 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCTAAAGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.66666666666669 8 29.5 0.038635150837581 0.336571435396116 0.114790343964011 -0.297936284558535 0.0224452705522793 0.14441940136491 0.0937973023000515 0.221022835225572 0.143345492736165 0.0376680309562423 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAAGTAATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.00000000000001 8 29.166666666666668 0.0394828001140665 0.341441829458385 0.115635510085851 -0.301959029344318 0.022759783068969 0.149093827355078 0.109204849652422 0.289651602239246 0.157924094362073 0.0558695661702317 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG:GTAATTGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.66666666666669 7 28.833333333333336 0.0391393148779276 0.293338244775017 0.133427248492424 -0.254198929897089 0.0217778941507334 0.139487820378313 NaN NaN 0.133527004244214 0.05694578063535 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC:ATTGCGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.83333333333334 7 29.166666666666668 0.039054375562259 0.289246860608988 0.135020914246166 -0.250192485046729 0.0221167646085425 0.130522779685686 0.126993110793306 0.287684697320028 0.126752621876374 0.0483971662783735 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT:GCGCTTCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79 8 29.500000000000004 0.0389698041980333 0.336571435396116 0.115784645099692 -0.297601631198083 0.0224331352072813 0.145238868931133 0.0967766479058 0.231536214834026 0.143633447854098 0.0382699037530611 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA:CTTCATAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.66666666666667 8 28.833333333333336 0.038635150837581 0.346457784201476 0.111514743207829 -0.307822633363895 0.0226795619764177 0.158054025367733 0.102665256734989 0.277391631711756 0.154230959998989 0.0459497076059623 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA:CATAGAAGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.25 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.33333333333334 7 28.166666666666668 0.0383061974523115 0.30188317215805 0.126890800764001 -0.263576974705738 0.0220218031835068 0.136975588761356 NaN NaN 0.144010685756126 0.0672110935080101 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AGAAGGTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.75 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.16666666666667 7 28.416666666666668 0.0516332867726302 0.298620355296958 0.172906119280731 -0.246987068524328 0.0324104511631989 0.134435850190813 0.179376982324921 0.335083077229826 0.136716429419456 0.0708301853615418 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG:AGGTGGCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.66666666666667 8 28.666666666666668 0.0519688353535439 0.349022437266925 0.148898264995494 -0.297053601913381 0.0330421266135308 0.15677171128753 NaN NaN 0.15500106045634 0.0553063487706591 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA:TGGCAGCTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.00000000000001 8 29 0.0661220906960037 0.343931200066585 0.192253830659162 -0.277809109370581 0.0351028837469181 0.150221049208935 0.184882559312748 0.298400292650397 0.162925791610087 0.0881708061284365 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC:CAGCTCGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.66666666666667 9 29 0.0804341477651982 0.400561864447693 0.200803308812493 -0.320127716682495 0.0382359818786899 0.163172350415723 0.142686571560569 0.159337417648976 0.172418965641895 0.0633559750040187 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT:CTCGCCTTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.16666666666667 9 29.166666666666668 0.0798980931045125 0.397542739270409 0.200979882694237 -0.317644646165896 0.0367076284131234 0.16330124978674 0.170201786748201 0.237669080536094 0.173675513906082 0.067406395846853 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TAT 2 GCCCTTTAT:GCCTTATAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.83333333333334 9 28.666666666666668 0.0791943804803756 0.406743218119021 0.19470362861023 -0.327548837638646 0.0372951159946727 0.16764679370315 0.190024445593488 0.305540583396263 0.175349093059655 0.0617646688949154 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 74 TAT TAT ATA 2 CTTTATAAG:TTATATAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.83333333333334 8 28.5 0.0932463137734779 0.351626041530565 0.265186029361174 -0.258379727757087 0.0405746018376042 0.15611752825404 0.212986760925841 0.213101528629796 0.165703955898935 0.118928890570567 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 75 AAA ATA AAG 2 TATAAAGGC:TATAAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.00000000000001 8 28.333333333333336 0.0930394865024842 0.354269507203646 0.26262346775728 -0.261230020701162 0.0394575893131855 0.166099406098474 0.2000021904683 0.189148257521293 0.157438230908491 0.0970646122658438 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 76 GGC AAG GCG 2 AAAGGCGTT:AAGGGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.33333333333334 8 28.333333333333336 0.0951500406590924 0.354269507203646 0.268580949600037 -0.259119466544554 0.0428933001691505 0.15851483434049 0.232138376777222 0.247277908450244 0.15440968441145 0.0933217955614539 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 77 GTT GCG TCC 2 GGCGTTCAA:GGCTTCCAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.33333333333334 8 28 0.0951500406590924 0.359679810196415 0.264540955487973 -0.264529769537322 0.0416439066063383 0.171630688130205 0.221732401601331 0.232844292351738 0.175631285649323 0.132024713419218 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 78 CAA TCC AAC 2 GTTCAACTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.16666666666669 7 27.333333333333336 0.0940829130843776 0.313301400524984 0.300295220279027 -0.219218487440606 0.0412320359051501 0.14997426635283 0.277885915994232 0.279856346958999 0.147528948781915 0.137296209082333 27 0 973 0.973 0.027 0.054 ORF3a all ss13 79 CTT AAC TCA 2 CAACTTGTA:CAGTTCATT 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.00000000000001 7 27.833333333333336 0.0942944168777401 0.306347708328316 0.307801933274735 -0.212053291450576 0.0400460593231618 0.139734626808444 NaN NaN 0.13531271421449 0.117083137904686 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TAT 2 CTTGTATGT:TTCATTTGC 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.50000000000001 6 28.166666666666668 0.0949346803392896 0.250581126994749 0.378858062767348 -0.15564644665546 0.0422573726339997 0.121648982551776 0.375603235881005 0.313135035488762 0.113550328095722 0.170460222858584 57 0 943 0.943 0.057 0.114 ORF3a all ss13 81 TGC TAT GCA 2 ATTTGCAAT:GTATGTAAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.08333333333334 5 27.916666666666668 0.0941885460903394 0.20465023999998 0.460241561848882 -0.110461693909641 0.0425503488606344 0.102591845745582 NaN NaN 0.101945341626248 0.278569509269379 92 0 908 0.908 0.092 0.184 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATA 2 TGCAATTTA:TGTAATATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.25000000000001 5 28.25 0.093977517058638 0.201879034260684 0.46551400150491 -0.107901517202046 0.0406457713119745 0.104367927309238 NaN NaN 0.101171135158858 0.286186507496075 115 0 885 0.885 0.115 0.23 ORF3a all ss13 83 ATG ATA TAC 2 AATATGCTG:AATTTACTG 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 1 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.25000000000001 5 28.25 0.093977517058638 0.201879034260684 0.46551400150491 -0.107901517202046 0.0407222953988909 0.100633185733596 NaN NaN 0.10229979138082 0.291536045372179 119 0 881 0.881 0.119 0.238 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 ATGCTGCTG:TTACTGCTG 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.25000000000001 4 28.083333333333332 0.0798094452064726 0.157958351375552 0.505256255914718 -0.0781489061690789 0.0377117360193636 0.0888415356013535 NaN NaN 0.0888144978505885 0.378907204667076 172 0 828 0.828 0.172 0.344 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA:CTGCTGCTT 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.66666666666669 4 28.833333333333332 0.0934540638415831 0.153398778089708 0.609223000374429 -0.0599447142481249 0.039295335932001 0.0803178782431505 NA NA 0.0908312056174412 0.509281252459581 228 0 772 0.772 0.228 0.456 ORF3a all ss13 86 CTA TGC TAT 2 CTGCTATTT:CTGCTTTTT 1:1 FALSE 1.5 1 0.25 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.83333333333336 4 29.166666666666668 0.0932463137734779 0.151456007747705 0.615665995427579 -0.0582096939742272 0.0400976186418197 0.0811504176371678 NaN NaN 0.0873851875904975 0.505329480963284 243 0 757 0.757 0.243 0.486 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:CTTTTTGTG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.75000000000003 4 30.166666666666668 0.0933500730718353 0.145913043990275 0.639765099260468 -0.0525629709184396 0.042272640388268 0.0806612346688178 NaN NaN 0.0843883769848241 0.533370089627279 272 0 728 0.728 0.272 0.544 ORF3a all ss13 88 GTG TTG TGA 2 TTTGTGACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.58333333333336 4 29.5 0.0923227698874005 0.149561992614941 0.617287642891284 -0.0572392227275405 0.0395153536278502 0.0820715528298809 NaN NaN 0.0902126714808932 0.525759754447453 264 0 736 0.736 0.264 0.528 ORF3a all ss13 89 ACA TGA CAA 2 GTGACAATT:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.4166666666667 4 29.666666666666664 0.092526415385480107 0.148632696437812 0.622517236133124 -0.0561062810523315 0.0399870163907413 0.077130634491639 NaN NaN 0.0874262367377938 0.521031852315193 262 0 738 0.738 0.262 0.524 ORF3a all ss13 90 ATC CAA TCT 2 ACAATTTAC:ACCATCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.08333333333336 4 29.333333333333332 0.0917171833187057 0.150503021596613 0.609404265414226 -0.0587858382779078 0.0412166518485236 0.0834532126507467 NaN NaN 0.0894046415220828 0.510843032218122 256 1 743 0.743 0.256 0.512 ORF3a all ss13 91 TAC TCT ACT 2 ATCTATTCA:ATTTACTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.41666666666669 4 29.666666666666664 0.092526415385480107 0.148632696437812 0.622517236133124 -0.0561062810523315 0.0401680708686483 0.0798442044962493 NaN NaN 0.0876370514385646 0.522034863358315 243 0 757 0.757 0.243 0.486 ORF3a all ss13 92 TCA ACT CAC 2 TACTCACAC:TATTCACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.41666666666669 4 29.666666666666664 0.092526415385480107 0.148632696437812 0.622517236133124 -0.0561062810523315 0.0416278921346549 0.0773343017710782 NaN NaN 0.0867361192434807 0.517721399582635 246 0 754 0.754 0.246 0.492 ORF3a all ss13 93 CAC CAC ACC 2 TCACACCTT:TCACATCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.91666666666669 4 28.833333333333332 0.0907253574709978 0.153398778089708 0.591434681558815 -0.0626734206187102 0.0396727673954722 0.079348037233859 NaN NaN 0.08814436330433 0.4770647037125 242 1 757 0.757 0.242 0.484 ORF3a all ss13 94 CTT ACC TTC 2 CACCTTCTA:CATCTTTTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.41666666666669 4 28.666666666666668 0.0913178588331776 0.154389040653112 0.591478892846771 -0.063071181819934 0.039126704226905 0.0843086178052567 NaN NaN 0.0885919997192585 0.476508966451213 264 0 736 0.736 0.264 0.528 ORF3a all ss13 95 CTA TTC TAC 2 CTTCTACTT:CTTTTGCTT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.91666666666669 4 28.833333333333332 0.0907253574709978 0.153398778089708 0.591434681558815 -0.0626734206187102 0.0385607851238605 0.0822849802678823 NaN NaN 0.0913825736976735 0.492816795624042 234 0 766 0.766 0.234 0.468 ORF3a all ss13 96 CTT TAC TTC 2 CTACTTCTA:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.08333333333333 1 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.91666666666669 4 29.833333333333332 0.0919181597303021 0.147714914296514 0.622267292155693 -0.0557967545662119 0.0405500276310612 0.0762647608167089 NaN NaN 0.0906379928967917 0.538158506570049 260 0 740 0.74 0.26 0.52 ORF3a all ss13 97 CTA TTC TAG 2 CTTCTAGCT:CTTGTCGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.16666666666669 4 30.083333333333336 0.0916170247341314 0.146359364647636 0.625973096799797 -0.0547423399135045 0.0399501730105508 0.0834205647981697 NaN NaN 0.0906685586080001 0.546001082960259 253 0 747 0.747 0.253 0.506 ORF3a all ss13 98 GCT TAG CTG 2 CTAGCTGCT:GTCGCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.16666666666669 4 30.250000000000004 0.0778235325055638 0.145469445655623 0.534981983019302 -0.0676459131500594 0.0371569120863818 0.0809831703008217 NaN NaN 0.0808151964228531 0.40256757267424 193 0 807 0.807 0.193 0.386 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.33333333333334 4 29.58333333333334 0.0766624238758939 0.149095891727942 0.514182000505963 -0.0724334678520486 0.0373977770875952 0.0788697626299465 NaN NaN 0.0896988039589348 0.41936766488095 208 0 792 0.792 0.208 0.416 ORF3a all ss13 100 GGC CAG GCA 2 GCAGGTATG:GCTGGCATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.50000000000001 4 29.41666666666667 0.0755354817013731 0.150031026615648 0.503465739089294 -0.0744955449142754 0.0362484425584231 0.0859560828665604 NaN NaN 0.0856544849246495 0.384452633808182 178 2 820 0.82 0.178 0.356 ORF3a all ss13 101 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA:GGTATGGAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.83333333333336 4 29.750000000000004 0.0752195633615916 0.148172379571929 0.50764902054554 -0.0729528162103373 0.0351810815452588 0.0798984801860117 NaN NaN 0.0838166933320336 0.38408988751255 193 1 806 0.806 0.193 0.386 ORF3a all ss13 102 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGCA:ATGGAGGCG 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.83333333333336 4 29.750000000000004 0.0761753537657808 0.148172379571929 0.514099550711489 -0.0719970258061481 0.0374199875898299 0.0816960527490975 NaN NaN 0.0839088004243557 0.390870911496481 183 0 817 0.817 0.183 0.366 ORF3a all ss13 103 GCA AAG CAC 2 GAAGCACAA:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.33333333333336 4 30.250000000000004 0.0902374551086072 0.145469445655623 0.620318959090768 -0.055231990547016 0.039833813031306 0.079136588046188 NaN NaN 0.088095734556821 0.530689259275061 256 1 743 0.743 0.256 0.512 ORF3a all ss13 104 CAA CAC AAT 2 GCACAATTC:GCGCAATTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.66666666666669 4 30.583333333333336 0.0898508998594655 0.143721781908901 0.62517245935914 -0.0538708820494353 0.0376561873549907 0.0792833544911285 NaN NaN 0.0860732276538783 0.531398452405107 278 1 721 0.721 0.278 0.556 ORF3a all ss13 105 TTC AAT TCT 2 CAATTCTTG:CAATTTTTG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.50000000000001 4 31.083333333333336 0.0912185711042866 0.141177857059553 0.646125199830793 -0.049959285955266 0.0393142753794778 0.0763039979075964 NaN NaN 0.0844720671579865 0.554232572181046 287 0 713 0.713 0.287 0.574 ORF3a all ss13 106 TTG TCT TGT 2 TTCTTGTAC:TTTTTGTAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.83333333333336 4 30.750000000000004 0.0908235725293773 0.142863650574837 0.635736047370573 -0.0520400780454593 0.0401438516574052 0.0761827726915108 NaN NaN 0.0813420354238481 0.522323065957719 277 0 723 0.723 0.277 0.554 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACA 2 TTGTACATC:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.83333333333336 4 31.41666666666667 0.0920189790070996 0.139531497680893 0.659485353031513 -0.0475125186737935 0.0404212404603552 0.0751427483432038 NaN NaN 0.0791824893545136 0.548480774991545 279 1 720 0.72 0.279 0.558 ORF3a all ss13 108 ATC ACA TCT 2 TACATCTAT:TACCTCTAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.83333333333336 4 31.91666666666667 0.0920189790070996 0.137132914796851 0.671020368402558 -0.0451139357897514 0.0389873243547323 0.0753624120394854 NaN NaN 0.0794834175718084 0.570313887605662 266 2 732 0.732 0.266 0.532 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 ATCTATGCC:CTCTATGCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.00000000000001 3 31.91666666666667 0.0918175614096642 0.100428343016685 0.914259447598474 -0.00861078160702046 0.0408506602858188 0.0633421099438655 NaN NaN 0.0742371188419539 0.907660272926217 448 1 551 0.551 0.448 0.896 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCC 2 TATGCCCTG:TATGCCTTG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.00000000000001 3 31.91666666666667 0.0918175614096642 0.100428343016685 0.914259447598474 -0.00861078160702046 0.0392480560239504 0.0596644221419954 NaN NaN 0.070221780189875 0.902405908306009 440 1 559 0.559 0.44 0.88 ORF3a all ss13 111 CTG CCC TGA 2 GCCCTGATT:GCCTTGATA 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.66666666666669 3 32.25000000000001 0.0922212833511261 0.0993184392369987 0.928541407412405 -0.00709715588587251 0.0403193448091104 0.0639042187845161 NaN NaN 0.0687834150264729 0.917819153760545 451 0 549 0.549 0.451 0.902 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 CTGATTTAT:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.50000000000001 3 32.41666666666667 0.0900437621201392 0.0987726497511971 0.911626470960883 -0.00872888763105795 0.040166305067366 0.0607411842076708 NaN NaN 0.0681937507911994 0.898147957275624 447 1 552 0.552 0.447 0.894 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATA 2 ATATATTTT:ATTTATATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.83333333333336 3 33.41666666666667 0.089658862987337 0.0956200277799543 0.937657780163635 -0.00596116479261728 0.0386679170289782 0.0615713063187237 NA NA 0.0663438577077818 0.928404388165222 482 0 518 0.518 0.482 0.964 ORF3a all ss13 114 ATC ATA TCT 2 TATATCTTG:TATTTTCTA 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.50000000000003 3 33.75 0.0900437621201392 0.094613463995175 0.951701357480486 -0.00456970187503583 0.0387919643044805 0.0581844069826033 NaN NaN 0.0679803845723569 0.946405855840372 483 0 517 0.517 0.483 0.966 ORF3a all ss13 115 CTA TCT TAC 2 ATCTTGCAA:TTTCTACAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.6666666666667 2 34.083333333333336 0.0910206427532005 0.0611024764460933 1.4896391774481 0.0299181663071073 0.0384458155740703 0.0428771056084773 NaN NaN 0.056672569008499 0.597559961614957 710 0 290 0.29 0.71 0.58 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAA 2 CTACAATGC:TTGCAAATT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.33333333333336 2 34.083333333333336 0.0902374551086072 0.0611024764460933 1.47682156856961 0.029134978662514 0.0382730871944 0.0476706993921419 NaN NaN 0.0547307595202266 0.594495516251541 695 1 304 0.304 0.695 0.608 ORF3a all ss13 117 ATT AAA GCA 2 CAAATTGTA:CAATGCATC 1:1 TRUE 2 0.5 0.5 0 2 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.00000000000001 2 34.75 0.0918175614096642 0.0598821656332629 1.53330395517062 0.0319353957764013 0.0399523555203378 0.0453732201393438 NA NA 0.0542041269912144 0.555747854926857 728 0 272 0.272 0.728 0.544 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TAA 2 ATTGTAAGT:TGCATCAAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.58333333333334 3 34.91666666666667 0.0647651348577861 0.0912516429860269 0.709742123412544 -0.0264865081282408 0.0300967193517464 0.0552520749824398 NA NA 0.0589306373931251 0.653105439694722 311 0 689 0.689 0.311 0.622 ORF3a all ss13 119 AAC TAA ACG 2 ATCAACGCA:GTAAGTTTT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.91666666666669 2 34.583333333333336 0.0644865306153867 0.0601826482875392 1.07151367462735 0.00430388232784751 0.0285316986428191 0.0457237959358322 NA NA 0.0477150200094877 0.928128492120404 561 1 438 0.438 0.561 0.876 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AGTTTTTGT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.08333333333334 3 34.75000000000001 0.0516889101836223 0.0917171833187057 0.563568442829408 -0.0400282731350834 0.0268493460520091 0.0556698343701426 NA NA 0.0571726795456874 0.483846504342381 210 2 788 0.788 0.21 0.42 ORF3a all ss13 121 TGT CAT GTA 2 GCATGTAGA:TTTTGTAGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.91666666666669 2 34.583333333333336 0.0385111332176099 0.0601826482875392 0.639904263328731 -0.0216715150699293 0.0217669479778911 0.04419234125991 NA NA 0.0492828824663994 0.660127481019124 333 7 660 0.66 0.333 0.666 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 TGTAGAATT:TGTAGATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.08333333333334 3 35.25000000000001 0.0389276557511925 0.0903346148069003 0.430927345341588 -0.0514069590557078 0.0233472593785614 0.0554232634419832 NA NA 0.0594421145194616 0.387135471923636 176 1 823 0.823 0.176 0.352 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATT:AGATTTATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.08333333333334 3 35.083333333333336 0.0389276557511925 0.0907908105289243 0.428762068808614 -0.0518631547777318 0.0228137420352895 0.0544985303749237 NA NA 0.0597960906160165 0.385759286283597 168 2 830 0.83 0.168 0.336 ORF3a all ss13 124 ATC TTA TCA 2 ATTATTATG:TTTATCATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.41666666666669 3 35.41666666666667 0.0256161505491714 0.0898829861073045 0.284994431744738 -0.0642668355581331 0.0182230135621388 0.0493644505818317 NA NA 0.0570078470759075 0.259601653515207 100 4 896 0.896 0.1 0.2 ORF3a all ss13 125 ATG TCA TGA 2 ATCATGAGA:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.41666666666669 3 35.41666666666667 0.0256161505491714 0.0898829861073045 0.284994431744738 -0.0642668355581331 0.017947564340036 0.0545430233507958 NA NA 0.0581724694333696 0.269261971178528 106 3 891 0.891 0.106 0.212 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGC:ATGAGATGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333336 3 35.41666666666667 0.0252389746234555 0.0898829861073045 0.280798132288625 -0.064644011483849 0.0178159463746649 0.0544863659713498 NA NA 0.0568674481808311 0.255643253685143 106 7 887 0.887 0.106 0.212 ORF3a all ss13 127 TGC GAT GCT 2 AGATGCTGG:AGATGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.91666666666669 3 35.75000000000001 0.0644865306153867 0.088993157850987 0.72462346738347 -0.0245066272356003 0.0447264072881434 0.0511290174354544 NA NA 0.0721197615086481 0.73400367806543 336 0 664 0.664 0.336 0.672 ORF3a all ss13 128 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCTG:TGTTGGCTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.66666666666669 4 35.833333333333336 0.078331997525698 0.120863906464681 0.648100825274815 -0.0425319089389834 0.045808224451943 0.0627139667759011 NaN NaN 0.075832418940819 0.574888139362635 251 1 748 0.748 0.251 0.502 ORF3a all ss13 129 CTG GGC TGT 2 TGGCTGTGC:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.33333333333336 4 35.16666666666667 0.0786746849626466 0.123354245726484 0.637794706613454 -0.0446795607638371 0.0473602709832855 0.0672099875849866 NaN NaN 0.0764012133157659 0.558681049405879 268 0 732 0.732 0.268 0.536 ORF3a all ss13 130 TGC TGT GCT 2 CTGTGCTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.08333333333333 0.5 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.50000000000003 4 34.833333333333336 0.0774882105210195 0.124638389543236 0.621704202092079 -0.0471501790222168 0.0479519442113681 0.0664041276489046 NaN NaN 0.076564872172736 0.538013330736907 254 0 746 0.746 0.254 0.508 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAG:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.08333333333336 4 34.583333333333336 0.0779078173603665 0.125619222573624 0.620190252448867 -0.0477114052132579 0.0474935510755367 0.0679225270235295 NaN NaN 0.0787611853277496 0.54466545318437 256 0 744 0.744 0.256 0.512 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.75000000000003 4 34.583333333333336 0.078246792038373 0.125619222573624 0.622888682442794 -0.0473724305352514 0.0490559903499577 0.0672949465302046 NaN NaN 0.0779303107927871 0.543265761187699 281 0 719 0.719 0.281 0.562 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA:AAGTGCAGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.25000000000003 4 34.083333333333336 0.0777394299845026 0.127628054258581 0.609109262349156 -0.0498886242740789 0.0466222717578065 0.0675450393436782 NaN NaN 0.0777428512882081 0.521059330125781 249 1 750 0.75 0.249 0.498 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC:TGCAGATCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.4166666666667 4 34.083333333333336 0.0775717695799524 0.127628054258581 0.60779559815891 -0.050056284678629 0.0477743434270831 0.0682668639153143 NaN NaN 0.0783450169203453 0.522874258427835 249 2 749 0.749 0.249 0.498 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG:AGATCCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.75000000000003 4 34.333333333333336 0.0646255322826462 0.126615652181289 0.510407135052426 -0.0619901198986428 0.044250720067728 0.0675174986445715 NA NA 0.0790543655546622 0.432954777782154 199 3 798 0.798 0.199 0.398 ORF3a all ss13 136 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAT:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.00000000000003 4 34.75000000000001 0.0644172539103222 0.124963623649128 0.51548804387421 -0.0605463697388062 0.044969565722276 0.0661478111088313 NaN NaN 0.0767088177480969 0.429935925725899 209 3 788 0.788 0.209 0.418 ORF3a all ss13 137 AAC AAA ACC 2 AAAAATCCA:AAGAACCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.41666666666669 4 34.16666666666667 0.06407309248799 0.127288788480472 0.503367918360067 -0.0632156959924819 0.0449735627856149 0.0685928437394441 NA NA 0.0747981595947116 0.398026860309418 177 1 822 0.822 0.177 0.354 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA:AATCCATTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.75000000000003 4 34.16666666666667 0.0646255322826462 0.127288788480472 0.50770796905307 -0.0626632561978257 0.0445772777420461 0.069633466558948 NA NA 0.07413343889247 0.397956460285871 176 2 822 0.822 0.176 0.352 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTC:CCATTACTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.58333333333336 4 34.33333333333334 0.0647651348577861 0.126615652181289 0.511509704701083 -0.0618505173235029 0.0464247795430714 0.0694621040642844 NA NA 0.0738785032295026 0.402484459961119 191 5 804 0.804 0.191 0.382 ORF3a all ss13 140 CTC TAC TCT 2 TTACTCTAT:TTACTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.25000000000003 4 35.33333333333334 0.0659040642696656 0.122722067836352 0.537018854323314 -0.056818003566686 0.0440420119096716 0.063264698396234 NA NA 0.0759617904865883 0.454471399182749 211 3 786 0.786 0.211 0.422 ORF3a all ss13 141 TAT TCT ATG 2 CTCTATGAT:CTTTATGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.25000000000003 4 35.33333333333334 0.0659040642696656 0.122722067836352 0.537018854323314 -0.056818003566686 0.0460195395123975 0.0675403609366445 NaN NaN 0.0761612871932845 0.455654063751677 234 1 765 0.765 0.234 0.468 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC:TATGATGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.25000000000003 4 36 0.0659040642696656 0.120256987556385 0.548026901461882 -0.054352923286719 0.0453819703892696 0.065359210389211 NA NA 0.0737099780802916 0.460885853742868 218 3 779 0.779 0.218 0.436 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC:GATGCTAAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.91666666666669 4 36.333333333333336 0.0661950873041523 0.119061291806916 0.555974878985038 -0.0528662045027636 0.0428191212404056 0.0657649526995087 NA NA 0.072941904442813 0.468592298393226 210 1 789 0.789 0.21 0.42 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC:GCTAACTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.25000000000003 5 36.66666666666667 0.0659040642696656 0.150503021596613 0.437891967686239 -0.0845989573269477 0.0445218938572866 0.074359558937606 NaN NaN 0.0855196234695347 0.322548448943913 136 0 864 0.864 0.136 0.272 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT:AACTATTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.25000000000003 5 36.66666666666667 0.0659040642696656 0.150503021596613 0.437891967686239 -0.0845989573269477 0.0446509729676832 0.0725318760726142 NaN NaN 0.0853121554838483 0.321373103848458 143 1 856 0.856 0.143 0.286 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT:TATTTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.41666666666669 5 36.5 0.0666364763682366 0.151264442981809 0.440529678056925 -0.0846279666135727 0.0456990828016116 0.0750788943546343 NA NA 0.0860714492794533 0.325494621407366 138 1 861 0.861 0.138 0.276 ORF3a all ss13 147 GTA TTG TAT 2 TTTGTATGT:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.75000000000003 5 35.666666666666664 0.0663415654213976 0.155190536855492 0.427484605476767 -0.0888489714340943 0.0444985627208071 0.0757725893654089 NaN NaN 0.0846649361755675 0.293985432596046 127 0 873 0.873 0.127 0.254 ORF3a all ss13 148 TGC TAT GCT 2 GTATGTTGG:GTTTGCTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.75000000000003 5 36.666666666666664 0.0672342400167485 0.150503021596613 0.446730167298258 -0.0832687815798649 0.0465479093733304 0.0752522740196453 NA NA 0.0816601403409698 0.307871130742347 104 0 896 0.896 0.104 0.208 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGTTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.08333333333337 5 36.49999999999999 0.0669340227304817 0.151264442981809 0.442496738896735 -0.0843304202513276 0.0462698851634684 0.0751563332590497 NaN NaN 0.0829664167599424 0.309419701563729 132 1 867 0.867 0.132 0.264 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.4166666666667 5 35.83333333333333 0.0666364763682366 0.154389040653112 0.431614032228871 -0.0877525642848749 0.0470739177506089 0.0757006866655903 NaN NaN 0.0872239964678887 0.314386761612925 122 0 878 0.878 0.122 0.244 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACTAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.75000000000003 5 35.83333333333333 0.0672342400167485 0.154389040653112 0.435485833271116 -0.0871548006363631 0.0458391603603722 0.0778366222003069 NA NA 0.0869803896358256 0.316341092922591 130 1 869 0.869 0.13 0.26 ORF3a all ss13 152 AAT CAC ATA 2 ACACATAAC:ACTAATAAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.75000000000003 5 34.83333333333333 0.0663415654213976 0.159326652781303 0.41638711579826 -0.0929850873599056 0.0466711402710052 0.0800593260288813 NaN NaN 0.0841814512758779 0.269341930648631 110 0 890 0.89 0.11 0.22 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 AATAACTAT:CATAACTAT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.4166666666667 5 35.49999999999999 0.0535344239114693 0.156000428408735 0.34316844163533 -0.102466004497265 0.0455067427418671 0.0765232448582953 NA NA 0.0836778802685261 0.220752672707455 89 2 909 0.909 0.089 0.178 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.25000000000003 5 35.16666666666666 0.0536541558618204 0.157645932730055 0.340345957124661 -0.103991776868235 0.0437402647558184 0.0820204971156516 NA NA 0.0852398952886333 0.222468856950753 88 0 912 0.912 0.088 0.176 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.58333333333336 6 35.16666666666666 0.0534152253723939 0.193580949501978 0.275932241833787 -0.140165724129584 0.0434306292081346 0.0897045372956539 NA NA 0.0973919801082332 0.150096231745371 50 1 949 0.949 0.05 0.1 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.91666666666669 6 35.16666666666666 0.0538952343889476 0.193580949501978 0.278411871248709 -0.139685715113031 0.0432422607732063 0.0852267489791629 NaN NaN 0.0953204585584604 0.142802906583472 47 1 952 0.952 0.047 0.094 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.91666666666669 6 35.16666666666666 0.0538952343889476 0.193580949501978 0.278411871248709 -0.139685715113031 0.0436191694910856 0.0868948695375664 NaN NaN 0.0980329894628309 0.154190508459035 48 0 952 0.952 0.048 0.096 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.75000000000001 6 34.83333333333332 0.0540165882431453 0.195697415235261 0.276020959082205 -0.141680826992116 0.0451916921299953 0.0905670230585732 0.392621308285072 0.482042766743001 0.0955538961837889 0.13814560850119 42 0 958 0.958 0.042 0.084 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAC:ATACCATAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666669 6 34.83333333333332 0.0542609435735893 0.195697415235261 0.277269597599736 -0.141436471661672 0.0486571384184751 0.086928898924494 NA NA 0.0936810653019834 0.131103185986023 29 1 970 0.97 0.029 0.058 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATACAAC:CCATATAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.08333333333336 6 34.83333333333332 0.0537744248135208 0.195697415235261 0.274783521023386 -0.14192299042174 0.0450244983336483 0.0878423202959638 NA NA 0.0921321143766229 0.123455791640948 42 0 958 0.958 0.042 0.084 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAACAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.08333333333336 6 34.83333333333332 0.0537744248135208 0.195697415235261 0.274783521023386 -0.14192299042174 0.043322397214573 0.0901927194034263 NA NA 0.0923989706496768 0.124543233890036 42 2 956 0.956 0.042 0.084 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.9166666666667 6 34.33333333333332 0.0538952343889476 0.198960851821961 0.270883613009335 -0.145065617433013 0.0440598339230672 0.0889056903141513 NaN NaN 0.0970928767503587 0.135151771100235 56 1 943 0.943 0.056 0.112 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.4166666666667 6 34.16666666666666 0.0542609435735893 0.200073130342575 0.271205551093648 -0.145812186768986 0.0468191963166442 0.0977667770519104 NA NA 0.0963473629283735 0.130177853901536 55 0 945 0.945 0.055 0.11 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.08333333333337 6 34.16666666666666 0.0537744248135208 0.200073130342575 0.268773846450273 -0.146298705529054 0.0442275027640551 0.0928798766107213 NA NA 0.0974537159159855 0.133300690072834 55 1 944 0.944 0.055 0.11 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.4166666666667 6 33.83333333333332 0.0535344239114693 0.202335646591906 0.264582266215522 -0.148801222680436 0.0442834481219433 0.093301939307232 NA NA 0.0981878583414913 0.12965221328152 48 0 952 0.952 0.048 0.096 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT:GATACAGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.25000000000003 6 33.99999999999999 0.0536541558618204 0.20119798994601 0.266673418935339 -0.147543834084189 0.0446634310097843 0.0919205014973638 NaN NaN 0.0969722668975018 0.128133040816587 49 0 951 0.951 0.049 0.098 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC:ACAGTTGTC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.4166666666667 6 33.83333333333332 0.0535344239114693 0.202335646591906 0.264582266215522 -0.148801222680436 0.0443564195495614 0.0899371256147354 NaN NaN 0.0955617893829152 0.119441875220524 33 1 966 0.966 0.033 0.066 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCA 2 ATTGTCGTT:GTTGTCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.83333333333337 5 34.16666666666666 0.0539558430514737 0.162798378928371 0.331427397537008 -0.108842535876897 0.0432257142793512 0.077768646931307 NA NA 0.0888580289897681 0.220611474845783 83 4 913 0.913 0.083 0.166 ORF3a all ss13 169 ATC TCA TCA 2 GTCATCACC:GTCGTTACT 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.33333333333337 5 34.33333333333332 0.0535942229866087 0.161916285324778 0.330999583390313 -0.10832206233817 0.0452001666032934 0.0794708470682389 NA NA 0.0872551984389823 0.2144433822746 91 5 904 0.904 0.091 0.182 ORF3a all ss13 170 ACC TCA CCT 2 ATCACCTCA:GTTACTGAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.33333333333337 4 33.499999999999986 0.066710614512372 0.130054644852002 0.512942960155608 -0.0633440303396297 0.0469887334765578 0.070979945645347 NA NA 0.0772234057677281 0.412062298379628 181 2 817 0.817 0.181 0.362 ORF3a all ss13 171 GAA CCT AAG 2 ACCTCAGGT:ACTGAAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.58333333333337 4 33.249999999999986 0.0805241909860523 0.131123163798598 0.614111104806285 -0.0505989728125454 0.046598067093683 0.071701181779174 NaN NaN 0.0831276927141472 0.542730115762078 260 0 740 0.74 0.26 0.52 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:TCAGGTGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.08333333333337 3 33.41666666666666 0.0810687166991055 0.0956200277799544 0.84782151376974 -0.0145513110808489 0.0497851560034044 0.0622529758145381 NA NA 0.072689190992945 0.841335624920662 404 0 596 0.596 0.404 0.808 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGATGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.4166666666667 3 33.74999999999999 0.0807048841711543 0.0946134639951751 0.852995765753486 -0.0139085798240208 0.0487924407964839 0.0590150955270901 NA NA 0.0705020190047167 0.843609078608598 413 2 585 0.585 0.413 0.826 ORF3a all ss13 174 GGA ACG GAA 2 GACGGCATT:GATGGAACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.58333333333337 3 33.91666666666666 0.0816206643196587 0.0941180977157372 0.867215405969804 -0.0124974333960785 0.0479212149759852 0.060895159813808 NA NA 0.0730411801632247 0.86414419425357 421 0 579 0.579 0.421 0.842 ORF3a all ss13 175 ACA GAA CAA 2 GGAACAAAT:GGCATTTCA 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.08333333333337 3 34.41666666666666 0.0821801867828476 0.0926626795339059 0.886874707230728 -0.0104824927510583 0.0483596884447542 0.0576098633440632 NaN NaN 0.0712968030191819 0.88311139876412 424 3 573 0.573 0.424 0.848 ORF3a all ss13 176 AAT CAA ATC 2 ACAAATCAG:ATTTCAACA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 3 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.50000000000003 5 35.08333333333332 0.0828427466732329 0.158062767299149 0.524112971630095 -0.0752200206259157 0.0497080983350138 0.0871481007319531 NaN NaN 0.104302633883139 0.470804395407758 210 0 790 0.79 0.21 0.42 ORF3a all ss13 177 ACA ATC AGC 2 AATCAGCCA:TCAACACCA 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.666666666666667 0.416666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.4166666666667 5 35.49999999999999 0.0403232602433046 0.156000428408735 0.258481727612018 -0.11567716816543 0.023087921246672 0.0894575173942479 NA NA 0.090844192815463 0.20289107890012 53 2 945 0.945 0.053 0.106 ORF3a all ss13 178 CCA AGC CAA 2 ACACCAAAA:CAGCCAAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.83333333333337 4 35.41666666666666 0.0264928206228062 0.122408407943652 0.216429745863549 -0.0959155873208458 0.0184710225639642 0.0799042444736284 NA NA 0.0840333942063133 0.25370414236737 94 5 901 0.901 0.094 0.188 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTA:CCAAAACTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.83333333333337 4 35.41666666666666 0.0264928206228062 0.122408407943652 0.216429745863549 -0.0959155873208458 0.0182769724317229 0.0802430201342973 NA NA 0.0818062262022403 0.241007226321634 87 7 906 0.906 0.087 0.174 ORF3a all ss13 180 CTA AAC TAA 2 AAACTAAAA:AAACTCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.6666666666667 4 35.91666666666666 0.0269087157486763 0.120559681536883 0.223198298184324 -0.0936509657882068 0.0180865142727264 0.0808567487662077 NA NA 0.0850980971854815 0.271111720696656 92 2 906 0.906 0.092 0.184 ORF3a all ss13 181 AAA TAA AAG 2 CTAAAAGAA:CTCAAAGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.33333333333336 4 36.08333333333332 0.0266694765273651 0.119955812971472 0.222327504326178 -0.0932863364441069 0.019863808315628 0.0850647071404943 NA NA 0.0826759651274236 0.259177694715036 85 6 909 0.909 0.085 0.17 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.66666666666669 4 36.08333333333332 0.0269087157486763 0.119955812971472 0.224321898890184 -0.0930470972227957 0.0186080799191666 0.0762987847112231 NA NA 0.0852478285802416 0.275057614462803 88 6 906 0.906 0.088 0.176 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC:GAAGACTAT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.83333333333334 4 36.58333333333332 0.0272138698048234 0.11818004032857 0.230274670148715 -0.0909661705237471 0.0186654658381092 0.0811722721987285 NA NA 0.0822800168444816 0.268913458031581 83 5 912 0.912 0.083 0.166 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA:GACTATCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.33333333333334 4 37.41666666666666 0.0420670999882827 0.115334665090853 0.364739429859576 -0.0732675651025699 0.0248161864072411 0.0762992768535299 NA NA 0.0839389096152545 0.38273517977015997 164 5 831 0.831 0.164 0.328 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT:TATCAAATT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.50000000000001 4 36.91666666666666 0.0557100557871529 0.117025173722032 0.476051895632986 -0.0613151179348791 0.027678900859818 0.0836153255835993 NaN NaN 0.0814277154467266 0.451449558289421 216 2 782 0.782 0.216 0.432 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.25000000000001 4 37.16666666666666 0.0559047993353385 0.116173757560117 0.481217105389824 -0.0602689582247781 0.0285474991638396 0.0749849208621478 NaN NaN 0.0830714534131113 0.468140776903275 240 0 760 0.76 0.24 0.48 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.75000000000001 4 37.16666666666666 0.056298401666626 0.116173757560117 0.484605153943593 -0.0598753558934906 0.0278040016053475 0.0804571770756007 NA NA 0.0842330994326254 0.47719001583123 239 0 761 0.761 0.239 0.478 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.41666666666667 4 37.49999999999999 0.0565638983071325 0.115057659974651 0.491613494656457 -0.0584937616675185 0.028401866978162 0.0750841476259462 NA NA 0.0849988507164828 0.4913449736262 237 1 762 0.762 0.237 0.474 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.58333333333334 4 36.99999999999999 0.0556454425645553 0.116739982283845 0.476661392917273 -0.0610945397192897 0.0279006884389936 0.0776968225015645 NA NA 0.0798267371329462 0.444069523313072 222 1 777 0.777 0.222 0.444 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666667 4 36.33333333333333 0.0546316519559279 0.119061291806916 0.45885317660189 -0.0644296398509879 0.026745124074397 0.0768200857473502 NaN NaN 0.0851621516027495 0.449317999938662 208 2 790 0.79 0.208 0.416 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGG 2 TCTGAGGAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.41666666666667 6 36.83333333333333 0.0550074627952336 0.18365333026498 0.299517916260311 -0.128645867469747 0.0286296261122907 0.103990219072985 NaN NaN 0.111397743415267 0.248158536530939 94 0 906 0.906 0.094 0.188 ORF3a all ss13 192 GAT AGG ATA 2 GAGGATAGG:GAGGATTGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.08333333333334 6 35.5 0.0560353868844177 0.191510018856633 0.292597678277952 -0.135474631972216 0.0283350399568936 0.113484353198851 NaN NaN 0.119850450532152 0.258322886405937 78 0 922 0.922 0.078 0.156 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 GATAGGCAC:GATTGGCAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.83333333333334 8 36.416666666666664 0.0570345959917882 0.259943938648383 0.219411140295665 -0.202909342656595 0.0289662244185284 0.132832978593561 NaN NaN 0.145685274734754 0.163682578925964 38 0 962 0.962 0.038 0.076 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.50000000000001 8 36.75 0.0573071018565008 0.25713126368002 0.222870999956719 -0.199824161823519 0.0298003963276825 0.134313169170569 NaN NaN 0.143508145502355 0.163794091984466 48 0 952 0.952 0.048 0.096 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT:CATTCAGGT 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.83333333333334 8 35.75 0.0570345959917882 0.265759990634356 0.214609414515893 -0.208725394642568 0.0293941458357105 0.147527785468764 NaN NaN 0.141922025144968 0.141370984637767 37 0 963 0.963 0.037 0.074 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333334 8 34.916666666666664 0.0550706014161129 0.273410739562984 0.201420769001748 -0.218340138146871 0.0271575666344365 0.138577490822255 NaN NaN 0.15100633071317 0.148205094840193 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.66666666666667 8 34.916666666666664 0.0548189130040021 0.273410739562984 0.200500218431887 -0.218591826558982 0.0279143172016577 0.147183196170367 NaN NaN 0.146914441414988 0.136781165090916 24 0 976 0.976 0.024 0.048 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.66666666666667 8 34.583333333333336 0.054077470426008 0.276597228353308 0.195509805893401 -0.2225197579273 0.0291562244114675 0.148398489449361 NaN NaN 0.159071593588456 0.161853331972364 39 0 961 0.961 0.039 0.078 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.5 8 35.083333333333336 0.0549444688504895 0.271845168498985 0.202116775346311 -0.216900699648496 0.0290341661303703 0.146283584287312 NaN NaN 0.149733115443632 0.147454343852772 36 0 964 0.964 0.036 0.072 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTA:GACTATGTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333334 8 35.083333333333336 0.0550706014161129 0.271845168498985 0.202580762130847 -0.216774567082873 0.0275488580896198 0.15332589642751 NaN NaN 0.151970119815963 0.153744583695737 40 0 960 0.96 0.04 0.08 ORF3a all ss13 201 GTA ATG TAG 2 TATGTAGTA:TATGTCGTT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.00000000000001 8 35.083333333333336 0.0545695157118212 0.271845168498985 0.200737486022397 -0.217275652787164 0.0271272157528133 0.150461014994707 NaN NaN 0.143182935889171 0.129148338757778 21 0 979 0.979 0.021 0.042 ORF3a all ss13 202 GTA TAG TAA 2 GTAGTAATA:GTCGTTGTA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.00000000000001 8 36.083333333333336 0.0553246126797069 0.262819463546309 0.210504244751107 -0.207494850866602 0.0282752396400004 0.141299735168204 NA NA 0.139177443818599 0.13599680795564 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 203 ATA TAA TAC 2 GTAATATAT:GTTGTACAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.833333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333334 8 35.75000000000001 0.0550706014161129 0.265759990634356 0.20721930823621 -0.210689389218243 0.0276310366317035 0.140088592301555 NaN NaN 0.145999491610203 0.148997082217068 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 ATATATGGC:GTACATGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.50000000000001 8 36.41666666666667 0.0564972895530331 0.259943938648383 0.217344131380016 -0.20344664909535 0.0287472703812761 0.132377023670668 NaN NaN 0.15158560325119 0.179555851245262 35 0 965 0.965 0.035 0.07 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT:TATGGCTAT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.66666666666669 7 35.91666666666667 0.0563645417845084 0.225687740489177 0.249745695811117 -0.169323198704669 0.0284799635978468 0.125302803483203 NaN NaN 0.13605878639452 0.213320900555503 73 0 927 0.927 0.073 0.146 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000001 7 36.583333333333336 0.0568993130810351 0.220904431633438 0.257574339547212 -0.164005118552403 0.0289528835217733 0.120880241333245 NaN NaN 0.125833502307359 0.192455235017437 64 0 936 0.936 0.064 0.128 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.33333333333334 8 36.25000000000001 0.0566306643811089 0.261373712626115 0.216665493297395 -0.204743048245006 0.0298246526792298 0.145049659883298 NaN NaN 0.140910821780665 0.146224494483853 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.66666666666669 8 36.583333333333336 0.0563645417845084 0.258529875671953 0.218019451864159 -0.202165333887444 0.0285216279392101 0.13760846259967 NaN NaN 0.145514295778124 0.164736692061047 38 0 962 0.962 0.038 0.076 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000001 8 36.25000000000001 0.0561009098120237 0.261373712626115 0.214638684389328 -0.205272802814091 0.0294023991978431 0.139461512466251 NaN NaN 0.149988279272786 0.171126754961686 36 0 964 0.964 0.036 0.072 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC:GAAGTTTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000001 8 35.583333333333336 0.0561009098120237 0.267255329878453 0.209915027092399 -0.21115442006643 0.029615743508795 0.139842575316084 NaN NaN 0.142508112474564 0.13841985725807 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC:GTTTATTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.00000000000001 8 35.583333333333336 0.0553246126797069 0.267255329878453 0.207010324938583 -0.211930717198747 0.0275819399979406 0.143346428192519 NaN NaN 0.154652191183661 0.17057144411255 32 0 968 0.968 0.032 0.064 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG:TATTACCAG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.00000000000001 8 35.25000000000001 0.0545695157118212 0.270297617029844 0.201886780621511 -0.215728101318022 0.0268161933045369 0.148256693928983 NaN NaN 0.144687271356621 0.135962620443912 30 1 969 0.969 0.03 0.06 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.16666666666667 8 35.083333333333336 0.0544456664773409 0.271845168498985 0.200281898618861 -0.217399502021645 0.0266659639900333 0.146442347033526 NaN NaN 0.149063172297678 0.144719654906852 35 0 965 0.965 0.035 0.07 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAA:CAGCTTGAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.5 8 34.41666666666667 0.0541996476239405 0.278218809519287 0.194809429734776 -0.224019161895346 0.028081813499625 0.163281269688543 NaN NaN 0.156701460922997 0.152834140174195 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 215 GAA TTG AAT 2 CTTGAATCG:CTTGAGTCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.83333333333334 8 34.083333333333336 0.0539558430514737 0.281520365031792 0.191658756358107 -0.227564521980318 0.0284028000165304 0.158142594817327 NaN NaN 0.159205623976505 0.152896510231938 39 0 961 0.961 0.039 0.078 ORF3a all ss13 216 TCG AAT CGA 2 GAATCGACT:GAGTCTACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.33333333333334 8 33.583333333333336 0.0535942229866087 0.286624098210084 0.186984357984186 -0.233029875223475 0.027544976119745 0.156525564990954 NaN NaN 0.159116713759289 0.143051466823882 30 1 969 0.969 0.03 0.06 ORF3a all ss13 217 ACA CGA CAC 2 TCGACTCAA:TCTACACAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.50000000000001 8 33.083333333333336 0.0527690107059348 0.291918675814013 0.180766134810624 -0.239149665108079 0.0260056125504997 0.15335002051463 NaN NaN 0.161497680259113 0.138653439342579 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT:ACTCAATTG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.66666666666669 8 32.91666666666667 0.0526531940049364 0.293727829875654 0.179258444891744 -0.241074635870718 0.0268628990898316 0.165188306747669 NaN NaN 0.164450347711665 0.14266414777389 24 0 976 0.976 0.024 0.048 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TGT 2 CAAATTACT:CAATTGTCG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.00000000000001 8 33.91666666666667 0.053834761795598 0.283201052715922 0.190093791245895 -0.229366290920324 0.0271893675454114 0.157341809435163 NaN NaN 0.154477498940146 0.13760007021466 32 1 967 0.967 0.032 0.064 ORF3a all ss13 220 ACT TGT CGA 2 ATTACTACA:TTGTCGACT 1:1 TRUE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.66666666666669 8 35.083333333333336 0.0407339920153049 0.271845168498985 0.149842619018101 -0.231111176483681 0.0244196714552555 0.14538234609357 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 221 ACA CGA CAG 2 ACTACAGAC:TCGACTGAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.91666666666669 8 35.833333333333336 0.0271830432683088 0.265018643484554 0.102570305661885 -0.237835600216245 0.0195922655946201 0.139404428263415 NA NA 0.14429440746643 0.0992980495844671 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT:ACTGATACT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.75000000000001 8 35.99999999999999 0.0272447663451876 0.263548415128416 0.103376703411069 -0.236303648783229 0.0199708989801318 0.14486980720078 NaN NaN 0.141476745262926 0.0948669546922068 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT:GATACTGGT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.41666666666669 8 36.33333333333333 0.0273690573365762 0.260656845281595 0.105000339841482 -0.233287787945019 0.0203214522736096 0.142702412982211 NaN NaN 0.140311485226447 0.0963840907067627 18 0 982 0.982 0.018 0.036 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT:ACTGGTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.58333333333336 8 36.16666666666666 0.0273067703935705 0.262094574111018 0.104186706215459 -0.234787803717448 0.0193794603905661 0.141476561033309 NA NA 0.142951851464802 0.100501799406047 13 1 986 0.986 0.013 0.026 ORF3a all ss13 225 ATT GTA CTG 2 GGTATTGAA:GGTGCTGAA 1:1 TRUE 0.916666666666667 0.75 1.33333333333333 0 0 0 2 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.08333333333336 8 35.66666666666666 0.0271215992572094 0.266505540694197 0.10176748740969 -0.239383941436987 0.0192859871491156 0.15183975703727 NaN NaN 0.142373679531309 0.0926895583915425 12 1 987 0.987 0.012 0.024 ORF3a all ss13 226 GAA CTG AAA 2 ATTGAAAAT:GCTGAAAAT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.83333333333336 6 34.99999999999999 0.0268485044068343 0.194633396613814 0.137943975052269 -0.167784892206979 0.0198342838365211 0.113300988653451 NaN NaN 0.120110128927417 0.162435999761488 41 0 959 0.959 0.041 0.082 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTAT:TTCATCTTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TAT TCT ATA 2 ATCTATAGC:ATCTTTAAC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC ATA ACA 2 TATAGCAAG:TTTAACAAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT:AGCAAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAAGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:AAAGATGTA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA---:GATGTA--- 1:1 TRUE 0.5 0 1.5 1 0 0 2 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG:GTA---GAT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C ATC 0 ---CCGAAT:---GATCAT 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.666666666666667 1.25 0 0 1 2 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT ATC ATG 2 CCGAATGTG:GATCATGTG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA:CATGTGCAA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.83333333333331 9 33.416666666666664 0.118766081588831 0.333664006808512 0.355945139917324 -0.214897925219681 0.0481863943228647 0.127811779969194 0.265311153149096 0.179721205861755 0.140713297673749 0.126710266962605 38 0 962 0.962 0.038 0.076 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.49999999999997 9 33.75 0.119357976360937 0.329524994837884 0.362212209182059 -0.210167018476948 0.049723142490244 0.131060165973432 0.264973949763906 0.171633799221349 0.137765930690815 0.127125223276142 42 0 958 0.958 0.042 0.084 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG:TTGTTTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.8333333333333 9 34.083333333333336 0.120559681536883 0.325488997542435 0.370395566200868 -0.204929316005551 0.0522731340779499 0.128103227008446 0.286274457743818 0.195718011565604 0.137546709232294 0.136253449319531 49 0 951 0.951 0.049 0.098 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA:TTTTTGAAC 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.49999999999996 9 34.083333333333336 0.121169674009144 0.325488997542435 0.37226964635985 -0.20431932353329 0.0490160565145852 0.128019930694416 0.373584354228938 0.319016578108625 0.130790685124435 0.118244274414874 24 0 976 0.976 0.024 0.048 ORF3a all ss13 6 AAC TGA ACA 2 ATGAGATTT:TTGAACATC 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 2 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 71.83333333333329 9 34.916666666666664 0.104386548100003 0.315824866691675 0.330520358303232 -0.211438318591672 0.0472745018885441 0.122274938659971 0.250703167656829 0.187378719787502 0.127310578971416 0.0967521866580278 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 7 ATC ACA TCT 2 AACATCTTC:AGATTTTTT 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.49999999999994 9 35.25 0.0723451996406718 0.312120297918684 0.231786269983376 -0.239775098278012 0.0335556404912459 0.115999391240553 0.176793722589127 0.189839228337206 0.12042467498876 0.0464721509000469 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 8 TTC TCT TCA 2 ATCTTCACT:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.08333333333329 8 34.83333333333333 0.071739235186476 0.274200382158177 0.261630690015202 -0.202461146971701 0.031485204126227 0.106750666302867 0.226739853297868 0.248549174339451 0.111241449981344 0.0687566667107328 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 9 ACT TCA CTC 2 TTCACTTTA:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.24999999999994 8 34.33333333333333 0.0705572800165473 0.27903683339124 0.252860094343238 -0.208479553374693 0.0309830189825165 0.110613485988373 0.22301428026607 0.256866216239266 0.112945713391613 0.0649156493411804 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 10 CTT CTC TAG 2 ACTCTTAGA:ACTTTAGGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.16666666666667 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.58333333333329 8 34.99999999999999 0.0712278649928988 0.272625681756849 0.261266160010655 -0.20139781676395 0.0331432659649615 0.107954949945365 0.225363043527866 0.246328888752981 0.111970538080679 0.0720712236521198 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 11 AGA TAG GAT 2 CTTAGATCA:TTAGGATCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1.16666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.66666666666661 8 35.08333333333332 0.0711433450940079 0.271845168498986 0.261705387249777 -0.200701823404978 0.0320222851984312 0.10755860553386801 0.229417060566385 0.253977827935151 0.109380515579066 0.0665211642979558 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGATCTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.99999999999996 7 35.58333333333332 0.0708072633533061 0.228158530802244 0.31034238826984 -0.157351267448938 0.0322824536503262 0.0936327342536455 NaN NaN 0.0964716660105288 0.102877240153461 28 0 972 0.972 0.028 0.056 ORF3a all ss13 13 ATT CAA TTA 2 TCAATTACT:TCTATTACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.3333333333333 7 35.08333333333332 0.0866346653413833 0.231968667588477 0.373475720846391 -0.145334002247094 0.0363099105944809 0.097021431166556 0.38990809068209 0.338135483970285 0.101285247751897 0.15131615779022 52 1 947 0.947 0.052 0.104 ORF3a all ss13 14 ACT TTA CTA 2 ATTACTAGA:ATTACTGCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.5833333333333 7 34.24999999999999 0.0863227141399176 0.238612230829161 0.361769863346703 -0.152289516689244 0.0353310881049642 0.099808352118864 NaN NaN 0.103676678436154 0.141862940097586 36 1 963 0.963 0.036 0.072 ORF3a all ss13 15 AGA CTA CAC 2 ACTAGACAA:ACTGCACAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.75 0.25 1 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.5833333333333 7 34.24999999999999 0.0863227141399176 0.238612230829161 0.361769863346703 -0.152289516689244 0.0364152686584611 0.0950426636764464 0.302053748642158 0.231033715103796 0.105327696850546 0.14821537332622 48 0 952 0.952 0.048 0.096 ORF3a all ss13 16 CAA CAC AAC 2 AGACAACCT:GCACAGCCA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.0833333333333 7 34.666666666666664 0.071739235186476 0.235243169141281 0.304957782401712 -0.163503933954805 0.0338330054399065 0.0951466319642384 NA NA 0.100923591201801 0.105215854261025 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 17 CCA AAC CAG 2 CAACCTGGT:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.41666666666663 7 35.33333333333333 0.0724326033146384 0.230047700566857 0.314859062429916 -0.157615097252218 0.0330818031750583 0.0945395595283481 0.325625972959224 0.33357666325145 0.0991400937623132 0.111874944543 45 0 955 0.955 0.045 0.09 ORF3a all ss13 18 GGT CAG GTA 2 CCAGTAAAA:CCTGGTAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 72.8333333333333 7 35.58333333333333 0.102850364976667 0.228158530802244 0.450784656681597 -0.125308165825577 0.0464640178942251 0.0900120901841166 0.481816052909807 0.349481785536807 0.10422984515906 0.229274729833627 118 0 882 0.882 0.118 0.236 ORF3a all ss13 19 AAA GTA AAA 2 GGTAAAGTT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.8333333333333 7 35.666666666666664 0.135026881134824 0.227535736496164 0.593431533938849 -0.0925088553613394 0.0565516849673757 0.0887857338804763 0.606571673422381 0.327907657438071 0.116853090951369 0.428554272952157 191 0 809 0.809 0.191 0.382 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAC:AAAGTTGAA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.8333333333333 7 34.99999999999999 0.133025780578275 0.23261619622788 0.57186809317421 -0.0995904156496043 0.0549631107765699 0.0948057926189894 0.532979369556123 0.283286917784658 0.112024945895026 0.374001934422294 184 0 816 0.816 0.184 0.368 ORF3a all ss13 21 GAA TTG AAA 2 ATTGACAAT:GTTGAAAAT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.91666666666664 6 35.33333333333333 0.132861703193865 0.19253988513586 0.690047691158199 -0.0596781819419952 0.0568665634398412 0.0788441667636927 0.718513981465384 0.33686313632307 0.103986712116585 0.566034120347891 274 0 726 0.726 0.274 0.548 ORF3a all ss13 22 AAT AAA ATG 2 GAAAATGTT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.33333333333331 6 35.08333333333333 0.134018841557532 0.194105738514483 0.690442449477259 -0.0600868969569509 0.0546721252155895 0.0825509649221775 NaN NaN 0.102601370597874 0.558121194462918 268 0 732 0.732 0.268 0.536 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT:AATGTTTCT 1:1 FALSE 2 1 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 72.58333333333331 7 35.41666666666666 0.152227160286946 0.229414483788198 0.663546423805949 -0.0771873235012513 0.0605856000270163 0.0931127757512512 NaN NaN 0.109643289767054 0.481441591579814 240 1 759 0.759 0.24 0.48 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT:GTTTCTCCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 71.91666666666664 8 36.24999999999999 0.136915000021786 0.261373712626115 0.523828500755305 -0.124458712604329 0.0566124224496754 0.0981066171804192 NaN NaN 0.114743107221115 0.278066656039881 140 1 859 0.859 0.14 0.28 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 71.91666666666664 8 36.24999999999999 0.136915000021786 0.261373712626115 0.523828500755305 -0.124458712604329 0.0597665010231568 0.0983597996970797 0.401376526083442 0.191865587782521 0.117308763710961 0.288712703098733 131 1 868 0.868 0.131 0.262 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.74999999999997 9 36.083333333333336 0.135196367873208 0.303233279917543 0.445849373492156 -0.168036912044335 0.0581987934165835 0.106654464403509 0.383511940964239 0.245014702940635 0.125476103672678 0.180507351777998 79 1 920 0.92 0.079 0.158 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT:GCAAGTTCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.74999999999997 10 35.416666666666664 0.133190264783882 0.354269507203646 0.375957461976314 -0.221079242419764 0.0565141043845543 0.129188768254832 0.374702673528917 0.315692618727168 0.141840750737844 0.119080650607679 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT:AGTTCTTTT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.08333333333331 10 36.083333333333336 0.134520967864149 0.345949449613147 0.388845734585139 -0.211428481748999 0.0592419255465682 0.128148776484104 0.294073400585591 0.186076788202821 0.14142662848277399 0.134922428702395 49 1 950 0.95 0.049 0.098 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT:TCTTTTCAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 74.41666666666666 9 35.416666666666664 0.13188569801946 0.310300874693003 0.425025221569037 -0.178415176673544 0.0578601395207261 0.115401558413966 0.307257830079145 0.166577421613754 0.133007921913143 0.179794642606849 70 0 930 0.93 0.07 0.14 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT:TTTCATTCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.08333333333331 8 34.58333333333333 0.146628474234188 0.276597228353308 0.530115486359445 -0.12996875411912 0.06057138860099 0.105725664869493 0.428275157769636 0.215793262855854 0.120334596124134 0.280114832718704 122 0 878 0.878 0.122 0.244 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CATTCTACA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.16666666666666 9 35 0.148632696437812 0.314890384170198 0.472014084613888 -0.166257687732386 0.0626061178750993 0.121090590522421 NaN NaN 0.137722194134424 0.227356654165828 68 0 932 0.932 0.068 0.136 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:TCTACAGCG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 75 9 34.666666666666664 0.130765040358583 0.318662395473949 0.41035604519352 -0.187897355115366 0.0555988037721945 0.120264353801803 0.328941806914054 0.212212949096196 0.142911083294328 0.18858215483921 64 0 936 0.936 0.064 0.128 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACAGCGTCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 75.66666666666667 9 34.666666666666664 0.12950744207608 0.318662395473949 0.406409554172409 -0.18915495339787 0.0556175688825903 0.123306335240505 0.328215971925015 0.215627751265788 0.1328979450111 0.15464635452676 65 0 935 0.935 0.065 0.13 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CCA 2 GCAACGATA:GCGTCCATC 1:1 TRUE 1.08333333333333 1 0.916666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76 9 34.5 0.144677749593369 0.320583011120205 0.451295747356746 -0.175905261526836 0.0580273348571946 0.116849524808099 0.362770020452883 0.213489578167182 0.137976422923791 0.202346896993988 83 0 917 0.917 0.083 0.166 ORF3a all ss13 35 ATA CCA TAC 2 ACGATACCG:TCCATCCCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.16666666666667 9 33.83333333333333 0.128580042454815 0.328506491880477 0.391407919273625 -0.199926449425662 0.0524052338480973 0.117131494803083 0.26969573813414 0.146697895025001 0.134786292833578 0.137998778722567 41 0 959 0.959 0.041 0.082 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA:ATCCCTTTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.25000000000001 9 33.166666666666664 0.128426768784144 0.336838303699426 0.38127127281446 -0.208411534915282 0.054380123565591 0.125288232963128 0.276798441877622 0.168378455536802 0.146043215142671 0.153564368514894 51 0 949 0.949 0.051 0.102 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA:CCTTTACAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.91666666666669 9 32.49999999999999 0.127213641474078 0.345611402393497 0.36808288324133 -0.218397760919419 0.0521752164656829 0.13579388368758 0.306804465565405 0.230243759803955 0.140524823303485 0.120146762662727 35 0 965 0.965 0.035 0.07 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC:TTACAGGCC 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.00000000000003 9 32.666666666666664 0.158481820250405 0.34337482021911 0.461541764038716 -0.184892999968705 0.0638720356651799 0.130392337081141 0.357233804345968 0.196361323959137 0.141603090022102 0.191650164632942 74 0 926 0.926 0.074 0.148 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCA 2 CAAGCCTCA:CAGGCCACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.50000000000003 10 33.33333333333333 0.159636110589832 0.383119217824493 0.416674766398593 -0.223483107234661 0.0614066491386346 0.141828315174541 0.284317005771665 0.142776694901344 0.161153474976073 0.165511334702851 64 0 936 0.936 0.064 0.128 ORF3a all ss13 40 ACT CCA CAC 2 GCCACTCTA:GCCTCACTC 1:1 TRUE 1 1 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.50000000000003 10 33.33333333333333 0.159636110589832 0.383119217824493 0.416674766398593 -0.223483107234661 0.0632785833190884 0.145283888975642 0.296527666826521 0.159967740239868 0.164617852788839 0.174594673244612 64 0 936 0.936 0.064 0.128 ORF3a all ss13 41 CTA CAC TAC 2 ACTCTACCT:TCACTCCCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.00000000000003 10 32.99999999999999 0.158481820250405 0.388186804671653 0.408261739819973 -0.229704984421248 0.0641443210291393 0.144521781743813 0.288601494972385 0.157179643766476 0.176649594572602 0.193483590381354 47 0 953 0.953 0.047 0.094 ORF3a all ss13 42 CCT TAC CTT 2 CTACCTTTC:CTCCCTTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.00000000000003 10 33.166666666666664 0.158481820250405 0.385635998709722 0.410962204723264 -0.227154178459317 0.0631727318571109 0.145626083344163 0.299000204393021 0.169300597156839 0.170706126057726 0.183296350137892 67 0 933 0.933 0.067 0.134 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.16666666666669 10 32.99999999999999 0.158100771086867 0.388186804671653 0.407280126949696 -0.230086033584785 0.063012148553176 0.148205630592333 0.305275149336585 0.182157614711269 0.164690656510022 0.162389494923377 45 0 955 0.955 0.045 0.09 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.66666666666669 10 32.666666666666664 0.156968578879544 0.393393351093114 0.399011773949351 -0.236424772213571 0.0644066712312464 0.149944569367171 0.255946367646267 0.119004345336787 0.170398158607301 0.165294130957432 56 0 944 0.944 0.056 0.112 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 78.16666666666669 10 32.33333333333333 0.171768261601848 0.398744783001625 0.430772436215543 -0.226976521399777 0.065046707913163 0.154373455551549 0.337703510712537 0.202099218442735 0.168740318220092 0.178585443482238 47 0 953 0.953 0.047 0.094 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.16666666666669 10 31.999999999999996 0.174273904523748 0.404247375549515 0.431107077162462 -0.229973471025768 0.0651457740202954 0.150613624722812 0.321880765460353 0.180460727476023 0.168405381561088 0.172066258540372 67 0 933 0.933 0.067 0.134 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT:CTTGTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.6666666666667 10 31.5 0.173011971365532 0.412799349622874 0.419118808020391 -0.239787378257342 0.0689578900174042 0.15918913639309001 0.374575280875038 0.263175369272832 0.180310624446225 0.183565332557213 53 0 947 0.947 0.053 0.106 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC:GTTGTTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.83333333333337 10 31.333333333333332 0.172595396296097 0.415733051779297 0.41515918822765 -0.243137655483201 0.0644451916545859 0.168523460008222 0.297127184136104 0.162340196316029 0.174562791607834 0.163668843464813 61 0 939 0.939 0.061 0.122 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.25000000000003 9 31.666666666666664 0.174062299764764 0.357254585771116 0.487222016728096 -0.183192286006352 0.0658819348021884 0.138547175176464 0.437459743376233 0.265385248405042 0.153047352856876 0.231320295598537 93 0 907 0.907 0.093 0.186 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 76.58333333333337 9 32.333333333333336 0.175769733616626 0.347877835747554 0.505262812271195 -0.172108102130928 0.067362489456731 0.132769087474124 0.472702499122014 0.285123206397716 0.157277102256965 0.273824068904461 101 0 899 0.899 0.101 0.202 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAT 2 GTTGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.58333333333337 9 31.333333333333336 0.173221017246649 0.362138828792688 0.478327656341463 -0.188917811546039 0.0654531932770929 0.13606129621966 0.482900365172287 0.321914771420532 0.152488286722236 0.215382356075719 97 0 903 0.903 0.097 0.194 ORF3a all ss13 52 TTT CAT TTC 2 GCATTTCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.25000000000003 10 32.16666666666667 0.174062299764764 0.401476777644409 0.433555088257015 -0.227414477879645 0.0668127055766321 0.144916948276537 0.309779786207664 0.161645418425939 0.161277212287288 0.158514768945375 58 0 942 0.942 0.058 0.116 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 TTTCTTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.1666666666667 10 32.25000000000001 0.174273904523748 0.400106006661284 0.435569328183773 -0.225832102137537 0.0652933793520481 0.15182975713686 0.315564865745472 0.167499031068825 0.165050214036803 0.171229765763839 54 0 946 0.946 0.054 0.108 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.50000000000004 10 31.91666666666667 0.173430571160122 0.405647413290395 0.427540187556838 -0.232216842130274 0.0647490519337711 0.149756252346975 0.382819452826669 0.26407155676034 0.163135697449548 0.154603378541615 52 0 948 0.948 0.052 0.104 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.83333333333337 10 31.91666666666667 0.188944817553035 0.405647413290395 0.465785831149311 -0.21670259573736 0.0639615959475281 0.151291321284076 0.306710907614762 0.128851183911973 0.16866651701977 0.198862483552401 75 0 925 0.925 0.075 0.15 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.83333333333337 10 31.58333333333334 0.186224058338554 0.411348356449444 0.452716184272494 -0.22512429811089 0.0681359527728726 0.151117417610605 0.315371024214206 0.151143694069673 0.176306788760132 0.201641240080243 63 0 937 0.937 0.063 0.126 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAGC:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.16666666666671 11 31.750000000000007 0.188029061147841 0.464842046991219 0.404500974825525 -0.276812985843379 0.0674336975689042 0.175003501314429 0.299784668556137 0.177238996072694 0.200102897007814 0.166556588548996 42 0 958 0.958 0.042 0.084 ORF3a all ss13 58 AGC AAA GCG 2 CAAAGCGCT:CAGAGCGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.33333333333337 11 31.916666666666675 0.190335390582075 0.461487146936457 0.412439201927073 -0.271151756354383 0.0706189102282286 0.17697931471758 0.26088449153294 0.113894847996002 0.191144986730297 0.156025619111146 35 0 965 0.965 0.035 0.07 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTGCG 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.16666666666671 11 32.25000000000001 0.193661500470681 0.454924919665286 0.425699916841593 -0.261263419194605 0.0688296388229353 0.162600572441 0.303812712467908 0.161156690908775 0.184497814243165 0.156752472753726 53 0 947 0.947 0.053 0.106 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTGCGAAA 1:1 TRUE 0.75 1 1.25 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.33333333333339 12 32.08333333333335 0.210322806792345 0.517914859037174 0.406095332316483 -0.307592052244828 0.0716047742879529 0.192382042471926 0.276420552425932 0.14179988063912 0.204448532738959 0.132453636402927 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:GCGAAATTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.41666666666671 11 31.000000000000014 0.206933202001177 0.480584396281972 0.430586601650221 -0.273651194280795 0.0736056297376445 0.17629287400379 0.278324139887347 0.121846649000258 0.194306307112208 0.159027599107253 49 0 951 0.951 0.049 0.098 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAATTAATA 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 75.75000000000004 11 30.666666666666682 0.21219469193644 0.487940674605862 0.4348780558371 -0.275745982669422 0.0717501981562124 0.185708154038491 0.275987266014647 0.115090846543657 0.208976062357292 0.186998703367261 50 0 950 0.95 0.05 0.1 ORF3a all ss13 63 ATA TAA TAC 2 ATAATTGCG:TTAATACCT 1:1 FALSE 1.25 0.583333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.41666666666671 11 30.500000000000014 0.192938959293253 0.49170694593066 0.392386076483168 -0.298767986637407 0.0663196850755922 0.190408186084137 0.27750828140046 0.15737315333408 0.194872475860527 0.125239848238149 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 64 CCT TAC CGC 2 ATACCTTTT:ATTGCGCTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.50000000000004 11 31.000000000000014 0.192699315438847 0.480584396281972 0.400968730840327 -0.287885080843125 0.0712607400798951 0.173778694094695 0.263082914629844 0.127479877653308 0.205594372536208 0.161436195433161 40 0 960 0.96 0.04 0.08 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 CCTTTTAAC:GCGCTCAAT 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.00000000000004 11 31.166666666666682 0.191273928510779 0.476991575039997 0.401000643448975 -0.285717646529218 0.0683912790871685 0.174443677027701 0.267477978005403 0.133824025070679 0.194621413200647 0.142085504800812 37 0 963 0.963 0.037 0.074 ORF3a all ss13 66 AAC TCA ACA 2 CTCAATAAA:TTTAACAGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.83333333333337 10 30.333333333333343 0.188944817553035 0.434275405344393 0.435080631386887 -0.245330587791358 0.069988633105292 0.176753429276786 0.351401967129828 0.215668585636179 0.190946153510436 0.19885674613334 62 0 938 0.938 0.062 0.124 ORF3a all ss13 67 AAA ACA AAA 2 AACAGTCTT:AATAAAAGA 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 2 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.50000000000004 10 29.66666666666668 0.189869585440856 0.447612053716135 0.424183361159589 -0.257742468275278 0.0680288971871862 0.177472657580447 0.297600722388378 0.154057828771074 0.189035268047484 0.172736846658048 59 0 941 0.941 0.059 0.118 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AGTCTTTGG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.916666666666667 0.75 0 2 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.75000000000004 10 29.25000000000001 0.156781460557421 0.456384596564427 0.343529255232629 -0.299603136007005 0.0572360592180865 0.178027196650027 0.244240020180321 0.159568819857215 0.186967660651864 0.109059908121742 17 1 982 0.982 0.017 0.034 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG:CTTTGGCAG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.25000000000004 11 29.66666666666668 0.126615652181289 0.511480409971365 0.247547412790213 -0.384864757790076 0.0477799598303451 0.199979933855655 0.168793890159693 0.142494102420825 0.212126064679018 0.0696283319302119 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCGT:TGGCAGCTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.25000000000004 12 30.000000000000014 0.16021960824549 0.571605039035172 0.280297753350685 -0.411385430789682 0.0579441238420372 0.203359206613874 0.160069172701469 0.079928013751988 0.229352408613424 0.0728638397980906 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 71 CGT AGC GTT 2 CAGCGTTGC:CAGCTAGCC 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.66666666666671 13 30.166666666666686 0.178173158730486 0.641018707059106 0.277953134235218 -0.46284554832862 0.0618899956313707 0.274731065448214 0.140703505006671 0.0482167849139349 0.25429667597633 0.0687436768037314 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 72 GCC GTT CCC 2 CGTTGCTTA:CTAGCCCTT 1:1 TRUE 1.25 0.75 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.91666666666671 13 30.33333333333335 0.177511154654184 0.635473395290402 0.279336878569186 -0.457962240636218 0.0638297673683731 NA 0.14251464447552 0.0499890857072591 0.246994955952687 0.0637197049022611 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TAT 2 GCCCTTTAT:TGCTTATAC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.33333333333337 12 29.916666666666682 0.160024633856936 0.573996432053642 0.278790293668552 -0.413971798196706 0.0606301663785421 0.228237848811359 0.166151579841375 0.0933612665486497 0.224059627124536 0.0646607265097633 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 74 TAC TAT ACC 2 CTTTATAAG:TTATACCAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 76.16666666666671 11 29.916666666666682 0.176854074420993 0.505377176735143 0.349944719632003 -0.32852310231415 0.0653083940938036 0.183079173938337 0.210038676272247 0.0956941801639276 0.193255756448892 0.0891422979377023 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 75 AAG ACC AGA 2 TACCAGAGC:TATAAGGGC 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.16666666666671 11 29.916666666666682 0.193661500470681 0.505377176735143 0.383201912127849 -0.311715676264462 0.0665825411408026 0.187391888857365 0.224150186099013 0.0873441965433173 0.188841103696668 0.098804536143351 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 76 AGC AGA GCT 2 AAGGGCTTC:CAGAGCTTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.33333333333339 11 29.083333333333346 0.193179203235308 0.526335245778486 0.367026918270659 -0.333156042543178 0.0641635357538086 NA 0.213678851373744 0.0858592451970316 0.225153592633556 0.13895774693871 21 0 979 0.979 0.021 0.042 ORF3a all ss13 77 TTC GCT TCC 2 AGCTTTCAA:GGCTTCCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.00000000000006 10 29.250000000000014 0.194146225437217 0.456384596564427 0.425400477795945 -0.26223837112721 0.0635094414779053 0.17658481508493 0.245935443350466 0.0836795702763966 0.190679102278289 0.169042679285707 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 78 CAA TCC AAT 2 TTCCAGTTC:TTTCAATTG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.50000000000006 10 28.583333333333346 0.192699315438847 0.471183220743389 0.408968967814312 -0.278483905304542 0.0629436243933875 0.194809172888403 0.242049320675059 0.0911025795865877 0.194630601016073 0.152478055519414 47 0 953 0.953 0.047 0.094 ORF3a all ss13 79 TTC AAT TCA 2 CAATTGCTT:CAGTTCATT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.33333333333339 10 29.083333333333346 0.193179203235308 0.459993680357088 0.419960559208867 -0.26681447712178 0.0658113688487499 0.184121274244104 0.268232138534195 0.117428035195711 0.179918364566374 0.138080993367992 25 0 975 0.975 0.025 0.05 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 TTCATTTGC:TTGCTTTGC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.833333333333333 0.75 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.33333333333339 10 29.75000000000001 0.17906358673515 0.445899039781238 0.401578767298985 -0.266835453046087 0.063976590445889 0.173048539847834 0.280892585190703 0.152816799300326 0.172140596861547 0.121117078525737 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT:CTTTGCAAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 76.00000000000004 9 29.41666666666668 0.177291583548173 0.393100353726364 0.451008455900767 -0.215808770178191 0.0637296678775169 0.15230008341028 0.294140483615614 0.125199566412369 0.151261473582436 0.153658710973901 59 0 941 0.941 0.059 0.118 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATG 2 TGCAATGTG:TGCAATTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.83333333333337 9 30.083333333333346 0.177731272847004 0.381735453594316 0.465587545441575 -0.204004180747312 0.0617019743219594 0.156164855011659 0.282818089247826 0.099713560734152 0.162334133007573 0.208864796765965 61 0 939 0.939 0.061 0.122 ORF3a all ss13 83 GTG ATG TAC 2 AATGTGCTT:AATTTACTG 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.83333333333337 9 30.083333333333346 0.177731272847004 0.381735453594316 0.465587545441575 -0.204004180747312 0.0628273603029307 0.141168286304734 0.343943130688937 0.175839783049071 0.157043447613175 0.193933566160144 68 0 932 0.932 0.068 0.136 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 GTGCTTCTT:TTACTGCTG 1:1 FALSE 1.25 1 0.25 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.00000000000004 9 30.25000000000001 0.160807403509091 0.378998328336262 0.424295812108218 -0.218190924827171 0.0595044755549247 0.144375798397283 0.235984473174707 0.0721798756732402 0.152057572428132 0.151309009251505 43 0 957 0.957 0.043 0.086 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA:CTTCTTATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.333333333333333 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.41666666666671 9 31.00000000000001 0.159830135220283 0.367161168989029 0.435313286697426 -0.207331033768746 0.0609278846490419 0.148173270268644 0.308427067229823 0.158127348869081 0.137220850781651 0.130806409587962 25 0 975 0.975 0.025 0.05 ORF3a all ss13 86 ATT TGC TAT 2 CTGCTATTT:CTTATTGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.75 0.333333333333333 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.66666666666671 9 31.00000000000001 0.159249476407495 0.367161168989029 0.43373180460773 -0.207911692581534 0.0613592217212772 0.150615264023653 0.241592568107914 0.072605475360376 0.146961505530855 0.157145994665794 42 0 958 0.958 0.042 0.084 ORF3a all ss13 87 GCT TAT CTT 2 ATTGCTTTG:CTATTTGTT 1:1 TRUE 1.41666666666667 0.75 0.833333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.41666666666671 9 31.91666666666668 0.159830135220283 0.353678577936851 0.451907876786421 -0.193848442716568 0.0613099046214792 0.144248099131975 0.271774760348923 0.0963518833351225 0.142531882482263 0.173818639900419 51 0 949 0.949 0.051 0.102 ORF3a all ss13 88 GTT CTT TGA 2 GCTTTGACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.33333333333337 9 31.41666666666668 0.126467034326845 0.360905050411732 0.350416360709186 -0.234438016084888 0.049372554973243 0.14192278388919 0.175051355380704 0.0453071325854308 0.133654808752999 0.0794209160610312 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 89 ACA TGA CAG 2 GTTACCATC:TTGACAGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.50000000000004 8 31.41666666666668 0.126170845288571 0.311094218237477 0.405571167485528 -0.184923372948906 0.0513364895419785 0.124052306007506 0.279123216960327 0.146218647933889 0.122633181760193 0.131570107593944 27 0 973 0.973 0.027 0.054 ORF3a all ss13 90 ATC CAG TCT 2 ACAGTTTAC:ACCATCTAT 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.16666666666671 8 31.083333333333346 0.124999865819317 0.315240156824316 0.396522660940621 -0.190240291005 0.048199238138113 0.131209388992965 0.226584350994552 0.0801182781632768 0.124132527598698 0.125384810956465 22 0 978 0.978 0.022 0.044 ORF3a all ss13 91 TAC TCT ACT 2 ATCTATTCA:GTTTACTCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.83333333333337 7 31.41666666666668 0.125582619575832 0.264386521096341 0.474996301078714 -0.13880390152051 0.0497650323052636 0.103859050176577 0.295493429889911 0.10795169295797 0.106446295105121 0.19224020418944 66 0 934 0.934 0.066 0.132 ORF3a all ss13 92 TCA ACT CAC 2 TACTCGCAC:TATTCACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.16666666666671 7 31.083333333333346 0.124999865819317 0.267793509240841 0.466777055850511 -0.142793643421525 0.0484905625585363 0.114013204887005 0.335989458471207 0.164753394224057 0.109075757450002 0.190492501293536 69 1 930 0.93 0.069 0.138 ORF3a all ss13 93 CAC CAC ACT 2 TCACATCTT:TCGCACTTA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.66666666666671 7 30.25000000000001 0.122443179667292 0.2767124213498 0.442492530946085 -0.154269241682508 0.0492675317228837 0.119664851895424 0.270796724902454 0.102250567739306 0.114821506233202 0.179091673174444 44 0 956 0.956 0.044 0.088 ORF3a all ss13 94 CTT ACT TAC 2 CACTTACTG:CATCTTTTG 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 1 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.16666666666671 8 30.083333333333346 0.123283681565969 0.328379628575385 0.375430358152277 -0.205095947009416 0.0469898035014601 0.137324666954163 0.251311568758717 0.135205913456578 0.133053738409755 0.123206824217983 25 0 975 0.975 0.025 0.05 ORF3a all ss13 95 CTG TAC TGC 2 CTTTTGCTT:TTACTGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.66666666666671 8 30.083333333333346 0.107808568999606 0.328379628575385 0.328304680370442 -0.220571059575779 0.044550286288014 0.140536522957172 NaN NaN 0.132203628861641 0.0952325591407911 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 96 CTT TGC TTG 2 CTGCTTGTT:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.00000000000004 8 31.083333333333346 0.108787621497542 0.315240156824316 0.345094427668902 -0.206452535326774 0.043474182741213 0.131140406676725 0.200067111939268 0.0845466971749366 0.124383534722121 0.0969534894130536 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TCG 2 CTTGTCGCT:CTTGTTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.16666666666671 8 31.416666666666682 0.108541192153805 0.311094218237477 0.348901348179183 -0.202553026083672 0.0446884046291375 0.131595075594485 0.222620468048763 0.117056876600698 0.119687705378492 0.0905799954336765 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 98 GCT TCG CTG 2 GTCGCTGCA:GTTGCTGCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.33333333333337 8 31.250000000000014 0.10829587866142 0.313153267006825 0.345823882651877 -0.204857388345405 0.0443027313220088 0.129658945907111 NaN NaN 0.125786769782771 0.103395947476856 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGG:GCTGCAGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.50000000000004 8 30.583333333333346 0.106609300297826 0.321673722092295 0.331420607205328 -0.215064421794468 0.0444880544816635 0.128456447156174 0.203447354410793 0.103307954894322 0.127393719079519 0.0913753358571931 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 100 GGG CAG GGC 2 GCAGGGCTT:GCAGGTATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.50000000000004 8 30.583333333333346 0.105204990412841 0.321673722092295 0.327054972748616 -0.216468731679453 0.0428670741954957 0.136176211316505 0.198187201292336 0.0988953795237757 0.124930530623692 0.0831467252338942 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 101 ATG GGC TGG 2 GGGCTTGAA:GGTATGGAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.50000000000004 8 31.250000000000014 0.105204990412841 0.313153267006825 0.335953673478835 -0.207948276593984 0.045864353435621 0.128237661448225 0.196061549935179 0.0866185236258167 0.123495662459094 0.0922104964600711 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 102 GAA TGG AAG 2 ATGGAGGCG:CTTGAAGCA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.33333333333339 7 30.91666666666668 0.105436462965892 0.269530500680923 0.391185645778584 -0.164094037715031 0.0438381662190282 0.115619121532586 0.242760708441498 0.107091633925688 0.110923343453574 0.139047784403531 30 0 970 0.97 0.03 0.06 ORF3a all ss13 103 GCA AAG CAC 2 GAAGCACCT:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.08333333333339 7 31.16666666666668 0.105785591121623 0.266933470240076 0.396299463782048 -0.161147879118453 0.0457705230354144 0.121225596350883 0.252429026619773 0.116428114151813 0.104908944757303 0.124520286634463 36 0 964 0.964 0.036 0.072 ORF3a all ss13 104 CAA CAC AAT 2 GCACCTTTC:GCGCAATTT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.91666666666671 7 31.66666666666668 0.120391329950725 0.261888204157181 0.459705049863446 -0.141496874206456 0.0477730699288833 0.114674651106706 NaN NaN 0.108136001570725 0.190700902856608 62 0 938 0.938 0.062 0.124 ORF3a all ss13 105 TTC AAT TCC 2 CAATTTTTG:CCTTTCCTT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.58333333333337 8 32.000000000000014 0.106490841739566 0.304098831081123 0.350184975591564 -0.197607989341557 0.0423644547263627 0.12460691641742799 0.215334271193247 0.103898836740096 0.118029420816908 0.0940860845579998 23 0 977 0.977 0.023 0.046 ORF3a all ss13 106 CTT TCC TGT 2 TTCCTTTAT:TTTTTGTAC 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.5 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.25000000000004 8 31.333333333333343 0.105552582259344 0.312120297918684 0.338179166696951 -0.20656771565934 0.0428705291000929 0.129480846166732 0.207412569883073 0.103003021478627 0.121762288055349 0.0897943475949223 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACC 2 CTTTATCTA:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.58333333333337 7 31.833333333333343 0.106490841739566 0.26024898720615 0.409188304180457 -0.153758145466584 0.0433745540342119 0.109198495666669 0.236162865499547 0.0831573578639892 0.104306803345692 0.14045599344069 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 108 CTA ACC TAC 2 TACCTCTAT:TATCTACTT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.666666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.66666666666671 7 32.25000000000001 0.106372646579413 0.256240196522408 0.415128648912471 -0.149867549942995 0.0446230885603458 0.115448884703932 NaN NaN 0.105153085565635 0.154090128519167 37 0 963 0.963 0.037 0.074 ORF3a all ss13 109 CTT TAC ATG 2 CTACTTGCT:CTCTATGCC 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.83333333333337 7 32.58333333333334 0.106137042941326 0.253121833623 0.419312081546497 -0.146984790681674 0.0443845039197918 0.112094068092834 0.277412283095443 0.130657974007642 0.0964309276967593 0.127446403833235 39 0 961 0.961 0.039 0.078 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 CTTGCTTTG:TATGCCTTG 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.33333333333337 6 32.08333333333334 0.0914173632067776 0.215112484631514 0.424974698067269 -0.123695121424736 0.0410031656286506 0.101157128435893 NaN NaN 0.0938642825265783 0.187567861429874 66 0 934 0.934 0.066 0.132 ORF3a all ss13 111 TTG CCT TGA 2 GCCTTGATA:GCTTTGATT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.83333333333337 6 32.58333333333334 0.0920189790070996 0.211299152734159 0.435491471765961 -0.11928017372706 0.0412267470900227 0.0968514553850726 NaN NaN 0.0869562620427161 0.170148721873804 62 0 938 0.938 0.062 0.124 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 TTGATATAT:TTGATTTAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.6666666666667 6 32.75000000000001 0.0898508998594654 0.210058104799921 0.4277430758744 -0.120207204940456 0.0417317353744053 0.091805603256984 NaN NaN 0.092850017529626 0.195444973792299 59 0 941 0.941 0.059 0.118 ORF3a all ss13 113 TAC TAT ACT 2 ATATATTTT:ATTTACTTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 83.1666666666667 6 33.583333333333336 0.0892772442797873 0.204066610769614 0.437490699449009 -0.114789366489827 0.0386730163453524 0.0920008115645244 0.304145557120834 0.150313385576062 0.0877023382739353 0.190584544130858 50 0 950 0.95 0.05 0.1 ORF3a all ss13 114 TTC ACT TCT 2 TACTTCTTA:TATTTTCTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.66666666666671 7 34.08333333333334 0.0898508998594654 0.239987262930077 0.374398619170238 -0.150136363070611 0.0390631261648233 0.0944227686467898 NaN NaN 0.0987528062947554 0.128429306571838 44 0 956 0.956 0.044 0.088 ORF3a all ss13 115 CTA TCT TAC 2 TTCTTACAG:TTTCTACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.16666666666671 7 33.91666666666668 0.0904319842103249 0.241378371827081 0.374648248415184 -0.150946387616756 0.0394739577516634 0.102366865773301 NaN NaN 0.0994408141289042 0.129026487122157 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAT 2 CTACAATGC:TTACAGTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.83333333333337 8 33.91666666666668 0.089658862987337 0.283201052715922 0.31659085348554 -0.193542189728585 0.0392488311918079 0.113722648697802 0.249592520038672 0.204644128875914 0.121047758330278 0.109844790444881 21 0 979 0.979 0.021 0.042 ORF3a all ss13 117 TGC AAT GCA 2 CAATGCATC:CAGTGCGTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.1666666666667 8 34.91666666666668 0.090431984210325 0.273410739562984 0.33075505503138 -0.182978755352659 0.0386708155633542 0.109736128732766 0.209330517357565 0.11409282269095 0.10504506316032 0.0815246780374822 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TCA 2 TGCATCAAC:TGCGTTGTA 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.6666666666667 8 35.41666666666668 0.0910206427532005 0.268767772591288 0.338659065689452 -0.177747129838087 0.0402702183425446 0.106178965164642 NaN NaN 0.106934108085479 0.096470326959326 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA:GTTGTATTT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 2 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.1666666666667 7 34.91666666666667 0.090431984210325 0.233267379251205 0.387675227031804 -0.14283539504088 0.0401223264975735 0.102110542581047 NaN NaN 0.0979164494314434 0.144634563144614 49 0 951 0.951 0.049 0.098 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:GTATTTGGC 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.75 1.16666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.33333333333336 7 35.41666666666668 0.0641416300786215 0.229414483788198 0.279588407059072 -0.165272853709576 0.0303793511287863 0.0957401989783737 NaN NaN 0.100506815023649 0.100094740732865 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 121 GGC CAT GCA 2 GCATGTAGA:TTTGGCAGG 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.75 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.25000000000003 6 35.25000000000001 0.0509209303034166 0.193059006111768 0.263758377964179 -0.142138075808352 0.0257538097087523 0.0878544048124021 NaN NaN 0.0991146554224953 0.151550209679928 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 122 AGA GCA GAA 2 GGCAGGCTT:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.66666666666669 6 35.91666666666667 0.0513020451633004 0.188983168709011 0.27146356743702 -0.137681123545711 0.026607767384417 0.0887359142663671 NaN NaN 0.0933204398521711 0.140116130567443 44 0 956 0.956 0.044 0.088 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATT:AGGCTTCTT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.66666666666669 6 35.66666666666667 0.0513020451633004 0.190491169998981 0.269314557538676 -0.139189124835681 0.0268696580649626 0.0930891917962998 NaN NaN 0.0932779894894192 0.135647540197495 45 0 955 0.955 0.045 0.09 ORF3a all ss13 124 ATT TTA TTA 2 ATTATTATG:CTTCTTGTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.16666666666669 6 35.83333333333334 0.0379028017472667 0.189483161783181 0.200032559044152 -0.151580360035914 0.0226644135969748 0.0857863106121995 NaN NaN 0.0946882490361109 0.109413242613279 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 125 ATG TTA TCA 2 ATTATGAGA:CTTGTCAGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.33333333333336 6 35.66666666666667 0.0250023152006939 0.190491169998981 0.131251832832081 -0.165488854798287 0.017906966452225 0.0847709901804928 0.230313546564523 0.568756885085658 0.0928247879597111 0.0746174223190024 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 126 AGA TCA GAT 2 ATGAGATGT:GTCAGATGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.83333333333336 6 36.33333333333334 0.0251595918684029 0.18652246930412 0.134887726729485 -0.161362877435717 0.0184610698568497 0.0797627598298123 NaN NaN 0.0865284020805398 0.0622018057696358 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 127 TGC GAT GCT 2 AGATGCTGG:AGATGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.16666666666669 6 36.83333333333334 0.0383879094086674 0.18365333026498 0.209023758802959 -0.145265420856313 0.0225457237559743 0.0823609552435282 0.287134346834494 0.466635003150946 0.0919609957082854 0.114188950666315 23 0 977 0.977 0.023 0.046 ORF3a all ss13 128 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCTG:TGTTGGCTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.50000000000001 6 37.16666666666667 0.0520816565415757 0.181789348152453 0.286494544762318 -0.129707691610878 0.0272573418648432 0.0838750213159379 NaN NaN 0.0850376820733307 0.127185122912623 39 0 961 0.961 0.039 0.078 ORF3a all ss13 129 CTG GGC TGT 2 TGGCTGTGC:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.16666666666669 6 36.50000000000001 0.0523087754921291 0.185556129985381 0.281902707801948 -0.133247354493252 0.026592466665682 0.0852480573352588 NaN NaN 0.0885049150677693 0.132186274372669 38 0 962 0.962 0.038 0.076 ORF3a all ss13 130 TGC TGT GCT 2 CTGTGCTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.08333333333333 0.5 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.91666666666669 6 36.41666666666667 0.0791072878500077 0.186038038359055 0.425221038384258 -0.106930750509047 0.0382163230871979 0.0833066756531966 NaN NaN 0.0960310876249592 0.26549314740774 117 0 883 0.883 0.117 0.234 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAA:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.33333333333336 6 36.33333333333334 0.0938723572155045 0.18652246930412 0.503276401849731 -0.0926501120886158 0.041816435553505 0.088851758321613 NaN NaN 0.0978160174776577 0.343543227985161 129 0 871 0.871 0.129 0.258 ORF3a all ss13 132 AAA GGA AAT 2 TGGAAATGC:TGGAAGTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.66666666666669 6 36.33333333333334 0.109283858386045 0.18652246930412 0.585901842248617 -0.0772386109180751 0.0442882931880386 0.083837515443885 0.701449911519014 0.403564280446721 0.0971726050191758 0.426694979772038 227 0 773 0.773 0.227 0.454 ORF3a all ss13 133 TGC AAT GCA 2 AAATGCAAA:AAGTGCAAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.41666666666669 6 35.58333333333334 0.122861989946783 0.190999228388671 0.643259090538138 -0.0681372384418884 0.0465803086146854 0.0911102765831734 NaN NaN 0.0999840754171564 0.495567243659552 267 0 733 0.733 0.267 0.534 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCA:TGCAAATCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.58333333333334 6 35.58333333333334 0.122582464773988 0.190999228388671 0.641795602045787 -0.0684167636146832 0.0464114638026129 0.0877665388220182 NaN NaN 0.101833471647419 0.501679533604048 240 0 760 0.76 0.24 0.48 ORF3a all ss13 135 TCA AAT CAA 2 AAATCAAAG:AAATCCAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.91666666666667 6 35.58333333333334 0.123708284429487 0.190999228388671 0.647689969604217 -0.0672909439591838 0.0450445420377208 0.0855214087529188 NaN NaN 0.105806100840043 0.524787117255778 264 1 735 0.735 0.264 0.528 ORF3a all ss13 136 AAG CAA AGA 2 TCAAAGAAT:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.91666666666667 6 36.25000000000001 0.123708284429487 0.187009442781175 0.66150822434267 -0.063301158351688 0.0470451911311912 0.0850208114183633 NaN NaN 0.100893014780834 0.530391346143826 265 0 735 0.735 0.265 0.53 ORF3a all ss13 137 AAC AGA ACC 2 AAGAACCCA:AAGAATCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.33333333333334 6 35.66666666666667 0.123002232202702 0.190491169998981 0.645710938745141 -0.0674889377962788 0.0449067046033545 0.0857563281456552 NaN NaN 0.104555159717052 0.518612003111176 244 0 756 0.756 0.244 0.488 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA:AATCCATTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.66666666666667 6 35.66666666666667 0.12413582885818 0.190491169998981 0.651661853191641 -0.0663553411408011 0.0479177072715996 0.0846032006592519 NaN NaN 0.105467187614205 0.529246762328505 234 0 766 0.766 0.234 0.468 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAA 2 CCATTAATT:CCATTACTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.5 6 35.83333333333334 0.124422507844916 0.189483161783181 0.656641501408385 -0.065060653938265 0.0486583700748658 0.08313081750061 0.842415065209676 0.435699945819623 0.0990393311663979 0.511234068309172 250 0 750 0.75 0.25 0.5 ORF3a all ss13 140 ATT TAA TTT 2 TTAATTTAT:TTACTTTAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.16666666666667 6 36.83333333333334 0.126764620575651 0.18365333026498 0.690238616379848 -0.056888709689329 0.0482308569942182 0.0815530903589056 NaN NaN 0.0981791068108423 0.562293639596722 284 0 716 0.716 0.284 0.568 ORF3a all ss13 141 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAC:CTTTATGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 77.25 6 36.83333333333334 0.142100073148949 0.18365333026498 0.773740791653074 -0.0415532571160311 0.0542109012961254 0.0817969323198058 0.962152340809341 0.421294754721444 0.100544992277326 0.679401315828758 346 1 653 0.653 0.346 0.692 ORF3a all ss13 142 GAC ATG ACT 2 TATGACTCA:TATGATGCC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 77.08333333333334 6 37.66666666666668 0.142438427764417 0.17906358673515 0.79546283173192 -0.0366251589707334 0.0495958233899433 0.0806922627421559 NaN NaN 0.104385026141826 0.725688862767285 378 0 622 0.622 0.378 0.756 ORF3a all ss13 143 GCC ACT CAA 2 GACTCAAAC:GATGCCAAC 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.66666666666667 7 38.08333333333334 0.159249476407496 0.210854230397134 0.75525862633895 -0.051604753989638 0.0559562796435479 0.0879136364001958 NaN NaN 0.101982177437039 0.612844450484584 304 0 696 0.696 0.304 0.608 ORF3a all ss13 144 AAC CAA ACT 2 GCCAACTAC:TCAAACTAT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.5 6 37.91666666666668 0.173430571160122 0.177731272847004 0.975802223109132 -0.00430070168688174 0.0573549494003571 0.0786965284533648 NaN NaN 0.101497942070171 0.966201906483294 502 0 498 0.498 0.502 0.996 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT:AACTATTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.16666666666667 7 38.250000000000014 0.190803499198466 0.209794072585264 0.909479933571146 -0.018990573386798 0.05653426479203 0.0863339574607901 0.66617203224532 0.172179880696335 0.105914593929358 0.857701504166706 440 1 559 0.559 0.44 0.88 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT:TATTTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.16666666666667 7 38.250000000000014 0.190803499198466 0.209794072585264 0.909479933571146 -0.018990573386798 0.0589422964444227 0.0873497751354171 0.80517026897833 0.258665964957424 0.105136619704772 0.856659904747014 443 1 556 0.556 0.443 0.886 ORF3a all ss13 147 GTT TTG TTT 2 TTTGTTTGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.16666666666667 7 37.75000000000001 0.190803499198466 0.213007236149638 0.895760644790615 -0.0222037369511714 0.056567090227463 0.0897459869309183 0.68070854829494 0.188199587472625 0.106659669320991 0.83509335079794 389 0 611 0.611 0.389 0.778 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.16666666666666 7 38.75000000000001 0.193661500470681 0.206677011490545 0.937024873129351 -0.0130155110198635 0.0552606013922025 0.0885502096854367 0.738916859526327 0.204760113609014 0.101097887200211 0.89756206039223 462 0 538 0.538 0.462 0.924 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGCTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76 7 39.083333333333336 0.194146225437217 0.20465023999998 0.948673333768069 -0.0105040145627635 0.0610295697346854 0.083450768513096 NaN NaN 0.101354889692233 0.917458223756317 464 1 535 0.535 0.464 0.928 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.33333333333333 7 38.41666666666667 0.193179203235308 0.208744590595666 0.925433337860678 -0.0155653873603581 0.0564437283413464 0.0846822156280466 0.680461816781732 0.173827474464971 0.105098158024454 0.882261220117746 439 0 561 0.561 0.439 0.878 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACTCAC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 75.66666666666666 7 38.41666666666667 0.195123032668416 0.208744590595666 0.93474533692883 -0.0136215579272495 0.0594753995435699 0.0846324950833249 0.76076278448282 0.219186227199524 0.105071085329085 0.896850182360532 446 0 554 0.554 0.446 0.892 ORF3a all ss13 152 CAC CAC ACA 2 ACACATAAC:ACTCACACT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 75.99999999999999 7 38.083333333333336 0.211388364105741 0.210854230397134 1.00253318943424 5.34133708607221e-4 0.0586292287372325 0.0886917832234931 NaN NaN 0.104183540796762 0.995909380989872 497 0 503 0.503 0.497 0.994 ORF3a all ss13 153 AAC ACA ACT 2 CACACTCAT:CATAACTAT 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.833333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.16666666666666 8 38.25000000000001 0.232011723094212 0.245198876012612 0.946218542544535 -0.0131871529184001 0.064689207310995 0.0933541671689592 0.683605514542628 0.166309856307926 0.111571454827666 0.905913401478632 463 1 536 0.536 0.463 0.926 ORF3a all ss13 154 CAT ACT ATG 2 AACTATGAC:ACTCATGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.16666666666666 8 37.91666666666667 0.232011723094212 0.247752936040273 0.936464071031222 -0.0157412129460611 0.0650060039588242 0.0976206260212734 NaN NaN 0.112891682086892 0.889105287816127 440 0 560 0.56 0.44 0.88 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 CATGACTAT:TATGACTAC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.58333333333333 7 37.75000000000001 0.267388088416834 0.213007236149638 1.25530049236916 0.0543808522671958 0.0762222511202426 0.0921819012738552 NaN NaN 0.11030142915283 0.621998188860086 693 0 307 0.307 0.693 0.614 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT:GACTATTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 74.74999999999999 7 37.91666666666667 0.270978159241796 0.211925228838758 1.27864983667409 0.0590529304030382 0.074610971829809 0.0940801824719861 0.941729907646265 0.17453761406366 0.110956612629525 0.594576116403546 693 0 307 0.307 0.693 0.614 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA:TATTGTATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.74999999999999 8 37.91666666666667 0.290428195761674 0.247752936040273 1.17224925929622 0.0426752597214017 0.0806999621054191 0.100256379057245 0.680166013720092 0.0848026254451619 0.117745300477551 0.717025454600055 650 0 350 0.35 0.65 0.7 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA:TGTATTCCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.24999999999999 8 37.91666666666667 0.292820423057718 0.247752936040273 1.18190495635587 0.0450674870174453 0.0811943840778911 0.0943498970546642 0.834900225557601 0.156885564695657 0.117651651205847 0.701676250687162 637 0 363 0.363 0.637 0.726 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT:ATTCCTTAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 73.74999999999999 8 38.08333333333334 0.295252898711496 0.246469230096624 1.19793005640398 0.048783668614871 0.0790937985894142 0.0976020767266546 NaN NaN 0.121937099751466 0.68910318920685 665 0 335 0.335 0.665 0.67 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATATAAC:CCTTACAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.08333333333333 8 38.41666666666668 0.293626725734023 0.243941664762153 1.20367599368608 0.0496850609718694 0.0786065384735498 0.0977979389552601 0.73915110273629 0.103427960664544 0.118697440044042 0.675518881037026 650 0 350 0.35 0.65 0.7 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAATAGC:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.41666666666667 8 38.08333333333334 0.292018592134243 0.246469230096624 1.18480749917449 0.0455493620376186 0.079866467595691 0.0955495698682171 0.762231593120575 0.120090687418035 0.120198138470917 0.704723279453436 625 0 375 0.375 0.625 0.75 ORF3a all ss13 162 AGC ACA GCA 2 AACAGTGTC:AATAGCATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.25 8 37.58333333333334 0.292820423057718 0.250361262210016 1.16959157528166 0.0424591608477017 0.0789246390905983 0.0997587746463788 NaN NaN 0.117567814998274 0.717990213732122 649 0 351 0.351 0.649 0.702 ORF3a all ss13 163 ATT GCA TCA 2 AGCATTACA:AGTGTCACA 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 73.58333333333334 8 37.58333333333334 0.296072846293748 0.250361262210016 1.18258249571128 0.0457115840837314 0.0794495018702078 0.096701371836249 0.78569034318772 0.132285295575644 0.122153238349573 0.708244304161003 649 0 351 0.351 0.649 0.702 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAA 2 ATTACAAAC:GTCACAGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.41666666666669 7 37.41666666666667 0.292018592134243 0.215204968042419 1.35693239236319 0.0768136240918237 0.0783109568657009 0.0907511991583109 NaN NaN 0.112119202787387 0.493276552913564 765 1 234 0.234 0.765 0.468 ORF3a all ss13 165 AAC CAA ACA 2 ACAAACACT:ACAGATACA 1:1 TRUE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.41666666666669 7 37.41666666666667 0.292018592134243 0.215204968042419 1.35693239236319 0.0768136240918237 0.0792386857226507 0.0945386698627852 1.17994278551164 0.250144503416482 0.110105479392301 0.485404419457049 759 0 241 0.241 0.759 0.482 ORF3a all ss13 166 ACA ACA CAA 2 AACACTATC:GATACAATT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.25000000000003 6 37.583333333333336 0.292820423057718 0.179512162520447 1.63120102251771 0.113308260537271 0.0850537380302029 0.0797963003379964 1.4000652210222 0.243982843479827 0.0993452360996609 0.254057018536428 875 1 124 0.124 0.875 0.248 ORF3a all ss13 167 ATC CAA TCG 2 ACAATTGTC:ACTATCGTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.58333333333336 6 37.25000000000001 0.291221195411518 0.181329278360777 1.60603515352935 0.109891917050741 0.079286633858875 0.0806303548995357 NaN NaN 0.0947217527745572 0.245985696219934 871 0 129 0.129 0.871 0.258 ORF3a all ss13 168 GTC TCG TCC 2 ATCGTCCTC:ATTGTCGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 73.91666666666669 6 37.41666666666667 0.294437538145597 0.180416123106718 1.6319912714865 0.114021415038879 0.0796225557204517 0.0780583365092625 NaN NaN 0.0957117806206448 0.233535953695547 884 0 116 0.116 0.884 0.232 ORF3a all ss13 169 CTC TCC TCA 2 GTCCTCACT:GTCGTTACT 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.50000000000003 6 37.50000000000001 0.29161934182815 0.179963002222943 1.62044052514129 0.111656339605206 0.0814192236028263 0.0818504419399911 NaN NaN 0.101727101120937 0.272376300974403 859 0 141 0.141 0.859 0.282 ORF3a all ss13 170 ACT TCA CTG 2 CTCACTGCA:GTTACTGAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 75.33333333333336 5 36.833333333333336 0.287686797643992 0.149749252688945 1.92112342785153 0.137937544955047 0.0796472743473153 0.0741809355172407 NaN NaN 0.0930769188796306 0.138347295616338 929 0 71 0.071 0.929 0.142 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTGCAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 19 75.83333333333336 5 36.333333333333336 0.304923460081186 0.152033634372753 2.00563159158309 0.152889825708433 0.0809584129424848 0.0734854896557205 NaN NaN 0.0955088105578339 0.109422796964868 947 0 53 0.053 0.947 0.106 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:GCAGGTGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 75.50000000000003 5 36.333333333333336 0.286913136438966 0.152033634372753 1.88716883354586 0.134879502066213 0.0770331444146118 0.0718275116018794 NaN NaN 0.0883213673941819 0.126725050799362 953 0 47 0.047 0.953 0.094 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGATGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 76.16666666666669 5 36.333333333333336 0.283860150265539 0.152033634372753 1.8670878416915 0.131826515892786 0.0782632197967091 0.0738251466577104 NaN NaN 0.0908887954592272 0.146942692891676 934 0 66 0.066 0.934 0.132 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT:GATGGTGTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 75.16666666666669 5 36.666666666666664 0.288464693936611 0.150503021596613 1.91667044871544 0.137961672339997 0.0793003457941148 0.0767033163774124 NaN NaN 0.0945972141372895 0.144727131262236 926 0 74 0.074 0.926 0.148 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TCA 2 GGCATTTCA:GGTGTCACT 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.66666666666669 5 37.166666666666664 0.290824148256573 0.148264213964023 1.96152625425271 0.142559934292549 0.0808363649810851 0.069784610298284 NaN NaN 0.0918806184268729 0.120763261538803 945 0 55 0.055 0.945 0.11 ORF3a all ss13 176 ACT TCA CAA 2 ATTTCAACA:GTCACTATT 1:1 TRUE 1 1 1 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.41666666666669 4 37.49999999999999 0.292018592134243 0.115057659974651 2.53801956513438 0.176960932159592 0.0810101930723078 0.0644197570223181 NaN NaN 0.0821466564060558 0.0312239136243719 991 0 9 0.009 0.991 0.018 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 ACTATTCCC:TCAACACCA 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 75.66666666666669 5 36.916666666666664 0.286143675421617 0.149375201835214 1.91560360693124 0.136768473586403 0.0745083661589075 0.0754897508601432 NaN NaN 0.0838900587936719 0.103031785371913 950 0 50 0.05 0.95 0.1 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA:ATTCCCATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.33333333333336 5 36.74999999999999 0.264238228927332 0.150125187835474 1.76011922274441 0.114113041091859 0.0731706132515728 0.077691806885499 NaN NaN 0.0812160801678799 0.160004991442884 929 0 71 0.071 0.929 0.142 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC:CCCATTCGG 1:1 TRUE 1.75 0.5 0.75 0 2 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.25000000000001 5 36.83333333333333 0.264584505778426 0.149749252688945 1.76685025819804 0.114835253089481 0.0699142426408082 0.0742314248449369 NaN NaN 0.0795726695802773 0.148978380266885 923 0 77 0.077 0.923 0.154 ORF3a all ss13 180 CGG AAC GGA 2 AAACTCAAA:ATTCGGACA 1:1 FALSE 1.5 1.16666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.50000000000001 5 37.08333333333333 0.230812226626943 0.148632696437812 1.55290344694456 0.082179530189131 0.0639202402347371 0.0737756105037292 NaN NaN 0.0714263402143941 0.249917675476937 885 1 114 0.114 0.885 0.228 ORF3a all ss13 181 AAA GGA AAG 2 CGGACACAA:CTCAAAGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.33333333333334 5 37.08333333333333 0.210322806792345 0.148632696437812 1.4150507380477 0.0616901103545339 0.0593536569576403 0.0715164041796594 NaN NaN 0.0691321727521907 0.372205238092802 836 0 164 0.164 0.836 0.328 ORF3a all ss13 182 CAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC:ACACAAGAC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.33333333333334 5 37.08333333333333 0.193179203235308 0.148632696437812 1.29970866347119 0.0445465067974963 0.0571132823698771 0.0732833017181772 NaN NaN 0.0683009044810193 0.514265956395529 779 0 221 0.221 0.779 0.442 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 CAAGACTAC:GAAGACTAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.08333333333334 6 37.83333333333333 0.179737298307158 0.178173158730486 1.00877876099754 0.00156413957667209 0.0570667619601733 0.0802144756629983 NaN NaN 0.0728837112274744 0.982878108054242 498 0 502 0.502 0.498 0.996 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 73.91666666666669 6 38.666666666666664 0.182949852558591 0.173851210542993 1.05233579902711 0.00909864201559726 0.0550427871966154 0.0790280464376331 NaN NaN 0.0741628810254087 0.902356873864961 542 0 458 0.458 0.542 0.916 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.58333333333336 7 38.333333333333336 0.181100119848143 0.2092680072815 0.865398023332508 -0.028167887433357 