SubjectID Dantu G6PD (+202) ABO ⍺-Thalassaemia ATP2B4 Time to treatment Treated (1=treated; 0=not treated) anti-schizont antibodies Location of residence Overall comparison across genotype groups 1 AG CC O Norm AA 12.5 1 0.531 Kilifi_South Variant Hazard ratio 95% - CI P-value 2 AG CC non-O Het AG 22 0 -0.240 Kilifi_North Dantu 0.34 0.15 - 0.77 0.010 3 GG CC O Het AG 22 0 1.123 Kilifi_South G6PD +202 0.77 0.49 - 1.20 0.242 4 AA CC O Norm AA 22 0 0.896 Kilifi_South ABO 0.69 0.40 - 1.19 0.185 5 AA CC Undetermined Norm GG 18.5 1 0.454 Kilifi_South ATP2B4 0.97 0.63 - 1.49 0.877 6 AA CC O Het AA 22 0 0.669 Kilifi_South 7 AA CC non-O Norm AG 22 0 0.685 Kilifi_South 8 AA CC O Homo GG 22 0 0.755 Kilifi_South 9 GG TT O Het GG 22 0 1.381 Kilifi_South 10 AA TT O Het GG 17.5 1 1.239 Kilifi_South 11 AA TT non-O Het GG 22 0 1.005 Kilifi_South 12 AA CC O Het AG 22 0 0.687 Kilifi_South 13 AA CC O Norm AG 18.5 1 0.756 Kilifi_South 14 GG CC non-O Het GG 22 0 0.870 Kilifi_South 15 AA CC O Het AG 13.5 1 1.332 Kilifi_South 16 AA TT O Norm AG 16.5 1 -0.237 Kilifi_North 17 AA CC non-O Norm GG 13.5 1 0.430 Kilifi_North 18 AA CT O Het AA 11.5 1 -1.011 Kilifi_North 19 AA CC non-O Het GG 14.5 1 -0.009 Kilifi_North 20 AA TT non-O Het AA 22 0 0.692 Kilifi_South 21 AA CC O Norm GG 22 0 0.705 Kilifi_South 22 AG TT O Het GG 22 0 1.801 Kilifi_South 23 AA CC non-O Norm GG 22 0 1.658 Kilifi_South 24 AA TT O Het GG 22 0 0.903 Kilifi_South 25 AA CC O Het GG 22 0 0.120 Kilifi_South 26 AA CC non-O Het AG 19.5 1 0.991 Kilifi_South 27 AA CT non-O Norm GG 14.5 1 -0.243 Kilifi_South 28 AA CC O Homo AG 22 0 1.199 Kilifi_South 29 AA CC non-Onon-O Het AA 22 0 0.466 Kilifi_South 30 AA CC O Het GG 13.5 1 -0.411 Kilifi_North 31 AA CC non-O Norm AA 13.5 1 -0.216 Kilifi_North 32 AG CC O Norm GG 14.5 1 0.167 Kilifi_South 33 AA CC O Het AG 16.5 1 0.210 Kilifi_North 34 AA CC non-O Het GG 17.5 1 -0.354 Kilifi_North 35 AA CC O Het GG 13.5 1 0.784 Kilifi_North 36 AA CC O Het AG 13.5 1 -0.387 Kilifi_South 37 AA CC O Homo GG 22 0 1.445 Kilifi_South 38 AA CC O Norm AG 22 0 1.324 Kilifi_South 39 AG CC O Norm AG 22 0 1.625 Kilifi_South 40 AA CT non-O Het AG 22 0 1.941 Kilifi_South 41 AA CT O NA AG 22 0 1.019 Kilifi_South 42 AG CC non-O Norm AG 22 0 1.253 Kilifi_South 43 AG CC O Het AA 22 0 1.251 Kilifi_South 44 AA CC Undetermined Norm GG 22 0 0.966 Kilifi_South 45 AA CC non-O Het GG 22 0 1.622 Kilifi_South 46 AA CC non-O Het AG 22 0 1.334 Kilifi_South 47 AA CC non-O Homo GG 22 0 1.303 Kilifi_South 48 AG CC O Het AG 22 0 1.244 Kilifi_South 49 AG CC non-O Het AG 22 0 1.120 Kilifi_South 50 AG CC O Norm GG 22 0 1.213 Kilifi_South 51 AA CT O Homo AG 22 0 0.836 Kilifi_South 52 AG CC O Norm AG 22 0 1.073 Kilifi_South 53 AA CC O Norm AG 22 0 0.475 Kilifi_South 54 AG CC O Het AG 22 0 0.806 Kilifi_South 55 AA CC O Homo GG 22 0 1.312 Kilifi_South 56 AA CC O Homo AG 22 0 -0.041 Kilifi_South 57 AA TT non-O Het GG 22 0 1.403 Kilifi_South 58 AA TT non-O Het GG 22 0 1.608 Kilifi_South 59 AA CC non-O Homo GG 13 1 1.335 Kilifi_South 60 AA CC O Norm GG 22 0 0.762 Kilifi_South 61 AA CC O Het GG 22 0 1.995 Kilifi_South 62 AA CC O Het GG 22 0 0.650 Kilifi_South 63 AA TT O Homo AG 22 0 1.055 Kilifi_South 64 AA CC non-O Norm AA 22 0 1.317 Kilifi_South 65 AA CC O Het AG 18 1 0.601 Kilifi_South 66 AG CC non-O Het GG 13 1 0.507 Kilifi_North 67 AA CC O Norm