product	sequences	frame	codon	ref_codon_maj	alt_codon1_maj	alt_codon2_maj	num_defined_seqs	nonamers	nonamer_counts	multiple_variants	NN_sites	SN_sites	NS_sites	SS_sites	NN_diffs	SN_diffs	NS_diffs	SS_diffs	pair	which_gene	ratio_name	sw_num_replicates	sw_N_diffs	sw_S_diffs	sw_N_sites	sw_S_sites	sw_dN	sw_dS	sw_dNdS	sw_dN_m_dS	sw_boot_dN_SE	sw_boot_dS_SE	sw_boot_dN_over_dS_SE	sw_boot_dN_over_dS_P	sw_boot_dN_m_dS_SE	sw_boot_dN_m_dS_P	sw_boot_dN_gt_dS_count	sw_boot_dN_eq_dS_count	sw_boot_dN_lt_dS_count	sw_ASL_dN_gt_dS_P	sw_ASL_dN_lt_dS_P	sw_ASL_dNdS_P
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.41666666666669	1	31.166666666666647	0	0.0327921082603738	0	-0.0327921082603738	0	0.0358984696653665	NA	NA	0.0358909690227038	0.360896033607885	0	370	630	0.63	0	0.001
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.08333333333334	1	31.49999999999998	0	0.0324374878453625	0	-0.0324374878453625	0	0.0353170977981971	NA	NA	0.0348932196946253	0.352567082456026	0	395	605	0.605	0	0.001
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.41666666666667	1	31.83333333333331	0	0.0320904564039067	0	-0.0320904564039067	0	0.034343425909388	NA	NA	0.0349001860739969	0.357838070773274	0	369	631	0.631	0	0.001
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.58333333333334	1	31.666666666666647	0	0.0322630388127681	0	-0.0322630388127681	0	0.0346476237169708	NA	NA	0.0340797538320111	0.343795621056605	0	358	642	0.642	0	0.001
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.91666666666667	1	32.333333333333314	0	0.0315836140125952	0	-0.0315836140125952	0	0.0307625500847606	NA	NA	0.0333219458545385	0.343214873506174	0	359	641	0.641	0	0.001
ORF3a	all	ss13	7	TTT	GAT	TTT	2	AGATTTTTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.58333333333333	1	32.66666666666664	0	0.0312545223004261	0	-0.0312545223004261	0	0.0331550341150075	NA	NA	0.033619131814798	0.352544682843513	0	373	627	0.627	0	0.001
ORF3a	all	ss13	8	TTT	TTT	TTA	2	TTTTTTACT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.41666666666667	1	32.833333333333314	0	0.0310925352587596	0	-0.0310925352587596	0	0.0336365467514909	NA	NA	0.0330392306426326	0.346664234793555	0	364	636	0.636	0	0.001
ORF3a	all	ss13	9	ACT	TTA	CTC	2	TTTACTCTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.41666666666667	1	32.49999999999998	0	0.0314182062818702	0	-0.0314182062818702	0	0.0336930446950641	NA	NA	0.0341974189693278	0.358236637385096	0	392	608	0.608	0	0.001
ORF3a	all	ss13	10	CTT	CTC	TTA	2	ACTCTTAGA:ACTCTTGGA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.41666666666667	1	33.49999999999998	0	0.0304610393656427	0	-0.0304610393656427	0	0.0317550121670634	NA	NA	0.0319865635541138	0.340941134636181	0	375	625	0.625	0	0.001
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TTA	GAT	2	CTTAGATCA:CTTGGATCA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.75	1	33.16666666666664	0	0.0307735475083969	0	-0.0307735475083969	0	0.0315425347613745	NA	NA	0.0311942086025057	0.323880571252744	0	376	624	0.624	0	0.001
ORF3a	all	ss13	12	TCA	GAT	CAA	2	AGATCAATT:GGATCAATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333334	0	33.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	13	ATT	CAA	TTA	2	TCAATTACT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333334	0	33.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	14	ACT	TTA	CTG	2	ATTACTGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.66666666666669	0	33.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	15	GCA	CTG	CAC	2	ACTGCACAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000001	0	32.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	16	CAG	CAC	AGC	2	GCACAGCCA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000001	0	32.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	17	CCA	AGC	CAG	2	CAGCCAGTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.00000000000001	0	33.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	18	GTA	CAG	TAA	2	CCAGTAAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.50000000000001	0	34.16666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	19	AAA	TAA	AAA	2	GTAAAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000003	0	34.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	20	ATT	AAA	TTG	2	AAAATTGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000003	0	34.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	21	GAC	TTG	ACA	2	ATTGACAAT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333336	0	34.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	22	AAT	ACA	ATG	2	GACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.6666666666667	0	34.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTT	2	AATGCTTCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.00000000000003	0	33.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	24	TCT	CTT	CTC	2	GCTTCTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.00000000000003	0	34.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.6666666666667	0	33.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333336	0	33.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	27	AGT	CAA	GTA	2	GCAAGTACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000003	0	32.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	28	ACT	GTA	CTG	2	AGTACTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333337	0	33.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	29	GTT	CTG	TTC	2	ACTGTTCAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333337	0	33.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	GTTCATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000004	0	32.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000004	0	33.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.00000000000004	0	33.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666671	0	33.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	34	ACG	CAA	CGA	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000004	0	33.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CGA	TAC	2	ACGATACCG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333337	0	32.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	36	CCG	TAC	CGC	2	ATACCGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000004	0	31.333333333333318	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	37	CTA	CGC	TAC	2	CCGCTACAA	2	FALSE	1	1	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000004	0	30.333333333333318	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	CTACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.66666666666671	0	30.999999999999982	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333337	0	31.666666666666647	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	40	TCA	CCT	CAC	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333337	0	31.666666666666647	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	41	CTC	CAC	TCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.6666666666667	0	31.666666666666647	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TCC	CTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000003	0	32.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333337	0	31.999999999999982	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	44	GGA	TCG	GAT	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.1666666666667	0	31.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	GGATGGCTT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.50000000000003	0	30.999999999999982	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTG	2	TGGCTTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666669	0	30.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	47	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.66666666666669	0	30.166666666666654	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	GTTATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000003	0	29.833333333333318	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333337	0	30.499999999999982	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.1666666666667	0	31.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAT	2	GTTGCATTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.1666666666667	0	30.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	52	TTT	CAT	TTC	2	GCATTTCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.50000000000003	0	30.833333333333318	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TTC	TTG	2	TTTCTTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.50000000000003	0	30.833333333333318	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333337	0	30.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.16666666666671	0	30.833333333333318	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.50000000000004	0	30.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	57	CAG	TTC	AGA	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.50000000000004	0	29.833333333333318	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	58	AGC	AGA	GCG	2	CAGAGCGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333337	0	29.833333333333318	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	59	GCT	GCG	CTA	2	AGCGCTACC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.50000000000004	0	30.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333337	0	30.166666666666654	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CCA	AAA	2	ACCAAAATA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333337	0	29.166666666666654	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATT	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.1666666666667	0	28.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	63	ATT	TAA	TTG	2	ATAATTGCG	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333337	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	64	GCG	TTG	CGC	2	ATTGCGCTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.6666666666667	0	29.166666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CGC	TCA	2	GCGCTCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000003	0	29.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	66	AAT	TCA	ATA	2	CTCAATAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.6666666666667	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	67	AAA	ATA	AAA	2	AATAAAAGA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.6666666666667	0	27.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	68	AGA	AAA	GAT	2	AAAAGATGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.6666666666667	0	27.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	69	TGG	GAT	GGC	2	AGATGGCAG	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000003	0	27.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	70	CAG	GGC	AGC	2	TGGCAGCTA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000003	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	71	CTA	AGC	TAG	2	CAGCTAGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333336	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	72	GCC	TAG	CCC	2	CTAGCCCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333336	0	28.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	73	CTT	CCC	TTT	2	GCCCTTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000003	0	29.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	74	TAT	TTT	ATA	2	CTTTATAAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333336	0	28.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	75	AAG	ATA	AGG	2	TATAAGGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000001	0	29.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	76	GGC	AGG	GCT	2	AAGGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.33333333333336	0	28.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	77	TTC	GCT	TCC	2	GGCTTCCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.33333333333336	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	78	CAG	TCC	AGT	2	TTCCAGTTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333336	0	27.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	79	TTC	AGT	TCA	2	CAGTTCATT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.16666666666669	0	27.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TCA	TTT	2	TTCATTTGC	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.50000000000001	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	81	TGC	TTT	GCA	2	ATTTGCAAT	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.33333333333336	0	27.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	82	AAT	GCA	ATT	2	TGCAATTTA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.16666666666669	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	83	TTA	ATT	TAC	2	AATTTACTG	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.16666666666669	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TGC	2	TTACTGCTG	2	FALSE	1	1	0	1	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.33333333333336	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	85	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.00000000000003	0	29.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	86	CTA	TGC	TAT	2	CTGCTATTT	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.1666666666667	0	29.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	87	TTT	TAT	TTG	2	CTATTTGTT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333337	0	31.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	88	GTT	TTG	TTA	2	TTTGTTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.00000000000003	0	30.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	89	ACC	TTA	CCA	2	GTTACCATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.6666666666667	0	30.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CCA	TCT	2	ACCATCTAT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.33333333333336	0	30.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	91	TAT	TCT	ATT	2	ATCTATTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.00000000000003	0	30.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	92	TCA	ATT	CAC	2	TATTCACAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.6666666666667	0	29.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	93	CAT	CAC	ATC	2	TCACATCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.00000000000003	0	28.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	94	CTT	ATC	TTT	2	CATCTTTTG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.6666666666667	0	28.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	95	TTG	TTT	TGC	2	CTTTTGCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.00000000000004	0	28.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	96	CTT	TGC	TTG	2	TTGCTTGTC	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.66666666666671	0	29.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	97	GTC	TTG	TCG	2	CTTGTCGCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.66666666666671	0	30.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	98	GCT	TCG	CTG	2	GTCGCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.66666666666671	0	30.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.16666666666671	0	29.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	100	GGT	CAG	GTA	2	GCAGGTATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.16666666666671	0	29.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GTA	TGG	2	GGTATGGAG	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.16666666666671	0	30.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	102	GAG	TGG	AGG	2	ATGGAGGCG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.16666666666671	0	30.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	103	GCG	AGG	CGC	2	GAGGCGCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.16666666666671	0	30.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CGC	AAT	2	GCGCAATTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.50000000000004	0	30.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	105	TTT	AAT	TTT	2	CAATTTTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.83333333333337	0	30.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	106	TTG	TTT	TGT	2	TTTTTGTAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.16666666666671	0	30.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TGT	ACC	2	TTGTACCTC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333339	0	31.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	108	CTC	ACC	TCT	2	TACCTCTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333339	0	31.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	109	TAT	TCT	ATG	2	CTCTATGCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.16666666666671	0	31.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ATG	CCT	2	TATGCCTTG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.16666666666671	0	31.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	111	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGATA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333339	0	31.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TGA	TAT	2	TTGATATAT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.83333333333339	0	31.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	113	TAT	TAT	ATT	2	ATATATTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.16666666666673	0	32.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	114	TTT	ATT	TTC	2	TATTTTCTA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.16666666666673	0	32.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TTC	TAC	2	TTTCTACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.16666666666673	0	33.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAT	2	CTACAATGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.83333333333339	0	33.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	117	TGC	AAT	GCA	2	CAATGCATC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.50000000000004	0	34.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	118	ATC	GCA	TCA	2	TGCATCAAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.16666666666671	0	34.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TCA	ACG	2	ATCAACGCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.83333333333337	0	33.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.83333333333337	0	34.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	121	TGT	CAT	GTA	2	GCATGTAGA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.1666666666667	0	33.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GTA	GAA	2	TGTAGAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.6666666666667	0	34.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	123	ATT	GAA	TTA	2	AGAATTATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.6666666666667	0	34.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	124	ATT	TTA	TTA	2	ATTATTATG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.00000000000004	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TTA	TGA	2	ATTATGAGA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.66666666666671	0	35.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.33333333333337	0	35.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	127	TGT	GAT	GTT	2	AGATGTTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.33333333333337	0	36.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GTT	GGC	2	TGTTGGCTT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333337	0	36.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	129	CTT	GGC	TTT	2	TGGCTTTGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.50000000000004	0	35.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	130	TGT	TTT	GTT	2	CTTTGTTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.66666666666671	0	34.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GTT	GGA	2	TGTTGGAAG	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.16666666666671	0	34.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	132	AAG	GGA	AGT	2	TGGAAGTGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333339	0	34.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AGT	GCA	2	AAGTGCAAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.33333333333339	0	34.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.50000000000004	0	34.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	135	TCC	AAT	CCA	2	AAATCCAAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333337	0	34.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	136	AAG	CCA	AGA	2	TCCAAGAAC	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333337	0	35.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AGA	ACC	2	AAGAACCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.50000000000003	0	34.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333337	0	34.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	139	TTA	CAT	TAC	2	CCATTACTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333337	0	34.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	140	CTT	TAC	TTT	2	TTACTTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.50000000000004	0	35.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	141	TAT	TTT	ATG	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.50000000000004	0	35.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	142	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGCC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.1666666666667	0	36.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ATG	CCA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333337	0	36.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CCA	ACT	2	GCCAACTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333337	0	36.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333337	0	36.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	146	TTT	ACT	TTG	2	TACTTTGTT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333337	0	36.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	147	GTT	TTG	TTT	2	TTTGTTTGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.33333333333337	0	35.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TTT	GCT	2	GTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.33333333333336	0	36.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.33333333333336	0	37.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.66666666666669	0	36.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000003	0	36.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	152	CAT	CAC	ATA	2	ACACATAAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000003	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ATA	ACT	2	CATAACTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333336	0	36.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	154	TAT	ACT	ATG	2	AACTATGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000003	0	36.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ATG	ACT	2	TATGACTAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.6666666666667	0	36.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000003	0	36.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000003	0	36.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333336	0	35.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000003	0	35.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	160	TAT	CAT	ATA	2	CCATATAAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.1666666666667	0	35.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ATA	ACA	2	TATAACAGT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.1666666666667	0	35.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	162	AGT	ACA	GTG	2	AACAGTGTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333337	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	163	GTC	GTG	TCA	2	AGTGTCACA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.1666666666667	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TCA	CAG	2	GTCACAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333337	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	165	GAT	CAG	ATA	2	ACAGATACA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.1666666666667	0	35.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	166	ACA	ATA	CAA	2	GATACAATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000004	0	35.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	167	ATT	CAA	TTG	2	ACAATTGTC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000004	0	35.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TTG	TCG	2	ATTGTCGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666671	0	35.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	169	GTT	TCG	TTA	2	GTCGTTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666671	0	35.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	170	ACT	TTA	CTG	2	GTTACTGAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333337	0	34.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	171	GAA	CTG	AAG	2	ACTGAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333337	0	34.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	172	GGT	AAG	GTG	2	GAAGGTGAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.1666666666667	0	34.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333336	0	34.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	174	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333336	0	34.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	175	ATT	GCA	TTT	2	GGCATTTCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333336	0	34.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	176	TCA	TTT	CAA	2	ATTTCAACA	2	FALSE	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.6666666666667	0	35.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	177	ACA	CAA	CAC	2	TCAACACCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.1666666666667	0	35.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	178	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333336	0	35.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333336	0	35.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	180	CTC	AAC	TCA	2	AAACTCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.66666666666669	0	35.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	181	AAA	TCA	AAG	2	CTCAAAGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.33333333333336	0	35.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	182	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.66666666666669	0	35.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	GAAGACTAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333334	0	36.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666667	0	37.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000001	0	36.83333333333331	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000001	0	36.83333333333331	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.00000000000001	0	36.83333333333331	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.66666666666667	0	37.16666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	189	TAT	GTT	ATT	2	GGTTATTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333334	0	36.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	190	TCT	ATT	CTG	2	TATTCTGAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666667	0	35.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	191	GAG	CTG	AGG	2	TCTGAGGAT	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666667	0	36.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	192	GAT	AGG	ATA	2	GAGGATAGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333334	0	35.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	193	AGG	ATA	GGC	2	GATAGGCAC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.00000000000001	0	36.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	ACT	2	AGGCACTCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.66666666666667	0	37.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	195	TCA	ACT	CAG	2	CACTCAGGT	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.00000000000001	0	36.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	196	GGT	CAG	GTG	2	TCAGGTGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666667	0	35.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	197	GTT	GTG	TTA	2	GGTGTTAAA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000001	0	35.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000001	0	35.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333334	0	35.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATG	2	GACTATGTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666669	0	35.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	201	GTC	ATG	TCG	2	TATGTCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333336	0	35.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	202	GTT	TCG	TTG	2	GTCGTTGTA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333336	0	36.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	203	GTA	TTG	TAC	2	GTTGTACAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666669	0	36.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	204	CAT	TAC	ATG	2	GTACATGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000001	0	36.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	205	GGC	ATG	GCT	2	CATGGCTAT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333334	0	36.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	206	TAT	GCT	ATT	2	GGCTATTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666667	0	37.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ATT	TCA	2	TATTTCACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.5	0	36.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	208	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333334	0	37.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CCG	AAG	2	ACCGAAGTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666667	0	36.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	210	GTT	AAG	TTT	2	GAAGTTTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666667	0	36.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	211	TAC	TTT	ACT	2	GTTTACTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666667	0	36.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666667	0	35.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.5	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	214	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333333	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	215	GAG	TTG	AGT	2	CTTGAGTCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666667	0	34.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	216	TCT	AGT	CTA	2	GAGTCTACA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.66666666666667	0	33.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CTA	CAC	2	TCTACACAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.00000000000001	0	33.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.16666666666669	0	33.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TTA	2	CAAATTACT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000001	0	34.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TTA	CTA	2	ATTACTACA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666669	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CTA	CAG	2	ACTACAGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000003	0	36.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666669	0	36.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000003	0	37.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333336	0	36.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	TTG	2	GGTATTGAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333336	0	36.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	226	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333336	0	35.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	227	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	GCT	ATG	CTA	2	AATGCTACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CTA	CAT	2	GCTACATTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TTT	TCT	TTA	2	ATCTTTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	TTA	ACA	2	TTTAACAAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	CTT	AGC	TTG	2	AAGCTTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	CCA	ACC	CA-	0	GACCCA---	2	FALSE	0	0	2	1	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	NA	NA	0	CCA---CCG	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	CGA	0	---CCGAAT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	CGA	ATG	2	CCGAATGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTG	ATG	TGC	2	AATGTGCAA	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TGC	AAA	2	GTGCAAATA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCT	GCT	CTT	2	GGCTCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CTT	CAG	2	TCTTCAGGA	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAT	CTA	ATC	2	GCTAATCCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	CCA	ATC	CAG	2	AATCCAGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	GCA	CAG	CAA	2	CCAGCAATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	ATG	CAA	TGG	2	GCAATGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	GAT	TGG	ATC	2	ATGGATCCA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATT	CAA	TTT	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGAG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAG	ATG	AGC	2	GATGAGCCG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCG	AGC	CGA	2	GAGCCGACG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CGA	CGA	2	CCGACGACG	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	TTG	CTT	TGT	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.66666666666669	11	33.25000000000001	0.117311764843583	0.436342234072308	0.268852647493533	-0.319030469228726	0.0471462776257194	0.169806461448092	0.188638970824551	0.154092676976318	0.180943885080767	0.0778758853580654	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.00000000000001	12	33.583333333333336	0.118472334721436	0.485308821352962	0.244117414538549	-0.366836486631527	0.046150426746107	0.191678067784685	0.157334347368319	0.120761857123023	0.202796588212987	0.0704682734455273	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.33333333333334	12	33.91666666666667	0.119656146346601	0.478631367986199	0.249996457294565	-0.358975221639598	0.0458080026013135	0.18447770717444	0.189190663428885	0.186368176417544	0.191889725837416	0.0613815352798064	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.5	12	33.75000000000001	0.119357976360937	0.481946176047835	0.247658311846612	-0.362588199686898	0.0475457400815602	0.196911116810291	0.174704881054834	0.15631314415339	0.185295823642384	0.0503701416163835	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAA	2	ATGAGAATT:ATGAGATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.83333333333334	12	34.41666666666667	0.118766081588831	0.46896366858246	0.253252201706427	-0.350197586993629	0.0476878320626852	0.184463446320324	0.159930116969843	0.11330347188198	0.196915278984791	0.0753353032442646	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	7	ATT	GAA	TTT	2	AGAATTTTT:AGATTTTTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.5	12	34.75000000000001	0.117599765999126	0.462739364695786	0.254138236275703	-0.345139598696659	0.0461532714853188	0.190993272687658	0.172887187959495	0.14157104388752	0.189649073536974	0.0687764437767601	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	8	TTT	TTT	TTA	2	ATTTTTAAT:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.5	12	34.91666666666667	0.101851155869296	0.459690676830551	0.221564545471172	-0.357839520961255	0.0424885941027108	0.189076340255097	0.160061871987528	0.166284023347465	0.191455070103535	0.0616155516179414	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	9	AAT	TTA	ATC	2	TTTAATCTT:TTTACTCTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.5	12	34.583333333333336	0.100388275971152	0.465830061577935	0.215504073805587	-0.365441785606782	0.0433039817665071	0.181528284179092	0.137041996382746	0.115825280835903	0.198264131662077	0.0652988298588894	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	10	CTT	ATC	TTA	2	AATCTTGGA:ACTCTTAGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.33333333333333	12	35.41666666666668	0.0866346653413833	0.450788036519037	0.192184925781021	-0.364153371177654	0.0410917617880417	NA	0.145636858839812	0.186962807042583	0.176094813720976	0.0386457391140923	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TTA	GAT	2	CTTAGATCA:CTTGGATCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.5	13	35.25000000000001	0.0864264476831886	0.507550613188961	0.170281436840688	-0.421124165505773	0.0395733478048933	0.197443417763849	0.11982903681156	0.155306144324342	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	12	TCA	GAT	CAA	2	AGATCAATT:GGATCTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.58333333333334	12	35.75000000000001	0.0863227141399175	0.445047583344664	0.193962887049463	-0.358724869204747	0.0414174027319075	0.165830454409831	0.141197836486801	0.169536114727009	0.173471923235797	0.0386481917374732	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	13	ATT	CAA	TAA	2	TCAATTACT:TCTGTAACA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.91666666666667	12	35.41666666666667	0.0871596303651496	0.450788036519037	0.193349475372488	-0.363628406153888	0.0416880120166497	0.159710644454643	0.132389078816765	0.144162611651401	0.189568072516412	0.0550863720429636	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	14	ACA	TAA	CAT	2	ATTACTGCA:GTAACATTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.83333333333334	11	34.75000000000001	0.0872653886078579	0.41121696623111	0.212212519847281	-0.323951577623252	0.0412984446629166	0.164487797318962	0.150902127254144	0.159637305865897	0.168626614180223	0.0547168673248078	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	15	GCA	CAT	CAC	2	ACATTCAAA:ACTGCACAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000001	12	34.583333333333336	0.0870541284395655	0.465830061577935	0.186879584680906	-0.378775933138369	0.0411252011369114	0.189835707932845	0.132619802839969	0.15879440887245	0.182942356483578	0.0384087247150623	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	16	AAA	CAC	AAC	2	GCACAGCCA:TTCAAACCA	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000001	12	34.583333333333336	0.0568993130810351	0.465830061577935	0.122146073802744	-0.408930748496899	0.0269500746785867	0.181190126831368	0.0840393950976822	0.146102104735631	0.176273550728828	0.020348209791837	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	17	CCA	AAC	CAG	2	AAACCAGGA:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000001	12	35.083333333333336	0.0573071018565008	0.456683122596106	0.125485482210788	-0.399376020739605	0.0260646309284868	0.186783930168751	0.0886786720026597	0.157051431802386	0.18558028041577	0.0313942744922577	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	18	GGA	CAG	GAA	2	CCAGGAAAA:CCAGTAAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000001	12	35.50000000000001	0.0571024790858329	0.449338673183752	0.127081158363775	-0.392236194097919	0.028172207331686	0.179624816335848	0.094164967891316	0.177157556495534	0.167977865530512	0.0195409708323607	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	19	AAA	GAA	AAA	2	GGAAAAATT:GTAAAAATT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000001	12	35.50000000000001	0.0568993130810351	0.449338673183752	0.126629013874724	-0.392439360102716	0.026277419253255	0.173384598166195	0.100138794499785	0.206038054445947	0.182729071417459	0.0317410177066212	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	20	ATT	AAA	TTG	2	AAAATTGAA:AAAATTGAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.16666666666667	12	35.66666666666667	0.0567646707244322	0.44646854291714	0.127141478666207	-0.389703872192708	0.0278030115812001	0.21109200308525	0.089783468482159	0.156749133442995	0.173658281418672	0.0248269596556409	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	21	GAA	TTG	AAG	2	ATTGAAGAT:ATTGACAAT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000001	12	36.00000000000001	0.0568993130810351	0.440839998676589	0.12907021425426	-0.383940685595554	0.0273762663022003	0.164039863906999	0.0924852215615801	0.162842022627056	0.16454748133018	0.0196317528699969	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	22	AAT	AAG	ATG	2	GAAGATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.58333333333334	13	36.083333333333336	0.0425143321315748	0.490977994348552	0.0865911153268373	-0.448463662216977	0.0239837754877096	0.20237554391085	0.0683223648113449	0.20501569902387	0.213326537660488	0.0355322239817507	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTA	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000001	12	35.75000000000001	0.0427161696956043	0.445047583344664	0.0959811294212175	-0.40233141364906	0.0239507056652361	0.200261621635049	0.0717318677182983	0.180878757636448	0.181702499103006	0.0268128517636556	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	24	ACT	CTA	CTC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.41666666666669	12	36.583333333333336	0.0432292511544661	0.431333307335396	0.10022238120566	-0.38810405618093	0.0243184546652676	0.166759536421932	0.0746027335879023	0.179137849985686	0.166489088540598	0.0197476624079809	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.75000000000001	11	36.25000000000001	0.0579298692281368	0.38888847704186	0.148962678629075	-0.330958607813723	0.0281001770768679	0.150561945519464	0.121044287408904	0.218455260312504	0.155975912527557	0.0338497343292809	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.5	11	36.166666666666664	0.0573071018565008	0.390063711884091	0.146917285844652	-0.33275661002759	0.0281546490796181	0.159353360412443	0.10718264320037	0.170462568577779	0.160371457675052	0.0379947213792506	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	27	AGT	CAA	ATT	2	GCAAGTACT:TCAGATTCT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.16666666666667	10	35.5	0.0567646707244322	0.353207278115753	0.160712064109362	-0.296442607391321	0.0292812679113203	0.142057485100627	0.129415527302344	0.214299348963457	0.152590005731131	0.0520476601271876	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	28	ACT	ATT	CTA	2	AGTACTGTT:GATTCTATT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.16666666666667	10	36.166666666666664	0.0427669289697661	0.344937320784251	0.123984638346848	-0.302170391814485	0.0247434160598808	0.134573906030745	NaN	NaN	0.144652653547308	0.0367133251399519	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	29	ATT	CTA	TTC	2	ACTGTTCAT:TCTATTCGC	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.33333333333334	9	35.66666666666666	0.0566306643811089	0.307611718065443	0.184097877471173	-0.250981053684334	0.0296267721632603	0.121886223310456	0.219919034232126	0.402527022069221	0.132049937275586	0.0573475338566083	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	ATTCGCGCT:GTTCATGCT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.75	8	35.33333333333333	0.056298401666626	0.269530500680923	0.208875810063787	-0.213232099014297	0.0283165917763298	0.111959566849508	0.220247016084729	0.342940785735197	0.12239294451383	0.0814747244247456	17	0	983	0.983	0.017	0.034
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.25	9	35.666666666666664	0.0566975883332357	0.307611718065443	0.184315437298047	-0.250914129732207	0.0285326514553224	0.125404768704469	NaN	NaN	0.12835321274356	0.0505981544090414	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.91666666666666	9	35.49999999999999	0.0561665862243823	0.309399206498443	0.181534357699347	-0.25323262027406	0.0289778617580435	0.128905914198564	0.162818206767965	0.264871327306098	0.138552566516236	0.0675944857813262	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.75	9	35.33333333333333	0.0555166649189651	0.311207889047031	0.17839093054153	-0.255691224128066	0.0274222997683728	0.132068484010429	0.14350613129904	0.213834943075864	0.134766521446399	0.0577896244950347	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	34	ACG	CAA	CGA	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.25	9	35.16666666666666	0.0551338852123344	0.313038150259031	0.176125130967943	-0.257904265046697	0.0285182199737466	0.137280034100644	0.148948103208571	0.237023342925674	0.126883867739897	0.0420928594914302	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CGA	TAC	2	ACGATACCG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.33333333333333	9	34.58333333333333	0.0550706014161129	0.319619774513248	0.172300357510672	-0.264549173097135	0.0277874328730878	0.144785602766467	0.145725312265091	0.237061316367588	0.135709363920325	0.0512500143315132	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	36	CCG	TAC	CGA	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	0.75	1	1.25	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.58333333333333	9	33.58333333333333	0.0548816190849609	0.331581375185359	0.165514782168574	-0.276699756100398	0.0271065365941502	0.141425131217301	0.13388423959933	0.216364565223526	0.147440186217681	0.0605603772599416	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	37	ATA	CGA	TAC	2	CCGATACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333333	9	32.33333333333333	0.0545075207127158	0.347877835747554	0.156685810682893	-0.293370315034838	0.0277777768350706	0.146814961226897	0.150182844926676	0.296809221362455	0.156350032963739	0.0606046633549683	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333333	8	32.83333333333332	0.0545075207127158	0.294640950387176	0.184996419001125	-0.24013342967446	0.0260343245965375	0.125895558699666	0.158714537778256	0.243779384009088	0.141585087134033	0.0898790293759083	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.74999999999999	8	33.499999999999986	0.0547563501152288	0.287492986673213	0.190461516118545	-0.232736636557984	0.0273479264498406	0.126773803420173	0.162676419985019	0.241679267791119	0.131577095905145	0.0769233626045988	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	40	TCA	CCT	CAC	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.74999999999999	8	33.499999999999986	0.0547563501152288	0.287492986673213	0.190461516118545	-0.232736636557984	0.027741266418304	0.116682356416754	0.18462294589711	0.302248155320038	0.127395508924839	0.0677174253482405	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	41	CTC	CAC	TCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.24999999999999	9	33.16666666666666	0.0543839525266103	0.336838303699426	0.16145418121788	-0.282454351172816	0.0274543801795743	0.148212682094296	NaN	NaN	0.152374598419687	0.0637843857751352	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TCC	CTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.58333333333331	9	33.83333333333332	0.0548816190849609	0.328506491880477	0.167064032040283	-0.273624872795516	0.0256748105455016	0.148292237774428	0.1498421594121	0.264878951796437	0.162634962499354	0.0924819938389821	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.74999999999999	9	33.66666666666666	0.0547563501152288	0.330549935209217	0.165652279074178	-0.275793585093988	0.0282528732555391	0.13886980563533	0.141633219389655	0.242167476018977	0.136048931864921	0.0426455772048442	3	1	996	0.996	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	44	GGA	TCG	GAT	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.24999999999999	9	33.33333333333332	0.0543839525266103	0.334715326971315	0.162478225956086	-0.280331374444704	0.0255593627732184	0.144250861536792	0.132991197432868	0.221812903947653	0.148118497537108	0.0584090118321318	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	GGATGGCTT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666666	9	33.16666666666666	0.0542609435735893	0.336838303699426	0.161088994267138	-0.282577360125837	0.0279236555339179	0.149525288015995	0.140040780238744	0.250020081630552	0.14595079474151	0.0528537543983898	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTA	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333331	9	32.83333333333332	0.0545075207127159	0.341167493576766	0.159767626573284	-0.28665997286405	0.0279517889405654	0.1533049096737	0.15514052721324	0.303092062516425	0.160572624381908	0.0742231022783937	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	47	ATT	TTA	TTA	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333333	9	32.33333333333333	0.0541384900641951	0.347877835747554	0.155625005392646	-0.293739345683359	0.028282390012781	0.156753374973083	0.121029118994539	0.198496244933225	0.155110125379056	0.0582585900945456	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.5	8	32.16666666666666	0.0541996476239405	0.30215833840741	0.179374985676752	-0.24795869078347	0.026321888016102	0.134080881322471	0.195330925655494	0.358454869613291	0.140480761318928	0.0775516269887364	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.91666666666666	7	32.49999999999999	0.0546316519559279	0.253894219074791	0.215174855713571	-0.199262567118863	0.0271084900778309	0.111774754754098	NaN	NaN	0.117886891454745	0.0909732442140649	13	0	987	0.987	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.08333333333333	7	33.33333333333333	0.055260890339147	0.246378050229027	0.224293074353733	-0.19111715988988	0.026905994148228	0.108821246667188	NaN	NaN	0.113386098820873	0.0918838308816194	18	0	982	0.982	0.018	0.036
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAC	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.74999999999999	7	32.666666666666664	0.0547563501152288	0.25235417746591	0.216982142578661	-0.197597827350681	0.0281446733262973	0.1176740165415	NaN	NaN	0.117286590954791	0.0920380607090082	14	0	986	0.986	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	52	CTT	CAC	TTC	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.41666666666664	8	33.5	0.0550074627952336	0.287492986673213	0.191334972834518	-0.23248552387798	0.0286454364504335	0.128372681007679	0.162167514342571	0.238055878217793	0.127247954297328	0.0676956204882342	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TTC	TTG	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.66666666666664	7	33.583333333333336	0.0548189130040021	0.244209971081393	0.224474507577463	-0.189391058077391	0.0280274990236382	0.100995122776069	0.206670754747719	0.277414630539707	0.110187306537555	0.0856489513728771	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.99999999999999	7	33.25000000000001	0.0545695157118212	0.247109400847682	0.22083140311387	-0.192539885135861	0.0272522998374203	0.10350887705182	0.216074624283953	0.306774028870551	0.11241284092477	0.0867506970042116	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333333	7	33.583333333333336	0.0543223783836108	0.244209971081393	0.222441279293652	-0.189887592697782	0.0269491576930264	0.104705483354781	0.210075094335338	0.289661017695689	0.105059788292723	0.0706961799967316	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666666	7	32.91666666666667	0.0533558250189308	0.250079150443413	0.213355751266453	-0.196723325424482	0.0273295426143004	0.10289159782253	NaN	NaN	0.105050905324119	0.0611170640738916	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	57	CAG	TTC	AGA	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333333	8	32.75000000000001	0.0535942229866087	0.295559839412279	0.181331208912486	-0.24196561642567	0.0264690873329097	0.1341919039626	0.146200246913503	0.214866873504487	0.127737212934086	0.05819245658513	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	58	AGC	AGA	GCG	2	CAGAGCGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666666	8	33.00000000000001	0.0542609435735893	0.292820423057718	0.185304505085337	-0.238559479484128	0.0266777844321306	0.12754083895103	0.203622297885777	0.36280123611865	0.130712582179214	0.0679906200352153	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	59	GCT	GCG	CTA	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.25	8	33.50000000000001	0.0551338852123344	0.287492986673213	0.191774713708074	-0.232359101460879	0.0276202624537243	0.123185654712591	0.20222998326412	0.342976699098126	0.134474106804247	0.0840044311132375	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.75	8	33	0.0547563501152288	0.292820423057718	0.186996349310088	-0.238064072942489	0.0277929466827451	0.126229234711533	0.162029993582052	0.248465413079414	0.136119046325408	0.0803013557216165	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CCA	AAA	2	ACCAAAATA:TCCAAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.25	7	32.5	0.0543839525266103	0.253894219074791	0.214199254810879	-0.199510266548181	0.025883447616423	0.111338889866288	0.22096917513268	0.332364304210569	0.117980879364891	0.0908293570411189	15	0	985	0.985	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATT	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.58333333333333	7	32.166666666666664	0.0556454425645554	0.257031947307571	0.216492319913714	-0.201386504743015	0.0268092143225882	0.117360466702125	NaN	NaN	0.118463465113775	0.089133126172836	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	63	ATT	TAA	TTA	2	ATAATTACA:ATAATTGCG	1:1	FALSE	0.916666666666667	0.75	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.08333333333333	7	31.833333333333336	0.055260890339147	0.26024898720615	0.212338541380656	-0.204988096867003	0.0286265221172732	0.117843873977626	0.202533419263035	0.294448658375998	0.119417138476561	0.0860574317581581	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	64	ACA	TTA	CAC	2	ATTACACTC:ATTGCGCTC	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.5	7	32.16666666666667	0.0549444688504895	0.25703194730757	0.213765134747011	-0.202087478457081	0.0288158671222254	0.117165830841019	0.189565666580346	0.259464617253449	0.117808266500742	0.0862731936415545	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CAC	TCA	2	ACACTCAAA:GCGCTCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333333	6	32.5	0.054693929928504303	0.211925228838758	0.258081259263935	-0.157231298910254	0.0279911356234317	0.0983344759013461	NaN	NaN	0.102355494163422	0.124506610836322	29	0	971	0.971	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	66	AAA	TCA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTCAATAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.16666666666666	6	31.833333333333336	0.0544456664773409	0.217071598340042	0.250818932065226	-0.162625931862701	0.0268375473694106	0.101978752059433	NaN	NaN	0.105134887529248	0.121903937161063	22	0	978	0.978	0.022	0.044
ORF3a	all	ss13	67	AAA	AAA	AAA	2	AAAAAGAGG:AATAAAAGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666666	6	30.833333333333336	0.039920730758297	0.22528117443765	0.177204024517129	-0.185360443679353	0.0238668491147457	0.110450313579168	0.217415661769778	0.415045297816891	0.101481255660154	0.0677676702805626	13	1	986	0.986	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	68	AGA	AAA	GAT	2	AAAAGATGG:AAGAGGTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.5	6	30.416666666666668	0.0534747581886499	0.228889480485489	0.233626980476457	-0.175414722296839	0.0271418251508684	0.109042807549674	NaN	NaN	0.107416558848985	0.102462179813287	20	0	980	0.98	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	69	TGG	GAT	GGC	2	AGATGGCAG:AGGTGGCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.5	7	31.16666666666667	0.0541996476239405	0.266933470240076	0.203045528817327	-0.212733822616136	0.0271900128198794	0.114232688836663	0.185162139293853	0.272824018384801	0.116001886482314	0.066671446740916	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	70	CAA	GGC	AAT	2	TGGCAATTT:TGGCAGCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.16666666666667	7	31.16666666666667	0.0544456664773409	0.266933470240076	0.203967177395826	-0.212487803762735	0.0277444823615445	0.124005896576671	NaN	NaN	0.119873915727665	0.0762959790193628	10	0	990	0.99	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	71	CTA	AAT	TAG	2	CAATTTGCT:CAGCTAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.5	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76	7	30.66666666666667	0.0545695157118212	0.272179120267026	0.200491189986524	-0.217609604555205	0.0267718166976297	0.117766610422928	NaN	NaN	0.121304976565262	0.0728283325154577	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	72	GCC	TAG	CCC	2	CTAGCCCTT:TTTGCTCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76	6	30.83333333333334	0.0545695157118212	0.22528117443765	0.242228476693796	-0.170711658725829	0.0280866280596666	0.100205730370232	0.237120312031988	0.306997483476591	0.104701634412113	0.103004651685045	24	0	976	0.976	0.024	0.048
ORF3a	all	ss13	73	CTC	CCC	TCT	2	GCCCTTTAT:GCTCTCTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76	6	31.000000000000007	0.0545695157118212	0.223869741416997	0.243755656152636	-0.169300225705176	0.0283778589055458	0.0982219159187968	NaN	NaN	0.105043768159791	0.107024782606225	29	0	971	0.971	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	74	TAT	TCT	ATA	2	CTCTCCAAG:CTTTATAAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333333	6	30.66666666666667	0.0543223783836108	0.2267106539047	0.239611052449462	-0.172388275521089	0.0267294699895985	0.105224064315766	0.225010218504052	0.286925870005682	0.103389296826329	0.0954407329837547	24	0	976	0.976	0.024	0.048
ORF3a	all	ss13	75	AAG	ATA	AGG	2	TATAAGGGC:TCCAAGGGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.333333333333333	1.08333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.33333333333333	6	30.66666666666667	0.0403684875103351	0.2267106539047	0.178061713532459	-0.186342166394365	0.0214818161753822	0.109189415772864	NaN	NaN	0.106896365396109	0.0812979957525323	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	76	GGC	AGG	GCT	2	AAGGGCTTC:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666666	6	29.916666666666675	0.0408727688266098	0.233376267232886	0.175136783663709	-0.192503498406276	0.0234556433383531	0.113898070872993	0.175786839198978	0.319103420738374	0.102944152381955	0.0614866055833367	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	77	GTT	GCT	TCC	2	GGCTTCCAG:GGTGTTCAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666666	6	29.583333333333343	0.0408727688266098	0.236467295831908	0.172847448873708	-0.195594527005299	0.0243811728713387	0.112363040339614	NaN	NaN	0.10899072593532	0.0727177892653747	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	78	CAG	TCC	AGT	2	GTTCATTTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.66666666666666	6	29.25000000000001	0.0548189130040021	0.23964200873058	0.228753352946699	-0.184823095726578	0.0273242243883407	0.110906069378227	NaN	NaN	0.109609016054453	0.0917566289360461	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	79	TTC	AGT	TCA	2	CAGTTCATT:CATTTTGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76	6	29.25000000000001	0.0405504159527068	0.23964200873058	0.169212468913562	-0.199091592777873	0.0237323121008991	0.10725317025352	NaN	NaN	0.106480207392932	0.0615182490528355	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TCA	CTT	2	TTCATTTGC:TTTGCTTGC	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666666	6	29.416666666666675	0.0408727688266098	0.238043979028558	0.171702594593692	-0.197171210201948	0.0239163183529283	0.115409486539163	NA	NA	0.10318690430269	0.0560282028210506	2	1	997	0.997	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	81	TGC	CTT	GCA	2	ATTTGCAAT:GCTTGCAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	76	5	29.166666666666675	0.0267885619515594	0.194633396613813	0.137635998845114	-0.167844834662254	0.0185551618595264	0.0973435452041797	NA	NA	0.0980617197695139	0.0869659042384535	9	1	990	0.99	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	82	AAC	GCA	ACT	2	TGCAACTTG:TGCAATTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666666	5	29.500000000000007	0.0267288865855191	0.192126605059278	0.139121214249699	-0.165397718473759	0.0190273197583015	0.0949057678349467	NA	NA	0.0970943752956697	0.0884794485192222	7	3	990	0.99	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	83	TTA	ACT	TAC	2	AACTTGCTT:AATTTACTG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.5	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666666	5	29.500000000000007	0.0267288865855191	0.192126605059278	0.139121214249699	-0.165397718473759	0.0189508716927542	0.096264903236162	NaN	NaN	0.0926225345945862	0.0741449447278626	7	2	991	0.991	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TGC	2	TTACTGCTG:TTGCTTCTA	1:1	FALSE	1.25	1	0.25	0.5	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.5	5	29.333333333333343	0.0266103300115572	0.193371831976575	0.137612235140746	-0.166761501965018	0.0181550356754451	0.10019032582415	NA	NA	0.0936470356942745	0.0749540982532768	7	2	991	0.991	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	85	CTA	TGC	TAC	2	CTGCTGCTA:CTTCTACTA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666667	5	29.833333333333343	0.0400540111089283	0.189683904532547	0.211161886442798	-0.149629893423619	0.0232758328032414	0.0950384087946211	NaN	NaN	0.0949124657380357	0.114909669662938	22	1	977	0.977	0.022	0.044
ORF3a	all	ss13	86	CTA	TAC	TAT	2	CTACTATTT:CTGCTATTT	1:1	FALSE	1.25	1	0	0.75	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	5	30.166666666666675	0.0400094855289696	0.187302855665743	0.213608518603527	-0.147293370136773	0.0233354217301021	0.0912298760330442	NaN	NaN	0.0880270605090153	0.0942734164846651	24	0	976	0.976	0.024	0.048
ORF3a	all	ss13	87	TTT	TAT	TTG	2	CTATTTGTT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666669	5	31.416666666666675	0.039920730758297	0.178884786483983	0.223164482251102	-0.138964055725686	0.0224985156626491	0.0873531859451968	NaN	NaN	0.0882069635704168	0.115156808166786	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	88	GTT	TTG	TTA	2	TTTGTTACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.33333333333334	5	30.41666666666668	0.0393103070130301	0.185556129985381	0.211851298128104	-0.146245822972351	0.0206795545623224	0.0923305519761569	NaN	NaN	0.0907003103833524	0.10687338437506	25	0	975	0.975	0.025	0.05
ORF3a	all	ss13	89	ACA	TTA	CAG	2	GTTACAGTC:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.16666666666669	5	30.583333333333343	0.0393963647100293	0.184409724221212	0.213634963537881	-0.145013359511182	0.0220955544963065	0.0981504415775989	NA	NA	0.08592879050035	0.0914881897741786	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CAG	TCT	2	ACAGTCTAC:ACCATCTAT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.83333333333334	5	30.25000000000001	0.039054375562259	0.18671695246621	0.209163522896116	-0.147662576903951	0.0215700590635913	0.0957825617715311	NaN	NaN	0.0902628586115291	0.101856885276825	23	0	977	0.977	0.023	0.046
ORF3a	all	ss13	91	TAC	TCT	ACT	2	ATCTATTCA:GTCTACTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.33333333333334	4	30.583333333333343	0.0393103070130301	0.143721781908901	0.273516696571069	-0.104411474895871	0.0226884846330014	0.0794388509050494	NA	NA	0.0750713848270292	0.164277223029623	46	1	953	0.953	0.046	0.092
ORF3a	all	ss13	92	TCA	ACT	CAC	2	TACTCTCAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.00000000000001	4	29.91666666666668	0.0389698041980333	0.147260274111344	0.26463215849081	-0.108290469913311	0.0223807898244705	0.081282537805113	NA	NA	0.077952090524847	0.164774181189574	46	0	954	0.954	0.046	0.092
ORF3a	all	ss13	93	CAC	CAC	ACC	2	TCACATCTT:TCTCACCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.50000000000001	4	29.083333333333343	0.0382248326940206	0.151937056450332	0.251583343702043	-0.113712223756312	0.0217988518131335	0.0808296221312236	NA	NA	0.0789413260794007	0.149735862113996	50	2	948	0.948	0.05	0.1
ORF3a	all	ss13	94	CTT	ACC	TTT	2	CACCTTTTG:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.50000000000001	4	28.41666666666668	0.0382248326940206	0.155898728322134	0.245190150717822	-0.117673895628113	0.0223081804853684	0.0863479306070147	NaN	NaN	0.0833692610096331	0.158103655033778	46	2	952	0.952	0.046	0.092
ORF3a	all	ss13	95	TTG	TTT	TGC	2	CTTTTGCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000001	4	28.583333333333343	0.0379827996140662	0.154888999008431	0.245225935071081	-0.116906199394364	0.0221231011750157	0.0851503259395093	NA	NA	0.0772870169755757	0.130375185694152	36	1	963	0.963	0.036	0.072
ORF3a	all	ss13	96	CTT	TGC	TTG	2	TTGCTTGTC:TTGCTTGTT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.83333333333336	4	29.41666666666668	0.0385523838449736	0.150031026615648	0.256962741071803	-0.111478642770675	0.0217118101769854	0.0798489662952372	NA	NA	0.0822276214876549	0.175184357056834	47	1	952	0.952	0.047	0.094
ORF3a	all	ss13	97	GTC	TTG	TCG	2	CTTGTCGCT:CTTGTTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.08333333333336	4	29.750000000000014	0.038428896281493	0.148172379571929	0.259352629636606	-0.109743483290436	0.0213292098446185	0.0825920054069631	NA	NA	0.0767049021308047	0.152509560437046	42	2	956	0.956	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	98	GCT	TCG	CTG	2	GTCGCTGCA:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.25000000000003	4	29.583333333333346	0.0515777829948789	0.149095891727942	0.345936983220126	-0.0975181087330634	0.0264604558485818	0.0815691178947629	NA	NA	0.0766412560519979	0.203232078804701	74	0	926	0.926	0.074	0.148
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.4166666666667	4	28.91666666666668	0.0508130785858607	0.152908411727716	0.332310551209854	-0.102095333141855	0.0258612256914691	0.082653047322282	NA	NA	0.0817596361445445	0.211765532768438	76	0	924	0.924	0.076	0.152
ORF3a	all	ss13	100	GGC	CAG	GCC	2	GCAGGTATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	4	28.75000000000001	0.0500707265730996	0.15389231077321	0.325362107577216	-0.103821584200111	0.0251547131204685	0.0807623073158841	NaN	NaN	0.0826578357538874	0.209101309275805	75	0	925	0.925	0.075	0.15
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GCC	TGG	2	GGCCTTGAA:GGTATGGAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.9166666666667	4	29.083333333333343	0.0498625949111442	0.151937056450332	0.328179287371176	-0.102074461539188	0.0258271546541717	0.0865760245995936	NA	NA	0.0831925237521822	0.219835083573163	76	0	924	0.924	0.076	0.152
ORF3a	all	ss13	102	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAGGCG:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333337	3	28.91666666666667	0.0500707265730995	0.11166090491713	0.448417703673995	-0.06159017834403	0.0253206459260828	0.0739318253153205	NA	NA	0.0684651562978946	0.368341525916388	181	2	817	0.817	0.181	0.362
ORF3a	all	ss13	103	GCC	AAG	CCC	2	GAAGCCCAA:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.33333333333337	3	29.16666666666667	0.0633287393599309	0.110629602831442	0.572439362874871	-0.0473008634715114	0.0277184772533944	0.0652171444387859	NA	NA	0.071312538343801593	0.507145110033389	226	1	773	0.773	0.226	0.452
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CCC	AAT	2	GCCCAATTT:GCGCAATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.58333333333337	4	29.500000000000007	0.0764181120413494	0.149561992614941	0.510946067949856	-0.0731438805735915	0.0304271071980761	0.0874807166691387	NaN	NaN	0.08027180635936	0.362188621817173	152	0	848	0.848	0.152	0.304
ORF3a	all	ss13	105	TTT	AAT	TTC	2	CAATTTCTC:CAATTTTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.9166666666667	4	29.500000000000007	0.0770731033781903	0.149561992614941	0.515325464916886	-0.0724888892367506	0.0301142426972666	0.082434415973292	NaN	NaN	0.0810561751789252	0.371159078580664	158	0	842	0.842	0.158	0.316
ORF3a	all	ss13	106	CTC	TTC	TCT	2	TTTCTCTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.25000000000004	4	29.166666666666675	0.0767442089720042	0.151456007747705	0.506709572721899	-0.0747117987757009	0.0313616205501475	0.0876219973306408	NA	NA	0.0801061939583145	0.350995827925635	158	0	842	0.842	0.158	0.316
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TCT	ACC	2	CTCTATCTT:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.25000000000004	3	30.000000000000007	0.0777394299845026	0.107325632730505	0.724332370624886	-0.0295862027460024	0.0312081486889804	0.0673022065428437	NaN	NaN	0.0575459860831094	0.607160072474915	310	0	690	0.69	0.31	0.62
ORF3a	all	ss13	108	CTC	ACC	TCT	2	TACCTCTAT:TATCTTTAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.66666666666671	3	30.08333333333334	0.0773216317702306	0.107006075844546	0.722591041302743	-0.0296844440743151	0.0308026142043148	0.0622506781525646	NA	NA	0.0604015526390456	0.623107024982968	309	0	691	0.691	0.309	0.618
ORF3a	all	ss13	109	TAC	TCT	ACG	2	CTCTATGCC:CTTTACGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.83333333333337	3	30.250000000000007	0.0771557683120387	0.106372646579413	0.725334668198159	-0.0292168782673746	0.0313349138189543	0.0653140973984015	NaN	NaN	0.0604209593075913	0.628701467480302	287	0	713	0.713	0.287	0.574
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ACG	CCT	2	TACGCTTTA:TATGCCTTG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.50000000000004	3	30.58333333333334	0.0774882105210195	0.105128058952294	0.737084003008014	-0.0276398484312747	0.0320032398979079	0.0660666715075847	NaN	NaN	0.0557943689864058	0.620326420939671	302	0	698	0.698	0.302	0.604
ORF3a	all	ss13	111	TTA	CCT	TAG	2	GCCTTGATA:GCTTTAGTT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.66666666666671	3	30.41666666666667	0.0773216317702306	0.105746684778908	0.731196745618005	-0.0284250530086775	0.0320016981484558	0.0668171090019069	NA	NA	0.0583141914466736	0.625941893015171	324	1	675	0.675	0.324	0.648
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TAG	TAT	2	TTAGTTTAT:TTGATATAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.66666666666671	3	30.41666666666667	0.0753771912377858	0.105746684778908	0.712809024655309	-0.0303694935411222	0.0294482369846406	0.0632907217721561	NaN	NaN	0.0568795878618961	0.59339269984474	292	0	708	0.708	0.292	0.584
ORF3a	all	ss13	113	TAT	TAT	ATT	2	ATATATTTT:GTTTATTTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.33333333333337	3	31.250000000000007	0.0747506138799603	0.102724391304868	0.727681253988779	-0.0279737774249076	0.030405142198121	0.0634353900240429	NaN	NaN	0.0569691403954602	0.623402492924706	338	1	661	0.661	0.338	0.676
ORF3a	all	ss13	114	TTT	ATT	TTC	2	TATTTTCTA:TATTTTCTG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.00000000000004	4	31.58333333333334	0.0750625939177369	0.138722674692595	0.541098231302657	-0.063660080774858	0.029941853057232	0.0700420077291081	NaN	NaN	0.0655980865482807	0.331819063765038	156	0	844	0.844	0.156	0.312
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TTC	TAC	2	TTTCTACAA:TTTCTGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.00000000000004	4	31.91666666666667	0.0760143706952156	0.137132914796851	0.554311638513798	-0.0611185441016354	0.0300882528446177	0.0753524102465565	NaN	NaN	0.0702222286595465	0.384104281227651	172	0	828	0.828	0.172	0.344
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAA	2	CTACAATGC:CTGCAAAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	83.00000000000004	4	32.583333333333336	0.103166657193186	0.134060541816084	0.769552739349054	-0.0308938846228982	0.0413847660519157	0.0735543394798662	NaN	NaN	0.0725062972176541	0.670045518217377	336	0	664	0.664	0.336	0.672
ORF3a	all	ss13	117	AGT	AAA	GCA	2	CAAAGTGTT:CAATGCATC	1:1	TRUE	2.25	0.416666666666667	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.50000000000004	5	33.41666666666667	0.105204990412841	0.166890228132415	0.630384364561891	-0.0616852377195736	0.0414861865856975	0.0768052309227232	NaN	NaN	0.0794069862059904	0.437262725995838	206	0	794	0.794	0.206	0.412
ORF3a	all	ss13	118	ATC	GCA	TCA	2	AGTGTTAAT:TGCATCAAC	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.08333333333337	5	33.75000000000001	0.0917171833187057	0.165046413582601	0.555705400243694	-0.0733292302638956	0.0403559056556557	0.0818560085299437	NaN	NaN	0.0795144932531966	0.356417936670251	185	0	815	0.815	0.185	0.37
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TCA	ACG	2	ATCAACGCA:GTTAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.91666666666671	4	32.91666666666667	0.0907253574709977	0.132575542143044	0.684329522658926	-0.0418501846720465	0.0398010702507995	0.068640982476451	NaN	NaN	0.0728154719121229	0.565465103844808	268	1	731	0.731	0.268	0.536
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT:AATGCTTGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.58333333333337	5	33.58333333333333	0.0923227698874005	0.16596317904302	0.55628465554681406	-0.0736404091556193	0.040979063096745	0.0812141512370045	NaN	NaN	0.082492121917216	0.372019850902397	168	0	832	0.832	0.168	0.336
ORF3a	all	ss13	121	TGC	CAT	GCA	2	GCATGTAGA:GCTTGCAGA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.58333333333337	5	33.58333333333333	0.0923227698874005	0.16596317904302	0.55628465554681406	-0.0736404091556193	0.0399271573600233	0.0805151081467677	NA	NA	0.0800369604961871	0.357530938361273	153	1	846	0.846	0.153	0.306
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GCA	GAA	2	TGCAGAATT:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.41666666666671	5	33.58333333333333	0.106728023137133	0.16596317904302	0.643082542480508	-0.0592351559058869	0.0426773562630092	0.0783361853602944	NaN	NaN	0.0830241015380484	0.475555341839975	235	0	765	0.765	0.235	0.47
ORF3a	all	ss13	123	ATT	GAA	TTA	2	AGAATTATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.41666666666671	5	33.416666666666664	0.106728023137133	0.166890228132415	0.639510319636283	-0.0601622049952821	0.0425349359479941	0.0793065049902654	NaN	NaN	0.0832101236556741	0.469670392250187	228	0	772	0.772	0.228	0.456
ORF3a	all	ss13	124	ATT	TTA	TTA	2	ATTATTATG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.75000000000006	5	33.75	0.106254713938364	0.165046413582601	0.643786869595842	-0.0587916996442377	0.0422557487356691	0.0810401936337557	NaN	NaN	0.0800792046741535	0.46284551592587603	223	0	777	0.777	0.223	0.446
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TTA	TGA	2	ATTATGAGA:ATTATGAGG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.91666666666673	5	33.58333333333333	0.106019632717102	0.16596317904302	0.63881418353417	-0.0599435463259179	0.0446431562668482	0.0850229504353044	NaN	NaN	0.0849624400066866	0.480480498264326	224	0	776	0.776	0.224	0.448
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATGT:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.25000000000006	6	34.41666666666667	0.105552582259344	0.198409364312814	0.53199395414084	-0.0928567820534696	0.0435951807685438	0.0857571588857094	NaN	NaN	0.0901004100878119	0.30273208392148	147	0	853	0.853	0.147	0.294
ORF3a	all	ss13	127	CTT	GAT	GTT	2	AGATGTTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.91666666666671	7	35.083333333333336	0.106019632717102	0.231968667588477	0.457042900747207	-0.125949034871375	0.0411562903162085	0.0942648101492903	0.379680657704052	0.228683869149405	0.0953421013529803	0.186493953747825	65	0	935	0.935	0.065	0.13
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GTT	GGC	2	CTTTGGCTG:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.33333333333339	6	34.75	0.119722609193913	0.196233824001589	0.61010179974347	-0.0765112148076763	0.0489898320031091	0.0845519240158604	0.659736261311061	0.355087532380218	0.10065030425162	0.447153728809096	214	0	786	0.786	0.214	0.428
ORF3a	all	ss13	129	CTG	GGC	TGT	2	TGGCTGTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.16666666666673	6	34.916666666666664	0.121614085547219	0.195163947524611	0.623138069759957	-0.0735498619773914	0.0507455201642528	0.0834593342011293	0.642848441858496	0.332376073622322	0.0967465069139115	0.447115478417855	239	0	761	0.761	0.239	0.478
ORF3a	all	ss13	130	TGC	TGT	GCT	2	CTGTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.5833333333334	6	35	0.15067539576423	0.194633396613813	0.774149752229811	-0.0439580008495832	0.0564102572281349	0.0845903738615901	NaN	NaN	0.0985662153051884	0.655615795880435	313	0	687	0.687	0.313	0.626
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GCT	GGA	2	TGCTGGAAG:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.16666666666674	6	34.916666666666664	0.182716561993313	0.195163947524611	0.936220876400706	-0.0124473855312983	0.0658615596606946	0.0882217693373277	NaN	NaN	0.10887722799176	0.90898019119968	449	0	551	0.551	0.449	0.898
ORF3a	all	ss13	132	AAG	GGA	AGT	2	TGGAAGTGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	14	80.16666666666674	7	34.583333333333336	0.198802969548925	0.235909286040997	0.842709385820348	-0.0371063164920715	0.0663544840251952	0.0975358521921493	0.780419528298036	0.280224186185585	0.120894892524658	0.758896357036813	384	0	616	0.616	0.384	0.768
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AGT	GCA	2	AAGTGCAAA:AAGTGCAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.41666666666674	7	34.333333333333336	0.231204431105144	0.237930656019994	0.971730314086617	-0.00672622491485039	0.0772869376992221	0.102392166314567	0.930359482606658	0.296269112727557	0.118236038361601	0.954634324751974	446	0	554	0.554	0.446	0.892
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCC:TGCAGATCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	16	80.75000000000007	7	34.166666666666664	0.230087393607352	0.239297754894712	0.961510874636447	-0.00921036128735936	0.0747413938007062	0.0980478110537425	NaN	NaN	0.118801757951379	0.93820419651292	473	0	527	0.527	0.473	0.946
ORF3a	all	ss13	135	TCC	AAT	CCA	2	AAATCCAAG:AGATCCAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.0833333333334	7	34.416666666666664	0.215501453764007	0.237252996159118	0.908319208830887	-0.0217515423951104	0.0769332120550306	0.098486108929139	0.682802393711712	0.183425628801685	0.121326799086105	0.857717372163361	402	0	598	0.598	0.402	0.804
ORF3a	all	ss13	136	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAT:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.0833333333334	7	35.083333333333336	0.215501453764007	0.231968667588477	0.929011042759951	-0.0164672138244696	0.0734845151234546	0.0994311875192649	NaN	NaN	0.123794831788123	0.89417740171738	475	0	525	0.525	0.475	0.95
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AAA	ACC	2	AAAAATCCA:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.50000000000006	7	34.5	0.214210364540791	0.236579217337834	0.905448783503668	-0.0223688527970423	0.0740469061836854	0.0964030047318008	0.810425127033115	0.263886756343564	0.120871791914557	0.8531799051207	429	0	571	0.571	0.429	0.858
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA:AATCCATTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.8333333333334	7	34.5	0.216283656691977	0.236579217337834	0.914212411072125	-0.0202955606458565	0.0778695849752855	0.10200706646818	NaN	NaN	0.122849383065748	0.868781167136295	438	0	562	0.562	0.438	0.876
ORF3a	all	ss13	139	TTA	CAT	TAC	2	CCATTACTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.66666666666673	7	34.66666666666667	0.216808309568067	0.235243169141281	0.921634878323956	-0.0184348595732146	0.0744328197519162	0.0980259077112235	0.75716182957745	0.223519339015234	0.121757678417372	0.879655349722624	443	0	557	0.557	0.443	0.886
ORF3a	all	ss13	140	CTT	TAC	TTT	2	TTACTTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.3333333333334	7	35.66666666666667	0.221099655165483	0.227535736496163	0.971713975880055	-0.00643608133068002	0.075943271351438	0.101750100962865	NaN	NaN	0.117887294936316	0.956460956913394	464	0	536	0.536	0.464	0.928
ORF3a	all	ss13	141	TAT	TTT	ATG	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.3333333333334	8	35.66666666666667	0.221099655165483	0.266505540694197	0.829624984867333	-0.0454058855287133	0.0771087683498882	0.10437508315954	0.652176153013234	0.203342112130104	0.132877906795463	0.732568148869923	364	0	636	0.636	0.364	0.728
ORF3a	all	ss13	142	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGCC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.16666666666673	8	36.50000000000001	0.221648134682889	0.259234959672941	0.855008656866834	-0.0375868249900517	0.0773789871546203	0.105260955166722	0.649519058764064	0.188049239082442	0.12152902167928	0.757106483200053	364	0	636	0.636	0.364	0.728
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ATG	CCA	2	GATGCCAAC:GATGCCAAT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.75000000000006	9	36.91666666666667	0.240550445951301	0.294844647490837	0.815854884931487	-0.0542942015395355	0.0778687158675707	0.113028655867282	0.708784923590841	0.249707023849202	0.133491355929648	0.684210363066955	338	0	662	0.662	0.338	0.676
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CCA	ACT	2	GCCAACTAC:GCCAATTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	78.08333333333339	9	37.25000000000001	0.257172181186926	0.29161934182815	0.881876282878645	-0.034447160641224	0.0853605049498739	0.106722577082802	0.615965823464885	0.152230619815025	0.14068175800781	0.806565795497522	377	0	623	0.623	0.377	0.754
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTT:AATTACTTT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.08333333333339	10	37.25000000000001	0.275437924150749	0.332307284140461	0.828865141681113	-0.0568693599897117	0.0845622825197722	0.115246486160132	0.457575510796732	0.0700746082954128	0.142295948042075	0.689410263444071	353	0	647	0.647	0.353	0.706
ORF3a	all	ss13	146	TTT	ACT	TTC	2	TACTTTCTT:TACTTTGTT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.416666666666667	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.91666666666671	10	37.41666666666667	0.27615017609084	0.330447149722366	0.835686361110557	-0.0542969736315267	0.0817272843716647	0.119446465869576	0.516726776782776	0.105820159522102	0.141100951785399	0.70037862880265	340	1	659	0.659	0.34	0.68
ORF3a	all	ss13	147	CTT	TTC	TTT	2	TTTCTTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.83333333333337	10	36.91666666666667	0.27650770083468	0.336092154301423	0.822713941089786	-0.059584453466743	0.086278013704398	0.116803380305412	0.487737328894885	0.0916423617970841	0.139414353645866	0.669094491330754	324	0	676	0.676	0.324	0.648
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TTT	GCT	2	CTTTGCTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.83333333333337	10	37.916666666666664	0.262179645500183	0.324991546958348	0.806727584006316	-0.0628119014581648	0.0828623126459787	0.115191051972857	0.47989684818826	0.0927544223473423	0.140976616035128	0.655923512569886	323	0	677	0.677	0.323	0.646
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC:TGCTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.83333333333337	10	38.083333333333336	0.262179645500183	0.323213439068629	0.811165668901886	-0.0610337935684456	0.0876041628780873	0.119500163237758	0.435710665821533	0.062644377941657	0.138414746121086	0.65925018208765	332	0	668	0.668	0.332	0.664
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.1666666666667	10	37.416666666666664	0.260825162391735	0.330447149722367	0.78930976590621	-0.0696219873306312	0.0834890519009047	0.112696897165982	0.460058864693339	0.0862222302762038	0.144907659381554	0.630902040095057	316	0	684	0.684	0.316	0.632
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.75000000000003	10	37.416666666666664	0.281242210583348	0.330447149722367	0.851095888766602	-0.0492049391390187	0.0870205605713278	0.125202302541067	0.490655414386739	0.0828098707650386	0.14193104329953	0.728830228173848	372	1	627	0.627	0.372	0.744
ORF3a	all	ss13	152	AAT	CAC	ATA	2	ACACATAAC:ACTAATTGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.08333333333337	10	37.083333333333336	0.279768061455196	0.334188826423192	0.837155641765588	-0.0544207649679961	0.0877643081097418	0.122788535195646	0.66896744827277	0.210783247826185	0.148201046501762	0.71346309189602	348	0	652	0.652	0.348	0.696
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ATA	ACT	2	AATTGCTAT:CATAACTAT	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.416666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.25000000000003	12	37.25	0.264584505778426	0.420971287091357	0.628509624983064	-0.156386781312931	0.0874360804809352	0.161278169699683	0.360650690347528	0.0813842547240734	0.182219968932533	0.390765057351554	174	0	826	0.826	0.174	0.348
ORF3a	all	ss13	154	TAT	ACT	ATG	2	AACTATGAC:TGCTATGAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.33333333333337	11	36.75	0.264238228927332	0.381986287095468	0.691747944504858	-0.117748058168135	0.0842326805647763	0.158676171144649	0.492735879128512	0.1603510209295	0.187818951906341	0.53070957946071	225	0	775	0.775	0.225	0.45
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ATG	ACT	2	TATGACTAC:TATGACTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.00000000000003	11	36.75	0.261500632286273	0.381986287095468	0.684581203882111	-0.120485654809195	0.0827225247266347	0.150257594754425	0.488817720224848	0.161368549049451	0.171674613942211	0.482787874013162	238	0	762	0.762	0.238	0.476
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.33333333333337	11	36.75	0.264238228927332	0.381986287095468	0.691747944504858	-0.117748058168135	0.0838115621967272	0.157781618295934	0.471623482822945	0.142447421871416	0.171446195963075	0.492213141475064	226	0	774	0.774	0.226	0.452
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA:TATTGTATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.33333333333337	11	36.75	0.264238228927332	0.381986287095468	0.691747944504858	-0.117748058168135	0.0855631389450472	0.153045874793982	0.447109816715533	0.121826005660628	0.17932008616209	0.511414873007	234	0	766	0.766	0.234	0.468
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.6666666666667	11	36.916666666666664	0.267034361445878	0.379740833733665	0.703201598891432	-0.112706472287786	0.0856597698541122	0.162688096153892	0.470392117257279	0.134933649003912	0.175832807568967	0.521531393539329	256	0	744	0.744	0.256	0.512
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.6666666666667	11	36.583333333333336	0.267034361445878	0.384259035673055	0.694933200407767	-0.117224674227177	0.0863157997203217	0.163699855017304	0.421763017697637	0.0994170343579972	0.18246904892318	0.520590173061101	245	1	754	0.754	0.245	0.49
ORF3a	all	ss13	160	TAT	CAT	ATA	2	CCATATAAC:CCATATAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.33333333333337	11	36.25	0.283107148654449	0.38888847704186	0.727990581793389	-0.105781328387411	0.0889307356735059	0.164360626664879	0.539052647754596	0.176855664969296	0.182757574085655	0.562719535837636	250	0	750	0.75	0.25	0.5
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ATA	ACA	2	TATAACAGT:TATAATAGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	19	76.58333333333337	11	36.333333333333336	0.301247890911877	0.38772045925013	0.776971871679159	-0.0864725683382532	0.0892532864615757	0.148859595090429	0.478280600557903	0.104266894985766	0.191835403456074	0.65215937005877	306	0	694	0.694	0.306	0.612
ORF3a	all	ss13	162	AGC	ACA	GCA	2	AACAGTGTC:AATAGCATA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	76.50000000000003	11	36	0.321454977502394	0.392436107823411	0.819126912875822	-0.070981130321017	0.0903018268425701	0.165789881160818	0.514585249260969	0.111425232970693	0.19051422313587	0.709463635060874	358	0	642	0.642	0.358	0.716
ORF3a	all	ss13	163	ATA	GCA	TAA	2	AGCATAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	75.6666666666667	11	36.166666666666664	0.325888073027	0.390063711884091	0.835473957454004	-0.064175638857091	0.0924100821119058	0.150897298515978	0.57607396682179	0.146977838695325	0.195631282854147	0.742878509289696	340	0	660	0.66	0.34	0.68
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TAA	CAG	2	ATAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	76.33333333333337	10	36.166666666666664	0.322331773206585	0.344937320784251	0.934464767319843	-0.0226055475776658	0.0914378857810362	0.162052642247701	0.681394207293547	0.170249953889013	0.173234016344428	0.896177665731428	438	0	562	0.562	0.438	0.876
ORF3a	all	ss13	165	GAT	CAG	ATA	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	76.83333333333337	10	35.5	0.319715833685829	0.353207278115753	0.905179064801297	-0.0334914444299241	0.0926693332333018	0.14684679915627	NaN	NaN	0.181369698488942	0.853496950568295	417	0	583	0.583	0.417	0.834
ORF3a	all	ss13	166	ACA	ATA	CAA	2	GATACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.00000000000003	10	35.333333333333336	0.29924444520191	0.355338264064231	0.842139660894551	-0.0560938188623211	0.0812777845604473	0.156974945692246	NaN	NaN	0.179326716518734	0.754430827686388	379	0	621	0.621	0.379	0.758
ORF3a	all	ss13	167	ATT	CAA	TTG	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	19	76.83333333333337	9	35.5	0.300042574574177	0.309399206498443	0.969758707431227	-0.0093566319242655	0.0851060897679339	0.137407059670552	0.729617072348867	0.183803832832561	0.165695371997479	0.954968286854134	495	0	505	0.505	0.495	0.99
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TTG	TCA	2	ATTGTCATT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	19	76.00000000000003	9	35.833333333333336	0.304098831081123	0.305845048400816	0.994290516296328	-0.00174621731969327	0.0835829031714359	0.138644391873763	0.738803633190747	0.178363276196399	0.165564289073996	0.991584815687789	490	0	510	0.51	0.49	0.98
ORF3a	all	ss13	169	ATT	TCA	TTA	2	GTCATTACA:GTCGTTACT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.00000000000003	9	35.5	0.29924444520191	0.309399206498443	0.967179097155882	-0.0101547612965326	0.0861055318609733	0.13705316786611	0.827760713295699	0.242634018775708	0.154832034634656	0.947707705596875	446	0	554	0.554	0.446	0.892
ORF3a	all	ss13	170	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATCA:GTTACTGAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.6666666666667	8	34.833333333333336	0.315450399129949	0.274200382158177	1.15043748898926	0.0412500169717713	0.0857103504763502	0.126125687588437	1.23848475426063	0.352937146302215	0.149828755434534	0.783074686479914	626	0	374	0.374	0.626	0.748
ORF3a	all	ss13	171	GAA	CAT	AAG	2	ACATCAGGT:ACTGAAGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	21	78.00000000000003	8	34.833333333333336	0.333514365946084	0.274200382158177	1.21631619664808	0.0593139837879067	0.0897173235289334	0.136189982081841	1.16214365783523	0.295277493661507	0.15359479244141	0.699369406802802	676	0	324	0.324	0.676	0.648
ORF3a	all	ss13	172	GGT	AAG	GTG	2	GAAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.33333333333336	8	35.16666666666667	0.317142638115025	0.271069160022998	1.16996945756617	0.0460734780920274	0.0875235621790061	0.127716971211057	NaN	NaN	0.154501309767403	0.765544655837485	635	0	365	0.365	0.635	0.73
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	78.00000000000001	8	35.16666666666667	0.313776384708054	0.271069160022998	1.15755102749953	0.0427072246850566	0.0857858134570749	0.138409704087319	1.11411549972935	0.29881098820315	0.149499757934575	0.77513278580768	631	1	368	0.368	0.631	0.736
ORF3a	all	ss13	174	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATT:GATGGCACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.16666666666669	8	35.33333333333334	0.317995686432648	0.269530500680923	1.17981336297483	0.0484651857517255	0.0870213468638305	0.125059462453457	1.01969402264626	0.247261390680168	0.152074868432577	0.749959374621693	649	0	351	0.351	0.649	0.702
ORF3a	all	ss13	175	ACT	GCA	CTA	2	GGCACTACA:GGCATTTCA	1:1	FALSE	1	0.833333333333333	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	76.66666666666669	8	35.83333333333334	0.320583011120205	0.265018643484554	1.20966210869195	0.0555643676356509	0.0853473704868684	0.121970229780606	NaN	NaN	0.150291605445164	0.71159829151344	660	0	340	0.34	0.66	0.68
ORF3a	all	ss13	176	ACA	CTA	CAA	2	ACTACAAGT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	76.58333333333334	8	36	0.321018393180178	0.263548415128416	1.21806231702725	0.0574699780517618	0.0889648842391842	0.127139034749023	1.05361789712263	0.24765009008854	0.146020381040245	0.693894808348143	645	0	355	0.355	0.645	0.71
ORF3a	all	ss13	177	ACA	CAA	CAC	2	ACAAGTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.41666666666669	7	35.833333333333336	0.316717853327956	0.226300369430573	1.3995463380148	0.0904174838973826	0.0875207427490029	0.110789234544932	1.60963638110279	0.38458474548401	0.136612681025885	0.508065571089688	750	0	250	0.25	0.75	0.5
ORF3a	all	ss13	178	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:AGTCCTATT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.75000000000001	7	35.833333333333336	0.295705458110177	0.226300369430573	1.3066945443096	0.069405088679604	0.0763022137800035	0.111316379932546	NaN	NaN	0.135861091222328	0.609453774079963	697	0	303	0.303	0.697	0.606
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTC:CCTATTACA	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.916666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	20	77.91666666666667	7	35.666666666666664	0.314193196111627	0.227535736496164	1.38085208481932	0.0866574596154632	0.0799743893431485	0.114854818981413	NaN	NaN	0.138616310934897	0.531865641506782	746	0	254	0.254	0.746	0.508
ORF3a	all	ss13	180	ACA	AAC	CAG	2	AAACTCAAA:ATTACAGAC	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.5	7	35.75	0.277947211843005	0.226916358788052	1.22488838322414	0.051030853054953	0.0697002456667836	0.110441235523236	1.09067608903857	0.261414468017307	0.128119724943219	0.690404650362027	681	0	319	0.319	0.681	0.638
ORF3a	all	ss13	181	AAA	CAG	AAG	2	ACAGACCAT:CTCAAAGAA	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.83333333333334	7	36.083333333333336	0.240246862716335	0.224472453654355	1.07027325092757	0.0157744090619799	0.0598798054304997	0.112539244980902	NaN	NaN	0.122950856997542	0.897912761549176	555	0	445	0.445	0.555	0.89
ORF3a	all	ss13	182	CAT	AAG	AAG	2	AAAGAAGAC:GACCATGAC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	2	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.83333333333334	6	36.416666666666664	0.226136674284849	0.186038038359055	1.21553998461542	0.0400986359257938	0.0626753227913117	0.101262421708668	NaN	NaN	0.113219427719013	0.723213396308438	669	0	331	0.331	0.669	0.662
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.25	6	36.666666666666664	0.193420049534211	0.184599802154181	1.04778037287745	0.00882024738003009	0.0511693483189394	0.0968491105596311	NaN	NaN	0.103323330023856	0.931970822711339	585	1	414	0.414	0.585	0.828
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	14	74.91666666666667	6	37.333333333333336	0.214927757699318	0.180871542612666	1.18828951528092	0.0340562150866518	0.0539082531203651	0.0920253511012859	NaN	NaN	0.109674715562217	0.756165397473956	628	0	372	0.372	0.628	0.744
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	75.91666666666667	6	37	0.229330320216207	0.182716561993313	1.25511512319611	0.0466137582228946	0.0549244719694535	0.0964954385574584	NaN	NaN	0.110633472736773	0.673510449696664	668	1	331	0.331	0.668	0.662
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	16	75.91666666666667	6	36.75	0.24743074621853	0.184125343811615	1.34381688634719	0.0633054024069151	0.0554579206073908	0.0918512916467922	NaN	NaN	0.110405861186448	0.566381973833099	720	0	280	0.28	0.72	0.56
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.66666666666667	6	36.75	0.267034361445878	0.184125343811615	1.45028574512312	0.0829090176342636	0.0584851217690507	0.093370795960835	NaN	NaN	0.114827808475621	0.470276595014412	787	0	213	0.213	0.787	0.426
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.5	6	36.916666666666664	0.267742763704315	0.183183742573707	1.46160767294392	0.0845590211306077	0.0585507301447078	0.0992104695843447	NaN	NaN	0.112221873007716	0.451150368707783	775	1	224	0.224	0.775	0.448
ORF3a	all	ss13	189	TAT	GTT	ATA	2	GGTTATACG:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.91666666666667	6	36.166666666666664	0.28050317670762	0.187498978963039	1.49602508909083	0.0930041977445808	0.0585573338348585	0.10404578716104	NaN	NaN	0.112846039438994	0.409843587616316	799	0	201	0.201	0.799	0.402
ORF3a	all	ss13	190	ACG	ATA	CGG	2	TATACGGAA:TATTCTGAG	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.41666666666667	6	35.333333333333336	0.292630113009912	0.19253988513586	1.51984152687858	0.100090227874052	0.0598488658276534	0.103962678417801	NaN	NaN	0.12105998436602	0.408360578512709	808	0	192	0.192	0.808	0.384
ORF3a	all	ss13	191	GAA	CGG	AAA	2	ACGGAAAAG:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	19	78.25	5	35.50000000000001	0.293392860236678	0.156000428408735	1.88071829820854	0.137392431827944	0.0592312280356921	0.0925870875413162	NaN	NaN	0.108332721265495	0.204710472332959	895	0	105	0.105	0.895	0.21
ORF3a	all	ss13	192	AAG	AAA	AGT	2	GAAAAGTGG:GAGGATAGG	1:1	TRUE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	19	76.75	5	34.333333333333336	0.300443259262439	0.161916285324778	1.85554688745359	0.138526973937661	0.0639803082081222	0.0927395719299392	NaN	NaN	0.110698053489192	0.210790455632959	900	0	100	0.1	0.9	0.2
ORF3a	all	ss13	193	AGG	AGT	GGC	2	AAGTGGGAA:GATAGGCAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	18	75.91666666666667	6	34.833333333333336	0.284997283854379	0.195697415235261	1.45631603520039	0.0892998686191179	0.0601850735607335	0.120398622546649	NaN	NaN	0.135958443502997	0.511298347693154	760	0	240	0.24	0.76	0.48
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	AAT	2	AGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.25000000000001	7	35.5	0.268812518156829	0.228784770270838	1.17495809637419	0.0400277478859912	0.0597627921187634	0.130336961804411	NaN	NaN	0.143390862067687	0.780128703024424	610	1	389	0.389	0.61	0.778
ORF3a	all	ss13	195	TCA	AAT	CAG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	16	75.58333333333334	6	34.5	0.248724605929925	0.197860943283853	1.25706772545354	0.0508636626460724	0.0560255130300642	0.120064640626265	NaN	NaN	0.136877885363547	0.710191557118557	662	0	338	0.338	0.662	0.676
ORF3a	all	ss13	196	GGT	CAG	GTG	2	TCAGGTGTT:TCTGGTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.25000000000001	6	33.5	0.24238832144563	0.20465023999998	1.18440282037125	0.0377380814456497	0.0565411880107104	0.129558009997238	NaN	NaN	0.147172921689959	0.797626541672074	630	0	370	0.37	0.63	0.74
ORF3a	all	ss13	197	GTT	GTG	TTA	2	GGTGTTAAA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.91666666666669	6	33.166666666666664	0.239944051297493	0.207018740932176	1.15904507107453	0.0329253103653171	0.0577072333393974	0.127590886336335	NaN	NaN	0.149321488480164	0.825482178342096	597	1	402	0.402	0.597	0.804
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.25000000000001	6	32.50000000000001	0.235201662735449	0.211925228838758	1.10983323705362	0.0232764338966907	0.0543183862240852	0.1358255714312	NaN	NaN	0.149521741695551	0.87629111899954	581	0	419	0.419	0.581	0.838
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.08333333333334	6	33.00000000000001	0.239340732066682	0.208223802448709	1.14943982989475	0.0311169296179728	0.0559118359696712	0.132084439388594	NaN	NaN	0.140608569680685	0.824857448241926	649	0	351	0.351	0.649	0.702
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATG	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.91666666666669	6	33.00000000000001	0.239944051297493	0.208223802448709	1.15233728553486	0.0317202488487835	0.0556249685897719	0.124208447324753	NaN	NaN	0.148075597973032	0.830378163680471	607	0	393	0.393	0.607	0.786
ORF3a	all	ss13	201	GTC	ATG	TCG	2	TATGTCGTT:TGTGTTACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.33333333333336	6	33.00000000000001	0.221099655165484	0.208223802448709	1.06183660352637	0.0128758527167741	0.0517278524569559	0.12957383519719	NaN	NaN	0.15040092001934	0.931776290471512	549	0	451	0.451	0.549	0.902
ORF3a	all	ss13	202	ACA	TCG	CAT	2	GTCGTTGTA:GTTACATTA	1:1	TRUE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	2	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.00000000000003	6	33.333333333333336	0.222199362107379	0.20582763427632	1.07954096100177	0.0163717278310589	0.0522912760139654	0.131530307722745	NaN	NaN	0.151800528282151	0.914114466401414	582	0	418	0.418	0.582	0.836
ORF3a	all	ss13	203	GTA	CAT	TAC	2	ACATTACAT:GTTGTACAT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.83333333333336	4	33.50000000000001	0.222753358291529	0.130054644852002	1.71276741822651	0.0926987134395269	0.0536222047046377	0.0871244682527856	NaN	NaN	0.102364274592166	0.365159886713386	813	0	187	0.187	0.813	0.374
ORF3a	all	ss13	204	CAT	TAC	ATG	2	GTACATGGC:TTACATGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.16666666666669	4	34.00000000000001	0.210854230397134	0.127969137773072	1.64769595284014	0.0828850926240612	0.0537802077992996	0.090057799679998	NaN	NaN	0.107897982970546	0.442380143359752	802	0	198	0.198	0.802	0.396
ORF3a	all	ss13	205	GGC	ATG	GCT	2	CATGGCTAT:CATGGTTAC	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.00000000000001	4	33.50000000000001	0.211388364105741	0.130054644852002	1.62538111842368	0.081333719253739	0.0522962967324416	0.0849705116870918	NaN	NaN	0.111455445569656	0.465547905977415	788	0	212	0.212	0.788	0.424
ORF3a	all	ss13	206	TAC	GCT	ACT	2	GGCTATTTC:GGTTACTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.33333333333334	4	34.16666666666667	0.213552421666518	0.127288788480472	1.67770016680833	0.0862636331860462	0.0543020054916195	0.082143460104862	NaN	NaN	0.107222196394291	0.421090091840457	787	0	213	0.213	0.787	0.426
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ACT	TCA	2	TACTTTACA:TATTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.66666666666667	5	33.833333333333336	0.212464845734057	0.164591833676269	1.29085897512964	0.0478730120577883	0.0522902738606466	0.0955212873255666	NaN	NaN	0.119585684593629	0.688917939638414	667	0	333	0.333	0.667	0.666
ORF3a	all	ss13	208	ACA	TCA	CAT	2	TTCACCGAA:TTTACATCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.33333333333334	5	33.833333333333336	0.210322806792345	0.164591833676269	1.27784472713284	0.0457309731160767	0.0513355310913076	0.0996863273391574	NaN	NaN	0.118481975812311	0.699515855944441	650	0	350	0.35	0.65	0.7
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CAT	AAG	2	ACATCAGAA:ACCGAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.33333333333334	5	33.833333333333336	0.210322806792345	0.164591833676269	1.27784472713284	0.0457309731160767	0.0530887224377419	0.100429462727341	NaN	NaN	0.118391981035715	0.699298576366868	664	0	336	0.336	0.664	0.672
ORF3a	all	ss13	210	GAA	AAG	AAT	2	GAAGTTTAC:TCAGAATGC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333334	5	33.50000000000001	0.193179203235308	0.16642540730596	1.16075547815944	0.0267537959293483	0.0518533876194151	0.0983489052394072	NaN	NaN	0.113288508421788	0.813311381557551	634	0	366	0.366	0.634	0.732
ORF3a	all	ss13	211	TAC	AAT	ACT	2	GAATGCTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.08333333333334	5	33.41666666666667	0.17448602671933	0.166890228132415	1.04551374080985	0.00759579858691528	0.0486559186313768	0.0971658633993663	NaN	NaN	0.111583296925917	0.945727603157604	588	0	412	0.412	0.588	0.824
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCAG:TGCTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.83333333333334	5	33.083333333333336	0.156594789439853	0.168775880107432	0.92782682774443	-0.0121810906675791	0.0457438893633057	0.0965944701198332	NaN	NaN	0.11276155559091	0.913975694922659	484	0	516	0.516	0.484	0.968
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.00000000000001	5	32.91666666666667	0.156222782397911	0.169734844556617	0.920393115544416	-0.0135120621587051	0.0455413052686312	0.102492884633083	NaN	NaN	0.116656088377649	0.907788718072814	469	0	531	0.531	0.469	0.938
ORF3a	all	ss13	214	CTG	AGC	TGT	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	1.5	1	0.333333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.00000000000001	5	32.583333333333336	0.156222782397911	0.171685985854599	0.909933222681419	-0.0154632034566873	0.0452850424081722	0.101390127084958	NaN	NaN	0.112109951872652	0.890296601933602	458	0	542	0.542	0.458	0.916
ORF3a	all	ss13	215	GAG	TGT	ACT	2	CTGTACTCT:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.83333333333334	5	32.91666666666667	0.156594789439853	0.169734844556617	0.922584810731774	-0.0131400551167634	0.0453789919578066	0.0994143990213665	NaN	NaN	0.110525469219631	0.905364783308685	478	0	522	0.522	0.478	0.956
ORF3a	all	ss13	216	TCT	ACT	CTA	2	GAGTCTACA:TACTCTACA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.66666666666669	5	32.41666666666667	0.13928785934632	0.172678550040526	0.806630929629826	-0.0333906906942059	0.0427023004020627	0.102784078034568	NaN	NaN	0.117680291125102	0.776609085530949	400	0	600	0.6	0.4	0.8
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CTA	CAC	2	TCTACACAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.33333333333336	5	31.41666666666667	0.136119019073684	0.178884786483983	0.760931221425428	-0.0427657674102989	0.0406497649873137	0.111299904873368	NaN	NaN	0.128790990057053	0.739847287884022	367	0	633	0.633	0.367	0.734
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT:ACACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.50000000000003	5	31.250000000000004	0.135810068779417	0.179963002222943	0.754655496417936	-0.044152933443526	0.0436411722398194	0.106269464188908	NaN	NaN	0.122078759522852	0.717594310676205	343	1	656	0.656	0.343	0.686
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TTA	2	CAAATTACT:CAACTTAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.33333333333336	5	32.75000000000001	0.139939466685309	0.170704815996831	0.819774567390688	-0.0307653493115219	0.0434958201878995	0.102937371309522	NaN	NaN	0.112400587228647	0.784306230155925	385	0	615	0.615	0.385	0.77
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TTA	CTA	2	ATTACTACA:CTTAGTACA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.50000000000003	5	33.583333333333336	0.126170845288571	0.16596317904302	0.76023396283501	-0.0397923337544486	0.0395659724348199	0.0967610641857291	NaN	NaN	0.115526094737309	0.730511989882343	381	0	619	0.619	0.381	0.762
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CTA	CAG	2	ACTACAGAC:AGTACAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.33333333333336	5	34.416666666666664	0.112888706112188	0.161478827235442	0.69909292781519	-0.0485901211232535	0.0368164128051825	0.0960772913037013	NaN	NaN	0.0998872008721821	0.626648202454814	353	0	647	0.647	0.353	0.706
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT:ACAGATACT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.00000000000003	5	34.75	0.113423227292943	0.15975246858483	0.709993581305531	-0.0463292412918871	0.0396492726405765	0.0977514692769704	NaN	NaN	0.106850877167358	0.664587764815288	332	0	668	0.668	0.332	0.664