0.0596781434777411 0.0890636875033436 0.622257667168996 0.164304578112895 0.0877534002586564 0.74821862987158 357 2 641 0.641 0.357 0.714 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.58333333333336 7 38.333333333333336 0.181100119848143 0.2092680072815 0.865398023332508 -0.028167887433357 0.0575909252950861 0.0883355457141722 NaN NaN 0.0874929132545695 0.747494521882738 388 0 612 0.612 0.388 0.776 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 74.58333333333336 7 38.166666666666664 0.21604093597738 0.210322806792346 1.02718739480631 0.00571812918503459 0.0636526361152448 0.090639289676425 0.720575614863326 0.154009971817962 0.0933609513318877 0.951162064345263 510 0 490 0.49 0.51 0.98 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAC:GGTGGTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 74.91666666666669 7 38.166666666666664 0.232919624976835 0.210322806792346 1.10743874394373 0.0225968181844892 0.0701771886361789 0.0896967903048449 0.873193112941067 0.204703952752307 0.0972468961536807 0.816254186266706 556 0 444 0.444 0.556 0.888 ORF3a all ss13 189 TAC GTT ACT 2 GGTTACTTC:GGTTATTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.33333333333336 7 37.416666666666664 0.245832397240244 0.215204968042419 1.14231748214933 0.0306274291978247 0.0719368053270856 0.0924026548079505 0.724983995624081 0.115107615635669 0.0972892745251339 0.752907536642458 622 0 378 0.378 0.622 0.756 ORF3a all ss13 190 TCT ACT CTG 2 TACTTCGAA:TATTCTGAG 1:1 TRUE 1.25 0.75 1 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 77.33333333333336 8 36.833333333333336 0.278672667324362 0.256437672127084 1.08670721042211 0.0222349951972787 0.0804481152586792 0.105671477829432 0.690054703692086 0.115299583924929 0.106393122316623 0.834456804046677 588 1 411 0.411 0.588 0.822 ORF3a all ss13 191 GAA CTG AAA 2 TCTGAGGAT:TTCGAAAAA 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 19 77.16666666666669 8 37.083333333333336 0.29845060643025 0.25437938121672 1.17324998984876 0.0440712252135302 0.0869869289318767 0.109138574401068 NaN NaN 0.109653507067628 0.687747684350766 647 1 352 0.352 0.647 0.704 ORF3a all ss13 192 AAA AAA AAT 2 GAAAAATGG:GAGGATAGG 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 19 75.66666666666669 8 35.916666666666664 0.305752635499859 0.264281463445784 1.15692047226226 0.0414711720540747 0.0911258283047394 0.113653156824194 0.72061255171233 0.108390825554401 0.118369776367395 0.726074011175319 675 0 325 0.325 0.675 0.65 ORF3a all ss13 193 AGG AAT GGC 2 AAATGGGAA:GATAGGCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.166666666666667 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.75000000000001 9 36.49999999999999 0.290428195761674 0.298979357278323 0.971398823000717 -0.00855116151664914 0.0879864261195822 0.134615084973183 NaN NaN 0.148297116537358 0.954017577249837 476 0 524 0.524 0.476 0.952 ORF3a all ss13 194 CAC GGC AAT 2 AGGCACTCA:TGGGAATCT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.41666666666669 9 36.83333333333333 0.292018592134243 0.29566229667922 0.987676127169741 -0.00364370454497703 0.0901721930716525 0.140460248786958 0.611856973636318 0.10647816913659 0.142262038835227 0.97956631444013 481 0 519 0.519 0.481 0.962 ORF3a all ss13 195 TCA AAT CAG 2 CACTCAGGT:GAATCTGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 74.25000000000001 8 36.33333333333333 0.27317936608966 0.260656845281595 1.04804217128668 0.0125225208080649 0.0851991623261172 0.121314519654083 NaN NaN 0.139134609725104 0.928284896367091 520 0 480 0.48 0.52 0.96 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT:TCTGGTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.41666666666669 8 35.83333333333333 0.268098391166812 0.265018643484554 1.01162087180647 0.00307974768225855 0.0863270094946755 0.127370902698176 0.776968820440011 0.192913100073109 0.136121667869478 0.981949431426181 513 0 487 0.487 0.513 0.974 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA:GGTGTTAAG 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.91666666666669 9 35.49999999999999 0.265978832161818 0.309399206498443 0.859662295750446 -0.043420374336625 0.0847648769764492 0.142403723903661 0.745482875649881 0.248844023023946 0.155102373177388 0.779518512367541 403 0 597 0.597 0.403 0.806 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAGGAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.25000000000001 9 34.833333333333336 0.260488747447952 0.316764994602515 0.82234070016108 -0.0562762471545621 0.0811699350483782 0.154416077752206 0.660697053833402 0.213258143820569 0.163110144837834 0.730079404283413 364 1 635 0.635 0.364 0.728 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT:AAGGACTAT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.25000000000001 9 35.166666666666664 0.264584505778426 0.313038150259031 0.845214890132367 -0.0484536444806047 0.0817246002482527 0.146505467087729 0.687960249619658 0.219228943493628 0.151053294853101 0.748383295237228 370 0 630 0.63 0.37 0.74 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATC 2 GACTATCTT:GACTATGTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.08333333333336 9 35.166666666666664 0.265279817755724 0.313038150259031 0.847436063419783 -0.0477583325033074 0.0785278975966739 0.146496711039042 NaN NaN 0.167162911502209 0.775108414756904 408 0 592 0.592 0.408 0.816 ORF3a all ss13 201 CTT ATC TCG 2 TATCTTACA:TATGTCGTT 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.75000000000003 9 35.166666666666664 0.262520489663413 0.313038150259031 0.838621393099159 -0.0505176605956185 0.0852290856022055 0.148964365708959 NaN NaN 0.156329538512133 0.746582758355255 391 0 609 0.609 0.391 0.782 ORF3a all ss13 202 ACA TCG CAC 2 CTTACACTT:GTCGTTGTA 1:1 TRUE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 1 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.25000000000003 9 35.666666666666664 0.24615039807976 0.307611718065443 0.800198378747694 -0.0614613199856827 0.0810576796612195 0.146467076768724 0.573664450864992 0.163049237680839 0.157000646860285 0.695448556700766 337 0 663 0.663 0.337 0.674 ORF3a all ss13 203 CTT CAC TAC 2 ACACTTATT:GTTGTACAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.08333333333336 8 35.833333333333336 0.22874291321268 0.265018643484554 0.863120081685922 -0.0362757302718734 0.0764295769690595 0.127434886097058 0.699474644440927 0.217219754673851 0.137434988835106 0.791819764714223 377 1 622 0.622 0.377 0.754 ORF3a all ss13 204 ATT TAC ATG 2 CTTATTGGT:GTACATGGC 1:1 TRUE 1.75 0.416666666666667 0.833333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 74.91666666666669 8 36 0.214927757699318 0.263548415128416 0.815515272951242 -0.0486206574290987 0.076647167339462 0.126078563800619 NaN NaN 0.135373464382339 0.719475818469625 347 1 652 0.652 0.347 0.694 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 ATTGGTCCT:CATGGCTAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.66666666666669 8 35.666666666666664 0.180871542612666 0.266505540694197 0.678678357461273 -0.0856339980815309 0.0666171216857547 0.123446099792165 0.535990680201029 0.205436840968228 0.136119994456863 0.529279216132584 216 0 784 0.784 0.216 0.432 ORF3a all ss13 206 CCT GCT ATT 2 GGCTATTTC:GGTCCTTTC 1:1 TRUE 1 1 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.16666666666669 8 36.166666666666664 0.18225176997286 0.262094574111018 0.695366436298912 -0.0798428041381584 0.0649955390535665 0.128062441935374 0.661263982972941 0.292996135235544 0.129444457496251 0.53735919756024 247 0 753 0.753 0.247 0.494 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 CCTTTCACT:TATTTCACC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.50000000000001 8 35.833333333333336 0.164427154593967 0.265018643484554 0.620436179251483 -0.100591488890586 0.0612191312935556 0.134188023609344 0.506677176960936 0.220756243439713 0.135293324877971 0.457174987329181 191 1 808 0.808 0.191 0.382 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA:TTCACTGAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.16666666666669 8 36.83333333333333 0.165253875289951 0.256437672127084 0.644421211279969 -0.091183796837133 0.0657064770434193 0.128833225904911 NaN NaN 0.138889392354753 0.511488987708124 193 0 807 0.807 0.193 0.386 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT:ACTGAAGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 73.33333333333336 8 35.66666666666666 0.167357663485657 0.266505540694197 0.627970672015756 -0.0991478772085396 0.0664389082704825 0.129901193180416 0.574491810719384 0.274354730429214 0.137014515802397 0.469292635478664 216 0 784 0.784 0.216 0.432 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC:GAAGTTTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 71.66666666666669 8 34.66666666666666 0.171730853718752 0.275793585093988 0.622678927286245 -0.104062731375236 0.06844102732549 0.132393597210549 NaN NaN 0.14213172554298 0.464072773968829 219 0 781 0.781 0.219 0.438 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC:GTTTATTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 70.00000000000001 8 34.33333333333333 0.176339806770694 0.27903683339124 0.631958887389774 -0.102697026620546 0.069002451618148 0.138612832867659 NaN NaN 0.143770540234733 0.475034254284693 202 0 798 0.798 0.202 0.404 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG:TATTACCAG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 68.33333333333334 8 33.99999999999999 0.181204210615459 0.282358178426184 0.641753008981217 -0.101153967810725 0.0714311357060773 0.138186413617424 0.74850407178691 0.391234474822928 0.146019353851123 0.488470493896781 218 0 782 0.782 0.218 0.436 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 68.33333333333334 8 33.99999999999999 0.181204210615459 0.282358178426184 0.641753008981217 -0.101153967810725 0.0744917049503087 0.13962861195998 NaN NaN 0.150130342999018 0.500454811875957 210 0 790 0.79 0.21 0.42 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAA:CAGCTTGAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 68.66666666666667 8 33.33333333333333 0.180209875167898 0.289246860608989 0.623031395357165 -0.109036985441091 0.0676188570538609 0.144754676967174 0.567844232283402 0.272559588882927 0.154571119786367 0.48055121105743 228 0 772 0.772 0.228 0.456 ORF3a all ss13 215 GAA TTG AAT 2 CTTGAATCT:CTTGAGTCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 69.00000000000001 8 32.99999999999999 0.179226444343955 0.292820423057718 0.612069480920829 -0.113593978713763 0.0696853889649212 0.15306769729194 NaN NaN 0.158961145251999 0.474854905936564 212 0 788 0.788 0.212 0.424 ORF3a all ss13 216 TCT AAT CTA 2 GAATCTACC:GAGTCTACA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 69.00000000000001 8 32.99999999999999 0.179226444343955 0.292820423057718 0.612069480920829 -0.113593978713763 0.0714315074504004 0.150875297881751 0.628262414275685 0.32994441515765 0.15558493502242501 0.465323492163698 196 0 804 0.804 0.196 0.392 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA:TCTACCCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 70.33333333333336 8 32.33333333333333 0.175398240794483 0.300242781455809 0.584188035908864 -0.124844540661326 0.0692086622930083 0.158406162332123 NaN NaN 0.164521580644436 0.447951967585376 189 0 811 0.811 0.189 0.378 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT:ACCCAGATT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 70.50000000000001 8 32.16666666666666 0.174931235415909 0.30215833840741 0.578938964047529 -0.127227102991502 0.0691258605392337 0.155738627367077 0.607090225740353 0.340271371551709 0.168527342395526 0.450288291083469 167 0 833 0.833 0.167 0.334 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT:CAGATTTCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 69.33333333333336 8 32.66666666666666 0.17825373890784 0.29648455248311 0.601224372112926 -0.11823081357527 0.0692934808770027 0.170453807023811 0.50120090299873 0.230307310078849 0.168536966024961 0.482983143245379 194 0 806 0.806 0.194 0.388 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CCA 2 ATTACTACA:ATTTCCACA 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 68.16666666666669 9 33.66666666666666 0.181705524684589 0.330549935209217 0.549706732114715 -0.148844410524628 0.0736095044212197 0.151755446639706 0.426180032338692 0.197104033390918 0.162635771873233 0.360086153754941 147 0 853 0.853 0.147 0.294 ORF3a all ss13 221 ACA CCA CAG 2 ACTACAGAC:TCCACAGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 67.33333333333334 9 34.49999999999999 0.165503521626615 0.320583011120205 0.516257929727158 -0.155079489493589 0.0694135880334773 0.146543353456283 0.498000855964137 0.299894000704864 0.157756033936324 0.325590878600281 126 0 874 0.874 0.126 0.252 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 67.00000000000001 9 34.83333333333332 0.16642540730596 0.316764994602515 0.525390779100433 -0.150339587296555 0.0705220096350495 0.156913820283813 NaN NaN 0.15765239437415 0.34027888376898 102 0 898 0.898 0.102 0.204 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 66.33333333333336 9 35.499999999999986 0.168300466878196 0.309399206498443 0.543958947997634 -0.141098739620247 0.0727254565570832 0.148306701231383 NaN NaN 0.155878912932876 0.365369134342338 148 0 852 0.852 0.148 0.296 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 66.66666666666669 9 35.16666666666666 0.167357663485657 0.313038150259031 0.534623857658158 -0.145680486773374 0.0723024731481091 0.143709994226002 0.468726399641948 0.25404127919218 0.153355548224053 0.34213638761527 138 0 862 0.862 0.138 0.276 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTA 2 GGTATTAAT:GGTATTGAA 1:1 FALSE 0.916666666666667 0.75 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 67.16666666666669 9 34.66666666666666 0.16596317904302 0.31866239547395 0.52081193576726 -0.15269921643093 0.0647987998386448 0.149072704966955 0.427345259007574 0.222952508485653 0.158383369054436 0.334990062790085 134 0 866 0.866 0.134 0.268 ORF3a all ss13 226 AAT TTA AAA 2 ATTAATAAT:ATTGAAAAT 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 67.58333333333336 10 34.16666666666666 0.164818808930133 0.37102218137708 0.444228990079228 -0.206203372446948 0.0682533295977841 0.169521434114384 0.320434696718621 0.165645439284201 0.181086615741535 0.254828203441707 62 0 938 0.938 0.062 0.124 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 AATAATGCG:GAAAATGCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCG ATG CGA 2 AATGCGACA:AATGCTACA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CGA CAT 2 GCGACATTC:GCTACATTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC:TTCTTCCTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT:TTCCTCTTC 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTC TCT TCT 2 ATCTTTAAC:CTCTTCTCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.666666666666667 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TCT ACA 2 TTCTCAAAG:TTTAACAAG 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGA 2 AACAAGCTT:TCAAAGAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 AAT AGA ATG 2 AAGAATGAT:AAGCTTGTT 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 2 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GAT ATG ATG 2 AATGATGAA:CTTGTTAAA 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA ATG AAA 2 GATGAAAGA:GTTAAAGAC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 AGA AAA ACC 2 AAAGACCCA:GAAAGAGAA 1:1 TRUE 2 0.583333333333333 0.416666666666667 0 2 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC AAC 1 AGAGAACAG:GACCCA--- 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.166666666666667 1.25 0.5 2 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- AAC AGG 1 CCA---CCG:GAACAGGAA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C AAA 1 ---CCGAAT:CAGGAAAGT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 2 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT AAA ATG 2 CCGAATGTG:GAAAGTGTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTC ATG TCC 2 AATGTGCAA:AGTGTCCAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TCC AAA 2 GTCCAAGTT:GTGCAAATA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC:CAAGTTCAC 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.833333333333333 0.333333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA:GTTCACACA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCA:GACGGCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCA GCT CAT 2 GGCTCATCA:GGCTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CAT CAG 2 TCATCAGGA:TCTTCAGGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAC 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAC CTA AC- 1 GCTAATCCA:GTAAAC--- 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 1.83333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 --- ATC CAG 1 AAC------:AATCCAGCA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 --- CAG CAA 1 ---------:CCAGCAATG 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 --- CAA TGG 1 ---------:GCAATGGAT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 --- TGG ATC 1 ------CCA:ATGGATCCA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA --C CAA 1 ---CCAATT:GATCCAATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAC:CCAATTTAT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAC TTT ACG 2 ATTTACGAT:ATTTATGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ACG ATG 2 TACGATGAG:TATGATGAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG:CCGACGCCG 1:1 FALSE 0.75 1 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT:ACGCCGACT 1:1 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT:CCGACTACT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTC 2 GTGCCTCTT:GTGCCTTTG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 CTT CTC TGT 2 CCTCTTTAA:CCTTTGTAA 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.66666666666669 1 31.74999999999998 0.01369901098297 0.0321765161581571 0.425745625027747 -0.0184775051751871 0.0139667173111392 0.0329347694354496 NA NA 0.0379290903903675 0.626145519163677 274 143 583 0.583 0.274 0.548 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.33333333333334 1 32.083333333333314 0.0137618540011474 0.0318350176854428 0.432286676801197 -0.0180731636842954 0.0137397035568047 0.0327592305258466 NA NA 0.0364472017337229 0.619984395739245 258 128 614 0.614 0.258 0.516 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666669 1 32.41666666666664 0.0138892858254281 0.0315006929809731 0.440920008769886 -0.017611407155545 0.0137040412962936 0.0345288910957194 NA NA 0.0359697939065173 0.624405248096668 280 120 600 0.6 0.28 0.56 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.83333333333334 1 32.24999999999998 0.0138572071256798 0.03166697281676 0.437591783902558 -0.0178097656910802 0.0141074258723959 0.035574202275713 NA NA 0.0374796048656672 0.63465474388155 294 119 587 0.587 0.294 0.588 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAA 2 ATGAGAATT:ATGAGATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666667 1 32.91666666666665 0.0137934922285677 0.0310121698640216 0.444776753418019 -0.017218677635454 0.0130445616806864 0.0322087696471474 NA NA 0.0353501795786106 0.626195381331414 276 141 583 0.583 0.276 0.552 ORF3a all ss13 7 ATT GAA TTT 2 AGAATTTTT:AGATTTTTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333333 1 33.24999999999998 0.0136678042173386 0.0306948207819131 0.445280469772033 -0.0170270165645745 0.0135091982744008 0.0306575102483451 NA NA 0.0363822219966986 0.639781903350761 288 125 587 0.587 0.288 0.576 ORF3a all ss13 8 TTT TTT TTA 2 ATTTTTACT:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333333 1 33.41666666666665 0 0.0305385697640887 0 -0.0305385697640887 0 0.0336694721153842 NA NA 0.0320942209245494 0.341336096827151 0 383 617 0.617 0 0.001 ORF3a all ss13 9 ACT TTA CTC 2 TTTACTCTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333333 1 33.083333333333314 0 0.0308526791703671 0 -0.0308526791703671 0 0.0320488000759189 NA NA 0.0325392623365242 0.343044062024044 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 10 CTT CTC TTA 2 ACTCTTAGA:ACTCTTGGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333333 1 34.08333333333331 0 0.0299291581301554 0 -0.0299291581301554 0 0.0325949051143364 NA NA 0.0315888722092298 0.343404989663802 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAT 2 CTTAGATCA:CTTGGATCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666666 1 33.74999999999998 0 0.0302307926160697 0 -0.0302307926160697 0 0.0316864274080158 NA NA 0.0323334027571958 0.349803265468904 0 383 617 0.617 0 0.001 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGATCAATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25 0 34.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 13 ATT CAA TTA 2 TCAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25 0 34.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 14 ACT TTA CTG 2 ATTACTGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 0 33.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 15 GCA CTG CAC 2 ACTGCACAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000001 0 33.41666666666664 0.0135443861537981 0 -Inf 0.0135443861537981 0.0134842754667325 0 NA NA 0.0137926969275048 0.326101356561771 636 364 0 0 0.636 0.001 ORF3a all ss13 16 CAG CAC AGC 2 GCACAGCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000001 0 33.41666666666664 0.0135443861537981 0 -Inf 0.0135443861537981 0.013815534738937 0 NA NA 0.0144155804060315 0.347440332309052 641 359 0 0 0.641 0.001 ORF3a all ss13 17 CCA AGC CAG 2 CAGCCAGGA:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000001 0 34.41666666666664 0.0137303605832671 0 -Inf 0.0137303605832671 0.0141248687786096 0 NA NA 0.0136033237126006 0.312812243348157 649 351 0 0 0.649 0.001 ORF3a all ss13 18 GGA CAG GAA 2 CCAGGAAAA:CCAGTAAAA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000001 0 34.583333333333314 0.0136367393123929 0 -Inf 0.0136367393123929 0.0134743055471456 0 NA NA 0.0135058907355728 0.312644669021319 625 375 0 0 0.625 0.001 ORF3a all ss13 19 AAA GAA AAA 2 GGAAAAATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.08333333333336 0 34.66666666666664 0.0136212597557268 0 -Inf 0.0136212597557268 0.0137229453906339 0 NA NA 0.0130224740169785 0.295569827351145 658 342 0 0 0.658 0.001 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333336 0 34.49999999999998 0.0135291154422588 0 -Inf 0.0135291154422588 0.0134725268933931 0 NA NA 0.0141147001083043 0.337804428682547 645 355 0 0 0.645 0.001 ORF3a all ss13 21 GAC TTG ACA 2 ATTGACAAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666669 0 34.833333333333314 0.013559691378237 0 -Inf 0.013559691378237 0.013121600431518 0 NA NA 0.0139115344298647 0.329704856828011 657 343 0 0 0.657 0.001 ORF3a all ss13 22 AAT ACA ATG 2 GACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.75000000000003 0 34.49999999999998 0.0138732279313668 0 -Inf 0.0138732279313668 0.0136871266807522 0 NA NA 0.0143530572053737 0.33375926677344 616 384 0 0 0.616 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.08333333333336 0 33.49999999999998 0.014002740465399 0 -Inf 0.014002740465399 0.0144613324432535 0 NA NA 0.0141364218162569 0.321908547784896 626 374 0 0 0.626 0.001 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.08333333333336 0 34.49999999999998 0.0142016077516528 0 -Inf 0.0142016077516528 0.0146117984641413 0 NA NA 0.0142269367003536 0.318172860730723 641 359 0 0 0.641 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.75000000000003 0 33.833333333333314 0.014068407802917701 0 -Inf 0.014068407802917701 0.0145923312296355 0 NA NA 0.013475119037981 0.296472221606759 636 364 0 0 0.636 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.91666666666669 0 33.333333333333314 0.0138412232800193 0 -Inf 0.0138412232800193 0.0137461497279585 0 NA NA 0.0141107702830095 0.326643151126222 648 352 0 0 0.648 0.001 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333336 0 32.66666666666665 0.0137146678675636 0 -Inf 0.0137146678675636 0.0142812309758957 0 NA NA 0.0140001209906669 0.327278337272044 631 369 0 0 0.631 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.9166666666667 0 33.333333333333314 0.0138412232800193 0 -Inf 0.0138412232800193 0.0134960914907797 0 NA NA 0.0135495853767701 0.307006362173935 604 396 0 0 0.604 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.9166666666667 0 32.999999999999986 0.0136522540928075 0 -Inf 0.0136522540928075 0.0134053772905831 0 NA NA 0.014010766911316 0.32985220185968 625 375 0 0 0.625 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333337 0 32.33333333333332 0.0135291154422588 0 -Inf 0.0135291154422588 0.0138245403787944 0 NA NA 0.0137530519425809 0.325254519867439 627 373 0 0 0.627 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333337 0 32.999999999999986 0.0137146678675636 0 -Inf 0.0137146678675636 0.0134749102397934 0 NA NA 0.0138009415845138 0.320345223043167 635 365 0 0 0.635 0.001 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.08333333333337 0 32.999999999999986 0.0136212597557268 0 -Inf 0.0136212597557268 0.0144640447940268 0 NA NA 0.0136245989423913 0.317429129252439 633 367 0 0 0.633 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000004 0 32.999999999999986 0.0134986770919624 0 -Inf 0.0134986770919624 0.0139609180609825 0 NA NA 0.0135302222719129 0.318440113558534 638 362 0 0 0.638 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333337 0 32.999999999999986 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0131917956636081 0 NA NA 0.0137839982980442 0.329603045724909 636 364 0 0 0.636 0.001 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.9166666666667 0 32.16666666666665 0.0134683754007452 0 -Inf 0.0134683754007452 0.0131601830899545 0 NA NA 0.0134840973662765 0.317875094886884 626 374 0 0 0.626 0.001 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333337 0 31.166666666666654 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0131773644640466 0 NA NA 0.0140966844026243 0.34044383316711 640 360 0 0 0.64 0.001 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333337 0 30.166666666666654 0.0133485169832455 0 -Inf 0.0133485169832455 0.0132658321791486 0 NA NA 0.0139341599350173 0.338077532118709 672 328 0 0 0.672 0.001 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000004 0 30.833333333333314 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0135309074009021 0 NA NA 0.0141671400938579 0.347153359916328 623 377 0 0 0.623 0.001 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.4166666666667 0 31.499999999999982 0.0133782811395161 0 -Inf 0.0133782811395161 0.0141867129361128 0 NA NA 0.0140291695097123 0.340283806176014 628 372 0 0 0.628 0.001 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.4166666666667 0 31.499999999999982 0.0133782811395161 0 -Inf 0.0133782811395161 0.0132443902607994 0 NA NA 0.0136944972398245 0.32861407792986 643 357 0 0 0.643 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000003 0 31.499999999999982 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0134672634826901 0 NA NA 0.0127679010968797 0.29687705128466 616 384 0 0 0.616 0.001 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333337 0 32.16666666666665 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0129866340284094 0 NA NA 0.0138297821549656 0.331206648866956 646 354 0 0 0.646 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.4166666666667 0 31.833333333333318 0.0133782811395161 0 -Inf 0.0133782811395161 0.0132126848222672 0 NA NA 0.0135127751338582 0.322151195455263 644 356 0 0 0.644 0.001 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000003 0 31.16666666666665 0.0132307731029258 0 -Inf 0.0132307731029258 0.0127091840758461 0 NA NA 0.0135189284453053 0.327735623287944 646 354 0 0 0.646 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333336 0 30.833333333333318 0.0131726767040263 0 -Inf 0.0131726767040263 0.0129353504698593 0 NA NA 0.0128919382726851 0.306886799358423 627 373 0 0 0.627 0.001 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000001 0 30.499999999999982 0.0132307731029258 0 -Inf 0.0132307731029258 0.0132124868560991 0 NA NA 0.0138105127369223 0.33805173554715 635 365 0 0 0.635 0.001 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.75000000000001 0 29.999999999999986 0.0131438194165355 0 -Inf 0.0131438194165355 0.0128934335137444 0 NA NA 0.0130845675295553 0.315123999228319 635 365 0 0 0.635 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.08333333333336 0 29.666666666666654 0.0130864825012098 0 -Inf 0.0130864825012098 0.0135220668363936 0 NA NA 0.0136944072275709 0.339270414205397 650 350 0 0 0.65 0.001 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.9166666666667 0 30.333333333333314 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.0131677412498252 0 NA NA 0.0130279390668175 0.307696194052163 682 318 0 0 0.682 0.001 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000003 0 30.999999999999982 0.0134081783305544 0 -Inf 0.0134081783305544 0.0136198917403039 0 NA NA 0.0136045715255445 0.324347024514093 637 363 0 0 0.637 0.001 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAT 2 GTTGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000003 0 29.999999999999986 0.0132307731029258 0 -Inf 0.0132307731029258 0.0131489508388201 0 NA NA 0.0129392635132191 0.306530560562708 621 379 0 0 0.621 0.001 ORF3a all ss13 52 TTT CAT TTC 2 GCATTTCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333336 0 30.666666666666654 0.0131726767040263 0 -Inf 0.0131726767040263 0.0136550769340839 0 NA NA 0.0131447366523537 0.316282949899838 638 362 0 0 0.638 0.001 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 TTTCTTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333336 0 30.666666666666654 0.0131726767040263 0 -Inf 0.0131726767040263 0.0137172939001742 0 NA NA 0.014098916488548 0.350147005267494 630 370 0 0 0.63 0.001 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.9166666666667 0 30.333333333333318 0.0131150882907867 0 -Inf 0.0131150882907867 0.0135464095212948 0 NA NA 0.012958232766828 0.311487995262218 641 359 0 0 0.641 0.001 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000004 0 30.66666666666665 0.0130580012294226 0 -Inf 0.0130580012294226 0.0129338191227464 0 NA NA 0.0130452502836919 0.316837715446458 658 342 0 0 0.658 0.001 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.58333333333337 0 29.999999999999986 0.0128345378007017 0 -Inf 0.0128345378007017 0.0139253505347155 0 NA NA 0.0133171694094465 0.335166919985171 618 382 0 0 0.618 0.001 ORF3a all ss13 57 CAG TTC AGA 2 TTTCAGAGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.58333333333337 0 29.66666666666665 0.0128345378007017 0 -Inf 0.0128345378007017 0.0126587663964399 0 NA NA 0.0129778772079096 0.322685112067704 640 360 0 0 0.64 0.001 ORF3a all ss13 58 AGC AGA GCG 2 CAGAGCGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.9166666666667 0 29.66666666666665 0.0129453051997499 0 -Inf 0.0129453051997499 0.0132225730136199 0 NA NA 0.0125960984953709 0.304079956314613 643 357 0 0 0.643 0.001 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333337 0 30.333333333333318 0.0131726767040263 0 -Inf 0.0131726767040263 0.0137503622706073 0 NA NA 0.013404071361657501 0.325736901862361 639 361 0 0 0.639 0.001 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.9166666666667 0 29.99999999999999 0.0131150882907867 0 -Inf 0.0131150882907867 0.0129348360638937 0 NA NA 0.0137710693724913 0.340911763162171 631 369 0 0 0.631 0.001 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.9166666666667 0 28.99999999999999 0.0129453051997499 0 -Inf 0.0129453051997499 0.0126821064226168 0 NA NA 0.013058108530524 0.321509124748087 656 344 0 0 0.656 0.001 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000003 0 28.666666666666657 0.0132307731029258 0 -Inf 0.0132307731029258 0.0135105336328708 0 NA NA 0.0133190392310426 0.320528245704104 641 359 0 0 0.641 0.001 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG:ATAATTTCG 1:1 FALSE 1.25 0.583333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.9166666666667 0 28.33333333333332 0.0131150882907867 0 -Inf 0.0131150882907867 0.0128212805634531 0 NA NA 0.0135903043725875 0.334528427310901 634 366 0 0 0.634 0.001 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC:ATTTCGCTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.6666666666667 0 29.166666666666657 0.0131582322381821 0 -Inf 0.0131582322381821 0.0140031589567288 0 NA NA 0.0133986210797972 0.326070936333205 633 367 0 0 0.633 0.001 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT:TCGCTCAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 0 29.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.6666666666667 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.6666666666667 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.6666666666667 0 27.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 0 27.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 0 28.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TTT 2 GCCCTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 0 29.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 74 TAT TTT ATA 2 CTTTATAAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 75 AAG ATA AGG 2 TATAAGGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666669 0 29.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 76 GGC AGG GCT 2 AAGGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666669 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 77 TTC GCT TCC 2 GGCTTCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666669 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGT 2 TTCCAGTTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666669 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 79 TTC AGT TCA 2 CAGTTCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000001 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 TTCATTTGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666669 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATT 2 TGCAATTTA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000001 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 83 TTA ATT TAC 2 AATTTACTG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000001 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666669 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 29.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 86 CTA TGC TAT 2 CTGCTATTT 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000003 0 29.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.6666666666667 0 31.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 88 GTT TTG TTA 2 TTTGTTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333336 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 89 ACC TTA CCA 2 GTTACCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000003 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 90 ATC CCA TCT 2 ACCATCTAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666669 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 91 TAT TCT ATT 2 ATCTATTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333336 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 92 TCA ATT CAC 2 TATTCACAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000003 0 29.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 93 CAT CAC ATC 2 TCACATCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333337 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 94 CTT ATC TTT 2 CATCTTTTG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000004 0 28.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 95 TTG TTT TGC 2 CTTTTGCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333339 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 96 CTT TGC TTG 2 TTGCTTGTC 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 30.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TCG 2 CTTGTCGCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 30.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 98 GCT TCG CTG 2 GTCGCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 30.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 29.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 100 GGT CAG GTA 2 GCAGGTATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000006 0 29.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 101 ATG GTA TGG 2 GGTATGGAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000006 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 102 GAG TGG AGG 2 ATGGAGGCG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 103 GCG AGG CGC 2 GAGGCGCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 104 CAA CGC AAT 2 GCGCAATTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333339 0 30.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTT 2 CAATTTTTG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666671 0 30.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 106 TTG TTT TGT 2 TTTTTGTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 30.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACC 2 TTGTACCTC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666673 0 31.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 108 CTC ACC TCT 2 TACCTCTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666673 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 CTCTATGCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000006 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 TATGCCTTG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000006 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 111 TTG CCT TGA 2 GCCTTGATA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333339 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 TTGATATAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333339 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATT 2 ATATATTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666673 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 114 TTT ATT TTC 2 TATTTTCTA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666673 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 TTTCTACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666673 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAT 2 CTACAATGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 117 TGC AAT GCA 2 CAATGCATC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TCA 2 TGCATCAAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.6666666666667 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 34.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 121 TGT CAT GTA 2 GCATGTAGA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.6666666666667 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 TGTAGAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333336 0 35.16666666666666 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0130350287136238 0 NA NA 0.0121102620956769 0.296914861890565 610 390 0 0 0.61 0.001 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATC:AGAATTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333336 0 34.99999999999999 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0122964879285818 0 NA NA 0.0127645995454484 0.322368527097239 646 354 0 0 0.646 0.001 ORF3a all ss13 124 ATC TTA TCA 2 ATTATCATG:ATTATTATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.1666666666667 0 35.33333333333332 0.0125789112103712 0 -Inf 0.0125789112103712 0.012711338701192 0 NA NA 0.0125975301102385 0.318026292301506 626 374 0 0 0.626 0.001 ORF3a all ss13 125 ATG TCA TGA 2 ATCATGAGA:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.6666666666667 0 35.83333333333332 0.0126585283405138 0 -Inf 0.0126585283405138 0.0126178672349555 0 NA NA 0.0136633371458063 0.354207241144506 638 362 0 0 0.638 0.001 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.6666666666667 0 36.16666666666666 0.0125002893639087 0 -Inf 0.0125002893639087 0.0129704663051343 0 NA NA 0.0127157634502297 0.325580582053811 613 387 0 0 0.613 0.001 ORF3a all ss13 127 TGT GAT GTT 2 AGATGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.6666666666667 0 36.49999999999999 0.0126585283405138 0 -Inf 0.0126585283405138 0.0128194752237696 0 NA NA 0.0126039127918278 0.315218025688219 669 331 0 0 0.669 0.001 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 TGTTGGCTT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 36.49999999999999 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0125341479192218 0 NA NA 0.0127126727820968 0.316303260981055 634 366 0 0 0.634 0.001 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333337 0 35.83333333333332 0.0127934871784325 0 -Inf 0.0127934871784325 0.0133054535326019 0 NA NA 0.0129770322945778 0.324203704283171 631 369 0 0 0.631 0.001 ORF3a all ss13 130 TGT TTT GTT 2 CTTTGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000003 0 35.33333333333332 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.0123313055220521 0 NA NA 0.012479791283823 0.312466515870023 636 364 0 0 0.636 0.001 ORF3a all ss13 131 TGG GTT GGA 2 TGTTGGAAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 35.33333333333332 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0129015873324996 0 NA NA 0.0121963623243432 0.298298952199927 603 397 0 0 0.603 0.001 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 35.33333333333332 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0127540429165221 0 NA NA 0.0125876102494819 0.31151912984227 670 330 0 0 0.67 0.001 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.6666666666667 0 34.83333333333332 0.0126585283405138 0 -Inf 0.0126585283405138 0.0128850968722078 0 NA NA 0.0128755701945205 0.325537001224452 653 347 0 0 0.653 0.001 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333337 0 34.83333333333332 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0127214799325653 0 NA NA 0.013261703095135 0.340839439173241 648 352 0 0 0.648 0.001 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 34.83333333333332 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0134830266220984 0 NA NA 0.0134629134930515 0.344025714606779 630 370 0 0 0.63 0.001 ORF3a all ss13 136 AAG CCA AGA 2 TCCAAGAAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 35.49999999999999 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0129806608925094 0 NA NA 0.0133763551884852 0.340912386006805 632 368 0 0 0.632 0.001 ORF3a all ss13 137 AAC AGA ACC 2 AAGAACCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333336 0 34.66666666666666 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0126716135949109 0 NA NA 0.0130740743374208 0.33395532796691 630 370 0 0 0.63 0.001 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 34.66666666666666 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0125041060246175 0 NA NA 0.0133538815068428 0.340100441771917 643 357 0 0 0.643 0.001 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 34.66666666666666 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0127389666026466 0 NA NA 0.0129556104942993 0.325463305017553 640 360 0 0 0.64 0.001 ORF3a all ss13 140 CTT TAC TTT 2 TTACTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 0 35.66666666666666 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.0131298672451604 0 NA NA 0.0132932170005533 0.329620000031935 638 362 0 0 0.638 0.001 ORF3a all ss13 141 TAT TTT ATG 2 CTTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 0 35.66666666666666 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.0138608926975682 0 NA NA 0.0130921385000027 0.322246231324505 626 374 0 0 0.626 0.001 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.4166666666667 0 36.74999999999999 0.0130296436641525 0 -Inf 0.0130296436641525 0.0131090658665916 0 NA NA 0.0134388180594442 0.332269450208396 624 376 0 0 0.624 0.001 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.08333333333336 1 37.08333333333333 0.0130864825012098 0.0274630224286674 0.476512828666281 -0.0143765399274576 0.013093527279918 0.0293880431481752 NA NA 0.0315758687185246 0.648892357832254 282 126 592 0.592 0.282 0.564 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000003 2 37.58333333333333 0.0130580012294226 0.0551973146854054 0.236569501684023 -0.0421393134559829 0.0128973208073314 0.0421162986082412 NA NA 0.042581778945521 0.322365248876958 135 49 816 0.816 0.135 0.27 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000003 2 37.58333333333333 0.0130580012294226 0.0551973146854054 0.236569501684023 -0.0421393134559829 0.0128263028385786 0.0415678545696133 NA NA 0.0457318373418122 0.356818821679275 141 51 808 0.808 0.141 0.282 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000003 2 37.58333333333333 0.0132307731029258 0.0551973146854054 0.239699579197539 -0.0419665415824796 0.0133533756708456 0.0433341918304003 NA NA 0.0468584069499107 0.37046469898983603 164 29 807 0.807 0.164 0.328 ORF3a all ss13 147 GTT TTG TTT 2 TTTGTTTGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.75000000000003 2 36.58333333333333 0.0131438194165355 0.0567646707244323 0.231549293756024 -0.0436208513078968 0.0134498070573982 0.0419515908630946 NA NA 0.0469200810633087 0.352534691624122 122 49 829 0.829 0.122 0.244 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000003 2 37.58333333333333 0.0133188849757348 0.0551973146854054 0.241295886432976 -0.0418784297096706 0.0137665998029531 0.0432311602247083 NA NA 0.0435843000848318 0.336622344620023 126 33 841 0.841 0.126 0.252 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000003 2 37.74999999999999 0.0133188849757348 0.0549444688504895 0.242406292287165 -0.0416255838747547 0.013150328527705 0.0410478135298275 NA NA 0.0447827948059248 0.352630301645862 151 40 809 0.809 0.151 0.302 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333336 2 37.08333333333333 0.0132600139021293 0.0559700169039056 0.236912808600634 -0.0427100030017764 0.0135628013295995 0.0444370731499154 NA NA 0.0421870824386978 0.311349095790981 126 45 829 0.829 0.126 0.252 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.41666666666669 2 37.08333333333333 0.0133782811395161 0.0559700169039056 0.239025854905229 -0.0425917357643895 0.0132148591452569 0.0416492333447008 NA NA 0.0444701642509812 0.338183892876504 119 51 830 0.83 0.119 0.238 ORF3a all ss13 152 CAT CAC ATA 2 ACACATAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.41666666666669 2 36.08333333333333 0.0132016609860952 0.0575822255219405 0.229266251285563 -0.0443805645358454 0.0143388299674309 0.0426051461525594 NA NA 0.0470538573422759 0.345585500844927 125 50 825 0.825 0.125 0.25 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 CATAACTAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000001 2 37.08333333333332 0.0134986770919624 0.0559700169039056 0.241176934342153 -0.0424713398119432 0.012925897220534 0.0447582261990613 NA NA 0.0472092038815577 0.368311280894338 164 39 797 0.797 0.164 0.328 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666669 2 36.74999999999999 0.013559691378237 0.0564972895530332 0.240006051361255 -0.0429375981747962 0.0147403524424523 0.0429253258652255 NA NA 0.0459103478167631 0.349660089308278 137 53 810 0.81 0.137 0.274 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333336 2 36.74999999999999 0.0134382094503063 0.0564972895530332 0.23785582559128 -0.0430590801027269 0.0136154885392759 0.043693957868014 NA NA 0.0459676312694938 0.348899465556016 118 50 832 0.832 0.118 0.236 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666669 2 36.74999999999999 0.013559691378237 0.0564972895530332 0.240006051361255 -0.0429375981747962 0.013961606105 0.0442187129180578 NA NA 0.0465405500793896 0.35622368606728 133 45 822 0.822 0.133 0.266 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666669 2 36.74999999999999 0.013559691378237 0.0564972895530332 0.240006051361255 -0.0429375981747962 0.0136199823435598 0.040962483028935 NA NA 0.0454402220818712 0.34469720851282 147 52 801 0.801 0.147 0.294 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA:TGTATACCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000001 2 36.41666666666666 0.0135904058348962 0.0570345959917882 0.238283547004574 -0.0434441901568921 0.0138576861938229 0.0441091191482193 NA NA 0.0448599937223156 0.332824917348452 125 51 824 0.824 0.125 0.25 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT:ATACCGTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666669 2 36.41666666666666 0.0136522540928075 0.0570345959917882 0.23936794598796 -0.0433823418989808 0.013755131560704 0.0442552921531298 NA NA 0.048490589333598 0.370971610509578 158 34 808 0.808 0.158 0.316 ORF3a all ss13 160 TAT CAT ATA 2 CCATATAAC:CCGTATAAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333336 2 36.41666666666666 0.0135291154422588 0.0570345959917882 0.237208929194601 -0.0435054805495295 0.0143293904368138 0.0440585082166705 NA NA 0.045338491154033 0.337271400624024 126 47 827 0.827 0.126 0.252 ORF3a all ss13 161 AAC ATA ACA 2 TATAACAGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.9166666666667 2 36.08333333333332 0.0134683754007452 0.0575822255219405 0.233898139202927 -0.0441138501211953 0.0142137158083069 0.0456518594200783 NA NA 0.0464726442625006 0.342496840878814 128 39 833 0.833 0.128 0.256 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333337 2 35.74999999999999 0.0135291154422588 0.0581404786806199 0.232697008164958 -0.0446113632383612 0.0133282764571171 0.0447345211557086 NA NA 0.0468805480812702 0.341301681429471 124 38 838 0.838 0.124 0.248 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.9166666666667 2 35.74999999999999 0.0136522540928075 0.0581404786806199 0.234814958573057 -0.0444882245878125 0.0141558291635195 0.0438178444378875 NA NA 0.0498985535286628 0.372621616189847 147 53 800 0.8 0.147 0.294 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333337 2 35.74999999999999 0.0135291154422588 0.0581404786806199 0.232697008164958 -0.0446113632383612 0.0133166084225967 0.046632246283175 NA NA 0.0445972024962622 0.317156868583508 124 44 832 0.832 0.124 0.248 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.9166666666667 2 35.41666666666666 0.0134683754007452 0.0587096677913667 0.229406431809613 -0.0452412923906215 0.0139280332099347 0.0448154727462085 NA NA 0.0456560961144492 0.321727280741855 125 38 837 0.837 0.125 0.25 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000004 2 35.58333333333332 0.0134986770919624 0.0584236862456271 0.231048021092178 -0.0449250091536647 0.0129794551990962 0.0437503167754 NA NA 0.0491383576629901 0.360582656625416 136 42 822 0.822 0.136 0.272 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000004 2 35.58333333333332 0.0134986770919624 0.0584236862456271 0.231048021092178 -0.0449250091536647 0.0134997406137082 0.0434155309772491 NA NA 0.0482776628922356 0.352083923861581 131 48 821 0.821 0.131 0.262 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCG 2 ATTGTCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666671 2 35.91666666666666 0.0136522540928075 0.0578600049104132 0.235953213518488 -0.0442077508176058 0.0141555782497159 0.0442182465683286 NA NA 0.048224571303699 0.359296754247403 122 39 839 0.839 0.122 0.244 ORF3a all ss13 169 GTT TCG TTA 2 GTCGTTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666671 2 35.58333333333332 0.0134683754007452 0.0584236862456271 0.230529366875636 -0.0449553108448819 0.0132156912744835 0.0437819468659912 NA NA 0.0489927239631659 0.358832729238325 130 52 818 0.818 0.13 0.26 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTG 2 GTTACTGAA:GTTACTGCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333337 2 34.91666666666666 0.0133485169832455 0.059584670169267 0.224026027925057 -0.0462361531860215 0.0134965189634366 0.046476810583541 NA NA 0.0458712947001272 0.313476564720805 122 39 839 0.839 0.122 0.244 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTGCAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333337 2 34.91666666666666 0.0133485169832455 0.059584670169267 0.224026027925057 -0.0462361531860215 0.0135199958814796 0.0456794501764203 NA NA 0.0480651422329294 0.336075874328923 123 50 827 0.827 0.123 0.246 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:GCAGGTGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000004 2 34.91666666666666 0 0.059584670169267 0 -0.059584670169267 0 0.0476959504122101 NA NA 0.0443948509503242 0.179546481350888 0 127 873 0.873 0 0.001 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.9166666666667 2 34.91666666666666 0 0.059584670169267 0 -0.059584670169267 0 0.0445623961579173 NA NA 0.0442851401624594 0.178471006070695 0 129 871 0.871 0 0.001 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.9166666666667 2 35.24999999999999 0 0.0589984642956841 0 -0.0589984642956841 0 0.0445878661630717 NA NA 0.0469106198207761 0.208508156287676 0 117 883 0.883 0 0.001 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TTT 2 GGCATTTCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.9166666666667 2 35.24999999999999 0 0.0589984642956841 0 -0.0589984642956841 0 0.0462900539683832 NA NA 0.0449521167514413 0.189360404455708 0 137 863 0.863 0 0.001 ORF3a all ss13 176 TCA TTT CAA 2 ATTTCAACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000004 2 35.58333333333332 0 0.0584236862456271 0 -0.0584236862456271 0 0.0444436915125986 NA NA 0.0427780627214776 0.172020769148093 0 128 872 0.872 0 0.001 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 TCAACACCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.25000000000004 2 35.749999999999986 0 0.0581404786806199 0 -0.0581404786806199 0 0.0435224991629271 NA NA 0.0454814408373074 0.20113163416775 0 126 874 0.874 0 0.001 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.9166666666667 2 35.749999999999986 0 0.0581404786806199 0 -0.0581404786806199 0 0.0445014786509533 NA NA 0.0446918772323646 0.193286438853959 0 137 863 0.863 0 0.001 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.9166666666667 2 35.749999999999986 0 0.0581404786806199 0 -0.0581404786806199 0 0.0454120679248635 NA NA 0.0422053925682738 0.16833904553112 0 142 858 0.858 0 0.001 ORF3a all ss13 180 CTC AAC TCA 2 AAACTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.75000000000003 2 36.249999999999986 0 0.0573071018565008 0 -0.0573071018565008 0 0.0441566513636732 NA NA 0.0436378581209109 0.189101154791635 0 138 862 0.862 0 0.001 ORF3a all ss13 181 AAA TCA AAG 2 CTCAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.41666666666669 2 36.249999999999986 0 0.0573071018565008 0 -0.0573071018565008 0 0.0437178973208348 NA NA 0.0463050774014078 0.215864910651245 0 152 848 0.848 0 0.001 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.75000000000003 2 36.249999999999986 0 0.0573071018565008 0 -0.0573071018565008 0 0.041740997209678 NA NA 0.0441093848727935 0.19387383120114 0 126 874 0.874 0 0.001 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666669 2 36.749999999999986 0 0.0564972895530332 0 -0.0564972895530332 0 0.0439560333671688 NA NA 0.044222521125843 0.201401696433524 0 136 864 0.864 0 0.001 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000001 2 37.749999999999986 0 0.0549444688504895 0 -0.0549444688504895 0 0.0440152991426168 NA NA 0.0416820190707926 0.187442877462604 0 124 876 0.876 0 0.001 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333334 2 37.083333333333314 0 0.0559700169039056 0 -0.0559700169039056 0 0.0423889314533523 NA NA 0.0453048260757506 0.216678103041394 0 131 869 0.869 0 0.001 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333334 2 37.083333333333314 0 0.0559700169039056 0 -0.0559700169039056 0 0.0418743014507481 NA NA 0.0424986611306833 0.187844301906051 0 135 865 0.865 0 0.001 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.08333333333334 2 37.083333333333314 0 0.0559700169039056 0 -0.0559700169039056 0 0.0432246752557076 NA NA 0.0418824201313621 0.181431431565234 0 131 869 0.869 0 0.001 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.75000000000001 2 37.41666666666665 0 0.0554524994575897 0 -0.0554524994575897 0 0.0428405535021733 NA NA 0.0443333179542684 0.211004282793908 0 127 873 0.873 0 0.001 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666667 2 36.91666666666665 0 0.0562324166616758 0 -0.0562324166616758 0 0.043491504881983 NA NA 0.043865260646867 0.199865418823667 0 113 887 0.887 0 0.001 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.25000000000001 2 36.249999999999986 0 0.0573071018565008 0 -0.0573071018565008 0 0.0441907848031071 NA NA 0.0433089724469141 0.185763736483042 0 135 865 0.865 0 0.001 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGA 2 TCTGAGAAT:TCTGAGGAT 1:1 FALSE 1.25 0.333333333333333 1.41666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000001 2 37.249999999999986 0 0.0557100557871529 0 -0.0557100557871529 0 0.0447267923396191 NA NA 0.0425859907471144 0.190812945530115 0 141 859 0.859 0 0.001 ORF3a all ss13 192 AAT AGA ATA 2 GAGAATTGG:GAGGATAGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000001 2 35.833333333333314 0 0.0579999025523778 0 -0.0579999025523778 0 0.0439800109290487 NA NA 0.0442786076548107 0.19023460042012 0 112 888 0.888 0 0.001 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 AATTGGCAC:GATAGGCAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0291301976158892 NA NA 0.0283999403810319 0.332431308063975 0 394 606 0.606 0 0.001 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCACTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666667 0 37.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000001 0 36.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000001 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 202 GTT TCG TTG 2 GTCGTTGTA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 36.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 203 GTA TTG TAC 2 GTTGTACAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 GTACATGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666667 0 37.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5 1 36.83333333333332 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0279102348954172 NA NA 0.0282816941741571 0.328189670507446 0 340 660 0.66 0 0.001 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 1 37.16666666666666 0 0.027400307499342 0 -0.027400307499342 0 0.0276485931030736 NA NA 0.0291919781631155 0.34792354130194 0 362 638 0.638 0 0.001 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666667 1 36.83333333333332 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0287595663775202 NA NA 0.0291271010915461 0.342423632380937 0 350 650 0.65 0 0.001 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666667 1 36.16666666666666 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.028442005521533 NA NA 0.0285550264383785 0.323839850574171 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 1 36.16666666666666 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0297533728903765 NA NA 0.0292365132634159 0.335246129409413 0 362 638 0.638 0 0.001 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666667 1 35.83333333333332 0 0.0284394261467203 0 -0.0284394261467203 0 0.028808255569852 NA NA 0.029855980931992 0.340816227798731 0 387 613 0.613 0 0.001 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.5 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0307283931628273 NA NA 0.030005732688727 0.338631958307118 0 394 606 0.606 0 0.001 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333333 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0293286794552856 NA NA 0.0318960936612422 0.358760140790947 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 215 GAG TTG AGT 2 CTTGAGTCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666667 1 34.499999999999986 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.0297284578044092 NA NA 0.0328219829746256 0.367784853423302 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 216 TCT AGT CTA 2 GAGTCTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666667 1 33.999999999999986 0 0.0300040009602743 0 -0.0300040009602743 0 0.0318339360024504 NA NA 0.0311688363799548 0.33573413881831 0 364 636 0.636 0 0.001 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000001 1 33.33333333333332 0 0.0306164958901914 0 -0.0306164958901914 0 0.0314237892199318 NA NA 0.0324907424250799 0.346031675193467 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666669 1 33.16666666666666 0 0.0307735475083969 0 -0.0307735475083969 0 0.0307099755293384 NA NA 0.032647439152021 0.34588442134634 0 352 648 0.648 0 0.001 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000001 1 34.66666666666666 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0289503181015385 NA NA 0.0317262968970942 0.353840498848845 0 358 642 0.642 0 0.001 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CTA 2 ATTACTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666669 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0306263428496305 NA NA 0.0294059847580026 0.328872406412088 0 374 626 0.626 0 0.001 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0290216184083657 NA NA 0.030421936984433 0.35441843460682 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666669 1 36.49999999999998 0 0.0279101972553257 0 -0.0279101972553257 0 0.0289172580541726 NA NA 0.0301257048426916 0.354208066024527 0 356 644 0.644 0 0.001 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000003 1 37.16666666666665 0 0.027400307499342 0 -0.027400307499342 0 0.0282657836367635 NA NA 0.0281775896665906 0.33084419181154 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333336 1 36.833333333333314 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0287338508543797 NA NA 0.0288252321111964 0.337392667698699 0 345 655 0.655 0 0.001 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 1 36.333333333333314 0 0.0280406490537152 0 -0.0280406490537152 0 0.0282687320471603 NA NA 0.0288090658413201 0.330390679362923 0 366 634 0.634 0 0.001 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 1 35.66666666666666 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.030354983139786 NA NA 0.0301947182474446 0.343968189603045 0 340 660 0.66 0 0.001 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTT TCT TTA 2 ATCTTTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TTA ACA 2 TTTAACAAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA--- 2 FALSE 0 0 2 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG 2 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C CGA 0 ---CCGAAT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT CGA ATG 2 CCGAATGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.33333333333337 2 32.16666666666665 0.100629159672279 0.0649053422482924 1.55039872199313 0.0357238174239865 0.0447438660313086 0.0472368955965066 NaN NaN 0.0679750556794206 0.599205741346889 709 1 290 0.29 0.709 0.58 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.6666666666667 3 32.499999999999986 0.10160438445965 0.0985020015458152 1.03149563323738 0.0031023829138352 0.0464641497191946 0.0636501014417273 NaN NaN 0.0830863119334739 0.970214487861126 516 0 484 0.484 0.516 0.968 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.00000000000003 3 32.833333333333314 0.102598726327403 0.0974341006801572 1.05300634594247 0.005164625647246 0.0445611268254872 0.0612591926340545 NaN NaN 0.0823074666494368 0.949967205838729 520 0 480 0.48 0.52 0.96 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA:TTTATGAGC 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.16666666666669 3 32.66666666666665 0.102348317920894 0.0979651368127982 1.04474225475203 0.00438318110809584 0.04542554133704 0.0627598985437423 NA NA 0.0790060641492597 0.955756822693014 546 0 454 0.454 0.546 0.908 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAT 2 ATGAGATTT:ATGAGCATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.50000000000001 3 33.33333333333332 0.101851155869296 0.0958750286324138 1.0623324688621 0.00597612723688257 0.0452530114453705 0.0628189364538617 NaN NaN 0.0811778067780133 0.941314549437196 528 0 472 0.472 0.528 0.944 ORF3a all ss13 7 ATT GAT TTT 2 AGATTTTTT:AGCATTTTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.16666666666667 3 33.66666666666665 0.0856035011092873 0.0948631103318398 0.90238977838528 -0.00925960922255248 0.0428505094793315 0.061676096087870703 NA NA 0.0741254552802525 0.900588408244839 461 1 538 0.538 0.461 0.922 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACA:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.75000000000001 3 33.249999999999986 0.0700625753990949 0.0961313950679982 0.728820957498187 -0.0260688196689033 0.0372720462950621 0.0624053051045593 NA NA 0.077402082062595 0.736269636349702 358 1 641 0.641 0.358 0.716 ORF3a all ss13 9 ACA TCA CAT 2 TTCACATTG:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.58333333333334 3 33.083333333333314 0.0692533163185839 0.0966482688635724 0.716549992388804 -0.0273949525449885 0.0392740800659244 0.0631840343383313 NA NA 0.0710539046956843 0.699828722779176 349 0 651 0.651 0.349 0.698 ORF3a all ss13 10 CTT CAT TGG 2 ACATTGGGA:ACTCTTAGA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.5 0.666666666666667 0.166666666666667 1 0 0 1 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.08333333333336 3 33.58333333333332 0.0697366111169322 0.0951140793534504 0.733189151290486 -0.0253774682365182 0.0378634976623695 0.0618739083196358 NaN NaN 0.0744748716216393 0.73329021992346 366 0 634 0.634 0.366 0.732 ORF3a all ss13 11 AGA TGG GAG 2 CTTAGATCA:TTGGGAGCA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.916666666666667 0.25 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.41666666666669 4 33.91666666666665 0.055774819305903 0.128312053707491 0.434681058359887 -0.0725372344015883 0.0367787425433713 0.0720700640371138 NA NA 0.084620810883589 0.391332564736681 160 0 840 0.84 0.16 0.32 ORF3a all ss13 12 GCA GAG CAA 2 AGATCAATT:GGAGCAATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.25000000000003 3 34.66666666666665 0.0559047993353385 0.0919517415692493 0.607979777014189 -0.0360469422339108 0.0362872529385691 0.0586227469827514 NA NA 0.0693434652999835 0.603180774413381 294 3 703 0.703 0.294 0.588 ORF3a all ss13 13 ATC CAA TCA 2 GCAATCACA:TCAATTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.25000000000001 4 34.66666666666665 0.0421163271222966 0.125290563497375 0.336149235398555 -0.0831742363750781 0.0329073314272112 0.067916737179547 NA NA 0.0734745738766533 0.257628605227042 102 2 896 0.896 0.102 0.204 ORF3a all ss13 14 ACA TCA CAC 2 ATCACACGC:ATTACTGCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.91666666666669 4 34.499999999999986 0.0423143935004423 0.125949614506391 0.33596286631187 -0.083635221005949 0.0311624529202872 0.0696088004120885 NA NA 0.0767511748961806 0.27584838355403 119 1 880 0.88 0.119 0.238 ORF3a all ss13 15 CGC CAC CAC 2 ACACGCCAA:ACTGCACAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 2 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.41666666666669 4 33.999999999999986 0.0420179878270026 0.127969137773073 0.328344697465361 -0.08595114994607 0.0314847609328099 0.0769846414189246 NA NA 0.0794821328109494 0.279523856290755 116 2 882 0.882 0.116 0.232 ORF3a all ss13 16 CAA CAC AAC 2 CGCCAACCA:GCACAGCCA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.08333333333336 4 34.33333333333332 0.0138093659583391 0.126615652181289 0.109065235778013 -0.11280628622295 0.0132459312590893 0.0737261927395634 NA NA 0.0775719649286512 0.145886810319246 18 5 977 0.977 0.018 0.036 ORF3a all ss13 17 CCA AAC CAG 2 CAACCAGCG:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.91666666666669 5 34.499999999999986 0.0138412232800193 0.161043735636461 0.0859469834409727 -0.147202512356441 0.0141707130779008 0.0807243452159559 NA NA 0.0839871481865623 0.0796571193551579 9 6 985 0.985 0.009 0.018 ORF3a all ss13 18 GCG CAG CGA 2 CCAGCGAAA:CCAGTAAAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666669 5 34.91666666666665 0.0137934922285677 0.158903109406266 0.0868044198764041 -0.145109617177698 0.0135742677909803 0.0799543949789031 NA NA 0.0797957675640951 0.0689858065430724 6 3 991 0.991 0.006 0.012 ORF3a all ss13 19 AAA CGA AAA 2 GCGAAAATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333334 5 34.499999999999986 0.0136678042173386 0.161043735636461 0.08487013893041 -0.147375931419122 0.0134822042059315 0.0805799760381803 NA NA 0.0828409771072642 0.0752361341335213 4 5 991 0.991 0.004 0.008 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAA:AAAATTGAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000001 5 34.16666666666666 0.0135443861537981 0.162798378928371 0.0831973035785418 -0.149253992774573 0.0132993924087532 0.0821722566337278 NA NA 0.0900861748632797 0.0975616720411409 7 3 990 0.99 0.007 0.014 ORF3a all ss13 21 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:ATTGACAAT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.33333333333334 5 34.499999999999986 0.0135750312327135 0.161043735636461 0.0842940657024854 -0.147468704403747 0.0141551538379378 0.0808180072434858 NA NA 0.0901473962044938 0.101868461959552 12 1 987 0.987 0.012 0.024 ORF3a all ss13 22 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666667 5 34.58333333333332 0 0.160610991304224 0 -0.160610991304224 0 0.0802554505901488 NA NA 0.0816971580689919 0.0493065594484446 0 6 994 0.994 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.08333333333334 5 34.249999999999986 0 0.162356129339379 0 -0.162356129339379 0 0.0828331897681544 NA NA 0.0879260278466539 0.0648184532723736 0 2 998 0.998 0 0.001 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666667 6 35.08333333333332 0 0.194105738514483 0 -0.194105738514483 0 0.0961816015447882 NA NA 0.0904172869485095 0.0318110511461029 0 2 998 0.998 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 6 34.499999999999986 0 0.197860943283853 0 -0.197860943283853 0 0.0934028633639145 NA NA 0.0980980362699601 0.0436984876625474 0 3 997 0.997 0 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333334 6 33.83333333333332 0 0.202335646591906 0 -0.202335646591906 0 0.0947605580984959 NA NA 0.101820447328519 0.0469023553752599 0 2 998 0.998 0 0.001 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 6 33.16666666666666 0 0.207018740932176 0 -0.207018740932176 0 0.0957205014425389 NA NA 0.0957438000831677 0.0306015594045308 0 3 997 0.997 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666669 7 33.83333333333332 0 0.242080044197288 0 -0.242080044197288 0 0.112627142782887 0 NaN 0.107217249421188 0.0239552584612482 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666669 7 32.99999999999999 0 0.249329979819956 0 -0.249329979819956 0 0.111838530036807 0 NaN 0.1110351887776 0.0247357846048197 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.41666666666669 7 32.49999999999999 0 0.253894219074791 0 -0.253894219074791 0 0.105463072325042 0 NaN 0.117624367551377 0.0308876435408203 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.58333333333336 8 32.83333333333333 0 0.294640950387176 0 -0.294640950387176 0 0.124060938401048 0 NaN 0.127258918630396 0.0205972176424939 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.08333333333336 8 32.83333333333333 0 0.294640950387176 0 -0.294640950387176 0 0.127642436947186 NA NA 0.12389289487517301 0.0173978181508406 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.75000000000003 8 32.83333333333333 0 0.294640950387176 0 -0.294640950387176 0 0.125330613990258 NA NA 0.128807247917226 0.02216920351623 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.58333333333336 8 32.99999999999999 0 0.292820423057718 0 -0.292820423057718 0 0.1228317331756 0 NaN 0.119680187466775 0.0144174432877254 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666669 8 32.166666666666664 0 0.30215833840741 0 -0.30215833840741 0 0.127131615250745 0 NaN 0.133514478551571 0.0236287307006492 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 8 31.16666666666666 0 0.314193196111627 0 -0.314193196111627 0 0.139980478631587 0 NaN 0.14067166948368 0.0255145751190517 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.08333333333336 8 30.66666666666666 0 0.320583011120205 0 -0.320583011120205 0 0.141818398798149 0 NaN 0.141645798725656 0.0236189094104986 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.58333333333336 8 30.999999999999993 0 0.316294221734959 0 -0.316294221734959 0 0.140995467894414 0 NaN 0.136385154245718 0.0203882592266499 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.25000000000001 8 31.66666666666666 0 0.308056623906756 0 -0.308056623906756 0 0.13840559572302 0 NaN 0.130586002453839 0.0183226509863725 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.25000000000001 8 31.66666666666666 0 0.308056623906756 0 -0.308056623906756 0 0.142328461506596 0 NaN 0.141222975595209 0.0291575984459071 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.91666666666669 8 31.33333333333333 0 0.312120297918684 0 -0.312120297918684 0 0.140308425663774 0 NaN 0.133758959188977 0.0196243614606851 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.58333333333334 8 31.66666666666666 0 0.308056623906756 0 -0.308056623906756 0 0.1352249995796 NA NA 0.132078729049294 0.0196811717819146 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.75000000000001 8 31.499999999999996 0 0.310074958318006 0 -0.310074958318006 0 0.136057275490826 0 NaN 0.129985192133923 0.0170576053573029 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.58333333333334 8 30.83333333333333 0 0.318423959611188 0 -0.318423959611188 0 0.137542428215213 0 NaN 0.143334916461261 0.026314545802075 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.91666666666667 8 30.499999999999996 0 0.322771994797419 0 -0.322771994797419 0 0.141476496396047 0 NaN 0.136302862513552 0.0178821186284248 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.25 8 30.16666666666666 0 0.327242322351052 0 -0.327242322351052 0 0.138629995450813 NA NA 0.143906332516756 0.0229662697112682 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT:CTTGTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666667 8 29.25 0 0.34021083900431 0 -0.34021083900431 0 0.142458860429515 0 NaN 0.151937980935501 0.0251466249449315 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC:GTTGTTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.91666666666667 8 28.75 0.0127798619317583 0.347735297618175 0.0367516959575126 -0.334955435686417 0.0128248641193302 0.148626275664101 NA NA 0.15181039956966 0.0273555580240954 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78 7 29.41666666666666 0.0129313548258796 0.286253342581981 0.045174511183834 -0.273321987756102 0.0130757122107715 0.134527912217977 0.07619159266383 0.553243546347561 0.133467643870874 0.0405744986980078 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.16666666666667 7 30.25 0.0130722263514627 0.2767124213498 0.0472411982364093 -0.263640194998337 0.0129949686561635 0.118675367590886 0.078093611243903 0.545225253655682 0.133284214623524 0.0479253055200838 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAC 2 GTTGCACTT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333333 7 29.583333333333336 0.0129592857062641 0.284292259601151 0.0455843775853955 -0.271332973894886 0.0124899596542219 0.122775653439611 0.0705298513950915 0.518076507611009 0.132244816004852 0.0401942054728682 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 52 CTT CAC TTC 2 GCACTTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.16666666666666 7 30.250000000000004 0.0129035440872231 0.2767124213498 0.046631604119106 -0.263808877262577 0.012987478831908 0.126771724185401 0.0733863360821777 0.525150454275191 0.122838717791538 0.0317452561473308 1 1 998 0.998 0.001 0.002 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 CTTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.49999999999999 6 30.250000000000004 0.0128482799476378 0.230365631898451 0.0557734234996542 -0.217517351950813 0.0127593790133727 0.107027797130621 NaN NaN 0.111726018971527 0.0515489081259211 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333333 6 29.916666666666668 0.0127934871784325 0.233376267232886 0.0548191439092043 -0.220582780054453 0.0120733559578689 0.103256138248452 NaN NaN 0.111494879361107 0.0478822745973189 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.66666666666667 6 29.750000000000004 0.0126585283405138 0.234911530842709 0.0538863643479027 -0.222253002502195 0.0128223406927567 0.101983505863102 NA NA 0.109996627703033 0.0433270132113297 1 1 998 0.998 0.001 0.002 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81 6 29.083333333333336 0.0124484185567784 0.24126182510618 0.0515971333272464 -0.228813406549402 0.012796759105993 0.112972738098216 0.0835294184860541 0.536765127931438 0.113629256301239 0.0440427290485647 1 1 998 0.998 0.001 0.002 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAGC:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81 6 28.750000000000004 0.0124484185567784 0.244568640424989 0.0508994879112328 -0.232120221868211 0.0127696451369035 0.110488034771299 NaN NaN 0.122626176853636 0.0583699417388575 2 1 997 0.997 0.002 0.004 ORF3a all ss13 58 AGC AAA GCG 2 CAAAGCGCT:CAGAGCGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.08333333333333 6 29.000000000000004 0.0125921111074123 0.242080044197288 0.0520163119978203 -0.229487933089876 0.0120805417798161 0.116216672744896 0.0840052263622196 0.535782449015237 0.11467657188762 0.0453734924640785 3 2 995 0.995 0.003 0.006 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.91666666666667 7 29.66666666666667 0.0127798619317583 0.283321879169121 0.0451072185785191 -0.270542017237363 0.0136234730016702 0.129635470126228 NaN NaN 0.121601806351379 0.0260933869355881 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.08333333333334 7 29.5 0.012752698321938 0.285269390232816 0.0447040543380074 -0.272516691910878 0.0125677864242351 0.127068214217085 NaN NaN 0.12566360013075 0.0301114878124458 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCCAAAGTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.08333333333334 6 28.5 0.0125921111074123 0.247109400847682 0.0509576368370301 -0.234517289740269 0.0120678433196297 0.128624565917829 NaN NaN 0.115944090994107 0.0431065988657722 3 1 996 0.996 0.003 0.006 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAAGTGATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.41666666666667 6 28.166666666666668 0.0128620515547158 0.250581126994749 0.0513288918003205 -0.237719075440033 0.0126815589827994 0.117200245584434 0.0983346392353314 0.601683003907265 0.118895714813728 0.0455660164851745 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG:GTGATTGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.08333333333333 5 27.833333333333332 0.012752698321938 0.205355044468623 0.0621007307365492 -0.192602346146685 0.0129523626458785 0.101758033697501 NA NA 0.104634232898894 0.0656625721286064 6 3 991 0.991 0.006 0.012 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC:ATTGCGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.24999999999999 5 28.166666666666668 0.0127256499425275 0.202564732921051 0.0628226333331541 -0.189839082978524 0.012966787944883 0.0997684608125418 NA NA 0.102223563336822 0.0632973407988074 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT:GCGCTTCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.24999999999999 6 28.666666666666668 0.0127256499425275 0.245409683406312 0.0518547180612196 -0.232684033463785 0.0127993847685127 0.108493739342675 NaN NaN 0.114960616580642 0.0429667995708212 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA:CTTCATAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.91666666666666 6 27.666666666666668 0.0126185941874855 0.255977372918159 0.0492957406493891 -0.243358778730673 0.0126499497886635 0.113215236593563 NA NA 0.117744480110989 0.0387494111160849 1 1 998 0.998 0.001 0.002 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA:CATAAGAGG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.58333333333333 5 27 0.012513324680928 0.212681467874346 0.0588359898302048 -0.200168143193418 0.0118287396364201 0.101589400475849 NA NA 0.104185958858922 0.0546991454487968 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AAGAGGTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.75 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.74999999999999 5 26.583333333333332 0.0381034317265946 0.21654566314 0.175960262487271 -0.178442231413406 0.0291506466175344 0.10353934470753 NaN NaN 0.111520185821684 0.109578823389029 21 1 978 0.978 0.021 0.042 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG:AGGTGGCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.91666666666666 6 27 0.03851113321761 0.263548415128416 0.146125459334844 -0.225037281910806 0.0294591759401615 0.126444385179713 NaN NaN 0.130426484229513 0.0844562038648486 10 1 989 0.989 0.01 0.02 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA:TGGCAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.25 6 27.333333333333332 0.0522518101768581 0.259707177538375 0.201195094691356 -0.207455367361517 0.0337752452253531 0.117883606021786 NaN NaN 0.117351938523158 0.0770934750087223 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC:CAGCTTGCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.91666666666666 7 27.333333333333332 0.0661950873041523 0.313301400524984 0.2112824494025 -0.247106313220832 0.0347228762438264 0.141763399390533 NaN NaN 0.135621468250555 0.068450512742757 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT:CTTGCCTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.75 7 27.166666666666664 0.0654722993105784 0.315691024758642 0.207393603795466 -0.250218725448064 0.036065855992675 0.133445555080871 NaN NaN 0.133745183183513 0.0613642687535805 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TGT 2 GCCCTTTAT:GCCTTGTAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.75 7 27.333333333333332 0.0654722993105784 0.313301400524984 0.208975444095908 -0.247829101214406 0.0348099450371252 0.134266582758394 0.181236273739689 0.248887691504461 0.138375542498947 0.0732950292182301 18 0 982 0.982 0.018 0.036 ORF3a all ss13 74 TAT TGT ATA 2 CTTTATAAG:TTGTATAAA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.91666666666667 6 27 0.0791072878500077 0.263548415128416 0.300162259793753 -0.184441127278409 0.0371109835959866 0.122494306186533 NaN NaN 0.124034007645191 0.137009364307329 37 0 963 0.963 0.037 0.074 ORF3a all ss13 75 AAA ATA AAG 2 TATAAAGGC:TATAAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.50000000000001 6 27.416666666666664 0.0795446789702432 0.258764472899754 0.307401854972027 -0.17921979392951 0.0371800893791407 0.122527065783595 NaN NaN 0.11622523705523 0.123072593374673 40 0 960 0.96 0.04 0.08 ORF3a all ss13 76 GGC AAG GCA 2 AAAGGCATT:AAGGGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.83333333333334 6 27.416666666666664 0.0813437533100697 0.258764472899754 0.314354410396912 -0.177420719589684 0.0398982854442793 0.111968972486884 NaN NaN 0.121402127793609 0.143897454741184 37 0 963 0.963 0.037 0.074 ORF3a all ss13 77 ATT GCA TCC 2 GGCATTCAG:GGCTTCCAG 1:1 TRUE 1.5 0.5 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.83333333333334 6 27.083333333333332 0.0813437533100697 0.262577384081623 0.309789640088667 -0.181233630771554 0.0395219384898857 0.120693512763892 NaN NaN 0.126332092688322 0.151406507422411 25 0 975 0.975 0.025 0.05 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGT 2 ATTCAGTTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.50000000000001 5 26.416666666666664 0.0806144362276048 0.218131224556612 0.369568531013692 -0.137516788329007 0.0382179566735648 0.0997030409039491 NA NA 0.109000791697405 0.207088166803154 89 0 911 0.911 0.089 0.178 ORF3a all ss13 79 TTC AGT TCA 2 CAGTTCATT:CAGTTTGTT 1:1 FALSE 1.75 0.75 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.33333333333334 5 26.916666666666664 0.0807955355010693 0.213443159911581 0.378534198680993 -0.132647624410512 0.0373401881492037 0.104280651206115 NaN NaN 0.109549996033575 0.225956356462595 89 0 911 0.911 0.089 0.178 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 TTCATTTGC:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.58333333333334 5 27.25 0.0816206643196587 0.210428875701957 0.387877680985488 -0.128808211382298 0.0392174649746612 0.0991311417850613 NaN NaN 0.107967834136917 0.232859995516359 81 0 919 0.919 0.081 0.162 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT:GTTTGCAAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.16666666666667 4 27 0.0809774510729235 0.165046413582601 0.490634418011128 -0.0840689625096777 0.0390497523402717 0.0864669691211351 NaN NaN 0.0904867384258287 0.352850242361186 163 0 837 0.837 0.163 0.326 ORF3a all ss13 82 AAC GCA ACC 2 TGCAACCTG:TGCAATTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78 4 27.666666666666664 0.0811601884801745 0.160610991304224 0.505321508952296 -0.0794508028240493 0.0389795634439029 0.0855735910557188 NaN NaN 0.0943841707130805 0.399910541764068 176 0 824 0.824 0.176 0.352 ORF3a all ss13 83 CTG ACC TAC 2 AACCTGCTG:AATTTACTG 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78 4 27.666666666666664 0.0811601884801745 0.160610991304224 0.505321508952296 -0.0794508028240493 0.0403765374466769 0.0918134490441461 NaN NaN 0.0882760853951542 0.368106228808778 182 0 818 0.818 0.182 0.364 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 CTGCTGCTA:TTACTGCTG 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.66666666666667 4 27.5 0.0804341477651982 0.16169725925912 0.497436679717016 -0.0812631114939219 0.0389768485082675 0.0917258133003759 NaN NaN 0.0884443428919333 0.358197535197781 184 0 816 0.816 0.184 0.368 ORF3a all ss13 85 CTA TGC TAC 2 CTGCTACTT:CTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.08333333333334 4 28.25 0.0941885460903394 0.156921757285409 0.600226174621721 -0.0627332111950698 0.041226786151181 0.0817751259399798 NaN NaN 0.0892086948991407 0.481919545865021 244 0 756 0.756 0.244 0.488 ORF3a all ss13 86 CTA TAC TAT 2 CTACTTTTT:CTGCTATTT 1:1 FALSE 1.25 1 0.5 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.25000000000001 4 28.583333333333332 0.093977517058638 0.154888999008431 0.606741070445699 -0.0609114819497926 0.0393089256560063 0.0812012060400406 NaN NaN 0.0856711869509758 0.477089530351012 225 0 775 0.775 0.225 0.45 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:CTTTTTGTG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.41666666666669 4 29.333333333333332 0.0937674327609406 0.150503021596613 0.62302691179358 -0.0567355888356729 0.040264613058543 0.0833683835723609 NaN NaN 0.0882075929846424 0.520090912912455 263 0 737 0.737 0.263 0.526 ORF3a all ss13 88 GTG TTG TGA 2 TTTGTGACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.25000000000001 4 28.666666666666664 0.0927309624185635 0.154389040653112 0.600631767813855 -0.061658078234548 0.0403888521317697 0.0825676680495973 NaN NaN 0.091937407660443 0.502441749354715 222 0 778 0.778 0.222 0.444 ORF3a all ss13 89 ACA TGA CAA 2 GTGACAATT:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.08333333333336 4 28.833333333333332 0.0929364169942089 0.153398778089708 0.605848482964182 -0.0604623610954991 0.039816558247609 0.0828159828900042 NA NA 0.0913686174074262 0.508137217869583 247 0 753 0.753 0.247 0.494 ORF3a all ss13 90 ATC CAA TCT 2 ACAATTTAC:ACCATCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.41666666666669 4 28.833333333333332 0.092526415385480107 0.153398778089708 0.6031757002091 -0.060872362704228 0.0389597326143873 0.0838724400720602 NaN NaN 0.0833007729579598 0.464929501145248 242 0 758 0.758 0.242 0.484 ORF3a all ss13 91 TAC TCT ACT 2 ATCTATTCA:ATTTACTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.00000000000001 4 28.916666666666664 0.0930394865024842 0.152908411727716 0.608465456224602 -0.059868925225232 0.0419763545354953 0.0829690851086756 NaN NaN 0.0871226111837211 0.49196923893881 253 0 747 0.747 0.253 0.506 ORF3a all ss13 92 TCA ACT CAC 2 TACTCACAT:TATTCACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.00000000000001 4 28.916666666666664 0.0930394865024842 0.152908411727716 0.608465456224602 -0.059868925225232 0.0420065822790431 0.0824896694953722 NaN NaN 0.0906314857807646 0.508884683001626 241 0 759 0.759 0.241 0.482 ORF3a all ss13 93 CAT CAC ATC 2 TCACATCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.50000000000001 4 28.083333333333332 0.0912185711042866 0.157958351375552 0.577484952900092 -0.0667397802712649 0.0403609870877146 0.08643971981824 NaN NaN 0.0893050358364738 0.454868119127164 206 0 794 0.794 0.206 0.412 ORF3a all ss13 94 CTT ATC TTC 2 CATCTTCTA:CATCTTTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.00000000000001 4 27.916666666666664 0.0918175614096642 0.159008783209024 0.577437041883189 -0.0671912217993599 0.0395728934341324 0.0851001656487024 NaN NaN 0.0903525591998914 0.457084621427629 215 1 784 0.784 0.215 0.43 ORF3a all ss13 95 CTA TTC TAC 2 CTTCTACTG:CTTTTGCTT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.33333333333336 4 28.249999999999996 0.0914173632067776 0.156921757285409 0.582566527345903 -0.0655043940786317 0.038940002671656 0.0792418824719381 NaN NaN 0.0884178428974547 0.458784153589047 239 0 761 0.761 0.239 0.478 ORF3a all ss13 96 CTG TAC TGT 2 CTACTGTTA:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.08333333333333 1 0.416666666666667 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.33333333333336 4 29.249999999999996 0.0926285758359223 0.150978005779684 0.61352364112619 -0.0583494299437612 0.0403475102385017 0.0780129402849609 NaN NaN 0.087550638173044 0.505113972495325 230 0 770 0.77 0.23 0.46 ORF3a all ss13 97 GTC TGT TAG 2 CTGTTAGCT:CTTGTCGCT 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.166666666666667 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.4166666666667 4 30.16666666666666 0.092526415385480107 0.145913043990275 0.634120246245064 -0.0533866286047949 0.0394962605982976 0.0768142124898328 NA NA 0.0845853070124928 0.527937720027424 256 0 744 0.744 0.256 0.512 ORF3a all ss13 98 GCT TAG CTG 2 GTCGCTGCA:TTAGCTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.50000000000003 4 30.333333333333325 0.0785029669229164 0.145028544735405 0.541293212768149 -0.0665255778124883 0.0372834285790546 0.0781331688080682 NaN NaN 0.084441074576949 0.430793614775425 190 0 810 0.81 0.19 0.38 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.6666666666667 4 29.666666666666664 0.0773216317702306 0.148632696437812 0.520219531929048 -0.0713110646675809 0.0374411783375809 0.0798979637742081 NaN NaN 0.0797718144544661 0.371355008375093 187 0 813 0.813 0.187 0.374 ORF3a all ss13 100 GGC CAG GCA 2 GCAGGTATG:GCTGGCATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.83333333333336 4 29.499999999999993 0.0761753537657808 0.149561992614941 0.509322939832048 -0.0733866388491602 0.037620165659052 0.0799745637900958 NaN NaN 0.0833468379916157 0.378590142391523 157 0 843 0.843 0.157 0.314 ORF3a all ss13 101 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAG:GGTATGGAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.1666666666667 4 29.833333333333325 0.0758540671866302 0.147714914296514 0.513516644868814 -0.0718608471098838 0.0353283731433493 0.0797042097103482 NaN NaN 0.0847422012863775 0.396441516796859 176 0 824 0.824 0.176 0.352 ORF3a all ss13 102 GAG TGG AGG 2 ATGGAGGCA:ATGGAGGCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.1666666666667 4 29.833333333333325 0.0768261689073374 0.147714914296514 0.520097576288886 -0.0708887453891766 0.0362015222013412 0.0776753866129414 NaN NaN 0.0838146228862414 0.397675393801304 187 0 813 0.813 0.187 0.374 ORF3a all ss13 103 GCA AGG CAC 2 GAGGCACAA:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.83333333333337 4 30.16666666666666 0.0908235725293773 0.145913043990275 0.622449988332987 -0.0550894714608976 0.0389180016656489 0.0762030434761188 NaN NaN 0.0820549364746908 0.501982920594124 256 1 743 0.743 0.256 0.512 ORF3a all ss13 104 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT:GCGCAATTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 82.08333333333337 5 30.499999999999996 0.104402791930732 0.184981141936135 0.564396947915787 -0.0805783500054035 0.040694626801355 0.0903920414105313 NaN NaN 0.0916586949686778 0.379340011561292 164 0 836 0.836 0.164 0.328 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTT 2 CAATTTTTG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.00000000000003 5 31.166666666666664 0.120256987556385 0.180507022556888 0.666217778416266 -0.0602500350005032 0.0449335424975047 0.0858226378302683 NaN NaN 0.0926685663813444 0.515584416018039 259 0 741 0.741 0.259 0.518 ORF3a all ss13 106 TTG TTT TGT 2 TTTTTGTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.1666666666667 5 31 0.119989202138919 0.181605039003649 0.660715158550793 -0.06161583686473 0.0442111824606184 0.0832781900238453 NaN NaN 0.0948058459600878 0.515746477804259 243 0 757 0.757 0.243 0.486 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACA 2 TTGTACATC:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.00000000000004 5 31.833333333333332 0.121889197123331 0.176245193423779 0.691588773319056 -0.054355996300448003 0.0429558542961256 0.0899825192409525 NaN NaN 0.0862798355717621 0.528696859986908 247 0 753 0.753 0.247 0.494 ORF3a all ss13 108 ATC ACA TCT 2 TACATCTAT:TACCTCTAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.00000000000004 5 32.33333333333333 0.121889197123331 0.173179167487274 0.703832908379629 -0.0512899703639432 0.0465143793193605 0.0813179663359391 NaN NaN 0.0907653263341339 0.572017105112158 274 0 726 0.726 0.274 0.548 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 ATCTATGCC:CTCTATGCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.1666666666667 4 32.33333333333333 0.121614085547219 0.135196367873208 0.899536632975772 -0.0135822823259886 0.0443659448313335 0.0722909390631226 NaN NaN 0.0816788684340196 0.867929667033259 418 0 582 0.582 0.418 0.836 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCC 2 TATGCCCTG:TATGCCTTG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.1666666666667 4 32.33333333333333 0.121614085547219 0.135196367873208 0.899536632975772 -0.0135822823259886 0.0456772962041419 0.0726304158468171 NaN NaN 0.0797108166044707 0.864699921073136 437 0 563 0.563 0.437 0.874 ORF3a all ss13 111 CTG CCC TGA 2 GCCCTGATT:GCCTTGATA 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.83333333333337 4 32.666666666666664 0.12216555897624 0.133686173554739 0.913823439835521 -0.011520614578499 0.0465314652141686 0.0728866309822662 NaN NaN 0.0766014894058772 0.880451610107266 462 0 538 0.538 0.462 0.924 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 CTGATTTAC:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.6666666666667 4 32.83333333333333 0.119192968934937 0.132943691128056 0.896567320521635 -0.013750722193119 0.0452662656892354 0.0731513024744118 NaN NaN 0.0761102556364895 0.85662782159804 428 0 572 0.572 0.428 0.856 ORF3a all ss13 113 TAC TAT ACA 2 ATATATTTT:ATTTACATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 82.00000000000004 4 33.83333333333333 0.118668003911171 0.128656816904346 0.922360794915347 -0.00998881299317511 0.0454569875388949 0.0719476876447657 NaN NaN 0.0748195371390194 0.893793685890752 465 0 535 0.535 0.465 0.93 ORF3a all ss13 114 ATT ACA TTC 2 TACATTCTG:TATTTTCTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.66666666666671 5 34.166666666666664 0.119192968934937 0.162798378928371 0.732150834176183 -0.0436054099934337 0.0447267812190376 0.0810300157505193 NaN NaN 0.0835231742588936 0.601617705449223 291 0 709 0.709 0.291 0.582 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 ATTCTGCAA:TTTCTACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.83333333333337 4 34.5 0.120525973482338 0.125949614506391 0.956938010129612 -0.00542364102405356 0.045427363267828 0.066933442658286 NaN NaN 0.0694796092463617 0.9377796073007 502 0 498 0.498 0.502 0.996 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAA 2 CTACAATGC:CTGCAAATC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.1666666666667 4 35.16666666666667 0.119989202138919 0.123354245726484 0.972720488316013 -0.00336504358756504 0.0435129431770258 0.0663854337397597 NaN NaN 0.0734253156904482 0.963446166726274 495 0 505 0.505 0.495 0.99 ORF3a all ss13 117 ATC AAA GCA 2 CAAATCCTA:CAATGCATC 1:1 TRUE 2.08333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.6666666666667 4 36 0.122443179667292 0.120256987556385 1.01817933539939 0.00218619211090793 0.0450040846719681 0.0648987257053183 NaN NaN 0.0702330317031281 0.975167706117785 517 0 483 0.483 0.517 0.966 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TAA 2 ATCCTAAGC:TGCATCAAC 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.4166666666667 4 36.333333333333336 0.0937674327609405 0.119061291806916 0.787555983459385 -0.0252938590459754 0.0357342160109515 0.0628246225926194 NaN NaN 0.0641115583302527 0.693190635503003 367 0 633 0.633 0.367 0.734 ORF3a all ss13 119 AAC TAA ACG 2 ATCAACGCA:CTAAGCTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.08333333333337 3 35.833333333333336 0.0929364169942089 0.0887734500607747 1.04689427898301 0.0041629669334342 0.0345273875042604 0.0533938278488608 NaN NaN 0.0528607244763367 0.937228692717673 561 1 438 0.438 0.561 0.876 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AGCTTTTGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.25000000000004 4 36.00000000000001 0.0798094452064725 0.120256987556385 0.66365744584324 -0.040447542349912 0.0321347172827249 0.0645720831976335 NaN NaN 0.0587001175997841 0.490789377091887 237 2 761 0.761 0.237 0.474 ORF3a all ss13 121 TGC CAT GCA 2 GCATGTAGA:TTTTGCAGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.08333333333339 3 35.833333333333336 0.0660492550084018 0.0887734500607747 0.744020368287864 -0.0227241950523728 0.0299083815905222 0.0537739401012962 NaN NaN 0.0574811983602123 0.692597399100311 360 0 640 0.64 0.36 0.72 ORF3a all ss13 122 AGA GCA GAA 2 TGCAGATTC:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.25000000000004 4 36.50000000000001 0.0667849179180056 0.118472334721436 0.563717411959823 -0.05168741680343 0.0303727932754974 0.0618913402006654 NaN NaN 0.0673292763777891 0.442676633399443 208 0 792 0.792 0.208 0.416 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TCA 2 AGAATTATT:AGATTCATC 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.25000000000004 4 36.333333333333336 0.0667849179180056 0.119061291806916 0.560928887167729 -0.0522763738889102 0.0305097192816407 0.060613113922959 NaN NaN 0.0630823576115257 0.407273969221027 210 0 790 0.79 0.21 0.42 ORF3a all ss13 124 ATC TCA TCA 2 ATTATTATG:TTCATCATG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.41666666666671 4 36.833333333333336 0.0528271104098974 0.117311764843583 0.450313832379338 -0.0644846544336854 0.0254854120648081 0.062414393244893 NaN NaN 0.0610656932604113 0.290973584055754 124 3 873 0.873 0.124 0.248 ORF3a all ss13 125 ATG TCA TGA 2 ATCATGAGA:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.75000000000004 4 36.50000000000001 0.0525954761681724 0.118472334721436 0.443947325692874 -0.0658768585532633 0.0259965985259605 0.0614290829713302 NaN NaN 0.0641915596999448 0.304771773602488 126 1 873 0.873 0.126 0.252 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGC:ATGAGATGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.75000000000004 5 36.66666666666667 0.0519126079323414 0.150503021596613 0.344927346850753 -0.0985904136642719 0.0246800898002045 0.0700970052210639 NaN NaN 0.0738544952247208 0.181900000937233 57 1 942 0.942 0.057 0.114 ORF3a all ss13 127 TGC GAT GCT 2 AGATGCTGG:AGATGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.4166666666667 6 37.333333333333336 0.0521382511052231 0.180871542612666 0.288261217613854 -0.128733291507443 0.024684650849919 0.0823919753183549 NaN NaN 0.0797824148437018 0.10662404654059 41 0 959 0.959 0.041 0.082 ORF3a all ss13 128 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCTG:TGTTGGCTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.9166666666667 7 37.66666666666667 0.0661950873041523 0.213552421666518 0.309971138643991 -0.147357334362366 0.0295839903540972 0.0847796173320817 0.237093679414838 0.191084253267277 0.0840683817516146 0.0796316969158201 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 129 CTG GGC TGT 2 TGGCTGTGC:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.58333333333337 7 37.00000000000001 0.0664886936625221 0.218017195136802 0.304969952580124 -0.15152850147428 0.0279222441239299 0.0923319874485193 0.251064062048587 0.224476829977763 0.0893500825678659 0.0899054631746229 18 0 982 0.982 0.018 0.036 ORF3a all ss13 130 TGC TGT GCT 2 CTGTGCTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.08333333333333 0.5 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.75000000000004 7 36.66666666666667 0.0654722993105784 0.220320838896122 0.297167983013388 -0.154848539585544 0.0313500837797451 0.0902207709708623 0.246584688900862 0.228150964857588 0.0887199385158311 0.0809216205023887 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAG:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.33333333333337 7 36.41666666666667 0.0658317081617892 0.222081009574389 0.296431055892412 -0.1562493014126 0.0302303611024688 0.094318580609722 0.258633056746306 0.251735046977253 0.0926796923769454 0.0918137981131991 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.00000000000004 7 36.41666666666667 0.0661220906960037 0.222081009574389 0.297738608189527 -0.155958918878386 0.029959827593713 0.0895496654156521 NaN NaN 0.0929575940380755 0.0933973521592985 21 0 979 0.979 0.021 0.042 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA:AAGTGCAGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.50000000000004 7 35.91666666666667 0.0656874718445632 0.225687740489177 0.291054674490452 -0.160000268644614 0.0297288892365237 0.0913579565435017 0.212072347337404 0.169929289399216 0.090978934362176 0.0786366652313036 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC:TGCAGATCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.66666666666671 7 35.91666666666667 0.0655438665862574 0.225687740489177 0.290418373830104 -0.16014387390292 0.0296046531910496 0.094133735355679607 NaN NaN 0.0925387828372067 0.0835303523939505 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG:AGATCCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.00000000000004 7 36.16666666666667 0.0524230797130337 0.223869741416997 0.234167777124406 -0.171446661703964 0.0250614934634792 0.0912709825995322 0.15784367560719 0.137930373829332 0.0889417738163829 0.0539014021722335 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 136 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAT:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.00000000000004 7 36.833333333333336 0.0524230797130337 0.219162920712879 0.239196847452641 -0.166739840999845 0.0263085707029525 0.0880755566631714 NaN NaN 0.0868065876745948 0.054754387788646 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 137 AAC AAA ACC 2 AAAAATCCG:AAGAACCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.4166666666667 7 36.25000000000001 0.0521382511052231 0.223270280899521 0.233520784294113 -0.171132029794298 0.0252533584444523 0.0937800641490202 NaN NaN 0.0880587251560055 0.0519696250739048 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA:AATCCGTTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.75000000000004 7 36.25000000000001 0.0525954761681724 0.223270280899521 0.235568638854547 -0.170674804731348 0.0251552277399639 0.0894288251440316 0.182673554698498 0.197203224858595 0.0902835879157663 0.0587004718978356 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTT:CCGTTGCTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.58333333333337 7 36.41666666666667 0.0527110387112104 0.222081009574389 0.237350500217147 -0.169369970863179 0.0259598420027305 0.0944863654152898 0.195868524555817 0.225594769476758 0.0885481620850609 0.0557808259542044 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 140 CTC TAC TCT 2 TTACTTTAT:TTGCTCTAT 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.58333333333337 7 37.08333333333334 0.0534152253723938 0.217448844139347 0.245645018642472 -0.164033618766953 0.0255686319437301 0.091091910941125 0.193277448266452 0.203748193482587 0.0876783693615689 0.0613650188171308 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 141 TAT TCT ATG 2 CTCTATGAT:CTTTATGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.50000000000004 7 37.16666666666667 0.0534747581886498 0.216883469282523 0.246559861687711 -0.163408711093873 0.0268363185433283 0.0951589572372187 NaN NaN 0.0852310935696365 0.0552070771678238 9 1 990 0.99 0.009 0.018 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC:TATGATGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.66666666666671 7 37.66666666666668 0.0533558250189307 0.213552421666518 0.249848840872668 -0.160196596647587 0.026664879649688802 0.0842157621630508 NaN NaN 0.0858083940133419 0.0619140793859556 11 1 988 0.988 0.011 0.022 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC:GATGCTAAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.00000000000004 7 38.00000000000001 0.0679196827842952 0.211388364105741 0.321302844986872 -0.143468681321445 0.0294067393679649 0.0897298335304632 NaN NaN 0.0883117274232551 0.10425397641136 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC:GCTAACTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.33333333333337 8 38.33333333333334 0.0676133227457231 0.244568640424989 0.276459494676958 -0.176955317679266 0.0296262017708621 0.0985740229429247 0.232644383583362 0.234701401078508 0.0952286182803867 0.0631383832511183 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.33333333333337 8 38.33333333333334 0.0676133227457231 0.244568640424989 0.276459494676958 -0.176955317679266 0.0293151289412132 0.0967465788846665 0.192983964819735 0.151986011362104 0.0972708090594357 0.0688805123228642 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTA:TACTTTGTT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.50000000000004 8 38.16666666666668 0.0683844676038055 0.245832397240244 0.278175164752494 -0.177447929636439 0.0307203080443696 0.0990970913971078 0.185301598309074 0.133303274320713 0.0957655292258882 0.063890734619108 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 147 GTA TTG TAT 2 TTTGTATGT:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.00000000000004 8 37.16666666666668 0.0679196827842952 0.253700676929915 0.267715812217001 -0.18578099414562 0.0303297776578336 0.0968949218152152 0.191828627721843 0.16283532899597 0.101539955288418 0.06730462773109 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 148 TGC TAT GCT 2 GTATGTTGG:GTTTGCTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.00000000000004 8 38.16666666666668 0.068855661939842 0.245832397240244 0.280091894773949 -0.176976735300402 0.0289286353727414 0.0981038845174571 0.20634866635608 0.174663051402751 0.0987729281140321 0.0731724674975013 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGTTGGCAC 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.16666666666671 8 38.16666666666668 0.0686978768215523 0.245832397240244 0.279450054560612 -0.177134520418692 0.0309503942564653 0.0966050356041141 0.195646795502393 0.153194151242854 0.0942070624796261 0.0600715687296841 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCACACC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.50000000000004 8 37.50000000000001 0.0683844676038055 0.251022027914968 0.272424169989457 -0.182637560311162 0.0310757690685682 0.101673269952623 NaN NaN 0.0947593911865557 0.0539320209226578 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CACACCAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.83333333333337 8 37.50000000000001 0.069014174040189 0.251022027914968 0.274932740418969 -0.182007853874779 0.0311891019095326 0.103038889648662 NaN NaN 0.0954544598946036 0.0565528840794104 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 152 AAT CAC ATA 2 ACACATAAC:ACCAATTGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.83333333333337 8 36.50000000000001 0.0680739069857003 0.259234959672941 0.262595396360061 -0.19116105268724 0.030067844376642502 0.101907270731553 0.212439398832672 0.21642304737234 0.102551292556476 0.0623142507142276 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 AATTGCTTT:CATAACTAT 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.416666666666667 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.50000000000004 8 37.16666666666667 0.0549444688504894 0.253700676929915 0.216572023044573 -0.198756208079426 0.0277406167195517 0.098080765250662 0.16999041601892 0.202654591180653 0.0943312651167366 0.0351173659469507 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC:TGCTTTGAT 1:1 FALSE 1.08333333333333 0.75 1.16666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.4166666666667 7 36.833333333333336 0.0408727688266097 0.219162920712879 0.186494908416357 -0.178290151886269 0.0239523347558212 0.0901622764043788 NA NA 0.0941834493976767 0.0583566238597778 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC:TTTGATTAC 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.00000000000004 7 36.666666666666664 0.0267885619515594 0.220320838896122 0.121588870511653 -0.193532276944563 0.018531116778754 0.0960761113094729 NaN NaN 0.0869329630957889 0.0259991595122904 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT:GATTACTGT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.50000000000004 7 36.5 0.0269691977905829 0.221491146757304 0.121761967398787 -0.194521948966721 0.0184647467676959 0.0957197832041843 0.115071113405456 0.289989166704375 0.0902662204258304 0.0311633566011969 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333337 7 36.666666666666664 0.0270299523623976 0.220320838896122 0.122684501828453 -0.193290886533725 0.0194188937642624 0.0891150639810925 0.115746818712645 0.289172608790046 0.0888404211688256 0.0295770414331131 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.1666666666667 7 36.333333333333336 0.0270909813104956 0.222674045667529 0.121662051943605 -0.195583064357033 0.0190534015996315 0.100247581319652 NaN NaN 0.0910020586824915 0.0316172956379837 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAC:ATACCATAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.6666666666667 7 36.50000000000001 0.0272757331281561 0.221491146757304 0.123145929430954 -0.194215413629148 0.0196203431794781 0.0949181840899508 NaN NaN 0.0916258200388684 0.0340348870751241 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATACAAC:CCATATAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333337 7 36.50000000000001 0.0270299523623976 0.221491146757304 0.122036265368274 -0.194461194394906 0.0190229528197512 0.0904356515074403 NaN NaN 0.0854608941518567 0.0228795078824016 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAACAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.50000000000003 8 36.50000000000001 0.0269691977905829 0.259234959672941 0.104033799394218 -0.232265761882358 0.0190209209375687 0.106740293268035 0.092529551844864 0.260872834307144 0.109205955481684 0.0334317298639948 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTA 2 AACAGTATC:AACAGTGTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.00000000000003 8 36.333333333333336 0.0271522864979704 0.260656845281595 0.104168706824626 -0.233504558783624 0.0196058986571498 0.106583326739676 NA NA 0.103380950744004 0.0239032535042044 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 163 ATC GTA TCA 2 AGTATCACT:AGTGTCACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.33333333333336 8 36.333333333333336 0.027400307499342 0.260656845281595 0.105120229893601 -0.233256537782253 0.0188883036296983 0.103670812563081 0.0959275376560944 0.273153376553905 0.103533100958845 0.0242613041163381 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 ATCACTGAC:GTCACAGAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.00000000000003 7 36.333333333333336 0.0271522864979704 0.222674045667529 0.121937365518167 -0.195521759169558 0.0191126541862766 0.0962531909740609 0.110783477228542 0.271035137074631 0.0932568760316185 0.0360295760762758 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 165 GAC CAG ACA 2 ACAGATACA:ACTGACACA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.50000000000003 8 35.666666666666664 0.0269691977905829 0.266505540694197 0.101195636384644 -0.239536342903614 0.019411299162525 0.118214367230899 0.0943608903841103 0.283526050925582 0.113687763778764 0.0351204582154566 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 166 ACA ACA CAA 2 GACACAATT:GATACAATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.6666666666667 8 35.5 0.0269087157486763 0.268009394822974 0.100402136150675 -0.241100679074298 0.0190858208747627 0.116345318102364 NaN NaN 0.10478993934673 0.0214029456772672 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.00000000000003 8 35.166666666666664 0.0267885619515594 0.271069160022998 0.0988255615256515 -0.244280598071438 0.0194031880437851 0.114618538788352 0.101154293791688 0.328579839025711 0.111694222326051 0.0287390380674134 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCC 2 ATTGTCCTC:ATTGTCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.1666666666667 8 35.5 0.0270909813104956 0.268009394822974 0.10108220769048 -0.240918413512479 0.0193720661014944 0.110604893600592 0.0921539435508844 0.27269200199608 0.109658387309417 0.0280211387941448 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 169 CTC TCC TCA 2 GTCCTCACG:GTCGTTACT 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.1666666666667 8 35.166666666666664 0.0267288865855191 0.271069160022998 0.0986054134053883 -0.244340273437479 0.01850196333829 0.115485270398773 NA NA 0.120758868132438 0.0430346714720114 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 170 ACG TCA CGT 2 CTCACGTCA:GTTACTGAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.83333333333337 7 34.33333333333333 0.0400986359257937 0.237930656019994 0.168530766890434 -0.1978320200942 0.0228436733128847 0.110421711828649 0.17092144722375 0.324126739476713 0.11290068699913 0.0797281025051393 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 171 GAA CGT AAG 2 ACGTCAGGT:ACTGAAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.83333333333337 7 34.33333333333333 0.0539558430514737 0.237930656019994 0.226771295275795 -0.18397481296852 0.0261817754096966 0.106674062183644 NaN NaN 0.111133969724026 0.0978367476227491 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:TCAGGTGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.33333333333337 6 34.5 0.0543223783836108 0.197860943283853 0.274548263452275 -0.143538564900242 0.0275851720060186 0.0958786225631357 0.286303925128938 0.33758901197833 0.0918669211678141 0.118179212837404 22 0 978 0.978 0.022 0.044 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGATGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.6666666666667 6 34.833333333333336 0.0540774704260079 0.195697415235261 0.276332062745937 -0.141619944809253 0.0278649946728055 0.0984892297953228 NaN NaN 0.0965755859525276 0.142535101809487 33 1 966 0.966 0.033 0.066 ORF3a all ss13 174 GGA ACG GAA 2 GACGGCATT:GATGGAACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.6666666666667 6 35.166666666666664 0.0548189130040021 0.193580949501978 0.283183408000806 -0.138762036497976 0.0274643100684468 0.0925709988965604 NaN NaN 0.0955309281779332 0.146352847227578 33 0 967 0.967 0.033 0.066 ORF3a all ss13 175 ACT GAA CTA 2 GGAACTACT:GGCATTTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.833333333333333 0.833333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.1666666666667 6 35.666666666666664 0.0551973146854054 0.190491169998981 0.289763114404204 -0.135293855313576 0.0269540189487097 0.0922109428189132 NaN NaN 0.0966679506623096 0.161641218983102 41 0 959 0.959 0.041 0.082 ORF3a all ss13 176 ACT CTA CAA 2 ACTACTCAG:ATTTCAACA 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000003 7 36.166666666666664 0.0555166649189651 0.223869741416997 0.247986461089243 -0.168353076498032 0.028277985676457 0.112211960943723 NaN NaN 0.114806240466462 0.142536487488271 28 0 972 0.972 0.028 0.056 ORF3a all ss13 177 ACA CAA AGC 2 ACTCAGCCA:TCAACACCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333337 6 36.24999999999999 0.0550706014161129 0.187009442781175 0.294480324614156 -0.131938841365062 0.0280382639586477 0.0972691734652209 NaN NaN 0.105812706957728 0.21243078058127501 45 1 954 0.954 0.045 0.09 ORF3a all ss13 178 CCA AGC CAA 2 ACACCAAAA:CAGCCAAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.00000000000003 5 35.91666666666666 0.0405504159527068 0.153991399978411 0.26332909473121 -0.113440984025705 0.022887881921993 0.0899295090291984 NaN NaN 0.101982683738658 0.265985393596327 74 0 926 0.926 0.074 0.148 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTA:CCAAAACTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.00000000000003 5 35.91666666666666 0.0405504159527068 0.153991399978411 0.26332909473121 -0.113440984025705 0.0237637978013755 0.0907230124332278 NaN NaN 0.0952686563549451 0.23375243749673 58 2 940 0.94 0.058 0.116 ORF3a all ss13 180 CTA AAC TAA 2 AAACTAAAA:AAACTCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.83333333333336 5 36.41666666666666 0.0412002891133781 0.151648059986963 0.271683588414648 -0.110447770873585 0.0239529426775352 0.0978104249322362 NaN NaN 0.0994568540431189 0.266779581653741 86 0 914 0.914 0.086 0.172 ORF3a all ss13 181 AAA TAA AAG 2 CTAAAAGAA:CTCAAAGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.50000000000003 5 36.58333333333333 0.0408264049162627 0.150882768440169 0.270583614937129 -0.110056363523907 0.0242173006355431 0.095950541062061 NA NA 0.0973489913084339 0.25825119807429 89 0 911 0.911 0.089 0.178 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.83333333333336 5 36.58333333333333 0.0412002891133781 0.150882768440169 0.273061593045434 -0.109682479326791 0.0246312278402745 0.092218630788589 NA NA 0.0984647801660437 0.265310931564787 81 1 918 0.918 0.081 0.162 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.00000000000001 