GG 13 1 -0.220 Kilifi_North 68 AA CT non-O Het AG 13 1 -0.861 Kilifi_North 69 AA CC O Het GG 17 1 -0.328 Kilifi_North 70 AA CC non-O Norm GG 14.5 1 0.257 Kilifi_North 71 AA CC non-O Het AA 14.5 1 0.856 Kilifi_North 72 AA CC non-O Het AG 19.5 1 1.624 Kilifi_North 73 AA CC O Het AG 16.5 1 0.014 Kilifi_North 74 AG CC O Het AG 13.5 1 -0.247 Kilifi_North 75 AA CC O Norm AG 13.5 1 0.168 Kilifi_North 76 AA CC non-O Homo GG 13 1 -0.482 Kilifi_North 77 AA CC O Homo AG 13 1 0.256 Kilifi_North 78 AA CC O Het GG 14.5 1 -0.520 Kilifi_North 79 AG TT non-O Norm AG 22 0 0.180 Kilifi_North 80 AA CC O Het AG 22 0 -0.009 Kilifi_North 81 AA TT non-O Norm GG 22 0 0.553 Kilifi_South 82 AA CC non-O Het AA 14.5 1 1.364 Kilifi_South 83 AG CT non-O Homo GG 18.5 1 0.054 Kilifi_South 84 AG CC non-O Homo AA 22 0 0.843 Kilifi_South 85 AA CT O Het GG 22 0 1.567 Kilifi_South 86 AA CC non-O NA GG 22 0 1.727 Kilifi_South 87 AA CT O Homo GG 22 0 0.500 Kilifi_South 88 AA CC O Homo AG 22 0 1.028 Kilifi_South 89 AA CT non-O Het AG 22 0 1.381 Ahero 90 AA CC O Het AG 21 1 0.085 Ahero 91 AA CC non-O Norm AG 22 0 0.435 Ahero 92 AA TT non-O Norm AG 22 0 1.137 Ahero 93 AA CC O Norm AA 16.5 1 -0.622 Ahero 94 AA CC non-O Het AA 22 0 2.609 Ahero 95 AA CC non-O Het AG 22 0 2.743 Ahero 96 AA CC O Norm AG 22 0 1.458 Ahero 97 AA CT non-O Norm AA 22 0 1.478 Ahero 98 AA TT O Homo AA 22 0 -0.183 Ahero 99 AA CC O Het AA 22 0 -0.015 Ahero 100 AA CC non-O Het GG 21 1 -0.171 Ahero 101 AA CC non-O Het GG 18 1 0.669 Ahero 102 AA CC non-O Homo AG 22 0 0.194 Ahero 103 AA CC non-O Norm AG 16.5 1 0.701 Ahero 104 AG CC non-O Norm AG 22 0 0.069 Kilifi_South 105 AA CC O Norm GG 22 0 0.961 Kilifi_South 106 AA CC O Norm AA 22 0 0.905 Kilifi_South 107 AA CC non-O Het AG 22 0 0.988 Kilifi_South 108 AA CC O Het GG 22 0 0.870 Kilifi_South 109 AG CC O Norm GG 22 0 0.289 Kilifi_South 110 AA CC non-O Het AG 22 0 1.091 Kilifi_South 111 AG CC non-O Norm AG 16.5 1 0.068 Kilifi_North 112 AA CC O Norm GG 15.5 1 -0.409 Kilifi_North 113 AA CC non-O Norm AG 15.5 1 -0.675 Kilifi_North 114 AA CC non-O Het AA 15.5 1 -0.879 Kilifi_North 115 AA CC non-O Het AG 17.5 1 0.014 Kilifi_North 116 AA TT O Homo GG 18.5 1 -0.090 Kilifi_North 117 AA CC non-O Het AG 14.5 1 -0.148 Kilifi_North 118 AA CC non-O Het GG 15 1 0.179 Kilifi_South 119 AA CC O Norm AG 16.5 1 0.136 Kilifi_North 120 AG CC non-O Het AG 15 1 -0.520 Kilifi_North 121 AG CC O Norm GG 22 0 0.709 Kilifi_South 122 AA CT O Norm GG 21 1 0.280 Kilifi_South 123 AG CC non-O Norm AG 22 0 0.750 Kilifi_South 124 AA CC O Het GG 22 0 1.631 Kilifi_South 125 AA CT O Homo AG 21 1 0.904 Kilifi_South 126 AG CT non-O Het GG 22 0 0.210 Kilifi_South 127 AA CT O Norm GG 17.5 1 0.114 Kilifi_South 128 AA CT O Het AA 22 0 1.670 Kilifi_South 129 AA CT non-O Norm GG 22 0 3.978 Kilifi_South 130 AA CC O Het GG 22 0 0.298 Kilifi_South 131 AG CC O Norm AG 22 0 1.682 Kilifi_South 132 AA CC O Het AG 22 0 0.113 Kilifi_South 133 AA CC non-O Norm AA 22 0 3.978 Kilifi_South 134 AG CC non-O Homo AA 22 0 0.773 Kilifi_South 135 AA CC non-O Het GG 18.5 1 0.094 Kilifi_South 136 AA CC non-O Het AG 21 1 3.978 Kilifi_North 137 AA CC non-O Homo GG 21 1 1.017 Kilifi_South 138 AG CC O Norm GG 22 0 1.049 Kilifi_South 139 AA CC non-O Het GG 22 0 1.436 Kilifi_South 140 AA CC O Het GG 22 0 2.284 Kilifi_South 141 AA CC non-O NA GG 22 0 0.352 Kilifi_South