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT:GATACTGGT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.33333333333337	5	35.416666666666664	0.114507630156718	0.156408563919793	0.732105885298188	-0.0419009337630746	0.0399900071554159	0.094754506479768	NaN	NaN	0.105306713298178	0.690708152315533	369	0	631	0.631	0.369	0.738
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.50000000000004	5	35.24999999999999	0.114234586398441	0.157231298910254	0.726538463971127	-0.0429967125118128	0.0398789541073991	0.0902679428325855	NaN	NaN	0.107052043310818	0.687946719522856	322	0	678	0.678	0.322	0.644
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	TTG	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	0.916666666666667	0.75	1.33333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.00000000000004	5	34.74999999999999	0.113423227292943	0.15975246858483	0.70999358130553	-0.0463292412918873	0.0400174421998434	0.0922321009727665	NaN	NaN	0.107158599497174	0.66549233636978	347	0	653	0.653	0.347	0.694
ORF3a	all	ss13	226	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.75000000000004	4	34.08333333333333	0.112227610965344	0.127628054258582	0.879333400617114	-0.0154004432932375	0.0383388653620684	0.0886033959187478	NaN	NaN	0.0955384641581002	0.871938825162687	477	0	523	0.523	0.477	0.954
ORF3a	all	ss13	227	AAT	AAA	ATA	2	GAAAATGCT:GAACATACT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	ACT	ATA	CTA	2	AATGCTACA:CATACTACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CTA	CAT	2	ACTACCTTC:GCTACATTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC:ACCTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC:TTCTTCATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTTT:TTCATTTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TAC	TCT	ACA	2	ATCTTTAAC:ATTTACAGT	1:1	TRUE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	ACA	ACA	2	TACAGTAGA:TTTAACAAG	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCTT:AGTAGAATT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	ATT	AGC	TTG	2	AAGCTTGTT:AGAATTGTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GTG	TTG	TGG	2	ATTGTGGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	TGG	AAG	2	GTGGATGAA:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	GAA	AAG	AAC	2	AAAGACCCA:GATGAACCA	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	CCA	AAC	CA-	1	GAACCAGAA:GACCCA---	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.5	1.16666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	CAG	AAG	1	CCA---CCG:CCAGAAGAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	ACC	1	---CCGAAT:GAAGACCAT	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.916666666666667	0	0	1	2	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	ACC	ATG	2	CCGAATGTG:GACCATGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTG	ATG	TGC	2	AATGTGCAA:CATGTTCAA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TGC	AAA	2	GTGCAAATA:GTTCAAATT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCA:GACGGCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCA	GCT	CAT	2	GGCTCATCA:GGCTCTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CAT	CAG	2	TCATCAGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT:GTTGTAAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAT	CTA	ATC	2	GCTAATCCA:GTAAATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	CCA	ATC	CAG	2	AATCCAGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	GCA	CAG	CAA	2	CCAGCAATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	ATG	CAA	TGG	2	GCAATGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	GAT	TGG	ATC	2	ATGGATCCA:ATGGATCCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAATT:GATCCTATC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATC	CAA	TCT	2	CCAATTTAT:CCTATCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAT	TCT	ATG	2	ATCTATGAT:ATTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGAG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAG	ATG	AGC	2	GATGAGCCG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCG	AGC	CGA	2	GAGCCGACG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CGA	CGA	2	CCGACGACG	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	TTG	CTT	TGT	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	72.58333333333336	14	33.75	0.135536624489237	0.604042526880535	0.224382586420183	-0.468505902391297	0.0420357202716414	0.24712085340517	0.113503998765321	0.0480563900346761	0.245002397484519	0.0558441001961008	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	71.91666666666669	15	34.08333333333333	0.136915000021786	0.662862330839796	0.206551185143263	-0.52594733081801	0.0423640619618802	NA	0.0989605459166314	0.0368693895827088	0.280768681859228	0.061035150163598	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	71.25000000000001	15	34.416666666666664	0.138321779350139	0.652616998847441	0.211949396957823	-0.514295219497301	0.0429872167334273	0.290878907711428	NA	NA	0.261668533995746	0.0493627078992832	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	71.41666666666667	15	34.25	0.137967373637613	0.657697243495181	0.20977337977641	-0.519729869857568	0.0415366953051124	0.265732100488519	0.106551183046137	0.0489810106103721	0.273431043037411	0.0573319792625361	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAA	2	ATGAGAATT:ATGAGATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	71.75000000000001	15	34.916666666666664	0.137263997871083	0.637863835561037	0.21519325946791	-0.500599837689954	0.0435414394083309	0.247490394782679	NA	NA	0.251741091902915	0.0467508557047627	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	7	ATT	GAA	TTT	2	AGAATTTTC:AGATTTTTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	72.41666666666667	15	35.25	0.135878602808038	0.628414519653643	0.216224480113745	-0.492535916845605	0.04430781014363	0.267731473136498	0.110269904860406	0.0498946851774857	0.236682323490406	0.0374339054147644	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	8	TTC	TTT	TCA	2	ATTTTCACT:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.66666666666667	15	35.166666666666664	0.119061291806916	0.630748970219412	0.188761769623657	-0.511687678412497	0.0409939417067286	NA	0.0996411110044083	0.058169741559064	0.277477249123677	0.0651728302944172	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	9	ACT	TCA	CTC	2	TTCACTCTT:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.5	15	35	0.117599765999126	0.635473395290403	0.185058519948557	-0.517873629291276	0.0409427195720789	0.270452252717316	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	10	CTT	CTC	TTA	2	ACTCTTAGA:ACTCTTGGA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	73	15	35.5	0.118472334721436	0.621519504417127	0.190617243512802	-0.503047169695691	0.0391994494775065	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TTA	GAA	2	CTTAGATCA:CTTGGAACT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.33333333333334	16	35.16666666666667	0.117889187641809	0.699763144259601	0.168470129655863	-0.581873956617792	0.0411467111535669	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	12	ACT	GAA	CAA	2	AGATCAATT:GGAACTGTA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.41666666666667	15	35.66666666666667	0.117744298602214	0.617010924563885	0.190830168340112	-0.499266625961671	0.040562190380888	NA	0.101052190595617	0.0589680080493358	0.264966790038986	0.0595296610001215	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	13	ATT	CAA	TAA	2	ACTGTAACT:TCAATTACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.75000000000001	15	35.333333333333336	0.102976648483437	0.626098273217229	0.164473618421415	-0.523121624733792	0.0372088218719389	0.244114702388149	0.0782544390221139	0.0355725478910494	0.25380520460044	0.0392921037633411	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	14	ACT	TAA	CTG	2	ATTACTGCA:GTAACTTTG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.91666666666669	14	34.66666666666667	0.102724391304868	0.579892416175111	0.177143877794477	-0.477168024870243	0.0363443796441459	0.237398281497236	0.0981478238353813	0.0710953223378805	0.225512875279752	0.0343513021370719	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	15	GCA	CTG	CAC	2	ACTGCACAG:ACTTTGAAA	1:1	TRUE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	1	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.08333333333336	14	34.5	0.102473368909235	0.584131426248621	0.175428618123381	-0.481658057339386	0.0352926120939245	NA	0.0883489825972018	0.0470741362793229	0.22374815539025	0.0313438791923688	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	16	AAA	CAC	AAC	2	GCACAGCCA:TTGAAACAA	1:1	TRUE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.41666666666669	13	34.333333333333336	0.0865304311153283	0.527177516628982	0.164139077228946	-0.440647085513654	0.0346604094132905	0.208937548319344	0.0917106210726697	0.0734941224334297	0.184251587386422	0.0167773485408843	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	17	CAA	AAC	AAG	2	AAACAAGGT:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.41666666666669	13	35.333333333333336	0.0877980575084776	0.505841285660844	0.173568389922495	-0.418043228152367	0.0341628898506855	0.20270254729248	0.105233694866783	0.0990736261596107	0.181073927424948	0.0209608931132486	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	18	GGT	AAG	GTG	2	CAAGGTGAA:CCAGTAAAA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.16666666666669	13	35.91666666666667	0.0726960870999215	0.494202238982722	0.147097850567332	-0.4215061518828	0.0330476820585178	0.186694026444114	0.0917072739986456	0.108715535434621	0.167270065669382	0.0117383566563215	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	19	AAA	GTG	AAA	2	GGTGAAATC:GTAAAAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.33333333333334	13	36.00000000000001	0.0574443341110379	0.492584652291803	0.116618197184529	-0.435140318180765	0.0288820640298948	0.182737339079597	0.0711380278908004	0.101146032167429	0.185179148650257	0.0187817691874212	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	20	ATC	AAA	TCA	2	AAAATTGAC:GAAATCAAG	1:1	FALSE	1.75	0.75	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	73	12	35.66666666666667	0.0568993130810351	0.44646854291714	0.127443050543418	-0.389569229836105	0.027363540195967	0.173165916431023	0.0819900665969882	0.12009574668694	0.171031571329753	0.0227407559828372	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	21	AAG	TCA	ACA	2	ATCAAGGAT:ATTGACAAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.91666666666667	12	36.16666666666667	0.0719113287774619	0.438080105957789	0.164151094285005	-0.366168777180327	0.0318444820719474	0.154781164053039	0.0990780391966679	0.0975627769681003	0.157168034088869	0.0198171644588048	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	22	AAT	ACA	ATG	2	AAGGATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.58333333333334	11	35.50000000000001	0.0580701054974426	0.399733821305343	0.145271934478331	-0.3416637158079	0.0281202528087019	0.153771757084483	0.103243313156542	0.159402710461902	0.152824859304885	0.0253743552799617	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTA	2	AATGCTTCT:GATGCTACT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.58333333333334	10	34.833333333333336	0.0589259989959384	0.361891385702354	0.162827857539564	-0.302965386706416	0.0288135854620882	0.13533545075614	0.111414677712356	0.143889829373177	0.14553276236511	0.0373637042633595	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	24	ACT	CTA	CTC	2	GCTACTCCT:GCTTCTCCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.75000000000001	10	35.66666666666667	0.05965876642654	0.351102161303205	0.169918539393495	-0.291443394876665	0.0291638063156355	0.140283794809204	0.121734456372998	0.162770808058071	0.144740855442529	0.0440564770724575	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	ACTCCTTCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.91666666666669	9	35.50000000000001	0.0751566968036821	0.309399206498442	0.242911730945439	-0.23424250969476	0.033265345337996	0.122255613270131	0.17983066177659	0.176765792521698	0.129768036189208	0.0710611720465784	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAGT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.66666666666669	9	35.416666666666664	0.0743181769831732	0.310300874693003	0.239503601324682	-0.23598269770983	0.0327060599109242	0.121133050609951	0.181055611751196	0.185895948173909	0.123416379116267	0.0558651985002273	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	27	AGT	CAA	ATT	2	GCAAGTACT:TCAGATTCT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.33333333333336	8	34.75	0.0735883919688925	0.274994650264777	0.267599358380384	-0.201406258295884	0.0316163474374825	0.124340003322128	0.211229711569668	0.205203853509432	0.120366998350959	0.0942745299105392	17	0	983	0.983	0.017	0.034
ORF3a	all	ss13	28	ACT	ATT	CTG	2	AGTACTGTT:GATTCTGTT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.33333333333336	8	35.416666666666664	0.0591439311842398	0.268767772591288	0.2200558891939	-0.209623841407048	0.0298075195486334	0.105644493807272	0.267372734672875	0.410490705180998	0.115590182346362	0.0697533445503192	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	29	GTT	CTG	TTC	2	ACTGTTCAT:TCTGTTCGC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.50000000000001	7	34.91666666666666	0.073408181482178	0.233267379251205	0.314695443991441	-0.159859197769027	0.0322722154094134	0.100475256672838	NaN	NaN	0.11421330175538601	0.161616710717731	39	0	961	0.961	0.039	0.078
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	GTTCATGCT:GTTCGCGCT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.91666666666669	7	34.74999999999999	0.0729614963194686	0.234580833893542	0.311029230770746	-0.161619337574074	0.0310116864296209	0.101152382618574	0.351221298555309	0.375852068613966	0.109373818216652	0.139493856821344	38	0	962	0.962	0.038	0.076
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA:CGCGCTACT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.41666666666669	8	35.08333333333333	0.0582110227221988	0.271845168498986	0.214133004620297	-0.213634145776787	0.0287465971854821	0.10976758197253	0.213552245780544	0.315996210701585	0.118914948588182	0.0724104353619329	10	0	990	0.99	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666669	8	34.58333333333333	0.0573756358851215	0.276597228353308	0.207433878591992	-0.219221592468186	0.0280426830483206	0.115283284104638	0.220618087051463	0.347094634723887	0.116644941566542	0.0601909616117781	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.25000000000003	8	34.41666666666666	0.0566975883332357	0.278218809519287	0.203787761263155	-0.221521221186051	0.0290497639109721	0.11762387464915	0.22464499870652	0.364325007335164	0.127837974818431	0.0831262460067228	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	34	ACG	CAA	CGA	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.75000000000003	8	34.24999999999999	0.0562984016666259	0.279859737639748	0.201166491977122	-0.223561335973122	0.0281974536560467	0.117044536143116	0.258795846661257	0.436971583443384	0.126392307141634	0.076929075414323	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CGA	TAC	2	ACGATACCG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.83333333333336	8	33.41666666666666	0.0562324166616758	0.288367224091207	0.195002801857572	-0.232134807429531	0.0284155432713868	0.128729156707589	0.195410719844614	0.31832178537026	0.123214131641771	0.0595656523605319	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	36	CCG	TAC	CGA	2	ATACCGATA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	0.75	1	1.25	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000003	8	32.41666666666666	0.0561009098120237	0.299294202221815	0.187444024627132	-0.243193292409791	0.0276976106845611	0.127222734797718	0.205533259612969	0.361774629246202	0.134686873054822	0.0709777388699601	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	37	ATA	CGA	TAC	2	CCGATACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.75000000000003	8	31.166666666666657	0.0555166649189651	0.314193196111627	0.176695948881213	-0.258676531192662	0.027958049284068	0.140105986444057	0.180985459408128	0.328916244617942	0.133756768648363	0.0531214558904273	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	ATACAAGCC:CTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.00000000000003	7	31.416666666666654	0.0553246126797069	0.264386521096341	0.209256555327746	-0.209061908416635	0.0272252635979294	0.114790507844419	NaN	NaN	0.128812282456341	0.104590111852251	18	0	982	0.982	0.018	0.036
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCA	2	CAAGCCACA:CAAGCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.66666666666669	7	32.08333333333332	0.0555809791152914	0.257828654327118	0.215573320429984	-0.202247675211827	0.0273392278513857	0.114974094299719	0.240460894694324	0.369985495384297	0.121489359292506	0.0959654945639051	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	40	ACA	CCA	CAC	2	GCCACACTC:GCCTCACTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.66666666666669	7	32.08333333333332	0.0555809791152914	0.257828654327118	0.215573320429984	-0.202247675211827	0.027527643004819	0.116838969147361	0.259441889196359	0.406023471720878	0.118400433582795	0.0876054196913918	20	0	980	0.98	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	41	CTC	CAC	TCC	2	ACACTCCCT:TCACTCCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.16666666666669	7	31.74999999999999	0.0551973146854054	0.261065996643646	0.211430501846433	-0.205868681958241	0.0271895463861404	0.111171075353427	0.283772948561587	0.456229848966504	0.13071723894653	0.115275815782549	15	0	985	0.985	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TCC	CTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333334	7	32.08333333333332	0.0554524994575896	0.257828654327118	0.215075006314987	-0.202376154869529	0.0276159697333196	0.111333204138587	0.274811005814931	0.433845127100087	0.121752974014271	0.096475377549712	15	0	985	0.985	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.16666666666667	7	31.74999999999999	0.0551973146854054	0.261065996643646	0.211430501846433	-0.205868681958241	0.0280469962537409	0.122724948910776	NaN	NaN	0.121961423605448	0.091414693391634	14	0	986	0.986	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	44	GGA	TCG	GAT	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	76	7	31.08333333333332	0.0545695157118212	0.267793509240842	0.203774601806139	-0.21322399352902	0.0276193065962097	0.122565381591231	0.294013920230838	0.488260556185594	0.127683367236541	0.0949305669575442	18	0	982	0.982	0.018	0.036
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	GGATGGCTT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333333	7	30.74999999999999	0.0543223783836108	0.271290419358981	0.20023699514331	-0.21696804097537	0.0271862910929968	0.125474208632642	0.249981386761826	0.423127235679718	0.129742625873838	0.0944660186211873	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTA	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	76	7	30.416666666666657	0.0545695157118212	0.274880898641229	0.198520581028239	-0.220311382929407	0.0278540392487797	0.124795420569955	0.261422613468077	0.447621895634589	0.132554360296086	0.0965036444225607	10	0	990	0.99	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	47	ATT	TTA	TTA	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.5	7	29.91666666666666	0.0541996476239405	0.280450538895226	0.193259202986196	-0.226250891271286	0.0266864849288696	0.123546821365706	NaN	NaN	0.139462263620824	0.104737193643816	10	0	990	0.99	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666667	6	29.749999999999993	0.0542609435735893	0.234911530842709	0.230984589725913	-0.18065058726912	0.0273517451242965	0.110707154112307	NaN	NaN	0.118803267134378	0.128363756958781	28	0	972	0.972	0.028	0.056
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333334	5	30.083333333333325	0.054693929928504303	0.187892466749351	0.291091659366344	-0.133198536820847	0.0270372854380824	0.0947391149605005	NaN	NaN	0.100333518055311	0.184324258675573	52	0	948	0.948	0.052	0.104
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	75	5	30.91666666666666	0.0553246126797069	0.182159096576957	0.303715892971251	-0.12683448389725	0.0284174602645166	0.0880060052315201	NaN	NaN	0.0993948329720855	0.201931773300363	67	0	933	0.933	0.067	0.134
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAC	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.66666666666666	5	30.25	0.0548189130040021	0.18671695246621	0.293593657565307	-0.131898039462208	0.0267951053376694	0.0950285010198766	NaN	NaN	0.0992748766822682	0.183975189693346	49	0	951	0.951	0.049	0.098
ORF3a	all	ss13	52	CTT	CAC	TTC	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.33333333333333	6	31.083333333333336	0.0550706014161129	0.223170685092358	0.246764495047019	-0.168100083676245	0.0280914396580002	0.109414344574292	0.278031774341066	0.37478790374126	0.106790213508552	0.115460850778858	42	0	958	0.958	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TTC	TTG	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.58333333333333	5	31.16666666666667	0.0548816190849609	0.180507022556888	0.304041462252055	-0.125625403471927	0.0281264264455522	0.0888383780281686	NaN	NaN	0.095155776603308	0.186765630980458	61	0	939	0.939	0.061	0.122
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.91666666666666	5	30.833333333333336	0.0546316519559279	0.182716561993313	0.298996715787195	-0.128084910037385	0.0278091730177009	0.0890142044347788	NaN	NaN	0.0979374994926969	0.190933366263614	70	0	930	0.93	0.07	0.14
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.91666666666666	5	31.16666666666667	0.0689348268033826	0.180507022556888	0.381895539724265	-0.111572195753505	0.0299825924785393	0.0907492166535546	NaN	NaN	0.0964662938611566	0.247438871926528	86	0	914	0.914	0.086	0.172
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.25	5	30.500000000000004	0.0676896531853505	0.184981141936135	0.365927318195064	-0.117291488750785	0.0299141330112439	0.0879346181623097	NaN	NaN	0.0966304670002949	0.224818462213133	93	0	907	0.907	0.093	0.186
ORF3a	all	ss13	57	CAA	TTC	AAA	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.91666666666666	6	30.333333333333336	0.0679967073757475	0.229625165344413	0.296120450359872	-0.161628457968665	0.0298360178595262	0.10524613666214	0.317852742845395	0.35152891290045	0.115538569633045	0.161838941573974	50	0	950	0.95	0.05	0.1
ORF3a	all	ss13	58	AGC	AAA	GCG	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.08333333333333	6	30.500000000000004	0.0687766788210944	0.228158530802244	0.301442503943482	-0.159381851981149	0.0301072984033842	0.0994577864953241	NaN	NaN	0.114103224967634	0.162467218009236	49	0	951	0.951	0.049	0.098
ORF3a	all	ss13	59	GCT	GCG	CTA	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.91666666666666	6	31.000000000000004	0.0698992129639131	0.223869741416997	0.312231624164488	-0.153970528453084	0.0312796260382627	0.106363660888647	0.420491280122881	0.457760184151483	0.111757395609995	0.168289396409061	62	0	938	0.938	0.062	0.124
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666666	6	30.5	0.0694136680239339	0.228158530802244	0.304234375019263	-0.15874486277831	0.0311629014218296	0.106814575873615	0.417312557233083	0.465981843798652	0.117223865022165	0.175671749805734	46	0	954	0.954	0.046	0.092
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CCA	AAA	2	ACCAAAATA:TCCAAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.41666666666666	5	29.5	0.0684625513252421	0.192126605059278	0.356340816536673	-0.123664053734036	0.0298503001418386	0.103927596624153	NaN	NaN	0.105694094279689	0.241993493234782	101	1	898	0.898	0.101	0.202
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATA:AAAATAATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.74999999999999	5	29.166666666666668	0.0700625753990949	0.194633396613813	0.359972012090563	-0.124570821214718	0.030324469376568	0.100186276124695	NaN	NaN	0.105977618822619	0.239816883552482	71	0	929	0.929	0.071	0.142
ORF3a	all	ss13	63	ATA	TAA	TAA	2	ATAATAACA:ATAATTGCG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.25	5	28.833333333333336	0.0695747645549368	0.197206849707019	0.352800953203709	-0.127632085152082	0.0306309289082594	0.10235858646917	NaN	NaN	0.108381180331319	0.23894725128822	97	0	903	0.903	0.097	0.194
ORF3a	all	ss13	64	ACA	TAA	CAC	2	ATAACACTC:ATTGCGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666666	5	29.166666666666668	0.0694136680239339	0.194633396613813	0.356638013987202	-0.12521972858988	0.0317043530944488	0.0953100936981234	NaN	NaN	0.106249693796091	0.238580591310862	86	0	914	0.914	0.086	0.172
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CAC	TCA	2	ACACTCAAA:GCGCTCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.74999999999999	5	29.500000000000004	0.0690937042816379	0.192126605059278	0.359625905325917	-0.12303290077764	0.0305074486192017	0.0934543904908548	NaN	NaN	0.102367642167163	0.229412753488595	96	1	903	0.903	0.096	0.192
ORF3a	all	ss13	66	AAA	TCA	AAA	2	CTCAAAAAG:CTCAATAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.08333333333333	5	29.166666666666668	0.0687766788210944	0.194633396613813	0.353365249837156	-0.125856717792719	0.0307853797725554	0.0990948670844655	NaN	NaN	0.109095956117159	0.248650577928775	89	0	911	0.911	0.089	0.178
ORF3a	all	ss13	67	AAA	AAA	AAA	2	AAAAAGAGG:AATAAAAGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333333	5	28.166666666666668	0.0537744248135208	0.202564732921051	0.265467853352731	-0.14879030810753	0.026193129216203	0.102427868136167	NA	NA	0.109131113835805	0.172753746314767	52	0	948	0.948	0.052	0.104
ORF3a	all	ss13	68	AGA	AAA	GAT	2	AAAAGATGG:AAGAGGTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.41666666666666	5	27.75	0.0675371643768684	0.206064750939693	0.327747293357485	-0.138527586562824	0.0287898330690517	0.0984061080111822	NaN	NaN	0.109433374893186	0.205562376194314	76	0	924	0.924	0.076	0.152
ORF3a	all	ss13	69	TGG	GAT	GGC	2	AGATGGCAG:AGGTGGCAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.58333333333333	5	28.333333333333336	0.0683065619163606	0.201197989946009	0.339499226282978	-0.132891428029649	0.0308815279898653	0.107203118921334	NaN	NaN	0.10978906963663	0.226115876690535	104	0	896	0.896	0.104	0.208
ORF3a	all	ss13	70	CAG	GGC	AGC	2	TGGCAGCTA:TGGCATTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.91666666666666	5	28.666666666666668	0.0689348268033826	0.198519415670312	0.347244759766295	-0.129584588866929	0.0303428512328224	0.103892347913021	NaN	NaN	0.107485222291939	0.227970306122536	84	1	915	0.915	0.084	0.168
ORF3a	all	ss13	71	CTA	AGC	TAG	2	CAGCTAGCC:CATTTAGCC	1:1	FALSE	0.5	0	0.166666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.33333333333333	6	28.83333333333334	0.0694941228620286	0.243733392896608	0.285123519744822	-0.17423927003458	0.0299412139921999	0.116837296368091	NaN	NaN	0.111854648533477	0.119297417638807	20	0	980	0.98	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	72	GCC	TAG	CCC	2	CTAGCCCTT:TTAGCCCTC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	77	6	29.000000000000004	0.111834664347976	0.242080044197288	0.461973909162186	-0.130245379849312	0.0542216407942929	0.112938932002553	0.523942370331821	0.377924688910001	0.127783956465915	0.308078417936533	103	0	897	0.897	0.103	0.206
ORF3a	all	ss13	73	CTC	CCC	TCT	2	GCCCTCTCT:GCCCTTTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.66666666666666	6	29.500000000000004	0.110800159129969	0.237252996159118	0.467012686557006	-0.126452837029149	0.0528559454195406	0.110883283630062	NaN	NaN	0.119496911322286	0.289959673184928	125	0	875	0.875	0.125	0.25
ORF3a	all	ss13	74	TAT	TCT	ATA	2	CTCTCTAAG:CTTTATAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	78	6	29.16666666666667	0.110290063467372	0.240449165598692	0.45868349425444	-0.13015910213132	0.0557421835409438	0.110297593572203	NaN	NaN	0.127712871454397	0.308129792969883	102	0	898	0.898	0.102	0.204
ORF3a	all	ss13	75	AAG	ATA	AGG	2	TATAAGGGC:TCTAAGGGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.333333333333333	1.08333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.16666666666666	6	29.000000000000004	0.095366381613935	0.242080044197288	0.393945655166083	-0.146713662583353	0.0488510651710594	0.109459583737148	NaN	NaN	0.121569635809533	0.227498320312092	106	0	894	0.894	0.106	0.212
ORF3a	all	ss13	76	GGC	AGG	GCT	2	AAGGGCTTC:AAGGGTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.24999999999999	6	28.250000000000007	0.0965740892437444	0.249703998029926	0.386754277086786	-0.153129908786182	0.0499197119409277	0.11745116418171	NaN	NaN	0.130046633483921	0.238996004095675	92	0	908	0.908	0.092	0.184
ORF3a	all	ss13	77	GTT	GCT	TCC	2	GGCTTCCAG:GGTGTTCAC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.24999999999999	6	27.916666666666675	0.0965740892437444	0.253250234920167	0.381338596879043	-0.156676145676422	0.0505820700038983	0.116704517408171	0.542587219355896	0.482170863894907	0.134986214926001	0.245771016221208	91	0	909	0.909	0.091	0.182
ORF3a	all	ss13	78	CAC	TCC	ACT	2	GTTCACTTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.49999999999999	6	27.583333333333343	0.11105698371059	0.256899645924678	0.432297145879103	-0.145842662214087	0.0537155271742404	0.122293684762414	NaN	NaN	0.130153553607671	0.262482410576451	81	1	918	0.918	0.081	0.162
ORF3a	all	ss13	79	TTC	ACT	TCA	2	CACTTTGTT:CAGTTCATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.75	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.83333333333331	6	27.583333333333343	0.095802032379497	0.256899645924678	0.37291617135037203	-0.161097613545181	0.0535799335544364	0.120500678213906	NaN	NaN	0.123465311043111	0.191960750326506	61	1	938	0.938	0.061	0.122
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TCA	TTT	2	TTCATTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.74999999999999	7	27.583333333333343	0.0959115685461867	0.309784984170421	0.309606899776082	-0.213873415624235	0.050977404344192	0.145372815082533	0.283683476127455	0.27510504613227	0.146840989002815	0.145255361746462	41	0	959	0.959	0.041	0.082
ORF3a	all	ss13	81	TGC	TTT	GCA	2	ATTTGCAAT:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.33333333333331	6	27.333333333333343	0.0951500406590925	0.259707177538375	0.366374320344045	-0.164557136879283	0.0546762672771873	0.12158148200228	0.418966018692698	0.38186091387313	0.126884846405548	0.194665109501121	66	0	934	0.934	0.066	0.132
ORF3a	all	ss13	82	AAC	GCA	ACT	2	TGCAACTTG:TGCAATTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.16666666666664	6	28.000000000000007	0.095366381613935	0.25235417746591	0.3779068869459	-0.156987795851975	0.0555854959901826	0.117032532811008	NA	NA	0.121032366353718	0.19460612359318	75	0	925	0.925	0.075	0.15
ORF3a	all	ss13	83	TTA	ACT	TAC	2	AACTTGCTG:AATTTACTG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.5	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.16666666666664	6	28.000000000000007	0.095366381613935	0.25235417746591	0.3779068869459	-0.156987795851975	0.0525065177181238	0.116428653462655	NaN	NaN	0.1242567024659	0.206440035457214	78	0	922	0.922	0.078	0.156
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TGC	2	TTACTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.25	1	0	0.75	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.49999999999999	6	27.833333333333343	0.0949346803392896	0.254152739478919	0.373533964394525	-0.15921805913963	0.0496008353058055	0.114589269738129	NaN	NaN	0.117220780376487	0.174376430021799	51	0	949	0.949	0.051	0.102
ORF3a	all	ss13	85	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTA:CTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.58333333333331	7	28.833333333333343	0.124279002650387	0.293338244775017	0.423671324363811	-0.16905924212463	0.0583960193699124	0.13759895419507	0.338698806703309	0.210978519173164	0.131339049442474	0.198025601608846	63	0	937	0.937	0.063	0.126
ORF3a	all	ss13	86	CTA	TGC	TAT	2	CTGCTATTT:CTGCTGTTT	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.41666666666664	7	29.500000000000007	0.124566345596374	0.285269390232816	0.436662151150222	-0.160703044636443	0.063893175625655	0.123193578040583	0.321656971279156	0.174609745695366	0.127228722597899	0.20655198685198	64	0	936	0.936	0.064	0.128
ORF3a	all	ss13	87	TTT	TAT	TTG	2	CTATTTGTT:CTGTTTGTA	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.5	1.08333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.33333333333331	7	30.750000000000007	0.12471051706475	0.27129041935898	0.459693775251712	-0.14657990229423	0.0599650505124523	0.116248795105244	0.329970386815548	0.163578530790659	0.122369557461275	0.230976920151254	85	0	915	0.915	0.085	0.17
ORF3a	all	ss13	88	GTA	TTG	TAA	2	TTTGTAACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999997	7	30.00000000000001	0.123142795706581	0.27950646396388	0.44057226426969	-0.156363668257299	0.0600134637809296	0.120880885032949	0.319202145057428	0.167515948243514	0.12123453259284	0.197133376984876	64	0	936	0.936	0.064	0.128
ORF3a	all	ss13	89	ACA	TAA	CAG	2	GTAACAGTT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.08333333333331	7	30.16666666666668	0.123424890893523	0.277637470472643	0.444554154320049	-0.15421257957912	0.0629858564645644	0.125105816306082	NaN	NaN	0.115141907358658	0.180464485122529	72	0	928	0.928	0.072	0.144
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CAG	TCT	2	ACAGTTTAT:ACCATCTAT	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.41666666666664	7	30.16666666666668	0.122861989946783	0.277637470472643	0.442526686825181	-0.15477548052586	0.0598972350751701	0.120566399797285	0.331217060906008	0.181528853245284	0.121546441049046	0.202881265813876	59	0	941	0.941	0.059	0.118
ORF3a	all	ss13	91	TAT	TCT	ATT	2	ATCTATTCA:GTTTATTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.91666666666664	6	30.50000000000001	0.123708284429488	0.228158530802243	0.542203195271764	-0.104450246372756	0.0600246049781543	0.104481173224902	0.433480045760468	0.21100210569007	0.10747246703681	0.331110689930108	144	0	856	0.856	0.144	0.288
ORF3a	all	ss13	92	TCA	ATT	CAC	2	TATTCACAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.24999999999999	6	30.16666666666668	0.123142795706581	0.231110927283054	0.53282982831773	-0.107968131576473	0.0575395590506946	0.103708024173168	NaN	NaN	0.100167067094508	0.281087074398216	119	1	880	0.88	0.119	0.238
ORF3a	all	ss13	93	CAT	CAC	ATC	2	TCACATCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.58333333333331	6	29.50000000000001	0.120931721082168	0.237252996159118	0.509716307232906	-0.116321275076949	0.0583066806085173	0.106231920924915	0.382081598877663	0.182187170240422	0.108116891795098	0.281978968582074	111	0	889	0.889	0.111	0.222
ORF3a	all	ss13	94	CTT	ATC	TTT	2	CATCTTTTG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.08333333333331	6	29.333333333333343	0.121751485582717	0.238840298338901	0.509761068083908	-0.117088812756184	0.0591768567330402	0.109443313635717	NaN	NaN	0.10391543780244	0.259839676951491	116	0	884	0.884	0.116	0.232
ORF3a	all	ss13	95	TTG	TTT	TGC	2	CTTTTGCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.41666666666666	6	29.66666666666668	0.121203743914918	0.235686824877377	0.51425761273664	-0.114483080962459	0.0586869463129924	0.103516694344339	NaN	NaN	0.106993193247659	0.284617776579687	99	0	901	0.901	0.099	0.198
ORF3a	all	ss13	96	CTT	TGC	TTG	2	TTGCTTGTC:TTGCTTGTT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.08333333333333	6	30.66666666666668	0.123424890893523	0.2267106539047	0.544415927384719	-0.103285763011177	0.0604245146247566	0.102486550275465	NaN	NaN	0.105056111874027	0.325534337390323	150	0	850	0.85	0.15	0.3
ORF3a	all	ss13	97	GTC	TTG	TCG	2	CTTGTCGCT:CTTGTTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.33333333333333	6	31.000000000000014	0.123002232202702	0.223869741416997	0.549436611773223	-0.100867509214295	0.0605725994000095	0.102378809756619	0.527470140623406	0.297576317330956	0.102674214253798	0.32590109423755	135	0	865	0.865	0.135	0.27
ORF3a	all	ss13	98	GCT	TCG	CTG	2	GTCGCTGCA:GTTGCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.16666666666666	7	31.000000000000014	0.123283681565969	0.268659167443214	0.458885072633998	-0.145375485877245	0.0592023748219006	0.11446516124183	0.367549878419807	0.211848954929074	0.123245756144597	0.238176158265151	81	0	919	0.919	0.081	0.162
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.24999999999999	7	30.416666666666682	0.121476995958792	0.274880898641228	0.441925927044289	-0.153403902682436	0.0581177007675556	0.122805303196016	NaN	NaN	0.120779490134341	0.204043490647327	71	0	929	0.929	0.071	0.142
ORF3a	all	ss13	100	GGC	CAG	GCC	2	GCAGGTATG:GCTGGCCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.41666666666666	7	30.25000000000001	0.119589757406955	0.2767124213498	0.432180661871258	-0.157122663942845	0.0601557184007115	0.121383509450291	NaN	NaN	0.117165168909112	0.179908890702891	75	0	925	0.925	0.075	0.15
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GCC	TGG	2	GGCCTTGAA:GGTATGGAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.75	7	30.583333333333343	0.119061291806916	0.273073727172108	0.436004199451513	-0.154012435365192	0.0573484029521655	0.112217882372871	0.333639726305675	0.191276770833155	0.127636793128652	0.227568474832445	71	0	929	0.929	0.071	0.142
ORF3a	all	ss13	102	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAGGCG:CTTGAAGCC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.41666666666667	6	30.416666666666675	0.119589757406955	0.228889480485489	0.522478172230971	-0.109299723078534	0.05892840119647	0.108143245399653	NaN	NaN	0.105484283491893	0.300122516873664	126	0	874	0.874	0.126	0.252
ORF3a	all	ss13	103	GCC	AAG	CCC	2	GAAGCCCCA:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.16666666666667	6	30.666666666666675	0.134588203229996	0.2267106539047	0.593656279102664	-0.092122450674704	0.058008119804455	0.104053815327259	NaN	NaN	0.110005594559224	0.402348530268659	163	0	837	0.837	0.163	0.326
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CCC	AAT	2	GCCCCATTT:GCGCAATTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.41666666666667	7	31.000000000000007	0.148969278730818	0.268659167443214	0.554491700947837	-0.119689888712396	0.0637806689309476	0.123933364443545	0.419720811635217	0.186469185394697	0.125682365506359	0.340934482215203	110	0	890	0.89	0.11	0.22
ORF3a	all	ss13	105	TTT	AAT	TTC	2	CAATTTTTG:CCATTTCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.08333333333334	7	31.000000000000007	0.134739729478646	0.268659167443214	0.501526639723268	-0.133919437964568	0.058009795980149	0.121576687452896	0.340588059057238	0.140877411755768	0.110924872593893	0.227317188471915	85	0	915	0.915	0.085	0.17
ORF3a	all	ss13	106	CTT	TTC	TGT	2	TTTCTTTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.91666666666667	7	31.166666666666675	0.135043810631934	0.266933470240076	0.505908122014364	-0.131889659608142	0.0599480917029951	0.121170504560021	NaN	NaN	0.108690191118313	0.224959411689823	81	0	919	0.919	0.081	0.162
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TGT	ACC	2	CTTTATCTT:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.91666666666667	6	32.00000000000001	0.136897596837873	0.215761554338836	0.634485588766599	-0.078863957500963	0.0596649292869394	0.0977800562259987	NaN	NaN	0.0931852379315978	0.39737768338153	176	0	824	0.824	0.176	0.352
ORF3a	all	ss13	108	CTC	ACC	TCT	2	TACCTCTAT:TATCTTTAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.00000000000001	6	32.41666666666667	0.136741167595466	0.212555050951034	0.643321186599168	-0.0758138833555683	0.0604966362291112	0.0996990642902505	0.447441878095441	0.150497625615462	0.09460877928957	0.422934325185019	190	0	810	0.81	0.19	0.38
ORF3a	all	ss13	109	TAT	TCT	ATG	2	CTCTATGCC:CTTTATGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.16666666666667	6	32.58333333333334	0.136429382099394	0.211299152734159	0.645669328693614	-0.0748697706347653	0.0604966103588547	0.0985880668287402	NaN	NaN	0.0907001156517008	0.409107647515727	193	1	806	0.806	0.193	0.386
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ATG	CCT	2	TATGCCTTG:TATGCTTTA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.16666666666667	6	32.58333333333334	0.136429382099394	0.211299152734159	0.645669328693614	-0.0748697706347653	0.0601211048388358	0.0959633242334466	NaN	NaN	0.0911559156042003	0.411454060590327	173	0	827	0.827	0.173	0.346
ORF3a	all	ss13	111	TTA	CCT	TAG	2	GCCTTGATA:GCTTTAGTT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.83333333333334	6	32.91666666666667	0.137054385390789	0.208831643632827	0.656291273710231	-0.0717772582420377	0.0595196903385858	0.0951135299099192	NaN	NaN	0.0894728037447227	0.422423216562438	181	0	819	0.819	0.181	0.362
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TAG	TAT	2	TTAGTTTAT:TTGATATAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.66666666666667	6	33.08333333333334	0.133686173554739	0.207619511953736	0.643899854578834	-0.0739333383989969	0.0584749209091571	0.0924469341410567	NaN	NaN	0.0909905205954933	0.416482469354407	183	0	817	0.817	0.183	0.366
ORF3a	all	ss13	113	TAT	TAT	ATT	2	ATATATTTT:GTTTATTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	82.33333333333334	6	33.91666666666667	0.132502157521956	0.201765204947521	0.65671460823198	-0.0692630474255645	0.0587414410381207	0.0911158779679913	NaN	NaN	0.0830154221156139	0.404089687960059	162	0	838	0.838	0.162	0.324
ORF3a	all	ss13	114	TTC	ATT	TCT	2	TATTTCTTG:TATTTTCTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	82	6	34.25000000000001	0.133091525357086	0.199515431752951	0.66707384079386	-0.0664239063958648	0.0600317761830686	0.0909686841729733	NaN	NaN	0.0851624234973212	0.43541011688901	195	0	805	0.805	0.195	0.39
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TCT	TAC	2	TTCTTGCAA:TTTCTACAA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	81	6	34.583333333333336	0.134891598224071	0.19731556308439	0.683633850850268	-0.0624239648603196	0.0567525038464882	0.085627115413526	NaN	NaN	0.0864774471621577	0.470385143203333	222	1	777	0.777	0.222	0.444
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAA	2	CTACAATGC:TTGCAAAGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	12	81	6	34.91666666666667	0.165046413582601	0.195163947524611	0.845680852821386	-0.0301175339420096	0.0657190591244398	0.0886105437508896	NaN	NaN	0.0881316816764674	0.732551579272702	347	1	652	0.652	0.347	0.694
ORF3a	all	ss13	117	AGT	AAA	GCA	2	CAAAGTATA:CAATGCATC	1:1	TRUE	2.25	0.416666666666667	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.5	7	35.75000000000001	0.16853783682123	0.226916358788052	0.742731100222926	-0.0583785219668221	0.0684146628007441	0.0994151644008368	0.614386059058056	0.226701395358636	0.101807543184531	0.566360082115965	269	0	731	0.731	0.269	0.538
ORF3a	all	ss13	118	ATA	GCA	TAA	2	AGTATAAAC:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.08333333333334	7	36.08333333333334	0.153847312516879	0.224472453654355	0.685372793018848	-0.070625141137476	0.0663675727410131	0.0981893953138769	0.44625310932313	0.124577946819072	0.0973632549655147	0.46822030461854	212	0	788	0.788	0.212	0.424
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TAA	ACG	2	ATAAACTTT:ATCAACGCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.75	7	35.41666666666667	0.152421181209951	0.229414483788198	0.664392146010585	-0.0769933025782464	0.0679026483313498	0.0980259504140077	NaN	NaN	0.0951398375302456	0.418362963695937	203	0	797	0.797	0.203	0.406
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT:AACTTTGTG	1:1	TRUE	1.08333333333333	0.75	1.16666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.75	8	35.75	0.154570468491074	0.265759990634356	0.581616774301211	-0.111189522143282	0.0687228303472908	0.10346447646205	0.353827852627991	0.100220704026733	0.108544722733608	0.305662440537306	146	0	854	0.854	0.146	0.292
ORF3a	all	ss13	121	GTG	CAT	GTA	2	GCATGTAGA:TTTGTGAGA	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	3	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.16666666666667	7	35.083333333333336	0.138321779350139	0.231968667588477	0.596295097903173	-0.0936468882383375	0.0639077522770373	0.101941254884264	0.433002048514705	0.16847563790451	0.102638524813597	0.36156076226061	158	0	842	0.842	0.158	0.316
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GTA	GAA	2	GTGAGAATA:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.33333333333333	8	35.75	0.109784651326779	0.265759990634356	0.413096986738779	-0.155975339307577	0.0493298876411897	0.104444079893347	0.241001428981228	0.0865130763385042	0.0925641658852505	0.0919787343033025	24	0	976	0.976	0.024	0.048
ORF3a	all	ss13	123	ATA	GAA	TAA	2	AGAATAATA:AGAATTATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	78	8	35.916666666666664	0.110290063467372	0.264281463445784	0.41732046595087	-0.153991399978411	0.0489367858040469	0.106470481865509	0.232162052999007	0.0722500095675037	0.093189277889480407	0.0984411498759461	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	124	ATA	TAA	TAA	2	ATAATAATG:ATTATTATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.33333333333333	8	36.25	0.109784651326779	0.261373712626115	0.420029429217395	-0.151589061299336	0.0481572068501942	0.105089378185598	0.232689695213096	0.0710581876289889	0.0949824407407901	0.110495643398747	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TAA	TGA	2	ATAATGAGG:ATTATGAGA	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.5	8	36.083333333333336	0.109533681430367	0.262819463546309	0.416763963948459	-0.153285782115942	0.0507343228085158	0.102105908110423	0.249194813537768	0.0944371234933064	0.0901033597328495	0.0889013826611578	17	0	983	0.983	0.017	0.034
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATGT:ATGAGGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	79	8	36.75	0.108787621497542	0.25713126368002	0.423082047435975	-0.148343642182477	0.0491583372847404	0.102103979987527	0.266555037140737	0.112462349759465	0.0948981184268115	0.11800827715696	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	127	CTT	GAT	GTT	2	AGATGTTGG:AGGCTTTGG	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	79	8	37.083333333333336	0.123566424807041	0.25437938121672	0.485756448561248	-0.130812956409678	0.0500569071738803	0.0996558524145339	0.253269048880288	0.0551178139092057	0.0898380821393261	0.14536582362398	46	0	954	0.954	0.046	0.092
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GTT	GGC	2	CTTTGGTTG:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.41666666666667	7	36.75	0.137843761514516	0.219740343511106	0.627302930868263	-0.08189658199659	0.0571630477067897	0.0887629389890247	0.458083654139532	0.170872108981864	0.0933315494105159	0.380225895770399	174	0	826	0.826	0.174	0.348
ORF3a	all	ss13	129	CTT	GGC	TGT	2	TGGCTTTGT:TGGTTGTGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.58333333333334	7	36.58333333333333	0.139450189981991	0.220904431633438	0.631269318369266	-0.0814542416514477	0.0594117270441096	0.0941226235655819	0.472747561856278	0.181771605019261	0.0934650747563903	0.383484540137252	190	1	809	0.809	0.19	0.38
ORF3a	all	ss13	130	TGC	TGT	GCT	2	CTTTGTTGG:TTGTGCTGG	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.66666666666669	6	36.666666666666664	0.170542381646746	0.184599802154181	0.923849211410884	-0.0140574205074358	0.0668432744397186	0.0834904679657523	NaN	NaN	0.0864339196685737	0.870803641640006	435	1	564	0.564	0.435	0.87
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GCT	GGA	2	TGCTGGAAA:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.25000000000003	6	36.58333333333333	0.204399702385691	0.185076724431924	1.10440522984766	0.0193229779537677	0.0748208324000315	0.0815207268610068	NaN	NaN	0.0968948462322962	0.841932540143976	592	0	408	0.408	0.592	0.816
ORF3a	all	ss13	132	AAA	GGA	AAT	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.1666666666667	7	36.33333333333333	0.20465023999998	0.222674045667529	0.919057447339599	-0.0180238056675486	0.0749303806047747	0.0957980303624045	0.648373418630183	0.156342144757383	0.110511876462033	0.870444554318417	422	0	578	0.578	0.422	0.844
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AAT	GCA	2	AAATGCCGT:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.75000000000003	7	35.75	0.236957742360063	0.226916358788052	1.0442514749736	0.0100413835720107	0.0818237586276154	0.095254891904491	0.873372389644532	0.231831482376025	0.12054347192391	0.93361225914922	524	1	475	0.475	0.524	0.95
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCC:TGCCGTTCC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	2	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.08333333333336	7	35.583333333333336	0.235784099565018	0.228158530802244	1.03342223819536	0.00762556876277484	0.0836274371880455	0.0949829190507183	0.864526242466336	0.231945435985925	0.115908323961573	0.947545291698546	544	1	455	0.455	0.544	0.91
ORF3a	all	ss13	135	TCC	AAT	CCA	2	AAATCCAAG:CGTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.75000000000003	6	35.583333333333336	0.202909342656595	0.190999228388671	1.06235687111619	0.0119101142679239	0.0733898190238041	0.0820915513637599	NaN	NaN	0.108246972595543	0.912387781669828	538	0	462	0.462	0.538	0.924
ORF3a	all	ss13	136	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAT:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.08333333333337	6	35.916666666666664	0.20192785781644	0.188983168709011	1.06849651847758	0.0129446891074287	0.0749360580655045	0.0790925361460101	NaN	NaN	0.106724363486835	0.903460664598302	557	1	442	0.442	0.557	0.884
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AAA	ACC	2	AAAAATCCT:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.50000000000003	6	35.333333333333336	0.200714352979387	0.19253988513586	1.04245597133165	0.00817446784352671	0.0721121727341265	0.0821034936127603	NaN	NaN	0.109367423512905	0.940419059637259	539	0	461	0.461	0.539	0.922
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA:AATCCTTTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.83333333333337	6	35.333333333333336	0.202663072619289	0.19253988513586	1.05257709318921	0.0101231874834284	0.0755512441209908	0.0874125253358889	1.14730104676929	0.358913389074638	0.110810235425818	0.927209667797172	554	0	446	0.446	0.554	0.892
ORF3a	all	ss13	139	TTA	CAT	TAC	2	CCATTACTT:CCTTTACTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.6666666666667	6	35.5	0.20315621560155	0.191510018856633	1.06081246722468	0.0116461967449163	0.0744089413214836	0.0859116933565492	NaN	NaN	0.105153651224535	0.911811353720394	542	0	458	0.458	0.542	0.916
ORF3a	all	ss13	140	CTT	TAC	TTT	2	TTACTTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.6666666666667	6	36.166666666666664	0.206166540743903	0.187498978963039	1.0995608716597	0.0186675617808639	0.0762092016377628	0.0834736963320646	NaN	NaN	0.106149805584484	0.860403509244536	571	0	429	0.429	0.571	0.858
ORF3a	all	ss13	141	TAT	TTT	ATG	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.9166666666667	7	36.166666666666664	0.205405574614085	0.223869741416997	0.917522722427592	-0.0184641668029129	0.0746146982313711	0.0947714303772656	NaN	NaN	0.116826057253263	0.874418691468093	432	0	568	0.568	0.432	0.864
ORF3a	all	ss13	142	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGCC:TATGATGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.75000000000003	7	37.00000000000001	0.205912255736412	0.218017195136802	0.944477134508614	-0.0121049394003899	0.0734105798162079	0.0863947196787794	0.698557049483963	0.176362491503091	0.115684555146571	0.916663479546595	461	0	539	0.539	0.461	0.922
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ATG	CCA	2	GATGCCAAC:GATGCTAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.33333333333336	8	37.41666666666667	0.224432171139643	0.251686323459179	0.891713812872488	-0.0272541523195361	0.0764168282332147	0.102587315682929	0.629752434345747	0.156782773217595	0.122269866054064	0.823612068535168	401	1	598	0.598	0.401	0.802
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CCA	ACT	2	GCCAACTAC:GCTAACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.83333333333336	8	37.583333333333336	0.240246862716335	0.250361262210016	0.959600780870018	-0.0101143994936813	0.0774189826625143	0.0951525879162233	0.615846030617358	0.119189887022494	0.117945804485918	0.931661469056505	467	0	533	0.533	0.467	0.934
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTC:AACTACTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.83333333333336	9	37.583333333333336	0.258158161718876	0.288464693936611	0.894938504244145	-0.0303065322177352	0.0813282874700835	0.113447812612308	0.542747873131221	0.0991675431833667	0.131312529013626	0.817472544759986	384	0	616	0.616	0.384	0.768
ORF3a	all	ss13	146	TTC	ACT	TCC	2	TACTTCCTG:TACTTTGTT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.416666666666667	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.83333333333336	9	37.583333333333336	0.258158161718876	0.288464693936611	0.894938504244145	-0.0303065322177352	0.0805538976543818	0.112415677156347	0.555269118661732	0.107022820658624	0.12765221654067	0.812334968108797	401	0	599	0.599	0.401	0.802
ORF3a	all	ss13	147	CTG	TCC	TGT	2	TTCCTGTGT:TTTGTTTGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.5	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.75000000000001	9	37.083333333333336	0.258488520746743	0.293223013063023	0.881542407079711	-0.0347344923162802	0.084228569828728	0.109033424082011	0.510251333213722	0.0840486403414173	0.128165981387724	0.786381962681239	375	0	625	0.625	0.375	0.75
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TGT	GCT	2	CTGTGTTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.41666666666669	8	37.583333333333336	0.259818540246921	0.250361262210016	1.03777452611248	0.00945727803690449	0.0823960627420628	0.0968129853437758	0.790120945592232	0.189035548394299	0.114984833915598	0.934449466771339	520	0	480	0.48	0.52	0.96
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC:TGTTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.50000000000003	8	37.666666666666664	0.259484741116488	0.249703998029926	1.03916934916432	0.00978074308656188	0.0848832714728175	0.0980960937849336	0.647598113168589	0.108570498698195	0.125824331298646	0.938040188266882	526	0	474	0.474	0.526	0.948
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.83333333333336	8	37	0.258158161718876	0.255061761633984	1.01213980513996	0.00309640008489126	0.084143753118046	0.100565490447827	0.742977436779706	0.173111021959895	0.119343160207261	0.97930092798328	511	0	489	0.489	0.511	0.978
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.41666666666669	8	37	0.278309461419876	0.255061761633984	1.09114537450444	0.0232476997858919	0.0880238437082741	0.0997702863639483	0.660038947422438	0.0982997264901313	0.121666984261142	0.848465669854767	566	0	434	0.434	0.566	0.868
ORF3a	all	ss13	152	AAT	CAC	ATA	2	ACACATAAC:ACTAATTGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.75000000000001	8	36.666666666666664	0.276866163038678	0.257828654327118	1.07383783141266	0.01903750871156	0.088702924031259	0.101666816134309	0.871350475546609	0.217805911819282	0.12558342452889	0.879508327637966	553	0	447	0.447	0.553	0.894
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ATA	ACT	2	AATTGTTAC:CATAACTAT	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.416666666666667	0.666666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.91666666666669	8	36.833333333333336	0.261839694220712	0.256437672127084	1.02106563380029	0.00540202209362856	0.0866326314951162	0.105303541150046	0.580836247173341	0.0787605427330003	0.119790924956907	0.964031251884686	479	0	521	0.521	0.479	0.958
ORF3a	all	ss13	154	TAC	ACT	ACG	2	AACTATGAC:TGTTACGAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.66666666666669	7	36.333333333333336	0.244568640424989	0.222674045667529	1.0983257599323	0.0218945947574604	0.0801302184566628	0.0929914633226434	0.84152022467684	0.191835449213725	0.115849404363636	0.850099194258184	553	0	447	0.447	0.553	0.894
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ACG	ACT	2	TACGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.33333333333336	7	36.333333333333336	0.242080044197288	0.222674045667529	1.08714979993104	0.0194059985297594	0.0801094850859739	0.0914685759176514	0.847097233450948	0.199358087501254	0.117472845447971	0.868790019385363	577	0	423	0.423	0.577	0.846
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.00000000000001	8	36.333333333333336	0.243317923578779	0.260656845281595	0.933479891218339	-0.0173389217028162	0.0821817280402273	0.104548246096281	NaN	NaN	0.129235210613304	0.893271614125312	461	0	539	0.539	0.461	0.922
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA:TATTGTATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.00000000000001	8	36.333333333333336	0.243317923578779	0.260656845281595	0.933479891218339	-0.0173389217028162	0.0854807238011228	0.103707486653548	NaN	NaN	0.12345278692154	0.888304597234972	442	0	558	0.558	0.442	0.884
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA:TGTATTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.50000000000001	8	36.333333333333336	0.245198876012612	0.260656845281595	0.940696093163087	-0.0154579692689833	0.0866087643074369	0.099228899070689	0.767329120644061	0.220222907103301	0.13192931635011	0.906726473250714	458	0	542	0.542	0.458	0.916
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAT:ATTCCATAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.16666666666669	8	36.333333333333336	0.246469230096624	0.260656845281595	0.945569757933489	-0.0141876151849704	0.0841411807582486	0.101778787823213	0.719996540556502	0.189082673278263	0.130823256194893	0.913639752964059	487	0	513	0.513	0.487	0.974
ORF3a	all	ss13	160	TAC	CAT	ACA	2	CCATACAAT:CCATATAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.16666666666669	8	36.666666666666664	0.264931700823142	0.257828654327118	1.02754948442236	0.00710304649602317	0.0853356890271093	0.102733675727639	NaN	NaN	0.130011947701828	0.956430212001995	515	0	485	0.485	0.515	0.97
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ACA	ACA	2	TACAATAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.50000000000001	8	36.666666666666664	0.282358178426184	0.257828654327118	1.09513885942229	0.0245295240990657	0.0879020838883488	0.106974483290654	NaN	NaN	0.13971738630711	0.860635469619264	567	0	433	0.433	0.567	0.866
ORF3a	all	ss13	162	AGT	ACA	GTG	2	AACAGTGTC:AATAGTGTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.16666666666669	8	36.333333333333336	0.283860150265539	0.260656845281595	1.0890185905491	0.0232033049839436	0.0891290317624703	0.104637588189459	0.68905847444772	0.114005135868214	0.134601534234575	0.863134750003407	596	0	404	0.404	0.596	0.808
ORF3a	all	ss13	163	GTA	GTG	TAA	2	AGTGTAACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	75.33333333333336	8	36.5	0.287686797643992	0.259234959672941	1.10975309042788	0.0284518379710517	0.0919936618729216	0.0993049589973304	0.765926854898768	0.147364902043214	0.138182209670877	0.836868341431763	589	0	411	0.411	0.589	0.822
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TAA	CAG	2	GTAACTTCT:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.00000000000003	8	36.5	0.284617216278678	0.259234959672941	1.09791216677627	0.025382256605737	0.0882818960933317	0.101226526297034	0.780650166727797	0.159603185863779	0.131016147635536	0.84638432187372	593	0	407	0.407	0.593	0.814
ORF3a	all	ss13	165	GAT	CAG	ATA	2	ACAGATACA:ACTTCTTCA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.50000000000003	8	35.833333333333336	0.282358178426184	0.265018643484554	1.06542760431358	0.0173395349416301	0.0875125524503207	0.10530865695502	0.749320986331939	0.155067646429457	0.136830897029495	0.899160143455671	522	0	478	0.478	0.522	0.956
ORF3a	all	ss13	166	ACA	ATA	CAA	2	GATACAATT:TCTTCAATT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.66666666666669	8	35.666666666666664	0.262862230268108	0.266505540694197	0.986329325774622	-0.00364331042608851	0.0812344294888848	0.109733051784442	0.704960226185548	0.161774715536337	0.129342591159449	0.977528231425723	493	0	507	0.507	0.493	0.986
ORF3a	all	ss13	167	ATT	CAA	TTG	2	ACAATTGTC:TCAATTGTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.50000000000001	7	35.833333333333336	0.263548415128416	0.226300369430573	1.16459560270082	0.037248045697843	0.0818458600307832	0.0953101994641584	NaN	NaN	0.123885697184318	0.763670252530872	631	0	369	0.369	0.631	0.738
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TTG	TCA	2	ATTGTCATT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.00000000000001	7	35.833333333333336	0.26562886029046	0.226300369430573	1.17378889375588	0.0393284908598868	0.0824444901915977	0.0942300314768296	0.91419513388023	0.199156368954498	0.117582906534502	0.738021485186489	655	0	345	0.345	0.655	0.69
ORF3a	all	ss13	169	ATT	TCA	TTA	2	GTCATTACC:GTCGTTACT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.50000000000001	7	36	0.263548415128416	0.225078444337754	1.1709180588299	0.0384699707906628	0.0759908401174407	0.0906522208541596	NaN	NaN	0.120125561433665	0.748780338920276	627	0	373	0.373	0.627	0.746
ORF3a	all	ss13	170	ACC	TTA	CCT	2	ATTACCTCC:GTTACTGAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.16666666666669	6	35.16666666666667	0.279401963476042	0.193580949501978	1.44333398609137	0.0858210139740639	0.0849960012425689	0.0854771765626795	NaN	NaN	0.111309551233875	0.440699742909743	771	1	228	0.228	0.771	0.456
ORF3a	all	ss13	171	GAA	CCT	AAG	2	ACCTCCGGT:ACTGAAGGT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.50000000000001	6	35.16666666666667	0.296875661285402	0.193580949501978	1.53359957190606	0.103294711783424	0.0839720089990166	0.0902151752408862	NaN	NaN	0.119308461827171	0.386611592695777	800	0	200	0.2	0.8	0.4
ORF3a	all	ss13	172	GGT	AAG	GTG	2	GAAGGTGAC:TCCGGTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.16666666666669	5	35.16666666666667	0.279401963476042	0.157645932730055	1.77233854776625	0.121756030745987	0.0809108476216147	0.079788847466062	NaN	NaN	0.110757888341077	0.271637688681105	871	0	129	0.129	0.871	0.258
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	78.16666666666669	5	34.833333333333336	0.275083189587406	0.159326652781303	1.72653592343394	0.115756536806103	0.0815974279720513	0.0800733631254451	NaN	NaN	0.110119782303488	0.293172490763885	843	0	157	0.157	0.843	0.314
ORF3a	all	ss13	174	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATT:GATGGCACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.16666666666667	5	35.166666666666664	0.279401963476042	0.157645932730055	1.77233854776625	0.121756030745987	0.0791448070017342	0.0780885520170125	NaN	NaN	0.111664168934236	0.275547151630792	859	0	141	0.141	0.859	0.282
ORF3a	all	ss13	175	ACA	GCA	CAA	2	GGCACAACA:GGCATTTCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.66666666666667	5	35.666666666666664	0.281613206922171	0.155190536855492	1.81462873077371	0.12642267006668	0.0839252559439675	0.0723523311779304	NaN	NaN	0.113315386018156	0.264563063790211	864	0	136	0.136	0.864	0.272
ORF3a	all	ss13	176	ACA	CAA	CAA	2	ACAACAAAT:ATTTCAACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.41666666666667	6	35.99999999999999	0.282732161667018	0.18848582121068	1.50001819686477	0.0942463404563385	0.0837063855074362	0.0871455984501543	1.39881968121711	0.283564810971845	0.121218560995961	0.436869141076497	802	0	198	0.198	0.802	0.396
ORF3a	all	ss13	177	AAT	CAA	ATC	2	ACAAATCCC:TCAACACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.91666666666667	6	36.166666666666664	0.261839694220712	0.187498978963039	1.39648597378403	0.0743407152576726	0.0797874817563765	0.0864780517010597	NaN	NaN	0.112237967431309	0.507747524719221	741	0	259	0.259	0.741	0.518
ORF3a	all	ss13	178	CCA	ATC	CAA	2	AATCCCATT:ACACCAAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.25	6	36.166666666666664	0.24238832144563	0.187498978963039	1.29274475405762	0.0548893424825905	0.0733044374580896	0.079833477086433	NaN	NaN	0.109565812447836	0.616391225246822	681	0	319	0.319	0.681	0.638
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTC:CCCATTACA	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.666666666666667	0.916666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.41666666666667	7	35.99999999999999	0.241772556876833	0.225078444337754	1.07417019692045	0.0166941125390794	0.0735766392679783	0.0956295351938332	NaN	NaN	0.118842962463827	0.888287047847896	565	0	435	0.435	0.565	0.87
ORF3a	all	ss13	180	ACA	AAC	CAG	2	AAACTCAAA:ATTACAGAA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	77	7	36.08333333333333	0.20822380244871	0.224472453654356	0.927614052677191	-0.0162486512056459	0.0616891078434736	0.0936538340471067	NaN	NaN	0.111099186286963	0.883721227457689	468	0	532	0.532	0.468	0.936
ORF3a	all	ss13	181	AAA	CAG	AAC	2	ACAGAACAT:CTCAAAGAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.33333333333333	7	36.416666666666664	0.173851210542993	0.22208100957439	0.782827900846511	-0.0482297990313963	0.0517757454939289	0.0954844279872073	NaN	NaN	0.105783645211228	0.648441256161328	348	1	651	0.651	0.348	0.696
ORF3a	all	ss13	182	CAT	AAC	AAG	2	AAAGAAGAC:GAACATGAC	1:1	TRUE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.41666666666666	6	36.666666666666664	0.176201863051343	0.184599802154181	0.954507323383669	-0.00839793910283881	0.0511479184270537	0.081550916526284	0.786453811522624	0.224867971753764	0.0914716880738661	0.926849663942585	430	1	569	0.569	0.43	0.86
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	CATGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.5	6	37.24999999999999	0.145735279379414	0.181329278360777	0.80370517489986	-0.0355939989813634	0.0429175888799482	0.0855450534858203	NaN	NaN	0.0883457469412205	0.687025975499155	375	1	624	0.624	0.375	0.75
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	73.83333333333333	6	38.25	0.16608898542729	0.175985531846771	0.943764999794996	-0.00989654641948087	0.0485826451140259	0.0799327391751588	NaN	NaN	0.0865133864783915	0.908926074013515	493	0	507	0.507	0.493	0.986
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	74.83333333333333	6	37.916666666666664	0.16360869705703	0.177731272847004	0.920539725149379	-0.0141225757899737	0.0460501799228654	0.0803217784928	NaN	NaN	0.0903280903054384	0.875759076149721	449	0	551	0.551	0.449	0.898
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.08333333333333	6	37.666666666666664	0.163000202065247	0.179063586735151	0.910292287992297	-0.0160633846699032	0.0489163688169371	0.0828674160469421	NaN	NaN	0.0910035094212706	0.859890226848265	435	0	565	0.565	0.435	0.87
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	12	75	6	37.5	0.179963002222943	0.179963002222943	1	0	0.0511430903454686	0.0836898732891767	NaN	NaN	0.0919516734725898	1	513	0	487	0.487	0.513	0.974
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	12	74.33333333333333	6	38.166666666666664	0.181789348152453	0.17641872921631	1.03044245336082	0.00537061893614302	0.0507398346570784	0.0779931263313202	NaN	NaN	0.0887418133945597	0.951741806938712	519	1	480	0.48	0.519	0.96
ORF3a	all	ss13	189	TAT	GTT	ATT	2	GGTTATTCT:GGTTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.5	6	37.666666666666664	0.195615152460455	0.179063586735151	1.09243401200148	0.0165515657253045	0.0532790580652569	0.080121192827766	NaN	NaN	0.0905650770529349	0.854987268921495	553	0	447	0.447	0.553	0.894
ORF3a	all	ss13	190	TCT	ATT	CTG	2	TATTCTGAG:TATTTTGAG	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	77	6	36.833333333333336	0.20822380244871	0.18365333026498	1.13378724005864	0.0245704721837293	0.0524664172942207	0.0828398976430169	NaN	NaN	0.100606814955575	0.807058314897925	589	0	411	0.411	0.589	0.822
ORF3a	all	ss13	191	GAG	CTG	AGA	2	TCTGAGGAT:TTTGAGAAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.58333333333333	5	37	0.209530707593171	0.149003021096613	1.40621784747111	0.0605276864965582	0.052255489788893	0.0759173136608142	NaN	NaN	0.083361248799255	0.467784206714474	772	0	228	0.228	0.772	0.456
ORF3a	all	ss13	192	AAA	AGA	AAT	2	GAGAAATGG:GAGGATAGG	1:1	TRUE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.08333333333333	5	35.833333333333336	0.214375488522047	0.154389040653112	1.38854084211661	0.0599864478689356	0.0502283982338501	0.0760230860828791	NaN	NaN	0.087553341052179	0.49325448735246	765	1	234	0.234	0.765	0.468
ORF3a	all	ss13	193	AGG	AAT	GGC	2	AAATGGGAA:GATAGGCAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	13	74.16666666666666	6	36.416666666666664	0.199643853662043	0.186038038359055	1.07313458808208	0.0136058153029877	0.0520050273603898	0.101166599674196	NaN	NaN	0.113024010991907	0.904182239977899	597	0	403	0.403	0.597	0.806
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	AAT	2	AGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	12	73.83333333333333	7	36.75	0.183183742573707	0.219740343511106	0.833637281378189	-0.0365566009373982	0.049536157777591	0.111553467742478	NaN	NaN	0.126879193150993	0.773253871324762	384	0	616	0.616	0.384	0.768
ORF3a	all	ss13	195	TCA	AAT	CAG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	74.16666666666666	6	35.75	0.165253875289951	0.18998582171068	0.869822146736865	-0.024731946420729	0.0497811467340232	0.100639444476472	NaN	NaN	0.117523650965816	0.833322487706361	423	0	577	0.577	0.423	0.846
ORF3a	all	ss13	196	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGTGTT:TCTGGAGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.33333333333333	6	35.25	0.162396234146618	0.193059006111768	0.841174091886711	-0.0306627719651506	0.0477535021210177	0.106994822488662	NaN	NaN	0.126426281982517	0.808365801554917	393	0	607	0.607	0.393	0.786
ORF3a	all	ss13	197	GTA	GAG	TAA	2	GGAGTAAAA:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	76	6	34.916666666666664	0.160807403509091	0.195163947524611	0.823960601067535	-0.0343565440155196	0.0483092817411393	0.105164195007121	NaN	NaN	0.122073084112661	0.778371087159047	384	0	616	0.616	0.384	0.768
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TAA	AAG	2	GTAAAAGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	77	6	34.583333333333336	0.158481820250405	0.19731556308439	0.803189661134959	-0.0388337428339852	0.046718491941793	0.102244200545925	NaN	NaN	0.122625662697545	0.751482416066096	386	1	613	0.613	0.386	0.772
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT:AAAGACTGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.83333333333333	6	35.083333333333336	0.161201678172285	0.194105738514483	0.830483835284742	-0.0329040603421978	0.0470973010862012	0.104225929714768	NaN	NaN	0.122950102130409	0.788990870276051	393	0	607	0.607	0.393	0.786
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATG	2	GACTATGTC:GACTGTGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.66666666666667	6	35.083333333333336	0.161597898479986	0.194105738514483	0.832525095428484	-0.0325078400344967	0.0485979417583488	0.102386289221475	NaN	NaN	0.124655604286847	0.794261231016985	401	0	599	0.599	0.401	0.802
ORF3a	all	ss13	201	GTC	ATG	TCG	2	TATGTCGTT:TGTGTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	76.08333333333334	6	35.083333333333336	0.144502989596306	0.194105738514483	0.744455010460828	-0.0496027489181768	0.044311752698661	0.107964564886238	NaN	NaN	0.118836641015805	0.676383793551379	331	1	668	0.668	0.331	0.662
ORF3a	all	ss13	202	GTA	TCG	TAT	2	GTCGTTGTA:GTTGTATTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.75000000000001	6	35.416666666666664	0.145204582995195	0.192023563619284	0.756181065794014	-0.0468189806240892	0.0439411368137772	0.100957846733713	NaN	NaN	0.119127084241798	0.694306855031958	330	1	669	0.669	0.33	0.66
ORF3a	all	ss13	203	GTA	TAT	TAC	2	GTATTACAC:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.58333333333334	6	35.583333333333336	0.145557948736739	0.190999228388671	0.762086579954858	-0.0454412796519319	0.0447085519590836	0.10604199955185	NaN	NaN	0.114319544355662	0.691003554022473	348	0	652	0.652	0.348	0.696
ORF3a	all	ss13	204	CAC	TAC	ACA	2	GTACATGGC:TTACACAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.25	6	36.083333333333336	0.14626988152442	0.187991098237596	0.778068126074532	-0.0417212167131764	0.0436523437820091	0.107973774040431	NaN	NaN	0.112518652893432	0.710791133924206	319	0	681	0.681	0.319	0.638
ORF3a	all	ss13	205	AGC	ACA	GCT	2	CACAGCTAC:CATGGCTAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	74.83333333333333	6	35.833333333333336	0.147169682776295	0.189483161783181	0.776690030878293	-0.0423134790068855	0.0461833994714806	0.109017419738704	NaN	NaN	0.113574521584947	0.709474930661768	351	0	649	0.649	0.351	0.702
ORF3a	all	ss13	206	TAC	GCT	ACT	2	AGCTACTTC:GGCTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	74.33333333333333	5	36	0.148264213964023	0.15359580948451	0.965288144654596	-0.00533159552048651	0.0455204849596136	0.0851075949822006	NaN	NaN	0.107150505717365	0.960315231456283	530	0	470	0.47	0.53	0.94
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ACT	TCA	2	TACTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	74.66666666666666	6	35.666666666666664	0.147532720684541	0.190491169998981	0.774485876092471	-0.0429584493144405	0.0456018111928633	0.100372853773283	NaN	NaN	0.117545625525961	0.714766631585868	389	0	611	0.611	0.389	0.778
ORF3a	all	ss13	208	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGAA:TTCACTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.49999999999999	6	35.5	0.145735279379414	0.191510018856633	0.760979922875539	-0.0457747394772194	0.0449548294539642	0.104015073236916	NaN	NaN	0.122836502125367	0.70941066946439	341	0	659	0.659	0.341	0.682
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CCG	AAG	2	ACCGAAGTT:ACTTCAGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.83333333333331	6	35.166666666666664	0.145028544735405	0.193580949501978	0.749188105071893	-0.0485524047665734	0.0461065433180308	0.101974113596669	NaN	NaN	0.122798375906789	0.692560166047681	342	0	658	0.658	0.342	0.684
ORF3a	all	ss13	210	GAT	AAG	ATT	2	GAAGTTTAC:TCAGATTAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.16666666666666	6	34.5	0.128580042454815	0.197860943283853	0.649850548171871	-0.0692809008290377	0.0422615475928843	0.0998400791909828	NaN	NaN	0.119076316133996	0.560688391676366	286	0	714	0.714	0.286	0.572
ORF3a	all	ss13	211	TAC	ATT	ACT	2	GATTACTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.83333333333333	6	34.5	0.112096321732094	0.197860943283853	0.566540924508174	-0.0857646215517595	0.0393194071164007	0.105684112762827	NaN	NaN	0.11835111644824	0.46865907685051	225	0	775	0.775	0.225	0.45
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	78	6	34	0.125290563497375	0.20119798994601	0.622722739581025	-0.0759074264486349	0.0392619581501498	0.112239405131791	NaN	NaN	0.126452914044686	0.548318216294189	244	0	756	0.756	0.244	0.488
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTG:TACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.5	6	33.5	0.124422507844916	0.20465023999998	0.607976359299299	-0.0802277321550646	0.0408089176845403	0.111918869309732	NaN	NaN	0.125797647386414	0.523634969803824	245	0	755	0.755	0.245	0.49
ORF3a	all	ss13	214	CTG	AGC	TGT	2	CAGCTGTAC:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	1.5	1	0.333333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.83333333333333	6	32.833333333333336	0.123850470889023	0.209443067094397	0.591332396947772	-0.0855925962053742	0.0401002189522031	0.115487261727778	NaN	NaN	0.123872382266208	0.489581876592974	231	0	769	0.769	0.231	0.462
ORF3a	all	ss13	215	GAG	TGT	ACT	2	CTGTACTCA:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	9	79	6	32.833333333333336	0.123566424807041	0.209443067094397	0.589976199839308	-0.0858766422873555	0.0398565281901699	0.112889808979713	NaN	NaN	0.125879408124092	0.495103905810267	248	1	751	0.751	0.248	0.496
ORF3a	all	ss13	216	TCA	ACT	CAA	2	GAGTCTACA:TACTCAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.83333333333334	6	32.333333333333336	0.107566557885163	0.213188653016244	0.504560427411523	-0.105622095131081	0.0377397856266313	0.116587619071221	NaN	NaN	0.120422915188496	0.380436130180893	180	0	820	0.82	0.18	0.36
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CAA	CAC	2	TCAACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.50000000000001	6	31.333333333333332	0.105204990412841	0.221099655165484	0.475826117114927	-0.115894664752642	0.0362826272262972	0.118597770242792	NaN	NaN	0.133554585351883	0.385520247184306	150	0	850	0.85	0.15	0.3
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.33333333333336	6	31.5	0.105436462965892	0.219740343511106	0.479822964145695	-0.114303880545214	0.0351187305025093	0.125085820055237	NaN	NaN	0.130170324927738	0.379883957798033	148	0	852	0.852	0.148	0.296
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TGA	2	CAAATTACT:CAATTGAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.5	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.66666666666669	6	32.5	0.107808568999606	0.211925228838758	0.508710405034559	-0.104116659839152	0.0369207960796013	0.12188473723355	NaN	NaN	0.126938785272042	0.412095509696473	179	0	821	0.821	0.179	0.358
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TGA	CTA	2	ATTACTACA:TTGAGCACA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.83333333333336	6	33.5	0.0945068750198486	0.20465023999998	0.46179703976823	-0.110143364980132	0.0348853560807999	0.109932677601566	NaN	NaN	0.115402890734748	0.339868727605688	139	0	861	0.861	0.139	0.278
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CTA	CAG	2	ACTACAGAC:AGCACAGAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.66666666666669	6	34.33333333333333	0.0815281512006671	0.198960851821961	0.409769813780363	-0.117432700621294	0.0311486192777066	0.116682164167525	NaN	NaN	0.116248577465033	0.312406122993316	123	0	877	0.877	0.123	0.246
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333336	6	34.66666666666666	0.081899468973744	0.196773198350618	0.416212521116886	-0.114873729376874	0.0325560078141007	0.110136160466539	NaN	NaN	0.116840541243328	0.325525400960609	123	0	877	0.877	0.123	0.246
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.6666666666667	6	35.33333333333333	0.0826523551002107	0.19253988513586	0.429273940004116	-0.10988753003565	0.0313471825220255	0.105993273136467	NaN	NaN	0.111562585650789	0.32463118977325	136	0	864	0.864	0.136	0.272
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT:ACTGGTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.00000000000003	6	35	0.0822741879423183	0.194633396613813	0.422713621473527	-0.112359208671495	0.0341611272119175	0.101984613196507	NaN	NaN	0.115106601274406	0.328999177024	135	0	865	0.865	0.135	0.27
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	TTG	2	GGTATTGAA:GGTGTTGAA	1:1	FALSE	0.916666666666667	0.75	1.33333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.50000000000003	6	34.5	0.0817133878414161	0.197860943283853	0.412983919338691	-0.116147555442437	0.0322133295451101	0.106209661442122	NaN	NaN	0.121642084724018	0.339663491968061	127	0	873	0.873	0.127	0.254
ORF3a	all	ss13	226	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT:GTTGAACAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.25000000000003	5	33.833333333333336	0.0808863909048056	0.164591833676269	0.491436234095908	-0.0837054427714631	0.0319085987369561	0.103971772873935	NaN	NaN	0.106470569590978	0.43175978364342	202	0	798	0.798	0.202	0.404
ORF3a	all	ss13	227	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT:GAACATGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	GCT	ATG	CTA	2	AATGCTACA:CATGTAACT	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CTA	CAT	2	GCTACATTC:GTAACTTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC:ACTTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTAC:TTCATCTTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TAC	TCT	ACA	2	ATCTACAAT:ATCTTTAAC	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	ACA	ACA	2	TACAATAAA:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAA	ACA	AAA	2	AACAAGCTT:AATAAAATC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	ATC	AAA	TCG	2	AAAATCGTA:AAGCTTGTT	1:1	TRUE	1.75	0.75	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GTA	TCG	TAG	2	ATCGTAGAT:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	TAG	AAG	2	GTAGATGAG:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCCA:GATGAGCCC	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	CCA	ACC	CA-	1	GACCCA---:GAGCCCGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.5	1.16666666666667	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	CCG	AAG	1	CCA---CCG:CCCGAAGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	AAC	1	---CCGAAT:GAAGAACAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	2	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	AAC	ATG	2	CCGAATGTG:GAACATGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTC	ATG	TCC	2	AATGTGCAA:CATGTCCAA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TCC	AAA	2	GTCCAAATT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC:CAAATTCAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA:ATTCACACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC:ATCGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCT:GACGGTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCA	GCT	CAT	2	GGCTCTTCA:GGTTCATCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CAT	CAG	2	TCATCCGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT:TCCGGAGTT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT:GTTGTTAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAT	CTA	ATC	2	GCTAATCCA:GTTAATCCA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	CCA	ATC	CAG	2	AATCCAGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	GCA	CAG	CAA	2	CCAGCAATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	ATG	CAA	TGG	2	GCAATGGAA:GCAATGGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	GAA	TGG	AAC	2	ATGGAACCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	AAC	CAA	2	GAACCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATT	CAA	TTT	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGAA:TATGATGAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAA	ATG	AAC	2	GATGAACCG:GATGAGCCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCG	AAC	CGA	2	GAACCGACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CGA	CGA	2	CCGACGACG	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	TTG	CTT	TGT	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.16666666666669	4	33.666666666666664	0.0881207952860292	0.129351945263207	0.681248319124383	-0.0412311499771781	0.0447140276794322	0.0710809280091804	NaN	NaN	0.0763081273205536	0.588973272054884	294	0	706	0.706	0.294	0.588
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000001	5	33.99999999999999	0.088993157850987	0.163690174515013	0.543668293559212	-0.0746970166640264	0.0429014142930561	0.084222586372437	NaN	NaN	0.0923713130412969	0.418710551292437	182	0	818	0.818	0.182	0.364
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	70.83333333333334	5	34.33333333333333	0.0898829861073045	0.161916285324778	0.555120109919848	-0.0720332992174739	0.0425367399736914	0.0777896491970491	NaN	NaN	0.0878269005452143	0.412117188398879	183	0	817	0.817	0.183	0.366
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA:TTTATGAGT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71	5	34.166666666666664	0.089658862987337	0.162798378928371	0.550735600547877	-0.0731395159410336	0.043565430784196	0.0831555169487258	NaN	NaN	0.0906428156610437	0.419725192263869	203	0	797	0.797	0.203	0.406
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATTT:ATGAGTATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333333	5	34.83333333333333	0.089213957146024	0.159326652781303	0.559943710538387	-0.0701126956352791	0.0426572082671878	0.0836850828356558	NaN	NaN	0.0893573236277025	0.432668836826957	193	0	807	0.807	0.193	0.386
ORF3a	all	ss13	7	ATT	GAT	TTT	2	AGATTTTTT:AGTATTTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72	5	35.166666666666664	0.0728728113402358	0.157645932730055	0.462256209711541	-0.0847731213898191	0.0397946042658403	0.0782328145768353	NA	NA	0.0890926598588822	0.341342329139741	133	0	867	0.867	0.133	0.266
ORF3a	all	ss13	8	TTC	TTT	TCA	2	ATTTTCACG:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.58333333333333	5	34.74999999999999	0.0572387314369155	0.15975246858483	0.358296381545562	-0.102513737147914	0.0369179928001006	0.082291755533642	NaN	NaN	0.0811213575443289	0.206334725850391	68	0	932	0.932	0.068	0.136
ORF3a	all	ss13	9	ACG	TCA	CGC	2	TTCACGCTC:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.41666666666666	5	34.58333333333333	0.0565638983071325	0.160610991304224	0.352179498101665	-0.104047092997091	0.0375381011168494	0.0806145568029952	NA	NA	0.0892204785855986	0.243541879631586	95	0	905	0.905	0.095	0.19
ORF3a	all	ss13	10	CTC	CGC	TCG	2	ACGCTCGGA:ACTCTTAGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666667	5	35.08333333333333	0.0569668741816512	0.158062767299148	0.360406660942713	-0.101095893117497	0.0352279204635009	0.0806838472499074	NA	NA	0.0828556431939793	0.222409938075467	69	0	931	0.931	0.069	0.138
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TCG	GAT	2	CTCGGATCA:CTTAGATCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.75	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.08333333333333	6	34.916666666666664	0.0568319121182793	0.195163947524611	0.291200874132312	-0.138332035406332	0.0361697120786439	0.0943844151045694	0.372560121483039	0.434437247866924	0.0911738808100254	0.129207826628064	37	1	962	0.962	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	12	TCA	GAT	CAA	2	AGATCAATT:GGATCAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.41666666666667	5	35.166666666666664	0.0565638983071325	0.157645932730055	0.358803410450111	-0.101082034422922	0.0364072055965063	0.0766520080570167	NaN	NaN	0.0835663675926744	0.226431700650649	95	1	904	0.904	0.095	0.19
ORF3a	all	ss13	13	ATC	CAA	TCA	2	TCAATCACA:TCAATTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.41666666666667	6	35.166666666666664	0.0565638983071325	0.193580949501978	0.292197648852603	-0.137017051194846	0.0364114081374859	0.0917453600102764	NaN	NaN	0.0933645956070327	0.142226967117244	41	0	959	0.959	0.041	0.082
ORF3a	all	ss13	14	ACA	TCA	CAC	2	ATCACACGT:ATTACTGCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.08333333333334	6	34.99999999999999	0.0568319121182793	0.194633396613814	0.291994658198581	-0.137801484495534	0.0357312808808038	0.0900958768267017	NaN	NaN	0.0956543041752542	0.149692123697608	47	0	953	0.953	0.047	0.094
ORF3a	all	ss13	15	CGT	CAC	CAC	2	ACACGTCAA:ACTGCACAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.58333333333334	6	34.49999999999999	0.0564308375631679	0.197860943283853	0.285204531155053	-0.141430105720685	0.0368330842765522	0.0942197616850218	NaN	NaN	0.0991866032110298	0.153897418410028	45	0	955	0.955	0.045	0.09
ORF3a	all	ss13	16	CAA	CAC	AAC	2	CGTCAACCG:GCACAGCCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.25000000000001	6	34.83333333333333	0.0278131522748419	0.195697415235261	0.142123247981614	-0.167884262960419	0.020070133044967	0.0906229202355151	0.154933971902465	0.358977627968267	0.0911299802896508	0.0654384986981293	5	1	994	0.994	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	17	CCA	AAC	CAG	2	CAACCGAGT:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.08333333333334	7	34.99999999999999	0.0278777737612569	0.23261619622788	0.119844508737245	-0.204738422466623	0.0195897723467287	0.0998595935525439	0.118456959151539	0.311675042668676	0.10504093345198	0.0512799156405489	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	18	AGT	CAG	GTA	2	CCAGTAAAA:CCGAGTAAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333334	7	35.166666666666664	0.0276848040229394	0.231324762417615	0.11967937947326	-0.203639958394675	0.0198130398478815	0.104477680347428	0.112464196392516	0.287258317252499	0.106976702914235	0.0569633871644318	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	19	AAA	GTA	AAA	2	AGTAAGATT:GTAAAAATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.41666666666667	6	34.916666666666664	0.0277488297186241	0.195163947524611	0.142182150292512	-0.167415117805987	0.0193357232432113	0.0916921775387167	NA	NA	0.0887806999582567	0.0593333397957667	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	20	ATT	AAA	TTG	2	AAAATTGAC:AAGATTGAA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.33333333333333	6	34.33333333333333	0.027400307499342	0.198960851821961	0.137717079759294	-0.171560544322619	0.0196785462929002	0.0991586031218646	NA	NA	0.091648985313146	0.06121619905807	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	21	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT:ATTGACAAT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666667	6	34.666666666666664	0.0274630224286674	0.196773198350618	0.139566885423759	-0.169310175921951	0.0197445642507812	0.0942360468887927	NA	NA	0.0889798526865719	0.0570676562064132	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	22	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.58333333333334	6	34.416666666666664	0.0137146678675636	0.198409364312814	0.0691230875874434	-0.18469469644525	0.0140345364695322	0.0951066066309999	NA	NA	0.0890211635183054	0.0380117550839894	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTC	2	AATGCTCTT:AATGCTTCT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.58333333333334	6	34.74999999999999	0.0139053809368069	0.196233824001589	0.0708612850386807	-0.182328443064782	0.0139475757327547	0.0918967841862252	NA	NA	0.0882982829369492	0.0389310498253892	0	2	998	0.998	0	0.001
ORF3a	all	ss13	24	CTT	CTC	CTC	2	GCTCTTCCT:GCTTCTCCT	1:1	TRUE	1	1	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.58333333333334	6	35.58333333333333	0.0141014729867999	0.190999228388671	0.0738299997636865	-0.176897755401871	0.0137050386540972	0.0903417988370405	NA	NA	0.0854324003776765	0.0383946297640233	0	4	996	0.996	0	0.001
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	CTTCCTGCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666667	5	34.99999999999999	0	0.158481820250405	0	-0.158481820250405	0	0.0778703321205519	NA	NA	0.0822958940454737	0.054134834916185	0	4	996	0.996	0	0.001
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666667	5	34.666666666666664	0	0.160180575223544	0	-0.160180575223544	0	0.0849666034326733	NA	NA	0.0830077753763795	0.0536433163922988	0	4	996	0.996	0	0.001
ORF3a	all	ss13	27	AGT	CAA	GTA	2	GCAAGTACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333334	5	33.99999999999999	0	0.163690174515013	0	-0.163690174515013	0	0.0816503412770472	NA	NA	0.0859785297834048	0.0569297973942703	0	2	998	0.998	0	0.001
ORF3a	all	ss13	28	ACT	GTA	CTG	2	AGTACTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000001	6	34.666666666666664	0	0.196773198350618	0	-0.196773198350618	0	0.091430253962933	NA	NA	0.0961241980172775	0.0406509706961044	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	29	GTT	CTG	TTC	2	ACTGTTCAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000001	6	33.83333333333333	0	0.202335646591906	0	-0.202335646591906	0	0.0968190242491941	NA	NA	0.0973143218518877	0.0375992467834792	0	3	997	0.997	0	0.001
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	GTTCATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000001	7	33.33333333333333	0	0.246378050229027	0	-0.246378050229027	0	0.112483641235352	0	NaN	0.110697196349978	0.0260347064306143	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA:CATGCTACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666669	8	33.666666666666664	0	0.285760509183	0	-0.285760509183	0	0.131593517241982	0	NaN	0.129571400252757	0.0274240127656301	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666669	8	33.666666666666664	0	0.285760509183	0	-0.285760509183	0	0.123057241878802	0	NaN	0.120493891365866	0.0177123684357662	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000003	8	33.49999999999999	0	0.287492986673213	0	-0.287492986673213	0	0.131114770347352	0	NaN	0.124259808741522	0.0206872466589411	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	34	ACG	CAA	CGA	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.1666666666667	8	33.166666666666664	0	0.291022534714547	0	-0.291022534714547	0	0.126617581759004	0	NaN	0.135886058723508	0.0322203787101175	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CGA	TAC	2	ACGATACCG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.25000000000003	8	32.33333333333333	0	0.300242781455809	0	-0.300242781455809	0	0.122831715553328	0	NaN	0.133514201023286	0.0245271083651542	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	36	CCG	TAC	CGC	2	ATACCGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.4166666666667	8	31.33333333333333	0	0.312120297918684	0	-0.312120297918684	0	0.137098823617467	0	NaN	0.144087756945408	0.0302972860807828	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	37	CTA	CGC	TAC	2	CCGCTACAA	2	FALSE	1	1	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.6666666666667	8	30.83333333333333	0	0.318423959611188	0	-0.318423959611188	0	0.146192647448099	0	NaN	0.149523401536516	0.0332052458513118	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	CTACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.1666666666667	8	31.16666666666666	0	0.314193196111627	0	-0.314193196111627	0	0.138601607298609	0	NaN	0.144250729073844	0.029398240120871	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333336	8	31.83333333333333	0	0.306064756191029	0	-0.306064756191029	0	0.140692756779681	0	NaN	0.131034783766078	0.0195041714354093	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	40	TCA	CCT	CAC	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333336	8	31.83333333333333	0	0.306064756191029	0	-0.306064756191029	0	0.138497269897919	NA	NA	0.135348197147055	0.0237398276358064	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	41	CTC	CAC	TCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000003	8	31.499999999999996	0	0.310074958318006	0	-0.310074958318006	0	0.134216047503363	0	NaN	0.135972766035183	0.0225828153028739	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TCC	CTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.16666666666669	8	31.83333333333333	0	0.306064756191029	0	-0.306064756191029	0	0.141225368548625	0	NaN	0.135483440033892	0.0238798658131644	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.33333333333336	8	31.66666666666666	0	0.308056623906756	0	-0.308056623906756	0	0.138407115530124	0	NaN	0.137950970482561	0.0255431574971001	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	44	GGA	TCG	GAT	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.16666666666669	8	30.999999999999996	0	0.316294221734959	0	-0.316294221734959	0	0.143000270809891	0	NaN	0.137971956597764	0.0218795183965944	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	GGATGGCTT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.33333333333336	8	30.66666666666666	0	0.320583011120205	0	-0.320583011120205	0	0.133083609931557	NA	NA	0.142414979076806	0.0243824719047863	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTG	2	TGGCTTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.33333333333336	8	30.33333333333333	0	0.324991546958348	0	-0.324991546958348	0	0.145158684440326	0	NaN	0.151533705531233	0.031978314660117003	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	47	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTATT:CTTGTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.75000000000001	8	29.916666666666668	0	0.330678508474864	0	-0.330678508474864	0	0.150049899104615	0	NaN	0.150792878312693	0.0283122881918693	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	GTTATTGGC:GTTGTTGGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.08333333333336	8	29.416666666666668	0.0129174344873365	0.337775741046657	0.0382426353275389	-0.324858306559321	0.0135667286465581	0.151999737327147	NA	NA	0.148243229734207	0.0284237892532036	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.1666666666667	7	30.08333333333333	0.0130722263514627	0.27856879640113	0.0469263841476314	-0.265496570049667	0.0135043302411631	0.132175412094477	0.0720304439086525	0.514736768126209	0.124790796851728	0.0333758013731421	2	1	997	0.997	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.33333333333336	7	30.916666666666668	0.0132162010123647	0.269530500680923	0.0490341574663208	-0.256314299668558	0.0132624605248434	0.120920758411954	NA	NA	0.131128946846574	0.050621599870614	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAC	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.00000000000001	7	30.250000000000004	0.0131007697802931	0.2767124213498	0.0473443501971748	-0.263611651569507	0.0128751687649768	0.127858909151219	0.0846149489312525	0.575802096297301	0.132990587889306	0.0474587886414538	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	52	CTT	CAC	TTC	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333336	7	30.91666666666667	0.0130438070339019	0.269530500680923	0.0483945490434253	-0.256486693647021	0.0135787777862336	0.128645067774683	NA	NA	0.12843980385387	0.0458316067413657	1	1	998	0.998	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TTC	TTG	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.66666666666669	6	30.91666666666667	0.0129873375085957	0.224573223705648	0.0578311932931881	-0.211585886197052	0.0126210188990919	0.108405928842289	NA	NA	0.104648907890417	0.0431903774207269	3	1	996	0.996	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.00000000000001	6	30.583333333333336	0.0129313548258795	0.227432270381152	0.0568580474714865	-0.214500915555273	0.0126565924549731	0.102220478228419	0.0864270827412369	0.510619717163721	0.113695582605972	0.0592107971318499	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333336	6	30.416666666666668	0.0127934871784325	0.228889480485489	0.0558937315568049	-0.216095993307057	0.012342469338167	0.106466724495478	NaN	NaN	0.112269540599619	0.0542548504696336	3	1	996	0.996	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.16666666666669	6	29.750000000000004	0.0125789112103712	0.234911530842709	0.0535474404566104	-0.222332619632338	0.0131774953001885	0.110382853610292	NaN	NaN	0.118584951829984	0.0608091585007958	2	2	996	0.996	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	57	CAA	TTC	AAA	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.16666666666669	6	29.416666666666668	0.0125789112103712	0.238043979028558	0.0528428035092713	-0.225465067818186	0.0130548843631057	0.115574858878815	NA	NA	0.110476215313139	0.0412660235323197	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	58	AGC	AAA	GCG	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.25000000000001	6	29.666666666666668	0.0127256499425275	0.235686824877377	0.0539938961337715	-0.22296117493485	0.0125440717403154	0.113099941176762	NA	NA	0.11937944312288	0.0618083509599907	4	1	995	0.995	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	59	GCT	GCG	CTA	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.08333333333336	7	30.333333333333336	0.0129174344873365	0.275793585093988	0.0468373275721202	-0.262876150606652	0.0134458153788063	0.123084127621915	NaN	NaN	0.136710037530024	0.0544958997292035	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.25000000000003	7	30.166666666666668	0.0128896835290581	0.277637470472643	0.0464263109266735	-0.264747786943585	0.0134025029307583	0.128466591391842	0.0900915421479408	0.606326808571074	0.133130470899932	0.0467416106809312	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CCA	AAA	2	ACCAAAATA:TCCAAAGTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.25000000000003	6	29.166666666666668	0.0127256499425275	0.240449165598692	0.0529244920057926	-0.227723515656165	0.012929248793201	0.122721229628623	NaN	NaN	0.119048418010556	0.0557653764805962	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATT:AAAGTGATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.58333333333336	6	28.833333333333332	0.0130014090011593	0.243733392896608	0.0533427481833584	-0.230731983895449	0.0125078120391474	0.116949031957693	NA	NA	0.119432782479827	0.0533720653910586	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	63	ATT	TAA	TTG	2	ATAATTGCG:GTGATTGCG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.25000000000001	5	28.5	0.0128896835290581	0.199849674976131	0.0644968951317912	-0.186959991447073	0.0129694621881766	0.0977374070686959	NA	NA	0.0946892193503384	0.0483295629058471	4	1	995	0.995	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	64	GCG	TTG	CGC	2	ATTGCGCTC:ATTGCGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.41666666666669	5	28.833333333333336	0.0128620515547158	0.197206849707019	0.0652211197218778	-0.184344798152303	0.013579406097319901	0.0952406853876893	NA	NA	0.0988638894689027	0.0622329670603678	6	1	993	0.993	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CGC	TCA	2	GCGCTCAAT:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.58333333333334	6	29.166666666666668	0.0128345378007018	0.240449165598692	0.0533773438919832	-0.22761462779799	0.0119559252846966	0.106396212242772	NA	NA	0.110068829995376	0.0386466126016519	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	66	AAT	TCA	ATA	2	CTCAATAAA:CTTCATAAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.25000000000001	6	28.166666666666668	0.0127256499425275	0.250581126994749	0.0507845506768518	-0.237855477052222	0.0133972309782975	0.122525594734711	NaN	NaN	0.1197267054102	0.0469608093265836	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	67	AAA	ATA	AAA	2	AATAAAAGA:CATAAGAGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.91666666666669	5	27.5	0.0126185941874855	0.20822380244871	0.0606011130288228	-0.195605208261224	0.0126327786428911	0.104012104233876	NA	NA	0.105144544504961	0.0628366223451989	8	2	990	0.99	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	68	AGA	AAA	GAT	2	AAAAGATGG:AAGAGGTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.75000000000001	5	27.25	0.0385937229566066	0.210428875701957	0.183405071323335	-0.17183515274535	0.0290093218390421	0.103753061612185	NaN	NaN	0.114927979473005	0.134873972832791	30	0	970	0.97	0.03	0.06
ORF3a	all	ss13	69	TGG	GAT	GGC	2	AGATGGCAG:AGGTGGCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25000000000001	6	27.5	0.0388436318463037	0.257828654327118	0.150656768339725	-0.218985022480815	0.0295696973357497	0.119100538622148	0.229564095262398	0.511648344106078	0.130001758546955	0.0920894461425702	15	0	985	0.985	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	70	CAG	GGC	AGC	2	TGGCAGCTA:TGGCAGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333336	6	27.833333333333336	0.0527110387112104	0.254152739478919	0.207399057823583	-0.201441700767709	0.0326123854488644	0.127062227628991	NaN	NaN	0.122586553940433	0.100328947859003	21	0	979	0.979	0.021	0.042
ORF3a	all	ss13	71	CTA	AGC	TAG	2	CAGCTAGCC:CAGCTCGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.25000000000001	7	27.833333333333336	0.0667849179180056	0.306347708328316	0.218003647823706	-0.23956279041031	0.0351561227650623	0.146464380754306	NaN	NaN	0.141824811025624	0.0911914838848879	13	0	987	0.987	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	72	GCC	TAG	CCC	2	CTAGCCCTT:CTCGCCCTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.41666666666667	7	28.333333333333336	0.0666364763682366	0.299699991491825	0.222343938138064	-0.233063515123588	0.0364653660974935	0.137593522640838	0.211612807998924	0.293391270650162	0.136891965763299	0.0886549149541241	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	73	CTG	CCC	TGT	2	GCCCTGTAT:GCCCTTTAT	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.08333333333334	7	27.833333333333336	0.0660492550084018	0.306347708328316	0.215602249381335	-0.240298453319914	0.0353757865110606	0.139000875058312	0.222948427512106	0.333519100517896	0.145452163567044	0.0985184635806998	13	0	987	0.987	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	74	TAT	TGT	ATA	2	CTGTATAAA:CTTTATAAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.41666666666667	7	27.666666666666668	0.0796327387923167	0.308630566923095	0.258019610909634	-0.228997828130778	0.0373484595587984	0.136563362442233	0.261804497308524	0.324357380890251	0.139666955589545	0.101088530329653	15	0	985	0.985	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	75	AAA	ATA	AAG	2	TATAAAGGC:TATAAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.16666666666667	7	27.916666666666668	0.0798980931045125	0.305219070273711	0.261772939131433	-0.225320977169198	0.0379547527816269	0.132009369874831	0.226943350292107	0.24871645255795	0.14141246081702	0.111079424192306	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	76	GGC	AAG	GCA	2	AAAGGCATT:AAGGGCTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.83333333333334	7	27.583333333333336	0.0813437533100697	0.309784984170422	0.262581330492508	-0.228441230860352	0.0384765224615722	0.137437621582427	NaN	NaN	0.148090251198601	0.122932433104394	25	0	975	0.975	0.025	0.05
ORF3a	all	ss13	77	ATT	GCA	TCC	2	GGCATTCAG:GGCTTCCAG	1:1	TRUE	1.5	0.5	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.83333333333334	7	27.25	0.0813437533100697	0.314491607077193	0.258651587131556	-0.233147853767123	0.038707260755238	0.1388277894319	NaN	NaN	0.153313939611562	0.128329659840094	27	0	973	0.973	0.027	0.054
ORF3a	all	ss13	78	CAG	TCC	AGC	2	ATTCAGCTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.16666666666667	6	26.916666666666668	0.0809774510729235	0.26452672930594	0.306121998655449	-0.183549278233017	0.0373905119042145	0.12269964157215	NaN	NaN	0.128343825843229	0.152677648631668	43	0	957	0.957	0.043	0.086
ORF3a	all	ss13	79	CTT	AGC	TCA	2	CAGCTTGTT:CAGTTCATT	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	0	1	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78	6	27.416666666666668	0.0811601884801745	0.258764472899754	0.313645020781567	-0.177604284419579	0.0401329745466895	0.121996849807493	NaN	NaN	0.130653120133334	0.174033366335144	48	0	952	0.952	0.048	0.096
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TCA	TTT	2	CTTGTTTGC:TTCATTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.5	5	27.916666666666668	0.0817133878414162	0.20465023999998	0.399283127356333	-0.122936852158564	0.039430884549191	0.0944231538981121	NaN	NaN	0.112138047501837	0.272947857855089	100	0	900	0.9	0.1	0.2
ORF3a	all	ss13	81	TGC	TTT	GCA	2	ATTTGCAAT:GTTTGCAAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.16666666666667	4	27.583333333333336	0.0809774510729235	0.16115228773261	0.502490235864876	-0.0801748366596865	0.0404117746049378	0.0833595866140033	NaN	NaN	0.09234697953493	0.385289660937146	169	0	831	0.831	0.169	0.338