5 37.08333333333333 0.0416773883661081 0.148632696437812 0.280405249753011 -0.106955308071703 0.0239712318609149 0.0914485614164718 NaN NaN 0.0919542661026095 0.244774368498308 90 0 910 0.91 0.09 0.18 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.50000000000001 5 37.916666666666664 0.0573071018565008 0.145028544735405 0.395143604047424 -0.0877214428789039 0.0297349958488367 0.0880669631713227 NaN NaN 0.0913702518385822 0.337022160439349 143 1 856 0.856 0.143 0.286 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.66666666666669 5 37.416666666666664 0.0711433450940078 0.147169682776295 0.483410331203533 -0.0760263376822875 0.030740787629917 0.088447733553526 NaN NaN 0.0925038446886883 0.411149640552628 200 0 800 0.8 0.2 0.4 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.66666666666669 5 37.416666666666664 0.0711433450940078 0.147169682776295 0.483410331203533 -0.0760263376822875 0.0339263785584565 0.0875860932561089 NaN NaN 0.0959669647871 0.428236121552726 214 0 786 0.786 0.214 0.428 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.16666666666669 5 37.416666666666664 0.0716534971389809 0.147169682776295 0.486876751972739 -0.0755161856373143 0.031595067532579 0.0820502469560928 NaN NaN 0.0940702044104003 0.422111079380445 209 0 791 0.791 0.209 0.418 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.83333333333334 5 37.75 0.0719976858062998 0.145735279379414 0.494030588289179 -0.0737375935731141 0.0317629250989449 0.0898685758810938 NaN NaN 0.10002613118083 0.461010887071175 208 0 792 0.792 0.208 0.416 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCC:GGTTATTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.00000000000001 5 37.25 0.070807263353306 0.147897559919249 0.478758834100889 -0.077090296565943 0.0322798209658204 0.0858241488323055 NaN NaN 0.0977199015651408 0.430176041170701 222 0 778 0.778 0.222 0.444 ORF3a all ss13 190 TCC ATT CCG 2 TATTCCGAG:TATTCTGAG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.33333333333334 5 36.58333333333333 0.0694941228620286 0.150882768440169 0.460583561532314 -0.0813886455781408 0.031749802006755 0.0983582383147622 NaN NaN 0.0997880871952643 0.414720454519395 183 0 817 0.817 0.183 0.366 ORF3a all ss13 191 GAG CCG AGG 2 TCCGAGTAT:TCTGAGGAT 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.66666666666667 7 37.25 0.0701445435081176 0.216321047091377 0.324261297970177 -0.146176503583259 0.0314508940749925 0.12262751638686 NaN NaN 0.127173652347602 0.250381008869238 92 0 908 0.908 0.092 0.184 ORF3a all ss13 192 GAT AGG ATA 2 GAGGATAGG:GAGTATTGG 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.16666666666667 7 36.08333333333333 0.0716534971389809 0.224472453654356 0.319208419440693 -0.152818956515375 0.0330670984439998 0.119345414558763 NaN NaN 0.122258539774999 0.211312151240215 77 0 923 0.923 0.077 0.154 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 GATAGGCAC:TATTGGCAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.25 9 36.99999999999999 0.0575131971253351 0.294031565832018 0.195602118305192 -0.236518368706683 0.0313196727385901 0.157395072148029 NaN NaN 0.16337829306635 0.147708481582205 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.75 9 37.49999999999999 0.0579298692281369 0.289246860608989 0.200278298980219 -0.231316991380852 0.0296756844740669 0.148001995454368 0.31361452454391 0.523074749922315 0.153728470975466 0.13239827650891 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT:CATTCAGGT 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.08333333333333 9 36.49999999999999 0.05765141989764 0.298979357278323 0.19282742602183 -0.241327937380683 0.0295305660293637 0.159093595425364 0.283744654763624 0.496769915625702 0.15566554809011 0.121070084974291 24 0 976 0.976 0.024 0.048 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTA:TCAGGTGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.58333333333334 9 35.666666666666664 0.0556454425645553 0.307611718065443 0.180895067699329 -0.251966275500888 0.0282483445558675 0.165975109228931 NaN NaN 0.16866595823573 0.135207647327492 21 0 979 0.979 0.021 0.042 ORF3a all ss13 197 GTA GTG TAA 2 GGTGTAAAG:GGTGTTAAA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.91666666666667 9 35.666666666666664 0.0553884822155736 0.307611718065443 0.180059727776007 -0.252223235849869 0.0280166875871417 0.16199660618332 NaN NaN 0.161823403117973 0.119083356249452 21 0 979 0.979 0.021 0.042 ORF3a all ss13 198 AAA TAA AAG 2 GTAAAGGAC:GTTAAAGAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666667 9 35.33333333333333 0.0546316519559279 0.311207889047031 0.175547130643824 -0.256576237091103 0.0287075197654168 0.168284628851284 0.255701166606134 0.492377452436343 0.160830903180182 0.110641417183272 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT:AAGGACTAT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.91666666666667 9 35.666666666666664 0.0553884822155736 0.307611718065443 0.180059727776007 -0.252223235849869 0.0281486220981621 NA NaN NaN 0.171671986374137 0.141774201275856 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTA:GACTATGTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000001 9 35.666666666666664 0.0555166649189651 0.307611718065443 0.180476430703313 -0.252095053146478 0.0287916084748636 0.158069225692579 NaN NaN 0.172967305911282 0.144986058626678 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 201 GTA ATG TAG 2 TATGTAGTA:TATGTCGTT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.41666666666669 9 35.666666666666664 0.0550074627952336 0.307611718065443 0.178821090240558 -0.25260425527021 0.0279567991096076 0.15656431044438 NaN NaN 0.171033594114376 0.139695014922519 20 1 979 0.979 0.02 0.04 ORF3a all ss13 202 GTA TAG TAA 2 GTAGTAATA:GTCGTTGTA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.41666666666669 9 36.666666666666664 0.055774819305903 0.297311454441185 0.18759727710705 -0.241536635135282 0.0299587068011129 0.145612245093544 NaN NaN 0.158642444122431 0.1278782996462 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 203 ATA TAA TAC 2 GTAATACAT:GTTGTACAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.833333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000001 9 36.333333333333336 0.0555166649189651 0.300666330810564 0.184645433259182 -0.245149665891599 0.0279139874674897 0.151501602656291 0.262631087941296 0.48201830975446 0.155275677664283 0.114381309143054 25 0 975 0.975 0.025 0.05 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 ATACATGGT:GTACATGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.91666666666669 9 37 0.0569668741816512 0.294031565832018 0.193744076492103 -0.237064691650367 0.0296781308954594 0.156965468396317 NaN NaN 0.156783579046163 0.130521011879181 23 0 977 0.977 0.023 0.046 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT:CATGGTTAT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000001 9 36.5 0.0571024790858329 0.298979357278323 0.19099137681494 -0.241876878192491 0.0294428414872583 0.15550176796345 NA NA 0.161990916006246 0.135397697511441 10 1 989 0.989 0.01 0.02 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC:GGTTATTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.08333333333334 9 37.16666666666667 0.05765141989764 0.292418950983896 0.19715350083728 -0.234767531086256 0.0298133718705183 0.144835087129665 NaN NaN 0.150456238692048 0.118672266083746 22 0 978 0.978 0.022 0.044 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC:TATTTCACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.41666666666667 10 36.833333333333336 0.0573756358851215 0.337052108354688 0.170227791083104 -0.279676472469567 0.0283913008565159 0.162318115446982 NaN NaN 0.168349675824703 0.0966566012170692 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA:TTCACTGAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000001 10 37.16666666666667 0.0571024790858329 0.333245355900159 0.17135266275981 -0.276142876814326 0.0280185536510416 0.172733583923455 NaN NaN 0.164043290968631 0.0923066453140111 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAA 2 ACCGAAGTT:ACTGAAATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.25000000000001 10 36.666666666666664 0.0566975883332357 0.338988842807293 0.167255027816555 -0.282291254474057 0.0292087834772333 0.166229485803351 NaN NaN 0.174814212312483 0.106352446313888 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 210 ATC AAA TCT 2 GAAATCTAC:GAAGTTTAC 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.833333333333333 0.333333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.25000000000001 10 36 0.0566975883332357 0.346967641461085 0.1634088645687 -0.290270053127849 0.0298843285814764 0.168426074818426 0.186135998019558 0.379997779549557 0.17705094247211 0.101115008722595 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 211 TAC TCT ACT 2 ATCTACTAC:GTTTACTAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.08333333333336 9 36 0.0560353868844177 0.304098831081123 0.18426702491819 -0.248063444196706 0.0286439215806561 0.154284972165777 0.24873488236292 0.458804416919989 0.159792543347053 0.120564298906408 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.41666666666669 9 35.33333333333333 0.0550074627952336 0.311207889047031 0.176754718409213 -0.256200426251798 0.0272920833728146 0.165935837380346 NaN NaN 0.162584052483916 0.115071226988378 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT:TACCAGTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.75000000000001 9 35 0.0547563501152288 0.314890384170198 0.173890194391052 -0.260134034054969 0.0270763103282335 0.164924684769081 NaN NaN 0.160259424755343 0.10454541001923 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TAG 2 CAGCTTGAG:CAGTTAGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.08333333333336 9 34.33333333333333 0.0545075207127158 0.322527276629002 0.169001274194291 -0.268019755916287 0.0265678881569939 0.164898913178336 NaN NaN 0.16812432713305 0.110896635585276 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 215 GAA TAG AAT 2 CTTGAGTCT:TTAGAATCG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666669 8 34.166666666666664 0.0542609435735893 0.28068756657018 0.193314382381175 -0.226426622996591 0.0266973229589141 0.152087135662529 NaN NaN 0.156973632149434 0.149175454101911 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 216 TCG AAT CGA 2 GAATCGACA:GAGTCTACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.91666666666669 8 33.666666666666664 0.0538952343889476 0.285760509183 0.188602807795367 -0.231865274794053 0.0267312585672938 0.144284077533986 NaN NaN 0.165463113384057 0.161121104213183 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 217 ACA CGA CAC 2 TCGACACAA:TCTACACAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.08333333333336 8 33.166666666666664 0.053060794799115 0.291022534714547 0.18232538195422 -0.237961739915432 0.0273306650321313 0.156936710502652 NaN NaN 0.174918505382035 0.173698667976906 30 0 970 0.97 0.03 0.06 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT:ACACAACTA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.25000000000003 8 33 0.0529436946379863 0.292820423057718 0.180806017849208 -0.239876728419732 0.0269930404992193 0.160037093581133 NaN NaN 0.166437780723062 0.149516991022814 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TAT 2 CAAATTACT:CAACTATCG 1:1 FALSE 1.5 1 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.08333333333336 8 34.5 0.0545075207127158 0.277405622254096 0.196490324420276 -0.222898101541381 0.0279351746209965 0.144296993754065 NaN NaN 0.159585185652134 0.162493487584511 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 220 ACT TAT CGA 2 ATTACTACA:CTATCGACT 1:1 TRUE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.08333333333336 8 35.666666666666664 0.0410592825874941 0.266505540694197 0.154065399468027 -0.225446258106703 0.0248438520936821 0.14787456695504 NaN NaN 0.146025079719934 0.122615650471292 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 221 ACA CGA CAG 2 ACTACAGAC:TCGACTGAC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.58333333333336 8 36.166666666666664 0.0273067703935705 0.262094574111018 0.104186706215459 -0.234787803717448 0.0206863933933856 0.137041932697601 NaN NaN 0.144231130652208 0.103554993199108 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT:ACTGACACT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.41666666666669 8 36.33333333333332 0.0273690573365762 0.260656845281595 0.105000339841482 -0.233287787945019 0.0198220237965181 0.144294646889063 NaN NaN 0.139719080908344 0.0949803792763392 14 1 985 0.985 0.014 0.028 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.08333333333336 8 36.66666666666666 0.0274944876870936 0.257828654327118 0.106638603683709 -0.230334166640025 0.0200572870826018 0.136653735497193 NaN NaN 0.141125608274814 0.102653852816312 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT:ACTGGTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.4166666666667 8 36.33333333333332 0.0273690573365762 0.260656845281595 0.105000339841482 -0.233287787945019 0.0188598999230542 0.133299352501408 NaN NaN 0.14114338197103 0.0983629109814601 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 225 ATT GTA CTG 2 GGTATTGAA:GGTGCTGAA 1:1 TRUE 0.916666666666667 0.75 1.33333333333333 0 0 0 2 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.9166666666667 8 35.83333333333332 0.0271830432683088 0.265018643484554 0.102570305661885 -0.237835600216245 0.0205739370160105 0.141046347619955 NA NA 0.152688350806339 0.119315321753665 14 3 983 0.983 0.014 0.028 ORF3a all ss13 226 GAA CTG AAA 2 ATTGAAAAT:GCTGAAAAT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.6666666666667 6 35.166666666666664 0.0269087157486763 0.193580949501978 0.13900497862989 -0.166672233753302 0.019791354534704 0.113709274593671 NA NA 0.120097223095755 0.165194638672213 40 0 960 0.96 0.04 0.08 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTAT:TTCATCTTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TAT TCT ATA 2 ATCTATAGC:ATCTTTAAC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC ATA ACA 2 TATAGCAAG:TTTAACAAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT:AGCAAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAAGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:AAAGATGTG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA---:GATGTG--- 1:1 TRUE 0.5 0 1.5 1 0 0 2 1 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG:GTG---GAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C ACC 0 ---CCGAAT:---GACCAT 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.666666666666667 1.25 0 0 1 2 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT ACC ATG 2 CCGAATGTG:GACCATGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTA ATG TAC 2 AATGTGCAA:CATGTACAA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TAC AAA 2 GTACAAATA:GTGCAAATA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA:AATCCAGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG:CCAGTAATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT:GTAATGGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 74.5 6 32.08333333333332 0.115892704074692 0.215112484631514 0.538753965271775 -0.0992197805568221 0.050107606938365 0.101661133277804 NaN NaN 0.104007561883542 0.340100352799441 137 0 863 0.863 0.137 0.274 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.83333333333333 7 32.41666666666666 0.117025173722032 0.254671378073331 0.459514432314162 -0.137646204351299 0.0535698588197926 0.122395031887622 0.410817620801089 0.2633380008349 0.128125350419145 0.282684257142247 101 0 899 0.899 0.101 0.202 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.16666666666666 7 32.74999999999999 0.11818004032857 0.251591206901637 0.469730408244254 -0.133411166573066 0.0533451105055554 0.119391508483494 0.43395230020917003 0.279053909893361 0.119642648971566 0.264815992339522 97 0 903 0.903 0.097 0.194 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA:TTTATGAGT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.33333333333331 7 32.58333333333333 0.117889187641809 0.253121833623 0.465740888308329 -0.135232645981191 0.0540663545414311 0.11671857964442 NaN NaN 0.126702298722852 0.285824693042847 103 0 897 0.897 0.103 0.206 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAT 2 ATGAGATTT:ATGAGTATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.66666666666666 7 33.24999999999999 0.117311764843583 0.247109400847682 0.474736146990595 -0.129797636004099 0.0534292224628227 0.109914393913932 0.40770099385476 0.244252896847006 0.118693187781834 0.274149798827556 101 0 899 0.899 0.101 0.202 ORF3a all ss13 7 ATT GAT TTT 2 AGATTTTTT:AGTATTTTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.33333333333331 7 33.58333333333333 0.100629159672279 0.244209971081393 0.412059995857992 -0.143580811409114 0.0473351140002089 0.120540617627274 NaN NaN 0.113797215905405 0.207047697170766 74 0 926 0.926 0.074 0.148 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACA:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.91666666666666 7 33.16666666666666 0.084696240393644 0.247845145848439 0.341730478939608 -0.163148905454795 0.0439228524205219 0.109647425294549 NaN NaN 0.118941264075651 0.170164249318891 48 0 952 0.952 0.048 0.096 ORF3a all ss13 9 ACA TCA CAC 2 TTCACACTT:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.74999999999999 7 32.99999999999999 0.0837104884722512 0.249329979819956 0.335741768930874 -0.165619491347705 0.0447884929439148 0.115472661707613 0.311333169744089 0.280855174285642 0.11224311631559 0.140066744039978 41 0 959 0.959 0.041 0.082 ORF3a all ss13 10 CTT CAC TTA 2 ACACTTGGA:ACTCTTAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.24999999999999 7 33.49999999999999 0.0842991638602775 0.244928374228876 0.344178840551578 -0.160629210368599 0.0473396253580941 0.117121537415581 0.321449095041545 0.284299733057206 0.119095531949977 0.177419676278589 33 0 967 0.967 0.033 0.066 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAT 2 CTTAGATCA:CTTGGATCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.24999999999999 8 33.49999999999999 0.0842991638602775 0.287492986673213 0.293221635893673 -0.203193822812936 0.0447765909343749 0.123130342160628 0.242328958048016 0.226273197747728 0.129850677735681 0.117623521840674 18 0 982 0.982 0.018 0.036 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGATCAATC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.33333333333333 7 33.99999999999999 0.0842004764033108 0.240680790060076 0.349842945015652 -0.156480313656765 0.0441878217928124 0.108460131455846 NaN NaN 0.114631220617273 0.172229204014213 37 0 963 0.963 0.037 0.074 ORF3a all ss13 13 ATC CAA TCA 2 TCAATCACA:TCAATTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.33333333333333 8 33.99999999999999 0.0842004764033108 0.282358178426184 0.298204489321435 -0.198157702022873 0.0452573847645469 0.134444764195351 0.246076619414461 0.22557519097831 0.126302502083207 0.116668093168801 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 14 ACA TCA CAC 2 ATCACACGT:ATTACTGCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 75 8 33.83333333333333 0.0845966206090083 0.284049034433322 0.297824003442852 -0.199452413824313 0.0460052577909397 0.128327722850516 0.255422363380009 0.243612027201436 0.12468558766815 0.109677827867656 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 15 CGT CAC CAC 2 ACACGTCAA:ACTGCACAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 2 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.5 8 33.33333333333333 0.0840037937823711 0.289246860608989 0.290422491035883 -0.205243066826617 0.0438251236340547 0.126970672358602 0.221904059672826 0.190610569590507 0.135938956557059 0.131089902079878 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 16 CAA CAC AAC 2 CGTCAACCA:GCACAGCCA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.16666666666666 8 33.66666666666666 0.0551973146854054 0.285760509183 0.193159351665549 -0.230563194497595 0.033705499232182 0.12801239559118 0.148569100339036 0.193555939093024 0.117301160990261 0.0493487443916658 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 17 CCA AAC CAA 2 CAACCAAGT:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75 9 33.83333333333333 0.0553246126797069 0.328506491880477 0.168412539925805 -0.27318187920077 0.0331242160795355 0.139955802912832 0.138235869984444 0.223110595946131 0.135056770093639 0.0431021388819049 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 18 AGT CAA GTA 2 CCAAGTAAG:CCAGTAAAA 1:1 TRUE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 2 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.25 9 34.24999999999999 0.0551338852123344 0.323508417071989 0.170424886348678 -0.268374531859654 0.0338242171804488 0.133554854884321 0.135266429563898 0.207698205979929 0.13207868352672 0.0421608254064544 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 19 AAA GTA AAA 2 AGTAAGATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.83333333333333 8 34.416666666666664 0.0412002891133781 0.278218809519287 0.148085922675627 -0.237018520405909 0.0246105588818665 0.130083756975225 0.156503366930611 0.344038645852853 0.125043167582872 0.0580270425029785 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAC:AAGATTGAA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.08333333333333 8 33.49999999999999 0.0405047802473168 0.287492986673213 0.14088962905157 -0.246988206425896 0.0226335412750079 0.126586128456893 0.144099913765069 0.328211929932193 0.146252767855926 0.0912623095498393 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 21 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:ATTGACAAT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.91666666666667 8 33.83333333333333 0.0405961546323978 0.284049034433322 0.142919530472572 -0.243452879800924 0.0239173203341133 0.116351392250092 0.145893038381786 0.327274432089724 0.124888408784177 0.0512520549055426 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 22 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75 8 33.91666666666666 0.0271522864979704 0.283201052715922 0.0958763614668015 -0.256048766217952 0.0189402123541309 0.121734181075918 0.116145533365274 0.409096462057742 0.124620873432199 0.0399155461073144 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT:AATGCTTTT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.66666666666667 8 33.58333333333333 0.0272757331281561 0.286624098210084 0.0951620373111968 -0.259348365081928 0.0189443697519558 0.126563719220231 0.122251222122742 0.436325110959808 0.126188385574058 0.0398551044914724 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT:GCTTTTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74 9 34.41666666666666 0.0275260251378209 0.321552160019395 0.0856036082486917 -0.294026134881574 0.01877654647997 0.133485840613937 NaN NaN 0.140455558858153 0.0363157054218593 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA:TTTCTTGCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74 9 34.08333333333333 0.0136367393123929 0.325488997542435 0.0418961605933085 -0.311852258230042 0.0137790168393668 0.131639552691086 0.0651623571268744 0.520256314313739 0.136960127376199 0.0227888207941082 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT:CTTGCAAGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75 8 33.99999999999999 0.0134986770919624 0.282358178426184 0.0478069279494638 -0.268859501334222 0.0134540611088227 0.126276224394055 0.0793499829402487 0.546853412371459 0.130769614244224 0.0397845989428345 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333334 8 33.66666666666666 0.0134382094503063 0.285760509183 0.0470261250888957 -0.272322299732694 0.0134845429934026 0.127809548180467 0.0735484627158193 0.522569486965442 0.131517696639413 0.038394942647222 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666669 8 34.33333333333333 0.013559691378237 0.27903683339124 0.0485946289364058 -0.265477142013003 0.0142582266974058 0.120042227305668 0.0772200948211646 0.529152474153544 0.121959652652556 0.029498326856282 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666669 8 33.5 0.0132893842388272 0.287492986673213 0.0462250728012817 -0.274203602434386 0.0129633018447455 0.128568414685449 0.0642701487644506 0.471998703116669 0.131728151104725 0.0373802129403731 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333336 8 32.666666666666664 0.0131726767040263 0.29648455248311 0.0444295549083512 -0.283311875779084 0.0126780056163513 0.128398245145468 NA NA 0.133310504688219 0.0335696832830234 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CATGCTACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.4166666666667 8 33.33333333333333 0.0133782811395161 0.289246860608989 0.0462521221884626 -0.275868579469472 0.013656595381271 0.121744156566866 0.0736063870572087 0.529760902083864 0.127975945080974 0.0311126944906782 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.9166666666667 8 33.33333333333333 0.0132893842388272 0.289246860608989 0.0459447829817317 -0.275957476370161 0.0133765775814023 0.125057616325625 0.0651524965983093 0.480693016886457 0.124192840807529 0.0262827701004049 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.75000000000003 8 33.16666666666666 0.0131438194165355 0.291022534714547 0.0451642668476783 -0.277878715298012 0.0129541814361743 0.127831773624871 0.0830836791885032 0.586716935076777 0.123280688286006 0.0241941044514682 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000003 8 32.99999999999999 0.0130580012294226 0.292820423057718 0.044593888271409 -0.279762421828295 0.0132034267721525 0.119637977857214 0.0865691032755239 0.606465843898094 0.125693544624068 0.026030923676822 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.33333333333337 8 32.16666666666666 0.0130438070339019 0.30215833840741 0.0431687806553745 -0.289114531373508 0.0133034380954519 0.143456859542344 0.0561657121001394 0.44213276850832 0.131042503613752 0.0273654279781944 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000003 8 31.16666666666666 0.0130155110198637 0.314193196111627 0.0414251841890286 -0.301177685091763 0.0132161965759763 0.161457316822918 0.0631573766818968 0.511885810894394 0.152312575918335 0.0480002919960305 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000003 8 30.66666666666666 0.0129732964431592 0.320583011120205 0.0404678226641736 -0.307609714677045 0.0132369601803766 0.132468146246901 0.0683754713239656 0.553952997271713 0.1459284490598 0.0350354091709552 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.9166666666667 8 31.333333333333325 0.0129453051997499 0.312120297918684 0.0414753711503971 -0.299174992718934 0.0126203127052506 0.138505819528343 0.0645744936263215 0.520686719143542 0.136262419298402 0.0281220452604195 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333337 8 31.99999999999999 0.0130014090011593 0.304098831081123 0.0427538933804418 -0.291097422079964 0.0129134579251279 0.144159181808784 0.062368474839391 0.493025387131572 0.134069638650879 0.0299130014205334 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC:GCCTCATTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333337 8 31.99999999999999 0.0130014090011593 0.304098831081123 0.0427538933804418 -0.291097422079964 0.0131904543810305 0.137143700651498 0.0678303551120054 0.528494267271549 0.135545116015409 0.0317451166809773 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT:TCATTCTCT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.25000000000003 8 31.666666666666657 0.0128896835290581 0.308056623906756 0.0418419294660568 -0.295166940377698 0.0128452252169704 0.138370984103152 0.0985455982230097 0.671132225711297 0.136811693134354 0.0309691664202052 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC:TTCTCTTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333337 7 31.999999999999993 0.0130014090011593 0.258630364718797 0.0502702341826547 -0.245628955717638 0.0127128937170874 0.124195222007603 NaN NaN 0.117573462968724 0.0366939505320893 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCC 2 CCTTTCGGA:TCTTTCCGA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.416666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.9166666666667 6 31.666666666666657 0.0129453051997499 0.218397760919419 0.0592739831454879 -0.205452455719669 0.0126749399348116 0.104976421337359 NA NA 0.109907776839516 0.0615787495996206 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 44 CGA TCC GAT 2 TTCCGATGG:TTCGGATGG 1:1 FALSE 1 1 0.75 0.25 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.6666666666667 6 30.999999999999993 0.0128208250194751 0.223869741416997 0.0572691286384879 -0.211048916397522 0.0128858247750898 0.109917387488821 NaN NaN 0.105981578495454 0.0464398305480478 6 1 993 0.993 0.006 0.012 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 CGATGGCTT:GGATGGCTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.33333333333337 6 30.916666666666657 0.0127121687353299 0.224573223705648 0.0566058968454403 -0.211861054970318 0.0126694905011181 0.104313038107338 NaN NaN 0.10869607376914 0.0512817947240585 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.6666666666667 6 30.583333333333325 0.0128208250194751 0.227432270381152 0.0563720574832618 -0.214611445361677 0.0126960419292833 0.112912613292475 NaN NaN 0.11967839563579 0.0729354125074144 5 1 994 0.994 0.005 0.01 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.08333333333336 6 30.16666666666666 0.012752698321938 0.231110927283054 0.055179988552939 -0.218358228961116 0.0129224428861516 0.112139754032514 0.0996602256783295 0.579797076649087 0.108598988032223 0.0443588632942359 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.4166666666667 6 29.66666666666666 0.0256161505491714 0.235686824877377 0.108687240207419 -0.210070674328206 0.0182236981582522 0.124597565476311 NaN NaN 0.113789470426985 0.064872669345251 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.25000000000003 6 30.333333333333325 0.0260047718198447 0.229625165344413 0.113248788654503 -0.203620393524568 0.0180391687746797 0.111156854177479 NaN NaN 0.119510875805636 0.0884219556564452 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.4166666666667 6 31.16666666666666 0.0262896575662818 0.222476012792921 0.118168503814171 -0.196186355226639 0.0181132002033626 0.108039467805362 NaN NaN 0.106431005556338 0.065282365704938 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAC 2 GTTGCACTT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.08333333333336 6 30.5 0.026061253903872 0.228158530802244 0.114224323816586 -0.202097276898372 0.0182611414025621 0.107613906677749 NaN NaN 0.110631136101976 0.0677348526842018 11 1 988 0.988 0.011 0.022 ORF3a all ss13 52 CTT CAC TTC 2 GCACTTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.00000000000001 6 31.333333333333336 0.0394828001140665 0.221099655165484 0.178574679750248 -0.181616855051417 0.0220197302129118 0.108310586043376 NaN NaN 0.112780131222196 0.10731881765692 18 0 982 0.982 0.018 0.036 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 CTTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.08333333333336 5 31.583333333333336 0.0394395350433882 0.177819473768805 0.221795364745406 -0.138379938725417 0.0219293392455372 0.091738577801412 NaN NaN 0.096443075536439 0.151334008086919 43 1 956 0.956 0.043 0.086 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.41666666666669 5 31.250000000000004 0.0528271104098974 0.179963002222943 0.293544282754595 -0.127135891813046 0.025641302536101 0.0916724915414056 NaN NaN 0.0972820326112475 0.19125364752946 60 0 940 0.94 0.06 0.12 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.25000000000003 5 31.083333333333336 0.0522518101768581 0.181054357970061 0.288597362486566 -0.128802547793203 0.0267529936058599 0.0889532113911935 NaN NaN 0.0989340541583777 0.192949526484947 59 0 941 0.941 0.059 0.118 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.58333333333336 5 30.416666666666668 0.0513569565272317 0.185556129985381 0.276773160397762 -0.134199173458149 0.0262421276255189 0.0900656641851295 NaN NaN 0.102212437693134 0.189201928822591 55 1 944 0.944 0.055 0.11 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAGC:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.25000000000003 5 30.416666666666668 0.0515777829948789 0.185556129985381 0.277963239473374 -0.133978346990502 0.0251387018273028 0.0904328727039241 NaN NaN 0.100985313535489 0.184604233026311 55 0 945 0.945 0.055 0.11 ORF3a all ss13 58 AGC AAA GCG 2 CAAAGCGCT:CAGAGCGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.33333333333336 5 30.666666666666668 0.0521949688493964 0.183841843524739 0.283912344701726 -0.131646874675342 0.0259384067580566 0.0950055126658445 NaN NaN 0.0997091058596084 0.186731721892885 56 0 944 0.944 0.056 0.112 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.1666666666667 6 31.333333333333336 0.0530021800130169 0.221099655165484 0.239720771944882 -0.168097475152467 0.0266291460031731 0.101345312681933 NaN NaN 0.113147425382703 0.137371716202221 30 0 970 0.97 0.03 0.06 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.33333333333337 6 31.166666666666664 0.0528853382457436 0.222476012792921 0.237712540699697 -0.169590674547178 0.025843241918194 0.106625481270138 NaN NaN 0.10941681518637 0.121153337810358 32 0 968 0.968 0.032 0.064 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCCAAAGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.33333333333337 5 30.166666666666664 0.0521949688493964 0.187302855665743 0.27866616696193103 -0.135107886816347 0.0260667480898495 0.0918890335600788 NA NA 0.0989752240517932 0.172231755789518 49 0 951 0.951 0.049 0.098 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAAGTAATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.6666666666667 5 29.833333333333332 0.0533558250189307 0.189683904532547 0.281288099538121 -0.136328079513617 0.0261299897378171 0.0964562340604394 NaN NaN 0.10452747941522 0.19215450545438 57 0 943 0.943 0.057 0.114 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG:GTAATTGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.33333333333336 4 29.5 0.0528853382457436 0.149561992614941 0.353601455296875 -0.0966766543691975 0.0259152475620797 0.0806939864623757 NaN NaN 0.0875502133687486 0.269488018200326 106 0 894 0.894 0.106 0.212 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC:ATTGCGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.50000000000001 4 29.833333333333332 0.0527690107059348 0.147714914296514 0.357235496207305 -0.0949459035905793 0.0266573397970239 0.0796035678907514 NaN NaN 0.0888984928080191 0.285508774098675 124 0 876 0.876 0.124 0.248 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT:GCGCTTCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.66666666666669 5 30.166666666666668 0.0526531940049364 0.187302855665743 0.281112606734092 -0.134649661660807 0.0257463705956519 0.0929288114722873 NaN NaN 0.0997874693790159 0.177219940264888 52 0 948 0.948 0.052 0.104 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA:CTTCATAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.33333333333336 5 29.166666666666668 0.0521949688493964 0.194633396613813 0.26817067244097 -0.142438427764417 0.0267202214317995 0.100553079219936 NaN NaN 0.103998351909181 0.170804937380754 55 0 945 0.945 0.055 0.11 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA:CATAAGAAG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.00000000000001 4 28.5 0.0517446536152136 0.155392217528976 0.332993855406978 -0.103647563913762 0.0252921452385869 0.0823267505760745 NaN NaN 0.0937539217942944 0.268930969058471 113 0 887 0.887 0.113 0.226 ORF3a all ss13 68 AAG AAA AGT 2 AAAAGATGG:AAGAAGTGG 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.583333333333333 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.16666666666669 4 28.083333333333332 0.0788471565774535 0.157958351375552 0.499164215698806 -0.079111194798098 0.0377771260353253 0.0875163361212648 NaN NaN 0.0967830912874134 0.413695767509872 178 0 822 0.822 0.178 0.356 ORF3a all ss13 69 TGG AGT GGC 2 AAGTGGCAG:AGATGGCAG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.58333333333334 4 28.083333333333332 0.0794568138723562 0.157958351375552 0.503023823561217 -0.0785015375031953 0.038401016692954 0.0846513743181546 NaN NaN 0.0965613380086309 0.416234863475296 189 0 811 0.811 0.189 0.378 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA:TGGCAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.58333333333334 4 28.75 0.0948273658335069 0.153892310773211 0.616193007675692 -0.0590649449397036 0.0408863440266788 0.0850524753166867 NaN NaN 0.0959449689335224 0.538150142767319 260 1 739 0.739 0.26 0.52 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC:CAGCTTGCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.25 5 28.75 0.109910568819637 0.197860943283853 0.555494010063213 -0.0879503744642156 0.0453865590745868 0.0966241457671333 NaN NaN 0.106306018984312 0.408048894172898 196 0 804 0.804 0.196 0.392 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT:CTTGCCTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.08333333333334 5 28.583333333333332 0.108664266868125 0.199182311241132 0.545551792179853 -0.0905180443730069 0.0416787283481578 0.103568799429354 NaN NaN 0.104927445281494 0.388317436688522 191 0 809 0.809 0.191 0.382 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TAT 2 GCCCTTTAT:GCCTTATAC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.08333333333334 5 28.75 0.108664266868125 0.197860943283853 0.549195132018722 -0.0891966764157284 0.0439057677250787 0.0962083881153367 NaN NaN 0.106539664310038 0.402471351027131 201 0 799 0.799 0.201 0.402 ORF3a all ss13 74 TAC TAT ACA 2 CTTTATAAG:TTATACAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.08333333333334 4 28.583333333333336 0.123424890893523 0.154888999008431 0.796860278545704 -0.0314641081149074 0.0472112460513564 0.0879712767648148 NaN NaN 0.094778123010782 0.739907015419677 371 1 628 0.628 0.371 0.742 ORF3a all ss13 75 AAA ACA AAG 2 TACAAAGGC:TATAAGGGC 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.25000000000001 4 28.416666666666668 0.123142795706581 0.155898728322134 0.789889674097476 -0.0327559326155526 0.0454064031754396 0.0837262660775799 NaN NaN 0.0965069649748212 0.73429695552567 367 0 633 0.633 0.367 0.734 ORF3a all ss13 76 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTT:AAGGGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.83333333333334 4 28.166666666666668 0.125582619575832 0.157438341821211 0.79766223477153 -0.0318557222453799 0.0463802873584783 0.0864391244806155 NaN NaN 0.0949742196782111 0.737312496240367 390 0 610 0.61 0.39 0.78 ORF3a all ss13 77 TTC GCT TCC 2 GGCTTCCAG:GGCTTTCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.83333333333334 4 27.833333333333336 0.125582619575832 0.159539275483744 0.787158016075028 -0.0339566559079127 0.0475469535370162 0.0867790169414178 NaN NaN 0.0977323696465258 0.728256779739617 386 1 613 0.613 0.386 0.772 ORF3a all ss13 78 CAA TCC AAT 2 TTCCAGTTC:TTTCAATTA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.33333333333334 4 27.166666666666668 0.12471051706475 0.163914658204208 0.760825898251169 -0.0392041411394582 0.0448856008717791 0.0912100468224817 NaN NaN 0.102257221175388 0.701432464686394 344 1 655 0.655 0.344 0.688 ORF3a all ss13 79 TTA AAT TAG 2 CAATTAGTT:CAGTTCATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.16666666666667 4 27.666666666666668 0.124999865819317 0.160610991304224 0.778277157772759 -0.0356111254849071 0.0474293614147815 0.0891021149201918 NaN NaN 0.0976386989408234 0.715317834118631 347 0 653 0.653 0.347 0.694 ORF3a all ss13 80 ATT TAG TTT 2 TTAGTTTGT:TTCATTTGC 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.5 4 28.5 0.126170845288571 0.155392217528976 0.811950864045325 -0.0292213722404048 0.0468737005811288 0.0834768003357807 NaN NaN 0.0910666558663313 0.74830213218013 377 2 621 0.621 0.377 0.754 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT:GTTTGTAAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.16666666666666 4 28.166666666666668 0.124999865819317 0.157438341821211 0.793960761866178 -0.0324384760018947 0.0486199410313182 0.0869290499258255 NaN NaN 0.100010073387002 0.745671489716568 394 0 606 0.606 0.394 0.788 ORF3a all ss13 82 AAC GCA ACT 2 TGCAATTTA:TGTAACTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.99999999999999 4 28.833333333333336 0.125290563497375 0.153398778089708 0.816763764728976 -0.0281082145923333 0.047390443674117 0.0842468206605249 NaN NaN 0.0934476277052854 0.76357379660631 376 1 623 0.623 0.376 0.752 ORF3a all ss13 83 TTA ACT TAC 2 AACTTGCTG:AATTTACTG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.99999999999999 4 28.833333333333336 0.125290563497375 0.153398778089708 0.816763764728976 -0.0281082145923333 0.0470122522348226 0.0854262669227841 NaN NaN 0.0913399481442811 0.758286354130192 375 1 624 0.624 0.375 0.75 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG:TTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.33333333333333 4 28.666666666666668 0.12471051706475 0.154389040653112 0.807767938301756 -0.0296785235883616 0.0461977577636898 0.080661034193247 NaN NaN 0.0937694290424772 0.751618984207614 408 1 591 0.591 0.408 0.816 ORF3a all ss13 85 CTA TGC TAC 2 CTGCTACTC:CTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.75 4 29.666666666666668 0.123992985319038 0.148632696437812 0.834224153168861 -0.0246397111187739 0.0466250760756031 0.0784079112192937 NaN NaN 0.0936241454230235 0.792414244716143 378 0 622 0.622 0.378 0.756 ORF3a all ss13 86 CTA TAC TAT 2 CTACTCTTT:CTGCTATTT 1:1 FALSE 1.25 1 0.5 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.91666666666667 4 30 0.123708284429487 0.146808432844572 0.842651079590635 -0.0231001484150841 0.0470346816781296 0.0762168078862614 NaN NaN 0.0895886890971916 0.796525216409138 393 0 607 0.607 0.393 0.786 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:CTCTTTGTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.83333333333334 4 31 0.123850470889023 0.141595553474679 0.874677684784575 -0.0177450825856562 0.0461423923704623 0.076095778642245 NaN NaN 0.0895096978017942 0.842851348628798 453 0 547 0.547 0.453 0.906 ORF3a all ss13 88 GTG TTG TGA 2 TTTGTGACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80 4 30.000000000000004 0.121889197123331 0.146808432844571 0.830260188475531 -0.0249192357212402 0.0447119069192018 0.0788556931088739 NaN NaN 0.0889774043360564 0.779429542283073 382 0 618 0.618 0.382 0.764 ORF3a all ss13 89 ACA TGA CAA 2 GTGACAATT:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.83333333333334 4 30.166666666666668 0.12216555897624 0.145913043990275 0.837249060367642 -0.0237474850140348 0.0454796615620642 0.0772281637627703 NaN NaN 0.0925888878751693 0.797577828134764 399 0 601 0.601 0.399 0.798 ORF3a all ss13 90 ATC CAA TCT 2 ACAATTTAT:ACCATCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.5 4 29.833333333333336 0.121067579367254 0.147714914296514 0.819602948990173 -0.0266473349292605 0.0457390139997247 0.0779646278227804 NaN NaN 0.086588675133813 0.758275469180674 379 0 621 0.621 0.379 0.758 ORF3a all ss13 91 TAT TCT ATT 2 ATCTATTCA:ATTTATTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.16666666666666 5 29.666666666666668 0.12161408554722 0.19089739885116 0.637065178881982 -0.0692833133039408 0.0453137624526385 0.0975253985002593 NaN NaN 0.108391903336112 0.522697580755826 244 0 756 0.756 0.244 0.488 ORF3a all ss13 92 TCA ATT CAC 2 TATTCACAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.16666666666666 5 29.666666666666668 0.12161408554722 0.19089739885116 0.637065178881982 -0.0692833133039408 0.047092718428096 0.0952676080073944 NaN NaN 0.106114901939483 0.513815318326165 226 0 774 0.774 0.226 0.452 ORF3a all ss13 93 CAT CAC ATC 2 TCACATCTT:TCACATTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.5 5 29.000000000000004 0.119457200757053 0.195911624447713 0.609750447906346 -0.0764544236906602 0.0442205368308194 0.100680155689968 NaN NaN 0.107885118203064 0.478532295010469 221 0 779 0.779 0.221 0.442 ORF3a all ss13 94 CTT ATC TTC 2 CATCTTTTG:CATTTTCTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.16666666666667 5 28.666666666666668 0.119989202138919 0.198519415670312 0.604420488211536 -0.078530213531393 0.0461582122087709 0.101786370543584 NaN NaN 0.112396749207047 0.484747292823778 213 0 787 0.787 0.213 0.426 ORF3a all ss13 95 CTA TTC TAC 2 CTTTTGCTT:TTTCTACTT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.16666666666667 4 29.000000000000004 0.119989202138919 0.152421181209951 0.787221311279831 -0.0324319790710327 0.0449515327544061 0.0825816302365001 NaN NaN 0.0913753314620645 0.722640945232502 396 0 604 0.604 0.396 0.792 ORF3a all ss13 96 CTT TAC TTG 2 CTACTTTTA:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.08333333333333 1 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.16666666666667 4 30.000000000000004 0.12161408554722 0.146808432844571 0.828386239065534 -0.0251943472973518 0.045824195462451 0.0806800464154925 NaN NaN 0.093804394255409193 0.788249925681336 404 0 596 0.596 0.404 0.808 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TAG 2 CTTGTCGCT:CTTTTAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.25000000000001 4 30.416666666666664 0.121476995958792 0.144590316625212 0.84014613698972 -0.0231133206664197 0.0457043576353873 0.0808071258370251 NaN NaN 0.0888077930858764 0.794661449439361 376 0 624 0.624 0.376 0.752 ORF3a all ss13 98 GCT TAG CTG 2 GTCGCTGCA:TTAGCTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.25000000000001 4 30.583333333333332 0.106966265210453 0.143721781908901 0.744259247204811 -0.0367555166984484 0.042307517152631 0.0734040811771007 NaN NaN 0.0865874825203105 0.671208528359855 323 0 677 0.677 0.323 0.646 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.75000000000001 4 29.583333333333336 0.104859684055263 0.149095891727942 0.703303644654422 -0.0442362076726795 0.0446697236865478 0.0766997294310237 NaN NaN 0.092280740400444 0.631678598498772 315 0 685 0.685 0.315 0.63 ORF3a all ss13 100 GGC CAG GCA 2 GCAGGTATG:GCTGGCATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 82.91666666666669 4 29.416666666666664 0.103277820283538 0.150031026615648 0.688376415287197 -0.0467532063321103 0.0427026658942995 0.084011990639022 NaN NaN 0.0936121463109635 0.617472786579859 298 0 702 0.702 0.298 0.596 ORF3a all ss13 101 ATG GCA TGG 2 GGCATTGAG:GGTATGGAG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.25 1.16666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 83.25000000000003 4 29.749999999999996 0.102834601347038 0.148172379571929 0.694020043709415 -0.0453377782248908 0.0419783043630898 0.0810720537800001 NaN NaN 0.0877610360058447 0.605432018361995 319 0 681 0.681 0.319 0.638 ORF3a all ss13 102 GAG TGG AGG 2 ATGGAGGCG:ATTGAGGTG 1:1 FALSE 2.08333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.83333333333336 4 29.41666666666666 0.089658862987337 0.150031026615649 0.597602142768951 -0.0603721636283115 0.0404750351570068 0.0829987420254413 NaN NaN 0.0865664113192773 0.48554709282429 240 0 760 0.76 0.24 0.48 ORF3a all ss13 103 GCG AGG CGC 2 GAGGCGCAA:GAGGTGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.75000000000003 5 29.16666666666666 0.0897547785817448 0.194633396613814 0.461147881829519 -0.104878618032069 0.0376808813598572 0.104588581219514 NaN NaN 0.113229125688289 0.354315429565391 139 0 861 0.861 0.139 0.278 ORF3a all ss13 104 CAA CGC AAT 2 GCGCAATTT:GTGCAATTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.08333333333336 5 29.499999999999993 0.0759341342651253 0.192126605059278 0.395229667654289 -0.116192470794153 0.0400012320916719 0.0996568311875342 NaN NaN 0.109600749103549 0.289079532017907 102 0 898 0.898 0.102 0.204 ORF3a all ss13 105 TTC AAT TCT 2 CAATTCTTG:CAATTTTTG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.08333333333336 5 29.83333333333333 0.0769083042436382 0.189683904532547 0.405455088206716 -0.112775600288909 0.0382426202063137 0.100416284814268 NaN NaN 0.104566149490863 0.280806381877753 97 0 903 0.903 0.097 0.194 ORF3a all ss13 106 TTG TCT TGT 2 TTCTTGTAC:TTTTTGTAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.4166666666667 5 29.499999999999993 0.0765808130596598 0.192126605059278 0.398595566897316 -0.115545791999618 0.0372639105466091 0.100947467718581 NaN NaN 0.111527024294594 0.300186268698428 91 0 909 0.909 0.091 0.182 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACA 2 TTGTACATC:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.4166666666667 5 30.16666666666666 0.0775717695799524 0.187302855665743 0.414151558470552 -0.109731086085791 0.0367547953383722 0.094546019009074 NaN NaN 0.103787618649338 0.290390356695225 100 0 900 0.9 0.1 0.2 ORF3a all ss13 108 ATC ACA TCT 2 TACATCTAT:TACCTCTAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.4166666666667 5 30.66666666666666 0.0775717695799524 0.183841843524739 0.421948388314078 -0.106270073944786 0.0372815355859574 0.0968164376293358 NaN NaN 0.101443181297519 0.294831128763125 108 1 891 0.891 0.108 0.216 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 ATCTATGCT:CTCTATGCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.58333333333336 4 30.66666666666666 0.0774048314449127 0.143291427572032 0.540191641303885 -0.0658865961271192 0.0360375726994273 0.0827248548276115 NaN NaN 0.0884405126168022 0.456282559413137 194 0 806 0.806 0.194 0.388 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 TATGCCTTG:TATGCTTTG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.58333333333336 4 30.66666666666666 0.0774048314449127 0.143291427572032 0.540191641303885 -0.0658865961271192 0.038073164746309 0.0851595390604818 NaN NaN 0.0862821845548688 0.445095147945857 206 0 794 0.794 0.206 0.412 ORF3a all ss13 111 TTG CCT TGA 2 GCCTTGATA:GCTTTGATT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.25000000000003 4 30.999999999999993 0.0777394299845026 0.141595553474679 0.549024514377878 -0.0638561234901766 0.0369468221258041 0.0798855046043021 NaN NaN 0.086797681287099 0.461919816166633 209 1 790 0.79 0.209 0.418 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 TTGATATAT:TTGATTTAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.08333333333336 4 31.16666666666666 0.0759341342651253 0.140762624951505 0.539448126171886 -0.0648284906863797 0.0371863613616318 0.0812847821232816 NaN NaN 0.0882109476559189 0.462384757759699 211 0 789 0.789 0.211 0.422 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATA 2 ATATATTTT:ATTTATATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.4166666666667 4 32.16666666666666 0.0756148767114708 0.135964367940317 0.55613744878116 -0.0603494912288461 0.0372591256795755 0.0798513050531468 NaN NaN 0.0835698008553621 0.470205500289603 197 0 803 0.803 0.197 0.394 ORF3a all ss13 114 ATT ATA TTC 2 TATATTCTG:TATTTTCTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.08333333333337 4 32.49999999999999 0.0759341342651253 0.134437018317738 0.564830544557727 -0.0585028840526131 0.0371336213282288 0.0748131109115304 NaN NaN 0.0836165656737753 0.484141771208002 200 0 800 0.8 0.2 0.4 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 ATTCTGCAA:TTTCTACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.25000000000004 3 32.83333333333333 0.0767442089720042 0.0974341006801572 0.787652458803199 -0.020689891708153 0.0374168297840146 0.0628161923788937 NaN NaN 0.0720229294944813 0.773907029262073 397 1 602 0.602 0.397 0.794 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAA 2 CTACAATGC:CTGCAAATT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.9166666666667 3 33.16666666666666 0.0760947770152294 0.0963891381007338 0.789453858750191 -0.0202943610855044 0.0362980181377553 0.0615217578492772 NaN NaN 0.0683777274929449 0.766620862886749 371 1 628 0.628 0.371 0.742 ORF3a all ss13 117 ATT AAA GCA 2 CAAATTTTA:CAATGCATC 1:1 TRUE 2.08333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 0 2 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.58333333333336 3 33.83333333333333 0.0774048314449127 0.0943651299007743 0.820269431370513 -0.0169602984558616 0.0377859418487733 0.0581844944814128 NaN NaN 0.0676146173014821 0.801939554292104 398 0 602 0.602 0.398 0.796 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TAA 2 ATTTTAAGC:TGCATCAAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.50000000000003 3 33.99999999999999 0.0507593239355005 0.0938723572155045 0.54072706216348 -0.043113033280004 0.0265277719177849 0.0585755696580617 NA NA 0.0581324216719848 0.458308566638482 236 0 764 0.764 0.236 0.472 ORF3a all ss13 119 AAC TAA ACG 2 ATCAACGCA:TTAAGCTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.50000000000003 3 34.16666666666666 0.0377438129156367 0.0933847109044368 0.404175507426061 -0.0556408979888001 0.0217447191119221 0.0576900702350023 NA NA 0.0576978801098241 0.33487093869365 140 3 857 0.857 0.14 0.28 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AGCTTTTGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.50000000000003 3 34.49999999999999 0.0252655469877565 0.0924244803179612 0.273364231000676 -0.0671589333302046 0.0182400929104934 0.0583036075038887 NA NA 0.056520881824188 0.234748898553647 69 12 919 0.919 0.069 0.138 ORF3a all ss13 121 TGC CAT GCA 2 GCATGTAGA:TTTTGCAGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.50000000000003 2 34.16666666666666 0.0125263872134486 0.0609472230590744 0.205528432383328 -0.0484208358456258 0.0126003171921243 0.0464891765504056 NA NA 0.0482768667417468 0.315869471310156 105 48 847 0.847 0.105 0.21 ORF3a all ss13 122 AGA GCA GAA 2 TGCAGATTT:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.66666666666669 3 34.83333333333332 0.0255343810572878 0.0914838201648647 0.279113629178054 -0.0659494391075768 0.0184543273097237 0.0552178580949174 NA NA 0.0527258111179283 0.211007492542065 53 17 930 0.93 0.053 0.106 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATT:AGATTTATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.66666666666669 3 34.66666666666666 0.0255343810572878 0.0919517415692493 0.277693283689007 -0.0664173605119615 0.0187000786766585 0.0566539282911224 NA NA 0.0526967350343598 0.207536078965461 58 20 922 0.922 0.058 0.116 ORF3a all ss13 124 ATC TTA TCA 2 ATTATTATG:TTTATCATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000003 3 34.99999999999999 0.0126053387372859 0.0910206427532006 0.138488790630328 -0.0784153040159147 0.0123289671924156 0.0606481515720834 NA NA 0.0530214927388693 0.139157876197281 0 45 955 0.955 0 0.001 ORF3a all ss13 125 ATG TCA TGA 2 ATCATGAGA:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 3 35.49999999999999 0.0126852918315464 0.0896588629873371 0.141483969446924 -0.0769735711557907 0.0130744573554989 0.0549183979610014 NA NA 0.0507691780245132 0.129482015824648 0 37 963 0.963 0 0.001 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGC:ATGAGATGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.50000000000003 3 35.83333333333332 0.0125263872134486 0.0887734500607747 0.14110510749411 -0.0762470628473261 0.0126703390463956 0.0556040427579812 NA NA 0.0493120587268814 0.122052564112106 0 55 945 0.945 0 0.001 ORF3a all ss13 127 TGC GAT GCT 2 AGATGCTGG:AGATGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 3 36.16666666666666 0.0126852918315464 0.0879053734766805 0.144306216216822 -0.0752200816451341 0.0124221426328945 0.0525245194387704 NA NA 0.050857712804057 0.139132303972213 0 48 952 0.952 0 0.001 ORF3a all ss13 128 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCTC:TGTTGGCTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.00000000000003 3 36.16666666666666 0.012766265677073 0.0879053734766805 0.145227364063923 -0.0751391077996075 0.0132277102884483 0.0527199137176285 NA NA 0.0523343421199571 0.151073078104405 0 52 948 0.948 0 0.001 ORF3a all ss13 129 CTC GGC TCT 2 TGGCTCTGT:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.6666666666667 3 35.49999999999999 0.0128208250194751 0.0896588629873371 0.142995623547956 -0.0768380379678621 0.0133660525568929 0.0579626500425128 NA NA 0.0536075678210239 0.151759807796016 0 46 954 0.954 0 0.001 ORF3a all ss13 130 TGT TCT GTT 2 CTCTGTTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333337 4 34.99999999999999 0.0126318775458731 0.123992985319038 0.101875743320244 -0.111361107773165 0.0127806089591046 0.0704117723391416 NA NA 0.0658009321684022 0.0905708611906853 0 18 982 0.982 0 0.001 ORF3a all ss13 131 TGG GTT GGA 2 TGTTGGAAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.6666666666667 4 34.66666666666666 0.0126585283405138 0.125290563497375 0.101033373840473 -0.112632035156861 0.0128488695546516 0.0719204119000671 NA NA 0.0675274119772451 0.0953265690693588 0 17 983 0.983 0 0.001 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.33333333333337 4 34.66666666666666 0.0127121687353299 0.125290563497375 0.101461501812116 -0.112578394762045 0.0129319778401258 0.0697209456332377 NA NA 0.0673194205336128 0.0944648054880972 0 19 981 0.981 0 0.001 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333337 4 34.16666666666666 0.0126318775458731 0.127288788480472 0.0992379430794176 -0.114656910934599 0.0123362294017934 0.0689765584333793 NA NA 0.0645287094764057 0.0755952857659861 0 23 977 0.977 0 0.001 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.6666666666667 4 34.16666666666666 0.0255343810572878 0.127288788480472 0.20060196473003 -0.101754407423184 0.0184923010451372 0.072241250326976 NA NA 0.0702557203228368 0.147521041281089 25 10 965 0.965 0.025 0.05 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.00000000000003 4 34.16666666666666 0.0257536031856687 0.127288788480472 0.202324206971454 -0.101535185294803 0.017746042321086 0.073260631152367 NA NA 0.0690414327466905 0.141388137320283 22 5 973 0.973 0.022 0.044 ORF3a all ss13 136 AAG CCA AGA 2 TCCAAGAAC:TCCAAGAAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.00000000000003 4 34.83333333333332 0.0257536031856687 0.124638389543236 0.206626572118335 -0.0988847863575677 0.018809676280091 0.072265492753649 NA NA 0.0670016255543646 0.139982412215993 27 4 969 0.969 0.027 0.054 ORF3a all ss13 137 AAC AGA ACC 2 AAGAACCCA:AAGAATCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.6666666666667 4 33.99999999999999 0.0255343810572878 0.127969137773073 0.199535462234401 -0.102434756715785 0.0188229477398355 0.0744369493081047 NA NA 0.0703747034711374 0.145513689745373 26 8 966 0.966 0.026 0.052 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA:AATCCATTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.00000000000003 4 33.99999999999999 0.0257536031856687 0.127969137773073 0.20124854815649 -0.102215534587404 0.0182369105703482 0.0713718696841891 NA NA 0.0694352106949637 0.140994027464571 22 5 973 0.973 0.022 0.044 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTT:CCATTATTA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.83333333333337 4 34.16666666666666 0.0258089981982962 0.127288788480472 0.202759398580148 -0.101479790282176 0.0187665601072907 0.0675664716779179 NA NA 0.0696917579859432 0.145358546821701 24 5 971 0.971 0.024 0.048 ORF3a all ss13 140 CTT TAC TAT 2 TTACTTTAT:TTATTATAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.5 0.5 0 1 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.50000000000003 4 35.16666666666666 0.0262608883838265 0.123354245726484 0.21289002441031 -0.0970933573426571 0.0190856460818436 0.0652076572813873 NA NA 0.0637283301909757 0.127620926585196 26 4 970 0.97 0.026 0.052 ORF3a all ss13 141 TAT TAT ATG 2 CTTTATGAT:TTATATGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.1666666666667 3 35.66666666666666 0.0263763446044989 0.089213957146024 0.295652669697484 -0.0628376125415251 0.0190328591510254 0.0552428496687743 NA NA 0.0507506612027287 0.21565546989926 59 17 924 0.924 0.059 0.118 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.1666666666667 3 36.33333333333332 0.0263763446044989 0.0874776777943207 0.301520859601641 -0.0611013331898217 0.019149893876743 0.054960539058539 NA NA 0.0521523780659614 0.241360714582433 80 22 898 0.898 0.08 0.16 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.83333333333337 3 36.66666666666665 0.0264928206228062 0.0866346653413833 0.305799306991161 -0.0601418447185771 0.0185022611276899 0.0569339405666566 NA NA 0.0499135149470029 0.22823378245459 75 14 911 0.911 0.075 0.15 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.00000000000003 4 37.16666666666665 0.026434454296256 0.116173757560117 0.227542388672217 -0.0897393032638607 0.0182460800116128 0.0646338025160736 NA NA 0.0630851458910748 0.154878009701621 35 6 959 0.959 0.035 0.07 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.00000000000003 4 37.16666666666665 0.026434454296256 0.116173757560117 0.227542388672217 -0.0897393032638607 0.018883453916039 0.0626039145159125 NA NA 0.0613227499083653 0.143359782429407 37 9 954 0.954 0.037 0.074 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.1666666666667 4 36.999999999999986 0.0267288865855191 0.116739982283845 0.228960858675905 -0.090011095698326 0.0196572022731094 0.0673399239832801 NA NA 0.0642252278202273 0.161067218207434 50 4 946 0.946 0.05 0.1 ORF3a all ss13 147 GTT TTG TTT 2 TTTGTTTGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.6666666666667 4 35.999999999999986 0.026551445288187 0.120256987556385 0.220789210071788 -0.0937055422681976 0.0182935257481003 0.0678665688586339 NA NA 0.0637449656092237 0.141559872552372 37 2 961 0.961 0.037 0.074 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.6666666666667 4 36.999999999999986 0.0269087157486763 0.116739982283845 0.230501283469872 -0.0898312665351687 0.0189630757056123 0.0644665919737095 NA NA 0.0615961908388243 0.144733085391452 28 10 962 0.962 0.028 0.056 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGCTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.6666666666667 4 37.16666666666665 0.0269087157486763 0.116173757560117 0.231624734482328 -0.0892650418114404 0.0180872098382855 0.0654042066307884 NA NA 0.062382342516973 0.152449007933836 38 3 959 0.959 0.038 0.076 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.00000000000003 4 36.499999999999986 0.0267885619515594 0.118472334721436 0.22611660363195701 -0.0916837727698762 0.0190047950165444 0.0630586270870388 NA NA 0.0597568555854259 0.124960683491244 25 7 968 0.968 0.025 0.05 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACATAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333336 4 36.499999999999986 0.0270299523623976 0.118472334721436 0.228154129197785 -0.091442382359038 0.0198959356755185 0.0671702940557211 NA NA 0.0608201298882499 0.132713050330242 31 1 968 0.968 0.031 0.062 ORF3a all ss13 152 CAT CAC ATA 2 ACACATAAC:ACATATAAT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.16666666666669 4 35.66666666666665 0.0267288865855191 0.121476995958792 0.220032495655277 -0.094748109373273 0.0187081236441424 0.06853744005582 NA NA 0.0659981086972738 0.151110912212741 27 6 967 0.967 0.027 0.054 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 CATAACTAT:TATAATTAT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.83333333333336 3 36.66666666666665 0.0272138698048234 0.0866346653413833 0.314122178432701 -0.0594207955365599 0.0189623082679612 0.0542202886048069 NA NA 0.050818735368673 0.242295081402798 72 12 916 0.916 0.072 0.144 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC:AATTATGAC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.50000000000003 3 36.333333333333314 0.0273378783823658 0.0874776777943207 0.312512621181408 -0.0601397994119549 0.0195659760553312 0.0564518653712517 NA NA 0.0506685546294397 0.235257008930742 75 15 910 0.91 0.075 0.15 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.00000000000003 3 36.499999999999986 0.0271522864979704 0.0870541284395655 0.31190119279432 -0.0599018419415951 0.0191280496085979 0.0539977232952515 NA NA 0.0502540978593745 0.233269381054558 79 15 906 0.906 0.079 0.158 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.33333333333336 3 36.499999999999986 0.027400307499342 0.0870541284395655 0.314750236324102 -0.0596538209402235 0.0197289340889244 0.0572505666620769 NA NA 0.050950166704009 0.241668400689361 85 22 893 0.893 0.085 0.17 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.33333333333336 3 36.499999999999986 0.027400307499342 0.0870541284395655 0.314750236324102 -0.0596538209402235 0.0184925156444728 0.0551296110447095 NA NA 0.0503374233961505 0.235986232390234 82 17 901 0.901 0.082 0.164 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.41666666666669 3 36.16666666666665 0.0273690573365762 0.0879053734766806 0.311346806846075 -0.0605363161401044 0.0193312172666151 0.0552330792095374 NA NA 0.0504345702780779 0.2300251480637 60 15 925 0.925 0.06 0.12 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAC:ATACCATAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.08333333333336 4 36.16666666666665 0.0274944876870936 0.119656146346601 0.229779150729557 -0.0921616586595075 0.0200596750985853 0.0633129524606983 NA NA 0.061908116213895 0.136570444537294 31 4 965 0.965 0.031 0.062 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATACAAC:CCATATAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.75000000000003 4 36.16666666666665 0.0272447663451876 0.119656146346601 0.227692159383683 -0.0924113800014135 0.0191069244459394 0.0628771967382555 NA NA 0.0623225040335086 0.13812938541259 32 7 961 0.961 0.032 0.064 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAACAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.75000000000003 4 36.16666666666665 0.0272447663451876 0.119656146346601 0.227692159383683 -0.0924113800014135 0.0188848577855096 0.0632315443529993 NA NA 0.0620968195480444 0.136702856651286 27 6 967 0.967 0.027 0.054 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.9166666666667 5 35.66666666666665 0.0271830432683088 0.155190536855492 0.175159154798341 -0.128007493587183 0.0196361273754083 0.0797397170123076 NaN NaN 0.0769930340977937 0.0963954577168215 15 2 983 0.983 0.015 0.03 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.25000000000003 5 35.66666666666665 0.0274316291149154 0.155190536855492 0.176760965396098 -0.127758907740576 0.0197274275919492 0.0815366712836031 NA NA 0.0731592710277982 0.0807567640745842 14 2 984 0.984 0.014 0.028 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.9166666666667 5 35.66666666666665 0.0271830432683088 0.155190536855492 0.175159154798341 -0.128007493587183 0.0201422306536227 0.0772151546528288 NA NA 0.0805020402337574 0.111808908170903 7 1 992 0.992 0.007 0.014 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000003 5 35.333333333333314 0.0270604324233619 0.15681884839392 0.172558545739271 -0.129758415970558 0.019451352271527 0.0804756479714191 NA NA 0.076706158103263 0.0907165981159441 4 3 993 0.993 0.004 0.008 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATC:GATACAATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.08333333333337 5 35.499999999999986 0.0271215992572094 0.156000428408735 0.173855928050072 -0.128878829151525 0.0194559560226494 0.0761293413015236 NaN NaN 0.0758455351297461 0.0892763016823176 9 1 990 0.99 0.009 0.018 ORF3a all ss13 167 ATC CAA TCG 2 ACAATCGTC:ACAATTGTC 1:1 FALSE 2 0.5 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.08333333333337 5 35.499999999999986 0.0271215992572094 0.156000428408735 0.173855928050072 -0.128878829151525 0.019508692416166 0.0769754608964225 NA NA 0.0814240987504665 0.113464912834485 9 3 988 0.988 0.009 0.018 ORF3a all ss13 168 GTC TCG TCG 2 ATCGTCGTT:ATTGTCGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.08333333333337 5 35.999999999999986 0.0274944876870936 0.15359580948451 0.179005454506664 -0.126101321797416 0.0196927026220664 0.0785869965215132 NA NA 0.0761337929325458 0.0976586331037039 15 1 984 0.984 0.015 0.03 ORF3a all ss13 169 GTT TCG TTA 2 GTCGTTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.4166666666667 5 35.333333333333314 0.0269995408952429 0.15681884839392 0.172170253587258 -0.129819307498677 0.0197600237938167 0.0833211998845243 NA NA 0.0759415311877836 0.0873650497131259 12 2 986 0.986 0.012 0.024 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTA 2 GTTACTACA:GTTACTGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.08333333333337 5 34.66666666666665 0.0267586909940917 0.160180575223544 0.167053283188351 -0.133421884229453 0.0184687597550344 0.0847590698972577 NaN NaN 0.0827547094184339 0.106905961353092 7 2 991 0.991 0.007 0.014 ORF3a all ss13 171 ACA CTA AAG 2 ACTACAGGT:ACTGAAGGT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.08333333333337 5 34.66666666666665 0.0267586909940917 0.160180575223544 0.167053283188351 -0.133421884229453 0.0188187271417429 0.0828548577336559 NA NA 0.0775041817144501 0.0851637922885341 11 3 986 0.986 0.011 0.022 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 ACAGGTGAC:GAAGGTGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000004 4 34.66666666666665 0.0133188849757348 0.125290563497375 0.106303975366939 -0.11197167852164 0.0134190409159407 0.068930960570879607 NA NA 0.0713516992364696 0.116579825046913 20 4 976 0.976 0.02 0.04 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.4166666666667 4 34.66666666666665 0.0132016609860952 0.125290563497375 0.105368358299161 -0.11208890251128 0.0127448887484055 0.0684075064237052 NA NA 0.0704705400524767 0.111704540945806 18 6 976 0.976 0.018 0.036 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.4166666666667 4 34.999999999999986 0.0133782811395161 0.123992985319038 0.1078954676758 -0.110614704179522 0.0129998096396709 0.0715057687057241 NA NA 0.0711532324606811 0.120041735568362 28 4 968 0.968 0.028 0.056 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TTT 2 GGCATTTCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.4166666666667 4 34.999999999999986 0.0133782811395161 0.123992985319038 0.1078954676758 -0.110614704179522 0.0138101718307602 0.0694402023711993 NA NA 0.0664681068516396 0.0960770343357306 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 176 TCA TTT CAA 2 ATTTCAACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333337 4 35.16666666666665 0.0133932130500048 0.123354245726484 0.108575209317902 -0.109961032676479 0.0133391293746086 0.0698832375710143 NA NA 0.071128042589921 0.122114486694948 26 2 972 0.972 0.026 0.052 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 TCAACACCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.08333333333337 4 35.08333333333332 0.0264053674769446 0.123672788927057 0.213509921673382 -0.0972674214501122 0.0185637133746949 0.0670397989804096 NaN NaN 0.0705508666414103 0.167991896849446 57 2 941 0.941 0.057 0.114 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA:ACACCAGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.75000000000003 4 35.08333333333332 0.0261749574292545 0.123672788927057 0.211646859881947 -0.0974978314978024 0.0180682069491262 0.0717558927910328 NA NA 0.0761691216033911 0.200538875649631 52 1 947 0.947 0.052 0.104 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC:CCAGAACTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.25000000000003 4 35.58333333333332 0.0263473854682498 0.12178588422283 0.216341866189043 -0.0954384987545805 0.0182426860143446 0.0682606192659387 NA NA 0.0722914447459985 0.18677132984163 47 0 953 0.953 0.047 0.094 ORF3a all ss13 180 CTC AAC TCA 2 AAACTCAAA:GAACTCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.08333333333336 3 36.08333333333332 0.0267586909940917 0.0881207952860292 0.303659209012314 -0.0613621042919375 0.0190143452299965 0.0567201477645432 NA NA 0.0608474430142367 0.313234533637738 122 7 871 0.871 0.122 0.244 ORF3a all ss13 181 AAA TCA AAG 2 CTCAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.75000000000001 3 36.08333333333332 0.0265221005560517 0.0881207952860292 0.300974366719731 -0.0615986947299775 0.0188638042386939 0.055280509217177 NA NA 0.0579790564038207 0.28804047488882 120 8 872 0.872 0.12 0.24 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC:AAAGAATAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.08333333333334 3 36.08333333333332 0.0267586909940917 0.0881207952860292 0.303659209012314 -0.0613621042919375 0.018796776898363 0.0560498182977748 NA NA 0.0591213206513142 0.299315939501059 117 12 871 0.871 0.117 0.234 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC:GAATACTAC 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000001 3 36.58333333333332 0.0270604324233619 0.0868438898173542 0.311598576253022 -0.0597834573939923 0.0188241858608155 0.0543987248011604 NA NA 0.05834324148813 0.305511737880382 130 4 866 0.866 0.13 0.26 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA:TACTACCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666667 3 37.583333333333314 0.0136522540928075 0.0843980831669965 0.161760238864597 -0.0707458290741891 0.0138015667123347 0.0540284047225629 NA NA 0.053949951424777 0.189748555083782 56 13 931 0.931 0.056 0.112 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25 3 36.91666666666665 0.0134081783305544 0.0860130038580104 0.155885479278093 -0.072604825527456 0.0135228428665464 0.0525192662060097 NA NA 0.0540142879573546 0.178890786299775 44 14 942 0.942 0.044 0.088 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25 3 36.91666666666665 0.0134081783305544 0.0860130038580104 0.155885479278093 -0.072604825527456 0.0135792349484729 0.053097776292814 NA NA 0.0570025989072334 0.202765929548475 55 19 926 0.926 0.055 0.11 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75 3 36.91666666666665 0.0134986770919624 0.0860130038580104 0.15693763136381 -0.072514326766048 0.0133679588913902 0.0537564122425327 NA NA 0.0581635347509911 0.212495864774398 63 10 927 0.927 0.063 0.126 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666667 3 37.249999999999986 0.013559691378237 0.0851978832927791 0.159155261306665 -0.0716381919145421 0.0129005380925676 0.0531842780062739 NA NA 0.0550942348045724 0.193503401618522 52 10 938 0.938 0.052 0.104 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333333 3 36.749999999999986 0.0133485169832455 0.0864264476831886 0.154449446217862 -0.0730779306999431 0.013209399283979 0.0516014223165024 NA NA 0.0582853241892214 0.209916011447373 59 19 922 0.922 0.059 0.118 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666667 3 36.083333333333314 0.0131150882907867 0.0881207952860293 0.14883079809047 -0.0750057069952426 0.01325755026434 0.0563894537378084 NA NA 0.0573177091938946 0.190671342937713 54 15 931 0.931 0.054 0.108 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGG 2 TCTGAGGAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333333 3 36.91666666666665 0.0132600139021293 0.0860130038580104 0.154162897554639 -0.0727529899558811 0.0127173778664508 0.0522697059441709 NA NA 0.0544839400417857 0.18177466699983 43 20 937 0.937 0.043 0.086 ORF3a all ss13 192 GAT AGG ATA 2 GAGGATAGG:GAGGATTGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75 3 35.583333333333314 0.0134986770919624 0.0894358561096487 0.150931378969672 -0.0759371790176862 0.0137882948084164 0.0564536470513571 NA NA 0.0594566247112457 0.201536527114559 60 16 924 0.924 0.06 0.12 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 GATAGGCAC:GATTGGCAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.91666666666667 3 36.749999999999986 0.0138412232800193 0.0864264476831886 0.160150320313484 -0.0725852244031693 0.0135478953293546 0.0558965011505534 NA NA 0.0564936217823558 0.198848452505807 62 16 922 0.922 0.062 0.124 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.41666666666667 2 37.249999999999986 0.0139376833302847 0.0557100557871529 0.250182541254946 -0.0417723724568682 0.0132622490748137 0.0419925869372341 NA NA 0.0440478938305042 0.342956476664285 146 37 817 0.817 0.146 0.292 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT:CATTCAGGT 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.75 2 36.249999999999986 0.0138732279313668 0.0573071018565008 0.242085666207758 -0.043433873925134 0.0147046257498346 0.0461751558085316 NA NA 0.0444882257182311 0.328915606637678 115 51 834 0.834 0.115 0.23 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25 2 35.41666666666665 0.0134081783305544 0.0587096677913667 0.228381096929424 -0.0453014894608123 0.013202993184744 0.0435057068859677 NA NA 0.0440347406903969 0.303589162481911 124 36 840 0.84 0.124 0.248 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333333 2 35.41666666666665 0.0133485169832455 0.0587096677913667 0.227364887000917 -0.0453611508081212 0.0130904917821212 0.043919772186637 NA NA 0.0455775353919138 0.319613529434798 104 49 847 0.847 0.104 0.208 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333334 2 35.08333333333332 0.0131726767040263 0.0592901175479514 0.222173226311666 -0.0461174408439251 0.0131336015455897 0.0442279000150792 NA NA 0.0492218225141151 0.348794162112108 133 34 833 0.833 0.133 0.266 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.41666666666667 2 35.58333333333332 0.0133782811395161 0.0584236862456271 0.228987282371582 -0.0450454051061109 0.01348756762589 0.0452603335418673 NA NA 0.0463277058047251 0.330890838197329 116 46 838 0.838 0.116 0.232 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000001 2 35.58333333333332 0.0134081783305544 0.0584236862456271 0.229499013023301 -0.0450155079150727 0.0135218481114275 0.0437890670993361 NA NA 0.0479812559453763 0.348147061369674 133 37 830 0.83 0.133 0.266 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666667 2 35.58333333333332 0.0132893842388272 0.0584236862456271 0.227465692304239 -0.0451343020067999 0.01306467968522 0.0441318247105997 NA NA 0.0473195088643045 0.340174677587513 126 40 834 0.834 0.126 0.252 ORF3a all ss13 202 GTT TCG TTG 2 GTCGTTGTA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666667 2 36.58333333333332 0.0134683754007452 0.0567646707244323 0.237266863858478 -0.0432962953236871 0.0132674974374717 0.0433653942489096 NA NA 0.0439647056179985 0.324723960761275 129 50 821 0.821 0.129 0.258 ORF3a all ss13 203 GTA TTG TAC 2 GTTGTACAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000001 2 36.24999999999999 0.0134081783305544 0.0573071018565008 0.233970623119784 -0.0438989235259464 0.0131583163089265 0.0415644881885828 NA NA 0.0456327369261441 0.33604706547843 134 51 815 0.815 0.134 0.268 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 GTACATGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333334 2 36.91666666666666 0.0137146678675636 0.0562324166616758 0.24389255667382 -0.0425177487941122 0.0133920160420267 0.041390954239692 NA NA 0.0460880104234431 0.35625019240079 129 47 824 0.824 0.129 0.258 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.41666666666667 2 36.41666666666666 0.0137460892532251 0.0570345959917882 0.241013178303293 -0.0432885067385631 0.0133849778604051 0.0428975191781078 NA NA 0.0452623296732943 0.338874484530136 150 42 808 0.808 0.15 0.3 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.75 2 37.08333333333333 0.0138732279313668 0.0559700169039056 0.247868925163729 -0.0420967889725388 0.0140530418504764 0.042806139260254 NA NA 0.0420403576476822 0.316661342876384 153 43 804 0.804 0.153 0.306 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC:TATTTCGCC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.08333333333333 3 36.74999999999999 0.0138093659583391 0.0864264476831886 0.159781714145649 -0.0726170817248494 0.0140432508452477 0.0526814733623345 NA NA 0.0554178537222806 0.190075647217237 56 17 927 0.927 0.056 0.112 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA:TTCGCCGAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666667 3 37.08333333333333 0.0137934922285677 0.0856035011092873 0.1611323374608 -0.0718100088807197 0.0140163401922607 0.051747416707015 NA NA 0.0569086061555095 0.207003498860905 63 20 917 0.917 0.063 0.126 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT:GCCGAAGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.5 2 36.74999999999999 0.0137303605832671 0.0564972895530332 0.243026890172821 -0.0427669289697661 0.0143326278143436 0.0427253124019633 NA NA 0.0444022839531479 0.33546243079887 117 50 833 0.833 0.117 0.234 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTC 2 GAAGTTCAC:GAAGTTTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.5 2 36.08333333333333 0.0137303605832671 0.0575822255219405 0.238447897051763 -0.0438518649386734 0.0136320673840015 0.0454115457655363 NA NA 0.0463737418134105 0.344343240448613 129 48 823 0.823 0.129 0.258 ORF3a all ss13 211 CAC TTC ACT 2 GTTCACTAC:GTTTACTAC 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.5 2 36.08333333333333 0.0135443861537981 0.0575822255219405 0.23521817767598 -0.0440378393681424 0.0136964278349167 0.0429965777776203 NA NA 0.0449569399208233 0.327305342753544 124 41 835 0.835 0.124 0.248 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 CACTACCAG:TACTACCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666667 1 35.74999999999999 0.013423177093157 0.0285069944752381 0.470873108170583 -0.0150838173820811 0.0138293399884043 0.0308510821425825 NA NA 0.0339118693270338 0.65646817519795 276 129 595 0.595 0.276 0.552 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333334 1 35.58333333333333 0.0133932130500048 0.0286430990492925 0.467589523988176 -0.0152498859992876 0.0137063932586471 0.0302264965490457 NA NA 0.0331715191804167 0.64571125630899 269 124 607 0.607 0.269 0.538 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666667 1 34.91666666666666 0.013333684515963 0.0292007684815911 0.456621014079436 -0.0158670839656281 0.013385034829189 0.0301116938876211 NA NA 0.0329137347945459 0.629748454371065 270 124 606 0.606 0.27 0.54 ORF3a all ss13 215 GAG TTG AGT 2 CTTGAGTCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.00000000000001 1 34.58333333333332 0.0132746828245506 0.0294878275056261 0.450175002618213 -0.0162131446810755 0.0133287774453239 0.030830408133244 NA NA 0.0345021248809764 0.638414118014001 298 144 558 0.558 0.298 0.596 ORF3a all ss13 216 TCT AGT CTA 2 GAGTCTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.50000000000001 1 34.08333333333332 0.0131871529184001 0.0299291581301553 0.440612223740209 -0.0167420052117552 0.0133974368833744 0.032025769256922 NA NA 0.034537167063479 0.627851363207338 276 112 612 0.612 0.276 0.552 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333336 1 33.41666666666666 0.0129592857062641 0.0305385697640887 0.4243579776779 -0.0175792840578246 0.0122409492279204 0.032679572385282 NA NA 0.0344956740016856 0.61032586169586 275 148 577 0.577 0.275 0.55 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.00000000000003 1 33.24999999999999 0.0129313548258795 0.0306948207819131 0.421287842589369 -0.0177634659560336 0.013154652402453 0.0337655083809239 NA NA 0.0345314251089118 0.606962220161686 240 131 629 0.629 0.24 0.48 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333336 1 34.74999999999999 0.0133041182530361 0.0293435958691742 0.453390862945065 -0.016039477616138 0.0134477481667339 0.0316965184975789 NA NA 0.0322298558080167 0.618724415164384 300 141 559 0.559 0.3 0.6 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CTA 2 ATTACTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000003 1 35.58333333333332 0.0134532755150005 0.0286430990492925 0.469686450193412 -0.015189823534292 0.013263833122714 0.0289568129582158 NA NA 0.0334731324163314 0.649978889912507 293 125 582 0.582 0.293 0.586 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.33333333333336 1 36.249999999999986 0.0135750312327134 0.0281063333749098 0.482988337597664 -0.0145313021421964 0.0131557644881262 0.0290970520559954 NA NA 0.0332656959019242 0.662237950157218 305 114 581 0.581 0.305 0.61 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000003 1 36.583333333333314 0.0136367393123929 0.02784542552167 0.489729966661145 -0.0142086862092771 0.0141549581636243 0.0284659004217611 NA NA 0.0311432694888228 0.648220153282756 284 118 598 0.598 0.284 0.568 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.33333333333337 1 37.249999999999986 0.0137618540011474 0.0273378783823658 0.503398757162679 -0.0135760243812184 0.0139039079914308 0.0281925485943652 NA NA 0.0333469363908906 0.683923827074327 278 142 580 0.58 0.278 0.556 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.6666666666667 1 36.91666666666665 0.0136990109829699 0.0275893176123833 0.496533157341346 -0.0138903066294134 0.014175913219666 0.0290674312532137 NA NA 0.0314981276875727 0.659221447765053 282 132 586 0.586 0.282 0.564 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTC 2 GGTATTCAA:GGTATTGAA 1:1 FALSE 1.25 0.583333333333333 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.1666666666667 1 36.41666666666665 0.0136058153029875 0.0279752710599065 0.486351509297332 -0.014369455756919 0.0131580662626847 0.0292566802541213 NA NA 0.0328838275805141 0.662128481862649 297 127 576 0.576 0.297 0.594 ORF3a all ss13 226 CAA TTC AAA 2 ATTCAAAAC:ATTGAAAAT 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333337 1 35.91666666666665 0.0135291154422588 0.0283721774047871 0.476844453960592 -0.0148430619625283 0.0131478800826659 0.0292590414062575 NA NA 0.0331242420317835 0.654079086677478 294 127 579 0.579 0.294 0.588 ORF3a all ss13 227 AAC AAA ACG 2 CAAAACGCT:GAAAATGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ACG CTA 2 AACGCTACA:AATGCTACA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTT TCT TTA 2 ATCTTTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TTA ACA 2 TTTAACAAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAAGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:AAAGATCCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA---:GATCCG--- 1:1 FALSE 0.166666666666667 0 1.83333333333333 1 0 0 0 1 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG:CCG---CCG 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C CGA 0 ---CCGAAT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT CGA ATG 2 CCGAATGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAC:GCAATGGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAC TGG ACC 2 ATGGACCCA:ATGGATCCA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ACC CAA 2 GACCCAATT:GATCCAATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 68.74999999999999 10 33.49999999999999 0.179963002222943 0.380635771846751 0.472795820922997 -0.200672769623808 0.0636574585672631 0.162117138693723 0.336597295427786 0.160130303993139 0.158732251200482 0.206150434467951 66 0 934 0.934 0.066 0.132 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 68.41666666666664 10 33.666666666666664 0.199793889563991 0.378184989500961 0.528296720151774 -0.17839109993697 0.0655915323859023 0.155978035186795 0.387050078606703 0.172274681528967 0.161866715536687 0.270424127107175 117 1 882 0.882 0.117 0.234 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG:TTGTTTATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 67.66666666666664 10 34.08333333333333 0.202335646591906 0.37219669468357103 0.543625586906205 -0.169861048091665 0.0666945168845165 0.153853221780951 0.324631763131832 0.0940144107179491 0.159399573163302 0.286590702607441 113 0 887 0.887 0.113 0.226 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA:TTTATTAGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 67.83333333333331 10 33.916666666666664 0.201765204947521 0.374568636610963 0.538660168595694 -0.172803431663443 0.0660168345893085 0.153537923022918 0.423703394292361 0.203616870067446 0.164970303376017 0.294877306428058 122 0 878 0.878 0.122 0.244 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAT 2 ATGAGATTT:ATTAGCATT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 67.49999999999999 10 34.25 0.202909342656595 0.369855206523338 0.548618321650669 -0.166945863866743 0.0721088872929418 0.159217958502017 0.359835332220772 0.127349621597941 0.16298833976305 0.305702557291813 108 0 892 0.892 0.108 0.216 ORF3a all ss13 7 ATT GAT TTT 2 AGATTTTTT:AGCATTTTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 67.49999999999999 10 34.25 0.183738969921944 0.369855206523338 0.496786219799639 -0.186116236601394 0.0663145191661545 0.155820874393413 0.351280307160126 0.157298500797145 0.156448190779912 0.234189900351687 78 0 922 0.922 0.078 0.156 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACA:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 68.08333333333331 10 33.83333333333333 0.163466307281544 0.375766217752027 0.435021296644122 -0.212299910470483 0.0604072347304054 0.153719739802927 0.294369672706813 0.139459686398825 0.158484919830626 0.180388740847259 51 0 949 0.949 0.051 0.102 ORF3a all ss13 9 ACA TCA CAT 2 TTCACATTA:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 68.91666666666664 10 33.666666666666664 0.179471289611342 0.378184989500961 0.474559526670176 -0.198713699889619 0.0638658524735745 0.164055066612081 0.324703886877511 0.143874225092795 0.15645531600632 0.204049460036107 72 0 928 0.928 0.072 0.144 ORF3a all ss13 10 CTT CAT TAG 2 ACATTAGGT:ACTCTTAGA 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 68.91666666666664 10 33.666666666666664 0.179471289611342 0.378184989500961 0.474559526670176 -0.198713699889619 0.0635465946132242 0.150997183915397 NaN NaN 0.157914154229554 0.20825965727249 68 0 932 0.932 0.068 0.136 ORF3a all ss13 11 AGA TAG GAT 2 CTTAGATCA:TTAGGTTCA 1:1 TRUE 1.33333333333333 1.16666666666667 0.5 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 68.91666666666664 11 33.83333333333333 0.179471289611342 0.426205388008903 0.421091085802024 -0.246734098397561 0.0659042524281875 0.172334652501417 0.259532592842705 0.104696783271555 0.176873730917985 0.163023948688653 56 0 944 0.944 0.056 0.112 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGTTCAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 69.49999999999999 10 34.08333333333333 0.15975246858483 0.37219669468357103 0.429215172694229 -0.212444226098741 0.0615588819609312 0.146177372190413 0.33970957392855 0.206417871360722 0.157291090083708 0.176809582426108 56 0 944 0.944 0.056 0.112 ORF3a all ss13 13 ATC CAA TCA 2 TCAATCACT:TCAATTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 69.83333333333333 11 33.74999999999999 0.158903109406266 0.427623797664225 0.371595571327483 -0.268720688257959 0.0593218704859112 0.17060005748903 0.226743422770467 0.101247155494224 0.176002434966037 0.126810510573052 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 14 ACT TCA CTC 2 ATCACTCGT:ATTACTGCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 69.58333333333333 11 33.416666666666664 0.159539275483744 0.433395768826612 0.368114520166372 -0.273856493342868 0.0601174861576246 0.172946866812432 0.24111296657817 0.126828039747199 0.187029923741147 0.143128679818382 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 15 CGT CTC CAC 1 ACTCGT---:ACTGCACAG 1:1 TRUE 0.5 0.5 1.5 0.5 0 0 2 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 70.08333333333333 11 32.916666666666664 0.17610346448782 0.442360526313466 0.39809940989859 -0.266257061825645 0.0635811960640404 0.176062554807632 0.285732680093095 0.163541714966691 0.195096647983554 0.172333392897386 28 0 972 0.972 0.028 0.056 ORF3a all ss13 16 --- CAC AGC 1 CGT------:GCACAGCCA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 70.41666666666666 10 32.583333333333336 0.175164425421709 0.394717387097679 0.443771749477967 -0.21955296167597 0.0578745704281 0.148927601812751 0.30995514812341 0.152221416444628 0.162392419009842 0.176378445172962 59 0 941 0.941 0.059 0.118 ORF3a all ss13 17 --- AGC CAG 1 ------GGT:CAGCCAGTA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 72.41666666666666 10 33.25 0.169734844556617 0.384373398718765 0.441588427093018 -0.214638554162148 0.0603296457402773 0.149659715403821 0.308473348186455 0.152278769946365 0.149759644785527 0.151794907017607 50 0 950 0.95 0.05 0.1 ORF3a all ss13 18 GGT --G GTA 1 ---GGTAGT:CCAGTAAAA 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 74.33333333333333 10 34 0.199131161218094 0.373378821179385 0.533322057713671 -0.17424765996129 0.0668282245586698 0.144349389409628 0.294986832314717 0.0706139587235819 0.151229546529812 0.249236245079365 104 1 895 0.895 0.104 0.208 ORF3a all ss13 19 AAA GTA AAA 2 GGTAGTGTG:GTAAAAATT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 74.66666666666667 10 33.916666666666664 0.19811368128119 0.374568636610963 0.528911558302614 -0.176454955329773 0.0676641682591852 0.13443317347239 0.365823888739337 0.148230713938851 0.161667465603726 0.275066760347412 103 1 896 0.896 0.103 0.206 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TGC 2 AAAATTGAC:AGTGTGCAA 1:1 TRUE 1.41666666666667 0.75 0.833333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.58333333333333 10 33.333333333333336 0.161796742774019 0.383119217824493 0.42231434824065 -0.221322475050474 0.0580397345642929 0.151551501974778 0.278702039786853 0.129699039243644 0.156136979561273 0.156339963205581 45 0 955 0.955 0.045 0.09 ORF3a all ss13 21 CAA TGC AAA 2 ATTGACAAT:GTGCAAAAT 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.83333333333333 9 33.5 0.145028544735405 0.332619377773053 0.436019529909524 -0.187590833037648 0.0535840139341701 0.133510746498789 0.303356713170851 0.150628156834565 0.140376081503091 0.181436631211336 59 0 941 0.941 0.059 0.118 ORF3a all ss13 22 AAT AAA ATG 2 CAAAATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 75 9 33.5 0.130765040358583 0.332619377773053 0.393137168477913 -0.201854337414469 0.0468142679699134 0.127275882652459 0.299596589776344 0.189445317236112 0.137382956737134 0.141756253862161 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTG 2 AATGCTGTT:AATGCTTCT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.25 10 33.833333333333336 0.148448225790773 0.375766217752027 0.395054740894073 -0.227317991961254 0.0525173094510438 0.14325204077382 0.246123241889927 0.108469720459511 0.148118632644633 0.124856994245042 40 0 960 0.96 0.04 0.08 ORF3a all ss13 24 GTT CTG CTC 2 GCTGTTCCT:GCTTCTCCT 1:1 TRUE 1 1 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 73.41666666666667 10 34.666666666666664 0.150313866488423 0.364130861836276 0.412801776071396 -0.213816995347853 0.0530340605256308 0.138444028825778 0.251175208528884 0.100283376598972 0.132917446079998 0.1076939715658 33 0 967 0.967 0.033 0.066 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 GTTCCTGCA:TCTCCTGCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 74.08333333333334 9 34 0.132534762850759 0.326488553443384 0.405939998364266 -0.193953790592625 0.0476362190574522 0.124363588207755 0.255133700138427 0.111589922955585 0.134639335946505 0.149713754504531 43 0 957 0.957 0.043 0.086 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAAT:CCTGCAAGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 75.08333333333334 10 33.666666666666664 0.130606503128167 0.378184989500961 0.345350838224728 -0.247578486372794 0.0447172826534147 0.142057071635671 0.26818863227746 0.197844782895851 0.14846433545866 0.0953960138344569 28 0 972 0.972 0.028 0.056 ORF3a all ss13 27 AAT CAA ATT 2 GCAAATTCT:GCAAGTACT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.08333333333334 11 33 0.128733683316993 0.440839998676589 0.292019062933161 -0.312106315359596 0.047612782828341 0.17415141058576 0.197616815510153 0.139487153114936 0.180671183386685 0.0840810376605301 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 28 ACT ATT CTC 2 AATTCTCTT:AGTACTGTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.41666666666667 11 33.666666666666664 0.114370944999209 0.429051936755032 0.266566667579243 -0.314680991755823 0.0470043134342822 0.157680955541995 0.189783610872827 0.160145574842051 0.174671899833603 0.0716154851743257 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 29 CTT CTC TTC 2 ACTGTTCAT:TCTCTTCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.08333333333334 10 33.666666666666664 0.11328912210942 0.378184989500961 0.29956007048009 -0.264895867391541 0.0447911381163465 0.141400355903656 0.228293910937079 0.189463299749608 0.15403143034334 0.0854775228805662 22 0 978 0.978 0.022 0.044 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 CTTCATGCT:GTTCATGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.58333333333334 10 33.166666666666664 0.112491115941025 0.385635998709722 0.291702839769634 -0.273144882768697 0.0448263849976496 0.162280127704847 0.205518800117757 0.155797383423446 0.160261399742797 0.0883117974782645 18 0 982 0.982 0.018 0.036 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CATGCTACG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.75000000000001 11 33.5 0.113827458253345 0.431937817010051 0.263527419389388 -0.318110358756707 0.0454143852727801 NA 0.197126429891197 0.181273340877759 0.182066957281701 0.08059982218956 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACGGCT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.25000000000001 11 33.5 0.113021862643589 0.431937817010051 0.261662346274622 -0.318915954366463 0.0438825804035425 0.181654664968161 0.183925937992459 0.154837467414184 0.180345583735322 0.0770007040405473 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACGGCTACC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.08333333333336 11 33.33333333333333 0.126913940754554 0.434863871439707 0.291847516176452 -0.307949930685152 0.0467564553558628 0.180003996499118 0.208017842262308 0.160619012919739 0.182499802575519 0.0915267125215627 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 34 ACC CAA CCA 2 GCAACGATA:GCTACCATC 1:1 FALSE 1.08333333333333 1 0.916666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.41666666666669 11 32.99999999999999 0.126318765773573 0.440839998676589 0.286541071937175 -0.314521232903017 0.0453028528463978 0.18037634501259 0.187387265168785 0.126230125540492 0.201647009180258 0.118816262794834 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 35 ATA CCA TAC 2 ACCATCCCT:ACGATACCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.58333333333336 11 32.08333333333333 0.126023271644748 0.45818181174223 0.275050795153885 -0.332158540097482 0.0475089506102878 0.204221025209537 0.187403918412663 0.1421885380074 0.212841888910434 0.118620944932849 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA:ATCCCTTTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 77.58333333333336 11 31.249999999999996 0.141428177785303 0.475215900934439 0.297608260807785 -0.333787723149136 0.0512074604932362 0.199916241156139 0.202177834825039 0.141017554561217 0.214650139497406 0.119938573228904 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA:CCTTTACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 78.16666666666669 11 30.416666666666664 0.171768261601848 0.493612753892137 0.347981814180154 -0.321844492290289 0.0562623796657265 0.224964404700806 0.226596842941718 0.124615177696699 0.239487076338007 0.178983682978745 30 0 970 0.97 0.03 0.06 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC:TTACAAGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 78.25000000000003 11 30.916666666666668 0.171562720556584 0.482401878032766 0.35564272936958 -0.310839157476182 0.0579881902869596 0.202862451480645 0.235000030604631 0.130184909003711 0.219595438385168 0.156919527532185 43 0 957 0.957 0.043 0.086 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCA 2 CAAGCCACT:CAAGCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.08333333333336 11 31.416666666666668 0.188257162672323 0.471705209541701 0.399099180726093 -0.283448046869378 0.0615744374744465 0.210990194928415 0.278023455262138 0.151148242169879 0.21274809133862 0.18275581459617601 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 40 ACT CCA CAC 2 GCCACTCTG:GCCTCACTC 1:1 TRUE 1 1 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.75000000000001 11 31.75 0.189175159494502 0.46484204699122 0.40696653996551 -0.275666887496718 0.0600009967458136 0.194438588356401 0.291138068434387 0.162158950620814 0.203669817809983 0.175896280634672 44 0 956 0.956 0.044 0.088 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 ACTCTGCCT:TCACTCCCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.25000000000001 11 31.416666666666668 0.187801514593863 0.471705209541701 0.398133221331872 -0.283903694947838 0.0611885396001824 0.205614544849241 0.361791317126821 0.271136143903391 0.21812694361959 0.193069365474806 49 0 951 0.951 0.049 0.098 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC:CTGCCTTTC 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.91666666666669 11 31.916666666666668 0.188715038816376 0.461487146936458 0.40892804939237 -0.272772108120082 0.0620055060590737 0.198463113176829 0.346697023160977 0.238200387212503 0.211028241668116 0.196154354196064 32 0 968 0.968 0.032 0.064 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.33333333333336 11 31.5 0.221099655165484 0.469969873663787 0.470454953722537 -0.248870218498304 0.0739990749537669 NA 0.33405132959753 0.159032982285439 0.209447888087515 0.234746654149477 64 0 936 0.936 0.064 0.128 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.83333333333336 11 31.166666666666668 0.219470498668977 0.476991575039997 0.460113993943339 -0.25752107637102 0.0705482367488676 0.218109074796605 0.298240172017295 0.122888215427488 0.240450871793054 0.284172809308808 72 0 928 0.928 0.072 0.144 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.00000000000003 11 30.833333333333336 0.218932806420976 0.484233634931206 0.452122262122662 -0.26530082851023 0.0704430640019553 0.216102976486008 0.3112264258641 0.146303824325209 0.23147616035737 0.251743051870015 72 0 928 0.928 0.072 0.144 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTA 2 TGGCTTATT:TGGCTTGTT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.33333333333336 11 30.5 0.221099655165484 0.49170694593066 0.449657376197941 -0.270607290765176 0.0686780080550943 0.222604482707922 0.267372106504397 0.0926141819623996 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 47 ATT TTA TTA 2 CTTATTGTT:CTTGTTATT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.00000000000001 11 29.58333333333334 0.218932806420976 0.513548987725995 0.426313383247848 -0.294616181305019 0.0723398203349393 0.25521746619921 0.268473920336404 0.112305882879496 0.235218580421072 0.210380127964953 43 0 957 0.957 0.043 0.086 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 ATTGTTGGC:GTTATTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.25000000000001 10 29.08333333333334 0.218131224556612 0.459993680357088 0.474204829047388 -0.241862455800476 0.0716418773544284 0.210537321506059 0.361559621291101 0.189670791728181 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.66666666666669 9 29.41666666666667 0.220010857490594 0.393100353726364 0.559681148604976 -0.17308949623577 0.0704155982856783 0.197099180392265 0.46000106672765 0.223720157438842 0.183764271160587 0.346238464708165 140 0 860 0.86 0.14 0.28 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.83333333333336 9 30.250000000000007 0.222753358291529 0.378998328336262 0.58774232400807 -0.156244970044734 0.0688808327876304 0.162801827971261 0.455219198587988 0.196662289027967 0.19603526848032 0.425436630103505 181 0 819 0.819 0.181 0.362 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAT 2 GTTGCATTG:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.50000000000001 9 29.583333333333346 0.220553902912914 0.390194741999512 0.565240581620113 -0.169640839086598 0.0680412785316296 0.163420331132184 0.449444903614513 0.208521422471995 0.202298012123327 0.401711219981871 145 0 855 0.855 0.145 0.29 ORF3a all ss13 52 TTG CAT TGC 2 GCATTGCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.83333333333334 10 30.083333333333346 0.219470498668977 0.439179787705354 0.499728140531413 -0.219709289036376 0.0694739713956598 0.188795574539636 0.352310594493096 0.15606507660947 0.196014648276602 0.262338097982008 94 0 906 0.906 0.094 0.188 ORF3a all ss13 53 CTT TGC TTG 2 TTGCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 79.00000000000001 10 30.083333333333346 0.202172332401979 0.439179787705354 0.460340703424213 -0.237007455303375 0.0671662341420731 0.189047009725455 0.311459811704294 0.139405112713272 0.215367936515825 0.271124356296357 68 0 932 0.932 0.068 0.136 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 79.41666666666669 10 29.66666666666668 0.200955878734158 0.447612053716135 0.448950999120322 -0.246656174981977 0.0690795354472434 0.185814497083705 0.35274135464549 0.203107332387211 0.230761203994044 0.285123473101327 62 0 938 0.938 0.062 0.124 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.41666666666669 10 30.00000000000001 0.217600112429929 0.440839998676589 0.493603377831344 -0.223239886246659 0.0699495200346453 0.206904070746662 0.348331768775034 0.156468439683531 0.207599306475737 0.282222430351744 93 0 907 0.907 0.093 0.186 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 80.75000000000001 10 29.333333333333346 0.213443159911581 0.454601852677736 0.469516696103061 -0.241158692766155 0.0681699005565414 0.201017491827982 0.344493309449522 0.172907839323369 0.866821087570544 0.780850806454981 84 0 916 0.916 0.084 0.168 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAAT:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 80.41666666666669 11 29.16666666666668 0.214467334863233 0.524158391451698 0.409165127108333 -0.309691056588464 0.0717343688742446 0.229090265445048 NA NA 0.262965872917283 0.238922068713917 45 0 955 0.955 0.045 0.09 ORF3a all ss13 58 AAT AAA ATG 2 CAAAATGCT:CAGAGCGCT 1:1 TRUE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.58333333333334 11 29.333333333333346 0.217071598340042 0.519860385419959 0.417557491257359 -0.302788787079917 0.0704577960122344 0.251989245631236 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 59 GCT ATG CTA 2 AATGCTTCA:AGCGCTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.41666666666669 11 29.833333333333346 0.203900474239319 0.507394724492928 0.401857694604708 -0.303494250253609 0.0683156926885811 0.227057492809427 NA NA 0.259507713442874 0.242202273234277 40 0 960 0.96 0.04 0.08 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CAA 2 GCTACCAAA:GCTTCAAAA 1:1 TRUE 1 1 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.41666666666669 11 29.66666666666668 0.220826439413092 0.511480409971365 0.431739779487263 -0.290653970558273 0.0722666784367454 0.216456517249449 NA NA 0.263466492754494 0.269944052656516 63 0 937 0.937 0.063 0.126 ORF3a all ss13 61 AAA CAA AAA 2 ACCAAAATA:TCAAAAGTA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.41666666666669 10 28.66666666666668 0.217600112429929 0.469279424823309 0.463689863479225 -0.25167931239338 0.0754050935021047 0.238423300373067 0.360778206267827 0.19870525213609 0.265268506838073 0.342736622763913 87 0 913 0.913 0.087 0.174 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAAGTAATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.50000000000001 10 28.583333333333346 0.223869741416997 0.471183220743389 0.4751224822136 -0.247313479326392 0.0717937241246899 0.223040242800882 0.40156935617426 0.236744081935153 0.237450203200454 0.297625790584454 90 0 910 0.91 0.09 0.18 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTC 2 ATAATTGCG:GTAATTCCT 1:1 FALSE 1.25 0.583333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.16666666666667 9 28.250000000000014 0.221648134682889 0.414750411612527 0.534413296471806 -0.193102276929638 0.0695964028197702 0.19654523110622 0.427508442810021 0.211275842442246 0.213817404953571 0.366463445979943 122 0 878 0.878 0.122 0.244 ORF3a all ss13 64 CCT TTC CGC 2 ATTCCTTTT:ATTGCGCTC 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.91666666666667 9 29.083333333333346 0.222476012792921 0.399046457298014 0.557519077601465 -0.176570444505093 0.0729801164368823 0.189547001413641 0.504037290326267 0.268680292970695 0.191255069311007 0.355892733327692 155 0 845 0.845 0.155 0.31 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 CCTTTTAAC:GCGCTCAAT 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.08333333333334 9 29.583333333333346 0.204901396368095 0.390194741999512 0.525125980217209 -0.185293345631417 0.0684672337463043 0.17075268667254 NaN NaN 0.193488418674378 0.338241463372061 126 0 874 0.874 0.126 0.252 ORF3a all ss13 66 AAC TCA ACA 2 CTCAATAAA:TTTAACAGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.91666666666667 8 28.750000000000007 0.202417403270485 0.347735297618175 0.582101974280294 -0.14531789434769 0.0701436905963806 0.16722818147421 0.518713592539272 0.261776117235003 0.182339259701447 0.425471720998092 206 0 794 0.794 0.206 0.412 ORF3a all ss13 67 AAA ACA AAA 2 AACAGCTTG:AATAAAAGA 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.58333333333334 8 28.083333333333343 0.203403693684308 0.358311508790663 0.567672789441835 -0.154907815106355 0.0669720504284831 0.16944247099115 0.603270309428306 0.346708742745578 0.193379418748469 0.423099013220362 184 0 816 0.816 0.184 0.368 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AGCTTGTGG 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.583333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 78.83333333333334 8 27.666666666666675 0.170137650782942 0.365261231304204 0.465797178023649 -0.195123580521262 0.0600070841265802 0.188531116529509 0.444805371606478 0.295010462702901 0.862981917735661 0.821120608405169 110 0 890 0.89 0.11 0.22 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG:TTGTGGCAG 1:1 FALSE 2.58333333333333 0 0.416666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 78 9 28.25000000000001 0.156222782397911 0.414750411612527 0.376666973736146 -0.258527629214616 0.0578836625812483 0.20006432604528 0.308029875169708 0.221395381824827 0.203115871486955 0.203085966632814 51 0 949 0.949 0.051 0.102 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCGC:TGGCAGCTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.08333333333334 10 28.50000000000001 0.17448602671933 0.473103037489357 0.368811892743884 -0.298617010770027 0.0610314652175995 0.2248496790863 0.246652345660379 0.134843949077473 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 71 CGC AGC GCT 2 CAGCGCTGC:CAGCTAGCC 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.83333333333334 11 28.333333333333346 0.191746695912757 0.546809392339506 0.350664598302482 -0.355062696426749 0.0645912813546616 0.283215876183164 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 72 GCC GCT CCC 2 CGCTGCCTT:CTAGCCCTT 1:1 TRUE 1.25 0.75 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.08333333333334 11 28.50000000000001 0.191038422684604 0.542117211529546 0.35239320689635 -0.351078788844943 0.058381113073105 0.246668327385601 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TTT 2 GCCCTTTAT:TGCCTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.50000000000001 10 28.083333333333343 0.173430571160122 0.482949898333899 0.359106755707849 -0.309519327173777 0.0622354441350682 0.227953188656081 0.27411095317627 0.190169417474832 0.251204951602879 0.217897299947829 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 74 TAT TTT ATA 2 CTTTATAAG:CTTTATCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.00000000000001 10 27.91666666666668 0.188485821210679 0.487008418426164 0.387027850195686 -0.298522597215485 0.0614180372279925 0.229097531063719 NA NA 0.232131969258778 0.198441731510372 41 0 959 0.959 0.041 0.082 ORF3a all ss13 75 AAG ATA AAA 2 TATAAGGGC:TATCAAAGC 1:1 TRUE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.16666666666667 10 27.91666666666668 0.20465023999998 0.487008418426164 0.420219101471256 -0.282358178426184 0.0634308615910146 NA 0.283825855489981 0.138725840673828 0.239205293744801 0.237840746995937 52 0 948 0.948 0.052 0.104 ORF3a all ss13 76 AGC AAA GCT 2 AAGGGCTTC:CAAAGCTTC 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.50000000000001 9 27.41666666666668 0.227287577010071 0.431776444265285 0.526401057836367 -0.204488867255214 0.0733928626813392 0.198916531218045 0.391975873151037 0.179290594299306 0.221584836385889 0.35608702430026 124 0 876 0.876 0.124 0.248 ORF3a all ss13 77 TTC GCT TCC 2 AGCTTCCAA:GGCTTCCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.16666666666669 8 27.083333333333343 0.228450345406382 0.375466090193812 0.608444680819135 -0.147015744787429 0.070603063687058 0.173492179524821 0.490800828984464 0.215087211624477 0.21136114311468 0.486700309586201 194 0 806 0.806 0.194 0.388 ORF3a all ss13 78 CAA TCC AAC 2 TTCCAACTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.33333333333334 8 26.75000000000001 0.227867466473375 0.381563200668848 0.597194556691899 -0.153695734195473 0.0701164315253435 0.169152362529206 0.505096692006969 0.237071971362136 0.192048300569185 0.423538573749212 174 0 826 0.826 0.174 0.348 ORF3a all ss13 79 CTT AAC TCA 2 CAACTTGTT:CAGTTCATT 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.66666666666667 8 26.75000000000001 0.2267106539047 0.381563200668848 0.594162784847427 -0.154852546764147 0.0664014850937162 0.184824753197662 0.515639910783762 0.249205054082598 0.214307339716946 0.469942693146224 175 0 825 0.825 0.175 0.35 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 CTTGTTTGC:TTCATTTGC 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.16666666666667 7 27.25000000000001 0.228450345406382 0.314491607077193 0.726411580676328 -0.0860412616708106 0.071775138674934 0.144799542337858 0.594969533456812 0.222115434246041 0.161530312938105 0.59426670905572 280 0 720 0.72 0.28 0.56 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT:GTTTGCAGT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.83333333333334 6 26.91666666666668 0.226136674284849 0.26452672930594 0.854872681026153 -0.0383900550210916 0.0716076003418248 0.128371017521649 NaN NaN 0.138566311586776 0.781740281858341 417 0 583 0.583 0.417 0.834 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATT 2 TGCAATTTA:TGCAGTCTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.66666666666667 6 27.583333333333343 0.2267106539047 0.256899645924678 0.882487218262539 -0.0301889920199777 0.0688799505838511 0.121782194463627 0.861121212504607 0.30545197646231 0.143386010328064 0.83324350676663 417 0 583 0.583 0.417 0.834 ORF3a all ss13 83 CTG ATT TAC 2 AATTTACTG:AGTCTGTTA 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.66666666666667 6 27.583333333333343 0.2092680072815 0.256899645924678 0.814590485433586 -0.0476316386431782 0.0700182649713254 0.12278532287592 NaN NaN 0.140300976556892 0.734236011617121 363 0 637 0.637 0.363 0.726 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TAG 2 CTGTTAGTT:TTACTGCTG 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.33333333333334 6 27.41666666666668 0.207190032471119 0.258764472899753 0.800689639305257 -0.0515744404286347 0.0679117713897917 0.13166789544073 0.8030855593512 0.318756449210783 0.139820056454381 0.712229870269342 363 0 637 0.637 0.363 0.726 ORF3a all ss13 85 CTG TAG TGC 2 CTGCTGCTA:TTAGTTGGT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.166666666666667 0.5 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.75000000000001 6 28.41666666666668 0.205912255736412 0.247968200054092 0.830397832026422 -0.04205594431768 0.0655533742525102 0.119592961355878 NaN NaN 0.133075895293926 0.751979913547285 381 0 619 0.619 0.381 0.762 ORF3a all ss13 86 CTA TGC GTT 2 CTGCTATTT:GTTGGTTTT 1:1 TRUE 1.58333333333333 1 0.166666666666667 0.25 2 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.08333333333334 6 28.583333333333343 0.188257162672323 0.246256582903472 0.764475655646194 -0.057999420231149 0.0636771128354025 0.113544577363609 NaN NaN 0.128561780960977 0.651888322888736 324 0 676 0.676 0.324 0.648 ORF3a all ss13 87 TTT GTT TTC 2 CTATTTGTT:GGTTTTCTC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.416666666666667 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.66666666666669 6 29.916666666666675 0.156968578879544 0.233376267232886 0.672598721115481 -0.0764076883533421 0.0527196505291019 0.109132047072318 NaN NaN 0.123160009481943 0.534998649167392 231 0 769 0.769 0.231 0.462 ORF3a all ss13 88 CTC TTC TCA 2 TTTCTCACA:TTTGTTACC 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.58333333333334 6 29.08333333333334 0.154934610949651 0.24126182510618 0.642184526629788 -0.0863272141565292 0.0545847231489295 0.113963952846214 0.63152447919978 0.309210583346804 0.121157674959657 0.476143098905223 230 0 770 0.77 0.23 0.46 ORF3a all ss13 89 ACA TCA CAG 2 CTCACAGTC:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 78.08333333333334 6 29.58333333333334 0.140432198903081 0.236467295831908 0.593875776390265 -0.0960350969288273 0.0530662128719235 0.10607196234745 NaN NaN 0.11502352869827 0.403764454993412 197 0 803 0.803 0.197 0.394 ORF3a all ss13 90 ATC CAG TCT 2 ACAGTCTAT:ACCATCTAT 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.25000000000001 6 29.58333333333334 0.155668085942854 0.236467295831908 0.658307041551785 -0.080799209889054 0.053615674319051 0.118841504683703 NaN NaN 0.124452797994782 0.516185985417493 234 1 765 0.765 0.234 0.468 ORF3a all ss13 91 TAT TCT ATG 2 ATCTATTCA:GTCTATGTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 78.25000000000001 5 29.58333333333334 0.171562720556584 0.191510018856633 0.895842011717508 -0.0199472983000491 0.0565504745733225 0.0961717877795431 NaN NaN 0.100024444460148 0.841930904556385 427 0 573 0.573 0.427 0.854 ORF3a all ss13 92 GTA ATG CAC 2 TATGTACAC:TATTCACAT 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 78.91666666666669 5 28.91666666666667 0.16993600795279 0.196557091159957 0.864563099453365 -0.0266210832071671 0.0549765465012012 0.0992205595741369 NaN NaN 0.110066032446314 0.808885036621197 429 0 571 0.571 0.429 0.858 ORF3a all ss13 93 CAC CAC ACC 2 GTACACCTA:TCACATCTT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.91666666666669 5 28.58333333333334 0.136897596837873 0.199182311241131 0.687297963282209 -0.0622847144032588 0.044843159978926 0.10720096547907 NaN NaN 0.102581078480108 0.543734470358764 273 0 727 0.727 0.273 0.546 ORF3a all ss13 94 CTA ACC TAT 2 CACCTATTG:CATCTTTTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.666666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.91666666666669 5 27.91666666666667 0.136897596837873 0.20465023999998 0.668934455380487 -0.0677526431621076 0.0440830847341168 0.111962326367667 NaN NaN 0.112752190941803 0.547907469745847 273 0 727 0.727 0.273 0.546 ORF3a all ss13 95 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG:CTTTTGCTT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 80.08333333333334 6 28.250000000000004 0.151718018390913 0.249703998029926 0.607591466648163 -0.0979859796390134 0.04711749918057 0.122842817265327 NaN NaN 0.112642600567171 0.384363879263939 174 1 825 0.825 0.174 0.348 ORF3a all ss13 96 CTG TGC TGG 2 TTGCTGGCA:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.416666666666667 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 79.08333333333334 6 29.250000000000004 0.153847312516879 0.23964200873058 0.64198807768234 -0.0857946962137003 0.049697567830016 0.111852482674959 NaN NaN 0.115333022760553 0.456945051057293 203 1 796 0.796 0.203 0.406 ORF3a all ss13 97 GCA TGG CAG 2 CTGGCAGCT:CTTGTCGCT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.91666666666669 6 30.166666666666668 0.154208039717062 0.231110927283054 0.667246856433554 -0.0769028875659924 0.0490392057788933 0.109312338997473 NaN NaN 0.110942060854924 0.48819620282320503 223 1 776 0.776 0.223 0.446 ORF3a all ss13 98 GCT CAG CTG 2 GCAGCTGCT:GTCGCTGCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.75000000000003 6 30.333333333333332 0.154570468491074 0.229625165344413 0.673142546285094 -0.075054696853339 0.0511454344958792 0.104940699378198 NaN NaN 0.110163017404048 0.495678047669461 217 0 783 0.783 0.217 0.434 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGG 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 79.9166666666667 6 29.666666666666668 0.152068784169476 0.235686824877377 0.645215464413823 -0.0836180407079008 0.0478921360834748 0.111761963704451 NaN NaN 0.110380324670466 0.448723537988673 236 0 764 0.764 0.236 0.472 ORF3a all ss13 100 GGG CAG GGC 2 GCAGGTATG:GCTGGGCTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 81.08333333333337 6 29.499999999999996 0.149647052546842 0.237252996159118 0.630748841824864 -0.0876059436122754 0.0468884766097867 0.111078453902836 0.512184275582337 0.218140363629632 0.112418566504008 0.435812681600862 213 0 787 0.787 0.213 0.426 ORF3a all ss13 101 ATG GGC TAG 2 GGGCTAGAA:GGTATGGAG 1:1 FALSE 2 0 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 81.4166666666667 6 29.83333333333333 0.148969278730818 0.234141361979703 0.636236491798196 -0.0851720832488851 0.046051790338851 0.110698098000499 0.494936188194517 0.198620423681862 0.108248160594672 0.431385807793103 179 0 821 0.821 0.179 0.358 ORF3a all ss13 102 GAA TAG AAG 2 ATGGAGGCG:CTAGAAGCC 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 80.58333333333337 5 29.83333333333333 0.15067539576423 0.189683904532547 0.794349927241066 -0.0390085087683172 0.0457160173135346 0.0962472915268306 NaN NaN 0.0966363214072361 0.686460540958007 329 0 671 0.671 0.329 0.658 ORF3a all ss13 103 GCC AAG CCC 2 GAAGCCCCA:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 80.4166666666667 5 29.999999999999996 0.151021335369834 0.18848582121068 0.801234461031581 -0.0374644858408459 0.0482315038409018 0.0933745291033379 NaN NaN 0.0920787469232211 0.684100231639102 311 0 689 0.689 0.311 0.622 ORF3a all ss13 104 CAA CCC AAT 2 GCCCCATTT:GCGCAATTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 80.25000000000004 5 30.499999999999996 0.166773778676097 0.184981141936135 0.901571786888826 -0.0182073632600383 0.0493039997898383 0.0937508630721007 NaN NaN 0.0928563549379398 0.844546798347592 433 0 567 0.567 0.433 0.866 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTC 2 CAATTTTTG:CCATTTCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 80.25000000000004 6 30.499999999999996 0.151368872535542 0.228158530802244 0.66343726882928 -0.076789658266702 0.0456397807413625 0.110872368615376 NaN NaN 0.10138029391698 0.448785304412767 222 0 778 0.778 0.222 0.444 ORF3a all ss13 106 CTT TTC TGT 2 TTTCTTTAT:TTTTTGTAC 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 80.58333333333337 6 30.166666666666664 0.15067539576423 0.231110927283054 0.651961365633266 -0.0804355315188237 0.0470199837158229 0.110877199706065 NaN NaN 0.108268655025053 0.457526859773926 216 0 784 0.784 0.216 0.432 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACC 2 CTTTATCTT:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 79.58333333333337 5 30.999999999999996 0.152775220957486 0.181605039003649 0.841249900309302 -0.0288298180461622 0.0466013016952834 0.0892492179944823 NaN NaN 0.0859515913887157 0.737308851188803 376 0 624 0.624 0.376 0.752 ORF3a all ss13 108 CTC ACC TCT 2 TACCTCTAT:TATCTTTTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 79.66666666666671 5 31.41666666666666 0.152597995025823 0.178884786483983 0.853051833110949 -0.0262867914581607 0.0458446636853613 0.0831368326362879 NaN NaN 0.0832609917841979 0.752218407773465 376 0 624 0.624 0.376 0.752 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 CTCTATGCC:CTTTTAGCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 79.83333333333337 5 31.58333333333333 0.152244778069162 0.177819473768805 0.856176069146992 -0.0255746956996429 0.0466607469662223 0.0883466422354721 NaN NaN 0.079584781412084707 0.747943967970365 383 0 617 0.617 0.383 0.766 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCC 2 TATGCCTTG:TTAGCCCTA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.83333333333337 5 31.749999999999996 0.137054385390789 0.176766832783369 0.775339939245002 -0.0397124473925802 0.0460045509408166 0.0859086142665823 NaN NaN 0.0826874281294089 0.631034074123096 309 0 691 0.691 0.309 0.618 ORF3a all ss13 111 CTA CCC TAA 2 GCCCTAATC:GCCTTGATA 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.1666666666667 5 32.416666666666664 0.138321779350139 0.172678550040526 0.801036256776982 -0.0343567706903863 0.0458010135672469 0.0839826499098459 NaN NaN 0.0774191815466424 0.657204579352751 331 0 669 0.669 0.331 0.662 ORF3a all ss13 112 ATA TAA TAT 2 CTAATCTAC:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 81.00000000000004 5 32.58333333333333 0.134891598224071 0.171685985854599 0.785687879838432 -0.0367943876305279 0.0460930318902752 0.0813763894900905 NaN NaN 0.0752121747686668 0.624694540111312 333 0 667 0.667 0.333 0.666 ORF3a all ss13 113 TAC TAT ACT 2 ATATATTTT:ATCTACTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 81.50000000000004 5 33.416666666666664 0.133985500074053 0.166890228132415 0.802836101151141 -0.0329047280583624 0.0450486260986707 0.0805144720479326 NaN NaN 0.0760787716151757 0.665371754786974 325 0 675 0.675 0.325 0.65 ORF3a all ss13 114 TTC ACT TCT 2 TACTTCTTA:TATTTTCTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 81.33333333333337 6 33.58333333333333 0.134286173586739 0.204066610769614 0.658050687862624 -0.0697804371828753 0.0432732232270834 0.0884754849637242 NaN NaN 0.0803481592312658 0.385133878521086 204 0 796 0.796 0.204 0.408 ORF3a all ss13 115 CTA TCT TAC 2 TTCTTACAG:TTTCTACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.66666666666671 6 33.58333333333333 0.135502521566611 0.204066610769614 0.664011231703112 -0.0685640892030032 0.0433500306426307 0.0907460202386042 NaN NaN 0.0866848083762318 0.428968187525698 213 0 787 0.787 0.213 0.426 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAT 2 CTACAATGC:TTACAGTGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 81.00000000000004 6 33.916666666666664 0.149817463962042 0.201765204947521 0.742533699014206 -0.0519477409854787 0.0468023352666508 0.0831926458510816 NaN NaN 0.0840094454498781 0.5363407238651 254 0 746 0.746 0.254 0.508 ORF3a all ss13 117 TGC AAT GCA 2 CAATGCATC:CAGTGTGTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 80.83333333333337 6 34.416666666666664 0.150159457687719 0.198409364312814 0.756816384185258 -0.0482499066250946 0.047156645948022 0.0855020445075362 NaN NaN 0.0844305778386323 0.567678166455623 297 0 703 0.703 0.297 0.594 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TCA 2 TGCATCAAC:TGTGTTGTT 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 80.1666666666667 6 35.083333333333336 0.151543243677375 0.194105738514483 0.780725211099659 -0.0425624948371081 0.0470160276231697 0.0835788353485078 NaN NaN 0.0818453646137005 0.603038834674101 321 0 679 0.679 0.321 0.642 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA:GTTGTTTTT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 81.00000000000004 5 34.24999999999999 0.149817463962042 0.162356129339379 0.922770606638898 -0.0125386653773369 0.0459717238791748 0.0752913722765263 NaN NaN 0.0780483710754876 0.872367108491371 440 0 560 0.56 0.44 0.88 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:GTTTTTGGT 1:1 TRUE 1.41666666666667 0.75 0.833333333333333 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.1666666666667 5 34.75 0.136429382099394 0.15975246858483 0.854004844544539 -0.0233230864854358 0.045448544031217 0.0733068113436628 NaN NaN 0.0742976847721969 0.753586325651382 383 0 617 0.617 0.383 0.766 ORF3a all ss13 121 GGT CAT GTA 2 GCATGTAGA:TTTGGTAGG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.75 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.75000000000003 4 34.916666666666664 0.122304211428858 0.124314847835042 0.98382625695 -0.00201063640618385 0.0417157240183721 0.0630796204098551 NaN NaN 0.0702177529367837 0.977156253540211 508 0 492 0.492 0.508 0.984 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 GGTAGGTTT:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.16666666666669 4 35.583333333333336 0.123283681565969 0.12178588422283 1.01229861204931 0.00149779734313836 0.0420014612159386 0.0634558538946348 NaN NaN 0.0752781094087509 0.984125657010274 507 0 493 0.493 0.507 0.986 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATT:AGGTTTTTA 1:1 FALSE 1.5 0.666666666666667 0.833333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.08333333333334 4 35.416666666666664 0.123424890893523 0.122408407943652 1.0083040288404 0.00101648294987136 0.0416811242300053 0.0653695133510832 NaN NaN 0.0737436765864296 0.989002306263225 530 0 470 0.47 0.53 0.94 ORF3a all ss13 124 ATT TTA TAT 2 ATTATTATG:TTTTTATTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.58333333333334 4 35.25 0.107929984092779 0.12303734291849899 0.877213222690225 -0.0151073588257201 0.0398484435005403 0.0626171800853372 NaN NaN 0.0697672515946955 0.828567316538099 431 0 569 0.569 0.431 0.862 ORF3a all ss13 125 ATG TAT TAA 2 ATTATGAGA:TTATTAAGG 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.166666666666667 0.5 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.25000000000001 4 35.41666666666667 0.093977517058638 0.122408407943652 0.767737434359072 -0.0284308908850139 0.0372646242868165 0.0618198711903098 NaN NaN 0.071414845992137 0.690549861543939 347 0 653 0.653 0.347 0.694 ORF3a all ss13 126 AGA TAA GAT 2 ATGAGATGT:TTAAGGTGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.25000000000001 5 36.25 0.0787608262631878 0.152421181209951 0.516731504361585 -0.0736603549467635 0.0320711585554241 0.0729026909420703 NaN NaN 0.0736589653733753 0.31730137841326 156 0 844 0.844 0.156 0.312 ORF3a all ss13 127 TGT GAT GTT 2 AGATGTTGG:AGGTGTTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.91666666666667 5 36.91666666666667 0.0931427851735378 0.149375201835214 0.6235491837279 -0.0562324166616758 0.0359932449234055 0.0683387720644928 NaN NaN 0.0744000242345685 0.449762037484943 227 1 772 0.772 0.227 0.454 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 TGTTGGCTT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.58333333333334 5 36.91666666666667 0.107929984092779 0.149375201835214 0.722542850264024 -0.0414452177424345 0.0392010078377583 0.0678489117284535 NaN NaN 0.0776263261909597 0.593406067710944 287 0 713 0.713 0.287 0.574 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGC:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.08333333333334 5 36.41666666666667 0.108664266868125 0.151648059986963 0.716555601683702 -0.0429837931188387 0.0396972987606175 0.0705660164127818 NaN NaN 0.0762868355735005 0.573128715769432 295 0 705 0.705 0.295 0.59 ORF3a all ss13 130 TGC TTT GCT 2 CTTTGCTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.00000000000001 5 36.16666666666667 0.121889197123331 0.152810715724973 0.797648231310598 -0.0309215186016417 0.0427515883091492 0.0688347266004323 NaN NaN 0.0766861729344104 0.68678523727073 343 1 656 0.656 0.343 0.686 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAA:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 79.83333333333334 5 36.16666666666667 0.152244778069162 0.152810715724973 0.996296479254575 -5.659376558107e-4 0.0529203598909436 0.068457995784156 NaN NaN 0.0839273928573127 0.994619760241054 524 0 476 0.476 0.524 0.952 ORF3a all ss13 132 AAA GGA AAT 2 TGGAAATGC:TGGAAGTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 79.50000000000001 5 35.833333333333336 0.16853783682123 0.154389040653112 1.09164378577822 0.0141487961681186 0.0517410748850994 0.0710262896042498 NaN NaN 0.0906871537842774 0.87601911281304 544 0 456 0.456 0.544 0.912 ORF3a all ss13 133 TGC AAT GCA 2 AAATGCAAG:AAGTGCAAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 80.25000000000001 5 35.083333333333336 0.182501746911826 0.158062767299148 1.15461566332332 0.0244389796126771 0.0544635728533533 0.0726648808765683 NaN NaN 0.0915035336797227 0.789405750028364 640 0 360 0.36 0.64 0.72 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC:TGCAAGTCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 80.41666666666667 5 35.083333333333336 0.182073635926153 0.158062767299148 1.15190717610025 0.0240108686270044 0.0556286259641598 0.070984260934076 NaN NaN 0.0879426449357297 0.784831131224643 627 0 373 0.373 0.627 0.746 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG:AAGTCCAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 79.75 5 35.083333333333336 0.183798305951801 0.158062767299148 1.16281847453642 0.0257355386526527 0.0567504346557202 0.075262728034288 NaN NaN 0.0880413575600715 0.770048142444007 632 1 367 0.367 0.632 0.734 ORF3a all ss13 136 AAG CCA AGA 2 TCCAAGAAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 79.75 5 35.75 0.183798305951801 0.154788747544192 1.18741387127851 0.0290095584076087 0.0554255485445357 0.07255559738392 NaN NaN 0.0858537593463081 0.73544229460686 657 1 342 0.342 0.657 0.684 ORF3a all ss13 137 AAC AGA ACC 2 AAGAACCCA:AAGAACCCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 80.41666666666667 5 34.91666666666667 0.182073635926153 0.158903109406266 1.14581543814003 0.0231705265198873 0.0550633115200198 0.0776620950555922 NaN NaN 0.0876369507761647 0.791477718591802 608 0 392 0.392 0.608 0.784 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA:AACCCTCTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 79.75 5 34.91666666666667 0.183798305951801 0.158903109406266 1.15666903334085 0.0248951965455355 0.0559250762492033 0.0723919654236071 NaN NaN 0.090694249327865 0.7837035798189 619 2 379 0.379 0.619 0.758 ORF3a all ss13 139 CTT CAT TAC 2 CCATTACTT:CCTCTTATT 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 1 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 79.75 5 34.91666666666667 0.183798305951801 0.158903109406266 1.15666903334085 0.0248951965455355 0.0543174810885991 0.0758780885819679 NaN NaN 0.0903072394558512 0.782799839776636 627 0 373 0.373 0.627 0.746 ORF3a all ss13 140 ATT TAC TTT 2 CTTATTTAT:TTACTTTAT 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 79.33333333333334 5 35.41666666666667 0.184892999968705 0.156408563919793 1.18211557816949 0.0284844360489122 0.0555228941669832 0.0729309940918934 NaN NaN 0.0898502073732701 0.751227385261974 664 0 336 0.336 0.664 0.672 ORF3a all ss13 141 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT:CTTTATGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 79 6 35.583333333333336 0.185778237042605 0.190999228388671 0.972664856344644 -0.00522099134606652 0.055509987484575 0.0760608241526731 NaN NaN 0.0908813516199524 0.954187981789265 471 0 529 0.529 0.471 0.942 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.83333333333334 6 36.41666666666668 0.186224058338554 0.186038038359055 1.00099990292921 1.86019979499297e-4 0.0552746460116071 0.0808141285774546 NaN NaN 0.0913996275127223 0.9983761162795 489 0 511 0.511 0.489 0.978 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC:GATGCCTCC 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.41666666666667 7 36.83333333333334 0.203900474239319 0.219162920712879 0.930360270688513 -0.0152624464735597 0.0609821936142864 0.0917858586926866 0.729618304228936 0.202262222457582 0.0949077977021468 0.872240363970734 464 0 536 0.536 0.464 0.928 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC:GCCTCCTAC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.75 7 37.16666666666668 0.219740343511106 0.216883469282523 1.01317239270487 0.002856874228583 0.0608071885056204 0.0949123243862093 NaN NaN 0.0979003944895372 0.976719885775875 485 0 515 0.515 0.485 0.97 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT:TCCTACTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.08333333333334 7 37.16666666666668 0.21866495405835 0.216883469282523 1.00821401825469 0.00178148477582774 0.0591633816186843 0.0878885618474084 0.636646698537145 0.113277511121168 0.096549558354789 0.98527866340698 511 0 489 0.489 0.511 0.978 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.08333333333334 7 37.16666666666668 0.21866495405835 0.216883469282523 1.00821401825469 0.00178148477582774 0.0590561613322712 0.0861460495725909 0.802805272984864 0.20916538352214 0.0947418629288571 0.984997809884499 503 0 497 0.497 0.503 0.994 ORF3a all ss13 147 GTT TTG TTT 2 TTTGTTTGC:TTTGTTTGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.25 7 36.500000000000014 0.218131224556612 0.221491146757304 0.984830444693244 -0.00335992220069167 0.0596486306917027 0.0932324771605291 0.689379739486512 0.153126514273767 0.100385147955134 0.973299540324853 508 0 492 0.492 0.508 0.984 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG:GTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.41666666666666 7 37.33333333333335 0.220826439413092 0.215761554338836 1.02347445581664 0.00506488507425668 0.0588098596110807 0.0830241166450343 0.816249252936869 0.209887477102058 0.0969010502131056 0.958314649311759 519 0 481 0.481 0.519 0.962 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGTTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.99999999999999 7 37.916666666666686 0.222199362107379 0.211925228838758 1.0484799913862 0.0102741332686216 0.0615119508603314 0.0823381095477712 0.736022929767602 0.154295761000016 0.0980020277949906 0.916506002812761 527 0 473 0.473 0.527 0.946 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.33333333333331 7 37.250000000000014 0.221099655165484 0.216321047091377 1.02209035199468 0.00477860807410707 0.0617015298899393 0.0886348952226395 0.842243603428918 0.224926130310224 0.0949462984437768 0.959859745899556 527 0 473 0.473 0.527 0.946 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACACAC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.66666666666664 7 37.250000000000014 0.223310144300941 0.216321047091377 1.032308909852 0.00698909720956464 0.0603936205481986 0.0913087247102655 0.649969308132406 0.1122315033757 0.0951348391247013 0.941435958795248 536 0 464 0.464 0.536 0.928 ORF3a all ss13 152 CAC CAC ACA 2 ACACACACT:ACACATAAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.33333333333331 7 36.58333333333335 0.221099655165484 0.220904431633438 1.00088374656227 1.9522353204543e-4 0.0596434967778166 0.0897538664883579 0.715067478761744 0.16160158324262 0.104424470697591 0.998508340522603 488 0 512 0.512 0.488 0.976 ORF3a all ss13 153 AAC ACA ACT 2 CACACTCAT:CATAACTAT 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.833333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.16666666666664 9 37.08333333333335 0.224997455190221 0.293223013063023 0.767325363858332 -0.0682255578728024 0.0600515487612393 0.127607503249354 0.617849832189746 0.214262914703616 0.131619088306988 0.604209835086369 301 0 699 0.699 0.301 0.602 ORF3a all ss13 154 CAT ACT ATG 2 AACTATGAC:ACTCATGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.33333333333331 9 36.58333333333335 0.224432171139643 0.298143042551514 0.752766756584183 -0.0737108714118708 0.0615456342419046 0.122299746368736 0.619252720077535 0.224135395445035 0.13936939951705 0.59688280620618706 295 0 705 0.705 0.295 0.59 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 CATGACTAT:TATGACTAC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.66666666666666 9 36.58333333333335 0.223310144300941 0.298143042551514 0.74900337230696 -0.0748328982505723 0.0591445833221295 0.127667520950348 0.511884951027441 0.143405547051904 0.133610461839417 0.575423080899038 252 0 748 0.748 0.252 0.504 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT:GACTATTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.99999999999999 9 36.58333333333335 0.22556561551435 0.298143042551514 0.756568436358453 -0.0725774270371632 0.0586886274199314 0.129366409701972 NaN NaN 0.131220897353581 0.580199378745889 290 0 710 0.71 0.29 0.58 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA:TATTGTATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.99999999999999 10 36.58333333333335 0.243317923578779 0.339965723440354 0.715713105181524 -0.0966477998615752 0.0613878782351174 0.142530959661279 0.42728684004921 0.0939307198288397 0.137951097403272 0.483556022402515 254 0 746 0.746 0.254 0.508 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA:TGTATTCCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.83333333333331 10 36.250000000000014 0.243941664762154 0.343931200066584 0.70927460118456 -0.0999895353044307 0.0625134429914636 0.140203745130958 0.410020157033976 0.0836565412778224 0.143755344515226 0.486708485621512 235 0 765 0.765 0.235 0.47 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT:ATTCCGTAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.33333333333333 10 36.416666666666686 0.245832397240244 0.341936766681188 0.71894110605968 -0.0961043694409441 0.0630678021640391 0.135559555778389 0.435554291719721 0.0988131521486776 0.140944398944131 0.495327383638197 216 0 784 0.784 0.216 0.432 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATATAAC:CCGTACAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.66666666666666 10 36.75000000000002 0.244568640424989 0.338017654584825 0.723538067043818 -0.0934490141598359 0.0620646043347551 0.139730699893981 0.459994093673271 0.115735250542406 0.139997700251182 0.504450304542989 224 0 776 0.776 0.224 0.448 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAATAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.16666666666666 11 36.416666666666686 0.242697391695876 0.386559590829672 0.627839529669862 -0.143862199133797 0.0634837875975139 0.157795041388688 0.386180249713498 0.103998997497869 0.169565158807972 0.396205004243637 150 0 850 0.85 0.15 0.3 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTA 2 AACAGTGTC:AATAGTATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 77 12 36.25000000000002 0.243317923578779 0.436713440811101 0.5571569382588 -0.193395517232323 0.063766470154708 0.167787195870865 NA NA 0.195599118653512 0.322793257507082 96 0 904 0.904 0.096 0.192 ORF3a all ss13 163 ATT GTA TCA 2 AGTATTACT:AGTGTCACA 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.33333333333334 12 36.25000000000002 0.245832397240244 0.436713440811101 0.562914658142107 -0.190881043570857 0.0645542356135302 0.178156524874328 0.34094894845179 0.0987338172191764 0.199938163427065 0.339729230141116 122 0 878 0.878 0.122 0.244 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 ATTACTGAA:GTCACAGAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.16666666666669 11 36.08333333333335 0.242697391695876 0.391246232330452 0.620318795788147 -0.148548840634577 0.0661076051352438 0.16615026912779499 0.356716008907998 0.0820398635661978 0.173409933963706 0.391647204283939 163 0 837 0.837 0.163 0.326 ORF3a all ss13 165 GAA CAG AAA 2 ACAGATACA:ACTGAAACC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 78.00000000000001 12 35.58333333333335 0.23964200873058 0.447898874313349 0.53503597011259 -0.208256865582769 0.0623626163918455 0.221514084509073 0.300230583966416 0.0747356159718518 0.195419615205685 0.286563485235586 90 0 910 0.91 0.09 0.18 ORF3a all ss13 166 ACA AAA CAA 2 GAAACCATA:GATACAATT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.41666666666669 12 35.166666666666686 0.220826439413092 0.455194503834612 0.485125451983326 -0.23436806442152 0.0616738402643379 0.200004093030914 0.264323642242186 0.066454376345859 0.203881028095236 0.25033607628778 67 0 933 0.933 0.067 0.134 ORF3a all ss13 167 ATA CAA TAG 2 ACAATTGTC:ACCATAGTC 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.25000000000001 12 35.33333333333335 0.221373552730839 0.452247062674235 0.489496938734791 -0.230873509943396 0.0621745162207062 NA 0.275285673119506 0.0753805828157239 0.200639476129824 0.249860466485972 73 0 927 0.927 0.073 0.146 ORF3a all ss13 168 GTC TAG TCC 2 ATAGTCCTC:ATTGTCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.75000000000001 12 35.33333333333335 0.22303140124308 0.452247062674235 0.493162741454299 -0.229215661431155 0.0608694586254227 0.187274180959013 0.263300930838309 0.0610683335990558 0.200853826033994 0.253784063010526 55 0 945 0.945 0.055 0.11 ORF3a all ss13 169 CTC TCC TCA 2 GTCCTCACT:GTCGTTACT 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.25000000000001 12 35.500000000000014 0.221373552730839 0.449338673183752 0.492665256614383 -0.227965120452912 0.0600160675278849 0.192404634323852 0.288831265253372 0.0880602300150817 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 170 ACT TCA CTG 2 CTCACTGCA:GTTACTGAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.08333333333334 11 34.83333333333335 0.21866495405835 0.409907779776052 0.533449143555692 -0.191242825717702 0.0644004511415462 0.180458717525814 0.369274839736706 0.148574298915762 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTGCAGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 79.41666666666667 11 34.500000000000014 0.234622119670259 0.415196475115379 0.565086973835843 -0.180574355445121 0.0622903456054908 0.186421521596282 0.401239957122396 0.159026955184017 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 172 GGA AAG GAG 2 GAAGGTGAC:GCAGGAGAT 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.25000000000001 12 34.33333333333335 0.218131224556612 0.470546852247873 0.463569618019048 -0.252415627691261 0.058739224058824 0.216065731430612 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 173 GAC GAG ACG 2 GGAGATGGT:GGTGACGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.66666666666669 12 34.58333333333335 0.216808309568067 0.465830061577934 0.465423611420995 -0.249021752009868 0.0598880579838078 0.215167860566775 NA NA 0.216216928080448 0.249435406538536 49 0 951 0.951 0.049 0.098 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT:GATGGTGTA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.33333333333336 12 35.25000000000001 0.221099655165484 0.453715851393363 0.487308641491113 -0.23261619622788 0.0601183490553549 0.210735024636818 0.274728067804135 0.076098650484052 0.207450531163528 0.262156256275261 72 0 928 0.928 0.072 0.144 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TAA 2 GGCATTTCA:GGTGTAACT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.83333333333336 12 35.75000000000001 0.222753358291529 0.445047583344664 0.500515824886569 -0.222294225053136 0.0609318343176748 0.191152243359254 0.301772595721029 0.097199229801175 0.199414507651016 0.264964226034307 76 0 924 0.924 0.076 0.152 ORF3a all ss13 176 ACT TAA CAA 2 ATTTCAACA:GTAACTATT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.41666666666669 11 36.08333333333334 0.224150600850135 0.391246232330452 0.572914401028184 -0.167095631480317 0.0612351505594267 0.193920316792598 0.446065525756613 0.199011566796053 0.178010969738935 0.347894215545875 116 0 884 0.884 0.116 0.232 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 ACTATTCCT:TCAACACCA 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.33333333333336 12 35.83333333333334 0.221099655165484 0.4436359012621 0.498380889681104 -0.22253624609661601 0.0578830791661739 0.212866923147627 0.288361055646701 0.0839304281345515 0.200463352864648 0.266951900586859 67 0 933 0.933 0.067 0.134 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA:ATTCCTATA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.83333333333336 12 35.83333333333334 0.202663072619289 0.4436359012621 0.456822975874434 -0.240972828642811 0.0569339018822119 0.213760066196361 0.264772958928763 0.0844664901642507 0.190281784060328 0.20536995360323201 43 0 957 0.957 0.043 0.086 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC:CCTATAAAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.41666666666669 12 36.25000000000001 0.203900474239319 0.436713440811102 0.466897638553597 -0.232812966571782 0.0558535344195902 NA 0.290053213421531 0.107464132368881 0.198266618346041 0.24029815576978 44 0 956 0.956 0.044 0.088 ORF3a all ss13 180 AAA AAC AAA 2 AAACTCAAA:ATAAAAACA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.50000000000001 12 36.50000000000001 0.189869585440857 0.432665530833062 0.438836865685321 -0.242795945392206 0.0560051214939387 0.195337832639389 0.251632372929324 0.0811660146887938 0.186757722525134 0.19358095507308 44 0 956 0.956 0.044 0.088 ORF3a all ss13 181 AAA AAA AAG 2 AAAACACAA:CTCAAAGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.50000000000001 12 36.83333333333334 0.157344163604509 0.427386723161588 0.368154074699741 -0.270042559557079 0.0466496288060961 0.189262801051253 0.194641337074497 0.0585644929207615 0.195416106926541 0.167007057356728 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 182 CAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC:ACACAAGAC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 77.50000000000001 12 36.83333333333334 0.141595553474679 0.427386723161588 0.331305456630069 -0.285791169686909 0.0438127794740088 0.191156446726855 0.181472733373019 0.0679031977118047 0.217683628491578 0.189225419176578 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 CAAGACTAC:GAAGACTAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.25000000000001 13 37.58333333333334 0.128426768784144 0.463804422121597 0.276898543133066 -0.335377653337454 0.0424597768851459 0.206686523165264 0.14592472926893 0.0577562237508223 0.192497640829948 0.0814659453277907 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 75.41666666666669 13 38.08333333333334 0.12997618937868 0.455422870822123 0.285396710850399 -0.325446681443442 0.0436521943414096 0.191154612641479 0.15169163824937 0.0599138864842197 0.190633685390842 0.0877879516471654 2 1 997 0.997 0.002 0.004 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.91666666666669 14 37.91666666666667 0.144852934121868 0.508409781321868 0.284913743683785 -0.3635568472 0.0468472123493912 0.236682351869325 0.131447775008984 0.0301963490906543 0.199704273093069 0.0686865395553544 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.91666666666669 14 37.91666666666667 0.144852934121868 0.508409781321868 0.284913743683785 -0.3635568472 0.0463723960459563 0.220618058750622 0.136895686276037 0.0374112986966571 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.58333333333336 15 37.75000000000001 0.161796742774019 0.565949969830206 0.285885239683925 -0.404153227056188 0.0489044149105956 NA 0.127431415521091 0.0248681996892858 0.248922320661883 0.10445867692927 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT:GGTGGTTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.91666666666669 15 37.75000000000001 0.177511154654184 0.565949969830206 0.313651672615938 -0.388438815176023 0.0525251177351818 NaN NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT:GGTTTTGTA 1:1 FALSE 1.08333333333333 0.75 1.16666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.08333333333336 15 37.00000000000001 0.191038422684604 0.583278426441006 0.32752526756435 -0.392240003756402 0.0489724648558816 NA NA NA 0.244587800971783 0.108785112348922 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 190 GTA ATT CTG 2 TATTCTGAG:TTTGTAGAA 1:1 TRUE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.25000000000003 15 36.25000000000001 0.187801514593863 0.601759854393703 0.312087144435849 -0.41395833979984 0.0495536526579066 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 191 GAA CTG AAA 2 GTAGAAAAA:TCTGAGGAT 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.4166666666667 16 37.41666666666667 0.190102201146667 0.633249524128026 0.300201095939921 -0.443147322981359 0.0529322129586246 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 192 AAA AAA AAT 2 GAAAAATGG:GAGGATAGG 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 75.9166666666667 16 36.25 0.19438950408697 0.665970168935947 0.291889206385258 -0.471580664848977 0.0523617411778085 NA NA NA 0.305757925094309 0.122992592856657 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 193 AGG AAT GGC 2 AAATGGGAG:GATAGGCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.166666666666667 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.50000000000003 17 37.333333333333336 0.181329278360777 0.700731928032625 0.258771252039103 -0.519402649671848 0.0524649548600411 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGGAGTCT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.1666666666667 17 37.666666666666664 0.18225176997286 0.690543996706516 0.263924921282485 -0.508292226733656 0.0527504630251574 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT:GAGTCTGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.00000000000003 16 37.166666666666664 0.165670373685146 0.639971159894683 0.258871624328211 -0.474300786209538 0.0493846210991473 NA 0.139512907845356 0.0635193129258276 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT:TCTGGTGTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.1666666666667 16 36.666666666666664 0.162798378928371 0.653879226977491 0.248973162339006 -0.49108084804912 0.0494392621763225 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 197 GTC GTG TCA 2 GGTGTCAAG:GGTGTTAAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.6666666666667 17 36.333333333333336 0.161597898479986 0.733331861643627 0.220361212886339 -0.571733963163641 0.0478168225291109 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 198 AAA TCA AAG 2 GTCAAGGAC:GTTAAAGAC 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.83333333333336 17 35.83333333333333 0.158864717514625 0.750892631745481 0.21156782048232 -0.592027914230856 0.0470739926646637 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT:AAGGACTAT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.08333333333336 17 35.916666666666664 0.160610991304224 0.747902915912637 0.214748449146286 -0.587291924608413 0.0492650141030646 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC:GACTATGTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.9166666666667 17 35.916666666666664 0.161004298535341 0.747902915912637 0.215274329207386 -0.586898617377296 0.0478317321126723 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT:TATGTTACA 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.58333333333337 17 35.916666666666664 0.159442558228446 0.747902915912637 0.21318617007113 -0.588460357684191 0.0504862203911562 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 202 ACA TCG CAC 2 GTCGTTGTA:GTTACACTC 1:1 TRUE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 2 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.75000000000004 17 36.75 0.16139954421812 0.719359620392829 0.224365588007265 -0.557960076174709 0.0478863191866766 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 203 CTC CAC TAC 2 ACACTCATA:GTTGTACAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.58333333333337 15 36.916666666666664 0.161796742774019 0.585272843252511 0.276446694288552 -0.423476100478493 0.0480676184384876 0.241154778959024 0.129289977713991 0.0325012272509014 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 204 ATA TAC ATG 2 CTCATAGGC:GTACATGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.25000000000004 15 37.25 0.148448225790773 0.57737985101115 0.257106695931283 -0.428931625220377 0.0459490135200491 0.250835566395848 0.127004588302117 0.0429301390906242 0.247827072546346 0.083492821322778 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCC 2 ATAGGCCTT:CATGGCTAT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.08333333333337 14 36.75 0.148817627628935 0.53186064142979 0.279805678474104 -0.383043013800855 0.0483993407213415 0.222811315141481 0.144277376148119 0.0524575966498984 0.237069011111937 0.106149508011381 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 206 CTT GCC ATT 2 GGCCTTTTC:GGCTATTTC 1:1 TRUE 1 1 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 73.4166666666667 14 37.416666666666664 0.150313866488423 0.518191864153376 0.290073767819582 -0.367877997664953 0.0486485866535651 0.226229388237769 0.144500852080656 0.0447050586946143 0.197606784949445 0.0626500663072386 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 CTTTTCACT:TATTTCACC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.75000000000003 14 37.08333333333333 0.133190264783882 0.524933685486366 0.253727791655202 -0.391743420702484 0.0445335565074723 0.224278990547698 0.130511177246076 0.0518824584228138 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA:TTCACTGAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.08333333333336 14 38.416666666666664 0.134520967864149 0.499003426396138 0.269579246851419 -0.364482458531989 0.0442174773727428 0.23221634389594 0.155425280170258 0.0828361373393 0.204923112732321 0.0753003922704326 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAA 2 ACCGAAGTT:ACTGAAATA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.25000000000003 14 37.24999999999999 0.136222315966333 0.521540117365088 0.261192401947048 -0.385317801398755 0.0446328041500499 NA 0.130377194437971 0.0451387063004393 0.222743106455495 0.0836525545423629 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 210 ATA AAA TAC 2 GAAATACAT:GAAGTTTAC 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.833333333333333 0.333333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 70.58333333333336 14 36.24999999999999 0.139757852131042 0.542615923209463 0.257563123662871 -0.402858071078421 0.0445442929754884 0.248173190365269 0.13599049256287 0.0582278104650779 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 211 CAT TAC ACT 2 ATACATTAC:GTTTACTAC 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 68.75000000000003 13 35.91666666666666 0.143865810138876 0.494202238982722 0.291107159763204 -0.350336428843846 0.0491784645521171 0.216652225433579 0.152905685782172 0.0569317077870638 0.195472390407247 0.0730920791023852 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 CATTACCAG:TACTACCAG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 67.08333333333336 12 35.24999999999999 0.147816328175158 0.453715851393363 0.32579053105862 -0.305899523218206 0.0484390749693204 0.212308902983024 0.174494027820673 0.0618934403671906 0.18960464168195 0.106667487881464 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT:TACCAGTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 67.08333333333336 12 35.24999999999999 0.147816328175158 0.453715851393363 0.32579053105862 -0.305899523218206 0.0485065675180887 0.199755410733962 NA NA 0.185298642107538 0.0987700233462941 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TGG 2 CAGCTTGAG:CAGTTGGAA 1:1 TRUE 2 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 67.41666666666669 12 34.58333333333332 0.147008907301978 0.465830061577935 0.315584843975088 -0.318821154275957 0.0472746215178625 0.220843085300008 0.15579273687342 0.0427985006009576 0.201488705726293 0.11357478718379 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 215 GAA TGG AAT 2 CTTGAGTCT:TTGGAATCT 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 67.08333333333336 11 34.58333333333332 0.147816328175158 0.413861226224391 0.357163993166669 -0.266044898049233 0.0499387635095766 0.175568771123058 0.195065645227638 0.0671014637746345 0.172308975843142 0.122588558489315 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 216 TCT AAT CTA 2 GAATCTACT:GAGTCTACA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 67.33333333333336 11 34.33333333333332 0.147209931783496 0.417893658242937 0.352266489045204 -0.270683726459441 0.0481047199058431 0.18202904754799001 0.194029040218526 0.0694417517052456 0.186634767028205 0.146963941200202 22 0 978 0.978 0.022 0.044 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA:TCTACTCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 68.6666666666667 11 33.66666666666666 0.144058298804489 0.429051936755032 0.335759581681459 -0.284993637950543 0.0472789700934663 0.187004448177769 0.187235832013239 0.0729338752480508 0.182593837238178 0.118569426353307 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT:ACTCAAATT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 69.08333333333337 11 33.24999999999999 0.143100987654802 0.436342234072309 0.32795584859908 -0.293241246417506 0.0486046991397795 NA 0.211204173491949 0.120473176682191 0.183957321620904 0.110919871916872 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT:CAAATTTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 68.00000000000003 11 33.66666666666666 0.145617010830718 0.429051936755032 0.339392503229413 -0.283434925924314 0.0488290242064374 0.195778835515994 0.188040775757516 0.0710922403074248 0.204524658581508 0.165801032137771 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CAG 2 ATTACTACA:ATTTCAGCT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 66.83333333333336 12 34.66666666666666 0.148427757405898 0.464279406304668 0.319694897922087 -0.31585164889877 0.0482213332479413 0.209002721051434 0.161500604379462 0.0477566394299482 0.193911106289583 0.103345275556461 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 221 ACA CAG CAG 2 ACTACAGAC:TCAGCTGAC 1:1 TRUE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 66.1666666666667 12 35.33333333333332 0.13184534303006 0.452247062674236 0.291533884709896 -0.320401719644176 0.0441897061037649 0.195238260622266 0.131240902017659 0.0263262813743739 0.173792431042085 0.0652431396381492 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT:GCTGACACT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 65.66666666666669 11 35.833333333333314 0.132943691128056 0.394838206251804 0.336704222192906 -0.261894515123748 0.0452964324297516 0.169500861960943 0.178063867259023 0.0586352534011359 0.157943120160836 0.0972857496864974 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 65.33333333333336 11 36.16666666666665 0.133686173554739 0.390063711884091 0.342729070871542 -0.256377538329352 0.0466732443754426 0.167544129285873 0.192224639064976 0.0745926214515125 0.152956899172738 0.0937103107181452 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 65.6666666666667 11 35.83333333333332 0.132943691128056 0.394838206251804 0.336704222192906 -0.261894515123748 0.044712637129034 0.178393936061073 0.246907009099532 0.172665659002025 0.15415195554363 0.0893309883003743 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTA 2 GGTATTAAC:GGTATTGAA 1:1 FALSE 0.916666666666667 0.75 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 66.1666666666667 11 35.33333333333332 0.13184534303006 0.402228531800232 0.32778714737109 -0.270383188770172 0.0450805629673276 0.172306521782869 0.171059480811336 0.0553374341002059 0.169474591155781 0.110618298341774 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 226 AAC TTA AAA 2 ATTAACAAC:ATTGAAAAT 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 66.58333333333336 12 34.83333333333332 0.130943856595945 0.461209824939353 0.283913849001727 -0.330265968343409 0.0458596343355601 0.19229063405196 0.179249863302789 0.113216489441867 0.200760847556645 0.0999550468534387 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 227 AAC AAA ACG 2 AACAACGCG:GAAAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCG ACG CGA 2 AACGCGACG:AATGCTACA 1:1 FALSE 1.08333333333333 1 0.916666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CGA CAT 2 GCGACGTTT:GCTACATTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC:ACGTTTTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC:TTTTTCCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT:TTCCTTTTC 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTC TCT TCT 2 ATCTTTAAC:CTTTTCTCT 1:1 FALSE 1.5 0.666666666666667 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TCT ACA 2 TTCTCTAAA:TTTAACAAG 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.833333333333333 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAA ACA AAT 2 AACAAGCTT:TCTAAATAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AAT ATG 2 AAATATGAT:AAGCTTGTT 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GAT ATG ATA 2 CTTGTTAAA:TATGATAGA 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA ATA AAG 2 GATAGAGAA:GTTAAAGAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.25 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAA AAG AAA 2 AAAGACCCA:AGAGAAAGT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 AGT AAA CA- 0 GAAAGT---:GACCCA--- 1:1 TRUE 0.333333333333333 0 2 0.666666666666667 1 0 2 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 AGT---GAG:CCA---CCG 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C AGA 0 ---CCGAAT:---GAGAGC 1:1 TRUE 0.833333333333333 0.666666666666667 1.5 0 0 0 2 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT AGA ATG 2 CCGAATGTG:GAGAGCGTC 1:1 TRUE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTC ATG TCC 2 AATGTGCAA:AGCGTCCAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TCC AAA 2 GTCCAAGTT:GTGCAAATA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC:CAAGTTCAC 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.833333333333333 0.333333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA:GTTCACACA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCA:GACGGCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCA GCT CAT 2 GGCTCATCA:GGCTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CAT CAG 2 TCATCAGGA:TCTTCAGGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA AT- 1 GCTAATCCA:GTAAAT--- 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 1.83333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 --- ATC CAG 1 AAT------:AATCCAGCA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 --- CAG CAA 1 ---------:CCAGCAATG 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 --- CAA TGG 1 ---------:GCAATGGAT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 --- TGG ATC 1 ------CCA:ATGGATCCA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA --C CAA 1 ---CCAATT:GATCCAATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCA:GATGAGCCG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCA AGC CAA 2 GAGCCAACG:GAGCCGACG 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CAA CGA 2 CCAACGCCG:CCGACGACG 1:1 FALSE 1.08333333333333 1 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT:ACGCCGACT 1:1 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT:CCGACTACT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTC 2 GTGCCTCTC:GTGCCTTTG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 CTC CTC TCT 2 CCTCTCTAA:CCTTTGTAA 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.00000000000001 3 33.83333333333332 0.0728728113402358 0.0943651299007743 0.772243003499939 -0.0214923185605385 0.0392535923406266 0.0614863110847074 NA NA 0.0727315450802595 0.767610408714725 405 0 595 0.595 0.405 0.81 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.33333333333334 4 34.16666666666666 0.0735883919688925 0.127288788480472 0.57812155215997 -0.0537003965115794 0.0404729764763235 0.0725732127336897 NaN NaN 0.0844248739622167 0.524728737351869 262 1 737 0.737 0.262 0.524 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.66666666666667 4 34.499999999999986 0.0743181769831732 0.125949614506391 0.590062758623226 -0.0516314375232181 0.0403306373244371 0.0700239875309078 NaN NaN 0.0796581704375729 0.516879864610191 254 0 746 0.746 0.254 0.508 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA:TTTATGAGT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.83333333333333 4 34.33333333333332 0.0741343759774745 0.126615652181289 0.585507199941824 -0.0524812762038146 0.039486435323247 0.0702378061850826 NaN NaN 0.0856892933166241 0.540233365353174 287 0 713 0.713 0.287 0.574 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAT 2 ATGAGATTT:ATGAGTATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.16666666666667 4 34.999999999999986 0.073769490149132 0.123992985319038 0.594948899402018 -0.0502234951699057 0.0412348490369971 0.0704378683811902 NaN NaN 0.0823347349986182 0.541867384598199 255 0 745 0.745 0.255 0.51 ORF3a all ss13 7 ATT GAT TTT 2 AGATTTTTT:AGTATTTTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.83333333333333 4 35.33333333333332 0.0578600049104132 0.122722067836352 0.471471887090176 -0.0648620629259384 0.0371917168445274 0.0724842351056908 NaN NaN 0.0800914493515955 0.418026372497604 187 1 812 0.812 0.187 0.374 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACG:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.16666666666667 4 35.16666666666666 0.0427669289697661 0.123354245726484 0.346700097089436 -0.0805873167567176 0.0331321888094098 0.0671594194133134 NA NA 0.0832961693129032 0.333304501334793 146 5 849 0.849 0.146 0.292 ORF3a all ss13 9 ACG TCA CGC 2 TTCACGCTT:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73 4 34.999999999999986 0.0422647024133488 0.123992985319038 0.340863656960919 -0.081728282905689 0.0319939845555835 0.0679657780456265 NaN NaN 0.0808290567934232 0.311956589377991 134 1 865 0.865 0.134 0.268 ORF3a all ss13 10 CTT CGC TTA 2 ACGCTTGGA:ACTCTTAGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.5 4 35.49999999999999 0.0425646124443371 0.122096350832699 0.34861494347739 -0.0795317383883624 0.0303081721507161 0.0687241668983663 NA NA 0.0802582712063998 0.321711184987337 146 1 853 0.853 0.146 0.292 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAT 2 CTTAGATCA:CTTGGATCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.83333333333333 5 35.166666666666664 0.0423642016009181 0.157645932730055 0.268730064057285 -0.115281731129137 0.0345998498762794 0.0807641603711283 NA NA 0.0924150963501552 0.212238414910949 72 0 928 0.928 0.072 0.144 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGATCAATC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.91666666666667 4 35.666666666666664 0.0423143935004423 0.121476995958792 0.348332564256004 -0.0791626024583498 0.032308772539217497 0.0656030140539355 NA NA 0.0782756138575884 0.311857742562542 130 1 869 0.869 0.13 0.26 ORF3a all ss13 13 ATC CAA TCA 2 TCAATCACA:TCAATTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.91666666666667 5 35.666666666666664 0.0423143935004423 0.155190536855492 0.272660913209186 -0.11287614335505 0.0324652503625027 0.0817693718437484 NA NA 0.0861282031120933 0.190006596169753 69 0 931 0.931 0.069 0.138 ORF3a all ss13 14 ACA TCA CAC 2 ATCACACGT:ATTACTGCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.58333333333334 5 35.49999999999999 0.0425143321315748 0.156000428408735 0.272527021657809 -0.11348609627716 0.0322978454312044 0.0808207927820546 NaN NaN 0.085552506574515 0.184671441045149 63 0 937 0.937 0.063 0.126 ORF3a all ss13 15 CGT CAC CAC 2 ACACGTCAA:ACTGCACAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 2 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.08333333333334 5 34.99999999999999 0.042215127927666 0.158481820250405 0.266372053658679 -0.116266692322739 0.0314494516827298 0.0805817580671815 NA NA 0.0874223108772585 0.183537045074255 68 2 930 0.93 0.068 0.136 ORF3a all ss13 16 CAA CAC AAC 2 CGTCAACCG:GCACAGCCA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.75000000000001 5 35.33333333333333 0.0138732279313668 0.15681884839392 0.0884665846832272 -0.142945620462553 0.0141024151403001 0.0853884000113171 NA NA 0.07840122094387 0.0682643876631549 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 17 CCA AAC CAG 2 CAACCGAGT:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.58333333333334 6 35.49999999999999 0.0139053809368069 0.191510018856633 0.0726091565330409 -0.177604637919827 0.0136853141611262 0.0920459618085817 0.117889673072835 0.537955444119891 0.0943465946655665 0.0597722238746027 2 2 996 0.996 0.002 0.004 ORF3a all ss13 18 AGT CAG GTA 2 CCAGTAAAA:CCGAGTAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.08333333333334 6 35.666666666666664 0.0138093659583391 0.190491169998981 0.0724934702139369 -0.176681804040642 0.0139703543415817 0.0893472746819971 0.151292604930416 0.631824311361257 0.0882730628111976 0.0453345472445356 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 19 AAA GTA AAA 2 AGTAAGATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.75000000000001 5 35.49999999999999 0.0138732279313668 0.156000428408735 0.0889307040556183 -0.142127200477368 0.0141204109221502 0.0806078406891296 NA NA 0.0805868952660723 0.0777906676775777 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAC:AAGATTGAA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000001 5 34.58333333333333 0.0136367393123929 0.160610991304224 0.0849053928480063 -0.146974251991831 0.0130310533246058 0.0860665226088089 NaN NaN 0.0840337300498213 0.0802925454333624 13 3 984 0.984 0.013 0.026 ORF3a all ss13 21 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:ATTGACAAT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333336 5 34.91666666666666 0.0136678042173386 0.158903109406266 0.0860134472409493 -0.145235305188927 0.0137643186722807 0.0791508705778929 NA NA 0.0825074329870065 0.0783621488766186 10 2 988 0.988 0.01 0.02 ORF3a all ss13 22 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000003 5 34.66666666666666 0 0.160180575223544 0 -0.160180575223544 0 0.0819613061737045 NA NA 0.0803998247697057 0.0463381457974775 0 6 994 0.994 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000003 5 34.99999999999999 0 0.158481820250405 0 -0.158481820250405 0 0.0815423332879267 NA NA 0.0796117889982736 0.0465157691566261 0 5 995 0.995 0 0.001 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.58333333333336 6 35.83333333333333 0 0.189483161783181 0 -0.189483161783181 0 0.0898999090285214 0 NaN 0.0858624207911056 0.0273264301978581 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666669 6 35.24999999999999 0 0.193059006111768 0 -0.193059006111768 0 0.0915027774948316 NA NA 0.0909409760851158 0.0337618564556302 0 2 998 0.998 0 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000001 6 34.58333333333333 0 0.19731556308439 0 -0.19731556308439 0 0.0923045196540763 NA NA 0.0940735057861997 0.0359527357259707 0 5 995 0.995 0 0.001 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666669 6 33.916666666666664 0 0.201765204947521 0 -0.201765204947521 0 0.0991095598105399 NA NA 0.0915281828301468 0.0274958581776214 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.66666666666669 7 34.58333333333333 0.01369901098297 0.235909286040997 0.058068977329656 -0.222210275058027 0.0140056522609745 0.104729924281647 0.0628520501944311 0.355538646913438 0.099697053862393 0.0258235553541621 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666669 7 33.75 0.013423177093157 0.242785843567104 0.0552881374627881 -0.229362666473947 0.0130303810521614 0.102654960075718 NA NA 0.105963097089457 0.0304219865988961 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666669 8 33.25 0.013333684515963 0.290131947007622 0.0459573123659239 -0.276798262491659 0.0131590493730247 0.132239881160232 NA NA 0.123569842647921 0.0250899693524326 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CATGCTACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 9 33.583333333333336 0.0134835092215562 0.331581375185359 0.0406642538774042 -0.318097865963803 0.0129452979273177 0.143989714613786 0.0408512789529265 0.319531157300499 0.132843010998028 0.0166412410361984 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333336 9 33.583333333333336 0.0133932130500048 0.331581375185359 0.0403919340841078 -0.318188162135354 0.0135223412725513 0.140556867853672 0.0456105075122611 0.375841755463302 0.142270858216618 0.0253193188924576 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.1666666666667 9 33.416666666666664 0.0132453773639628 0.333664006808512 0.0396967521029747 -0.320418629444549 0.0134489122659937 0.133869709602214 0.0469665139967421 0.397991403427954 0.136102906573382 0.0185607248252217 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.50000000000003 9 33.08333333333333 0.0131871529184001 0.337910093969753 0.0390256259097739 -0.324722941051353 0.0132157588925975 0.140090200467844 0.0408974702000496 0.339966824801259 0.142307153363665 0.0224984619576789 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333337 9 32.25 0.0131726767040263 0.349022437266925 0.0377416329081218 -0.335849760562899 0.0134470585648541 0.155208876415852 0.0387239598003281 0.329742545914578 0.143965872133608 0.0196563929160579 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.75000000000003 9 31.249999999999996 0.0131438194165355 0.363381236586463 0.0361708808633219 -0.350237417169927 0.0133985456441199 0.15469936333328899 0.0398935195675078 0.364573065407938 0.14790890936162 0.0178880920805825 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.00000000000003 9 30.749999999999996 0.0131007697802931 0.37102218137708 0.0353099368120486 -0.357921411596787 0.0130285334304871 0.162539188709824 0.0405057022591292 0.383357023981729 0.157818818263997 0.0233337133420134 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.1666666666667 9 31.41666666666666 0.0130722263514627 0.360905050411733 0.0362206800280281 -0.34783282406027 0.0133264306468716 0.156023455544918 0.0388058497252599 0.350622791983611 0.165165299173421 0.0352071377295646 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.83333333333337 9 32.08333333333333 0.0131294381352109 0.351334800597847 0.0373701612048373 -0.338205362462636 0.0130706695671263 0.142859582793264 0.0419492788029992 0.373014172620192 0.146125253777257 0.0206408877143986 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.83333333333337 9 32.08333333333333 0.0131294381352109 0.351334800597847 0.0373701612048373 -0.338205362462636 0.0129210392145878 0.160868480678489 0.038334653178189 0.329639529895849 0.145676061680017 0.0202530715241377 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000003 9 31.749999999999993 0.0130155110198637 0.356054425493677 0.0365548356878795 -0.343038914473814 0.0129961572482121 0.148719787846847 0.0381748402199159 0.338282884430463 0.157870956122605 0.0297873133215557 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC:CTCCCTTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.1666666666667 9 32.08333333333333 0.0130722263514627 0.351334800597847 0.0372073199956806 -0.338262574246384 0.0132938082070195 0.15297181842093 0.0417143458465478 0.37241704452249 0.150892321182064 0.024977657282386 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA:CCTTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000003 9 31.749999999999996 0.0130155110198637 0.356054425493677 0.0365548356878795 -0.343038914473814 0.0127301794931117 0.153494924401957 0.0353087562027025 0.300533055846655 0.145930241805253 0.0187378947562494 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG:TTTGGATGG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000003 9 30.916666666666657 0.0128482799476378 0.368439033844524 0.0348722007371769 -0.355590753896887 0.0125959580752478 0.161246718091891 0.0354691308198069 0.325523563643333 0.159881457638166 0.0261423884024576 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.4166666666667 9 30.999999999999993 0.0128620515547158 0.367161168989029 0.0350310780144078 -0.354299117434314 0.0132009909299115 0.17224258171605 0.0363750989016563 0.335521893657154 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000003 9 30.999999999999993 0.0129732964431592 0.367161168989029 0.0353340645441372 -0.35418787254587 0.0126633913369443 0.160465745774139 0.0388253718208364 0.362782084795476 0.158150337402733 0.0251192131584968 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT:CTTGTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.16666666666669 9 30.58333333333333 0.0129035440872231 0.373642557445839 0.0345344603554523 -0.360739013358616 0.0124379133278 0.167873285518405 0.0371913607707033 0.353116457107936 0.163500601481393 0.02735973354856 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC:GTTGTTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.50000000000003 9 30.08333333333333 0.0259205062991005 0.381735453594316 0.0679017525226964 -0.355814947295216 0.0183325596280832 0.186806556774753 0.0649238323998843 0.295622024675188 0.157018153732239 0.0234467781425636 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.58333333333337 8 30.749999999999993 0.0262321821040851 0.319499782912404 0.0821039121371704 -0.293267600808319 0.0182063859549845 0.13992067988587 0.0846869639958373 0.332296365889276 0.14966327058147 0.0500523664791417 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.75000000000003 8 31.58333333333333 0.0265221005560517 0.309062449462982 0.0858146973277917 -0.28254034890692997 0.018467526936771 0.133206170537344 NaN NaN 0.131878844091554 0.0321594098862256 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAC 2 GTTGCACTT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.41666666666669 8 30.916666666666664 0.0262896575662818 0.317355464450165 0.08283978223545 -0.291065806883883 0.0184312284599827 0.138587734758534 0.0787321900555028 0.292720781095192 0.149520752268526 0.0515757193378191 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 52 CTT CAC TTC 2 GCACTTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.75000000000001 8 31.583333333333332 0.0261749574292545 0.309062449462982 0.0846914837914969 -0.282887492033727 0.0187304385702892 0.133150441039711 0.0738494580377743 0.251459109607375 0.131040928975927 0.0308678575764164 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 CTTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.08333333333336 7 31.583333333333332 0.026061253903872 0.262715660011633 0.0991994687439571 -0.236654406107761 0.018496729298911 0.118022526514829 0.0946677553010292 0.294698661621472 0.113399294305135 0.0368960436945446 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.41666666666669 7 31.25 0.0259485340559256 0.266078995344485 0.0975219183398179 -0.240130461288559 0.0191133344529795 0.116106016888185 NaN NaN 0.116059148107938 0.0385427848328462 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.25000000000003 7 31.083333333333332 0.0256709551422775 0.267793509240842 0.0958610057990246 -0.242122554098564 0.0183894767105904 0.11945412120272 NaN NaN 0.127160691184005 0.0569013786574324 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333336 7 30.416666666666664 0.0252389746234555 0.274880898641229 0.0918178554720063 -0.249641924017773 0.018472234869499 0.12363528281724 0.0989123730105511 0.353265083347915 0.119763234068971 0.037118152972224 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 57 CAG TTC AGA 2 TTTCAGAGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333336 7 30.083333333333332 0.0252389746234555 0.27856879640113 0.0906023034507865 -0.253329821777674 0.0182660896183316 0.132015753200016 0.0817571623946204 0.267780647143041 0.125857820870375 0.0441329981721079 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 58 AGC AGA GCG 2 CAGAGCGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.91666666666669 7 30.083333333333332 0.0254531319881873 0.27856879640113 0.0913710807420642 -0.253115664412943 0.0180138683565406 0.12743245893351 0.088465055028761 0.301674372318276 0.123679388891226 0.0407025974512425 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.75000000000003 8 30.75 0.0258367851740807 0.319499782912404 0.0808663622196083 -0.293662997738323 0.0185488533422327 0.141740052262397 0.0767103897721394 0.29180168727385 0.132249350795625 0.0263831464409465 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.9166666666667 8 30.58333333333333 0.0257812709329177 0.321673722092295 0.0801472708595094 -0.295892451159377 0.0177214731545026 0.140838028884883 0.078092862227045 0.304746779881457 0.142470142551013 0.0378132442474914 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCCAAAGTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.9166666666667 7 29.58333333333333 0.0254531319881873 0.284292259601151 0.0895315687591948 -0.258839127612963 0.017724978982657 0.128147710322182 NaN NaN 0.1277616269559 0.0427695401101143 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAAGTGATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.25000000000003 7 29.249999999999996 0.0260047718198447 0.288242003650766 0.0902185368214136 -0.262237231830922 0.0181005556458907 0.130306378776279 0.0875182304703014 0.302609189665354 0.130273565401067 0.0441174197543854 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG:GTGATTGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.91666666666669 6 28.91666666666666 0.0257812709329177 0.242903880611306 0.106137748265013 -0.217122609678389 0.018251670187671 0.113590862214038 NA NA 0.111605220896692 0.0517205912380589 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC:ATTGCGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.08333333333336 6 29.249999999999996 0.0257259947650973 0.23964200873058 0.107351774012294 -0.213916013965482 0.017811840926576 0.103213466022581 NaN NaN 0.108356244935821 0.0483599341321033 0 2 998 0.998 0 0.001 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT:GCGCTTCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.25000000000001 7 29.58333333333333 0.0256709551422775 0.284292259601151 0.0902977632183608 -0.258621304458873 0.0181123956879557 0.125270287316359 NaN NaN 0.127058258347394 0.0418051617286403 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA:CTTCATAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.91666666666669 7 28.58333333333333 0.0254531319881873 0.29648455248311 0.0858497745498471 -0.271031420494923 0.0174708205626794 0.136491104847312 0.0844083565607179 0.309116933295332 0.132652829356714 0.0410362545931399 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA:CATAAGAGA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333336 6 27.916666666666664 0.0252389746234555 0.253250234920167 0.0996602219595639 -0.228011260296711 0.017593461811595 0.116968146342312 NaN NaN 0.11271833856195 0.0430895580590112 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AAGAGATGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.41666666666669 6 27.666666666666664 0.051467132797986 0.255977372918159 0.201061258701335 -0.204510240120173 0.0317678633128514 0.117418570779821 NaN NaN 0.117669368782673 0.0822095002575121 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.08333333333334 7 27.83333333333333 0.0516889101836223 0.306347708328316 0.168726283169146 -0.254658798144693 0.0319562611319773 0.134430383068864 0.178510297582072 0.344561497820519 0.142822039198669 0.0745782088008219 3 1 996 0.996 0.003 0.006 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA:TGGCAGCTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.25 8 28.249999999999996 0.0659040642696657 0.355606480428288 0.185328636841184 -0.289702416158622 0.0360060344373413 0.155330386910864 0.169531991470496 0.274315671318737 0.162838469192383 0.0752268963946976 3 1 996 0.996 0.003 0.006 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC:CAGCTCGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.91666666666666 9 28.249999999999996 0.0801652234595281 0.414750411612528 0.193285458470915 -0.334585188152999 0.0388722593687238 0.178115305648743 0.131815576097002 0.142557735422508 0.171994556919063 0.051735961288477 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT:CTCGCTTTG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.08333333333331 9 28.749999999999996 0.0799869383386865 0.405179631729213 0.197411054443484 -0.325192693390526 0.0387667892615258 0.170943815465818 0.137528715708593 0.151168308809864 0.167501586441231 0.0522060784165409 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TGT 2 GCCCTTTAT:GCTTTGTAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.74999999999999 9 28.249999999999996 0.0792816652689177 0.414750411612528 0.191155121367269 -0.33546874634361 0.0381831034112215 0.165383852605931 0.137972415764936 0.165912169411432 0.170733531591459 0.0494295894374501 4 1 995 0.995 0.004 0.008 ORF3a all ss13 74 TAT TGT ATA 2 CTTTATAAG:TTGTATAAA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.74999999999999 8 28.083333333333332 0.0933500730718353 0.358311508790663 0.260527699450406 -0.264961435718828 0.0417932207091309 0.16081536551721 0.159075562633737 0.101471629747839 0.155192417209179 0.0877646041461512 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 75 AAA ATA AAG 2 TATAAAGGC:TATAAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.49999999999999 8 28.333333333333332 0.0936627429044699 0.354269507203646 0.264382739693793 -0.260606764299176 0.0414221414083841 0.151999422697173 0.225186398402647 0.240370288055334 0.147677048356715 0.0776129721913145 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 76 GGC AAG GCA 2 AAAGGCATG:AAGGGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.16666666666666 8 27.999999999999996 0.095366381613935 0.359679810196415 0.265142437552603 -0.26431342858248 0.0421366078847226 0.148146048813378 NaN NaN 0.152689050239852 0.0834416227857225 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 77 ATG GCA TCC 2 GGCATGCAG:GGCTTCCAG 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.166666666666667 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.16666666666666 8 27.666666666666664 0.095366381613935 0.365261231304204 0.261090894517929 -0.269894849690269 0.0422727743421036 0.161471824943616 0.195521147396197 0.181758926034243 0.156658966402891 0.0849214859319723 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGC 2 ATGCAGCTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.5 7 26.999999999999996 0.0806144362276048 0.318117930840238 0.253410538710219 -0.237503494612633 0.0387137237341897 0.144374897078977 0.210645471299149 0.22896890478613 0.140798483772874 0.091635514773489593 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 79 CTT AGC TCA 2 CAGCTTGTT:CAGTTCATT 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.33333333333333 7 27.499999999999996 0.0807955355010694 0.310948193753578 0.259836002022571 -0.230152658252508 0.037715505766131 0.143050701898375 NaN NaN 0.141406911188219 0.103611575327867 21 0 979 0.979 0.021 0.042 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 CTTGTTTGC:TTCATTTGC 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.83333333333333 6 27.999999999999996 0.0813437533100697 0.25235417746591 0.322339634425344 -0.17101042415584 0.0403513368143391 0.124954937349618 NaN NaN 0.116068258412033 0.1406537695327 42 0 958 0.958 0.042 0.084 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT:GTTTGCAAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.5 5 27.666666666666664 0.0806144362276048 0.206779411053799 0.389857171063472 -0.126164974826194 0.0387270946207314 0.104347040578311 NaN NaN 0.0970558014942885 0.193627692597929 74 0 926 0.926 0.074 0.148 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATC 2 TGCAATCTG:TGCAATTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.33333333333333 5 28.33333333333333 0.0807955355010694 0.20119798994601 0.401572279736743 -0.12040245444494 0.0412743773037296 0.103372401189372 NA NA 0.101527285051252 0.235656941757337 83 0 917 0.917 0.083 0.166 ORF3a all ss13 83 CTG ATC TAC 2 AATCTGCTG:AATTTACTG 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.33333333333333 5 28.33333333333333 0.0807955355010694 0.20119798994601 0.401572279736743 -0.12040245444494 0.0394012662378065 0.102186563737974 NaN NaN 0.098108599895826 0.219733715655228 76 0 924 0.924 0.076 0.152 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 CTGCTGCTA:TTACTGCTG 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.83333333333333 5 28.33333333333333 0.0802546646756371 0.20119798994601 0.398884028101737 -0.120943325270372 0.0383104194735516 0.0950827967155695 NaN NaN 0.0954910850962957 0.205319644430305 73 0 927 0.927 0.073 0.146 ORF3a all ss13 85 CTA TGC TAC 2 CTGCTACTC:CTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.25 5 29.33333333333333 0.0798094452064726 0.193371831976575 0.412725288842176 -0.113562386770102 0.0374732846836752 0.0967910296223833 NaN NaN 0.0957898989021595 0.235805535269146 80 0 920 0.92 0.08 0.16 ORF3a all ss13 86 CTA TAC TAT 2 CTACTCTTT:CTGCTATTT 1:1 FALSE 1.25 1 0.5 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.41666666666667 5 29.666666666666664 0.0796327387923167 0.19089739885116 0.417149417810586 -0.111264660058844 0.0393368018567446 0.0902948426781036 NaN NaN 0.0966233720993466 0.249514480229188 88 0 912 0.912 0.088 0.176 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:CTCTTTGTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.58333333333334 5 30.416666666666664 0.0794568138723562 0.185556129985381 0.428209048542973 -0.106099316113025 0.0361647174012423 0.0883742185139388 NaN NaN 0.0927752720248828 0.252782786298899 108 0 892 0.892 0.108 0.216 ORF3a all ss13 88 GTG TTG TGA 2 TTTGTGACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.75 5 29.416666666666668 0.0782467920383731 0.192747196311253 0.405955539358499 -0.11450040427288 0.0374332719779898 0.0963995069659345 NaN NaN 0.0979631295548454 0.242479701716817 81 1 918 0.918 0.081 0.162 ORF3a all ss13 89 ACA TGA CAA 2 GTGACAATT:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.41666666666667 5 29.75 0.0785887320551954 0.190288706694225 0.41299735239401 -0.11169997463903 0.0362034253185291 0.0955788409019039 NaN NaN 0.0918804033240612 0.224095208073484 74 0 926 0.926 0.074 0.148 ORF3a all ss13 90 ATC CAA TCT 2 ACAATTTAT:ACCATCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.08333333333333 5 29.416666666666668 0.0779078173603665 0.192747196311253 0.404196890286067 -0.114839378950886 0.0366267362463715 0.0980413657131136 NA NA 0.0932813229359898 0.21828248975191 75 0 925 0.925 0.075 0.15 ORF3a all ss13 91 TAT TCT ATT 2 ATCTATTCA:ATTTATTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.41666666666666 5 29.75 0.0785887320551954 0.190288706694225 0.41299735239401 -0.11169997463903 0.0362630800856739 0.0908156402401739 NA NA 0.0933445888350356 0.23144646034703 99 0 901 0.901 0.099 0.198 ORF3a all ss13 92 TCA ATT CAC 2 TATTCACAC:TATTCACAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.41666666666666 5 29.75 0.0785887320551954 0.190288706694225 0.41299735239401 -0.11169997463903 0.0382763515649383 0.0952789515756716 NaN NaN 0.0959075313652828 0.24415534102021 78 0 922 0.922 0.078 0.156 ORF3a all ss13 93 CAC CAC ACC 2 TCACACCTC:TCACATCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.75 5 29.083333333333332 0.0772386109180752 0.195270406950441 0.395546934757391 -0.118031796032366 0.0365145714976199 0.0957992691443493 NaN NaN 0.0945073689571205 0.211695679568295 73 0 927 0.927 0.073 0.146 ORF3a all ss13 94 CTC ACC TCT 2 CACCTCTTA:CATCTTTTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.41666666666667 5 28.75 0.0913178588331776 0.197860943283853 0.461525439622372 -0.106543084450676 0.0390281581944072 0.0976317360121855 NaN NaN 0.100788102668011 0.290466036704229 117 1 882 0.882 0.117 0.234 ORF3a all ss13 95 TTA TCT TAC 2 CTCTTACTT:CTTTTGCTT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.91666666666667 5 28.916666666666668 0.0907253574709978 0.196557091159957 0.461572548390869 -0.105831733688959 0.0393254308690292 0.0970309036817447 NaN NaN 0.0950922436995526 0.265735229148952 104 2 894 0.894 0.104 0.208 ORF3a all ss13 96 CTT TAC TTG 2 TTACTTTTA:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.08333333333333 1 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.91666666666667 5 29.583333333333332 0.0919181597303021 0.191510018856633 0.479965279514244 -0.0995918591263312 0.0411201260547009 0.106162043536242 NaN NaN 0.0917601615416151 0.277766823927585 122 0 878 0.878 0.122 0.244 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TAG 2 CTTGTCGCT:CTTTTAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81 5 29.999999999999996 0.0918175614096643 0.18848582121068 0.487132458133471 -0.0966682598010153 0.038583694080705 0.0910420483820041 NaN NaN 0.0921467072420488 0.294146333645654 121 0 879 0.879 0.121 0.242 ORF3a all ss13 98 GCT TAG CTG 2 GTCGCTGCA:TTAGCTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81 5 30.16666666666666 0.0779922851430357 0.187302855665743 0.416396668731091 -0.109310570522707 0.0382218486445012 0.0918919457209984 NaN NaN 0.0911692176001684 0.230533581361475 89 0 911 0.911 0.089 0.178 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.50000000000001 5 29.166666666666664 0.0764993759663411 0.194633396613813 0.393043420591016 -0.118134020647472 0.0370516389070504 0.0953111271432537 NaN NaN 0.0911074044101518 0.19475313385023 61 1 938 0.938 0.061 0.122 ORF3a all ss13 100 GGC CAG GCA 2 GCAGGTATG:GCTGGCATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.66666666666667 5 28.999999999999996 0.0753771912377859 0.195911624447713 0.384750988872043 -0.120534433209927 0.0351471883422073 0.100378284344622 NaN NaN 0.0967060232611822 0.212617407407265 64 1 935 0.935 0.064 0.128 ORF3a all ss13 101 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAG:GGTATGGAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.00000000000001 5 29.33333333333333 0.0750625939177369 0.193371831976575 0.388177497986522 -0.118309238058838 0.036635666844628 0.0949932091549051 NaN NaN 0.094273355933768 0.209493483992254 62 0 938 0.938 0.062 0.124 ORF3a all ss13 102 GAG TGG AGG 2 ATGGAGGCA:ATGGAGGCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.16666666666669 5 29.16666666666666 0.0758540671866302 0.194633396613814 0.389727911583118 -0.118779329427183 0.0366362895913658 0.0972343952811541 NaN NaN 0.0940769355883821 0.206741412512933 78 0 922 0.922 0.078 0.156 ORF3a all ss13 103 GCA AGG CAC 2 GAGGCACAA:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.16666666666669 5 29.16666666666666 0.0758540671866302 0.194633396613814 0.389727911583118 -0.118779329427183 0.0374394033453069 0.0999952034528441 NaN NaN 0.0966114851580835 0.218901818617217 81 0 919 0.919 0.081 0.162 ORF3a all ss13 104 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT:GCGCAATTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.50000000000001 5 29.499999999999996 0.0755354817013731 0.192126605059278 0.393154720441074 -0.116591123357905 0.0357883972908431 0.0938528776514801 NaN NaN 0.0950908561954662 0.220160157227157 84 0 916 0.916 0.084 0.168 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTT 2 CAATTTTTG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.33333333333334 5 29.999999999999996 0.0766624238758939 0.18848582121068 0.406727802566139 -0.111823397334786 0.0379668889638384 0.0948654221300066 NaN NaN 0.0889356545901995 0.208626307301076 77 0 923 0.923 0.077 0.154 ORF3a all ss13 106 TTG TTT TGT 2 TTTTTGTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.66666666666669 5 29.66666666666666 0.0763370207324567 0.19089739885116 0.399885075395791 -0.114560378118704 0.0377241271530162 0.0980937252533107 NaN NaN 0.094290025258115 0.224374191836845 70 0 930 0.93 0.07 0.14 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACA 2 TTGTACATC:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.33333333333336 5 30.66666666666666 0.0776555092056302 0.183841843524739 0.422403886497039 -0.106186334319109 0.0393044717373803 0.0925923478407629 NaN NaN 0.0865619043382356 0.219931691880218 89 0 911 0.911 0.089 0.178 ORF3a all ss13 108 ATC ACA TCT 2 TACATCTAT:TACCTCTAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.33333333333336 5 31.16666666666666 0.0776555092056302 0.180507022556888 0.430207690014701 -0.102851513351257 0.038415468295441 0.084567453036797 NaN NaN 0.0864788607230711 0.234311608775892 95 0 905 0.905 0.095 0.19 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 ATCTATGCT:CTCTATGCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.50000000000001 4 31.16666666666666 0.0774882105210195 0.140762624951505 0.550488530231057 -0.0632744144304855 0.0400474670547032 0.076812915330544 NA NA 0.0757916767012135 0.403804152459016 172 0 828 0.828 0.172 0.344 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 TATGCCTTG:TATGCTCTG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.50000000000001 4 31.16666666666666 0.0774882105210195 0.140762624951505 0.550488530231057 -0.0632744144304855 0.0380284900703977 0.0769491174310652 NaN NaN 0.0755333989150626 0.402198572651286 206 0 794 0.794 0.206 0.412 ORF3a all ss13 111 CTG CCT TGA 2 GCCTTGATA:GCTCTGATT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.16666666666669 4 31.499999999999996 0.0778235325055638 0.139125907283501 0.559374842724157 -0.0613023747779369 0.0385892354298819 0.0751993123477694 NaN NaN 0.0770338648925751 0.426157158087846 188 0 812 0.812 0.188 0.376 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 CTGATTTAT:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.00000000000001 4 31.66666666666666 0.0760143706952156 0.13832177935014 0.549547374624189 -0.062307408654924 0.0362487153662896 0.0787931523332984 NA NA 0.0749693875123819 0.405914497376532 179 2 819 0.819 0.179 0.358 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATA 2 ATATATTTT:ATTTATATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.33333333333336 4 32.666666666666664 0.0756944389424704 0.133686173554739 0.566209929791106 -0.0579917346122687 0.0374522729341668 0.0715196288865086 NaN NaN 0.0702219294743532 0.408897636378897 203 1 796 0.796 0.203 0.406 ORF3a all ss13 114 ATT ATA TTC 2 TATATTCTG:TATTTTCTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.00000000000003 4 32.99999999999999 0.0760143706952156 0.132209431753494 0.574954219884594 -0.0561950610582784 0.0368510370361372 0.0702898744558129 NaN NaN 0.0724895171492617 0.438211810889174 204 2 794 0.794 0.204 0.408 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 ATTCTGCAA:TTTCTACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.1666666666667 3 33.33333333333333 0.0768261689073374 0.0958750286324137 0.801315733650418 -0.0190488597250762 0.037612093424396 0.0606286455203998 NA NA 0.0566558163450637 0.736704424392329 361 4 635 0.635 0.361 0.722 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAG 2 CTACAATGC:CTGCAAGTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.83333333333336 3 33.66666666666666 0.0761753537657808 0.0948631103318397 0.80300291124034 -0.0186877565660589 0.0355809578671831 0.0603288560164819 NA NA 0.0558916765147085 0.738110408730383 349 1 650 0.65 0.349 0.698 ORF3a all ss13 117 GTT AAG GCA 2 CAAGTTGTG:CAATGCATC 1:1 TRUE 1.75 0.75 0.5 0 2 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.50000000000001 3 34.33333333333333 0.0774882105210195 0.0929021112845893 0.834084494416364 -0.0154139007635698 0.0380047267442093 0.0577063168648051 NA NA 0.0564271382090838 0.784726634368951 414 2 584 0.584 0.414 0.828 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TCA 2 GTTGTGTGC:TGCATCAAC 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.58333333333334 3 34.49999999999999 0.0507056829412418 0.0924244803179612 0.548617452506119 -0.0417187973767194 0.0254589956674739 0.0554338639084286 NA NA 0.0491580951654245 0.396067245245302 160 5 835 0.835 0.16 0.32 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA:GTGTGCTTC 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.416666666666667 0.75 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.91666666666669 2 34.16666666666666 0.0504922483436096 0.0609472230590744 0.828458554947925 -0.0104549747154648 0.025342191980622802 0.0454000392940709 NA NA 0.0328050130914653 0.749953620652258 371 13 616 0.616 0.371 0.742 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:TGCTTCTGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.75000000000003 1 34.74999999999999 0.0381034317265946 0.0293435958691742 1.29852632569217 0.00875983585742037 0.0219067671639971 0.0316901661994025 NA NA 0.0250652725605547 0.726728252323811 598 58 344 0.344 0.598 0.688 ORF3a all ss13 121 TGC CAT GCA 2 GCATGTAGA:TTCTGCAGA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.75000000000003 0 34.41666666666666 0.025185997239258 0 -Inf 0.025185997239258 0.0177186952928173 0 NA NA 0.0180522080882815 0.162962943338843 905 95 0 0 0.905 0.001 ORF3a all ss13 122 AGA GCA GAA 2 TGCAGATTT:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.25000000000003 0 34.74999999999999 0.0383470098919532 0 -Inf 0.0383470098919532 0.0225729939819986 0 NA NA 0.0221280170686306 0.0831024457986951 947 53 0 0 0.947 0.001 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATT:AGATTTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.25000000000003 0 34.58333333333332 0.0383470098919532 0 -Inf 0.0383470098919532 0.0224101529237188 0 NA NA 0.0223310313692126 0.0859413037866262 948 52 0 0 0.948 0.001 ORF3a all ss13 124 ATT TTA TTA 2 ATTATTATG:TTTATTATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333337 0 34.91666666666666 0.0252389746234554 0 -Inf 0.0252389746234554 0.0184256024927908 0 NA NA 0.0184928343272572 0.172316695170412 868 132 0 0 0.868 0.001 ORF3a all ss13 125 ATG TTA TGA 2 ATTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.25000000000003 0 35.24999999999999 0.0253456008907938 0 -Inf 0.0253456008907938 0.017881220749621 0 NA NA 0.0181626408664007 0.16287116143152 879 121 0 0 0.879 0.001 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGC:ATGAGATGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.9166666666667 0 35.91666666666666 0.0251332418122965 0 -Inf 0.0251332418122965 0.0178277952360268 0 NA NA 0.0176491852595548 0.154433318269947 865 135 0 0 0.865 0.001 ORF3a all ss13 127 TGC GAT GCT 2 AGATGCTGG:AGATGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.9166666666667 0 36.24999999999999 0.0254531319881873 0 -Inf 0.0254531319881873 0.0188427494017271 0 NA NA 0.0181494876509238 0.160791056345369 889 111 0 0 0.889 0.001 ORF3a all ss13 128 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCTT:TGTTGGCTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.4166666666667 0 36.24999999999999 0.0256161505491714 0 -Inf 0.0256161505491714 0.0181649806658362 0 NA NA 0.0191327204729421 0.180614272391728 869 131 0 0 0.869 0.001 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGC:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.08333333333337 0 35.58333333333332 0.0257259947650973 0 -Inf 0.0257259947650973 0.0186639830583152 0 NA NA 0.0180101798716778 0.153172704840561 868 132 0 0 0.868 0.001 ORF3a all ss13 130 TGC TTT GCT 2 CTTTGCTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.25000000000003 0 35.08333333333332 0.0253456008907938 0 -Inf 0.0253456008907938 0.0180950227046524 0 NA NA 0.0174595807321852 0.146592566896303 874 126 0 0 0.874 0.001 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAG:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.75000000000003 0 35.08333333333332 0.0255072404553968 0 -Inf 0.0255072404553968 0.0180175284370683 0 NA NA 0.017647634915136 0.1483559200909 870 130 0 0 0.87 0.001 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.4166666666667 0 35.08333333333332 0.0256161505491714 0 -Inf 0.0256161505491714 0.0182701328578428 0 NA NA 0.0177003773090876 0.147838314308049 884 116 0 0 0.884 0.001 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.9166666666667 0 34.58333333333332 0.0254531319881873 0 -Inf 0.0254531319881873 0.0181338435693862 0 NA NA 0.0183759923176255 0.166012824111354 875 125 0 0 0.875 0.001 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.08333333333337 0 34.58333333333332 0.0253992526173405 0 -Inf 0.0253992526173405 0.0175079817644787 0 NA NA 0.0182425260475217 0.163828525116967 871 129 0 0 0.871 0.001 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAA:AAATCCAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.4166666666667 0 34.58333333333332 0.0256161505491714 0 -Inf 0.0256161505491714 0.0186631727030806 0 NA NA 0.017364712589186 0.140163014155917 873 127 0 0 0.873 0.001 ORF3a all ss13 136 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAC:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.4166666666667 0 35.24999999999999 0.0256161505491714 0 -Inf 0.0256161505491714 0.0184895615868153 0 NA NA 0.0176448541095889 0.146567448748768 871 129 0 0 0.871 0.001 ORF3a all ss13 137 AAC AAA ACC 2 AAAAACCCA:AAGAACCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.83333333333336 0 34.66666666666666 0.0254801574935108 0 -Inf 0.0254801574935108 0.0187092790093869 0 NA NA 0.0180414878372361 0.157858967411515 867 133 0 0 0.867 0.001 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.1666666666667 0 34.66666666666666 0.025698445480572 0 -Inf 0.025698445480572 0.0188673540903091 0 NA NA 0.0184352624369718 0.163322688444718 884 116 0 0 0.884 0.001 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTC:CCATTACTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.1666666666667 0 34.66666666666666 0.025698445480572 0 -Inf 0.025698445480572 0.0191469271395261 0 NA NA 0.0175762269744895 0.143710004814111 869 131 0 0 0.869 0.001 ORF3a all ss13 140 CTC TAC TCT 2 TTACTCTAT:TTACTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.83333333333337 0 35.66666666666666 0.0261464386246643 0 -Inf 0.0261464386246643 0.0190186237470963 0 NA NA 0.0189622925609682 0.167936428473018 872 128 0 0 0.872 0.001 ORF3a all ss13 141 TAT TCT ATG 2 CTCTATGAT:CTTTATGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.83333333333337 0 35.66666666666666 0.0261464386246643 0 -Inf 0.0261464386246643 0.0193538814718949 0 NA NA 0.0183662682469253 0.154558839848658 846 154 0 0 0.846 0.001 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC:TATGATGTC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.83333333333337 0 36.33333333333332 0.0261464386246643 0 -Inf 0.0261464386246643 0.0184020983146013 0 NA NA 0.0183427746649626 0.154031408303653 854 146 0 0 0.854 0.001 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC:GATGTCAAC 1:1 FALSE 2 1 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.50000000000003 0 36.66666666666665 0.0262608883838265 0 -Inf 0.0262608883838265 0.0187187350759568 0 NA NA 0.0188272207400778 0.163065250276948 875 125 0 0 0.875 0.001 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC:GTCAACTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.6666666666667 1 37.16666666666665 0.0129873375085957 0.027400307499342 0.473985100674786 -0.0144129699907463 0.0133381714363398 0.0282535596170948 NA NA 0.0332367617815022 0.664545936437885 299 136 565 0.565 0.299 0.598 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.6666666666667 1 37.16666666666665 0.0129873375085957 0.027400307499342 0.473985100674786 -0.0144129699907463 0.0134345917754379 0.0287946651411512 NA NA 0.032486112985034 0.65728438805881 302 137 561 0.561 0.302 0.604 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.6666666666667 1 37.16666666666665 0.0131582322381821 0.027400307499342 0.480222064606324 -0.0142420752611598 0.013047227528317 0.0298933165053316 NA NA 0.0324162921499565 0.660408457174933 281 133 586 0.586 0.281 0.562 ORF3a all ss13 147 GTT TTG TTT 2 TTTGTTTGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.1666666666667 1 36.16666666666666 0.0130722263514627 0.0281723261817365 0.464009477497005 -0.0151000998302737 0.0125537262119691 0.02960342416318 NA NA 0.0335689235798272 0.652837515427203 269 140 591 0.591 0.269 0.538 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666669 1 37.16666666666665 0.0132453773639628 0.027400307499342 0.483402507956557 -0.0141549301353792 0.0127507831094706 0.029291543019874 NA NA 0.0324429172952947 0.6626171740716 290 137 573 0.573 0.29 0.58 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGCTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666669 1 37.33333333333332 0.0132453773639628 0.0272757331281561 0.485610315283877 -0.0140303557641934 0.0129035811836727 0.0293042194160658 NA NA 0.0310078698985116 0.65092520531723 281 121 598 0.598 0.281 0.562 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.50000000000003 1 36.66666666666665 0.0131871529184001 0.0277809537602618 0.474683231979716 -0.0145938008418617 0.0129108334671645 0.0299975210119903 NA NA 0.0328694057998115 0.657047320355771 275 127 598 0.598 0.275 0.55 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333336 1 36.66666666666665 0.0133041182530361 0.0277809537602618 0.478893502643761 -0.0144768355072257 0.0137704612069493 0.0287877648923332 NA NA 0.0332866369307337 0.663624610299412 263 137 600 0.6 0.263 0.526 ORF3a all ss13 152 CAT CAC ATA 2 ACACATAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.66666666666669 1 35.83333333333332 0.0131582322381821 0.0284394261467203 0.462675729471411 -0.0152811939085382 0.0130193785144199 0.0301263119997113 NA NA 0.0333586032863813 0.646888831194161 300 121 579 0.579 0.3 0.6 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 CATAACTAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000001 1 36.833333333333314 0.0134532755150005 0.0276529018562458 0.486505017988262 -0.0141996263412453 0.0136477065366817 0.0276076366571085 NA NA 0.032083374192868 0.658065797181369 306 124 570 0.57 0.306 0.612 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.0135624551081753 0.0300768079985336 NA NA 0.0338058590264861 0.67021514450094 291 127 582 0.582 0.291 0.582 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333336 1 36.499999999999986 0.0133932130500048 0.0279101972553257 0.479868090056196 -0.0145169842053209 0.0136679179824114 0.0300913374181112 NA NA 0.0342575538292569 0.671740784559354 313 135 552 0.552 0.313 0.626 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.0140124438951193 0.0288822618173149 NA NA 0.0315812579300496 0.648497807686522 301 138 561 0.561 0.301 0.602 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.0134825074335126 0.0283093933682404 NA NA 0.0323759170087307 0.656564523118415 276 153 571 0.571 0.276 0.552 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000001 1 36.16666666666665 0.0135443861537981 0.0281723261817365 0.480769179883296 -0.0146279400279383 0.0132984985320228 0.0301732217255457 NA NA 0.0331267928442853 0.658797292006825 299 138 563 0.563 0.299 0.598 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAC:ATACCATAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666669 1 36.16666666666665 0.0136058153029875 0.0281723261817365 0.482949658300062 -0.0145665108787489 0.0126907754514501 0.0288157891360319 NA NA 0.0339158020789028 0.667566389902133 286 117 597 0.597 0.286 0.572 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATACAAC:CCATATAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 36.16666666666665 0.0134835092215562 0.0281723261817365 0.478608302863443 -0.0146888169601802 0.0134665482319721 0.0298268094793105 NA NA 0.0325726307005277 0.652021400562378 306 131 563 0.563 0.306 0.612 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAACAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 36.16666666666665 0.0134835092215562 0.0281723261817365 0.478608302863443 -0.0146888169601802 0.0133110475780884 0.0311838669309139 NA NA 0.0345841286733887 0.671035619977837 298 145 557 0.557 0.298 0.596 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.6666666666667 1 35.66666666666665 0.0135138791270087 0.0285748846742028 0.472928562305237 -0.0150610055471941 0.0135610337317918 0.0295059456041647 NA NA 0.0337577706542578 0.655489407352671 289 127 584 0.584 0.289 0.578 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000003 1 35.66666666666665 0.0136367393123929 0.0285748846742028 0.477228148700247 -0.0149381453618099 0.0135265814824336 0.0301438723449329 NA NA 0.0346148094145598 0.666065893494749 295 107 598 0.598 0.295 0.59 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.6666666666667 1 35.66666666666665 0.0135138791270087 0.0285748846742028 0.472928562305237 -0.0150610055471941 0.0136952978189979 0.0314508390959794 NA NA 0.0343481094938248 0.661037384075456 301 113 586 0.586 0.301 0.602 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000003 1 35.333333333333314 0.0134532755150005 0.028849710620847 0.466322719551961 -0.0153964351058466 0.0129359207028053 0.0313446794656779 NA NA 0.0354898652648289 0.664414619196714 288 159 553 0.553 0.288 0.576 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 35.499999999999986 0.0134835092215562 0.0287116399282627 0.469618219483296 -0.0152281307067065 0.0136935318444524 0.031088269330397 NA NA 0.0349953219939221 0.663455287715294 268 118 614 0.614 0.268 0.536 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 35.499999999999986 0.0134835092215562 0.0287116399282627 0.469618219483296 -0.0152281307067065 0.0138621543207773 0.030115801124314 NA NA 0.0330793222123355 0.645263613271168 283 121 596 0.596 0.283 0.566 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCG 2 ATTGTCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000004 1 35.833333333333314 0.0136367393123929 0.0284394261467203 0.479501212227008 -0.0148026868343274 0.013651834096237 0.0286660684432199 NA NA 0.0327914851926831 0.651687869326066 303 134 563 0.563 0.303 0.606 ORF3a all ss13 169 GTT TCG TTA 2 GTCGTTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 35.499999999999986 0.0134532755150005 0.0287116399282627 0.468565207303174 -0.0152583644132622 0.0141003731853534 0.0307967894013279 NA NA 0.033712232208776 0.650832352724081 276 121 603 0.603 0.276 0.552 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTG 2 GTTACTGAA:GTTACTGCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.6666666666667 1 34.83333333333332 0.013333684515963 0.0292720079293014 0.455509732990195 -0.0159383234133385 0.014445477208661 0.0325928749115374 NA NA 0.0345301768506383 0.644384941279531 279 142 579 0.579 0.279 0.558 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTGCAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.6666666666667 1 34.83333333333332 0.013333684515963 0.0292720079293014 0.455509732990195 -0.0159383234133385 0.0137802120441905 0.0309476933235692 NA NA 0.0348941138305806 0.647841746957479 300 142 558 0.558 0.3 0.6 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:GCAGGTGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0301491524204878 NA NA 0.0313939888981817 0.351125686814836 0 346 654 0.654 0 0.001 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0308502069955849 NA NA 0.0316474992226672 0.354997611524471 0 373 627 0.627 0 0.001 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0306362134671938 NA NA 0.030152143474617 0.336336997515972 0 378 622 0.622 0 0.001 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TTT 2 GGCATTTCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0295172525951191 NA NA 0.0309668765100451 0.34920470056953 0 379 621 0.621 0 0.001 ORF3a all ss13 176 TCA TTT CAA 2 ATTTCAACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 1 35.49999999999998 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0306466402335211 NA NA 0.0303976943152666 0.344897102594248 0 349 651 0.651 0 0.001 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 TCAACACCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333337 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.029783859922153 NA NA 0.0306305234854012 0.35087717705095 0 344 656 0.656 0 0.001 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0293313566885521 NA NA 0.0301209128792298 0.342787154883413 0 346 654 0.654 0 0.001 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0311049626554894 NA NA 0.0323476527213997 0.377037417913004 0 367 633 0.633 0 0.001 ORF3a all ss13 180 CTC AAC TCA 2 AAACTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333336 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0307069101495669 NA NA 0.0297086693741306 0.342983688735248 0 348 652 0.652 0 0.001 ORF3a all ss13 181 AAA TCA AAG 2 CTCAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000003 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0296418265310409 NA NA 0.0293723207160212 0.337485503936161 0 367 633 0.633 0 0.001 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333336 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0310831480007044 NA NA 0.0306276542541022 0.357660051150718 0 364 636 0.636 0 0.001 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0295509483239262 NA NA 0.0290517584152553 0.338942297142216 0 375 625 0.625 0 0.001 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 37.66666666666664 0 0.0270299523623977 0 -0.0270299523623977 0 0.0284288728676326 NA NA 0.0290971091978725 0.352911565472362 0 378 622 0.622 0 0.001 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0297237513579516 NA NA 0.0305034251412399 0.366849046751877 0 363 637 0.637 0 0.001 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0282447954241525 NA NA 0.0281697603352451 0.328495884372813 0 364 636 0.636 0 0.001 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0298550277048589 NA NA 0.0300105020364058 0.359030991697298 0 352 648 0.648 0 0.001 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333334 1 37.333333333333314 0 0.0272757331281561 0 -0.0272757331281561 0 0.0283114321580177 NA NA 0.0295541199840554 0.356055162472533 0 381 619 0.619 0 0.001 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 1 36.833333333333314 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0279784160335988 NA NA 0.0297922065214225 0.353307738016917 0 361 639 0.639 0 0.001 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333334 1 36.16666666666664 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0299774256953831 NA NA 0.028720177083696 0.326629960283565 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGG 2 TCTGAGGAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.5 1 36.99999999999997 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0299918614351438 NA NA 0.0292457714601299 0.346604040385629 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 192 GAT AGG ATA 2 GAGGATAGG:GAGGATTGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 1 35.66666666666664 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0301085173013717 NA NA 0.0310309050170454 0.35712747088062 0 393 607 0.607 0 0.001 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 GATAGGCAC:GATTGGCAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333334 1 36.833333333333314 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0296207556183189 NA NA 0.0280374685985999 0.323993853364159 0 381 619 0.619 0 0.001 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCACTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333334 0 37.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666667 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666667 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666667 0 34.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000001 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 202 GTT TCG TTG 2 GTCGTTGTA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000001 0 36.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 203 GTA TTG TAC 2 GTTGTACAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 0 36.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 GTACATGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666669 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333334 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666667 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.029210116025385 NA NA 0.0302888732864954 0.359037860976449 0 380 620 0.62 0 0.001 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 1 36.999999999999986 0 0.0275260251378209 0 -0.0275260251378209 0 0.0288937090792839 NA NA 0.0274708269102831 0.316339081961995 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0282586906632534 NA NA 0.0280112317253845 0.32130530258599 0 383 617 0.617 0 0.001 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 35.999999999999986 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0301703040390033 NA NA 0.0295015486035245 0.337332349752977 0 356 644 0.644 0 0.001 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333334 1 35.999999999999986 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0293719758461568 NA NA 0.0304263739131248 0.352222747125444 0 396 604 0.604 0 0.001 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333334 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0291482741935945 NA NA 0.0287309880530291 0.319947038229355 0 401 599 0.599 0 0.001 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666667 1 35.33333333333332 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0306625528173906 NA NA 0.0299393441251635 0.335243849582109 0 349 651 0.651 0 0.001 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76 1 34.66666666666665 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.030217373452655 NA NA 0.0323102500164949 0.3626069761679 0 371 629 0.629 0 0.001 ORF3a all ss13 215 GAG TTG AGT 2 CTTGAGTCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333334 1 34.33333333333332 0 0.0297068535712844 0 -0.0297068535712844 0 0.0318201480450899 NA NA 0.0318094209278896 0.350354905276181 0 373 627 0.627 0 0.001 ORF3a all ss13 216 TCT AGT CTA 2 GAGTCTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333334 1 33.83333333333332 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.031023417224381 NA NA 0.0321046864869344 0.347594591711582 0 331 669 0.669 0 0.001 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666669 1 33.16666666666665 0 0.0307735475083969 0 -0.0307735475083969 0 0.0340782518667553 NA NA 0.0331381373256313 0.353073374818434 0 350 650 0.65 0 0.001 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333336 1 32.999999999999986 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.0324735945044094 NA NA 0.032374986146739 0.339357386526734 0 362 638 0.638 0 0.001 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666669 1 34.499999999999986 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.0302073854024416 NA NA 0.0308971116858828 0.338698931786516 0 362 638 0.638 0 0.001 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CTA 2 ATTACTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 1 35.333333333333314 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0297891597062795 NA NA 0.0281102580915086 0.304747636868591 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 1 35.99999999999998 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0303828529263293 NA NA 0.0303178751172787 0.350502133343457 0 371 629 0.629 0 0.001 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 1 36.33333333333331 0 0.0280406490537152 0 -0.0280406490537152 0 0.0299889291284886 NA NA 0.0295997593827763 0.343472214560169 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0280156711748007 NA NA 0.0298228726350419 0.356015703057872 0 367 633 0.633 0 0.001 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.029109935240464 NA NA 0.0277295665466405 0.316414519817875 0 368 632 0.632 0 0.001 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0312035011966732 NA NA 0.0291700399858105 0.334145957446406 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.030075071611349 NA NA 0.03060794054378 0.348221044016004 0 375 625 0.625 0 0.001 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTT TCT TTA 2 ATCTTTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TTA ACA 2 TTTAACAAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAAGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:AAAGATCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA---:GATCCA--- 1:1 FALSE 0.166666666666667 0 1.83333333333333 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG 2 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C CGA 0 ---CCGAAT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT CGA ATG 2 CCGAATGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000001 2 31.916666666666647 0.0137303605832671 0.0654365742860852 0.209827007802069 -0.0517062137028181 0.0143647951760762 0.0494534436363115 NA NA 0.0567182717471143 0.36196226513246 119 46 835 0.835 0.119 0.238 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666669 2 32.24999999999998 0.0137934922285677 0.0647301776657746 0.213092142273863 -0.0509366854372069 0.0134414865345869 0.047845537063387 NA NA 0.0511563126990092 0.319392653490807 116 55 829 0.829 0.116 0.232 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000001 2 32.583333333333314 0.0139215133950447 0.0640388786228152 0.21739158608696799 -0.0501173652277706 0.0137576480181197 0.0490572512195744 NA NA 0.0524193454674775 0.339029144839719 115 41 844 0.844 0.115 0.23 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666667 2 32.41666666666665 0.0138892858254281 0.0643826713791054 0.215730188386308 -0.0504933855536773 0.0133552934201181 0.0518431030770946 NA NA 0.0521214781635019 0.332663202270296 137 55 808 0.808 0.137 0.274 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAA 2 ATGAGAATT:ATGAGATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73 2 33.083333333333314 0.0138252762666285 0.0630291953285242 0.219347180216527 -0.0492039190618957 0.0138014276558025 0.0512657683170398 NA NA 0.0503692949498146 0.328636799761512 136 39 825 0.825 0.136 0.272 ORF3a all ss13 7 ATT GAA TTT 2 AGAATTTTT:AGATTTTTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.66666666666666 2 33.41666666666665 0.01369901098297 0.062373587449531503 0.219628396299224 -0.0486745764665615 0.013812017755648 0.0461554264378087 NA NA 0.0516643519079613 0.346125684508675 117 38 845 0.845 0.117 0.234 ORF3a all ss13 8 TTT TTT TTA 2 ATTTTTACT:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666666 2 33.583333333333314 0 0.062050874504436 0 -0.062050874504436 0 0.046392263380787 NA NA 0.0493584813180391 0.208700353642961 0 121 879 0.879 0 0.001 ORF3a all ss13 9 ACT TTA CTC 2 TTTACTCTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666666 2 33.24999999999998 0 0.0626996766264699 0 -0.0626996766264699 0 0.0498226119017975 NA NA 0.0468609893047626 0.180898711970202 0 124 876 0.876 0 0.001 ORF3a all ss13 10 CTT CTC TTA 2 ACTCTTAGA:ACTCTTGGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666666 3 34.24999999999998 0 0.0931427851735379 0 -0.0931427851735379 0 0.0579514013527225 NA NA 0.0562501156834143 0.097748486201221 0 38 962 0.962 0 0.001 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAT 2 CTTAGATCA:CTTGGATCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333331 3 33.583333333333314 0 0.0951140793534504 0 -0.0951140793534504 0 0.0546051154982364 NA NA 0.0576247588524463 0.0988250573690193 0 40 960 0.96 0 0.001 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGATCAATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666666 2 34.083333333333314 0 0.0611024764460933 0 -0.0611024764460933 0 0.0448408680823666 NA NA 0.0462474983059111 0.186432655996793 0 131 869 0.869 0 0.001 ORF3a all ss13 13 ATT CAA TTA 2 TCAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666666 2 34.083333333333314 0 0.0611024764460933 0 -0.0611024764460933 0 0.045354452239307 NA NA 0.0464024186330777 0.187907323265761 0 131 869 0.869 0 0.001 ORF3a all ss13 14 ACT TTA CTG 2 ATTACTGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25 2 33.74999999999998 0 0.0617314855970427 0 -0.0617314855970427 0 0.0468100901204693 NA NA 0.0489351409404463 0.207130192571132 0 149 851 0.851 0 0.001 ORF3a all ss13 15 GCA CTG CAC 2 ACTGCACAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333334 2 33.41666666666664 0 0.062373587449531503 0 -0.062373587449531503 0 0.0474105131109522 NA NA 0.0454156376849367 0.16962973567457101 0 153 847 0.847 0 0.001 ORF3a all ss13 16 CAG CAC AGC 2 GCACAGCCA:GCACAGTCA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333334 2 33.41666666666664 0 0.062373587449531503 0 -0.062373587449531503 0 0.0467561801174842 NA NA 0.0457566084209966 0.172832027797823 0 115 885 0.885 0 0.001 ORF3a all ss13 17 CCA AGC CAG 2 CAGCCAGTA:CAGTCAGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.58333333333334 2 34.41666666666664 0 0.0604861633757489 0 -0.0604861633757489 0 0.0453823188356515 NA NA 0.0455756848949469 0.184456215240841 0 129 871 0.871 0 0.001 ORF3a all ss13 18 GGA CAG GAA 2 CCAGTAAAA:TCAGGAAAA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.08333333333334 1 34.583333333333314 0 0.0294878275056261 0 -0.0294878275056261 0 0.0292904719838273 NA NA 0.0287282614101259 0.304684381527923 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 19 AAA GAA AAA 2 GGAAAAATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666669 1 34.66666666666664 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0301177066787169 NA NA 0.0295146625076803 0.318938598103991 0 355 645 0.645 0 0.001 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 1 34.49999999999998 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.0308126224220514 NA NA 0.030100124111918 0.326064586100701 0 368 632 0.632 0 0.001 ORF3a all ss13 21 GAC TTG ACA 2 ATTGACAAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 1 34.833333333333314 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0286996065039483 NA NA 0.0299517993284412 0.328418761992979 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 22 AAT ACA ATG 2 GACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333336 1 34.49999999999998 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.028969994316418 NA NA 0.028885356208346 0.306131802286057 0 384 616 0.616 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666669 1 33.49999999999998 0 0.0304610393656427 0 -0.0304610393656427 0 0.0320753673230397 NA NA 0.0303924459107863 0.31621952109208 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.16666666666669 1 34.49999999999998 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.0291307661278964 NA NA 0.0283977152080945 0.297900801324266 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333336 1 33.833333333333314 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.0289769767171631 NA NA 0.0284061173315151 0.288435201908628 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000003 1 33.333333333333314 0 0.0306164958901914 0 -0.0306164958901914 0 0.0299883934881101 NA NA 0.0297581128087499 0.303552353936597 0 353 647 0.647 0 0.001 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666669 1 32.66666666666665 0 0.0312545223004261 0 -0.0312545223004261 0 0.0318767556655582 NA NA 0.0314351594855264 0.32009939099626 0 354 646 0.646 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000003 1 33.333333333333314 0 0.0306164958901914 0 -0.0306164958901914 0 0.0309962197368323 NA NA 0.0327313621859047 0.349588812045605 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 1 32.999999999999986 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.0315627452744324 NA NA 0.0321707226132018 0.336299745896274 0 368 632 0.632 0 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.6666666666667 1 32.33333333333332 0 0.0315836140125951 0 -0.0315836140125951 0 0.0311053063512275 NA NA 0.0308780208691047 0.306378308115469 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 1 32.999999999999986 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.0296141746344964 NA NA 0.030408210234245 0.30904285146801 0 379 621 0.621 0 0.001 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.1666666666667 1 32.999999999999986 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.0330786406642605 NA NA 0.0315155320488531 0.326350547940723 0 382 618 0.618 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 1 32.999999999999986 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.0300566033742448 NA NA 0.0316219461210828 0.327981183555471 0 330 670 0.67 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 1 32.999999999999986 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.031014988286447 NA NA 0.0303079255171238 0.307444769566473 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 32.16666666666665 0 0.0317507728699206 0 -0.0317507728699206 0 0.0319690413614832 NA NA 0.031162116935671 0.308255137678535 0 374 626 0.626 0 0.001 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 1 31.166666666666654 0 0.0327921082603738 0 -0.0327921082603738 0 0.0329382763623308 NA NA 0.0330330264466383 0.320852885482488 0 385 615 0.615 0 0.001 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA:CCGCTACAG 1:1 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.6666666666667 1 30.166666666666654 0 0.0339040775760351 0 -0.0339040775760351 0 0.0340244914820005 NA NA 0.0319039461221628 0.287921518271259 0 360 640 0.64 0 0.001 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC:CTACAGGCC 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 1 30.833333333333314 0 0.0331545693783718 0 -0.0331545693783718 0 0.0336057609098626 NA NA 0.0336576601435538 0.324598179874031 0 368 632 0.632 0 0.001 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA:CAGGCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.6666666666667 1 31.333333333333314 0 0.0326138339548042 0 -0.0326138339548042 0 0.0321374549165264 NA NA 0.0336799272169656 0.332871433199586 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.6666666666667 1 31.333333333333314 0 0.0326138339548042 0 -0.0326138339548042 0 0.0316163437828285 NA NA 0.0321803480388556 0.310835471917733 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 1 31.333333333333314 0 0.0326138339548042 0 -0.0326138339548042 0 0.0339659631504927 NA NA 0.0325830527708892 0.316853544711067 0 379 621 0.621 0 0.001 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 1 31.999999999999982 0 0.031919710814097 0 -0.031919710814097 0 0.0314925350005994 NA NA 0.0325009067619427 0.326041942008876 0 384 616 0.616 0 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.6666666666667 1 31.66666666666665 0 0.0322630388127681 0 -0.0322630388127681 0 0.0334525773712736 NA NA 0.0331996029410732 0.331155081652239 0 373 627 0.627 0 0.001 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000003 1 30.999999999999982 0 0.0329723425658371 0 -0.0329723425658371 0 0.0336195561490891 NA NA 0.0340978509570667 0.333548128614462 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 1 30.66666666666665 0 0.0333388219281254 0 -0.0333388219281254 0 0.0333201197883429 NA NA 0.0312831240290094 0.286553544194476 0 353 647 0.647 0 0.001 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 1 30.333333333333314 0 0.0337135408966998 0 -0.0337135408966998 0 0.0345130630811654 NA NA 0.0336419992238805 0.316282472407056 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000001 1 29.833333333333318 0 0.0342916870035714 0 -0.0342916870035714 0 0.0339458838798027 NA NA 0.0341506432464785 0.315315934350653 0 394 606 0.606 0 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 1 29.499999999999986 0 0.0346882632380668 0 -0.0346882632380668 0 0.0351117437825144 NA NA 0.0356857238130321 0.33102629640381 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.1666666666667 1 30.166666666666647 0 0.0339040775760351 0 -0.0339040775760351 0 0.0331937126211896 NA NA 0.0330384696353698 0.304797320863726 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 1 30.999999999999986 0 0.032972342565837 0 -0.032972342565837 0 0.0319599869976231 NA NA 0.0334460472063282 0.324213227436972 0 335 665 0.665 0 0.001 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAT 2 GTTGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 1 30.33333333333332 0 0.0337135408966998 0 -0.0337135408966998 0 0.0342351612673341 NA NA 0.0321900086709878 0.294947703406535 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 52 TTT CAT TTC 2 GCATTTCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 1 30.99999999999999 0 0.032972342565837 0 -0.032972342565837 0 0.0342978627178045 NA NA 0.0329643572764822 0.317193292034584 0 350 650 0.65 0 0.001 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 TTTCTTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 1 30.99999999999999 0 0.032972342565837 0 -0.032972342565837 0 0.0313292377799542 NA NA 0.0341730147761195 0.334612482868288 0 350 650 0.65 0 0.001 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666669 1 30.666666666666657 0 0.0333388219281254 0 -0.0333388219281254 0 0.0322034812280578 NA NA 0.0352686438597169 0.34451481369149 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 1 30.99999999999999 0 0.032972342565837 0 -0.032972342565837 0 0.032965561542318 NA NA 0.0333673732564516 0.323073722177707 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333336 1 30.33333333333332 0 0.0337135408966998 0 -0.0337135408966998 0 0.0338416928726342 NA NA 0.0326885968571051 0.302374474295981 0 366 634 0.634 0 0.001 ORF3a all ss13 57 CAG TTC AGA 2 TTTCAGAGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333336 1 29.99999999999999 0 0.034096780557568 0 -0.034096780557568 0 0.0345653506979671 NA NA 0.0350294548165898 0.330367172442333 0 352 648 0.648 0 0.001 ORF3a all ss13 58 AGC AGA GCG 2 CAGAGCGCT:CAGAGCGTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666669 1 29.99999999999999 0 0.034096780557568 0 -0.034096780557568 0 0.035153862794731 NA NA 0.033560427605095 0.30963809728968 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGTTACC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 1 30.666666666666657 0 0.0333388219281254 0 -0.0333388219281254 0 0.0349242300885951 NA NA 0.0336970477468633 0.322482527181271 0 367 633 0.633 0 0.001 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GTTACCAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.6666666666667 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333337 0 29.