ORF3a	all	ss13	82	AAT	GCA	ATT	2	TGCAATTTA:TGCAATTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78	4	28.25	0.0811601884801745	0.156921757285409	0.517201628914723	-0.0757615688052347	0.0405031657978174	0.0810396856681512	NaN	NaN	0.0896731145309722	0.398186884916375	191	0	809	0.809	0.191	0.382
ORF3a	all	ss13	83	TTA	ATT	TAC	2	AATTTACTG:AATTTGCTG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78	4	28.25	0.0811601884801745	0.156921757285409	0.517201628914723	-0.0757615688052347	0.0389710460870892	0.0833823803277335	NA	NA	0.0911321747731096	0.40578315400609	197	1	802	0.802	0.197	0.394
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TGC	2	TTACTGCTG:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.25	1	0	0.75	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.16666666666667	4	28.25	0.0809774510729235	0.156921757285409	0.516037116036381	-0.0759443062124858	0.0394778993405615	0.0822152571364449	NaN	NaN	0.0874783355082245	0.385312289387628	188	0	812	0.812	0.188	0.376
ORF3a	all	ss13	85	CTA	TGC	TAC	2	CTGCTACTT:CTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.58333333333334	4	29.25	0.0805241909860523	0.150978005779684	0.533350474264167	-0.0704538147936312	0.0420616308335128	0.0776108841645514	NaN	NaN	0.087004854077098	0.418073077384806	198	0	802	0.802	0.198	0.396
ORF3a	all	ss13	86	CTA	TAC	TAT	2	CTACTTTTT:CTGCTATTT	1:1	FALSE	1.25	1	0.5	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.75	4	29.583333333333336	0.0803443058867966	0.149095891727942	0.538876725278266	-0.0687515858411459	0.0400934444496037	0.0836772230898943	NaN	NaN	0.0890797179918896	0.440233826084178	216	0	784	0.784	0.216	0.432
ORF3a	all	ss13	87	TTT	TAT	TTG	2	CTATTTGTT:CTTTTTGTG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.91666666666667	4	30.333333333333336	0.0801652234595281	0.145028544735405	0.552754794621875	-0.0648633212758766	0.0391363313518926	0.0762456799107105	NaN	NaN	0.0844799882987217	0.442608924590459	210	0	790	0.79	0.21	0.42
ORF3a	all	ss13	88	GTG	TTG	TGA	2	TTTGTGACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.75	4	29.666666666666668	0.0792816652689176	0.148632696437812	0.533406627000737	-0.0693510311688939	0.0377056290259604	0.0812414514452758	NaN	NaN	0.0852585446477259	0.415977123041798	210	1	789	0.789	0.21	0.42
ORF3a	all	ss13	89	ACA	TGA	CAA	2	GTGACAATT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.41666666666667	4	30	0.0796327387923167	0.146808432844572	0.542426189349935	-0.0671756940522548	0.0387950322711397	0.0778720461036121	NaN	NaN	0.089372477123105	0.452269160986838	218	0	782	0.782	0.218	0.436
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CAA	TCT	2	ACAATTTAC:ACCATCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.08333333333334	4	29.666666666666668	0.0789336765288098	0.148632696437812	0.531065360587305	-0.0696990199090017	0.0399510757392084	0.0812238331849445	NaN	NaN	0.0837256257519142	0.405144053665053	185	1	814	0.814	0.185	0.37
ORF3a	all	ss13	91	TAC	TCT	ACT	2	ATCTATTCA:ATTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.41666666666667	4	30	0.0796327387923167	0.146808432844572	0.542426189349935	-0.0671756940522548	0.0394510422443442	0.0829267777058042	NaN	NaN	0.0885317338679782	0.447986975941368	200	0	800	0.8	0.2	0.4
ORF3a	all	ss13	92	TCA	ACT	CAC	2	TACTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.08333333333334	5	29.666666666666668	0.0789336765288098	0.19089739885116	0.413487438822323	-0.111963722322351	0.0379149572062007	0.0959947576654264	NaN	NaN	0.106648815500771	0.293793708353108	97	1	902	0.902	0.097	0.194
ORF3a	all	ss13	93	CAC	CAC	ACC	2	TCACACCTA:TCACATCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.58333333333334	5	28.833333333333332	0.0774048314449128	0.197206849707019	0.392505795614653	-0.119802018262106	0.0377944945780847	0.107048652654519	NaN	NaN	0.104779302388036	0.252882993453301	107	0	893	0.893	0.107	0.214
ORF3a	all	ss13	94	CTA	ACC	TAC	2	CACCTACTA:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.666666666666667	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.25	5	28.5	0.0777394299845027	0.199849674976131	0.388989524220079	-0.122110244991629	0.0392299484579426	0.106089339406552	NaN	NaN	0.111170781384124	0.272028846628033	104	0	896	0.896	0.104	0.208
ORF3a	all	ss13	95	CTA	TAC	TAC	2	CTACTACTT:CTTTTGCTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	1	0	1	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.75	5	28.833333333333332	0.0772386109180752	0.197206849707019	0.391662921611623	-0.119968238788944	0.0367241732916151	0.103708198003441	NaN	NaN	0.10634438750285	0.25927318130805	101	0	899	0.899	0.101	0.202
ORF3a	all	ss13	96	CTT	TAC	TTG	2	CTACTTTTA:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1.08333333333333	1	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.08333333333334	5	29.833333333333332	0.0779078173603665	0.189683904532547	0.410724449986206	-0.111776087172181	0.0387535755548347	0.094660192357269	NaN	NaN	0.105989782423074	0.291611486944727	94	1	905	0.905	0.094	0.188
ORF3a	all	ss13	97	GTC	TTG	TAG	2	CTTGTCGCT:CTTTTAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.16666666666667	5	30.249999999999996	0.0778235325055638	0.18671695246621	0.416799500407696	-0.108893419960646	0.0359214770819838	0.0928762928982074	NaN	NaN	0.102721857546849	0.289108058649757	97	0	903	0.903	0.097	0.194
ORF3a	all	ss13	98	GCT	TAG	CTG	2	GTCGCTGCA:TTAGCTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.16666666666667	5	30.41666666666666	0.0642791463517657	0.185556129985381	0.346413488774691	-0.121276983633615	0.0341127638237126	0.0921781283203887	NA	NA	0.0943766722211466	0.198781324942988	59	0	941	0.941	0.059	0.118
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.66666666666669	5	29.416666666666664	0.063062337907906	0.192747196311253	0.327176421316507	-0.129684858403347	0.0357081703858296	0.0981330546052052	NaN	NaN	0.107966710698522	0.229690707835438	67	1	932	0.932	0.067	0.134
ORF3a	all	ss13	100	GGC	CAG	GCA	2	GCAGGTATG:GCTGGCATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.83333333333334	5	29.249999999999996	0.0621473370101289	0.194000551939624	0.320346186589563	-0.131853214929495	0.0331951800636459	0.094886696236679	NaN	NaN	0.107756009690288	0.221092787038224	65	0	935	0.935	0.065	0.13
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAG:GGTATGGAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.16666666666669	5	29.58333333333333	0.0618907677660026	0.191510018856633	0.32317248014233	-0.129619251090631	0.0333091260805997	0.104011973546741	NaN	NaN	0.0994937837996808	0.192647342685713	50	0	950	0.95	0.05	0.1
ORF3a	all	ss13	102	GAG	TGG	AGG	2	ATGGAGGCA:ATGGAGGCG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.33333333333336	5	29.41666666666666	0.0625362067042883	0.192747196311253	0.324446777442632	-0.130210989606965	0.0339681529335443	0.0943978171851989	NaN	NaN	0.111160359837702	0.24144618592224	67	1	932	0.932	0.067	0.134
ORF3a	all	ss13	103	GCA	AGG	CAC	2	GAGGCACAA:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.33333333333336	5	29.41666666666666	0.0625362067042883	0.192747196311253	0.324446777442632	-0.130210989606965	0.0345116153041028	0.0987849128810735	NA	NA	0.099484322950501	0.190581987096006	54	0	946	0.946	0.054	0.108
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT:GCGCAATTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.66666666666669	5	29.749999999999996	0.0622764214574927	0.190288706694225	0.327273344484729	-0.128012285236733	0.0337317859378132	0.0970731517135198	NaN	NaN	0.099272102926835	0.197221136781412	52	0	948	0.948	0.052	0.104
ORF3a	all	ss13	105	TTT	AAT	TTT	2	CAATTTTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.50000000000001	5	30.249999999999996	0.0631952577133049	0.18671695246621	0.338454847717919	-0.123521694752905	0.0339710269675854	0.0908822788116926	NaN	NaN	0.0993223317494069	0.21363034483959	72	0	928	0.928	0.072	0.144
ORF3a	all	ss13	106	TTG	TTT	TGT	2	TTTTTGTAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.83333333333336	5	29.91666666666666	0.062929976401818	0.189082955000185	0.332816759721977	-0.126152978598367	0.035124536748464	0.0942836414151145	NaN	NaN	0.108227929780021	0.243766850627194	68	1	931	0.931	0.068	0.136
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TGT	ACA	2	TTGTACATC:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.50000000000003	5	30.91666666666666	0.0640047012994632	0.182159096576957	0.351367033006903	-0.118154395277494	0.0351062550539317	0.093619079572222	NaN	NaN	0.0945612486482369	0.211481808615277	75	0	925	0.925	0.075	0.15
ORF3a	all	ss13	108	ATC	ACA	TCT	2	TACATCTAT:TACCTCTAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.50000000000003	5	31.41666666666666	0.0640047012994632	0.178884786483983	0.357798460995418	-0.11488008518452	0.0342635581766926	0.0911631323920138	NaN	NaN	0.0959132280142339	0.231014291390764	88	0	912	0.912	0.088	0.176
ORF3a	all	ss13	109	TAT	TCT	ATG	2	ATCTATGCC:CTCTATGCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.66666666666669	4	31.41666666666666	0.0638683562552301	0.139531497680893	0.457734327494257	-0.075663141425663	0.0356728800655153	0.0791177234749987	NA	NA	0.0848188924233443	0.37236329934756	159	1	840	0.84	0.159	0.318
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ATG	CCC	2	TATGCCCTG:TATGCCTTG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.66666666666669	4	31.41666666666666	0.0638683562552301	0.139531497680893	0.457734327494257	-0.075663141425663	0.0347281560161287	0.0787541495115948	NA	NA	0.0820784131690223	0.356612185562082	152	0	848	0.848	0.152	0.304
ORF3a	all	ss13	111	CTG	CCC	TGA	2	GCCCTGATT:GCCTTGATA	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.33333333333336	4	31.749999999999996	0.0641416300786215	0.137923200937065	0.465053229934023	-0.0737815708584438	0.0350890314802798	0.0792570196847768	NaN	NaN	0.0826936103825401	0.372270631762068	169	0	831	0.831	0.169	0.338
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TGA	TAT	2	CTGATTTAT:TTGATATAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.33333333333336	4	31.749999999999996	0.0625362067042883	0.137923200937065	0.453413249398292	-0.075386994232777	0.0329155032048751	0.0753076745896607	NaN	NaN	0.0823006474175589	0.359669436440814	157	0	843	0.843	0.157	0.314
ORF3a	all	ss13	113	TAT	TAT	ATA	2	ATATATTTT:ATTTATATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.6666666666667	4	32.74999999999999	0.0622764214574927	0.133313895827917	0.467141261387183	-0.0710374743704243	0.0339652475117212	0.0735668012643162	NaN	NaN	0.0824883494342325	0.389137861383775	172	0	828	0.828	0.172	0.344
ORF3a	all	ss13	114	ATT	ATA	TTC	2	TATATTCTG:TATTTTCTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.33333333333337	4	33.08333333333333	0.0625362067042883	0.13184534303006	0.474314869733627	-0.0693091363257716	0.0341087397365219	0.07507876953691	NaN	NaN	0.0777134807265186	0.372470795397635	165	1	834	0.834	0.165	0.33
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TTC	TAC	2	ATTCTGCAA:TTTCTACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.50000000000004	3	33.416666666666664	0.0631952577133049	0.0956200277799543	0.660899804994128	-0.0324247700666494	0.034021558259125	0.0619690186703555	NaN	NaN	0.0670765465005624	0.628812092283299	343	1	656	0.656	0.343	0.686
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAG	2	CTACAATGC:CTGCAAGTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.1666666666667	3	33.74999999999999	0.0626669142682301	0.0946134639951751	0.662346685366322	-0.031946549726945	0.0346456132704751	0.0609008872263947	NA	NA	0.0631443195582635	0.612906412278438	314	2	684	0.684	0.314	0.628
ORF3a	all	ss13	117	GTT	AAG	GCA	2	CAAGTTGTG:CAATGCATC	1:1	TRUE	1.75	0.75	0.5	0	2	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.83333333333336	3	34.416666666666664	0.0637325912188816	0.0926626795339059	0.687791369076063	-0.0289300883150243	0.0325464649754781	0.0597363401050731	NA	NA	0.0623135979003434	0.642457140354133	329	2	669	0.669	0.329	0.658
ORF3a	all	ss13	118	ATC	GCA	TCA	2	GTTGTGAGC:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.91666666666669	3	34.58333333333333	0.0375469431438597	0.092187504132096	0.407288856525049	-0.0546405609882364	0.0218385935735985	0.059710848671938	NA	NA	0.0539818117757717	0.311440920959062	133	8	859	0.859	0.133	0.266
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TCA	ACG	2	ATCAACGCA:GTGAGCTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.25000000000003	2	34.24999999999999	0.037390920168914	0.0607927570603562	0.615055509520511	-0.0234018368914422	0.023320744153861	0.047414741579361	NA	NA	0.0430305966309564	0.586550345439039	291	12	697	0.697	0.291	0.582
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT:AGCTTCTGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.25000000000003	2	34.58333333333332	0.0250283912732922	0.0601826482875393	0.415873877030339	-0.035154257014247	0.0183841740728173	0.0427538215565313	NA	NA	0.0417495983786257	0.399773270321217	146	43	811	0.811	0.146	0.292
ORF3a	all	ss13	121	TGC	CAT	GCA	2	GCATGTAGA:TTCTGCAGA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.25000000000003	1	34.24999999999999	0.0124097970858067	0.0297805871963345	0.416707602304569	-0.0173707901105278	0.0128405726829992	0.0308298419493826	NA	NA	0.0335153905017173	0.604253901496942	280	126	594	0.594	0.28	0.56
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GCA	GAA	2	TGCAGATTT:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.75000000000003	1	34.58333333333332	0.025185997239258	0.0294878275056261	0.854115049148761	-0.00430183026636807	0.0189732013998445	0.0306401568857659	NA	NA	0.0371338648986407	0.907774154515439	468	43	489	0.489	0.468	0.936
ORF3a	all	ss13	123	ATT	GAA	TTA	2	AGAATTATT:AGATTTATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.75000000000003	1	34.41666666666666	0.025185997239258	0.0296334842053817	0.84991683950158	-0.00444748696612369	0.0185479742321811	0.0303879130746459	NA	NA	0.035757011243518	0.901013745841324	437	44	519	0.519	0.437	0.874
ORF3a	all	ss13	124	ATT	TTA	TTA	2	ATTATTATG:TTTATTATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333337	1	34.74999999999999	0.0124355180497881	0.0293435958691742	0.423789848566303	-0.0169080778193861	0.0128617371570511	0.0310828143850334	NA	NA	0.0349350518501603	0.628395768027166	267	141	592	0.592	0.267	0.534
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TTA	TGA	2	ATTATGAGA:ATTATGAGG	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.75000000000003	1	35.08333333333332	0.0124872811774231	0.0290593249318817	0.429716836392265	-0.0165720437544586	0.013096412399419	0.0319568029656855	NA	NA	0.0332041400373115	0.61771196160495	265	138	597	0.597	0.265	0.53
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATGT:ATGAGGTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.4166666666667	1	35.74999999999999	0.0123841823043677	0.0285069944752381	0.434426095501752	-0.0161228121708704	0.0123859922480088	0.0303317541203993	NA	NA	0.0333858978749995	0.629150533329861	280	130	590	0.59	0.28	0.56
ORF3a	all	ss13	127	TGC	GAT	GCT	2	AGATGTTGG:AGGTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.4166666666667	1	36.08333333333332	0.0125394770467935	0.0282386296527663	0.444054021069154	-0.0156991526059728	0.0129433892560528	0.0301927267167983	NA	NA	0.0325888342441763	0.629994851576989	270	129	601	0.601	0.27	0.54
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCTT:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.25000000000003	1	35.74999999999999	0.0125657389590355	0.0285069944752381	0.440794941394133	-0.0159412555162027	0.0131644471633255	0.0311860797506295	NA	NA	0.0316905983668341	0.614944648376671	288	134	578	0.578	0.288	0.576
ORF3a	all	ss13	129	CTT	GGC	TTT	2	TGGCTTTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.9166666666667	1	35.08333333333332	0.0126185941874855	0.0290593249318817	0.434235627189032	-0.0164407307443962	0.0127224044437658	0.0315724928323149	NA	NA	0.0322898753838677	0.61063969191932	265	130	605	0.605	0.265	0.53
ORF3a	all	ss13	130	TGC	TTT	GCT	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333337	1	34.58333333333332	0.0124355180497881	0.0294878275056261	0.421716996527313	-0.017052309455838	0.0127908223622237	0.0312444651276891	NA	NA	0.033294912510531	0.608539307140054	271	122	607	0.607	0.271	0.542
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GCT	GGA	2	TGCTGGAAG:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.58333333333337	1	34.58333333333332	0.012513324680928	0.0294878275056261	0.424355598205414	-0.0169745028246981	0.0128989959446714	0.0320951400966726	NA	NA	0.0353480242982585	0.631077512165448	268	124	608	0.608	0.268	0.536
ORF3a	all	ss13	132	AAG	GGA	AGT	2	TGGAAGTGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.25000000000004	1	34.58333333333332	0.0125657389590355	0.0294878275056261	0.426133086835169	-0.0169220885465907	0.0128631465505103	0.0311780857679223	NA	NA	0.0349244288910448	0.62800662954142	273	109	618	0.618	0.273	0.546
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AGT	GCA	2	AAGTGCAAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.75000000000004	1	34.08333333333332	0.0124872811774231	0.0299291581301553	0.417227946176055	-0.0174418769527323	0.0125930954210508	0.0306573916814048	NA	NA	0.0373271059273499	0.64030594748952	296	119	585	0.585	0.296	0.592
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.9166666666667	1	34.08333333333332	0.012461345857946	0.0299291581301553	0.416361389243036	-0.0174678122722094	0.0126140488229631	0.0304956252909433	NA	NA	0.0347928034669111	0.615630625802732	288	113	599	0.599	0.288	0.576
ORF3a	all	ss13	135	TCC	AAT	CCA	2	AAATCCAAA:AAATCCAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.25000000000003	1	34.08333333333332	0.0125657389590355	0.0299291581301553	0.419849395843004	-0.0173634191711199	0.0123269218141478	0.0332644915677825	NA	NA	0.0319760301459737	0.58712044019572	263	139	598	0.598	0.263	0.526
ORF3a	all	ss13	136	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.25000000000003	1	34.74999999999999	0.0125657389590355	0.0293435958691742	0.428227645141335	-0.0167778569101387	0.0122502086091403	0.0300572758928164	NA	NA	0.0338745836627103	0.620393045867602	268	124	608	0.608	0.268	0.536
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AAA	ACC	2	AAAAACCCA:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.6666666666667	1	34.16666666666666	0.0125002893639087	0.0298546878003148	0.418704407412257	-0.017354398436406	0.0128709978563522	0.0300249200459851	NA	NA	0.0342710656470344	0.612585483905096	285	116	599	0.599	0.285	0.57
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.00000000000003	1	34.16666666666666	0.0126053387372859	0.0298546878003148	0.422223096808032	-0.0172493490630289	0.0132828777405543	0.0323371641786659	NA	NA	0.0355033760961339	0.627072846149463	251	127	622	0.622	0.251	0.502
ORF3a	all	ss13	139	TTA	CAT	TAC	2	CCATTACTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.00000000000003	1	34.16666666666666	0.0126053387372859	0.0298546878003148	0.422223096808032	-0.0172493490630289	0.0133703734611526	0.0310736920474154	NA	NA	0.0356126118692971	0.628129915298535	262	114	624	0.624	0.262	0.524
ORF3a	all	ss13	140	CTT	TAC	TTC	2	TTACTTCAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.6666666666667	1	35.16666666666666	0.0128208250194751	0.0289891158257094	0.442263403153011	-0.0161682908062344	0.0128413445973339	0.031336528842819	NA	NA	0.0326454762354942	0.620410284061514	287	120	593	0.593	0.287	0.574
ORF3a	all	ss13	141	CAT	TTC	ATG	2	CTTCATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.6666666666667	1	35.16666666666666	0.0128208250194751	0.0289891158257094	0.442263403153011	-0.0161682908062344	0.0135031411042708	0.0308245017390172	NA	NA	0.0352842515546842	0.646787448724318	280	137	583	0.583	0.28	0.56
ORF3a	all	ss13	142	GAT	ATG	ATG	2	CATGATGCC:TATGATGCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.00000000000003	0	36.16666666666665	0.0129313548258795	0	-Inf	0.0129313548258795	0.0131924296219873	0	NA	NA	0.0128318165821907	0.313571064581368	635	365	0	0	0.635	0.001
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ATG	CCA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.6666666666667	0	36.499999999999986	0.0129873375085957	0	-Inf	0.0129873375085957	0.0127590718889092	0	NA	NA	0.0131390280851687	0.32292988126127	643	357	0	0	0.643	0.001
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CCA	ACT	2	GCCAACTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333337	1	36.999999999999986	0.0129592857062641	0.0275260251378209	0.470801201458542	-0.0145667394315568	0.0128620540771704	0.0288359543900891	NA	NA	0.0329856637285803	0.65877275255695	301	113	586	0.586	0.301	0.602
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333337	1	36.999999999999986	0.0129592857062641	0.0275260251378209	0.470801201458542	-0.0145667394315568	0.013560796987351501	0.0287717533558677	NA	NA	0.0334046590946768	0.662786599775567	321	115	564	0.564	0.321	0.642
ORF3a	all	ss13	146	TTT	ACT	TTG	2	TACTTTGTT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.83333333333337	1	36.999999999999986	0.0131294381352109	0.0275260251378209	0.476982712522883	-0.0143965870026101	0.0131607320500721	0.0288447316944887	NA	NA	0.0330318130986173	0.662952785242513	289	132	579	0.579	0.289	0.578
ORF3a	all	ss13	147	GTT	TTG	TTT	2	TTTGTTTGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333337	1	35.99999999999999	0.0130438070339019	0.0283052459871353	0.460826485656769	-0.0152614389532334	0.0137429152187017	0.0302853608167593	NA	NA	0.0321989256078557	0.635518771649713	297	123	580	0.58	0.297	0.594
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TTT	GCT	2	GTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.33333333333336	1	36.999999999999986	0.0132162010123647	0.0275260251378209	0.480134743254504	-0.0143098241254563	0.0131093632221095	0.0307597418070031	NA	NA	0.0330210176717006	0.664756864797754	311	123	566	0.566	0.311	0.622
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC:TGCTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.33333333333336	1	37.16666666666665	0.0132162010123647	0.027400307499342	0.482337689556297	-0.0141841064869773	0.0130227163390457	0.0292219484117638	NA	NA	0.0319310610390726	0.656890539714412	292	143	565	0.565	0.292	0.584
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA:TGGCATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.66666666666669	1	36.499999999999986	0.0131582322381821	0.0279101972553257	0.471448915885799	-0.0147519650171436	0.0130287631978183	0.0293021157784878	NA	NA	0.0330573898609897	0.655414379614219	292	125	583	0.583	0.292	0.584
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT:CATACACAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666669	1	36.33333333333332	0.0132453773639628	0.0280406490537152	0.472363437044187	-0.0147952716897525	0.014058707889325	0.0303779024166726	NA	NA	0.0330500736960516	0.654396940616412	299	116	585	0.585	0.299	0.598
ORF3a	all	ss13	152	CAT	CAC	ATA	2	ACACATAAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.00000000000003	1	35.499999999999986	0.0131007697802931	0.0287116399282627	0.456287756917612	-0.0156108701479696	0.0132648136389639	0.029812010145018	NA	NA	0.0312983469406392	0.617937065151285	275	121	604	0.604	0.275	0.55
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ATA	ACT	2	CATAACTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333336	1	36.499999999999986	0.0133932130500048	0.0279101972553257	0.479868090056196	-0.0145169842053209	0.0138313518479918	0.0288712541084394	NA	NA	0.0322612735898751	0.652723603035109	272	124	604	0.604	0.272	0.544
ORF3a	all	ss13	154	TAT	ACT	ATG	2	AACTATGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000003	1	36.16666666666665	0.0134532755150005	0.0281723261817365	0.477535132463501	-0.014719050666736	0.0131575462226399	0.0297934519284047	NA	NA	0.0338521094948748	0.663704314187745	288	121	591	0.591	0.288	0.576
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ATG	ACT	2	TATGACTAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.6666666666667	1	36.16666666666665	0.013333684515963	0.0281723261817365	0.473290151120248	-0.0148386416657735	0.0136251843992532	0.0293357290304515	NA	NA	0.0343862337023412	0.666084096077119	291	130	579	0.579	0.291	0.582
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000003	1	36.16666666666665	0.0134532755150005	0.0281723261817365	0.477535132463501	-0.014719050666736	0.0131159959289731	0.0304581441982171	NA	NA	0.0340063768453809	0.665136769159111	283	127	590	0.59	0.283	0.566
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000003	1	36.16666666666665	0.0134532755150005	0.0281723261817365	0.477535132463501	-0.014719050666736	0.0135844345717422	0.0299775524457656	NA	NA	0.0329387842039313	0.654975586264964	280	145	575	0.575	0.28	0.56
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333336	1	35.833333333333314	0.0134835092215562	0.0284394261467203	0.474113266280206	-0.0149559169251641	0.0136776680243112	0.0302010264323231	NA	NA	0.0335951396220958	0.656188976226249	279	123	598	0.598	0.279	0.558
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.50000000000003	1	35.833333333333314	0.0135443861537981	0.0284394261467203	0.47625384858056	-0.0148950399929221	0.0142902702369419	0.0314295834469948	NA	NA	0.0333480648926355	0.655125042339943	307	119	574	0.574	0.307	0.614
ORF3a	all	ss13	160	TAT	CAT	ATA	2	CCATATAAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.1666666666667	1	35.833333333333314	0.013423177093157	0.0284394261467203	0.471991840619646	-0.0150162490535633	0.01377384178834	0.0291433109149771	NA	NA	0.0322451204869573	0.641436991802196	315	130	555	0.555	0.315	0.63
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ATA	ACA	2	TATAACAGT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.1666666666667	1	35.833333333333314	0.013423177093157	0.0284394261467203	0.471991840619646	-0.0150162490535633	0.0131614027547271	0.02975118668593	NA	NA	0.0338286596770933	0.657121146389017	286	118	596	0.596	0.286	0.572
ORF3a	all	ss13	162	AGT	ACA	GTG	2	AACAGTGTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333337	1	35.499999999999986	0.0134835092215562	0.0287116399282627	0.469618219483296	-0.0152281307067065	0.0133826864741764	0.0308313571421296	NA	NA	0.0349694360630798	0.663221509628756	282	119	599	0.599	0.282	0.564
ORF3a	all	ss13	163	GTC	GTG	TCA	2	AGTGTCACA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.1666666666667	1	35.499999999999986	0.0136058153029875	0.0287116399282627	0.473878027760945	-0.0151058246252752	0.0141484701081066	0.0304991296251496	NA	NA	0.0327912966151131	0.645038488684419	305	137	558	0.558	0.305	0.61
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TCA	CAG	2	GTCACAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333337	1	35.499999999999986	0.0134835092215562	0.0287116399282627	0.469618219483296	-0.0152281307067065	0.0141521308385432	0.0306611144573738	NA	NA	0.034292546938716	0.656995361462936	288	134	578	0.578	0.288	0.576
ORF3a	all	ss13	165	GAT	CAG	ATA	2	ACAGATACA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.1666666666667	1	35.16666666666665	0.013423177093157	0.0289891158257094	0.463041962847741	-0.0155659387325524	0.0136167961071835	0.0306605635494373	NA	NA	0.0332069341571203	0.63924428836889	291	124	585	0.585	0.291	0.582
ORF3a	all	ss13	166	ACA	ATA	CAA	2	GATACAATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000004	1	35.333333333333314	0.0134532755150005	0.028849710620847	0.466322719551961	-0.0153964351058466	0.0139820783210397	0.0306628473489147	NA	NA	0.0328705661723581	0.639501571704115	263	142	595	0.595	0.263	0.526
ORF3a	all	ss13	167	ATT	CAA	TTG	2	ACAATTGTC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000004	1	35.333333333333314	0.0134532755150005	0.028849710620847	0.466322719551961	-0.0153964351058466	0.0138662250056099	0.0319473698819861	NA	NA	0.0349525120304373	0.659578046156315	271	127	602	0.602	0.271	0.542
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TTG	TCG	2	ATTGTCGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.16666666666671	1	35.66666666666665	0.0136058153029875	0.0285748846742028	0.476145939279005	-0.0149690693712153	0.0141436747383563	0.0296966532712721	NA	NA	0.0328041146498034	0.648162168438286	280	139	581	0.581	0.28	0.56
ORF3a	all	ss13	169	GTT	TCG	TTA	2	GTCGTTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666671	1	35.333333333333314	0.013423177093157	0.028849710620847	0.465279436233142	-0.01542653352769	0.0137243280692021	0.0303016408872314	NA	NA	0.0348972511900099	0.658448802191559	284	135	581	0.581	0.284	0.568
ORF3a	all	ss13	170	ACT	TTA	CTG	2	GTTACTGAA:GTTACTGCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333337	1	34.66666666666665	0.0133041182530361	0.029415534864961	0.452282044644501	-0.0161114166119248	0.0133823651049762	0.0306906122091251	NA	NA	0.033558051443582	0.631152132961614	285	120	595	0.595	0.285	0.57
ORF3a	all	ss13	171	GAA	CTG	AAG	2	ACTGAAGGT:ACTGCAGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333337	1	34.66666666666665	0.0133041182530361	0.029415534864961	0.452282044644501	-0.0161114166119248	0.0138042586700073	0.0317980756184105	NA	NA	0.0348034619450941	0.643417632981175	276	129	595	0.595	0.276	0.552
ORF3a	all	ss13	172	GGT	AAG	GTG	2	GAAGGTGAC:GCAGGTGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000004	1	34.66666666666665	0	0.029415534864961	0	-0.029415534864961	0	0.0309718044327457	NA	NA	0.0311389541305973	0.344835593092574	0	363	637	0.637	0	0.001
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.1666666666667	1	34.66666666666665	0	0.029415534864961	0	-0.029415534864961	0	0.0325232693358205	NA	NA	0.0308066335403663	0.339656499585203	0	373	627	0.627	0	0.001
ORF3a	all	ss13	174	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.1666666666667	1	34.999999999999986	0	0.0291298749871979	0	-0.0291298749871979	0	0.0297141553917401	NA	NA	0.0310643433313913	0.348384699671061	0	352	648	0.648	0	0.001
ORF3a	all	ss13	175	ATT	GCA	TTT	2	GGCATTTCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.1666666666667	1	34.999999999999986	0	0.0291298749871979	0	-0.0291298749871979	0	0.0298249867038309	NA	NA	0.0310937147006343	0.348840215937683	0	368	632	0.632	0	0.001
ORF3a	all	ss13	176	TCA	TTT	CAA	2	ATTTCAACA	2	FALSE	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000004	1	35.333333333333314	0	0.028849710620847	0	-0.028849710620847	0	0.0316776732063256	NA	NA	0.0296070600140382	0.32984805640584	0	382	618	0.618	0	0.001
ORF3a	all	ss13	177	ACA	CAA	CAC	2	TCAACACCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.50000000000004	1	35.49999999999998	0	0.0287116399282627	0	-0.0287116399282627	0	0.029392725931784	NA	NA	0.0301013385286828	0.340168352269452	0	354	646	0.646	0	0.001
ORF3a	all	ss13	178	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.1666666666667	1	35.49999999999998	0	0.0287116399282627	0	-0.0287116399282627	0	0.0302296548376214	NA	NA	0.0301020397141756	0.340179600753522	0	367	633	0.633	0	0.001
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.1666666666667	1	35.49999999999998	0	0.0287116399282627	0	-0.0287116399282627	0	0.0301417802352431	NA	NA	0.0298109773267729	0.335485766850159	0	360	640	0.64	0	0.001
ORF3a	all	ss13	180	CTC	AAC	TCA	2	AAACTCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000003	1	35.99999999999998	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.029950363892892	NA	NA	0.0312884033929319	0.365647588078714	0	367	633	0.633	0	0.001
ORF3a	all	ss13	181	AAA	TCA	AAG	2	CTCAAAGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.66666666666669	1	35.99999999999998	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.0304344526764827	NA	NA	0.0287589799610938	0.325005940063881	0	367	633	0.633	0	0.001
ORF3a	all	ss13	182	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000003	1	35.99999999999998	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.0292834576625325	NA	NA	0.0315319256552382	0.369361807458767	0	349	651	0.651	0	0.001
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	GAAGACTAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666669	1	36.49999999999998	0	0.0279101972553257	0	-0.0279101972553257	0	0.0282164828139494	NA	NA	0.0299224140592069	0.350947931268902	0	342	658	0.658	0	0.001
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000001	1	37.49999999999998	0	0.0271522864979704	0	-0.0271522864979704	0	0.0284843698225056	NA	NA	0.0301628026418846	0.368018561503343	0	362	638	0.638	0	0.001
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333334	1	36.83333333333331	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0309735297647702	NA	NA	0.0279372833553805	0.322261756617132	0	376	624	0.624	0	0.001
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333334	1	36.83333333333331	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0283761888592709	NA	NA	0.0300251697651074	0.357055287076579	0	353	647	0.647	0	0.001
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333334	1	36.83333333333331	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0285345055019678	NA	NA	0.0296617732876044	0.351194909070683	0	359	641	0.641	0	0.001
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.00000000000001	1	37.16666666666664	0	0.027400307499342	0	-0.027400307499342	0	0.028527907695141	NA	NA	0.0297493164111823	0.35702959441775	0	378	622	0.622	0	0.001
ORF3a	all	ss13	189	TAT	GTT	ATT	2	GGTTATTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666667	1	36.66666666666664	0	0.0277809537602618	0	-0.0277809537602618	0	0.0289143090450712	NA	NA	0.0293485526738417	0.34384935196379	0	365	635	0.635	0	0.001
ORF3a	all	ss13	190	TCT	ATT	CTG	2	TATTCTGAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.50000000000001	1	35.99999999999998	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.030395402289339	NA	NA	0.0302736011551596	0.349798021324223	0	354	646	0.646	0	0.001
ORF3a	all	ss13	191	GAG	CTG	AGG	2	TCTGAGGAT	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000001	1	36.99999999999998	0	0.027526025137821	0	-0.027526025137821	0	0.0302670054224922	NA	NA	0.0288171963043071	0.339479386635945	0	349	651	0.651	0	0.001
ORF3a	all	ss13	192	GAT	AGG	ATA	2	GAGGATAGG:GAGGATTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666667	1	35.66666666666665	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0297616828708315	NA	NA	0.0311817957206286	0.359459034089393	0	362	638	0.638	0	0.001
ORF3a	all	ss13	193	AGG	ATA	GGC	2	GATAGGCAC:GATTGGCAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.166666666666667	0.5	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333334	1	36.833333333333314	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0310136189576531	NA	NA	0.0277997378156664	0.31987339795804	0	331	669	0.669	0	0.001
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	ACT	2	AGGCACTCA:TGGCACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.83333333333334	0	37.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	195	TCA	ACT	CAG	2	CACTCAGGT	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666667	0	36.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	196	GGT	CAG	GTG	2	TCAGGTGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333334	0	35.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	197	GTT	GTG	TTA	2	GGTGTTAAA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666667	0	35.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC:GTTAAAGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666669	0	34.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT:AAAGATTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000001	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATG	2	GACTATGTC:GATTATGTC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333336	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	201	GTC	ATG	TCG	2	TATGTCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333336	0	35.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	202	GTT	TCG	TTG	2	GTCGTTGTA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333336	0	36.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	203	GTA	TTG	TAC	2	GTTGTACAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666669	0	36.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	204	CAT	TAC	ATG	2	GTACATGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000001	0	36.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	205	GGC	ATG	GCT	2	CATGGCTAT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333334	0	36.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	206	TAT	GCT	ATT	2	GGCTATTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666667	0	37.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ATT	TCA	2	TATTTCACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.5	1	36.83333333333332	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0280009604275602	NA	NA	0.0291732925118571	0.343188429852213	0	378	622	0.622	0	0.001
ORF3a	all	ss13	208	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333334	1	37.16666666666666	0	0.027400307499342	0	-0.027400307499342	0	0.0296076858516363	NA	NA	0.028489196100612	0.33616068252418	0	365	635	0.635	0	0.001
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CCG	AAG	2	ACCGAAGTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666667	1	36.83333333333332	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0300077628169933	NA	NA	0.0302000305944813	0.359846261345193	0	356	644	0.644	0	0.001
ORF3a	all	ss13	210	GTT	AAG	TTT	2	GAAGTTTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666667	1	36.16666666666666	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.0295088724786112	NA	NA	0.0305499350697236	0.356438328660713	0	363	637	0.637	0	0.001
ORF3a	all	ss13	211	TAC	TTT	ACT	2	GTTTACTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666667	1	36.16666666666666	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.0288022936998262	NA	NA	0.0300868063133271	0.349083687555236	0	374	626	0.626	0	0.001
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666667	1	35.83333333333332	0	0.0284394261467203	0	-0.0284394261467203	0	0.0285068938119361	NA	NA	0.0294152351904433	0.333630821132289	0	377	623	0.623	0	0.001
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.5	1	35.499999999999986	0	0.0287116399282627	0	-0.0287116399282627	0	0.0289627191100565	NA	NA	0.0298420131126169	0.33598861726386	0	366	634	0.634	0	0.001
ORF3a	all	ss13	214	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333333	1	34.83333333333332	0	0.0292720079293014	0	-0.0292720079293014	0	0.029706817209953	NA	NA	0.0323597817673567	0.365687991460049	0	365	635	0.635	0	0.001
ORF3a	all	ss13	215	GAG	TTG	AGT	2	CTTGAGTCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666667	1	34.499999999999986	0	0.0295604764056576	0	-0.0295604764056576	0	0.0296024205630486	NA	NA	0.0330543362861624	0.371161667551263	0	378	622	0.622	0	0.001
ORF3a	all	ss13	216	TCT	AGT	CTA	2	GAGTCTACA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.66666666666667	1	33.999999999999986	0	0.0300040009602743	0	-0.0300040009602743	0	0.0317907920700334	NA	NA	0.0308391755227841	0.330593864877406	0	342	658	0.658	0	0.001
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CTA	CAC	2	TCTACACAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.00000000000001	1	33.33333333333332	0	0.0306164958901914	0	-0.0306164958901914	0	0.0328611898263599	NA	NA	0.0329925905660473	0.353417445836529	0	369	631	0.631	0	0.001
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.16666666666669	1	33.16666666666666	0	0.0307735475083969	0	-0.0307735475083969	0	0.0315943580165929	NA	NA	0.031450223889615	0.327834896597753	0	353	647	0.647	0	0.001
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TTA	2	CAAATTACT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000001	1	34.66666666666666	0	0.029415534864961	0	-0.029415534864961	0	0.0308283998516665	NA	NA	0.0310788166968807	0.343902892703317	0	383	617	0.617	0	0.001
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TTA	CTA	2	ATTACTACA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666669	1	35.499999999999986	0	0.0287116399282627	0	-0.0287116399282627	0	0.028963465380525	NA	NA	0.0309936808085517	0.354253329590108	0	368	632	0.632	0	0.001
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CTA	CAG	2	ACTACAGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000003	1	36.16666666666665	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.0284117412451803	NA	NA	0.0279189108180849	0.31293778632889	0	369	631	0.631	0	0.001
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666669	1	36.49999999999998	0	0.0279101972553257	0	-0.0279101972553257	0	0.029125185530417	NA	NA	0.0282187822656438	0.3226315593952	0	381	619	0.619	0	0.001
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000003	1	37.16666666666665	0	0.027400307499342	0	-0.027400307499342	0	0.0293947502874684	NA	NA	0.0276204366556596	0.321182790159725	0	385	615	0.615	0	0.001
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333336	1	36.833333333333314	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0282809728590902	NA	NA	0.0298156775249015	0.353686818137957	0	366	634	0.634	0	0.001
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	TTG	2	GGTATTGAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333336	1	36.333333333333314	0	0.0280406490537152	0	-0.0280406490537152	0	0.0291582872758503	NA	NA	0.0310983252174861	0.367228398012671	0	368	632	0.632	0	0.001
ORF3a	all	ss13	226	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333336	1	35.66666666666666	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0306987010036613	NA	NA	0.0294275814952013	0.331536381874615	0	357	643	0.643	0	0.001
ORF3a	all	ss13	227	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	GCT	ATG	CTA	2	AATGCTACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CTA	CAT	2	GCTACATTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TTT	TCT	TTA	2	ATCTTTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	TTA	ACA	2	TTTAACAAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	CTT	AGC	TTG	2	AAGCTTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	CCA	ACC	CA-	0	GACCCA---	2	FALSE	0	0	2	1	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	NA	NA	0	CCA---CCG	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	CGA	0	---CCGAAT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	CGA	ATG	2	CCGAATGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTG	ATG	TGC	2	AATGTGCAA	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TGC	AAA	2	GTGCAAATA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCT	GCT	CTT	2	GGCTCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CTT	CAG	2	TCTTCAGGA	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT:GTTGTAAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAT	CTA	ATC	2	GCTAATCCA:GTAAATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	CCA	ATC	CAG	2	AATCCAGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	GCA	CAG	CAA	2	CCAGCAATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	ATG	CAA	TGG	2	GCAATGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	GAT	TGG	ATC	2	ATGGATCCA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATT	CAA	TTT	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGAG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAG	ATG	AGC	2	GATGAGCCG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCG	AGC	CGA	2	GAGCCGACG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CGA	CGA	2	CCGACGACG:CCGACGATG	1:1	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT:ACGATGACT	1:1	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT:ATGACTACT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	TTG	CTT	TGT	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.25000000000001	7	32.83333333333332	0.100750036200046	0.250832878769865	0.401662001784392	-0.150082842569819	0.0375959826008535	0.113774293788784	NaN	NaN	0.112914333815674	0.18379043693269	39	0	961	0.961	0.039	0.078
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.58333333333334	8	33.16666666666665	0.101727620280473	0.291022534714547	0.349552382190106	-0.189294914434074	0.0376931940948706	0.129995365331707	NaN	NaN	0.133683649293233	0.156777985815336	38	0	962	0.962	0.038	0.076
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.91666666666667	8	33.499999999999986	0.102724391304868	0.287492986673213	0.357310946933229	-0.184768595368345	0.0382088349865849	0.137784332710328	0.25270299237455	0.157374781640565	0.139421305061415	0.185087031802922	37	0	963	0.963	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA:TTTATGAGC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.08333333333334	8	33.33333333333332	0.102473368909235	0.289246860608989	0.354276512088964	-0.186773491699753	0.0385448748552949	0.138458583585106	0.319640454354786	0.267706618240926	0.131508179217173	0.155537124529072	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATTT:ATGAGCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.41666666666667	8	33.999999999999986	0.101974992322902	0.282358178426184	0.361154732231567	-0.180383186103283	0.0364461813939493	0.123668504947076	0.290059656832857	0.213093152386546	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	7	ATT	GAT	TTT	2	AGATTTTTT:AGCATTTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.08333333333333	8	34.33333333333332	0.0857055104092924	0.27903683339124	0.307147659926042	-0.193331322981948	0.0338914954281983	0.121784292899488	NaN	NaN	0.122012547332994	0.113075431260769	17	0	983	0.983	0.017	0.034
ORF3a	all	ss13	8	TTC	TTT	TCA	2	ATTTTCACA:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666667	8	33.91666666666666	0.0701445435081176	0.283201052715922	0.247684614288773	-0.213056509207804	0.0310122219762007	0.131552208418491	0.16465953889789	0.132524037707463	0.12202389700467	0.0808069859487857	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	9	ACA	TCA	CAT	2	TTCACATTG:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.5	8	33.749999999999986	0.069333399391501	0.284902170689401	0.243358621044302	-0.2155687712979	0.029689241052564	0.126318759399268	0.168882678439121	0.149586888578536	0.136290123894316	0.113720280886776	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	10	CTT	CAT	TGG	2	ACATTGGGA:ACTCTTAGA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.5	0.666666666666667	0.166666666666667	1	0	0	1	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75	8	34.24999999999999	0.069817817299509	0.279859737639748	0.249474318415115	-0.210041920340239	0.0305272867022466	0.12086371899174	0.211906413616914	0.239081628296954	0.121594046263635	0.0840953121682145	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TGG	GAG	2	CTTAGATCA:TTGGGAGCA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.916666666666667	0.25	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.16666666666667	9	34.74999999999999	0.0559700169039056	0.317710819960381	0.176166543244845	-0.261740803056476	0.0275613853549237	0.136960435525625	0.139457056729258	0.206506005048305	0.132544419125475	0.048297629566357	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	12	GCA	GAG	CAA	2	AGATCAATT:GGAGCAATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74	8	35.49999999999999	0.0561009098120238	0.268009394822974	0.20932441509776	-0.211908485010951	0.028765362519075	0.115667256940981	0.15365329199113	0.173098022321172	0.11445088131688	0.0640942914002501	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	13	ATC	CAA	TCA	2	GCAATCACG:TCAATTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73	9	35.49999999999999	0.0422647024133488	0.309399206498443	0.13660249129812	-0.267134504085094	0.0239162841017245	0.130505834350209	0.0976097546894799	0.161670344926916	0.127323834351651	0.0358988325336282	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	14	ACG	TCA	CGC	2	ATCACGCGC:ATTACTGCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.66666666666667	9	35.33333333333333	0.042464170499631	0.311207889047031	0.136449530986066	-0.2687437185474	0.0255298482636277	0.131151277177832	NA	NA	0.121816531386712	0.0273745458291932	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	15	CGC	CGC	CAC	2	ACGCGCAAT:ACTGCACAG	1:1	TRUE	1	1	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.16666666666667	9	34.83333333333333	0.0421656696333547	0.316764994602515	0.133113413261669	-0.27459932496916	0.0246507393995783	0.133463654995004	NaN	NaN	0.125961305557832	0.0292552966861795	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	16	AAT	CAC	AGC	2	CGCAATCCA:GCACAGCCA	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	1	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.16666666666667	8	34.83333333333333	0.02784542552167	0.274200382158177	0.101551373862079	-0.246354956636507	0.0195779632058	0.130031093813207	NaN	NaN	0.121765541730105	0.0430534520287364	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	17	CCA	AGC	CAG	2	AATCCAGCG:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73	8	34.99999999999999	0.0138252762666285	0.272625681756849	0.0507115697154279	-0.258800405490221	0.0137231856838516	0.118840098605752	0.0690299726843627	0.462564148449215	0.126962045047938	0.041509180615373	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	18	GCG	CAG	CGA	2	CCAGCGAAA:CCAGTAAAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.66666666666667	8	34.74999999999999	0.0276529018562458	0.274994650264777	0.100557962962626	-0.247341748408531	0.0192648858405986	0.120129743021474	0.110449165009666	0.362587526879413	0.127789627408972	0.0529242444768514	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	19	AAA	CGA	AAA	2	GCGAAAATT:GTAAAAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.33333333333333	8	34.33333333333333	0.027400307499342	0.27903683339124	0.0981960236802276	-0.251636525891898	0.0184804311252301	0.119810390990532	0.108925770470185	0.367325258272396	0.124557004469126	0.0433572645174354	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	20	ATT	AAA	TTG	2	AAAATTGAA:AAAATTGAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75	8	33.99999999999999	0.0271522864979704	0.282358178426184	0.0961625643334031	-0.255205891928214	0.0190649727393229	0.119739233667142	NaN	NaN	0.129972493098439	0.0495837267698471	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	21	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT:ATTGACAAT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.83333333333333	8	34.33333333333333	0.0272138698048234	0.27903683339124	0.0975278764243519	-0.251822963586417	0.0191518177137365	0.119249466140928	0.121771744058201	0.423185324735806	0.120781612165398	0.0370743344638073	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	22	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.25	8	34.08333333333333	0.0135904058348962	0.281520365031792	0.0482750362779667	-0.267929959196896	0.0136875098934912	0.128595781972835	NaN	NaN	0.128455867448449	0.036999063846339	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTT	2	AATGCTTCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.25	8	34.41666666666666	0.0137776549513118	0.278218809519287	0.0495209327331863	-0.264441154567975	0.0130353167925671	0.127900952902742	0.0812471121056719	0.542186402139172	0.122080722388175	0.030302230914729	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	24	TCT	CTT	CTC	2	GCTTCTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.58333333333333	9	35.24999999999999	0.0139053809368069	0.312120297918684	0.0445513509679836	-0.298214916981877	0.0143234070371161	0.126092997179683	0.0577711979344072	0.440606827568428	0.132351520880226	0.0242463175435303	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.91666666666666	9	34.91666666666666	0.0138412232800193	0.315824866691675	0.0438256285042045	-0.301983643411656	0.0138613425247253	0.136184061586702	NA	NA	0.138932661863194	0.0297353996501115	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.25	9	34.25	0.0135904058348962	0.323508417071989	0.0420094350493266	-0.309918011237093	0.0136251211587275	0.142925406574062	0.0687895131342102	0.541401292246811	0.135101780226938	0.0217928255977413	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	27	AGT	CAA	GTA	2	GCAAGTACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.91666666666667	9	33.58333333333333	0.0134683754007452	0.331581375185359	0.0406186125297785	-0.318112999784614	0.0136697071000707	0.142820188663436	0.0569498323417863	0.475700364101606	0.140258441462924	0.0233262281701009	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	28	ACT	GTA	CTG	2	AGTACTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.91666666666667	10	34.25	0.0136522540928075	0.369855206523338	0.0369124291128399	-0.356202952430531	0.0134814305269801	0.15616682757097	0.053794364759992	0.492601812756177	0.144046074441128	0.0134043990104684	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	29	GTT	CTG	TTC	2	ACTGTTCAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666667	10	33.416666666666664	0.0133782811395161	0.381873370361936	0.0350332916035395	-0.36849508922242	0.0138534385157613	0.158219268273193	0.0408192577653109	0.390752219163925	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	GTTCATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.91666666666667	11	32.916666666666664	0.0132893842388272	0.442360526313466	0.0300419758281282	-0.429071142074638	0.0131719269498567	0.206208318548197	0.0435943921291162	0.490744748077329	0.186863564708424	0.0216659702344408	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA:CATGCTACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.08333333333334	12	33.25	0.0134382094503063	0.492181967718371	0.0273033356191459	-0.478743758268064	0.0140527313914649	0.234116377720867	0.0353465393818578	0.439849603525726	0.185913832962253	0.0100215711252385	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25	12	33.583333333333336	0.0134081783305544	0.485308821352962	0.0276281364372784	-0.471900643022408	0.0135507224477712	0.201034039412365	NA	NA	0.207021881461626	0.0226390051222513	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.08333333333334	12	33.416666666666664	0.0132600139021293	0.488720381506319	0.0271321074461017	-0.475460367604189	0.0134858996669149	0.224468989736847	0.0344476513401684	0.430911398057492	0.215583722606374	0.0274221273747252	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	34	ACG	CAA	CGA	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666667	13	33.25	0.0264636052740321	0.552515991632425	0.047896541774012	-0.526052386358393	0.0190291451641463	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CGA	TAC	2	ACGATACCA:ACGATACCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77	13	32.416666666666664	0.0264344542962561	0.573811734264465	0.046068166120968	-0.547377279968209	0.0192883315464101	NA	NA	NA	0.247874131986283	0.0272242570435297	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	36	CCA	TAC	CAC	2	ATACCACTA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666667	13	31.416666666666664	0.0263763446044989	0.601759854393703	0.0438320110786954	-0.575383509789204	0.0186658873654122	NA	0.038075919791859	0.249660635653682	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	37	CTA	CAC	TAC	2	CCACTACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666667	13	30.666666666666664	0.0262035385209603	0.624681842201328	0.0419470148653932	-0.598478303680368	0.018476143635415	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	CTACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333334	13	31.333333333333332	0.0261464386246643	0.604218872989977	0.0432731246796026	-0.578072434365312	0.0184711990900236	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCA	2	CAAGCCACA:CAAGCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.5	13	32	0.0262608883838265	0.585118918162181	0.0448812840752273	-0.558858029778355	0.018869644039161	0.258566033213502	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	40	ACA	CCA	CAC	2	GCCACATTC:GCCTCACTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.5	13	32	0.0262608883838265	0.585118918162181	0.0448812840752273	-0.558858029778355	0.0180917633076508	NA	0.0367863324096028	0.222444692674414	NaN	NaN	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	41	CTC	CAC	TCC	2	ACATTCCCT:TCACTCCCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666667	12	31.666666666666668	0.026032982222434	0.527796967417862	0.0493238571449075	-0.501763985195428	0.0178386596951683	0.237910177203225	0.0410321177718779	0.22933282690584	0.259527073357035	0.053189625116423	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TCC	CTT	2	CTCCCTTTC:TTCCCTTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.5	11	32	0.0262608883838265	0.459828354664807	0.057110198006318	-0.43356746628098	0.0188108355859807	0.20157566895244	0.0504749803025644	0.257863390376242	0.212109093005887	0.0409458721045747	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666667	11	31.833333333333332	0.0262035385209603	0.463158329862746	0.0565757686550205	-0.436954791341785	0.0176954788741572	0.194294551598012	0.0456577471848142	0.215298296218638	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	44	GGA	TCG	GAT	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.5	11	31.166666666666668	0.0259205062991005	0.476991575039997	0.0543416438685043	-0.451071068740897	0.0188948750039823	0.203980910645168	0.0516459431284368	0.292709731199464	0.228991161794107	0.0488591545757766	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	GGATGGCTT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666667	11	31	0.025864632053377	0.480584396281972	0.0538191257424877	-0.454719764228595	0.0174500792273146	0.205634979500091	0.0404950546243293	0.183838208632872	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTA	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78	11	30.666666666666668	0.0260895870640617	0.487940674605862	0.053468768688193	-0.4618510875418	0.0181962691165387	0.21710873470263	0.0463923031147513	0.249101157680016	0.200441700323852	0.0212132887307581	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	47	ATT	TTA	TTA	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666667	11	30.250000000000004	0.0259485340559256	0.497470663057698	0.0521609332627441	-0.471522129001772	0.0174876507096332	0.21892285405526	0.0498108843947258	0.295016833019315	0.222044553744529	0.0337080101050398	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000001	10	29.750000000000004	0.0392246245521367	0.445899039781238	0.0879675017272534	-0.406674415229101	0.0221386798669262	0.18392077768099999	0.0634993043794653	0.165951534466853	0.190294256875316	0.0325913294845969	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333334	9	30.416666666666668	0.0397005575048303	0.376300989048554	0.105502134355825	-0.336600431543724	0.0226148726720172	0.16555340687078	0.0886680995774933	0.234103597465329	0.170938646808626	0.0489381552634039	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666667	9	31.083333333333332	0.0400540111089283	0.365892312067182	0.10946939792923	-0.325838300958254	0.0223636393363068	0.161359301987302	0.103008388482795	0.287907524386578	0.154525394300213	0.0349757381578985	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAC	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.83333333333334	9	30.41666666666667	0.0532374199351599	0.376300989048554	0.141475631168991	-0.323063569113394	0.0261357871281039	0.163655981644427	0.11315114126366	0.211181073927424	0.160435315910881	0.0440443315274208	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	52	CTT	CAC	TTC	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.16666666666667	9	31.08333333333334	0.0530021800130169	0.365892312067182	0.144857320760774	-0.312890132054165	0.0261572486118093	0.159514563690553	0.139237201093972	0.298170989619455	0.1659314592581	0.05934093544616	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TTC	TTG	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.66666666666667	8	30.91666666666667	0.0526531940049364	0.317355464450165	0.165912359808144	-0.264702270445229	0.0262204305686099	0.136621790196176	0.128604160391984	0.197015582250046	0.135477138185957	0.0507187286273845	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.00000000000001	8	30.58333333333334	0.0524230797130337	0.321673722092295	0.162969730234888	-0.269250642379261	0.0252307040805565	0.138330954676391	0.140733929974939	0.246864502328607	0.147989273212863	0.0688514994407452	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.83333333333336	8	30.41666666666667	0.0518565020980098	0.32387790933552	0.160111266015026	-0.27202140723751	0.0252191536574666	0.13491608143909	0.130432173977344	0.219618098548164	0.140131357358336	0.0522353934034399	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.16666666666669	8	29.750000000000004	0.0509750280987295	0.33301033366905	0.153073412278519	-0.28203530557032	0.0250921488289679	0.146802643531092	0.154831458460051	0.322836655524725	0.151073108505502	0.0619184021645362	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	57	CAA	TTC	AAA	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333336	8	29.750000000000004	0.0511925740908369	0.33301033366905	0.153726683273777	-0.281817759578213	0.0259759554244518	0.142113343393186	0.125235991066268	0.219636208760742	0.151700764894696	0.0632085858245588	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	58	AGC	AAA	GCG	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.91666666666669	8	30.000000000000004	0.0518005174564371	0.329524994837884	0.157197536660068	-0.277724477381447	0.026072542308859	0.149223291349447	0.128876535019924	0.222558533799163	0.142426538117988	0.0511822048643749	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	59	GCT	GCG	CTA	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.75000000000001	9	30.66666666666667	0.0525954761681725	0.372327664735418	0.141261262994109	-0.319732188567246	0.0255286363684064	0.159199491176551	0.0987755798638922	0.152681620143223	0.166728556739582	0.055151469958295	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAAA:GCTTCTAAA	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.91666666666669	9	30.5	0.0524804194365887	0.374966963646815	0.139960115222365	-0.322486544210226	0.0259625437247505	0.156821702561482	0.103407726096895	0.175902872058984	0.157315723794508	0.040371062086917	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CCA	AAA	2	ACCAAAATA:TCTAAAGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.08333333333336	8	29.333333333333332	0.0516889101836223	0.338988842807293	0.152479679730953	-0.287299932623671	0.0250624162512207	0.154129663618281	0.121952528296084	0.211182691610125	0.14715173639325	0.0508900216006543	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATT:AAAGTAATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.41666666666669	8	28.999999999999996	0.0528271104098974	0.343931200066585	0.153597900974585	-0.291104089656687	0.0262902857671972	0.14706425868726	0.144323319424651	0.287209787529146	0.1534759048215	0.0578620879182527	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	63	ATT	TAA	TTG	2	ATAATTGCG:GTAATTGCG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.08333333333334	7	28.666666666666664	0.0523658652014987	0.295428214280316	0.177254110035041	-0.243062349078818	0.0263945658438836	0.129547753428221	NaN	NaN	0.136108623786699	0.074132159972237	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	64	GCG	TTG	CGC	2	ATTGCGCTC:ATTGCGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.25	7	29	0.0522518101768581	0.291278006061648	0.17938810720161	-0.23902619588479	0.0266043872780222	0.14139337729251	0.152765301296698	0.240285855447538	0.133598822221646	0.0735932368593959	7	1	992	0.992	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CGC	TCA	2	GCGCTCAAT:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.41666666666667	8	29.333333333333332	0.0521382511052232	0.338988842807293	0.153805212801244	-0.28685059170207	0.0267162497342289	0.149865329518722	0.14511654863574	0.289202063672988	0.144699603395621	0.0474359596656825	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	66	AAT	TCA	ATA	2	CTCAATAAA:CTTCATAGA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.08333333333334	8	28.666666666666664	0.0516889101836223	0.349022437266925	0.148096238707117	-0.297333527083303	0.0250299824558652	0.152282259100758	0.160342863165763	0.35568301660951	0.151639562006219	0.0499033786126784	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	67	AAA	ATA	AAA	2	AATAAAAGA:CATAGAAGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.25	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.75	7	28	0.0512472511431301	0.304098831081123	0.168521697242102	-0.252851579937993	0.0259468965380173	0.140849944652441	NaN	NaN	0.130002662419972	0.0517783098402923	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	68	AGA	AAA	GAT	2	AAAAGATGG:AGAAGGTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.58333333333334	7	28.25	0.0647651348577861	0.300787567424286	0.215318523343186	-0.2360224325665	0.0357565983463346	0.141109056494466	NaN	NaN	0.134586317125817	0.0794839532235841	10	0	990	0.99	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	69	TGG	GAT	GGC	2	AGATGGCAG:AGGTGGCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.08333333333334	8	28.5	0.0651875872755847	0.351626041530565	0.185388963206009	-0.286438454254981	0.0341983235644641	0.147077224873007	NaN	NaN	0.153148228003305	0.0614373454273544	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	70	CAG	GGC	AGC	2	TGGCAGCTA:TGGCAGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.41666666666667	8	28.833333333333332	0.0796327387923167	0.346457784201476	0.22984831752548401	-0.26682504540916	0.0361552561944754	0.155231382468026	0.203436528120486	0.258548641407438	0.163671006465881	0.103048170645378	20	0	980	0.98	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	71	CTA	AGC	TAG	2	CAGCTAGCC:CAGCTCGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.08333333333334	9	28.833333333333332	0.0941885460903394	0.40362830824239	0.233354658647422	-0.30943976215205	0.0413647943857969	0.179776278223517	0.215096610756218	0.277973473545117	0.179552839777774	0.0848178272013179	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	72	GCC	TAG	CCC	2	CTAGCCCTT:CTCGCCTTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.58333333333334	9	28.999999999999996	0.093558286859156	0.400561864447693	0.233567633774016	-0.307003577588537	0.0393516850645258	0.166978671495586	0.171691682610779	0.173706567688046	0.175837533263958	0.0808196045265244	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	73	CTT	CCC	TAT	2	GCCCTTTAT:GCCTTATAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.25	9	28.499999999999996	0.0927309624185635	0.409907779776052	0.226223963031943	-0.317176817357489	0.039129050661475	0.172298115044297	0.183012596220957	0.216417144743188	0.184978802219765	0.0864065257374866	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	74	TAT	TAT	ATA	2	CTTTATAAG:TTATATAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.25	8	28.333333333333332	0.106966265210453	0.354269507203646	0.301934722112464	-0.247303241993193	0.0425842642496723	0.157533451392679	0.232125191883119	0.193347170580273	0.162498244499793	0.128038513392096	13	0	987	0.987	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	75	AAA	ATA	AAG	2	TATAAAGGC:TATAAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.41666666666667	8	28.166666666666664	0.106728023137133	0.356953773574163	0.298996763834347	-0.25022575043703	0.0435501570208774	0.160576192862757	NaN	NaN	0.150689707359787	0.0968065831599684	24	0	976	0.976	0.024	0.048
ORF3a	all	ss13	76	GGC	AAG	GCG	2	AAAGGCGTT:AAGGGCTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.75000000000001	8	28.166666666666664	0.109159374475305	0.356953773574163	0.305808153762592	-0.247794399098858	0.0418661711486098	0.161117028963423	0.261814757221177	0.242793642782141	0.160611439114477	0.122874669123048	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	77	GTT	GCG	TCC	2	GGCGTTCAA:GGCTTCCAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.75000000000001	8	27.833333333333332	0.109159374475305	0.362448618140339	0.301171997938308	-0.253289243665034	0.0431547713924339	0.163762996441946	0.229119589201756	0.188686367725837	0.166017820653694	0.127090815858137	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	78	CAA	TCC	AAC	2	GTTCAACTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.58333333333336	7	27.166666666666664	0.107929984092779	0.315691024758642	0.341884867253657	-0.207761040665863	0.0438063221307299	0.150969252246762	0.261491447429362	0.191062684804607	0.146381860891221	0.155809052781659	41	0	959	0.959	0.041	0.082
ORF3a	all	ss13	79	CTT	AAC	TCA	2	CAACTTGTA:CAGTTCATT	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.41666666666669	7	27.666666666666664	0.108173637989641	0.308630566923095	0.350495542512468	-0.200456928933454	0.0434844791834305	0.14730307286271	0.337226208961513	0.2986427026541	0.144060463755582	0.164080604322039	46	0	954	0.954	0.046	0.092
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TCA	TAT	2	CTTGTATGT:TTCATTTGC	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.91666666666669	6	27.999999999999996	0.108911256999757	0.25235417746591	0.431580955359732	-0.143442920466153	0.0426067678033878	0.118034573631241	0.41855484935566	0.302483789244272	0.126999181509415	0.258695783831473	98	0	902	0.902	0.098	0.196
ORF3a	all	ss13	81	TGC	TAT	GCA	2	ATTTGCAAT:GTATGTAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.50000000000001	5	27.749999999999996	0.108051673445481	0.206064750939693	0.524357867867969	-0.0980130774942115	0.0430003848953617	0.101161774483111	NaN	NaN	0.106016462153305	0.355221838644458	147	0	853	0.853	0.147	0.294
ORF3a	all	ss13	82	AAT	GCA	ATA	2	TGCAATTTA:TGTAATATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.66666666666669	5	28.083333333333332	0.107808568999606	0.203255134092856	0.530410065560037	-0.0954465650932503	0.0416345018931933	0.107633682096401	NaN	NaN	0.104373610914685	0.36046978802001	170	0	830	0.83	0.17	0.34
ORF3a	all	ss13	83	ATG	ATA	TAC	2	AATATGCTG:AATTTACTG	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.166666666666667	0.5	0.166666666666667	1	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.66666666666669	5	28.083333333333332	0.107808568999606	0.203255134092856	0.530410065560037	-0.0954465650932503	0.0424798216725947	0.101612686561656	NaN	NaN	0.108019368556534	0.376908924391581	154	0	846	0.846	0.154	0.308
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TGC	2	ATGCTGCTG:TTACTGCTG	1:1	FALSE	1.25	1	0	0.75	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.66666666666669	4	27.916666666666664	0.0934540638415831	0.159008783209024	0.587728941480758	-0.065554719367441	0.0395103183235246	0.0887698436747279	NaN	NaN	0.0951771104869596	0.490970788317601	233	1	766	0.766	0.233	0.466
ORF3a	all	ss13	85	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTA:CTGCTGCTT	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.08333333333336	4	28.666666666666664	0.107205575102587	0.154389040653112	0.694385913981173	-0.0471834655505242	0.0427542474240161	0.0843638307055041	NaN	NaN	0.0897116188096273	0.598925738518636	314	0	686	0.686	0.314	0.628
ORF3a	all	ss13	86	CTA	TGC	TAT	2	CTGCTATTT:CTGCTTTTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.25	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.25000000000001	4	28.999999999999996	0.106966265210453	0.152421181209951	0.701780844114525	-0.0454549159994987	0.0430408973304647	0.0800617538290194	NaN	NaN	0.0894635076413097	0.611394912214335	293	0	707	0.707	0.293	0.586
ORF3a	all	ss13	87	TTT	TAT	TTG	2	CTATTTGTT:CTTTTTGTG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.16666666666669	4	29.999999999999996	0.10708578623022	0.146808432844572	0.729425307220555	-0.0397226466143517	0.0439664467259272	0.080945030790787	NaN	NaN	0.0854638890563791	0.642082808201693	321	0	679	0.679	0.321	0.642
ORF3a	all	ss13	88	GTG	TTG	TGA	2	TTTGTGACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.00000000000001	4	29.33333333333333	0.105902482398361	0.150503021596613	0.703656852034553	-0.044600539198252	0.0440254495206743	0.0817098369047426	NaN	NaN	0.0870950033864381	0.608587549493293	296	0	704	0.704	0.296	0.592
ORF3a	all	ss13	89	ACA	TGA	CAA	2	GTGACAATT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.83333333333336	4	29.499999999999996	0.106137042941326	0.149561992614941	0.709652506533424	-0.0434249496736147	0.041683668175829	0.0812780961247416	NaN	NaN	0.0888070059221541	0.624855059793331	305	0	695	0.695	0.305	0.61
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CAA	TCT	2	ACAATTTAC:ACCATCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.50000000000001	4	29.166666666666664	0.105204990412841	0.151456007747705	0.69462408244704	-0.0462510173348637	0.0440689708768497	0.0817822888797737	NaN	NaN	0.0917757052013665	0.614291530878211	328	0	672	0.672	0.328	0.656
ORF3a	all	ss13	91	TAC	TCT	ACT	2	ATCTATTCA:ATTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.83333333333336	4	29.499999999999996	0.106137042941326	0.149561992614941	0.709652506533424	-0.0434249496736147	0.043246239055889	0.0810297721577261	NaN	NaN	0.0892492553674917	0.626571510251644	324	0	676	0.676	0.324	0.648
ORF3a	all	ss13	92	TCA	ACT	CAC	2	TACTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.83333333333336	4	29.499999999999996	0.106137042941326	0.149561992614941	0.709652506533424	-0.0434249496736147	0.0424290969676353	0.0822731207943284	NaN	NaN	0.0905176627714862	0.631412233277352	302	0	698	0.698	0.302	0.604
ORF3a	all	ss13	93	CAC	CAC	ACC	2	TCACACCTT:TCACATCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	82.33333333333336	4	28.666666666666664	0.104062731375236	0.154389040653112	0.674029263573499	-0.0503263092778758	0.0410369718716779	0.0853638614379307	NaN	NaN	0.0929924191620795	0.588378541875109	323	0	677	0.677	0.323	0.646
ORF3a	all	ss13	94	CTT	ACC	TTC	2	CACCTTCTA:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.83333333333336	4	28.499999999999996	0.104745085924422	0.155392217528976	0.674069059506729	-0.0506471316045541	0.0421496816207931	0.0875340071116891	NaN	NaN	0.0914245404326183	0.579594294742993	273	0	727	0.727	0.273	0.546
ORF3a	all	ss13	95	CTA	TTC	TAC	2	CTTCTACTT:CTTTTGCTT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	82.33333333333336	4	28.666666666666664	0.104062731375236	0.154389040653112	0.674029263573499	-0.0503263092778758	0.0422307237256891	0.0809678792368645	NaN	NaN	0.0892428601122437	0.572804951090084	295	0	705	0.705	0.295	0.59
ORF3a	all	ss13	96	CTT	TAC	TTC	2	CTACTTCTA:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1.08333333333333	1	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.33333333333336	4	29.666666666666664	0.105436462965892	0.148632696437812	0.709375968362432	-0.0431962334719195	0.0433143249493172	0.0778483411611279	NaN	NaN	0.0897534129968912	0.630319798799083	349	0	651	0.651	0.349	0.698
ORF3a	all	ss13	97	CTA	TTC	TAG	2	CTTCTAGCT:CTTGTCGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.58333333333336	4	29.916666666666668	0.105089635467852	0.147260274111344	0.713631942504693	-0.0421706386434921	0.0438351800576925	0.080557676181714	NaN	NaN	0.0886281620854426	0.634205943732597	320	0	680	0.68	0.32	0.64
ORF3a	all	ss13	98	GCT	TAG	CTG	2	CTAGCTGCT:GTCGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.58333333333336	4	30.083333333333332	0.0911194993124764	0.146359364647636	0.62257375557655	-0.0552398653351595	0.039594777601187	0.0772725248639407	NaN	NaN	0.0868314572745593	0.524663394096516	263	1	736	0.736	0.263	0.526
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTTGC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.75000000000001	4	29.41666666666667	0.0897547785817448	0.150031026615648	0.59824144782852	-0.0602762480339036	0.0385235569864748	0.081795315444834	NaN	NaN	0.0896797471573918	0.501502362059458	245	0	755	0.755	0.245	0.49
ORF3a	all	ss13	100	GGT	CAG	GCA	2	GCAGGTATG:GCTTGCATG	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	83.75000000000001	4	29.41666666666667	0.0886171797125078	0.150031026615648	0.590659023746658	-0.0614138469031406	0.0396091925499144	0.0813194762826665	NaN	NaN	0.0865997142080439	0.478219506781159	221	1	778	0.778	0.221	0.442
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GCA	TGG	2	GGTATGGAG:TGCATGGAA	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.83333333333336	4	29.750000000000004	0.0752195633615916	0.148172379571929	0.50764902054554	-0.0729528162103373	0.0346734385435084	0.0788609864377555	NaN	NaN	0.084093722583989	0.385658265512306	188	2	810	0.81	0.188	0.376
ORF3a	all	ss13	102	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGCA:ATGGAGGCG	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.83333333333336	4	29.750000000000004	0.0761753537657808	0.148172379571929	0.514099550711489	-0.0719970258061481	0.037591306699302	0.0801664223323963	NaN	NaN	0.084848444926306	0.396139101032845	177	1	822	0.822	0.177	0.354
ORF3a	all	ss13	103	GCA	AAG	CAC	2	GAAGCACAA:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.33333333333336	4	30.250000000000004	0.0902374551086072	0.145469445655623	0.620318959090768	-0.055231990547016	0.0389755250877005	0.0795498131700332	NaN	NaN	0.086656444121035	0.523885572432942	257	0	743	0.743	0.257	0.514
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTC:GCGCAATTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.66666666666669	4	30.583333333333336	0.0898508998594655	0.143721781908901	0.62517245935914	-0.0538708820494353	0.0400125131557799	0.0782998416633621	NaN	NaN	0.0840179299484053	0.521403687616631	278	0	722	0.722	0.278	0.556
ORF3a	all	ss13	105	TTC	AAT	TCT	2	CAATTCTTG:CAATTTTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.50000000000001	4	31.083333333333336	0.0912185711042866	0.141177857059553	0.646125199830793	-0.049959285955266	0.0392371095000606	0.0751918435589677	NaN	NaN	0.0848524126373283	0.556009793450212	266	0	734	0.734	0.266	0.532
ORF3a	all	ss13	106	TTG	TCT	TGT	2	TTCTTGTAC:TTTTTGTAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.83333333333336	4	30.750000000000004	0.0908235725293773	0.142863650574837	0.635736047370573	-0.0520400780454593	0.0396740224397862	0.0746224463177429	NaN	NaN	0.0826212548941439	0.528784170471453	266	2	732	0.732	0.266	0.532
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TGT	ACA	2	TTGTACATC:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.83333333333336	4	31.41666666666667	0.0920189790070996	0.139531497680893	0.659485353031513	-0.0475125186737935	0.0401901867230579	0.0736456764935231	NaN	NaN	0.0817328928089807	0.561028485432942	286	0	714	0.714	0.286	0.572
ORF3a	all	ss13	108	ATC	ACA	TCT	2	TACATCTAT:TACCTCTAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.83333333333336	4	31.91666666666667	0.0920189790070996	0.137132914796851	0.671020368402558	-0.0451139357897514	0.0404915172549633	0.0726403532510362	NaN	NaN	0.0852442046708165	0.596644725274911	266	0	734	0.734	0.266	0.532
ORF3a	all	ss13	109	TAT	TCT	ATG	2	ATCTATGCC:CTCTATGCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.00000000000001	3	31.91666666666667	0.0918175614096642	0.100428343016685	0.914259447598474	-0.00861078160702046	0.0400730443353795	0.0610175614960165	NaN	NaN	0.0736197365824397	0.906889413114545	477	0	523	0.523	0.477	0.954
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ATG	CCC	2	TATGCCCTG:TATGCCTTG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.00000000000001	3	31.91666666666667	0.0918175614096642	0.100428343016685	0.914259447598474	-0.00861078160702046	0.0411666924602572	0.0613999437735315	NaN	NaN	0.0711414242507372	0.903661316467543	489	0	511	0.511	0.489	0.978
ORF3a	all	ss13	111	CTG	CCC	TGA	2	GCCCTGATT:GCCTTGATA	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.66666666666669	3	32.25000000000001	0.0922212833511261	0.0993184392369987	0.928541407412405	-0.00709715588587251	0.0402554376997811	0.0630343076565773	NaN	NaN	0.0691715034122025	0.918278611128938	473	1	526	0.526	0.473	0.946
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TGA	TAT	2	CTGATTTAT:TTGATATAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.50000000000001	3	32.41666666666667	0.0900437621201392	0.0987726497511971	0.911626470960883	-0.00872888763105795	0.0393043468694558	0.0630551377252939	NaN	NaN	0.0724708148141841	0.904129112046176	465	0	535	0.535	0.465	0.93
ORF3a	all	ss13	113	TAT	TAT	ATA	2	ATATATTTT:ATTTATATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.83333333333336	3	33.41666666666667	0.089658862987337	0.0956200277799543	0.937657780163635	-0.00596116479261728	0.040425952985262	0.0609178338152923	NaN	NaN	0.0683847757498108	0.930535642473534	496	0	504	0.504	0.496	0.992
ORF3a	all	ss13	114	ATC	ATA	TCT	2	TATATCTTG:TATTTTCTA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.50000000000003	3	33.75	0.0900437621201392	0.094613463995175	0.951701357480486	-0.00456970187503583	0.0388931363732818	0.0588918926683706	NaN	NaN	0.064739087485404	0.943726900829803	484	1	515	0.515	0.484	0.968
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TCT	TAC	2	ATCTTGCAA:TTTCTACAA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.6666666666667	2	34.083333333333336	0.0910206427532005	0.0611024764460933	1.4896391774481	0.0299181663071073	0.0402547374982026	0.0441043707533014	NaN	NaN	0.0573807083489658	0.602089790397971	696	0	304	0.304	0.696	0.608
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAA	2	CTACAATGC:TTGCAAATT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.33333333333336	2	34.083333333333336	0.0902374551086072	0.0611024764460933	1.47682156856961	0.029134978662514	0.041172762283164	0.0472323030266896	NA	NA	0.0551735477205864	0.597457251495931	729	0	271	0.271	0.729	0.542
ORF3a	all	ss13	117	ATT	AAA	GCA	2	CAAATTGTA:CAATGCATC	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	2	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.00000000000001	2	34.75	0.0918175614096642	0.0598821656332629	1.53330395517062	0.0319353957764013	0.0401299994531534	0.0434588904482408	NaN	NaN	0.0548386638166347	0.560329726188737	743	3	254	0.254	0.743	0.508
ORF3a	all	ss13	118	ATC	GCA	TAA	2	ATTGTAAGT:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.58333333333334	3	34.91666666666667	0.0647651348577861	0.0912516429860269	0.709742123412544	-0.0264865081282408	0.0293922937894272	0.0562068396843616	NaN	NaN	0.0596541305932506	0.657041685298569	320	1	679	0.679	0.32	0.64
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TAA	ACG	2	ATCAACGCA:GTAAGTTTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.91666666666669	2	34.583333333333336	0.0644865306153867	0.0601826482875392	1.07151367462735	0.00430388232784751	0.0285840078999295	0.043649617076954	NA	NA	0.0453718851608561	0.924427686410693	549	3	448	0.448	0.549	0.896
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT:AGTTTTTGT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.08333333333334	3	34.75000000000001	0.0516889101836223	0.0917171833187057	0.563568442829408	-0.0400282731350834	0.0253169225422537	0.054280285177047	NA	NA	0.0561578910429077	0.475981335250155	244	2	754	0.754	0.244	0.488
ORF3a	all	ss13	121	TGT	CAT	GTA	2	GCATGTAGA:TTTTGTAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.91666666666669	2	34.583333333333336	0.0385111332176099	0.0601826482875392	0.639904263328731	-0.0216715150699293	0.0222451158550891	0.0454178658128339	NA	NA	0.0512587417828942	0.672450881042863	322	4	674	0.674	0.322	0.644
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GTA	GAA	2	TGTAGAATT:TGTAGATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333334	3	35.25000000000001	0.0389276557511925	0.0903346148069003	0.430927345341588	-0.0514069590557078	0.0224828796792255	0.0513802664010731	NA	NA	0.0610276670156378	0.399589286331615	186	3	811	0.811	0.186	0.372
ORF3a	all	ss13	123	ATT	GAA	TTA	2	AGAATTATT:AGATTTATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333334	3	35.083333333333336	0.0389276557511925	0.0907908105289243	0.428762068808614	-0.0518631547777318	0.0221913633325626	0.056628855791271	NA	NA	0.0586065021231393	0.376189758605492	181	1	818	0.818	0.181	0.362
ORF3a	all	ss13	124	ATC	TTA	TCA	2	ATTATTATG:TTTATCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.41666666666669	3	35.41666666666667	0.0256161505491714	0.0898829861073045	0.284994431744738	-0.0642668355581331	0.0175797500932098	0.0529734018024589	NA	NA	0.0577757883321629	0.265988159289964	103	9	888	0.888	0.103	0.206
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TCA	TGA	2	ATCATGAGA:ATTATGAGA	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.41666666666669	3	35.41666666666667	0.0256161505491714	0.0898829861073045	0.284994431744738	-0.0642668355581331	0.0173931519004988	0.05206938570512	NA	NA	0.0586329750482296	0.273040749158895	109	1	890	0.89	0.109	0.218
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATGC:ATGAGATGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.58333333333336	3	35.41666666666667	0.0252389746234555	0.0898829861073045	0.280798132288625	-0.064644011483849	0.0181539966970486	0.0515077668744212	NA	NA	0.0575022110435675	0.26092799895613	101	2	897	0.897	0.101	0.202
ORF3a	all	ss13	127	TGC	GAT	GCT	2	AGATGCTGG:AGATGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.91666666666669	3	35.75000000000001	0.0644865306153867	0.088993157850987	0.72462346738347	-0.0245066272356003	0.0438332550396193	0.0541882119557169	NA	NA	0.0717074407781847	0.732532644937352	364	1	635	0.635	0.364	0.728
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCTG:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.66666666666669	4	35.833333333333336	0.078331997525698	0.120863906464681	0.648100825274815	-0.0425319089389834	0.0457531394140857	0.0639205379310662	NA	NA	0.0774087873781685	0.582699764681372	267	2	731	0.731	0.267	0.534
ORF3a	all	ss13	129	CTG	GGC	TGT	2	TGGCTGTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.33333333333336	4	35.16666666666667	0.0786746849626466	0.123354245726484	0.637794706613454	-0.0446795607638371	0.0462515199116288	0.0636593408803987	NaN	NaN	0.0795053498373828	0.57413697913003	264	0	736	0.736	0.264	0.528
ORF3a	all	ss13	130	TGC	TGT	GCT	2	CTGTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.50000000000003	4	34.833333333333336	0.0774882105210195	0.124638389543236	0.621704202092079	-0.0471501790222168	0.0428446663306459	0.0646889144269677	NaN	NaN	0.0749756492972016	0.5294320506232	257	1	742	0.742	0.257	0.514
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GCT	GGA	2	TGCTGGAAG:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.08333333333336	4	34.583333333333336	0.0779078173603665	0.125619222573624	0.620190252448867	-0.0477114052132579	0.0450321552155597	0.0691805540218066	NaN	NaN	0.0809871558979594	0.555778691237829	282	0	718	0.718	0.282	0.564
ORF3a	all	ss13	132	AAG	GGA	AGT	2	TGGAAGTGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.75000000000003	4	34.583333333333336	0.078246792038373	0.125619222573624	0.622888682442794	-0.0473724305352514	0.0456537449231839	0.0682783537299132	NaN	NaN	0.07701252293944	0.538471295411321	259	1	740	0.74	0.259	0.518
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AGT	GCA	2	AAGTGCAAA:AAGTGCAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.25000000000003	4	34.083333333333336	0.0777394299845026	0.127628054258581	0.609109262349156	-0.0498886242740789	0.0468204080197105	0.0672336943262243	NA	NA	0.0781307458317178	0.523130404732566	245	0	755	0.755	0.245	0.49
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCC:TGCAGATCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.4166666666667	4	34.083333333333336	0.0775717695799524	0.127628054258581	0.60779559815891	-0.050056284678629	0.0456221886041624	0.0653313557684076	NaN	NaN	0.0786582828992639	0.524531038241099	258	1	741	0.741	0.258	0.516
ORF3a	all	ss13	135	TCC	AAT	CCA	2	AAATCCAAG:AGATCCAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.75000000000003	4	34.333333333333336	0.0646255322826462	0.126615652181289	0.510407135052426	-0.0619901198986428	0.0445399797496899	0.0691274680278895	NA	NA	0.077041075544831	0.421029034439652	196	0	804	0.804	0.196	0.392
ORF3a	all	ss13	136	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAT:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.00000000000003	4	34.75000000000001	0.0644172539103222	0.124963623649128	0.51548804387421	-0.0605463697388062	0.0455604571625501	0.0659672049137774	NA	NA	0.0741124343939483	0.413955333168195	186	1	813	0.813	0.186	0.372
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AAA	ACC	2	AAAAATCCA:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.41666666666669	4	34.16666666666667	0.06407309248799	0.127288788480472	0.503367918360067	-0.0632156959924819	0.043095624787637	0.0680881423120873	NA	NA	0.0741566007072956	0.3939576327055	184	4	812	0.812	0.184	0.368
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA:AATCCATTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.75000000000003	4	34.16666666666667	0.0646255322826462	0.127288788480472	0.50770796905307	-0.0626632561978257	0.0444649024460049	0.0675726194810641	NA	NA	0.0800550906633539	0.433772951346591	195	2	803	0.803	0.195	0.39
ORF3a	all	ss13	139	TTA	CAT	TAC	2	CCATTACTC:CCATTACTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.58333333333336	4	34.33333333333334	0.0647651348577861	0.126615652181289	0.511509704701083	-0.0618505173235029	0.0445055013522512	0.0680492043664174	NA	NA	0.0782002729011069	0.428988008896036	203	2	795	0.795	0.203	0.406
ORF3a	all	ss13	140	CTC	TAC	TCT	2	TTACTCTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.25000000000003	4	35.33333333333334	0.0659040642696656	0.122722067836352	0.537018854323314	-0.056818003566686	0.0433426422836185	0.0655752928610544	NA	NA	0.0718734696782308	0.429219368393523	196	2	802	0.802	0.196	0.392
ORF3a	all	ss13	141	TAT	TCT	ATG	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.25000000000003	4	35.33333333333334	0.0659040642696656	0.122722067836352	0.537018854323314	-0.056818003566686	0.0436765851288844	0.0680278260437488	NA	NA	0.0730991984110712	0.436997960633152	192	1	807	0.807	0.192	0.384
ORF3a	all	ss13	142	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGCC:TATGATGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.25000000000003	4	36	0.0659040642696656	0.120256987556385	0.548026901461882	-0.054352923286719	0.0456643199326785	0.0625916333965522	NaN	NaN	0.0728702776784271	0.455736255261514	203	1	796	0.796	0.203	0.406
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ATG	CCA	2	GATGCCAAC:GATGCTAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.91666666666669	4	36.333333333333336	0.0661950873041523	0.119061291806916	0.555974878985038	-0.0528662045027636	0.0471537390269344	0.0648268543352489	NaN	NaN	0.0718674957185533	0.461970142070339	214	2	784	0.784	0.214	0.428
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CCA	ACT	2	GCCAACTAC:GCTAACTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.25000000000003	5	36.66666666666667	0.0659040642696656	0.150503021596613	0.437891967686239	-0.0845989573269477	0.0443786669941505	0.0746920891810674	NaN	NaN	0.0840204602846419	0.313989948575117	129	0	871	0.871	0.129	0.258
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.25000000000003	5	36.66666666666667	0.0659040642696656	0.150503021596613	0.437891967686239	-0.0845989573269477	0.0447335098877408	0.0748177488047326	NaN	NaN	0.0780275366045273	0.278267597851558	123	1	876	0.876	0.123	0.246
ORF3a	all	ss13	146	TTT	ACT	TTG	2	TACTTTGTT:TATTTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.41666666666669	5	36.5	0.0666364763682366	0.151264442981809	0.440529678056925	-0.0846279666135727	0.0486564166411372	0.078395077883016	NA	NA	0.085537676294825	0.322484686634456	151	2	847	0.847	0.151	0.302
ORF3a	all	ss13	147	GTA	TTG	TAT	2	TTTGTATGT:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.75000000000003	5	35.666666666666664	0.0663415654213976	0.155190536855492	0.427484605476767	-0.0888489714340943	0.0452946222239404	0.0759366706535852	NaN	NaN	0.0829571421217638	0.284159282087205	131	0	869	0.869	0.131	0.262
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TAT	GCT	2	GTATGTTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.75000000000003	5	36.666666666666664	0.0672342400167485	0.150503021596613	0.446730167298258	-0.0832687815798649	0.0453867472901412	0.075143968329092	NA	NA	0.08062428562498	0.301697391202518	131	0	869	0.869	0.131	0.262
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC:TGTTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.08333333333337	5	36.49999999999999	0.0669340227304817	0.151264442981809	0.442496738896735	-0.0843304202513276	0.0469131046567976	0.0726439023877235	NaN	NaN	0.0801302175357057	0.292608174581366	128	0	872	0.872	0.128	0.256
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.4166666666667	5	35.83333333333333	0.0666364763682366	0.154389040653112	0.431614032228871	-0.0877525642848749	0.0451998726222547	0.0769421996317792	NaN	NaN	0.0846355824719228	0.299815899457063	130	0	870	0.87	0.13	0.26
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.75000000000003	5	35.83333333333333	0.0672342400167485	0.154389040653112	0.435485833271116	-0.0871548006363631	0.0483482616251408	0.0766775617427125	NaN	NaN	0.0888496962126985	0.32663021440537	133	1	866	0.866	0.133	0.266
ORF3a	all	ss13	152	AAT	CAC	ATA	2	ACACATAAC:ACTAATAAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.75000000000003	5	34.83333333333333	0.0663415654213976	0.159326652781303	0.41638711579826	-0.0929850873599056	0.0442042220858277	0.0804232789131866	NA	NA	0.089323878334113	0.297881107724523	128	0	872	0.872	0.128	0.256
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ATA	ACT	2	AATAACTAT:CATAACTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.4166666666667	5	35.49999999999999	0.0535344239114693	0.156000428408735	0.34316844163533	-0.102466004497265	0.0421665452532776	0.0745573090470369	NA	NA	0.0846751385205395	0.226237716730108	93	2	905	0.905	0.093	0.186
ORF3a	all	ss13	154	TAT	ACT	ATG	2	AACTATGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.25000000000003	5	35.16666666666666	0.0536541558618204	0.157645932730055	0.340345957124661	-0.103991776868235	0.0430159965512458	0.0782572537945622	NaN	NaN	0.0914164588609973	0.255303937684316	102	3	895	0.895	0.102	0.204
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ATG	ACT	2	TATGACTAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	6	35.16666666666666	0.0534152253723939	0.193580949501978	0.275932241833787	-0.140165724129584	0.0433407108001537	0.0894697179645167	NaN	NaN	0.0921528172190185	0.128256326816261	54	2	944	0.944	0.054	0.108
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.91666666666669	6	35.16666666666666	0.0538952343889476	0.193580949501978	0.278411871248709	-0.139685715113031	0.0437902932113979	0.0870769053852838	0.359207500533056	0.438296794365718	0.0966307305747926	0.148300082791438	50	1	949	0.949	0.05	0.1
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.91666666666669	6	35.16666666666666	0.0538952343889476	0.193580949501978	0.278411871248709	-0.139685715113031	0.0444847597401774	0.0904730967505182	NaN	NaN	0.101342197319292	0.168093129011513	53	0	947	0.947	0.053	0.106
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.75000000000001	6	34.83333333333332	0.0540165882431453	0.195697415235261	0.276020959082205	-0.141680826992116	0.0466128605860365	0.085971491209977	0.398232676402667	0.488237514847921	0.0918982413254757	0.12314305076621	36	1	963	0.963	0.036	0.072
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAC:ATACCATAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666669	6	34.83333333333332	0.0542609435735893	0.195697415235261	0.277269597599736	-0.141436471661672	0.0428018988858912	0.0904386486489387	NA	NA	0.101555680131437	0.163710898173521	58	0	942	0.942	0.058	0.116
ORF3a	all	ss13	160	TAC	CAT	ACA	2	CCATACAAC:CCATATAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333336	6	34.83333333333332	0.0537744248135208	0.195697415235261	0.274783521023386	-0.14192299042174	0.0435855856976576	0.0918168397279138	NA	NA	0.0957161742935783	0.138141308629073	45	0	955	0.955	0.045	0.09
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ACA	ACA	2	TACAACAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333336	6	34.83333333333332	0.0537744248135208	0.195697415235261	0.274783521023386	-0.14192299042174	0.043400328802802	0.087862863743004	0.383051214260014	0.473155372855265	0.0889814282440057	0.110718236300193	47	0	953	0.953	0.047	0.094
ORF3a	all	ss13	162	AGT	ACA	GTG	2	AACAGTGTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.9166666666667	6	34.33333333333332	0.0538952343889476	0.198960851821961	0.270883613009335	-0.145065617433013	0.0446696204125677	0.0902901871079168	NaN	NaN	0.0910792732535289	0.111218491352797	44	1	955	0.955	0.044	0.088
ORF3a	all	ss13	163	GTC	GTG	TCA	2	AGTGTCACA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.4166666666667	6	34.16666666666666	0.0542609435735893	0.200073130342575	0.271205551093648	-0.145812186768986	0.0436543847240427	0.0952251697959836	NA	NA	0.095332992827821	0.126139566637606	42	1	957	0.957	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TCA	CAG	2	GTCACAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333337	6	34.16666666666666	0.0537744248135208	0.200073130342575	0.268773846450273	-0.146298705529054	0.0437351064643694	0.0879679396100234	NA	NA	0.0921746037773681	0.11246938272636	44	0	956	0.956	0.044	0.088
ORF3a	all	ss13	165	GAT	CAG	ATA	2	ACAGATACA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.4166666666667	6	33.83333333333332	0.0535344239114693	0.202335646591906	0.264582266215522	-0.148801222680436	0.0429537297215039	0.0927526971228679	NaN	NaN	0.0999169690118107	0.136421873938556	42	0	958	0.958	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	166	ACA	ATA	CAA	2	GATACAATT:GATACAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.25000000000003	6	33.99999999999999	0.0536541558618204	0.20119798994601	0.266673418935339	-0.147543834084189	0.0455634312102479	0.0898631781551461	NA	NA	0.0960464112063955	0.124496133700853	40	1	959	0.959	0.04	0.08
ORF3a	all	ss13	167	ATT	CAA	TTG	2	ACAATTGTC:ACAGTTGTC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.4166666666667	6	33.83333333333332	0.0535344239114693	0.202335646591906	0.264582266215522	-0.148801222680436	0.0436749536796809	0.0907549859429557	NA	NA	0.100334631637864	0.138061266631853	57	1	942	0.942	0.057	0.114
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TTG	TCA	2	ATTGTCGTT:GTTGTCATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.83333333333337	5	34.16666666666666	0.0539558430514737	0.162798378928371	0.331427397537008	-0.108842535876897	0.0440974777712318	0.0772505094816191	NA	NA	0.0846018677096775	0.198259413092354	100	1	899	0.899	0.1	0.2
ORF3a	all	ss13	169	ATC	TCA	TCA	2	GTCATCACC:GTCGTTACT	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	5	34.33333333333332	0.0535942229866087	0.161916285324778	0.330999583390313	-0.10832206233817	0.0430368030078459	0.0772038207596678	NA	NA	0.085455881521095	0.20494841258881	70	2	928	0.928	0.07	0.14
ORF3a	all	ss13	170	ACC	TCA	CCT	2	ATCACCTCA:GTTACTGAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.33333333333337	4	33.499999999999986	0.066710614512372	0.130054644852002	0.512942960155608	-0.0633440303396297	0.046405317034077	0.069866689555295	NA	NA	0.0825912539853775	0.443106434368912	195	0	805	0.805	0.195	0.39
ORF3a	all	ss13	171	GAA	CCT	AAG	2	ACCTCAGGT:ACTGAAGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.58333333333337	4	33.249999999999986	0.0805241909860523	0.131123163798598	0.614111104806285	-0.0505989728125454	0.0475148078946846	0.075479647621134	NA	NA	0.0809946011433672	0.532154636949316	238	0	762	0.762	0.238	0.476
ORF3a	all	ss13	172	GGT	AAG	GTG	2	GAAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.08333333333337	3	33.41666666666666	0.0810687166991055	0.0956200277799544	0.84782151376974	-0.0145513110808489	0.048039356800838	0.0616941055226749	NaN	NaN	0.0741106788974329	0.84433961562848	402	3	595	0.595	0.402	0.804
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.4166666666667	3	33.74999999999999	0.0807048841711543	0.0946134639951751	0.852995765753486	-0.0139085798240208	0.0496578933595663	0.0573517985202425	NA	NA	0.0746290256800436	0.85215494978242	455	1	544	0.544	0.455	0.91
ORF3a	all	ss13	174	GGA	ACG	GAA	2	GACGGCATT:GATGGAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.58333333333337	3	33.91666666666666	0.0816206643196587	0.0941180977157372	0.867215405969804	-0.0124974333960785	0.050067363470874	0.0581155244292511	NaN	NaN	0.072313923064608	0.862791380870998	408	0	592	0.592	0.408	0.816
ORF3a	all	ss13	175	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAAAT:GGCATTTCA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333337	3	34.41666666666666	0.0821801867828476	0.0926626795339059	0.886874707230728	-0.0104824927510583	0.0505553215638439	0.0593636094224726	NA	NA	0.0741453923431702	0.887571701010158	435	0	565	0.565	0.435	0.87
ORF3a	all	ss13	176	AAT	CAA	ATC	2	ACAAATCAG:ATTTCAACA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	3	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.50000000000003	5	35.08333333333332	0.0828427466732329	0.158062767299149	0.524112971630095	-0.0752200206259157	0.0493409226753614	0.0881920898924465	NaN	NaN	0.0983342024189233	0.444305724406511	208	0	792	0.792	0.208	0.416
ORF3a	all	ss13	177	ACA	ATC	AGC	2	AATCAGCCA:TCAACACCA	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.4166666666667	5	35.49999999999999	0.0403232602433046	0.156000428408735	0.258481727612018	-0.11567716816543	0.0231907548087241	0.0931743509789263	NA	NA	0.0881486379867293	0.189420039722086	48	2	950	0.95	0.048	0.096
ORF3a	all	ss13	178	CCA	AGC	CAA	2	ACACCAAAA:CAGCCAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333337	4	35.41666666666666	0.0264928206228062	0.122408407943652	0.216429745863549	-0.0959155873208458	0.018707896107486702	0.0830621379553455	NA	NA	0.0852665513233559	0.260635170863674	91	4	905	0.905	0.091	0.182
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTA:CCAAAACTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333337	4	35.41666666666666	0.0264928206228062	0.122408407943652	0.216429745863549	-0.0959155873208458	0.0185448436648178	0.0826114819343049	NA	NA	0.0820064398377528	0.242157778290744	78	3	919	0.919	0.078	0.156
ORF3a	all	ss13	180	CTA	AAC	TAA	2	AAACTAAAA:AAACTCAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.6666666666667	4	35.91666666666666	0.0269087157486763	0.120559681536883	0.223198298184324	-0.0936509657882068	0.018670983972967	0.0804729239805226	NA	NA	0.0816783634625971	0.251554295478231	95	5	900	0.9	0.095	0.19
ORF3a	all	ss13	181	AAA	TAA	AAG	2	CTAAAAGAA:CTCAAAGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.33333333333336	4	36.08333333333332	0.0266694765273651	0.119955812971472	0.222327504326178	-0.0932863364441069	0.0192931316260826	0.0828558350601862	NA	NA	0.0798344209027474	0.242606070302287	85	4	911	0.911	0.085	0.17
ORF3a	all	ss13	182	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666669	4	36.08333333333332	0.0269087157486763	0.119955812971472	0.224321898890184	-0.0930470972227957	0.0187994736029742	0.078599550850199	NA	NA	0.0828505542338217	0.261407123978455	112	5	883	0.883	0.112	0.224
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	GAAGACTAC:GAAGACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.83333333333334	4	36.58333333333332	0.0272138698048234	0.11818004032857	0.230274670148715	-0.0909661705237471	0.0185610180061026	0.0731697387772279	NA	NA	0.0788638874068793	0.248722505905596	91	5	904	0.904	0.091	0.182
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA:GACTATCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.33333333333334	4	37.41666666666666	0.0420670999882827	0.115334665090853	0.364739429859576	-0.0732675651025699	0.0248460596397175	0.0760281965456467	NA	NA	0.0805021801215938	0.362753195712582	160	0	840	0.84	0.16	0.32
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT:TATCAAATT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000001	4	36.91666666666666	0.0557100557871529	0.117025173722032	0.476051895632986	-0.0613151179348791	0.027603202904312	0.0766375956591861	NaN	NaN	0.0795435185414648	0.440803324042899	217	0	783	0.783	0.217	0.434
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.25000000000001	4	37.16666666666666	0.0559047993353385	0.116173757560117	0.481217105389824	-0.0602689582247781	0.0277655460840028	0.0778807644737107	NA	NA	0.0812587869750287	0.458274221550792	230	0	770	0.77	0.23	0.46
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.75000000000001	4	37.16666666666666	0.056298401666626	0.116173757560117	0.484605153943593	-0.0598753558934906	0.0286915168286126	0.0769793754537039	NaN	NaN	0.0815724110581193	0.462939726190847	228	1	771	0.771	0.228	0.456
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.41666666666667	4	37.49999999999999	0.0565638983071325	0.115057659974651	0.491613494656457	-0.0584937616675185	0.0278875622015881	0.0746090697546349	NaN	NaN	0.0837166255017652	0.484732400201889	259	0	741	0.741	0.259	0.518
ORF3a	all	ss13	189	TAT	GTT	ATT	2	GGTTATTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.58333333333334	4	36.99999999999999	0.0556454425645553	0.116739982283845	0.476661392917273	-0.0610945397192897	0.02701525586665	0.0743258567756067	NaN	NaN	0.0871056370843572	0.483063121033572	223	0	777	0.777	0.223	0.446
ORF3a	all	ss13	190	TCT	ATT	CTG	2	TATTCTGAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.91666666666667	4	36.33333333333333	0.0546316519559279	0.119061291806916	0.45885317660189	-0.0644296398509879	0.0271091576161786	0.0841039234478988	NaN	NaN	0.0821891648679474	0.43308769804028	211	1	788	0.788	0.211	0.422
ORF3a	all	ss13	191	GAG	CTG	AGG	2	TCTGAGGAT	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.41666666666667	6	36.83333333333333	0.0550074627952336	0.18365333026498	0.299517916260311	-0.128645867469747	0.0281409355268416	0.103226652258675	NA	NA	0.111786137813419	0.249805763667644	91	0	909	0.909	0.091	0.182
ORF3a	all	ss13	192	GAT	AGG	ATA	2	GAGGATAGG:GAGGATTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.08333333333334	6	35.5	0.0560353868844177	0.191510018856633	0.292597678277952	-0.135474631972216	0.0283093020859279	0.110472108973349	NaN	NaN	0.116678731838134	0.245604871574858	82	0	918	0.918	0.082	0.164
ORF3a	all	ss13	193	AGG	ATA	GGC	2	GATAGGCAC:GATTGGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.166666666666667	0.5	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.83333333333334	8	36.416666666666664	0.0570345959917882	0.259943938648383	0.219411140295665	-0.202909342656595	0.0296167719950823	0.132433011558562	NaN	NaN	0.138698766358946	0.143481095686014	28	0	972	0.972	0.028	0.056