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.6666666666667 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 0 28.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666669 0 29.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 0 29.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666669 0 28.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666669 0 27.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666669 0 27.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 0 28.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000001 0 28.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 28.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TTT 2 GCCCTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000001 0 29.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 74 TAT TTT ATA 2 CTTTATAAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 0 29.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 75 AAG ATA AGG 2 TATAAGGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666669 0 29.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 76 GGC AGG GCT 2 AAGGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666669 0 29.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 77 TTC GCT TCC 2 GGCTTCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666669 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGT 2 TTCCAGTTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666669 0 28.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 79 TTC AGT TCA 2 CAGTTCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 0 28.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 TTCATTTGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333334 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666669 0 28.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATT 2 TGCAATTTA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 83 TTA ATT TAC 2 AATTTACTG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666669 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 0 30.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 86 CTA TGC TAT 2 CTGCTATTT 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 88 GTT TTG TTA 2 TTTGTTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333336 0 30.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 89 ACC TTA CCA 2 GTTACCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000003 0 31.333333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 90 ATC CCA TCT 2 ACCATCTAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666669 0 30.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 91 TAT TCT ATT 2 ATCTATTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333336 0 30.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 92 TCA ATT CAC 2 TATTCACAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666669 0 30.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 93 CAT CAC ATC 2 TCACATCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000003 0 29.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 94 CTT ATC TTT 2 CATCTTTTG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.6666666666667 0 29.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 95 TTG TTT TGC 2 CTTTTGCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000003 0 29.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 96 CTT TGC TTG 2 TTGCTTGTC 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.6666666666667 0 30.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TCG 2 CTTGTCGCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.6666666666667 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 98 GCT TCG CTG 2 GTCGCTGCA:GTCGCTGCG 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.6666666666667 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCGGGT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.1666666666667 0 30.499999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 100 GGT CAG GTA 2 GCAGGTATG:GCGGGTATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 0 30.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 101 ATG GTA TGG 2 GGTATGGAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 30.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 102 GAG TGG AGG 2 ATGGAGGCG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333339 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 103 GCG AGG CGC 2 GAGGCGCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333339 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 104 CAA CGC AAT 2 GCGCAATTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 30.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTT 2 CAATTTTTG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000004 0 30.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 106 TTG TTT TGT 2 TTTTTGTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333339 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACC 2 TTGTACCTC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 108 CTC ACC TCT 2 TACCTCTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 CTCTATGCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333339 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 TATGCCTTG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333339 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 111 TTG CCT TGA 2 GCCTTGATA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 TTGATATAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000006 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATT 2 ATATATTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.8333333333334 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 114 TTT ATT TTC 2 TATTTTCTA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.8333333333334 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 TTTCTACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.8333333333334 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAT 2 CTACAATGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000006 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 117 TGC AAT GCA 2 CAATGCATC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TCA 2 TGCATCAAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 34.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 121 TGT CAT GTA 2 GCATGTAGA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.6666666666667 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 TGTAGAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333336 0 35.16666666666666 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0132730827253567 0 NA NA 0.0123003339614746 0.304442110335234 621 379 0 0 0.621 0.001 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATC:AGAATTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333336 0 34.99999999999999 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0125560879817451 0 NA NA 0.0127462296625452 0.321671637850847 651 349 0 0 0.651 0.001 ORF3a all ss13 124 ATC TTA TCA 2 ATTATCATG:ATTATTATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.1666666666667 0 35.33333333333332 0.0125789112103712 0 -Inf 0.0125789112103712 0.0131347337938193 0 NA NA 0.0131299871442473 0.338048029507545 633 367 0 0 0.633 0.001 ORF3a all ss13 125 ATG TCA TGA 2 ATCATGAGA:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.6666666666667 0 35.83333333333332 0.0126585283405138 0 -Inf 0.0126585283405138 0.0131848548808386 0 NA NA 0.0131775135515149 0.336745357776127 639 361 0 0 0.639 0.001 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.6666666666667 0 36.16666666666666 0.0125002893639087 0 -Inf 0.0125002893639087 0.0125602190965702 0 NA NA 0.0128989528958606 0.332498619580783 668 332 0 0 0.668 0.001 ORF3a all ss13 127 TGT GAT GTT 2 AGATGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.6666666666667 0 36.49999999999999 0.0126585283405138 0 -Inf 0.0126585283405138 0.0127199077781345 0 NA NA 0.0135940752415771 0.351760562203805 632 368 0 0 0.632 0.001 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 TGTTGGCTT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 36.49999999999999 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0122029296404861 0 NA NA 0.0133648855409395 0.340498189086361 648 352 0 0 0.648 0.001 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333337 0 35.83333333333332 0.0127934871784325 0 -Inf 0.0127934871784325 0.0130115861368733 0 NA NA 0.0128744054404345 0.320361737194479 649 351 0 0 0.649 0.001 ORF3a all ss13 130 TGT TTT GTT 2 CTTTGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000003 0 35.33333333333332 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.0124853908380615 0 NA NA 0.0129521073390815 0.330440564780767 662 338 0 0 0.662 0.001 ORF3a all ss13 131 TGG GTT GGA 2 TGTTGGAAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 35.33333333333332 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0125351142108365 0 NA NA 0.013042737532725 0.330754990002137 623 377 0 0 0.623 0.001 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 35.33333333333332 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0127178660557994 0 NA NA 0.0129557632256574 0.325469008480173 636 364 0 0 0.636 0.001 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.6666666666667 0 34.83333333333332 0.0126585283405138 0 -Inf 0.0126585283405138 0.0130770842296394 0 NA NA 0.0130396677547422 0.331662440067556 643 357 0 0 0.643 0.001 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333337 0 34.83333333333332 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0126007294952094 0 NA NA 0.0131425131590515 0.336478625937266 622 378 0 0 0.622 0.001 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 34.83333333333332 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0125218968354697 0 NA NA 0.0133630628917429 0.34043233304511 658 342 0 0 0.658 0.001 ORF3a all ss13 136 AAG CCA AGA 2 TCCAAGAAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 35.49999999999999 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0130176818139007 0 NA NA 0.012960688997273 0.325652914823727 639 361 0 0 0.639 0.001 ORF3a all ss13 137 AAC AGA ACC 2 AAGAACCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333336 0 34.66666666666666 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0126981123882532 0 NA NA 0.0128672086479202 0.326242348973144 643 357 0 0 0.643 0.001 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 34.66666666666666 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.013029603708967 0 NA NA 0.0134061009606266 0.341984770707822 647 353 0 0 0.647 0.001 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTC:CCATTACTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 34.66666666666666 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0130905276741966 0 NA NA 0.0126560610564764 0.314143417353299 629 371 0 0 0.629 0.001 ORF3a all ss13 140 CTC TAC TCT 2 TTACTCTAT:TTACTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 0 35.66666666666666 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.0129590367424879 0 NA NA 0.012881894029119 0.314411824173568 637 363 0 0 0.637 0.001 ORF3a all ss13 141 TAT TCT ATG 2 CTCTATGAT:CTTTATGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 0 35.66666666666666 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.0130076578474677 0 NA NA 0.0134710007209428 0.336042779589745 647 353 0 0 0.647 0.001 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 0 36.33333333333332 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.013285712609517 0 NA NA 0.0133472735203536 0.331582487556569 652 348 0 0 0.652 0.001 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000003 0 36.66666666666665 0.0130155110198637 0 -Inf 0.0130155110198637 0.012848163501207 0 NA NA 0.0130569701377947 0.318849581559873 654 346 0 0 0.654 0.001 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.6666666666667 1 37.16666666666665 0.0129873375085957 0.027400307499342 0.473985100674786 -0.0144129699907463 0.0131668322606145 0.0279908650602879 NA NA 0.0324352056214685 0.656780945937961 308 123 569 0.569 0.308 0.616 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.6666666666667 1 37.16666666666665 0.0129873375085957 0.027400307499342 0.473985100674786 -0.0144129699907463 0.0134753793106438 0.0283660263158499 NA NA 0.029678766025467 0.62722782948618 288 149 563 0.563 0.288 0.576 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.6666666666667 1 37.16666666666665 0.0131582322381821 0.027400307499342 0.480222064606324 -0.0142420752611598 0.0135615516921816 0.0279784837783522 NA NA 0.0321322909204224 0.657597581959122 305 101 594 0.594 0.305 0.61 ORF3a all ss13 147 GTT TTG TTT 2 TTTGTTTGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.1666666666667 1 36.16666666666666 0.0130722263514627 0.0281723261817365 0.464009477497005 -0.0151000998302737 0.0132403395488964 0.0303873092449133 NA NA 0.0303775629172281 0.619132153573676 296 129 575 0.575 0.296 0.592 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666669 1 37.16666666666665 0.0132453773639628 0.027400307499342 0.483402507956557 -0.0141549301353792 0.0128231233794392 0.0293211671837342 NA NA 0.0329161978660458 0.667174314263512 294 135 571 0.571 0.294 0.588 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGCTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666669 1 37.33333333333332 0.0132453773639628 0.0272757331281561 0.485610315283877 -0.0140303557641934 0.0137267519233816 0.0282320903208135 NA NA 0.0317809920112938 0.65887274758523 303 119 578 0.578 0.303 0.606 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.50000000000003 1 36.66666666666665 0.0131871529184001 0.0277809537602618 0.474683231979716 -0.0145938008418617 0.0136524444644706 0.0286800112986148 NA NA 0.032932779858582 0.657665160044927 291 121 588 0.588 0.291 0.582 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333336 1 36.66666666666665 0.0133041182530361 0.0277809537602618 0.478893502643761 -0.0144768355072257 0.0136749681196351 0.027968697156292 NA NA 0.0311599383494925 0.642219583855703 270 137 593 0.593 0.27 0.54 ORF3a all ss13 152 CAT CAC ATA 2 ACACATAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.66666666666669 1 35.83333333333332 0.0131582322381821 0.0284394261467203 0.462675729471411 -0.0152811939085382 0.0135166769380809 0.0312291403733821 NA NA 0.0349788697880093 0.662206146755066 280 129 591 0.591 0.28 0.56 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 CATAACTAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000001 1 36.833333333333314 0.0134532755150005 0.0276529018562458 0.486505017988262 -0.0141996263412453 0.0145400153871858 0.0283139847350052 NA NA 0.033292980181221 0.669739821637327 289 117 594 0.594 0.289 0.578 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.0139584359525302 0.0298207555598539 NA NA 0.0331804600501413 0.664376018944735 279 121 600 0.6 0.279 0.558 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333336 1 36.499999999999986 0.0133932130500048 0.0279101972553257 0.479868090056196 -0.0145169842053209 0.0145612200334512 0.0310567109281219 NA NA 0.0333402758100221 0.663258437967332 272 134 594 0.594 0.272 0.544 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.0142071975653404 0.0301995673043844 NA NA 0.0342300803402629 0.67406540778696 302 117 581 0.581 0.302 0.604 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.01353125668931 0.0296209937295046 NA NA 0.0340993639802393 0.672888316656016 288 129 583 0.583 0.288 0.576 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000001 1 36.16666666666665 0.0135443861537981 0.0281723261817365 0.480769179883296 -0.0146279400279383 0.0133004102237021 0.0281907479420443 NA NA 0.0326867488824314 0.654500397816876 315 121 564 0.564 0.315 0.63 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666669 1 36.16666666666665 0.0136058153029875 0.0281723261817365 0.482949658300062 -0.0145665108787489 0.0129813604720143 0.0302824886510807 NA NA 0.0335267801289946 0.663944344707353 286 131 583 0.583 0.286 0.572 ORF3a all ss13 160 TAT CAT ATA 2 CCATATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 36.16666666666665 0.0134835092215562 0.0281723261817365 0.478608302863443 -0.0146888169601802 0.0134797611643795 0.02957799352314 NA NA 0.0328052486510335 0.654327760317911 311 139 550 0.55 0.311 0.622 ORF3a all ss13 161 AAC ATA ACA 2 TATAACAGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 36.16666666666665 0.0134835092215562 0.0281723261817365 0.478608302863443 -0.0146888169601802 0.0134070906061283 0.0287391873605113 NA NA 0.0345066626295745 0.67034059791365 275 131 594 0.594 0.275 0.55 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000003 1 35.833333333333314 0.0135443861537981 0.0284394261467203 0.47625384858056 -0.0148950399929221 0.0136486098712885 0.0306347403221135 NA NA 0.0340964547318027 0.662220055453894 290 129 581 0.581 0.29 0.58 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333336 1 35.833333333333314 0.0136678042173386 0.0284394261467203 0.480593530503246 -0.0147716219293817 0.0146152572424601 0.0314299480958399 NA NA 0.0333181484268727 0.657512143439974 300 120 580 0.58 0.3 0.6 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000003 1 35.833333333333314 0.0135443861537981 0.0284394261467203 0.47625384858056 -0.0148950399929221 0.0135139108082906 0.0294794553744823 NA NA 0.0337746798186922 0.659204290385608 293 137 570 0.57 0.293 0.586 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 35.499999999999986 0.0134835092215562 0.0287116399282627 0.469618219483296 -0.0152281307067065 0.0141400036295198 0.0315446269691783 NA NA 0.032969527378128 0.644163779291713 281 134 585 0.585 0.281 0.562 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATC:GATACAATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.6666666666667 1 35.66666666666665 0.0135138791270087 0.0285748846742028 0.472928562305237 -0.0150610055471941 0.0134613562827489 0.0300475784622117 NA NA 0.0336019752529259 0.653995972033789 304 135 561 0.561 0.304 0.608 ORF3a all ss13 167 ATC CAA TCG 2 ACAATCGTC:ACAATTGTC 1:1 FALSE 2 0.5 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.6666666666667 1 35.66666666666665 0.0135138791270087 0.0285748846742028 0.472928562305237 -0.0150610055471941 0.0133098661477512 0.0306130132560711 NA NA 0.0326610838841212 0.64470534079397 271 125 604 0.604 0.271 0.542 ORF3a all ss13 168 GTC TCG TCG 2 ATCGTCGTT:ATTGTCGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.6666666666667 1 36.16666666666665 0.0136990109829699 0.0281723261817365 0.486257715979829 -0.0144733151987666 0.0141764665394096 0.0285822905256756 NA NA 0.0325277963036702 0.656354283138308 285 140 575 0.575 0.285 0.57 ORF3a all ss13 169 GTT TCG TTA 2 GTCGTTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 35.499999999999986 0.0134532755150005 0.0287116399282627 0.468565207303174 -0.0152583644132622 0.0143173606590622 0.0312650157844974 NA NA 0.0326391730273104 0.640152031464807 272 127 601 0.601 0.272 0.544 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTG 2 GTTACTGAA:GTTACTGCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.6666666666667 1 34.83333333333332 0.013333684515963 0.0292720079293014 0.455509732990195 -0.0159383234133385 0.0139745543952494 0.0326154300729756 NA NA 0.0338717900460688 0.637963119900447 287 125 588 0.588 0.287 0.574 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTGCAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.6666666666667 1 34.83333333333332 0.013333684515963 0.0292720079293014 0.455509732990195 -0.0159383234133385 0.0134466829455516 0.0301622541351396 NA NA 0.0354970661605638 0.653428797165234 281 112 607 0.607 0.281 0.562 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:GCAGGTGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0294449610508083 NA NA 0.0300782281207385 0.330455954061747 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0305721527306173 NA NA 0.0311761118235102 0.3477696291222 0 348 652 0.652 0 0.001 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0317959662031157 NA NA 0.0320240694033489 0.365344089612231 0 361 639 0.639 0 0.001 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TTT 2 GGCATTTCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0293702639745057 NA NA 0.0315524109379104 0.358220741587733 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 176 TCA TTT CAA 2 ATTTCAACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 1 35.49999999999998 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0308460076339345 NA NA 0.0314937300754492 0.361946623788437 0 383 617 0.617 0 0.001 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 TCAACACCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333337 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0294561235068824 NA NA 0.0304663158870895 0.348286912919788 0 378 622 0.622 0 0.001 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0302986203864077 NA NA 0.0294248592922916 0.331491650552266 0 360 640 0.64 0 0.001 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0295656921108869 NA NA 0.0303744955515438 0.346831673339995 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 180 CTC AAC TCA 2 AAACTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333336 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0305542646585565 NA NA 0.0306021561017164 0.357259621794656 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 181 AAA TCA AAG 2 CTCAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000003 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0301110543324147 NA NA 0.0285879301238009 0.324397061337975 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333336 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0304955211165909 NA NA 0.0294735085683472 0.339146771273694 0 354 646 0.646 0 0.001 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0303622553158507 NA NA 0.0292956064504312 0.342977964128047 0 374 626 0.626 0 0.001 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 37.66666666666664 0 0.0270299523623977 0 -0.0270299523623977 0 0.02765863772031 NA NA 0.0287923921552006 0.347839599149206 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0298720111004911 NA NA 0.0293641130120338 0.348550991784452 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.027889245622248 NA NA 0.0272908643987206 0.313158432712277 0 364 636 0.636 0 0.001 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0303608958764314 NA NA 0.027816082410987 0.322383206183148 0 382 618 0.618 0 0.001 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333334 1 37.333333333333314 0 0.0272757331281561 0 -0.0272757331281561 0 0.028102325401527 NA NA 0.0290064578932574 0.347046714629666 0 366 634 0.634 0 0.001 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 1 36.833333333333314 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.028137388693077 NA NA 0.0297422066869918 0.352499056472852 0 352 648 0.648 0 0.001 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333334 1 36.16666666666664 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0288031733700229 NA NA 0.0289241485331729 0.330053011379271 0 378 622 0.622 0 0.001 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGG 2 TCTGAGGAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.5 1 36.99999999999997 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0293572176544278 NA NA 0.0288597734948862 0.340192377145904 0 343 657 0.657 0 0.001 ORF3a all ss13 192 GAT AGG ATA 2 GAGGATAGG:GAGGATTGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 1 35.66666666666664 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0315818592874169 NA NA 0.030565724649168 0.349856889962842 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 GATAGGCAC:GATTGGCAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666667 2 36.833333333333314 0 0.0563645417845085 0 -0.0563645417845085 0 0.042887106372877 NA NA 0.0427644597347142 0.187495946514324 0 128 872 0.872 0 0.001 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCACTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.50000000000001 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0274227892174468 NA NA 0.0278073854210388 0.322231889179707 0 361 639 0.639 0 0.001 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 1 35.99999999999998 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0274965742618967 NA NA 0.0284076689718076 0.319058489477863 0 385 615 0.615 0 0.001 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000001 1 34.99999999999998 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0300263610102681 NA NA 0.030391787138023 0.337821520607926 0 366 634 0.634 0 0.001 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333334 1 34.99999999999998 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0293049529745512 NA NA 0.028424485550559 0.305449892493843 0 384 616 0.616 0 0.001 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333334 1 34.66666666666665 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0298433841643577 NA NA 0.0286839186645898 0.305124427224164 0 374 626 0.626 0 0.001 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666667 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0285564394527713 NA NA 0.0277524779446004 0.296226583732803 0 354 646 0.646 0 0.001 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000001 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0288174830869758 NA NA 0.0294078230271119 0.324249893932828 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666669 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0283869181995935 NA NA 0.0283444747935665 0.306429330583627 0 390 610 0.61 0 0.001 ORF3a all ss13 202 GTT TCG TTG 2 GTCGTTGTA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666669 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0279947319819303 NA NA 0.0270373476713275 0.297421797766354 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 203 GTA TTG TAC 2 GTTGTACAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000001 1 35.83333333333332 0 0.0284394261467203 0 -0.0284394261467203 0 0.0275196632946654 NA NA 0.028900694435673 0.325096070593864 0 378 622 0.622 0 0.001 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 GTACATGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333334 1 36.499999999999986 0 0.0279101972553257 0 -0.0279101972553257 0 0.0271499339008639 NA NA 0.0273818211390059 0.308062176496207 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666667 1 35.999999999999986 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.028308277457013 NA NA 0.028185851324336 0.315264884037403 0 379 621 0.621 0 0.001 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0276198949706282 NA NA 0.0271265798916965 0.30577719285338 0 363 637 0.637 0 0.001 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333333 2 36.33333333333332 0 0.0571705240409132 0 -0.0571705240409132 0 0.0400313891524302 NA NA 0.0420081305848605 0.173532810865155 0 134 866 0.866 0 0.001 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666667 2 36.66666666666665 0 0.0566306643811089 0 -0.0566306643811089 0 0.0399403992829757 NA NA 0.0408780490336833 0.16594353428974 0 139 861 0.861 0 0.001 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74 2 36.33333333333332 0 0.0571705240409132 0 -0.0571705240409132 0 0.0415847997263392 NA NA 0.0433789699706985 0.187526478793474 0 129 871 0.871 0 0.001 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74 2 35.66666666666665 0 0.0582817382454872 0 -0.0582817382454872 0 0.0424349719820416 NA NA 0.0410668234372175 0.155842827943893 0 134 866 0.866 0 0.001 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75 2 35.66666666666665 0 0.0582817382454872 0 -0.0582817382454872 0 0.0420675729983095 NA NA 0.0426834748789718 0.172114693778232 0 142 858 0.858 0 0.001 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76 2 35.33333333333332 0 0.0588537115811214 0 -0.0588537115811214 0 0.0413400810234041 NA NA 0.0423976146327047 0.165095231195634 0 128 872 0.872 0 0.001 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333333 2 34.999999999999986 0 0.0594370287406055 0 -0.0594370287406055 0 0.0418741660757799 NA NA 0.0436200069050697 0.173005664245326 0 119 881 0.881 0 0.001 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666666 2 34.33333333333332 0 0.0606390724718212 0 -0.0606390724718212 0 0.0436287744450467 NA NA 0.0440370900868504 0.168512251896209 0 137 863 0.863 0 0.001 ORF3a all ss13 215 GAG TTG AGT 2 CTTGAGTCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77 2 33.999999999999986 0 0.0612585232607004 0 -0.0612585232607004 0 0.0460403314176263 NA NA 0.0452814023053414 0.176106532392679 0 131 869 0.869 0 0.001 ORF3a all ss13 216 TCT AGT CTA 2 GAGTCTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.5 2 33.499999999999986 0 0.0622118122355633 0 -0.0622118122355633 0 0.045031131729805 NA NA 0.0441653165455935 0.158949812244109 0 114 886 0.886 0 0.001 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333334 2 32.83333333333332 0 0.0635300231041221 0 -0.0635300231041221 0 0.0460586265346385 NA NA 0.0454832420834248 0.162480133665911 0 116 884 0.884 0 0.001 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000001 2 32.66666666666665 0 0.0638683562552302 0 -0.0638683562552302 0 0.0461550922872434 NA NA 0.0475162516533167 0.178904060043214 0 132 868 0.868 0 0.001 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333334 2 34.16666666666665 0 0.0609472230590744 0 -0.0609472230590744 0 0.0425992073956662 NA NA 0.0459104223600398 0.184335150448957 0 128 872 0.872 0 0.001 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CTA 2 ATTACTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000001 2 34.999999999999986 0 0.0594370287406055 0 -0.0594370287406055 0 0.0434218731151592 NA NA 0.0450589702970015 0.187137604423011 0 117 883 0.883 0 0.001 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 2 35.66666666666665 0 0.0582817382454872 0 -0.0582817382454872 0 0.0428571380088566 NA NA 0.0439416392753495 0.184725713656359 0 133 867 0.867 0 0.001 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 2 35.99999999999998 0 0.0577207808520962 0 -0.0577207808520962 0 0.0403489720428453 NA NA 0.0427004261702536 0.176451708522924 0 126 874 0.874 0 0.001 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 2 36.66666666666664 0 0.0566306643811089 0 -0.0566306643811089 0 0.0408448514157035 NA NA 0.0420128313162925 0.177678534770167 0 150 850 0.85 0 0.001 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 2 36.333333333333314 0 0.0571705240409132 0 -0.0571705240409132 0 0.0402943959079456 NA NA 0.0413569753040258 0.166858997591415 0 123 877 0.877 0 0.001 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666669 2 35.833333333333314 0 0.0579999025523778 0 -0.0579999025523778 0 0.0421238197201232 NA NA 0.0406966338159646 0.154106071034331 0 140 860 0.86 0 0.001 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666669 2 35.16666666666665 0 0.0591439311842398 0 -0.0591439311842398 0 0.0435773519826499 NA NA 0.0432259936927738 0.171234086762123 0 130 870 0.87 0 0.001 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTT TCT TTA 2 ATCTTTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TTA ACA 2 TTTAACAAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAAGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:AAAGATCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA---:GATCCA--- 1:1 FALSE 0.166666666666667 0 1.83333333333333 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CAG:CCA---CCG 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CAG --C AGA 0 ---CAGAAT:---CCGAAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.666666666666667 1.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT AGA ATG 2 CAGAATGTG:CCGAATGTG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 72.83333333333334 3 33.333333333333314 0.102850364976667 0.0958750286324138 1.07275446426198 0.00697533634425315 0.0475484756596035 0.0636124413957545 NaN NaN 0.0696909957120277 0.92027327776341 531 0 469 0.469 0.531 0.938 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 72.16666666666667 4 33.66666666666665 0.103869405415859 0.129351945263207 0.802998402571404 -0.0254825398473481 0.0517839987586652 0.073659542103482 NaN NaN 0.0796427055829958 0.748998084284486 371 0 629 0.629 0.371 0.742 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 71.5 4 33.999999999999986 0.104908874463151 0.127969137773073 0.819798244239058 -0.0230602633099215 0.0481439831257546 0.0758619093167949 NaN NaN 0.0785436861996392 0.769065161356321 375 1 624 0.624 0.375 0.75 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA:TTTATGAGT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 71.66666666666666 4 33.83333333333332 0.104647058454807 0.128656816904346 0.813381373585596 -0.0240097584495385 0.0514270718960592 0.0720064203045816 NaN NaN 0.0819527179987617 0.769544423588654 375 0 625 0.625 0.375 0.75 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAT 2 ATGAGATTT:ATGAGTATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 72 4 34.499999999999986 0.104127333640662 0.125949614506391 0.826738009868049 -0.0218222808657294 0.0525104317040065 0.0692624135180425 NaN NaN 0.0800171920541221 0.78506853397667 357 0 643 0.643 0.357 0.714 ORF3a all ss13 7 ATT GAT TTT 2 AGATTTTTT:AGTATTTTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.66666666666666 4 34.83333333333332 0.0874776777943207 0.124638389543236 0.701851797948457 -0.0371607117489157 0.0458028161982775 0.068481520441962 NaN NaN 0.0782864504602307 0.635017812183344 301 1 698 0.698 0.301 0.602 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACG:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.25 4 34.41666666666665 0.0715679639391767 0.126281753068954 0.566732423330377 -0.0547137891297775 0.0445937414136136 0.0769314738257792 NaN NaN 0.0720680059098004 0.447734925831377 213 0 787 0.787 0.213 0.426 ORF3a all ss13 9 ACG TCA CGC 2 TTCACGCTT:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.08333333333333 4 34.249999999999986 0.0707237388415596 0.126951325912032 0.557093345291771 -0.056227587070472 0.0431511898223655 0.0736754909375692 NA NA 0.0762025445112675 0.460593326775356 191 1 808 0.808 0.191 0.382 ORF3a all ss13 10 CTT CGC TTA 2 ACGCTTGGA:ACTCTTAGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.58333333333333 4 34.749999999999986 0.0712278649928988 0.124963623649129 0.56998879284176 -0.0537357586562297 0.0452860514579139 0.0727597296727524 NA NA 0.0766534393623599 0.483289193868267 212 0 788 0.788 0.212 0.424 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAT 2 CTTAGATCA:CTTGGATCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.91666666666666 5 34.41666666666666 0.0708909855297231 0.161478827235442 0.439011025429121 -0.0905878417057187 0.0451990901665506 0.0851971357423435 NA NA 0.0852791632524722 0.288121937555801 123 0 877 0.877 0.123 0.246 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGATCAATC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74 4 34.91666666666666 0.070807263353306 0.124314847835042 0.569580099130741 -0.0535075844817355 0.0436050800875434 0.0689386431524109 NA NA 0.0703080413942088 0.446630180136025 229 3 768 0.768 0.229 0.458 ORF3a all ss13 13 ATC CAA TCA 2 TCAATCACA:TCAATTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74 5 34.91666666666666 0.070807263353306 0.158903109406266 0.445600237892601 -0.0880958460529596 0.0442591093803514 0.079917781639041 NaN NaN 0.084448407259328 0.29685968940901 117 0 883 0.883 0.117 0.234 ORF3a all ss13 14 ACA TCA CAC 2 ATCACACGT:ATTACTGCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.66666666666667 5 34.74999999999999 0.0711433450940078 0.15975246858483 0.445334871656335 -0.088609123490822 0.0432408683863944 0.0822426243383731 NaN NaN 0.0826286777421655 0.283550571581403 117 2 881 0.881 0.117 0.234 ORF3a all ss13 15 CGT CAC CAC 2 ACACGTCAA:ACTGCACAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 2 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.16666666666667 5 34.24999999999999 0.0706404112947758 0.162356129339379 0.435095438541243 -0.091715718044603 0.0419170517447281 0.0893796914749855 NaN NaN 0.0845863679796287 0.278238516628889 103 3 894 0.894 0.103 0.206 ORF3a all ss13 16 CAA CAC AAC 2 CGTCAACCA:GCACAGCCA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.83333333333334 5 34.58333333333332 0.0417741375922484 0.160610991304224 0.26009513578757 -0.118836853711976 0.0310518283568591 0.0853220790663602 NA NA 0.0742472483097478 0.109475369075206 9 2 989 0.989 0.009 0.018 ORF3a all ss13 17 CCA AAC CAA 2 CAACCAAGT:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.66666666666667 6 34.74999999999999 0.0418713371647064 0.196233824001589 0.213374719560922 -0.154362486836883 0.0319746599465933 0.0968830733014512 0.222865266155995 0.338357443756637 0.0863761895027922 0.0739220785077947 10 2 988 0.988 0.01 0.02 ORF3a all ss13 18 AGT CAA GTA 2 CCAAGTAAG:CCAGTAAAA 1:1 TRUE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 2 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.91666666666667 6 35.16666666666666 0.04172570688178 0.193580949501978 0.215546555532075 -0.151855242620198 0.031012329020038 0.0972470265299036 0.196874009107353 0.273584478967286 0.0895303149611798 0.089860862604219 11 1 988 0.988 0.011 0.022 ORF3a all ss13 19 AAA GTA AAA 2 AGTAAGATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.41666666666667 5 35.24999999999999 0.0137460892532251 0.157231298910254 0.0874259091446627 -0.143485209657028 0.0136825477673107 0.0850626652450605 NA NA 0.0824219076860166 0.0817076803881712 7 2 991 0.991 0.007 0.014 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAC:AAGATTGAA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.33333333333333 5 34.66666666666666 0.0135750312327135 0.160180575223544 0.0847482986858331 -0.146605543990831 0.0127727327575583 0.0830781514155926 NA NA 0.0827732100888379 0.0765322004490388 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 21 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:ATTGACAAT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666667 5 34.99999999999999 0.0136058153029875 0.158481820250405 0.0858509530083009 -0.144876004947418 0.0139338441131131 0.0838486634108581 NA NA 0.0809341537558653 0.073446225258883 7 1 992 0.992 0.007 0.014 ORF3a all ss13 22 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.58333333333334 5 34.74999999999999 0 0.15975246858483 0 -0.15975246858483 0 0.0815295744300746 NA NA 0.0863875445112142 0.0644212175337893 0 4 996 0.996 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666667 5 35.24999999999999 0 0.157231298910254 0 -0.157231298910254 0 0.0840668525213771 NA NA 0.0798575473358411 0.0489649006691427 0 2 998 0.998 0 0.001 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666667 6 36.24999999999999 0 0.187009442781175 0 -0.187009442781175 0 0.0869593509008544 NA NA 0.091823899214131 0.0416891711146139 0 2 998 0.998 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5 6 35.666666666666664 0 0.190491169998981 0 -0.190491169998981 0 0.0899552450968529 NA NA 0.0892305027751871 0.0327756170059461 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.58333333333334 6 35.25 0 0.193059006111768 0 -0.193059006111768 0 0.0900696929050078 NA NA 0.090118108931647 0.0321702578669328 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25 6 34.58333333333333 0 0.19731556308439 0 -0.19731556308439 0 0.096596721987626 NA NA 0.0920327806665166 0.0320352537853876 0 4 996 0.996 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666667 7 35.25 0 0.230684450150283 0 -0.230684450150283 0 0.106970335298446 0 NaN 0.0995593219191402 0.0205007219490148 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666669 7 34.41666666666667 0 0.237252996159118 0 -0.237252996159118 0 0.104039197525427 0 NaN 0.111205325448447 0.0328863592398867 0 4 996 0.996 0 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.41666666666669 8 33.91666666666667 0 0.283201052715922 0 -0.283201052715922 0 0.122219445292588 0 NaN 0.121973210459154 0.020242094081282 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CATGCTACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333336 9 34.25 0 0.323508417071989 0 -0.323508417071989 0 0.133596224273751 0 NaN 0.135393836845873 0.0168764659328096 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333336 9 34.25 0 0.323508417071989 0 -0.323508417071989 0 0.14108022510304 0 NaN 0.133972732760518 0.0157467356171098 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.91666666666669 9 34.083333333333336 0 0.325488997542435 0 -0.325488997542435 0 0.140009125284242 0 NaN 0.135883523550661 0.0166043735761115 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.58333333333336 9 33.75 0 0.329524994837884 0 -0.329524994837884 0 0.147520033159445 0 NaN 0.136473826918935 0.0157539899216756 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666669 9 32.916666666666664 0 0.340074619327003 0 -0.340074619327003 0 0.148795065015133 0 NaN 0.140369436711649 0.0154051642522831 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA:ATACCGTTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 9 31.916666666666664 0 0.353678577936851 0 -0.353678577936851 0 0.153200876424462 0 NaN 0.154253100788992 0.0218568827873475 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA:CCGTTACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.08333333333336 9 31.416666666666664 0 0.360905050411733 0 -0.360905050411733 0 0.156028789403395 0 NaN 0.160219925244041 0.0242868836885709 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC:TTACAAGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.9166666666667 9 32.08333333333333 0 0.351334800597847 0 -0.351334800597847 0 0.164377597527175 NA NA 0.146556894498313 0.0165182535837307 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.58333333333336 9 32.74999999999999 0 0.342267536553415 0 -0.342267536553415 0 0.154516727400531 0 NaN 0.143713153936977 0.0172375157106201 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.58333333333336 9 32.74999999999999 0 0.342267536553415 0 -0.342267536553415 0 0.150092991804688 0 NaN 0.142137936412614 0.0160403709166755 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.25000000000003 9 32.416666666666664 0 0.346740849805289 0 -0.346740849805289 0 0.162173854488305 0 NaN 0.145001608800423 0.0167893004947441 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.91666666666669 9 32.74999999999999 0 0.342267536553415 0 -0.342267536553415 0 0.137716937238752 0 NaN 0.151130145479861 0.0235298375116255 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.08333333333336 9 32.58333333333333 0 0.344489417518041 0 -0.344489417518041 0 0.147116240723887 0 NaN 0.146701427076719 0.0188626190062551 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.91666666666669 9 31.91666666666666 0 0.353678577936852 0 -0.353678577936852 0 0.159774296873556 0 NaN 0.152636846599087 0.0204969503746694 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333336 9 31.749999999999996 0 0.356054425493677 0 -0.356054425493677 0 0.159501450138453 0 NaN 0.15065639409043 0.0181103500174997 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.75000000000001 9 31.41666666666666 0 0.360905050411733 0 -0.360905050411733 0 0.153465484047641 0 NaN 0.150119545735812 0.0162115547117863 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT:CTTGTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666669 9 31 0 0.367161168989029 0 -0.367161168989029 0 0.157396539652459 0 NaN 0.156663217320984 0.0190969250319151 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC:GTTGTTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000001 9 30.5 0.0128482799476378 0.374966963646815 0.0342650985107575 -0.362118683699177 0.0129816715834563 0.164719909642664 0.0503051500074602 0.495779781836506 0.162398269939459 0.0257594877485188 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333336 8 31.16666666666666 0.0130014090011593 0.314193196111627 0.0413803009169562 -0.301191787110468 0.0135577983227183 0.132890934977027 0.0654985810364829 0.527534561584708 0.135569398347153 0.0263049559689932 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.75000000000001 8 32 0.0131438194165355 0.304098831081123 0.0432221964478029 -0.290955011664588 0.0130861194547273 0.132076270820422 0.0632954086024478 0.494692379084378 0.133101773727941 0.0288186097639792 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAC 2 GTTGCACTT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.41666666666669 8 31.333333333333336 0.0130296436641525 0.312120297918684 0.0417455825559512 -0.299090654254532 0.0125666983699065 0.136963181863952 0.0646963072269801 0.518762281400087 0.144498219623949 0.0384657358449106 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 52 CTT CAC TTC 2 GCACTTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000001 8 32 0.0129732964431592 0.304098831081123 0.0426614479149327 -0.291125534637964 0.0130695653737743 0.12948353800125 0.0654540685137959 0.514545124877115 0.134992864945527 0.031036889548837 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 CTTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.08333333333334 7 32 0.0129174344873365 0.258630364718797 0.0499455448759134 -0.245712930231461 0.0129629327479116 0.115050273057504 NaN NaN 0.110638380749722 0.0263600925008765 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.41666666666669 7 31.666666666666668 0.0128620515547158 0.261888204157181 0.0491127563232907 -0.249026152602465 0.0133526983221256 0.118588025444153 0.0875996605837221 0.575036107381213 0.113521660000342 0.0282609845546639 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.25000000000003 7 31.500000000000004 0.0127256499425275 0.263548415128416 0.0482858147195717 -0.250822765185889 0.0123608652970484 0.121899018952975 0.0803903255286307 0.548078384498317 0.116125897891229 0.0307787859817827 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.58333333333336 7 30.833333333333336 0.012513324680928 0.27040756553749 0.0462757935638941 -0.257894240856562 0.0128585143932092 0.123324616013964 0.0783613495816161 0.554826263477376 0.12279613922902 0.0357128344579022 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAGC:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.58333333333336 7 30.500000000000004 0.012513324680928 0.273974299787122 0.045673352174459 -0.261460975106194 0.0123869935148557 0.123337774490484 NA NA 0.127296664776574 0.0399805385085211 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 58 AGC AAA GCG 2 CAAAGCGCT:CAGAGCGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.66666666666669 7 30.750000000000004 0.0126585283405138 0.27129041935898 0.0466604326478763 -0.258631891018467 0.0123180495115526 0.123844164725384 0.0648361604585813 0.471730167245367 0.129880092959235 0.046446509583677 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000003 8 31.41666666666667 0.0128482799476378 0.311094218237477 0.0413002852332983 -0.29824593828984 0.0133467820835095 0.129968416120676 NaN NaN 0.133901086851195 0.0259232167711299 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.66666666666669 8 31.25 0.0128208250194751 0.313153267006825 0.0409410546535848 -0.30033244198735 0.0133279162277894 0.135793915123738 0.0730211413119796 0.57501980157886 0.133033996929712 0.0239730054297231 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCCAAAGTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.66666666666669 7 30.25 0.0126585283405138 0.2767124213498 0.0457461514693328 -0.264053893009286 0.0127139535308974 0.122232144149018 0.082031870885524 0.577074425759337 0.12649872561869 0.036851668435141 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAAGTGATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.00000000000001 7 29.916666666666668 0.0129313548258795 0.280450538895226 0.046109217250285 -0.267519184069347 0.0135762932090612 0.128610619570031 0.0794584543271319 0.561716772096571 0.125524214327861 0.033071371083743 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG:GTGATTGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.66666666666669 6 29.583333333333332 0.0128208250194751 0.236467295831909 0.0542181741215862 -0.223646470812433 0.0130989707581102 0.109724675657303 NaN NaN 0.109792148004368 0.041650164926426 2 1 997 0.997 0.002 0.004 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC:ATTGCGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333334 6 29.916666666666668 0.0127934871784325 0.233376267232886 0.0548191439092043 -0.220582780054453 0.0130911208335188 0.111675246258667 NA NA 0.112585804816055 0.0500845122268399 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT:GCGCTTCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79 7 30.25 0.012766265677073 0.2767124213498 0.0461354991395011 -0.263946155672727 0.0125819745714046 0.123353699508352 NaN NaN 0.122873363496559 0.0317045947564377 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA:CTTCATAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.66666666666667 7 29.25 0.0126585283405138 0.288242003650766 0.0439163209392995 -0.275583475310253 0.0131879078413444 0.127740618226479 0.0715250117494848 0.539215662343818 0.128575647547247 0.0320844673670408 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA:CATAAGAGG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.33333333333334 6 28.583333333333336 0.0125525942666428 0.246256582903472 0.0509736394399787 -0.233703988636829 0.0125904420542731 0.106812447948438 NaN NaN 0.115022711355653 0.042173164338896 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AAGAGGTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.75 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.16666666666667 6 28.333333333333336 0.0383879094086674 0.248833044237754 0.154271750869184 -0.210445134829086 0.0302416286294362 0.119417355935878 NaN NaN 0.119818322865212 0.0790254981081684 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG:AGGTGGCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.33333333333334 7 28.916666666666668 0.0388017557993917 0.292304449352025 0.132744321495641 -0.253502693552633 0.0300435810806204 0.125745143018028 0.159052765078852 0.403946914934354 0.131525342769338 0.0539290915280752 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA:TGGCAGCTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.66666666666669 7 29.25 0.0526531940049364 0.288242003650766 0.182670094358388 -0.23558880964583 0.032777879212933 0.13680296892817 0.228400676778962 0.423838777344637 0.132909226412593 0.0763026039626729 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC:CAGCTCGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.33333333333334 8 29.25 0.0667106145123721 0.34021083900431 0.196086093869358 -0.273500224491938 0.0368639368470732 0.153666428123227 0.185336261531676 0.290054632690146 0.136679779377328 0.0453892472265008 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT:CTCGCTATG 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.5 8 29.75 0.0665625029345024 0.33301033366905 0.199881193478678 -0.266447830734547 0.0357759886014045 0.135942469570898 0.181336807699972 0.270346535537888 0.148240236038186 0.0722712520108847 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 73 ATG CCC TGT 2 GCCCTTTAT:GCTATGTAC 1:1 TRUE 1.5 0.5 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.33333333333334 8 29.083333333333332 0.0658317081617893 0.342681915513506 0.192107330972342 -0.276850207351716 0.035415131296188 0.13900663195866 0.171383796638141 0.262322399582332 0.144416689332671 0.0552349285356743 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 74 TAC TGT ACA 2 ATGTACAAA:CTTTATAAG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.16666666666667 7 28.749999999999996 0.0798980931045125 0.294379472599244 0.271411903822799 -0.214481379494732 0.0379113325904643 0.135502988133374 0.32734294801454 0.407027314373107 0.140534959281681 0.126965511776388 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 75 AAA ACA AAG 2 TACAAAGGC:TATAAGGGC 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.08333333333334 7 28.833333333333332 0.0799869383386865 0.293338244775017 0.272678178735386 -0.213351306436331 0.0378901255420201 0.127676791185874 NaN NaN 0.133526690181753 0.110083558543932 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 76 GGC AAG GCA 2 AAAGGCATT:AAGGGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.66666666666667 7 28.583333333333332 0.0815281512006671 0.29648455248311 0.274982795959704 -0.214956401282443 0.040644426777871 0.131366843374709 0.269132085746419 0.306904363171403 0.139484009557656 0.123296647145819 33 0 967 0.967 0.033 0.066 ORF3a all ss13 77 ATT GCA TCC 2 GGCATTCAG:GGCTTCCAG 1:1 TRUE 1.5 0.5 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.66666666666667 7 28.249999999999996 0.0815281512006671 0.300787567424286 0.271048939618122 -0.219259416223619 0.041652045643062 0.135841935064895 NaN NaN 0.138286211564839 0.11284189648412 28 0 972 0.972 0.028 0.056 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGC 2 ATTCAGCTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.33333333333334 6 27.583333333333332 0.0807955355010693 0.256899645924678 0.314502323310941 -0.176104110423609 0.0387522202540721 0.114909994589908 NaN NaN 0.124754594916505 0.158066534408898 44 0 956 0.956 0.044 0.088 ORF3a all ss13 79 CTT AGC TCA 2 CAGCTTGTT:CAGTTCATT 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.16666666666667 6 28.083333333333332 0.0809774510729235 0.25146449764628 0.322023394279814 -0.170487046573357 0.0369394386430552 0.11928330091607 NaN NaN 0.123051187061601 0.165900559002327 57 0 943 0.943 0.057 0.114 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 CTTGTTTGC:TTCATTTGC 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.66666666666667 5 28.583333333333332 0.0815281512006671 0.199182311241132 0.409314214162163 -0.117654160040464 0.0398672662017299 0.0960946221788919 NaN NaN 0.104881324919331 0.261954421145445 97 0 903 0.903 0.097 0.194 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT:GTTTGCAAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.33333333333334 4 28.249999999999996 0.0807955355010693 0.156921757285409 0.514877840388433 -0.07612622178434 0.0407808450439767 0.0820053911800659 NaN NaN 0.0889268909889584 0.391967904526067 188 1 811 0.811 0.188 0.376 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATT 2 TGCAATTTA:TGCAATTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.16666666666667 4 28.916666666666664 0.0809774510729235 0.152908411727716 0.529581402082182 -0.0719309606547927 0.0378259014173375 0.0816772022787578 NaN NaN 0.0882147608566398 0.414839202701133 187 1 812 0.812 0.187 0.374 ORF3a all ss13 83 TTA ATT TAC 2 AATTTACTG:AATTTGCTG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.16666666666667 4 28.916666666666664 0.0809774510729235 0.152908411727716 0.529581402082182 -0.0719309606547927 0.0381479411184983 0.0817780543488144 NaN NaN 0.0908081914372516 0.428290863178461 193 0 807 0.807 0.193 0.386 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG:TTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.33333333333334 4 28.916666666666664 0.0807955355010693 0.152908411727716 0.528391699241124 -0.0721128762266469 0.0382454692967718 0.0821836131782436 NA NA 0.0889797308244224 0.417686411700235 211 0 789 0.789 0.211 0.422 ORF3a all ss13 85 CTA TGC TAC 2 CTGCTACTC:CTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.75000000000001 4 29.916666666666664 0.0803443058867966 0.147260274111344 0.545593890624214 -0.0669159682245477 0.0372959099166369 0.0779258343610866 NaN NaN 0.086681982693377 0.440131662698023 201 0 799 0.799 0.201 0.402 ORF3a all ss13 86 CTA TAC TAT 2 CTACTCTTT:CTGCTATTT 1:1 FALSE 1.25 1 0.5 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.91666666666669 4 30.249999999999996 0.080165223459528 0.145469445655623 0.551079459320323 -0.0653042221960952 0.0394514164701397 0.0765466576269613 NaN NaN 0.0826539021948169 0.429473792160857 198 1 801 0.801 0.198 0.396 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:CTCTTTGTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.08333333333336 4 30.999999999999996 0.0799869383386865 0.141595553474679 0.564897246953381 -0.0616086151359926 0.038240894448812 0.0740500069600763 NaN NaN 0.0816288520555101 0.450404594102851 220 0 780 0.78 0.22 0.44 ORF3a all ss13 88 GTA TTG TAA 2 TTTGTAACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.25000000000001 4 30 0.0787608262631878 0.146808432844572 0.536487071873951 -0.0680476065813837 0.038032847540697703 0.0832699750688202 NaN NaN 0.0884036460026888 0.441455586329643 200 1 799 0.799 0.2 0.4 ORF3a all ss13 89 ACA TAA CAA 2 GTAACAATT:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.91666666666669 4 30.333333333333332 0.0791072878500077 0.145028544735405 0.545460123000847 -0.065921256885397 0.0415584893384098 0.0762798866971189 NaN NaN 0.0819357474065209 0.421080452751565 213 0 787 0.787 0.213 0.426 ORF3a all ss13 90 ATC CAA TCT 2 ACAATTTAC:ACCATCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.58333333333334 4 30 0.0784173889505937 0.146808432844572 0.534147715026803 -0.0683910438939778 0.038194090459186 0.0799478819033856 NaN NaN 0.0782315389699398 0.3820021597086 185 0 815 0.815 0.185 0.37 ORF3a all ss13 91 TAC TCT ACT 2 ATCTATTCA:ATTTACTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.91666666666667 4 30.333333333333332 0.0791072878500077 0.145028544735405 0.545460123000847 -0.065921256885397 0.0378185712528211 0.0748123483257006 NA NA 0.0835629494137325 0.4301813252328 202 0 798 0.798 0.202 0.404 ORF3a all ss13 92 TCA ACT CAC 2 TACTCACAC:TATTCACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.91666666666667 4 30.333333333333332 0.0791072878500077 0.145028544735405 0.545460123000847 -0.065921256885397 0.0381678913087737 0.0797421601760708 NaN NaN 0.0814159530879081 0.4181213760439 203 0 797 0.797 0.203 0.406 ORF3a all ss13 93 CAC CAC ACC 2 TCACACCTT:TCACATCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.41666666666667 4 29.5 0.0775717695799525 0.149561992614941 0.518659642223857 -0.0719902230349886 0.0365868454950575 0.0789220787213713 NA NA 0.0811339364909506 0.374916866990115 176 1 823 0.823 0.176 0.352 ORF3a all ss13 94 CTT ACC TTT 2 CACCTTTTA:CATCTTTTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.08333333333334 4 29.166666666666668 0.0779078173603665 0.151456007747705 0.514392387062949 -0.0735481903873386 0.0382797652922916 0.083319712035805 NaN NaN 0.0856125871400801 0.39029554925616 184 1 815 0.815 0.184 0.368 ORF3a all ss13 95 TTA TTT TAC 2 CTTTTACTT:CTTTTGCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.58333333333334 4 29.333333333333332 0.0774048314449128 0.150503021596613 0.514307491130494 -0.0730981901517006 0.0379187022736571 0.082113876449868 NaN NaN 0.0862526674050677 0.396722594403236 179 0 821 0.821 0.179 0.358 ORF3a all ss13 96 CTT TAC TTG 2 TTACTTTTA:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.08333333333333 1 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.25000000000001 4 30.333333333333332 0.0787608262631878 0.145028544735405 0.543071203030285 -0.066267718472217 0.0416581092197582 0.0781366365696556 NaN NaN 0.0852400177263009 0.436908083503445 205 0 795 0.795 0.205 0.41 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TAG 2 CTTGTCGCT:CTTTTAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.33333333333336 4 30.749999999999996 0.0786746849626466 0.142863650574837 0.550697708241987 -0.0641889656121901 0.0369850791052617 0.0770558194841941 NaN NaN 0.0812318352261811 0.429414071194547 200 0 800 0.8 0.2 0.4 ORF3a all ss13 98 GCT TAG CTG 2 GTCGCTGCA:TTAGCTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.33333333333336 4 30.91666666666666 0.0649756739796766 0.142015736265178 0.457524466572852 -0.0770400622855019 0.0345487051376292 0.0730218286866289 NaN NaN 0.0774132955222045 0.319649362577799 140 0 860 0.86 0.14 0.28 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.83333333333336 4 29.916666666666664 0.0637325912188816 0.147260274111344 0.432788758566978 -0.0835276828924626 0.0365548731009934 0.082515949963464 NA NA 0.0818989918248223 0.307782253624972 142 0 858 0.858 0.142 0.284 ORF3a all ss13 100 GGC CAG GCA 2 GCAGGTATG:GCTGGCATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.00000000000003 4 29.749999999999996 0.062798169682851 0.148172379571929 0.423818324739573 -0.0853742098890779 0.0332037283305619 0.0784076446225319 NaN NaN 0.0793844487498912 0.282172153733591 122 0 878 0.878 0.122 0.244 ORF3a all ss13 101 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAG:GGTATGGAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.33333333333336 4 30.08333333333333 0.0625362067042883 0.146359364647636 0.427278478933315 -0.0838231579433477 0.0343956343510777 0.0794989178037926 NaN NaN 0.0835258977351344 0.315591274009472 142 0 858 0.858 0.142 0.284 ORF3a all ss13 102 GAG TGG AGG 2 ATGGAGGCA:ATGGAGGCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.50000000000003 4 29.91666666666666 0.0631952577133049 0.147260274111344 0.429139889183709 -0.0840650163980394 0.034912318544892 0.0812060969618305 NA NA 0.0800597155158916 0.293704817837581 144 0 856 0.856 0.144 0.288 ORF3a all ss13 103 GCA AGG CAC 2 GAGGCACAA:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.50000000000003 4 29.91666666666666 0.0631952577133049 0.147260274111344 0.429139889183709 -0.0840650163980394 0.0336075349468977 0.0792853772382332 NaN NaN 0.08193893840388 0.304916518828776 127 1 872 0.872 0.127 0.254 ORF3a all ss13 104 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT:GCGCAATTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.83333333333336 4 30.249999999999996 0.062929976401818 0.145469445655623 0.432599272776464 -0.0825394692538053 0.0353023811921706 0.0780709514404592 NaN NaN 0.0802841779494732 0.303906857039656 131 1 868 0.868 0.131 0.262 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTT 2 CAATTTTTG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.6666666666667 4 30.749999999999996 0.0638683562552301 0.142863650574837 0.44705812848996 -0.0789952943196066 0.0355291929883681 0.0749550444661236 NaN NaN 0.0831176531038251 0.341907352430861 160 3 837 0.837 0.16 0.32 ORF3a all ss13 106 TTG TTT TGT 2 TTTTTGTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.00000000000003 4 30.416666666666664 0.0635974024950577 0.144590316625212 0.439845516487156 -0.0809929141301541 0.0336286593985818 0.0765137179605144 NaN NaN 0.0778122747232104 0.29793319197704 155 1 844 0.844 0.155 0.31 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACA 2 TTGTACATC:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.6666666666667 4 31.416666666666664 0.0646952582133052 0.139531497680893 0.463660602004448 -0.074836239467588 0.0347085190871903 0.0732232587401859 NaN NaN 0.0791357559362573 0.344317385301247 151 2 847 0.847 0.151 0.302 ORF3a all ss13 108 ATC ACA TCT 2 TACATCTAT:TACCTCTAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.6666666666667 4 31.916666666666664 0.0646952582133052 0.137132914796851 0.47177045940535 -0.0724376565835459 0.036855490315403 0.0727624498738726 NaN NaN 0.0760988726798779 0.341153433641829 147 2 851 0.851 0.147 0.294 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 ATCTATGCT:CTCTATGCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.83333333333336 3 31.916666666666664 0.0645559565784322 0.100428343016685 0.642806150527717 -0.0358723864382525 0.0355842870954593 0.0613855739856852 NaN NaN 0.0655448502537171 0.584175893740349 291 3 706 0.706 0.291 0.582 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 TATGCCTTG:TATGCTCTG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.83333333333336 3 31.916666666666664 0.0645559565784322 0.100428343016685 0.642806150527717 -0.0358723864382525 0.0361918723989309 0.0605335278068118 NA NA 0.0652943871107936 0.58273465021982 258 1 741 0.741 0.258 0.516 ORF3a all ss13 111 CTG CCT TGA 2 GCCTTGATA:GCTCTGATT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.50000000000003 3 32.24999999999999 0.0648351627055778 0.0993184392369987 0.652800861588902 -0.0344832765314209 0.0354633979974585 0.0603156621154929 NA NA 0.0660740316059637 0.601747973245575 300 1 699 0.699 0.3 0.6 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 CTGATTTAT:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.33333333333336 3 32.416666666666664 0.0633287393599309 0.0987726497511971 0.641156631106409 -0.0354439103912663 0.0326538298009956 0.0629749410401137 NaN NaN 0.0634340041437525 0.576330622588678 275 3 722 0.722 0.275 0.55 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATA 2 ATATATTTT:ATTTATATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.6666666666667 3 33.416666666666664 0.063062337907906 0.0956200277799543 0.659509721677014 -0.0325576898720483 0.0338091877736214 0.0564985952822904 NA NA 0.0619569833945918 0.599243560353363 305 2 693 0.693 0.305 0.61 ORF3a all ss13 114 ATT ATA TTC 2 TATATTCTG:TATTTTCTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.33333333333337 3 33.74999999999999 0.0633287393599309 0.0946134639951751 0.66934172670351 -0.0312847246352442 0.0354748928491173 0.0539956401662132 NA NA 0.0648113092861877 0.629305414307778 288 1 711 0.711 0.288 0.576 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 ATTCTGCAA:TTTCTACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.50000000000004 2 34.08333333333333 0.0640047012994632 0.0611024764460933 1.04749766330552 0.00290222485336998 0.0356266716125255 0.0437361780194693 NA NA 0.0479804336253898 0.951767232168707 557 6 437 0.437 0.557 0.874 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAG 2 CTACAATGC:CTGCAAGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.1666666666667 2 34.41666666666666 0.0634627864197421 0.0604861633757489 1.04921163581664 0.0029766230439932 0.0350084415025346 0.0469634179169038 NA NA 0.0482186165098485 0.950776398120019 530 5 465 0.465 0.53 0.93 ORF3a all ss13 117 GCT AAG CTG 2 CAAGCTGTG:CAATGCATC 1:1 TRUE 1.75 0.75 0.5 0 2 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.83333333333336 2 35.08333333333333 0.0645559565784322 0.0592901175479514 1.08881478479482 0.00526583903048081 0.0365838089814119 0.0425426843278257 NA NA 0.0479659722493926 0.91258162736374 554 9 437 0.437 0.554 0.874 ORF3a all ss13 118 ATC CTG TCA 2 GCTGTGAGC:TGCATCAAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.9166666666667 2 35.24999999999999 0.0380229253413545 0.0589984642956841 0.644473136636134 -0.0209755389543296 0.0226445816460648 0.0438875484944828 NA NA 0.0406580831183885 0.605923672173489 293 12 695 0.695 0.293 0.586 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA:GTGAGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.58333333333336 1 34.58333333333333 0.0377042739400825 0.0294878275056261 1.27863858172966 0.00821644643445639 0.0220674930641572 0.0306775491999739 NA NA 0.0258543201842804 0.750638309062957 629 31 340 0.34 0.629 0.68 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AGCTTCTGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333336 1 34.91666666666666 0.0252389746234555 0.0292007684815911 0.864325698803675 -0.00396179385813554 0.0188063974856422 0.0301320408494756 NA NA 0.0229320577728903 0.862838312296955 340 139 521 0.521 0.34 0.68 ORF3a all ss13 121 TGC CAT GCA 2 GCATGTAGA:TTCTGCAGA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.58333333333336 0 34.58333333333332 0.012513324680928 0 -Inf 0.012513324680928 0.0128700713318899 0 NA NA 0.0123377306492308 0.310471929274244 595 405 0 0 0.595 0.001 ORF3a all ss13 122 AGA GCA GAA 2 TGCAGATTT:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.08333333333336 0 34.91666666666666 0.0253992526173405 0 -Inf 0.0253992526173405 0.0183139818896045 0 NA NA 0.0185024923722499 0.169830815406003 884 116 0 0 0.884 0.001 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATT:AGATTTATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.08333333333336 0 34.74999999999999 0.0253992526173405 0 -Inf 0.0253992526173405 0.0179989378827905 0 NA NA 0.0179088798343391 0.15611805292361 874 126 0 0 0.874 0.001 ORF3a all ss13 124 ATC TTA TCA 2 ATTATTATG:TTTATCATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.4166666666667 0 35.08333333333332 0.0125394770467935 0 -Inf 0.0125394770467935 0.0127257541156939 0 NA NA 0.0125639987702735 0.318255959972543 641 359 0 0 0.641 0.001 ORF3a all ss13 125 ATG TCA TGA 2 ATCATGAGA:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.9166666666667 0 35.58333333333332 0.0126185941874855 0 -Inf 0.0126185941874855 0.013043360696271 0 NA NA 0.0125202207540449 0.313523038229914 649 351 0 0 0.649 0.001 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.9166666666667 0 35.91666666666666 0.012461345857946 0 -Inf 0.012461345857946 0.0130321497335534 0 NA NA 0.0130976315377398 0.341391317732477 656 344 0 0 0.656 0.001 ORF3a all ss13 127 TGT GAT GTT 2 AGATGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.9166666666667 0 36.24999999999999 0.0126185941874855 0 -Inf 0.0126185941874855 0.0125687131835052 0 NA NA 0.0123978380302939 0.308770150371523 639 361 0 0 0.639 0.001 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 TGTTGGCTT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.4166666666667 0 36.24999999999999 0.012698716061835 0 -Inf 0.012698716061835 0.0126492510808444 0 NA NA 0.0130891977940844 0.33196294059782 611 389 0 0 0.611 0.001 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.08333333333337 0 35.58333333333332 0.012752698321938 0 -Inf 0.012752698321938 0.0133567761022613 0 NA NA 0.0125965313993865 0.311347979166154 635 365 0 0 0.635 0.001 ORF3a all ss13 130 TGT TTT GTT 2 CTTTGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000003 0 35.08333333333332 0.0125657389590355 0 -Inf 0.0125657389590355 0.0122338103056302 0 NA NA 0.013170259935103 0.340033258420884 667 333 0 0 0.667 0.001 ORF3a all ss13 131 TGG GTT GGA 2 TGTTGGAAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.75000000000003 0 35.08333333333332 0.0126451889006809 0 -Inf 0.0126451889006809 0.0125462163046097 0 NA NA 0.012653131834133 0.317614394779831 625 375 0 0 0.625 0.001 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.4166666666667 0 35.08333333333332 0.012698716061835 0 -Inf 0.012698716061835 0.0129160040003365 0 NA NA 0.0129186125396167 0.325618108549129 620 380 0 0 0.62 0.001 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.9166666666667 0 34.58333333333332 0.0126185941874855 0 -Inf 0.0126185941874855 0.0127415446978392 0 NA NA 0.0129123326337385 0.328444743670568 630 370 0 0 0.63 0.001 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.08333333333337 0 34.58333333333332 0.0125921111074123 0 -Inf 0.0125921111074123 0.0119257672536902 0 NA NA 0.0124083697743266 0.310197428947619 644 356 0 0 0.644 0.001 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAA:AAATCCAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.4166666666667 0 34.58333333333332 0.012698716061835 0 -Inf 0.012698716061835 0.0129592017077089 0 NA NA 0.0132884835282167 0.339265187712992 646 354 0 0 0.646 0.001 ORF3a all ss13 136 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAC:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.4166666666667 0 35.24999999999999 0.012698716061835 0 -Inf 0.012698716061835 0.0124170237106505 0 NA NA 0.0131113202782773 0.332779399921134 636 364 0 0 0.636 0.001 ORF3a all ss13 137 AAC AAA ACC 2 AAAAACCCA:AAGAACCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333336 0 34.66666666666666 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.012253277662409 0 NA NA 0.0127258854492165 0.320898655507835 612 388 0 0 0.612 0.001 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 34.66666666666666 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0131173384787285 0 NA NA 0.0125507597298858 0.310100561609986 630 370 0 0 0.63 0.001 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTC:CCATTACTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 34.66666666666666 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0127587701316129 0 NA NA 0.013355639082298301 0.340163994355279 620 380 0 0 0.62 0.001 ORF3a all ss13 140 CTC TAC TCT 2 TTACTCTAT:TTACTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 0 35.66666666666666 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.01324525859024 0 NA NA 0.0130732560903996 0.321547815328902 622 378 0 0 0.622 0.001 ORF3a all ss13 141 TAT TCT ATG 2 CTCTATGAT:CTTTATGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 0 35.66666666666666 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.0128589615575245 0 NA NA 0.0134407524699621 0.33495639864796 623 377 0 0 0.623 0.001 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 0 36.33333333333332 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.012932905447642 0 NA NA 0.0130878235760487 0.322086722942262 618 382 0 0 0.618 0.001 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000003 0 36.66666666666665 0.0130155110198637 0 -Inf 0.0130155110198637 0.013211210126444 0 NA NA 0.0132150362751799 0.324672383286038 627 373 0 0 0.627 0.001 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.6666666666667 1 37.16666666666665 0.0129873375085957 0.027400307499342 0.473985100674786 -0.0144129699907463 0.0128063136356253 0.0274842477551312 NA NA 0.0328489341636423 0.66083166024507 294 124 582 0.582 0.294 0.588 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.6666666666667 1 37.16666666666665 0.0129873375085957 0.027400307499342 0.473985100674786 -0.0144129699907463 0.0131464599783806 0.0278583936949792 NA NA 0.029830581848723 0.628981514070945 294 133 573 0.573 0.294 0.588 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.6666666666667 1 37.16666666666665 0.0131582322381821 0.027400307499342 0.480222064606324 -0.0142420752611598 0.0139608167461553 0.0306250978982966 NA NA 0.0318396524021853 0.654653960758534 258 139 603 0.603 0.258 0.516 ORF3a all ss13 147 GTT TTG TTT 2 TTTGTTTGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.1666666666667 1 36.16666666666666 0.0130722263514627 0.0281723261817365 0.464009477497005 -0.0151000998302737 0.0125983438067184 0.0304952811765754 NA NA 0.032749149912507 0.644738542174861 279 129 592 0.592 0.279 0.558 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666669 1 37.16666666666665 0.0132453773639628 0.027400307499342 0.483402507956557 -0.0141549301353792 0.0131705672992473 0.0289742035387335 NA NA 0.0323192183504132 0.661406189833161 298 126 576 0.576 0.298 0.596 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGCTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666669 1 37.33333333333332 0.0132453773639628 0.0272757331281561 0.485610315283877 -0.0140303557641934 0.0134373122361099 0.0292246336544333 NA NA 0.0318878359161811 0.659943740427028 275 145 580 0.58 0.275 0.55 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.50000000000003 1 36.66666666666665 0.0131871529184001 0.0277809537602618 0.474683231979716 -0.0145938008418617 0.0135480070604146 0.0293988173977844 NA NA 0.0321511066307239 0.649891545407788 312 123 565 0.565 0.312 0.624 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333336 1 36.66666666666665 0.0133041182530361 0.0277809537602618 0.478893502643761 -0.0144768355072257 0.0136436456222898 0.0272026810564484 NA NA 0.0335613825657514 0.666211015733406 300 127 573 0.573 0.3 0.6 ORF3a all ss13 152 CAT CAC ATA 2 ACACATAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.66666666666669 1 35.83333333333332 0.0131582322381821 0.0284394261467203 0.462675729471411 -0.0152811939085382 0.0131231143381983 0.0288154866451368 NA NA 0.0328992257844808 0.642300368777549 294 120 586 0.586 0.294 0.588 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 CATAACTAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000001 1 36.833333333333314 0.0134532755150005 0.0276529018562458 0.486505017988262 -0.0141996263412453 0.0145174520562927 0.0297670039959244 NA NA 0.032336253950556 0.660571663818396 310 118 572 0.572 0.31 0.62 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.014168020311731 0.0289839950299847 NA NA 0.0323514015347934 0.656320995111752 288 128 584 0.584 0.288 0.576 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333336 1 36.499999999999986 0.0133932130500048 0.0279101972553257 0.479868090056196 -0.0145169842053209 0.0139700299573176 0.0295176621855928 NA NA 0.0324282823681632 0.654395492788023 296 119 585 0.585 0.296 0.592 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.0134154678643588 0.0299325544006238 NA NA 0.0325481414349821 0.658266013980673 267 139 594 0.594 0.267 0.534 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.0133327318906272 0.0309659883743447 NA NA 0.0334595426187604 0.66700618764028 305 131 564 0.564 0.305 0.61 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000001 1 36.16666666666665 0.0135443861537981 0.0281723261817365 0.480769179883296 -0.0146279400279383 0.0134863281062907 0.0302009468162912 NA NA 0.03313807455227 0.658906100992852 316 128 556 0.556 0.316 0.632 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAC:ATACCATAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666669 1 36.16666666666665 0.0136058153029875 0.0281723261817365 0.482949658300062 -0.0145665108787489 0.0134997586225191 0.0296511478403121 NA NA 0.0334538068657788 0.663256418042906 270 138 592 0.592 0.27 0.54 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATACAAC:CCATATAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 36.16666666666665 0.0134835092215562 0.0281723261817365 0.478608302863443 -0.0146888169601802 0.0128150166236803 0.0295236914564301 NA NA 0.0332025650062813 0.658199731054848 314 141 545 0.545 0.314 0.628 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAACAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 36.16666666666665 0.0134835092215562 0.0281723261817365 0.478608302863443 -0.0146888169601802 0.013790502170456 0.0304044241038287 NA NA 0.0346699766987844 0.671802543139756 318 118 564 0.564 0.318 0.636 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.6666666666667 1 35.66666666666665 0.0135138791270087 0.0285748846742028 0.472928562305237 -0.0150610055471941 0.0144655931354037 0.0288261291232449 NA NA 0.0333430067552366 0.651485779557541 299 123 578 0.578 0.299 0.598 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000003 1 35.66666666666665 0.0136367393123929 0.0285748846742028 0.477228148700247 -0.0149381453618099 0.0136930257449297 0.0301789826806418 NA NA 0.034047054518539 0.660842689222392 320 133 547 0.547 0.32 0.64 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.6666666666667 1 35.66666666666665 0.0135138791270087 0.0285748846742028 0.472928562305237 -0.0150610055471941 0.0139356568648558 0.031304858193158 NA NA 0.0314554902707992 0.632078274730177 279 136 585 0.585 0.279 0.558 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000003 1 35.333333333333314 0.0134532755150005 0.028849710620847 0.466322719551961 -0.0153964351058466 0.0136161765483216 0.030356064992349 NA NA 0.0343491838120817 0.653985103543182 287 140 573 0.573 0.287 0.574 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 35.499999999999986 0.0134835092215562 0.0287116399282627 0.469618219483296 -0.0152281307067065 0.0135730489849046 0.0307022877572558 NA NA 0.0337071497905418 0.651429305098667 290 128 582 0.582 0.29 0.58 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 35.499999999999986 0.0134835092215562 0.0287116399282627 0.469618219483296 -0.0152281307067065 0.0137714242489084 0.0302505143751447 NA NA 0.0333039658792616 0.647493687570915 290 120 590 0.59 0.29 0.58 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCG 2 ATTGTCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000004 1 35.833333333333314 0.0136367393123929 0.0284394261467203 0.479501212227008 -0.0148026868343274 0.0133387823124564 0.0292700654885573 NA NA 0.032310617817174 0.646854077702444 317 120 563 0.563 0.317 0.634 ORF3a all ss13 169 GTT TCG TTA 2 GTCGTTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 35.499999999999986 0.0134532755150005 0.0287116399282627 0.468565207303174 -0.0152583644132622 0.0139032572687473 0.0305253259385835 NA NA 0.0342230327574954 0.655705068467647 306 129 565 0.565 0.306 0.612 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTG 2 GTTACTGAA:GTTACTGCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.6666666666667 1 34.83333333333332 0.013333684515963 0.0292720079293014 0.455509732990195 -0.0159383234133385 0.0137593037521337 0.0314963373732292 NA NA 0.0367412800713454 0.664434548984928 281 128 591 0.591 0.281 0.562 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTGCAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.6666666666667 1 34.83333333333332 0.013333684515963 0.0292720079293014 0.455509732990195 -0.0159383234133385 0.013603823624094 0.0311257023444106 NA NA 0.034377095372561 0.642911383442006 264 136 600 0.6 0.264 0.528 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:GCAGGTGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0322888867659216 NA NA 0.0325540122640724 0.368555299844807 0 377 623 0.623 0 0.001 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0311266419563928 NA NA 0.0320080108069615 0.360442986368248 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0293806049049088 NA NA 0.0302599033240967 0.33806061820234 0 353 647 0.647 0 0.001 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TTT 2 GGCATTTCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0311178235357468 NA NA 0.0310625942198397 0.35069173906633 0 368 632 0.632 0 0.001 ORF3a all ss13 176 TCA TTT CAA 2 ATTTCAACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 1 35.49999999999998 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0301687921112989 NA NA 0.0315719349359326 0.363136977851339 0 340 660 0.66 0 0.001 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 TCAACACCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333337 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0305280808872491 NA NA 0.0304532820676021 0.348080641798128 0 355 645 0.645 0 0.001 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0301073276207856 NA NA 0.0300603992726579 0.341816437096021 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.032425386153998 NA NA 0.0289829619661801 0.324172324078157 0 338 662 0.662 0 0.001 ORF3a all ss13 180 CTC AAC TCA 2 AAACTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333336 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0308372193132155 NA NA 0.0307192355456222 0.359095097746563 0 371 629 0.629 0 0.001 ORF3a all ss13 181 AAA TCA AAG 2 CTCAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000003 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0285873879211258 NA NA 0.0303163658169013 0.352745129406469 0 386 614 0.614 0 0.001 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333336 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0291567768157343 NA NA 0.0295841454076965 0.340956091618356 0 374 626 0.626 0 0.001 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0280221977971122 NA NA 0.0289740739555584 0.337648872502821 0 375 625 0.625 0 0.001 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 37.66666666666664 0 0.0270299523623977 0 -0.0270299523623977 0 0.0280535068678572 NA NA 0.0292264815017616 0.35504676925151 0 364 636 0.636 0 0.001 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0281261954761113 NA NA 0.0296893123268987 0.35385601661082 0 348 652 0.652 0 0.001 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0294008118785048 NA NA 0.0298211959416942 0.355988659440768 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0296240184493579 NA NA 0.0278293276382099 0.322613564196513 0 393 607 0.607 0 0.001 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333334 1 37.333333333333314 0 0.0272757331281561 0 -0.0272757331281561 0 0.0280122303045889 NA NA 0.0292371922554475 0.350865306671068 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 1 36.833333333333314 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0297482779655066 NA NA 0.0295019278506764 0.348591279181245 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333334 1 36.16666666666664 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0304122403821402 NA NA 0.0291714960042825 0.334170084100588 0 366 634 0.634 0 0.001 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGG 2 TCTGAGGAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.5 1 36.99999999999997 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0287571516920892 NA NA 0.0280697526570507 0.326775523101208 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 192 GAT AGG ATA 2 GAGGATAGG:GAGGATTGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 1 35.66666666666664 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0310395790089331 NA NA 0.0311146286611617 0.358422783361125 0 364 636 0.636 0 0.001 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 GATAGGCAC:GATTGGCAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333334 1 36.833333333333314 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0281876683636813 NA NA 0.028894118970374 0.338545769116293 0 397 603 0.603 0 0.001 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCACTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333334 0 37.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666667 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666667 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666667 0 34.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000001 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 202 GTT TCG TTG 2 GTCGTTGTA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000001 0 36.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 203 GTA TTG TAC 2 GTTGTACAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 0 36.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 GTACATGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666669 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333334 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666667 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0314124768786047 NA NA 0.0303836218709439 0.360538340594311 0 373 627 0.627 0 0.001 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 1 36.999999999999986 0 0.0275260251378209 0 -0.0275260251378209 0 0.0311123885235043 NA NA 0.028847377266501 0.339984910260687 0 360 640 0.64 0 0.001 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0301957908036747 NA NA 0.0280504310607186 0.321982009997041 0 371 629 0.629 0 0.001 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 35.999999999999986 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0282678268943319 NA NA 0.0296473763333111 0.339714145770451 0 356 644 0.644 0 0.001 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333334 1 35.999999999999986 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0315672799925353 NA NA 0.0294510153269294 0.336504020906404 0 368 632 0.632 0 0.001 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333334 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0265970762173286 NA NA 0.030420539816966 0.347562032063402 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666667 1 35.33333333333332 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0290013547473636 NA NA 0.0309169095784652 0.350749264807898 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76 1 34.66666666666665 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0295959311205202 NA NA 0.031717109290646 0.3537010918778 0 362 638 0.638 0 0.001 ORF3a all ss13 215 GAG TTG AGT 2 CTTGAGTCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333334 1 34.33333333333332 0 0.0297068535712844 0 -0.0297068535712844 0 0.030201968241485 NA NA 0.0308847384481235 0.336118973288973 0 381 619 0.619 0 0.001 ORF3a all ss13 216 TCT AGT CTA 2 GAGTCTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333334 1 33.83333333333332 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.0312944433375349 NA NA 0.033283518024041 0.364936678919692 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666669 1 33.16666666666665 0 0.0307735475083969 0 -0.0307735475083969 0 0.0324110799264583 NA NA 0.031873911054963 0.33430564457781 0 388 612 0.612 0 0.001 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333336 1 32.999999999999986 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.0349065879514306 NA NA 0.0313013994132812 0.323051954994048 0 390 610 0.61 0 0.001 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666669 1 34.499999999999986 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.030758933874535 NA NA 0.0320820567120168 0.356840500593709 0 398 602 0.602 0 0.001 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CTA 2 ATTACTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 1 35.333333333333314 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0295778486710676 NA NA 0.0300766312630981 0.337454552192148 0 367 633 0.633 0 0.001 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 1 35.99999999999998 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0304610831483715 NA NA 0.0317532076755607 0.372707242861099 0 385 615 0.615 0 0.001 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 1 36.33333333333331 0 0.0280406490537152 0 -0.0280406490537152 0 0.0291499944513651 NA NA 0.029603454229384 0.343532448907469 0 364 636 0.636 0 0.001 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0283724397875399 NA NA 0.0279885577958229 0.325374095716324 0 388 612 0.612 0 0.001 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.027880201409493 NA NA 0.0285612006075643 0.330711582378946 0 391 609 0.609 0 0.001 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0299331674369401 NA NA 0.0299908391601187 0.347543692103784 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0308477915550706 NA NA 0.0318639493298756 0.367551250861671 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTT TCT TTA 2 ATCTTTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TTA ACA 2 TTTAACAAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAAGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:AAAGATCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA---:GATCCA--- 1:1 FALSE 0.166666666666667 0 1.83333333333333 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG 2 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C CGA 0 ---CCGAAT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT CGA ATG 2 CCGAATGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000001 1 31.416666666666647 0.0136367393123929 0.0325254218363474 0.419264026182551 -0.0188886825239545 0.0141358709689382 0.0341284938477551 NA NA 0.0385454325209518 0.624107819619689 275 120 605 0.605 0.275 0.55 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.66666666666669 1 31.74999999999998 0.01369901098297 0.0321765161581571 0.425745625027747 -0.0184775051751871 0.0139983025926073 0.0348905382989556 NA NA 0.0378149539918113 0.625103965639352 261 136 603 0.603 0.261 0.522 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.00000000000001 1 32.083333333333314 0.0138252762666285 0.0318350176854428 0.434278893865682 -0.0180097414188143 0.0127717100230662 0.033081397380593 NA NA 0.037761633340021 0.633410353714986 266 132 602 0.602 0.266 0.532 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666667 1 31.916666666666647 0.0137934922285677 0.0320048558445568 0.430981232834191 -0.0182113636159891 0.0140241670642644 0.0350631552957016 NA NA 0.0356125383916371 0.609088461805221 272 135 593 0.593 0.272 0.544 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAA 2 ATGAGAATT:ATGAGATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.5 1 32.583333333333314 0.0137303605832671 0.0313361505112163 0.438163602078454 -0.0176057899279492 0.0135652776958774 0.0348493192319901 NA NA 0.034553138791554 0.610382213101664 307 127 566 0.566 0.307 0.614 ORF3a all ss13 7 ATT GAA TTT 2 AGAATTTTT:AGATTTTTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666666 1 32.91666666666664 0.0136058153029875 0.0310121698640216 0.438725034805518 -0.0174063545610341 0.0138921213486234 0.0320701084945142 NA NA 0.0359410462667608 0.628170886048331 293 124 583 0.583 0.293 0.586 ORF3a all ss13 8 TTT TTT TTA 2 ATTTTTACT:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666666 1 33.083333333333314 0 0.0308526791703671 0 -0.0308526791703671 0 0.0334976264351403 NA NA 0.0338253432523902 0.361706996976515 0 391 609 0.609 0 0.001 ORF3a all ss13 9 ACT TTA CTC 2 TTTACTCTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666666 1 32.74999999999998 0 0.0311733183159379 0 -0.0311733183159379 0 0.0328677910734721 NA NA 0.0326782817493249 0.340110943804243 0 395 605 0.605 0 0.001 ORF3a all ss13 10 CTT CTC TTA 2 ACTCTTAGA:ACTCTTGGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666666 1 33.74999999999998 0 0.0302307926160697 0 -0.0302307926160697 0 0.0339922475434858 NA NA 0.0327381148130943 0.355792150029563 0 323 677 0.677 0 0.001 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAT 2 CTTAGATCA:CTTGGATCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.49999999999999 1 33.41666666666664 0 0.0305385697640888 0 -0.0305385697640888 0 0.032734623096634 NA NA 0.0319133271701851 0.338606548506364 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGATCAATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333333 0 33.91666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 13 ATT CAA TTA 2 TCAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333333 0 33.91666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 14 ACT TTA CTG 2 ATTACTGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666667 0 33.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 15 GCA CTG CAC 2 ACTGCACAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000001 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 16 CAG CAC AGC 2 GCACAGCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000001 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 17 CCA AGC CAG 2 CAGCCAGGA:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.75000000000001 0 34.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 18 GGA CAG GAA 2 CCAGGAAAA:CCAGTAAAA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000001 0 34.41666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 19 AAA GAA AAA 2 GGAAAAATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 34.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 0 34.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 21 GAC TTG ACA 2 ATTGACAAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 0 34.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 22 AAT ACA ATG 2 GACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000003 0 34.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333336 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333336 0 34.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000003 0 33.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666669 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333336 0 32.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.1666666666667 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.1666666666667 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 0 32.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333337 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333337 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCA:ACGATACCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000003 0 31.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 36 CCA TAC CAC 2 ATACCACTA:ATACCGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.6666666666667 0 30.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 37 CTA CAC TAC 2 CCACTACAA:CCGCTACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.1666666666667 0 29.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000004 0 30.999999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.6666666666667 0 31.666666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.6666666666667 0 31.666666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 0 31.666666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 0 32.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.6666666666667 0 31.999999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000003 0 31.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 0 30.999999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 0 30.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000001 0 30.166666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.1666666666667 0 30.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000003 0 31.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAT 2 GTTGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000003 0 30.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 52 TTT CAT TTC 2 GCATTTCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 0 30.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 TTTCTTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333336 0 30.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 0 30.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000004 0 30.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333337 0 30.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 57 CAG TTC AGA 2 TTTCAGAGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333337 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 58 AGC AGA GCG 2 CAGAGCGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 30.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 0 30.166666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 29.166666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000003 0 28.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 0 29.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 0 29.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000003 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000003 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000003 0 27.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 0 27.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333336 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666669 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666669 0 28.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TTT 2 GCCCTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 29.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 74 TAT TTT ATA 2 CTTTATAAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666669 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 75 AAG ATA AGG 2 TATAAGGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000001 0 29.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 76 GGC AGG GCT 2 AAGGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 77 TTC GCT TCC 2 GGCTTCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGT 2 TTCCAGTTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000001 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 79 TTC AGT TCA 2 CAGTTCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 TTCATTTGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666669 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000001 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATT 2 TGCAATTTA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 83 TTA ATT TAC 2 AATTTACTG:AATTTATTG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG:TTATTGCTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 1 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000001 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA:TTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 29.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 86 CTA TGC TAT 2 CTGCTATTT 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000003 0 29.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.6666666666667 0 31.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 88 GTT TTG TTA 2 TTTGTTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333336 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 89 ACC TTA CCA 2 GTTACCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000003 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 90 ATC CCA TCT 2 ACCATCTAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666669 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 91 TAT TCT ATT 2 ATCTATTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333336 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 92 TCA ATT CAC 2 TATTCACAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000003 0 29.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 93 CAT CAC ATC 2 TCACATCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333337 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 94 CTT ATC TTT 2 CATCTTTTG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000004 0 28.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 95 TTG TTT TGC 2 CTTTTGCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333339 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 96 CTT TGC TTG 2 TTGCTTGTC 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 30.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TCG 2 CTTGTCGCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 30.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 98 GCT TCG CTG 2 GTCGCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 30.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 29.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 100 GGT CAG GTA 2 GCAGGTATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000006 0 29.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 101 ATG GTA TGG 2 GGTATGGAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000006 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 102 GAG TGG AGG 2 ATGGAGGCG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 103 GCG AGG CGC 2 GAGGCGCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 104 CAA CGC AAT 2 GCGCAATTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333339 0 30.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTT 2 CAATTTTTG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666671 0 30.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 106 TTG TTT TGT 2 TTTTTGTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 30.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACC 2 TTGTACCTC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666673 0 31.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 108 CTC ACC TCT 2 TACCTCTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666673 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 CTCTATGCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000006 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 TATGCCTTA:TATGCCTTG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000006 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 111 TTA CCT TAA 2 GCCTTAATA:GCCTTGATA 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666673 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 112 ATA TAA TAT 2 TTAATATAT:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666673 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATT 2 ATATATTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000007 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 114 TTT ATT TTC 2 TATTTTCTA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000007 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 TTTCTACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000007 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAT 2 CTACAATGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666673 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 117 TGC AAT GCA 2 CAATGCATC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TCA 2 TGCATCAAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666671 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 121 TGT CAT GTA 2 GCATGTAGA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 TGTAGAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.1666666666667 0 34.83333333333332 0.0125789112103712 0 -Inf 0.0125789112103712 0.0130942779634681 0 NA NA 0.0130495035461689 0.335077054616706 613 387 0 0 0.613 0.001 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATC:AGAATTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.1666666666667 0 34.66666666666666 0.0125789112103712 0 -Inf 0.0125789112103712 0.0127120664541313 0 NA NA 0.0124095327560743 0.310750239083886 613 387 0 0 0.613 0.001 ORF3a all ss13 124 ATC TTA TCA 2 ATTATCATG:ATTATTATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.50000000000004 0 34.99999999999999 0.0125263872134486 0 -Inf 0.0125263872134486 0.0130982035150536 0 NA NA 0.0128918509157981 0.331223916547467 638 362 0 0 0.638 0.001 ORF3a all ss13 125 ATG TCA TGA 2 ATCATGAGA:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000004 0 35.49999999999999 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.0122281306058644 0 NA NA 0.0125355955474107 0.314625535277035 649 351 0 0 0.649 0.001 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.00000000000004 0 35.83333333333332 0.0124484185567784 0 -Inf 0.0124484185567784 0.0125731776570738 0 NA NA 0.0123401309950759 0.313082440099888 645 355 0 0 0.645 0.001 ORF3a all ss13 127 TGT GAT GTT 2 AGATGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000003 0 36.16666666666666 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.0127439052850306 0 NA NA 0.0126337548917911 0.318400225091579 642 358 0 0 0.642 0.001 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 TGTTGGCTT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 36.16666666666666 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0126640206694493 0 NA NA 0.0121841648501209 0.297815511888738 656 344 0 0 0.656 0.001 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 35.49999999999999 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0126192242767428 0 NA NA 0.013408494766209 0.342070958010628 606 394 0 0 0.606 0.001 ORF3a all ss13 130 TGT TTT GTT 2 CTTTGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.33333333333337 0 34.99999999999999 0.0125525942666428 0 -Inf 0.0125525942666428 0.01263085652543 0 NA NA 0.0130306134886224 0.335389127839263 639 361 0 0 0.639 0.001 ORF3a all ss13 131 TGG GTT GGA 2 TGTTGGAAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333337 0 34.99999999999999 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0125856854802917 0 NA NA 0.0130983974922015 0.334853724849622 621 379 0 0 0.621 0.001 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000004 0 34.99999999999999 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0126019528718589 0 NA NA 0.0124602113876656 0.308647573323241 664 336 0 0 0.664 0.001 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000004 0 34.49999999999999 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.013501453761451 0 NA NA 0.0131200380670303 0.336667834944014 623 377 0 0 0.623 0.001 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.1666666666667 0 34.49999999999999 0.0125789112103712 0 -Inf 0.0125789112103712 0.012943473999488 0 NA NA 0.0130684266466922 0.335777351345404 665 335 0 0 0.665 0.001 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 34.49999999999999 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0130469421481178 0 NA NA 0.013247957767251 0.338300770173143 638 362 0 0 0.638 0.001 ORF3a all ss13 136 AAG CCA AGA 2 TCCAAGAAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 35.16666666666666 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0133262433088146 0 NA NA 0.0127145103838006 0.318423906283424 612 388 0 0 0.612 0.001 ORF3a all ss13 137 AAC AGA ACC 2 AAGAACCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.1666666666667 0 34.33333333333332 0.0125789112103712 0 -Inf 0.0125789112103712 0.0131215859592586 0 NA NA 0.0128597954004399 0.327996206189282 643 357 0 0 0.643 0.001 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 34.33333333333332 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0120710338282008 0 NA NA 0.0125250643995833 0.311159263025244 636 364 0 0 0.636 0.001 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 34.33333333333332 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0128633697648266 0 NA NA 0.0129291144928851 0.32652292793293197 638 362 0 0 0.638 0.001 ORF3a all ss13 140 CTT TAC TTT 2 TTACTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.1666666666667 0 35.33333333333332 0.0129035440872231 0 -Inf 0.0129035440872231 0.0135472116119266 0 NA NA 0.0134048009387925 0.335745200167211 629 371 0 0 0.629 0.001 ORF3a all ss13 141 TAT TTT ATG 2 CTTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.1666666666667 0 35.33333333333332 0.0129035440872231 0 -Inf 0.0129035440872231 0.0129546646358832 0 NA NA 0.0136671338721044 0.345103482877925 609 391 0 0 0.609 0.001 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000003 0 36.41666666666666 0.0129732964431592 0 -Inf 0.0129732964431592 0.0134096618416973 0 NA NA 0.0137099071617254 0.344010050386029 656 344 0 0 0.656 0.001 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.4166666666667 1 36.74999999999999 0.0130296436641525 0.0277167798918218 0.470099474578469 -0.0146871362276693 0.0136162195287014 0.029879120703832 NA NA 0.0318061681170749 0.644246222039784 261 143 596 0.596 0.261 0.522 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333337 2 37.24999999999999 0.0130014090011593 0.0557100557871529 0.233376341442429 -0.0427086467859935 0.0129908770953452 0.0447870305613605 NA NA 0.0460733859769751 0.353942108552803 120 45 835 0.835 0.12 0.24 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333337 2 37.24999999999999 0.0130014090011593 0.0557100557871529 0.233376341442429 -0.0427086467859935 0.0127082982740123 0.0428377436514359 NA NA 0.0467629874236822 0.361084665745946 142 45 813 0.813 0.142 0.284 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333337 2 37.24999999999999 0.0131726767040263 0.0557100557871529 0.23645061053886 -0.0425373790831266 0.0133763406981268 0.0431251849091632 NA NA 0.0472594692537592 0.368076822873489 126 41 833 0.833 0.126 0.252 ORF3a all ss13 147 GTT TTG TTT 2 TTTGTTTGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.08333333333337 2 36.25 0.0130864825012098 0.0573071018565008 0.228357081012033 -0.044220619355291 0.013411458613568 0.0440463420785782 NA NA 0.0487983625527276 0.364834956761022 114 50 836 0.836 0.114 0.228 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333336 2 37.24999999999999 0.0132600139021293 0.0557100557871529 0.23801832029734 -0.0424500418850236 0.0138600148202172 0.0416032143435105 NA NA 0.0450528396150369 0.346075979144422 154 60 786 0.786 0.154 0.308 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333336 2 37.41666666666666 0.0132600139021293 0.0554524994575897 0.239123827272575 -0.0421924855554604 0.0130676862537334 0.0409646914955234 NA NA 0.0468178357012438 0.367479129384279 141 49 810 0.81 0.141 0.282 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.41666666666669 2 36.74999999999999 0.0132016609860952 0.0564972895530332 0.233668926253586 -0.043295628566938 0.0130407246489326 0.0444236574218127 NA NA 0.0455336593707365 0.341681100234421 130 45 825 0.825 0.13 0.26 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000003 2 36.74999999999999 0.0133188849757348 0.0564972895530332 0.23574378666843 -0.0431784045772984 0.0130069831171045 0.0441100487823982 NA NA 0.0445295970943844 0.332217837329076 140 44 816 0.816 0.14 0.28 ORF3a all ss13 152 CAT CAC ATA 2 ACACATAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.75000000000003 2 35.74999999999999 0.0131438194165355 0.0581404786806199 0.226070024100383 -0.0449966592640844 0.0139191594180098 0.0439809779586659 NA NA 0.0483307716193853 0.351845955671387 135 48 817 0.817 0.135 0.27 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 CATAACTAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000003 2 36.58333333333333 0.0134081783305544 0.0567646707244323 0.236206396680169 -0.0433564923938779 0.0143620749187063 0.044115231293891 NA NA 0.045714560215486 0.342916915181024 143 47 810 0.81 0.143 0.286 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333336 2 36.58333333333333 0.0135291154422588 0.0567646707244323 0.238336896340626 -0.0432355552821735 0.0136908153816306 0.0440310896457681 NA NA 0.0485126809347664 0.37281023060112 144 44 812 0.812 0.144 0.288 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000003 2 36.58333333333333 0.0134081783305544 0.0567646707244323 0.236206396680169 -0.0433564923938779 0.0135044296683833 0.0426470282391162 NA NA 0.0468629443565965 0.354874132468454 152 46 802 0.802 0.152 0.304 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333336 2 36.58333333333333 0.0135291154422588 0.0567646707244323 0.238336896340626 -0.0432355552821735 0.0140005557432695 0.041776729772907 NA NA 0.0459659586618326 0.346910165591428 153 49 798 0.798 0.153 0.306 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333336 2 36.58333333333333 0.0135291154422588 0.0567646707244323 0.238336896340626 -0.0432355552821735 0.0146564642327278 0.0436714643852784 NA NA 0.0462829374208031 0.350222630875628 135 46 819 0.819 0.135 0.27 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666669 2 36.25 0.013559691378237 0.0573071018565008 0.23661450219889 -0.0437474104782638 0.0136860263781786 0.0449632088058593 NA NA 0.0471111274193867 0.353096228674584 147 40 813 0.813 0.147 0.294 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.08333333333336 2 36.25 0.0136212597557268 0.0573071018565008 0.237688860794862 -0.043685842100774 0.013779096464726 0.0444010897914672 NA NA 0.0467490371957223 0.350058533692866 157 55 788 0.788 0.157 0.314 ORF3a all ss13 160 TAT CAT ATA 2 CCATATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000003 2 36.25 0.0134986770919624 0.0573071018565008 0.235549812408305 -0.0438084247645384 0.0139968586598899 0.0432075683756087 NA NA 0.0457315819183083 0.338089561268168 138 50 812 0.812 0.138 0.276 ORF3a all ss13 161 AAC ATA ACA 2 TATAACAGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000003 2 36.25 0.0134986770919624 0.0573071018565008 0.235549812408305 -0.0438084247645384 0.0134303839654198 0.0422155731376509 NA NA 0.0474897406828994 0.356277283141401 132 41 827 0.827 0.132 0.264 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.4166666666667 2 35.916666666666664 0.013559691378237 0.0578600049104132 0.234353443267624 -0.0443003135321762 0.0134685080346893 0.0439539139378804 NA NA 0.0483513118448994 0.359552877712697 123 51 826 0.826 0.123 0.246 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.75000000000003 2 35.916666666666664 0.0136833898069031 0.0578600049104132 0.236491335043777 -0.0441766151035101 0.0131503842286918 0.0432275017965544 NA NA 0.0474678446884301 0.352027387527786 129 47 824 0.824 0.129 0.258 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.4166666666667 2 35.916666666666664 0.013559691378237 0.0578600049104132 0.234353443267624 -0.0443003135321762 0.0134194768271371 0.0455651181033491 NA NA 0.0482168533223527 0.358214637179492 132 49 819 0.819 0.132 0.264 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000003 2 35.58333333333333 0.0134986770919624 0.058423686245627 0.231048021092178 -0.0449250091536646 0.0141941071652268 0.0478373693972762 NA NA 0.0473347621825265 0.34257419840449 136 49 815 0.815 0.136 0.272 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333337 2 35.75 0.0135291154422588 0.0581404786806199 0.232697008164958 -0.0446113632383612 0.0132463402042009 0.0435992828637469 NA NA 0.0475497814142523 0.348139927674727 124 53 823 0.823 0.124 0.248 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333337 2 35.75 0.0135291154422588 0.0581404786806199 0.232697008164958 -0.0446113632383612 0.0135319615894696 0.0447581587977257 NA NA 0.0478682700124155 0.351356654472516 143 47 810 0.81 0.143 0.286 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCG 2 ATTGTCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.75000000000003 2 36.08333333333333 0.0136833898069031 0.0575822255219405 0.237632180466685 -0.0438988357150374 0.0136701075491106 0.0450412279348233 NA NA 0.0477635849216458 0.358050662526644 149 44 807 0.807 0.149 0.298 ORF3a all ss13 169 GTT TCG TTA 2 GTCGTTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000003 2 35.75 0.0134986770919624 0.0581404786806199 0.232173477038502 -0.0446418015886575 0.0134770670624322 0.0454345611996482 NA NA 0.0469156631921495 0.341333876469978 142 50 808 0.808 0.142 0.284 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTG 2 GTTACTGAA:GTTACTGCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.4166666666667 2 35.083333333333336 0.0133782811395161 0.0592901175479514 0.225640995376613 -0.0459118364084352 0.0136182222175139 0.0440375865131895 NA NA 0.0501095258822638 0.35954642540133 129 46 825 0.825 0.129 0.258 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTGCAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.4166666666667 2 35.083333333333336 0.0133782811395161 0.0592901175479514 0.225640995376613 -0.0459118364084352 0.013650467082863 0.0468675297272905 NA NA 0.0480037642635021 0.338859282711117 122 38 840 0.84 0.122 0.244 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:GCAGGTGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333337 2 35.083333333333336 0 0.0592901175479514 0 -0.0592901175479514 0 0.0463670858178157 NA NA 0.0452519800428234 0.190120911619219 0 119 881 0.881 0 0.001 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.75000000000003 2 35.083333333333336 0 0.0592901175479514 0 -0.0592901175479514 0 0.0456559954950954 NA NA 0.0434363505023615 0.17225667442175 0 107 893 0.893 0 0.001 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000003 2 35.416666666666664 0 0.0587096677913667 0 -0.0587096677913667 0 0.045716902322342 NA NA 0.0478664261133234 0.219998820261292 0 134 866 0.866 0 0.001 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TTT 2 GGCATTTCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000003 2 35.416666666666664 0 0.0587096677913667 0 -0.0587096677913667 0 0.0442280718046632 NA NA 0.045742050229335 0.199318901295465 0 127 873 0.873 0 0.001 ORF3a all ss13 176 TCA TTT CAA 2 ATTTCAACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333337 2 35.74999999999999 0 0.0581404786806199 0 -0.0581404786806199 0 0.0457440131341489 NA NA 0.0441004609288983 0.187381684767333 0 120 880 0.88 0 0.001 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 TCAACACCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.08333333333337 2 35.916666666666664 0 0.0578600049104132 0 -0.0578600049104132 0 0.043502610970698 NA NA 0.0458125177878813 0.206598633021451 0 139 861 0.861 0 0.001 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.75000000000003 2 35.916666666666664 0 0.0578600049104132 0 -0.0578600049104132 0 0.0434750231519985 NA NA 0.0444598266443073 0.193121677414134 0 122 878 0.878 0 0.001 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.75000000000003 2 35.916666666666664 0 0.0578600049104132 0 -0.0578600049104132 0 0.0450715717212226 NA NA 0.0426971373934678 0.175377387133731 0 116 884 0.884 0 0.001 ORF3a all ss13 180 CTC AAC TCA 2 AAACTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.58333333333336 2 36.416666666666664 0 0.0570345959917882 0 -0.0570345959917882 0 0.0417985035822241 NA NA 0.0435397185598596 0.190214758168316 0 121 879 0.879 0 0.001 ORF3a all ss13 181 AAA TCA AAG 2 CTCAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.25000000000001 2 36.416666666666664 0 0.0570345959917882 0 -0.0570345959917882 0 0.0436876658189651 NA NA 0.0453607562441283 0.208624938186195 0 136 864 0.864 0 0.001 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.58333333333334 2 36.416666666666664 0 0.0570345959917882 0 -0.0570345959917882 0 0.0424136415663492 NA NA 0.0451625893861496 0.206634973854506 0 117 883 0.883 0 0.001 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75 2 36.916666666666664 0 0.0562324166616758 0 -0.0562324166616758 0 0.0428355031679461 NA NA 0.0450234664297848 0.211680451585575 0 131 869 0.869 0 0.001 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.08333333333334 2 37.91666666666666 0 0.054693929928504303 0 -0.054693929928504303 0 0.0436092716482432 NA NA 0.0411754640987184 0.184074520875785 0 107 893 0.893 0 0.001 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666667 2 37.24999999999999 0 0.0557100557871529 0 -0.0557100557871529 0 0.041423819586895 NA NA 0.0422578783915078 0.187391405264049 0 139 861 0.861 0 0.001 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666667 2 37.24999999999999 0 0.0557100557871529 0 -0.0557100557871529 0 0.0425456353507698 NA NA 0.0431193197734394 0.196357990783506 0 134 866 0.866 0 0.001 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.91666666666667 2 37.24999999999999 0 0.0557100557871529 0 -0.0557100557871529 0 0.0419734562009012 NA NA 0.043830307554002 0.203714567513122 0 140 860 0.86 0 0.001 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.58333333333333 2 37.58333333333333 0 0.0551973146854054 0 -0.0551973146854054 0 0.042621485743067 NA NA 0.0451725103111106 0.221736869307711 0 134 866 0.866 0 0.001 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75 2 37.08333333333333 0 0.0559700169039056 0 -0.0559700169039056 0 0.0439640570850528 NA NA 0.0428945827446544 0.191951706026809 0 119 881 0.881 0 0.001 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.08333333333333 2 36.41666666666666 0 0.0570345959917882 0 -0.0570345959917882 0 0.042787956304619 NA NA 0.044631589575209 0.201285575594261 0 114 886 0.886 0 0.001 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGA 2 TCTGAGAAT:TCTGAGGAT 1:1 FALSE 1.25 0.333333333333333 1.41666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333333 2 37.41666666666666 0 0.0554524994575897 0 -0.0554524994575897 0 0.0451164493067669 NA NA 0.0445005607713674 0.212724792128314 0 119 881 0.881 0 0.001 ORF3a all ss13 192 AAT AGA ATA 2 GAGAATTGG:GAGGATAGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333333 2 35.999999999999986 0 0.0577207808520962 0 -0.0577207808520962 0 0.0441299329829624 NA NA 0.043483913536696 0.184374620367687 0 138 862 0.862 0 0.001 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 AATTGGCAC:GATAGGCAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72 1 37.16666666666666 0 0.027400307499342 0 -0.027400307499342 0 0.0269822888584054 NA NA 0.0294004155759196 0.351351991000619 0 371 629 0.629 0 0.001 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCACTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.5 0 37.