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	ACT	2	AGGCACTCA:TGGCATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000001	8	36.75	0.0573071018565008	0.25713126368002	0.222870999956719	-0.199824161823519	0.0288432246263095	0.139371366475171	NaN	NaN	0.140065874351838	0.153682488266758	43	0	957	0.957	0.043	0.086
ORF3a	all	ss13	195	TCA	ACT	CAG	2	CACTCAGGT:CATTCAGGT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.83333333333334	8	35.75	0.0570345959917882	0.265759990634356	0.214609414515893	-0.208725394642568	0.0293847178625587	0.145429046056504	NaN	NaN	0.139115280978521	0.133516724166445	27	0	973	0.973	0.027	0.054
ORF3a	all	ss13	196	GGT	CAG	GTG	2	TCAGGTGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.33333333333334	8	34.916666666666664	0.0550706014161129	0.273410739562984	0.201420769001748	-0.218340138146871	0.0284919114409425	0.150602871544251	NaN	NaN	0.144716588275055	0.131364474688394	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	197	GTT	GTG	TTA	2	GGTGTTAAA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.66666666666667	8	34.916666666666664	0.0548189130040021	0.273410739562984	0.200500218431887	-0.218591826558982	0.0277858278910617	0.147108044550282	NaN	NaN	0.153672300517094	0.1548944057345	30	0	970	0.97	0.03	0.06
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666667	8	34.583333333333336	0.054077470426008	0.276597228353308	0.195509805893401	-0.2225197579273	0.0273987032639104	0.146688676927419	NaN	NaN	0.151990529495896	0.143183840715997	43	1	956	0.956	0.043	0.086
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.5	8	35.083333333333336	0.0549444688504895	0.271845168498985	0.202116775346311	-0.216900699648496	0.0270647220875859	0.138291352136548	NaN	NaN	0.145670618781854	0.136492523860166	35	0	965	0.965	0.035	0.07
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATG	2	GACTATGTA:GACTATGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.33333333333334	8	35.083333333333336	0.0550706014161129	0.271845168498985	0.202580762130847	-0.216774567082873	0.0277012690347462	0.145716840532728	NaN	NaN	0.147405461767787	0.141399149553545	35	1	964	0.964	0.035	0.07
ORF3a	all	ss13	201	GTA	ATG	TAG	2	TATGTAGTA:TATGTCGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000001	8	35.083333333333336	0.0545695157118212	0.271845168498985	0.200737486022397	-0.217275652787164	0.0265024618379158	0.148009008289887	NaN	NaN	0.147938549467973	0.141917286194196	42	0	958	0.958	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	202	GTA	TAG	TAA	2	GTAGTAATA:GTCGTTGTA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.00000000000001	8	36.083333333333336	0.0553246126797069	0.262819463546309	0.210504244751107	-0.207494850866602	0.0279634831632087	0.146565845542217	NaN	NaN	0.147942929275068	0.160756122217531	40	0	960	0.96	0.04	0.08
ORF3a	all	ss13	203	ATA	TAA	TAC	2	GTAATATAT:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.33333333333334	8	35.75000000000001	0.0550706014161129	0.265759990634356	0.20721930823621	-0.210689389218243	0.0279549338335804	0.134258442506826	NaN	NaN	0.143049828710578	0.140794410958442	33	0	967	0.967	0.033	0.066
ORF3a	all	ss13	204	CAT	TAC	ATG	2	ATATATGGC:GTACATGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.50000000000001	8	36.41666666666667	0.0564972895530331	0.259943938648383	0.217344131380016	-0.20344664909535	0.0284207391318397	0.130091350751857	NaN	NaN	0.140638725271356	0.148011638161399	47	0	953	0.953	0.047	0.094
ORF3a	all	ss13	205	GGC	ATG	GCT	2	CATGGCTAT:TATGGCTAT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666669	7	35.91666666666667	0.0563645417845084	0.225687740489177	0.249745695811117	-0.169323198704669	0.0282753545845118	0.129746846563931	NaN	NaN	0.131745197835435	0.198711079668192	55	0	945	0.945	0.055	0.11
ORF3a	all	ss13	206	TAT	GCT	ATT	2	GGCTATTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000001	7	36.583333333333336	0.0568993130810351	0.220904431633438	0.257574339547212	-0.164005118552403	0.0292695751474676	0.124929184077513	NaN	NaN	0.132493838145771	0.215778343907712	79	0	921	0.921	0.079	0.158
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ATT	TCA	2	TATTTCACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.33333333333334	8	36.25000000000001	0.0566306643811089	0.261373712626115	0.216665493297395	-0.204743048245006	0.028968565646069	0.137524264835028	NaN	NaN	0.147647598937462	0.165533006894462	37	1	962	0.962	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	208	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666669	8	36.583333333333336	0.0563645417845084	0.258529875671953	0.218019451864159	-0.202165333887444	0.0289626455167787	0.136365803897504	NaN	NaN	0.140270317586902	0.149512580167698	50	0	950	0.95	0.05	0.1
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CCG	AAG	2	ACCGAAGTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	8	36.25000000000001	0.0561009098120237	0.261373712626115	0.214638684389328	-0.205272802814091	0.028049261567926	0.143392990217015	NaN	NaN	0.144402666899825	0.155162578099467	29	0	971	0.971	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	210	GTT	AAG	TTT	2	GAAGTTTAC:GAAGTTTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	8	35.583333333333336	0.0561009098120237	0.267255329878453	0.209915027092399	-0.21115442006643	0.0285230470251197	0.141229892546928	NaN	NaN	0.152030709165493	0.16486522477887	37	0	963	0.963	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	211	TAC	TTT	ACT	2	GTTTACTAC:GTTTATTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.00000000000001	8	35.583333333333336	0.0553246126797069	0.267255329878453	0.207010324938583	-0.211930717198747	0.0278236954765622	0.144262578455051	NaN	NaN	0.163342287939273	0.194471628448486	48	0	952	0.952	0.048	0.096
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000001	8	35.25000000000001	0.0545695157118212	0.270297617029844	0.201886780621511	-0.215728101318022	0.0275587507447044	0.145308989468933	NaN	NaN	0.152029415149741	0.155902158721049	40	0	960	0.96	0.04	0.08
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.16666666666667	8	35.083333333333336	0.0544456664773409	0.271845168498985	0.200281898618861	-0.217399502021645	0.0269060864605267	0.146741701578825	NaN	NaN	0.153416971128376	0.156468341735667	34	0	966	0.966	0.034	0.068
ORF3a	all	ss13	214	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAA:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.5	8	34.41666666666667	0.0541996476239405	0.278218809519287	0.194809429734776	-0.224019161895346	0.0267612030178035	0.144714758429477	NaN	NaN	0.156513393383054	0.152341431643443	32	0	968	0.968	0.032	0.064
ORF3a	all	ss13	215	GAA	TTG	AAT	2	CTTGAATCG:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.83333333333334	8	34.083333333333336	0.0539558430514737	0.281520365031792	0.191658756358107	-0.227564521980318	0.0277892494612373	0.1616904799443	NaN	NaN	0.162015546806174	0.160144875415865	37	0	963	0.963	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	216	TCG	AAT	CGA	2	GAATCGACT:GAGTCTACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333334	8	33.583333333333336	0.0535942229866087	0.286624098210084	0.186984357984186	-0.233029875223475	0.026244476539278	0.155216729822288	NaN	NaN	0.153404456530521	0.12874854002289501	26	0	974	0.974	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CGA	CAC	2	TCGACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.50000000000001	8	33.083333333333336	0.0527690107059348	0.291918675814013	0.180766134810624	-0.239149665108079	0.0280360967386292	0.164686518305537	NaN	NaN	0.170647448640753	0.161086907929193	29	0	971	0.971	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.66666666666669	8	32.91666666666667	0.0526531940049364	0.293727829875654	0.179258444891744	-0.241074635870718	0.0262428873154809	0.163434054860219	NaN	NaN	0.168843324505895	0.153349198997432	32	0	968	0.968	0.032	0.064
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TGT	2	CAAATTACT:CAATTGTCG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000001	8	33.91666666666667	0.053834761795598	0.283201052715922	0.190093791245895	-0.229366290920324	0.0267125364253777	0.156274451354991	NaN	NaN	0.165490132407604	0.165752499122007	26	0	974	0.974	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TGT	CGA	2	ATTACTACA:TTGTCGACT	1:1	TRUE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.66666666666669	8	35.083333333333336	0.0407339920153049	0.271845168498985	0.149842619018101	-0.231111176483681	0.0246557280231435	0.139898166503392	NaN	NaN	0.157270511443332	0.141693499518566	15	0	985	0.985	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CGA	CAG	2	ACTACAGAC:TCGACTGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666669	8	35.833333333333336	0.0271830432683088	0.265018643484554	0.102570305661885	-0.237835600216245	0.0195028969719712	0.146190956990835	NA	NA	0.143772852439385	0.0980776329207833	10	1	989	0.989	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT:ACTGATACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000001	8	35.99999999999999	0.0272447663451876	0.263548415128416	0.103376703411069	-0.236303648783229	0.0208582226119521	0.145538045402498	NaN	NaN	0.142810440724164	0.0979921707520816	11	1	988	0.988	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT:GATACTGGT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666669	8	36.33333333333333	0.0273690573365762	0.260656845281595	0.105000339841482	-0.233287787945019	0.0197891445576909	0.151023045079856	NA	NA	0.148544516908263	0.116300987544524	16	0	984	0.984	0.016	0.032
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT:ACTGGTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333336	8	36.16666666666666	0.0273067703935705	0.262094574111018	0.104186706215459	-0.234787803717448	0.0199072063494363	0.144251556451897	NaN	NaN	0.141064013935635	0.0960313040941855	10	0	990	0.99	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	CTG	2	GGTATTGAA:GGTGCTGAA	1:1	TRUE	0.916666666666667	0.75	1.33333333333333	0	0	0	2	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333336	8	35.66666666666666	0.0271215992572094	0.266505540694197	0.10176748740969	-0.239383941436987	0.0196077124310249	0.143241989696673	NaN	NaN	0.146075355144658	0.101261124101972	13	0	987	0.987	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	226	GAA	CTG	AAA	2	ATTGAAAAT:GCTGAAAAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.83333333333336	6	34.99999999999999	0.0268485044068343	0.194633396613814	0.137943975052269	-0.167784892206979	0.0191792420788722	0.114436944240924	NaN	NaN	0.117242296390917	0.152402921528615	29	6	965	0.965	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	227	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	GCT	ATG	CTA	2	AATGCTACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CTA	CAT	2	GCTACATTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTAT:TTCATCTTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TAT	TCT	ATA	2	ATCTATAGC:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	ATA	ACA	2	TATAGCAAG:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCTT:AGCAAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	CTT	AGC	TTG	2	AAGCTTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC:GTTAAAGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCCA:AAAGATGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	CCA	ACC	CA-	0	GACCCA---:GATGTA---	1:1	TRUE	0.5	0	1.5	1	0	0	2	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	NA	NA	0	CCA---CCG:GTA---GAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	ATC	0	---CCGAAT:---GATCAT	1:1	TRUE	1.08333333333333	0.666666666666667	1.25	0	0	1	2	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	ATC	ATG	2	CCGAATGTG:GATCATGTG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTG	ATG	TGC	2	AATGTGCAA:CATGTGCAA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TGC	AAA	2	GTGCAAATA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCT	GCT	CTT	2	GGCTCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CTT	CAG	2	TCTTCAGGA	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT:GTTGTAAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAT	CTA	ATC	2	GCTAATCCA:GTAAATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	CCA	ATC	CAG	2	AATCCAGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	GCA	CAG	CAA	2	CCAGCAATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	ATG	CAA	TGG	2	GCAATGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	GAT	TGG	ATC	2	ATGGATCCA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATT	CAA	TTT	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGAG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAG	ATG	AGC	2	GATGAGCCG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCG	AGC	CGA	2	GAGCCGACG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CGA	CGA	2	CCGACGACG	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	TTG	CTT	TGT	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.25000000000001	7	32.83333333333332	0.100750036200046	0.250832878769865	0.401662001784392	-0.150082842569819	0.0366719007765245	0.119340713173646	0.310513456486184	0.195823885531329	0.113507602781561	0.186092498124094	66	0	934	0.934	0.066	0.132
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.58333333333334	8	33.16666666666665	0.101727620280473	0.291022534714547	0.349552382190106	-0.189294914434074	0.0377985520208935	0.135428724118294	0.324155437408323	0.280878463595393	0.126968612360039	0.135993107311565	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.91666666666667	8	33.499999999999986	0.102724391304868	0.287492986673213	0.357310946933229	-0.184768595368345	0.0384334317998179	0.125170154889199	0.268281219815747	0.182908743620418	0.13389868026438	0.16761328214248	44	0	956	0.956	0.044	0.088
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA:TTTATGAGC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.08333333333334	8	33.33333333333332	0.102473368909235	0.289246860608989	0.354276512088964	-0.186773491699753	0.0395554658553403	0.134161644091018	0.250835206536362	0.157835892858891	0.129420257954549	0.148976814210037	25	0	975	0.975	0.025	0.05
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATTT:ATGAGCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.41666666666667	8	33.999999999999986	0.101974992322902	0.282358178426184	0.361154732231567	-0.180383186103283	0.0391635358341617	0.132458446179729	0.26560805539159	0.173915987534771	0.133382287500759	0.176254627562825	30	0	970	0.97	0.03	0.06
ORF3a	all	ss13	7	ATT	GAT	TTT	2	AGATTTTTT:AGCATTTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.08333333333333	8	34.33333333333332	0.0857055104092924	0.27903683339124	0.307147659926042	-0.193331322981948	0.0338523929785073	0.12519111988583	0.239216182813783	0.199150612860053	0.124465049806602	0.120351938582586	14	0	986	0.986	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	8	TTC	TTT	TCA	2	ATTTTCACA:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666667	8	33.91666666666666	0.0701445435081176	0.283201052715922	0.247684614288773	-0.213056509207804	0.0301001832875947	0.122998497855774	0.209526510405177	0.237159726007114	0.133581097221769	0.110721176909953	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	9	ACA	TCA	CAT	2	TTCACATTG:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.5	8	33.749999999999986	0.069333399391501	0.284902170689401	0.243358621044302	-0.2155687712979	0.0317557652735277	0.127096371898125	0.173076109410894	0.159700773460966	0.121900140236181	0.0769932846020861	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	10	CTT	CAT	TGG	2	ACATTGGGA:ACTCTTAGA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.5	0.666666666666667	0.166666666666667	1	0	0	1	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75	8	34.24999999999999	0.069817817299509	0.279859737639748	0.249474318415115	-0.210041920340239	0.0317272723424337	0.122039288589993	0.230480586949182	0.27907072152664403	0.127041242269761	0.0982624024834421	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TGG	GAG	2	CTTAGATCA:TTGGGAGCA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.916666666666667	0.25	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.16666666666667	9	34.74999999999999	0.0559700169039056	0.317710819960381	0.176166543244845	-0.261740803056476	0.0276084642165405	0.134284871908525	0.112618181746212	0.117751464379672	0.12727531401995	0.0397350122231833	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	12	GCA	GAG	CAA	2	AGATCAATT:GGAGCAATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74	8	35.49999999999999	0.0561009098120238	0.268009394822974	0.20932441509776	-0.211908485010951	0.0267019355487892	0.115771723496269	0.170398526859591	0.219281732567747	0.110457057633352	0.055051518641329	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	13	ATC	CAA	TCA	2	GCAATCACG:TCAATTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73	9	35.49999999999999	0.0422647024133488	0.309399206498443	0.13660249129812	-0.267134504085094	0.0240487028032026	0.135802595150925	0.0905383129330555	0.131354743740292	0.130456190780377	0.0405898831818328	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	14	ACG	TCA	CGC	2	ATCACGCGC:ATTACTGCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.66666666666667	9	35.33333333333333	0.042464170499631	0.311207889047031	0.136449530986066	-0.2687437185474	0.0237794935715071	0.1328117410354	0.0988553638222319	0.167495937879068	0.124287991423343	0.030597666149832	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	15	CGC	CGC	CAC	2	ACGCGCAAT:ACTGCACAG	1:1	TRUE	1	1	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.16666666666667	9	34.83333333333333	0.0421656696333547	0.316764994602515	0.133113413261669	-0.27459932496916	0.0242769415225015	0.135027431953699	0.0936342080442982	0.155133026882109	0.123921310724526	0.026697194850817	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	16	AAT	CAC	AGC	2	CGCAATCCA:GCACAGCCA	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	1	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.16666666666667	8	34.83333333333333	0.02784542552167	0.274200382158177	0.101551373862079	-0.246354956636507	0.019671368105621	0.122975584967422	0.0903575790224012	0.261062537919564	0.122285526353377	0.0439478335713273	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	17	CCA	AGC	CAG	2	AATCCAGCG:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73	8	34.99999999999999	0.0138252762666285	0.272625681756849	0.0507115697154279	-0.258800405490221	0.0140632627343597	0.120837983394361	NA	NA	0.123833746822549	0.0366265963993175	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	18	GCG	CAG	CGA	2	CCAGCGAAA:CCAGTAAAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.66666666666667	8	34.74999999999999	0.0276529018562458	0.274994650264777	0.100557962962626	-0.247341748408531	0.019311888137828	0.116761480779516	0.112129668788689	0.36982528627495	0.133852368080355	0.0646211805615587	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	19	AAA	CGA	AAA	2	GCGAAAATT:GTAAAAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.33333333333333	8	34.33333333333333	0.027400307499342	0.27903683339124	0.0981960236802276	-0.251636525891898	0.019046726757821	0.127429894070873	0.131430058490114	0.454981951385027	0.126675739501546	0.0469820630651765	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	20	ATT	AAA	TTG	2	AAAATTGAA:AAAATTGAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75	8	33.99999999999999	0.0271522864979704	0.282358178426184	0.0961625643334031	-0.255205891928214	0.0180965374825677	0.127538067702205	0.132028147333433	0.4663999962552	0.12675720733415	0.0440784283760287	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	21	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT:ATTGACAAT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.83333333333333	8	34.33333333333333	0.0272138698048234	0.27903683339124	0.0975278764243519	-0.251822963586417	0.0190042566799595	0.129757483646873	0.139265968248296	0.483740335537536	0.126151312434954	0.045912404395207	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	22	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.25	8	34.08333333333333	0.0135904058348962	0.281520365031792	0.0482750362779667	-0.267929959196896	0.0135187667662597	0.12084094925269	0.0641652055123796	0.451837384309974	0.120672221227762	0.0263976080885759	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTT	2	AATGCTTCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.25	8	34.41666666666666	0.0137776549513118	0.278218809519287	0.0495209327331863	-0.264441154567975	0.0141372274841886	0.130710946694351	0.0704863972491592	0.482329913809103	0.125923953292034	0.0357282454875141	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	24	TCT	CTT	CTC	2	GCTTCTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.58333333333333	9	35.24999999999999	0.0139053809368069	0.312120297918684	0.0445513509679836	-0.298214916981877	0.014205410224402	0.135108127446967	0.0717175571880914	0.534464329426071	0.123482391684811	0.0157334811356446	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.91666666666666	9	34.91666666666666	0.0138412232800193	0.315824866691675	0.0438256285042045	-0.301983643411656	0.0133874720005589	0.132132404700118	0.0741651256722523	0.55457427365365	0.129025315536487	0.0192579814226128	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.25	9	34.25	0.0135904058348962	0.323508417071989	0.0420094350493266	-0.309918011237093	0.0137610783805825	0.141894936455162	0.0640254736151559	0.511736453404932	0.14387154374022	0.0312299769879569	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	27	AGT	CAA	GTA	2	GCAAGTACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.91666666666667	9	33.58333333333333	0.0134683754007452	0.331581375185359	0.0406186125297785	-0.318112999784614	0.0132331132618429	0.142153662723558	0.0580140493709545	0.483832816625915	0.143872299370735	0.0270303765366392	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	28	ACT	GTA	CTG	2	AGTACTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.91666666666667	10	34.25	0.0136522540928075	0.369855206523338	0.0369124291128399	-0.356202952430531	0.0132852707646939	0.15642806503011	0.0502171063115562	0.462304858326488	0.152458927507235	0.0194711163349659	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	29	GTT	CTG	TTC	2	ACTGTTCAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666667	10	33.416666666666664	0.0133782811395161	0.381873370361936	0.0350332916035395	-0.36849508922242	0.0133061226489011	0.162602889238046	0.0472623136690618	0.458540568863699	0.168566455328981	0.0288117784115701	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	GTTCATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.91666666666667	11	32.916666666666664	0.0132893842388272	0.442360526313466	0.0300419758281282	-0.429071142074638	0.0134756206487517	0.192697856188901	0.0404836478204305	0.458040805316693	0.205891228263017	0.0371628965863761	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA:CATGCTACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.08333333333334	12	33.25	0.0134382094503063	0.492181967718371	0.0273033356191459	-0.478743758268064	0.0126508229210528	0.204095737528996	0.034606414728186	0.43013101709356	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25	12	33.583333333333336	0.0134081783305544	0.485308821352962	0.0276281364372784	-0.471900643022408	0.0133573592383878	0.204338542044026	0.0359268897799343	0.441887391814056	0.219099914193594	0.0312546967444218	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.08333333333334	12	33.416666666666664	0.0132600139021293	0.488720381506319	0.0271321074461017	-0.475460367604189	0.0124141519576333	0.222348791022108	0.0327902125232038	0.407984710114591	0.197045544826793	0.0158241399558603	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	34	ACG	CAA	CGA	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666667	13	33.25	0.0264636052740321	0.552515991632425	0.047896541774012	-0.526052386358393	0.0191058012542198	0.253438994475317	0.0404476552554596	0.236349279480201	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CGA	TAC	2	ACGATACCA:ACGATACCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77	13	32.416666666666664	0.0264344542962561	0.573811734264465	0.046068166120968	-0.547377279968209	0.0180006786865173	NA	0.041128761261125	0.262672801681395	0.258964801955821	0.034539783688111	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	36	CCA	TAC	CAC	2	ATACCACTA:ATACCGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666667	13	31.416666666666664	0.0263763446044989	0.601759854393703	0.0438320110786954	-0.575383509789204	0.0181281671263406	NA	NA	NA	0.31875808411723	0.071062327545408	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	37	CTA	CAC	TAC	2	CCACTACAA:CCGCTACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666667	13	30.666666666666664	0.0262035385209603	0.624681842201328	0.0419470148653932	-0.598478303680368	0.0183251620491216	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	CTACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333334	13	31.333333333333332	0.0261464386246643	0.604218872989977	0.0432731246796026	-0.578072434365312	0.0178956055109925	NA	0.0380982073484163	0.256027303332612	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCA	2	CAAGCCACA:CAAGCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.5	13	32	0.0262608883838265	0.585118918162181	0.0448812840752273	-0.558858029778355	0.018297631653245	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	40	ACA	CCA	CAC	2	GCCACATTC:GCCTCACTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.5	13	32	0.0262608883838265	0.585118918162181	0.0448812840752273	-0.558858029778355	0.0181201386581607	0.279018829893821	0.0355117520314694	0.20628633485217	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	41	CTC	CAC	TCC	2	ACATTCCCT:TCACTCCCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666667	12	31.666666666666668	0.026032982222434	0.527796967417862	0.0493238571449075	-0.501763985195428	0.0182501322211503	0.227762252635404	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TCC	CTT	2	CTCCCTTTC:TTCCCTTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.5	11	32	0.0262608883838265	0.459828354664807	0.057110198006318	-0.43356746628098	0.0181348861253211	0.203261106385323	0.0519352101985307	0.271487634618497	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666667	11	31.833333333333332	0.0262035385209603	0.463158329862746	0.0565757686550205	-0.436954791341785	0.0177350271603045	NA	0.0471101559600206	0.229780257647835	0.207031046768139	0.0348087587289882	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	44	GGA	TCG	GAT	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.5	11	31.166666666666668	0.0259205062991005	0.476991575039997	0.0543416438685043	-0.451071068740897	0.0176388359220026	0.215694727535846	NA	NA	0.238141980588447	0.0582082029143946	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	GGATGGCTT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666667	11	31	0.025864632053377	0.480584396281972	0.0538191257424877	-0.454719764228595	0.0178890766928103	0.223538759922004	0.0485930776767987	0.268057429372663	0.210795014467625	0.030992759923209202	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTA	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78	11	30.666666666666668	0.0260895870640617	0.487940674605862	0.053468768688193	-0.4618510875418	0.0181277300721408	0.219416719575246	0.0469111764515173	0.25437487678464	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	47	ATT	TTA	TTA	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666667	11	30.250000000000004	0.0259485340559256	0.497470663057698	0.0521609332627441	-0.471522129001772	0.0176006008964266	0.221952668311739	0.048299386802736	0.280164349453375	0.224155342674894	0.0354176578836735	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000001	10	29.750000000000004	0.0392246245521367	0.445899039781238	0.0879675017272534	-0.406674415229101	0.021415793458117	0.197294632344885	0.0798714211435546	0.270738300452855	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333334	9	30.416666666666668	0.0397005575048303	0.376300989048554	0.105502134355825	-0.336600431543724	0.0221467471411414	0.166059129713909	0.0860174381848524	0.220002939731951	0.165773828742202	0.042307779603378	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000001	9	31.250000000000004	0.0401433603117785	0.363381236586463	0.110471747767931	-0.323237876274684	0.0238545244697258	0.153266110691209	0.0964299339165332	0.251953762382845	0.154500736077621	0.0364255850607952	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAC	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666667	9	30.58333333333334	0.0397883346582442	0.373642557445839	0.106487694898116	-0.333854222787594	0.0227534543954037	0.158961723738927	0.0937185338969565	0.255851902048858	0.161636581422625	0.0388793039261436	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	52	CTT	CAC	TTC	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75	9	31.250000000000007	0.0396131668795608	0.363381236586463	0.109012692156809	-0.323768069706902	0.0230286734596511	0.160769846840414	0.0828124216023812	0.188046221433402	0.159709383913382	0.0426386306119616	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TTC	TTG	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.25	8	31.083333333333343	0.0393532888030902	0.315240156824316	0.12483590034826	-0.275886868021226	0.0221773357796772	0.134578897634194	0.125073201843286	0.318229561430317	0.136721596214649	0.0436044511908812	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333334	8	30.750000000000007	0.0391819232689515	0.319499782912404	0.122635210928121	-0.280317859643452	0.0219275182759213	0.146246361864727	0.105141992936456	0.243462020312931	0.134493514861386	0.0371376009413689	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.41666666666669	8	30.58333333333334	0.038759969965707	0.321673722092295	0.120494673029543	-0.282913752126588	0.0215383129211292	0.142585315853206	0.110715992317804	0.276452890640797	0.133373286386119	0.0339035013432556	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000001	8	29.916666666666675	0.0381034317265946	0.330678508474864	0.115228025862137	-0.292575076748269	0.0209731206399248	0.149988034009007	0.0898278344428302	0.199574326746618	0.139401489109179	0.0358350210846373	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	57	CAA	TTC	AAA	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.41666666666669	8	29.916666666666675	0.0382654718118908	0.330678508474864	0.115718048894005	-0.292413036662973	0.0218983325202185	0.148721678069166	0.111539875784195	0.299521990234101	0.144149843641407	0.0425056511565099	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	58	AGC	AAA	GCG	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.50000000000001	8	30.166666666666675	0.0387182740539804	0.327242322351052	0.118316829485292	-0.288524048297072	0.0221588138160947	0.142172064494435	0.100802832044645	0.240497142559241	0.139006050461951	0.0379289038820846	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	59	GCT	GCG	CTA	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.33333333333336	9	30.83333333333334	0.0393103070130301	0.369726004774488	0.106322807985895	-0.330415697761458	0.0218143180831123	0.149632018986607	0.0840970861224482	0.20612722477196	0.150035208875224	0.0276473438437954	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAAA:GCTTCTAAA	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000001	9	30.66666666666667	0.0392246245521367	0.372327664735418	0.105349745042476	-0.333103040183282	0.0220073215365395	0.163547466748293	0.0945822662476727	0.265346773620186	0.162649857317096	0.04056232940398	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CCA	AAA	2	ACCAAAATA:TCTAAAGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.66666666666669	8	29.5	0.038635150837581	0.336571435396116	0.114790343964011	-0.297936284558535	0.0224452705522793	0.14441940136491	0.0937973023000515	0.221022835225572	0.143345492736165	0.0376680309562423	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATT:AAAGTAATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000001	8	29.166666666666668	0.0394828001140665	0.341441829458385	0.115635510085851	-0.301959029344318	0.022759783068969	0.149093827355078	0.109204849652422	0.289651602239246	0.157924094362073	0.0558695661702317	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	63	ATT	TAA	TTG	2	ATAATTGCG:GTAATTGCG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.66666666666669	7	28.833333333333336	0.0391393148779276	0.293338244775017	0.133427248492424	-0.254198929897089	0.0217778941507334	0.139487820378313	NaN	NaN	0.133527004244214	0.05694578063535	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	64	GCG	TTG	CGC	2	ATTGCGCTC:ATTGCGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.83333333333334	7	29.166666666666668	0.039054375562259	0.289246860608988	0.135020914246166	-0.250192485046729	0.0221167646085425	0.130522779685686	0.126993110793306	0.287684697320028	0.126752621876374	0.0483971662783735	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CGC	TCA	2	GCGCTCAAT:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79	8	29.500000000000004	0.0389698041980333	0.336571435396116	0.115784645099692	-0.297601631198083	0.0224331352072813	0.145238868931133	0.0967766479058	0.231536214834026	0.143633447854098	0.0382699037530611	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	66	AAT	TCA	ATA	2	CTCAATAAA:CTTCATAGA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.66666666666667	8	28.833333333333336	0.038635150837581	0.346457784201476	0.111514743207829	-0.307822633363895	0.0226795619764177	0.158054025367733	0.102665256734989	0.277391631711756	0.154230959998989	0.0459497076059623	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	67	AAA	ATA	AAA	2	AATAAAAGA:CATAGAAGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.25	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.33333333333334	7	28.166666666666668	0.0383061974523115	0.30188317215805	0.126890800764001	-0.263576974705738	0.0220218031835068	0.136975588761356	NaN	NaN	0.144010685756126	0.0672110935080101	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	68	AGA	AAA	GAT	2	AAAAGATGG:AGAAGGTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.16666666666667	7	28.416666666666668	0.0516332867726302	0.298620355296958	0.172906119280731	-0.246987068524328	0.0324104511631989	0.134435850190813	0.179376982324921	0.335083077229826	0.136716429419456	0.0708301853615418	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	69	TGG	GAT	GGC	2	AGATGGCAG:AGGTGGCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.66666666666667	8	28.666666666666668	0.0519688353535439	0.349022437266925	0.148898264995494	-0.297053601913381	0.0330421266135308	0.15677171128753	NaN	NaN	0.15500106045634	0.0553063487706591	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	70	CAG	GGC	AGC	2	TGGCAGCTA:TGGCAGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.00000000000001	8	29	0.0661220906960037	0.343931200066585	0.192253830659162	-0.277809109370581	0.0351028837469181	0.150221049208935	0.184882559312748	0.298400292650397	0.162925791610087	0.0881708061284365	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	71	CTA	AGC	TAG	2	CAGCTAGCC:CAGCTCGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.66666666666667	9	29	0.0804341477651982	0.400561864447693	0.200803308812493	-0.320127716682495	0.0382359818786899	0.163172350415723	0.142686571560569	0.159337417648976	0.172418965641895	0.0633559750040187	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	72	GCC	TAG	CCC	2	CTAGCCCTT:CTCGCCTTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.16666666666667	9	29.166666666666668	0.0798980931045125	0.397542739270409	0.200979882694237	-0.317644646165896	0.0367076284131234	0.16330124978674	0.170201786748201	0.237669080536094	0.173675513906082	0.067406395846853	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	73	CTT	CCC	TAT	2	GCCCTTTAT:GCCTTATAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.83333333333334	9	28.666666666666668	0.0791943804803756	0.406743218119021	0.19470362861023	-0.327548837638646	0.0372951159946727	0.16764679370315	0.190024445593488	0.305540583396263	0.175349093059655	0.0617646688949154	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	74	TAT	TAT	ATA	2	CTTTATAAG:TTATATAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.83333333333334	8	28.5	0.0932463137734779	0.351626041530565	0.265186029361174	-0.258379727757087	0.0405746018376042	0.15611752825404	0.212986760925841	0.213101528629796	0.165703955898935	0.118928890570567	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	75	AAA	ATA	AAG	2	TATAAAGGC:TATAAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.00000000000001	8	28.333333333333336	0.0930394865024842	0.354269507203646	0.26262346775728	-0.261230020701162	0.0394575893131855	0.166099406098474	0.2000021904683	0.189148257521293	0.157438230908491	0.0970646122658438	16	0	984	0.984	0.016	0.032
ORF3a	all	ss13	76	GGC	AAG	GCG	2	AAAGGCGTT:AAGGGCTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.33333333333334	8	28.333333333333336	0.0951500406590924	0.354269507203646	0.268580949600037	-0.259119466544554	0.0428933001691505	0.15851483434049	0.232138376777222	0.247277908450244	0.15440968441145	0.0933217955614539	14	0	986	0.986	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	77	GTT	GCG	TCC	2	GGCGTTCAA:GGCTTCCAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.33333333333334	8	28	0.0951500406590924	0.359679810196415	0.264540955487973	-0.264529769537322	0.0416439066063383	0.171630688130205	0.221732401601331	0.232844292351738	0.175631285649323	0.132024713419218	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	78	CAA	TCC	AAC	2	GTTCAACTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.16666666666669	7	27.333333333333336	0.0940829130843776	0.313301400524984	0.300295220279027	-0.219218487440606	0.0412320359051501	0.14997426635283	0.277885915994232	0.279856346958999	0.147528948781915	0.137296209082333	27	0	973	0.973	0.027	0.054
ORF3a	all	ss13	79	CTT	AAC	TCA	2	CAACTTGTA:CAGTTCATT	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.00000000000001	7	27.833333333333336	0.0942944168777401	0.306347708328316	0.307801933274735	-0.212053291450576	0.0400460593231618	0.139734626808444	NaN	NaN	0.13531271421449	0.117083137904686	26	0	974	0.974	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TCA	TAT	2	CTTGTATGT:TTCATTTGC	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.50000000000001	6	28.166666666666668	0.0949346803392896	0.250581126994749	0.378858062767348	-0.15564644665546	0.0422573726339997	0.121648982551776	0.375603235881005	0.313135035488762	0.113550328095722	0.170460222858584	57	0	943	0.943	0.057	0.114
ORF3a	all	ss13	81	TGC	TAT	GCA	2	ATTTGCAAT:GTATGTAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.08333333333334	5	27.916666666666668	0.0941885460903394	0.20465023999998	0.460241561848882	-0.110461693909641	0.0425503488606344	0.102591845745582	NaN	NaN	0.101945341626248	0.278569509269379	92	0	908	0.908	0.092	0.184
ORF3a	all	ss13	82	AAT	GCA	ATA	2	TGCAATTTA:TGTAATATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.25000000000001	5	28.25	0.093977517058638	0.201879034260684	0.46551400150491	-0.107901517202046	0.0406457713119745	0.104367927309238	NaN	NaN	0.101171135158858	0.286186507496075	115	0	885	0.885	0.115	0.23
ORF3a	all	ss13	83	ATG	ATA	TAC	2	AATATGCTG:AATTTACTG	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.166666666666667	0.5	0.166666666666667	1	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.25000000000001	5	28.25	0.093977517058638	0.201879034260684	0.46551400150491	-0.107901517202046	0.0407222953988909	0.100633185733596	NaN	NaN	0.10229979138082	0.291536045372179	119	0	881	0.881	0.119	0.238
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TGC	2	ATGCTGCTG:TTACTGCTG	1:1	FALSE	1.25	1	0	0.75	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.25000000000001	4	28.083333333333332	0.0798094452064726	0.157958351375552	0.505256255914718	-0.0781489061690789	0.0377117360193636	0.0888415356013535	NaN	NaN	0.0888144978505885	0.378907204667076	172	0	828	0.828	0.172	0.344
ORF3a	all	ss13	85	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTA:CTGCTGCTT	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.66666666666669	4	28.833333333333332	0.0934540638415831	0.153398778089708	0.609223000374429	-0.0599447142481249	0.039295335932001	0.0803178782431505	NA	NA	0.0908312056174412	0.509281252459581	228	0	772	0.772	0.228	0.456
ORF3a	all	ss13	86	CTA	TGC	TAT	2	CTGCTATTT:CTGCTTTTT	1:1	FALSE	1.5	1	0.25	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.83333333333336	4	29.166666666666668	0.0932463137734779	0.151456007747705	0.615665995427579	-0.0582096939742272	0.0400976186418197	0.0811504176371678	NaN	NaN	0.0873851875904975	0.505329480963284	243	0	757	0.757	0.243	0.486
ORF3a	all	ss13	87	TTT	TAT	TTG	2	CTATTTGTT:CTTTTTGTG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.75000000000003	4	30.166666666666668	0.0933500730718353	0.145913043990275	0.639765099260468	-0.0525629709184396	0.042272640388268	0.0806612346688178	NaN	NaN	0.0843883769848241	0.533370089627279	272	0	728	0.728	0.272	0.544
ORF3a	all	ss13	88	GTG	TTG	TGA	2	TTTGTGACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.58333333333336	4	29.5	0.0923227698874005	0.149561992614941	0.617287642891284	-0.0572392227275405	0.0395153536278502	0.0820715528298809	NaN	NaN	0.0902126714808932	0.525759754447453	264	0	736	0.736	0.264	0.528
ORF3a	all	ss13	89	ACA	TGA	CAA	2	GTGACAATT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.4166666666667	4	29.666666666666664	0.092526415385480107	0.148632696437812	0.622517236133124	-0.0561062810523315	0.0399870163907413	0.077130634491639	NaN	NaN	0.0874262367377938	0.521031852315193	262	0	738	0.738	0.262	0.524
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CAA	TCT	2	ACAATTTAC:ACCATCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.08333333333336	4	29.333333333333332	0.0917171833187057	0.150503021596613	0.609404265414226	-0.0587858382779078	0.0412166518485236	0.0834532126507467	NaN	NaN	0.0894046415220828	0.510843032218122	256	1	743	0.743	0.256	0.512
ORF3a	all	ss13	91	TAC	TCT	ACT	2	ATCTATTCA:ATTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.41666666666669	4	29.666666666666664	0.092526415385480107	0.148632696437812	0.622517236133124	-0.0561062810523315	0.0401680708686483	0.0798442044962493	NaN	NaN	0.0876370514385646	0.522034863358315	243	0	757	0.757	0.243	0.486
ORF3a	all	ss13	92	TCA	ACT	CAC	2	TACTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.41666666666669	4	29.666666666666664	0.092526415385480107	0.148632696437812	0.622517236133124	-0.0561062810523315	0.0416278921346549	0.0773343017710782	NaN	NaN	0.0867361192434807	0.517721399582635	246	0	754	0.754	0.246	0.492
ORF3a	all	ss13	93	CAC	CAC	ACC	2	TCACACCTT:TCACATCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.91666666666669	4	28.833333333333332	0.0907253574709978	0.153398778089708	0.591434681558815	-0.0626734206187102	0.0396727673954722	0.079348037233859	NaN	NaN	0.08814436330433	0.4770647037125	242	1	757	0.757	0.242	0.484
ORF3a	all	ss13	94	CTT	ACC	TTC	2	CACCTTCTA:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.41666666666669	4	28.666666666666668	0.0913178588331776	0.154389040653112	0.591478892846771	-0.063071181819934	0.039126704226905	0.0843086178052567	NaN	NaN	0.0885919997192585	0.476508966451213	264	0	736	0.736	0.264	0.528
ORF3a	all	ss13	95	CTA	TTC	TAC	2	CTTCTACTT:CTTTTGCTT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.91666666666669	4	28.833333333333332	0.0907253574709978	0.153398778089708	0.591434681558815	-0.0626734206187102	0.0385607851238605	0.0822849802678823	NaN	NaN	0.0913825736976735	0.492816795624042	234	0	766	0.766	0.234	0.468
ORF3a	all	ss13	96	CTT	TAC	TTC	2	CTACTTCTA:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1.08333333333333	1	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.91666666666669	4	29.833333333333332	0.0919181597303021	0.147714914296514	0.622267292155693	-0.0557967545662119	0.0405500276310612	0.0762647608167089	NaN	NaN	0.0906379928967917	0.538158506570049	260	0	740	0.74	0.26	0.52
ORF3a	all	ss13	97	CTA	TTC	TAG	2	CTTCTAGCT:CTTGTCGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.16666666666669	4	30.083333333333336	0.0916170247341314	0.146359364647636	0.625973096799797	-0.0547423399135045	0.0399501730105508	0.0834205647981697	NaN	NaN	0.0906685586080001	0.546001082960259	253	0	747	0.747	0.253	0.506
ORF3a	all	ss13	98	GCT	TAG	CTG	2	CTAGCTGCT:GTCGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.16666666666669	4	30.250000000000004	0.0778235325055638	0.145469445655623	0.534981983019302	-0.0676459131500594	0.0371569120863818	0.0809831703008217	NaN	NaN	0.0808151964228531	0.40256757267424	193	0	807	0.807	0.193	0.386
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.33333333333334	4	29.58333333333334	0.0766624238758939	0.149095891727942	0.514182000505963	-0.0724334678520486	0.0373977770875952	0.0788697626299465	NaN	NaN	0.0896988039589348	0.41936766488095	208	0	792	0.792	0.208	0.416
ORF3a	all	ss13	100	GGC	CAG	GCA	2	GCAGGTATG:GCTGGCATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.50000000000001	4	29.41666666666667	0.0755354817013731	0.150031026615648	0.503465739089294	-0.0744955449142754	0.0362484425584231	0.0859560828665604	NaN	NaN	0.0856544849246495	0.384452633808182	178	2	820	0.82	0.178	0.356
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA:GGTATGGAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.83333333333336	4	29.750000000000004	0.0752195633615916	0.148172379571929	0.50764902054554	-0.0729528162103373	0.0351810815452588	0.0798984801860117	NaN	NaN	0.0838166933320336	0.38408988751255	193	1	806	0.806	0.193	0.386
ORF3a	all	ss13	102	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGCA:ATGGAGGCG	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.83333333333336	4	29.750000000000004	0.0761753537657808	0.148172379571929	0.514099550711489	-0.0719970258061481	0.0374199875898299	0.0816960527490975	NaN	NaN	0.0839088004243557	0.390870911496481	183	0	817	0.817	0.183	0.366
ORF3a	all	ss13	103	GCA	AAG	CAC	2	GAAGCACAA:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.33333333333336	4	30.250000000000004	0.0902374551086072	0.145469445655623	0.620318959090768	-0.055231990547016	0.039833813031306	0.079136588046188	NaN	NaN	0.088095734556821	0.530689259275061	256	1	743	0.743	0.256	0.512
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTC:GCGCAATTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.66666666666669	4	30.583333333333336	0.0898508998594655	0.143721781908901	0.62517245935914	-0.0538708820494353	0.0376561873549907	0.0792833544911285	NaN	NaN	0.0860732276538783	0.531398452405107	278	1	721	0.721	0.278	0.556
ORF3a	all	ss13	105	TTC	AAT	TCT	2	CAATTCTTG:CAATTTTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.50000000000001	4	31.083333333333336	0.0912185711042866	0.141177857059553	0.646125199830793	-0.049959285955266	0.0393142753794778	0.0763039979075964	NaN	NaN	0.0844720671579865	0.554232572181046	287	0	713	0.713	0.287	0.574
ORF3a	all	ss13	106	TTG	TCT	TGT	2	TTCTTGTAC:TTTTTGTAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.83333333333336	4	30.750000000000004	0.0908235725293773	0.142863650574837	0.635736047370573	-0.0520400780454593	0.0401438516574052	0.0761827726915108	NaN	NaN	0.0813420354238481	0.522323065957719	277	0	723	0.723	0.277	0.554
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TGT	ACA	2	TTGTACATC:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.83333333333336	4	31.41666666666667	0.0920189790070996	0.139531497680893	0.659485353031513	-0.0475125186737935	0.0404212404603552	0.0751427483432038	NaN	NaN	0.0791824893545136	0.548480774991545	279	1	720	0.72	0.279	0.558
ORF3a	all	ss13	108	ATC	ACA	TCT	2	TACATCTAT:TACCTCTAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.83333333333336	4	31.91666666666667	0.0920189790070996	0.137132914796851	0.671020368402558	-0.0451139357897514	0.0389873243547323	0.0753624120394854	NaN	NaN	0.0794834175718084	0.570313887605662	266	2	732	0.732	0.266	0.532
ORF3a	all	ss13	109	TAT	TCT	ATG	2	ATCTATGCC:CTCTATGCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.00000000000001	3	31.91666666666667	0.0918175614096642	0.100428343016685	0.914259447598474	-0.00861078160702046	0.0408506602858188	0.0633421099438655	NaN	NaN	0.0742371188419539	0.907660272926217	448	1	551	0.551	0.448	0.896
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ATG	CCC	2	TATGCCCTG:TATGCCTTG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.00000000000001	3	31.91666666666667	0.0918175614096642	0.100428343016685	0.914259447598474	-0.00861078160702046	0.0392480560239504	0.0596644221419954	NaN	NaN	0.070221780189875	0.902405908306009	440	1	559	0.559	0.44	0.88
ORF3a	all	ss13	111	CTG	CCC	TGA	2	GCCCTGATT:GCCTTGATA	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.66666666666669	3	32.25000000000001	0.0922212833511261	0.0993184392369987	0.928541407412405	-0.00709715588587251	0.0403193448091104	0.0639042187845161	NaN	NaN	0.0687834150264729	0.917819153760545	451	0	549	0.549	0.451	0.902
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TGA	TAT	2	CTGATTTAT:TTGATATAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.50000000000001	3	32.41666666666667	0.0900437621201392	0.0987726497511971	0.911626470960883	-0.00872888763105795	0.040166305067366	0.0607411842076708	NaN	NaN	0.0681937507911994	0.898147957275624	447	1	552	0.552	0.447	0.894
ORF3a	all	ss13	113	TAT	TAT	ATA	2	ATATATTTT:ATTTATATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.83333333333336	3	33.41666666666667	0.089658862987337	0.0956200277799543	0.937657780163635	-0.00596116479261728	0.0386679170289782	0.0615713063187237	NA	NA	0.0663438577077818	0.928404388165222	482	0	518	0.518	0.482	0.964
ORF3a	all	ss13	114	ATC	ATA	TCT	2	TATATCTTG:TATTTTCTA	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.50000000000003	3	33.75	0.0900437621201392	0.094613463995175	0.951701357480486	-0.00456970187503583	0.0387919643044805	0.0581844069826033	NaN	NaN	0.0679803845723569	0.946405855840372	483	0	517	0.517	0.483	0.966
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TCT	TAC	2	ATCTTGCAA:TTTCTACAA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.6666666666667	2	34.083333333333336	0.0910206427532005	0.0611024764460933	1.4896391774481	0.0299181663071073	0.0384458155740703	0.0428771056084773	NaN	NaN	0.056672569008499	0.597559961614957	710	0	290	0.29	0.71	0.58
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAA	2	CTACAATGC:TTGCAAATT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.33333333333336	2	34.083333333333336	0.0902374551086072	0.0611024764460933	1.47682156856961	0.029134978662514	0.0382730871944	0.0476706993921419	NaN	NaN	0.0547307595202266	0.594495516251541	695	1	304	0.304	0.695	0.608
ORF3a	all	ss13	117	ATT	AAA	GCA	2	CAAATTGTA:CAATGCATC	1:1	TRUE	2	0.5	0.5	0	2	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.00000000000001	2	34.75	0.0918175614096642	0.0598821656332629	1.53330395517062	0.0319353957764013	0.0399523555203378	0.0453732201393438	NA	NA	0.0542041269912144	0.555747854926857	728	0	272	0.272	0.728	0.544
ORF3a	all	ss13	118	ATC	GCA	TAA	2	ATTGTAAGT:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.58333333333334	3	34.91666666666667	0.0647651348577861	0.0912516429860269	0.709742123412544	-0.0264865081282408	0.0300967193517464	0.0552520749824398	NA	NA	0.0589306373931251	0.653105439694722	311	0	689	0.689	0.311	0.622
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TAA	ACG	2	ATCAACGCA:GTAAGTTTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.91666666666669	2	34.583333333333336	0.0644865306153867	0.0601826482875392	1.07151367462735	0.00430388232784751	0.0285316986428191	0.0457237959358322	NA	NA	0.0477150200094877	0.928128492120404	561	1	438	0.438	0.561	0.876
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT:AGTTTTTGT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.08333333333334	3	34.75000000000001	0.0516889101836223	0.0917171833187057	0.563568442829408	-0.0400282731350834	0.0268493460520091	0.0556698343701426	NA	NA	0.0571726795456874	0.483846504342381	210	2	788	0.788	0.21	0.42
ORF3a	all	ss13	121	TGT	CAT	GTA	2	GCATGTAGA:TTTTGTAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.91666666666669	2	34.583333333333336	0.0385111332176099	0.0601826482875392	0.639904263328731	-0.0216715150699293	0.0217669479778911	0.04419234125991	NA	NA	0.0492828824663994	0.660127481019124	333	7	660	0.66	0.333	0.666
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GTA	GAA	2	TGTAGAATT:TGTAGATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333334	3	35.25000000000001	0.0389276557511925	0.0903346148069003	0.430927345341588	-0.0514069590557078	0.0233472593785614	0.0554232634419832	NA	NA	0.0594421145194616	0.387135471923636	176	1	823	0.823	0.176	0.352
ORF3a	all	ss13	123	ATT	GAA	TTA	2	AGAATTATT:AGATTTATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333334	3	35.083333333333336	0.0389276557511925	0.0907908105289243	0.428762068808614	-0.0518631547777318	0.0228137420352895	0.0544985303749237	NA	NA	0.0597960906160165	0.385759286283597	168	2	830	0.83	0.168	0.336
ORF3a	all	ss13	124	ATC	TTA	TCA	2	ATTATTATG:TTTATCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.41666666666669	3	35.41666666666667	0.0256161505491714	0.0898829861073045	0.284994431744738	-0.0642668355581331	0.0182230135621388	0.0493644505818317	NA	NA	0.0570078470759075	0.259601653515207	100	4	896	0.896	0.1	0.2
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TCA	TGA	2	ATCATGAGA:ATTATGAGA	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.41666666666669	3	35.41666666666667	0.0256161505491714	0.0898829861073045	0.284994431744738	-0.0642668355581331	0.017947564340036	0.0545430233507958	NA	NA	0.0581724694333696	0.269261971178528	106	3	891	0.891	0.106	0.212
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATGC:ATGAGATGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.58333333333336	3	35.41666666666667	0.0252389746234555	0.0898829861073045	0.280798132288625	-0.064644011483849	0.0178159463746649	0.0544863659713498	NA	NA	0.0568674481808311	0.255643253685143	106	7	887	0.887	0.106	0.212
ORF3a	all	ss13	127	TGC	GAT	GCT	2	AGATGCTGG:AGATGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.91666666666669	3	35.75000000000001	0.0644865306153867	0.088993157850987	0.72462346738347	-0.0245066272356003	0.0447264072881434	0.0511290174354544	NA	NA	0.0721197615086481	0.73400367806543	336	0	664	0.664	0.336	0.672
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCTG:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.66666666666669	4	35.833333333333336	0.078331997525698	0.120863906464681	0.648100825274815	-0.0425319089389834	0.045808224451943	0.0627139667759011	NaN	NaN	0.075832418940819	0.574888139362635	251	1	748	0.748	0.251	0.502
ORF3a	all	ss13	129	CTG	GGC	TGT	2	TGGCTGTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.33333333333336	4	35.16666666666667	0.0786746849626466	0.123354245726484	0.637794706613454	-0.0446795607638371	0.0473602709832855	0.0672099875849866	NaN	NaN	0.0764012133157659	0.558681049405879	268	0	732	0.732	0.268	0.536
ORF3a	all	ss13	130	TGC	TGT	GCT	2	CTGTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.50000000000003	4	34.833333333333336	0.0774882105210195	0.124638389543236	0.621704202092079	-0.0471501790222168	0.0479519442113681	0.0664041276489046	NaN	NaN	0.076564872172736	0.538013330736907	254	0	746	0.746	0.254	0.508
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GCT	GGA	2	TGCTGGAAG:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.08333333333336	4	34.583333333333336	0.0779078173603665	0.125619222573624	0.620190252448867	-0.0477114052132579	0.0474935510755367	0.0679225270235295	NaN	NaN	0.0787611853277496	0.54466545318437	256	0	744	0.744	0.256	0.512
ORF3a	all	ss13	132	AAG	GGA	AGT	2	TGGAAGTGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.75000000000003	4	34.583333333333336	0.078246792038373	0.125619222573624	0.622888682442794	-0.0473724305352514	0.0490559903499577	0.0672949465302046	NaN	NaN	0.0779303107927871	0.543265761187699	281	0	719	0.719	0.281	0.562
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AGT	GCA	2	AAGTGCAAA:AAGTGCAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.25000000000003	4	34.083333333333336	0.0777394299845026	0.127628054258581	0.609109262349156	-0.0498886242740789	0.0466222717578065	0.0675450393436782	NaN	NaN	0.0777428512882081	0.521059330125781	249	1	750	0.75	0.249	0.498
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCC:TGCAGATCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.4166666666667	4	34.083333333333336	0.0775717695799524	0.127628054258581	0.60779559815891	-0.050056284678629	0.0477743434270831	0.0682668639153143	NaN	NaN	0.0783450169203453	0.522874258427835	249	2	749	0.749	0.249	0.498
ORF3a	all	ss13	135	TCC	AAT	CCA	2	AAATCCAAG:AGATCCAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.75000000000003	4	34.333333333333336	0.0646255322826462	0.126615652181289	0.510407135052426	-0.0619901198986428	0.044250720067728	0.0675174986445715	NA	NA	0.0790543655546622	0.432954777782154	199	3	798	0.798	0.199	0.398
ORF3a	all	ss13	136	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAT:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.00000000000003	4	34.75000000000001	0.0644172539103222	0.124963623649128	0.51548804387421	-0.0605463697388062	0.044969565722276	0.0661478111088313	NaN	NaN	0.0767088177480969	0.429935925725899	209	3	788	0.788	0.209	0.418
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AAA	ACC	2	AAAAATCCA:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.41666666666669	4	34.16666666666667	0.06407309248799	0.127288788480472	0.503367918360067	-0.0632156959924819	0.0449735627856149	0.0685928437394441	NA	NA	0.0747981595947116	0.398026860309418	177	1	822	0.822	0.177	0.354
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA:AATCCATTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.75000000000003	4	34.16666666666667	0.0646255322826462	0.127288788480472	0.50770796905307	-0.0626632561978257	0.0445772777420461	0.069633466558948	NA	NA	0.07413343889247	0.397956460285871	176	2	822	0.822	0.176	0.352
ORF3a	all	ss13	139	TTA	CAT	TAC	2	CCATTACTC:CCATTACTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.58333333333336	4	34.33333333333334	0.0647651348577861	0.126615652181289	0.511509704701083	-0.0618505173235029	0.0464247795430714	0.0694621040642844	NA	NA	0.0738785032295026	0.402484459961119	191	5	804	0.804	0.191	0.382
ORF3a	all	ss13	140	CTC	TAC	TCT	2	TTACTCTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.25000000000003	4	35.33333333333334	0.0659040642696656	0.122722067836352	0.537018854323314	-0.056818003566686	0.0440420119096716	0.063264698396234	NA	NA	0.0759617904865883	0.454471399182749	211	3	786	0.786	0.211	0.422
ORF3a	all	ss13	141	TAT	TCT	ATG	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.25000000000003	4	35.33333333333334	0.0659040642696656	0.122722067836352	0.537018854323314	-0.056818003566686	0.0460195395123975	0.0675403609366445	NaN	NaN	0.0761612871932845	0.455654063751677	234	1	765	0.765	0.234	0.468
ORF3a	all	ss13	142	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGCC:TATGATGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.25000000000003	4	36	0.0659040642696656	0.120256987556385	0.548026901461882	-0.054352923286719	0.0453819703892696	0.065359210389211	NA	NA	0.0737099780802916	0.460885853742868	218	3	779	0.779	0.218	0.436
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ATG	CCA	2	GATGCCAAC:GATGCTAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.91666666666669	4	36.333333333333336	0.0661950873041523	0.119061291806916	0.555974878985038	-0.0528662045027636	0.0428191212404056	0.0657649526995087	NA	NA	0.072941904442813	0.468592298393226	210	1	789	0.789	0.21	0.42
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CCA	ACT	2	GCCAACTAC:GCTAACTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.25000000000003	5	36.66666666666667	0.0659040642696656	0.150503021596613	0.437891967686239	-0.0845989573269477	0.0445218938572866	0.074359558937606	NaN	NaN	0.0855196234695347	0.322548448943913	136	0	864	0.864	0.136	0.272
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.25000000000003	5	36.66666666666667	0.0659040642696656	0.150503021596613	0.437891967686239	-0.0845989573269477	0.0446509729676832	0.0725318760726142	NaN	NaN	0.0853121554838483	0.321373103848458	143	1	856	0.856	0.143	0.286
ORF3a	all	ss13	146	TTT	ACT	TTG	2	TACTTTGTT:TATTTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.41666666666669	5	36.5	0.0666364763682366	0.151264442981809	0.440529678056925	-0.0846279666135727	0.0456990828016116	0.0750788943546343	NA	NA	0.0860714492794533	0.325494621407366	138	1	861	0.861	0.138	0.276
ORF3a	all	ss13	147	GTA	TTG	TAT	2	TTTGTATGT:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.75000000000003	5	35.666666666666664	0.0663415654213976	0.155190536855492	0.427484605476767	-0.0888489714340943	0.0444985627208071	0.0757725893654089	NaN	NaN	0.0846649361755675	0.293985432596046	127	0	873	0.873	0.127	0.254
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TAT	GCT	2	GTATGTTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.75000000000003	5	36.666666666666664	0.0672342400167485	0.150503021596613	0.446730167298258	-0.0832687815798649	0.0465479093733304	0.0752522740196453	NA	NA	0.0816601403409698	0.307871130742347	104	0	896	0.896	0.104	0.208
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC:TGTTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.08333333333337	5	36.49999999999999	0.0669340227304817	0.151264442981809	0.442496738896735	-0.0843304202513276	0.0462698851634684	0.0751563332590497	NaN	NaN	0.0829664167599424	0.309419701563729	132	1	867	0.867	0.132	0.264
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.4166666666667	5	35.83333333333333	0.0666364763682366	0.154389040653112	0.431614032228871	-0.0877525642848749	0.0470739177506089	0.0757006866655903	NaN	NaN	0.0872239964678887	0.314386761612925	122	0	878	0.878	0.122	0.244
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT:CATACTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.75000000000003	5	35.83333333333333	0.0672342400167485	0.154389040653112	0.435485833271116	-0.0871548006363631	0.0458391603603722	0.0778366222003069	NA	NA	0.0869803896358256	0.316341092922591	130	1	869	0.869	0.13	0.26
ORF3a	all	ss13	152	AAT	CAC	ATA	2	ACACATAAC:ACTAATAAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.75000000000003	5	34.83333333333333	0.0663415654213976	0.159326652781303	0.41638711579826	-0.0929850873599056	0.0466711402710052	0.0800593260288813	NaN	NaN	0.0841814512758779	0.269341930648631	110	0	890	0.89	0.11	0.22
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ATA	ACT	2	AATAACTAT:CATAACTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.4166666666667	5	35.49999999999999	0.0535344239114693	0.156000428408735	0.34316844163533	-0.102466004497265	0.0455067427418671	0.0765232448582953	NA	NA	0.0836778802685261	0.220752672707455	89	2	909	0.909	0.089	0.178
ORF3a	all	ss13	154	TAT	ACT	ATG	2	AACTATGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.25000000000003	5	35.16666666666666	0.0536541558618204	0.157645932730055	0.340345957124661	-0.103991776868235	0.0437402647558184	0.0820204971156516	NA	NA	0.0852398952886333	0.222468856950753	88	0	912	0.912	0.088	0.176
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ATG	ACT	2	TATGACTAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	6	35.16666666666666	0.0534152253723939	0.193580949501978	0.275932241833787	-0.140165724129584	0.0434306292081346	0.0897045372956539	NA	NA	0.0973919801082332	0.150096231745371	50	1	949	0.949	0.05	0.1
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.91666666666669	6	35.16666666666666	0.0538952343889476	0.193580949501978	0.278411871248709	-0.139685715113031	0.0432422607732063	0.0852267489791629	NaN	NaN	0.0953204585584604	0.142802906583472	47	1	952	0.952	0.047	0.094
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.91666666666669	6	35.16666666666666	0.0538952343889476	0.193580949501978	0.278411871248709	-0.139685715113031	0.0436191694910856	0.0868948695375664	NaN	NaN	0.0980329894628309	0.154190508459035	48	0	952	0.952	0.048	0.096
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.75000000000001	6	34.83333333333332	0.0540165882431453	0.195697415235261	0.276020959082205	-0.141680826992116	0.0451916921299953	0.0905670230585732	0.392621308285072	0.482042766743001	0.0955538961837889	0.13814560850119	42	0	958	0.958	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAC:ATACCATAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666669	6	34.83333333333332	0.0542609435735893	0.195697415235261	0.277269597599736	-0.141436471661672	0.0486571384184751	0.086928898924494	NA	NA	0.0936810653019834	0.131103185986023	29	1	970	0.97	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	160	TAC	CAT	ACA	2	CCATACAAC:CCATATAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333336	6	34.83333333333332	0.0537744248135208	0.195697415235261	0.274783521023386	-0.14192299042174	0.0450244983336483	0.0878423202959638	NA	NA	0.0921321143766229	0.123455791640948	42	0	958	0.958	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ACA	ACA	2	TACAACAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333336	6	34.83333333333332	0.0537744248135208	0.195697415235261	0.274783521023386	-0.14192299042174	0.043322397214573	0.0901927194034263	NA	NA	0.0923989706496768	0.124543233890036	42	2	956	0.956	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	162	AGT	ACA	GTG	2	AACAGTGTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.9166666666667	6	34.33333333333332	0.0538952343889476	0.198960851821961	0.270883613009335	-0.145065617433013	0.0440598339230672	0.0889056903141513	NaN	NaN	0.0970928767503587	0.135151771100235	56	1	943	0.943	0.056	0.112
ORF3a	all	ss13	163	GTC	GTG	TCA	2	AGTGTCACA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.4166666666667	6	34.16666666666666	0.0542609435735893	0.200073130342575	0.271205551093648	-0.145812186768986	0.0468191963166442	0.0977667770519104	NA	NA	0.0963473629283735	0.130177853901536	55	0	945	0.945	0.055	0.11
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TCA	CAG	2	GTCACAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333337	6	34.16666666666666	0.0537744248135208	0.200073130342575	0.268773846450273	-0.146298705529054	0.0442275027640551	0.0928798766107213	NA	NA	0.0974537159159855	0.133300690072834	55	1	944	0.944	0.055	0.11
ORF3a	all	ss13	165	GAT	CAG	ATA	2	ACAGATACA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.4166666666667	6	33.83333333333332	0.0535344239114693	0.202335646591906	0.264582266215522	-0.148801222680436	0.0442834481219433	0.093301939307232	NA	NA	0.0981878583414913	0.12965221328152	48	0	952	0.952	0.048	0.096
ORF3a	all	ss13	166	ACA	ATA	CAA	2	GATACAATT:GATACAGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.25000000000003	6	33.99999999999999	0.0536541558618204	0.20119798994601	0.266673418935339	-0.147543834084189	0.0446634310097843	0.0919205014973638	NaN	NaN	0.0969722668975018	0.128133040816587	49	0	951	0.951	0.049	0.098
ORF3a	all	ss13	167	ATT	CAA	TTG	2	ACAATTGTC:ACAGTTGTC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.4166666666667	6	33.83333333333332	0.0535344239114693	0.202335646591906	0.264582266215522	-0.148801222680436	0.0443564195495614	0.0899371256147354	NaN	NaN	0.0955617893829152	0.119441875220524	33	1	966	0.966	0.033	0.066
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TTG	TCA	2	ATTGTCGTT:GTTGTCATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.83333333333337	5	34.16666666666666	0.0539558430514737	0.162798378928371	0.331427397537008	-0.108842535876897	0.0432257142793512	0.077768646931307	NA	NA	0.0888580289897681	0.220611474845783	83	4	913	0.913	0.083	0.166
ORF3a	all	ss13	169	ATC	TCA	TCA	2	GTCATCACC:GTCGTTACT	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	5	34.33333333333332	0.0535942229866087	0.161916285324778	0.330999583390313	-0.10832206233817	0.0452001666032934	0.0794708470682389	NA	NA	0.0872551984389823	0.2144433822746	91	5	904	0.904	0.091	0.182
ORF3a	all	ss13	170	ACC	TCA	CCT	2	ATCACCTCA:GTTACTGAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.33333333333337	4	33.499999999999986	0.066710614512372	0.130054644852002	0.512942960155608	-0.0633440303396297	0.0469887334765578	0.070979945645347	NA	NA	0.0772234057677281	0.412062298379628	181	2	817	0.817	0.181	0.362
ORF3a	all	ss13	171	GAA	CCT	AAG	2	ACCTCAGGT:ACTGAAGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.58333333333337	4	33.249999999999986	0.0805241909860523	0.131123163798598	0.614111104806285	-0.0505989728125454	0.046598067093683	0.071701181779174	NaN	NaN	0.0831276927141472	0.542730115762078	260	0	740	0.74	0.26	0.52
ORF3a	all	ss13	172	GGT	AAG	GTG	2	GAAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.08333333333337	3	33.41666666666666	0.0810687166991055	0.0956200277799544	0.84782151376974	-0.0145513110808489	0.0497851560034044	0.0622529758145381	NA	NA	0.072689190992945	0.841335624920662	404	0	596	0.596	0.404	0.808
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.4166666666667	3	33.74999999999999	0.0807048841711543	0.0946134639951751	0.852995765753486	-0.0139085798240208	0.0487924407964839	0.0590150955270901	NA	NA	0.0705020190047167	0.843609078608598	413	2	585	0.585	0.413	0.826
ORF3a	all	ss13	174	GGA	ACG	GAA	2	GACGGCATT:GATGGAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.58333333333337	3	33.91666666666666	0.0816206643196587	0.0941180977157372	0.867215405969804	-0.0124974333960785	0.0479212149759852	0.060895159813808	NA	NA	0.0730411801632247	0.86414419425357	421	0	579	0.579	0.421	0.842
ORF3a	all	ss13	175	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAAAT:GGCATTTCA	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333337	3	34.41666666666666	0.0821801867828476	0.0926626795339059	0.886874707230728	-0.0104824927510583	0.0483596884447542	0.0576098633440632	NaN	NaN	0.0712968030191819	0.88311139876412	424	3	573	0.573	0.424	0.848
ORF3a	all	ss13	176	AAT	CAA	ATC	2	ACAAATCAG:ATTTCAACA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	3	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.50000000000003	5	35.08333333333332	0.0828427466732329	0.158062767299149	0.524112971630095	-0.0752200206259157	0.0497080983350138	0.0871481007319531	NaN	NaN	0.104302633883139	0.470804395407758	210	0	790	0.79	0.21	0.42
ORF3a	all	ss13	177	ACA	ATC	AGC	2	AATCAGCCA:TCAACACCA	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.4166666666667	5	35.49999999999999	0.0403232602433046	0.156000428408735	0.258481727612018	-0.11567716816543	0.023087921246672	0.0894575173942479	NA	NA	0.090844192815463	0.20289107890012	53	2	945	0.945	0.053	0.106
ORF3a	all	ss13	178	CCA	AGC	CAA	2	ACACCAAAA:CAGCCAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333337	4	35.41666666666666	0.0264928206228062	0.122408407943652	0.216429745863549	-0.0959155873208458	0.0184710225639642	0.0799042444736284	NA	NA	0.0840333942063133	0.25370414236737	94	5	901	0.901	0.094	0.188
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTA:CCAAAACTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333337	4	35.41666666666666	0.0264928206228062	0.122408407943652	0.216429745863549	-0.0959155873208458	0.0182769724317229	0.0802430201342973	NA	NA	0.0818062262022403	0.241007226321634	87	7	906	0.906	0.087	0.174
ORF3a	all	ss13	180	CTA	AAC	TAA	2	AAACTAAAA:AAACTCAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.6666666666667	4	35.91666666666666	0.0269087157486763	0.120559681536883	0.223198298184324	-0.0936509657882068	0.0180865142727264	0.0808567487662077	NA	NA	0.0850980971854815	0.271111720696656	92	2	906	0.906	0.092	0.184
ORF3a	all	ss13	181	AAA	TAA	AAG	2	CTAAAAGAA:CTCAAAGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.33333333333336	4	36.08333333333332	0.0266694765273651	0.119955812971472	0.222327504326178	-0.0932863364441069	0.019863808315628	0.0850647071404943	NA	NA	0.0826759651274236	0.259177694715036	85	6	909	0.909	0.085	0.17
ORF3a	all	ss13	182	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666669	4	36.08333333333332	0.0269087157486763	0.119955812971472	0.224321898890184	-0.0930470972227957	0.0186080799191666	0.0762987847112231	NA	NA	0.0852478285802416	0.275057614462803	88	6	906	0.906	0.088	0.176
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	GAAGACTAC:GAAGACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.83333333333334	4	36.58333333333332	0.0272138698048234	0.11818004032857	0.230274670148715	-0.0909661705237471	0.0186654658381092	0.0811722721987285	NA	NA	0.0822800168444816	0.268913458031581	83	5	912	0.912	0.083	0.166
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA:GACTATCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.33333333333334	4	37.41666666666666	0.0420670999882827	0.115334665090853	0.364739429859576	-0.0732675651025699	0.0248161864072411	0.0762992768535299	NA	NA	0.0839389096152545	0.38273517977015997	164	5	831	0.831	0.164	0.328
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT:TATCAAATT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000001	4	36.91666666666666	0.0557100557871529	0.117025173722032	0.476051895632986	-0.0613151179348791	0.027678900859818	0.0836153255835993	NaN	NaN	0.0814277154467266	0.451449558289421	216	2	782	0.782	0.216	0.432
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.25000000000001	4	37.16666666666666	0.0559047993353385	0.116173757560117	0.481217105389824	-0.0602689582247781	0.0285474991638396	0.0749849208621478	NaN	NaN	0.0830714534131113	0.468140776903275	240	0	760	0.76	0.24	0.48
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.75000000000001	4	37.16666666666666	0.056298401666626	0.116173757560117	0.484605153943593	-0.0598753558934906	0.0278040016053475	0.0804571770756007	NA	NA	0.0842330994326254	0.47719001583123	239	0	761	0.761	0.239	0.478
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.41666666666667	4	37.49999999999999	0.0565638983071325	0.115057659974651	0.491613494656457	-0.0584937616675185	0.028401866978162	0.0750841476259462	NA	NA	0.0849988507164828	0.4913449736262	237	1	762	0.762	0.237	0.474
ORF3a	all	ss13	189	TAT	GTT	ATT	2	GGTTATTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.58333333333334	4	36.99999999999999	0.0556454425645553	0.116739982283845	0.476661392917273	-0.0610945397192897	0.0279006884389936	0.0776968225015645	NA	NA	0.0798267371329462	0.444069523313072	222	1	777	0.777	0.222	0.444
ORF3a	all	ss13	190	TCT	ATT	CTG	2	TATTCTGAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.91666666666667	4	36.33333333333333	0.0546316519559279	0.119061291806916	0.45885317660189	-0.0644296398509879	0.026745124074397	0.0768200857473502	NaN	NaN	0.0851621516027495	0.449317999938662	208	2	790	0.79	0.208	0.416
ORF3a	all	ss13	191	GAG	CTG	AGG	2	TCTGAGGAT	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.41666666666667	6	36.83333333333333	0.0550074627952336	0.18365333026498	0.299517916260311	-0.128645867469747	0.0286296261122907	0.103990219072985	NaN	NaN	0.111397743415267	0.248158536530939	94	0	906	0.906	0.094	0.188
ORF3a	all	ss13	192	GAT	AGG	ATA	2	GAGGATAGG:GAGGATTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.08333333333334	6	35.5	0.0560353868844177	0.191510018856633	0.292597678277952	-0.135474631972216	0.0283350399568936	0.113484353198851	NaN	NaN	0.119850450532152	0.258322886405937	78	0	922	0.922	0.078	0.156
ORF3a	all	ss13	193	AGG	ATA	GGC	2	GATAGGCAC:GATTGGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.166666666666667	0.5	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.83333333333334	8	36.416666666666664	0.0570345959917882	0.259943938648383	0.219411140295665	-0.202909342656595	0.0289662244185284	0.132832978593561	NaN	NaN	0.145685274734754	0.163682578925964	38	0	962	0.962	0.038	0.076
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	ACT	2	AGGCACTCA:TGGCATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000001	8	36.75	0.0573071018565008	0.25713126368002	0.222870999956719	-0.199824161823519	0.0298003963276825	0.134313169170569	NaN	NaN	0.143508145502355	0.163794091984466	48	0	952	0.952	0.048	0.096
ORF3a	all	ss13	195	TCA	ACT	CAG	2	CACTCAGGT:CATTCAGGT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.83333333333334	8	35.75	0.0570345959917882	0.265759990634356	0.214609414515893	-0.208725394642568	0.0293941458357105	0.147527785468764	NaN	NaN	0.141922025144968	0.141370984637767	37	0	963	0.963	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	196	GGT	CAG	GTG	2	TCAGGTGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.33333333333334	8	34.916666666666664	0.0550706014161129	0.273410739562984	0.201420769001748	-0.218340138146871	0.0271575666344365	0.138577490822255	NaN	NaN	0.15100633071317	0.148205094840193	20	0	980	0.98	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	197	GTT	GTG	TTA	2	GGTGTTAAA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.66666666666667	8	34.916666666666664	0.0548189130040021	0.273410739562984	0.200500218431887	-0.218591826558982	0.0279143172016577	0.147183196170367	NaN	NaN	0.146914441414988	0.136781165090916	24	0	976	0.976	0.024	0.048
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666667	8	34.583333333333336	0.054077470426008	0.276597228353308	0.195509805893401	-0.2225197579273	0.0291562244114675	0.148398489449361	NaN	NaN	0.159071593588456	0.161853331972364	39	0	961	0.961	0.039	0.078
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.5	8	35.083333333333336	0.0549444688504895	0.271845168498985	0.202116775346311	-0.216900699648496	0.0290341661303703	0.146283584287312	NaN	NaN	0.149733115443632	0.147454343852772	36	0	964	0.964	0.036	0.072
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATG	2	GACTATGTA:GACTATGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.33333333333334	8	35.083333333333336	0.0550706014161129	0.271845168498985	0.202580762130847	-0.216774567082873	0.0275488580896198	0.15332589642751	NaN	NaN	0.151970119815963	0.153744583695737	40	0	960	0.96	0.04	0.08
ORF3a	all	ss13	201	GTA	ATG	TAG	2	TATGTAGTA:TATGTCGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000001	8	35.083333333333336	0.0545695157118212	0.271845168498985	0.200737486022397	-0.217275652787164	0.0271272157528133	0.150461014994707	NaN	NaN	0.143182935889171	0.129148338757778	21	0	979	0.979	0.021	0.042
ORF3a	all	ss13	202	GTA	TAG	TAA	2	GTAGTAATA:GTCGTTGTA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.00000000000001	8	36.083333333333336	0.0553246126797069	0.262819463546309	0.210504244751107	-0.207494850866602	0.0282752396400004	0.141299735168204	NA	NA	0.139177443818599	0.13599680795564	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	203	ATA	TAA	TAC	2	GTAATATAT:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.33333333333334	8	35.75000000000001	0.0550706014161129	0.265759990634356	0.20721930823621	-0.210689389218243	0.0276310366317035	0.140088592301555	NaN	NaN	0.145999491610203	0.148997082217068	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	204	CAT	TAC	ATG	2	ATATATGGC:GTACATGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.50000000000001	8	36.41666666666667	0.0564972895530331	0.259943938648383	0.217344131380016	-0.20344664909535	0.0287472703812761	0.132377023670668	NaN	NaN	0.15158560325119	0.179555851245262	35	0	965	0.965	0.035	0.07
ORF3a	all	ss13	205	GGC	ATG	GCT	2	CATGGCTAT:TATGGCTAT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666669	7	35.91666666666667	0.0563645417845084	0.225687740489177	0.249745695811117	-0.169323198704669	0.0284799635978468	0.125302803483203	NaN	NaN	0.13605878639452	0.213320900555503	73	0	927	0.927	0.073	0.146
ORF3a	all	ss13	206	TAT	GCT	ATT	2	GGCTATTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000001	7	36.583333333333336	0.0568993130810351	0.220904431633438	0.257574339547212	-0.164005118552403	0.0289528835217733	0.120880241333245	NaN	NaN	0.125833502307359	0.192455235017437	64	0	936	0.936	0.064	0.128
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ATT	TCA	2	TATTTCACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.33333333333334	8	36.25000000000001	0.0566306643811089	0.261373712626115	0.216665493297395	-0.204743048245006	0.0298246526792298	0.145049659883298	NaN	NaN	0.140910821780665	0.146224494483853	29	0	971	0.971	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	208	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666669	8	36.583333333333336	0.0563645417845084	0.258529875671953	0.218019451864159	-0.202165333887444	0.0285216279392101	0.13760846259967	NaN	NaN	0.145514295778124	0.164736692061047	38	0	962	0.962	0.038	0.076
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CCG	AAG	2	ACCGAAGTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	8	36.25000000000001	0.0561009098120237	0.261373712626115	0.214638684389328	-0.205272802814091	0.0294023991978431	0.139461512466251	NaN	NaN	0.149988279272786	0.171126754961686	36	0	964	0.964	0.036	0.072
ORF3a	all	ss13	210	GTT	AAG	TTT	2	GAAGTTTAC:GAAGTTTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	8	35.583333333333336	0.0561009098120237	0.267255329878453	0.209915027092399	-0.21115442006643	0.029615743508795	0.139842575316084	NaN	NaN	0.142508112474564	0.13841985725807	34	0	966	0.966	0.034	0.068
ORF3a	all	ss13	211	TAC	TTT	ACT	2	GTTTACTAC:GTTTATTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.00000000000001	8	35.583333333333336	0.0553246126797069	0.267255329878453	0.207010324938583	-0.211930717198747	0.0275819399979406	0.143346428192519	NaN	NaN	0.154652191183661	0.17057144411255	32	0	968	0.968	0.032	0.064
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000001	8	35.25000000000001	0.0545695157118212	0.270297617029844	0.201886780621511	-0.215728101318022	0.0268161933045369	0.148256693928983	NaN	NaN	0.144687271356621	0.135962620443912	30	1	969	0.969	0.03	0.06
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.16666666666667	8	35.083333333333336	0.0544456664773409	0.271845168498985	0.200281898618861	-0.217399502021645	0.0266659639900333	0.146442347033526	NaN	NaN	0.149063172297678	0.144719654906852	35	0	965	0.965	0.035	0.07
ORF3a	all	ss13	214	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAA:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.5	8	34.41666666666667	0.0541996476239405	0.278218809519287	0.194809429734776	-0.224019161895346	0.028081813499625	0.163281269688543	NaN	NaN	0.156701460922997	0.152834140174195	29	0	971	0.971	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	215	GAA	TTG	AAT	2	CTTGAATCG:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.83333333333334	8	34.083333333333336	0.0539558430514737	0.281520365031792	0.191658756358107	-0.227564521980318	0.0284028000165304	0.158142594817327	NaN	NaN	0.159205623976505	0.152896510231938	39	0	961	0.961	0.039	0.078
ORF3a	all	ss13	216	TCG	AAT	CGA	2	GAATCGACT:GAGTCTACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333334	8	33.583333333333336	0.0535942229866087	0.286624098210084	0.186984357984186	-0.233029875223475	0.027544976119745	0.156525564990954	NaN	NaN	0.159116713759289	0.143051466823882	30	1	969	0.969	0.03	0.06
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CGA	CAC	2	TCGACTCAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.50000000000001	8	33.083333333333336	0.0527690107059348	0.291918675814013	0.180766134810624	-0.239149665108079	0.0260056125504997	0.15335002051463	NaN	NaN	0.161497680259113	0.138653439342579	26	0	974	0.974	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT:ACTCAATTG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.66666666666669	8	32.91666666666667	0.0526531940049364	0.293727829875654	0.179258444891744	-0.241074635870718	0.0268628990898316	0.165188306747669	NaN	NaN	0.164450347711665	0.14266414777389	24	0	976	0.976	0.024	0.048
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TGT	2	CAAATTACT:CAATTGTCG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000001	8	33.91666666666667	0.053834761795598	0.283201052715922	0.190093791245895	-0.229366290920324	0.0271893675454114	0.157341809435163	NaN	NaN	0.154477498940146	0.13760007021466	32	1	967	0.967	0.032	0.064
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TGT	CGA	2	ATTACTACA:TTGTCGACT	1:1	TRUE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.66666666666669	8	35.083333333333336	0.0407339920153049	0.271845168498985	0.149842619018101	-0.231111176483681	0.0244196714552555	0.14538234609357	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CGA	CAG	2	ACTACAGAC:TCGACTGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666669	8	35.833333333333336	0.0271830432683088	0.265018643484554	0.102570305661885	-0.237835600216245	0.0195922655946201	0.139404428263415	NA	NA	0.14429440746643	0.0992980495844671	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT:ACTGATACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000001	8	35.99999999999999	0.0272447663451876	0.263548415128416	0.103376703411069	-0.236303648783229	0.0199708989801318	0.14486980720078	NaN	NaN	0.141476745262926	0.0948669546922068	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT:GATACTGGT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666669	8	36.33333333333333	0.0273690573365762	0.260656845281595	0.105000339841482	-0.233287787945019	0.0203214522736096	0.142702412982211	NaN	NaN	0.140311485226447	0.0963840907067627	18	0	982	0.982	0.018	0.036
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT:ACTGGTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333336	8	36.16666666666666	0.0273067703935705	0.262094574111018	0.104186706215459	-0.234787803717448	0.0193794603905661	0.141476561033309	NA	NA	0.142951851464802	0.100501799406047	13	1	986	0.986	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	CTG	2	GGTATTGAA:GGTGCTGAA	1:1	TRUE	0.916666666666667	0.75	1.33333333333333	0	0	0	2	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333336	8	35.66666666666666	0.0271215992572094	0.266505540694197	0.10176748740969	-0.239383941436987	0.0192859871491156	0.15183975703727	NaN	NaN	0.142373679531309	0.0926895583915425	12	1	987	0.987	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	226	GAA	CTG	AAA	2	ATTGAAAAT:GCTGAAAAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.83333333333336	6	34.99999999999999	0.0268485044068343	0.194633396613814	0.137943975052269	-0.167784892206979	0.0198342838365211	0.113300988653451	NaN	NaN	0.120110128927417	0.162435999761488	41	0	959	0.959	0.041	0.082
ORF3a	all	ss13	227	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	GCT	ATG	CTA	2	AATGCTACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CTA	CAT	2	GCTACATTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTAT:TTCATCTTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TAT	TCT	ATA	2	ATCTATAGC:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	ATA	ACA	2	TATAGCAAG:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCTT:AGCAAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	CTT	AGC	TTG	2	AAGCTTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC:GTTAAAGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCCA:AAAGATGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	CCA	ACC	CA-	0	GACCCA---:GATGTA---	1:1	TRUE	0.5	0	1.5	1	0	0	2	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	NA	NA	0	CCA---CCG:GTA---GAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	ATC	0	---CCGAAT:---GATCAT	1:1	TRUE	1.08333333333333	0.666666666666667	1.25	0	0	1	2	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	ATC	ATG	2	CCGAATGTG:GATCATGTG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTG	ATG	TGC	2	AATGTGCAA:CATGTGCAA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TGC	AAA	2	GTGCAAATA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCT	GCT	CTT	2	GGCTCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CTT	CAG	2	TCTTCAGGA	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT:GTTGTAAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAT	CTA	ATC	2	GCTAATCCA:GTAAATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	CCA	ATC	CAG	2	AATCCAGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	GCA	CAG	CAA	2	CCAGCAATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	ATG	CAA	TGG	2	GCAATGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	GAT	TGG	ATC	2	ATGGATCCA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATT	CAA	TTT	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGAG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAG	ATG	AGC	2	GATGAGCCG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCG	AGC	CGA	2	GAGCCGACG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CGA	CGA	2	CCGACGACG	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	TTG	CTT	TGT	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.83333333333331	9	33.416666666666664	0.118766081588831	0.333664006808512	0.355945139917324	-0.214897925219681	0.0481863943228647	0.127811779969194	0.265311153149096	0.179721205861755	0.140713297673749	0.126710266962605	38	0	962	0.962	0.038	0.076
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.49999999999997	9	33.75	0.119357976360937	0.329524994837884	0.362212209182059	-0.210167018476948	0.049723142490244	0.131060165973432	0.264973949763906	0.171633799221349	0.137765930690815	0.127125223276142	42	0	958	0.958	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG:TTGTTTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.8333333333333	9	34.083333333333336	0.120559681536883	0.325488997542435	0.370395566200868	-0.204929316005551	0.0522731340779499	0.128103227008446	0.286274457743818	0.195718011565604	0.137546709232294	0.136253449319531	49	0	951	0.951	0.049	0.098
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA:TTTTTGAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.49999999999996	9	34.083333333333336	0.121169674009144	0.325488997542435	0.37226964635985	-0.20431932353329	0.0490160565145852	0.128019930694416	0.373584354228938	0.319016578108625	0.130790685124435	0.118244274414874	24	0	976	0.976	0.024	0.048
ORF3a	all	ss13	6	AAC	TGA	ACA	2	ATGAGATTT:TTGAACATC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	2	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	71.83333333333329	9	34.916666666666664	0.104386548100003	0.315824866691675	0.330520358303232	-0.211438318591672	0.0472745018885441	0.122274938659971	0.250703167656829	0.187378719787502	0.127310578971416	0.0967521866580278	29	0	971	0.971	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	7	ATC	ACA	TCT	2	AACATCTTC:AGATTTTTT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.49999999999994	9	35.25	0.0723451996406718	0.312120297918684	0.231786269983376	-0.239775098278012	0.0335556404912459	0.115999391240553	0.176793722589127	0.189839228337206	0.12042467498876	0.0464721509000469	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	8	TTC	TCT	TCA	2	ATCTTCACT:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.08333333333329	8	34.83333333333333	0.071739235186476	0.274200382158177	0.261630690015202	-0.202461146971701	0.031485204126227	0.106750666302867	0.226739853297868	0.248549174339451	0.111241449981344	0.0687566667107328	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	9	ACT	TCA	CTC	2	TTCACTTTA:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.24999999999994	8	34.33333333333333	0.0705572800165473	0.27903683339124	0.252860094343238	-0.208479553374693	0.0309830189825165	0.110613485988373	0.22301428026607	0.256866216239266	0.112945713391613	0.0649156493411804	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	10	CTT	CTC	TAG	2	ACTCTTAGA:ACTTTAGGA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.16666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.58333333333329	8	34.99999999999999	0.0712278649928988	0.272625681756849	0.261266160010655	-0.20139781676395	0.0331432659649615	0.107954949945365	0.225363043527866	0.246328888752981	0.111970538080679	0.0720712236521198	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TAG	GAT	2	CTTAGATCA:TTAGGATCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1.16666666666667	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.66666666666661	8	35.08333333333332	0.0711433450940079	0.271845168498986	0.261705387249777	-0.200701823404978	0.0320222851984312	0.10755860553386801	0.229417060566385	0.253977827935151	0.109380515579066	0.0665211642979558	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	12	TCA	GAT	CAA	2	AGATCAATT:GGATCTATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.99999999999996	7	35.58333333333332	0.0708072633533061	0.228158530802244	0.31034238826984	-0.157351267448938	0.0322824536503262	0.0936327342536455	NaN	NaN	0.0964716660105288	0.102877240153461	28	0	972	0.972	0.028	0.056
ORF3a	all	ss13	13	ATT	CAA	TTA	2	TCAATTACT:TCTATTACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.3333333333333	7	35.08333333333332	0.0866346653413833	0.231968667588477	0.373475720846391	-0.145334002247094	0.0363099105944809	0.097021431166556	0.38990809068209	0.338135483970285	0.101285247751897	0.15131615779022	52	1	947	0.947	0.052	0.104
ORF3a	all	ss13	14	ACT	TTA	CTA	2	ATTACTAGA:ATTACTGCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.5833333333333	7	34.24999999999999	0.0863227141399176	0.238612230829161	0.361769863346703	-0.152289516689244	0.0353310881049642	0.099808352118864	NaN	NaN	0.103676678436154	0.141862940097586	36	1	963	0.963	0.036	0.072
ORF3a	all	ss13	15	AGA	CTA	CAC	2	ACTAGACAA:ACTGCACAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.75	0.25	1	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.5833333333333	7	34.24999999999999	0.0863227141399176	0.238612230829161	0.361769863346703	-0.152289516689244	0.0364152686584611	0.0950426636764464	0.302053748642158	0.231033715103796	0.105327696850546	0.14821537332622	48	0	952	0.952	0.048	0.096
ORF3a	all	ss13	16	CAA	CAC	AAC	2	AGACAACCT:GCACAGCCA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.0833333333333	7	34.666666666666664	0.071739235186476	0.235243169141281	0.304957782401712	-0.163503933954805	0.0338330054399065	0.0951466319642384	NA	NA	0.100923591201801	0.105215854261025	34	0	966	0.966	0.034	0.068
ORF3a	all	ss13	17	CCA	AAC	CAG	2	CAACCTGGT:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.41666666666663	7	35.33333333333333	0.0724326033146384	0.230047700566857	0.314859062429916	-0.157615097252218	0.0330818031750583	0.0945395595283481	0.325625972959224	0.33357666325145	0.0991400937623132	0.111874944543	45	0	955	0.955	0.045	0.09
ORF3a	all	ss13	18	GGT	CAG	GTA	2	CCAGTAAAA:CCTGGTAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.8333333333333	7	35.58333333333333	0.102850364976667	0.228158530802244	0.450784656681597	-0.125308165825577	0.0464640178942251	0.0900120901841166	0.481816052909807	0.349481785536807	0.10422984515906	0.229274729833627	118	0	882	0.882	0.118	0.236
ORF3a	all	ss13	19	AAA	GTA	AAA	2	GGTAAAGTT:GTAAAAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	72.8333333333333	7	35.666666666666664	0.135026881134824	0.227535736496164	0.593431533938849	-0.0925088553613394	0.0565516849673757	0.0887857338804763	0.606571673422381	0.327907657438071	0.116853090951369	0.428554272952157	191	0	809	0.809	0.191	0.382
ORF3a	all	ss13	20	ATT	AAA	TTG	2	AAAATTGAC:AAAGTTGAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.8333333333333	7	34.99999999999999	0.133025780578275	0.23261619622788	0.57186809317421	-0.0995904156496043	0.0549631107765699	0.0948057926189894	0.532979369556123	0.283286917784658	0.112024945895026	0.374001934422294	184	0	816	0.816	0.184	0.368
ORF3a	all	ss13	21	GAA	TTG	AAA	2	ATTGACAAT:GTTGAAAAT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.91666666666664	6	35.33333333333333	0.132861703193865	0.19253988513586	0.690047691158199	-0.0596781819419952	0.0568665634398412	0.0788441667636927	0.718513981465384	0.33686313632307	0.103986712116585	0.566034120347891	274	0	726	0.726	0.274	0.548
ORF3a	all	ss13	22	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGTT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.33333333333331	6	35.08333333333333	0.134018841557532	0.194105738514483	0.690442449477259	-0.0600868969569509	0.0546721252155895	0.0825509649221775	NaN	NaN	0.102601370597874	0.558121194462918	268	0	732	0.732	0.268	0.536
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTT	2	AATGCTTCT:AATGTTTCT	1:1	FALSE	2	1	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	72.58333333333331	7	35.41666666666666	0.152227160286946	0.229414483788198	0.663546423805949	-0.0771873235012513	0.0605856000270163	0.0931127757512512	NaN	NaN	0.109643289767054	0.481441591579814	240	1	759	0.759	0.24	0.48
ORF3a	all	ss13	24	TCT	CTT	CTC	2	GCTTCTCCT:GTTTCTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	71.91666666666664	8	36.24999999999999	0.136915000021786	0.261373712626115	0.523828500755305	-0.124458712604329	0.0566124224496754	0.0981066171804192	NaN	NaN	0.114743107221115	0.278066656039881	140	1	859	0.859	0.14	0.28
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	71.91666666666664	8	36.24999999999999	0.136915000021786	0.261373712626115	0.523828500755305	-0.124458712604329	0.0597665010231568	0.0983597996970797	0.401376526083442	0.191865587782521	0.117308763710961	0.288712703098733	131	1	868	0.868	0.131	0.262
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	72.74999999999997	9	36.083333333333336	0.135196367873208	0.303233279917543	0.445849373492156	-0.168036912044335	0.0581987934165835	0.106654464403509	0.383511940964239	0.245014702940635	0.125476103672678	0.180507351777998	79	1	920	0.92	0.079	0.158
ORF3a	all	ss13	27	AGT	CAA	GTA	2	GCAAGTACT:GCAAGTTCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.74999999999997	10	35.416666666666664	0.133190264783882	0.354269507203646	0.375957461976314	-0.221079242419764	0.0565141043845543	0.129188768254832	0.374702673528917	0.315692618727168	0.141840750737844	0.119080650607679	34	0	966	0.966	0.034	0.068
ORF3a	all	ss13	28	ACT	GTA	CTG	2	AGTACTGTT:AGTTCTTTT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.08333333333331	10	36.083333333333336	0.134520967864149	0.345949449613147	0.388845734585139	-0.211428481748999	0.0592419255465682	0.128148776484104	0.294073400585591	0.186076788202821	0.14142662848277399	0.134922428702395	49	1	950	0.95	0.049	0.098
ORF3a	all	ss13	29	GTT	CTG	TTC	2	ACTGTTCAT:TCTTTTCAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.41666666666666	9	35.416666666666664	0.13188569801946	0.310300874693003	0.425025221569037	-0.178415176673544	0.0578601395207261	0.115401558413966	0.307257830079145	0.166577421613754	0.133007921913143	0.179794642606849	70	0	930	0.93	0.07	0.14
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	GTTCATGCT:TTTCATTCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.08333333333331	8	34.58333333333333	0.146628474234188	0.276597228353308	0.530115486359445	-0.12996875411912	0.06057138860099	0.105725664869493	0.428275157769636	0.215793262855854	0.120334596124134	0.280114832718704	122	0	878	0.878	0.122	0.244
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA:CATTCTACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	74.16666666666666	9	35	0.148632696437812	0.314890384170198	0.472014084613888	-0.166257687732386	0.0626061178750993	0.121090590522421	NaN	NaN	0.137722194134424	0.227356654165828	68	0	932	0.932	0.068	0.136
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA:TCTACAGCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	9	34.666666666666664	0.130765040358583	0.318662395473949	0.41035604519352	-0.187897355115366	0.0555988037721945	0.120264353801803	0.328941806914054	0.212212949096196	0.142911083294328	0.18858215483921	64	0	936	0.936	0.064	0.128
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG:ACAGCGTCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.66666666666667	9	34.666666666666664	0.12950744207608	0.318662395473949	0.406409554172409	-0.18915495339787	0.0556175688825903	0.123306335240505	0.328215971925015	0.215627751265788	0.1328979450111	0.15464635452676	65	0	935	0.935	0.065	0.13
ORF3a	all	ss13	34	ACG	CAA	CCA	2	GCAACGATA:GCGTCCATC	1:1	TRUE	1.08333333333333	1	0.916666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	76	9	34.5	0.144677749593369	0.320583011120205	0.451295747356746	-0.175905261526836	0.0580273348571946	0.116849524808099	0.362770020452883	0.213489578167182	0.137976422923791	0.202346896993988	83	0	917	0.917	0.083	0.166
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CCA	TAC	2	ACGATACCG:TCCATCCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.16666666666667	9	33.83333333333333	0.128580042454815	0.328506491880477	0.391407919273625	-0.199926449425662	0.0524052338480973	0.117131494803083	0.26969573813414	0.146697895025001	0.134786292833578	0.137998778722567	41	0	959	0.959	0.041	0.082
ORF3a	all	ss13	36	CCG	TAC	CGC	2	ATACCGCTA:ATCCCTTTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.25000000000001	9	33.166666666666664	0.128426768784144	0.336838303699426	0.38127127281446	-0.208411534915282	0.054380123565591	0.125288232963128	0.276798441877622	0.168378455536802	0.146043215142671	0.153564368514894	51	0	949	0.949	0.051	0.102
ORF3a	all	ss13	37	CTA	CGC	TAC	2	CCGCTACAA:CCTTTACAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.91666666666669	9	32.49999999999999	0.127213641474078	0.345611402393497	0.36808288324133	-0.218397760919419	0.0521752164656829	0.13579388368758	0.306804465565405	0.230243759803955	0.140524823303485	0.120146762662727	35	0	965	0.965	0.035	0.07
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	CTACAAGCC:TTACAGGCC	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.00000000000003	9	32.666666666666664	0.158481820250405	0.34337482021911	0.461541764038716	-0.184892999968705	0.0638720356651799	0.130392337081141	0.357233804345968	0.196361323959137	0.141603090022102	0.191650164632942	74	0	926	0.926	0.074	0.148
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCA	2	CAAGCCTCA:CAGGCCACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.50000000000003	10	33.33333333333333	0.159636110589832	0.383119217824493	0.416674766398593	-0.223483107234661	0.0614066491386346	0.141828315174541	0.284317005771665	0.142776694901344	0.161153474976073	0.165511334702851	64	0	936	0.936	0.064	0.128
ORF3a	all	ss13	40	ACT	CCA	CAC	2	GCCACTCTA:GCCTCACTC	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.50000000000003	10	33.33333333333333	0.159636110589832	0.383119217824493	0.416674766398593	-0.223483107234661	0.0632785833190884	0.145283888975642	0.296527666826521	0.159967740239868	0.164617852788839	0.174594673244612	64	0	936	0.936	0.064	0.128
ORF3a	all	ss13	41	CTA	CAC	TAC	2	ACTCTACCT:TCACTCCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.5	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.00000000000003	10	32.99999999999999	0.158481820250405	0.388186804671653	0.408261739819973	-0.229704984421248	0.0641443210291393	0.144521781743813	0.288601494972385	0.157179643766476	0.176649594572602	0.193483590381354	47	0	953	0.953	0.047	0.094
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TAC	CTT	2	CTACCTTTC:CTCCCTTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.00000000000003	10	33.166666666666664	0.158481820250405	0.385635998709722	0.410962204723264	-0.227154178459317	0.0631727318571109	0.145626083344163	0.299000204393021	0.169300597156839	0.170706126057726	0.183296350137892	67	0	933	0.933	0.067	0.134
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.16666666666669	10	32.99999999999999	0.158100771086867	0.388186804671653	0.407280126949696	-0.230086033584785	0.063012148553176	0.148205630592333	0.305275149336585	0.182157614711269	0.164690656510022	0.162389494923377	45	0	955	0.955	0.045	0.09
ORF3a	all	ss13	44	GGA	TCG	GAT	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.66666666666669	10	32.666666666666664	0.156968578879544	0.393393351093114	0.399011773949351	-0.236424772213571	0.0644066712312464	0.149944569367171	0.255946367646267	0.119004345336787	0.170398158607301	0.165294130957432	56	0	944	0.944	0.056	0.112
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	GGATGGCTT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.16666666666669	10	32.33333333333333	0.171768261601848	0.398744783001625	0.430772436215543	-0.226976521399777	0.065046707913163	0.154373455551549	0.337703510712537	0.202099218442735	0.168740318220092	0.178585443482238	47	0	953	0.953	0.047	0.094
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTG	2	TGGCTTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.16666666666669	10	31.999999999999996	0.174273904523748	0.404247375549515	0.431107077162462	-0.229973471025768	0.0651457740202954	0.150613624722812	0.321880765460353	0.180460727476023	0.168405381561088	0.172066258540372	67	0	933	0.933	0.067	0.134
ORF3a	all	ss13	47	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTATT:CTTGTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.6666666666667	10	31.5	0.173011971365532	0.412799349622874	0.419118808020391	-0.239787378257342	0.0689578900174042	0.15918913639309001	0.374575280875038	0.263175369272832	0.180310624446225	0.183565332557213	53	0	947	0.947	0.053	0.106
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	GTTATTGGC:GTTGTTGGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.83333333333337	10	31.333333333333332	0.172595396296097	0.415733051779297	0.41515918822765	-0.243137655483201	0.0644451916545859	0.168523460008222	0.297127184136104	0.162340196316029	0.174562791607834	0.163668843464813	61	0	939	0.939	0.061	0.122
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.25000000000003	9	31.666666666666664	0.174062299764764	0.357254585771116	0.487222016728096	-0.183192286006352	0.0658819348021884	0.138547175176464	0.437459743376233	0.265385248405042	0.153047352856876	0.231320295598537	93	0	907	0.907	0.093	0.186
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.58333333333337	9	32.333333333333336	0.175769733616626	0.347877835747554	0.505262812271195	-0.172108102130928	0.067362489456731	0.132769087474124	0.472702499122014	0.285123206397716	0.157277102256965	0.273824068904461	101	0	899	0.899	0.101	0.202
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAT	2	GTTGCATTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.58333333333337	9	31.333333333333336	0.173221017246649	0.362138828792688	0.478327656341463	-0.188917811546039	0.0654531932770929	0.13606129621966	0.482900365172287	0.321914771420532	0.152488286722236	0.215382356075719	97	0	903	0.903	0.097	0.194
ORF3a	all	ss13	52	TTT	CAT	TTC	2	GCATTTCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.25000000000003	10	32.16666666666667	0.174062299764764	0.401476777644409	0.433555088257015	-0.227414477879645	0.0668127055766321	0.144916948276537	0.309779786207664	0.161645418425939	0.161277212287288	0.158514768945375	58	0	942	0.942	0.058	0.116
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TTC	TTG	2	TTTCTTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.1666666666667	10	32.25000000000001	0.174273904523748	0.400106006661284	0.435569328183773	-0.225832102137537	0.0652933793520481	0.15182975713686	0.315564865745472	0.167499031068825	0.165050214036803	0.171229765763839	54	0	946	0.946	0.054	0.108
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.50000000000004	10	31.91666666666667	0.173430571160122	0.405647413290395	0.427540187556838	-0.232216842130274	0.0647490519337711	0.149756252346975	0.382819452826669	0.26407155676034	0.163135697449548	0.154603378541615	52	0	948	0.948	0.052	0.104
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.83333333333337	10	31.91666666666667	0.188944817553035	0.405647413290395	0.465785831149311	-0.21670259573736	0.0639615959475281	0.151291321284076	0.306710907614762	0.128851183911973	0.16866651701977	0.198862483552401	75	0	925	0.925	0.075	0.15
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.83333333333337	10	31.58333333333334	0.186224058338554	0.411348356449444	0.452716184272494	-0.22512429811089	0.0681359527728726	0.151117417610605	0.315371024214206	0.151143694069673	0.176306788760132	0.201641240080243	63	0	937	0.937	0.063	0.126
ORF3a	all	ss13	57	CAA	TTC	AAA	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.16666666666671	11	31.750000000000007	0.188029061147841	0.464842046991219	0.404500974825525	-0.276812985843379	0.0674336975689042	0.175003501314429	0.299784668556137	0.177238996072694	0.200102897007814	0.166556588548996	42	0	958	0.958	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	58	AGC	AAA	GCG	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.33333333333337	11	31.916666666666675	0.190335390582075	0.461487146936457	0.412439201927073	-0.271151756354383	0.0706189102282286	0.17697931471758	0.26088449153294	0.113894847996002	0.191144986730297	0.156025619111146	35	0	965	0.965	0.035	0.07
ORF3a	all	ss13	59	GCT	GCG	CTA	2	AGCGCTACC:AGCGCTGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.16666666666671	11	32.25000000000001	0.193661500470681	0.454924919665286	0.425699916841593	-0.261263419194605	0.0688296388229353	0.162600572441	0.303812712467908	0.161156690908775	0.184497814243165	0.156752472753726	53	0	947	0.947	0.053	0.106
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAAA:GCTGCGAAA	1:1	TRUE	0.75	1	1.25	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.33333333333339	12	32.08333333333335	0.210322806792345	0.517914859037174	0.406095332316483	-0.307592052244828	0.0716047742879529	0.192382042471926	0.276420552425932	0.14179988063912	0.204448532738959	0.132453636402927	29	0	971	0.971	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CCA	AAA	2	ACCAAAATA:GCGAAATTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.41666666666671	11	31.000000000000014	0.206933202001177	0.480584396281972	0.430586601650221	-0.273651194280795	0.0736056297376445	0.17629287400379	0.278324139887347	0.121846649000258	0.194306307112208	0.159027599107253	49	0	951	0.951	0.049	0.098
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATT:AAATTAATA	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.75000000000004	11	30.666666666666682	0.21219469193644	0.487940674605862	0.4348780558371	-0.275745982669422	0.0717501981562124	0.185708154038491	0.275987266014647	0.115090846543657	0.208976062357292	0.186998703367261	50	0	950	0.95	0.05	0.1
ORF3a	all	ss13	63	ATA	TAA	TAC	2	ATAATTGCG:TTAATACCT	1:1	FALSE	1.25	0.583333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.41666666666671	11	30.500000000000014	0.192938959293253	0.49170694593066	0.392386076483168	-0.298767986637407	0.0663196850755922	0.190408186084137	0.27750828140046	0.15737315333408	0.194872475860527	0.125239848238149	34	0	966	0.966	0.034	0.068
ORF3a	all	ss13	64	CCT	TAC	CGC	2	ATACCTTTT:ATTGCGCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.50000000000004	11	31.000000000000014	0.192699315438847	0.480584396281972	0.400968730840327	-0.287885080843125	0.0712607400798951	0.173778694094695	0.263082914629844	0.127479877653308	0.205594372536208	0.161436195433161	40	0	960	0.96	0.04	0.08
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CGC	TCA	2	CCTTTTAAC:GCGCTCAAT	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.00000000000004	11	31.166666666666682	0.191273928510779	0.476991575039997	0.401000643448975	-0.285717646529218	0.0683912790871685	0.174443677027701	0.267477978005403	0.133824025070679	0.194621413200647	0.142085504800812	37	0	963	0.963	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	66	AAC	TCA	ACA	2	CTCAATAAA:TTTAACAGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.83333333333337	10	30.333333333333343	0.188944817553035	0.434275405344393	0.435080631386887	-0.245330587791358	0.069988633105292	0.176753429276786	0.351401967129828	0.215668585636179	0.190946153510436	0.19885674613334	62	0	938	0.938	0.062	0.124
ORF3a	all	ss13	67	AAA	ACA	AAA	2	AACAGTCTT:AATAAAAGA	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	2	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.50000000000004	10	29.66666666666668	0.189869585440856	0.447612053716135	0.424183361159589	-0.257742468275278	0.0680288971871862	0.177472657580447	0.297600722388378	0.154057828771074	0.189035268047484	0.172736846658048	59	0	941	0.941	0.059	0.118
ORF3a	all	ss13	68	AGA	AAA	GAT	2	AAAAGATGG:AGTCTTTGG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.75	0	2	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.75000000000004	10	29.25000000000001	0.156781460557421	0.456384596564427	0.343529255232629	-0.299603136007005	0.0572360592180865	0.178027196650027	0.244240020180321	0.159568819857215	0.186967660651864	0.109059908121742	17	1	982	0.982	0.017	0.034
ORF3a	all	ss13	69	TGG	GAT	GGC	2	AGATGGCAG:CTTTGGCAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.25000000000004	11	29.66666666666668	0.126615652181289	0.511480409971365	0.247547412790213	-0.384864757790076	0.0477799598303451	0.199979933855655	0.168793890159693	0.142494102420825	0.212126064679018	0.0696283319302119	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	70	CAG	GGC	AGC	2	TGGCAGCGT:TGGCAGCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.25000000000004	12	30.000000000000014	0.16021960824549	0.571605039035172	0.280297753350685	-0.411385430789682	0.0579441238420372	0.203359206613874	0.160069172701469	0.079928013751988	0.229352408613424	0.0728638397980906	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	71	CGT	AGC	GTT	2	CAGCGTTGC:CAGCTAGCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.66666666666671	13	30.166666666666686	0.178173158730486	0.641018707059106	0.277953134235218	-0.46284554832862	0.0618899956313707	0.274731065448214	0.140703505006671	0.0482167849139349	0.25429667597633	0.0687436768037314	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	72	GCC	GTT	CCC	2	CGTTGCTTA:CTAGCCCTT	1:1	TRUE	1.25	0.75	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.91666666666671	13	30.33333333333335	0.177511154654184	0.635473395290402	0.279336878569186	-0.457962240636218	0.0638297673683731	NA	0.14251464447552	0.0499890857072591	0.246994955952687	0.0637197049022611	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	73	CTT	CCC	TAT	2	GCCCTTTAT:TGCTTATAC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.33333333333337	12	29.916666666666682	0.160024633856936	0.573996432053642	0.278790293668552	-0.413971798196706	0.0606301663785421	0.228237848811359	0.166151579841375	0.0933612665486497	0.224059627124536	0.0646607265097633	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	74	TAC	TAT	ACC	2	CTTTATAAG:TTATACCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.16666666666671	11	29.916666666666682	0.176854074420993	0.505377176735143	0.349944719632003	-0.32852310231415	0.0653083940938036	0.183079173938337	0.210038676272247	0.0956941801639276	0.193255756448892	0.0891422979377023	14	0	986	0.986	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	75	AAG	ACC	AGA	2	TACCAGAGC:TATAAGGGC	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.16666666666671	11	29.916666666666682	0.193661500470681	0.505377176735143	0.383201912127849	-0.311715676264462	0.0665825411408026	0.187391888857365	0.224150186099013	0.0873441965433173	0.188841103696668	0.098804536143351	17	0	983	0.983	0.017	0.034
ORF3a	all	ss13	76	AGC	AGA	GCT	2	AAGGGCTTC:CAGAGCTTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333339	11	29.083333333333346	0.193179203235308	0.526335245778486	0.367026918270659	-0.333156042543178	0.0641635357538086	NA	0.213678851373744	0.0858592451970316	0.225153592633556	0.13895774693871	21	0	979	0.979	0.021	0.042
ORF3a	all	ss13	77	TTC	GCT	TCC	2	AGCTTTCAA:GGCTTCCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.00000000000006	10	29.250000000000014	0.194146225437217	0.456384596564427	0.425400477795945	-0.26223837112721	0.0635094414779053	0.17658481508493	0.245935443350466	0.0836795702763966	0.190679102278289	0.169042679285707	34	0	966	0.966	0.034	0.068
ORF3a	all	ss13	78	CAA	TCC	AAT	2	TTCCAGTTC:TTTCAATTG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.50000000000006	10	28.583333333333346	0.192699315438847	0.471183220743389	0.408968967814312	-0.278483905304542	0.0629436243933875	0.194809172888403	0.242049320675059	0.0911025795865877	0.194630601016073	0.152478055519414	47	0	953	0.953	0.047	0.094
ORF3a	all	ss13	79	TTC	AAT	TCA	2	CAATTGCTT:CAGTTCATT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333339	10	29.083333333333346	0.193179203235308	0.459993680357088	0.419960559208867	-0.26681447712178	0.0658113688487499	0.184121274244104	0.268232138534195	0.117428035195711	0.179918364566374	0.138080993367992	25	0	975	0.975	0.025	0.05
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TCA	TTT	2	TTCATTTGC:TTGCTTTGC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.75	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.33333333333339	10	29.75000000000001	0.17906358673515	0.445899039781238	0.401578767298985	-0.266835453046087	0.063976590445889	0.173048539847834	0.280892585190703	0.152816799300326	0.172140596861547	0.121117078525737	29	0	971	0.971	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	81	TGC	TTT	GCA	2	ATTTGCAAT:CTTTGCAAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.00000000000004	9	29.41666666666668	0.177291583548173	0.393100353726364	0.451008455900767	-0.215808770178191	0.0637296678775169	0.15230008341028	0.294140483615614	0.125199566412369	0.151261473582436	0.153658710973901	59	0	941	0.941	0.059	0.118
ORF3a	all	ss13	82	AAT	GCA	ATG	2	TGCAATGTG:TGCAATTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.83333333333337	9	30.083333333333346	0.177731272847004	0.381735453594316	0.465587545441575	-0.204004180747312	0.0617019743219594	0.156164855011659	0.282818089247826	0.099713560734152	0.162334133007573	0.208864796765965	61	0	939	0.939	0.061	0.122
ORF3a	all	ss13	83	GTG	ATG	TAC	2	AATGTGCTT:AATTTACTG	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.83333333333337	9	30.083333333333346	0.177731272847004	0.381735453594316	0.465587545441575	-0.204004180747312	0.0628273603029307	0.141168286304734	0.343943130688937	0.175839783049071	0.157043447613175	0.193933566160144	68	0	932	0.932	0.068	0.136
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TGC	2	GTGCTTCTT:TTACTGCTG	1:1	FALSE	1.25	1	0.25	0.5	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.00000000000004	9	30.25000000000001	0.160807403509091	0.378998328336262	0.424295812108218	-0.218190924827171	0.0595044755549247	0.144375798397283	0.235984473174707	0.0721798756732402	0.152057572428132	0.151309009251505	43	0	957	0.957	0.043	0.086
ORF3a	all	ss13	85	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTA:CTTCTTATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.41666666666671	9	31.00000000000001	0.159830135220283	0.367161168989029	0.435313286697426	-0.207331033768746	0.0609278846490419	0.148173270268644	0.308427067229823	0.158127348869081	0.137220850781651	0.130806409587962	25	0	975	0.975	0.025	0.05
ORF3a	all	ss13	86	ATT	TGC	TAT	2	CTGCTATTT:CTTATTGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.75	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666671	9	31.00000000000001	0.159249476407495	0.367161168989029	0.43373180460773	-0.207911692581534	0.0613592217212772	0.150615264023653	0.241592568107914	0.072605475360376	0.146961505530855	0.157145994665794	42	0	958	0.958	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	87	GCT	TAT	CTT	2	ATTGCTTTG:CTATTTGTT	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.75	0.833333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.41666666666671	9	31.91666666666668	0.159830135220283	0.353678577936851	0.451907876786421	-0.193848442716568	0.0613099046214792	0.144248099131975	0.271774760348923	0.0963518833351225	0.142531882482263	0.173818639900419	51	0	949	0.949	0.051	0.102
ORF3a	all	ss13	88	GTT	CTT	TGA	2	GCTTTGACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.33333333333337	9	31.41666666666668	0.126467034326845	0.360905050411732	0.350416360709186	-0.234438016084888	0.049372554973243	0.14192278388919	0.175051355380704	0.0453071325854308	0.133654808752999	0.0794209160610312	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	89	ACA	TGA	CAG	2	GTTACCATC:TTGACAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.50000000000004	8	31.41666666666668	0.126170845288571	0.311094218237477	0.405571167485528	-0.184923372948906	0.0513364895419785	0.124052306007506	0.279123216960327	0.146218647933889	0.122633181760193	0.131570107593944	27	0	973	0.973	0.027	0.054
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CAG	TCT	2	ACAGTTTAC:ACCATCTAT	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.16666666666671	8	31.083333333333346	0.124999865819317	0.315240156824316	0.396522660940621	-0.190240291005	0.048199238138113	0.131209388992965	0.226584350994552	0.0801182781632768	0.124132527598698	0.125384810956465	22	0	978	0.978	0.022	0.044
ORF3a	all	ss13	91	TAC	TCT	ACT	2	ATCTATTCA:GTTTACTCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.83333333333337	7	31.41666666666668	0.125582619575832	0.264386521096341	0.474996301078714	-0.13880390152051	0.0497650323052636	0.103859050176577	0.295493429889911	0.10795169295797	0.106446295105121	0.19224020418944	66	0	934	0.934	0.066	0.132
ORF3a	all	ss13	92	TCA	ACT	CAC	2	TACTCGCAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.16666666666671	7	31.083333333333346	0.124999865819317	0.267793509240841	0.466777055850511	-0.142793643421525	0.0484905625585363	0.114013204887005	0.335989458471207	0.164753394224057	0.109075757450002	0.190492501293536	69	1	930	0.93	0.069	0.138
ORF3a	all	ss13	93	CAC	CAC	ACT	2	TCACATCTT:TCGCACTTA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.66666666666671	7	30.25000000000001	0.122443179667292	0.2767124213498	0.442492530946085	-0.154269241682508	0.0492675317228837	0.119664851895424	0.270796724902454	0.102250567739306	0.114821506233202	0.179091673174444	44	0	956	0.956	0.044	0.088
ORF3a	all	ss13	94	CTT	ACT	TAC	2	CACTTACTG:CATCTTTTG	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	1	0	0	1	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.16666666666671	8	30.083333333333346	0.123283681565969	0.328379628575385	0.375430358152277	-0.205095947009416	0.0469898035014601	0.137324666954163	0.251311568758717	0.135205913456578	0.133053738409755	0.123206824217983	25	0	975	0.975	0.025	0.05
ORF3a	all	ss13	95	CTG	TAC	TGC	2	CTTTTGCTT:TTACTGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.66666666666671	8	30.083333333333346	0.107808568999606	0.328379628575385	0.328304680370442	-0.220571059575779	0.044550286288014	0.140536522957172	NaN	NaN	0.132203628861641	0.0952325591407911	16	0	984	0.984	0.016	0.032
ORF3a	all	ss13	96	CTT	TGC	TTG	2	CTGCTTGTT:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.00000000000004	8	31.083333333333346	0.108787621497542	0.315240156824316	0.345094427668902	-0.206452535326774	0.043474182741213	0.131140406676725	0.200067111939268	0.0845466971749366	0.124383534722121	0.0969534894130536	13	0	987	0.987	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	97	GTC	TTG	TCG	2	CTTGTCGCT:CTTGTTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.16666666666671	8	31.416666666666682	0.108541192153805	0.311094218237477	0.348901348179183	-0.202553026083672	0.0446884046291375	0.131595075594485	0.222620468048763	0.117056876600698	0.119687705378492	0.0905799954336765	14	0	986	0.986	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	98	GCT	TCG	CTG	2	GTCGCTGCA:GTTGCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.33333333333337	8	31.250000000000014	0.10829587866142	0.313153267006825	0.345823882651877	-0.204857388345405	0.0443027313220088	0.129658945907111	NaN	NaN	0.125786769782771	0.103395947476856	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGG:GCTGCAGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.50000000000004	8	30.583333333333346	0.106609300297826	0.321673722092295	0.331420607205328	-0.215064421794468	0.0444880544816635	0.128456447156174	0.203447354410793	0.103307954894322	0.127393719079519	0.0913753358571931	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	100	GGG	CAG	GGC	2	GCAGGGCTT:GCAGGTATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.50000000000004	8	30.583333333333346	0.105204990412841	0.321673722092295	0.327054972748616	-0.216468731679453	0.0428670741954957	0.136176211316505	0.198187201292336	0.0988953795237757	0.124930530623692	0.0831467252338942	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GGC	TGG	2	GGGCTTGAA:GGTATGGAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.50000000000004	8	31.250000000000014	0.105204990412841	0.313153267006825	0.335953673478835	-0.207948276593984	0.045864353435621	0.128237661448225	0.196061549935179	0.0866185236258167	0.123495662459094	0.0922104964600711	16	0	984	0.984	0.016	0.032
ORF3a	all	ss13	102	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAGGCG:CTTGAAGCA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.33333333333339	7	30.91666666666668	0.105436462965892	0.269530500680923	0.391185645778584	-0.164094037715031	0.0438381662190282	0.115619121532586	0.242760708441498	0.107091633925688	0.110923343453574	0.139047784403531	30	0	970	0.97	0.03	0.06
ORF3a	all	ss13	103	GCA	AAG	CAC	2	GAAGCACCT:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.08333333333339	7	31.16666666666668	0.105785591121623	0.266933470240076	0.396299463782048	-0.161147879118453	0.0457705230354144	0.121225596350883	0.252429026619773	0.116428114151813	0.104908944757303	0.124520286634463	36	0	964	0.964	0.036	0.072
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CAC	AAT	2	GCACCTTTC:GCGCAATTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.91666666666671	7	31.66666666666668	0.120391329950725	0.261888204157181	0.459705049863446	-0.141496874206456	0.0477730699288833	0.114674651106706	NaN	NaN	0.108136001570725	0.190700902856608	62	0	938	0.938	0.062	0.124
ORF3a	all	ss13	105	TTC	AAT	TCC	2	CAATTTTTG:CCTTTCCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.58333333333337	8	32.000000000000014	0.106490841739566	0.304098831081123	0.350184975591564	-0.197607989341557	0.0423644547263627	0.12460691641742799	0.215334271193247	0.103898836740096	0.118029420816908	0.0940860845579998	23	0	977	0.977	0.023	0.046
ORF3a	all	ss13	106	CTT	TCC	TGT	2	TTCCTTTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.5	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.25000000000004	8	31.333333333333343	0.105552582259344	0.312120297918684	0.338179166696951	-0.20656771565934	0.0428705291000929	0.129480846166732	0.207412569883073	0.103003021478627	0.121762288055349	0.0897943475949223	14	0	986	0.986	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TGT	ACC	2	CTTTATCTA:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.58333333333337	7	31.833333333333343	0.106490841739566	0.26024898720615	0.409188304180457	-0.153758145466584	0.0433745540342119	0.109198495666669	0.236162865499547	0.0831573578639892	0.104306803345692	0.14045599344069	29	0	971	0.971	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	108	CTA	ACC	TAC	2	TACCTCTAT:TATCTACTT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.666666666666667	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.66666666666671	7	32.25000000000001	0.106372646579413	0.256240196522408	0.415128648912471	-0.149867549942995	0.0446230885603458	0.115448884703932	NaN	NaN	0.105153085565635	0.154090128519167	37	0	963	0.963	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	109	CTT	TAC	ATG	2	CTACTTGCT:CTCTATGCC	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.83333333333337	7	32.58333333333334	0.106137042941326	0.253121833623	0.419312081546497	-0.146984790681674	0.0443845039197918	0.112094068092834	0.277412283095443	0.130657974007642	0.0964309276967593	0.127446403833235	39	0	961	0.961	0.039	0.078
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ATG	CCT	2	CTTGCTTTG:TATGCCTTG	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.33333333333337	6	32.08333333333334	0.0914173632067776	0.215112484631514	0.424974698067269	-0.123695121424736	0.0410031656286506	0.101157128435893	NaN	NaN	0.0938642825265783	0.187567861429874	66	0	934	0.934	0.066	0.132
ORF3a	all	ss13	111	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGATA:GCTTTGATT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.83333333333337	6	32.58333333333334	0.0920189790070996	0.211299152734159	0.435491471765961	-0.11928017372706	0.0412267470900227	0.0968514553850726	NaN	NaN	0.0869562620427161	0.170148721873804	62	0	938	0.938	0.062	0.124
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TGA	TAT	2	TTGATATAT:TTGATTTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.6666666666667	6	32.75000000000001	0.0898508998594654	0.210058104799921	0.4277430758744	-0.120207204940456	0.0417317353744053	0.091805603256984	NaN	NaN	0.092850017529626	0.195444973792299	59	0	941	0.941	0.059	0.118
ORF3a	all	ss13	113	TAC	TAT	ACT	2	ATATATTTT:ATTTACTTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	83.1666666666667	6	33.583333333333336	0.0892772442797873	0.204066610769614	0.437490699449009	-0.114789366489827	0.0386730163453524	0.0920008115645244	0.304145557120834	0.150313385576062	0.0877023382739353	0.190584544130858	50	0	950	0.95	0.05	0.1
ORF3a	all	ss13	114	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTTA:TATTTTCTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.66666666666671	7	34.08333333333334	0.0898508998594654	0.239987262930077	0.374398619170238	-0.150136363070611	0.0390631261648233	0.0944227686467898	NaN	NaN	0.0987528062947554	0.128429306571838	44	0	956	0.956	0.044	0.088
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TCT	TAC	2	TTCTTACAG:TTTCTACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.16666666666671	7	33.91666666666668	0.0904319842103249	0.241378371827081	0.374648248415184	-0.150946387616756	0.0394739577516634	0.102366865773301	NaN	NaN	0.0994408141289042	0.129026487122157	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAT	2	CTACAATGC:TTACAGTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.83333333333337	8	33.91666666666668	0.089658862987337	0.283201052715922	0.31659085348554	-0.193542189728585	0.0392488311918079	0.113722648697802	0.249592520038672	0.204644128875914	0.121047758330278	0.109844790444881	21	0	979	0.979	0.021	0.042
ORF3a	all	ss13	117	TGC	AAT	GCA	2	CAATGCATC:CAGTGCGTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.1666666666667	8	34.91666666666668	0.090431984210325	0.273410739562984	0.33075505503138	-0.182978755352659	0.0386708155633542	0.109736128732766	0.209330517357565	0.11409282269095	0.10504506316032	0.0815246780374822	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	118	ATC	GCA	TCA	2	TGCATCAAC:TGCGTTGTA	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.6666666666667	8	35.41666666666668	0.0910206427532005	0.268767772591288	0.338659065689452	-0.177747129838087	0.0402702183425446	0.106178965164642	NaN	NaN	0.106934108085479	0.096470326959326	20	0	980	0.98	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TCA	ACG	2	ATCAACGCA:GTTGTATTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.1666666666667	7	34.91666666666667	0.090431984210325	0.233267379251205	0.387675227031804	-0.14283539504088	0.0401223264975735	0.102110542581047	NaN	NaN	0.0979164494314434	0.144634563144614	49	0	951	0.951	0.049	0.098
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT:GTATTTGGC	1:1	TRUE	1.08333333333333	0.75	1.16666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.33333333333336	7	35.41666666666668	0.0641416300786215	0.229414483788198	0.279588407059072	-0.165272853709576	0.0303793511287863	0.0957401989783737	NaN	NaN	0.100506815023649	0.100094740732865	26	0	974	0.974	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	121	GGC	CAT	GCA	2	GCATGTAGA:TTTGGCAGG	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.25000000000003	6	35.25000000000001	0.0509209303034166	0.193059006111768	0.263758377964179	-0.142138075808352	0.0257538097087523	0.0878544048124021	NaN	NaN	0.0991146554224953	0.151550209679928	34	0	966	0.966	0.034	0.068
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GCA	GAA	2	GGCAGGCTT:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.66666666666669	6	35.91666666666667	0.0513020451633004	0.188983168709011	0.27146356743702	-0.137681123545711	0.026607767384417	0.0887359142663671	NaN	NaN	0.0933204398521711	0.140116130567443	44	0	956	0.956	0.044	0.088
ORF3a	all	ss13	123	ATT	GAA	TTA	2	AGAATTATT:AGGCTTCTT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.66666666666669	6	35.66666666666667	0.0513020451633004	0.190491169998981	0.269314557538676	-0.139189124835681	0.0268696580649626	0.0930891917962998	NaN	NaN	0.0932779894894192	0.135647540197495	45	0	955	0.955	0.045	0.09
ORF3a	all	ss13	124	ATT	TTA	TTA	2	ATTATTATG:CTTCTTGTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.16666666666669	6	35.83333333333334	0.0379028017472667	0.189483161783181	0.200032559044152	-0.151580360035914	0.0226644135969748	0.0857863106121995	NaN	NaN	0.0946882490361109	0.109413242613279	20	0	980	0.98	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TTA	TCA	2	ATTATGAGA:CTTGTCAGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.33333333333336	6	35.66666666666667	0.0250023152006939	0.190491169998981	0.131251832832081	-0.165488854798287	0.017906966452225	0.0847709901804928	0.230313546564523	0.568756885085658	0.0928247879597111	0.0746174223190024	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TCA	GAT	2	ATGAGATGT:GTCAGATGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.83333333333336	6	36.33333333333334	0.0251595918684029	0.18652246930412	0.134887726729485	-0.161362877435717	0.0184610698568497	0.0797627598298123	NaN	NaN	0.0865284020805398	0.0622018057696358	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	127	TGC	GAT	GCT	2	AGATGCTGG:AGATGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.16666666666669	6	36.83333333333334	0.0383879094086674	0.18365333026498	0.209023758802959	-0.145265420856313	0.0225457237559743	0.0823609552435282	0.287134346834494	0.466635003150946	0.0919609957082854	0.114188950666315	23	0	977	0.977	0.023	0.046
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCTG:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.50000000000001	6	37.16666666666667	0.0520816565415757	0.181789348152453	0.286494544762318	-0.129707691610878	0.0272573418648432	0.0838750213159379	NaN	NaN	0.0850376820733307	0.127185122912623	39	0	961	0.961	0.039	0.078
ORF3a	all	ss13	129	CTG	GGC	TGT	2	TGGCTGTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.16666666666669	6	36.50000000000001	0.0523087754921291	0.185556129985381	0.281902707801948	-0.133247354493252	0.026592466665682	0.0852480573352588	NaN	NaN	0.0885049150677693	0.132186274372669	38	0	962	0.962	0.038	0.076
ORF3a	all	ss13	130	TGC	TGT	GCT	2	CTGTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.91666666666669	6	36.41666666666667	0.0791072878500077	0.186038038359055	0.425221038384258	-0.106930750509047	0.0382163230871979	0.0833066756531966	NaN	NaN	0.0960310876249592	0.26549314740774	117	0	883	0.883	0.117	0.234
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GCT	GGA	2	TGCTGGAAA:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.33333333333336	6	36.33333333333334	0.0938723572155045	0.18652246930412	0.503276401849731	-0.0926501120886158	0.041816435553505	0.088851758321613	NaN	NaN	0.0978160174776577	0.343543227985161	129	0	871	0.871	0.129	0.258
ORF3a	all	ss13	132	AAA	GGA	AAT	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.66666666666669	6	36.33333333333334	0.109283858386045	0.18652246930412	0.585901842248617	-0.0772386109180751	0.0442882931880386	0.083837515443885	0.701449911519014	0.403564280446721	0.0971726050191758	0.426694979772038	227	0	773	0.773	0.227	0.454
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AAT	GCA	2	AAATGCAAA:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.41666666666669	6	35.58333333333334	0.122861989946783	0.190999228388671	0.643259090538138	-0.0681372384418884	0.0465803086146854	0.0911102765831734	NaN	NaN	0.0999840754171564	0.495567243659552	267	0	733	0.733	0.267	0.534
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCA:TGCAAATCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.58333333333334	6	35.58333333333334	0.122582464773988	0.190999228388671	0.641795602045787	-0.0684167636146832	0.0464114638026129	0.0877665388220182	NaN	NaN	0.101833471647419	0.501679533604048	240	0	760	0.76	0.24	0.48
ORF3a	all	ss13	135	TCA	AAT	CAA	2	AAATCAAAG:AAATCCAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.91666666666667	6	35.58333333333334	0.123708284429487	0.190999228388671	0.647689969604217	-0.0672909439591838	0.0450445420377208	0.0855214087529188	NaN	NaN	0.105806100840043	0.524787117255778	264	1	735	0.735	0.264	0.528
ORF3a	all	ss13	136	AAG	CAA	AGA	2	TCAAAGAAT:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.91666666666667	6	36.25000000000001	0.123708284429487	0.187009442781175	0.66150822434267	-0.063301158351688	0.0470451911311912	0.0850208114183633	NaN	NaN	0.100893014780834	0.530391346143826	265	0	735	0.735	0.265	0.53
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AGA	ACC	2	AAGAACCCA:AAGAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.33333333333334	6	35.66666666666667	0.123002232202702	0.190491169998981	0.645710938745141	-0.0674889377962788	0.0449067046033545	0.0857563281456552	NaN	NaN	0.104555159717052	0.518612003111176	244	0	756	0.756	0.244	0.488
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA:AATCCATTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.66666666666667	6	35.66666666666667	0.12413582885818	0.190491169998981	0.651661853191641	-0.0663553411408011	0.0479177072715996	0.0846032006592519	NaN	NaN	0.105467187614205	0.529246762328505	234	0	766	0.766	0.234	0.468
ORF3a	all	ss13	139	TTA	CAT	TAA	2	CCATTAATT:CCATTACTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.5	6	35.83333333333334	0.124422507844916	0.189483161783181	0.656641501408385	-0.065060653938265	0.0486583700748658	0.08313081750061	0.842415065209676	0.435699945819623	0.0990393311663979	0.511234068309172	250	0	750	0.75	0.25	0.5
ORF3a	all	ss13	140	ATT	TAA	TTT	2	TTAATTTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.16666666666667	6	36.83333333333334	0.126764620575651	0.18365333026498	0.690238616379848	-0.056888709689329	0.0482308569942182	0.0815530903589056	NaN	NaN	0.0981791068108423	0.562293639596722	284	0	716	0.716	0.284	0.568
ORF3a	all	ss13	141	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAC:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.25	6	36.83333333333334	0.142100073148949	0.18365333026498	0.773740791653074	-0.0415532571160311	0.0542109012961254	0.0817969323198058	0.962152340809341	0.421294754721444	0.100544992277326	0.679401315828758	346	1	653	0.653	0.346	0.692
ORF3a	all	ss13	142	GAC	ATG	ACT	2	TATGACTCA:TATGATGCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.08333333333334	6	37.66666666666668	0.142438427764417	0.17906358673515	0.79546283173192	-0.0366251589707334	0.0495958233899433	0.0806922627421559	NaN	NaN	0.104385026141826	0.725688862767285	378	0	622	0.622	0.378	0.756
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ACT	CAA	2	GACTCAAAC:GATGCCAAC	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.66666666666667	7	38.08333333333334	0.159249476407496	0.210854230397134	0.75525862633895	-0.051604753989638	0.0559562796435479	0.0879136364001958	NaN	NaN	0.101982177437039	0.612844450484584	304	0	696	0.696	0.304	0.608
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CAA	ACT	2	GCCAACTAC:TCAAACTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.5	6	37.91666666666668	0.173430571160122	0.177731272847004	0.975802223109132	-0.00430070168688174	0.0573549494003571	0.0786965284533648	NaN	NaN	0.101497942070171	0.966201906483294	502	0	498	0.498	0.502	0.996
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTT:AACTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.16666666666667	7	38.250000000000014	0.190803499198466	0.209794072585264	0.909479933571146	-0.018990573386798	0.05653426479203	0.0863339574607901	0.66617203224532	0.172179880696335	0.105914593929358	0.857701504166706	440	1	559	0.559	0.44	0.88
ORF3a	all	ss13	146	TTT	ACT	TTG	2	TACTTTGTT:TATTTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.16666666666667	7	38.250000000000014	0.190803499198466	0.209794072585264	0.909479933571146	-0.018990573386798	0.0589422964444227	0.0873497751354171	0.80517026897833	0.258665964957424	0.105136619704772	0.856659904747014	443	1	556	0.556	0.443	0.886
ORF3a	all	ss13	147	GTT	TTG	TTT	2	TTTGTTTGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.16666666666667	7	37.75000000000001	0.190803499198466	0.213007236149638	0.895760644790615	-0.0222037369511714	0.056567090227463	0.0897459869309183	0.68070854829494	0.188199587472625	0.106659669320991	0.83509335079794	389	0	611	0.611	0.389	0.778
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TTT	GCT	2	GTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.16666666666666	7	38.75000000000001	0.193661500470681	0.206677011490545	0.937024873129351	-0.0130155110198635	0.0552606013922025	0.0885502096854367	0.738916859526327	0.204760113609014	0.101097887200211	0.89756206039223	462	0	538	0.538	0.462	0.924
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC:TGCTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76	7	39.083333333333336	0.194146225437217	0.20465023999998	0.948673333768069	-0.0105040145627635	0.0610295697346854	0.083450768513096	NaN	NaN	0.101354889692233	0.917458223756317	464	1	535	0.535	0.464	0.928
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA:TGGCATACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333333	7	38.41666666666667	0.193179203235308	0.208744590595666	0.925433337860678	-0.0155653873603581	0.0564437283413464	0.0846822156280466	0.680461816781732	0.173827474464971	0.105098158024454	0.882261220117746	439	0	561	0.561	0.439	0.878
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT:CATACTCAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.66666666666666	7	38.41666666666667	0.195123032668416	0.208744590595666	0.93474533692883	-0.0136215579272495	0.0594753995435699	0.0846324950833249	0.76076278448282	0.219186227199524	0.105071085329085	0.896850182360532	446	0	554	0.554	0.446	0.892
ORF3a	all	ss13	152	CAC	CAC	ACA	2	ACACATAAC:ACTCACACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	75.99999999999999	7	38.083333333333336	0.211388364105741	0.210854230397134	1.00253318943424	5.34133708607221e-4	0.0586292287372325	0.0886917832234931	NaN	NaN	0.104183540796762	0.995909380989872	497	0	503	0.503	0.497	0.994
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ACA	ACT	2	CACACTCAT:CATAACTAT	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	75.16666666666666	8	38.25000000000001	0.232011723094212	0.245198876012612	0.946218542544535	-0.0131871529184001	0.064689207310995	0.0933541671689592	0.683605514542628	0.166309856307926	0.111571454827666	0.905913401478632	463	1	536	0.536	0.463	0.926
ORF3a	all	ss13	154	CAT	ACT	ATG	2	AACTATGAC:ACTCATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	75.16666666666666	8	37.91666666666667	0.232011723094212	0.247752936040273	0.936464071031222	-0.0157412129460611	0.0650060039588242	0.0976206260212734	NaN	NaN	0.112891682086892	0.889105287816127	440	0	560	0.56	0.44	0.88
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ATG	ACT	2	CATGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.58333333333333	7	37.75000000000001	0.267388088416834	0.213007236149638	1.25530049236916	0.0543808522671958	0.0762222511202426	0.0921819012738552	NaN	NaN	0.11030142915283	0.621998188860086	693	0	307	0.307	0.693	0.614
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	74.74999999999999	7	37.91666666666667	0.270978159241796	0.211925228838758	1.27864983667409	0.0590529304030382	0.074610971829809	0.0940801824719861	0.941729907646265	0.17453761406366	0.110956612629525	0.594576116403546	693	0	307	0.307	0.693	0.614
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA:TATTGTATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.74999999999999	8	37.91666666666667	0.290428195761674	0.247752936040273	1.17224925929622	0.0426752597214017	0.0806999621054191	0.100256379057245	0.680166013720092	0.0848026254451619	0.117745300477551	0.717025454600055	650	0	350	0.35	0.65	0.7
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA:TGTATTCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.24999999999999	8	37.91666666666667	0.292820423057718	0.247752936040273	1.18190495635587	0.0450674870174453	0.0811943840778911	0.0943498970546642	0.834900225557601	0.156885564695657	0.117651651205847	0.701676250687162	637	0	363	0.363	0.637	0.726
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAT:ATTCCTTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	73.74999999999999	8	38.08333333333334	0.295252898711496	0.246469230096624	1.19793005640398	0.048783668614871	0.0790937985894142	0.0976020767266546	NaN	NaN	0.121937099751466	0.68910318920685	665	0	335	0.335	0.665	0.67
ORF3a	all	ss13	160	TAC	CAT	ACA	2	CCATATAAC:CCTTACAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.08333333333333	8	38.41666666666668	0.293626725734023	0.243941664762153	1.20367599368608	0.0496850609718694	0.0786065384735498	0.0977979389552601	0.73915110273629	0.103427960664544	0.118697440044042	0.675518881037026	650	0	350	0.35	0.65	0.7
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ACA	ACA	2	TACAATAGC:TATAACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.41666666666667	8	38.08333333333334	0.292018592134243	0.246469230096624	1.18480749917449	0.0455493620376186	0.079866467595691	0.0955495698682171	0.762231593120575	0.120090687418035	0.120198138470917	0.704723279453436	625	0	375	0.375	0.625	0.75
ORF3a	all	ss13	162	AGC	ACA	GCA	2	AACAGTGTC:AATAGCATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.25	8	37.58333333333334	0.292820423057718	0.250361262210016	1.16959157528166	0.0424591608477017	0.0789246390905983	0.0997587746463788	NaN	NaN	0.117567814998274	0.717990213732122	649	0	351	0.351	0.649	0.702
ORF3a	all	ss13	163	ATT	GCA	TCA	2	AGCATTACA:AGTGTCACA	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	73.58333333333334	8	37.58333333333334	0.296072846293748	0.250361262210016	1.18258249571128	0.0457115840837314	0.0794495018702078	0.096701371836249	0.78569034318772	0.132285295575644	0.122153238349573	0.708244304161003	649	0	351	0.351	0.649	0.702
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TCA	CAA	2	ATTACAAAC:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.41666666666669	7	37.41666666666667	0.292018592134243	0.215204968042419	1.35693239236319	0.0768136240918237	0.0783109568657009	0.0907511991583109	NaN	NaN	0.112119202787387	0.493276552913564	765	1	234	0.234	0.765	0.468
ORF3a	all	ss13	165	AAC	CAA	ACA	2	ACAAACACT:ACAGATACA	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.41666666666669	7	37.41666666666667	0.292018592134243	0.215204968042419	1.35693239236319	0.0768136240918237	0.0792386857226507	0.0945386698627852	1.17994278551164	0.250144503416482	0.110105479392301	0.485404419457049	759	0	241	0.241	0.759	0.482
ORF3a	all	ss13	166	ACA	ACA	CAA	2	AACACTATC:GATACAATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.25000000000003	6	37.583333333333336	0.292820423057718	0.179512162520447	1.63120102251771	0.113308260537271	0.0850537380302029	0.0797963003379964	1.4000652210222	0.243982843479827	0.0993452360996609	0.254057018536428	875	1	124	0.124	0.875	0.248
ORF3a	all	ss13	167	ATC	CAA	TCG	2	ACAATTGTC:ACTATCGTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.58333333333336	6	37.25000000000001	0.291221195411518	0.181329278360777	1.60603515352935	0.109891917050741	0.079286633858875	0.0806303548995357	NaN	NaN	0.0947217527745572	0.245985696219934	871	0	129	0.129	0.871	0.258
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TCG	TCC	2	ATCGTCCTC:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	73.91666666666669	6	37.41666666666667	0.294437538145597	0.180416123106718	1.6319912714865	0.114021415038879	0.0796225557204517	0.0780583365092625	NaN	NaN	0.0957117806206448	0.233535953695547	884	0	116	0.116	0.884	0.232
ORF3a	all	ss13	169	CTC	TCC	TCA	2	GTCCTCACT:GTCGTTACT	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.50000000000003	6	37.50000000000001	0.29161934182815	0.179963002222943	1.62044052514129	0.111656339605206	0.0814192236028263	0.0818504419399911	NaN	NaN	0.101727101120937	0.272376300974403	859	0	141	0.141	0.859	0.282
ORF3a	all	ss13	170	ACT	TCA	CTG	2	CTCACTGCA:GTTACTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	75.33333333333336	5	36.833333333333336	0.287686797643992	0.149749252688945	1.92112342785153	0.137937544955047	0.0796472743473153	0.0741809355172407	NaN	NaN	0.0930769188796306	0.138347295616338	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss13	171	GAA	CTG	AAG	2	ACTGAAGGT:ACTGCAGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	75.83333333333336	5	36.333333333333336	0.304923460081186	0.152033634372753	2.00563159158309	0.152889825708433	0.0809584129424848	0.0734854896557205	NaN	NaN	0.0955088105578339	0.109422796964868	947	0	53	0.053	0.947	0.106
ORF3a	all	ss13	172	GGT	AAG	GTG	2	GAAGGTGAC:GCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	75.50000000000003	5	36.333333333333336	0.286913136438966	0.152033634372753	1.88716883354586	0.134879502066213	0.0770331444146118	0.0718275116018794	NaN	NaN	0.0883213673941819	0.126725050799362	953	0	47	0.047	0.953	0.094
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	76.16666666666669	5	36.333333333333336	0.283860150265539	0.152033634372753	1.8670878416915	0.131826515892786	0.0782632197967091	0.0738251466577104	NaN	NaN	0.0908887954592272	0.146942692891676	934	0	66	0.066	0.934	0.132
ORF3a	all	ss13	174	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATT:GATGGTGTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	75.16666666666669	5	36.666666666666664	0.288464693936611	0.150503021596613	1.91667044871544	0.137961672339997	0.0793003457941148	0.0767033163774124	NaN	NaN	0.0945972141372895	0.144727131262236	926	0	74	0.074	0.926	0.148
ORF3a	all	ss13	175	ATT	GCA	TCA	2	GGCATTTCA:GGTGTCACT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.66666666666669	5	37.166666666666664	0.290824148256573	0.148264213964023	1.96152625425271	0.142559934292549	0.0808363649810851	0.069784610298284	NaN	NaN	0.0918806184268729	0.120763261538803	945	0	55	0.055	0.945	0.11
ORF3a	all	ss13	176	ACT	TCA	CAA	2	ATTTCAACA:GTCACTATT	1:1	TRUE	1	1	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.41666666666669	4	37.49999999999999	0.292018592134243	0.115057659974651	2.53801956513438	0.176960932159592	0.0810101930723078	0.0644197570223181	NaN	NaN	0.0821466564060558	0.0312239136243719	991	0	9	0.009	0.991	0.018
ORF3a	all	ss13	177	ACA	CAA	CAC	2	ACTATTCCC:TCAACACCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	75.66666666666669	5	36.916666666666664	0.286143675421617	0.149375201835214	1.91560360693124	0.136768473586403	0.0745083661589075	0.0754897508601432	NaN	NaN	0.0838900587936719	0.103031785371913	950	0	50	0.05	0.95	0.1
ORF3a	all	ss13	178	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ATTCCCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.33333333333336	5	36.74999999999999	0.264238228927332	0.150125187835474	1.76011922274441	0.114113041091859	0.0731706132515728	0.077691806885499	NaN	NaN	0.0812160801678799	0.160004991442884	929	0	71	0.071	0.929	0.142
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTC:CCCATTCGG	1:1	TRUE	1.75	0.5	0.75	0	2	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.25000000000001	5	36.83333333333333	0.264584505778426	0.149749252688945	1.76685025819804	0.114835253089481	0.0699142426408082	0.0742314248449369	NaN	NaN	0.0795726695802773	0.148978380266885	923	0	77	0.077	0.923	0.154
ORF3a	all	ss13	180	CGG	AAC	GGA	2	AAACTCAAA:ATTCGGACA	1:1	FALSE	1.5	1.16666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	75.50000000000001	5	37.08333333333333	0.230812226626943	0.148632696437812	1.55290344694456	0.082179530189131	0.0639202402347371	0.0737756105037292	NaN	NaN	0.0714263402143941	0.249917675476937	885	1	114	0.114	0.885	0.228
ORF3a	all	ss13	181	AAA	GGA	AAG	2	CGGACACAA:CTCAAAGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.33333333333334	5	37.08333333333333	0.210322806792345	0.148632696437812	1.4150507380477	0.0616901103545339	0.0593536569576403	0.0715164041796594	NaN	NaN	0.0691321727521907	0.372205238092802	836	0	164	0.164	0.836	0.328
ORF3a	all	ss13	182	CAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGAC:ACACAAGAC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.33333333333334	5	37.08333333333333	0.193179203235308	0.148632696437812	1.29970866347119	0.0445465067974963	0.0571132823698771	0.0732833017181772	NaN	NaN	0.0683009044810193	0.514265956395529	779	0	221	0.221	0.779	0.442
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	CAAGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.08333333333334	6	37.83333333333333	0.179737298307158	0.178173158730486	1.00877876099754	0.00156413957667209	0.0570667619601733	0.0802144756629983	NaN	NaN	0.0728837112274744	0.982878108054242	498	0	502	0.502	0.498	0.996
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	73.91666666666669	6	38.666666666666664	0.182949852558591	0.173851210542993	1.05233579902711	0.00909864201559726	0.0550427871966154	0.0790280464376331	NaN	NaN	0.0741628810254087	0.902356873864961	542	0	458	0.458	0.542	0.916
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	74.58333333333336	7	38.333333333333336	0.181100119848143	0.2092680072815	0.865398023332508	-0.028167887433357	0.0596781434777411	0.0890636875033436	0.622257667168996	0.164304578112895	0.0877534002586564	0.74821862987158	357	2	641	0.641	0.357	0.714
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	74.58333333333336	7	38.333333333333336	0.181100119848143	0.2092680072815	0.865398023332508	-0.028167887433357	0.0575909252950861	0.0883355457141722	NaN	NaN	0.0874929132545695	0.747494521882738	388	0	612	0.612	0.388	0.776
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	74.58333333333336	7	38.166666666666664	0.21604093597738	0.210322806792346	1.02718739480631	0.00571812918503459	0.0636526361152448	0.090639289676425	0.720575614863326	0.154009971817962	0.0933609513318877	0.951162064345263	510	0	490	0.49	0.51	0.98
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAC:GGTGGTTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	74.91666666666669	7	38.166666666666664	0.232919624976835	0.210322806792346	1.10743874394373	0.0225968181844892	0.0701771886361789	0.0896967903048449	0.873193112941067	0.204703952752307	0.0972468961536807	0.816254186266706	556	0	444	0.444	0.556	0.888
ORF3a	all	ss13	189	TAC	GTT	ACT	2	GGTTACTTC:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.33333333333336	7	37.416666666666664	0.245832397240244	0.215204968042419	1.14231748214933	0.0306274291978247	0.0719368053270856	0.0924026548079505	0.724983995624081	0.115107615635669	0.0972892745251339	0.752907536642458	622	0	378	0.378	0.622	0.756
ORF3a	all	ss13	190	TCT	ACT	CTG	2	TACTTCGAA:TATTCTGAG	1:1	TRUE	1.25	0.75	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	77.33333333333336	8	36.833333333333336	0.278672667324362	0.256437672127084	1.08670721042211	0.0222349951972787	0.0804481152586792	0.105671477829432	0.690054703692086	0.115299583924929	0.106393122316623	0.834456804046677	588	1	411	0.411	0.588	0.822
ORF3a	all	ss13	191	GAA	CTG	AAA	2	TCTGAGGAT:TTCGAAAAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	77.16666666666669	8	37.083333333333336	0.29845060643025	0.25437938121672	1.17324998984876	0.0440712252135302	0.0869869289318767	0.109138574401068	NaN	NaN	0.109653507067628	0.687747684350766	647	1	352	0.352	0.647	0.704
ORF3a	all	ss13	192	AAA	AAA	AAT	2	GAAAAATGG:GAGGATAGG	1:1	TRUE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	19	75.66666666666669	8	35.916666666666664	0.305752635499859	0.264281463445784	1.15692047226226	0.0414711720540747	0.0911258283047394	0.113653156824194	0.72061255171233	0.108390825554401	0.118369776367395	0.726074011175319	675	0	325	0.325	0.675	0.65
ORF3a	all	ss13	193	AGG	AAT	GGC	2	AAATGGGAA:GATAGGCAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.75000000000001	9	36.49999999999999	0.290428195761674	0.298979357278323	0.971398823000717	-0.00855116151664914	0.0879864261195822	0.134615084973183	NaN	NaN	0.148297116537358	0.954017577249837	476	0	524	0.524	0.476	0.952
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	AAT	2	AGGCACTCA:TGGGAATCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	18	74.41666666666669	9	36.83333333333333	0.292018592134243	0.29566229667922	0.987676127169741	-0.00364370454497703	0.0901721930716525	0.140460248786958	0.611856973636318	0.10647816913659	0.142262038835227	0.97956631444013	481	0	519	0.519	0.481	0.962
ORF3a	all	ss13	195	TCA	AAT	CAG	2	CACTCAGGT:GAATCTGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	74.25000000000001	8	36.33333333333333	0.27317936608966	0.260656845281595	1.04804217128668	0.0125225208080649	0.0851991623261172	0.121314519654083	NaN	NaN	0.139134609725104	0.928284896367091	520	0	480	0.48	0.52	0.96
ORF3a	all	ss13	196	GGT	CAG	GTG	2	TCAGGTGTT:TCTGGTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.41666666666669	8	35.83333333333333	0.268098391166812	0.265018643484554	1.01162087180647	0.00307974768225855	0.0863270094946755	0.127370902698176	0.776968820440011	0.192913100073109	0.136121667869478	0.981949431426181	513	0	487	0.487	0.513	0.974
ORF3a	all	ss13	197	GTT	GTG	TTA	2	GGTGTTAAA:GGTGTTAAG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	75.91666666666669	9	35.49999999999999	0.265978832161818	0.309399206498443	0.859662295750446	-0.043420374336625	0.0847648769764492	0.142403723903661	0.745482875649881	0.248844023023946	0.155102373177388	0.779518512367541	403	0	597	0.597	0.403	0.806
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC:GTTAAGGAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	77.25000000000001	9	34.833333333333336	0.260488747447952	0.316764994602515	0.82234070016108	-0.0562762471545621	0.0811699350483782	0.154416077752206	0.660697053833402	0.213258143820569	0.163110144837834	0.730079404283413	364	1	635	0.635	0.364	0.728
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT:AAGGACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.25000000000001	9	35.166666666666664	0.264584505778426	0.313038150259031	0.845214890132367	-0.0484536444806047	0.0817246002482527	0.146505467087729	0.687960249619658	0.219228943493628	0.151053294853101	0.748383295237228	370	0	630	0.63	0.37	0.74
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATC	2	GACTATCTT:GACTATGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.08333333333336	9	35.166666666666664	0.265279817755724	0.313038150259031	0.847436063419783	-0.0477583325033074	0.0785278975966739	0.146496711039042	NaN	NaN	0.167162911502209	0.775108414756904	408	0	592	0.592	0.408	0.816
ORF3a	all	ss13	201	CTT	ATC	TCG	2	TATCTTACA:TATGTCGTT	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	17	76.75000000000003	9	35.166666666666664	0.262520489663413	0.313038150259031	0.838621393099159	-0.0505176605956185	0.0852290856022055	0.148964365708959	NaN	NaN	0.156329538512133	0.746582758355255	391	0	609	0.609	0.391	0.782
ORF3a	all	ss13	202	ACA	TCG	CAC	2	CTTACACTT:GTCGTTGTA	1:1	TRUE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.25000000000003	9	35.666666666666664	0.24615039807976	0.307611718065443	0.800198378747694	-0.0614613199856827	0.0810576796612195	0.146467076768724	0.573664450864992	0.163049237680839	0.157000646860285	0.695448556700766	337	0	663	0.663	0.337	0.674
ORF3a	all	ss13	203	CTT	CAC	TAC	2	ACACTTATT:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.08333333333336	8	35.833333333333336	0.22874291321268	0.265018643484554	0.863120081685922	-0.0362757302718734	0.0764295769690595	0.127434886097058	0.699474644440927	0.217219754673851	0.137434988835106	0.791819764714223	377	1	622	0.622	0.377	0.754
ORF3a	all	ss13	204	ATT	TAC	ATG	2	CTTATTGGT:GTACATGGC	1:1	TRUE	1.75	0.416666666666667	0.833333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	74.91666666666669	8	36	0.214927757699318	0.263548415128416	0.815515272951242	-0.0486206574290987	0.076647167339462	0.126078563800619	NaN	NaN	0.135373464382339	0.719475818469625	347	1	652	0.652	0.347	0.694
ORF3a	all	ss13	205	GGC	ATG	GCT	2	ATTGGTCCT:CATGGCTAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	74.66666666666669	8	35.666666666666664	0.180871542612666	0.266505540694197	0.678678357461273	-0.0856339980815309	0.0666171216857547	0.123446099792165	0.535990680201029	0.205436840968228	0.136119994456863	0.529279216132584	216	0	784	0.784	0.216	0.432
ORF3a	all	ss13	206	CCT	GCT	ATT	2	GGCTATTTC:GGTCCTTTC	1:1	TRUE	1	1	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	74.16666666666669	8	36.166666666666664	0.18225176997286	0.262094574111018	0.695366436298912	-0.0798428041381584	0.0649955390535665	0.128062441935374	0.661263982972941	0.292996135235544	0.129444457496251	0.53735919756024	247	0	753	0.753	0.247	0.494
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ATT	TCA	2	CCTTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	74.50000000000001	8	35.833333333333336	0.164427154593967	0.265018643484554	0.620436179251483	-0.100591488890586	0.0612191312935556	0.134188023609344	0.506677176960936	0.220756243439713	0.135293324877971	0.457174987329181	191	1	808	0.808	0.191	0.382
ORF3a	all	ss13	208	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGAA:TTCACTGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	74.16666666666669	8	36.83333333333333	0.165253875289951	0.256437672127084	0.644421211279969	-0.091183796837133	0.0657064770434193	0.128833225904911	NaN	NaN	0.138889392354753	0.511488987708124	193	0	807	0.807	0.193	0.386
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CCG	AAG	2	ACCGAAGTT:ACTGAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	73.33333333333336	8	35.66666666666666	0.167357663485657	0.266505540694197	0.627970672015756	-0.0991478772085396	0.0664389082704825	0.129901193180416	0.574491810719384	0.274354730429214	0.137014515802397	0.469292635478664	216	0	784	0.784	0.216	0.432
ORF3a	all	ss13	210	GTT	AAG	TTT	2	GAAGTTTAC:GAAGTTTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	71.66666666666669	8	34.66666666666666	0.171730853718752	0.275793585093988	0.622678927286245	-0.104062731375236	0.06844102732549	0.132393597210549	NaN	NaN	0.14213172554298	0.464072773968829	219	0	781	0.781	0.219	0.438
ORF3a	all	ss13	211	TAC	TTT	ACT	2	GTTTACTAC:GTTTATTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	70.00000000000001	8	34.33333333333333	0.176339806770694	0.27903683339124	0.631958887389774	-0.102697026620546	0.069002451618148	0.138612832867659	NaN	NaN	0.143770540234733	0.475034254284693	202	0	798	0.798	0.202	0.404
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCAG:TATTACCAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	68.33333333333334	8	33.99999999999999	0.181204210615459	0.282358178426184	0.641753008981217	-0.101153967810725	0.0714311357060773	0.138186413617424	0.74850407178691	0.391234474822928	0.146019353851123	0.488470493896781	218	0	782	0.782	0.218	0.436
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	68.33333333333334	8	33.99999999999999	0.181204210615459	0.282358178426184	0.641753008981217	-0.101153967810725	0.0744917049503087	0.13962861195998	NaN	NaN	0.150130342999018	0.500454811875957	210	0	790	0.79	0.21	0.42
ORF3a	all	ss13	214	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAA:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	68.66666666666667	8	33.33333333333333	0.180209875167898	0.289246860608989	0.623031395357165	-0.109036985441091	0.0676188570538609	0.144754676967174	0.567844232283402	0.272559588882927	0.154571119786367	0.48055121105743	228	0	772	0.772	0.228	0.456
ORF3a	all	ss13	215	GAA	TTG	AAT	2	CTTGAATCT:CTTGAGTCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	69.00000000000001	8	32.99999999999999	0.179226444343955	0.292820423057718	0.612069480920829	-0.113593978713763	0.0696853889649212	0.15306769729194	NaN	NaN	0.158961145251999	0.474854905936564	212	0	788	0.788	0.212	0.424
ORF3a	all	ss13	216	TCT	AAT	CTA	2	GAATCTACC:GAGTCTACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	69.00000000000001	8	32.99999999999999	0.179226444343955	0.292820423057718	0.612069480920829	-0.113593978713763	0.0714315074504004	0.150875297881751	0.628262414275685	0.32994441515765	0.15558493502242501	0.465323492163698	196	0	804	0.804	0.196	0.392
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CTA	CAC	2	TCTACACAA:TCTACCCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	70.33333333333336	8	32.33333333333333	0.175398240794483	0.300242781455809	0.584188035908864	-0.124844540661326	0.0692086622930083	0.158406162332123	NaN	NaN	0.164521580644436	0.447951967585376	189	0	811	0.811	0.189	0.378
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT:ACCCAGATT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	70.50000000000001	8	32.16666666666666	0.174931235415909	0.30215833840741	0.578938964047529	-0.127227102991502	0.0691258605392337	0.155738627367077	0.607090225740353	0.340271371551709	0.168527342395526	0.450288291083469	167	0	833	0.833	0.167	0.334
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TTA	2	CAAATTACT:CAGATTTCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	69.33333333333336	8	32.66666666666666	0.17825373890784	0.29648455248311	0.601224372112926	-0.11823081357527	0.0692934808770027	0.170453807023811	0.50120090299873	0.230307310078849	0.168536966024961	0.482983143245379	194	0	806	0.806	0.194	0.388
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TTA	CCA	2	ATTACTACA:ATTTCCACA	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	68.16666666666669	9	33.66666666666666	0.181705524684589	0.330549935209217	0.549706732114715	-0.148844410524628	0.0736095044212197	0.151755446639706	0.426180032338692	0.197104033390918	0.162635771873233	0.360086153754941	147	0	853	0.853	0.147	0.294
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CCA	CAG	2	ACTACAGAC:TCCACAGAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	67.33333333333334	9	34.49999999999999	0.165503521626615	0.320583011120205	0.516257929727158	-0.155079489493589	0.0694135880334773	0.146543353456283	0.498000855964137	0.299894000704864	0.157756033936324	0.325590878600281	126	0	874	0.874	0.126	0.252
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	67.00000000000001	9	34.83333333333332	0.16642540730596	0.316764994602515	0.525390779100433	-0.150339587296555	0.0705220096350495	0.156913820283813	NaN	NaN	0.15765239437415	0.34027888376898	102	0	898	0.898	0.102	0.204
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	66.33333333333336	9	35.499999999999986	0.168300466878196	0.309399206498443	0.543958947997634	-0.141098739620247	0.0727254565570832	0.148306701231383	NaN	NaN	0.155878912932876	0.365369134342338	148	0	852	0.852	0.148	0.296
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	66.66666666666669	9	35.16666666666666	0.167357663485657	0.313038150259031	0.534623857658158	-0.145680486773374	0.0723024731481091	0.143709994226002	0.468726399641948	0.25404127919218	0.153355548224053	0.34213638761527	138	0	862	0.862	0.138	0.276
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	TTA	2	GGTATTAAT:GGTATTGAA	1:1	FALSE	0.916666666666667	0.75	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	67.16666666666669	9	34.66666666666666	0.16596317904302	0.31866239547395	0.52081193576726	-0.15269921643093	0.0647987998386448	0.149072704966955	0.427345259007574	0.222952508485653	0.158383369054436	0.334990062790085	134	0	866	0.866	0.134	0.268
ORF3a	all	ss13	226	AAT	TTA	AAA	2	ATTAATAAT:ATTGAAAAT	1:1	TRUE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	67.58333333333336	10	34.16666666666666	0.164818808930133	0.37102218137708	0.444228990079228	-0.206203372446948	0.0682533295977841	0.169521434114384	0.320434696718621	0.165645439284201	0.181086615741535	0.254828203441707	62	0	938	0.938	0.062	0.124
ORF3a	all	ss13	227	AAT	AAA	ATG	2	AATAATGCG:GAAAATGCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	GCG	ATG	CGA	2	AATGCGACA:AATGCTACA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CGA	CAT	2	GCGACATTC:GCTACATTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC:TTCTTCCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTTT:TTCCTCTTC	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TTC	TCT	TCT	2	ATCTTTAAC:CTCTTCTCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	TCT	ACA	2	TTCTCAAAG:TTTAACAAG	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAG	ACA	AGA	2	AACAAGCTT:TCAAAGAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	AAT	AGA	ATG	2	AAGAATGAT:AAGCTTGTT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	2	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GAT	ATG	ATG	2	AATGATGAA:CTTGTTAAA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	ATG	AAA	2	GATGAAAGA:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	AGA	AAA	ACC	2	AAAGACCCA:GAAAGAGAA	1:1	TRUE	2	0.583333333333333	0.416666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	CCA	ACC	AAC	1	AGAGAACAG:GACCCA---	1:1	TRUE	1.08333333333333	0.166666666666667	1.25	0.5	2	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	AAC	AGG	1	CCA---CCG:GAACAGGAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	AAA	1	---CCGAAT:CAGGAAAGT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	2	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	AAA	ATG	2	CCGAATGTG:GAAAGTGTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTC	ATG	TCC	2	AATGTGCAA:AGTGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TCC	AAA	2	GTCCAAGTT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC:CAAGTTCAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA:GTTCACACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCA:GACGGCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCA	GCT	CAT	2	GGCTCATCA:GGCTCTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CAT	CAG	2	TCATCAGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT:GTTGTAAAC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAC	CTA	AC-	1	GCTAATCCA:GTAAAC---	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	---	ATC	CAG	1	AAC------:AATCCAGCA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	---	CAG	CAA	1	---------:CCAGCAATG	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	---	CAA	TGG	1	---------:GCAATGGAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	---	TGG	ATC	1	------CCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	--C	CAA	1	---CCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATT	CAA	TTT	2	CCAATTTAC:CCAATTTAT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAC	TTT	ACG	2	ATTTACGAT:ATTTATGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ACG	ATG	2	TACGATGAG:TATGATGAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAG	ATG	AGC	2	GATGAGCCG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCG	AGC	CGA	2	GAGCCGACG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CGA	CGA	2	CCGACGACG:CCGACGCCG	1:1	FALSE	0.75	1	1.25	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT:ACGCCGACT	1:1	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT:CCGACTACT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTC	2	GTGCCTCTT:GTGCCTTTG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	CTT	CTC	TGT	2	CCTCTTTAA:CCTTTGTAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.66666666666669	1	31.74999999999998	0.01369901098297	0.0321765161581571	0.425745625027747	-0.0184775051751871	0.0139667173111392	0.0329347694354496	NA	NA	0.0379290903903675	0.626145519163677	274	143	583	0.583	0.274	0.548
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.33333333333334	1	32.083333333333314	0.0137618540011474	0.0318350176854428	0.432286676801197	-0.0180731636842954	0.0137397035568047	0.0327592305258466	NA	NA	0.0364472017337229	0.619984395739245	258	128	614	0.614	0.258	0.516
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.66666666666669	1	32.41666666666664	0.0138892858254281	0.0315006929809731	0.440920008769886	-0.017611407155545	0.0137040412962936	0.0345288910957194	NA	NA	0.0359697939065173	0.624405248096668	280	120	600	0.6	0.28	0.56
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.83333333333334	1	32.24999999999998	0.0138572071256798	0.03166697281676	0.437591783902558	-0.0178097656910802	0.0141074258723959	0.035574202275713	NA	NA	0.0374796048656672	0.63465474388155	294	119	587	0.587	0.294	0.588
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAA	2	ATGAGAATT:ATGAGATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.16666666666667	1	32.91666666666665	0.0137934922285677	0.0310121698640216	0.444776753418019	-0.017218677635454	0.0130445616806864	0.0322087696471474	NA	NA	0.0353501795786106	0.626195381331414	276	141	583	0.583	0.276	0.552
ORF3a	all	ss13	7	ATT	GAA	TTT	2	AGAATTTTT:AGATTTTTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.83333333333333	1	33.24999999999998	0.0136678042173386	0.0306948207819131	0.445280469772033	-0.0170270165645745	0.0135091982744008	0.0306575102483451	NA	NA	0.0363822219966986	0.639781903350761	288	125	587	0.587	0.288	0.576
ORF3a	all	ss13	8	TTT	TTT	TTA	2	ATTTTTACT:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333333	1	33.41666666666665	0	0.0305385697640887	0	-0.0305385697640887	0	0.0336694721153842	NA	NA	0.0320942209245494	0.341336096827151	0	383	617	0.617	0	0.001
ORF3a	all	ss13	9	ACT	TTA	CTC	2	TTTACTCTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333333	1	33.083333333333314	0	0.0308526791703671	0	-0.0308526791703671	0	0.0320488000759189	NA	NA	0.0325392623365242	0.343044062024044	0	370	630	0.63	0	0.001
ORF3a	all	ss13	10	CTT	CTC	TTA	2	ACTCTTAGA:ACTCTTGGA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333333	1	34.08333333333331	0	0.0299291581301554	0	-0.0299291581301554	0	0.0325949051143364	NA	NA	0.0315888722092298	0.343404989663802	0	365	635	0.635	0	0.001
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TTA	GAT	2	CTTAGATCA:CTTGGATCA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666666	1	33.74999999999998	0	0.0302307926160697	0	-0.0302307926160697	0	0.0316864274080158	NA	NA	0.0323334027571958	0.349803265468904	0	383	617	0.617	0	0.001
ORF3a	all	ss13	12	TCA	GAT	CAA	2	AGATCAATT:GGATCAATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.25	0	34.24999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	13	ATT	CAA	TTA	2	TCAATTACT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.25	0	34.24999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	14	ACT	TTA	CTG	2	ATTACTGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666667	0	33.74999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	15	GCA	CTG	CAC	2	ACTGCACAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.50000000000001	0	33.41666666666664	0.0135443861537981	0	-Inf	0.0135443861537981	0.0134842754667325	0	NA	NA	0.0137926969275048	0.326101356561771	636	364	0	0	0.636	0.001
ORF3a	all	ss13	16	CAG	CAC	AGC	2	GCACAGCCA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.50000000000001	0	33.41666666666664	0.0135443861537981	0	-Inf	0.0135443861537981	0.013815534738937	0	NA	NA	0.0144155804060315	0.347440332309052	641	359	0	0	0.641	0.001
ORF3a	all	ss13	17	CCA	AGC	CAG	2	CAGCCAGGA:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.50000000000001	0	34.41666666666664	0.0137303605832671	0	-Inf	0.0137303605832671	0.0141248687786096	0	NA	NA	0.0136033237126006	0.312812243348157	649	351	0	0	0.649	0.001
ORF3a	all	ss13	18	GGA	CAG	GAA	2	CCAGGAAAA:CCAGTAAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.00000000000001	0	34.583333333333314	0.0136367393123929	0	-Inf	0.0136367393123929	0.0134743055471456	0	NA	NA	0.0135058907355728	0.312644669021319	625	375	0	0	0.625	0.001
ORF3a	all	ss13	19	AAA	GAA	AAA	2	GGAAAAATT:GTAAAAATT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.08333333333336	0	34.66666666666664	0.0136212597557268	0	-Inf	0.0136212597557268	0.0137229453906339	0	NA	NA	0.0130224740169785	0.295569827351145	658	342	0	0	0.658	0.001
ORF3a	all	ss13	20	ATT	AAA	TTG	2	AAAATTGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333336	0	34.49999999999998	0.0135291154422588	0	-Inf	0.0135291154422588	0.0134725268933931	0	NA	NA	0.0141147001083043	0.337804428682547	645	355	0	0	0.645	0.001
ORF3a	all	ss13	21	GAC	TTG	ACA	2	ATTGACAAT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.41666666666669	0	34.833333333333314	0.013559691378237	0	-Inf	0.013559691378237	0.013121600431518	0	NA	NA	0.0139115344298647	0.329704856828011	657	343	0	0	0.657	0.001
ORF3a	all	ss13	22	AAT	ACA	ATG	2	GACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75000000000003	0	34.49999999999998	0.0138732279313668	0	-Inf	0.0138732279313668	0.0136871266807522	0	NA	NA	0.0143530572053737	0.33375926677344	616	384	0	0	0.616	0.001
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTT	2	AATGCTTCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.08333333333336	0	33.49999999999998	0.014002740465399	0	-Inf	0.014002740465399	0.0144613324432535	0	NA	NA	0.0141364218162569	0.321908547784896	626	374	0	0	0.626	0.001
ORF3a	all	ss13	24	TCT	CTT	CTC	2	GCTTCTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.08333333333336	0	34.49999999999998	0.0142016077516528	0	-Inf	0.0142016077516528	0.0146117984641413	0	NA	NA	0.0142269367003536	0.318172860730723	641	359	0	0	0.641	0.001
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.75000000000003	0	33.833333333333314	0.014068407802917701	0	-Inf	0.014068407802917701	0.0145923312296355	0	NA	NA	0.013475119037981	0.296472221606759	636	364	0	0	0.636	0.001
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.91666666666669	0	33.333333333333314	0.0138412232800193	0	-Inf	0.0138412232800193	0.0137461497279585	0	NA	NA	0.0141107702830095	0.326643151126222	648	352	0	0	0.648	0.001
ORF3a	all	ss13	27	AGT	CAA	GTA	2	GCAAGTACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.58333333333336	0	32.66666666666665	0.0137146678675636	0	-Inf	0.0137146678675636	0.0142812309758957	0	NA	NA	0.0140001209906669	0.327278337272044	631	369	0	0	0.631	0.001
ORF3a	all	ss13	28	ACT	GTA	CTG	2	AGTACTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.9166666666667	0	33.333333333333314	0.0138412232800193	0	-Inf	0.0138412232800193	0.0134960914907797	0	NA	NA	0.0135495853767701	0.307006362173935	604	396	0	0	0.604	0.001
ORF3a	all	ss13	29	GTT	CTG	TTC	2	ACTGTTCAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.9166666666667	0	32.999999999999986	0.0136522540928075	0	-Inf	0.0136522540928075	0.0134053772905831	0	NA	NA	0.014010766911316	0.32985220185968	625	375	0	0	0.625	0.001
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	GTTCATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333337	0	32.33333333333332	0.0135291154422588	0	-Inf	0.0135291154422588	0.0138245403787944	0	NA	NA	0.0137530519425809	0.325254519867439	627	373	0	0	0.627	0.001
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.58333333333337	0	32.999999999999986	0.0137146678675636	0	-Inf	0.0137146678675636	0.0134749102397934	0	NA	NA	0.0138009415845138	0.320345223043167	635	365	0	0	0.635	0.001
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.08333333333337	0	32.999999999999986	0.0136212597557268	0	-Inf	0.0136212597557268	0.0144640447940268	0	NA	NA	0.0136245989423913	0.317429129252439	633	367	0	0	0.633	0.001
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75000000000004	0	32.999999999999986	0.0134986770919624	0	-Inf	0.0134986770919624	0.0139609180609825	0	NA	NA	0.0135302222719129	0.318440113558534	638	362	0	0	0.638	0.001
ORF3a	all	ss13	34	ACG	CAA	CGA	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.08333333333337	0	32.999999999999986	0.0134382094503063	0	-Inf	0.0134382094503063	0.0131917956636081	0	NA	NA	0.0137839982980442	0.329603045724909	636	364	0	0	0.636	0.001
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CGA	TAC	2	ACGATACCG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.9166666666667	0	32.16666666666665	0.0134683754007452	0	-Inf	0.0134683754007452	0.0131601830899545	0	NA	NA	0.0134840973662765	0.317875094886884	626	374	0	0	0.626	0.001
ORF3a	all	ss13	36	CCG	TAC	CGC	2	ATACCGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.08333333333337	0	31.166666666666654	0.0134382094503063	0	-Inf	0.0134382094503063	0.0131773644640466	0	NA	NA	0.0140966844026243	0.34044383316711	640	360	0	0	0.64	0.001
ORF3a	all	ss13	37	CTA	CGC	TAC	2	CCGCTACAA	2	FALSE	1	1	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.58333333333337	0	30.166666666666654	0.0133485169832455	0	-Inf	0.0133485169832455	0.0132658321791486	0	NA	NA	0.0139341599350173	0.338077532118709	672	328	0	0	0.672	0.001
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	CTACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000004	0	30.833333333333314	0.0133188849757348	0	-Inf	0.0133188849757348	0.0135309074009021	0	NA	NA	0.0141671400938579	0.347153359916328	623	377	0	0	0.623	0.001
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.4166666666667	0	31.499999999999982	0.0133782811395161	0	-Inf	0.0133782811395161	0.0141867129361128	0	NA	NA	0.0140291695097123	0.340283806176014	628	372	0	0	0.628	0.001
ORF3a	all	ss13	40	TCA	CCT	CAC	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.4166666666667	0	31.499999999999982	0.0133782811395161	0	-Inf	0.0133782811395161	0.0132443902607994	0	NA	NA	0.0136944972398245	0.32861407792986	643	357	0	0	0.643	0.001
ORF3a	all	ss13	41	CTC	CAC	TCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000003	0	31.499999999999982	0.0133188849757348	0	-Inf	0.0133188849757348	0.0134672634826901	0	NA	NA	0.0127679010968797	0.29687705128466	616	384	0	0	0.616	0.001
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TCC	CTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.08333333333337	0	32.16666666666665	0.0134382094503063	0	-Inf	0.0134382094503063	0.0129866340284094	0	NA	NA	0.0138297821549656	0.331206648866956	646	354	0	0	0.646	0.001
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.4166666666667	0	31.833333333333318	0.0133782811395161	0	-Inf	0.0133782811395161	0.0132126848222672	0	NA	NA	0.0135127751338582	0.322151195455263	644	356	0	0	0.644	0.001
ORF3a	all	ss13	44	GGA	TCG	GAT	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.25000000000003	0	31.16666666666665	0.0132307731029258	0	-Inf	0.0132307731029258	0.0127091840758461	0	NA	NA	0.0135189284453053	0.327735623287944	646	354	0	0	0.646	0.001
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	GGATGGCTT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.58333333333336	0	30.833333333333318	0.0131726767040263	0	-Inf	0.0131726767040263	0.0129353504698593	0	NA	NA	0.0128919382726851	0.306886799358423	627	373	0	0	0.627	0.001
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTG	2	TGGCTTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.25000000000001	0	30.499999999999982	0.0132307731029258	0	-Inf	0.0132307731029258	0.0132124868560991	0	NA	NA	0.0138105127369223	0.33805173554715	635	365	0	0	0.635	0.001
ORF3a	all	ss13	47	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.75000000000001	0	29.999999999999986	0.0131438194165355	0	-Inf	0.0131438194165355	0.0128934335137444	0	NA	NA	0.0130845675295553	0.315123999228319	635	365	0	0	0.635	0.001
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	GTTATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.08333333333336	0	29.666666666666654	0.0130864825012098	0	-Inf	0.0130864825012098	0.0135220668363936	0	NA	NA	0.0136944072275709	0.339270414205397	650	350	0	0	0.65	0.001
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.9166666666667	0	30.333333333333314	0.0132893842388272	0	-Inf	0.0132893842388272	0.0131677412498252	0	NA	NA	0.0130279390668175	0.307696194052163	682	318	0	0	0.682	0.001
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000003	0	30.999999999999982	0.0134081783305544	0	-Inf	0.0134081783305544	0.0136198917403039	0	NA	NA	0.0136045715255445	0.324347024514093	637	363	0	0	0.637	0.001
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAT	2	GTTGCATTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.25000000000003	0	29.999999999999986	0.0132307731029258	0	-Inf	0.0132307731029258	0.0131489508388201	0	NA	NA	0.0129392635132191	0.306530560562708	621	379	0	0	0.621	0.001
ORF3a	all	ss13	52	TTT	CAT	TTC	2	GCATTTCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.58333333333336	0	30.666666666666654	0.0131726767040263	0	-Inf	0.0131726767040263	0.0136550769340839	0	NA	NA	0.0131447366523537	0.316282949899838	638	362	0	0	0.638	0.001
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TTC	TTG	2	TTTCTTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.58333333333336	0	30.666666666666654	0.0131726767040263	0	-Inf	0.0131726767040263	0.0137172939001742	0	NA	NA	0.014098916488548	0.350147005267494	630	370	0	0	0.63	0.001
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.9166666666667	0	30.333333333333318	0.0131150882907867	0	-Inf	0.0131150882907867	0.0135464095212948	0	NA	NA	0.012958232766828	0.311487995262218	641	359	0	0	0.641	0.001
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.25000000000004	0	30.66666666666665	0.0130580012294226	0	-Inf	0.0130580012294226	0.0129338191227464	0	NA	NA	0.0130452502836919	0.316837715446458	658	342	0	0	0.658	0.001
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.58333333333337	0	29.999999999999986	0.0128345378007017	0	-Inf	0.0128345378007017	0.0139253505347155	0	NA	NA	0.0133171694094465	0.335166919985171	618	382	0	0	0.618	0.001
ORF3a	all	ss13	57	CAG	TTC	AGA	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.58333333333337	0	29.66666666666665	0.0128345378007017	0	-Inf	0.0128345378007017	0.0126587663964399	0	NA	NA	0.0129778772079096	0.322685112067704	640	360	0	0	0.64	0.001
ORF3a	all	ss13	58	AGC	AGA	GCG	2	CAGAGCGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.9166666666667	0	29.66666666666665	0.0129453051997499	0	-Inf	0.0129453051997499	0.0132225730136199	0	NA	NA	0.0125960984953709	0.304079956314613	643	357	0	0	0.643	0.001
ORF3a	all	ss13	59	GCT	GCG	CTA	2	AGCGCTACC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.58333333333337	0	30.333333333333318	0.0131726767040263	0	-Inf	0.0131726767040263	0.0137503622706073	0	NA	NA	0.013404071361657501	0.325736901862361	639	361	0	0	0.639	0.001
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.9166666666667	0	29.99999999999999	0.0131150882907867	0	-Inf	0.0131150882907867	0.0129348360638937	0	NA	NA	0.0137710693724913	0.340911763162171	631	369	0	0	0.631	0.001
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CCA	AAA	2	ACCAAAATA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.9166666666667	0	28.99999999999999	0.0129453051997499	0	-Inf	0.0129453051997499	0.0126821064226168	0	NA	NA	0.013058108530524	0.321509124748087	656	344	0	0	0.656	0.001
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATT	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.25000000000003	0	28.666666666666657	0.0132307731029258	0	-Inf	0.0132307731029258	0.0135105336328708	0	NA	NA	0.0133190392310426	0.320528245704104	641	359	0	0	0.641	0.001
ORF3a	all	ss13	63	ATT	TAA	TTG	2	ATAATTGCG:ATAATTTCG	1:1	FALSE	1.25	0.583333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.9166666666667	0	28.33333333333332	0.0131150882907867	0	-Inf	0.0131150882907867	0.0128212805634531	0	NA	NA	0.0135903043725875	0.334528427310901	634	366	0	0	0.634	0.001
ORF3a	all	ss13	64	GCG	TTG	CGC	2	ATTGCGCTC:ATTTCGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.6666666666667	0	29.166666666666657	0.0131582322381821	0	-Inf	0.0131582322381821	0.0140031589567288	0	NA	NA	0.0133986210797972	0.326070936333205	633	367	0	0	0.633	0.001
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CGC	TCA	2	GCGCTCAAT:TCGCTCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000003	0	29.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	66	AAT	TCA	ATA	2	CTCAATAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.6666666666667	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	67	AAA	ATA	AAA	2	AATAAAAGA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.6666666666667	0	27.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	68	AGA	AAA	GAT	2	AAAAGATGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.6666666666667	0	27.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	69	TGG	GAT	GGC	2	AGATGGCAG	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000003	0	27.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	70	CAG	GGC	AGC	2	TGGCAGCTA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000003	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	71	CTA	AGC	TAG	2	CAGCTAGCC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333336	0	28.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	72	GCC	TAG	CCC	2	CTAGCCCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333336	0	28.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	73	CTT	CCC	TTT	2	GCCCTTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000003	0	29.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	74	TAT	TTT	ATA	2	CTTTATAAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333336	0	28.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	75	AAG	ATA	AGG	2	TATAAGGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.66666666666669	0	29.166666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	76	GGC	AGG	GCT	2	AAGGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666669	0	28.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	77	TTC	GCT	TCC	2	GGCTTCCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666669	0	28.666666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	78	CAG	TCC	AGT	2	TTCCAGTTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.66666666666669	0	27.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	79	TTC	AGT	TCA	2	CAGTTCATT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000001	0	27.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TCA	TTT	2	TTCATTTGC	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.33333333333336	0	28.666666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	81	TGC	TTT	GCA	2	ATTTGCAAT	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.16666666666669	0	27.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	82	AAT	GCA	ATT	2	TGCAATTTA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000001	0	28.666666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	83	TTA	ATT	TAC	2	AATTTACTG	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000001	0	28.666666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TGC	2	TTACTGCTG	2	FALSE	1	1	0	1	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.16666666666669	0	28.666666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	85	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333336	0	29.666666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	86	CTA	TGC	TAT	2	CTGCTATTT	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.00000000000003	0	29.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	87	TTT	TAT	TTG	2	CTATTTGTT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.6666666666667	0	31.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	88	GTT	TTG	TTA	2	TTTGTTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.83333333333336	0	30.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	89	ACC	TTA	CCA	2	GTTACCATC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.50000000000003	0	30.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CCA	TCT	2	ACCATCTAT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.16666666666669	0	30.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	91	TAT	TCT	ATT	2	ATCTATTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.83333333333336	0	30.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	92	TCA	ATT	CAC	2	TATTCACAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.50000000000003	0	29.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	93	CAT	CAC	ATC	2	TCACATCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.83333333333337	0	29.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	94	CTT	ATC	TTT	2	CATCTTTTG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.50000000000004	0	28.833333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	95	TTG	TTT	TGC	2	CTTTTGCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.83333333333339	0	29.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	96	CTT	TGC	TTG	2	TTGCTTGTC	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.50000000000006	0	30.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	97	GTC	TTG	TCG	2	CTTGTCGCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.50000000000006	0	30.666666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	98	GCT	TCG	CTG	2	GTCGCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.50000000000006	0	30.666666666666657	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.00000000000006	0	29.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	100	GGT	CAG	GTA	2	GCAGGTATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.00000000000006	0	29.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GTA	TGG	2	GGTATGGAG	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.00000000000006	0	30.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	102	GAG	TGG	AGG	2	ATGGAGGCG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.00000000000006	0	30.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	103	GCG	AGG	CGC	2	GAGGCGCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.00000000000006	0	30.333333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CGC	AAT	2	GCGCAATTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.33333333333339	0	30.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	105	TTT	AAT	TTT	2	CAATTTTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.66666666666671	0	30.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	106	TTG	TTT	TGT	2	TTTTTGTAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.00000000000006	0	30.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TGT	ACC	2	TTGTACCTC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.66666666666673	0	31.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	108	CTC	ACC	TCT	2	TACCTCTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.66666666666673	0	31.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	109	TAT	TCT	ATG	2	CTCTATGCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.00000000000006	0	31.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ATG	CCT	2	TATGCCTTG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.00000000000006	0	31.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	111	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGATA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.33333333333339	0	32.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TGA	TAT	2	TTGATATAT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.33333333333339	0	32.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	113	TAT	TAT	ATT	2	ATATATTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.66666666666673	0	33.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	114	TTT	ATT	TTC	2	TATTTTCTA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.66666666666673	0	33.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TTC	TAC	2	TTTCTACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.66666666666673	0	33.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAT	2	CTACAATGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.33333333333339	0	34.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	117	TGC	AAT	GCA	2	CAATGCATC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.00000000000004	0	34.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	118	ATC	GCA	TCA	2	TGCATCAAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.6666666666667	0	35.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TCA	ACG	2	ATCAACGCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.33333333333337	0	34.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.33333333333337	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	121	TGT	CAT	GTA	2	GCATGTAGA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.6666666666667	0	34.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GTA	GAA	2	TGTAGAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.83333333333336	0	35.16666666666666	0.0126318775458731	0	-Inf	0.0126318775458731	0.0130350287136238	0	NA	NA	0.0121102620956769	0.296914861890565	610	390	0	0	0.61	0.001
ORF3a	all	ss13	123	ATT	GAA	TTA	2	AGAATTATC:AGAATTATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.83333333333336	0	34.99999999999999	0.0126318775458731	0	-Inf	0.0126318775458731	0.0122964879285818	0	NA	NA	0.0127645995454484	0.322368527097239	646	354	0	0	0.646	0.001
ORF3a	all	ss13	124	ATC	TTA	TCA	2	ATTATCATG:ATTATTATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.1666666666667	0	35.33333333333332	0.0125789112103712	0	-Inf	0.0125789112103712	0.012711338701192	0	NA	NA	0.0125975301102385	0.318026292301506	626	374	0	0	0.626	0.001
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TCA	TGA	2	ATCATGAGA:ATTATGAGA	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.6666666666667	0	35.83333333333332	0.0126585283405138	0	-Inf	0.0126585283405138	0.0126178672349555	0	NA	NA	0.0136633371458063	0.354207241144506	638	362	0	0	0.638	0.001
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.6666666666667	0	36.16666666666666	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0129704663051343	0	NA	NA	0.0127157634502297	0.325580582053811	613	387	0	0	0.613	0.001
ORF3a	all	ss13	127	TGT	GAT	GTT	2	AGATGTTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.6666666666667	0	36.49999999999999	0.0126585283405138	0	-Inf	0.0126585283405138	0.0128194752237696	0	NA	NA	0.0126039127918278	0.315218025688219	669	331	0	0	0.669	0.001
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GTT	GGC	2	TGTTGGCTT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.1666666666667	0	36.49999999999999	0.0127391597743079	0	-Inf	0.0127391597743079	0.0125341479192218	0	NA	NA	0.0127126727820968	0.316303260981055	634	366	0	0	0.634	0.001
ORF3a	all	ss13	129	CTT	GGC	TTT	2	TGGCTTTGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333337	0	35.83333333333332	0.0127934871784325	0	-Inf	0.0127934871784325	0.0133054535326019	0	NA	NA	0.0129770322945778	0.324203704283171	631	369	0	0	0.631	0.001
ORF3a	all	ss13	130	TGT	TTT	GTT	2	CTTTGTTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.00000000000003	0	35.33333333333332	0.0126053387372859	0	-Inf	0.0126053387372859	0.0123313055220521	0	NA	NA	0.012479791283823	0.312466515870023	636	364	0	0	0.636	0.001
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GTT	GGA	2	TGTTGGAAG	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.50000000000003	0	35.33333333333332	0.0126852918315464	0	-Inf	0.0126852918315464	0.0129015873324996	0	NA	NA	0.0121963623243432	0.298298952199927	603	397	0	0	0.603	0.001
ORF3a	all	ss13	132	AAG	GGA	AGT	2	TGGAAGTGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.1666666666667	0	35.33333333333332	0.0127391597743079	0	-Inf	0.0127391597743079	0.0127540429165221	0	NA	NA	0.0125876102494819	0.31151912984227	670	330	0	0	0.67	0.001
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AGT	GCA	2	AAGTGCAAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.6666666666667	0	34.83333333333332	0.0126585283405138	0	-Inf	0.0126585283405138	0.0128850968722078	0	NA	NA	0.0128755701945205	0.325537001224452	653	347	0	0	0.653	0.001
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.83333333333337	0	34.83333333333332	0.0126318775458731	0	-Inf	0.0126318775458731	0.0127214799325653	0	NA	NA	0.013261703095135	0.340839439173241	648	352	0	0	0.648	0.001
ORF3a	all	ss13	135	TCC	AAT	CCA	2	AAATCCAAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.1666666666667	0	34.83333333333332	0.0127391597743079	0	-Inf	0.0127391597743079	0.0134830266220984	0	NA	NA	0.0134629134930515	0.344025714606779	630	370	0	0	0.63	0.001
ORF3a	all	ss13	136	AAG	CCA	AGA	2	TCCAAGAAC	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.1666666666667	0	35.49999999999999	0.0127391597743079	0	-Inf	0.0127391597743079	0.0129806608925094	0	NA	NA	0.0133763551884852	0.340912386006805	632	368	0	0	0.632	0.001
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AGA	ACC	2	AAGAACCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.83333333333336	0	34.66666666666666	0.0126318775458731	0	-Inf	0.0126318775458731	0.0126716135949109	0	NA	NA	0.0130740743374208	0.33395532796691	630	370	0	0	0.63	0.001
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.1666666666667	0	34.66666666666666	0.0127391597743079	0	-Inf	0.0127391597743079	0.0125041060246175	0	NA	NA	0.0133538815068428	0.340100441771917	643	357	0	0	0.643	0.001
ORF3a	all	ss13	139	TTA	CAT	TAC	2	CCATTACTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.1666666666667	0	34.66666666666666	0.0127391597743079	0	-Inf	0.0127391597743079	0.0127389666026466	0	NA	NA	0.0129556104942993	0.325463305017553	640	360	0	0	0.64	0.001
ORF3a	all	ss13	140	CTT	TAC	TTT	2	TTACTTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333337	0	35.66666666666666	0.0129592857062641	0	-Inf	0.0129592857062641	0.0131298672451604	0	NA	NA	0.0132932170005533	0.329620000031935	638	362	0	0	0.638	0.001
ORF3a	all	ss13	141	TAT	TTT	ATG	2	CTTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333337	0	35.66666666666666	0.0129592857062641	0	-Inf	0.0129592857062641	0.0138608926975682	0	NA	NA	0.0130921385000027	0.322246231324505	626	374	0	0	0.626	0.001
ORF3a	all	ss13	142	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGCC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.4166666666667	0	36.74999999999999	0.0130296436641525	0	-Inf	0.0130296436641525	0.0131090658665916	0	NA	NA	0.0134388180594442	0.332269450208396	624	376	0	0	0.624	0.001
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ATG	CCA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.08333333333336	1	37.08333333333333	0.0130864825012098	0.0274630224286674	0.476512828666281	-0.0143765399274576	0.013093527279918	0.0293880431481752	NA	NA	0.0315758687185246	0.648892357832254	282	126	592	0.592	0.282	0.564
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CCA	ACT	2	GCCAACTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.25000000000003	2	37.58333333333333	0.0130580012294226	0.0551973146854054	0.236569501684023	-0.0421393134559829	0.0128973208073314	0.0421162986082412	NA	NA	0.042581778945521	0.322365248876958	135	49	816	0.816	0.135	0.27
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.25000000000003	2	37.58333333333333	0.0130580012294226	0.0551973146854054	0.236569501684023	-0.0421393134559829	0.0128263028385786	0.0415678545696133	NA	NA	0.0457318373418122	0.356818821679275	141	51	808	0.808	0.141	0.282
ORF3a	all	ss13	146	TTT	ACT	TTG	2	TACTTTGTT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.25000000000003	2	37.58333333333333	0.0132307731029258	0.0551973146854054	0.239699579197539	-0.0419665415824796	0.0133533756708456	0.0433341918304003	NA	NA	0.0468584069499107	0.37046469898983603	164	29	807	0.807	0.164	0.328
ORF3a	all	ss13	147	GTT	TTG	TTT	2	TTTGTTTGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.75000000000003	2	36.58333333333333	0.0131438194165355	0.0567646707244323	0.231549293756024	-0.0436208513078968	0.0134498070573982	0.0419515908630946	NA	NA	0.0469200810633087	0.352534691624122	122	49	829	0.829	0.122	0.244
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TTT	GCT	2	GTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000003	2	37.58333333333333	0.0133188849757348	0.0551973146854054	0.241295886432976	-0.0418784297096706	0.0137665998029531	0.0432311602247083	NA	NA	0.0435843000848318	0.336622344620023	126	33	841	0.841	0.126	0.252
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000003	2	37.74999999999999	0.0133188849757348	0.0549444688504895	0.242406292287165	-0.0416255838747547	0.013150328527705	0.0410478135298275	NA	NA	0.0447827948059248	0.352630301645862	151	40	809	0.809	0.151	0.302
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.08333333333336	2	37.08333333333333	0.0132600139021293	0.0559700169039056	0.236912808600634	-0.0427100030017764	0.0135628013295995	0.0444370731499154	NA	NA	0.0421870824386978	0.311349095790981	126	45	829	0.829	0.126	0.252
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666669	2	37.08333333333333	0.0133782811395161	0.0559700169039056	0.239025854905229	-0.0425917357643895	0.0132148591452569	0.0416492333447008	NA	NA	0.0444701642509812	0.338183892876504	119	51	830	0.83	0.119	0.238
ORF3a	all	ss13	152	CAT	CAC	ATA	2	ACACATAAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.41666666666669	2	36.08333333333333	0.0132016609860952	0.0575822255219405	0.229266251285563	-0.0443805645358454	0.0143388299674309	0.0426051461525594	NA	NA	0.0470538573422759	0.345585500844927	125	50	825	0.825	0.125	0.25
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ATA	ACT	2	CATAACTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75000000000001	2	37.08333333333332	0.0134986770919624	0.0559700169039056	0.241176934342153	-0.0424713398119432	0.012925897220534	0.0447582261990613	NA	NA	0.0472092038815577	0.368311280894338	164	39	797	0.797	0.164	0.328
ORF3a	all	ss13	154	TAT	ACT	ATG	2	AACTATGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.41666666666669	2	36.74999999999999	0.013559691378237	0.0564972895530332	0.240006051361255	-0.0429375981747962	0.0147403524424523	0.0429253258652255	NA	NA	0.0459103478167631	0.349660089308278	137	53	810	0.81	0.137	0.274
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ATG	ACT	2	TATGACTAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.08333333333336	2	36.74999999999999	0.0134382094503063	0.0564972895530332	0.23785582559128	-0.0430590801027269	0.0136154885392759	0.043693957868014	NA	NA	0.0459676312694938	0.348899465556016	118	50	832	0.832	0.118	0.236
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.41666666666669	2	36.74999999999999	0.013559691378237	0.0564972895530332	0.240006051361255	-0.0429375981747962	0.013961606105	0.0442187129180578	NA	NA	0.0465405500793896	0.35622368606728	133	45	822	0.822	0.133	0.266
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.41666666666669	2	36.74999999999999	0.013559691378237	0.0564972895530332	0.240006051361255	-0.0429375981747962	0.0136199823435598	0.040962483028935	NA	NA	0.0454402220818712	0.34469720851282	147	52	801	0.801	0.147	0.294
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA:TGTATACCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.25000000000001	2	36.41666666666666	0.0135904058348962	0.0570345959917882	0.238283547004574	-0.0434441901568921	0.0138576861938229	0.0441091191482193	NA	NA	0.0448599937223156	0.332824917348452	125	51	824	0.824	0.125	0.25
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAT:ATACCGTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.91666666666669	2	36.41666666666666	0.0136522540928075	0.0570345959917882	0.23936794598796	-0.0433823418989808	0.013755131560704	0.0442552921531298	NA	NA	0.048490589333598	0.370971610509578	158	34	808	0.808	0.158	0.316
ORF3a	all	ss13	160	TAT	CAT	ATA	2	CCATATAAC:CCGTATAAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333336	2	36.41666666666666	0.0135291154422588	0.0570345959917882	0.237208929194601	-0.0435054805495295	0.0143293904368138	0.0440585082166705	NA	NA	0.045338491154033	0.337271400624024	126	47	827	0.827	0.126	0.252
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ATA	ACA	2	TATAACAGT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.9166666666667	2	36.08333333333332	0.0134683754007452	0.0575822255219405	0.233898139202927	-0.0441138501211953	0.0142137158083069	0.0456518594200783	NA	NA	0.0464726442625006	0.342496840878814	128	39	833	0.833	0.128	0.256
ORF3a	all	ss13	162	AGT	ACA	GTG	2	AACAGTGTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333337	2	35.74999999999999	0.0135291154422588	0.0581404786806199	0.232697008164958	-0.0446113632383612	0.0133282764571171	0.0447345211557086	NA	NA	0.0468805480812702	0.341301681429471	124	38	838	0.838	0.124	0.248
ORF3a	all	ss13	163	GTC	GTG	TCA	2	AGTGTCACA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.9166666666667	2	35.74999999999999	0.0136522540928075	0.0581404786806199	0.234814958573057	-0.0444882245878125	0.0141558291635195	0.0438178444378875	NA	NA	0.0498985535286628	0.372621616189847	147	53	800	0.8	0.147	0.294
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TCA	CAG	2	GTCACAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333337	2	35.74999999999999	0.0135291154422588	0.0581404786806199	0.232697008164958	-0.0446113632383612	0.0133166084225967	0.046632246283175	NA	NA	0.0445972024962622	0.317156868583508	124	44	832	0.832	0.124	0.248
ORF3a	all	ss13	165	GAT	CAG	ATA	2	ACAGATACA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.9166666666667	2	35.41666666666666	0.0134683754007452	0.0587096677913667	0.229406431809613	-0.0452412923906215	0.0139280332099347	0.0448154727462085	NA	NA	0.0456560961144492	0.321727280741855	125	38	837	0.837	0.125	0.25
ORF3a	all	ss13	166	ACA	ATA	CAA	2	GATACAATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75000000000004	2	35.58333333333332	0.0134986770919624	0.0584236862456271	0.231048021092178	-0.0449250091536647	0.0129794551990962	0.0437503167754	NA	NA	0.0491383576629901	0.360582656625416	136	42	822	0.822	0.136	0.272
ORF3a	all	ss13	167	ATT	CAA	TTG	2	ACAATTGTC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75000000000004	2	35.58333333333332	0.0134986770919624	0.0584236862456271	0.231048021092178	-0.0449250091536647	0.0134997406137082	0.0434155309772491	NA	NA	0.0482776628922356	0.352083923861581	131	48	821	0.821	0.131	0.262
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TTG	TCG	2	ATTGTCGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.91666666666671	2	35.91666666666666	0.0136522540928075	0.0578600049104132	0.235953213518488	-0.0442077508176058	0.0141555782497159	0.0442182465683286	NA	NA	0.048224571303699	0.359296754247403	122	39	839	0.839	0.122	0.244
ORF3a	all	ss13	169	GTT	TCG	TTA	2	GTCGTTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.91666666666671	2	35.58333333333332	0.0134683754007452	0.0584236862456271	0.230529366875636	-0.0449553108448819	0.0132156912744835	0.0437819468659912	NA	NA	0.0489927239631659	0.358832729238325	130	52	818	0.818	0.13	0.26
ORF3a	all	ss13	170	ACT	TTA	CTG	2	GTTACTGAA:GTTACTGCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.58333333333337	2	34.91666666666666	0.0133485169832455	0.059584670169267	0.224026027925057	-0.0462361531860215	0.0134965189634366	0.046476810583541	NA	NA	0.0458712947001272	0.313476564720805	122	39	839	0.839	0.122	0.244
ORF3a	all	ss13	171	GAA	CTG	AAG	2	ACTGAAGGT:ACTGCAGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.58333333333337	2	34.91666666666666	0.0133485169832455	0.059584670169267	0.224026027925057	-0.0462361531860215	0.0135199958814796	0.0456794501764203	NA	NA	0.0480651422329294	0.336075874328923	123	50	827	0.827	0.123	0.246
ORF3a	all	ss13	172	GGT	AAG	GTG	2	GAAGGTGAC:GCAGGTGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.25000000000004	2	34.91666666666666	0	0.059584670169267	0	-0.059584670169267	0	0.0476959504122101	NA	NA	0.0443948509503242	0.179546481350888	0	127	873	0.873	0	0.001
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.9166666666667	2	34.91666666666666	0	0.059584670169267	0	-0.059584670169267	0	0.0445623961579173	NA	NA	0.0442851401624594	0.178471006070695	0	129	871	0.871	0	0.001
ORF3a	all	ss13	174	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.9166666666667	2	35.24999999999999	0	0.0589984642956841	0	-0.0589984642956841	0	0.0445878661630717	NA	NA	0.0469106198207761	0.208508156287676	0	117	883	0.883	0	0.001
ORF3a	all	ss13	175	ATT	GCA	TTT	2	GGCATTTCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.9166666666667	2	35.24999999999999	0	0.0589984642956841	0	-0.0589984642956841	0	0.0462900539683832	NA	NA	0.0449521167514413	0.189360404455708	0	137	863	0.863	0	0.001
ORF3a	all	ss13	176	TCA	TTT	CAA	2	ATTTCAACA	2	FALSE	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.75000000000004	2	35.58333333333332	0	0.0584236862456271	0	-0.0584236862456271	0	0.0444436915125986	NA	NA	0.0427780627214776	0.172020769148093	0	128	872	0.872	0	0.001
ORF3a	all	ss13	177	ACA	CAA	CAC	2	TCAACACCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.25000000000004	2	35.749999999999986	0	0.0581404786806199	0	-0.0581404786806199	0	0.0435224991629271	NA	NA	0.0454814408373074	0.20113163416775	0	126	874	0.874	0	0.001
ORF3a	all	ss13	178	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.9166666666667	2	35.749999999999986	0	0.0581404786806199	0	-0.0581404786806199	0	0.0445014786509533	NA	NA	0.0446918772323646	0.193286438853959	0	137	863	0.863	0	0.001
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.9166666666667	2	35.749999999999986	0	0.0581404786806199	0	-0.0581404786806199	0	0.0454120679248635	NA	NA	0.0422053925682738	0.16833904553112	0	142	858	0.858	0	0.001
ORF3a	all	ss13	180	CTC	AAC	TCA	2	AAACTCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.75000000000003	2	36.249999999999986	0	0.0573071018565008	0	-0.0573071018565008	0	0.0441566513636732	NA	NA	0.0436378581209109	0.189101154791635	0	138	862	0.862	0	0.001
ORF3a	all	ss13	181	AAA	TCA	AAG	2	CTCAAAGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.41666666666669	2	36.249999999999986	0	0.0573071018565008	0	-0.0573071018565008	0	0.0437178973208348	NA	NA	0.0463050774014078	0.215864910651245	0	152	848	0.848	0	0.001