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333333 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.5 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333333 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333334 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.5 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTC:TATGTCGTT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666667 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 202 GTC TCG TCG 2 GTCGTCGTA:GTCGTTGTA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 0 36.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 203 GTA TCG TAC 2 GTCGTACAT:GTTGTACAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333334 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 GTACATGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666667 0 37.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666667 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666667 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666667 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666667 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333333 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 215 GAG TTG AGT 2 CTTGAGTCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666667 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 216 TCT AGT CTA 2 GAGTCTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666667 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000001 0 32.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666669 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000001 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CTA 2 ATTACTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666669 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 0 35.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 0 36.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTT TCT TTA 2 ATCTTTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TTA ACA 2 TTTAACAAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA--- 2 FALSE 0 0 2 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG 2 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C CGA 0 ---CCGAAT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT CGA ATG 2 CCGAATGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCA:GGAGTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCA TTG CAA 2 GTTGCAAAT:GTTGCTAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CAA ATC 2 GCAAATCCA:GCTAATCCA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 71.6666666666667 13 34.24999999999999 0.154389040653111 0.529040426590835 0.291828436718915 -0.374651385937724 0.0447672476581776 0.207975844715869 0.161905599486931 0.0714729947261368 0.215536940571244 0.0821714310894991 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 71.1666666666667 13 34.58333333333333 0.173087929386131 0.521669795223997 0.331795957846878 -0.348581865837866 0.049938998482555 0.215709383273875 0.190736700394918 0.0819381292321881 0.240485084025339 0.147199466480053 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 70.50000000000003 13 34.916666666666664 0.174931235415909 0.514509589834553 0.339996063964832 -0.339578354418645 0.047353378098802 0.203410872801764 0.212029490750045 0.108817259840574 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 70.6666666666667 13 34.74999999999999 0.174466721451565 0.518063977375493 0.336766749032449 -0.343597255923928 0.0469806927230036 NA 0.188916202468306 0.0746473643361549 0.203981429351025 0.0920940367565949 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAA 2 ATGAGAATT:ATGAGATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 71.00000000000003 13 35.416666666666664 0.173545088089764 0.504143861537968 0.344237233317367 -0.330598773448204 0.0466214138929209 0.207991803476578 0.198914466799818 0.0835268490904623 0.193169214753978 0.0869987223215817 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 7 ATT GAA TTT 2 AGAATTTTC:AGATTTTTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 71.66666666666669 13 35.74999999999999 0.171730853718752 0.497470663057698 0.3452080021427 -0.325739809338946 0.0481155101447426 0.20228552165221 0.197255097422987 0.0801081828605319 0.21555413162841 0.130744112995429 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACT:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 71.91666666666669 13 35.666666666666664 0.153793349454572 0.499121736922077 0.308127933684007 -0.345328387467504 0.0468855146122502 0.205744343365489 0.195145458813317 0.114343986177771 0.208283915645739 0.0973236149482591 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 9 ACT TCA CTC 2 TTCACTCTT:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 72.75000000000001 13 35.49999999999999 0.15184060156898 0.502458212610211 0.302195481650475 -0.350617611041231 0.0450233127861933 0.218708645208428 NA NA 0.205742173707219 0.0883511741188732 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 10 CTT CTC TTA 2 ACTCTTAGA:ACTCTTGGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 72.25000000000001 13 36 0.153006233162977 0.492584652291803 0.310619164545828 -0.339578419128826 0.0443211808020028 0.216215300651471 0.192812837220326 0.107182340752906 0.202907305169602 0.0942162625531894 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAA 2 CTTAGATCA:CTTGGAACT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 72.58333333333336 14 35.66666666666667 0.152227160286946 0.555752401303185 0.273911835432449 -0.403525241016239 0.0435504375275576 NA 0.144737600414687 0.0584281399004362 0.24701852552251 0.10234645931507 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 12 ACT GAA CAA 2 AGATCAATT:GGAACTGTT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 72.9166666666667 13 35.91666666666667 0.151456007747705 0.494202238982722 0.306465644630558 -0.342746231235017 0.0433567691754274 0.186162848299373 0.19076922910356 0.108169989506423 0.192439182599415 0.0749022244142272 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 13 ATT CAA TTA 2 ACTGTTACT:TCAATTACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.25000000000003 13 35.583333333333336 0.136222315966333 0.500784212559093 0.272017992081287 -0.36456189659276 0.0418983570352566 0.197464561309012 0.153298479188303 0.0759914348815434 0.201337515073618 0.0701872582131737 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 14 ACT TTA CTC 2 ATTACTGCA:GTTACTCTT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.1666666666667 12 34.916666666666664 0.136394827252207 0.459690676830551 0.296710014204799 -0.323295849578345 0.0422395311900376 0.182460443150392 0.188600376582602 0.115667726591173 0.181678066511126 0.075158068126583 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 15 CTT CTC CAC 2 ACTCTTAAA:ACTGCACAG 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 2 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.33333333333337 13 34.75 0.136050241705975 0.518063977375493 0.262612819357185 -0.382013735669518 0.0431209127193448 0.221700107808823 0.139200891221413 0.0592176105819509 0.212049211506389 0.0716188487814924 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 16 AAA CAC AAC 2 CTTAAACAA:GCACAGCCA 1:1 TRUE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.83333333333337 11 34.25 0.135026881134824 0.419255775264057 0.322063258519888 -0.284228894129233 0.0418705298727855 0.157203634905387 0.182953931364827 0.0783481985035616 0.153288623887697 0.0637094999888922 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 17 CAA AAC AAG 2 AAACAAGGT:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.08333333333337 11 35 0.136567777235198 0.407314864488159 0.335287977783015 -0.270747087252961 0.0425609273077561 0.15126634141385 0.201407147163012 0.0959671723770156 0.153522824088718 0.0778056749637136 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 18 GGT AAG GTG 2 CAAGGTGAA:CCAGTAAAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.83333333333337 11 35.58333333333333 0.120559681536883 0.39849830557263 0.302534991619707 -0.277938624035747 0.0410023106699069 0.14534232637656 0.167996507928082 0.0717279517758755 0.146129519734043 0.0571709063323233 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 19 AAA GTG AAA 2 GGTGAAATC:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 71.83333333333337 11 35.75 0.104386548100003 0.396050572650373 0.263568734168082 -0.29166402455037 0.0384963538992009 0.142248469889279 0.145173528528339 0.0694405562923434 0.146317120656843 0.0462210468148078 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 20 ATC AAA TCA 2 AAAATTGAC:GAAATCAAA 1:1 FALSE 1.75 0.75 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 72.83333333333337 10 35.08333333333333 0.102850364976667 0.358584319769766 0.286823375441244 -0.255733954793099 0.0372942317287315 0.134223018012227 0.205485607850215 0.162765108532541 0.146144057540422 0.0801397412143588 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 21 AAA TCA AAG 2 ATCAAAGGT:ATTGACAAT 1:1 TRUE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 72.75000000000003 10 35.58333333333333 0.102976648483437 0.352151516121281 0.292421425918189 -0.249174867637844 0.0385894392804837 0.132984301334921 0.232868708894248 0.209212006245324 0.138514076316261 0.0720323352713675 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 22 AAT AAG ATG 2 AAAGGTGCT:GACAATGCT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.4166666666667 9 34.916666666666664 0.0891034205520704 0.315824866691675 0.282129211310831 -0.226721446139604 0.0348841810594177 0.125004207454518 0.188431840798788 0.134328719792826 0.121251092475033 0.0615045466672365 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTA 2 AATGCTTCT:GGTGCTACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.75000000000003 8 34.25 0.0742261626042775 0.279859737639748 0.265226299539471 -0.20563357503547 0.0339758415834474 0.111024064983132 0.284675465285854 0.351502175949249 0.118452359557034 0.0825634183248698 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 24 ACT CTA CTC 2 GCTACTCCT:GCTTCTCCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.4166666666667 8 34.58333333333333 0.0745955951479784 0.276597228353308 0.269690320442021 -0.202001633205329 0.0319612927859349 0.101305886294411 0.256053623375314 0.29222313261901 0.123778687077047 0.102688309419658 21 0 979 0.979 0.021 0.042 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTA 2 ACTCCTACA:TCTCCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 70.58333333333337 7 34.416666666666664 0.0902212821659396 0.237252996159118 0.3802745745113 -0.147031713993178 0.0364681577999619 0.0994634469504331 0.417337679307285 0.362194445892349 0.115820482028657 0.20427013945456 68 0 932 0.932 0.068 0.136 ORF3a all ss13 26 ACA CTA CAA 2 CCTACAAAT:CCTGCAAGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.6666666666667 7 34 0.0887734500607746 0.240680790060076 0.368843105586516 -0.151907339999301 0.0347812003481038 0.100589497779667 0.38837965559695 0.342266088246682 0.107719199124759 0.158475907615613 55 1 944 0.944 0.055 0.11 ORF3a all ss13 27 AAT CAA ATT 2 ACAAATTCT:GCAAGTACT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.33333333333337 6 33.333333333333336 0.0879053734766805 0.20582763427632 0.427082465314978 -0.11792226079964 0.0356246984210496 0.086756972631559 0.475687608571126 0.369280829143077 0.103848487609099 0.256156595022438 95 0 905 0.905 0.095 0.19 ORF3a all ss13 28 ACT ATT CTG 2 AATTCTGTT:AGTACTGTT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.33333333333337 7 34 0.0735883919688925 0.240680790060076 0.305750998866691 -0.167092398091183 0.0339438641861186 0.106855770412792 NaN NaN 0.110145458591901 0.129262701572672 40 0 960 0.96 0.04 0.08 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT:TCTGTTCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.50000000000004 6 33.5 0.0876910035441767 0.20465023999998 0.428492063064207 -0.116959236455804 0.0359387399733247 0.0930208542278573 NaN NaN 0.103546167218519 0.258671332170938 109 0 891 0.891 0.109 0.218 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT:GTTCGCACT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.08333333333337 6 33.166666666666664 0.086948881899372693 0.207018740932176 0.420004882204646 -0.120069859032803 0.0369941643671821 0.0943622228154941 NaN NaN 0.10570877095241 0.256017163083945 106 0 894 0.894 0.106 0.212 ORF3a all ss13 31 ACT ATG CTA 2 CATGCTACA:CGCACTACT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.58333333333337 7 33.5 0.0722580068136367 0.244928374228876 0.295016888268382 -0.172670367415239 0.0340019177996831 0.103853827235088 0.358633783551797 0.41072798352877 0.116806077238475 0.1393367894307 27 0 973 0.973 0.027 0.054 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 ACTACTGCA:GCTACAGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.58333333333337 7 33 0.0564308375631679 0.249329979819956 0.226329932741812 -0.192899142256788 0.0280158582276316 0.105210678499392 0.26105259863678 0.385947614273782 0.112610377692872 0.0867165172791426 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.41666666666671 7 32.83333333333333 0.055774819305903 0.250832878769865 0.22235848657255 -0.195058059463962 0.0280677901646772 0.108688678111853 0.236288621305966 0.346681233061464 0.116040187436187 0.0927721139558445 13 0 987 0.987 0.013 0.026 ORF3a all ss13 34 ACA CAA CAA 2 GCAACAATA:GCAACGATA 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.91666666666671 7 32.66666666666666 0.0553884822155736 0.25235417746591 0.219487082685825 -0.196965695250336 0.0284473476123386 0.110026219990882 0.240222549191968 0.360883825975095 0.114413631982321 0.0851559681326198 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 35 ATA CAA TAC 2 ACAATACCG:ACGATACCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000004 7 32.33333333333333 0.055516664918965 0.255453355429593 0.217326035219241 -0.199936690510628 0.0270085623993582 0.114040514182167 NaN NaN 0.115393717562581 0.0831582575059156 23 0 977 0.977 0.023 0.046 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGA 2 ATACCGATA:ATACCGCTA 1:1 FALSE 0.75 1 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.6666666666667 7 31.66666666666666 0.0555809791152914 0.261888204157181 0.21223170128706 -0.20630722504189 0.0276698708874757 0.12333335000113 0.209347775585577 0.310689762067753 0.123053174708919 0.0936266546433167 20 0 980 0.98 0.02 0.04 ORF3a all ss13 37 ATA CGA TAC 2 CCGATACAA:CCGCTACAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.4166666666667 7 30.41666666666666 0.0550074627952335 0.274880898641229 0.20011380589609 -0.219873435845995 0.0278714684123787 0.120230729063578 0.210335299201001 0.341399424915969 0.12533725025361 0.0793869076242629 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 ATACAAGCC:CTACAAGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.9166666666667 6 30.499999999999993 0.0546316519559279 0.228158530802244 0.239446019238614 -0.173526878846316 0.027481718312535 0.109000164586565 NaN NaN 0.110329800749059 0.11576478249052401 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCA 2 CAAGCCACA:CAAGCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.58333333333336 6 30.999999999999993 0.0692533163185839 0.223869741416997 0.309346479252805 -0.154616425098413 0.0322182220772158 0.101738573869839 0.431379918342919 0.473306760815799 0.110174493016111 0.160504243287124 52 0 948 0.948 0.052 0.104 ORF3a all ss13 40 ACA CCA CAC 2 GCCACACTC:GCCTCACTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.58333333333336 6 30.999999999999993 0.0692533163185839 0.223869741416997 0.309346479252805 -0.154616425098413 0.0316185840150866 0.109382539716848 NaN NaN 0.112423141258084 0.169036033760217 48 0 952 0.952 0.048 0.096 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 ACACTCCCT:TCACTCCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.08333333333336 6 30.66666666666666 0.0687766788210943 0.2267106539047 0.303367652276303 -0.157933975083606 0.0301630422963071 0.101048196025477 0.33831616748532 0.36987973864287 0.11213373131232 0.158999917810767 53 0 947 0.947 0.053 0.106 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.75000000000001 6 30.999999999999996 0.0690937042816379 0.223869741416997 0.30863351091713 -0.15477603713536 0.0302397758740098 0.103192939849789 NaN NaN 0.110824679200306 0.162538532449947 42 0 958 0.958 0.042 0.084 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.08333333333334 6 30.66666666666666 0.0687766788210944 0.2267106539047 0.303367652276303 -0.157933975083606 0.0312964119738529 0.111218887464248 NaN NaN 0.111991609110741 0.158471653249705 59 0 941 0.941 0.059 0.118 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.58333333333334 6 30.33333333333333 0.0683065619163606 0.229625165344413 0.297469843141575 -0.161318603428052 0.0298640129661548 0.113036984181541 0.349850429022759 0.395170989687293 0.117297812138807 0.169041303540913 49 0 951 0.951 0.049 0.098 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.08333333333334 6 29.999999999999996 0.0821801867828477 0.23261619622788 0.353286607362201 -0.150436009445032 0.0328246147423182 0.112273961225135 NaN NaN 0.115346493143406 0.192162110558505 79 0 921 0.921 0.079 0.158 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.66666666666667 6 29.666666666666664 0.0826523551002107 0.235686824877377 0.350687210213015 -0.153034469777166 0.0338408254069206 0.115792432711248 0.456433882629851 0.442297187172233 0.119582914673575 0.200638267102904 66 0 934 0.934 0.066 0.132 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT:CTTGTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.33333333333334 6 29 0.081899468973744 0.242080044197288 0.338315656068694 -0.160180575223544 0.0334749809334602 0.109018870096517 NaN NaN 0.125706247898198 0.202576552790438 72 1 927 0.927 0.072 0.144 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC:GTTGTTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.50000000000001 6 28.833333333333332 0.0962416871584159 0.243733392896608 0.394864593704817 -0.147491705738192 0.0354317675996424 0.115851631768137 NaN NaN 0.127976388400104 0.24911914166819 83 0 917 0.917 0.083 0.166 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 76.91666666666669 5 29.166666666666668 0.0970208852905793 0.194633396613813 0.498480152833615 -0.0976125113232341 0.0365043005435602 0.0962073086257882 NaN NaN 0.116354221074643 0.401511173983107 167 0 833 0.833 0.167 0.334 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.25000000000001 5 29.833333333333332 0.113021862643589 0.189683904532547 0.59584318934238 -0.0766620418889588 0.0402242394225752 0.0943210772570787 NaN NaN 0.111714032643786 0.492565140740598 234 0 766 0.766 0.234 0.468 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAA 2 GTTGCAATT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.91666666666667 5 29.16666666666667 0.11196533988639 0.194633396613813 0.575262734116227 -0.0826680567274232 0.0384238843713546 0.0921344479956381 NaN NaN 0.1091404929787 0.448782558538146 205 2 793 0.793 0.205 0.41 ORF3a all ss13 52 ATT CAA TTC 2 GCAATTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.25 6 29.66666666666667 0.111444464849685 0.235686824877377 0.472849786608427 -0.124242360027692 0.0406656253707391 0.110936803826244 NaN NaN 0.121663811333801 0.30716251158414 113 0 887 0.887 0.113 0.226 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 ATTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.58333333333333 6 29.500000000000004 0.0961313950679982 0.237252996159118 0.405185167834619 -0.141121601091119 0.0385681939383352 0.110734757216587 NaN NaN 0.125138563122936 0.259437038307613 102 0 898 0.898 0.102 0.204 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.91666666666667 6 29.16666666666667 0.0956927464587129 0.240449165598692 0.397974957494439 -0.144756419139979 0.0363806279666967 0.112268574886343 NaN NaN 0.128511673224272 0.25999338121647 82 1 917 0.917 0.082 0.164 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.91666666666667 7 29.500000000000004 0.110417145764054 0.285269390232816 0.387062718765372 -0.174852244468762 0.0396410705035849 0.12712787727749 0.395889753609074 0.328221088887585 0.13373347605924 0.191053805878185 52 0 948 0.948 0.052 0.104 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.91666666666667 7 29.16666666666667 0.108911256999757 0.289246860608988 0.376533929427797 -0.180335603609232 0.039150567778069 0.123406158607863 0.355979646562084 0.290173970554278 0.12958163463338 0.164020643813432 54 0 946 0.946 0.054 0.108 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAGC:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.58333333333334 8 29.000000000000004 0.109408627044446 0.343931200066585 0.318111956761308 -0.234522573022138 0.0394175004148126 0.158477044435022 0.316591572439212 0.314992030896426 0.158506276273618 0.138985608457349 35 0 965 0.965 0.035 0.07 ORF3a all ss13 58 AGC AAA GCG 2 CAAAGCGCT:CAGAGCGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.75 8 29.500000000000004 0.12572916000110201 0.336571435396116 0.373558617216371 -0.210842275395014 0.0433040154361081 0.152108294427849 0.36402468639288 0.304801873152232 0.151774172452034 0.164776758879298 57 0 943 0.943 0.057 0.114 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.75 8 29.83333333333334 0.127514764415745 0.331840258108129 0.384265505164218 -0.204325493692384 0.0419557793755031 0.144978277834975 NaN NaN 0.171352116059351 0.233092477241909 58 0 942 0.942 0.058 0.116 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CAA 2 GCTACCAAA:GCTTCAAAA 1:1 TRUE 1 1 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.25 8 29.333333333333336 0.126615652181289 0.338988842807293 0.373509792041348 -0.212373190626004 0.045462507089822 0.154724885050972 0.462203410963306 0.419029012914395 0.161231119697693 0.187772508937423 33 0 967 0.967 0.033 0.066 ORF3a all ss13 61 AAA CAA AAA 2 ACCAAAATA:TCAAAAATA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.25 7 28.333333333333336 0.124855023415448 0.299699991491825 0.416600023223071 -0.174844968076376 0.0431688009545966 0.139508460636654 0.427812748338072 0.330160532563306 0.143815431652925 0.224076575313468 81 0 919 0.919 0.081 0.162 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.66666666666666 7 27.916666666666668 0.1276658623949 0.305219070273711 0.418276165641989 -0.17755320787881 0.0426898585740638 0.146814237630118 NaN NaN 0.157704810637755 0.260225669183282 79 0 921 0.921 0.079 0.158 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTA 2 ATAATTACA:ATAATTGCG 1:1 FALSE 0.916666666666667 0.75 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 77.16666666666667 7 27.583333333333336 0.142269048679191 0.309784984170422 0.459250951301515 -0.167515935491231 0.0468076377254484 0.136445161058439 0.396747656640559 0.247052147536158 0.160994167509181 0.298103325545168 96 0 904 0.904 0.096 0.192 ORF3a all ss13 64 ACA TTA CAC 2 ATTACACTC:ATTGCGCTC 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 77.25 7 28.250000000000004 0.142100073148949 0.300787567424286 0.472426684273507 -0.158687494275336 0.046835020657123 0.145979315626677 0.528037727540993 0.370956258842195 0.159142877272497 0.318697274362878 110 0 890 0.89 0.11 0.22 ORF3a all ss13 65 CTC CAC TCA 2 ACACTCAAA:GCGCTCAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.5 6 28.583333333333336 0.157344163604509 0.246256582903472 0.638943989839188 -0.0889124192989628 0.0495696922349386 0.121759361741859 NaN NaN 0.131089868708805 0.497609733318203 246 0 754 0.754 0.246 0.492 ORF3a all ss13 66 AAA TCA AAA 2 CTCAAAAAG:CTCAATAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.83333333333334 6 28.250000000000004 0.156594789439853 0.249703998029926 0.627121674764237 -0.0931092085900732 0.0473776402758934 0.128692397776636 NaN NaN 0.131611959266515 0.479285325983491 240 0 760 0.76 0.24 0.48 ORF3a all ss13 67 AAA AAA AAA 2 AAAAAGAGA:AATAAAAGA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 78.83333333333334 6 27.250000000000004 0.138964332467004 0.260656845281595 0.533131337168132 -0.121692512814591 0.0456147755865439 0.125223869917725 NaN NaN 0.133573035900782 0.362265879998561 144 1 855 0.855 0.144 0.288 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AAGAGATGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 78.66666666666667 6 27.000000000000004 0.170542381646746 0.263548415128416 0.647100767286524 -0.0930060334816709 0.0557073589146028 0.13802762642244 NaN NaN 0.140981652412553 0.509444375378244 241 0 759 0.759 0.241 0.482 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 78 7 27.500000000000004 0.172180831233375 0.310948193753578 0.553728353121826 -0.138767362520203 0.0559018909608542 0.140374369947184 0.576083957087531 0.336454711134885 0.161609960132048 0.390530330427414 166 0 834 0.834 0.166 0.332 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA:TGGCAGTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77 7 28.166666666666668 0.174698668260279 0.30188317215805 0.578696278468999 -0.12718450389777 0.0577244844293956 0.134974410766643 0.517816255960742 0.263750386088338 0.151201163058932 0.400257810938132 181 0 819 0.819 0.181 0.362 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC:CAGTTAGCC 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.58333333333333 8 28.166666666666668 0.192460269414335 0.356953773574163 0.539174211515509 -0.164493504159828 0.0593992480492035 0.150226021321024 0.442568856726813 0.223116364689384 0.16485469008998 0.318371953685596 134 0 866 0.866 0.134 0.268 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT:TTAGCCCTC 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 78.08333333333333 8 28.500000000000004 0.239340732066682 0.351626041530565 0.680668391410588 -0.112285309463883 0.0786168113559607 NA 0.539995779600687 0.207486570193965 0.183373449603035 0.540318560852052 240 0 760 0.76 0.24 0.48 ORF3a all ss13 73 CTC CCC TCT 2 GCCCTCTCT:GCCCTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 78.75 8 29.000000000000004 0.236957742360063 0.343931200066585 0.688968439950166 -0.106973457706521 0.0819136902663214 0.146340060259635 0.638799126546202 0.280794216460824 0.16866342344493301 0.525922782880747 222 1 777 0.777 0.222 0.444 ORF3a all ss13 74 TAT TCT ATA 2 CTCTCTAAA:CTTTATAAG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 79.08333333333333 8 28.666666666666668 0.235784099565019 0.349022437266925 0.675555707568152 -0.113238337701906 0.0779583505169835 0.14726046717832 0.472712814873748 0.152974384754138 0.169450484698919 0.503962531463968 259 0 741 0.741 0.259 0.518 ORF3a all ss13 75 AAA ATA AAG 2 TATAAGGGC:TCTAAAGGT 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 79.24999999999999 8 28.500000000000004 0.218131224556612 0.351626041530565 0.620350027566576 -0.133494816973953 0.0731281086601802 0.157072034412043 0.488353590447171 0.203981826414936 0.17639829671643 0.449181289673814 189 0 811 0.811 0.189 0.378 ORF3a all ss13 76 GGC AAG GCT 2 AAAGGTGTT:AAGGGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 80.16666666666666 8 27.916666666666668 0.21524198382966 0.361058803919773 0.596141075893795 -0.145816820090113 0.0737816704388369 0.145723137268624 0.51603088268528 0.247990921848081 0.181341701681994 0.421339359077809 172 0 828 0.828 0.172 0.344 ORF3a all ss13 77 GTT GCT TCC 2 GGCTTCCAG:GGTGTTCAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 80.83333333333333 8 27.583333333333336 0.213188653016244 0.366684297251457 0.581395643648324 -0.153495644235213 0.0737298798197617 0.155223547938657 0.46237193070351 0.208601645201369 0.176302365305332 0.383951514210988 171 0 829 0.829 0.171 0.342 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGT 2 GTTCATTTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 81.74999999999999 7 26.916666666666668 0.226800603533016 0.319345642309943 0.710204159644971 -0.0925450387769264 0.0770370922188349 0.14941016750709 NaN NaN 0.172276123673531 0.591136266199449 255 0 745 0.745 0.255 0.51 ORF3a all ss13 79 TTC AGT TCA 2 CAGTTCATT:CATTTTGTT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 81.74999999999999 7 27.250000000000004 0.210428875701957 0.314491607077193 0.66910808099978 -0.104062731375236 0.0715381287627305 0.137189267629503 NaN NaN 0.165951775646822 0.530615912859482 233 0 767 0.767 0.233 0.466 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 TTCATTTGC:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 81.49999999999999 8 27.416666666666668 0.211174384075759 0.369564632029722 0.57141394433755 -0.158390247953963 0.0719985331935066 0.162377183579814 0.474664518553792 0.228656467124655 0.184706410034148 0.391155152284995 153 0 847 0.847 0.153 0.306 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT:GTTTGCAAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 82.08333333333333 7 27.166666666666668 0.209443067094397 0.315691024758642 0.663443210824648 -0.106247957664245 0.068998852786629 0.14281982183419 0.505294226437156 0.189188355530186 0.158687557268564 0.503149905910778 258 0 742 0.742 0.258 0.516 ORF3a all ss13 82 AAC GCA ACT 2 TGCAACTTG:TGCAATTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 81.91666666666666 7 27.833333333333336 0.209934806572056 0.306347708328316 0.685282771389517 -0.0964129017562602 0.0729978484505551 0.135530734331317 NaN NaN 0.156917942468508 0.538940435093249 270 0 730 0.73 0.27 0.54 ORF3a all ss13 83 TTA ACT TAC 2 AACTTGCTT:AATTTACTG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 81.91666666666666 7 27.833333333333336 0.209934806572056 0.306347708328316 0.685282771389517 -0.0964129017562602 0.0721141580409226 0.136910689306215 NaN NaN 0.154161230490438 0.531706569308873 246 0 754 0.754 0.246 0.492 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG:TTGCTTCTG 1:1 FALSE 1.25 1 0.25 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 82.24999999999999 7 27.666666666666668 0.208953640725498 0.308630566923095 0.677034821303249 -0.0996769261975969 0.070333847016815 0.136980441286151 0.674225897786008 0.315298536956534 0.157450358837506 0.526688647361835 265 1 734 0.734 0.265 0.53 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA:CTTCTGCTG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0 0.416666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 82.33333333333333 8 28.416666666666668 0.241501898090417 0.352942733680569 0.684252358936474 -0.111440835590152 0.0818944845703832 0.156848976894995 0.465028561208291 0.141177548518375 0.16800362485115 0.507123072109643 208 0 792 0.792 0.208 0.416 ORF3a all ss13 86 CTA TGC TAT 2 CTGCTATTT:CTGCTGTTT 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 82.08333333333333 8 29.083333333333336 0.242370165568345 0.342681915513506 0.707274456561722 -0.100311749945161 0.0827162442030208 0.143681745909408 0.563872485301882 0.209727057026452 0.161294431918149 0.533996443154801 257 0 743 0.743 0.257 0.514 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:CTGTTTTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.416666666666667 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 81.74999999999999 8 30.583333333333336 0.243537699774927 0.321673722092295 0.757095413920851 -0.0781360223173679 0.0843327830518392 0.134071445692106 0.71012979781433 0.286361867696306 0.153461981254503 0.610643184084861 290 0 710 0.71 0.29 0.58 ORF3a all ss13 88 GTT TTG TAA 2 TTTGTTACC:TTTTTAACA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 82.41666666666666 8 30 0.241213868267319 0.329524994837884 0.732004770642628 -0.0883111265705654 0.0802357244623861 0.132941777560077 0.534843628541859 0.171113946755785 0.152750601003587 0.563170071282944 264 0 736 0.736 0.264 0.528 ORF3a all ss13 89 ACA TAA CAG 2 GTTACCATC:TTAACAGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 82.24999999999999 8 30.333333333333336 0.225192434762777 0.324991546958348 0.692917821618415 -0.0997991121955707 0.0826453832914946 0.135909337111488 NaN NaN 0.149371188332394 0.504051723901355 241 0 759 0.759 0.241 0.482 ORF3a all ss13 90 ATC CAG TCT 2 ACAGTTTAT:ACCATCTAT 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 82.58333333333333 8 30.333333333333336 0.224133026337864 0.324991546958348 0.689658018602525 -0.100858520620484 0.079676098717367 0.137336022206457 0.471351857018177 0.143426600600587 0.154009220417784 0.512540994528054 254 0 746 0.746 0.254 0.508 ORF3a all ss13 91 TAT TCT ATT 2 ATCTATTCA:GTTTATTCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 82.08333333333333 7 30.666666666666668 0.225725931872573 0.272179120267026 0.829328611434707 -0.0464531883944532 0.0792191137066362 0.114480574174082 NaN NaN 0.129847524460082 0.720529048238335 334 0 666 0.666 0.334 0.668 ORF3a all ss13 92 TCA ATT CAC 2 TATTCACAT:TATTCTCAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 82.08333333333333 7 30.666666666666668 0.225725931872573 0.272179120267026 0.829328611434707 -0.0464531883944532 0.0791860943688988 0.119157783820709 NaN NaN 0.125809458851758 0.711952967720175 344 0 656 0.656 0.344 0.688 ORF3a all ss13 93 CAC CAC ACT 2 TCACATCTT:TCTCACTTG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 83.41666666666666 7 30 0.221527920701746 0.27950646396388 0.792568148729373 -0.0579785432621343 0.077763155916802 0.127080676042389 0.759305077545113 0.296574574298566 0.130257152153833 0.656241470399421 330 0 670 0.67 0.33 0.66 ORF3a all ss13 94 CTT ACT TGT 2 CACTTGTTG:CATCTTTTG 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 1 0 0 1 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 83.41666666666666 7 29.333333333333332 0.221527920701746 0.287244189192079 0.771218110015833 -0.0657162684903335 0.076811468230392 0.127254038976602 NaN NaN 0.138550154457277 0.635276058275203 303 0 697 0.697 0.303 0.606 ORF3a all ss13 95 TTG TGT TGC 2 CTTTTGCTT:TTGTTGCTT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0 0.416666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 83.58333333333333 7 29.666666666666668 0.205119567508109 0.283321879169121 0.723980682712006 -0.0782023116610125 0.0765789280248835 0.117315833904653 0.564086137204717 0.199331778490376 0.134407763641628 0.560681983757834 272 0 728 0.728 0.272 0.544 ORF3a all ss13 96 CTT TGC TTC 2 TTGCTTCTT:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 82.33333333333333 7 30.666666666666668 0.208709789830043 0.272179120267026 0.766810435808905 -0.0634693304369835 0.0779770823386488 0.119127357122708 0.562811803069131 0.173051713462395 0.128919962853973 0.622496135421959 293 0 707 0.707 0.293 0.586 ORF3a all ss13 97 CTT TTC TCG 2 CTTCTTGCT:CTTGTCGCT 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 82.41666666666667 7 31.16666666666667 0.208466511079119 0.266933470240076 0.780968047549929 -0.0584669591609568 0.0761291312614319 0.111315085756269 NaN NaN 0.128156889753594 0.648236144693623 327 0 673 0.673 0.327 0.654 ORF3a all ss13 98 GCT TCG CTG 2 CTTGCTGGT:GTCGCTGCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 82.58333333333334 7 31.000000000000004 0.20798166192439 0.268659167443214 0.774146901085557 -0.0606775055188241 0.0783850842425852 0.116008086969837 0.600019723707953 0.196980385268023 0.126575907424099 0.631670864421455 296 0 704 0.704 0.296 0.592 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGGTGGC 1:1 TRUE 1 1 1 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 83.75000000000001 7 30.333333333333336 0.20465023999998 0.275793585093988 0.742041334754893 -0.0711433450940079 0.0744189669486776 0.119548028709408 0.688288646179943 0.280990852691695 0.131046819235627 0.587209023021169 287 0 713 0.713 0.287 0.574 ORF3a all ss13 100 GGC CAG GCT 2 GCAGGTATG:GGTGGCTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 84.75000000000001 7 30.333333333333336 0.186591880810284 0.275793585093988 0.676563527562452 -0.0892017042837041 0.071932656307221 0.118283214136471 0.590898458166361 0.25221981824887 0.129356198669112 0.490457099390858 237 0 763 0.763 0.237 0.474 ORF3a all ss13 101 ATG GCT TGG 2 GGCTTGGAA:GGTATGGAG 1:1 FALSE 2 0 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 85.08333333333336 7 30.666666666666668 0.185762354530838 0.272179120267026 0.682500385586493 -0.0864167657361885 0.0722243362282316 0.118233012311182 NaN NaN 0.13042384096031 0.507596944123402 247 0 753 0.753 0.247 0.494 ORF3a all ss13 102 GAA TGG AAG 2 ATGGAGGCG:TTGGAAGCC 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 84.08333333333336 6 30.833333333333336 0.1882734769284 0.22528117443765 0.835726630946288 -0.0370076975092496 0.074477017404004 0.103256193178486 0.727907943947554 0.2509184831325 0.113104393109318 0.743517021529963 358 1 641 0.641 0.358 0.716 ORF3a all ss13 103 GCC AAG CCA 2 GAAGCCACT:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 83.58333333333336 6 31.333333333333336 0.205119567508109 0.221099655165484 0.927724502123649 -0.0159800876573748 0.0725310085575045 0.0940791194463791 NaN NaN 0.110478880572035 0.884992095219652 447 0 553 0.553 0.447 0.894 ORF3a all ss13 104 ACT CCA AAT 2 GCCACTTTT:GCGCAATTT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 83.83333333333336 7 31.666666666666668 0.220248108096996 0.261888204157181 0.841000490288623 -0.0416400960601849 0.0729514839021771 0.113768909467827 0.583675621940443 0.149621511200131 0.116433041540196 0.72061927685624 356 0 644 0.644 0.356 0.712 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTC 2 ACTTTTCTC:CAATTTTTG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 83.50000000000003 6 31.666666666666668 0.205355044468623 0.218397760919419 0.940279990070005 -0.0130427164507963 0.0748561696910851 0.102212012788341 NaN NaN 0.114940891418912 0.909655369881647 455 0 545 0.545 0.455 0.91 ORF3a all ss13 106 CTC TTC TCT 2 TTTCTCTTT:TTTTTGTAC 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 84.1666666666667 6 31.000000000000004 0.203486321240682 0.223869741416997 0.908949641665293 -0.0203834201763158 0.0715997748615656 0.103724049525704 NaN NaN 0.11495436241726 0.859259005459238 407 0 593 0.593 0.407 0.814 ORF3a all ss13 107 TAC TCT ACC 2 CTCTTTCTT:TTGTACCTC 1:1 TRUE 1.58333333333333 0.666666666666667 0.75 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 83.1666666666667 5 31.833333333333336 0.206302418001819 0.176245193423779 1.17054209532834 0.03005722457804 0.0741991567447689 0.0860415677864259 NaN NaN 0.0917931498511024 0.743331198614074 661 0 339 0.339 0.661 0.678 ORF3a all ss13 108 CTC ACC TCT 2 TACCTCTAT:TTTCTTTAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 83.25000000000003 5 31.916666666666668 0.190418811971405 0.175726637753458 1.08360812228457 0.0146921742179472 0.0706863695163521 0.0850790847973607 NaN NaN 0.0872776025654519 0.86631704580873 589 0 411 0.411 0.589 0.822 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 CTCTATGCC:CTTTATGCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 83.25000000000003 5 32.25 0.190418811971405 0.173682709081938 1.09636021327587 0.0167361028894663 0.0726238991050047 0.0835089386290123 NaN NaN 0.0898538682151639 0.852241559873816 588 0 412 0.412 0.588 0.824 ORF3a all ss13 110 GCA ATG CAT 2 TATGCATTA:TATGCCTTG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 82.9166666666667 5 32.583333333333336 0.191290772696447 0.171685985854599 1.11418979099699 0.0196047868418487 0.0734938738510762 0.0833339329095675 NaN NaN 0.0894885572700943 0.82659091840976 599 1 400 0.4 0.599 0.8 ORF3a all ss13 111 TTA CAT TAG 2 GCATTAGCT:GCCTTGATA 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 82.58333333333337 5 32.916666666666664 0.192170799722049 0.169734844556617 1.13218237671846 0.0224359551654322 0.0705240804462682 0.080526468039671 NaN NaN 0.0870205410280731 0.796542996669282 622 0 378 0.378 0.622 0.756 ORF3a all ss13 112 ATA TAG CTT 2 TTAGCTTAT:TTGATATAT 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.833333333333333 0 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 84.08333333333337 5 33.416666666666664 0.1882734769284 0.166890228132415 1.12812762637618 0.0213832487959853 0.0718803400651129 0.0804521398665247 NaN NaN 0.0935014714687685 0.819106564996956 586 0 414 0.414 0.586 0.828 ORF3a all ss13 113 TAT CTT ATT 2 ATATATTTT:GCTTATTGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 84.75000000000003 5 34.25 0.171610109242551 0.162356129339379 1.05699803229374 0.00925397990317228 0.0647327169178336 0.0747180106585225 NaN NaN 0.0803928525915766 0.908358341507628 534 0 466 0.466 0.534 0.932 ORF3a all ss13 114 TGC ATT GCT 2 TATTGCTTG:TATTTTCTA 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.416666666666667 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 84.75000000000003 5 34.25 0.171610109242551 0.162356129339379 1.05699803229374 0.00925397990317228 0.067999142038188 0.0747373197315976 NaN NaN 0.0837624041672217 0.912029567358488 548 0 452 0.452 0.548 0.904 ORF3a all ss13 115 CTA GCT TAC 2 TGCTTGCAA:TTTCTACAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 83.83333333333336 5 34.583333333333336 0.158832738492858 0.160610991304224 0.988928199764377 -0.0017782528113657 0.0663729771934578 0.0787243699521969 NA NA 0.0830188725012209 0.982910729432571 503 0 497 0.497 0.503 0.994 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAA 2 CTACAATGC:TTGCAAACT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 83.83333333333336 5 34.91666666666667 0.18891195758578 0.158903109406266 1.18884997462694 0.0300088481795145 0.0729321761301568 0.0734765436333737 NaN NaN 0.0907082525878929 0.74077425656987 658 0 342 0.342 0.658 0.684 ORF3a all ss13 117 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTA:CAATGCATC 1:1 TRUE 1.75 0.75 0.5 0 2 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 82.33333333333336 6 35.75 0.19283618143601 0.18998582171068 1.01500301285467 0.00285035972533057 0.0734141195960686 0.082375689396277 NaN NaN 0.0923234629792144 0.975370326248277 499 1 500 0.5 0.499 0.998 ORF3a all ss13 118 ATC CTG TAA 2 ACTGTAAAT:TGCATCAAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 82.41666666666669 6 35.91666666666667 0.161879739624373 0.188983168709011 0.856582841372657 -0.0271034290846383 0.0690794786252512 0.0844408603031832 NaN NaN 0.0883318420584487 0.758967860430231 393 0 607 0.607 0.393 0.786 ORF3a all ss13 119 AAC TAA ACG 2 ATCAACGCA:GTAAATTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 83.08333333333336 5 35.25 0.160431369407456 0.157231298910254 1.02035263029296 0.00320007049720256 0.0649484822986512 0.0768874053176518 NaN NaN 0.083482085452544 0.969422641060797 508 0 492 0.492 0.508 0.984 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AATTTTGTG 1:1 TRUE 1.25 0.75 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 82.25000000000003 6 35.41666666666667 0.162245943584362 0.192023563619284 0.844927260625367 -0.0297776200349215 0.0655647881958878 0.0868150543331503 NaN NaN 0.0891184121131328 0.738277356527999 360 0 640 0.64 0.36 0.72 ORF3a all ss13 121 GTG CAT GTA 2 GCATGTAGA:TTTGTGAGA 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 3 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 82.1666666666667 5 35.25000000000001 0.147466580202113 0.157231298910253 0.937895833871385 -0.00976471870814036 0.064242494515275 0.074450354700574 NaN NaN 0.0866847667211427 0.910310972235571 454 2 544 0.544 0.454 0.908 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 GTGAGAATA:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 81.9166666666667 5 35.583333333333336 0.133239689602572 0.155594424961324 0.856326887262778 -0.0223547353587516 0.0555338041540338 0.0741115508943217 NaN NaN 0.0779676271212175 0.774328123896506 402 1 597 0.597 0.402 0.804 ORF3a all ss13 123 ATA GAA TAA 2 AGAATAATA:AGAATTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 81.58333333333336 5 35.75000000000001 0.133835669008081 0.154788747544192 0.864634355736166 -0.0209530785361116 0.0575419231967684 0.0721805041599152 NaN NaN 0.0804198224568888 0.794442488867099 428 0 572 0.572 0.428 0.856 ORF3a all ss13 124 ATA TAA TAA 2 ATAATAATG:ATTATTATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 81.9166666666667 5 36.083333333333336 0.133239689602572 0.153202253301895 0.869697975916942 -0.0199625636993223 0.0576636789338249 0.0730674555820387 NaN NaN 0.0737281588304601 0.786576383647603 401 0 599 0.599 0.401 0.802 ORF3a all ss13 125 ATG TAA TGA 2 ATAATGCGA:ATTATGAGA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 82.08333333333336 5 35.91666666666667 0.132943691128056 0.153991399978411 0.863318933048817 -0.0210477088503556 0.0558455560672652 0.071840263563667 NaN NaN 0.0778414003944238 0.786858526887612 364 0 636 0.636 0.364 0.728 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT:ATGCGATTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 80.4166666666667 5 36.75000000000001 0.151021335369834 0.150125187835474 1.0059693349749 8.96147534359931e-4 0.0580307313297739 0.0718457050061579 NaN NaN 0.0796193291452033 0.99101967835145 509 0 491 0.491 0.509 0.982 ORF3a all ss13 127 TGT GAT GTT 2 AGATGTTGG:CGATTCTGG 1:1 TRUE 2.25 0.416666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.9166666666667 6 37.91666666666668 0.154208039717061 0.177731272847004 0.867647191441702 -0.0235232331299421 0.0578740003037255 0.0802870099061774 0.773912157269359 0.262237449917881 0.0856003468750688 0.783467584094484 392 0 608 0.608 0.392 0.784 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 TGTTGGCTT:TTCTGGTTG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 78.33333333333337 6 38.250000000000014 0.171357672967179 0.175985531846771 0.973703185534473 -0.00462785887959158 0.0675885359132282 0.0771159392596941 NaN NaN 0.0928217331902498 0.960235951106124 501 0 499 0.499 0.501 0.998 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TGT 2 TGGCTTTGT:TGGTTGTGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.83333333333337 6 37.750000000000014 0.172595396296097 0.178617257777546 0.966286228126123 -0.00602186148144968 0.069366848391593 0.0776935270756119 NaN NaN 0.0943776889353403 0.949124711982545 492 0 508 0.508 0.492 0.984 ORF3a all ss13 130 TGC TGT GCT 2 CTTTGTTGG:TTGTGCTGG 1:1 FALSE 2.08333333333333 0.5 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.25000000000004 5 37.66666666666668 0.204399702385691 0.146091244169313 1.39912356519328 0.0583084582163778 0.0801535111277586 0.0702167872957529 NaN NaN 0.092220332803037 0.527208278461278 732 0 268 0.268 0.732 0.536 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAG:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.66666666666671 6 37.750000000000014 0.223310144300941 0.178617257777546 1.25021594822073 0.0446928865233949 0.0819795165556711 0.0761649723572789 NaN NaN 0.0974283351710596 0.64643111731566 676 0 324 0.324 0.676 0.648 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.16666666666671 7 37.916666666666686 0.22499745519022 0.211925228838758 1.06168320035841 0.0130722263514627 0.079155424739231 0.0892213657192099 0.765266636971075 0.165338834546154 0.107807037918085 0.903488444840577 548 0 452 0.452 0.548 0.904 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA:AAGTGCCGT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.75000000000004 7 37.33333333333335 0.240550445951301 0.215761554338836 1.11489021613896 0.0247888916124658 0.0838609674104476 0.0919952362075479 0.81632746378952 0.172020913229697 0.109903178236354 0.821549806744202 600 0 400 0.4 0.6 0.8 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC:TGCCGTTCC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 2 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.58333333333337 7 37.666666666666686 0.241159939803403 0.213552421666518 1.12927747632849 0.0276075181368848 0.0815582302889575 0.0866102285644908 NaN NaN 0.106302403823663 0.795089504216342 605 0 395 0.395 0.605 0.79 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG:CGTTCCAAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.25000000000004 6 37.666666666666686 0.207447505316393 0.17906358673515 1.15851306845106 0.0283839185812421 0.0719110053879928 0.0811341037660659 NaN NaN 0.104965175159279 0.786842754908131 605 0 395 0.395 0.605 0.79 ORF3a all ss13 136 AAG CCA AGA 2 TCCAAGAAC:TCCAAGAAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.58333333333337 6 38.000000000000014 0.206421458535371 0.177291583548173 1.16430489481912 0.0291298749871979 0.0709222131605172 0.0795633893440037 NaN NaN 0.100774710584516 0.772535940202657 610 0 390 0.39 0.61 0.78 ORF3a all ss13 137 AAC AGA ACC 2 AAGAACCCA:AAGAATCCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.25000000000004 6 37.166666666666686 0.204399702385691 0.181789348152453 1.12437667257752 0.0226103542332379 0.0742842917268337 0.0807721821141372 1.12614925189828 0.318072839959689 0.103813602401394 0.827586808726896 585 0 415 0.415 0.585 0.83 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA:AATCCTTTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.58333333333337 6 37.166666666666686 0.206421458535371 0.181789348152453 1.13549809509334 0.0246321103829172 0.0735703923533141 0.0756435490993473 NaN NaN 0.108366415628411 0.820187430083733 582 1 417 0.417 0.582 0.834 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTT:CCTTTACTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.41666666666671 6 37.33333333333335 0.206933202001177 0.180871542612666 1.14408932998555 0.0260616593885112 0.0727312763461533 0.079000762025241 NaN NaN 0.103647785174557 0.801470512238941 600 0 400 0.4 0.6 0.8 ORF3a all ss13 140 CTC TAC TCT 2 TTACTCTAT:TTACTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.41666666666671 6 38.000000000000014 0.210058104799921 0.177291583548173 1.18481712778455 0.0327665212517484 0.0752278330092052 0.0780541464639494 NaN NaN 0.105128865003691 0.755284042741551 625 0 375 0.375 0.625 0.75 ORF3a all ss13 141 TAT TCT ATG 2 CTCTATGAT:CTTTATGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.25000000000004 7 38.166666666666686 0.210588181130888 0.210322806792345 1.00126174779897 2.65374338543067e-4 0.0695923836969275 0.0882839444988647 0.786168689329901 0.202806427732989 0.108860905818276 0.998054968620239 524 0 476 0.476 0.524 0.952 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.41666666666671 7 38.66666666666669 0.210058104799921 0.207190032471118 1.01384271383423 0.00286807232880265 0.0742552966172412 0.0834761361714013 NaN NaN 0.1098765873001 0.979175447221259 506 0 494 0.494 0.506 0.988 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.00000000000004 8 39.08333333333336 0.229036237163386 0.239040218372072 0.958149380565265 -0.0100039812086855 0.0759722762611273 0.094852995265739 0.61053420984802 0.116563539966007 0.114984269627892 0.930669094327219 469 0 531 0.531 0.469 0.938 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.33333333333337 8 39.41666666666669 0.245832397240244 0.23666322859543 1.03874352893448 0.00916916864481451 0.075233167199519 0.0926082744103144 NaN NaN 0.109127089735081 0.933038267589265 535 0 465 0.465 0.535 0.93 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.33333333333337 9 39.41666666666669 0.264238228927332 0.272278228294921 0.970471383562553 -0.00803999936758831 0.0785474061265208 0.104273236485061 0.561234668120549 0.0837782809651973 0.121161284273064 0.947092946478613 479 0 521 0.521 0.479 0.958 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTC 2 TACTTTCTT:TACTTTGTT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.416666666666667 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.33333333333337 9 39.41666666666669 0.264238228927332 0.272278228294921 0.970471383562553 -0.00803999936758831 0.0767339550298725 0.102510800363463 NaN NaN 0.117801559110705 0.945586335199073 473 0 527 0.527 0.473 0.946 ORF3a all ss13 147 CTT TTC TTT 2 TTTCTTTGT:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.25000000000003 9 38.916666666666686 0.264584505778426 0.27650770083468 0.956879338187464 -0.0119231950562541 0.0780648293584117 0.104041166804814 0.549287138011123 0.0815017088929604 0.12144129528798 0.921788783546241 443 0 557 0.557 0.443 0.886 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 CTTTGTTGG:GTTTGCTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.25000000000003 9 39.916666666666686 0.250032194187064 0.268177549189386 0.93233827717059 -0.0181453550023228 0.0819698454615668 0.0979912899102545 0.775156595891612 0.229063749930499 0.118539926610499 0.878340090336403 423 0 577 0.577 0.423 0.846 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGTTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.08333333333336 9 40.25000000000002 0.250691205609424 0.265512409704092 0.944178864893036 -0.0148212040946676 0.0794909395459879 0.0962155293175508 0.557202735543568 0.0901707105325483 0.11574531324422 0.898109290007115 464 0 536 0.536 0.464 0.928 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.41666666666669 9 39.58333333333335 0.249376670246877 0.270897321493184 0.920557903165358 -0.0215206512463066 0.0754774399151888 0.106951422749972 0.542680362779724 0.0898258703158064 0.119687052801418 0.857303554408622 402 0 598 0.598 0.402 0.804 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACTAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.00000000000001 9 39.58333333333335 0.269890947642084 0.270897321493184 0.996285035800456 -0.00100637385109958 0.0773327901538523 0.101531153099476 0.619439732236076 0.107755315123293 0.121352236903526 0.993383220821594 480 0 520 0.52 0.48 0.96 ORF3a all ss13 152 AAT CAC ATA 2 ACACATAAC:ACTAATTGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.33333333333334 9 39.25000000000002 0.268454974683989 0.273673442339373 0.980931771783275 -0.00521846765538386 0.080657413110086 0.105172684457633 0.676309435794351 0.146941828830849 0.120113136935722 0.965345795186325 463 0 537 0.537 0.463 0.926 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 AATTGTTAT:CATAACTAT 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.416666666666667 0.666666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 74.50000000000001 9 39.416666666666686 0.253025618871543 0.272278228294921 0.929290676144242 -0.0192526094233776 0.0819496445250233 0.0970156886002142 0.58097810268331 0.109703357617105 0.124290446258226 0.876900031241033 450 0 550 0.55 0.45 0.9 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC:TGTTATGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 74.25000000000001 8 38.916666666666686 0.23537608894668 0.240246862716335 0.979725963059063 -0.00487077376965517 0.0802855971925707 0.0986447866484117 0.656135749457465 0.135391198757997 0.110767930853895 0.964926101896898 473 0 527 0.527 0.473 0.946 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC:TATGACTAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 74.91666666666669 8 38.916666666666686 0.232919624976835 0.240246862716335 0.969501213640605 -0.00732723773950039 0.0789358143397486 0.0908455527977971 0.734129107503559 0.186630085793833 0.118186055723533 0.950564838046643 470 1 529 0.529 0.47 0.94 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT:GACTATTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 74.25000000000001 8 39.250000000000014 0.254039571433588 0.237845735137858 1.06808546004133 0.0161938362957298 0.078141025091993 0.0913015938534824 0.808811120815584 0.186647356000534 0.118785475074196 0.89156165664208 561 0 439 0.439 0.561 0.878 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA:TATTGTATA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 74.25000000000001 8 39.250000000000014 0.254039571433588 0.237845735137858 1.06808546004133 0.0161938362957298 0.0816486368437798 0.0877648274978704 0.884209495416762 0.227064494159299 0.120059453812946 0.892705322565729 539 0 461 0.461 0.539 0.922 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 73.91666666666667 8 39.08333333333335 0.255404339826275 0.239040218372072 1.06845760753419 0.016364121454203 0.0807651359898745 0.0896707127781 0.666129772944304 0.10871886675878 0.120394896273555 0.89188421486928 546 0 454 0.454 0.546 0.908 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAC:ATACCATAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 73.58333333333334 8 39.08333333333335 0.256783994978279 0.239040218372072 1.07422925199386 0.0177437766062077 0.081880551536886 0.0892790603547148 NaN NaN 0.114117003568751 0.876436945386299 553 0 447 0.447 0.553 0.894 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATACAAT:CCATATAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 73.91666666666667 8 39.08333333333335 0.274667035877296 0.239040218372072 1.14904110173532 0.0356268175052243 0.0830925391414903 0.0910422662612795 0.741498469770489 0.121232671001279 0.125970316422702 0.77731547571124 625 0 375 0.375 0.625 0.75 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAATAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.25 8 39.08333333333335 0.292820423057718 0.239040218372072 1.22498391714961 0.0537802046856461 0.0833710742958454 0.0913376931673827 0.927844248862103 0.186752445419825 0.125541135605386 0.6683693052658 662 0 338 0.338 0.662 0.676 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC:AATAGTGTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 73.91666666666667 8 38.75000000000002 0.294437538145598 0.241465856426246 1.21937545333881 0.0529716817193518 0.0846352652927915 0.0884992282030734 0.974816031809251 0.210979169284318 0.122505373889909 0.665448594251587 674 0 326 0.326 0.674 0.652 ORF3a all ss13 163 GTA GTG TAA 2 AGTGTAACC:AGTGTCACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 73.08333333333334 8 38.916666666666686 0.298560606540447 0.240246862716335 1.24272426771693 0.058313743824112 0.0884009722196837 0.0922467414541048 0.992211311011559 0.210395215288184 0.119599687839554 0.62585134526085 686 0 314 0.314 0.686 0.628 ORF3a all ss13 164 ACA TAA CAG 2 GTAACCTCT:GTCACAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 73.75000000000001 8 38.916666666666686 0.295252898711496 0.240246862716335 1.22895631340713 0.0550060359951604 0.086480729412579 0.0957006600634028 0.85216361692771 0.149257231437223 0.118675657176798 0.643006806532196 656 0 344 0.344 0.656 0.688 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA:ACCTCTTCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 74.25000000000001 8 38.25000000000002 0.292820423057718 0.245198876012612 1.19421600873349 0.0476215470451062 0.0846265358063229 0.094199190294066 NaN NaN 0.122174894383988 0.696697922339286 665 0 335 0.335 0.665 0.67 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT:TCTTCAATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 74.41666666666667 8 38.08333333333335 0.272441624207265 0.246469230096624 1.10537783601003 0.0259723941106406 0.0768472479167292 0.0935233576344774 0.877165683278829 0.207608060331275 0.123002030386055 0.832766955749797 571 0 429 0.429 0.571 0.858 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC:TCAATTGTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 74.25 7 38.25000000000002 0.27317936608966 0.209794072585264 1.30213100266994 0.0633852935043955 0.0784528319071272 0.085551676845289 0.935325211810864 0.16387115074106 0.107471212469782 0.555332401699062 722 0 278 0.278 0.722 0.556 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCA 2 ATTGTCATC:ATTGTCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 73.75 7 38.25000000000002 0.275417031803789 0.209794072585264 1.31279701285104 0.0656229592185242 0.0788262097150207 0.0840538241935577 NaN NaN 0.117859855149954 0.577672247758379 711 0 289 0.289 0.711 0.578 ORF3a all ss13 169 ATC TCA TCA 2 GTCATCACA:GTCGTTACT 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 74.75 7 37.916666666666686 0.270978159241796 0.211925228838758 1.27864983667409 0.0590529304030382 0.0801456190407022 0.0865801438617768 1.09084238377 0.24112987027299 0.115029015205198 0.607689578741438 698 0 302 0.302 0.698 0.604 ORF3a all ss13 170 ACA TCA CAT 2 ATCACATGT:GTTACTGAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.25 7 37.41666666666668 0.268812518156829 0.215204968042419 1.24909996549821 0.0536075501144099 0.0754890168581704 0.0914763621832726 1.06685955412236 0.24167133952907 0.117662398029369 0.648674210461428 706 0 294 0.294 0.706 0.588 ORF3a all ss13 171 GAA CAT AAG 2 ACATGTGGT:ACTGAAGGT 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.416666666666667 0.666666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 75.91666666666666 7 37.08333333333335 0.284997283854379 0.217448844139347 1.31064060139011 0.0675484397150317 0.0777041661912805 0.0950198161984837 0.887775611206807 0.139858094883557 0.117643594756164 0.565846919318149 725 0 275 0.275 0.725 0.55 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:TGTGGTGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 75 7 37.41666666666668 0.251022027914968 0.215204968042419 1.16643230961791 0.0358170598725486 0.0697311957528156 0.0872829703426765 0.978175228054124 0.233081936742126 0.103695874946423 0.729790018897594 626 0 374 0.374 0.626 0.748 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGATGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76 7 37.08333333333335 0.247109400847682 0.217448844139347 1.1364024574411 0.0296605567083346 0.0686540394245303 0.0869502314208845 0.948447752759557 0.230850508098372 0.107738486366514 0.783084684849104 599 0 401 0.401 0.599 0.802 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT:GATGGTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 74.99999999999999 7 37.41666666666668 0.251022027914968 0.215204968042419 1.16643230961791 0.0358170598725486 0.074146784269614 0.0892760545899843 0.920746641871443 0.205214978991545 0.106588061675518 0.736846308789422 624 0 376 0.376 0.624 0.752 ORF3a all ss13 175 ACT GCA CTA 2 GGCATTTCA:GGTACTACG 1:1 FALSE 1 0.833333333333333 1.16666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 74.49999999999999 7 37.91666666666668 0.253025618871543 0.211925228838758 1.19393816516323 0.0411003900327855 0.0709049415525558 0.0865611667615571 NaN NaN 0.106908465694931 0.700648896120477 654 0 346 0.346 0.654 0.692 ORF3a all ss13 176 ACG CTA CAA 2 ACTACGAAT:ATTTCAACA 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 74.41666666666666 8 38.083333333333336 0.234757088700051 0.246469230096625 0.952480310049323 -0.0117121413965736 0.0688495355984167 0.0954867989169311 0.575229216289617 0.0977567728959571 0.112121927336639 0.916805124796193 436 1 563 0.563 0.436 0.872 ORF3a all ss13 177 AAT CAA ATC 2 ACGAATCCC:TCAACACCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.75 7 37.416666666666664 0.229920775536938 0.215204968042419 1.06838042647611 0.0147158074945183 0.0668723462056046 0.0884243063171547 NaN NaN 0.106277754663533 0.88987249634854 531 0 469 0.469 0.531 0.938 ORF3a all ss13 178 CCA ATC CAA 2 AATCCCATT:ACACCAAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.41666666666666 7 37.083333333333336 0.210058104799921 0.217448844139347 0.966011595192983 -0.00739073933942602 0.0559933471448477 0.0918846381311495 0.699994023998456 0.167577917344879 0.0931708758099197 0.936774466579475 495 0 505 0.505 0.495 0.99 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC:CCCATTTCT 1:1 TRUE 1.75 0.5 0.75 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.58333333333333 8 36.916666666666664 0.209530707593171 0.255747848414627 0.819286296608341 -0.0462171408214558 0.0591193965232304 0.103112780637226 0.49102537978025 0.0952122906057717 0.114129014176345 0.685510422201194 361 0 639 0.639 0.361 0.722 ORF3a all ss13 180 CTC AAC CTG 2 AAACTCAAA:ATTTCTGAG 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 76.16666666666666 8 36.833333333333336 0.176854074420993 0.256437672127084 0.689657151205727 -0.0795835977060907 0.0480277410363175 0.107144119454585 0.411143906661603 0.093462216071818 0.102083618647614 0.435630920491684 165 0 835 0.835 0.165 0.33 ORF3a all ss13 181 AAA CTG AAG 2 CTCAAAGAA:TCTGAGGAC 1:1 TRUE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.66666666666666 7 37 0.159249476407496 0.218017195136802 0.730444570243963 -0.0587677187293066 0.0439284041330681 0.0903238046480456 NaN NaN 0.0982705149610543 0.549826687518975 266 1 733 0.733 0.266 0.532 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC:GAGGACGAC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.16666666666666 6 36.83333333333333 0.160415060140258 0.18365333026498 0.873466655403452 -0.0232382701247223 0.0461478227840311 0.0817925612290603 0.715461418813789 0.222145156904661 0.0873461747541971 0.790202285911946 388 0 612 0.612 0.388 0.776 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC:GACGACTAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.24999999999999 6 37.416666666666664 0.14626988152442 0.180416123106718 0.810736196996648 -0.0341462415822984 0.0451962821509053 0.0798813346428494 NaN NaN 0.0864120351373069 0.692727699230348 355 0 645 0.645 0.355 0.71 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.08333333333331 6 37.916666666666664 0.165461861324707 0.177731272847004 0.930966501697993 -0.0122694115222971 0.0458275614810521 0.0803960018589095 NaN NaN 0.0888237802648478 0.890136050403389 463 0 537 0.537 0.463 0.926 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.08333333333331 6 37.583333333333336 0.163000202065247 0.179512162520447 0.908017594889601 -0.0165119604551996 0.0452250964198452 0.0802102193311055 NaN NaN 0.0904937420013808 0.855217647325594 423 0 577 0.577 0.423 0.846 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.33333333333331 6 37.333333333333336 0.162396234146618 0.180871542612666 0.897853978579634 -0.018475308466048 0.0465890907295209 0.0804666322195313 NaN NaN 0.090831093162283 0.838820127236548 418 0 582 0.582 0.418 0.836 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.08333333333331 6 37.333333333333336 0.179737298307158 0.180871542612666 0.993729006292952 -0.00113424430550815 0.0482218164739477 0.0804293902693674 0.809335777811526 0.219509743707066 0.0941244818758735 0.990385348221917 520 0 480 0.48 0.52 0.96 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAC:GGTGGTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.74999999999997 6 37.666666666666664 0.180643544434896 0.179063586735151 1.00882344494798 0.00157995769974512 0.0479510611830415 0.07903797813512 NaN NaN 0.0955673381790897 0.986809652167441 519 0 481 0.481 0.519 0.962 ORF3a all ss13 189 TAC GTT ACA 2 GGTTACACG:GGTTATTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 75.99999999999997 7 37.083333333333336 0.194146225437217 0.217448844139347 0.892836318379336 -0.0233026187021304 0.0519352014078635 0.0957487438398383 0.725670740982281 0.218562291408108 0.0970095682107598 0.810167858700081 396 0 604 0.604 0.396 0.792 ORF3a all ss13 190 ACG ACA CGG 2 TACACGGAA:TATTCTGAG 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.49999999999997 7 36.25 0.206677011490545 0.223270280899521 0.925680796646449 -0.0165932694089759 0.0493971852764716 0.097575589712691 NaN NaN 0.104824947300739 0.874224314999849 456 0 544 0.544 0.456 0.912 ORF3a all ss13 191 GAA CGG AAA 2 ACGGAAAAG:TCTGAGGAT 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.33333333333331 6 36.416666666666664 0.207190032471119 0.186038038359055 1.11369714655473 0.0211519941120637 0.0511763730710265 0.0856548126008005 NaN NaN 0.0906495804374999 0.815498933325325 622 0 378 0.378 0.622 0.756 ORF3a all ss13 192 AAG AAA AGT 2 GAAAAGTGG:GAGGATAGG 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 75.83333333333331 6 35.24999999999999 0.211925228838758 0.193059006111768 1.09772257252825 0.0188662227269894 0.050589855910341 0.0916249475443606 NaN NaN 0.0947159696203757 0.8421161965774 608 0 392 0.392 0.608 0.784 ORF3a all ss13 193 AGG AGT GGC 2 AAGTGGGAG:GATAGGCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.166666666666667 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 74.91666666666664 7 35.83333333333332 0.197357408027963 0.226300369430574 0.872103781909688 -0.0289429614026108 0.0510217714190004 0.108299848263128 NaN NaN 0.128855347001518 0.822278084467405 430 0 570 0.57 0.43 0.86 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGGAGTCT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.58333333333331 8 36.16666666666666 0.181100119848143 0.262094574111018 0.690972411246607 -0.0809944542628753 0.0480552830691481 0.126298259374126 0.667682048430481 0.300723827590942 0.136802126169057 0.553813409351584 258 0 742 0.742 0.258 0.516 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT:GAGTCTGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.91666666666664 7 35.16666666666666 0.163405359234642 0.231324762417615 0.706389396132364 -0.0679194031829733 0.0482522280304439 0.121841289395905 NaN NaN 0.123496336105667 0.582339266041788 309 1 690 0.69 0.309 0.618 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT:TCTGGTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.58333333333331 7 34.16666666666666 0.159442558228446 0.239297754894712 0.666293581812327 -0.0798551966662659 0.0453907986059015 0.135976832801706 NaN NaN 0.129909947424304 0.538755137764372 258 0 742 0.742 0.258 0.516 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA:GGTGTTAAG 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.24999999999999 7 33.83333333333332 0.15791093535129 0.242080044197288 0.652308767849519 -0.084169108845998 0.0459269910831392 0.12365968539955 NaN NaN 0.13270802919150201 0.525922395207547 237 1 762 0.762 0.237 0.474 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAGGAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.58333333333331 7 33.166666666666664 0.154934610949651 0.247845145848439 0.625126671007694 -0.0929105348987879 0.0460645643886832 0.127538481449493 NaN NaN 0.136436638968197 0.49588455145234 216 0 784 0.784 0.216 0.432 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT:AAGGACTGT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.58333333333331 7 33.49999999999999 0.157156146021032 0.244928374228876 0.641641241100859 -0.0877722282078443 0.0465162789985848 0.127252645865489 0.665609043327508 0.335050352364367 0.142044749602755 0.536628369141467 239 0 761 0.761 0.239 0.478 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC:GACTGTGTT 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.41666666666666 7 33.49999999999999 0.157532633260459 0.244928374228876 0.643178373091435 -0.0873957409684174 0.0466991399467644 0.119273778999014 NaN NaN 0.128320898701892 0.495826081857535 236 0 764 0.764 0.236 0.472 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT:TGTGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 77.83333333333333 7 33.49999999999999 0.140928423479337 0.244928374228876 0.575386269243124 -0.103999950749539 0.0433354325631152 0.130213616978593 0.653267043148667 0.378435478971437 0.133019069662172 0.434307190270713 197 0 803 0.803 0.197 0.394 ORF3a all ss13 202 GTA TCG TAT 2 GTCGTTGTA:GTTGTATTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 77.5 7 33.83333333333333 0.141595553474679 0.242080044197288 0.584912126665355 -0.100484490722609 0.0439178913895369 0.12932209705223 NaN NaN 0.132928374930688 0.449691417427394 194 0 806 0.806 0.194 0.388 ORF3a all ss13 203 GTA TAT TAC 2 GTATTACAT:GTTGTACAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 77.33333333333333 8 33.99999999999999 0.141931499728896 0.282358178426184 0.502664737816337 -0.140426678697288 0.0421358426545194 0.137841295164314 NaN NaN 0.140298583683618 0.316868862724964 125 0 875 0.875 0.125 0.25 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATA 2 GTACATGGC:TTACATAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.66666666666666 8 34.83333333333333 0.143291427572032 0.274200382158177 0.522579240933996 -0.130908954586146 0.0417707784902936 0.136778117774179 0.461863676866968 0.25786247269461 0.137741019294266 0.341909450175729 133 0 867 0.867 0.133 0.266 ORF3a all ss13 205 AGT ATA GCT 2 CATAGTTAT:CATGGCTAT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.24999999999999 8 34.58333333333333 0.144154737019872 0.276597228353308 0.521172022865458 -0.132442491333435 0.0432125610370287 0.140907930793872 0.499402564064356 0.29667465711982 0.148424004856823 0.372218609295475 143 1 856 0.856 0.143 0.286 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 AGTTATTTC:GGCTATTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 75.58333333333331 8 34.916666666666664 0.12966331412301 0.273410739562984 0.474243675761464 -0.143747425439974 0.042246100039502 0.127901834010356 NaN NaN 0.139118563812178 0.301476260967076 89 0 911 0.911 0.089 0.178 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 75.91666666666664 9 34.58333333333333 0.129042071919527 0.319619774513248 0.403736195972374 -0.190577702593721 0.0413539910790974 0.143755516877675 0.351926267247321 0.251291478289408 0.149765885032371 0.203194068626249 58 0 942 0.942 0.058 0.116 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA:TTCACCTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.58333333333331 9 34.58333333333333 0.127817319751755 0.319619774513248 0.399904292362415 -0.191802454761493 0.0412058392726829 0.147863660691593 NaN NaN 0.156112171259883 0.219214508119715 56 0 944 0.944 0.056 0.112 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT:ACCTCAGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.91666666666664 9 34.24999999999999 0.127213641474078 0.323508417071989 0.393231318756599 -0.196294775597911 0.0417291279027326 0.151819146296368 NaN NaN 0.162546827104478 0.227193518846067 61 0 939 0.939 0.061 0.122 ORF3a all ss13 210 GAT AAG ATT 2 GAAGTTTAC:TCAGATTAC 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.24999999999999 9 33.58333333333333 0.111444464849685 0.331581375185359 0.336099893389326 -0.220136910335674 0.0381831814774445 0.148982836893157 0.287545635840288 0.242461020607446 0.159444332418605 0.167386422797319 36 0 964 0.964 0.036 0.072 ORF3a all ss13 211 TAC ATT ACT 2 GATTACTAC:GTTTACTAC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.91666666666666 9 33.58333333333333 0.095692746458713 0.331581375185359 0.288595058770171 -0.235888628726646 0.0351776830731853 0.154255904414131 0.253796965778962 0.255492318833035 0.160401428344774 0.141395463802408 22 0 978 0.978 0.022 0.044 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.08333333333333 9 33.08333333333333 0.108664266868125 0.337910093969753 0.321577451539082 -0.229245827101628 0.0377762857005955 0.162969552032167 0.262879366469719 0.221220539963716 0.162524807180152 0.158383769536251 34 0 966 0.966 0.034 0.068 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTG:TACCAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.58333333333333 9 32.58333333333333 0.107929984092779 0.344489417518041 0.313304207921356 -0.236559433425262 0.035398735048248 0.164434177014986 0.257508094286792 0.223727085584289 0.172791270455165 0.17098446985404 28 0 972 0.972 0.028 0.056 ORF3a all ss13 214 CTG AGC TGT 2 CAGCTGTAC:CAGCTTGAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 79.91666666666666 9 31.91666666666666 0.107445960020993 0.353678577936852 0.303795498861615 -0.246232617915859 0.0372200217880719 0.172199449160751 0.265462470050905 0.252457400754671 0.172576136169139 0.153635902503246 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 215 GAG TGT ACT 2 CTGTACTCA:CTTGAGTCT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.08333333333333 9 31.91666666666666 0.107205575102587 0.353678577936852 0.303115828298 -0.246473002834264 0.0359796664162992 0.166084300872371 0.263492708322723 0.249988821205512 0.167717882204309 0.141678517455146 28 0 972 0.972 0.028 0.056 ORF3a all ss13 216 TCA ACT CAA 2 GAGTCTACA:TACTCAACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.91666666666666 9 31.41666666666666 0.0919181597303021 0.360905050411733 0.254687928654472 -0.268986890681431 0.0334498502562755 0.184601635097832 0.233772334533491 0.27594670870693 0.17512096032099 0.124536845911071 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 217 ACA CAA CAC 2 TCAACACAA:TCTACACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.58333333333333 9 30.41666666666666 0.0899472274836082 0.376300989048554 0.239030005504456 -0.286353761564946 0.0320933057277483 0.183064536279669 0.240225505286908 0.319724870539774 0.196836538266107 0.145730314037621 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT:ACACAAGTG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.41666666666667 9 30.58333333333333 0.0901405044378968 0.373642557445839 0.241247959156695 -0.283502053007942 0.0331690027442549 0.184444988573455 0.234820569042149 0.304245568394528 0.177135745061365 0.109492345824637 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TGA 2 CAAATTACT:CAAGTGAGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.25 9 32.08333333333333 0.0927309624185635 0.351334800597847 0.263939018454103 -0.258603838179283 0.035288349096442 0.163324699799907 NaN NaN 0.172923181157154 0.134788191356547 12 0 988 0.988 0.012 0.024 ORF3a all ss13 220 ACT TGA CTA 2 ATTACTACA:GTGAGTACA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.41666666666667 8 32.91666666666666 0.0937674327609406 0.293727829875654 0.319232375088992 -0.199960397114714 0.0344272975379371 0.150501740731426 0.308798776148764 0.301235425268662 0.148828860235457 0.1790909427938 57 0 943 0.943 0.057 0.114 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC:AGTACAGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.25000000000001 8 33.74999999999999 0.0808863909048056 0.284902170689401 0.28390935284585 -0.204015779784595 0.0323337201722272 0.14729098628062 0.248241637343888 0.252755773964431 0.147174112902695 0.165679568245387 30 0 970 0.97 0.03 0.06 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.91666666666667 8 34.08333333333332 0.0812518671161106 0.281520365031792 0.288618079572804 -0.200268497915682 0.0312115656040539 0.146540290602688 0.282732508699388 0.307341268855101 0.150473840591434 0.183215654942791 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.25000000000001 8 34.749999999999986 0.0819928280328052 0.274994650264777 0.298161538611238 -0.193001822231972 0.0314577578376964 0.136207672170561 NaN NaN 0.132045661146442 0.143842789695718 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT:ACTGGTGTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.58333333333336 8 34.41666666666666 0.0816206643196587 0.278218809519287 0.293368606028776 -0.196598145199628 0.0326588889712781 0.130794063594537 0.252992103741524 0.246213371387287 0.133131280771081 0.139749660780809 36 0 964 0.964 0.036 0.072 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA:GGTGTTGAA 1:1 FALSE 0.916666666666667 0.75 1.33333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.08333333333336 8 33.91666666666666 0.0810687166991055 0.283201052715922 0.286258528778935 -0.202132336016817 0.0325104519529675 0.141081667927445 0.264035492122082 0.278290825257456 0.141077449537584 0.151921959038013 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:GTTGAACAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.83333333333336 7 33.24999999999999 0.080254664675637 0.247109400847682 0.324773822445978 -0.166854736172045 0.0323740095261331 0.128221802469235 NaN NaN 0.135960942131135 0.21973784495901 52 0 948 0.948 0.052 0.104 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GAACATGTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA:CATGTTACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC:GTTACTTTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC:ACTTTCTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTAC:TTCATCTTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TAC TCT ACA 2 ATCTACAAT:ATCTTTAAC 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC ACA ACA 2 TACAATAAA:TTTAACAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAA ACA AAA 2 AACAAGCTT:AATAAAATT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 ATT AAA TTG 2 AAAATTGTT:AAGCTTGTT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 ATTGTTGAT:CTTGTTAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTGATGAG 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:GATGAGCCT 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 1 GACCCA---:GAGCCTGAA 1:1 FALSE 0.666666666666667 0.5 1.33333333333333 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- CTG AAG 1 CCA---CCG:CCTGAAGAA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C AAC 1 ---CCGAAT:GAAGAACAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 2 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT AAC ATG 2 CCGAATGTG:GAACATGTT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA:CATGTTCAA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA:GTTCAAATT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC:CAAATTCAC 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA:ATTCACACA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC:ATCGACGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT:GACGGTACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 ACA GCT CAT 2 GGCTCTTCA:GGTACATCT 1:1 TRUE 1 1 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CAT CAG 2 ACATCTGGA:TCTTCAGGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT:TCTGGAGTT 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTTAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTTAATCCA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAA:GCAATGGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAA TGG AAC 2 ATGGAACCA:ATGGATCCA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA AAC CAA 2 GAACCAATT:GATCCAATT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAA:TATGATGAG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAA ATG AAC 2 GATGAACCG:GATGAGCCG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AAC CGA 2 GAACCGACG:GAGCCGACG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666669 3 31.916666666666647 0.0137934922285677 0.100428343016685 0.137346607683013 -0.0866348507881171 0.0138792885164277 0.0666177599317625 NA NA 0.0715686871541787 0.226081973673962 55 13 932 0.932 0.055 0.11 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.83333333333334 3 32.24999999999998 0.0138572071256798 0.0993184392369988 0.139523005316395 -0.0854612321113189 0.0144199890632929 0.0636519096278567 NA NA 0.0664158927850161 0.198178383802785 54 10 936 0.936 0.054 0.108 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666669 3 32.583333333333314 0.0139864193085547 0.0982328346145695 0.142380288255271 -0.0842464153060147 0.0136984945475914 0.0660424168863916 NA NA 0.0663042757448517 0.203869899661004 38 17 945 0.945 0.038 0.076 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.33333333333334 3 32.41666666666665 0.0139538908732759 0.0987726497511972 0.141272821053449 -0.0848187588779214 0.0144857942285167 0.0657479247907869 NA NA 0.064805609294931 0.190595951024268 45 20 935 0.935 0.045 0.09 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAA 2 ATGAGAATT:ATGAGATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666667 3 33.083333333333314 0.0138892858254281 0.0966482688635724 0.143709618276082 -0.0827589830381443 0.0136919337846099 0.0612943452157081 NA NA 0.0641082929214219 0.19672976667614 46 19 935 0.935 0.046 0.092 ORF3a all ss13 7 ATT GAA TTT 2 AGAATTTTT:AGATTTTTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.33333333333333 3 33.41666666666665 0.0137618540011474 0.0956200277799544 0.143922296621968 -0.081858173778807 0.0136250936314089 0.063486252787059 NA NA 0.065694386974391 0.212747811475134 47 23 930 0.93 0.047 0.094 ORF3a all ss13 8 TTT TTT TTA 2 ATTTTTACT:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333333 3 33.583333333333314 0 0.0951140793534504 0 -0.0951140793534504 0 0.0629462196734467 NA NA 0.0631167506971208 0.131822288368287 0 44 956 0.956 0 0.001 ORF3a all ss13 9 ACT TTA CTC 2 TTTACTCTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333333 3 33.24999999999998 0 0.0961313950679983 0 -0.0961313950679983 0 0.0655924513768151 NA NA 0.0622913354592206 0.122768994563028 0 43 957 0.957 0 0.001 ORF3a all ss13 10 CTT CTC TTA 2 ACTCTTAGA:ACTCTTGGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333333 3 34.24999999999998 0 0.0931427851735379 0 -0.0931427851735379 0 0.0557527679088093 NA NA 0.0616449882667577 0.130799991098314 0 44 956 0.956 0 0.001 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAT 2 CTTAGATCA:CTTGGATCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666666 3 33.91666666666665 0 0.0941180977157372 0 -0.0941180977157372 0 0.0603059638254157 NA NA 0.0587294225496161 0.109029294166846 0 55 945 0.945 0 0.001 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGATCAATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.75 2 34.41666666666665 0 0.0604861633757489 0 -0.0604861633757489 0 0.0476726089555547 NA NA 0.0448190649997121 0.177156116489452 0 120 880 0.88 0 0.001 ORF3a all ss13 13 ATT CAA TTA 2 TCAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.75 2 34.41666666666665 0 0.0604861633757489 0 -0.0604861633757489 0 0.0473897767472456 NA NA 0.0454387613789354 0.183137081033695 0 130 870 0.87 0 0.001 ORF3a all ss13 14 ACT TTA CTG 2 ATTACTGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.58333333333334 2 34.083333333333314 0 0.0611024764460933 0 -0.0611024764460933 0 0.0485385644528527 NA NA 0.0494167274188901 0.216282591074651 0 109 891 0.891 0 0.001 ORF3a all ss13 15 GCA CTG CAC 2 ACTGCACAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.91666666666669 2 33.74999999999998 0 0.0617314855970427 0 -0.0617314855970427 0 0.0495539013241987 NA NA 0.0459515455804952 0.179141224369099 0 138 862 0.862 0 0.001 ORF3a all ss13 16 CAG CAC AGC 2 GCACAGCCA:GCACAGTCA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.91666666666669 2 33.74999999999998 0 0.0617314855970427 0 -0.0617314855970427 0 0.0471245786110254 NA NA 0.0530579155797214 0.244637391402611 0 113 887 0.887 0 0.001 ORF3a all ss13 17 CCA AGC CAG 2 CAGCCAGTA:CAGTCAGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.91666666666669 2 34.74999999999998 0 0.059882165633263 0 -0.059882165633263 0 0.0466364133339898 NA NA 0.046696083809545 0.199709063663445 0 124 876 0.876 0 0.001 ORF3a all ss13 18 GGA CAG GAA 2 CCAGTAAAA:TCAGGAAAA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666669 1 34.91666666666664 0 0.0292007684815911 0 -0.0292007684815911 0 0.0310748471364408 NA NA 0.0311514563825892 0.348562855949579 0 351 649 0.649 0 0.001 ORF3a all ss13 19 AAA GAA AAA 2 GGAAAAATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000003 1 34.99999999999998 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0305223768049137 NA NA 0.0290606180476196 0.316158558312544 0 337 663 0.663 0 0.001 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 1 34.833333333333314 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0315583972292422 NA NA 0.0315480821482778 0.353483411794467 0 387 613 0.613 0 0.001 ORF3a all ss13 21 GAC TTG ACA 2 ATTGACAAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333336 1 35.16666666666664 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0311083177719206 NA NA 0.0308538411688417 0.347441957957238 0 382 618 0.618 0 0.001 ORF3a all ss13 22 AAT ACA ATG 2 GACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.1666666666667 1 34.833333333333314 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0339908229534647 NA NA 0.0317673780270172 0.356816233475548 0 338 662 0.662 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000003 1 33.833333333333314 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.0330025749153835 NA NA 0.0315979733333157 0.33991788467196 0 378 622 0.622 0 0.001 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000003 1 34.833333333333314 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0317417096452767 NA NA 0.0315721385618263 0.353850308739467 0 354 646 0.646 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.1666666666667 1 34.16666666666664 0 0.0298546878003148 0 -0.0298546878003148 0 0.0331156412339843 NA NA 0.0322872191785534 0.355142990290994 0 361 639 0.639 0 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT:CCTGCAGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333336 1 33.66666666666665 0 0.0303071537534075 0 -0.0303071537534075 0 0.035154629150105 NA NA 0.0328946908151172 0.35687358909605 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT:GCAGGTACT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000003 1 32.99999999999998 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.0322060092298501 NA NA 0.0338068477951383 0.360207886267024 0 377 623 0.623 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT:GGTACTGTT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.6666666666667 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333337 0 32.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333337 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333337 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.6666666666667 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 0 31.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA:CCGCTACAG 1:1 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 0 30.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC:CTACAGGCC 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000004 0 31.166666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA:CAGGCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333337 1 31.666666666666647 0 0.0322630388127681 0 -0.0322630388127681 0 0.0346338411480147 NA NA 0.034833337978165 0.354336068438137 0 356 644 0.644 0 0.001 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333337 1 31.666666666666647 0 0.0322630388127681 0 -0.0322630388127681 0 0.0342079628390474 NA NA 0.0348322153513217 0.354320558325918 0 347 653 0.653 0 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.4166666666667 1 31.666666666666647 0 0.0322630388127681 0 -0.0322630388127681 0 0.0342464814940882 NA NA 0.0353672687029854 0.361648319988275 0 347 653 0.653 0 0.001 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000003 1 32.333333333333314 0 0.0315836140125952 0 -0.0315836140125952 0 0.0336605167088729 NA NA 0.0332130451470712 0.341634821707988 0 340 660 0.66 0 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333336 1 31.999999999999982 0 0.031919710814097 0 -0.031919710814097 0 0.0340728850206598 NA NA 0.0348866869216983 0.360215823621598 0 371 629 0.629 0 0.001 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.91666666666669 1 31.333333333333314 0 0.0326138339548042 0 -0.0326138339548042 0 0.0342485267603542 NA NA 0.0328000501340723 0.320065794491938 0 348 652 0.652 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.25000000000003 1 30.999999999999982 0 0.0329723425658371 0 -0.0329723425658371 0 0.035759667863229 NA NA 0.0343270090353492 0.336785307435824 0 341 659 0.659 0 0.001 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.91666666666669 1 30.66666666666665 0 0.0333388219281254 0 -0.0333388219281254 0 0.0359041828678979 NA NA 0.0344157743817514 0.33269110354151 0 373 627 0.627 0 0.001 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.41666666666669 1 30.166666666666654 0 0.0339040775760351 0 -0.0339040775760351 0 0.0366192536327046 NA NA 0.0368354497387181 0.357353421436478 0 371 629 0.629 0 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.75000000000003 1 29.833333333333318 0 0.0342916870035714 0 -0.0342916870035714 0 0.0372334191714318 NA NA 0.0354392613039807 0.333234904306411 0 368 632 0.632 0 0.001 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.58333333333336 1 30.499999999999982 0 0.0335251341884302 0 -0.0335251341884302 0 0.0348533384369521 NA NA 0.0350598220155328 0.338957766897572 0 380 620 0.62 0 0.001 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000003 1 31.333333333333318 0 0.0326138339548042 0 -0.0326138339548042 0 0.0333252596444697 NA NA 0.0341326354428535 0.33932341279139 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAT 2 GTTGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.41666666666669 1 30.666666666666657 0 0.0333388219281254 0 -0.0333388219281254 0 0.0335009531240171 NA NA 0.0362615576593757 0.357887170612069 0 357 643 0.643 0 0.001 ORF3a all ss13 52 TTT CAT TTC 2 GCATTTCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.75000000000001 1 31.33333333333332 0 0.0326138339548042 0 -0.0326138339548042 0 0.0355709768390154 NA NA 0.0336761831823034 0.332817687052888 0 378 622 0.622 0 0.001 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 TTTCTTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.75000000000001 1 31.33333333333332 0 0.0326138339548042 0 -0.0326138339548042 0 0.0343352941927506 NA NA 0.0333311101034118 0.32783683977971 0 371 629 0.629 0 0.001 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.08333333333336 1 30.99999999999999 0 0.032972342565837 0 -0.032972342565837 0 0.0350830089050006 NA NA 0.0327335826898298 0.313793495757284 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.4166666666667 1 31.33333333333332 0 0.0326138339548042 0 -0.0326138339548042 0 0.0349346476605847 NA NA 0.0354023252092151 0.356928148433581 0 361 639 0.639 0 0.001 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.75000000000003 1 30.666666666666654 0 0.0333388219281254 0 -0.0333388219281254 0 0.035479689259911 NA NA 0.035136818683222 0.342707743420371 0 354 646 0.646 0 0.001 ORF3a all ss13 57 CAG TTC AGA 2 TTTCAGAGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.75000000000003 1 30.33333333333332 0 0.0337135408966998 0 -0.0337135408966998 0 0.0376769158993932 NA NA 0.0358185853558321 0.346586808618649 0 382 618 0.618 0 0.001 ORF3a all ss13 58 AGC AGA GCG 2 CAGAGCGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.08333333333336 1 30.33333333333332 0 0.0337135408966998 0 -0.0337135408966998 0 0.0362695605981626 NA NA 0.0347417252165776 0.331844699863854 0 375 625 0.625 0 0.001 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.75000000000003 1 30.99999999999999 0 0.032972342565837 0 -0.032972342565837 0 0.0343572367938825 NA NA 0.0348821393729223 0.344531253609314 0 375 625 0.625 0 0.001 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.08333333333336 1 30.666666666666657 0 0.0333388219281254 0 -0.0333388219281254 0 0.0357707765241812 NA NA 0.0340929821471475 0.328134018224733 0 351 649 0.649 0 0.001 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.08333333333336 1 29.666666666666657 0 0.0344888349313675 0 -0.0344888349313675 0 0.0376735544516455 NA NA 0.0353118226522181 0.32872081207187 0 348 652 0.652 0 0.001 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.41666666666669 1 29.333333333333325 0 0.0348900117261696 0 -0.0348900117261696 0 0.0376256298441594 NA NA 0.0378404403898758 0.356513058867155 0 363 637 0.637 0 0.001 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.08333333333336 1 28.999999999999993 0 0.0353006331434894 0 -0.0353006331434894 0 0.0366299722019306 NA NA 0.0372406681706232 0.343177578946356 0 340 660 0.66 0 0.001 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.91666666666669 1 29.66666666666666 0 0.0344888349313675 0 -0.0344888349313675 0 0.0381629460394207 NA NA 0.035745454527693 0.334622286638849 0 334 666 0.666 0 0.001 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.25000000000001 1 29.999999999999993 0 0.034096780557568 0 -0.034096780557568 0 0.0369245064993968 NA NA 0.0361022155223827 0.344939131153086 0 351 649 0.649 0 0.001 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.91666666666669 1 28.999999999999993 0 0.0353006331434894 0 -0.0353006331434894 0 0.0383116101688128 NA NA 0.0377901016688794 0.350240039515446 0 358 642 0.642 0 0.001 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.91666666666669 1 27.999999999999993 0 0.036592623127074 0 -0.036592623127074 0 0.0376777519054465 NA NA 0.0380994360619803 0.336828523014939 0 374 626 0.626 0 0.001 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.91666666666669 1 27.833333333333325 0 0.0368172076473927 0 -0.0368172076473927 0 0.0368307409552881 NA NA 0.0398295949724061 0.355294689441301 0 358 642 0.642 0 0.001 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.25000000000001 1 28.333333333333325 0 0.0361515763634083 0 -0.0361515763634083 0 0.0365342479169304 NA NA 0.0403550480565927 0.370339412838813 0 362 638 0.638 0 0.001 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000001 1 28.999999999999993 0 0.0353006331434894 0 -0.0353006331434894 0 0.0383375808436869 NA NA 0.037752450383654 0.349759742134784 0 391 609 0.609 0 0.001 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333334 1 28.999999999999993 0 0.0353006331434894 0 -0.0353006331434894 0 0.0373044679238918 NA NA 0.0377875038784956 0.350206918209439 0 375 625 0.625 0 0.001 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.08333333333334 1 29.333333333333325 0 0.0348900117261696 0 -0.0348900117261696 0 0.0383767120022399 NA NA 0.0352696760841796 0.322547987777464 0 355 645 0.645 0 0.001 ORF3a all ss13 73 CTT CCC TTT 2 GCCCTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.75000000000001 1 29.833333333333325 0 0.0342916870035713 0 -0.0342916870035713 0 0.034711499033832 NA NA 0.0342762440015152 0.317092519415434 0 354 646 0.646 0 0.001 ORF3a all ss13 74 TAT TTT ATA 2 CTTTATAAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.08333333333334 1 29.499999999999993 0 0.0346882632380668 0 -0.0346882632380668 0 0.0360981220370275 NA NA 0.0364427679541222 0.341170073864579 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 75 AAG ATA AGG 2 TATAAGGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.91666666666667 1 29.66666666666666 0 0.0344888349313675 0 -0.0344888349313675 0 0.0377716780861441 NA NA 0.0370435868210611 0.351836031134313 0 320 680 0.68 0 0.001 ORF3a all ss13 76 GGC AGG GCT 2 AAGGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.41666666666669 1 29.499999999999993 0 0.0346882632380668 0 -0.0346882632380668 0 0.0362637291903366 NA NA 0.035303343395093 0.325815529459833 0 363 637 0.637 0 0.001 ORF3a all ss13 77 TTC GCT TCC 2 GGCTTCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.41666666666669 1 29.16666666666666 0 0.0350941211300692 0 -0.0350941211300692 0 0.0366889308476447 NA NA 0.0363414752289134 0.334205909662927 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGT 2 TTCCAGTTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.91666666666669 1 28.499999999999993 0 0.0359350167719231 0 -0.0359350167719231 0 0.0383141285050854 NA NA 0.0360307348063859 0.318597838057663 0 389 611 0.611 0 0.001 ORF3a all ss13 79 TTC AGT TCA 2 CAGTTCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.25000000000001 1 28.499999999999993 0 0.0359350167719231 0 -0.0359350167719231 0 0.0394539978837695 NA NA 0.0379304387279025 0.343438763104687 0 334 666 0.666 0 0.001 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 TTCATTTGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.58333333333334 1 29.16666666666666 0 0.0350941211300692 0 -0.0350941211300692 0 0.0384450502825677 NA NA 0.0373438254833446 0.347342223735716 0 361 639 0.639 0 0.001 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.41666666666669 1 28.499999999999993 0 0.0359350167719231 0 -0.0359350167719231 0 0.0381341787201138 NA NA 0.038807716696579 0.354458419439946 0 366 634 0.634 0 0.001 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATT 2 TGCAATTTA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.25000000000001 1 29.16666666666666 0 0.0350941211300692 0 -0.0350941211300692 0 0.035702705136846 NA NA 0.0376276665195513 0.3509914029305 0 397 603 0.603 0 0.001 ORF3a all ss13 83 TTA ATT TAC 2 AATTTACTG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.25000000000001 1 29.16666666666666 0 0.0350941211300692 0 -0.0350941211300692 0 0.0348738629439238 NA NA 0.035987373044596 0.329471605559396 0 371 629 0.629 0 0.001 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.41666666666669 1 29.16666666666666 0 0.0350941211300692 0 -0.0350941211300692 0 0.0401466854549612 NA NA 0.0361393546371241 0.331509591079924 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.08333333333336 1 30.16666666666666 0 0.0339040775760351 0 -0.0339040775760351 0 0.0362771069564037 NA NA 0.036985101459331 0.35930220354962 0 362 638 0.638 0 0.001 ORF3a all ss13 86 CTA TGC TAT 2 CTGCTATTT 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.25000000000001 1 30.499999999999993 0 0.0335251341884302 0 -0.0335251341884302 0 0.0348087311129456 NA NA 0.0345999705708521 0.332577452445174 0 364 636 0.636 0 0.001 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTA 2 CTATTTATT:CTATTTGTT 1:1 FALSE 0.916666666666667 0.75 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.91666666666669 1 31.999999999999993 0 0.0319197108140969 0 -0.0319197108140969 0 0.0325495609605286 NA NA 0.0332184497239019 0.336600899569744 0 376 624 0.624 0 0.001 ORF3a all ss13 88 ATT TTA TTA 2 TTTATTACC:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333336 1 30.999999999999996 0 0.032972342565837 0 -0.032972342565837 0 0.0348939027421154 NA NA 0.0340100428379027 0.332301557055622 0 330 670 0.67 0 0.001 ORF3a all ss13 89 ACC TTA CCA 2 ATTACCATC:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000003 0 31.333333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 90 ATC CCA TCT 2 ACCATCTAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666669 0 30.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 91 TAT TCT ATT 2 ATCTATTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333336 0 30.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 92 TCA ATT CAC 2 TATTCACAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000003 0 30.333333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 93 CAT CAC ATC 2 TCACATCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333336 0 29.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 94 CTT ATC TTT 2 CATCTTTTG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000003 0 29.333333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 95 TTG TTT TGC 2 CTTTTGCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 29.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 96 CTT TGC TTG 2 TTGCTTGTC 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000004 0 30.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TCG 2 CTTGTCGCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000004 0 31.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 98 GCT TCG CTG 2 GTCGCTGCA:GTCGCTGCG 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000004 0 31.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCGGGT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000004 0 30.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 100 GGT CAG GTA 2 GCAGGTATG:GCGGGTATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 29.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 101 ATG GTA TGG 2 GGTATGGAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000006 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 102 GAG TGG AGG 2 ATGGAGGCG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 103 GCG AGG CGC 2 GAGGCGCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 104 CAA CGC AAT 2 GCGCAATTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333339 0 30.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTT 2 CAATTTTTG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666671 0 30.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 106 TTG TTT TGT 2 TTTTTGTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 30.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACC 2 TTGTACCTC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666673 0 31.