ORF3a	all	ss13	182	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.75000000000003	2	36.249999999999986	0	0.0573071018565008	0	-0.0573071018565008	0	0.041740997209678	NA	NA	0.0441093848727935	0.19387383120114	0	126	874	0.874	0	0.001
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	GAAGACTAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.91666666666669	2	36.749999999999986	0	0.0564972895530332	0	-0.0564972895530332	0	0.0439560333671688	NA	NA	0.044222521125843	0.201401696433524	0	136	864	0.864	0	0.001
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.25000000000001	2	37.749999999999986	0	0.0549444688504895	0	-0.0549444688504895	0	0.0440152991426168	NA	NA	0.0416820190707926	0.187442877462604	0	124	876	0.876	0	0.001
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.58333333333334	2	37.083333333333314	0	0.0559700169039056	0	-0.0559700169039056	0	0.0423889314533523	NA	NA	0.0453048260757506	0.216678103041394	0	131	869	0.869	0	0.001
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.58333333333334	2	37.083333333333314	0	0.0559700169039056	0	-0.0559700169039056	0	0.0418743014507481	NA	NA	0.0424986611306833	0.187844301906051	0	135	865	0.865	0	0.001
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.08333333333334	2	37.083333333333314	0	0.0559700169039056	0	-0.0559700169039056	0	0.0432246752557076	NA	NA	0.0418824201313621	0.181431431565234	0	131	869	0.869	0	0.001
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.75000000000001	2	37.41666666666665	0	0.0554524994575897	0	-0.0554524994575897	0	0.0428405535021733	NA	NA	0.0443333179542684	0.211004282793908	0	127	873	0.873	0	0.001
ORF3a	all	ss13	189	TAT	GTT	ATT	2	GGTTATTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.91666666666667	2	36.91666666666665	0	0.0562324166616758	0	-0.0562324166616758	0	0.043491504881983	NA	NA	0.043865260646867	0.199865418823667	0	113	887	0.887	0	0.001
ORF3a	all	ss13	190	TCT	ATT	CTG	2	TATTCTGAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.25000000000001	2	36.249999999999986	0	0.0573071018565008	0	-0.0573071018565008	0	0.0441907848031071	NA	NA	0.0433089724469141	0.185763736483042	0	135	865	0.865	0	0.001
ORF3a	all	ss13	191	GAG	CTG	AGA	2	TCTGAGAAT:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	1.25	0.333333333333333	1.41666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.25000000000001	2	37.249999999999986	0	0.0557100557871529	0	-0.0557100557871529	0	0.0447267923396191	NA	NA	0.0425859907471144	0.190812945530115	0	141	859	0.859	0	0.001
ORF3a	all	ss13	192	AAT	AGA	ATA	2	GAGAATTGG:GAGGATAGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.00000000000001	2	35.833333333333314	0	0.0579999025523778	0	-0.0579999025523778	0	0.0439800109290487	NA	NA	0.0442786076548107	0.19023460042012	0	112	888	0.888	0	0.001
ORF3a	all	ss13	193	AGG	ATA	GGC	2	AATTGGCAC:GATAGGCAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.166666666666667	0.5	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666667	1	36.99999999999998	0	0.027526025137821	0	-0.027526025137821	0	0.0291301976158892	NA	NA	0.0283999403810319	0.332431308063975	0	394	606	0.606	0	0.001
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	ACT	2	AGGCACTCA:TGGCACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.66666666666667	0	37.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	195	TCA	ACT	CAG	2	CACTCAGGT	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.00000000000001	0	36.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	196	GGT	CAG	GTG	2	TCAGGTGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666667	0	35.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	197	GTT	GTG	TTA	2	GGTGTTAAA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000001	0	35.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000001	0	35.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333334	0	35.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATG	2	GACTATGTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666669	0	35.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	201	GTC	ATG	TCG	2	TATGTCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333336	0	35.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	202	GTT	TCG	TTG	2	GTCGTTGTA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333336	0	36.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	203	GTA	TTG	TAC	2	GTTGTACAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666669	0	36.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	204	CAT	TAC	ATG	2	GTACATGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000001	0	36.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	205	GGC	ATG	GCT	2	CATGGCTAT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333334	0	36.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	206	TAT	GCT	ATT	2	GGCTATTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666667	0	37.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ATT	TCA	2	TATTTCACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.5	1	36.83333333333332	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0279102348954172	NA	NA	0.0282816941741571	0.328189670507446	0	340	660	0.66	0	0.001
ORF3a	all	ss13	208	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333334	1	37.16666666666666	0	0.027400307499342	0	-0.027400307499342	0	0.0276485931030736	NA	NA	0.0291919781631155	0.34792354130194	0	362	638	0.638	0	0.001
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CCG	AAG	2	ACCGAAGTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666667	1	36.83333333333332	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0287595663775202	NA	NA	0.0291271010915461	0.342423632380937	0	350	650	0.65	0	0.001
ORF3a	all	ss13	210	GTT	AAG	TTT	2	GAAGTTTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666667	1	36.16666666666666	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.028442005521533	NA	NA	0.0285550264383785	0.323839850574171	0	369	631	0.631	0	0.001
ORF3a	all	ss13	211	TAC	TTT	ACT	2	GTTTACTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666667	1	36.16666666666666	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.0297533728903765	NA	NA	0.0292365132634159	0.335246129409413	0	362	638	0.638	0	0.001
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666667	1	35.83333333333332	0	0.0284394261467203	0	-0.0284394261467203	0	0.028808255569852	NA	NA	0.029855980931992	0.340816227798731	0	387	613	0.613	0	0.001
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.5	1	35.499999999999986	0	0.0287116399282627	0	-0.0287116399282627	0	0.0307283931628273	NA	NA	0.030005732688727	0.338631958307118	0	394	606	0.606	0	0.001
ORF3a	all	ss13	214	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333333	1	34.83333333333332	0	0.0292720079293014	0	-0.0292720079293014	0	0.0293286794552856	NA	NA	0.0318960936612422	0.358760140790947	0	372	628	0.628	0	0.001
ORF3a	all	ss13	215	GAG	TTG	AGT	2	CTTGAGTCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666667	1	34.499999999999986	0	0.0295604764056576	0	-0.0295604764056576	0	0.0297284578044092	NA	NA	0.0328219829746256	0.367784853423302	0	372	628	0.628	0	0.001
ORF3a	all	ss13	216	TCT	AGT	CTA	2	GAGTCTACA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.66666666666667	1	33.999999999999986	0	0.0300040009602743	0	-0.0300040009602743	0	0.0318339360024504	NA	NA	0.0311688363799548	0.33573413881831	0	364	636	0.636	0	0.001
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CTA	CAC	2	TCTACACAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.00000000000001	1	33.33333333333332	0	0.0306164958901914	0	-0.0306164958901914	0	0.0314237892199318	NA	NA	0.0324907424250799	0.346031675193467	0	357	643	0.643	0	0.001
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.16666666666669	1	33.16666666666666	0	0.0307735475083969	0	-0.0307735475083969	0	0.0307099755293384	NA	NA	0.032647439152021	0.34588442134634	0	352	648	0.648	0	0.001
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TTA	2	CAAATTACT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000001	1	34.66666666666666	0	0.029415534864961	0	-0.029415534864961	0	0.0289503181015385	NA	NA	0.0317262968970942	0.353840498848845	0	358	642	0.642	0	0.001
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TTA	CTA	2	ATTACTACA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666669	1	35.499999999999986	0	0.0287116399282627	0	-0.0287116399282627	0	0.0306263428496305	NA	NA	0.0294059847580026	0.328872406412088	0	374	626	0.626	0	0.001
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CTA	CAG	2	ACTACAGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000003	1	36.16666666666665	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.0290216184083657	NA	NA	0.030421936984433	0.35441843460682	0	359	641	0.641	0	0.001
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666669	1	36.49999999999998	0	0.0279101972553257	0	-0.0279101972553257	0	0.0289172580541726	NA	NA	0.0301257048426916	0.354208066024527	0	356	644	0.644	0	0.001
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000003	1	37.16666666666665	0	0.027400307499342	0	-0.027400307499342	0	0.0282657836367635	NA	NA	0.0281775896665906	0.33084419181154	0	372	628	0.628	0	0.001
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333336	1	36.833333333333314	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0287338508543797	NA	NA	0.0288252321111964	0.337392667698699	0	345	655	0.655	0	0.001
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	TTG	2	GGTATTGAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333336	1	36.333333333333314	0	0.0280406490537152	0	-0.0280406490537152	0	0.0282687320471603	NA	NA	0.0288090658413201	0.330390679362923	0	366	634	0.634	0	0.001
ORF3a	all	ss13	226	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333336	1	35.66666666666666	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.030354983139786	NA	NA	0.0301947182474446	0.343968189603045	0	340	660	0.66	0	0.001
ORF3a	all	ss13	227	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	GCT	ATG	CTA	2	AATGCTACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CTA	CAT	2	GCTACATTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TTT	TCT	TTA	2	ATCTTTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	TTA	ACA	2	TTTAACAAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	CTT	AGC	TTG	2	AAGCTTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	CCA	ACC	CA-	0	GACCCA---	2	FALSE	0	0	2	1	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	NA	NA	0	CCA---CCG	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	CGA	0	---CCGAAT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	CGA	ATG	2	CCGAATGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTG	ATG	TGC	2	AATGTGCAA	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TGC	AAA	2	GTGCAAATA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCT	GCT	CTT	2	GGCTCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CTT	CAG	2	TCTTCAGGA	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT:GTTGTAAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAT	CTA	ATC	2	GCTAATCCA:GTAAATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	CCA	ATC	CAG	2	AATCCAGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	GCA	CAG	CAA	2	CCAGCAATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	ATG	CAA	TGG	2	GCAATGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	GAT	TGG	ATC	2	ATGGATCCA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATT	CAA	TTT	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGAG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAG	ATG	AGC	2	GATGAGCCG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCG	AGC	CGA	2	GAGCCGACG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CGA	CGA	2	CCGACGACG	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	TTG	CTT	TGT	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.33333333333337	2	32.16666666666665	0.100629159672279	0.0649053422482924	1.55039872199313	0.0357238174239865	0.0447438660313086	0.0472368955965066	NaN	NaN	0.0679750556794206	0.599205741346889	709	1	290	0.29	0.709	0.58
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.6666666666667	3	32.499999999999986	0.10160438445965	0.0985020015458152	1.03149563323738	0.0031023829138352	0.0464641497191946	0.0636501014417273	NaN	NaN	0.0830863119334739	0.970214487861126	516	0	484	0.484	0.516	0.968
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.00000000000003	3	32.833333333333314	0.102598726327403	0.0974341006801572	1.05300634594247	0.005164625647246	0.0445611268254872	0.0612591926340545	NaN	NaN	0.0823074666494368	0.949967205838729	520	0	480	0.48	0.52	0.96
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA:TTTATGAGC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.16666666666669	3	32.66666666666665	0.102348317920894	0.0979651368127982	1.04474225475203	0.00438318110809584	0.04542554133704	0.0627598985437423	NA	NA	0.0790060641492597	0.955756822693014	546	0	454	0.454	0.546	0.908
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATTT:ATGAGCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.50000000000001	3	33.33333333333332	0.101851155869296	0.0958750286324138	1.0623324688621	0.00597612723688257	0.0452530114453705	0.0628189364538617	NaN	NaN	0.0811778067780133	0.941314549437196	528	0	472	0.472	0.528	0.944
ORF3a	all	ss13	7	ATT	GAT	TTT	2	AGATTTTTT:AGCATTTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.16666666666667	3	33.66666666666665	0.0856035011092873	0.0948631103318398	0.90238977838528	-0.00925960922255248	0.0428505094793315	0.061676096087870703	NA	NA	0.0741254552802525	0.900588408244839	461	1	538	0.538	0.461	0.922
ORF3a	all	ss13	8	TTC	TTT	TCA	2	ATTTTCACA:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.75000000000001	3	33.249999999999986	0.0700625753990949	0.0961313950679982	0.728820957498187	-0.0260688196689033	0.0372720462950621	0.0624053051045593	NA	NA	0.077402082062595	0.736269636349702	358	1	641	0.641	0.358	0.716
ORF3a	all	ss13	9	ACA	TCA	CAT	2	TTCACATTG:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.58333333333334	3	33.083333333333314	0.0692533163185839	0.0966482688635724	0.716549992388804	-0.0273949525449885	0.0392740800659244	0.0631840343383313	NA	NA	0.0710539046956843	0.699828722779176	349	0	651	0.651	0.349	0.698
ORF3a	all	ss13	10	CTT	CAT	TGG	2	ACATTGGGA:ACTCTTAGA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.5	0.666666666666667	0.166666666666667	1	0	0	1	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.08333333333336	3	33.58333333333332	0.0697366111169322	0.0951140793534504	0.733189151290486	-0.0253774682365182	0.0378634976623695	0.0618739083196358	NaN	NaN	0.0744748716216393	0.73329021992346	366	0	634	0.634	0.366	0.732
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TGG	GAG	2	CTTAGATCA:TTGGGAGCA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.916666666666667	0.25	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.41666666666669	4	33.91666666666665	0.055774819305903	0.128312053707491	0.434681058359887	-0.0725372344015883	0.0367787425433713	0.0720700640371138	NA	NA	0.084620810883589	0.391332564736681	160	0	840	0.84	0.16	0.32
ORF3a	all	ss13	12	GCA	GAG	CAA	2	AGATCAATT:GGAGCAATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.25000000000003	3	34.66666666666665	0.0559047993353385	0.0919517415692493	0.607979777014189	-0.0360469422339108	0.0362872529385691	0.0586227469827514	NA	NA	0.0693434652999835	0.603180774413381	294	3	703	0.703	0.294	0.588
ORF3a	all	ss13	13	ATC	CAA	TCA	2	GCAATCACA:TCAATTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.25000000000001	4	34.66666666666665	0.0421163271222966	0.125290563497375	0.336149235398555	-0.0831742363750781	0.0329073314272112	0.067916737179547	NA	NA	0.0734745738766533	0.257628605227042	102	2	896	0.896	0.102	0.204
ORF3a	all	ss13	14	ACA	TCA	CAC	2	ATCACACGC:ATTACTGCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.91666666666669	4	34.499999999999986	0.0423143935004423	0.125949614506391	0.33596286631187	-0.083635221005949	0.0311624529202872	0.0696088004120885	NA	NA	0.0767511748961806	0.27584838355403	119	1	880	0.88	0.119	0.238
ORF3a	all	ss13	15	CGC	CAC	CAC	2	ACACGCCAA:ACTGCACAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.41666666666669	4	33.999999999999986	0.0420179878270026	0.127969137773073	0.328344697465361	-0.08595114994607	0.0314847609328099	0.0769846414189246	NA	NA	0.0794821328109494	0.279523856290755	116	2	882	0.882	0.116	0.232
ORF3a	all	ss13	16	CAA	CAC	AAC	2	CGCCAACCA:GCACAGCCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.08333333333336	4	34.33333333333332	0.0138093659583391	0.126615652181289	0.109065235778013	-0.11280628622295	0.0132459312590893	0.0737261927395634	NA	NA	0.0775719649286512	0.145886810319246	18	5	977	0.977	0.018	0.036
ORF3a	all	ss13	17	CCA	AAC	CAG	2	CAACCAGCG:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.91666666666669	5	34.499999999999986	0.0138412232800193	0.161043735636461	0.0859469834409727	-0.147202512356441	0.0141707130779008	0.0807243452159559	NA	NA	0.0839871481865623	0.0796571193551579	9	6	985	0.985	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	18	GCG	CAG	CGA	2	CCAGCGAAA:CCAGTAAAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.16666666666669	5	34.91666666666665	0.0137934922285677	0.158903109406266	0.0868044198764041	-0.145109617177698	0.0135742677909803	0.0799543949789031	NA	NA	0.0797957675640951	0.0689858065430724	6	3	991	0.991	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	19	AAA	CGA	AAA	2	GCGAAAATT:GTAAAAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.83333333333334	5	34.499999999999986	0.0136678042173386	0.161043735636461	0.08487013893041	-0.147375931419122	0.0134822042059315	0.0805799760381803	NA	NA	0.0828409771072642	0.0752361341335213	4	5	991	0.991	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	20	ATT	AAA	TTG	2	AAAATTGAA:AAAATTGAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.50000000000001	5	34.16666666666666	0.0135443861537981	0.162798378928371	0.0831973035785418	-0.149253992774573	0.0132993924087532	0.0821722566337278	NA	NA	0.0900861748632797	0.0975616720411409	7	3	990	0.99	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	21	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT:ATTGACAAT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.33333333333334	5	34.499999999999986	0.0135750312327135	0.161043735636461	0.0842940657024854	-0.147468704403747	0.0141551538379378	0.0808180072434858	NA	NA	0.0901473962044938	0.101868461959552	12	1	987	0.987	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	22	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.41666666666667	5	34.58333333333332	0	0.160610991304224	0	-0.160610991304224	0	0.0802554505901488	NA	NA	0.0816971580689919	0.0493065594484446	0	6	994	0.994	0	0.001
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTT	2	AATGCTTCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.08333333333334	5	34.249999999999986	0	0.162356129339379	0	-0.162356129339379	0	0.0828331897681544	NA	NA	0.0879260278466539	0.0648184532723736	0	2	998	0.998	0	0.001
ORF3a	all	ss13	24	TCT	CTT	CTC	2	GCTTCTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.41666666666667	6	35.08333333333332	0	0.194105738514483	0	-0.194105738514483	0	0.0961816015447882	NA	NA	0.0904172869485095	0.0318110511461029	0	2	998	0.998	0	0.001
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000001	6	34.499999999999986	0	0.197860943283853	0	-0.197860943283853	0	0.0934028633639145	NA	NA	0.0980980362699601	0.0436984876625474	0	3	997	0.997	0	0.001
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333334	6	33.83333333333332	0	0.202335646591906	0	-0.202335646591906	0	0.0947605580984959	NA	NA	0.101820447328519	0.0469023553752599	0	2	998	0.998	0	0.001
ORF3a	all	ss13	27	AGT	CAA	GTA	2	GCAAGTACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000001	6	33.16666666666666	0	0.207018740932176	0	-0.207018740932176	0	0.0957205014425389	NA	NA	0.0957438000831677	0.0306015594045308	0	3	997	0.997	0	0.001
ORF3a	all	ss13	28	ACT	GTA	CTG	2	AGTACTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666669	7	33.83333333333332	0	0.242080044197288	0	-0.242080044197288	0	0.112627142782887	0	NaN	0.107217249421188	0.0239552584612482	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	29	GTT	CTG	TTC	2	ACTGTTCAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.66666666666669	7	32.99999999999999	0	0.249329979819956	0	-0.249329979819956	0	0.111838530036807	0	NaN	0.1110351887776	0.0247357846048197	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	GTTCATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.41666666666669	7	32.49999999999999	0	0.253894219074791	0	-0.253894219074791	0	0.105463072325042	0	NaN	0.117624367551377	0.0308876435408203	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.58333333333336	8	32.83333333333333	0	0.294640950387176	0	-0.294640950387176	0	0.124060938401048	0	NaN	0.127258918630396	0.0205972176424939	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.08333333333336	8	32.83333333333333	0	0.294640950387176	0	-0.294640950387176	0	0.127642436947186	NA	NA	0.12389289487517301	0.0173978181508406	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.75000000000003	8	32.83333333333333	0	0.294640950387176	0	-0.294640950387176	0	0.125330613990258	NA	NA	0.128807247917226	0.02216920351623	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	34	ACG	CAA	CGA	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.58333333333336	8	32.99999999999999	0	0.292820423057718	0	-0.292820423057718	0	0.1228317331756	0	NaN	0.119680187466775	0.0144174432877254	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CGA	TAC	2	ACGATACCG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.66666666666669	8	32.166666666666664	0	0.30215833840741	0	-0.30215833840741	0	0.127131615250745	0	NaN	0.133514478551571	0.0236287307006492	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	36	CCG	TAC	CGC	2	ATACCGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333336	8	31.16666666666666	0	0.314193196111627	0	-0.314193196111627	0	0.139980478631587	0	NaN	0.14067166948368	0.0255145751190517	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	37	CTA	CGC	TAC	2	CCGCTACAA	2	FALSE	1	1	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.08333333333336	8	30.66666666666666	0	0.320583011120205	0	-0.320583011120205	0	0.141818398798149	0	NaN	0.141645798725656	0.0236189094104986	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	CTACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.58333333333336	8	30.999999999999993	0	0.316294221734959	0	-0.316294221734959	0	0.140995467894414	0	NaN	0.136385154245718	0.0203882592266499	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.25000000000001	8	31.66666666666666	0	0.308056623906756	0	-0.308056623906756	0	0.13840559572302	0	NaN	0.130586002453839	0.0183226509863725	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	40	TCA	CCT	CAC	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.25000000000001	8	31.66666666666666	0	0.308056623906756	0	-0.308056623906756	0	0.142328461506596	0	NaN	0.141222975595209	0.0291575984459071	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	41	CTC	CAC	TCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.91666666666669	8	31.33333333333333	0	0.312120297918684	0	-0.312120297918684	0	0.140308425663774	0	NaN	0.133758959188977	0.0196243614606851	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TCC	CTT	2	CTCCCTTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.58333333333334	8	31.66666666666666	0	0.308056623906756	0	-0.308056623906756	0	0.1352249995796	NA	NA	0.132078729049294	0.0196811717819146	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.75000000000001	8	31.499999999999996	0	0.310074958318006	0	-0.310074958318006	0	0.136057275490826	0	NaN	0.129985192133923	0.0170576053573029	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	44	GGA	TCG	GAT	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.58333333333334	8	30.83333333333333	0	0.318423959611188	0	-0.318423959611188	0	0.137542428215213	0	NaN	0.143334916461261	0.026314545802075	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	GGATGGCTT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.91666666666667	8	30.499999999999996	0	0.322771994797419	0	-0.322771994797419	0	0.141476496396047	0	NaN	0.136302862513552	0.0178821186284248	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTG	2	TGGCTTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.25	8	30.16666666666666	0	0.327242322351052	0	-0.327242322351052	0	0.138629995450813	NA	NA	0.143906332516756	0.0229662697112682	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	47	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTATT:CTTGTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.66666666666667	8	29.25	0	0.34021083900431	0	-0.34021083900431	0	0.142458860429515	0	NaN	0.151937980935501	0.0251466249449315	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	GTTATTGGC:GTTGTTGGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.91666666666667	8	28.75	0.0127798619317583	0.347735297618175	0.0367516959575126	-0.334955435686417	0.0128248641193302	0.148626275664101	NA	NA	0.15181039956966	0.0273555580240954	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78	7	29.41666666666666	0.0129313548258796	0.286253342581981	0.045174511183834	-0.273321987756102	0.0130757122107715	0.134527912217977	0.07619159266383	0.553243546347561	0.133467643870874	0.0405744986980078	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666667	7	30.25	0.0130722263514627	0.2767124213498	0.0472411982364093	-0.263640194998337	0.0129949686561635	0.118675367590886	0.078093611243903	0.545225253655682	0.133284214623524	0.0479253055200838	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAC	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333333	7	29.583333333333336	0.0129592857062641	0.284292259601151	0.0455843775853955	-0.271332973894886	0.0124899596542219	0.122775653439611	0.0705298513950915	0.518076507611009	0.132244816004852	0.0401942054728682	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	52	CTT	CAC	TTC	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.16666666666666	7	30.250000000000004	0.0129035440872231	0.2767124213498	0.046631604119106	-0.263808877262577	0.012987478831908	0.126771724185401	0.0733863360821777	0.525150454275191	0.122838717791538	0.0317452561473308	1	1	998	0.998	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TTC	TTG	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.49999999999999	6	30.250000000000004	0.0128482799476378	0.230365631898451	0.0557734234996542	-0.217517351950813	0.0127593790133727	0.107027797130621	NaN	NaN	0.111726018971527	0.0515489081259211	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333333	6	29.916666666666668	0.0127934871784325	0.233376267232886	0.0548191439092043	-0.220582780054453	0.0120733559578689	0.103256138248452	NaN	NaN	0.111494879361107	0.0478822745973189	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.66666666666667	6	29.750000000000004	0.0126585283405138	0.234911530842709	0.0538863643479027	-0.222253002502195	0.0128223406927567	0.101983505863102	NA	NA	0.109996627703033	0.0433270132113297	1	1	998	0.998	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81	6	29.083333333333336	0.0124484185567784	0.24126182510618	0.0515971333272464	-0.228813406549402	0.012796759105993	0.112972738098216	0.0835294184860541	0.536765127931438	0.113629256301239	0.0440427290485647	1	1	998	0.998	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	57	CAA	TTC	AAA	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81	6	28.750000000000004	0.0124484185567784	0.244568640424989	0.0508994879112328	-0.232120221868211	0.0127696451369035	0.110488034771299	NaN	NaN	0.122626176853636	0.0583699417388575	2	1	997	0.997	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	58	AGC	AAA	GCG	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.08333333333333	6	29.000000000000004	0.0125921111074123	0.242080044197288	0.0520163119978203	-0.229487933089876	0.0120805417798161	0.116216672744896	0.0840052263622196	0.535782449015237	0.11467657188762	0.0453734924640785	3	2	995	0.995	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	59	GCT	GCG	CTA	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.91666666666667	7	29.66666666666667	0.0127798619317583	0.283321879169121	0.0451072185785191	-0.270542017237363	0.0136234730016702	0.129635470126228	NaN	NaN	0.121601806351379	0.0260933869355881	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.08333333333334	7	29.5	0.012752698321938	0.285269390232816	0.0447040543380074	-0.272516691910878	0.0125677864242351	0.127068214217085	NaN	NaN	0.12566360013075	0.0301114878124458	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CCA	AAA	2	ACCAAAATA:TCCAAAGTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.08333333333334	6	28.5	0.0125921111074123	0.247109400847682	0.0509576368370301	-0.234517289740269	0.0120678433196297	0.128624565917829	NaN	NaN	0.115944090994107	0.0431065988657722	3	1	996	0.996	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATT:AAAGTGATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.41666666666667	6	28.166666666666668	0.0128620515547158	0.250581126994749	0.0513288918003205	-0.237719075440033	0.0126815589827994	0.117200245584434	0.0983346392353314	0.601683003907265	0.118895714813728	0.0455660164851745	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	63	ATT	TAA	TTG	2	ATAATTGCG:GTGATTGCG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.08333333333333	5	27.833333333333332	0.012752698321938	0.205355044468623	0.0621007307365492	-0.192602346146685	0.0129523626458785	0.101758033697501	NA	NA	0.104634232898894	0.0656625721286064	6	3	991	0.991	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	64	GCG	TTG	CGC	2	ATTGCGCTC:ATTGCGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.24999999999999	5	28.166666666666668	0.0127256499425275	0.202564732921051	0.0628226333331541	-0.189839082978524	0.012966787944883	0.0997684608125418	NA	NA	0.102223563336822	0.0632973407988074	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CGC	TCA	2	GCGCTCAAT:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.24999999999999	6	28.666666666666668	0.0127256499425275	0.245409683406312	0.0518547180612196	-0.232684033463785	0.0127993847685127	0.108493739342675	NaN	NaN	0.114960616580642	0.0429667995708212	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	66	AAT	TCA	ATA	2	CTCAATAAA:CTTCATAAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.91666666666666	6	27.666666666666668	0.0126185941874855	0.255977372918159	0.0492957406493891	-0.243358778730673	0.0126499497886635	0.113215236593563	NA	NA	0.117744480110989	0.0387494111160849	1	1	998	0.998	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	67	AAA	ATA	AAA	2	AATAAAAGA:CATAAGAGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.58333333333333	5	27	0.012513324680928	0.212681467874346	0.0588359898302048	-0.200168143193418	0.0118287396364201	0.101589400475849	NA	NA	0.104185958858922	0.0546991454487968	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	68	AGA	AAA	GAT	2	AAAAGATGG:AAGAGGTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.75	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.74999999999999	5	26.583333333333332	0.0381034317265946	0.21654566314	0.175960262487271	-0.178442231413406	0.0291506466175344	0.10353934470753	NaN	NaN	0.111520185821684	0.109578823389029	21	1	978	0.978	0.021	0.042
ORF3a	all	ss13	69	TGG	GAT	GGC	2	AGATGGCAG:AGGTGGCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.91666666666666	6	27	0.03851113321761	0.263548415128416	0.146125459334844	-0.225037281910806	0.0294591759401615	0.126444385179713	NaN	NaN	0.130426484229513	0.0844562038648486	10	1	989	0.989	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	70	CAG	GGC	AGC	2	TGGCAGCTA:TGGCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.25	6	27.333333333333332	0.0522518101768581	0.259707177538375	0.201195094691356	-0.207455367361517	0.0337752452253531	0.117883606021786	NaN	NaN	0.117351938523158	0.0770934750087223	20	0	980	0.98	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	71	CTA	AGC	TAG	2	CAGCTAGCC:CAGCTTGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.5	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.91666666666666	7	27.333333333333332	0.0661950873041523	0.313301400524984	0.2112824494025	-0.247106313220832	0.0347228762438264	0.141763399390533	NaN	NaN	0.135621468250555	0.068450512742757	17	0	983	0.983	0.017	0.034
ORF3a	all	ss13	72	GCC	TAG	CCC	2	CTAGCCCTT:CTTGCCTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.75	7	27.166666666666664	0.0654722993105784	0.315691024758642	0.207393603795466	-0.250218725448064	0.036065855992675	0.133445555080871	NaN	NaN	0.133745183183513	0.0613642687535805	14	0	986	0.986	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	73	CTT	CCC	TGT	2	GCCCTTTAT:GCCTTGTAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.75	7	27.333333333333332	0.0654722993105784	0.313301400524984	0.208975444095908	-0.247829101214406	0.0348099450371252	0.134266582758394	0.181236273739689	0.248887691504461	0.138375542498947	0.0732950292182301	18	0	982	0.982	0.018	0.036
ORF3a	all	ss13	74	TAT	TGT	ATA	2	CTTTATAAG:TTGTATAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.91666666666667	6	27	0.0791072878500077	0.263548415128416	0.300162259793753	-0.184441127278409	0.0371109835959866	0.122494306186533	NaN	NaN	0.124034007645191	0.137009364307329	37	0	963	0.963	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	75	AAA	ATA	AAG	2	TATAAAGGC:TATAAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.50000000000001	6	27.416666666666664	0.0795446789702432	0.258764472899754	0.307401854972027	-0.17921979392951	0.0371800893791407	0.122527065783595	NaN	NaN	0.11622523705523	0.123072593374673	40	0	960	0.96	0.04	0.08
ORF3a	all	ss13	76	GGC	AAG	GCA	2	AAAGGCATT:AAGGGCTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.83333333333334	6	27.416666666666664	0.0813437533100697	0.258764472899754	0.314354410396912	-0.177420719589684	0.0398982854442793	0.111968972486884	NaN	NaN	0.121402127793609	0.143897454741184	37	0	963	0.963	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	77	ATT	GCA	TCC	2	GGCATTCAG:GGCTTCCAG	1:1	TRUE	1.5	0.5	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.83333333333334	6	27.083333333333332	0.0813437533100697	0.262577384081623	0.309789640088667	-0.181233630771554	0.0395219384898857	0.120693512763892	NaN	NaN	0.126332092688322	0.151406507422411	25	0	975	0.975	0.025	0.05
ORF3a	all	ss13	78	CAG	TCC	AGT	2	ATTCAGTTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.50000000000001	5	26.416666666666664	0.0806144362276048	0.218131224556612	0.369568531013692	-0.137516788329007	0.0382179566735648	0.0997030409039491	NA	NA	0.109000791697405	0.207088166803154	89	0	911	0.911	0.089	0.178
ORF3a	all	ss13	79	TTC	AGT	TCA	2	CAGTTCATT:CAGTTTGTT	1:1	FALSE	1.75	0.75	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.33333333333334	5	26.916666666666664	0.0807955355010693	0.213443159911581	0.378534198680993	-0.132647624410512	0.0373401881492037	0.104280651206115	NaN	NaN	0.109549996033575	0.225956356462595	89	0	911	0.911	0.089	0.178
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TCA	TTT	2	TTCATTTGC:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.58333333333334	5	27.25	0.0816206643196587	0.210428875701957	0.387877680985488	-0.128808211382298	0.0392174649746612	0.0991311417850613	NaN	NaN	0.107967834136917	0.232859995516359	81	0	919	0.919	0.081	0.162
ORF3a	all	ss13	81	TGC	TTT	GCA	2	ATTTGCAAT:GTTTGCAAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.16666666666667	4	27	0.0809774510729235	0.165046413582601	0.490634418011128	-0.0840689625096777	0.0390497523402717	0.0864669691211351	NaN	NaN	0.0904867384258287	0.352850242361186	163	0	837	0.837	0.163	0.326
ORF3a	all	ss13	82	AAC	GCA	ACC	2	TGCAACCTG:TGCAATTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78	4	27.666666666666664	0.0811601884801745	0.160610991304224	0.505321508952296	-0.0794508028240493	0.0389795634439029	0.0855735910557188	NaN	NaN	0.0943841707130805	0.399910541764068	176	0	824	0.824	0.176	0.352
ORF3a	all	ss13	83	CTG	ACC	TAC	2	AACCTGCTG:AATTTACTG	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78	4	27.666666666666664	0.0811601884801745	0.160610991304224	0.505321508952296	-0.0794508028240493	0.0403765374466769	0.0918134490441461	NaN	NaN	0.0882760853951542	0.368106228808778	182	0	818	0.818	0.182	0.364
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TGC	2	CTGCTGCTA:TTACTGCTG	1:1	FALSE	1.25	1	0	0.75	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.66666666666667	4	27.5	0.0804341477651982	0.16169725925912	0.497436679717016	-0.0812631114939219	0.0389768485082675	0.0917258133003759	NaN	NaN	0.0884443428919333	0.358197535197781	184	0	816	0.816	0.184	0.368
ORF3a	all	ss13	85	CTA	TGC	TAC	2	CTGCTACTT:CTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.08333333333334	4	28.25	0.0941885460903394	0.156921757285409	0.600226174621721	-0.0627332111950698	0.041226786151181	0.0817751259399798	NaN	NaN	0.0892086948991407	0.481919545865021	244	0	756	0.756	0.244	0.488
ORF3a	all	ss13	86	CTA	TAC	TAT	2	CTACTTTTT:CTGCTATTT	1:1	FALSE	1.25	1	0.5	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.25000000000001	4	28.583333333333332	0.093977517058638	0.154888999008431	0.606741070445699	-0.0609114819497926	0.0393089256560063	0.0812012060400406	NaN	NaN	0.0856711869509758	0.477089530351012	225	0	775	0.775	0.225	0.45
ORF3a	all	ss13	87	TTT	TAT	TTG	2	CTATTTGTT:CTTTTTGTG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.41666666666669	4	29.333333333333332	0.0937674327609406	0.150503021596613	0.62302691179358	-0.0567355888356729	0.040264613058543	0.0833683835723609	NaN	NaN	0.0882075929846424	0.520090912912455	263	0	737	0.737	0.263	0.526
ORF3a	all	ss13	88	GTG	TTG	TGA	2	TTTGTGACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.25000000000001	4	28.666666666666664	0.0927309624185635	0.154389040653112	0.600631767813855	-0.061658078234548	0.0403888521317697	0.0825676680495973	NaN	NaN	0.091937407660443	0.502441749354715	222	0	778	0.778	0.222	0.444
ORF3a	all	ss13	89	ACA	TGA	CAA	2	GTGACAATT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.08333333333336	4	28.833333333333332	0.0929364169942089	0.153398778089708	0.605848482964182	-0.0604623610954991	0.039816558247609	0.0828159828900042	NA	NA	0.0913686174074262	0.508137217869583	247	0	753	0.753	0.247	0.494
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CAA	TCT	2	ACAATTTAC:ACCATCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.41666666666669	4	28.833333333333332	0.092526415385480107	0.153398778089708	0.6031757002091	-0.060872362704228	0.0389597326143873	0.0838724400720602	NaN	NaN	0.0833007729579598	0.464929501145248	242	0	758	0.758	0.242	0.484
ORF3a	all	ss13	91	TAC	TCT	ACT	2	ATCTATTCA:ATTTACTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.00000000000001	4	28.916666666666664	0.0930394865024842	0.152908411727716	0.608465456224602	-0.059868925225232	0.0419763545354953	0.0829690851086756	NaN	NaN	0.0871226111837211	0.49196923893881	253	0	747	0.747	0.253	0.506
ORF3a	all	ss13	92	TCA	ACT	CAC	2	TACTCACAT:TATTCACAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.00000000000001	4	28.916666666666664	0.0930394865024842	0.152908411727716	0.608465456224602	-0.059868925225232	0.0420065822790431	0.0824896694953722	NaN	NaN	0.0906314857807646	0.508884683001626	241	0	759	0.759	0.241	0.482
ORF3a	all	ss13	93	CAT	CAC	ATC	2	TCACATCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.50000000000001	4	28.083333333333332	0.0912185711042866	0.157958351375552	0.577484952900092	-0.0667397802712649	0.0403609870877146	0.08643971981824	NaN	NaN	0.0893050358364738	0.454868119127164	206	0	794	0.794	0.206	0.412
ORF3a	all	ss13	94	CTT	ATC	TTC	2	CATCTTCTA:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.00000000000001	4	27.916666666666664	0.0918175614096642	0.159008783209024	0.577437041883189	-0.0671912217993599	0.0395728934341324	0.0851001656487024	NaN	NaN	0.0903525591998914	0.457084621427629	215	1	784	0.784	0.215	0.43
ORF3a	all	ss13	95	CTA	TTC	TAC	2	CTTCTACTG:CTTTTGCTT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.33333333333336	4	28.249999999999996	0.0914173632067776	0.156921757285409	0.582566527345903	-0.0655043940786317	0.038940002671656	0.0792418824719381	NaN	NaN	0.0884178428974547	0.458784153589047	239	0	761	0.761	0.239	0.478
ORF3a	all	ss13	96	CTG	TAC	TGT	2	CTACTGTTA:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1.08333333333333	1	0.416666666666667	0.5	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.33333333333336	4	29.249999999999996	0.0926285758359223	0.150978005779684	0.61352364112619	-0.0583494299437612	0.0403475102385017	0.0780129402849609	NaN	NaN	0.087550638173044	0.505113972495325	230	0	770	0.77	0.23	0.46
ORF3a	all	ss13	97	GTC	TGT	TAG	2	CTGTTAGCT:CTTGTCGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.166666666666667	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.4166666666667	4	30.16666666666666	0.092526415385480107	0.145913043990275	0.634120246245064	-0.0533866286047949	0.0394962605982976	0.0768142124898328	NA	NA	0.0845853070124928	0.527937720027424	256	0	744	0.744	0.256	0.512
ORF3a	all	ss13	98	GCT	TAG	CTG	2	GTCGCTGCA:TTAGCTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.50000000000003	4	30.333333333333325	0.0785029669229164	0.145028544735405	0.541293212768149	-0.0665255778124883	0.0372834285790546	0.0781331688080682	NaN	NaN	0.084441074576949	0.430793614775425	190	0	810	0.81	0.19	0.38
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.6666666666667	4	29.666666666666664	0.0773216317702306	0.148632696437812	0.520219531929048	-0.0713110646675809	0.0374411783375809	0.0798979637742081	NaN	NaN	0.0797718144544661	0.371355008375093	187	0	813	0.813	0.187	0.374
ORF3a	all	ss13	100	GGC	CAG	GCA	2	GCAGGTATG:GCTGGCATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.83333333333336	4	29.499999999999993	0.0761753537657808	0.149561992614941	0.509322939832048	-0.0733866388491602	0.037620165659052	0.0799745637900958	NaN	NaN	0.0833468379916157	0.378590142391523	157	0	843	0.843	0.157	0.314
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAG:GGTATGGAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.1666666666667	4	29.833333333333325	0.0758540671866302	0.147714914296514	0.513516644868814	-0.0718608471098838	0.0353283731433493	0.0797042097103482	NaN	NaN	0.0847422012863775	0.396441516796859	176	0	824	0.824	0.176	0.352
ORF3a	all	ss13	102	GAG	TGG	AGG	2	ATGGAGGCA:ATGGAGGCG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.1666666666667	4	29.833333333333325	0.0768261689073374	0.147714914296514	0.520097576288886	-0.0708887453891766	0.0362015222013412	0.0776753866129414	NaN	NaN	0.0838146228862414	0.397675393801304	187	0	813	0.813	0.187	0.374
ORF3a	all	ss13	103	GCA	AGG	CAC	2	GAGGCACAA:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.83333333333337	4	30.16666666666666	0.0908235725293773	0.145913043990275	0.622449988332987	-0.0550894714608976	0.0389180016656489	0.0762030434761188	NaN	NaN	0.0820549364746908	0.501982920594124	256	1	743	0.743	0.256	0.512
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT:GCGCAATTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	82.08333333333337	5	30.499999999999996	0.104402791930732	0.184981141936135	0.564396947915787	-0.0805783500054035	0.040694626801355	0.0903920414105313	NaN	NaN	0.0916586949686778	0.379340011561292	164	0	836	0.836	0.164	0.328
ORF3a	all	ss13	105	TTT	AAT	TTT	2	CAATTTTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.00000000000003	5	31.166666666666664	0.120256987556385	0.180507022556888	0.666217778416266	-0.0602500350005032	0.0449335424975047	0.0858226378302683	NaN	NaN	0.0926685663813444	0.515584416018039	259	0	741	0.741	0.259	0.518
ORF3a	all	ss13	106	TTG	TTT	TGT	2	TTTTTGTAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.1666666666667	5	31	0.119989202138919	0.181605039003649	0.660715158550793	-0.06161583686473	0.0442111824606184	0.0832781900238453	NaN	NaN	0.0948058459600878	0.515746477804259	243	0	757	0.757	0.243	0.486
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TGT	ACA	2	TTGTACATC:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.00000000000004	5	31.833333333333332	0.121889197123331	0.176245193423779	0.691588773319056	-0.054355996300448003	0.0429558542961256	0.0899825192409525	NaN	NaN	0.0862798355717621	0.528696859986908	247	0	753	0.753	0.247	0.494
ORF3a	all	ss13	108	ATC	ACA	TCT	2	TACATCTAT:TACCTCTAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.00000000000004	5	32.33333333333333	0.121889197123331	0.173179167487274	0.703832908379629	-0.0512899703639432	0.0465143793193605	0.0813179663359391	NaN	NaN	0.0907653263341339	0.572017105112158	274	0	726	0.726	0.274	0.548
ORF3a	all	ss13	109	TAT	TCT	ATG	2	ATCTATGCC:CTCTATGCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.1666666666667	4	32.33333333333333	0.121614085547219	0.135196367873208	0.899536632975772	-0.0135822823259886	0.0443659448313335	0.0722909390631226	NaN	NaN	0.0816788684340196	0.867929667033259	418	0	582	0.582	0.418	0.836
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ATG	CCC	2	TATGCCCTG:TATGCCTTG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.1666666666667	4	32.33333333333333	0.121614085547219	0.135196367873208	0.899536632975772	-0.0135822823259886	0.0456772962041419	0.0726304158468171	NaN	NaN	0.0797108166044707	0.864699921073136	437	0	563	0.563	0.437	0.874
ORF3a	all	ss13	111	CTG	CCC	TGA	2	GCCCTGATT:GCCTTGATA	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.83333333333337	4	32.666666666666664	0.12216555897624	0.133686173554739	0.913823439835521	-0.011520614578499	0.0465314652141686	0.0728866309822662	NaN	NaN	0.0766014894058772	0.880451610107266	462	0	538	0.538	0.462	0.924
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TGA	TAT	2	CTGATTTAC:TTGATATAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.6666666666667	4	32.83333333333333	0.119192968934937	0.132943691128056	0.896567320521635	-0.013750722193119	0.0452662656892354	0.0731513024744118	NaN	NaN	0.0761102556364895	0.85662782159804	428	0	572	0.572	0.428	0.856
ORF3a	all	ss13	113	TAC	TAT	ACA	2	ATATATTTT:ATTTACATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	82.00000000000004	4	33.83333333333333	0.118668003911171	0.128656816904346	0.922360794915347	-0.00998881299317511	0.0454569875388949	0.0719476876447657	NaN	NaN	0.0748195371390194	0.893793685890752	465	0	535	0.535	0.465	0.93
ORF3a	all	ss13	114	ATT	ACA	TTC	2	TACATTCTG:TATTTTCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.66666666666671	5	34.166666666666664	0.119192968934937	0.162798378928371	0.732150834176183	-0.0436054099934337	0.0447267812190376	0.0810300157505193	NaN	NaN	0.0835231742588936	0.601617705449223	291	0	709	0.709	0.291	0.582
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TTC	TAC	2	ATTCTGCAA:TTTCTACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.83333333333337	4	34.5	0.120525973482338	0.125949614506391	0.956938010129612	-0.00542364102405356	0.045427363267828	0.066933442658286	NaN	NaN	0.0694796092463617	0.9377796073007	502	0	498	0.498	0.502	0.996
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAA	2	CTACAATGC:CTGCAAATC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.1666666666667	4	35.16666666666667	0.119989202138919	0.123354245726484	0.972720488316013	-0.00336504358756504	0.0435129431770258	0.0663854337397597	NaN	NaN	0.0734253156904482	0.963446166726274	495	0	505	0.505	0.495	0.99
ORF3a	all	ss13	117	ATC	AAA	GCA	2	CAAATCCTA:CAATGCATC	1:1	TRUE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.6666666666667	4	36	0.122443179667292	0.120256987556385	1.01817933539939	0.00218619211090793	0.0450040846719681	0.0648987257053183	NaN	NaN	0.0702330317031281	0.975167706117785	517	0	483	0.483	0.517	0.966
ORF3a	all	ss13	118	ATC	GCA	TAA	2	ATCCTAAGC:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.4166666666667	4	36.333333333333336	0.0937674327609405	0.119061291806916	0.787555983459385	-0.0252938590459754	0.0357342160109515	0.0628246225926194	NaN	NaN	0.0641115583302527	0.693190635503003	367	0	633	0.633	0.367	0.734
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TAA	ACG	2	ATCAACGCA:CTAAGCTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.08333333333337	3	35.833333333333336	0.0929364169942089	0.0887734500607747	1.04689427898301	0.0041629669334342	0.0345273875042604	0.0533938278488608	NaN	NaN	0.0528607244763367	0.937228692717673	561	1	438	0.438	0.561	0.876
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT:AGCTTTTGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.25000000000004	4	36.00000000000001	0.0798094452064725	0.120256987556385	0.66365744584324	-0.040447542349912	0.0321347172827249	0.0645720831976335	NaN	NaN	0.0587001175997841	0.490789377091887	237	2	761	0.761	0.237	0.474
ORF3a	all	ss13	121	TGC	CAT	GCA	2	GCATGTAGA:TTTTGCAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.08333333333339	3	35.833333333333336	0.0660492550084018	0.0887734500607747	0.744020368287864	-0.0227241950523728	0.0299083815905222	0.0537739401012962	NaN	NaN	0.0574811983602123	0.692597399100311	360	0	640	0.64	0.36	0.72
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GCA	GAA	2	TGCAGATTC:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.25000000000004	4	36.50000000000001	0.0667849179180056	0.118472334721436	0.563717411959823	-0.05168741680343	0.0303727932754974	0.0618913402006654	NaN	NaN	0.0673292763777891	0.442676633399443	208	0	792	0.792	0.208	0.416
ORF3a	all	ss13	123	ATT	GAA	TCA	2	AGAATTATT:AGATTCATC	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.25000000000004	4	36.333333333333336	0.0667849179180056	0.119061291806916	0.560928887167729	-0.0522763738889102	0.0305097192816407	0.060613113922959	NaN	NaN	0.0630823576115257	0.407273969221027	210	0	790	0.79	0.21	0.42
ORF3a	all	ss13	124	ATC	TCA	TCA	2	ATTATTATG:TTCATCATG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.41666666666671	4	36.833333333333336	0.0528271104098974	0.117311764843583	0.450313832379338	-0.0644846544336854	0.0254854120648081	0.062414393244893	NaN	NaN	0.0610656932604113	0.290973584055754	124	3	873	0.873	0.124	0.248
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TCA	TGA	2	ATCATGAGA:ATTATGAGA	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.75000000000004	4	36.50000000000001	0.0525954761681724	0.118472334721436	0.443947325692874	-0.0658768585532633	0.0259965985259605	0.0614290829713302	NaN	NaN	0.0641915596999448	0.304771773602488	126	1	873	0.873	0.126	0.252
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATGC:ATGAGATGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.75000000000004	5	36.66666666666667	0.0519126079323414	0.150503021596613	0.344927346850753	-0.0985904136642719	0.0246800898002045	0.0700970052210639	NaN	NaN	0.0738544952247208	0.181900000937233	57	1	942	0.942	0.057	0.114
ORF3a	all	ss13	127	TGC	GAT	GCT	2	AGATGCTGG:AGATGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.4166666666667	6	37.333333333333336	0.0521382511052231	0.180871542612666	0.288261217613854	-0.128733291507443	0.024684650849919	0.0823919753183549	NaN	NaN	0.0797824148437018	0.10662404654059	41	0	959	0.959	0.041	0.082
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCTG:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.9166666666667	7	37.66666666666667	0.0661950873041523	0.213552421666518	0.309971138643991	-0.147357334362366	0.0295839903540972	0.0847796173320817	0.237093679414838	0.191084253267277	0.0840683817516146	0.0796316969158201	15	0	985	0.985	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	129	CTG	GGC	TGT	2	TGGCTGTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.58333333333337	7	37.00000000000001	0.0664886936625221	0.218017195136802	0.304969952580124	-0.15152850147428	0.0279222441239299	0.0923319874485193	0.251064062048587	0.224476829977763	0.0893500825678659	0.0899054631746229	18	0	982	0.982	0.018	0.036
ORF3a	all	ss13	130	TGC	TGT	GCT	2	CTGTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.5	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.75000000000004	7	36.66666666666667	0.0654722993105784	0.220320838896122	0.297167983013388	-0.154848539585544	0.0313500837797451	0.0902207709708623	0.246584688900862	0.228150964857588	0.0887199385158311	0.0809216205023887	17	0	983	0.983	0.017	0.034
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GCT	GGA	2	TGCTGGAAG:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.33333333333337	7	36.41666666666667	0.0658317081617892	0.222081009574389	0.296431055892412	-0.1562493014126	0.0302303611024688	0.094318580609722	0.258633056746306	0.251735046977253	0.0926796923769454	0.0918137981131991	20	0	980	0.98	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	132	AAG	GGA	AGT	2	TGGAAGTGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.00000000000004	7	36.41666666666667	0.0661220906960037	0.222081009574389	0.297738608189527	-0.155958918878386	0.029959827593713	0.0895496654156521	NaN	NaN	0.0929575940380755	0.0933973521592985	21	0	979	0.979	0.021	0.042
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AGT	GCA	2	AAGTGCAAA:AAGTGCAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.50000000000004	7	35.91666666666667	0.0656874718445632	0.225687740489177	0.291054674490452	-0.160000268644614	0.0297288892365237	0.0913579565435017	0.212072347337404	0.169929289399216	0.090978934362176	0.0786366652313036	16	0	984	0.984	0.016	0.032
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCC:TGCAGATCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.66666666666671	7	35.91666666666667	0.0655438665862574	0.225687740489177	0.290418373830104	-0.16014387390292	0.0296046531910496	0.094133735355679607	NaN	NaN	0.0925387828372067	0.0835303523939505	15	0	985	0.985	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	135	TCC	AAT	CCA	2	AAATCCAAG:AGATCCAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.00000000000004	7	36.16666666666667	0.0524230797130337	0.223869741416997	0.234167777124406	-0.171446661703964	0.0250614934634792	0.0912709825995322	0.15784367560719	0.137930373829332	0.0889417738163829	0.0539014021722335	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	136	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAT:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.00000000000004	7	36.833333333333336	0.0524230797130337	0.219162920712879	0.239196847452641	-0.166739840999845	0.0263085707029525	0.0880755566631714	NaN	NaN	0.0868065876745948	0.054754387788646	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AAA	ACC	2	AAAAATCCG:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.4166666666667	7	36.25000000000001	0.0521382511052231	0.223270280899521	0.233520784294113	-0.171132029794298	0.0252533584444523	0.0937800641490202	NaN	NaN	0.0880587251560055	0.0519696250739048	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA:AATCCGTTG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.75000000000004	7	36.25000000000001	0.0525954761681724	0.223270280899521	0.235568638854547	-0.170674804731348	0.0251552277399639	0.0894288251440316	0.182673554698498	0.197203224858595	0.0902835879157663	0.0587004718978356	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	139	TTA	CAT	TAC	2	CCATTACTT:CCGTTGCTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333337	7	36.41666666666667	0.0527110387112104	0.222081009574389	0.237350500217147	-0.169369970863179	0.0259598420027305	0.0944863654152898	0.195868524555817	0.225594769476758	0.0885481620850609	0.0557808259542044	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	140	CTC	TAC	TCT	2	TTACTTTAT:TTGCTCTAT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333337	7	37.08333333333334	0.0534152253723938	0.217448844139347	0.245645018642472	-0.164033618766953	0.0255686319437301	0.091091910941125	0.193277448266452	0.203748193482587	0.0876783693615689	0.0613650188171308	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	141	TAT	TCT	ATG	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.50000000000004	7	37.16666666666667	0.0534747581886498	0.216883469282523	0.246559861687711	-0.163408711093873	0.0268363185433283	0.0951589572372187	NaN	NaN	0.0852310935696365	0.0552070771678238	9	1	990	0.99	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	142	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGCC:TATGATGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666671	7	37.66666666666668	0.0533558250189307	0.213552421666518	0.249848840872668	-0.160196596647587	0.026664879649688802	0.0842157621630508	NaN	NaN	0.0858083940133419	0.0619140793859556	11	1	988	0.988	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ATG	CCA	2	GATGCCAAC:GATGCTAAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.00000000000004	7	38.00000000000001	0.0679196827842952	0.211388364105741	0.321302844986872	-0.143468681321445	0.0294067393679649	0.0897298335304632	NaN	NaN	0.0883117274232551	0.10425397641136	26	0	974	0.974	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CCA	ACT	2	GCCAACTAC:GCTAACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.33333333333337	8	38.33333333333334	0.0676133227457231	0.244568640424989	0.276459494676958	-0.176955317679266	0.0296262017708621	0.0985740229429247	0.232644383583362	0.234701401078508	0.0952286182803867	0.0631383832511183	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.33333333333337	8	38.33333333333334	0.0676133227457231	0.244568640424989	0.276459494676958	-0.176955317679266	0.0293151289412132	0.0967465788846665	0.192983964819735	0.151986011362104	0.0972708090594357	0.0688805123228642	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	146	TTT	ACT	TTG	2	TACTTTGTA:TACTTTGTT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.50000000000004	8	38.16666666666668	0.0683844676038055	0.245832397240244	0.278175164752494	-0.177447929636439	0.0307203080443696	0.0990970913971078	0.185301598309074	0.133303274320713	0.0957655292258882	0.063890734619108	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	147	GTA	TTG	TAT	2	TTTGTATGT:TTTGTTTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.00000000000004	8	37.16666666666668	0.0679196827842952	0.253700676929915	0.267715812217001	-0.18578099414562	0.0303297776578336	0.0968949218152152	0.191828627721843	0.16283532899597	0.101539955288418	0.06730462773109	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TAT	GCT	2	GTATGTTGG:GTTTGCTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.00000000000004	8	38.16666666666668	0.068855661939842	0.245832397240244	0.280091894773949	-0.176976735300402	0.0289286353727414	0.0981038845174571	0.20634866635608	0.174663051402751	0.0987729281140321	0.0731724674975013	16	0	984	0.984	0.016	0.032
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC:TGTTGGCAC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.16666666666671	8	38.16666666666668	0.0686978768215523	0.245832397240244	0.279450054560612	-0.177134520418692	0.0309503942564653	0.0966050356041141	0.195646795502393	0.153194151242854	0.0942070624796261	0.0600715687296841	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA:TGGCACACC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.50000000000004	8	37.50000000000001	0.0683844676038055	0.251022027914968	0.272424169989457	-0.182637560311162	0.0310757690685682	0.101673269952623	NaN	NaN	0.0947593911865557	0.0539320209226578	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT:CACACCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.83333333333337	8	37.50000000000001	0.069014174040189	0.251022027914968	0.274932740418969	-0.182007853874779	0.0311891019095326	0.103038889648662	NaN	NaN	0.0954544598946036	0.0565528840794104	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	152	AAT	CAC	ATA	2	ACACATAAC:ACCAATTGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.83333333333337	8	36.50000000000001	0.0680739069857003	0.259234959672941	0.262595396360061	-0.19116105268724	0.030067844376642502	0.101907270731553	0.212439398832672	0.21642304737234	0.102551292556476	0.0623142507142276	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ATA	ACT	2	AATTGCTTT:CATAACTAT	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.416666666666667	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000004	8	37.16666666666667	0.0549444688504894	0.253700676929915	0.216572023044573	-0.198756208079426	0.0277406167195517	0.098080765250662	0.16999041601892	0.202654591180653	0.0943312651167366	0.0351173659469507	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	154	TAT	ACT	ATG	2	AACTATGAC:TGCTTTGAT	1:1	FALSE	1.08333333333333	0.75	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.4166666666667	7	36.833333333333336	0.0408727688266097	0.219162920712879	0.186494908416357	-0.178290151886269	0.0239523347558212	0.0901622764043788	NA	NA	0.0941834493976767	0.0583566238597778	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ATG	ACT	2	TATGACTAC:TTTGATTAC	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.00000000000004	7	36.666666666666664	0.0267885619515594	0.220320838896122	0.121588870511653	-0.193532276944563	0.018531116778754	0.0960761113094729	NaN	NaN	0.0869329630957889	0.0259991595122904	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT:GATTACTGT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000004	7	36.5	0.0269691977905829	0.221491146757304	0.121761967398787	-0.194521948966721	0.0184647467676959	0.0957197832041843	0.115071113405456	0.289989166704375	0.0902662204258304	0.0311633566011969	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333337	7	36.666666666666664	0.0270299523623976	0.220320838896122	0.122684501828453	-0.193290886533725	0.0194188937642624	0.0891150639810925	0.115746818712645	0.289172608790046	0.0888404211688256	0.0295770414331131	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.1666666666667	7	36.333333333333336	0.0270909813104956	0.222674045667529	0.121662051943605	-0.195583064357033	0.0190534015996315	0.100247581319652	NaN	NaN	0.0910020586824915	0.0316172956379837	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAC:ATACCATAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.6666666666667	7	36.50000000000001	0.0272757331281561	0.221491146757304	0.123145929430954	-0.194215413629148	0.0196203431794781	0.0949181840899508	NaN	NaN	0.0916258200388684	0.0340348870751241	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	160	TAC	CAT	ACA	2	CCATACAAC:CCATATAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333337	7	36.50000000000001	0.0270299523623976	0.221491146757304	0.122036265368274	-0.194461194394906	0.0190229528197512	0.0904356515074403	NaN	NaN	0.0854608941518567	0.0228795078824016	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ACA	ACA	2	TACAACAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000003	8	36.50000000000001	0.0269691977905829	0.259234959672941	0.104033799394218	-0.232265761882358	0.0190209209375687	0.106740293268035	0.092529551844864	0.260872834307144	0.109205955481684	0.0334317298639948	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	162	AGT	ACA	GTA	2	AACAGTATC:AACAGTGTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000003	8	36.333333333333336	0.0271522864979704	0.260656845281595	0.104168706824626	-0.233504558783624	0.0196058986571498	0.106583326739676	NA	NA	0.103380950744004	0.0239032535042044	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	163	ATC	GTA	TCA	2	AGTATCACT:AGTGTCACA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.33333333333336	8	36.333333333333336	0.027400307499342	0.260656845281595	0.105120229893601	-0.233256537782253	0.0188883036296983	0.103670812563081	0.0959275376560944	0.273153376553905	0.103533100958845	0.0242613041163381	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TCA	CAG	2	ATCACTGAC:GTCACAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000003	7	36.333333333333336	0.0271522864979704	0.222674045667529	0.121937365518167	-0.195521759169558	0.0191126541862766	0.0962531909740609	0.110783477228542	0.271035137074631	0.0932568760316185	0.0360295760762758	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	165	GAC	CAG	ACA	2	ACAGATACA:ACTGACACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000003	8	35.666666666666664	0.0269691977905829	0.266505540694197	0.101195636384644	-0.239536342903614	0.019411299162525	0.118214367230899	0.0943608903841103	0.283526050925582	0.113687763778764	0.0351204582154566	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	166	ACA	ACA	CAA	2	GACACAATT:GATACAATT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.6666666666667	8	35.5	0.0269087157486763	0.268009394822974	0.100402136150675	-0.241100679074298	0.0190858208747627	0.116345318102364	NaN	NaN	0.10478993934673	0.0214029456772672	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	167	ATT	CAA	TTG	2	ACAATTGTC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.00000000000003	8	35.166666666666664	0.0267885619515594	0.271069160022998	0.0988255615256515	-0.244280598071438	0.0194031880437851	0.114618538788352	0.101154293791688	0.328579839025711	0.111694222326051	0.0287390380674134	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TTG	TCC	2	ATTGTCCTC:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.1666666666667	8	35.5	0.0270909813104956	0.268009394822974	0.10108220769048	-0.240918413512479	0.0193720661014944	0.110604893600592	0.0921539435508844	0.27269200199608	0.109658387309417	0.0280211387941448	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	169	CTC	TCC	TCA	2	GTCCTCACG:GTCGTTACT	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.1666666666667	8	35.166666666666664	0.0267288865855191	0.271069160022998	0.0986054134053883	-0.244340273437479	0.01850196333829	0.115485270398773	NA	NA	0.120758868132438	0.0430346714720114	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	170	ACG	TCA	CGT	2	CTCACGTCA:GTTACTGAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333337	7	34.33333333333333	0.0400986359257937	0.237930656019994	0.168530766890434	-0.1978320200942	0.0228436733128847	0.110421711828649	0.17092144722375	0.324126739476713	0.11290068699913	0.0797281025051393	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	171	GAA	CGT	AAG	2	ACGTCAGGT:ACTGAAGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.83333333333337	7	34.33333333333333	0.0539558430514737	0.237930656019994	0.226771295275795	-0.18397481296852	0.0261817754096966	0.106674062183644	NaN	NaN	0.111133969724026	0.0978367476227491	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	172	GGT	AAG	GTG	2	GAAGGTGAC:TCAGGTGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333337	6	34.5	0.0543223783836108	0.197860943283853	0.274548263452275	-0.143538564900242	0.0275851720060186	0.0958786225631357	0.286303925128938	0.33758901197833	0.0918669211678141	0.118179212837404	22	0	978	0.978	0.022	0.044
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGATGGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.6666666666667	6	34.833333333333336	0.0540774704260079	0.195697415235261	0.276332062745937	-0.141619944809253	0.0278649946728055	0.0984892297953228	NaN	NaN	0.0965755859525276	0.142535101809487	33	1	966	0.966	0.033	0.066
ORF3a	all	ss13	174	GGA	ACG	GAA	2	GACGGCATT:GATGGAACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.6666666666667	6	35.166666666666664	0.0548189130040021	0.193580949501978	0.283183408000806	-0.138762036497976	0.0274643100684468	0.0925709988965604	NaN	NaN	0.0955309281779332	0.146352847227578	33	0	967	0.967	0.033	0.066
ORF3a	all	ss13	175	ACT	GAA	CTA	2	GGAACTACT:GGCATTTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.833333333333333	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.1666666666667	6	35.666666666666664	0.0551973146854054	0.190491169998981	0.289763114404204	-0.135293855313576	0.0269540189487097	0.0922109428189132	NaN	NaN	0.0966679506623096	0.161641218983102	41	0	959	0.959	0.041	0.082
ORF3a	all	ss13	176	ACT	CTA	CAA	2	ACTACTCAG:ATTTCAACA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.75000000000003	7	36.166666666666664	0.0555166649189651	0.223869741416997	0.247986461089243	-0.168353076498032	0.028277985676457	0.112211960943723	NaN	NaN	0.114806240466462	0.142536487488271	28	0	972	0.972	0.028	0.056
ORF3a	all	ss13	177	ACA	CAA	AGC	2	ACTCAGCCA:TCAACACCA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.33333333333337	6	36.24999999999999	0.0550706014161129	0.187009442781175	0.294480324614156	-0.131938841365062	0.0280382639586477	0.0972691734652209	NaN	NaN	0.105812706957728	0.21243078058127501	45	1	954	0.954	0.045	0.09
ORF3a	all	ss13	178	CCA	AGC	CAA	2	ACACCAAAA:CAGCCAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.00000000000003	5	35.91666666666666	0.0405504159527068	0.153991399978411	0.26332909473121	-0.113440984025705	0.022887881921993	0.0899295090291984	NaN	NaN	0.101982683738658	0.265985393596327	74	0	926	0.926	0.074	0.148
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTA:CCAAAACTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.00000000000003	5	35.91666666666666	0.0405504159527068	0.153991399978411	0.26332909473121	-0.113440984025705	0.0237637978013755	0.0907230124332278	NaN	NaN	0.0952686563549451	0.23375243749673	58	2	940	0.94	0.058	0.116
ORF3a	all	ss13	180	CTA	AAC	TAA	2	AAACTAAAA:AAACTCAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.83333333333336	5	36.41666666666666	0.0412002891133781	0.151648059986963	0.271683588414648	-0.110447770873585	0.0239529426775352	0.0978104249322362	NaN	NaN	0.0994568540431189	0.266779581653741	86	0	914	0.914	0.086	0.172
ORF3a	all	ss13	181	AAA	TAA	AAG	2	CTAAAAGAA:CTCAAAGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.50000000000003	5	36.58333333333333	0.0408264049162627	0.150882768440169	0.270583614937129	-0.110056363523907	0.0242173006355431	0.095950541062061	NA	NA	0.0973489913084339	0.25825119807429	89	0	911	0.911	0.089	0.178
ORF3a	all	ss13	182	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.83333333333336	5	36.58333333333333	0.0412002891133781	0.150882768440169	0.273061593045434	-0.109682479326791	0.0246312278402745	0.092218630788589	NA	NA	0.0984647801660437	0.265310931564787	81	1	918	0.918	0.081	0.162
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	GAAGACTAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.00000000000001	5	37.08333333333333	0.0416773883661081	0.148632696437812	0.280405249753011	-0.106955308071703	0.0239712318609149	0.0914485614164718	NaN	NaN	0.0919542661026095	0.244774368498308	90	0	910	0.91	0.09	0.18
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000001	5	37.916666666666664	0.0573071018565008	0.145028544735405	0.395143604047424	-0.0877214428789039	0.0297349958488367	0.0880669631713227	NaN	NaN	0.0913702518385822	0.337022160439349	143	1	856	0.856	0.143	0.286
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.66666666666669	5	37.416666666666664	0.0711433450940078	0.147169682776295	0.483410331203533	-0.0760263376822875	0.030740787629917	0.088447733553526	NaN	NaN	0.0925038446886883	0.411149640552628	200	0	800	0.8	0.2	0.4
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.66666666666669	5	37.416666666666664	0.0711433450940078	0.147169682776295	0.483410331203533	-0.0760263376822875	0.0339263785584565	0.0875860932561089	NaN	NaN	0.0959669647871	0.428236121552726	214	0	786	0.786	0.214	0.428
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.16666666666669	5	37.416666666666664	0.0716534971389809	0.147169682776295	0.486876751972739	-0.0755161856373143	0.031595067532579	0.0820502469560928	NaN	NaN	0.0940702044104003	0.422111079380445	209	0	791	0.791	0.209	0.418
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.83333333333334	5	37.75	0.0719976858062998	0.145735279379414	0.494030588289179	-0.0737375935731141	0.0317629250989449	0.0898685758810938	NaN	NaN	0.10002613118083	0.461010887071175	208	0	792	0.792	0.208	0.416
ORF3a	all	ss13	189	TAT	GTT	ATT	2	GGTTATTCC:GGTTATTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.00000000000001	5	37.25	0.070807263353306	0.147897559919249	0.478758834100889	-0.077090296565943	0.0322798209658204	0.0858241488323055	NaN	NaN	0.0977199015651408	0.430176041170701	222	0	778	0.778	0.222	0.444
ORF3a	all	ss13	190	TCC	ATT	CCG	2	TATTCCGAG:TATTCTGAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.33333333333334	5	36.58333333333333	0.0694941228620286	0.150882768440169	0.460583561532314	-0.0813886455781408	0.031749802006755	0.0983582383147622	NaN	NaN	0.0997880871952643	0.414720454519395	183	0	817	0.817	0.183	0.366
ORF3a	all	ss13	191	GAG	CCG	AGG	2	TCCGAGTAT:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666667	7	37.25	0.0701445435081176	0.216321047091377	0.324261297970177	-0.146176503583259	0.0314508940749925	0.12262751638686	NaN	NaN	0.127173652347602	0.250381008869238	92	0	908	0.908	0.092	0.184
ORF3a	all	ss13	192	GAT	AGG	ATA	2	GAGGATAGG:GAGTATTGG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.16666666666667	7	36.08333333333333	0.0716534971389809	0.224472453654356	0.319208419440693	-0.152818956515375	0.0330670984439998	0.119345414558763	NaN	NaN	0.122258539774999	0.211312151240215	77	0	923	0.923	0.077	0.154
ORF3a	all	ss13	193	AGG	ATA	GGC	2	GATAGGCAC:TATTGGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.166666666666667	0.5	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.25	9	36.99999999999999	0.0575131971253351	0.294031565832018	0.195602118305192	-0.236518368706683	0.0313196727385901	0.157395072148029	NaN	NaN	0.16337829306635	0.147708481582205	20	0	980	0.98	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	ACT	2	AGGCACTCA:TGGCATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.75	9	37.49999999999999	0.0579298692281369	0.289246860608989	0.200278298980219	-0.231316991380852	0.0296756844740669	0.148001995454368	0.31361452454391	0.523074749922315	0.153728470975466	0.13239827650891	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	195	TCA	ACT	CAG	2	CACTCAGGT:CATTCAGGT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.08333333333333	9	36.49999999999999	0.05765141989764	0.298979357278323	0.19282742602183	-0.241327937380683	0.0295305660293637	0.159093595425364	0.283744654763624	0.496769915625702	0.15566554809011	0.121070084974291	24	0	976	0.976	0.024	0.048
ORF3a	all	ss13	196	GGT	CAG	GTG	2	TCAGGTGTA:TCAGGTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.58333333333334	9	35.666666666666664	0.0556454425645553	0.307611718065443	0.180895067699329	-0.251966275500888	0.0282483445558675	0.165975109228931	NaN	NaN	0.16866595823573	0.135207647327492	21	0	979	0.979	0.021	0.042
ORF3a	all	ss13	197	GTA	GTG	TAA	2	GGTGTAAAG:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.91666666666667	9	35.666666666666664	0.0553884822155736	0.307611718065443	0.180059727776007	-0.252223235849869	0.0280166875871417	0.16199660618332	NaN	NaN	0.161823403117973	0.119083356249452	21	0	979	0.979	0.021	0.042
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TAA	AAG	2	GTAAAGGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.91666666666667	9	35.33333333333333	0.0546316519559279	0.311207889047031	0.175547130643824	-0.256576237091103	0.0287075197654168	0.168284628851284	0.255701166606134	0.492377452436343	0.160830903180182	0.110641417183272	15	0	985	0.985	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT:AAGGACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.91666666666667	9	35.666666666666664	0.0553884822155736	0.307611718065443	0.180059727776007	-0.252223235849869	0.0281486220981621	NA	NaN	NaN	0.171671986374137	0.141774201275856	16	0	984	0.984	0.016	0.032
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATG	2	GACTATGTA:GACTATGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.75000000000001	9	35.666666666666664	0.0555166649189651	0.307611718065443	0.180476430703313	-0.252095053146478	0.0287916084748636	0.158069225692579	NaN	NaN	0.172967305911282	0.144986058626678	14	0	986	0.986	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	201	GTA	ATG	TAG	2	TATGTAGTA:TATGTCGTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.41666666666669	9	35.666666666666664	0.0550074627952336	0.307611718065443	0.178821090240558	-0.25260425527021	0.0279567991096076	0.15656431044438	NaN	NaN	0.171033594114376	0.139695014922519	20	1	979	0.979	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	202	GTA	TAG	TAA	2	GTAGTAATA:GTCGTTGTA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.41666666666669	9	36.666666666666664	0.055774819305903	0.297311454441185	0.18759727710705	-0.241536635135282	0.0299587068011129	0.145612245093544	NaN	NaN	0.158642444122431	0.1278782996462	29	0	971	0.971	0.029	0.058
ORF3a	all	ss13	203	ATA	TAA	TAC	2	GTAATACAT:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.75000000000001	9	36.333333333333336	0.0555166649189651	0.300666330810564	0.184645433259182	-0.245149665891599	0.0279139874674897	0.151501602656291	0.262631087941296	0.48201830975446	0.155275677664283	0.114381309143054	25	0	975	0.975	0.025	0.05
ORF3a	all	ss13	204	CAT	TAC	ATG	2	ATACATGGT:GTACATGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666669	9	37	0.0569668741816512	0.294031565832018	0.193744076492103	-0.237064691650367	0.0296781308954594	0.156965468396317	NaN	NaN	0.156783579046163	0.130521011879181	23	0	977	0.977	0.023	0.046
ORF3a	all	ss13	205	GGC	ATG	GCT	2	CATGGCTAT:CATGGTTAT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000001	9	36.5	0.0571024790858329	0.298979357278323	0.19099137681494	-0.241876878192491	0.0294428414872583	0.15550176796345	NA	NA	0.161990916006246	0.135397697511441	10	1	989	0.989	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	206	TAT	GCT	ATT	2	GGCTATTTC:GGTTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.08333333333334	9	37.16666666666667	0.05765141989764	0.292418950983896	0.19715350083728	-0.234767531086256	0.0298133718705183	0.144835087129665	NaN	NaN	0.150456238692048	0.118672266083746	22	0	978	0.978	0.022	0.044
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ATT	TCA	2	TATTTCACC:TATTTCACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666667	10	36.833333333333336	0.0573756358851215	0.337052108354688	0.170227791083104	-0.279676472469567	0.0283913008565159	0.162318115446982	NaN	NaN	0.168349675824703	0.0966566012170692	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	208	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGAA:TTCACTGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000001	10	37.16666666666667	0.0571024790858329	0.333245355900159	0.17135266275981	-0.276142876814326	0.0280185536510416	0.172733583923455	NaN	NaN	0.164043290968631	0.0923066453140111	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CCG	AAA	2	ACCGAAGTT:ACTGAAATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.25000000000001	10	36.666666666666664	0.0566975883332357	0.338988842807293	0.167255027816555	-0.282291254474057	0.0292087834772333	0.166229485803351	NaN	NaN	0.174814212312483	0.106352446313888	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	210	ATC	AAA	TCT	2	GAAATCTAC:GAAGTTTAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.25000000000001	10	36	0.0566975883332357	0.346967641461085	0.1634088645687	-0.290270053127849	0.0298843285814764	0.168426074818426	0.186135998019558	0.379997779549557	0.17705094247211	0.101115008722595	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	211	TAC	TCT	ACT	2	ATCTACTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.08333333333336	9	36	0.0560353868844177	0.304098831081123	0.18426702491819	-0.248063444196706	0.0286439215806561	0.154284972165777	0.24873488236292	0.458804416919989	0.159792543347053	0.120564298906408	26	0	974	0.974	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.41666666666669	9	35.33333333333333	0.0550074627952336	0.311207889047031	0.176754718409213	-0.256200426251798	0.0272920833728146	0.165935837380346	NaN	NaN	0.162584052483916	0.115071226988378	13	0	987	0.987	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTT:TACCAGTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.75000000000001	9	35	0.0547563501152288	0.314890384170198	0.173890194391052	-0.260134034054969	0.0270763103282335	0.164924684769081	NaN	NaN	0.160259424755343	0.10454541001923	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	214	CTT	AGC	TAG	2	CAGCTTGAG:CAGTTAGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.5	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333336	9	34.33333333333333	0.0545075207127158	0.322527276629002	0.169001274194291	-0.268019755916287	0.0265678881569939	0.164898913178336	NaN	NaN	0.16812432713305	0.110896635585276	16	0	984	0.984	0.016	0.032
ORF3a	all	ss13	215	GAA	TAG	AAT	2	CTTGAGTCT:TTAGAATCG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666669	8	34.166666666666664	0.0542609435735893	0.28068756657018	0.193314382381175	-0.226426622996591	0.0266973229589141	0.152087135662529	NaN	NaN	0.156973632149434	0.149175454101911	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	216	TCG	AAT	CGA	2	GAATCGACA:GAGTCTACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.91666666666669	8	33.666666666666664	0.0538952343889476	0.285760509183	0.188602807795367	-0.231865274794053	0.0267312585672938	0.144284077533986	NaN	NaN	0.165463113384057	0.161121104213183	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CGA	CAC	2	TCGACACAA:TCTACACAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.08333333333336	8	33.166666666666664	0.053060794799115	0.291022534714547	0.18232538195422	-0.237961739915432	0.0273306650321313	0.156936710502652	NaN	NaN	0.174918505382035	0.173698667976906	30	0	970	0.97	0.03	0.06
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT:ACACAACTA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.25000000000003	8	33	0.0529436946379863	0.292820423057718	0.180806017849208	-0.239876728419732	0.0269930404992193	0.160037093581133	NaN	NaN	0.166437780723062	0.149516991022814	34	0	966	0.966	0.034	0.068
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TAT	2	CAAATTACT:CAACTATCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333336	8	34.5	0.0545075207127158	0.277405622254096	0.196490324420276	-0.222898101541381	0.0279351746209965	0.144296993754065	NaN	NaN	0.159585185652134	0.162493487584511	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TAT	CGA	2	ATTACTACA:CTATCGACT	1:1	TRUE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333336	8	35.666666666666664	0.0410592825874941	0.266505540694197	0.154065399468027	-0.225446258106703	0.0248438520936821	0.14787456695504	NaN	NaN	0.146025079719934	0.122615650471292	26	0	974	0.974	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CGA	CAG	2	ACTACAGAC:TCGACTGAC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333336	8	36.166666666666664	0.0273067703935705	0.262094574111018	0.104186706215459	-0.234787803717448	0.0206863933933856	0.137041932697601	NaN	NaN	0.144231130652208	0.103554993199108	9	0	991	0.991	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT:ACTGACACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666669	8	36.33333333333332	0.0273690573365762	0.260656845281595	0.105000339841482	-0.233287787945019	0.0198220237965181	0.144294646889063	NaN	NaN	0.139719080908344	0.0949803792763392	14	1	985	0.985	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.08333333333336	8	36.66666666666666	0.0274944876870936	0.257828654327118	0.106638603683709	-0.230334166640025	0.0200572870826018	0.136653735497193	NaN	NaN	0.141125608274814	0.102653852816312	13	0	987	0.987	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT:ACTGGTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.4166666666667	8	36.33333333333332	0.0273690573365762	0.260656845281595	0.105000339841482	-0.233287787945019	0.0188598999230542	0.133299352501408	NaN	NaN	0.14114338197103	0.0983629109814601	10	0	990	0.99	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	CTG	2	GGTATTGAA:GGTGCTGAA	1:1	TRUE	0.916666666666667	0.75	1.33333333333333	0	0	0	2	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.9166666666667	8	35.83333333333332	0.0271830432683088	0.265018643484554	0.102570305661885	-0.237835600216245	0.0205739370160105	0.141046347619955	NA	NA	0.152688350806339	0.119315321753665	14	3	983	0.983	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	226	GAA	CTG	AAA	2	ATTGAAAAT:GCTGAAAAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.6666666666667	6	35.166666666666664	0.0269087157486763	0.193580949501978	0.13900497862989	-0.166672233753302	0.019791354534704	0.113709274593671	NA	NA	0.120097223095755	0.165194638672213	40	0	960	0.96	0.04	0.08
ORF3a	all	ss13	227	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	GCT	ATG	CTA	2	AATGCTACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CTA	CAT	2	GCTACATTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTAT:TTCATCTTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TAT	TCT	ATA	2	ATCTATAGC:ATCTTTAAC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	ATA	ACA	2	TATAGCAAG:TTTAACAAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCTT:AGCAAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	CTT	AGC	TTG	2	AAGCTTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC:GTTAAAGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCCA:AAAGATGTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	CCA	ACC	CA-	0	GACCCA---:GATGTG---	1:1	TRUE	0.5	0	1.5	1	0	0	2	1	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	NA	NA	0	CCA---CCG:GTG---GAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	ACC	0	---CCGAAT:---GACCAT	1:1	TRUE	1.08333333333333	0.666666666666667	1.25	0	0	1	2	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	ACC	ATG	2	CCGAATGTG:GACCATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTA	ATG	TAC	2	AATGTGCAA:CATGTACAA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TAC	AAA	2	GTACAAATA:GTGCAAATA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCT	GCT	CTT	2	GGCTCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CTT	CAG	2	TCTTCAGGA	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT:GTTGTAAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAT	CTA	ATC	2	GCTAATCCA:GTAAATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	CCA	ATC	CAG	2	AATCCAGCA:AATCCAGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	GCA	CAG	CAA	2	CCAGCAATG:CCAGTAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	ATG	CAA	TGG	2	GCAATGGAT:GTAATGGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	GAT	TGG	ATC	2	ATGGATCCA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATT	CAA	TTT	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGAG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAG	ATG	AGC	2	GATGAGCCG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCG	AGC	CGA	2	GAGCCGACG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CGA	CGA	2	CCGACGACG	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	TTG	CTT	TGT	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.5	6	32.08333333333332	0.115892704074692	0.215112484631514	0.538753965271775	-0.0992197805568221	0.050107606938365	0.101661133277804	NaN	NaN	0.104007561883542	0.340100352799441	137	0	863	0.863	0.137	0.274
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.83333333333333	7	32.41666666666666	0.117025173722032	0.254671378073331	0.459514432314162	-0.137646204351299	0.0535698588197926	0.122395031887622	0.410817620801089	0.2633380008349	0.128125350419145	0.282684257142247	101	0	899	0.899	0.101	0.202
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.16666666666666	7	32.74999999999999	0.11818004032857	0.251591206901637	0.469730408244254	-0.133411166573066	0.0533451105055554	0.119391508483494	0.43395230020917003	0.279053909893361	0.119642648971566	0.264815992339522	97	0	903	0.903	0.097	0.194
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA:TTTATGAGT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.33333333333331	7	32.58333333333333	0.117889187641809	0.253121833623	0.465740888308329	-0.135232645981191	0.0540663545414311	0.11671857964442	NaN	NaN	0.126702298722852	0.285824693042847	103	0	897	0.897	0.103	0.206
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATTT:ATGAGTATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.66666666666666	7	33.24999999999999	0.117311764843583	0.247109400847682	0.474736146990595	-0.129797636004099	0.0534292224628227	0.109914393913932	0.40770099385476	0.244252896847006	0.118693187781834	0.274149798827556	101	0	899	0.899	0.101	0.202
ORF3a	all	ss13	7	ATT	GAT	TTT	2	AGATTTTTT:AGTATTTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.33333333333331	7	33.58333333333333	0.100629159672279	0.244209971081393	0.412059995857992	-0.143580811409114	0.0473351140002089	0.120540617627274	NaN	NaN	0.113797215905405	0.207047697170766	74	0	926	0.926	0.074	0.148
ORF3a	all	ss13	8	TTC	TTT	TCA	2	ATTTTCACA:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.91666666666666	7	33.16666666666666	0.084696240393644	0.247845145848439	0.341730478939608	-0.163148905454795	0.0439228524205219	0.109647425294549	NaN	NaN	0.118941264075651	0.170164249318891	48	0	952	0.952	0.048	0.096
ORF3a	all	ss13	9	ACA	TCA	CAC	2	TTCACACTT:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.74999999999999	7	32.99999999999999	0.0837104884722512	0.249329979819956	0.335741768930874	-0.165619491347705	0.0447884929439148	0.115472661707613	0.311333169744089	0.280855174285642	0.11224311631559	0.140066744039978	41	0	959	0.959	0.041	0.082
ORF3a	all	ss13	10	CTT	CAC	TTA	2	ACACTTGGA:ACTCTTAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.24999999999999	7	33.49999999999999	0.0842991638602775	0.244928374228876	0.344178840551578	-0.160629210368599	0.0473396253580941	0.117121537415581	0.321449095041545	0.284299733057206	0.119095531949977	0.177419676278589	33	0	967	0.967	0.033	0.066
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TTA	GAT	2	CTTAGATCA:CTTGGATCA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.24999999999999	8	33.49999999999999	0.0842991638602775	0.287492986673213	0.293221635893673	-0.203193822812936	0.0447765909343749	0.123130342160628	0.242328958048016	0.226273197747728	0.129850677735681	0.117623521840674	18	0	982	0.982	0.018	0.036
ORF3a	all	ss13	12	TCA	GAT	CAA	2	AGATCAATT:GGATCAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.33333333333333	7	33.99999999999999	0.0842004764033108	0.240680790060076	0.349842945015652	-0.156480313656765	0.0441878217928124	0.108460131455846	NaN	NaN	0.114631220617273	0.172229204014213	37	0	963	0.963	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	13	ATC	CAA	TCA	2	TCAATCACA:TCAATTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.33333333333333	8	33.99999999999999	0.0842004764033108	0.282358178426184	0.298204489321435	-0.198157702022873	0.0452573847645469	0.134444764195351	0.246076619414461	0.22557519097831	0.126302502083207	0.116668093168801	26	0	974	0.974	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	14	ACA	TCA	CAC	2	ATCACACGT:ATTACTGCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75	8	33.83333333333333	0.0845966206090083	0.284049034433322	0.297824003442852	-0.199452413824313	0.0460052577909397	0.128327722850516	0.255422363380009	0.243612027201436	0.12468558766815	0.109677827867656	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	15	CGT	CAC	CAC	2	ACACGTCAA:ACTGCACAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.5	8	33.33333333333333	0.0840037937823711	0.289246860608989	0.290422491035883	-0.205243066826617	0.0438251236340547	0.126970672358602	0.221904059672826	0.190610569590507	0.135938956557059	0.131089902079878	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	16	CAA	CAC	AAC	2	CGTCAACCA:GCACAGCCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.16666666666666	8	33.66666666666666	0.0551973146854054	0.285760509183	0.193159351665549	-0.230563194497595	0.033705499232182	0.12801239559118	0.148569100339036	0.193555939093024	0.117301160990261	0.0493487443916658	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	17	CCA	AAC	CAA	2	CAACCAAGT:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75	9	33.83333333333333	0.0553246126797069	0.328506491880477	0.168412539925805	-0.27318187920077	0.0331242160795355	0.139955802912832	0.138235869984444	0.223110595946131	0.135056770093639	0.0431021388819049	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	18	AGT	CAA	GTA	2	CCAAGTAAG:CCAGTAAAA	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	2	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.25	9	34.24999999999999	0.0551338852123344	0.323508417071989	0.170424886348678	-0.268374531859654	0.0338242171804488	0.133554854884321	0.135266429563898	0.207698205979929	0.13207868352672	0.0421608254064544	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	19	AAA	GTA	AAA	2	AGTAAGATT:GTAAAAATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.83333333333333	8	34.416666666666664	0.0412002891133781	0.278218809519287	0.148085922675627	-0.237018520405909	0.0246105588818665	0.130083756975225	0.156503366930611	0.344038645852853	0.125043167582872	0.0580270425029785	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	20	ATT	AAA	TTG	2	AAAATTGAC:AAGATTGAA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333333	8	33.49999999999999	0.0405047802473168	0.287492986673213	0.14088962905157	-0.246988206425896	0.0226335412750079	0.126586128456893	0.144099913765069	0.328211929932193	0.146252767855926	0.0912623095498393	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	21	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT:ATTGACAAT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666667	8	33.83333333333333	0.0405961546323978	0.284049034433322	0.142919530472572	-0.243452879800924	0.0239173203341133	0.116351392250092	0.145893038381786	0.327274432089724	0.124888408784177	0.0512520549055426	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	22	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75	8	33.91666666666666	0.0271522864979704	0.283201052715922	0.0958763614668015	-0.256048766217952	0.0189402123541309	0.121734181075918	0.116145533365274	0.409096462057742	0.124620873432199	0.0399155461073144	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTT	2	AATGCTTCT:AATGCTTTT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666667	8	33.58333333333333	0.0272757331281561	0.286624098210084	0.0951620373111968	-0.259348365081928	0.0189443697519558	0.126563719220231	0.122251222122742	0.436325110959808	0.126188385574058	0.0398551044914724	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	24	TCT	CTT	CTC	2	GCTTCTCCT:GCTTTTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74	9	34.41666666666666	0.0275260251378209	0.321552160019395	0.0856036082486917	-0.294026134881574	0.01877654647997	0.133485840613937	NaN	NaN	0.140455558858153	0.0363157054218593	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCA:TTTCTTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74	9	34.08333333333333	0.0136367393123929	0.325488997542435	0.0418961605933085	-0.311852258230042	0.0137790168393668	0.131639552691086	0.0651623571268744	0.520256314313739	0.136960127376199	0.0227888207941082	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAGT:CTTGCAAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75	8	33.99999999999999	0.0134986770919624	0.282358178426184	0.0478069279494638	-0.268859501334222	0.0134540611088227	0.126276224394055	0.0793499829402487	0.546853412371459	0.130769614244224	0.0397845989428345	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	27	AGT	CAA	GTA	2	GCAAGTACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.08333333333334	8	33.66666666666666	0.0134382094503063	0.285760509183	0.0470261250888957	-0.272322299732694	0.0134845429934026	0.127809548180467	0.0735484627158193	0.522569486965442	0.131517696639413	0.038394942647222	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	28	ACT	GTA	CTG	2	AGTACTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.41666666666669	8	34.33333333333333	0.013559691378237	0.27903683339124	0.0485946289364058	-0.265477142013003	0.0142582266974058	0.120042227305668	0.0772200948211646	0.529152474153544	0.121959652652556	0.029498326856282	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	29	GTT	CTG	TTC	2	ACTGTTCAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.91666666666669	8	33.5	0.0132893842388272	0.287492986673213	0.0462250728012817	-0.274203602434386	0.0129633018447455	0.128568414685449	0.0642701487644506	0.471998703116669	0.131728151104725	0.0373802129403731	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	GTTCATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.58333333333336	8	32.666666666666664	0.0131726767040263	0.29648455248311	0.0444295549083512	-0.283311875779084	0.0126780056163513	0.128398245145468	NA	NA	0.133310504688219	0.0335696832830234	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA:CATGCTACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.4166666666667	8	33.33333333333333	0.0133782811395161	0.289246860608989	0.0462521221884626	-0.275868579469472	0.013656595381271	0.121744156566866	0.0736063870572087	0.529760902083864	0.127975945080974	0.0311126944906782	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.9166666666667	8	33.33333333333333	0.0132893842388272	0.289246860608989	0.0459447829817317	-0.275957476370161	0.0133765775814023	0.125057616325625	0.0651524965983093	0.480693016886457	0.124192840807529	0.0262827701004049	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.75000000000003	8	33.16666666666666	0.0131438194165355	0.291022534714547	0.0451642668476783	-0.277878715298012	0.0129541814361743	0.127831773624871	0.0830836791885032	0.586716935076777	0.123280688286006	0.0241941044514682	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	34	ACG	CAA	CGA	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.25000000000003	8	32.99999999999999	0.0130580012294226	0.292820423057718	0.044593888271409	-0.279762421828295	0.0132034267721525	0.119637977857214	0.0865691032755239	0.606465843898094	0.125693544624068	0.026030923676822	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CGA	TAC	2	ACGATACCG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333337	8	32.16666666666666	0.0130438070339019	0.30215833840741	0.0431687806553745	-0.289114531373508	0.0133034380954519	0.143456859542344	0.0561657121001394	0.44213276850832	0.131042503613752	0.0273654279781944	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	36	CCG	TAC	CGC	2	ATACCGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000003	8	31.16666666666666	0.0130155110198637	0.314193196111627	0.0414251841890286	-0.301177685091763	0.0132161965759763	0.161457316822918	0.0631573766818968	0.511885810894394	0.152312575918335	0.0480002919960305	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	37	CTA	CGC	TAC	2	CCGCTACAA	2	FALSE	1	1	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.75000000000003	8	30.66666666666666	0.0129732964431592	0.320583011120205	0.0404678226641736	-0.307609714677045	0.0132369601803766	0.132468146246901	0.0683754713239656	0.553952997271713	0.1459284490598	0.0350354091709552	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	CTACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.9166666666667	8	31.333333333333325	0.0129453051997499	0.312120297918684	0.0414753711503971	-0.299174992718934	0.0126203127052506	0.138505819528343	0.0645744936263215	0.520686719143542	0.136262419298402	0.0281220452604195	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.58333333333337	8	31.99999999999999	0.0130014090011593	0.304098831081123	0.0427538933804418	-0.291097422079964	0.0129134579251279	0.144159181808784	0.062368474839391	0.493025387131572	0.134069638650879	0.0299130014205334	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	40	TCA	CCT	CAC	2	GCCTCACTC:GCCTCATTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.58333333333337	8	31.99999999999999	0.0130014090011593	0.304098831081123	0.0427538933804418	-0.291097422079964	0.0131904543810305	0.137143700651498	0.0678303551120054	0.528494267271549	0.135545116015409	0.0317451166809773	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	41	CTC	CAC	TCC	2	TCACTCCCT:TCATTCTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.25000000000003	8	31.666666666666657	0.0128896835290581	0.308056623906756	0.0418419294660568	-0.295166940377698	0.0128452252169704	0.138370984103152	0.0985455982230097	0.671132225711297	0.136811693134354	0.0309691664202052	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TCC	CTT	2	CTCCCTTTC:TTCTCTTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.58333333333337	7	31.999999999999993	0.0130014090011593	0.258630364718797	0.0502702341826547	-0.245628955717638	0.0127128937170874	0.124195222007603	NaN	NaN	0.117573462968724	0.0366939505320893	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCC	2	CCTTTCGGA:TCTTTCCGA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.416666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.9166666666667	6	31.666666666666657	0.0129453051997499	0.218397760919419	0.0592739831454879	-0.205452455719669	0.0126749399348116	0.104976421337359	NA	NA	0.109907776839516	0.0615787495996206	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	44	CGA	TCC	GAT	2	TTCCGATGG:TTCGGATGG	1:1	FALSE	1	1	0.75	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.6666666666667	6	30.999999999999993	0.0128208250194751	0.223869741416997	0.0572691286384879	-0.211048916397522	0.0128858247750898	0.109917387488821	NaN	NaN	0.105981578495454	0.0464398305480478	6	1	993	0.993	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	CGATGGCTT:GGATGGCTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.33333333333337	6	30.916666666666657	0.0127121687353299	0.224573223705648	0.0566058968454403	-0.211861054970318	0.0126694905011181	0.104313038107338	NaN	NaN	0.10869607376914	0.0512817947240585	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTG	2	TGGCTTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.6666666666667	6	30.583333333333325	0.0128208250194751	0.227432270381152	0.0563720574832618	-0.214611445361677	0.0126960419292833	0.112912613292475	NaN	NaN	0.11967839563579	0.0729354125074144	5	1	994	0.994	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	47	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.08333333333336	6	30.16666666666666	0.012752698321938	0.231110927283054	0.055179988552939	-0.218358228961116	0.0129224428861516	0.112139754032514	0.0996602256783295	0.579797076649087	0.108598988032223	0.0443588632942359	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	GTTATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.4166666666667	6	29.66666666666666	0.0256161505491714	0.235686824877377	0.108687240207419	-0.210070674328206	0.0182236981582522	0.124597565476311	NaN	NaN	0.113789470426985	0.064872669345251	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000003	6	30.333333333333325	0.0260047718198447	0.229625165344413	0.113248788654503	-0.203620393524568	0.0180391687746797	0.111156854177479	NaN	NaN	0.119510875805636	0.0884219556564452	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.4166666666667	6	31.16666666666666	0.0262896575662818	0.222476012792921	0.118168503814171	-0.196186355226639	0.0181132002033626	0.108039467805362	NaN	NaN	0.106431005556338	0.065282365704938	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAC	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	6	30.5	0.026061253903872	0.228158530802244	0.114224323816586	-0.202097276898372	0.0182611414025621	0.107613906677749	NaN	NaN	0.110631136101976	0.0677348526842018	11	1	988	0.988	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	52	CTT	CAC	TTC	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000001	6	31.333333333333336	0.0394828001140665	0.221099655165484	0.178574679750248	-0.181616855051417	0.0220197302129118	0.108310586043376	NaN	NaN	0.112780131222196	0.10731881765692	18	0	982	0.982	0.018	0.036
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TTC	TTG	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	5	31.583333333333336	0.0394395350433882	0.177819473768805	0.221795364745406	-0.138379938725417	0.0219293392455372	0.091738577801412	NaN	NaN	0.096443075536439	0.151334008086919	43	1	956	0.956	0.043	0.086
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.41666666666669	5	31.250000000000004	0.0528271104098974	0.179963002222943	0.293544282754595	-0.127135891813046	0.025641302536101	0.0916724915414056	NaN	NaN	0.0972820326112475	0.19125364752946	60	0	940	0.94	0.06	0.12
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.25000000000003	5	31.083333333333336	0.0522518101768581	0.181054357970061	0.288597362486566	-0.128802547793203	0.0267529936058599	0.0889532113911935	NaN	NaN	0.0989340541583777	0.192949526484947	59	0	941	0.941	0.059	0.118
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.58333333333336	5	30.416666666666668	0.0513569565272317	0.185556129985381	0.276773160397762	-0.134199173458149	0.0262421276255189	0.0900656641851295	NaN	NaN	0.102212437693134	0.189201928822591	55	1	944	0.944	0.055	0.11
ORF3a	all	ss13	57	CAA	TTC	AAA	2	TTTCAAAGC:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.25000000000003	5	30.416666666666668	0.0515777829948789	0.185556129985381	0.277963239473374	-0.133978346990502	0.0251387018273028	0.0904328727039241	NaN	NaN	0.100985313535489	0.184604233026311	55	0	945	0.945	0.055	0.11
ORF3a	all	ss13	58	AGC	AAA	GCG	2	CAAAGCGCT:CAGAGCGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.33333333333336	5	30.666666666666668	0.0521949688493964	0.183841843524739	0.283912344701726	-0.131646874675342	0.0259384067580566	0.0950055126658445	NaN	NaN	0.0997091058596084	0.186731721892885	56	0	944	0.944	0.056	0.112
ORF3a	all	ss13	59	GCT	GCG	CTA	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.1666666666667	6	31.333333333333336	0.0530021800130169	0.221099655165484	0.239720771944882	-0.168097475152467	0.0266291460031731	0.101345312681933	NaN	NaN	0.113147425382703	0.137371716202221	30	0	970	0.97	0.03	0.06
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.33333333333337	6	31.166666666666664	0.0528853382457436	0.222476012792921	0.237712540699697	-0.169590674547178	0.025843241918194	0.106625481270138	NaN	NaN	0.10941681518637	0.121153337810358	32	0	968	0.968	0.032	0.064
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CCA	AAA	2	ACCAAAATA:TCCAAAGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.33333333333337	5	30.166666666666664	0.0521949688493964	0.187302855665743	0.27866616696193103	-0.135107886816347	0.0260667480898495	0.0918890335600788	NA	NA	0.0989752240517932	0.172231755789518	49	0	951	0.951	0.049	0.098
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATT:AAAGTAATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.6666666666667	5	29.833333333333332	0.0533558250189307	0.189683904532547	0.281288099538121	-0.136328079513617	0.0261299897378171	0.0964562340604394	NaN	NaN	0.10452747941522	0.19215450545438	57	0	943	0.943	0.057	0.114
ORF3a	all	ss13	63	ATT	TAA	TTG	2	ATAATTGCG:GTAATTGCG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.33333333333336	4	29.5	0.0528853382457436	0.149561992614941	0.353601455296875	-0.0966766543691975	0.0259152475620797	0.0806939864623757	NaN	NaN	0.0875502133687486	0.269488018200326	106	0	894	0.894	0.106	0.212
ORF3a	all	ss13	64	GCG	TTG	CGC	2	ATTGCGCTC:ATTGCGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.50000000000001	4	29.833333333333332	0.0527690107059348	0.147714914296514	0.357235496207305	-0.0949459035905793	0.0266573397970239	0.0796035678907514	NaN	NaN	0.0888984928080191	0.285508774098675	124	0	876	0.876	0.124	0.248
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CGC	TCA	2	GCGCTCAAT:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.66666666666669	5	30.166666666666668	0.0526531940049364	0.187302855665743	0.281112606734092	-0.134649661660807	0.0257463705956519	0.0929288114722873	NaN	NaN	0.0997874693790159	0.177219940264888	52	0	948	0.948	0.052	0.104
ORF3a	all	ss13	66	AAT	TCA	ATA	2	CTCAATAAA:CTTCATAAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.33333333333336	5	29.166666666666668	0.0521949688493964	0.194633396613813	0.26817067244097	-0.142438427764417	0.0267202214317995	0.100553079219936	NaN	NaN	0.103998351909181	0.170804937380754	55	0	945	0.945	0.055	0.11
ORF3a	all	ss13	67	AAA	ATA	AAA	2	AATAAAAGA:CATAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.00000000000001	4	28.5	0.0517446536152136	0.155392217528976	0.332993855406978	-0.103647563913762	0.0252921452385869	0.0823267505760745	NaN	NaN	0.0937539217942944	0.268930969058471	113	0	887	0.887	0.113	0.226
ORF3a	all	ss13	68	AAG	AAA	AGT	2	AAAAGATGG:AAGAAGTGG	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.16666666666669	4	28.083333333333332	0.0788471565774535	0.157958351375552	0.499164215698806	-0.079111194798098	0.0377771260353253	0.0875163361212648	NaN	NaN	0.0967830912874134	0.413695767509872	178	0	822	0.822	0.178	0.356
ORF3a	all	ss13	69	TGG	AGT	GGC	2	AAGTGGCAG:AGATGGCAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.58333333333334	4	28.083333333333332	0.0794568138723562	0.157958351375552	0.503023823561217	-0.0785015375031953	0.038401016692954	0.0846513743181546	NaN	NaN	0.0965613380086309	0.416234863475296	189	0	811	0.811	0.189	0.378
ORF3a	all	ss13	70	CAG	GGC	AGC	2	TGGCAGCTA:TGGCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.58333333333334	4	28.75	0.0948273658335069	0.153892310773211	0.616193007675692	-0.0590649449397036	0.0408863440266788	0.0850524753166867	NaN	NaN	0.0959449689335224	0.538150142767319	260	1	739	0.739	0.26	0.52
ORF3a	all	ss13	71	CTA	AGC	TAG	2	CAGCTAGCC:CAGCTTGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.5	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.25	5	28.75	0.109910568819637	0.197860943283853	0.555494010063213	-0.0879503744642156	0.0453865590745868	0.0966241457671333	NaN	NaN	0.106306018984312	0.408048894172898	196	0	804	0.804	0.196	0.392
ORF3a	all	ss13	72	GCC	TAG	CCC	2	CTAGCCCTT:CTTGCCTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.08333333333334	5	28.583333333333332	0.108664266868125	0.199182311241132	0.545551792179853	-0.0905180443730069	0.0416787283481578	0.103568799429354	NaN	NaN	0.104927445281494	0.388317436688522	191	0	809	0.809	0.191	0.382
ORF3a	all	ss13	73	CTT	CCC	TAT	2	GCCCTTTAT:GCCTTATAC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.08333333333334	5	28.75	0.108664266868125	0.197860943283853	0.549195132018722	-0.0891966764157284	0.0439057677250787	0.0962083881153367	NaN	NaN	0.106539664310038	0.402471351027131	201	0	799	0.799	0.201	0.402
ORF3a	all	ss13	74	TAC	TAT	ACA	2	CTTTATAAG:TTATACAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.08333333333334	4	28.583333333333336	0.123424890893523	0.154888999008431	0.796860278545704	-0.0314641081149074	0.0472112460513564	0.0879712767648148	NaN	NaN	0.094778123010782	0.739907015419677	371	1	628	0.628	0.371	0.742
ORF3a	all	ss13	75	AAA	ACA	AAG	2	TACAAAGGC:TATAAGGGC	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.25000000000001	4	28.416666666666668	0.123142795706581	0.155898728322134	0.789889674097476	-0.0327559326155526	0.0454064031754396	0.0837262660775799	NaN	NaN	0.0965069649748212	0.73429695552567	367	0	633	0.633	0.367	0.734
ORF3a	all	ss13	76	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTT:AAGGGCTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.83333333333334	4	28.166666666666668	0.125582619575832	0.157438341821211	0.79766223477153	-0.0318557222453799	0.0463802873584783	0.0864391244806155	NaN	NaN	0.0949742196782111	0.737312496240367	390	0	610	0.61	0.39	0.78
ORF3a	all	ss13	77	TTC	GCT	TCC	2	GGCTTCCAG:GGCTTTCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.83333333333334	4	27.833333333333336	0.125582619575832	0.159539275483744	0.787158016075028	-0.0339566559079127	0.0475469535370162	0.0867790169414178	NaN	NaN	0.0977323696465258	0.728256779739617	386	1	613	0.613	0.386	0.772
ORF3a	all	ss13	78	CAA	TCC	AAT	2	TTCCAGTTC:TTTCAATTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.33333333333334	4	27.166666666666668	0.12471051706475	0.163914658204208	0.760825898251169	-0.0392041411394582	0.0448856008717791	0.0912100468224817	NaN	NaN	0.102257221175388	0.701432464686394	344	1	655	0.655	0.344	0.688
ORF3a	all	ss13	79	TTA	AAT	TAG	2	CAATTAGTT:CAGTTCATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.16666666666667	4	27.666666666666668	0.124999865819317	0.160610991304224	0.778277157772759	-0.0356111254849071	0.0474293614147815	0.0891021149201918	NaN	NaN	0.0976386989408234	0.715317834118631	347	0	653	0.653	0.347	0.694
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TAG	TTT	2	TTAGTTTGT:TTCATTTGC	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.5	4	28.5	0.126170845288571	0.155392217528976	0.811950864045325	-0.0292213722404048	0.0468737005811288	0.0834768003357807	NaN	NaN	0.0910666558663313	0.74830213218013	377	2	621	0.621	0.377	0.754
ORF3a	all	ss13	81	TGC	TTT	GCA	2	ATTTGCAAT:GTTTGTAAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.16666666666666	4	28.166666666666668	0.124999865819317	0.157438341821211	0.793960761866178	-0.0324384760018947	0.0486199410313182	0.0869290499258255	NaN	NaN	0.100010073387002	0.745671489716568	394	0	606	0.606	0.394	0.788
ORF3a	all	ss13	82	AAC	GCA	ACT	2	TGCAATTTA:TGTAACTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.99999999999999	4	28.833333333333336	0.125290563497375	0.153398778089708	0.816763764728976	-0.0281082145923333	0.047390443674117	0.0842468206605249	NaN	NaN	0.0934476277052854	0.76357379660631	376	1	623	0.623	0.376	0.752
ORF3a	all	ss13	83	TTA	ACT	TAC	2	AACTTGCTG:AATTTACTG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.5	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.99999999999999	4	28.833333333333336	0.125290563497375	0.153398778089708	0.816763764728976	-0.0281082145923333	0.0470122522348226	0.0854262669227841	NaN	NaN	0.0913399481442811	0.758286354130192	375	1	624	0.624	0.375	0.75
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TGC	2	TTACTGCTG:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.25	1	0	0.75	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.33333333333333	4	28.666666666666668	0.12471051706475	0.154389040653112	0.807767938301756	-0.0296785235883616	0.0461977577636898	0.080661034193247	NaN	NaN	0.0937694290424772	0.751618984207614	408	1	591	0.591	0.408	0.816
ORF3a	all	ss13	85	CTA	TGC	TAC	2	CTGCTACTC:CTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.75	4	29.666666666666668	0.123992985319038	0.148632696437812	0.834224153168861	-0.0246397111187739	0.0466250760756031	0.0784079112192937	NaN	NaN	0.0936241454230235	0.792414244716143	378	0	622	0.622	0.378	0.756
ORF3a	all	ss13	86	CTA	TAC	TAT	2	CTACTCTTT:CTGCTATTT	1:1	FALSE	1.25	1	0.5	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.91666666666667	4	30	0.123708284429487	0.146808432844572	0.842651079590635	-0.0231001484150841	0.0470346816781296	0.0762168078862614	NaN	NaN	0.0895886890971916	0.796525216409138	393	0	607	0.607	0.393	0.786
ORF3a	all	ss13	87	TTT	TAT	TTG	2	CTATTTGTT:CTCTTTGTG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	78.83333333333334	4	31	0.123850470889023	0.141595553474679	0.874677684784575	-0.0177450825856562	0.0461423923704623	0.076095778642245	NaN	NaN	0.0895096978017942	0.842851348628798	453	0	547	0.547	0.453	0.906
ORF3a	all	ss13	88	GTG	TTG	TGA	2	TTTGTGACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80	4	30.000000000000004	0.121889197123331	0.146808432844571	0.830260188475531	-0.0249192357212402	0.0447119069192018	0.0788556931088739	NaN	NaN	0.0889774043360564	0.779429542283073	382	0	618	0.618	0.382	0.764
ORF3a	all	ss13	89	ACA	TGA	CAA	2	GTGACAATT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.83333333333334	4	30.166666666666668	0.12216555897624	0.145913043990275	0.837249060367642	-0.0237474850140348	0.0454796615620642	0.0772281637627703	NaN	NaN	0.0925888878751693	0.797577828134764	399	0	601	0.601	0.399	0.798
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CAA	TCT	2	ACAATTTAT:ACCATCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.5	4	29.833333333333336	0.121067579367254	0.147714914296514	0.819602948990173	-0.0266473349292605	0.0457390139997247	0.0779646278227804	NaN	NaN	0.086588675133813	0.758275469180674	379	0	621	0.621	0.379	0.758
ORF3a	all	ss13	91	TAT	TCT	ATT	2	ATCTATTCA:ATTTATTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.16666666666666	5	29.666666666666668	0.12161408554722	0.19089739885116	0.637065178881982	-0.0692833133039408	0.0453137624526385	0.0975253985002593	NaN	NaN	0.108391903336112	0.522697580755826	244	0	756	0.756	0.244	0.488
ORF3a	all	ss13	92	TCA	ATT	CAC	2	TATTCACAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.16666666666666	5	29.666666666666668	0.12161408554722	0.19089739885116	0.637065178881982	-0.0692833133039408	0.047092718428096	0.0952676080073944	NaN	NaN	0.106114901939483	0.513815318326165	226	0	774	0.774	0.226	0.452
ORF3a	all	ss13	93	CAT	CAC	ATC	2	TCACATCTT:TCACATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.5	5	29.000000000000004	0.119457200757053	0.195911624447713	0.609750447906346	-0.0764544236906602	0.0442205368308194	0.100680155689968	NaN	NaN	0.107885118203064	0.478532295010469	221	0	779	0.779	0.221	0.442
ORF3a	all	ss13	94	CTT	ATC	TTC	2	CATCTTTTG:CATTTTCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.16666666666667	5	28.666666666666668	0.119989202138919	0.198519415670312	0.604420488211536	-0.078530213531393	0.0461582122087709	0.101786370543584	NaN	NaN	0.112396749207047	0.484747292823778	213	0	787	0.787	0.213	0.426
ORF3a	all	ss13	95	CTA	TTC	TAC	2	CTTTTGCTT:TTTCTACTT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.16666666666667	4	29.000000000000004	0.119989202138919	0.152421181209951	0.787221311279831	-0.0324319790710327	0.0449515327544061	0.0825816302365001	NaN	NaN	0.0913753314620645	0.722640945232502	396	0	604	0.604	0.396	0.792
ORF3a	all	ss13	96	CTT	TAC	TTG	2	CTACTTTTA:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1.08333333333333	1	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.16666666666667	4	30.000000000000004	0.12161408554722	0.146808432844571	0.828386239065534	-0.0251943472973518	0.045824195462451	0.0806800464154925	NaN	NaN	0.093804394255409193	0.788249925681336	404	0	596	0.596	0.404	0.808
ORF3a	all	ss13	97	GTC	TTG	TAG	2	CTTGTCGCT:CTTTTAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.25000000000001	4	30.416666666666664	0.121476995958792	0.144590316625212	0.84014613698972	-0.0231133206664197	0.0457043576353873	0.0808071258370251	NaN	NaN	0.0888077930858764	0.794661449439361	376	0	624	0.624	0.376	0.752
ORF3a	all	ss13	98	GCT	TAG	CTG	2	GTCGCTGCA:TTAGCTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.25000000000001	4	30.583333333333332	0.106966265210453	0.143721781908901	0.744259247204811	-0.0367555166984484	0.042307517152631	0.0734040811771007	NaN	NaN	0.0865874825203105	0.671208528359855	323	0	677	0.677	0.323	0.646
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.75000000000001	4	29.583333333333336	0.104859684055263	0.149095891727942	0.703303644654422	-0.0442362076726795	0.0446697236865478	0.0766997294310237	NaN	NaN	0.092280740400444	0.631678598498772	315	0	685	0.685	0.315	0.63
ORF3a	all	ss13	100	GGC	CAG	GCA	2	GCAGGTATG:GCTGGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	82.91666666666669	4	29.416666666666664	0.103277820283538	0.150031026615648	0.688376415287197	-0.0467532063321103	0.0427026658942995	0.084011990639022	NaN	NaN	0.0936121463109635	0.617472786579859	298	0	702	0.702	0.298	0.596
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GCA	TGG	2	GGCATTGAG:GGTATGGAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.25	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	83.25000000000003	4	29.749999999999996	0.102834601347038	0.148172379571929	0.694020043709415	-0.0453377782248908	0.0419783043630898	0.0810720537800001	NaN	NaN	0.0877610360058447	0.605432018361995	319	0	681	0.681	0.319	0.638
ORF3a	all	ss13	102	GAG	TGG	AGG	2	ATGGAGGCG:ATTGAGGTG	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.333333333333333	0.583333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.83333333333336	4	29.41666666666666	0.089658862987337	0.150031026615649	0.597602142768951	-0.0603721636283115	0.0404750351570068	0.0829987420254413	NaN	NaN	0.0865664113192773	0.48554709282429	240	0	760	0.76	0.24	0.48
ORF3a	all	ss13	103	GCG	AGG	CGC	2	GAGGCGCAA:GAGGTGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.75000000000003	5	29.16666666666666	0.0897547785817448	0.194633396613814	0.461147881829519	-0.104878618032069	0.0376808813598572	0.104588581219514	NaN	NaN	0.113229125688289	0.354315429565391	139	0	861	0.861	0.139	0.278
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CGC	AAT	2	GCGCAATTT:GTGCAATTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.08333333333336	5	29.499999999999993	0.0759341342651253	0.192126605059278	0.395229667654289	-0.116192470794153	0.0400012320916719	0.0996568311875342	NaN	NaN	0.109600749103549	0.289079532017907	102	0	898	0.898	0.102	0.204
ORF3a	all	ss13	105	TTC	AAT	TCT	2	CAATTCTTG:CAATTTTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.08333333333336	5	29.83333333333333	0.0769083042436382	0.189683904532547	0.405455088206716	-0.112775600288909	0.0382426202063137	0.100416284814268	NaN	NaN	0.104566149490863	0.280806381877753	97	0	903	0.903	0.097	0.194
ORF3a	all	ss13	106	TTG	TCT	TGT	2	TTCTTGTAC:TTTTTGTAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.4166666666667	5	29.499999999999993	0.0765808130596598	0.192126605059278	0.398595566897316	-0.115545791999618	0.0372639105466091	0.100947467718581	NaN	NaN	0.111527024294594	0.300186268698428	91	0	909	0.909	0.091	0.182
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TGT	ACA	2	TTGTACATC:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.4166666666667	5	30.16666666666666	0.0775717695799524	0.187302855665743	0.414151558470552	-0.109731086085791	0.0367547953383722	0.094546019009074	NaN	NaN	0.103787618649338	0.290390356695225	100	0	900	0.9	0.1	0.2
ORF3a	all	ss13	108	ATC	ACA	TCT	2	TACATCTAT:TACCTCTAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.4166666666667	5	30.66666666666666	0.0775717695799524	0.183841843524739	0.421948388314078	-0.106270073944786	0.0372815355859574	0.0968164376293358	NaN	NaN	0.101443181297519	0.294831128763125	108	1	891	0.891	0.108	0.216
ORF3a	all	ss13	109	TAT	TCT	ATG	2	ATCTATGCT:CTCTATGCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.58333333333336	4	30.66666666666666	0.0774048314449127	0.143291427572032	0.540191641303885	-0.0658865961271192	0.0360375726994273	0.0827248548276115	NaN	NaN	0.0884405126168022	0.456282559413137	194	0	806	0.806	0.194	0.388
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ATG	CCT	2	TATGCCTTG:TATGCTTTG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.58333333333336	4	30.66666666666666	0.0774048314449127	0.143291427572032	0.540191641303885	-0.0658865961271192	0.038073164746309	0.0851595390604818	NaN	NaN	0.0862821845548688	0.445095147945857	206	0	794	0.794	0.206	0.412
ORF3a	all	ss13	111	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGATA:GCTTTGATT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.25000000000003	4	30.999999999999993	0.0777394299845026	0.141595553474679	0.549024514377878	-0.0638561234901766	0.0369468221258041	0.0798855046043021	NaN	NaN	0.086797681287099	0.461919816166633	209	1	790	0.79	0.209	0.418
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TGA	TAT	2	TTGATATAT:TTGATTTAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.08333333333336	4	31.16666666666666	0.0759341342651253	0.140762624951505	0.539448126171886	-0.0648284906863797	0.0371863613616318	0.0812847821232816	NaN	NaN	0.0882109476559189	0.462384757759699	211	0	789	0.789	0.211	0.422
ORF3a	all	ss13	113	TAT	TAT	ATA	2	ATATATTTT:ATTTATATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.4166666666667	4	32.16666666666666	0.0756148767114708	0.135964367940317	0.55613744878116	-0.0603494912288461	0.0372591256795755	0.0798513050531468	NaN	NaN	0.0835698008553621	0.470205500289603	197	0	803	0.803	0.197	0.394
ORF3a	all	ss13	114	ATT	ATA	TTC	2	TATATTCTG:TATTTTCTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.08333333333337	4	32.49999999999999	0.0759341342651253	0.134437018317738	0.564830544557727	-0.0585028840526131	0.0371336213282288	0.0748131109115304	NaN	NaN	0.0836165656737753	0.484141771208002	200	0	800	0.8	0.2	0.4
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TTC	TAC	2	ATTCTGCAA:TTTCTACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.25000000000004	3	32.83333333333333	0.0767442089720042	0.0974341006801572	0.787652458803199	-0.020689891708153	0.0374168297840146	0.0628161923788937	NaN	NaN	0.0720229294944813	0.773907029262073	397	1	602	0.602	0.397	0.794
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAA	2	CTACAATGC:CTGCAAATT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.9166666666667	3	33.16666666666666	0.0760947770152294	0.0963891381007338	0.789453858750191	-0.0202943610855044	0.0362980181377553	0.0615217578492772	NaN	NaN	0.0683777274929449	0.766620862886749	371	1	628	0.628	0.371	0.742
ORF3a	all	ss13	117	ATT	AAA	GCA	2	CAAATTTTA:CAATGCATC	1:1	TRUE	2.08333333333333	0.583333333333333	0.333333333333333	0	2	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.58333333333336	3	33.83333333333333	0.0774048314449127	0.0943651299007743	0.820269431370513	-0.0169602984558616	0.0377859418487733	0.0581844944814128	NaN	NaN	0.0676146173014821	0.801939554292104	398	0	602	0.602	0.398	0.796
ORF3a	all	ss13	118	ATC	GCA	TAA	2	ATTTTAAGC:TGCATCAAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.5	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.50000000000003	3	33.99999999999999	0.0507593239355005	0.0938723572155045	0.54072706216348	-0.043113033280004	0.0265277719177849	0.0585755696580617	NA	NA	0.0581324216719848	0.458308566638482	236	0	764	0.764	0.236	0.472
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TAA	ACG	2	ATCAACGCA:TTAAGCTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.50000000000003	3	34.16666666666666	0.0377438129156367	0.0933847109044368	0.404175507426061	-0.0556408979888001	0.0217447191119221	0.0576900702350023	NA	NA	0.0576978801098241	0.33487093869365	140	3	857	0.857	0.14	0.28
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT:AGCTTTTGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.50000000000003	3	34.49999999999999	0.0252655469877565	0.0924244803179612	0.273364231000676	-0.0671589333302046	0.0182400929104934	0.0583036075038887	NA	NA	0.056520881824188	0.234748898553647	69	12	919	0.919	0.069	0.138
ORF3a	all	ss13	121	TGC	CAT	GCA	2	GCATGTAGA:TTTTGCAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000003	2	34.16666666666666	0.0125263872134486	0.0609472230590744	0.205528432383328	-0.0484208358456258	0.0126003171921243	0.0464891765504056	NA	NA	0.0482768667417468	0.315869471310156	105	48	847	0.847	0.105	0.21
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GCA	GAA	2	TGCAGATTT:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.66666666666669	3	34.83333333333332	0.0255343810572878	0.0914838201648647	0.279113629178054	-0.0659494391075768	0.0184543273097237	0.0552178580949174	NA	NA	0.0527258111179283	0.211007492542065	53	17	930	0.93	0.053	0.106
ORF3a	all	ss13	123	ATT	GAA	TTA	2	AGAATTATT:AGATTTATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.66666666666669	3	34.66666666666666	0.0255343810572878	0.0919517415692493	0.277693283689007	-0.0664173605119615	0.0187000786766585	0.0566539282911224	NA	NA	0.0526967350343598	0.207536078965461	58	20	922	0.922	0.058	0.116
ORF3a	all	ss13	124	ATC	TTA	TCA	2	ATTATTATG:TTTATCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.00000000000003	3	34.99999999999999	0.0126053387372859	0.0910206427532006	0.138488790630328	-0.0784153040159147	0.0123289671924156	0.0606481515720834	NA	NA	0.0530214927388693	0.139157876197281	0	45	955	0.955	0	0.001
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TCA	TGA	2	ATCATGAGA:ATTATGAGA	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.50000000000003	3	35.49999999999999	0.0126852918315464	0.0896588629873371	0.141483969446924	-0.0769735711557907	0.0130744573554989	0.0549183979610014	NA	NA	0.0507691780245132	0.129482015824648	0	37	963	0.963	0	0.001
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATGC:ATGAGATGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000003	3	35.83333333333332	0.0125263872134486	0.0887734500607747	0.14110510749411	-0.0762470628473261	0.0126703390463956	0.0556040427579812	NA	NA	0.0493120587268814	0.122052564112106	0	55	945	0.945	0	0.001
ORF3a	all	ss13	127	TGC	GAT	GCT	2	AGATGCTGG:AGATGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.50000000000003	3	36.16666666666666	0.0126852918315464	0.0879053734766805	0.144306216216822	-0.0752200816451341	0.0124221426328945	0.0525245194387704	NA	NA	0.050857712804057	0.139132303972213	0	48	952	0.952	0	0.001
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCTC:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.00000000000003	3	36.16666666666666	0.012766265677073	0.0879053734766805	0.145227364063923	-0.0751391077996075	0.0132277102884483	0.0527199137176285	NA	NA	0.0523343421199571	0.151073078104405	0	52	948	0.948	0	0.001
ORF3a	all	ss13	129	CTC	GGC	TCT	2	TGGCTCTGT:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.6666666666667	3	35.49999999999999	0.0128208250194751	0.0896588629873371	0.142995623547956	-0.0768380379678621	0.0133660525568929	0.0579626500425128	NA	NA	0.0536075678210239	0.151759807796016	0	46	954	0.954	0	0.001
ORF3a	all	ss13	130	TGT	TCT	GTT	2	CTCTGTTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.83333333333337	4	34.99999999999999	0.0126318775458731	0.123992985319038	0.101875743320244	-0.111361107773165	0.0127806089591046	0.0704117723391416	NA	NA	0.0658009321684022	0.0905708611906853	0	18	982	0.982	0	0.001
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GTT	GGA	2	TGTTGGAAG	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.6666666666667	4	34.66666666666666	0.0126585283405138	0.125290563497375	0.101033373840473	-0.112632035156861	0.0128488695546516	0.0719204119000671	NA	NA	0.0675274119772451	0.0953265690693588	0	17	983	0.983	0	0.001
ORF3a	all	ss13	132	AAG	GGA	AGT	2	TGGAAGTGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.33333333333337	4	34.66666666666666	0.0127121687353299	0.125290563497375	0.101461501812116	-0.112578394762045	0.0129319778401258	0.0697209456332377	NA	NA	0.0673194205336128	0.0944648054880972	0	19	981	0.981	0	0.001
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AGT	GCA	2	AAGTGCAAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.83333333333337	4	34.16666666666666	0.0126318775458731	0.127288788480472	0.0992379430794176	-0.114656910934599	0.0123362294017934	0.0689765584333793	NA	NA	0.0645287094764057	0.0755952857659861	0	23	977	0.977	0	0.001
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.6666666666667	4	34.16666666666666	0.0255343810572878	0.127288788480472	0.20060196473003	-0.101754407423184	0.0184923010451372	0.072241250326976	NA	NA	0.0702557203228368	0.147521041281089	25	10	965	0.965	0.025	0.05
ORF3a	all	ss13	135	TCC	AAT	CCA	2	AAATCCAAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.00000000000003	4	34.16666666666666	0.0257536031856687	0.127288788480472	0.202324206971454	-0.101535185294803	0.017746042321086	0.073260631152367	NA	NA	0.0690414327466905	0.141388137320283	22	5	973	0.973	0.022	0.044
ORF3a	all	ss13	136	AAG	CCA	AGA	2	TCCAAGAAC:TCCAAGAAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.00000000000003	4	34.83333333333332	0.0257536031856687	0.124638389543236	0.206626572118335	-0.0988847863575677	0.018809676280091	0.072265492753649	NA	NA	0.0670016255543646	0.139982412215993	27	4	969	0.969	0.027	0.054
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AGA	ACC	2	AAGAACCCA:AAGAATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.6666666666667	4	33.99999999999999	0.0255343810572878	0.127969137773073	0.199535462234401	-0.102434756715785	0.0188229477398355	0.0744369493081047	NA	NA	0.0703747034711374	0.145513689745373	26	8	966	0.966	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA:AATCCATTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.00000000000003	4	33.99999999999999	0.0257536031856687	0.127969137773073	0.20124854815649	-0.102215534587404	0.0182369105703482	0.0713718696841891	NA	NA	0.0694352106949637	0.140994027464571	22	5	973	0.973	0.022	0.044
ORF3a	all	ss13	139	TTA	CAT	TAC	2	CCATTACTT:CCATTATTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333337	4	34.16666666666666	0.0258089981982962	0.127288788480472	0.202759398580148	-0.101479790282176	0.0187665601072907	0.0675664716779179	NA	NA	0.0696917579859432	0.145358546821701	24	5	971	0.971	0.024	0.048
ORF3a	all	ss13	140	CTT	TAC	TAT	2	TTACTTTAT:TTATTATAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	1	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.50000000000003	4	35.16666666666666	0.0262608883838265	0.123354245726484	0.21289002441031	-0.0970933573426571	0.0190856460818436	0.0652076572813873	NA	NA	0.0637283301909757	0.127620926585196	26	4	970	0.97	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	141	TAT	TAT	ATG	2	CTTTATGAT:TTATATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.1666666666667	3	35.66666666666666	0.0263763446044989	0.089213957146024	0.295652669697484	-0.0628376125415251	0.0190328591510254	0.0552428496687743	NA	NA	0.0507506612027287	0.21565546989926	59	17	924	0.924	0.059	0.118
ORF3a	all	ss13	142	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGCC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.1666666666667	3	36.33333333333332	0.0263763446044989	0.0874776777943207	0.301520859601641	-0.0611013331898217	0.019149893876743	0.054960539058539	NA	NA	0.0521523780659614	0.241360714582433	80	22	898	0.898	0.08	0.16
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ATG	CCA	2	GATGCCAAC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333337	3	36.66666666666665	0.0264928206228062	0.0866346653413833	0.305799306991161	-0.0601418447185771	0.0185022611276899	0.0569339405666566	NA	NA	0.0499135149470029	0.22823378245459	75	14	911	0.911	0.075	0.15
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CCA	ACT	2	GCCAACTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000003	4	37.16666666666665	0.026434454296256	0.116173757560117	0.227542388672217	-0.0897393032638607	0.0182460800116128	0.0646338025160736	NA	NA	0.0630851458910748	0.154878009701621	35	6	959	0.959	0.035	0.07
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000003	4	37.16666666666665	0.026434454296256	0.116173757560117	0.227542388672217	-0.0897393032638607	0.018883453916039	0.0626039145159125	NA	NA	0.0613227499083653	0.143359782429407	37	9	954	0.954	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	146	TTT	ACT	TTG	2	TACTTTGTT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.1666666666667	4	36.999999999999986	0.0267288865855191	0.116739982283845	0.228960858675905	-0.090011095698326	0.0196572022731094	0.0673399239832801	NA	NA	0.0642252278202273	0.161067218207434	50	4	946	0.946	0.05	0.1
ORF3a	all	ss13	147	GTT	TTG	TTT	2	TTTGTTTGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.6666666666667	4	35.999999999999986	0.026551445288187	0.120256987556385	0.220789210071788	-0.0937055422681976	0.0182935257481003	0.0678665688586339	NA	NA	0.0637449656092237	0.141559872552372	37	2	961	0.961	0.037	0.074
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TTT	GCT	2	GTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.6666666666667	4	36.999999999999986	0.0269087157486763	0.116739982283845	0.230501283469872	-0.0898312665351687	0.0189630757056123	0.0644665919737095	NA	NA	0.0615961908388243	0.144733085391452	28	10	962	0.962	0.028	0.056
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC:TGCTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.6666666666667	4	37.16666666666665	0.0269087157486763	0.116173757560117	0.231624734482328	-0.0892650418114404	0.0180872098382855	0.0654042066307884	NA	NA	0.062382342516973	0.152449007933836	38	3	959	0.959	0.038	0.076
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA:TGGCATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.00000000000003	4	36.499999999999986	0.0267885619515594	0.118472334721436	0.22611660363195701	-0.0916837727698762	0.0190047950165444	0.0630586270870388	NA	NA	0.0597568555854259	0.124960683491244	25	7	968	0.968	0.025	0.05
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT:CATACATAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333336	4	36.499999999999986	0.0270299523623976	0.118472334721436	0.228154129197785	-0.091442382359038	0.0198959356755185	0.0671702940557211	NA	NA	0.0608201298882499	0.132713050330242	31	1	968	0.968	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	152	CAT	CAC	ATA	2	ACACATAAC:ACATATAAT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666669	4	35.66666666666665	0.0267288865855191	0.121476995958792	0.220032495655277	-0.094748109373273	0.0187081236441424	0.06853744005582	NA	NA	0.0659981086972738	0.151110912212741	27	6	967	0.967	0.027	0.054
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ATA	ACT	2	CATAACTAT:TATAATTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.83333333333336	3	36.66666666666665	0.0272138698048234	0.0866346653413833	0.314122178432701	-0.0594207955365599	0.0189623082679612	0.0542202886048069	NA	NA	0.050818735368673	0.242295081402798	72	12	916	0.916	0.072	0.144
ORF3a	all	ss13	154	TAT	ACT	ATG	2	AACTATGAC:AATTATGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.50000000000003	3	36.333333333333314	0.0273378783823658	0.0874776777943207	0.312512621181408	-0.0601397994119549	0.0195659760553312	0.0564518653712517	NA	NA	0.0506685546294397	0.235257008930742	75	15	910	0.91	0.075	0.15
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ATG	ACT	2	TATGACTAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000003	3	36.499999999999986	0.0271522864979704	0.0870541284395655	0.31190119279432	-0.0599018419415951	0.0191280496085979	0.0539977232952515	NA	NA	0.0502540978593745	0.233269381054558	79	15	906	0.906	0.079	0.158
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.33333333333336	3	36.499999999999986	0.027400307499342	0.0870541284395655	0.314750236324102	-0.0596538209402235	0.0197289340889244	0.0572505666620769	NA	NA	0.050950166704009	0.241668400689361	85	22	893	0.893	0.085	0.17
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.33333333333336	3	36.499999999999986	0.027400307499342	0.0870541284395655	0.314750236324102	-0.0596538209402235	0.0184925156444728	0.0551296110447095	NA	NA	0.0503374233961505	0.235986232390234	82	17	901	0.901	0.082	0.164
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666669	3	36.16666666666665	0.0273690573365762	0.0879053734766806	0.311346806846075	-0.0605363161401044	0.0193312172666151	0.0552330792095374	NA	NA	0.0504345702780779	0.2300251480637	60	15	925	0.925	0.06	0.12
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAC:ATACCATAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.08333333333336	4	36.16666666666665	0.0274944876870936	0.119656146346601	0.229779150729557	-0.0921616586595075	0.0200596750985853	0.0633129524606983	NA	NA	0.061908116213895	0.136570444537294	31	4	965	0.965	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	160	TAC	CAT	ACA	2	CCATACAAC:CCATATAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000003	4	36.16666666666665	0.0272447663451876	0.119656146346601	0.227692159383683	-0.0924113800014135	0.0191069244459394	0.0628771967382555	NA	NA	0.0623225040335086	0.13812938541259	32	7	961	0.961	0.032	0.064
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ACA	ACA	2	TACAACAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000003	4	36.16666666666665	0.0272447663451876	0.119656146346601	0.227692159383683	-0.0924113800014135	0.0188848577855096	0.0632315443529993	NA	NA	0.0620968195480444	0.136702856651286	27	6	967	0.967	0.027	0.054
ORF3a	all	ss13	162	AGT	ACA	GTG	2	AACAGTGTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.9166666666667	5	35.66666666666665	0.0271830432683088	0.155190536855492	0.175159154798341	-0.128007493587183	0.0196361273754083	0.0797397170123076	NaN	NaN	0.0769930340977937	0.0963954577168215	15	2	983	0.983	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	163	GTC	GTG	TCA	2	AGTGTCACA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.25000000000003	5	35.66666666666665	0.0274316291149154	0.155190536855492	0.176760965396098	-0.127758907740576	0.0197274275919492	0.0815366712836031	NA	NA	0.0731592710277982	0.0807567640745842	14	2	984	0.984	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TCA	CAG	2	GTCACAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.9166666666667	5	35.66666666666665	0.0271830432683088	0.155190536855492	0.175159154798341	-0.128007493587183	0.0201422306536227	0.0772151546528288	NA	NA	0.0805020402337574	0.111808908170903	7	1	992	0.992	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	165	GAT	CAG	ATA	2	ACAGATACA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000003	5	35.333333333333314	0.0270604324233619	0.15681884839392	0.172558545739271	-0.129758415970558	0.019451352271527	0.0804756479714191	NA	NA	0.076706158103263	0.0907165981159441	4	3	993	0.993	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	166	ACA	ATA	CAA	2	GATACAATC:GATACAATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333337	5	35.499999999999986	0.0271215992572094	0.156000428408735	0.173855928050072	-0.128878829151525	0.0194559560226494	0.0761293413015236	NaN	NaN	0.0758455351297461	0.0892763016823176	9	1	990	0.99	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	167	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGTC:ACAATTGTC	1:1	FALSE	2	0.5	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333337	5	35.499999999999986	0.0271215992572094	0.156000428408735	0.173855928050072	-0.128878829151525	0.019508692416166	0.0769754608964225	NA	NA	0.0814240987504665	0.113464912834485	9	3	988	0.988	0.009	0.018
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TCG	TCG	2	ATCGTCGTT:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.08333333333337	5	35.999999999999986	0.0274944876870936	0.15359580948451	0.179005454506664	-0.126101321797416	0.0196927026220664	0.0785869965215132	NA	NA	0.0761337929325458	0.0976586331037039	15	1	984	0.984	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	169	GTT	TCG	TTA	2	GTCGTTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.4166666666667	5	35.333333333333314	0.0269995408952429	0.15681884839392	0.172170253587258	-0.129819307498677	0.0197600237938167	0.0833211998845243	NA	NA	0.0759415311877836	0.0873650497131259	12	2	986	0.986	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	170	ACT	TTA	CTA	2	GTTACTACA:GTTACTGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333337	5	34.66666666666665	0.0267586909940917	0.160180575223544	0.167053283188351	-0.133421884229453	0.0184687597550344	0.0847590698972577	NaN	NaN	0.0827547094184339	0.106905961353092	7	2	991	0.991	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	171	ACA	CTA	AAG	2	ACTACAGGT:ACTGAAGGT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333337	5	34.66666666666665	0.0267586909940917	0.160180575223544	0.167053283188351	-0.133421884229453	0.0188187271417429	0.0828548577336559	NA	NA	0.0775041817144501	0.0851637922885341	11	3	986	0.986	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	172	GGT	AAG	GTG	2	ACAGGTGAC:GAAGGTGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000004	4	34.66666666666665	0.0133188849757348	0.125290563497375	0.106303975366939	-0.11197167852164	0.0134190409159407	0.068930960570879607	NA	NA	0.0713516992364696	0.116579825046913	20	4	976	0.976	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.4166666666667	4	34.66666666666665	0.0132016609860952	0.125290563497375	0.105368358299161	-0.11208890251128	0.0127448887484055	0.0684075064237052	NA	NA	0.0704705400524767	0.111704540945806	18	6	976	0.976	0.018	0.036
ORF3a	all	ss13	174	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.4166666666667	4	34.999999999999986	0.0133782811395161	0.123992985319038	0.1078954676758	-0.110614704179522	0.0129998096396709	0.0715057687057241	NA	NA	0.0711532324606811	0.120041735568362	28	4	968	0.968	0.028	0.056
ORF3a	all	ss13	175	ATT	GCA	TTT	2	GGCATTTCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.4166666666667	4	34.999999999999986	0.0133782811395161	0.123992985319038	0.1078954676758	-0.110614704179522	0.0138101718307602	0.0694402023711993	NA	NA	0.0664681068516396	0.0960770343357306	17	0	983	0.983	0.017	0.034
ORF3a	all	ss13	176	TCA	TTT	CAA	2	ATTTCAACA	2	FALSE	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333337	4	35.16666666666665	0.0133932130500048	0.123354245726484	0.108575209317902	-0.109961032676479	0.0133391293746086	0.0698832375710143	NA	NA	0.071128042589921	0.122114486694948	26	2	972	0.972	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	177	ACA	CAA	CAC	2	TCAACACCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333337	4	35.08333333333332	0.0264053674769446	0.123672788927057	0.213509921673382	-0.0972674214501122	0.0185637133746949	0.0670397989804096	NaN	NaN	0.0705508666414103	0.167991896849446	57	2	941	0.941	0.057	0.114
ORF3a	all	ss13	178	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCAGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75000000000003	4	35.08333333333332	0.0261749574292545	0.123672788927057	0.211646859881947	-0.0974978314978024	0.0180682069491262	0.0717558927910328	NA	NA	0.0761691216033911	0.200538875649631	52	1	947	0.947	0.052	0.104
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTC:CCAGAACTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25000000000003	4	35.58333333333332	0.0263473854682498	0.12178588422283	0.216341866189043	-0.0954384987545805	0.0182426860143446	0.0682606192659387	NA	NA	0.0722914447459985	0.18677132984163	47	0	953	0.953	0.047	0.094
ORF3a	all	ss13	180	CTC	AAC	TCA	2	AAACTCAAA:GAACTCAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333336	3	36.08333333333332	0.0267586909940917	0.0881207952860292	0.303659209012314	-0.0613621042919375	0.0190143452299965	0.0567201477645432	NA	NA	0.0608474430142367	0.313234533637738	122	7	871	0.871	0.122	0.244
ORF3a	all	ss13	181	AAA	TCA	AAG	2	CTCAAAGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.75000000000001	3	36.08333333333332	0.0265221005560517	0.0881207952860292	0.300974366719731	-0.0615986947299775	0.0188638042386939	0.055280509217177	NA	NA	0.0579790564038207	0.28804047488882	120	8	872	0.872	0.12	0.24
ORF3a	all	ss13	182	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGAC:AAAGAATAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333334	3	36.08333333333332	0.0267586909940917	0.0881207952860292	0.303659209012314	-0.0613621042919375	0.018796776898363	0.0560498182977748	NA	NA	0.0591213206513142	0.299315939501059	117	12	871	0.871	0.117	0.234
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	GAAGACTAC:GAATACTAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000001	3	36.58333333333332	0.0270604324233619	0.0868438898173542	0.311598576253022	-0.0597834573939923	0.0188241858608155	0.0543987248011604	NA	NA	0.05834324148813	0.305511737880382	130	4	866	0.866	0.13	0.26
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA:TACTACCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.91666666666667	3	37.583333333333314	0.0136522540928075	0.0843980831669965	0.161760238864597	-0.0707458290741891	0.0138015667123347	0.0540284047225629	NA	NA	0.053949951424777	0.189748555083782	56	13	931	0.931	0.056	0.112
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25	3	36.91666666666665	0.0134081783305544	0.0860130038580104	0.155885479278093	-0.072604825527456	0.0135228428665464	0.0525192662060097	NA	NA	0.0540142879573546	0.178890786299775	44	14	942	0.942	0.044	0.088
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25	3	36.91666666666665	0.0134081783305544	0.0860130038580104	0.155885479278093	-0.072604825527456	0.0135792349484729	0.053097776292814	NA	NA	0.0570025989072334	0.202765929548475	55	19	926	0.926	0.055	0.11
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75	3	36.91666666666665	0.0134986770919624	0.0860130038580104	0.15693763136381	-0.072514326766048	0.0133679588913902	0.0537564122425327	NA	NA	0.0581635347509911	0.212495864774398	63	10	927	0.927	0.063	0.126
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.41666666666667	3	37.249999999999986	0.013559691378237	0.0851978832927791	0.159155261306665	-0.0716381919145421	0.0129005380925676	0.0531842780062739	NA	NA	0.0550942348045724	0.193503401618522	52	10	938	0.938	0.052	0.104
ORF3a	all	ss13	189	TAT	GTT	ATT	2	GGTTATTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.58333333333333	3	36.749999999999986	0.0133485169832455	0.0864264476831886	0.154449446217862	-0.0730779306999431	0.013209399283979	0.0516014223165024	NA	NA	0.0582853241892214	0.209916011447373	59	19	922	0.922	0.059	0.118
ORF3a	all	ss13	190	TCT	ATT	CTG	2	TATTCTGAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.91666666666667	3	36.083333333333314	0.0131150882907867	0.0881207952860293	0.14883079809047	-0.0750057069952426	0.01325755026434	0.0563894537378084	NA	NA	0.0573177091938946	0.190671342937713	54	15	931	0.931	0.054	0.108
ORF3a	all	ss13	191	GAG	CTG	AGG	2	TCTGAGGAT	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.08333333333333	3	36.91666666666665	0.0132600139021293	0.0860130038580104	0.154162897554639	-0.0727529899558811	0.0127173778664508	0.0522697059441709	NA	NA	0.0544839400417857	0.18177466699983	43	20	937	0.937	0.043	0.086
ORF3a	all	ss13	192	GAT	AGG	ATA	2	GAGGATAGG:GAGGATTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75	3	35.583333333333314	0.0134986770919624	0.0894358561096487	0.150931378969672	-0.0759371790176862	0.0137882948084164	0.0564536470513571	NA	NA	0.0594566247112457	0.201536527114559	60	16	924	0.924	0.06	0.12
ORF3a	all	ss13	193	AGG	ATA	GGC	2	GATAGGCAC:GATTGGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.166666666666667	0.5	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.91666666666667	3	36.749999999999986	0.0138412232800193	0.0864264476831886	0.160150320313484	-0.0725852244031693	0.0135478953293546	0.0558965011505534	NA	NA	0.0564936217823558	0.198848452505807	62	16	922	0.922	0.062	0.124
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	ACT	2	AGGCACTCA:TGGCATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.41666666666667	2	37.249999999999986	0.0139376833302847	0.0557100557871529	0.250182541254946	-0.0417723724568682	0.0132622490748137	0.0419925869372341	NA	NA	0.0440478938305042	0.342956476664285	146	37	817	0.817	0.146	0.292
ORF3a	all	ss13	195	TCA	ACT	CAG	2	CACTCAGGT:CATTCAGGT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75	2	36.249999999999986	0.0138732279313668	0.0573071018565008	0.242085666207758	-0.043433873925134	0.0147046257498346	0.0461751558085316	NA	NA	0.0444882257182311	0.328915606637678	115	51	834	0.834	0.115	0.23
ORF3a	all	ss13	196	GGT	CAG	GTG	2	TCAGGTGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25	2	35.41666666666665	0.0134081783305544	0.0587096677913667	0.228381096929424	-0.0453014894608123	0.013202993184744	0.0435057068859677	NA	NA	0.0440347406903969	0.303589162481911	124	36	840	0.84	0.124	0.248
ORF3a	all	ss13	197	GTT	GTG	TTA	2	GGTGTTAAA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.58333333333333	2	35.41666666666665	0.0133485169832455	0.0587096677913667	0.227364887000917	-0.0453611508081212	0.0130904917821212	0.043919772186637	NA	NA	0.0455775353919138	0.319613529434798	104	49	847	0.847	0.104	0.208
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.58333333333334	2	35.08333333333332	0.0131726767040263	0.0592901175479514	0.222173226311666	-0.0461174408439251	0.0131336015455897	0.0442279000150792	NA	NA	0.0492218225141151	0.348794162112108	133	34	833	0.833	0.133	0.266
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666667	2	35.58333333333332	0.0133782811395161	0.0584236862456271	0.228987282371582	-0.0450454051061109	0.01348756762589	0.0452603335418673	NA	NA	0.0463277058047251	0.330890838197329	116	46	838	0.838	0.116	0.232
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATG	2	GACTATGTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000001	2	35.58333333333332	0.0134081783305544	0.0584236862456271	0.229499013023301	-0.0450155079150727	0.0135218481114275	0.0437890670993361	NA	NA	0.0479812559453763	0.348147061369674	133	37	830	0.83	0.133	0.266
ORF3a	all	ss13	201	GTC	ATG	TCG	2	TATGTCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.91666666666667	2	35.58333333333332	0.0132893842388272	0.0584236862456271	0.227465692304239	-0.0451343020067999	0.01306467968522	0.0441318247105997	NA	NA	0.0473195088643045	0.340174677587513	126	40	834	0.834	0.126	0.252
ORF3a	all	ss13	202	GTT	TCG	TTG	2	GTCGTTGTA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.91666666666667	2	36.58333333333332	0.0134683754007452	0.0567646707244323	0.237266863858478	-0.0432962953236871	0.0132674974374717	0.0433653942489096	NA	NA	0.0439647056179985	0.324723960761275	129	50	821	0.821	0.129	0.258
ORF3a	all	ss13	203	GTA	TTG	TAC	2	GTTGTACAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000001	2	36.24999999999999	0.0134081783305544	0.0573071018565008	0.233970623119784	-0.0438989235259464	0.0131583163089265	0.0415644881885828	NA	NA	0.0456327369261441	0.33604706547843	134	51	815	0.815	0.134	0.268
ORF3a	all	ss13	204	CAT	TAC	ATG	2	GTACATGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.58333333333334	2	36.91666666666666	0.0137146678675636	0.0562324166616758	0.24389255667382	-0.0425177487941122	0.0133920160420267	0.041390954239692	NA	NA	0.0460880104234431	0.35625019240079	129	47	824	0.824	0.129	0.258
ORF3a	all	ss13	205	GGC	ATG	GCT	2	CATGGCTAT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.41666666666667	2	36.41666666666666	0.0137460892532251	0.0570345959917882	0.241013178303293	-0.0432885067385631	0.0133849778604051	0.0428975191781078	NA	NA	0.0452623296732943	0.338874484530136	150	42	808	0.808	0.15	0.3
ORF3a	all	ss13	206	TAT	GCT	ATT	2	GGCTATTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75	2	37.08333333333333	0.0138732279313668	0.0559700169039056	0.247868925163729	-0.0420967889725388	0.0140530418504764	0.042806139260254	NA	NA	0.0420403576476822	0.316661342876384	153	43	804	0.804	0.153	0.306
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ATT	TCA	2	TATTTCACC:TATTTCGCC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.08333333333333	3	36.74999999999999	0.0138093659583391	0.0864264476831886	0.159781714145649	-0.0726170817248494	0.0140432508452477	0.0526814733623345	NA	NA	0.0554178537222806	0.190075647217237	56	17	927	0.927	0.056	0.112
ORF3a	all	ss13	208	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGAA:TTCGCCGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.16666666666667	3	37.08333333333333	0.0137934922285677	0.0856035011092873	0.1611323374608	-0.0718100088807197	0.0140163401922607	0.051747416707015	NA	NA	0.0569086061555095	0.207003498860905	63	20	917	0.917	0.063	0.126
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CCG	AAG	2	ACCGAAGTT:GCCGAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.5	2	36.74999999999999	0.0137303605832671	0.0564972895530332	0.243026890172821	-0.0427669289697661	0.0143326278143436	0.0427253124019633	NA	NA	0.0444022839531479	0.33546243079887	117	50	833	0.833	0.117	0.234
ORF3a	all	ss13	210	GTT	AAG	TTC	2	GAAGTTCAC:GAAGTTTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.5	2	36.08333333333333	0.0137303605832671	0.0575822255219405	0.238447897051763	-0.0438518649386734	0.0136320673840015	0.0454115457655363	NA	NA	0.0463737418134105	0.344343240448613	129	48	823	0.823	0.129	0.258
ORF3a	all	ss13	211	CAC	TTC	ACT	2	GTTCACTAC:GTTTACTAC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.5	2	36.08333333333333	0.0135443861537981	0.0575822255219405	0.23521817767598	-0.0440378393681424	0.0136964278349167	0.0429965777776203	NA	NA	0.0449569399208233	0.327305342753544	124	41	835	0.835	0.124	0.248
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	CACTACCAG:TACTACCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666667	1	35.74999999999999	0.013423177093157	0.0285069944752381	0.470873108170583	-0.0150838173820811	0.0138293399884043	0.0308510821425825	NA	NA	0.0339118693270338	0.65646817519795	276	129	595	0.595	0.276	0.552
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333334	1	35.58333333333333	0.0133932130500048	0.0286430990492925	0.467589523988176	-0.0152498859992876	0.0137063932586471	0.0302264965490457	NA	NA	0.0331715191804167	0.64571125630899	269	124	607	0.607	0.269	0.538
ORF3a	all	ss13	214	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.66666666666667	1	34.91666666666666	0.013333684515963	0.0292007684815911	0.456621014079436	-0.0158670839656281	0.013385034829189	0.0301116938876211	NA	NA	0.0329137347945459	0.629748454371065	270	124	606	0.606	0.27	0.54
ORF3a	all	ss13	215	GAG	TTG	AGT	2	CTTGAGTCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.00000000000001	1	34.58333333333332	0.0132746828245506	0.0294878275056261	0.450175002618213	-0.0162131446810755	0.0133287774453239	0.030830408133244	NA	NA	0.0345021248809764	0.638414118014001	298	144	558	0.558	0.298	0.596
ORF3a	all	ss13	216	TCT	AGT	CTA	2	GAGTCTACA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.50000000000001	1	34.08333333333332	0.0131871529184001	0.0299291581301553	0.440612223740209	-0.0167420052117552	0.0133974368833744	0.032025769256922	NA	NA	0.034537167063479	0.627851363207338	276	112	612	0.612	0.276	0.552
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CTA	CAC	2	TCTACACAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333336	1	33.41666666666666	0.0129592857062641	0.0305385697640887	0.4243579776779	-0.0175792840578246	0.0122409492279204	0.032679572385282	NA	NA	0.0344956740016856	0.61032586169586	275	148	577	0.577	0.275	0.55
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.00000000000003	1	33.24999999999999	0.0129313548258795	0.0306948207819131	0.421287842589369	-0.0177634659560336	0.013154652402453	0.0337655083809239	NA	NA	0.0345314251089118	0.606962220161686	240	131	629	0.629	0.24	0.48
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TTA	2	CAAATTACT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333336	1	34.74999999999999	0.0133041182530361	0.0293435958691742	0.453390862945065	-0.016039477616138	0.0134477481667339	0.0316965184975789	NA	NA	0.0322298558080167	0.618724415164384	300	141	559	0.559	0.3	0.6
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TTA	CTA	2	ATTACTACA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000003	1	35.58333333333332	0.0134532755150005	0.0286430990492925	0.469686450193412	-0.015189823534292	0.013263833122714	0.0289568129582158	NA	NA	0.0334731324163314	0.649978889912507	293	125	582	0.582	0.293	0.586
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CTA	CAG	2	ACTACAGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.33333333333336	1	36.249999999999986	0.0135750312327134	0.0281063333749098	0.482988337597664	-0.0145313021421964	0.0131557644881262	0.0290970520559954	NA	NA	0.0332656959019242	0.662237950157218	305	114	581	0.581	0.305	0.61
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.00000000000003	1	36.583333333333314	0.0136367393123929	0.02784542552167	0.489729966661145	-0.0142086862092771	0.0141549581636243	0.0284659004217611	NA	NA	0.0311432694888228	0.648220153282756	284	118	598	0.598	0.284	0.568
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.33333333333337	1	37.249999999999986	0.0137618540011474	0.0273378783823658	0.503398757162679	-0.0135760243812184	0.0139039079914308	0.0281925485943652	NA	NA	0.0333469363908906	0.683923827074327	278	142	580	0.58	0.278	0.556
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.6666666666667	1	36.91666666666665	0.0136990109829699	0.0275893176123833	0.496533157341346	-0.0138903066294134	0.014175913219666	0.0290674312532137	NA	NA	0.0314981276875727	0.659221447765053	282	132	586	0.586	0.282	0.564
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	TTC	2	GGTATTCAA:GGTATTGAA	1:1	FALSE	1.25	0.583333333333333	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.1666666666667	1	36.41666666666665	0.0136058153029875	0.0279752710599065	0.486351509297332	-0.014369455756919	0.0131580662626847	0.0292566802541213	NA	NA	0.0328838275805141	0.662128481862649	297	127	576	0.576	0.297	0.594
ORF3a	all	ss13	226	CAA	TTC	AAA	2	ATTCAAAAC:ATTGAAAAT	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333337	1	35.91666666666665	0.0135291154422588	0.0283721774047871	0.476844453960592	-0.0148430619625283	0.0131478800826659	0.0292590414062575	NA	NA	0.0331242420317835	0.654079086677478	294	127	579	0.579	0.294	0.588
ORF3a	all	ss13	227	AAC	AAA	ACG	2	CAAAACGCT:GAAAATGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	GCT	ACG	CTA	2	AACGCTACA:AATGCTACA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CTA	CAT	2	GCTACATTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TTT	TCT	TTA	2	ATCTTTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	TTA	ACA	2	TTTAACAAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	CTT	AGC	TTG	2	AAGCTTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC:GTTAAAGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCCA:AAAGATCCG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	CCA	ACC	CA-	0	GACCCA---:GATCCG---	1:1	FALSE	0.166666666666667	0	1.83333333333333	1	0	0	0	1	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	NA	NA	0	CCA---CCG:CCG---CCG	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	CGA	0	---CCGAAT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	CGA	ATG	2	CCGAATGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTG	ATG	TGC	2	AATGTGCAA	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TGC	AAA	2	GTGCAAATA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCT	GCT	CTT	2	GGCTCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CTT	CAG	2	TCTTCAGGA	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT:GTTGTAAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAT	CTA	ATC	2	GCTAATCCA:GTAAATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	CCA	ATC	CAG	2	AATCCAGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	GCA	CAG	CAA	2	CCAGCAATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	ATG	CAA	TGG	2	GCAATGGAC:GCAATGGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	GAC	TGG	ACC	2	ATGGACCCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	ACC	CAA	2	GACCCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATT	CAA	TTT	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGAG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAG	ATG	AGC	2	GATGAGCCG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCG	AGC	CGA	2	GAGCCGACG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CGA	CGA	2	CCGACGACG	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	TTG	CTT	TGT	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	68.74999999999999	10	33.49999999999999	0.179963002222943	0.380635771846751	0.472795820922997	-0.200672769623808	0.0636574585672631	0.162117138693723	0.336597295427786	0.160130303993139	0.158732251200482	0.206150434467951	66	0	934	0.934	0.066	0.132
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	68.41666666666664	10	33.666666666666664	0.199793889563991	0.378184989500961	0.528296720151774	-0.17839109993697	0.0655915323859023	0.155978035186795	0.387050078606703	0.172274681528967	0.161866715536687	0.270424127107175	117	1	882	0.882	0.117	0.234
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG:TTGTTTATT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	67.66666666666664	10	34.08333333333333	0.202335646591906	0.37219669468357103	0.543625586906205	-0.169861048091665	0.0666945168845165	0.153853221780951	0.324631763131832	0.0940144107179491	0.159399573163302	0.286590702607441	113	0	887	0.887	0.113	0.226
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA:TTTATTAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	67.83333333333331	10	33.916666666666664	0.201765204947521	0.374568636610963	0.538660168595694	-0.172803431663443	0.0660168345893085	0.153537923022918	0.423703394292361	0.203616870067446	0.164970303376017	0.294877306428058	122	0	878	0.878	0.122	0.244
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATTT:ATTAGCATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	67.49999999999999	10	34.25	0.202909342656595	0.369855206523338	0.548618321650669	-0.166945863866743	0.0721088872929418	0.159217958502017	0.359835332220772	0.127349621597941	0.16298833976305	0.305702557291813	108	0	892	0.892	0.108	0.216
ORF3a	all	ss13	7	ATT	GAT	TTT	2	AGATTTTTT:AGCATTTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	67.49999999999999	10	34.25	0.183738969921944	0.369855206523338	0.496786219799639	-0.186116236601394	0.0663145191661545	0.155820874393413	0.351280307160126	0.157298500797145	0.156448190779912	0.234189900351687	78	0	922	0.922	0.078	0.156
ORF3a	all	ss13	8	TTC	TTT	TCA	2	ATTTTCACA:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	68.08333333333331	10	33.83333333333333	0.163466307281544	0.375766217752027	0.435021296644122	-0.212299910470483	0.0604072347304054	0.153719739802927	0.294369672706813	0.139459686398825	0.158484919830626	0.180388740847259	51	0	949	0.949	0.051	0.102
ORF3a	all	ss13	9	ACA	TCA	CAT	2	TTCACATTA:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	68.91666666666664	10	33.666666666666664	0.179471289611342	0.378184989500961	0.474559526670176	-0.198713699889619	0.0638658524735745	0.164055066612081	0.324703886877511	0.143874225092795	0.15645531600632	0.204049460036107	72	0	928	0.928	0.072	0.144
ORF3a	all	ss13	10	CTT	CAT	TAG	2	ACATTAGGT:ACTCTTAGA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	68.91666666666664	10	33.666666666666664	0.179471289611342	0.378184989500961	0.474559526670176	-0.198713699889619	0.0635465946132242	0.150997183915397	NaN	NaN	0.157914154229554	0.20825965727249	68	0	932	0.932	0.068	0.136
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TAG	GAT	2	CTTAGATCA:TTAGGTTCA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1.16666666666667	0.5	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	68.91666666666664	11	33.83333333333333	0.179471289611342	0.426205388008903	0.421091085802024	-0.246734098397561	0.0659042524281875	0.172334652501417	0.259532592842705	0.104696783271555	0.176873730917985	0.163023948688653	56	0	944	0.944	0.056	0.112
ORF3a	all	ss13	12	TCA	GAT	CAA	2	AGATCAATT:GGTTCAATC	1:1	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	69.49999999999999	10	34.08333333333333	0.15975246858483	0.37219669468357103	0.429215172694229	-0.212444226098741	0.0615588819609312	0.146177372190413	0.33970957392855	0.206417871360722	0.157291090083708	0.176809582426108	56	0	944	0.944	0.056	0.112
ORF3a	all	ss13	13	ATC	CAA	TCA	2	TCAATCACT:TCAATTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	69.83333333333333	11	33.74999999999999	0.158903109406266	0.427623797664225	0.371595571327483	-0.268720688257959	0.0593218704859112	0.17060005748903	0.226743422770467	0.101247155494224	0.176002434966037	0.126810510573052	34	0	966	0.966	0.034	0.068
ORF3a	all	ss13	14	ACT	TCA	CTC	2	ATCACTCGT:ATTACTGCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	69.58333333333333	11	33.416666666666664	0.159539275483744	0.433395768826612	0.368114520166372	-0.273856493342868	0.0601174861576246	0.172946866812432	0.24111296657817	0.126828039747199	0.187029923741147	0.143128679818382	26	0	974	0.974	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	15	CGT	CTC	CAC	1	ACTCGT---:ACTGCACAG	1:1	TRUE	0.5	0.5	1.5	0.5	0	0	2	1	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	70.08333333333333	11	32.916666666666664	0.17610346448782	0.442360526313466	0.39809940989859	-0.266257061825645	0.0635811960640404	0.176062554807632	0.285732680093095	0.163541714966691	0.195096647983554	0.172333392897386	28	0	972	0.972	0.028	0.056
ORF3a	all	ss13	16	---	CAC	AGC	1	CGT------:GCACAGCCA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	70.41666666666666	10	32.583333333333336	0.175164425421709	0.394717387097679	0.443771749477967	-0.21955296167597	0.0578745704281	0.148927601812751	0.30995514812341	0.152221416444628	0.162392419009842	0.176378445172962	59	0	941	0.941	0.059	0.118
ORF3a	all	ss13	17	---	AGC	CAG	1	------GGT:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	72.41666666666666	10	33.25	0.169734844556617	0.384373398718765	0.441588427093018	-0.214638554162148	0.0603296457402773	0.149659715403821	0.308473348186455	0.152278769946365	0.149759644785527	0.151794907017607	50	0	950	0.95	0.05	0.1
ORF3a	all	ss13	18	GGT	--G	GTA	1	---GGTAGT:CCAGTAAAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	74.33333333333333	10	34	0.199131161218094	0.373378821179385	0.533322057713671	-0.17424765996129	0.0668282245586698	0.144349389409628	0.294986832314717	0.0706139587235819	0.151229546529812	0.249236245079365	104	1	895	0.895	0.104	0.208
ORF3a	all	ss13	19	AAA	GTA	AAA	2	GGTAGTGTG:GTAAAAATT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	2	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	74.66666666666667	10	33.916666666666664	0.19811368128119	0.374568636610963	0.528911558302614	-0.176454955329773	0.0676641682591852	0.13443317347239	0.365823888739337	0.148230713938851	0.161667465603726	0.275066760347412	103	1	896	0.896	0.103	0.206
ORF3a	all	ss13	20	ATT	AAA	TGC	2	AAAATTGAC:AGTGTGCAA	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.75	0.833333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.58333333333333	10	33.333333333333336	0.161796742774019	0.383119217824493	0.42231434824065	-0.221322475050474	0.0580397345642929	0.151551501974778	0.278702039786853	0.129699039243644	0.156136979561273	0.156339963205581	45	0	955	0.955	0.045	0.09
ORF3a	all	ss13	21	CAA	TGC	AAA	2	ATTGACAAT:GTGCAAAAT	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.83333333333333	9	33.5	0.145028544735405	0.332619377773053	0.436019529909524	-0.187590833037648	0.0535840139341701	0.133510746498789	0.303356713170851	0.150628156834565	0.140376081503091	0.181436631211336	59	0	941	0.941	0.059	0.118
ORF3a	all	ss13	22	AAT	AAA	ATG	2	CAAAATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75	9	33.5	0.130765040358583	0.332619377773053	0.393137168477913	-0.201854337414469	0.0468142679699134	0.127275882652459	0.299596589776344	0.189445317236112	0.137382956737134	0.141756253862161	31	0	969	0.969	0.031	0.062
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGTT:AATGCTTCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	74.25	10	33.833333333333336	0.148448225790773	0.375766217752027	0.395054740894073	-0.227317991961254	0.0525173094510438	0.14325204077382	0.246123241889927	0.108469720459511	0.148118632644633	0.124856994245042	40	0	960	0.96	0.04	0.08
ORF3a	all	ss13	24	GTT	CTG	CTC	2	GCTGTTCCT:GCTTCTCCT	1:1	TRUE	1	1	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	73.41666666666667	10	34.666666666666664	0.150313866488423	0.364130861836276	0.412801776071396	-0.213816995347853	0.0530340605256308	0.138444028825778	0.251175208528884	0.100283376598972	0.132917446079998	0.1076939715658	33	0	967	0.967	0.033	0.066
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	GTTCCTGCA:TCTCCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.08333333333334	9	34	0.132534762850759	0.326488553443384	0.405939998364266	-0.193953790592625	0.0476362190574522	0.124363588207755	0.255133700138427	0.111589922955585	0.134639335946505	0.149713754504531	43	0	957	0.957	0.043	0.086
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAAT:CCTGCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.08333333333334	10	33.666666666666664	0.130606503128167	0.378184989500961	0.345350838224728	-0.247578486372794	0.0447172826534147	0.142057071635671	0.26818863227746	0.197844782895851	0.14846433545866	0.0953960138344569	28	0	972	0.972	0.028	0.056
ORF3a	all	ss13	27	AAT	CAA	ATT	2	GCAAATTCT:GCAAGTACT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.08333333333334	11	33	0.128733683316993	0.440839998676589	0.292019062933161	-0.312106315359596	0.047612782828341	0.17415141058576	0.197616815510153	0.139487153114936	0.180671183386685	0.0840810376605301	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	28	ACT	ATT	CTC	2	AATTCTCTT:AGTACTGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.41666666666667	11	33.666666666666664	0.114370944999209	0.429051936755032	0.266566667579243	-0.314680991755823	0.0470043134342822	0.157680955541995	0.189783610872827	0.160145574842051	0.174671899833603	0.0716154851743257	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	29	CTT	CTC	TTC	2	ACTGTTCAT:TCTCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.08333333333334	10	33.666666666666664	0.11328912210942	0.378184989500961	0.29956007048009	-0.264895867391541	0.0447911381163465	0.141400355903656	0.228293910937079	0.189463299749608	0.15403143034334	0.0854775228805662	22	0	978	0.978	0.022	0.044
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	CTTCATGCT:GTTCATGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.58333333333334	10	33.166666666666664	0.112491115941025	0.385635998709722	0.291702839769634	-0.273144882768697	0.0448263849976496	0.162280127704847	0.205518800117757	0.155797383423446	0.160261399742797	0.0883117974782645	18	0	982	0.982	0.018	0.036
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA:CATGCTACG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.75000000000001	11	33.5	0.113827458253345	0.431937817010051	0.263527419389388	-0.318110358756707	0.0454143852727801	NA	0.197126429891197	0.181273340877759	0.182066957281701	0.08059982218956	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA:GCTACGGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.25000000000001	11	33.5	0.113021862643589	0.431937817010051	0.261662346274622	-0.318915954366463	0.0438825804035425	0.181654664968161	0.183925937992459	0.154837467414184	0.180345583735322	0.0770007040405473	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG:ACGGCTACC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.08333333333336	11	33.33333333333333	0.126913940754554	0.434863871439707	0.291847516176452	-0.307949930685152	0.0467564553558628	0.180003996499118	0.208017842262308	0.160619012919739	0.182499802575519	0.0915267125215627	15	0	985	0.985	0.015	0.03
ORF3a	all	ss13	34	ACC	CAA	CCA	2	GCAACGATA:GCTACCATC	1:1	FALSE	1.08333333333333	1	0.916666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.41666666666669	11	32.99999999999999	0.126318765773573	0.440839998676589	0.286541071937175	-0.314521232903017	0.0453028528463978	0.18037634501259	0.187387265168785	0.126230125540492	0.201647009180258	0.118816262794834	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CCA	TAC	2	ACCATCCCT:ACGATACCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	77.58333333333336	11	32.08333333333333	0.126023271644748	0.45818181174223	0.275050795153885	-0.332158540097482	0.0475089506102878	0.204221025209537	0.187403918412663	0.1421885380074	0.212841888910434	0.118620944932849	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	36	CCG	TAC	CGC	2	ATACCGCTA:ATCCCTTTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.58333333333336	11	31.249999999999996	0.141428177785303	0.475215900934439	0.297608260807785	-0.333787723149136	0.0512074604932362	0.199916241156139	0.202177834825039	0.141017554561217	0.214650139497406	0.119938573228904	13	0	987	0.987	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	37	CTA	CGC	TAC	2	CCGCTACAA:CCTTTACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.16666666666669	11	30.416666666666664	0.171768261601848	0.493612753892137	0.347981814180154	-0.321844492290289	0.0562623796657265	0.224964404700806	0.226596842941718	0.124615177696699	0.239487076338007	0.178983682978745	30	0	970	0.97	0.03	0.06
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	CTACAAGCC:TTACAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.25000000000003	11	30.916666666666668	0.171562720556584	0.482401878032766	0.35564272936958	-0.310839157476182	0.0579881902869596	0.202862451480645	0.235000030604631	0.130184909003711	0.219595438385168	0.156919527532185	43	0	957	0.957	0.043	0.086
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCA	2	CAAGCCACT:CAAGCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.08333333333336	11	31.416666666666668	0.188257162672323	0.471705209541701	0.399099180726093	-0.283448046869378	0.0615744374744465	0.210990194928415	0.278023455262138	0.151148242169879	0.21274809133862	0.18275581459617601	34	0	966	0.966	0.034	0.068
ORF3a	all	ss13	40	ACT	CCA	CAC	2	GCCACTCTG:GCCTCACTC	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.75000000000001	11	31.75	0.189175159494502	0.46484204699122	0.40696653996551	-0.275666887496718	0.0600009967458136	0.194438588356401	0.291138068434387	0.162158950620814	0.203669817809983	0.175896280634672	44	0	956	0.956	0.044	0.088
ORF3a	all	ss13	41	CTC	CAC	TCC	2	ACTCTGCCT:TCACTCCCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.5	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.25000000000001	11	31.416666666666668	0.187801514593863	0.471705209541701	0.398133221331872	-0.283903694947838	0.0611885396001824	0.205614544849241	0.361791317126821	0.271136143903391	0.21812694361959	0.193069365474806	49	0	951	0.951	0.049	0.098
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TCC	CTT	2	CTCCCTTTC:CTGCCTTTC	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.91666666666669	11	31.916666666666668	0.188715038816376	0.461487146936458	0.40892804939237	-0.272772108120082	0.0620055060590737	0.198463113176829	0.346697023160977	0.238200387212503	0.211028241668116	0.196154354196064	32	0	968	0.968	0.032	0.064
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCG	2	CCTTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.33333333333336	11	31.5	0.221099655165484	0.469969873663787	0.470454953722537	-0.248870218498304	0.0739990749537669	NA	0.33405132959753	0.159032982285439	0.209447888087515	0.234746654149477	64	0	936	0.936	0.064	0.128
ORF3a	all	ss13	44	GGA	TCG	GAT	2	TTCGGATGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.83333333333336	11	31.166666666666668	0.219470498668977	0.476991575039997	0.460113993943339	-0.25752107637102	0.0705482367488676	0.218109074796605	0.298240172017295	0.122888215427488	0.240450871793054	0.284172809308808	72	0	928	0.928	0.072	0.144
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	GGATGGCTT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.00000000000003	11	30.833333333333336	0.218932806420976	0.484233634931206	0.452122262122662	-0.26530082851023	0.0704430640019553	0.216102976486008	0.3112264258641	0.146303824325209	0.23147616035737	0.251743051870015	72	0	928	0.928	0.072	0.144
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTA	2	TGGCTTATT:TGGCTTGTT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.33333333333336	11	30.5	0.221099655165484	0.49170694593066	0.449657376197941	-0.270607290765176	0.0686780080550943	0.222604482707922	0.267372106504397	0.0926141819623996	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	47	ATT	TTA	TTA	2	CTTATTGTT:CTTGTTATT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.00000000000001	11	29.58333333333334	0.218932806420976	0.513548987725995	0.426313383247848	-0.294616181305019	0.0723398203349393	0.25521746619921	0.268473920336404	0.112305882879496	0.235218580421072	0.210380127964953	43	0	957	0.957	0.043	0.086
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	ATTGTTGGC:GTTATTGGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.25000000000001	10	29.08333333333334	0.218131224556612	0.459993680357088	0.474204829047388	-0.241862455800476	0.0716418773544284	0.210537321506059	0.361559621291101	0.189670791728181	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.66666666666669	9	29.41666666666667	0.220010857490594	0.393100353726364	0.559681148604976	-0.17308949623577	0.0704155982856783	0.197099180392265	0.46000106672765	0.223720157438842	0.183764271160587	0.346238464708165	140	0	860	0.86	0.14	0.28
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.83333333333336	9	30.250000000000007	0.222753358291529	0.378998328336262	0.58774232400807	-0.156244970044734	0.0688808327876304	0.162801827971261	0.455219198587988	0.196662289027967	0.19603526848032	0.425436630103505	181	0	819	0.819	0.181	0.362
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAT	2	GTTGCATTG:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.50000000000001	9	29.583333333333346	0.220553902912914	0.390194741999512	0.565240581620113	-0.169640839086598	0.0680412785316296	0.163420331132184	0.449444903614513	0.208521422471995	0.202298012123327	0.401711219981871	145	0	855	0.855	0.145	0.29
ORF3a	all	ss13	52	TTG	CAT	TGC	2	GCATTGCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.83333333333334	10	30.083333333333346	0.219470498668977	0.439179787705354	0.499728140531413	-0.219709289036376	0.0694739713956598	0.188795574539636	0.352310594493096	0.15606507660947	0.196014648276602	0.262338097982008	94	0	906	0.906	0.094	0.188
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TGC	TTG	2	TTGCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.00000000000001	10	30.083333333333346	0.202172332401979	0.439179787705354	0.460340703424213	-0.237007455303375	0.0671662341420731	0.189047009725455	0.311459811704294	0.139405112713272	0.215367936515825	0.271124356296357	68	0	932	0.932	0.068	0.136
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	79.41666666666669	10	29.66666666666668	0.200955878734158	0.447612053716135	0.448950999120322	-0.246656174981977	0.0690795354472434	0.185814497083705	0.35274135464549	0.203107332387211	0.230761203994044	0.285123473101327	62	0	938	0.938	0.062	0.124
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.41666666666669	10	30.00000000000001	0.217600112429929	0.440839998676589	0.493603377831344	-0.223239886246659	0.0699495200346453	0.206904070746662	0.348331768775034	0.156468439683531	0.207599306475737	0.282222430351744	93	0	907	0.907	0.093	0.186
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAA:GTTTTTCAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.75000000000001	10	29.333333333333346	0.213443159911581	0.454601852677736	0.469516696103061	-0.241158692766155	0.0681699005565414	0.201017491827982	0.344493309449522	0.172907839323369	0.866821087570544	0.780850806454981	84	0	916	0.916	0.084	0.168
ORF3a	all	ss13	57	CAA	TTC	AAA	2	TTTCAAAAT:TTTCAGAGC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	80.41666666666669	11	29.16666666666668	0.214467334863233	0.524158391451698	0.409165127108333	-0.309691056588464	0.0717343688742446	0.229090265445048	NA	NA	0.262965872917283	0.238922068713917	45	0	955	0.955	0.045	0.09
ORF3a	all	ss13	58	AAT	AAA	ATG	2	CAAAATGCT:CAGAGCGCT	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.58333333333334	11	29.333333333333346	0.217071598340042	0.519860385419959	0.417557491257359	-0.302788787079917	0.0704577960122344	0.251989245631236	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	59	GCT	ATG	CTA	2	AATGCTTCA:AGCGCTACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.41666666666669	11	29.833333333333346	0.203900474239319	0.507394724492928	0.401857694604708	-0.303494250253609	0.0683156926885811	0.227057492809427	NA	NA	0.259507713442874	0.242202273234277	40	0	960	0.96	0.04	0.08
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CAA	2	GCTACCAAA:GCTTCAAAA	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.41666666666669	11	29.66666666666668	0.220826439413092	0.511480409971365	0.431739779487263	-0.290653970558273	0.0722666784367454	0.216456517249449	NA	NA	0.263466492754494	0.269944052656516	63	0	937	0.937	0.063	0.126
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CAA	AAA	2	ACCAAAATA:TCAAAAGTA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.41666666666669	10	28.66666666666668	0.217600112429929	0.469279424823309	0.463689863479225	-0.25167931239338	0.0754050935021047	0.238423300373067	0.360778206267827	0.19870525213609	0.265268506838073	0.342736622763913	87	0	913	0.913	0.087	0.174
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATT:AAAGTAATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.50000000000001	10	28.583333333333346	0.223869741416997	0.471183220743389	0.4751224822136	-0.247313479326392	0.0717937241246899	0.223040242800882	0.40156935617426	0.236744081935153	0.237450203200454	0.297625790584454	90	0	910	0.91	0.09	0.18
ORF3a	all	ss13	63	ATT	TAA	TTC	2	ATAATTGCG:GTAATTCCT	1:1	FALSE	1.25	0.583333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.16666666666667	9	28.250000000000014	0.221648134682889	0.414750411612527	0.534413296471806	-0.193102276929638	0.0695964028197702	0.19654523110622	0.427508442810021	0.211275842442246	0.213817404953571	0.366463445979943	122	0	878	0.878	0.122	0.244
ORF3a	all	ss13	64	CCT	TTC	CGC	2	ATTCCTTTT:ATTGCGCTC	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.91666666666667	9	29.083333333333346	0.222476012792921	0.399046457298014	0.557519077601465	-0.176570444505093	0.0729801164368823	0.189547001413641	0.504037290326267	0.268680292970695	0.191255069311007	0.355892733327692	155	0	845	0.845	0.155	0.31
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CGC	TCA	2	CCTTTTAAC:GCGCTCAAT	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.08333333333334	9	29.583333333333346	0.204901396368095	0.390194741999512	0.525125980217209	-0.185293345631417	0.0684672337463043	0.17075268667254	NaN	NaN	0.193488418674378	0.338241463372061	126	0	874	0.874	0.126	0.252
ORF3a	all	ss13	66	AAC	TCA	ACA	2	CTCAATAAA:TTTAACAGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.91666666666667	8	28.750000000000007	0.202417403270485	0.347735297618175	0.582101974280294	-0.14531789434769	0.0701436905963806	0.16722818147421	0.518713592539272	0.261776117235003	0.182339259701447	0.425471720998092	206	0	794	0.794	0.206	0.412
ORF3a	all	ss13	67	AAA	ACA	AAA	2	AACAGCTTG:AATAAAAGA	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	2	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.58333333333334	8	28.083333333333343	0.203403693684308	0.358311508790663	0.567672789441835	-0.154907815106355	0.0669720504284831	0.16944247099115	0.603270309428306	0.346708742745578	0.193379418748469	0.423099013220362	184	0	816	0.816	0.184	0.368
ORF3a	all	ss13	68	AGA	AAA	GAT	2	AAAAGATGG:AGCTTGTGG	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.583333333333333	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.83333333333334	8	27.666666666666675	0.170137650782942	0.365261231304204	0.465797178023649	-0.195123580521262	0.0600070841265802	0.188531116529509	0.444805371606478	0.295010462702901	0.862981917735661	0.821120608405169	110	0	890	0.89	0.11	0.22
ORF3a	all	ss13	69	TGG	GAT	GGC	2	AGATGGCAG:TTGTGGCAG	1:1	FALSE	2.58333333333333	0	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78	9	28.25000000000001	0.156222782397911	0.414750411612527	0.376666973736146	-0.258527629214616	0.0578836625812483	0.20006432604528	0.308029875169708	0.221395381824827	0.203115871486955	0.203085966632814	51	0	949	0.949	0.051	0.102
ORF3a	all	ss13	70	CAG	GGC	AGC	2	TGGCAGCGC:TGGCAGCTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.08333333333334	10	28.50000000000001	0.17448602671933	0.473103037489357	0.368811892743884	-0.298617010770027	0.0610314652175995	0.2248496790863	0.246652345660379	0.134843949077473	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	71	CGC	AGC	GCT	2	CAGCGCTGC:CAGCTAGCC	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.83333333333334	11	28.333333333333346	0.191746695912757	0.546809392339506	0.350664598302482	-0.355062696426749	0.0645912813546616	0.283215876183164	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	72	GCC	GCT	CCC	2	CGCTGCCTT:CTAGCCCTT	1:1	TRUE	1.25	0.75	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.08333333333334	11	28.50000000000001	0.191038422684604	0.542117211529546	0.35239320689635	-0.351078788844943	0.058381113073105	0.246668327385601	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	73	CTT	CCC	TTT	2	GCCCTTTAT:TGCCTTTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	77.50000000000001	10	28.083333333333343	0.173430571160122	0.482949898333899	0.359106755707849	-0.309519327173777	0.0622354441350682	0.227953188656081	0.27411095317627	0.190169417474832	0.251204951602879	0.217897299947829	26	0	974	0.974	0.026	0.052
ORF3a	all	ss13	74	TAT	TTT	ATA	2	CTTTATAAG:CTTTATCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.00000000000001	10	27.91666666666668	0.188485821210679	0.487008418426164	0.387027850195686	-0.298522597215485	0.0614180372279925	0.229097531063719	NA	NA	0.232131969258778	0.198441731510372	41	0	959	0.959	0.041	0.082
ORF3a	all	ss13	75	AAG	ATA	AAA	2	TATAAGGGC:TATCAAAGC	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.16666666666667	10	27.91666666666668	0.20465023999998	0.487008418426164	0.420219101471256	-0.282358178426184	0.0634308615910146	NA	0.283825855489981	0.138725840673828	0.239205293744801	0.237840746995937	52	0	948	0.948	0.052	0.104
ORF3a	all	ss13	76	AGC	AAA	GCT	2	AAGGGCTTC:CAAAGCTTC	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.50000000000001	9	27.41666666666668	0.227287577010071	0.431776444265285	0.526401057836367	-0.204488867255214	0.0733928626813392	0.198916531218045	0.391975873151037	0.179290594299306	0.221584836385889	0.35608702430026	124	0	876	0.876	0.124	0.248
ORF3a	all	ss13	77	TTC	GCT	TCC	2	AGCTTCCAA:GGCTTCCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.16666666666669	8	27.083333333333343	0.228450345406382	0.375466090193812	0.608444680819135	-0.147015744787429	0.070603063687058	0.173492179524821	0.490800828984464	0.215087211624477	0.21136114311468	0.486700309586201	194	0	806	0.806	0.194	0.388
ORF3a	all	ss13	78	CAA	TCC	AAC	2	TTCCAACTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.33333333333334	8	26.75000000000001	0.227867466473375	0.381563200668848	0.597194556691899	-0.153695734195473	0.0701164315253435	0.169152362529206	0.505096692006969	0.237071971362136	0.192048300569185	0.423538573749212	174	0	826	0.826	0.174	0.348
ORF3a	all	ss13	79	CTT	AAC	TCA	2	CAACTTGTT:CAGTTCATT	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.66666666666667	8	26.75000000000001	0.2267106539047	0.381563200668848	0.594162784847427	-0.154852546764147	0.0664014850937162	0.184824753197662	0.515639910783762	0.249205054082598	0.214307339716946	0.469942693146224	175	0	825	0.825	0.175	0.35
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TCA	TTT	2	CTTGTTTGC:TTCATTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.16666666666667	7	27.25000000000001	0.228450345406382	0.314491607077193	0.726411580676328	-0.0860412616708106	0.071775138674934	0.144799542337858	0.594969533456812	0.222115434246041	0.161530312938105	0.59426670905572	280	0	720	0.72	0.28	0.56
ORF3a	all	ss13	81	TGC	TTT	GCA	2	ATTTGCAAT:GTTTGCAGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.83333333333334	6	26.91666666666668	0.226136674284849	0.26452672930594	0.854872681026153	-0.0383900550210916	0.0716076003418248	0.128371017521649	NaN	NaN	0.138566311586776	0.781740281858341	417	0	583	0.583	0.417	0.834
ORF3a	all	ss13	82	AAT	GCA	ATT	2	TGCAATTTA:TGCAGTCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.66666666666667	6	27.583333333333343	0.2267106539047	0.256899645924678	0.882487218262539	-0.0301889920199777	0.0688799505838511	0.121782194463627	0.861121212504607	0.30545197646231	0.143386010328064	0.83324350676663	417	0	583	0.583	0.417	0.834
ORF3a	all	ss13	83	CTG	ATT	TAC	2	AATTTACTG:AGTCTGTTA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.66666666666667	6	27.583333333333343	0.2092680072815	0.256899645924678	0.814590485433586	-0.0476316386431782	0.0700182649713254	0.12278532287592	NaN	NaN	0.140300976556892	0.734236011617121	363	0	637	0.637	0.363	0.726
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TAG	2	CTGTTAGTT:TTACTGCTG	1:1	FALSE	1.25	1	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.33333333333334	6	27.41666666666668	0.207190032471119	0.258764472899753	0.800689639305257	-0.0515744404286347	0.0679117713897917	0.13166789544073	0.8030855593512	0.318756449210783	0.139820056454381	0.712229870269342	363	0	637	0.637	0.363	0.726
ORF3a	all	ss13	85	CTG	TAG	TGC	2	CTGCTGCTA:TTAGTTGGT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.166666666666667	0.5	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	77.75000000000001	6	28.41666666666668	0.205912255736412	0.247968200054092	0.830397832026422	-0.04205594431768	0.0655533742525102	0.119592961355878	NaN	NaN	0.133075895293926	0.751979913547285	381	0	619	0.619	0.381	0.762
ORF3a	all	ss13	86	CTA	TGC	GTT	2	CTGCTATTT:GTTGGTTTT	1:1	TRUE	1.58333333333333	1	0.166666666666667	0.25	2	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.08333333333334	6	28.583333333333343	0.188257162672323	0.246256582903472	0.764475655646194	-0.057999420231149	0.0636771128354025	0.113544577363609	NaN	NaN	0.128561780960977	0.651888322888736	324	0	676	0.676	0.324	0.648
ORF3a	all	ss13	87	TTT	GTT	TTC	2	CTATTTGTT:GGTTTTCTC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.416666666666667	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.66666666666669	6	29.916666666666675	0.156968578879544	0.233376267232886	0.672598721115481	-0.0764076883533421	0.0527196505291019	0.109132047072318	NaN	NaN	0.123160009481943	0.534998649167392	231	0	769	0.769	0.231	0.462
ORF3a	all	ss13	88	CTC	TTC	TCA	2	TTTCTCACA:TTTGTTACC	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.58333333333334	6	29.08333333333334	0.154934610949651	0.24126182510618	0.642184526629788	-0.0863272141565292	0.0545847231489295	0.113963952846214	0.63152447919978	0.309210583346804	0.121157674959657	0.476143098905223	230	0	770	0.77	0.23	0.46
ORF3a	all	ss13	89	ACA	TCA	CAG	2	CTCACAGTC:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.08333333333334	6	29.58333333333334	0.140432198903081	0.236467295831908	0.593875776390265	-0.0960350969288273	0.0530662128719235	0.10607196234745	NaN	NaN	0.11502352869827	0.403764454993412	197	0	803	0.803	0.197	0.394
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CAG	TCT	2	ACAGTCTAT:ACCATCTAT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.25000000000001	6	29.58333333333334	0.155668085942854	0.236467295831908	0.658307041551785	-0.080799209889054	0.053615674319051	0.118841504683703	NaN	NaN	0.124452797994782	0.516185985417493	234	1	765	0.765	0.234	0.468
ORF3a	all	ss13	91	TAT	TCT	ATG	2	ATCTATTCA:GTCTATGTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.25000000000001	5	29.58333333333334	0.171562720556584	0.191510018856633	0.895842011717508	-0.0199472983000491	0.0565504745733225	0.0961717877795431	NaN	NaN	0.100024444460148	0.841930904556385	427	0	573	0.573	0.427	0.854
ORF3a	all	ss13	92	GTA	ATG	CAC	2	TATGTACAC:TATTCACAT	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	78.91666666666669	5	28.91666666666667	0.16993600795279	0.196557091159957	0.864563099453365	-0.0266210832071671	0.0549765465012012	0.0992205595741369	NaN	NaN	0.110066032446314	0.808885036621197	429	0	571	0.571	0.429	0.858
ORF3a	all	ss13	93	CAC	CAC	ACC	2	GTACACCTA:TCACATCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.91666666666669	5	28.58333333333334	0.136897596837873	0.199182311241131	0.687297963282209	-0.0622847144032588	0.044843159978926	0.10720096547907	NaN	NaN	0.102581078480108	0.543734470358764	273	0	727	0.727	0.273	0.546
ORF3a	all	ss13	94	CTA	ACC	TAT	2	CACCTATTG:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.666666666666667	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.91666666666669	5	27.91666666666667	0.136897596837873	0.20465023999998	0.668934455380487	-0.0677526431621076	0.0440830847341168	0.111962326367667	NaN	NaN	0.112752190941803	0.547907469745847	273	0	727	0.727	0.273	0.546
ORF3a	all	ss13	95	TTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:CTTTTGCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.08333333333334	6	28.250000000000004	0.151718018390913	0.249703998029926	0.607591466648163	-0.0979859796390134	0.04711749918057	0.122842817265327	NaN	NaN	0.112642600567171	0.384363879263939	174	1	825	0.825	0.174	0.348
ORF3a	all	ss13	96	CTG	TGC	TGG	2	TTGCTGGCA:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.416666666666667	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.08333333333334	6	29.250000000000004	0.153847312516879	0.23964200873058	0.64198807768234	-0.0857946962137003	0.049697567830016	0.111852482674959	NaN	NaN	0.115333022760553	0.456945051057293	203	1	796	0.796	0.203	0.406
ORF3a	all	ss13	97	GCA	TGG	CAG	2	CTGGCAGCT:CTTGTCGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.91666666666669	6	30.166666666666668	0.154208039717062	0.231110927283054	0.667246856433554	-0.0769028875659924	0.0490392057788933	0.109312338997473	NaN	NaN	0.110942060854924	0.48819620282320503	223	1	776	0.776	0.223	0.446
ORF3a	all	ss13	98	GCT	CAG	CTG	2	GCAGCTGCT:GTCGCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	78.75000000000003	6	30.333333333333332	0.154570468491074	0.229625165344413	0.673142546285094	-0.075054696853339	0.0511454344958792	0.104940699378198	NaN	NaN	0.110163017404048	0.495678047669461	217	0	783	0.783	0.217	0.434
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.9166666666667	6	29.666666666666668	0.152068784169476	0.235686824877377	0.645215464413823	-0.0836180407079008	0.0478921360834748	0.111761963704451	NaN	NaN	0.110380324670466	0.448723537988673	236	0	764	0.764	0.236	0.472
ORF3a	all	ss13	100	GGG	CAG	GGC	2	GCAGGTATG:GCTGGGCTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.08333333333337	6	29.499999999999996	0.149647052546842	0.237252996159118	0.630748841824864	-0.0876059436122754	0.0468884766097867	0.111078453902836	0.512184275582337	0.218140363629632	0.112418566504008	0.435812681600862	213	0	787	0.787	0.213	0.426
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GGC	TAG	2	GGGCTAGAA:GGTATGGAG	1:1	FALSE	2	0	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.4166666666667	6	29.83333333333333	0.148969278730818	0.234141361979703	0.636236491798196	-0.0851720832488851	0.046051790338851	0.110698098000499	0.494936188194517	0.198620423681862	0.108248160594672	0.431385807793103	179	0	821	0.821	0.179	0.358
ORF3a	all	ss13	102	GAA	TAG	AAG	2	ATGGAGGCG:CTAGAAGCC	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.58333333333337	5	29.83333333333333	0.15067539576423	0.189683904532547	0.794349927241066	-0.0390085087683172	0.0457160173135346	0.0962472915268306	NaN	NaN	0.0966363214072361	0.686460540958007	329	0	671	0.671	0.329	0.658
ORF3a	all	ss13	103	GCC	AAG	CCC	2	GAAGCCCCA:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.4166666666667	5	29.999999999999996	0.151021335369834	0.18848582121068	0.801234461031581	-0.0374644858408459	0.0482315038409018	0.0933745291033379	NaN	NaN	0.0920787469232211	0.684100231639102	311	0	689	0.689	0.311	0.622
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CCC	AAT	2	GCCCCATTT:GCGCAATTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.25000000000004	5	30.499999999999996	0.166773778676097	0.184981141936135	0.901571786888826	-0.0182073632600383	0.0493039997898383	0.0937508630721007	NaN	NaN	0.0928563549379398	0.844546798347592	433	0	567	0.567	0.433	0.866
ORF3a	all	ss13	105	TTT	AAT	TTC	2	CAATTTTTG:CCATTTCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.25000000000004	6	30.499999999999996	0.151368872535542	0.228158530802244	0.66343726882928	-0.076789658266702	0.0456397807413625	0.110872368615376	NaN	NaN	0.10138029391698	0.448785304412767	222	0	778	0.778	0.222	0.444
ORF3a	all	ss13	106	CTT	TTC	TGT	2	TTTCTTTAT:TTTTTGTAC	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.58333333333337	6	30.166666666666664	0.15067539576423	0.231110927283054	0.651961365633266	-0.0804355315188237	0.0470199837158229	0.110877199706065	NaN	NaN	0.108268655025053	0.457526859773926	216	0	784	0.784	0.216	0.432
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TGT	ACC	2	CTTTATCTT:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.58333333333337	5	30.999999999999996	0.152775220957486	0.181605039003649	0.841249900309302	-0.0288298180461622	0.0466013016952834	0.0892492179944823	NaN	NaN	0.0859515913887157	0.737308851188803	376	0	624	0.624	0.376	0.752
ORF3a	all	ss13	108	CTC	ACC	TCT	2	TACCTCTAT:TATCTTTTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.66666666666671	5	31.41666666666666	0.152597995025823	0.178884786483983	0.853051833110949	-0.0262867914581607	0.0458446636853613	0.0831368326362879	NaN	NaN	0.0832609917841979	0.752218407773465	376	0	624	0.624	0.376	0.752
ORF3a	all	ss13	109	TAT	TCT	ATG	2	CTCTATGCC:CTTTTAGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.5	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.83333333333337	5	31.58333333333333	0.152244778069162	0.177819473768805	0.856176069146992	-0.0255746956996429	0.0466607469662223	0.0883466422354721	NaN	NaN	0.079584781412084707	0.747943967970365	383	0	617	0.617	0.383	0.766
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ATG	CCC	2	TATGCCTTG:TTAGCCCTA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.83333333333337	5	31.749999999999996	0.137054385390789	0.176766832783369	0.775339939245002	-0.0397124473925802	0.0460045509408166	0.0859086142665823	NaN	NaN	0.0826874281294089	0.631034074123096	309	0	691	0.691	0.309	0.618
ORF3a	all	ss13	111	CTA	CCC	TAA	2	GCCCTAATC:GCCTTGATA	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.1666666666667	5	32.416666666666664	0.138321779350139	0.172678550040526	0.801036256776982	-0.0343567706903863	0.0458010135672469	0.0839826499098459	NaN	NaN	0.0774191815466424	0.657204579352751	331	0	669	0.669	0.331	0.662
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TAA	TAT	2	CTAATCTAC:TTGATATAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.00000000000004	5	32.58333333333333	0.134891598224071	0.171685985854599	0.785687879838432	-0.0367943876305279	0.0460930318902752	0.0813763894900905	NaN	NaN	0.0752121747686668	0.624694540111312	333	0	667	0.667	0.333	0.666
ORF3a	all	ss13	113	TAC	TAT	ACT	2	ATATATTTT:ATCTACTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.50000000000004	5	33.416666666666664	0.133985500074053	0.166890228132415	0.802836101151141	-0.0329047280583624	0.0450486260986707	0.0805144720479326	NaN	NaN	0.0760787716151757	0.665371754786974	325	0	675	0.675	0.325	0.65
ORF3a	all	ss13	114	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTTA:TATTTTCTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.33333333333337	6	33.58333333333333	0.134286173586739	0.204066610769614	0.658050687862624	-0.0697804371828753	0.0432732232270834	0.0884754849637242	NaN	NaN	0.0803481592312658	0.385133878521086	204	0	796	0.796	0.204	0.408
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TCT	TAC	2	TTCTTACAG:TTTCTACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.66666666666671	6	33.58333333333333	0.135502521566611	0.204066610769614	0.664011231703112	-0.0685640892030032	0.0433500306426307	0.0907460202386042	NaN	NaN	0.0866848083762318	0.428968187525698	213	0	787	0.787	0.213	0.426
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAT	2	CTACAATGC:TTACAGTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.00000000000004	6	33.916666666666664	0.149817463962042	0.201765204947521	0.742533699014206	-0.0519477409854787	0.0468023352666508	0.0831926458510816	NaN	NaN	0.0840094454498781	0.5363407238651	254	0	746	0.746	0.254	0.508
ORF3a	all	ss13	117	TGC	AAT	GCA	2	CAATGCATC:CAGTGTGTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.83333333333337	6	34.416666666666664	0.150159457687719	0.198409364312814	0.756816384185258	-0.0482499066250946	0.047156645948022	0.0855020445075362	NaN	NaN	0.0844305778386323	0.567678166455623	297	0	703	0.703	0.297	0.594
ORF3a	all	ss13	118	ATC	GCA	TCA	2	TGCATCAAC:TGTGTTGTT	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	80.1666666666667	6	35.083333333333336	0.151543243677375	0.194105738514483	0.780725211099659	-0.0425624948371081	0.0470160276231697	0.0835788353485078	NaN	NaN	0.0818453646137005	0.603038834674101	321	0	679	0.679	0.321	0.642
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TCA	ACG	2	ATCAACGCA:GTTGTTTTT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.00000000000004	5	34.24999999999999	0.149817463962042	0.162356129339379	0.922770606638898	-0.0125386653773369	0.0459717238791748	0.0752913722765263	NaN	NaN	0.0780483710754876	0.872367108491371	440	0	560	0.56	0.44	0.88
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT:GTTTTTGGT	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.75	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.1666666666667	5	34.75	0.136429382099394	0.15975246858483	0.854004844544539	-0.0233230864854358	0.045448544031217	0.0733068113436628	NaN	NaN	0.0742976847721969	0.753586325651382	383	0	617	0.617	0.383	0.766
ORF3a	all	ss13	121	GGT	CAT	GTA	2	GCATGTAGA:TTTGGTAGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.75	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.75000000000003	4	34.916666666666664	0.122304211428858	0.124314847835042	0.98382625695	-0.00201063640618385	0.0417157240183721	0.0630796204098551	NaN	NaN	0.0702177529367837	0.977156253540211	508	0	492	0.492	0.508	0.984
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GTA	GAA	2	GGTAGGTTT:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.16666666666669	4	35.583333333333336	0.123283681565969	0.12178588422283	1.01229861204931	0.00149779734313836	0.0420014612159386	0.0634558538946348	NaN	NaN	0.0752781094087509	0.984125657010274	507	0	493	0.493	0.507	0.986
ORF3a	all	ss13	123	ATT	GAA	TTA	2	AGAATTATT:AGGTTTTTA	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	79.08333333333334	4	35.416666666666664	0.123424890893523	0.122408407943652	1.0083040288404	0.00101648294987136	0.0416811242300053	0.0653695133510832	NaN	NaN	0.0737436765864296	0.989002306263225	530	0	470	0.47	0.53	0.94
ORF3a	all	ss13	124	ATT	TTA	TAT	2	ATTATTATG:TTTTTATTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.58333333333334	4	35.25	0.107929984092779	0.12303734291849899	0.877213222690225	-0.0151073588257201	0.0398484435005403	0.0626171800853372	NaN	NaN	0.0697672515946955	0.828567316538099	431	0	569	0.569	0.431	0.862
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TAT	TAA	2	ATTATGAGA:TTATTAAGG	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.166666666666667	0.5	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.25000000000001	4	35.41666666666667	0.093977517058638	0.122408407943652	0.767737434359072	-0.0284308908850139	0.0372646242868165	0.0618198711903098	NaN	NaN	0.071414845992137	0.690549861543939	347	0	653	0.653	0.347	0.694
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TAA	GAT	2	ATGAGATGT:TTAAGGTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.25000000000001	5	36.25	0.0787608262631878	0.152421181209951	0.516731504361585	-0.0736603549467635	0.0320711585554241	0.0729026909420703	NaN	NaN	0.0736589653733753	0.31730137841326	156	0	844	0.844	0.156	0.312
ORF3a	all	ss13	127	TGT	GAT	GTT	2	AGATGTTGG:AGGTGTTGG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.91666666666667	5	36.91666666666667	0.0931427851735378	0.149375201835214	0.6235491837279	-0.0562324166616758	0.0359932449234055	0.0683387720644928	NaN	NaN	0.0744000242345685	0.449762037484943	227	1	772	0.772	0.227	0.454
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GTT	GGC	2	TGTTGGCTT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.58333333333334	5	36.91666666666667	0.107929984092779	0.149375201835214	0.722542850264024	-0.0414452177424345	0.0392010078377583	0.0678489117284535	NaN	NaN	0.0776263261909597	0.593406067710944	287	0	713	0.713	0.287	0.574
ORF3a	all	ss13	129	CTT	GGC	TTT	2	TGGCTTTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	79.08333333333334	5	36.41666666666667	0.108664266868125	0.151648059986963	0.716555601683702	-0.0429837931188387	0.0396972987606175	0.0705660164127818	NaN	NaN	0.0762868355735005	0.573128715769432	295	0	705	0.705	0.295	0.59
ORF3a	all	ss13	130	TGC	TTT	GCT	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	80.00000000000001	5	36.16666666666667	0.121889197123331	0.152810715724973	0.797648231310598	-0.0309215186016417	0.0427515883091492	0.0688347266004323	NaN	NaN	0.0766861729344104	0.68678523727073	343	1	656	0.656	0.343	0.686
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GCT	GGA	2	TGCTGGAAA:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	79.83333333333334	5	36.16666666666667	0.152244778069162	0.152810715724973	0.996296479254575	-5.659376558107e-4	0.0529203598909436	0.068457995784156	NaN	NaN	0.0839273928573127	0.994619760241054	524	0	476	0.476	0.524	0.952
ORF3a	all	ss13	132	AAA	GGA	AAT	2	TGGAAATGC:TGGAAGTGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.50000000000001	5	35.833333333333336	0.16853783682123	0.154389040653112	1.09164378577822	0.0141487961681186	0.0517410748850994	0.0710262896042498	NaN	NaN	0.0906871537842774	0.87601911281304	544	0	456	0.456	0.544	0.912
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AAT	GCA	2	AAATGCAAG:AAGTGCAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.25000000000001	5	35.083333333333336	0.182501746911826	0.158062767299148	1.15461566332332	0.0244389796126771	0.0544635728533533	0.0726648808765683	NaN	NaN	0.0915035336797227	0.789405750028364	640	0	360	0.36	0.64	0.72
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCC:TGCAAGTCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.41666666666667	5	35.083333333333336	0.182073635926153	0.158062767299148	1.15190717610025	0.0240108686270044	0.0556286259641598	0.070984260934076	NaN	NaN	0.0879426449357297	0.784831131224643	627	0	373	0.373	0.627	0.746
ORF3a	all	ss13	135	TCC	AAT	CCA	2	AAATCCAAG:AAGTCCAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.75	5	35.083333333333336	0.183798305951801	0.158062767299148	1.16281847453642	0.0257355386526527	0.0567504346557202	0.075262728034288	NaN	NaN	0.0880413575600715	0.770048142444007	632	1	367	0.367	0.632	0.734
ORF3a	all	ss13	136	AAG	CCA	AGA	2	TCCAAGAAC	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.75	5	35.75	0.183798305951801	0.154788747544192	1.18741387127851	0.0290095584076087	0.0554255485445357	0.07255559738392	NaN	NaN	0.0858537593463081	0.73544229460686	657	1	342	0.342	0.657	0.684
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AGA	ACC	2	AAGAACCCA:AAGAACCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.41666666666667	5	34.91666666666667	0.182073635926153	0.158903109406266	1.14581543814003	0.0231705265198873	0.0550633115200198	0.0776620950555922	NaN	NaN	0.0876369507761647	0.791477718591802	608	0	392	0.392	0.608	0.784
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA:AACCCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.75	5	34.91666666666667	0.183798305951801	0.158903109406266	1.15666903334085	0.0248951965455355	0.0559250762492033	0.0723919654236071	NaN	NaN	0.090694249327865	0.7837035798189	619	2	379	0.379	0.619	0.758
ORF3a	all	ss13	139	CTT	CAT	TAC	2	CCATTACTT:CCTCTTATT	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	1	0	0	1	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.75	5	34.91666666666667	0.183798305951801	0.158903109406266	1.15666903334085	0.0248951965455355	0.0543174810885991	0.0758780885819679	NaN	NaN	0.0903072394558512	0.782799839776636	627	0	373	0.373	0.627	0.746
ORF3a	all	ss13	140	ATT	TAC	TTT	2	CTTATTTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.33333333333334	5	35.41666666666667	0.184892999968705	0.156408563919793	1.18211557816949	0.0284844360489122	0.0555228941669832	0.0729309940918934	NaN	NaN	0.0898502073732701	0.751227385261974	664	0	336	0.336	0.664	0.672
ORF3a	all	ss13	141	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79	6	35.583333333333336	0.185778237042605	0.190999228388671	0.972664856344644	-0.00522099134606652	0.055509987484575	0.0760608241526731	NaN	NaN	0.0908813516199524	0.954187981789265	471	0	529	0.529	0.471	0.942
ORF3a	all	ss13	142	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGCC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.83333333333334	6	36.41666666666668	0.186224058338554	0.186038038359055	1.00099990292921	1.86019979499297e-4	0.0552746460116071	0.0808141285774546	NaN	NaN	0.0913996275127223	0.9983761162795	489	0	511	0.511	0.489	0.978
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ATG	CCA	2	GATGCCAAC:GATGCCTCC	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.41666666666667	7	36.83333333333334	0.203900474239319	0.219162920712879	0.930360270688513	-0.0152624464735597	0.0609821936142864	0.0917858586926866	0.729618304228936	0.202262222457582	0.0949077977021468	0.872240363970734	464	0	536	0.536	0.464	0.928
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CCA	ACT	2	GCCAACTAC:GCCTCCTAC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.75	7	37.16666666666668	0.219740343511106	0.216883469282523	1.01317239270487	0.002856874228583	0.0608071885056204	0.0949123243862093	NaN	NaN	0.0979003944895372	0.976719885775875	485	0	515	0.515	0.485	0.97
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTT:TCCTACTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.08333333333334	7	37.16666666666668	0.21866495405835	0.216883469282523	1.00821401825469	0.00178148477582774	0.0591633816186843	0.0878885618474084	0.636646698537145	0.113277511121168	0.096549558354789	0.98527866340698	511	0	489	0.489	0.511	0.978
ORF3a	all	ss13	146	TTT	ACT	TTG	2	TACTTTGTT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.08333333333334	7	37.16666666666668	0.21866495405835	0.216883469282523	1.00821401825469	0.00178148477582774	0.0590561613322712	0.0861460495725909	0.802805272984864	0.20916538352214	0.0947418629288571	0.984997809884499	503	0	497	0.497	0.503	0.994
ORF3a	all	ss13	147	GTT	TTG	TTT	2	TTTGTTTGC:TTTGTTTGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.25	7	36.500000000000014	0.218131224556612	0.221491146757304	0.984830444693244	-0.00335992220069167	0.0596486306917027	0.0932324771605291	0.689379739486512	0.153126514273767	0.100385147955134	0.973299540324853	508	0	492	0.492	0.508	0.984
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TTT	GCT	2	GTTTGCTGG:GTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.41666666666666	7	37.33333333333335	0.220826439413092	0.215761554338836	1.02347445581664	0.00506488507425668	0.0588098596110807	0.0830241166450343	0.816249252936869	0.209887477102058	0.0969010502131056	0.958314649311759	519	0	481	0.481	0.519	0.962
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC:TGTTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.99999999999999	7	37.916666666666686	0.222199362107379	0.211925228838758	1.0484799913862	0.0102741332686216	0.0615119508603314	0.0823381095477712	0.736022929767602	0.154295761000016	0.0980020277949906	0.916506002812761	527	0	473	0.473	0.527	0.946
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA:TGGCATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.33333333333331	7	37.250000000000014	0.221099655165484	0.216321047091377	1.02209035199468	0.00477860807410707	0.0617015298899393	0.0886348952226395	0.842243603428918	0.224926130310224	0.0949462984437768	0.959859745899556	527	0	473	0.473	0.527	0.946
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT:CATACACAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.66666666666664	7	37.250000000000014	0.223310144300941	0.216321047091377	1.032308909852	0.00698909720956464	0.0603936205481986	0.0913087247102655	0.649969308132406	0.1122315033757	0.0951348391247013	0.941435958795248	536	0	464	0.464	0.536	0.928
ORF3a	all	ss13	152	CAC	CAC	ACA	2	ACACACACT:ACACATAAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.33333333333331	7	36.58333333333335	0.221099655165484	0.220904431633438	1.00088374656227	1.9522353204543e-4	0.0596434967778166	0.0897538664883579	0.715067478761744	0.16160158324262	0.104424470697591	0.998508340522603	488	0	512	0.512	0.488	0.976
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ACA	ACT	2	CACACTCAT:CATAACTAT	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.16666666666664	9	37.08333333333335	0.224997455190221	0.293223013063023	0.767325363858332	-0.0682255578728024	0.0600515487612393	0.127607503249354	0.617849832189746	0.214262914703616	0.131619088306988	0.604209835086369	301	0	699	0.699	0.301	0.602
ORF3a	all	ss13	154	CAT	ACT	ATG	2	AACTATGAC:ACTCATGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.33333333333331	9	36.58333333333335	0.224432171139643	0.298143042551514	0.752766756584183	-0.0737108714118708	0.0615456342419046	0.122299746368736	0.619252720077535	0.224135395445035	0.13936939951705	0.59688280620618706	295	0	705	0.705	0.295	0.59
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ATG	ACT	2	CATGACTAT:TATGACTAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.66666666666666	9	36.58333333333335	0.223310144300941	0.298143042551514	0.74900337230696	-0.0748328982505723	0.0591445833221295	0.127667520950348	0.511884951027441	0.143405547051904	0.133610461839417	0.575423080899038	252	0	748	0.748	0.252	0.504
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT:GACTATTGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	76.99999999999999	9	36.58333333333335	0.22556561551435	0.298143042551514	0.756568436358453	-0.0725774270371632	0.0586886274199314	0.129366409701972	NaN	NaN	0.131220897353581	0.580199378745889	290	0	710	0.71	0.29	0.58
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA:TATTGTATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.99999999999999	10	36.58333333333335	0.243317923578779	0.339965723440354	0.715713105181524	-0.0966477998615752	0.0613878782351174	0.142530959661279	0.42728684004921	0.0939307198288397	0.137951097403272	0.483556022402515	254	0	746	0.746	0.254	0.508
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA:TGTATTCCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.83333333333331	10	36.250000000000014	0.243941664762154	0.343931200066584	0.70927460118456	-0.0999895353044307	0.0625134429914636	0.140203745130958	0.410020157033976	0.0836565412778224	0.143755344515226	0.486708485621512	235	0	765	0.765	0.235	0.47
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAT:ATTCCGTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.33333333333333	10	36.416666666666686	0.245832397240244	0.341936766681188	0.71894110605968	-0.0961043694409441	0.0630678021640391	0.135559555778389	0.435554291719721	0.0988131521486776	0.140944398944131	0.495327383638197	216	0	784	0.784	0.216	0.432
ORF3a	all	ss13	160	TAC	CAT	ACA	2	CCATATAAC:CCGTACAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.66666666666666	10	36.75000000000002	0.244568640424989	0.338017654584825	0.723538067043818	-0.0934490141598359	0.0620646043347551	0.139730699893981	0.459994093673271	0.115735250542406	0.139997700251182	0.504450304542989	224	0	776	0.776	0.224	0.448
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ACA	ACA	2	TACAATAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.16666666666666	11	36.416666666666686	0.242697391695876	0.386559590829672	0.627839529669862	-0.143862199133797	0.0634837875975139	0.157795041388688	0.386180249713498	0.103998997497869	0.169565158807972	0.396205004243637	150	0	850	0.85	0.15	0.3
ORF3a	all	ss13	162	AGT	ACA	GTA	2	AACAGTGTC:AATAGTATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77	12	36.25000000000002	0.243317923578779	0.436713440811101	0.5571569382588	-0.193395517232323	0.063766470154708	0.167787195870865	NA	NA	0.195599118653512	0.322793257507082	96	0	904	0.904	0.096	0.192
ORF3a	all	ss13	163	ATT	GTA	TCA	2	AGTATTACT:AGTGTCACA	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	76.33333333333334	12	36.25000000000002	0.245832397240244	0.436713440811101	0.562914658142107	-0.190881043570857	0.0645542356135302	0.178156524874328	0.34094894845179	0.0987338172191764	0.199938163427065	0.339729230141116	122	0	878	0.878	0.122	0.244
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TCA	CAG	2	ATTACTGAA:GTCACAGAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	77.16666666666669	11	36.08333333333335	0.242697391695876	0.391246232330452	0.620318795788147	-0.148548840634577	0.0661076051352438	0.16615026912779499	0.356716008907998	0.0820398635661978	0.173409933963706	0.391647204283939	163	0	837	0.837	0.163	0.326
ORF3a	all	ss13	165	GAA	CAG	AAA	2	ACAGATACA:ACTGAAACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	78.00000000000001	12	35.58333333333335	0.23964200873058	0.447898874313349	0.53503597011259	-0.208256865582769	0.0623626163918455	0.221514084509073	0.300230583966416	0.0747356159718518	0.195419615205685	0.286563485235586	90	0	910	0.91	0.09	0.18
ORF3a	all	ss13	166	ACA	AAA	CAA	2	GAAACCATA:GATACAATT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.41666666666669	12	35.166666666666686	0.220826439413092	0.455194503834612	0.485125451983326	-0.23436806442152	0.0616738402643379	0.200004093030914	0.264323642242186	0.066454376345859	0.203881028095236	0.25033607628778	67	0	933	0.933	0.067	0.134
ORF3a	all	ss13	167	ATA	CAA	TAG	2	ACAATTGTC:ACCATAGTC	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.25000000000001	12	35.33333333333335	0.221373552730839	0.452247062674235	0.489496938734791	-0.230873509943396	0.0621745162207062	NA	0.275285673119506	0.0753805828157239	0.200639476129824	0.249860466485972	73	0	927	0.927	0.073	0.146
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TAG	TCC	2	ATAGTCCTC:ATTGTCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.75000000000001	12	35.33333333333335	0.22303140124308	0.452247062674235	0.493162741454299	-0.229215661431155	0.0608694586254227	0.187274180959013	0.263300930838309	0.0610683335990558	0.200853826033994	0.253784063010526	55	0	945	0.945	0.055	0.11
ORF3a	all	ss13	169	CTC	TCC	TCA	2	GTCCTCACT:GTCGTTACT	1:1	TRUE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.25000000000001	12	35.500000000000014	0.221373552730839	0.449338673183752	0.492665256614383	-0.227965120452912	0.0600160675278849	0.192404634323852	0.288831265253372	0.0880602300150817	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	170	ACT	TCA	CTG	2	CTCACTGCA:GTTACTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.08333333333334	11	34.83333333333335	0.21866495405835	0.409907779776052	0.533449143555692	-0.191242825717702	0.0644004511415462	0.180458717525814	0.369274839736706	0.148574298915762	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	171	GAA	CTG	AAG	2	ACTGAAGGT:ACTGCAGGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	16	79.41666666666667	11	34.500000000000014	0.234622119670259	0.415196475115379	0.565086973835843	-0.180574355445121	0.0622903456054908	0.186421521596282	0.401239957122396	0.159026955184017	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	172	GGA	AAG	GAG	2	GAAGGTGAC:GCAGGAGAT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.25000000000001	12	34.33333333333335	0.218131224556612	0.470546852247873	0.463569618019048	-0.252415627691261	0.058739224058824	0.216065731430612	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GAG	ACG	2	GGAGATGGT:GGTGACGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	79.66666666666669	12	34.58333333333335	0.216808309568067	0.465830061577934	0.465423611420995	-0.249021752009868	0.0598880579838078	0.215167860566775	NA	NA	0.216216928080448	0.249435406538536	49	0	951	0.951	0.049	0.098
ORF3a	all	ss13	174	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATT:GATGGTGTA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.33333333333336	12	35.25000000000001	0.221099655165484	0.453715851393363	0.487308641491113	-0.23261619622788	0.0601183490553549	0.210735024636818	0.274728067804135	0.076098650484052	0.207450531163528	0.262156256275261	72	0	928	0.928	0.072	0.144
ORF3a	all	ss13	175	ATT	GCA	TAA	2	GGCATTTCA:GGTGTAACT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.83333333333336	12	35.75000000000001	0.222753358291529	0.445047583344664	0.500515824886569	-0.222294225053136	0.0609318343176748	0.191152243359254	0.301772595721029	0.097199229801175	0.199414507651016	0.264964226034307	76	0	924	0.924	0.076	0.152
ORF3a	all	ss13	176	ACT	TAA	CAA	2	ATTTCAACA:GTAACTATT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	77.41666666666669	11	36.08333333333334	0.224150600850135	0.391246232330452	0.572914401028184	-0.167095631480317	0.0612351505594267	0.193920316792598	0.446065525756613	0.199011566796053	0.178010969738935	0.347894215545875	116	0	884	0.884	0.116	0.232
ORF3a	all	ss13	177	ACA	CAA	CAC	2	ACTATTCCT:TCAACACCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	78.33333333333336	12	35.83333333333334	0.221099655165484	0.4436359012621	0.498380889681104	-0.22253624609661601	0.0578830791661739	0.212866923147627	0.288361055646701	0.0839304281345515	0.200463352864648	0.266951900586859	67	0	933	0.933	0.067	0.134
ORF3a	all	ss13	178	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ATTCCTATA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.83333333333336	12	35.83333333333334	0.202663072619289	0.4436359012621	0.456822975874434	-0.240972828642811	0.0569339018822119	0.213760066196361	0.264772958928763	0.0844664901642507	0.190281784060328	0.20536995360323201	43	0	957	0.957	0.043	0.086
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTC:CCTATAAAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	78.41666666666669	12	36.25000000000001	0.203900474239319	0.436713440811102	0.466897638553597	-0.232812966571782	0.0558535344195902	NA	0.290053213421531	0.107464132368881	0.198266618346041	0.24029815576978	44	0	956	0.956	0.044	0.088
ORF3a	all	ss13	180	AAA	AAC	AAA	2	AAACTCAAA:ATAAAAACA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.50000000000001	12	36.50000000000001	0.189869585440857	0.432665530833062	0.438836865685321	-0.242795945392206	0.0560051214939387	0.195337832639389	0.251632372929324	0.0811660146887938	0.186757722525134	0.19358095507308	44	0	956	0.956	0.044	0.088
ORF3a	all	ss13	181	AAA	AAA	AAG	2	AAAACACAA:CTCAAAGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.50000000000001	12	36.83333333333334	0.157344163604509	0.427386723161588	0.368154074699741	-0.270042559557079	0.0466496288060961	0.189262801051253	0.194641337074497	0.0585644929207615	0.195416106926541	0.167007057356728	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	182	CAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGAC:ACACAAGAC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.50000000000001	12	36.83333333333334	0.141595553474679	0.427386723161588	0.331305456630069	-0.285791169686909	0.0438127794740088	0.191156446726855	0.181472733373019	0.0679031977118047	0.217683628491578	0.189225419176578	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	CAAGACTAC:GAAGACTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.25000000000001	13	37.58333333333334	0.128426768784144	0.463804422121597	0.276898543133066	-0.335377653337454	0.0424597768851459	0.206686523165264	0.14592472926893	0.0577562237508223	0.192497640829948	0.0814659453277907	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.41666666666669	13	38.08333333333334	0.12997618937868	0.455422870822123	0.285396710850399	-0.325446681443442	0.0436521943414096	0.191154612641479	0.15169163824937	0.0599138864842197	0.190633685390842	0.0877879516471654	2	1	997	0.997	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.91666666666669	14	37.91666666666667	0.144852934121868	0.508409781321868	0.284913743683785	-0.3635568472	0.0468472123493912	0.236682351869325	0.131447775008984	0.0301963490906543	0.199704273093069	0.0686865395553544	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	75.91666666666669	14	37.91666666666667	0.144852934121868	0.508409781321868	0.284913743683785	-0.3635568472	0.0463723960459563	0.220618058750622	0.136895686276037	0.0374112986966571	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.58333333333336	15	37.75000000000001	0.161796742774019	0.565949969830206	0.285885239683925	-0.404153227056188	0.0489044149105956	NA	0.127431415521091	0.0248681996892858	0.248922320661883	0.10445867692927	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAT:GGTGGTTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	75.91666666666669	15	37.75000000000001	0.177511154654184	0.565949969830206	0.313651672615938	-0.388438815176023	0.0525251177351818	NaN	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	189	TAT	GTT	ATT	2	GGTTATTCT:GGTTTTGTA	1:1	FALSE	1.08333333333333	0.75	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.08333333333336	15	37.00000000000001	0.191038422684604	0.583278426441006	0.32752526756435	-0.392240003756402	0.0489724648558816	NA	NA	NA	0.244587800971783	0.108785112348922	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	190	GTA	ATT	CTG	2	TATTCTGAG:TTTGTAGAA	1:1	TRUE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.25000000000003	15	36.25000000000001	0.187801514593863	0.601759854393703	0.312087144435849	-0.41395833979984	0.0495536526579066	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	191	GAA	CTG	AAA	2	GTAGAAAAA:TCTGAGGAT	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.4166666666667	16	37.41666666666667	0.190102201146667	0.633249524128026	0.300201095939921	-0.443147322981359	0.0529322129586246	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	192	AAA	AAA	AAT	2	GAAAAATGG:GAGGATAGG	1:1	TRUE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	75.9166666666667	16	36.25	0.19438950408697	0.665970168935947	0.291889206385258	-0.471580664848977	0.0523617411778085	NA	NA	NA	0.305757925094309	0.122992592856657	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	193	AGG	AAT	GGC	2	AAATGGGAG:GATAGGCAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.166666666666667	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	74.50000000000003	17	37.333333333333336	0.181329278360777	0.700731928032625	0.258771252039103	-0.519402649671848	0.0524649548600411	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	ACT	2	AGGCACTCA:TGGGAGTCT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	74.1666666666667	17	37.666666666666664	0.18225176997286	0.690543996706516	0.263924921282485	-0.508292226733656	0.0527504630251574	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	195	TCA	ACT	CAG	2	CACTCAGGT:GAGTCTGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	74.00000000000003	16	37.166666666666664	0.165670373685146	0.639971159894683	0.258871624328211	-0.474300786209538	0.0493846210991473	NA	0.139512907845356	0.0635193129258276	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	196	GGT	CAG	GTG	2	TCAGGTGTT:TCTGGTGTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.1666666666667	16	36.666666666666664	0.162798378928371	0.653879226977491	0.248973162339006	-0.49108084804912	0.0494392621763225	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	197	GTC	GTG	TCA	2	GGTGTCAAG:GGTGTTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.6666666666667	17	36.333333333333336	0.161597898479986	0.733331861643627	0.220361212886339	-0.571733963163641	0.0478168225291109	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TCA	AAG	2	GTCAAGGAC:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.83333333333336	17	35.83333333333333	0.158864717514625	0.750892631745481	0.21156782048232	-0.592027914230856	0.0470739926646637	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT:AAGGACTAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.08333333333336	17	35.916666666666664	0.160610991304224	0.747902915912637	0.214748449146286	-0.587291924608413	0.0492650141030646	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATG	2	GACTATGTC:GACTATGTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.9166666666667	17	35.916666666666664	0.161004298535341	0.747902915912637	0.215274329207386	-0.586898617377296	0.0478317321126723	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	201	GTC	ATG	TCG	2	TATGTCGTT:TATGTTACA	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.58333333333337	17	35.916666666666664	0.159442558228446	0.747902915912637	0.21318617007113	-0.588460357684191	0.0504862203911562	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	202	ACA	TCG	CAC	2	GTCGTTGTA:GTTACACTC	1:1	TRUE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	2	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.75000000000004	17	36.75	0.16139954421812	0.719359620392829	0.224365588007265	-0.557960076174709	0.0478863191866766	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	203	CTC	CAC	TAC	2	ACACTCATA:GTTGTACAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.58333333333337	15	36.916666666666664	0.161796742774019	0.585272843252511	0.276446694288552	-0.423476100478493	0.0480676184384876	0.241154778959024	0.129289977713991	0.0325012272509014	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	204	ATA	TAC	ATG	2	CTCATAGGC:GTACATGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	74.25000000000004	15	37.25	0.148448225790773	0.57737985101115	0.257106695931283	-0.428931625220377	0.0459490135200491	0.250835566395848	0.127004588302117	0.0429301390906242	0.247827072546346	0.083492821322778	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	205	GGC	ATG	GCC	2	ATAGGCCTT:CATGGCTAT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	74.08333333333337	14	36.75	0.148817627628935	0.53186064142979	0.279805678474104	-0.383043013800855	0.0483993407213415	0.222811315141481	0.144277376148119	0.0524575966498984	0.237069011111937	0.106149508011381	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	206	CTT	GCC	ATT	2	GGCCTTTTC:GGCTATTTC	1:1	TRUE	1	1	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	73.4166666666667	14	37.416666666666664	0.150313866488423	0.518191864153376	0.290073767819582	-0.367877997664953	0.0486485866535651	0.226229388237769	0.144500852080656	0.0447050586946143	0.197606784949445	0.0626500663072386	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ATT	TCA	2	CTTTTCACT:TATTTCACC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.75000000000003	14	37.08333333333333	0.133190264783882	0.524933685486366	0.253727791655202	-0.391743420702484	0.0445335565074723	0.224278990547698	0.130511177246076	0.0518824584228138	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	208	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGAA:TTCACTGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.08333333333336	14	38.416666666666664	0.134520967864149	0.499003426396138	0.269579246851419	-0.364482458531989	0.0442174773727428	0.23221634389594	0.155425280170258	0.0828361373393	0.204923112732321	0.0753003922704326	4	0	996	0.996	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CCG	AAA	2	ACCGAAGTT:ACTGAAATA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	72.25000000000003	14	37.24999999999999	0.136222315966333	0.521540117365088	0.261192401947048	-0.385317801398755	0.0446328041500499	NA	0.130377194437971	0.0451387063004393	0.222743106455495	0.0836525545423629	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	210	ATA	AAA	TAC	2	GAAATACAT:GAAGTTTAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	70.58333333333336	14	36.24999999999999	0.139757852131042	0.542615923209463	0.257563123662871	-0.402858071078421	0.0445442929754884	0.248173190365269	0.13599049256287	0.0582278104650779	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	211	CAT	TAC	ACT	2	ATACATTAC:GTTTACTAC	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	68.75000000000003	13	35.91666666666666	0.143865810138876	0.494202238982722	0.291107159763204	-0.350336428843846	0.0491784645521171	0.216652225433579	0.152905685782172	0.0569317077870638	0.195472390407247	0.0730920791023852	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	CATTACCAG:TACTACCAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	67.08333333333336	12	35.24999999999999	0.147816328175158	0.453715851393363	0.32579053105862	-0.305899523218206	0.0484390749693204	0.212308902983024	0.174494027820673	0.0618934403671906	0.18960464168195	0.106667487881464	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTT:TACCAGTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	67.08333333333336	12	35.24999999999999	0.147816328175158	0.453715851393363	0.32579053105862	-0.305899523218206	0.0485065675180887	0.199755410733962	NA	NA	0.185298642107538	0.0987700233462941	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	214	CTT	AGC	TGG	2	CAGCTTGAG:CAGTTGGAA	1:1	TRUE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	67.41666666666669	12	34.58333333333332	0.147008907301978	0.465830061577935	0.315584843975088	-0.318821154275957	0.0472746215178625	0.220843085300008	0.15579273687342	0.0427985006009576	0.201488705726293	0.11357478718379	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	215	GAA	TGG	AAT	2	CTTGAGTCT:TTGGAATCT	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	67.08333333333336	11	34.58333333333332	0.147816328175158	0.413861226224391	0.357163993166669	-0.266044898049233	0.0499387635095766	0.175568771123058	0.195065645227638	0.0671014637746345	0.172308975843142	0.122588558489315	16	0	984	0.984	0.016	0.032
ORF3a	all	ss13	216	TCT	AAT	CTA	2	GAATCTACT:GAGTCTACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	67.33333333333336	11	34.33333333333332	0.147209931783496	0.417893658242937	0.352266489045204	-0.270683726459441	0.0481047199058431	0.18202904754799001	0.194029040218526	0.0694417517052456	0.186634767028205	0.146963941200202	22	0	978	0.978	0.022	0.044
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CTA	CAC	2	TCTACACAA:TCTACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	68.6666666666667	11	33.66666666666666	0.144058298804489	0.429051936755032	0.335759581681459	-0.284993637950543	0.0472789700934663	0.187004448177769	0.187235832013239	0.0729338752480508	0.182593837238178	0.118569426353307	16	0	984	0.984	0.016	0.032
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT:ACTCAAATT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	69.08333333333337	11	33.24999999999999	0.143100987654802	0.436342234072309	0.32795584859908	-0.293241246417506	0.0486046991397795	NA	0.211204173491949	0.120473176682191	0.183957321620904	0.110919871916872	10	0	990	0.99	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TTA	2	CAAATTACT:CAAATTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	68.00000000000003	11	33.66666666666666	0.145617010830718	0.429051936755032	0.339392503229413	-0.283434925924314	0.0488290242064374	0.195778835515994	0.188040775757516	0.0710922403074248	0.204524658581508	0.165801032137771	14	0	986	0.986	0.014	0.028
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TTA	CAG	2	ATTACTACA:ATTTCAGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	66.83333333333336	12	34.66666666666666	0.148427757405898	0.464279406304668	0.319694897922087	-0.31585164889877	0.0482213332479413	0.209002721051434	0.161500604379462	0.0477566394299482	0.193911106289583	0.103345275556461	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CAG	CAG	2	ACTACAGAC:TCAGCTGAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	66.1666666666667	12	35.33333333333332	0.13184534303006	0.452247062674236	0.291533884709896	-0.320401719644176	0.0441897061037649	0.195238260622266	0.131240902017659	0.0263262813743739	0.173792431042085	0.0652431396381492	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT:GCTGACACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	65.66666666666669	11	35.833333333333314	0.132943691128056	0.394838206251804	0.336704222192906	-0.261894515123748	0.0452964324297516	0.169500861960943	0.178063867259023	0.0586352534011359	0.157943120160836	0.0972857496864974	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	65.33333333333336	11	36.16666666666665	0.133686173554739	0.390063711884091	0.342729070871542	-0.256377538329352	0.0466732443754426	0.167544129285873	0.192224639064976	0.0745926214515125	0.152956899172738	0.0937103107181452	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	65.6666666666667	11	35.83333333333332	0.132943691128056	0.394838206251804	0.336704222192906	-0.261894515123748	0.044712637129034	0.178393936061073	0.246907009099532	0.172665659002025	0.15415195554363	0.0893309883003743	17	0	983	0.983	0.017	0.034
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	TTA	2	GGTATTAAC:GGTATTGAA	1:1	FALSE	0.916666666666667	0.75	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	66.1666666666667	11	35.33333333333332	0.13184534303006	0.402228531800232	0.32778714737109	-0.270383188770172	0.0450805629673276	0.172306521782869	0.171059480811336	0.0553374341002059	0.169474591155781	0.110618298341774	6	0	994	0.994	0.006	0.012
ORF3a	all	ss13	226	AAC	TTA	AAA	2	ATTAACAAC:ATTGAAAAT	1:1	TRUE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	66.58333333333336	12	34.83333333333332	0.130943856595945	0.461209824939353	0.283913849001727	-0.330265968343409	0.0458596343355601	0.19229063405196	0.179249863302789	0.113216489441867	0.200760847556645	0.0999550468534387	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	227	AAC	AAA	ACG	2	AACAACGCG:GAAAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	GCG	ACG	CGA	2	AACGCGACG:AATGCTACA	1:1	FALSE	1.08333333333333	1	0.916666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CGA	CAT	2	GCGACGTTT:GCTACATTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC:ACGTTTTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC:TTTTTCCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTTT:TTCCTTTTC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TTC	TCT	TCT	2	ATCTTTAAC:CTTTTCTCT	1:1	FALSE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	TCT	ACA	2	TTCTCTAAA:TTTAACAAG	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAA	ACA	AAT	2	AACAAGCTT:TCTAAATAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	CTT	AAT	ATG	2	AAATATGAT:AAGCTTGTT	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GAT	ATG	ATA	2	CTTGTTAAA:TATGATAGA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	ATA	AAG	2	GATAGAGAA:GTTAAAGAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.25	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	GAA	AAG	AAA	2	AAAGACCCA:AGAGAAAGT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	AGT	AAA	CA-	0	GAAAGT---:GACCCA---	1:1	TRUE	0.333333333333333	0	2	0.666666666666667	1	0	2	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	NA	NA	0	AGT---GAG:CCA---CCG	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	AGA	0	---CCGAAT:---GAGAGC	1:1	TRUE	0.833333333333333	0.666666666666667	1.5	0	0	0	2	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	AGA	ATG	2	CCGAATGTG:GAGAGCGTC	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTC	ATG	TCC	2	AATGTGCAA:AGCGTCCAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TCC	AAA	2	GTCCAAGTT:GTGCAAATA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC:CAAGTTCAC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA:GTTCACACA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCA:GACGGCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCA	GCT	CAT	2	GGCTCATCA:GGCTCTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CAT	CAG	2	TCATCAGGA:TCTTCAGGA	1:1	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT:GTTGTAAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAT	CTA	AT-	1	GCTAATCCA:GTAAAT---	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	---	ATC	CAG	1	AAT------:AATCCAGCA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	---	CAG	CAA	1	---------:CCAGCAATG	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	---	CAA	TGG	1	---------:GCAATGGAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	---	TGG	ATC	1	------CCA:ATGGATCCA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	--C	CAA	1	---CCAATT:GATCCAATT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATT	CAA	TTT	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGAG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAG	ATG	AGC	2	GATGAGCCA:GATGAGCCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCA	AGC	CAA	2	GAGCCAACG:GAGCCGACG	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CAA	CGA	2	CCAACGCCG:CCGACGACG	1:1	FALSE	1.08333333333333	1	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT:ACGCCGACT	1:1	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT:CCGACTACT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTC	2	GTGCCTCTC:GTGCCTTTG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	CTC	CTC	TCT	2	CCTCTCTAA:CCTTTGTAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.00000000000001	3	33.83333333333332	0.0728728113402358	0.0943651299007743	0.772243003499939	-0.0214923185605385	0.0392535923406266	0.0614863110847074	NA	NA	0.0727315450802595	0.767610408714725	405	0	595	0.595	0.405	0.81
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.33333333333334	4	34.16666666666666	0.0735883919688925	0.127288788480472	0.57812155215997	-0.0537003965115794	0.0404729764763235	0.0725732127336897	NaN	NaN	0.0844248739622167	0.524728737351869	262	1	737	0.737	0.262	0.524
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.66666666666667	4	34.499999999999986	0.0743181769831732	0.125949614506391	0.590062758623226	-0.0516314375232181	0.0403306373244371	0.0700239875309078	NaN	NaN	0.0796581704375729	0.516879864610191	254	0	746	0.746	0.254	0.508
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA:TTTATGAGT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.83333333333333	4	34.33333333333332	0.0741343759774745	0.126615652181289	0.585507199941824	-0.0524812762038146	0.039486435323247	0.0702378061850826	NaN	NaN	0.0856892933166241	0.540233365353174	287	0	713	0.713	0.287	0.574
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATTT:ATGAGTATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.16666666666667	4	34.999999999999986	0.073769490149132	0.123992985319038	0.594948899402018	-0.0502234951699057	0.0412348490369971	0.0704378683811902	NaN	NaN	0.0823347349986182	0.541867384598199	255	0	745	0.745	0.255	0.51
ORF3a	all	ss13	7	ATT	GAT	TTT	2	AGATTTTTT:AGTATTTTC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333333	4	35.33333333333332	0.0578600049104132	0.122722067836352	0.471471887090176	-0.0648620629259384	0.0371917168445274	0.0724842351056908	NaN	NaN	0.0800914493515955	0.418026372497604	187	1	812	0.812	0.187	0.374
ORF3a	all	ss13	8	TTC	TTT	TCA	2	ATTTTCACG:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.16666666666667	4	35.16666666666666	0.0427669289697661	0.123354245726484	0.346700097089436	-0.0805873167567176	0.0331321888094098	0.0671594194133134	NA	NA	0.0832961693129032	0.333304501334793	146	5	849	0.849	0.146	0.292
ORF3a	all	ss13	9	ACG	TCA	CGC	2	TTCACGCTT:TTTACTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73	4	34.999999999999986	0.0422647024133488	0.123992985319038	0.340863656960919	-0.081728282905689	0.0319939845555835	0.0679657780456265	NaN	NaN	0.0808290567934232	0.311956589377991	134	1	865	0.865	0.134	0.268
ORF3a	all	ss13	10	CTT	CGC	TTA	2	ACGCTTGGA:ACTCTTAGA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.5	4	35.49999999999999	0.0425646124443371	0.122096350832699	0.34861494347739	-0.0795317383883624	0.0303081721507161	0.0687241668983663	NA	NA	0.0802582712063998	0.321711184987337	146	1	853	0.853	0.146	0.292
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TTA	GAT	2	CTTAGATCA:CTTGGATCA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.83333333333333	5	35.166666666666664	0.0423642016009181	0.157645932730055	0.268730064057285	-0.115281731129137	0.0345998498762794	0.0807641603711283	NA	NA	0.0924150963501552	0.212238414910949	72	0	928	0.928	0.072	0.144
ORF3a	all	ss13	12	TCA	GAT	CAA	2	AGATCAATT:GGATCAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.91666666666667	4	35.666666666666664	0.0423143935004423	0.121476995958792	0.348332564256004	-0.0791626024583498	0.032308772539217497	0.0656030140539355	NA	NA	0.0782756138575884	0.311857742562542	130	1	869	0.869	0.13	0.26
ORF3a	all	ss13	13	ATC	CAA	TCA	2	TCAATCACA:TCAATTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.91666666666667	5	35.666666666666664	0.0423143935004423	0.155190536855492	0.272660913209186	-0.11287614335505	0.0324652503625027	0.0817693718437484	NA	NA	0.0861282031120933	0.190006596169753	69	0	931	0.931	0.069	0.138
ORF3a	all	ss13	14	ACA	TCA	CAC	2	ATCACACGT:ATTACTGCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.58333333333334	5	35.49999999999999	0.0425143321315748	0.156000428408735	0.272527021657809	-0.11348609627716	0.0322978454312044	0.0808207927820546	NaN	NaN	0.085552506574515	0.184671441045149	63	0	937	0.937	0.063	0.126
ORF3a	all	ss13	15	CGT	CAC	CAC	2	ACACGTCAA:ACTGCACAG	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.08333333333334	5	34.99999999999999	0.042215127927666	0.158481820250405	0.266372053658679	-0.116266692322739	0.0314494516827298	0.0805817580671815	NA	NA	0.0874223108772585	0.183537045074255	68	2	930	0.93	0.068	0.136
ORF3a	all	ss13	16	CAA	CAC	AAC	2	CGTCAACCG:GCACAGCCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75000000000001	5	35.33333333333333	0.0138732279313668	0.15681884839392	0.0884665846832272	-0.142945620462553	0.0141024151403001	0.0853884000113171	NA	NA	0.07840122094387	0.0682643876631549	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	17	CCA	AAC	CAG	2	CAACCGAGT:CAGCCAGTA	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.58333333333334	6	35.49999999999999	0.0139053809368069	0.191510018856633	0.0726091565330409	-0.177604637919827	0.0136853141611262	0.0920459618085817	0.117889673072835	0.537955444119891	0.0943465946655665	0.0597722238746027	2	2	996	0.996	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	18	AGT	CAG	GTA	2	CCAGTAAAA:CCGAGTAAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.08333333333334	6	35.666666666666664	0.0138093659583391	0.190491169998981	0.0724934702139369	-0.176681804040642	0.0139703543415817	0.0893472746819971	0.151292604930416	0.631824311361257	0.0882730628111976	0.0453345472445356	5	0	995	0.995	0.005	0.01
ORF3a	all	ss13	19	AAA	GTA	AAA	2	AGTAAGATT:GTAAAAATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75000000000001	5	35.49999999999999	0.0138732279313668	0.156000428408735	0.0889307040556183	-0.142127200477368	0.0141204109221502	0.0806078406891296	NA	NA	0.0805868952660723	0.0777906676775777	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	20	ATT	AAA	TTG	2	AAAATTGAC:AAGATTGAA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.00000000000001	5	34.58333333333333	0.0136367393123929	0.160610991304224	0.0849053928480063	-0.146974251991831	0.0130310533246058	0.0860665226088089	NaN	NaN	0.0840337300498213	0.0802925454333624	13	3	984	0.984	0.013	0.026
ORF3a	all	ss13	21	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT:ATTGACAAT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.83333333333336	5	34.91666666666666	0.0136678042173386	0.158903109406266	0.0860134472409493	-0.145235305188927	0.0137643186722807	0.0791508705778929	NA	NA	0.0825074329870065	0.0783621488766186	10	2	988	0.988	0.01	0.02
ORF3a	all	ss13	22	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT:GACAATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.25000000000003	5	34.66666666666666	0	0.160180575223544	0	-0.160180575223544	0	0.0819613061737045	NA	NA	0.0803998247697057	0.0463381457974775	0	6	994	0.994	0	0.001
ORF3a	all	ss13	23	GCT	ATG	CTT	2	AATGCTTCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.25000000000003	5	34.99999999999999	0	0.158481820250405	0	-0.158481820250405	0	0.0815423332879267	NA	NA	0.0796117889982736	0.0465157691566261	0	5	995	0.995	0	0.001
ORF3a	all	ss13	24	TCT	CTT	CTC	2	GCTTCTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.58333333333336	6	35.83333333333333	0	0.189483161783181	0	-0.189483161783181	0	0.0898999090285214	0	NaN	0.0858624207911056	0.0273264301978581	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	25	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666669	6	35.24999999999999	0	0.193059006111768	0	-0.193059006111768	0	0.0915027774948316	NA	NA	0.0909409760851158	0.0337618564556302	0	2	998	0.998	0	0.001
ORF3a	all	ss13	26	GCA	CTG	CAA	2	CCTGCAAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000001	6	34.58333333333333	0	0.19731556308439	0	-0.19731556308439	0	0.0923045196540763	NA	NA	0.0940735057861997	0.0359527357259707	0	5	995	0.995	0	0.001
ORF3a	all	ss13	27	AGT	CAA	GTA	2	GCAAGTACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666669	6	33.916666666666664	0	0.201765204947521	0	-0.201765204947521	0	0.0991095598105399	NA	NA	0.0915281828301468	0.0274958581776214	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	28	ACT	GTA	CTG	2	AGTACTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.66666666666669	7	34.58333333333333	0.01369901098297	0.235909286040997	0.058068977329656	-0.222210275058027	0.0140056522609745	0.104729924281647	0.0628520501944311	0.355538646913438	0.099697053862393	0.0258235553541621	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	29	GTT	CTG	TTC	2	ACTGTTCAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666669	7	33.75	0.013423177093157	0.242785843567104	0.0552881374627881	-0.229362666473947	0.0130303810521614	0.102654960075718	NA	NA	0.105963097089457	0.0304219865988961	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	30	CAT	TTC	ATG	2	GTTCATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.66666666666669	8	33.25	0.013333684515963	0.290131947007622	0.0459573123659239	-0.276798262491659	0.0131590493730247	0.132239881160232	NA	NA	0.123569842647921	0.0250899693524326	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	31	GCT	ATG	CTA	2	CATGCTACA:CATGCTACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333336	9	33.583333333333336	0.0134835092215562	0.331581375185359	0.0406642538774042	-0.318097865963803	0.0129452979273177	0.143989714613786	0.0408512789529265	0.319531157300499	0.132843010998028	0.0166412410361984	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	32	ACA	CTA	CAG	2	GCTACAGCA:GCTACTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333336	9	33.583333333333336	0.0133932130500048	0.331581375185359	0.0403919340841078	-0.318188162135354	0.0135223412725513	0.140556867853672	0.0456105075122611	0.375841755463302	0.142270858216618	0.0253193188924576	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	33	GCA	CAG	CAA	2	ACAGCAACG:ACTGCAACG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.1666666666667	9	33.416666666666664	0.0132453773639628	0.333664006808512	0.0396967521029747	-0.320418629444549	0.0134489122659937	0.133869709602214	0.0469665139967421	0.397991403427954	0.136102906573382	0.0185607248252217	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	34	ACG	CAA	CGA	2	GCAACGATA	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.50000000000003	9	33.08333333333333	0.0131871529184001	0.337910093969753	0.0390256259097739	-0.324722941051353	0.0132157588925975	0.140090200467844	0.0408974702000496	0.339966824801259	0.142307153363665	0.0224984619576789	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	35	ATA	CGA	TAC	2	ACGATACCG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.58333333333337	9	32.25	0.0131726767040263	0.349022437266925	0.0377416329081218	-0.335849760562899	0.0134470585648541	0.155208876415852	0.0387239598003281	0.329742545914578	0.143965872133608	0.0196563929160579	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	36	CCG	TAC	CGC	2	ATACCGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.75000000000003	9	31.249999999999996	0.0131438194165355	0.363381236586463	0.0361708808633219	-0.350237417169927	0.0133985456441199	0.15469936333328899	0.0398935195675078	0.364573065407938	0.14790890936162	0.0178880920805825	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	37	CTA	CGC	TAC	2	CCGCTACAA	2	FALSE	1	1	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.00000000000003	9	30.749999999999996	0.0131007697802931	0.37102218137708	0.0353099368120486	-0.357921411596787	0.0130285334304871	0.162539188709824	0.0405057022591292	0.383357023981729	0.157818818263997	0.0233337133420134	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	38	CAA	TAC	AAG	2	CTACAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.1666666666667	9	31.41666666666666	0.0130722263514627	0.360905050411733	0.0362206800280281	-0.34783282406027	0.0133264306468716	0.156023455544918	0.0388058497252599	0.350622791983611	0.165165299173421	0.0352071377295646	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	39	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.83333333333337	9	32.08333333333333	0.0131294381352109	0.351334800597847	0.0373701612048373	-0.338205362462636	0.0130706695671263	0.142859582793264	0.0419492788029992	0.373014172620192	0.146125253777257	0.0206408877143986	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	40	TCA	CCT	CAC	2	GCCTCACTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.83333333333337	9	32.08333333333333	0.0131294381352109	0.351334800597847	0.0373701612048373	-0.338205362462636	0.0129210392145878	0.160868480678489	0.038334653178189	0.329639529895849	0.145676061680017	0.0202530715241377	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	41	CTC	CAC	TCC	2	TCACTCCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000003	9	31.749999999999993	0.0130155110198637	0.356054425493677	0.0365548356878795	-0.343038914473814	0.0129961572482121	0.148719787846847	0.0381748402199159	0.338282884430463	0.157870956122605	0.0297873133215557	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	42	CCT	TCC	CTT	2	CTCCCTTTC:CTCCCTTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.1666666666667	9	32.08333333333333	0.0130722263514627	0.351334800597847	0.0372073199956806	-0.338262574246384	0.0132938082070195	0.15297181842093	0.0417143458465478	0.37241704452249	0.150892321182064	0.024977657282386	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	43	TTC	CTT	TCG	2	CCTTTCGGA:CCTTTTGGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000003	9	31.749999999999996	0.0130155110198637	0.356054425493677	0.0365548356878795	-0.343038914473814	0.0127301794931117	0.153494924401957	0.0353087562027025	0.300533055846655	0.145930241805253	0.0187378947562494	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	44	GGA	TCG	GAT	2	TTCGGATGG:TTTGGATGG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.50000000000003	9	30.916666666666657	0.0128482799476378	0.368439033844524	0.0348722007371769	-0.355590753896887	0.0125959580752478	0.161246718091891	0.0354691308198069	0.325523563643333	0.159881457638166	0.0261423884024576	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	45	TGG	GAT	GGC	2	GGATGGCTT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.4166666666667	9	30.999999999999993	0.0128620515547158	0.367161168989029	0.0350310780144078	-0.354299117434314	0.0132009909299115	0.17224258171605	0.0363750989016563	0.335521893657154	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
ORF3a	all	ss13	46	CTT	GGC	TTG	2	TGGCTTGTT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.75000000000003	9	30.999999999999993	0.0129732964431592	0.367161168989029	0.0353340645441372	-0.35418787254587	0.0126633913369443	0.160465745774139	0.0388253718208364	0.362782084795476	0.158150337402733	0.0251192131584968	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	47	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTATT:CTTGTTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.16666666666669	9	30.58333333333333	0.0129035440872231	0.373642557445839	0.0345344603554523	-0.360739013358616	0.0124379133278	0.167873285518405	0.0371913607707033	0.353116457107936	0.163500601481393	0.02735973354856	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	48	ATT	TTA	TTG	2	GTTATTGGC:GTTGTTGGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000003	9	30.08333333333333	0.0259205062991005	0.381735453594316	0.0679017525226964	-0.355814947295216	0.0183325596280832	0.186806556774753	0.0649238323998843	0.295622024675188	0.157018153732239	0.0234467781425636	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	49	GGC	TTG	GCG	2	ATTGGCGTT:GTTGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333337	8	30.749999999999993	0.0262321821040851	0.319499782912404	0.0821039121371704	-0.293267600808319	0.0182063859549845	0.13992067988587	0.0846869639958373	0.332296365889276	0.14966327058147	0.0500523664791417	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	50	GTT	GCG	TTG	2	GGCGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.75000000000003	8	31.58333333333333	0.0265221005560517	0.309062449462982	0.0858146973277917	-0.28254034890692997	0.018467526936771	0.133206170537344	NaN	NaN	0.131878844091554	0.0321594098862256	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	51	GCA	TTG	CAC	2	GTTGCACTT:GTTGCATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666669	8	30.916666666666664	0.0262896575662818	0.317355464450165	0.08283978223545	-0.291065806883883	0.0184312284599827	0.138587734758534	0.0787321900555028	0.292720781095192	0.149520752268526	0.0515757193378191	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	52	CTT	CAC	TTC	2	GCACTTCTT:GCATTTCTT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75000000000001	8	31.583333333333332	0.0261749574292545	0.309062449462982	0.0846914837914969	-0.282887492033727	0.0187304385702892	0.133150441039711	0.0738494580377743	0.251459109607375	0.131040928975927	0.0308678575764164	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	53	CTT	TTC	TTG	2	CTTCTTGCT:TTTCTTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	7	31.583333333333332	0.026061253903872	0.262715660011633	0.0991994687439571	-0.236654406107761	0.018496729298911	0.118022526514829	0.0946677553010292	0.294698661621472	0.113399294305135	0.0368960436945446	0	1	999	0.999	0	0.001
ORF3a	all	ss13	54	GCT	TTG	CTG	2	CTTGCTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	7	31.25	0.0259485340559256	0.266078995344485	0.0975219183398179	-0.240130461288559	0.0191133344529795	0.116106016888185	NaN	NaN	0.116059148107938	0.0385427848328462	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	55	GTT	CTG	TTT	2	GCTGTTTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.25000000000003	7	31.083333333333332	0.0256709551422775	0.267793509240842	0.0958610057990246	-0.242122554098564	0.0183894767105904	0.11945412120272	NaN	NaN	0.127160691184005	0.0569013786574324	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	56	TTT	TTT	TTC	2	GTTTTTCAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.58333333333336	7	30.416666666666664	0.0252389746234555	0.274880898641229	0.0918178554720063	-0.249641924017773	0.018472234869499	0.12363528281724	0.0989123730105511	0.353265083347915	0.119763234068971	0.037118152972224	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	57	CAG	TTC	AGA	2	TTTCAGAGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.58333333333336	7	30.083333333333332	0.0252389746234555	0.27856879640113	0.0906023034507865	-0.253329821777674	0.0182660896183316	0.132015753200016	0.0817571623946204	0.267780647143041	0.125857820870375	0.0441329981721079	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	58	AGC	AGA	GCG	2	CAGAGCGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.91666666666669	7	30.083333333333332	0.0254531319881873	0.27856879640113	0.0913710807420642	-0.253115664412943	0.0180138683565406	0.12743245893351	0.088465055028761	0.301674372318276	0.123679388891226	0.0407025974512425	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	59	GCT	GCG	CTA	2	AGCGCTACC:AGCGCTTCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.75000000000003	8	30.75	0.0258367851740807	0.319499782912404	0.0808663622196083	-0.293662997738323	0.0185488533422327	0.141740052262397	0.0767103897721394	0.29180168727385	0.132249350795625	0.0263831464409465	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	60	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAAA:GCTTCCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.9166666666667	8	30.58333333333333	0.0257812709329177	0.321673722092295	0.0801472708595094	-0.295892451159377	0.0177214731545026	0.140838028884883	0.078092862227045	0.304746779881457	0.142470142551013	0.0378132442474914	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	61	AAA	CCA	AAA	2	ACCAAAATA:TCCAAAGTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.9166666666667	7	29.58333333333333	0.0254531319881873	0.284292259601151	0.0895315687591948	-0.258839127612963	0.017724978982657	0.128147710322182	NaN	NaN	0.1277616269559	0.0427695401101143	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	62	ATA	AAA	TAA	2	AAAATAATT:AAAGTGATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000003	7	29.249999999999996	0.0260047718198447	0.288242003650766	0.0902185368214136	-0.262237231830922	0.0181005556458907	0.130306378776279	0.0875182304703014	0.302609189665354	0.130273565401067	0.0441174197543854	0	0	1000	1	0	0.001
ORF3a	all	ss13	63	ATT	TAA	TTG	2	ATAATTGCG:GTGATTGCG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.91666666666669	6	28.91666666666666	0.0257812709329177	0.242903880611306	0.106137748265013	-0.217122609678389	0.018251670187671	0.113590862214038	NA	NA	0.111605220896692	0.0517205912380589	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	64	GCG	TTG	CGC	2	ATTGCGCTC:ATTGCGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333336	6	29.249999999999996	0.0257259947650973	0.23964200873058	0.107351774012294	-0.213916013965482	0.017811840926576	0.103213466022581	NaN	NaN	0.108356244935821	0.0483599341321033	0	2	998	0.998	0	0.001
ORF3a	all	ss13	65	CTC	CGC	TCA	2	GCGCTCAAT:GCGCTTCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.25000000000001	7	29.58333333333333	0.0256709551422775	0.284292259601151	0.0902977632183608	-0.258621304458873	0.0181123956879557	0.125270287316359	NaN	NaN	0.127058258347394	0.0418051617286403	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	66	AAT	TCA	ATA	2	CTCAATAAA:CTTCATAAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.91666666666669	7	28.58333333333333	0.0254531319881873	0.29648455248311	0.0858497745498471	-0.271031420494923	0.0174708205626794	0.136491104847312	0.0844083565607179	0.309116933295332	0.132652829356714	0.0410362545931399	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	67	AAA	ATA	AAA	2	AATAAAAGA:CATAAGAGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.58333333333336	6	27.916666666666664	0.0252389746234555	0.253250234920167	0.0996602219595639	-0.228011260296711	0.017593461811595	0.116968146342312	NaN	NaN	0.11271833856195	0.0430895580590112	1	0	999	0.999	0.001	0.002
ORF3a	all	ss13	68	AGA	AAA	GAT	2	AAAAGATGG:AAGAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.41666666666669	6	27.666666666666664	0.051467132797986	0.255977372918159	0.201061258701335	-0.204510240120173	0.0317678633128514	0.117418570779821	NaN	NaN	0.117669368782673	0.0822095002575121	20	0	980	0.98	0.02	0.04
ORF3a	all	ss13	69	TGG	GAT	GGC	2	AGATGGCAG	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.08333333333334	7	27.83333333333333	0.0516889101836223	0.306347708328316	0.168726283169146	-0.254658798144693	0.0319562611319773	0.134430383068864	0.178510297582072	0.344561497820519	0.142822039198669	0.0745782088008219	3	1	996	0.996	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	70	CAG	GGC	AGC	2	TGGCAGCTA:TGGCAGCTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.25	8	28.249999999999996	0.0659040642696657	0.355606480428288	0.185328636841184	-0.289702416158622	0.0360060344373413	0.155330386910864	0.169531991470496	0.274315671318737	0.162838469192383	0.0752268963946976	3	1	996	0.996	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	71	CTA	AGC	TAG	2	CAGCTAGCC:CAGCTCGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.91666666666666	9	28.249999999999996	0.0801652234595281	0.414750411612528	0.193285458470915	-0.334585188152999	0.0388722593687238	0.178115305648743	0.131815576097002	0.142557735422508	0.171994556919063	0.051735961288477	2	0	998	0.998	0.002	0.004
ORF3a	all	ss13	72	GCC	TAG	CCC	2	CTAGCCCTT:CTCGCTTTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.08333333333331	9	28.749999999999996	0.0799869383386865	0.405179631729213	0.197411054443484	-0.325192693390526	0.0387667892615258	0.170943815465818	0.137528715708593	0.151168308809864	0.167501586441231	0.0522060784165409	3	0	997	0.997	0.003	0.006
ORF3a	all	ss13	73	CTT	CCC	TGT	2	GCCCTTTAT:GCTTTGTAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.74999999999999	9	28.249999999999996	0.0792816652689177	0.414750411612528	0.191155121367269	-0.33546874634361	0.0381831034112215	0.165383852605931	0.137972415764936	0.165912169411432	0.170733531591459	0.0494295894374501	4	1	995	0.995	0.004	0.008
ORF3a	all	ss13	74	TAT	TGT	ATA	2	CTTTATAAG:TTGTATAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.74999999999999	8	28.083333333333332	0.0933500730718353	0.358311508790663	0.260527699450406	-0.264961435718828	0.0417932207091309	0.16081536551721	0.159075562633737	0.101471629747839	0.155192417209179	0.0877646041461512	7	0	993	0.993	0.007	0.014
ORF3a	all	ss13	75	AAA	ATA	AAG	2	TATAAAGGC:TATAAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.49999999999999	8	28.333333333333332	0.0936627429044699	0.354269507203646	0.264382739693793	-0.260606764299176	0.0414221414083841	0.151999422697173	0.225186398402647	0.240370288055334	0.147677048356715	0.0776129721913145	12	0	988	0.988	0.012	0.024
ORF3a	all	ss13	76	GGC	AAG	GCA	2	AAAGGCATG:AAGGGCTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.16666666666666	8	27.999999999999996	0.095366381613935	0.359679810196415	0.265142437552603	-0.26431342858248	0.0421366078847226	0.148146048813378	NaN	NaN	0.152689050239852	0.0834416227857225	11	0	989	0.989	0.011	0.022
ORF3a	all	ss13	77	ATG	GCA	TCC	2	GGCATGCAG:GGCTTCCAG	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.166666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.16666666666666	8	27.666666666666664	0.095366381613935	0.365261231304204	0.261090894517929	-0.269894849690269	0.0422727743421036	0.161471824943616	0.195521147396197	0.181758926034243	0.156658966402891	0.0849214859319723	8	0	992	0.992	0.008	0.016
ORF3a	all	ss13	78	CAG	TCC	AGC	2	ATGCAGCTT:TTCCAGTTC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.5	7	26.999999999999996	0.0806144362276048	0.318117930840238	0.253410538710219	-0.237503494612633	0.0387137237341897	0.144374897078977	0.210645471299149	0.22896890478613	0.140798483772874	0.091635514773489593	19	0	981	0.981	0.019	0.038
ORF3a	all	ss13	79	CTT	AGC	TCA	2	CAGCTTGTT:CAGTTCATT	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.33333333333333	7	27.499999999999996	0.0807955355010694	0.310948193753578	0.259836002022571	-0.230152658252508	0.037715505766131	0.143050701898375	NaN	NaN	0.141406911188219	0.103611575327867	21	0	979	0.979	0.021	0.042
ORF3a	all	ss13	80	ATT	TCA	TTT	2	CTTGTTTGC:TTCATTTGC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.83333333333333	6	27.999999999999996	0.0813437533100697	0.25235417746591	0.322339634425344	-0.17101042415584	0.0403513368143391	0.124954937349618	NaN	NaN	0.116068258412033	0.1406537695327	42	0	958	0.958	0.042	0.084
ORF3a	all	ss13	81	TGC	TTT	GCA	2	ATTTGCAAT:GTTTGCAAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.5	5	27.666666666666664	0.0806144362276048	0.206779411053799	0.389857171063472	-0.126164974826194	0.0387270946207314	0.104347040578311	NaN	NaN	0.0970558014942885	0.193627692597929	74	0	926	0.926	0.074	0.148
ORF3a	all	ss13	82	AAT	GCA	ATC	2	TGCAATCTG:TGCAATTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.33333333333333	5	28.33333333333333	0.0807955355010694	0.20119798994601	0.401572279736743	-0.12040245444494	0.0412743773037296	0.103372401189372	NA	NA	0.101527285051252	0.235656941757337	83	0	917	0.917	0.083	0.166
ORF3a	all	ss13	83	CTG	ATC	TAC	2	AATCTGCTG:AATTTACTG	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.33333333333333	5	28.33333333333333	0.0807955355010694	0.20119798994601	0.401572279736743	-0.12040245444494	0.0394012662378065	0.102186563737974	NaN	NaN	0.098108599895826	0.219733715655228	76	0	924	0.924	0.076	0.152
ORF3a	all	ss13	84	CTG	TAC	TGC	2	CTGCTGCTA:TTACTGCTG	1:1	FALSE	1.25	1	0	0.75	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.83333333333333	5	28.33333333333333	0.0802546646756371	0.20119798994601	0.398884028101737	-0.120943325270372	0.0383104194735516	0.0950827967155695	NaN	NaN	0.0954910850962957	0.205319644430305	73	0	927	0.927	0.073	0.146
ORF3a	all	ss13	85	CTA	TGC	TAC	2	CTGCTACTC:CTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.25	5	29.33333333333333	0.0798094452064726	0.193371831976575	0.412725288842176	-0.113562386770102	0.0374732846836752	0.0967910296223833	NaN	NaN	0.0957898989021595	0.235805535269146	80	0	920	0.92	0.08	0.16
ORF3a	all	ss13	86	CTA	TAC	TAT	2	CTACTCTTT:CTGCTATTT	1:1	FALSE	1.25	1	0.5	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.41666666666667	5	29.666666666666664	0.0796327387923167	0.19089739885116	0.417149417810586	-0.111264660058844	0.0393368018567446	0.0902948426781036	NaN	NaN	0.0966233720993466	0.249514480229188	88	0	912	0.912	0.088	0.176
ORF3a	all	ss13	87	TTT	TAT	TTG	2	CTATTTGTT:CTCTTTGTG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.58333333333334	5	30.416666666666664	0.0794568138723562	0.185556129985381	0.428209048542973	-0.106099316113025	0.0361647174012423	0.0883742185139388	NaN	NaN	0.0927752720248828	0.252782786298899	108	0	892	0.892	0.108	0.216
ORF3a	all	ss13	88	GTG	TTG	TGA	2	TTTGTGACA:TTTGTTACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.75	5	29.416666666666668	0.0782467920383731	0.192747196311253	0.405955539358499	-0.11450040427288	0.0374332719779898	0.0963995069659345	NaN	NaN	0.0979631295548454	0.242479701716817	81	1	918	0.918	0.081	0.162
ORF3a	all	ss13	89	ACA	TGA	CAA	2	GTGACAATT:GTTACCATC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.41666666666667	5	29.75	0.0785887320551954	0.190288706694225	0.41299735239401	-0.11169997463903	0.0362034253185291	0.0955788409019039	NaN	NaN	0.0918804033240612	0.224095208073484	74	0	926	0.926	0.074	0.148
ORF3a	all	ss13	90	ATC	CAA	TCT	2	ACAATTTAT:ACCATCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.08333333333333	5	29.416666666666668	0.0779078173603665	0.192747196311253	0.404196890286067	-0.114839378950886	0.0366267362463715	0.0980413657131136	NA	NA	0.0932813229359898	0.21828248975191	75	0	925	0.925	0.075	0.15
ORF3a	all	ss13	91	TAT	TCT	ATT	2	ATCTATTCA:ATTTATTCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.41666666666666	5	29.75	0.0785887320551954	0.190288706694225	0.41299735239401	-0.11169997463903	0.0362630800856739	0.0908156402401739	NA	NA	0.0933445888350356	0.23144646034703	99	0	901	0.901	0.099	0.198
ORF3a	all	ss13	92	TCA	ATT	CAC	2	TATTCACAC:TATTCACAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.41666666666666	5	29.75	0.0785887320551954	0.190288706694225	0.41299735239401	-0.11169997463903	0.0382763515649383	0.0952789515756716	NaN	NaN	0.0959075313652828	0.24415534102021	78	0	922	0.922	0.078	0.156
ORF3a	all	ss13	93	CAC	CAC	ACC	2	TCACACCTC:TCACATCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.75	5	29.083333333333332	0.0772386109180752	0.195270406950441	0.395546934757391	-0.118031796032366	0.0365145714976199	0.0957992691443493	NaN	NaN	0.0945073689571205	0.211695679568295	73	0	927	0.927	0.073	0.146
ORF3a	all	ss13	94	CTC	ACC	TCT	2	CACCTCTTA:CATCTTTTG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.41666666666667	5	28.75	0.0913178588331776	0.197860943283853	0.461525439622372	-0.106543084450676	0.0390281581944072	0.0976317360121855	NaN	NaN	0.100788102668011	0.290466036704229	117	1	882	0.882	0.117	0.234
ORF3a	all	ss13	95	TTA	TCT	TAC	2	CTCTTACTT:CTTTTGCTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.91666666666667	5	28.916666666666668	0.0907253574709978	0.196557091159957	0.461572548390869	-0.105831733688959	0.0393254308690292	0.0970309036817447	NaN	NaN	0.0950922436995526	0.265735229148952	104	2	894	0.894	0.104	0.208
ORF3a	all	ss13	96	CTT	TAC	TTG	2	TTACTTTTA:TTGCTTGTC	1:1	FALSE	1.08333333333333	1	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.91666666666667	5	29.583333333333332	0.0919181597303021	0.191510018856633	0.479965279514244	-0.0995918591263312	0.0411201260547009	0.106162043536242	NaN	NaN	0.0917601615416151	0.277766823927585	122	0	878	0.878	0.122	0.244
ORF3a	all	ss13	97	GTC	TTG	TAG	2	CTTGTCGCT:CTTTTAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81	5	29.999999999999996	0.0918175614096643	0.18848582121068	0.487132458133471	-0.0966682598010153	0.038583694080705	0.0910420483820041	NaN	NaN	0.0921467072420488	0.294146333645654	121	0	879	0.879	0.121	0.242
ORF3a	all	ss13	98	GCT	TAG	CTG	2	GTCGCTGCA:TTAGCTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81	5	30.16666666666666	0.0779922851430357	0.187302855665743	0.416396668731091	-0.109310570522707	0.0382218486445012	0.0918919457209984	NaN	NaN	0.0911692176001684	0.230533581361475	89	0	911	0.911	0.089	0.178
ORF3a	all	ss13	99	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGGT:GCTGCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.50000000000001	5	29.166666666666664	0.0764993759663411	0.194633396613813	0.393043420591016	-0.118134020647472	0.0370516389070504	0.0953111271432537	NaN	NaN	0.0911074044101518	0.19475313385023	61	1	938	0.938	0.061	0.122
ORF3a	all	ss13	100	GGC	CAG	GCA	2	GCAGGTATG:GCTGGCATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.66666666666667	5	28.999999999999996	0.0753771912377859	0.195911624447713	0.384750988872043	-0.120534433209927	0.0351471883422073	0.100378284344622	NaN	NaN	0.0967060232611822	0.212617407407265	64	1	935	0.935	0.064	0.128
ORF3a	all	ss13	101	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAG:GGTATGGAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.00000000000001	5	29.33333333333333	0.0750625939177369	0.193371831976575	0.388177497986522	-0.118309238058838	0.036635666844628	0.0949932091549051	NaN	NaN	0.094273355933768	0.209493483992254	62	0	938	0.938	0.062	0.124
ORF3a	all	ss13	102	GAG	TGG	AGG	2	ATGGAGGCA:ATGGAGGCG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.16666666666669	5	29.16666666666666	0.0758540671866302	0.194633396613814	0.389727911583118	-0.118779329427183	0.0366362895913658	0.0972343952811541	NaN	NaN	0.0940769355883821	0.206741412512933	78	0	922	0.922	0.078	0.156
ORF3a	all	ss13	103	GCA	AGG	CAC	2	GAGGCACAA:GAGGCGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.16666666666669	5	29.16666666666666	0.0758540671866302	0.194633396613814	0.389727911583118	-0.118779329427183	0.0374394033453069	0.0999952034528441	NaN	NaN	0.0966114851580835	0.218901818617217	81	0	919	0.919	0.081	0.162
ORF3a	all	ss13	104	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT:GCGCAATTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.50000000000001	5	29.499999999999996	0.0755354817013731	0.192126605059278	0.393154720441074	-0.116591123357905	0.0357883972908431	0.0938528776514801	NaN	NaN	0.0950908561954662	0.220160157227157	84	0	916	0.916	0.084	0.168
ORF3a	all	ss13	105	TTT	AAT	TTT	2	CAATTTTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.33333333333334	5	29.999999999999996	0.0766624238758939	0.18848582121068	0.406727802566139	-0.111823397334786	0.0379668889638384	0.0948654221300066	NaN	NaN	0.0889356545901995	0.208626307301076	77	0	923	0.923	0.077	0.154
ORF3a	all	ss13	106	TTG	TTT	TGT	2	TTTTTGTAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.66666666666669	5	29.66666666666666	0.0763370207324567	0.19089739885116	0.399885075395791	-0.114560378118704	0.0377241271530162	0.0980937252533107	NaN	NaN	0.094290025258115	0.224374191836845	70	0	930	0.93	0.07	0.14
ORF3a	all	ss13	107	TAC	TGT	ACA	2	TTGTACATC:TTGTACCTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.33333333333336	5	30.66666666666666	0.0776555092056302	0.183841843524739	0.422403886497039	-0.106186334319109	0.0393044717373803	0.0925923478407629	NaN	NaN	0.0865619043382356	0.219931691880218	89	0	911	0.911	0.089	0.178
ORF3a	all	ss13	108	ATC	ACA	TCT	2	TACATCTAT:TACCTCTAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.33333333333336	5	31.16666666666666	0.0776555092056302	0.180507022556888	0.430207690014701	-0.102851513351257	0.038415468295441	0.084567453036797	NaN	NaN	0.0864788607230711	0.234311608775892	95	0	905	0.905	0.095	0.19
ORF3a	all	ss13	109	TAT	TCT	ATG	2	ATCTATGCT:CTCTATGCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.50000000000001	4	31.16666666666666	0.0774882105210195	0.140762624951505	0.550488530231057	-0.0632744144304855	0.0400474670547032	0.076812915330544	NA	NA	0.0757916767012135	0.403804152459016	172	0	828	0.828	0.172	0.344
ORF3a	all	ss13	110	GCC	ATG	CCT	2	TATGCCTTG:TATGCTCTG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.50000000000001	4	31.16666666666666	0.0774882105210195	0.140762624951505	0.550488530231057	-0.0632744144304855	0.0380284900703977	0.0769491174310652	NaN	NaN	0.0755333989150626	0.402198572651286	206	0	794	0.794	0.206	0.412
ORF3a	all	ss13	111	CTG	CCT	TGA	2	GCCTTGATA:GCTCTGATT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.16666666666669	4	31.499999999999996	0.0778235325055638	0.139125907283501	0.559374842724157	-0.0613023747779369	0.0385892354298819	0.0751993123477694	NaN	NaN	0.0770338648925751	0.426157158087846	188	0	812	0.812	0.188	0.376
ORF3a	all	ss13	112	ATA	TGA	TAT	2	CTGATTTAT:TTGATATAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.00000000000001	4	31.66666666666666	0.0760143706952156	0.13832177935014	0.549547374624189	-0.062307408654924	0.0362487153662896	0.0787931523332984	NA	NA	0.0749693875123819	0.405914497376532	179	2	819	0.819	0.179	0.358
ORF3a	all	ss13	113	TAT	TAT	ATA	2	ATATATTTT:ATTTATATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.33333333333336	4	32.666666666666664	0.0756944389424704	0.133686173554739	0.566209929791106	-0.0579917346122687	0.0374522729341668	0.0715196288865086	NaN	NaN	0.0702219294743532	0.408897636378897	203	1	796	0.796	0.203	0.406
ORF3a	all	ss13	114	ATT	ATA	TTC	2	TATATTCTG:TATTTTCTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.00000000000003	4	32.99999999999999	0.0760143706952156	0.132209431753494	0.574954219884594	-0.0561950610582784	0.0368510370361372	0.0702898744558129	NaN	NaN	0.0724895171492617	0.438211810889174	204	2	794	0.794	0.204	0.408
ORF3a	all	ss13	115	CTA	TTC	TAC	2	ATTCTGCAA:TTTCTACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.1666666666667	3	33.33333333333333	0.0768261689073374	0.0958750286324137	0.801315733650418	-0.0190488597250762	0.037612093424396	0.0606286455203998	NA	NA	0.0566558163450637	0.736704424392329	361	4	635	0.635	0.361	0.722
ORF3a	all	ss13	116	CAA	TAC	AAG	2	CTACAATGC:CTGCAAGTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.83333333333336	3	33.66666666666666	0.0761753537657808	0.0948631103318397	0.80300291124034	-0.0186877565660589	0.0355809578671831	0.0603288560164819	NA	NA	0.0558916765147085	0.738110408730383	349	1	650	0.65	0.349	0.698
ORF3a	all	ss13	117	GTT	AAG	GCA	2	CAAGTTGTG:CAATGCATC	1:1	TRUE	1.75	0.75	0.5	0	2	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.50000000000001	3	34.33333333333333	0.0774882105210195	0.0929021112845893	0.834084494416364	-0.0154139007635698	0.0380047267442093	0.0577063168648051	NA	NA	0.0564271382090838	0.784726634368951	414	2	584	0.584	0.414	0.828
ORF3a	all	ss13	118	ATC	GCA	TCA	2	GTTGTGTGC:TGCATCAAC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333334	3	34.49999999999999	0.0507056829412418	0.0924244803179612	0.548617452506119	-0.0417187973767194	0.0254589956674739	0.0554338639084286	NA	NA	0.0491580951654245	0.396067245245302	160	5	835	0.835	0.16	0.32
ORF3a	all	ss13	119	AAC	TCA	ACG	2	ATCAACGCA:GTGTGCTTC	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.416666666666667	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.91666666666669	2	34.16666666666666	0.0504922483436096	0.0609472230590744	0.828458554947925	-0.0104549747154648	0.025342191980622802	0.0454000392940709	NA	NA	0.0328050130914653	0.749953620652258	371	13	616	0.616	0.371	0.742
ORF3a	all	ss13	120	GCA	ACG	CAT	2	AACGCATGT:TGCTTCTGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000003	1	34.74999999999999	0.0381034317265946	0.0293435958691742	1.29852632569217	0.00875983585742037	0.0219067671639971	0.0316901661994025	NA	NA	0.0250652725605547	0.726728252323811	598	58	344	0.344	0.598	0.688
ORF3a	all	ss13	121	TGC	CAT	GCA	2	GCATGTAGA:TTCTGCAGA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.75000000000003	0	34.41666666666666	0.025185997239258	0	-Inf	0.025185997239258	0.0177186952928173	0	NA	NA	0.0180522080882815	0.162962943338843	905	95	0	0	0.905	0.001
ORF3a	all	ss13	122	AGA	GCA	GAA	2	TGCAGATTT:TGTAGAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.25000000000003	0	34.74999999999999	0.0383470098919532	0	-Inf	0.0383470098919532	0.0225729939819986	0	NA	NA	0.0221280170686306	0.0831024457986951	947	53	0	0	0.947	0.001
ORF3a	all	ss13	123	ATT	GAA	TTA	2	AGAATTATT:AGATTTATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.25000000000003	0	34.58333333333332	0.0383470098919532	0	-Inf	0.0383470098919532	0.0224101529237188	0	NA	NA	0.0223310313692126	0.0859413037866262	948	52	0	0	0.948	0.001
ORF3a	all	ss13	124	ATT	TTA	TTA	2	ATTATTATG:TTTATTATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.58333333333337	0	34.91666666666666	0.0252389746234554	0	-Inf	0.0252389746234554	0.0184256024927908	0	NA	NA	0.0184928343272572	0.172316695170412	868	132	0	0	0.868	0.001
ORF3a	all	ss13	125	ATG	TTA	TGA	2	ATTATGAGA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.25000000000003	0	35.24999999999999	0.0253456008907938	0	-Inf	0.0253456008907938	0.017881220749621	0	NA	NA	0.0181626408664007	0.16287116143152	879	121	0	0	0.879	0.001
ORF3a	all	ss13	126	AGA	TGA	GAT	2	ATGAGATGC:ATGAGATGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.9166666666667	0	35.91666666666666	0.0251332418122965	0	-Inf	0.0251332418122965	0.0178277952360268	0	NA	NA	0.0176491852595548	0.154433318269947	865	135	0	0	0.865	0.001
ORF3a	all	ss13	127	TGC	GAT	GCT	2	AGATGCTGG:AGATGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.9166666666667	0	36.24999999999999	0.0254531319881873	0	-Inf	0.0254531319881873	0.0188427494017271	0	NA	NA	0.0181494876509238	0.160791056345369	889	111	0	0	0.889	0.001
ORF3a	all	ss13	128	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCTT:TGTTGGCTT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.4166666666667	0	36.24999999999999	0.0256161505491714	0	-Inf	0.0256161505491714	0.0181649806658362	0	NA	NA	0.0191327204729421	0.180614272391728	869	131	0	0	0.869	0.001
ORF3a	all	ss13	129	CTT	GGC	TTT	2	TGGCTTTGC:TGGCTTTGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333337	0	35.58333333333332	0.0257259947650973	0	-Inf	0.0257259947650973	0.0186639830583152	0	NA	NA	0.0180101798716778	0.153172704840561	868	132	0	0	0.868	0.001
ORF3a	all	ss13	130	TGC	TTT	GCT	2	CTTTGCTGG:CTTTGTTGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.25000000000003	0	35.08333333333332	0.0253456008907938	0	-Inf	0.0253456008907938	0.0180950227046524	0	NA	NA	0.0174595807321852	0.146592566896303	874	126	0	0	0.874	0.001
ORF3a	all	ss13	131	TGG	GCT	GGA	2	TGCTGGAAG:TGTTGGAAG	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.75000000000003	0	35.08333333333332	0.0255072404553968	0	-Inf	0.0255072404553968	0.0180175284370683	0	NA	NA	0.017647634915136	0.1483559200909	870	130	0	0	0.87	0.001
ORF3a	all	ss13	132	AAG	GGA	AGT	2	TGGAAGTGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.4166666666667	0	35.08333333333332	0.0256161505491714	0	-Inf	0.0256161505491714	0.0182701328578428	0	NA	NA	0.0177003773090876	0.147838314308049	884	116	0	0	0.884	0.001
ORF3a	all	ss13	133	TGC	AGT	GCA	2	AAGTGCAAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.9166666666667	0	34.58333333333332	0.0254531319881873	0	-Inf	0.0254531319881873	0.0181338435693862	0	NA	NA	0.0183759923176255	0.166012824111354	875	125	0	0	0.875	0.001
ORF3a	all	ss13	134	AAA	GCA	AAT	2	TGCAAATCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.08333333333337	0	34.58333333333332	0.0253992526173405	0	-Inf	0.0253992526173405	0.0175079817644787	0	NA	NA	0.0182425260475217	0.163828525116967	871	129	0	0	0.871	0.001
ORF3a	all	ss13	135	TCC	AAT	CCA	2	AAATCCAAA:AAATCCAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.4166666666667	0	34.58333333333332	0.0256161505491714	0	-Inf	0.0256161505491714	0.0186631727030806	0	NA	NA	0.017364712589186	0.140163014155917	873	127	0	0	0.873	0.001
ORF3a	all	ss13	136	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAC:TCCAAGAAC	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.4166666666667	0	35.24999999999999	0.0256161505491714	0	-Inf	0.0256161505491714	0.0184895615868153	0	NA	NA	0.0176448541095889	0.146567448748768	871	129	0	0	0.871	0.001
ORF3a	all	ss13	137	AAC	AAA	ACC	2	AAAAACCCA:AAGAACCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.83333333333336	0	34.66666666666666	0.0254801574935108	0	-Inf	0.0254801574935108	0.0187092790093869	0	NA	NA	0.0180414878372361	0.157858967411515	867	133	0	0	0.867	0.001
ORF3a	all	ss13	138	CCA	ACC	CAT	2	AACCCATTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.1666666666667	0	34.66666666666666	0.025698445480572	0	-Inf	0.025698445480572	0.0188673540903091	0	NA	NA	0.0184352624369718	0.163322688444718	884	116	0	0	0.884	0.001
ORF3a	all	ss13	139	TTA	CAT	TAC	2	CCATTACTC:CCATTACTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.1666666666667	0	34.66666666666666	0.025698445480572	0	-Inf	0.025698445480572	0.0191469271395261	0	NA	NA	0.0175762269744895	0.143710004814111	869	131	0	0	0.869	0.001
ORF3a	all	ss13	140	CTC	TAC	TCT	2	TTACTCTAT:TTACTTTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333337	0	35.66666666666666	0.0261464386246643	0	-Inf	0.0261464386246643	0.0190186237470963	0	NA	NA	0.0189622925609682	0.167936428473018	872	128	0	0	0.872	0.001
ORF3a	all	ss13	141	TAT	TCT	ATG	2	CTCTATGAT:CTTTATGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333337	0	35.66666666666666	0.0261464386246643	0	-Inf	0.0261464386246643	0.0193538814718949	0	NA	NA	0.0183662682469253	0.154558839848658	846	154	0	0	0.846	0.001
ORF3a	all	ss13	142	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGCC:TATGATGTC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333337	0	36.33333333333332	0.0261464386246643	0	-Inf	0.0261464386246643	0.0184020983146013	0	NA	NA	0.0183427746649626	0.154031408303653	854	146	0	0	0.854	0.001
ORF3a	all	ss13	143	GCC	ATG	CCA	2	GATGCCAAC:GATGTCAAC	1:1	FALSE	2	1	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.50000000000003	0	36.66666666666665	0.0262608883838265	0	-Inf	0.0262608883838265	0.0187187350759568	0	NA	NA	0.0188272207400778	0.163065250276948	875	125	0	0	0.875	0.001
ORF3a	all	ss13	144	AAC	CCA	ACT	2	GCCAACTAC:GTCAACTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.6666666666667	1	37.16666666666665	0.0129873375085957	0.027400307499342	0.473985100674786	-0.0144129699907463	0.0133381714363398	0.0282535596170948	NA	NA	0.0332367617815022	0.664545936437885	299	136	565	0.565	0.299	0.598
ORF3a	all	ss13	145	TAC	ACT	ACT	2	AACTACTTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.6666666666667	1	37.16666666666665	0.0129873375085957	0.027400307499342	0.473985100674786	-0.0144129699907463	0.0134345917754379	0.0287946651411512	NA	NA	0.032486112985034	0.65728438805881	302	137	561	0.561	0.302	0.604
ORF3a	all	ss13	146	TTT	ACT	TTG	2	TACTTTGTT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.6666666666667	1	37.16666666666665	0.0131582322381821	0.027400307499342	0.480222064606324	-0.0142420752611598	0.013047227528317	0.0298933165053316	NA	NA	0.0324162921499565	0.660408457174933	281	133	586	0.586	0.281	0.562
ORF3a	all	ss13	147	GTT	TTG	TTT	2	TTTGTTTGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.1666666666667	1	36.16666666666666	0.0130722263514627	0.0281723261817365	0.464009477497005	-0.0151000998302737	0.0125537262119691	0.02960342416318	NA	NA	0.0335689235798272	0.652837515427203	269	140	591	0.591	0.269	0.538
ORF3a	all	ss13	148	TGC	TTT	GCT	2	GTTTGCTGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666669	1	37.16666666666665	0.0132453773639628	0.027400307499342	0.483402507956557	-0.0141549301353792	0.0127507831094706	0.029291543019874	NA	NA	0.0324429172952947	0.6626171740716	290	137	573	0.573	0.29	0.58
ORF3a	all	ss13	149	TGG	GCT	GGC	2	TGCTGGCAC:TGCTGGCAT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666669	1	37.33333333333332	0.0132453773639628	0.0272757331281561	0.485610315283877	-0.0140303557641934	0.0129035811836727	0.0293042194160658	NA	NA	0.0310078698985116	0.65092520531723	281	121	598	0.598	0.281	0.562
ORF3a	all	ss13	150	CAC	GGC	ACA	2	TGGCACACA:TGGCATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.50000000000003	1	36.66666666666665	0.0131871529184001	0.0277809537602618	0.474683231979716	-0.0145938008418617	0.0129108334671645	0.0299975210119903	NA	NA	0.0328694057998115	0.657047320355771	275	127	598	0.598	0.275	0.55
ORF3a	all	ss13	151	ACA	ACA	CAC	2	CACACACAT:CATACACAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333336	1	36.66666666666665	0.0133041182530361	0.0277809537602618	0.478893502643761	-0.0144768355072257	0.0137704612069493	0.0287877648923332	NA	NA	0.0332866369307337	0.663624610299412	263	137	600	0.6	0.263	0.526
ORF3a	all	ss13	152	CAT	CAC	ATA	2	ACACATAAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.66666666666669	1	35.83333333333332	0.0131582322381821	0.0284394261467203	0.462675729471411	-0.0152811939085382	0.0130193785144199	0.0301263119997113	NA	NA	0.0333586032863813	0.646888831194161	300	121	579	0.579	0.3	0.6
ORF3a	all	ss13	153	AAC	ATA	ACT	2	CATAACTAT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000001	1	36.833333333333314	0.0134532755150005	0.0276529018562458	0.486505017988262	-0.0141996263412453	0.0136477065366817	0.0276076366571085	NA	NA	0.032083374192868	0.658065797181369	306	124	570	0.57	0.306	0.612
ORF3a	all	ss13	154	TAT	ACT	ATG	2	AACTATGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.66666666666669	1	36.499999999999986	0.0135138791270087	0.0279101972553257	0.484191458891607	-0.0143963181283171	0.0135624551081753	0.0300768079985336	NA	NA	0.0338058590264861	0.67021514450094	291	127	582	0.582	0.291	0.582
ORF3a	all	ss13	155	GAC	ATG	ACT	2	TATGACTAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333336	1	36.499999999999986	0.0133932130500048	0.0279101972553257	0.479868090056196	-0.0145169842053209	0.0136679179824114	0.0300913374181112	NA	NA	0.0342575538292569	0.671740784559354	313	135	552	0.552	0.313	0.626
ORF3a	all	ss13	156	TAC	ACT	ACT	2	GACTACTGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.66666666666669	1	36.499999999999986	0.0135138791270087	0.0279101972553257	0.484191458891607	-0.0143963181283171	0.0140124438951193	0.0288822618173149	NA	NA	0.0315812579300496	0.648497807686522	301	138	561	0.561	0.301	0.602
ORF3a	all	ss13	157	TGT	ACT	GTA	2	TACTGTATA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.66666666666669	1	36.499999999999986	0.0135138791270087	0.0279101972553257	0.484191458891607	-0.0143963181283171	0.0134825074335126	0.0283093933682404	NA	NA	0.0323759170087307	0.656564523118415	276	153	571	0.571	0.276	0.552
ORF3a	all	ss13	158	ATA	GTA	TAC	2	TGTATACCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.50000000000001	1	36.16666666666665	0.0135443861537981	0.0281723261817365	0.480769179883296	-0.0146279400279383	0.0132984985320228	0.0301732217255457	NA	NA	0.0331267928442853	0.658797292006825	299	138	563	0.563	0.299	0.598
ORF3a	all	ss13	159	CCA	TAC	CAT	2	ATACCATAC:ATACCATAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.16666666666669	1	36.16666666666665	0.0136058153029875	0.0281723261817365	0.482949658300062	-0.0145665108787489	0.0126907754514501	0.0288157891360319	NA	NA	0.0339158020789028	0.667566389902133	286	117	597	0.597	0.286	0.572
ORF3a	all	ss13	160	TAC	CAT	ACA	2	CCATACAAC:CCATATAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333336	1	36.16666666666665	0.0134835092215562	0.0281723261817365	0.478608302863443	-0.0146888169601802	0.0134665482319721	0.0298268094793105	NA	NA	0.0325726307005277	0.652021400562378	306	131	563	0.563	0.306	0.612
ORF3a	all	ss13	161	AAC	ACA	ACA	2	TACAACAGT:TATAACAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333336	1	36.16666666666665	0.0134835092215562	0.0281723261817365	0.478608302863443	-0.0146888169601802	0.0133110475780884	0.0311838669309139	NA	NA	0.0345841286733887	0.671035619977837	298	145	557	0.557	0.298	0.596
ORF3a	all	ss13	162	AGT	ACA	GTG	2	AACAGTGTC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.6666666666667	1	35.66666666666665	0.0135138791270087	0.0285748846742028	0.472928562305237	-0.0150610055471941	0.0135610337317918	0.0295059456041647	NA	NA	0.0337577706542578	0.655489407352671	289	127	584	0.584	0.289	0.578
ORF3a	all	ss13	163	GTC	GTG	TCA	2	AGTGTCACA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.00000000000003	1	35.66666666666665	0.0136367393123929	0.0285748846742028	0.477228148700247	-0.0149381453618099	0.0135265814824336	0.0301438723449329	NA	NA	0.0346148094145598	0.666065893494749	295	107	598	0.598	0.295	0.59
ORF3a	all	ss13	164	ACA	TCA	CAG	2	GTCACAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.6666666666667	1	35.66666666666665	0.0135138791270087	0.0285748846742028	0.472928562305237	-0.0150610055471941	0.0136952978189979	0.0314508390959794	NA	NA	0.0343481094938248	0.661037384075456	301	113	586	0.586	0.301	0.602
ORF3a	all	ss13	165	GAT	CAG	ATA	2	ACAGATACA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000003	1	35.333333333333314	0.0134532755150005	0.028849710620847	0.466322719551961	-0.0153964351058466	0.0129359207028053	0.0313446794656779	NA	NA	0.0354898652648289	0.664414619196714	288	159	553	0.553	0.288	0.576
ORF3a	all	ss13	166	ACA	ATA	CAA	2	GATACAATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333337	1	35.499999999999986	0.0134835092215562	0.0287116399282627	0.469618219483296	-0.0152281307067065	0.0136935318444524	0.031088269330397	NA	NA	0.0349953219939221	0.663455287715294	268	118	614	0.614	0.268	0.536
ORF3a	all	ss13	167	ATT	CAA	TTG	2	ACAATTGTC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333337	1	35.499999999999986	0.0134835092215562	0.0287116399282627	0.469618219483296	-0.0152281307067065	0.0138621543207773	0.030115801124314	NA	NA	0.0330793222123355	0.645263613271168	283	121	596	0.596	0.283	0.566
ORF3a	all	ss13	168	GTC	TTG	TCG	2	ATTGTCGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.00000000000004	1	35.833333333333314	0.0136367393123929	0.0284394261467203	0.479501212227008	-0.0148026868343274	0.013651834096237	0.0286660684432199	NA	NA	0.0327914851926831	0.651687869326066	303	134	563	0.563	0.303	0.606
ORF3a	all	ss13	169	GTT	TCG	TTA	2	GTCGTTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000004	1	35.499999999999986	0.0134532755150005	0.0287116399282627	0.468565207303174	-0.0152583644132622	0.0141003731853534	0.0307967894013279	NA	NA	0.033712232208776	0.650832352724081	276	121	603	0.603	0.276	0.552
ORF3a	all	ss13	170	ACT	TTA	CTG	2	GTTACTGAA:GTTACTGCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.6666666666667	1	34.83333333333332	0.013333684515963	0.0292720079293014	0.455509732990195	-0.0159383234133385	0.014445477208661	0.0325928749115374	NA	NA	0.0345301768506383	0.644384941279531	279	142	579	0.579	0.279	0.558
ORF3a	all	ss13	171	GAA	CTG	AAG	2	ACTGAAGGT:ACTGCAGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.6666666666667	1	34.83333333333332	0.013333684515963	0.0292720079293014	0.455509732990195	-0.0159383234133385	0.0137802120441905	0.0309476933235692	NA	NA	0.0348941138305806	0.647841746957479	300	142	558	0.558	0.3	0.6
ORF3a	all	ss13	172	GGT	AAG	GTG	2	GAAGGTGAC:GCAGGTGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333337	1	34.83333333333332	0	0.0292720079293014	0	-0.0292720079293014	0	0.0301491524204878	NA	NA	0.0313939888981817	0.351125686814836	0	346	654	0.654	0	0.001
ORF3a	all	ss13	173	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000003	1	34.83333333333332	0	0.0292720079293014	0	-0.0292720079293014	0	0.0308502069955849	NA	NA	0.0316474992226672	0.354997611524471	0	373	627	0.627	0	0.001
ORF3a	all	ss13	174	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000003	1	35.16666666666665	0	0.0289891158257094	0	-0.0289891158257094	0	0.0306362134671938	NA	NA	0.030152143474617	0.336336997515972	0	378	622	0.622	0	0.001
ORF3a	all	ss13	175	ATT	GCA	TTT	2	GGCATTTCA	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000003	1	35.16666666666665	0	0.0289891158257094	0	-0.0289891158257094	0	0.0295172525951191	NA	NA	0.0309668765100451	0.34920470056953	0	379	621	0.621	0	0.001
ORF3a	all	ss13	176	TCA	TTT	CAA	2	ATTTCAACA	2	FALSE	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333337	1	35.49999999999998	0	0.0287116399282627	0	-0.0287116399282627	0	0.0306466402335211	NA	NA	0.0303976943152666	0.344897102594248	0	349	651	0.651	0	0.001
ORF3a	all	ss13	177	ACA	CAA	CAC	2	TCAACACCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.33333333333337	1	35.66666666666665	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.029783859922153	NA	NA	0.0306305234854012	0.35087717705095	0	344	656	0.656	0	0.001
ORF3a	all	ss13	178	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000003	1	35.66666666666665	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0293313566885521	NA	NA	0.0301209128792298	0.342787154883413	0	346	654	0.654	0	0.001
ORF3a	all	ss13	179	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACTC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000003	1	35.66666666666665	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0311049626554894	NA	NA	0.0323476527213997	0.377037417913004	0	367	633	0.633	0	0.001
ORF3a	all	ss13	180	CTC	AAC	TCA	2	AAACTCAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333336	1	36.16666666666665	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.0307069101495669	NA	NA	0.0297086693741306	0.342983688735248	0	348	652	0.652	0	0.001
ORF3a	all	ss13	181	AAA	TCA	AAG	2	CTCAAAGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.50000000000003	1	36.16666666666665	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.0296418265310409	NA	NA	0.0293723207160212	0.337485503936161	0	367	633	0.633	0	0.001
ORF3a	all	ss13	182	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333336	1	36.16666666666665	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.0310831480007044	NA	NA	0.0306276542541022	0.357660051150718	0	364	636	0.636	0	0.001
ORF3a	all	ss13	183	GAC	AAG	ACT	2	GAAGACTAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000001	1	36.66666666666665	0	0.0277809537602618	0	-0.0277809537602618	0	0.0295509483239262	NA	NA	0.0290517584152553	0.338942297142216	0	375	625	0.625	0	0.001
ORF3a	all	ss13	184	TAC	ACT	ACC	2	GACTACCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.33333333333334	1	37.66666666666664	0	0.0270299523623977	0	-0.0270299523623977	0	0.0284288728676326	NA	NA	0.0290971091978725	0.352911565472362	0	378	622	0.622	0	0.001
ORF3a	all	ss13	185	CAA	ACC	AAA	2	TACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666667	1	36.99999999999998	0	0.027526025137821	0	-0.027526025137821	0	0.0297237513579516	NA	NA	0.0305034251412399	0.366849046751877	0	363	637	0.637	0	0.001
ORF3a	all	ss13	186	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGT	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666667	1	36.99999999999998	0	0.027526025137821	0	-0.027526025137821	0	0.0282447954241525	NA	NA	0.0281697603352451	0.328495884372813	0	364	636	0.636	0	0.001
ORF3a	all	ss13	187	GGT	TTG	GTG	2	ATTGGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666667	1	36.99999999999998	0	0.027526025137821	0	-0.027526025137821	0	0.0298550277048589	NA	NA	0.0300105020364058	0.359030991697298	0	352	648	0.648	0	0.001
ORF3a	all	ss13	188	GGT	GTG	GTT	2	GGTGGTTAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333334	1	37.333333333333314	0	0.0272757331281561	0	-0.0272757331281561	0	0.0283114321580177	NA	NA	0.0295541199840554	0.356055162472533	0	381	619	0.619	0	0.001
ORF3a	all	ss13	189	TAT	GTT	ATT	2	GGTTATTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000001	1	36.833333333333314	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0279784160335988	NA	NA	0.0297922065214225	0.353307738016917	0	361	639	0.639	0	0.001
ORF3a	all	ss13	190	TCT	ATT	CTG	2	TATTCTGAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.33333333333334	1	36.16666666666664	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.0299774256953831	NA	NA	0.028720177083696	0.326629960283565	0	365	635	0.635	0	0.001
ORF3a	all	ss13	191	GAG	CTG	AGG	2	TCTGAGGAT	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.5	1	36.99999999999997	0	0.027526025137821	0	-0.027526025137821	0	0.0299918614351438	NA	NA	0.0292457714601299	0.346604040385629	0	357	643	0.643	0	0.001
ORF3a	all	ss13	192	GAT	AGG	ATA	2	GAGGATAGG:GAGGATTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666667	1	35.66666666666664	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0301085173013717	NA	NA	0.0310309050170454	0.35712747088062	0	393	607	0.607	0	0.001
ORF3a	all	ss13	193	AGG	ATA	GGC	2	GATAGGCAC:GATTGGCAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.166666666666667	0.5	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333334	1	36.833333333333314	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0296207556183189	NA	NA	0.0280374685985999	0.323993853364159	0	381	619	0.619	0	0.001
ORF3a	all	ss13	194	CAC	GGC	ACT	2	AGGCACTCA:TGGCACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.83333333333334	0	37.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	195	TCA	ACT	CAG	2	CACTCAGGT	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666667	0	36.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	196	GGT	CAG	GTG	2	TCAGGTGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333334	0	35.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	197	GTT	GTG	TTA	2	GGTGTTAAA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666667	0	35.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	198	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666667	0	34.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	199	GAC	AAG	ACT	2	AAAGACTAT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000001	0	35.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	200	TAT	ACT	ATG	2	GACTATGTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333334	0	35.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	201	GTC	ATG	TCG	2	TATGTCGTT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000001	0	35.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	202	GTT	TCG	TTG	2	GTCGTTGTA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000001	0	36.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	203	GTA	TTG	TAC	2	GTTGTACAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333336	0	36.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	204	CAT	TAC	ATG	2	GTACATGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666669	0	36.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	205	GGC	ATG	GCT	2	CATGGCTAT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000001	0	36.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	206	TAT	GCT	ATT	2	GGCTATTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333334	0	36.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
ORF3a	all	ss13	207	TTC	ATT	TCA	2	TATTTCACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.66666666666667	1	36.66666666666665	0	0.0277809537602618	0	-0.0277809537602618	0	0.029210116025385	NA	NA	0.0302888732864954	0.359037860976449	0	380	620	0.62	0	0.001
ORF3a	all	ss13	208	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000001	1	36.999999999999986	0	0.0275260251378209	0	-0.0275260251378209	0	0.0288937090792839	NA	NA	0.0274708269102831	0.316339081961995	0	376	624	0.624	0	0.001
ORF3a	all	ss13	209	GAA	CCG	AAG	2	ACCGAAGTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.33333333333334	1	36.66666666666665	0	0.0277809537602618	0	-0.0277809537602618	0	0.0282586906632534	NA	NA	0.0280112317253845	0.32130530258599	0	383	617	0.617	0	0.001
ORF3a	all	ss13	210	GTT	AAG	TTT	2	GAAGTTTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.33333333333334	1	35.999999999999986	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.0301703040390033	NA	NA	0.0295015486035245	0.337332349752977	0	356	644	0.644	0	0.001
ORF3a	all	ss13	211	TAC	TTT	ACT	2	GTTTACTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333334	1	35.999999999999986	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.0293719758461568	NA	NA	0.0304263739131248	0.352222747125444	0	396	604	0.604	0	0.001
ORF3a	all	ss13	212	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333334	1	35.66666666666665	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0291482741935945	NA	NA	0.0287309880530291	0.319947038229355	0	401	599	0.599	0	0.001
ORF3a	all	ss13	213	CAG	ACC	AGC	2	TACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.66666666666667	1	35.33333333333332	0	0.028849710620847	0	-0.028849710620847	0	0.0306625528173906	NA	NA	0.0299393441251635	0.335243849582109	0	349	651	0.651	0	0.001
ORF3a	all	ss13	214	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76	1	34.66666666666665	0	0.029415534864961	0	-0.029415534864961	0	0.030217373452655	NA	NA	0.0323102500164949	0.3626069761679	0	371	629	0.629	0	0.001
ORF3a	all	ss13	215	GAG	TTG	AGT	2	CTTGAGTCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.33333333333334	1	34.33333333333332	0	0.0297068535712844	0	-0.0297068535712844	0	0.0318201480450899	NA	NA	0.0318094209278896	0.350354905276181	0	373	627	0.627	0	0.001
ORF3a	all	ss13	216	TCT	AGT	CTA	2	GAGTCTACA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.83333333333334	1	33.83333333333332	0	0.0301548153585304	0	-0.0301548153585304	0	0.031023417224381	NA	NA	0.0321046864869344	0.347594591711582	0	331	669	0.669	0	0.001
ORF3a	all	ss13	217	ACA	CTA	CAC	2	TCTACACAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.16666666666669	1	33.16666666666665	0	0.0307735475083969	0	-0.0307735475083969	0	0.0340782518667553	NA	NA	0.0331381373256313	0.353073374818434	0	350	650	0.65	0	0.001
ORF3a	all	ss13	218	CAA	CAC	AAA	2	ACACAAATT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.33333333333336	1	32.999999999999986	0	0.0309322189005369	0	-0.0309322189005369	0	0.0324735945044094	NA	NA	0.032374986146739	0.339357386526734	0	362	638	0.638	0	0.001
ORF3a	all	ss13	219	ATT	AAA	TTA	2	CAAATTACT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666669	1	34.499999999999986	0	0.0295604764056576	0	-0.0295604764056576	0	0.0302073854024416	NA	NA	0.0308971116858828	0.338698931786516	0	362	638	0.638	0	0.001
ORF3a	all	ss13	220	ACT	TTA	CTA	2	ATTACTACA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333336	1	35.333333333333314	0	0.028849710620847	0	-0.028849710620847	0	0.0297891597062795	NA	NA	0.0281102580915086	0.304747636868591	0	370	630	0.63	0	0.001
ORF3a	all	ss13	221	ACA	CTA	CAG	2	ACTACAGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666669	1	35.99999999999998	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.0303828529263293	NA	NA	0.0303178751172787	0.350502133343457	0	371	629	0.629	0	0.001
ORF3a	all	ss13	222	GAC	CAG	ACA	2	ACAGACACT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333336	1	36.33333333333331	0	0.0280406490537152	0	-0.0280406490537152	0	0.0299889291284886	NA	NA	0.0295997593827763	0.343472214560169	0	365	635	0.635	0	0.001
ORF3a	all	ss13	223	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGGT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.6666666666667	1	36.99999999999998	0	0.027526025137821	0	-0.027526025137821	0	0.0280156711748007	NA	NA	0.0298228726350419	0.356015703057872	0	367	633	0.633	0	0.001
ORF3a	all	ss13	224	GGT	CTG	GTA	2	ACTGGTATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.00000000000003	1	36.66666666666665	0	0.0277809537602618	0	-0.0277809537602618	0	0.029109935240464	NA	NA	0.0277295665466405	0.316414519817875	0	368	632	0.632	0	0.001
ORF3a	all	ss13	225	ATT	GTA	TTG	2	GGTATTGAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000003	1	36.16666666666665	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.0312035011966732	NA	NA	0.0291700399858105	0.334145957446406	0	357	643	0.643	0	0.001
ORF3a	all	ss13	226	GAA	TTG	AAA	2	ATTGAAAAT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000003	1	35.499999999999986	0	0.0287116399282627	0	-0.0287116399282627	0	0.030075071611349	NA	NA	0.03060794054378	0.348221044016004	0	375	625	0.625	0	0.001
ORF3a	all	ss13	227	AAT	AAA	ATG	2	GAAAATGCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	228	GCT	ATG	CTA	2	AATGCTACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	229	ACA	CTA	CAT	2	GCTACATTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	230	TTC	CAT	TCT	2	ACATTCTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	231	TTC	TCT	TCA	2	TTCTTCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	232	ATC	TCA	TCT	2	TTCATCTTT	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	233	TTT	TCT	TTA	2	ATCTTTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	234	AAC	TTA	ACA	2	TTTAACAAG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	235	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	236	CTT	AGC	TTG	2	AAGCTTGTT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	237	GTT	TTG	TTA	2	CTTGTTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	238	AAA	TTA	AAG	2	GTTAAAGAC:GTTAAAGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	239	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCCA:AAAGATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	240	CCA	ACC	CA-	0	GACCCA---:GATCCA---	1:1	FALSE	0.166666666666667	0	1.83333333333333	1	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	241	---	NA	NA	0	CCA---CCG	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	242	CCG	--C	CGA	0	---CCGAAT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	243	AAT	CGA	ATG	2	CCGAATGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	244	GTG	ATG	TGC	2	AATGTGCAA	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	245	CAA	TGC	AAA	2	GTGCAAATA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	246	ATA	AAA	TAC	2	CAAATACAC	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	247	CAC	TAC	ACA	2	ATACACACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	248	ACA	ACA	CAA	2	CACACAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	249	ATC	CAA	TCG	2	ACAATCGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	250	GAC	TCG	ACG	2	ATCGACGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	251	GGC	ACG	GCT	2	GACGGCTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	252	TCT	GCT	CTT	2	GGCTCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	253	TCA	CTT	CAG	2	TCTTCAGGA	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	254	GGA	CAG	GAG	2	TCAGGAGTT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	255	GTT	GAG	TTG	2	GGAGTTGCT:GGAGTTGTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	256	GCT	TTG	CTA	2	GTTGCTAAT:GTTGTAAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	257	AAT	CTA	ATC	2	GCTAATCCA:GTAAATCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	258	CCA	ATC	CAG	2	AATCCAGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	259	GCA	CAG	CAA	2	CCAGCAATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	260	ATG	CAA	TGG	2	GCAATGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	261	GAT	TGG	ATC	2	ATGGATCCA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	262	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAATT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	263	ATT	CAA	TTT	2	CCAATTTAT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	264	TAT	TTT	ATG	2	ATTTATGAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	265	GAT	ATG	ATG	2	TATGATGAG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	266	GAG	ATG	AGC	2	GATGAGCCG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	267	CCG	AGC	CGA	2	GAGCCGACG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	268	ACG	CGA	CGA	2	CCGACGACG	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	269	ACG	CGA	CGA	2	ACGACGACT	2	FALSE	0.5	1	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	270	ACT	CGA	CTA	2	ACGACTACT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	271	ACT	CTA	CTA	2	ACTACTAGC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	272	AGC	CTA	GCG	2	ACTAGCGTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	273	GTG	GCG	TGC	2	AGCGTGCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	274	CCT	TGC	CTT	2	GTGCCTTTG	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	275	TTG	CTT	TGT	2	CCTTTGTAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
ORF3a	all	ss13	2	GAT	TGG	ATT	2	ATGGATTTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.50000000000001	2	31.916666666666647	0.0137303605832671	0.0654365742860852	0.209827007802069	-0.0517062137028181	0.0143647951760762	0.0494534436363115	NA	NA	0.0567182717471143	0.36196226513246	119	46	835	0.835	0.119	0.238
ORF3a	all	ss13	3	TTG	ATT	TGT	2	GATTTGTTT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.16666666666669	2	32.24999999999998	0.0137934922285677	0.0647301776657746	0.213092142273863	-0.0509366854372069	0.0134414865345869	0.047845537063387	NA	NA	0.0511563126990092	0.319392653490807	116	55	829	0.829	0.116	0.232
ORF3a	all	ss13	4	TTT	TGT	TTA	2	TTGTTTATG	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.50000000000001	2	32.583333333333314	0.0139215133950447	0.0640388786228152	0.21739158608696799	-0.0501173652277706	0.0137576480181197	0.0490572512195744	NA	NA	0.0524193454674775	0.339029144839719	115	41	844	0.844	0.115	0.23
ORF3a	all	ss13	5	ATG	TTA	TGA	2	TTTATGAGA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.66666666666667	2	32.41666666666665	0.0138892858254281	0.0643826713791054	0.215730188386308	-0.0504933855536773	0.0133552934201181	0.0518431030770946	NA	NA	0.0521214781635019	0.332663202270296	137	55	808	0.808	0.137	0.274
ORF3a	all	ss13	6	AGA	TGA	GAA	2	ATGAGAATT:ATGAGATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73	2	33.083333333333314	0.0138252762666285	0.0630291953285242	0.219347180216527	-0.0492039190618957	0.0138014276558025	0.0512657683170398	NA	NA	0.0503692949498146	0.328636799761512	136	39	825	0.825	0.136	0.272
ORF3a	all	ss13	7	ATT	GAA	TTT	2	AGAATTTTT:AGATTTTTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.66666666666666	2	33.41666666666665	0.01369901098297	0.062373587449531503	0.219628396299224	-0.0486745764665615	0.013812017755648	0.0461554264378087	NA	NA	0.0516643519079613	0.346125684508675	117	38	845	0.845	0.117	0.234
ORF3a	all	ss13	8	TTT	TTT	TTA	2	ATTTTTACT:TTTTTTACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.66666666666666	2	33.583333333333314	0	0.062050874504436	0	-0.062050874504436	0	0.046392263380787	NA	NA	0.0493584813180391	0.208700353642961	0	121	879	0.879	0	0.001
ORF3a	all	ss13	9	ACT	TTA	CTC	2	TTTACTCTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666666	2	33.24999999999998	0	0.0626996766264699	0	-0.0626996766264699	0	0.0498226119017975	NA	NA	0.0468609893047626	0.180898711970202	0	124	876	0.876	0	0.001
ORF3a	all	ss13	10	CTT	CTC	TTA	2	ACTCTTAGA:ACTCTTGGA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.66666666666666	3	34.24999999999998	0	0.0931427851735379	0	-0.0931427851735379	0	0.0579514013527225	NA	NA	0.0562501156834143	0.097748486201221	0	38	962	0.962	0	0.001
ORF3a	all	ss13	11	AGA	TTA	GAT	2	CTTAGATCA:CTTGGATCA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333331	3	33.583333333333314	0	0.0951140793534504	0	-0.0951140793534504	0	0.0546051154982364	NA	NA	0.0576247588524463	0.0988250573690193	0	40	960	0.96	0	0.001
ORF3a	all	ss13	12	TCA	GAT	CAA	2	AGATCAATT:GGATCAATT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.41666666666666	2	34.083333333333314	0	0.0611024764460933	0	-0.0611024764460933	0	0.0448408680823666	NA	NA	0.0462474983059111	0.186432655996793	0	131	869	0.869	0	0.001
ORF3a	all	ss13	13	ATT	CAA	TTA	2	TCAATTACT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.41666666666666	2	34.083333333333314	0	0.0611024764460933	0	-0.0611024764460933	0	0.045354452239307	NA	NA	0.0464024186330777	0.187907323265761	0	131	869	0.869	0	0.001
ORF3a	all	ss13	14	ACT	TTA	CTG	2	ATTACTGCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.25	2	33.74999999999998	0	0.0617314855970427	0	-0.0617314855970427	0	0.0468100901204693	NA	NA	0.0489351409404463	0.207130192571132	0	149	851	0.851	0	0.001
ORF3a	all	ss13	15	GCA	CTG	CAC	2	ACTGCACAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.58333333333334	2	33.41666666666664	0	0.062373587449531503	0	-0.062373587449531503	0	0.0474105131109522	NA	NA	0.0454156376849367	0.16962973567457101	0	153	847	0.847	0	0.001
ORF3a	all	ss13	16	CAG	CAC	AGC	2	GCACAGCCA:GCACAGTCA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.58333333333334	2	33.41666666666664	0	0.062373587449531503	0	-0.062373587449531503	0	0.0467561801174842	NA	NA	0.0457566084209966	0.172832027797823	0	115	885	0.885	0	0.001
ORF3a	all	ss13	17	CCA	AGC	CAG	2	CAGCCAGTA:CAGTCAGGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.58333333333334	2	34.41666666666664	0	0.0604861633757489	0	-0.0604861633757489	0	0.0453823188356515	NA	NA	0.0455756848949469	0.184456215240841	0	129	871	0.871	0	0.001
ORF3a	all	ss13	18	GGA	CAG	GAA	2	CCAGTAAAA:TCAGGAAAA	1:1	FALSE	1.58333333333333