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 108 CTC ACC TCT 2 TACCTCTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666673 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 CTCTATGCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000006 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 TATGCCTTG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000006 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 111 TTG CCT TGA 2 GCCTTGATA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666673 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 TTGATATAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666673 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATT 2 ATATATTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000007 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 114 TTT ATT TTC 2 TATTTTCTA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000007 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 TTTCTACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000007 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAT 2 CTACAATGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666673 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 117 TGC AAT GCA 2 CAATGCATC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 118 ATC GCA TCA 2 TGCATCAAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666671 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 121 TGT CAT GTA 2 GCATGTAGA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 TGTAGAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.1666666666667 0 34.83333333333332 0.0125789112103712 0 -Inf 0.0125789112103712 0.01316834015957 0 NA NA 0.0127546250072437 0.324023438545635 645 355 0 0 0.645 0.001 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATC:AGAATTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.1666666666667 0 34.66666666666666 0.0125789112103712 0 -Inf 0.0125789112103712 0.0124263143828615 0 NA NA 0.0124714570162959 0.313158826290593 634 366 0 0 0.634 0.001 ORF3a all ss13 124 ATC TTA TCA 2 ATTATCATG:ATTATTATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.50000000000004 0 34.99999999999999 0.0125263872134486 0 -Inf 0.0125263872134486 0.0128981002880969 0 NA NA 0.012502239774686 0.316376702295448 637 363 0 0 0.637 0.001 ORF3a all ss13 125 ATG TCA TGA 2 ATCATGAGA:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000004 0 35.49999999999999 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.0131935606948028 0 NA NA 0.012978221944848 0.331414568477309 640 360 0 0 0.64 0.001 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.00000000000004 0 35.83333333333332 0.0124484185567784 0 -Inf 0.0124484185567784 0.0121596397740821 0 NA NA 0.0124278905950859 0.316511810218958 679 321 0 0 0.679 0.001 ORF3a all ss13 127 TGT GAT GTT 2 AGATGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000003 0 36.16666666666666 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.012905863868504 0 NA NA 0.0134349703998396 0.348116798997572 634 366 0 0 0.634 0.001 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 TGTTGGCTT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 36.16666666666666 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0125520193173224 0 NA NA 0.0126098921475904 0.314425475926317 642 358 0 0 0.642 0.001 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 35.49999999999999 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0131547870697384 0 NA NA 0.0129387431207964 0.324832997489717 650 350 0 0 0.65 0.001 ORF3a all ss13 130 TGT TTT GTT 2 CTTTGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.33333333333337 0 34.99999999999999 0.0125525942666428 0 -Inf 0.0125525942666428 0.0125216764994518 0 NA NA 0.0121966003067367 0.303391355919159 619 381 0 0 0.619 0.001 ORF3a all ss13 131 TGG GTT GGA 2 TGTTGGAAG 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333337 0 34.99999999999999 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0129075612954695 0 NA NA 0.0132205342254056 0.339338015906276 650 350 0 0 0.65 0.001 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC:TGGAAGTGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000004 0 34.99999999999999 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0124535457342218 0 NA NA 0.0135136301491499 0.347882999273919 654 346 0 0 0.654 0.001 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA:AAGTGTAAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000004 0 34.49999999999999 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.0131478517581882 0 NA NA 0.0125048215378312 0.313436087711191 634 366 0 0 0.634 0.001 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC:TGTAAATCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.1666666666667 0 34.49999999999999 0.0125789112103712 0 -Inf 0.0125789112103712 0.012791106366644 0 NA NA 0.0123288813720262 0.307595681041978 624 376 0 0 0.624 0.001 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 34.49999999999999 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0125012599132988 0 NA NA 0.0138538002531914 0.359848239330086 655 345 0 0 0.655 0.001 ORF3a all ss13 136 AAG CCA AGA 2 TCCAAGAAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 35.16666666666666 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0129549966175666 0 NA NA 0.0135750750693002 0.350069425903476 639 361 0 0 0.639 0.001 ORF3a all ss13 137 AAC AGA ACC 2 AAGAACCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.1666666666667 0 34.33333333333332 0.0125789112103712 0 -Inf 0.0125789112103712 0.0126602565823475 0 NA NA 0.0130058079989611 0.333455832811557 644 356 0 0 0.644 0.001 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 34.33333333333332 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0123609526624833 0 NA NA 0.0124074191222642 0.306593659723678 620 380 0 0 0.62 0.001 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 34.33333333333332 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0129849964310195 0 NA NA 0.0127679514058002 0.320453680912819 600 400 0 0 0.6 0.001 ORF3a all ss13 140 CTT TAC TTT 2 TTACTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.1666666666667 0 35.33333333333332 0.0129035440872231 0 -Inf 0.0129035440872231 0.0134489829757749 0 NA NA 0.0132308030299681 0.329428640728172 645 355 0 0 0.645 0.001 ORF3a all ss13 141 TAT TTT ATG 2 CTTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.1666666666667 0 35.33333333333332 0.0129035440872231 0 -Inf 0.0129035440872231 0.0126609568104227 0 NA NA 0.0134905701572084 0.33882665681225 617 383 0 0 0.617 0.001 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000003 0 36.41666666666666 0.0129732964431592 0 -Inf 0.0129732964431592 0.0134952293328583 0 NA NA 0.0131190127917472 0.322715625305243 632 368 0 0 0.632 0.001 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.4166666666667 1 36.74999999999999 0.0130296436641525 0.0277167798918218 0.470099474578469 -0.0146871362276693 0.0134539155687353 0.0294611440817364 NA NA 0.0347198194406564 0.672281547288561 266 136 598 0.598 0.266 0.532 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333337 2 37.24999999999999 0.0130014090011593 0.0557100557871529 0.233376341442429 -0.0427086467859935 0.0133170527850437 0.043109772107518 NA NA 0.0473958854880567 0.367532748301374 133 46 821 0.821 0.133 0.266 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333337 2 37.24999999999999 0.0130014090011593 0.0557100557871529 0.233376341442429 -0.0427086467859935 0.0129968168819881 0.0426380361845177 NA NA 0.0441938847246117 0.333847724536301 136 42 822 0.822 0.136 0.272 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTG 2 TACTTTGTT 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333337 2 37.24999999999999 0.0131726767040263 0.0557100557871529 0.23645061053886 -0.0425373790831266 0.0136982244384407 0.044027474278603 NA NA 0.0484065154152197 0.379535120326853 134 44 822 0.822 0.134 0.268 ORF3a all ss13 147 GTT TTG TTT 2 TTTGTTTGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.08333333333337 2 36.25 0.0130864825012098 0.0573071018565008 0.228357081012033 -0.044220619355291 0.0131948849287498 0.0448038769656504 NA NA 0.0473123417563904 0.349967186362264 143 56 801 0.801 0.143 0.286 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333336 2 37.24999999999999 0.0132600139021293 0.0557100557871529 0.23801832029734 -0.0424500418850236 0.0125218648667113 0.0438070940436672 NA NA 0.0476379335055489 0.372876883657148 124 55 821 0.821 0.124 0.248 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333336 2 37.41666666666666 0.0132600139021293 0.0554524994575897 0.239123827272575 -0.0421924855554604 0.0141555750860866 0.0411011912017454 NA NA 0.0469614833771983 0.368946361869571 156 38 806 0.806 0.156 0.312 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.41666666666669 2 36.74999999999999 0.0132016609860952 0.0564972895530332 0.233668926253586 -0.043295628566938 0.0132015835368945 0.0425880580874543 NA NA 0.0468703980489715 0.355626511016211 134 54 812 0.812 0.134 0.268 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000003 2 36.74999999999999 0.0133188849757348 0.0564972895530332 0.23574378666843 -0.0431784045772984 0.0137695610013746 0.0426620366838168 NA NA 0.0455767281571273 0.343446029704098 140 37 823 0.823 0.14 0.28 ORF3a all ss13 152 CAT CAC ATA 2 ACACATAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.75000000000003 2 35.74999999999999 0.0131438194165355 0.0581404786806199 0.226070024100383 -0.0449966592640844 0.0139882751380502 0.043685111228415 NA NA 0.045980322049482 0.327774261105272 121 42 837 0.837 0.121 0.242 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 CATAACTAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000003 2 36.58333333333333 0.0134081783305544 0.0567646707244323 0.236206396680169 -0.0433564923938779 0.0135213615821972 0.0458192009503782 NA NA 0.0464977770610944 0.351108012755588 122 41 837 0.837 0.122 0.244 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333336 2 36.58333333333333 0.0135291154422588 0.0567646707244323 0.238336896340626 -0.0432355552821735 0.0139697223173665 0.0441432428159683 NA NA 0.0457504940781871 0.344643941231724 149 37 814 0.814 0.149 0.298 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000003 2 36.58333333333333 0.0134081783305544 0.0567646707244323 0.236206396680169 -0.0433564923938779 0.0132755651812469 0.0444879942910233 NA NA 0.0454928623017319 0.340570083770391 128 31 841 0.841 0.128 0.256 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333336 2 36.58333333333333 0.0135291154422588 0.0567646707244323 0.238336896340626 -0.0432355552821735 0.0136419996980419 0.0449832373528031 NA NA 0.0438859953636718 0.324536218192255 151 41 808 0.808 0.151 0.302 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333336 2 36.58333333333333 0.0135291154422588 0.0567646707244323 0.238336896340626 -0.0432355552821735 0.0133997836988327 0.0446527709785873 NA NA 0.0431843542758312 0.316737068695394 128 52 820 0.82 0.128 0.256 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666669 2 36.25 0.013559691378237 0.0573071018565008 0.23661450219889 -0.0437474104782638 0.0147878860972995 0.0432124047576532 NA NA 0.0472012201471549 0.354015866592808 133 51 816 0.816 0.133 0.266 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666669 2 36.416666666666664 0.0136522540928075 0.0570345959917882 0.23936794598796 -0.0433823418989808 0.014521088049172 0.0429407250367072 NA NA 0.0481623082101394 0.36771968096211 141 58 801 0.801 0.141 0.282 ORF3a all ss13 160 TAT CAT ATA 2 CCATATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333336 2 36.416666666666664 0.0135291154422588 0.0570345959917882 0.237208929194601 -0.0435054805495295 0.0137974241646809 0.0428902438045017 NA NA 0.0504068060622112 0.388089400180628 152 44 804 0.804 0.152 0.304 ORF3a all ss13 161 AAC ATA ACA 2 TATAACAGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333336 2 36.416666666666664 0.0135291154422588 0.0570345959917882 0.237208929194601 -0.0435054805495295 0.0135130014153987 0.0447104656661892 NA NA 0.0468557732613486 0.353149428833993 139 44 817 0.817 0.139 0.278 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000003 2 36.083333333333336 0.0135904058348962 0.0575822255219405 0.236017377093524 -0.0439918196870443 0.0139669942363079 0.043029084947505 NA NA 0.0473063003704727 0.35240435412689203 139 58 803 0.803 0.139 0.278 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333336 2 36.083333333333336 0.0137146678675636 0.0575822255219405 0.238175369973117 -0.0438675576543768 0.0136906390390958 0.0462207931610353 NA NA 0.0456166914454583 0.336222512626338 139 42 819 0.819 0.139 0.278 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000003 2 36.083333333333336 0.0135904058348962 0.0575822255219405 0.236017377093524 -0.0439918196870443 0.0137999272617989 0.0439046942435716 NA NA 0.048506608766979 0.364446857343378 126 44 830 0.83 0.126 0.252 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333336 2 35.75 0.0135291154422588 0.0581404786806199 0.232697008164958 -0.0446113632383612 0.0140114087216377 0.0436632011285892 NA NA 0.0466869096353824 0.339303024276297 125 43 832 0.832 0.125 0.25 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.4166666666667 2 35.916666666666664 0.013559691378237 0.0578600049104132 0.234353443267624 -0.0443003135321762 0.0138706345375465 0.046750582194904 NA NA 0.0453003028397354 0.328111256982015 114 47 839 0.839 0.114 0.228 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.4166666666667 2 35.916666666666664 0.013559691378237 0.0578600049104132 0.234353443267624 -0.0443003135321762 0.012890041389635 0.0457526572059801 NA NA 0.0456448525591629 0.331775668662267 133 45 822 0.822 0.133 0.266 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCG 2 ATTGTCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333337 2 36.25 0.0137146678675636 0.0573071018565008 0.239318817795143 -0.0435924339889372 0.0136971003128388 0.0441311808836226 NA NA 0.0473200388194257 0.356932624072406 124 38 838 0.838 0.124 0.248 ORF3a all ss13 169 GTT TCG TTA 2 GTCGTTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333337 2 35.916666666666664 0.0135291154422588 0.0578600049104132 0.233824996441089 -0.0443308894681545 0.0145386093532646 0.0448743218463356 NA NA 0.0483401658535609 0.359110582580647 138 43 819 0.819 0.138 0.276 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTG 2 GTTACTGAA:GTTACTGCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000003 2 35.25000000000001 0.0134081783305544 0.0589984642956841 0.227263175247347 -0.0455902859651297 0.0133902407622208 0.0458656092891076 NA NA 0.0503498554978465 0.365216421868973 146 49 805 0.805 0.146 0.292 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTGCAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000003 2 35.25000000000001 0.0134081783305544 0.0589984642956841 0.227263175247347 -0.0455902859651297 0.0129388606006252 0.0430984643147699 NA NA 0.0482110942428554 0.344332797937075 112 47 841 0.841 0.112 0.224 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:GCAGGTGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.9166666666667 2 35.25000000000001 0 0.0589984642956841 0 -0.0589984642956841 0 0.0445152267547301 NA NA 0.0437672162221252 0.177656495252696 0 127 873 0.873 0 0.001 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.58333333333336 2 35.25000000000001 0 0.0589984642956841 0 -0.0589984642956841 0 0.0462574439316489 NA NA 0.0439260415267245 0.17922929230311 0 125 875 0.875 0 0.001 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333336 2 35.583333333333336 0 0.058423686245627 0 -0.058423686245627 0 0.0428619539591929 NA NA 0.0447924489281128 0.192124504576446 0 121 879 0.879 0 0.001 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TTT 2 GGCATTTCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333336 2 35.583333333333336 0 0.058423686245627 0 -0.058423686245627 0 0.0453067732101038 NA NA 0.0443597075252044 0.187823879270861 0 105 895 0.895 0 0.001 ORF3a all ss13 176 TCA TTT CAA 2 ATTTCAACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.4166666666667 2 35.916666666666664 0 0.0578600049104132 0 -0.0578600049104132 0 0.0434184698613959 NA NA 0.0438706105882761 0.187209736330373 0 128 872 0.872 0 0.001 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 TCAACACCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.9166666666667 2 36.08333333333333 0 0.0575822255219405 0 -0.0575822255219405 0 0.04615026924805 NA NA 0.0446408430620888 0.197085364794143 0 125 875 0.875 0 0.001 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.58333333333336 2 36.08333333333333 0 0.0575822255219405 0 -0.0575822255219405 0 0.0456145658228207 NA NA 0.0450240399234465 0.200924600183171 0 153 847 0.847 0 0.001 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.58333333333336 2 36.08333333333333 0 0.0575822255219405 0 -0.0575822255219405 0 0.0448750776452701 NA NA 0.0449935470327093 0.200619518062511 0 136 864 0.864 0 0.001 ORF3a all ss13 180 CTC AAC TCA 2 AAACTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.41666666666669 2 36.58333333333333 0 0.0567646707244323 0 -0.0567646707244323 0 0.0452946367893107 NA NA 0.0437392713144084 0.194357292307805 0 128 872 0.872 0 0.001 ORF3a all ss13 181 AAA TCA AAG 2 CTCAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.08333333333336 2 36.58333333333333 0 0.0567646707244323 0 -0.0567646707244323 0 0.0430207089758297 NA NA 0.0450165537119727 0.207318479518128 0 132 868 0.868 0 0.001 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.41666666666669 2 36.58333333333333 0 0.0567646707244323 0 -0.0567646707244323 0 0.0443417069079141 NA NA 0.0454801932014103 0.211987662641715 0 123 877 0.877 0 0.001 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333334 2 37.08333333333333 0 0.0559700169039056 0 -0.0559700169039056 0 0.0446349443249897 NA NA 0.042767363855278 0.190633077251934 0 141 859 0.859 0 0.001 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.91666666666667 2 38.08333333333333 0 0.0544456664773409 0 -0.0544456664773409 0 0.042845250036754 NA NA 0.0409587542521419 0.183755500382589 0 128 872 0.872 0 0.001 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25 2 37.416666666666664 0 0.0554524994575896 0 -0.0554524994575896 0 0.0415205191518128 NA NA 0.0429876592167718 0.197063427339359 0 121 879 0.879 0 0.001 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25 2 37.416666666666664 0 0.0554524994575896 0 -0.0554524994575896 0 0.0457591084146814 NA NA 0.0427735288414291 0.19483049367954 0 149 851 0.851 0 0.001 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.75 2 37.416666666666664 0 0.0554524994575896 0 -0.0554524994575896 0 0.0412645726618905 NA NA 0.0420587075709653 0.18735148962906 0 142 858 0.858 0 0.001 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666667 2 37.74999999999999 0 0.0549444688504895 0 -0.0549444688504895 0 0.044328065432131 NA NA 0.0451180096195619 0.223302033760446 0 136 864 0.864 0 0.001 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333334 2 37.24999999999999 0 0.0557100557871529 0 -0.0557100557871529 0 0.0403268716589627 NA NA 0.0445878392125164 0.211502333371988 0 136 864 0.864 0 0.001 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.91666666666667 2 36.58333333333333 0 0.0567646707244323 0 -0.0567646707244323 0 0.0426369509022463 NA NA 0.0454919376715391 0.212105670321797 0 131 869 0.869 0 0.001 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGA 2 TCTGAGAAT:TCTGAGGAT 1:1 FALSE 1.25 0.333333333333333 1.41666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333333 2 37.41666666666666 0 0.0554524994575897 0 -0.0554524994575897 0 0.043347298712666 NA NA 0.041965121902033 0.18636971456933 0 122 878 0.878 0 0.001 ORF3a all ss13 192 AAT AGA ATA 2 GAGAATTGG:GAGGATAGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333333 2 35.999999999999986 0 0.0577207808520962 0 -0.0577207808520962 0 0.0461992128609057 NA NA 0.0441280984585142 0.190863870196572 0 128 872 0.872 0 0.001 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 AATTGGCAC:GATAGGCAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72 1 37.16666666666666 0 0.027400307499342 0 -0.027400307499342 0 0.0284740883634906 NA NA 0.028191811027449 0.331088186849071 0 384 616 0.616 0 0.001 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCACTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.5 0 37.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333333 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.5 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333333 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333334 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000001 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTC:TATGTCGTT 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666667 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 202 GTC TCG TCG 2 GTCGTCGTA:GTCGTTGTA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 0 36.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 203 GTA TCG TAC 2 GTCGTACAT:GTTGTACAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333334 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 GTACATGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666667 0 37.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC:TATTTCACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5 1 36.83333333333332 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0298001630350477 NA NA 0.0280941631143334 0.324971229519351 0 362 638 0.638 0 0.001 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA:TTCACTGAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333334 1 37.16666666666666 0 0.027400307499342 0 -0.027400307499342 0 0.0298776712806215 NA NA 0.0299691706025941 0.360568085708056 0 325 675 0.675 0 0.001 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT:ACTGAAGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0291008777602695 NA NA 0.029332253732265 0.343581289102734 0 377 623 0.623 0 0.001 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 35.999999999999986 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.031129276337829 NA NA 0.0298689078463874 0.343308081248945 0 363 637 0.637 0 0.001 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333334 1 35.999999999999986 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.029645519466237 NA NA 0.0294679006594789 0.336780971344067 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333334 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0300325963768417 NA NA 0.0306925818157298 0.351852030431587 0 354 646 0.646 0 0.001 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666667 1 35.33333333333332 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0312233570410937 NA NA 0.030569812837824 0.345306617009487 0 358 642 0.642 0 0.001 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76 1 34.66666666666665 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0325965257654918 NA NA 0.0332169700693035 0.375856056108357 0 350 650 0.65 0 0.001 ORF3a all ss13 215 GAG TTG AGT 2 CTTGAGTCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333334 1 34.33333333333332 0 0.0297068535712844 0 -0.0297068535712844 0 0.0303846765554414 NA NA 0.0304578731596526 0.329390470081483 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 216 TCT AGT CTA 2 GAGTCTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333334 1 33.83333333333332 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.033339840863023 NA NA 0.0318313786404408 0.343470721540458 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666669 1 33.16666666666665 0 0.0307735475083969 0 -0.0307735475083969 0 0.0327003830528924 NA NA 0.0322225615401384 0.339561983675952 0 373 627 0.627 0 0.001 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333336 1 32.999999999999986 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.0328152364540732 NA NA 0.0318305676444167 0.331161416564368 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666669 1 34.499999999999986 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.029394858779523 NA NA 0.030382157356944 0.330575594273532 0 373 627 0.627 0 0.001 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CTA 2 ATTACTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 1 35.333333333333314 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0311964959301757 NA NA 0.0308709726960671 0.350032898080211 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 1 35.99999999999998 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0291011424023131 NA NA 0.0300660558647872 0.34648183658078 0 375 625 0.625 0 0.001 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 1 36.33333333333331 0 0.0280406490537152 0 -0.0280406490537152 0 0.0289416611606067 NA NA 0.0299593563857534 0.349295675986275 0 355 645 0.645 0 0.001 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0284401907598181 NA NA 0.0283240830125454 0.331138087835242 0 341 659 0.659 0 0.001 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.028530612614475 NA NA 0.0310415468618683 0.37080828181319 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0302076644273447 NA NA 0.0293886202609479 0.337753522463786 0 356 644 0.644 0 0.001 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0300694107035034 NA NA 0.0299477936194565 0.337698285194573 0 348 652 0.652 0 0.001 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTT TCT TTA 2 ATCTTTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TTA ACA 2 TTTAACAAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAAGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:AAAGATCCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA---:GATCCG--- 1:1 FALSE 0.166666666666667 0 1.83333333333333 1 0 0 0 1 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG:CCG---CCG 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C CGA 0 ---CCGAAT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT CGA ATG 2 CCGAATGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.08333333333336 4 33.58333333333332 0.0882289030696765 0.129702340924675 0.680241408448564 -0.0414734378549981 0.0427648310452717 0.0725576115398366 NaN NaN 0.083757304114782 0.620485741196584 310 0 690 0.69 0.31 0.62 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.41666666666669 5 33.91666666666666 0.0891034205520704 0.164139760909006 0.542850922035073 -0.0750363403569358 0.0434008039818921 0.0868725890144187 NaN NaN 0.0954948831921676 0.432006380840278 209 0 791 0.791 0.209 0.418 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 70.75000000000001 5 34.249999999999986 0.0899954688835902 0.162356129339379 0.554309031939715 -0.0723606604557887 0.0428713393985104 0.0804374454246245 NaN NaN 0.0960284352252578 0.451129278519768 207 0 793 0.793 0.207 0.414 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA:TTTATGAGT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 70.91666666666667 5 34.08333333333332 0.0897707844932621 0.163243053958072 0.549921006233558 -0.0734722694648103 0.0456057315353057 0.0854278507167035 NaN NaN 0.0907781053271849 0.418307456275004 203 0 797 0.797 0.203 0.406 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAT 2 ATGAGATTT:ATGAGTATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.25 5 34.74999999999999 0.0893247686558477 0.15975246858483 0.559144841060253 -0.0704276999289821 0.0432514477153355 0.0823187756793501 NaN NaN 0.0917149190751399 0.442547805154734 198 0 802 0.802 0.198 0.396 ORF3a all ss13 7 ATT GAT TTT 2 AGATTTTTT:AGTATTTTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.91666666666666 5 35.08333333333332 0.0729614963194686 0.158062767299149 0.461598247115225 -0.0851012709796799 0.038159398726157 0.0796184186646108 NaN NaN 0.088389629908638 0.335649403867169 148 0 852 0.852 0.148 0.296 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACA:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.5 5 34.66666666666666 0.0573071018565008 0.160180575223544 0.35776561406727603 -0.102873473367043 0.0353414325852904 0.0851451435439688 NA NA 0.0845213311370399 0.223554642851532 85 2 913 0.913 0.085 0.17 ORF3a all ss13 9 ACA TCA CAC 2 TTCACACTT:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.33333333333333 5 34.499999999999986 0.0566306643811089 0.161043735636461 0.351647731948709 -0.104413071255352 0.034940193298949 0.0840261143208972 NaN NaN 0.0897513347840537 0.244683659319475 71 1 928 0.928 0.071 0.142 ORF3a all ss13 10 CTT CAC TTA 2 ACACTTGGC:ACTCTTAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.83333333333334 5 34.99999999999999 0.0570345959917882 0.158481820250405 0.359881000241366 -0.101447224258617 0.036038034621727 0.0817871608073406 NA NA 0.0851628961217379 0.233569630429054 80 1 919 0.919 0.08 0.16 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAT 2 CTTAGATCA:CTTGGCTCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.916666666666667 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.83333333333334 6 34.99999999999999 0.0570345959917882 0.194633396613814 0.293036020457243 -0.137598800622025 0.0343826001273121 0.0932543402880998 NA NA 0.0971042653190171 0.156476735183846 47 0 953 0.953 0.047 0.094 ORF3a all ss13 12 TCA GAT CAA 2 AGATCAATT:GGCTCAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.83333333333334 5 35.58333333333333 0.0423642016009181 0.155594424961324 0.272273261792307 -0.113230223360406 0.0332398526005333 0.0763078754709023 NaN NaN 0.0908299422683531 0.212537669600771 62 2 936 0.936 0.062 0.124 ORF3a all ss13 13 ATC CAA TCA 2 TCAATCACA:TCAATTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.16666666666667 6 35.24999999999999 0.0421656696333547 0.193059006111768 0.218408198004208 -0.150893336478414 0.0318564685778682 0.0923100881003248 0.296939684607936 0.462016465107954 0.0957009402852538 0.114860567924757 30 0 970 0.97 0.03 0.06 ORF3a all ss13 14 ACA TCA CAC 2 ATCACACGT:ATTACTGCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.83333333333334 6 35.08333333333332 0.0423642016009181 0.194105738514483 0.218253215619162 -0.151741536913565 0.0319420085328747 0.0904191547801199 0.347201863139513 0.529606953503952 0.100138803339968 0.129693394271623 38 0 962 0.962 0.038 0.076 ORF3a all ss13 15 CGT CAC CAC 2 ACACGTCAA:ACTGCACAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 2 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.33333333333334 6 34.58333333333332 0.0420670999882827 0.19731556308439 0.213197070371438 -0.155248463096108 0.0322227886638386 0.0947588701956442 NaN NaN 0.104629461201124 0.13786384226935 43 0 957 0.957 0.043 0.086 ORF3a all ss13 16 CAA CAC AAC 2 CGTCAACCG:GCACAGCCA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.33333333333334 7 34.91666666666666 0.0137618540011474 0.233267379251205 0.0589960501349281 -0.219505525250058 0.0143548360206971 0.106830854825801 NaN NaN 0.109781354603585 0.045556539859555 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 17 CCA AAC CAG 2 CAACCGAGT:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666667 8 35.08333333333332 0.0137934922285677 0.271845168498986 0.0507402515363047 -0.258051676270418 0.0134910000220187 0.120299050883295 0.0924942379539992 0.583295476928429 0.120772458596481 0.0326243112258092 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 18 AGT CAG GTA 2 CCAGTAAAA:CCGAGTAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.66666666666667 8 35.24999999999999 0.01369901098297 0.270297617029844 0.0506812125593304 -0.256598606046874 0.0134903024756259 0.120464066821447 0.08419704466987 0.547216895645369 0.11553782538549 0.0263573543195392 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 19 AAA GTA AAA 2 AGTAAGATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.5 7 34.99999999999999 0.0137303605832671 0.23261619622788 0.0590258150804612 -0.218885835644613 0.0138987961841908 0.105518765739466 0.0861916066316773 0.493456934504305 0.106129280159883 0.0391653597202988 4 0 996 0.996 0.004 0.008 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTG 2 AAAATTGAC:AAGATTGAA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666666 7 34.41666666666666 0.013559691378237 0.237252996159118 0.0571528772987253 -0.223693304780881 0.0137436743214463 0.106261978346067 0.0836843832246912 0.494633697286008 0.111927263398437 0.0456560271911498 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 21 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:ATTGACAAT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25 7 34.74999999999999 0.0135904058348962 0.234580833893542 0.0579348517494988 -0.220990428058646 0.0131394251611647 0.1067966019806 NA NA 0.103798631176879 0.0332517558547252 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 22 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666667 7 34.49999999999999 0 0.236579217337834 0 -0.236579217337834 0 0.109786413205665 0 NaN 0.106843515076445 0.0268109656962288 0 2 998 0.998 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTT 2 AATGCTTCT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666667 7 34.83333333333332 0 0.233922247929282 0 -0.233922247929282 0 0.102995354435275 0 NaN 0.108376147458809 0.0308944727219019 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 24 TCT CTT CTC 2 GCTTCTCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666667 7 35.66666666666666 0 0.227535736496164 0 -0.227535736496164 0 0.106460292288212 0 NaN 0.104151554378013 0.0289137838974994 0 1 999 0.999 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333334 8 35.08333333333332 0 0.271845168498986 0 -0.271845168498986 0 0.121618573190031 0 NaN 0.122068363039566 0.0259478629077364 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666667 8 34.666666666666664 0 0.275793585093988 0 -0.275793585093988 0 0.119315102265913 0 NaN 0.126311997361317 0.0290040534391064 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 27 AGT CAA GTA 2 GCAAGTACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333334 8 33.99999999999999 0 0.282358178426184 0 -0.282358178426184 0 0.125133746246167 0 NaN 0.129279619719153 0.0289557184468287 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 28 ACT GTA CTG 2 AGTACTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000001 9 34.666666666666664 0 0.318662395473949 0 -0.318662395473949 0 0.13059149292499 0 NaN 0.127650008982182 0.0125469592206016 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 9 33.83333333333333 0 0.328506491880477 0 -0.328506491880477 0 0.142385878483564 0 NaN 0.141908193208032 0.0206171650936519 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000001 10 33.33333333333333 0 0.383119217824493 0 -0.383119217824493 0 0.15909958195002 0 NaN 0.163735637465687 0.0192907334013356 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CATGCTACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 11 33.666666666666664 0 0.429051936755032 0 -0.429051936755032 0 0.172171662477932 0 NaN 0.16933527573335 0.0112851717154335 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666669 11 33.666666666666664 0 0.429051936755032 0 -0.429051936755032 0 0.179263036571087 NA NA 0.166733876282459 0.0100741438138957 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 11 33.49999999999999 0 0.431937817010051 0 -0.431937817010051 0 0.184813937082095 0 NaN 0.190705966631364 0.0235162828788662 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.6666666666667 11 33.166666666666664 0 0.437830967559119 0 -0.437830967559119 0 0.198553012061137 0 NaN NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.75000000000003 11 32.33333333333333 0 0.453314298713446 0 -0.453314298713446 0 0.205004956992407 0 NaN 0.188080837778318 0.015943344672414 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGC 2 ATACCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.9166666666667 11 31.33333333333333 0 0.473453832631393 0 -0.473453832631393 0 0.209536764139391 0 NaN 0.203397829755452 0.0199268102034978 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 37 CTA CGC TAC 2 CCGCTACAA 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 11 30.83333333333333 0 0.484233634931207 0 -0.484233634931207 0 0.205834672262955 0 NaN 0.241269173839558 0.0447468372386215 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 CTACAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333337 11 31.499999999999993 0 0.469969873663787 0 -0.469969873663787 0 0.205930994986356 NA NA 0.197991136220706 0.0176112588377542 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 11 32.16666666666666 0 0.456547379060522 0 -0.456547379060522 0 0.197456184260218 0 NaN 0.200271184879116 0.0226287002415555 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 11 32.16666666666666 0 0.456547379060522 0 -0.456547379060522 0 0.196258727049101 0 NaN 0.203581391967237 0.024923967881423 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.6666666666667 11 31.833333333333325 0 0.463158329862746 0 -0.463158329862746 0 0.205497792088266 0 NaN 0.201803970294914 0.0217279512431251 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333336 11 32.16666666666666 0 0.456547379060522 0 -0.456547379060522 0 0.213543322043071 0 NaN 0.210645337664656 0.030206293507884 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCA 2 CCTTTCAGA:CCTTTCGGA 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 11 31.999999999999993 0 0.459828354664807 0 -0.459828354664807 0 0.212588648701459 0 NaN 0.195705054824232 0.0187936575949954 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 44 AGA TCA GAT 2 TTCAGATGG:TTCGGATGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.75 0.25 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.58333333333336 11 31.333333333333325 0 0.473453832631394 0 -0.473453832631394 0 0.227179845152751 0 NaN 0.209437092289271 0.0237839366057962 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 AGATGGCTT:GGATGGCTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.4166666666667 10 31.416666666666657 0 0.414260875430664 0 -0.414260875430664 0 0.175827570872488 0 NaN 0.198070525022818 0.0364849065326617 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTG 2 TGGCTTGTT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.75000000000003 10 31.083333333333325 0 0.420214690450793 0 -0.420214690450793 0 0.169863659306238 0 NaN NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 47 GTT TTG TTA 2 CTTGTTATT:CTTGTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666669 10 30.66666666666666 0 0.42790864385071 0 -0.42790864385071 0 0.194400912183131 0 NaN 0.18646507532979 0.0217419478237359 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 GTTATTGGC:GTTGTTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000003 10 30.16666666666666 0.0128482799476378 0.437532385818425 0.0293653232631099 -0.424684105870787 0.0128436826106279 0.185090119485376 0.0390465893464019 0.452015820083241 0.197023938781371 0.0311231230646181 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333337 9 30.833333333333325 0.0130014090011593 0.369726004774488 0.035164983888784 -0.356724595773329 0.0124491514324337 0.175980723991429 0.0565414531400018 0.533986060747375 0.165653277890175 0.0312840195090097 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.75000000000003 9 31.66666666666666 0.0131438194165355 0.357254585771116 0.0367911846062529 -0.344110766354581 0.0137278398373752 0.163423270430316 0.0607886214081764 0.545025231307229 0.163709873097587 0.035557228592513 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAC 2 GTTGCACTT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.41666666666669 9 31 0.0130296436641525 0.367161168989029 0.0354875318107015 -0.354131525324877 0.0127018736599611 0.164438436211458 0.0439537283178217 0.419445349954711 0.1668550564955 0.0338049902030554 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 52 CTT CAC TTC 2 GCACTTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000001 9 31.666666666666668 0.0129732964431592 0.357254585771116 0.0363138696041005 -0.344281289327957 0.0128216929179942 0.154593581127744 0.0528722729266867 0.492194554330445 0.157735358987482 0.0290614974640888 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 CTTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.08333333333336 8 31.666666666666668 0.0129174344873365 0.308056623906756 0.041932013418567 -0.29513918941942 0.0126616333966656 0.1410443020648 0.057812638492118 0.468262629843409 0.13618237936142 0.0302169564150819 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.41666666666669 8 31.333333333333332 0.0128620515547158 0.312120297918684 0.041208635389893 -0.299258246363968 0.0134304564563441 0.141275702881813 0.0624786847338001 0.50953423641249 0.139304783776733 0.0316957560811401 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.25000000000003 8 31.166666666666664 0.0127256499425275 0.314193196111627 0.0405026273643631 -0.301467546169099 0.012775288563594 0.136472581287319 0.0627629189927622 0.518715080966712 0.138052409499692 0.0289829684956226 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.58333333333336 8 30.5 0.012513324680928 0.322771994797419 0.0387683097747739 -0.310258670116491 0.0117356227501066 0.139354505223072 NaN NaN 0.137671629708469 0.0242204810284107 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAGC:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.58333333333336 8 30.166666666666664 0.012513324680928 0.327242322351052 0.0382387112737339 -0.314728997670124 0.0129922247771069 0.144390106340332 0.057491365311145 0.505973138569585 0.136472433224716 0.0211009852397398 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 58 AGC AAA GCG 2 CAAAGCGCT:CAGAGCGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.66666666666669 8 30.416666666666664 0.0126585283405138 0.32387790933552 0.0390842597646888 -0.311219380995006 0.0131337904315452 0.142019319724962 0.0666982375149079 0.557884657402637 0.154124196307609 0.0434584800194612 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000003 9 31.083333333333332 0.0128482799476378 0.365892312067182 0.035114921860612 -0.353044032119544 0.013096683274945 0.159768068005171 0.0469510729860981 0.454517723317468 0.151583290583296 0.0198567772602736 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.6666666666667 9 30.916666666666664 0.0128208250194751 0.368439033844524 0.0347976838547602 -0.355618208825049 0.0134894679311447 0.146711841156983 0.0467321921706162 0.456502005383265 0.156449415806038 0.0230228341709381 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCCAAAGTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.6666666666667 8 29.916666666666664 0.0126585283405138 0.330678508474864 0.0382804688423712 -0.31801998013435 0.0128080715541183 0.138327980828663 0.0585652765710297 0.51334529169466 0.158001305985184 0.0441390368588152 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAAGTGATT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.00000000000003 8 29.58333333333333 0.0129313548258795 0.33537582899551 0.0385578020473641 -0.32244447416963 0.0130944489121493 0.149399850009653 NaN NaN 0.148449857302959 0.0298498791237668 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 63 ATT TAA TTG 2 ATAATTGCG:GTGATTGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.66666666666669 7 29.249999999999996 0.0128208250194751 0.288242003650766 0.0444793779431562 -0.275421178631291 0.0135799921067228 0.13271285917304 0.0734453483395595 0.544772489407603 0.130298725646802 0.0345351516770534 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 64 GCG TTG CGC 2 ATTGCGCTC:ATTGCGTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333336 7 29.583333333333332 0.0127934871784325 0.284292259601151 0.045001180110852 -0.271498772422718 0.0125137665465521 0.13377903711059 0.0767271144524786 0.55753319182794 0.123615416239633 0.0280691852414159 1 1 998 0.998 0.001 0.002 ORF3a all ss13 65 CTC CGC TCA 2 GCGCTCAAT:GCGTTTCAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.16666666666669 7 29.583333333333332 0.025698445480572 0.284292259601151 0.0903944606744686 -0.258593814120579 0.0176743297395877 0.13570657602311 NaN NaN 0.127771786270835 0.0429832643759457 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 66 AAT TCA ATA 2 CTCAATAAA:TTTCATAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.50000000000001 6 28.583333333333332 0.0255888359187695 0.246256582903472 0.103911276673566 -0.220667746984703 0.017573544166824 0.117536214892728 NaN NaN 0.126063904886101 0.0800418098412847 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 67 AAA ATA AAA 2 AATAAAAGA:CATAAGAGG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.16666666666669 5 27.916666666666664 0.0253723983888037 0.20465023999998 0.123979323888436 -0.179277841611177 0.0177237743002759 0.109470575915207 NA NA 0.105330842486257 0.0887469190188801 10 1 989 0.989 0.01 0.02 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AAGAGGTGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.75 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.00000000000001 5 27.666666666666664 0.0517446536152136 0.206779411053799 0.250240840475897 -0.155034757438585 0.0327529616456007 0.107027187260439 NaN NaN 0.111859717002563 0.165754575193009 45 0 955 0.955 0.045 0.09 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAG:AGGTGGCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.16666666666669 6 28.249999999999996 0.0523087754921291 0.249703998029926 0.209483131647176 -0.197395222537797 0.0322508791913321 0.118544458755757 NaN NaN 0.12935025222777 0.126996892772654 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 70 CAG GGC AGC 2 TGGCAGCTA:TGGCAGCTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.50000000000003 6 28.58333333333333 0.0665625029345024 0.246256582903472 0.270297354692823 -0.17969407996897 0.0359388074826673 0.112456613231547 0.304471122981607 0.374669738878267 0.12683047644057 0.156539885674072 36 0 964 0.964 0.036 0.072 ORF3a all ss13 71 CTA AGC TAG 2 CAGCTAGCC:CAGCTCGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.16666666666669 7 28.58333333333333 0.0809774510729234 0.29648455248311 0.273125363175663 -0.215507101410186 0.0387231773717775 0.130450297171016 0.264357174265793 0.301525302749447 0.140696339714574 0.125592064326263 25 0 975 0.975 0.025 0.05 ORF3a all ss13 72 GCC TAG CCC 2 CTAGCCCTT:CTCGCTCTG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.66666666666669 7 28.749999999999996 0.0804341477651982 0.294379472599244 0.273232868633805 -0.213945324834046 0.0369361592554132 0.139748397127748 0.280193547656093 0.329482088400958 0.135313130202468 0.113852244049082 23 0 977 0.977 0.023 0.046 ORF3a all ss13 73 CTG CCC TGC 2 GCCCTTTAT:GCTCTGCAC 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.33333333333336 7 28.249999999999996 0.0797209939872174 0.300787567424286 0.265040854812873 -0.221066573437068 0.0386448022351033 0.136321927714153 NaN NaN 0.13544816938286 0.102655908564985 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 74 CAC TGC ACA 2 CTGCACAAA:CTTTATAAG 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.666666666666667 0.416666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.66666666666669 7 28.08333333333333 0.0934540638415831 0.30298689611095603 0.308442592868305 -0.209532832269373 0.0401131636264528 0.144335115976716 0.276305703440075 0.264289814049866 0.144768117211189 0.147793705313498 31 0 969 0.969 0.031 0.062 ORF3a all ss13 75 AAA ACA AAG 2 CACAAAGGC:TATAAGGGC 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.08333333333336 6 28.33333333333333 0.0941885460903394 0.248833044237754 0.378521053660158 -0.154644498147414 0.0416898726877857 0.11527270086139 NaN NaN 0.120485169323234 0.199311777431537 58 0 942 0.942 0.058 0.116 ORF3a all ss13 76 GGC AAG GCA 2 AAAGGCATT:AAGGGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.00000000000001 6 27.749999999999996 0.0955837099260903 0.255061761633985 0.374747313410521 -0.159478051707894 0.040516134012107 0.119246402442004 NaN NaN 0.121804000952636 0.190432545987293 70 0 930 0.93 0.07 0.14 ORF3a all ss13 77 ATT GCA TCC 2 GGCATTCAG:GGCTTCCAG 1:1 TRUE 1.5 0.5 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.00000000000001 6 27.41666666666666 0.0955837099260903 0.258764472899754 0.369384981079376 -0.163180762973663 0.0413645822646383 0.121119586012897 0.420193462660519 0.379356208249449 0.125310184576465 0.192843005340917 66 0 934 0.934 0.066 0.132 ORF3a all ss13 78 CAG TCC AGC 2 ATTCAGCTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.66666666666669 5 26.749999999999996 0.0947202939932191 0.214983142229521 0.44059405314717 -0.120262848236302 0.0409756394980938 0.109338008048688 NaN NaN 0.116947744385868 0.303786685602749 116 0 884 0.884 0.116 0.232 ORF3a all ss13 79 CTT AGC TCA 2 CAGCTTGTT:CAGTTCATT 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.50000000000001 5 27.249999999999996 0.0949346803392896 0.210428875701957 0.451148541390067 -0.115494195362668 0.0392492337283617 0.106957560955997 NaN NaN 0.105995570933461 0.275883473960222 132 0 868 0.868 0.132 0.264 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 CTTGTTTGC:TTCATTTGC 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.00000000000001 4 27.749999999999996 0.0955837099260903 0.160073332783954 0.597124507022646 -0.0644896228578632 0.0420520187787702 0.086490353441803 NaN NaN 0.0874627164272157 0.460916561635606 238 0 762 0.762 0.238 0.476 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT:GTTTGCAAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.66666666666669 3 27.41666666666666 0.0947202939932191 0.11827731107372 0.800832324757383 -0.0235570170805005 0.0427268297186663 0.0695855749482283 NaN NaN 0.0795833269461463 0.767226700668189 375 2 623 0.623 0.375 0.75 ORF3a all ss13 82 AAT GCA ATT 2 TGCAATTTA:TGCAATTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.50000000000001 3 28.08333333333333 0.0949346803392896 0.115242181679947 0.823784129694316 -0.0203075013406576 0.0410685137049648 0.0677116289585061 NA NA 0.0766415583929621 0.791034707358016 418 0 582 0.582 0.418 0.836 ORF3a all ss13 83 TTA ATT TAC 2 AATTTACTG:AATTTGCTG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.50000000000001 3 28.08333333333333 0.0949346803392896 0.115242181679947 0.823784129694316 -0.0203075013406576 0.042882062310441 0.0692368666781323 NaN NaN 0.0764932620577152 0.790639008776321 423 0 577 0.577 0.423 0.846 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG:TTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.66666666666669 3 28.08333333333333 0.0947202939932191 0.115242181679947 0.821923818279301 -0.0205218876867281 0.0407491663437206 0.0688284148701604 NaN NaN 0.0782887729371997 0.793220710066126 412 0 588 0.588 0.412 0.824 ORF3a all ss13 85 CTA TGC TAC 2 CTGCTACTC:CTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.08333333333336 3 29.08333333333333 0.0941885460903394 0.110971243090164 0.848765350982072 -0.0167826969998241 0.0413901062502107 0.0657259572524774 NaN NaN 0.0748483709090976 0.82258409192511 406 0 594 0.594 0.406 0.812 ORF3a all ss13 86 CTA TAC TAT 2 CTACTCTTT:CTGCTATTT 1:1 FALSE 1.25 1 0.5 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.25000000000003 3 29.41666666666666 0.093977517058638 0.109617210244414 0.857324473493679 -0.0156396931857758 0.0409460402841166 0.06426599519592 NaN NaN 0.0685723238771864 0.819587250085741 440 1 559 0.559 0.44 0.88 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:CTCTTTGTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.4166666666667 3 30.16666666666666 0.0937674327609405 0.106688419438138 0.878890448042584 -0.0129209866771978 0.0424063059042589 0.0626648180873727 NaN NaN 0.073468813005104 0.860395790750004 461 0 539 0.539 0.461 0.922 ORF3a all ss13 88 GTA TTG TAA 2 TTTGTAACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.58333333333336 3 29.166666666666664 0.0923227698874005 0.110629602831442 0.834521389614546 -0.0183068329440417 0.040724262738253 0.0680268797466627 NaN NaN 0.0734616234182015 0.803204011619733 433 0 567 0.567 0.433 0.866 ORF3a all ss13 89 ACA TAA CAA 2 GTAACAATT:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.25000000000003 3 29.499999999999996 0.0927309624185635 0.109283858386045 0.848533020228764 -0.0165528959674817 0.0409742860088115 0.0658336932989124 NaN NaN 0.0739660963277186 0.822920466674363 411 0 589 0.589 0.411 0.822 ORF3a all ss13 90 ATC CAA TCT 2 ACAATTTAC:ACCATCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.75000000000003 3 29.333333333333332 0.106254713938364 0.109952605643907 0.96636831220245 -0.00369789170554298 0.0436812349770961 0.0650568729813217 NaN NaN 0.0767333597757075 0.961563665901814 486 0 514 0.514 0.486 0.972 ORF3a all ss13 91 TAC TCT ACT 2 ATCTATTCA:ATTTACTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.08333333333336 3 29.666666666666664 0.107205575102587 0.108623210908842 0.986949052652804 -0.00141763580625469 0.0439243795291322 0.0692701980597806 NaN NaN 0.0750972892147327 0.984938969715825 501 0 499 0.499 0.501 0.998 ORF3a all ss13 92 TCA ACT CAC 2 TACTCACAC:TATTCACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.4166666666667 3 29.333333333333332 0.106728023137133 0.109952605643907 0.970672977799027 -0.00322458250677364 0.0436252262782115 0.0649277099971987 NaN NaN 0.0752089351620218 0.965801183765196 503 1 496 0.496 0.503 0.992 ORF3a all ss13 93 CAC CAC ACC 2 TCACACCTT:TCACATCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.9166666666667 3 28.499999999999996 0.104630738407805 0.113423227292943 0.92248070263043 -0.00879248888513795 0.0409131881360266 0.0669209872074721 NaN NaN 0.0745510380409493 0.906115842445789 504 0 496 0.496 0.504 0.992 ORF3a all ss13 94 CTT ACC TTC 2 CACCTTCTA:CATCTTTTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.58333333333337 3 28.166666666666664 0.105089635467852 0.114873729376874 0.914827402556743 -0.00978409390902217 0.0423363062800389 0.067381441282221 NaN NaN 0.0773717470490173 0.899371260033656 438 0 562 0.562 0.438 0.876 ORF3a all ss13 95 CTA TTC TAC 2 CTTCTACTT:CTTTTGCTT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 82.08333333333337 3 28.333333333333332 0.104402791930732 0.114143861506444 0.914659715843219 -0.00974106957571219 0.0422370753997515 0.0685085719156064 NaN NaN 0.07460552182953 0.896117314867519 452 0 548 0.548 0.452 0.904 ORF3a all ss13 96 CTT TAC TTG 2 CTACTTTTA:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.08333333333333 1 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.08333333333337 3 29.333333333333332 0.105785591121623 0.109952605643907 0.962101721028982 -0.00416701452228316 0.042236919480076 0.0683655467395184 NaN NaN 0.074719946547983 0.95552628058888 469 0 531 0.531 0.469 0.938 ORF3a all ss13 97 GTC TTG TAG 2 CTTGTCGCT:CTTTTAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.33333333333337 3 29.583333333333336 0.105436462965892 0.108952531416164 0.967728437287595 -0.00351606845027201 0.0417686846264572 0.0667367390357202 NaN NaN 0.0761435041219921 0.963169280392671 518 1 481 0.481 0.518 0.962 ORF3a all ss13 98 GCT TAG CTG 2 GTCGCTGCA:TTAGCTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.00000000000003 3 30.083333333333336 0.0918175614096642 0.107006075844546 0.858059326865263 -0.0151885144348816 0.0386651525519835 0.0657497061522206 NaN NaN 0.0699938948498076 0.828210134716878 436 0 564 0.564 0.436 0.872 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.50000000000003 3 29.08333333333334 0.0900437621201392 0.110971243090164 0.811415278523817 -0.0209274809700243 0.0387394324016316 0.0665179449080789 NaN NaN 0.0732875486299207 0.775220488945603 409 0 591 0.591 0.409 0.818 ORF3a all ss13 100 GGC CAG GCA 2 GCAGGTATG:GCTGGCATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 83.6666666666667 3 28.916666666666668 0.0887108757537488 0.11166090491713 0.794466745720775 -0.0229500291633808 0.0378780826010791 0.068340783587599 NaN NaN 0.0741093022980375 0.756805745615011 384 0 616 0.616 0.384 0.768 ORF3a all ss13 101 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAG:GGTATGGAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 84.00000000000004 3 29.25 0.0883372767422875 0.110290063467372 0.80095408385018 -0.0219527867250849 0.0404415899203799 0.0643558043832094 NaN NaN 0.0712194206211357 0.757898515593688 396 0 604 0.604 0.396 0.792 ORF3a all ss13 102 GAG TGG AGG 2 ATGGAGGCA:ATGGAGGCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 83.16666666666671 3 29.083333333333332 0.0892772442797872 0.110971243090164 0.804507922897195 -0.0216939988103763 0.040730381381652 0.0688735780817368 NaN NaN 0.0736295340934317 0.768271051361371 398 0 602 0.602 0.398 0.796 ORF3a all ss13 103 GCA AGG CAC 2 GAGGCACAA:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 83.16666666666671 3 29.083333333333332 0.0892772442797872 0.110971243090164 0.804507922897195 -0.0216939988103763 0.0388052411581702 0.0670506570737502 NaN NaN 0.0697251972966452 0.75569745432416 426 0 574 0.574 0.426 0.852 ORF3a all ss13 104 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT:GCGCAATTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 83.50000000000004 3 29.416666666666668 0.0888988641889684 0.109617210244414 0.81099367508761 -0.0207183460554454 0.0394447304790794 0.0667652632642736 NaN NaN 0.071080216744496 0.770685480639672 388 0 612 0.612 0.388 0.776 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTT 2 CAATTTTTG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.33333333333337 3 29.916666666666668 0.0902374551086072 0.107647107231784 0.838271063934025 -0.0174096521231763 0.0400766231713212 0.0669266535709881 NaN NaN 0.0706520697083352 0.805361846361652 436 2 562 0.562 0.436 0.872 ORF3a all ss13 106 TTG TTT TGT 2 TTTTTGTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 82.66666666666671 3 29.583333333333336 0.0898508998594654 0.108952531416164 0.824679323110571 -0.0191016315566986 0.0400802426480266 0.0642713643529499 NaN NaN 0.0710905514276285 0.788164877807998 400 0 600 0.6 0.4 0.8 ORF3a all ss13 107 TAC TGT ACA 2 TTGTACATC:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.33333333333337 3 30.583333333333336 0.0914173632067776 0.105128058952294 0.869581005469354 -0.0137106957455166 0.0399009747442121 0.0635783184249988 NA NA 0.0697750183628046 0.844219902298496 417 1 582 0.582 0.417 0.834 ORF3a all ss13 108 ATC ACA TCT 2 TACATCTAT:TACCTCTAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.33333333333337 3 31.083333333333336 0.0914173632067776 0.103314927985559 0.8848417647792 -0.0118975647787809 0.0422788966509702 0.0606185450864848 NaN NaN 0.0709410517808694 0.866810974238746 454 0 546 0.546 0.454 0.908 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 ATCTATGCT:CTCTATGCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.50000000000004 2 31.083333333333336 0.0912185711042866 0.0672719567702241 1.35596726308787 0.0239466143340625 0.0414718962697492 0.0494668920061786 NaN NaN 0.0574397988306895 0.676752034897994 640 0 360 0.36 0.64 0.72 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 TATGCCTTG:TATGCTTTG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.50000000000004 2 31.083333333333336 0.0912185711042866 0.0672719567702241 1.35596726308787 0.0239466143340625 0.0393180927377835 0.0470798948326044 NaN NaN 0.0592300394948252 0.685993250590817 699 0 301 0.301 0.699 0.602 ORF3a all ss13 111 TTG CCT TGA 2 GCCTTGATA:GCTTTGATT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 81.16666666666671 2 31.416666666666668 0.0916170247341314 0.0665255778124882 1.37716992090421 0.0250914469216432 0.0408645954733327 0.0496498608224888 NaN NaN 0.0544404602651365 0.644872476452821 690 2 308 0.308 0.69 0.616 ORF3a all ss13 112 ATA TGA TAT 2 TTGATATAT:TTGATTTAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 83.00000000000004 2 31.583333333333332 0.0894676462102161 0.0661585688516753 1.35232136612264 0.0233090773585407 0.038810600105749 0.0485766518690736 NA NA 0.0565026060403018 0.679950253552926 690 2 308 0.308 0.69 0.616 ORF3a all ss13 113 TAT TAT ATG 2 ATATATTTT:ATTTATGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 83.33333333333337 2 32.583333333333336 0.0890876519924752 0.0640388786228151 1.39114946901547 0.0250487733696601 0.0399717350596493 0.04633730032043 NA NA 0.0548373952505041 0.647827242897276 700 0 300 0.3 0.7 0.6 ORF3a all ss13 114 GTT ATG TTC 2 TATGTTCTG:TATTTTCTA 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 83.00000000000004 2 32.916666666666664 0.0894676462102161 0.0633621979772033 1.41200351418373 0.0261054482330128 0.0396056186123667 0.0457019046301771 NaN NaN 0.0539023453640186 0.628165835943632 727 0 273 0.273 0.727 0.546 ORF3a all ss13 115 CTA TTC TAC 2 GTTCTGCAA:TTTCTACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.00000000000004 2 33.583333333333336 0.0769906155450625 0.0620508745044359 1.24076600305703 0.0149397410406266 0.0360499372467301 0.0432659744440989 NA NA 0.051467213819683 0.771604442813427 624 2 374 0.374 0.624 0.748 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAG 2 CTACAATGC:CTGCAAGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.66666666666671 2 33.916666666666664 0.0763370207324567 0.0614153696041381 1.24296281573323 0.0149216511283186 0.0380737967028952 0.0432812343819116 NA NA 0.0498272482680855 0.764583218205592 620 0 380 0.38 0.62 0.76 ORF3a all ss13 117 GCT AAG CTG 2 CAAGCTGTC:CAATGCATC 1:1 TRUE 1.75 0.75 0.5 0 2 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.33333333333337 2 34.583333333333336 0.0776555092056302 0.0601826482875392 1.29033054236181 0.0174728609180911 0.0378614784437753 0.0447655577743382 NA NA 0.0505058931866116 0.729375125402492 619 1 380 0.38 0.619 0.76 ORF3a all ss13 118 ATC CTG TCA 2 GCTGTCAGC:TGCATCAAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.4166666666667 2 34.75 0.0508130785858607 0.0598821656332629 0.84855111782456 -0.00906908704740221 0.0264745850724387 0.0447029928936839 NA NA 0.0441145193210713 0.837118573579474 426 4 570 0.57 0.426 0.852 ORF3a all ss13 119 AAC TCA ACG 2 ATCAACGCA:GTCAGCTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.08333333333337 1 34.083333333333336 0.0503862036875865 0.0299291581301553 1.6835155692809 0.0204570455574312 0.0249926546376668 0.0314392674678173 NA NA 0.0288437971007922 0.478178331966469 743 14 243 0.243 0.743 0.486 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AGCTTTTGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.08333333333337 1 34.416666666666664 0.0379427585051849 0.0296334842053817 1.28040152964173 0.00830927429980315 0.0222025815513843 0.028395535498127 NA NA 0.0240686289180397 0.729919544857129 636 50 314 0.314 0.636 0.628 ORF3a all ss13 121 TGC CAT GCA 2 GCATGTAGA:TTTTGCAGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.08333333333337 0 34.08333333333333 0.025080706950469 0 -Inf 0.025080706950469 0.0176929393707345 0 NA NA 0.0178192801867913 0.159278011760004 874 126 0 0 0.874 0.001 ORF3a all ss13 122 AGA GCA GAA 2 TGCAGATTT:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.25000000000003 0 34.75 0.0383470098919532 0 -Inf 0.0383470098919532 0.021464950813338 0 NA NA 0.0224835616688052 0.0880904759266778 962 38 0 0 0.962 0.001 ORF3a all ss13 123 ATT GAA TTA 2 AGAATTATT:AGATTTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.25000000000003 0 34.58333333333333 0.0383470098919532 0 -Inf 0.0383470098919532 0.0233025868019033 0 NA NA 0.022701446703544 0.091183420241674 955 45 0 0 0.955 0.001 ORF3a all ss13 124 ATT TTA TTA 2 ATTATTATG:TTTATTATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333337 0 34.916666666666664 0.0252389746234554 0 -Inf 0.0252389746234554 0.0180423500419448 0 NA NA 0.018318706770656 0.168274142660381 876 124 0 0 0.876 0.001 ORF3a all ss13 125 ATG TTA TGA 2 ATTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.25000000000003 0 35.25 0.0253456008907938 0 -Inf 0.0253456008907938 0.0177010697033287 0 NA NA 0.0186040976720537 0.1730822257277 878 122 0 0 0.878 0.001 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.9166666666667 0 35.916666666666664 0.0251332418122965 0 -Inf 0.0251332418122965 0.018228571177447 0 NA NA 0.0182127347495966 0.167592259951381 872 128 0 0 0.872 0.001 ORF3a all ss13 127 TGT GAT GTT 2 AGATGTTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.9166666666667 0 36.25 0.0254531319881873 0 -Inf 0.0254531319881873 0.0179176207075808 0 NA NA 0.0182584716579256 0.163304001854414 879 121 0 0 0.879 0.001 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 TGTTGGCTT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.4166666666667 0 36.25 0.0256161505491714 0 -Inf 0.0256161505491714 0.0187637015736785 0 NA NA 0.0185404732460115 0.167084070142415 867 133 0 0 0.867 0.001 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGC:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.08333333333337 0 35.58333333333333 0.0257259947650973 0 -Inf 0.0257259947650973 0.0181295684250901 0 NA NA 0.0190885447468396 0.177748773148324 864 136 0 0 0.864 0.001 ORF3a all ss13 130 TGC TTT GCT 2 CTTTGCTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.25000000000003 0 35.08333333333333 0.0253456008907938 0 -Inf 0.0253456008907938 0.0181209406420876 0 NA NA 0.0180886534473778 0.161157915582748 869 131 0 0 0.869 0.001 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAG:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.75000000000003 0 35.08333333333333 0.0255072404553968 0 -Inf 0.0255072404553968 0.0180805037374575 0 NA NA 0.0179207734242605 0.154639446806467 867 133 0 0 0.867 0.001 ORF3a all ss13 132 AAG GGA AGT 2 TGGAAGTGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.4166666666667 0 35.08333333333333 0.0256161505491714 0 -Inf 0.0256161505491714 0.0185054247677496 0 NA NA 0.0188072787129841 0.173187197365313 878 122 0 0 0.878 0.001 ORF3a all ss13 133 TGC AGT GCA 2 AAGTGCAAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.9166666666667 0 34.58333333333333 0.0254531319881873 0 -Inf 0.0254531319881873 0.0195438443371775 0 NA NA 0.0176089293647656 0.148326665157299 882 118 0 0 0.882 0.001 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.08333333333337 0 34.58333333333333 0.0253992526173405 0 -Inf 0.0253992526173405 0.0179328881109942 0 NA NA 0.0175006795431716 0.146688128571523 870 130 0 0 0.87 0.001 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAA:AAATCCAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.4166666666667 0 34.58333333333333 0.0256161505491714 0 -Inf 0.0256161505491714 0.0182179765491644 0 NA NA 0.0176224564912671 0.146054910420245 897 103 0 0 0.897 0.001 ORF3a all ss13 136 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAC:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.4166666666667 0 35.25 0.0256161505491714 0 -Inf 0.0256161505491714 0.0185366288231566 0 NA NA 0.0182036242241603 0.159367919993197 862 138 0 0 0.862 0.001 ORF3a all ss13 137 AAC AAA ACC 2 AAAAACCCA:AAGAACCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.83333333333336 0 34.666666666666664 0.0254801574935108 0 -Inf 0.0254801574935108 0.0179232173400951 0 NA NA 0.0176200762274635 0.148152891877929 882 118 0 0 0.882 0.001 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAA 2 AACCCAATA:AACCCATTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.1666666666667 0 34.666666666666664 0.025698445480572 0 -Inf 0.025698445480572 0.0187382443631497 0 NA NA 0.0181137238127037 0.155978357738662 863 137 0 0 0.863 0.001 ORF3a all ss13 139 ATA CAA TAC 2 CCAATACTT:CCATTACTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.1666666666667 0 34.666666666666664 0.025698445480572 0 -Inf 0.025698445480572 0.0180792558245607 0 NA NA 0.0190181346689121 0.176612146605854 865 135 0 0 0.865 0.001 ORF3a all ss13 140 CTT TAC TTT 2 ATACTTTAT:TTACTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.00000000000003 0 35.5 0.0129313548258795 0 -Inf 0.0129313548258795 0.0130371983744832 0 NA NA 0.0131218322941011 0.3243864223917 625 375 0 0 0.625 0.001 ORF3a all ss13 141 TAT TTT ATG 2 CTTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.00000000000003 0 35.5 0.0129313548258795 0 -Inf 0.0129313548258795 0.0128621096235582 0 NA NA 0.0132670814276079 0.329711690048748 618 382 0 0 0.618 0.001 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.66666666666669 0 36.49999999999999 0.0129873375085957 0 -Inf 0.0129873375085957 0.0131436826141143 0 NA NA 0.0126182600218351 0.303362458639191 655 345 0 0 0.655 0.001 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.33333333333334 0 36.83333333333333 0.0130438070339019 0 -Inf 0.0130438070339019 0.013781419201886 0 NA NA 0.0132415871261348 0.324592774137219 649 351 0 0 0.649 0.001 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000001 1 37.33333333333333 0.0130155110198637 0.0272757331281561 0.477182811501704 -0.0142602221082924 0.0131224854773877 0.0292545372721956 NA NA 0.0315714495272747 0.651498848577251 274 137 589 0.589 0.274 0.548 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTC:AACTACTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000001 1 37.33333333333333 0.0130155110198637 0.0272757331281561 0.477182811501704 -0.0142602221082924 0.013494240035624201 0.028611800166397 NA NA 0.0337621225031722 0.672752498227051 286 125 589 0.589 0.286 0.572 ORF3a all ss13 146 TTC ACT TCG 2 TACTTCGTT:TACTTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.50000000000001 1 37.33333333333333 0.0131871529184001 0.0272757331281561 0.483475654217606 -0.014088580209756 0.0126642523754794 0.028925808331134 NA NA 0.0326795078694245 0.666385773992825 320 128 552 0.552 0.32 0.64 ORF3a all ss13 147 GTT TCG TTT 2 TTCGTTTGC:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.83333333333336 1 36.49999999999999 0.0131294381352109 0.0279101972553257 0.470417246252374 -0.0147807591201148 0.0132107949057704 0.0300782498380672 NA NA 0.0320582546083615 0.644756000666449 289 147 564 0.564 0.289 0.578 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 GTTTGCTGG 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666669 1 37.16666666666665 0.0132453773639628 0.027400307499342 0.483402507956557 -0.0141549301353792 0.0138955209190638 0.0287045385431273 NA NA 0.0323082204155433 0.661298116711316 295 113 592 0.592 0.295 0.59 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGCTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666669 1 37.33333333333332 0.0132453773639628 0.0272757331281561 0.485610315283877 -0.0140303557641934 0.0135615742767213 0.0285317888467727 NA NA 0.0309249184918977 0.650051278902975 308 138 554 0.554 0.308 0.616 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.50000000000003 1 36.66666666666665 0.0131871529184001 0.0277809537602618 0.474683231979716 -0.0145938008418617 0.013363215895767 0.0274331734298512 NA NA 0.0336510447864421 0.664520492315392 297 128 575 0.575 0.297 0.594 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333336 1 36.66666666666665 0.0133041182530361 0.0277809537602618 0.478893502643761 -0.0144768355072257 0.0140252626814123 0.0293434533238128 NA NA 0.0328992222798608 0.659911180606654 301 130 569 0.569 0.301 0.602 ORF3a all ss13 152 CAT CAC ATA 2 ACACATAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.66666666666669 1 35.83333333333332 0.0131582322381821 0.0284394261467203 0.462675729471411 -0.0152811939085382 0.0136351564599671 0.0301734770071046 NA NA 0.0327459305552898 0.640743633973216 258 140 602 0.602 0.258 0.516 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 CATAACTAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000001 1 36.833333333333314 0.0134532755150005 0.0276529018562458 0.486505017988262 -0.0141996263412453 0.013126043515526 0.0301330971991832 NA NA 0.0326867459280819 0.663986804830738 302 141 557 0.557 0.302 0.604 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.0137908619947435 0.0297594906943101 NA NA 0.0346644119601038 0.67791833484276 281 144 575 0.575 0.281 0.562 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333336 1 36.499999999999986 0.0133932130500048 0.0279101972553257 0.479868090056196 -0.0145169842053209 0.013314945222164 0.0290121949753904 NA NA 0.0321818370668129 0.651922908271787 308 128 564 0.564 0.308 0.616 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.0133623024104938 0.028750248533339 NA NA 0.0340688628205559 0.672612472054701 280 126 594 0.594 0.28 0.56 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 36.499999999999986 0.0135138791270087 0.0279101972553257 0.484191458891607 -0.0143963181283171 0.0135084840714284 0.0284039514841407 NA NA 0.032460842880782 0.657405582622387 292 126 582 0.582 0.292 0.584 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000001 1 36.16666666666665 0.0135443861537981 0.0281723261817365 0.480769179883296 -0.0146279400279383 0.0130173048176793 0.0290566704820796 NA NA 0.0338385047229714 0.665532955999965 300 137 563 0.563 0.3 0.6 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAC:ATACCATAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666669 1 36.16666666666665 0.0136058153029875 0.0281723261817365 0.482949658300062 -0.0145665108787489 0.0137463499725482 0.0289812826626101 NA NA 0.0337993309783537 0.666489899928392 282 134 584 0.584 0.282 0.564 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATACAAC:CCATATAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 36.16666666666665 0.0134835092215562 0.0281723261817365 0.478608302863443 -0.0146888169601802 0.0129604631631879 0.0276962714954444 NA NA 0.0319690648148775 0.645896898310641 276 141 583 0.583 0.276 0.552 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAACAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 36.16666666666665 0.0134835092215562 0.0281723261817365 0.478608302863443 -0.0146888169601802 0.013169243262998 0.0298775764888575 NA NA 0.0309514120703262 0.635088763926876 293 144 563 0.563 0.293 0.586 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.6666666666667 1 35.66666666666665 0.0135138791270087 0.0285748846742028 0.472928562305237 -0.0150610055471941 0.0136664098118809 0.0285604759689937 NA NA 0.0325565368560413 0.643643366216091 306 134 560 0.56 0.306 0.612 ORF3a all ss13 163 GTC GTG TCA 2 AGTGTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000003 1 35.66666666666665 0.0136367393123929 0.0285748846742028 0.477228148700247 -0.0149381453618099 0.0134537584773624 0.0302497206429976 NA NA 0.0338083327435287 0.658599176830938 290 129 581 0.581 0.29 0.58 ORF3a all ss13 164 ACA TCA CAG 2 GTCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.6666666666667 1 35.66666666666665 0.0135138791270087 0.0285748846742028 0.472928562305237 -0.0150610055471941 0.0141505752505641 0.0299263811923761 NA NA 0.033433702717344 0.652368875378629 305 120 575 0.575 0.305 0.61 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000003 1 35.333333333333314 0.0134532755150005 0.028849710620847 0.466322719551961 -0.0153964351058466 0.0138797033030594 0.0300942213338977 NA NA 0.0354949792141892 0.664460011584504 272 140 588 0.588 0.272 0.544 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 35.499999999999986 0.0134835092215562 0.0287116399282627 0.469618219483296 -0.0152281307067065 0.0133143307525451 0.0305485339672581 NA NA 0.0347926956432607 0.661616942679419 310 128 562 0.562 0.31 0.62 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 35.499999999999986 0.0134835092215562 0.0287116399282627 0.469618219483296 -0.0152281307067065 0.0132087784814382 0.0295652813270317 NA NA 0.0336858008651734 0.651223030715534 278 126 596 0.596 0.278 0.556 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCG 2 ATTGTCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000004 1 35.833333333333314 0.0136367393123929 0.0284394261467203 0.479501212227008 -0.0148026868343274 0.0136826239515632 0.0311985390220219 NA NA 0.0338002252000271 0.661425141229291 295 110 595 0.595 0.295 0.59 ORF3a all ss13 169 GTT TCG TTA 2 GTCGTTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 35.499999999999986 0.0134532755150005 0.0287116399282627 0.468565207303174 -0.0152583644132622 0.0132218972863433 0.029774473735429 NA NA 0.0346232885384896 0.659432681912471 300 120 580 0.58 0.3 0.6 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTG 2 GTTACTGAA:GTTACTGCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.6666666666667 1 34.83333333333332 0.013333684515963 0.0292720079293014 0.455509732990195 -0.0159383234133385 0.012822802675091 0.0319109563650991 NA NA 0.0339880829866289 0.639113537961874 302 143 555 0.555 0.302 0.604 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTGCAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.6666666666667 1 34.83333333333332 0.013333684515963 0.0292720079293014 0.455509732990195 -0.0159383234133385 0.0136458488834173 0.0304572162954823 NA NA 0.0355272178886821 0.653703713481243 270 144 586 0.586 0.27 0.54 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:GCAGGTGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0319529411716866 NA NA 0.0312418515920635 0.348785017591107 0 342 658 0.658 0 0.001 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000003 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0323717504755534 NA NA 0.0313471722980057 0.35040676607053 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0296860929485651 NA NA 0.029700942712817 0.329047850932492 0 375 625 0.625 0 0.001 ORF3a all ss13 175 ATT GCA TTT 2 GGCATTTCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0307767721225994 NA NA 0.0308984175491632 0.348137972015679 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 176 TCA TTT CAA 2 ATTTCAACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 1 35.49999999999998 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0297339392219039 NA NA 0.0313474373599466 0.359710611302418 0 360 640 0.64 0 0.001 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 TCAACACCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333337 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0301515620421208 NA NA 0.0307243934149537 0.352350882957268 0 402 598 0.598 0 0.001 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0319879310308397 NA NA 0.0303262296004791 0.346064747655397 0 354 646 0.646 0 0.001 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000003 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0322737514255796 NA NA 0.0302842367221043 0.345396393193592 0 361 639 0.639 0 0.001 ORF3a all ss13 180 CTC AAC TCA 2 AAACTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333336 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.029757657479351 NA NA 0.0308404920712259 0.360987531322262 0 383 617 0.617 0 0.001 ORF3a all ss13 181 AAA TCA AAG 2 CTCAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000003 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0298283613869815 NA NA 0.0303010772710124 0.352502255957043 0 363 637 0.637 0 0.001 ORF3a all ss13 182 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333336 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0296009993032947 NA NA 0.0304164585328753 0.354331764031576 0 378 622 0.622 0 0.001 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 GAAGACTAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0296073714092924 NA NA 0.0286828449487188 0.332766553552158 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 37.66666666666664 0 0.0270299523623977 0 -0.0270299523623977 0 0.0279628166530616 NA NA 0.0283811846360796 0.340899301846151 0 350 650 0.65 0 0.001 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0287883096744654 NA NA 0.0283757414267468 0.332019160582609 0 360 640 0.64 0 0.001 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.027380486462268 NA NA 0.0280373888477101 0.326217426012051 0 352 648 0.648 0 0.001 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0301657887642968 NA NA 0.0292747623009964 0.34708180963097 0 364 636 0.636 0 0.001 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333334 1 37.333333333333314 0 0.0272757331281561 0 -0.0272757331281561 0 0.0279074712719349 NA NA 0.0293181251290182 0.352196687253462 0 356 644 0.644 0 0.001 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATT 2 GGTTATTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 1 36.833333333333314 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.0290044771163968 NA NA 0.0286112192792877 0.33379127757311 0 368 632 0.632 0 0.001 ORF3a all ss13 190 TCT ATT CTG 2 TATTCTGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333334 1 36.16666666666664 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0291343563994394 NA NA 0.0305830917585657 0.356959979250838 0 369 631 0.631 0 0.001 ORF3a all ss13 191 GAG CTG AGG 2 TCTGAGGAT 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.5 1 36.99999999999997 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0305313423288836 NA NA 0.0275652002144076 0.31799876388303 0 358 642 0.642 0 0.001 ORF3a all ss13 192 GAT AGG ATA 2 GAGGATAGG:GAGGATTGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666667 1 35.66666666666664 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.029521399120895 NA NA 0.0298142573059861 0.337845871417474 0 365 635 0.635 0 0.001 ORF3a all ss13 193 AGG ATA GGC 2 GATAGGCAC:GATTGGCAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.166666666666667 0.5 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333334 1 36.833333333333314 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.028520240598392 NA NA 0.0286981757655374 0.335258047020615 0 373 627 0.627 0 0.001 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGCACTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333334 0 37.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666667 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 196 GGT CAG GTG 2 TCAGGTGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 197 GTT GTG TTA 2 GGTGTTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666667 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 198 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666667 0 34.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000001 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333334 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000001 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 202 GTT TCG TTG 2 GTCGTTGTA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000001 0 36.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 203 GTA TTG TAC 2 GTTGTACAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 0 36.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 204 CAT TAC ATG 2 GTACATGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666669 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 205 GGC ATG GCT 2 CATGGCTAT 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 206 TAT GCT ATT 2 GGCTATTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333334 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 ORF3a all ss13 207 TTC ATT TCA 2 TATTTCACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666667 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0293509722907183 NA NA 0.0287376829637617 0.333689926889749 0 359 641 0.641 0 0.001 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000001 1 36.999999999999986 0 0.0275260251378209 0 -0.0275260251378209 0 0.0287463619536002 NA NA 0.0303797579599917 0.364901627992731 0 360 640 0.64 0 0.001 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.029070562283971 NA NA 0.0286532460967622 0.33226738251675 0 374 626 0.626 0 0.001 ORF3a all ss13 210 GTT AAG TTT 2 GAAGTTTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333334 1 35.999999999999986 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0288500480959432 NA NA 0.0307397233477246 0.357153007986624 0 390 610 0.61 0 0.001 ORF3a all ss13 211 TAC TTT ACT 2 GTTTACTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333334 1 35.999999999999986 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0295355229940272 NA NA 0.0294367749467997 0.33627031966058 0 370 630 0.63 0 0.001 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333334 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0297389020914445 NA NA 0.0301344088712432 0.343003356013517 0 364 636 0.636 0 0.001 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666667 1 35.33333333333332 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0293560017525828 NA NA 0.0290070526172371 0.319942654853609 0 349 651 0.651 0 0.001 ORF3a all ss13 214 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76 1 34.66666666666665 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0313713214456221 NA NA 0.0303443957626487 0.332350951177237 0 360 640 0.64 0 0.001 ORF3a all ss13 215 GAG TTG AGT 2 CTTGAGTCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333334 1 34.33333333333332 0 0.0297068535712844 0 -0.0297068535712844 0 0.0310022113641931 NA NA 0.0304300517937629 0.328948479098968 0 372 628 0.628 0 0.001 ORF3a all ss13 216 TCT AGT CTA 2 GAGTCTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333334 1 33.83333333333332 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.0322027568619481 NA NA 0.0323668394296357 0.351513450713828 0 361 639 0.639 0 0.001 ORF3a all ss13 217 ACA CTA CAC 2 TCTACACAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666669 1 33.16666666666665 0 0.0307735475083969 0 -0.0307735475083969 0 0.0318340420927635 NA NA 0.034173724351693 0.36785253288553 0 380 620 0.62 0 0.001 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333336 1 32.999999999999986 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.0334419666471987 NA NA 0.0325047006556475 0.341288241615948 0 360 640 0.64 0 0.001 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TTA 2 CAAATTACT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666669 1 34.499999999999986 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.0314126184552963 NA NA 0.0309309568415049 0.339227728217459 0 392 608 0.608 0 0.001 ORF3a all ss13 220 ACT TTA CTA 2 ATTACTACA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 1 35.333333333333314 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0314456305333451 NA NA 0.0316498425371476 0.362017356691865 0 367 633 0.633 0 0.001 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666669 1 35.99999999999998 0 0.0283052459871353 0 -0.0283052459871353 0 0.0296165431782497 NA NA 0.0307952627144857 0.358020851308331 0 354 646 0.646 0 0.001 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 1 36.33333333333331 0 0.0280406490537152 0 -0.0280406490537152 0 0.0294816358648815 NA NA 0.030159267341801 0.352499333636577 0 349 651 0.651 0 0.001 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 1 36.99999999999998 0 0.027526025137821 0 -0.027526025137821 0 0.0297634228402572 NA NA 0.0296443998316981 0.353127281934604 0 347 653 0.653 0 0.001 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0288548478307112 NA NA 0.0292810253748231 0.342737684415795 0 353 647 0.647 0 0.001 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0284915967643022 NA NA 0.0295373167324281 0.340191171735825 0 390 610 0.61 0 0.001 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0300858172813674 NA NA 0.0303219652161146 0.343693585618779 0 355 645 0.645 0 0.001 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTTT 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TTT TCT TTA 2 ATCTTTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC TTA ACA 2 TTTAACAAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAG ACA AGC 2 AACAAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 CTT AGC TTG 2 AAGCTTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 CTTGTTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTAAAGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:AAAGATCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 0 GACCCA---:GATCCA--- 1:1 FALSE 0.166666666666667 0 1.83333333333333 1 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- NA NA 0 CCA---CCG 2 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C CGA 0 ---CCGAAT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT CGA ATG 2 CCGAATGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTG ATG TGC 2 AATGTGCAA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TGC AAA 2 GTGCAAATA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCT GCT CTT 2 GGCTCTTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CTT CAG 2 TCTTCAGGA 2 FALSE 0 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTAAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTAAATCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAT TGG ATC 2 ATGGATCCA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA ATC CAA 2 GATCCAATT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAG ATG AGC 2 GATGAGCCG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AGC CGA 2 GAGCCGACG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.00000000000001 13 33.333333333333336 0.13468918273131 0.55047688131015 0.244677274022382 -0.41578769857884 0.0411141767065623 0.207182376239515 0.135273767756909 0.0704888785875485 0.197235713374792 0.0350244928330304 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.66666666666669 13 33.666666666666664 0.13536628178422 0.542475164047975 0.249534523892505 -0.407108882263755 0.0428773111384633 0.228931695298501 0.11997821047319 0.0375409430122173 0.21937293977359 0.0634842931555145 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.00000000000001 13 34 0.136741167595466 0.534712355892094 0.255728460524037 -0.397971188296628 0.0435131524978532 0.206734181594305 0.128357304376835 0.0463362697269879 0.2112912650745 0.0596300187329984 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.16666666666667 13 33.833333333333336 0.136394827252207 0.538564596680398 0.253256207505871 -0.402169769428191 0.0426391233489771 0.210765700694265 0.125880351520459 0.0442325497150978 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAA 2 ATGAGAATT:ATGAGATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.5 13 34.5 0.135707397617875 0.5234923537768 0.259234727381971 -0.387784956158925 0.0425646167740202 0.212225048084345 0.133117827465576 0.0514858350108087 0.194434692508802 0.0461058844547166 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 7 ATT GAA TTT 2 AGAATTTTC:AGATTTTTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.16666666666666 13 34.833333333333336 0.134353173765451 0.516280426355466 0.260232941066309 -0.381927252590015 0.0414031719987367 0.198410747296342 0.130786463826007 0.0466179975368456 0.187737298606226 0.0419142374804831 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 8 TTC TTT TCA 2 ATTTTCACA:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.41666666666666 13 34.75 0.117744298602214 0.518063977375493 0.227277525063036 -0.400319678773278 0.0391800309530623 0.201273873064426 0.114159411742509 0.0464942400148388 0.189599060246653 0.0347378440833334 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 9 ACA TCA CAC 2 TTCACACTT:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 74.25 13 34.583333333333336 0.116314797139764 0.521669795223997 0.222966325067413 -0.405354998084233 0.0382532284549435 0.215949227269964 0.122188317526636 0.0680348195235498 0.203594307805744 0.0464815723678513 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 10 CTT CAC TTA 2 ACACTTGGA:ACTCTTAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.75 13 35.083333333333336 0.117168293677861 0.511005500979717 0.229289691506689 -0.393837207301856 0.0410788869545509 0.205547198803221 0.118567102409629 0.0531329211148881 0.198459428632372 0.0472032307523178 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAA 2 CTTAGATCA:CTTGGAACT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.75 14 35.083333333333336 0.117168293677861 0.569571828708295 0.205712936932961 -0.452403535030434 0.0383929556185378 0.21913919768414 0.0997027299816564 0.0390876634308194 0.228319536550382 0.0475409346739948 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 12 ACT GAA CAA 2 AGATCAATT:GGAACTGTA 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.58333333333334 13 35.833333333333336 0.117455588516201 0.495830870111496 0.236886397351156 -0.378375281595295 0.0403704944261903 0.177542987831385 0.125552650921258 0.0591940306627273 0.18773540420693 0.0438553112243443 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 13 ATT CAA TAA 2 ACTGTAACT:TCAATTACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.91666666666667 13 35.50000000000001 0.101236464717174 0.502458212610211 0.201482356495405 -0.401221747893036 0.037572477024229 0.19168100491986 0.107409457559212 0.0606780213219033 0.166716140936004 0.0161010855966225 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 14 ACT TAA CTG 2 ATTACTGCA:GTAACTTTG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.08333333333334 12 35.833333333333336 0.100992663859693 0.4436359012621 0.227647635307194 -0.342643237402407 0.036901789695457 0.168948650440416 0.12187592586754 0.0617810517603861 0.167225149470844 0.0404627545608296 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 15 GCA CTG CAC 2 ACTGCACAG:ACTTTGAAA 1:1 TRUE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 1 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.25000000000001 12 35.666666666666664 0.100750036200046 0.44646854291714 0.225659876375084 -0.345718506717094 0.0351136844667305 0.173479792662871 0.11296217934229 0.0457536784145862 0.164992416886945 0.0361390046054902 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 16 AAA CAC AAC 2 GCACAGCCA:TTGAAACAA 1:1 TRUE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.08333333333334 11 36.00000000000001 0.0857055104092924 0.392436107823411 0.218393538975416 -0.306730597414118 0.0317817291254406 0.150115787074528 0.134065448354474 0.103311560550153 0.141407544761682 0.0300732183054198 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 17 CAA AAC AAG 2 AAACAAGGT:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.33333333333334 11 36.75000000000001 0.0866346653413833 0.381986287095468 0.226800459252432 -0.295351621754084 0.0335109412769225 0.149079043575943 0.135261459684499 0.0935902120172071 0.152527550876529 0.0528209181655603 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 18 GGT AAG GTG 2 CAAGGTGAA:CCAGTAAAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.08333333333334 11 37.333333333333336 0.071739235186476 0.374243374589241 0.191691396715346 -0.302504139402765 0.0310857335481548 0.140346475430373 0.114093532657201 0.0929329974414292 0.134703503633765 0.0247230011741647 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 19 AAA GTG AAA 2 GGTGAAATT:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.08333333333334 11 37.50000000000001 0.0568319121182793 0.372089607282221 0.152737166010589 -0.315257695163942 0.0284800604222033 0.136803303809746 0.0997640960428657 0.125773517508707 0.134416378808796 0.0190076169673663 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 20 ATT AAA TTA 2 AAAATTGAC:GAAATTAAG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.08333333333334 10 36.833333333333336 0.0560353868844177 0.337052108354688 0.16625140592638 -0.281016721470271 0.0271528897367813 0.130981889112444 0.115607829347868 0.150416022490321 0.124975667255669 0.0245397724268343 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 21 AAG TTA ACA 2 ATTAAGGAT:ATTGACAAT 1:1 TRUE 2.08333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.16666666666669 10 37.16666666666667 0.0559700169039056 0.333245355900159 0.16795437929726 -0.277275338996253 0.0256757696762879 0.130698538316073 0.108174930126846 0.120514344051677 0.121158282978021 0.0221062076915298 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 22 AAT ACA ATG 2 AAGGATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.75000000000003 9 36.583333333333336 0.0424141271286909 0.298143042551514 0.14226099916909 -0.255728915422823 0.0232995818425445 0.1207881588045 0.117413935198535 0.225658113208066 0.11983894586933 0.0328478324716529 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTA 2 AATGCTTCT:GATGCTACT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.75000000000003 8 35.91666666666667 0.0430225461599401 0.264281463445784 0.162790630863772 -0.221258917285844 0.0247887180340463 0.116483916145667 0.127919752429562 0.203160146489318 0.109039092123488 0.042440919499067 3 0 997 0.997 0.003 0.006 ORF3a all ss13 24 ACT CTA CTC 2 GCTACTCCT:GCTTCTCCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.25000000000003 8 36.41666666666667 0.0433333505001085 0.259943938648383 0.166702677221199 -0.216610588148275 0.0246660810701065 0.1069790029055 0.139805948041514 0.233109865373664 0.103023177003508 0.0355057977728684 2 0 998 0.998 0.002 0.004 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 ACTCCTTCA:TCTCCTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.4166666666667 7 36.25 0.0582110227221988 0.223270280899521 0.260719977991141 -0.165059258177322 0.029988246491257 0.0945614208943162 NaN NaN 0.0988614752990949 0.0949982520176982 15 0 985 0.985 0.015 0.03 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT:CCTTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.1666666666667 7 36.166666666666664 0.0575822255219405 0.223869741416997 0.257213079165903 -0.166287515895057 0.0267667783906613 0.0930757321949533 0.255696871374256 0.314449384354764 0.0985316991693963 0.0914774725432693 21 0 979 0.979 0.021 0.042 ORF3a all ss13 27 AGT CAA ATT 2 GCAAGTACT:TCAGATTCT 1:1 TRUE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.83333333333336 6 35.49999999999999 0.0570345959917882 0.191510018856633 0.297815207435622 -0.134475422864845 0.0286856530411732 0.0883163771726286 NaN NaN 0.0926826080228851 0.146801016586237 27 0 973 0.973 0.027 0.054 ORF3a all ss13 28 ACT ATT CTG 2 AGTACTGTT:GATTCTGTT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.00000000000003 6 36.166666666666664 0.0428688103799615 0.187498978963039 0.228634900398108 -0.144630168583078 0.0240849459073871 0.0845811178209412 NaN NaN 0.0864621669554465 0.0943752032536244 25 0 975 0.975 0.025 0.05 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT:TCTGTTCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.1666666666667 5 35.66666666666666 0.0567646707244322 0.155190536855492 0.365774047017374 -0.0984258661310596 0.0279686225739404 0.0743802461199601 NaN NaN 0.0803372756631286 0.220515648010993 99 0 901 0.901 0.099 0.198 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT:GTTCGCGCT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.33333333333337 5 35.49999999999999 0.0566306643811088 0.156000428408735 0.363016082447745 -0.0993697640276259 0.0279902197138754 0.0766847828858535 NaN NaN 0.0800330888797063 0.21438104136064 79 0 921 0.921 0.079 0.158 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CGCGCTACT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.00000000000004 5 35.83333333333333 0.0422647024133488 0.154389040653112 0.273754550417287 -0.112124338239763 0.0241331663977662 0.0740741683371429 NaN NaN 0.0814644498786616 0.168710478928104 60 1 939 0.939 0.06 0.12 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.00000000000004 5 35.33333333333333 0.0416773883661081 0.15681884839392 0.265767723669396 -0.115141460027811 0.0236806587943876 0.0738201031324932 NaN NaN 0.0822135820093734 0.161358771790675 49 0 951 0.951 0.049 0.098 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.83333333333337 5 35.16666666666666 0.0412002891133781 0.157645932730055 0.261346984345783 -0.116445643616677 0.0252439007066042 0.0760751064064719 NaN NaN 0.0829142060455684 0.160196423271568 48 1 951 0.951 0.048 0.096 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.33333333333337 5 34.99999999999999 0.0409192381878258 0.158481820250405 0.258195155275049 -0.117562582062579 0.0245459415306543 0.0806282351844426 NaN NaN 0.0799300251618754 0.1413401323129 51 0 949 0.949 0.051 0.102 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.41666666666671 5 34.16666666666666 0.0408727688266097 0.162798378928371 0.251063733531359 -0.121925610101761 0.0225960678520513 0.0777039135553486 NA NA 0.0796727808787002 0.125935179943921 37 1 962 0.962 0.037 0.074 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGA 2 ATACCGATA:ATACCGCTA 1:1 FALSE 0.75 1 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.58333333333337 5 33.16666666666666 0.0407801460981609 0.168300466878196 0.242305602917161 -0.127520320780035 0.0244905796859745 0.0833031957101105 NA NA 0.0857932818942986 0.137182018874174 43 1 956 0.956 0.043 0.086 ORF3a all ss13 37 ATA CGA TAC 2 CCGATACAA:CCGCTACAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.33333333333337 5 31.916666666666657 0.0403684875103351 0.175726637753458 0.229723211155793 -0.135358150243123 0.0226834894486708 0.0882036057312136 NaN NaN 0.0930698291757702 0.145843208484843 42 0 958 0.958 0.042 0.084 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 ATACAAGCC:CTACAAGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.58333333333337 4 32.16666666666665 0.0402331091273882 0.135964367940317 0.295909213103899 -0.0957312588129288 0.0238260832291428 0.0757504811171721 NaN NaN 0.0795521657210935 0.228830404427417 84 0 916 0.916 0.084 0.168 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.25000000000004 4 32.83333333333332 0.0404138163712346 0.132943691128056 0.303991983585792 -0.0925298747568213 0.0233217961759648 0.0689104395792988 NaN NaN 0.07776018795294 0.234070396399716 97 0 903 0.903 0.097 0.194 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.25000000000004 4 32.83333333333332 0.0404138163712346 0.132943691128056 0.303991983585792 -0.0925298747568213 0.0235920711221427 0.0693561450952482 NaN NaN 0.0766230467710214 0.227201744463832 93 0 907 0.907 0.093 0.186 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.75000000000004 5 32.499999999999986 0.0401433603117785 0.172180831233375 0.233146512444047 -0.132037470921597 0.0226595403339338 0.0884248779440357 NaN NaN 0.0860287609668685 0.124831453084713 44 1 955 0.955 0.044 0.088 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.4166666666667 5 32.83333333333332 0.0403232602433046 0.17021844254226 0.23689125362132 -0.129895182298956 0.0243998776176491 0.0910110330895757 NaN NaN 0.0909557677122007 0.153259121128468 40 0 960 0.96 0.04 0.08 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.58333333333337 5 32.66666666666666 0.0402331091273882 0.171193988985735 0.235014730165208 -0.130960879858347 0.0236834612219768 0.0847577491804435 NaN NaN 0.0884371404192346 0.138650345360589 40 1 959 0.959 0.04 0.08 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.4166666666667 5 31.999999999999986 0.0397883346582442 0.175211138386129 0.227087929595886 -0.135422803727885 0.022636604778907 0.0948316016129875 NaN NaN 0.0922739282790212 0.14220823479125 29 0 971 0.971 0.029 0.058 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.75000000000003 5 31.666666666666654 0.0396131668795607 0.177291583548173 0.223435123578763 -0.137678416668612 0.0237897904491165 0.084327646312918 NaN NaN 0.0925322347169899 0.136778109635733 40 1 959 0.959 0.04 0.08 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTA 2 TGGCTTATT:TGGCTTGTT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.41666666666669 5 31.33333333333332 0.0397883346582442 0.179422266799376 0.221758064748643 -0.139633932141131 0.0235689974676365 0.0902956604806389 NaN NaN 0.0979292201791266 0.153907064545048 43 0 957 0.957 0.043 0.086 ORF3a all ss13 47 ATT TTA TTA 2 CTTATTGTT:CTTGTTATT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.08333333333336 5 30.666666666666657 0.0394395350433882 0.183841843524739 0.214529697305178 -0.144402308481351 0.0224832501851378 0.0957270483991653 NaN NaN 0.0950524963200664 0.128715983924653 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 ATTGTTGGC:GTTATTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.66666666666669 4 30.833333333333325 0.0396568140359608 0.142438427764417 0.27841373046851 -0.102781613728456 0.0241656693405864 0.0755639470929377 NaN NaN 0.0813976564004048 0.20669351159441 77 0 923 0.923 0.077 0.154 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.08333333333336 3 31.166666666666657 0.0399650588551816 0.103018812035868 0.38793942645414 -0.0630537531806866 0.0225594361995993 0.058331859454019 NA NA 0.0676617674426834 0.351390101255664 143 3 854 0.854 0.143 0.286 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.25000000000003 3 31.999999999999993 0.0404138163712346 0.100148544468392 0.403538729252223 -0.0597347280971574 0.0228809576199952 0.0607346223508895 NA NA 0.0685940236041053 0.383839064643299 180 1 819 0.819 0.18 0.36 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAT 2 GTTGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.91666666666669 3 31.333333333333332 0.0400540111089283 0.102431651254313 0.391031586608751 -0.0623776401453848 0.0229585003872391 0.0624971390648963 NA NA 0.0687252920955934 0.364069868379664 163 0 837 0.837 0.163 0.326 ORF3a all ss13 52 TTT CAT TTC 2 GCATTTCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.58333333333334 4 32.16666666666667 0.0541384900641951 0.135964367940317 0.398181456541318 -0.0818258778761218 0.0276491702545526 0.0737536960600928 NaN NaN 0.0763428077054913 0.283800124803314 109 1 890 0.89 0.109 0.218 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 TTTCTTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.50000000000001 4 32.25 0.0541996476239404 0.135579277355344 0.399763508710014 -0.0813796297314035 0.0281264195343811 0.0726552417768439 NA NA 0.0724981621265171 0.261647312430054 113 1 886 0.886 0.113 0.226 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.83333333333336 4 31.916666666666668 0.0539558430514737 0.137132914796851 0.393456546383514 -0.0831770717453774 0.0262473800298583 0.0735037082717007 NaN NaN 0.0746165389654212 0.264967420731167 105 1 894 0.894 0.105 0.21 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.83333333333336 4 32.25 0.0680739069857003 0.135579277355344 0.502096694373753 -0.0675053703696436 0.0301522927625078 0.0710617136830516 NA NA 0.073064181291069 0.355528596439683 172 0 828 0.828 0.172 0.344 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAA:GTTTTTCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.16666666666669 4 31.583333333333336 0.0668593871386967 0.138722674692595 0.481964374510908 -0.0718632875538982 0.0290844915945391 0.0712037239238239 NaN NaN 0.0781262954724631 0.357659080177386 179 0 821 0.821 0.179 0.358 ORF3a all ss13 57 CAA TTC AAA 2 TTTCAAAGC:TTTCAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.50000000000003 5 31.75 0.0674611774972046 0.176766832783369 0.381639340564977 -0.109305655286164 0.0298005216529715 0.084622470950325 NaN NaN 0.0897726024001057 0.223382220613043 77 0 923 0.923 0.077 0.154 ORF3a all ss13 58 AGC AAA GCG 2 CAAAGCGCT:CAGAGCGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.33333333333336 5 32.25 0.0685408136920715 0.173682709081938 0.394632338788174 -0.105141895389867 0.0306127829856093 0.089337244114946 NaN NaN 0.0892638268868118 0.238845258025633 98 0 902 0.902 0.098 0.196 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.00000000000003 5 32.91666666666667 0.0698178172995089 0.169734844556617 0.411334617131137 -0.0999170272571077 0.0305323494238588 0.0838419199283359 NaN NaN 0.0866055894843697 0.248622432539343 98 1 901 0.901 0.098 0.196 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCCAAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.1666666666667 5 32.75 0.0696555937548328 0.170704815996831 0.408047033401365 -0.101049222241998 0.03099235425523 0.0831775963539783 NaN NaN 0.084880212886005807 0.233853036185397 115 0 885 0.885 0.115 0.23 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCCAAGATC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.6666666666667 4 32.25 0.0691734181620252 0.135579277355344 0.510206423218546 -0.0664058591933187 0.0306315397225529 0.0719613377534038 NaN NaN 0.0761636458572804 0.383271699023645 186 1 813 0.813 0.186 0.372 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAGATCATA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.25000000000003 4 31.666666666666664 0.0705572800165472 0.138321779350139 0.510095231192354 -0.0677644993335923 0.0330277018092226 0.0771437783588558 NaN NaN 0.0801413943070015 0.397797259272095 177 0 823 0.823 0.177 0.354 ORF3a all ss13 63 ATA TAA TAA 2 ATAATTGCG:ATCATAACC 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.75000000000003 4 31.333333333333332 0.0710590256920246 0.139939466685309 0.50778402530159406 -0.0688804409932846 0.0313766360302228 0.0743343103373356 NaN NaN 0.0791990893085168 0.384457518470013 206 0 794 0.794 0.206 0.412 ORF3a all ss13 64 ACC TAA CCC 2 ATAACCCTT:ATTGCGCTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.58333333333336 4 31.000000000000004 0.0712278649928987 0.141595553474679 0.50303744181935806 -0.0703676884817803 0.032778024964568 0.0815896027844394 NaN NaN 0.080408330930276 0.381503541914166 167 1 832 0.832 0.167 0.334 ORF3a all ss13 65 CTC CCC TCA 2 ACCCTTAAA:GCGCTCAAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.75000000000001 4 31.500000000000004 0.0710590256920246 0.139125907283501 0.510753367790987 -0.0680668815914762 0.0325477283915643 0.0727192107631398 NaN NaN 0.0783209090369169 0.384805149112264 165 0 835 0.835 0.165 0.33 ORF3a all ss13 66 AAA TCA AAA 2 CTCAATAAA:CTTAAAAAG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.58333333333336 4 30.666666666666664 0.0702267037754945 0.143291427572032 0.490097034871063 -0.0730647237965374 0.0314221777511444 0.0757012557932821 NaN NaN 0.0821115156211562 0.373560878104118 188 0 812 0.812 0.188 0.376 ORF3a all ss13 67 AAA AAA AAA 2 AAAAAGAGA:AATAAAAGA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.08333333333336 4 30.166666666666664 0.0552608903391469 0.145913043990275 0.378724813271869 -0.090652153651128 0.0275224376877642 0.0780636258999363 NA NA 0.0775198187524209 0.242240028752102 102 1 897 0.897 0.102 0.204 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AAGAGATGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.41666666666669 4 29.75 0.0694136680239339 0.148172379571929 0.468465635933434 -0.078758711547995 0.0314364258476449 0.0775161051134891 NaN NaN 0.0811889759954406 0.332013310523588 169 0 831 0.831 0.169 0.338 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAA:AGATGGCAG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.75000000000001 4 30.25 0.0700625753990949 0.145469445655623 0.481630868140911 -0.0754068702565283 0.030936958260756 0.0779235842589995 NA NA 0.0803036102068912 0.347719362207263 160 0 840 0.84 0.16 0.32 ORF3a all ss13 70 CAA GGC AAC 2 TGGCAACTA:TGGCAGCTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.75000000000001 4 30.916666666666664 0.0710590256920246 0.142015736265178 0.500360224583421 -0.0709567105731539 0.0310630938860084 0.0796759829795434 NaN NaN 0.0790462872638532 0.369366703446248 173 1 826 0.826 0.173 0.346 ORF3a all ss13 71 CTA AAC TAG 2 CAACTAGCA:CAGCTAGCC 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.16666666666667 5 31.083333333333336 0.0868438898173542 0.181054357970061 0.479656445672048 -0.0942104681527069 0.0356875831539716 0.0845389028588106 NaN NaN 0.0845084491372669 0.264933858914043 100 1 899 0.899 0.1 0.2 ORF3a all ss13 72 GCA TAG CAC 2 CTAGCACTC:CTAGCCCTT 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 74.66666666666667 5 31.416666666666668 0.115613009870444 0.178884786483983 0.646298727481754 -0.063271776613539693 0.0457001335055696 0.0859419560679009 NaN NaN 0.091802193875705193 0.490685733644665 247 0 753 0.753 0.247 0.494 ORF3a all ss13 73 CTC CAC TCT 2 GCACTCTCT:GCCCTTTAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.33333333333334 5 31.916666666666668 0.114507630156718 0.175726637753458 0.651623633278474 -0.0612190075967393 0.0440320544090798 0.0830590778439962 NaN NaN 0.0895995936663382 0.494448281945246 231 0 769 0.769 0.231 0.462 ORF3a all ss13 74 TAT TCT ATA 2 CTCTCTAAG:CTTTATAAG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.33333333333334 5 31.916666666666668 0.114507630156718 0.175726637753458 0.651623633278474 -0.0612190075967393 0.0452618409810437 0.0805599982135503 NaN NaN 0.087971546179941 0.486494243754124 246 0 754 0.754 0.246 0.492 ORF3a all ss13 75 AAG ATA AGG 2 TATAAGGGC:TCTAAGGGT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.333333333333333 1.08333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.5 5 31.750000000000004 0.0989668835968827 0.176766832783369 0.559872471767192 -0.0777999491864862 0.0426294552501018 0.0865690205947537 NaN NaN 0.0894486222218797 0.384424758523028 165 0 835 0.835 0.165 0.33 ORF3a all ss13 76 GGC AGG GCT 2 AAGGGCTTC:AAGGGTATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.58333333333334 5 31.000000000000007 0.100268266713039 0.181605039003649 0.552122712360557 -0.0813367722906094 0.0436678293046324 0.0844302549197386 NaN NaN 0.0888826543133636 0.360137627058743 159 0 841 0.841 0.159 0.318 ORF3a all ss13 77 ATT GCT TCC 2 GGCTTCCAG:GGTATTCAC 1:1 TRUE 1.5 0.5 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.58333333333334 5 30.66666666666667 0.100268266713039 0.183841843524739 0.545405032883858 -0.083573576811699593 0.0437824552663983 0.0898520235062044 NaN NaN 0.0938730644820794 0.373314042242683 167 0 833 0.833 0.167 0.334 ORF3a all ss13 78 CAC TCC ACT 2 ATTCACTTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 74.66666666666667 5 30.33333333333334 0.115613009870444 0.186134722106651 0.621125433030169 -0.0705217122362072 0.0461863780672936 0.0917329020408534 NaN NaN 0.0896510793863021 0.431501864759717 215 0 785 0.785 0.215 0.43 ORF3a all ss13 79 TTC ACT TCA 2 CACTTTATT:CAGTTCATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 75 5 30.33333333333334 0.0996725050998238 0.186134722106651 0.535485824309092 -0.0864622170068271 0.0435412580318313 0.0922119556429055 NaN NaN 0.0884081187245706 0.32807948829241 126 0 874 0.874 0.126 0.252 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 TTCATTTGC:TTTATTTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.83333333333333 5 30.500000000000007 0.0999099569047448 0.184981141936135 0.540108877364584 -0.0850711850313904 0.0446660027618149 0.0888964781278022 NaN NaN 0.0821109927426919 0.300178299763885 129 0 871 0.871 0.129 0.258 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAC:ATTTGCAAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.33333333333333 5 30.16666666666667 0.099200976433313 0.187302855665743 0.529628745278423 -0.08810187923243 0.0435773453008545 0.0931277055921121 NaN NaN 0.0859415779359021 0.30529861606988 119 0 881 0.881 0.119 0.238 ORF3a all ss13 82 AAC GCA ACT 2 TGCAACTTG:TGCAATTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.16666666666666 5 30.83333333333334 0.0994361809511673 0.182716561993313 0.544210004098077 -0.0832803810421455 0.0416717479626572 0.0915048914696589 NA NA 0.0874193210470675 0.340765319392863 135 0 865 0.865 0.135 0.27 ORF3a all ss13 83 TTA ACT TAC 2 AACTTGCTG:AATTTACTG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.16666666666666 5 30.83333333333334 0.0994361809511673 0.182716561993313 0.544210004098077 -0.0832803810421455 0.042578451933605 0.0835727772378406 NA NA 0.0888236157759718 0.348453722060665 124 1 875 0.875 0.124 0.248 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG:TTGCTGCTG 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.5 5 30.66666666666667 0.0989668835968827 0.183841843524739 0.538326213986019 -0.084874959927856 0.0418607711027877 0.0835079082938331 NA NA 0.0838495243210939 0.311428346578117 131 0 869 0.869 0.131 0.262 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA:CTGCTGCTG 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 75.58333333333333 6 31.66666666666667 0.12966331412301 0.218397760919419 0.593702579995089 -0.0887344467964092 0.055916524160674 0.100483510837271 NaN NaN 0.0904321428037153 0.326480885321902 122 0 878 0.878 0.122 0.244 ORF3a all ss13 86 CTA TGC TAT 2 CTGCTATTT:CTGCTGTTT 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 75.41666666666666 6 32.33333333333334 0.12997618937868 0.213188653016244 0.609676863846862 -0.0832124636375634 0.0535571903725967 0.0958758015570505 NaN NaN 0.0866170001344005 0.336705867135036 141 0 859 0.859 0.141 0.282 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:CTGTTTGTA 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.5 1.08333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 75.33333333333333 6 33.58333333333334 0.13013319533385 0.204066610769614 0.637699596436022 -0.0739334154357645 0.0499913345137443 0.0892451627901348 NaN NaN 0.0827377356530837 0.37154257810054 163 0 837 0.837 0.163 0.326 ORF3a all ss13 88 GTA TTG TAA 2 TTTGTAACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.24999999999999 6 32.83333333333334 0.128426768784144 0.209443067094397 0.61318223880985 -0.0810162983102529 0.0530382619442966 0.0921085330608192 0.361039122850901 0.0894357439515292 0.0801215700188146 0.311936443261233 140 0 860 0.86 0.14 0.28 ORF3a all ss13 89 ACA TAA CAG 2 GTAACAGTT:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 75.91666666666666 6 33.16666666666668 0.129042071919527 0.207018740932176 0.623335217567591 -0.0779766690126494 0.0540077924331208 0.0921584797399029 0.390986258414933 0.110876973793687 0.081403128916753 0.338109396152932 156 0 844 0.844 0.156 0.312 ORF3a all ss13 90 ATC CAG TCT 2 ACAGTTTAC:ACCATCTAT 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.58333333333331 6 32.83333333333334 0.127817319751755 0.209443067094397 0.610272383445126 -0.0816257473426418 0.0542248762191419 0.0942379336128621 NaN NaN 0.0823885266114466 0.32181173279954 143 1 856 0.856 0.143 0.286 ORF3a all ss13 91 TAC TCT ACT 2 ATCTATTCA:GTTTACTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.08333333333331 5 33.16666666666668 0.128733683316993 0.168300466878196 0.764903898990144 -0.0395667835612023 0.0549584800479377 0.0790863617510014 NaN NaN 0.0650839120862041 0.54323063132658 275 2 723 0.723 0.275 0.55 ORF3a all ss13 92 TCA ACT CAC 2 TACTCACAT:TATTCACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.08333333333331 5 33.16666666666668 0.128733683316993 0.168300466878196 0.764903898990144 -0.0395667835612023 0.0541207077069565 0.0818921078346966 NaN NaN 0.0663894491117297 0.551188590927561 262 1 737 0.737 0.262 0.524 ORF3a all ss13 93 CAT CAC ATC 2 TCACATCTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.58333333333331 5 32.33333333333334 0.126023271644748 0.173179167487274 0.727704570204777 -0.0471558958425262 0.0532489282575027 0.0812881641775348 NA NA 0.0706960767311301 0.50475756278244 217 0 783 0.783 0.217 0.434 ORF3a all ss13 94 CTT ATC TTT 2 CATCTTTTG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.08333333333331 5 32.16666666666668 0.126913940754554 0.174189200634337 0.728598215574658 -0.0472752598797831 0.054772255057703 0.0892676807944258 NaN NaN 0.0706782831566402 0.503572301391251 219 0 781 0.781 0.219 0.438 ORF3a all ss13 95 TTG TTT TGC 2 CTTTTGCTC:CTTTTGCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.41666666666666 5 32.50000000000001 0.126318765773573 0.172180831233375 0.733640120498427 -0.0458620654598025 0.0514904957753956 0.0824775865743129 NA NA 0.0703126288794245 0.514233916826029 250 0 750 0.75 0.25 0.5 ORF3a all ss13 96 CTC TGC TCG 2 TTGCTCGTT:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.08333333333333 5 33.50000000000001 0.128733683316993 0.16642540730596 0.773521816175141 -0.0376917239889662 0.0521425391680997 0.0788271767074281 NaN NaN 0.06965837082877 0.588442818500585 288 0 712 0.712 0.288 0.576 ORF3a all ss13 97 GTC TCG TCG 2 CTCGTTGCT:CTTGTCGCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.16666666666667 5 34.000000000000014 0.128580042454815 0.163690174515013 0.785508616114415 -0.0351101320601981 0.0540934936769529 0.0777341147995222 NA NA 0.0649140597765087 0.588596504664732 271 0 729 0.729 0.271 0.542 ORF3a all ss13 98 GCT TCG CTG 2 GTCGCTGCA:GTTGCTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.33333333333333 6 33.83333333333335 0.128273860987016 0.202335646591905 0.633965705735152 -0.0740617856048899 0.053106358469335 0.094198872974133 NaN NaN 0.0773035029587439 0.338029950118113 161 0 839 0.839 0.161 0.322 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.5 6 33.16666666666668 0.126170845288571 0.207018740932176 0.609465813193732 -0.0808478956436047 0.051790482081665 0.0923474734618476 NaN NaN 0.0819799741334526 0.324039496793501 138 0 862 0.862 0.138 0.276 ORF3a all ss13 100 GGT CAG GTA 2 GCAGGTATG:GCTGGTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.66666666666667 6 33.00000000000001 0.12413582885818 0.208223802448709 0.59616541143877 -0.0840879735905294 0.0523551825746804 0.0978234951440324 NaN NaN 0.0810306450187557 0.299395530715247 120 0 880 0.88 0.12 0.24 ORF3a all ss13 101 ATG GTA TGG 2 GGTATGGAG:GGTCTTGAA 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79 6 33.33333333333334 0.123566424807041 0.20582763427632 0.600339333644362 -0.0822612094692786 0.051431826863288 0.0901251651051956 NaN NaN 0.0798142120957847 0.302700913902395 134 0 866 0.866 0.134 0.268 ORF3a all ss13 102 GAA TGG AAG 2 ATGGAGGCG:CTTGAAGCC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.66666666666667 5 33.16666666666667 0.109283858386045 0.168300466878196 0.649337820703358 -0.0590166084921504 0.0494035499610276 0.0814592867028029 NA NA 0.073079177897401107 0.419337715016798 217 0 783 0.783 0.217 0.434 ORF3a all ss13 103 GCC AAG CCC 2 GAAGCCCCA:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.41666666666667 5 33.41666666666667 0.124566345596373 0.166890228132415 0.746396880094976 -0.0423238825360416 0.0524260258095112 0.0833749230304526 NaN NaN 0.071734694768628 0.555186793177959 262 1 737 0.737 0.262 0.524 ORF3a all ss13 104 CAA CCC AAT 2 GCCCCATTC:GCGCAATTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 78.66666666666667 6 33.75000000000001 0.13928785934632 0.202909342656595 0.686453652269975 -0.0636214833102755 0.0537005015541989 0.097188984907592 NaN NaN 0.0818226606924688 0.43683237601274 198 0 802 0.802 0.198 0.396 ORF3a all ss13 105 TTC AAT TCC 2 CAATTTTTG:CCATTCCTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.33333333333334 6 33.75000000000001 0.12471051706475 0.202909342656595 0.614612000768297 -0.0781988255918452 0.0535215724529619 0.090391130635687 NaN NaN 0.0800206587822883 0.328453831796993 143 1 856 0.856 0.143 0.286 ORF3a all ss13 106 CTC TCC TCT 2 TTCCTCTAC:TTTTTGTAC 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.5 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.66666666666669 6 33.41666666666667 0.12413582885818 0.205237238024368 0.604840671474253 -0.0811014091661882 0.0503001397984295 0.0988544034631175 NaN NaN 0.086890206080138 0.350624821003011 138 0 862 0.862 0.138 0.276 ORF3a all ss13 107 TAC TCT ACC 2 CTCTACCTC:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.00000000000001 5 33.91666666666667 0.125290563497375 0.164139760909006 0.763316351891311 -0.0388491974116316 0.0519387873201151 0.0767548794826313 NaN NaN 0.063977158007851 0.543694678884882 242 0 758 0.758 0.242 0.484 ORF3a all ss13 108 CTC ACC TCT 2 TACCTCTAC:TACCTCTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.41666666666669 5 34.00000000000001 0.124566345596373 0.163690174515013 0.760988531935057 -0.03912382891864 0.0509986409145595 0.0767949045905773 NA NA 0.0664278190587521 0.555883051315616 247 0 753 0.753 0.247 0.494 ORF3a all ss13 109 TAC TCT ACG 2 CTCTACGCT:CTCTATGCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.75000000000001 5 34.00000000000001 0.123992985319038 0.163690174515013 0.757485815421775 -0.0396971891959759 0.0507403783173642 0.0843533476975848 NaN NaN 0.0675711161274929 0.556876312265167 259 0 741 0.741 0.259 0.518 ORF3a all ss13 110 GCC ACG CCT 2 TACGCTTTA:TATGCCTTG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.75000000000001 5 34.00000000000001 0.123992985319038 0.163690174515013 0.757485815421775 -0.0396971891959759 0.0520211279382568 0.077714217682767 NaN NaN 0.0678216558724412 0.558334377538365 285 0 715 0.715 0.285 0.57 ORF3a all ss13 111 TTA CCT TAG 2 GCCTTGATA:GCTTTAGTC 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.58333333333334 5 34.16666666666667 0.124279002650387 0.162798378928371 0.76339213859782 -0.0385193762779835 0.0507292393993796 0.0802822134098059 NaN NaN 0.0657575572466427 0.558024240450533 250 0 750 0.75 0.25 0.5 ORF3a all ss13 112 ATA TAG TAT 2 TTAGTCTAC:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.41666666666667 5 34.33333333333334 0.121203743914918 0.161916285324778 0.748558081553087 -0.04071254140986 0.0489140791975978 0.0795362571171116 NaN NaN 0.0637618458115613 0.523142101338307 227 0 773 0.773 0.227 0.454 ORF3a all ss13 113 TAC TAT ACT 2 ATATATTTT:GTCTACTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.08333333333334 5 35.16666666666667 0.120122945288033 0.157645932730055 0.761979349595559 -0.0375229874420224 0.0480772426527979 0.0777307062074361 NA NA 0.0609624849433501 0.538218310252656 275 0 725 0.725 0.275 0.55 ORF3a all ss13 114 TTC ACT TCT 2 TACTTCTTG:TATTTTCTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.08333333333334 5 35.16666666666667 0.120122945288033 0.157645932730055 0.761979349595559 -0.0375229874420224 0.04912015126395 0.0760351538052169 NaN NaN 0.0624792958817685 0.548128592076832 267 2 731 0.731 0.267 0.534 ORF3a all ss13 115 CTA TCT TAC 2 TTCTTGCAG:TTTCTACAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.25 5 35.33333333333334 0.121476995958792 0.15681884839392 0.774632623583928 -0.0353418524351274 0.0514765596606671 0.0739238444840175 NaN NaN 0.0624600312661434 0.571508338945243 282 0 718 0.718 0.282 0.564 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAT 2 CTACAATGC:TTGCAGAGT 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 80.25 5 35.66666666666667 0.151368872535542 0.155190536855492 0.975374372707347 -0.00382166431995015 0.0585059248470838 0.0734907125726894 NaN NaN 0.0695429848422632 0.956175121015675 498 0 502 0.502 0.498 0.996 ORF3a all ss13 117 AGT AAT GCA 2 CAATGCATC:CAGAGTATA 1:1 TRUE 2.25 0.416666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 79 6 36.25000000000001 0.154027464172684 0.187009442781175 0.823634688612573 -0.0329819786084912 0.0614243965096251 0.0879885857260487 NaN NaN 0.0794070119231618 0.677883157598891 324 1 675 0.675 0.324 0.648 ORF3a all ss13 118 ATA GCA TAA 2 AGTATAAAC:TGCATCAAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 78.58333333333334 6 36.58333333333334 0.139450189981991 0.185076724431923 0.753472325653162 -0.0456265344499327 0.0565685257270084 0.0817240884946982 0.535672952711256 0.159548940735242 0.0752291334408854 0.54418220861457 266 1 733 0.733 0.266 0.532 ORF3a all ss13 119 AAC TAA ACG 2 ATAAACTTT:ATCAACGCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.25 6 35.91666666666667 0.138162071083302 0.188983168709011 0.731081355165755 -0.0508210976257087 0.0603657105261717 0.087288792266941 NaN NaN 0.0766203509650561 0.507148307841666 255 0 745 0.745 0.255 0.51 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AACTTTGTA 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.75 1.16666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 78.25 7 36.25000000000001 0.140103325003136 0.223270280899521 0.627505480974368 -0.0831669558963848 0.0575993081126977 0.0949123336338787 0.364442965940812 0.0851019845731007 0.0896933693238431 0.353803813260133 143 0 857 0.857 0.143 0.286 ORF3a all ss13 121 GTA CAT GTA 2 GCATGTAGA:TTTGTAAGA 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.66666666666667 6 35.583333333333336 0.12413582885818 0.190999228388671 0.64992843115351 -0.0668633995304912 0.0582116342242283 0.0872207185688235 NaN NaN 0.0847444017288383 0.430111547434571 192 1 807 0.807 0.192 0.384 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 GTAAGAATA:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.83333333333333 6 36.25 0.110544521791661 0.187009442781175 0.591117326203746 -0.0764649209895146 0.0500802192484536 0.0863511372681359 NaN NaN 0.0808870533886971 0.344490661714386 133 2 865 0.865 0.133 0.266 ORF3a all ss13 123 ATA GAA TAA 2 AGAATAATA:AGAATTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.83333333333333 6 36.083333333333336 0.110544521791661 0.187991098237596 0.588030618619755 -0.0774465764459353 0.0486256671333865 0.0859982429047598 NA NA 0.0831287779180519 0.351519607710233 148 0 852 0.852 0.148 0.296 ORF3a all ss13 124 ATA TAA TAA 2 ATAATAATG:ATTATTATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.16666666666667 6 36.416666666666664 0.110036776004805 0.186038038359055 0.591474609039003 -0.0760012623542498 0.0488688318965641 0.0863339173570259 NaN NaN 0.0777527700329228 0.328334853918473 139 0 861 0.861 0.139 0.278 ORF3a all ss13 125 ATG TAA TGA 2 ATAATGAGG:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.33333333333334 6 36.25 0.109784651326779 0.187009442781175 0.587054052961596 -0.0772247914543967 0.0504467889880634 0.0835636148392255 NaN NaN 0.0798380052091442 0.333409801922037 159 0 841 0.841 0.159 0.318 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT:ATGAGGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.83333333333334 6 36.916666666666664 0.109035174336848 0.183183742573707 0.595222986521176 -0.0741485682368589 0.0501827602754843 0.0765834414140387 NaN NaN 0.076496642999936 0.332393102534909 141 0 859 0.859 0.141 0.282 ORF3a all ss13 127 CTT GAT GTT 2 AGATGTTGG:AGGCTTTGG 1:1 TRUE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.83333333333334 6 37.25 0.123850470889023 0.181329278360777 0.683014193894308 -0.0574788074717544 0.0494978691947948 0.0805946259298026 NaN NaN 0.0775453805545174 0.45855520783959 225 0 775 0.775 0.225 0.45 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 CTTTGGCTT:TGTTGGCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.25000000000001 5 36.916666666666664 0.138162071083302 0.149375201835214 0.924933117317014 -0.0112131307519114 0.0576468578153243 0.0729553693390968 NaN NaN 0.0774593294734023 0.884899159833766 467 0 533 0.533 0.467 0.934 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGC:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 78.08333333333336 5 37.08333333333333 0.140432198903081 0.148632696437812 0.944827095711329 -0.00820049753473054 0.0620909143853344 0.0700727219217013 NaN NaN 0.0757953539225602 0.913842903060872 468 0 532 0.532 0.468 0.936 ORF3a all ss13 130 TGC TTT GCT 2 CTTTGCTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 78.83333333333336 5 36.83333333333333 0.170137650782942 0.149749252688945 1.13615024935281 0.020388398093996202 0.0671041617202337 0.0722280196637822 NaN NaN 0.0853702474758376 0.811242657837904 602 0 398 0.398 0.602 0.796 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAA:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.16666666666669 6 37 0.188029061147841 0.182716561993313 1.02907508272141 0.00531249915452803 0.072016644531861 0.0783878360352347 NaN NaN 0.0922028185552165 0.954053281712552 524 0 476 0.476 0.524 0.952 ORF3a all ss13 132 AAA GGA AAT 2 TGGAAATGC:TGGAAGTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.83333333333336 7 37 0.188944817553035 0.218017195136802 0.866650987939163 -0.0290723775837673 0.0681838244930526 0.0878351467972541 NaN NaN 0.102282563260241 0.776229596588282 386 0 614 0.614 0.386 0.772 ORF3a all ss13 133 TGC AAT GCA 2 AAATGCCGT:AAGTGCAAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.41666666666669 7 36.416666666666664 0.220826439413092 0.22208100957439 0.99435084447922 -0.00125457016129757 0.0776616557596869 0.094734337938224 NaN NaN 0.109962584063705 0.990897081449186 490 0 510 0.51 0.49 0.98 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC:TGCCGTTCC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 2 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 78.75000000000001 7 36.25 0.219740343511106 0.223270280899521 0.984189846610155 -0.00352993738841512 0.0765103758529103 0.0939236645804025 0.797990672640524 0.217450795345513 0.104896023911709 0.97315483519528 492 0 508 0.508 0.492 0.984 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG:CGTTCCAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.41666666666669 6 36.25 0.187348078274046 0.187009442781175 1.0018107935505 3.38635492870665e-4 0.0675954500184983 0.0809151442711087 NaN NaN 0.102706210382919 0.997369277466771 483 0 517 0.517 0.483 0.966 ORF3a all ss13 136 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAC:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.50000000000003 6 36.833333333333336 0.187122184471386 0.18365333026498 1.01888805501866 0.00346885420640528 0.0724221288737304 0.0830464002788727 NaN NaN 0.102490264726243 0.973000197724808 532 0 468 0.468 0.532 0.936 ORF3a all ss13 137 AAC AAA ACC 2 AAAAACCCA:AAGAACCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.91666666666669 6 36.25 0.186000879178407 0.187009442781175 0.994606884081526 -0.0010085636027681 0.0663568952709588 0.0851416184280429 1.01374847015227 0.326534548861565 0.104716021653189 0.992315360407942 491 0 509 0.509 0.491 0.982 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.25000000000003 6 36.25 0.187801514593863 0.187009442781175 1.00423546426805 7.92071812687839e-4 0.0695219059478114 0.0874508145875201 NaN NaN 0.101910722448453 0.993798733906049 515 0 485 0.485 0.515 0.97 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTC:CCATTACTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.25000000000003 6 36.25 0.187801514593863 0.187009442781175 1.00423546426805 7.92071812687839e-4 0.0667179620218646 0.084440236671878 NaN NaN 0.102732730209564 0.993848351855802 528 1 471 0.471 0.528 0.942 ORF3a all ss13 140 CTC TAC TCT 2 TTACTCTAT:TTACTTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.9166666666667 6 37.25 0.191510018856633 0.181329278360777 1.05614504501364 0.0101807404958561 0.0671518373049488 0.0839333450682033 NaN NaN 0.0985413282669046 0.917713428780223 511 0 489 0.489 0.511 0.978 ORF3a all ss13 141 TAT TCT ATG 2 CTCTATGAT:CTTTATGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.9166666666667 7 37.25 0.191510018856633 0.216321047091377 0.885304603651151 -0.0248110282347435 0.070326649599740207 0.0872528837193812 0.761901845508814 0.245248975341926 0.115584200038733 0.830034273753022 411 0 589 0.589 0.411 0.822 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC:TATGATGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.08333333333337 7 37.75 0.191038422684604 0.213007236149638 0.896863534487621 -0.0219688134650343 0.07074814960655 0.0911226717574585 0.874717007557741 0.305212927072812 0.10512388004106 0.834463665840484 396 0 604 0.604 0.396 0.792 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC:GATGCTAAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.6666666666667 8 38.16666666666667 0.2092680072815 0.245832397240244 0.851262932106498 -0.0365643899587446 0.0710916814067786 0.103939072954561 0.782010843593681 0.276349539201107 0.118881581986749 0.758409667397264 369 0 631 0.631 0.369 0.738 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC:GCTAACTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77.1666666666667 8 38.333333333333336 0.22499745519022 0.244568640424989 0.919976718189382 -0.0195711852347686 0.0745833335682344 0.104314396179403 NaN NaN 0.119938727179081 0.870379445383614 415 0 585 0.585 0.415 0.83 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTC:AACTACTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.1666666666667 9 38.333333333333336 0.242697391695876 0.281613206922171 0.861811114430259 -0.0389158152262958 0.0729933343312209 0.106116755334369 0.551425040120182 0.118080844990206 0.127724177482034 0.760605036104644 361 0 639 0.639 0.361 0.722 ORF3a all ss13 146 TTC ACT TCC 2 TACTTCCTT:TACTTTGTT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.416666666666667 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.1666666666667 9 38.333333333333336 0.242697391695876 0.281613206922171 0.861811114430259 -0.0389158152262958 0.0794525941665952 0.107912414634147 0.590257518352318 0.144273714013126 0.124255895355747 0.754135634536308 363 0 637 0.637 0.363 0.726 ORF3a all ss13 147 CTT TCC TTT 2 TTCCTTTGT:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.08333333333336 9 37.833333333333336 0.243007258038147 0.286143675421617 0.849249097258884 -0.0431364173834697 0.0736120757876427 0.107637219171027 0.547007549919218 0.120533945443474 0.126516763625106 0.733138088113256 345 0 655 0.655 0.345 0.69 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 CTTTGTTGG:GTTTGCTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.75000000000003 8 38.166666666666664 0.244254746699589 0.245832397240244 0.993582414041575 -0.00157765054065484 0.0751987421063922 0.0973817027223731 0.626289639488411 0.112635378130103 0.109402272358399 0.988494394543824 510 0 490 0.49 0.51 0.98 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGTTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.75000000000003 8 38.333333333333336 0.244254746699589 0.244568640424989 0.998716541397727 -3.13893725399639e-4 0.0765150215129724 0.0996916093653138 0.691968270827551 0.148936494100082 0.108941126064346 0.997701046246373 503 0 497 0.497 0.503 0.994 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.08333333333336 8 37.666666666666664 0.243007258038147 0.249703998029926 0.973181286464719 -0.00669673999177897 0.0750722601636648 0.0972376596422295 0.728657507843972 0.181686190411798 0.109762862479013 0.95135046323443 449 0 551 0.551 0.449 0.898 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACTAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.66666666666669 8 37.666666666666664 0.262862230268108 0.249703998029926 1.05269532062761 0.013158232238182 0.0785969279598668 0.0976619281474509 0.735361925226471 0.152277337950765 0.115613614007059 0.909386718812363 556 0 444 0.444 0.556 0.888 ORF3a all ss13 152 AAT CAC ATA 2 ACACATAAC:ACTAATTGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.00000000000001 8 37.333333333333336 0.261500632286273 0.25235417746591 1.03624451519769 0.00914645482036364 0.0769953912062818 0.0947361483407332 0.854954823327452 0.225494798924675 0.119370556485668 0.938923963418202 541 0 459 0.459 0.541 0.918 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 AATTGTTAT:CATAACTAT 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.416666666666667 0.666666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.16666666666669 8 37.5 0.246469230096624 0.251022027914968 0.9818629549918 -0.00455279781834342 0.073745777635133 0.0997657379764599 0.75483415524808 0.193338404332454 0.112953053018372 0.967848379402277 447 1 552 0.552 0.447 0.894 ORF3a all ss13 154 TAT ACT ATG 2 AACTATGAC:TGTTATGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.91666666666669 7 37 0.229330320216207 0.218017195136802 1.05189097617877 0.0113131250794051 0.0760183005159106 0.0930537328780313 0.78783297787167 0.181820705258308 0.110551186132845 0.918491712471088 512 0 488 0.488 0.512 0.976 ORF3a all ss13 155 GAC ATG ACT 2 TATGACTAC:TATGACTAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.58333333333336 7 37 0.226998746097743 0.218017195136802 1.04119652560114 0.00898155096094103 0.0776421721141747 0.0917872141552396 NaN NaN 0.105853942201978 0.93238181448332 553 1 446 0.446 0.553 0.892 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT:GACTATTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.75000000000001 8 37.5 0.229920775536938 0.251022027914968 0.91593864270279 -0.0211012523780302 0.0763592153356167 0.100395193400266 NaN NaN 0.117868307250837 0.857918879884782 426 0 574 0.574 0.426 0.852 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA:TATTGTATA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.75000000000001 8 37.5 0.229920775536938 0.251022027914968 0.91593864270279 -0.0211012523780302 0.0747569765641923 0.103749767715003 0.775217204001498 0.237394158512663 0.120739496671807 0.861262896661583 427 0 573 0.573 0.427 0.854 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA:TGTATACCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.25000000000001 8 37.5 0.231710672423342 0.251022027914968 0.923069080223639 -0.0193113554916258 0.0757482108751656 0.0998025703557006 0.675104371528253 0.171531814736113 0.112637511199211 0.863872356253664 430 0 570 0.57 0.43 0.86 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT:ATACCTTAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 74.91666666666669 8 37.5 0.232919624976835 0.251022027914968 0.927885201595673 -0.0181024029381332 0.0793042608139134 0.105902380182087 0.786369204678106 0.238015621144515 0.124339184120461 0.884245944494654 435 0 565 0.565 0.435 0.87 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATATAAC:CCTTACAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.25000000000001 8 37.5 0.250032194187064 0.251022027914968 0.996056785390007 -9.89833727904343e-4 0.0794376722685069 0.104045565179585 NaN NaN 0.118547288182529 0.993337984490081 516 0 484 0.484 0.516 0.968 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAATAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.91666666666669 8 37.166666666666664 0.265978832161818 0.253700676929915 1.0483962257432 0.0122781552319022 0.0781626424581221 0.10161412869275 0.751036129936642 0.162734628866582 0.12289998554761 0.920420830903662 553 0 447 0.447 0.553 0.894 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC:AATAGTGTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.58333333333336 8 36.83333333333333 0.267388088416834 0.256437672127084 1.04270205777068 0.01095041628975 0.0819523423301272 0.104267186355276 0.664908594072999 0.116837130937912 0.127006775348616 0.931292207424554 559 0 441 0.441 0.559 0.882 ORF3a all ss13 163 GTA GTG TAA 2 AGTGTAACT:AGTGTCACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 74.9166666666667 8 36.83333333333333 0.270252370379024 0.256437672127084 1.05387156316524 0.0138146982519408 0.083134028382153 0.101941388602327 0.819876606297839 0.198651615338747 0.126299915432726 0.912901011461298 524 0 476 0.476 0.524 0.952 ORF3a all ss13 164 ACA TAA CAG 2 GTAACTTCT:GTCACAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.58333333333337 8 36.83333333333333 0.267388088416834 0.256437672127084 1.04270205777068 0.0109504162897499 0.0822080340043436 0.101481786786977 0.76688174557125 0.1739360456886 0.125798304743821 0.93063382939336 523 0 477 0.477 0.523 0.954 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA:ACTTCTTCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.08333333333337 8 36.166666666666664 0.265279817755724 0.262094574111018 1.01215303161277 0.00318524364470557 0.0804300093161133 0.105045853777047 0.71823249107458 0.158767886503996 0.125314935057308 0.979721626221237 486 0 514 0.514 0.486 0.972 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT:TCTTCAATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.25000000000003 8 36 0.24615039807976 0.263548415128416 0.933985499248103 -0.017398017048656 0.0740700669893279 0.111124403613631 0.644719205820063 0.147429707082395 0.122669777238343 0.887215816068681 450 0 550 0.55 0.45 0.9 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC:TCAATTGTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.08333333333336 7 36.166666666666664 0.246788896582768 0.223869741416997 1.10237719050687 0.022919155165771 0.073466803482358 0.0934438143428348 NaN NaN 0.115192854405639 0.842291420927722 609 0 391 0.391 0.609 0.782 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCA 2 ATTGTCATT:ATTGTCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.58333333333336 7 36.166666666666664 0.248724605929925 0.223869741416997 1.11102377818283 0.024854864512928 0.0725224788655604 0.0971841042222852 NaN NaN 0.108647366992595 0.819050501109014 584 0 416 0.416 0.584 0.832 ORF3a all ss13 169 ATT TCA TTA 2 GTCATTACT:GTCGTTACT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.08333333333336 7 36.33333333333333 0.246788896582768 0.222674045667529 1.1082966397945 0.0241148509152397 0.0681796888184239 0.0917106671457276 NaN NaN 0.112754658141988 0.830648351244659 609 0 391 0.391 0.609 0.782 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTG 2 ATTACTTCA:GTTACTGAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.75000000000001 6 35.5 0.262520489663413 0.191510018856633 1.37079245895714 0.0710104708067793 0.0761855081043905 0.0888650631753309 NaN NaN 0.107735586568511 0.509819959297178 737 0 263 0.263 0.737 0.526 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTTCAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 18 77.08333333333336 6 35.5 0.279768061455196 0.191510018856633 1.46085339621127 0.088258042598563 0.0754356905452004 0.0904794402098804 NaN NaN 0.105931574480142 0.404754008667451 801 1 198 0.198 0.801 0.396 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:TCAGGTGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.75000000000001 6 35.5 0.262520489663413 0.191510018856633 1.37079245895714 0.0710104708067793 0.0746487764414153 0.0860759252520447 NaN NaN 0.109198711165374 0.515507038954856 746 0 254 0.254 0.746 0.508 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGATGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.41666666666669 6 35.5 0.259818540246921 0.191510018856633 1.35668380066018 0.0683085213902876 0.0744919475122971 0.0870681567804622 NaN NaN 0.109394678142916 0.532350014499966 730 0 270 0.27 0.73 0.54 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT:GATGGCACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.41666666666667 6 35.83333333333333 0.263892866595519 0.189483161783181 1.3926982435383 0.0744097048123385 0.0759386791944521 0.0876869402393388 NaN NaN 0.107723780541995 0.489725559432899 767 0 233 0.233 0.767 0.466 ORF3a all ss13 175 ACA GCA CAA 2 GGCACAACA:GGCATTTCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.91666666666667 6 36.33333333333333 0.265978832161818 0.18652246930412 1.42598815656973 0.0794563628576972 0.0778969795929527 0.0844209072139895 NaN NaN 0.10406602079998 0.445154057392775 776 0 224 0.224 0.776 0.448 ORF3a all ss13 176 ACA CAA CAA 2 ACAACAAGT:ATTTCAACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.66666666666667 7 36.666666666666664 0.267034361445878 0.220320838896122 1.2120249849438 0.046713522549756 0.0767837454363384 0.090246886246063 NaN NaN 0.116813810192868 0.689232190965153 661 0 339 0.339 0.661 0.678 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 ACAAGTCCT:TCAACACCA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.16666666666667 7 36.83333333333333 0.246469230096625 0.219162920712879 1.12459365523568 0.0273063093837455 0.0735280380738691 0.090096298703945 0.803946827642503 0.16186071654578 0.108200667812763 0.800757180320226 595 0 405 0.405 0.595 0.81 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA:AGTCCTATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.5 7 36.83333333333333 0.227287577010071 0.219162920712879 1.03707130873582 0.008124656297192 0.0631078739895733 0.0965300424779546 NaN NaN 0.110480722290158 0.941377106409655 539 0 461 0.461 0.539 0.922 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC:CCTATTTCT 1:1 TRUE 1.75 0.5 0.75 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 15 77 8 36.33333333333333 0.22556561551435 0.260656845281595 0.865373841499023 -0.0350912297672447 0.0653209756529767 0.105942587348778 NaN NaN 0.122016039720034 0.77365660437857 381 0 619 0.619 0.381 0.762 ORF3a all ss13 180 CTC AAC CTG 2 AAACTCAAA:ATTTCTGAA 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.58333333333333 8 36.24999999999999 0.192460269414335 0.261373712626115 0.736341338540198 -0.0689134432117806 0.0560170287702973 0.109225431483334 0.505886712016437 0.145518187863347 0.112890334849177 0.541566463724892 253 0 747 0.747 0.253 0.506 ORF3a all ss13 181 AAA CTG AAC 2 CTCAAAGAA:TCTGAACAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.08333333333333 7 36.416666666666664 0.17448602671933 0.22208100957439 0.785686390086782 -0.0475949828550593 0.0495287750358565 0.0933565314589384 0.622276607059891 0.206732999095645 0.105730101877458 0.652598348031681 313 0 687 0.687 0.313 0.626 ORF3a all ss13 182 CAT AAC AAG 2 AAAGAAGAC:GAACATGAC 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 76.41666666666666 6 36.416666666666664 0.176201863051343 0.186038038359055 0.94712814973501 -0.00983617530771244 0.0525159718662334 0.0817660841722 0.935931734721879 0.311555814378113 0.095548010984105 0.918006744528824 444 0 556 0.556 0.444 0.888 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 CATGACTAC:GAAGACTAC 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.5 6 36.99999999999999 0.145735279379414 0.182716561993313 0.797603007573816 -0.0369812826138989 0.0464878754773124 0.0839768592771428 0.627500270032767 0.2037002098563 0.0879851130003766 0.674256849052256 356 0 644 0.644 0.356 0.712 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA:GACTACCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 73.83333333333333 6 38 0.16608898542729 0.177291583548173 0.93681257792004 -0.011202598120883 0.04622955803142 0.0808836776505479 NaN NaN 0.0883473555995567 0.899097321165324 447 0 553 0.553 0.447 0.894 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT:TACCAGATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.83333333333333 6 37.666666666666664 0.16360869705703 0.179063586735151 0.913690494198692 -0.0154548896781206 0.0471865483719596 0.0798584396522986 NaN NaN 0.0925347014766248 0.867356490416861 448 0 552 0.552 0.448 0.896 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT:CAGATTGGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.33333333333333 6 37.166666666666664 0.162396234146618 0.181789348152453 0.893320955254364 -0.0193931140058356 0.0481877027107959 0.0824051117333829 NaN NaN 0.0914308607082376 0.83202365743285 397 0 603 0.603 0.397 0.794 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.08333333333333 6 37.166666666666664 0.179737298307158 0.181789348152453 0.988711935731379 -0.00205204984529567 0.0481699443358311 0.0843733548514202 NaN NaN 0.0889495351022599 0.981594578697693 498 0 502 0.502 0.498 0.996 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.74999999999999 6 37.5 0.180643544434896 0.179963002222943 1.00378156734188 6.80542211952406e-4 0.0523979966427813 0.0827727530127117 0.95273445806641 0.292075443572699 0.088169561285299 0.993841539818995 494 0 506 0.506 0.494 0.988 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATA 2 GGTTATACT:GGTTATTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 75.99999999999999 7 36.916666666666664 0.194146225437217 0.218588546001055 0.888181146674905 -0.0244423205638378 0.0511741844815549 0.0926414922467716 NaN NaN 0.0980359867218634 0.803113353813752 422 0 578 0.578 0.422 0.844 ORF3a all ss13 190 ACT ATA CTG 2 TATACTGAA:TATTCTGAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.49999999999999 7 36.083333333333336 0.206677011490545 0.224472453654355 0.920723269719267 -0.0177954421638106 0.0498914581801107 0.101337508250739 NaN NaN 0.108816913690048 0.870096724743189 441 0 559 0.559 0.441 0.882 ORF3a all ss13 191 GAA CTG AAA 2 ACTGAAAAA:TCTGAGGAT 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.16666666666666 6 36.416666666666664 0.207705622965276 0.186038038359055 1.11646857168211 0.0216675846062212 0.0508603098639567 0.0854840527345968 NaN NaN 0.0938151070728641 0.817345484140817 611 0 389 0.389 0.611 0.778 ORF3a all ss13 192 AAA AAA AAT 2 GAAAAATGG:GAGGATAGG 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 75.66666666666666 6 35.24999999999999 0.212464845734057 0.193059006111768 1.1005176604455 0.0194058396222887 0.0527975497446169 0.0890037226828571 0.871742914966582 0.206792758136009 0.0986987475198812 0.84412736151495 594 1 405 0.405 0.594 0.81 ORF3a all ss13 193 AGG AAT GGC 2 AAATGGGAG:GATAGGCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.166666666666667 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 74.74999999999999 7 35.83333333333333 0.197860943283853 0.226300369430573 0.874328856739029 -0.0284394261467202 0.0548244804453129 0.117825577359148 NaN NaN 0.129638600317402 0.82635819397294 398 0 602 0.602 0.398 0.796 ORF3a all ss13 194 CAC GGC ACT 2 AGGCACTCA:TGGGAGTCT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.41666666666666 8 36.16666666666666 0.181559020381432 0.262094574111018 0.692723307978619 -0.0805355537295864 0.0515054175263396 0.120138337924983 NaN NaN 0.139176411366601 0.562819912876029 264 0 736 0.736 0.264 0.528 ORF3a all ss13 195 TCA ACT CAG 2 CACTCAGGT:GAGTCTGGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.74999999999999 7 35.16666666666666 0.163812543580385 0.231324762417615 0.708149624226789 -0.0675122188372297 0.0487409701960024 0.125420371156762 0.793995424452578 0.372456590638723 0.128215712502028 0.59850484617353 329 0 671 0.671 0.329 0.658 ORF3a all ss13 196 GGA CAG GAG 2 TCAGGTGTT:TCTGGAGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.91666666666666 7 34.66666666666666 0.161004298535341 0.235243169141281 0.684416466259414 -0.07423887060594 0.0458451086068731 0.1166926106557 NaN NaN 0.134117855233969 0.579897408889662 273 0 727 0.727 0.273 0.546 ORF3a all ss13 197 GTA GAG TAA 2 GGAGTAAAA:GGTGTTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.58333333333333 7 34.33333333333333 0.159442558228446 0.237930656019994 0.670121962825369 -0.078488097791548 0.0458883967419254 0.128719831700628 0.737139308526785 0.363305492830867 0.124819728801629 0.529472381700948 270 0 730 0.73 0.27 0.54 ORF3a all ss13 198 AAA TAA AAG 2 GTAAAAGAC:GTTAAAGAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.58333333333333 7 33.99999999999999 0.157156146021032 0.240680790060076 0.652965057916771 -0.0835246440390442 0.0493468536597235 0.124470713937934 NA NA 0.13485949952603 0.535688679083078 250 0 750 0.75 0.25 0.5 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT:AAAGACTGT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.41666666666666 7 34.49999999999999 0.159830135220283 0.236579217337834 0.67558823221588 -0.0767490821175502 0.0460509075119162 0.12408508904505 NaN NaN 0.135900481354811 0.572247397850973 282 0 718 0.718 0.282 0.564 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC:GACTGTGTT 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.25 7 34.49999999999999 0.16021960824549 0.236579217337834 0.677234501189076 -0.076359609092344 0.0458310264542052 0.120590342100868 0.739900444444266 0.360031588248652 0.131429975224104 0.561246640522655 262 0 738 0.738 0.262 0.524 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT:TGTGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.66666666666666 7 34.49999999999999 0.143291427572032 0.236579217337834 0.605680537726239 -0.0932877897658017 0.0430798286183958 0.127402171198915 NaN NaN 0.133001926339781 0.483052302602515 234 1 765 0.765 0.234 0.468 ORF3a all ss13 202 GTA TCG TAT 2 GTCGTTGTA:GTTGTATTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.33333333333333 7 34.83333333333333 0.143981241370948 0.233922247929282 0.615508967810858 -0.0899410065583338 0.0455227698031036 0.121626979076225 0.66838477294717 0.357107770775889 0.132373432786845 0.496853363672506 226 0 774 0.774 0.226 0.452 ORF3a all ss13 203 GTA TAT TAC 2 GTATTACAC:GTTGTACAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.16666666666666 7 34.99999999999999 0.144328652584645 0.23261619622788 0.620458312555569 -0.0882875436432342 0.0436669898503968 0.125243656922157 NaN NaN 0.13162687151274 0.502385518616237 201 0 799 0.799 0.201 0.402 ORF3a all ss13 204 CAC TAC ACA 2 GTACATGGC:TTACACAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.83333333333333 7 35.49999999999999 0.145028544735405 0.228784770270838 0.633908212350492 -0.0837562255354331 0.0447136792469731 0.115065666223291 NaN NaN 0.130049008603716 0.519552178408567 237 0 763 0.763 0.237 0.474 ORF3a all ss13 205 AGT ACA GCT 2 CACAGTTAC:CATGGCTAT 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.41666666666666 7 35.24999999999999 0.145913043990275 0.230684450150283 0.63252223500638 -0.084771406160008 0.0435480787198115 0.11808917641534 NaN NaN 0.126014792994274 0.501131830859187 249 1 750 0.75 0.249 0.498 ORF3a all ss13 206 TAC GCT ACT 2 AGTTACTTC:GGCTATTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.91666666666666 6 35.41666666666666 0.146988835142564 0.192023563619284 0.765472905366926 -0.0450347284767198 0.0450744395588137 0.104961123497452 NaN NaN 0.117522410793858 0.701570590652126 367 0 633 0.633 0.367 0.734 ORF3a all ss13 207 TTC ACT TCA 2 TACTTCACT:TATTTCACC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.24999999999999 7 35.08333333333333 0.14626988152442 0.231968667588477 0.630558786430197 -0.0856987860640572 0.0451398371791727 0.114726414065447 NaN NaN 0.124108275366536 0.489869568335716 213 0 787 0.787 0.213 0.426 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA:TTCACTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.08333333333331 7 34.916666666666664 0.144502989596306 0.233267379251205 0.619473627474895 -0.0887643896548992 0.0462027860950817 0.124516909762191 0.614902128840779 0.313726012351244 0.131323186964736 0.499089402762386 232 1 767 0.767 0.232 0.464 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT:ACTTCAGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.41666666666664 7 34.58333333333333 0.143808164114262 0.235909286040997 0.609590942890102 -0.0921011219267348 0.0455603778971823 0.119314672366909 NaN NaN 0.133168615773252 0.489180508425487 212 0 788 0.788 0.212 0.424 ORF3a all ss13 210 GAT AAG ATT 2 GAAGTTTAC:TCAGATTAT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.74999999999999 7 33.916666666666664 0.127514764415745 0.241378371827081 0.528277506599032 -0.113863607411337 0.0415246898809031 0.120972168740647 NaN NaN 0.132651299978847 0.390689390085567 160 0 840 0.84 0.16 0.32 ORF3a all ss13 211 TAC ATT ACT 2 GATTATTAC:GTTTACTAC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.41666666666666 7 33.916666666666664 0.111185843809109 0.241378371827081 0.460628858200936 -0.130192528017972 0.0364805224210674 0.120642682034675 NaN NaN 0.134657674034781 0.333623644347162 110 0 890 0.89 0.11 0.22 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG:TATTACCAG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.58333333333333 7 33.416666666666664 0.124279002650387 0.245651054395603 0.505916829692272 -0.121372051745216 0.0402208702438802 0.126269097523952 NaN NaN 0.139006646933059 0.382587604724662 164 0 836 0.836 0.164 0.328 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTG:TACCAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.91666666666666 7 33.08333333333333 0.123708284429487 0.248585325313905 0.497649184533612 -0.124877040884417 0.0394094346074121 0.128589511786271 NaN NaN 0.137987473281102 0.36547161623003 136 0 864 0.864 0.136 0.272 ORF3a all ss13 214 CTG AGC TGT 2 CAGCTGTAC:CAGCTTGAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.24999999999999 7 32.416666666666664 0.123142795706581 0.254671378073331 0.483536063762623 -0.13152858236675 0.0392965982912119 0.122591446016488 0.469830817915965 0.303399516085817 0.136885771003643 0.336620653420628 131 1 868 0.868 0.131 0.262 ORF3a all ss13 215 GAG TGT ACT 2 CTGTACTCA:CTTGAGTCT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.41666666666666 7 32.416666666666664 0.122861989946783 0.254671378073331 0.482433443743355 -0.131809388126548 0.040218171206884 0.126697998357895 NaN NaN 0.140327267661684 0.347576791244468 127 0 873 0.873 0.127 0.254 ORF3a all ss13 216 TCA ACT CAA 2 GAGTCTACA:TACTCAACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.25 7 31.91666666666666 0.106966265210453 0.259437126225709 0.412301303081011 -0.152470861015256 0.0377883143656503 0.142288248107132 NaN NaN 0.142507078433561 0.284656306486438 103 0 897 0.897 0.103 0.206 ORF3a all ss13 217 ACA CAA CAC 2 TCAACTCAA:TCTACACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.91666666666666 7 30.91666666666666 0.104630738407805 0.269530500680923 0.38819628258573 -0.164899762273118 0.0365666128765198 0.13510393955019 NaN NaN 0.14488906554367 0.255074357357465 79 0 921 0.921 0.079 0.158 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT:ACTCAATTG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.75 7 31.08333333333333 0.104859684055263 0.267793509240842 0.391569177134001 -0.162933825185579 0.0369722377076903 0.141296803895149 NaN NaN 0.143049014549629 0.254700245449123 81 0 919 0.919 0.081 0.162 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TGA 2 CAAATTACT:CAATTGAGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.08333333333333 7 32.08333333333333 0.107205575102587 0.257828654327118 0.415801631445398 -0.150623079224531 0.0371955065946815 0.131621732315938 NaN NaN 0.142447411024393 0.290331675824356 91 0 909 0.909 0.091 0.182 ORF3a all ss13 220 ACT TGA CTA 2 ATTACTACA:TTGAGCACA 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.25 7 33.08333333333333 0.0939775170586381 0.248585325313905 0.378049335534858 -0.154607808255267 0.0327967016062226 0.131108676152035 NaN NaN 0.137185737082503 0.259744075704111 77 0 923 0.923 0.077 0.154 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC:AGCACAGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.08333333333334 7 33.91666666666666 0.0810687166991055 0.241378371827081 0.335857417901474 -0.160309655127976 0.0318895604956931 0.125227444575691 NaN NaN 0.12437653046081 0.197430771366373 50 0 950 0.95 0.05 0.1 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.75000000000001 7 34.249999999999986 0.0814358477684013 0.238612230829161 0.341289495033081 -0.15717638306076 0.0323558105502545 0.126333644370592 NaN NaN 0.117875452777421 0.182397082245514 52 0 948 0.948 0.052 0.104 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.08333333333334 7 34.91666666666666 0.0821801867828477 0.233267379251205 0.352300381847853 -0.151087192468358 0.0312354742576214 0.125474407064022 NaN NaN 0.127195611673956 0.234899063289377 66 0 934 0.934 0.066 0.132 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT:ACTGGTGTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.41666666666669 7 34.58333333333332 0.0818063224852469 0.235909286040997 0.346770251642533 -0.15410296355575 0.0320748483412048 0.115537881561535 NaN NaN 0.125277402802947 0.218661960329426 50 0 950 0.95 0.05 0.1 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA:GGTGTTGAA 1:1 FALSE 0.916666666666667 0.75 1.33333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.91666666666669 7 34.08333333333332 0.0812518671161106 0.239987262930077 0.338567414470594 -0.158735395813966 0.0327958438143893 0.122309617380252 NaN NaN 0.127202884082161 0.212070799648291 71 1 928 0.928 0.071 0.142 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:GTTGAACAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.66666666666669 6 33.416666666666664 0.0804341477651982 0.205237238024368 0.391908157308412 -0.12480309025917 0.0315456844691191 0.121215308169861 NA NA 0.11371746242812 0.272429891526985 93 0 907 0.907 0.093 0.186 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GAACATGTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA:CATGTTACC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC:GTTACCTTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC:ACCTTCTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTAC:TTCATCTTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TAC TCT ACA 2 ATCTACAAT:ATCTTTAAC 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC ACA ACA 2 TACAATAAA:TTTAACAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAA ACA AAA 2 AACAAGCTT:AATAAAATT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 ATT AAA TTG 2 AAAATTGTT:AAGCTTGTT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 ATTGTTGAT:CTTGTTAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTGATGAG 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:GATGAGCCT 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 1 GACCCA---:GAGCCTGAA 1:1 FALSE 0.666666666666667 0.5 1.33333333333333 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- CTG AAG 1 CCA---CCG:CCTGAAGAA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C AAC 1 ---CCGAAT:GAAGAACAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 2 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT AAC ATG 2 CCGAATGTG:GAACATGTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTC ATG TCC 2 AATGTGCAA:CATGTCCAA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TCC AAA 2 GTCCAAATT:GTGCAAATA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC:CAAATTCAC 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA:ATTCACACA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC:ATCGACGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT:GACGGTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCA GCT CAT 2 GGCTCTTCA:GGTTCATCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CAT CAG 2 TCATCCGGA:TCTTCAGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT:TCCGGAGTT 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTTAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTTAATCCA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAA:GCAATGGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAA TGG AAC 2 ATGGAACCA:ATGGATCCA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA AAC CAA 2 GAACCAATT:GATCCAATT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAA:TATGATGAG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAA ATG AAC 2 GATGAACCG:GATGAGCCG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AAC CGA 2 GAACCGACG:GAGCCGACG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 2 GAT TGG ATT 2 ATGGATTTG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 73.41666666666669 14 33.416666666666664 0.150313866488423 0.613358771049555 0.245066792199306 -0.463044904561132 0.0459626055613649 0.280850730346816 0.131589703832283 0.0625530148871352 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 3 TTG ATT TGT 2 GATTTGTTT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 72.75000000000001 15 33.75 0.15184060156898 0.673456194904469 0.225464703892907 -0.521615593335489 0.0466957593331342 0.312100030461482 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 4 TTT TGT TTA 2 TTGTTTATG 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 72.08333333333334 15 34.083333333333336 0.153398778089708 0.662862330839796 0.231418759149224 -0.509463552750088 0.0451885927306911 NA NA NA 0.315779326086738 0.106667817617065 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 5 ATG TTA TGA 2 TTTATGAGA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 72.25 15 33.916666666666664 0.153006233162977 0.66811452976938 0.229011982744622 -0.515108296606403 0.04521884864733 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 6 AGA TGA GAA 2 ATGAGAATC:ATGAGATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 72.58333333333334 15 34.583333333333336 0.152227160286946 0.647619409730388 0.235056513130637 -0.495392249443442 0.0459229938027259 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 7 ATC GAA TCT 2 AGAATCTTC:AGATTTTTT 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 73.25 15 34.916666666666664 0.150692654973098 0.637863835561037 0.2362458044679 -0.487171180587939 0.0456897736044523 0.314801253545454 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 8 TTC TCT TCA 2 ATCTTCACA:TTTTTTACT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.25 15 35.083333333333336 0.134185798854255 0.633101851812417 0.211949781018827 -0.498916052958161 0.0442546879326504 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 9 ACA TCA CAA 2 TTCACAATT:TTTACTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 74.41666666666666 15 34.583333333333336 0.13188569801946 0.647619409730388 0.203646919838869 -0.515733711710928 0.0423392029176695 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 10 ATT CAA TTA 2 ACAATTGGA:ACTCTTAGA 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.91666666666666 15 35.083333333333336 0.132861703193865 0.633101851812417 0.209858339244333 -0.500240148618551 0.0443610123724099 0.286179097468987 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 11 AGA TTA GAA 2 ATTGGAACT:CTTAGATCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.66666666666666 16 35.083333333333336 0.117311764843583 0.70251551983635 0.166988146925082 -0.585203754992768 0.0391166611050175 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 12 ACT GAA CAA 2 AGATCAATT:GGAACTGTA 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.75 15 35.583333333333336 0.117168293677861 0.619256547280528 0.189208001421069 -0.502088253602668 0.0395440572146512 0.284738982869597 0.0959239940852883 0.0485550256056669 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 13 ATT CAA TAA 2 ACTGTAACT:TCAATTACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.08333333333334 15 35.25000000000001 0.100992663859693 0.628414519653642 0.160710264803169 -0.52742185579395 0.0354632066967126 0.313737736264482 NA NA 0.270517662359265 0.051214721316666 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 14 ACT TAA CTG 2 ATTACTGCA:GTAACTTTG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.25000000000001 14 35.583333333333336 0.100750036200046 0.557683525640128 0.180658082170173 -0.456933489440082 0.0360100616924456 0.243684257697065 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 15 GCA CTG CAC 2 ACTGCACAG:ACTTTGAAG 1:1 TRUE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 1 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.41666666666669 14 35.416666666666664 0.10050857327761 0.561588195649006 0.178972019099255 -0.461079622371396 0.0371820680034455 0.259385290803139 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 16 AAG CAC AGC 2 GCACAGCCA:TTGAAGCAA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.41666666666669 13 35.583333333333336 0.085298926564713 0.500784212559093 0.170330702177732 -0.41548528599438 0.0322927008787189 0.21954927116463 0.102976646862467 0.0981130541848818 0.20673693004371 0.0444598367294228 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 17 CAA AGC AAG 2 AAGCAAGGT:CAGCCAGTA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.41666666666669 13 36.583333333333336 0.0865304311153283 0.481561276915033 0.179687269852048 -0.395030845799705 0.0345466831469899 0.205598546602346 0.120629022291511 0.136333197231141 NA NA NA NA NA NA NA 1 ORF3a all ss13 18 GGT AAG GTG 2 CAAGGTGAA:CCAGTAAAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.16666666666669 13 37.166666666666664 0.0716534971389809 0.471036208761442 0.152118872830157 -0.399382711622461 0.0313008536490064 NA 0.0907257896502517 0.0936034436263666 0.182200315577039 0.0283796572770122 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 19 AAA GTG AAA 2 GGTGAAATC:GTAAAAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.16666666666669 13 37.333333333333336 0.0567646707244322 0.46811573180474497 0.121262044549507 -0.411351061080313 0.0294591139149491 0.174609630487412 0.0814518288896062 0.136551161814703 0.189308842526349 0.0297870980261301 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 20 ATC AAA TCA 2 AAAATTGAC:GAAATCAAG 1:1 FALSE 1.75 0.75 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.16666666666669 12 36.666666666666664 0.0559700169039056 0.430009485560493 0.130159958752891 -0.374039468656588 0.0272416826624502 0.184388761843809 0.0883360755798838 0.140626173105315 0.177931929409833 0.0355402054299039 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 21 AAG TCA ACA 2 ATCAAGGAT:ATTGACAAT 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.08333333333336 12 37.166666666666664 0.0560353868844177 0.422238513751146 0.132710269337115 -0.366203126866728 0.027839868428402 0.159939717986822 0.0917873055588325 0.14822052068022 0.177682622706402 0.039303447361129 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 22 AAT ACA ATG 2 AAGGATGCT:GACAATGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.91666666666669 11 36.333333333333336 0.0423143935004423 0.38772045925013 0.109136344216347 -0.345406065749688 0.0240654335617049 0.169750111260445 0.088999179829948 0.22009996130614 0.158725307030737 0.0295459352834906 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 23 GCT ATG CTA 2 AATGCTTCT:GATGCTACT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.91666666666669 10 35.666666666666664 0.0429199333819239 0.351102161303205 0.122243432574199 -0.308182227921281 0.0244046583986476 0.163481066138677 0.104783055793612 0.243358372206119 0.157906559277385 0.0509768448062976 1 0 999 0.999 0.001 0.002 ORF3a all ss13 24 ACT CTA CTC 2 GCTACTCCT:GCTTCTCCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.41666666666669 10 36.166666666666664 0.0432292511544661 0.344937320784251 0.125324946155956 -0.301708069629785 0.0234467010692694 0.156006494008998 0.107986743957333 0.245821443158024 0.142156665969148 0.0338072540370094 0 0 1000 1 0 0.001 ORF3a all ss13 25 CCT CTC CTG 2 ACTCCTTCA:TCTCCTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.75000000000001 9 35.833333333333336 0.0579298692281368 0.305845048400816 0.189409210745889 -0.24791517917268 0.0286188434111777 0.139343950021635 0.151685423034465 0.211775730262243 0.142966762894929 0.082904665213155 11 0 989 0.989 0.011 0.022 ORF3a all ss13 26 GCA CTG CAA 2 CCTGCAAGT:CCTTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.50000000000001 9 35.74999999999999 0.0573071018565008 0.306725803994525 0.186834955227711 -0.249418702138024 0.0284880433667056 0.140765985324234 NaN NaN 0.143217144440854 0.0815885812462731 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 27 AGT CAA ATT 2 GCAAGTACT:TCAGATTTT 1:1 TRUE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.16666666666669 8 35.08333333333333 0.0567646707244322 0.271845168498986 0.208812505434115 -0.215080497774553 0.0279346884110314 0.126718620430358 NaN NaN 0.133088996115632 0.106080212943586 17 0 983 0.983 0.017 0.034 ORF3a all ss13 28 ACT ATT CTG 2 AGTACTGTT:GATTTTGTT 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.75 1.16666666666667 0 0 0 2 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.16666666666669 8 35.74999999999999 0.0427669289697661 0.265759990634356 0.16092312792337 -0.22299306166459 0.0254092981358858 0.118416361209989 0.184841420716119 0.38397204375179 0.127998284840232 0.0814810390962815 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 29 GTT CTG TTC 2 ACTGTTCAT:TTTGTTCGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.08333333333336 6 35.24999999999999 0.0568319121182793 0.193059006111768 0.294375866026045 -0.136227093993489 0.0281181244902101 0.085016619072374 NaN NaN 0.096377806415085 0.157517710480106 50 1 949 0.949 0.05 0.1 ORF3a all ss13 30 CAT TTC ATG 2 GTTCATGCT:GTTCGCGCT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.1666666666667 6 35.41666666666666 0.0567646707244322 0.192023563619284 0.295613046933015 -0.135258892894852 0.0283919108224855 0.085837494924457 0.420885834994959 0.482455170046061 0.0952244277928949 0.155484798423537 52 0 948 0.948 0.052 0.104 ORF3a all ss13 31 GCT ATG CTA 2 CATGCTACA:CGCGCTACT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.6666666666667 7 35.74999999999999 0.042464170499631 0.226916358788052 0.187135783098362 -0.184452188288421 0.0250508173986856 0.105325511638156 0.207757366591402 0.367725519203987 0.104468307365643 0.0774582476641762 7 1 992 0.992 0.007 0.014 ORF3a all ss13 32 ACA CTA CAG 2 GCTACAGCA:GCTACTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.6666666666667 7 35.24999999999999 0.0418713371647064 0.230684450150283 0.181509144363344 -0.188813112985577 0.0245187381563547 0.101689917384332 NaN NaN 0.105984979064625 0.074829460797873 9 0 991 0.991 0.009 0.018 ORF3a all ss13 33 GCA CAG CAA 2 ACAGCAACG:ACTGCAACG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.50000000000003 7 35.08333333333332 0.0413898116754681 0.231968667588477 0.178428458057515 -0.190578855913009 0.0239708370237679 0.106099662168461 0.232383169214043 0.442594097319509 0.106705386640366 0.0740946523966053 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 34 ACG CAA CGA 2 GCAACGATA 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.00000000000003 7 34.91666666666665 0.0411061773712463 0.233267379251206 0.176219141755689 -0.192161201879959 0.0236924118795359 0.096513362117302 0.231118708590185 0.445784549590074 0.107074212610543 0.0727087873368319 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 35 ATA CGA TAC 2 ACGATACCG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.08333333333337 7 34.08333333333332 0.0410592825874941 0.239987262930077 0.171089424022712 -0.198927980342583 0.0234242616940004 0.103958805082412 NaN NaN 0.111320316082895 0.0739395568105221 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 36 CCG TAC CGA 2 ATACCGATA:ATACCGCTA 1:1 FALSE 0.75 1 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.58333333333337 7 33.08333333333332 0.0407801460981609 0.248585325313905 0.164048887627076 -0.207805179215744 0.0248828748816184 0.109620497718939 NaN NaN 0.113039453333535 0.0660120200167497 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 37 ATA CGA TAC 2 CCGATACAA:CCGCTACAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.6666666666667 7 31.83333333333332 0.0401881846005797 0.26024898720615 0.154422059551554 -0.220060802605571 0.0236993782472848 0.118339317688765 NaN NaN 0.120930506967803 0.0688002190941029 8 0 992 0.992 0.008 0.016 ORF3a all ss13 38 CAA TAC AAG 2 ATACAAGCC:CTACAAGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.9166666666667 6 32.083333333333314 0.0400540111089283 0.215112484631514 0.186200309003638 -0.175058473522586 0.0233073979558921 0.103198335958154 NaN NaN 0.102046716623646 0.086258386356504 27 0 973 0.973 0.027 0.054 ORF3a all ss13 39 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.58333333333336 6 32.749999999999986 0.0402331091273882 0.210058104799921 0.191533238699406 -0.169824995672533 0.0239491691444152 0.0998569404211562 NaN NaN 0.100240468521686 0.090231844572736 19 0 981 0.981 0.019 0.038 ORF3a all ss13 40 TCA CCT CAC 2 GCCTCACTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.58333333333336 6 32.749999999999986 0.0402331091273882 0.210058104799921 0.191533238699406 -0.169824995672533 0.0242191366251194 0.101054452823622 NaN NaN 0.104478700150986 0.10406652090806 16 0 984 0.984 0.016 0.032 ORF3a all ss13 41 CTC CAC TCC 2 TCACTCCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.08333333333336 7 32.41666666666665 0.0399650588551816 0.254671378073331 0.156927956166609 -0.214706319218149 0.0232173111961889 0.112694989260287 0.18098041038088 0.385887697926483 0.11946702601511 0.0723036353585144 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 42 CCT TCC CTT 2 CTCCCTTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.75000000000001 7 32.749999999999986 0.0401433603117785 0.251591206901637 0.159557882829638 -0.211447846589858 0.0238980060882139 0.113208157263976 0.233913320510923 0.495160564950861 0.121419062998895 0.0816009519936315 7 0 993 0.993 0.007 0.014 ORF3a all ss13 43 TTC CTT TCG 2 CCTTTCGGA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.91666666666669 7 32.58333333333332 0.0400540111089283 0.253121833623 0.158240048025983 -0.213067822514072 0.0232710424394877 0.111925151750348 0.196767342279667 0.42128220845913 0.114825928269835 0.0635145316992664 5 0 995 0.995 0.005 0.01 ORF3a all ss13 44 GGA TCG GAT 2 TTCGGATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.75000000000001 7 31.91666666666665 0.0396131668795608 0.259437126225709 0.152688890197995 -0.219823959346148 0.0232452218902491 0.120495974853252 NaN NaN 0.123501133072473 0.0750866386146233 6 1 993 0.993 0.006 0.012 ORF3a all ss13 45 TGG GAT GGC 2 GGATGGCTT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.91666666666669 7 31.749999999999986 0.0395261602343306 0.261065996643646 0.151402943096736 -0.221539836409316 0.0227820316812482 0.121309797514713 NaN NaN 0.125822398369228 0.0782833522841586 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 46 CTT GGC TTA 2 TGGCTTATT:TGGCTTGTT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.58333333333334 7 31.41666666666665 0.0397005575048303 0.264386521096342 0.150161049588317 -0.224685963591511 0.0227683472605498 0.118386351831958 0.198724245417251 0.449873936864425 0.124640908313901 0.0714406395781477 10 0 990 0.99 0.01 0.02 ORF3a all ss13 47 ATT TTA TTA 2 CTTATTGTT:CTTGTTATT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.25 7 30.74999999999999 0.0393532888030902 0.271290419358981 0.145059633495633 -0.23193713055589 0.0217071745131134 0.123012639552382 NaN NaN 0.126727317298862 0.0672191007570254 6 0 994 0.994 0.006 0.012 ORF3a all ss13 48 ATT TTA TTG 2 ATTGTTGGC:GTTATTGGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.83333333333334 6 30.916666666666654 0.0395696157178212 0.224573223705648 0.176199170430424 -0.185003607987827 0.0224170951480727 0.110177720172405 NaN NaN 0.110128575575821 0.0929792231195959 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 49 GGC TTG GCG 2 ATTGGCGTT:GTTGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.25000000000001 5 31.249999999999986 0.0398765009105086 0.179963002222943 0.22158166077441 -0.140086501312435 0.0227089683220811 0.0898894551807329 NaN NaN 0.0992262746425029 0.158012281573039 43 0 957 0.957 0.043 0.086 ORF3a all ss13 50 GTT GCG TTG 2 GGCGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.41666666666669 5 32.08333333333332 0.0403232602433046 0.17469866826028 0.230816071151887 -0.134375408016975 0.0235894399215526 0.0903998367695877 NaN NaN 0.0931098350349298 0.148966274619266 38 1 961 0.961 0.038 0.076 ORF3a all ss13 51 GCA TTG CAC 2 GTTGCACTT:GTTGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.08333333333334 5 31.41666666666666 0.0399650588551816 0.178884786483983 0.223412284748764 -0.138919727628802 0.0227284029832526 0.0858858675574601 NA NA 0.0926164084596542 0.133628065912353 32 0 968 0.968 0.032 0.064 ORF3a all ss13 52 CTT CAC TTC 2 GCACTTCTT:GCATTTCTT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.75 6 32.25 0.0401433603117785 0.213826069393717 0.187738382067262 -0.173682709081938 0.0236962771457473 0.100190959241823 NaN NaN 0.107280117966608 0.105454888411898 14 0 986 0.986 0.014 0.028 ORF3a all ss13 53 CTT TTC TTG 2 CTTCTTGCT:TTTCTTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77 5 32.333333333333336 0.0400094855289696 0.173179167487274 0.2310294367936 -0.133169681958305 0.0230350239965916 0.086246849553805 NaN NaN 0.0896203096387811 0.137297120110295 42 2 956 0.956 0.042 0.084 ORF3a all ss13 54 GCT TTG CTG 2 CTTGCTGTT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.33333333333334 5 32 0.0398323689854613 0.175211138386129 0.22733925110217101 -0.135378769400668 0.0235777166385409 0.085474900835853 NaN NaN 0.0925263472810951 0.143429755684497 52 1 947 0.947 0.052 0.104 ORF3a all ss13 55 GTT CTG TTT 2 GCTGTTTTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.33333333333334 5 32.33333333333333 0.0535942229866087 0.173179167487274 0.309472690995278 -0.119584944500666 0.0264532594675406 0.08351283597981 NaN NaN 0.0924176806695002 0.195678630668459 83 0 917 0.917 0.083 0.166 ORF3a all ss13 56 TTT TTT TTC 2 GTTTTTCAG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.33333333333334 5 32 0.0528853382457436 0.175211138386129 0.30183776404212 -0.122325800140385 0.0267313453408534 0.0854126958078872 NA NA 0.0930534217377777 0.188652421625312 69 0 931 0.931 0.069 0.138 ORF3a all ss13 57 CAG TTC AGA 2 TTTCAGAGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.00000000000001 6 31.833333333333332 0.0531195394264593 0.217071598340042 0.244709763196416 -0.163952058913583 0.0269395706316 0.0993672498066012 0.313246796888094 0.434682310338778 0.102804221906421 0.110757215515008 22 0 978 0.978 0.022 0.044 ORF3a all ss13 58 AGC AGA GCG 2 CAGAGCGCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.08333333333334 6 32.083333333333336 0.0537744248135208 0.215112484631514 0.2499828166907 -0.161338059817993 0.0272803994920607 0.101739998045941 0.314914773443676 0.427305457799613 0.104879045843997 0.123969166251262 26 0 974 0.974 0.026 0.052 ORF3a all ss13 59 GCT GCG CTA 2 AGCGCTACC:AGCGCTTCC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666669 6 32.583333333333336 0.0546316519559279 0.211299152734159 0.258551211630561 -0.156667500778232 0.0272275195763976 0.100490276405136 0.322904205128955 0.423302088509079 0.107358944541222 0.144486160949001 40 0 960 0.96 0.04 0.08 ORF3a all ss13 60 ACC CTA CCA 2 GCTACCAAA:GCTTCCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666669 6 32.08333333333333 0.0542609435735893 0.215112484631514 0.25224451136129 -0.160851541057925 0.0278493277531775 0.0973771659494255 0.288899135293805 0.382595978983269 0.111979146152894 0.150876628501871 36 0 964 0.964 0.036 0.072 ORF3a all ss13 61 AAA CCA AAA 2 ACCAAAATA:TCCAAAATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.41666666666669 5 31.08333333333333 0.0535344239114693 0.181054357970061 0.295681498703951 -0.127519934058592 0.0284095253488306 0.0916150849784547 NaN NaN 0.0971302574435907 0.189224908089448 73 0 927 0.927 0.073 0.146 ORF3a all ss13 62 ATA AAA TAA 2 AAAATAATT:AAAATCATA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.75000000000001 5 30.749999999999996 0.0547563501152288 0.183277466946071 0.298762041115183 -0.128521116830843 0.027145508746724 0.0914322232178639 NaN NaN 0.100660688353193 0.201681460951469 69 0 931 0.931 0.069 0.138 ORF3a all ss13 63 ATA TAA TAA 2 ATAATTGCG:ATCATAACC 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.25000000000001 5 30.416666666666664 0.0551338852123344 0.185556129985381 0.29712780287387 -0.130422244773046 0.0284914080231942 0.0981365195238256 NaN NaN 0.100073387122038 0.192483958235214 58 0 942 0.942 0.058 0.116 ORF3a all ss13 64 ACC TAA CCC 2 ATAACCCTC:ATTGCGCTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.08333333333334 5 30.083333333333332 0.0552608903391469 0.187892466749351 0.294109132181786 -0.132631576410205 0.0273320381115304 0.0933501878325656 NaN NaN 0.102965263282403 0.197704324558818 62 0 938 0.938 0.062 0.124 ORF3a all ss13 65 CTC CCC TCA 2 ACCCTCAAA:GCGCTCAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.25 5 30.583333333333332 0.0551338852123344 0.184409724221212 0.298974934457348 -0.129275839008877 0.029007855858467 0.0940287071360533 NaN NaN 0.100511618108834 0.198380922677878 66 0 934 0.934 0.066 0.132 ORF3a all ss13 66 AAA TCA AAA 2 CTCAAAAAG:CTCAATAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666667 5 29.916666666666668 0.0546316519559279 0.189082955000185 0.288929543944744 -0.134451303044257 0.0260310497036257 0.0992771259972216 NaN NaN 0.102159887262459 0.188144832268391 56 0 944 0.944 0.056 0.112 ORF3a all ss13 67 AAA AAA AAA 2 AAAAAGAGA:AATAAAAGA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.66666666666667 5 29.166666666666668 0.0401881846005798 0.194633396613813 0.206481443060464 -0.154445212013234 0.0233133060075487 0.0998963124776953 NaN NaN 0.102136377870819 0.130496483876175 43 0 957 0.957 0.043 0.086 ORF3a all ss13 68 AGA AAA GAT 2 AAAAGATGG:AAGAGATGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 77 5 28.75 0.053834761795598 0.197860943283853 0.272083822618627 -0.144026181488255 0.0263070771703335 0.100232671590467 NaN NaN 0.114320725987347 0.207725956737756 53 0 947 0.947 0.053 0.106 ORF3a all ss13 69 TGG GAT GGC 2 AGATGGCAA:AGATGGCAG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.33333333333333 5 29.25 0.0543223783836108 0.194000551939624 0.280011463062831 -0.139678173556013 0.0268959159533941 0.095913791472011 NaN NaN 0.104344387589342 0.180692259733455 57 0 943 0.943 0.057 0.114 ORF3a all ss13 70 CAA GGC AAC 2 TGGCAACTA:TGGCAGCTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333333 5 29.916666666666668 0.0550706014161129 0.189082955000185 0.29125100893446 -0.134012353584072 0.0261296412223817 0.0994002521973567 NaN NaN 0.106120536625524 0.206649751335065 57 0 943 0.943 0.057 0.114 ORF3a all ss13 71 CTA AAC TAG 2 CAACTAGCA:CAGCTAGCC 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.74999999999999 6 30.083333333333336 0.0700625753990949 0.231861099259994 0.302174774564194 -0.161798523860899 0.0309356728372923 0.114135496389052 NaN NaN 0.119805421427699 0.176852169482821 39 0 961 0.961 0.039 0.078 ORF3a all ss13 72 GCA TAG CAC 2 CTAGCACTC:CTAGCCCTT 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 76.25 6 30.41666666666667 0.0979270134965697 0.228889480485489 0.427835360929914 -0.13096246698892 0.0420770728182779 0.103912772897237 NaN NaN 0.117180276130719 0.263731340417347 89 0 911 0.911 0.089 0.178 ORF3a all ss13 73 CTC CAC TCT 2 GCACTCTCC:GCCCTTTAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 76.91666666666666 6 30.91666666666667 0.0970208852905795 0.224573223705648 0.432023389474724 -0.127552338415068 0.0423809202844549 0.106219347393574 NaN NaN 0.116186485688861 0.272281251853574 115 1 884 0.884 0.115 0.23 ORF3a all ss13 74 TAT TCT ATA 2 CTCTCCAAG:CTTTATAAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 76.91666666666666 6 30.91666666666667 0.0970208852905795 0.224573223705648 0.432023389474724 -0.127552338415068 0.0418494792922302 0.101986225199815 NaN NaN 0.114219904397865 0.264111492007781 95 0 905 0.905 0.095 0.19 ORF3a all ss13 75 AAG ATA AGG 2 TATAAGGGC:TCCAAGGGT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.333333333333333 1.08333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.91666666666666 6 30.91666666666667 0.0823684046093706 0.224573223705648 0.366777495777201 -0.142204819096277 0.0398223236159772 0.109368838284704 NaN NaN 0.108582035531721 0.190313155007025 65 0 935 0.935 0.065 0.13 ORF3a all ss13 76 GGC AGG GCT 2 AAGGGCTTC:AAGGGTGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76 6 30.16666666666667 0.0834192263326683 0.231110927283054 0.360948862580177 -0.147691700950386 0.0403168370708631 0.103168617939267 0.413823469406753 0.383083420130759 0.112989829084932 0.191170650802513 53 0 947 0.947 0.053 0.106 ORF3a all ss13 77 GTT GCT TCC 2 GGCTTCCAG:GGTGTTCAC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76 6 29.83333333333334 0.0834192263326683 0.234141361979703 0.356277189247322 -0.150722135647034 0.0378831926079168 0.106591531447119 NaN NaN 0.113565023975745 0.184446504983931 61 0 939 0.939 0.061 0.122 ORF3a all ss13 78 CAC TCC ACT 2 GTTCACTTT:TTCCAGTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 76.25 6 29.500000000000007 0.0979270134965697 0.237252996159118 0.412753537708301 -0.139325982662548 0.0439099929416426 0.107698752024682 NaN NaN 0.106069045471107 0.189000896987116 56 0 944 0.944 0.056 0.112 ORF3a all ss13 79 TTC ACT TCA 2 CACTTTGTT:CAGTTCATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.75 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.58333333333333 6 29.500000000000007 0.082747441258963 0.237252996159118 0.348773008554408 -0.154505554900155 0.0401251353682719 0.107174357734985 NaN NaN 0.11107237647541 0.164214836309562 45 1 954 0.954 0.045 0.09 ORF3a all ss13 80 ATT TCA TTT 2 TTCATTTGC:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.16666666666666 6 29.666666666666675 0.0832261761385522 0.235686824877377 0.3531218861379 -0.152460648738825 0.0403683033283014 0.113126806616673 NaN NaN 0.110831640631739 0.168943707084299 39 0 961 0.961 0.039 0.078 ORF3a all ss13 81 TGC TTT GCA 2 ATTTGCAAT:GTTTGCAAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.83333333333333 5 29.33333333333334 0.0824628375267119 0.193371831976575 0.426446999461129 -0.110908994449863 0.0400986071850675 0.0968521532094286 NaN NaN 0.0994687820916909 0.264844810762191 97 0 903 0.903 0.097 0.194 ORF3a all ss13 82 AAC GCA ACT 2 TGCAACTTG:TGCAATTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.66666666666666 5 30.000000000000007 0.0826523551002108 0.188485821210679 0.438507016439323 -0.105833466110469 0.0387655386802557 0.0953096790835765 NA NA 0.0919016727875839 0.249487719332821 84 0 916 0.916 0.084 0.168 ORF3a all ss13 83 TTA ACT TAC 2 AACTTGCTG:AATTTACTG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.66666666666666 5 30.000000000000007 0.0826523551002108 0.188485821210679 0.438507016439323 -0.105833466110469 0.0388901699760271 0.091665839253002 NaN NaN 0.093590354635046 0.258132563768692 115 0 885 0.885 0.115 0.23 ORF3a all ss13 84 CTG TAC TGC 2 TTACTGCTG:TTGCTGTTG 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 77 5 29.83333333333334 0.0822741879423184 0.189683904532547 0.433743643906282 -0.107409716590229 0.0386948227864822 0.0905780506740828 NaN NaN 0.0982113659695205 0.274104686206262 88 0 912 0.912 0.088 0.176 ORF3a all ss13 85 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA:CTGTTGTTG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.08333333333333 6 30.83333333333334 0.111704294041658 0.22528117443765 0.495843890731196 -0.113576880395992 0.0496731367241914 0.106239355494498 NaN NaN 0.0964940209888014 0.239181369711113 86 0 914 0.914 0.086 0.172 ORF3a all ss13 86 CTA TGC TAT 2 CTGCTATTT:TTGTTGTTT 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.666666666666667 0 0.5 0 1 0 1 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.58333333333333 6 31.500000000000007 0.112491115941025 0.219740343511106 0.511927460126773 -0.107249227570081 0.048601094619223 0.100694766540856 NaN NaN 0.0947715661618291 0.257777240164886 89 0 911 0.911 0.089 0.178 ORF3a all ss13 87 TTT TAT TTG 2 CTATTTGTT:TTGTTTGTA 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.5 1.08333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.16666666666667 6 32.75000000000001 0.113155334268708 0.210058104799921 0.538685876350676 -0.0969027705312136 0.0519801841332264 0.0990973042817104 NaN NaN 0.0909366744327739 0.286601265424205 99 2 899 0.899 0.099 0.198 ORF3a all ss13 88 GTA TTG TAA 2 TTTGTAACA:TTTGTTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.08333333333333 6 32.00000000000001 0.111704294041658 0.215761554338836 0.517721029513142 -0.104057260297178 0.0492615870526016 0.0965066665615763 NaN NaN 0.0907601328567601 0.251584828104284 98 0 902 0.902 0.098 0.196 ORF3a all ss13 89 ACA TAA CAG 2 GTAACAGTT:GTTACCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.75 6 32.33333333333334 0.112227610965344 0.213188653016244 0.526423941319209 -0.100961042050899 0.0507496328369454 0.101580382354363 NaN NaN 0.0922608246172915 0.273823322326612 114 0 886 0.886 0.114 0.228 ORF3a all ss13 90 ATC CAG TCT 2 ACAGTTTAC:ACCATCTAT 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.41666666666666 6 32.00000000000001 0.111185843809109 0.215761554338836 0.515318144373864 -0.104575710529726 0.0487263384424436 0.0978139650789092 NaN NaN 0.0928917968732579 0.260258727167098 98 0 902 0.902 0.098 0.196 ORF3a all ss13 91 TAC TCT ACT 2 ATCTATTCA:GTTTACTCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.91666666666666 5 32.33333333333334 0.11196533988639 0.173179167487274 0.646528918639234 -0.061213827600884 0.0516076256129716 0.0832339336169847 NaN NaN 0.0766900282641052 0.424755594687466 223 0 777 0.777 0.223 0.446 ORF3a all ss13 92 TCA ACT CAC 2 TACTCACAC:TATTCACAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.25 5 32.00000000000001 0.111444464849685 0.175211138386129 0.636058106101023 -0.0637666735364435 0.0528831800702105 0.0858976609538577 NaN NaN 0.0810337864845396 0.431331832326797 200 0 800 0.8 0.2 0.4 ORF3a all ss13 93 CAC CAC ACC 2 TCACACCTT:TCACATCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.75 5 31.166666666666675 0.109159374475305 0.180507022556888 0.604737549426382 -0.0713476480815828 0.050665732084201 0.0861111289975121 NaN NaN 0.0812934695597651 0.380130784725542 161 1 838 0.838 0.161 0.322 ORF3a all ss13 94 CTT ACC TTT 2 CACCTTTTG:CATCTTTTG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.41666666666667 5 30.833333333333343 0.109659022528177 0.182716561993313 0.600159182790393 -0.073057539465136 0.0514062125476233 0.0936038293519024 NaN NaN 0.0830885117163819 0.379252916161846 173 0 827 0.827 0.173 0.346 ORF3a all ss13 95 TTG TTT TGC 2 CTTTTGCTC:CTTTTGCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.91666666666667 5 31.00000000000001 0.108911256999757 0.181605039003649 0.599714950627381 -0.0726937820038919 0.0500284933777051 0.0894227493646407 NaN NaN 0.0819085682331989 0.374810241236543 178 0 822 0.822 0.178 0.356 ORF3a all ss13 96 CTC TGC TCG 2 TTGCTCGTT:TTGCTTGTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.58333333333334 5 32.00000000000001 0.110928422497729 0.175211138386129 0.633112846132339 -0.0642827158883997 0.051109537409564 0.0807125756018877 NA NA 0.077359468036249 0.405995552260336 197 1 802 0.802 0.197 0.394 ORF3a all ss13 97 GTC TCG TCG 2 CTCGTTGCT:CTTGTCGCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.83333333333334 5 32.33333333333334 0.110544521791661 0.173179167487274 0.6383245940929 -0.0626346456956135 0.0524709061176252 0.0879329896727838 NA NA 0.0762268040768554 0.411254524104029 199 1 800 0.8 0.199 0.398 ORF3a all ss13 98 GCT TCG CTG 2 GTCGCTGCA:GTTGCTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.33333333333334 5 31.833333333333343 0.12471051706475 0.176245193423779 0.707596698906195 -0.0515346763590291 0.0523613175859413 0.082040630569414 NaN NaN 0.0808424433116911 0.523818390461723 252 0 748 0.748 0.252 0.504 ORF3a all ss13 99 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGGT:GCTGCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.50000000000001 5 31.166666666666675 0.122722067836352 0.180507022556888 0.679874201557311 -0.0577849547205362 0.0518057666739057 0.0899193815197325 NaN NaN 0.0829076116849363 0.48581525342656 229 0 771 0.771 0.229 0.458 ORF3a all ss13 100 GGC CAG GCC 2 GCAGGTATG:GCTGGCCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.66666666666667 5 31.000000000000007 0.120796168025329 0.181605039003649 0.665158680001727 -0.0608088709783196 0.0495042275757911 0.0920282992095265 NaN NaN 0.0819100521537712 0.457853536384225 211 0 789 0.789 0.211 0.422 ORF3a all ss13 101 ATG GCC TGG 2 GGCCTTGAA:GGTATGGAG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.00000000000001 5 31.33333333333334 0.120256987556385 0.179422266799376 0.670245615004141 -0.0591652792429911 0.0486580341055495 0.0875554318081171 NaN NaN 0.0812510572090287 0.466504277894287 236 0 764 0.764 0.236 0.472 ORF3a all ss13 102 GAA TGG AAG 2 ATGGAGGCG:CTTGAAGCC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.66666666666669 4 31.166666666666668 0.120796168025329 0.140762624951505 0.85815512510473 -0.0199664569261761 0.0502038073339344 0.0780274413242752 NaN NaN 0.0708313676182406 0.778029993416859 391 1 608 0.608 0.391 0.782 ORF3a all ss13 103 GCC AAG CCC 2 GAAGCCCCT:GAGGCGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.41666666666669 4 31.416666666666668 0.135964367940317 0.139531497680893 0.974434949815172 -0.00356712974057627 0.0520214973677625 0.0784501293762526 NaN NaN 0.0678084073373505 0.958045828479243 515 1 484 0.484 0.515 0.968 ORF3a all ss13 104 CAA CCC AAT 2 GCCCCTTTT:GCGCAATTT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 80.66666666666669 5 31.750000000000004 0.150503021596613 0.176766832783369 0.851421158747906 -0.0262638111867556 0.0537084630369782 0.0937935296378678 NaN NaN 0.077873220182627 0.735918113563979 337 0 663 0.663 0.337 0.674 ORF3a all ss13 105 TTT AAT TTC 2 CAATTTTTG:CCTTTTCTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.33333333333336 5 31.750000000000004 0.136119019073684 0.176766832783369 0.770048413100781 -0.0406478137096845 0.052445792168467 0.0895570712632144 NaN NaN 0.0763622373788646 0.594516466123255 282 0 718 0.718 0.282 0.564 ORF3a all ss13 106 CTC TTC TCT 2 TTTCTCTAT:TTTTTGTAC 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.50000000000003 5 31.583333333333336 0.135810068779417 0.177819473768805 0.763752506409917 -0.0420094049893877 0.0541939881628305 0.0912146461612069 NaN NaN 0.079305184850673 0.596307281666167 293 0 707 0.707 0.293 0.586 ORF3a all ss13 107 TAC TCT ACC 2 CTCTATCTT:TTGTACCTC 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.50000000000003 4 32.41666666666667 0.137685157650863 0.134815620966532 1.02128489757907 0.00286953668433149 0.0523409964784637 0.070274616564620307 NaN NaN 0.0573329556303105 0.960082234653092 532 0 468 0.468 0.532 0.936 ORF3a all ss13 108 CTC ACC TCT 2 TACCTCTAT:TATCTTTAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.9166666666667 4 32.5 0.136897596837873 0.134437018317738 1.01830283467251 0.00246057852013423 0.0526299308270226 0.0731027910146214 NaN NaN 0.0555143645843782 0.964646718099201 528 1 471 0.471 0.528 0.942 ORF3a all ss13 109 TAT TCT ATG 2 CTCTATGCC:CTTTATGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.08333333333336 4 32.66666666666667 0.13658509642645 0.133686173554739 1.02168453770968 0.00289892287171084 0.0508853159638522 0.0727052010620587 NA NA 0.0567449242461243 0.959256266205045 538 0 462 0.462 0.538 0.924 ORF3a all ss13 110 GCC ATG CCT 2 TATGCCTTG:TATGCTTTA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.75000000000003 4 33 0.137211534497054 0.132209431753494 1.03783468907791 0.00500210274356044 0.0549007594692609 0.0699186270082952 NaN NaN 0.0538881199876481 0.926043503588197 569 0 431 0.431 0.569 0.862 ORF3a all ss13 111 TTA CCT TAG 2 GCCTTGATA:GCTTTAGTC 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.08333333333336 4 33.66666666666667 0.13848185832304 0.129351945263207 1.07058195407309 0.00912991305983299 0.0538911798758546 0.0687149777999608 NaN NaN 0.05745332378628 0.873739708216756 588 0 412 0.412 0.588 0.824 ORF3a all ss13 112 ATA TAG TAT 2 TTAGTCTAC:TTGATATAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.91666666666669 4 33.833333333333336 0.135043810631934 0.128656816904346 1.04964364797193 0.00638699372758836 0.0526510041056326 0.0693447258308232 NaN NaN 0.0538179546122657 0.905530665397359 545 1 454 0.454 0.545 0.908 ORF3a all ss13 113 TAC TAT ACT 2 ATATATTTT:GTCTACTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 81.58333333333334 4 34.666666666666664 0.133835669008081 0.125290563497375 1.06820230727819 0.00854510551070597 0.0512912448594442 0.06469462891602 NaN NaN 0.0536211818360389 0.873384752353651 587 0 413 0.413 0.587 0.826 ORF3a all ss13 114 TTC ACT TCT 2 TACTTCTTG:TATTTTCTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 81.58333333333334 4 34.666666666666664 0.133835669008081 0.125290563497375 1.06820230727819 0.00854510551070597 0.0518841622538061 0.0683294704359579 NaN NaN 0.0510510478703642 0.867068269516791 578 1 421 0.421 0.578 0.842 ORF3a all ss13 115 CTA TCT TAC 2 TTCTTGCAG:TTTCTACAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 80.75000000000001 4 34.833333333333336 0.135349271124206 0.124638389543236 1.08593565449796 0.0107108815809696 0.0530813085321946 0.0673569183517102 NaN NaN 0.0517361061873939 0.835987100888769 587 0 413 0.413 0.587 0.826 ORF3a all ss13 116 CAA TAC AAT 2 CTACAATGC:TTGCAGAGT 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 12 80.75000000000001 4 35.16666666666667 0.165618196142339 0.123354245726484 1.34262258398117 0.0422639504158554 0.0588242444576811 0.0646233843802597 NaN NaN 0.0591167809005823 0.474656581587282 765 1 234 0.234 0.765 0.468 ORF3a all ss13 117 AGT AAT GCA 2 CAATGCATC:CAGAGTATA 1:1 TRUE 2.25 0.416666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 12 79.50000000000001 5 35.75 0.16853783682123 0.154788747544192 1.08882486288683 0.0137490892770378 0.0636048682165753 0.0734266509959322 NaN NaN 0.0706361087171674 0.845669498624599 569 0 431 0.431 0.569 0.862 ORF3a all ss13 118 ATA GCA TAA 2 AGTATAAAC:TGCATCAAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 79.08333333333334 5 36.083333333333336 0.153847312516879 0.153202253301895 1.00421050735927 6.45059214984617e-4 0.0612940999128827 0.0735415100325057 NaN NaN 0.0692055954555641 0.992563096486711 518 0 482 0.482 0.518 0.964 ORF3a all ss13 119 AAC TAA ACG 2 ATAAACTTT:ATCAACGCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 79.75000000000001 5 35.41666666666667 0.152421181209951 0.156408563919793 0.974506621569096 -0.00398738270984156 0.0585612857594057 0.0757779863022799 NaN NaN 0.0685853563978663 0.953639086186276 469 1 530 0.53 0.469 0.938 ORF3a all ss13 120 GCA ACG CAT 2 AACGCATGT:AACTTTGTA 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.75 1.16666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.75000000000001 6 35.75 0.154570468491074 0.18998582171068 0.81358949367528 -0.0354153532196058 0.0608063928304234 0.0841467213158709 NaN NaN 0.078413157284297 0.65152067755629 307 0 693 0.693 0.307 0.614 ORF3a all ss13 121 GTA CAT GTA 2 GCATGTAGA:TTTGTAAGA 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.16666666666669 5 35.08333333333333 0.138321779350139 0.158062767299148 0.875106653601431 -0.0197409879490089 0.058234794812741 0.0765972977482565 NaN NaN 0.0726373149936487 0.785795223122882 398 0 602 0.602 0.398 0.796 ORF3a all ss13 122 AGA GTA GAA 2 GTAAGAATA:TGTAGAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.33333333333334 5 35.74999999999999 0.12471051706475 0.154788747544192 0.805682060507305 -0.0300782304794424 0.054144949175024 0.0762757739238885 NaN NaN 0.0695797763464534 0.665534947234691 322 1 677 0.677 0.322 0.644 ORF3a all ss13 123 ATA GAA TAA 2 AGAATAATA:AGAATTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.33333333333334 5 35.58333333333333 0.12471051706475 0.155594424961324 0.801510189685454 -0.0308839078965741 0.0516090724823406 0.076833943801175 NaN NaN 0.0703435200821176 0.660629577857338 323 0 677 0.677 0.323 0.646 ORF3a all ss13 124 ATA TAA TAA 2 ATAATAATG:ATTATTATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.66666666666669 5 35.916666666666664 0.12413582885818 0.153991399978411 0.806121828073405 -0.0298555711202315 0.0538687092014787 0.076019308829186 NaN NaN 0.0659999409910293 0.651011428181247 350 0 650 0.65 0.35 0.7 ORF3a all ss13 125 ATG TAA TGA 2 ATAATGAGG:ATTATGAGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.83333333333336 5 35.74999999999999 0.123850470889023 0.154788747544192 0.800125802772991 -0.0309382766551696 0.0513964017577617 0.0715870061376475 NA NA 0.0700856412548571 0.65889788545611 322 0 678 0.678 0.322 0.644 ORF3a all ss13 126 AGA TGA GAT 2 ATGAGATGT:ATGAGGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.33333333333336 5 36.416666666666664 0.123002232202702 0.151648059986963 0.811103236093337 -0.0286458277842609 0.0503263058859326 0.0740999923139316 NaN NaN 0.067084996174627 0.669373525362469 309 1 690 0.69 0.309 0.618 ORF3a all ss13 127 CTT GAT GTT 2 AGATGTTGG:AGGCTTTGG 1:1 TRUE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 79.33333333333336 5 36.74999999999999 0.138002732232705 0.150125187835474 0.919251021247317 -0.0121224556027693 0.0527472075317678 0.0728143656325549 NaN NaN 0.0683739361981046 0.859275545519356 457 1 542 0.542 0.457 0.914 ORF3a all ss13 128 TGG GTT GGC 2 CTTTGGCTT:TGTTGGCTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 79.75000000000003 4 36.41666666666666 0.152421181209951 0.118766081588831 1.28337298975337 0.0336550996211202 0.0597881674877931 0.0628352635559755 NaN NaN 0.0716456651915798 0.638538144637331 663 0 337 0.337 0.663 0.674 ORF3a all ss13 129 CTT GGC TTT 2 TGGCTTTGC:TGGCTTTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.58333333333337 4 36.58333333333333 0.154934610949651 0.11818004032857 1.31100489151039 0.0367545706210805 0.0599302081357786 0.0634762256908381 NaN NaN 0.0696164976903662 0.597528649361649 706 0 294 0.294 0.706 0.588 ORF3a all ss13 130 TGC TTT GCT 2 CTTTGCTGG:CTTTGTTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 13 79.33333333333337 4 36.33333333333333 0.184892999968705 0.119061291806916 1.55292284471892 0.0658317081617891 0.0680407117251589 0.0657124284137723 NaN NaN 0.0793955608226361 0.407013270562913 797 0 203 0.203 0.797 0.406 ORF3a all ss13 131 TGG GCT GGA 2 TGCTGGAAA:TGTTGGAAG 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.6666666666667 5 36.49999999999999 0.20315621560155 0.151264442981809 1.34305334153103 0.0518917726197403 0.0733269058930607 0.0750170413157557 NaN NaN 0.0814404846461185 0.524011405309273 770 0 230 0.23 0.77 0.46 ORF3a all ss13 132 AAA GGA AAT 2 TGGAAATGC:TGGAAGTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.33333333333337 6 36.49999999999999 0.204149781227553 0.185556129985381 1.10020499588797 0.0185936512421722 0.0738329181906007 0.0845427118379127 NaN NaN 0.095104577043967 0.844995723237207 607 1 392 0.392 0.607 0.784 ORF3a all ss13 133 TGC AAT GCA 2 AAATGCCGT:AAGTGCAAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 78.9166666666667 6 35.91666666666666 0.236369452063806 0.188983168709011 1.25074340576731 0.0473862833547951 0.0785837801151686 0.0828296447894038 NaN NaN 0.0981589874339631 0.629273023864078 671 0 329 0.329 0.671 0.658 ORF3a all ss13 134 AAA GCA AAT 2 TGCAAATCC:TGCCGTTCC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 2 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 79.25000000000003 6 35.74999999999999 0.235201662735449 0.18998582171068 1.23799587052146 0.0452158410247687 0.0797434506095499 0.0810022808382542 NaN NaN 0.102364184332792 0.658695133245324 674 0 326 0.326 0.674 0.652 ORF3a all ss13 135 TCC AAT CCA 2 AAATCCAAG:CGTTCCAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.9166666666667 5 35.74999999999999 0.202417403270485 0.154788747544192 1.30770102143694 0.0476286557262927 0.0700850825005079 0.0741463154971852 NaN NaN 0.0949460235255871 0.615921277314229 711 1 288 0.288 0.711 0.576 ORF3a all ss13 136 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAC:TCCAAGAAC 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 79.00000000000004 5 36.33333333333333 0.202172332401979 0.152033634372753 1.32978688062075 0.0501386980292261 0.0712640816717075 0.0740386214378566 NaN NaN 0.094187692689786 0.594499195919589 710 0 290 0.29 0.71 0.58 ORF3a all ss13 137 AAC AAA ACC 2 AAAAACCCA:AAGAACCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 79.4166666666667 5 35.74999999999999 0.200955878734158 0.154788747544192 1.29825896211729 0.0461671311899655 0.0662788053819059 0.0721501501034375 NaN NaN 0.0986548315881455 0.639808728081989 686 1 313 0.313 0.686 0.626 ORF3a all ss13 138 CCA ACC CAT 2 AACCCATTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.75000000000004 5 35.74999999999999 0.202909342656595 0.154788747544192 1.31087915546745 0.0481205951124028 0.0692402925418926 0.0740911039574187 NaN NaN 0.0995134158094107 0.628698968961147 675 0 325 0.325 0.675 0.65 ORF3a all ss13 139 TTA CAT TAC 2 CCATTACTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.75000000000004 5 35.74999999999999 0.202909342656595 0.154788747544192 1.31087915546745 0.0481205951124028 0.0717986471046955 0.0727163951823805 NaN NaN 0.0970359960556384 0.619961732886625 690 0 310 0.31 0.69 0.62 ORF3a all ss13 140 CTT TAC TTT 2 TTACTTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.41666666666671 5 36.74999999999999 0.206933202001177 0.150125187835474 1.3784042836833 0.0568080141657033 0.073686375872305 0.0737084692842676 NaN NaN 0.0990242550483866 0.566185871599144 718 0 282 0.282 0.718 0.564 ORF3a all ss13 141 TAT TTT ATG 2 CTTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.41666666666671 6 36.74999999999999 0.206933202001177 0.184125343811615 1.12387136782701 0.0228078581895625 0.0697088430488448 0.0799881741674327 NaN NaN 0.100556034867677 0.820565734545068 582 0 418 0.418 0.582 0.836 ORF3a all ss13 142 GAT ATG ATG 2 TATGATGCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.25000000000004 6 37.58333333333333 0.207447505316393 0.179512162520447 1.1556181063373001 0.0279353427959456 0.0720728535944587 0.078258808106638 NaN NaN 0.101531464084253 0.78320886483716 601 0 399 0.399 0.601 0.798 ORF3a all ss13 143 GCC ATG CCA 2 GATGCCAAC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.83333333333337 7 38 0.226136674284849 0.211388364105741 1.06976878903198 0.0147483101791078 0.0744632439979069 0.0865472756467818 NaN NaN 0.111694644679675 0.894951596060651 535 0 465 0.465 0.535 0.93 ORF3a all ss13 144 AAC CCA ACT 2 GCCAACTAC:GCCAACTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 77.1666666666667 7 38.33333333333333 0.242697391695876 0.2092680072815 1.15974436249784 0.0334293844143758 0.0759430203830415 0.0845450510965628 0.986983301642467 0.239978914335558 0.108373099401095 0.757727992875405 602 0 398 0.398 0.602 0.796 ORF3a all ss13 145 TAC ACT ACT 2 AACTACTTT:AACTATTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.1666666666667 8 38.33333333333333 0.260825162391735 0.244568640424989 1.06647018169826 0.0162565219667463 0.0794335855231298 0.0990034291600088 0.823641894150581 0.195381415872127 0.112922643852468 0.885530810077343 554 0 446 0.446 0.554 0.892 ORF3a all ss13 146 TTT ACT TTC 2 TACTTTGTT:TATTTTCTT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.416666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.1666666666667 8 38.33333333333333 0.260825162391735 0.244568640424989 1.06647018169826 0.0162565219667463 0.079533085736992 0.0980850339479643 0.76569664544386 0.163677160033566 0.115462466805495 0.888032002938105 537 0 463 0.463 0.537 0.926 ORF3a all ss13 147 CTT TTC TTT 2 TTTCTTTGC:TTTGTTTGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.9166666666667 8 38 0.261839694220712 0.247109400847682 1.0596104127261 0.0147302933730303 0.0812031133430311 0.0970323087629073 0.787465901639699 0.178433069652686 0.112772916173813 0.896076656709963 547 0 453 0.453 0.547 0.906 ORF3a all ss13 148 TGC TTT GCT 2 CTTTGCTGG:GTTTGCTGG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.25000000000003 8 38.666666666666664 0.24615039807976 0.242080044197288 1.01681408269719 0.00407035388247218 0.0783712451322272 0.0942070090080987 0.782076978072953 0.193551009669885 0.11268319812603 0.971184999643542 515 1 484 0.484 0.515 0.968 ORF3a all ss13 149 TGG GCT GGC 2 TGCTGGCAC:TGCTGGCAT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.25000000000003 8 38.833333333333336 0.24615039807976 0.24085480398197 1.02198666586773 0.00529559409779015 0.0755620977335525 0.0940362431017334 0.727128881295461 0.159869779183098 0.111619314965706 0.96215988051592 510 0 490 0.49 0.51 0.98 ORF3a all ss13 150 CAC GGC ACA 2 TGGCACACA:TGGCATACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.58333333333336 8 38.166666666666664 0.244883349127368 0.245832397240244 0.996139450603215 -9.49048112875939e-4 0.0760920169966856 0.0952813140808955 0.60059837131326 0.097200789104955 0.11349150817837 0.993327941237856 468 0 532 0.532 0.468 0.936 ORF3a all ss13 151 ACA ACA CAC 2 CACACACAT:CATACTAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.16666666666669 8 38.166666666666664 0.264931700823142 0.245832397240244 1.07769237821097 0.0190993035828973 0.0812059688107931 0.0993757102240476 0.727430540225269 0.13847190867641 0.121289460586664 0.874875409574231 578 0 422 0.422 0.578 0.844 ORF3a all ss13 152 AAT CAC ATA 2 ACACATAAC:ACTAATTGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.50000000000001 8 37.833333333333336 0.263548415128416 0.24839986250598 1.06098454511854 0.0151485526224362 0.0807020249883646 0.0983589252612551 0.639569930521433 0.0971353184026863 0.114631539466752 0.894865685080921 589 1 410 0.41 0.589 0.82 ORF3a all ss13 153 AAC ATA ACT 2 AATTGTTAC:CATAACTAT 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.416666666666667 0.666666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.66666666666669 8 38 0.24839986250598 0.247109400847682 1.00522222810574 0.00129046165829849 0.0810395827798724 0.096626523880981 0.688090925545077 0.144046797791099 0.1126453159035 0.990859656221642 517 0 483 0.483 0.517 0.966 ORF3a all ss13 154 TAC ACT ACG 2 AACTATGAC:TGTTACGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.41666666666669 7 37.5 0.231110927283054 0.21465126546101 1.07668094472536 0.0164596618220438 0.0742746565609943 0.0898814417730464 0.85842686801876 0.209751555364484 0.106642071776862 0.877337782184503 568 0 432 0.432 0.568 0.864 ORF3a all ss13 155 GAC ACG ACT 2 TACGACTAT:TATGACTAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.08333333333336 7 37.5 0.22874291321268 0.21465126546101 1.06564903179772 0.0140916477516703 0.0717761650520724 0.090633898023988 0.833126582971457 0.200863187783324 0.112775999160204 0.900561121921403 563 0 437 0.437 0.563 0.874 ORF3a all ss13 156 TAC ACT ACT 2 GACTACTGT:GACTATTGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.75000000000001 8 37.5 0.229920775536938 0.251022027914968 0.91593864270279 -0.0211012523780302 0.0766872394581379 0.105976558057601 NaN NaN 0.114732888879085 0.854079090253119 428 0 572 0.572 0.428 0.856 ORF3a all ss13 157 TGT ACT GTA 2 TACTGTATA:TATTGTATA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.75000000000001 8 37.5 0.229920775536938 0.251022027914968 0.91593864270279 -0.0211012523780302 0.0788350692391117 0.100881051967569 0.769108379516804 0.233689029430673 0.120134326617841 0.860571155917778 437 0 563 0.563 0.437 0.874 ORF3a all ss13 158 ATA GTA TAC 2 TGTATACCA:TGTATACCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 15 75.25000000000001 8 37.5 0.231710672423342 0.251022027914968 0.923069080223639 -0.0193113554916258 0.0768303404405933 0.0999711258132454 0.732976999136678 0.207906651690429 0.118214971989519 0.870236609066223 431 0 569 0.569 0.431 0.862 ORF3a all ss13 159 CCA TAC CAT 2 ATACCATAT:ATACCTTAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 15 74.91666666666669 8 37.5 0.232919624976835 0.251022027914968 0.927885201595673 -0.0181024029381332 0.0750867799708526 0.100259241395929 0.563645178495404 0.0997180217955525 0.124889553919197 0.884752485175301 447 1 552 0.552 0.447 0.894 ORF3a all ss13 160 TAC CAT ACA 2 CCATATAAC:CCTTACAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.25000000000001 8 37.5 0.250032194187064 0.251022027914968 0.996056785390007 -9.89833727904343e-4 0.0807287686377279 0.101682672998119 0.735838727680218 0.175852972311947 0.1244940679227 0.993656205942487 496 0 504 0.504 0.496 0.992 ORF3a all ss13 161 AAC ACA ACA 2 TACAATAGT:TATAACAGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.91666666666669 8 37.166666666666664 0.265978832161818 0.253700676929915 1.0483962257432 0.0122781552319022 0.0791159350927144 0.103566732535506 0.807157046370182 0.193986780701605 0.128700551213869 0.923996359181947 554 0 446 0.446 0.554 0.892 ORF3a all ss13 162 AGT ACA GTG 2 AACAGTGTC:AATAGTGTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.41666666666669 8 37 0.268098391166812 0.255061761633984 1.05111165801299 0.013036629532828 0.0785745072488557 0.100938903897525 0.663602887567983 0.11320583025702 0.126811033848921 0.918118855946486 536 0 464 0.464 0.536 0.928 ORF3a all ss13 163 GTA GTG TAA 2 AGTGTAACT:AGTGTCACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 74.75000000000003 8 37 0.270978159241796 0.255061761633984 1.06240213156942 0.0159163976078114 0.0824355122394689 0.103217572868028 0.863447858947469 0.218540467225963 0.128976080289773 0.90178575684051 543 0 457 0.457 0.543 0.914 ORF3a all ss13 164 ACA TAA CAG 2 GTAACTTCT:GTCACAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.4166666666667 8 37 0.268098391166812 0.255061761633984 1.05111165801299 0.0130366295328279 0.081068072997939 0.100450202368555 0.834337500992547 0.207735779019952 0.127312590588873 0.918440304258532 529 0 471 0.471 0.529 0.942 ORF3a all ss13 165 GAT CAG ATA 2 ACAGATACA:ACTTCTTCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.9166666666667 8 36.33333333333333 0.265978832161817 0.260656845281595 1.02041759875699 0.00532198688022251 0.0804727875278534 0.109683084935944 0.907592442611424 0.260880444331112 0.134883089504624 0.968526598430122 515 0 485 0.485 0.515 0.97 ORF3a all ss13 166 ACA ATA CAA 2 GATACAATT:TCTTCAATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 76.08333333333336 8 36.166666666666664 0.246788896582768 0.262094574111018 0.94160246323235 -0.0153056775282497 0.0729562814363685 0.102158882703825 0.848162892474904 0.266927065363475 0.122469761386131 0.900543218793798 450 0 550 0.55 0.45 0.9 ORF3a all ss13 167 ATT CAA TTG 2 ACAATTGTC:TCAATTGTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.91666666666669 7 36.33333333333333 0.24743074621853 0.222674045667529 1.11117910251635 0.024756700551001 0.0725296540058955 0.100264285584949 NaN NaN 0.113068242441536 0.826686179993939 562 0 438 0.438 0.562 0.876 ORF3a all ss13 168 GTC TTG TCA 2 ATTGTCATT:ATTGTCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.41666666666669 7 36.33333333333333 0.249376670246877 0.222674045667529 1.11991799268433 0.0267026245793482 0.0730080901240198 0.0989732604472308 0.929032640485826 0.228023152014618 0.111554114861666 0.810819273539747 578 0 422 0.422 0.578 0.844 ORF3a all ss13 169 ATT TCA TTA 2 GTCATTACT:GTCGTTACT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 75.91666666666669 7 36.5 0.24743074621853 0.221491146757304 1.11711348214585 0.0259395994612258 0.0727132107676192 0.0941402811585147 NaN NaN 0.113249983907693 0.818832177638981 613 0 387 0.387 0.613 0.774 ORF3a all ss13 170 ACT TTA CTG 2 ATTACTTCA:GTTACTGAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.58333333333336 6 35.66666666666667 0.26320487089109 0.190491169998981 1.38171691051348 0.0727137008921085 0.0742684571453413 0.0864252506895454 NaN NaN 0.111308043175531 0.513585150670496 747 0 253 0.253 0.747 0.506 ORF3a all ss13 171 GAA CTG AAG 2 ACTGAAGGT:ACTTCAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 18 76.91666666666669 6 35.66666666666667 0.28050317670762 0.190491169998981 1.47252587460679 0.0900120067086391 0.0768624910294356 0.0897529376940814 NaN NaN 0.10659553005634 0.398431557647961 812 0 188 0.188 0.812 0.376 ORF3a all ss13 172 GGT AAG GTG 2 GAAGGTGAC:TCAGGTGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.58333333333336 6 35.66666666666667 0.26320487089109 0.190491169998981 1.38171691051348 0.0727137008921085 0.0754613631484738 0.0862420122359126 1.07980812777532 0.20068766489084 0.107417422395114 0.498452582947533 770 0 230 0.23 0.77 0.46 ORF3a all ss13 173 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGATGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 77.25000000000001 6 35.66666666666667 0.260488747447952 0.190491169998981 1.36745838376312 0.0699975774489711 0.0756372851802923 0.0834682005021238 1.46174676188303 0.349532696208167 0.109239378664765 0.521670575630114 732 0 268 0.268 0.732 0.536 ORF3a all ss13 174 GGC ACG GCA 2 GACGGCATT:GATGGCACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 76.25 6 36 0.264584505778426 0.18848582121068 1.40373691813501 0.0760986845677468 0.0758907061231353 0.089717878170451 NaN NaN 0.109410256729362 0.486719960960384 748 0 252 0.252 0.748 0.504 ORF3a all ss13 175 ACA GCA CAA 2 GGCACAACA:GGCATTTCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.75 6 36.5 0.266681578953987 0.185556129985381 1.43720166493555 0.0811254489686059 0.0779600410003041 0.0874640692971118 NaN NaN 0.111240139378949 0.46582908357021 769 0 231 0.231 0.769 0.462 ORF3a all ss13 176 ACA CAA CAA 2 ACAACAAGT:ATTTCAACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 17 75.5 7 36.83333333333333 0.267742763704315 0.219162920712879 1.22166086687209 0.0485798429914359 0.0738138144528889 0.092919206545337 NaN NaN 0.116076723004087 0.675570664233025 670 0 330 0.33 0.67 0.66 ORF3a all ss13 177 ACA CAA CAC 2 ACAAGTCCT:TCAACACCA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 16 76 7 36.99999999999999 0.247109400847682 0.218017195136802 1.13343995959871 0.0290922057108795 0.0715407750619692 0.0942950277095397 NaN NaN 0.111997472676933 0.79505068300301 592 0 408 0.408 0.592 0.816 ORF3a all ss13 178 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA:AGTCCTATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.33333333333333 7 36.99999999999999 0.227867466473375 0.218017195136802 1.04518116715698 0.00985027133657235 0.063480595174680493 0.0960063035342781 0.743147999185875 0.159598263514135 0.109724449674328 0.928467761460304 529 0 471 0.471 0.529 0.942 ORF3a all ss13 179 AAA CAA AAC 2 CCAAAACTC:CCTATTTCT 1:1 TRUE 1.75 0.5 0.75 0 2 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 15 76.83333333333333 8 36.49999999999999 0.226136674284849 0.259234959672941 0.872323218173005 -0.0330982853880918 0.0651685440711155 0.112009410305076 NaN NaN 0.120933751585596 0.784323327741805 385 0 615 0.615 0.385 0.77 ORF3a all ss13 180 CTC AAC CTG 2 AAACTCAAA:ATTTCTGAA 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 1 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 13 76.41666666666666 8 36.416666666666664 0.192938959293253 0.259943938648383 0.742232961062556 -0.0670049793551305 0.0558984069825327 0.108223119875348 0.559101911427758 0.184328456160782 0.116881958160303 0.566461551803969 266 0 734 0.734 0.266 0.532 ORF3a all ss13 181 AAA CTG AAC 2 CTCAAAGAA:TCTGAACAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 12 76.91666666666666 7 36.58333333333333 0.174911831064805 0.220904431633438 0.79179865144149 -0.0459926005686332 0.0532215751027896 0.0885270938079629 NaN NaN 0.105146353105672 0.661810348933529 338 0 662 0.662 0.338 0.676 ORF3a all ss13 182 CAT AAC AAG 2 AAAGAAGAC:GAACATGAC 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 12 76.25 6 36.58333333333333 0.176636132337568 0.185076724431924 0.954394091854264 -0.00844059209435605 0.051426305047972 0.0849256234146737 0.867673913053895 0.271355830464979 0.0957156389089328 0.929730399105786 485 0 515 0.515 0.485 0.97 ORF3a all ss13 183 GAC AAG ACT 2 CATGACTAC:GAAGACTAC 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.33333333333333 6 37.166666666666664 0.146091244169314 0.181789348152453 0.803629286611432 -0.03569810398314 0.0438491336235986 0.0801467387607205 NaN NaN 0.0870324552048076 0.68168123068758 364 0 636 0.636 0.364 0.728 ORF3a all ss13 184 TAC ACT ACC 2 GACTACCAA:GACTACCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 73.66666666666666 6 38.166666666666664 0.166509726707943 0.17641872921631 0.943832479961818 -0.00990900250836776 0.0483987824484419 0.076290350219619 0.932724618422672 0.311581543073792 0.0895285558697492 0.911870266139464 464 0 536 0.536 0.464 0.928 ORF3a all ss13 185 CAA ACC AAA 2 TACCAAATT:TACCAGATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.66666666666666 6 37.833333333333336 0.164016900723622 0.178173158730486 0.920547751930036 -0.0141562580068637 0.0490099905379084 0.0808732703849981 NaN NaN 0.0907564351706712 0.876048184500063 443 0 557 0.557 0.443 0.886 ORF3a all ss13 186 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGT:CAGATTGGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.16666666666666 6 37.333333333333336 0.162798378928371 0.180871542612666 0.900077350902022 -0.0180731636842953 0.0478690995357815 0.0862034874770288 NaN NaN 0.0912275135008041 0.842958306493266 433 0 567 0.567 0.433 0.866 ORF3a all ss13 187 GGT TTG GTG 2 ATTGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.91666666666666 6 37.333333333333336 0.180189276431286 0.180871542612666 0.996227896486506 -6.82266181380287e-4 0.0510374410569639 0.0836853491725333 NaN NaN 0.0998211253505362 0.994546591093164 501 0 499 0.499 0.501 0.998 ORF3a all ss13 188 GGT GTG GTT 2 GGTGGTTAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.58333333333331 6 37.666666666666664 0.181100119848143 0.179063586735151 1.01137323980897 0.00203653311299229 0.0517178701875153 0.0825217368948133 NaN NaN 0.0858489109805153 0.981074122901768 527 0 473 0.473 0.527 0.946 ORF3a all ss13 189 TAT GTT ATA 2 GGTTATACT:GGTTATTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 13 75.83333333333331 7 37.083333333333336 0.194633396613814 0.217448844139347 0.895076712797274 -0.0228154475255336 0.0530028801040921 0.0963340315296607 0.63054763775632 0.155746670928391 0.0976830353487276 0.815321832831815 408 0 592 0.592 0.408 0.816 ORF3a all ss13 190 ACT ATA CTG 2 TATACTGAA:TATTCTGAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 77.33333333333331 7 36.25 0.207190032471119 0.223270280899521 0.927978554227561 -0.016080248428402 0.0533702289448565 0.0984715645679245 NaN NaN 0.102651483384969 0.875521511930593 444 0 556 0.556 0.444 0.888 ORF3a all ss13 191 GAA CTG AAA 2 ACTGAAAAA:TCTGAGGAT 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 76.99999999999999 6 36.58333333333333 0.20822380244871 0.185076724431924 1.12506747181653 0.0231470780167861 0.0538196270703266 0.0843432704896768 NaN NaN 0.0931977566409326 0.803851868574351 610 0 390 0.39 0.61 0.78 ORF3a all ss13 192 AAA AAA AAT 2 GAAAAATGG:GAGGATAGG 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 14 75.49999999999999 6 35.41666666666666 0.213007236149638 0.192023563619284 1.10927654989237 0.0209836725303542 0.0501672169628869 0.0871356826212466 NaN NaN 0.099922760527341 0.833668510207349 602 0 398 0.398 0.602 0.796 ORF3a all ss13 193 AGG AAT GGC 2 AAATGGGAA:GATAGGCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.166666666666667 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 13 74.58333333333331 7 35.99999999999999 0.19836706953938 0.225078444337754 0.88132415399899 -0.0267113747983741 0.0525939941891731 0.113297848015325 NaN NaN 0.125726677294137 0.831751376498771 440 2 558 0.558 0.44 0.88 ORF3a all ss13 194 CAC GGC AAT 2 AGGCACTCA:TGGGAATCT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.24999999999999 8 36.33333333333333 0.182020263927749 0.260656845281595 0.698313768553086 -0.0786365813538456 0.0505432032490258 0.125644258993214 NaN NaN 0.130285356230778 0.546128292777769 233 1 766 0.766 0.233 0.466 ORF3a all ss13 195 TCA AAT CAG 2 CACTCAGGT:GAATCTGGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.58333333333331 7 35.33333333333333 0.164221770415357 0.230047700566857 0.713859647415299 -0.0658259301515001 0.048275883671219 0.115163725885352 NaN NaN 0.129806323260953 0.612078473605521 327 0 673 0.673 0.327 0.654 ORF3a all ss13 196 GGA CAG GAG 2 TCAGGTGTT:TCTGGAGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.74999999999999 7 34.83333333333333 0.161399544218121 0.233922247929282 0.689970901215493 -0.0725227037111612 0.0488721868369612 0.123498575542806 0.758855844136983 0.363231233827314 0.131027499815231 0.579926396284399 276 0 724 0.724 0.276 0.552 ORF3a all ss13 197 GTA GAG TAA 2 GGAGTAAAA:GGTGTTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.41666666666666 7 34.49999999999999 0.159830135220283 0.236579217337834 0.67558823221588 -0.0767490821175502 0.0473764282545792 0.121813835850963 NaN NaN 0.131028549608214 0.558048097818348 281 0 719 0.719 0.281 0.562 ORF3a all ss13 198 AAA TAA AAG 2 GTAAAAGAC:GTTAAAGAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.41666666666666 7 34.16666666666666 0.157532633260459 0.239297754894712 0.65831220744119 -0.0817651216342532 0.0477503696507148 0.120265877374769 NaN NaN 0.131500259401572 0.534082086417503 247 0 753 0.753 0.247 0.494 ORF3a all ss13 199 GAC AAG ACT 2 AAAGACTAT:AAAGACTGT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.24999999999999 7 34.66666666666666 0.16021960824549 0.235243169141281 0.681080810254115 -0.0750235608957916 0.0477138881715555 0.116093395074104 NaN NaN 0.1323945613377 0.570940794279378 293 0 707 0.707 0.293 0.586 ORF3a all ss13 200 TAT ACT ATG 2 GACTATGTC:GACTGTGTT 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.08333333333333 7 34.66666666666666 0.160610991304224 0.235243169141281 0.682744548504891 -0.0746321778370574 0.0473461665462901 0.115777705721805 0.667390231414991 0.306304769899512 0.136653932050092 0.584969708973909 261 0 739 0.739 0.261 0.522 ORF3a all ss13 201 GTC ATG TCG 2 TATGTCGTT:TGTGTTGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.5 7 34.66666666666666 0.143635503733589 0.235243169141281 0.61058310112854 -0.0916076654076921 0.0435572484617644 0.121929093597141 NaN NaN 0.134021032664607 0.494270732481186 226 0 774 0.774 0.226 0.452 ORF3a all ss13 202 GTA TCG TAT 2 GTCGTTGTA:GTTGTATTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.16666666666666 7 34.99999999999999 0.144328652584645 0.23261619622788 0.620458312555569 -0.0882875436432342 0.04390279735636 0.123011057628044 NaN NaN 0.119538026757449 0.460166402602863 190 0 810 0.81 0.19 0.38 ORF3a all ss13 203 GTA TAT TAC 2 GTATTACAC:GTTGTACAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 76 7 35.16666666666666 0.144677749593369 0.231324762417615 0.625431311725198 -0.0866470128242463 0.0448522923856167 0.123254532438558 NaN NaN 0.126640782395522 0.49385192590638 212 0 788 0.788 0.212 0.424 ORF3a all ss13 204 CAC TAC ACA 2 GTACATGGC:TTACACAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.66666666666666 7 35.66666666666666 0.145381050470112 0.227535736496164 0.63893721798977 -0.0821546860260515 0.043465705765425 0.107849683294158 NaN NaN 0.125326676317905 0.512130224436386 218 1 781 0.781 0.218 0.436 ORF3a all ss13 205 AGT ACA GCT 2 CACAGTTAC:CATGGCTAT 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 0 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.24999999999999 7 35.41666666666666 0.14626988152442 0.229414483788198 0.63757910620613 -0.083144602263778 0.0437375763673665 0.114317063158321 NaN NaN 0.126323642379707 0.510417859947461 233 0 767 0.767 0.233 0.466 ORF3a all ss13 206 TAC GCT ACT 2 AGTTACTTC:GGCTATTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.74999999999999 6 35.58333333333333 0.147350977402095 0.190999228388671 0.771474202514812 -0.0436482509865767 0.0445309766846367 0.10890210791212 NaN NaN 0.109867161115329 0.691159482624925 349 0 651 0.651 0.349 0.698 ORF3a all ss13 207 TTC ACT TCA 2 TACTTCACT:TATTTCACC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.08333333333331 7 35.24999999999999 0.146628474234188 0.230684450150283 0.635623572107547 -0.0840559759160946 0.0456128047286296 0.117635690376066 NaN NaN 0.127727654591891 0.510481892334892 248 0 752 0.752 0.248 0.496 ORF3a all ss13 208 ACC TCA CCG 2 TTCACCGAA:TTCACTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.91666666666664 7 35.08333333333333 0.144852934121868 0.231968667588477 0.624450429567684 -0.0871157334666092 0.0437409558316655 0.119426150700046 NaN NaN 0.125546092192923 0.487748420003724 209 0 791 0.791 0.209 0.418 ORF3a all ss13 209 GAA CCG AAG 2 ACCGAAGTT:ACTTCAGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.24999999999997 7 34.74999999999999 0.144154737019873 0.234580833893542 0.614520524235551 -0.09042609687367 0.0446510162521521 0.117640661399569 0.838042887263878 0.463387353602013 0.128565381235728 0.481839422145667 233 2 765 0.765 0.233 0.466 ORF3a all ss13 210 GAC AAG ACT 2 GAAGTTTAC:TCAGACTAT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.58333333333331 7 34.08333333333333 0.127817319751755 0.239987262930077 0.532600431336209 -0.112169943178322 0.0424076227616482 0.125074893174001 0.643934742275702 0.408178618678886 0.1268671055803 0.37661357839024 163 0 837 0.837 0.163 0.326 ORF3a all ss13 211 TAC ACT ACT 2 GACTATTAC:GTTTACTAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 77.24999999999999 7 34.08333333333333 0.111444464849685 0.239987262930077 0.464376581861164 -0.128542798080391 0.0394850512866007 0.120601835818745 NaN NaN 0.125255209881071 0.304775117130308 130 0 870 0.87 0.13 0.26 ORF3a all ss13 212 TAC ACT ACC 2 TACTACCAG:TATTACCAG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.58333333333333 7 33.416666666666664 0.124279002650387 0.245651054395603 0.505916829692272 -0.121372051745216 0.0400084048035379 0.13462760679313 0.532682259486122 0.342237528551205 0.128321884002118 0.34422987824471 158 1 841 0.841 0.158 0.316 ORF3a all ss13 213 CAG ACC AGC 2 TACCAGCTG:TACCAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.91666666666666 7 33.08333333333333 0.123708284429487 0.248585325313905 0.497649184533612 -0.124877040884417 0.0397379747308344 0.127878989696736 NaN NaN 0.13811502110122 0.365914546054474 161 0 839 0.839 0.161 0.322 ORF3a all ss13 214 CTG AGC TGT 2 CAGCTGTAC:CAGCTTGAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.24999999999999 7 32.416666666666664 0.123142795706581 0.254671378073331 0.483536063762623 -0.13152858236675 0.0401692580490667 0.126424441576119 0.536267504710003 0.367232448774204 0.146189096444073 0.368271722231595 134 0 866 0.866 0.134 0.268 ORF3a all ss13 215 GAG TGT ACT 2 CTGTACTCA:CTTGAGTCT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.41666666666666 7 32.416666666666664 0.122861989946783 0.254671378073331 0.482433443743355 -0.131809388126548 0.04025247193627 0.132525515852217 NaN NaN 0.141085144459741 0.350172785786228 138 0 862 0.862 0.138 0.276 ORF3a all ss13 216 TCA ACT CAA 2 GAGTCTACA:TACTCAACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.25 7 31.91666666666666 0.106966265210453 0.259437126225709 0.412301303081011 -0.152470861015256 0.0375294552512024 0.132314641503092 NaN NaN 0.137548362307715 0.267650641855676 91 0 909 0.909 0.091 0.182 ORF3a all ss13 217 ACA CAA CAC 2 TCAACTCAA:TCTACACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.91666666666666 7 30.91666666666666 0.104630738407805 0.269530500680923 0.38819628258573 -0.164899762273118 0.0368826181791565 0.153242412896771 NaN NaN 0.142591461681699 0.247497523002176 75 0 925 0.925 0.075 0.15 ORF3a all ss13 218 CAA CAC AAA 2 ACACAAATT:ACTCAATTG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.75 7 31.08333333333333 0.104859684055263 0.267793509240842 0.391569177134001 -0.162933825185579 0.0370495881558901 0.13378002706463 0.375875976434281 0.297527133764856 0.14502156486857 0.261219062693645 81 0 919 0.919 0.081 0.162 ORF3a all ss13 219 ATT AAA TGA 2 CAAATTACT:CAATTGAGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.08333333333333 7 32.08333333333333 0.107205575102587 0.257828654327118 0.415801631445398 -0.150623079224531 0.0372575636860086 0.128709358386899 NaN NaN 0.139686715097295 0.280903428313957 77 0 923 0.923 0.077 0.154 ORF3a all ss13 220 ACT TGA CTA 2 ATTACTACA:TTGAGTACA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.25 7 33.08333333333333 0.0939775170586381 0.248585325313905 0.378049335534858 -0.154607808255267 0.0344275019060543 0.124159997968 NaN NaN 0.136753188614138 0.258239951531218 84 0 916 0.916 0.084 0.168 ORF3a all ss13 221 ACA CTA CAG 2 ACTACAGAC:AGTACAGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.08333333333334 7 33.91666666666666 0.0810687166991055 0.241378371827081 0.335857417901474 -0.160309655127976 0.0316784503122609 0.128571618124034 NaN NaN 0.12583187531088 0.202663849957087 65 0 935 0.935 0.065 0.13 ORF3a all ss13 222 GAC CAG ACA 2 ACAGACACT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.75000000000001 7 34.249999999999986 0.0814358477684013 0.238612230829161 0.341289495033081 -0.15717638306076 0.0318731781868829 0.129210109853229 NaN NaN 0.134311117256107 0.241903976943743 59 0 941 0.941 0.059 0.118 ORF3a all ss13 223 ACT ACA CTG 2 GACACTGGT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.08333333333334 7 34.91666666666666 0.0821801867828477 0.233267379251205 0.352300381847853 -0.151087192468358 0.0339437063868426 0.124623822114948 NaN NaN 0.12249549051248 0.217422746121898 62 0 938 0.938 0.062 0.124 ORF3a all ss13 224 GGT CTG GTA 2 ACTGGTATT:ACTGGTGTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.41666666666669 7 34.58333333333332 0.0818063224852469 0.235909286040997 0.346770251642533 -0.15410296355575 0.0314227701195659 0.12539023542498 NaN NaN 0.121159825770458 0.203409293703457 44 0 956 0.956 0.044 0.088 ORF3a all ss13 225 ATT GTA TTG 2 GGTATTGAA:GGTGTTGAA 1:1 FALSE 0.916666666666667 0.75 1.33333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.91666666666669 7 34.08333333333332 0.0812518671161106 0.239987262930077 0.338567414470594 -0.158735395813966 0.0319000009746693 0.119439158226845 NaN NaN 0.130377252111738 0.22341085349338 67 0 933 0.933 0.067 0.134 ORF3a all ss13 226 GAA TTG AAA 2 ATTGAAAAT:GTTGAACAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.66666666666669 6 33.416666666666664 0.0804341477651982 0.205237238024368 0.391908157308412 -0.12480309025917 0.0313269752775823 0.115985589721645 NaN NaN 0.116457950545559 0.283873687750159 100 0 900 0.9 0.1 0.2 ORF3a all ss13 227 AAT AAA ATG 2 GAAAATGCT:GAACATGTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 228 GCT ATG CTA 2 AATGCTACA:CATGTTACC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 229 ACA CTA CAT 2 GCTACATTC:GTTACCTTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 230 TTC CAT TCT 2 ACATTCTTC:ACCTTCTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 231 TTC TCT TCA 2 TTCTTCATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 232 ATC TCA TCT 2 TTCATCTAC:TTCATCTTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 233 TAC TCT ACA 2 ATCTACAAT:ATCTTTAAC 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 234 AAC ACA ACA 2 TACAATAAA:TTTAACAAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 235 AAA ACA AAA 2 AACAAGCTT:AATAAAATT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 236 ATT AAA TTG 2 AAAATTGTT:AAGCTTGTT 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 237 GTT TTG TTA 2 ATTGTTGAT:CTTGTTAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 238 AAA TTA AAG 2 GTTAAAGAC:GTTGATGAG 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 239 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:GATGAGCCT 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 240 CCA ACC CA- 1 GACCCA---:GAGCCTGAA 1:1 FALSE 0.666666666666667 0.5 1.33333333333333 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 241 --- CTG AAG 1 CCA---CCG:CCTGAAGAA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 242 CCG --C AAC 1 ---CCGAAT:GAAGAACAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 2 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 243 AAT AAC ATG 2 CCGAATGTG:GAACATGTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 244 GTC ATG TCC 2 AATGTGCAA:CATGTCCAA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 245 CAA TCC AAA 2 GTCCAAATT:GTGCAAATA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 246 ATA AAA TAC 2 CAAATACAC:CAAATTCAC 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 247 CAC TAC ACA 2 ATACACACA:ATTCACACA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 248 ACA ACA CAA 2 CACACAATC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 249 ATC CAA TCG 2 ACAATCGAC 2 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 250 GAC TCG ACG 2 ATCGACGGC:ATCGACGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 251 GGC ACG GCT 2 GACGGCTCT:GACGGTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 252 TCA GCT CAT 2 GGCTCTTCA:GGTTCATCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 253 TCA CAT CAG 2 TCATCCGGA:TCTTCAGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 254 GGA CAG GAG 2 TCAGGAGTT:TCCGGAGTT 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 255 GTT GAG TTG 2 GGAGTTGCT:GGAGTTGTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 256 GCT TTG CTA 2 GTTGCTAAT:GTTGTTAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 257 AAT CTA ATC 2 GCTAATCCA:GTTAATCCA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 258 CCA ATC CAG 2 AATCCAGCA:AATCCAGTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 259 GCA CAG CAA 2 CCAGCAATG:CCAGTAATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 260 ATG CAA TGG 2 GCAATGGAT:GTAATGGAA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 261 GAA TGG AAC 2 ATGGAACCA:ATGGATCCA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 262 CCA AAC CAA 2 GAACCAATT:GATCCAATT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 263 ATT CAA TTT 2 CCAATTTAT 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 264 TAT TTT ATG 2 ATTTATGAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 265 GAT ATG ATG 2 TATGATGAA:TATGATGAG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 266 GAA ATG AAC 2 GATGAACCG:GATGAGCCG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 267 CCG AAC CGA 2 GAACCGACG:GAGCCGACG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 268 ACG CGA CGA 2 CCGACGACG 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 269 ACG CGA CGA 2 ACGACGACT 2 FALSE 0.5 1 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 270 ACT CGA CTA 2 ACGACTACT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 271 ACT CTA CTA 2 ACTACTAGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 272 AGC CTA GCG 2 ACTAGCGTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 273 GTG GCG TGC 2 AGCGTGCCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 274 CCT TGC CTT 2 GTGCCTTTG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ORF3a all ss13 275 TTG CTT TGT 2 CCTTTGTAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA